6m3v_ABCDEFGHKLMNOPQR : 3D-footprint complex

structure name	355 BP DI-NUCLEOSOME HARBORING COHESIVE DNA TERMINI
reference	Adhireksan et al. 'Nat 11 4747 2020
source	HOMO SAPIENS
experiment	X-ray (resolution=4.60, R-factor=?)
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6m3v_A interface=2,3,4, pHRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6m3v_B interface=22, dniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6m3v_C interface=27, trssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 6m3v_D interface=3, rsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6m3v_E interface=2,3,4,46, pHRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6m3v_F interface=12,22, dniqgitkpaiRrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6m3v_G interface=27, trssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 6m3v_H interface=2, sRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6m3v_K interface=2,3,4,28,46, pHRYrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6m3v_L interface=12,22, dniqgitkpaiRrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6m3v_M interface=27,62, trssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 6m3v_N interface=3, rsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6m3v_O interface=2,3,4,46, pHRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6m3v_P interface=22, dniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6m3v_Q interface=28,63, ktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 6m3v_R interface=4, krsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak
interface signature	HRY/R/R/R/HRYR/RR/R/R/HRYLR/RR/RR/R/HRYR/R/RR/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.596 IC/col=0.005 n_of_columns=351

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  18  20  24  24  24  24  24  24  24  24  34  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  18  19  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  15  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  19  24  24  24  24  24  24  24  22  31  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  22  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  25  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  38  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  19  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  20  19  18  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  19  24  24  24  24  24  24  24  20  27  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  18  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  42  38  24  24  24  24  24  24  24  24  22  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  42  19  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  17  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  20  24  24  24  24  24  24  24  25  23  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  27  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  22  27  31  24  24  24  24  24  24  24  24  19  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  19  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  36  20  18  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  20  24  24  24  24  24  24  24  20  25  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  30  18  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  36  18  19  24  24  24  24  24  24  24  24  20  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  18  38  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  49  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  38  24  24  24  24  24  24  24  27  21  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  25  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  27  22  23  24  24  24  24  24  24  24  24  20  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  39  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  20  38  18  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  38  24  24  24  24  24  24  24  34  22  24  24  24  24  24  24  24  24  27  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  22  42  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  18  19  24  24  24  24  24  24  24  24  20  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  18  20  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  15  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  19  24  24  24  24  24  24  24  22  21  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  22  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  22  25  21  24  24  24  24  24  24  24  24  19  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  19  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  20  19  42  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  19  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  18  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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updated Wed Nov 30 02:17:46 2022