7xsx_ABEWabcdejk : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX TRANSCRIBING A NUCLEOSOME (EC49)
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7xsx_A interface=239,304,435,818,819,1338, sqfpyssaplrsvkevqfgllspeeiraisvvkieypeimdesrqrpregglndpklgsidrnfkcqtcgegmaecpghfghmelakpvfhigfipkikkvcecicmncgkllldetnptmaqairirdpkkrfnavwqlcktkmvceadapvsrggcgntqpvvrkdgmklwgtwkksrdaqperklltpgeilnvfkhispedcfrlgfnedyarpewmiitvlpvpppqvrpsiaMdettqgqddlthklsdilkaninvqklemdgspqhiineveqllqfhvatymdndiagqpqalqKsgrpvkairarlkgkegrlrgnlmgkrvdfsartvisgdpnleldqvgvpisiaktlsypetvtqynihrlteyvrngpnehpgakyvirdngdridlryhkragdivlqygwkverhlmdddpvlfnrqPslhkmsmmahrvkvmpystfrlnlsvtspynadfdgdemnlhvpqseetraelsqlcavplqivspqsnkpvmgivqdtlcgvrkmtlrdtfieyeqvmnmlfwvpswdgvvpqpailkpkplwtgkqllsiaipsgihlqrtdggnsllspkdngmlivdgkvmfgvvdkktvgsgggglihtvmrekgpkicaelfgniqkvvnywllhngfsigigdaiadastmkeithaissakeqvqeiiykaqhnelelkpgmtlresfegevsrtlndardsagrsaemnlkdlnnvkqmvsagskgsfiniaqmsacvgqqmvegkriafgfadrslphftkddfspeskgfvensylrgltpqefffhamagreglidtavkTAetgyiqrrlvkaledimvhydgttrnslgdiiqflygedgldgtqverqtidtipgsdkafhkryyvdlmdeknsikpdvieyaadilgdvelqkelnseyeqlvsdrkflreivfvngdhnwplpvnlrriiqnaqqifhldrakasdltipeiihgvrdlckklfvlrgenelikeaqqnatslfqclvrarlatrrileefrlnrdafewvlgtieaqfqrslvhpgemvgviaaqsigepatqmnvtlgvprlkeilnvakniktpaltvyldreialdiekakviqssieyttlknvtsateiyydpdptstvieedfdtveayfsqspwllrleldrarmldkqltmnqvadkisevfsddlfvmwsednadkliircrvieedqmlkrieahmldlialrgipgiskvymvkhkvsvpdesgeykneelwaletdginlaevmavpgvdssrtysnsfveilsvlgieatrsslykeilnviafdgsyvnyrhmallvdvmtsrgylmaitRhginradtgalmrcsfeetveilfeagaaaelddcrgvsenvmlgqlapmgtgafdvmidekllts > 7xsx_B interface=462, ddtittedcwtvisaffeekglvsqqldsfdefmetsiqdlvweeprlildqpaqhdninkryeirfgkiylsrptmteadgtthamfpqearlrnltysspvyldmeksmftsidgnkvhigkvpimlrskfcslrtldevdlykmkecpydmggyfvingsekvliaqersaanivqvfkkaapspishvaeirsalekgsrlistmqiklygredkgtgrtikatlpyvkqdipivivfralgvvpdgeilqhicydendwqmlemlkpcieegfviqdkevaldfigrrgsaalgirrekriqyakdilqkellphitqeegfetrktfflgymvnrlllcalerkdqddrdhfgkkrldlagpllanlfrilfrkltreiyrymqrcietdrdfnlnlavksttitsglkyslatgnwgeqkkamssragvsqvlnrytysstlshlrrtntpigrDgklakprqlhnthwglvcpaetpegqacglvknlsllsgisigspsepiinfleewgmepledydpaqhtkstrifvngvwtgihrdpsmlvstmrdlrrsgaispevsiirdirerefkiftdvgrvyrplfiveddeskdnkgelritkehirkiqqgydddvygwsslvtsgvieyvdgeeeetimiamtpedlqtndtakrikpemstsshhtfthceihpsmilgvaasiipfpdhnqsprntyqsamgkqamgvfltnynvrmdtmanilyypqkplaktqameylkfrelpagqnaivaiacysgynqedsmimnqssidrglfrslffrsymdqekrfgisiveefekptrattlrlkhgtyekldedgliapgvrvsgddiiigkttpippdteelgqrtkyhtkrdastplrstengivdqvllttnqeglkfvkvrmrttkvpqigdkfasrhgqkgtigvtyrhedmpfsaegivpdliinphaipsrmtvahliecllskvgsirgyegdatpftdltvdavsnllrdngyqsrgfevmynghtgkklmaqvffgptyyqrlrhmvddkiharargpvqvltrqpvegrsrdgglrfgemerdcmiahgaagflkerlmeasdafrvhvcgicglmsvianlkknqfecrscknktniyqlhipyaakllfqelmamniaprlytersg > 7xsx_E interface= ednnriisrlwrsfrtvkemaadrgyfisqeemdqsleefrskicdsmgnpqrklmsflanptpealekysdlgtlwvefcdepsvgiktmrnfclriqeknfstgifiyqnnitpsankmiptvspaiietfqesdlvvnithhelvpkhirlsdgeksqllqryklkesqlpriqredpvarylglkrgqvvkiirrsetsgryasyricl > 7xsx_W interface= pqrlliptvddpgiwgvkvrlgkekdvvrqilkkklaregtknpleiysafqrdsfkghvyiearkaeaindalkgnvnvfsnnskflvgiveykdllrpvkssdvkltrgsyvrvkngkfkgdlaqvdevlenglearlklvprldygfrpaqrlfseaearvheptirrdrdgfvtyggeeyyegflyktfrlqnlivnsinptlnelslfqsneesttidlstiadslketaknlvsfqpgdnveiingelnhltgtvssvnqstivsvrlhsdddtinsetveiptsdlrkifnvgdhvrvihgkhtddtglivevngdkvefisnqtkrtvivfsnylikstdstvsinesgrfelhdlvqvnsdlvgiviraqkdsfdvlcsdgkllslppvsiysklnlnpnqqiaidsngvevkvgdtvreftgerrqgtilhvyrnflflrsreivenqgvfVtssnrvktirdptlnktvkirqggykgkigivkeangdrfrvelhnpnktipipcsflliesthgwvpyed > 7xsx_a interface=25, ellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqsaaigalqeaseaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7xsx_b interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7xsx_c interface=27, trssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7xsx_d interface= rsrkesysiyvykvlkqvhpdtgissKamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7xsx_e interface= rpgtvalreirryqkstellirklpfQrlvreiaqdfktdlrfqsaaigalqeaseaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7xsx_j interface= klrnettnteeekerlrkeiqkqlheKiqkeglarfnksdaqdgnenhavfkryesyvresqipskvknlrisidpkaqtiilpicgrpvpfhinsfkngskneegdymyirlnfnspgmgssvkktelpyedgddkefvrsltfrstnkermsevfkaitelkktavkrdqerktmedvvaqaqlvefkgrpkklenvfvrpapdskrvtgtlfihqngiryqspvrsdhrvdilfsnikhlffqpckeelmviihchlktplmigkkktfdvqfyrevsdvtvdeyrygdedeleqeqeerrrkalldkefrrfaeeiseasnglldletpfrelgftgvpfrssvlclptrdcliqlidtpflvvtleeievahlervqfglknfdlvfvfkdfskpvvhintipiemlefvkqwltdvdipysegavnlnwgtimktiqadpyeffenggwsflgggesddeeseee > 7xsx_k interface= mstvdfdtiflnqskapgrfritssgLgwkpssqvptkgktdpfllpsgdilsvswsrgyrgwelrvytrndkvimldgfeqqdfqqlkneiqrtfnvnlehkehslrgwnwgktqltraelvfnvnnrpaweipyseisnsnltgrheismelnpktvdenhyetlgdelvevrlyvpgqksqlfyeqlkdkadfdttseaivsfedilfltprgrfeismyannlrlrgqsydykiqnknvlrifslprlddrhhlvilqvdpplrqgqtrypflvmqfdrneelevelnlsdeeykskyegklnrsygtdstykilshclrglterrvitpgsfqsqhmqpgvncslkasegqiylldkclffatkpcvylpysgiisvvtsrgsrtfdievqfsggshtfaninkdeqkpiedflkgqgvrvkne
interface signature	MKPTAR/D//V/R/R/R/K/Q/K/L

Estimated binding specificities ?

contact

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specificity:

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