1zbb_ABCDEFGHabcdefgh : 3D-footprint complex

structure name	STRUCTURE OF THE 4_601_167 TETRANUCLEOSOME
reference	Richmond et al. Nature 436 138 2005
source	XENOPUS LAEVIS
experiment	X-ray (resolution=9.00, R-factor=?)
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 1zbb_A interface=1,2,27,45, HRyrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 1zbb_B interface=23, vdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 1zbb_C interface=31,111, traktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpkktsK > 1zbb_D interface=2,9,11,12,15, kKgskkdgKkRRktRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 1zbb_E interface=2,27,45, hRyrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 1zbb_F interface=1,24,37, SgrgkgkkrhrkvlrdniqgitkPairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 1zbb_G interface=1,30, KaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpkkte > 1zbb_H interface=4,7, kkrRktRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 1zbb_a interface=2,27,45, hRyrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 1zbb_b interface=23, vdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 1zbb_c interface=31,111, traktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpkktsK > 1zbb_d interface=2,9,11,12,15, kKgskkdgKkRRktRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 1zbb_e interface=2,27,45, hRyrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 1zbb_f interface=1,24,37, SgrgkgkkrhrkvlrdniqgitkPairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 1zbb_g interface=1,30, KaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpkkte > 1zbb_h interface=4,7, kkrRktRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak
interface signature	HRLR/R/RK/KKRRR/RLR/SPR/KR/RR/RLR/R/RK/KKRRR/RLR/SPR/KR/RR

Estimated binding specificities ?

readout + contact

# IC=5.382 IC/col=0.016 n_of_columns=345

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  45  63  57  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  12  19  14  24  24  18  23  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  22  24  24  16  25  24  16  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  25  45  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  22  22  27  24  19  27  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  24  24  21  24  16  13  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  45  66  56  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  12  20  14  24  24  18  21  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  22  24  24  19  22  24  16  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  25  48  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  22  22  27  24  19  27  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  23  24  16  13  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  24  16  10  13  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  60  19  14  24  24  42  31  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  25  24  24  16  27  24  19  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  22  19  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  25  25  25  24  38  25  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  21  24  19  13  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  24  16  10  14  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  60  19  16  24  24  42  31  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  22  24  24  16  27  24  16  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  22  16  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  25  22  22  24  38  22  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  21  24  16  14  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  16  10  13  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  12  20  54  24  24  18  21  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  22  24  24  19  22  24  45  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  27  16  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  27  27  22  24  20  22  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  21  24  45  57  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  19  10  13  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  12  19  52  24  24  18  23  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  25  24  24  16  25  24  48  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  27  16  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  27  30  25  24  19  25  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  21  24  45  56  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  19  13  13  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  12  38  14  24  24  18  21  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  27  24  24  45  22  24  16  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  22  16  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  22  22  22  24  19  22  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  33  24  16  13  56  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  16  10  13  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  12  38  14  24  24  18  21  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  27  24  24  45  22  24  16  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  22  16  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  22  22  22  24  20  22  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  31  24  19  13  56  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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