7pez_eklmnopqs : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	NUCLEOSOME 4 OF THE 4X177 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7pez_e interface=4, krsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7pez_k interface=4,5,29,47, kphRYrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvglfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirge > 7pez_l interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7pez_m interface=2,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7pez_n interface=4, krsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7pez_o interface=4,29,47, kphRyrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvglfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirge > 7pez_p interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7pez_q interface=2,33,68, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7pez_s interface=44,67, sgppvselitkavaaskersgvslaalkkalaaagydveknnsRiklglkslvskgtlvqtkgtgaSgsfklnkk
interface signature	R/RYLR/R/RR/R/RLR/R/RRR/RS

Estimated binding specificities ?

readout + contact

# IC=3.788 IC/col=0.021 n_of_columns=181

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  16  12  24  24  24  18  67  13  24  24  24  42  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  19  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  19   6  25  24  22  24  24  24  24  27  20  24  24  24  24  24  27  24  17  12  23  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  19  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  20  24  24  24  38  67  23  24  24  42  10  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  30  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  16  60  24  24  24  18   9  14  24  24  24  18  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  19  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  20  78  22  24  22  24  24  24  24  22  20  24  24  24  24  24  22  24  15  12  21  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  45  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  19  24  24  24  19  11  21  24  24  18  10  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  45  12  24  24  24  42   9  56  24  24  24  18  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  19  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  38   6  27  24  30  24  24  24  24  22  36  24  24  24  24  24  25  24  49  12  31  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  16  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  38  24  24  24  19   9  21  24  24  18  63  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  19  12  24  24  24  18  11  13  24  24  24  18  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  39  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  19   6  22  24  22  24  24  24  24  25  20  24  24  24  24  24  22  24  15  60  21  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  16  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  19  24  24  24  20   9  31  24  24  18  13  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  22  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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