7pfw_abcdefghu : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	NUCLEOSOME 2 OF THE 4X207 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7pfw_a interface=4,5,29, kphRYrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvglfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirge > 7pfw_b interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7pfw_c interface=33, arakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7pfw_d interface=4, krsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7pfw_e interface=4,47, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvglfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirge > 7pfw_f interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7pfw_g interface=2,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7pfw_h interface=4, krsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7pfw_u interface=44,67, sgppvselitkavaaskersgvslaalkkalaaagydveknnsRiklglkslvskgtlvqtkgtgaSgsfklnkk
interface signature	RYL/R/R/R/RR/R/RR/R/RS

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.807 IC/col=0.011 n_of_columns=167

specificity:

A |  24  24  24  24  24  23  16  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  17  19  24  24  24  24  24  24  24  24  20  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  19  60  18  21  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  23  24  20   9  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  19  13  22  24  30  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  21  16  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  49  19  24  24  24  24  24  24  24  24  36  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  38  12  42  23  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  31  24  34   9  36  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  38  14  30  24  22  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  31  45  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  36  15  19  24  24  24  24  24  24  24  24  20  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  20  12  18  31  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  21  24  20  67  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  19  13  22  24  22  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  21  19  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  15  39  24  24  24  24  24  24  24  24  20  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  19  12  18  21  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  21  24  22  11  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  20  56  22  24  22  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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