7xd0_ABCDEFGHKL : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	CRYO-EM STRUCTURE OF H2BK34UB NUCLEOSOME
source	HOMO SAPIENS / SYNTHETIC CONSTRUCT
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7xd0_A interface=4, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7xd0_B interface= kvlRdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7xd0_C interface=1,32, RakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7xd0_D interface= RkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnSfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7xd0_E interface=4,5, kphRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7xd0_F interface= kvlRDniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7xd0_G interface=1, Rakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7xd0_H interface=1, Rkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7xd0_K interface=74, mqifvktltgktitlevepsdtienvkakiqdkegippdqqrlifagkqledgrtlsdyniqkestlhlvlrlRgg > 7xd0_L interface= mqifvktltgktitlevepsdtienvkakiqdkegippdqqrlifagkqledgrtlsdyniqkestlhlvlrlRgg
interface signature	R/R/RR/RS/RY/RD/R/R/R/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=0.496 IC/col=0.003 n_of_columns=145

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  17  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  42  25  24  24  24  24  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  15  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  18  22  24  24  24  24  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  39  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  15  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  18  22  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  49  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  18  27  24  24  24  24  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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