5oxv_ABCDEFGHKLMNOPQR : 3D-footprint complex

structure name	STRUCTURE OF THE 4_601_157 TETRANUCLEOSOME (C2 FORM)
reference	Ekundayo et al. 'J. 429 3031 2017
source	XENOPUS LAEVIS
experiment	X-ray (resolution=6.72, R-factor=?)
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 5oxv_A interface=3,4,28,46, phRYrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 5oxv_B interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5oxv_C interface=20,27, trssraglqfpvgrvhrllRkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 5oxv_D interface= ktrkesyaiyvykvlkqvhPdtgissKamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 5oxv_E interface=2, hRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 5oxv_F interface=21, niqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5oxv_G interface= aktrssraglqfpvgrvhrlLrkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 5oxv_H interface=2, tRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 5oxv_K interface=3,4,28,46, phRYrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 5oxv_L interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5oxv_M interface=20,27, trssraglqfpvgrvhrllRkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 5oxv_N interface= ktrkesyaiyvykvlkqvhPdtgissKamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 5oxv_O interface=1,2,3, HRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 5oxv_P interface=21, niqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5oxv_Q interface= aktrssraglqfpvgrvhrlLrkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 5oxv_R interface=2, tRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa
interface signature	RYLR/R/RR/PK/R/R/L/R/RYLR/R/RR/PK/HRY/R/L/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=2.191 IC/col=0.007 n_of_columns=308

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   4  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  21  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  25  19  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   7  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  23  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  22  19  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  81  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  48  21  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  81  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  21  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   7  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  31  27  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  27  19  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   4  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  31  27  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  27  19  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   4  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  23  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  38  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  25  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   4  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  21  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  25  38  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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updated Tue Nov 29 09:20:32 2022