7cow_ABCDEFGHKLMNOPQRST : 3D-footprint complex

structure name	353 BP DI-NUCLEOSOME HARBORING COHESIVE DNA TERMINI WITH LINKER HISTONE H1.0
reference	Adhireksan et al. 'Nucleic 49 e52 2021
source	HOMO SAPIENS
experiment	X-ray (resolution=2.86, R-factor=?)
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7cow_A interface=3,4,6, phRYrPgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7cow_B interface=23, rdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7cow_C interface=30, kaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 7cow_D interface=4, krsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7cow_E interface=3,4, phRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7cow_F interface= vlRDniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7cow_G interface=30, kaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7cow_H interface=1,5, RkrsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7cow_K interface=2,3, pHRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7cow_L interface=23, rdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7cow_M interface=31, akaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 7cow_N interface=4, krsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7cow_O interface=4,5, kphRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7cow_P interface=23, rdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7cow_Q interface=31,66, akaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7cow_R interface=4, krsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7cow_S interface=25,26,68, tdhpkysdmivaaiqaeknragssRQsiqkyikshykvgenadsqiklsikrlvttgvlkqtkgvgaSgsfrlak > 7cow_T interface=25,68,75, tdhpkysdmivaaiqaeknragssRqsiqkyikshykvgenadsqiklsikrlvttgvlkqtkgvgaSgsfrlaK
interface signature	RYP/R/R/R/RY/RD/R/RR/HR/R/R/R/RY/R/RR/R/RQS/RSK

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.523 IC/col=0.004 n_of_columns=349

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  22  24  24  24  24  24  24  24  24  34  22  24  24  24  24  24  24  21  19  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  14  19  22  24  24  24  24  24  27  18  21  24  24  24  24  24  24  15  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  25  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  25  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  22  24  24  24  24  24  24  22  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  31  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  22  22  24  24  24  24  24  27  15  24  24  24  24  24  24  22  21  15  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  42  30  24  24  24  24  24  24  24  24  20  25  24  24  24  24  24  24  31  19  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  54  20  22  24  24  24  24  24  22  18  31  24  24  24  24  24  24  15  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  22  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  27  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  30  24  24  24  24  24  24  22  27  31  24  24  24  24  24  24  24  24  21  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  25  22  24  24  24  24  24  22  15  24  24  24  24  24  24  30  21  17  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  18  22  24  24  24  24  24  24  24  24  20  27  24  24  24  24  24  24  21  20  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  14  38  30  24  24  24  24  24  22  42  23  24  24  24  24  24  24  49  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  27  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  22  24  24  24  24  24  24  30  25  23  24  24  24  24  24  24  24  24  21  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  27  30  24  24  24  24  24  25  51  24  24  24  24  24  24  22  31  15  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  30  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  22  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  23  38  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  14  19  22  24  24  24  24  24  25  18  21  24  24  24  24  24  24  17  48  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  22  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  22  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  22  24  24  24  24  24  24  22  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  23  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  22  22  24  24  24  24  24  22  15  24  24  24  24  24  24  22  23  49  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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