5oy7_ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZabcdef : 3D-footprint complex

structure name	STRUCTURE OF THE 4_601_157 TETRANUCLEOSOME (P1 FORM)
reference	Richmond et al. 'J. 429 3031 2017
source	XENOPUS LAEVIS
experiment	X-ray (resolution=5.77, R-factor=?)
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 5oy7_A interface=3,28,46, phRyrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 5oy7_B interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5oy7_C interface=20,27, trssraglqfpvgrvhrllRkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 5oy7_D interface= ktrkesyaiyvykvlkqvhPdtgissKamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 5oy7_E interface=1,2,3, HRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 5oy7_F interface=21, niqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5oy7_G interface= aktrssraglqfpvgrvhrlLrkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 5oy7_H interface=2, tRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 5oy7_I interface=3,4,28,46, phRYrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 5oy7_J interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5oy7_K interface=20,27, trssraglqfpvgrvhrllRkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 5oy7_L interface= ktrkesyaiyvykvlkqvhPdtgissKamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 5oy7_M interface=1,2, HRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 5oy7_N interface=21, niqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5oy7_O interface= aktrssraglqfpvgrvhrlLrkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 5oy7_P interface=2, tRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 5oy7_Q interface=2,3,4,28,46, pHRYrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 5oy7_R interface=25, kvlrdniqgitkpairrarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5oy7_S interface=20,27, trssraglqfpvgrvhrllRkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 5oy7_T interface= ktrkesyaiyvykvlkqvhPdtgissKamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 5oy7_U interface=1,2,3, HRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 5oy7_V interface=21, niqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5oy7_W interface= aktrssraglqfpvgrvhrlLrkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 5oy7_X interface=2, tRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 5oy7_Y interface=2,3,4,28,46, pHRYrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 5oy7_Z interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5oy7_a interface=20,27, trssraglqfpvgrvhrllRkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 5oy7_b interface= ktrkesyaiyvykvlkqvhPdtgissKamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 5oy7_c interface=2,3, hRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 5oy7_d interface=21, niqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5oy7_e interface= aktrssraglqfpvgrvhrlLrkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 5oy7_f interface=2, tRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa
interface signature	RLR/R/RR/PK/HRY/R/L/R/RYLR/R/RR/PK/HR/R/L/R/HRYLR/R/RR/PK/HRY/R/L/R/HRYLR/R/RR/PK/RY/R/L/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=4.894 IC/col=0.008 n_of_columns=619

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   4  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  21  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  25  19  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   4  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  23  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  16  21  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   4  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  21  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  25  19  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  14  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   4  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  21  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  25  19  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  81  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  48  21  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  81  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  21  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  19  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  16  31  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  81  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  21  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  22  19  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  22  56  39  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  81  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  23  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   7  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  31  27  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  27  19  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   4  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  31  30  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  27  19  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  19  21  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   7  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  33  27  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  27  19  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  13  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   4  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  31  30  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  27  19  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   4  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  23  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  38  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   7  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  21  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  25  38  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  45  23  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   4  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  21  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  39  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  30  13  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   7  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  21  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  38  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24

scan!

home
updated Tue Nov 29 09:28:55 2022