7pfv_ABCDEFGHU : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	NUCLEOSOME 1 OF THE 4X207 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7pfv_A interface=4, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvglfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirge > 7pfv_B interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7pfv_C interface=2,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7pfv_D interface=1,4, KrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7pfv_E interface=4,47, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvglfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirge > 7pfv_F interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7pfv_G interface=2,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7pfv_H interface=4,57, krsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkRstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7pfv_U interface=44,67, sgppvselitkavaaskersgvslaalkkalaaagydveknnsRiklglkslvskgtlvqtkgtgaSgsfklnkk
interface signature	R/R/RR/KR/RR/R/RR/RR/RS

Estimated binding specificities ?

readout + contact

# IC=2.378 IC/col=0.014 n_of_columns=176

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  16  18  24  24  42   8  21  24  24  24  19  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  60  18  21  22  24  24  24  24  24  19  22  24  24  24  24  22  24  22  10  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  36  25  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  23  23  24  24  24  24  18  15  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  18  52  18  24  24  18   8  21  24  24  24  39  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  12  42  21  25  24  24  24  24  24  39  20  24  24  24  24  27  24  27  10  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  22  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  31  21  24  24  24  24  18  49  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  36  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  42  14  18  24  24  18   8  21  24  24  24  19  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  12  18  31  22  24  24  24  24  24  19  20  24  24  24  24  25  24  22  66  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  27  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  21  21  24  24  24  24  18  17  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  14  42  24  24  18  72  33  24  24  24  19  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  12  18  23  27  24  24  24  24  24  19  34  24  24  24  24  22  24  25  10  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  22  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  21  31  24  24  24  24  42  15  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

scan!

home
updated Thu Dec 1 19:48:08 2022