7pfd_ABCDEFGHU : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	NUCLEOSOME 1 OF THE 4X197 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7pfd_A interface=4, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvglfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirge > 7pfd_B interface=16,26, kvlrdniqgitkpaiRrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7pfd_C interface=2,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7pfd_D interface=1,4, KrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7pfd_E interface=3,4,47, kpHRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvglfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirge > 7pfd_F interface=16,26, kvlrdniqgitkpaiRrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7pfd_G interface=2,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7pfd_H interface= kRsrkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgiMnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7pfd_U interface=4,44,67, sgpPvselitkavaaskersgvslaalkkalaaagydveknnsRiklglkslvskgtlvqtkgtgaSgsfklnkk
interface signature	R/RR/RR/KR/HRR/RR/RR/RM/PRS

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=3.130 IC/col=0.018 n_of_columns=172

specificity:

A |  24  24  24  24  22  24  13  51  24  24  24  24  24  25  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  12   7  16  24  24  27  13  20  24  24  24  16  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  39  16  25  20  24  24  24  24  24  15  19  24  24  24  25  23  22  20  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  20  24  24  24  24  24  25  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  22  24  56  15  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  12  74  16  24  24  25  14  22  24  24  24  45  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  48  19  52  22  20  24  24  24  24  24  49  20  24  24  24  27  31  27  34  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  38  24  24  24  24  24  22  52  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  27  24  14  15  24  24  24  24  24  27  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  60   7  19  24  24  22  13  20  24  24  24  19  48  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  19  14  27  22  24  24  24  24  24  17  19  24  24  24  22  21  25  22  56  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  19  24  24  24  24  24  22  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  25  24  13  15  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  12   8  45  24  24  22  56  34  24  24  24  16  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  19  14  22  34  24  24  24  24  24  15  38  24  24  24  22  21  22  20  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  19  24  24  24  24  24  27  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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