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structure nameYEAST RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH THE +1 NUCLEOSOME AND NTP (COMPLEX C)
experimentNMR
links to other resourcesNAKB PDBSum PDIdb DNAproDB
protein sequence
interface signatureSRRKHY/EAQADT/YREETD/T/NVFLFVTQNVFPLFVT/RRMPTVLTRLWVLVFM/F//N/R/RR/R/RR/RR/RYLR/R/R/S

Estimated binding specificities ?

readout + contactlogo
# IC=9.034 IC/col=0.042 n_of_columns=217 specificity:   
A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  25  24  24  24  24  24  24  60  15  22  24  24  25  19  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  23   8  16  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  25  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  38  66  15  24  24  31  20  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  23  21  22  24  21  31  34  24  24  24  24  39  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  15  22  24  24  24  24  24  24  24  24  60  13   9  96   0  48   0  96  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  12  15  27  24  24  27  19  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  21  70  16  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  22  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  20  10  17  24  24  21  19  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  21  21  25  24  33  21  20  24  24  24  24  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  15  25  24  24  24  24  24  24  24  24  12  13   9   0   0  16   0   0  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  27  24  24  24  24  24  24  12  15  22  24  24  22  19  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  31   8  48  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  27  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  19  10  15  24  24  23  38  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  21  33  22  24  21  23  20  24  24  24  24  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  17  22  24  24  24  24  24  24  24  24  12  14  11   0   0  16   0   0  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  22  24  24  24  24  24  24  12  51  25  24  24  22  39  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  21  10  16  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  19  10  49  24  24  21  19  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  31  21  27  24  21  21  22  24  24  24  24  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  49  27  24  24  24  24  24  24  24  24  12  56  67   0  96  16  96   0  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24
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