structure nameCRYO-EM RECONSTRUCTION OF MEMBRANE-ENVELOPED FILAMENTOUS VIRUS SFV1 (SULFOLOBUS FILAMENTOUS VIRUS 1)
referencePrangishvili et al. 'Nat 9 3360 2018
sourceSULFOLOBUS FILAMENTOUS VIRUS 1
experimentX-ray (resolution=3.70, R-factor=?)
links to other resourcesNAKB PDBSum PDIdb DNAproDB
protein sequence
interface signatureMY/Y/Y/MYY/Y/YY/YY/YY/MY/MY/YY/YY/MYY/MYY/MYY/MYY/YY/MYY/MYY/MYY/MYY/MYY/MYY/MYY/MYY/MY/YYY/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ/YYYQ

Estimated binding specificities ?

contactlogo
# IC=89.752 IC/col=0.267 n_of_columns=336 specificity:   
A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  13  38  21  52  16  63  10  60  15  63  12  74   8  34  19  56  15  69   9  66  18  51  14  72   8  38  19  56  14  63   9  60  18  67  15  78  10  38  19  60  14  67  10  60  18  54  15  67   9  45  19  56  17  63   8  60  19  52  14  67  12  42  18  56  16  66  11  60  16  63   8  69   9  42  19  56  17  56  10  60  16  52  14  78  10  42  20  57  15  60   9  60  19  52  13  67  11  45  18  56  15  60   8  60  20  74  14  69   7  42  19  56  15  60  14  60  20  84  16  67   6  39  20  60  14  60  13  70  18  52  15  88   7  38  18  63  12  60  12  63  18  78  16  67   8  39  19  56  14  60   8  63  15  60  18  85  12  33  18  56  17  67   9  67  18  78  14  85   9  34  18  56  15  56  10  67  13  81  13  78   7  38  19  57  16  60   7  69  14  56  15  85  13  42  18  60  17  56  10  67  17  52  15  96  10  42  18  56  15  67   8  63  18  84  16  72   9  38  19  60  17  63  10  66  18  52  12  67  11  38  19  60  15  63   9  66  18  54  15  74  13  38  19  60  15  60   8  60  18  78  13  70   9  38  19  56  15  69   8  60  18  52  13  67  11  42  22  56  16  56   9  63  18  54  14  67   7  42  19  56  15  60   8  60  18  54  16  74   9  42  21  56  15  57   9  60  18  54  15  74   9  45  18  60  15  60  12  52  19  49  19  67  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  13  20  21  16  16  10   8  12  17  13  12   7   8  20  19  13  15   9   9  10  18  15  14   8   8  20  19  13  14  10   9  12  18   9  17   6  10  19  19  12  16   9  13  12  18  14  15   9  11  19  20  13  15  13   8  12  16  14  14  11  12  18  18  13  16  10   9  12  19  10   8   9  11  18  20  14  15  13   8  12  19  14  16   6  13  18  22  13  15  12   9  12  20  14  13   9   9  16  18  13  15  12   7  12  19   7  13   9   7  18  19  13  15  12  13  12  19   4  14   9   6  19  20  12  14  12  13   8  18  14  15   2   7  19  18  13  12  12  12  13  18   6  16  11   7  19  16  14  13  12   8  13  17  12  18   5  12  21  18  13  15  11   9  11  18   6  16   3  11  20  18  14  15  13   8  11  14   4  14   6   7  19  19  13  14  12   7   9  16  13  15   3  10  18  18  12  15  13   8  11  15  14  15   0  13  18  18  13  15  11   8  10  18   4  14   8  11  19  20  12  15  10   8  10  18  14  12   9   9  19  19  12  15  13   9  10  18  14  15   8  10  19  19  12  15  12  10  12  18   6  13   8  11  20  19  14  15   9   8  12  18  14  10  11   9  18  20  13  16  14   9  10  18  14  13   9   4  18  16  14  17  12  10  12  18  14  14   7   9  18  21  13  15  13  11  12  18  14  15   8   9  16  18  12  15  12  12  16  19  15  16  11  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  14  19  21  14  16  13   8  12  15  10  12   8   8  22  19  13  17   9  11  10  18  15  14   8   8  19  20  14  16  10   9  12  18   9  15   6  13  20  20  12  14   9  10  12  18  14  15  11   9  16  19  13  15  10  10  12  16  14  16   9  12  18  18  14  16  10   9  12  16  13  10   9   9  18  19  13  15  13   8  12  16  16  14   6  10  18  20  13  15  12  11  12  19  16  13  11   9  16  18  14  15  12   7  12  19   8  13   9   7  18  19  14  15  12  13  12  19   4  14   9   6  19  22  12  16  12  14   8  18  14  17   4   8  19  18  10  12  12  12  10  18   6  19   9   7  19  16  13  13  12  10  10  15  12  18   3  12  21  18  13  15   9   9   9  18   6  14   3   9  20  18  13  15  13   8   9  13   7  13   6   8  19  19  13  14  12   7   9  14  13  15   5  10  18  18  12  15  13   8   9  15  14  17   0  10  18  18  14  15   9   8  10  18   4  14   8   9  20  19  12  15  13   8  10  18  16  12   9   9  19  19  12  15  10   9  10  18  14  15   7  10  19  19  12  17  12   8  12  18   6  14   8   9  19  19  13  17   9   8  12  18  14  10   9   9  18  20  13  16  13  11  13  18  14  13  11   4  18  16  13  15  12   8  12  18  14  14   7  11  18  21  14  15  13   9  12  18  14  17   7   9  19  18  12  17  12  12  14  20  17  16   9  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  56  19  33  14  48  10  70  12  49  10  60   7  72  20  39  14  49   9  67  10  42  15  54   8  72  19  38  13  52  13  69  12  42  11  49   6  63  19  38  12  52  11  63  12  42  14  51   9  67  16  38  14  49  10  70  12  45  16  52   9  60  18  42  13  48  10  67  12  45  10  70   9  67  18  38  13  49  14  70  12  45  14  52   6  63  18  34  13  51  12  67  12  38  14  57   9  67  19  42  13  51  12  74  12  38   7  56   9  75  18  39  13  51  12  56  12  38   4  52  11  78  19  34  12  52  12  56  10  42  16  49   2  74  20  42  10  60  12  60  10  42   6  45   9  74  19  45  13  56  12  70  10  49  12  42   3  60  21  42  14  49   9  69   9  42   6  52   5  67  22  42  13  51  14  70   9  56   4  56   6  74  20  39  13  52  12  75   9  52  14  51   3  63  18  42  12  49  14  70   9  49  16  49   0  63  18  42  13  51   9  72  13  42   4  52   8  67  19  38  12  49  10  70  10  42  14  60  11  67  20  39  12  51  10  69  10  42  14  51   7  63  20  39  12  49  12  70  12  42   6  56  10  67  19  39  13  49   9  72  12  42  16  63   9  67  18  34  14  48  13  67  10  42  14  56   9  81  18  45  13  49  12  70  12  42  14  52   8  67  18  33  13  51  13  67  12  42  14  49   7  69  16  42  12  49  12  60  14  38  15  45   9  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24
scan!

home
updated Tue Nov 29 15:24:58 2022