6ir9_ABEWabcdef : 3D-footprint complex

structure name	RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH ELF1 AND SPT4/5, STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME
source	HOMO SAPIENS
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6ir9_A interface=258,304,1338, sqfpyssaplrsvkevqfgllspeeiraisvvkieypeimdesrqrpregglndpklgsidrnfkcqtcgegmaecpghfghmelakpvfhigfipkikkvcecicmncgkllldetnptmaqairirdpkkrfnavwqlcktkmvceadapvsrggcgntqpvvrkdgmklwgtwkksrdaqperklltpgeilnvfkhispedcfrlgfnedyarpewmiitvlpvpppqvrpsiamdettqgqddlthklsdilKaninvqklemdgspqhiineveqllqfhvatymdndiagqpqalqKsgrpvkairarlkgkegrlrgnlmgkrvdfsartvisgdpnleldqvgvpisiaktlsypetvtqynihrlteyvrngpnehpgakyvirdngdridlryhkragdivlqygwkverhlmdddpvlfnrqpslhkmsmmahrvkvmpystfrlnlsvtspynadfdgdemnlhvpqseetraelsqlcavplqivspqsnkpvmgivqdtlcgvrkmtlrdtfieyeqvmnmlfwvpswdgvvpqpailkpkplwtgkqllsiaipsgihlqrtdggnsllspkdngmlivdgkvmfgvvdkktvgsgggglihtvmrekgpkicaelfgniqkvvnywllhngfsigigdaiadastmkeithaissakeqvqeiiykaqhnelelkpgmtlresfegevsrtlndardsagrsaemnlkdlnnvkqmvsagskgsfiniaqmsacvgqqmvegkriafgfadrslphftkddfspeskgfvensylrgltpqefffhamagreglidtavktaetgyiqrrlvkaledimvhydgttrnslgdiiqflygedgldgtqverqtidtipgsdkafhkryyvdlmdeknsikpdvieyaadilgdvelqkelnseyeqlvsdrkflreivfvngdhnwplpvnlrriiqnaqqifhldrakasdltipeiihgvrdlckklfvlrgenelikeaqqnatslfqclvrarlatrrileefrlnrdafewvlgtieaqfqrslvhpgemvgviaaqsigepatqmnvtlgvprlkeilnvakniktpaltvyldreialdiekakviqssieyttlknvtsateiyydpdptstvieedfdtveayfsqspwllrleldrarmldkqltmnqvadkisevfsddlfvmwsednadkliircrvieedqmlkrieahmldlialrgipgiskvymvkhkvsvpdesgeykneelwaletdginlaevmavpgvdssrtysnsfveilsvlgieatrsslykeilnviafdgsyvnyrhmallvdvmtsrgylmaitRhginradtgalmrcsfeetveilfeagaaaelddcrgvsenvmlgqlapmgtgafdvmideklltslpadyapt > 6ir9_B interface=383,427,428,462,464, ddtittedcwtvisaffeekglvsqqldsfdefmetsiqdlvweeprlildqpaqhdninkryeirfgkiylsrptmteadgtthamfpqearlrnltysspvyldmeksmftsidgnkvhigkvpimlrskfcslrtldevdlykmkecpydmggyfvingsekvliaqersaanivqvfkkaapspishvaeirsalekgsrlistmqiklygredkgtgrtikatlpyvkqdipivivfralgvvpdgeilqhicydendwqmlemlkpcieegfviqdkevaldfigrrgsaalgirrekriqyakdilqkellphitqeegfetrktfflgymvnrlllcalerkdqddrdhfgkkrldlagpllanlfrilfrkltReiyrymqrcietdrdfnlnlavksttitsglkyslatgnwgeqKKamssragvsqvlnrytysstlshlrrtntpigrDgKlakprqlhnthwglvcpaetpegqacglvknlsllsgisigspsepiinfleewgmepledydpaqhtkstrifvngvwtgihrdpsmlvstmrdlrrsgaispevsiirdirerefkiftdvgrvyrplfiveddeskdnkgelritkehirkiqqgydddvygwsslvtsgvieyvdgeeeetimiamtpedlqtrslndtakrikpemstsshhtfthceihpsmilgvaasiipfpdhnqsprntyqsamgkqamgvfltnynvrmdtmanilyypqkplaktqameylkfrelpagqnaivaiacysgynqedsmimnqssidrglfrslffrsymdqekrfgisiveefekptrattlrlkhgtyekldedgliapgvrvsgddiiigkttpippyhtkrdastplrstengivdqvllttnqeglkfvkvrmrttkvpqigdkfasrhgqkgtigvtyrhedmpfsaegivpdliinphaipsrmtvahliecllskvgsirgyegdatpftdltvdavsnllrdngyqsrgfevmynghtgkklmaqvffgptyyqrlrhmvddkiharargpvqvltrqpvegrsrdgglrfgemerdcmiahgaagflkerlmeasdafrvhvcgicglmsvianlkknqfecrscknktniyqlhipyaakllfqelmamniaprlytersg > 6ir9_E interface= ednnriisrlwrsfrtvkemaadrgyfisqeemdqsleefrskicdsmgnpqrklmsflanptpealekysdlgtlwvefcdepsvgiktmrnfclriqeknfstgifiyqnnitpsankmiptvspaiietfqesdlvvnithhelvpkhirlsdgeksqllqryklkesqlpriqredpvarylglkrgqvvkiirrsetsgryasyricl > 6ir9_W interface= pqrlliptvddpgiwgvkvrlgkekdvvrqilkkklaregtknpleiysafqrdsfkghvyiearkaeaindalkgnvnvfsnnskflvgiveykdllrpvkltrgsyvrvkngkfkgdlaqvdevlenglearlklvprldygkdlsytskfrpaqrlfseaearvheirrdrdgfvtyggeeyyegflyktfrlqnlivnsinptlnelslfdptlnktvkirqggykgkigivkeangdrfrvelhnpnktipipcsflliesthgwvpyed > 6ir9_a interface=3,46, phRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqsaaigalqeaseaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 6ir9_b interface= rdNiqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirDavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6ir9_c interface=62, trssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 6ir9_d interface= rsrkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsReiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6ir9_e interface=2, hRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqsaaigalqeaseaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6ir9_f interface= nIqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg
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Estimated binding specificities ?

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