7pft_ABCDEFGHKLMNOPQRSUabcdefghu : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	TRINUCLEOSOME OF THE 4X207 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7pft_A interface=4, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvglfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirge > 7pft_B interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7pft_C interface=2,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7pft_D interface=1,4, KrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7pft_E interface=4,47, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvglfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirge > 7pft_F interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7pft_G interface=2,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7pft_H interface=4,57, krsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkRstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7pft_K interface=4, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvglfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirge > 7pft_L interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7pft_M interface=2,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7pft_N interface=1,4, KrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7pft_O interface=4, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvglfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirge > 7pft_P interface=16,26, kvlrdniqgitkpaiRrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7pft_Q interface=2,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7pft_R interface= kRsrkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgiMnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7pft_S interface=44,67, sgppvselitkavaaskersgvslaalkkalaaagydveknnsRiklglkslvskgtlvqtkgtgaSgsfklnkk > 7pft_U interface=44,67, sgppvselitkavaaskersgvslaalkkalaaagydveknnsRiklglkslvskgtlvqtkgtgaSgsfklnkk > 7pft_a interface=3,4,5,29, kpHRYrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvglfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirge > 7pft_b interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7pft_c interface=33, arakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7pft_d interface=4, krsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7pft_e interface=4,5,47, kphRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvglfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirge > 7pft_f interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7pft_g interface=2,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7pft_h interface=4, krsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7pft_u interface=1,4,44,67, SgpPvselitkavaaskersgvslaalkkalaaagydveknnsRiklglkslvskgtlvqtkgtgaSgsfklnkk
interface signature	R/R/RR/KR/RR/R/RR/RR/R/R/RR/KR/R/RR/RR/RM/RS/RS/HRYL/R/R/R/RYR/R/RR/R/SPRS

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=7.126 IC/col=0.012 n_of_columns=587

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  20  16  16  24  24  20  70  13  24  24  24  38  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20   4  19  24  22  24  24  24  24  24  19  20  24  24  24  24  30  24  19  12  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  19  24  24  24  30  34  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  22  24  22  56  19  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20   9  20  24  21  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  21  18  12  19  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  38  15  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  25  24  24  24  24  24  24  24  22  18  19  30  22  21  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  15  42  24  24  24  24  33  23  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  10  22  24  22  24  24  24  24  36  19  24  24  24  24  24  30  21  18  12  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  19  24  24  24  31  72  18  24  24  42  14  18  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  45  48  24  24  20   8  10  24  24  24  20  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  81  19  24  22  24  24  24  24  24  19  34  24  24  24  24  22  24  19  12  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  19  24  24  24  22  20  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  22  24  22  13  19  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  67  20  24  21  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  31  18  12  20  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  20  24  24  24  24  24  24  24  24  20  17  36  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  27  24  24  24  24  24  24  24  25  42  38  22  22  21  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  24  15  18  24  24  24  24  21  21  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  27  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  66  25  24  25  24  24  24  24  20  19  24  24  24  24  24  22  33  18  12  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  20  24  24  24  23   8  18  24  24  18  14  42  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
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