structure nameRNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH ELF1 AND SPT4/5, STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME (+1A)
sourceHOMO SAPIENS
experimentNMR
links to other resourcesNAKB PDBSum PDIdb DNAproDB
protein sequence
interface signatureKR/RKKDK///RR/ND/R/R/R/I

Estimated binding specificities ?

contactlogo
# IC=3.448 IC/col=0.028 n_of_columns=121 specificity:   
A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   0  22  21   7  24  19  88  38  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  12  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   0  22  31   8  24  19   4  19  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  60  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  96  22  23   7  24  38   2  19  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  12  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   0  30  21  74  24  20   2  20  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  12  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
scan!

home
updated Tue Nov 29 20:43:58 2022