7c0m_ABCDEFGHKk : 3D-footprint complex

structure name	HUMAN CGAS-NUCLEOSOME COMPLEX
source	HOMO SAPIENS
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7c0m_A interface=3,46, phRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7c0m_B interface= kvLrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenVirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7c0m_C interface=27, trssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7c0m_D interface=3, rsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7c0m_E interface=2,45, hRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7c0m_F interface=21, niqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7c0m_G interface= aktrssraglqfpvgrvhrlLrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7c0m_H interface=2, sRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7c0m_K interface= dAapgasklravleklklsrddistaagmvkgvvdhlllrlkcdsafrgvgllntgsyyehvkisapnefdvmfklevpriqleeysntrayyfvkfkrnpkenplsqflegeilsaskmlskfrkiikeeindikdtdvimkrkrggspavtllisekisvditlalesksswpastqeglriqnwlsakvrkqlrlkpfylvpkhakegngfqeetwrlsfshiekeilnnhgksktccenkeekccrkdclklmkylleqlkerfkdkkhldkfssyhvktaffhvctqnpqdsqwdrkdlglcfdncvtyflqclrteklenyfipefnlfssnlidkrskefltkqieyernnefpvfdef > 7c0m_k interface=144, daapgasklravleklklsrddistaagmvkgvvdhlllrlkcdsafrgvgllntgsyyehvkisapnefdvmfklevpriqleeysntrayyfvkfkrnpkenplsqflegeilsaskmlskfrkiikeeindikdtdvimkRkrggspavtllisekisvditlalesksswpastqeglriqnwlsakvrkqlrlkpfylvpkhakegngfqeetwrlsfshiekeilnnhgksktccenkeekccrkdclklmkylleqlkerfkdkkhldkfssyhvktaffhvctqnpqdsqwdrkdlglcfdncvtyflqclrteklenyfipefnlfssnlidkrskefltkqieyernnefpvfdef
interface signature	RR/LV/R/R/RR/R/L/R/A/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=0.757 IC/col=0.005 n_of_columns=144

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  13  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  19  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  27  24  24  24  24  24  24  27  14  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  56  45  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  19  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  36  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  24  22  24  24  24  24  24  24  22  16  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  13  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  39  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  25  24  24  24  24  24  24  25  52  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  14  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  19  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  22  24  24  24  24  24  24  22  14  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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updated Wed Nov 30 22:14:59 2022