6m44_ABCDEFGHKLMNOPQR : 3D-footprint complex

structure name	355 BP DI-NUCLEOSOME HARBORING COHESIVE DNA TERMINI (HIGH CRYOPROTECTANT)
reference	Adhireksan et al. 'Nat 11 4747 2020
source	HOMO SAPIENS
experiment	X-ray (resolution=3.81, R-factor=?)
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6m44_A interface=2,4, pHrYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6m44_B interface= dNiQgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6m44_C interface=27, trssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 6m44_D interface=3, rsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6m44_E interface=3,4,46, phRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6m44_F interface= dnIQgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdAvtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6m44_G interface=27, trssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 6m44_H interface=2, sRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6m44_K interface=2,3,4,46, pHRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6m44_L interface=22, dniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6m44_M interface=27,62, trssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 6m44_N interface=3, rsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6m44_O interface=3,4,5, kpHRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6m44_P interface=22, dniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6m44_Q interface=30, kaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 6m44_R interface=4, krsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak
interface signature	HY/NQ/R/R/RYR/IQA/R/R/HRYR/R/RR/R/HRY/R/R/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.061 IC/col=0.003 n_of_columns=351

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  19  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  20  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  19  24  24  24  24  24  24  24  24  20  18  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  22  24  24  24  24  24  24  24  24  19  18  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  27  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  39  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  36  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  19  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  36  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  22  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  30  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  48  20  24  24  24  24  24  24  24  24  19  18  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  19  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  20  45  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  20  24  24  24  24  24  24  24  24  34  42  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  30  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  20  24  24  24  24  24  24  24  24  39  42  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  19  25  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  20  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  38  24  24  24  24  24  24  24  24  20  18  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  30  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  34  24  24  24  24  24  24  24  24  19  18  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

scan!

home
updated Wed Nov 30 02:45:02 2022