6om3_LMNOPQRST : 3D-footprint complex

structure name	CRYSTAL STRUCTURE OF THE ORC1 BAH DOMAIN IN COMPLEX WITH A NUCLEOSOME CORE PARTICLE
reference	De Ioannes et al. 'Nat 10 2894 2019
source	XENOPUS LAEVIS
experiment	X-ray (resolution=3.30, R-factor=?)
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6om3_L interface= aktlkdlqgweiittdeqgniikrlrrrktehylkrssdgiklgrgdsvvmhneaagtysvymiqelrlntinnvvelwaltylrwfevnplahyrqfnplnyynklfsetanknelyltaelaelqlfnfirvanvmdgskwevlkgnvdperdftvryiceptgekfvdiniedvkayikkvepreaqeylkdltl > 6om3_M interface=3,4,5,47, kpHRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 6om3_N interface= hrKVLrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvfleNvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 6om3_O interface=31, akaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 6om3_P interface=2, tRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 6om3_Q interface=1,2,44, RYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 6om3_R interface= LRdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenVirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 6om3_S interface=31, akaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 6om3_T interface=2, tRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa
interface signature	/HRYR/KVLN/R/R/RYR/LRV/R/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.195 IC/col=0.008 n_of_columns=146

specificity:

A |  24  24  24  33  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  12  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  15  15  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  21  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  42  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  12  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  15  15  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  21  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  18  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  60  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  51  51  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  21  25  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  52  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  12  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  15  15  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24

scan!

home
updated Wed Nov 30 04:39:33 2022