7v9c_ABCDEFGHKLMNOPQR : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	TELOMERIC DINUCLEOSOME IN OPEN STATE
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7v9c_A interface=1,2,4,44, RYrPgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7v9c_B interface= VLrDniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvfleNvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9c_C interface=27,108,110, trssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkktesHhKakgk > 7v9c_D interface= rsrkesysvyvykvlkqvhpdtgissKamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7v9c_E interface=2, rYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9c_F interface= nIqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9c_G interface=29, aktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7v9c_H interface=3, rsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7v9c_K interface=26,44, ryrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7v9c_L interface=11,12,15, vlrdniqgitKPaiRrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9c_M interface=62,104,110, trssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkKteshhKakgk > 7v9c_N interface= rsrkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsReiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7v9c_O interface=4, ryrPgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9c_P interface= niqGitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9c_Q interface= aktRssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7v9c_R interface=3, rsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa
interface signature	RYPR/VLDN/RHK/K/Y/I/R/R/LR/KPR/RKK/R/P/G/R/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.781 IC/col=0.007 n_of_columns=273

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  20  12  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  20  24  24  24  24  21  22  24  25  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  15  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  21  27  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  22  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  20  12  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  22  24  24  24  24  21  22  24  22  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  15  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  21  22  24  24  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  10  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  34  60  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  20  24  24  24  24  21  25  24  27  27  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  17  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  21  22  24  24  30  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  10  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  30  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  22  12  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  34  24  24  24  24  33  27  24  22  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  49  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  33  25  24  24  22  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  63  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  22  24

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