6r8y_ABCDEFGHL : 3D-footprint complex

structure name	CRYO-EM STRUCTURE OF NCP-6-4PP(-1)-UV-DDB
source	HOMO SAPIENS
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6r8y_A interface=6,49, vkkphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6r8y_B interface=15,29, rhrkvlrdniqgitKpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6r8y_C interface=3,34,115,117, kaRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkktesHhK > 6r8y_D interface=5, rkrsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6r8y_E interface=6,49, vkkphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6r8y_F interface=25, vlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6r8y_G interface=3,115,117, kaRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkktesHhK > 6r8y_H interface=5, rkrsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6r8y_L interface=281,282, vglagpqilppcrsivrtlhqhklgraswpsvqqglqqsflhtldsyrilqkaapfdrratslawhpthpstvavgskggdimlwnfgikdkptfikgigaggsitglkfnplntnqfyassmegttrlqdfkgnilrvfassdtiniwfcsldvsassrmvvtgdnvgnvillnmdgkelwnlrmhkkkvthvalnpccdwflatasvdqtvkiwdlrqvrgkasflyslphrhpvnaacfspdgarllttdqkseirvysasqwdcplgliphphrhfQHltpikaawhprynlivvgrypdpnfksctpyelrtidvfdgnsgkmmcqlydpessgisslnefnpmgdtlasamgyhiliwsqeeartrk
interface signature	RR/KR/RRHK/R/RR/R/RHK/R/QH

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=5.242 IC/col=0.037 n_of_columns=143

specificity:

A |  96  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  33  45  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  22  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  27  45  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  96   0  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  22  18  22  24  24  25  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   6
C |   0  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  30  24  24  21  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  22  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  22  16  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24   0   0  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  27  18  22  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   6
G |   0  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  22  24  24  21  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  25  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  25  19  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24   0  96  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  22  18  22  24  24  27  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   6
T |   0  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  22  24  24  21  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  48  27  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  22  16  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24   0   0  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  25  42  30  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  78

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updated Wed Nov 30 07:02:20 2022