6l9z_ABCDEFGHKLMNOPQRS : 3D-footprint complex

structure name	338 BP DI-NUCLEOSOME ASSEMBLED WITH LINKER HISTONE H1.X
reference	Adhireksan et al. 'Nucleic 49 e52 2021
source	HOMO SAPIENS
experiment	X-ray (resolution=2.50, R-factor=?)
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6l9z_A interface=3,4,6, phRYrPgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6l9z_B interface=27, rkvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6l9z_C interface=2,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkkte > 6l9z_D interface= kRsrkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgiMnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6l9z_E interface=5,6,48, kkphRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6l9z_F interface=30, krhrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6l9z_G interface=30, kaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 6l9z_H interface= krsrkesysiyvykvlkqvhpdtgisskaMgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6l9z_K interface=4,6, kphRyRpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6l9z_L interface=28, hrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6l9z_M interface=1,32,67, RakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkkte > 6l9z_N interface=1,2, RKrsrkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6l9z_O interface=5,6,48, kkphRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6l9z_P interface=37, glgkggakrhrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6l9z_Q interface=29,64, aktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 6l9z_R interface=4, krsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6l9z_S interface=25, nskkknqpgkysqlvvetirrlgeRngsslakiyteakkvpwfdqqngrtylkysikalvqndtllqvkgtgangsfklnrkkl
interface signature	RYP/R/RR/RM/RYR/R/R/M/RR/R/RRR/RK/RYR/R/RR/R/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.249 IC/col=0.004 n_of_columns=338

specificity:

A |  24  24  24  24  21  17  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  20  38  18  24  24  24  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  19  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  22  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  27  21  21  24  24  24  24  24  24  21  22  24  24  24  24  24  24  24  24  31  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  24  21  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  42  42  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  33  15  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  25  24  24  24  24  20  19  18  24  24  24  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  19  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  25  21  31  24  24  24  24  24  24  31  25  24  24  24  24  24  24  24  24  21  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  21  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  25  24  24  24  18  18  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  21  49  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  27  24  24  24  24  36  20  42  24  24  24  25  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  39  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  30  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  22  31  23  24  24  24  24  24  24  23  27  24  24  24  24  24  24  24  24  21  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  33  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  27  24  24  24  18  18  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  21  15  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  22  24  24  24  24  20  19  18  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  19  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  45  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  22  23  21  24  24  24  24  24  24  21  22  24  24  24  24  24  24  24  24  23  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  21  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  22  24  24  24  18  18  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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