7xzx_ABCDEFGHKLMN : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	CRYO-EM STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH P53 DNA-BINDING DOMAIN
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7xzx_A interface=3, phRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7xzx_B interface=15,25, vlrdniqgitkpaiRrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7xzx_C interface=1,32,65,67, RakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkKtRiiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 7xzx_D interface=4, krsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7xzx_E interface=4,47, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7xzx_F interface=23, rdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7xzx_G interface=30, kaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7xzx_H interface= rsrkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamGimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7xzx_K interface=155,183,184,187, sssvpsqktyqgsygfrlgflhsgtaksvtctyspalnkmfcqlaktcpvqlwvdstpppgtrvramaiykqsqhmtevvrrcphhercsdsdglappqhlirvegnlrveylddrntfrhsvvvpyeppevgsdcttihynymcnsscmggmnRrpiltiitledssgnllgrnsfevrvcACpgRdrrteeenlrk > 7xzx_L interface=27,28,183,184,187, sssvpsqktyqgsygfrlgflhsgtaKSvtctyspalnkmfcqlaktcpvqlwvdstpppgtrvramaiykqsqhmtevvrrcphhercsdsdglappqhlirvegnlrveylddrntfrhsvvvpyeppevgsdcttihynymcnsscmggmnrrpiltiitledssgnllgrnsfevrvcACpgRdrrteeenlrk > 7xzx_M interface=27,28,183,184,187,188, sssvpsqktyqgsygfrlgflhsgtaKSvtctyspalnkmfcqlaktcpvqlwvdstpppgtrvramaiykqsqhmtevvrrcphhercsdsdglappqhlirvegnlrveylddrntfrhsvvvpyeppevgsdcttihynymcnsscmggmnrrpiltiitledssgnllgrnsfevrvcACpgRDrrteeenlrk > 7xzx_N interface=27,28,183,184,187,188, sssvpsqktyqgsygfrlgflhsgtaKSvtctyspalnkmfcqlaktcpvqlwvdstpppgtrvramaiykqsqhmtevvrrcphhercsdsdglappqhlirvegnlrveylddrntfrhsvvvpyeppevgsdcttihynymcnsscmggmnrrpiltiitledssgnllgrnsfevrvcACpgRDrrteeenlrk
interface signature	R/RR/RRKR/R/RR/R/R/G/RACR/KSACR/KSACRD/KSACRD

Estimated binding specificities ?

readout + contact

# IC=9.566 IC/col=0.056 n_of_columns=171

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  21  24  24  24  24  24  24  24  22  25  24  24  24  38  21  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  20  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  22  22  12  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  48  16   7  18  12  96   0   6   9  14  15  15  10  16   6  85   9   9  13  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  33  24  24  24  24  24  24  24  20  27  24  24  24  19  21  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  20  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  34  34  12  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  16   8  18  60   0   0   6   9  54  49  17  10  14  78   3   9  11  13  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  21  24  24  24  24  24  24  24  34  22  24  24  24  20  23  24  24  24  24  24  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  36  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  20  20  60  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  45  74  42  12   0   0  78   9  14  17  49  66  52   6   3   9  67  13  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  21  24  24  24  24  24  24  24  20  22  24  24  24  19  31  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  20  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  20  20  12  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  19   7  18  12   0  96   6  69  14  15  15  10  14   6   5  69   9  57  24  24

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