7u50_ABCDEFGHK : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	APE1 BOUND TO A NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH AP-SITE AT SHL-6
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7u50_A interface=2,4, hRyRpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvglfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7u50_B interface= dNiQgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 7u50_C interface=31, akaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgkvtiaqggvlpniqavllp > 7u50_D interface=2, sRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkyts > 7u50_E interface=3,46, phRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvglfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7u50_F interface= kvLrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenVirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 7u50_G interface= ktRssraglqfpvgrvhrllrkgnyaervgagapvylaavleyltAeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgkvtiaqggvlpniqavllpk > 7u50_H interface=2, sRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytss > 7u50_K interface=56,86,135,187,227,228,229, alyedppdqktspsgkpatlkicswnvdglrawikkkgldwvkeeapdilclqetKcsenklpaelqelpglshqywsapsdkegYsgvgllsrqcplkvsygigdeehdqegrvivaefdsfvlvtayvpnagRglvrleyrqrwdeafrkflkglasrkplvlcgdlnvaheeidlrnpkgnkkNagftpqerqgfgellqavpladsfrhlypntpyaytfwtYMMnarsknvgwrldyfllshsllpalcdskirskalgsdhcpitlylal
interface signature	RR/NQ/R/R/RR/LV/RA/R/KYRNYMM

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=3.094 IC/col=0.022 n_of_columns=143

specificity:

A |  24  22  24  24  24  22   0  81  24  52  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  10  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  16  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  27  24  24  24  22   0   4  24  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  63  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  14  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  22  24  24  24  25  96   7  24  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  39  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  10  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  14  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  25  24  24  24  27   0   4  24  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  52  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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