6ne3_ABCDEFGHW : 3D-footprint complex

structure name	CRYO-EM STRUCTURE OF SINGLY-BOUND SNF2H-NUCLEOSOME COMPLEX WITH SNF2H BOUND AT SHL-2
source	XENOPUS LAEVIS / HOMO SAPIENS
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6ne3_A interface=4,5,48, kkpHRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 6ne3_B interface= akrHRkvlrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvfLenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6ne3_C interface= gktRAkaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaervgagapvylaavLeyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpkkte > 6ne3_D interface=3,4,7, kkRRktRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6ne3_E interface=3,4,5,47, kpHRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6ne3_F interface= kvLRDniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvIrdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6ne3_G interface= raKAKtrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaervgagapvylaavleYltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpkk > 6ne3_H interface= trKESyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageaSrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 6ne3_W interface=275,359, trfedspsyvkwgklrdyqvrglnwlislyengingilademglgktlqtisllgymkhyrnipgphmvlvpkstlhnwmsefkrwvptlrsvcligdkeqraafvrdvllpgewdvcvtsyemlikeksvfkkfnwrylvideahrikneksklseivrefkttnrllltgtplqnnlhelwsllnfllpdvfnsaddfdswfqklverlhmvlrpfllrrikadvekslppkkevkiyvglskmqrewytrilmkdidilnsagkmdkmrllNilmqlrkccnhpylfdgaepgppyttdmhlvtnsgkmvvldkllpklkeqgsrvlifsqmtrvldiledycmwrnyeycrldgQtphderqdsinaynepnstkfvfmlstragglginlatadvvilydsdwnpqvdlqamdrahrigqtktvrvfrfitdntveeriveraemklrldsiviqq
interface signature	HRR/HRL/RAL/RRR/HRYR/LRDI/KAKY/KESS/NQ

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.235 IC/col=0.008 n_of_columns=156

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  34  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  14  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  15  16  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  18  42  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  23  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  20  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  52  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  52  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  17  19  24  36  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  18  18  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  31  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  20  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  14  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  14  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  49  16  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  42  18  36  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  21  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  57  22  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  14  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  16  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  15  45  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  18  18  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  21  24  24  24  24  24

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updated Wed Nov 30 03:42:46 2022