6r8z_ABCDEFGHL : 3D-footprint complex

structure name	CRYO-EM STRUCTURE OF NCP_THF2(-1)-UV-DDB
source	HOMO SAPIENS
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6r8z_A interface=6, vkkphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6r8z_B interface=29, rhrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6r8z_C interface=3,34,113,115, kaRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkktEsHhk > 6r8z_D interface=2, rKrsrkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6r8z_E interface=6,49, vkkphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6r8z_F interface=25, vlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6r8z_G interface=3,34,115,117, kaRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkktesHhK > 6r8z_H interface=2,5, rKrsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6r8z_L interface=268,269,270, rsivrtlhqhklgraswpsvqqglqqsflhtldsyrilqkaapfdrratslawhpthpstvavgskggdimlwnfgikdkptfikgigaggsitglkfnplntnqfyassmegttrlqdfkgnilrvfassdtiniwfcsldvsassrmvvtgdnvgnvillnmdgkelwnlrmhkkkvthvalnpccdwflatasvdqtvkiwdlrqvrgkasflyslphrhpvnaacfspdgarllttdqkseirvysasqwdcplgliphphrhFQHltpikaawhprynlivvgrypdpnfksctpyelrtidvfdgnsgkmmcqlydpessgisslnefnpmgdtlasamgyhiliwsqeeartrk
interface signature	R/R/RREH/K/RR/R/RRHK/KR/FQH

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=5.386 IC/col=0.037 n_of_columns=144

specificity:

A |  96  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  22  24  24  34  27  20  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  19  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  27  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  96  24  24   3  24  24  24  33  19  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24   0
C |   0  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  27  24  24  22  22  22  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  20  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  22  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   0  24  24   3  24  24  24  21  19  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24   0
G |   0  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  25  24  24  20  22  34  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  19  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  25  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   0  24  24  87  24  24  24  21  39  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24   0
T |   0  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  22  24  24  20  25  20  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  38  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  27  24  25  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   0  24  24   3  24  24  24  21  19  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  22  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  96

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updated Wed Nov 30 07:07:53 2022