7e8d_ABCDEFGHK : 3D-footprint complex

structure name	NSD2 E1099K MUTANT BOUND TO NUCLEOSOME
source	HOMO SAPIENS
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7e8d_A interface=3,4,28, phRYrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7e8d_B interface=23, rdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 7e8d_C interface=1,32, RakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgkvtiaqggvlpniqavllpkk > 7e8d_D interface=3, rsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7e8d_E interface=10,53, atggvmkphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7e8d_F interface= dniqgitkpAirrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehAkrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 7e8d_G interface=1, Rakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgkvtiaqggvlpniqavllpkk > 7e8d_H interface= Krsrkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7e8d_K interface=139, rkpppykhikvnkpygkvqiytadiseipkcnckptdenpcgfdseclnrmlmfechpqvcpagefcqnqcftkrqypetkiiktdgkgwglvakrdirkgefvneyvgelidkeecmarikhahendithfymltidKdriidagpkgnysrfmnhscqpncetlkwtvngdtrvglfavcdipagteltfnynldclgnektvcrcgasncsgflg
interface signature	RYL/R/RR/R/RR/AA/R/K/K

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.897 IC/col=0.011 n_of_columns=172

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  18  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  14  21  24  42  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  20   7  21  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  14  10  23  24  24  21  20  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  54  21  24  18  45  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  36   8  31  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  22  24  24  24  52  10  31  24  24  21  19  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  18  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  14  31  24  18  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  20  74  23  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  22  24  24  24  14  13  21  24  24  33  38  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  42  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  14  23  24  18  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  20   7  21  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  30  24  24  24  16  63  21  24  24  21  19  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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updated Wed Nov 30 23:45:45 2022