6wq0_ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWabcdefghijklmnopqrstuvw : 3D-footprint complex

structure name	CRYO-EM OF THE S. SOLFATARICUS ROD-SHAPED VIRUS, SSRV1
source	UNCLASSIFIED RUDIVIRUS
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6wq0_A interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_B interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_C interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_D interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_E interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_F interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_G interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_H interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_I interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_J interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_K interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_L interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_M interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_N interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_O interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_P interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_Q interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_R interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_S interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_T interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_U interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_V interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_W interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_a interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_b interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_c interface= akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_d interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_e interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_f interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_g interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_h interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_i interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_j interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_k interface= akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_l interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_m interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_n interface= akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_o interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_p interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_q interface= akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_r interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_s interface= akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_t interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_u interface=16, akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_v interface= akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy > 6wq0_w interface= akgrtprsfsqrygkWnakftafsnptvastiltnvapiaqgnfqtnvpkftsvneqvsavltqygvtgpsraiyqgyglkvaralnrigagpaltnmvaglkayyvsayganpeildavtniilgsptgy
interface signature	W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W/W

Estimated binding specificities ?

readout + contact

# IC=33.333 IC/col=0.111 n_of_columns=301

specificity:

A |  24  22  24  24  24  20  24  24  34  15  38  22  27  16  45  24  45  16  27  23  49  10  56  21  27  16  49  24  49  19  27  21  45  12  57  22  27  16  45  24  60  14  30  23  49   9  56  25  30  16  51  24  45  15  27  21  51  12  56  22  27  19  54  24  51  16  27  21  52  12  60  25  27  15  56  24  52  17  30  21  49  10  60  22  24  18  48  24  52  15  27  21  52  10  52  22  30  16  49  24  49  16  27  21  49   9  52  22  27  16  49  24  49  16  27  21  56  10  56  22  27  19  52  24  49  16  27  21  49  10  56  22  27  16  49  24  51  15  27  21  49   9  54  22  27  16  49  24  49  19  27  21  49  10  60  22  27  19  52  24  49  16  30  21  52  10  56  22  27  19  49  22  49  13  30  21  52  10  60  25  27  16  49  24  49  15  30  23  52   9  56  25  30  16  49  24  51  16  30  21  49  10  60  22  27  15  49  22  49  15  27  23  52  12  56  25  30  19  52  22  56  14  27  21  52   8  60  22  27  19  49  24  51  19  27  21  52  10  60  21  27  15  49  24  51  16  24  21  49   9  52  22  24  16  52  24  51  15  27  23  54  11  56  22  27  19  49  22  51  15  27  21  52   8  60  25  30  18  45  24  49  22  27  21  42  18  34  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  25  24  24  24  20  24  24  22  15  19  22  25  16  16  24  16  16  22  21  15  13  13  23  25  16  15  24  15  19  22  23  19  12  13  22  22  16  19  24  12  16  22  21  15   9  13  22  22  16  15  24  16  17  22  21  15  12  13  25  25  16  14  24  15  16  22  21  16  12  12  22  22  15  13  24  14  15  22  21  17  10  12  25  24  18  16  24  14  17  22  21  14  10  14  25  22  19  15  24  17  16  22  21  17   9  16  22  22  19  15  24  17  16  22  21  14  10  14  22  22  16  14  24  15  14  22  23  15  10  14  22  25  16  17  24  15  17  22  21  15  11  14  22  22  16  15  24  15  16  22  23  17  13  12  25  25  16  14  24  17  16  22  21  16  10  13  22  25  16  15  22  15  14  22  23  16   8  12  22  22  16  15  24  15  15  22  21  14  11  13  22  22  16  15  24  15  16  22  21  15  10  12  22  22  15  17  22  15  15  22  21  14  12  13  22  22  19  14  22  13  13  22  21  14   8  12  22  25  16  15  24  15  16  22  21  14  13  12  23  25  15  15  24  15  19  24  21  17   9  16  25  24  16  14  24  15  15  25  21  14   9  13  22  22  16  15  22  15  15  25  21  14   8  12  22  22  18  19  24  15  20  22  23  18  18  22  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  22  24  24  24  20  24  24  20  15  20  25  22  16  16  24  19  19  25  21  15  10  13  21  22  19  15  24  15  19  22  21  16  12  13  25  25  19  16  24  12  14  22  21  17   9  13  22  22  19  15  24  19  15  25  23  15  12  13  22  22  16  14  24  15  16  22  21  14  12  12  22  22  15  13  24  16  15  22  23  15  10  12  22  24  18  16  24  14  15  25  21  14  10  16  22  22  16  17  24  15  19  25  23  15  11  14  25  25  16  17  24  15  16  25  23  13  10  13  25  22  16  14  24  17  14  25  21  17  10  13  22  22  16  15  24  15  15  22  23  17   9  14  22  22  19  17  24  17  16  22  21  15  10  12  22  22  16  14  24  15  19  22  21  14  13  13  22  22  16  15  25  15  13  22  21  14   8  12  22  22  19  17  24  15  17  22  21  14   9  14  22  22  16  17  24  15  16  22  23  17  10  12  22  25  17  15  25  15  17  22  21  16  12  13  22  22  20  14  25  14  13  25  21  16  10  12  22  22  16  15  24  15  16  25  23  14  10  12  21  22  15  15  24  15  16  24  23  15   9  14  22  24  16  14  24  15  17  22  21  14   9  14  25  22  16  17  22  15  15  22  21  16  10  12  22  22  18  16  24  15  20  25  21  18  18  20  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  27  24  24  24  36  24  24  20  51  19  27  22  48  19  24  16  45  22  31  17  63  14  31  22  45  17  24  17  39  25  31  16  60  13  27  22  45  16  24  12  52  22  31  15  69  14  27  22  45  15  24  16  49  22  31  15  60  14  27  22  45  14  24  15  48  25  33  14  60  12  27  25  51  14  24  14  49  22  31  15  66  12  27  24  42  16  24  16  49  22  33  16  66  14  27  22  45  15  24  15  45  22  31  15  67  14  27  22  45  15  24  15  48  22  31  13  66  13  27  25  45  16  24  15  52  22  31  15  66  13  30  22  48  15  24  15  49  25  31  15  67  14  30  25  45  15  24  15  45  25  31  15  63  12  27  22  45  16  24  15  45  22  33  14  63  14  30  22  45  17  27  17  56  22  31  14  70  12  27  25  45  15  24  17  49  22  31  16  67  13  27  22  48  15  24  15  48  22  31  15  66  12  30  22  49  15  27  17  49  25  31  14  60  14  27  22  38  16  27  13  56  22  33  14  70  12  30  22  45  17  24  15  45  22  31  16  63  12  31  22  51  17  24  15  45  24  31  15  69  14  27  24  48  16  24  15  49  22  31  14  67  13  27  25  45  15  30  15  51  22  33  14  70  12  27  22  42  16  24  17  34  22  31  18  42  20  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24

scan!

home
updated Wed Nov 30 15:21:32 2022