8ieg_CDEFGHKL : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	BRE1(MRBD-RING)/RAD6-UB/NUCLEOSOME COMPLEX
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 8ieg_C interface=2,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 8ieg_D interface=3, rsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtcytsa > 8ieg_E interface=3,4,46, phRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 8ieg_F interface= rdNIqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirDavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 8ieg_G interface=2, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 8ieg_H interface=3, rsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 8ieg_K interface=4,47, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 8ieg_L interface=24, lrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg
interface signature	RR/R/RYR/NID/R/R/RR/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.592 IC/col=0.011 n_of_columns=147

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  22  22  24  24  27  13  15  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  23  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  36  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  22  24  24  24  12  13  24  24  24  24  23  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  27  22  24  24  22  14  17  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  31  10  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  22  24  24  24  60  14  24  24  24  24  21  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  25  22  24  24  25  13  15  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  21  63  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  25  24  24  24  12  13  24  24  24  24  31  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  22  30  24  24  22  56  49  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  21  10  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  27  24  24  24  12  56  24  24  24  24  21  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24

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