Interface of input file ?

interface graph
legend  pdf

footprint
legend

structure nameNUCLEOSOME STACK OF THE 4X207 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1
experimentNMR
links to other resourcesNAKB PDBSum PDIdb DNAproDB
protein sequence
interface signatureR/R/RR/KR/RR/RR/RR/RR/R/R/RR/KR/R/RR/RR/RM/RS/PRS

Estimated binding specificities ?

readout + contactlogo
# IC=6.354 IC/col=0.018 n_of_columns=352 specificity:   
A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  19  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  16  12  18  24  24  45   5  18  24  24  24  20  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  60  18  23  25  24  24  24  24  24  15  19  24  24  24  25  21  24  21  10  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  22  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  21  21  24  24  24  24  18  15  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  20  22  24  24  24  18  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  60  19  22  21  24  24  24  24  20  20  24  24  24  24  24  21  20  19   4  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  18  24  24  24   9   8  20  24  24  15  12  20  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  19  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  19  60  18  24  24  16   3  18  24  24  24  34  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  12  42  21  22  24  24  24  24  24  51  19  24  24  24  27  33  24  33  13  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  27  33  21  24  24  24  24  18  51  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  20  22  24  24  24  42  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  12  39  22  21  24  24  24  24  22  38  24  24  24  24  24  31  34  38   7  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  18  24  24  24  69  10  36  24  24  17  12  34  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  38  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  45  12  18  24  24  16   3  18  24  24  24  22  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  12  18  31  22  24  24  24  24  24  15  20  24  24  24  22  21  24  21  63  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  30  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  21  23  24  24  24  24  18  15  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  20  22  24  24  24  18  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  12  19  30  21  24  24  24  24  34  19  24  24  24  24  24  21  22  20  81  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  18  24  24  24   9   8  20  24  24  49  60  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  20  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  16  12  42  24  24  19  85  42  24  24  24  20  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  12  18  21  27  24  24  24  24  24  15  38  24  24  24  22  21  24  21  10  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  22  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  25  21  31  24  24  24  24  42  15  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  36  30  24  24  24  18  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  12  19  22  33  24  24  24  24  20  19  24  24  24  24  24  23  20  19   4  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  42  24  24  24   9  70  20  24  24  15  12  20  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
scan!

home
updated Thu Dec 1 19:14:58 2022