# Contreras-Moreira,B. (2010) 3D-footprint: a database for the structural analysis of protein-DNA complexes. Nucleic Acids Research, 38: D91-D97 # Thu Dec 21 12:55:20 2023 # LEGEND: H = hydrogen bond, w = water-mediated hydrogen bond, V = hydrophobic interaction # LEGEND: x = generic side-chain contact | <- interaction distance -> >10mh_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=TERNARY STRUCTURE OF HHAI METHYLTRANSFERASE WITH ADOHCY AND HEMIMETHYLATED DNA CONTAINING 5,6-DIHYDRO-5-AZACYTOSINE AT THE TARGET organism=Haemophilus haemolyticus : H : SER OG A0087 <- 3.30 -> DG N3 C0426 : score 2.49462 : w : ARG NH2 A0228 <- 6.05 -> DA N7 C0425 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0240 <- 2.89 -> DG N7 C0426 : score 5.9411 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.77 -> DG O6 C0426 : score 6.6396 : x : ILE xxxx A0086 <- 3.29 -> DT xxx B0410 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0237 <- 3.42 -> DG xxx C0426 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0260 <- 4.40 -> DT xxx B0405 : score x.xxxxx >1a02_FJN:p53-like_transcription_factors;E_set_domains;A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Leucine_zipper_domain; title=STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAINS OF NFAT, FOS AND JUN BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 F0147 <- 2.73 -> DC N4 A4016 : score 4.2523 : H : ASN ND2 F0147 <- 2.87 -> DT O4 B5006 : score 5.21063 : w : ASN ND2 F0147 <- 6.06 -> DA N6 B5005 : score 2.5 : H : ASN OD1 J0272 <- 2.86 -> DC N4 B5011 : score 4.14327 : w : ASN OD1 J0272 <- 5.96 -> DT O4 A4011 : score 3.132 : w : ARG NH1 J0280 <- 5.71 -> DA N6 B5009 : score 1.486 : H : ARG NH1 N0421 <- 2.98 -> DG N7 A4004 : score 5.8322 : H : ARG NH2 N0421 <- 2.86 -> DG O6 A4004 : score 6.5208 : H : GLU OE2 N0427 <- 2.83 -> DC N4 B5019 : score 5.23379 : H : ARG NH1 N0430 <- 3.18 -> DG N7 A4003 : score 5.5902 : H : ARG NH2 N0430 <- 3.02 -> DG O6 A4003 : score 6.3096 : H : GLN OE1 N0571 <- 2.94 -> DA N6 A4005 : score 5.88309 : H : GLN NE2 N0571 <- 3.10 -> DA N7 A4005 : score 5.72436 : w : GLN OE1 N0571 <- 5.86 -> DT O4 B5017 : score 3.068 : V : ALA CB F0150 <- 3.58 -> DT C7 B5006 : score 5.90692 : x : TYR xxxx N0424 <- 3.20 -> DT xxx B5018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0537 <- 3.11 -> DT xxx A4010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0572 <- 3.00 -> DT xxx B5015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0151 <- 4.13 -> DT xxx A4015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0155 <- 3.24 -> DT xxx A4014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0275 <- 4.02 -> DT xxx A4010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0279 <- 3.55 -> DT xxx A4011 : score x.xxxxx >1a02_J:Leucine_zipper_domain;A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors; title=STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAINS OF NFAT, FOS AND JUN BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 J0272 <- 2.86 -> DC N4 B5011 : score 4.14327 : w : ASN OD1 J0272 <- 5.96 -> DT O4 A4011 : score 3.132 : w : ARG NH1 J0280 <- 5.71 -> DA N6 B5009 : score 1.486 : x : ALA xxxx J0275 <- 4.02 -> DT xxx A4010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0279 <- 3.55 -> DT xxx A4011 : score x.xxxxx >1a0a_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=PHOSPHATE SYSTEM POSITIVE REGULATORY PROTEIN PHO4/DNA COMPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : H : GLU OE1 A0009 <- 3.04 -> DC N4 C0005 : score 5.49109 : H : GLU OE2 A0009 <- 2.61 -> DA N6 C0006 : score 3.16723 : H : ARG NH1 A0013 <- 3.47 -> DG O6 D0011 : score 5.26817 : H : HIS NE2 B0005 <- 2.75 -> DG O6 C0010 : score 8.03338 : H : HIS NE2 B0005 <- 2.58 -> DG O6 C0011 : score 8.30382 : H : GLU OE1 B0009 <- 2.68 -> DA N6 D0009 : score 2.74642 : H : ARG NH2 B0013 <- 3.18 -> DG O6 C0008 : score 6.0984 : x : LYS xxxx A0001 <- 3.89 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0002 <- 3.73 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0005 <- 3.47 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0012 <- 4.34 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0002 <- 2.91 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0006 <- 4.02 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0012 <- 4.04 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx >1a0a_B:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=PHOSPHATE SYSTEM POSITIVE REGULATORY PROTEIN PHO4/DNA COMPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : H : HIS NE2 B0005 <- 2.75 -> DG O6 C0010 : score 8.03338 : H : HIS NE2 B0005 <- 2.58 -> DG O6 C0011 : score 8.30382 : H : GLU OE1 B0009 <- 2.68 -> DA N6 D0009 : score 2.74642 : H : ARG NH2 B0013 <- 3.18 -> DG O6 C0008 : score 6.0984 : x : ARG xxxx B0002 <- 2.91 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0006 <- 4.02 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0012 <- 4.04 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx >1a1f_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=DSNR (ZIF268 VARIANT) ZINC FINGER-DNA COMPLEX (GACC SITE) organism=Mus musculus : H : SER OG A0120 <- 2.67 -> DG O6 C0052 : score 4.19739 : H : ASN OD1 A0121 <- 2.97 -> DA N6 B0009 : score 5.81705 : H : ASN ND2 A0121 <- 2.97 -> DA N7 B0009 : score 5.67092 : H : ARG NH1 A0124 <- 3.03 -> DG O6 B0008 : score 5.8035 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.93 -> DG N7 B0008 : score 6.21862 : w : ARG NH1 A0124 <- 5.92 -> DT O4 C0054 : score 1.768 : H : ARG NH1 A0146 <- 3.13 -> DG N7 B0007 : score 5.6507 : H : ARG NH2 A0146 <- 2.98 -> DG O6 B0007 : score 6.3624 : H : ASP OD2 A0148 <- 2.92 -> DC N4 C0055 : score 6.0512 : w : ASP OD2 A0148 <- 5.57 -> DT O4 C0054 : score 2.798 : H : HIS NE2 A0149 <- 2.90 -> DG N7 B0006 : score 6.66651 : H : ARG NH1 A0174 <- 2.86 -> DG N7 B0004 : score 5.9774 : H : ARG NH2 A0174 <- 2.94 -> DG O6 B0004 : score 6.4152 : w : ASP OD1 A0176 <- 5.96 -> DC N4 C0057 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0176 <- 5.77 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : w : ASP OD2 A0176 <- 6.07 -> DC N4 C0059 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0180 <- 2.76 -> DG O6 B0002 : score 6.132 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.82 -> DG N7 B0002 : score 6.35908 : x : ASP xxxx A0118 <- 2.94 -> DC xxx B0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0147 <- 3.60 -> DT xxx C0054 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0152 <- 4.35 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0175 <- 4.28 -> DC xxx C0056 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0177 <- 3.10 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >1a1g_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=DSNR (ZIF268 VARIANT) ZINC FINGER-DNA COMPLEX (GCGT SITE) organism=Mus musculus : w : SER OG A0120 <- 5.40 -> DA N7 C0052 : score 2.343 : H : ASN OD1 A0121 <- 3.35 -> DC N4 B0009 : score 3.7323 : H : ARG NH1 A0124 <- 3.02 -> DG O6 B0008 : score 5.81567 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.86 -> DG N7 B0008 : score 6.308 : w : ARG NH1 A0124 <- 5.59 -> DG O6 C0054 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0146 <- 2.94 -> DG N7 B0007 : score 5.8806 : H : ARG NH2 A0146 <- 2.88 -> DG O6 B0007 : score 6.4944 : w : SER OG A0147 <- 6.40 -> DG N7 C0054 : score 2.749 : H : ASP OD2 A0148 <- 3.16 -> DC N4 C0055 : score 5.7536 : w : ASP OD2 A0148 <- 5.53 -> DC N4 C0056 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0149 <- 2.99 -> DG O6 B0006 : score 7.6516 : H : ARG NH1 A0174 <- 2.85 -> DG N7 B0004 : score 5.9895 : H : ARG NH2 A0174 <- 2.75 -> DG O6 B0004 : score 6.666 : w : ASP OD1 A0176 <- 5.82 -> DC N4 C0057 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0176 <- 5.69 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0180 <- 2.82 -> DG O6 B0002 : score 6.059 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.80 -> DG N7 B0002 : score 6.38462 : w : ARG NH1 A0180 <- 6.18 -> DG O6 C0060 : score 2.756 : x : THR xxxx A0152 <- 4.28 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0177 <- 3.29 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >1a1h_A:C2H2_and_C2HC_zinc_fingers; title=QGSR (ZIF268 VARIANT) ZINC FINGER-DNA COMPLEX (GCAC SITE) organism=Mus musculus : H : GLN OE1 A0118 <- 3.02 -> DA N6 B0010 : score 5.78625 : H : GLN NE2 A0118 <- 2.83 -> DA N7 B0010 : score 6.05321 : w : GLN OE1 A0118 <- 6.58 -> DG O6 C0052 : score 2.87 : H : ARG NH1 A0124 <- 3.01 -> DG O6 B0008 : score 5.82783 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.93 -> DG N7 B0008 : score 6.21862 : w : ARG NH1 A0124 <- 5.12 -> DG O6 C0054 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0146 <- 2.86 -> DG N7 B0007 : score 5.9774 : H : ARG NH2 A0146 <- 2.77 -> DG O6 B0007 : score 6.6396 : H : ASP OD2 A0148 <- 3.17 -> DC N4 C0055 : score 5.7412 : w : ASP OD2 A0148 <- 5.66 -> DC N4 C0056 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0149 <- 2.71 -> DG N7 B0006 : score 6.92501 : H : ARG NH1 A0174 <- 2.91 -> DG N7 B0004 : score 5.9169 : H : ARG NH2 A0174 <- 2.86 -> DG O6 B0004 : score 6.5208 : w : ASP OD1 A0176 <- 5.96 -> DC N4 C0057 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0176 <- 5.78 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0180 <- 2.72 -> DG O6 B0002 : score 6.18067 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.67 -> DG N7 B0002 : score 6.55062 : w : ARG NH1 A0180 <- 5.90 -> DG O6 C0060 : score 2.756 : x : SER xxxx A0121 <- 3.50 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0147 <- 4.38 -> DG xxx C0054 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0152 <- 4.19 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0177 <- 3.07 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >1a1i_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=RADR (ZIF268 VARIANT) ZINC FINGER-DNA COMPLEX (GCAC SITE) organism=Mus musculus : w : ASP OD1 A0121 <- 5.74 -> DC N4 B0009 : score 2.835 : H : ARG NH1 A0124 <- 3.05 -> DG O6 B0008 : score 5.77917 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.86 -> DG N7 B0008 : score 6.308 : w : ARG NH1 A0124 <- 5.86 -> DG O6 C0054 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0146 <- 2.91 -> DG N7 B0007 : score 5.9169 : H : ARG NH2 A0146 <- 2.80 -> DG O6 B0007 : score 6.6 : w : SER OG A0147 <- 5.97 -> DG N7 C0054 : score 2.749 : H : ASP OD2 A0148 <- 2.93 -> DC N4 C0055 : score 6.0388 : w : ASP OD2 A0148 <- 5.66 -> DC N4 C0056 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0149 <- 2.79 -> DG N7 B0006 : score 6.81617 : H : ARG NH1 A0174 <- 2.98 -> DG N7 B0004 : score 5.8322 : H : ARG NH2 A0174 <- 2.78 -> DG O6 B0004 : score 6.6264 : H : ASP OD2 A0176 <- 3.25 -> DA N6 C0058 : score 3.64233 : w : ASP OD1 A0176 <- 5.61 -> DC N4 C0057 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0176 <- 5.83 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0180 <- 2.97 -> DG O6 B0002 : score 5.8765 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.78 -> DG N7 B0002 : score 6.41015 : w : ARG NH1 A0180 <- 5.74 -> DG O6 C0060 : score 2.756 : x : ARG xxxx A0118 <- 3.58 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0152 <- 4.17 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0177 <- 3.77 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >1a1j_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=RADR (ZIF268 VARIANT) ZINC FINGER-DNA COMPLEX (GCGT SITE) organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0124 <- 2.88 -> DG O6 B0008 : score 5.986 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.83 -> DG N7 B0008 : score 6.34631 : w : ARG NH1 A0124 <- 5.92 -> DG O6 C0054 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0146 <- 2.78 -> DG N7 B0007 : score 6.0742 : H : ARG NH2 A0146 <- 2.65 -> DG O6 B0007 : score 6.798 : w : SER OG A0147 <- 6.27 -> DG N7 C0054 : score 2.749 : H : ASP OD2 A0148 <- 3.21 -> DC N4 C0055 : score 5.6916 : w : ASP OD2 A0148 <- 5.47 -> DC N4 C0056 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0149 <- 2.66 -> DG N7 B0006 : score 6.99304 : H : ARG NH1 A0174 <- 2.89 -> DG N7 B0004 : score 5.9411 : H : ARG NH2 A0174 <- 2.86 -> DG O6 B0004 : score 6.5208 : w : ASP OD1 A0176 <- 5.59 -> DC N4 C0057 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0176 <- 5.80 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0180 <- 2.81 -> DG O6 B0002 : score 6.07117 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.94 -> DG N7 B0002 : score 6.20585 : w : ARG NH1 A0180 <- 5.67 -> DG O6 C0060 : score 2.756 : x : ARG xxxx A0118 <- 3.83 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0121 <- 3.18 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0152 <- 4.05 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0177 <- 3.01 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >1a1k_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=RADR (ZIF268 VARIANT) ZINC FINGER-DNA COMPLEX (GACC SITE) organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0124 <- 2.63 -> DG N7 B0008 : score 6.2557 : H : ARG NH1 A0124 <- 3.04 -> DG O6 B0008 : score 5.79133 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.79 -> DT O4 C0054 : score 3.56095 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.97 -> DG O6 B0008 : score 6.3756 : H : ARG NH1 A0146 <- 2.86 -> DG N7 B0007 : score 5.9774 : H : ARG NH2 A0146 <- 2.68 -> DG O6 B0007 : score 6.7584 : H : ASP OD2 A0148 <- 2.88 -> DC N4 C0055 : score 6.1008 : w : ASP OD2 A0148 <- 5.64 -> DC N4 C0056 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0149 <- 2.55 -> DG N7 B0006 : score 7.14269 : H : ARG NH1 A0174 <- 2.88 -> DG N7 B0004 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0174 <- 2.74 -> DG O6 B0004 : score 6.6792 : H : ASP OD2 A0176 <- 3.18 -> DA N6 C0058 : score 3.69837 : w : ASP OD1 A0176 <- 5.39 -> DC N4 C0057 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0176 <- 5.73 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0180 <- 2.86 -> DG O6 B0002 : score 6.01033 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.66 -> DG N7 B0002 : score 6.56338 : w : ARG NH1 A0180 <- 5.79 -> DG O6 C0060 : score 2.756 : x : ARG xxxx A0118 <- 4.08 -> DC xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0121 <- 3.59 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0147 <- 3.46 -> DT xxx C0054 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0152 <- 4.22 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0177 <- 3.03 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >1a1l_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZIF268 ZINC FINGER-DNA COMPLEX (GCAC SITE) organism=Mus musculus : w : ASP OD2 A0120 <- 6.20 -> DG N7 C0052 : score 2.718 : H : ARG NH1 A0124 <- 2.99 -> DG O6 B0008 : score 5.85217 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.77 -> DG N7 B0008 : score 6.42292 : w : ARG NH1 A0124 <- 5.41 -> DG O6 C0054 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0146 <- 2.88 -> DG N7 B0007 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0146 <- 2.86 -> DG O6 B0007 : score 6.5208 : w : SER OG A0147 <- 5.98 -> DG N7 C0054 : score 2.749 : H : ASP OD2 A0148 <- 3.11 -> DC N4 C0055 : score 5.8156 : w : ASP OD2 A0148 <- 5.69 -> DC N4 C0056 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0149 <- 2.64 -> DG N7 B0006 : score 7.02025 : H : ARG NH1 A0174 <- 3.01 -> DG N7 B0004 : score 5.7959 : H : ARG NH2 A0174 <- 2.84 -> DG O6 B0004 : score 6.5472 : w : ASP OD1 A0176 <- 5.67 -> DC N4 C0057 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0176 <- 5.67 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0180 <- 2.88 -> DG O6 B0002 : score 5.986 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.73 -> DG N7 B0002 : score 6.474 : w : ARG NH1 A0180 <- 5.34 -> DG O6 C0060 : score 2.756 : x : ARG xxxx A0118 <- 3.70 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0121 <- 3.77 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0152 <- 4.05 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0177 <- 2.91 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >1a31_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_N-terminal_DNA-binding_fragment; title=HUMAN RECONSTITUTED DNA TOPOISOMERASE I IN COVALENT COMPLEX WITH A 22 BASE PAIR DNA DUPLEX organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0425 <- 5.45 -> DA N7 D0113 : score 1.655 : V : ASN CG A0722 <- 3.76 -> DT C7 C0011 : score 2.67469 : x : ARG xxxx A0364 <- 3.55 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0426 <- 3.35 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0428 <- 4.40 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0491 <- 3.98 -> DC xxx D0117 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0532 <- 3.76 -> DA xxx D0114 : score x.xxxxx >1a35_A:Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_N-terminal_DNA-binding_fragment;DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=HUMAN TOPOISOMERASE I/DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0364 <- 3.39 -> DG N3 C0012 : score 3.18425 : w : ARG NH2 A0364 <- 5.30 -> DA N3 D0113 : score 2.092 : w : LYS NZ A0425 <- 5.66 -> DA N7 D0113 : score 1.655 : H : LYS NZ A0532 <- 2.94 -> DT O2 C0010 : score 3.48674 : w : LYS NZ A0532 <- 6.11 -> DT O2 C0009 : score 0.522 : w : ASP OD1 A0533 <- 5.23 -> DA N3 D0113 : score 1.331 : w : LYS NZ A0587 <- 5.49 -> DG N2 D0115 : score 0.846 : x : TYR xxxx A0426 <- 3.09 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0428 <- 4.20 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0491 <- 3.94 -> DC xxx D0117 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0493 <- 3.59 -> DT xxx D0116 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0718 <- 3.77 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0722 <- 4.43 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >1a36_A:Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_N-terminal_DNA-binding_fragment;DNA_breaking-rejoining_enzymes;Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_dispensable_insert_domain; title=TOPOISOMERASE I/DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0364 <- 2.49 -> DG N3 B0012 : score 3.83409 : H : LYS NZ A0532 <- 3.03 -> DT O2 B0010 : score 3.42217 : x : ASN xxxx A0352 <- 4.15 -> DT xxx C0112 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0426 <- 2.77 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0428 <- 3.78 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0491 <- 3.67 -> DT xxx C0116 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0493 <- 4.03 -> DG xxx C0115 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0718 <- 3.80 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0722 <- 4.32 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0745 <- 3.54 -> DT xxx C0109 : score x.xxxxx >1a3q_A:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=HUMAN NF-KAPPA-B P52 BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0052 <- 2.89 -> DG O6 D0607 : score 5.97383 : H : ARG NH2 A0052 <- 2.82 -> DG O6 D0607 : score 6.5736 : w : ARG NH2 A0052 <- 6.13 -> DC N4 C0512 : score 0.976 : H : ARG NH1 A0054 <- 3.14 -> DG O6 D0606 : score 5.66967 : H : ARG NH2 A0054 <- 3.04 -> DG N7 D0606 : score 6.07815 : H : GLU OE1 A0058 <- 3.01 -> DC N4 C0513 : score 5.52569 : w : GLU OE2 A0058 <- 5.93 -> DC N4 C0512 : score 3.597 : H : HIS ND1 A0062 <- 2.82 -> DG N7 D0605 : score 6.19818 : H : LYS NZ A0221 <- 2.84 -> DG O6 D0608 : score 5.73452 : x : TYR xxxx A0055 <- 3.87 -> DT xxx C0511 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0057 <- 4.12 -> DC xxx C0512 : score x.xxxxx >1a3q_AB:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=HUMAN NF-KAPPA-B P52 BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0052 <- 2.89 -> DG O6 D0607 : score 5.97383 : H : ARG NH2 A0052 <- 2.82 -> DG O6 D0607 : score 6.5736 : w : ARG NH2 A0052 <- 6.13 -> DC N4 C0512 : score 0.976 : H : ARG NH1 A0054 <- 3.14 -> DG O6 D0606 : score 5.66967 : H : ARG NH2 A0054 <- 3.04 -> DG N7 D0606 : score 6.07815 : H : GLU OE1 A0058 <- 3.01 -> DC N4 C0513 : score 5.52569 : w : GLU OE2 A0058 <- 5.93 -> DC N4 C0512 : score 3.597 : H : HIS ND1 A0062 <- 2.82 -> DG N7 D0605 : score 6.19818 : H : LYS NZ A0221 <- 2.84 -> DG O6 D0608 : score 5.73452 : H : ARG NH1 B0052 <- 2.85 -> DG N7 C0506 : score 5.9895 : H : ARG NH2 B0052 <- 3.29 -> DG O6 C0507 : score 5.9532 : H : ARG NH1 B0054 <- 2.99 -> DG O6 C0506 : score 5.85217 : H : ARG NH2 B0054 <- 3.03 -> DG N7 C0506 : score 6.09092 : H : GLU OE1 B0058 <- 2.60 -> DC N4 D0613 : score 5.99867 : H : LYS NZ B0221 <- 2.76 -> DG O6 C0508 : score 5.82702 : x : TYR xxxx A0055 <- 3.87 -> DT xxx C0511 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0057 <- 4.12 -> DC xxx C0512 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0055 <- 3.68 -> DT xxx D0611 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0057 <- 3.85 -> DC xxx D0612 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0062 <- 3.86 -> DG xxx C0505 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0252 <- 4.33 -> DT xxx D0610 : score x.xxxxx >1a66_A:p53-like_transcription_factors; title=SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE CORE NFATC1/DNA COMPLEX, 18 STRUCTURES organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0026 <- 2.80 -> DG O6 B0319 : score 6.6 : H : ARG NE A0035 <- 3.12 -> DG N7 B0316 : score 4.1388 : H : GLN OE1 A0176 <- 2.75 -> DA N6 B0320 : score 6.11309 : H : GLN NE2 A0176 <- 3.03 -> DA N7 B0320 : score 5.80962 : x : ARG xxxx A0028 <- 2.78 -> DG xxx B0318 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0029 <- 2.96 -> DT xxx C0346 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0032 <- 3.24 -> DC xxx C0347 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0125 <- 3.95 -> DT xxx C0345 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0142 <- 3.96 -> DT xxx C0343 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0177 <- 3.21 -> DT xxx C0343 : score x.xxxxx >1a6y_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=REVERBA ORPHAN NUCLEAR RECEPTOR/DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0119 <- 2.61 -> DC N4 D0633 : score 5.98713 : H : LYS NZ A0122 <- 3.27 -> DA N7 C0605 : score 2.66108 : H : LYS NZ A0122 <- 2.80 -> DG O6 C0606 : score 5.78077 : H : ARG NH2 A0126 <- 3.07 -> DG O6 C0607 : score 6.2436 : w : ARG NH2 A0126 <- 6.30 -> DT O4 C0608 : score 2.366 : H : ARG NH2 A0127 <- 2.39 -> DG N7 D0631 : score 6.90815 : w : ARG NH2 A0127 <- 6.43 -> DT O4 C0608 : score 2.366 : x : HIS xxxx A0112 <- 4.13 -> DA xxx C0605 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0173 <- 3.57 -> DT xxx D0638 : score x.xxxxx >1a6y_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=REVERBA ORPHAN NUCLEAR RECEPTOR/DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0119 <- 2.61 -> DC N4 D0633 : score 5.98713 : H : LYS NZ A0122 <- 3.27 -> DA N7 C0605 : score 2.66108 : H : LYS NZ A0122 <- 2.80 -> DG O6 C0606 : score 5.78077 : H : ARG NH2 A0126 <- 3.07 -> DG O6 C0607 : score 6.2436 : w : ARG NH2 A0126 <- 6.30 -> DT O4 C0608 : score 2.366 : H : ARG NH2 A0127 <- 2.39 -> DG N7 D0631 : score 6.90815 : w : ARG NH2 A0127 <- 6.43 -> DT O4 C0608 : score 2.366 : H : GLU OE2 B0119 <- 3.07 -> DC N4 D0625 : score 4.98105 : H : LYS NZ B0122 <- 2.92 -> DG N7 C0614 : score 5.25664 : H : LYS NZ B0122 <- 3.07 -> DG O6 C0614 : score 5.46861 : H : ARG NH2 B0127 <- 3.10 -> DG N7 D0623 : score 6.00154 : w : ARG NE B0127 <- 6.38 -> DG O6 D0623 : score 1.369 : x : HIS xxxx A0112 <- 4.13 -> DA xxx C0605 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0173 <- 3.57 -> DT xxx D0638 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0126 <- 3.55 -> DG xxx C0615 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0175 <- 3.79 -> DA xxx C0610 : score x.xxxxx >1a73_A:His-Me_finger_endonucleases; title=INTRON-ENCODED ENDONUCLEASE I-PPOI COMPLEXED WITH DNA organism=Physarum polycephalum : H : ASN ND2 A0057 <- 2.92 -> DG O6 F0016 : score 5.50314 : H : GLN OE1 A0063 <- 2.82 -> DA N6 F0017 : score 6.02835 : H : GLN NE2 A0063 <- 2.96 -> DA N7 F0017 : score 5.89487 : w : GLN OE1 A0063 <- 5.98 -> DC N4 C0005 : score 3.488 : H : LYS NZ A0065 <- 2.84 -> DG N7 C0003 : score 5.34281 : H : ARG NH1 A0074 <- 2.80 -> DG O6 F0018 : score 6.08333 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.96 -> DG N7 F0018 : score 6.18031 : H : LYS NZ A0120 <- 2.93 -> DT O2 C0011 : score 3.49391 : w : LYS NZ A0120 <- 5.93 -> DA N3 C0012 : score 1.538 : V : VAL CG2 A0072 <- 3.81 -> DT C7 C0002 : score 6.10777 : x : ALA xxxx A0055 <- 3.67 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.07 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0067 <- 3.57 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0116 <- 3.72 -> DA xxx E0013 : score x.xxxxx >1a73_AB:His-Me_finger_endonucleases; title=INTRON-ENCODED ENDONUCLEASE I-PPOI COMPLEXED WITH DNA organism=Physarum polycephalum : H : ASN ND2 A0057 <- 2.92 -> DG O6 F0016 : score 5.50314 : H : GLN OE1 A0063 <- 2.82 -> DA N6 F0017 : score 6.02835 : H : GLN NE2 A0063 <- 2.96 -> DA N7 F0017 : score 5.89487 : w : GLN OE1 A0063 <- 5.98 -> DC N4 C0005 : score 3.488 : H : LYS NZ A0065 <- 2.84 -> DG N7 C0003 : score 5.34281 : H : ARG NH1 A0074 <- 2.80 -> DG O6 F0018 : score 6.08333 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.96 -> DG N7 F0018 : score 6.18031 : H : LYS NZ A0120 <- 2.93 -> DT O2 C0011 : score 3.49391 : w : LYS NZ A0120 <- 5.93 -> DA N3 C0012 : score 1.538 : H : ASN ND2 B0057 <- 2.90 -> DG O6 D0016 : score 5.52569 : H : GLN OE1 B0063 <- 2.82 -> DA N6 D0017 : score 6.02835 : H : GLN NE2 B0063 <- 2.93 -> DA N7 D0017 : score 5.93141 : w : GLN OE1 B0063 <- 5.70 -> DC N4 E0005 : score 3.488 : H : LYS NZ B0065 <- 2.94 -> DG N7 E0003 : score 5.23509 : w : LYS NZ B0065 <- 6.29 -> DA N6 E0004 : score 2.097 : H : ARG NH1 B0074 <- 2.74 -> DG O6 D0018 : score 6.15633 : H : ARG NH2 B0074 <- 2.98 -> DG N7 D0018 : score 6.15477 : H : LYS NZ B0120 <- 2.96 -> DT O2 E0011 : score 3.47239 : w : LYS NZ B0120 <- 5.68 -> DA N3 E0012 : score 1.538 : V : VAL CG2 A0072 <- 3.81 -> DT C7 C0002 : score 6.10777 : x : ALA xxxx A0055 <- 3.67 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.07 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0067 <- 3.57 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0116 <- 3.72 -> DA xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0055 <- 3.77 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0061 <- 3.08 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0067 <- 4.05 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0116 <- 3.71 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx >1a74_AB:His-Me_finger_endonucleases; title=I-PPOL HOMING ENDONUCLEASE/DNA COMPLEX organism=Physarum polycephalum : H : ARG NE A0061 <- 3.23 -> DA N7 D0415 : score -8.32795 : H : GLN OE1 A0063 <- 2.80 -> DA N6 D0417 : score 6.05256 : H : GLN NE2 A0063 <- 3.00 -> DA N7 D0417 : score 5.84615 : w : GLN OE1 A0063 <- 5.87 -> DC N4 C0405 : score 3.488 : H : LYS NZ A0065 <- 2.85 -> DG N7 C0403 : score 5.33204 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.75 -> DG N7 D0418 : score 6.44846 : H : LYS NZ A0120 <- 2.70 -> DT O2 C0411 : score 3.65892 : w : LYS NZ A0120 <- 5.61 -> DA N3 C0412 : score 1.538 : H : ARG NE B0061 <- 3.17 -> DA N7 C0415 : score -8.43728 : H : GLN OE1 B0063 <- 2.73 -> DA N6 C0417 : score 6.1373 : H : GLN NE2 B0063 <- 2.97 -> DA N7 C0417 : score 5.88269 : w : GLN OE1 B0063 <- 5.97 -> DC N4 D0405 : score 3.488 : H : LYS NZ B0065 <- 3.00 -> DG N7 D0403 : score 5.17046 : w : LYS NZ B0065 <- 6.17 -> DA N6 D0404 : score 2.097 : H : ARG NH2 B0074 <- 2.95 -> DG N7 C0418 : score 6.19308 : H : ARG NH2 B0074 <- 3.11 -> DG O6 C0418 : score 6.1908 : H : LYS NZ B0120 <- 2.95 -> DT O2 D0411 : score 3.47956 : V : VAL CG2 A0072 <- 3.72 -> DT C7 C0402 : score 6.24554 : x : ALA xxxx A0055 <- 3.71 -> DA xxx C0404 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0057 <- 3.05 -> DG xxx D0416 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0067 <- 3.81 -> DT xxx C0402 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0116 <- 3.50 -> DT xxx C0411 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0055 <- 3.82 -> DA xxx D0404 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0057 <- 2.93 -> DG xxx C0416 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0067 <- 3.95 -> DT xxx D0402 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0116 <- 3.57 -> DA xxx C0413 : score x.xxxxx >1a74_B:His-Me_finger_endonucleases; title=I-PPOL HOMING ENDONUCLEASE/DNA COMPLEX organism=Physarum polycephalum : H : ARG NE B0061 <- 3.17 -> DA N7 C0415 : score -8.43728 : H : GLN OE1 B0063 <- 2.73 -> DA N6 C0417 : score 6.1373 : H : GLN NE2 B0063 <- 2.97 -> DA N7 C0417 : score 5.88269 : w : GLN OE1 B0063 <- 5.97 -> DC N4 D0405 : score 3.488 : H : LYS NZ B0065 <- 3.00 -> DG N7 D0403 : score 5.17046 : w : LYS NZ B0065 <- 6.17 -> DA N6 D0404 : score 2.097 : H : ARG NH2 B0074 <- 2.95 -> DG N7 C0418 : score 6.19308 : H : ARG NH2 B0074 <- 3.11 -> DG O6 C0418 : score 6.1908 : H : LYS NZ B0120 <- 2.95 -> DT O2 D0411 : score 3.47956 : x : ALA xxxx B0055 <- 3.82 -> DA xxx D0404 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0057 <- 2.93 -> DG xxx C0416 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0067 <- 3.95 -> DT xxx D0402 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0116 <- 3.57 -> DA xxx C0413 : score x.xxxxx >1aay_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZIF268 ZINC FINGER-DNA COMPLEX organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0118 <- 2.92 -> DG N7 B0010 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0118 <- 2.81 -> DG O6 B0010 : score 6.5868 : w : ASP OD2 A0120 <- 5.92 -> DC N4 B0009 : score 3.623 : w : ASP OD2 A0120 <- 5.82 -> DC N4 C0053 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0124 <- 2.86 -> DG O6 B0008 : score 6.01033 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.68 -> DG N7 B0008 : score 6.53785 : w : ARG NH1 A0124 <- 5.87 -> DG O6 C0054 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0146 <- 2.80 -> DG N7 B0007 : score 6.05 : H : ARG NH2 A0146 <- 2.78 -> DG O6 B0007 : score 6.6264 : w : SER OG A0147 <- 5.99 -> DG N7 C0054 : score 2.749 : H : ASP OD2 A0148 <- 2.99 -> DC N4 C0055 : score 5.9644 : w : ASP OD2 A0148 <- 5.37 -> DC N4 C0056 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0149 <- 2.70 -> DG N7 B0006 : score 6.93862 : H : ARG NH1 A0174 <- 2.90 -> DG N7 B0004 : score 5.929 : H : ARG NH2 A0174 <- 2.88 -> DG O6 B0004 : score 6.4944 : w : ASP OD1 A0176 <- 5.77 -> DC N4 C0057 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0176 <- 5.95 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : w : ASP OD2 A0176 <- 5.86 -> DC N4 C0059 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0180 <- 2.91 -> DG O6 B0002 : score 5.9495 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.71 -> DG N7 B0002 : score 6.49954 : w : ARG NH1 A0180 <- 5.70 -> DG O6 C0060 : score 2.756 : x : GLU xxxx A0121 <- 3.55 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0152 <- 4.24 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0177 <- 3.96 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx >1ahd_P:Homeodomain-like; title=DETERMINATION OF THE NMR SOLUTION STRUCTURE OF AN ANTENNAPEDIA HOMEODOMAIN-DNA COMPLEX organism=DROSOPHILA SUBOBSCURA : H : ARG NH1 P0003 <- 3.03 -> DG N3 A0012 : score 2.91215 : H : GLN OE1 P0050 <- 2.89 -> DC N4 A0007 : score 4.50083 : x : ARG xxxx P0028 <- 3.35 -> DA xxx A0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx P0046 <- 4.24 -> DA xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx P0047 <- 3.39 -> DT xxx B0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0051 <- 3.63 -> DA xxx B0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx P0054 <- 3.50 -> DC xxx A0007 : score x.xxxxx >1ais_A:TATA-box_binding_protein-like; title=TATA-BINDING PROTEIN/TRANSCRIPTION FACTOR (II)B/TATA-BOX COMPLEX FROM PYROCOCCUS WOESEI organism=PYROCOCCUS WOESEI : H : ASN ND2 A0013 <- 3.11 -> DA N3 E1423 : score 3.57162 : H : ASN ND2 A0013 <- 3.40 -> DA N3 E1424 : score 3.35077 : H : THR OG1 A0068 <- 3.46 -> DT O2 E1422 : score 2.35584 : H : SER OG A0159 <- 3.14 -> DT O2 C1410 : score 3.44601 : x : VAL xxxx A0015 <- 3.69 -> DA xxx E1423 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0043 <- 3.20 -> DT xxx E1421 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0044 <- 3.37 -> DA xxx C1415 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0058 <- 3.47 -> DT xxx E1421 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0060 <- 3.69 -> DA xxx C1414 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0066 <- 3.42 -> DA xxx C1413 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0106 <- 3.59 -> DA xxx E1424 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0134 <- 3.08 -> DT xxx C1409 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0135 <- 3.07 -> DA xxx E1427 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0149 <- 3.14 -> DT xxx C1409 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0151 <- 3.72 -> DA xxx E1426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0157 <- 3.49 -> DA xxx E1425 : score x.xxxxx >1ais_AB:TATA-box_binding_protein-like;Cyclin-like; title=TATA-BINDING PROTEIN/TRANSCRIPTION FACTOR (II)B/TATA-BOX COMPLEX FROM PYROCOCCUS WOESEI organism=PYROCOCCUS WOESEI : H : ASN ND2 A0013 <- 3.11 -> DA N3 E1423 : score 3.57162 : H : ASN ND2 A0013 <- 3.40 -> DA N3 E1424 : score 3.35077 : H : THR OG1 A0068 <- 3.46 -> DT O2 E1422 : score 2.35584 : H : SER OG A0159 <- 3.14 -> DT O2 C1410 : score 3.44601 : x : VAL xxxx A0015 <- 3.69 -> DA xxx E1423 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0043 <- 3.20 -> DT xxx E1421 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0044 <- 3.37 -> DA xxx C1415 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0058 <- 3.47 -> DT xxx E1421 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0060 <- 3.69 -> DA xxx C1414 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0066 <- 3.42 -> DA xxx C1413 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0106 <- 3.59 -> DA xxx E1424 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0134 <- 3.08 -> DT xxx C1409 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0135 <- 3.07 -> DA xxx E1427 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0149 <- 3.14 -> DT xxx C1409 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0151 <- 3.72 -> DA xxx E1426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0157 <- 3.49 -> DA xxx E1425 : score x.xxxxx >1akh_A:Homeodomain-like; title=MAT A1/ALPHA2/DNA TERNARY COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN OD1 A0120 <- 3.15 -> DA N6 D0026 : score 5.60027 : H : ASN ND2 A0120 <- 3.32 -> DA N7 D0026 : score 5.25998 : H : ARG NH1 A0124 <- 2.80 -> DG N7 D0025 : score 6.05 : H : ARG NH2 A0124 <- 3.00 -> DG N7 D0025 : score 6.12923 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.48 -> DG O6 D0025 : score 7.0224 : V : ARG CZ A0115 <- 3.52 -> DT C7 C0015 : score 2.28157 : x : VAL xxxx A0116 <- 4.15 -> DA xxx D0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0119 <- 3.15 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0123 <- 2.96 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx >1akh_AB:Homeodomain-like; title=MAT A1/ALPHA2/DNA TERNARY COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN OD1 A0120 <- 3.15 -> DA N6 D0026 : score 5.60027 : H : ASN ND2 A0120 <- 3.32 -> DA N7 D0026 : score 5.25998 : H : ARG NH1 A0124 <- 2.80 -> DG N7 D0025 : score 6.05 : H : ARG NH2 A0124 <- 3.00 -> DG N7 D0025 : score 6.12923 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.48 -> DG O6 D0025 : score 7.0224 : H : ARG NE B0132 <- 3.38 -> DA N3 D0038 : score 1.85867 : w : ARG NH2 B0132 <- 5.64 -> DT O2 C0007 : score 2.261 : H : ARG NH2 B0135 <- 2.54 -> DT O2 D0035 : score 4.45347 : w : ASN OD1 B0178 <- 6.17 -> DT O4 C0005 : score 3.132 : w : SER OG B0181 <- 5.18 -> DA N7 C0004 : score 2.343 : w : SER OG B0181 <- 6.11 -> DT O4 C0005 : score 2.338 : H : ARG NH2 B0185 <- 2.68 -> DG N7 C0006 : score 6.53785 : H : ARG NH2 B0185 <- 2.79 -> DG O6 C0006 : score 6.6132 : V : ASN CG B0182 <- 3.71 -> DT C7 D0037 : score 2.70779 : V : ARG CZ A0115 <- 3.52 -> DT C7 C0015 : score 2.28157 : x : VAL xxxx A0116 <- 4.15 -> DA xxx D0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0119 <- 3.15 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0123 <- 2.96 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx >1am9_A:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=HUMAN SREBP-1A BOUND TO LDL RECEPTOR PROMOTER organism=Homo sapiens : H : HIS NE2 A0328 <- 2.50 -> DG O6 G0051 : score 8.43108 : w : HIS ND1 A0328 <- 5.88 -> DA N6 F0024 : score 2.619 : H : GLU OE1 A0332 <- 2.61 -> DC N4 F0026 : score 5.98713 : H : ARG NH2 A0336 <- 2.73 -> DG N7 G0049 : score 6.474 : V : ILE CG2 A0331 <- 3.69 -> DT C7 F0025 : score 7.28629 : x : ASN xxxx A0329 <- 3.46 -> DT xxx G0050 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0335 <- 3.53 -> DC xxx F0026 : score x.xxxxx >1am9_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=HUMAN SREBP-1A BOUND TO LDL RECEPTOR PROMOTER organism=Homo sapiens : H : HIS NE2 A0328 <- 2.50 -> DG O6 G0051 : score 8.43108 : w : HIS ND1 A0328 <- 5.88 -> DA N6 F0024 : score 2.619 : H : GLU OE1 A0332 <- 2.61 -> DC N4 F0026 : score 5.98713 : H : ARG NH2 A0336 <- 2.73 -> DG N7 G0049 : score 6.474 : H : HIS NE2 B0328 <- 2.86 -> DG N7 G0044 : score 6.72093 : H : HIS NE2 B0328 <- 2.94 -> DG O6 G0044 : score 7.73114 : H : GLU OE1 B0332 <- 3.14 -> DC N4 F0030 : score 5.37573 : H : GLU OE2 B0332 <- 2.67 -> DC N4 F0031 : score 5.40228 : w : ARG NH1 B0336 <- 5.62 -> DC N4 F0029 : score 1.892 : V : ILE CG2 A0331 <- 3.69 -> DT C7 F0025 : score 7.28629 : x : ASN xxxx A0329 <- 3.46 -> DT xxx G0050 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0335 <- 3.53 -> DC xxx F0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0325 <- 3.01 -> DC xxx F0030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0329 <- 4.38 -> DC xxx F0030 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0331 <- 3.50 -> DG xxx G0044 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0335 <- 3.40 -> DG xxx G0046 : score x.xxxxx >1am9_CD:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=HUMAN SREBP-1A BOUND TO LDL RECEPTOR PROMOTER organism=Homo sapiens : H : HIS NE2 C0328 <- 2.56 -> DG O6 E0013 : score 8.33563 : w : HIS ND1 C0328 <- 5.55 -> DA N6 H0062 : score 2.619 : H : GLU OE1 C0332 <- 2.48 -> DC N4 H0064 : score 6.1371 : H : HIS NE2 D0328 <- 2.78 -> DG N7 E0006 : score 6.82977 : H : GLU OE2 D0332 <- 2.75 -> DC N4 H0069 : score 5.31804 : w : ARG NH1 D0336 <- 6.14 -> DC N4 H0067 : score 1.892 : V : ILE CG2 C0331 <- 3.79 -> DT C7 H0063 : score 7.10901 : x : ASN xxxx C0329 <- 3.48 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0335 <- 3.37 -> DC xxx H0064 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0336 <- 3.64 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0325 <- 3.25 -> DC xxx H0068 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0329 <- 4.38 -> DC xxx H0068 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0331 <- 3.75 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0335 <- 3.43 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx >1an2_A:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=RECOGNITION BY MAX OF ITS COGNATE DNA THROUGH A DIMERIC B/HLH/Z DOMAIN organism=Mus musculus : V : GLU CB A0032 <- 3.76 -> DT C7 B0013 : score 1.64397 : x : HIS xxxx A0028 <- 3.83 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0029 <- 3.43 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0036 <- 3.36 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx >1an4_A:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE AND FUNCTION OF THE B/HLH/Z DOMAIN OF USF organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0208 <- 2.51 -> DC N4 C0309 : score 6.10249 : H : ARG NH2 A0212 <- 2.57 -> DG N7 D0333 : score 6.67831 : H : ARG NH2 A0212 <- 3.32 -> DT O4 D0334 : score 3.18425 : x : GLN xxxx A0203 <- 3.21 -> DG xxx C0306 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0207 <- 4.38 -> DT xxx C0308 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0211 <- 3.02 -> DC xxx C0309 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0238 <- 4.47 -> DG xxx D0328 : score x.xxxxx >1an4_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE AND FUNCTION OF THE B/HLH/Z DOMAIN OF USF organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0208 <- 2.51 -> DC N4 C0309 : score 6.10249 : H : ARG NH2 A0212 <- 2.57 -> DG N7 D0333 : score 6.67831 : H : ARG NH2 A0212 <- 3.32 -> DT O4 D0334 : score 3.18425 : H : ARG NH1 B0212 <- 2.99 -> DG O6 C0312 : score 5.85217 : x : GLN xxxx A0203 <- 3.21 -> DG xxx C0306 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0207 <- 4.38 -> DT xxx C0308 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0211 <- 3.02 -> DC xxx C0309 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0238 <- 4.47 -> DG xxx D0328 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0200 <- 2.61 -> DA xxx D0326 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0204 <- 3.82 -> DG xxx C0314 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0208 <- 3.30 -> DT xxx C0313 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0211 <- 3.66 -> DC xxx D0330 : score x.xxxxx >1aoi_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=COMPLEX BETWEEN NUCLEOSOME CORE PARTICLE (H3,H4,H2A,H2B) AND 146 BP LONG DNA FRAGMENT organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.07 -> DA N3 J0229 : score 3.0648 : H : ARG NH1 D0027 <- 3.13 -> DT O2 J0191 : score 4.02219 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.03 -> DA N3 I0082 : score 3.51268 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.28 -> DA N3 I0082 : score 2.92873 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.40 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.02 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.32 -> DA xxx J0245 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.47 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.12 -> DA xxx J0257 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.13 -> DG xxx J0277 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0028 <- 3.70 -> DC xxx I0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.99 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.68 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.54 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.04 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.36 -> DT xxx J0184 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0028 <- 3.73 -> DA xxx J0173 : score x.xxxxx >1aoi_D:Histone-fold; title=COMPLEX BETWEEN NUCLEOSOME CORE PARTICLE (H3,H4,H2A,H2B) AND 146 BP LONG DNA FRAGMENT organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 D0027 <- 3.13 -> DT O2 J0191 : score 4.02219 : x : LYS xxxx D0028 <- 3.70 -> DC xxx I0026 : score x.xxxxx >1apl_CD:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MAT-ALPHA2 HOMEODOMAIN-OPERATOR COMPLEX SUGGESTS A GENERAL MODEL FOR HOMEODOMAIN-DNA INTERACTIONS organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NH1 C0135 <- 3.37 -> DA N3 B0031 : score 3.2623 : H : ARG NH2 C0135 <- 2.88 -> DT O2 B0032 : score 4.1656 : H : ASN OD1 C0182 <- 2.98 -> DA N6 A0016 : score 5.80501 : H : ASN ND2 C0182 <- 3.11 -> DA N7 A0016 : score 5.50654 : H : ARG NH2 C0185 <- 2.93 -> DG N7 B0027 : score 6.21862 : H : ARG NH1 D0135 <- 2.96 -> DT O2 A0010 : score 4.16861 : H : ASN OD1 D0182 <- 3.27 -> DA N6 B0038 : score 5.45575 : H : ASN ND2 D0182 <- 3.14 -> DA N7 B0038 : score 5.47132 : x : TYR xxxx C0131 <- 3.61 -> DA xxx B0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0178 <- 4.35 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0181 <- 3.87 -> DT xxx B0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0178 <- 3.86 -> DC xxx B0039 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0181 <- 3.92 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0185 <- 2.99 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx >1apl_D:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MAT-ALPHA2 HOMEODOMAIN-OPERATOR COMPLEX SUGGESTS A GENERAL MODEL FOR HOMEODOMAIN-DNA INTERACTIONS organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NH1 D0135 <- 2.96 -> DT O2 A0010 : score 4.16861 : H : ASN OD1 D0182 <- 3.27 -> DA N6 B0038 : score 5.45575 : H : ASN ND2 D0182 <- 3.14 -> DA N7 B0038 : score 5.47132 : V : ARG CZ D0185 <- 3.80 -> DT C7 A0004 : score 2.13231 : x : ASN xxxx D0178 <- 3.86 -> DC xxx B0039 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0181 <- 3.92 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx >1au7_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=PIT-1 MUTANT/DNA COMPLEX organism=Rattus norvegicus : H : GLN OE1 A0044 <- 3.09 -> DA N6 C0460 : score 5.70152 : H : GLN NE2 A0044 <- 2.91 -> DA N7 C0460 : score 5.95577 : H : THR OG1 A0045 <- 3.34 -> DT O4 C0461 : score 3.46736 : H : ARG NH2 A0049 <- 2.50 -> DG O6 D0484 : score 6.996 : H : ARG NH2 A0105 <- 2.98 -> DA N3 C0458 : score 3.12311 : H : GLN NE2 A0154 <- 3.22 -> DA N7 C0454 : score 5.57821 : V : VAL CG1 A0147 <- 3.77 -> DT C7 D0493 : score 6.10597 : x : SER xxxx A0043 <- 3.54 -> DT xxx D0485 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0048 <- 3.61 -> DA xxx C0460 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0055 <- 4.02 -> DT xxx D0483 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0059 <- 4.33 -> DT xxx D0483 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0146 <- 4.00 -> DC xxx C0451 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0150 <- 3.73 -> DT xxx C0452 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0151 <- 3.31 -> DA xxx D0492 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0155 <- 4.33 -> DC xxx D0491 : score x.xxxxx >1au7_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=PIT-1 MUTANT/DNA COMPLEX organism=Rattus norvegicus : H : GLN OE1 A0044 <- 3.09 -> DA N6 C0460 : score 5.70152 : H : GLN NE2 A0044 <- 2.91 -> DA N7 C0460 : score 5.95577 : H : THR OG1 A0045 <- 3.34 -> DT O4 C0461 : score 3.46736 : H : ARG NH2 A0049 <- 2.50 -> DG O6 D0484 : score 6.996 : H : ARG NH2 A0105 <- 2.98 -> DA N3 C0458 : score 3.12311 : H : GLN NE2 A0154 <- 3.22 -> DA N7 C0454 : score 5.57821 : H : GLN OE1 B0044 <- 3.09 -> DA N6 D0488 : score 5.70152 : H : GLN NE2 B0044 <- 3.22 -> DA N7 D0488 : score 5.57821 : H : THR OG1 B0045 <- 3.14 -> DT O4 C0457 : score 3.62285 : H : THR OG1 B0045 <- 3.48 -> DT O4 D0489 : score 3.35852 : H : ARG NH1 B0049 <- 2.91 -> DG N7 C0456 : score 5.9169 : H : ARG NH2 B0049 <- 2.22 -> DG O6 C0456 : score 7.3656 : H : ARG NH2 B0105 <- 2.43 -> DA N3 C0462 : score 3.47948 : w : ARG NH1 B0146 <- 5.76 -> DT O4 D0480 : score 1.768 : w : ARG NH2 B0146 <- 5.49 -> DT O4 D0480 : score 2.366 : H : ASN OD1 B0151 <- 2.93 -> DA N6 C0464 : score 5.86523 : H : GLN OE1 B0154 <- 3.03 -> DA N6 D0482 : score 5.77415 : H : GLN NE2 B0154 <- 2.83 -> DA N7 D0482 : score 6.05321 : V : LEU CD2 B0055 <- 3.63 -> DT C7 C0455 : score 5.97486 : V : VAL CG1 B0147 <- 3.82 -> DT C7 C0465 : score 6.03021 : V : VAL CG1 A0147 <- 3.77 -> DT C7 D0493 : score 6.10597 : x : SER xxxx A0043 <- 3.54 -> DT xxx D0485 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0048 <- 3.61 -> DA xxx C0460 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0055 <- 4.02 -> DT xxx D0483 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0059 <- 4.33 -> DT xxx D0483 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0146 <- 4.00 -> DC xxx C0451 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0150 <- 3.73 -> DT xxx C0452 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0151 <- 3.31 -> DA xxx D0492 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0155 <- 4.33 -> DC xxx D0491 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0027 <- 4.31 -> DT xxx D0487 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 3.52 -> DT xxx C0457 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0048 <- 3.83 -> DA xxx D0488 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0150 <- 3.62 -> DT xxx D0480 : score x.xxxxx >1awc_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=MOUSE GABP ALPHA/BETA DOMAIN BOUND TO DNA organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NE A0376 <- 2.75 -> DG O6 D0009 : score 3.98044 : H : ARG NH2 A0376 <- 2.87 -> DG N7 D0009 : score 6.29523 : H : ARG NE A0379 <- 2.82 -> DG N7 D0008 : score 4.40411 : H : ARG NH2 A0379 <- 2.94 -> DG O6 D0008 : score 6.4152 : H : TYR OH A0380 <- 2.92 -> DT O4 E0033 : score 3.4185 : H : TYR OH A0380 <- 3.26 -> DA N6 D0010 : score 4.24083 : w : TYR OH A0380 <- 5.64 -> DA N7 D0010 : score 3.238 : x : LYS xxxx A0373 <- 3.96 -> DT xxx E0034 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0377 <- 4.19 -> DT xxx E0033 : score x.xxxxx >1az0_A:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV ENDONUCLEASE/DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : ASN OD1 A0185 <- 2.81 -> DA N6 D0805 : score 6.00975 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.97 -> DA N7 D0805 : score 5.67092 : H : THR OG1 A0186 <- 2.78 -> DT O4 C0908 : score 3.90273 : V : THR CB A0106 <- 3.81 -> DT C7 C0908 : score 3.51734 : x : LYS xxxx A0104 <- 4.32 -> DT xxx C0910 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.27 -> DG xxx D0804 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.41 -> DT xxx C0908 : score x.xxxxx >1az0_AB:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV ENDONUCLEASE/DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : ASN OD1 A0185 <- 2.81 -> DA N6 D0805 : score 6.00975 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.97 -> DA N7 D0805 : score 5.67092 : H : THR OG1 A0186 <- 2.78 -> DT O4 C0908 : score 3.90273 : H : ASN ND2 B0070 <- 3.04 -> DC O2 C0909 : score 4.26447 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.87 -> DA N6 C0905 : score 5.93749 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.90 -> DA N7 C0905 : score 5.7531 : H : THR OG1 B0186 <- 2.70 -> DT O4 D0808 : score 3.96492 : V : THR CB A0106 <- 3.81 -> DT C7 C0908 : score 3.51734 : x : LYS xxxx A0104 <- 4.32 -> DT xxx C0910 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.27 -> DG xxx D0804 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.41 -> DT xxx C0908 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.64 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.26 -> DG xxx C0904 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.42 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx >1azp_A:Chromo_domain-like; title=HYPERTHERMOPHILE CHROMOSOMAL PROTEIN SAC7D BOUND WITH KINKED DNA DUPLEX organism=SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS : w : TYR OH A0008 <- 5.32 -> DT O2 C0113 : score 3.068 : H : TRP NE1 A0024 <- 3.03 -> DG N3 B0103 : score -8.69241 : H : SER OG A0031 <- 3.01 -> DG N2 B0103 : score 3.23264 : H : ARG NH1 A0042 <- 2.99 -> DT O2 B0105 : score 4.14277 : H : ARG NH1 A0042 <- 3.05 -> DC O2 B0106 : score 3.4675 : w : ARG NH2 A0042 <- 5.42 -> DC O2 B0106 : score 1.669 : x : VAL xxxx A0026 <- 3.26 -> DC xxx B0102 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0029 <- 3.39 -> DC xxx C0114 : score x.xxxxx >1azq_A:Chromo_domain-like; title=HYPERTHERMOPHILE CHROMOSOMAL PROTEIN SAC7D BOUND WITH KINKED DNA DUPLEX organism=SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS : w : TYR OH A0008 <- 5.62 -> DA N3 C0112 : score 1.448 : H : TRP NE1 A0024 <- 3.03 -> DA N3 B0104 : score -8.69241 : x : VAL xxxx A0026 <- 3.44 -> DA xxx B0104 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0029 <- 3.64 -> DT xxx C0114 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0031 <- 3.52 -> DT xxx C0113 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0042 <- 3.20 -> DT xxx B0106 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0044 <- 4.25 -> DT xxx C0113 : score x.xxxxx >1b01_AB:Ribbon-helix-helix; title=TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR COPG/DNA COMPLEX organism=Streptococcus agalactiae : H : ARG NE A0004 <- 2.96 -> DT O4 F0113 : score 1.79949 : H : ARG NH1 A0004 <- 3.07 -> DG N7 E0106 : score 5.7233 : H : ARG NH2 A0004 <- 3.22 -> DT O4 F0113 : score 3.25532 : H : ARG NH2 A0004 <- 2.52 -> DG O6 F0114 : score 6.9696 : H : ARG NH2 A0004 <- 3.11 -> DG O6 E0106 : score 6.1908 : H : THR OG1 A0006 <- 2.49 -> DT O4 E0105 : score 4.12818 : H : ARG NH2 B0004 <- 2.73 -> DG O6 E0104 : score 6.6924 : H : THR OG1 B0006 <- 3.28 -> DC N4 F0115 : score 3.64613 A : x : THR xxxx B0008 <- 3.47 -> DG xxx F0112 : score x.xxxxx >1b01_B:Ribbon-helix-helix; title=TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR COPG/DNA COMPLEX organism=Streptococcus agalactiae : H : ARG NH2 B0004 <- 2.73 -> DG O6 E0104 : score 6.6924 : H : THR OG1 B0006 <- 3.28 -> DC N4 F0115 : score 3.64613 A : x : THR xxxx B0008 <- 3.47 -> DG xxx F0112 : score x.xxxxx >1b3t_A:Viral_DNA-binding_domain; title=EBNA-1 NUCLEAR PROTEIN/DNA COMPLEX organism=Human herpesvirus 4 : w : ARG NH1 A0469 <- 5.46 -> DT O2 C0111 : score 1.855 : H : LYS NZ A0477 <- 3.02 -> DG O6 D0202 : score 5.52642 : H : LYS NZ A0477 <- 2.86 -> DG O6 D0203 : score 5.7114 : w : LYS NZ A0477 <- 6.44 -> DT O4 C0115 : score 1.7 : w : LYS NZ A0477 <- 5.84 -> DG O6 D0203 : score 3.005 : w : LYS NZ A0514 <- 5.45 -> DG N7 C0112 : score 2.519 : w : THR OG1 A0515 <- 6.84 -> DA N6 D0204 : score 3.251 : w : ASN ND2 A0519 <- 6.38 -> DG O6 D0203 : score 2.971 : x : LYS xxxx A0461 <- 3.06 -> DA xxx D0204 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0464 <- 3.60 -> DG xxx C0112 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0465 <- 3.85 -> DT xxx C0114 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0475 <- 4.07 -> DT xxx C0115 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0478 <- 4.31 -> DT xxx C0114 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0518 <- 3.44 -> DC xxx C0113 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0522 <- 4.05 -> DT xxx C0114 : score x.xxxxx >1b3t_AB:Viral_DNA-binding_domain; title=EBNA-1 NUCLEAR PROTEIN/DNA COMPLEX organism=Human herpesvirus 4 : w : ARG NH1 A0469 <- 5.46 -> DT O2 C0111 : score 1.855 : H : LYS NZ A0477 <- 3.02 -> DG O6 D0202 : score 5.52642 : H : LYS NZ A0477 <- 2.86 -> DG O6 D0203 : score 5.7114 : w : LYS NZ A0477 <- 6.44 -> DT O4 C0115 : score 1.7 : w : LYS NZ A0514 <- 5.45 -> DG N7 C0112 : score 2.519 : w : THR OG1 A0515 <- 6.84 -> DA N6 D0204 : score 3.251 : w : LYS NZ B0461 <- 5.90 -> DG N2 C0103 : score 0.846 : w : ARG NH1 B0469 <- 6.15 -> DT O2 C0109 : score 1.855 : H : LYS NZ B0477 <- 2.93 -> DG N7 C0102 : score 5.24586 : H : LYS NZ B0477 <- 2.76 -> DG O6 C0102 : score 5.82702 : w : LYS NZ B0477 <- 6.35 -> DG O6 C0103 : score 3.005 : w : LYS NZ B0477 <- 6.30 -> DT O4 D0215 : score 1.7 : w : LYS NZ B0514 <- 5.53 -> DG N7 D0212 : score 2.519 : w : ASN ND2 B0519 <- 6.73 -> DG O6 C0103 : score 2.971 : x : LYS xxxx A0461 <- 3.06 -> DA xxx D0204 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0464 <- 3.60 -> DG xxx C0112 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0465 <- 3.85 -> DT xxx C0114 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0475 <- 4.07 -> DT xxx C0115 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0478 <- 4.31 -> DT xxx C0114 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0518 <- 3.44 -> DC xxx C0113 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0519 <- 4.02 -> DG xxx D0202 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0522 <- 4.05 -> DT xxx C0114 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0464 <- 3.98 -> DG xxx D0212 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0465 <- 3.52 -> DT xxx D0214 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0478 <- 4.36 -> DT xxx D0214 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0515 <- 3.79 -> DG xxx C0103 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0518 <- 3.41 -> DC xxx D0213 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0522 <- 4.40 -> DT xxx D0214 : score x.xxxxx >1b69_A:DNA-binding_domain; title=THE SOLUTION STRUCTURE OF TN916 INTEGRASE N-TERMINAL DOMAIN/DNA COMPLEX organism=ENTEROCOCCUS FAECALIS : H : ARG NH1 A0020 <- 3.22 -> DT O4 B0107 : score 2.99344 : H : ARG NH2 A0020 <- 3.19 -> DT O4 B0107 : score 3.27665 : H : TYR OH A0040 <- 3.26 -> DC N4 C0121 : score 3.82641 : V : LYS CE A0028 <- 3.65 -> DT C7 C0122 : score 2.69856 : V : LEU CD2 A0026 <- 3.83 -> DT C7 B0104 : score 5.6883 : x : LYS xxxx A0021 <- 4.46 -> DA xxx B0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0024 <- 2.83 -> DT xxx C0119 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0030 <- 4.42 -> DG xxx B0101 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0036 <- 3.98 -> DT xxx C0122 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0038 <- 3.11 -> DT xxx C0122 : score x.xxxxx >1b72_A:Homeodomain-like; title=PBX1, HOMEOBOX PROTEIN HOX-B1/DNA TERNARY COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0207 <- 2.59 -> DT O2 D0011 : score 4.41113 : H : ASN OD1 A0253 <- 3.07 -> DA N6 D0013 : score 5.69662 : H : ASN ND2 A0253 <- 2.99 -> DA N7 D0013 : score 5.64743 : w : ASN OD1 A0253 <- 5.68 -> DT O4 D0014 : score 3.132 : w : ASN OD1 A0253 <- 5.98 -> DA N6 E0028 : score 2.837 : x : ILE xxxx A0249 <- 3.72 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0252 <- 3.65 -> DC xxx E0026 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0256 <- 3.48 -> DG xxx E0027 : score x.xxxxx >1b72_AB:Homeodomain-like; title=PBX1, HOMEOBOX PROTEIN HOX-B1/DNA TERNARY COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0207 <- 2.59 -> DT O2 D0011 : score 4.41113 : H : ASN OD1 A0253 <- 3.07 -> DA N6 D0013 : score 5.69662 : H : ASN ND2 A0253 <- 2.99 -> DA N7 D0013 : score 5.64743 : w : ASN OD1 A0253 <- 5.68 -> DT O4 D0014 : score 3.132 : w : ASN OD1 A0253 <- 5.98 -> DA N6 E0028 : score 2.837 : H : ASN OD1 B0286 <- 2.84 -> DA N6 D0009 : score 5.97362 : H : ASN ND2 B0286 <- 2.96 -> DA N7 D0009 : score 5.68266 : w : ASN OD1 B0286 <- 6.23 -> DT O4 D0010 : score 3.132 : w : ASN OD1 B0286 <- 5.85 -> DA N6 E0032 : score 2.837 : H : ARG NH1 B0290 <- 3.07 -> DG N7 D0008 : score 5.7233 : H : ARG NH2 B0290 <- 2.65 -> DG O6 D0008 : score 6.798 : V : ASN CG B0282 <- 3.89 -> DT C7 D0010 : score 2.58862 : x : ILE xxxx A0249 <- 3.72 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0252 <- 3.65 -> DC xxx E0026 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0256 <- 3.48 -> DG xxx E0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0237 <- 2.70 -> DT xxx E0036 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0289 <- 4.10 -> DA xxx E0031 : score x.xxxxx >1b8i_A:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF THE HOMEOTIC UBX/EXD/DNA TERNARY COMPLEX organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH1 A0105 <- 2.90 -> DA N3 C0011 : score 3.60841 : w : GLN NE2 A0150 <- 5.79 -> DT O4 D0026 : score 2.257 : H : ASN ND2 A0151 <- 3.24 -> DA N7 D0025 : score 5.35391 : w : ASN OD1 A0151 <- 5.93 -> DT O4 D0026 : score 3.132 : w : ASN OD1 A0151 <- 6.17 -> DA N6 C0007 : score 2.837 : V : ILE CG1 A0147 <- 3.61 -> DT C7 D0026 : score 5.19453 : x : MET xxxx A0154 <- 3.83 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >1b8i_AB:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF THE HOMEOTIC UBX/EXD/DNA TERNARY COMPLEX organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH1 A0105 <- 2.90 -> DA N3 C0011 : score 3.60841 : w : GLN NE2 A0150 <- 5.79 -> DT O4 D0026 : score 2.257 : H : ASN ND2 A0151 <- 3.24 -> DA N7 D0025 : score 5.35391 : w : ASN OD1 A0151 <- 5.93 -> DT O4 D0026 : score 3.132 : w : ASN OD1 A0151 <- 6.17 -> DA N6 C0007 : score 2.837 : H : ARG NH2 B0205 <- 2.29 -> DT O2 D0019 : score 4.66513 : H : ARG NH1 B0258 <- 2.98 -> DG N7 D0020 : score 5.8322 : H : ARG NH2 B0258 <- 2.49 -> DG O6 D0020 : score 7.0092 : V : ILE CG1 A0147 <- 3.61 -> DT C7 D0026 : score 5.19453 : x : MET xxxx A0154 <- 3.83 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0250 <- 3.69 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0254 <- 2.83 -> DA xxx D0021 : score x.xxxxx >1b94_A:Restriction_endonuclease-like; title=RESTRICTION ENDONUCLEASE ECORV WITH CALCIUM organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 3.07 -> DC O2 D0009 : score 4.2376 : w : ASN OD1 A0070 <- 5.81 -> DT O2 C0006 : score 1.953 : w : LYS NZ A0104 <- 6.01 -> DT O4 C0011 : score 1.7 : H : ASN OD1 A0185 <- 3.06 -> DA N6 D0005 : score 5.70866 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.98 -> DA N7 D0005 : score 5.65917 : H : THR OG1 A0186 <- 2.60 -> DT O4 C0008 : score 4.04267 : V : THR CB A0106 <- 3.90 -> DT C7 C0008 : score 3.438 : x : SER xxxx A0183 <- 3.30 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.45 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >1b94_AB:Restriction_endonuclease-like; title=RESTRICTION ENDONUCLEASE ECORV WITH CALCIUM organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 3.07 -> DC O2 D0009 : score 4.2376 : w : LYS NZ A0104 <- 6.01 -> DT O4 C0011 : score 1.7 : H : ASN OD1 A0185 <- 3.06 -> DA N6 D0005 : score 5.70866 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.98 -> DA N7 D0005 : score 5.65917 : H : THR OG1 A0186 <- 2.60 -> DT O4 C0008 : score 4.04267 : w : LYS NZ B0038 <- 6.10 -> DT O2 C0006 : score 0.522 : w : LYS NZ B0104 <- 5.33 -> DT O4 D0010 : score 1.7 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.84 -> DA N6 C0005 : score 5.97362 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.90 -> DA N7 C0005 : score 5.7531 : H : THR OG1 B0186 <- 2.58 -> DT O4 D0008 : score 4.05822 : V : THR CB A0106 <- 3.90 -> DT C7 C0008 : score 3.438 : V : ASN CG B0188 <- 3.58 -> DT C7 D0008 : score 2.79386 : x : SER xxxx A0183 <- 3.30 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.45 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0070 <- 2.98 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.77 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.27 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1b95_AB:Restriction_endonuclease-like; title=ANALYSIS OF A MUTATIONAL HOT-SPOT IN THE ECORV RESTRICTION ENDONUCLEASE: A CATALYTIC ROLE FOR A MAIN CHAIN CARBONYL GROUP organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 2.88 -> DC O2 D0009 : score 4.40782 A : H : ASN OD1 A0185 <- 3.02 -> DA N6 D0005 : score 5.75684 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.91 -> DA N7 D0005 : score 5.74136 : H : THR OG1 A0186 <- 2.58 -> DT O4 C0008 : score 4.05822 : w : LYS NZ B0038 <- 5.64 -> DT O2 C0006 : score 0.522 : w : LYS NZ B0104 <- 5.80 -> DT O4 D0011 : score 1.7 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.86 -> DA N6 C0005 : score 5.94953 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.89 -> DA N7 C0005 : score 5.76484 : H : THR OG1 B0186 <- 2.61 -> DT O4 D0008 : score 4.03489 : V : ASN CG B0188 <- 3.56 -> DT C7 D0008 : score 2.8071 : V : THR CB A0106 <- 3.87 -> DT C7 C0008 : score 3.46445 : x : LYS xxxx A0104 <- 4.02 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.06 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.33 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0070 <- 3.31 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.74 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.22 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1b95_B:Restriction_endonuclease-like; title=ANALYSIS OF A MUTATIONAL HOT-SPOT IN THE ECORV RESTRICTION ENDONUCLEASE: A CATALYTIC ROLE FOR A MAIN CHAIN CARBONYL GROUP organism=Escherichia coli : w : LYS NZ B0038 <- 5.64 -> DT O2 C0006 : score 0.522 : w : LYS NZ B0104 <- 5.80 -> DT O4 D0011 : score 1.7 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.86 -> DA N6 C0005 : score 5.94953 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.89 -> DA N7 C0005 : score 5.76484 : H : THR OG1 B0186 <- 2.61 -> DT O4 D0008 : score 4.03489 : V : ASN CG B0188 <- 3.56 -> DT C7 D0008 : score 2.8071 : x : ASN xxxx B0070 <- 3.31 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.74 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.22 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1b96_A:Restriction_endonuclease-like; title=ANALYSIS OF A MUTATIONAL HOT-SPOT IN THE ECORV RESTRICTION ENDONUCLEASE: A CATALYTIC ROLE FOR A MAIN CHAIN CARBONYL GROUP organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 2.92 -> DC O2 D0009 : score 4.37198 : w : ASN OD1 A0070 <- 5.60 -> DT O2 C0006 : score 1.953 : H : ASN OD1 A0185 <- 3.02 -> DA N6 D0005 : score 5.75684 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.98 -> DA N7 D0005 : score 5.65917 : H : THR OG1 A0186 <- 2.62 -> DT O4 C0008 : score 4.02712 : V : ASN CG A0188 <- 3.62 -> DT C7 C0008 : score 2.76737 : x : LYS xxxx A0104 <- 3.80 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0106 <- 3.46 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.13 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >1b96_AB:Restriction_endonuclease-like; title=ANALYSIS OF A MUTATIONAL HOT-SPOT IN THE ECORV RESTRICTION ENDONUCLEASE: A CATALYTIC ROLE FOR A MAIN CHAIN CARBONYL GROUP organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 2.92 -> DC O2 D0009 : score 4.37198 : H : ASN OD1 A0185 <- 3.02 -> DA N6 D0005 : score 5.75684 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.98 -> DA N7 D0005 : score 5.65917 : H : THR OG1 A0186 <- 2.62 -> DT O4 C0008 : score 4.02712 : w : LYS NZ B0038 <- 5.93 -> DT O2 C0006 : score 0.522 : w : LYS NZ B0104 <- 5.70 -> DT O4 D0011 : score 1.7 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.88 -> DA N6 C0005 : score 5.92545 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.94 -> DA N7 C0005 : score 5.70614 : H : THR OG1 B0186 <- 2.74 -> DT O4 D0008 : score 3.93383 : V : ASN CG A0188 <- 3.62 -> DT C7 C0008 : score 2.76737 : V : ASN CG B0188 <- 3.64 -> DT C7 D0008 : score 2.75413 : x : LYS xxxx A0104 <- 3.80 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0106 <- 3.46 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.13 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0070 <- 3.38 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.62 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.27 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1b97_AB:Restriction_endonuclease-like; title=ANALYSIS OF A MUTATIONAL HOT-SPOT IN THE ECORV RESTRICTION ENDONUCLEASE: A CATALYTIC ROLE FOR A MAIN CHAIN CARBONYL GROUP organism=Escherichia coli : w : ASN OD1 A0070 <- 6.00 -> DT O2 C0006 : score 1.953 : w : ASN ND2 A0070 <- 5.78 -> DT O2 C0006 : score 1.666 : H : ASN OD1 A0185 <- 3.02 -> DA N6 D0005 : score 5.75684 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.98 -> DA N7 D0005 : score 5.65917 : H : THR OG1 A0186 <- 2.64 -> DT O4 C0008 : score 4.01157 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.89 -> DA N6 C0005 : score 5.9134 : H : ASN ND2 B0185 <- 3.05 -> DA N7 C0005 : score 5.57699 : H : THR OG1 B0186 <- 2.55 -> DT O4 D0008 : score 4.08154 : V : ASN CG B0188 <- 3.55 -> DT C7 D0008 : score 2.81372 : V : ASN CG A0188 <- 3.59 -> DT C7 C0008 : score 2.78724 : x : LYS xxxx A0104 <- 4.17 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0106 <- 3.65 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.26 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0070 <- 3.31 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0104 <- 4.12 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.75 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.40 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1b97_B:Restriction_endonuclease-like; title=ANALYSIS OF A MUTATIONAL HOT-SPOT IN THE ECORV RESTRICTION ENDONUCLEASE: A CATALYTIC ROLE FOR A MAIN CHAIN CARBONYL GROUP organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 B0185 <- 2.89 -> DA N6 C0005 : score 5.9134 : H : ASN ND2 B0185 <- 3.05 -> DA N7 C0005 : score 5.57699 : H : THR OG1 B0186 <- 2.55 -> DT O4 D0008 : score 4.08154 : V : ASN CG B0188 <- 3.55 -> DT C7 D0008 : score 2.81372 : x : ASN xxxx B0070 <- 3.31 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0104 <- 4.12 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.75 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.40 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1bbx_C:Chromo_domain-like; title=NON-SPECIFIC PROTEIN-DNA INTERACTIONS IN THE SSO7D-DNA COMPLEX, NMR, 1 STRUCTURE organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : H : LYS NZ C0027 <- 2.41 -> DC O2 A0005 : score 3.17595 : H : ARG NH2 C0042 <- 2.68 -> DG N3 A0004 : score 3.6969 : x : TRP xxxx C0023 <- 3.53 -> DC xxx B0021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0025 <- 2.60 -> DG xxx B0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0030 <- 4.36 -> DG xxx B0020 : score x.xxxxx >1bbx_CD:Chromo_domain-like; title=NON-SPECIFIC PROTEIN-DNA INTERACTIONS IN THE SSO7D-DNA COMPLEX, NMR, 1 STRUCTURE organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : H : LYS NZ C0027 <- 2.41 -> DC O2 A0005 : score 3.17595 : H : ARG NH2 C0042 <- 2.68 -> DG N3 A0004 : score 3.6969 : H : LYS NZ D0027 <- 2.41 -> DC O2 B0017 : score 3.17595 : H : ARG NH2 D0042 <- 2.67 -> DG N3 B0016 : score 3.70412 : x : TRP xxxx C0023 <- 3.53 -> DC xxx B0021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0025 <- 2.60 -> DG xxx B0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0030 <- 4.36 -> DG xxx B0020 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0023 <- 3.53 -> DC xxx A0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0025 <- 2.60 -> DG xxx A0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0030 <- 4.35 -> DG xxx A0008 : score x.xxxxx >1bc7_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=SERUM RESPONSE FACTOR ACCESSORY PROTEIN 1A (SAP-1)/DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NE C0061 <- 2.69 -> DG O6 A0006 : score 4.02773 : H : ARG NH2 C0061 <- 3.00 -> DG N7 A0006 : score 6.12923 : H : TYR OH C0065 <- 3.00 -> DA N6 B0015 : score 4.48369 : H : TYR OH C0065 <- 3.01 -> DA N6 A0007 : score 4.47435 : w : TYR OH C0065 <- 5.46 -> DT O4 A0008 : score 2.914 : w : TYR OH C0065 <- 6.05 -> DA N7 A0007 : score 3.238 : x : LYS xxxx C0058 <- 3.93 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0064 <- 3.13 -> DG xxx A0005 : score x.xxxxx >1bc8_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURES OF SAP-1 BOUND TO DNA SEQUENCES FROM THE E74 AND C-FOS PROMOTERS PROVIDE INSIGHTS INTO HOW ETS PROTEINS DISCRIMINATE BETWEEN RELATED DNA TARGETS organism=Homo sapiens : w : ASP OD1 C0057 <- 5.89 -> DC N4 A0004 : score 2.835 : w : ASP OD1 C0057 <- 6.18 -> DC N4 B0016 : score 2.835 : H : ARG NE C0061 <- 2.87 -> DG O6 A0006 : score 3.88585 : H : ARG NH2 C0061 <- 2.99 -> DG N7 A0006 : score 6.142 : H : ARG NE C0064 <- 2.87 -> DG N7 A0005 : score 4.35989 : H : ARG NH2 C0064 <- 2.98 -> DG O6 A0005 : score 6.3624 : w : ARG NH2 C0064 <- 5.92 -> DC N4 A0004 : score 0.976 : H : TYR OH C0065 <- 3.03 -> DA N6 A0007 : score 4.45567 : w : TYR OH C0065 <- 5.29 -> DA N7 A0007 : score 3.238 : x : LYS xxxx C0058 <- 3.63 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0062 <- 4.27 -> DT xxx B0014 : score x.xxxxx >1bdh_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PURINE REPRESSOR MUTANT-HYPOXANTHINE-PALINDROMIC OPERATOR COMPLEX organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0016 <- 2.83 -> DC N4 B0703 : score 4.00913 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.78 -> DG O6 B0702 : score 6.10767 : H : ARG NH2 A0026 <- 2.89 -> DG N7 B0702 : score 6.26969 : x : SER xxxx A0014 <- 4.06 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.59 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0055 <- 3.87 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx >1bdi_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PURINE REPRESSOR MUTANT-HYPOXANTHINE-PALINDROMIC OPERATOR COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : THR OG1 A0016 <- 3.25 -> DC N4 B0703 : score 3.67033 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.83 -> DG O6 B0702 : score 6.04683 : H : ARG NH2 A0026 <- 2.93 -> DG N7 B0702 : score 6.21862 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.21 -> DG O6 B0702 : score 6.0588 : x : SER xxxx A0014 <- 4.10 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.47 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 3.39 -> DA xxx B0706 : score x.xxxxx >1bdt_ABCD:Ribbon-helix-helix; title=WILD TYPE GENE-REGULATING PROTEIN ARC/DNA COMPLEX organism=Enterobacteria phage P22 : H : GLN OE1 A0009 <- 2.81 -> DA N6 F0018 : score 6.04046 : H : ASN OD1 A0011 <- 2.79 -> DC N4 F0016 : score 4.20198 : H : ARG NH2 A0013 <- 2.74 -> DG O6 E0008 : score 6.6792 : H : GLN OE1 B0009 <- 2.86 -> DA N6 E0007 : score 5.97993 : H : GLN NE2 B0009 <- 3.07 -> DA N7 E0007 : score 5.7609 : H : ARG NH1 B0013 <- 3.15 -> DA N7 E0004 : score 2.38104 : w : ARG NH2 B0013 <- 5.67 -> DG O6 E0005 : score 2.468 : H : ASN OD1 C0011 <- 2.70 -> DC N4 E0016 : score 4.27746 : H : ARG NH2 C0013 <- 2.68 -> DG O6 F0008 : score 6.7584 : H : GLN OE1 D0009 <- 3.05 -> DA N6 F0007 : score 5.74994 : H : GLN NE2 D0009 <- 2.92 -> DA N7 F0007 : score 5.94359 : H : ASN ND2 D0011 <- 2.65 -> DT O4 F0006 : score 5.44315 : V : MET CG C0004 <- 3.66 -> DT C7 F0003 : score 6.00618 : V : MET CE B0004 <- 3.83 -> DT C7 F0015 : score 6.87828 : V : MET CE A0004 <- 3.86 -> DT C7 E0003 : score 6.8263 : x : SER xxxx B0005 <- 4.36 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0011 <- 3.19 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0005 <- 3.58 -> DA xxx F0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0009 <- 3.12 -> DA xxx E0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0004 <- 3.90 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0005 <- 3.29 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0013 <- 3.46 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx >1bdt_C:Ribbon-helix-helix; title=WILD TYPE GENE-REGULATING PROTEIN ARC/DNA COMPLEX organism=Enterobacteria phage P22 : H : ASN OD1 C0011 <- 2.70 -> DC N4 E0016 : score 4.27746 : H : ARG NH2 C0013 <- 2.68 -> DG O6 F0008 : score 6.7584 : V : MET CG C0004 <- 3.66 -> DT C7 F0003 : score 6.00618 : x : SER xxxx C0005 <- 3.58 -> DA xxx F0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0009 <- 3.12 -> DA xxx E0018 : score x.xxxxx >1bdv_ABCD:Ribbon-helix-helix; title=ARC FV10 COCRYSTAL organism=Enterobacteria phage P22 : H : GLN OE1 A0009 <- 2.94 -> DA N6 F0018 : score 5.88309 : H : ASN OD1 A0011 <- 2.89 -> DC N4 F0016 : score 4.1181 : H : ARG NH2 A0013 <- 2.87 -> DG O6 E0008 : score 6.5076 : H : GLN OE1 B0009 <- 2.74 -> DA N6 E0007 : score 6.1252 : H : GLN NE2 B0009 <- 3.04 -> DA N7 E0007 : score 5.79744 : H : ASN OD1 C0011 <- 2.76 -> DC N4 E0016 : score 4.22714 : H : ARG NH2 C0013 <- 2.85 -> DG O6 F0008 : score 6.534 : H : GLN OE1 D0009 <- 3.03 -> DA N6 F0007 : score 5.77415 : H : GLN NE2 D0009 <- 3.05 -> DA N7 F0007 : score 5.78526 : H : ASN ND2 D0011 <- 2.66 -> DT O4 F0006 : score 5.43258 : x : MET xxxx B0004 <- 3.57 -> DC xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0005 <- 4.35 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0011 <- 3.10 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0013 <- 2.81 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0009 <- 3.44 -> DA xxx E0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0004 <- 4.08 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0005 <- 3.56 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0013 <- 3.80 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx >1bdv_D:Ribbon-helix-helix; title=ARC FV10 COCRYSTAL organism=Enterobacteria phage P22 : H : GLN OE1 D0009 <- 3.03 -> DA N6 F0007 : score 5.77415 : H : GLN NE2 D0009 <- 3.05 -> DA N7 F0007 : score 5.78526 : H : ASN ND2 D0011 <- 2.66 -> DT O4 F0006 : score 5.43258 : x : MET xxxx D0004 <- 4.08 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0005 <- 3.56 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0013 <- 3.80 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx >1bf4_A:Chromo_domain-like; title=CHROMOSOMAL DNA-BINDING PROTEIN SSO7D/D(GCGAACGC) COMPLEX organism=Sulfolobus acidocaldarius : w : TYR OH A0008 <- 5.48 -> DA N3 C0113 : score 1.448 : w : LYS NZ A0009 <- 6.12 -> DA N3 C0112 : score 1.538 : H : TRP NE1 A0024 <- 2.93 -> DG N3 B0103 : score -8.87464 : H : SER OG A0031 <- 2.85 -> DG N2 B0103 : score 3.34062 : w : SER OG A0031 <- 6.38 -> DC O2 C0114 : score 1.768 : H : ARG NH1 A0043 <- 2.91 -> DC O2 B0106 : score 3.5697 : w : ARG NH2 A0043 <- 5.42 -> DC O2 B0106 : score 1.669 : x : VAL xxxx A0026 <- 3.30 -> DC xxx B0102 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0029 <- 3.56 -> DC xxx C0114 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0045 <- 4.46 -> DC xxx C0114 : score x.xxxxx >1bf5_A:p53-like_transcription_factors;SH2_domain;STAT; title=TYROSINE PHOSPHORYLATED STAT-1/DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 A0421 <- 2.37 -> DG N2 C2002 : score 4.68094 : H : ASN ND2 A0460 <- 2.35 -> DT O4 B1012 : score 5.76023 : H : ASN ND2 A0460 <- 2.79 -> DT O4 C2007 : score 5.29518 : V : SER CB A0462 <- 3.89 -> DT C7 B1012 : score 3.06083 : x : LYS xxxx A0336 <- 3.72 -> DC xxx B1010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0459 <- 3.70 -> DT xxx C2006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0461 <- 4.12 -> DG xxx B1011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0463 <- 4.03 -> DT xxx C2006 : score x.xxxxx >1bg1_A:p53-like_transcription_factors;STAT;SH2_domain; title=TRANSCRIPTION FACTOR STAT3B/DNA COMPLEX organism=Mus musculus : H : ASN ND2 A0466 <- 2.89 -> DT O4 B1007 : score 5.18949 : x : SER xxxx A0465 <- 3.34 -> DT xxx B1006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0469 <- 4.25 -> DT xxx B1006 : score x.xxxxx >1bgb_A:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV ENDONUCLEASE COMPLEX WITH 5'-CGGGATATCCC DNA organism=Escherichia coli : w : GLN NE2 A0069 <- 5.88 -> DT O2 D0906 : score 1.565 : H : ASN OD1 A0185 <- 3.09 -> DA N6 C0805 : score 5.67253 : H : THR OG1 A0186 <- 2.57 -> DT O4 D0908 : score 4.06599 : V : THR CB A0106 <- 3.78 -> DT C7 D0908 : score 3.54378 : x : SER xxxx A0183 <- 3.36 -> DG xxx C0804 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.51 -> DT xxx D0908 : score x.xxxxx >1bgb_AB:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV ENDONUCLEASE COMPLEX WITH 5'-CGGGATATCCC DNA organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 A0185 <- 3.09 -> DA N6 C0805 : score 5.67253 : H : THR OG1 A0186 <- 2.57 -> DT O4 D0908 : score 4.06599 : w : LYS NZ B0104 <- 5.73 -> DC N4 C0810 : score 0.048 : H : ASN OD1 B0185 <- 3.02 -> DA N6 D0905 : score 5.75684 : H : ASN ND2 B0185 <- 3.15 -> DA N7 D0905 : score 5.45958 : H : THR OG1 B0186 <- 2.77 -> DT O4 C0808 : score 3.9105 : V : THR CB A0106 <- 3.78 -> DT C7 D0908 : score 3.54378 : V : THR CG2 B0106 <- 3.82 -> DT C7 C0808 : score 4.21574 : x : SER xxxx A0183 <- 3.36 -> DG xxx C0804 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.51 -> DT xxx D0908 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0070 <- 3.17 -> DC xxx D0909 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.42 -> DC xxx C0809 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.76 -> DT xxx C0808 : score x.xxxxx >1bhm_A:Restriction_endonuclease-like; title=RESTRICTION ENDONUCLEASE BAMHI COMPLEX WITH DNA organism=Bacillus amyloliquefaciens : H : ASN ND2 A0116 <- 2.84 -> DG O6 C0005 : score 5.59335 : H : ASN ND2 A0116 <- 2.93 -> DT O4 D0007 : score 5.14722 : H : ASP OD2 A0154 <- 2.92 -> DC N4 D0009 : score 6.0512 : w : ASP OD1 A0154 <- 5.60 -> DT O4 C0003 : score 2.616 : H : ARG NE A0155 <- 2.59 -> DG O6 C0004 : score 4.10655 : H : ARG NH2 A0155 <- 2.95 -> DG N7 C0004 : score 6.19308 : H : ASP OD2 A0196 <- 3.08 -> DG N2 D0005 : score 5.15327 : x : ARG xxxx A0122 <- 4.09 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0153 <- 3.85 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0156 <- 4.33 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0198 <- 4.46 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >1bhm_AB:Restriction_endonuclease-like; title=RESTRICTION ENDONUCLEASE BAMHI COMPLEX WITH DNA organism=Bacillus amyloliquefaciens : H : ASN ND2 A0116 <- 2.84 -> DG O6 C0005 : score 5.59335 : H : ASN ND2 A0116 <- 2.93 -> DT O4 D0007 : score 5.14722 : H : ASP OD2 A0154 <- 2.92 -> DC N4 D0009 : score 6.0512 : w : ASP OD1 A0154 <- 5.60 -> DT O4 C0003 : score 2.616 : H : ARG NE A0155 <- 2.59 -> DG O6 C0004 : score 4.10655 : H : ARG NH2 A0155 <- 2.95 -> DG N7 C0004 : score 6.19308 : H : ASP OD2 A0196 <- 3.08 -> DG N2 D0005 : score 5.15327 : w : LYS NZ B0052 <- 5.62 -> DT O4 D0003 : score 1.7 : H : ASN ND2 B0116 <- 2.81 -> DT O4 C0007 : score 5.27405 : H : ASN ND2 B0116 <- 2.96 -> DG O6 D0005 : score 5.45803 : H : ASP OD2 B0154 <- 2.90 -> DC N4 C0009 : score 6.076 : w : ASP OD1 B0154 <- 5.34 -> DT O4 D0003 : score 2.616 : w : ASP OD2 B0154 <- 6.95 -> DT O4 D0003 : score 2.798 : H : ARG NE B0155 <- 3.38 -> DG N7 D0004 : score 3.90887 : H : ARG NE B0155 <- 3.13 -> DG O6 D0004 : score 3.68092 : H : ARG NH2 B0155 <- 3.22 -> DG N7 D0004 : score 5.84831 : x : ARG xxxx A0122 <- 4.09 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0153 <- 3.85 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0156 <- 4.33 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0198 <- 4.46 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0122 <- 4.03 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0153 <- 3.52 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0156 <- 4.20 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >1bl0_A:Homeodomain-like; title=MULTIPLE ANTIBIOTIC RESISTANCE PROTEIN (MARA)/DNA COMPLEX organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0046 <- 2.66 -> DG O6 B0420 : score 6.7848 : H : ARG NH2 A0046 <- 2.90 -> DG O6 C0430 : score 6.468 : H : ARG NH1 A0096 <- 2.91 -> DG O6 B0410 : score 5.9495 : H : ARG NH1 A0096 <- 3.09 -> DG O6 C0440 : score 5.7305 : H : ARG NH2 A0096 <- 2.80 -> DG N7 C0440 : score 6.38462 : V : THR CG2 A0095 <- 3.76 -> DT C7 B0408 : score 4.27929 : x : SER xxxx A0040 <- 4.09 -> DG xxx C0430 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0042 <- 3.14 -> DC xxx C0432 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0043 <- 4.47 -> DT xxx C0429 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0045 <- 3.19 -> DG xxx B0417 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0091 <- 3.88 -> DT xxx B0406 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0092 <- 3.29 -> DT xxx B0407 : score x.xxxxx >1bnk_A:FMT_C-terminal_domain-like; title=HUMAN 3-METHYLADENINE DNA GLYCOSYLASE COMPLEXED TO DNA organism=Homo sapiens : w : TYR OH A0165 <- 5.99 -> DT O2 D0009 : score 3.068 : x : TYR xxxx A0162 <- 3.11 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0164 <- 3.74 -> DT xxx E0019 : score x.xxxxx >1bnz_A:Chromo_domain-like; title=SSO7D HYPERTHERMOPHILE PROTEIN/DNA COMPLEX organism=SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS : w : TYR OH A0008 <- 5.42 -> DA N3 C0077 : score 1.448 : H : TRP NE1 A0024 <- 3.10 -> DA N3 B0069 : score -8.56485 : H : SER OG A0031 <- 3.35 -> DT O2 C0078 : score 3.29072 : H : ARG NH1 A0043 <- 2.58 -> DT O2 B0071 : score 4.49589 : x : VAL xxxx A0026 <- 3.61 -> DA xxx B0068 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0029 <- 3.41 -> DT xxx C0078 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0045 <- 4.20 -> DT xxx C0078 : score x.xxxxx >1bp7_AB:Homing_endonucleases; title=GROUP I MOBILE INTRON ENDONUCLEASE I-CREI COMPLEXED WITH HOMING SITE DNA organism=Chlamydomonas reinhardtii : H : LYS NZ A0028 <- 2.52 -> DG O6 10019 : score 6.10449 : H : SER OG A0032 <- 3.09 -> DG N7 20002 : score 4.22209 : H : SER OG A0032 <- 3.34 -> DG O6 20002 : score 3.64919 : H : TYR OH A0033 <- 2.74 -> DA N7 20003 : score 4.2011 : H : TYR OH A0033 <- 2.86 -> DA N6 20003 : score 4.61447 : H : GLN OE1 A0038 <- 3.43 -> DA N6 20004 : score 5.28994 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.91 -> DA N7 20004 : score 5.95577 : H : GLN NE2 A0044 <- 3.31 -> DA N7 10016 : score 5.46859 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.12 -> DG N7 20008 : score 5.6628 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.71 -> DG O6 20008 : score 6.7188 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.99 -> DG O6 10015 : score 5.85217 : H : ARG NH2 A0070 <- 3.34 -> DG N7 10015 : score 5.69508 : H : LYS NZ B0028 <- 2.69 -> DT O4 20019 : score 3.6661 : H : ASN ND2 B0030 <- 3.05 -> DT O4 20021 : score 5.02038 : H : TYR OH B0033 <- 2.60 -> DA N7 10003 : score 4.31733 : H : TYR OH B0033 <- 2.80 -> DA N6 10003 : score 4.67051 : H : GLN OE1 B0038 <- 3.33 -> DA N6 10004 : score 5.41099 : H : GLN NE2 B0038 <- 2.73 -> DA N7 10004 : score 6.175 : H : GLN NE2 B0044 <- 3.22 -> DA N7 20016 : score 5.57821 : H : ARG NH1 B0068 <- 3.21 -> DG N7 10008 : score 5.5539 : H : ARG NH2 B0068 <- 2.64 -> DG O6 10008 : score 6.8112 : H : ARG NH1 B0070 <- 2.69 -> DG O6 20015 : score 6.21717 : H : ARG NH2 B0070 <- 3.15 -> DG N7 20015 : score 5.93769 : x : SER xxxx A0022 <- 4.34 -> DA xxx 10016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 4.25 -> DC xxx 10017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0026 <- 3.02 -> DA xxx 10018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0030 <- 3.48 -> DT xxx 10021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.76 -> DG xxx 10015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 4.32 -> DC xxx 20006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.90 -> DG xxx 10013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 4.43 -> DT xxx 20011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0140 <- 4.11 -> DA xxx 10016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0022 <- 4.21 -> DA xxx 20016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0024 <- 3.63 -> DA xxx 20016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0026 <- 2.86 -> DG xxx 20018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0032 <- 3.04 -> DC xxx 10002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0046 <- 4.07 -> DG xxx 20015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0066 <- 4.37 -> DA xxx 10006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0073 <- 3.91 -> DC xxx 20014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0075 <- 4.41 -> DA xxx 20016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0140 <- 3.79 -> DC xxx 10010 : score x.xxxxx >1bp7_CD:Homing_endonucleases; title=GROUP I MOBILE INTRON ENDONUCLEASE I-CREI COMPLEXED WITH HOMING SITE DNA organism=Chlamydomonas reinhardtii : H : LYS NZ C0028 <- 2.51 -> DT O4 40019 : score 3.79524 : H : ASN ND2 C0030 <- 3.04 -> DT O4 40021 : score 5.03095 : H : SER OG C0032 <- 2.97 -> DC N4 30002 : score 3.55067 : H : TYR OH C0033 <- 2.55 -> DA N7 30003 : score 4.35885 : H : TYR OH C0033 <- 2.72 -> DA N6 30003 : score 4.74524 : H : GLN OE1 C0038 <- 3.35 -> DA N6 30004 : score 5.38678 : H : GLN NE2 C0038 <- 2.83 -> DA N7 30004 : score 6.05321 : H : GLN NE2 C0044 <- 3.23 -> DA N7 40016 : score 5.56603 : H : ARG NH1 C0068 <- 3.34 -> DG N7 30008 : score 5.3966 : H : ARG NH2 C0068 <- 2.76 -> DG O6 30008 : score 6.6528 : H : ARG NH1 C0070 <- 2.84 -> DG O6 40015 : score 6.03467 : H : ARG NH2 C0070 <- 3.32 -> DG N7 40015 : score 5.72062 : H : LYS NZ D0028 <- 2.59 -> DG O6 30019 : score 6.02356 : H : SER OG D0032 <- 3.07 -> DG N7 40002 : score 4.24002 : H : TYR OH D0033 <- 2.80 -> DA N7 40003 : score 4.15128 : H : TYR OH D0033 <- 2.96 -> DA N6 40003 : score 4.52106 : H : GLN OE1 D0038 <- 3.34 -> DA N6 40004 : score 5.39889 : H : GLN NE2 D0038 <- 2.98 -> DA N7 40004 : score 5.87051 : H : GLN NE2 D0044 <- 3.07 -> DA N7 30016 : score 5.7609 : H : ARG NH1 D0068 <- 3.33 -> DG N7 40008 : score 5.4087 : H : ARG NH2 D0068 <- 2.74 -> DG O6 40008 : score 6.6792 : H : ARG NH1 D0070 <- 2.90 -> DG O6 30015 : score 5.96167 : H : ARG NH2 D0070 <- 3.20 -> DG N7 30015 : score 5.87385 : x : SER xxxx C0022 <- 4.09 -> DA xxx 40016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0024 <- 3.63 -> DA xxx 40016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0026 <- 2.94 -> DG xxx 40018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0046 <- 4.02 -> DG xxx 40015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0066 <- 4.23 -> DA xxx 30006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0073 <- 3.70 -> DC xxx 40014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0075 <- 4.46 -> DA xxx 40016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0139 <- 4.35 -> DG xxx 40015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0140 <- 3.81 -> DC xxx 30010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0022 <- 4.25 -> DA xxx 30016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0024 <- 4.07 -> DA xxx 30016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0026 <- 3.06 -> DA xxx 30018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0030 <- 3.33 -> DT xxx 30021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0046 <- 3.73 -> DG xxx 30015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0066 <- 4.31 -> DC xxx 40006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0073 <- 4.03 -> DG xxx 30013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0139 <- 4.22 -> DT xxx 40011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0140 <- 4.14 -> DC xxx 40010 : score x.xxxxx >1bp7_D:Homing_endonucleases; title=GROUP I MOBILE INTRON ENDONUCLEASE I-CREI COMPLEXED WITH HOMING SITE DNA organism=Chlamydomonas reinhardtii : H : LYS NZ D0028 <- 2.59 -> DG O6 30019 : score 6.02356 : H : SER OG D0032 <- 3.07 -> DG N7 40002 : score 4.24002 : H : TYR OH D0033 <- 2.80 -> DA N7 40003 : score 4.15128 : H : TYR OH D0033 <- 2.96 -> DA N6 40003 : score 4.52106 : H : GLN OE1 D0038 <- 3.34 -> DA N6 40004 : score 5.39889 : H : GLN NE2 D0038 <- 2.98 -> DA N7 40004 : score 5.87051 : H : GLN NE2 D0044 <- 3.07 -> DA N7 30016 : score 5.7609 : H : ARG NH1 D0068 <- 3.33 -> DG N7 40008 : score 5.4087 : H : ARG NH2 D0068 <- 2.74 -> DG O6 40008 : score 6.6792 : H : ARG NH1 D0070 <- 2.90 -> DG O6 30015 : score 5.96167 : H : ARG NH2 D0070 <- 3.20 -> DG N7 30015 : score 5.87385 : x : SER xxxx D0022 <- 4.25 -> DA xxx 30016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0024 <- 4.07 -> DA xxx 30016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0026 <- 3.06 -> DA xxx 30018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0030 <- 3.33 -> DT xxx 30021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0046 <- 3.73 -> DG xxx 30015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0066 <- 4.31 -> DC xxx 40006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0073 <- 4.03 -> DG xxx 30013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0139 <- 4.22 -> DT xxx 40011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0140 <- 4.14 -> DC xxx 40010 : score x.xxxxx >1bpx_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA/DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : w : ASN OD1 A0037 <- 6.75 -> DC O2 T0005 : score 2.172 : x : HIS xxxx A0034 <- 3.38 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.96 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.64 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >1bpy_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH GAPPED DNA AND DDCTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.37 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.16 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.71 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >1bpz_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH NICKED DNA organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0271 <- 2.29 -> DG N2 P0011 : score 5.3885 : x : LYS xxxx A0234 <- 3.83 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx >1bss_AB:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV-T93A/DNA/CA2+ organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 2.91 -> DC O2 D0809 : score 4.38094 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.66 -> DA N6 D0805 : score 6.1904 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.66 -> DA N7 D0805 : score 6.03489 : H : THR OG1 A0186 <- 2.92 -> DT O4 C0908 : score 3.79389 : H : ASN ND2 B0070 <- 2.86 -> DC O2 C0909 : score 4.42573 : w : LYS NZ B0104 <- 6.39 -> DT O4 D0810 : score 1.7 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.91 -> DA N6 C0905 : score 5.88932 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.94 -> DA N7 C0905 : score 5.70614 : H : THR OG1 B0186 <- 2.73 -> DT O4 D0808 : score 3.9416 : V : ASN CG B0188 <- 3.59 -> DT C7 D0808 : score 2.78724 : x : THR xxxx A0106 <- 3.51 -> DT xxx C0908 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.16 -> DT xxx C0908 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 2.99 -> DT xxx C0908 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.59 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.17 -> DG xxx C0904 : score x.xxxxx >1bss_B:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV-T93A/DNA/CA2+ organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 B0070 <- 2.86 -> DC O2 C0909 : score 4.42573 : w : LYS NZ B0104 <- 6.39 -> DT O4 D0810 : score 1.7 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.91 -> DA N6 C0905 : score 5.88932 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.94 -> DA N7 C0905 : score 5.70614 : H : THR OG1 B0186 <- 2.73 -> DT O4 D0808 : score 3.9416 : V : ASN CG B0188 <- 3.59 -> DT C7 D0808 : score 2.78724 : x : THR xxxx B0106 <- 3.59 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.17 -> DG xxx C0904 : score x.xxxxx >1bsu_AB:Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURAL AND ENERGETIC ORIGINS OF INDIRECT READOUT IN SITE-SPECIFIC DNA CLEAVAGE BY A RESTRICTION ENDONUCLEASE organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 A0185 <- 2.89 -> DA N6 D0805 : score 5.9134 : H : ASN ND2 A0185 <- 3.01 -> DA N7 D0805 : score 5.62395 : H : THR OG1 A0186 <- 2.63 -> DT O4 C0908 : score 4.01934 : H : ASN ND2 B0070 <- 2.88 -> DC O2 C0909 : score 4.40782 : w : LYS NZ B0104 <- 6.01 -> DT O4 D0810 : score 1.7 : H : ASN OD1 B0185 <- 3.05 -> DA N6 C0905 : score 5.72071 : H : ASN ND2 B0185 <- 3.24 -> DA N7 C0905 : score 5.35391 : H : THR OG1 B0186 <- 2.66 -> DT O4 D0808 : score 3.99602 : V : SER CB B0183 <- 3.84 -> DT C7 D0808 : score 3.09997 : V : ASN CG A0188 <- 3.53 -> DT C7 C0908 : score 2.82696 : x : ASN xxxx A0070 <- 3.97 -> DC xxx D0809 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0104 <- 4.42 -> DT xxx C0910 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0106 <- 3.59 -> DT xxx C0908 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.33 -> DG xxx D0804 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.63 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.53 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx >1bsu_B:Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURAL AND ENERGETIC ORIGINS OF INDIRECT READOUT IN SITE-SPECIFIC DNA CLEAVAGE BY A RESTRICTION ENDONUCLEASE organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 B0070 <- 2.88 -> DC O2 C0909 : score 4.40782 : w : LYS NZ B0104 <- 6.01 -> DT O4 D0810 : score 1.7 : H : ASN OD1 B0185 <- 3.05 -> DA N6 C0905 : score 5.72071 : H : ASN ND2 B0185 <- 3.24 -> DA N7 C0905 : score 5.35391 : H : THR OG1 B0186 <- 2.66 -> DT O4 D0808 : score 3.99602 : V : SER CB B0183 <- 3.84 -> DT C7 D0808 : score 3.09997 : x : THR xxxx B0106 <- 3.63 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.53 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx >1bua_A:Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURAL AND ENERGETIC ORIGINS OF INDIRECT READOUT IN SITE-SPECIFIC DNA CLEAVAGE BY A RESTRICTION ENDONUCLEASE organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 2.96 -> DC O2 D0809 : score 4.33614 : w : ASN OD1 A0070 <- 5.63 -> DT O2 D0808 : score 1.953 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.82 -> DA N6 D0805 : score 5.99771 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.91 -> DA N7 D0805 : score 5.74136 : H : THR OG1 A0186 <- 2.54 -> DT O4 C0908 : score 4.08931 : V : ASN CG A0188 <- 3.58 -> DT C7 C0908 : score 2.79386 : x : THR xxxx A0106 <- 3.66 -> DT xxx C0908 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.37 -> DG xxx D0804 : score x.xxxxx >1bua_AB:Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURAL AND ENERGETIC ORIGINS OF INDIRECT READOUT IN SITE-SPECIFIC DNA CLEAVAGE BY A RESTRICTION ENDONUCLEASE organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 2.96 -> DC O2 D0809 : score 4.33614 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.82 -> DA N6 D0805 : score 5.99771 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.91 -> DA N7 D0805 : score 5.74136 : H : THR OG1 A0186 <- 2.54 -> DT O4 C0908 : score 4.08931 : w : ASN OD1 B0070 <- 6.16 -> DC O2 D0806 : score 2.172 : w : ASN ND2 B0070 <- 6.24 -> DC O2 D0806 : score 1.885 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.85 -> DA N6 C0905 : score 5.96158 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.92 -> DA N7 C0905 : score 5.72962 : H : THR OG1 B0186 <- 2.54 -> DT O4 D0808 : score 4.08931 : V : ASN CG A0188 <- 3.58 -> DT C7 C0908 : score 2.79386 : V : ASN CG B0188 <- 3.64 -> DT C7 D0808 : score 2.75413 : x : THR xxxx A0106 <- 3.66 -> DT xxx C0908 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.37 -> DG xxx D0804 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0104 <- 4.08 -> DT xxx D0810 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.66 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.23 -> DG xxx C0904 : score x.xxxxx >1bvo_A:p53-like_transcription_factors; title=DORSAL HOMOLOGUE GAMBIF1 BOUND TO DNA organism=Anopheles gambiae : H : ARG NH1 A0062 <- 2.63 -> DG O6 E0025 : score 6.29017 : H : ARG NH2 A0062 <- 3.12 -> DG N7 E0025 : score 5.976 : H : ARG NH1 A0064 <- 2.68 -> DG O6 E0024 : score 6.22933 : H : ARG NH2 A0064 <- 2.52 -> DG N7 E0024 : score 6.74215 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.86 -> DG N7 E0023 : score 5.9774 : H : ARG NH2 A0070 <- 2.80 -> DG N7 E0023 : score 6.38462 : H : ARG NH2 A0070 <- 2.49 -> DG O6 E0023 : score 7.0092 : H : LYS NZ A0222 <- 3.30 -> DG N7 E0025 : score 4.84731 >1by4_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE AND MECHANISM OF THE HOMODIMERIC ASSEMBLY OF THE RXR ON DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A1161 <- 2.48 -> DG N7 F1540 : score 6.79323 : x : GLU xxxx A1153 <- 3.53 -> DC xxx F1542 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1156 <- 3.58 -> DG xxx E1497 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1160 <- 3.51 -> DG xxx E1498 : score x.xxxxx >1by4_BC:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE AND MECHANISM OF THE HOMODIMERIC ASSEMBLY OF THE RXR ON DNA organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 B1253 <- 2.33 -> DC N4 F1535 : score 6.31014 : H : LYS NZ B1256 <- 3.00 -> DG O6 E1504 : score 5.54954 : H : ARG NH1 B1261 <- 2.99 -> DG N7 F1533 : score 5.8201 : H : LYS NZ C2156 <- 3.30 -> DG N7 G2497 : score 4.84731 : w : LYS NZ C2160 <- 6.04 -> DT O4 G2499 : score 1.7 : w : LYS NZ C2160 <- 6.07 -> DG O6 G2498 : score 3.005 : H : ARG NH2 C2161 <- 2.52 -> DG N7 H2540 : score 6.74215 : w : ARG NE C2161 <- 5.82 -> DG O6 H2540 : score 1.369 : w : ARG NH2 C2161 <- 5.76 -> DG O6 H2540 : score 2.468 : x : LYS xxxx B1260 <- 3.86 -> DT xxx E1506 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C2153 <- 2.97 -> DC xxx H2542 : score x.xxxxx >1c0w_ABCD:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;C-terminal_domain_of_transcriptional_repressors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE COBALT-ACTIVATED DIPHTHERIA TOXIN REPRESSOR- DNA COMPLEX REVEALS A METAL BINDING SH-LIKE DOMAIN organism=Corynebacterium diphtheriae : H : GLN OE1 B0043 <- 2.82 -> DC N4 E0416 : score 4.565 : H : GLN OE1 C0043 <- 3.12 -> DC N4 E0411 : score 4.29 : H : GLN OE1 D0043 <- 2.98 -> DC N4 F0516 : score 4.41833 : V : PRO CG C0039 <- 3.87 -> DT C7 E0413 : score 6.24769 : V : PRO CG A0039 <- 3.83 -> DT C7 F0513 : score 6.31128 : x : SER xxxx A0037 <- 3.16 -> DT xxx F0513 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0040 <- 3.41 -> DC xxx F0512 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0043 <- 3.43 -> DG xxx F0511 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0047 <- 3.61 -> DG xxx F0510 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0037 <- 2.87 -> DT xxx E0418 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0039 <- 3.18 -> DT xxx E0418 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0040 <- 3.15 -> DC xxx E0417 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0042 <- 4.06 -> DT xxx F0502 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0037 <- 2.95 -> DT xxx E0413 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0040 <- 3.45 -> DC xxx E0412 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0047 <- 3.72 -> DG xxx E0410 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0037 <- 3.15 -> DT xxx F0518 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0039 <- 3.41 -> DT xxx E0403 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0040 <- 3.20 -> DC xxx F0517 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 4.35 -> DT xxx E0402 : score x.xxxxx >1c0w_D:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;C-terminal_domain_of_transcriptional_repressors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE COBALT-ACTIVATED DIPHTHERIA TOXIN REPRESSOR- DNA COMPLEX REVEALS A METAL BINDING SH-LIKE DOMAIN organism=Corynebacterium diphtheriae : H : GLN OE1 D0043 <- 2.98 -> DC N4 F0516 : score 4.41833 : x : SER xxxx D0037 <- 3.15 -> DT xxx F0518 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0039 <- 3.41 -> DT xxx E0403 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0040 <- 3.20 -> DC xxx F0517 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 4.35 -> DT xxx E0402 : score x.xxxxx >1c7u_A:SRF-like; title=COMPLEX OF THE DNA BINDING CORE DOMAIN OF THE TRANSCRIPTION FACTOR MEF2A WITH A 20MER OLIGONUCLEOTIDE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0002 <- 3.36 -> DT O2 C0207 : score 2.28831 : H : ARG NH2 A0014 <- 3.03 -> DG N7 C0204 : score 6.09092 : x : VAL xxxx A0018 <- 3.99 -> DG xxx D0235 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0022 <- 2.98 -> DA xxx D0234 : score x.xxxxx >1c7u_AB:SRF-like; title=COMPLEX OF THE DNA BINDING CORE DOMAIN OF THE TRANSCRIPTION FACTOR MEF2A WITH A 20MER OLIGONUCLEOTIDE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0002 <- 3.36 -> DT O2 C0207 : score 2.28831 : H : ARG NH2 A0014 <- 3.03 -> DG N7 C0204 : score 6.09092 : H : ARG NE B0102 <- 3.36 -> DT O2 D0227 : score 2.28831 : H : ARG NH2 B0114 <- 3.03 -> DG N7 D0224 : score 6.09092 : x : VAL xxxx A0018 <- 3.99 -> DG xxx D0235 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0022 <- 2.98 -> DA xxx D0234 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0118 <- 3.99 -> DG xxx C0215 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0122 <- 2.97 -> DA xxx C0214 : score x.xxxxx >1c8c_A:Chromo_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURES OF THE CHROMOSOMAL PROTEINS SSO7D/SAC7D BOUND TO DNA CONTAINING T-G MISMATCHED BASE PAIRS organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : H : TRP NE1 A0024 <- 3.02 -> DG N3 B0103 : score -8.71063 : H : SER OG A0031 <- 2.88 -> DG N2 B0103 : score 3.32037 : H : ARG NH1 A0043 <- 2.99 -> DT O2 B0105 : score 4.14277 : H : ARG NH1 A0043 <- 2.88 -> DC O2 B0106 : score 3.5916 : w : ARG NH2 A0043 <- 5.80 -> DC O2 B0106 : score 1.669 : x : TYR xxxx A0008 <- 4.26 -> DT xxx C0113 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0026 <- 3.44 -> DT xxx B0102 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0029 <- 3.50 -> DG xxx B0103 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0045 <- 4.49 -> DC xxx C0114 : score x.xxxxx >1c9b_AEIM:Cyclin-like;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) organism=HOMO SAPIENS : w : ARG NH1 A0286 <- 5.38 -> DG N7 C0002 : score 2.063 : w : ASP OD1 E0282 <- 6.80 -> DC N4 H0117 : score 2.835 : x : VAL xxxx A0283 <- 4.26 -> DC xxx D0115 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0283 <- 4.35 -> DC xxx H0115 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0286 <- 3.66 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0283 <- 4.34 -> DC xxx L0115 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx M0283 <- 4.22 -> DC xxx P0115 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0286 <- 3.39 -> DG xxx O0001 : score x.xxxxx >1c9b_M:Cyclin-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) organism=HOMO SAPIENS : w : ARG NH1 M0286 <- 6.36 -> DG O6 O0001 : score 2.756 : x : VAL xxxx M0283 <- 4.22 -> DC xxx P0115 : score x.xxxxx >1c9b_QR:Cyclin-like;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) organism=HOMO SAPIENS : x : VAL xxxx Q0283 <- 4.30 -> DC xxx T0115 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0167 <- 3.62 -> DT xxx T0108 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0169 <- 3.49 -> DA xxx S0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0197 <- 3.04 -> DT xxx T0106 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0212 <- 3.71 -> DT xxx T0107 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0214 <- 3.22 -> DA xxx S0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0220 <- 3.55 -> DA xxx S0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0222 <- 3.74 -> DT xxx T0107 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0257 <- 3.27 -> DA xxx S0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0259 <- 3.44 -> DT xxx T0109 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0288 <- 3.06 -> DA xxx S0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx R0289 <- 3.49 -> DA xxx T0112 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0303 <- 3.69 -> DA xxx S0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0305 <- 3.11 -> DT xxx T0111 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0311 <- 3.30 -> DA xxx T0110 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0313 <- 3.33 -> DA xxx S0011 : score x.xxxxx >1ca6_A:Chromo_domain-like; title=INTERCALATION SITE OF HYPERTHERMOPHILE CHROMOSOMAL PROTEIN SSO7D/SAC7D BOUND TO DNA organism=SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS : w : TYR OH A0008 <- 5.61 -> DT O2 C0113 : score 3.068 : H : TRP NE1 A0024 <- 3.06 -> DG N3 B0103 : score -8.63774 : H : SER OG A0031 <- 2.90 -> DG N2 B0103 : score 3.30687 : w : ARG NH1 A0042 <- 6.10 -> DC O2 B0106 : score 1.381 : x : VAL xxxx A0026 <- 3.35 -> DT xxx B0102 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0029 <- 3.27 -> DG xxx B0103 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0044 <- 4.33 -> DC xxx C0114 : score x.xxxxx >1cdw_A:TATA-box_binding_protein-like; title=HUMAN TBP CORE DOMAIN COMPLEXED WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 A0163 <- 2.72 -> DT O2 C0108 : score 4.82209 : H : ASN ND2 A0163 <- 3.20 -> DT O2 C0109 : score 4.36646 : H : THR OG1 A0309 <- 2.94 -> DA N3 B0008 : score 1.31594 : x : VAL xxxx A0165 <- 3.49 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0193 <- 3.10 -> DT xxx C0106 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0208 <- 3.59 -> DT xxx C0106 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0210 <- 3.63 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0216 <- 3.69 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0218 <- 3.62 -> DT xxx C0107 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0253 <- 3.19 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0255 <- 3.46 -> DT xxx C0109 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0284 <- 3.31 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0285 <- 3.55 -> DA xxx C0112 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0299 <- 3.43 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0301 <- 3.20 -> DT xxx C0111 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0307 <- 3.48 -> DA xxx C0110 : score x.xxxxx >1cez_A:DNA/RNA_polymerases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A T7 RNA POLYMERASE-T7 PROMOTER COMPLEX organism=Enterobacteria phage T7 : H : ARG NH1 A0096 <- 3.29 -> DA N3 N0102 : score 3.32121 : H : ASP OD2 A0240 <- 2.97 -> DG N2 T0005 : score 5.27337 : H : ARG NH1 A0746 <- 2.90 -> DG O6 T0007 : score 5.96167 : H : ARG NH2 A0746 <- 2.94 -> DG N7 T0007 : score 6.20585 : H : ASN ND2 A0748 <- 3.32 -> DG N7 N0107 : score 4.10896 : w : ASN ND2 A0748 <- 6.18 -> DT O4 T0010 : score 3.275 : H : ARG NH1 A0756 <- 2.69 -> DG N7 T0009 : score 6.1831 : H : ARG NH2 A0756 <- 2.81 -> DG O6 T0009 : score 6.5868 : H : GLN OE1 A0758 <- 2.94 -> DA N6 T0008 : score 5.88309 : H : GLN NE2 A0758 <- 3.00 -> DA N7 T0008 : score 5.84615 : x : LYS xxxx A0098 <- 2.98 -> DA xxx N0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0231 <- 3.96 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0237 <- 3.22 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0760 <- 4.14 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >1cf7_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS OF DNA RECOGNITION BY THE HETERODIMERIC CELL CYCLE TRANSCRIPTION FACTOR E2F-DP organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0017 <- 3.27 -> DT O2 C0504 : score 3.90161 : H : ARG NH2 A0017 <- 2.95 -> DC O2 C0505 : score 3.58776 : w : ARG NH1 A0017 <- 6.21 -> DA N3 D0613 : score 2.585 : H : ARG NE A0056 <- 3.04 -> DG O6 D0607 : score 3.75186 : H : ARG NH2 A0056 <- 3.00 -> DG N7 D0607 : score 6.12923 : H : ARG NH1 A0057 <- 3.24 -> DG N7 C0508 : score 5.5176 : H : ARG NH2 A0057 <- 2.70 -> DG O6 C0508 : score 6.732 : x : TYR xxxx A0059 <- 3.74 -> DC xxx D0606 : score x.xxxxx >1cf7_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS OF DNA RECOGNITION BY THE HETERODIMERIC CELL CYCLE TRANSCRIPTION FACTOR E2F-DP organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0017 <- 3.27 -> DT O2 C0504 : score 3.90161 : H : ARG NH2 A0017 <- 2.95 -> DC O2 C0505 : score 3.58776 : w : ARG NH1 A0017 <- 6.21 -> DA N3 D0613 : score 2.585 : H : ARG NE A0056 <- 3.04 -> DG O6 D0607 : score 3.75186 : H : ARG NH2 A0056 <- 3.00 -> DG N7 D0607 : score 6.12923 : H : ARG NH1 A0057 <- 3.24 -> DG N7 C0508 : score 5.5176 : H : ARG NH2 A0057 <- 2.70 -> DG O6 C0508 : score 6.732 : H : ARG NE B0121 <- 3.30 -> DG O6 C0506 : score 3.54692 : H : ARG NH2 B0121 <- 2.98 -> DG N7 C0506 : score 6.15477 : H : ARG NH2 B0122 <- 3.09 -> DG N7 D0609 : score 6.01431 : H : ARG NH2 B0122 <- 2.90 -> DG O6 D0609 : score 6.468 : x : TYR xxxx A0059 <- 3.74 -> DC xxx D0606 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0118 <- 4.21 -> DG xxx D0609 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0124 <- 3.69 -> DC xxx C0505 : score x.xxxxx >1cf7_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS OF DNA RECOGNITION BY THE HETERODIMERIC CELL CYCLE TRANSCRIPTION FACTOR E2F-DP organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE B0121 <- 3.30 -> DG O6 C0506 : score 3.54692 : H : ARG NH2 B0121 <- 2.98 -> DG N7 C0506 : score 6.15477 : H : ARG NH2 B0122 <- 3.09 -> DG N7 D0609 : score 6.01431 : H : ARG NH2 B0122 <- 2.90 -> DG O6 D0609 : score 6.468 : x : ASN xxxx B0118 <- 4.21 -> DG xxx D0609 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0124 <- 3.69 -> DC xxx C0505 : score x.xxxxx >1cgp_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN (CAP)/DNA COMPLEX + ADENOSINE-3',5'- CYCLIC-MONOPHOSPHATE organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0180 <- 2.89 -> DG N7 E0025 : score 5.9411 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.74 -> DG N7 E0025 : score 6.46123 : H : GLU OE2 A0181 <- 3.30 -> DC N4 D0005 : score 4.73885 : H : ARG NH2 A0185 <- 2.76 -> DT O4 D0004 : score 3.58228 : x : SER xxxx A0179 <- 3.29 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0182 <- 3.89 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx >1cgp_AB:C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN (CAP)/DNA COMPLEX + ADENOSINE-3',5'- CYCLIC-MONOPHOSPHATE organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0180 <- 2.89 -> DG N7 E0025 : score 5.9411 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.74 -> DG N7 E0025 : score 6.46123 : H : GLU OE2 A0181 <- 3.30 -> DC N4 D0005 : score 4.73885 : H : ARG NH2 A0185 <- 2.76 -> DT O4 D0004 : score 3.58228 : H : ARG NH1 B0180 <- 3.27 -> DG O6 C0025 : score 5.5115 : H : ARG NH2 B0180 <- 2.74 -> DG N7 C0025 : score 6.46123 : H : GLU OE2 B0181 <- 2.91 -> DC N4 F0005 : score 5.14955 : H : ARG NH2 B0185 <- 2.62 -> DT O4 F0004 : score 3.68178 : x : SER xxxx A0179 <- 3.29 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0182 <- 3.89 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0179 <- 3.43 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0182 <- 3.67 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx >1cit_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=DNA-BINDING MECHANISM OF THE MONOMERIC ORPHAN NUCLEAR RECEPTOR NGFI-B organism=Rattus norvegicus : H : GLU OE1 A0250 <- 2.87 -> DC N4 C0426 : score 5.6872 : H : LYS NZ A0253 <- 2.56 -> DG O6 B0409 : score 6.05825 : H : ARG NH1 A0311 <- 2.99 -> DT O2 C0428 : score 4.14277 : x : CYS xxxx A0241 <- 4.08 -> DA xxx B0407 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0257 <- 3.86 -> DG xxx B0410 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0258 <- 3.30 -> DG xxx C0424 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0313 <- 2.82 -> DT xxx C0431 : score x.xxxxx >1cjg_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=NMR STRUCTURE OF LAC REPRESSOR HP62-DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : TYR OH A0007 <- 3.00 -> DC N4 D0013 : score 4.04554 : x : LEU xxxx A0006 <- 3.71 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0017 <- 3.75 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0018 <- 3.59 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0029 <- 3.53 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0053 <- 4.02 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0056 <- 3.30 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 2.97 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx >1cjg_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=NMR STRUCTURE OF LAC REPRESSOR HP62-DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : TYR OH A0007 <- 3.00 -> DC N4 D0013 : score 4.04554 : H : TYR OH B0007 <- 3.01 -> DC N4 C0013 : score 4.03711 : x : LEU xxxx A0006 <- 3.71 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0017 <- 3.75 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0018 <- 3.59 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0029 <- 3.53 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0053 <- 4.02 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0056 <- 3.30 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 2.97 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0006 <- 3.75 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0017 <- 3.70 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0018 <- 3.68 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0029 <- 3.66 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0053 <- 4.48 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0056 <- 3.36 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0057 <- 2.98 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx >1ckq_A:Restriction_endonuclease-like; title=PRE-TRANSITION STATE ECO RI ENDONUCLEASE/COGNATE DNA (TCGCGAATTCGCG) COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NE A0145 <- 3.16 -> DA N7 B0007 : score -8.45551 : x : GLN xxxx A0115 <- 3.35 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0137 <- 4.06 -> DC xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0138 <- 3.74 -> DC xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0141 <- 3.27 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0142 <- 3.22 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >1ckt_A:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HMG1 DOMAIN A BOUND TO A CISPLATIN-MODIFIED DNA DUPLEX organism=Rattus norvegicus : w : TYR OH A0015 <- 5.64 -> DC O2 B0111 : score 1.343 : H : SER OG A0041 <- 2.63 -> DA N3 B0110 : score 3.10598 : w : SER OG A0041 <- 6.43 -> DC O2 B0111 : score 1.768 : x : VAL xxxx A0019 <- 3.84 -> DT xxx C0207 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0037 <- 3.09 -> DC xxx C0209 : score x.xxxxx >1cl8_A:Restriction_endonuclease-like; title=A PRE-TRANSITION STATE ECO RI ENDONUCLEASE/COGNATE DNA (TCGCGAPTTCGCG) COMPLEX WITH DNA BASE ANALOG PURINE (P) organism=? : V : GLN CG A0115 <- 3.68 -> DT C7 B0008 : score 3.35305 : x : MET xxxx A0137 <- 3.87 -> DC xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0138 <- 3.73 -> DC xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0141 <- 3.30 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0142 <- 3.29 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0145 <- 3.44 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx >1clq_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A REPLICATION FORK DNA POLYMERASE EDITING COMPLEX AT 2.7 A RESOLUTION organism=Enterobacteria phage RB69 : H : SER OG A0220 <- 2.98 -> DG O6 E0002 : score 3.94375 : x : ASN xxxx A0217 <- 3.90 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0255 <- 2.88 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.32 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx >1cma_A:Ribbon-helix-helix; title=MET REPRESSOR/DNA COMPLEX + S-ADENOSYL-METHIONINE organism=ESCHERICHIA COLI : H : LYS NZ A0023 <- 3.36 -> DA N7 D0011 : score 2.60822 : H : LYS NZ A0023 <- 2.77 -> DG N7 D0012 : score 5.41821 : H : THR OG1 A0025 <- 3.11 -> DA N7 C0005 : score 3.20243 >1cma_AB:Ribbon-helix-helix; title=MET REPRESSOR/DNA COMPLEX + S-ADENOSYL-METHIONINE organism=ESCHERICHIA COLI : H : LYS NZ A0023 <- 3.36 -> DA N7 D0011 : score 2.60822 : H : LYS NZ A0023 <- 2.77 -> DG N7 D0012 : score 5.41821 : H : THR OG1 A0025 <- 3.11 -> DA N7 C0005 : score 3.20243 : H : LYS NZ B0023 <- 2.85 -> DG O6 C0004 : score 5.72296 : w : LYS NZ B0023 <- 5.18 -> DT O4 D0016 : score 1.7 : H : THR OG1 B0025 <- 2.91 -> DA N7 D0013 : score 3.33899 >1co0_A:TrpR-like; title=NMR STUDY OF TRP REPRESSOR-MTR OPERATOR DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NE A0069 <- 3.32 -> DT O4 F0003 : score 1.66564 : H : LYS NZ A0072 <- 3.15 -> DT O4 E0017 : score 3.33608 : V : ALA CB A0077 <- 3.82 -> DT C7 E0014 : score 5.57098 : x : ILE xxxx A0079 <- 2.71 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0080 <- 2.51 -> DG xxx E0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0081 <- 3.96 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0082 <- 3.50 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0083 <- 2.94 -> DA xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0084 <- 3.50 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx >1co0_AB:TrpR-like; title=NMR STUDY OF TRP REPRESSOR-MTR OPERATOR DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NE A0069 <- 3.32 -> DT O4 F0003 : score 1.66564 : H : LYS NZ A0072 <- 3.15 -> DT O4 E0017 : score 3.33608 : V : ALA CB A0077 <- 3.82 -> DT C7 E0014 : score 5.57098 : x : ILE xxxx A0079 <- 2.71 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0080 <- 2.51 -> DG xxx E0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0081 <- 3.96 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0082 <- 3.50 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0083 <- 2.94 -> DA xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0084 <- 3.50 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0079 <- 3.75 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0080 <- 3.09 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0083 <- 3.03 -> DC xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0084 <- 3.86 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx >1cqt_AI:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY COMPLEX CONTAINING AN OCA-B PEPTIDE, THE OCT-1 POU DOMAIN, AND AN OCTAMER ELEMENT organism=HOMO SAPIENS : H : GLN OE1 A0044 <- 3.35 -> DA N6 M0204 : score 5.38678 : H : GLN NE2 A0044 <- 2.84 -> DA N7 M0204 : score 6.04103 : H : THR OG1 A0045 <- 3.25 -> DT O4 M0205 : score 3.53733 : H : ARG NH1 A0049 <- 2.69 -> DG N7 N0225 : score 6.1831 : H : ARG NH2 A0049 <- 2.69 -> DG O6 N0225 : score 6.7452 : H : ARG NH2 A0105 <- 2.83 -> DA N3 M0208 : score 3.22031 : H : ASN OD1 A0151 <- 2.70 -> DA N6 M0210 : score 6.14223 : H : GLN OE1 A0154 <- 3.20 -> DA N6 N0221 : score 5.56836 : H : GLN NE2 A0154 <- 2.99 -> DA N7 N0221 : score 5.85833 : V : VAL CG1 A0147 <- 3.63 -> DT C7 M0211 : score 6.31808 : x : SER xxxx A0043 <- 4.21 -> DG xxx N0225 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0048 <- 3.85 -> DT xxx M0205 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0055 <- 4.06 -> DT xxx N0224 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0059 <- 4.14 -> DT xxx N0224 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0102 <- 3.50 -> DT xxx N0223 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0150 <- 3.82 -> DT xxx N0219 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx I0303 <- 3.76 -> DC xxx M0207 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0306 <- 3.55 -> DT xxx N0223 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0308 <- 3.91 -> DT xxx N0224 : score x.xxxxx >1cqt_BJ:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY COMPLEX CONTAINING AN OCA-B PEPTIDE, THE OCT-1 POU DOMAIN, AND AN OCTAMER ELEMENT organism=HOMO SAPIENS : H : GLN OE1 B0544 <- 3.12 -> DA N6 O0704 : score 5.6652 : H : GLN NE2 B0544 <- 2.76 -> DA N7 O0704 : score 6.13846 : H : THR OG1 B0545 <- 3.21 -> DC N4 P0726 : score 3.7026 : H : ARG NH2 B0549 <- 2.91 -> DG O6 P0725 : score 6.4548 : H : ASN ND2 B0651 <- 3.02 -> DA N7 O0710 : score 5.61221 : x : SER xxxx B0543 <- 4.22 -> DG xxx P0725 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0546 <- 4.36 -> DT xxx P0724 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0548 <- 4.35 -> DT xxx O0705 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0555 <- 4.08 -> DT xxx P0724 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0559 <- 4.34 -> DT xxx P0724 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0605 <- 3.16 -> DG xxx P0725 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0647 <- 3.65 -> DA xxx O0710 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0650 <- 4.25 -> DT xxx P0719 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0654 <- 3.03 -> DA xxx P0721 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx J0806 <- 3.49 -> DT xxx P0723 : score x.xxxxx >1cqt_I: title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY COMPLEX CONTAINING AN OCA-B PEPTIDE, THE OCT-1 POU DOMAIN, AND AN OCTAMER ELEMENT organism=HOMO SAPIENS : x : TYR xxxx I0303 <- 3.76 -> DC xxx M0207 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0306 <- 3.55 -> DT xxx N0223 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0308 <- 3.91 -> DT xxx N0224 : score x.xxxxx >1crx_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRE RECOMBINASE/DNA COMPLEX REACTION INTERMEDIATE I organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ A0086 <- 2.52 -> DG O6 E0015 : score 6.10449 : H : LYS NZ A0244 <- 2.57 -> DT O2 E0003 : score 3.75219 : H : LYS NZ A0244 <- 3.13 -> DT O2 D0019 : score 3.35043 : H : ARG NE A0259 <- 2.79 -> DG O6 D0012 : score 3.94891 : H : ARG NH2 A0259 <- 3.06 -> DG N7 D0012 : score 6.05262 : w : GLU OE1 A0262 <- 5.53 -> DC N4 D0011 : score 3.528 : H : ARG NH1 A0282 <- 3.25 -> DA N3 E0012 : score 3.35067 : H : ARG NH2 A0282 <- 2.98 -> DA N3 E0012 : score 3.12311 : w : ARG NH2 A0282 <- 5.64 -> DA N3 D0010 : score 2.092 : V : GLN CG A0090 <- 3.61 -> DT C7 E0013 : score 3.41002 : x : HIS xxxx A0040 <- 3.57 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.84 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0043 <- 3.29 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0044 <- 3.35 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.95 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.84 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.81 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx >1cyq_A:His-Me_finger_endonucleases; title=INTRON ENCODED HOMING ENDONUCLEASE I-PPOI (H98A)/DNA HOMING SITE COMPLEX organism=Physarum polycephalum : H : ASN ND2 A0057 <- 3.11 -> DG O6 D0516 : score 5.28888 : H : ARG NE A0061 <- 3.12 -> DA N7 D0515 : score -8.5284 : H : GLN OE1 A0063 <- 2.81 -> DA N6 D0517 : score 6.04046 : H : GLN NE2 A0063 <- 3.01 -> DA N7 D0517 : score 5.83397 : w : GLN OE1 A0063 <- 5.93 -> DC N4 C0405 : score 3.488 : H : LYS NZ A0065 <- 2.90 -> DG N7 C0403 : score 5.27818 : H : ARG NH1 A0074 <- 3.06 -> DG N7 D0518 : score 5.7354 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.80 -> DG O6 D0518 : score 6.6 : H : LYS NZ A0120 <- 2.83 -> DT O2 C0411 : score 3.56566 : w : LYS NZ A0120 <- 5.53 -> DA N3 C0412 : score 1.538 : V : VAL CG2 A0072 <- 3.84 -> DT C7 C0402 : score 6.06185 : x : ALA xxxx A0055 <- 3.80 -> DA xxx C0404 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0067 <- 3.50 -> DT xxx C0402 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0116 <- 3.63 -> DA xxx D0513 : score x.xxxxx >1cyq_AB:His-Me_finger_endonucleases; title=INTRON ENCODED HOMING ENDONUCLEASE I-PPOI (H98A)/DNA HOMING SITE COMPLEX organism=Physarum polycephalum : H : ASN ND2 A0057 <- 3.11 -> DG O6 D0516 : score 5.28888 : H : ARG NE A0061 <- 3.12 -> DA N7 D0515 : score -8.5284 : H : GLN OE1 A0063 <- 2.81 -> DA N6 D0517 : score 6.04046 : H : GLN NE2 A0063 <- 3.01 -> DA N7 D0517 : score 5.83397 : w : GLN OE1 A0063 <- 5.93 -> DC N4 C0405 : score 3.488 : H : LYS NZ A0065 <- 2.90 -> DG N7 C0403 : score 5.27818 : H : ARG NH1 A0074 <- 3.06 -> DG N7 D0518 : score 5.7354 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.80 -> DG O6 D0518 : score 6.6 : H : LYS NZ A0120 <- 2.83 -> DT O2 C0411 : score 3.56566 : w : LYS NZ A0120 <- 5.53 -> DA N3 C0412 : score 1.538 : H : ASN ND2 B0257 <- 3.02 -> DG O6 C0416 : score 5.39037 : H : ARG NE B0261 <- 3.16 -> DA N7 C0415 : score -8.45551 : H : GLN OE1 B0263 <- 2.96 -> DA N6 C0417 : score 5.85888 : H : GLN NE2 B0263 <- 3.03 -> DA N7 C0417 : score 5.80962 : w : GLN OE1 B0263 <- 5.87 -> DC N4 D0505 : score 3.488 : H : LYS NZ B0265 <- 2.98 -> DG N7 D0503 : score 5.19201 : w : LYS NZ B0265 <- 6.07 -> DA N6 D0504 : score 2.097 : H : ARG NH1 B0274 <- 3.02 -> DG N7 C0418 : score 5.7838 : H : ARG NH2 B0274 <- 2.71 -> DG O6 C0418 : score 6.7188 : H : LYS NZ B0320 <- 2.94 -> DT O2 D0511 : score 3.48674 : w : LYS NZ B0320 <- 5.77 -> DA N3 D0512 : score 1.538 : V : VAL CG2 A0072 <- 3.84 -> DT C7 C0402 : score 6.06185 : x : ALA xxxx A0055 <- 3.80 -> DA xxx C0404 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0067 <- 3.50 -> DT xxx C0402 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0116 <- 3.63 -> DA xxx D0513 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0255 <- 3.84 -> DA xxx D0504 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0267 <- 3.89 -> DT xxx D0502 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0316 <- 3.78 -> DA xxx C0413 : score x.xxxxx >1cz0_AB:His-Me_finger_endonucleases; title=INTRON ENCODED HOMING ENDONUCLEASE I-PPOI/DNA COMPLEX LACKING CATALYTIC METAL ION organism=Physarum polycephalum : H : ASN ND2 A0057 <- 3.07 -> DG O6 D0516 : score 5.33398 : H : ARG NE A0061 <- 3.06 -> DA N7 D0515 : score -8.63774 : H : GLN OE1 A0063 <- 2.93 -> DA N6 D0517 : score 5.8952 : H : GLN NE2 A0063 <- 3.04 -> DA N7 D0517 : score 5.79744 : w : GLN OE1 A0063 <- 5.94 -> DC N4 C0405 : score 3.488 : H : LYS NZ A0065 <- 3.00 -> DG N7 C0403 : score 5.17046 : H : LYS NZ A0065 <- 3.22 -> DG O6 C0403 : score 5.29518 : w : LYS NZ A0065 <- 6.24 -> DA N6 C0404 : score 2.097 : H : ARG NH1 A0074 <- 3.05 -> DG N7 D0518 : score 5.7475 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.86 -> DG O6 D0518 : score 6.5208 : H : LYS NZ A0120 <- 2.82 -> DT O2 C0411 : score 3.57283 : w : LYS NZ A0120 <- 5.73 -> DA N3 C0412 : score 1.538 : H : ASN ND2 B0257 <- 3.03 -> DG O6 C0416 : score 5.37909 : H : GLN OE1 B0263 <- 2.86 -> DA N6 C0417 : score 5.97993 : H : GLN NE2 B0263 <- 2.99 -> DA N7 C0417 : score 5.85833 : w : GLN OE1 B0263 <- 5.92 -> DC N4 D0505 : score 3.488 : H : LYS NZ B0265 <- 3.18 -> DG N7 D0503 : score 4.97657 : w : LYS NZ B0265 <- 6.34 -> DA N6 D0504 : score 2.097 : w : LYS NZ B0265 <- 5.12 -> DA N6 D0504 : score 2.097 : H : ARG NH1 B0274 <- 3.08 -> DG N7 C0418 : score 5.7112 : H : ARG NH2 B0274 <- 2.67 -> DG O6 C0418 : score 6.7716 : H : LYS NZ B0320 <- 2.92 -> DT O2 D0511 : score 3.50109 : w : LYS NZ B0320 <- 5.89 -> DA N3 D0512 : score 1.538 : x : ALA xxxx A0055 <- 3.78 -> DA xxx C0404 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0067 <- 3.74 -> DT xxx C0402 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0072 <- 4.15 -> DT xxx C0402 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0116 <- 3.74 -> DA xxx D0513 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0255 <- 3.91 -> DA xxx D0504 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0261 <- 3.17 -> DA xxx C0415 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0267 <- 4.14 -> DT xxx D0502 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0316 <- 3.77 -> DT xxx D0511 : score x.xxxxx >1cz0_B:His-Me_finger_endonucleases; title=INTRON ENCODED HOMING ENDONUCLEASE I-PPOI/DNA COMPLEX LACKING CATALYTIC METAL ION organism=Physarum polycephalum : H : ASN ND2 B0257 <- 3.03 -> DG O6 C0416 : score 5.37909 : H : GLN OE1 B0263 <- 2.86 -> DA N6 C0417 : score 5.97993 : H : GLN NE2 B0263 <- 2.99 -> DA N7 C0417 : score 5.85833 : w : GLN OE1 B0263 <- 5.92 -> DC N4 D0505 : score 3.488 : H : LYS NZ B0265 <- 3.18 -> DG N7 D0503 : score 4.97657 : w : LYS NZ B0265 <- 6.34 -> DA N6 D0504 : score 2.097 : w : LYS NZ B0265 <- 5.12 -> DA N6 D0504 : score 2.097 : H : ARG NH1 B0274 <- 3.08 -> DG N7 C0418 : score 5.7112 : H : ARG NH2 B0274 <- 2.67 -> DG O6 C0418 : score 6.7716 : H : LYS NZ B0320 <- 2.92 -> DT O2 D0511 : score 3.50109 : w : LYS NZ B0320 <- 5.89 -> DA N3 D0512 : score 1.538 : x : ALA xxxx B0255 <- 3.91 -> DA xxx D0504 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0261 <- 3.17 -> DA xxx C0415 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0267 <- 4.14 -> DT xxx D0502 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0316 <- 3.77 -> DT xxx D0511 : score x.xxxxx >1d02_A:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MUNI RESTRICTION ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH COGNATE DNA organism=MYCOPLASMA : w : LYS NZ A0045 <- 5.30 -> DC O2 C0010 : score 1.3 : w : LYS NZ A0045 <- 5.50 -> DG N3 D0001 : score 2.232 : H : ARG NE A0115 <- 2.77 -> DG O6 D0008 : score 3.96467 : H : ARG NH2 A0115 <- 3.05 -> DG N7 D0008 : score 6.06538 : H : ASN OD1 A0117 <- 2.90 -> DA N6 C0004 : score 5.90136 : H : ASN OD1 A0117 <- 2.84 -> DA N6 C0005 : score 5.97362 : H : ASN ND2 A0117 <- 3.14 -> DA N7 C0004 : score 5.47132 : H : ARG NH1 A0121 <- 3.03 -> DA N7 D0005 : score 2.44248 : V : GLN CG A0102 <- 3.79 -> DT C7 D0006 : score 3.26352 : x : ALA xxxx A0118 <- 3.25 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx >1d02_AB:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MUNI RESTRICTION ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH COGNATE DNA organism=MYCOPLASMA : w : LYS NZ A0045 <- 5.30 -> DC O2 C0010 : score 1.3 : w : LYS NZ A0045 <- 5.50 -> DG N3 D0001 : score 2.232 : H : ARG NE A0115 <- 2.77 -> DG O6 D0008 : score 3.96467 : H : ARG NH2 A0115 <- 3.05 -> DG N7 D0008 : score 6.06538 : H : ASN OD1 A0117 <- 2.90 -> DA N6 C0004 : score 5.90136 : H : ASN OD1 A0117 <- 2.84 -> DA N6 C0005 : score 5.97362 : H : ASN ND2 A0117 <- 3.14 -> DA N7 C0004 : score 5.47132 : H : ARG NH1 A0121 <- 3.03 -> DA N7 D0005 : score 2.44248 : w : LYS NZ B0045 <- 6.06 -> DC O2 D0010 : score 1.3 : H : ARG NE B0115 <- 2.77 -> DG O6 C0008 : score 3.96467 : H : ARG NH2 B0115 <- 2.99 -> DG N7 C0008 : score 6.142 : H : ASN OD1 B0117 <- 2.80 -> DA N6 D0004 : score 6.02179 : H : ASN OD1 B0117 <- 2.86 -> DA N6 D0005 : score 5.94953 : H : ASN ND2 B0117 <- 3.19 -> DA N7 D0004 : score 5.41261 : H : ARG NH1 B0121 <- 3.04 -> DA N7 C0005 : score 2.43736 : V : GLN CG A0102 <- 3.79 -> DT C7 D0006 : score 3.26352 : V : GLN CG B0102 <- 3.89 -> DT C7 C0006 : score 3.18214 : x : ALA xxxx A0118 <- 3.25 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0118 <- 3.33 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx >1d0e_A:DNA/RNA_polymerases; title=CRYSTAL STRUCTURES OF THE N-TERMINAL FRAGMENT FROM MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEXED WITH NUCLEIC ACID: FUNCTIONAL IMPLICATIONS FOR TEMPLATE-PRIMER BINDING TO THE FINGERS DOMAIN organism=Moloney murine leukemia virus : H : ARG NH2 A0116 <- 2.98 -> DA N3 E0005 : score 3.12311 : x : LEU xxxx A0099 <- 2.94 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0101 <- 4.44 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0112 <- 3.95 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx >1d1u_A:DNA/RNA_polymerases; title=USE OF AN N-TERMINAL FRAGMENT FROM MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS REVERSE TRANSCRIPTASE TO FACILITATE CRYSTALLIZATION AND ANALYSIS OF A PSEUDO-16-MER DNA MOLECULE CONTAINING G-A MISPAIRS organism=Moloney murine leukemia virus : H : ASP OD2 A0114 <- 3.15 -> DG N2 C0016 : score 5.07685 : H : ARG NH1 A0116 <- 3.22 -> DC O2 B0003 : score 3.3434 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.79 -> DT O2 B0002 : score 4.2418 : x : TYR xxxx A0064 <- 2.99 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0099 <- 3.04 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx >1d2i_A:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RESTRICTION ENDONUCLEASE BGLII COMPLEXED WITH DNA 16-MER organism=BACILLUS SUBTILIS : H : SER OG A0097 <- 2.70 -> DA N7 C0009 : score 4.55338 : w : ASN OD1 A0098 <- 5.88 -> DG O6 D0024 : score 3.125 : H : ASN ND2 A0140 <- 3.05 -> DT O4 C0012 : score 5.02038 : w : ASN OD1 A0140 <- 6.15 -> DA N6 D0021 : score 2.837 : H : SER OG A0141 <- 2.75 -> DA N7 D0023 : score 4.50874 : H : SER OG A0141 <- 2.96 -> DA N6 D0023 : score 3.18447 : w : TYR OH A0190 <- 5.45 -> DT O2 D0026 : score 3.068 : w : ARG NH2 A0192 <- 6.00 -> DA N3 C0007 : score 2.092 : w : ARG NH2 A0192 <- 5.81 -> DT O2 D0028 : score 2.261 : V : GLN CG A0039 <- 3.83 -> DT C7 C0012 : score 3.23097 : x : TYR xxxx A0099 <- 3.34 -> DA xxx D0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0101 <- 3.91 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0139 <- 4.00 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0142 <- 4.40 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >1d2i_AB:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RESTRICTION ENDONUCLEASE BGLII COMPLEXED WITH DNA 16-MER organism=BACILLUS SUBTILIS : H : SER OG A0097 <- 2.70 -> DA N7 C0009 : score 4.55338 : w : ASN OD1 A0098 <- 5.88 -> DG O6 D0024 : score 3.125 : H : ASN ND2 A0140 <- 3.05 -> DT O4 C0012 : score 5.02038 : w : ASN OD1 A0140 <- 6.15 -> DA N6 D0021 : score 2.837 : H : SER OG A0141 <- 2.75 -> DA N7 D0023 : score 4.50874 : H : SER OG A0141 <- 2.96 -> DA N6 D0023 : score 3.18447 : w : TYR OH A0190 <- 5.33 -> DT O2 C0010 : score 3.068 : w : ARG NH2 A0192 <- 5.94 -> DG N3 C0008 : score 0.677 : w : THR OG1 B0081 <- 6.29 -> DT O2 D0022 : score 2.522 : H : SER OG B0097 <- 2.75 -> DA N7 D0025 : score 4.50874 : w : ASN OD1 B0098 <- 5.80 -> DG O6 C0008 : score 3.125 : H : ASN ND2 B0140 <- 2.98 -> DT O4 D0028 : score 5.09437 : w : ASN OD1 B0140 <- 5.50 -> DA N7 C0005 : score 2.277 : w : ASN ND2 B0140 <- 6.13 -> DA N6 C0005 : score 2.5 : H : SER OG B0141 <- 2.74 -> DA N7 C0007 : score 4.51767 : H : SER OG B0141 <- 2.95 -> DA N6 C0007 : score 3.19105 : w : TYR OH B0190 <- 5.31 -> DT O2 C0010 : score 3.068 : V : GLN CG A0039 <- 3.83 -> DT C7 C0012 : score 3.23097 : x : TYR xxxx A0099 <- 3.34 -> DA xxx D0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0101 <- 3.91 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0139 <- 4.00 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0142 <- 4.40 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0039 <- 3.91 -> DT xxx D0028 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0099 <- 3.34 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0101 <- 4.00 -> DG xxx D0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0139 <- 4.04 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0142 <- 4.37 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx >1d3u_A:TATA-box_binding_protein-like; title=TATA-BINDING PROTEIN/TRANSCRIPTION FACTOR (II)B/BRE+TATA-BOX COMPLEX FROM PYROCOCCUS WOESEI organism=PYROCOCCUS WOESEI : H : ASN ND2 A0013 <- 2.86 -> DT O2 D1435 : score 4.6892 : H : ASN ND2 A0013 <- 3.08 -> DT O2 D1436 : score 4.48037 : H : ASN ND2 A0104 <- 3.20 -> DA N3 C1413 : score 3.50308 : H : ASN ND2 A0104 <- 3.19 -> DA N3 C1414 : score 3.51069 : H : SER OG A0159 <- 2.97 -> DT O2 C1412 : score 3.57172 : x : VAL xxxx A0015 <- 3.68 -> DA xxx C1414 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0043 <- 3.21 -> DA xxx D1433 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0044 <- 3.25 -> DA xxx C1417 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0058 <- 3.66 -> DA xxx D1433 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0060 <- 3.18 -> DT xxx C1416 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0066 <- 3.47 -> DA xxx C1415 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0068 <- 3.51 -> DT xxx D1435 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0106 <- 3.32 -> DT xxx D1436 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0134 <- 3.05 -> DT xxx C1411 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0135 <- 3.51 -> DA xxx D1439 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0149 <- 3.47 -> DT xxx C1411 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0151 <- 3.59 -> DA xxx D1438 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0157 <- 3.64 -> DA xxx D1437 : score x.xxxxx >1d3u_AB:TATA-box_binding_protein-like;Cyclin-like; title=TATA-BINDING PROTEIN/TRANSCRIPTION FACTOR (II)B/BRE+TATA-BOX COMPLEX FROM PYROCOCCUS WOESEI organism=PYROCOCCUS WOESEI : H : ASN ND2 A0013 <- 2.86 -> DT O2 D1435 : score 4.6892 : H : ASN ND2 A0013 <- 3.08 -> DT O2 D1436 : score 4.48037 : H : ASN ND2 A0104 <- 3.20 -> DA N3 C1413 : score 3.50308 : H : ASN ND2 A0104 <- 3.19 -> DA N3 C1414 : score 3.51069 : H : SER OG A0159 <- 2.97 -> DT O2 C1412 : score 3.57172 : H : ARG NE B1283 <- 3.26 -> DG N7 C1404 : score 4.01499 : H : ARG NH2 B1283 <- 3.13 -> DG N7 C1404 : score 5.96323 : w : ASN ND2 B1284 <- 6.49 -> DT O4 D1442 : score 3.275 : V : VAL CG2 B1280 <- 3.72 -> DT C7 D1443 : score 6.24554 : x : VAL xxxx A0015 <- 3.68 -> DA xxx C1414 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0043 <- 3.21 -> DA xxx D1433 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0044 <- 3.25 -> DA xxx C1417 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0058 <- 3.66 -> DA xxx D1433 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0060 <- 3.18 -> DT xxx C1416 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0066 <- 3.47 -> DA xxx C1415 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0068 <- 3.51 -> DT xxx D1435 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0106 <- 3.32 -> DT xxx D1436 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0134 <- 3.05 -> DT xxx C1411 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0135 <- 3.51 -> DA xxx D1439 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0149 <- 3.47 -> DT xxx C1411 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0151 <- 3.59 -> DA xxx D1438 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0157 <- 3.64 -> DA xxx D1437 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B1278 <- 3.88 -> DT xxx D1443 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B1281 <- 3.73 -> DT xxx D1442 : score x.xxxxx >1d5y_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE E. COLI ROB TRANSCRIPTION FACTOR IN COMPLEX WITH DNA organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0040 <- 2.89 -> DG O6 M0006 : score 6.4812 : V : TRP CD1 A0036 <- 3.82 -> DT C7 N0015 : score 7.29667 : x : SER xxxx A0034 <- 3.80 -> DA xxx M0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0037 <- 3.68 -> DC xxx M0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0039 <- 3.21 -> DG xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0090 <- 4.28 -> DT xxx M0010 : score x.xxxxx >1d5y_C:Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE E. COLI ROB TRANSCRIPTION FACTOR IN COMPLEX WITH DNA organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 C0040 <- 2.58 -> DG O6 O0006 : score 6.8904 : x : SER xxxx C0034 <- 3.96 -> DA xxx O0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0036 <- 3.03 -> DT xxx P0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0037 <- 3.80 -> DC xxx O0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0039 <- 3.13 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx >1d5y_CD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE E. COLI ROB TRANSCRIPTION FACTOR IN COMPLEX WITH DNA organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 C0040 <- 2.58 -> DG O6 O0006 : score 6.8904 : x : SER xxxx C0034 <- 3.96 -> DA xxx O0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0036 <- 3.03 -> DT xxx P0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0037 <- 3.80 -> DC xxx O0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0039 <- 3.13 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx >1d66_AB:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=DNA RECOGNITION BY GAL4: STRUCTURE OF A PROTEIN/DNA COMPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0018 <- 2.67 -> DG O6 D0004 : score 5.93107 : H : LYS NZ B0018 <- 2.77 -> DG N7 E0022 : score 5.41821 : H : LYS NZ B0018 <- 2.53 -> DG O6 E0022 : score 6.09293 : x : ARG xxxx A0015 <- 3.26 -> DT xxx E0034 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0019 <- 3.80 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx >1d66_B:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=DNA RECOGNITION BY GAL4: STRUCTURE OF A PROTEIN/DNA COMPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ B0018 <- 2.77 -> DG N7 E0022 : score 5.41821 : H : LYS NZ B0018 <- 2.53 -> DG O6 E0022 : score 6.09293 >1dc1_A:Restriction_endonuclease-like; title=RESTRICTION ENZYME BSOBI/DNA COMPLEX STRUCTURE: ENCIRCLEMENT OF THE DNA AND HISTIDINE-CATALYZED HYDROLYSIS WITHIN A CANONICAL RESTRICTION ENZYME FOLD organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0081 <- 2.99 -> DA N7 W0008 : score 2.82557 : H : LYS NZ A0081 <- 2.84 -> DG O6 W0009 : score 5.73452 : H : ARG NE A0131 <- 3.28 -> DG N3 C0008 : score 1.58664 : H : ARG NH2 A0131 <- 3.32 -> DG N3 C0008 : score 3.23479 : H : ASN OD1 A0132 <- 2.88 -> DG N2 W0009 : score 4.7232 : H : ASN ND2 A0132 <- 2.89 -> DG N3 W0009 : score 4.80676 : w : ASP OD2 A0246 <- 5.53 -> DA N6 C0009 : score 3.409 : H : GLU OE2 A0252 <- 3.05 -> DC N4 W0006 : score 5.00212 : H : HIS NE2 A0253 <- 2.91 -> DG N7 C0008 : score 6.65291 : x : ALA xxxx A0248 <- 3.59 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx >1dc1_AB:Restriction_endonuclease-like; title=RESTRICTION ENZYME BSOBI/DNA COMPLEX STRUCTURE: ENCIRCLEMENT OF THE DNA AND HISTIDINE-CATALYZED HYDROLYSIS WITHIN A CANONICAL RESTRICTION ENZYME FOLD organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0081 <- 2.99 -> DA N7 W0008 : score 2.82557 : H : LYS NZ A0081 <- 2.84 -> DG O6 W0009 : score 5.73452 : H : ARG NE A0131 <- 3.28 -> DG N3 C0008 : score 1.58664 : H : ARG NH2 A0131 <- 3.32 -> DG N3 C0008 : score 3.23479 : H : ASN OD1 A0132 <- 2.88 -> DG N2 W0009 : score 4.7232 : H : ASN ND2 A0132 <- 2.89 -> DG N3 W0009 : score 4.80676 : H : GLU OE2 A0252 <- 3.05 -> DC N4 W0006 : score 5.00212 : H : HIS NE2 A0253 <- 2.91 -> DG N7 C0008 : score 6.65291 : H : LYS NZ B0081 <- 3.03 -> DA N7 C0009 : score 2.80207 : H : LYS NZ B0081 <- 2.81 -> DG O6 C0010 : score 5.76921 : H : ARG NE B0131 <- 3.41 -> DG N3 W0007 : score 1.541 : H : ASN OD1 B0132 <- 2.90 -> DG N2 C0010 : score 4.704 : H : ASN ND2 B0132 <- 2.87 -> DG N3 C0010 : score 4.82634 : H : GLU OE2 B0252 <- 2.97 -> DC N4 C0007 : score 5.08636 : H : HIS NE2 B0253 <- 3.03 -> DG N7 W0007 : score 6.48965 : x : ASP xxxx A0246 <- 3.87 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0248 <- 3.59 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0246 <- 3.82 -> DG xxx W0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0248 <- 3.59 -> DG xxx W0009 : score x.xxxxx >1dct_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=DNA (CYTOSINE-5) METHYLASE FROM HAEIII COVALENTLY BOUND TO DNA organism=HAEMOPHILUS INFLUENZAE BIOTYPE AEGYPTIUS : H : SER OG B0219 <- 2.78 -> DG O6 N0010 : score 4.10739 : H : ARG NE B0225 <- 2.71 -> DG N7 G0008 : score 4.50139 : H : ARG NH2 B0225 <- 2.68 -> DG O6 G0008 : score 6.7584 : H : ARG NH1 B0227 <- 3.08 -> DG N7 G0009 : score 5.7112 : H : ARG NH1 B0227 <- 3.08 -> DG N7 G0009 : score 5.7112 : H : ARG NH1 B0243 <- 2.68 -> DG N7 N0009 : score 6.1952 : x : GLU xxxx B0076 <- 3.51 -> DG xxx G0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0220 <- 2.89 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0221 <- 3.24 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0239 <- 2.94 -> DC xxx G0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0244 <- 2.74 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx >1ddn_ABCD:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;C-terminal_domain_of_transcriptional_repressors; title=DIPHTHERIA TOX REPRESSOR (C102D MUTANT)/TOX DNA OPERATOR COMPLEX organism=Corynebacterium diphtheriae : H : GLN OE1 A0043 <- 2.72 -> DC N4 F0420 : score 4.65667 : H : GLN NE2 A0043 <- 3.23 -> DG N7 F0419 : score 3.83763 : H : GLN OE1 B0043 <- 2.91 -> DC N4 E0321 : score 4.4825 : H : GLN NE2 C0043 <- 3.17 -> DT O4 E0317 : score 4.80689 : H : GLN OE1 D0043 <- 3.27 -> DC N4 F0424 : score 4.1525 : V : PRO CG A0039 <- 3.75 -> DT C7 F0421 : score 6.43846 : V : PRO CG C0039 <- 3.58 -> DT C7 E0318 : score 6.70872 : x : SER xxxx A0037 <- 3.76 -> DT xxx F0421 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0040 <- 3.80 -> DC xxx F0420 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0047 <- 4.08 -> DA xxx F0418 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0060 <- 4.41 -> DG xxx E0310 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0037 <- 3.48 -> DT xxx E0323 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0039 <- 3.42 -> DT xxx E0323 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0040 <- 3.18 -> DC xxx E0322 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0042 <- 3.74 -> DT xxx F0410 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0047 <- 3.63 -> DA xxx E0320 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0037 <- 3.69 -> DT xxx E0318 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0040 <- 2.96 -> DT xxx E0317 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0047 <- 3.97 -> DG xxx E0315 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0037 <- 3.38 -> DT xxx F0426 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0039 <- 3.36 -> DT xxx F0426 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0040 <- 3.34 -> DC xxx F0425 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 3.86 -> DT xxx E0307 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0047 <- 3.58 -> DT xxx F0423 : score x.xxxxx >1ddn_B:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=DIPHTHERIA TOX REPRESSOR (C102D MUTANT)/TOX DNA OPERATOR COMPLEX organism=Corynebacterium diphtheriae : H : GLN OE1 B0043 <- 2.91 -> DC N4 E0321 : score 4.4825 : x : SER xxxx B0037 <- 3.48 -> DT xxx E0323 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0039 <- 3.42 -> DT xxx E0323 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0040 <- 3.18 -> DC xxx E0322 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0042 <- 3.74 -> DT xxx F0410 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0047 <- 3.63 -> DA xxx E0320 : score x.xxxxx >1de8_B:DNase_I-like; title=HUMAN APURINIC/APYRIMIDINIC ENDONUCLEASE-1 (APE1) BOUND TO ABASIC DNA organism=Homo sapiens : w : ASP OD1 B0070 <- 6.04 -> DT O2 Y0019 : score 2.105 : x : ARG xxxx B0177 <- 2.91 -> DG xxx X0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0229 <- 4.00 -> DG xxx X0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0269 <- 4.00 -> DG xxx Y0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0270 <- 3.48 -> DG xxx Y0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0271 <- 3.97 -> DG xxx X0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0308 <- 4.40 -> DG xxx Y0018 : score x.xxxxx >1dew_B:DNase_I-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN APE1 BOUND TO ABASIC DNA organism=Homo sapiens : w : ASP OD1 B0070 <- 5.76 -> DC O2 X0006 : score 1.919 : w : ASP OD1 B0070 <- 5.58 -> DG N3 Y0026 : score 2.718 : w : LYS NZ B0098 <- 5.90 -> DA N3 Y0027 : score 1.538 : w : ASN ND2 B0229 <- 6.01 -> DG N7 X0009 : score 3.259 : x : ARG xxxx B0177 <- 3.36 -> DG xxx Y0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0269 <- 3.90 -> DG xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0270 <- 3.65 -> DC xxx X0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0271 <- 3.25 -> DG xxx Y0023 : score x.xxxxx >1dfm_A:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RESTRICTION ENDONUCLEASE BGLII COMPLEXED WITH DNA 16-MER organism=Bacillus subtilis : H : SER OG A0097 <- 2.75 -> DA N7 C0009 : score 4.50874 : w : ASN OD1 A0098 <- 5.80 -> DG O6 D0024 : score 3.125 : H : ASN ND2 A0140 <- 2.99 -> DT O4 C0012 : score 5.0838 : w : ASN OD1 A0140 <- 5.67 -> DA N7 D0021 : score 2.277 : H : SER OG A0141 <- 2.73 -> DA N7 D0023 : score 4.5266 : H : SER OG A0141 <- 2.91 -> DA N6 D0023 : score 3.21737 : w : TYR OH A0190 <- 5.46 -> DT O2 D0026 : score 3.068 : w : ARG NH2 A0192 <- 5.86 -> DA N3 C0007 : score 2.092 : w : ARG NH2 A0192 <- 5.79 -> DT O2 D0028 : score 2.261 : V : GLN CG A0039 <- 3.86 -> DT C7 C0012 : score 3.20655 : x : TYR xxxx A0099 <- 3.29 -> DA xxx D0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0101 <- 3.97 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0139 <- 3.98 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0142 <- 4.40 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >1dfm_AB:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RESTRICTION ENDONUCLEASE BGLII COMPLEXED WITH DNA 16-MER organism=Bacillus subtilis : H : SER OG A0097 <- 2.75 -> DA N7 C0009 : score 4.50874 : w : ASN OD1 A0098 <- 5.80 -> DG O6 D0024 : score 3.125 : H : ASN ND2 A0140 <- 2.99 -> DT O4 C0012 : score 5.0838 : w : ASN OD1 A0140 <- 5.67 -> DA N7 D0021 : score 2.277 : H : SER OG A0141 <- 2.73 -> DA N7 D0023 : score 4.5266 : H : SER OG A0141 <- 2.91 -> DA N6 D0023 : score 3.21737 : w : TYR OH A0190 <- 5.40 -> DT O2 C0010 : score 3.068 : w : ARG NH2 A0192 <- 5.95 -> DG N3 C0008 : score 0.677 : w : THR OG1 B0081 <- 6.04 -> DT O2 D0022 : score 2.522 : H : SER OG B0097 <- 2.80 -> DA N7 D0025 : score 4.4641 : w : ASN OD1 B0098 <- 5.77 -> DG O6 C0008 : score 3.125 : H : ASN ND2 B0140 <- 2.97 -> DT O4 D0028 : score 5.10494 : w : ASN OD1 B0140 <- 5.48 -> DA N7 C0005 : score 2.277 : w : ASN ND2 B0140 <- 6.03 -> DA N6 C0005 : score 2.5 : H : SER OG B0141 <- 2.76 -> DA N7 C0007 : score 4.49982 : H : SER OG B0141 <- 3.00 -> DA N6 C0007 : score 3.15815 : w : TYR OH B0190 <- 5.34 -> DT O2 C0010 : score 3.068 : V : GLN CG B0039 <- 3.89 -> DT C7 D0028 : score 3.18214 : V : GLN CG A0039 <- 3.86 -> DT C7 C0012 : score 3.20655 : x : TYR xxxx A0099 <- 3.29 -> DA xxx D0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0101 <- 3.97 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0139 <- 3.98 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0142 <- 4.40 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0099 <- 3.35 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0101 <- 3.98 -> DG xxx D0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0139 <- 4.02 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0142 <- 4.32 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx >1dgc_A:Leucine_zipper_domain; title=THE X-RAY STRUCTURE OF THE GCN4-BZIP BOUND TO ATF/CREB SITE DNA SHOWS THE COMPLEX DEPENDS ON DNA FLEXIBILITY organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN OD1 A0235 <- 3.20 -> DC N4 B0003 : score 3.8581 : H : ARG NH2 A0243 <- 2.69 -> DG N7 B0001 : score 6.52508 : V : ALA CB A0239 <- 3.55 -> DT C7 B0002 : score 5.94891 : x : THR xxxx A0236 <- 4.49 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx >1dh3_AC:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A CREB BZIP-CRE COMPLEX REVEALS THE BASIS FOR CREB FAIMLY SELECTIVE DIMERIZATION AND DNA BINDING organism=Mus musculus : H : ASN OD1 A0293 <- 3.30 -> DC N4 B0003 : score 3.77423 : H : ASN ND2 C0293 <- 3.00 -> DT O4 B-004 : score 5.07323 : w : ARG NH1 C0301 <- 5.23 -> DA N6 B-002 : score 1.486 : V : ALA CB A0296 <- 3.67 -> DT C7 D-004 : score 5.78094 : V : ALA CB C0296 <- 3.52 -> DT C7 B-004 : score 5.9909 : V : ALA CB A0297 <- 3.57 -> DT C7 B0002 : score 5.92092 : x : ARG xxxx A0294 <- 4.48 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0300 <- 4.36 -> DT xxx D-004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0301 <- 3.48 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0297 <- 4.44 -> DT xxx B-004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0300 <- 3.78 -> DT xxx B-004 : score x.xxxxx >1dh3_C:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A CREB BZIP-CRE COMPLEX REVEALS THE BASIS FOR CREB FAIMLY SELECTIVE DIMERIZATION AND DNA BINDING organism=Mus musculus : H : ASN ND2 C0293 <- 3.00 -> DT O4 B-004 : score 5.07323 : w : ARG NH1 C0301 <- 5.55 -> DG O6 D0001 : score 2.756 : V : ALA CB C0296 <- 3.52 -> DT C7 B-004 : score 5.9909 : x : ALA xxxx C0297 <- 4.44 -> DT xxx B-004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0300 <- 3.78 -> DT xxx B-004 : score x.xxxxx >1diz_B:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI 3-METHYLADENINE DNA GLYCOSYLASE (ALKA) COMPLEXED WITH DNA organism=Escherichia coli : w : ARG NH1 B0178 <- 5.38 -> DT O2 C0009 : score 1.855 : w : ARG NH2 B0178 <- 5.91 -> DA N3 D0018 : score 2.092 : x : LEU xxxx B0125 <- 3.42 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0126 <- 3.89 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0239 <- 4.44 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx >1dmu_A:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RESTRICTION ENDONUCLEASE BGLI (E.C.3.1.21.4) BOUND TO ITS DNA RECOGNITION SEQUENCE organism=Bacillus subtilis : w : ARG NH1 A0071 <- 5.67 -> DA N3 F0002 : score 2.585 : H : ASP OD1 A0150 <- 3.20 -> DC N4 F0005 : score 4.91728 : H : LYS NZ A0266 <- 2.85 -> DG N7 F0004 : score 5.33204 : w : ASP OD2 A0267 <- 5.53 -> DA N6 F0002 : score 3.409 : w : LYS NZ A0271 <- 6.55 -> DA N6 F0002 : score 2.097 : w : LYS NZ A0271 <- 5.63 -> DA N7 F0000 : score 1.655 : H : ARG NH1 A0277 <- 2.97 -> DG N7 F0003 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0277 <- 2.59 -> DG O6 F0003 : score 6.8772 : x : LYS xxxx A0073 <- 3.67 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx >1dnk_A:DNase_I-like; title=THE X-RAY STRUCTURE OF THE DNASE I-D(GGTATACC)2 COMPLEX AT 2.3 ANGSTROMS RESOLUTION organism=BOS TAURUS : H : ARG NH1 A0041 <- 2.96 -> DT O2 B0305 : score 4.16861 : H : ARG NH2 A0041 <- 2.87 -> DT O2 B0305 : score 4.17407 : w : SER OG A0075 <- 5.95 -> DA N3 C0312 : score 0.958 : x : TYR xxxx A0076 <- 4.16 -> DA xxx C0312 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0175 <- 4.20 -> DC xxx C0315 : score x.xxxxx >1dp7_P:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=COCRYSTAL STRUCTURE OF RFX-DBD IN COMPLEX WITH ITS COGNATE X-BOX BINDING SITE organism=? : H : LYS NZ P0045 <- 2.98 -> DC O2 D0006 : score 2.84009 : H : ARG NH1 P0058 <- 2.67 -> DG O6 D0011 : score 6.2415 : H : ARG NH2 P0058 <- 3.13 -> DG N7 D0011 : score 5.96323 : H : TYR OH P0067 <- 2.74 -> DG N7 D0010 : score 4.33863 : w : TYR OH P0067 <- 5.59 -> DG O6 D0010 : score 3.344 : x : ALA xxxx P0041 <- 3.40 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0062 <- 3.32 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx >1drg_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TRIMERIC CRE RECOMBINASE-LOX COMPLEX organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ A0086 <- 2.79 -> DG O6 B0015 : score 5.79233 : H : GLN NE2 A0090 <- 2.85 -> DT O4 B0013 : score 5.13912 : H : GLN NE2 A0090 <- 2.96 -> DT O4 C0007 : score 5.02491 : w : ARG NH2 A0241 <- 5.09 -> DA N3 B0005 : score 2.092 : H : ARG NH1 A0243 <- 3.17 -> DT O2 C0017 : score 3.98774 : H : ARG NH2 A0243 <- 2.91 -> DT O2 C0017 : score 4.1402 : H : LYS NZ A0244 <- 2.58 -> DT O2 B0003 : score 3.74502 : H : LYS NZ A0244 <- 2.60 -> DT O2 C0019 : score 3.73067 : H : ARG NE A0259 <- 2.61 -> DG O6 C0012 : score 4.09078 : H : ARG NH2 A0259 <- 2.66 -> DG N7 C0012 : score 6.56338 : w : GLU OE1 A0262 <- 5.54 -> DC N4 C0011 : score 3.528 : H : ARG NH2 A0282 <- 2.60 -> DA N3 B0012 : score 3.36933 : w : ARG NH1 A0282 <- 5.99 -> DT O2 C0009 : score 1.855 : x : HIS xxxx A0040 <- 3.07 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.69 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0043 <- 3.29 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0044 <- 3.46 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 4.01 -> DT xxx B0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.43 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 4.18 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.72 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0320 <- 4.16 -> DC xxx B0016 : score x.xxxxx >1dsz_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE RXR/RAR DNA-BINDING DOMAIN HETERODIMER IN COMPLEX WITH THE RETINOIC ACID RESPONSE ELEMENT DR1 organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE2 A1153 <- 2.96 -> DC N4 D1542 : score 5.09689 : w : GLU OE1 A1153 <- 5.76 -> DC N4 D1543 : score 3.528 : w : GLU OE2 A1153 <- 5.94 -> DA N6 D1541 : score 2.785 : H : LYS NZ A1156 <- 2.80 -> DG O6 C1497 : score 5.78077 : w : LYS NZ A1156 <- 5.97 -> DA N6 C1496 : score 2.097 : w : ARG NH2 A1160 <- 5.58 -> DG O6 C1498 : score 2.468 : w : ARG NH2 A1160 <- 5.65 -> DG O6 D1540 : score 2.468 : H : ARG NH1 A1161 <- 2.97 -> DG N7 D1540 : score 5.8443 : w : ARG NH1 A1161 <- 5.55 -> DG O6 D1540 : score 2.756 >1dsz_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE RXR/RAR DNA-BINDING DOMAIN HETERODIMER IN COMPLEX WITH THE RETINOIC ACID RESPONSE ELEMENT DR1 organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE2 A1153 <- 2.96 -> DC N4 D1542 : score 5.09689 : w : GLU OE1 A1153 <- 5.76 -> DC N4 D1543 : score 3.528 : w : GLU OE2 A1153 <- 5.94 -> DA N6 D1541 : score 2.785 : H : LYS NZ A1156 <- 2.80 -> DG O6 C1497 : score 5.78077 : w : LYS NZ A1156 <- 5.97 -> DA N6 C1496 : score 2.097 : w : ARG NH2 A1160 <- 5.58 -> DG O6 C1498 : score 2.468 : H : ARG NH1 A1161 <- 2.97 -> DG N7 D1540 : score 5.8443 : H : GLU OE2 B1253 <- 2.90 -> DC N4 D1535 : score 5.16008 : w : GLU OE1 B1253 <- 5.65 -> DC N4 D1536 : score 3.528 : w : GLU OE2 B1253 <- 5.89 -> DA N6 D1534 : score 2.785 : H : LYS NZ B1256 <- 3.10 -> DG O6 C1504 : score 5.43392 : w : LYS NZ B1256 <- 6.48 -> DA N6 C1503 : score 2.097 : w : LYS NZ B1260 <- 5.52 -> DG N7 C1505 : score 2.519 : w : LYS NZ B1260 <- 5.37 -> DT O4 C1506 : score 1.7 : H : ARG NH1 B1261 <- 3.00 -> DG N7 D1533 : score 5.808 : w : ARG NH1 B1261 <- 5.44 -> DG O6 D1533 : score 2.756 : w : ARG NH1 B1309 <- 5.64 -> DT O2 D1538 : score 1.855 >1du0_A:Homeodomain-like; title=ENGRAILED HOMEODOMAIN Q50A VARIANT DNA COMPLEX organism=Drosophila melanogaster : H : ASN OD1 A0051 <- 3.10 -> DA N6 C0213 : score 5.66049 : H : ASN ND2 A0051 <- 3.22 -> DA N7 C0213 : score 5.37739 : w : ASN OD1 A0051 <- 5.76 -> DT O4 C0214 : score 3.132 : w : ASN OD1 A0051 <- 5.65 -> DA N6 D0309 : score 2.837 : x : ILE xxxx A0047 <- 3.53 -> DT xxx C0214 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0050 <- 4.20 -> DT xxx D0307 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 4.23 -> DT xxx C0211 : score x.xxxxx >1du0_AB:Homeodomain-like; title=ENGRAILED HOMEODOMAIN Q50A VARIANT DNA COMPLEX organism=Drosophila melanogaster : H : ASN OD1 A0051 <- 3.10 -> DA N6 C0213 : score 5.66049 : H : ASN ND2 A0051 <- 3.22 -> DA N7 C0213 : score 5.37739 : w : ASN OD1 A0051 <- 5.76 -> DT O4 C0214 : score 3.132 : w : ASN OD1 A0051 <- 5.65 -> DA N6 D0309 : score 2.837 : w : ASN OD1 B0151 <- 5.63 -> DT O4 D0302 : score 3.132 : w : ASN OD1 B0151 <- 5.72 -> DA N6 C0221 : score 2.837 : x : ILE xxxx A0047 <- 3.53 -> DT xxx C0214 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0050 <- 4.20 -> DT xxx D0307 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 4.23 -> DT xxx C0211 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0147 <- 3.88 -> DT xxx D0302 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0150 <- 4.07 -> DT xxx C0219 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0153 <- 4.43 -> DT xxx C0219 : score x.xxxxx >1dux_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ELK-1/DNA STRUCTURE REVEALS HOW RESIDUES DISTAL FROM DNA-BINDING SURFACE AFFECT DNA-RECOGNITION organism=Homo sapiens : H : ASP OD1 F0058 <- 2.86 -> DC N4 E0008 : score 5.28073 : w : ASP OD1 F0058 <- 6.21 -> DC N4 D0005 : score 2.835 : w : ASP OD1 F0058 <- 5.95 -> DC N4 D0004 : score 2.835 : w : ASP OD2 F0058 <- 5.39 -> DC N4 E0007 : score 3.623 : w : SER OG F0061 <- 6.46 -> DC N4 D0005 : score 2.105 : H : ARG NE F0062 <- 2.76 -> DG O6 D0007 : score 3.97255 : H : ARG NH2 F0062 <- 2.99 -> DG N7 D0007 : score 6.142 : H : ARG NE F0065 <- 2.96 -> DG N7 D0006 : score 4.2803 : H : ARG NH2 F0065 <- 2.87 -> DG O6 D0006 : score 6.5076 : w : ARG NH2 F0065 <- 6.18 -> DC N4 D0005 : score 0.976 : x : LYS xxxx F0059 <- 3.82 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0066 <- 3.78 -> DA xxx E0003 : score x.xxxxx >1e3m_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI MUTS BINDING TO DNA WITH A G:T MISMATCH organism=ESCHERICHIA COLI : H : GLU OE2 A0038 <- 2.79 -> DT N3 F0022 : score 2.64117 : H : GLU OE2 A0038 <- 3.11 -> DG N2 E0010 : score 4.04302 : H : ARG NH1 A0058 <- 3.09 -> DC O2 E0011 : score 3.4383 : H : ARG NH2 A0058 <- 3.00 -> DC O2 E0011 : score 3.55077 : V : PHE CZ A0036 <- 3.89 -> DT C7 F0022 : score 6.95479 : x : MET xxxx A0033 <- 3.59 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0035 <- 4.46 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 3.30 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.72 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >1e3o_C:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF OCT-1 POU DIMER BOUND TO MORE organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 C0044 <- 3.04 -> DA N6 A0201 : score 5.76204 : H : GLN NE2 C0044 <- 2.98 -> DA N7 A0201 : score 5.87051 : w : GLN OE1 C0044 <- 5.75 -> DA N6 B0210 : score 3.392 : H : THR OG1 C0045 <- 2.96 -> DC N4 B0209 : score 3.90427 : H : THR OG1 C0045 <- 2.60 -> DT O4 A0202 : score 4.04267 : H : ARG NH1 C0049 <- 2.95 -> DG N7 B0208 : score 5.8685 : H : ARG NH2 C0049 <- 2.71 -> DG O6 B0208 : score 6.7188 : w : ARG NH2 C0049 <- 6.02 -> DG N7 A0203 : score 2.18 : w : ARG NH1 C0146 <- 6.58 -> DG O6 A0207 : score 2.756 : w : SER OG C0150 <- 6.19 -> DG O6 A0207 : score 2.749 : H : ASN OD1 C0151 <- 2.95 -> DA N6 A0205 : score 5.84114 : H : ASN ND2 C0151 <- 3.01 -> DA N7 A0205 : score 5.62395 : w : ASN OD1 C0151 <- 5.52 -> DT O4 A0206 : score 3.132 : H : GLN OE1 C0154 <- 3.06 -> DA N6 B0206 : score 5.73783 : w : GLN OE1 C0154 <- 5.42 -> DA N7 B0206 : score 1.196 : w : GLN OE1 C0154 <- 5.83 -> DT O4 B0207 : score 3.068 : w : GLN NE2 C0154 <- 5.79 -> DT O4 A0206 : score 2.257 : w : ARG NH2 C0158 <- 6.00 -> DT O4 B0207 : score 2.366 : x : SER xxxx C0043 <- 4.46 -> DG xxx B0208 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0048 <- 3.63 -> DT xxx A0202 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0055 <- 4.27 -> DT xxx B0207 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0059 <- 4.11 -> DT xxx B0207 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0147 <- 3.98 -> DA xxx A0205 : score x.xxxxx >1e7j_A:HMG-box; title=HMG-D COMPLEXED TO A BULGE DNA organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : SER xxxx A0010 <- 4.14 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0012 <- 4.04 -> DA xxx C0023 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0013 <- 3.40 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0032 <- 3.80 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0033 <- 4.16 -> DA xxx C0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0036 <- 4.28 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx >1ea4_DEFG:Ribbon-helix-helix; title=TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR COPG/22BP DSDNA COMPLEX organism=STREPTOCOCCUS AGALACTIAE : H : ARG NE D0004 <- 3.06 -> DT O4 W0216 : score 1.76231 : H : ARG NH2 D0004 <- 3.22 -> DG O6 X0206 : score 6.0456 : H : ARG NH2 D0004 <- 3.31 -> DT O4 W0216 : score 3.19135 : H : ARG NH2 D0004 <- 2.98 -> DG O6 W0217 : score 6.3624 : H : THR OG1 D0006 <- 2.97 -> DT O4 X0205 : score 3.75502 : H : ARG NH1 E0004 <- 2.89 -> DA N7 X0203 : score 2.51417 : H : THR OG1 E0006 <- 3.30 -> DG N7 W0217 : score 3.14885 : H : ARG NH1 F0004 <- 2.91 -> DG N7 W0208 : score 5.9169 : H : ARG NH2 F0004 <- 3.03 -> DT O4 X0214 : score 3.39037 : H : ARG NH2 F0004 <- 2.83 -> DG O6 X0215 : score 6.5604 : H : THR OG1 F0006 <- 3.47 -> DT O4 W0207 : score 3.3663 : x : THR xxxx E0008 <- 3.80 -> DT xxx W0216 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0004 <- 3.12 -> DC xxx W0205 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0006 <- 3.50 -> DC xxx X0216 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0008 <- 3.64 -> DG xxx X0213 : score x.xxxxx >1ea4_H:Ribbon-helix-helix; title=TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR COPG/22BP DSDNA COMPLEX organism=STREPTOCOCCUS AGALACTIAE : H : ARG NH1 H0004 <- 3.25 -> DG O6 U0208 : score 5.53583 : H : ARG NH2 H0004 <- 2.91 -> DT O4 V0214 : score 3.47566 : H : ARG NH2 H0004 <- 3.05 -> DG O6 U0208 : score 6.27 : H : THR OG1 H0006 <- 2.61 -> DT O4 U0207 : score 4.03489 >1ea4_HKL:Ribbon-helix-helix; title=TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR COPG/22BP DSDNA COMPLEX organism=STREPTOCOCCUS AGALACTIAE : H : ARG NH1 H0004 <- 3.25 -> DG O6 U0208 : score 5.53583 : H : ARG NH2 H0004 <- 2.91 -> DT O4 V0214 : score 3.47566 : H : ARG NH2 H0004 <- 3.05 -> DG O6 U0208 : score 6.27 : H : THR OG1 H0006 <- 2.61 -> DT O4 U0207 : score 4.03489 : H : ARG NH1 K0004 <- 3.18 -> DG O6 V0206 : score 5.621 : H : ARG NH2 K0004 <- 2.70 -> DT O4 U0216 : score 3.62492 : H : THR OG1 K0006 <- 3.19 -> DT O4 V0205 : score 3.58398 : x : ARG xxxx L0004 <- 3.26 -> DT xxx V0204 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0006 <- 3.88 -> DG xxx U0217 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0008 <- 3.26 -> DA xxx U0215 : score x.xxxxx >1ebm_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE (HOGG1) BOUND TO A SUBSTRATE OLIGONUCLEOTIDE organism=Homo sapiens : w : SER OG A0148 <- 5.74 -> DG N3 C0026 : score 2.344 : w : ASN ND2 A0149 <- 6.54 -> DA N6 C0024 : score 2.5 : w : TYR OH A0203 <- 5.68 -> DG N3 C0026 : score 3.344 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.90 -> DC O2 D0009 : score 3.577 : H : ARG NH2 A0204 <- 3.08 -> DC N3 D0009 : score 2.16273 : x : ASN xxxx A0151 <- 3.49 -> DA xxx C0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0154 <- 2.71 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0207 <- 4.49 -> DT xxx C0027 : score x.xxxxx >1ecr_A:Replication_terminator_protein_Tus; title=ESCHERICHIA COLI REPLICATION TERMINATOR PROTEIN (TUS) COMPLEXED WITH DNA organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0089 <- 2.85 -> DT O2 C0332 : score 3.55131 : H : LYS NZ A0089 <- 2.70 -> DT O2 B0322 : score 3.65892 : H : LYS NZ A0175 <- 2.88 -> DT O4 C0337 : score 3.52978 : w : LYS NZ A0175 <- 5.93 -> DG N7 C0336 : score 2.519 : H : ARG NH2 A0232 <- 2.77 -> DG N7 C0333 : score 6.42292 : w : GLN OE1 A0237 <- 5.38 -> DG N7 C0336 : score 2.87 : w : GLN NE2 A0237 <- 5.80 -> DG O6 C0336 : score 2.87 : H : GLN OE1 A0250 <- 3.23 -> DA N6 B0312 : score 5.53204 : H : GLN NE2 A0250 <- 2.89 -> DA N7 B0312 : score 5.98013 : w : GLN NE2 A0252 <- 5.98 -> DG O6 B0313 : score 2.87 : V : VAL CG1 A0234 <- 3.68 -> DT C7 C0335 : score 6.24233 : x : ARG xxxx A0093 <- 4.32 -> DT xxx C0335 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0136 <- 4.03 -> DT xxx B0322 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0153 <- 4.16 -> DG xxx C0333 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0173 <- 3.38 -> DT xxx B0314 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0177 <- 3.50 -> DA xxx B0319 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0178 <- 3.42 -> DC xxx B0317 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0198 <- 3.28 -> DG xxx C0329 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0239 <- 4.27 -> DG xxx B0313 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 3.51 -> DA xxx B0312 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0254 <- 4.09 -> DG xxx C0336 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0288 <- 3.57 -> DA xxx B0312 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0290 <- 3.06 -> DT xxx B0314 : score x.xxxxx >1efa_AB:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LAC REPRESSOR DIMER BOUND TO OPERATOR AND THE ANTI-INDUCER ONPF organism=Escherichia coli : H : TYR OH A0007 <- 3.19 -> DC N4 E0013 : score 3.8854 : H : TYR OH A0017 <- 2.88 -> DG O6 D0008 : score 3.5752 : H : ARG NH2 A0022 <- 2.91 -> DG N7 D0006 : score 6.24415 : H : TYR OH B0017 <- 3.16 -> DG O6 E0008 : score 3.37173 : H : ARG NH2 B0022 <- 3.17 -> DG N7 E0006 : score 5.91215 : H : ARG NH2 B0022 <- 3.00 -> DG O6 E0006 : score 6.336 : x : LEU xxxx A0006 <- 4.42 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0016 <- 4.24 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0018 <- 2.70 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0021 <- 3.83 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0053 <- 3.43 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0056 <- 3.80 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 2.99 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0006 <- 4.22 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0007 <- 3.57 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0016 <- 4.04 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0018 <- 2.72 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0021 <- 3.88 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0029 <- 3.36 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0053 <- 3.62 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0056 <- 3.89 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0057 <- 3.24 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx >1efa_B:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LAC REPRESSOR DIMER BOUND TO OPERATOR AND THE ANTI-INDUCER ONPF organism=Escherichia coli : H : TYR OH B0017 <- 3.16 -> DG O6 E0008 : score 3.37173 : H : ARG NH2 B0022 <- 3.17 -> DG N7 E0006 : score 5.91215 : H : ARG NH2 B0022 <- 3.00 -> DG O6 E0006 : score 6.336 : x : LEU xxxx B0006 <- 4.22 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0007 <- 3.57 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0016 <- 4.04 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0018 <- 2.72 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0021 <- 3.88 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0029 <- 3.36 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0053 <- 3.62 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0056 <- 3.89 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0057 <- 3.24 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx >1egw_A:SRF-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MEF2A CORE BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0003 <- 2.77 -> DT O2 E0006 : score 2.59238 : H : ARG NH2 A0003 <- 3.05 -> DT O2 E0006 : score 4.02167 : H : LYS NZ A0023 <- 3.00 -> DA N7 F0013 : score 2.81969 : w : LYS NZ A0023 <- 6.06 -> DG O6 F0014 : score 3.005 : x : ARG xxxx A0015 <- 3.12 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx >1egw_AB:SRF-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MEF2A CORE BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0003 <- 2.77 -> DT O2 E0006 : score 2.59238 : H : ARG NH2 A0003 <- 3.05 -> DT O2 E0006 : score 4.02167 : H : LYS NZ A0023 <- 3.00 -> DA N7 F0013 : score 2.81969 : w : LYS NZ A0023 <- 6.06 -> DG O6 F0014 : score 3.005 : H : ARG NE B0003 <- 2.82 -> DT O2 F0006 : score 2.56662 : H : ARG NH2 B0003 <- 3.05 -> DT O2 F0006 : score 4.02167 : H : LYS NZ B0023 <- 2.82 -> DA N7 E0013 : score 2.92543 : H : LYS NZ B0023 <- 2.86 -> DG O6 E0014 : score 5.7114 : w : LYS NZ B0023 <- 6.18 -> DG O6 F0004 : score 3.005 : w : LYS NZ B0023 <- 5.99 -> DG N7 E0014 : score 2.519 : x : ARG xxxx A0015 <- 3.12 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx >1ej9_A:Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_N-terminal_DNA-binding_fragment;DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TOPOISOMERASE I DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0364 <- 2.99 -> DG N3 C0012 : score 3.47307 : w : ASN OD1 A0491 <- 6.80 -> DC N4 D0117 : score 2.732 : H : LYS NZ A0532 <- 2.89 -> DC O2 C0010 : score 2.89312 : w : LYS NZ A0532 <- 5.87 -> DG N3 D0115 : score 2.232 : w : ASP OD1 A0533 <- 5.93 -> DG N3 D0113 : score 2.718 : w : ASP OD2 A0533 <- 5.90 -> DG N3 D0113 : score 2.312 : w : ASN OD1 A0722 <- 6.26 -> DA N7 C0011 : score 2.277 : x : ASN xxxx A0352 <- 4.44 -> DT xxx D0112 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0424 <- 4.33 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0426 <- 3.31 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0428 <- 4.44 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx >1emh_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN URACIL-DNA GLYCOSYLASE BOUND TO UNCLEAVED SUBSTRATE-CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0276 <- 6.42 -> DT O2 C0026 : score 1.855 : x : PRO xxxx A0271 <- 3.19 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0272 <- 3.61 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx >1emj_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=URACIL-DNA GLYCOSYLASE BOUND TO DNA CONTAINING A 4'-THIO- 2'DEOXYURIDINE ANALOG PRODUCT organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0276 <- 5.35 -> DT O2 C0026 : score 1.855 : x : PRO xxxx A0271 <- 3.21 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0272 <- 3.49 -> DA xxx C0028 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0275 <- 4.19 -> DA xxx C0027 : score x.xxxxx >1eo3_AB:Restriction_endonuclease-like; title=INHIBITION OF ECORV ENDONUCLEASE BY DEOXYRIBO-3'-S- PHOSPHOROTHIOLATES: A HIGH RESOLUTION X-RAY CRYSTALLOGRAPHIC STUDY organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 2.70 -> DC O2 D0009 : score 4.56908 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.91 -> DA N6 D0005 : score 5.88932 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.95 -> DA N7 D0005 : score 5.6944 : H : THR OG1 A0186 <- 2.70 -> DT O4 C0008 : score 3.96492 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.90 -> DA N6 C0005 : score 5.90136 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.94 -> DA N7 C0005 : score 5.70614 : H : THR OG1 B0186 <- 2.77 -> DT O4 D0008 : score 3.9105 : V : THR CB B0106 <- 3.75 -> DT C7 D0008 : score 3.57023 : V : THR CB A0106 <- 3.76 -> DT C7 C0008 : score 3.56142 : x : LYS xxxx A0104 <- 4.26 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.24 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.53 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.11 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.45 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1eo3_B:Restriction_endonuclease-like; title=INHIBITION OF ECORV ENDONUCLEASE BY DEOXYRIBO-3'-S- PHOSPHOROTHIOLATES: A HIGH RESOLUTION X-RAY CRYSTALLOGRAPHIC STUDY organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 B0185 <- 2.90 -> DA N6 C0005 : score 5.90136 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.94 -> DA N7 C0005 : score 5.70614 : H : THR OG1 B0186 <- 2.77 -> DT O4 D0008 : score 3.9105 : V : THR CB B0106 <- 3.75 -> DT C7 D0008 : score 3.57023 : x : SER xxxx B0183 <- 3.11 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.45 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1eo4_AB:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV BOUND TO MN2+ AND COGNATE DNA CONTAINING A 3'S SUBSTITION AT THE CLEAVAGE SITE organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 A0185 <- 2.90 -> DA N6 D0005 : score 5.90136 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.99 -> DA N7 D0005 : score 5.64743 : H : THR OG1 A0186 <- 2.62 -> DT O4 C0008 : score 4.02712 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.92 -> DA N6 C0005 : score 5.87727 : H : ASN ND2 B0185 <- 3.12 -> DA N7 C0005 : score 5.4948 : H : THR OG1 B0186 <- 2.64 -> DT O4 D0008 : score 4.01157 : V : ASN CG B0188 <- 3.61 -> DT C7 D0008 : score 2.77399 : V : ASN CG A0188 <- 3.55 -> DT C7 C0008 : score 2.81372 : x : ASN xxxx A0070 <- 3.31 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0106 <- 3.62 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.31 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0070 <- 3.61 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.95 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.35 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1eo4_B:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV BOUND TO MN2+ AND COGNATE DNA CONTAINING A 3'S SUBSTITION AT THE CLEAVAGE SITE organism=Escherichia coli : w : ASN ND2 B0070 <- 5.52 -> DA N3 D0005 : score 2.277 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.92 -> DA N6 C0005 : score 5.87727 : H : ASN ND2 B0185 <- 3.12 -> DA N7 C0005 : score 5.4948 : H : THR OG1 B0186 <- 2.64 -> DT O4 D0008 : score 4.01157 : V : ASN CG B0188 <- 3.61 -> DT C7 D0008 : score 2.77399 : x : THR xxxx B0106 <- 3.95 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.35 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1eon_A:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV BOUND TO 3'-S-PHOSPHOROTHIOLATE DNA AND CA2+ organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 2.94 -> DC O2 D0009 : score 4.35406 : w : ASN OD1 A0070 <- 6.08 -> DT O2 D0008 : score 1.953 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.96 -> DA N6 D0005 : score 5.8291 : H : ASN ND2 A0185 <- 3.00 -> DA N7 D0005 : score 5.63569 : H : THR OG1 A0186 <- 2.70 -> DT O4 C0008 : score 3.96492 : V : THR CB A0106 <- 3.61 -> DT C7 C0008 : score 3.69365 : x : SER xxxx A0183 <- 3.26 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.43 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >1eon_AB:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV BOUND TO 3'-S-PHOSPHOROTHIOLATE DNA AND CA2+ organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 2.94 -> DC O2 D0009 : score 4.35406 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.96 -> DA N6 D0005 : score 5.8291 : H : ASN ND2 A0185 <- 3.00 -> DA N7 D0005 : score 5.63569 : H : THR OG1 A0186 <- 2.70 -> DT O4 C0008 : score 3.96492 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.95 -> DA N6 C0005 : score 5.84114 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.87 -> DA N7 C0005 : score 5.78833 : H : THR OG1 B0186 <- 2.59 -> DT O4 D0008 : score 4.05044 : V : ASN CG A0188 <- 3.51 -> DT C7 C0008 : score 2.8402 : x : THR xxxx A0106 <- 3.52 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.26 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.63 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.31 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.44 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1eoo_A:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV BOUND TO COGNATE DNA organism=Escherichia coli : w : ASN ND2 A0070 <- 5.37 -> DC O2 D0009 : score 1.885 : w : LYS NZ A0104 <- 6.15 -> DT O4 C0010 : score 1.7 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.62 -> DA N6 D0005 : score 6.23858 : H : ASN ND2 A0185 <- 3.03 -> DA N7 D0005 : score 5.60047 : H : THR OG1 A0186 <- 2.55 -> DT O4 C0008 : score 4.08154 : V : THR CG2 A0106 <- 3.57 -> DT C7 C0008 : score 4.48055 : x : SER xxxx A0183 <- 3.37 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.42 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >1eoo_AB:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV BOUND TO COGNATE DNA organism=Escherichia coli : w : LYS NZ A0104 <- 6.15 -> DT O4 C0010 : score 1.7 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.62 -> DA N6 D0005 : score 6.23858 : H : ASN ND2 A0185 <- 3.03 -> DA N7 D0005 : score 5.60047 : H : THR OG1 A0186 <- 2.55 -> DT O4 C0008 : score 4.08154 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.84 -> DA N6 C0005 : score 5.97362 : H : ASN ND2 B0185 <- 3.03 -> DA N7 C0005 : score 5.60047 : H : THR OG1 B0186 <- 2.65 -> DT O4 D0008 : score 4.00379 : V : THR CG2 A0106 <- 3.57 -> DT C7 C0008 : score 4.48055 : V : THR CB B0106 <- 3.80 -> DT C7 D0008 : score 3.52615 : x : ASN xxxx A0070 <- 3.85 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.37 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.42 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0070 <- 4.09 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.51 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.49 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1eop_A:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV BOUND TO COGNATE DNA organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 2.91 -> DC O2 D0009 : score 4.38094 : H : ASN OD1 A0185 <- 3.03 -> DA N6 D0005 : score 5.74479 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.94 -> DA N7 D0005 : score 5.70614 : H : THR OG1 A0186 <- 2.92 -> DT O4 C0008 : score 3.79389 : V : THR CB A0106 <- 3.70 -> DT C7 C0008 : score 3.61431 : x : LYS xxxx A0104 <- 3.73 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.30 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.41 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >1eop_AB:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV BOUND TO COGNATE DNA organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 2.91 -> DC O2 D0009 : score 4.38094 : H : ASN OD1 A0185 <- 3.03 -> DA N6 D0005 : score 5.74479 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.94 -> DA N7 D0005 : score 5.70614 : H : THR OG1 A0186 <- 2.92 -> DT O4 C0008 : score 3.79389 : H : ASN OD1 B0185 <- 3.02 -> DA N6 C0005 : score 5.75684 : H : ASN ND2 B0185 <- 3.03 -> DA N7 C0005 : score 5.60047 : H : THR OG1 B0186 <- 2.64 -> DT O4 D0008 : score 4.01157 : V : THR CB A0106 <- 3.70 -> DT C7 C0008 : score 3.61431 : V : ASN CG B0188 <- 3.67 -> DT C7 D0008 : score 2.73427 : x : LYS xxxx A0104 <- 3.73 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.30 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.41 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0070 <- 3.82 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 4.01 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.25 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1eqz_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=X-RAY STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE AT 2.5 A RESOLUTION organism=GALLUS GALLUS : H : ARG NH2 B0029 <- 2.62 -> DT O2 J0191 : score 4.38573 : H : ARG NH2 C0040 <- 2.65 -> DA N3 J0229 : score 3.33694 : w : ARG NH1 C0040 <- 5.39 -> DC O2 J0230 : score 1.381 : H : ARG NH2 G0040 <- 3.32 -> DA N3 I0082 : score 2.90281 : x : LYS xxxx B0031 <- 4.34 -> DG xxx J0268 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0033 <- 3.75 -> DG xxx J0267 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0041 <- 4.36 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0065 <- 3.37 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.88 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0045 <- 4.24 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0122 <- 4.48 -> DT xxx I0143 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0065 <- 3.92 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0083 <- 3.84 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0032 <- 4.38 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0045 <- 4.22 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx >1eqz_E:Histone-fold; title=X-RAY STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE AT 2.5 A RESOLUTION organism=GALLUS GALLUS : x : SER xxxx E0122 <- 4.48 -> DT xxx I0143 : score x.xxxxx >1eri_A:Restriction_endonuclease-like; title=X-RAY STRUCTURE OF THE DNA-ECO RI ENDONUCLEASE-DNA RECOGNITION COMPLEX: THE RECOGNITION NETWORK AND THE INTEGRATION OF RECOGNITION AND CLEAVAGE organism=ESCHERICHIA COLI : w : LYS NZ A0089 <- 6.36 -> DC O2 B0004 : score 1.3 : H : ARG NE A0145 <- 3.10 -> DA N7 B0007 : score -8.56485 : V : GLN CG A0115 <- 3.81 -> DT C7 B0008 : score 3.24725 : x : MET xxxx A0137 <- 4.09 -> DC xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0138 <- 3.89 -> DC xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0141 <- 3.50 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0142 <- 3.15 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >1esg_A:Restriction_endonuclease-like; title=RESTRICTION ENDONUCLEASE BAMHI BOUND TO A NON-SPECIFIC DNA. organism=Bacillus amyloliquefaciens : H : ARG NH2 A0155 <- 3.43 -> DG O6 D0002 : score 5.7684 : H : SER OG A0195 <- 3.29 -> DA N3 D0008 : score 2.70947 : x : ASP xxxx A0196 <- 4.31 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx >1esg_AB:Restriction_endonuclease-like; title=RESTRICTION ENDONUCLEASE BAMHI BOUND TO A NON-SPECIFIC DNA. organism=Bacillus amyloliquefaciens : H : ARG NH2 A0155 <- 3.43 -> DG O6 D0002 : score 5.7684 : H : SER OG A0195 <- 3.29 -> DA N3 D0008 : score 2.70947 : x : ASP xxxx A0196 <- 4.31 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0155 <- 3.82 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >1evw_AB:His-Me_finger_endonucleases; title=L116A MUTANT OF THE HOMING ENDONUCLEASE I-PPOI COMPLEXED TO HOMING SITE DNA. organism=Physarum polycephalum : H : ARG NE A0061 <- 2.96 -> DG N7 O0014 : score 4.2803 : H : GLN OE1 A0063 <- 3.12 -> DA N6 O0016 : score 5.6652 : H : GLN NE2 A0063 <- 3.14 -> DA N7 O0016 : score 5.67564 : H : LYS NZ A0065 <- 3.14 -> DG O6 E0004 : score 5.38768 : H : ARG NH1 A0074 <- 2.84 -> DG O6 O0017 : score 6.03467 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.68 -> DG N7 O0017 : score 6.53785 : H : ASN ND2 B0057 <- 2.64 -> DG O6 M0016 : score 5.81889 : H : ARG NE B0061 <- 3.06 -> DA N7 M0015 : score -8.63774 : H : GLN OE1 B0063 <- 2.83 -> DA N6 M0017 : score 6.01625 : H : GLN NE2 B0063 <- 3.15 -> DA N7 M0017 : score 5.66346 : H : ARG NH1 B0074 <- 2.84 -> DG N7 M0018 : score 6.0016 : H : ARG NH2 B0074 <- 2.77 -> DG O6 M0018 : score 6.6396 : V : VAL CG1 B0072 <- 3.65 -> DT C7 F0001 : score 6.28778 : V : VAL CG1 A0072 <- 3.87 -> DT C7 E0002 : score 5.95445 : x : ALA xxxx A0055 <- 3.67 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0057 <- 3.19 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0067 <- 3.86 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0120 <- 4.21 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0055 <- 4.29 -> DA xxx F0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0065 <- 2.98 -> DG xxx F0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0067 <- 3.61 -> DT xxx F0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0120 <- 4.09 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx >1evw_B:His-Me_finger_endonucleases; title=L116A MUTANT OF THE HOMING ENDONUCLEASE I-PPOI COMPLEXED TO HOMING SITE DNA. organism=Physarum polycephalum : H : ASN ND2 B0057 <- 2.64 -> DG O6 M0016 : score 5.81889 : H : ARG NE B0061 <- 3.06 -> DA N7 M0015 : score -8.63774 : H : GLN OE1 B0063 <- 2.83 -> DA N6 M0017 : score 6.01625 : H : GLN NE2 B0063 <- 3.15 -> DA N7 M0017 : score 5.66346 : H : ARG NH1 B0074 <- 2.84 -> DG N7 M0018 : score 6.0016 : H : ARG NH2 B0074 <- 2.77 -> DG O6 M0018 : score 6.6396 : V : VAL CG1 B0072 <- 3.65 -> DT C7 F0001 : score 6.28778 : x : ALA xxxx B0055 <- 4.29 -> DA xxx F0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0065 <- 2.98 -> DG xxx F0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0067 <- 3.61 -> DT xxx F0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0120 <- 4.09 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx >1evw_CD:His-Me_finger_endonucleases; title=L116A MUTANT OF THE HOMING ENDONUCLEASE I-PPOI COMPLEXED TO HOMING SITE DNA. organism=Physarum polycephalum : H : ARG NE C0061 <- 2.69 -> DG N7 P0014 : score 4.51907 : H : LYS NZ C0065 <- 2.82 -> DG N7 G0003 : score 5.36435 : H : ARG NH1 C0074 <- 3.30 -> DG N7 P0017 : score 5.445 : H : ARG NH2 C0074 <- 2.81 -> DG O6 P0017 : score 6.5868 : H : ASN ND2 D0057 <- 2.90 -> DG O6 N0016 : score 5.52569 : H : ARG NE D0061 <- 3.04 -> DA N7 N0015 : score -8.67418 : H : LYS NZ D0065 <- 2.73 -> DG N7 H0002 : score 5.4613 : H : ARG NH1 D0074 <- 3.34 -> DG N7 N0018 : score 5.3966 : H : ARG NH2 D0074 <- 3.01 -> DG O6 N0018 : score 6.3228 : x : ALA xxxx C0055 <- 3.38 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0057 <- 2.99 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0063 <- 2.84 -> DA xxx P0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0072 <- 4.25 -> DT xxx G0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0120 <- 4.46 -> DA xxx H0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0055 <- 4.32 -> DC xxx H0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0063 <- 2.73 -> DA xxx N0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0067 <- 2.99 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0072 <- 3.07 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx >1ewn_A:FMT_C-terminal_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN AAG DNA REPAIR GLYCOSYLASE COMPLEXED WITH 1,N6-ETHENOADENINE-DNA organism=Homo sapiens : V : TYR CZ A0162 <- 3.84 -> DT C7 D0008 : score 5.52369 : x : MET xxxx A0164 <- 3.35 -> DA xxx E0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0165 <- 3.10 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1ewq_A:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE TAQ MUTS COMPLEXED WITH A HETERODUPLEX DNA AT 2.2 A RESOLUTION organism=Thermus aquaticus : x : PHE xxxx A0039 <- 3.37 -> DG xxx C1914 : score x.xxxxx >1ewq_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE TAQ MUTS COMPLEXED WITH A HETERODUPLEX DNA AT 2.2 A RESOLUTION organism=Thermus aquaticus : x : PHE xxxx A0039 <- 3.37 -> DG xxx C1914 : score x.xxxxx >1exi_A:Probable_bacterial_effector-binding_domain;Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSCRIPTION ACTIVATOR BMRR, FROM B. SUBTILIS, BOUND TO 21 BASE PAIR BMR OPERATOR AND TPSB organism=Bacillus subtilis : x : ARG xxxx A0023 <- 2.91 -> DC xxx M-008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0042 <- 2.86 -> DC xxx M-010 : score x.xxxxx >1exj_A:Probable_bacterial_effector-binding_domain;Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSCRIPTION ACTIVATOR BMRR, FROM B. SUBTILIS, BOUND TO 21 BASE PAIR BMR OPERATOR AND TPP organism=Bacillus subtilis : x : ARG xxxx A0023 <- 2.79 -> DT xxx M-007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0042 <- 3.31 -> DC xxx M-010 : score x.xxxxx >1eyg_ABD:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CHYMOTRYPTIC FRAGMENT OF E. COLI SSB BOUND TO TWO 35-MER SINGLE STRAND DNAS organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A1033 <- 2.37 -> DC N4 R0124 : score 4.3802 : H : THR OG1 A1085 <- 2.95 -> DC O2 R0107 : score 2.54687 : H : SER OG B2037 <- 2.86 -> DC N4 R0104 : score 3.63153 : H : GLU OE2 B2050 <- 2.23 -> DC N4 R0103 : score 5.86564 >1eyg_D:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CHYMOTRYPTIC FRAGMENT OF E. COLI SSB BOUND TO TWO 35-MER SINGLE STRAND DNAS organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 D4003 <- 2.43 -> DC O2 Q0003 : score 3.9201 : H : ARG NH2 D4003 <- 2.73 -> DC N3 Q0004 : score 2.3231 : H : ASN OD1 D4013 <- 3.11 -> DC N4 Q0020 : score 3.93359 : w : GLU OE2 D4053 <- 5.96 -> DC N4 Q0024 : score 3.597 : w : THR OG1 D4085 <- 5.59 -> DC O2 Q0007 : score 2.048 >1eyu_AB:Restriction_endonuclease-like; title=HIGH RESOLUTION STRUCTURE OF THE PVUII ENDONCULEASE/COGNATE DNA COMPLEX AT PH 4.6 organism=Proteus vulgaris : w : GLN OE1 A0033 <- 5.61 -> DC O2 C0009 : score 1.091 : H : ASP OD1 A0034 <- 3.25 -> DG N2 D0008 : score 4.6865 : H : HIS ND1 A0084 <- 2.81 -> DG O6 C0008 : score 6.21063 : H : ASN ND2 A0141 <- 3.05 -> DG O6 D0011 : score 5.35654 : H : LYS NZ A0143 <- 2.94 -> DG O6 D0011 : score 5.61891 : H : LYS NZ A0143 <- 2.69 -> DG O6 D0012 : score 5.90795 : w : GLN NE2 B0033 <- 5.68 -> DC O2 D0009 : score 2.699 : H : ASP OD1 B0034 <- 3.17 -> DG N2 C0008 : score 4.7689 : w : THR OG1 B0077 <- 5.48 -> DG N7 C0012 : score 3.422 : H : HIS ND1 B0084 <- 2.86 -> DG O6 D0008 : score 6.1484 : H : ASN OD1 B0140 <- 2.88 -> DA N6 D0007 : score 5.92545 : H : ASN ND2 B0140 <- 3.08 -> DA N7 D0007 : score 5.54176 : H : ASN ND2 B0141 <- 2.94 -> DG O6 C0011 : score 5.48058 : H : LYS NZ B0143 <- 2.95 -> DG O6 C0011 : score 5.60735 : H : LYS NZ B0143 <- 2.81 -> DG O6 C0012 : score 5.76921 : x : THR xxxx A0077 <- 4.48 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0081 <- 3.28 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0140 <- 2.84 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0081 <- 3.37 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx >1eyu_B:Restriction_endonuclease-like; title=HIGH RESOLUTION STRUCTURE OF THE PVUII ENDONCULEASE/COGNATE DNA COMPLEX AT PH 4.6 organism=Proteus vulgaris : w : GLN NE2 B0033 <- 5.68 -> DC O2 D0009 : score 2.699 : H : ASP OD1 B0034 <- 3.17 -> DG N2 C0008 : score 4.7689 : w : THR OG1 B0077 <- 5.48 -> DG N7 C0012 : score 3.422 : H : HIS ND1 B0084 <- 2.86 -> DG O6 D0008 : score 6.1484 : H : ASN OD1 B0140 <- 2.88 -> DA N6 D0007 : score 5.92545 : H : ASN ND2 B0140 <- 3.08 -> DA N7 D0007 : score 5.54176 : H : ASN ND2 B0141 <- 2.94 -> DG O6 C0011 : score 5.48058 : H : LYS NZ B0143 <- 2.95 -> DG O6 C0011 : score 5.60735 : H : LYS NZ B0143 <- 2.81 -> DG O6 C0012 : score 5.76921 : x : SER xxxx B0081 <- 3.37 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx >1f0o_AB:Restriction_endonuclease-like; title=PVUII ENDONUCLEASE/COGNATE DNA COMPLEX (GLUTARALDEHYDE-CROSSLINKED CRYSTAL) AT PH 7.5 WITH TWO CALCIUM IONS AT EACH ACTIVE SITE organism=Proteus vulgaris : H : ASP OD1 A0034 <- 2.79 -> DG N2 D0008 : score 5.1603 : w : ASP OD2 A0034 <- 6.06 -> DT O2 C0010 : score 1.008 : w : THR OG1 A0077 <- 6.02 -> DT O4 D0013 : score 2.809 : H : ASN ND2 A0141 <- 2.94 -> DG O6 D0011 : score 5.48058 : H : LYS NZ A0143 <- 2.48 -> DG O6 D0012 : score 6.15074 : H : ASP OD1 B0034 <- 2.90 -> DG N2 C0008 : score 5.047 : w : ASP OD2 B0034 <- 6.20 -> DT O2 D0010 : score 1.008 : H : HIS ND1 B0084 <- 2.85 -> DG O6 D0008 : score 6.16085 : H : ASN OD1 B0140 <- 2.87 -> DA N6 D0007 : score 5.93749 : H : ASN ND2 B0140 <- 3.09 -> DA N7 D0007 : score 5.53002 : H : ASN ND2 B0141 <- 2.85 -> DG O6 C0011 : score 5.58208 : H : LYS NZ B0143 <- 2.93 -> DG O6 C0011 : score 5.63047 : H : LYS NZ B0143 <- 2.71 -> DG O6 C0012 : score 5.88482 : V : SER CB B0081 <- 3.89 -> DT C7 C0010 : score 3.06083 : x : SER xxxx A0081 <- 3.28 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0084 <- 3.15 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0140 <- 2.86 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0033 <- 4.11 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx >1f0o_B:Restriction_endonuclease-like; title=PVUII ENDONUCLEASE/COGNATE DNA COMPLEX (GLUTARALDEHYDE-CROSSLINKED CRYSTAL) AT PH 7.5 WITH TWO CALCIUM IONS AT EACH ACTIVE SITE organism=Proteus vulgaris : H : ASP OD1 B0034 <- 2.90 -> DG N2 C0008 : score 5.047 : w : ASP OD2 B0034 <- 6.20 -> DT O2 D0010 : score 1.008 : H : HIS ND1 B0084 <- 2.85 -> DG O6 D0008 : score 6.16085 : H : ASN OD1 B0140 <- 2.87 -> DA N6 D0007 : score 5.93749 : H : ASN ND2 B0140 <- 3.09 -> DA N7 D0007 : score 5.53002 : H : ASN ND2 B0141 <- 2.85 -> DG O6 C0011 : score 5.58208 : H : LYS NZ B0143 <- 2.93 -> DG O6 C0011 : score 5.63047 : H : LYS NZ B0143 <- 2.71 -> DG O6 C0012 : score 5.88482 : V : SER CB B0081 <- 3.89 -> DT C7 C0010 : score 3.06083 : x : GLN xxxx B0033 <- 4.11 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx >1f0v_AB:RNase_A-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN RNASE A DIMER DISPLAYING A NEW TYPE OF 3D DOMAIN SWAPPING organism=BOS TAURUS : H : THR OG1 B0245 <- 2.76 -> DG N7 N0754 : score 3.52671 : w : GLU OE1 B0286 <- 5.62 -> DC N4 N0753 : score 3.528 >1f0v_CD:RNase_A-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN RNASE A DIMER DISPLAYING A NEW TYPE OF 3D DOMAIN SWAPPING organism=BOS TAURUS : H : THR OG1 D0645 <- 2.75 -> DG N7 P0758 : score 3.53371 : w : GLU OE1 D0686 <- 5.59 -> DC N4 P0757 : score 3.528 >1f2i_GH:C2H2_and_C2HC_zinc_fingers; title=COCRYSTAL STRUCTURE OF SELECTED ZINC FINGER DIMER BOUND TO DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 G1118 <- 3.19 -> DG N7 A1007 : score 5.5781 : H : ARG NH2 G1118 <- 2.71 -> DG O6 A1007 : score 6.7188 : w : ASP OD2 G1120 <- 6.35 -> DC N4 A1006 : score 3.623 : w : ASP OD2 G1120 <- 5.72 -> DC N4 B2008 : score 3.623 : H : ARG NH2 G1124 <- 3.13 -> DG O6 B2009 : score 6.1644 : H : ARG NH2 G1124 <- 2.70 -> DG O6 A1005 : score 6.732 : H : ARG NH1 G1146 <- 2.85 -> DG N7 A1004 : score 5.9895 : H : ARG NH2 G1146 <- 2.71 -> DG O6 A1004 : score 6.7188 : H : ASP OD2 G1148 <- 3.06 -> DC N4 B2010 : score 5.8776 : w : ASP OD2 G1148 <- 6.07 -> DC N4 B2011 : score 3.623 : H : HIS NE2 G1149 <- 2.57 -> DG N7 A1003 : score 7.11548 : H : ARG NH1 H2118 <- 3.17 -> DG N7 B2007 : score 5.6023 : H : ARG NH2 H2118 <- 2.71 -> DG O6 B2007 : score 6.7188 : H : ARG NH1 H2124 <- 2.93 -> DG O6 B2005 : score 5.92517 : H : ARG NH2 H2124 <- 2.91 -> DG N7 B2005 : score 6.24415 : w : ARG NH1 H2124 <- 5.96 -> DG O6 A1009 : score 2.756 : H : ARG NH1 H2146 <- 2.92 -> DG N7 B2004 : score 5.9048 : H : ARG NH2 H2146 <- 2.92 -> DG O6 B2004 : score 6.4416 : H : ASP OD2 H2148 <- 3.14 -> DC N4 A1010 : score 5.7784 : H : HIS NE2 H2149 <- 2.73 -> DG N7 B2003 : score 6.8978 : x : GLU xxxx G1121 <- 3.27 -> DC xxx A1006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx H2120 <- 3.89 -> DC xxx A1008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H2121 <- 3.66 -> DC xxx B2006 : score x.xxxxx >1f2i_IJ:C2H2_and_C2HC_zinc_fingers; title=COCRYSTAL STRUCTURE OF SELECTED ZINC FINGER DIMER BOUND TO DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH2 I3118 <- 2.97 -> DG O6 C3007 : score 6.3756 : w : ASP OD2 I3120 <- 5.70 -> DC N4 D4008 : score 3.623 : H : ARG NH1 I3124 <- 3.30 -> DG O6 C3005 : score 5.475 : H : ARG NH2 I3124 <- 3.05 -> DG N7 C3005 : score 6.06538 : H : ARG NH1 I3146 <- 2.98 -> DG N7 C3004 : score 5.8322 : H : ARG NH2 I3146 <- 2.83 -> DG O6 C3004 : score 6.5604 : w : SER OG I3147 <- 5.95 -> DG N7 D4009 : score 2.749 : H : ASP OD2 I3148 <- 3.09 -> DC N4 D4010 : score 5.8404 : w : ASP OD2 I3148 <- 5.94 -> DC N4 D4011 : score 3.623 : H : HIS NE2 I3149 <- 2.81 -> DG N7 C3003 : score 6.78896 : H : ARG NH1 J4118 <- 3.19 -> DG N7 D4007 : score 5.5781 : H : ARG NH2 J4118 <- 2.87 -> DG O6 D4007 : score 6.5076 : w : ASP OD2 J4120 <- 5.77 -> DC N4 C3008 : score 3.623 : H : ARG NH1 J4124 <- 2.74 -> DG O6 D4005 : score 6.15633 : H : ARG NH2 J4124 <- 2.59 -> DG N7 D4005 : score 6.65277 : w : ARG NH1 J4124 <- 5.75 -> DG O6 C3009 : score 2.756 : H : ARG NH1 J4146 <- 2.74 -> DG N7 D4004 : score 6.1226 : H : ARG NH2 J4146 <- 2.80 -> DG O6 D4004 : score 6.6 : H : ASP OD2 J4148 <- 2.93 -> DC N4 C3010 : score 6.0388 : w : ASP OD2 J4148 <- 6.23 -> DC N4 C3011 : score 3.623 : H : HIS NE2 J4149 <- 2.82 -> DG N7 D4003 : score 6.77535 : x : GLU xxxx I3121 <- 3.33 -> DG xxx C3005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx J4121 <- 3.43 -> DC xxx D4006 : score x.xxxxx >1f2i_J:C2H2_and_C2HC_zinc_fingers; title=COCRYSTAL STRUCTURE OF SELECTED ZINC FINGER DIMER BOUND TO DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 J4118 <- 3.19 -> DG N7 D4007 : score 5.5781 : H : ARG NH2 J4118 <- 2.87 -> DG O6 D4007 : score 6.5076 : w : ASP OD2 J4120 <- 5.77 -> DC N4 C3008 : score 3.623 : H : ARG NH1 J4124 <- 2.74 -> DG O6 D4005 : score 6.15633 : H : ARG NH2 J4124 <- 2.59 -> DG N7 D4005 : score 6.65277 : w : ARG NH1 J4124 <- 5.75 -> DG O6 C3009 : score 2.756 : H : ARG NH1 J4146 <- 2.74 -> DG N7 D4004 : score 6.1226 : H : ARG NH2 J4146 <- 2.80 -> DG O6 D4004 : score 6.6 : H : ASP OD2 J4148 <- 2.93 -> DC N4 C3010 : score 6.0388 : w : ASP OD2 J4148 <- 6.23 -> DC N4 C3011 : score 3.623 : H : HIS NE2 J4149 <- 2.82 -> DG N7 D4003 : score 6.77535 >1f2i_KL:C2H2_and_C2HC_zinc_fingers; title=COCRYSTAL STRUCTURE OF SELECTED ZINC FINGER DIMER BOUND TO DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 K5118 <- 3.00 -> DG N7 E5007 : score 5.808 : H : ARG NH1 K5118 <- 3.14 -> DG O6 E5007 : score 5.66967 : H : ARG NH2 K5118 <- 2.72 -> DG O6 E5007 : score 6.7056 : w : ASP OD2 K5120 <- 5.95 -> DC N4 E5006 : score 3.623 : w : ASP OD2 K5120 <- 5.75 -> DC N4 F6008 : score 3.623 : H : ARG NH1 K5124 <- 3.05 -> DG O6 E5005 : score 5.77917 : H : ARG NH2 K5124 <- 3.03 -> DG N7 E5005 : score 6.09092 : w : ARG NH1 K5124 <- 5.50 -> DG O6 F6009 : score 2.756 : H : ARG NH1 K5146 <- 3.09 -> DG N7 E5004 : score 5.6991 : H : ARG NH2 K5146 <- 2.87 -> DG O6 E5004 : score 6.5076 : H : ASP OD2 K5148 <- 3.01 -> DC N4 F6010 : score 5.9396 : H : HIS NE2 K5149 <- 2.76 -> DG N7 E5003 : score 6.85698 : H : ARG NH1 L6118 <- 3.18 -> DG N7 F6007 : score 5.5902 : H : ARG NH2 L6118 <- 2.54 -> DG O6 F6007 : score 6.9432 : H : ARG NH1 L6124 <- 3.06 -> DG O6 F6005 : score 5.767 : H : ARG NH2 L6124 <- 3.01 -> DG N7 F6005 : score 6.11646 : H : ARG NH1 L6146 <- 3.02 -> DG N7 F6004 : score 5.7838 : H : ARG NH2 L6146 <- 3.04 -> DG O6 F6004 : score 6.2832 : H : HIS NE2 L6149 <- 2.81 -> DG N7 F6003 : score 6.78896 : x : GLU xxxx K5121 <- 3.28 -> DC xxx E5006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L6120 <- 3.79 -> DC xxx E5008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L6121 <- 3.25 -> DC xxx F6006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L6148 <- 3.42 -> DC xxx E5010 : score x.xxxxx >1f44_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TRIMERIC CRE RECOMBINASE-LOX COMPLEX organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ A0043 <- 2.87 -> DG N7 M0010 : score 5.31049 : H : MET SD A0044 <- 3.33 -> DA N6 M0012 : score 5.34222 : H : GLN NE2 A0090 <- 3.19 -> DT O4 N0007 : score 4.78613 : H : GLN NE2 A0090 <- 2.75 -> DT O4 M0013 : score 5.24294 : w : ARG NH2 A0241 <- 5.38 -> DA N3 M0005 : score 2.092 : w : ARG NH2 A0241 <- 5.49 -> DT O2 N0016 : score 2.261 : H : ARG NH1 A0243 <- 2.64 -> DT O2 N0017 : score 4.44422 : w : ARG NH1 A0243 <- 5.43 -> DA N3 N0018 : score 2.585 : H : LYS NZ A0244 <- 2.34 -> DT O2 N0019 : score 3.9172 : H : LYS NZ A0244 <- 2.32 -> DT O2 M0003 : score 3.93155 : H : ARG NE A0259 <- 2.93 -> DG O6 N0012 : score 3.83856 : H : ARG NH2 A0259 <- 2.98 -> DG N7 N0012 : score 6.15477 : w : GLU OE1 A0262 <- 5.81 -> DC N4 N0011 : score 3.528 : H : ARG NH2 A0282 <- 2.64 -> DA N3 M0012 : score 3.34342 : w : ARG NH2 A0282 <- 5.04 -> DA N3 N0010 : score 2.092 : x : HIS xxxx A0040 <- 3.33 -> DT xxx N0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.78 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.77 -> DT xxx M0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0086 <- 3.21 -> DA xxx M0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.46 -> DT xxx M0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 4.03 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.72 -> DT xxx M0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0320 <- 3.71 -> DC xxx M0016 : score x.xxxxx >1f4k_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE REPLICATION TERMINATOR PROTEIN/B-SITE DNA COMPLEX organism=Bacillus subtilis : H : HIS NE2 A0054 <- 2.97 -> DG O6 E0005 : score 7.68342 : H : ARG NH1 A0059 <- 3.11 -> DG O6 D0014 : score 5.70617 : H : ARG NH2 A0059 <- 2.82 -> DG N7 D0014 : score 6.35908 : H : HIS NE2 B0054 <- 2.86 -> DG O6 D0005 : score 7.8584 : H : THR OG1 B0055 <- 3.21 -> DT O4 E0015 : score 3.56843 : H : ARG NH1 B0059 <- 2.74 -> DG O6 E0014 : score 6.15633 : H : ARG NH2 B0059 <- 2.88 -> DG N7 E0014 : score 6.28246 : V : ASN CG A0053 <- 3.65 -> DT C7 D0015 : score 2.74751 : V : ASN CG B0053 <- 3.61 -> DT C7 E0015 : score 2.77399 : x : ARG xxxx A0016 <- 3.22 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0035 <- 3.79 -> DA xxx E0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0055 <- 2.94 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0056 <- 4.46 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0058 <- 3.37 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0016 <- 3.16 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0035 <- 3.84 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0056 <- 4.32 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0058 <- 3.32 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >1f4k_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE REPLICATION TERMINATOR PROTEIN/B-SITE DNA COMPLEX organism=Bacillus subtilis : H : HIS NE2 B0054 <- 2.86 -> DG O6 D0005 : score 7.8584 : H : THR OG1 B0055 <- 3.21 -> DT O4 E0015 : score 3.56843 : H : ARG NH1 B0059 <- 2.74 -> DG O6 E0014 : score 6.15633 : H : ARG NH2 B0059 <- 2.88 -> DG N7 E0014 : score 6.28246 : V : ASN CG B0053 <- 3.61 -> DT C7 E0015 : score 2.77399 : x : ARG xxxx B0016 <- 3.16 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0035 <- 3.84 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0056 <- 4.32 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0058 <- 3.32 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >1f4r_A:FMT_C-terminal_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN AAG DNA REPAIR GLYCOSYLASE COMPLEXED WITH 1,N6-ETHENOADENINE-DNA organism=Homo sapiens : V : TYR CZ A0162 <- 3.80 -> DT C7 D0008 : score 5.57949 : x : MET xxxx A0164 <- 3.44 -> DA xxx E0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0165 <- 3.14 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1f4s_P:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF TRANSCRIPTIONAL FACTOR ALCR IN COMPLEX WITH A TARGET DNA organism=EMERICELLA NIDULANS : H : ARG NE P0006 <- 2.84 -> DA N3 B0002 : score 2.08574 : H : LYS NZ P0019 <- 2.42 -> DG N7 A0007 : score 5.79523 : H : ARG NE P0020 <- 2.69 -> DG N7 B0006 : score 4.51907 : H : ARG NE P0020 <- 2.64 -> DG O6 B0006 : score 4.06714 : H : ARG NH2 P0020 <- 2.77 -> DG N7 B0006 : score 6.42292 : H : ARG NH2 P0044 <- 2.92 -> DT O4 A0003 : score 3.46855 : x : MET xxxx P0001 <- 2.51 -> DT xxx A0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0005 <- 3.06 -> DG xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0016 <- 4.19 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0021 <- 3.17 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx P0045 <- 2.55 -> DG xxx A0004 : score x.xxxxx >1f5e_P:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF TRANSCRIPTIONAL FACTOR ALCR IN COMPLEX WITH A TARGET DNA organism=EMERICELLA NIDULANS : H : ARG NH2 P0005 <- 2.74 -> DG N3 A0007 : score 3.65358 : H : LYS NZ P0019 <- 2.96 -> DG N7 A0006 : score 5.21355 : H : LYS NZ P0019 <- 2.44 -> DG N7 A0007 : score 5.77368 : H : ARG NE P0020 <- 2.79 -> DG N7 B0006 : score 4.43064 : H : ARG NE P0020 <- 2.52 -> DG O6 B0006 : score 4.16172 : H : ARG NH2 P0020 <- 2.33 -> DG N7 B0006 : score 6.98477 : V : ARG CZ P0044 <- 3.54 -> DT C7 A0003 : score 2.27091 : x : ARG xxxx P0006 <- 1.81 -> DA xxx B0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0016 <- 3.97 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0021 <- 3.43 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx P0045 <- 2.60 -> DG xxx A0004 : score x.xxxxx >1f5t_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain; title=DIPHTHERIA TOX REPRESSOR (C102D MUTANT) COMPLEXED WITH NICKEL AND DTXR CONSENSUS BINDING SEQUENCE organism=Corynebacterium diphtheriae : x : SER xxxx A1037 <- 3.23 -> DT xxx F0421 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1039 <- 3.50 -> DT xxx F0421 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1040 <- 3.24 -> DC xxx F0420 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1043 <- 3.38 -> DG xxx F0418 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1047 <- 4.10 -> DG xxx F0418 : score x.xxxxx >1f5t_ABCD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain; title=DIPHTHERIA TOX REPRESSOR (C102D MUTANT) COMPLEXED WITH NICKEL AND DTXR CONSENSUS BINDING SEQUENCE organism=Corynebacterium diphtheriae : H : GLN OE1 B2043 <- 2.90 -> DC N4 E0321 : score 4.49167 : H : GLN OE1 D4043 <- 3.04 -> DC N4 F0424 : score 4.36333 : V : PRO CG D4039 <- 3.77 -> DT C7 F0426 : score 6.40667 : x : SER xxxx A1037 <- 3.23 -> DT xxx F0421 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1039 <- 3.50 -> DT xxx F0421 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1040 <- 3.24 -> DC xxx F0420 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1043 <- 3.38 -> DG xxx F0418 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1047 <- 4.10 -> DG xxx F0418 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B2002 <- 4.37 -> DT xxx F0416 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B2037 <- 3.31 -> DT xxx E0323 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B2039 <- 3.10 -> DT xxx E0323 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B2040 <- 3.69 -> DC xxx E0322 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B2042 <- 4.08 -> DT xxx F0410 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B2047 <- 3.75 -> DA xxx E0320 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C3037 <- 2.99 -> DT xxx E0318 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C3039 <- 3.39 -> DT xxx F0416 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C3040 <- 3.40 -> DC xxx E0317 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C3042 <- 4.46 -> DT xxx F0415 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C3043 <- 3.09 -> DC xxx E0317 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C3047 <- 4.33 -> DG xxx E0315 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D4002 <- 3.66 -> DA xxx F0423 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D4037 <- 3.56 -> DT xxx F0426 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D4040 <- 3.33 -> DC xxx F0425 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D4042 <- 4.46 -> DT xxx E0307 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D4047 <- 3.69 -> DA xxx F0423 : score x.xxxxx >1f66_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=2.6 A CRYSTAL STRUCTURE OF A NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING THE VARIANT HISTONE H2A.Z organism=HOMO SAPIENS / XENOPUS LAEVIS / MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.72 -> DA N3 J0229 : score 3.29158 : H : ARG NH1 E0640 <- 3.14 -> DA N3 I0082 : score 3.43167 : H : ARG NH1 H1430 <- 3.08 -> DG N3 I0122 : score 2.88162 : x : LEU xxxx A0465 <- 4.10 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 4.08 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.17 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0641 <- 4.05 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 4.24 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 3.98 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.37 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0245 <- 4.35 -> DG xxx J0214 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G1045 <- 4.23 -> DA xxx I0111 : score x.xxxxx >1f6o_A:FMT_C-terminal_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN AAG DNA REPAIR GLYCOSYLASE COMPLEXED WITH DNA organism=Homo sapiens : V : TYR CZ A0162 <- 3.77 -> DT C7 D0008 : score 5.62133 : x : MET xxxx A0164 <- 3.27 -> DT xxx E0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0165 <- 3.14 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1fiu_AB:Restriction_endonuclease-like; title=TETRAMERIC RESTRICTION ENDONUCLEASE NGOMIV IN COMPLEX WITH CLEAVED DNA organism=Neisseria gonorrhoeae : H : ASP OD2 A0034 <- 2.98 -> DC N4 J0009 : score 5.9768 : H : SER OG A0036 <- 2.80 -> DC N4 E0003 : score 3.67564 : H : GLN NE2 A0063 <- 2.82 -> DC O2 I0009 : score 3.68009 : H : ARG NE A0191 <- 2.84 -> DG O6 J0008 : score 3.9095 : H : ARG NH2 A0191 <- 2.96 -> DG N7 J0008 : score 6.18031 : H : ASP OD1 A0193 <- 2.86 -> DC N4 I0006 : score 5.28073 : H : ASP OD2 A0193 <- 3.06 -> DC N4 I0005 : score 5.8776 : H : ARG NE A0194 <- 3.12 -> DG O6 J0007 : score 3.6888 : H : ARG NH2 A0194 <- 2.99 -> DG N7 J0007 : score 6.142 : H : ARG NH2 A0227 <- 2.76 -> DG O6 E0004 : score 6.6528 : H : ASP OD2 B0034 <- 3.02 -> DC N4 I0009 : score 5.9272 : H : SER OG B0036 <- 2.95 -> DC N4 F0003 : score 3.56537 : H : GLN NE2 B0063 <- 2.76 -> DC O2 J0009 : score 3.72443 : H : ARG NE B0191 <- 2.82 -> DG O6 I0008 : score 3.92526 : H : ARG NH2 B0191 <- 2.93 -> DG N7 I0008 : score 6.21862 : H : ASP OD1 B0193 <- 2.84 -> DC N4 J0006 : score 5.30211 : H : ASP OD2 B0193 <- 3.19 -> DC N4 J0005 : score 5.7164 : H : ARG NE B0194 <- 3.08 -> DG O6 I0007 : score 3.72033 : H : ARG NH2 B0194 <- 2.95 -> DG N7 I0007 : score 6.19308 : H : ARG NH2 B0227 <- 2.74 -> DG O6 F0004 : score 6.6792 : w : ARG NE B0227 <- 5.65 -> DG N7 F0004 : score 1.593 : x : SER xxxx A0192 <- 3.37 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0192 <- 3.37 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx >1fiu_B:Restriction_endonuclease-like; title=TETRAMERIC RESTRICTION ENDONUCLEASE NGOMIV IN COMPLEX WITH CLEAVED DNA organism=Neisseria gonorrhoeae : H : ASP OD2 B0034 <- 3.02 -> DC N4 I0009 : score 5.9272 : H : SER OG B0036 <- 2.95 -> DC N4 F0003 : score 3.56537 : H : GLN NE2 B0063 <- 2.76 -> DC O2 J0009 : score 3.72443 : H : ARG NE B0191 <- 2.82 -> DG O6 I0008 : score 3.92526 : H : ARG NH2 B0191 <- 2.93 -> DG N7 I0008 : score 6.21862 : H : ASP OD1 B0193 <- 2.84 -> DC N4 J0006 : score 5.30211 : H : ASP OD2 B0193 <- 3.19 -> DC N4 J0005 : score 5.7164 : H : ARG NE B0194 <- 3.08 -> DG O6 I0007 : score 3.72033 : H : ARG NH2 B0194 <- 2.95 -> DG N7 I0007 : score 6.19308 : H : ARG NH2 B0227 <- 2.74 -> DG O6 F0004 : score 6.6792 : w : ARG NE B0227 <- 5.65 -> DG N7 F0004 : score 1.593 : x : SER xxxx B0192 <- 3.37 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx >1fiu_CD:Restriction_endonuclease-like; title=TETRAMERIC RESTRICTION ENDONUCLEASE NGOMIV IN COMPLEX WITH CLEAVED DNA organism=Neisseria gonorrhoeae : H : ASP OD2 C0034 <- 3.06 -> DC N4 K0009 : score 5.8776 : H : SER OG C0036 <- 2.94 -> DC N4 H0003 : score 3.57272 : H : GLN NE2 C0063 <- 2.79 -> DC O2 L0009 : score 3.70226 : H : ARG NE C0191 <- 2.83 -> DG O6 K0008 : score 3.91738 : H : ARG NH2 C0191 <- 2.92 -> DG N7 K0008 : score 6.23138 : H : ASP OD1 C0193 <- 2.85 -> DC N4 L0006 : score 5.29142 : H : ASP OD2 C0193 <- 3.10 -> DC N4 L0005 : score 5.828 : H : ARG NE C0194 <- 3.13 -> DG O6 K0007 : score 3.68092 : H : ARG NH2 C0194 <- 3.05 -> DG N7 K0007 : score 6.06538 : H : ARG NH2 C0227 <- 2.78 -> DG O6 H0004 : score 6.6264 : H : ASP OD2 D0034 <- 2.88 -> DC N4 L0009 : score 6.1008 : w : ASP OD2 D0034 <- 5.35 -> DC N4 G0003 : score 3.623 : w : ASN ND2 D0037 <- 6.17 -> DC N4 G0003 : score 2.395 : H : GLN NE2 D0063 <- 2.76 -> DC O2 K0009 : score 3.72443 : H : ARG NE D0191 <- 2.84 -> DG O6 L0008 : score 3.9095 : H : ARG NH2 D0191 <- 2.95 -> DG N7 L0008 : score 6.19308 : H : ASP OD1 D0193 <- 2.87 -> DC N4 K0006 : score 5.27004 : H : ASP OD2 D0193 <- 3.20 -> DC N4 K0005 : score 5.704 : H : ARG NE D0194 <- 3.11 -> DG O6 L0007 : score 3.69668 : H : ARG NH2 D0194 <- 3.02 -> DG N7 L0007 : score 6.10369 : H : ARG NH2 D0227 <- 2.80 -> DG O6 G0004 : score 6.6 : w : ARG NE D0227 <- 5.68 -> DG N7 G0004 : score 1.593 : x : SER xxxx C0192 <- 3.38 -> DG xxx H0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0036 <- 3.38 -> DC xxx L0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0192 <- 3.30 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx >1fjl_B:Homeodomain-like; title=HOMEODOMAIN FROM THE DROSOPHILA PAIRED PROTEIN BOUND TO A DNA OLIGONUCLEOTIDE organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 B0002 <- 2.61 -> DT O2 D0012 : score 4.47005 : H : ARG NH1 B0002 <- 2.78 -> DA N3 E0005 : score 3.69678 : w : ARG NH2 B0002 <- 5.28 -> DT O2 E0006 : score 2.261 : H : ARG NH1 B0005 <- 2.54 -> DT O2 E0003 : score 4.53034 : H : ARG NH2 B0005 <- 3.02 -> DT O2 E0003 : score 4.04707 : w : ARG NH1 B0005 <- 5.53 -> DA N3 D0013 : score 2.585 : w : GLN NE2 B0050 <- 6.05 -> DT O4 E0006 : score 2.257 : w : GLN NE2 B0050 <- 5.70 -> DT O4 E0006 : score 2.257 : H : ASN OD1 B0051 <- 3.06 -> DA N6 E0005 : score 5.70866 : H : ASN ND2 B0051 <- 3.25 -> DA N7 E0005 : score 5.34217 : w : ASN OD1 B0051 <- 5.47 -> DT O4 E0006 : score 3.132 : V : GLN CG B0050 <- 3.89 -> DT C7 D0008 : score 3.18214 : x : VAL xxxx B0047 <- 3.74 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx >1fjx_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF TERNARY COMPLEX OF HHAI METHYLTRANSFERASE MUTANT (T250G) IN COMPLEX WITH DNA AND ADOHCY organism=HAEMOPHILUS HAEMOLYTICUS : H : ARG NH2 A0240 <- 2.62 -> DG N7 D0426 : score 6.61446 : H : ARG NH2 A0240 <- 3.09 -> DG O6 D0426 : score 6.2172 : w : ARG NH1 A0240 <- 5.79 -> DA N6 D0425 : score 1.486 : x : ILE xxxx A0086 <- 3.18 -> DT xxx C0410 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.54 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0228 <- 3.88 -> DA xxx D0425 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0237 <- 3.12 -> DC xxx C0407 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0239 <- 4.08 -> DG xxx C0406 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0254 <- 4.07 -> DC xxx D0429 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0260 <- 4.40 -> DA xxx C0405 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0296 <- 4.04 -> DT xxx C0404 : score x.xxxxx >1flo_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=FLP RECOMBINASE-HOLLIDAY JUNCTION COMPLEX I organism=Saccharomyces cerevisiae : w : SER OG A0059 <- 5.75 -> DT O4 E-007 : score 2.338 : w : SER OG A0059 <- 5.96 -> DA N6 F0006 : score 2.209 : H : LYS NZ A0082 <- 3.21 -> DG N7 F0005 : score 4.94425 : w : LYS NZ A0082 <- 5.77 -> DA N6 F0006 : score 2.097 : H : ARG NH1 A0170 <- 3.20 -> DA N3 E-016 : score 3.38749 : H : LYS NZ A0223 <- 2.79 -> DC O2 E-005 : score 2.95205 : H : ARG NE A0281 <- 2.81 -> DG O6 F0011 : score 3.93314 : H : ARG NH2 A0281 <- 3.11 -> DG N7 F0011 : score 5.98877 : H : LYS NZ A0285 <- 2.93 -> DT O4 E-013 : score 3.49391 : x : ALA xxxx A0055 <- 3.71 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0056 <- 3.93 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0060 <- 3.97 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0062 <- 4.43 -> DT xxx E-009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0278 <- 3.75 -> DT xxx E-012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0282 <- 4.07 -> DT xxx E-013 : score x.xxxxx >1fn7_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=COUPLING OF DAMAGE RECOGNITION AND CATALYSIS BY A HUMAN BASE-EXCISION DNA REPAIR PROTEIN organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 A0151 <- 3.26 -> DA N3 D0022 : score 3.45738 : H : ASN ND2 A0151 <- 3.26 -> DA N3 D0022 : score 3.45738 : H : ARG NH1 A0154 <- 3.16 -> DC O2 C0008 : score 3.3872 : H : ARG NH2 A0154 <- 2.60 -> DC O2 C0008 : score 3.84667 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.76 -> DC O2 C0008 : score 3.6792 : H : ARG NH2 A0204 <- 3.16 -> DC N3 C0008 : score 2.12607 : x : ASN xxxx A0149 <- 3.09 -> DG xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0150 <- 4.12 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0203 <- 3.35 -> DG xxx D0024 : score x.xxxxx >1fok_A:Restriction_endonuclease-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF RESTRICTION ENDONUCLEASE FOKI BOUND TO DNA organism=PLANOMICROBIUM OKEANOKOITES : H : GLN OE1 A0012 <- 2.65 -> DA N6 C0936 : score 6.23414 : H : GLN NE2 A0012 <- 3.02 -> DA N7 C0936 : score 5.82179 : H : ASN OD1 A0013 <- 2.96 -> DA N6 B0905 : score 5.8291 : H : ASN ND2 A0013 <- 2.63 -> DA N7 B0905 : score 6.07011 : H : ARG NE A0079 <- 2.77 -> DG N7 B0907 : score 4.44833 : H : ARG NH2 A0079 <- 3.15 -> DG O6 B0907 : score 6.138 : H : GLN OE1 A0095 <- 2.88 -> DG N2 B0903 : score 5.51797 : H : GLN NE2 A0095 <- 2.72 -> DG N3 B0903 : score 5.05525 : w : ASN ND2 A0104 <- 5.69 -> DT O4 C0934 : score 3.275 : H : ASN ND2 A0217 <- 2.81 -> DG O6 C0940 : score 5.62718 : H : GLU OE2 A0220 <- 2.89 -> DC N4 C0938 : score 5.17061 : H : LYS NZ A0225 <- 3.06 -> DG N7 B0904 : score 5.10583 : H : ARG NH1 A0228 <- 2.92 -> DG N7 B0903 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0228 <- 2.55 -> DG O6 B0903 : score 6.93 : x : ASP xxxx A0103 <- 3.96 -> DT xxx B0906 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0105 <- 3.40 -> DC xxx C0935 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0218 <- 3.56 -> DC xxx C0939 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0222 <- 3.45 -> DA xxx C0936 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0229 <- 3.91 -> DG xxx B0903 : score x.xxxxx >1fos_EF:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors;Leucine_zipper_domain; title=TWO HUMAN C-FOS:C-JUN:DNA COMPLEXES organism=HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 E0147 <- 2.90 -> DC N4 A0012 : score 4.10972 : H : ASN ND2 E0147 <- 3.32 -> DT O4 B0029 : score 4.73502 : H : ARG NH2 E0155 <- 2.63 -> DG N7 A0010 : score 6.60169 : H : ASN ND2 F0271 <- 3.36 -> DT O4 A0007 : score 4.69274 : V : ALA CB F0274 <- 3.88 -> DT C7 A0007 : score 5.48699 : V : ALA CB E0151 <- 3.67 -> DT C7 A0011 : score 5.78094 : V : ALA CB E0150 <- 3.86 -> DT C7 B0029 : score 5.51499 : V : ALA CB F0275 <- 3.68 -> DT C7 B0033 : score 5.76694 : x : ARG xxxx F0279 <- 2.76 -> DC xxx B0032 : score x.xxxxx >1fos_GH:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors;Leucine_zipper_domain; title=TWO HUMAN C-FOS:C-JUN:DNA COMPLEXES organism=HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 G0147 <- 2.97 -> DC N4 D0034 : score 4.05101 : H : ASN ND2 G0147 <- 2.88 -> DT O4 C0007 : score 5.20006 : H : ARG NH1 H0279 <- 2.93 -> DG N7 C0010 : score 5.8927 : H : ARG NH2 H0279 <- 3.27 -> DG N7 C0010 : score 5.78446 : H : ARG NH2 H0279 <- 2.74 -> DG O6 C0010 : score 6.6792 : V : ALA CB G0151 <- 3.75 -> DT C7 D0033 : score 5.66896 : x : ARG xxxx G0143 <- 3.87 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0150 <- 3.91 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0155 <- 2.81 -> DC xxx D0032 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0271 <- 3.18 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0274 <- 4.12 -> DA xxx D0028 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0275 <- 3.50 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0278 <- 4.17 -> DT xxx D0029 : score x.xxxxx >1fos_H:Leucine_zipper_domain;A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors; title=TWO HUMAN C-FOS:C-JUN:DNA COMPLEXES organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 H0279 <- 2.93 -> DG N7 C0010 : score 5.8927 : H : ARG NH2 H0279 <- 3.27 -> DG N7 C0010 : score 5.78446 : H : ARG NH2 H0279 <- 2.74 -> DG O6 C0010 : score 6.6792 : x : ASN xxxx H0271 <- 3.18 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0274 <- 4.12 -> DA xxx D0028 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0275 <- 3.50 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0278 <- 4.17 -> DT xxx D0029 : score x.xxxxx >1fw6_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TAQ MUTS-DNA-ADP TERNARY COMPLEX organism=Thermus aquaticus : x : PHE xxxx A0039 <- 3.48 -> DG xxx C1914 : score x.xxxxx >1g2d_F:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=STRUCTURE OF A CYS2HIS2 ZINC FINGER/TATA BOX COMPLEX (CLONE #2) organism=Mus musculus : H : GLN OE1 F0218 <- 2.98 -> DA N6 D0063 : score 5.83467 : H : GLN NE2 F0218 <- 3.08 -> DA N7 D0063 : score 5.74872 : H : ASN OD1 F0221 <- 2.99 -> DA N6 D0062 : score 5.79297 : H : ASN ND2 F0221 <- 2.95 -> DA N7 D0062 : score 5.6944 : H : GLN OE1 F0246 <- 2.80 -> DA N6 D0060 : score 6.05256 : H : GLN NE2 F0246 <- 3.05 -> DA N7 D0060 : score 5.78526 : w : GLN OE1 F0246 <- 5.54 -> DT O4 E0073 : score 3.068 : H : THR OG1 F0248 <- 2.66 -> DT O4 E0074 : score 3.99602 : w : THR OG1 F0248 <- 5.98 -> DT O4 E0073 : score 2.809 : H : GLN OE1 F0252 <- 2.77 -> DA N6 D0058 : score 6.08888 : H : GLN NE2 F0252 <- 3.29 -> DA N7 D0058 : score 5.49295 : w : THR OG1 F0274 <- 5.43 -> DT O4 D0057 : score 2.809 : H : THR OG1 F0277 <- 3.14 -> DC N4 D0056 : score 3.75907 : H : ARG NH1 F0280 <- 2.82 -> DG O6 D0055 : score 6.059 : H : ARG NH1 F0280 <- 2.98 -> DG O6 E0078 : score 5.86433 : H : ARG NH2 F0280 <- 3.02 -> DG N7 D0055 : score 6.10369 : H : ARG NH2 F0280 <- 2.84 -> DG O6 D0055 : score 6.5472 : V : THR CG2 F0274 <- 3.81 -> DT C7 D0057 : score 4.22633 : V : HIS CG F0247 <- 3.55 -> DT C7 E0073 : score 3.18641 : V : HIS CB F0276 <- 3.90 -> DT C7 E0076 : score 4.022 : x : THR xxxx F0220 <- 3.10 -> DC xxx E0070 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0275 <- 3.42 -> DA xxx E0075 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0279 <- 4.45 -> DT xxx E0076 : score x.xxxxx >1g2f_F:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=STRUCTURE OF A CYS2HIS2 ZINC FINGER/TATA BOX COMPLEX (TATAZF;CLONE #6) organism=Mus musculus : H : GLN OE1 F0218 <- 2.72 -> DA N6 D0063 : score 6.14941 : H : GLN NE2 F0218 <- 2.87 -> DA N7 D0063 : score 6.00449 : H : THR OG1 F0220 <- 3.37 -> DT O4 E0071 : score 3.44404 : H : ASN OD1 F0221 <- 2.95 -> DA N6 D0062 : score 5.84114 : H : ASN ND2 F0221 <- 2.82 -> DA N7 D0062 : score 5.84703 : H : GLN OE1 F0246 <- 2.81 -> DA N6 D0060 : score 6.04046 : H : GLN NE2 F0246 <- 2.86 -> DA N7 D0060 : score 6.01667 : w : GLN OE1 F0246 <- 5.74 -> DT O4 E0073 : score 3.068 : w : THR OG1 F0274 <- 5.31 -> DT O4 D0057 : score 2.809 : H : THR OG1 F0277 <- 3.07 -> DC N4 D0056 : score 3.81553 : H : ARG NH1 F0280 <- 3.00 -> DG O6 E0078 : score 5.84 : H : ARG NH1 F0280 <- 2.95 -> DG O6 D0055 : score 5.90083 : H : ARG NH2 F0280 <- 2.86 -> DG O6 D0055 : score 6.5208 : V : HIS CB F0276 <- 3.63 -> DT C7 E0076 : score 4.30045 : V : SER CB F0249 <- 3.65 -> DT C7 D0059 : score 3.24871 >1g38_A:DNA_methylase_specificity_domain;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=ADENINE-SPECIFIC METHYLTRANSFERASE M. TAQ I/DNA COMPLEX organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0116 <- 2.75 -> DC O2 C0706 : score 2.97562 : H : LYS NZ A0116 <- 2.75 -> DC O2 C0706 : score 2.97562 : w : LYS NZ A0116 <- 5.68 -> DT O2 C0705 : score 0.522 : H : TYR OH A0117 <- 3.05 -> DG N2 C0707 : score 4.64526 : H : LYS NZ A0139 <- 2.83 -> DT O2 B0603 : score 3.56566 : H : LYS NZ A0200 <- 3.39 -> DG N7 B0608 : score 4.75036 : H : LYS NZ A0200 <- 2.79 -> DG O6 B0608 : score 5.79233 : w : LYS NZ A0200 <- 6.19 -> DG O6 C0701 : score 3.005 : H : ARG NE A0271 <- 2.91 -> DT O4 B0603 : score 1.81808 : H : ARG NH2 A0271 <- 2.77 -> DG O6 C0707 : score 6.6396 : w : GLU OE2 A0274 <- 5.58 -> DT O4 B0602 : score 2.279 : w : ARG NH2 A0296 <- 5.59 -> DC O2 C0703 : score 1.669 : H : HIS NE2 A0394 <- 2.91 -> DG O6 B0605 : score 7.77886 : H : HIS NE2 A0394 <- 2.91 -> DG O6 B0605 : score 7.77886 : V : PRO CG A0393 <- 3.54 -> DT C7 C0705 : score 6.77231 : x : VAL xxxx A0021 <- 3.32 -> DA xxx B0606 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0105 <- 2.98 -> DA xxx B0606 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0108 <- 3.25 -> DA xxx B0606 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0196 <- 3.82 -> DA xxx B0606 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0199 <- 3.46 -> DA xxx B0606 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0201 <- 4.43 -> DA xxx B0606 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0268 <- 3.70 -> DT xxx B0603 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0272 <- 3.45 -> DG xxx C0707 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0273 <- 4.15 -> DG xxx C0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0323 <- 3.36 -> DT xxx B0602 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0335 <- 3.65 -> DC xxx B0604 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0336 <- 3.83 -> DT xxx C0705 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0353 <- 4.16 -> DC xxx C0706 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0354 <- 3.19 -> DC xxx C0706 : score x.xxxxx >1g4d_A:Putative_DNA-binding_domain; title=NMR STRUCTURE OF THE MU BACTERIOPHAGE REPRESSOR DNA-BINDING DOMAIN/DNA COMPLEX organism=ENTEROBACTERIA PHAGE MU : x : SER xxxx A0031 <- 3.29 -> DT xxx B0105 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0033 <- 3.49 -> DT xxx B0105 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0036 <- 4.22 -> DG xxx C0129 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0037 <- 3.53 -> DC xxx B0103 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0053 <- 3.65 -> DA xxx C0126 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0056 <- 2.88 -> DT xxx C0128 : score x.xxxxx >1g9y_A:Homing_endonucleases; title=HOMING ENDONUCLEASE I-CREI / DNA SUBSTRATE COMPLEX WITH CALCIUM organism=Chlamydomonas reinhardtii : w : GLN NE2 A0026 <- 5.81 -> DA N6 D0518 : score 2.804 : H : LYS NZ A0028 <- 3.00 -> DG O6 D0519 : score 5.54954 : w : LYS NZ A0028 <- 5.76 -> DA N6 C0405 : score 2.097 : w : LYS NZ A0028 <- 5.96 -> DA N6 D0518 : score 2.097 : w : ASN OD1 A0030 <- 6.50 -> DT O4 D0522 : score 3.132 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.18 -> DT O4 D0522 : score 3.275 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.25 -> DT O4 D0520 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.37 -> DG N7 C0402 : score 3.9711 : w : SER OG A0032 <- 6.31 -> DT O4 D0522 : score 2.338 : H : TYR OH A0033 <- 3.02 -> DA N7 C0403 : score 3.96863 : H : TYR OH A0033 <- 3.07 -> DA N6 C0403 : score 4.41831 : H : GLN OE1 A0038 <- 3.20 -> DA N6 C0404 : score 5.56836 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.98 -> DA N7 C0404 : score 5.87051 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.54 -> DA N6 C0405 : score 3.392 : w : GLN OE1 A0038 <- 6.09 -> DT O4 D0520 : score 3.068 : H : GLN NE2 A0044 <- 2.92 -> DA N7 D0516 : score 5.94359 : w : GLN OE1 A0044 <- 5.78 -> DC N4 D0517 : score 3.488 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.11 -> DG N7 C0408 : score 5.6749 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.72 -> DG O6 C0408 : score 6.7056 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.69 -> DG O6 D0515 : score 6.21717 : H : ARG NH2 A0070 <- 2.92 -> DG N7 D0515 : score 6.23138 : w : LYS NZ A0139 <- 6.44 -> DC O2 C0412 : score 1.3 : w : THR OG1 A0140 <- 5.58 -> DC O2 D0517 : score 2.048 : x : SER xxxx A0022 <- 4.32 -> DA xxx D0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.63 -> DA xxx D0516 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.54 -> DG xxx D0515 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 4.20 -> DC xxx C0406 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.90 -> DA xxx D0514 : score x.xxxxx >1g9y_AB:Homing_endonucleases; title=HOMING ENDONUCLEASE I-CREI / DNA SUBSTRATE COMPLEX WITH CALCIUM organism=Chlamydomonas reinhardtii : w : GLN NE2 A0026 <- 5.81 -> DA N6 D0518 : score 2.804 : H : LYS NZ A0028 <- 3.00 -> DG O6 D0519 : score 5.54954 : w : LYS NZ A0028 <- 5.76 -> DA N6 C0405 : score 2.097 : w : LYS NZ A0028 <- 5.96 -> DA N6 D0518 : score 2.097 : w : ASN OD1 A0030 <- 6.50 -> DT O4 D0522 : score 3.132 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.18 -> DT O4 D0522 : score 3.275 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.25 -> DT O4 D0520 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.37 -> DG N7 C0402 : score 3.9711 : w : SER OG A0032 <- 6.31 -> DT O4 D0522 : score 2.338 : H : TYR OH A0033 <- 3.02 -> DA N7 C0403 : score 3.96863 : H : TYR OH A0033 <- 3.07 -> DA N6 C0403 : score 4.41831 : H : GLN OE1 A0038 <- 3.20 -> DA N6 C0404 : score 5.56836 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.98 -> DA N7 C0404 : score 5.87051 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.54 -> DA N6 C0405 : score 3.392 : w : GLN OE1 A0038 <- 6.09 -> DT O4 D0520 : score 3.068 : H : GLN NE2 A0044 <- 2.92 -> DA N7 D0516 : score 5.94359 : w : GLN OE1 A0044 <- 5.78 -> DC N4 D0517 : score 3.488 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.11 -> DG N7 C0408 : score 5.6749 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.72 -> DG O6 C0408 : score 6.7056 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.69 -> DG O6 D0515 : score 6.21717 : H : ARG NH2 A0070 <- 2.92 -> DG N7 D0515 : score 6.23138 : w : LYS NZ A0139 <- 6.44 -> DC O2 C0412 : score 1.3 : w : THR OG1 A0140 <- 5.58 -> DC O2 D0517 : score 2.048 : w : GLN NE2 B0226 <- 5.35 -> DG O6 C0418 : score 2.87 : w : LYS NZ B0228 <- 5.72 -> DG O6 C0418 : score 3.005 : w : ASN OD1 B0230 <- 5.88 -> DT O4 C0422 : score 3.132 : w : ASN ND2 B0230 <- 6.22 -> DT O4 C0420 : score 3.275 : H : SER OG B0232 <- 3.17 -> DC N4 D0502 : score 3.40364 : w : SER OG B0232 <- 5.51 -> DT O4 C0422 : score 2.338 : H : TYR OH B0233 <- 2.45 -> DA N7 D0503 : score 4.44187 : H : TYR OH B0233 <- 2.91 -> DA N6 D0503 : score 4.56776 : H : GLN OE1 B0238 <- 3.23 -> DA N6 D0504 : score 5.53204 : H : GLN NE2 B0238 <- 3.05 -> DA N7 D0504 : score 5.78526 : w : GLN OE1 B0238 <- 6.10 -> DA N6 D0505 : score 3.392 : w : GLN OE1 B0238 <- 5.69 -> DT O4 C0420 : score 3.068 : w : SER OG B0240 <- 6.48 -> DA N6 D0505 : score 2.209 : H : GLN NE2 B0244 <- 3.10 -> DA N7 C0416 : score 5.72436 : w : GLN OE1 B0244 <- 5.78 -> DC N4 C0417 : score 3.488 : H : ARG NH1 B0268 <- 2.93 -> DG N7 D0508 : score 5.8927 : H : ARG NH2 B0268 <- 2.67 -> DG O6 D0508 : score 6.7716 : H : ARG NH1 B0270 <- 2.82 -> DG O6 C0415 : score 6.059 : H : ARG NH2 B0270 <- 3.11 -> DG N7 C0415 : score 5.98877 : w : SER OG B0272 <- 5.82 -> DA N7 C0413 : score 2.343 : w : THR OG1 B0340 <- 5.35 -> DC O2 C0417 : score 2.048 : x : SER xxxx A0022 <- 4.32 -> DA xxx D0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.63 -> DA xxx D0516 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.54 -> DG xxx D0515 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 4.20 -> DC xxx C0406 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.90 -> DA xxx D0514 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0222 <- 4.03 -> DA xxx C0416 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0224 <- 3.66 -> DA xxx C0416 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0246 <- 3.87 -> DG xxx C0415 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0266 <- 4.49 -> DA xxx D0505 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0273 <- 3.69 -> DC xxx C0414 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0339 <- 4.15 -> DG xxx D0511 : score x.xxxxx >1g9z_A:Homing_endonucleases; title=LAGLIDADG HOMING ENDONUCLEASE I-CREI / DNA PRODUCT COMPLEX WITH MAGNESIUM organism=Chlamydomonas reinhardtii : w : GLN NE2 A0026 <- 5.95 -> DA N6 D0518 : score 2.804 : w : LYS NZ A0028 <- 6.07 -> DA N6 D0518 : score 2.097 : w : ASN OD1 A0030 <- 6.27 -> DT O4 D0522 : score 3.132 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.16 -> DT O4 D0522 : score 3.275 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.34 -> DT O4 D0520 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.35 -> DG N7 E0602 : score 3.98903 : w : SER OG A0032 <- 6.02 -> DT O4 D0522 : score 2.338 : H : TYR OH A0033 <- 2.65 -> DA N7 E0603 : score 4.27582 : H : GLN OE1 A0038 <- 2.80 -> DA N6 E0604 : score 6.05256 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.58 -> DA N7 E0604 : score 6.35769 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.99 -> DA N6 E0605 : score 3.392 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.94 -> DT O4 D0520 : score 3.068 : w : SER OG A0040 <- 6.17 -> DA N6 E0605 : score 2.209 : w : GLN NE2 A0044 <- 5.99 -> DA N6 D0516 : score 2.804 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.25 -> DG N7 E0608 : score 5.5055 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.80 -> DG O6 E0608 : score 6.6 : w : ARG NH2 A0068 <- 6.25 -> DA N6 D0516 : score 1.997 : H : ARG NH1 A0070 <- 3.09 -> DG O6 D0515 : score 5.7305 : H : ARG NH2 A0070 <- 3.23 -> DG N7 D0515 : score 5.83554 : w : SER OG A0072 <- 6.03 -> DG N7 C0513 : score 2.749 : w : THR OG1 A0140 <- 5.46 -> DA N3 D0516 : score 2.845 : x : SER xxxx A0022 <- 3.78 -> DA xxx D0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.71 -> DC xxx D0517 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.79 -> DA xxx C0514 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 4.23 -> DC xxx E0606 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.85 -> DG xxx C0513 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 3.47 -> DT xxx E0611 : score x.xxxxx >1g9z_AB:Homing_endonucleases; title=LAGLIDADG HOMING ENDONUCLEASE I-CREI / DNA PRODUCT COMPLEX WITH MAGNESIUM organism=Chlamydomonas reinhardtii : w : GLN NE2 A0026 <- 5.95 -> DA N6 D0518 : score 2.804 : w : LYS NZ A0028 <- 6.07 -> DA N6 D0518 : score 2.097 : w : ASN OD1 A0030 <- 6.27 -> DT O4 D0522 : score 3.132 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.16 -> DT O4 D0522 : score 3.275 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.34 -> DT O4 D0520 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.35 -> DG N7 E0602 : score 3.98903 : w : SER OG A0032 <- 6.02 -> DT O4 D0522 : score 2.338 : H : TYR OH A0033 <- 2.65 -> DA N7 E0603 : score 4.27582 : H : GLN OE1 A0038 <- 2.80 -> DA N6 E0604 : score 6.05256 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.58 -> DA N7 E0604 : score 6.35769 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.99 -> DA N6 E0605 : score 3.392 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.94 -> DT O4 D0520 : score 3.068 : w : SER OG A0040 <- 6.17 -> DA N6 E0605 : score 2.209 : w : GLN NE2 A0044 <- 5.99 -> DA N6 D0516 : score 2.804 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.25 -> DG N7 E0608 : score 5.5055 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.80 -> DG O6 E0608 : score 6.6 : w : ARG NH2 A0068 <- 6.25 -> DA N6 D0516 : score 1.997 : H : ARG NH1 A0070 <- 3.09 -> DG O6 D0515 : score 5.7305 : H : ARG NH2 A0070 <- 3.23 -> DG N7 D0515 : score 5.83554 : w : SER OG A0072 <- 6.03 -> DG N7 C0513 : score 2.749 : w : THR OG1 A0140 <- 5.46 -> DA N3 D0516 : score 2.845 : w : GLN NE2 B0226 <- 5.47 -> DG O6 F0618 : score 2.87 : H : LYS NZ B0228 <- 2.63 -> DT O4 F0619 : score 3.70914 : w : LYS NZ B0228 <- 6.16 -> DA N7 C0505 : score 1.655 : w : LYS NZ B0228 <- 5.60 -> DG O6 F0618 : score 3.005 : w : LYS NZ B0228 <- 6.33 -> DA N6 C0505 : score 2.097 : H : ASN ND2 B0230 <- 3.03 -> DT O4 F0621 : score 5.04152 : w : ASN OD1 B0230 <- 5.92 -> DT O4 F0622 : score 3.132 : w : ASN ND2 B0230 <- 5.70 -> DT O4 F0620 : score 3.275 : w : ASN ND2 B0230 <- 6.04 -> DT O4 F0622 : score 3.275 : H : SER OG B0232 <- 2.71 -> DC N4 C0502 : score 3.7418 : w : SER OG B0232 <- 5.91 -> DT O4 F0622 : score 2.338 : H : TYR OH B0233 <- 2.60 -> DA N7 C0503 : score 4.31733 : H : TYR OH B0233 <- 2.48 -> DA N6 C0503 : score 4.96943 : H : GLN OE1 B0238 <- 3.41 -> DA N6 C0504 : score 5.31415 : H : GLN NE2 B0238 <- 3.21 -> DA N7 C0504 : score 5.59038 : w : GLN OE1 B0238 <- 5.59 -> DT O4 F0620 : score 3.068 : w : GLN OE1 B0238 <- 6.11 -> DA N6 C0505 : score 3.392 : w : SER OG B0240 <- 6.46 -> DA N6 C0505 : score 2.209 : H : GLN NE2 B0244 <- 2.96 -> DA N7 F0616 : score 5.89487 : w : GLN OE1 B0244 <- 5.72 -> DC N4 F0617 : score 3.488 : H : ARG NH1 B0268 <- 3.37 -> DG N7 C0508 : score 5.3603 : H : ARG NH2 B0268 <- 2.93 -> DG O6 C0508 : score 6.4284 : H : ARG NH1 B0270 <- 2.60 -> DG O6 F0615 : score 6.32667 : H : ARG NH2 B0270 <- 3.03 -> DG N7 F0615 : score 6.09092 : w : THR OG1 B0340 <- 5.41 -> DC O2 F0617 : score 2.048 : x : SER xxxx A0022 <- 3.78 -> DA xxx D0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.71 -> DC xxx D0517 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.79 -> DA xxx C0514 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 4.23 -> DC xxx E0606 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.85 -> DG xxx C0513 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 3.47 -> DT xxx E0611 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0222 <- 4.10 -> DA xxx F0616 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0224 <- 3.62 -> DA xxx F0616 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0246 <- 3.70 -> DG xxx F0615 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0273 <- 3.75 -> DC xxx E0614 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0339 <- 3.96 -> DG xxx C0511 : score x.xxxxx >1ga5_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ORPHAN NUCLEAR RECEPTOR REV-ERB(ALPHA) DNA- BINDING DOMAIN BOUND TO ITS COGNATE RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0019 <- 2.62 -> DC N4 D0625 : score 5.97559 : H : ARG NH2 A0027 <- 2.82 -> DG N7 D0623 : score 6.35908 : H : ARG NH1 A0075 <- 2.71 -> DA N3 D0632 : score 3.74833 : H : GLU OE1 B0019 <- 3.18 -> DC N4 D0633 : score 5.32958 : H : LYS NZ B0022 <- 3.09 -> DG N7 C0606 : score 5.07352 : H : LYS NZ B0022 <- 2.76 -> DG O6 C0606 : score 5.82702 : H : ARG NH2 B0027 <- 2.66 -> DG N7 D0631 : score 6.56338 : w : ARG NH2 B0027 <- 5.98 -> DG O6 D0631 : score 2.468 : x : LYS xxxx A0022 <- 3.31 -> DG xxx C0614 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0026 <- 2.94 -> DG xxx C0614 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0073 <- 3.88 -> DT xxx C0612 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0012 <- 4.49 -> DA xxx C0605 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0026 <- 3.13 -> DG xxx C0607 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0073 <- 3.88 -> DT xxx D0638 : score x.xxxxx >1ga5_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ORPHAN NUCLEAR RECEPTOR REV-ERB(ALPHA) DNA- BINDING DOMAIN BOUND TO ITS COGNATE RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 B0019 <- 3.18 -> DC N4 D0633 : score 5.32958 : w : GLU OE1 B0019 <- 6.48 -> DA N6 D0632 : score 2.939 : H : LYS NZ B0022 <- 3.09 -> DG N7 C0606 : score 5.07352 : H : LYS NZ B0022 <- 2.76 -> DG O6 C0606 : score 5.82702 : H : ARG NH2 B0027 <- 2.66 -> DG N7 D0631 : score 6.56338 : w : ARG NH2 B0027 <- 5.98 -> DG O6 D0631 : score 2.468 : x : HIS xxxx B0012 <- 4.49 -> DA xxx C0605 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0026 <- 3.13 -> DG xxx C0607 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0073 <- 3.88 -> DT xxx D0638 : score x.xxxxx >1ga5_EF:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ORPHAN NUCLEAR RECEPTOR REV-ERB(ALPHA) DNA- BINDING DOMAIN BOUND TO ITS COGNATE RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : LYS NZ E0022 <- 2.78 -> DG N7 G0614 : score 5.40744 : w : LYS NZ E0022 <- 5.07 -> DG O6 G0615 : score 3.005 : H : ARG NH2 E0027 <- 2.78 -> DG N7 H0623 : score 6.41015 : H : ARG NH1 E0075 <- 2.45 -> DA N3 H0632 : score 3.93979 : H : GLU OE1 F0019 <- 2.66 -> DC N4 H0633 : score 5.92945 : H : LYS NZ F0022 <- 3.17 -> DG N7 G0606 : score 4.98734 : H : LYS NZ F0022 <- 2.81 -> DG O6 G0606 : score 5.76921 : w : ARG NH1 F0026 <- 5.12 -> DG O6 G0607 : score 2.756 : H : ARG NH2 F0027 <- 2.64 -> DG N7 H0631 : score 6.58892 : x : GLU xxxx E0019 <- 2.51 -> DC xxx H0625 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0026 <- 2.98 -> DG xxx G0614 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0073 <- 4.02 -> DT xxx G0612 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0073 <- 4.35 -> DT xxx H0638 : score x.xxxxx >1gat_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=SOLUTION STRUCTURE OF THE SPECIFIC DNA COMPLEX OF THE ZINC CONTAINING DNA BINDING DOMAIN OF THE ERYTHROID TRANSCRIPTION FACTOR GATA-1 BY MULTIDIMENSIONAL NMR organism=GALLUS GALLUS : H : LYS NZ A0057 <- 2.90 -> DT O2 B0109 : score 3.51544 : V : LEU CD1 A0033 <- 3.65 -> DT C7 C0123 : score 5.94621 : x : THR xxxx A0016 <- 3.09 -> DT xxx C0125 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0017 <- 2.59 -> DG xxx B0107 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0029 <- 4.12 -> DA xxx B0108 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0037 <- 4.01 -> DT xxx C0122 : score x.xxxxx >1gau_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=SOLUTION STRUCTURE OF THE SPECIFIC DNA COMPLEX OF THE ZINC CONTAINING DNA BINDING DOMAIN OF THE ERYTHROID TRANSCRIPTION FACTOR GATA-1 BY MULTIDIMENSIONAL NMR organism=? : V : LEU CG A0017 <- 3.84 -> DT C7 C0125 : score 4.35498 : x : THR xxxx A0016 <- 2.67 -> DT xxx C0125 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0029 <- 3.66 -> DA xxx C0124 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0033 <- 3.16 -> DA xxx C0124 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0037 <- 3.88 -> DT xxx C0122 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0057 <- 3.86 -> DT xxx B0109 : score x.xxxxx >1gcc_A:DNA-binding_domain; title=SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE COMPLEX OF GCC-BOX BINDING DOMAIN OF ATERF1 AND GCC-BOX DNA, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ARG NH2 A0150 <- 2.85 -> DG N7 C0020 : score 6.32077 : H : ARG NH2 A0150 <- 2.79 -> DG O6 C0020 : score 6.6132 : H : ARG NH1 A0152 <- 2.89 -> DG O6 B0005 : score 5.97383 : H : ARG NH1 A0152 <- 2.91 -> DG O6 C0021 : score 5.9495 : H : ARG NH2 A0152 <- 2.87 -> DG O6 C0021 : score 6.5076 : H : ARG NE A0162 <- 3.11 -> DG N7 C0017 : score 4.14764 : H : ARG NH2 A0162 <- 3.17 -> DG N7 C0017 : score 5.91215 : H : ARG NH2 A0162 <- 2.98 -> DG O6 C0017 : score 6.3624 : H : ARG NH1 A0170 <- 2.93 -> DG N7 B0008 : score 5.8927 : x : TRP xxxx A0154 <- 2.98 -> DA xxx B0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0160 <- 3.98 -> DC xxx C0019 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0172 <- 3.39 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx >1gd2_G:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BZIP TRANSCRIPTION FACTOR PAP1 BOUND TO DNA organism=Schizosaccharomyces pombe : H : ARG NH2 G0082 <- 3.02 -> DG O6 D-005 : score 6.3096 : H : ASN OD1 G0086 <- 3.14 -> DA N6 C0004 : score 5.61231 : H : GLN NE2 G0090 <- 2.84 -> DT O4 D-003 : score 5.1495 : w : GLN NE2 G0090 <- 5.67 -> DT O4 D-004 : score 2.257 : H : ARG NH2 G0094 <- 2.58 -> DG N7 C0001 : score 6.66554 : V : PHE CD2 G0093 <- 3.77 -> DT C7 D-003 : score 6.56063 : x : GLN xxxx G0085 <- 3.74 -> DG xxx D-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0087 <- 4.30 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0089 <- 4.00 -> DG xxx D-005 : score x.xxxxx >1gdt_A:Resolvase-like;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A SITE-SPECIFIC RECOMBINASE, GAMMA-DELTA RESOLVASE COMPLEXED WITH A 34 BP CLEAVAGE SITE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0130 <- 3.08 -> DA N3 E0022 : score 3.47586 : H : ARG NH2 A0130 <- 2.97 -> DA N3 E0022 : score 3.12959 : H : ARG NH1 A0142 <- 2.75 -> DA N3 F0025 : score 3.71887 : H : ARG NH1 A0172 <- 2.91 -> DG N7 C0006 : score 5.9169 : H : ARG NH2 A0172 <- 2.88 -> DG N7 C0006 : score 6.28246 : H : ARG NH2 A0172 <- 2.83 -> DG O6 C0006 : score 6.5604 : H : SER OG A0173 <- 2.81 -> DG O6 F0028 : score 4.08284 : x : ILE xxxx A0122 <- 3.89 -> DT xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0125 <- 4.49 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0126 <- 3.36 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0140 <- 4.18 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0171 <- 3.80 -> DC xxx F0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0174 <- 4.08 -> DC xxx F0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0176 <- 3.28 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0177 <- 3.90 -> DT xxx F0026 : score x.xxxxx >1gdt_AB:Resolvase-like;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A SITE-SPECIFIC RECOMBINASE, GAMMA-DELTA RESOLVASE COMPLEXED WITH A 34 BP CLEAVAGE SITE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0130 <- 3.08 -> DA N3 E0022 : score 3.47586 : H : ARG NH2 A0130 <- 2.97 -> DA N3 E0022 : score 3.12959 : H : ARG NH1 A0142 <- 2.75 -> DA N3 F0025 : score 3.71887 : H : ARG NH1 A0172 <- 2.91 -> DG N7 C0006 : score 5.9169 : H : ARG NH2 A0172 <- 2.88 -> DG N7 C0006 : score 6.28246 : H : ARG NH2 A0172 <- 2.83 -> DG O6 C0006 : score 6.5604 : H : SER OG A0173 <- 2.81 -> DG O6 F0028 : score 4.08284 : H : ARG NH2 B0172 <- 2.57 -> DG N7 E0006 : score 6.67831 : H : SER OG B0173 <- 3.18 -> DG N7 D0028 : score 4.14142 : H : SER OG B0173 <- 2.79 -> DG O6 D0028 : score 4.09921 : H : SER OG B0173 <- 2.89 -> DG O6 D0029 : score 4.01739 : x : ILE xxxx A0122 <- 3.89 -> DT xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0125 <- 4.49 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0126 <- 3.36 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0140 <- 4.18 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0171 <- 3.80 -> DC xxx F0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0174 <- 4.08 -> DC xxx F0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0176 <- 3.28 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0177 <- 3.90 -> DT xxx F0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0126 <- 4.11 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0140 <- 3.99 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0142 <- 3.04 -> DA xxx D0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0171 <- 3.68 -> DC xxx D0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0174 <- 4.02 -> DC xxx D0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0176 <- 3.19 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0177 <- 3.84 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx >1gji_A:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C-REL BOUND TO DNA organism=Gallus gallus : H : ARG NH2 A0021 <- 3.27 -> DG O6 D0305 : score 5.9796 : H : ARG NH2 A0023 <- 2.67 -> DG O6 D0304 : score 6.7716 : x : TYR xxxx A0024 <- 3.24 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0026 <- 3.77 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0027 <- 3.65 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0178 <- 3.48 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx >1gji_AB:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C-REL BOUND TO DNA organism=Gallus gallus : H : ARG NH2 A0021 <- 3.27 -> DG O6 D0305 : score 5.9796 : H : ARG NH2 A0023 <- 2.67 -> DG O6 D0304 : score 6.7716 : H : ARG NH1 B0021 <- 3.02 -> DG N7 C0010 : score 5.7838 : H : ARG NH2 B0021 <- 3.12 -> DG N7 C0010 : score 5.976 : H : ARG NH2 B0021 <- 2.65 -> DG O6 C0010 : score 6.798 : H : GLU OE2 B0027 <- 2.58 -> DC N4 D0311 : score 5.49706 A : x : TYR xxxx A0024 <- 3.24 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0026 <- 3.77 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0027 <- 3.65 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0178 <- 3.48 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0023 <- 3.94 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0024 <- 3.60 -> DT xxx D0310 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0026 <- 3.93 -> DT xxx D0310 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0178 <- 3.74 -> DT xxx D0309 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0209 <- 3.45 -> DT xxx D0308 : score x.xxxxx >1glu_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSIS OF THE INTERACTION OF THE GLUCOCORTICOID RECEPTOR WITH DNA organism=Rattus norvegicus : w : LYS NZ A0461 <- 5.63 -> DG O6 D-007 : score 3.005 : H : ARG NH1 A0466 <- 2.96 -> DG O6 C0004 : score 5.88867 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.66 -> DG N7 C0004 : score 6.56338 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.87 -> DG O6 C0004 : score 6.5076 : x : VAL xxxx A0462 <- 3.06 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0511 <- 3.33 -> DC xxx D-009 : score x.xxxxx >1glu_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSIS OF THE INTERACTION OF THE GLUCOCORTICOID RECEPTOR WITH DNA organism=Rattus norvegicus : w : LYS NZ A0461 <- 5.59 -> DT O4 C0006 : score 1.7 : H : ARG NH1 A0466 <- 2.96 -> DG O6 C0004 : score 5.88867 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.66 -> DG N7 C0004 : score 6.56338 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.87 -> DG O6 C0004 : score 6.5076 : x : VAL xxxx A0462 <- 3.06 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0511 <- 3.33 -> DC xxx D-009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0461 <- 2.73 -> DG xxx C-007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0466 <- 3.42 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx >1gm5_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Nucleic_acid-binding_proteins;RecG,_N-terminal_domain; title=STRUCTURE OF RECG BOUND TO THREE-WAY DNA JUNCTION organism=THERMOTOGA MARITIMA : x : MET xxxx A0185 <- 4.07 -> DG xxx X0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0204 <- 3.29 -> DG xxx X0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0205 <- 2.87 -> DC xxx Y0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0206 <- 2.84 -> DC xxx Y0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0240 <- 4.13 -> DG xxx X0010 : score x.xxxxx >1gt0_C:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A POU/HMG/DNA TERNARY COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : GLN OE1 C0044 <- 2.96 -> DA N6 A0013 : score 5.85888 : H : GLN NE2 C0044 <- 3.03 -> DA N7 A0013 : score 5.80962 : H : THR OG1 C0045 <- 2.83 -> DC N4 B0035 : score 4.00913 : H : THR OG1 C0045 <- 2.77 -> DT O4 A0014 : score 3.9105 : H : ARG NH1 C0049 <- 3.36 -> DG O6 A0015 : score 5.402 : H : ARG NH2 C0049 <- 3.23 -> DG N7 A0015 : score 5.83554 : H : ARG NH1 C0105 <- 2.91 -> DT O2 A0017 : score 4.21167 : H : ARG NH2 C0105 <- 3.03 -> DT O2 A0017 : score 4.0386 : H : ASN OD1 C0151 <- 2.88 -> DA N6 A0019 : score 5.92545 : H : ASN ND2 C0151 <- 2.92 -> DA N7 A0019 : score 5.72962 : V : VAL CG2 C0147 <- 3.74 -> DT C7 A0020 : score 6.21492 : x : SER xxxx C0043 <- 3.96 -> DG xxx B0034 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0048 <- 3.75 -> DT xxx A0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0150 <- 3.16 -> DC xxx B0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0154 <- 3.63 -> DA xxx B0030 : score x.xxxxx >1gt0_CD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like;HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A POU/HMG/DNA TERNARY COMPLEX organism=HOMO SAPIENS / MUS MUSCULUS : H : GLN OE1 C0044 <- 2.96 -> DA N6 A0013 : score 5.85888 : H : GLN NE2 C0044 <- 3.03 -> DA N7 A0013 : score 5.80962 : H : THR OG1 C0045 <- 2.77 -> DT O4 A0014 : score 3.9105 : H : THR OG1 C0045 <- 2.83 -> DC N4 B0035 : score 4.00913 : H : ARG NH1 C0049 <- 3.36 -> DG O6 A0015 : score 5.402 : H : ARG NH2 C0049 <- 3.23 -> DG N7 A0015 : score 5.83554 : H : ARG NH1 C0105 <- 2.91 -> DT O2 A0017 : score 4.21167 : H : ARG NH2 C0105 <- 3.03 -> DT O2 A0017 : score 4.0386 : H : ASN OD1 C0151 <- 2.88 -> DA N6 A0019 : score 5.92545 : H : ASN ND2 C0151 <- 2.92 -> DA N7 A0019 : score 5.72962 : H : ARG NH1 D0005 <- 3.05 -> DT O2 A0008 : score 4.09109 : H : ARG NH1 D0005 <- 2.88 -> DC O2 B0043 : score 3.5916 : H : ARG NH2 D0005 <- 3.01 -> DT O2 A0008 : score 4.05553 : H : ASN ND2 D0008 <- 3.06 -> DT O2 A0006 : score 4.49935 : H : ASN ND2 D0030 <- 2.60 -> DG N3 B0047 : score 5.09067 : H : SER OG D0031 <- 3.23 -> DC O2 A0003 : score 2.28617 : H : SER OG D0034 <- 2.54 -> DT O2 A0004 : score 3.8897 : H : TYR OH D0072 <- 2.90 -> DA N3 B0042 : score 4.06826 : V : VAL CG2 C0147 <- 3.74 -> DT C7 A0020 : score 6.21492 : x : SER xxxx C0043 <- 3.96 -> DG xxx B0034 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0048 <- 3.75 -> DT xxx A0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0150 <- 3.16 -> DC xxx B0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0154 <- 3.63 -> DA xxx B0030 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0010 <- 3.63 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0011 <- 3.07 -> DA xxx B0045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0018 <- 2.98 -> DA xxx B0046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0076 <- 3.54 -> DG xxx A0011 : score x.xxxxx >1gtw_A:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C/EBPBETA BZIP HOMODIMER BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THE TOM-1A PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0278 <- 3.11 -> DA N7 C0011 : score 2.40152 : H : ASN OD1 A0281 <- 2.91 -> DA N6 C0011 : score 5.88932 : H : ASN ND2 A0281 <- 3.01 -> DT O4 D0106 : score 5.06266 : w : ASN ND2 A0281 <- 6.16 -> DA N6 D0105 : score 2.5 : H : ARG NH1 A0289 <- 2.60 -> DG O6 C0009 : score 6.32667 : H : ARG NH2 A0289 <- 2.96 -> DG N7 C0009 : score 6.18031 : w : ARG NH1 A0289 <- 6.48 -> DG O6 D0108 : score 2.756 : x : ALA xxxx A0284 <- 4.03 -> DA xxx D0105 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0285 <- 3.26 -> DT xxx D0107 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 4.26 -> DT xxx D0107 : score x.xxxxx >1gtw_AB:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C/EBPBETA BZIP HOMODIMER BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THE TOM-1A PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0278 <- 3.11 -> DA N7 C0011 : score 2.40152 : H : ASN OD1 A0281 <- 2.91 -> DA N6 C0011 : score 5.88932 : H : ASN ND2 A0281 <- 3.01 -> DT O4 D0106 : score 5.06266 : w : ASN ND2 A0281 <- 6.16 -> DA N6 D0105 : score 2.5 : H : ARG NH1 A0289 <- 2.60 -> DG O6 C0009 : score 6.32667 : H : ARG NH2 A0289 <- 2.96 -> DG N7 C0009 : score 6.18031 : w : ARG NH1 A0289 <- 6.48 -> DG O6 D0108 : score 2.756 : w : ARG NH1 B0278 <- 6.48 -> DA N6 D0113 : score 1.486 : H : ASN OD1 B0281 <- 2.81 -> DC N4 D0112 : score 4.1852 : H : ASN ND2 B0281 <- 2.99 -> DT O4 C0005 : score 5.0838 : w : ASN ND2 B0281 <- 5.78 -> DG N7 C0004 : score 3.259 : w : ASN OD1 B0282 <- 5.91 -> DC N4 D0111 : score 2.732 : H : ARG NH1 B0289 <- 2.71 -> DG O6 D0110 : score 6.19283 : H : ARG NH2 B0289 <- 3.17 -> DG O6 D0110 : score 6.1116 : H : ARG NH2 B0289 <- 2.68 -> DG O6 C0007 : score 6.7584 : w : ARG NH2 B0289 <- 5.62 -> DG N7 C0007 : score 2.18 : x : ALA xxxx A0284 <- 4.03 -> DA xxx D0105 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0285 <- 3.26 -> DT xxx D0107 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 4.26 -> DT xxx D0107 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0284 <- 4.02 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0285 <- 3.67 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 3.97 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >1gu4_A:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C/EBPBETA BZIP HOMODIMER BOUND TO A HIGH AFFINITY DNA FRAGMENT organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0278 <- 3.09 -> DA N7 C0012 : score 2.41176 : H : ASN OD1 A0281 <- 2.92 -> DA N6 C0012 : score 5.87727 : H : ASN ND2 A0281 <- 3.07 -> DT O4 D0105 : score 4.99925 : w : ASN ND2 A0281 <- 6.03 -> DA N6 D0104 : score 2.5 : H : ARG NH1 A0289 <- 2.69 -> DG O6 C0010 : score 6.21717 : H : ARG NH2 A0289 <- 3.06 -> DG N7 C0010 : score 6.05262 : w : ARG NH1 A0289 <- 6.24 -> DG O6 D0107 : score 2.756 : x : ALA xxxx A0284 <- 4.11 -> DT xxx D0105 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0285 <- 3.27 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 4.17 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx >1gu4_AB:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C/EBPBETA BZIP HOMODIMER BOUND TO A HIGH AFFINITY DNA FRAGMENT organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0278 <- 3.09 -> DA N7 C0012 : score 2.41176 : H : ASN OD1 A0281 <- 2.92 -> DA N6 C0012 : score 5.87727 : H : ASN ND2 A0281 <- 3.07 -> DT O4 D0105 : score 4.99925 : w : ASN ND2 A0281 <- 6.03 -> DA N6 D0104 : score 2.5 : H : ARG NH1 A0289 <- 2.69 -> DG O6 C0010 : score 6.21717 : H : ARG NH2 A0289 <- 3.06 -> DG N7 C0010 : score 6.05262 : w : ARG NH1 A0289 <- 6.24 -> DG O6 D0107 : score 2.756 : H : ARG NH1 B0278 <- 3.02 -> DA N7 D0111 : score 2.44761 : H : ASN OD1 B0281 <- 2.97 -> DA N6 D0111 : score 5.81705 : H : ASN ND2 B0281 <- 2.98 -> DT O4 C0006 : score 5.09437 : w : ASN ND2 B0281 <- 6.15 -> DA N6 C0005 : score 2.5 : w : ASN OD1 B0282 <- 5.88 -> DC N4 D0110 : score 2.732 : H : ARG NH1 B0289 <- 3.49 -> DG O6 C0008 : score 5.24383 : H : ARG NH2 B0289 <- 3.25 -> DG N7 C0008 : score 5.81 : w : ARG NH1 B0289 <- 5.05 -> DG O6 D0109 : score 2.756 : x : ALA xxxx A0284 <- 4.11 -> DT xxx D0105 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0285 <- 3.27 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 4.17 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0284 <- 4.07 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0285 <- 3.35 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 3.92 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx >1gu5_A:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C/EBPBETA BZIP HOMODIMER BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THE MIM-1 PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 A0281 <- 2.97 -> DA N6 C0012 : score 5.81705 : H : ASN ND2 A0281 <- 2.96 -> DT O4 D0105 : score 5.11551 : w : ASN ND2 A0281 <- 6.60 -> DA N6 D0104 : score 2.5 : w : ASN OD1 A0282 <- 5.95 -> DC N4 C0011 : score 2.732 : H : ARG NH1 A0289 <- 3.15 -> DG O6 D0107 : score 5.6575 : H : ARG NH2 A0289 <- 2.60 -> DG N7 D0107 : score 6.64 : w : ARG NH1 A0289 <- 5.95 -> DC N4 C0010 : score 1.892 : V : ALA CB A0284 <- 3.86 -> DT C7 D0105 : score 5.51499 : x : ARG xxxx A0278 <- 3.10 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0285 <- 3.14 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 3.89 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx >1gu5_AB:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C/EBPBETA BZIP HOMODIMER BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THE MIM-1 PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 A0281 <- 2.97 -> DA N6 C0012 : score 5.81705 : H : ASN ND2 A0281 <- 2.96 -> DT O4 D0105 : score 5.11551 : w : ASN ND2 A0281 <- 6.60 -> DA N6 D0104 : score 2.5 : w : ASN OD1 A0282 <- 5.95 -> DC N4 C0011 : score 2.732 : H : ARG NH1 A0289 <- 3.15 -> DG O6 D0107 : score 5.6575 : H : ARG NH2 A0289 <- 2.60 -> DG N7 D0107 : score 6.64 : w : ARG NH1 A0289 <- 5.95 -> DC N4 C0010 : score 1.892 : H : ARG NH1 B0278 <- 3.15 -> DA N7 D0111 : score 2.38104 : H : ASN OD1 B0281 <- 2.80 -> DA N6 D0111 : score 6.02179 : H : ASN ND2 B0281 <- 2.90 -> DT O4 C0006 : score 5.17892 : w : ASN ND2 B0281 <- 6.41 -> DG O6 C0005 : score 2.971 : w : ASN OD1 B0282 <- 5.80 -> DC N4 D0110 : score 2.732 : V : ALA CB A0284 <- 3.86 -> DT C7 D0105 : score 5.51499 : x : ARG xxxx A0278 <- 3.10 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0285 <- 3.14 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 3.89 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0284 <- 4.08 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0285 <- 3.28 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 3.96 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0289 <- 3.78 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >1gxp_A:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=PHOB EFFECTOR DOMAIN IN COMPLEX WITH PHO BOX DNA. organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0201 <- 2.77 -> DG O6 C0006 : score 6.11983 : V : VAL CG2 A0197 <- 3.88 -> DT C7 C0007 : score 6.00062 : x : ARG xxxx A0193 <- 3.49 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0194 <- 3.64 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0196 <- 4.23 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0200 <- 4.06 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0219 <- 3.22 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx >1gxp_AB:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=PHOB EFFECTOR DOMAIN IN COMPLEX WITH PHO BOX DNA. organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0201 <- 2.77 -> DG O6 C0006 : score 6.11983 : H : ARG NH1 B0201 <- 2.71 -> DG O6 C0017 : score 6.19283 : V : VAL CG2 A0197 <- 3.88 -> DT C7 C0007 : score 6.00062 : V : VAL CG2 B0197 <- 3.57 -> DT C7 C0018 : score 6.47515 : x : ARG xxxx A0193 <- 3.49 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0194 <- 3.64 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0196 <- 4.23 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0200 <- 4.06 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0219 <- 3.22 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0193 <- 3.75 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0194 <- 4.06 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0200 <- 3.77 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0219 <- 3.21 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx >1gxp_EF:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=PHOB EFFECTOR DOMAIN IN COMPLEX WITH PHO BOX DNA. organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 E0201 <- 2.78 -> DG O6 G0006 : score 6.6264 : H : ARG NH2 F0201 <- 2.79 -> DG O6 G0017 : score 6.6132 : V : VAL CB F0197 <- 3.55 -> DT C7 G0018 : score 4.17372 : x : ARG xxxx E0193 <- 3.45 -> DT xxx H0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0194 <- 4.06 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0197 <- 3.93 -> DC xxx G0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0200 <- 3.75 -> DG xxx H0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0219 <- 3.29 -> DT xxx H0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0193 <- 3.88 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0194 <- 4.21 -> DT xxx G0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0200 <- 2.81 -> DG xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0219 <- 3.40 -> DC xxx H0002 : score x.xxxxx >1h0m_AB:Pheromone-binding_domain_of_LuxR-like_quorum-sensing_transcription_factors;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE QUORUM SENSING PROTEIN TRAR BOUND TO ITS AUTOINDUCER AND TO ITS TARGET DNA organism=Rhizobium radiobacter : H : ARG NH1 A0206 <- 2.88 -> DG O6 F0005 : score 5.986 : H : ARG NH2 A0206 <- 3.09 -> DG N7 F0005 : score 6.01431 : H : ARG NH2 A0210 <- 2.89 -> DT O4 F0004 : score 3.48988 : H : ARG NH1 B0206 <- 2.79 -> DG O6 E0005 : score 6.0955 : H : ARG NH2 B0206 <- 3.10 -> DG N7 E0005 : score 6.00154 : H : ARG NH2 B0210 <- 2.82 -> DT O4 E0004 : score 3.53963 : V : VAL CG2 B0207 <- 3.54 -> DT C7 E0004 : score 6.52108 : V : VAL CG2 A0207 <- 3.85 -> DT C7 F0004 : score 6.04654 : x : TYR xxxx A0202 <- 4.24 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0203 <- 3.73 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0202 <- 4.23 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0203 <- 4.18 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0211 <- 3.94 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx >1h0m_C:Pheromone-binding_domain_of_LuxR-like_quorum-sensing_transcription_factors;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE QUORUM SENSING PROTEIN TRAR BOUND TO ITS AUTOINDUCER AND TO ITS TARGET DNA organism=Rhizobium radiobacter : H : ARG NH1 C0206 <- 2.84 -> DG O6 H0005 : score 6.03467 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.97 -> DG N7 H0005 : score 6.16754 : H : ARG NH2 C0210 <- 2.89 -> DT O4 H0004 : score 3.48988 : V : VAL CG2 C0207 <- 3.73 -> DT C7 H0004 : score 6.23023 : x : TYR xxxx C0202 <- 4.37 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0203 <- 3.86 -> DT xxx H0004 : score x.xxxxx >1h0m_CD:Pheromone-binding_domain_of_LuxR-like_quorum-sensing_transcription_factors;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE QUORUM SENSING PROTEIN TRAR BOUND TO ITS AUTOINDUCER AND TO ITS TARGET DNA organism=Rhizobium radiobacter : H : ARG NH1 C0206 <- 2.84 -> DG O6 H0005 : score 6.03467 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.97 -> DG N7 H0005 : score 6.16754 : H : ARG NH2 C0210 <- 2.89 -> DT O4 H0004 : score 3.48988 : H : ARG NH1 D0206 <- 2.94 -> DG O6 G0005 : score 5.913 : H : ARG NH2 D0206 <- 3.12 -> DG N7 G0005 : score 5.976 : H : ARG NH2 D0210 <- 2.78 -> DT O4 G0004 : score 3.56806 : V : VAL CG2 C0207 <- 3.73 -> DT C7 H0004 : score 6.23023 : x : TYR xxxx C0202 <- 4.37 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0203 <- 3.86 -> DT xxx H0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0202 <- 4.50 -> DT xxx H0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0203 <- 4.29 -> DT xxx G0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0207 <- 3.43 -> DT xxx G0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0211 <- 3.82 -> DT xxx G0002 : score x.xxxxx >1h38_C:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURE OF A T7 RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX AT 2.9A RESOLUTION organism=BACTERIOPHAGE T7 : x : PHE xxxx C0644 <- 3.04 -> DA xxx K0009 : score x.xxxxx >1h6f_AB:p53-like_transcription_factors; title=HUMAN TBX3, A TRANSCRIPTION FACTOR RESPONSIBLE FOR ULNAR-MAMMARY SYNDROME, BOUND TO A PALINDROMIC DNA SITE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0130 <- 3.00 -> DG N7 D0018 : score 6.12923 : H : ARG NH2 B0130 <- 3.04 -> DG N7 C0018 : score 6.07815 : V : ALA CB A0263 <- 3.80 -> DT C7 C0005 : score 5.59897 : V : ALA CB B0263 <- 3.73 -> DT C7 D0005 : score 5.69696 : x : THR xxxx A0262 <- 3.43 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0279 <- 3.41 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0283 <- 3.39 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0262 <- 3.48 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0279 <- 4.00 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0283 <- 3.34 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx >1h6f_B:p53-like_transcription_factors; title=HUMAN TBX3, A TRANSCRIPTION FACTOR RESPONSIBLE FOR ULNAR-MAMMARY SYNDROME, BOUND TO A PALINDROMIC DNA SITE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 B0130 <- 3.04 -> DG N7 C0018 : score 6.07815 : V : ALA CB B0263 <- 3.73 -> DT C7 D0005 : score 5.69696 : x : THR xxxx B0262 <- 3.48 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0279 <- 4.00 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0283 <- 3.34 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx >1h88_ABC:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY PROTEIN-DNA COMPLEX1 organism=HOMO SAPIENS / MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0278 <- 2.57 -> DA N7 D0011 : score 2.67803 : H : ASN OD1 A0281 <- 3.42 -> DA N6 D0011 : score 5.27509 : H : ASN ND2 A0281 <- 3.16 -> DT O4 E0016 : score 4.90412 : H : ARG NH1 A0289 <- 3.29 -> DG N7 D0009 : score 5.4571 : H : ARG NH2 A0289 <- 2.54 -> DG O6 D0009 : score 6.9432 : H : ASN OD1 B0281 <- 3.18 -> DC N4 E0022 : score 3.87488 : H : ASN ND2 B0281 <- 3.25 -> DT O4 D0005 : score 4.809 : w : ASN ND2 B0281 <- 6.21 -> DG O6 D0004 : score 2.971 : H : ARG NH1 B0289 <- 2.79 -> DG O6 E0020 : score 6.0955 : H : ARG NH2 B0289 <- 2.61 -> DG O6 D0007 : score 6.8508 : H : LYS NZ C0128 <- 2.40 -> DG O6 D0022 : score 6.24323 : H : GLU OE1 C0132 <- 3.13 -> DC N4 D0020 : score 5.38726 : H : ASN OD1 C0179 <- 3.19 -> DA N6 D0019 : score 5.55209 : H : ASN ND2 C0179 <- 3.22 -> DA N7 D0019 : score 5.37739 : H : LYS NZ C0182 <- 3.05 -> DG N7 E0008 : score 5.1166 : H : LYS NZ C0182 <- 2.65 -> DT O4 E0009 : score 3.69479 : H : ASN OD1 C0183 <- 3.08 -> DA N6 D0018 : score 5.68457 : H : ASN ND2 C0183 <- 2.92 -> DA N7 D0018 : score 5.72962 : V : VAL CG2 B0285 <- 3.88 -> DT C7 D0005 : score 6.00062 : x : ALA xxxx A0284 <- 4.16 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0285 <- 3.24 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 4.31 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0278 <- 3.22 -> DC xxx E0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0282 <- 3.87 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0284 <- 4.27 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 4.07 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0131 <- 4.09 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0178 <- 4.45 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0186 <- 3.55 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0187 <- 4.10 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx >1h88_C:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY PROTEIN-DNA COMPLEX1 organism=MUS MUSCULUS : H : LYS NZ C0128 <- 2.40 -> DG O6 D0022 : score 6.24323 : H : GLU OE1 C0132 <- 3.13 -> DC N4 D0020 : score 5.38726 : H : ASN OD1 C0179 <- 3.19 -> DA N6 D0019 : score 5.55209 : H : ASN ND2 C0179 <- 3.22 -> DA N7 D0019 : score 5.37739 : H : LYS NZ C0182 <- 3.05 -> DG N7 E0008 : score 5.1166 : H : LYS NZ C0182 <- 2.65 -> DT O4 E0009 : score 3.69479 : H : ASN OD1 C0183 <- 3.08 -> DA N6 D0018 : score 5.68457 : H : ASN ND2 C0183 <- 2.92 -> DA N7 D0018 : score 5.72962 : x : ARG xxxx C0131 <- 4.09 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0178 <- 4.45 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0186 <- 3.55 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0187 <- 4.10 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx >1h89_A:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY PROTEIN-DNA COMPLEX2 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0278 <- 3.04 -> DA N7 D0011 : score 2.43736 : H : ASN OD1 A0281 <- 3.25 -> DA N6 D0011 : score 5.47983 : H : ASN ND2 A0281 <- 3.40 -> DT O4 E0016 : score 4.65046 : H : ARG NH1 A0289 <- 3.17 -> DG N7 D0009 : score 5.6023 : H : ARG NH2 A0289 <- 2.77 -> DG O6 D0009 : score 6.6396 : H : ARG NH2 A0289 <- 2.89 -> DG O6 E0018 : score 6.4812 : V : VAL CG2 A0285 <- 3.76 -> DT C7 E0016 : score 6.18431 : x : ALA xxxx A0284 <- 4.03 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 4.33 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx >1h89_ABC:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY PROTEIN-DNA COMPLEX2 organism=HOMO SAPIENS / MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0278 <- 3.04 -> DA N7 D0011 : score 2.43736 : H : ASN OD1 A0281 <- 3.25 -> DA N6 D0011 : score 5.47983 : H : ASN ND2 A0281 <- 3.40 -> DT O4 E0016 : score 4.65046 : H : ARG NH1 A0289 <- 3.17 -> DG N7 D0009 : score 5.6023 : H : ARG NH2 A0289 <- 2.89 -> DG O6 E0018 : score 6.4812 : H : ARG NH2 A0289 <- 2.77 -> DG O6 D0009 : score 6.6396 : H : ASN OD1 B0281 <- 2.95 -> DC N4 E0022 : score 4.06778 : H : ASN ND2 B0281 <- 3.25 -> DT O4 D0005 : score 4.809 : w : ASN ND2 B0281 <- 6.58 -> DG N7 D0004 : score 3.259 : w : ASN OD1 B0282 <- 6.02 -> DC N4 E0021 : score 2.732 : H : ARG NH1 B0289 <- 2.49 -> DG O6 E0020 : score 6.4605 : H : ARG NH2 B0289 <- 3.18 -> DG O6 E0020 : score 6.0984 : H : ARG NH2 B0289 <- 2.58 -> DG O6 D0007 : score 6.8904 : H : LYS NZ C0128 <- 2.57 -> DG O6 D0022 : score 6.04668 : H : GLU OE2 C0132 <- 3.03 -> DC N4 D0020 : score 5.02318 : w : GLU OE1 C0132 <- 5.63 -> DG O6 D0021 : score 2.669 : w : GLU OE2 C0132 <- 5.76 -> DC N4 E0007 : score 3.597 : H : ASN OD1 C0179 <- 3.07 -> DA N6 D0019 : score 5.69662 : H : LYS NZ C0182 <- 2.54 -> DG N7 E0008 : score 5.66596 : H : ASN OD1 C0183 <- 2.91 -> DA N6 D0018 : score 5.88932 : H : ASN ND2 C0183 <- 3.02 -> DA N7 D0018 : score 5.61221 : w : ASN OD1 C0183 <- 5.57 -> DT O4 E0009 : score 3.132 : w : ASN ND2 C0186 <- 6.00 -> DT O4 E0009 : score 3.275 : V : VAL CG2 A0285 <- 3.76 -> DT C7 E0016 : score 6.18431 : V : VAL CG2 B0285 <- 3.72 -> DT C7 D0005 : score 6.24554 : x : ALA xxxx A0284 <- 4.03 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 4.33 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0278 <- 3.37 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0284 <- 4.35 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 3.95 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0131 <- 3.96 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0187 <- 4.23 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx >1h8a_ABC:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY PROTEIN-DNA COMPLEX3 organism=HOMO SAPIENS / AVIAN MYELOBLASTOSIS VIRUS : H : ARG NH1 A0278 <- 3.12 -> DA N7 D0011 : score 2.3964 : H : ASN OD1 A0281 <- 2.93 -> DA N6 D0011 : score 5.86523 : H : ASN ND2 A0281 <- 3.06 -> DT O4 E0016 : score 5.00982 : w : ASN ND2 A0281 <- 6.57 -> DA N6 E0015 : score 2.5 : H : ARG NH1 A0289 <- 3.13 -> DG N7 D0009 : score 5.6507 : H : ARG NH2 A0289 <- 2.64 -> DG O6 D0009 : score 6.8112 : w : ARG NH2 A0289 <- 6.34 -> DG O6 E0018 : score 2.468 : w : ARG NH1 B0278 <- 6.11 -> DA N6 E0023 : score 1.486 : H : ASN OD1 B0281 <- 3.08 -> DC N4 E0022 : score 3.95875 : H : ASN ND2 B0281 <- 2.78 -> DT O4 D0005 : score 5.30575 : w : ASN ND2 B0281 <- 5.68 -> DG N7 D0004 : score 3.259 : w : ASN OD1 B0282 <- 5.87 -> DC N4 E0021 : score 2.732 : H : ARG NH1 B0289 <- 2.62 -> DG O6 E0020 : score 6.30233 : H : ARG NH2 B0289 <- 3.09 -> DG O6 E0020 : score 6.2172 : H : ARG NH2 B0289 <- 2.65 -> DG O6 D0007 : score 6.798 : H : LYS NZ C0128 <- 2.59 -> DG O6 D0022 : score 6.02356 : H : GLU OE1 C0132 <- 3.09 -> DC N4 D0020 : score 5.43341 : H : ASN OD1 C0179 <- 3.07 -> DA N6 D0019 : score 5.69662 : H : LYS NZ C0182 <- 2.81 -> DG N7 E0008 : score 5.37513 : H : ASN OD1 C0183 <- 2.91 -> DA N6 D0018 : score 5.88932 : H : ASN ND2 C0183 <- 3.18 -> DA N7 D0018 : score 5.42435 : V : VAL CG2 B0285 <- 3.61 -> DT C7 D0005 : score 6.41392 : x : ALA xxxx A0284 <- 4.13 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0285 <- 3.29 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 4.19 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0284 <- 4.08 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 4.19 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0131 <- 4.20 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0186 <- 3.57 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0187 <- 4.18 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx >1h8a_B:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY PROTEIN-DNA COMPLEX3 organism=? : w : ARG NH1 B0278 <- 6.11 -> DA N6 E0023 : score 1.486 : H : ASN OD1 B0281 <- 3.08 -> DC N4 E0022 : score 3.95875 : H : ASN ND2 B0281 <- 2.78 -> DT O4 D0005 : score 5.30575 : w : ASN ND2 B0281 <- 5.68 -> DG N7 D0004 : score 3.259 : w : ASN OD1 B0282 <- 5.87 -> DC N4 E0021 : score 2.732 : H : ARG NH1 B0289 <- 2.62 -> DG O6 E0020 : score 6.30233 : H : ARG NH2 B0289 <- 2.65 -> DG O6 D0007 : score 6.798 : H : ARG NH2 B0289 <- 3.09 -> DG O6 E0020 : score 6.2172 : V : VAL CG2 B0285 <- 3.61 -> DT C7 D0005 : score 6.41392 : x : ALA xxxx B0284 <- 4.08 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 4.19 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx >1h9d_C:p53-like_transcription_factors; title=AML1/CBF-BETA/DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 C0080 <- 2.77 -> DG N7 G0004 : score 6.0863 : H : ARG NH2 C0080 <- 2.63 -> DG O6 G0004 : score 6.8244 : H : ARG NH1 C0142 <- 3.21 -> DA N3 H0002 : score 3.38012 : H : ARG NH2 C0142 <- 3.02 -> DC O2 H0001 : score 3.53597 : H : ASP OD1 C0171 <- 2.94 -> DC N4 H0005 : score 5.19522 : H : ASP OD2 C0171 <- 3.10 -> DC N4 H0004 : score 5.828 : H : ARG NH1 C0174 <- 3.18 -> DG O6 G0006 : score 5.621 : H : ARG NH2 C0174 <- 3.17 -> DG N7 G0006 : score 5.91215 : H : ARG NH2 C0177 <- 2.83 -> DG O6 G0007 : score 6.5604 : x : VAL xxxx C0170 <- 3.56 -> DC xxx H0005 : score x.xxxxx >1h9t_AB:Fatty_acid_responsive_transcription_factor_FadR,_C-terminal_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;GntR_ligand-binding_domain-like; title=FADR, FATTY ACID RESPONSIVE TRANSCRIPTION FACTOR FROM E. COLI IN COMPLEX WITH FADB OPERATOR organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 A0035 <- 3.01 -> DG O6 Y0006 : score 6.3228 : H : ARG NH1 A0045 <- 2.68 -> DG O6 Y0007 : score 6.22933 : H : ARG NH2 A0045 <- 2.74 -> DG N7 Y0007 : score 6.46123 : H : ARG NH2 A0045 <- 3.24 -> DG O6 Y0007 : score 6.0192 : H : THR OG1 A0046 <- 3.32 -> DC N4 X0010 : score 3.61387 : H : HIS NE2 A0065 <- 2.99 -> DA N3 X0015 : score 4.0848 : H : ARG NH1 B0035 <- 2.64 -> DG N7 X0006 : score 6.2436 : H : ARG NH2 B0035 <- 2.96 -> DG O6 X0006 : score 6.3888 : H : ARG NH1 B0045 <- 2.84 -> DG O6 X0007 : score 6.03467 : H : ARG NH2 B0045 <- 2.66 -> DG N7 X0007 : score 6.56338 : H : THR OG1 B0046 <- 3.05 -> DG O6 Y0010 : score 4.00462 : x : THR xxxx A0044 <- 3.77 -> DC xxx X0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0049 <- 3.44 -> DT xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0050 <- 4.08 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0044 <- 3.40 -> DG xxx Y0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0049 <- 3.45 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0050 <- 4.12 -> DT xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0065 <- 3.51 -> DA xxx Y0015 : score x.xxxxx >1h9t_B:Fatty_acid_responsive_transcription_factor_FadR,_C-terminal_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=FADR, FATTY ACID RESPONSIVE TRANSCRIPTION FACTOR FROM E. COLI IN COMPLEX WITH FADB OPERATOR organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 B0035 <- 2.64 -> DG N7 X0006 : score 6.2436 : H : ARG NH2 B0035 <- 2.96 -> DG O6 X0006 : score 6.3888 : H : ARG NH1 B0045 <- 2.84 -> DG O6 X0007 : score 6.03467 : H : ARG NH2 B0045 <- 2.66 -> DG N7 X0007 : score 6.56338 : H : THR OG1 B0046 <- 3.05 -> DG O6 Y0010 : score 4.00462 : x : THR xxxx B0044 <- 3.40 -> DG xxx Y0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0049 <- 3.45 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0050 <- 4.12 -> DT xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0065 <- 3.51 -> DA xxx Y0015 : score x.xxxxx >1hao_H:?;Trypsin-like_serine_proteases;?;?; title=COMPLEX OF HUMAN ALPHA-THROMBIN WITH A 15MER OLIGONUCLEOTIDE GGTTGGTGTGGTTGG (BASED ON NMR MODEL OF DNA) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 H0075 <- 2.33 -> DT O4 D0413 : score 3.88791 : H : ARG NE H0077 <- 2.59 -> DT O2 D0413 : score 2.68515 : x : ILE xxxx H0024 <- 3.81 -> DT xxx D0412 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0071 <- 3.86 -> DT xxx D0412 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0076 <- 3.40 -> DT xxx D0403 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0078 <- 4.20 -> DT xxx D0413 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0079 <- 2.50 -> DT xxx D0412 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0082 <- 3.81 -> DT xxx D0403 : score x.xxxxx >1hbx_A:SRF-like; title=TERNARY COMPLEX OF SAP-1 AND SRF WITH SPECIFIC SRE DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0143 <- 2.79 -> DA N3 W-001 : score 3.68942 : H : ARG NH1 A0143 <- 2.95 -> DT O2 C-002 : score 4.17722 : H : LYS NZ A0163 <- 2.84 -> DG O6 C-005 : score 5.73452 : x : THR xxxx A0140 <- 2.84 -> DC xxx W-004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0158 <- 3.41 -> DA xxx W-009 : score x.xxxxx >1hbx_ABG:SRF-like; title=TERNARY COMPLEX OF SAP-1 AND SRF WITH SPECIFIC SRE DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0143 <- 2.95 -> DT O2 C-002 : score 4.17722 : H : ARG NH1 A0143 <- 2.79 -> DA N3 W-001 : score 3.68942 : H : LYS NZ A0163 <- 2.84 -> DG O6 C-005 : score 5.73452 : H : THR OG1 B0140 <- 2.50 -> DC O2 C0004 : score 2.78318 : H : ARG NH1 B0143 <- 3.16 -> DT O2 W0002 : score 3.99635 : H : LYS NZ B0163 <- 3.13 -> DG N7 W0004 : score 5.03043 : H : ARG NE G0061 <- 3.09 -> DG O6 W-010 : score 3.71245 : H : ARG NH2 G0061 <- 2.72 -> DG N7 W-010 : score 6.48677 : H : ARG NH1 G0064 <- 2.77 -> DG N7 W-011 : score 6.0863 : H : ARG NH1 G0064 <- 2.38 -> DG O6 W-011 : score 6.59433 : H : TYR OH G0065 <- 3.02 -> DA N6 W-009 : score 4.46501 : x : THR xxxx A0140 <- 2.84 -> DC xxx W-004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0158 <- 3.41 -> DA xxx W-009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0159 <- 4.23 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0162 <- 3.99 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0058 <- 4.34 -> DT xxx C-009 : score x.xxxxx >1hbx_DH:SRF-like; title=TERNARY COMPLEX OF SAP-1 AND SRF WITH SPECIFIC SRE DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 D0143 <- 2.92 -> DA N3 X-001 : score 3.59368 : H : ARG NE H0061 <- 3.04 -> DG O6 X-010 : score 3.75186 : H : ARG NH2 H0061 <- 3.11 -> DG N7 X-010 : score 5.98877 : H : ARG NH1 H0064 <- 3.26 -> DG N7 X-011 : score 5.4934 : H : ARG NH1 H0064 <- 2.59 -> DG O6 X-011 : score 6.33883 : H : TYR OH H0065 <- 2.89 -> DA N6 X-009 : score 4.58644 : x : THR xxxx D0140 <- 3.26 -> DG xxx F-005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0158 <- 3.13 -> DA xxx X-009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0163 <- 3.01 -> DG xxx F-005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx H0057 <- 3.81 -> DC xxx F-011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0058 <- 4.09 -> DT xxx F-009 : score x.xxxxx >1hcq_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE ESTROGEN RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO DNA: HOW RECEPTORS DISCRIMINATE BETWEEN THEIR RESPONSE ELEMENTS organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0025 <- 2.68 -> DC N4 D0033 : score 5.90638 : w : GLU OE1 A0025 <- 6.13 -> DA N6 D0032 : score 2.939 : H : LYS NZ A0028 <- 3.22 -> DG O6 C0004 : score 5.29518 : H : LYS NZ A0032 <- 2.92 -> DG N7 C0005 : score 5.25664 : H : LYS NZ A0032 <- 3.06 -> DT O4 C0006 : score 3.40065 : H : ARG NH1 A0033 <- 3.09 -> DG N7 D0031 : score 5.6991 : H : GLU OE1 B0025 <- 3.00 -> DC N4 C0015 : score 5.53723 : w : GLU OE1 B0025 <- 6.54 -> DA N6 C0014 : score 2.939 : H : LYS NZ B0028 <- 3.15 -> DG N7 D0022 : score 5.00888 : H : LYS NZ B0028 <- 2.71 -> DG O6 D0022 : score 5.88482 : H : LYS NZ B0032 <- 3.28 -> DG N7 D0023 : score 4.86885 : w : LYS NZ B0032 <- 6.28 -> DT O4 D0024 : score 1.7 : H : ARG NH1 B0033 <- 3.20 -> DG N7 C0013 : score 5.566 : w : ARG NH1 B0033 <- 6.01 -> DT O4 D0024 : score 1.768 : x : ALA xxxx A0029 <- 3.47 -> DG xxx D0031 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0029 <- 3.86 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >1hcq_E:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE ESTROGEN RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO DNA: HOW RECEPTORS DISCRIMINATE BETWEEN THEIR RESPONSE ELEMENTS organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 E0025 <- 2.48 -> DC N4 H0033 : score 6.1371 : w : GLU OE1 E0025 <- 5.98 -> DA N6 H0032 : score 2.939 : H : LYS NZ E0028 <- 2.75 -> DG O6 G0004 : score 5.83858 : H : LYS NZ E0032 <- 2.83 -> DG N7 G0005 : score 5.35358 : H : ARG NH1 E0033 <- 2.70 -> DG N7 H0031 : score 6.171 : w : ARG NH1 E0033 <- 5.91 -> DG O6 H0031 : score 2.756 : x : ALA xxxx E0029 <- 3.51 -> DG xxx H0031 : score x.xxxxx >1hcq_EF:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE ESTROGEN RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO DNA: HOW RECEPTORS DISCRIMINATE BETWEEN THEIR RESPONSE ELEMENTS organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 E0025 <- 2.48 -> DC N4 H0033 : score 6.1371 : w : GLU OE1 E0025 <- 5.98 -> DA N6 H0032 : score 2.939 : H : LYS NZ E0028 <- 2.75 -> DG O6 G0004 : score 5.83858 : H : LYS NZ E0032 <- 2.83 -> DG N7 G0005 : score 5.35358 : H : ARG NH1 E0033 <- 2.70 -> DG N7 H0031 : score 6.171 : w : ARG NH1 E0033 <- 6.45 -> DT O4 G0006 : score 1.768 : H : GLU OE1 F0025 <- 2.92 -> DC N4 G0015 : score 5.62952 : H : LYS NZ F0028 <- 2.96 -> DG N7 H0022 : score 5.21355 : H : LYS NZ F0032 <- 3.15 -> DG N7 H0023 : score 5.00888 : H : ARG NH1 F0033 <- 3.20 -> DG N7 G0013 : score 5.566 : x : ALA xxxx E0029 <- 3.51 -> DG xxx H0031 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0029 <- 3.44 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx >1hcr_A:Homeodomain-like; title=HIN RECOMBINASE BOUND TO DNA: THE ORIGIN OF SPECIFICITY IN MAJOR AND MINOR GROOVE INTERACTIONS organism=? : H : SER OG A0174 <- 2.60 -> DA N7 B0010 : score 4.64267 : H : SER OG A0174 <- 3.04 -> DT O4 B0011 : score 3.38448 : H : ARG NH2 A0178 <- 2.62 -> DG N7 B0009 : score 6.61446 : w : ARG NE A0178 <- 6.17 -> DT O4 C0022 : score 1.317 : x : ARG xxxx A0140 <- 3.23 -> DA xxx C0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0175 <- 3.49 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0177 <- 3.30 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0185 <- 2.95 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0186 <- 4.47 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0187 <- 4.31 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0190 <- 3.13 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx >1hdd_C:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ENGRAILED HOMEODOMAIN-DNA COMPLEX AT 2.8 ANGSTROMS RESOLUTION: A FRAMEWORK FOR UNDERSTANDING HOMEODOMAIN-DNA INTERACTIONS organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 C0005 <- 2.50 -> DT O2 A0011 : score 4.5648 : H : ASN OD1 C0051 <- 3.14 -> DA N6 A0013 : score 5.61231 : H : ASN ND2 C0051 <- 3.43 -> DA N7 A0013 : score 5.13083 : V : GLN CG C0050 <- 3.59 -> DT C7 B0028 : score 3.42629 : x : ARG xxxx C0003 <- 3.86 -> DA xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0047 <- 2.94 -> DT xxx A0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0055 <- 4.36 -> DT xxx A0011 : score x.xxxxx >1hdd_CD:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ENGRAILED HOMEODOMAIN-DNA COMPLEX AT 2.8 ANGSTROMS RESOLUTION: A FRAMEWORK FOR UNDERSTANDING HOMEODOMAIN-DNA INTERACTIONS organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 C0005 <- 2.50 -> DT O2 A0011 : score 4.5648 : H : ASN OD1 C0051 <- 3.14 -> DA N6 A0013 : score 5.61231 : H : ASN ND2 C0051 <- 3.43 -> DA N7 A0013 : score 5.13083 : V : ILE CG2 D0047 <- 3.54 -> DT C7 B0023 : score 7.55222 : V : GLN CG C0050 <- 3.59 -> DT C7 B0028 : score 3.42629 : x : ARG xxxx C0003 <- 3.86 -> DA xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0047 <- 2.94 -> DT xxx A0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0055 <- 4.36 -> DT xxx A0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0050 <- 3.48 -> DT xxx A0019 : score x.xxxxx >1hf0_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA-BINDING DOMAIN OF OCT-1 BOUND TO DNA AS A DIMER organism=HOMO SAPIENS : H : GLN OE1 A0044 <- 2.92 -> DA N6 M0011 : score 5.9073 : H : GLN NE2 A0044 <- 2.45 -> DA N7 M0011 : score 6.51603 : H : THR OG1 A0045 <- 3.05 -> DC N4 N0010 : score 3.83167 : H : THR OG1 A0045 <- 3.13 -> DG O6 M0012 : score 3.93717 : H : ARG NH1 A0049 <- 3.03 -> DG N7 N0009 : score 5.7717 : H : ARG NH2 A0049 <- 2.44 -> DG O6 N0009 : score 7.0752 : H : ARG NH1 A0105 <- 2.68 -> DA N3 M0015 : score 3.77042 : w : ARG NH1 A0105 <- 5.99 -> DT O2 N0008 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0105 <- 5.83 -> DC O2 M0014 : score 1.669 : w : SER OG A0150 <- 5.35 -> DC N4 N0004 : score 2.105 : H : ASN OD1 A0151 <- 3.22 -> DA N6 M0017 : score 5.51596 : H : ASN ND2 A0151 <- 3.24 -> DA N7 M0017 : score 5.35391 : H : GLN NE2 B0044 <- 2.42 -> DT O4 N0012 : score 5.58554 : H : THR OG1 B0045 <- 3.03 -> DT O4 N0013 : score 3.70837 : H : THR OG1 B0045 <- 2.77 -> DA N6 M0009 : score 2.77553 : H : ARG NH2 B0049 <- 2.41 -> DG O6 M0008 : score 7.1148 : H : ARG NH1 B0105 <- 2.69 -> DA N3 N0016 : score 3.76306 : w : SER OG B0150 <- 6.29 -> DC N4 M0003 : score 2.105 : H : ASN ND2 B0151 <- 3.17 -> DA N7 N0018 : score 5.43609 : w : ASN OD1 B0151 <- 6.06 -> DC N4 M0003 : score 2.732 : V : VAL CG1 A0147 <- 3.84 -> DT C7 M0018 : score 5.99991 : x : GLN xxxx A0027 <- 4.49 -> DA xxx M0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0043 <- 3.91 -> DG xxx N0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0048 <- 3.69 -> DA xxx M0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0102 <- 3.29 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0146 <- 3.87 -> DT xxx N0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0154 <- 2.92 -> DA xxx N0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0027 <- 3.55 -> DT xxx N0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 3.80 -> DG xxx M0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0048 <- 3.81 -> DT xxx N0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0102 <- 3.92 -> DT xxx M0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0147 <- 3.87 -> DA xxx N0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0154 <- 3.06 -> DC xxx M0003 : score x.xxxxx >1hf0_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA-BINDING DOMAIN OF OCT-1 BOUND TO DNA AS A DIMER organism=HOMO SAPIENS : H : GLN NE2 B0044 <- 2.42 -> DT O4 N0012 : score 5.58554 : H : THR OG1 B0045 <- 3.03 -> DT O4 N0013 : score 3.70837 : H : THR OG1 B0045 <- 2.77 -> DA N6 M0009 : score 2.77553 : H : ARG NH2 B0049 <- 2.41 -> DG O6 M0008 : score 7.1148 : H : ARG NH1 B0105 <- 2.69 -> DA N3 N0016 : score 3.76306 : w : SER OG B0150 <- 6.29 -> DC N4 M0003 : score 2.105 : H : ASN ND2 B0151 <- 3.17 -> DA N7 N0018 : score 5.43609 : w : ASN OD1 B0151 <- 6.06 -> DC N4 M0003 : score 2.732 : x : GLN xxxx B0027 <- 3.55 -> DT xxx N0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 3.80 -> DG xxx M0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0048 <- 3.81 -> DT xxx N0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0102 <- 3.92 -> DT xxx M0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0147 <- 3.87 -> DA xxx N0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0154 <- 3.06 -> DC xxx M0003 : score x.xxxxx >1hht_R:DNA/RNA_polymerases; title=RNA DEPENDENT RNA POLYMERASE FROM DSRNA BACTERIOPHAGE PHI6 PLUS TEMPLATE organism=BACTERIOPHAGE PHI-6 : H : SER OG R0393 <- 3.03 -> DT O2 F0005 : score 3.52735 : H : THR OG1 R0633 <- 3.19 -> DC O2 F0007 : score 2.42084 : H : GLU OE1 R0634 <- 2.80 -> DC N4 F0007 : score 5.76795 : V : VAL CG2 R0202 <- 3.65 -> DT C7 F0005 : score 6.35269 : x : GLN xxxx R0026 <- 3.77 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0030 <- 3.40 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx R0144 <- 3.61 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0204 <- 2.72 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx R0272 <- 3.76 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx R0288 <- 3.68 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0398 <- 3.64 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx R0530 <- 3.71 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0626 <- 3.60 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx R0629 <- 3.18 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx R0642 <- 3.85 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx R0646 <- 3.36 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx >1hjb_ABC:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RUNX-1/AML1/CBFALPHA RUNT DOMAIN AND C/EBPBETA BZIP HOMODIMER BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THE CSF-1R PROMOTER organism=HOMO SAPIENS / MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 A0278 <- 2.98 -> DA N7 H0021 : score 1.61161 : H : ASN OD1 A0281 <- 3.43 -> DA N6 H0021 : score 5.26305 : H : ASN ND2 A0281 <- 3.28 -> DT O4 G0006 : score 4.77729 : H : ARG NH1 A0289 <- 3.25 -> DG N7 H0019 : score 5.5055 : H : ARG NH2 A0289 <- 2.34 -> DG O6 H0019 : score 7.2072 : H : ASN OD1 B0281 <- 2.90 -> DA N6 G0012 : score 5.90136 : H : ARG NH2 C0080 <- 3.10 -> DG N7 G0018 : score 6.00154 : H : ARG NH1 C0142 <- 2.98 -> DA N3 H0005 : score 3.5495 : H : ARG NH2 C0142 <- 3.16 -> DC O2 H0004 : score 3.43241 : H : ASP OD2 C0171 <- 3.18 -> DC N4 H0008 : score 5.7288 : H : ARG NH1 C0174 <- 2.77 -> DG O6 G0020 : score 6.11983 : H : ARG NH1 C0177 <- 3.20 -> DG N7 G0021 : score 5.566 : H : ARG NH2 C0177 <- 2.85 -> DG O6 G0021 : score 6.534 : V : VAL CG2 A0285 <- 3.83 -> DT C7 G0007 : score 6.07715 : x : ALA xxxx A0284 <- 4.39 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 4.03 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0278 <- 2.93 -> DA xxx G0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0282 <- 4.18 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0284 <- 4.21 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0285 <- 3.82 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 4.18 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0289 <- 4.31 -> DT xxx H0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0170 <- 4.21 -> DC xxx H0008 : score x.xxxxx >1hjb_D:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RUNX-1/AML1/CBFALPHA RUNT DOMAIN AND C/EBPBETA BZIP HOMODIMER BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THE CSF-1R PROMOTER organism=? : H : ASN ND2 D0281 <- 3.11 -> DT O4 I0006 : score 4.95697 : H : ARG NH1 D0289 <- 3.07 -> DG N7 J0019 : score 5.7233 : H : ARG NH1 D0289 <- 3.32 -> DG O6 J0019 : score 5.45067 : V : VAL CG2 D0285 <- 3.53 -> DT C7 I0006 : score 6.53638 : x : ARG xxxx D0278 <- 3.50 -> DA xxx J0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0288 <- 4.20 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx >1hjb_DEF:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RUNX-1/AML1/CBFALPHA RUNT DOMAIN AND C/EBPBETA BZIP HOMODIMER BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THE CSF-1R PROMOTER organism=MUS MUSCULUS / HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 D0281 <- 3.11 -> DT O4 I0006 : score 4.95697 : H : ARG NH1 D0289 <- 3.07 -> DG N7 J0019 : score 5.7233 : H : ARG NH1 D0289 <- 3.32 -> DG O6 J0019 : score 5.45067 : H : ARG NH2 E0278 <- 3.09 -> DA N7 I0012 : score 1.57483 : H : ASN ND2 E0281 <- 3.34 -> DT O4 J0015 : score 4.71388 : H : ARG NH2 F0080 <- 2.85 -> DG O6 I0018 : score 6.534 : H : ARG NH1 F0142 <- 2.64 -> DA N3 J0005 : score 3.79988 : H : ASP OD2 F0171 <- 2.98 -> DC N4 J0008 : score 5.9768 : H : ARG NH1 F0174 <- 2.46 -> DG O6 I0020 : score 6.497 : H : ARG NH2 F0174 <- 2.96 -> DG N7 I0020 : score 6.18031 : H : ARG NH2 F0177 <- 2.69 -> DG N7 I0021 : score 6.52508 : H : ARG NH2 F0177 <- 2.53 -> DG O6 I0021 : score 6.9564 : V : VAL CG2 D0285 <- 3.53 -> DT C7 I0006 : score 6.53638 : V : VAL CG2 E0285 <- 3.68 -> DT C7 J0015 : score 6.30677 : x : ARG xxxx D0278 <- 3.50 -> DA xxx J0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0288 <- 4.20 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0282 <- 3.98 -> DA xxx I0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0284 <- 4.06 -> DG xxx J0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0288 <- 3.88 -> DT xxx J0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0289 <- 3.47 -> DG xxx J0018 : score x.xxxxx >1hjc_D:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RUNX-1/AML1/CBFALPHA RUNT DOMAIN BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THE CSF-1R PROMOTER organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 D0080 <- 3.04 -> DG N7 E0018 : score 5.7596 : H : ARG NH2 D0080 <- 2.88 -> DG O6 E0018 : score 6.4944 : H : ARG NH1 D0142 <- 3.45 -> DA N3 F0005 : score 3.20338 : H : ARG NH2 D0142 <- 3.02 -> DC O2 F0004 : score 3.53597 : H : ASP OD1 D0171 <- 3.22 -> DC N4 F0007 : score 4.8959 : H : ASP OD2 D0171 <- 2.93 -> DC N4 F0008 : score 6.0388 : w : ASP OD2 D0171 <- 6.00 -> DT O4 E0019 : score 2.798 : H : ARG NH1 D0174 <- 2.96 -> DG O6 E0020 : score 5.88867 : H : ARG NH1 D0177 <- 3.10 -> DG N7 E0021 : score 5.687 : H : ARG NH2 D0177 <- 3.18 -> DG O6 E0021 : score 6.0984 : x : VAL xxxx D0170 <- 3.51 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx >1hlo_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF AN INTACT HUMAN MAX-DNA COMPLEX: NEW INSIGHTS INTO MECHANISMS OF TRANSCRIPTIONAL CONTROL organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0022 <- 2.89 -> DC N4 D0118 : score 5.66413 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.86 -> DG N7 C0108 : score 5.9774 : H : HIS NE2 B0018 <- 2.86 -> DG O6 D0124 : score 7.8584 : H : GLU OE1 B0022 <- 2.89 -> DC N4 C0105 : score 5.66413 : w : GLU OE2 B0022 <- 5.19 -> DG O6 D0121 : score 2.892 : H : ARG NH1 B0026 <- 2.96 -> DG N7 D0121 : score 5.8564 : w : ARG NH1 B0026 <- 5.60 -> DG O6 D0121 : score 2.756 : x : HIS xxxx A0018 <- 2.66 -> DG xxx C0110 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0019 <- 3.36 -> DT xxx C0109 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0025 <- 3.59 -> DC xxx D0118 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0019 <- 3.02 -> DT xxx D0122 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0021 <- 4.36 -> DC xxx C0102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0025 <- 3.54 -> DC xxx C0105 : score x.xxxxx >1hlo_B:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF AN INTACT HUMAN MAX-DNA COMPLEX: NEW INSIGHTS INTO MECHANISMS OF TRANSCRIPTIONAL CONTROL organism=Homo sapiens : H : HIS NE2 B0018 <- 2.86 -> DG O6 D0124 : score 7.8584 : H : GLU OE1 B0022 <- 2.89 -> DC N4 C0105 : score 5.66413 : w : GLU OE2 B0022 <- 5.19 -> DG O6 D0121 : score 2.892 : H : ARG NH1 B0026 <- 2.96 -> DG N7 D0121 : score 5.8564 : w : ARG NH1 B0026 <- 5.60 -> DG O6 D0121 : score 2.756 : x : ASN xxxx B0019 <- 3.02 -> DT xxx D0122 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0021 <- 4.36 -> DC xxx C0102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0025 <- 3.54 -> DC xxx C0105 : score x.xxxxx >1hlv_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CENP-B(1-129) COMPLEXED WITH THE CENP-B BOX DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0005 <- 2.77 -> DT O2 B0009 : score 4.33225 : H : ARG NH2 A0005 <- 3.06 -> DT O2 B0009 : score 4.0132 : w : ARG NH1 A0005 <- 5.67 -> DA N3 C0013 : score 2.585 : H : SER OG A0040 <- 2.64 -> DG N7 C0016 : score 4.62548 : H : SER OG A0040 <- 2.57 -> DG O6 C0016 : score 4.27921 : w : THR OG1 A0068 <- 6.12 -> DC O2 C0012 : score 2.048 : H : LYS NZ A0070 <- 2.86 -> DT O2 C0010 : score 3.54413 : H : ASN ND2 A0120 <- 3.08 -> DG O6 B0018 : score 5.32271 : w : ASN OD1 A0120 <- 6.23 -> DT O4 C0003 : score 3.132 : H : ARG NH2 A0125 <- 2.29 -> DG O6 B0016 : score 7.2732 : x : GLN xxxx A0007 <- 4.30 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0039 <- 4.14 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.67 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0043 <- 3.44 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0044 <- 3.28 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0119 <- 3.63 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0124 <- 3.63 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx >1hlz_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ORPHAN NUCLEAR RECEPTOR REV-ERB(ALPHA) DNA- BINDING DOMAIN BOUND TO ITS COGNATE RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0019 <- 2.56 -> DC N4 D0625 : score 6.04481 : H : LYS NZ A0022 <- 2.92 -> DG O6 C0614 : score 5.64203 : H : ARG NH2 A0027 <- 2.62 -> DG N7 D0623 : score 6.61446 : H : GLU OE1 B0019 <- 2.91 -> DC N4 D0633 : score 5.64105 : H : LYS NZ B0022 <- 2.80 -> DG O6 C0606 : score 5.78077 : H : ARG NH2 B0027 <- 2.62 -> DG N7 D0631 : score 6.61446 : x : ARG xxxx A0026 <- 2.32 -> DG xxx C0615 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0075 <- 4.28 -> DA xxx C0610 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0026 <- 3.01 -> DG xxx C0607 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0073 <- 4.07 -> DT xxx D0638 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0075 <- 2.98 -> DA xxx C0601 : score x.xxxxx >1hlz_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ORPHAN NUCLEAR RECEPTOR REV-ERB(ALPHA) DNA- BINDING DOMAIN BOUND TO ITS COGNATE RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 B0019 <- 2.91 -> DC N4 D0633 : score 5.64105 : H : LYS NZ B0022 <- 2.80 -> DG O6 C0606 : score 5.78077 : H : ARG NH2 B0027 <- 2.62 -> DG N7 D0631 : score 6.61446 : x : ARG xxxx B0026 <- 3.01 -> DG xxx C0607 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0073 <- 4.07 -> DT xxx D0638 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0075 <- 2.98 -> DA xxx C0601 : score x.xxxxx >1hry_A:HMG-box; title=THE 3D STRUCTURE OF THE HUMAN SRY-DNA COMPLEX SOLVED BY MULTID- DIMENSIONAL HETERONUCLEAR-EDITED AND-FILTERED NMR organism=? : H : SER OG A0033 <- 2.73 -> DG N2 C0001 : score 3.4216 : H : SER OG A0036 <- 3.29 -> DT O2 C0002 : score 3.33509 : x : ASN xxxx A0010 <- 3.10 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0012 <- 2.64 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0013 <- 2.96 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0020 <- 4.13 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0074 <- 3.19 -> DA xxx B0003 : score x.xxxxx >1hrz_A:HMG-box; title=THE 3D STRUCTURE OF THE HUMAN SRY-DNA COMPLEX SOLVED BY MULTI- DIMENSIONAL HETERONUCLEAR-EDITED AND-FILTERED NMR organism=? : H : SER OG A0033 <- 2.83 -> DG N2 C0009 : score 3.35411 : H : SER OG A0036 <- 3.29 -> DT O2 C0010 : score 3.33509 : x : ASN xxxx A0010 <- 2.69 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0012 <- 2.66 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0013 <- 3.21 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0017 <- 4.40 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0020 <- 3.83 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0035 <- 4.28 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0074 <- 3.36 -> DA xxx B0003 : score x.xxxxx >1hu0_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN HOGG1-DNA BOROHYDRIDE TRAPPED INTERMEDIATE COMPLEX organism=Homo sapiens : w : SER OG A0148 <- 5.50 -> DG N3 E0024 : score 2.344 : w : ASN OD1 A0149 <- 6.24 -> DG O6 E0024 : score 3.125 : H : ASN ND2 A0151 <- 3.30 -> DA N3 E0022 : score 3.42692 : H : ARG NH2 A0154 <- 2.50 -> DC O2 D0008 : score 3.92064 : w : TYR OH A0203 <- 5.52 -> DG N3 E0024 : score 3.344 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.95 -> DC O2 D0008 : score 3.5405 : H : ARG NH2 A0204 <- 3.19 -> DC N3 D0008 : score 2.11233 : x : ASN xxxx A0150 <- 4.18 -> DA xxx E0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0207 <- 3.96 -> DT xxx E0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0293 <- 3.90 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0294 <- 4.41 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx >1hut_H:Trypsin-like_serine_proteases; title=THE STRUCTURE OF ALPHA-THROMBIN INHIBITED BY A 15-MER SINGLE-STRANDED DNA APTAMER organism=HOMO SAPIENS : V : ILE CB H0024 <- 3.89 -> DT C7 D0407 : score -2.95155 : x : HIS xxxx H0071 <- 2.68 -> DT xxx D0407 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0075 <- 2.20 -> DG xxx D0408 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0076 <- 3.86 -> DG xxx D0408 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0077 <- 2.50 -> DT xxx D0407 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0079 <- 2.94 -> DT xxx D0409 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0117 <- 3.59 -> DT xxx D0409 : score x.xxxxx >1hut_HL:Trypsin-like_serine_proteases; title=THE STRUCTURE OF ALPHA-THROMBIN INHIBITED BY A 15-MER SINGLE-STRANDED DNA APTAMER organism=HOMO SAPIENS : V : ILE CB H0024 <- 3.89 -> DT C7 D0407 : score -2.95155 : x : HIS xxxx H0071 <- 2.68 -> DT xxx D0407 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0075 <- 2.20 -> DG xxx D0408 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0076 <- 3.86 -> DG xxx D0408 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0077 <- 2.50 -> DT xxx D0407 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0079 <- 2.94 -> DT xxx D0409 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0117 <- 3.59 -> DT xxx D0409 : score x.xxxxx >1huz_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE COMPLEXED WITH DNA AND CR-PCP organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0234 <- 2.84 -> DC O2 T0007 : score 2.92258 : w : LYS NZ A0234 <- 5.11 -> DC O2 P0006 : score 1.3 : H : TYR OH A0271 <- 2.92 -> DC O2 P0007 : score 3.4135 : V : ASP CB A0276 <- 3.72 -> DT C7 P0008 : score 2.73674 : x : ASN xxxx A0279 <- 3.70 -> DT xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0283 <- 3.42 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx >1hw2_A:GntR_ligand-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=FADR-DNA COMPLEX: TRANSCRIPTIONAL CONTROL OF FATTY ACID METABOLISM IN ECHERICHIA COLI organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0035 <- 3.25 -> DG N7 E0007 : score 5.5055 : H : ARG NH2 A0035 <- 3.07 -> DG O6 E0007 : score 6.2436 : H : ARG NH2 A0045 <- 2.73 -> DG O6 E0008 : score 6.6924 : H : THR OG1 A0046 <- 3.05 -> DC N4 D0011 : score 3.83167 : H : HIS NE2 A0065 <- 3.06 -> DA N3 D0016 : score 4.02535 : x : THR xxxx A0044 <- 3.86 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0049 <- 3.00 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0050 <- 4.32 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx >1hw2_AB:Fatty_acid_responsive_transcription_factor_FadR,_C-terminal_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;GntR_ligand-binding_domain-like; title=FADR-DNA COMPLEX: TRANSCRIPTIONAL CONTROL OF FATTY ACID METABOLISM IN ECHERICHIA COLI organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0035 <- 3.25 -> DG N7 E0007 : score 5.5055 : H : ARG NH2 A0035 <- 3.07 -> DG O6 E0007 : score 6.2436 : H : ARG NH2 A0045 <- 2.73 -> DG O6 E0008 : score 6.6924 : H : THR OG1 A0046 <- 3.05 -> DC N4 D0011 : score 3.83167 : H : HIS NE2 A0065 <- 3.06 -> DA N3 D0016 : score 4.02535 : H : ARG NH1 B0035 <- 3.07 -> DG N7 D0007 : score 5.7233 : H : ARG NH2 B0035 <- 2.56 -> DG O6 D0007 : score 6.9168 : H : ARG NH2 B0045 <- 2.76 -> DG O6 D0008 : score 6.6528 : x : THR xxxx A0044 <- 3.86 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0049 <- 3.00 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0050 <- 4.32 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0044 <- 3.40 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0046 <- 3.36 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0049 <- 3.03 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0050 <- 4.13 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0065 <- 3.43 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx >1hwt_C:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF A HAP1/DNA COMPLEX REVEALS DRAMATICALLY ASYMMETRIC DNA BINDING BY A HOMODIMERIC PROTEIN organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ C0071 <- 2.95 -> DG N7 A0012 : score 5.22432 : V : VAL CG1 C0072 <- 3.69 -> DT C7 A0010 : score 6.22718 : x : ARG xxxx C0070 <- 4.40 -> DT xxx A0010 : score x.xxxxx >1hwt_CD:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain;Leucine_zipper_domain; title=STRUCTURE OF A HAP1/DNA COMPLEX REVEALS DRAMATICALLY ASYMMETRIC DNA BINDING BY A HOMODIMERIC PROTEIN organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ C0071 <- 2.95 -> DG N7 A0012 : score 5.22432 : H : ARG NH1 D0057 <- 2.75 -> DT O2 B0012 : score 4.34947 : H : ARG NH2 D0057 <- 2.62 -> DT O2 B0012 : score 4.38573 : H : ARG NH1 D0059 <- 2.91 -> DA N3 B0014 : score 3.60105 : H : ARG NH2 D0059 <- 3.01 -> DT O2 A0008 : score 4.05553 : H : LYS NZ D0071 <- 2.94 -> DG N7 A0003 : score 5.23509 : H : LYS NZ D0071 <- 3.01 -> DG O6 A0003 : score 5.53798 : H : LYS NZ D0071 <- 2.45 -> DG O6 B0017 : score 6.18542 : V : VAL CG1 C0072 <- 3.69 -> DT C7 A0010 : score 6.22718 : x : ARG xxxx C0070 <- 4.40 -> DT xxx A0010 : score x.xxxxx >1hwt_GH:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain;Leucine_zipper_domain; title=STRUCTURE OF A HAP1/DNA COMPLEX REVEALS DRAMATICALLY ASYMMETRIC DNA BINDING BY A HOMODIMERIC PROTEIN organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ G0071 <- 2.92 -> DG N7 E0012 : score 5.25664 : H : ARG NH1 H0057 <- 2.72 -> DT O2 F0012 : score 4.37531 : H : ARG NH2 H0057 <- 2.84 -> DT O2 F0012 : score 4.19947 : H : ARG NH1 H0059 <- 2.74 -> DA N3 F0014 : score 3.72624 : H : LYS NZ H0071 <- 2.68 -> DG O6 F0017 : score 5.91951 : H : LYS NZ H0071 <- 2.91 -> DG N7 E0003 : score 5.26741 : V : VAL CG1 G0072 <- 3.62 -> DT C7 E0010 : score 6.33324 : x : ARG xxxx G0070 <- 4.24 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx >1hys_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH A POLYPURINE TRACT RNA:DNA organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.81 -> DT O2 F0898 : score 3.21023 : x : TYR xxxx A0115 <- 4.40 -> DG xxx F0899 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0258 <- 3.74 -> DT xxx F0894 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0266 <- 4.09 -> DG xxx F0896 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.50 -> DC xxx F0883 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.14 -> DT xxx F0885 : score x.xxxxx >1i3j_A:DNA-binding_domain_of_intron-encoded_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA-BINDING DOMAIN OF INTRON ENDONUCLEASE I- TEVI WITH ITS SUBSTRATE organism=Enterobacteria phage T4 : H : ARG NH2 A0168 <- 3.13 -> DA N3 C0048 : score 3.02592 : w : ARG NH1 A0168 <- 5.53 -> DA N3 C0049 : score 2.585 : H : ARG NH1 A0170 <- 2.75 -> DT O2 B0005 : score 4.34947 : w : ASN OD1 A0175 <- 5.89 -> DG N3 B0006 : score 3.377 : w : SER OG A0176 <- 6.54 -> DG N2 B0006 : score 1.651 : H : HIS NE2 A0182 <- 2.84 -> DT O2 B0009 : score 5.19783 : H : HIS NE2 A0182 <- 3.06 -> DC O2 C0045 : score 5.01225 : H : ASN OD1 A0201 <- 3.13 -> DG N2 C0040 : score 4.4832 : H : ASN ND2 A0201 <- 2.60 -> DC O2 B0014 : score 4.65867 : w : SER OG A0225 <- 6.17 -> DA N6 C0035 : score 2.209 : V : SER CB A0226 <- 3.86 -> DT C7 B0016 : score 3.08431 : x : GLN xxxx A0158 <- 4.01 -> DA xxx C0051 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0177 <- 3.36 -> DC xxx C0046 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0190 <- 3.80 -> DA xxx C0044 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0194 <- 3.33 -> DT xxx B0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0199 <- 3.31 -> DC xxx B0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0228 <- 4.08 -> DT xxx C0033 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0230 <- 3.87 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0231 <- 3.49 -> DA xxx C0032 : score x.xxxxx >1i6h_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 A1386 <- 3.25 -> DA N3 D0001 : score 2.94817 : x : PRO xxxx A0448 <- 4.17 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 3.50 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 4.06 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >1i6h_AB: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 A1386 <- 3.25 -> DA N3 D0001 : score 2.94817 : x : PRO xxxx A0448 <- 4.17 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 3.50 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 4.06 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B1097 <- 4.11 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1i6j_A:DNA/RNA_polymerases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A PSEUDO-16-MER DNA WITH STACKED GUANINES AND TWO G-A MISPAIRS COMPLEXED WITH THE N-TERMINAL FRAGMENT OF MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS REVERSE TRANSCRIPTASE organism=Moloney murine leukemia virus : w : ASP OD2 A0114 <- 5.74 -> DG N2 B0001 : score 1.62 : H : ARG NH1 A0116 <- 2.87 -> DT O2 B0002 : score 4.24612 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.60 -> DT O2 B0002 : score 4.40267 : x : LEU xxxx A0099 <- 3.34 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0112 <- 4.18 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx >1iaw_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF NAEI COMPLEXED WITH 17MER DNA organism=LECHEVALIERIA AEROCOLONIGENES : H : LYS NZ A0059 <- 3.07 -> DC O2 E0008 : score 2.78706 : H : ASN ND2 A0144 <- 2.85 -> DG N7 E0007 : score 4.54004 : H : ASN ND2 A0144 <- 2.36 -> DG O6 E0007 : score 6.13465 : H : ASP OD1 A0146 <- 2.84 -> DC N4 F0008 : score 5.30211 : H : ASP OD2 A0146 <- 3.46 -> DC N4 F0009 : score 5.3816 : H : LYS NZ A0148 <- 2.98 -> DG N7 F0010 : score 5.19201 : H : LYS NZ A0148 <- 3.08 -> DG O6 F0011 : score 5.45705 : H : ARG NH1 A0150 <- 3.00 -> DG O6 F0013 : score 5.84 : H : ARG NH2 A0150 <- 2.89 -> DG O6 F0013 : score 6.4812 : H : LYS NZ B0059 <- 3.23 -> DC O2 F0008 : score 2.69278 : H : MET SD B0106 <- 3.46 -> DC N4 E0012 : score -7.90882 : H : ASN ND2 B0144 <- 3.09 -> DG O6 E0011 : score 5.31143 : H : ASN ND2 B0144 <- 2.61 -> DG O6 F0007 : score 5.85272 : H : ASP OD1 B0146 <- 2.77 -> DC N4 E0008 : score 5.37694 : H : ASP OD2 B0146 <- 3.33 -> DC N4 E0009 : score 5.5428 : H : LYS NZ B0148 <- 2.93 -> DG N7 E0010 : score 5.24586 : H : LYS NZ B0148 <- 3.00 -> DG N7 E0011 : score 5.17046 : H : ARG NH1 B0150 <- 2.93 -> DG O6 E0013 : score 5.92517 : H : ARG NH2 B0150 <- 2.70 -> DG O6 E0013 : score 6.732 : x : THR xxxx A0060 <- 3.28 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0063 <- 2.68 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0106 <- 3.74 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0145 <- 3.20 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0060 <- 4.13 -> DC xxx F0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0063 <- 3.18 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0145 <- 3.16 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx >1iaw_B:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NAEI COMPLEXED WITH 17MER DNA organism=LECHEVALIERIA AEROCOLONIGENES : H : LYS NZ B0059 <- 3.23 -> DC O2 F0008 : score 2.69278 : H : MET SD B0106 <- 3.46 -> DC N4 E0012 : score -7.90882 : H : ASN ND2 B0144 <- 2.61 -> DG O6 F0007 : score 5.85272 : H : ASN ND2 B0144 <- 3.09 -> DG O6 E0011 : score 5.31143 : H : ASP OD1 B0146 <- 2.77 -> DC N4 E0008 : score 5.37694 : H : ASP OD2 B0146 <- 3.33 -> DC N4 E0009 : score 5.5428 : H : LYS NZ B0148 <- 2.93 -> DG N7 E0010 : score 5.24586 : H : LYS NZ B0148 <- 3.00 -> DG N7 E0011 : score 5.17046 : H : ARG NH1 B0150 <- 2.93 -> DG O6 E0013 : score 5.92517 : H : ARG NH2 B0150 <- 2.70 -> DG O6 E0013 : score 6.732 : x : THR xxxx B0060 <- 4.13 -> DC xxx F0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0063 <- 3.18 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0145 <- 3.16 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx >1ic8_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 1A BOUND TO DNA : MODY3 GENE PRODUCT organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 A0141 <- 3.19 -> DA N6 E0312 : score 5.58046 : H : GLN NE2 A0141 <- 3.13 -> DA N7 E0312 : score 5.68782 : H : GLN NE2 A0146 <- 3.17 -> DG O6 F0407 : score 5.37555 : H : ASN OD1 A0270 <- 2.65 -> DA N6 F0416 : score 6.20245 : H : ASN ND2 A0270 <- 3.30 -> DA N7 F0416 : score 5.28346 : H : LYS NZ A0273 <- 2.37 -> DG N7 E0304 : score 5.84908 : H : LYS NZ A0273 <- 2.86 -> DG O6 E0304 : score 5.7114 : H : GLN OE1 B0141 <- 3.02 -> DA N6 F0412 : score 5.78625 : H : SER OG B0142 <- 3.08 -> DT O4 F0413 : score 3.35604 : H : LYS NZ B0273 <- 3.10 -> DG N7 F0404 : score 5.06274 : H : LYS NZ B0273 <- 2.95 -> DG N7 F0405 : score 5.22432 : H : LYS NZ B0273 <- 2.38 -> DG O6 F0405 : score 6.26635 : V : THR CG2 B0152 <- 3.85 -> DT C7 E0306 : score 4.18396 : x : ASN xxxx A0140 <- 2.93 -> DG xxx F0407 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0142 <- 2.94 -> DA xxx F0408 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0143 <- 4.29 -> DG xxx F0407 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0145 <- 3.72 -> DT xxx E0313 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0153 <- 3.73 -> DG xxx F0405 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0265 <- 3.00 -> DT xxx E0302 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0266 <- 4.08 -> DA xxx F0416 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0140 <- 3.37 -> DT xxx E0307 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0143 <- 3.75 -> DT xxx E0307 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0145 <- 3.83 -> DT xxx F0413 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0146 <- 3.08 -> DT xxx F0414 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0153 <- 4.05 -> DG xxx E0305 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0203 <- 3.35 -> DT xxx E0314 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0265 <- 3.22 -> DC xxx F0402 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0266 <- 4.15 -> DA xxx E0316 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0269 <- 4.49 -> DT xxx F0403 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0270 <- 3.09 -> DA xxx E0316 : score x.xxxxx >1ic8_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 1A BOUND TO DNA : MODY3 GENE PRODUCT organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 B0141 <- 3.02 -> DA N6 F0412 : score 5.78625 : H : SER OG B0142 <- 3.08 -> DT O4 F0413 : score 3.35604 : H : LYS NZ B0273 <- 3.10 -> DG N7 F0404 : score 5.06274 : H : LYS NZ B0273 <- 2.95 -> DG N7 F0405 : score 5.22432 : H : LYS NZ B0273 <- 2.38 -> DG O6 F0405 : score 6.26635 : V : THR CG2 B0152 <- 3.85 -> DT C7 E0306 : score 4.18396 : x : ASN xxxx B0140 <- 3.37 -> DT xxx E0307 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0143 <- 3.75 -> DT xxx E0307 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0145 <- 3.83 -> DT xxx F0413 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0146 <- 3.08 -> DT xxx F0414 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0153 <- 4.05 -> DG xxx E0305 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0203 <- 3.35 -> DT xxx E0314 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0265 <- 3.22 -> DC xxx F0402 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0266 <- 4.15 -> DA xxx E0316 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0269 <- 4.49 -> DT xxx F0403 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0270 <- 3.09 -> DA xxx E0316 : score x.xxxxx >1id3_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE YEAST NUCLEOSOME CORE PARTICLE REVEALS FUNDAMENTAL DIFFERENCES IN INTER-NUCLEOSOME INTERACTIONS organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 D0036 <- 3.25 -> DA N3 I0027 : score 2.94817 : H : ARG NH1 E0040 <- 2.92 -> DA N3 I0082 : score 3.59368 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.16 -> DA N3 I0082 : score 3.00648 : V : PRO CG F0032 <- 3.77 -> DT C7 J0208 : score 6.40667 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.22 -> DA xxx J0229 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.74 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.78 -> DA xxx J0245 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.38 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 4.15 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.38 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.01 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx >1id3_E:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE YEAST NUCLEOSOME CORE PARTICLE REVEALS FUNDAMENTAL DIFFERENCES IN INTER-NUCLEOSOME INTERACTIONS organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 E0040 <- 2.92 -> DA N3 I0082 : score 3.59368 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.16 -> DA N3 I0082 : score 3.00648 : x : TYR xxxx E0041 <- 4.38 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.01 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx >1if1_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=INTERFERON REGULATORY FACTOR 1 (IRF-1) COMPLEX WITH DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH2 A0082 <- 2.70 -> DG N7 C0207 : score 6.51231 : H : CYS SG A0083 <- 3.30 -> DT O4 C0216 : score 6.39 : w : CYS SG A0083 <- 6.05 -> DA N6 C0208 : score 4.476 : H : ARG NH2 B0082 <- 2.63 -> DG N7 D0507 : score 6.60169 : H : CYS SG B0083 <- 3.32 -> DT O4 D0516 : score 6.3616 : w : ASN ND2 B0086 <- 5.73 -> DA N7 D0508 : score 1.989 : x : ASN xxxx A0080 <- 3.44 -> DT xxx C0216 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.40 -> DT xxx C0215 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0040 <- 4.41 -> DC xxx D0523 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0080 <- 3.36 -> DT xxx D0516 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0087 <- 3.48 -> DT xxx D0515 : score x.xxxxx >1if1_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=INTERFERON REGULATORY FACTOR 1 (IRF-1) COMPLEX WITH DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH2 B0082 <- 2.63 -> DG N7 D0507 : score 6.60169 : H : CYS SG B0083 <- 3.32 -> DT O4 D0516 : score 6.3616 : w : ASN ND2 B0086 <- 5.73 -> DA N7 D0508 : score 1.989 : x : HIS xxxx B0040 <- 4.41 -> DC xxx D0523 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0080 <- 3.36 -> DT xxx D0516 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0087 <- 3.48 -> DT xxx D0515 : score x.xxxxx >1ig4_A:DNA-binding_domain; title=SOLUTION STRUCTURE OF THE METHYL-CPG-BINDING DOMAIN OF HUMAN MBD1 IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0022 <- 2.63 -> DG N7 B0107 : score 6.60169 : H : ARG NH1 A0044 <- 3.19 -> DG O6 C0120 : score 5.60883 : x : THR xxxx A0027 <- 3.51 -> DG xxx B0107 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0032 <- 4.31 -> DG xxx B0107 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0034 <- 4.23 -> DG xxx B0107 : score x.xxxxx >1ig7_A:Homeodomain-like; title=MSX-1 HOMEODOMAIN/DNA COMPLEX STRUCTURE organism=Mus musculus : w : ARG NH2 A0102 <- 5.94 -> DT O2 C0025 : score 2.261 : H : ARG NH1 A0105 <- 2.55 -> DT O2 B0007 : score 4.52173 : H : ARG NH2 A0105 <- 3.10 -> DT O2 B0007 : score 3.97933 : w : ARG NH1 A0105 <- 6.02 -> DA N3 C0027 : score 2.585 : w : LYS NZ A0146 <- 5.70 -> DT O4 C0021 : score 1.7 : H : GLN OE1 A0150 <- 2.81 -> DC N4 C0022 : score 4.57417 : w : GLN OE1 A0150 <- 6.81 -> DG O6 B0012 : score 2.87 : w : GLN NE2 A0150 <- 6.71 -> DG O6 B0012 : score 2.87 : w : GLN NE2 A0150 <- 5.13 -> DT O4 B0010 : score 2.257 : H : ASN OD1 A0151 <- 2.74 -> DA N6 B0009 : score 6.09406 : H : ASN ND2 A0151 <- 2.96 -> DA N7 B0009 : score 5.68266 : w : ASN OD1 A0151 <- 6.03 -> DA N6 C0024 : score 2.837 : w : ASN OD1 A0151 <- 5.32 -> DT O4 B0010 : score 3.132 : x : ILE xxxx A0147 <- 3.74 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0158 <- 3.74 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx >1ig9_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF THE REPLICATING COMPLEX OF A POL ALPHA FAMILY DNA POLYMERASE organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0567 <- 5.36 -> DG N3 T0004 : score 3.344 : w : ASP OD1 A0621 <- 6.22 -> DG N2 T0005 : score 2.312 : w : THR OG1 A0622 <- 6.51 -> DG N2 T0005 : score 2.036 : H : LYS NZ A0706 <- 2.56 -> DC O2 P0114 : score 3.08757 : w : LYS NZ A0706 <- 6.13 -> DG N2 T0005 : score 0.846 : w : LYS NZ A0734 <- 5.40 -> DT O2 P0112 : score 0.522 : H : LYS NZ A0800 <- 2.67 -> DT O2 P0108 : score 3.68045 : x : PRO xxxx A0361 <- 4.16 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0561 <- 3.65 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0565 <- 3.34 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx >1ign_A:Homeodomain-like; title=DNA-BINDING DOMAIN OF RAP1 IN COMPLEX WITH TELOMERIC DNA SITE organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0360 <- 2.72 -> DA N3 C0005 : score 2.82135 : w : LYS NZ A0360 <- 6.36 -> DT O2 D0035 : score 0.522 : H : HIS NE2 A0385 <- 2.70 -> DG O6 D0031 : score 8.11292 : H : ASN OD1 A0401 <- 2.78 -> DC N4 C0008 : score 4.21036 : H : ARG NH1 A0404 <- 2.97 -> DG N7 D0032 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0404 <- 2.56 -> DG N7 D0031 : score 6.69108 : H : LYS NZ A0446 <- 2.79 -> DA N3 C0013 : score 2.78248 : w : ASN OD1 A0539 <- 6.71 -> DC N4 C0016 : score 2.732 : H : ARG NH2 A0542 <- 2.94 -> DG N7 D0023 : score 6.20585 : H : ARG NH2 A0542 <- 2.75 -> DG O6 D0023 : score 6.666 : H : ASP OD2 A0543 <- 2.98 -> DC N4 C0014 : score 5.9768 : H : ARG NH1 A0546 <- 2.72 -> DG O6 D0024 : score 6.18067 : H : ARG NH2 A0546 <- 2.99 -> DG N7 D0024 : score 6.142 : H : LYS NZ A0547 <- 2.74 -> DT O4 D0025 : score 3.63023 : x : SER xxxx A0402 <- 3.94 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0405 <- 3.24 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0408 <- 3.37 -> DG xxx D0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0410 <- 3.52 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0578 <- 3.74 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0588 <- 3.57 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0589 <- 3.51 -> DT xxx D0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0591 <- 3.32 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx >1ign_AB:Homeodomain-like; title=DNA-BINDING DOMAIN OF RAP1 IN COMPLEX WITH TELOMERIC DNA SITE organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0360 <- 2.72 -> DA N3 C0005 : score 2.82135 : w : LYS NZ A0360 <- 6.36 -> DT O2 D0035 : score 0.522 : H : HIS NE2 A0385 <- 2.70 -> DG O6 D0031 : score 8.11292 : H : ASN OD1 A0401 <- 2.78 -> DC N4 C0008 : score 4.21036 : H : ARG NH1 A0404 <- 2.97 -> DG N7 D0032 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0404 <- 2.56 -> DG N7 D0031 : score 6.69108 : H : LYS NZ A0446 <- 2.79 -> DA N3 C0013 : score 2.78248 : w : ASN OD1 A0539 <- 6.71 -> DC N4 C0016 : score 2.732 : H : ARG NH2 A0542 <- 2.94 -> DG N7 D0023 : score 6.20585 : H : ARG NH2 A0542 <- 2.75 -> DG O6 D0023 : score 6.666 : H : ASP OD2 A0543 <- 2.98 -> DC N4 C0014 : score 5.9768 : H : ARG NH1 A0546 <- 2.72 -> DG O6 D0024 : score 6.18067 : H : ARG NH2 A0546 <- 2.99 -> DG N7 D0024 : score 6.142 : H : LYS NZ A0547 <- 2.74 -> DT O4 D0025 : score 3.63023 : H : LYS NZ B0360 <- 2.82 -> DA N3 E0005 : score 2.76582 : H : HIS NE2 B0385 <- 3.19 -> DG O6 F0030 : score 7.33345 : H : HIS NE2 B0385 <- 2.68 -> DG O6 F0031 : score 8.14474 : H : ASN OD1 B0401 <- 2.97 -> DC N4 E0008 : score 4.05101 : H : ARG NH1 B0404 <- 3.28 -> DG N7 F0032 : score 5.4692 : H : ARG NH2 B0404 <- 2.81 -> DG N7 F0031 : score 6.37185 : w : ARG NE B0408 <- 6.25 -> DT O4 F0033 : score 1.317 : w : ARG NH2 B0408 <- 6.02 -> DT O4 F0033 : score 2.366 : H : LYS NZ B0446 <- 2.89 -> DA N3 E0013 : score 2.72694 : w : LYS NZ B0446 <- 6.64 -> DG N3 F0028 : score 2.232 : H : ARG NH2 B0542 <- 3.23 -> DG N7 F0023 : score 5.83554 : H : ARG NH2 B0542 <- 2.49 -> DG O6 F0023 : score 7.0092 : H : ASP OD2 B0543 <- 2.87 -> DC N4 E0014 : score 6.1132 : H : ARG NH1 B0546 <- 2.87 -> DG O6 F0024 : score 5.99817 : H : ARG NH2 B0546 <- 3.14 -> DG N7 F0024 : score 5.95046 : H : LYS NZ B0547 <- 2.95 -> DT O4 F0025 : score 3.47956 : x : SER xxxx A0402 <- 3.94 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0405 <- 3.24 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0408 <- 3.37 -> DG xxx D0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0410 <- 3.52 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0578 <- 3.74 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0588 <- 3.57 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0589 <- 3.51 -> DT xxx D0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0591 <- 3.32 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0402 <- 4.11 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0405 <- 3.15 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0410 <- 4.04 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0539 <- 3.79 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0578 <- 3.86 -> DC xxx E0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0588 <- 3.41 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0589 <- 3.54 -> DT xxx F0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0591 <- 3.18 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx >1ihf_A:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=INTEGRATION HOST FACTOR/DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0060 <- 3.11 -> DC O2 E0036 : score 3.4237 : H : ARG NH1 A0063 <- 3.05 -> DT O2 C-037 : score 4.09109 : H : ARG NH1 A0063 <- 2.99 -> DG N3 C-036 : score 2.93657 : w : ARG NH1 A0063 <- 5.98 -> DG N3 C-036 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0063 <- 6.16 -> DG N3 C-036 : score 0.677 : x : ASN xxxx A0064 <- 4.29 -> DA xxx E0038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0065 <- 3.01 -> DT xxx C-038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0066 <- 3.57 -> DT xxx C-038 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0073 <- 3.53 -> DC xxx E0036 : score x.xxxxx >1ihf_AB:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=INTEGRATION HOST FACTOR/DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0060 <- 3.11 -> DC O2 E0036 : score 3.4237 : H : ARG NH1 A0063 <- 3.05 -> DT O2 C-037 : score 4.09109 : H : ARG NH1 A0063 <- 2.99 -> DG N3 C-036 : score 2.93657 : H : ARG NH1 B0046 <- 3.00 -> DT O2 E0044 : score 4.13415 : H : ARG NH2 B0046 <- 3.02 -> DT O2 E0044 : score 4.04707 : w : ARG NH1 B0046 <- 6.17 -> DA N3 C-044 : score 2.585 : w : ARG NH2 B0059 <- 5.51 -> DC O2 C-030 : score 1.669 : w : ASN ND2 B0063 <- 5.83 -> DA N3 C-028 : score 2.277 : w : LYS NZ B0065 <- 6.14 -> DT O2 C-027 : score 0.522 : x : ASN xxxx A0064 <- 4.29 -> DA xxx E0038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0065 <- 3.01 -> DT xxx C-038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0066 <- 3.57 -> DT xxx C-038 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0073 <- 3.53 -> DC xxx E0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0062 <- 3.49 -> DA xxx C-029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0064 <- 3.25 -> DA xxx C-028 : score x.xxxxx >1ijw_C:Homeodomain-like; title=TESTING THE WATER-MEDIATED HIN RECOMBINASE DNA RECOGNITION BY SYSTEMATIC MUTATIONS. organism=? : H : ARG NH1 C0140 <- 3.19 -> DA N3 B0026 : score 3.39485 : H : SER OG C0174 <- 2.69 -> DA N7 A0010 : score 4.56231 : H : ARG NH1 C0178 <- 2.45 -> DG N7 A0009 : score 6.4735 : w : ARG NE C0178 <- 5.81 -> DT O4 B0022 : score 1.317 : x : THR xxxx C0175 <- 3.54 -> DG xxx A0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0177 <- 3.39 -> DT xxx B0020 : score x.xxxxx >1imh_C:E_set_domains;p53-like_transcription_factors; title=TONEBP/DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 C0217 <- 3.28 -> DG N7 A4007 : score 5.4692 : H : ARG NH2 C0217 <- 2.88 -> DG O6 A4007 : score 6.4944 : H : GLU OE1 C0223 <- 2.74 -> DC N4 B5011 : score 5.83716 : H : ARG NH1 C0226 <- 2.93 -> DG N7 A4006 : score 5.8927 : H : ARG NH2 C0226 <- 3.12 -> DG O6 A4006 : score 6.1776 : x : TYR xxxx C0220 <- 3.39 -> DT xxx B5010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0222 <- 4.48 -> DT xxx B5010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0364 <- 3.09 -> DA xxx A4008 : score x.xxxxx >1imh_CD:E_set_domains;p53-like_transcription_factors; title=TONEBP/DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 C0217 <- 3.28 -> DG N7 A4007 : score 5.4692 : H : ARG NH2 C0217 <- 2.88 -> DG O6 A4007 : score 6.4944 : H : GLU OE1 C0223 <- 2.74 -> DC N4 B5011 : score 5.83716 : H : ARG NH1 C0226 <- 2.93 -> DG N7 A4006 : score 5.8927 : H : ARG NH2 C0226 <- 3.12 -> DG O6 A4006 : score 6.1776 : H : GLU OE2 D0223 <- 3.17 -> DC N4 B5003 : score 4.87575 : x : TYR xxxx C0220 <- 3.39 -> DT xxx B5010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0222 <- 4.48 -> DT xxx B5010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0364 <- 3.09 -> DA xxx A4008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0220 <- 3.85 -> DT xxx A4013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0222 <- 4.39 -> DT xxx A4013 : score x.xxxxx >1io4_A:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RUNX-1/AML1/CBFALPHA RUNT DOMAIN-CBFBETA CORE DOMAIN HETERODIMER AND C/EBPBETA BZIP HOMODIMER BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THE CSF-1R PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0278 <- 2.93 -> DA N7 F0021 : score 2.49369 : H : ARG NH1 A0289 <- 3.32 -> DG O6 F0019 : score 5.45067 : H : ARG NH2 A0289 <- 2.84 -> DG N7 F0019 : score 6.33354 : V : VAL CG2 A0285 <- 3.71 -> DT C7 E0006 : score 6.26085 : x : ASN xxxx A0281 <- 3.60 -> DA xxx F0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0282 <- 4.25 -> DA xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0284 <- 3.99 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 3.95 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx >1io4_ABC:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RUNX-1/AML1/CBFALPHA RUNT DOMAIN-CBFBETA CORE DOMAIN HETERODIMER AND C/EBPBETA BZIP HOMODIMER BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THE CSF-1R PROMOTER organism=MUS MUSCULUS / HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0278 <- 2.93 -> DA N7 F0021 : score 2.49369 : H : ARG NH1 A0289 <- 3.32 -> DG O6 F0019 : score 5.45067 : H : ARG NH2 A0289 <- 2.84 -> DG N7 F0019 : score 6.33354 : H : ASN OD1 B0281 <- 3.32 -> DA N6 E0012 : score 5.39553 : H : ARG NH1 C0080 <- 3.09 -> DG N7 E0018 : score 5.6991 : H : ARG NH2 C0080 <- 2.74 -> DG O6 E0018 : score 6.6792 : H : ARG NH2 C0142 <- 3.12 -> DA N3 F0005 : score 3.0324 : H : ASP OD1 C0171 <- 2.94 -> DC N4 F0007 : score 5.19522 : H : ASP OD2 C0171 <- 2.83 -> DC N4 F0008 : score 6.1628 : H : ARG NH1 C0174 <- 2.39 -> DG O6 E0020 : score 6.58217 : H : ARG NH2 C0174 <- 2.84 -> DG N7 E0020 : score 6.33354 : H : ARG NH1 C0177 <- 2.59 -> DG N7 E0021 : score 6.3041 : H : ARG NH2 C0177 <- 2.48 -> DG O6 E0021 : score 7.0224 : V : VAL CG2 A0285 <- 3.71 -> DT C7 E0006 : score 6.26085 : x : ASN xxxx A0281 <- 3.60 -> DA xxx F0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0282 <- 4.25 -> DA xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0284 <- 3.99 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 3.95 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0278 <- 3.23 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0282 <- 3.93 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0284 <- 4.30 -> DT xxx F0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0285 <- 3.79 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 3.83 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0289 <- 3.44 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0170 <- 3.79 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx >1ipp_A:His-Me_finger_endonucleases; title=HOMING ENDONUCLEASE/DNA COMPLEX organism=Physarum polycephalum : H : GLN OE1 A0063 <- 2.77 -> DA N6 D0217 : score 6.08888 : H : GLN NE2 A0063 <- 2.92 -> DA N7 D0217 : score 5.94359 : w : GLN OE1 A0063 <- 6.18 -> DC N4 C0205 : score 3.488 : H : LYS NZ A0065 <- 2.63 -> DG N7 C0203 : score 5.56902 : H : LYS NZ A0065 <- 3.01 -> DG O6 C0203 : score 5.53798 : w : LYS NZ A0065 <- 6.26 -> DA N6 C0204 : score 2.097 : H : ARG NH2 A0074 <- 3.04 -> DG N7 D0218 : score 6.07815 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.47 -> DG O6 D0218 : score 7.0356 : H : LYS NZ A0120 <- 2.91 -> DT O2 C0211 : score 3.50826 : w : LYS NZ A0120 <- 5.56 -> DA N3 C0212 : score 1.538 : V : VAL CG2 A0072 <- 3.80 -> DT C7 C0202 : score 6.12308 : x : ALA xxxx A0055 <- 3.77 -> DA xxx C0204 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0057 <- 2.91 -> DG xxx D0216 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.16 -> DA xxx D0215 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0067 <- 3.57 -> DT xxx C0202 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0116 <- 3.36 -> DA xxx D0213 : score x.xxxxx >1ipp_AB:His-Me_finger_endonucleases; title=HOMING ENDONUCLEASE/DNA COMPLEX organism=Physarum polycephalum : H : GLN OE1 A0063 <- 2.77 -> DA N6 D0217 : score 6.08888 : H : GLN NE2 A0063 <- 2.92 -> DA N7 D0217 : score 5.94359 : w : GLN OE1 A0063 <- 6.18 -> DC N4 C0205 : score 3.488 : H : LYS NZ A0065 <- 2.63 -> DG N7 C0203 : score 5.56902 : H : LYS NZ A0065 <- 3.01 -> DG O6 C0203 : score 5.53798 : w : LYS NZ A0065 <- 6.26 -> DA N6 C0204 : score 2.097 : H : ARG NH2 A0074 <- 3.04 -> DG N7 D0218 : score 6.07815 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.47 -> DG O6 D0218 : score 7.0356 : H : LYS NZ A0120 <- 2.91 -> DT O2 C0211 : score 3.50826 : w : LYS NZ A0120 <- 5.56 -> DA N3 C0212 : score 1.538 : H : GLN OE1 B0063 <- 3.14 -> DA N6 C0217 : score 5.64099 : H : GLN NE2 B0063 <- 3.00 -> DA N7 C0217 : score 5.84615 : w : GLN OE1 B0063 <- 6.21 -> DC N4 D0205 : score 3.488 : H : LYS NZ B0065 <- 2.69 -> DG N7 D0203 : score 5.50439 : w : LYS NZ B0065 <- 6.31 -> DA N6 D0204 : score 2.097 : H : ARG NH2 B0074 <- 2.94 -> DG N7 C0218 : score 6.20585 : H : ARG NH2 B0074 <- 2.54 -> DG O6 C0218 : score 6.9432 : H : LYS NZ B0120 <- 2.96 -> DT O2 D0211 : score 3.47239 : w : LYS NZ B0120 <- 5.67 -> DA N3 D0212 : score 1.538 : V : VAL CG2 A0072 <- 3.80 -> DT C7 C0202 : score 6.12308 : x : ALA xxxx A0055 <- 3.77 -> DA xxx C0204 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0057 <- 2.91 -> DG xxx D0216 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.16 -> DA xxx D0215 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0067 <- 3.57 -> DT xxx C0202 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0116 <- 3.36 -> DA xxx D0213 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0055 <- 4.03 -> DA xxx D0204 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0057 <- 2.75 -> DG xxx C0216 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0061 <- 3.31 -> DA xxx C0215 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0067 <- 3.64 -> DT xxx D0202 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0116 <- 3.65 -> DA xxx C0213 : score x.xxxxx >1iu3_CF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE E.COLI SEQA PROTEIN COMPLEXED WITH HEMIMETHYLATED DNA organism=ESCHERICHIA COLI : w : ARG NH1 C0053 <- 5.78 -> DA N7 B0215 : score 0.388 : H : ASN ND2 C0085 <- 3.02 -> DT O4 B0216 : score 5.05209 : H : ASN ND2 C0087 <- 2.54 -> DT O4 A0206 : score 5.55942 : w : ARG NH1 F0051 <- 5.93 -> DT O2 E0212 : score 1.855 : w : GLN OE1 F0069 <- 5.80 -> DC N4 E0217 : score 3.488 : H : ASN ND2 F0085 <- 3.19 -> DT O4 E0216 : score 4.87242 : H : ASN ND2 F0087 <- 2.56 -> DT O4 D0206 : score 5.53828 : w : ARG NE F0090 <- 6.54 -> DG O6 E0214 : score 1.369 : w : ARG NH2 F0090 <- 6.14 -> DG O6 E0214 : score 2.468 : V : GLN CG F0069 <- 3.79 -> DT C7 E0216 : score 3.26352 : x : ARG xxxx C0051 <- 3.77 -> DG xxx B0213 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0069 <- 4.03 -> DT xxx B0216 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0090 <- 3.86 -> DG xxx B0213 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0053 <- 3.36 -> DA xxx E0215 : score x.xxxxx >1iu3_F:Replication_modulator_SeqA,_C-terminal_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE E.COLI SEQA PROTEIN COMPLEXED WITH HEMIMETHYLATED DNA organism=ESCHERICHIA COLI : w : ARG NH1 F0051 <- 5.93 -> DT O2 E0212 : score 1.855 : w : GLN OE1 F0069 <- 5.80 -> DC N4 E0217 : score 3.488 : H : ASN ND2 F0085 <- 3.19 -> DT O4 E0216 : score 4.87242 : H : ASN ND2 F0087 <- 2.56 -> DT O4 D0206 : score 5.53828 : w : ARG NE F0090 <- 6.54 -> DG O6 E0214 : score 1.369 : w : ARG NH2 F0090 <- 6.14 -> DG O6 E0214 : score 2.468 : V : GLN CG F0069 <- 3.79 -> DT C7 E0216 : score 3.26352 : x : ARG xxxx F0053 <- 3.36 -> DA xxx E0215 : score x.xxxxx >1iv6_A:Homeodomain-like; title=SOLUTION STRUCTURE OF THE DNA COMPLEX OF HUMAN TRF1 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0380 <- 2.76 -> DT O2 B0009 : score 4.34086 : H : ARG NH2 A0380 <- 2.96 -> DT O2 B0009 : score 4.09787 : H : ASP OD2 A0422 <- 2.79 -> DC N4 C0021 : score 6.2124 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.75 -> DG N7 B0006 : score 6.1105 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.82 -> DG O6 B0006 : score 6.5736 : x : SER xxxx A0417 <- 3.56 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0418 <- 3.46 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0419 <- 3.74 -> DC xxx C0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0421 <- 3.44 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0426 <- 4.00 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx >1ixy_B:UDP-Glycosyltransferase/glycogen_phosphorylase; title=TERNARY COMPLEX OF T4 PHAGE BGT WITH UDP AND A 13 MER DNA DUPLEX organism=Enterobacteria phage T4 : H : ASN OD1 B0070 <- 2.66 -> DG N2 e0020 : score 4.9344 : w : ASN OD1 B0111 <- 6.48 -> DT O4 e0019 : score 3.132 : H : ARG NH1 B0115 <- 2.90 -> DG N7 e0020 : score 5.929 : H : ARG NH2 B0115 <- 2.53 -> DG O6 e0020 : score 6.9564 >1j1v_A:TrpR-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNAA DOMAINIV COMPLEXED WITH DNAABOX DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0399 <- 3.10 -> DA N3 C0210 : score 3.46113 : w : ARG NH1 A0399 <- 5.60 -> DA N3 C0211 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0399 <- 6.14 -> DT O2 C0209 : score 2.261 : w : ASP OD2 A0433 <- 6.11 -> DA N6 B0109 : score 3.409 : H : THR OG1 A0435 <- 2.94 -> DC N4 B0108 : score 3.9204 : V : HIS CB A0439 <- 3.63 -> DT C7 B0106 : score 4.30045 : V : PRO CG A0423 <- 3.61 -> DT C7 C0203 : score 6.66103 : V : LEU CD2 A0438 <- 3.56 -> DT C7 C0205 : score 6.07516 : x : LEU xxxx A0422 <- 4.49 -> DT xxx C0203 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0434 <- 3.13 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0436 <- 3.52 -> DC xxx B0107 : score x.xxxxx >1j3e_A:Replication_modulator_SeqA,_C-terminal_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE E.COLI SEQA PROTEIN COMPLEXED WITH N6- METHYLADENINE- GUANINE MISMATCH DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 A0051 <- 2.92 -> DT O2 C0212 : score 4.13173 : H : ASN ND2 A0085 <- 2.98 -> DG O6 B0204 : score 5.43548 : H : ASN ND2 A0085 <- 2.56 -> DG O6 C0216 : score 5.90911 : H : ASN ND2 A0087 <- 2.93 -> DT O4 B0206 : score 5.14722 : w : ASN ND2 A0087 <- 5.64 -> DG O6 C0214 : score 2.971 : x : ARG xxxx A0053 <- 3.67 -> DA xxx C0215 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0071 <- 3.92 -> DG xxx B0203 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0090 <- 3.33 -> DG xxx C0213 : score x.xxxxx >1j46_A:HMG-box; title=3D SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE WILD TYPE HMG-BOX DOMAIN OF THE HUMAN MALE SEX DETERMINING FACTOR SRY COMPLEXED TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0007 <- 2.53 -> DT O2 C0123 : score 4.46193 : H : ASN ND2 A0010 <- 2.66 -> DG N3 C0122 : score 5.03193 : H : ASN ND2 A0032 <- 3.23 -> DA N3 B0110 : score 3.48023 : H : SER OG A0033 <- 3.33 -> DG N3 C0118 : score 2.47798 : H : SER OG A0036 <- 2.55 -> DT O2 C0119 : score 3.88231 : H : TYR OH A0074 <- 2.41 -> DA N3 B0106 : score 4.47508 : x : PHE xxxx A0012 <- 3.07 -> DT xxx C0120 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0013 <- 2.95 -> DA xxx B0108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0020 <- 3.54 -> DA xxx B0110 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0076 <- 4.39 -> DG xxx C0124 : score x.xxxxx >1j47_A:HMG-box; title=3D SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE M9I MUTANT OF THE HMG-BOX DOMAIN OF THE HUMAN MALE SEX DETERMINING FACTOR SRY COMPLEXED TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 A0010 <- 2.45 -> DG N3 C0122 : score 5.23751 : H : ASN ND2 A0032 <- 3.42 -> DA N3 B0110 : score 3.33554 : H : SER OG A0033 <- 2.69 -> DG N3 C0118 : score 2.83277 : H : SER OG A0036 <- 2.66 -> DT O2 C0119 : score 3.80096 : H : TYR OH A0074 <- 2.78 -> DA N3 B0106 : score 4.16789 : x : ARG xxxx A0007 <- 3.41 -> DT xxx C0123 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0012 <- 3.22 -> DT xxx C0121 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0013 <- 3.18 -> DA xxx B0109 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0020 <- 3.54 -> DA xxx B0110 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0076 <- 4.37 -> DG xxx C0124 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0078 <- 4.03 -> DG xxx B0104 : score x.xxxxx >1j4w_A:Eukaryotic_type_KH-domain_KH-domain_type_I; title=COMPLEX OF THE KH3 AND KH4 DOMAINS OF FBP WITH A SINGLE_STRANDED 29MER DNA OLIGONUCLEOTIDE FROM THE FUSE ELEMENT OF THE C-MYC ONCOGENE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0011 <- 2.94 -> DT O4 B0218 : score 3.45434 : H : THR OG1 A0115 <- 2.68 -> DA N6 B0205 : score 2.82519 : x : VAL xxxx A0014 <- 3.47 -> DT xxx B0218 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0018 <- 2.72 -> DT xxx B0218 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0037 <- 3.26 -> DT xxx B0221 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0038 <- 3.86 -> DT xxx B0219 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0048 <- 3.44 -> DT xxx B0219 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0117 <- 3.71 -> DT xxx B0204 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0119 <- 2.77 -> DA xxx B0205 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0126 <- 3.51 -> DT xxx B0207 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0136 <- 2.74 -> DC xxx B0209 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0138 <- 2.89 -> DC xxx B0209 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0139 <- 3.06 -> DT xxx B0206 : score x.xxxxx >1j59_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN (CAP)/DNA COMPLEX + ADENOSINE-3',5'- CYCLIC-MONOPHOSPHATE organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0180 <- 3.35 -> DG N7 C0005 : score 5.68231 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.54 -> DG O6 C0005 : score 6.9432 : H : GLU OE2 A0181 <- 2.74 -> DC N4 F0007 : score 5.32857 : H : ARG NH1 A0185 <- 2.83 -> DG N7 C0007 : score 6.0137 : w : ARG NH1 A0185 <- 6.35 -> DG N7 C0007 : score 2.063 : x : GLN xxxx A0170 <- 3.92 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0179 <- 4.31 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx >1j5n_A:HMG-box; title=SOLUTION STRUCTURE OF THE NON-SEQUENCE-SPECIFIC HMGB PROTEIN NHP6A IN COMPLEX WITH SRY DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 A0023 <- 2.94 -> DC O2 C0125 : score 3.59515 : H : SER OG A0026 <- 2.59 -> DA N3 C0123 : score 3.13001 : V : THR CG2 A0003 <- 3.90 -> DT C7 B0105 : score 4.131 : x : ARG xxxx A0010 <- 3.17 -> DT xxx B0109 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0011 <- 3.69 -> DA xxx C0119 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0013 <- 4.26 -> DT xxx B0108 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0028 <- 2.54 -> DC xxx C0121 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0029 <- 2.67 -> DT xxx B0109 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0048 <- 2.50 -> DT xxx B0112 : score x.xxxxx >1j5o_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MET184ILE MUTANT OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DOUBLE STRANDED DNA TEMPLATE-PRIMER organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.50 -> DC O2 P0837 : score 3.70728 : x : ILE xxxx A0094 <- 4.34 -> DG xxx T0804 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 4.40 -> DA xxx P0838 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.18 -> DT xxx T0802 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0184 <- 3.72 -> DA xxx P0838 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.21 -> DC xxx T0807 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0266 <- 3.99 -> DG xxx P0835 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.87 -> DC xxx P0824 : score x.xxxxx >1jb7_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=DNA G-QUARTETS IN A 1.86 A RESOLUTION STRUCTURE OF AN OXYTRICHA NOVA TELOMERIC PROTEIN-DNA COMPLEX organism=STERKIELLA NOVA : H : GLU OE2 B0045 <- 2.84 -> DG N2 D0009 : score 4.27577 A : w : TYR OH B0134 <- 6.27 -> DT O4 D0006 : score 2.914 : w : TYR OH B0134 <- 5.29 -> DT O4 D0006 : score 2.914 : H : LYS NZ B0145 <- 2.83 -> DG N7 D0010 : score 5.35358 : x : LYS xxxx B0044 <- 4.38 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0048 <- 4.12 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0049 <- 3.18 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0051 <- 3.56 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 4.18 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0106 <- 3.93 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0109 <- 2.96 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0140 <- 3.30 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >1je8_AB:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=TWO-COMPONENT RESPONSE REGULATOR NARL/DNA COMPLEX: DNA BENDING FOUND IN A HIGH AFFINITY SITE organism=Escherichia coli : w : LYS NZ A0188 <- 5.54 -> DT O4 C0013 : score 1.7 : w : LYS NZ A0188 <- 5.40 -> DA N7 C0012 : score 1.655 : H : LYS NZ A0192 <- 2.86 -> DG N7 C0015 : score 5.32127 : H : LYS NZ A0192 <- 2.91 -> DG O6 C0015 : score 5.65359 : H : LYS NZ A0192 <- 3.05 -> DG O6 C0016 : score 5.49173 : w : LYS NZ B0188 <- 5.74 -> DT O4 D0033 : score 1.7 : w : LYS NZ B0188 <- 5.41 -> DA N7 D0032 : score 1.655 : H : LYS NZ B0192 <- 3.22 -> DG N7 D0035 : score 4.93348 : H : LYS NZ B0192 <- 3.28 -> DG O6 D0036 : score 5.22582 : V : VAL CG1 B0189 <- 3.80 -> DT C7 C0003 : score 6.06051 : V : LYS CE A0188 <- 3.83 -> DT C7 C0013 : score 2.58152 : V : VAL CG1 A0189 <- 3.65 -> DT C7 D0023 : score 6.28778 : V : LYS CE B0188 <- 3.85 -> DT C7 D0033 : score 2.56851 : x : SER xxxx A0185 <- 3.51 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0186 <- 3.50 -> DA xxx D0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0190 <- 3.91 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0185 <- 3.68 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0186 <- 3.30 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0190 <- 3.83 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx >1je8_EF:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=TWO-COMPONENT RESPONSE REGULATOR NARL/DNA COMPLEX: DNA BENDING FOUND IN A HIGH AFFINITY SITE organism=Escherichia coli : w : LYS NZ E0188 <- 5.61 -> DT O4 G0013 : score 1.7 : w : LYS NZ E0188 <- 5.19 -> DA N7 G0012 : score 1.655 : H : LYS NZ E0192 <- 3.04 -> DG N7 G0015 : score 5.12737 : H : LYS NZ E0192 <- 3.07 -> DG O6 G0016 : score 5.46861 : w : LYS NZ F0188 <- 5.57 -> DT O4 H0033 : score 1.7 : H : LYS NZ F0192 <- 2.95 -> DG N7 H0035 : score 5.22432 : H : LYS NZ F0192 <- 2.90 -> DG O6 H0035 : score 5.66515 : H : LYS NZ F0192 <- 3.07 -> DG O6 H0036 : score 5.46861 : V : VAL CG1 F0189 <- 3.74 -> DT C7 G0003 : score 6.15142 : V : LYS CE E0188 <- 3.83 -> DT C7 G0013 : score 2.58152 : V : VAL CG1 E0189 <- 3.77 -> DT C7 H0023 : score 6.10597 : V : LYS CE F0188 <- 3.79 -> DT C7 H0033 : score 2.60753 : x : SER xxxx E0185 <- 3.63 -> DC xxx H0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0186 <- 3.29 -> DA xxx H0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0190 <- 3.80 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0185 <- 3.66 -> DC xxx G0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0186 <- 3.47 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0190 <- 3.88 -> DT xxx G0003 : score x.xxxxx >1je8_F:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=TWO-COMPONENT RESPONSE REGULATOR NARL/DNA COMPLEX: DNA BENDING FOUND IN A HIGH AFFINITY SITE organism=Escherichia coli : w : LYS NZ F0188 <- 5.57 -> DT O4 H0033 : score 1.7 : H : LYS NZ F0192 <- 2.95 -> DG N7 H0035 : score 5.22432 : H : LYS NZ F0192 <- 2.90 -> DG O6 H0035 : score 5.66515 : H : LYS NZ F0192 <- 3.07 -> DG O6 H0036 : score 5.46861 : V : LYS CE F0188 <- 3.79 -> DT C7 H0033 : score 2.60753 : V : VAL CG1 F0189 <- 3.74 -> DT C7 G0003 : score 6.15142 : x : SER xxxx F0185 <- 3.66 -> DC xxx G0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0186 <- 3.47 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0190 <- 3.88 -> DT xxx G0003 : score x.xxxxx >1jey_AB:SPOC_domain-like;vWA-like;C-terminal_domain_of_Ku80; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE KU HETERODIMER BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 B0400 <- 2.59 -> DA N3 D0024 : score 3.37581 >1jfi_ABC:TATA-box_binding_protein-like;Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NC2-TBP-DNA TERNARY COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 C0367 <- 2.75 -> DT O2 E0710 : score 4.79362 : H : ASN ND2 C0367 <- 3.20 -> DT O2 E0711 : score 4.36646 : H : THR OG1 C0513 <- 2.57 -> DA N3 D0609 : score 1.41612 : x : LYS xxxx A0029 <- 3.64 -> DG xxx D0614 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0202 <- 3.40 -> DT xxx D0617 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0369 <- 3.53 -> DA xxx D0610 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0397 <- 2.90 -> DT xxx E0708 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0412 <- 3.28 -> DT xxx E0708 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0414 <- 3.43 -> DA xxx D0612 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0420 <- 3.34 -> DA xxx D0611 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0422 <- 3.63 -> DT xxx E0709 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0457 <- 3.21 -> DA xxx D0609 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0459 <- 3.47 -> DT xxx E0711 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0488 <- 3.27 -> DA xxx D0607 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0489 <- 3.32 -> DA xxx E0714 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0503 <- 3.58 -> DA xxx D0607 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0505 <- 2.98 -> DT xxx E0713 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0511 <- 3.29 -> DA xxx E0712 : score x.xxxxx >1jfi_B:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NC2-TBP-DNA TERNARY COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0202 <- 3.40 -> DT xxx D0617 : score x.xxxxx >1jfs_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PURINE REPRESSOR MUTANT-HYPOXANTHINE-PURF OPERATOR COMPLEX organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0016 <- 3.12 -> DC N4 B0703 : score 3.7752 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.69 -> DG O6 B0702 : score 6.21717 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.26 -> DG N7 B0702 : score 5.79723 : x : SER xxxx A0014 <- 4.43 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.70 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 3.23 -> DA xxx B0706 : score x.xxxxx >1jft_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PURINE REPRESSOR MUTANT-HYPOXANTHINE-PURF OPERATOR COMPLEX organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0016 <- 3.13 -> DC N4 B0703 : score 3.76713 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.80 -> DG O6 B0702 : score 6.08333 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.14 -> DG N7 B0702 : score 5.95046 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.24 -> DG O6 B0702 : score 6.0192 : x : SER xxxx A0014 <- 4.29 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.78 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 3.34 -> DA xxx B0706 : score x.xxxxx >1jgg_AB:Homeodomain-like; title=EVEN-SKIPPED HOMEODOMAIN COMPLEXED TO AT-RICH DNA organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 A0103 <- 2.50 -> DT O2 D0214 : score 4.5648 : H : ARG NH2 A0103 <- 2.94 -> DT O2 D0214 : score 4.1148 : w : GLN NE2 A0150 <- 5.56 -> DT O4 C0209 : score 2.257 : H : ASN OD1 A0151 <- 3.05 -> DA N6 C0208 : score 5.72071 : H : ASN ND2 A0151 <- 2.79 -> DA N7 C0208 : score 5.88225 : w : ASN OD1 A0151 <- 6.04 -> DT O4 C0209 : score 3.132 : H : ARG NH1 B0303 <- 2.88 -> DT O2 D0219 : score 4.23751 : H : ARG NH2 B0303 <- 2.57 -> DT O2 D0219 : score 4.42807 : H : ARG NH2 B0303 <- 2.31 -> DA N3 C0203 : score 3.55724 : H : ARG NH1 B0305 <- 2.82 -> DT O2 C0201 : score 4.28918 : H : GLN NE2 B0350 <- 2.99 -> DT O4 C0204 : score 4.99377 A : H : ASN OD1 B0351 <- 3.12 -> DA N6 C0203 : score 5.6364 : H : ASN ND2 B0351 <- 2.88 -> DA N7 C0203 : score 5.77658 : V : VAL CG2 B0347 <- 3.71 -> DT C7 C0204 : score 6.26085 : V : VAL CG2 A0147 <- 3.78 -> DT C7 C0209 : score 6.15369 : x : TYR xxxx A0104 <- 2.37 -> DA xxx C0207 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0105 <- 3.04 -> DA xxx D0216 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0154 <- 3.13 -> DA xxx D0212 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0158 <- 4.02 -> DT xxx D0213 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0304 <- 2.62 -> DA xxx C0202 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0354 <- 3.11 -> DT xxx D0218 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0355 <- 3.79 -> DT xxx C0201 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0358 <- 3.65 -> DT xxx D0218 : score x.xxxxx >1jgg_B:Homeodomain-like; title=EVEN-SKIPPED HOMEODOMAIN COMPLEXED TO AT-RICH DNA organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 B0303 <- 2.88 -> DT O2 D0219 : score 4.23751 : H : ARG NH2 B0303 <- 2.31 -> DA N3 C0203 : score 3.55724 : H : ARG NH2 B0303 <- 2.57 -> DT O2 D0219 : score 4.42807 : H : ARG NH1 B0305 <- 2.82 -> DT O2 C0201 : score 4.28918 : H : GLN NE2 B0350 <- 2.99 -> DT O4 C0204 : score 4.99377 A : H : ASN OD1 B0351 <- 3.12 -> DA N6 C0203 : score 5.6364 : H : ASN ND2 B0351 <- 2.88 -> DA N7 C0203 : score 5.77658 : V : VAL CG2 B0347 <- 3.71 -> DT C7 C0204 : score 6.26085 : x : TYR xxxx B0304 <- 2.62 -> DA xxx C0202 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0354 <- 3.11 -> DT xxx D0218 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0355 <- 3.79 -> DT xxx C0201 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0358 <- 3.65 -> DT xxx D0218 : score x.xxxxx >1jh9_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PURINE REPRESSOR MUTANT-HYPOXANTHINE-PURF OPERATOR COMPLEX organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0016 <- 2.95 -> DA N6 B0703 : score 2.67621 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.65 -> DG O6 B0702 : score 6.26583 : H : ARG NH2 A0026 <- 2.90 -> DG N7 B0702 : score 6.25692 : H : ARG NH2 A0026 <- 2.93 -> DG O6 B0702 : score 6.4284 : x : SER xxxx A0014 <- 4.31 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0015 <- 4.39 -> DA xxx B0704 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.58 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 3.16 -> DA xxx B0706 : score x.xxxxx >1jj4_AB:Viral_DNA-binding_domain; title=HUMAN PAPILLOMAVIRUS TYPE 18 E2 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO ITS DNA TARGET organism=Human papillomavirus type 18 : H : ASN OD1 A0297 <- 3.07 -> DC N4 D0905 : score 3.96714 : H : ASN ND2 A0297 <- 3.17 -> DA N7 D0904 : score 5.43609 : H : LYS NZ A0300 <- 2.60 -> DG N7 C0613 : score 5.60133 : H : LYS NZ A0300 <- 2.64 -> DG O6 C0614 : score 5.96575 : H : CYS SG A0301 <- 3.35 -> DA N6 D0904 : score 5.10723 : w : CYS SG A0301 <- 6.32 -> DT O4 C0615 : score 4.152 : w : ARG NE A0305 <- 5.56 -> DA N6 D0903 : score 1.081 : w : ASN ND2 B0297 <- 5.62 -> DC N4 D0912 : score 2.395 : H : LYS NZ B0300 <- 2.62 -> DG N7 D0913 : score 5.57979 : H : LYS NZ B0300 <- 2.83 -> DG O6 D0914 : score 5.74608 : H : CYS SG B0301 <- 3.29 -> DA N6 C0604 : score 5.17609 : V : TYR CZ A0304 <- 3.55 -> DT C7 C0615 : score 5.92821 : V : TYR CZ B0304 <- 3.66 -> DT C7 D0915 : score 5.77477 : x : ARG xxxx B0305 <- 3.24 -> DC xxx C0602 : score x.xxxxx >1jj4_B:Viral_DNA-binding_domain; title=HUMAN PAPILLOMAVIRUS TYPE 18 E2 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO ITS DNA TARGET organism=Human papillomavirus type 18 : w : ASN ND2 B0297 <- 5.62 -> DC N4 D0912 : score 2.395 : H : LYS NZ B0300 <- 2.62 -> DG N7 D0913 : score 5.57979 : H : LYS NZ B0300 <- 2.83 -> DG O6 D0914 : score 5.74608 : H : CYS SG B0301 <- 3.29 -> DA N6 C0604 : score 5.17609 : V : TYR CZ B0304 <- 3.66 -> DT C7 D0915 : score 5.77477 : x : ARG xxxx B0305 <- 3.24 -> DC xxx C0602 : score x.xxxxx >1jj6_C:Homeodomain-like; title=TESTING THE WATER-MEDIATED HIN RECOMBINASE DNA RECOGNITION BY SYSTEMATIC MUTATIONS. organism=? : H : ARG NH1 C0140 <- 3.22 -> DA N3 B0026 : score 3.37276 : H : SER OG C0174 <- 2.77 -> DA N7 A0010 : score 4.49089 : H : SER OG C0174 <- 2.99 -> DA N6 A0010 : score 3.16473 : H : ARG NH1 C0178 <- 2.51 -> DG N7 A0009 : score 6.4009 : w : ARG NE C0178 <- 6.17 -> DT O4 B0022 : score 1.317 : x : THR xxxx C0175 <- 3.51 -> DG xxx A0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0177 <- 3.58 -> DT xxx B0020 : score x.xxxxx >1jj8_C:Homeodomain-like; title=TESTING THE WATER-MEDIATED HIN RECOMBINASE DNA RECOGNITION BY SYSTEMATIC MUTATIONS organism=? : H : ARG NH1 C0140 <- 3.19 -> DA N3 B0026 : score 3.39485 : H : SER OG C0174 <- 2.76 -> DA N7 A0010 : score 4.49982 : H : ARG NH1 C0178 <- 2.79 -> DG N7 A0009 : score 6.0621 : x : THR xxxx C0175 <- 3.29 -> DG xxx A0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0177 <- 3.24 -> DT xxx B0020 : score x.xxxxx >1jk1_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZIF268 D20A MUTANT BOUND TO WT DNA SITE organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0118 <- 2.98 -> DG O6 B0011 : score 5.86433 : H : ARG NH2 A0118 <- 2.76 -> DG O6 B0010 : score 6.6528 : H : GLU OE2 A0121 <- 3.06 -> DC N4 B0009 : score 4.99158 : H : ARG NH1 A0124 <- 3.07 -> DG O6 B0008 : score 5.75483 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.85 -> DG N7 B0008 : score 6.32077 : w : ARG NH1 A0124 <- 5.58 -> DG O6 C0054 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0146 <- 2.92 -> DG N7 B0007 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0146 <- 2.72 -> DG O6 B0007 : score 6.7056 : H : ASP OD1 A0148 <- 3.21 -> DC N4 C0055 : score 4.90659 : w : ASP OD1 A0148 <- 5.75 -> DC N4 C0056 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0148 <- 5.58 -> DG N7 C0054 : score 2.718 : H : HIS NE2 A0149 <- 2.76 -> DG N7 B0006 : score 6.85698 : H : ARG NH1 A0174 <- 3.02 -> DG N7 B0004 : score 5.7838 : H : ARG NH2 A0174 <- 2.83 -> DG O6 B0004 : score 6.5604 : H : ASP OD1 A0176 <- 3.24 -> DA N6 C0058 : score 3.17563 : w : ASP OD1 A0176 <- 5.75 -> DC N4 B0003 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0176 <- 5.97 -> DC N4 C0057 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0180 <- 3.02 -> DG O6 B0002 : score 5.81567 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.85 -> DG N7 B0002 : score 6.32077 : w : ARG NH1 A0180 <- 5.57 -> DG O6 C0060 : score 2.756 : x : ALA xxxx A0120 <- 3.88 -> DC xxx C0052 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0152 <- 4.39 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0177 <- 3.54 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >1jk2_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZIF268 D20A MUTANT BOUND TO THE GCT DNA SITE organism=MUS MUSCULUS : H : GLU OE2 A0121 <- 2.85 -> DC N4 B0009 : score 5.21273 : w : GLU OE1 A0121 <- 5.67 -> DT O4 B0010 : score 2.749 : H : ARG NH1 A0124 <- 3.04 -> DG O6 B0008 : score 5.79133 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.91 -> DG N7 B0008 : score 6.24415 : w : ARG NH1 A0124 <- 5.78 -> DG O6 C0054 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0146 <- 2.92 -> DG N7 B0007 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0146 <- 2.74 -> DG O6 B0007 : score 6.6792 : H : ASP OD1 A0148 <- 2.98 -> DC N4 C0055 : score 5.15246 : w : ASP OD1 A0148 <- 5.81 -> DC N4 C0056 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0148 <- 5.95 -> DG N7 C0054 : score 2.718 : H : HIS NE2 A0149 <- 2.67 -> DG N7 B0006 : score 6.97943 : H : ARG NH1 A0174 <- 2.88 -> DG N7 B0004 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0174 <- 2.78 -> DG O6 B0004 : score 6.6264 : H : ASP OD1 A0176 <- 3.21 -> DA N6 C0058 : score 3.19652 : w : ASP OD1 A0176 <- 5.91 -> DC N4 B0003 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0176 <- 5.97 -> DC N4 C0057 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0180 <- 2.99 -> DG O6 B0002 : score 5.85217 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.84 -> DG N7 B0002 : score 6.33354 : w : ARG NH1 A0180 <- 5.95 -> DG O6 C0060 : score 2.756 : x : ARG xxxx A0118 <- 3.72 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0120 <- 4.12 -> DC xxx C0052 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0152 <- 4.39 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0177 <- 3.20 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >1jko_C:Homeodomain-like; title=TESTING THE WATER-MEDIATED HIN RECOMBINASE DNA RECOGNITION BY SYSTEMATIC MUTATIONS organism=? : H : ARG NH1 C0140 <- 2.94 -> DA N3 B0026 : score 3.57895 : H : SER OG C0174 <- 2.83 -> DG N7 A0010 : score 4.45516 : H : SER OG C0174 <- 2.88 -> DG O6 A0010 : score 4.02557 : H : ARG NH1 C0178 <- 3.25 -> DG N7 A0009 : score 5.5055 : x : THR xxxx C0175 <- 3.70 -> DG xxx A0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0177 <- 3.32 -> DT xxx B0020 : score x.xxxxx >1jkp_C:Homeodomain-like; title=TESTING THE WATER-MEDIATED HIN RECOMBINASE DNA RECOGNITION BY SYSTEMATIC MUTATIONS organism=? : H : ARG NH1 C0140 <- 3.29 -> DA N3 B0026 : score 3.32121 : H : SER OG C0174 <- 2.66 -> DA N7 A0010 : score 4.5891 : H : ARG NH1 C0178 <- 2.92 -> DG N7 A0009 : score 5.9048 A : x : THR xxxx C0175 <- 3.80 -> DG xxx A0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0177 <- 3.25 -> DT xxx B0020 : score x.xxxxx >1jkq_C:Homeodomain-like; title=TESTING THE WATER-MEDIATED HIN RECOMBINASE DNA RECOGNITION BY SYSTEMATIC MUTATIONS organism=? : H : ARG NH1 C0140 <- 3.12 -> DA N3 B0026 : score 3.4464 : H : SER OG C0174 <- 2.74 -> DA N7 A0010 : score 4.51767 : x : THR xxxx C0175 <- 3.94 -> DT xxx A0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0177 <- 3.30 -> DT xxx B0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0178 <- 3.48 -> DT xxx A0009 : score x.xxxxx >1jkr_C:Homeodomain-like; title=TESTING THE WATER-MEDIATED HIN RECOMBINASE DNA RECOGNITION BY SYSTEMATIC MUTATIONS organism=? : H : ARG NH1 C0140 <- 3.03 -> DA N3 B0026 : score 3.51268 : H : SER OG C0174 <- 2.87 -> DA N7 A0010 : score 4.40161 : H : ARG NH1 C0178 <- 2.61 -> DG N7 A0009 : score 6.2799 : x : THR xxxx C0175 <- 3.62 -> DG xxx A0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0177 <- 3.62 -> DT xxx B0020 : score x.xxxxx >1jnm_A:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE JUN/CRE COMPLEX organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0258 <- 5.86 -> DA N7 C0214 : score 1.655 : H : ASN OD1 A0262 <- 3.24 -> DC N4 C0213 : score 3.82455 : H : ASN ND2 A0262 <- 2.85 -> DT O4 D0307 : score 5.23177 : w : ASN ND2 A0262 <- 6.01 -> DA N7 D0306 : score 1.989 : V : ALA CB A0266 <- 3.60 -> DT C7 C0212 : score 5.87892 : x : ALA xxxx A0265 <- 3.93 -> DT xxx D0307 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0269 <- 3.68 -> DT xxx D0307 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0270 <- 3.60 -> DC xxx C0210 : score x.xxxxx >1jnm_AB:Leucine_zipper_domain;A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE JUN/CRE COMPLEX organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0258 <- 5.86 -> DA N7 C0214 : score 1.655 : H : ASN OD1 A0262 <- 3.24 -> DC N4 C0213 : score 3.82455 : H : ASN ND2 A0262 <- 2.85 -> DT O4 D0307 : score 5.23177 : w : ASN ND2 A0262 <- 6.01 -> DA N7 D0306 : score 1.989 : H : ASN OD1 B0262 <- 3.11 -> DC N4 D0313 : score 3.93359 : H : ASN ND2 B0262 <- 3.12 -> DT O4 C0207 : score 4.9464 : w : ASN ND2 B0262 <- 5.91 -> DA N7 C0206 : score 1.989 : H : ARG NH2 B0270 <- 2.40 -> DG O6 D0311 : score 7.128 : V : ALA CB A0266 <- 3.60 -> DT C7 C0212 : score 5.87892 : V : ALA CB B0266 <- 3.60 -> DT C7 D0312 : score 5.87892 : x : ALA xxxx A0265 <- 3.93 -> DT xxx D0307 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0269 <- 3.68 -> DT xxx D0307 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0270 <- 3.60 -> DC xxx C0210 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0265 <- 3.91 -> DT xxx C0207 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0269 <- 3.82 -> DT xxx C0207 : score x.xxxxx >1jt0_ABCD:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A COOPERATIVE QACR-DNA COMPLEX organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : H : LYS NZ A0036 <- 3.07 -> DG N7 F0021 : score 5.09506 : H : LYS NZ B0036 <- 2.72 -> DG N7 E0021 : score 5.47207 : H : LYS NZ C0036 <- 2.71 -> DG N7 E0026 : score 5.48284 : H : LYS NZ C0036 <- 2.77 -> DG O6 E0026 : score 5.81545 : H : LYS NZ D0036 <- 2.62 -> DG N7 F0026 : score 5.57979 : H : LYS NZ D0036 <- 2.53 -> DG O6 F0026 : score 6.09293 : x : THR xxxx A0025 <- 4.13 -> DG xxx F0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0035 <- 3.35 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0038 <- 3.22 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0040 <- 3.26 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.54 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0025 <- 3.69 -> DG xxx E0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0035 <- 3.58 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0038 <- 3.29 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0040 <- 3.26 -> DT xxx E0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0041 <- 3.48 -> DA xxx F0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0025 <- 3.81 -> DG xxx E0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0035 <- 3.32 -> DA xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0038 <- 3.16 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0040 <- 3.42 -> DT xxx E0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0041 <- 3.08 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0025 <- 3.97 -> DG xxx F0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0035 <- 3.31 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0038 <- 3.22 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0040 <- 3.45 -> DT xxx F0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0041 <- 3.61 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx >1jt0_C:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A COOPERATIVE QACR-DNA COMPLEX organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : H : LYS NZ C0036 <- 2.71 -> DG N7 E0026 : score 5.48284 : H : LYS NZ C0036 <- 2.77 -> DG O6 E0026 : score 5.81545 : x : THR xxxx C0025 <- 3.81 -> DG xxx E0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0035 <- 3.32 -> DA xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0038 <- 3.16 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0040 <- 3.42 -> DT xxx E0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0041 <- 3.08 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx >1jwl_AB:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF THE DIMERIC LAC REPRESSOR/OPERATOR O1/ONPF COMPLEX organism=Escherichia coli : V : GLN CB A0018 <- 3.66 -> DT C7 D0008 : score 1.89803 : x : HIS xxxx A0029 <- 4.46 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0053 <- 4.29 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0056 <- 4.47 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 3.66 -> DC xxx E0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0018 <- 2.78 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0029 <- 4.11 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0053 <- 3.52 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0056 <- 4.18 -> DC xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0057 <- 3.15 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx >1jwl_B:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF THE DIMERIC LAC REPRESSOR/OPERATOR O1/ONPF COMPLEX organism=Escherichia coli : x : GLN xxxx B0018 <- 2.78 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0029 <- 4.11 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0053 <- 3.52 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0056 <- 4.18 -> DC xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0057 <- 3.15 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx >1jx4_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A Y-FAMILY DNA POLYMERASE IN A TERNARY COMPLEX WITH DNA SUBSTRATES AND AN INCOMING NUCLEOTIDE organism=Sulfolobus solfataricus : w : LYS NZ A0221 <- 5.74 -> DA N3 P0010 : score 1.538 : x : VAL xxxx A0032 <- 3.57 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.59 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 4.26 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0332 <- 3.85 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.11 -> DG xxx T0008 : score x.xxxxx >1jxl_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A Y-FAMILY DNA POLYMERASE IN A TERNARY COMPLEX WITH DNA SUBSTRATES AND AN INCOMING NUCLEOTIDE organism=Sulfolobus solfataricus : x : VAL xxxx A0032 <- 3.79 -> DC xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.39 -> DC xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.12 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx >1k3w_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TRAPPED REACTION INTERMEDIATE OF THE DNA REPAIR ENZYME ENDONUCLEASE VIII WITH DNA organism=Escherichia coli : x : GLN xxxx A0069 <- 3.13 -> DG xxx C0428 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0070 <- 3.73 -> DG xxx C0428 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0071 <- 3.31 -> DT xxx B0408 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0252 <- 3.89 -> DG xxx C0428 : score x.xxxxx >1k3x_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TRAPPED REACTION INTERMEDIATE OF THE DNA REPAIR ENZYME ENDONUCLEASE VIII WITH BROMINATED-DNA organism=Escherichia coli : w : GLN NE2 A0069 <- 6.29 -> DC O2 B0406 : score 2.699 : x : LEU xxxx A0070 <- 3.71 -> DG xxx C0428 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0252 <- 3.79 -> DG xxx C0428 : score x.xxxxx >1k4t_A:Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_N-terminal_DNA-binding_fragment;DNA_breaking-rejoining_enzymes;Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_dispensable_insert_domain; title=HUMAN DNA TOPOISOMERASE I (70 KDA) IN COMPLEX WITH THE POISON TOPOTECAN AND COVALENT COMPLEX WITH A 22 BASE PAIR DNA DUPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0364 <- 2.73 -> DA N3 D0113 : score 3.2851 : w : LYS NZ A0425 <- 5.91 -> DC N4 B0008 : score 0.048 : H : LYS NZ A0532 <- 2.64 -> DT O2 B0010 : score 3.70197 : x : TYR xxxx A0426 <- 3.23 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0428 <- 4.21 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0436 <- 4.20 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0491 <- 4.02 -> DT xxx D0116 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0722 <- 3.84 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx >1k61_ABCD:Homeodomain-like; title=MATALPHA2 HOMEODOMAIN BOUND TO DNA organism=? : w : HIS NE2 A0134 <- 6.03 -> DA N3 F0030 : score 2.619 : H : ASN OD1 A0182 <- 3.26 -> DA N6 E0016 : score 5.46779 : H : ASN ND2 A0182 <- 3.23 -> DA N7 E0016 : score 5.36565 : H : ARG NH1 A0185 <- 2.86 -> DG N7 F0027 : score 5.9774 : H : ARG NH2 A0185 <- 2.65 -> DG O6 F0027 : score 6.798 : H : ARG NH2 B0135 <- 2.93 -> DT O2 E0010 : score 4.12327 : w : ASN OD1 B0178 <- 5.94 -> DC N4 F0039 : score 2.732 : w : SER OG B0181 <- 5.52 -> DA N7 E0003 : score 2.343 : H : ASN OD1 B0182 <- 3.28 -> DA N6 F0038 : score 5.4437 : H : ASN ND2 B0182 <- 3.10 -> DA N7 F0038 : score 5.51828 : w : ASN OD1 B0182 <- 6.06 -> DT O4 F0037 : score 3.132 : H : ARG NH1 B0185 <- 2.77 -> DG O6 E0005 : score 6.11983 : H : ARG NH2 B0185 <- 3.05 -> DG N7 E0005 : score 6.06538 : w : ASN OD1 C0178 <- 5.40 -> DC N4 E0021 : score 2.732 : w : ASN OD1 C0178 <- 5.78 -> DG N7 E0020 : score 1.873 : H : ARG NH2 C0185 <- 2.98 -> DG O6 F0023 : score 6.3624 : w : ARG NH1 C0185 <- 5.85 -> DG O6 E0020 : score 2.756 : H : ARG NH2 D0132 <- 3.07 -> DA N3 F0038 : score 3.0648 : H : LYS NZ D0177 <- 3.01 -> DG N7 F0033 : score 5.15969 : H : ASN OD1 D0178 <- 3.05 -> DA N6 E0008 : score 5.72071 : H : ASN ND2 D0178 <- 3.02 -> DA N7 E0008 : score 5.61221 : w : ASN OD1 D0178 <- 5.57 -> DT O4 E0009 : score 3.132 : w : ASN OD1 D0178 <- 6.45 -> DA N6 F0035 : score 2.837 : w : SER OG D0181 <- 5.98 -> DA N7 F0035 : score 2.343 : w : SER OG D0181 <- 6.81 -> DA N6 F0035 : score 2.209 : x : ARG xxxx A0135 <- 3.37 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0178 <- 4.12 -> DC xxx E0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0181 <- 4.11 -> DT xxx F0026 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0134 <- 3.53 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0182 <- 4.11 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0174 <- 3.95 -> DA xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0182 <- 3.79 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx >1k61_B:Homeodomain-like; title=MATALPHA2 HOMEODOMAIN BOUND TO DNA organism=? : H : ARG NH2 B0135 <- 2.93 -> DT O2 E0010 : score 4.12327 : w : ASN OD1 B0178 <- 5.94 -> DC N4 F0039 : score 2.732 : w : SER OG B0181 <- 5.52 -> DA N7 E0003 : score 2.343 : H : ASN OD1 B0182 <- 3.28 -> DA N6 F0038 : score 5.4437 : H : ASN ND2 B0182 <- 3.10 -> DA N7 F0038 : score 5.51828 : w : ASN OD1 B0182 <- 6.06 -> DT O4 F0037 : score 3.132 : H : ARG NH1 B0185 <- 2.77 -> DG O6 E0005 : score 6.11983 : H : ARG NH2 B0185 <- 3.05 -> DG N7 E0005 : score 6.06538 : x : HIS xxxx B0134 <- 3.53 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx >1k6o_ABC:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;SRF-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY SAP-1/SRF/C-FOS SRE DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0361 <- 2.84 -> DG O6 D0106 : score 3.9095 : H : ARG NH2 A0361 <- 2.65 -> DG N7 D0106 : score 6.57615 : H : TYR OH A0365 <- 2.78 -> DA N6 D0107 : score 4.68919 : H : THR OG1 B0140 <- 2.52 -> DC O2 D0112 : score 2.77268 : H : ARG NH1 B0143 <- 3.08 -> DA N3 E0210 : score 3.47586 : H : LYS NZ B0163 <- 3.09 -> DG O6 E0213 : score 5.44548 : H : THR OG1 C0140 <- 2.60 -> DC O2 E0205 : score 2.73067 : H : ARG NH1 C0143 <- 2.71 -> DT O2 D0117 : score 4.38393 : H : LYS NZ C0163 <- 3.37 -> DT O4 E0203 : score 3.17824 : x : LYS xxxx A0358 <- 4.24 -> DT xxx E0217 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0364 <- 3.12 -> DA xxx D0104 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0162 <- 3.57 -> DT xxx D0108 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0158 <- 3.88 -> DT xxx E0201 : score x.xxxxx >1k6o_C:SRF-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY SAP-1/SRF/C-FOS SRE DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : THR OG1 C0140 <- 2.60 -> DC O2 E0205 : score 2.73067 : H : ARG NH1 C0143 <- 2.71 -> DT O2 D0117 : score 4.38393 : H : LYS NZ C0163 <- 3.37 -> DT O4 E0203 : score 3.17824 : x : TYR xxxx C0158 <- 3.88 -> DT xxx E0201 : score x.xxxxx >1k78_A:Homeodomain-like; title=PAX5(1-149)+ETS-1(331-440)+DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 A0029 <- 2.82 -> DG N2 C0016 : score 4.7808 : w : ASN OD1 A0029 <- 6.21 -> DC O2 D0014 : score 2.172 : w : ARG NE A0031 <- 6.04 -> DT O2 C0018 : score 0.757 : w : ARG NH2 A0031 <- 6.13 -> DT O2 C0018 : score 2.261 : H : HIS NE2 A0062 <- 2.77 -> DG O6 C0011 : score 8.00157 : H : SER OG A0086 <- 2.79 -> DA N3 C0021 : score 3.00985 : H : SER OG A0133 <- 2.79 -> DG O6 C0025 : score 4.09921 : x : SER xxxx A0061 <- 3.46 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0066 <- 3.89 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0067 <- 3.82 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0083 <- 3.70 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0131 <- 3.56 -> DG xxx C0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0134 <- 4.06 -> DG xxx C0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0136 <- 4.27 -> DA xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0137 <- 3.40 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx >1k78_BI:Homeodomain-like; title=PAX5(1-149)+ETS-1(331-440)+DNA organism=MUS MUSCULUS / HOMO SAPIENS : w : GLU OE2 B0387 <- 6.40 -> DC N4 C0007 : score 3.597 : w : GLU OE2 B0387 <- 5.80 -> DC N4 D0022 : score 3.597 : H : ARG NE B0391 <- 2.92 -> DG O6 C0009 : score 3.84644 : H : ARG NH2 B0391 <- 2.99 -> DG N7 C0009 : score 6.142 : H : ARG NE B0394 <- 2.88 -> DG N7 C0008 : score 4.35105 : H : ARG NH2 B0394 <- 2.82 -> DG O6 C0008 : score 6.5736 : w : SER OG I0086 <- 6.27 -> DT O2 C0023 : score 1.55 : H : SER OG I0133 <- 2.75 -> DG N7 D0011 : score 4.52687 : H : ARG NH1 I0137 <- 3.17 -> DG N7 D0010 : score 5.6023 : H : ARG NH2 I0137 <- 2.63 -> DG O6 D0010 : score 6.8244 : x : LYS xxxx B0388 <- 3.87 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0395 <- 3.52 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0131 <- 3.92 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0140 <- 3.49 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx >1k78_EF:Homeodomain-like; title=PAX5(1-149)+ETS-1(331-440)+DNA organism=MUS MUSCULUS / HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 E0029 <- 3.00 -> DG N2 G0016 : score 4.608 : w : ASN OD1 E0029 <- 5.82 -> DC O2 H0015 : score 2.172 : H : HIS NE2 E0062 <- 2.71 -> DG O6 G0011 : score 8.09702 : H : SER OG E0086 <- 2.46 -> DA N3 G0021 : score 3.20811 : H : SER OG E0133 <- 2.76 -> DG N7 G0025 : score 4.51791 : w : GLU OE2 F0387 <- 5.73 -> DC N4 H0022 : score 3.597 : H : ARG NE F0391 <- 2.82 -> DG O6 G0009 : score 3.92526 : H : ARG NH2 F0391 <- 2.75 -> DG N7 G0009 : score 6.44846 : H : ARG NE F0394 <- 2.85 -> DG N7 G0008 : score 4.37758 : H : ARG NH2 F0394 <- 2.82 -> DG O6 G0008 : score 6.5736 : x : SER xxxx E0061 <- 3.55 -> DC xxx H0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0066 <- 4.34 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0067 <- 4.07 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E0083 <- 3.99 -> DA xxx H0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0131 <- 3.60 -> DG xxx G0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0137 <- 3.45 -> DT xxx G0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0388 <- 3.86 -> DT xxx H0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0395 <- 3.59 -> DT xxx H0018 : score x.xxxxx >1k79_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ETS-1(331-440)+GGAA DUPLEX organism=Mus musculus : H : ARG NE D0391 <- 2.81 -> DG O6 E0009 : score 3.93314 : H : ARG NH2 D0391 <- 2.76 -> DG N7 E0009 : score 6.43569 : H : ARG NE D0394 <- 3.06 -> DG N7 E0008 : score 4.19186 : H : ARG NH2 D0394 <- 3.05 -> DG O6 E0008 : score 6.27 : H : TYR OH D0395 <- 2.99 -> DA N6 E0010 : score 4.49303 : x : LYS xxxx D0388 <- 3.53 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx >1k7a_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ETS-1(331-440)+GGAG DUPLEX organism=Mus musculus : H : ARG NH2 A0391 <- 2.95 -> DG N7 B0009 : score 6.19308 : H : ARG NE A0394 <- 2.87 -> DG N7 B0008 : score 4.35989 : H : ARG NH2 A0394 <- 2.61 -> DG O6 B0008 : score 6.8508 : H : TYR OH A0395 <- 2.74 -> DC N4 C0006 : score 4.26467 : H : TYR OH A0395 <- 2.78 -> DA N6 B0010 : score 4.68919 : x : LYS xxxx A0388 <- 3.66 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >1k82_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI FORMAMIDOPYRIMIDINE-DNA GLYCOSYLASE (FPG) COVALENTLY TRAPPED WITH DNA organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0033 <- 3.02 -> DA N3 f0008 : score 3.09719 : w : ARG NH2 A0033 <- 6.03 -> DC O2 e0006 : score 1.669 : H : ARG NE A0108 <- 2.54 -> DC O2 e0007 : score 2.79724 : H : ARG NH2 A0108 <- 3.11 -> DC N3 e0007 : score 2.14898 : w : ARG NH1 A0108 <- 6.58 -> DG O6 f0007 : score 2.756 : w : ARG NH1 A0108 <- 6.14 -> DA N3 f0006 : score 2.585 : x : MET xxxx A0073 <- 3.32 -> DG xxx f0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0110 <- 3.20 -> DC xxx e0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0149 <- 4.37 -> DG xxx e0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0159 <- 4.42 -> DG xxx e0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0256 <- 4.22 -> DC xxx e0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0257 <- 3.12 -> DT xxx e0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0258 <- 3.81 -> DG xxx f0007 : score x.xxxxx >1k82_AB:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI FORMAMIDOPYRIMIDINE-DNA GLYCOSYLASE (FPG) COVALENTLY TRAPPED WITH DNA organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 B0033 <- 2.87 -> DA N3 e0021 : score 3.19439 : H : ARG NE B0108 <- 2.70 -> DC O2 f0019 : score 2.71215 : H : ARG NH2 B0108 <- 3.22 -> DC N3 f0019 : score 2.09858 : w : ARG NH1 B0108 <- 6.37 -> DG O6 e0020 : score 2.756 : x : MET xxxx B0073 <- 3.39 -> DG xxx e0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0110 <- 3.25 -> DC xxx f0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0256 <- 4.32 -> DC xxx f0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0257 <- 2.97 -> DT xxx f0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0258 <- 3.92 -> DG xxx e0020 : score x.xxxxx >1k82_CD:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI FORMAMIDOPYRIMIDINE-DNA GLYCOSYLASE (FPG) COVALENTLY TRAPPED WITH DNA organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 D0033 <- 2.92 -> DA N3 g0021 : score 3.16199 : H : ARG NE D0108 <- 2.73 -> DC O2 h0019 : score 2.6962 : H : ARG NH2 D0108 <- 3.13 -> DC N3 h0019 : score 2.13982 : w : ARG NH1 D0108 <- 6.22 -> DG O6 g0020 : score 2.756 : w : ARG NH1 D0108 <- 6.07 -> DA N3 g0019 : score 2.585 : x : MET xxxx D0073 <- 3.40 -> DG xxx g0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0110 <- 3.19 -> DC xxx h0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0256 <- 4.38 -> DC xxx h0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0257 <- 3.76 -> DT xxx h0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0258 <- 3.68 -> DG xxx g0020 : score x.xxxxx >1kb2_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF VDR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO MOUSE OSTEOPONTIN (SPP) RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0042 <- 3.27 -> DA N6 D0431 : score 2.42994 : w : GLU OE1 A0042 <- 5.51 -> DA N6 D0430 : score 2.939 : H : LYS NZ A0045 <- 2.58 -> DG O6 C0405 : score 6.03512 : w : LYS NZ A0045 <- 6.15 -> DG N7 C0404 : score 2.519 : w : ARG NH1 A0049 <- 6.17 -> DT O4 C0406 : score 1.768 : w : ARG NH2 A0049 <- 6.36 -> DT O4 C0406 : score 2.366 : w : ARG NH1 A0050 <- 6.09 -> DT O4 C0407 : score 1.768 : w : GLU OE1 B0242 <- 5.52 -> DT O4 C0415 : score 2.749 : H : LYS NZ B0245 <- 3.04 -> DG O6 C0414 : score 5.50329 : w : LYS NZ B0245 <- 6.06 -> DG O6 C0413 : score 3.005 : w : ARG NH1 B0249 <- 5.74 -> DT O4 C0415 : score 1.768 : x : LYS xxxx A0103 <- 4.45 -> DG xxx C0404 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0250 <- 3.27 -> DG xxx D0420 : score x.xxxxx >1kb2_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF VDR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO MOUSE OSTEOPONTIN (SPP) RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : w : GLU OE1 B0242 <- 5.52 -> DT O4 C0415 : score 2.749 : H : LYS NZ B0245 <- 3.04 -> DG O6 C0414 : score 5.50329 : w : LYS NZ B0245 <- 6.06 -> DG O6 C0413 : score 3.005 : w : ARG NH1 B0249 <- 5.74 -> DT O4 C0415 : score 1.768 : x : ARG xxxx B0250 <- 3.27 -> DG xxx D0420 : score x.xxxxx >1kb4_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF VDR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO A CANONICAL DIRECT REPEAT WITH THREE BASE PAIR SPACER (DR3) RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0042 <- 3.08 -> DC N4 D0431 : score 5.44494 : H : LYS NZ A0045 <- 2.83 -> DG O6 C0405 : score 5.74608 : w : ARG NH1 A0050 <- 5.76 -> DG O6 D0429 : score 2.756 : x : ARG xxxx A0049 <- 3.76 -> DG xxx C0405 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0103 <- 3.86 -> DA xxx C0404 : score x.xxxxx >1kb4_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF VDR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO A CANONICAL DIRECT REPEAT WITH THREE BASE PAIR SPACER (DR3) RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0042 <- 3.08 -> DC N4 D0431 : score 5.44494 : H : LYS NZ A0045 <- 2.83 -> DG O6 C0405 : score 5.74608 : w : ARG NH1 A0050 <- 5.76 -> DG O6 D0429 : score 2.756 : H : GLU OE1 B0242 <- 3.15 -> DC N4 D0422 : score 5.36419 : H : LYS NZ B0245 <- 3.07 -> DG O6 C0414 : score 5.46861 : w : LYS NZ B0245 <- 5.64 -> DA N6 C0413 : score 2.097 : H : ARG NH1 B0250 <- 3.26 -> DG N7 D0420 : score 5.4934 : w : ARG NH1 B0250 <- 5.45 -> DG O6 D0420 : score 2.756 : x : ARG xxxx A0049 <- 3.76 -> DG xxx C0405 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0103 <- 3.86 -> DA xxx C0404 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0249 <- 4.05 -> DG xxx C0414 : score x.xxxxx >1kb6_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF VDR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO RAT OSTEOCALCIN (OC) RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0042 <- 2.64 -> DC N4 D0431 : score 5.95252 : w : GLU OE2 A0042 <- 6.42 -> DC N4 D0432 : score 3.597 : H : LYS NZ A0045 <- 2.89 -> DG O6 C0405 : score 5.67672 : w : LYS NZ A0045 <- 6.01 -> DG O6 C0404 : score 3.005 : w : ARG NH1 A0049 <- 5.67 -> DG O6 C0406 : score 2.756 : x : ARG xxxx A0050 <- 3.98 -> DT xxx D0428 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0103 <- 4.18 -> DG xxx C0404 : score x.xxxxx >1kb6_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF VDR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO RAT OSTEOCALCIN (OC) RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0042 <- 2.64 -> DC N4 D0431 : score 5.95252 : w : GLU OE2 A0042 <- 6.42 -> DC N4 D0432 : score 3.597 : H : LYS NZ A0045 <- 2.89 -> DG O6 C0405 : score 5.67672 : w : LYS NZ A0045 <- 6.01 -> DG O6 C0404 : score 3.005 : w : ARG NH1 A0049 <- 5.67 -> DG O6 C0406 : score 2.756 : H : LYS NZ B0245 <- 2.94 -> DG O6 C0414 : score 5.61891 : w : LYS NZ B0245 <- 6.21 -> DA N6 C0413 : score 2.097 : w : ARG NH1 B0249 <- 5.25 -> DG O6 C0415 : score 2.756 : H : ARG NH2 B0250 <- 2.80 -> DG N7 D0420 : score 6.38462 : x : ARG xxxx A0050 <- 3.98 -> DT xxx D0428 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0103 <- 4.18 -> DG xxx C0404 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0242 <- 2.93 -> DC xxx D0422 : score x.xxxxx >1kbu_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRE RECOMBINASE BOUND TO A LOXP HOLLIDAY JUNCTION organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ B0043 <- 2.29 -> DG N7 C0009 : score 5.93526 : H : LYS NZ B0086 <- 2.41 -> DA N7 C0014 : score 3.16628 : w : GLN OE1 B0089 <- 5.95 -> DA N6 D0020 : score 3.392 : H : GLN OE1 B0090 <- 2.79 -> DA N6 C0013 : score 6.06467 : H : LYS NZ B0201 <- 2.44 -> DA N3 C0014 : score 2.97686 : w : ARG NH2 B0241 <- 6.03 -> DA N3 C0004 : score 2.092 : H : ARG NH1 B0243 <- 2.93 -> DT O2 D0032 : score 4.19444 : H : ARG NH2 B0243 <- 3.13 -> DT O2 D0032 : score 3.95393 : H : LYS NZ B0244 <- 2.90 -> DT O2 C0002 : score 3.51544 : H : LYS NZ B0244 <- 2.89 -> DT O2 D0034 : score 3.52261 : H : ARG NE B0259 <- 2.73 -> DG O6 D0027 : score 3.9962 : H : ARG NH2 B0259 <- 2.98 -> DG N7 D0027 : score 6.15477 : w : GLU OE1 B0262 <- 5.94 -> DC N4 D0026 : score 3.528 : H : ARG NH2 B0282 <- 2.83 -> DA N3 C0011 : score 3.22031 : w : ARG NH2 B0282 <- 6.66 -> DT O2 C0010 : score 2.261 : V : MET CE B0044 <- 3.68 -> DT C7 C0012 : score 7.13816 : V : HIS CG B0040 <- 3.69 -> DT C7 D0024 : score 3.08145 : x : THR xxxx B0041 <- 3.39 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.48 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.79 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 3.68 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 3.91 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >1kc6_A:Restriction_endonuclease-like; title=HINCII BOUND TO COGNATE DNA organism=Haemophilus influenzae : H : GLN NE2 A0109 <- 2.66 -> DC O2 F0007 : score 3.79833 : w : GLN NE2 A0109 <- 5.49 -> DT O2 F0006 : score 1.565 : w : ASN OD1 A0110 <- 5.99 -> DG N3 F0005 : score 3.377 : H : ASN OD1 A0141 <- 2.91 -> DA N6 F0009 : score 5.88932 : H : ASN ND2 A0141 <- 2.97 -> DG N7 F0008 : score 4.42998 : H : ASN ND2 A0201 <- 2.89 -> DG N7 E0005 : score 4.50335 : H : GLN NE2 A0209 <- 3.13 -> DG O6 E0005 : score 5.42199 : V : ALA CB A0205 <- 3.72 -> DT C7 F0006 : score 5.71095 : x : ALA xxxx A0137 <- 4.45 -> DC xxx F0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0138 <- 3.08 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.66 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.66 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.31 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.67 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 4.16 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx >1kc6_CD:Restriction_endonuclease-like; title=HINCII BOUND TO COGNATE DNA organism=Haemophilus influenzae : H : GLN NE2 C0109 <- 3.05 -> DA N3 G0009 : score 3.82558 : H : ASN OD1 C0141 <- 3.22 -> DA N6 H0009 : score 5.51596 : H : ASN ND2 C0141 <- 3.14 -> DG N7 H0008 : score 4.27406 : H : ASN ND2 C0201 <- 3.15 -> DG N7 G0005 : score 4.26488 : H : GLN NE2 C0209 <- 3.18 -> DG O6 G0005 : score 5.36394 : H : ASN ND2 D0141 <- 2.78 -> DG N7 G0008 : score 4.60424 : H : ASN ND2 D0201 <- 2.93 -> DG N7 H0005 : score 4.46666 : H : GLN NE2 D0209 <- 2.99 -> DG O6 H0005 : score 5.58453 : V : ALA CB D0205 <- 3.65 -> DT C7 G0006 : score 5.80894 : V : ALA CB C0205 <- 3.60 -> DT C7 H0006 : score 5.87892 : x : GLN xxxx C0138 <- 3.20 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0140 <- 3.77 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0203 <- 4.33 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0204 <- 3.39 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0207 <- 4.39 -> DC xxx H0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0109 <- 3.36 -> DC xxx G0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0110 <- 4.17 -> DG xxx G0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0138 <- 3.10 -> DG xxx H0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0140 <- 3.80 -> DA xxx G0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0199 <- 3.87 -> DG xxx H0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0203 <- 4.07 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0204 <- 3.55 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0207 <- 4.09 -> DC xxx G0007 : score x.xxxxx >1kfv_B:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LACTOCOCCUS LACTIS FORMAMIDO-PYRIMIDINE DNA GLYCOSYLASE (ALIAS FPG OR MUTM) NON COVALENTLY BOUND TO AN AP SITE CONTAINING DNA. organism=Lactococcus lactis : H : ARG NH1 B0074 <- 2.80 -> DT O2 G0008 : score 4.30641 : H : ARG NE B0109 <- 3.13 -> DC O2 H0020 : score 2.48348 : H : ARG NH2 B0109 <- 3.17 -> DC N3 H0020 : score 2.12149 : V : MET CE B0075 <- 3.51 -> DT C7 G0008 : score 7.4327 : x : PHE xxxx B0111 <- 3.51 -> DC xxx H0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0260 <- 3.24 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx >1kln_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DNA POLYMERASE I KLENOW FRAGMENT (E.C.2.7.7.7) MUTANT/DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : x : ARG xxxx A0455 <- 3.52 -> DC xxx B0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0663 <- 3.85 -> DC xxx B0011 : score x.xxxxx >1kqq_A:ARID-like; title=SOLUTION STRUCTURE OF THE DEAD RINGER ARID-DNA COMPLEX organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : THR OG1 A0092 <- 3.28 -> DA N7 B0410 : score 3.08635 : H : THR OG1 A0092 <- 3.15 -> DA N6 B0410 : score 2.56585 : H : SER OG A0093 <- 2.81 -> DT O4 C0421 : score 3.54802 : x : LEU xxxx A0096 <- 3.00 -> DT xxx C0421 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0131 <- 3.42 -> DT xxx B0413 : score x.xxxxx >1ksx_ABEF:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=CRYSTAL STRUCTURES OF TWO INTERMEDIATES IN THE ASSEMBLY OF THE PAPILLOMAVIRUS REPLICATION INITIATION COMPLEX organism=Bovine papillomavirus : x : ASN xxxx A0184 <- 4.02 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0186 <- 4.01 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0187 <- 3.01 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0188 <- 4.49 -> DC xxx G0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0184 <- 4.48 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0186 <- 4.01 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0187 <- 3.72 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0188 <- 4.40 -> DC xxx G0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0184 <- 4.02 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0186 <- 4.01 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0187 <- 3.00 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0188 <- 4.36 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0184 <- 4.48 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0186 <- 4.01 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0187 <- 3.72 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0188 <- 4.31 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx >1ksx_I:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=CRYSTAL STRUCTURES OF TWO INTERMEDIATES IN THE ASSEMBLY OF THE PAPILLOMAVIRUS REPLICATION INITIATION COMPLEX organism=Bovine papillomavirus : x : ASN xxxx I0184 <- 4.02 -> DT xxx K0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0186 <- 4.01 -> DT xxx K0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0187 <- 3.01 -> DT xxx K0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0188 <- 4.06 -> DC xxx O0018 : score x.xxxxx >1ksx_IM:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=CRYSTAL STRUCTURES OF TWO INTERMEDIATES IN THE ASSEMBLY OF THE PAPILLOMAVIRUS REPLICATION INITIATION COMPLEX organism=Bovine papillomavirus : x : ASN xxxx I0184 <- 4.02 -> DT xxx K0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0186 <- 4.01 -> DT xxx K0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0187 <- 3.01 -> DT xxx K0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0188 <- 4.06 -> DC xxx O0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx M0184 <- 4.02 -> DT xxx O0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0186 <- 4.01 -> DT xxx O0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0187 <- 3.01 -> DT xxx O0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0188 <- 4.37 -> DC xxx K0018 : score x.xxxxx >1ksx_JN:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=CRYSTAL STRUCTURES OF TWO INTERMEDIATES IN THE ASSEMBLY OF THE PAPILLOMAVIRUS REPLICATION INITIATION COMPLEX organism=Bovine papillomavirus : x : ASN xxxx J0184 <- 4.48 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0186 <- 4.01 -> DT xxx K0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0187 <- 3.72 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0188 <- 4.07 -> DC xxx O0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx N0184 <- 4.48 -> DT xxx O0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx N0186 <- 4.01 -> DT xxx O0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx N0187 <- 3.72 -> DT xxx O0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx N0188 <- 4.36 -> DC xxx K0015 : score x.xxxxx >1ksy_A:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=CRYSTAL STRUCTURES OF TWO INTERMEDIATES IN THE ASSEMBLY OF THE PAPILLOMAVIRUS REPLICATION INITIATION COMPLEX organism=Bovine papillomavirus : V : LYS CB A0186 <- 3.87 -> DT C7 F0006 : score 2.26529 : x : ASN xxxx A0184 <- 3.57 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0187 <- 3.53 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0188 <- 4.19 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx >1ksy_AC:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=CRYSTAL STRUCTURES OF TWO INTERMEDIATES IN THE ASSEMBLY OF THE PAPILLOMAVIRUS REPLICATION INITIATION COMPLEX organism=Bovine papillomavirus : V : LYS CB A0186 <- 3.87 -> DT C7 F0006 : score 2.26529 : x : ASN xxxx A0184 <- 3.57 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0187 <- 3.53 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0188 <- 4.19 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0184 <- 3.65 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0186 <- 3.94 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0187 <- 3.71 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0188 <- 4.36 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx >1ku7_A:Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS AQUATICS RNA POLYMERASE SIGMAA SUBUNIT REGION 4 BOUND TO-35 ELEMENT DNA organism=Thermus aquaticus : H : ARG NE A0409 <- 2.85 -> DG N7 C0018 : score 4.37758 : H : ARG NH2 A0409 <- 2.57 -> DG O6 C0018 : score 6.9036 : H : GLU OE1 A0410 <- 2.94 -> DC N4 C0020 : score 5.60645 : w : GLU OE2 A0410 <- 6.07 -> DA N6 C0021 : score 2.785 : w : ARG NH1 A0413 <- 6.64 -> DA N6 C0021 : score 1.486 : H : GLN NE2 A0414 <- 3.00 -> DT O4 B0003 : score 4.98338 : x : LEU xxxx A0398 <- 4.42 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0408 <- 3.94 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0411 <- 3.79 -> DC xxx B0002 : score x.xxxxx >1kx3_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=X-RAY STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE, NCP146, AT 2.0 A RESOLUTION organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.56 -> DA N3 J0009 : score 3.39525 : H : ARG NH1 A0083 <- 3.19 -> DA N3 J0025 : score 3.39485 : H : ARG NH2 A0083 <- 2.91 -> DC O2 I-023 : score 3.61735 : w : ARG NH1 C0077 <- 5.34 -> DG N3 J0057 : score 1.593 : w : ARG NH2 C0077 <- 5.79 -> DG N3 J0057 : score 0.677 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.61 -> DA N3 I0009 : score 3.36285 : w : ARG NH2 E0040 <- 6.16 -> DA N3 I0010 : score 2.092 : w : ARG NH1 G0077 <- 5.79 -> DG N3 I0058 : score 1.593 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.48 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.65 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.14 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.38 -> DG xxx J0047 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.95 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.76 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0032 <- 4.35 -> DT xxx J-012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.05 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.47 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >1kx3_C:Histone-fold; title=X-RAY STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE, NCP146, AT 2.0 A RESOLUTION organism=XENOPUS LAEVIS : w : ARG NH1 C0077 <- 5.34 -> DG N3 J0057 : score 1.593 : w : ARG NH2 C0077 <- 5.79 -> DG N3 J0057 : score 0.677 >1kx4_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=X-RAY STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE, NCP146B, AT 2.6 A RESOLUTION organism=XENOPUS LAEVIS : w : ARG NH2 E0040 <- 5.61 -> DT O2 J-009 : score 2.261 : w : ARG NH1 G0077 <- 6.55 -> DG N3 J-056 : score 1.593 : w : ARG NH2 G0077 <- 6.44 -> DG N3 J-056 : score 0.677 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.17 -> DA xxx J0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.73 -> DC xxx J-068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.08 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 4.16 -> DT xxx J0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.25 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0026 <- 3.44 -> DG xxx J-028 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.36 -> DC xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.05 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.08 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.13 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.01 -> DC xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.07 -> DA xxx J-047 : score x.xxxxx >1kx4_G:Histone-fold; title=X-RAY STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE, NCP146B, AT 2.6 A RESOLUTION organism=? : w : ARG NH1 G0077 <- 6.55 -> DG N3 J-056 : score 1.593 : w : ARG NH2 G0077 <- 6.44 -> DG N3 J-056 : score 0.677 : x : ARG xxxx G0042 <- 4.01 -> DC xxx I0038 : score x.xxxxx >1kx5_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=X-RAY STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE, NCP147, AT 1.9 A RESOLUTION organism=XENOPUS LAEVIS : w : HIS NE2 A0039 <- 5.25 -> DA N3 J-069 : score 2.619 : H : ARG NH2 A0040 <- 2.98 -> DA N3 J0009 : score 3.12311 : w : ARG NH1 A0040 <- 6.05 -> DA N3 J0010 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0040 <- 6.67 -> DG N2 J0008 : score 1.593 : w : TYR OH A0041 <- 5.56 -> DT O2 I0069 : score 3.068 : w : TYR OH A0041 <- 5.73 -> DA N3 J-069 : score 1.448 : w : ARG NH1 A0083 <- 5.01 -> DC O2 I-024 : score 1.381 : w : ARG NH1 A0083 <- 5.66 -> DA N3 J0026 : score 2.585 : w : ARG NH1 A0083 <- 6.28 -> DG N3 J0025 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0083 <- 5.21 -> DC O2 I-024 : score 1.669 : w : ARG NH2 A0083 <- 6.15 -> DG N3 J0025 : score 0.677 : w : ARG NH2 B0017 <- 6.02 -> DC N4 J0016 : score 0.976 : w : ARG NH2 B0045 <- 5.74 -> DC O2 I-005 : score 1.669 : w : ARG NH2 B0045 <- 5.52 -> DC O2 J0006 : score 1.669 : w : ARG NH2 C0042 <- 5.25 -> DT O2 I-036 : score 2.261 : w : ARG NH1 C0077 <- 5.61 -> DG N3 J0058 : score 1.593 : w : ARG NH2 C0077 <- 6.16 -> DG N2 I-056 : score 1.593 : w : LYS NZ D0009 <- 6.35 -> DA N7 I-046 : score 1.655 : H : LYS NZ D0024 <- 2.42 -> DT O2 J0050 : score 3.85981 : w : ARG NH2 D0027 <- 5.35 -> DG N3 J0049 : score 0.677 : H : ARG NH2 D0030 <- 2.92 -> DG N3 J0048 : score 3.52361 : w : ARG NH2 D0030 <- 6.24 -> DG N3 J0049 : score 0.677 : w : HIS NE2 E0039 <- 5.20 -> DT O2 J0070 : score 3.682 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.97 -> DA N3 I0009 : score 3.12959 : w : ARG NH1 E0040 <- 5.99 -> DA N3 I0010 : score 2.585 : w : ARG NH2 E0040 <- 5.84 -> DG N2 I0008 : score 1.593 : w : TYR OH E0041 <- 5.65 -> DT O2 I-068 : score 3.068 : w : ARG NH1 E0083 <- 6.36 -> DC O2 J-024 : score 1.381 : w : ARG NH2 E0083 <- 5.65 -> DA N3 I0026 : score 2.092 : w : ARG NH2 E0083 <- 5.95 -> DC O2 J-024 : score 1.669 : w : SER OG F0001 <- 6.64 -> DG O6 I0025 : score 2.749 : w : ARG NH2 F0045 <- 5.43 -> DC O2 I0006 : score 1.669 : H : LYS NZ G0013 <- 2.34 -> DT O2 I0045 : score 3.9172 : w : LYS NZ G0013 <- 5.68 -> DT O2 I0046 : score 0.522 : w : ARG NH2 G0042 <- 5.77 -> DA N3 I0038 : score 2.092 : w : ARG NH1 G0077 <- 5.50 -> DG N3 I0058 : score 1.593 : w : ARG NH2 G0077 <- 5.63 -> DT O2 I0057 : score 2.261 : H : ARG NH1 H0030 <- 3.25 -> DG N3 I0048 : score 2.77783 : x : LEU xxxx A0065 <- 4.14 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0128 <- 3.30 -> DG xxx J-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0026 <- 3.16 -> DG xxx J-028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.90 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0032 <- 4.32 -> DT xxx J-012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0005 <- 4.08 -> DT xxx J-040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0027 <- 3.40 -> DG xxx I-028 : score x.xxxxx >1kx5_G:Histone-fold; title=X-RAY STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE, NCP147, AT 1.9 A RESOLUTION organism=XENOPUS LAEVIS : H : LYS NZ G0013 <- 2.34 -> DT O2 I0045 : score 3.9172 : w : LYS NZ G0013 <- 5.68 -> DT O2 I0046 : score 0.522 : w : ARG NH2 G0042 <- 5.69 -> DT O2 J-037 : score 2.261 : w : ARG NH1 G0077 <- 5.50 -> DG N3 I0058 : score 1.593 : w : ARG NH2 G0077 <- 5.63 -> DT O2 I0057 : score 2.261 : x : LYS xxxx G0005 <- 4.08 -> DT xxx J-040 : score x.xxxxx >1l1m_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=SOLUTION STRUCTURE OF A DIMER OF LAC REPRESSOR DNA-BINDING DOMAIN COMPLEXED TO ITS NATURAL OPERATOR O1 organism=ESCHERICHIA COLI : H : TYR OH A0007 <- 2.82 -> DC N4 D0014 : score 4.19725 : H : TYR OH A0017 <- 2.70 -> DG N7 C0008 : score 4.37292 : H : TYR OH A0017 <- 2.90 -> DG O6 C0008 : score 3.56067 : H : TYR OH A0017 <- 2.81 -> DA N6 C0009 : score 4.66117 : H : GLN OE1 A0018 <- 2.64 -> DC N4 D0016 : score 4.73 : H : GLN OE1 A0018 <- 2.79 -> DA N6 D0017 : score 6.06467 : H : TYR OH B0017 <- 2.48 -> DA N7 C0014 : score 4.41696 : H : TYR OH B0017 <- 2.57 -> DT O4 C0015 : score 3.66368 : H : GLN OE1 B0018 <- 2.72 -> DA N6 C0016 : score 6.14941 : x : LEU xxxx A0006 <- 3.49 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0016 <- 3.38 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0021 <- 3.62 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0022 <- 3.49 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0029 <- 3.08 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0053 <- 3.59 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0056 <- 3.15 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 2.80 -> DC xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0007 <- 3.86 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0016 <- 3.34 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0021 <- 3.50 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0022 <- 3.17 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0029 <- 3.14 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0053 <- 4.02 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0056 <- 2.96 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0057 <- 3.06 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >1l1m_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=SOLUTION STRUCTURE OF A DIMER OF LAC REPRESSOR DNA-BINDING DOMAIN COMPLEXED TO ITS NATURAL OPERATOR O1 organism=ESCHERICHIA COLI : H : TYR OH B0017 <- 2.48 -> DA N7 C0014 : score 4.41696 : H : TYR OH B0017 <- 2.57 -> DT O4 C0015 : score 3.66368 : H : GLN OE1 B0018 <- 2.72 -> DA N6 C0016 : score 6.14941 : x : TYR xxxx B0007 <- 3.86 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0016 <- 3.34 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0021 <- 3.50 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0022 <- 3.17 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0029 <- 3.14 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0053 <- 4.02 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0056 <- 2.96 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0057 <- 3.06 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >1l1t_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM (FPG) BOUND TO ABASIC-SITE CONTAINING DNA organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : ARG NH1 A0076 <- 3.26 -> DG N3 C0019 : score 2.77173 : w : ARG NH1 A0076 <- 5.35 -> DT O2 C0020 : score 1.855 : w : GLU OE1 A0078 <- 6.18 -> DT O2 B0008 : score 2.462 : w : GLU OE1 A0078 <- 6.25 -> DA N3 C0017 : score 0.995 : H : ARG NE A0112 <- 2.84 -> DC O2 B0007 : score 2.6377 : H : ARG NH1 A0112 <- 3.02 -> DC N3 B0007 : score 1.46954 : w : ARG NH2 A0112 <- 6.36 -> DA N3 C0017 : score 2.092 : x : MET xxxx A0077 <- 3.60 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.47 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 4.08 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx >1l1z_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM (FPG) COVALENT-DNA INTERMEDIATE organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : w : GLU OE2 A0078 <- 5.84 -> DT O2 B0008 : score 2.279 : H : ARG NE A0112 <- 2.93 -> DC O2 B0007 : score 2.58984 : H : ARG NH1 A0112 <- 3.16 -> DC N3 B0007 : score 1.4265 : w : ARG NH2 A0112 <- 6.35 -> DA N3 C0017 : score 2.092 : w : ARG NH2 A0112 <- 6.37 -> DG O6 C0019 : score 2.468 : x : ARG xxxx A0076 <- 3.32 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0077 <- 3.55 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.46 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 4.18 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx >1l2b_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM (FPG) DNA END-PRODUCT STRUCTURE organism=? : x : ARG xxxx A0076 <- 3.51 -> DG xxx D0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0077 <- 3.67 -> DG xxx D0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0112 <- 4.26 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.36 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 3.75 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx >1l2c_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM (FPG)-DNA ESTRANGED THYMINE MISMATCH RECOGNITION COMPLEX organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : w : ARG NH1 A0076 <- 5.92 -> DG N2 C0019 : score 1.082 : w : GLU OE2 A0078 <- 5.67 -> DT O2 B0008 : score 2.279 : H : ARG NE A0112 <- 3.18 -> DT O2 B0007 : score 2.38108 : x : MET xxxx A0077 <- 3.66 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0111 <- 4.47 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.43 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 4.13 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx >1l2d_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM (FPG)-DNA ESTRANGED GUANINE MISMATCH RECOGNITION COMPLEX organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : ARG NE A0112 <- 3.14 -> DG N7 B0007 : score 4.12111 : H : ARG NH1 A0112 <- 3.06 -> DG O6 B0007 : score 5.767 : w : ARG NH2 A0112 <- 5.80 -> DA N3 C0017 : score 2.092 : x : ARG xxxx A0076 <- 3.10 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0077 <- 3.52 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.43 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 4.22 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx >1l3l_A:Pheromone-binding_domain_of_LuxR-like_quorum-sensing_transcription_factors;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A BACTERIAL QUORUM-SENSING TRANSCRIPTION FACTOR COMPLEXED WITH PHEROMONE AND DNA organism=Agrobacterium tumefaciens : w : TYR OH A0202 <- 5.64 -> DT O4 F0113 : score 2.914 : H : ARG NH1 A0206 <- 2.90 -> DG O6 H0106 : score 5.96167 : H : ARG NH2 A0206 <- 2.94 -> DG N7 H0106 : score 6.20585 : w : ARG NH1 A0206 <- 5.35 -> DG O6 F0114 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0210 <- 3.21 -> DT O4 H0105 : score 2.99998 : H : ARG NH2 A0210 <- 2.80 -> DT O4 H0105 : score 3.55385 : w : ARG NH1 A0210 <- 5.35 -> DG O6 F0114 : score 2.756 : V : VAL CG2 A0207 <- 3.63 -> DT C7 H0105 : score 6.38331 : x : MET xxxx A0191 <- 3.92 -> DT xxx F0113 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0203 <- 4.03 -> DT xxx H0105 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0211 <- 3.80 -> DT xxx H0103 : score x.xxxxx >1l3l_AC:Pheromone-binding_domain_of_LuxR-like_quorum-sensing_transcription_factors;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A BACTERIAL QUORUM-SENSING TRANSCRIPTION FACTOR COMPLEXED WITH PHEROMONE AND DNA organism=Agrobacterium tumefaciens : w : TYR OH A0202 <- 5.64 -> DT O4 F0113 : score 2.914 : H : ARG NH1 A0206 <- 2.90 -> DG O6 H0106 : score 5.96167 : H : ARG NH2 A0206 <- 2.94 -> DG N7 H0106 : score 6.20585 : w : ARG NH1 A0206 <- 5.35 -> DG O6 F0114 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0210 <- 3.21 -> DT O4 H0105 : score 2.99998 : H : ARG NH2 A0210 <- 2.80 -> DT O4 H0105 : score 3.55385 : w : ARG NH1 A0210 <- 5.35 -> DG O6 F0114 : score 2.756 : w : TYR OH C0202 <- 5.94 -> DC N4 F0107 : score 1.343 : H : ARG NH1 C0206 <- 2.90 -> DG O6 F0106 : score 5.96167 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.92 -> DG N7 F0106 : score 6.23138 : w : ARG NH1 C0206 <- 5.33 -> DG O6 H0114 : score 2.756 : H : ARG NH1 C0210 <- 3.15 -> DT O4 F0105 : score 3.03919 : H : ARG NH2 C0210 <- 2.96 -> DT O4 F0105 : score 3.44012 : w : ARG NH1 C0210 <- 5.58 -> DG O6 H0114 : score 2.756 : w : ARG NH2 C0210 <- 5.74 -> DG N7 F0104 : score 2.18 : V : VAL CG2 A0207 <- 3.63 -> DT C7 H0105 : score 6.38331 : V : VAL CG2 C0207 <- 3.69 -> DT C7 F0105 : score 6.29146 : x : MET xxxx A0191 <- 3.92 -> DT xxx F0113 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0203 <- 4.03 -> DT xxx H0105 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0211 <- 3.80 -> DT xxx H0103 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0191 <- 3.98 -> DT xxx H0113 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0203 <- 4.16 -> DT xxx F0105 : score x.xxxxx >1l3l_BD:Pheromone-binding_domain_of_LuxR-like_quorum-sensing_transcription_factors;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A BACTERIAL QUORUM-SENSING TRANSCRIPTION FACTOR COMPLEXED WITH PHEROMONE AND DNA organism=Agrobacterium tumefaciens : w : TYR OH B0202 <- 5.78 -> DT O4 E0013 : score 2.914 : H : ARG NH1 B0206 <- 2.97 -> DG O6 G0006 : score 5.8765 : H : ARG NH2 B0206 <- 3.03 -> DG N7 G0006 : score 6.09092 : w : ARG NH1 B0206 <- 5.43 -> DG O6 E0014 : score 2.756 : H : ARG NH1 B0210 <- 3.24 -> DT O4 G0005 : score 2.98037 : H : ARG NH2 B0210 <- 2.87 -> DT O4 G0005 : score 3.50409 : w : ARG NH1 B0210 <- 5.47 -> DG O6 E0014 : score 2.756 : w : TYR OH D0202 <- 5.78 -> DT O4 G0013 : score 2.914 : H : ARG NH1 D0206 <- 2.85 -> DG O6 E0006 : score 6.0225 : H : ARG NH2 D0206 <- 3.04 -> DG N7 E0006 : score 6.07815 : w : ARG NH1 D0206 <- 5.41 -> DG O6 G0014 : score 2.756 : H : ARG NH1 D0210 <- 3.15 -> DT O4 E0005 : score 3.03919 : H : ARG NH2 D0210 <- 2.84 -> DT O4 E0005 : score 3.52542 : w : ARG NH1 D0210 <- 5.48 -> DG O6 G0014 : score 2.756 : w : ARG NH2 D0210 <- 6.30 -> DG O6 E0004 : score 2.468 : V : VAL CG2 D0207 <- 3.61 -> DT C7 E0005 : score 6.41392 : V : VAL CG2 B0207 <- 3.51 -> DT C7 G0005 : score 6.567 : x : MET xxxx B0191 <- 4.01 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0203 <- 4.04 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0211 <- 3.93 -> DT xxx G0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0191 <- 3.97 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0203 <- 4.13 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx >1l3s_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS DNA POLYMERASE I FRAGMENT COMPLEXED TO 9 BASE PAIRS OF DUPLEX DNA. organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.80 -> DC O2 B0026 : score 2.94615 : w : LYS NZ A0582 <- 5.60 -> DA N3 C0010 : score 1.538 : w : LYS NZ A0582 <- 5.82 -> DT O2 B0025 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 5.55 -> DA N3 C0010 : score 2.845 : w : TYR OH A0587 <- 5.89 -> DG N2 C0009 : score 2.834 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.99 -> DG N3 B0029 : score 2.93657 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.25 -> DG N3 B0029 : score 3.28533 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.73 -> DG N3 C0007 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.69 -> DT O2 C0008 : score 1.666 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.13 -> DA N3 B0027 : score 3.55638 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.56 -> DG N3 C0009 : score 2.566 : H : ARG NH2 A0629 <- 2.92 -> DG N7 B0029 : score 6.23138 : w : GLU OE1 A0658 <- 6.19 -> DC O2 C0006 : score 2.68 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.41 -> DC O2 C0006 : score 1.885 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.32 -> DC O2 C0006 : score 2.699 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.57 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0714 <- 3.29 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >1l3t_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS DNA POLYMERASE I FRAGMENT PRODUCT COMPLEX WITH 10 BASE PAIRS OF DUPLEX DNA FOLLOWING ADDITION OF A SINGLE DTTP RESIDUE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 3.00 -> DA N3 B0026 : score 2.66585 : w : LYS NZ A0582 <- 5.95 -> DG N2 C0008 : score 0.846 : w : LYS NZ A0582 <- 5.99 -> DC O2 B0027 : score 1.3 : w : THR OG1 A0586 <- 6.33 -> DG N2 C0008 : score 2.036 : w : TYR OH A0587 <- 6.39 -> DC O2 B0027 : score 1.343 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.78 -> DT O2 B0029 : score 4.32364 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.03 -> DT O2 B0029 : score 4.0386 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.78 -> DC O2 C0005 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.79 -> DG N3 C0006 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.14 -> DC O2 B0027 : score 4.17488 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.94 -> DT O2 C0007 : score 1.666 : w : GLU OE1 A0658 <- 6.01 -> DA N3 C0004 : score 0.995 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.28 -> DA N3 C0004 : score 2.277 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.26 -> DA N3 C0004 : score 1.888 : x : TYR xxxx A0714 <- 3.38 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.05 -> DG xxx B0028 : score x.xxxxx >1l3u_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS DNA POLYMERASE I FRAGMENT PRODUCT COMPLEX WITH 11 BASE PAIRS OF DUPLEX DNA FOLLOWING ADDITION OF A DTTP AND A DATP RESIDUE. organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.71 -> DC O2 B0026 : score 2.99918 : w : LYS NZ A0582 <- 5.70 -> DA N3 B0025 : score 1.538 : w : LYS NZ A0582 <- 5.50 -> DT O2 C0008 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 5.39 -> DT O2 C0008 : score 2.522 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.93 -> DA N3 B0029 : score 3.58632 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.81 -> DA N3 C0005 : score 2.585 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.77 -> DC O2 C0006 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.05 -> DG N3 B0027 : score 4.65013 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.51 -> DG N3 C0007 : score 2.566 : H : ARG NH2 A0629 <- 2.94 -> DA N7 B0029 : score 1.62498 : w : GLU OE1 A0658 <- 6.10 -> DT O2 C0004 : score 2.462 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.43 -> DT O2 C0004 : score 1.666 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.46 -> DT O2 C0004 : score 1.565 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.59 -> DT O2 B0028 : score 3.682 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.36 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.35 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx >1l3v_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS DNA POLYMERASE I FRAGMENT PRODUCT COMPLEX WITH 15 BASE PAIRS OF DUPLEX DNA FOLLOWING ADDITION OF DTTP, DATP, DCTP, AND DGTP RESIDUES. organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.81 -> DC O2 B0031 : score 2.94026 : w : LYS NZ A0582 <- 5.81 -> DA N3 B0030 : score 1.538 : w : LYS NZ A0582 <- 5.58 -> DT O2 C0008 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 5.38 -> DT O2 C0008 : score 2.522 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.80 -> DC O2 B0034 : score 3.65 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.10 -> DC O2 B0034 : score 3.47679 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.78 -> DA N3 C0005 : score 2.585 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.72 -> DC O2 C0006 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.07 -> DG N3 B0032 : score 4.63055 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.67 -> DG N3 C0007 : score 2.566 : w : GLU OE1 A0658 <- 6.04 -> DG N3 C0004 : score 2.669 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.48 -> DG N3 C0004 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.30 -> DG N3 C0004 : score 1.484 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.48 -> DT O2 B0033 : score 3.682 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.38 -> DG xxx B0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.46 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1l5u_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS DNA POLYMERASE I FRAGMENT PRODUCT COMPLEX WITH 12 BASE PAIRS OF DUPLEX DNA FOLLOWING ADDITION OF A DTTP, A DATP, AND A DCTP RESIDUE. organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.90 -> DG N3 B0026 : score 1.42477 : w : LYS NZ A0582 <- 5.69 -> DG N3 C0008 : score 2.232 : w : THR OG1 A0586 <- 5.57 -> DG N3 C0008 : score 2.036 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.82 -> DC O2 B0029 : score 3.6354 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.14 -> DC O2 B0029 : score 3.44721 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.68 -> DT O2 C0005 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.78 -> DA N3 C0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.03 -> DT O2 B0027 : score 4.52783 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.80 -> DC O2 C0007 : score 1.885 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.68 -> DA N3 B0028 : score 2.619 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.39 -> DT xxx B0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.40 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.45 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1lat_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR MUTANT/DNA COMPLEX organism=Rattus norvegicus : w : GLU OE1 A0458 <- 5.28 -> DT O4 D0014 : score 2.749 : H : LYS NZ A0461 <- 3.11 -> DG N7 C0006 : score 5.05197 : H : LYS NZ A0461 <- 2.97 -> DG O6 C0006 : score 5.58422 : w : LYS NZ A0461 <- 6.20 -> DA N6 C0005 : score 2.097 : H : ARG NH1 A0466 <- 2.92 -> DG N7 D0012 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.63 -> DG O6 D0012 : score 6.8244 : V : ALA CB A0462 <- 3.71 -> DT C7 D0013 : score 5.72495 >1lat_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR MUTANT/DNA COMPLEX organism=Rattus norvegicus : w : GLU OE1 A0458 <- 5.28 -> DT O4 D0014 : score 2.749 : H : LYS NZ A0461 <- 3.11 -> DG N7 C0006 : score 5.05197 : H : LYS NZ A0461 <- 2.97 -> DG O6 C0006 : score 5.58422 : w : LYS NZ A0461 <- 6.20 -> DA N6 C0005 : score 2.097 : H : ARG NH1 A0466 <- 2.92 -> DG N7 D0012 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.63 -> DG O6 D0012 : score 6.8244 : w : GLU OE1 B0458 <- 5.50 -> DT O4 C0014 : score 2.749 : w : GLU OE2 B0458 <- 6.02 -> DA N6 D0005 : score 2.785 : H : LYS NZ B0461 <- 3.13 -> DG N7 D0006 : score 5.03043 : H : LYS NZ B0461 <- 3.14 -> DG O6 D0006 : score 5.38768 : w : LYS NZ B0461 <- 5.99 -> DT O4 C0014 : score 1.7 : H : ARG NH1 B0466 <- 3.12 -> DG N7 C0012 : score 5.6628 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.97 -> DG O6 C0012 : score 6.3756 : V : ALA CB A0462 <- 3.71 -> DT C7 D0013 : score 5.72495 : x : ALA xxxx B0462 <- 3.95 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0510 <- 3.14 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx >1lb2_ABE:C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE E. COLI ALPHA C-TERMINAL DOMAIN OF RNA POLYMERASE IN COMPLEX WITH CAP AND DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 A0180 <- 3.02 -> DG N7 K0018 : score 6.10369 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.55 -> DG O6 K0018 : score 6.93 : H : ARG NH1 A0185 <- 3.01 -> DT O4 J0015 : score 3.13069 : H : ARG NH2 A0185 <- 3.15 -> DT O4 J0015 : score 3.30508 : H : ARG NH2 A0185 <- 2.90 -> DG N7 K0016 : score 6.25692 : H : ARG NH2 A0185 <- 3.10 -> DG O6 K0016 : score 6.204 : w : ARG NH1 B0265 <- 6.69 -> DA N3 J0031 : score 2.585 : w : ARG NH2 B0265 <- 6.74 -> DA N3 J0031 : score 2.092 : V : GLU CB A0181 <- 3.55 -> DT C7 J0015 : score 1.72942 : x : GLN xxxx A0170 <- 4.23 -> DA xxx K0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0179 <- 4.04 -> DT xxx J0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0182 <- 4.40 -> DA xxx J0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0265 <- 4.08 -> DA xxx J0029 : score x.xxxxx >1lb2_B:C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit; title=STRUCTURE OF THE E. COLI ALPHA C-TERMINAL DOMAIN OF RNA POLYMERASE IN COMPLEX WITH CAP AND DNA organism=ESCHERICHIA COLI : w : ARG NH1 B0265 <- 6.69 -> DA N3 J0031 : score 2.585 : w : ARG NH2 B0265 <- 6.74 -> DA N3 J0031 : score 2.092 >1lcc_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF THE COMPLEX OF LAC REPRESSOR HEADPIECE AND AN 11 BASE- PAIR HALF-OPERATOR DETERMINED BY NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY AND RESTRAINED MOLECULAR DYNAMICS organism=ESCHERICHIA COLI : w : TYR OH A0007 <- 6.24 -> DC N4 C0003 : score 1.343 : w : TYR OH A0017 <- 6.15 -> DA N6 B0008 : score 2.545 : H : GLN OE1 A0018 <- 2.73 -> DC N4 C0005 : score 4.6475 : H : GLN NE2 A0018 <- 3.06 -> DT O4 B0006 : score 4.92109 : H : ARG NH1 A0022 <- 2.95 -> DG O6 B0005 : score 5.90083 : w : ASN ND2 A0050 <- 6.48 -> DG N3 C0002 : score 2.566 : V : TYR CZ A0017 <- 3.90 -> DT C7 C0004 : score 5.44 : x : THR xxxx A0019 <- 4.49 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0021 <- 3.19 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0026 <- 3.26 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0029 <- 3.40 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx >1lcd_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF THE COMPLEX OF LAC REPRESSOR HEADPIECE AND AN 11 BASE- PAIR HALF-OPERATOR DETERMINED BY NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY AND RESTRAINED MOLECULAR DYNAMICS organism=ESCHERICHIA COLI : w : TYR OH A0017 <- 5.73 -> DG O6 B0007 : score 3.344 : H : GLN OE1 A0018 <- 2.70 -> DC N4 C0005 : score 4.675 : H : ARG NH1 A0022 <- 3.32 -> DG O6 B0005 : score 5.45067 : H : ARG NH2 A0022 <- 2.99 -> DA N7 C0006 : score 1.60827 : x : SER xxxx A0021 <- 3.34 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0026 <- 2.82 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0029 <- 3.70 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx >1le5_A:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A NF-KB HETERODIMER BOUND TO AN IFNB-KB organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0033 <- 2.83 -> DG N7 D0016 : score 6.0137 : H : ARG NH2 A0033 <- 2.99 -> DG O6 D0016 : score 6.3492 : H : GLU OE1 A0039 <- 2.80 -> DC N4 C0010 : score 5.76795 : H : ARG NH2 A0187 <- 2.57 -> DT O4 C0009 : score 3.71732 : x : ARG xxxx A0035 <- 3.28 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0036 <- 3.23 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0038 <- 3.84 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0043 <- 4.44 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx >1le5_AB:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A NF-KB HETERODIMER BOUND TO AN IFNB-KB organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0033 <- 2.83 -> DG N7 D0016 : score 6.0137 : H : ARG NH2 A0033 <- 2.99 -> DG O6 D0016 : score 6.3492 : H : GLU OE1 A0039 <- 2.80 -> DC N4 C0010 : score 5.76795 : H : ARG NH2 A0187 <- 2.57 -> DT O4 C0009 : score 3.71732 : H : ARG NH1 B0054 <- 2.80 -> DG O6 C0004 : score 6.08333 : H : ARG NH2 B0054 <- 2.32 -> DT O4 D0021 : score 3.89502 : H : HIS ND1 B0064 <- 2.70 -> DG O6 C0002 : score 6.34754 : V : TYR CZ B0057 <- 3.51 -> DT C7 D0020 : score 5.984 : x : ARG xxxx A0035 <- 3.28 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0036 <- 3.23 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0038 <- 3.84 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0043 <- 4.44 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0060 <- 3.32 -> DT xxx D0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0241 <- 3.47 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0243 <- 4.43 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0272 <- 4.38 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx >1le5_EF:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A NF-KB HETERODIMER BOUND TO AN IFNB-KB organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 E0033 <- 3.31 -> DG N7 H0016 : score 5.73338 : H : ARG NH2 E0033 <- 2.55 -> DG O6 H0016 : score 6.93 : H : ARG NH2 E0035 <- 3.05 -> DG N7 H0015 : score 6.06538 : H : ARG NH2 E0035 <- 2.71 -> DG O6 H0015 : score 6.7188 : H : GLU OE2 E0039 <- 3.24 -> DC N4 G0010 : score 4.80203 : H : ARG NH1 F0054 <- 3.26 -> DG N7 G0004 : score 5.4934 : H : ARG NH2 F0054 <- 2.47 -> DG O6 G0004 : score 7.0356 : H : ARG NH1 F0056 <- 2.49 -> DG O6 G0003 : score 6.4605 : H : ARG NH2 F0056 <- 2.53 -> DG N7 G0003 : score 6.72938 : H : GLU OE1 F0060 <- 2.83 -> DC N4 H0022 : score 5.73334 : H : HIS ND1 F0064 <- 2.99 -> DG N7 G0002 : score 5.9866 : H : HIS ND1 F0064 <- 2.66 -> DG O6 G0002 : score 6.39732 : V : ARG CZ E0187 <- 3.84 -> DT C7 G0009 : score 2.11098 : x : TYR xxxx E0036 <- 3.31 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx E0038 <- 4.46 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0246 <- 4.11 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0057 <- 3.10 -> DT xxx H0021 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx F0059 <- 3.79 -> DT xxx H0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0241 <- 3.31 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0272 <- 4.00 -> DT xxx H0019 : score x.xxxxx >1le8_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MATA1/MATALPHA2-3A HETERODIMER BOUND TO DNA COMPLEX organism=? : H : ASN OD1 A0120 <- 2.99 -> DA N6 D0026 : score 5.79297 : H : ASN ND2 A0120 <- 3.04 -> DA N7 D0026 : score 5.58873 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.86 -> DG N7 D0025 : score 6.308 : V : VAL CG2 A0116 <- 3.89 -> DT C7 D0027 : score 5.98531 : x : ARG xxxx A0115 <- 3.33 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0119 <- 3.26 -> DA xxx C0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0123 <- 3.40 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx >1le8_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MATA1/MATALPHA2-3A HETERODIMER BOUND TO DNA COMPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ASN OD1 A0120 <- 2.99 -> DA N6 D0026 : score 5.79297 : H : ASN ND2 A0120 <- 3.04 -> DA N7 D0026 : score 5.58873 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.86 -> DG N7 D0025 : score 6.308 : V : VAL CG2 A0116 <- 3.89 -> DT C7 D0027 : score 5.98531 : V : ALA CB B0182 <- 3.75 -> DT C7 D0037 : score 5.66896 : x : ARG xxxx A0115 <- 3.33 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0119 <- 3.26 -> DA xxx C0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0123 <- 3.40 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0134 <- 3.38 -> DT xxx D0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0135 <- 3.47 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0178 <- 3.11 -> DC xxx D0039 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0181 <- 4.19 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0185 <- 4.12 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >1le8_B:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MATA1/MATALPHA2-3A HETERODIMER BOUND TO DNA COMPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : V : ALA CB B0182 <- 3.75 -> DT C7 D0037 : score 5.66896 : x : HIS xxxx B0134 <- 3.38 -> DT xxx D0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0135 <- 3.47 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0178 <- 3.11 -> DC xxx D0039 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0181 <- 4.19 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0185 <- 4.12 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >1le9_A:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A NF-KB HETERODIMER BOUND TO THE IG/HIV-KB SITI organism=? : H : ARG NH2 A0033 <- 2.72 -> DG O6 D0716 : score 6.7056 : H : ARG NH1 A0035 <- 3.42 -> DG N7 D0715 : score 5.2998 : H : ARG NH2 A0035 <- 3.00 -> DG O6 D0715 : score 6.336 : H : GLU OE1 A0039 <- 3.24 -> DC N4 C0710 : score 5.26037 : x : TYR xxxx A0036 <- 3.59 -> DT xxx C0709 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0038 <- 4.37 -> DT xxx C0709 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0043 <- 4.50 -> DA xxx D0714 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0187 <- 2.77 -> DT xxx C0709 : score x.xxxxx >1le9_AB:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A NF-KB HETERODIMER BOUND TO THE IG/HIV-KB SITI organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 A0033 <- 2.72 -> DG O6 D0716 : score 6.7056 : H : ARG NH1 A0035 <- 3.42 -> DG N7 D0715 : score 5.2998 : H : ARG NH2 A0035 <- 3.00 -> DG O6 D0715 : score 6.336 : H : GLU OE1 A0039 <- 3.24 -> DC N4 C0710 : score 5.26037 : H : ARG NH2 B0054 <- 3.33 -> DG O6 C0704 : score 5.9004 : H : ARG NH1 B0056 <- 3.16 -> DG N7 C0703 : score 5.6144 : H : ARG NH1 B0056 <- 2.53 -> DG O6 C0703 : score 6.41183 : H : ARG NH2 B0056 <- 2.71 -> DG N7 C0703 : score 6.49954 : H : LYS NZ B0241 <- 2.65 -> DG N7 D0720 : score 5.54747 : x : TYR xxxx A0036 <- 3.59 -> DT xxx C0709 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0038 <- 4.37 -> DT xxx C0709 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0043 <- 4.50 -> DA xxx D0714 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0187 <- 2.77 -> DT xxx C0709 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0057 <- 3.37 -> DT xxx D0721 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0059 <- 4.33 -> DT xxx D0721 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0060 <- 3.43 -> DT xxx D0721 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0064 <- 3.54 -> DG xxx C0703 : score x.xxxxx >1le9_EF:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A NF-KB HETERODIMER BOUND TO THE IG/HIV-KB SITI organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 F0054 <- 2.60 -> DG O6 G0804 : score 6.32667 : V : ARG CZ E0187 <- 3.64 -> DT C7 G0808 : score 2.2176 : x : ARG xxxx E0033 <- 3.73 -> DG xxx H0815 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0035 <- 4.35 -> DG xxx H0815 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0036 <- 3.58 -> DT xxx G0809 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx E0038 <- 3.20 -> DT xxx G0809 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0039 <- 2.73 -> DT xxx G0809 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0056 <- 3.00 -> DC xxx H0822 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0057 <- 3.46 -> DG xxx H0820 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0060 <- 2.95 -> DC xxx H0822 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0064 <- 4.12 -> DC xxx H0823 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0241 <- 3.65 -> DA xxx H0819 : score x.xxxxx >1lei_AB:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=THE KB DNA SEQUENCE FROM THE HLV-LTR FUNCTIONS AS AN ALLOSTERIC REGULATOR OF HIV TRANSCRIPTION organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 A0035 <- 2.51 -> DG O6 D0004 : score 6.9828 : H : GLU OE2 A0039 <- 2.74 -> DA N6 C0013 : score 3.0879 : H : ARG NH2 B0054 <- 3.24 -> DG O6 C0007 : score 6.0192 : H : GLU OE1 B0060 <- 3.01 -> DC N4 D0011 : score 5.52569 : H : HIS ND1 B0064 <- 3.07 -> DG N7 C0005 : score 5.88703 : x : TYR xxxx A0036 <- 3.58 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0038 <- 3.54 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0187 <- 3.68 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0056 <- 3.25 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx >1lei_B:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=THE KB DNA SEQUENCE FROM THE HLV-LTR FUNCTIONS AS AN ALLOSTERIC REGULATOR OF HIV TRANSCRIPTION organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 B0054 <- 3.24 -> DG O6 C0007 : score 6.0192 : H : GLU OE1 B0060 <- 3.01 -> DC N4 D0011 : score 5.52569 : H : HIS ND1 B0064 <- 3.07 -> DG N7 C0005 : score 5.88703 : x : ARG xxxx B0056 <- 3.25 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx >1lfu_P:Homeodomain-like; title=NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE EXTENDED PBX HOMEODOMAIN BOUND TO DNA organism=MUS MUSCULUS : H : LYS NZ P0004 <- 2.50 -> DT O2 B0024 : score 3.80241 : H : LYS NZ P0004 <- 2.53 -> DT O2 A0006 : score 3.78089 : x : ARG xxxx P0003 <- 3.61 -> DA xxx A0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0005 <- 3.49 -> DT xxx A0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0047 <- 3.89 -> DT xxx A0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0051 <- 3.02 -> DA xxx A0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx P0054 <- 3.34 -> DA xxx B0019 : score x.xxxxx >1lli_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF A MUTANT PROTEIN WITH ALTERED BUT IMPROVED HYDROPHOBIC CORE PACKING organism=Enterobacteria phage lambda : H : LYS NZ A0004 <- 2.93 -> DG O6 E0014 : score 5.63047 : H : GLN OE1 A0044 <- 2.94 -> DA N6 D0004 : score 5.88309 : H : GLN NE2 A0044 <- 3.23 -> DA N7 D0004 : score 5.56603 : H : SER OG A0045 <- 2.81 -> DG N7 E0016 : score 4.47309 : H : SER OG A0045 <- 2.94 -> DG O6 E0016 : score 3.97648 : H : SER OG B0001 <- 2.81 -> DG O6 D0011 : score 4.08284 : H : LYS NZ B0003 <- 2.79 -> DG N7 D0011 : score 5.39667 : H : LYS NZ B0004 <- 2.98 -> DG O6 D0013 : score 5.57266 : H : LYS NZ B0004 <- 2.93 -> DG O6 D0014 : score 5.63047 : H : GLN OE1 B0044 <- 2.97 -> DA N6 E0004 : score 5.84678 : H : GLN NE2 B0044 <- 2.83 -> DA N7 E0004 : score 6.05321 : H : SER OG B0045 <- 2.94 -> DG N7 D0016 : score 4.35655 : H : SER OG B0045 <- 3.16 -> DG O6 D0016 : score 3.79647 : x : ASN xxxx A0055 <- 2.73 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0002 <- 4.46 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0054 <- 4.45 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0055 <- 2.97 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx >1lli_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF A MUTANT PROTEIN WITH ALTERED BUT IMPROVED HYDROPHOBIC CORE PACKING organism=Enterobacteria phage lambda : H : SER OG B0001 <- 2.81 -> DG O6 D0011 : score 4.08284 : H : LYS NZ B0003 <- 2.79 -> DG N7 D0011 : score 5.39667 : H : LYS NZ B0004 <- 2.98 -> DG O6 D0013 : score 5.57266 : H : LYS NZ B0004 <- 2.93 -> DG O6 D0014 : score 5.63047 : H : GLN OE1 B0044 <- 2.97 -> DA N6 E0004 : score 5.84678 : H : GLN NE2 B0044 <- 2.83 -> DA N7 E0004 : score 6.05321 : H : SER OG B0045 <- 2.94 -> DG N7 D0016 : score 4.35655 : H : SER OG B0045 <- 3.16 -> DG O6 D0016 : score 3.79647 : x : THR xxxx B0002 <- 4.46 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0054 <- 4.45 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0055 <- 2.97 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx >1llm_CD:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A ZIF23-GCN4 CHIMERA BOUND TO DNA organism=MUS MUSCULUS, SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 C0115 <- 2.63 -> DG O6 B0032 : score 6.29017 : H : ARG NH2 C0115 <- 2.48 -> DG N7 B0032 : score 6.79323 : H : HIS NE2 C0118 <- 2.95 -> DG N7 B0031 : score 6.59849 : H : ARG NH1 C0143 <- 2.93 -> DG N7 B0029 : score 5.8927 : H : ARG NH2 C0143 <- 2.74 -> DG O6 B0029 : score 6.6792 : H : ASP OD1 C0145 <- 2.96 -> DA N6 A0005 : score 3.37063 : w : ASP OD2 C0145 <- 6.03 -> DC N4 A0004 : score 3.623 : H : ARG NH1 D0215 <- 2.82 -> DG N7 A0012 : score 6.0258 : H : ARG NH2 D0215 <- 2.70 -> DG O6 A0012 : score 6.732 : H : ASP OD1 D0217 <- 2.81 -> DC N4 B0022 : score 5.33418 : w : ASP OD1 D0217 <- 5.93 -> DC N4 B0023 : score 2.835 : H : HIS NE2 D0218 <- 2.83 -> DG N7 A0011 : score 6.76175 : H : ARG NH1 D0243 <- 2.95 -> DG N7 A0009 : score 5.8685 : H : ARG NH2 D0243 <- 2.75 -> DG O6 A0009 : score 6.666 : H : ASP OD1 D0245 <- 3.02 -> DA N6 B0025 : score 3.32884 : H : ARG NH1 D0249 <- 3.03 -> DG O6 B0027 : score 5.8035 A : H : ARG NH2 D0249 <- 2.65 -> DG O6 A0007 : score 6.798 A : w : ARG NH2 D0249 <- 5.86 -> DG N7 A0007 : score 2.18 A : x : ASP xxxx C0117 <- 3.38 -> DC xxx A0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0121 <- 4.26 -> DT xxx B0030 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0146 <- 3.17 -> DC xxx B0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0149 <- 3.06 -> DC xxx B0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0221 <- 4.28 -> DT xxx A0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0246 <- 3.11 -> DC xxx A0008 : score x.xxxxx >1llm_D:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A ZIF23-GCN4 CHIMERA BOUND TO DNA organism=MUS MUSCULUS, SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 D0215 <- 2.82 -> DG N7 A0012 : score 6.0258 : H : ARG NH2 D0215 <- 2.70 -> DG O6 A0012 : score 6.732 : H : ASP OD1 D0217 <- 2.81 -> DC N4 B0022 : score 5.33418 : w : ASP OD1 D0217 <- 5.93 -> DC N4 B0023 : score 2.835 : H : HIS NE2 D0218 <- 2.83 -> DG N7 A0011 : score 6.76175 : H : ARG NH1 D0243 <- 2.95 -> DG N7 A0009 : score 5.8685 : H : ARG NH2 D0243 <- 2.75 -> DG O6 A0009 : score 6.666 : H : ASP OD1 D0245 <- 3.02 -> DA N6 B0025 : score 3.32884 : H : ARG NH1 D0249 <- 3.03 -> DG O6 B0027 : score 5.8035 A : H : ARG NH2 D0249 <- 2.65 -> DG O6 A0007 : score 6.798 A : w : ARG NH2 D0249 <- 5.86 -> DG N7 A0007 : score 2.18 A >1lmb_34:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=REFINED 1.8 ANGSTROM CRYSTAL STRUCTURE OF THE LAMBDA REPRESSOR- OPERATOR COMPLEX organism=ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA : H : GLN OE1 30044 <- 3.12 -> DA N6 10004 : score 5.6652 : H : GLN NE2 30044 <- 3.32 -> DA N7 10004 : score 5.45641 : w : GLN OE1 30044 <- 6.29 -> DG O6 20037 : score 2.87 : H : SER OG 30045 <- 2.60 -> DG O6 20036 : score 4.25467 : w : SER OG 30045 <- 6.03 -> DG O6 20037 : score 2.749 : H : LYS NZ 40003 <- 2.57 -> DG O6 10011 : score 6.04668 : H : LYS NZ 40003 <- 2.99 -> DG O6 20030 : score 5.5611 : H : LYS NZ 40004 <- 2.80 -> DG O6 10013 : score 5.78077 : H : LYS NZ 40004 <- 2.90 -> DG O6 10014 : score 5.66515 : H : GLN OE1 40044 <- 2.94 -> DA N6 20024 : score 5.88309 : H : GLN NE2 40044 <- 2.91 -> DA N7 20024 : score 5.95577 : H : SER OG 40045 <- 3.18 -> DG N7 10016 : score 4.14142 : H : SER OG 40045 <- 2.88 -> DG O6 10016 : score 4.02557 : H : ASN ND2 40055 <- 2.91 -> DG N7 10014 : score 4.48501 : x : GLU xxxx 30034 <- 4.22 -> DT xxx 10003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx 30055 <- 3.06 -> DG xxx 20034 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx 40034 <- 3.13 -> DT xxx 20023 : score x.xxxxx >1lmb_4:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=REFINED 1.8 ANGSTROM CRYSTAL STRUCTURE OF THE LAMBDA REPRESSOR- OPERATOR COMPLEX organism=? : H : LYS NZ 40003 <- 2.99 -> DG O6 20030 : score 5.5611 : H : LYS NZ 40003 <- 2.57 -> DG O6 10011 : score 6.04668 : H : LYS NZ 40004 <- 2.80 -> DG O6 10013 : score 5.78077 : H : LYS NZ 40004 <- 2.90 -> DG O6 10014 : score 5.66515 : H : GLN OE1 40044 <- 2.94 -> DA N6 20024 : score 5.88309 : H : GLN NE2 40044 <- 2.91 -> DA N7 20024 : score 5.95577 : H : SER OG 40045 <- 3.18 -> DG N7 10016 : score 4.14142 : H : SER OG 40045 <- 2.88 -> DG O6 10016 : score 4.02557 : H : ASN ND2 40055 <- 2.91 -> DG N7 10014 : score 4.48501 : x : GLU xxxx 40034 <- 3.13 -> DT xxx 20023 : score x.xxxxx >1lo1_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ESTROGEN RELATED RECEPTOR 2 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 A0121 <- 2.80 -> DC N4 C0019 : score 5.76795 : H : LYS NZ A0124 <- 2.91 -> DG O6 B0008 : score 5.65359 : H : ARG NH1 A0179 <- 2.82 -> DT O2 C0021 : score 4.28918 : H : ARG NH1 A0182 <- 2.84 -> DC O2 B0004 : score 3.6208 : x : HIS xxxx A0114 <- 3.64 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0122 <- 4.17 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0125 <- 4.38 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0128 <- 3.06 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0129 <- 3.73 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx >1lpq_A:Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_N-terminal_DNA-binding_fragment;DNA_breaking-rejoining_enzymes;Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_dispensable_insert_domain; title=HUMAN DNA TOPOISOMERASE I (70 KDA) IN NON-COVALENT COMPLEX WITH A 22 BASE PAIR DNA DUPLEX CONTAINING AN 8-OXOG LESION organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0532 <- 2.96 -> DT O2 B0010 : score 3.47239 : V : MET CE A0428 <- 3.58 -> DT C7 B0009 : score 7.31142 : x : ARG xxxx A0364 <- 3.45 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0426 <- 3.17 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0491 <- 3.78 -> DC xxx C0117 : score x.xxxxx >1lq1_AB:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=DNA COMPLEXED STRUCTURE OF THE KEY TRANSCRIPTION FACTOR INITIATING DEVELOPMENT IN SPORULATION BACTERIA organism=Bacillus subtilis : H : GLU OE2 A0213 <- 3.15 -> DC N4 H0123 : score 4.89681 : H : ARG NE A0214 <- 3.20 -> DG N7 G0006 : score 4.06805 : H : ARG NH2 A0214 <- 3.30 -> DG O6 G0006 : score 5.94 : H : ARG NH1 A0217 <- 3.05 -> DG N7 H0124 : score 5.7475 : H : ARG NH2 A0217 <- 3.02 -> DG O6 H0124 : score 6.3096 : H : ARG NE B0214 <- 3.12 -> DG N7 G0016 : score 4.1388 : H : ARG NH2 B0214 <- 3.27 -> DG O6 G0016 : score 5.9796 : x : THR xxxx A0194 <- 3.97 -> DT xxx H0121 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0210 <- 3.67 -> DC xxx G0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0218 <- 3.60 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0218 <- 3.30 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx >1lq1_D:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=DNA COMPLEXED STRUCTURE OF THE KEY TRANSCRIPTION FACTOR INITIATING DEVELOPMENT IN SPORULATION BACTERIA organism=Bacillus subtilis : w : SER OG D0210 <- 6.49 -> DC N4 E0008 : score 2.105 : w : GLU OE1 D0213 <- 6.17 -> DC N4 E0008 : score 3.528 : H : ARG NE D0214 <- 2.93 -> DG N7 E0006 : score 4.30683 : H : ARG NH2 D0214 <- 3.02 -> DG O6 E0006 : score 6.3096 : H : ARG NH1 D0217 <- 2.82 -> DG N7 F0124 : score 6.0258 : H : ARG NH2 D0217 <- 2.67 -> DG O6 F0124 : score 6.7716 : x : THR xxxx D0194 <- 4.16 -> DT xxx F0121 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0218 <- 3.57 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx >1lrr_A:Replication_modulator_SeqA,_C-terminal_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI SEQA COMPLEXED WITH HEMIMETHYLATED DNA organism=Escherichia coli : w : ARG NH1 A0116 <- 6.07 -> DC O2 B0004 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0116 <- 5.39 -> DC O2 B0004 : score 1.669 : H : ASN ND2 A0150 <- 2.93 -> DT O4 B0007 : score 5.14722 : H : ASN ND2 A0152 <- 2.96 -> DT O4 C0007 : score 5.11551 : V : GLN CG A0134 <- 3.56 -> DT C7 B0007 : score 3.45071 : x : ARG xxxx A0118 <- 2.84 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0155 <- 3.92 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx >1lv5_B:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE CLOSED CONFORMATION OF BACILLUS DNA POLYMERASE I FRAGMENT BOUND TO DNA AND DCTP organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ B0582 <- 3.10 -> DG N3 E0026 : score 1.36662 : H : ARG NH1 B0615 <- 2.77 -> DA N3 E0029 : score 3.70414 : H : ARG NH2 B0615 <- 3.15 -> DA N3 E0029 : score 3.01296 : H : ASN ND2 B0625 <- 2.48 -> DC O2 E0027 : score 4.76617 : w : GLU OE2 B0658 <- 6.09 -> DT O2 F0004 : score 2.279 : w : ASN ND2 B0793 <- 6.34 -> DT O2 F0004 : score 1.666 : w : GLN OE1 B0797 <- 5.70 -> DT O2 F0004 : score 2.481 : x : TYR xxxx B0587 <- 3.99 -> DC xxx E0027 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0829 <- 4.28 -> DG xxx E0028 : score x.xxxxx >1lws_A:Hedgehog/intein_Hint_domain;Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE INTEIN HOMING ENDONUCLEASE PI-SCEI BOUND TO ITS RECOGNITION SEQUENCE organism=Saccharomyces cerevisiae : H : GLN OE1 A0055 <- 3.06 -> DG N2 B0023 : score 5.31609 : H : ARG NH1 A0094 <- 3.22 -> DT O4 C0007 : score 2.99344 : H : HIS NE2 A0170 <- 3.08 -> DT O4 C0010 : score 5.29487 : H : GLU OE2 A0366 <- 3.06 -> DC N4 C0022 : score 4.99158 : H : HIS NE2 A0377 <- 3.01 -> DG O6 B0014 : score 7.61978 : V : HIS CG A0333 <- 3.71 -> DT C7 C0017 : score 3.06645 : V : THR CB A0375 <- 3.73 -> DT C7 B0013 : score 3.58786 : x : ARG xxxx A0057 <- 3.14 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0090 <- 2.81 -> DA xxx B0028 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0096 <- 4.44 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0103 <- 4.31 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0127 <- 3.61 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0129 <- 4.50 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0169 <- 3.96 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0220 <- 4.27 -> DC xxx C0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0223 <- 3.64 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0328 <- 3.10 -> DA xxx B0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0336 <- 4.31 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0340 <- 3.39 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0364 <- 3.87 -> DC xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0371 <- 4.40 -> DG xxx C0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0380 <- 4.41 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0384 <- 3.45 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx >1lwt_A:Hedgehog/intein_Hint_domain;Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE INTEIN HOMING ENDONUCLEASE PI-SCEI BOUND TO ITS SUBSTRATE DNA (CA2+ FREE) organism=Saccharomyces cerevisiae : H : GLN OE1 A0055 <- 3.08 -> DG N2 B0023 : score 5.29366 : H : ARG NH1 A0094 <- 3.21 -> DT O4 C0007 : score 2.99998 : H : ARG NH2 A0094 <- 2.36 -> DG O6 B0031 : score 7.1808 : H : HIS NE2 A0170 <- 3.04 -> DT O4 C0010 : score 5.33974 : H : ARG NH2 A0223 <- 2.89 -> DG O6 B0007 : score 6.4812 : H : ARG NH2 A0223 <- 3.20 -> DT O4 B0008 : score 3.26954 : H : LYS NZ A0340 <- 2.93 -> DG N7 B0016 : score 5.24586 : H : LYS NZ A0340 <- 2.98 -> DG O6 B0017 : score 5.57266 : H : GLU OE1 A0366 <- 3.00 -> DC N4 C0022 : score 5.53723 : H : HIS NE2 A0377 <- 3.17 -> DG O6 B0014 : score 7.36526 : x : ARG xxxx A0090 <- 3.00 -> DA xxx B0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0092 <- 4.19 -> DA xxx B0029 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0096 <- 4.00 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0097 <- 3.90 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0101 <- 3.98 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0103 <- 3.36 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0125 <- 4.38 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0127 <- 3.06 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0129 <- 4.29 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0169 <- 3.80 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0173 <- 4.41 -> DG xxx B0025 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0328 <- 3.96 -> DA xxx B0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0364 <- 3.20 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0369 <- 3.59 -> DC xxx C0023 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0371 <- 4.35 -> DG xxx C0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0373 <- 3.60 -> DC xxx C0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0375 <- 3.05 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0384 <- 3.90 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx >1lwv_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=BOROHYDRIDE-TRAPPED HOGG1 INTERMEDIATE STRUCTURE CO-CRYSTALLIZED WITH 8-AMINOGUANINE organism=Homo sapiens : w : SER OG A0148 <- 5.52 -> DG N3 E0024 : score 2.344 : w : ASN ND2 A0149 <- 6.40 -> DA N6 E0022 : score 2.5 : H : ARG NH1 A0154 <- 3.08 -> DC O2 D0008 : score 3.4456 : w : TYR OH A0203 <- 5.46 -> DG N3 E0024 : score 3.344 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.68 -> DC O2 D0008 : score 3.7376 : H : ARG NH2 A0204 <- 2.81 -> DC N3 D0008 : score 2.28644 : x : ASN xxxx A0150 <- 4.35 -> DA xxx E0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0151 <- 3.60 -> DA xxx E0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0293 <- 4.12 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx >1lww_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=BOROHYDRIDE-TRAPPED HOGG1 INTERMEDIATE STRUCTURE CO-CRYSTALLIZED WITH 8-BROMOGUANINE organism=Homo sapiens : w : SER OG A0148 <- 5.68 -> DG N3 E0024 : score 2.344 : H : ASN ND2 A0151 <- 3.22 -> DA N3 E0022 : score 3.48785 : H : ARG NH1 A0154 <- 3.17 -> DC O2 D0008 : score 3.3799 : H : ARG NH2 A0154 <- 2.84 -> DT O2 D0009 : score 4.19947 : w : TYR OH A0203 <- 5.53 -> DG N3 E0024 : score 3.344 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.76 -> DC O2 D0008 : score 3.6792 : H : ARG NH2 A0204 <- 2.91 -> DC N3 D0008 : score 2.24062 : x : ASN xxxx A0149 <- 2.86 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0150 <- 4.34 -> DA xxx E0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0207 <- 4.24 -> DT xxx E0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0293 <- 4.10 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx >1lwy_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=HOGG1 BOROHYDRIDE-TRAPPED INTERMEDIATE WITHOUT 8-OXOGUANINE organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 A0151 <- 3.28 -> DA N3 E0022 : score 3.44215 : H : ARG NH1 A0154 <- 3.15 -> DC O2 D0008 : score 3.3945 : H : TYR OH A0203 <- 3.29 -> DG N2 E0024 : score 4.41055 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.84 -> DC O2 D0008 : score 3.6208 : H : ARG NH2 A0204 <- 3.01 -> DC N3 D0008 : score 2.1948 : x : ASN xxxx A0149 <- 2.97 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0150 <- 4.23 -> DA xxx E0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0207 <- 4.18 -> DT xxx E0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0293 <- 4.02 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx >1m0e_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=ZEBULARINE: A NOVEL DNA METHYLATION INHIBITOR THAT FORMS A COVALENT COMPLEX WITH DNA METHYLTRANSFERASE organism=Haemophilus haemolyticus : H : ARG NH1 A0240 <- 2.87 -> DG N7 D0426 : score 5.9653 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.83 -> DG O6 D0426 : score 6.5604 : w : ARG NH2 A0240 <- 5.98 -> DC N4 C0409 : score 0.976 : w : LYS NZ A0261 <- 5.67 -> DT O4 C0405 : score 1.7 : V : ALA CB A0260 <- 3.52 -> DT C7 C0405 : score 5.9909 : x : ILE xxxx A0086 <- 3.45 -> DT xxx C0410 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.33 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0228 <- 4.41 -> DA xxx D0425 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0237 <- 3.28 -> DC xxx C0407 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0239 <- 4.31 -> DC xxx C0407 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0254 <- 4.39 -> DC xxx D0429 : score x.xxxxx >1m18_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=LIGAND BINDING ALTERS THE STRUCTURE AND DYNAMICS OF NUCLEOSOMAL DNA organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.68 -> DA N3 J0229 : score 3.3175 : H : ARG NH1 E0640 <- 3.28 -> DA N3 I0082 : score 3.32857 : x : HIS xxxx A0439 <- 4.46 -> DA xxx J0151 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0441 <- 4.47 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.65 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 3.36 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.18 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0842 <- 4.35 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 4.11 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 3.97 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.36 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0235 <- 4.10 -> DG xxx I0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0245 <- 4.31 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx >1m19_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=LIGAND BINDING ALTERS THE STRUCTURE AND DYNAMICS OF NUCLEOSOMAL DNA organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 3.06 -> DA N3 J0229 : score 3.07128 : w : ARG NH1 A0483 <- 5.55 -> DG N3 J0246 : score 1.593 : x : TYR xxxx A0441 <- 4.21 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 4.08 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.37 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0640 <- 3.29 -> DA xxx I0082 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0641 <- 4.29 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 4.14 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 3.78 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.42 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0245 <- 4.39 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G1042 <- 4.04 -> DT xxx J0184 : score x.xxxxx >1m19_G:Histone-fold; title=LIGAND BINDING ALTERS THE STRUCTURE AND DYNAMICS OF NUCLEOSOMAL DNA organism=? : x : ARG xxxx G1042 <- 4.04 -> DT xxx J0184 : score x.xxxxx >1m1a_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=LIGAND BINDING ALTERS THE STRUCTURE AND DYNAMICS OF NUCLEOSOMAL DNA organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.72 -> DA N3 J0228 : score 3.29158 : H : ARG NH2 E0640 <- 2.62 -> DA N3 I0083 : score 3.35637 : x : TYR xxxx A0441 <- 4.35 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.81 -> DT xxx J0237 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 3.55 -> DA xxx J0245 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0032 <- 4.21 -> DT xxx I0062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.97 -> DC xxx J0225 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 3.47 -> DT xxx I0092 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 3.33 -> DT xxx J0194 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0245 <- 4.07 -> DT xxx I0080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G1042 <- 3.14 -> DT xxx I0112 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H1436 <- 4.49 -> DT xxx I0123 : score x.xxxxx >1m1a_E:Histone-fold; title=LIGAND BINDING ALTERS THE STRUCTURE AND DYNAMICS OF NUCLEOSOMAL DNA organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 E0640 <- 2.62 -> DA N3 I0083 : score 3.35637 : x : LEU xxxx E0665 <- 3.47 -> DT xxx I0092 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 3.33 -> DT xxx J0194 : score x.xxxxx >1m3h_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HOGG1 D268E MUTANT WITH PRODUCT OLIGONUCLEOTIDE organism=Homo sapiens : x : ASN xxxx A0149 <- 3.53 -> DG xxx D0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0203 <- 3.37 -> DG xxx D0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0207 <- 4.42 -> DT xxx D0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0293 <- 4.34 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx >1m3q_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HOGG1 D268E MUTANT WITH BASE-EXCISED DNA AND 8- AMINOGUANINE organism=Homo sapiens : w : ASN OD1 A0151 <- 6.07 -> DG N3 B0010 : score 3.377 : H : ARG NH2 A0154 <- 2.69 -> DC O2 B0008 : score 3.78009 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.72 -> DC O2 B0008 : score 3.7084 : H : ARG NH2 A0204 <- 2.77 -> DC N3 B0008 : score 2.30477 : x : ASN xxxx A0149 <- 3.10 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0150 <- 4.39 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0203 <- 3.37 -> DG xxx C0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0207 <- 4.46 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0293 <- 4.40 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx >1m5x_A:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HOMING ENDONUCLEASE I-MSOI BOUND TO ITS DNA SUBSTRATE organism=Monomastix sp. : w : TYR OH A0026 <- 5.79 -> DC N4 C0517 : score 1.343 : H : LYS NZ A0028 <- 2.70 -> DA N7 C0518 : score 2.99592 : H : ARG NH2 A0032 <- 2.76 -> DG N7 D0553 : score 6.43569 : w : SER OG A0047 <- 5.70 -> DA N7 C0516 : score 2.343 : H : ARG NH1 A0072 <- 2.90 -> DG N7 D0558 : score 5.929 : H : ARG NH2 A0072 <- 2.89 -> DG O6 D0558 : score 6.4812 : H : ARG NH1 A0075 <- 2.92 -> DG N7 C0515 : score 5.9048 : H : ARG NH1 A0075 <- 3.05 -> DG O6 C0515 : score 5.77917 : H : ARG NH2 A0075 <- 2.74 -> DG O6 C0515 : score 6.6792 : w : ARG NH1 A0075 <- 6.14 -> DA N6 C0516 : score 1.486 : w : ASP OD1 A0077 <- 6.15 -> DA N6 C0514 : score 3.122 : w : ASP OD1 A0081 <- 5.90 -> DA N6 C0516 : score 3.122 : w : THR OG1 A0083 <- 5.72 -> DC N4 C0517 : score 2.558 : V : ASP CG A0077 <- 3.88 -> DT C7 D0559 : score 2.62942 : x : SER xxxx A0024 <- 4.12 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0034 <- 4.30 -> DG xxx D0552 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0035 <- 3.76 -> DG xxx D0553 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0041 <- 4.26 -> DA xxx D0554 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0049 <- 3.85 -> DG xxx C0515 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0079 <- 4.00 -> DA xxx C0514 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0085 <- 3.82 -> DA xxx D0555 : score x.xxxxx >1m5x_AB:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HOMING ENDONUCLEASE I-MSOI BOUND TO ITS DNA SUBSTRATE organism=Monomastix sp. : w : TYR OH A0026 <- 5.79 -> DC N4 C0517 : score 1.343 : H : LYS NZ A0028 <- 2.70 -> DA N7 C0518 : score 2.99592 : H : ARG NH2 A0032 <- 2.76 -> DG N7 D0553 : score 6.43569 : w : SER OG A0047 <- 5.70 -> DA N7 C0516 : score 2.343 : H : ARG NH1 A0072 <- 2.90 -> DG N7 D0558 : score 5.929 : H : ARG NH2 A0072 <- 2.89 -> DG O6 D0558 : score 6.4812 : H : ARG NH1 A0075 <- 2.92 -> DG N7 C0515 : score 5.9048 : H : ARG NH1 A0075 <- 3.05 -> DG O6 C0515 : score 5.77917 : H : ARG NH2 A0075 <- 2.74 -> DG O6 C0515 : score 6.6792 : w : ARG NH1 A0075 <- 6.14 -> DA N6 C0516 : score 1.486 : w : ASP OD1 A0077 <- 6.15 -> DA N6 C0514 : score 3.122 : w : ASP OD1 A0081 <- 5.90 -> DA N6 C0516 : score 3.122 : w : THR OG1 A0083 <- 5.72 -> DC N4 C0517 : score 2.558 : w : TYR OH B0226 <- 6.08 -> DC N4 D0567 : score 1.343 : H : LYS NZ B0228 <- 2.83 -> DG N7 D0568 : score 5.35358 : H : LYS NZ B0228 <- 2.75 -> DT O4 D0569 : score 3.62305 : H : ARG NH1 B0232 <- 2.80 -> DG O6 C0504 : score 6.08333 : H : ARG NH2 B0232 <- 2.86 -> DG N7 C0504 : score 6.308 : w : ARG NH1 B0232 <- 5.71 -> DA N6 C0503 : score 1.486 : H : ASP OD1 B0234 <- 2.57 -> DC N4 C0502 : score 5.59074 : w : ASP OD2 B0234 <- 5.90 -> DA N6 C0503 : score 3.409 : w : SER OG B0247 <- 5.74 -> DA N7 D0566 : score 2.343 : H : ARG NH1 B0272 <- 3.25 -> DG O6 C0508 : score 5.53583 : H : ARG NH2 B0272 <- 2.92 -> DG N7 C0508 : score 6.23138 : H : ARG NH1 B0275 <- 2.55 -> DG N7 D0565 : score 6.3525 : H : ARG NH2 B0275 <- 2.58 -> DG O6 D0565 : score 6.8904 : w : ARG NH1 B0275 <- 5.61 -> DA N6 D0566 : score 1.486 : w : ASP OD2 B0281 <- 5.83 -> DA N6 D0566 : score 3.409 : w : THR OG1 B0283 <- 6.18 -> DC N4 D0567 : score 2.558 : V : ASP CG B0277 <- 3.79 -> DT C7 C0509 : score 2.68978 : V : ASP CG A0077 <- 3.88 -> DT C7 D0559 : score 2.62942 : x : SER xxxx A0024 <- 4.12 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0034 <- 4.30 -> DG xxx D0552 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0035 <- 3.76 -> DG xxx D0553 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0041 <- 4.26 -> DA xxx D0554 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0049 <- 3.85 -> DG xxx C0515 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0079 <- 4.00 -> DA xxx C0514 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0085 <- 3.82 -> DA xxx D0555 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0224 <- 4.02 -> DA xxx D0566 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0230 <- 3.99 -> DT xxx D0570 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0235 <- 3.12 -> DA xxx C0503 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0249 <- 4.23 -> DG xxx D0565 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0279 <- 3.48 -> DC xxx D0564 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0285 <- 3.89 -> DA xxx C0505 : score x.xxxxx >1m6x_D:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=FLPE-HOLLIDAY JUNCTION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : LYS NZ D0082 <- 2.55 -> DG N7 J0021 : score 5.65519 : H : LYS NZ D0223 <- 2.94 -> DC O2 H0013 : score 2.86366 : H : ARG NE D0281 <- 2.56 -> DG O6 J0027 : score 4.1302 : H : ARG NH2 D0281 <- 2.83 -> DG N7 J0027 : score 6.34631 : H : LYS NZ D0285 <- 3.00 -> DG N7 H0004 : score 5.17046 : H : LYS NZ D0285 <- 3.19 -> DT O4 H0005 : score 3.30738 : x : ALA xxxx D0055 <- 3.77 -> DA xxx J0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0056 <- 3.70 -> DA xxx J0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0058 <- 3.45 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0059 <- 4.38 -> DA xxx J0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0060 <- 3.30 -> DG xxx J0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0062 <- 4.28 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0170 <- 2.80 -> DA xxx H0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0278 <- 3.46 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0282 <- 4.07 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0284 <- 4.32 -> DA xxx J0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0333 <- 4.17 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx >1ma7_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CRE SITE-SPECIFIC RECOMBINASE COMPLEXED WITH A MUTANT DNA SUBSTRATE, LOXP-A8/T27 organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ A0086 <- 3.14 -> DG N7 D0014 : score 5.01966 : H : GLN NE2 A0090 <- 3.00 -> DT O4 C0022 : score 4.98338 : w : ARG NE A0243 <- 6.07 -> DT O2 C0032 : score 0.757 : H : LYS NZ A0244 <- 2.32 -> DT O2 D0002 : score 3.93155 : H : LYS NZ A0244 <- 2.99 -> DT O2 C0034 : score 3.45087 : w : ARG NH2 A0282 <- 5.88 -> DT O2 C0024 : score 2.261 : V : ARG CB A0259 <- 3.67 -> DT C7 D0006 : score 1.03779 : V : HIS CG A0040 <- 3.81 -> DT C7 C0024 : score 2.99148 : x : THR xxxx A0041 <- 3.84 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0043 <- 4.39 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0044 <- 3.40 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.91 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.40 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 3.64 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 4.20 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.63 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0262 <- 3.85 -> DA xxx C0025 : score x.xxxxx >1ma7_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CRE SITE-SPECIFIC RECOMBINASE COMPLEXED WITH A MUTANT DNA SUBSTRATE, LOXP-A8/T27 organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ A0086 <- 3.14 -> DG N7 D0014 : score 5.01966 : H : GLN NE2 A0090 <- 3.00 -> DT O4 C0022 : score 4.98338 : w : ARG NE A0243 <- 6.07 -> DT O2 C0032 : score 0.757 : H : LYS NZ A0244 <- 2.32 -> DT O2 D0002 : score 3.93155 : H : LYS NZ A0244 <- 2.99 -> DT O2 C0034 : score 3.45087 : w : ARG NH2 A0282 <- 5.88 -> DT O2 C0024 : score 2.261 : H : LYS NZ B0086 <- 2.31 -> DA N7 C0014 : score 3.22502 : H : GLN NE2 B0090 <- 2.94 -> DT O4 D0022 : score 5.04568 : H : LYS NZ B0201 <- 2.52 -> DA N3 C0014 : score 2.93243 : w : ARG NH2 B0241 <- 5.58 -> DA N3 C0004 : score 2.092 : H : ARG NH1 B0243 <- 2.80 -> DT O2 D0032 : score 4.30641 : H : ARG NH2 B0243 <- 3.18 -> DT O2 D0032 : score 3.9116 : H : LYS NZ B0244 <- 2.69 -> DT O2 C0002 : score 3.6661 : w : ARG NE B0259 <- 6.10 -> DA N6 D0028 : score 1.081 : w : GLU OE1 B0262 <- 5.70 -> DC N4 D0026 : score 3.528 : V : ARG CB A0259 <- 3.67 -> DT C7 D0006 : score 1.03779 : V : HIS CG B0040 <- 3.87 -> DT C7 D0024 : score 2.94649 : V : ARG CB B0259 <- 3.82 -> DT C7 C0007 : score 1.0001 : V : MET CE B0044 <- 3.76 -> DT C7 C0012 : score 6.99956 : V : HIS CG A0040 <- 3.81 -> DT C7 C0024 : score 2.99148 : x : THR xxxx A0041 <- 3.84 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0043 <- 4.39 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0044 <- 3.40 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.91 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.40 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 3.64 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 4.20 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.63 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0262 <- 3.85 -> DA xxx C0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0041 <- 3.51 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0043 <- 3.00 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.89 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.30 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 3.61 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0121 <- 3.88 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 3.80 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0282 <- 3.38 -> DA xxx D0025 : score x.xxxxx >1mdm_AB:Homeodomain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=INHIBITED FRAGMENT OF ETS-1 AND PAIRED DOMAIN OF PAX5 BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS / MUS MUSCULUS : H : ASN OD1 A0029 <- 2.64 -> DG N2 C0014 : score 4.9536 : H : HIS NE2 A0062 <- 2.65 -> DG O6 C0009 : score 8.19246 : H : SER OG A0086 <- 2.72 -> DA N3 C0019 : score 3.05191 : H : SER OG A0133 <- 2.87 -> DG N7 C0023 : score 4.4193 : H : ARG NE B0391 <- 2.67 -> DG O6 C0007 : score 4.04349 : H : ARG NH2 B0391 <- 2.88 -> DG N7 C0007 : score 6.28246 : H : ARG NE B0394 <- 3.04 -> DG N7 C0006 : score 4.20955 : H : ARG NH2 B0394 <- 2.86 -> DG O6 C0006 : score 6.5208 : x : SER xxxx A0061 <- 3.43 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0066 <- 4.24 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0067 <- 3.64 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0083 <- 3.54 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0131 <- 3.64 -> DG xxx C0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0134 <- 3.38 -> DG xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0136 <- 4.13 -> DA xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0137 <- 3.19 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0387 <- 3.93 -> DC xxx D0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0388 <- 3.93 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0395 <- 3.85 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx >1mdm_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=INHIBITED FRAGMENT OF ETS-1 AND PAIRED DOMAIN OF PAX5 BOUND TO DNA organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NE B0391 <- 2.67 -> DG O6 C0007 : score 4.04349 : H : ARG NH2 B0391 <- 2.88 -> DG N7 C0007 : score 6.28246 : H : ARG NE B0394 <- 3.04 -> DG N7 C0006 : score 4.20955 : H : ARG NH2 B0394 <- 2.86 -> DG O6 C0006 : score 6.5208 : x : GLU xxxx B0387 <- 3.93 -> DC xxx D0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0388 <- 3.93 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0395 <- 3.85 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx >1mdy_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYOD BHLH DOMAIN BOUND TO DNA: PERSPECTIVES ON DNA RECOGNITION AND IMPLICATIONS FOR TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 A0111 <- 2.74 -> DG N7 F0024 : score 6.46123 : H : GLU OE1 A0118 <- 3.10 -> DC N4 E0005 : score 5.42187 : w : GLU OE2 A0118 <- 6.26 -> DC N4 F0022 : score 3.597 : w : ARG NH2 B0111 <- 5.01 -> DG O6 E0010 : score 2.468 : H : GLU OE1 B0118 <- 2.97 -> DC N4 F0019 : score 5.57184 : x : THR xxxx A0115 <- 4.37 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0117 <- 4.18 -> DA xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0121 <- 3.47 -> DC xxx E0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0115 <- 4.28 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0117 <- 4.13 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0121 <- 3.96 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx >1mdy_C:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYOD BHLH DOMAIN BOUND TO DNA: PERSPECTIVES ON DNA RECOGNITION AND IMPLICATIONS FOR TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 C0111 <- 2.68 -> DG N7 H0052 : score 6.53785 : x : THR xxxx C0115 <- 3.38 -> DT xxx H0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0117 <- 3.85 -> DA xxx G0031 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0118 <- 2.87 -> DC xxx G0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0121 <- 3.41 -> DC xxx G0033 : score x.xxxxx >1mdy_CD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYOD BHLH DOMAIN BOUND TO DNA: PERSPECTIVES ON DNA RECOGNITION AND IMPLICATIONS FOR TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 C0111 <- 2.68 -> DG N7 H0052 : score 6.53785 : H : ARG NH2 D0111 <- 2.57 -> DG N7 G0038 : score 6.67831 : x : THR xxxx C0115 <- 3.38 -> DT xxx H0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0117 <- 3.85 -> DA xxx G0031 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0118 <- 2.87 -> DC xxx G0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0121 <- 3.41 -> DC xxx G0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0117 <- 4.16 -> DA xxx H0045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0118 <- 3.08 -> DC xxx H0047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0121 <- 3.00 -> DC xxx H0047 : score x.xxxxx >1mey_C:C2H2_and_C2HC_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A DESIGNED ZINC FINGER PROTEIN BOUND TO DNA organism=? : H : GLN OE1 C0016 <- 2.71 -> DA N6 A0011 : score 6.16151 : H : GLN NE2 C0016 <- 3.22 -> DA N7 A0011 : score 5.57821 : H : SER OG C0018 <- 2.60 -> DG N7 B0003 : score 4.66133 : H : ASN OD1 C0019 <- 3.00 -> DA N6 A0010 : score 5.78092 : H : ASN ND2 C0019 <- 2.83 -> DA N7 A0010 : score 5.83529 : w : ASN OD1 C0019 <- 5.68 -> DT O4 B0004 : score 3.132 : H : LYS NZ C0022 <- 3.11 -> DG N7 A0009 : score 5.05197 : H : LYS NZ C0022 <- 2.95 -> DG O6 A0009 : score 5.60735 : w : LYS NZ C0022 <- 6.11 -> DT O4 B0005 : score 1.7 : H : GLN OE1 C0044 <- 2.94 -> DA N6 A0008 : score 5.88309 : H : GLN NE2 C0044 <- 3.03 -> DA N7 A0008 : score 5.80962 : w : GLN OE1 C0044 <- 6.06 -> DT O4 B0005 : score 3.068 : H : SER OG C0046 <- 2.92 -> DC N4 B0006 : score 3.58743 : w : SER OG C0046 <- 5.85 -> DT O4 B0007 : score 2.338 : H : ASP OD1 C0047 <- 2.84 -> DC N4 A0007 : score 5.30211 : w : ASP OD1 C0047 <- 5.77 -> DT O4 B0007 : score 2.616 : H : LYS NZ C0050 <- 2.72 -> DG O6 B0008 : score 5.87326 : w : LYS NZ C0050 <- 5.78 -> DG N7 A0006 : score 2.519 : H : ARG NH1 C0072 <- 3.03 -> DG N7 A0005 : score 5.7717 : H : ARG NH2 C0072 <- 2.78 -> DG O6 A0005 : score 6.6264 : H : ASP OD2 C0074 <- 2.74 -> DC N4 B0009 : score 6.2744 : H : HIS NE2 C0075 <- 3.10 -> DA N7 A0004 : score 3.99138 : H : ARG NH1 C0078 <- 2.72 -> DG O6 A0003 : score 6.18067 : H : ARG NH2 C0078 <- 2.48 -> DG N7 A0003 : score 6.79323 >1mey_CF:C2H2_and_C2HC_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A DESIGNED ZINC FINGER PROTEIN BOUND TO DNA organism=? : H : GLN OE1 C0016 <- 2.71 -> DA N6 A0011 : score 6.16151 : H : GLN NE2 C0016 <- 3.22 -> DA N7 A0011 : score 5.57821 : H : SER OG C0018 <- 2.60 -> DG N7 B0003 : score 4.66133 : H : ASN OD1 C0019 <- 3.00 -> DA N6 A0010 : score 5.78092 : H : ASN ND2 C0019 <- 2.83 -> DA N7 A0010 : score 5.83529 : w : ASN OD1 C0019 <- 5.68 -> DT O4 B0004 : score 3.132 : H : LYS NZ C0022 <- 3.11 -> DG N7 A0009 : score 5.05197 : H : LYS NZ C0022 <- 2.95 -> DG O6 A0009 : score 5.60735 : w : LYS NZ C0022 <- 6.11 -> DT O4 B0005 : score 1.7 : H : GLN OE1 C0044 <- 2.94 -> DA N6 A0008 : score 5.88309 : H : GLN NE2 C0044 <- 3.03 -> DA N7 A0008 : score 5.80962 : w : GLN OE1 C0044 <- 6.06 -> DT O4 B0005 : score 3.068 : H : SER OG C0046 <- 2.92 -> DC N4 B0006 : score 3.58743 : w : SER OG C0046 <- 5.85 -> DT O4 B0007 : score 2.338 : H : ASP OD1 C0047 <- 2.84 -> DC N4 A0007 : score 5.30211 : w : ASP OD1 C0047 <- 5.77 -> DT O4 B0007 : score 2.616 : H : LYS NZ C0050 <- 2.72 -> DG O6 B0008 : score 5.87326 : w : LYS NZ C0050 <- 5.78 -> DG N7 A0006 : score 2.519 : H : ARG NH1 C0072 <- 3.03 -> DG N7 A0005 : score 5.7717 : H : ARG NH2 C0072 <- 2.78 -> DG O6 A0005 : score 6.6264 : H : ASP OD2 C0074 <- 2.74 -> DC N4 B0009 : score 6.2744 : H : HIS NE2 C0075 <- 3.10 -> DA N7 A0004 : score 3.99138 : H : ARG NH1 C0078 <- 2.72 -> DG O6 A0003 : score 6.18067 : H : ARG NH2 C0078 <- 2.48 -> DG N7 A0003 : score 6.79323 : H : GLN OE1 F0016 <- 2.94 -> DA N6 D0011 : score 5.88309 : H : GLN NE2 F0016 <- 2.76 -> DA N7 D0011 : score 6.13846 : H : SER OG F0018 <- 3.10 -> DG N7 E0003 : score 4.21313 : H : ASN ND2 F0019 <- 3.15 -> DA N7 D0010 : score 5.45958 : H : LYS NZ F0022 <- 2.68 -> DG N7 D0009 : score 5.51516 : H : GLN OE1 F0044 <- 2.78 -> DA N6 D0008 : score 6.07677 : H : GLN NE2 F0044 <- 2.88 -> DA N7 D0008 : score 5.99231 : H : SER OG F0046 <- 2.97 -> DC N4 E0006 : score 3.55067 : H : ARG NH1 F0072 <- 2.49 -> DG N7 D0005 : score 6.4251 : H : ARG NH2 F0072 <- 2.85 -> DG O6 D0005 : score 6.534 : H : ASP OD2 F0074 <- 2.81 -> DC N4 E0009 : score 6.1876 : w : ASP OD2 F0074 <- 6.24 -> DC N4 E0010 : score 3.623 : H : HIS NE2 F0075 <- 2.78 -> DA N7 D0004 : score 4.26314 : H : ARG NH1 F0078 <- 2.74 -> DG O6 D0003 : score 6.15633 : H : ARG NH2 F0078 <- 2.64 -> DG N7 D0003 : score 6.58892 : x : SER xxxx C0045 <- 3.34 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0045 <- 3.46 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0047 <- 2.88 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0050 <- 3.24 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx >1mhd_AB:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A SMAD MH1 DOMAIN BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0074 <- 2.92 -> DG N7 D2004 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.62 -> DG O6 D2004 : score 6.8376 : H : GLN OE1 A0076 <- 3.35 -> DA N6 C1007 : score 5.38678 : H : LYS NZ A0081 <- 3.01 -> DA N7 C1007 : score 2.81382 : H : ARG NH1 B0074 <- 3.29 -> DG N7 C1003 : score 5.4571 : H : ARG NH2 B0074 <- 2.75 -> DG O6 C1003 : score 6.666 : H : GLN OE1 B0076 <- 2.94 -> DA N6 D2008 : score 5.88309 : H : LYS NZ B0081 <- 3.08 -> DA N7 D2008 : score 2.7727 >1mhd_B:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A SMAD MH1 DOMAIN BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 B0074 <- 3.29 -> DG N7 C1003 : score 5.4571 : H : ARG NH2 B0074 <- 2.75 -> DG O6 C1003 : score 6.666 : H : GLN OE1 B0076 <- 2.94 -> DA N6 D2008 : score 5.88309 : H : LYS NZ B0081 <- 3.08 -> DA N7 D2008 : score 2.7727 >1mht_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=COVALENT TERNARY STRUCTURE OF HHAI METHYLTRANSFERASE, DNA AND S- ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE organism=Haemophilus haemolyticus : H : ARG NH2 A0240 <- 2.61 -> DG N7 C0426 : score 6.62723 : H : ARG NH2 A0240 <- 3.05 -> DG O6 C0426 : score 6.27 : x : ILE xxxx A0086 <- 3.46 -> DT xxx B0410 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.40 -> DG xxx C0428 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0237 <- 3.33 -> DG xxx C0426 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0252 <- 4.47 -> DG xxx C0428 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0254 <- 4.23 -> DC xxx C0429 : score x.xxxxx >1mj2_A:Ribbon-helix-helix; title=METHIONINE REPRESSOR MUTANT (Q44K) PLUS COREPRESSOR (S-ADENOSYL METHIONINE) COMPLEXED TO A CONSENSUS OPERATOR SEQUENCE organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0023 <- 3.02 -> DA N7 G0009 : score 2.80794 : H : LYS NZ A0023 <- 2.99 -> DG N7 G0010 : score 5.18123 : H : THR OG1 A0025 <- 3.36 -> DA N7 F0003 : score 3.03172 : H : THR OG1 A0025 <- 2.80 -> DC N4 F0004 : score 4.03333 : x : SER xxxx A0027 <- 4.46 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx >1mj2_ABCD:Ribbon-helix-helix; title=METHIONINE REPRESSOR MUTANT (Q44K) PLUS COREPRESSOR (S-ADENOSYL METHIONINE) COMPLEXED TO A CONSENSUS OPERATOR SEQUENCE organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0023 <- 3.02 -> DA N7 G0009 : score 2.80794 : H : LYS NZ A0023 <- 2.99 -> DG N7 G0010 : score 5.18123 : H : THR OG1 A0025 <- 3.36 -> DA N7 F0003 : score 3.03172 : H : THR OG1 A0025 <- 2.80 -> DC N4 F0004 : score 4.03333 : H : LYS NZ B0023 <- 3.01 -> DG N7 F0002 : score 5.15969 : H : LYS NZ B0023 <- 2.93 -> DG O6 F0002 : score 5.63047 : w : LYS NZ B0023 <- 5.48 -> DA N6 F0001 : score 2.097 : H : THR OG1 B0025 <- 2.50 -> DA N7 G0011 : score 3.61895 : w : THR OG1 B0025 <- 5.77 -> DC N4 G0012 : score 2.558 : H : LYS NZ C0023 <- 2.50 -> DG N7 F0010 : score 5.70905 : H : THR OG1 C0025 <- 3.06 -> DC N4 G0004 : score 3.8236 : H : LYS NZ D0023 <- 3.09 -> DA N7 G0001 : score 2.76682 : H : LYS NZ D0023 <- 2.81 -> DG N7 G0002 : score 5.37513 : H : THR OG1 D0025 <- 2.47 -> DA N7 F0011 : score 3.63943 : x : SER xxxx A0027 <- 4.46 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0027 <- 4.18 -> DA xxx G0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0027 <- 4.45 -> DA xxx G0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0027 <- 4.02 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx >1mjm_AB:Ribbon-helix-helix; title=METHIONINE APOREPRESSOR MUTANT (Q44K) COMPLEXED TO HALF OF THE CONSENSUS OPERATOR SEQUENCE organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0023 <- 3.21 -> DA N7 D0412 : score 2.69633 : H : LYS NZ A0023 <- 2.77 -> DG N7 D0413 : score 5.41821 : H : THR OG1 A0025 <- 3.36 -> DA N7 C0404 : score 3.03172 : H : THR OG1 A0025 <- 2.97 -> DC N4 C0405 : score 3.8962 : w : THR OG1 A0025 <- 6.32 -> DC N4 D0415 : score 2.558 : H : LYS NZ B0023 <- 2.87 -> DG O6 C0403 : score 5.69984 : H : THR OG1 B0025 <- 2.78 -> DA N7 D0414 : score 3.42776 : H : THR OG1 B0025 <- 3.05 -> DC N4 D0415 : score 3.83167 : w : THR OG1 B0025 <- 5.50 -> DC N4 D0415 : score 2.558 >1mjm_B:Ribbon-helix-helix; title=METHIONINE APOREPRESSOR MUTANT (Q44K) COMPLEXED TO HALF OF THE CONSENSUS OPERATOR SEQUENCE organism=Escherichia coli : H : LYS NZ B0023 <- 2.87 -> DG O6 C0403 : score 5.69984 : H : THR OG1 B0025 <- 2.78 -> DA N7 D0414 : score 3.42776 : H : THR OG1 B0025 <- 3.05 -> DC N4 D0415 : score 3.83167 : w : THR OG1 B0025 <- 5.50 -> DC N4 D0415 : score 2.558 >1mjo_ABCD:Ribbon-helix-helix; title=METHIONINE HOLOREPRESSOR MUTANT (Q44K) PLUS COREPRESSOR (S-ADENOSYL METHIONINE) COMPLEXED TO THE MINIMAL MET CONSENSUS OPERATOR WITH THE CENTRAL TA STEP MUTATED TO AT organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0023 <- 3.11 -> DG N7 G0010 : score 5.05197 : H : THR OG1 A0025 <- 3.22 -> DA N7 F0003 : score 3.12732 : H : THR OG1 A0025 <- 2.91 -> DC N4 F0004 : score 3.9446 : H : LYS NZ B0023 <- 2.91 -> DG N7 F0002 : score 5.26741 : H : LYS NZ B0023 <- 2.89 -> DG O6 F0002 : score 5.67672 : w : LYS NZ B0023 <- 5.71 -> DA N6 F0001 : score 2.097 : H : THR OG1 B0025 <- 2.59 -> DA N7 G0011 : score 3.55749 : w : THR OG1 B0025 <- 6.28 -> DC N4 G0012 : score 2.558 : H : LYS NZ C0023 <- 3.30 -> DG N7 F0010 : score 4.84731 : H : THR OG1 C0025 <- 3.02 -> DC N4 G0004 : score 3.85587 : w : THR OG1 C0025 <- 5.83 -> DC N4 F0012 : score 2.558 : H : LYS NZ D0023 <- 3.00 -> DG N7 G0002 : score 5.17046 : w : LYS NZ D0023 <- 5.46 -> DA N6 G0001 : score 2.097 : H : THR OG1 D0025 <- 2.61 -> DA N7 F0011 : score 3.54384 : w : THR OG1 D0025 <- 5.72 -> DC N4 F0012 : score 2.558 : x : SER xxxx A0027 <- 4.42 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0027 <- 4.30 -> DA xxx G0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0027 <- 4.43 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx >1mjo_B:Ribbon-helix-helix; title=METHIONINE HOLOREPRESSOR MUTANT (Q44K) PLUS COREPRESSOR (S-ADENOSYL METHIONINE) COMPLEXED TO THE MINIMAL MET CONSENSUS OPERATOR WITH THE CENTRAL TA STEP MUTATED TO AT organism=Escherichia coli : H : LYS NZ B0023 <- 2.91 -> DG N7 F0002 : score 5.26741 : H : LYS NZ B0023 <- 2.89 -> DG O6 F0002 : score 5.67672 : w : LYS NZ B0023 <- 5.71 -> DA N6 F0001 : score 2.097 : H : THR OG1 B0025 <- 2.59 -> DA N7 G0011 : score 3.55749 : w : THR OG1 B0025 <- 6.28 -> DC N4 G0012 : score 2.558 >1mjp_A:Ribbon-helix-helix; title=METHIONINE APOREPRESSOR MUTANT (Q44K) COMPLEXED TO THE MINIMAL MET CONSENSUS OPERATOR organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0023 <- 3.36 -> DA N7 D0001 : score 2.60822 : H : THR OG1 A0025 <- 3.13 -> DC N4 C0006 : score 3.76713 : x : SER xxxx A0027 <- 4.40 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx >1mjp_AB:Ribbon-helix-helix; title=METHIONINE APOREPRESSOR MUTANT (Q44K) COMPLEXED TO THE MINIMAL MET CONSENSUS OPERATOR organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0023 <- 3.36 -> DA N7 D0001 : score 2.60822 : H : THR OG1 A0025 <- 3.13 -> DC N4 C0006 : score 3.76713 : H : LYS NZ B0023 <- 2.85 -> DG N7 C0004 : score 5.33204 : H : LYS NZ B0023 <- 2.82 -> DG O6 C0004 : score 5.75765 : H : THR OG1 B0025 <- 2.73 -> DA N7 D0003 : score 3.4619 : H : THR OG1 B0025 <- 3.36 -> DC N4 D0004 : score 3.5816 : x : SER xxxx A0027 <- 4.40 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0027 <- 4.43 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx >1mjq_A:Ribbon-helix-helix; title=METHIONINE REPRESSOR MUTANT (Q44K) PLUS COREPRESSOR (S-ADENOSYL METHIONINE) COMPLEXED TO AN ALTERED MET CONSENSUS OPERATOR SEQUENCE organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0023 <- 3.12 -> DG N7 F0010 : score 5.0412 : H : LYS NZ A0023 <- 2.57 -> DG O6 F0010 : score 6.04668 : H : THR OG1 A0025 <- 3.21 -> DT O4 E0004 : score 3.56843 : x : SER xxxx A0027 <- 4.30 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx >1mjq_ABCD:Ribbon-helix-helix; title=METHIONINE REPRESSOR MUTANT (Q44K) PLUS COREPRESSOR (S-ADENOSYL METHIONINE) COMPLEXED TO AN ALTERED MET CONSENSUS OPERATOR SEQUENCE organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0023 <- 3.12 -> DG N7 F0010 : score 5.0412 : H : LYS NZ A0023 <- 2.57 -> DG O6 F0010 : score 6.04668 : H : THR OG1 A0025 <- 3.21 -> DT O4 E0004 : score 3.56843 : H : LYS NZ B0023 <- 2.46 -> DG N7 E0002 : score 5.75214 : H : LYS NZ B0023 <- 3.02 -> DG O6 E0002 : score 5.52642 : H : THR OG1 B0025 <- 2.44 -> DA N7 F0011 : score 3.65992 : H : LYS NZ C0023 <- 3.02 -> DA N7 E0009 : score 2.80794 : H : LYS NZ C0023 <- 3.03 -> DG N7 E0010 : score 5.13815 : H : LYS NZ C0023 <- 2.74 -> DG O6 E0010 : score 5.85014 : H : THR OG1 C0025 <- 3.03 -> DT O4 F0004 : score 3.70837 : H : LYS NZ D0023 <- 2.52 -> DG N7 F0002 : score 5.68751 : H : THR OG1 D0025 <- 2.37 -> DA N7 E0011 : score 3.70772 : x : SER xxxx A0027 <- 4.30 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0027 <- 4.11 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0027 <- 4.41 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx >1mjq_GHIJ:Ribbon-helix-helix; title=METHIONINE REPRESSOR MUTANT (Q44K) PLUS COREPRESSOR (S-ADENOSYL METHIONINE) COMPLEXED TO AN ALTERED MET CONSENSUS OPERATOR SEQUENCE organism=Escherichia coli : H : LYS NZ G0023 <- 2.27 -> DG O6 L0010 : score 6.39353 : H : THR OG1 G0025 <- 2.79 -> DT O4 K0004 : score 3.89495 : H : LYS NZ H0023 <- 2.46 -> DG N7 K0002 : score 5.75214 : H : LYS NZ H0023 <- 2.87 -> DG O6 K0002 : score 5.69984 : H : THR OG1 H0025 <- 2.34 -> DA N7 L0011 : score 3.7282 : H : LYS NZ I0023 <- 3.33 -> DA N7 K0009 : score 2.62584 : H : LYS NZ I0023 <- 2.77 -> DG O6 K0010 : score 5.81545 : H : THR OG1 I0025 <- 2.71 -> DT O4 L0004 : score 3.95715 : H : LYS NZ J0023 <- 2.73 -> DG N7 L0002 : score 5.4613 : H : LYS NZ J0023 <- 2.80 -> DG O6 L0002 : score 5.78077 : H : THR OG1 J0025 <- 2.38 -> DA N7 K0011 : score 3.70089 : x : SER xxxx G0027 <- 4.41 -> DA xxx K0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0027 <- 4.44 -> DA xxx L0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0027 <- 4.23 -> DA xxx L0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0027 <- 4.39 -> DA xxx K0009 : score x.xxxxx >1mm8_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TN5 TRANSPOSASE COMPLEXED WITH ME DNA organism=Escherichia coli : H : GLN OE1 A0243 <- 3.22 -> DA N6 B0115 : score 5.54415 : H : GLN NE2 A0243 <- 2.92 -> DA N7 B0115 : score 5.94359 : H : LYS NZ A0244 <- 2.50 -> DG N7 C0203 : score 5.70905 : H : LYS NZ A0330 <- 3.22 -> DC O2 B0118 : score 2.69868 : w : LYS NZ A0330 <- 6.46 -> DT O2 C0204 : score 0.522 : H : SER OG A0438 <- 2.91 -> DC N4 C0207 : score 3.59478 : H : LYS NZ A0439 <- 2.90 -> DG N7 B0114 : score 5.27818 : H : LYS NZ A0439 <- 2.80 -> DG O6 B0114 : score 5.78077 : x : PRO xxxx A0242 <- 4.22 -> DT xxx C0204 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0255 <- 4.41 -> DG xxx B0114 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0256 <- 4.05 -> DT xxx C0204 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0323 <- 4.06 -> DG xxx C0203 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0440 <- 3.40 -> DA xxx B0112 : score x.xxxxx >1mnm_A:SRF-like; title=YEAST MATALPHA2/MCM1/DNA TERNARY TRANSCRIPTION COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 A0019 <- 2.38 -> DT O2 E0008 : score 4.58893 : H : LYS NZ A0038 <- 2.98 -> DG O6 F0048 : score 5.57266 : w : LYS NZ A0038 <- 5.59 -> DA N6 E0005 : score 2.097 : V : VAL CG2 A0034 <- 3.88 -> DT C7 E0004 : score 6.00062 : x : THR xxxx A0030 <- 4.03 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx >1mnm_ABCD:SRF-like;Homeodomain-like; title=YEAST MATALPHA2/MCM1/DNA TERNARY TRANSCRIPTION COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 A0019 <- 2.38 -> DT O2 E0008 : score 4.58893 : H : LYS NZ A0038 <- 2.98 -> DG O6 F0048 : score 5.57266 : w : LYS NZ A0038 <- 5.59 -> DA N6 E0005 : score 2.097 : H : LYS NZ B0038 <- 2.69 -> DG N7 E0014 : score 5.50439 : H : LYS NZ B0038 <- 2.72 -> DG O6 E0015 : score 5.87326 : H : ARG NE C0132 <- 2.89 -> DA N3 E0022 : score 2.06472 : H : ARG NH2 C0132 <- 2.80 -> DC O2 E0023 : score 3.69872 : H : ARG NH1 C0135 <- 3.25 -> DA N3 F0035 : score 3.35067 : H : ARG NH2 C0135 <- 2.52 -> DT O2 F0036 : score 4.4704 : H : ARG NH1 C0185 <- 3.09 -> DG N7 F0031 : score 5.6991 : H : ARG NH2 C0185 <- 2.53 -> DG O6 F0031 : score 6.9564 : H : ARG NH2 D0135 <- 3.08 -> DG N3 F0048 : score 3.40808 : H : ASN OD1 D0182 <- 3.17 -> DA N6 F0051 : score 5.57618 : H : ASN ND2 D0182 <- 3.19 -> DA N7 F0051 : score 5.41261 : H : ARG NH1 D0185 <- 2.92 -> DT O4 E0003 : score 3.18952 : H : ARG NH2 D0185 <- 2.89 -> DA N7 E0002 : score 1.6417 : V : VAL CG2 A0034 <- 3.88 -> DT C7 E0004 : score 6.00062 : V : ASN CG D0178 <- 3.74 -> DT C7 F0052 : score 2.68793 : x : THR xxxx A0030 <- 4.03 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0018 <- 3.65 -> DA xxx F0043 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0034 <- 3.27 -> DT xxx F0037 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0037 <- 3.48 -> DT xxx F0036 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0178 <- 3.89 -> DC xxx E0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0181 <- 4.09 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0182 <- 2.96 -> DA xxx E0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0131 <- 3.28 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx >1mnm_C:Homeodomain-like; title=YEAST MATALPHA2/MCM1/DNA TERNARY TRANSCRIPTION COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NE C0132 <- 2.89 -> DA N3 E0022 : score 2.06472 : H : ARG NH2 C0132 <- 2.80 -> DC O2 E0023 : score 3.69872 : H : ARG NH1 C0135 <- 3.25 -> DA N3 F0035 : score 3.35067 : H : ARG NH2 C0135 <- 2.52 -> DT O2 F0036 : score 4.4704 : H : ARG NH1 C0185 <- 3.09 -> DG N7 F0031 : score 5.6991 : H : ARG NH2 C0185 <- 2.53 -> DG O6 F0031 : score 6.9564 : V : ASN CG C0182 <- 3.77 -> DT C7 E0021 : score 2.66807 : x : ASN xxxx C0178 <- 3.89 -> DC xxx E0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0181 <- 4.09 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx >1mnn_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF THE SPORULATION SPECIFIC TRANSCRIPTION FACTOR NDT80 BOUND TO DNA organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NH1 A0058 <- 2.96 -> DT O2 C0006 : score 4.16861 : w : ARG NH1 A0058 <- 6.42 -> DT O2 C0005 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0058 <- 6.26 -> DT O2 C0005 : score 2.261 : H : ARG NH1 A0111 <- 2.98 -> DG N7 C0010 : score 5.8322 : H : ARG NH2 A0111 <- 2.68 -> DG O6 C0010 : score 6.7584 : H : ARG NH1 A0177 <- 2.86 -> DG N7 C0008 : score 5.9774 : H : ARG NH2 A0177 <- 2.78 -> DG O6 C0008 : score 6.6264 : H : ARG NH1 A0326 <- 2.69 -> DG N7 B0004 : score 6.1831 : H : ARG NH2 A0326 <- 2.68 -> DG O6 B0004 : score 6.7584 : H : ARG NH2 A0326 <- 2.88 -> DT O4 C0011 : score 3.49698 : x : PRO xxxx A0057 <- 3.23 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0112 <- 4.16 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0178 <- 4.08 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx >1mow_A:Homing_endonucleases; title=E-DREI organism=? : H : ARG NH2 A0033 <- 2.40 -> DG O6 B0321 : score 7.128 : w : ARG NH1 A0033 <- 5.17 -> DG N7 B0320 : score 2.063 : H : GLU OE1 A0035 <- 3.07 -> DC N4 C0404 : score 5.45648 : H : ARG NH1 A0037 <- 2.95 -> DG O6 C0406 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.89 -> DG O6 C0405 : score 6.4812 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.79 -> DG O6 C0406 : score 6.6132 : w : ARG NH1 A0037 <- 5.87 -> DT O4 B0317 : score 1.768 : H : ASP OD2 A0075 <- 3.20 -> DC N4 C0409 : score 5.704 : w : ASP OD2 A0075 <- 5.60 -> DT O4 C0410 : score 2.798 : H : THR OG1 A0076 <- 2.68 -> DA N7 B0314 : score 3.49604 : H : THR OG1 A0076 <- 2.70 -> DA N6 B0314 : score 2.81415 : H : ARG NE A0077 <- 3.01 -> DG N7 B0315 : score 4.23608 : H : ARG NH2 A0077 <- 2.88 -> DT O4 B0316 : score 3.49698 : w : ARG NH1 A0077 <- 6.25 -> DA N7 C0407 : score 0.388 : w : ARG NH2 A0077 <- 6.53 -> DA N7 C0407 : score 1.486 : w : GLU OE1 A0079 <- 5.61 -> DT O4 B0317 : score 2.749 : w : GLU OE2 A0079 <- 6.00 -> DA N7 C0407 : score 1.687 : H : ARG NH1 A0081 <- 3.14 -> DG N7 C0406 : score 5.6386 : H : ARG NH2 A0081 <- 3.33 -> DG N7 C0406 : score 5.70785 : w : GLN OE1 A0123 <- 6.11 -> DA N6 C0417 : score 3.392 : H : LYS NZ A0125 <- 2.87 -> DG O6 C0418 : score 5.69984 : w : LYS NZ A0125 <- 5.78 -> DA N6 B0305 : score 2.097 : w : LYS NZ A0125 <- 6.23 -> DA N6 C0417 : score 2.097 : w : ASN OD1 A0127 <- 6.35 -> DT O4 C0421 : score 3.132 : w : ASN ND2 A0127 <- 6.11 -> DT O4 C0421 : score 3.275 : w : ASN ND2 A0127 <- 6.13 -> DT O4 C0419 : score 3.275 : H : TYR OH A0130 <- 2.66 -> DA N7 B0303 : score 4.26752 : H : TYR OH A0130 <- 3.06 -> DA N6 B0303 : score 4.42765 : H : GLN OE1 A0135 <- 3.12 -> DA N6 B0304 : score 5.6652 : H : GLN NE2 A0135 <- 2.94 -> DA N7 B0304 : score 5.91923 : w : GLN OE1 A0135 <- 5.66 -> DT O4 C0419 : score 3.068 : w : GLN OE1 A0135 <- 5.82 -> DA N6 B0305 : score 3.392 : H : GLN NE2 A0141 <- 3.04 -> DA N7 C0415 : score 5.79744 : w : GLN OE1 A0141 <- 6.05 -> DC N4 C0416 : score 3.488 : H : ARG NH1 A0165 <- 3.05 -> DG N7 B0308 : score 5.7475 : H : ARG NH2 A0165 <- 2.58 -> DG O6 B0308 : score 6.8904 : H : ARG NH1 A0167 <- 2.66 -> DG O6 C0414 : score 6.25367 : H : ARG NH1 A0167 <- 2.99 -> DT O4 B0309 : score 3.14377 : H : ARG NH2 A0167 <- 3.03 -> DG N7 C0414 : score 6.09092 : w : THR OG1 A0237 <- 5.26 -> DC O2 C0416 : score 2.048 : x : TYR xxxx A0025 <- 3.54 -> DT xxx B0317 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0027 <- 4.15 -> DT xxx B0317 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0029 <- 3.37 -> DC xxx B0319 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0034 <- 3.29 -> DG xxx C0402 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.78 -> DG xxx B0315 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0070 <- 3.28 -> DG xxx C0405 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0072 <- 4.31 -> DG xxx C0406 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0083 <- 4.12 -> DC xxx C0403 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0119 <- 4.20 -> DA xxx C0415 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0121 <- 3.71 -> DA xxx C0415 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0129 <- 2.97 -> DC xxx B0301 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0143 <- 3.70 -> DG xxx C0414 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0163 <- 4.38 -> DC xxx B0306 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0170 <- 3.82 -> DA xxx C0413 : score x.xxxxx >1mq2_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH GAPPED DNA CONTAINING AN 8- OXO-7,8-DIHYDRO-GUANINE AND DAMP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.19 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.49 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.60 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >1mq3_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH GAPPED DNA CONTAINING AN 8- OXO-7,8-DIHYDRO-GUANINE TEMPLATE PAIRED WITH DCTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.06 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.60 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.49 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >1mse_C:Homeodomain-like; title=SOLUTION STRUCTURE OF A SPECIFIC DNA COMPLEX OF THE MYB DNA-BINDING DOMAIN WITH COOPERATIVE RECOGNITION HELICES organism=MUS MUSCULUS : H : LYS NZ C0128 <- 2.80 -> DG N7 A0008 : score 5.3859 : H : GLU OE1 C0132 <- 2.77 -> DC N4 A0006 : score 5.80256 : H : GLU OE2 C0132 <- 2.79 -> DC N4 B0025 : score 5.27592 : H : LYS NZ C0182 <- 2.79 -> DA N7 B0026 : score 2.94305 : H : LYS NZ C0182 <- 2.80 -> DG N7 B0027 : score 5.3859 : H : ASN OD1 C0183 <- 2.95 -> DA N6 A0004 : score 5.84114 : H : ASN ND2 C0183 <- 2.72 -> DA N7 A0004 : score 5.96444 : H : SER OG C0187 <- 3.16 -> DT O4 A0003 : score 3.29916 : x : ARG xxxx C0131 <- 3.46 -> DC xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0136 <- 3.64 -> DA xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0178 <- 3.71 -> DC xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0179 <- 4.12 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0186 <- 3.25 -> DT xxx B0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0188 <- 3.72 -> DC xxx A0002 : score x.xxxxx >1msf_C:Homeodomain-like; title=SOLUTION STRUCTURE OF A SPECIFIC DNA COMPLEX OF THE MYB DNA-BINDING DOMAIN WITH COOPERATIVE RECOGNITION HELICES organism=MUS MUSCULUS : H : LYS NZ C0182 <- 2.77 -> DA N7 B0026 : score 2.9548 : V : ASN CG C0183 <- 3.63 -> DT C7 A0003 : score 2.76075 : x : LYS xxxx C0128 <- 3.43 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0131 <- 3.90 -> DC xxx A0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0132 <- 3.39 -> DC xxx A0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0136 <- 3.92 -> DA xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0178 <- 3.57 -> DC xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0179 <- 3.26 -> DA xxx A0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0184 <- 4.38 -> DT xxx A0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0186 <- 4.01 -> DT xxx B0028 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0187 <- 3.76 -> DC xxx A0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0188 <- 4.10 -> DC xxx A0002 : score x.xxxxx >1msw_D:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURAL BASIS FOR THE TRANSITION FROM INITIATION TO ELONGATION TRANSCRIPTION IN T7 RNA POLYMERASE organism=Enterobacteria phage T7 : V : LYS CE D0164 <- 3.87 -> DT C7 N0021 : score 2.55551 : x : THR xxxx D0602 <- 4.42 -> DC xxx N0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0644 <- 3.42 -> DA xxx T0121 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0647 <- 3.58 -> DT xxx N0021 : score x.xxxxx >1mtl_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=NON-PRODUCTIVE MUG-DNA COMPLEX organism=Escherichia coli : H : GLN NE2 A0110 <- 2.75 -> DG O6 C0204 : score 5.86318 : w : GLN OE1 A0110 <- 6.30 -> DC N4 C0203 : score 3.488 : H : ARG NH1 A0146 <- 3.10 -> DC O2 D0223 : score 3.431 : H : ARG NH2 A0146 <- 2.52 -> DC O2 D0223 : score 3.90585 : x : GLU xxxx A0079 <- 4.31 -> DC xxx C0201 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0144 <- 3.69 -> DC xxx C0201 : score x.xxxxx >1mtl_AB:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=NON-PRODUCTIVE MUG-DNA COMPLEX organism=Escherichia coli : H : GLN NE2 A0110 <- 2.75 -> DG O6 C0204 : score 5.86318 : w : GLN OE1 A0110 <- 6.30 -> DC N4 C0203 : score 3.488 : H : ARG NH1 A0146 <- 3.10 -> DC O2 D0223 : score 3.431 : H : ARG NH2 A0146 <- 2.52 -> DC O2 D0223 : score 3.90585 : x : GLU xxxx A0079 <- 4.31 -> DC xxx C0201 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0144 <- 3.69 -> DC xxx C0201 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0032 <- 4.42 -> DC xxx C0201 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0033 <- 3.80 -> DC xxx C0201 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0034 <- 3.52 -> DC xxx C0201 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0036 <- 3.82 -> DG xxx D0224 : score x.xxxxx >1muh_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TN5 TRANSPOSASE COMPLEXED WITH TRANSPOSON END DNA organism=Escherichia coli : H : GLN OE1 A0243 <- 3.27 -> DA N6 B0015 : score 5.48362 : H : GLN NE2 A0243 <- 2.99 -> DA N7 B0015 : score 5.85833 : H : LYS NZ A0330 <- 2.86 -> DC O2 B0018 : score 2.9108 : H : SER OG A0438 <- 2.78 -> DC N4 C0007 : score 3.69034 : H : LYS NZ A0439 <- 2.89 -> DG O6 B0014 : score 5.67672 : x : LYS xxxx A0244 <- 3.35 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0323 <- 4.17 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0440 <- 3.49 -> DA xxx B0012 : score x.xxxxx >1mus_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TN5 TRANSPOSASE COMPLEXED WITH RESOLVED OUTSIDE END DNA organism=Escherichia coli : H : GLN OE1 A0243 <- 2.90 -> DA N6 B0015 : score 5.93151 : H : GLN NE2 A0243 <- 2.95 -> DA N7 B0015 : score 5.90705 : H : LYS NZ A0244 <- 2.92 -> DG N7 C0003 : score 5.25664 : H : LYS NZ A0330 <- 3.00 -> DC O2 B0018 : score 2.82831 : H : SER OG A0438 <- 2.82 -> DC N4 C0007 : score 3.66094 : H : LYS NZ A0439 <- 3.13 -> DT O4 C0006 : score 3.35043 : x : VAL xxxx A0247 <- 3.96 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0440 <- 3.57 -> DT xxx B0011 : score x.xxxxx >1mwi_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MUG-DNA PRODUCT COMPLEX organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx A0144 <- 4.22 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0146 <- 3.29 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx >1mwj_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MUG-DNA PSEUDO SUBSTRATE COMPLEX organism=Escherichia coli : x : ARG xxxx A0146 <- 3.15 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx >1n39_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURAL AND BIOCHEMICAL EXPLORATION OF A CRITICAL AMINO ACID IN HUMAN 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0149 <- 6.11 -> DG O6 C0024 : score 2.971 : w : ASN ND2 A0149 <- 5.93 -> DA N7 C0022 : score 1.989 : H : ARG NH1 A0154 <- 3.01 -> DC O2 B0008 : score 3.4967 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.63 -> DC O2 B0008 : score 3.7741 : H : ARG NH2 A0204 <- 3.10 -> DC N3 B0008 : score 2.15356 : x : ASN xxxx A0150 <- 4.10 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0151 <- 3.46 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0203 <- 3.24 -> DG xxx C0024 : score x.xxxxx >1n3a_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURAL AND BIOCHEMICAL EXPLORATION OF A CRITICAL AMINO ACID IN HUMAN 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 A0151 <- 3.34 -> DA N3 C0022 : score 3.39646 : H : TYR OH A0203 <- 3.37 -> DG N2 C0024 : score 4.33231 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.66 -> DC O2 B0008 : score 3.7522 : H : ARG NH2 A0204 <- 2.78 -> DC N3 B0008 : score 2.30019 : x : ASN xxxx A0149 <- 3.01 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0150 <- 4.29 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0154 <- 2.74 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0207 <- 4.47 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0293 <- 4.31 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx >1n3c_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURAL AND BIOCHEMICAL EXPLORATION OF A CRITICAL AMINO ACID IN HUMAN 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0149 <- 6.26 -> DA N6 C0022 : score 2.5 : H : ARG NH2 A0154 <- 2.51 -> DC O2 B0008 : score 3.91324 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.75 -> DC O2 B0008 : score 3.6865 : H : ARG NH2 A0204 <- 3.09 -> DC N3 B0008 : score 2.15815 : x : ASN xxxx A0150 <- 4.27 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0151 <- 3.27 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0203 <- 3.48 -> DG xxx C0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0207 <- 4.29 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx >1n3e_ABGH:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF I-CREI BOUND TO A PALINDROMIC DNA SEQUENCE I (PALINDROME OF LEFT SIDE OF WILDTYPE DNA TARGET SEQUENCE) organism=Chlamydomonas reinhardtii : H : GLN NE2 A0026 <- 3.37 -> DG N7 D0418 : score 3.72006 : H : LYS NZ A0028 <- 3.05 -> DT O4 D0419 : score 3.40782 : w : LYS NZ A0028 <- 6.24 -> DA N6 E0455 : score 2.097 : H : TYR OH A0033 <- 2.59 -> DA N7 E0453 : score 4.32564 : H : GLN NE2 A0038 <- 3.19 -> DA N7 E0454 : score 5.61474 : w : SER OG A0040 <- 6.53 -> DA N6 E0455 : score 2.209 : H : GLN NE2 A0044 <- 2.50 -> DA N7 D0416 : score 6.45513 : w : GLN OE1 A0044 <- 5.98 -> DC N4 D0417 : score 3.488 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.00 -> DG N7 E0458 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.78 -> DG O6 E0458 : score 6.6264 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.82 -> DG O6 D0415 : score 6.059 : H : ARG NH2 A0070 <- 3.18 -> DG N7 D0415 : score 5.89938 : H : GLN NE2 B0226 <- 3.40 -> DG N7 F0468 : score 3.69487 : H : LYS NZ B0228 <- 2.99 -> DT O4 F0469 : score 3.45087 : w : LYS NZ B0228 <- 5.66 -> DA N6 C0405 : score 2.097 : H : TYR OH B0233 <- 2.56 -> DA N7 C0403 : score 4.35054 : H : GLN NE2 B0238 <- 2.91 -> DA N7 C0404 : score 5.95577 : w : SER OG B0240 <- 6.27 -> DA N6 C0405 : score 2.209 : H : GLN NE2 B0244 <- 2.50 -> DA N7 F0466 : score 6.45513 : w : GLN OE1 B0244 <- 5.59 -> DC N4 F0467 : score 3.488 : H : ARG NH1 B0268 <- 2.94 -> DG N7 C0408 : score 5.8806 : H : ARG NH2 B0268 <- 2.82 -> DG O6 C0408 : score 6.5736 : H : ARG NH1 B0270 <- 2.82 -> DG O6 F0465 : score 6.059 : H : ARG NH2 B0270 <- 3.22 -> DG N7 F0465 : score 5.84831 : H : GLN NE2 G0526 <- 3.40 -> DG N7 J0918 : score 3.69487 : H : LYS NZ G0528 <- 2.95 -> DT O4 J0919 : score 3.47956 : w : LYS NZ G0528 <- 5.59 -> DA N6 K0955 : score 2.097 : w : SER OG G0532 <- 5.94 -> DG O6 K0952 : score 2.749 : H : TYR OH G0533 <- 2.57 -> DA N7 K0953 : score 4.34224 : H : GLN OE1 G0538 <- 3.44 -> DA N6 K0954 : score 5.27784 : H : GLN NE2 G0538 <- 2.80 -> DA N7 K0954 : score 6.08974 : w : SER OG G0540 <- 6.06 -> DA N6 K0955 : score 2.209 : H : GLN NE2 G0544 <- 2.85 -> DA N7 J0916 : score 6.02885 : w : GLN OE1 G0544 <- 6.28 -> DC N4 J0917 : score 3.488 : H : ARG NH1 G0568 <- 3.03 -> DG N7 K0958 : score 5.7717 : H : ARG NH2 G0568 <- 2.83 -> DG O6 K0958 : score 6.5604 : H : ARG NH1 G0570 <- 2.75 -> DG O6 J0915 : score 6.14417 : H : ARG NH2 G0570 <- 3.17 -> DG N7 J0915 : score 5.91215 : w : THR OG1 G0640 <- 5.35 -> DC O2 J0917 : score 2.048 : H : GLN NE2 H0726 <- 3.41 -> DG N7 L0968 : score 3.68647 : w : SER OG H0732 <- 5.57 -> DG O6 I0902 : score 2.749 : H : TYR OH H0733 <- 2.45 -> DA N7 I0903 : score 4.44187 : H : TYR OH H0733 <- 3.34 -> DA N6 I0903 : score 4.1661 : H : GLN NE2 H0738 <- 2.93 -> DA N7 I0904 : score 5.93141 : H : GLN NE2 H0744 <- 2.59 -> DA N7 L0966 : score 6.34551 : H : ARG NH1 H0768 <- 2.89 -> DG N7 I0908 : score 5.9411 : H : ARG NH2 H0768 <- 2.73 -> DG O6 I0908 : score 6.6924 : H : ARG NH1 H0770 <- 2.82 -> DG O6 L0965 : score 6.059 : H : ARG NH2 H0770 <- 3.23 -> DG N7 L0965 : score 5.83554 : V : LYS CE H0728 <- 3.83 -> DT C7 L0969 : score 2.58152 : x : SER xxxx A0022 <- 4.11 -> DA xxx D0416 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.51 -> DA xxx D0416 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0032 <- 2.96 -> DC xxx E0451 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.98 -> DC xxx C0414 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 4.40 -> DA xxx E0456 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.89 -> DC xxx C0414 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0140 <- 4.27 -> DC xxx E0460 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0222 <- 4.22 -> DA xxx F0466 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0224 <- 3.70 -> DA xxx F0466 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0232 <- 3.35 -> DC xxx C0401 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0246 <- 3.82 -> DC xxx E0464 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0266 <- 4.48 -> DA xxx C0406 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0273 <- 4.19 -> DC xxx E0464 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0340 <- 4.24 -> DC xxx C0410 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0522 <- 4.11 -> DA xxx J0916 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0524 <- 3.83 -> DA xxx J0916 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0546 <- 4.02 -> DG xxx J0915 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0566 <- 4.41 -> DA xxx K0956 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0573 <- 4.15 -> DC xxx I0914 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0722 <- 4.16 -> DA xxx L0966 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0724 <- 3.62 -> DA xxx L0966 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0746 <- 3.92 -> DC xxx K0964 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0766 <- 4.38 -> DA xxx I0906 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx H0773 <- 3.97 -> DC xxx K0964 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0840 <- 4.29 -> DC xxx I0910 : score x.xxxxx >1n3e_G:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF I-CREI BOUND TO A PALINDROMIC DNA SEQUENCE I (PALINDROME OF LEFT SIDE OF WILDTYPE DNA TARGET SEQUENCE) organism=Chlamydomonas reinhardtii : H : GLN NE2 G0526 <- 3.40 -> DG N7 J0918 : score 3.69487 : H : LYS NZ G0528 <- 2.95 -> DT O4 J0919 : score 3.47956 : w : LYS NZ G0528 <- 5.59 -> DA N6 K0955 : score 2.097 : w : SER OG G0532 <- 5.94 -> DG O6 K0952 : score 2.749 : H : TYR OH G0533 <- 2.57 -> DA N7 K0953 : score 4.34224 : H : GLN OE1 G0538 <- 3.44 -> DA N6 K0954 : score 5.27784 : H : GLN NE2 G0538 <- 2.80 -> DA N7 K0954 : score 6.08974 : w : SER OG G0540 <- 6.06 -> DA N6 K0955 : score 2.209 : H : GLN NE2 G0544 <- 2.85 -> DA N7 J0916 : score 6.02885 : w : GLN OE1 G0544 <- 6.28 -> DC N4 J0917 : score 3.488 : H : ARG NH1 G0568 <- 3.03 -> DG N7 K0958 : score 5.7717 : H : ARG NH2 G0568 <- 2.83 -> DG O6 K0958 : score 6.5604 : H : ARG NH1 G0570 <- 2.75 -> DG O6 J0915 : score 6.14417 : H : ARG NH2 G0570 <- 3.17 -> DG N7 J0915 : score 5.91215 : w : THR OG1 G0640 <- 5.35 -> DC O2 J0917 : score 2.048 : x : SER xxxx G0522 <- 4.11 -> DA xxx J0916 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0524 <- 3.83 -> DA xxx J0916 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0546 <- 4.02 -> DG xxx J0915 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0566 <- 4.41 -> DA xxx K0956 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0573 <- 4.15 -> DC xxx I0914 : score x.xxxxx >1n3f_A:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF I-CREI BOUND TO A PALINDROMIC DNA SEQUENCE II (PALINDROME OF RIGHT SIDE OF WILDTYPE DNA TARGET SEQUENCE) organism=Chlamydomonas reinhardtii : w : GLN OE1 A0026 <- 5.46 -> DA N6 F0468 : score 3.392 : H : LYS NZ A0028 <- 2.60 -> DG O6 F0469 : score 6.012 : w : LYS NZ A0028 <- 6.07 -> DA N6 C0405 : score 2.097 : w : LYS NZ A0028 <- 5.94 -> DA N6 F0468 : score 2.097 : H : ASN ND2 A0030 <- 3.13 -> DT O4 F0471 : score 4.93583 : w : ASN OD1 A0030 <- 6.36 -> DT O4 F0472 : score 3.132 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.00 -> DT O4 F0470 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.40 -> DG N7 C0402 : score 3.94421 : w : SER OG A0032 <- 6.23 -> DT O4 F0472 : score 2.338 : H : TYR OH A0033 <- 2.50 -> DA N7 C0403 : score 4.40036 : H : TYR OH A0033 <- 2.95 -> DA N6 C0403 : score 4.5304 : H : GLN OE1 A0038 <- 3.22 -> DA N6 C0404 : score 5.54415 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.77 -> DA N7 C0404 : score 6.12628 : w : GLN OE1 A0038 <- 6.12 -> DA N6 C0405 : score 3.392 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.93 -> DT O4 F0470 : score 3.068 : H : GLN NE2 A0044 <- 2.98 -> DA N7 F0466 : score 5.87051 : w : GLN OE1 A0044 <- 5.82 -> DC N4 F0467 : score 3.488 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.00 -> DG N7 C0408 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.81 -> DG O6 C0408 : score 6.5868 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.76 -> DG O6 F0465 : score 6.132 : H : ARG NH2 A0070 <- 3.00 -> DG N7 F0465 : score 6.12923 : w : LYS NZ A0139 <- 6.06 -> DC O2 C0412 : score 1.3 : w : THR OG1 A0140 <- 5.29 -> DC O2 F0467 : score 2.048 : x : SER xxxx A0022 <- 4.12 -> DA xxx F0466 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.66 -> DA xxx F0466 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.75 -> DG xxx F0465 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 4.07 -> DC xxx C0406 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 4.02 -> DG xxx E0463 : score x.xxxxx >1n3f_AB:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF I-CREI BOUND TO A PALINDROMIC DNA SEQUENCE II (PALINDROME OF RIGHT SIDE OF WILDTYPE DNA TARGET SEQUENCE) organism=Chlamydomonas reinhardtii : w : GLN OE1 A0026 <- 5.46 -> DA N6 F0468 : score 3.392 : H : LYS NZ A0028 <- 2.60 -> DG O6 F0469 : score 6.012 : w : LYS NZ A0028 <- 6.07 -> DA N6 C0405 : score 2.097 : w : LYS NZ A0028 <- 5.94 -> DA N6 F0468 : score 2.097 : H : ASN ND2 A0030 <- 3.13 -> DT O4 F0471 : score 4.93583 : w : ASN OD1 A0030 <- 6.36 -> DT O4 F0472 : score 3.132 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.00 -> DT O4 F0470 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.40 -> DG N7 C0402 : score 3.94421 : w : SER OG A0032 <- 6.23 -> DT O4 F0472 : score 2.338 : H : TYR OH A0033 <- 2.50 -> DA N7 C0403 : score 4.40036 : H : TYR OH A0033 <- 2.95 -> DA N6 C0403 : score 4.5304 : H : GLN OE1 A0038 <- 3.22 -> DA N6 C0404 : score 5.54415 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.77 -> DA N7 C0404 : score 6.12628 : w : GLN OE1 A0038 <- 6.12 -> DA N6 C0405 : score 3.392 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.93 -> DT O4 F0470 : score 3.068 : H : GLN NE2 A0044 <- 2.98 -> DA N7 F0466 : score 5.87051 : w : GLN OE1 A0044 <- 5.82 -> DC N4 F0467 : score 3.488 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.00 -> DG N7 C0408 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.81 -> DG O6 C0408 : score 6.5868 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.76 -> DG O6 F0465 : score 6.132 : H : ARG NH2 A0070 <- 3.00 -> DG N7 F0465 : score 6.12923 : w : LYS NZ A0139 <- 6.06 -> DC O2 C0412 : score 1.3 : w : THR OG1 A0140 <- 5.29 -> DC O2 F0467 : score 2.048 : w : GLN OE1 B0226 <- 5.51 -> DA N6 D0418 : score 3.392 : H : LYS NZ B0228 <- 2.68 -> DG O6 D0419 : score 5.91951 : w : LYS NZ B0228 <- 5.88 -> DA N6 D0418 : score 2.097 : w : LYS NZ B0228 <- 6.36 -> DA N6 E0455 : score 2.097 : w : ASN ND2 B0230 <- 5.75 -> DT O4 D0420 : score 3.275 : w : SER OG B0232 <- 5.02 -> DG O6 E0452 : score 2.749 : H : TYR OH B0233 <- 2.61 -> DA N7 E0453 : score 4.30903 : H : TYR OH B0233 <- 2.95 -> DA N6 E0453 : score 4.5304 : H : GLN OE1 B0238 <- 3.18 -> DA N6 E0454 : score 5.59257 : H : GLN NE2 B0238 <- 2.95 -> DA N7 E0454 : score 5.90705 : w : GLN OE1 B0238 <- 5.46 -> DT O4 D0420 : score 3.068 : w : GLN OE1 B0238 <- 6.13 -> DA N6 E0455 : score 3.392 : w : SER OG B0240 <- 6.51 -> DA N6 E0455 : score 2.209 : H : GLN NE2 B0244 <- 2.87 -> DA N7 D0416 : score 6.00449 : w : GLN OE1 B0244 <- 5.82 -> DC N4 D0417 : score 3.488 : H : ARG NH1 B0268 <- 2.68 -> DG O6 E0458 : score 6.22933 : H : ARG NH2 B0268 <- 3.06 -> DG N7 E0458 : score 6.05262 : H : ARG NH1 B0270 <- 2.75 -> DG O6 D0415 : score 6.14417 : H : ARG NH2 B0270 <- 2.95 -> DG N7 D0415 : score 6.19308 : w : LYS NZ B0339 <- 6.02 -> DC O2 E0462 : score 1.3 : w : THR OG1 B0340 <- 5.47 -> DC O2 D0417 : score 2.048 : x : SER xxxx A0022 <- 4.12 -> DA xxx F0466 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.66 -> DA xxx F0466 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.75 -> DG xxx F0465 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 4.07 -> DC xxx C0406 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 4.02 -> DG xxx E0463 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0222 <- 4.09 -> DA xxx D0416 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0224 <- 3.77 -> DA xxx D0416 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0246 <- 3.66 -> DG xxx D0415 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0266 <- 3.92 -> DC xxx E0456 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0273 <- 3.96 -> DA xxx C0414 : score x.xxxxx >1n3f_GH:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF I-CREI BOUND TO A PALINDROMIC DNA SEQUENCE II (PALINDROME OF RIGHT SIDE OF WILDTYPE DNA TARGET SEQUENCE) organism=Chlamydomonas reinhardtii : H : GLN NE2 G0526 <- 2.96 -> DA N7 L0968 : score 5.89487 : H : LYS NZ G0528 <- 2.53 -> DG O6 L0969 : score 6.09293 : w : LYS NZ G0528 <- 5.88 -> DA N6 I0905 : score 2.097 : w : ASN ND2 G0530 <- 5.80 -> DT O4 L0970 : score 3.275 : H : TYR OH G0533 <- 2.38 -> DA N7 I0903 : score 4.49999 : H : TYR OH G0533 <- 2.85 -> DA N6 I0903 : score 4.62381 : H : GLN OE1 G0538 <- 3.24 -> DA N6 I0904 : score 5.51994 : H : GLN NE2 G0538 <- 2.82 -> DA N7 I0904 : score 6.06538 : w : GLN OE1 G0538 <- 6.09 -> DA N6 I0905 : score 3.392 : w : GLN OE1 G0538 <- 5.67 -> DT O4 L0970 : score 3.068 : w : SER OG G0540 <- 6.29 -> DA N6 I0905 : score 2.209 : H : GLN NE2 G0544 <- 2.81 -> DA N7 L0966 : score 6.07756 : w : GLN OE1 G0544 <- 5.79 -> DC N4 L0967 : score 3.488 : H : ARG NH1 G0568 <- 3.10 -> DG N7 I0908 : score 5.687 : H : ARG NH2 G0568 <- 2.84 -> DG O6 I0908 : score 6.5472 : H : ARG NH1 G0570 <- 2.69 -> DG O6 L0965 : score 6.21717 : H : ARG NH1 G0570 <- 2.91 -> DT O4 I0909 : score 3.19605 : H : ARG NH2 G0570 <- 3.00 -> DG N7 L0965 : score 6.12923 : w : LYS NZ G0639 <- 5.80 -> DC O2 I0912 : score 1.3 : w : THR OG1 G0640 <- 5.33 -> DC O2 L0967 : score 2.048 : H : LYS NZ H0728 <- 2.64 -> DG O6 J0919 : score 5.96575 : w : LYS NZ H0728 <- 5.59 -> DA N6 K0955 : score 2.097 : w : ASN ND2 H0730 <- 6.07 -> DT O4 J0920 : score 3.275 : w : SER OG H0732 <- 5.54 -> DG O6 K0952 : score 2.749 : H : TYR OH H0733 <- 2.60 -> DA N7 K0953 : score 4.31733 : H : TYR OH H0733 <- 2.73 -> DA N6 K0953 : score 4.7359 : H : GLN OE1 H0738 <- 3.44 -> DA N6 K0954 : score 5.27784 : H : GLN NE2 H0738 <- 3.04 -> DA N7 K0954 : score 5.79744 : w : GLN OE1 H0738 <- 5.46 -> DT O4 J0920 : score 3.068 : w : GLN OE1 H0738 <- 6.27 -> DA N6 K0955 : score 3.392 : H : GLN NE2 H0744 <- 2.97 -> DA N7 J0916 : score 5.88269 : w : GLN OE1 H0744 <- 5.69 -> DC N4 J0917 : score 3.488 : H : ARG NH1 H0768 <- 3.00 -> DG O6 K0958 : score 5.84 : H : ARG NH2 H0768 <- 3.29 -> DG N7 K0958 : score 5.75892 : H : ARG NH1 H0770 <- 2.79 -> DG O6 J0915 : score 6.0955 : H : ARG NH2 H0770 <- 3.01 -> DG N7 J0915 : score 6.11646 : w : LYS NZ H0839 <- 5.89 -> DC O2 K0962 : score 1.3 : w : THR OG1 H0840 <- 5.37 -> DC O2 J0917 : score 2.048 : x : SER xxxx G0522 <- 4.15 -> DA xxx L0966 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0524 <- 3.54 -> DA xxx L0966 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0532 <- 3.82 -> DG xxx I0902 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0546 <- 3.70 -> DG xxx L0965 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0566 <- 4.25 -> DC xxx I0906 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0573 <- 3.97 -> DG xxx K0963 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0722 <- 4.13 -> DA xxx J0916 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0724 <- 3.63 -> DA xxx J0916 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0726 <- 3.11 -> DA xxx J0918 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0746 <- 3.73 -> DG xxx J0915 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0766 <- 3.81 -> DC xxx K0956 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx H0773 <- 3.99 -> DA xxx I0914 : score x.xxxxx >1n48_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=Y-FAMILY DNA POLYMERASE DPO4 IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING ABASIC LESION organism=Sulfolobus solfataricus : H : LYS NZ A0243 <- 3.01 -> DG N7 B1805 : score 5.15969 : w : LYS NZ A0243 <- 5.84 -> DG O6 B1805 : score 3.005 : x : ALA xxxx A0042 <- 3.60 -> DT xxx C1906 : score x.xxxxx >1n56_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=Y-FAMILY DNA POLYMERASE DPO4 IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING ABASIC LESION organism=Sulfolobus solfataricus : w : LYS NZ B0221 <- 5.73 -> DA N3 E1810 : score 1.538 : x : VAL xxxx B0032 <- 3.54 -> DT xxx F1905 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0042 <- 3.59 -> DT xxx F1905 : score x.xxxxx >1n5y_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CROSSLINKED TO POST-TRANSLOCATION AZTMP- TERMINATED DNA (COMPLEX P) organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.69 -> DC O2 P0821 : score 3.57438 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.02 -> DT O2 P0806 : score 4.11693 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.82 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.66 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.27 -> DG xxx T0714 : score x.xxxxx >1n6j_A:SRF-like; title=STRUCTURAL BASIS OF SEQUENCE-SPECIFIC RECRUITMENT OF HISTONE DEACETYLASES BY MYOCYTE ENHANCER FACTOR-2 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0003 <- 2.64 -> DT O2 C0006 : score 2.65938 : x : LYS xxxx A0023 <- 3.55 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx >1n6j_AB:SRF-like; title=STRUCTURAL BASIS OF SEQUENCE-SPECIFIC RECRUITMENT OF HISTONE DEACETYLASES BY MYOCYTE ENHANCER FACTOR-2 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0003 <- 2.64 -> DT O2 C0006 : score 2.65938 : H : ARG NE B0003 <- 2.63 -> DT O2 D0006 : score 2.66454 : H : ARG NH2 B0003 <- 3.12 -> DT O2 D0006 : score 3.9624 : w : LYS NZ B0023 <- 5.98 -> DA N7 C0014 : score 1.655 : w : LYS NZ B0023 <- 5.71 -> DC N4 D0004 : score 0.048 : x : LYS xxxx A0023 <- 3.55 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx >1n6q_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CROSSLINKED TO PRE-TRANSLOCATION AZTMP- TERMINATED DNA (COMPLEX N) organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.94 -> DC O2 P0821 : score 3.39951 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.13 -> DT O2 P0806 : score 4.02219 : x : ILE xxxx A0094 <- 4.08 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0151 <- 3.35 -> DA xxx T0705 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.26 -> DT xxx T0706 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.30 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx >1n6q_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CROSSLINKED TO PRE-TRANSLOCATION AZTMP- TERMINATED DNA (COMPLEX N) organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.94 -> DC O2 P0821 : score 3.39951 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.13 -> DT O2 P0806 : score 4.02219 : x : ILE xxxx A0094 <- 4.08 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0151 <- 3.35 -> DA xxx T0705 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.26 -> DT xxx T0706 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.30 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx >1nfk_A:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=STRUCTURE OF THE NUCLEAR FACTOR KAPPA-B (NF-KB) P50 HOMODIMER organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0054 <- 3.18 -> DG N7 D0003 : score 5.5902 : H : ARG NH2 A0054 <- 3.02 -> DG O6 D0003 : score 6.3096 : H : ARG NH1 A0056 <- 2.64 -> DG O6 D0002 : score 6.278 : H : ARG NH2 A0056 <- 3.27 -> DG N7 D0002 : score 5.78446 : H : GLU OE1 A0060 <- 3.20 -> DC N4 C0010 : score 5.30651 : w : GLU OE2 A0060 <- 5.85 -> DC N4 C0009 : score 3.597 : H : LYS NZ A0241 <- 2.92 -> DT O4 C0008 : score 3.50109 : x : TYR xxxx A0057 <- 3.41 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0059 <- 3.53 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0243 <- 4.22 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0272 <- 3.34 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0305 <- 3.47 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1nfk_AB:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=STRUCTURE OF THE NUCLEAR FACTOR KAPPA-B (NF-KB) P50 HOMODIMER organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0054 <- 3.18 -> DG N7 D0003 : score 5.5902 : H : ARG NH2 A0054 <- 3.02 -> DG O6 D0003 : score 6.3096 : H : ARG NH1 A0056 <- 2.64 -> DG O6 D0002 : score 6.278 : H : ARG NH2 A0056 <- 3.27 -> DG N7 D0002 : score 5.78446 : H : GLU OE1 A0060 <- 3.20 -> DC N4 C0010 : score 5.30651 : w : GLU OE2 A0060 <- 5.85 -> DC N4 C0009 : score 3.597 : H : LYS NZ A0241 <- 2.92 -> DT O4 C0008 : score 3.50109 : H : ARG NH2 B0054 <- 2.69 -> DG O6 C0003 : score 6.7452 : H : ARG NH1 B0056 <- 2.95 -> DG N7 C0002 : score 5.8685 : H : ARG NH2 B0056 <- 2.83 -> DG O6 C0002 : score 6.5604 : H : GLU OE2 B0060 <- 2.93 -> DC N4 D0010 : score 5.12848 : x : TYR xxxx A0057 <- 3.41 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0059 <- 3.53 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0243 <- 4.22 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0272 <- 3.34 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0305 <- 3.47 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0057 <- 3.33 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0059 <- 3.52 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0241 <- 3.15 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0243 <- 4.49 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0272 <- 3.52 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0305 <- 4.34 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >1ng9_A:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=E.COLI MUTS R697A: AN ATPASE-ASYMMETRY MUTANT organism=Escherichia coli : H : GLU OE2 A0038 <- 2.64 -> DT N3 F0022 : score 2.72025 : w : ARG NH1 A0058 <- 5.72 -> DC O2 E0011 : score 1.381 : x : MET xxxx A0033 <- 3.77 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0036 <- 3.18 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 4.15 -> DC xxx F0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.25 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >1ng9_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=E.COLI MUTS R697A: AN ATPASE-ASYMMETRY MUTANT organism=Escherichia coli : H : GLU OE2 A0038 <- 2.64 -> DT N3 F0022 : score 2.72025 : w : ARG NH1 A0058 <- 5.72 -> DC O2 E0011 : score 1.381 : x : MET xxxx A0033 <- 3.77 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0036 <- 3.18 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 4.15 -> DC xxx F0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.25 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >1ngm_I:TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A YEAST BRF1-TBP-DNA TERNARY COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN ND2 I0069 <- 2.67 -> DT O2 L0014 : score 4.86955 : H : ASN ND2 I0069 <- 3.10 -> DT O2 L0015 : score 4.46138 : H : THR OG1 I0215 <- 2.83 -> DA N3 K0005 : score 1.34572 : x : VAL xxxx I0071 <- 3.35 -> DA xxx K0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0099 <- 2.88 -> DT xxx L0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0114 <- 3.25 -> DT xxx L0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0116 <- 3.67 -> DA xxx K0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0122 <- 3.37 -> DA xxx K0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0124 <- 3.66 -> DT xxx L0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0159 <- 3.12 -> DA xxx K0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0161 <- 3.70 -> DA xxx K0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0190 <- 3.08 -> DA xxx K0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0191 <- 3.23 -> DA xxx L0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0205 <- 3.73 -> DA xxx K0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0207 <- 3.38 -> DT xxx L0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0213 <- 3.44 -> DA xxx L0016 : score x.xxxxx >1nh2_AC:Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A YEAST TFIIA/TBP/DNA COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN ND2 A0069 <- 2.82 -> DT O2 F0004 : score 4.72717 : H : ASN ND2 A0069 <- 3.17 -> DT O2 F0005 : score 4.39494 : H : ASN ND2 A0159 <- 3.26 -> DA N3 E0012 : score 3.45738 : H : THR OG1 A0215 <- 2.75 -> DA N3 E0012 : score 1.36738 : x : VAL xxxx A0071 <- 3.63 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0099 <- 3.28 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0114 <- 3.40 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0116 <- 3.65 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0122 <- 3.62 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0124 <- 3.57 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0161 <- 3.45 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0190 <- 3.21 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0191 <- 3.31 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0205 <- 3.67 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0207 <- 3.31 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0213 <- 3.53 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx >1nh3_A:Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_N-terminal_DNA-binding_fragment;DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=HUMAN TOPOISOMERASE I ARA-C COMPLEX organism=Homo sapiens : x : ILE xxxx A0424 <- 3.60 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0426 <- 3.01 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0428 <- 3.75 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0491 <- 3.68 -> DC xxx D0117 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0532 <- 3.32 -> DA xxx D0114 : score x.xxxxx >1njw_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=GUANINE-THYMINE MISMATCH AT THE POLYMERASE ACTIVE SITE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.98 -> DG N3 B0026 : score 1.40151 : w : LYS NZ A0582 <- 5.84 -> DA N3 B0025 : score 1.538 : w : LYS NZ A0582 <- 5.57 -> DT O2 C0008 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 5.29 -> DT O2 C0008 : score 2.522 : H : ARG NH1 A0615 <- 3.15 -> DG N3 B0029 : score 2.83888 : w : ASN ND2 A0622 <- 6.17 -> DC O2 C0007 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.90 -> DC O2 B0027 : score 4.3899 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.82 -> DC O2 C0007 : score 1.885 : x : PHE xxxx A0710 <- 3.82 -> DG xxx B0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.24 -> DG xxx B0029 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 3.56 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx >1njx_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=THYMINE-GUANINE MISMATCH AT THE POLYMERASE ACTIVE SITE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 3.02 -> DG N3 B0026 : score 1.38988 : w : LYS NZ A0582 <- 5.55 -> DA N3 C0008 : score 1.538 : w : LYS NZ A0582 <- 5.74 -> DT O2 B0025 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 5.52 -> DA N3 C0008 : score 2.845 : w : ASN ND2 A0622 <- 6.20 -> DC O2 C0007 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.94 -> DC O2 B0027 : score 4.35406 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.87 -> DC O2 C0007 : score 1.885 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.96 -> DT O2 B0028 : score 3.682 : x : PHE xxxx A0710 <- 3.40 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 2.96 -> DT xxx B0029 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 3.91 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1njy_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=THYMINE-THYMINE MISMATCH AT THE POLYMERASE ACTIVE SITE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.68 -> DC O2 B0026 : score 3.01686 : w : LYS NZ A0582 <- 5.52 -> DT O2 C0008 : score 0.522 : w : LYS NZ A0582 <- 6.03 -> DA N3 B0025 : score 1.538 : w : THR OG1 A0586 <- 5.55 -> DT O2 C0008 : score 2.522 : H : ARG NH1 A0615 <- 3.10 -> DT O2 B0029 : score 4.04803 : w : ARG NH1 A0615 <- 6.23 -> DA N3 C0005 : score 2.585 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.46 -> DC O2 C0006 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.12 -> DG N3 B0027 : score 4.5816 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.90 -> DG N3 C0007 : score 2.566 : w : GLU OE1 A0658 <- 5.98 -> DT O2 C0004 : score 2.462 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.44 -> DT O2 C0004 : score 1.666 : H : GLN NE2 A0797 <- 2.93 -> DT O2 C0004 : score 3.83107 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.28 -> DT O2 C0004 : score 1.565 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.46 -> DT O2 B0028 : score 3.682 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.38 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.43 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx >1njz_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CYTOSINE-THYMINE MISMATCH AT THE POLYMERASE ACTIVE SITE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.96 -> DA N3 B0026 : score 2.68806 : w : LYS NZ A0582 <- 5.87 -> DG N3 C0010 : score 2.232 : w : THR OG1 A0586 <- 5.99 -> DG N3 C0010 : score 2.036 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.78 -> DC O2 B0029 : score 3.6646 A : w : ARG NH1 A0615 <- 5.76 -> DG N3 C0007 : score 1.593 A : w : ARG NH2 A0615 <- 6.07 -> DT O2 C0006 : score 2.261 A : w : ASN ND2 A0622 <- 5.61 -> DC O2 C0008 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.13 -> DG N3 B0027 : score 4.57181 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.61 -> DT O2 C0009 : score 1.666 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.86 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0714 <- 3.45 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.32 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx >1nk0_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=ADENINE-GUANINE MISMATCH AT THE POLYMERASE ACTIVE SITE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 3.02 -> DG N3 B0026 : score 1.38988 : w : LYS NZ A0582 <- 5.75 -> DA N3 B0025 : score 1.538 : w : LYS NZ A0582 <- 5.41 -> DT O2 C0008 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 5.40 -> DT O2 C0008 : score 2.522 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.14 -> DA N3 B0029 : score 3.01944 : w : ARG NH2 A0615 <- 5.58 -> DT O2 C0005 : score 2.261 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.95 -> DC O2 C0007 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.94 -> DC O2 B0027 : score 4.35406 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.82 -> DC O2 C0007 : score 1.885 : H : ARG NH2 A0629 <- 2.94 -> DA N7 B0029 : score 1.62498 : w : ASN ND2 A0724 <- 6.02 -> DG N7 C0004 : score 3.259 : w : GLN OE1 A0797 <- 5.85 -> DG N2 C0004 : score 2.177 : w : GLN NE2 A0797 <- 5.75 -> DG N3 C0004 : score 1.484 : w : HIS NE2 A0829 <- 6.00 -> DA N3 B0028 : score 2.619 : x : PHE xxxx A0710 <- 3.70 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.09 -> DA xxx B0029 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 3.51 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1nk2_P:Homeodomain-like; title=VND/NK-2 HOMEODOMAIN/DNA COMPLEX, NMR, 20 STRUCTURES organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : LYS NZ P0111 <- 3.07 -> DG N3 B0027 : score 1.37534 : H : LYS NZ P0111 <- 3.27 -> DA N3 A0008 : score 2.51589 : H : ARG NE P0113 <- 3.30 -> DC O2 A0006 : score 2.39308 : H : ARG NH2 P0113 <- 3.01 -> DT O2 A0005 : score 4.05553 : H : ASN ND2 P0159 <- 3.08 -> DA N7 A0008 : score 5.54176 : x : ILE xxxx P0155 <- 4.20 -> DA xxx A0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx P0158 <- 4.04 -> DC xxx B0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx P0162 <- 4.25 -> DA xxx B0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0166 <- 3.32 -> DT xxx B0025 : score x.xxxxx >1nk3_P:Homeodomain-like; title=VND/NK-2 HOMEODOMAIN/DNA COMPLEX, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NE P0105 <- 3.11 -> DC O2 A0006 : score 2.49412 : H : ARG NH2 P0105 <- 2.91 -> DT O2 A0005 : score 4.1402 : H : ARG NH2 P0105 <- 3.08 -> DC O2 A0006 : score 3.49159 : H : ARG NH2 P0105 <- 2.66 -> DC O2 B0029 : score 3.80228 : x : LYS xxxx P0103 <- 3.58 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx P0147 <- 3.91 -> DA xxx A0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx P0150 <- 3.74 -> DC xxx B0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0151 <- 3.35 -> DA xxx A0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx P0154 <- 4.00 -> DA xxx B0023 : score x.xxxxx >1nk4_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=GUANINE-GUANINE MISMATCH AT THE POLYMERASE ACTIVE SITE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.76 -> DC O2 B0026 : score 2.96972 : w : LYS NZ A0582 <- 5.91 -> DT O2 B0025 : score 0.522 : w : LYS NZ A0582 <- 5.57 -> DA N3 C0008 : score 1.538 : w : THR OG1 A0586 <- 5.66 -> DA N3 C0008 : score 2.845 : w : TYR OH A0587 <- 5.83 -> DG N2 C0007 : score 2.834 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.81 -> DT O2 C0006 : score 1.666 : w : ASN ND2 A0622 <- 6.13 -> DG N3 C0007 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.06 -> DA N3 B0027 : score 3.60969 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.80 -> DG N3 C0007 : score 2.566 : x : ARG xxxx A0615 <- 3.60 -> DG xxx B0029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0710 <- 3.24 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 2.95 -> DG xxx B0029 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 3.88 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1nk5_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=ADENINE-ADENINE MISMATCH AT THE POLYMERASE ACTIVE SITE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.96 -> DG N3 B0026 : score 1.40732 : w : LYS NZ A0582 <- 5.54 -> DT O2 B0025 : score 0.522 : w : LYS NZ A0582 <- 5.55 -> DA N3 C0008 : score 1.538 : w : THR OG1 A0586 <- 5.83 -> DA N3 C0008 : score 2.845 : H : ARG NH1 A0615 <- 3.03 -> DA N3 B0029 : score 3.51268 : w : ARG NH1 A0615 <- 6.02 -> DA N3 C0005 : score 2.585 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.67 -> DT O2 C0006 : score 1.666 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.29 -> DA N3 B0027 : score 3.43454 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.95 -> DC O2 C0007 : score 1.885 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.38 -> DT O2 B0028 : score 3.682 : x : ARG xxxx A0629 <- 3.10 -> DA xxx B0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.32 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.19 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx >1nk6_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CYTOSINE-CYTOSINE MISMATCH AT THE POLYMERASE ACTIVE SITE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.82 -> DG N3 B0026 : score 1.44803 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.61 -> DT O2 C0006 : score 1.666 : w : ASN ND2 A0622 <- 6.10 -> DC O2 C0007 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.29 -> DA N3 B0027 : score 3.43454 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.71 -> DC O2 C0007 : score 1.885 : w : GLN OE1 A0797 <- 5.66 -> DG N2 C0004 : score 2.177 : w : GLN NE2 A0797 <- 5.53 -> DG N3 C0004 : score 1.484 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.44 -> DA xxx B0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0710 <- 3.86 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.59 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 3.65 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 3.87 -> DT xxx B0028 : score x.xxxxx >1nk8_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=A BACILLUS DNA POLYMERASE I PRODUCT COMPLEX BOUND TO A GUANINE- THYMINE MISMATCH AFTER A SINGLE ROUND OF PRIMER EXTENSION, FOLLOWING INCORPORATION OF DCTP. organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 3.02 -> DG N3 B0026 : score 1.38988 : w : LYS NZ A0582 <- 5.84 -> DA N3 B0025 : score 1.538 : w : LYS NZ A0582 <- 5.39 -> DT O2 C0008 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 5.46 -> DT O2 C0008 : score 2.522 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.83 -> DC O2 B0029 : score 3.6281 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.90 -> DC O2 C0007 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.01 -> DC O2 B0027 : score 4.29135 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.63 -> DC O2 C0007 : score 1.885 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.25 -> DG N3 C0004 : score 1.484 : x : PHE xxxx A0710 <- 3.80 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.27 -> DC xxx B0029 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 3.56 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.08 -> DG xxx B0028 : score x.xxxxx >1nk9_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=A BACILLUS DNA POLYMERASE I PRODUCT COMPLEX BOUND TO A GUANINE- THYMINE MISMATCH AFTER TWO ROUNDS OF PRIMER EXTENSION, FOLLOWING INCORPORATION OF DCTP AND DGTP. organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.69 -> DC O2 B0026 : score 3.01097 : w : LYS NZ A0582 <- 5.51 -> DC O2 C0008 : score 1.3 : w : THR OG1 A0586 <- 5.48 -> DC O2 C0008 : score 2.048 : w : TYR OH A0587 <- 5.67 -> DG N2 C0007 : score 2.834 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.90 -> DG N3 B0029 : score 2.99151 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.45 -> DT O2 C0006 : score 1.666 : w : ASN ND2 A0622 <- 6.02 -> DG N3 C0007 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.30 -> DG N3 B0027 : score 4.40538 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.62 -> DG N3 C0007 : score 2.566 : H : ARG NH2 A0629 <- 2.98 -> DG N7 B0029 : score 6.15477 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.89 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0714 <- 3.14 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.81 -> DG xxx B0029 : score x.xxxxx >1nkb_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=A BACILLUS DNA POLYMERASE I PRODUCT COMPLEX BOUND TO A GUANINE- THYMINE MISMATCH AFTER THREE ROUNDS OF PRIMER EXTENSION, FOLLOWING INCORPORATION OF DCTP, DGTP, AND DTTP. organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 3.27 -> DG N3 B0026 : score 1.31718 : w : LYS NZ A0582 <- 5.87 -> DC O2 B0025 : score 1.3 : w : LYS NZ A0582 <- 6.25 -> DG N2 C0008 : score 0.846 : w : THR OG1 A0586 <- 5.69 -> DG N2 C0008 : score 2.036 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.76 -> DT O2 B0029 : score 4.34086 : H : ARG NH2 A0615 <- 2.91 -> DT O2 B0029 : score 4.1402 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.90 -> DC O2 C0005 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.88 -> DG N3 C0006 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.25 -> DC O2 B0027 : score 4.07633 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.80 -> DT O2 C0007 : score 1.666 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.43 -> DC xxx B0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0710 <- 4.35 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.29 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.70 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.34 -> DG xxx B0028 : score x.xxxxx >1nkc_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=A BACILLUS DNA POLYMERASE I PRODUCT COMPLEX BOUND TO A GUANINE- THYMINE MISMATCH AFTER FIVE ROUNDS OF PRIMER EXTENSION, FOLLOWING INCORPORATION OF DCTP, DGTP, DTTP, AND DATP. organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 3.00 -> DG N3 B0013 : score 1.39569 : w : LYS NZ A0582 <- 5.92 -> DC O2 B0012 : score 1.3 : w : LYS NZ A0582 <- 5.82 -> DG N3 C0031 : score 2.232 : w : THR OG1 A0586 <- 5.58 -> DG N3 C0031 : score 2.036 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.86 -> DC O2 B0016 : score 3.6062 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.24 -> DC O2 B0016 : score 3.37323 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.54 -> DT O2 C0028 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.83 -> DA N3 C0029 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.05 -> DT O2 B0014 : score 4.50885 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.66 -> DC O2 C0030 : score 1.885 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.77 -> DA N3 B0015 : score 2.619 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.43 -> DT xxx B0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.38 -> DG xxx C0027 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.42 -> DG xxx C0027 : score x.xxxxx >1nke_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=A BACILLUS DNA POLYMERASE I PRODUCT COMPLEX BOUND TO A CYTOSINE- THYMINE MISMATCH AFTER A SINGLE ROUND OF PRIMER EXTENSION, FOLLOWING INCORPORATION OF DCTP. organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.95 -> DG N3 B0026 : score 1.41023 : w : LYS NZ A0582 <- 6.10 -> DA N3 B0025 : score 1.538 : w : LYS NZ A0582 <- 5.53 -> DT O2 C0010 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 5.30 -> DT O2 C0010 : score 2.522 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.88 -> DC O2 B0029 : score 3.5916 A : H : ARG NH2 A0615 <- 3.24 -> DC O2 B0029 : score 3.37323 A : w : ASN ND2 A0622 <- 5.92 -> DG N3 C0008 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.03 -> DC O2 B0027 : score 4.27343 : w : ASN ND2 A0625 <- 6.31 -> DC O2 C0009 : score 1.885 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.72 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.38 -> DC xxx B0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.20 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.75 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx >1nkp_A:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYC-MAX RECOGNIZING DNA organism=HOMO SAPIENS : H : HIS NE2 A0906 <- 3.05 -> DG O6 G0313 : score 7.55615 : H : GLU OE1 A0910 <- 2.95 -> DC N4 F0108 : score 5.59491 : w : GLU OE1 A0910 <- 5.61 -> DG N7 F0107 : score 1.976 : w : GLU OE2 A0910 <- 5.24 -> DG O6 G0311 : score 2.892 : H : ARG NH2 A0914 <- 2.33 -> DG N7 G0311 : score 6.98477 : w : ARG NE A0914 <- 5.45 -> DG O6 G0311 : score 1.369 : w : ARG NH2 A0914 <- 5.74 -> DG O6 G0311 : score 2.468 : x : LYS xxxx A0902 <- 4.49 -> DT xxx F0105 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0907 <- 3.33 -> DT xxx G0312 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0913 <- 3.36 -> DC xxx F0108 : score x.xxxxx >1nkp_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYC-MAX RECOGNIZING DNA organism=HOMO SAPIENS : H : HIS NE2 A0906 <- 3.05 -> DG O6 G0313 : score 7.55615 : H : GLU OE1 A0910 <- 2.95 -> DC N4 F0108 : score 5.59491 : w : GLU OE1 A0910 <- 5.61 -> DG N7 F0107 : score 1.976 : H : ARG NH2 A0914 <- 2.33 -> DG N7 G0311 : score 6.98477 : H : HIS NE2 B0207 <- 2.79 -> DG O6 F0113 : score 7.96975 : w : HIS ND1 B0207 <- 5.93 -> DA N7 G0306 : score 2.619 : H : GLU OE1 B0211 <- 3.20 -> DC N4 G0308 : score 5.30651 : w : GLU OE1 B0211 <- 5.35 -> DG N7 G0307 : score 1.976 : w : GLU OE2 B0211 <- 5.39 -> DG O6 F0111 : score 2.892 : w : ARG NH1 B0215 <- 5.79 -> DG O6 F0111 : score 2.756 : x : LYS xxxx A0902 <- 4.49 -> DT xxx F0105 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0907 <- 3.33 -> DT xxx G0312 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0913 <- 3.36 -> DC xxx F0108 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0208 <- 3.36 -> DT xxx F0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0214 <- 3.46 -> DC xxx G0308 : score x.xxxxx >1nkp_DE: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYC-MAX RECOGNIZING DNA organism=HOMO SAPIENS : H : HIS NE2 D0506 <- 3.01 -> DG O6 H0613 : score 7.61978 : H : GLU OE1 D0510 <- 3.10 -> DC N4 J0808 : score 5.42187 : w : GLU OE1 D0510 <- 5.87 -> DG N7 J0807 : score 1.976 : w : ARG NH1 D0513 <- 5.76 -> DA N7 J0809 : score 0.388 : H : ARG NH1 D0514 <- 3.12 -> DG N7 H0611 : score 5.6628 : H : HIS NE2 E0707 <- 2.77 -> DG O6 J0813 : score 8.00157 : H : GLU OE1 E0711 <- 3.13 -> DC N4 H0608 : score 5.38726 : w : GLU OE1 E0711 <- 5.45 -> DG N7 H0607 : score 1.976 : w : GLU OE2 E0711 <- 5.35 -> DG O6 J0811 : score 2.892 : H : ARG NH2 E0715 <- 2.52 -> DG N7 J0811 : score 6.74215 : w : ARG NE E0715 <- 5.17 -> DG O6 J0811 : score 1.369 : x : ASN xxxx D0507 <- 3.37 -> DT xxx H0612 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0708 <- 3.36 -> DT xxx J0812 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0714 <- 3.59 -> DC xxx H0608 : score x.xxxxx >1nlw_A:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MAD-MAX RECOGNIZING DNA organism=HOMO SAPIENS : H : HIS NE2 A0006 <- 2.89 -> DG O6 F0113 : score 7.81068 : H : GLU OE1 A0010 <- 2.69 -> DC N4 G0308 : score 5.89484 : w : GLU OE2 A0010 <- 5.98 -> DG O6 F0111 : score 2.892 : x : ASN xxxx A0007 <- 3.18 -> DT xxx F0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0013 <- 3.50 -> DC xxx G0308 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0014 <- 3.83 -> DC xxx F0110 : score x.xxxxx >1nlw_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MAD-MAX RECOGNIZING DNA organism=HOMO SAPIENS : H : HIS NE2 A0006 <- 2.89 -> DG O6 F0113 : score 7.81068 : H : GLU OE1 A0010 <- 2.69 -> DC N4 G0308 : score 5.89484 : w : GLU OE2 A0010 <- 5.98 -> DG O6 F0111 : score 2.892 : w : GLU OE1 B0211 <- 5.35 -> DG N7 F0107 : score 1.976 : H : ARG NH2 B0215 <- 2.45 -> DG N7 G0311 : score 6.83154 : x : ASN xxxx A0007 <- 3.18 -> DT xxx F0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0013 <- 3.50 -> DC xxx G0308 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0014 <- 3.83 -> DC xxx F0110 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0203 <- 4.25 -> DT xxx F0105 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0207 <- 2.95 -> DG xxx G0313 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0208 <- 3.60 -> DT xxx G0312 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0214 <- 3.48 -> DG xxx F0107 : score x.xxxxx >1nlw_DE: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MAD-MAX RECOGNIZING DNA organism=HOMO SAPIENS : H : HIS NE2 D0506 <- 3.30 -> DG O6 J0807 : score 7.15846 : H : GLU OE1 D0510 <- 3.26 -> DC N4 J0808 : score 5.2373 : w : GLU OE2 D0510 <- 5.63 -> DG O6 H0611 : score 2.892 : w : ARG NH1 D0514 <- 5.49 -> DG O6 H0611 : score 2.756 : H : HIS NE2 E0707 <- 3.34 -> DG O6 H0607 : score 7.09483 : H : ARG NH2 E0715 <- 3.36 -> DG N7 J0811 : score 5.66954 : x : ASN xxxx D0507 <- 3.58 -> DT xxx H0612 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0509 <- 4.49 -> DT xxx J0805 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0513 <- 3.64 -> DC xxx J0808 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0708 <- 3.62 -> DT xxx J0812 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0711 <- 3.04 -> DC xxx H0608 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0714 <- 3.53 -> DC xxx H0608 : score x.xxxxx >1nne_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MUTS-ADPBEF3-DNA COMPLEX organism=THERMUS AQUATICUS : x : PHE xxxx A0039 <- 3.52 -> DG xxx C1914 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B1472 <- 4.43 -> DA xxx C1909 : score x.xxxxx >1nne_B:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MUTS-ADPBEF3-DNA COMPLEX organism=? : x : ASP xxxx B1472 <- 4.43 -> DA xxx C1909 : score x.xxxxx >1nnj_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE COMPLEX BETWEEN THE LACTOCOCCUS LACTIS FPG AND AN ABASIC SITE CONTAINING DNA organism=Lactococcus lactis : H : ARG NH1 A0074 <- 2.91 -> DT O2 D0008 : score 4.21167 : w : ARG NH1 A0074 <- 6.02 -> DA N3 E0022 : score 2.585 : w : GLU OE2 A0076 <- 5.83 -> DT O2 D0006 : score 2.279 : H : ARG NE A0109 <- 2.86 -> DC O2 E0023 : score 2.62707 : H : ARG NH2 A0109 <- 3.01 -> DC N3 E0023 : score 2.1948 : w : ARG NH1 A0109 <- 6.18 -> DT O2 D0006 : score 1.855 : x : MET xxxx A0075 <- 3.50 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.39 -> DA xxx E0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.41 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1nvp_AC:TATA-box_binding_protein-like;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain; title=HUMAN TFIIA/TBP/DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 A0167 <- 2.95 -> DT O2 F0005 : score 4.60377 : H : ASN ND2 A0167 <- 3.04 -> DT O2 F0006 : score 4.51834 : H : ASN ND2 A0257 <- 3.16 -> DA N3 E0012 : score 3.53354 : H : ASN ND2 A0257 <- 3.20 -> DA N3 E0013 : score 3.50308 : H : THR OG1 A0313 <- 2.78 -> DA N3 E0012 : score 1.35926 : x : VAL xxxx A0169 <- 3.56 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0197 <- 3.36 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0212 <- 3.50 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0214 <- 3.66 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0220 <- 3.51 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0222 <- 3.63 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0259 <- 3.56 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0288 <- 3.11 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0289 <- 3.40 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0303 <- 3.58 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0305 <- 3.27 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0311 <- 3.42 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx >1nwq_AC:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C/EBPALPHA-DNA COMPLEX organism=Rattus norvegicus : H : ASN OD1 A0292 <- 3.37 -> DA N6 D0003 : score 5.33531 : H : ARG NH2 A0300 <- 2.70 -> DG O6 D0001 : score 6.732 : w : ARG NH2 A0300 <- 5.66 -> DG N7 B-002 : score 2.18 : H : ARG NH1 C0289 <- 3.03 -> DA N7 B0003 : score 2.44248 : H : ASN OD1 C0292 <- 2.98 -> DA N6 B0003 : score 5.80501 : H : ASN ND2 C0292 <- 3.10 -> DT O4 D-004 : score 4.96754 : H : ARG NH1 C0300 <- 2.97 -> DG O6 B0001 : score 5.8765 : H : ARG NH2 C0300 <- 2.83 -> DG O6 D-002 : score 6.5604 : H : ARG NH2 C0300 <- 3.15 -> DG O6 B0001 : score 6.138 : V : VAL CG2 A0296 <- 3.85 -> DT C7 B-004 : score 6.04654 : x : ARG xxxx A0289 <- 2.90 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0293 <- 4.20 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0295 <- 4.33 -> DA xxx B-005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0295 <- 3.99 -> DA xxx D-005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0296 <- 2.94 -> DT xxx D-003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0299 <- 4.35 -> DT xxx D-004 : score x.xxxxx >1nwq_C:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C/EBPALPHA-DNA COMPLEX organism=Rattus norvegicus : H : ARG NH1 C0289 <- 3.03 -> DA N7 B0003 : score 2.44248 : H : ASN OD1 C0292 <- 2.98 -> DA N6 B0003 : score 5.80501 : H : ASN ND2 C0292 <- 3.10 -> DT O4 D-004 : score 4.96754 : H : ARG NH1 C0300 <- 2.97 -> DG O6 B0001 : score 5.8765 : H : ARG NH2 C0300 <- 3.15 -> DG O6 B0001 : score 6.138 : H : ARG NH2 C0300 <- 2.83 -> DG O6 D-002 : score 6.5604 : x : ALA xxxx C0295 <- 3.99 -> DA xxx D-005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0296 <- 2.94 -> DT xxx D-003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0299 <- 4.35 -> DT xxx D-004 : score x.xxxxx >1nzb_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF WILD TYPE CRE RECOMBINASE-LOXP SYNAPSE organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ A0086 <- 2.99 -> DG O6 D0115 : score 5.5611 : H : ARG NE A0259 <- 2.68 -> DG O6 C0128 : score 4.03561 : H : ARG NH2 A0259 <- 2.59 -> DG N7 C0128 : score 6.65277 : H : LYS NZ B0201 <- 3.06 -> DT O2 D0123 : score 3.40065 : H : LYS NZ B0244 <- 3.17 -> DT O2 D0135 : score 3.32173 : H : ARG NE B0259 <- 2.36 -> DG O6 D0128 : score 4.28784 : H : ARG NH2 B0259 <- 3.23 -> DG N7 D0128 : score 5.83554 : H : ARG NH2 B0282 <- 2.68 -> DA N3 C0112 : score 3.3175 : V : GLN CG A0090 <- 3.80 -> DT C7 D0113 : score 3.25538 : V : HIS CG B0040 <- 3.64 -> DT C7 D0125 : score 3.11893 : V : MET CE B0044 <- 3.67 -> DT C7 C0111 : score 7.15549 : V : GLN CG B0090 <- 3.90 -> DT C7 C0113 : score 3.174 : V : ASN CG B0317 <- 3.63 -> DT C7 C0118 : score 2.76075 : x : HIS xxxx A0040 <- 3.54 -> DT xxx C0125 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.22 -> DT xxx C0123 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0044 <- 3.50 -> DA xxx C0124 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.87 -> DT xxx D0111 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.44 -> DT xxx D0113 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 4.20 -> DA xxx D0105 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0244 <- 2.81 -> DT xxx D0103 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.87 -> DT xxx D0108 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0262 <- 3.39 -> DC xxx C0127 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0282 <- 2.69 -> DA xxx D0112 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0317 <- 3.27 -> DA xxx D0117 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0041 <- 3.84 -> DT xxx D0123 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0043 <- 3.52 -> DT xxx D0125 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.83 -> DT xxx C0111 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0086 <- 3.33 -> DA xxx C0114 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.27 -> DT xxx C0113 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 3.79 -> DT xxx D0123 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0241 <- 4.33 -> DA xxx C0105 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 3.75 -> DT xxx C0108 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0262 <- 3.56 -> DA xxx D0126 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0319 <- 4.27 -> DT xxx C0118 : score x.xxxxx >1nzb_B:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF WILD TYPE CRE RECOMBINASE-LOXP SYNAPSE organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ B0201 <- 3.06 -> DT O2 D0123 : score 3.40065 : H : LYS NZ B0244 <- 3.17 -> DT O2 D0135 : score 3.32173 : H : ARG NE B0259 <- 2.36 -> DG O6 D0128 : score 4.28784 : H : ARG NH2 B0259 <- 3.23 -> DG N7 D0128 : score 5.83554 : H : ARG NH2 B0282 <- 2.68 -> DA N3 C0112 : score 3.3175 : V : MET CE B0044 <- 3.67 -> DT C7 C0111 : score 7.15549 : V : GLN CG B0090 <- 3.90 -> DT C7 C0113 : score 3.174 : V : ASN CG B0317 <- 3.63 -> DT C7 C0118 : score 2.76075 : V : HIS CG B0040 <- 3.64 -> DT C7 D0125 : score 3.11893 : x : THR xxxx B0041 <- 3.84 -> DT xxx D0123 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0043 <- 3.52 -> DT xxx D0125 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.83 -> DT xxx C0111 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0086 <- 3.33 -> DA xxx C0114 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.27 -> DT xxx C0113 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 3.79 -> DT xxx D0123 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0241 <- 4.33 -> DA xxx C0105 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 3.75 -> DT xxx C0108 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0262 <- 3.56 -> DA xxx D0126 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0319 <- 4.27 -> DT xxx C0118 : score x.xxxxx >1o3q_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=PROTEIN-DNA RECOGNITION AND DNA DEFORMATION REVEALED IN CRYSTAL STRUCTURES OF CAP-DNA COMPLEXES organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0180 <- 3.03 -> DG N7 B0005 : score 5.7717 : H : ARG NH2 A0185 <- 3.16 -> DG O6 B0007 : score 6.1248 : H : ARG NH2 A0185 <- 2.68 -> DT O4 C0008 : score 3.63914 : V : GLU CB A0181 <- 3.82 -> DT C7 C0008 : score 1.61955 : x : SER xxxx A0179 <- 3.64 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0182 <- 4.46 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx >1o3r_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=PROTEIN-DNA RECOGNITION AND DNA DEFORMATION REVEALED IN CRYSTAL STRUCTURES OF CAP-DNA COMPLEXES organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0180 <- 2.78 -> DG N7 B0005 : score 6.0742 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.84 -> DG O6 B0005 : score 6.5472 : H : GLU OE1 A0181 <- 2.80 -> DC N4 C0007 : score 5.76795 : H : ARG NH1 A0185 <- 3.18 -> DT O4 C0008 : score 3.01958 : H : ARG NH2 A0185 <- 3.07 -> DG O6 B0007 : score 6.2436 : H : ARG NH2 A0185 <- 3.29 -> DT O4 C0008 : score 3.20557 : x : SER xxxx A0179 <- 4.06 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0201 <- 3.90 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx >1o3s_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=PROTEIN-DNA RECOGNITION AND DNA DEFORMATION REVEALED IN CRYSTAL STRUCTURES OF CAP-DNA COMPLEXES organism=Escherichia coli : H : ASP OD1 A0181 <- 2.99 -> DC N4 B0006 : score 5.14177 : H : ARG NH2 A0185 <- 2.68 -> DG O6 B0007 : score 6.7584 : H : ARG NH2 A0185 <- 2.96 -> DT O4 C0008 : score 3.44012 : x : SER xxxx A0179 <- 3.72 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0180 <- 3.30 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx >1o3t_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=PROTEIN-DNA RECOGNITION AND DNA DEFORMATION REVEALED IN CRYSTAL STRUCTURES OF CAP-DNA COMPLEXES organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0185 <- 3.37 -> DT O4 D0008 : score 3.14871 : x : GLN xxxx A0170 <- 4.47 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0180 <- 4.06 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0181 <- 3.42 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1o4x_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=TERNARY COMPLEX OF THE DNA BINDING DOMAINS OF THE OCT1 AND SOX2 TRANSCRIPTION FACTORS WITH A 19MER OLIGONUCLEOTIDE FROM THE HOXB1 REGULATORY ELEMENT organism=HOMO SAPIENS : H : THR OG1 A0049 <- 2.98 -> DC N4 D0326 : score 3.88813 : H : THR OG1 A0049 <- 3.17 -> DT O4 C0312 : score 3.59953 : H : ASN ND2 A0154 <- 3.22 -> DA N7 C0317 : score 5.37739 : x : SER xxxx A0047 <- 4.01 -> DG xxx D0325 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0048 <- 3.53 -> DA xxx C0311 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0053 <- 3.10 -> DG xxx C0313 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0150 <- 3.80 -> DA xxx C0317 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0157 <- 3.53 -> DC xxx D0320 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0161 <- 4.45 -> DT xxx C0315 : score x.xxxxx >1o4x_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like;HMG-box; title=TERNARY COMPLEX OF THE DNA BINDING DOMAINS OF THE OCT1 AND SOX2 TRANSCRIPTION FACTORS WITH A 19MER OLIGONUCLEOTIDE FROM THE HOXB1 REGULATORY ELEMENT organism=HOMO SAPIENS : H : THR OG1 A0049 <- 2.98 -> DC N4 D0326 : score 3.88813 : H : THR OG1 A0049 <- 3.17 -> DT O4 C0312 : score 3.59953 : H : ASN ND2 A0154 <- 3.22 -> DA N7 C0317 : score 5.37739 : H : ARG NH2 B0210 <- 2.99 -> DT O2 C0309 : score 4.07247 : H : ASN ND2 B0213 <- 3.26 -> DT O2 C0307 : score 4.30951 : H : ASN ND2 B0235 <- 3.37 -> DA N3 D0334 : score 3.37362 : H : SER OG B0236 <- 3.21 -> DC O2 C0304 : score 2.29618 : H : SER OG B0239 <- 2.68 -> DT O2 C0305 : score 3.78617 : x : SER xxxx A0047 <- 4.01 -> DG xxx D0325 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0048 <- 3.53 -> DA xxx C0311 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0053 <- 3.10 -> DG xxx C0313 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0150 <- 3.80 -> DA xxx C0317 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0157 <- 3.53 -> DC xxx D0320 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0161 <- 4.45 -> DT xxx C0315 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0215 <- 3.56 -> DT xxx C0306 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0216 <- 3.03 -> DA xxx D0333 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0223 <- 3.74 -> DA xxx D0333 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0277 <- 3.16 -> DA xxx D0330 : score x.xxxxx >1o4x_B:HMG-box; title=TERNARY COMPLEX OF THE DNA BINDING DOMAINS OF THE OCT1 AND SOX2 TRANSCRIPTION FACTORS WITH A 19MER OLIGONUCLEOTIDE FROM THE HOXB1 REGULATORY ELEMENT organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 B0210 <- 2.99 -> DT O2 C0309 : score 4.07247 : H : ASN ND2 B0213 <- 3.26 -> DT O2 C0307 : score 4.30951 : H : ASN ND2 B0235 <- 3.37 -> DA N3 D0334 : score 3.37362 : H : SER OG B0236 <- 3.21 -> DC O2 C0304 : score 2.29618 : H : SER OG B0239 <- 2.68 -> DT O2 C0305 : score 3.78617 : x : PHE xxxx B0215 <- 3.56 -> DT xxx C0306 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0216 <- 3.03 -> DA xxx D0333 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0223 <- 3.74 -> DA xxx D0333 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0277 <- 3.16 -> DA xxx D0330 : score x.xxxxx >1oct_C:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE OCT-1 POU DOMAIN BOUND TO AN OCTAMER SITE: DNA RECOGNITION WITH TETHERED DNA-BINDING MODULES organism=? : H : GLN OE1 C0044 <- 3.37 -> DA N6 A0204 : score 5.36257 : H : GLN NE2 C0044 <- 3.16 -> DA N7 A0204 : score 5.65128 : H : THR OG1 C0045 <- 2.93 -> DT O4 A0205 : score 3.78611 : H : THR OG1 C0045 <- 3.22 -> DC N4 B0226 : score 3.69453 : H : ARG NH1 C0049 <- 2.84 -> DG O6 B0225 : score 6.03467 : H : ARG NH2 C0049 <- 3.21 -> DG O6 B0225 : score 6.0588 : H : ARG NH1 C0105 <- 3.23 -> DA N3 A0208 : score 3.36539 : V : VAL CG1 C0147 <- 3.58 -> DT C7 A0211 : score 6.39384 : x : SER xxxx C0043 <- 3.88 -> DG xxx B0225 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0048 <- 3.93 -> DA xxx A0204 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0055 <- 4.28 -> DT xxx B0224 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0102 <- 3.69 -> DT xxx B0223 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0150 <- 4.34 -> DT xxx B0219 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0151 <- 3.47 -> DA xxx A0210 : score x.xxxxx >1odg_A:Restriction_endonuclease-like; title=VERY-SHORT-PATCH DNA REPAIR ENDONUCLEASE BOUND TO ITS REACTION PRODUCT SITE organism=ESCHERICHIA COLI : V : TRP CB A0068 <- 3.85 -> DT C7 W0001 : score 5.42771 : V : PRO CG A0079 <- 3.69 -> DT C7 F0007 : score 6.53385 : x : PHE xxxx A0067 <- 3.83 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0069 <- 3.67 -> DT xxx W0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0085 <- 4.27 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0086 <- 3.22 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0089 <- 2.69 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0093 <- 2.85 -> DT xxx W0001 : score x.xxxxx >1odh_A:GCM_domain; title=STRUCTURE OF THE GCM DOMAIN BOUND TO DNA organism=MUS MUSCULUS : H : ASN ND2 A0065 <- 2.80 -> DG O6 C1008 : score 5.63846 : H : HIS NE2 A0067 <- 2.54 -> DG O6 C1009 : score 8.36745 : x : ASN xxxx A0063 <- 3.36 -> DC xxx C1006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0064 <- 4.19 -> DC xxx D1018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0100 <- 3.85 -> DT xxx C1004 : score x.xxxxx >1oe4_B:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=XENOPUS SMUG1, AN ANTI-MUTATOR URACIL-DNA GLYCOSYLASE organism=XENOPUS LAEVIS : x : VAL xxxx B0147 <- 3.79 -> DG xxx E0292 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0151 <- 3.05 -> DG xxx E0292 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0253 <- 3.68 -> DG xxx E0292 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0259 <- 3.47 -> DG xxx E0292 : score x.xxxxx >1oe5_B:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=XENOPUS SMUG1, AN ANTI-MUTATOR URACIL-DNA GLYCOSYLASE organism=XENOPUS LAEVIS : x : VAL xxxx B0147 <- 3.86 -> DG xxx E0292 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0151 <- 3.03 -> DG xxx E0292 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0253 <- 3.71 -> DG xxx E0292 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0259 <- 3.17 -> DG xxx E0292 : score x.xxxxx >1oe6_B:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=XENOPUS SMUG1, AN ANTI-MUTATOR URACIL-DNA GLYCOSYLASE organism=XENOPUS LAEVIS : x : VAL xxxx B0147 <- 3.68 -> DG xxx E0292 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0151 <- 3.07 -> DG xxx E0292 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0253 <- 3.85 -> DG xxx E0292 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0259 <- 3.08 -> DG xxx E0292 : score x.xxxxx >1oh5_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI MUTS BINDING TO DNA WITH A C:A MISMATCH organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 A0058 <- 3.12 -> DC O2 E0011 : score 3.462 : x : ASP xxxx A0035 <- 3.91 -> DA xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0036 <- 3.16 -> DA xxx F0022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0038 <- 2.84 -> DA xxx F0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 3.79 -> DA xxx F0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.55 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >1oh6_A:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI MUTS BINDING TO DNA WITH AN A:A MISMATCH organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 A0058 <- 2.95 -> DC O2 E0011 : score 3.58776 : x : MET xxxx A0033 <- 3.23 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0035 <- 4.23 -> DA xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0036 <- 3.30 -> DA xxx F0022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0038 <- 2.65 -> DA xxx F0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 3.94 -> DA xxx F0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.37 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >1oh6_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI MUTS BINDING TO DNA WITH AN A:A MISMATCH organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 A0058 <- 2.95 -> DC O2 E0011 : score 3.58776 : x : MET xxxx A0033 <- 3.23 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0035 <- 4.23 -> DA xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0036 <- 3.30 -> DA xxx F0022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0038 <- 2.65 -> DA xxx F0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 3.94 -> DA xxx F0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.37 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >1oh7_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI MUTS BINDING TO DNA WITH A G:G MISMATCH organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 A0058 <- 3.11 -> DC O2 E0011 : score 3.4694 : x : MET xxxx A0033 <- 3.26 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0035 <- 4.09 -> DA xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0036 <- 3.20 -> DG xxx F0022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0038 <- 2.43 -> DG xxx F0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 3.40 -> DG xxx F0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.50 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >1oh8_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI MUTS BINDING TO DNA WITH AN UNPAIRED THYMIDINE organism=ESCHERICHIA COLI : H : GLU OE2 A0038 <- 2.80 -> DT N3 F0022 : score 2.6359 : H : ARG NH1 A0058 <- 2.65 -> DC O2 F0021 : score 3.7595 : V : PHE CZ A0036 <- 3.82 -> DT C7 F0022 : score 7.0793 : x : MET xxxx A0033 <- 3.39 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0035 <- 4.49 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 4.13 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.79 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >1omh_A:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=CONJUGATIVE RELAXASE TRWC IN COMPLEX WITH ORIT DNA. METAL-FREE STRUCTURE. organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0075 <- 2.97 -> DA N3 B0005 : score 3.55686 : H : ARG NH2 A0128 <- 2.75 -> DG O6 B0003 : score 6.666 : H : ARG NH2 A0128 <- 2.45 -> DG O6 B0015 : score 7.062 : H : LYS NZ A0130 <- 2.83 -> DG N7 B0013 : score 5.35358 : H : LYS NZ A0130 <- 3.08 -> DG O6 B0013 : score 5.45705 : x : ALA xxxx A0073 <- 3.30 -> DG xxx B0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0081 <- 4.21 -> DC xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0178 <- 3.85 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0181 <- 4.15 -> DC xxx B0016 : score x.xxxxx >1orn_A:DNA-glycosylase; title=STRUCTURE OF A TRAPPED ENDONUCLEASE III-DNA COVALENT INTERMEDIATE: ESTRANGED-GUANINE COMPLEX organism=Geobacillus stearothermophilus : x : GLN xxxx A0042 <- 3.01 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0043 <- 4.31 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0044 <- 3.86 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0082 <- 3.38 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >1orp_A:DNA-glycosylase; title=STRUCTURE OF A TRAPPED ENDONUCLEASE III-DNA COVALENT INTERMEDIATE: ESTRANGED-ADENINE COMPLEX organism=Geobacillus stearothermophilus : x : GLN xxxx A0042 <- 2.91 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0044 <- 4.28 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0082 <- 3.42 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0085 <- 4.10 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >1osb_C:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=CONJUGATIVE RELAXASE TRWC IN COMPLEX WITH ORIT DNA. METAL-FREE STRUCTURE. organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 C0075 <- 3.24 -> DA N3 D0005 : score 3.35803 : H : ARG NH1 C0128 <- 3.35 -> DG N7 D0015 : score 5.3845 : H : ARG NH2 C0128 <- 3.05 -> DG O6 D0003 : score 6.27 : H : ARG NH2 C0128 <- 3.29 -> DG N7 D0015 : score 5.75892 : H : ARG NH2 C0128 <- 2.36 -> DG O6 D0015 : score 7.1808 : H : LYS NZ C0130 <- 2.76 -> DG N7 D0013 : score 5.42898 : H : LYS NZ C0130 <- 2.89 -> DG O6 D0013 : score 5.67672 : x : ALA xxxx C0073 <- 3.49 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0081 <- 4.46 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >1osl_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=SOLUTION STRUCTURE OF A DIMERIC LACTOSE DNA-BINDING DOMAIN COMPLEXED TO A NONSPECIFIC DNA SEQUENCE organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 A0022 <- 2.72 -> DA N7 C0003 : score 1.69854 : H : ARG NH2 A0022 <- 2.67 -> DT O4 C0004 : score 3.64625 : H : ARG NH1 A0051 <- 2.87 -> DT O2 D0009 : score 4.24612 : H : ARG NH2 A0051 <- 3.01 -> DT O2 C0011 : score 4.05553 : H : GLN NE2 B0018 <- 2.56 -> DT O4 C0013 : score 5.4402 : H : ARG NH2 B0022 <- 3.20 -> DA N7 D0003 : score 1.53805 : H : LYS NZ B0059 <- 2.73 -> DT O2 C0009 : score 3.6374 : x : TYR xxxx A0007 <- 3.30 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0017 <- 3.69 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0018 <- 2.86 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0019 <- 3.35 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0021 <- 4.01 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0029 <- 3.62 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0007 <- 2.86 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0016 <- 4.50 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0017 <- 4.36 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx >1osl_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=SOLUTION STRUCTURE OF A DIMERIC LACTOSE DNA-BINDING DOMAIN COMPLEXED TO A NONSPECIFIC DNA SEQUENCE organism=ESCHERICHIA COLI : H : GLN NE2 B0018 <- 2.56 -> DT O4 C0013 : score 5.4402 : H : ARG NH2 B0022 <- 3.20 -> DA N7 D0003 : score 1.53805 : H : LYS NZ B0059 <- 2.73 -> DT O2 C0009 : score 3.6374 : x : TYR xxxx B0007 <- 2.86 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0016 <- 4.50 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0017 <- 4.36 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx >1otc_AB:Nucleic_acid-binding_proteins; title=THE O. NOVA TELOMERE END BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH SINGLE STRAND DNA organism=STERKIELLA NOVA : H : TYR OH A0072 <- 2.93 -> DT O4 D0008 : score 3.4115 : H : LYS NZ A0077 <- 3.42 -> DG N7 D0003 : score 4.71805 : H : LYS NZ A0077 <- 3.01 -> DG O6 D0003 : score 5.53798 : H : GLN OE1 A0135 <- 2.58 -> DG N2 D0002 : score 5.85443 : H : GLN NE2 A0135 <- 2.94 -> DG N3 D0002 : score 4.83632 : H : ASP OD2 A0223 <- 2.95 -> DG N2 D0004 : score 5.29521 : H : ASP OD1 A0225 <- 2.67 -> DG N2 D0003 : score 5.2839 : H : ARG NE A0274 <- 2.96 -> DG O6 D0004 : score 3.81491 : H : ARG NH2 A0274 <- 3.20 -> DG O6 D0004 : score 6.072 : H : GLU OE2 B0045 <- 2.70 -> DG N2 D0009 : score 4.39646 : V : TYR CZ B0134 <- 3.55 -> DT C7 D0006 : score 5.92821 : x : ASP xxxx A0060 <- 3.95 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0062 <- 3.34 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0063 <- 3.35 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0065 <- 3.34 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0066 <- 3.79 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0107 <- 3.35 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0112 <- 3.66 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0114 <- 3.88 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 3.60 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0130 <- 3.43 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0237 <- 4.28 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0239 <- 3.27 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 3.55 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0258 <- 4.24 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0260 <- 3.82 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0261 <- 4.12 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0272 <- 3.78 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0275 <- 3.52 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0291 <- 3.77 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0292 <- 3.38 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0293 <- 3.01 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0044 <- 4.29 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0048 <- 4.28 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0049 <- 3.22 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0051 <- 3.32 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 4.11 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0106 <- 4.09 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0109 <- 3.06 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0140 <- 3.25 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0145 <- 3.17 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >1otc_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=THE O. NOVA TELOMERE END BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH SINGLE STRAND DNA organism=STERKIELLA NOVA : H : GLU OE2 B0045 <- 2.70 -> DG N2 D0009 : score 4.39646 : V : TYR CZ B0134 <- 3.55 -> DT C7 D0006 : score 5.92821 : x : LYS xxxx B0044 <- 4.29 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0048 <- 4.28 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0049 <- 3.22 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0051 <- 3.32 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 4.11 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0106 <- 4.09 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0109 <- 3.06 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0140 <- 3.25 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0145 <- 3.17 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >1oup_A:His-Me_finger_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PERIPLASMIC ENDONUCLEASE VVN COMPLEXED WITH OCTAMER DOUBLE STRANDED DNA organism=VIBRIO VULNIFICUS : H : LYS NZ A0100 <- 3.13 -> DG O6 G0007 : score 5.39924 : x : ARG xxxx A0072 <- 3.67 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx >1ouq_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF WILD-TYPE CRE RECOMBINASE-LOXP SYNAPSE organism=Enterobacteria phage P1 : H : ARG NE A0259 <- 2.69 -> DG O6 X0128 : score 4.02773 : H : ARG NH2 A0259 <- 2.86 -> DG N7 X0128 : score 6.308 : V : GLN CG A0090 <- 3.76 -> DT C7 D0113 : score 3.28794 : x : HIS xxxx A0040 <- 3.57 -> DT xxx X0125 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.84 -> DT xxx X0123 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0044 <- 3.34 -> DT xxx D0113 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.73 -> DT xxx D0111 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0086 <- 3.06 -> DG xxx D0115 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.40 -> DT xxx D0113 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 3.74 -> DT xxx X0123 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 4.42 -> DA xxx D0105 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0244 <- 2.84 -> DT xxx D0103 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 4.20 -> DT xxx D0108 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0262 <- 3.20 -> DC xxx X0127 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0282 <- 3.74 -> DA xxx D0112 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0317 <- 4.50 -> DA xxx D0117 : score x.xxxxx >1ouq_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF WILD-TYPE CRE RECOMBINASE-LOXP SYNAPSE organism=Enterobacteria phage P1 : H : ARG NE A0259 <- 2.69 -> DG O6 X0128 : score 4.02773 : H : ARG NH2 A0259 <- 2.86 -> DG N7 X0128 : score 6.308 : H : LYS NZ B0043 <- 3.16 -> DT O4 D0125 : score 3.3289 : H : LYS NZ B0201 <- 3.14 -> DT O2 D0123 : score 3.34325 : H : LYS NZ B0244 <- 2.69 -> DT O2 C0103 : score 3.6661 : H : LYS NZ B0244 <- 2.53 -> DT O2 D0135 : score 3.78089 : H : ARG NE B0259 <- 2.70 -> DG O6 D0128 : score 4.01985 : H : ARG NH2 B0259 <- 3.18 -> DG N7 D0128 : score 5.89938 : H : ARG NH2 B0282 <- 3.14 -> DA N3 C0112 : score 3.01944 : V : MET CE B0044 <- 3.61 -> DT C7 C0113 : score 7.25944 : V : GLN CG A0090 <- 3.76 -> DT C7 D0113 : score 3.28794 : V : HIS CG B0040 <- 3.62 -> DT C7 D0125 : score 3.13393 : x : HIS xxxx A0040 <- 3.57 -> DT xxx X0125 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.84 -> DT xxx X0123 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0044 <- 3.34 -> DT xxx D0113 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.73 -> DT xxx D0111 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0086 <- 3.06 -> DG xxx D0115 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.40 -> DT xxx D0113 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 3.74 -> DT xxx X0123 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 4.42 -> DA xxx D0105 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0244 <- 2.84 -> DT xxx D0103 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 4.20 -> DT xxx D0108 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0262 <- 3.20 -> DC xxx X0127 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0282 <- 3.74 -> DA xxx D0112 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0317 <- 4.50 -> DA xxx D0117 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0041 <- 4.05 -> DT xxx D0123 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.81 -> DT xxx C0111 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0086 <- 3.52 -> DA xxx C0114 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.47 -> DT xxx C0113 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0090 <- 2.80 -> DT xxx D0123 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 4.49 -> DT xxx D0122 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0241 <- 4.17 -> DA xxx C0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0243 <- 4.29 -> DT xxx D0133 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 3.51 -> DT xxx C0108 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0262 <- 3.59 -> DC xxx D0127 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0317 <- 4.20 -> DT xxx X0118 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0320 <- 4.45 -> DT xxx X0116 : score x.xxxxx >1ouq_EF:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF WILD-TYPE CRE RECOMBINASE-LOXP SYNAPSE organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ E0244 <- 2.84 -> DT O2 Y0135 : score 3.55848 : H : LYS NZ E0244 <- 2.59 -> DT O2 H0103 : score 3.73784 : H : ARG NE E0259 <- 2.52 -> DG O6 Y0128 : score 4.16172 : H : ARG NH2 E0259 <- 3.31 -> DG N7 Y0128 : score 5.73338 : H : ARG NH2 E0259 <- 3.06 -> DG O6 Y0128 : score 6.2568 : H : ARG NH1 E0282 <- 3.21 -> DA N3 H0112 : score 3.38012 : H : GLN NE2 F0090 <- 3.21 -> DT O4 H0123 : score 4.76536 : H : LYS NZ F0244 <- 2.33 -> DT O2 G0103 : score 3.92437 : H : ARG NE F0259 <- 2.98 -> DG O6 H0128 : score 3.79915 : H : ARG NH2 F0259 <- 3.13 -> DG N7 H0128 : score 5.96323 : H : ARG NH2 F0282 <- 3.01 -> DA N3 G0112 : score 3.10367 : V : HIS CG F0040 <- 3.77 -> DT C7 H0125 : score 3.02147 : x : HIS xxxx E0040 <- 3.14 -> DT xxx Y0125 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0041 <- 3.62 -> DT xxx Y0123 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0044 <- 3.16 -> DT xxx H0113 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0047 <- 3.94 -> DT xxx H0111 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0086 <- 3.01 -> DG xxx H0115 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0087 <- 3.30 -> DT xxx H0113 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0090 <- 2.57 -> DT xxx Y0123 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0094 <- 4.05 -> DT xxx Y0123 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0241 <- 4.19 -> DC xxx H0106 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0257 <- 4.44 -> DT xxx H0107 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0262 <- 3.68 -> DC xxx Y0127 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0316 <- 4.15 -> DA xxx H0117 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0317 <- 3.84 -> DA xxx H0117 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0041 <- 3.95 -> DT xxx H0123 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0044 <- 3.10 -> DT xxx G0113 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0047 <- 4.16 -> DT xxx G0111 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0086 <- 3.89 -> DA xxx G0114 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0087 <- 3.27 -> DT xxx G0113 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0094 <- 3.77 -> DT xxx H0123 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0201 <- 3.24 -> DT xxx H0123 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0241 <- 3.91 -> DA xxx G0105 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0257 <- 4.39 -> DT xxx G0108 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0262 <- 3.66 -> DC xxx H0127 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0319 <- 2.90 -> DT xxx Y0118 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0320 <- 4.40 -> DG xxx Y0117 : score x.xxxxx >1ouz_A:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MUTANT IHF (BETAE44A) COMPLEXED WITH A VARIANT H' SITE (T44A) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0060 <- 3.29 -> DC O2 E0036 : score 3.2923 : w : ARG NH1 A0060 <- 5.94 -> DA N3 C0035 : score 2.585 : H : ARG NH1 A0063 <- 3.16 -> DT O2 C0037 : score 3.99635 : H : ARG NH1 A0063 <- 2.82 -> DG N3 C0036 : score 3.04035 : x : ASN xxxx A0064 <- 3.77 -> DA xxx E0038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0065 <- 3.16 -> DT xxx C0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0066 <- 3.05 -> DT xxx E0039 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0073 <- 3.43 -> DC xxx E0036 : score x.xxxxx >1ouz_AB:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MUTANT IHF (BETAE44A) COMPLEXED WITH A VARIANT H' SITE (T44A) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0060 <- 3.29 -> DC O2 E0036 : score 3.2923 : w : ARG NH1 A0060 <- 5.94 -> DA N3 C0035 : score 2.585 : H : ARG NH1 A0063 <- 3.16 -> DT O2 C0037 : score 3.99635 : H : ARG NH1 A0063 <- 2.82 -> DG N3 C0036 : score 3.04035 : H : ARG NH1 B0046 <- 3.04 -> DT O2 C0044 : score 4.0997 : H : ARG NH2 B0046 <- 2.69 -> DT O2 C0044 : score 4.32647 : x : ASN xxxx A0064 <- 3.77 -> DA xxx E0038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0065 <- 3.16 -> DT xxx C0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0066 <- 3.05 -> DT xxx E0039 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0073 <- 3.43 -> DC xxx E0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0059 <- 3.58 -> DA xxx C0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0062 <- 3.48 -> DA xxx C0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0063 <- 3.65 -> DA xxx C0028 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0064 <- 3.36 -> DA xxx C0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0065 <- 3.21 -> DT xxx D0028 : score x.xxxxx >1owf_A:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MUTANT IHF (BETAE44A) COMPLEXED WITH THE NATIVE H' SITE organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0060 <- 2.90 -> DT O2 E0035 : score 4.22028 : H : ARG NH1 A0063 <- 2.53 -> DT O2 C0037 : score 4.53896 : H : ARG NH1 A0063 <- 2.71 -> DG N3 C0036 : score 3.10751 : x : ASN xxxx A0064 <- 3.94 -> DA xxx E0038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0065 <- 3.21 -> DT xxx C0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0066 <- 3.40 -> DT xxx E0039 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0073 <- 3.53 -> DC xxx E0036 : score x.xxxxx >1owf_AB:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MUTANT IHF (BETAE44A) COMPLEXED WITH THE NATIVE H' SITE organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0060 <- 2.90 -> DT O2 E0035 : score 4.22028 : H : ARG NH1 A0063 <- 2.53 -> DT O2 C0037 : score 4.53896 : H : ARG NH1 A0063 <- 2.71 -> DG N3 C0036 : score 3.10751 : H : ARG NH1 B0046 <- 3.06 -> DT O2 E0044 : score 4.08248 : H : ARG NH2 B0046 <- 3.06 -> DT O2 E0044 : score 4.0132 : H : ARG NH1 B0059 <- 3.38 -> DA N3 C0029 : score 3.25493 : H : ARG NH1 B0059 <- 3.38 -> DA N3 C0029 : score 3.25493 : x : ASN xxxx A0064 <- 3.94 -> DA xxx E0038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0065 <- 3.21 -> DT xxx C0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0066 <- 3.40 -> DT xxx E0039 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0073 <- 3.53 -> DC xxx E0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0062 <- 3.85 -> DA xxx C0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0063 <- 3.62 -> DA xxx C0028 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0064 <- 3.54 -> DA xxx C0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0065 <- 3.52 -> DT xxx D0028 : score x.xxxxx >1owf_B:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MUTANT IHF (BETAE44A) COMPLEXED WITH THE NATIVE H' SITE organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 B0046 <- 3.06 -> DT O2 E0044 : score 4.08248 : H : ARG NH2 B0046 <- 3.06 -> DT O2 E0044 : score 4.0132 : H : ARG NH1 B0059 <- 3.38 -> DA N3 C0029 : score 3.25493 : H : ARG NH1 B0059 <- 3.38 -> DA N3 C0029 : score 3.25493 : x : ARG xxxx B0062 <- 3.85 -> DA xxx C0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0063 <- 3.62 -> DA xxx C0028 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0064 <- 3.54 -> DA xxx C0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0065 <- 3.52 -> DT xxx D0028 : score x.xxxxx >1owg_A:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF WT IHF COMPLEXED WITH AN ALTERED H' SITE (T44A) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0060 <- 3.27 -> DC O2 E0036 : score 3.3069 : H : ARG NH1 A0063 <- 2.73 -> DT O2 C0037 : score 4.3667 : H : ARG NH1 A0063 <- 2.78 -> DG N3 C0036 : score 3.06477 : x : ASN xxxx A0064 <- 3.92 -> DA xxx E0038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0065 <- 3.15 -> DT xxx C0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0066 <- 3.04 -> DT xxx E0039 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0073 <- 3.51 -> DC xxx E0036 : score x.xxxxx >1owg_AB:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF WT IHF COMPLEXED WITH AN ALTERED H' SITE (T44A) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0060 <- 3.27 -> DC O2 E0036 : score 3.3069 : H : ARG NH1 A0063 <- 2.73 -> DT O2 C0037 : score 4.3667 : H : ARG NH1 A0063 <- 2.78 -> DG N3 C0036 : score 3.06477 : H : ARG NH1 B0046 <- 2.74 -> DT O2 C0044 : score 4.35809 : H : ARG NH2 B0046 <- 3.23 -> DT O2 C0044 : score 3.86927 : x : ASN xxxx A0064 <- 3.92 -> DA xxx E0038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0065 <- 3.15 -> DT xxx C0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0066 <- 3.04 -> DT xxx E0039 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0073 <- 3.51 -> DC xxx E0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0059 <- 3.58 -> DA xxx C0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0062 <- 3.47 -> DA xxx C0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0063 <- 3.59 -> DA xxx C0028 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0064 <- 3.25 -> DA xxx C0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0065 <- 3.54 -> DT xxx D0028 : score x.xxxxx >1owr_P:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NFAT1 BOUND MONOMERICALLY TO DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 P0421 <- 3.17 -> DG N7 E4007 : score 5.6023 : H : ARG NH2 P0421 <- 2.78 -> DG O6 E4007 : score 6.6264 : H : GLU OE1 P0427 <- 3.22 -> DC N4 F5011 : score 5.28344 : H : ARG NH1 P0430 <- 3.20 -> DG N7 E4006 : score 5.566 : H : ARG NH2 P0430 <- 2.92 -> DG O6 E4006 : score 6.4416 : H : GLN OE1 P0571 <- 3.22 -> DA N6 E4008 : score 5.54415 : x : TYR xxxx P0424 <- 3.07 -> DT xxx F5010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0426 <- 4.11 -> DT xxx F5010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0537 <- 3.78 -> DT xxx F5006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0572 <- 3.47 -> DT xxx F5008 : score x.xxxxx >1ozj_AB:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD3-MH1 BOUND TO DNA AT 2.4 A RESOLUTION organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0074 <- 2.85 -> DG N7 D2005 : score 5.9895 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.70 -> DG O6 D2005 : score 6.732 : H : GLN OE1 A0076 <- 2.99 -> DA N6 C1008 : score 5.82257 : w : GLN NE2 A0076 <- 5.52 -> DT O4 D2008 : score 2.257 : H : LYS NZ A0081 <- 3.15 -> DA N7 C1008 : score 2.73158 : H : LYS NZ A0081 <- 2.90 -> DG O6 C1009 : score 5.66515 : H : ARG NH1 B0074 <- 3.14 -> DG N7 C1004 : score 5.6386 : H : ARG NH2 B0074 <- 2.76 -> DG O6 C1004 : score 6.6528 : H : GLN OE1 B0076 <- 3.05 -> DA N6 D2009 : score 5.74994 : H : LYS NZ B0081 <- 2.93 -> DA N7 D2009 : score 2.86081 : H : LYS NZ B0081 <- 3.00 -> DG O6 D2010 : score 5.54954 : x : HIS xxxx A0079 <- 4.40 -> DT xxx C1007 : score x.xxxxx >1ozj_B:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD3-MH1 BOUND TO DNA AT 2.4 A RESOLUTION organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0074 <- 3.14 -> DG N7 C1004 : score 5.6386 : H : ARG NH2 B0074 <- 2.76 -> DG O6 C1004 : score 6.6528 : H : GLN OE1 B0076 <- 3.05 -> DA N6 D2009 : score 5.74994 : H : LYS NZ B0081 <- 2.93 -> DA N7 D2009 : score 2.86081 : H : LYS NZ B0081 <- 3.00 -> DG O6 D2010 : score 5.54954 >1p34_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NUCLEOSOME CORE PARTICLES CONTAINING HISTONE 'SIN' MUTANTS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.86 -> DA N3 J0229 : score 3.20087 : H : ARG NH1 E0640 <- 3.31 -> DA N3 I0082 : score 3.30648 : x : HIS xxxx A0439 <- 4.30 -> DA xxx J0151 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.38 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.43 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0641 <- 4.40 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 4.01 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 4.38 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.16 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0245 <- 4.48 -> DG xxx J0214 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H1430 <- 3.85 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >1p3a_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NUCLEOSOME CORE PARTICLES CONTAINING HISTONE 'SIN' MUTANTS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.77 -> DA N3 J0229 : score 3.25918 : H : ARG NH2 E0640 <- 2.72 -> DA N3 I0082 : score 3.29158 : x : HIS xxxx A0439 <- 4.32 -> DA xxx J0151 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.62 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 4.01 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.14 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0842 <- 4.25 -> DA xxx J0257 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0639 <- 4.42 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 3.35 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 4.25 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.42 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0245 <- 4.38 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx >1p3b_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NUCLEOSOME CORE PARTICLES CONTAINING HISTONE 'SIN' MUTANTS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.69 -> DA N3 J0229 : score 3.31102 : H : ARG NH1 E0640 <- 3.36 -> DA N3 I0082 : score 3.26966 : x : HIS xxxx A0439 <- 4.45 -> DA xxx J0151 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.35 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 4.26 -> DA xxx J0245 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0877 <- 4.36 -> DG xxx J0277 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 4.09 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 4.10 -> DA xxx I0099 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.25 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx >1p3b_F:Histone-fold; title=CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NUCLEOSOME CORE PARTICLES CONTAINING HISTONE 'SIN' MUTANTS organism=XENOPUS LAEVIS : x : PRO xxxx F0232 <- 4.25 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx >1p3f_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NUCLEOSOME CORE PARTICLES CONTAINING HISTONE 'SIN' MUTANTS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.83 -> DA N3 J0229 : score 3.22031 : H : ARG NH1 E0640 <- 3.33 -> DA N3 I0082 : score 3.29175 : H : ARG NH2 E0640 <- 3.19 -> DA N3 I0082 : score 2.98704 : x : HIS xxxx A0439 <- 4.17 -> DT xxx I0143 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.69 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0639 <- 4.43 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 3.86 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.43 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H1430 <- 4.25 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >1p3g_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NUCLEOSOME CORE PARTICLES CONTAINING HISTONE 'SIN' MUTANTS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.79 -> DA N3 J0229 : score 3.24622 : H : ARG NH1 E0640 <- 3.35 -> DA N3 I0082 : score 3.27703 : w : ARG NH2 E0640 <- 5.49 -> DA N3 I0083 : score 2.092 : x : TYR xxxx A0441 <- 4.43 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.15 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 4.20 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 4.06 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 4.15 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.26 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx >1p3i_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NUCLEOSOME CORE PARTICLES CONTAINING HISTONE 'SIN' MUTANTS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.61 -> DA N3 J0229 : score 3.36285 : H : ARG NH2 D1230 <- 2.95 -> DG N3 J0267 : score 3.50195 : H : ARG NH1 E0640 <- 3.41 -> DA N3 I0082 : score 3.23284 : x : HIS xxxx A0439 <- 4.37 -> DA xxx J0151 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.66 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 3.84 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0842 <- 4.24 -> DA xxx J0257 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0641 <- 4.23 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 4.05 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 4.11 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.28 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H1430 <- 4.44 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >1p3k_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NUCLEOSOME CORE PARTICLES CONTAINING HISTONE 'SIN' MUTANTS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.66 -> DA N3 J0229 : score 3.33046 : H : ARG NH2 E0640 <- 2.97 -> DA N3 I0082 : score 3.12959 : x : LEU xxxx A0465 <- 3.39 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 3.89 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0639 <- 3.86 -> DT xxx J0289 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 3.89 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 4.33 -> DA xxx I0099 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.02 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0235 <- 4.31 -> DG xxx I0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0245 <- 4.02 -> DG xxx J0214 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G1042 <- 4.48 -> DT xxx J0183 : score x.xxxxx >1p3k_G:Histone-fold; title=CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NUCLEOSOME CORE PARTICLES CONTAINING HISTONE 'SIN' MUTANTS organism=? : x : ARG xxxx G1042 <- 4.48 -> DT xxx J0183 : score x.xxxxx >1p3l_A:Histone-fold; title=CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NUCLEOSOME CORE PARTICLES CONTAINING HISTONE 'SIN' MUTANTS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.56 -> DA N3 J0229 : score 3.39525 : x : LEU xxxx A0465 <- 3.80 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 4.20 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx >1p3l_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NUCLEOSOME CORE PARTICLES CONTAINING HISTONE 'SIN' MUTANTS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.56 -> DA N3 J0229 : score 3.39525 : H : ARG NH1 E0640 <- 2.97 -> DA N3 I0082 : score 3.55686 : w : ARG NH2 F0245 <- 5.81 -> DG N3 J0214 : score 0.677 : x : LEU xxxx A0465 <- 3.80 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 4.20 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 4.32 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 4.18 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.35 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H1430 <- 4.18 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >1p3m_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NUCLEOSOME CORE PARTICLES CONTAINING HISTONE 'SIN' MUTANTS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.77 -> DA N3 J0229 : score 3.25918 : H : ARG NH2 E0640 <- 2.97 -> DA N3 I0082 : score 3.12959 : x : TYR xxxx A0441 <- 4.47 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.31 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 4.29 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.35 -> DG xxx J0227 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0842 <- 4.03 -> DA xxx J0257 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0877 <- 4.16 -> DG xxx J0277 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0639 <- 4.14 -> DT xxx J0289 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 4.41 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 4.26 -> DA xxx I0099 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.40 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0245 <- 4.16 -> DT xxx I0080 : score x.xxxxx >1p3o_A:Histone-fold; title=CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NUCLEOSOME CORE PARTICLES CONTAINING HISTONE 'SIN' MUTANTS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.67 -> DA N3 J0229 : score 3.32398 : x : TYR xxxx A0441 <- 4.43 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.30 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 4.09 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx >1p3o_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NUCLEOSOME CORE PARTICLES CONTAINING HISTONE 'SIN' MUTANTS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.67 -> DA N3 J0229 : score 3.32398 : H : ARG NH2 E0640 <- 3.21 -> DA N3 I0082 : score 2.97408 : x : TYR xxxx A0441 <- 4.43 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.30 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 4.09 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.18 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0877 <- 4.44 -> DG xxx J0277 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 4.01 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 4.07 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.11 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0245 <- 3.98 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G1042 <- 4.49 -> DT xxx J0183 : score x.xxxxx >1p3p_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NUCLEOSOME CORE PARTICLES CONTAINING HISTONE 'SIN' MUTANTS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.73 -> DA N3 J0229 : score 3.2851 : H : ARG NH1 E0640 <- 3.28 -> DA N3 I0082 : score 3.32857 : H : ARG NH2 E0640 <- 3.33 -> DA N3 I0082 : score 2.89633 : w : ARG NH2 E0640 <- 5.81 -> DA N3 I0083 : score 2.092 : x : TYR xxxx A0441 <- 4.44 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.29 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 4.16 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.33 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0877 <- 4.50 -> DG xxx J0277 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0641 <- 4.38 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 3.97 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 4.01 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.40 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0245 <- 4.44 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H1430 <- 4.15 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >1p3p_H:Histone-fold; title=CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NUCLEOSOME CORE PARTICLES CONTAINING HISTONE 'SIN' MUTANTS organism=? : x : ARG xxxx H1430 <- 4.15 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >1p47_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TANDEM ZIF268 MOLECULES COMPLEXED TO DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0118 <- 3.22 -> DG N7 C0012 : score 5.5418 : H : ARG NH2 A0118 <- 2.71 -> DG O6 C0012 : score 6.7188 : H : ASP OD2 A0120 <- 2.49 -> DC N4 D0052 : score 6.5844 : w : ASP OD1 A0120 <- 5.99 -> DG O6 D0051 : score 3.411 : H : ARG NH1 A0124 <- 2.85 -> DG O6 C0010 : score 6.0225 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.99 -> DG N7 C0010 : score 6.142 : w : ARG NH1 A0124 <- 5.42 -> DG O6 D0054 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0146 <- 2.79 -> DG N7 C0009 : score 6.0621 : H : ARG NH2 A0146 <- 2.81 -> DG O6 C0009 : score 6.5868 : H : ASP OD2 A0148 <- 3.10 -> DC N4 D0055 : score 5.828 : w : ASP OD2 A0148 <- 6.05 -> DC N4 D0056 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0149 <- 2.31 -> DG N7 C0008 : score 7.46922 : H : ARG NH1 A0174 <- 3.06 -> DG N7 C0006 : score 5.7354 : H : ARG NH2 A0174 <- 2.64 -> DG O6 C0006 : score 6.8112 : w : ASP OD1 A0176 <- 5.55 -> DC N4 D0057 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0176 <- 6.01 -> DC N4 C0005 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0180 <- 2.95 -> DG O6 C0004 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0180 <- 3.01 -> DG N7 C0004 : score 6.11646 : x : GLU xxxx A0121 <- 3.33 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0152 <- 4.28 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0177 <- 3.33 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >1p47_AB:beta-beta-alpha_zinc_fingers;C2H2_and_C2HC_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TANDEM ZIF268 MOLECULES COMPLEXED TO DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0118 <- 3.22 -> DG N7 C0012 : score 5.5418 : H : ARG NH2 A0118 <- 2.71 -> DG O6 C0012 : score 6.7188 : H : ASP OD2 A0120 <- 2.49 -> DC N4 D0052 : score 6.5844 : w : ASP OD1 A0120 <- 5.99 -> DG O6 D0051 : score 3.411 : H : ARG NH1 A0124 <- 2.85 -> DG O6 C0010 : score 6.0225 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.99 -> DG N7 C0010 : score 6.142 : w : ARG NH1 A0124 <- 5.42 -> DG O6 D0054 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0146 <- 2.79 -> DG N7 C0009 : score 6.0621 : H : ARG NH2 A0146 <- 2.81 -> DG O6 C0009 : score 6.5868 : H : ASP OD2 A0148 <- 3.10 -> DC N4 D0055 : score 5.828 : w : ASP OD2 A0148 <- 6.05 -> DC N4 D0056 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0149 <- 2.31 -> DG N7 C0008 : score 7.46922 : H : ARG NH1 A0174 <- 3.06 -> DG N7 C0006 : score 5.7354 : H : ARG NH2 A0174 <- 2.64 -> DG O6 C0006 : score 6.8112 : w : ASP OD1 A0176 <- 5.55 -> DC N4 D0057 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0176 <- 6.01 -> DC N4 C0005 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0180 <- 2.95 -> DG O6 C0004 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0180 <- 3.01 -> DG N7 C0004 : score 6.11646 : H : ARG NH1 B0118 <- 2.91 -> DG N7 C0021 : score 5.9169 : H : ARG NH2 B0118 <- 2.84 -> DG O6 C0021 : score 6.5472 : H : ASP OD2 B0120 <- 3.07 -> DA N6 D0043 : score 3.78643 : H : ARG NH1 B0124 <- 2.71 -> DG O6 C0019 : score 6.19283 : H : ARG NH2 B0124 <- 2.73 -> DG N7 C0019 : score 6.474 : H : ARG NH1 B0146 <- 2.95 -> DG N7 C0018 : score 5.8685 : H : ARG NH2 B0146 <- 2.71 -> DG O6 C0018 : score 6.7188 : H : ASP OD2 B0148 <- 2.78 -> DC N4 D0046 : score 6.2248 : H : HIS NE2 B0149 <- 2.72 -> DG N7 C0017 : score 6.91141 : H : ARG NH1 B0174 <- 3.13 -> DG N7 C0015 : score 5.6507 : H : ARG NH2 B0174 <- 3.00 -> DG O6 C0015 : score 6.336 : H : ASP OD2 B0176 <- 3.16 -> DA N6 D0049 : score 3.71438 : H : ARG NH1 B0180 <- 2.83 -> DG O6 C0013 : score 6.04683 : H : ARG NH2 B0180 <- 2.75 -> DG N7 C0013 : score 6.44846 : w : ARG NH1 B0180 <- 5.47 -> DG O6 D0051 : score 2.756 : x : GLU xxxx A0121 <- 3.33 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0152 <- 4.28 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0177 <- 3.33 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0121 <- 3.82 -> DC xxx C0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0147 <- 4.47 -> DG xxx D0045 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0152 <- 4.24 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0177 <- 3.48 -> DC xxx C0014 : score x.xxxxx >1p4e_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=FLPE W330F MUTANT-DNA HOLLIDAY JUNCTION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : LYS NZ A0082 <- 2.92 -> DG N7 H0021 : score 5.25664 : H : ARG NH1 A0170 <- 2.42 -> DA N3 E0002 : score 3.96189 : H : LYS NZ A0223 <- 2.53 -> DC O2 E0013 : score 3.10525 : H : ARG NE A0281 <- 2.73 -> DG O6 H0027 : score 3.9962 : H : ARG NH2 A0281 <- 2.80 -> DG N7 H0027 : score 6.38462 : w : LYS NZ A0285 <- 5.73 -> DG O6 E0004 : score 3.005 : x : ALA xxxx A0055 <- 3.60 -> DA xxx H0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0056 <- 3.46 -> DA xxx H0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0058 <- 3.27 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0059 <- 4.30 -> DA xxx H0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0060 <- 3.52 -> DG xxx H0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0062 <- 4.21 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0278 <- 3.77 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0282 <- 4.05 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0284 <- 4.19 -> DA xxx H0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0331 <- 4.28 -> DT xxx I0016 : score x.xxxxx >1p51_B:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=ANABAENA HU-DNA COCRYSTAL STRUCTURE (AHU6) organism=Anabaena sp. : H : ARG NH1 B0058 <- 2.91 -> DG N3 e0013 : score 2.98541 : H : LYS NZ B0064 <- 3.32 -> DG N3 e0016 : score 1.30265 >1p51_BCD:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=ANABAENA HU-DNA COCRYSTAL STRUCTURE (AHU6) organism=Anabaena sp. : H : ARG NH1 B0058 <- 2.91 -> DG N3 e0013 : score 2.98541 : H : LYS NZ B0064 <- 3.32 -> DG N3 e0016 : score 1.30265 : H : ARG NH1 C0058 <- 2.87 -> DG N3 e0032 : score 3.00983 >1p59_A:DNA-glycosylase; title=STRUCTURE OF A NON-COVALENT ENDONUCLEASE III-DNA COMPLEX organism=Geobacillus stearothermophilus : x : ALA xxxx A0041 <- 4.11 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0042 <- 3.45 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0043 <- 4.48 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0044 <- 4.37 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0082 <- 3.47 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx >1p5w_A:ssDNA_viruses; title=THE STRUCTURES OF HOST RANGE CONTROLLING REGIONS OF THE CAPSIDS OF CANINE AND FELINE PARVOVIRUSES AND MUTANTS organism=Canine parvovirus : H : GLN NE2 A0143 <- 3.01 -> DT O4 B0002 : score 4.973 : H : TYR OH A0244 <- 2.81 -> DC O2 B0005 : score 3.49044 : V : PHE CB A0266 <- 3.56 -> DT C7 B0002 : score 6.14909 : x : PHE xxxx A0141 <- 3.36 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0177 <- 3.63 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0179 <- 3.45 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0182 <- 4.26 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0263 <- 3.04 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0267 <- 3.62 -> DA xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0492 <- 4.28 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0493 <- 3.32 -> DA xxx B0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0495 <- 3.82 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx >1p71_AB:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=ANABAENA HU-DNA CORCRYSTAL STRUCTURE (TR3) organism=Anabaena sp. : H : ARG NH1 A0058 <- 3.12 -> DG N3 D0014 : score 2.8572 : w : LYS NZ A0064 <- 5.17 -> DG N3 D0017 : score 2.232 : w : ARG NH1 B0058 <- 6.00 -> DA N3 D0009 : score 2.585 : x : ARG xxxx A0061 <- 3.27 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0063 <- 3.27 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0071 <- 4.17 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0061 <- 3.20 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0063 <- 3.36 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0064 <- 2.78 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0071 <- 4.20 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx >1p71_B:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=ANABAENA HU-DNA CORCRYSTAL STRUCTURE (TR3) organism=Anabaena sp. : w : ARG NH1 B0058 <- 6.00 -> DA N3 D0009 : score 2.585 : x : ARG xxxx B0061 <- 3.20 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0063 <- 3.36 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0064 <- 2.78 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0071 <- 4.20 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx >1p78_AB:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=ANABAENA HU-DNA COCRYSTAL STRUCTURE (AHU2) organism=Anabaena sp. : H : ARG NH1 A0058 <- 3.25 -> DG N3 D0014 : score 2.77783 : H : LYS NZ A0064 <- 2.83 -> DT O2 D0016 : score 3.56566 : H : ARG NH1 B0058 <- 3.05 -> DG N3 C0014 : score 2.89994 : w : ARG NH1 B0058 <- 5.93 -> DA N3 D0009 : score 2.585 : x : ARG xxxx A0061 <- 3.14 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0063 <- 3.29 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0071 <- 4.26 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0061 <- 3.17 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0063 <- 3.43 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0064 <- 3.09 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0071 <- 4.04 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx >1p78_B:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=ANABAENA HU-DNA COCRYSTAL STRUCTURE (AHU2) organism=Anabaena sp. : H : ARG NH1 B0058 <- 3.05 -> DG N3 C0014 : score 2.89994 : w : ARG NH1 B0058 <- 5.93 -> DA N3 D0009 : score 2.585 : x : ARG xxxx B0061 <- 3.17 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0063 <- 3.43 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0064 <- 3.09 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0071 <- 4.04 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx >1p7d_B:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LAMBDA INTEGRASE (RESIDUES 75-356) BOUND TO DNA organism=ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA : H : LYS NZ B0095 <- 2.75 -> DG O6 F0030 : score 5.83858 : H : ASN ND2 B0099 <- 3.06 -> DA N7 F0028 : score 5.56525 : H : ASN ND2 B0099 <- 3.00 -> DA N7 F0029 : score 5.63569 : H : LYS NZ B0235 <- 2.74 -> DT O2 E0013 : score 3.63023 : H : ARG NH2 B0287 <- 2.60 -> DG N7 F0033 : score 6.64 : H : ARG NH2 B0287 <- 2.74 -> DG O6 F0033 : score 6.6792 : V : LEU CD1 B0142 <- 3.88 -> DT C7 E0011 : score 5.61666 : x : THR xxxx B0096 <- 3.28 -> DA xxx F0028 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0100 <- 3.14 -> DA xxx F0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0102 <- 4.30 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0103 <- 4.11 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0138 <- 4.13 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0139 <- 3.86 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0286 <- 3.93 -> DT xxx F0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0288 <- 3.41 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0335 <- 4.49 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0341 <- 3.83 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx >1p7h_L:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=STRUCTURE OF NFAT1 BOUND AS A DIMER TO THE HIV-1 LTR KB ELEMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 L0421 <- 3.04 -> DG O6 B0005 : score 6.2832 : H : GLU OE2 L0427 <- 3.06 -> DC N4 A0013 : score 4.99158 : H : ARG NH1 L0430 <- 2.99 -> DG N7 B0004 : score 5.8201 : H : ARG NH2 L0430 <- 3.04 -> DG O6 B0004 : score 6.2832 : H : GLN OE1 L0571 <- 3.03 -> DA N6 B0006 : score 5.77415 : H : GLN NE2 L0571 <- 2.85 -> DA N7 B0006 : score 6.02885 : x : TYR xxxx L0424 <- 2.97 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0426 <- 4.42 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0537 <- 3.60 -> DC xxx B0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0664 <- 3.93 -> DA xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0665 <- 4.45 -> DC xxx A0014 : score x.xxxxx >1p7h_LN:p53-like_transcription_factors;E_set_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF NFAT1 BOUND AS A DIMER TO THE HIV-1 LTR KB ELEMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 L0421 <- 3.04 -> DG O6 B0005 : score 6.2832 : H : GLU OE2 L0427 <- 3.06 -> DC N4 A0013 : score 4.99158 : H : ARG NH1 L0430 <- 2.99 -> DG N7 B0004 : score 5.8201 : H : ARG NH2 L0430 <- 3.04 -> DG O6 B0004 : score 6.2832 : H : GLN OE1 L0571 <- 3.03 -> DA N6 B0006 : score 5.77415 : H : GLN NE2 L0571 <- 2.85 -> DA N7 B0006 : score 6.02885 : H : ARG NH2 N0421 <- 3.13 -> DG O6 C0006 : score 6.1644 : H : GLU OE2 N0427 <- 3.07 -> DC N4 D0012 : score 4.98105 : H : ARG NH1 N0430 <- 3.09 -> DG N7 C0005 : score 5.6991 : H : ARG NH2 N0430 <- 3.22 -> DG O6 C0005 : score 6.0456 : H : GLN NE2 N0571 <- 2.85 -> DG N7 C0007 : score 4.15673 : x : TYR xxxx L0424 <- 2.97 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0426 <- 4.42 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0537 <- 3.60 -> DC xxx B0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0664 <- 3.93 -> DA xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0665 <- 4.45 -> DC xxx A0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx N0424 <- 3.43 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx N0426 <- 4.30 -> DC xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0537 <- 3.41 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx N0664 <- 3.85 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0665 <- 4.25 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx >1p8k_Z:Homing_endonucleases; title=THE STRUCTURE AND DNA RECOGNITION OF A BIFUNCTIONAL HOMING ENDONUCLEASE AND GROUP I INTRON SPLICING FACTOR organism=Emericella nidulans : H : GLU OE1 Z0035 <- 2.61 -> DC N4 D0517 : score 5.98713 : H : ARG NH1 Z0059 <- 3.02 -> DG N7 A0411 : score 5.7838 : H : ARG NH1 Z0061 <- 2.46 -> DG N7 A0412 : score 6.4614 : H : ARG NH1 Z0061 <- 2.25 -> DG O6 A0412 : score 6.7525 : H : ARG NH2 Z0061 <- 2.93 -> DG N7 A0411 : score 6.21862 : H : ARG NH1 Z0070 <- 3.28 -> DG O6 A0409 : score 5.49933 : H : ARG NH2 Z0070 <- 3.25 -> DG N7 A0409 : score 5.81 : H : ARG NH1 Z0072 <- 2.90 -> DG N7 A0408 : score 5.929 : H : ARG NH2 Z0072 <- 2.86 -> DG O6 A0408 : score 6.5208 : H : ARG NH2 Z0072 <- 3.20 -> DG O6 A0409 : score 6.072 : H : LYS NZ Z0200 <- 2.81 -> DT O4 B0417 : score 3.58001 : V : ALA CB Z0170 <- 3.71 -> DT C7 B0417 : score 5.72495 : V : THR CG2 Z0204 <- 3.65 -> DT C7 C0507 : score 4.39581 : x : TYR xxxx Z0018 <- 3.68 -> DC xxx D0518 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Z0020 <- 3.67 -> DT xxx D0519 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Z0022 <- 3.82 -> DC xxx D0520 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Z0024 <- 2.89 -> DG xxx A0406 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0027 <- 3.61 -> DT xxx A0405 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Z0029 <- 4.20 -> DC xxx D0521 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Z0064 <- 4.27 -> DA xxx C0515 : score x.xxxxx : x : MET xxxx Z0066 <- 3.64 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx Z0150 <- 3.37 -> DC xxx B0418 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Z0152 <- 3.91 -> DT xxx B0419 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0154 <- 3.03 -> DG xxx B0420 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Z0156 <- 3.11 -> DT xxx C0506 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0162 <- 3.30 -> DT xxx C0505 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Z0164 <- 4.00 -> DT xxx C0506 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Z0166 <- 3.33 -> DT xxx B0419 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx Z0168 <- 2.94 -> DC xxx B0418 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0192 <- 4.04 -> DA xxx C0510 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx Z0198 <- 4.14 -> DC xxx A0416 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Z0202 <- 2.81 -> DG xxx B0420 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0243 <- 4.49 -> DT xxx C0506 : score x.xxxxx >1pa6_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE OXYTRICHA NOVA TELOMERE END-BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH NONCOGNATE SSDNA GGGGTTTTGAGG organism=STERKIELLA NOVA : w : LYS NZ B0044 <- 5.76 -> DT O4 D0006 : score 1.7 : H : GLU OE2 B0045 <- 2.53 -> DG N2 D0009 : score 4.54301 : w : GLU OE1 B0045 <- 5.95 -> DG O6 D0009 : score 2.669 : w : TYR OH B0134 <- 6.20 -> DT O4 D0006 : score 2.914 : w : TYR OH B0134 <- 5.21 -> DT O4 D0006 : score 2.914 : x : PRO xxxx B0048 <- 4.22 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0049 <- 3.16 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0051 <- 3.40 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0102 <- 3.83 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0106 <- 3.91 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0109 <- 4.00 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0140 <- 3.10 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0145 <- 3.92 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx >1par_ABCD:Ribbon-helix-helix; title=DNA RECOGNITION BY BETA-SHEETS IN THE ARC REPRESSOR-OPERATOR CRYSTAL STRUCTURE organism=ENTEROBACTERIA PHAGE P22 : H : GLN OE1 A0009 <- 3.14 -> DA N6 F0018 : score 5.64099 : H : GLN NE2 A0009 <- 3.07 -> DA N7 F0018 : score 5.7609 : H : ASN OD1 A0011 <- 3.15 -> DC N4 F0016 : score 3.90004 : H : ARG NH2 A0013 <- 2.67 -> DG O6 E0008 : score 6.7716 : H : GLN OE1 B0009 <- 2.81 -> DA N6 E0007 : score 6.04046 : H : GLN NE2 B0009 <- 3.12 -> DA N7 E0007 : score 5.7 : H : ASN ND2 B0011 <- 3.38 -> DT O4 F0017 : score 4.6716 : H : ARG NH1 B0013 <- 3.10 -> DA N7 E0004 : score 2.40664 : w : SER OG C0005 <- 5.17 -> DA N7 F0002 : score 2.343 : H : GLN OE1 C0009 <- 3.40 -> DA N6 E0018 : score 5.32626 : H : GLN NE2 C0009 <- 3.15 -> DA N7 E0018 : score 5.66346 : H : ARG NH1 C0013 <- 2.80 -> DG O6 F0008 : score 6.08333 : H : GLN OE1 D0009 <- 2.96 -> DA N6 F0007 : score 5.85888 : H : GLN NE2 D0009 <- 2.81 -> DA N7 F0007 : score 6.07756 : H : ASN ND2 D0011 <- 3.20 -> DT O4 E0017 : score 4.86185 : H : ARG NH1 D0013 <- 2.74 -> DG N7 F0004 : score 6.1226 : H : ARG NH1 D0013 <- 2.67 -> DG O6 F0004 : score 6.2415 : H : ARG NH2 D0013 <- 2.89 -> DG O6 F0004 : score 6.4812 : x : MET xxxx A0004 <- 2.62 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0004 <- 3.74 -> DC xxx F0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0004 <- 3.54 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0011 <- 3.12 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0004 <- 3.51 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0005 <- 3.64 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx >1par_B:Ribbon-helix-helix; title=DNA RECOGNITION BY BETA-SHEETS IN THE ARC REPRESSOR-OPERATOR CRYSTAL STRUCTURE organism=ENTEROBACTERIA PHAGE P22 : H : GLN OE1 B0009 <- 2.81 -> DA N6 E0007 : score 6.04046 : H : GLN NE2 B0009 <- 3.12 -> DA N7 E0007 : score 5.7 : H : ASN ND2 B0011 <- 3.38 -> DT O4 F0017 : score 4.6716 : H : ARG NH1 B0013 <- 3.10 -> DA N7 E0004 : score 2.40664 : x : MET xxxx B0004 <- 3.74 -> DC xxx F0014 : score x.xxxxx >1pdn_C:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A PAIRED DOMAIN-DNA COMPLEX AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION REVEALS STRUCTURAL BASIS FOR PAX DEVELOPMENTAL MUTATIONS organism=Drosophila melanogaster : H : ASN OD1 C0014 <- 3.01 -> DG N2 A0009 : score 4.5984 : H : HIS NE2 C0047 <- 3.05 -> DG O6 A0004 : score 7.55615 : x : SER xxxx C0046 <- 3.44 -> DT xxx B0026 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0049 <- 4.10 -> DT xxx B0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0051 <- 3.61 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0052 <- 3.60 -> DG xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0068 <- 3.84 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0071 <- 3.10 -> DA xxx A0014 : score x.xxxxx >1per_L:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=THE COMPLEX BETWEEN PHAGE 434 REPRESSION DNA-BINDING DOMAIN AND OPERATOR SITE OR3: STRUCTURAL DIFFERENCES BETWEEN CONSENSUS AND NON- CONSENSUS HALF-SITES organism=PHAGE 434 : H : GLN NE2 L0028 <- 3.24 -> DA N7 B0004 : score 5.55385 : H : GLN NE2 L0029 <- 2.37 -> DG O6 A0017 : score 6.30437 : H : GLN NE2 L0033 <- 2.82 -> DT O4 A0015 : score 5.17026 : w : GLN NE2 L0033 <- 6.14 -> DA N7 B0006 : score 1.888 : w : LYS NZ L0038 <- 6.07 -> DA N7 B0006 : score 1.655 : w : ARG NH2 L0043 <- 5.10 -> DA N3 B0011 : score 2.092 : x : GLN xxxx L0017 <- 4.41 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0027 <- 3.75 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0030 <- 3.99 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0032 <- 3.78 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >1per_LR:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=THE COMPLEX BETWEEN PHAGE 434 REPRESSION DNA-BINDING DOMAIN AND OPERATOR SITE OR3: STRUCTURAL DIFFERENCES BETWEEN CONSENSUS AND NON- CONSENSUS HALF-SITES organism=PHAGE 434 : H : GLN NE2 L0028 <- 3.24 -> DA N7 B0004 : score 5.55385 : H : GLN NE2 L0029 <- 2.37 -> DG O6 A0017 : score 6.30437 : H : GLN NE2 L0033 <- 2.82 -> DT O4 A0015 : score 5.17026 : w : GLN NE2 L0033 <- 6.14 -> DA N7 B0006 : score 1.888 : w : LYS NZ L0038 <- 6.07 -> DA N7 B0006 : score 1.655 : w : ARG NH2 L0043 <- 5.02 -> DT O2 A0012 : score 2.261 : H : GLN OE1 R0028 <- 2.70 -> DA N6 A0005 : score 6.17362 : H : GLN NE2 R0029 <- 2.52 -> DG O6 B0016 : score 6.13022 : x : GLN xxxx L0017 <- 4.41 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0027 <- 3.75 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0030 <- 3.99 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0032 <- 3.78 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx R0017 <- 4.29 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0027 <- 3.83 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0030 <- 4.28 -> DC xxx B0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0032 <- 3.82 -> DC xxx A0006 : score x.xxxxx >1ph1_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE OXYTRICHA NOVA TELOMERE END-BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH NONCOGNATE SSDNA GGGGTTTTGGGGT organism=STERKIELLA NOVA : H : GLU OE2 B0045 <- 2.65 -> DG N2 D0010 : score 4.43956 : H : LYS NZ B0145 <- 2.90 -> DG N7 D0011 : score 5.27818 : V : TYR CZ B0134 <- 3.81 -> DT C7 D0006 : score 5.56554 : x : LYS xxxx B0044 <- 4.40 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0048 <- 3.99 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0049 <- 3.23 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0051 <- 3.39 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 4.45 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0106 <- 3.90 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0109 <- 3.02 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0140 <- 3.26 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx >1ph2_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE OXYTRICHA NOVA TELOMERE END-BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH NONCOGNATE SSDNA GGGGTTTTG organism=STERKIELLA NOVA : w : TYR OH B0134 <- 5.88 -> DT O4 D0006 : score 2.914 : w : TYR OH B0134 <- 6.28 -> DT O4 D0006 : score 2.914 : w : ASN ND2 B0137 <- 6.09 -> DT O2 D0008 : score 1.666 : H : LYS NZ B0145 <- 3.12 -> DG N7 D0009 : score 5.0412 : x : GLU xxxx B0045 <- 2.54 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0049 <- 3.41 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0051 <- 3.60 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 4.43 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0106 <- 3.84 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0109 <- 3.11 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0140 <- 2.90 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >1ph3_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE OXYTRICHA NOVA TELOMERE END-BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH NONCOGNATE SSDNA GGGGTTTTGGTG organism=STERKIELLA NOVA : H : GLU OE2 B0045 <- 2.87 -> DG N2 D0009 : score 4.24991 : w : TYR OH B0134 <- 5.35 -> DT O4 D0006 : score 2.914 : w : TYR OH B0134 <- 6.21 -> DT O4 D0006 : score 2.914 : H : LYS NZ B0145 <- 2.77 -> DG N7 D0010 : score 5.41821 : x : PRO xxxx B0048 <- 4.19 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0049 <- 3.31 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0051 <- 3.43 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 4.27 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0106 <- 3.95 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0109 <- 2.81 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0140 <- 3.29 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >1ph4_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE OXYTRICHA NOVA TELOMERE END-BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH NONCOGNATE SSDNA GGGGTTTTGGCG organism=STERKIELLA NOVA : H : GLU OE2 B0045 <- 2.73 -> DG N2 D0009 : score 4.3706 : w : TYR OH B0134 <- 6.20 -> DT O4 D0006 : score 2.914 : w : TYR OH B0134 <- 5.42 -> DT O4 D0006 : score 2.914 : H : LYS NZ B0145 <- 2.79 -> DG N7 D0010 : score 5.39667 : x : LYS xxxx B0044 <- 4.28 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0048 <- 4.20 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0049 <- 3.24 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0051 <- 3.29 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 4.15 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0106 <- 3.88 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0109 <- 2.93 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0140 <- 3.21 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >1ph5_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE OXYTRICHA NOVA TELOMERE END-BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH NONCOGNATE SSDNA GGGGTTTTG(3DR)GG organism=STERKIELLA NOVA : w : LYS NZ B0044 <- 5.80 -> DT O4 D0007 : score 1.7 : H : GLU OE2 B0045 <- 2.79 -> DG N2 D0009 : score 4.31888 : w : GLU OE1 B0045 <- 6.05 -> DG O6 D0009 : score 2.669 : w : TYR OH B0134 <- 5.94 -> DT O4 D0007 : score 2.914 : w : TYR OH B0134 <- 5.53 -> DT O4 D0007 : score 2.914 : x : PRO xxxx B0048 <- 4.32 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0049 <- 3.33 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0051 <- 3.58 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 4.17 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0106 <- 3.83 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >1ph6_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE OXYTRICHA NOVA TELOMERE END-BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH NONCOGNATE SSDNA GGGGTTTTGTGG organism=STERKIELLA NOVA : H : GLU OE2 B0045 <- 2.77 -> DG N2 D0009 : score 4.33612 : x : PRO xxxx B0048 <- 4.17 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0049 <- 3.20 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0051 <- 3.38 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 4.27 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0106 <- 3.91 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0109 <- 3.48 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0134 <- 3.31 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0140 <- 3.30 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0145 <- 3.41 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >1ph7_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE OXYTRICHA NOVA TELOMERE END-BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH NONCOGNATE SSDNA GGGGTTTTGIGG organism=STERKIELLA NOVA : w : LYS NZ B0044 <- 5.85 -> DT O4 D0007 : score 1.7 : w : LYS NZ B0044 <- 5.65 -> DT O4 D0007 : score 1.7 : H : GLU OE2 B0045 <- 2.66 -> DG N2 D0009 : score 4.43094 : w : GLU OE1 B0045 <- 5.97 -> DG O6 D0009 : score 2.669 : w : TYR OH B0134 <- 6.18 -> DT O4 D0007 : score 2.914 : w : TYR OH B0134 <- 5.72 -> DT O4 D0007 : score 2.914 : x : PRO xxxx B0048 <- 4.26 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0049 <- 3.36 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0051 <- 3.33 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 4.18 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0106 <- 3.67 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0109 <- 3.04 -> DI xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0140 <- 3.32 -> DI xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0145 <- 2.82 -> DI xxx D0010 : score x.xxxxx >1ph8_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE OXYTRICHA NOVA TELOMERE END-BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH NONCOGNATE SSDNA GGGGTTTTGCGG organism=STERKIELLA NOVA : w : LYS NZ B0044 <- 5.76 -> DT O4 D0007 : score 1.7 : w : LYS NZ B0044 <- 6.23 -> DT O4 D0007 : score 1.7 : H : GLU OE2 B0045 <- 2.76 -> DG N2 D0009 : score 4.34474 : w : TYR OH B0134 <- 5.37 -> DT O4 D0007 : score 2.914 : w : TYR OH B0134 <- 6.18 -> DT O4 D0007 : score 2.914 : H : LYS NZ B0145 <- 3.24 -> DC O2 D0010 : score 2.68689 : x : PRO xxxx B0048 <- 4.26 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0049 <- 3.45 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0051 <- 3.31 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 4.25 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0106 <- 3.72 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0109 <- 3.49 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0140 <- 3.03 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx >1ph9_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE OXYTRICHA NOVA TELOMERE END-BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH NONCOGNATE SSDNA GGGGTTTTGAGG organism=STERKIELLA NOVA : H : GLU OE2 B0045 <- 2.71 -> DG N2 D0009 : score 4.38784 : w : GLU OE1 B0045 <- 5.90 -> DG O6 D0009 : score 2.669 : w : TYR OH B0134 <- 5.81 -> DT O4 D0007 : score 2.914 : w : TYR OH B0134 <- 5.55 -> DT O4 D0007 : score 2.914 : x : LYS xxxx B0044 <- 4.34 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0048 <- 4.20 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0049 <- 3.55 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0051 <- 3.46 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 4.45 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0102 <- 3.56 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0106 <- 3.94 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0109 <- 3.82 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0140 <- 3.13 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0145 <- 3.67 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx >1phj_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE OXYTRICHA NOVA TELOMERE END-BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH NONCOGNATE SSDNA GG(3DR)GTTTTGGGG organism=STERKIELLA NOVA : H : GLU OE2 B0045 <- 2.90 -> DG N2 D0009 : score 4.22405 : H : LYS NZ B0145 <- 2.98 -> DG N7 D0010 : score 5.19201 : x : LYS xxxx B0044 <- 4.44 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0048 <- 4.04 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0049 <- 3.58 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0051 <- 3.63 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 4.23 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0106 <- 4.13 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0109 <- 3.14 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0134 <- 3.40 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0140 <- 3.36 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >1pji_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF WILD TYPE LACTOCOCCUS LACTIS FPG COMPLEXED TO A 1,3 PROPANEDIOL CONTAINING DNA organism=Lactococcus lactis subsp. cremoris : H : ARG NH1 A0074 <- 2.93 -> DT O2 D0008 : score 4.19444 : H : ARG NH1 A0074 <- 2.93 -> DT O2 D0008 : score 4.19444 : w : ARG NH1 A0074 <- 5.88 -> DA N3 E0022 : score 2.585 : w : GLU OE2 A0076 <- 5.85 -> DT O2 D0006 : score 2.279 : H : ARG NE A0109 <- 2.93 -> DC O2 E0023 : score 2.58984 : H : ARG NH2 A0109 <- 3.13 -> DC N3 E0023 : score 2.13982 : w : ARG NH1 A0109 <- 6.15 -> DT O2 D0006 : score 1.855 : x : MET xxxx A0075 <- 3.54 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.40 -> DA xxx E0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.51 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1pjj_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=COMPLEX BETWEEN THE LACTOCOCCUS LACTIS FPG AND AN ABASIC SITE CONTAINING DNA. organism=Lactococcus lactis : H : ARG NH1 A0074 <- 2.83 -> DT O2 D0008 : score 4.28057 : w : ARG NH2 A0074 <- 6.36 -> DT O2 D0009 : score 2.261 : H : ARG NE A0109 <- 2.90 -> DC O2 E0023 : score 2.60579 : H : ARG NH2 A0109 <- 3.10 -> DC N3 E0023 : score 2.15356 : x : MET xxxx A0075 <- 3.47 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.44 -> DA xxx E0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.38 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1pm5_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF WILD TYPE LACTOCOCCUS LACTIS FPG COMPLEXED TO A TETRAHYDROFURAN CONTAINING DNA organism=Lactococcus lactis subsp. cremoris : H : ARG NH1 A0074 <- 2.76 -> DT O2 D0008 : score 4.34086 : w : ARG NH2 A0074 <- 6.17 -> DT O2 D0009 : score 2.261 : w : GLU OE2 A0076 <- 6.15 -> DT O2 D0006 : score 2.279 : H : ARG NE A0109 <- 2.93 -> DC O2 E0023 : score 2.58984 : H : ARG NH2 A0109 <- 3.16 -> DC N3 E0023 : score 2.12607 : w : ARG NH1 A0109 <- 6.43 -> DT O2 D0006 : score 1.855 : x : MET xxxx A0075 <- 3.42 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.42 -> DC xxx E0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.42 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1pnr_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PURINE REPRESSOR-HYPOXANTHINE-PURF-OPERATOR COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : THR OG1 A0016 <- 3.32 -> DA N7 B0703 : score 3.05904 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.59 -> DG O6 B0702 : score 6.33883 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.03 -> DG N7 B0702 : score 6.09092 : x : SER xxxx A0014 <- 3.73 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.40 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 3.01 -> DA xxx B0706 : score x.xxxxx >1pp7_U:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE T. VAGINALIS INITIATOR BINDING PROTEIN BOUND TO THE FERREDOXIN INR organism=Trichomonas vaginalis : H : ARG NH2 U0028 <- 2.63 -> DT O2 E0027 : score 4.37727 : H : ASN OD1 U0081 <- 2.93 -> DC N4 E0033 : score 4.08456 : H : ASN ND2 U0081 <- 2.97 -> DT O4 F0007 : score 5.10494 : w : ASN ND2 U0081 <- 6.11 -> DG N7 F0006 : score 3.259 : w : ASN ND2 U0084 <- 5.56 -> DG N7 F0006 : score 3.259 : V : VAL CG1 U0085 <- 3.62 -> DT C7 E0031 : score 6.33324 : x : LYS xxxx U0025 <- 3.35 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx U0082 <- 3.47 -> DT xxx E0032 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx U0086 <- 4.49 -> DT xxx E0031 : score x.xxxxx >1pp8_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE T. VAGINALIS IBP39 INITIATOR BINDING DOMAIN (IBD) BOUND TO THE ALPHA-SCS INR ELEMENT organism=Trichomonas vaginalis : H : LYS NZ F0025 <- 2.89 -> DT O2 J0012 : score 3.52261 : H : LYS NZ F0025 <- 3.07 -> DG N3 J0013 : score 1.37534 : H : ASN ND2 F0081 <- 2.94 -> DT O4 J0007 : score 5.13665 : x : SER xxxx F0026 <- 4.06 -> DA xxx K0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0028 <- 3.42 -> DT xxx K0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0082 <- 3.36 -> DT xxx K0032 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0085 <- 4.31 -> DT xxx K0032 : score x.xxxxx >1pp8_FMU:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE T. VAGINALIS IBP39 INITIATOR BINDING DOMAIN (IBD) BOUND TO THE ALPHA-SCS INR ELEMENT organism=Trichomonas vaginalis : H : LYS NZ F0025 <- 2.89 -> DT O2 J0012 : score 3.52261 : H : LYS NZ F0025 <- 3.07 -> DG N3 J0013 : score 1.37534 : H : ASN ND2 F0081 <- 2.94 -> DT O4 J0007 : score 5.13665 : H : LYS NZ M0025 <- 3.29 -> DT O2 R0012 : score 3.23564 : H : ASN OD1 M0081 <- 3.07 -> DC N4 Y0033 : score 3.96714 : H : ASN ND2 M0081 <- 3.12 -> DT O4 R0007 : score 4.9464 : H : LYS NZ U0025 <- 2.68 -> DT O2 G0012 : score 3.67327 : H : ARG NH1 U0028 <- 2.72 -> DC O2 T0003 : score 3.7084 : H : ASN ND2 U0081 <- 3.20 -> DT O4 G0007 : score 4.86185 : V : VAL CG1 M0085 <- 3.69 -> DT C7 Y0032 : score 6.22718 : x : SER xxxx U0026 <- 3.85 -> DA xxx E0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx U0082 <- 3.61 -> DT xxx E0032 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx U0085 <- 4.00 -> DT xxx E0032 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx U0086 <- 4.35 -> DT xxx E0031 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0026 <- 4.06 -> DA xxx K0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0028 <- 3.42 -> DT xxx K0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0082 <- 3.36 -> DT xxx K0032 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0085 <- 4.31 -> DT xxx K0032 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0026 <- 4.41 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0028 <- 4.19 -> DA xxx R0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0082 <- 3.37 -> DT xxx Y0032 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx M0084 <- 4.02 -> DT xxx R0005 : score x.xxxxx >1pt3_AB: title=CRYSTAL STRUCTURES OF NUCLEASE-COLE7 COMPLEXED WITH OCTAMER DNA organism=ESCHERICHIA COLI STR. K12 SUBSTR. : H : ASP OD2 A0493 <- 3.10 -> DC N4 C0006 : score 5.828 : w : ASP OD1 A0493 <- 6.36 -> DT O4 C0005 : score 2.616 : w : LYS NZ A0497 <- 5.98 -> DG O6 C0007 : score 3.005 : H : ASP OD2 B0493 <- 2.93 -> DC N4 E0006 : score 6.0388 : w : ASP OD1 B0493 <- 5.93 -> DG O6 E0007 : score 3.411 : H : LYS NZ B0497 <- 2.75 -> DG O6 F0009 : score 5.83858 : w : LYS NZ B0497 <- 5.46 -> DG O6 H0009 : score 3.005 : w : LYS NZ B0497 <- 6.42 -> DG N7 F0009 : score 2.519 : w : ARG NH1 B0538 <- 5.34 -> DG N3 F0015 : score 1.593 : x : ARG xxxx A0496 <- 3.23 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0538 <- 3.55 -> DC xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0494 <- 4.02 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0496 <- 3.42 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx >1pt3_B:His-Me_finger_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURES OF NUCLEASE-COLE7 COMPLEXED WITH OCTAMER DNA organism=ESCHERICHIA COLI STR. K12 SUBSTR. : H : ASP OD2 B0493 <- 2.93 -> DC N4 E0006 : score 6.0388 : w : ASP OD1 B0493 <- 5.93 -> DG O6 E0007 : score 3.411 : H : LYS NZ B0497 <- 2.75 -> DG O6 F0009 : score 5.83858 : w : LYS NZ B0497 <- 5.46 -> DG O6 H0009 : score 3.005 : w : LYS NZ B0497 <- 6.42 -> DG N7 F0009 : score 2.519 : w : ARG NH1 B0538 <- 5.34 -> DG N3 F0015 : score 1.593 : x : ASP xxxx B0494 <- 4.02 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0496 <- 3.42 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx >1pue_E:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=PU.1 ETS DOMAIN-DNA COMPLEX organism=Mus musculus : w : GLU OE1 E0228 <- 5.61 -> DC N4 B0026 : score 3.528 : w : GLU OE2 E0228 <- 6.54 -> DG O6 A0007 : score 2.892 : H : ARG NH1 E0232 <- 2.56 -> DG O6 A0009 : score 6.37533 : H : ARG NH2 E0235 <- 2.75 -> DG N7 A0008 : score 6.44846 : w : ARG NH2 E0235 <- 5.79 -> DG O6 A0008 : score 2.468 : w : ASN OD1 E0236 <- 5.71 -> DT O4 B0023 : score 3.132 : x : LYS xxxx E0229 <- 3.65 -> DT xxx B0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0233 <- 4.12 -> DT xxx B0023 : score x.xxxxx >1puf_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HOXA9 AND PBX1 HOMEODOMAINS BOUND TO DNA organism=MUS MUSCULUS : w : ARG NH1 A0206 <- 6.00 -> DT O2 E0029 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0206 <- 5.75 -> DT O2 E0029 : score 2.261 : w : ARG NH2 A0206 <- 5.57 -> DA N3 E0030 : score 2.092 : H : ARG NH1 A0209 <- 2.93 -> DA N3 E0032 : score 3.58632 : w : GLN OE1 A0254 <- 5.55 -> DC N4 D0014 : score 3.488 : w : GLN NE2 A0254 <- 5.86 -> DG N7 E0025 : score 2.582 : H : ASN OD1 A0255 <- 3.04 -> DA N6 D0013 : score 5.73275 : H : ASN ND2 A0255 <- 2.88 -> DA N7 D0013 : score 5.77658 : w : ASN OD1 A0255 <- 5.68 -> DG O6 E0028 : score 3.125 : x : ILE xxxx A0251 <- 3.62 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0258 <- 4.22 -> DC xxx E0027 : score x.xxxxx >1puf_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HOXA9 AND PBX1 HOMEODOMAINS BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS / MUS MUSCULUS : w : ARG NH1 A0206 <- 6.00 -> DT O2 E0029 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0206 <- 5.75 -> DT O2 E0029 : score 2.261 : w : ARG NH2 A0206 <- 5.57 -> DA N3 E0030 : score 2.092 : H : ARG NH1 A0209 <- 2.93 -> DA N3 E0032 : score 3.58632 : w : GLN OE1 A0254 <- 5.55 -> DC N4 D0014 : score 3.488 : w : GLN NE2 A0254 <- 5.86 -> DG N7 E0025 : score 2.582 : H : ASN OD1 A0255 <- 3.04 -> DA N6 D0013 : score 5.73275 : H : ASN ND2 A0255 <- 2.88 -> DA N7 D0013 : score 5.77658 : w : ASN OD1 A0255 <- 5.68 -> DG O6 E0028 : score 3.125 : H : ARG NH2 B0237 <- 3.20 -> DT O2 E0036 : score 3.89467 : H : ASN OD1 B0286 <- 2.86 -> DA N6 D0009 : score 5.94953 : H : ASN ND2 B0286 <- 3.12 -> DA N7 D0009 : score 5.4948 : w : ASN OD1 B0286 <- 6.27 -> DT O4 D0010 : score 3.132 : H : ARG NH1 B0290 <- 3.13 -> DG N7 D0008 : score 5.6507 : H : ARG NH2 B0290 <- 2.80 -> DG O6 D0008 : score 6.6 : x : ILE xxxx A0251 <- 3.62 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0258 <- 4.22 -> DC xxx E0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0282 <- 3.34 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0289 <- 4.24 -> DA xxx E0031 : score x.xxxxx >1puf_B:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HOXA9 AND PBX1 HOMEODOMAINS BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 B0237 <- 3.20 -> DT O2 E0036 : score 3.89467 : H : ASN OD1 B0286 <- 2.86 -> DA N6 D0009 : score 5.94953 : H : ASN ND2 B0286 <- 3.12 -> DA N7 D0009 : score 5.4948 : w : ASN OD1 B0286 <- 6.27 -> DT O4 D0010 : score 3.132 : w : ASN OD1 B0286 <- 5.62 -> DA N6 E0032 : score 2.837 : H : ARG NH1 B0290 <- 3.13 -> DG N7 D0008 : score 5.6507 : H : ARG NH2 B0290 <- 2.80 -> DG O6 D0008 : score 6.6 : x : ASN xxxx B0282 <- 3.34 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0289 <- 4.24 -> DA xxx E0031 : score x.xxxxx >1pv4_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_termination_factor,_N-terminal_domain; title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE RHO TRANSCRIPTION TERMINATION FACTOR IN COMPLEX WITH SINGLE STRANDED DNA organism=Escherichia coli : H : ASP OD2 A0078 <- 3.19 -> DC N4 G0004 : score 5.7164 : x : LEU xxxx A0058 <- 3.18 -> DC xxx G0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0064 <- 3.48 -> DC xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0066 <- 2.52 -> DC xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0074 <- 4.09 -> DC xxx G0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0080 <- 3.25 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0102 <- 3.79 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0108 <- 2.82 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0109 <- 3.25 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0110 <- 3.21 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0112 <- 4.17 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx >1pvi_A:Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURE OF PVUII ENDONUCLEASE WITH COGNATE DNA organism=PROTEUS VULGARIS : H : ASP OD1 A0034 <- 3.11 -> DG N2 D0008 : score 4.8307 : H : HIS ND1 A0084 <- 2.90 -> DG O6 C0008 : score 6.09862 : H : ASN OD1 A0140 <- 3.33 -> DA N6 C0007 : score 5.38348 : H : ASN ND2 A0140 <- 3.43 -> DA N7 C0007 : score 5.13083 : H : ASN ND2 A0141 <- 2.93 -> DG O6 D0011 : score 5.49186 : H : LYS NZ A0143 <- 3.07 -> DG O6 D0012 : score 5.46861 : x : SER xxxx A0081 <- 3.36 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx >1pvi_AB:Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURE OF PVUII ENDONUCLEASE WITH COGNATE DNA organism=PROTEUS VULGARIS : H : ASP OD1 A0034 <- 3.11 -> DG N2 D0008 : score 4.8307 : H : HIS ND1 A0084 <- 2.90 -> DG O6 C0008 : score 6.09862 : H : ASN OD1 A0140 <- 3.33 -> DA N6 C0007 : score 5.38348 : H : ASN ND2 A0140 <- 3.43 -> DA N7 C0007 : score 5.13083 : H : ASN ND2 A0141 <- 2.93 -> DG O6 D0011 : score 5.49186 : H : LYS NZ A0143 <- 3.07 -> DG O6 D0012 : score 5.46861 : H : HIS ND1 B0084 <- 3.19 -> DG O6 D0008 : score 5.73768 : H : ASN OD1 B0140 <- 2.87 -> DA N6 D0007 : score 5.93749 : H : ASN ND2 B0140 <- 3.08 -> DA N7 D0007 : score 5.54176 : H : ASN ND2 B0141 <- 3.08 -> DG O6 C0011 : score 5.32271 : H : LYS NZ B0143 <- 2.94 -> DG N7 C0011 : score 5.23509 : x : SER xxxx A0081 <- 3.36 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0034 <- 3.74 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0081 <- 3.72 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx >1pvp_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=BASIS FOR A SWITCH IN SUBSTRATE SPECIFICITY: CRYSTAL STRUCTURE OF SELECTED VARIANT OF CRE SITE-SPECIFIC RECOMBINASE, ALSHG BOUND TO THE ENGINEERED RECOGNITION SITE LOXM7 organism=Escherichia phage P1 : H : LYS NZ B0043 <- 3.03 -> DT O4 D0024 : score 3.42217 : H : LYS NZ B0086 <- 2.57 -> DA N7 C0014 : score 3.07229 : w : GLN OE1 B0090 <- 6.21 -> DT O4 D0021 : score 3.068 : H : LYS NZ B0201 <- 2.64 -> DA N3 C0014 : score 2.86578 : w : ARG NH2 B0241 <- 5.37 -> DA N3 C0004 : score 2.092 : H : ARG NH1 B0243 <- 2.31 -> DT O2 D0032 : score 4.72844 : H : LYS NZ B0244 <- 2.81 -> DT O2 C0002 : score 3.58001 : H : SER OG B0259 <- 3.16 -> DC N4 C0007 : score 3.41099 : H : ARG NH2 B0282 <- 3.00 -> DA N3 C0011 : score 3.11015 : V : HIS CG B0040 <- 3.77 -> DT C7 D0024 : score 3.02147 : V : MET CE B0044 <- 3.66 -> DT C7 C0012 : score 7.17282 : x : THR xxxx B0041 <- 3.43 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.61 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.70 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 3.62 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 3.65 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0262 <- 3.93 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0317 <- 3.56 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx >1pvq_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=BASIS FOR A SWITCH IN SUBSTRATE SPECIFICITY: CRYSTAL STRUCTURE OF SELECTED VARIANT OF CRE SITE-SPECIFIC RECOMBINASE, LNSGG BOUND TO THE ENGINEERED RECOGNITION SITE LOXM7 organism=Escherichia phage P1 : H : LYS NZ A0244 <- 2.35 -> DT O2 D0002 : score 3.91003 : H : SER OG A0259 <- 3.18 -> DC N4 D0007 : score 3.39629 : H : ARG NH2 A0282 <- 2.46 -> DA N3 D0011 : score 3.46005 : x : MET xxxx A0044 <- 3.42 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.74 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.08 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0090 <- 3.01 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 4.06 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 4.10 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx >1pvq_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=BASIS FOR A SWITCH IN SUBSTRATE SPECIFICITY: CRYSTAL STRUCTURE OF SELECTED VARIANT OF CRE SITE-SPECIFIC RECOMBINASE, LNSGG BOUND TO THE ENGINEERED RECOGNITION SITE LOXM7 organism=Escherichia phage P1 : H : LYS NZ B0043 <- 3.14 -> DT O4 D0024 : score 3.34325 : H : LYS NZ B0086 <- 2.64 -> DA N7 C0014 : score 3.03117 : H : LYS NZ B0201 <- 2.27 -> DA N3 C0014 : score 3.07128 : w : ARG NH2 B0241 <- 5.35 -> DA N3 C0004 : score 2.092 : H : ARG NH1 B0243 <- 2.68 -> DT O2 D0032 : score 4.40976 : H : LYS NZ B0244 <- 2.68 -> DT O2 C0002 : score 3.67327 : H : LYS NZ B0244 <- 3.41 -> DT O2 D0034 : score 3.14954 : H : SER OG B0259 <- 2.95 -> DC N4 C0007 : score 3.56537 : H : ARG NH2 B0282 <- 2.69 -> DA N3 C0011 : score 3.31102 : V : MET CE B0044 <- 3.72 -> DT C7 C0012 : score 7.06886 : V : HIS CG B0040 <- 3.56 -> DT C7 D0024 : score 3.17891 : x : THR xxxx B0041 <- 3.63 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.54 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 4.02 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0090 <- 2.89 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 3.63 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 4.06 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0320 <- 4.37 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx >1pvr_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=BASIS FOR A SWITCH IN SUBSTRATE SPECIFICITY: CRYSTAL STRUCTURE OF SELECTED VARIANT OF CRE SITE-SPECIFIC RECOMBINASE, LNSGG BOUND TO THE LOXP (WILDTYPE) RECOGNITION SITE organism=Enterobacteria phage P1 : H : GLN NE2 A0090 <- 2.92 -> DT O4 D0012 : score 5.06644 : w : GLN NE2 A0090 <- 5.05 -> DA N6 D0013 : score 2.804 : H : LYS NZ A0244 <- 2.47 -> DT O2 D0002 : score 3.82393 : H : SER OG A0259 <- 3.41 -> DT O4 D0007 : score 3.1214 : V : MET CE A0044 <- 3.80 -> DT C7 D0012 : score 6.93026 : x : SER xxxx A0047 <- 3.79 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.77 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 4.43 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.55 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0282 <- 3.86 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx >1pvr_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=BASIS FOR A SWITCH IN SUBSTRATE SPECIFICITY: CRYSTAL STRUCTURE OF SELECTED VARIANT OF CRE SITE-SPECIFIC RECOMBINASE, LNSGG BOUND TO THE LOXP (WILDTYPE) RECOGNITION SITE organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ B0043 <- 2.91 -> DT O4 D0024 : score 3.50826 : H : LYS NZ B0086 <- 2.30 -> DA N7 C0014 : score 3.2309 : H : LYS NZ B0201 <- 2.33 -> DA N3 C0014 : score 3.03795 : w : ARG NH2 B0241 <- 5.83 -> DA N3 C0004 : score 2.092 : H : ARG NH1 B0243 <- 3.13 -> DT O2 D0032 : score 4.02219 : H : ARG NH2 B0243 <- 2.55 -> DT O2 D0032 : score 4.445 : H : LYS NZ B0244 <- 3.12 -> DT O2 C0002 : score 3.3576 : H : SER OG B0259 <- 3.18 -> DT O4 C0007 : score 3.28494 : H : SER OG B0259 <- 2.50 -> DG O6 D0027 : score 4.33649 : H : ARG NH2 B0282 <- 2.49 -> DA N3 C0011 : score 3.44061 : V : MET CE B0044 <- 3.64 -> DT C7 C0012 : score 7.20747 : V : HIS CG B0040 <- 3.69 -> DT C7 D0024 : score 3.08145 : x : THR xxxx B0041 <- 3.30 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.54 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.92 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0090 <- 2.70 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 3.65 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 3.30 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0320 <- 3.89 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx >1pyi_A:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A PPR1-DNA COMPLEX: DNA RECOGNITION BY PROTEINS CONTAINING A ZN2CYS6 BINUCLEAR CLUSTER organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0041 <- 2.73 -> DG N7 D0003 : score 5.4613 : x : LYS xxxx A0040 <- 4.30 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0042 <- 4.14 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx >1pyi_AB:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A PPR1-DNA COMPLEX: DNA RECOGNITION BY PROTEINS CONTAINING A ZN2CYS6 BINUCLEAR CLUSTER organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0041 <- 2.73 -> DG N7 D0003 : score 5.4613 : w : LYS NZ B0041 <- 5.93 -> DG O6 E0018 : score 3.005 : V : ILE CG2 B0042 <- 3.82 -> DT C7 E0015 : score 7.05583 : x : LYS xxxx A0040 <- 4.30 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0042 <- 4.14 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0040 <- 4.18 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx >1pzu_BHIM:p53-like_transcription_factors;E_set_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=AN ASYMMETRIC NFAT1-RHR HOMODIMER ON A PSEUDO-PALINDROMIC, KAPPA-B SITE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0421 <- 3.06 -> DG N7 W0005 : score 5.7354 : H : ARG NH2 B0421 <- 2.59 -> DG O6 W0005 : score 6.8772 : H : GLU OE2 B0427 <- 2.93 -> DC N4 T0012 : score 5.12848 : H : ARG NH2 B0430 <- 3.42 -> DG N7 W0004 : score 5.59292 : H : GLN OE1 B0571 <- 2.78 -> DA N6 W0006 : score 6.07677 : H : GLN NE2 B0571 <- 2.80 -> DA N7 W0006 : score 6.08974 : H : ARG NH1 H0421 <- 2.93 -> DG N7 Z0005 : score 5.8927 : H : ARG NH2 H0421 <- 2.60 -> DG O6 Z0005 : score 6.864 : H : GLU OE2 H0427 <- 2.77 -> DC N4 V0012 : score 5.29698 : H : ARG NH2 H0430 <- 3.08 -> DG N7 Z0004 : score 6.02708 : H : GLN OE1 H0571 <- 2.82 -> DA N6 Z0006 : score 6.02835 : H : GLN NE2 H0571 <- 2.52 -> DA N7 Z0006 : score 6.43077 : H : ARG NH1 I0421 <- 2.99 -> DG N7 V0006 : score 5.8201 : H : ARG NH2 I0421 <- 2.82 -> DG O6 V0006 : score 6.5736 : H : GLU OE2 I0427 <- 2.97 -> DC N4 Z0011 : score 5.08636 : H : ARG NH2 I0430 <- 3.44 -> DG N7 V0005 : score 5.56738 : H : GLN OE1 I0571 <- 2.72 -> DA N6 V0007 : score 6.14941 : H : GLN NE2 I0571 <- 2.69 -> DA N7 V0007 : score 6.22372 : H : ARG NH1 M0421 <- 3.00 -> DG N7 X0006 : score 5.808 : H : ARG NH2 M0421 <- 2.70 -> DG O6 X0006 : score 6.732 : H : GLU OE2 M0427 <- 3.13 -> DC N4 Y0011 : score 4.91787 : H : ARG NH2 M0430 <- 3.31 -> DG N7 X0005 : score 5.73338 : H : GLN OE1 M0571 <- 2.99 -> DA N6 X0007 : score 5.82257 : H : GLN NE2 M0571 <- 3.13 -> DA N7 X0007 : score 5.68782 : x : TYR xxxx B0424 <- 3.45 -> DT xxx T0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0537 <- 4.18 -> DC xxx W0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0424 <- 3.09 -> DT xxx V0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0537 <- 3.26 -> DC xxx Z0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx I0424 <- 3.37 -> DT xxx Z0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0537 <- 3.05 -> DC xxx V0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx M0424 <- 3.07 -> DT xxx Y0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0537 <- 2.86 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx >1pzu_M:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=AN ASYMMETRIC NFAT1-RHR HOMODIMER ON A PSEUDO-PALINDROMIC, KAPPA-B SITE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 M0421 <- 3.00 -> DG N7 X0006 : score 5.808 : H : ARG NH2 M0421 <- 2.70 -> DG O6 X0006 : score 6.732 : H : GLU OE2 M0427 <- 3.13 -> DC N4 Y0011 : score 4.91787 : H : ARG NH2 M0430 <- 3.31 -> DG N7 X0005 : score 5.73338 : H : GLN OE1 M0571 <- 2.99 -> DA N6 X0007 : score 5.82257 : H : GLN NE2 M0571 <- 3.13 -> DA N7 X0007 : score 5.68782 : x : TYR xxxx M0424 <- 3.07 -> DT xxx Y0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0537 <- 2.86 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx >1q0t_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=TERNARY STRUCTURE OF T4DAM WITH ADOHCY AND DNA organism=Enterobacteria phage T4 : x : ASN xxxx A0135 <- 3.40 -> DT xxx C0411 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0138 <- 3.86 -> DG xxx C0412 : score x.xxxxx >1q3f_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=URACIL DNA GLYCOSYLASE BOUND TO A CATIONIC 1-AZA-2'-DEOXYRIBOSE- CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : w : TYR OH A0275 <- 5.35 -> DA N3 C0027 : score 1.448 : w : ARG NH1 A0276 <- 5.63 -> DT O2 B0007 : score 1.855 : x : PRO xxxx A0271 <- 3.12 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0272 <- 3.58 -> DA xxx C0027 : score x.xxxxx >1q3u_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A WILD-TYPE CRE RECOMBINASE-LOXP SYNAPSE: PRE- CLEAVAGE COMPLEX organism=Enterobacteria phage P1 : H : MET SD A0044 <- 3.33 -> DA N6 D0112 : score 5.34222 : H : LYS NZ A0086 <- 3.23 -> DG N7 D0115 : score 4.92271 : H : LYS NZ A0086 <- 2.86 -> DG O6 D0115 : score 5.7114 : H : LYS NZ A0244 <- 2.89 -> DT O2 C0135 : score 3.52261 : H : LYS NZ A0244 <- 2.95 -> DT O2 D0103 : score 3.47956 : H : ARG NE A0259 <- 2.53 -> DG O6 C0128 : score 4.15384 : H : ARG NH2 A0259 <- 2.70 -> DG N7 C0128 : score 6.51231 : H : ASN OD1 A0317 <- 3.45 -> DA N6 D0117 : score 5.23896 : V : HIS CG A0040 <- 3.89 -> DT C7 C0125 : score 2.9315 : x : THR xxxx A0041 <- 3.80 -> DT xxx C0123 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.89 -> DT xxx D0111 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.71 -> DT xxx D0113 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0090 <- 2.87 -> DT xxx C0123 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 3.88 -> DT xxx C0123 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 4.09 -> DA xxx D0105 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.74 -> DT xxx D0108 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0260 <- 4.49 -> DT xxx D0107 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0262 <- 3.00 -> DC xxx C0127 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0282 <- 2.74 -> DA xxx D0112 : score x.xxxxx >1q3v_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A WILD-TYPE CRE RECOMBINASE-LOXP SYNAPSE: PHOSPHOTYROSINE COVALENT INTERMEDIATE organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ A0086 <- 3.27 -> DG N7 D0115 : score 4.87962 : H : LYS NZ A0086 <- 2.78 -> DG O6 D0115 : score 5.80389 : H : ARG NE A0259 <- 2.82 -> DG O6 X0128 : score 3.92526 : H : ARG NH2 A0259 <- 2.84 -> DG N7 X0128 : score 6.33354 : V : HIS CG A0040 <- 3.89 -> DT C7 X0125 : score 2.9315 : x : THR xxxx A0041 <- 3.71 -> DT xxx X0123 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0044 <- 3.42 -> DT xxx D0113 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.86 -> DT xxx D0111 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.36 -> DT xxx D0113 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0090 <- 2.87 -> DT xxx X0123 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 3.85 -> DT xxx X0123 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 4.16 -> DA xxx D0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0243 <- 3.95 -> DT xxx X0133 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0244 <- 2.76 -> DT xxx D0103 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.91 -> DT xxx D0108 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0262 <- 3.22 -> DC xxx X0127 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0282 <- 3.76 -> DA xxx D0112 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0317 <- 4.06 -> DA xxx D0117 : score x.xxxxx >1q3v_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A WILD-TYPE CRE RECOMBINASE-LOXP SYNAPSE: PHOSPHOTYROSINE COVALENT INTERMEDIATE organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ A0086 <- 3.27 -> DG N7 D0115 : score 4.87962 : H : LYS NZ A0086 <- 2.78 -> DG O6 D0115 : score 5.80389 : H : ARG NE A0259 <- 2.82 -> DG O6 X0128 : score 3.92526 : H : ARG NH2 A0259 <- 2.84 -> DG N7 X0128 : score 6.33354 : H : LYS NZ B0043 <- 3.21 -> DT O4 D0125 : score 3.29303 : H : LYS NZ B0201 <- 3.27 -> DT O2 D0123 : score 3.24998 : H : LYS NZ B0244 <- 2.57 -> DT O2 C0103 : score 3.75219 : H : LYS NZ B0244 <- 2.99 -> DT O2 D0135 : score 3.45087 : H : ARG NE B0259 <- 2.75 -> DG O6 D0128 : score 3.98044 : H : ARG NH2 B0259 <- 3.22 -> DG N7 D0128 : score 5.84831 : H : ARG NH2 B0282 <- 2.91 -> DA N3 C0112 : score 3.16847 : V : HIS CG A0040 <- 3.89 -> DT C7 X0125 : score 2.9315 : x : THR xxxx A0041 <- 3.71 -> DT xxx X0123 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0044 <- 3.42 -> DT xxx D0113 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.86 -> DT xxx D0111 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.36 -> DT xxx D0113 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0090 <- 2.87 -> DT xxx X0123 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 3.85 -> DT xxx X0123 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 4.16 -> DA xxx D0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0243 <- 3.95 -> DT xxx X0133 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0244 <- 2.76 -> DT xxx D0103 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.91 -> DT xxx D0108 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0262 <- 3.22 -> DC xxx X0127 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0282 <- 3.76 -> DA xxx D0112 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0317 <- 4.06 -> DA xxx D0117 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0040 <- 3.11 -> DT xxx D0125 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0041 <- 3.63 -> DT xxx D0123 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0044 <- 3.51 -> DA xxx D0124 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 4.00 -> DT xxx C0111 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0086 <- 3.48 -> DA xxx C0114 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.20 -> DT xxx C0113 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0090 <- 2.84 -> DT xxx D0123 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 4.24 -> DT xxx D0123 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0241 <- 4.06 -> DA xxx C0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0243 <- 4.14 -> DT xxx D0133 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 3.62 -> DT xxx C0108 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0262 <- 3.27 -> DC xxx D0127 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0317 <- 3.52 -> DT xxx X0118 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0319 <- 3.13 -> DT xxx X0118 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0320 <- 4.26 -> DG xxx X0117 : score x.xxxxx >1q3v_EF:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A WILD-TYPE CRE RECOMBINASE-LOXP SYNAPSE: PHOSPHOTYROSINE COVALENT INTERMEDIATE organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ E0244 <- 2.56 -> DT O2 H0103 : score 3.75936 : H : ARG NE E0259 <- 2.57 -> DG O6 Y0128 : score 4.12231 : H : ARG NH2 E0259 <- 2.71 -> DG N7 Y0128 : score 6.49954 : H : ARG NH1 E0282 <- 2.94 -> DA N3 H0112 : score 3.57895 : H : GLN NE2 F0090 <- 2.96 -> DT O4 H0123 : score 5.02491 : H : LYS NZ F0244 <- 2.51 -> DT O2 G0103 : score 3.79524 : H : LYS NZ F0244 <- 3.06 -> DT O2 H0135 : score 3.40065 : H : ARG NE F0259 <- 2.89 -> DG O6 H0128 : score 3.87009 : H : ARG NH2 F0259 <- 3.13 -> DG N7 H0128 : score 5.96323 : H : ARG NH2 F0282 <- 2.93 -> DA N3 G0112 : score 3.15551 : V : HIS CG E0040 <- 3.86 -> DT C7 Y0125 : score 2.95399 : V : HIS CG F0040 <- 3.70 -> DT C7 H0125 : score 3.07395 : x : THR xxxx E0041 <- 3.75 -> DT xxx Y0123 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0044 <- 3.03 -> DT xxx H0113 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0047 <- 3.83 -> DT xxx H0111 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0086 <- 3.09 -> DG xxx H0115 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0087 <- 3.08 -> DT xxx H0113 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0090 <- 2.67 -> DT xxx Y0123 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0094 <- 4.06 -> DT xxx Y0123 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0241 <- 4.15 -> DT xxx Y0133 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0257 <- 3.82 -> DT xxx H0108 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0262 <- 3.61 -> DC xxx Y0127 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0316 <- 4.07 -> DA xxx H0117 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0317 <- 3.91 -> DA xxx H0117 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0041 <- 3.79 -> DT xxx H0123 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0044 <- 3.28 -> DT xxx G0113 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0047 <- 4.08 -> DT xxx G0111 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0086 <- 3.58 -> DA xxx G0114 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0087 <- 3.06 -> DT xxx G0113 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0094 <- 3.76 -> DT xxx H0123 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0201 <- 3.02 -> DT xxx H0123 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0241 <- 4.03 -> DA xxx G0105 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0257 <- 3.96 -> DT xxx G0108 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0262 <- 3.32 -> DC xxx H0127 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0319 <- 2.76 -> DT xxx Y0118 : score x.xxxxx >1q9x_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ENTEROBACTERIA PHAGE RB69 GP43 DNA POLYMERASE COMPLEXED WITH TETRAHYDROFURAN CONTAINING DNA organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ D0706 <- 2.85 -> DC O2 L0952 : score 2.91669 : H : LYS NZ D0800 <- 3.28 -> DT O2 L0946 : score 3.24281 : x : LYS xxxx D0734 <- 3.65 -> DT xxx L0950 : score x.xxxxx >1q9y_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ENTEROBACTERIA PHAGE RB69 GP43 DNA POLYMERASE COMPLEXED WITH 8-OXOGUANOSINE CONTAINING DNA organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0709 <- 2.53 -> DC O2 P0937 : score 3.10525 : H : LYS NZ A0803 <- 3.00 -> DT O2 P0931 : score 3.44369 : x : LYS xxxx A0737 <- 3.84 -> DT xxx P0935 : score x.xxxxx >1qai_AB:DNA/RNA_polymerases; title=CRYSTAL STRUCTURES OF THE N-TERMINAL FRAGMENT FROM MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEXED WITH NUCLEIC ACID: FUNCTIONAL IMPLICATIONS FOR TEMPLATE-PRIMER BINDING TO THE FINGERS DOMAIN organism=Moloney murine leukemia virus : H : ARG NH1 A0116 <- 3.25 -> DT O2 C0003 : score 3.91883 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.91 -> DA N3 C0002 : score 3.16847 : H : ARG NH2 B0116 <- 2.85 -> DA N3 D0002 : score 3.20735 : x : LEU xxxx A0099 <- 3.91 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0114 <- 3.32 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0064 <- 3.11 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0099 <- 3.10 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0114 <- 2.99 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx >1qai_B:DNA/RNA_polymerases; title=CRYSTAL STRUCTURES OF THE N-TERMINAL FRAGMENT FROM MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEXED WITH NUCLEIC ACID: FUNCTIONAL IMPLICATIONS FOR TEMPLATE-PRIMER BINDING TO THE FINGERS DOMAIN organism=Moloney murine leukemia virus : H : ARG NH2 B0116 <- 2.85 -> DA N3 D0002 : score 3.20735 : x : TYR xxxx B0064 <- 3.11 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0099 <- 3.10 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0114 <- 2.99 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx >1qaj_A:DNA/RNA_polymerases; title=CRYSTAL STRUCTURES OF THE N-TERMINAL FRAGMENT FROM MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEXED WITH NUCLEIC ACID: FUNCTIONAL IMPLICATIONS FOR TEMPLATE-PRIMER BINDING TO THE FINGERS DOMAIN organism=Moloney murine leukemia virus : H : ARG NH1 A0116 <- 2.68 -> DT O2 C0003 : score 4.40976 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.73 -> DA N3 C0002 : score 3.2851 : x : LEU xxxx A0099 <- 2.95 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0101 <- 4.23 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0112 <- 3.95 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0114 <- 3.97 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx >1qbj_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ZALPHA Z-DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx C0174 <- 3.50 -> DG xxx F0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0177 <- 3.56 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx >1qln_A:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURE OF A TRANSCRIBING T7 RNA POLYMERASE INITIATION COMPLEX organism=BACTERIOPHAGE T7 : H : LYS NZ A0098 <- 3.07 -> DA N3 N0105 : score 2.62697 : w : LYS NZ A0098 <- 5.88 -> DT O2 T0018 : score 0.522 : H : ASP OD2 A0240 <- 2.88 -> DG N2 T0010 : score 5.37163 : H : ARG NH1 A0746 <- 3.05 -> DG O6 T0012 : score 5.77917 : H : ARG NH2 A0746 <- 2.83 -> DG N7 T0012 : score 6.34631 : H : ASN ND2 A0748 <- 3.12 -> DG N7 N0107 : score 4.2924 : H : ARG NH1 A0756 <- 3.00 -> DG N7 T0014 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0756 <- 3.10 -> DG O6 T0014 : score 6.204 : H : GLN OE1 A0758 <- 3.03 -> DA N6 T0013 : score 5.77415 : H : GLN NE2 A0758 <- 3.26 -> DA N7 T0013 : score 5.52949 : x : ARG xxxx A0096 <- 3.25 -> DA xxx N0103 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0135 <- 3.79 -> DA xxx T0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0139 <- 2.91 -> DA xxx T0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0206 <- 2.82 -> DA xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0231 <- 4.42 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0234 <- 4.21 -> DT xxx N0114 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0237 <- 3.43 -> DG xxx T0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0760 <- 3.93 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0761 <- 3.82 -> DA xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0762 <- 3.79 -> DA xxx T0009 : score x.xxxxx >1qn3_A:TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE C(-25) ADENOVIRUS MAJOR LATE PROMOTER TATA BOX VARIANT BOUND TO WILD-TYPE TBP (ARABIDOPSIS THALIANA TBP ISOFORM 2). TATA ELEMENT RECOGNITION BY THE TATA BOX-BINDING PROTEIN HAS BEEN CONSERVED THROUGHOUT EVOLUTION. organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ASN ND2 A0027 <- 2.85 -> DT O2 D0222 : score 4.69869 : H : ASN ND2 A0027 <- 3.16 -> DT O2 D0223 : score 4.40443 : H : ASN ND2 A0117 <- 3.27 -> DA N3 C0206 : score 3.44977 : H : ASN ND2 A0117 <- 3.33 -> DA N3 C0207 : score 3.40408 : H : THR OG1 A0173 <- 2.79 -> DA N3 C0206 : score 1.35655 : x : VAL xxxx A0029 <- 3.57 -> DA xxx C0208 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0057 <- 3.20 -> DG xxx D0220 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0072 <- 3.90 -> DC xxx C0209 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0074 <- 3.39 -> DC xxx C0209 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0080 <- 3.72 -> DA xxx C0208 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0082 <- 3.48 -> DT xxx D0221 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0119 <- 3.52 -> DT xxx D0223 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0148 <- 3.25 -> DA xxx C0204 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0149 <- 3.31 -> DA xxx D0226 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0163 <- 3.74 -> DT xxx C0205 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0165 <- 3.39 -> DT xxx D0225 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0171 <- 3.45 -> DA xxx D0224 : score x.xxxxx >1qn4_A:TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE T(-24) ADENOVIRUS MAJOR LATE PROMOTER TATA BOX VARIANT BOUND TO WILD-TYPE TBP (ARABIDOPSIS THALIANA TBP ISOFORM 2). TATA ELEMENT RECOGNITION BY THE TATA BOX-BINDING PROTEIN HAS BEEN CONSERVED THROUGHOUT EVOLUTION. organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ASN ND2 A0027 <- 2.84 -> DT O2 D0222 : score 4.70818 : H : ASN ND2 A0027 <- 3.14 -> DT O2 D0223 : score 4.42342 : H : THR OG1 A0173 <- 2.87 -> DA N3 C0206 : score 1.33489 : x : VAL xxxx A0029 <- 3.57 -> DA xxx C0207 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0057 <- 3.24 -> DT xxx D0220 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0072 <- 3.45 -> DT xxx D0220 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0074 <- 3.58 -> DA xxx C0209 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0080 <- 3.69 -> DA xxx C0208 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0082 <- 3.53 -> DT xxx D0221 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0117 <- 3.38 -> DA xxx C0206 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0119 <- 3.40 -> DT xxx D0223 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0148 <- 3.26 -> DA xxx C0204 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0149 <- 3.42 -> DA xxx D0226 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0163 <- 3.75 -> DT xxx C0205 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0165 <- 3.29 -> DT xxx D0225 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0171 <- 3.44 -> DA xxx D0224 : score x.xxxxx >1qn5_B:TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE G(-26) ADENOVIRUS MAJOR LATE PROMOTER TATA BOX VARIANT BOUND TO WILD-TYPE TBP (ARABIDOPSIS THALIANA TBP ISOFORM 2). TATA ELEMENT RECOGNITION BY THE TATA BOX-BINDING PROTEIN HAS BEEN CONSERVED THROUGHOUT EVOLUTION. organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ASN ND2 B0027 <- 2.89 -> DT O2 F0222 : score 4.66072 : H : ASN ND2 B0027 <- 3.09 -> DT O2 F0223 : score 4.47088 : H : ASN ND2 B0117 <- 3.27 -> DA N3 E0207 : score 3.44977 : H : THR OG1 B0173 <- 2.89 -> DA N3 E0206 : score 1.32948 : x : VAL xxxx B0029 <- 3.48 -> DA xxx E0207 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0057 <- 3.31 -> DT xxx F0220 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0072 <- 3.44 -> DT xxx F0220 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0074 <- 3.55 -> DA xxx E0209 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0080 <- 3.72 -> DG xxx E0208 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0082 <- 3.16 -> DG xxx E0208 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0119 <- 3.50 -> DT xxx F0223 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0148 <- 3.29 -> DA xxx E0204 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0149 <- 3.15 -> DA xxx F0226 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0163 <- 3.44 -> DA xxx E0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0165 <- 3.25 -> DT xxx F0225 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0171 <- 3.43 -> DA xxx F0224 : score x.xxxxx >1qn6_B:TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE T(-26) ADENOVIRUS MAJOR LATE PROMOTER TATA BOX VARIANT BOUND TO WILD-TYPE TBP (ARABIDOPSIS THALIANA TBP ISOFORM 2). TATA ELEMENT RECOGNITION BY THE TATA BOX-BINDING PROTEIN HAS BEEN CONSERVED THROUGHOUT EVOLUTION. organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ASN ND2 B0027 <- 3.08 -> DT O2 F0222 : score 4.48037 : H : ASN ND2 B0027 <- 3.20 -> DT O2 F0223 : score 4.36646 : w : THR OG1 B0082 <- 5.60 -> DA N3 F0221 : score 2.845 : H : ASN ND2 B0117 <- 3.23 -> DA N3 E0207 : score 3.48023 : H : THR OG1 B0173 <- 2.77 -> DA N3 E0206 : score 1.36197 : x : VAL xxxx B0029 <- 3.60 -> DA xxx E0207 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0057 <- 3.24 -> DT xxx F0220 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0072 <- 3.46 -> DT xxx F0220 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0074 <- 3.61 -> DA xxx E0209 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0080 <- 3.52 -> DT xxx E0208 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0119 <- 3.43 -> DT xxx F0223 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0148 <- 3.23 -> DA xxx E0204 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0149 <- 3.19 -> DA xxx F0226 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0163 <- 3.58 -> DT xxx E0205 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0165 <- 3.30 -> DT xxx F0225 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0171 <- 3.46 -> DA xxx F0224 : score x.xxxxx >1qn7_B:TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE T(-27) ADENOVIRUS MAJOR LATE PROMOTER TATA BOX VARIANT BOUND TO WILD-TYPE TBP (ARABIDOPSIS THALIANA TBP ISOFORM 2). TATA ELEMENT RECOGNITION BY THE TATA BOX-BINDING PROTEIN HAS BEEN CONSERVED THROUGHOUT EVOLUTION. organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ASN ND2 B0027 <- 3.10 -> DA N3 F0222 : score 3.57923 : H : ASN ND2 B0027 <- 3.21 -> DT O2 F0223 : score 4.35697 : H : ASN ND2 B0117 <- 3.26 -> DA N3 E0206 : score 3.45738 : H : ASN ND2 B0117 <- 3.11 -> DT O2 E0207 : score 4.45189 : H : THR OG1 B0173 <- 2.76 -> DA N3 E0206 : score 1.36468 : x : VAL xxxx B0029 <- 3.27 -> DT xxx E0207 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0057 <- 3.27 -> DT xxx F0220 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0072 <- 3.39 -> DT xxx F0220 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0074 <- 3.65 -> DA xxx E0209 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0080 <- 3.65 -> DA xxx E0209 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0082 <- 3.34 -> DA xxx F0222 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0119 <- 3.45 -> DT xxx F0223 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0148 <- 3.34 -> DA xxx E0204 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0149 <- 3.27 -> DA xxx F0226 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0163 <- 3.43 -> DA xxx E0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0165 <- 3.23 -> DT xxx F0225 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0171 <- 3.38 -> DA xxx F0224 : score x.xxxxx >1qn8_B:TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE T(-28) ADENOVIRUS MAJOR LATE PROMOTER TATA BOX VARIANT BOUND TO WILD-TYPE TBP (ARABIDOPSIS THALIANA TBP ISOFORM 2). TATA ELEMENT RECOGNITION BY THE TATA BOX-BINDING PROTEIN HAS BEEN CONSERVED THROUGHOUT EVOLUTION. organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ASN ND2 B0027 <- 2.99 -> DT O2 F0222 : score 4.5658 : H : ASN ND2 B0027 <- 3.20 -> DA N3 F0223 : score 3.50308 : H : ASN ND2 B0117 <- 2.90 -> DT O2 E0206 : score 4.65123 : H : THR OG1 B0173 <- 2.81 -> DT O2 E0206 : score 2.70867 : x : VAL xxxx B0029 <- 3.45 -> DA xxx E0207 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0057 <- 3.13 -> DT xxx F0220 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0072 <- 3.54 -> DT xxx F0220 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0074 <- 3.42 -> DA xxx E0209 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0080 <- 3.60 -> DA xxx E0208 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0082 <- 3.48 -> DT xxx F0221 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0119 <- 3.64 -> DA xxx F0223 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0148 <- 3.18 -> DA xxx E0204 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0149 <- 3.32 -> DA xxx F0226 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0163 <- 3.66 -> DA xxx E0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0165 <- 3.30 -> DT xxx F0225 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0171 <- 3.38 -> DA xxx F0224 : score x.xxxxx >1qn9_B:TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE C(-29) ADENOVIRUS MAJOR LATE PROMOTER TATA BOX VARIANT BOUND TO WILD-TYPE TBP (ARABIDOPSIS THALIANA TBP ISOFORM 2). TATA ELEMENT RECOGNITION BY THE TATA BOX-BINDING PROTEIN HAS BEEN CONSERVED THROUGHOUT EVOLUTION. organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ASN ND2 B0027 <- 2.87 -> DT O2 F0222 : score 4.67971 : H : ASN ND2 B0027 <- 3.12 -> DT O2 F0223 : score 4.4424 : H : ASN ND2 B0117 <- 3.32 -> DA N3 E0206 : score 3.41169 : H : ASN ND2 B0117 <- 3.03 -> DA N3 E0207 : score 3.63254 : H : THR OG1 B0173 <- 2.80 -> DA N3 E0206 : score 1.35385 : x : VAL xxxx B0029 <- 3.56 -> DT xxx F0222 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0057 <- 3.21 -> DT xxx F0220 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0072 <- 3.52 -> DT xxx F0220 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0074 <- 3.53 -> DA xxx E0209 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0080 <- 3.68 -> DA xxx E0208 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0082 <- 3.58 -> DT xxx F0221 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0119 <- 3.43 -> DT xxx F0223 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0148 <- 3.29 -> DA xxx E0204 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0149 <- 3.25 -> DA xxx F0226 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0163 <- 3.49 -> DA xxx E0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0165 <- 3.28 -> DT xxx F0225 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0171 <- 3.45 -> DG xxx F0224 : score x.xxxxx >1qna_B:TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE T(-30) ADENOVIRUS MAJOR LATE PROMOTER TATA BOX VARIANT BOUND TO WILD-TYPE TBP (ARABIDOPSIS THALIANA TBP ISOFORM 2). TATA ELEMENT RECOGNITION BY THE TATA BOX-BINDING PROTEIN HAS BEEN CONSERVED THROUGHOUT EVOLUTION. organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ASN ND2 B0027 <- 2.95 -> DT O2 F0222 : score 4.60377 : H : ASN ND2 B0027 <- 3.11 -> DT O2 F0223 : score 4.45189 : H : ASN ND2 B0117 <- 3.35 -> DA N3 E0206 : score 3.38885 : H : ASN ND2 B0117 <- 3.20 -> DA N3 E0207 : score 3.50308 : H : THR OG1 B0173 <- 2.75 -> DA N3 E0206 : score 1.36738 : x : VAL xxxx B0029 <- 3.60 -> DT xxx F0222 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0057 <- 3.29 -> DT xxx F0220 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0072 <- 3.39 -> DT xxx F0220 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0074 <- 3.50 -> DA xxx E0209 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0080 <- 3.59 -> DA xxx E0208 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0082 <- 3.44 -> DT xxx F0221 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0119 <- 3.43 -> DT xxx F0223 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0148 <- 2.95 -> DT xxx E0204 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0149 <- 3.03 -> DA xxx F0226 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0163 <- 3.38 -> DT xxx E0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0165 <- 3.64 -> DA xxx F0225 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0171 <- 3.47 -> DA xxx F0224 : score x.xxxxx >1qnb_A:TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE T(-25) ADENOVIRUS MAJOR LATE PROMOTER TATA BOX VARIANT BOUND TO WILD-TYPE TBP (ARABIDOPSIS THALIANA TBP ISOFORM 2). TATA ELEMENT RECOGNITION BY THE TATA BOX-BINDING PROTEIN HAS BEEN CONSERVED THROUGHOUT EVOLUTION. organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ASN ND2 A0027 <- 2.87 -> DT O2 D0222 : score 4.67971 : H : ASN ND2 A0027 <- 3.05 -> DT O2 D0223 : score 4.50885 : H : ASN ND2 A0117 <- 3.15 -> DA N3 C0206 : score 3.54115 : H : ASN ND2 A0117 <- 3.31 -> DA N3 C0207 : score 3.41931 : H : THR OG1 A0173 <- 2.83 -> DA N3 C0206 : score 1.34572 : x : VAL xxxx A0029 <- 3.57 -> DA xxx C0207 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0057 <- 3.38 -> DA xxx D0220 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0072 <- 3.71 -> DA xxx D0220 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0074 <- 3.25 -> DT xxx C0209 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0080 <- 3.58 -> DA xxx C0208 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0082 <- 3.44 -> DT xxx D0221 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0119 <- 3.39 -> DT xxx D0223 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0148 <- 3.29 -> DA xxx C0204 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0149 <- 3.14 -> DA xxx D0226 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0163 <- 3.67 -> DA xxx C0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0165 <- 3.32 -> DT xxx D0225 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0171 <- 3.34 -> DA xxx D0224 : score x.xxxxx >1qnc_A:TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE A(-31) ADENOVIRUS MAJOR LATE PROMOTER TATA BOX VARIANT BOUND TO WILD-TYPE TBP (ARABIDOPSIS THALIANA TBP ISOFORM 2). TATA ELEMENT RECOGNITION BY THE TATA BOX-BINDING PROTEIN HAS BEEN CONSERVED THROUGHOUT EVOLUTION. organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ASN ND2 A0027 <- 2.86 -> DT O2 D0222 : score 4.6892 : H : ASN ND2 A0027 <- 3.26 -> DT O2 D0223 : score 4.30951 : H : ASN ND2 A0117 <- 3.41 -> DA N3 C0207 : score 3.34315 : H : THR OG1 A0173 <- 2.84 -> DA N3 C0206 : score 1.34302 : x : VAL xxxx A0029 <- 3.66 -> DT xxx D0222 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0057 <- 3.14 -> DT xxx D0220 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0072 <- 3.47 -> DT xxx D0220 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0074 <- 3.43 -> DA xxx C0209 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0080 <- 3.69 -> DA xxx C0208 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0082 <- 3.50 -> DT xxx D0221 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0119 <- 3.31 -> DT xxx D0223 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0148 <- 3.34 -> DA xxx C0204 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0149 <- 2.99 -> DT xxx D0226 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0163 <- 3.65 -> DT xxx D0225 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0165 <- 3.43 -> DT xxx D0225 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0171 <- 3.59 -> DA xxx D0224 : score x.xxxxx >1qne_B:TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ADENOVIRUS MAJOR LATE PROMOTER TATA BOX BOUND TO WILD-TYPE TBP (ARABIDOPSIS THALIANA TBP ISOFORM 2). organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ASN ND2 B0027 <- 2.76 -> DT O2 F0222 : score 4.78412 : H : ASN ND2 B0027 <- 3.17 -> DT O2 F0223 : score 4.39494 : H : ASN ND2 B0117 <- 3.19 -> DA N3 E0207 : score 3.51069 : H : THR OG1 B0173 <- 2.77 -> DA N3 E0206 : score 1.36197 : x : VAL xxxx B0029 <- 3.57 -> DA xxx E0207 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0057 <- 3.19 -> DT xxx F0220 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0072 <- 3.59 -> DT xxx F0220 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0074 <- 3.53 -> DA xxx E0209 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0080 <- 3.63 -> DA xxx E0209 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0082 <- 3.56 -> DT xxx F0221 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0119 <- 3.45 -> DT xxx F0223 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0148 <- 3.27 -> DA xxx E0204 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0149 <- 3.35 -> DA xxx F0226 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0163 <- 3.56 -> DA xxx E0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0165 <- 3.29 -> DT xxx F0225 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0171 <- 3.45 -> DA xxx F0224 : score x.xxxxx >1qp0_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PURINE REPRESSOR-HYPOXANTHINE-PALINDROMIC OPERATOR COMPLEX organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0016 <- 2.75 -> DC N4 M0703 : score 4.07367 : H : ARG NH1 A0026 <- 3.16 -> DG O6 M0702 : score 5.64533 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.17 -> DG N7 M0702 : score 5.91215 : x : SER xxxx A0014 <- 4.40 -> DG xxx M0702 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0015 <- 4.41 -> DA xxx M0704 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.78 -> DG xxx M0708 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 3.29 -> DC xxx M0706 : score x.xxxxx >1qp4_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PURINE REPRESSOR-HYPOXANTHINE-PALINDROMIC OPERATOR COMPLEX organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0016 <- 2.89 -> DC N4 M0703 : score 3.96073 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.71 -> DG O6 M0702 : score 6.19283 : H : ARG NH2 A0026 <- 2.74 -> DG N7 M0702 : score 6.46123 : x : SER xxxx A0014 <- 4.46 -> DG xxx M0702 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.47 -> DC xxx M0707 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 2.99 -> DT xxx M0706 : score x.xxxxx >1qp7_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PURINE REPRESSOR MUTANT-HYPOXANTHINE-PALINDROMIC OPERATOR COMPLEX organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0016 <- 2.84 -> DC N4 M0703 : score 4.00107 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.69 -> DG O6 M0702 : score 6.21717 : H : ARG NH2 A0026 <- 2.80 -> DG N7 M0702 : score 6.38462 : x : SER xxxx A0014 <- 4.06 -> DG xxx M0702 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.58 -> DC xxx M0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0055 <- 3.96 -> DC xxx M0707 : score x.xxxxx >1qp9_A:Leucine_zipper_domain;Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF HAP1-PC7 COMPLEXED TO THE UAS OF CYC7 organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NH1 A0055 <- 2.78 -> DT O2 F0003 : score 4.32364 : H : ARG NH2 A0055 <- 3.16 -> DT O2 F0003 : score 3.92853 : H : LYS NZ A0071 <- 2.82 -> DG N7 E0012 : score 5.36435 : V : VAL CG1 A0072 <- 3.66 -> DT C7 E0010 : score 6.27263 : x : ARG xxxx A0070 <- 4.21 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx >1qp9_AB:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain;Leucine_zipper_domain; title=STRUCTURE OF HAP1-PC7 COMPLEXED TO THE UAS OF CYC7 organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NH1 A0055 <- 2.78 -> DT O2 F0003 : score 4.32364 : H : ARG NH2 A0055 <- 3.16 -> DT O2 F0003 : score 3.92853 : H : LYS NZ A0071 <- 2.82 -> DG N7 E0012 : score 5.36435 : H : ARG NH1 B0057 <- 2.65 -> DT O2 F0012 : score 4.4356 : H : ARG NH2 B0057 <- 2.97 -> DT O2 F0012 : score 4.0894 : w : ARG NH1 B0057 <- 5.75 -> DA N3 E0009 : score 2.585 : H : ARG NH2 B0059 <- 3.25 -> DT O2 E0008 : score 3.85233 : V : VAL CG1 A0072 <- 3.66 -> DT C7 E0010 : score 6.27263 : x : ARG xxxx A0070 <- 4.21 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0071 <- 3.04 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx >1qp9_CD:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain;Leucine_zipper_domain; title=STRUCTURE OF HAP1-PC7 COMPLEXED TO THE UAS OF CYC7 organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ C0071 <- 2.99 -> DG N7 G0012 : score 5.18123 : H : ARG NH1 D0057 <- 2.91 -> DT O2 H0012 : score 4.21167 : H : ARG NH2 D0057 <- 2.51 -> DT O2 H0012 : score 4.47887 : H : ARG NH1 D0059 <- 2.60 -> DT O2 G0008 : score 4.47867 : H : LYS NZ D0071 <- 3.19 -> DG N7 G0003 : score 4.9658 : H : LYS NZ D0071 <- 3.30 -> DG O6 H0017 : score 5.20269 : x : VAL xxxx C0072 <- 4.07 -> DT xxx G0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0072 <- 4.49 -> DC xxx G0002 : score x.xxxxx >1qpi_A:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TETRACYCLINE REPRESSOR/OPERATOR COMPLEX organism=Escherichia coli : x : ARG xxxx A0028 <- 4.46 -> DC xxx M0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0039 <- 3.32 -> DT xxx M0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0040 <- 3.57 -> DC xxx M0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0043 <- 2.84 -> DC xxx M0001 : score x.xxxxx >1qpz_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PURINE REPRESSOR-HYPOXANTHINE-PALINDROMIC OPERATOR COMPLEX organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0016 <- 3.01 -> DC N4 M0703 : score 3.86393 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.70 -> DG O6 M0702 : score 6.205 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.08 -> DG N7 M0702 : score 6.02708 : x : SER xxxx A0014 <- 4.16 -> DG xxx M0702 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.71 -> DC xxx M0707 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 2.81 -> DA xxx M0706 : score x.xxxxx >1qqa_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PURINE REPRESSOR MUTANT-HYPOXANTHINE-PALINDROMIC OPERATOR COMPLEX organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0016 <- 2.92 -> DC N4 M0703 : score 3.93653 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.65 -> DG O6 M0702 : score 6.26583 : H : ARG NH2 A0026 <- 2.78 -> DG N7 M0702 : score 6.41015 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.21 -> DG O6 M0702 : score 6.0588 : x : SER xxxx A0014 <- 3.97 -> DG xxx M0702 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.59 -> DC xxx M0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0055 <- 3.91 -> DC xxx M0707 : score x.xxxxx >1qqb_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PURINE REPRESSOR MUTANT-HYPOXANTHINE-PALINDROMIC OPERATOR COMPLEX organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0016 <- 2.83 -> DC N4 M0703 : score 4.00913 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.73 -> DG O6 M0702 : score 6.1685 : H : ARG NH2 A0026 <- 2.70 -> DG N7 M0702 : score 6.51231 : x : SER xxxx A0014 <- 4.18 -> DG xxx M0702 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.54 -> DC xxx M0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0055 <- 3.82 -> DC xxx M0707 : score x.xxxxx >1qrh_A:Restriction_endonuclease-like; title=X-RAY STRUCTURE OF THE DNA-ECO RI ENDONUCLEASE COMPLEXES WITH AN R145K MUTATION AT 2.7 A organism=ESCHERICHIA COLI : V : GLN CG A0115 <- 3.76 -> DT C7 M0008 : score 3.28794 : x : MET xxxx A0137 <- 4.16 -> DC xxx M0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0138 <- 4.25 -> DC xxx M0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0141 <- 3.37 -> DT xxx M0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0142 <- 3.28 -> DT xxx M0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0145 <- 3.29 -> DA xxx M0007 : score x.xxxxx >1qri_A:Restriction_endonuclease-like; title=X-RAY STRUCTURE OF THE DNA-ECO RI ENDONUCLEASE COMPLEXES WITH AN E144D MUTATION AT 2.7 A organism=ESCHERICHIA COLI : w : LYS NZ A0089 <- 6.55 -> DC O2 M0004 : score 1.3 : H : ARG NE A0145 <- 3.05 -> DA N7 M0007 : score -8.65596 : V : GLN CG A0115 <- 3.83 -> DT C7 M0008 : score 3.23097 : x : MET xxxx A0137 <- 4.10 -> DC xxx M0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0138 <- 4.04 -> DC xxx M0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0141 <- 3.39 -> DT xxx M0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0142 <- 3.32 -> DT xxx M0008 : score x.xxxxx >1qrv_A:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX OF HMG-D AND DNA organism=Drosophila melanogaster : w : SER OG A0010 <- 5.44 -> DA N3 C0006 : score 0.958 : H : TYR OH A0012 <- 2.77 -> DT O2 C0005 : score 3.23597 : w : ARG NH1 A0020 <- 5.64 -> DT O2 D0017 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0020 <- 5.81 -> DT O2 D0017 : score 2.261 : x : ARG xxxx A0007 <- 3.15 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0013 <- 3.41 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0016 <- 3.92 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0032 <- 3.51 -> DC xxx D0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0033 <- 3.27 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0036 <- 3.26 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx >1qrv_AB:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX OF HMG-D AND DNA organism=Drosophila melanogaster : w : SER OG A0010 <- 5.44 -> DA N3 C0006 : score 0.958 : H : TYR OH A0012 <- 2.77 -> DT O2 C0005 : score 3.23597 : w : ARG NH1 A0020 <- 5.64 -> DT O2 D0017 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0020 <- 5.81 -> DT O2 D0017 : score 2.261 : H : ASN OD1 B0017 <- 2.85 -> DG N2 C0001 : score 4.752 : H : ASN ND2 B0017 <- 3.22 -> DG N3 C0001 : score 4.4837 : x : ARG xxxx A0007 <- 3.15 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0013 <- 3.41 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0016 <- 3.92 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0032 <- 3.51 -> DC xxx D0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0033 <- 3.27 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0036 <- 3.26 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0009 <- 3.84 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0013 <- 3.74 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0020 <- 4.21 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx >1qss_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DDGTP-TRAPPED CLOSED TERNARY COMPLEX OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.95 -> DC O2 B0109 : score 2.85777 : w : LYS NZ A0540 <- 5.77 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : ASN ND2 A0580 <- 6.00 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : GLU OE1 A0615 <- 6.25 -> DC O2 C0205 : score 2.68 : w : ASN ND2 A0750 <- 6.33 -> DC O2 C0205 : score 1.885 : w : GLN NE2 A0754 <- 6.09 -> DC O2 C0205 : score 2.699 : x : TYR xxxx A0545 <- 4.48 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0573 <- 3.46 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0583 <- 3.29 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0587 <- 3.67 -> DC xxx B0111 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0664 <- 3.91 -> DC xxx C0204 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0671 <- 3.38 -> DC xxx C0204 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0673 <- 4.47 -> DC xxx C0204 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0677 <- 3.63 -> DC xxx C0204 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0784 <- 4.29 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >1qsy_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DDATP-TRAPPED CLOSED TERNARY COMPLEX OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 3.13 -> DC O2 B0109 : score 2.75171 : w : LYS NZ A0540 <- 6.24 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.95 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : x : TYR xxxx A0545 <- 4.49 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0573 <- 3.41 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0583 <- 3.18 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0754 <- 4.37 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0784 <- 4.47 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >1qtm_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DDTTP-TRAPPED CLOSED TERNARY COMPLEX OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 3.08 -> DC O2 B0109 : score 2.78117 : w : LYS NZ A0540 <- 5.28 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.83 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.72 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.86 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.72 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.67 -> DG N3 C0208 : score 3.377 : w : GLU OE1 A0615 <- 6.06 -> DA N3 C0205 : score 0.995 : w : ASN ND2 A0750 <- 6.58 -> DA N3 C0205 : score 2.277 : w : GLN NE2 A0754 <- 6.19 -> DA N3 C0205 : score 1.888 : x : TYR xxxx A0545 <- 4.45 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0573 <- 3.24 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0664 <- 4.31 -> DA xxx C0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0667 <- 4.03 -> DA xxx C0204 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0671 <- 3.71 -> DA xxx C0204 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0673 <- 4.08 -> DA xxx C0204 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0677 <- 3.89 -> DA xxx C0204 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0784 <- 4.21 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >1qum_A:Xylose_isomerase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI ENDONUCLEASE IV IN COMPLEX WITH DAMAGED DNA organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 A0035 <- 3.07 -> DG N2 D0938 : score 4.5408 : H : ASN ND2 A0035 <- 2.97 -> DC O2 C0908 : score 4.32718 : x : GLN xxxx A0036 <- 3.97 -> DC xxx C0908 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0037 <- 3.18 -> DG xxx D0938 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0038 <- 3.36 -> DG xxx C0909 : score x.xxxxx >1qx0_A:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=CONJUGATIVE RELAXASE TRWC IN COMPLEX WITH ORIT DNA. METAL-BOUND STRUCTURE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0075 <- 2.74 -> DA N3 B0005 : score 3.72624 : H : ARG NH1 A0128 <- 3.35 -> DG N7 B0015 : score 5.3845 : H : ARG NH2 A0128 <- 2.69 -> DG O6 B0003 : score 6.7452 : H : ARG NH2 A0128 <- 2.43 -> DG O6 B0015 : score 7.0884 : H : LYS NZ A0130 <- 3.11 -> DG N7 B0013 : score 5.05197 : x : ALA xxxx A0073 <- 3.46 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0081 <- 4.26 -> DC xxx B0016 : score x.xxxxx >1qzh_BF:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF POT1 (PROTECTION OF TELOMERE)- SSDNA COMPLEX organism=Schizosaccharomyces pombe : H : THR OG1 B0062 <- 3.07 -> DT N3 H0003 : score 2.21825 : H : THR OG1 B0062 <- 3.36 -> DT O2 H0004 : score 2.41012 : H : ASP OD2 B0064 <- 3.04 -> DT N3 H0004 : score 3.41499 : H : THR OG1 B0111 <- 2.70 -> DG O6 H0002 : score 4.29969 : H : GLN OE1 B0120 <- 3.15 -> DC N4 H0006 : score 4.2625 : H : GLN NE2 B0120 <- 3.20 -> DC N3 H0006 : score 1.28682 : H : LYS NZ B0124 <- 2.44 -> DG N7 H0001 : score 5.77368 >1qzh_DE:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF POT1 (PROTECTION OF TELOMERE)- SSDNA COMPLEX organism=Schizosaccharomyces pombe : H : THR OG1 D0062 <- 3.14 -> DT N3 J0003 : score 2.18542 : H : ASP OD2 D0064 <- 2.97 -> DT N3 J0004 : score 3.46522 : H : THR OG1 D0111 <- 2.83 -> DG O6 J0002 : score 4.19009 : H : GLN OE1 D0120 <- 3.24 -> DC N4 J0006 : score 4.18 : H : GLN NE2 D0120 <- 2.69 -> DC N3 J0006 : score 1.42949 : H : LYS NZ D0124 <- 2.75 -> DG N7 J0001 : score 5.43976 >1qzh_E:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF POT1 (PROTECTION OF TELOMERE)- SSDNA COMPLEX organism=Schizosaccharomyces pombe : H : THR OG1 E0062 <- 3.00 -> DT N3 K0003 : score 2.25108 : H : ASP OD2 E0064 <- 2.70 -> DT N3 K0004 : score 3.65892 : H : LYS NZ E0090 <- 3.39 -> DT O4 K0003 : score 3.16389 : H : THR OG1 E0111 <- 2.93 -> DG O6 K0002 : score 4.10578 : H : GLN NE2 E0120 <- 2.81 -> DC N3 K0006 : score 1.39592 : H : LYS NZ E0124 <- 2.57 -> DG N7 K0001 : score 5.63365 >1r0a_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COVALENTLY TETHERED TO DNA TEMPLATE-PRIMER SOLVED TO 2.8 ANGSTROMS organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.83 -> DG N3 P0821 : score 3.09542 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.73 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 4.23 -> DT xxx T0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.00 -> DT xxx T0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.36 -> DC xxx T0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 3.74 -> DC xxx P0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0358 <- 3.13 -> DT xxx P0812 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.25 -> DC xxx P0806 : score x.xxxxx >1r0n_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HETERODIMERIC ECDSYONE RECEPTOR DNA BINDING COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 A0119 <- 3.43 -> DC N4 D0032 : score 5.04119 : H : LYS NZ A0122 <- 3.01 -> DG O6 C0005 : score 5.53798 : w : LYS NZ A0122 <- 5.69 -> DA N7 C0004 : score 1.655 : H : ARG NH1 A0127 <- 2.98 -> DG N7 D0030 : score 5.8322 : x : LYS xxxx A0126 <- 3.20 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx >1r0n_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HETERODIMERIC ECDSYONE RECEPTOR DNA BINDING COMPLEX organism=DROSOPHILA MELANOGASTER / HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 A0119 <- 3.43 -> DC N4 D0032 : score 5.04119 : H : LYS NZ A0122 <- 3.01 -> DG O6 C0005 : score 5.53798 : w : LYS NZ A0122 <- 5.69 -> DA N7 C0004 : score 1.655 : H : ARG NH1 A0127 <- 2.98 -> DG N7 D0030 : score 5.8322 : H : GLU OE1 B0219 <- 2.82 -> DC N4 C0014 : score 5.74488 : H : LYS NZ B0222 <- 2.62 -> DG O6 D0023 : score 5.98888 : H : ARG NH1 B0227 <- 3.03 -> DG N7 C0012 : score 5.7717 : x : LYS xxxx A0126 <- 3.20 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0213 <- 3.77 -> DG xxx D0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0226 <- 3.53 -> DG xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0251 <- 3.51 -> DT xxx D0029 : score x.xxxxx >1r0o_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETERODIMERIC ECDYSONE RECEPTOR DNA-BINDING COMPLEX organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : GLU OE1 A0025 <- 2.94 -> DC N4 D0033 : score 5.60645 : w : GLU OE1 A0025 <- 5.78 -> DA N6 D0032 : score 2.939 : w : LYS NZ A0028 <- 6.02 -> DG O6 C0006 : score 3.005 : w : LYS NZ A0028 <- 6.43 -> DA N6 C0004 : score 2.097 : w : LYS NZ A0032 <- 5.69 -> DT O4 C0007 : score 1.7 : H : ARG NH1 A0033 <- 3.08 -> DG N7 D0031 : score 5.7112 : H : GLU OE1 B0025 <- 2.76 -> DC N4 C0015 : score 5.81409 : H : LYS NZ B0028 <- 2.62 -> DG O6 D0022 : score 5.98888 : w : LYS NZ B0028 <- 6.03 -> DA N6 D0021 : score 2.097 : H : ARG NH1 B0033 <- 3.04 -> DG N7 C0013 : score 5.7596 : x : TYR xxxx B0019 <- 4.27 -> DG xxx D0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0032 <- 3.37 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx >1r0o_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETERODIMERIC ECDYSONE RECEPTOR DNA-BINDING COMPLEX organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : GLU OE1 B0025 <- 2.76 -> DC N4 C0015 : score 5.81409 : H : LYS NZ B0028 <- 2.62 -> DG O6 D0022 : score 5.98888 : w : LYS NZ B0028 <- 6.03 -> DA N6 D0021 : score 2.097 : H : ARG NH1 B0033 <- 3.04 -> DG N7 C0013 : score 5.7596 : x : TYR xxxx B0019 <- 4.27 -> DG xxx D0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0032 <- 3.37 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx >1r2y_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM (FPG) BOUND TO 8-OXOGUANINE (OXOG) CONTAINING DNA organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : ARG NE A0112 <- 2.72 -> DC O2 B0007 : score 2.70152 : H : ARG NH1 A0112 <- 2.98 -> DC N3 B0007 : score 1.48184 : w : ARG NH2 A0112 <- 5.78 -> DG O6 C0019 : score 2.468 : w : ARG NH2 A0112 <- 5.88 -> DA N3 C0017 : score 2.092 : x : ARG xxxx A0076 <- 3.00 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0077 <- 3.55 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0111 <- 4.46 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.42 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0223 <- 3.46 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 3.74 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx >1r2z_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM (FPG) BOUND TO 5,6-DIHYDROURACIL (DHU) CONTAINING DNA organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : w : GLU OE1 A0078 <- 6.45 -> DT O2 B0008 : score 2.462 : w : GLU OE2 A0078 <- 6.24 -> DT O2 B0008 : score 2.279 : H : ARG NE A0112 <- 2.78 -> DC O2 B0007 : score 2.66961 : H : ARG NH1 A0112 <- 3.03 -> DC N3 B0007 : score 1.46647 : w : ARG NH1 A0112 <- 6.48 -> DG O6 C0019 : score 2.756 : w : ARG NH2 A0112 <- 6.33 -> DA N3 C0017 : score 2.092 : w : ARG NH2 A0112 <- 6.22 -> DG O6 C0019 : score 2.468 : x : ARG xxxx A0076 <- 3.58 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0077 <- 3.71 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.37 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 3.99 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx >1r49_A:Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_N-terminal_DNA-binding_fragment;DNA_breaking-rejoining_enzymes;Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_dispensable_insert_domain; title=HUMAN TOPOISOMERASE I (TOPO70) DOUBLE MUTANT K532R/Y723F organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0364 <- 3.32 -> DG N3 B0012 : score 2.7351 : H : ARG NH1 A0532 <- 2.98 -> DT O2 B0010 : score 4.15138 : H : ARG NH1 A0532 <- 2.44 -> DA N3 C0114 : score 3.94716 : x : TYR xxxx A0426 <- 3.11 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0428 <- 3.80 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0491 <- 3.30 -> DC xxx C0117 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0493 <- 3.89 -> DT xxx C0116 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0722 <- 4.12 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx >1r4i_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ANDROGEN RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO A DIRECT REPEAT RESPONSE ELEMENT organism=Rattus norvegicus : H : ARG NH2 A0568 <- 3.10 -> DG N7 D0030 : score 6.00154 : H : ARG NH2 A0568 <- 3.05 -> DG O6 D0030 : score 6.27 : V : VAL CG2 A0564 <- 3.68 -> DT C7 D0031 : score 6.30677 : x : LYS xxxx A0563 <- 3.36 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1r4i_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ANDROGEN RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO A DIRECT REPEAT RESPONSE ELEMENT organism=Rattus norvegicus : H : ARG NH2 A0568 <- 3.10 -> DG N7 D0030 : score 6.00154 : H : ARG NH2 A0568 <- 3.05 -> DG O6 D0030 : score 6.27 : H : LYS NZ B0563 <- 3.39 -> DG N7 D0021 : score 4.75036 : H : ARG NH1 B0568 <- 3.23 -> DG O6 C0013 : score 5.56017 : H : ARG NH2 B0568 <- 2.71 -> DG N7 C0013 : score 6.49954 : V : VAL CG2 A0564 <- 3.68 -> DT C7 D0031 : score 6.30677 : x : LYS xxxx A0563 <- 3.36 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0553 <- 4.12 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0564 <- 4.11 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0567 <- 4.23 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx >1r4o_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSIS OF THE INTERACTION OF THE GLUCOCORTICOID RECEPTOR WITH DNA organism=Rattus norvegicus : H : ARG NH1 A0466 <- 2.29 -> DG O6 D0014 : score 6.70383 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.80 -> DG N7 D0014 : score 6.38462 : w : ARG NH1 B0466 <- 5.78 -> DA N7 C0012 : score 0.388 : x : LYS xxxx A0461 <- 2.84 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0462 <- 3.24 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0511 <- 3.39 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0461 <- 3.42 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0462 <- 4.46 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >1r4o_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSIS OF THE INTERACTION OF THE GLUCOCORTICOID RECEPTOR WITH DNA organism=Rattus norvegicus : w : ARG NH1 B0466 <- 5.78 -> DA N7 C0012 : score 0.388 : x : LYS xxxx B0461 <- 3.42 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0462 <- 4.46 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >1r4r_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSIS OF THE INTERACTION OF THE GLUCOCORTICOID RECEPTOR WITH DNA organism=Rattus norvegicus : H : ARG NH2 A0466 <- 3.30 -> DG O6 D0014 : score 5.94 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.89 -> DG O6 C0013 : score 6.4812 : V : VAL CG2 B0462 <- 3.56 -> DT C7 C0014 : score 6.49046 : x : LYS xxxx A0461 <- 3.40 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0462 <- 3.30 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0465 <- 4.41 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0451 <- 4.39 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0461 <- 3.93 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx >1r4r_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSIS OF THE INTERACTION OF THE GLUCOCORTICOID RECEPTOR WITH DNA organism=Rattus norvegicus : H : ARG NH2 B0466 <- 2.89 -> DG O6 C0013 : score 6.4812 : V : VAL CG2 B0462 <- 3.56 -> DT C7 C0014 : score 6.49046 : x : HIS xxxx B0451 <- 4.39 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0461 <- 3.93 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx >1r71_AB:KorB_DNA-binding_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF KORB IN COMPLEX WITH THE OPERATOR DNA organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0211 <- 3.26 -> DC N4 F0011 : score 3.66227 A : w : GLU OE2 A0215 <- 6.29 -> DG O6 E0007 : score 2.892 : w : GLU OE2 A0215 <- 6.46 -> DA N7 E0006 : score 1.687 : H : ARG NH1 A0240 <- 3.41 -> DG O6 F0010 : score 5.34117 : H : THR OG1 B0211 <- 2.84 -> DC N4 E0011 : score 4.00107 A : w : GLU OE2 B0215 <- 6.61 -> DG O6 F0007 : score 2.892 : w : GLU OE2 B0215 <- 6.26 -> DA N7 F0006 : score 1.687 : H : ARG NH1 B0240 <- 3.48 -> DG O6 E0010 : score 5.256 : H : ARG NH2 B0240 <- 3.28 -> DG N7 E0010 : score 5.77169 : V : ALA CB B0183 <- 3.81 -> DT C7 F0004 : score 5.58498 : V : PRO CB A0182 <- 3.84 -> DT C7 E0003 : score 5.74809 : V : ALA CB A0183 <- 3.83 -> DT C7 E0004 : score 5.55698 : x : SER xxxx A0181 <- 3.31 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0184 <- 4.23 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0186 <- 3.30 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0187 <- 3.91 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0209 <- 4.00 -> DC xxx F0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0181 <- 3.64 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0182 <- 3.28 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0184 <- 4.15 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0186 <- 3.31 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0187 <- 3.39 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0209 <- 3.70 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx >1r71_B:KorB_DNA-binding_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF KORB IN COMPLEX WITH THE OPERATOR DNA organism=Escherichia coli : H : THR OG1 B0211 <- 2.84 -> DC N4 E0011 : score 4.00107 A : w : GLU OE2 B0215 <- 6.61 -> DG O6 F0007 : score 2.892 : w : GLU OE2 B0215 <- 6.26 -> DA N7 F0006 : score 1.687 : H : ARG NH1 B0240 <- 3.48 -> DG O6 E0010 : score 5.256 : H : ARG NH2 B0240 <- 3.28 -> DG N7 E0010 : score 5.77169 : V : ALA CB B0183 <- 3.81 -> DT C7 F0004 : score 5.58498 : x : SER xxxx B0181 <- 3.64 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0182 <- 3.28 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0184 <- 4.15 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0186 <- 3.31 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0187 <- 3.39 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0209 <- 3.70 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx >1r71_CD:KorB_DNA-binding_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF KORB IN COMPLEX WITH THE OPERATOR DNA organism=Escherichia coli : H : THR OG1 C0211 <- 2.79 -> DC N4 G0011 : score 4.0414 A : w : GLU OE2 C0215 <- 6.82 -> DG O6 H0007 : score 2.892 : H : ARG NH2 C0240 <- 3.28 -> DG N7 G0010 : score 5.77169 : w : GLU OE2 D0215 <- 6.11 -> DG O6 G0007 : score 2.892 : w : GLU OE2 D0215 <- 6.12 -> DA N7 G0006 : score 1.687 : H : ARG NH1 D0240 <- 3.22 -> DG O6 H0010 : score 5.57233 : H : ARG NH2 D0240 <- 3.15 -> DG N7 H0010 : score 5.93769 : w : ARG NH1 D0240 <- 5.92 -> DG N7 G0007 : score 2.063 : V : PRO CB D0182 <- 3.69 -> DT C7 G0003 : score 5.96582 : V : ALA CB C0183 <- 3.55 -> DT C7 G0012 : score 5.94891 : V : ALA CB D0183 <- 3.65 -> DT C7 H0012 : score 5.80894 : x : SER xxxx C0181 <- 3.23 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0182 <- 3.06 -> DT xxx H0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0184 <- 4.30 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0186 <- 3.58 -> DT xxx H0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0187 <- 3.59 -> DC xxx G0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0209 <- 3.72 -> DG xxx G0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0181 <- 4.37 -> DT xxx H0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0186 <- 3.61 -> DT xxx G0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0187 <- 3.87 -> DT xxx H0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0209 <- 4.13 -> DC xxx H0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0211 <- 3.50 -> DC xxx H0011 : score x.xxxxx >1r7m_B:Homing_endonucleases; title=THE HOMING ENDONUCLEASE I-SCEI BOUND TO ITS DNA RECOGNITION REGION organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ASN ND2 B0315 <- 2.91 -> DT O2 E0023 : score 4.64174 : H : ARG NH1 B0348 <- 2.78 -> DG O6 E0018 : score 6.10767 : H : ARG NH2 B0348 <- 3.01 -> DG N7 E0018 : score 6.11646 : H : ARG NH2 B0350 <- 3.34 -> DG N7 E0019 : score 5.69508 : H : ARG NH2 B0350 <- 2.34 -> DG O6 E0019 : score 7.2072 : H : GLN NE2 B0359 <- 2.99 -> DG O6 E0017 : score 5.58453 : H : GLU OE2 B0361 <- 2.87 -> DC N4 E0015 : score 5.19167 : H : LYS NZ B0386 <- 2.91 -> DT O4 F0011 : score 3.50826 : w : LYS NZ B0386 <- 5.97 -> DC N4 F0010 : score 0.048 : H : ARG NH1 B0388 <- 2.83 -> DG O6 F0012 : score 6.04683 : H : ARG NH2 B0388 <- 2.68 -> DG N7 F0012 : score 6.53785 : w : GLN OE1 B0402 <- 6.25 -> DC N4 F0009 : score 3.488 : H : ASN ND2 B0452 <- 2.90 -> DT O4 E0006 : score 5.17892 : H : ASN OD1 B0492 <- 3.14 -> DC N4 F0017 : score 3.90843 : H : ASN ND2 B0492 <- 3.05 -> DG O6 E0009 : score 5.35654 : H : LYS NZ B0493 <- 2.89 -> DG N7 E0010 : score 5.28895 : H : LYS NZ B0493 <- 2.81 -> DG O6 E0010 : score 5.76921 : V : ASP CG B0450 <- 3.78 -> DT C7 E0006 : score 2.69649 : x : PRO xxxx B0314 <- 3.14 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0346 <- 3.62 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0396 <- 3.65 -> DA xxx E0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0451 <- 3.51 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0463 <- 3.36 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0465 <- 4.00 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx >1r8d_AB:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MTAN BOUND TO DNA organism=Bacillus subtilis : H : ARG NE A0017 <- 3.09 -> DT O4 D0005 : score 1.75115 : H : ARG NH2 A0017 <- 3.02 -> DG O6 D0004 : score 6.3096 : H : TYR OH A0038 <- 2.94 -> DG N2 D0010 : score 4.75283 : w : TYR OH A0038 <- 5.94 -> DT O2 D0011 : score 3.068 : H : ARG NE B0017 <- 3.24 -> DG N7 C0004 : score 4.03268 : H : ARG NH2 B0017 <- 2.87 -> DG O6 C0004 : score 6.5076 : H : TYR OH B0038 <- 2.86 -> DG N2 C0010 : score 4.83107 : w : TYR OH B0038 <- 5.59 -> DC O2 D-010 : score 1.343 : x : HIS xxxx A0020 <- 3.94 -> DT xxx C-007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0021 <- 3.21 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0020 <- 3.83 -> DT xxx D-007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0021 <- 3.04 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx >1r8d_B:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MTAN BOUND TO DNA organism=Bacillus subtilis : H : ARG NE B0017 <- 3.24 -> DG N7 C0004 : score 4.03268 : H : ARG NH2 B0017 <- 2.87 -> DG O6 C0004 : score 6.5076 : H : TYR OH B0038 <- 2.86 -> DG N2 C0010 : score 4.83107 : w : TYR OH B0038 <- 5.56 -> DT O2 C0011 : score 3.068 : x : HIS xxxx B0020 <- 3.83 -> DT xxx D-007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0021 <- 3.04 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx >1r8e_A:Probable_bacterial_effector-binding_domain;Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BMRR BOUND TO DNA AT 2.4A RESOLUTION organism=Bacillus subtilis : x : LYS xxxx A0020 <- 4.08 -> DC xxx B-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0023 <- 3.45 -> DT xxx B-007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0042 <- 3.60 -> DC xxx B-010 : score x.xxxxx >1r9s_AB: title=RNA POLYMERASE II STRAND SEPARATED ELONGATION COMPLEX, MATCHED NUCLEOTIDE organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A0350 <- 3.93 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0447 <- 4.41 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 4.22 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 3.19 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 3.52 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.47 -> DA xxx T0001 : score x.xxxxx >1ram_AB:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=A NOVEL DNA RECOGNITION MODE BY NF-KB P65 HOMODIMER organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0033 <- 2.91 -> DG N7 D0007 : score 5.9169 : H : ARG NH1 A0033 <- 3.14 -> DG O6 D0007 : score 5.66967 : H : ARG NH2 A0033 <- 2.61 -> DG O6 D0007 : score 6.8508 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.97 -> DG N7 D0006 : score 6.16754 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.47 -> DG O6 D0006 : score 7.0356 : H : GLU OE2 A0039 <- 3.32 -> DC N4 C0014 : score 4.71778 : V : ARG CZ A0187 <- 3.89 -> DT C7 C0012 : score 2.08433 : x : TYR xxxx A0036 <- 3.12 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0038 <- 3.99 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0218 <- 3.69 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0036 <- 4.07 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0038 <- 4.33 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0039 <- 3.21 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0187 <- 3.46 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx >1ram_B:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=A NOVEL DNA RECOGNITION MODE BY NF-KB P65 HOMODIMER organism=Mus musculus : x : TYR xxxx B0036 <- 4.07 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0038 <- 4.33 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0039 <- 3.21 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0187 <- 3.46 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx >1rcs_A:TrpR-like; title=NMR STUDY OF TRP REPRESSOR-OPERATOR DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0069 <- 2.88 -> DG N7 F0002 : score 5.9532 : H : ARG NH1 A0069 <- 3.20 -> DG O6 F0002 : score 5.59667 : V : THR CG2 A0081 <- 3.89 -> DT C7 E0014 : score 4.14159 : x : GLN xxxx A0068 <- 4.09 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0072 <- 3.31 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0079 <- 2.93 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0080 <- 3.06 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0083 <- 3.43 -> DA xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0084 <- 3.06 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx >1rcs_AB:TrpR-like; title=NMR STUDY OF TRP REPRESSOR-OPERATOR DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0069 <- 2.88 -> DG N7 F0002 : score 5.9532 : H : ARG NH1 A0069 <- 3.20 -> DG O6 F0002 : score 5.59667 : H : ARG NH1 B0569 <- 2.86 -> DG N7 E0002 : score 5.9774 : H : ARG NH1 B0569 <- 3.19 -> DT O4 E0003 : score 3.01305 : H : ARG NH2 B0569 <- 3.12 -> DG O6 E0002 : score 6.1776 : H : THR OG1 B0583 <- 3.48 -> DA N7 E0004 : score 2.94978 : V : GLN CB B0568 <- 3.61 -> DT C7 E0003 : score 1.92095 : V : THR CG2 A0081 <- 3.89 -> DT C7 E0014 : score 4.14159 : x : GLN xxxx A0068 <- 4.09 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0072 <- 3.31 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0079 <- 2.93 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0080 <- 3.06 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0083 <- 3.43 -> DA xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0084 <- 3.06 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0572 <- 3.38 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0579 <- 2.91 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0580 <- 3.11 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0581 <- 3.99 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0584 <- 3.05 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx >1rep_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 OF MINI-F PLASMID COMPLEXED WITH AN ITERON DNA organism=Escherichia coli : H : GLU OE2 C0077 <- 2.59 -> DC N4 A0015 : score 5.48653 : w : GLU OE1 C0077 <- 5.70 -> DG N7 A0014 : score 1.976 : w : GLU OE1 C0077 <- 5.92 -> DG O6 A0014 : score 2.669 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.64 -> DG N3 B0025 : score 3.72578 : H : ARG NH1 C0200 <- 2.66 -> DG O6 A0004 : score 6.25367 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.63 -> DT O4 A0005 : score 3.67468 : H : ASP OD1 C0203 <- 3.28 -> DC N4 B0038 : score 4.83176 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.88 -> DG O6 A0006 : score 6.4944 : H : ARG NE C0207 <- 2.77 -> DG N7 B0036 : score 4.44833 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.34 -> DG O6 B0036 : score 7.2072 : V : PRO CG C0202 <- 3.60 -> DT C7 A0003 : score 6.67692 : x : SER xxxx C0075 <- 3.07 -> DG xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 3.88 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.65 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0080 <- 3.28 -> DG xxx B0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.81 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 3.65 -> DT xxx B0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 3.44 -> DG xxx B0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0233 <- 3.79 -> DC xxx A0001 : score x.xxxxx >1rh6_AB:Putative_DNA-binding_domain; title=BACTERIOPHAGE LAMBDA EXCISIONASE (XIS)-DNA COMPLEX organism=ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA : H : GLU OE2 B0019 <- 3.05 -> DC N4 D0023 : score 5.00212 : w : GLU OE1 B0019 <- 5.97 -> DA N6 D0022 : score 2.939 : H : ARG NH1 B0023 <- 2.90 -> DG N7 C0005 : score 5.929 : H : ARG NH2 B0023 <- 3.16 -> DT O4 D0024 : score 3.29797 : H : ARG NH2 B0023 <- 2.83 -> DT O4 C0006 : score 3.53252 : H : ARG NH1 B0039 <- 3.06 -> DC O2 D0019 : score 3.4602 : w : ARG NH1 B0039 <- 5.80 -> DA N3 D0018 : score 2.585 : x : THR xxxx B0020 <- 4.44 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0022 <- 4.06 -> DG xxx D0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0026 <- 3.53 -> DA xxx D0022 : score x.xxxxx >1rh6_B:Putative_DNA-binding_domain; title=BACTERIOPHAGE LAMBDA EXCISIONASE (XIS)-DNA COMPLEX organism=ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA : H : GLU OE2 B0019 <- 3.05 -> DC N4 D0023 : score 5.00212 : w : GLU OE1 B0019 <- 5.97 -> DA N6 D0022 : score 2.939 : H : ARG NH1 B0023 <- 2.90 -> DG N7 C0005 : score 5.929 : H : ARG NH2 B0023 <- 2.83 -> DT O4 C0006 : score 3.53252 : H : ARG NH2 B0023 <- 3.16 -> DT O4 D0024 : score 3.29797 : H : ARG NH1 B0039 <- 3.06 -> DC O2 D0019 : score 3.4602 : w : ARG NH1 B0039 <- 5.80 -> DA N3 D0018 : score 2.585 : x : THR xxxx B0020 <- 4.44 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0022 <- 4.06 -> DG xxx D0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0026 <- 3.53 -> DA xxx D0022 : score x.xxxxx >1rio_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF BACTERIOPHAGE LAMBDA CI-NTD IN COMPLEX WITH SIGMA- REGION4 OF THERMUS AQUATICUS BOUND TO DNA organism=ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA : H : LYS NZ A0004 <- 3.27 -> DG N7 U0011 : score 4.87962 : H : LYS NZ A0004 <- 2.76 -> DG O6 T0016 : score 5.82702 : H : LYS NZ A0005 <- 2.53 -> DG O6 T0018 : score 6.09293 : H : LYS NZ A0005 <- 3.21 -> DG N7 T0019 : score 4.94425 : H : LYS NZ A0005 <- 2.68 -> DG O6 T0019 : score 5.91951 : H : GLN OE1 A0045 <- 3.35 -> DA N6 U0005 : score 5.38678 : H : GLN NE2 A0045 <- 3.34 -> DA N7 U0005 : score 5.43205 : H : SER OG A0046 <- 2.89 -> DG N7 T0021 : score 4.40137 : H : ASN ND2 A0056 <- 2.96 -> DG N7 T0019 : score 4.43915 >1rio_ABH:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF BACTERIOPHAGE LAMBDA CI-NTD IN COMPLEX WITH SIGMA- REGION4 OF THERMUS AQUATICUS BOUND TO DNA organism=THERMUS AQUATICUS / ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA : H : LYS NZ A0004 <- 3.27 -> DG N7 U0011 : score 4.87962 : H : LYS NZ A0004 <- 2.76 -> DG O6 T0016 : score 5.82702 : H : LYS NZ A0005 <- 2.53 -> DG O6 T0018 : score 6.09293 : H : LYS NZ A0005 <- 3.21 -> DG N7 T0019 : score 4.94425 : H : LYS NZ A0005 <- 2.68 -> DG O6 T0019 : score 5.91951 : H : GLN OE1 A0045 <- 3.35 -> DA N6 U0005 : score 5.38678 : H : GLN NE2 A0045 <- 3.34 -> DA N7 U0005 : score 5.43205 : H : SER OG A0046 <- 2.89 -> DG N7 T0021 : score 4.40137 : H : ASN ND2 A0056 <- 2.96 -> DG N7 T0019 : score 4.43915 : H : LYS NZ B0005 <- 2.92 -> DG O6 U0015 : score 5.64203 : H : GLN OE1 B0045 <- 2.82 -> DA N6 T0009 : score 6.02835 : H : GLN NE2 B0045 <- 3.14 -> DA N7 T0009 : score 5.67564 : H : SER OG B0046 <- 2.76 -> DG O6 U0017 : score 4.12375 : H : ARG NE H0409 <- 3.03 -> DG N7 T0005 : score 4.21839 : H : ARG NH2 H0409 <- 2.86 -> DG O6 T0005 : score 6.5208 : H : GLU OE2 H0410 <- 3.26 -> DA N6 T0008 : score 2.77056 : H : GLN NE2 H0414 <- 2.90 -> DT O4 U0019 : score 5.0872 : x : THR xxxx H0408 <- 3.83 -> DT xxx U0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0411 <- 3.77 -> DT xxx U0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0413 <- 3.61 -> DC xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0056 <- 2.96 -> DG xxx U0015 : score x.xxxxx >1rm1_A:TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURE OF A YEAST TFIIA/TBP/TATA-BOX DNA COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN ND2 A0069 <- 2.85 -> DT O2 E0023 : score 4.69869 : H : ASN ND2 A0159 <- 3.24 -> DA N3 D0013 : score 3.47262 : H : THR OG1 A0215 <- 2.68 -> DA N3 D0013 : score 1.38634 : x : VAL xxxx A0071 <- 3.47 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0099 <- 3.05 -> DT xxx E0021 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0114 <- 3.39 -> DT xxx E0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0116 <- 3.63 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0122 <- 3.59 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0124 <- 3.65 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0161 <- 3.51 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0190 <- 3.38 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0191 <- 3.28 -> DA xxx E0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0205 <- 3.62 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0207 <- 2.98 -> DT xxx E0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0213 <- 3.59 -> DA xxx E0025 : score x.xxxxx >1rm1_AC:TATA-box_binding_protein-like;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain; title=STRUCTURE OF A YEAST TFIIA/TBP/TATA-BOX DNA COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN ND2 A0069 <- 2.85 -> DT O2 E0023 : score 4.69869 : H : ASN ND2 A0159 <- 3.24 -> DA N3 D0013 : score 3.47262 : H : THR OG1 A0215 <- 2.68 -> DA N3 D0013 : score 1.38634 : x : VAL xxxx A0071 <- 3.47 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0099 <- 3.05 -> DT xxx E0021 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0114 <- 3.39 -> DT xxx E0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0116 <- 3.63 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0122 <- 3.59 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0124 <- 3.65 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0161 <- 3.51 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0190 <- 3.38 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0191 <- 3.28 -> DA xxx E0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0205 <- 3.62 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0207 <- 2.98 -> DT xxx E0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0213 <- 3.59 -> DA xxx E0025 : score x.xxxxx >1rpe_LR:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=THE PHAGE 434 OR2/R1-69 COMPLEX AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION organism=PHAGE 434 : H : GLN OE1 L0028 <- 2.84 -> DA N6 A0025 : score 6.00414 : H : GLN NE2 L0028 <- 2.95 -> DA N7 A0025 : score 5.90705 : H : GLN NE2 L0033 <- 2.78 -> DT O4 B0014 : score 5.21179 : w : LYS NZ L0038 <- 6.15 -> DA N6 A0028 : score 2.097 : w : ARG NH2 L0043 <- 5.36 -> DA N3 B0011 : score 2.092 : H : GLN OE1 R0028 <- 3.03 -> DA N6 B0004 : score 5.77415 : H : GLN NE2 R0028 <- 3.11 -> DA N7 B0004 : score 5.71218 : w : GLN OE1 R0033 <- 5.66 -> DA N6 A0034 : score 3.392 : V : GLN CB R0029 <- 3.60 -> DT C7 A0035 : score 1.92554 : x : GLN xxxx L0017 <- 4.16 -> DA xxx A0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0027 <- 4.02 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0029 <- 3.41 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0030 <- 3.25 -> DT xxx B0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0032 <- 3.79 -> DC xxx A0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0027 <- 3.85 -> DT xxx A0035 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0030 <- 2.91 -> DT xxx A0035 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0032 <- 3.51 -> DA xxx B0004 : score x.xxxxx >1rpe_R:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=THE PHAGE 434 OR2/R1-69 COMPLEX AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION organism=? : H : GLN OE1 R0028 <- 3.03 -> DA N6 B0004 : score 5.77415 : H : GLN NE2 R0028 <- 3.11 -> DA N7 B0004 : score 5.71218 : w : GLN OE1 R0033 <- 5.66 -> DA N6 A0034 : score 3.392 : V : GLN CB R0029 <- 3.60 -> DT C7 A0035 : score 1.92554 : x : THR xxxx R0027 <- 3.85 -> DT xxx A0035 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0030 <- 2.91 -> DT xxx A0035 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0032 <- 3.51 -> DA xxx B0004 : score x.xxxxx >1rr8_C:Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_N-terminal_DNA-binding_fragment;DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=STRUCTURAL MECHANISMS OF CAMPTOTHECIN RESISTANCE BY MUTATIONS IN HUMAN TOPOISOMERASE I organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 C0364 <- 2.71 -> DA N3 B0113 : score 3.29806 : H : ARG NH2 C0364 <- 2.71 -> DA N3 B0113 : score 3.29806 : H : LYS NZ C0532 <- 2.65 -> DT O2 A0010 : score 3.69479 : H : LYS NZ C0532 <- 2.65 -> DT O2 A0010 : score 3.69479 : x : GLU xxxx C0356 <- 3.79 -> DC xxx B0112 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0425 <- 3.93 -> DA xxx B0114 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0426 <- 2.95 -> DA xxx A0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0428 <- 4.37 -> DC xxx A0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0436 <- 4.16 -> DT xxx A0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0491 <- 3.82 -> DC xxx B0117 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0722 <- 3.81 -> DT xxx A0010 : score x.xxxxx >1rrj_A:Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_N-terminal_DNA-binding_fragment;DNA_breaking-rejoining_enzymes;Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_dispensable_insert_domain; title=STRUCTURAL MECHANISMS OF CAMPTOTHECIN RESISTANCE BY MUTATIONS IN HUMAN TOPOISOMERASE I organism=Homo sapiens : w : GLU OE1 A0356 <- 6.72 -> DC N4 C0112 : score 3.528 : H : ARG NH2 A0364 <- 2.68 -> DA N3 C0113 : score 3.3175 : w : ARG NH1 A0364 <- 6.47 -> DG N2 B0011 : score 1.082 : w : LYS NZ A0425 <- 6.34 -> DC N4 B0008 : score 0.048 : H : LYS NZ A0532 <- 2.89 -> DT O2 B0010 : score 3.52261 : V : PHE CZ A0640 <- 3.66 -> DT C7 C0106 : score 7.36389 : x : TYR xxxx A0426 <- 3.10 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0428 <- 4.00 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0436 <- 4.26 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0491 <- 3.93 -> DT xxx C0116 : score x.xxxxx >1rrq_A:Nudix;DNA-glycosylase; title=MUTY ADENINE GLYCOSYLASE IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING AN A:OXOG PAIR organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : w : TRP NE1 A0030 <- 5.73 -> DA N6 C0018 : score 4.074 : w : GLN OE1 A0047 <- 5.91 -> DG N3 C0019 : score 1.484 : H : ARG NH1 A0050 <- 2.54 -> DC O2 C0016 : score 3.8398 : H : ARG NH1 A0050 <- 3.03 -> DA N3 C0017 : score 3.51268 : w : THR OG1 A0053 <- 6.45 -> DG N3 B0008 : score 2.036 : H : CYS SG A0164 <- 3.04 -> DA N6 B0002 : score 5.46302 : x : ARG xxxx A0026 <- 3.30 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0028 <- 3.66 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0031 <- 3.70 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0043 <- 3.45 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0046 <- 3.36 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0048 <- 3.76 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0051 <- 3.35 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0088 <- 3.24 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0126 <- 3.32 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0144 <- 4.39 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0191 <- 3.57 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0192 <- 3.85 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0195 <- 4.45 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0308 <- 3.84 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0309 <- 4.02 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >1rrs_A:DNA-glycosylase;Nudix; title=MUTY ADENINE GLYCOSYLASE IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING AN ABASIC SITE organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : w : GLN OE1 A0047 <- 5.71 -> DG N3 C0019 : score 1.484 : x : GLN xxxx A0048 <- 2.89 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0050 <- 4.15 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0088 <- 3.19 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0308 <- 3.86 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0309 <- 3.83 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >1rtd_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF A CATALYTIC COMPLEX OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE: IMPLICATIONS FOR NUCLEOSIDE ANALOG DRUG RESISTANCE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.84 -> DG N2 F0021 : score 4.85063 : H : TYR OH A0183 <- 2.67 -> DG N3 F0021 : score 3.19507 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.66 -> DC O2 F0006 : score 3.7522 : H : GLN NE2 A0475 <- 3.27 -> DC O2 F0008 : score 3.34755 : x : PHE xxxx A0061 <- 3.59 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.43 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.33 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.80 -> DG xxx F0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.14 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.58 -> DG xxx F0022 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0258 <- 3.97 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx >1rtd_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF A CATALYTIC COMPLEX OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE: IMPLICATIONS FOR NUCLEOSIDE ANALOG DRUG RESISTANCE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH C0183 <- 3.21 -> DG N2 H0021 : score 4.48878 : H : TYR OH C0183 <- 2.86 -> DG N3 H0021 : score 3.07673 : H : ARG NH1 C0448 <- 2.72 -> DC O2 H0006 : score 3.7084 : H : GLN NE2 C0475 <- 3.11 -> DC O2 H0008 : score 3.46579 : x : PHE xxxx C0061 <- 3.48 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0074 <- 3.36 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0094 <- 3.55 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 3.61 -> DG xxx H0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.10 -> DC xxx G0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.50 -> DG xxx H0022 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0258 <- 3.99 -> DC xxx H0017 : score x.xxxxx >1run_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN (CAP)/DNA COMPLEX + ADENOSINE-3',5'- CYCLIC-MONOPHOSPHATE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0180 <- 3.12 -> DG O6 C0005 : score 5.694 : H : ARG NH2 A0180 <- 3.07 -> DG O6 C0005 : score 6.2436 : H : GLU OE1 A0181 <- 2.73 -> DC N4 F0007 : score 5.8487 : H : ARG NH1 A0185 <- 2.90 -> DG N7 C0007 : score 5.929 : x : SER xxxx A0179 <- 3.93 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx >1ruo_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN (CAP) MUTANT/DNA COMPLEX + ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0180 <- 2.58 -> DG N7 C0005 : score 6.3162 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.81 -> DG O6 C0005 : score 6.5868 : H : ARG NH1 A0185 <- 3.34 -> DG N7 C0007 : score 5.3966 : x : GLN xxxx A0170 <- 4.07 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0179 <- 3.99 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0181 <- 2.73 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0182 <- 4.28 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx >1rv5_A:Restriction_endonuclease-like; title=COMPLEX OF ECORV ENDONUCLEASE WITH D(AAAGAT)/D(ATCTT) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ASN OD1 A0185 <- 2.73 -> DA N6 D0005 : score 6.1061 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.98 -> DA N7 D0005 : score 5.65917 : H : THR OG1 A0186 <- 2.89 -> DT O4 C0008 : score 3.81721 : V : ASN CG A0188 <- 3.63 -> DT C7 C0008 : score 2.76075 : x : ASN xxxx A0070 <- 4.10 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0104 <- 4.40 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0106 <- 3.70 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.08 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >1rv5_AB:Restriction_endonuclease-like; title=COMPLEX OF ECORV ENDONUCLEASE WITH D(AAAGAT)/D(ATCTT) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ASN OD1 A0185 <- 2.73 -> DA N6 D0005 : score 6.1061 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.98 -> DA N7 D0005 : score 5.65917 : H : THR OG1 A0186 <- 2.89 -> DT O4 C0008 : score 3.81721 : H : ASN ND2 B0070 <- 2.92 -> DA N3 D0005 : score 3.71631 : H : ASN ND2 B0070 <- 2.79 -> DC O2 C0009 : score 4.48845 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.94 -> DA N6 C0005 : score 5.85318 : H : ASN ND2 B0185 <- 3.00 -> DA N7 C0005 : score 5.63569 : H : THR OG1 B0186 <- 2.90 -> DT O4 D0008 : score 3.80944 : V : ASN CG B0188 <- 3.67 -> DT C7 D0008 : score 2.73427 : V : ASN CG A0188 <- 3.63 -> DT C7 C0008 : score 2.76075 : x : ASN xxxx A0070 <- 4.10 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0104 <- 4.40 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0106 <- 3.70 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.08 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.69 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.15 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1rva_AB:Restriction_endonuclease-like; title=MG2+ BINDING TO THE ACTIVE SITE OF ECO RV ENDONUCLEASE: A CRYSTALLOGRAPHIC STUDY OF COMPLEXES WITH SUBSTRATE AND PRODUCT DNA AT 2 ANGSTROMS RESOLUTION organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 A0185 <- 2.86 -> DA N6 D0005 : score 5.94953 : H : ASN ND2 A0185 <- 3.02 -> DA N7 D0005 : score 5.61221 : H : THR OG1 A0186 <- 2.58 -> DT O4 C0008 : score 4.05822 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.83 -> DA N6 C0005 : score 5.98566 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.89 -> DA N7 C0005 : score 5.76484 : H : THR OG1 B0186 <- 2.50 -> DT O4 D0008 : score 4.12041 : V : THR CB A0106 <- 3.87 -> DT C7 C0008 : score 3.46445 : V : THR CG2 B0106 <- 3.85 -> DT C7 D0008 : score 4.18396 : x : ASN xxxx A0070 <- 3.54 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0104 <- 4.15 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.29 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.50 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0038 <- 4.22 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0070 <- 3.07 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.33 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.51 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1rva_B:Restriction_endonuclease-like; title=MG2+ BINDING TO THE ACTIVE SITE OF ECO RV ENDONUCLEASE: A CRYSTALLOGRAPHIC STUDY OF COMPLEXES WITH SUBSTRATE AND PRODUCT DNA AT 2 ANGSTROMS RESOLUTION organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 B0185 <- 2.83 -> DA N6 C0005 : score 5.98566 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.89 -> DA N7 C0005 : score 5.76484 : H : THR OG1 B0186 <- 2.50 -> DT O4 D0008 : score 4.12041 : V : THR CG2 B0106 <- 3.85 -> DT C7 D0008 : score 4.18396 : x : LYS xxxx B0038 <- 4.22 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0070 <- 3.07 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.33 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.51 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1rvb_A:Restriction_endonuclease-like; title=MG2+ BINDING TO THE ACTIVE SITE OF ECO RV ENDONUCLEASE: A CRYSTALLOGRAPHIC STUDY OF COMPLEXES WITH SUBSTRATE AND PRODUCT DNA AT 2 ANGSTROMS RESOLUTION organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 3.04 -> DC O2 D0009 : score 4.26447 : w : ASN OD1 A0070 <- 5.79 -> DT O2 D0008 : score 1.953 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.83 -> DA N6 D0005 : score 5.98566 : H : ASN ND2 A0185 <- 3.14 -> DA N7 D0005 : score 5.47132 : H : THR OG1 A0186 <- 2.61 -> DT O4 C0008 : score 4.03489 : V : THR CB A0106 <- 3.77 -> DT C7 C0008 : score 3.5526 : x : LYS xxxx A0104 <- 4.26 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.25 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.47 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >1rvb_AB:Restriction_endonuclease-like; title=MG2+ BINDING TO THE ACTIVE SITE OF ECO RV ENDONUCLEASE: A CRYSTALLOGRAPHIC STUDY OF COMPLEXES WITH SUBSTRATE AND PRODUCT DNA AT 2 ANGSTROMS RESOLUTION organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 3.04 -> DC O2 D0009 : score 4.26447 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.83 -> DA N6 D0005 : score 5.98566 : H : ASN ND2 A0185 <- 3.14 -> DA N7 D0005 : score 5.47132 : H : THR OG1 A0186 <- 2.61 -> DT O4 C0008 : score 4.03489 : H : ASN ND2 B0070 <- 2.95 -> DC O2 C0009 : score 4.3451 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.85 -> DA N6 C0005 : score 5.96158 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.96 -> DA N7 C0005 : score 5.68266 : H : THR OG1 B0186 <- 2.55 -> DT O4 D0008 : score 4.08154 : V : THR CB A0106 <- 3.77 -> DT C7 C0008 : score 3.5526 : V : THR CG2 B0106 <- 3.73 -> DT C7 D0008 : score 4.31107 : x : LYS xxxx A0104 <- 4.26 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.25 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.47 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.27 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.39 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1rvc_A:Restriction_endonuclease-like; title=MG2+ BINDING TO THE ACTIVE SITE OF ECO RV ENDONUCLEASE: A CRYSTALLOGRAPHIC STUDY OF COMPLEXES WITH SUBSTRATE AND PRODUCT DNA AT 2 ANGSTROMS RESOLUTION organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 A0185 <- 2.82 -> DA N6 E0005 : score 5.99771 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.98 -> DA N7 E0005 : score 5.65917 : H : THR OG1 A0186 <- 2.55 -> DT O4 D0008 : score 4.08154 : V : ASN CG A0188 <- 3.59 -> DT C7 D0008 : score 2.78724 : x : LYS xxxx A0104 <- 4.34 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0106 <- 3.69 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.21 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx >1rvc_AB:Restriction_endonuclease-like; title=MG2+ BINDING TO THE ACTIVE SITE OF ECO RV ENDONUCLEASE: A CRYSTALLOGRAPHIC STUDY OF COMPLEXES WITH SUBSTRATE AND PRODUCT DNA AT 2 ANGSTROMS RESOLUTION organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 A0185 <- 2.82 -> DA N6 E0005 : score 5.99771 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.98 -> DA N7 E0005 : score 5.65917 : H : THR OG1 A0186 <- 2.55 -> DT O4 D0008 : score 4.08154 : H : ASN ND2 B0070 <- 3.31 -> DA N3 E0005 : score 3.41931 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.80 -> DA N6 C0005 : score 6.02179 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.87 -> DA N7 C0005 : score 5.78833 : H : THR OG1 B0186 <- 2.57 -> DT O4 F0008 : score 4.06599 : V : ASN CG A0188 <- 3.59 -> DT C7 D0008 : score 2.78724 : V : ASN CG B0188 <- 3.66 -> DT C7 F0008 : score 2.74089 : x : LYS xxxx A0104 <- 4.34 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0106 <- 3.69 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.21 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0104 <- 4.21 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.71 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.24 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1rxw_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A. FULGIDUS FEN-1 BOUND TO DNA organism=Archaeoglobus fulgidus : w : SER OG A0059 <- 5.42 -> DC O2 B0015 : score 1.768 : w : SER OG A0059 <- 5.92 -> DG N3 C0002 : score 2.344 : w : ARG NH1 A0314 <- 5.63 -> DA N3 B0013 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0314 <- 5.85 -> DA N3 B0013 : score 2.092 : x : ILE xxxx A0038 <- 3.46 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0039 <- 3.60 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0047 <- 3.73 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >1ryr_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=REPLICATION OF A CIS-SYN THYMINE DIMER AT ATOMIC RESOLUTION organism=Sulfolobus solfataricus : w : LYS NZ A0339 <- 6.28 -> DA N7 B1807 : score 1.655 : x : ALA xxxx A0042 <- 3.30 -> DT xxx C1905 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 4.06 -> DT xxx C1909 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.91 -> DA xxx C1908 : score x.xxxxx >1rys_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=REPLICATION OF A CIS-SYN THYMINE DIMER AT ATOMIC RESOLUTION organism=Sulfolobus solfataricus : x : VAL xxxx B0032 <- 3.67 -> DT xxx F1904 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0295 <- 4.24 -> DT xxx E1811 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0332 <- 4.39 -> DT xxx F1905 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0336 <- 4.21 -> DA xxx F1907 : score x.xxxxx >1rz9_ABCDE:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AAV REP COMPLEXED WITH THE REP-BINDING SEQUENCE organism=Adeno-associated virus - 5 : H : ARG NH1 A0106 <- 2.99 -> DT O2 F0022 : score 4.14277 : H : ARG NH1 A0106 <- 2.97 -> DC O2 F0023 : score 3.5259 : H : ARG NH2 A0106 <- 2.88 -> DC O2 F0023 : score 3.63954 : H : ARG NH1 B0106 <- 2.88 -> DG N3 F0019 : score 3.00372 : H : LYS NZ B0137 <- 3.04 -> DG N7 F0012 : score 5.12737 : H : LYS NZ B0137 <- 2.74 -> DG O6 F0012 : score 5.85014 : H : ARG NH2 C0106 <- 2.65 -> DC O2 F0015 : score 3.80968 : H : ARG NH1 D0106 <- 3.39 -> DT O2 F0010 : score 3.79825 : H : ARG NH2 D0106 <- 2.57 -> DC O2 F0011 : score 3.86886 : H : ARG NH2 E0106 <- 2.47 -> DC O2 F0007 : score 3.94283 : x : MET xxxx A0102 <- 3.65 -> DG xxx G0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0137 <- 3.31 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0138 <- 4.10 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0102 <- 3.93 -> DG xxx G0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0138 <- 4.34 -> DC xxx F0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0102 <- 3.52 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0137 <- 3.77 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0138 <- 4.32 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0102 <- 3.50 -> DG xxx G0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0137 <- 3.65 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0138 <- 3.25 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0102 <- 4.28 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0137 <- 3.20 -> DG xxx G0026 : score x.xxxxx >1rz9_B:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AAV REP COMPLEXED WITH THE REP-BINDING SEQUENCE organism=Adeno-associated virus - 5 : H : ARG NH1 B0106 <- 2.88 -> DG N3 F0019 : score 3.00372 : H : LYS NZ B0137 <- 3.04 -> DG N7 F0012 : score 5.12737 : H : LYS NZ B0137 <- 2.74 -> DG O6 F0012 : score 5.85014 : x : MET xxxx B0102 <- 3.93 -> DG xxx G0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0138 <- 4.34 -> DC xxx F0013 : score x.xxxxx >1rzr_AD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSCRIPTIONAL REGULATOR-PHOSPHOPROTEIN-DNA COMPLEX organism=BACILLUS MEGATERIUM : H : ARG NH1 A0021 <- 3.15 -> DT O4 B0712 : score 3.03919 : H : ARG NH2 A0021 <- 2.44 -> DG N7 E0702 : score 6.84431 : H : ARG NH1 D0021 <- 3.01 -> DG N7 B0702 : score 5.7959 : H : ARG NH2 D0021 <- 2.34 -> DG O6 B0702 : score 7.2072 : V : MET CE D0016 <- 3.51 -> DT C7 E0710 : score 7.4327 : x : ILE xxxx A0005 <- 4.46 -> DC xxx B0709 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0015 <- 3.53 -> DG xxx E0702 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0016 <- 3.21 -> DT xxx B0710 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0017 <- 2.89 -> DA xxx E0703 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0020 <- 4.04 -> DT xxx B0710 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0052 <- 4.04 -> DG xxx B0708 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0055 <- 3.55 -> DC xxx E0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0056 <- 3.18 -> DC xxx B0709 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0005 <- 4.08 -> DC xxx E0709 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0015 <- 3.33 -> DT xxx B0703 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0017 <- 2.87 -> DT xxx B0703 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0020 <- 4.28 -> DT xxx E0710 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0052 <- 3.34 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0055 <- 3.42 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0056 <- 3.13 -> DC xxx E0709 : score x.xxxxx >1rzr_CG: title=CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSCRIPTIONAL REGULATOR-PHOSPHOPROTEIN-DNA COMPLEX organism=BACILLUS MEGATERIUM : H : ARG NH1 C0021 <- 3.42 -> DG N7 R0702 : score 5.2998 : H : ARG NH2 C0021 <- 2.96 -> DG O6 R0702 : score 6.3888 : V : MET CE G0016 <- 3.52 -> DT C7 R0710 : score 7.41537 : x : ILE xxxx G0005 <- 3.97 -> DC xxx R0709 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0015 <- 3.53 -> DG xxx H0702 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0017 <- 3.03 -> DA xxx H0703 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0020 <- 3.19 -> DT xxx R0711 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0021 <- 2.92 -> DT xxx H0701 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0052 <- 3.71 -> DG xxx R0708 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0055 <- 3.71 -> DC xxx H0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0056 <- 3.51 -> DC xxx R0709 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0005 <- 3.24 -> DT xxx H0710 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0015 <- 2.69 -> DT xxx R0703 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0016 <- 3.65 -> DT xxx H0710 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0017 <- 2.91 -> DT xxx R0703 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0018 <- 4.44 -> DT xxx R0701 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0020 <- 4.03 -> DT xxx H0710 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0029 <- 3.46 -> DT xxx R0701 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0052 <- 3.60 -> DG xxx H0708 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0055 <- 3.13 -> DC xxx R0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0056 <- 3.39 -> DC xxx H0709 : score x.xxxxx >1rzr_D:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSCRIPTIONAL REGULATOR-PHOSPHOPROTEIN-DNA COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 D0021 <- 3.01 -> DG N7 B0702 : score 5.7959 : H : ARG NH2 D0021 <- 2.34 -> DG O6 B0702 : score 7.2072 : V : MET CE D0016 <- 3.51 -> DT C7 E0710 : score 7.4327 : x : ILE xxxx D0005 <- 4.08 -> DC xxx E0709 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0015 <- 3.33 -> DT xxx B0703 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0017 <- 2.87 -> DT xxx B0703 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0020 <- 4.28 -> DT xxx E0710 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0052 <- 3.34 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0055 <- 3.42 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0056 <- 3.13 -> DC xxx E0709 : score x.xxxxx >1rzt_E:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE LAMBDA COMPLEXED WITH A TWO NUCLEOTIDE GAP DNA MOLECULE organism=Homo sapiens : x : TRP xxxx E0274 <- 3.30 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0275 <- 3.99 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0277 <- 3.57 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx >1rzt_EI:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;DNA_polymerase_beta-like,_second_domain;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE LAMBDA COMPLEXED WITH A TWO NUCLEOTIDE GAP DNA MOLECULE organism=Homo sapiens : x : TRP xxxx E0274 <- 3.30 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0275 <- 3.99 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0277 <- 3.57 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0274 <- 3.15 -> DG xxx L0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0275 <- 3.94 -> DG xxx L0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0277 <- 3.94 -> DC xxx J0004 : score x.xxxxx >1s0m_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A BENZO[A]PYRENE DIOL EPOXIDE ADDUCT IN A TERNARY COMPLEX WITH A DNA POLYMERASE organism=Sulfolobus solfataricus : x : SER xxxx B0244 <- 4.21 -> DT xxx F1909 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0332 <- 3.30 -> DA xxx F1906 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0336 <- 4.12 -> DA xxx F1908 : score x.xxxxx >1s0n_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=SNAPSHOTS OF REPLICATION THROUGH AN ABASIC LESION: STRUCTURAL BASIS FOR BASE SUBSTITUTION AND FRAMESHIFT organism=Sulfolobus solfataricus : x : ARG xxxx A0332 <- 4.28 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.45 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx >1s0o_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=SNAPSHOTS OF REPLICATION THROUGH AN ABASIC LESION: STRUCTURAL BASIS FOR BASE SUBSTITUTION AND FRAMESHIFT organism=Sulfolobus solfataricus : w : ARG NH1 B0336 <- 5.75 -> DT O4 F1909 : score 1.768 : x : VAL xxxx B0032 <- 3.36 -> DA xxx F1904 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0042 <- 3.65 -> DA xxx F1904 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0044 <- 4.33 -> DA xxx F1904 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0332 <- 4.03 -> DG xxx F1905 : score x.xxxxx >1s0v_A:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURAL BASIS FOR SUBSTRATE SELECTION BY T7 RNA POLYMERASE organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : w : ARG NH2 A0647 <- 5.41 -> DG N3 G0001 : score 0.677 : w : ASP OD2 A0653 <- 6.74 -> DT O4 E0010 : score 2.798 : x : TYR xxxx A0639 <- 4.28 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0644 <- 2.95 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0649 <- 3.26 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx >1s10_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=SNAPSHOTS OF REPLICATION THROUGH AN ABASIC LESION: STRUCTURAL BASIS FOR BASE SUBSTITUTION AND FRAMESHIFT organism=Sulfolobus solfataricus : w : SER OG A0297 <- 6.12 -> DG N7 B1808 : score 2.749 : x : ARG xxxx A0336 <- 4.35 -> DG xxx C1908 : score x.xxxxx >1s32_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=MOLECULAR RECOGNITION OF THE NUCLEOSOMAL 'SUPERGROOVE' organism=XENOPUS LAEVIS : w : HIS NE2 A0439 <- 5.29 -> DA N3 J0151 : score 2.619 : H : ARG NH2 A0440 <- 2.65 -> DA N3 J0229 : score 3.33694 : w : TYR OH A0441 <- 5.78 -> DT O2 I0142 : score 3.068 : w : TYR OH A0441 <- 6.07 -> DA N3 J0151 : score 1.448 : w : ARG NH1 D1230 <- 5.56 -> DG N2 J0267 : score 1.082 : w : HIS NE2 E0639 <- 5.39 -> DT O2 J0289 : score 3.682 : H : ARG NH1 E0640 <- 3.26 -> DA N3 I0082 : score 3.3433 : w : ARG NH1 E0640 <- 6.31 -> DG N3 I0081 : score 1.593 : w : ARG NH2 E0640 <- 5.41 -> DA N3 I0083 : score 2.092 : w : ARG NH2 F0245 <- 5.61 -> DC O2 I0079 : score 1.669 : w : ARG NH1 G1077 <- 5.61 -> DG N3 I0131 : score 1.593 : w : ARG NH2 G1077 <- 5.92 -> DT O2 I0130 : score 2.261 : x : LEU xxxx A0465 <- 3.67 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 4.39 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.29 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1226 <- 2.95 -> DG xxx J0192 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0641 <- 4.49 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 4.12 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 3.86 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.32 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H1426 <- 2.95 -> DG xxx J0249 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H1430 <- 3.35 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >1s32_D:Histone-fold; title=MOLECULAR RECOGNITION OF THE NUCLEOSOMAL 'SUPERGROOVE' organism=XENOPUS LAEVIS : w : ARG NH1 D1230 <- 5.56 -> DG N2 J0267 : score 1.082 : x : ARG xxxx D1226 <- 2.95 -> DG xxx J0192 : score x.xxxxx >1s40_A:Nucleic_acid-binding_proteins; title=SOLUTION STRUCTURE OF THE CDC13 DNA-BINDING DOMAIN COMPLEXED WITH A SINGLE-STRANDED TELOMERIC DNA 11-MER organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : SER OG A0038 <- 2.68 -> DG O6 B0006 : score 4.18921 : H : SER OG A0046 <- 2.94 -> DG N7 B0006 : score 4.35655 : H : ASN ND2 A0114 <- 2.58 -> DG O6 B0011 : score 5.88655 : x : GLU xxxx A0024 <- 3.37 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0025 <- 4.11 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0027 <- 3.20 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0040 <- 4.16 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0041 <- 3.24 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0043 <- 2.52 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0044 <- 4.38 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0048 <- 4.14 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0060 <- 3.68 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0061 <- 3.11 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0062 <- 3.76 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0063 <- 3.29 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0070 <- 2.37 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0081 <- 3.09 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0085 <- 3.06 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0111 <- 3.60 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0112 <- 2.73 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0127 <- 3.64 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0131 <- 3.66 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0136 <- 2.66 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0137 <- 4.26 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0140 <- 4.49 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx >1s6m_A:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=CONJUGATIVE RELAXASE TRWC IN COMPLEX WITH ORIT DNA. METAL-BOUND STRUCTURE organism=ESCHERICHIA COLI : w : SER OG A0072 <- 6.26 -> DA N6 B0010 : score 2.209 : H : ARG NH1 A0075 <- 2.90 -> DA N3 B0005 : score 3.60841 : H : ARG NH1 A0128 <- 3.10 -> DG N7 B0015 : score 5.687 : H : ARG NH2 A0128 <- 2.78 -> DG O6 B0015 : score 6.6264 : H : LYS NZ A0130 <- 2.96 -> DG N7 B0013 : score 5.21355 : w : LYS NZ A0181 <- 5.94 -> DG O6 B0003 : score 3.005 : x : ALA xxxx A0073 <- 3.59 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0081 <- 4.49 -> DC xxx B0016 : score x.xxxxx >1s76_D:DNA/RNA_polymerases; title=T7 RNA POLYMERASE ALPHA BETA METHYLENE ATP ELONGATION COMPLEX organism=Enterobacteria phage T7 : H : ARG NE D0632 <- 2.94 -> DT O4 T0120 : score 1.80692 : H : ARG NH2 D0632 <- 3.09 -> DT O4 T0120 : score 3.34772 : V : TYR CZ D0178 <- 3.54 -> DT C7 N0016 : score 5.94215 : V : LYS CE D0164 <- 3.83 -> DT C7 N0021 : score 2.58152 : x : GLU xxxx D0168 <- 2.33 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0172 <- 3.68 -> DA xxx N0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0173 <- 2.73 -> DA xxx N0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0174 <- 4.46 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0379 <- 3.45 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0385 <- 3.55 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0427 <- 4.21 -> DC xxx T0118 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0636 <- 3.05 -> DT xxx T0120 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0639 <- 3.67 -> DT xxx T0120 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0641 <- 4.45 -> DT xxx T0120 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0644 <- 3.20 -> DA xxx T0121 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0647 <- 3.43 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0649 <- 3.33 -> DT xxx T0120 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0670 <- 2.93 -> DG xxx N0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0671 <- 3.61 -> DG xxx N0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0780 <- 4.11 -> DT xxx T0120 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0784 <- 3.67 -> DT xxx T0119 : score x.xxxxx >1s77_D:DNA/RNA_polymerases; title=T7 RNAP PRODUCT PYROPHOSPHATE ELONGATION COMPLEX organism=Enterobacteria phage T7 : H : ARG NH2 D0632 <- 2.93 -> DT O4 T0120 : score 3.46145 : x : ASN xxxx D0165 <- 3.43 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0168 <- 2.82 -> DG xxx N0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0172 <- 3.62 -> DA xxx N0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0173 <- 3.53 -> DA xxx N0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0178 <- 3.51 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0385 <- 3.74 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0427 <- 4.33 -> DC xxx T0118 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0636 <- 3.29 -> DT xxx T0120 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0639 <- 3.72 -> DT xxx T0120 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0641 <- 4.23 -> DT xxx T0120 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0644 <- 3.02 -> DA xxx T0121 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0647 <- 2.55 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0649 <- 3.51 -> DT xxx T0120 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0669 <- 3.69 -> DG xxx N0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0670 <- 3.20 -> DG xxx N0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0671 <- 3.55 -> DG xxx N0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0780 <- 4.19 -> DT xxx T0120 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0784 <- 3.47 -> DT xxx T0119 : score x.xxxxx >1s97_C:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 WITH GT MISMATCH organism=Sulfolobus solfataricus : x : VAL xxxx C0032 <- 4.22 -> DG xxx K0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0042 <- 3.64 -> DG xxx K0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0044 <- 4.06 -> DG xxx K0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0244 <- 4.13 -> DT xxx K0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0332 <- 3.22 -> DT xxx K0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0336 <- 3.55 -> DG xxx K0008 : score x.xxxxx >1s9f_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO WITH AT MATCHED organism=Sulfolobus solfataricus : w : LYS NZ A0078 <- 5.91 -> DT O2 I0006 : score 0.522 : x : SER xxxx A0244 <- 4.17 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0332 <- 3.53 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.30 -> DG xxx I0008 : score x.xxxxx >1s9k_CDE:p53-like_transcription_factors;E_set_domains;A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NFAT1 AND FOS-JUN ON THE IL-2 ARRE1 SITE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 C0421 <- 3.01 -> DG N7 A4004 : score 5.7959 : H : ARG NH2 C0421 <- 2.73 -> DG O6 A4004 : score 6.6924 : H : GLN OE1 C0571 <- 2.92 -> DA N6 A4005 : score 5.9073 : H : GLN NE2 C0571 <- 3.09 -> DA N7 A4005 : score 5.73654 : H : ASN OD1 D0147 <- 3.39 -> DA N6 A4016 : score 5.31122 : H : ASN ND2 D0147 <- 3.05 -> DT O4 B5006 : score 5.02038 : H : ARG NH1 D0155 <- 3.24 -> DG N7 A4014 : score 5.5176 : H : ARG NH2 D0155 <- 3.00 -> DG O6 A4014 : score 6.336 : H : ASN OD1 E0272 <- 2.97 -> DC N4 B5011 : score 4.05101 : x : TYR xxxx C0424 <- 3.40 -> DT xxx B5018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0427 <- 2.74 -> DT xxx B5018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0430 <- 2.59 -> DT xxx A4003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0537 <- 4.00 -> DA xxx A4010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0572 <- 3.60 -> DT xxx B5015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0143 <- 4.45 -> DT xxx A4018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0150 <- 4.18 -> DA xxx B5005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0151 <- 3.98 -> DT xxx A4015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0275 <- 3.94 -> DT xxx A4011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx E0279 <- 4.20 -> DT xxx A4011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0280 <- 4.00 -> DA xxx B5008 : score x.xxxxx >1s9k_E:Leucine_zipper_domain;A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NFAT1 AND FOS-JUN ON THE IL-2 ARRE1 SITE organism=HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 E0272 <- 2.97 -> DC N4 B5011 : score 4.05101 : x : ALA xxxx E0275 <- 3.94 -> DT xxx A4011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx E0279 <- 4.20 -> DT xxx A4011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0280 <- 4.00 -> DA xxx B5008 : score x.xxxxx >1sa3_A:Restriction_endonuclease-like; title=AN ASYMMETRIC COMPLEX OF RESTRICTION ENDONUCLEASE MSPI ON ITS PALINDROMIC DNA RECOGNITION SITE organism=MORAXELLA SP. : w : SER OG A0027 <- 5.78 -> DC O2 C0005 : score 1.768 : w : ASP OD1 A0028 <- 5.63 -> DG N2 D0017 : score 2.312 : w : ASP OD2 A0028 <- 6.24 -> DC O2 C0005 : score 1.919 : w : ASP OD2 A0028 <- 6.41 -> DG N3 D0017 : score 2.312 : H : SER OG A0127 <- 2.79 -> DG N7 C0006 : score 4.49102 : H : SER OG A0127 <- 3.25 -> DG O6 C0006 : score 3.72283 : w : SER OG A0127 <- 6.14 -> DG N7 C0007 : score 2.749 : w : GLU OE1 A0130 <- 5.68 -> DC N4 C0005 : score 3.528 : w : GLU OE1 A0130 <- 5.62 -> DC N4 C0004 : score 3.528 : H : THR OG1 A0248 <- 2.94 -> DC N4 D0014 : score 3.9204 : H : SER OG A0251 <- 2.76 -> DG N7 D0016 : score 4.51791 : w : SER OG A0251 <- 5.82 -> DG O6 D0017 : score 2.749 : H : GLN NE2 A0259 <- 2.68 -> DG O6 C0006 : score 5.94445 : H : LYS NZ A0261 <- 3.06 -> DG O6 C0006 : score 5.48017 : H : LYS NZ A0261 <- 2.83 -> DG O6 C0007 : score 5.74608 : w : LYS NZ A0261 <- 6.07 -> DG N7 C0007 : score 2.519 : x : ASN xxxx A0246 <- 3.99 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0249 <- 3.30 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0253 <- 3.76 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx >1sa3_AB: title=AN ASYMMETRIC COMPLEX OF RESTRICTION ENDONUCLEASE MSPI ON ITS PALINDROMIC DNA RECOGNITION SITE organism=MORAXELLA SP. : w : SER OG A0027 <- 5.78 -> DC O2 C0005 : score 1.768 : w : ASP OD1 A0028 <- 5.63 -> DG N2 D0017 : score 2.312 : w : ASP OD2 A0028 <- 6.24 -> DC O2 C0005 : score 1.919 : w : ASP OD2 A0028 <- 6.41 -> DG N3 D0017 : score 2.312 : H : SER OG A0127 <- 2.79 -> DG N7 C0006 : score 4.49102 : H : SER OG A0127 <- 3.25 -> DG O6 C0006 : score 3.72283 : w : GLU OE1 A0130 <- 5.68 -> DC N4 C0005 : score 3.528 : w : GLU OE1 A0130 <- 5.62 -> DC N4 C0004 : score 3.528 : H : THR OG1 A0248 <- 2.94 -> DC N4 D0014 : score 3.9204 : H : SER OG A0251 <- 2.76 -> DG N7 D0016 : score 4.51791 : w : SER OG A0251 <- 5.82 -> DG O6 D0017 : score 2.749 : H : GLN NE2 A0259 <- 2.68 -> DG O6 C0006 : score 5.94445 : H : LYS NZ A0261 <- 3.06 -> DG O6 C0006 : score 5.48017 : H : LYS NZ A0261 <- 2.83 -> DG O6 C0007 : score 5.74608 : w : SER OG B0027 <- 5.71 -> DC O2 E0005 : score 1.768 : w : ASP OD1 B0028 <- 5.93 -> DG N3 F0018 : score 2.718 : w : ASP OD2 B0028 <- 6.02 -> DC O2 E0005 : score 1.919 : w : ASP OD2 B0028 <- 6.23 -> DG N3 F0017 : score 2.312 : H : SER OG B0127 <- 2.73 -> DG N7 E0006 : score 4.5448 : w : SER OG B0127 <- 6.13 -> DG N7 E0007 : score 2.749 : w : GLU OE1 B0130 <- 5.67 -> DC N4 E0005 : score 3.528 : w : GLU OE1 B0130 <- 5.55 -> DC N4 E0004 : score 3.528 : H : THR OG1 B0248 <- 2.94 -> DC N4 F0014 : score 3.9204 : H : SER OG B0251 <- 2.89 -> DG N7 F0016 : score 4.40137 : w : SER OG B0251 <- 5.78 -> DG O6 F0017 : score 2.749 : H : GLN NE2 B0259 <- 2.75 -> DG O6 E0006 : score 5.86318 : H : LYS NZ B0261 <- 2.96 -> DG O6 E0006 : score 5.59578 : H : LYS NZ B0261 <- 2.90 -> DG O6 E0007 : score 5.66515 : w : LYS NZ B0261 <- 6.06 -> DG N7 E0007 : score 2.519 : x : ASN xxxx A0246 <- 3.99 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0249 <- 3.30 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0253 <- 3.76 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0246 <- 4.29 -> DC xxx F0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0249 <- 3.38 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx >1sax_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF S.AUREUS METHICILLIN-RESISTANCE REGULATING TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR MECI IN COMPLEX WITH 25-BP DS- DNA organism=Staphylococcus aureus subsp. aureus : H : LYS NZ A0043 <- 2.51 -> DT O4 D0018 : score 3.79524 : H : THR OG1 A0047 <- 3.11 -> DA N7 D0016 : score 3.20243 : H : THR OG1 A0047 <- 2.77 -> DA N6 D0016 : score 2.77553 : H : ARG NH1 A0051 <- 2.86 -> DG N7 D0014 : score 5.9774 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.93 -> DG O6 D0014 : score 6.4284 : x : THR xxxx A0044 <- 3.78 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0046 <- 3.32 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0048 <- 4.04 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx >1sax_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF S.AUREUS METHICILLIN-RESISTANCE REGULATING TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR MECI IN COMPLEX WITH 25-BP DS- DNA organism=Staphylococcus aureus subsp. aureus : H : LYS NZ A0043 <- 2.51 -> DT O4 D0018 : score 3.79524 : H : THR OG1 A0047 <- 3.11 -> DA N7 D0016 : score 3.20243 : H : THR OG1 A0047 <- 2.77 -> DA N6 D0016 : score 2.77553 : H : ARG NH1 A0051 <- 2.86 -> DG N7 D0014 : score 5.9774 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.93 -> DG O6 D0014 : score 6.4284 : H : LYS NZ B0043 <- 2.68 -> DT O4 C0022 : score 3.67327 : H : THR OG1 B0047 <- 3.06 -> DA N7 C0020 : score 3.23657 : H : THR OG1 B0047 <- 2.83 -> DA N6 C0020 : score 2.74242 : H : ARG NH1 B0051 <- 2.78 -> DG N7 C0018 : score 6.0742 : H : ARG NH2 B0051 <- 3.27 -> DG N7 C0018 : score 5.78446 : H : ARG NH2 B0051 <- 2.88 -> DG O6 C0018 : score 6.4944 : x : THR xxxx A0044 <- 3.78 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0046 <- 3.32 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0048 <- 4.04 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0044 <- 3.88 -> DA xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0046 <- 4.48 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0048 <- 3.99 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx >1sc7_A:Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_N-terminal_DNA-binding_fragment;DNA_breaking-rejoining_enzymes;Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_dispensable_insert_domain; title=HUMAN DNA TOPOISOMERASE I (70 KDA) IN COMPLEX WITH THE INDENOISOQUINOLINE MJ-II-38 AND COVALENT COMPLEX WITH A 22 BASE PAIR DNA DUPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0364 <- 3.14 -> DA N3 D0113 : score 3.43167 : H : LYS NZ A0532 <- 2.84 -> DA N3 D0114 : score 2.75471 : x : ILE xxxx A0424 <- 4.37 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0425 <- 3.79 -> DA xxx D0113 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0426 <- 3.30 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0428 <- 3.48 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0491 <- 4.25 -> DC xxx D0117 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0533 <- 4.39 -> DA xxx D0113 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0722 <- 4.30 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx >1seu_A:Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_N-terminal_DNA-binding_fragment;DNA_breaking-rejoining_enzymes;Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_dispensable_insert_domain; title=HUMAN DNA TOPOISOMERASE I (70 KDA) IN COMPLEX WITH THE INDOLOCARBAZOLE SA315F AND COVALENT COMPLEX WITH A 22 BASE PAIR DNA DUPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0532 <- 2.74 -> DT O2 B0010 : score 3.63023 : x : ARG xxxx A0364 <- 3.14 -> DA xxx D0113 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0425 <- 3.94 -> DA xxx D0113 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0426 <- 3.07 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0428 <- 4.24 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0436 <- 3.58 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0491 <- 4.00 -> DT xxx D0116 : score x.xxxxx >1sfo_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II STRAND SEPARATED ELONGATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : PHE xxxx A0252 <- 3.60 -> DA xxx T0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0257 <- 4.30 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0317 <- 4.23 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0350 <- 3.84 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0447 <- 4.48 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.90 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 3.20 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.63 -> DA xxx T0001 : score x.xxxxx >1sfo_AB: title=RNA POLYMERASE II STRAND SEPARATED ELONGATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : PHE xxxx A0252 <- 3.60 -> DA xxx T0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0257 <- 4.30 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0317 <- 4.23 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0350 <- 3.84 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0447 <- 4.48 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.90 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 3.20 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.63 -> DA xxx T0001 : score x.xxxxx >1sfu_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE VIRAL ZALPHA DOMAIN BOUND TO LEFT-HANDED Z- DNA organism=Yaba-like disease virus : x : TYR xxxx A0051 <- 3.55 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1skm_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=HHAI METHYLTRANSFERASE IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING AN ABASIC SOUTH CARBOCYCLIC SUGAR AT ITS TARGET SITE organism=Haemophilus haemolyticus : w : ARG NH2 A0228 <- 6.76 -> DA N7 D0005 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0240 <- 2.82 -> DG N7 D0006 : score 6.0258 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.83 -> DG O6 D0006 : score 6.5604 : w : LYS NZ A0261 <- 5.55 -> DT O4 C0005 : score 1.7 : V : ALA CB A0260 <- 3.60 -> DT C7 C0005 : score 5.87892 : x : ILE xxxx A0086 <- 3.70 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.55 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0237 <- 3.26 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0239 <- 4.25 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0252 <- 4.12 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx >1skn_P:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors; title=THE BINDING DOMAIN OF SKN-1 IN COMPLEX WITH DNA: A NEW DNA-BINDING MOTIF organism=Caenorhabditis elegans : H : ASN OD1 P0511 <- 3.36 -> DC N4 A0010 : score 3.72391 : H : ASN ND2 P0511 <- 3.40 -> DT O4 B0007 : score 4.65046 : H : ARG NH1 P0519 <- 3.19 -> DG N7 A0008 : score 5.5781 : H : ARG NH2 P0519 <- 3.11 -> DG N7 A0008 : score 5.98877 : H : ARG NH2 P0519 <- 2.26 -> DG O6 A0008 : score 7.3128 : x : ARG xxxx P0507 <- 3.43 -> DC xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx P0515 <- 3.33 -> DT xxx A0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx P0518 <- 4.06 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0522 <- 4.47 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx >1skr_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=T7 DNA POLYMERASE COMPLEXED TO DNA PRIMER/TEMPLATE AND DDATP organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : w : ARG NH1 A0429 <- 5.53 -> DT O2 T0006 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0436 <- 5.69 -> DG N3 T0007 : score 2.566 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.02 -> DC O2 P0020 : score 3.5323 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.03 -> DG N3 T0008 : score 4.74676 : w : HIS NE2 A0653 <- 5.85 -> DA N3 P0021 : score 2.619 : x : LYS xxxx A0394 <- 3.39 -> DC xxx P0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0523 <- 4.24 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0530 <- 3.38 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0536 <- 4.18 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0540 <- 3.53 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0611 <- 4.19 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0615 <- 3.60 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx >1sks_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BINARY 3' COMPLEX OF T7 DNA POLYMERASE WITH A DNA PRIMER/TEMPLATE CONTAINING A CIS-SYN THYMINE DIMER ON THE TEMPLATE organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : LYS NZ A0394 <- 2.83 -> DG N3 P0018 : score 1.44512 : w : LYS NZ A0394 <- 5.74 -> DT O2 P0017 : score 0.522 : w : ARG NH1 A0429 <- 5.85 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0436 <- 5.76 -> DG N3 T0008 : score 2.566 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.18 -> DC O2 P0019 : score 3.41406 : H : GLN NE2 A0439 <- 2.91 -> DC O2 T0009 : score 3.61358 : x : TYR xxxx A0530 <- 3.33 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx >1skw_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BINARY 3' COMPLEX OF T7 DNA POLYMERASE WITH A DNA PRIMER/TEMPLATE CONTAINING A DISORDERED CIS-SYN THYMINE DIMER ON THE TEMPLATE organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : LYS NZ A0394 <- 3.17 -> DG N3 P0018 : score 1.34626 : w : ARG NH1 A0429 <- 5.56 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0436 <- 5.67 -> DG N3 T0008 : score 2.566 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.00 -> DC O2 T0009 : score 3.54708 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.03 -> DC O2 P0019 : score 3.52491 : w : HIS NE2 A0653 <- 5.70 -> DC O2 P0020 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0530 <- 3.42 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0615 <- 3.75 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx >1sl0_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY 3' COMPLEX OF T7 DNA POLYMERASE WITH A DNA PRIMER/TEMPLATE CONTAINING A DISORDERED CIS-SYN THYMINE DIMER ON THE TEMPLATE AND AN INCOMING NUCLEOTIDE organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.08 -> DC O2 P0019 : score 3.48796 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.09 -> DC O2 T0009 : score 3.48057 : x : LYS xxxx A0394 <- 3.54 -> DG xxx P0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0429 <- 4.34 -> DG xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0436 <- 4.23 -> DG xxx T0008 : score x.xxxxx >1sl1_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BINARY 5' COMPLEX OF T7 DNA POLYMERASE WITH A DNA PRIMER/TEMPLATE CONTAINING A CIS-SYN THYMINE DIMER ON THE TEMPLATE organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : LYS NZ A0394 <- 3.18 -> DG N3 P0018 : score 1.34335 : w : ASN ND2 A0436 <- 6.27 -> DG N3 T0008 : score 2.566 : H : GLN NE2 A0439 <- 2.88 -> DC O2 T0009 : score 3.63575 >1sl2_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY 5' COMPLEX OF T7 DNA POLYMERASE WITH A DNA PRIMER/TEMPLATE CONTAINING A CIS-SYN THYMINE DIMER ON THE TEMPLATE AND AN INCOMING NUCLEOTIDE organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : LYS NZ A0394 <- 2.83 -> DC O2 P0019 : score 2.92848 : w : ARG NH1 A0429 <- 5.52 -> DA N3 T0006 : score 2.585 : w : ASN ND2 A0436 <- 5.77 -> DG N3 T0007 : score 2.566 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.16 -> DG N3 T0008 : score 4.61739 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.00 -> DC O2 P0020 : score 3.54708 : w : HIS NE2 A0653 <- 5.60 -> DT O2 P0021 : score 3.682 >1srs_AB:SRF-like; title=SERUM RESPONSE FACTOR (SRF) CORE COMPLEXED WITH SPECIFIC SRE DNA organism=Homo sapiens : H : THR OG1 A0140 <- 3.01 -> DC O2 W-004 : score 2.51536 : H : ARG NH1 A0143 <- 2.93 -> DT O2 C-002 : score 4.19444 : H : THR OG1 B0140 <- 2.83 -> DC O2 C0004 : score 2.60989 : H : LYS NZ B0163 <- 2.99 -> DG N7 W0004 : score 5.18123 : H : LYS NZ B0163 <- 3.13 -> DG O6 W0005 : score 5.39924 : x : LYS xxxx A0163 <- 3.35 -> DG xxx C-005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0143 <- 3.09 -> DT xxx W0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0159 <- 4.40 -> DC xxx W0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0162 <- 3.81 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >1srs_B:SRF-like; title=SERUM RESPONSE FACTOR (SRF) CORE COMPLEXED WITH SPECIFIC SRE DNA organism=Homo sapiens : H : THR OG1 B0140 <- 2.83 -> DC O2 C0004 : score 2.60989 : H : LYS NZ B0163 <- 2.99 -> DG N7 W0004 : score 5.18123 : H : LYS NZ B0163 <- 3.13 -> DG O6 W0005 : score 5.39924 : x : ARG xxxx B0143 <- 3.09 -> DT xxx W0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0159 <- 4.40 -> DC xxx W0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0162 <- 3.81 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >1ssp_E:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=WILD-TYPE URACIL-DNA GLYCOSYLASE BOUND TO URACIL-CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : w : TYR OH E0275 <- 5.23 -> DA N3 B0027 : score 1.448 : x : PRO xxxx E0271 <- 2.91 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0272 <- 3.40 -> DA xxx B0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0276 <- 3.94 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx >1stx_A:Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURE OF THE K38A MUTANT OF ECORV BOUND TO COGNATE DNA AND MN2+ organism=Escherichia coli : w : ASN OD1 A0070 <- 6.03 -> DT O2 C0006 : score 1.953 : w : ASN ND2 A0070 <- 5.79 -> DA N3 C0005 : score 2.277 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.69 -> DA N6 E0005 : score 6.15427 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.74 -> DA N7 E0005 : score 5.94096 : H : THR OG1 A0186 <- 2.68 -> DT O4 D0008 : score 3.98047 : x : THR xxxx A0106 <- 3.50 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.08 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.30 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1stx_AB:Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURE OF THE K38A MUTANT OF ECORV BOUND TO COGNATE DNA AND MN2+ organism=Escherichia coli : w : ASN OD1 A0070 <- 6.03 -> DT O2 C0006 : score 1.953 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.69 -> DA N6 E0005 : score 6.15427 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.74 -> DA N7 E0005 : score 5.94096 : H : THR OG1 A0186 <- 2.68 -> DT O4 D0008 : score 3.98047 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.94 -> DA N6 C0005 : score 5.85318 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.79 -> DA N7 C0005 : score 5.88225 : H : THR OG1 B0186 <- 2.92 -> DT O4 F0008 : score 3.79389 : V : THR CB B0106 <- 3.79 -> DT C7 F0008 : score 3.53497 : x : THR xxxx A0106 <- 3.50 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.08 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.30 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0070 <- 3.61 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.23 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.56 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx >1suz_A:Restriction_endonuclease-like; title=THE STRUCTURE OF K92A ECORV BOUND TO COGNATE DNA AND MG2+ organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 2.73 -> DC O2 D0009 : score 4.5422 : w : ASN OD1 A0070 <- 5.21 -> DT O2 D0008 : score 1.953 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.90 -> DA N6 D0005 : score 5.90136 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.93 -> DA N7 D0005 : score 5.71788 : H : THR OG1 A0186 <- 2.67 -> DT O4 C0008 : score 3.98825 : V : THR CB A0106 <- 3.87 -> DT C7 C0008 : score 3.46445 : x : SER xxxx A0183 <- 3.35 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.44 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >1suz_AB:Restriction_endonuclease-like; title=THE STRUCTURE OF K92A ECORV BOUND TO COGNATE DNA AND MG2+ organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 2.73 -> DC O2 D0009 : score 4.5422 : w : ASN OD1 A0070 <- 5.32 -> DT O2 C0006 : score 1.953 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.90 -> DA N6 D0005 : score 5.90136 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.93 -> DA N7 D0005 : score 5.71788 : H : THR OG1 A0186 <- 2.67 -> DT O4 C0008 : score 3.98825 : H : ASN ND2 B0070 <- 2.99 -> DC O2 C0009 : score 4.30927 : w : ASN ND2 B0120 <- 6.33 -> DT O2 C0010 : score 1.666 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.86 -> DA N6 C0005 : score 5.94953 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.86 -> DA N7 C0005 : score 5.80007 : H : THR OG1 B0186 <- 2.64 -> DT O4 D0008 : score 4.01157 : V : THR CB A0106 <- 3.87 -> DT C7 C0008 : score 3.46445 : x : SER xxxx A0183 <- 3.35 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.44 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.67 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.37 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.40 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1svc_P:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=NFKB P50 HOMODIMER BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 P0063 <- 3.11 -> DC N4 D0013 : score 5.41034 : w : GLU OE2 P0063 <- 6.10 -> DC N4 D0012 : score 3.597 : w : HIS NE2 P0067 <- 5.17 -> DC N4 D0014 : score 3.208 : x : ARG xxxx P0057 <- 3.24 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0059 <- 3.97 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx P0060 <- 3.38 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx P0244 <- 3.27 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0308 <- 3.84 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx >1sx5_A:Restriction_endonuclease-like; title=K38A ECORV BOUND TO CLEAVED DNA AND MN2+: P1 CRYSTAL FORM organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 2.81 -> DC O2 F0009 : score 4.47053 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.94 -> DA N6 E0005 : score 5.85318 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.95 -> DA N7 E0005 : score 5.6944 : H : THR OG1 A0186 <- 3.00 -> DT O4 D0008 : score 3.73169 : w : THR OG1 A0186 <- 5.19 -> DT O4 D0008 : score 2.809 : x : THR xxxx A0106 <- 3.47 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.23 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.31 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1sx5_AB:Restriction_endonuclease-like; title=K38A ECORV BOUND TO CLEAVED DNA AND MN2+: P1 CRYSTAL FORM organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 2.81 -> DC O2 F0009 : score 4.47053 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.94 -> DA N6 E0005 : score 5.85318 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.95 -> DA N7 E0005 : score 5.6944 : H : THR OG1 A0186 <- 3.00 -> DT O4 D0008 : score 3.73169 : w : ASP OD1 B0036 <- 5.96 -> DT O2 C0006 : score 2.105 : H : ASN ND2 B0070 <- 2.94 -> DC O2 D0009 : score 4.35406 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.81 -> DA N6 C0005 : score 6.00975 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.89 -> DA N7 C0005 : score 5.76484 : H : THR OG1 B0186 <- 2.64 -> DT O4 F0008 : score 4.01157 : V : ASN CG B0188 <- 3.58 -> DT C7 F0008 : score 2.79386 : x : THR xxxx A0106 <- 3.47 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.23 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.31 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.64 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.31 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >1sx8_A:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV BOUND TO COGNATE DNA AND MN2+ organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 3.11 -> DC O2 D0009 : score 4.20176 : H : ASN OD1 A0185 <- 3.11 -> DA N6 D0005 : score 5.64844 : H : ASN ND2 A0185 <- 3.17 -> DA N7 D0005 : score 5.43609 : H : THR OG1 A0186 <- 2.62 -> DT O4 C0008 : score 4.02712 : x : THR xxxx A0106 <- 3.37 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.11 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.44 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >1sx8_AB:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV BOUND TO COGNATE DNA AND MN2+ organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 3.11 -> DC O2 D0009 : score 4.20176 : H : ASN OD1 A0185 <- 3.11 -> DA N6 D0005 : score 5.64844 : H : ASN ND2 A0185 <- 3.17 -> DA N7 D0005 : score 5.43609 : H : THR OG1 A0186 <- 2.62 -> DT O4 C0008 : score 4.02712 : H : ASN ND2 B0070 <- 3.03 -> DC O2 C0009 : score 4.27343 : H : ASN OD1 B0185 <- 3.21 -> DA N6 C0005 : score 5.52801 : H : ASN ND2 B0185 <- 3.26 -> DA N7 C0005 : score 5.33043 : H : THR OG1 B0186 <- 2.59 -> DT O4 D0008 : score 4.05044 : V : SER CB B0183 <- 3.81 -> DT C7 D0008 : score 3.12345 : x : THR xxxx A0106 <- 3.37 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.11 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.44 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.65 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.38 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >1sxp_A:UDP-Glycosyltransferase/glycogen_phosphorylase; title=BGT IN COMPLEX WITH A 13MER DNA CONTAINING A CENTRAL A:G MISMATCH organism=Enterobacteria phage T4 : H : ASN OD1 A0070 <- 2.81 -> DG N2 D0020 : score 4.7904 : H : LYS NZ A0075 <- 3.01 -> DA N7 D0021 : score 2.81382 : H : LYS NZ A0075 <- 3.01 -> DA N7 D0021 : score 2.81382 : H : ARG NH1 A0115 <- 2.83 -> DG N7 D0020 : score 6.0137 : H : ARG NH2 A0115 <- 2.72 -> DG O6 D0020 : score 6.7056 : x : ASN xxxx A0010 <- 3.76 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0019 <- 3.85 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0022 <- 3.37 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0066 <- 4.38 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0071 <- 3.93 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0072 <- 3.17 -> DA xxx D0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0099 <- 3.72 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0100 <- 3.87 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0102 <- 3.15 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0103 <- 3.91 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx >1sxp_AB:UDP-Glycosyltransferase/glycogen_phosphorylase; title=BGT IN COMPLEX WITH A 13MER DNA CONTAINING A CENTRAL A:G MISMATCH organism=Enterobacteria phage T4 : H : ASN OD1 A0070 <- 2.81 -> DG N2 D0020 : score 4.7904 : H : LYS NZ A0075 <- 3.01 -> DA N7 D0021 : score 2.81382 : H : LYS NZ A0075 <- 3.01 -> DA N7 D0021 : score 2.81382 : H : ARG NH1 A0115 <- 2.83 -> DG N7 D0020 : score 6.0137 : H : ARG NH2 A0115 <- 2.72 -> DG O6 D0020 : score 6.7056 : x : ASN xxxx A0010 <- 3.76 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0019 <- 3.85 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0022 <- 3.37 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0066 <- 4.38 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0071 <- 3.93 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0072 <- 3.17 -> DA xxx D0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0099 <- 3.72 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0100 <- 3.87 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0102 <- 3.15 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0103 <- 3.91 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0215 <- 3.39 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0217 <- 3.00 -> DC xxx D0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0220 <- 4.47 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >1sxq_A:UDP-Glycosyltransferase/glycogen_phosphorylase; title=BGT IN COMPLEX WITH A 13MER DNA CONTAINING A CENTRAL C:G BASE PAIR AND UDP organism=Enterobacteria phage T4 : H : SER OG A0068 <- 2.88 -> DT O2 C0013 : score 3.63828 : H : SER OG A0068 <- 2.81 -> DT N3 C0013 : score 1.98321 : w : LYS NZ A0075 <- 5.72 -> DA N6 E0015 : score 2.097 : H : TYR OH A0119 <- 2.85 -> DA N6 E0014 : score 4.62381 : V : PHE CD2 A0072 <- 3.73 -> DT C7 C0012 : score 6.62575 : x : ASN xxxx A0070 <- 3.19 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0076 <- 3.65 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0116 <- 4.07 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0117 <- 3.39 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0120 <- 3.87 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0192 <- 3.98 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >1t03_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CROSSLINKED TO TENOFOVIR TERMINATED TEMPLATE-PRIMER (COMPLEX P) organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.76 -> DC O2 P0821 : score 3.52542 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.63 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.05 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.29 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.22 -> DC xxx T0723 : score x.xxxxx >1t03_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CROSSLINKED TO TENOFOVIR TERMINATED TEMPLATE-PRIMER (COMPLEX P) organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.76 -> DC O2 P0821 : score 3.52542 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.63 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.05 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.29 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.22 -> DC xxx T0723 : score x.xxxxx >1t05_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CROSSLINKED TO TEMPLATE-PRIMER WITH TENOFOVIR-DIPHOSPHATE BOUND AS THE INCOMING NUCLEOTIDE SUBSTRATE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.75 -> DC O2 P0821 : score 3.53241 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.57 -> DC O2 T0723 : score 3.8179 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.38 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx >1t2k_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAINS OF IRF3, ATF-2 AND JUN BOUND TO DNA organism=? : w : ARG NH1 A0081 <- 5.65 -> DA N7 E0014 : score 0.388 : w : SER OG A0082 <- 6.17 -> DA N7 E0014 : score 2.343 : V : SER CB A0082 <- 3.62 -> DT C7 F0017 : score 3.27219 : x : LEU xxxx A0042 <- 3.33 -> DT xxx F0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0078 <- 3.35 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0079 <- 4.03 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0086 <- 3.35 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx >1t2k_ABCD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAINS OF IRF3, ATF-2 AND JUN BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : w : ARG NH1 A0081 <- 5.65 -> DA N7 E0014 : score 0.388 : w : SER OG A0082 <- 6.17 -> DA N7 E0014 : score 2.343 : w : HIS NE2 B0040 <- 5.33 -> DT O2 F0017 : score 3.682 : H : ASN OD1 D0344 <- 3.10 -> DC N4 F0027 : score 3.94197 : H : ASN ND2 D0344 <- 3.09 -> DT O4 E0005 : score 4.97811 : H : ARG NH2 D0352 <- 3.08 -> DG N7 F0025 : score 6.02708 : H : ARG NH2 D0352 <- 2.84 -> DG O6 F0025 : score 6.5472 : V : SER CB A0082 <- 3.62 -> DT C7 F0017 : score 3.27219 : V : ALA CB D0348 <- 3.87 -> DT C7 F0026 : score 5.50099 : x : LEU xxxx A0042 <- 3.33 -> DT xxx F0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0078 <- 3.35 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0079 <- 4.03 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0086 <- 3.35 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0042 <- 3.44 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0078 <- 3.19 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0079 <- 4.12 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0081 <- 3.32 -> DG xxx E0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0082 <- 3.87 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0083 <- 4.41 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0086 <- 3.49 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0262 <- 4.43 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0263 <- 4.50 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0266 <- 3.81 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0269 <- 4.16 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0270 <- 2.77 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0345 <- 4.27 -> DT xxx F0026 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0347 <- 4.05 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0351 <- 4.44 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx >1t2t_A:DNA-binding_domain_of_intron-encoded_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA-BINDING DOMAIN OF INTRON ENDONUCLEASE I- TEVI WITH OPERATOR SITE organism=Enterobacteria phage T4 : H : ARG NH1 A0168 <- 2.74 -> DC O2 C0049 : score 3.6938 : H : ARG NH2 A0168 <- 2.97 -> DA N3 C0048 : score 3.12959 : H : ARG NH1 A0170 <- 2.86 -> DT O2 B0005 : score 4.25473 : H : ARG NH2 A0170 <- 2.79 -> DT O2 B0005 : score 4.2418 : w : ARG NH1 A0170 <- 5.11 -> DA N3 B0006 : score 2.585 : H : ASN ND2 A0175 <- 3.31 -> DG N3 B0007 : score 4.3956 : H : SER OG A0176 <- 3.25 -> DA N3 C0048 : score 2.7335 : H : HIS NE2 A0182 <- 3.01 -> DA N3 B0009 : score 4.06782 : H : ASN OD1 A0201 <- 2.94 -> DG N2 C0040 : score 4.6656 : H : ASN ND2 A0201 <- 3.29 -> DC O2 B0014 : score 4.0405 : x : GLN xxxx A0158 <- 3.49 -> DA xxx C0051 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0177 <- 3.59 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0190 <- 3.54 -> DG xxx C0043 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0194 <- 3.62 -> DT xxx B0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0199 <- 3.39 -> DC xxx B0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0225 <- 3.41 -> DT xxx C0034 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0226 <- 4.11 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0228 <- 3.93 -> DT xxx C0033 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0230 <- 3.45 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0231 <- 3.56 -> DT xxx C0033 : score x.xxxxx >1t38_A:Methylated_DNA-protein_cysteine_methyltransferase,_C-terminal_domain;Methylated_DNA-protein_cysteine_methyltransferase_domain; title=HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE BOUND TO DNA CONTAINING O6- METHYLGUANINE organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0128 <- 3.03 -> DG O6 C0019 : score 6.2964 : H : ARG NH2 A0128 <- 3.03 -> DG O6 C0019 : score 6.2964 : x : ALA xxxx A0129 <- 3.86 -> DC xxx C0021 : score x.xxxxx >1t39_B:Methylated_DNA-protein_cysteine_methyltransferase,_C-terminal_domain;Methylated_DNA-protein_cysteine_methyltransferase_domain; title=HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE COVALENTLY CROSSLINKED TO DNA organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx B0128 <- 2.66 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx >1t3n_AB:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF THE CATALYTIC CORE OF DNA POLYMERASE IOTA IN COMPLEX WITH DNA AND DTTP organism=Homo sapiens : w : TYR OH B0459 <- 5.36 -> DG N3 T0006 : score 3.344 : w : GLN NE2 B0479 <- 5.43 -> DG N3 T0006 : score 1.484 : w : GLU OE1 B0725 <- 5.34 -> DG N7 T0007 : score 1.976 : w : GLU OE2 B0725 <- 5.23 -> DG N7 T0007 : score 2.669 : w : GLN NE2 B0781 <- 5.17 -> DA N7 P0007 : score 1.888 : x : LEU xxxx A0123 <- 3.93 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0305 <- 3.67 -> DG xxx P0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 3.63 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0357 <- 3.57 -> DC xxx T0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 2.95 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0482 <- 3.49 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0484 <- 4.48 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0519 <- 4.28 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0721 <- 4.18 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0763 <- 3.13 -> DA xxx P0007 : score x.xxxxx >1t3n_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF THE CATALYTIC CORE OF DNA POLYMERASE IOTA IN COMPLEX WITH DNA AND DTTP organism=Homo sapiens : w : TYR OH B0459 <- 5.36 -> DG N3 T0006 : score 3.344 : w : GLN NE2 B0479 <- 5.43 -> DG N3 T0006 : score 1.484 : w : GLU OE1 B0725 <- 5.34 -> DG N7 T0007 : score 1.976 : w : GLU OE2 B0725 <- 5.23 -> DG N7 T0007 : score 2.669 : w : GLN NE2 B0781 <- 5.17 -> DA N7 P0007 : score 1.888 : x : LEU xxxx B0482 <- 3.49 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0484 <- 4.48 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0519 <- 4.28 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0721 <- 4.18 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0763 <- 3.13 -> DA xxx P0007 : score x.xxxxx >1t7p_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=T7 DNA POLYMERASE COMPLEXED TO DNA PRIMER/TEMPLATE,A NUCLEOSIDE TRIPHOSPHATE, AND ITS PROCESSIVITY FACTOR THIOREDOXIN organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : w : ARG NH1 A0429 <- 5.50 -> DT O2 T0006 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0436 <- 5.89 -> DG N3 T0007 : score 2.566 : H : GLN NE2 A0439 <- 2.90 -> DC O2 P0020 : score 3.62097 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.00 -> DG N3 T0008 : score 4.77662 : w : HIS NE2 A0653 <- 5.66 -> DA N3 P0021 : score 2.619 : x : LYS xxxx A0394 <- 3.16 -> DC xxx P0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0523 <- 3.38 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0530 <- 3.66 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0540 <- 4.32 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0611 <- 4.19 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0615 <- 3.32 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx >1t8e_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=T7 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DCTP AT THE INSERTION SITE. organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : w : ARG NE A0339 <- 5.90 -> DT O2 C1017 : score 0.757 : H : LYS NZ A0394 <- 2.95 -> DC O2 C1019 : score 2.85777 : w : LYS NZ A0394 <- 5.83 -> DC O2 D2009 : score 1.3 : w : ARG NH1 A0429 <- 5.33 -> DT O2 D2006 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0436 <- 5.80 -> DG N3 D2007 : score 2.566 : H : GLN NE2 A0439 <- 2.89 -> DC O2 C1020 : score 3.62836 : H : GLN NE2 A0439 <- 2.82 -> DG N3 D2008 : score 4.95574 : w : HIS NE2 A0653 <- 5.68 -> DA N3 C1021 : score 2.619 : x : THR xxxx A0523 <- 3.72 -> DG xxx D2004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0526 <- 4.25 -> DG xxx D2004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0530 <- 3.46 -> DG xxx D2004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0532 <- 4.07 -> DG xxx D2004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0536 <- 4.47 -> DG xxx D2004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0540 <- 4.03 -> DG xxx D2004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0611 <- 4.00 -> DG xxx D2004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0615 <- 3.53 -> DA xxx D2005 : score x.xxxxx >1t8i_A:Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_N-terminal_DNA-binding_fragment;DNA_breaking-rejoining_enzymes;Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_dispensable_insert_domain; title=HUMAN DNA TOPOISOMERASE I (70 KDA) IN COMPLEX WITH THE POISON CAMPTOTHECIN AND COVALENT COMPLEX WITH A 22 BASE PAIR DNA DUPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0532 <- 2.76 -> DT O2 B0010 : score 3.61588 : x : ASN xxxx A0352 <- 4.04 -> DC xxx D0112 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0356 <- 2.76 -> DC xxx D0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0364 <- 3.51 -> DA xxx D0113 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0425 <- 3.94 -> DA xxx D0113 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0426 <- 3.16 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0428 <- 4.13 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0436 <- 4.30 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0491 <- 3.85 -> DC xxx D0117 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0722 <- 4.18 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx >1t9i_AB:Homing_endonucleases; title=I-CREI(D20N)/DNA COMPLEX organism=Chlamydomonas reinhardtii : w : GLN NE2 A0026 <- 5.64 -> DA N6 C0518 : score 2.804 : H : LYS NZ A0028 <- 3.02 -> DG O6 C0519 : score 5.52642 : w : LYS NZ A0028 <- 5.72 -> DA N6 D0555 : score 2.097 : w : LYS NZ A0028 <- 5.76 -> DA N6 C0518 : score 2.097 : H : ASN ND2 A0030 <- 3.06 -> DT O4 C0521 : score 5.00982 : w : ASN OD1 A0030 <- 6.29 -> DT O4 C0522 : score 3.132 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.18 -> DT O4 C0522 : score 3.275 : w : ASN ND2 A0030 <- 5.87 -> DT O4 C0520 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.18 -> DG N7 D0552 : score 4.14142 : w : SER OG A0032 <- 6.08 -> DT O4 C0522 : score 2.338 : H : TYR OH A0033 <- 2.55 -> DA N7 D0553 : score 4.35885 : H : TYR OH A0033 <- 3.00 -> DA N6 D0553 : score 4.48369 : H : GLN OE1 A0038 <- 2.87 -> DA N6 D0554 : score 5.96783 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.73 -> DA N7 D0554 : score 6.175 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.66 -> DA N6 D0555 : score 3.392 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.63 -> DT O4 C0520 : score 3.068 : w : SER OG A0040 <- 6.20 -> DA N6 D0555 : score 2.209 : w : GLN NE2 A0044 <- 5.74 -> DA N6 C0516 : score 2.804 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.14 -> DG N7 D0558 : score 5.6386 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.91 -> DG O6 D0558 : score 6.4548 : w : ARG NH2 A0068 <- 5.92 -> DA N6 C0516 : score 1.997 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.68 -> DG O6 C0515 : score 6.22933 : H : ARG NH2 A0070 <- 2.91 -> DG N7 C0515 : score 6.24415 : w : SER OG A0072 <- 5.95 -> DG N7 C0513 : score 2.749 : w : THR OG1 A0140 <- 5.25 -> DC O2 C0517 : score 2.048 : w : THR OG1 A0140 <- 5.58 -> DA N3 C0516 : score 2.845 : w : GLN NE2 B0326 <- 5.59 -> DG O6 D0568 : score 2.87 : H : LYS NZ B0328 <- 2.83 -> DT O4 D0569 : score 3.56566 : w : LYS NZ B0328 <- 5.82 -> DA N6 C0505 : score 2.097 : w : LYS NZ B0328 <- 5.85 -> DG O6 D0568 : score 3.005 : w : ASN OD1 B0330 <- 6.36 -> DT O4 D0572 : score 3.132 : w : ASN ND2 B0330 <- 6.24 -> DT O4 D0572 : score 3.275 : w : ASN ND2 B0330 <- 6.06 -> DT O4 D0570 : score 3.275 : H : SER OG B0332 <- 3.20 -> DC N4 C0502 : score 3.38159 : w : SER OG B0332 <- 6.12 -> DT O4 D0572 : score 2.338 : H : TYR OH B0333 <- 2.66 -> DA N7 C0503 : score 4.26752 : H : TYR OH B0333 <- 3.26 -> DA N6 C0503 : score 4.24083 : H : GLN OE1 B0338 <- 3.40 -> DA N6 C0504 : score 5.32626 : H : GLN NE2 B0338 <- 3.04 -> DA N7 C0504 : score 5.79744 : w : GLN OE1 B0338 <- 5.95 -> DA N6 C0505 : score 3.392 : w : GLN OE1 B0338 <- 5.80 -> DT O4 D0570 : score 3.068 : w : SER OG B0340 <- 6.49 -> DA N6 C0505 : score 2.209 : H : GLN NE2 B0344 <- 2.97 -> DA N7 D0566 : score 5.88269 : w : GLN OE1 B0344 <- 5.62 -> DC N4 D0567 : score 3.488 : H : ARG NH1 B0368 <- 2.96 -> DG N7 C0508 : score 5.8564 : H : ARG NH2 B0368 <- 2.73 -> DG O6 C0508 : score 6.6924 : H : ARG NH1 B0370 <- 2.78 -> DG O6 D0565 : score 6.10767 : H : ARG NH2 B0370 <- 3.03 -> DG N7 D0565 : score 6.09092 : w : SER OG B0372 <- 5.42 -> DA N7 D0563 : score 2.343 : w : THR OG1 B0440 <- 5.42 -> DC O2 D0567 : score 2.048 : x : SER xxxx A0022 <- 4.29 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.76 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 4.15 -> DA xxx C0514 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 4.17 -> DC xxx D0556 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.85 -> DA xxx C0514 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 4.05 -> DT xxx D0561 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0322 <- 4.18 -> DA xxx D0566 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0324 <- 3.79 -> DA xxx D0566 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0346 <- 4.23 -> DC xxx D0564 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0366 <- 4.40 -> DA xxx C0505 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0373 <- 3.81 -> DA xxx D0563 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0439 <- 4.25 -> DG xxx D0565 : score x.xxxxx >1t9i_B:Homing_endonucleases; title=I-CREI(D20N)/DNA COMPLEX organism=Chlamydomonas reinhardtii : w : GLN NE2 B0326 <- 5.59 -> DG O6 D0568 : score 2.87 : H : LYS NZ B0328 <- 2.83 -> DT O4 D0569 : score 3.56566 : w : LYS NZ B0328 <- 5.82 -> DA N6 C0505 : score 2.097 : w : LYS NZ B0328 <- 5.85 -> DG O6 D0568 : score 3.005 : w : ASN OD1 B0330 <- 6.36 -> DT O4 D0572 : score 3.132 : w : ASN ND2 B0330 <- 6.24 -> DT O4 D0572 : score 3.275 : w : ASN ND2 B0330 <- 6.06 -> DT O4 D0570 : score 3.275 : H : SER OG B0332 <- 3.20 -> DC N4 C0502 : score 3.38159 : w : SER OG B0332 <- 6.12 -> DT O4 D0572 : score 2.338 : H : TYR OH B0333 <- 2.66 -> DA N7 C0503 : score 4.26752 : H : TYR OH B0333 <- 3.26 -> DA N6 C0503 : score 4.24083 : H : GLN OE1 B0338 <- 3.40 -> DA N6 C0504 : score 5.32626 : H : GLN NE2 B0338 <- 3.04 -> DA N7 C0504 : score 5.79744 : w : GLN OE1 B0338 <- 5.95 -> DA N6 C0505 : score 3.392 : w : GLN OE1 B0338 <- 5.80 -> DT O4 D0570 : score 3.068 : w : SER OG B0340 <- 6.49 -> DA N6 C0505 : score 2.209 : H : GLN NE2 B0344 <- 2.97 -> DA N7 D0566 : score 5.88269 : w : GLN OE1 B0344 <- 5.62 -> DC N4 D0567 : score 3.488 : H : ARG NH1 B0368 <- 2.96 -> DG N7 C0508 : score 5.8564 : H : ARG NH2 B0368 <- 2.73 -> DG O6 C0508 : score 6.6924 : H : ARG NH1 B0370 <- 2.78 -> DG O6 D0565 : score 6.10767 : H : ARG NH2 B0370 <- 3.03 -> DG N7 D0565 : score 6.09092 : w : SER OG B0372 <- 5.42 -> DA N7 D0563 : score 2.343 : w : THR OG1 B0440 <- 5.42 -> DC O2 D0567 : score 2.048 : x : SER xxxx B0322 <- 4.18 -> DA xxx D0566 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0324 <- 3.79 -> DA xxx D0566 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0346 <- 4.23 -> DC xxx D0564 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0366 <- 4.40 -> DA xxx C0505 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0373 <- 3.81 -> DA xxx D0563 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0439 <- 4.25 -> DG xxx D0565 : score x.xxxxx >1t9j_A:Homing_endonucleases; title=I-CREI(Q47E)/DNA COMPLEX organism=Chlamydomonas reinhardtii : w : GLN OE1 A0026 <- 5.52 -> DA N6 C0518 : score 3.392 : H : LYS NZ A0028 <- 2.82 -> DG O6 C0519 : score 5.75765 : w : LYS NZ A0028 <- 5.58 -> DA N6 C0518 : score 2.097 : w : LYS NZ A0028 <- 5.69 -> DA N6 D0555 : score 2.097 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.13 -> DT O4 C0522 : score 3.275 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.05 -> DT O4 C0520 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.08 -> DG N7 D0552 : score 4.23106 : w : SER OG A0032 <- 6.23 -> DT O4 C0522 : score 2.338 : H : TYR OH A0033 <- 2.85 -> DA N7 D0553 : score 4.10977 : H : TYR OH A0033 <- 3.04 -> DA N6 D0553 : score 4.44633 : H : GLN OE1 A0038 <- 2.96 -> DA N6 D0554 : score 5.85888 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.79 -> DA N7 D0554 : score 6.10192 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.95 -> DT O4 C0520 : score 3.068 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.81 -> DA N6 D0555 : score 3.392 : w : SER OG A0040 <- 6.17 -> DA N6 D0555 : score 2.209 : H : GLN NE2 A0044 <- 3.03 -> DA N7 C0516 : score 5.80962 : w : GLN OE1 A0044 <- 5.84 -> DC N4 C0517 : score 3.488 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.25 -> DG N7 D0558 : score 5.5055 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.89 -> DG O6 D0558 : score 6.4812 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.69 -> DG O6 C0515 : score 6.21717 : H : ARG NH2 A0070 <- 3.08 -> DG N7 C0515 : score 6.02708 : w : THR OG1 A0140 <- 5.35 -> DC O2 C0517 : score 2.048 : x : SER xxxx A0022 <- 4.27 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.90 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.57 -> DG xxx C0515 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 4.48 -> DC xxx D0556 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.98 -> DA xxx C0514 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 3.75 -> DT xxx D0561 : score x.xxxxx >1t9j_AB:Homing_endonucleases; title=I-CREI(Q47E)/DNA COMPLEX organism=Chlamydomonas reinhardtii : w : GLN OE1 A0026 <- 5.52 -> DA N6 C0518 : score 3.392 : H : LYS NZ A0028 <- 2.82 -> DG O6 C0519 : score 5.75765 : w : LYS NZ A0028 <- 5.58 -> DA N6 C0518 : score 2.097 : w : LYS NZ A0028 <- 5.69 -> DA N6 D0555 : score 2.097 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.13 -> DT O4 C0522 : score 3.275 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.05 -> DT O4 C0520 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.08 -> DG N7 D0552 : score 4.23106 : w : SER OG A0032 <- 6.23 -> DT O4 C0522 : score 2.338 : H : TYR OH A0033 <- 2.85 -> DA N7 D0553 : score 4.10977 : H : TYR OH A0033 <- 3.04 -> DA N6 D0553 : score 4.44633 : H : GLN OE1 A0038 <- 2.96 -> DA N6 D0554 : score 5.85888 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.79 -> DA N7 D0554 : score 6.10192 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.95 -> DT O4 C0520 : score 3.068 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.81 -> DA N6 D0555 : score 3.392 : w : SER OG A0040 <- 6.17 -> DA N6 D0555 : score 2.209 : H : GLN NE2 A0044 <- 3.03 -> DA N7 C0516 : score 5.80962 : w : GLN OE1 A0044 <- 5.84 -> DC N4 C0517 : score 3.488 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.25 -> DG N7 D0558 : score 5.5055 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.89 -> DG O6 D0558 : score 6.4812 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.69 -> DG O6 C0515 : score 6.21717 : H : ARG NH2 A0070 <- 3.08 -> DG N7 C0515 : score 6.02708 : w : THR OG1 A0140 <- 5.35 -> DC O2 C0517 : score 2.048 : w : GLN OE1 B0326 <- 5.58 -> DG O6 D0568 : score 2.87 : H : LYS NZ B0328 <- 2.97 -> DT O4 D0569 : score 3.46522 : w : LYS NZ B0328 <- 5.86 -> DA N6 C0505 : score 2.097 : w : LYS NZ B0328 <- 5.94 -> DG O6 D0568 : score 3.005 : w : ASN ND2 B0330 <- 6.13 -> DT O4 D0570 : score 3.275 : H : TYR OH B0333 <- 2.42 -> DA N7 C0503 : score 4.46678 : H : TYR OH B0333 <- 3.07 -> DA N6 C0503 : score 4.41831 : H : GLN OE1 B0338 <- 3.03 -> DA N6 C0504 : score 5.77415 : H : GLN NE2 B0338 <- 2.82 -> DA N7 C0504 : score 6.06538 : w : GLN OE1 B0338 <- 6.24 -> DA N6 C0505 : score 3.392 : w : GLN OE1 B0338 <- 5.78 -> DT O4 D0570 : score 3.068 : w : SER OG B0340 <- 6.43 -> DA N6 C0505 : score 2.209 : H : GLN NE2 B0344 <- 2.94 -> DA N7 D0566 : score 5.91923 : w : GLN OE1 B0344 <- 5.66 -> DC N4 D0567 : score 3.488 : H : ARG NH1 B0368 <- 3.10 -> DG N7 C0508 : score 5.687 : H : ARG NH2 B0368 <- 2.59 -> DG O6 C0508 : score 6.8772 : H : ARG NH1 B0370 <- 2.67 -> DG O6 D0565 : score 6.2415 : H : ARG NH2 B0370 <- 2.88 -> DG N7 D0565 : score 6.28246 : w : THR OG1 B0440 <- 5.35 -> DC O2 D0567 : score 2.048 : x : SER xxxx A0022 <- 4.27 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.90 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.57 -> DG xxx C0515 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 4.48 -> DC xxx D0556 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.98 -> DA xxx C0514 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 3.75 -> DT xxx D0561 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0322 <- 4.14 -> DA xxx D0566 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0324 <- 3.75 -> DA xxx D0566 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0332 <- 3.55 -> DC xxx C0502 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0346 <- 3.70 -> DG xxx D0565 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0366 <- 4.43 -> DA xxx C0505 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0373 <- 4.02 -> DC xxx D0564 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0439 <- 4.14 -> DG xxx C0511 : score x.xxxxx >1tau_A:DNA/RNA_polymerases;PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain;Ribonuclease_H-like; title=TAQ POLYMERASE (E.C.2.7.7.7)/DNA/B-OCTYLGLUCOSIDE COMPLEX organism=Thermus aquaticus : H : ASN ND2 A0583 <- 2.66 -> DC O2 P0953 : score 4.60491 : H : ARG NH2 A0677 <- 2.60 -> DG N7 T0901 : score 6.64 : H : GLN NE2 A0754 <- 3.39 -> DC O2 P0951 : score 3.25888 : x : ASN xxxx A0580 <- 4.41 -> DA xxx T0904 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0667 <- 3.55 -> DC xxx P0951 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0671 <- 3.36 -> DG xxx T0901 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0746 <- 2.98 -> DG xxx T0901 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0750 <- 4.10 -> DG xxx T0901 : score x.xxxxx >1tc3_C:Homeodomain-like; title=TRANSPOSASE TC3A1-65 FROM CAENORHABDITIS ELEGANS organism=Caenorhabditis elegans : H : ARG NE C0203 <- 3.01 -> DT O2 A0012 : score 2.46869 : H : ARG NH2 C0203 <- 3.14 -> DT O2 A0012 : score 3.94547 : H : HIS NE2 C0226 <- 2.87 -> DG N7 A0007 : score 6.70733 : H : ARG NH1 C0236 <- 2.76 -> DG N7 A0008 : score 6.0984 : H : ARG NH2 C0236 <- 3.08 -> DG N7 A0008 : score 6.02708 : H : ARG NH2 C0236 <- 2.65 -> DG O6 A0008 : score 6.798 : H : HIS ND1 C0237 <- 2.89 -> DG N7 B0110 : score 6.11106 : H : HIS ND1 C0237 <- 2.77 -> DG O6 B0110 : score 6.26042 : H : HIS ND1 C0237 <- 2.72 -> DG O6 B0111 : score 6.32265 : w : ARG NH1 C0240 <- 5.15 -> DT O4 A0009 : score 1.768 : x : PRO xxxx C0202 <- 2.76 -> DT xxx B0108 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0235 <- 4.07 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx >1tdz_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE COMPLEX BETWEEN THE LACTOCOCCUS LACTIS FPG (MUTM) AND A FAPY-DG CONTAINING DNA organism=Lactococcus lactis : H : ARG NH1 A0074 <- 2.88 -> DT O2 B0008 : score 4.23751 : w : ARG NH1 A0074 <- 6.22 -> DT O2 B0009 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0074 <- 6.03 -> DT O2 B0009 : score 2.261 : w : GLU OE2 A0076 <- 5.82 -> DT O2 B0006 : score 2.279 : H : ARG NE A0109 <- 2.77 -> DC O2 C0023 : score 2.67493 : H : ARG NH2 A0109 <- 3.08 -> DC N3 C0023 : score 2.16273 : w : ARG NH1 A0109 <- 6.11 -> DT O2 B0006 : score 1.855 : x : MET xxxx A0075 <- 3.56 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.39 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.57 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >1tez_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=COMPLEX BETWEEN DNA AND THE DNA PHOTOLYASE FROM ANACYSTIS NIDULANS organism=SYNECHOCOCCUS ELONGATUS : w : GLU OE2 A0283 <- 6.65 -> DT O2 I0007 : score 2.279 : x : ARG xxxx A0232 <- 3.53 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0286 <- 3.20 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0290 <- 3.74 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0402 <- 3.16 -> DA xxx J0009 : score x.xxxxx >1tf3_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=TFIIIA FINGER 1-3 BOUND TO DNA, NMR, 22 STRUCTURES organism=XENOPUS LAEVIS : H : HIS NE2 A0059 <- 2.86 -> DG O6 E0008 : score 7.8584 : H : HIS NE2 A0059 <- 2.81 -> DG O6 E0009 : score 7.93794 : H : ARG NH1 A0062 <- 2.76 -> DG O6 E0007 : score 6.132 : H : ARG NH2 A0062 <- 2.75 -> DG N7 E0007 : score 6.44846 : H : ASN OD1 A0089 <- 2.86 -> DA N6 E0005 : score 5.94953 : H : ASN ND2 A0089 <- 2.83 -> DA N7 E0005 : score 5.83529 : H : ARG NH1 A0096 <- 2.89 -> DG N7 E0003 : score 5.9411 >1tf6_A:C2H2_and_C2HC_zinc_fingers; title=CO-CRYSTAL STRUCTURE OF XENOPUS TFIIIA ZINC FINGER DOMAIN BOUND TO THE 5S RIBOSOMAL RNA GENE INTERNAL CONTROL REGION organism=Xenopus laevis : H : LYS NZ A0026 <- 2.82 -> DG N7 C0035 : score 5.36435 : H : LYS NZ A0026 <- 2.61 -> DG O6 C0035 : score 6.00044 : H : HIS NE2 A0059 <- 3.27 -> DG O6 B0025 : score 7.20618 : H : ARG NH1 A0062 <- 2.93 -> DG O6 B0024 : score 5.92517 : H : ARG NH2 A0062 <- 3.29 -> DG O6 B0024 : score 5.9532 : H : ASN OD1 A0089 <- 3.04 -> DA N6 B0022 : score 5.73275 : H : LYS NZ A0092 <- 2.98 -> DT O4 C0043 : score 3.45804 : H : LYS NZ A0092 <- 2.71 -> DG O6 B0021 : score 5.88482 : H : ARG NH2 A0151 <- 2.93 -> DG N7 B0010 : score 6.21862 : H : ARG NH2 A0151 <- 2.99 -> DG O6 B0010 : score 6.3492 : H : ARG NH2 A0151 <- 3.13 -> DT O4 B0011 : score 3.31929 : H : ARG NH1 A0154 <- 3.35 -> DG O6 B0009 : score 5.41417 : H : ARG NH2 A0154 <- 3.18 -> DG N7 B0009 : score 5.89938 : V : HIS CB A0058 <- 3.81 -> DT C7 C0038 : score 4.11482 >1tgh_A:TATA-box_binding_protein-like; title=TATA BINDING PROTEIN (TBP)/DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 A0163 <- 2.89 -> DA N3 C0118 : score 3.73915 : H : ASN ND2 A0163 <- 3.16 -> DT O2 C0119 : score 4.40443 : H : ASN ND2 A0253 <- 3.21 -> DA N3 B0106 : score 3.49546 : H : ASN ND2 A0253 <- 2.58 -> DT O2 B0107 : score 4.95498 : H : THR OG1 A0309 <- 2.88 -> DA N3 B0106 : score 1.33218 : x : VAL xxxx A0165 <- 3.49 -> DT xxx B0107 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0193 <- 3.00 -> DA xxx C0116 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0208 <- 2.98 -> DT xxx C0117 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0210 <- 3.40 -> DT xxx B0109 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0216 <- 3.51 -> DA xxx B0108 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0218 <- 3.43 -> DT xxx C0117 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0255 <- 3.30 -> DT xxx C0119 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0284 <- 3.18 -> DA xxx B0104 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0285 <- 3.15 -> DA xxx C0122 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0299 <- 2.96 -> DT xxx B0105 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0301 <- 2.89 -> DT xxx C0121 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0307 <- 3.12 -> DA xxx C0120 : score x.xxxxx >1tk0_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=T7 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH 8 OXO GUANOSINE AND DDCTP AT THE INSERTION SITE organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : LYS NZ A0394 <- 3.06 -> DC O2 P0819 : score 2.79295 : w : ARG NH1 A0429 <- 5.35 -> DT O2 T0856 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0436 <- 5.86 -> DG N3 T0857 : score 2.566 : H : GLN NE2 A0439 <- 2.84 -> DC O2 P0820 : score 3.66531 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.06 -> DG N3 T0858 : score 4.71691 : w : HIS NE2 A0653 <- 5.81 -> DA N3 P0821 : score 2.619 : x : ASN xxxx A0611 <- 3.89 -> DC xxx T0855 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0615 <- 3.39 -> DC xxx T0855 : score x.xxxxx >1tk5_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=T7 DNA POLYMERASE BINARY COMPLEX WITH 8 OXO GUANOSINE IN THE TEMPLATING STRAND organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : LYS NZ A0394 <- 2.83 -> DC O2 P0819 : score 2.92848 : w : ARG NH1 A0429 <- 5.52 -> DT O2 T0856 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0436 <- 5.78 -> DG N3 T0857 : score 2.566 : H : GLN NE2 A0439 <- 2.95 -> DG N3 T0858 : score 4.82637 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.05 -> DC O2 P0820 : score 3.51013 : w : HIS NE2 A0653 <- 5.76 -> DA N3 P0821 : score 2.619 : x : TYR xxxx A0530 <- 3.36 -> DC xxx T0855 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0615 <- 3.67 -> DC xxx T0855 : score x.xxxxx >1tk8_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=T7 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH 8 OXO GUANOSINE AND DAMP AT THE ELONGATION SITE organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : LYS NZ A0394 <- 2.78 -> DC O2 P0819 : score 2.95794 : w : LYS NZ A0394 <- 5.95 -> DG N3 P0818 : score 2.232 : w : LYS NZ A0394 <- 6.08 -> DC O2 T0859 : score 1.3 : w : ARG NH1 A0429 <- 5.59 -> DT O2 T0856 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0436 <- 5.67 -> DG N3 T0857 : score 2.566 : H : GLN NE2 A0439 <- 2.75 -> DC O2 P0820 : score 3.73182 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.00 -> DG N3 T0858 : score 4.77662 : w : HIS NE2 A0653 <- 5.78 -> DA N3 P0821 : score 2.619 : x : ARG xxxx A0111 <- 4.43 -> DC xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0615 <- 4.41 -> DT xxx T0856 : score x.xxxxx >1tkd_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=T7 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH 8 OXO GUANOSINE AND DCMP AT THE ELONGATION SITE organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : LYS NZ A0394 <- 2.89 -> DC O2 P0819 : score 2.89312 : w : LYS NZ A0394 <- 5.96 -> DG N3 P0818 : score 2.232 : w : LYS NZ A0394 <- 6.44 -> DC O2 T0859 : score 1.3 : w : ARG NH1 A0429 <- 5.38 -> DT O2 T0856 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0436 <- 5.60 -> DG N3 T0857 : score 2.566 : H : GLN NE2 A0439 <- 2.99 -> DG N3 T0858 : score 4.78657 : H : GLN NE2 A0439 <- 2.84 -> DC O2 P0820 : score 3.66531 : w : HIS NE2 A0653 <- 5.67 -> DA N3 P0821 : score 2.619 : x : ARG xxxx A0111 <- 4.23 -> DC xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0615 <- 4.44 -> DT xxx T0856 : score x.xxxxx >1tl8_A:Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_N-terminal_DNA-binding_fragment;DNA_breaking-rejoining_enzymes;Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_dispensable_insert_domain; title=HUMAN DNA TOPOISOMERASE I (70 KDA) IN COMPLEX WITH THE INDENOISOQUINOLINE AI-III-52 AND COVALENT COMPLEX WITH A 22 BASE PAIR DNA DUPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0532 <- 3.00 -> DT O2 B0010 : score 3.44369 : x : GLU xxxx A0356 <- 3.56 -> DG xxx D0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0364 <- 3.01 -> DG xxx D0112 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0424 <- 3.84 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0426 <- 3.01 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0428 <- 4.17 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0436 <- 4.00 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0491 <- 3.68 -> DC xxx D0117 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0722 <- 3.99 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx >1tn9_A:DNA-binding_domain; title=THE SOLUTION STRUCTURE OF TN916 INTEGRASE N-TERMINAL DOMAIN/DNA COMPLEX organism=ENTEROCOCCUS FAECALIS : H : ARG NH2 A0020 <- 2.52 -> DA N7 B0105 : score 1.76542 : H : ARG NH2 A0020 <- 3.28 -> DG N7 B0106 : score 5.77169 : H : TYR OH A0040 <- 2.87 -> DA N7 C0120 : score 4.09316 : V : LYS CE A0028 <- 3.77 -> DT C7 C0122 : score 2.62053 : x : LYS xxxx A0021 <- 4.31 -> DA xxx B0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0024 <- 2.93 -> DT xxx C0119 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0026 <- 3.96 -> DT xxx B0104 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0030 <- 4.15 -> DG xxx B0101 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0036 <- 4.21 -> DT xxx C0122 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0038 <- 2.83 -> DC xxx C0121 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0055 <- 3.95 -> DT xxx B0111 : score x.xxxxx >1tqe_PQ:SRF-like; title=MECHANISM OF RECRUITMENT OF CLASS II HISTONE DEACETYLASES BY MYOCYTE ENHANCER FACTOR-2 organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ P0023 <- 2.90 -> DA N7 C0013 : score 2.87844 : H : ARG NE Q0003 <- 2.93 -> DT O2 C0006 : score 2.50992 : H : LYS NZ Q0023 <- 2.78 -> DG O6 D0014 : score 5.80389 : x : ARG xxxx P0003 <- 3.21 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx >1tqe_RS:SRF-like; title=MECHANISM OF RECRUITMENT OF CLASS II HISTONE DEACETYLASES BY MYOCYTE ENHANCER FACTOR-2 organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ R0023 <- 2.88 -> DA N7 E0013 : score 2.89018 : H : ARG NE S0003 <- 2.90 -> DT O2 E0006 : score 2.52538 : H : LYS NZ S0023 <- 2.74 -> DG O6 F0014 : score 5.85014 : x : ARG xxxx R0003 <- 3.28 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx >1tqe_S:SRF-like; title=MECHANISM OF RECRUITMENT OF CLASS II HISTONE DEACETYLASES BY MYOCYTE ENHANCER FACTOR-2 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE S0003 <- 2.90 -> DT O2 E0006 : score 2.52538 : H : LYS NZ S0023 <- 2.74 -> DG O6 F0014 : score 5.85014 >1tro_AG:TrpR-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TRP REPRESSOR OPERATOR COMPLEX AT ATOMIC RESOLUTION organism=ESCHERICHIA COLI STR. K12 SUBSTR. : H : ARG NH1 A0069 <- 2.93 -> DG N7 I0002 : score 5.8927 : H : ARG NH2 A0069 <- 2.99 -> DG O6 I0002 : score 6.3492 : w : LYS NZ A0072 <- 6.04 -> DG N7 J0016 : score 2.519 : w : THR OG1 A0083 <- 5.82 -> DA N6 I0004 : score 3.251 : H : ARG NH2 G0069 <- 2.68 -> DG N7 L0002 : score 6.53785 : H : ARG NH2 G0069 <- 3.31 -> DG O6 L0002 : score 5.9268 : w : LYS NZ G0072 <- 5.90 -> DG N7 K0016 : score 2.519 : w : THR OG1 G0083 <- 5.73 -> DA N6 L0004 : score 3.251 : V : ILE CG1 G0079 <- 3.76 -> DT C7 L0003 : score 5.00856 : V : ILE CG1 A0079 <- 3.69 -> DT C7 I0003 : score 5.09535 : x : GLN xxxx A0068 <- 3.53 -> DT xxx I0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0080 <- 3.87 -> DC xxx I0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0081 <- 3.25 -> DT xxx J0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0068 <- 3.66 -> DT xxx L0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0080 <- 3.79 -> DC xxx L0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0081 <- 3.16 -> DT xxx K0014 : score x.xxxxx >1tro_C:TrpR-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TRP REPRESSOR OPERATOR COMPLEX AT ATOMIC RESOLUTION organism=? : H : ARG NH1 C0069 <- 2.87 -> DG N7 J0002 : score 5.9653 : H : ARG NH2 C0069 <- 2.96 -> DG O6 J0002 : score 6.3888 : w : LYS NZ C0072 <- 6.03 -> DG N7 I0016 : score 2.519 : w : THR OG1 C0083 <- 5.82 -> DA N6 J0004 : score 3.251 : V : ILE CG1 C0079 <- 3.56 -> DT C7 J0003 : score 5.25651 : x : GLN xxxx C0068 <- 3.76 -> DT xxx J0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0080 <- 3.88 -> DC xxx J0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0081 <- 3.31 -> DT xxx I0014 : score x.xxxxx >1trr_A:TrpR-like; title=TANDEM BINDING IN CRYSTALS OF A TRP REPRESSOR/OPERATOR HALF-SITE COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : V : ILE CG1 A0079 <- 3.60 -> DT C7 I0006 : score 5.20692 : V : ALA CB A0080 <- 3.51 -> DT C7 C0009 : score 6.0049 : x : ALA xxxx A0002 <- 2.70 -> DG xxx I0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0068 <- 3.21 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0069 <- 3.13 -> DC xxx I0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0081 <- 3.41 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0083 <- 3.97 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0084 <- 4.37 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx >1trr_AB:TrpR-like; title=TANDEM BINDING IN CRYSTALS OF A TRP REPRESSOR/OPERATOR HALF-SITE COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : V : ALA CB A0080 <- 3.51 -> DT C7 C0009 : score 6.0049 : V : ILE CG1 A0079 <- 3.60 -> DT C7 I0006 : score 5.20692 : V : ALA CB B0080 <- 3.59 -> DT C7 I0017 : score 5.89292 : x : ALA xxxx A0002 <- 2.70 -> DG xxx I0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0068 <- 3.21 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0069 <- 3.13 -> DC xxx I0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0081 <- 3.41 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0083 <- 3.97 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0084 <- 4.37 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0081 <- 3.05 -> DT xxx I0017 : score x.xxxxx >1trr_DEGH:TrpR-like; title=TANDEM BINDING IN CRYSTALS OF A TRP REPRESSOR/OPERATOR HALF-SITE COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : w : THR OG1 D0083 <- 5.99 -> DA N6 L0007 : score 3.251 : H : ARG NH1 E0069 <- 2.29 -> DA N7 C0013 : score 2.8214 : w : THR OG1 E0083 <- 5.76 -> DC N4 C0016 : score 2.558 : w : THR OG1 G0083 <- 5.88 -> DC N4 C0008 : score 2.558 : V : ALA CB G0080 <- 3.58 -> DT C7 I0009 : score 5.90692 : V : ILE CG1 D0079 <- 3.60 -> DT C7 L0006 : score 5.20692 : V : ALA CB E0080 <- 3.77 -> DT C7 L0017 : score 5.64097 : V : ALA CB H0080 <- 3.56 -> DT C7 C0017 : score 5.93491 : V : ALA CB D0080 <- 3.53 -> DT C7 F0009 : score 5.97691 : x : ALA xxxx D0002 <- 2.70 -> DG xxx L0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0068 <- 3.18 -> DT xxx L0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0069 <- 3.08 -> DC xxx L0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0081 <- 3.41 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0084 <- 4.39 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0068 <- 4.35 -> DC xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0072 <- 4.49 -> DG xxx I0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E0079 <- 2.81 -> DG xxx I0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0081 <- 3.03 -> DT xxx L0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0002 <- 2.87 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0068 <- 3.35 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0069 <- 2.99 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0079 <- 2.83 -> DG xxx I0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0081 <- 3.47 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0084 <- 4.38 -> DA xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0069 <- 2.14 -> DA xxx L0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0072 <- 4.42 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0079 <- 2.91 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0081 <- 3.22 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx >1trr_JK:TrpR-like; title=TANDEM BINDING IN CRYSTALS OF A TRP REPRESSOR/OPERATOR HALF-SITE COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : w : THR OG1 J0083 <- 5.64 -> DA N7 F0007 : score 2.152 : V : ALA CB K0080 <- 3.55 -> DT C7 F0017 : score 5.94891 : V : ALA CB J0080 <- 3.59 -> DT C7 L0009 : score 5.89292 : x : ALA xxxx J0002 <- 2.88 -> DG xxx F0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx J0068 <- 3.54 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0069 <- 2.94 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J0079 <- 2.91 -> DG xxx L0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0081 <- 3.48 -> DT xxx L0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0084 <- 4.48 -> DA xxx L0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx K0081 <- 3.25 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx >1tsr_B:p53-like_transcription_factors; title=P53 CORE DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0120 <- 2.67 -> DG N7 F0008 : score 5.52593 : H : LYS NZ B0120 <- 2.41 -> DG O6 F0008 : score 6.23167 : w : ARG NH2 B0248 <- 5.31 -> DG N2 F0013 : score 1.593 : H : CYS SG B0277 <- 3.24 -> DC N4 E0014 : score -3.16628 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.82 -> DG O6 E0013 : score 6.059 : H : ARG NH2 B0280 <- 2.83 -> DG N7 E0013 : score 6.34631 : x : ALA xxxx B0276 <- 4.41 -> DC xxx E0014 : score x.xxxxx >1tsr_BC: title=P53 CORE DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0120 <- 2.67 -> DG N7 F0008 : score 5.52593 : H : LYS NZ B0120 <- 2.41 -> DG O6 F0008 : score 6.23167 : w : ARG NH2 B0248 <- 5.31 -> DG N2 F0013 : score 1.593 : H : CYS SG B0277 <- 3.24 -> DC N4 E0014 : score -3.16628 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.82 -> DG O6 E0013 : score 6.059 : H : ARG NH2 B0280 <- 2.83 -> DG N7 E0013 : score 6.34631 : x : ALA xxxx B0276 <- 4.41 -> DC xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0280 <- 4.41 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx >1ttu_A:DNA-binding_protein_LAG-1_CSL;p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CSL BOUND TO DNA organism=Caenorhabditis elegans : H : ARG NH1 A0234 <- 2.75 -> DG O6 B0008 : score 6.14417 : H : ARG NH2 A0234 <- 2.95 -> DG N7 B0008 : score 6.19308 : H : LYS NZ A0368 <- 2.82 -> DT O4 C0007 : score 3.57283 : H : LYS NZ A0368 <- 2.43 -> DG O6 B0010 : score 6.20855 : H : GLN NE2 A0401 <- 3.14 -> DA N3 C0013 : score 3.75309 : x : TYR xxxx A0229 <- 3.45 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0232 <- 3.68 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0367 <- 3.84 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0400 <- 3.99 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx >1tup_B:p53-like_transcription_factors; title=TUMOR SUPPRESSOR P53 COMPLEXED WITH DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0120 <- 2.64 -> DG N7 F1108 : score 5.55825 : H : LYS NZ B0120 <- 2.38 -> DG O6 F1108 : score 6.26635 : w : ARG NH1 B0248 <- 5.69 -> DT O2 E1011 : score 1.855 : w : ARG NH2 B0248 <- 6.46 -> DT O2 E1011 : score 2.261 : H : CYS SG B0277 <- 3.24 -> DC N4 E1014 : score -3.16628 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.82 -> DG O6 E1013 : score 6.059 : H : ARG NH2 B0280 <- 2.83 -> DG N7 E1013 : score 6.34631 : x : ALA xxxx B0276 <- 4.41 -> DC xxx E1014 : score x.xxxxx >1tup_BC: title=TUMOR SUPPRESSOR P53 COMPLEXED WITH DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0120 <- 2.64 -> DG N7 F1108 : score 5.55825 : H : LYS NZ B0120 <- 2.38 -> DG O6 F1108 : score 6.26635 : w : ARG NH1 B0248 <- 5.69 -> DT O2 E1011 : score 1.855 : w : ARG NH2 B0248 <- 6.46 -> DT O2 E1011 : score 2.261 : H : CYS SG B0277 <- 3.24 -> DC N4 E1014 : score -3.16628 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.82 -> DG O6 E1013 : score 6.059 : H : ARG NH2 B0280 <- 2.83 -> DG N7 E1013 : score 6.34631 : x : ALA xxxx B0276 <- 4.41 -> DC xxx E1014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0280 <- 4.38 -> DG xxx F1119 : score x.xxxxx >1tv9_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH NICKED DNA CONTAINING A MISMATCHED TEMPLATE ADENINE AND INCOMING CYTIDINE organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 6.43 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.77 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : TYR OH A0271 <- 6.36 -> DC O2 P0010 : score 1.343 >1tva_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH NICKED DNA CONTAINING A MISMATCHED TEMPLATE THYMIDINE AND INCOMING CYTIDINE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.39 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.65 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.34 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >1tw8_ABCD:Restriction_endonuclease-like; title=HINCII BOUND TO CA2+ AND COGNATE DNA GTCGAC organism=Haemophilus influenzae : w : GLN NE2 A0138 <- 5.80 -> DC O2 F0011 : score 2.699 : H : ASN OD1 A0141 <- 2.80 -> DA N6 F0009 : score 6.02179 : w : ASN ND2 A0141 <- 6.25 -> DT O4 E0006 : score 3.275 : H : ASN ND2 A0201 <- 2.86 -> DG N7 E0005 : score 4.53087 : H : GLN NE2 A0209 <- 2.89 -> DG O6 E0005 : score 5.70064 : H : GLN NE2 B0109 <- 3.32 -> DC O2 E0007 : score 3.31061 : H : ASN OD1 B0141 <- 2.78 -> DA N6 E0009 : score 6.04588 : w : ASN ND2 B0141 <- 5.63 -> DG O6 E0008 : score 2.971 : H : ASN ND2 B0201 <- 2.78 -> DG N7 F0005 : score 4.60424 : H : GLN NE2 B0209 <- 2.97 -> DG O6 F0005 : score 5.60775 : w : LYS NZ C0108 <- 6.30 -> DC O2 G0011 : score 1.3 : H : GLN NE2 C0109 <- 2.92 -> DC O2 H0007 : score 3.60619 : H : GLN NE2 C0138 <- 2.78 -> DG O6 G0005 : score 5.82835 : H : ASN ND2 C0141 <- 2.73 -> DG N7 H0008 : score 4.6501 : H : ASN ND2 C0201 <- 3.08 -> DG N7 G0005 : score 4.32909 : H : GLN NE2 C0209 <- 2.74 -> DG O6 G0005 : score 5.87479 : H : ASN ND2 D0141 <- 2.77 -> DG N7 G0008 : score 4.61341 : H : ASN ND2 D0201 <- 2.99 -> DG N7 H0005 : score 4.41163 : H : GLN NE2 D0209 <- 3.07 -> DG O6 H0005 : score 5.49165 : V : ALA CB A0205 <- 3.82 -> DT C7 F0006 : score 5.57098 : V : ALA CB C0205 <- 3.68 -> DT C7 H0006 : score 5.76694 : x : HIS xxxx A0031 <- 3.09 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0109 <- 2.99 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0110 <- 4.45 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0136 <- 4.33 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 4.32 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.35 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.21 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.65 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 4.36 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0031 <- 3.12 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0136 <- 4.25 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0138 <- 3.00 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.85 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.27 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.08 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.35 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0205 <- 3.88 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 4.26 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0031 <- 3.24 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0136 <- 4.28 -> DC xxx H0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0140 <- 3.73 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0199 <- 3.60 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0203 <- 4.33 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0204 <- 3.13 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0207 <- 4.47 -> DC xxx H0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0031 <- 2.88 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0109 <- 3.19 -> DC xxx G0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0138 <- 3.30 -> DG xxx H0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0140 <- 3.72 -> DA xxx G0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0199 <- 2.88 -> DG xxx H0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0203 <- 3.76 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0204 <- 3.11 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0205 <- 3.81 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0207 <- 4.30 -> DC xxx G0007 : score x.xxxxx >1tw8_B:Restriction_endonuclease-like; title=HINCII BOUND TO CA2+ AND COGNATE DNA GTCGAC organism=Haemophilus influenzae : H : GLN NE2 B0109 <- 3.32 -> DC O2 E0007 : score 3.31061 : w : ASN ND2 B0110 <- 5.85 -> DG N3 E0005 : score 2.566 : H : ASN OD1 B0141 <- 2.78 -> DA N6 E0009 : score 6.04588 : w : ASN ND2 B0141 <- 5.63 -> DG O6 E0008 : score 2.971 : H : ASN ND2 B0201 <- 2.78 -> DG N7 F0005 : score 4.60424 : H : GLN NE2 B0209 <- 2.97 -> DG O6 F0005 : score 5.60775 : x : HIS xxxx B0031 <- 3.12 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0136 <- 4.25 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0138 <- 3.00 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.85 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.27 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.08 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.35 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0205 <- 3.88 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 4.26 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx >1tx3_A:Restriction_endonuclease-like; title=HINCII BOUND TO COGNATE DNA organism=Haemophilus influenzae : H : GLN NE2 A0109 <- 2.94 -> DC O2 F0007 : score 3.59142 : w : ASN ND2 A0110 <- 6.39 -> DG N3 F0005 : score 2.566 : H : GLN NE2 A0138 <- 2.98 -> DG O6 E0005 : score 5.59614 : w : GLN OE1 A0138 <- 6.37 -> DC O2 F0011 : score 1.091 : H : ASN OD1 A0141 <- 3.07 -> DA N6 F0009 : score 5.69662 : H : ASN ND2 A0141 <- 2.99 -> DG N7 F0008 : score 4.41163 : w : ASN ND2 A0141 <- 6.12 -> DT O4 E0006 : score 3.275 : H : ASN ND2 A0201 <- 2.81 -> DG N7 E0005 : score 4.57673 : H : GLN NE2 A0209 <- 2.97 -> DG O6 E0005 : score 5.60775 : V : ALA CB A0205 <- 3.52 -> DT C7 F0006 : score 5.9909 : x : ALA xxxx A0137 <- 4.36 -> DC xxx F0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.56 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.33 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.18 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.61 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 4.30 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx >1tx3_ABCD:Restriction_endonuclease-like; title=HINCII BOUND TO COGNATE DNA organism=Haemophilus influenzae : H : GLN NE2 A0109 <- 2.94 -> DC O2 F0007 : score 3.59142 : H : GLN NE2 A0138 <- 2.98 -> DG O6 E0005 : score 5.59614 : w : GLN OE1 A0138 <- 6.37 -> DC O2 F0011 : score 1.091 : H : ASN OD1 A0141 <- 3.07 -> DA N6 F0009 : score 5.69662 : H : ASN ND2 A0141 <- 2.99 -> DG N7 F0008 : score 4.41163 : w : ASN ND2 A0141 <- 6.12 -> DT O4 E0006 : score 3.275 : H : ASN ND2 A0201 <- 2.81 -> DG N7 E0005 : score 4.57673 : H : GLN NE2 A0209 <- 2.97 -> DG O6 E0005 : score 5.60775 : H : GLN NE2 B0109 <- 3.18 -> DC O2 E0007 : score 3.41406 : w : GLN OE1 B0138 <- 5.88 -> DC O2 E0011 : score 1.091 : H : ASN OD1 B0141 <- 3.05 -> DA N6 E0009 : score 5.72071 : H : ASN ND2 B0141 <- 3.14 -> DG N7 E0008 : score 4.27406 : H : ASN ND2 B0201 <- 2.99 -> DG N7 F0005 : score 4.41163 : H : GLN NE2 B0209 <- 3.28 -> DG O6 F0005 : score 5.24784 : w : GLN OE1 B0209 <- 6.34 -> DG N7 F0004 : score 2.87 : H : GLN NE2 C0109 <- 3.09 -> DA N3 G0009 : score 3.79336 : w : GLN OE1 C0138 <- 6.54 -> DC O2 H0011 : score 1.091 : H : ASN ND2 C0141 <- 3.01 -> DG N7 H0008 : score 4.39329 : H : ASN ND2 C0201 <- 2.90 -> DG N7 G0005 : score 4.49418 : H : GLN NE2 C0209 <- 3.01 -> DG O6 G0005 : score 5.56131 : w : GLN OE1 D0138 <- 6.09 -> DC O2 G0011 : score 1.091 : H : ASN OD1 D0141 <- 3.12 -> DA N6 G0009 : score 5.6364 : H : ASN ND2 D0141 <- 2.72 -> DG N7 G0008 : score 4.65927 : H : ASN ND2 D0201 <- 2.80 -> DG N7 H0005 : score 4.5859 : H : GLN NE2 D0209 <- 2.99 -> DG O6 H0005 : score 5.58453 : V : ALA CB A0205 <- 3.52 -> DT C7 F0006 : score 5.9909 : V : ALA CB D0205 <- 3.57 -> DT C7 G0006 : score 5.92092 : V : ALA CB B0205 <- 3.53 -> DT C7 E0006 : score 5.97691 : V : ALA CB C0205 <- 3.59 -> DT C7 H0006 : score 5.89292 : x : ASN xxxx A0110 <- 4.35 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0137 <- 4.36 -> DC xxx F0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.56 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.33 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.18 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.61 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 4.30 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0031 <- 3.12 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0110 <- 4.27 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0136 <- 4.44 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.60 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.33 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.28 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.65 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 4.21 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0031 <- 3.44 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0136 <- 4.37 -> DC xxx H0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0140 <- 3.60 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0199 <- 3.33 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0203 <- 4.28 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0204 <- 3.30 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0207 <- 4.19 -> DC xxx H0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0109 <- 3.51 -> DC xxx G0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0140 <- 3.77 -> DA xxx G0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0199 <- 3.37 -> DG xxx H0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0203 <- 4.00 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0204 <- 3.51 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0207 <- 4.36 -> DC xxx G0007 : score x.xxxxx >1u0c_A:Homing_endonucleases; title=Y33C MUTANT OF HOMING ENDONUCLEASE I-CREI organism=Chlamydomonas reinhardtii : w : ASN ND2 A0030 <- 6.45 -> DT O4 C0520 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.06 -> DG N7 D0552 : score 4.24898 : H : GLN OE1 A0038 <- 2.62 -> DA N6 D0554 : score 6.27046 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.85 -> DA N7 D0554 : score 6.02885 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.82 -> DT O4 C0520 : score 3.068 : H : GLN NE2 A0044 <- 2.91 -> DA N7 C0516 : score 5.95577 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.06 -> DG N7 D0558 : score 5.7354 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.67 -> DG O6 D0558 : score 6.7716 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.71 -> DG O6 C0515 : score 6.19283 : H : ARG NH2 A0070 <- 2.95 -> DG N7 C0515 : score 6.19308 : x : SER xxxx A0022 <- 4.40 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0026 <- 3.45 -> DA xxx C0518 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0028 <- 3.63 -> DA xxx D0555 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0033 <- 4.18 -> DT xxx D0553 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.65 -> DG xxx C0515 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 3.81 -> DC xxx D0556 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 4.16 -> DA xxx C0514 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 4.40 -> DT xxx D0561 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0140 <- 4.47 -> DC xxx D0560 : score x.xxxxx >1u0c_AB:Homing_endonucleases; title=Y33C MUTANT OF HOMING ENDONUCLEASE I-CREI organism=Chlamydomonas reinhardtii : w : ASN ND2 A0030 <- 6.45 -> DT O4 C0520 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.06 -> DG N7 D0552 : score 4.24898 : H : GLN OE1 A0038 <- 2.62 -> DA N6 D0554 : score 6.27046 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.85 -> DA N7 D0554 : score 6.02885 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.82 -> DT O4 C0520 : score 3.068 : H : GLN NE2 A0044 <- 2.91 -> DA N7 C0516 : score 5.95577 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.06 -> DG N7 D0558 : score 5.7354 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.67 -> DG O6 D0558 : score 6.7716 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.71 -> DG O6 C0515 : score 6.19283 : H : ARG NH2 A0070 <- 2.95 -> DG N7 C0515 : score 6.19308 : w : GLN NE2 B0326 <- 5.44 -> DG O6 D0568 : score 2.87 : w : LYS NZ B0328 <- 6.08 -> DG O6 D0568 : score 3.005 : H : GLN OE1 B0338 <- 3.05 -> DA N6 C0504 : score 5.74994 : H : GLN NE2 B0338 <- 2.67 -> DA N7 C0504 : score 6.24808 : w : GLN OE1 B0344 <- 5.43 -> DC N4 D0567 : score 3.488 : H : ARG NH2 B0368 <- 2.90 -> DG O6 C0508 : score 6.468 : H : ARG NH1 B0370 <- 3.26 -> DG O6 D0565 : score 5.52367 : H : ARG NH2 B0370 <- 3.43 -> DG N7 D0565 : score 5.58015 : V : LYS CG B0328 <- 3.85 -> DT C7 D0569 : score 2.09249 : x : SER xxxx A0022 <- 4.40 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0026 <- 3.45 -> DA xxx C0518 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0028 <- 3.63 -> DA xxx D0555 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0033 <- 4.18 -> DT xxx D0553 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.65 -> DG xxx C0515 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 3.81 -> DC xxx D0556 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 4.16 -> DA xxx C0514 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 4.40 -> DT xxx D0561 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0140 <- 4.47 -> DC xxx D0560 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0322 <- 3.83 -> DA xxx D0566 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0324 <- 4.16 -> DA xxx D0566 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0330 <- 4.27 -> DA xxx C0504 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0332 <- 3.33 -> DC xxx C0502 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0333 <- 4.07 -> DC xxx C0502 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0346 <- 4.27 -> DG xxx D0565 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0366 <- 4.08 -> DA xxx C0506 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0373 <- 3.39 -> DC xxx D0564 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0439 <- 3.85 -> DG xxx D0565 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0440 <- 3.31 -> DC xxx C0510 : score x.xxxxx >1u0d_A:Homing_endonucleases; title=Y33H MUTANT OF HOMING ENDONUCLEASE I-CREI organism=Chlamydomonas reinhardtii : H : LYS NZ A0028 <- 2.79 -> DG O6 C0519 : score 5.79233 : H : SER OG A0032 <- 2.95 -> DG N7 D0552 : score 4.34759 : H : GLN OE1 A0038 <- 2.70 -> DA N6 D0554 : score 6.17362 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.89 -> DA N7 D0554 : score 5.98013 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.26 -> DG N7 D0558 : score 5.4934 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.57 -> DG O6 D0558 : score 6.9036 : H : ARG NH2 A0070 <- 2.71 -> DG N7 C0515 : score 6.49954 : H : ARG NH2 A0070 <- 2.32 -> DG O6 C0515 : score 7.2336 : x : SER xxxx A0022 <- 3.72 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.54 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0026 <- 2.91 -> DA xxx C0518 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0030 <- 3.51 -> DT xxx C0521 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0033 <- 3.44 -> DG xxx D0553 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0044 <- 3.47 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.58 -> DG xxx C0515 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 4.32 -> DC xxx D0556 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.29 -> DA xxx C0514 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 3.43 -> DT xxx D0561 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0140 <- 4.16 -> DC xxx D0560 : score x.xxxxx >1u0d_AB:Homing_endonucleases; title=Y33H MUTANT OF HOMING ENDONUCLEASE I-CREI organism=Chlamydomonas reinhardtii : H : LYS NZ A0028 <- 2.79 -> DG O6 C0519 : score 5.79233 : H : SER OG A0032 <- 2.95 -> DG N7 D0552 : score 4.34759 : H : GLN OE1 A0038 <- 2.70 -> DA N6 D0554 : score 6.17362 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.89 -> DA N7 D0554 : score 5.98013 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.26 -> DG N7 D0558 : score 5.4934 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.57 -> DG O6 D0558 : score 6.9036 : H : ARG NH2 A0070 <- 2.71 -> DG N7 C0515 : score 6.49954 : H : ARG NH2 A0070 <- 2.32 -> DG O6 C0515 : score 7.2336 : H : SER OG B0332 <- 2.69 -> DC N4 C0502 : score 3.75651 : H : HIS NE2 B0333 <- 2.92 -> DG N7 C0503 : score 6.6393 : H : GLN NE2 B0338 <- 3.15 -> DA N7 C0504 : score 5.66346 : H : GLN NE2 B0344 <- 3.05 -> DA N7 D0566 : score 5.78526 : H : ARG NH1 B0368 <- 2.86 -> DG O6 C0508 : score 6.01033 : H : ARG NH2 B0368 <- 2.88 -> DG O6 C0508 : score 6.4944 : H : ARG NH1 B0370 <- 2.81 -> DG O6 D0565 : score 6.07117 : H : ARG NH2 B0370 <- 3.00 -> DG N7 D0565 : score 6.12923 : H : ARG NH2 B0370 <- 3.09 -> DG O6 D0565 : score 6.2172 : x : SER xxxx A0022 <- 3.72 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.54 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0026 <- 2.91 -> DA xxx C0518 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0030 <- 3.51 -> DT xxx C0521 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0033 <- 3.44 -> DG xxx D0553 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0044 <- 3.47 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.58 -> DG xxx C0515 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 4.32 -> DC xxx D0556 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.29 -> DA xxx C0514 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 3.43 -> DT xxx D0561 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0140 <- 4.16 -> DC xxx D0560 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0324 <- 3.39 -> DC xxx D0567 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0326 <- 3.88 -> DC xxx D0567 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0328 <- 3.25 -> DT xxx D0569 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0330 <- 3.34 -> DT xxx D0571 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0346 <- 3.84 -> DG xxx D0565 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0366 <- 4.02 -> DA xxx C0505 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0373 <- 3.74 -> DC xxx D0564 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0440 <- 4.49 -> DC xxx C0510 : score x.xxxxx >1u1o_A:RNA-binding_domain,_RBD; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UP1 COMPLEXED WITH D(TTAGGGTTAG(DI)G); A HUMAN TELOMERIC REPEAT CONTAINING INOSINE organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0015 <- 3.02 -> DG N7 B0204 : score 5.14892 : H : ASP OD1 A0042 <- 3.22 -> DG N2 B0205 : score 4.7174 : H : GLU OE1 A0085 <- 2.63 -> DT N3 B0202 : score 1.80817 : H : ARG NH2 A0092 <- 2.96 -> DG N7 B0205 : score 6.18031 : w : ARG NH1 A0092 <- 5.56 -> DT O4 B0207 : score 1.768 : H : SER OG A0095 <- 3.19 -> DG N2 B0204 : score 3.11116 : x : GLU xxxx A0011 <- 4.32 -> DG xxx B0205 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0012 <- 2.89 -> DG xxx B0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0017 <- 3.46 -> DA xxx B0203 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0044 <- 3.67 -> DG xxx B0205 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0046 <- 3.42 -> DG xxx B0205 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0059 <- 3.36 -> DG xxx B0204 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0082 <- 3.31 -> DT xxx B0202 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0087 <- 3.08 -> DT xxx B0202 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0089 <- 3.86 -> DG xxx B0204 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0090 <- 3.86 -> DA xxx B0203 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0101 <- 3.35 -> DA xxx B0203 : score x.xxxxx >1u1q_A:RNA-binding_domain,_RBD; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UP1 COMPLEXED WITH D(TTAGGGTTA(DI)GG); A HUMAN TELOMERIC REPEAT CONTAINING INOSINE organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0015 <- 2.88 -> DG N7 B0204 : score 5.29972 : H : ASP OD1 A0042 <- 3.01 -> DG N2 B0205 : score 4.9337 : H : GLU OE1 A0085 <- 2.67 -> DT N3 B0202 : score 1.79418 : H : ARG NH2 A0092 <- 2.94 -> DG N7 B0205 : score 6.20585 : w : ARG NH1 A0092 <- 5.72 -> DT O4 B0207 : score 1.768 : H : SER OG A0095 <- 3.16 -> DG N2 B0204 : score 3.13141 : x : GLU xxxx A0011 <- 4.09 -> DG xxx B0205 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0012 <- 2.80 -> DG xxx B0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0017 <- 3.45 -> DA xxx B0203 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0044 <- 3.82 -> DG xxx B0205 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0046 <- 4.37 -> DG xxx B0205 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0059 <- 3.35 -> DG xxx B0204 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0082 <- 3.98 -> DT xxx B0202 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0087 <- 2.96 -> DT xxx B0202 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0089 <- 3.83 -> DG xxx B0204 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0090 <- 3.83 -> DA xxx B0203 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0093 <- 4.39 -> DT xxx B0208 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0101 <- 3.44 -> DA xxx B0203 : score x.xxxxx >1u35_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING THE HISTONE DOMAIN OF MACROH2A organism=HOMO SAPIENS / MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 A0440 <- 3.10 -> DA N3 J0227 : score 3.04536 : H : LYS NZ C0814 <- 2.83 -> DT O2 J0263 : score 3.56566 : H : ARG NH1 C0842 <- 2.50 -> DT O2 J0256 : score 4.5648 : H : ARG NH2 E0640 <- 3.15 -> DA N3 I0082 : score 3.01296 : H : LYS NZ G1014 <- 2.65 -> DA N3 J0175 : score 2.86023 : H : ARG NH2 G1042 <- 2.61 -> DT O2 I0111 : score 4.3942 : x : HIS xxxx A0439 <- 4.41 -> DA xxx J0150 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.69 -> DT xxx J0236 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 3.40 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.36 -> DT xxx J0224 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0639 <- 4.34 -> DT xxx J0287 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0641 <- 4.42 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 3.63 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 4.40 -> DC xxx J0194 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H1430 <- 3.92 -> DA xxx J0172 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H1436 <- 4.46 -> DT xxx I0122 : score x.xxxxx >1u35_G:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING THE HISTONE DOMAIN OF MACROH2A organism=? : H : LYS NZ G1014 <- 2.65 -> DA N3 J0175 : score 2.86023 : H : ARG NH2 G1042 <- 2.61 -> DT O2 I0111 : score 4.3942 >1u3e_M:His-Me_finger_endonucleases;DNA-binding_domain_of_intron-encoded_endonucleases; title=DNA BINDING AND CLEAVAGE BY THE HNH HOMING ENDONUCLEASE I-HMUI organism=Bacillus phage SPO1 : H : GLN OE1 M0033 <- 3.37 -> DC N4 A0011 : score 4.06083 : H : ARG NH1 M0041 <- 3.25 -> DT O4 C0025 : score 2.97383 : H : ARG NH2 M0041 <- 3.00 -> DT O4 C0025 : score 3.41169 : H : THR OG1 M0052 <- 2.86 -> DG O6 C0027 : score 4.1648 : H : GLN OE1 M0100 <- 3.24 -> DG N2 B0021 : score 5.11422 : H : GLN NE2 M0100 <- 3.19 -> DG N3 B0021 : score 4.58754 : H : ASN ND2 M0119 <- 3.33 -> DC O2 B0017 : score 4.00466 : w : ASN ND2 M0119 <- 5.15 -> DC O2 A0022 : score 1.885 : H : LYS NZ M0151 <- 3.06 -> DG N7 B0010 : score 5.10583 : H : LYS NZ M0151 <- 2.61 -> DG O6 B0010 : score 6.00044 : H : LYS NZ M0151 <- 3.39 -> DG O6 B0011 : score 5.09864 : H : ASP OD1 M0154 <- 3.13 -> DC N4 A0027 : score 4.99211 : H : ARG NH2 M0160 <- 3.24 -> DG N7 B0009 : score 5.82277 : H : ARG NH2 M0160 <- 2.99 -> DG O6 B0009 : score 6.3492 : V : THR CG2 M0153 <- 3.59 -> DT C7 A0026 : score 4.45936 : x : PRO xxxx M0035 <- 4.09 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx M0037 <- 3.44 -> DT xxx C0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx M0039 <- 3.69 -> DT xxx C0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx M0045 <- 3.69 -> DA xxx A0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx M0054 <- 3.59 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx M0093 <- 3.21 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx M0097 <- 3.46 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx M0106 <- 3.48 -> DC xxx A0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx M0108 <- 3.09 -> DC xxx A0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx M0111 <- 3.42 -> DT xxx B0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx M0112 <- 3.36 -> DA xxx A0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx M0115 <- 3.44 -> DG xxx A0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0148 <- 3.30 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0149 <- 3.82 -> DA xxx A0024 : score x.xxxxx >1u45_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=8OXOGUANINE AT THE PRE-INSERTION SITE OF THE POLYMERASE ACTIVE SITE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.76 -> DT O2 C0008 : score 3.61588 : w : LYS NZ A0582 <- 6.15 -> DG N2 C0007 : score 0.846 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.92 -> DG N3 B0029 : score 2.9793 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.23 -> DG N3 B0029 : score 3.29977 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.86 -> DG N3 C0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.87 -> DA N3 C0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.03 -> DT O2 B0027 : score 4.52783 : H : ARG NH2 A0629 <- 2.93 -> DG N7 B0029 : score 6.21862 : w : GLU OE1 A0658 <- 5.73 -> DC O2 C0004 : score 2.68 : w : ASN ND2 A0793 <- 5.82 -> DC O2 C0004 : score 1.885 : w : GLN OE1 A0797 <- 5.87 -> DC O2 C0004 : score 1.091 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.55 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0714 <- 3.28 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx >1u47_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CYTOSINE-8-OXOGUANINE BASE PAIR AT THE POLYMERASE ACTIVE SITE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.80 -> DT O2 B0026 : score 3.58718 : H : ARG NH1 A0615 <- 3.15 -> DC O2 B0029 : score 3.3945 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.78 -> DG N3 C0006 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.17 -> DC O2 B0027 : score 4.14801 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.66 -> DA N3 C0007 : score 2.277 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.50 -> DC xxx B0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 2.97 -> DC xxx B0029 : score x.xxxxx >1u48_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=EXTENSION OF A CYTOSINE-8-OXOGUANINE BASE PAIR organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.93 -> DC O2 B0026 : score 2.86955 : w : LYS NZ A0582 <- 5.75 -> DT O2 B0025 : score 0.522 : w : LYS NZ A0582 <- 5.59 -> DA N3 C0008 : score 1.538 : w : THR OG1 A0586 <- 5.56 -> DA N3 C0008 : score 2.845 : w : TYR OH A0587 <- 5.87 -> DG N2 C0007 : score 2.834 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.96 -> DA N3 B0029 : score 3.56423 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.28 -> DA N3 B0029 : score 2.92873 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.61 -> DC O2 C0006 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.20 -> DG N3 B0027 : score 4.50328 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.68 -> DG N3 C0007 : score 2.566 : H : ARG NH2 A0629 <- 2.95 -> DA N7 B0029 : score 1.62164 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.58 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0714 <- 3.59 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.27 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx >1u49_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=ADENINE-8OXOGUANINE MISMATCH AT THE POLYMERASE ACTIVE SITE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.51 -> DT O2 B0026 : score 3.79524 : w : LYS NZ A0582 <- 5.45 -> DG N3 C0008 : score 2.232 : w : THR OG1 A0586 <- 5.51 -> DG N3 C0008 : score 2.036 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.95 -> DA N3 B0029 : score 3.57159 : w : ARG NH1 A0615 <- 6.27 -> DC O2 C0005 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.86 -> DG N3 C0006 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.00 -> DC O2 B0027 : score 4.30031 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.46 -> DC xxx B0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0629 <- 3.04 -> DA xxx B0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 4.18 -> DA xxx B0029 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.40 -> DG xxx B0028 : score x.xxxxx >1u4b_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=EXTENSION OF AN ADENINE-8OXOGUANINE MISMATCH organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.90 -> DG N3 B0026 : score 1.42477 : w : LYS NZ A0582 <- 6.01 -> DG N3 C0008 : score 2.232 : w : LYS NZ A0582 <- 6.12 -> DC O2 B0025 : score 1.3 : w : THR OG1 A0586 <- 6.08 -> DG N3 C0008 : score 2.036 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.98 -> DA N3 B0029 : score 3.5495 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.78 -> DA N3 C0005 : score 2.585 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.18 -> DA N3 B0027 : score 3.51831 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.94 -> DC O2 C0007 : score 1.885 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.57 -> DT O2 B0028 : score 3.682 : x : TYR xxxx A0714 <- 3.40 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.26 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx >1u78_A:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF THE BIPARTITE DNA-BINDING DOMAIN OF TC3 TRANSPOSASE BOUND TO TRANSPOSON DNA organism=Caenorhabditis elegans : H : ARG NE A0003 <- 2.86 -> DT O2 B0011 : score 2.546 : H : ARG NH2 A0003 <- 2.93 -> DT O2 B0011 : score 4.12327 : H : HIS NE2 A0026 <- 3.16 -> DG N7 B0006 : score 6.31278 : H : ARG NH1 A0036 <- 3.04 -> DG N7 B0007 : score 5.7596 : H : ARG NH2 A0036 <- 2.61 -> DG O6 B0007 : score 6.8508 : H : HIS ND1 A0037 <- 2.76 -> DG N7 C0046 : score 6.27286 : H : ARG NE A0054 <- 2.77 -> DT O2 C0042 : score 2.59238 : H : ARG NH2 A0054 <- 2.64 -> DA N3 C0043 : score 3.34342 : H : ARG NH1 A0057 <- 2.85 -> DT O2 C0039 : score 4.26335 : H : ARG NE A0094 <- 2.81 -> DG O6 C0034 : score 3.93314 : H : ARG NH2 A0094 <- 2.81 -> DG N7 C0034 : score 6.37185 : x : PRO xxxx A0002 <- 3.00 -> DT xxx C0044 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0035 <- 3.76 -> DG xxx C0046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 3.22 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0092 <- 4.18 -> DT xxx B0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0093 <- 3.05 -> DG xxx C0032 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0095 <- 3.88 -> DT xxx B0020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0097 <- 4.33 -> DG xxx C0032 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0098 <- 3.92 -> DT xxx B0020 : score x.xxxxx >1u8b_A:Ada_DNA_repair_protein,_N-terminal_domain_N-Ada_10; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE METHYLATED N-ADA/DNA COMPLEX organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0045 <- 2.91 -> DT O2 C0303 : score 4.21167 : H : ARG NH1 A0071 <- 3.10 -> DT O2 C0305 : score 4.04803 : w : ARG NH1 A0071 <- 6.03 -> DA N3 B0202 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0071 <- 6.11 -> DT O2 E0502 : score 2.261 : V : PHE CD2 A0114 <- 3.60 -> DT C7 E0505 : score 6.83738 : x : THR xxxx A0033 <- 3.91 -> DT xxx B0205 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0034 <- 3.97 -> DT xxx B0204 : score x.xxxxx >1u8r_ABCD:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;C-terminal_domain_of_transcriptional_repressors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN IDER-DNA COMPLEX REVEALS A CONFORMATIONAL CHANGE IN ACTIVATED IDER FOR BASE-SPECIFIC INTERACTIONS organism=Mycobacterium tuberculosis : V : PRO CG C0039 <- 3.83 -> DT C7 E0017 : score 6.31128 : V : PRO CG D0039 <- 3.85 -> DT C7 F0025 : score 6.27949 : x : SER xxxx A0037 <- 3.33 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0039 <- 3.43 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0040 <- 3.61 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0043 <- 3.50 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0047 <- 3.72 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0037 <- 3.07 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0039 <- 3.33 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0040 <- 3.57 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0042 <- 3.98 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0043 <- 3.22 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0047 <- 3.94 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0037 <- 3.28 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0040 <- 3.42 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0043 <- 3.71 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0047 <- 4.09 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0037 <- 3.08 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0040 <- 3.27 -> DC xxx F0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0043 <- 3.04 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0047 <- 3.42 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx >1u8r_B:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;C-terminal_domain_of_transcriptional_repressors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN IDER-DNA COMPLEX REVEALS A CONFORMATIONAL CHANGE IN ACTIVATED IDER FOR BASE-SPECIFIC INTERACTIONS organism=Mycobacterium tuberculosis : x : SER xxxx B0037 <- 3.07 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0039 <- 3.33 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0040 <- 3.57 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0042 <- 3.98 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0043 <- 3.22 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0047 <- 3.94 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx >1u8r_GHIJ:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;C-terminal_domain_of_transcriptional_repressors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN IDER-DNA COMPLEX REVEALS A CONFORMATIONAL CHANGE IN ACTIVATED IDER FOR BASE-SPECIFIC INTERACTIONS organism=Mycobacterium tuberculosis : H : GLN OE1 H0043 <- 3.29 -> DC N4 K0020 : score 4.13417 : V : PRO CG H0039 <- 3.72 -> DT C7 K0022 : score 6.48615 : x : SER xxxx G0037 <- 3.07 -> DT xxx L0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0039 <- 3.33 -> DT xxx L0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0040 <- 3.42 -> DC xxx L0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0043 <- 3.46 -> DG xxx L0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0047 <- 3.90 -> DG xxx L0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0037 <- 3.23 -> DT xxx K0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0040 <- 3.59 -> DC xxx K0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0042 <- 3.98 -> DT xxx L0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0047 <- 3.79 -> DC xxx K0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0037 <- 3.26 -> DT xxx K0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0039 <- 3.41 -> DT xxx K0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0040 <- 3.35 -> DC xxx K0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0043 <- 3.64 -> DG xxx K0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0047 <- 4.00 -> DG xxx K0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0037 <- 3.14 -> DT xxx L0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0039 <- 3.37 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0040 <- 3.53 -> DC xxx L0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0042 <- 4.11 -> DT xxx K0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx J0043 <- 3.08 -> DT xxx L0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0047 <- 3.20 -> DT xxx L0022 : score x.xxxxx >1ua0_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=AMINOFLUORENE DNA ADDUCT AT THE PRE-INSERTION SITE OF A DNA POLYMERASE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 3.05 -> DG N3 B0026 : score 1.38115 : w : LYS NZ A0582 <- 5.57 -> DT O2 B0025 : score 0.522 : w : LYS NZ A0582 <- 5.46 -> DA N3 C0008 : score 1.538 : w : THR OG1 A0586 <- 5.42 -> DA N3 C0008 : score 2.845 : H : ARG NH1 A0615 <- 3.00 -> DG N3 B0029 : score 2.93046 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.93 -> DA N3 C0005 : score 2.585 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.83 -> DC O2 C0006 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.15 -> DG N3 B0027 : score 4.55223 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.86 -> DC O2 C0007 : score 1.885 : w : GLU OE2 A0658 <- 5.49 -> DC O2 C0004 : score 1.988 : w : ASN ND2 A0793 <- 5.86 -> DC O2 C0004 : score 1.885 : w : GLN NE2 A0797 <- 5.95 -> DC O2 C0004 : score 2.699 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.37 -> DT O2 B0028 : score 3.682 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.46 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0629 <- 3.41 -> DG xxx B0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.25 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx >1ua1_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF AMINOFLUORENE ADDUCT PAIRED OPPOSITE CYTOSINE AT THE POLYMERASE ACTIVE SITE. organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 3.07 -> DG N3 B0013 : score 1.37534 : w : LYS NZ A0582 <- 6.58 -> DG N3 B0012 : score 2.232 : w : LYS NZ A0582 <- 5.93 -> DC O2 C0031 : score 1.3 : w : THR OG1 A0586 <- 5.78 -> DC O2 C0031 : score 2.048 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.71 -> DC O2 B0016 : score 3.7157 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.17 -> DC O2 B0016 : score 3.42501 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.80 -> DC O2 C0028 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.85 -> DA N3 C0029 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.94 -> DT O2 B0014 : score 4.61326 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.81 -> DC O2 C0030 : score 1.885 : w : ASN OD1 A0793 <- 5.96 -> DG N3 C0027 : score 3.377 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.47 -> DT xxx B0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0710 <- 4.06 -> DG xxx C0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 2.97 -> DC xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 3.54 -> DG xxx C0027 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.01 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx >1uaa_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=E. COLI REP HELICASE/DNA COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 A0251 <- 3.04 -> DT O2 C0014 : score 4.0997 : H : ARG NH2 A0350 <- 2.59 -> DT O2 C0012 : score 4.41113 : H : ARG NH2 B0251 <- 2.92 -> DT O2 C0003 : score 4.13173 : H : ARG NH2 B0350 <- 2.87 -> DT O2 C0002 : score 4.17407 : V : TRP CD2 B0250 <- 3.75 -> DT C7 C0002 : score 5.56512 : V : ASP CB B0110 <- 3.83 -> DT C7 C0005 : score 2.66295 : x : HIS xxxx A0085 <- 3.23 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0110 <- 3.65 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0129 <- 3.95 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0133 <- 2.72 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0134 <- 4.33 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0137 <- 4.37 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0183 <- 3.26 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0250 <- 3.00 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 3.46 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0537 <- 4.36 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0558 <- 2.90 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0580 <- 4.20 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0582 <- 3.04 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0616 <- 4.37 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0085 <- 3.17 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0090 <- 3.83 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0093 <- 3.19 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0094 <- 3.10 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0103 <- 3.27 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0105 <- 2.60 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0107 <- 3.64 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0133 <- 3.11 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0183 <- 3.16 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0558 <- 3.09 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0580 <- 2.84 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0582 <- 3.11 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0583 <- 4.09 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx >1uaa_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;?; title=E. COLI REP HELICASE/DNA COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 B0251 <- 2.92 -> DT O2 C0003 : score 4.13173 : H : ARG NH2 B0350 <- 2.87 -> DT O2 C0002 : score 4.17407 : V : TRP CD2 B0250 <- 3.75 -> DT C7 C0002 : score 5.56512 : V : ASP CB B0110 <- 3.83 -> DT C7 C0005 : score 2.66295 : x : HIS xxxx B0085 <- 3.17 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0090 <- 3.83 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0093 <- 3.19 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0094 <- 3.10 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0103 <- 3.27 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0105 <- 2.60 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0107 <- 3.64 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0133 <- 3.11 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0183 <- 3.16 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0558 <- 3.09 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0580 <- 2.84 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0582 <- 3.11 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0583 <- 4.09 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx >1ubd_C:C2H2_and_C2HC_zinc_fingers; title=CO-CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN YY1 ZINC FINGER DOMAIN BOUND TO THE ADENO-ASSOCIATED VIRUS P5 INITIATOR ELEMENT organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 C0336 <- 2.86 -> DC N4 A0006 : score 5.69873 : w : SER OG C0338 <- 5.73 -> DT O4 A0007 : score 2.338 : H : LYS NZ C0339 <- 2.69 -> DG N7 B0033 : score 5.50439 : H : LYS NZ C0339 <- 3.08 -> DG O6 B0033 : score 5.45705 : H : ARG NH1 C0342 <- 3.00 -> DG O6 B0032 : score 5.84 : H : ARG NH2 C0342 <- 2.87 -> DG N7 B0032 : score 6.29523 : H : ASN OD1 C0369 <- 3.45 -> DA N6 B0030 : score 5.23896 : H : ASN ND2 C0369 <- 2.86 -> DA N7 B0030 : score 5.80007 : H : GLN OE1 C0396 <- 2.86 -> DA N6 B0028 : score 5.97993 : H : GLN NE2 C0396 <- 2.79 -> DA N7 B0028 : score 6.10192 : w : GLN OE1 C0396 <- 5.27 -> DT O4 A0012 : score 3.068 : w : THR OG1 C0398 <- 5.21 -> DT O4 A0012 : score 2.809 : V : LEU CD1 C0366 <- 3.59 -> DT C7 B0031 : score 6.03217 : x : LYS xxxx C0315 <- 3.82 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0368 <- 3.22 -> DC xxx A0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0399 <- 2.92 -> DA xxx B0027 : score x.xxxxx >1v14_A:His-Me_finger_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE COLICIN E9, MUTANT HIS103ALA, IN COMPLEX WITH MG+2 AND DSDNA (RESOLUTION 2.9A) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ASP OD1 A0051 <- 2.90 -> DC N4 E0008 : score 5.23797 : x : ARG xxxx A0005 <- 4.15 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0054 <- 3.64 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0096 <- 3.67 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx >1v15_A:His-Me_finger_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE COLICIN E9, MUTANT HIS103ALA, IN COMPLEX WITH ZN+2 AND DSDNA (RESOLUTION 2.4A) organism=? : H : ASP OD1 A0051 <- 2.76 -> DC N4 E0008 : score 5.38763 : x : ARG xxxx A0005 <- 3.68 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0054 <- 3.93 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0096 <- 3.16 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx >1vas_A:T4_endonuclease_V; title=ATOMIC MODEL OF A PYRIMIDINE DIMER SPECIFIC EXCISION REPAIR ENZYME COMPLEXED WITH A DNA SUBSTRATE: STRUCTURAL BASIS FOR DAMAGED DNA RECOGNITION organism=Enterobacteria phage T4 : w : THR OG1 A0002 <- 6.28 -> DA N3 C0220 : score 2.845 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.66 -> DT O2 B0207 : score 4.42699 : w : GLN NE2 A0071 <- 5.80 -> DA N7 C0221 : score 1.888 : x : MET xxxx A0018 <- 4.16 -> DC xxx C0222 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0021 <- 3.40 -> DA xxx C0221 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0022 <- 3.15 -> DG xxx B0206 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0023 <- 2.63 -> DT xxx B0207 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0025 <- 3.29 -> DA xxx C0221 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0075 <- 3.17 -> DA xxx C0221 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0087 <- 3.21 -> DA xxx C0221 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0091 <- 3.11 -> DA xxx C0221 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0128 <- 4.23 -> DC xxx B0205 : score x.xxxxx >1vfc_A:Homeodomain-like; title=SOLUTION STRUCTURE OF THE DNA COMPLEX OF HUMAN TRF2 organism=HOMO SAPIENS : x : LYS xxxx A0447 <- 3.17 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0484 <- 4.00 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0485 <- 3.20 -> DC xxx C0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0488 <- 4.11 -> DA xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0489 <- 3.19 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0492 <- 3.59 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx >1vkx_A:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NFKB P50/P65 HETERODIMER COMPLEXED TO THE IMMUNOGLOBULIN KB DNA organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0033 <- 3.23 -> DG N7 D0015 : score 5.5297 : H : ARG NH2 A0033 <- 2.65 -> DG O6 D0015 : score 6.798 : H : ARG NH1 A0035 <- 2.68 -> DG O6 D0014 : score 6.22933 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.92 -> DG N7 D0014 : score 6.23138 : H : GLU OE1 A0039 <- 3.25 -> DC N4 C0011 : score 5.24883 : x : TYR xxxx A0036 <- 2.88 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0038 <- 3.99 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0187 <- 3.29 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >1vkx_AB:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NFKB P50/P65 HETERODIMER COMPLEXED TO THE IMMUNOGLOBULIN KB DNA organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0033 <- 3.23 -> DG N7 D0015 : score 5.5297 : H : ARG NH2 A0033 <- 2.65 -> DG O6 D0015 : score 6.798 : H : ARG NH1 A0035 <- 2.68 -> DG O6 D0014 : score 6.22933 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.92 -> DG N7 D0014 : score 6.23138 : H : GLU OE1 A0039 <- 3.25 -> DC N4 C0011 : score 5.24883 : H : ARG NH1 B0354 <- 2.69 -> DG O6 C0005 : score 6.21717 : H : ARG NH2 B0354 <- 2.80 -> DG O6 C0005 : score 6.6 : H : ARG NH1 B0356 <- 2.56 -> DG O6 C0004 : score 6.37533 : H : ARG NH2 B0356 <- 2.50 -> DG N7 C0004 : score 6.76769 : H : GLU OE1 B0360 <- 2.97 -> DC N4 D0021 : score 5.57184 : H : HIS ND1 B0364 <- 2.51 -> DG N7 C0003 : score 6.58402 : x : TYR xxxx A0036 <- 2.88 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0038 <- 3.99 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0187 <- 3.29 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0357 <- 2.99 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0359 <- 3.91 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0541 <- 2.84 -> DG xxx D0019 : score x.xxxxx >1vol_AB:Cyclin-like;TATA-box_binding_protein-like; title=TFIIB (HUMAN CORE DOMAIN)/TBP (A.THALIANA)/TATA ELEMENT TERNARY COMPLEX organism=HOMO SAPIENS / ARABIDOPSIS THALIANA : H : ASN ND2 B0027 <- 2.55 -> DT O2 D0109 : score 4.98346 : H : ASN ND2 B0027 <- 3.15 -> DT O2 D0110 : score 4.41392 : H : ASN ND2 B0117 <- 3.37 -> DA N3 C0007 : score 3.37362 : H : ASN ND2 B0117 <- 2.93 -> DA N3 C0008 : score 3.70869 : H : THR OG1 B0173 <- 3.45 -> DT O2 C0006 : score 2.36127 : x : VAL xxxx B0029 <- 3.54 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0057 <- 2.91 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0072 <- 3.37 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0074 <- 3.48 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0080 <- 3.47 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0082 <- 3.47 -> DT xxx D0108 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0119 <- 2.78 -> DT xxx D0110 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0148 <- 3.20 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0149 <- 3.36 -> DA xxx D0113 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0163 <- 3.63 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0165 <- 3.47 -> DT xxx D0112 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0171 <- 3.24 -> DA xxx D0111 : score x.xxxxx >1vol_B:TATA-box_binding_protein-like; title=TFIIB (HUMAN CORE DOMAIN)/TBP (A.THALIANA)/TATA ELEMENT TERNARY COMPLEX organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ASN ND2 B0027 <- 2.55 -> DT O2 D0109 : score 4.98346 : H : ASN ND2 B0027 <- 3.15 -> DT O2 D0110 : score 4.41392 : H : ASN ND2 B0117 <- 3.37 -> DA N3 C0007 : score 3.37362 : H : ASN ND2 B0117 <- 2.93 -> DA N3 C0008 : score 3.70869 : H : THR OG1 B0173 <- 3.45 -> DT O2 C0006 : score 2.36127 : x : VAL xxxx B0029 <- 3.54 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0057 <- 2.91 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0072 <- 3.37 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0074 <- 3.48 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0080 <- 3.47 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0082 <- 3.47 -> DT xxx D0108 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0119 <- 2.78 -> DT xxx D0110 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0148 <- 3.20 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0149 <- 3.36 -> DA xxx D0113 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0163 <- 3.63 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0165 <- 3.47 -> DT xxx D0112 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0171 <- 3.24 -> DA xxx D0111 : score x.xxxxx >1vpw_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF THE PURR MUTANT, L54M, BOUND TO HYPOXANTHINE AND PURF OPERATOR DNA organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0026 <- 2.64 -> DG O6 B0702 : score 6.278 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.03 -> DG N7 B0702 : score 6.09092 : x : SER xxxx A0014 <- 3.92 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0016 <- 3.10 -> DC xxx B0703 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0054 <- 3.42 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 2.96 -> DA xxx B0706 : score x.xxxxx >1vrl_A:DNA-glycosylase;Nudix; title=MUTY ADENINE GLYCOSYLASE IN COMPLEX WITH DNA AND SOAKED ADENINE FREE BASE organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : w : GLN OE1 A0047 <- 5.95 -> DG N3 C0019 : score 1.484 : w : GLN NE2 A0048 <- 6.45 -> DG N3 C0019 : score 1.484 : x : ARG xxxx A0050 <- 4.36 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0088 <- 3.24 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0308 <- 3.61 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0309 <- 3.58 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >1vrr_AB:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RESTRICTION ENDONUCLEASE BSTYI COMPLEX WITH DNA organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : w : ARG NH2 A0077 <- 6.23 -> DA N3 C0013 : score 2.092 : H : TYR OH A0115 <- 3.06 -> DA N3 D0003 : score 3.93542 : H : LYS NZ A0133 <- 2.69 -> DA N7 C0005 : score 3.0018 : H : SER OG A0172 <- 2.95 -> DT O4 D0010 : score 3.44847 : H : TYR OH B0115 <- 2.89 -> DA N3 C0003 : score 4.07656 : H : LYS NZ B0133 <- 2.93 -> DG N7 D0006 : score 5.24586 : H : LYS NZ B0133 <- 2.77 -> DG O6 D0006 : score 5.81545 : w : LYS NZ B0133 <- 6.25 -> DA N6 D0005 : score 2.097 : H : SER OG B0172 <- 2.83 -> DT O4 C0010 : score 3.5338 : x : GLU xxxx A0046 <- 3.27 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0048 <- 4.41 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0134 <- 3.23 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0136 <- 3.92 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0174 <- 4.30 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0046 <- 3.13 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0048 <- 4.37 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0134 <- 3.31 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0136 <- 3.86 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0174 <- 4.17 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >1vrr_B:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RESTRICTION ENDONUCLEASE BSTYI COMPLEX WITH DNA organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : TYR OH B0115 <- 2.89 -> DA N3 C0003 : score 4.07656 : H : LYS NZ B0133 <- 2.93 -> DG N7 D0006 : score 5.24586 : H : LYS NZ B0133 <- 2.77 -> DG O6 D0006 : score 5.81545 : w : LYS NZ B0133 <- 6.25 -> DA N6 D0005 : score 2.097 : H : SER OG B0172 <- 2.83 -> DT O4 C0010 : score 3.5338 : x : GLU xxxx B0046 <- 3.13 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0048 <- 4.37 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0134 <- 3.31 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0136 <- 3.86 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0174 <- 4.17 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >1vtl_E:TATA-box_binding_protein-like; title=CO-CRYSTAL STRUCTURE OF TBP RECOGNIZING THE MINOR GROOVE OF A TATA ELEMENT organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ASN ND2 E0027 <- 3.00 -> DT O2 B0308 : score 4.55631 : H : ASN ND2 E0027 <- 3.11 -> DT O2 B0309 : score 4.45189 : H : ASN ND2 E0117 <- 3.24 -> DA N3 A0206 : score 3.47262 : H : ASN ND2 E0117 <- 3.35 -> DA N3 A0207 : score 3.38885 : H : THR OG1 E0173 <- 3.38 -> DT O2 A0205 : score 2.39927 : x : VAL xxxx E0029 <- 3.68 -> DT xxx B0308 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0057 <- 3.36 -> DT xxx B0306 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0072 <- 3.71 -> DT xxx B0307 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0074 <- 3.54 -> DA xxx A0209 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0080 <- 3.52 -> DA xxx A0208 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0082 <- 3.71 -> DT xxx B0308 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0119 <- 3.39 -> DT xxx B0309 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0148 <- 3.30 -> DA xxx A0204 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0149 <- 2.83 -> DA xxx B0312 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0163 <- 3.97 -> DT xxx A0205 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0165 <- 3.29 -> DT xxx B0311 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0171 <- 3.41 -> DA xxx B0310 : score x.xxxxx >1vtn_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CO-CRYSTAL STRUCTURE OF THE HNF-3/FORK HEAD DNA-RECOGNITION MOTIF RESEMBLES HISTONE H5 organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 C0165 <- 3.36 -> DA N6 A0010 : score 5.34735 : H : ASN ND2 C0165 <- 3.12 -> DA N7 A0010 : score 5.4948 : H : ARG NH1 C0210 <- 2.65 -> DT O2 A0004 : score 4.4356 : H : ARG NH2 C0210 <- 2.65 -> DT O2 A0004 : score 4.36033 : V : HIS CG C0169 <- 3.78 -> DT C7 A0008 : score 3.01397 : x : SER xxxx C0166 <- 3.90 -> DT xxx A0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0168 <- 4.19 -> DG xxx B0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0172 <- 2.93 -> DT xxx B0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0173 <- 4.48 -> DT xxx B0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0214 <- 3.65 -> DA xxx A0006 : score x.xxxxx >1vto_A:TATA-box_binding_protein-like; title=1.9 A RESOLUTION REFINED STRUCTURE OF TBP RECOGNIZING THE MINOR GROOVE OF TATAAAAG organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ASN ND2 A0027 <- 2.89 -> DT O2 D0222 : score 4.66072 : H : ASN ND2 A0027 <- 3.15 -> DT O2 D0223 : score 4.41392 : H : ASN ND2 A0117 <- 3.25 -> DA N3 C0206 : score 3.465 : H : ASN ND2 A0117 <- 3.29 -> DA N3 C0207 : score 3.43454 : H : THR OG1 A0173 <- 2.83 -> DA N3 C0206 : score 1.34572 : x : VAL xxxx A0029 <- 3.73 -> DT xxx D0222 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0057 <- 3.09 -> DT xxx D0220 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0072 <- 3.42 -> DT xxx D0220 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0074 <- 3.72 -> DA xxx C0209 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0080 <- 3.64 -> DA xxx C0208 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0082 <- 3.48 -> DT xxx D0221 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0119 <- 3.56 -> DT xxx D0223 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0148 <- 3.28 -> DA xxx C0204 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0149 <- 3.21 -> DA xxx D0226 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0163 <- 3.69 -> DA xxx C0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0165 <- 3.32 -> DT xxx D0225 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0171 <- 3.55 -> DA xxx D0224 : score x.xxxxx >1w0t_A:Homeodomain-like; title=HTRF1 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH TELOMERIC DNA. organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0380 <- 2.48 -> DT O2 C0017 : score 4.50427 : H : LYS NZ A0421 <- 2.74 -> DG N7 C0013 : score 5.45053 : H : LYS NZ A0421 <- 3.06 -> DG O6 C0013 : score 5.48017 : H : ASP OD1 A0422 <- 2.75 -> DC N4 D0007 : score 5.39832 : H : ARG NH1 A0425 <- 3.06 -> DG N7 C0014 : score 5.7354 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.72 -> DG O6 C0014 : score 6.7056 : x : SER xxxx A0417 <- 4.48 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0418 <- 3.79 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx >1w0t_AB:Homeodomain-like; title=HTRF1 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH TELOMERIC DNA. organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0380 <- 2.48 -> DT O2 C0017 : score 4.50427 : H : LYS NZ A0421 <- 2.74 -> DG N7 C0013 : score 5.45053 : H : LYS NZ A0421 <- 3.06 -> DG O6 C0013 : score 5.48017 : H : ASP OD1 A0422 <- 2.75 -> DC N4 D0007 : score 5.39832 : H : ARG NH1 A0425 <- 3.06 -> DG N7 C0014 : score 5.7354 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.72 -> DG O6 C0014 : score 6.7056 : H : ARG NH2 B0380 <- 2.71 -> DA N3 D0010 : score 3.29806 : H : LYS NZ B0421 <- 2.91 -> DG N7 C0007 : score 5.26741 : H : LYS NZ B0421 <- 2.86 -> DG O6 C0007 : score 5.7114 : H : ASP OD2 B0422 <- 2.99 -> DC N4 D0013 : score 5.9644 : H : ARG NH1 B0425 <- 2.96 -> DG N7 C0008 : score 5.8564 : H : ARG NH2 B0425 <- 2.73 -> DG O6 C0008 : score 6.6924 : x : SER xxxx A0417 <- 4.48 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0418 <- 3.79 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0417 <- 4.12 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0418 <- 3.93 -> DC xxx D0014 : score x.xxxxx >1w0u_A:Homeodomain-like; title=HTRF2 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH TELOMERIC DNA. organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ A0447 <- 3.15 -> DT O2 C0016 : score 3.33608 : H : LYS NZ A0447 <- 2.93 -> DA N3 D0005 : score 2.70472 : H : LYS NZ A0488 <- 2.74 -> DG N7 C0012 : score 5.45053 : H : LYS NZ A0488 <- 2.79 -> DG O6 C0012 : score 5.79233 : H : ASP OD1 A0489 <- 2.88 -> DC N4 D0007 : score 5.25935 : w : ASP OD2 A0489 <- 6.75 -> DC N4 D0006 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0492 <- 2.94 -> DG N7 C0013 : score 5.8806 : H : ARG NH2 A0492 <- 2.67 -> DG O6 C0013 : score 6.7716 : V : VAL CG2 A0485 <- 3.88 -> DT C7 C0010 : score 6.00062 : x : THR xxxx A0493 <- 4.43 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx >1w0u_AB:Homeodomain-like; title=HTRF2 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH TELOMERIC DNA. organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ A0447 <- 2.93 -> DA N3 D0005 : score 2.70472 : H : LYS NZ A0447 <- 3.15 -> DT O2 C0016 : score 3.33608 : H : LYS NZ A0488 <- 2.74 -> DG N7 C0012 : score 5.45053 : H : LYS NZ A0488 <- 2.79 -> DG O6 C0012 : score 5.79233 : H : ASP OD1 A0489 <- 2.88 -> DC N4 D0007 : score 5.25935 : w : ASP OD2 A0489 <- 6.75 -> DC N4 D0006 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0492 <- 2.94 -> DG N7 C0013 : score 5.8806 : H : ARG NH2 A0492 <- 2.67 -> DG O6 C0013 : score 6.7716 : H : LYS NZ B0447 <- 3.17 -> DA N3 C0011 : score 2.57143 : w : LYS NZ B0447 <- 5.48 -> DA N3 D0010 : score 1.538 : H : LYS NZ B0488 <- 2.89 -> DG N7 C0006 : score 5.28895 : H : LYS NZ B0488 <- 2.80 -> DG O6 C0006 : score 5.78077 : H : ASP OD1 B0489 <- 2.74 -> DC N4 D0013 : score 5.40901 : w : ASP OD2 B0489 <- 6.87 -> DC N4 D0012 : score 3.623 : H : ARG NH1 B0492 <- 3.08 -> DG N7 C0007 : score 5.7112 : H : ARG NH2 B0492 <- 2.77 -> DG O6 C0007 : score 6.6396 : V : VAL CG2 B0485 <- 3.81 -> DT C7 C0004 : score 6.10777 : V : VAL CG2 A0485 <- 3.88 -> DT C7 C0010 : score 6.00062 : x : THR xxxx A0493 <- 4.43 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx >1w36_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like;?; title=RECBCD:DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : x : SER xxxx B0249 <- 3.60 -> DC xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0252 <- 4.27 -> DG xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0562 <- 4.06 -> DT xxx Y0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0824 <- 3.81 -> DC xxx Y0008 : score x.xxxxx >1w36_BC:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=RECBCD:DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : x : SER xxxx B0249 <- 3.60 -> DC xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0252 <- 4.27 -> DG xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0562 <- 4.06 -> DT xxx Y0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0824 <- 3.81 -> DC xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C1078 <- 3.25 -> DA xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1079 <- 3.44 -> DT xxx Y0039 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1080 <- 2.90 -> DA xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C1081 <- 3.55 -> DA xxx Y0005 : score x.xxxxx >1w36_EF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=RECBCD:DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : x : SER xxxx E0249 <- 2.86 -> DC xxx Z0017 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E0252 <- 4.32 -> DG xxx Z0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0824 <- 3.77 -> DC xxx Z0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F1078 <- 3.14 -> DA xxx Z0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F1079 <- 3.54 -> DT xxx Z0039 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F1080 <- 3.11 -> DA xxx Z0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F1081 <- 3.57 -> DA xxx Z0005 : score x.xxxxx >1w7a_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=ATP BOUND MUTS organism=ESCHERICHIA COLI : H : GLU OE2 A0038 <- 2.78 -> DT N3 F0022 : score 2.64644 : H : ARG NH1 A0058 <- 3.18 -> DC O2 E0011 : score 3.3726 : H : ARG NH2 A0058 <- 3.01 -> DC O2 E0011 : score 3.54337 : x : MET xxxx A0033 <- 3.73 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0035 <- 4.14 -> DA xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0036 <- 3.45 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 3.38 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.31 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >1wb9_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI DNA MISMATCH REPAIR ENZYME MUTS, E38T MUTANT, IN COMPLEX WITH A G.T MISMATCH organism=ESCHERICHIA COLI : w : THR OG1 A0038 <- 5.37 -> DT N3 F0022 : score 2.117 : H : ARG NH1 A0058 <- 3.21 -> DC O2 E0011 : score 3.3507 : H : ARG NH2 A0058 <- 2.79 -> DC O2 E0011 : score 3.70612 : x : MET xxxx A0033 <- 3.64 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0035 <- 4.08 -> DA xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0036 <- 3.37 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 4.43 -> DC xxx F0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.68 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >1wbb_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI DNA MISMATCH REPAIR ENZYME MUTS, E38A MUTANT, IN COMPLEX WITH A G.T MISMATCH organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 A0058 <- 3.16 -> DC O2 E0011 : score 3.43241 : V : PHE CZ A0036 <- 3.74 -> DT C7 F0022 : score 7.22159 : x : MET xxxx A0033 <- 3.65 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0035 <- 3.84 -> DA xxx E0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 3.34 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.39 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >1wbd_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI DNA MISMATCH REPAIR ENZYME MUTS, E38Q MUTANT, IN COMPLEX WITH A G.T MISMATCH organism=ESCHERICHIA COLI : w : ASP OD2 A0035 <- 5.46 -> DA N3 E0008 : score 1.331 : H : GLN OE1 A0038 <- 2.95 -> DT N3 F0022 : score 3.31168 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.54 -> DT O2 F0022 : score 4.13787 : H : ARG NH1 A0058 <- 3.34 -> DC O2 E0011 : score 3.2558 : H : ARG NH2 A0058 <- 3.27 -> DC O2 E0011 : score 3.35104 : V : PHE CZ A0036 <- 3.88 -> DT C7 F0022 : score 6.97257 : x : MET xxxx A0033 <- 4.39 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 4.15 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.04 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >1wd0_A:Chromo_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURES OF THE HYPERTHERMOPHILIC CHROMOSOMAL PROTEIN SAC7D IN COMPLEX WITH DNA DECAMERS organism=SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS : H : TRP NE1 A0024 <- 2.98 -> DA N3 B0106 : score -8.78352 : H : SER OG A0031 <- 3.23 -> DT O2 C0115 : score 3.37946 : H : ARG NH2 A0042 <- 3.04 -> DA N3 B0108 : score 3.08424 : w : ARG NE A0042 <- 5.69 -> DT O2 B0107 : score 0.757 : x : VAL xxxx A0026 <- 3.30 -> DT xxx B0105 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0029 <- 3.45 -> DT xxx C0115 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0044 <- 4.23 -> DT xxx C0115 : score x.xxxxx >1wd1_A:Chromo_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURES OF THE HYPERTHERMOPHILIC CHROMOSOMAL PROTEIN SAC7D IN COMPLEX WITH DNA DECAMERS organism=SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS : H : TRP NE1 A0024 <- 2.89 -> DG N3 B0106 : score -8.94753 : H : SER OG A0031 <- 3.04 -> DG N2 B0106 : score 3.21239 : H : ARG NH2 A0042 <- 2.36 -> DT O2 B0107 : score 4.60587 : H : ARG NH2 A0042 <- 3.15 -> DA N3 B0108 : score 3.01296 : x : VAL xxxx A0026 <- 3.44 -> DG xxx B0106 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0029 <- 3.22 -> DG xxx C0116 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0044 <- 4.09 -> DC xxx C0115 : score x.xxxxx >1wet_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF THE PURR-GUANINE-PURF OPERATOR COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0026 <- 2.45 -> DG O6 B0702 : score 6.50917 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.21 -> DG N7 B0702 : score 5.86108 : x : SER xxxx A0014 <- 3.85 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0016 <- 3.46 -> DA xxx B0703 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.55 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 3.27 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx >1wte_A:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TYPE II RESTRCITION ENDONUCLEASE, ECOO109I COMPLEXED WITH COGNATE DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : THR OG1 A0070 <- 2.89 -> DG N2 X0006 : score 3.94563 : w : LYS NZ A0074 <- 5.51 -> DG N3 X0005 : score 2.232 : w : LYS NZ A0074 <- 5.73 -> DG N3 Y0011 : score 2.232 : H : GLN NE2 A0133 <- 3.05 -> DG O6 Y0006 : score 5.51487 : H : LYS NZ A0173 <- 2.89 -> DA N7 Y0004 : score 2.88431 : x : THR xxxx A0066 <- 3.99 -> DC xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0130 <- 3.24 -> DC xxx X0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0131 <- 3.94 -> DC xxx X0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0134 <- 3.68 -> DG xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0136 <- 3.46 -> DC xxx X0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0172 <- 4.03 -> DC xxx Y0003 : score x.xxxxx >1wte_AB:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TYPE II RESTRCITION ENDONUCLEASE, ECOO109I COMPLEXED WITH COGNATE DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : THR OG1 A0070 <- 2.89 -> DG N2 X0006 : score 3.94563 : w : LYS NZ A0074 <- 5.73 -> DG N3 Y0011 : score 2.232 : H : GLN NE2 A0133 <- 3.05 -> DG O6 Y0006 : score 5.51487 : H : LYS NZ A0173 <- 2.89 -> DA N7 Y0004 : score 2.88431 : H : THR OG1 B0070 <- 2.94 -> DG N2 Y0006 : score 3.90545 : w : LYS NZ B0074 <- 5.58 -> DG N3 X0011 : score 2.232 : H : GLN NE2 B0133 <- 2.97 -> DG O6 X0006 : score 5.60775 : H : LYS NZ B0173 <- 2.93 -> DG N7 X0004 : score 5.24586 : x : THR xxxx A0066 <- 3.99 -> DC xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0130 <- 3.24 -> DC xxx X0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0131 <- 3.94 -> DC xxx X0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0134 <- 3.68 -> DG xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0136 <- 3.46 -> DC xxx X0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0172 <- 4.03 -> DC xxx Y0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0032 <- 3.07 -> DT xxx X0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0066 <- 3.70 -> DC xxx X0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0130 <- 3.37 -> DC xxx Y0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0131 <- 4.00 -> DG xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0134 <- 3.72 -> DG xxx X0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0136 <- 4.08 -> DG xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0172 <- 4.35 -> DC xxx X0003 : score x.xxxxx >1wto_A:Chromo_domain-like; title=HYPERTHERMOPHILE CHROMOSOMAL PROTEIN SAC7D DOUBLE MUTANT V26F/M29F IN COMPLEX WITH DNA GCGATCGC organism=SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS : H : TRP NE1 A0024 <- 3.02 -> DG N3 B0103 : score -8.71063 : w : SER OG A0031 <- 5.49 -> DC O2 C0114 : score 1.768 : H : ARG NH1 A0042 <- 2.98 -> DT O2 B0105 : score 4.15138 : H : ARG NH2 A0042 <- 2.93 -> DT O2 B0105 : score 4.12327 : w : ARG NH1 A0042 <- 5.70 -> DC O2 C0114 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0042 <- 5.68 -> DC O2 B0106 : score 1.669 : x : PHE xxxx A0026 <- 3.24 -> DG xxx B0103 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0029 <- 3.50 -> DG xxx C0115 : score x.xxxxx >1wtp_B:Chromo_domain-like; title=HYPERTHERMOPHILE CHROMOSOMAL PROTEIN SAC7D SINGLE MUTANT M29F IN COMPLEX WITH DNA GCGA(UBR)CGC organism=SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS : w : TYR OH B0008 <- 5.67 -> DC O2 F0114 : score 1.343 : H : TRP NE1 B0024 <- 2.95 -> DG N3 E0103 : score -8.83819 : H : SER OG B0031 <- 2.90 -> DG N2 E0103 : score 3.30687 : H : ARG NH1 B0042 <- 2.80 -> DC O2 E0106 : score 3.65 : x : VAL xxxx B0026 <- 3.45 -> DG xxx E0103 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0029 <- 3.28 -> DC xxx F0114 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0044 <- 4.49 -> DC xxx F0114 : score x.xxxxx >1wtq_A:Chromo_domain-like; title=HYPERTHERMOPHILE CHROMOSOMAL PROTEIN SAC7D SINGLE MUTANT M29F IN COMPLEX WITH DNA GTAATTAC organism=SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS : w : TYR OH A0008 <- 5.45 -> DA N3 C0112 : score 1.448 : H : TRP NE1 A0024 <- 2.96 -> DA N3 B0104 : score -8.81997 : w : SER OG A0031 <- 5.97 -> DT O2 C0113 : score 1.55 : H : ARG NH1 A0042 <- 2.97 -> DT O2 B0106 : score 4.15999 : H : ARG NH1 A0042 <- 3.09 -> DA N3 B0107 : score 3.46849 : w : ARG NH2 A0042 <- 6.08 -> DA N3 B0107 : score 2.092 : x : VAL xxxx A0026 <- 3.33 -> DA xxx B0104 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0029 <- 3.20 -> DT xxx C0113 : score x.xxxxx >1wtr_A:Chromo_domain-like; title=HYPERTHERMOPHILE CHROMOSOMAL PROTEIN SAC7D SINGLE MUTANT M29A IN COMPLEX WITH DNA GCGATCGC organism=SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS : w : TYR OH A0008 <- 5.09 -> DT O2 C0113 : score 3.068 : H : TRP NE1 A0024 <- 2.96 -> DG N3 B0103 : score -8.81997 : H : SER OG A0031 <- 2.76 -> DG N2 B0103 : score 3.40135 : H : ARG NH1 A0042 <- 2.80 -> DT O2 B0105 : score 4.30641 : H : ARG NH1 A0042 <- 3.00 -> DC O2 B0106 : score 3.504 : w : ARG NH2 A0042 <- 5.67 -> DC O2 B0106 : score 1.669 : x : VAL xxxx A0026 <- 3.43 -> DG xxx B0103 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0029 <- 4.05 -> DG xxx C0115 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0044 <- 3.97 -> DC xxx C0114 : score x.xxxxx >1wtv_A:Chromo_domain-like; title=HYPERTHERMOPHILE CHROMOSOMAL PROTEIN SAC7D SINGLE MUTANT M29A IN COMPLEX WITH DNA GTAATTAC organism=SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS : w : TYR OH A0008 <- 5.36 -> DA N3 C0112 : score 1.448 : H : TRP NE1 A0024 <- 2.95 -> DA N3 B0104 : score -8.83819 : w : SER OG A0031 <- 6.03 -> DT O2 C0113 : score 1.55 : H : ARG NH1 A0042 <- 2.91 -> DT O2 B0106 : score 4.21167 : w : ARG NH2 A0042 <- 6.01 -> DA N3 B0107 : score 2.092 : x : VAL xxxx A0026 <- 3.58 -> DA xxx B0104 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0029 <- 4.04 -> DT xxx C0114 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0044 <- 4.22 -> DT xxx C0113 : score x.xxxxx >1wtw_A:Chromo_domain-like; title=HYPERTHERMOPHILE CHROMOSOMAL PROTEIN SAC7D SINGLE MUTANT V26A IN COMPLEX WITH DNA GCGATCGC organism=SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS : H : TRP NE1 A0024 <- 3.05 -> DG N3 B0103 : score -8.65596 : H : SER OG A0031 <- 2.83 -> DG N2 B0103 : score 3.35411 : H : ARG NH1 A0042 <- 2.76 -> DT O2 B0105 : score 4.34086 : w : ARG NH2 A0042 <- 5.82 -> DC O2 B0106 : score 1.669 : x : TYR xxxx A0008 <- 4.04 -> DT xxx C0113 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0026 <- 3.76 -> DC xxx B0102 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0029 <- 3.40 -> DC xxx C0114 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0044 <- 4.11 -> DC xxx C0114 : score x.xxxxx >1wtx_A:Chromo_domain-like; title=HYPERTHERMOPHILE CHROMOSOMAL PROTEIN SAC7D SINGLE MUTANT V26A IN COMPLEX WITH DNA GTAATTAC organism=SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS : H : TRP NE1 A0024 <- 2.88 -> DA N3 B0104 : score -8.96575 : H : SER OG A0031 <- 3.07 -> DT O2 C0113 : score 3.49777 : H : ARG NH1 A0042 <- 3.24 -> DT O2 B0106 : score 3.92745 : w : ARG NH1 A0042 <- 6.47 -> DA N3 B0107 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0042 <- 6.23 -> DA N3 B0107 : score 2.092 : x : ALA xxxx A0026 <- 4.07 -> DA xxx B0103 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0029 <- 3.48 -> DT xxx C0113 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0044 <- 4.04 -> DT xxx C0113 : score x.xxxxx >1wvl_A:Chromo_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MULTIMERIC DNA-BINDING PROTEIN SAC7D-GCN4 WITH DNA DECAMER organism=Sulfolobus acidocaldarius : H : TRP NE1 A0024 <- 2.66 -> DA N3 C0106 : score -9.36666 : H : SER OG A0031 <- 3.11 -> DT O2 D0115 : score 3.46819 : x : TYR xxxx A0008 <- 4.32 -> DA xxx D0114 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0026 <- 3.10 -> DT xxx C0105 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0029 <- 3.62 -> DT xxx D0115 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0042 <- 3.05 -> DA xxx C0108 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0044 <- 3.90 -> DT xxx D0115 : score x.xxxxx >1x9m_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=T7 DNA POLYMERASE IN COMPLEX WITH AN N-2-ACETYLAMINOFLUORENE-ADDUCTED DNA organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : LYS NZ A0394 <- 2.93 -> DT O2 C0019 : score 3.49391 : w : ARG NH1 A0429 <- 5.62 -> DT O2 D0006 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0436 <- 5.68 -> DC O2 D0007 : score 1.885 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.09 -> DA N3 D0008 : score 3.79336 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.02 -> DG N3 C0020 : score 4.75671 : w : HIS NE2 A0653 <- 5.70 -> DA N3 C0021 : score 2.619 : x : TYR xxxx A0530 <- 3.48 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0615 <- 3.52 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx >1x9n_A:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA LIGASE I BOUND TO 5'-ADENYLATED, NICKED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0305 <- 3.12 -> DT O2 D0010 : score 4.0308 : H : ARG NH2 A0305 <- 2.94 -> DT O2 D0010 : score 4.1148 : H : LYS NZ A0770 <- 3.29 -> DG N3 D0013 : score 1.31137 : x : THR xxxx A0798 <- 3.82 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0872 <- 3.39 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx >1x9s_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=T7 DNA POLYMERASE IN COMPLEX WITH A PRIMER/TEMPLATE DNA CONTAINING A DISORDERED N-2 AMINOFLUORENE ON THE TEMPLATE, CRYSTALLIZED WITH DIDEOXY-CTP AS THE INCOMING NUCLEOTIDE. organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : w : ASN ND2 A0436 <- 5.54 -> DC O2 T0007 : score 1.885 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.22 -> DA N3 T0008 : score 3.68866 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.06 -> DG N3 P0020 : score 4.71691 : x : LYS xxxx A0394 <- 3.37 -> DT xxx P0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0429 <- 3.40 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0530 <- 3.82 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0615 <- 3.81 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >1x9w_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=T7 DNA POLYMERASE IN COMPLEX WITH A PRIMER/TEMPLATE DNA CONTAINING A DISORDERED N-2 AMINOFLUORENE ON THE TEMPLATE, CRYSTALLIZED WITH DIDEOXY-ATP AS THE INCOMING NUCLEOTIDE. organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : w : ARG NH1 A0429 <- 5.42 -> DT O2 D0006 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0436 <- 5.72 -> DC O2 D0007 : score 1.885 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.31 -> DG N3 C0020 : score 4.46813 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.05 -> DA N3 D0008 : score 3.82558 : w : HIS NE2 A0653 <- 5.64 -> DA N3 C0021 : score 2.619 : x : LYS xxxx A0394 <- 3.15 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0530 <- 4.02 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0615 <- 3.67 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx >1xbr_AB:p53-like_transcription_factors; title=T DOMAIN FROM XENOPUS LAEVIS BOUND TO DNA organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0067 <- 2.97 -> DG N7 D0517 : score 6.16754 : H : ARG NH2 B0067 <- 2.92 -> DG N7 C0517 : score 6.23138 : V : ALA CB A0195 <- 3.63 -> DT C7 C0504 : score 5.83693 : V : ALA CB B0195 <- 3.59 -> DT C7 D0504 : score 5.89292 : x : THR xxxx A0194 <- 3.65 -> DT xxx C0504 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0211 <- 3.88 -> DG xxx D0515 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0215 <- 3.50 -> DG xxx D0517 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0194 <- 3.70 -> DT xxx D0504 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0211 <- 3.51 -> DT xxx D0512 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0215 <- 3.45 -> DG xxx C0517 : score x.xxxxx >1xbr_B:p53-like_transcription_factors; title=T DOMAIN FROM XENOPUS LAEVIS BOUND TO DNA organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 B0067 <- 2.92 -> DG N7 C0517 : score 6.23138 : V : ALA CB B0195 <- 3.59 -> DT C7 D0504 : score 5.89292 : x : THR xxxx B0194 <- 3.70 -> DT xxx D0504 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0211 <- 3.51 -> DT xxx D0512 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0215 <- 3.45 -> DG xxx C0517 : score x.xxxxx >1xc8_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE COMPLEX BETWEEN THE WILD-TYPE LACTOCOCCUS LACTIS FPG (MUTM) AND A FAPY-DG CONTAINING DNA organism=Lactococcus lactis subsp. cremoris : H : ARG NH1 A0074 <- 2.89 -> DT O2 B0008 : score 4.22889 : H : ARG NH1 A0074 <- 2.89 -> DT O2 B0008 : score 4.22889 : w : ARG NH2 A0074 <- 6.27 -> DT O2 B0009 : score 2.261 : w : GLU OE2 A0076 <- 6.11 -> DT O2 B0006 : score 2.279 : H : ARG NE A0109 <- 2.70 -> DC O2 C0023 : score 2.71215 : H : ARG NH2 A0109 <- 3.08 -> DC N3 C0023 : score 2.16273 : w : ARG NH1 A0109 <- 6.17 -> DT O2 B0006 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0109 <- 6.07 -> DT O4 B0006 : score 2.366 : x : MET xxxx A0075 <- 3.52 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.41 -> DC xxx C0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.42 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >1xc9_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF A HIGH-FIDELITY POLYMERASE BOUND TO A BENZO[A]PYRENE ADDUCT THAT BLOCKS REPLICATION organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.94 -> DG N3 B0026 : score 1.41314 : w : LYS NZ A0582 <- 5.38 -> DC O2 C0008 : score 1.3 : w : THR OG1 A0586 <- 5.53 -> DC O2 C0008 : score 2.048 : w : ASN ND2 A0622 <- 6.47 -> DA N3 C0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.16 -> DT O2 B0027 : score 4.40443 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.54 -> DC O2 C0007 : score 1.885 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.49 -> DT xxx B0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0629 <- 3.11 -> DC xxx B0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.28 -> DC xxx B0029 : score x.xxxxx >1xhu_ABCD:Restriction_endonuclease-like; title=HINCII BOUND TO CLEAVED, COGNATE DNA CONTAINING GTCGAC organism=Haemophilus influenzae : w : GLN OE1 A0109 <- 6.03 -> DC O2 G0007 : score 1.091 : w : GLN OE1 A0138 <- 6.28 -> DC O2 H0011 : score 1.091 : H : ASN OD1 A0141 <- 2.93 -> DA N6 H0009 : score 5.86523 : H : ASN ND2 A0141 <- 3.04 -> DG N7 H0008 : score 4.36577 : H : GLN NE2 A0209 <- 3.29 -> DG O6 E0005 : score 5.23623 : H : GLN NE2 B0109 <- 2.99 -> DC O2 E0007 : score 3.55447 : w : GLN OE1 B0138 <- 5.54 -> DC O2 F0011 : score 1.091 : H : ASN OD1 B0141 <- 3.06 -> DA N6 F0009 : score 5.70866 : w : ASN ND2 B0141 <- 6.15 -> DT O4 G0006 : score 3.275 : H : ASN ND2 B0201 <- 3.06 -> DG N7 G0005 : score 4.34743 : H : GLN NE2 B0209 <- 3.20 -> DG O6 G0005 : score 5.34072 : H : ASN OD1 C0141 <- 2.95 -> DA N6 L0009 : score 5.84114 : H : ASN ND2 C0141 <- 2.77 -> DG N7 L0008 : score 4.61341 : H : ASN ND2 C0201 <- 3.10 -> DG N7 I0005 : score 4.31074 : H : GLN NE2 C0209 <- 3.07 -> DG O6 I0005 : score 5.49165 : H : ASN OD1 D0141 <- 2.57 -> DA N6 J0009 : score 6.2988 : H : ASN ND2 D0201 <- 2.60 -> DG N7 K0005 : score 4.76933 : H : GLN NE2 D0209 <- 2.43 -> DG O6 K0005 : score 6.23471 : V : ALA CB B0205 <- 3.68 -> DT C7 E0006 : score 5.76694 : V : ALA CB C0205 <- 3.71 -> DT C7 K0006 : score 5.72495 : V : ALA CB A0205 <- 3.76 -> DT C7 G0006 : score 5.65496 : V : ALA CB D0205 <- 3.88 -> DT C7 I0006 : score 5.48699 : x : HIS xxxx A0031 <- 2.89 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0110 <- 3.74 -> DG xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0137 <- 4.44 -> DC xxx H0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 4.14 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.24 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0201 <- 3.32 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 3.76 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.67 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0031 <- 3.53 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0136 <- 4.46 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.60 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.15 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 3.47 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.00 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0031 <- 3.03 -> DG xxx J0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0109 <- 3.45 -> DC xxx J0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0136 <- 4.50 -> DC xxx L0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0138 <- 2.68 -> DG xxx I0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0140 <- 3.50 -> DA xxx L0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0199 <- 3.26 -> DG xxx I0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0203 <- 4.18 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0204 <- 3.30 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0031 <- 2.97 -> DG xxx L0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0109 <- 2.89 -> DC xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0110 <- 4.00 -> DG xxx I0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0138 <- 3.09 -> DG xxx K0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0140 <- 4.02 -> DA xxx J0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0199 <- 3.01 -> DG xxx K0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0203 <- 4.11 -> DT xxx K0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0204 <- 3.27 -> DT xxx K0006 : score x.xxxxx >1xhu_B:Restriction_endonuclease-like; title=HINCII BOUND TO CLEAVED, COGNATE DNA CONTAINING GTCGAC organism=Haemophilus influenzae : H : GLN NE2 B0109 <- 2.99 -> DC O2 E0007 : score 3.55447 : w : GLN OE1 B0138 <- 5.54 -> DC O2 F0011 : score 1.091 : H : ASN OD1 B0141 <- 3.06 -> DA N6 F0009 : score 5.70866 : w : ASN ND2 B0141 <- 6.25 -> DG O6 F0008 : score 2.971 : H : ASN ND2 B0201 <- 3.06 -> DG N7 G0005 : score 4.34743 : H : GLN NE2 B0209 <- 3.20 -> DG O6 G0005 : score 5.34072 : V : ALA CB B0205 <- 3.68 -> DT C7 E0006 : score 5.76694 : x : HIS xxxx B0031 <- 3.53 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0136 <- 4.46 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.60 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.15 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 3.47 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.00 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx >1xhv_ABCD:Restriction_endonuclease-like; title=HINCII BOUND TO CLEAVED COGNATE DNA GTCGAC AND MN2+ organism=Haemophilus influenzae : w : GLN NE2 A0138 <- 5.80 -> DC O2 H0011 : score 2.699 : H : ASN OD1 A0141 <- 3.03 -> DA N6 H0009 : score 5.74479 : H : ASN ND2 A0141 <- 2.95 -> DG N7 H0008 : score 4.44832 : H : ASN ND2 A0201 <- 2.92 -> DG N7 E0005 : score 4.47584 : H : GLN NE2 A0209 <- 2.99 -> DG O6 E0005 : score 5.58453 : H : GLN NE2 B0109 <- 3.03 -> DC O2 E0007 : score 3.52491 : w : GLN OE1 B0138 <- 6.43 -> DC O2 F0011 : score 1.091 : H : ASN ND2 B0141 <- 3.11 -> DG N7 F0008 : score 4.30157 : w : ASN ND2 B0141 <- 5.94 -> DT O4 G0006 : score 3.275 : H : ASN ND2 B0201 <- 3.01 -> DG N7 G0005 : score 4.39329 : H : GLN NE2 B0209 <- 3.23 -> DG O6 G0005 : score 5.30589 : H : GLN NE2 C0109 <- 2.78 -> DC O2 K0007 : score 3.70965 : H : GLN NE2 C0109 <- 3.17 -> DA N3 J0009 : score 3.72893 : w : GLN OE1 C0138 <- 5.86 -> DC O2 L0011 : score 1.091 : H : ASN OD1 C0141 <- 2.93 -> DA N6 L0009 : score 5.86523 : H : ASN ND2 C0141 <- 2.74 -> DG N7 L0008 : score 4.64093 : w : ASN ND2 C0141 <- 6.52 -> DT O4 I0006 : score 3.275 : H : ASN ND2 C0201 <- 2.98 -> DG N7 I0005 : score 4.4208 : H : GLN NE2 C0209 <- 2.91 -> DG O6 I0005 : score 5.67742 : w : GLN OE1 D0138 <- 6.51 -> DC O2 J0011 : score 1.091 : H : ASN ND2 D0141 <- 2.86 -> DG N7 J0008 : score 4.53087 : H : ASN ND2 D0201 <- 2.84 -> DG N7 K0005 : score 4.54921 : H : GLN NE2 D0209 <- 2.79 -> DG O6 K0005 : score 5.81674 : w : GLN OE1 D0209 <- 6.32 -> DG O6 K0004 : score 2.87 : V : ALA CB C0205 <- 3.52 -> DT C7 K0006 : score 5.9909 : V : ALA CB D0205 <- 3.67 -> DT C7 I0006 : score 5.78094 : x : GLN xxxx A0109 <- 2.92 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0110 <- 3.96 -> DG xxx G0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.66 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.65 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.27 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.57 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0205 <- 3.92 -> DC xxx G0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 4.11 -> DC xxx G0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0031 <- 3.62 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0110 <- 4.40 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0136 <- 4.13 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.54 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.42 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.04 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.37 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0205 <- 3.48 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 4.30 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0140 <- 3.49 -> DA xxx L0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0199 <- 3.51 -> DG xxx I0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0203 <- 4.26 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0204 <- 3.48 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0207 <- 4.07 -> DC xxx K0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0109 <- 2.97 -> DC xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0110 <- 3.85 -> DG xxx I0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0136 <- 4.29 -> DC xxx J0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0140 <- 3.60 -> DA xxx J0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0199 <- 3.18 -> DG xxx K0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0203 <- 4.26 -> DT xxx K0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0204 <- 3.49 -> DT xxx K0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0207 <- 4.37 -> DC xxx I0007 : score x.xxxxx >1xhv_B:Restriction_endonuclease-like; title=HINCII BOUND TO CLEAVED COGNATE DNA GTCGAC AND MN2+ organism=Haemophilus influenzae : H : GLN NE2 B0109 <- 3.03 -> DC O2 E0007 : score 3.52491 : w : GLN OE1 B0138 <- 6.43 -> DC O2 F0011 : score 1.091 : H : ASN ND2 B0141 <- 3.11 -> DG N7 F0008 : score 4.30157 : w : ASN ND2 B0141 <- 5.94 -> DT O4 G0006 : score 3.275 : H : ASN ND2 B0201 <- 3.01 -> DG N7 G0005 : score 4.39329 : H : GLN NE2 B0209 <- 3.23 -> DG O6 G0005 : score 5.30589 : x : HIS xxxx B0031 <- 3.62 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0110 <- 4.40 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0136 <- 4.13 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.54 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.42 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.04 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.37 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0205 <- 3.48 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 4.30 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx >1xhz_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PHI29 DNA POLYMERASE, ORTHORHOMBIC CRYSTAL FORM, SSDNA COMPLEX organism=Bacillus phage phi29 : H : ASN ND2 D0062 <- 2.97 -> DT O2 H0003 : score 4.58478 : H : ASN ND2 D0062 <- 2.80 -> DT O2 H0004 : score 4.74615 : V : LYS CE D0555 <- 3.81 -> DT C7 H0002 : score 2.59452 : x : THR xxxx D0017 <- 3.90 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0065 <- 2.83 -> DT xxx H0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0148 <- 3.49 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0528 <- 4.30 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0529 <- 4.10 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0533 <- 4.27 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0535 <- 2.96 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0538 <- 3.98 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0567 <- 3.33 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx >1xns_B:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=PEPTIDE TRAPPED HOLLIDAY JUNCTION INTERMEDIATE IN CRE-LOXP RECOMBINATION organism=Enterobacteria phage P1 : H : GLN NE2 B0090 <- 2.57 -> DT O4 D0023 : score 5.42981 : H : ARG NH1 B0243 <- 2.84 -> DT O2 D0033 : score 4.27196 : H : LYS NZ B0244 <- 2.26 -> DT O2 D0035 : score 3.97459 : H : ARG NE B0259 <- 2.86 -> DG O6 D0028 : score 3.89373 : H : ARG NH2 B0259 <- 2.76 -> DG N7 D0028 : score 6.43569 : w : GLU OE1 B0262 <- 5.10 -> DC N4 D0027 : score 3.528 : V : HIS CG B0040 <- 3.74 -> DT C7 D0025 : score 3.04396 : x : THR xxxx B0041 <- 3.69 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0044 <- 3.57 -> DA xxx D0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 3.66 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0201 <- 2.96 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0282 <- 3.24 -> DA xxx D0026 : score x.xxxxx >1xo0_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=HIGH RESOLUTION STRUCTURE OF THE HOLLIDAY JUNCTION INTERMEDIATE IN CRE-LOXP SITE-SPECIFIC RECOMBINATION organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ B0043 <- 2.49 -> DG N7 C0010 : score 5.71982 : H : GLN NE2 B0090 <- 3.17 -> DT O4 D0023 : score 4.80689 : H : LYS NZ B0201 <- 3.00 -> DT O2 D0023 : score 3.44369 : H : LYS NZ B0201 <- 2.55 -> DA N3 C0015 : score 2.91577 : w : ARG NH2 B0241 <- 5.62 -> DA N3 C0005 : score 2.092 : H : ARG NH1 B0243 <- 2.98 -> DT O2 D0033 : score 4.15138 : w : ARG NH1 B0243 <- 5.80 -> DA N3 D0034 : score 2.585 : H : LYS NZ B0244 <- 2.85 -> DT O2 C0003 : score 3.55131 : H : ARG NE B0259 <- 2.70 -> DG O6 D0028 : score 4.01985 : H : ARG NH2 B0259 <- 2.91 -> DG N7 D0028 : score 6.24415 : w : GLU OE1 B0262 <- 6.00 -> DC N4 D0027 : score 3.528 : H : ARG NH1 B0282 <- 3.33 -> DA N3 C0012 : score 3.29175 : H : ARG NH2 B0282 <- 3.22 -> DA N3 C0012 : score 2.96761 : w : ARG NH2 B0282 <- 5.78 -> DA N3 D0026 : score 2.092 : V : HIS CG B0040 <- 3.72 -> DT C7 D0025 : score 3.05895 : V : MET CE B0044 <- 3.87 -> DT C7 C0013 : score 6.80898 : x : THR xxxx B0041 <- 3.60 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.56 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0086 <- 3.09 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.48 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 3.65 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 3.77 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >1xpx_A:Homeodomain-like; title=STRUCTURAL BASIS OF PROSPERO-DNA INTERACTION; IMPLICATIONS FOR TRANSCRIPTION REGULATION IN DEVELOPING CELLS organism=Drosophila melanogaster : H : LYS NZ A1290 <- 2.41 -> DG O6 C0406 : score 6.23167 : H : ASN OD1 A1294 <- 3.30 -> DA N6 C0405 : score 5.41962 : H : ASN ND2 A1294 <- 3.22 -> DA N7 C0405 : score 5.37739 : w : GLU OE1 A1297 <- 5.57 -> DT O4 D0308 : score 2.749 >1xs9_A:Homeodomain-like; title=A MODEL OF THE TERNARY COMPLEX FORMED BETWEEN MARA, THE ALPHA-CTD OF RNA POLYMERASE AND DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : HIS ND1 A0043 <- 3.06 -> DG N7 C0430 : score 5.89948 : H : ARG NH1 A0046 <- 2.92 -> DG O6 B0420 : score 5.93733 : H : ARG NH2 A0046 <- 2.95 -> DG N7 B0419 : score 6.19308 : H : ARG NH2 A0046 <- 3.12 -> DG N7 B0420 : score 5.976 : H : GLN NE2 A0092 <- 2.88 -> DT O4 B0407 : score 5.10797 : H : ARG NH1 A0096 <- 2.86 -> DG O6 C0440 : score 6.01033 : H : ARG NH2 A0096 <- 2.93 -> DG N7 C0440 : score 6.21862 : x : TRP xxxx A0042 <- 3.50 -> DC xxx C0431 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0045 <- 3.42 -> DT xxx B0418 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0091 <- 3.47 -> DT xxx B0407 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0095 <- 3.84 -> DT xxx B0408 : score x.xxxxx >1xsd_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE BLAI REPRESSOR IN COMPLEX WITH DNA organism=Staphylococcus aureus : H : THR OG1 A0047 <- 3.16 -> DA N7 B0213 : score 3.16829 : H : THR OG1 A0047 <- 2.88 -> DA N6 B0213 : score 2.71483 : H : ARG NH1 A0051 <- 2.83 -> DG N7 B0211 : score 6.0137 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.79 -> DG O6 B0211 : score 6.6132 : x : LYS xxxx A0043 <- 3.67 -> DG xxx B0214 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0044 <- 3.56 -> DA xxx B0213 : score x.xxxxx >1xsl_EI:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;DNA_polymerase_beta-like,_second_domain;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE LAMBDA IN COMPLEX WITH A ONE NUCLEOTIDE DNA GAP organism=Homo sapiens : w : LYS NZ I0281 <- 5.89 -> DC O2 J0004 : score 1.3 : x : TRP xxxx E0274 <- 3.30 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0275 <- 3.93 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0277 <- 3.73 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0274 <- 3.22 -> DG xxx L0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0275 <- 3.79 -> DG xxx L0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0277 <- 3.88 -> DC xxx J0004 : score x.xxxxx >1xsl_I:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE LAMBDA IN COMPLEX WITH A ONE NUCLEOTIDE DNA GAP organism=Homo sapiens : w : LYS NZ I0281 <- 5.89 -> DC O2 J0004 : score 1.3 : x : TRP xxxx I0274 <- 3.22 -> DG xxx L0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0275 <- 3.79 -> DG xxx L0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0277 <- 3.88 -> DC xxx J0004 : score x.xxxxx >1xsp_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE LAMBDA IN COMPLEX WITH NICKED DNA AND PYROPHOSPHATE organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 A0372 <- 5.69 -> DC O2 T0009 : score 2.699 : w : LYS NZ A0472 <- 5.67 -> DA N3 P0005 : score 1.538 : H : TYR OH A0505 <- 2.70 -> DC O2 P0006 : score 3.56738 : H : ASN ND2 A0513 <- 3.17 -> DG N3 P0007 : score 4.53265 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.02 -> DG N3 T0006 : score 2.91825 : H : GLU OE2 A0529 <- 2.84 -> DG N2 T0006 : score 4.27577 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.70 -> DG xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.33 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx >1xyi_A:Chromo_domain-like; title=HYPERTHERMOPHILE CHROMOSOMAL PROTEIN SAC7D DOUBLE MUTANT VAL26ALA/MET29ALA IN COMPLEX WITH DNA GCGATCGC organism=SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS : H : TRP NE1 A0024 <- 3.00 -> DA N3 B0104 : score -8.74708 : w : SER OG A0031 <- 5.63 -> DC O2 C0114 : score 1.768 : H : ARG NH1 A0042 <- 2.77 -> DT O2 B0105 : score 4.33225 : H : ARG NH2 A0042 <- 2.87 -> DT O2 B0105 : score 4.17407 : H : ARG NH2 A0042 <- 2.90 -> DT O2 C0113 : score 4.14867 : x : ALA xxxx A0026 <- 3.44 -> DG xxx B0103 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0029 <- 3.42 -> DC xxx C0114 : score x.xxxxx >1y1w_AB: title=COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 2.87 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0505 <- 3.58 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx >1y1w_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ASP xxxx B0505 <- 3.58 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx >1y6f_AB:UDP-Glycosyltransferase/glycogen_phosphorylase; title=ALPHA-GLUCOSYLTRANSFERASE IN COMPLEX WITH UDP-GLUCOSE AND DNA CONTAINING AN ABASIC SITE organism=Enterobacteria phage T4 : w : ASP OD2 A1273 <- 6.37 -> DA N7 C0008 : score 2.024 : V : ALA CB A1239 <- 3.78 -> DT C7 C0006 : score 5.62697 : x : LEU xxxx A1119 <- 3.55 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1123 <- 3.88 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1206 <- 3.92 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1207 <- 3.79 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1236 <- 3.09 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1238 <- 3.54 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1240 <- 3.90 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1241 <- 3.38 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1244 <- 3.69 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B1119 <- 4.24 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B1207 <- 3.95 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B1238 <- 3.87 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B1239 <- 4.46 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >1y6f_B:UDP-Glycosyltransferase/glycogen_phosphorylase; title=ALPHA-GLUCOSYLTRANSFERASE IN COMPLEX WITH UDP-GLUCOSE AND DNA CONTAINING AN ABASIC SITE organism=Enterobacteria phage T4 : x : LEU xxxx B1119 <- 4.24 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B1207 <- 3.95 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B1238 <- 3.16 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B1239 <- 4.46 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1241 <- 3.99 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx >1y6g_AB:UDP-Glycosyltransferase/glycogen_phosphorylase; title=ALPHA-GLUCOSYLTRANSFERASE IN COMPLEX WITH UDP AND A 13_MER DNA CONTAINING A HMU BASE AT 2.8 A RESOLUTION organism=Enterobacteria phage T4 : H : LYS NZ A1244 <- 2.62 -> DG N7 D0007 : score 5.57979 : V : ALA CB A1239 <- 3.81 -> DT C7 C0006 : score 5.58498 : V : ARG CB A1236 <- 3.51 -> DT C7 D0006 : score 1.078 : x : THR xxxx A1206 <- 4.17 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1207 <- 3.56 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1238 <- 3.62 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1240 <- 4.00 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1241 <- 3.56 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A1242 <- 3.83 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1245 <- 4.39 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B1119 <- 3.12 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B1207 <- 3.83 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B1238 <- 3.25 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B1239 <- 3.67 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1241 <- 4.14 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B1242 <- 4.40 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx >1y6g_B:UDP-Glycosyltransferase/glycogen_phosphorylase; title=ALPHA-GLUCOSYLTRANSFERASE IN COMPLEX WITH UDP AND A 13_MER DNA CONTAINING A HMU BASE AT 2.8 A RESOLUTION organism=Enterobacteria phage T4 : V : THR CG2 B1207 <- 3.83 -> DT C7 C0011 : score 4.20515 : x : LEU xxxx B1119 <- 3.12 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B1238 <- 3.28 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B1239 <- 3.98 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >1y77_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX WITH SUBSTRATE ANALOGUE GMPCPP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 A1386 <- 2.49 -> DT O2 T0015 : score 4.57341 : H : ARG NH2 A1386 <- 2.24 -> DT O2 T0015 : score 4.70747 : x : HIS xxxx A1387 <- 4.41 -> DG xxx N0003 : score x.xxxxx >1y77_AB: title=COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX WITH SUBSTRATE ANALOGUE GMPCPP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 A1386 <- 2.49 -> DT O2 T0015 : score 4.57341 : H : ARG NH2 A1386 <- 2.24 -> DT O2 T0015 : score 4.70747 : x : HIS xxxx A1387 <- 4.41 -> DG xxx N0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0505 <- 3.25 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx >1y8z_A:UDP-Glycosyltransferase/glycogen_phosphorylase; title=ALPHA-GLUCOSYLTRANSFERASE IN COMPLEX WITH UDP AND A 13-MER DNA CONTAINING A HMU BASE AT 1.9 A RESOLUTION organism=Enterobacteria phage T4 : H : LYS NZ A1244 <- 2.90 -> DG N7 D0007 : score 5.27818 : V : THR CG2 A1045 <- 3.79 -> DT C7 D0004 : score 4.24752 : x : LEU xxxx A1119 <- 4.08 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1206 <- 3.63 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1207 <- 3.27 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1236 <- 3.42 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1238 <- 3.40 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A1239 <- 3.24 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1240 <- 3.79 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1241 <- 3.51 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A1242 <- 4.41 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx >1y8z_AB:UDP-Glycosyltransferase/glycogen_phosphorylase; title=ALPHA-GLUCOSYLTRANSFERASE IN COMPLEX WITH UDP AND A 13-MER DNA CONTAINING A HMU BASE AT 1.9 A RESOLUTION organism=Enterobacteria phage T4 : H : LYS NZ A1244 <- 2.90 -> DG N7 D0007 : score 5.27818 : V : THR CG2 A1045 <- 3.79 -> DT C7 D0004 : score 4.24752 : x : LEU xxxx A1119 <- 4.08 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1206 <- 3.63 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1207 <- 3.27 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1236 <- 3.42 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1238 <- 3.40 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A1239 <- 3.24 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1240 <- 3.79 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1241 <- 3.51 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A1242 <- 4.41 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B1119 <- 3.28 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B1207 <- 3.60 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1237 <- 4.43 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B1238 <- 3.29 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B1239 <- 3.50 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B1242 <- 3.78 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx >1ya6_A:UDP-Glycosyltransferase/glycogen_phosphorylase; title=ALPHA-GLUCOSYLTRANSFERASE IN COMPLEX WITH UDP AND A 13-MER DNA CONTAINING A CENTRAL A:G MISMATCH organism=Enterobacteria phage T4 : H : LYS NZ A1244 <- 2.79 -> DG N7 D0007 : score 5.39667 : x : THR xxxx A1045 <- 3.33 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1206 <- 4.20 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1207 <- 3.54 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1235 <- 3.27 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1236 <- 3.46 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1237 <- 3.58 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1238 <- 3.45 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A1239 <- 3.31 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1240 <- 3.85 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1241 <- 3.49 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A1242 <- 4.40 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A1274 <- 3.70 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx >1ya6_AB:UDP-Glycosyltransferase/glycogen_phosphorylase; title=ALPHA-GLUCOSYLTRANSFERASE IN COMPLEX WITH UDP AND A 13-MER DNA CONTAINING A CENTRAL A:G MISMATCH organism=Enterobacteria phage T4 : H : LYS NZ A1244 <- 2.79 -> DG N7 D0007 : score 5.39667 : x : THR xxxx A1045 <- 3.33 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1206 <- 4.20 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1207 <- 3.54 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1235 <- 3.27 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1236 <- 3.46 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1237 <- 3.58 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1238 <- 3.45 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A1239 <- 3.31 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1240 <- 3.85 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1241 <- 3.49 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A1242 <- 4.40 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A1274 <- 3.70 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B1119 <- 3.36 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B1207 <- 4.15 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1237 <- 4.00 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B1238 <- 3.00 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B1239 <- 3.31 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B1242 <- 3.98 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx >1yfh_A:Methylated_DNA-protein_cysteine_methyltransferase_domain;Methylated_DNA-protein_cysteine_methyltransferase,_C-terminal_domain; title=WT HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE BOUND TO DNA CONTAINING AN ALKYLATED CYTOSINE organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0128 <- 2.80 -> DA xxx G0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0129 <- 4.05 -> DC xxx G0007 : score x.xxxxx >1yfh_AB:Methylated_DNA-protein_cysteine_methyltransferase_domain;Methylated_DNA-protein_cysteine_methyltransferase,_C-terminal_domain; title=WT HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE BOUND TO DNA CONTAINING AN ALKYLATED CYTOSINE organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0128 <- 2.80 -> DA xxx G0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0129 <- 4.05 -> DC xxx G0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0128 <- 3.35 -> DG xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0129 <- 4.22 -> DC xxx G0015 : score x.xxxxx >1yfi_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF RESTRICTION ENDONUCLEASE MSPI IN COMPLEX WITH ITS COGNATE DNA IN P212121 SPACE GROUP organism=MORAXELLA SP. : w : SER OG A0027 <- 5.74 -> DC O2 C0005 : score 1.768 : H : SER OG A0127 <- 2.72 -> DG N7 C0006 : score 4.55376 : w : GLU OE1 A0130 <- 6.08 -> DC N4 C0005 : score 3.528 : w : GLU OE1 A0130 <- 5.70 -> DC N4 C0004 : score 3.528 : H : THR OG1 A0248 <- 2.90 -> DC N4 D0014 : score 3.95267 : H : SER OG A0251 <- 2.60 -> DG N7 D0016 : score 4.66133 : w : SER OG A0251 <- 5.61 -> DG O6 D0017 : score 2.749 : H : GLN NE2 A0259 <- 2.83 -> DG O6 C0006 : score 5.7703 : H : LYS NZ A0261 <- 3.02 -> DG O6 C0006 : score 5.52642 : H : LYS NZ A0261 <- 2.97 -> DG O6 C0007 : score 5.58422 : H : SER OG B0127 <- 2.71 -> DG N7 E0006 : score 4.56273 : H : SER OG B0127 <- 3.18 -> DG O6 E0006 : score 3.78011 : w : SER OG B0127 <- 6.03 -> DG N7 E0007 : score 2.749 : w : GLU OE1 B0130 <- 5.43 -> DC N4 E0004 : score 3.528 : H : THR OG1 B0248 <- 2.90 -> DC N4 F0014 : score 3.95267 : H : SER OG B0251 <- 2.52 -> DG N7 F0016 : score 4.73305 : H : GLN NE2 B0259 <- 2.74 -> DG O6 E0006 : score 5.87479 : H : LYS NZ B0261 <- 3.15 -> DG O6 E0006 : score 5.37612 : H : LYS NZ B0261 <- 2.84 -> DG O6 E0007 : score 5.73452 : w : LYS NZ B0261 <- 5.75 -> DG N7 E0007 : score 2.519 : x : LYS xxxx A0123 <- 3.69 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0246 <- 4.16 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0249 <- 3.40 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0253 <- 4.23 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0123 <- 4.03 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0237 <- 4.30 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0246 <- 4.31 -> DC xxx F0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0249 <- 3.43 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0253 <- 4.12 -> DC xxx E0002 : score x.xxxxx >1yfi_B:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RESTRICTION ENDONUCLEASE MSPI IN COMPLEX WITH ITS COGNATE DNA IN P212121 SPACE GROUP organism=MORAXELLA SP. : H : SER OG B0127 <- 2.71 -> DG N7 E0006 : score 4.56273 : H : SER OG B0127 <- 3.18 -> DG O6 E0006 : score 3.78011 : w : SER OG B0127 <- 6.03 -> DG N7 E0007 : score 2.749 : w : GLU OE1 B0130 <- 5.43 -> DC N4 E0004 : score 3.528 : H : THR OG1 B0248 <- 2.90 -> DC N4 F0014 : score 3.95267 : H : SER OG B0251 <- 2.52 -> DG N7 F0016 : score 4.73305 : H : GLN NE2 B0259 <- 2.74 -> DG O6 E0006 : score 5.87479 : H : LYS NZ B0261 <- 3.15 -> DG O6 E0006 : score 5.37612 : H : LYS NZ B0261 <- 2.84 -> DG O6 E0007 : score 5.73452 : w : LYS NZ B0261 <- 5.75 -> DG N7 E0007 : score 2.519 : x : LYS xxxx B0123 <- 4.03 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0237 <- 4.30 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0246 <- 4.31 -> DC xxx F0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0249 <- 3.43 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0253 <- 4.12 -> DC xxx E0002 : score x.xxxxx >1yfj_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=T4DAM IN COMPLEX WITH ADOHCY AND 15-MER OLIGONUCLEOTIDE SHOWING SEMI- SPECIFIC AND SPECIFIC CONTACT organism=? : H : ARG NH1 B0130 <- 3.15 -> DG N7 80815 : score 5.6265 : H : ARG NH2 B0130 <- 2.58 -> DG O6 80815 : score 6.8904 : x : SER xxxx B0112 <- 3.46 -> DG xxx 80815 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0113 <- 4.15 -> DG xxx 80815 : score x.xxxxx >1yfj_EF: title=T4DAM IN COMPLEX WITH ADOHCY AND 15-MER OLIGONUCLEOTIDE SHOWING SEMI- SPECIFIC AND SPECIFIC CONTACT organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T4 : H : ARG NH1 E0130 <- 3.22 -> DG N7 01015 : score 5.5418 : H : ARG NH2 E0130 <- 3.16 -> DG N7 01015 : score 5.92492 : H : ARG NH2 E0130 <- 2.55 -> DG O6 01015 : score 6.93 : H : SER OG F0112 <- 2.97 -> DT N3 90909 : score 1.91962 : H : ARG NH1 F0116 <- 2.71 -> DG O6 90907 : score 6.19283 : H : ARG NH2 F0116 <- 2.92 -> DG N7 90907 : score 6.23138 : H : ARG NH1 F0130 <- 3.36 -> DG N7 01007 : score 5.3724 : H : ARG NH2 F0130 <- 3.09 -> DG O6 01007 : score 6.2172 : H : TYR OH F0181 <- 2.41 -> DA N7 01008 : score 4.47508 : V : PHE CD2 F0111 <- 3.83 -> DT C7 90909 : score 6.46296 : x : SER xxxx E0112 <- 3.27 -> DG xxx 01015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0113 <- 4.38 -> DG xxx 01015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0113 <- 4.49 -> DG xxx 01006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0114 <- 3.67 -> DT xxx 01009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0126 <- 3.15 -> DA xxx 90908 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0129 <- 4.11 -> DT xxx 90909 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0171 <- 3.14 -> DA xxx 01008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0174 <- 3.43 -> DA xxx 01008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0177 <- 4.07 -> DA xxx 01008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0178 <- 4.44 -> DT xxx 01009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0179 <- 3.39 -> DA xxx 01008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0180 <- 4.38 -> DT xxx 01009 : score x.xxxxx >1yfl_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=T4DAM IN COMPLEX WITH SINEFUNGIN AND 16-MER OLIGONUCLEOTIDE SHOWING SEMI-SPECIFIC AND SPECIFIC CONTACT AND FLIPPED BASE organism=Enterobacteria phage T4 : H : SER OG A0112 <- 2.56 -> DT N3 F0501 : score 2.08256 : H : ARG NH1 A0130 <- 3.13 -> DG O6 G0615 : score 5.68183 : H : ARG NH2 A0130 <- 2.76 -> DG N7 G0615 : score 6.43569 : H : ARG NH2 A0130 <- 2.72 -> DG O6 G0615 : score 6.7056 : H : ASP OD1 A0171 <- 3.17 -> DA N6 G0616 : score 3.22438 : H : SER OG B0112 <- 2.49 -> DT N3 F0509 : score 2.11038 : H : ARG NH1 B0116 <- 3.37 -> DG O6 F0507 : score 5.38983 : H : ARG NH2 B0116 <- 3.07 -> DG N7 F0507 : score 6.03985 : H : ARG NH1 B0130 <- 3.19 -> DG O6 G0607 : score 5.60883 : H : ARG NH2 B0130 <- 2.85 -> DG N7 G0607 : score 6.32077 : H : ARG NH2 B0130 <- 2.63 -> DG O6 G0607 : score 6.8244 : H : ASP OD1 B0171 <- 3.24 -> DA N6 G0608 : score 3.17563 : V : PHE CD2 A0111 <- 3.76 -> DT C7 F0501 : score 6.57691 : V : PHE CD2 B0111 <- 3.77 -> DT C7 F0509 : score 6.56063 : x : LYS xxxx A0011 <- 3.11 -> DA xxx G0616 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0113 <- 3.88 -> DG xxx G0615 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0129 <- 4.24 -> DT xxx F0501 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0173 <- 4.45 -> DA xxx G0616 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0174 <- 3.15 -> DA xxx G0616 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0177 <- 2.96 -> DA xxx G0616 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0179 <- 3.60 -> DA xxx G0616 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0181 <- 3.41 -> DA xxx G0616 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0182 <- 4.03 -> DA xxx G0616 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0011 <- 3.46 -> DA xxx G0608 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0113 <- 3.89 -> DG xxx G0607 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0114 <- 3.59 -> DT xxx G0609 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0126 <- 3.32 -> DA xxx F0508 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0129 <- 4.37 -> DT xxx F0509 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0173 <- 4.23 -> DA xxx G0608 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0174 <- 3.13 -> DA xxx G0608 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0177 <- 3.04 -> DA xxx G0608 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0179 <- 3.40 -> DA xxx G0608 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0180 <- 4.24 -> DT xxx G0609 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0181 <- 3.33 -> DA xxx G0608 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0182 <- 3.61 -> DA xxx G0608 : score x.xxxxx >1yfl_D:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=T4DAM IN COMPLEX WITH SINEFUNGIN AND 16-MER OLIGONUCLEOTIDE SHOWING SEMI-SPECIFIC AND SPECIFIC CONTACT AND FLIPPED BASE organism=Enterobacteria phage T4 : H : SER OG D0112 <- 2.74 -> DT N3 H0501 : score 2.01103 : H : ARG NH1 D0130 <- 3.25 -> DG O6 I0615 : score 5.53583 : H : ARG NH2 D0130 <- 2.65 -> DG N7 I0615 : score 6.57615 : H : ARG NH2 D0130 <- 3.12 -> DG O6 I0615 : score 6.1776 : x : THR xxxx D0008 <- 4.15 -> DA xxx I0616 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0011 <- 3.70 -> DA xxx I0616 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0111 <- 3.23 -> DT xxx H0501 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0113 <- 3.87 -> DG xxx I0615 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0129 <- 4.00 -> DT xxx H0501 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0171 <- 4.05 -> DA xxx I0616 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0173 <- 4.15 -> DA xxx I0616 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0174 <- 3.28 -> DA xxx I0616 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0177 <- 3.16 -> DA xxx I0616 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0179 <- 3.19 -> DA xxx I0616 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0181 <- 3.29 -> DA xxx I0616 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0182 <- 3.43 -> DA xxx I0616 : score x.xxxxx >1yfl_DE:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=T4DAM IN COMPLEX WITH SINEFUNGIN AND 16-MER OLIGONUCLEOTIDE SHOWING SEMI-SPECIFIC AND SPECIFIC CONTACT AND FLIPPED BASE organism=Enterobacteria phage T4 : H : SER OG D0112 <- 2.74 -> DT N3 H0501 : score 2.01103 : H : ARG NH1 D0130 <- 3.25 -> DG O6 I0615 : score 5.53583 : H : ARG NH2 D0130 <- 2.65 -> DG N7 I0615 : score 6.57615 : H : ARG NH2 D0130 <- 3.12 -> DG O6 I0615 : score 6.1776 : H : SER OG E0112 <- 2.67 -> DT N3 H0509 : score 2.03885 : H : ARG NH1 E0116 <- 2.82 -> DG O6 H0507 : score 6.059 : H : ARG NH2 E0116 <- 2.58 -> DG N7 H0507 : score 6.66554 : H : ARG NH1 E0130 <- 3.30 -> DG O6 I0607 : score 5.475 : H : ARG NH2 E0130 <- 2.67 -> DG N7 I0607 : score 6.55062 : H : ARG NH2 E0130 <- 3.19 -> DG O6 I0607 : score 6.0852 : H : ASP OD1 E0171 <- 3.39 -> DA N6 I0608 : score 3.07117 : V : PHE CD2 E0111 <- 3.88 -> DT C7 H0509 : score 6.38156 : x : THR xxxx D0008 <- 4.15 -> DA xxx I0616 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0011 <- 3.70 -> DA xxx I0616 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0111 <- 3.23 -> DT xxx H0501 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0113 <- 3.87 -> DG xxx I0615 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0129 <- 4.00 -> DT xxx H0501 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0171 <- 4.05 -> DA xxx I0616 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0173 <- 4.15 -> DA xxx I0616 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0174 <- 3.28 -> DA xxx I0616 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0177 <- 3.16 -> DA xxx I0616 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0179 <- 3.19 -> DA xxx I0616 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0181 <- 3.29 -> DA xxx I0616 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0182 <- 3.43 -> DA xxx I0616 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0008 <- 4.08 -> DA xxx I0608 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0011 <- 3.45 -> DA xxx I0608 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0113 <- 4.24 -> DG xxx I0607 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0114 <- 3.79 -> DA xxx H0508 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0126 <- 3.13 -> DA xxx H0508 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0129 <- 4.19 -> DT xxx H0509 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0173 <- 4.24 -> DA xxx I0608 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0174 <- 3.27 -> DA xxx I0608 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0177 <- 3.39 -> DA xxx I0608 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0178 <- 3.56 -> DT xxx I0609 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0179 <- 3.25 -> DA xxx I0608 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0181 <- 3.21 -> DA xxx I0608 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0182 <- 3.73 -> DA xxx I0608 : score x.xxxxx >1ynw_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF VITAMIN D RECEPTOR AND 9-CIS RETINOIC ACID RECEPTOR DNA-BINDING DOMAINS BOUND TO A DR3 RESPONSE ELEMENT organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 A0042 <- 2.67 -> DC N4 D0433 : score 5.91792 : H : LYS NZ A0045 <- 2.64 -> DG O6 C0404 : score 5.96575 : H : ARG NH1 A0050 <- 3.19 -> DG N7 D0431 : score 5.5781 : x : ARG xxxx A0049 <- 4.31 -> DG xxx C0404 : score x.xxxxx >1ynw_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF VITAMIN D RECEPTOR AND 9-CIS RETINOIC ACID RECEPTOR DNA-BINDING DOMAINS BOUND TO A DR3 RESPONSE ELEMENT organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 A0042 <- 2.67 -> DC N4 D0433 : score 5.91792 : H : LYS NZ A0045 <- 2.64 -> DG O6 C0404 : score 5.96575 : H : ARG NH1 A0050 <- 3.19 -> DG N7 D0431 : score 5.5781 : H : GLU OE2 B0253 <- 2.77 -> DC N4 D0424 : score 5.29698 : H : ARG NH1 B0261 <- 2.85 -> DG N7 D0422 : score 5.9895 : x : ARG xxxx A0049 <- 4.31 -> DG xxx C0404 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0256 <- 3.50 -> DG xxx C0413 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0260 <- 3.32 -> DG xxx C0414 : score x.xxxxx >1yo5_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ANALYSIS OF THE 2.0A CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTEIN-DNA COMPLEX OF HUMAN PDEF ETS DOMAIN BOUND TO THE PROSTATE SPECIFIC ANTIGEN REGULATORY SITE organism=Homo sapiens : H : ARG NE C0307 <- 2.72 -> DG O6 A0007 : score 4.00408 : H : ARG NH2 C0307 <- 2.94 -> DG N7 A0007 : score 6.20585 : w : SER OG C0308 <- 5.74 -> DA N7 B0005 : score 2.343 : H : ARG NE C0310 <- 3.03 -> DG N7 A0006 : score 4.21839 : H : ARG NH2 C0310 <- 3.09 -> DG O6 A0006 : score 6.2172 : w : GLN OE1 C0311 <- 5.81 -> DT O4 B0006 : score 3.068 : H : ARG NH2 C0326 <- 3.33 -> DA N3 A0002 : score 2.89633 : w : ARG NE C0326 <- 6.34 -> DT O2 B0012 : score 0.757 : w : ARG NH2 C0326 <- 5.65 -> DT O2 A0001 : score 2.261 : x : LYS xxxx C0304 <- 3.85 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx >1yqk_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=HUMAN 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE CROSSLINKED WITH GUANINE CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : H : SER OG A0148 <- 3.13 -> DG N3 C0024 : score 2.58886 : H : SER OG A0148 <- 3.13 -> DG N3 C0024 : score 2.58886 : H : ARG NH1 A0204 <- 3.13 -> DC O2 B0008 : score 3.4091 : x : CYS xxxx A0149 <- 3.32 -> DG xxx C0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0151 <- 4.50 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0152 <- 3.30 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0203 <- 3.40 -> DG xxx C0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0207 <- 3.99 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0268 <- 3.43 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0270 <- 3.17 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0319 <- 3.89 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx >1yql_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CATALYTICALLY INACTIVE HOGG1 CROSSLINKED WITH 7-DEAZA-8-AZAGUANINE CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : H : SER OG A0148 <- 2.99 -> DG N3 C0024 : score 2.66647 : H : SER OG A0148 <- 2.99 -> DG N3 C0024 : score 2.66647 : H : ASN ND2 A0151 <- 3.29 -> DA N3 C0022 : score 3.43454 : H : ARG NH1 A0154 <- 3.49 -> DC O2 B0008 : score 3.1463 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.88 -> DC O2 B0008 : score 3.5916 : x : CYS xxxx A0149 <- 3.49 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0203 <- 3.47 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0207 <- 4.35 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0293 <- 4.45 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx >1yqm_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CATALYTICALLY INACTIVE HUMAN 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE CROSSLINKED TO 7-DEAZAGUANINE CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : H : SER OG A0148 <- 3.26 -> DG N3 C0024 : score 2.51679 : H : ASN ND2 A0151 <- 3.41 -> DA N3 C0022 : score 3.34315 : H : ASN ND2 A0151 <- 3.41 -> DA N3 C0022 : score 3.34315 : H : ARG NH2 A0154 <- 2.88 -> DC O2 B0008 : score 3.63954 : H : ARG NH1 A0204 <- 3.00 -> DC O2 B0008 : score 3.504 : V : PRO CG A0293 <- 3.82 -> DT C7 B0003 : score 6.32718 : x : CYS xxxx A0149 <- 3.65 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0203 <- 3.42 -> DG xxx C0024 : score x.xxxxx >1yqr_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CATALYTICALLY INACTIVE HUMAN 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE CROSSLINKED TO OXOG CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : H : SER OG A0148 <- 3.12 -> DG N3 C0024 : score 2.5944 : H : SER OG A0148 <- 3.12 -> DG N3 C0024 : score 2.5944 : H : ARG NH2 A0204 <- 2.37 -> DC O2 B0008 : score 4.01681 : x : CYS xxxx A0149 <- 3.61 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0151 <- 3.77 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0154 <- 2.86 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0203 <- 3.59 -> DG xxx C0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0207 <- 4.49 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0293 <- 4.28 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx >1yrn_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MATA1/MATALPHA2 HOMEODOMAIN HETERODIMER BOUND TO DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN OD1 A0120 <- 3.37 -> DA N6 D0026 : score 5.33531 : H : ASN ND2 A0120 <- 2.99 -> DA N7 D0026 : score 5.64743 : H : ARG NH1 A0124 <- 2.66 -> DG N7 D0025 : score 6.2194 : H : ARG NH2 A0124 <- 3.02 -> DT O4 C0019 : score 3.39748 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.52 -> DG O6 D0025 : score 6.9696 : x : ARG xxxx A0115 <- 3.32 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0116 <- 3.87 -> DA xxx D0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0119 <- 3.27 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0123 <- 3.37 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx >1yrn_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MATA1/MATALPHA2 HOMEODOMAIN HETERODIMER BOUND TO DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN OD1 A0120 <- 3.37 -> DA N6 D0026 : score 5.33531 : H : ASN ND2 A0120 <- 2.99 -> DA N7 D0026 : score 5.64743 : H : ARG NH1 A0124 <- 2.66 -> DG N7 D0025 : score 6.2194 : H : ARG NH2 A0124 <- 3.02 -> DT O4 C0019 : score 3.39748 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.52 -> DG O6 D0025 : score 6.9696 : H : ARG NE B0132 <- 3.20 -> DA N3 D0038 : score 1.93436 : w : ARG NH2 B0132 <- 5.05 -> DC O2 D0039 : score 1.669 : H : ARG NH1 B0135 <- 2.70 -> DT O2 C0011 : score 4.39254 : w : ARG NH1 B0135 <- 5.42 -> DT O2 D0036 : score 1.855 : w : SER OG B0181 <- 5.72 -> DT O4 C0005 : score 2.338 : w : SER OG B0181 <- 5.45 -> DA N7 C0004 : score 2.343 : H : ASN OD1 B0182 <- 3.25 -> DA N6 D0038 : score 5.47983 : H : ARG NH2 B0185 <- 2.34 -> DG N7 C0006 : score 6.972 : H : ARG NH2 B0185 <- 2.69 -> DG O6 C0006 : score 6.7452 : x : ARG xxxx A0115 <- 3.32 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0116 <- 3.87 -> DA xxx D0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0119 <- 3.27 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0123 <- 3.37 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0178 <- 3.44 -> DC xxx D0039 : score x.xxxxx >1ysa_C:Leucine_zipper_domain; title=THE GCN4 BASIC REGION LEUCINE ZIPPER BINDS DNA AS A DIMER OF UNINTERRUPTED ALPHA HELICES: CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTEIN-DNA COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN OD1 C0235 <- 3.01 -> DC N4 A0012 : score 4.01746 : H : ASN ND2 C0235 <- 2.94 -> DT O4 B0029 : score 5.13665 : V : ALA CB C0239 <- 3.90 -> DT C7 A0011 : score 5.459 : x : LYS xxxx C0231 <- 3.93 -> DA xxx B0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0236 <- 3.88 -> DT xxx A0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0238 <- 3.74 -> DA xxx B0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0243 <- 4.05 -> DA xxx A0009 : score x.xxxxx >1ysa_CD:Leucine_zipper_domain; title=THE GCN4 BASIC REGION LEUCINE ZIPPER BINDS DNA AS A DIMER OF UNINTERRUPTED ALPHA HELICES: CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTEIN-DNA COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN OD1 C0235 <- 3.01 -> DC N4 A0012 : score 4.01746 : H : ASN ND2 C0235 <- 2.94 -> DT O4 B0029 : score 5.13665 : H : ASN OD1 D0235 <- 2.99 -> DC N4 B0034 : score 4.03423 : H : ASN ND2 D0235 <- 3.17 -> DT O4 A0007 : score 4.89355 : w : ASN ND2 D0235 <- 6.47 -> DA N6 A0006 : score 2.5 : H : ARG NH1 D0243 <- 2.88 -> DG O6 B0032 : score 5.986 : H : ARG NH2 D0243 <- 2.62 -> DG N7 B0032 : score 6.61446 : V : ALA CB D0239 <- 3.67 -> DT C7 B0033 : score 5.78094 : V : ALA CB C0239 <- 3.90 -> DT C7 A0011 : score 5.459 : x : LYS xxxx C0231 <- 3.93 -> DA xxx B0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0236 <- 3.88 -> DT xxx A0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0238 <- 3.74 -> DA xxx B0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0243 <- 4.05 -> DA xxx A0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0231 <- 4.45 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0236 <- 4.18 -> DT xxx B0033 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0238 <- 3.98 -> DA xxx A0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0242 <- 4.14 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx >1ytb_A:TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A YEAST TBP/TATA-BOX COMPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ASN ND2 A0069 <- 3.14 -> DA N3 C0024 : score 3.54877 : H : THR OG1 A0124 <- 2.93 -> DA N3 C0024 : score 1.31865 : H : ASN ND2 A0159 <- 3.40 -> DA N3 C0005 : score 3.35077 : H : ASN ND2 A0159 <- 3.28 -> DT O2 C0006 : score 4.29052 : H : THR OG1 A0215 <- 2.90 -> DA N3 C0005 : score 1.32677 : x : VAL xxxx A0071 <- 3.37 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0099 <- 3.34 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0114 <- 3.49 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0116 <- 3.79 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0122 <- 3.57 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0161 <- 3.35 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0190 <- 3.36 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0191 <- 3.38 -> DA xxx C0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0205 <- 3.77 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0207 <- 3.32 -> DT xxx C0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0213 <- 3.56 -> DA xxx C0026 : score x.xxxxx >1ytf_A:TATA-box_binding_protein-like; title=YEAST TFIIA/TBP/DNA COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN ND2 A0069 <- 2.97 -> DT O2 F0004 : score 4.58478 : H : ASN ND2 A0069 <- 3.30 -> DT O2 F0005 : score 4.27154 : H : ASN ND2 A0159 <- 3.26 -> DA N3 E0012 : score 3.45738 : H : ASN ND2 A0159 <- 3.44 -> DA N3 E0013 : score 3.32031 : H : THR OG1 A0215 <- 2.77 -> DA N3 E0012 : score 1.36197 : x : VAL xxxx A0071 <- 3.50 -> DA xxx E0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0099 <- 3.33 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0114 <- 3.65 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0116 <- 3.88 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0122 <- 3.76 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0124 <- 3.83 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0161 <- 3.38 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0190 <- 3.31 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0191 <- 3.20 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0205 <- 3.50 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0207 <- 3.36 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0213 <- 3.47 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx >1ytf_AC:Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;TATA-box_binding_protein-like; title=YEAST TFIIA/TBP/DNA COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN ND2 A0069 <- 2.97 -> DT O2 F0004 : score 4.58478 : H : ASN ND2 A0069 <- 3.30 -> DT O2 F0005 : score 4.27154 : H : ASN ND2 A0159 <- 3.26 -> DA N3 E0012 : score 3.45738 : H : ASN ND2 A0159 <- 3.44 -> DA N3 E0013 : score 3.32031 : H : THR OG1 A0215 <- 2.77 -> DA N3 E0012 : score 1.36197 : x : VAL xxxx A0071 <- 3.50 -> DA xxx E0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0099 <- 3.33 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0114 <- 3.65 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0116 <- 3.88 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0122 <- 3.76 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0124 <- 3.83 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0161 <- 3.38 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0190 <- 3.31 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0191 <- 3.20 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0205 <- 3.50 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0207 <- 3.36 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0213 <- 3.47 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx >1yui_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE GAGA FACTOR/DNA COMPLEX, REGULARIZED MEAN STRUCTURE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH1 A0014 <- 2.91 -> DC O2 C0117 : score 3.5697 : H : LYS NZ A0016 <- 3.07 -> DC O2 C0119 : score 2.78706 : H : ARG NH1 A0027 <- 2.41 -> DG O6 B0108 : score 6.55783 : H : ARG NH1 A0047 <- 2.43 -> DG O6 B0106 : score 6.5335 : H : ASN OD1 A0048 <- 3.29 -> DA N6 B0105 : score 5.43166 : H : ASN ND2 A0048 <- 3.46 -> DA N7 B0105 : score 5.0956 : H : ARG NH1 A0051 <- 2.78 -> DG O6 B0104 : score 6.10767 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.98 -> DG N7 B0104 : score 6.15477 : H : ARG NH2 A0051 <- 3.26 -> DG O6 B0104 : score 5.9928 : x : SER xxxx A0030 <- 4.10 -> DA xxx C0114 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0045 <- 2.62 -> DA xxx B0105 : score x.xxxxx >1yuj_A:C2H2_and_C2HC_zinc_fingers; title=SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE GAGA FACTOR/DNA COMPLEX, 50 STRUCTURES organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH1 A0014 <- 2.53 -> DC O2 C0117 : score 3.8471 : H : LYS NZ A0016 <- 3.40 -> DT O2 C0118 : score 3.15672 : H : ARG NH1 A0027 <- 2.46 -> DG O6 B0108 : score 6.497 : H : ARG NH1 A0047 <- 2.94 -> DG O6 B0106 : score 5.913 : H : ASN OD1 A0048 <- 3.32 -> DA N6 B0105 : score 5.39553 : H : ASN ND2 A0048 <- 3.36 -> DA N7 B0105 : score 5.21302 : H : ARG NH1 A0051 <- 2.79 -> DG O6 B0104 : score 6.0955 : H : ARG NH2 A0051 <- 3.06 -> DG O6 B0104 : score 6.2568 : x : SER xxxx A0030 <- 3.84 -> DA xxx C0114 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0031 <- 4.45 -> DT xxx C0116 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0045 <- 2.98 -> DA xxx B0105 : score x.xxxxx >1z19_B:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A LAMBDA INTEGRASE(75-356) DIMER BOUND TO A COC' CORE SITE organism=ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA : H : LYS NZ B0095 <- 2.81 -> DG O6 E0057 : score 5.76921 : H : ASN OD1 B0099 <- 3.16 -> DA N6 E0056 : score 5.58823 : H : ASN ND2 B0099 <- 3.21 -> DA N7 E0056 : score 5.38913 : w : ARG NH2 B0177 <- 5.64 -> DT O2 C0011 : score 2.261 : H : LYS NZ B0235 <- 2.67 -> DT O2 C0013 : score 3.68045 : H : ARG NH2 B0287 <- 2.81 -> DG O6 E0060 : score 6.5868 : x : THR xxxx B0096 <- 3.29 -> DA xxx E0055 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0100 <- 3.47 -> DA xxx E0054 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0102 <- 4.36 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0138 <- 3.97 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0139 <- 3.86 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0142 <- 3.72 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0276 <- 4.23 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0281 <- 4.13 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0284 <- 3.36 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0286 <- 4.19 -> DT xxx E0059 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0288 <- 3.42 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx >1z1b_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A LAMBDA INTEGRASE DIMER BOUND TO A COC' CORE SITE organism=ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA : H : ARG NH1 A0019 <- 2.66 -> DT O4 F0016 : score 3.35945 : V : TYR CG A0017 <- 3.61 -> DT C7 G0035 : score 3.91926 : x : ASN xxxx A0020 <- 3.33 -> DC xxx G0038 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0023 <- 3.70 -> DA xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0027 <- 3.06 -> DT xxx G0034 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0034 <- 3.63 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx >1z1g_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A LAMBDA INTEGRASE TETRAMER BOUND TO A HOLLIDAY JUNCTION organism=? : H : ARG NH2 A0287 <- 2.59 -> DG O6 J0025 : score 6.8772 : x : LYS xxxx A0095 <- 4.20 -> DG xxx J0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0096 <- 3.49 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0099 <- 2.68 -> DA xxx J0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0138 <- 4.12 -> DT xxx I0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0142 <- 3.89 -> DT xxx I0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0235 <- 3.56 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0338 <- 3.26 -> DT xxx I0013 : score x.xxxxx >1z63_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=SULFOLOBUS SOLFATARICUS SWI2/SNF2 ATPASE CORE IN COMPLEX WITH DSDNA organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : ARG xxxx A0547 <- 4.20 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx >1z9c_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF OHRR BOUND TO THE OHRA PROMOTER: STRUCTURE OF MARR FAMILY PROTEIN WITH OPERATOR DNA organism=Bacillus subtilis : w : ASP OD1 A0067 <- 5.51 -> DA N6 H0019 : score 3.122 : x : SER xxxx A0068 <- 2.52 -> DA xxx G0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0070 <- 3.40 -> DA xxx H0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0072 <- 4.07 -> DT xxx G0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0077 <- 3.28 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0094 <- 3.26 -> DA xxx H0025 : score x.xxxxx >1z9c_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF OHRR BOUND TO THE OHRA PROMOTER: STRUCTURE OF MARR FAMILY PROTEIN WITH OPERATOR DNA organism=Bacillus subtilis : w : ASP OD1 A0067 <- 5.51 -> DA N6 H0019 : score 3.122 : H : SER OG B0068 <- 2.49 -> DA N7 H0010 : score 4.74088 : H : ARG NH1 B0094 <- 2.79 -> DT O2 H0007 : score 4.31502 : x : SER xxxx A0068 <- 2.52 -> DA xxx G0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0070 <- 3.40 -> DA xxx H0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0072 <- 4.07 -> DT xxx G0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0077 <- 3.28 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0094 <- 3.26 -> DA xxx H0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0070 <- 3.26 -> DA xxx G0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0072 <- 3.83 -> DT xxx H0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0077 <- 3.80 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx >1z9c_CD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF OHRR BOUND TO THE OHRA PROMOTER: STRUCTURE OF MARR FAMILY PROTEIN WITH OPERATOR DNA organism=Bacillus subtilis : H : SER OG C0068 <- 2.65 -> DA N7 I0010 : score 4.59803 : w : ASP OD2 D0067 <- 5.66 -> DA N6 I0019 : score 3.409 : H : SER OG D0068 <- 2.35 -> DA N7 J0010 : score 4.86587 : H : ARG NH1 D0094 <- 3.05 -> DT O2 J0007 : score 4.09109 : w : ARG NH1 D0094 <- 5.96 -> DT O2 J0006 : score 1.855 : w : ARG NH2 D0094 <- 6.04 -> DT O2 J0006 : score 2.261 : x : ASP xxxx C0067 <- 4.15 -> DC xxx J0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0070 <- 3.33 -> DA xxx J0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0072 <- 3.83 -> DA xxx I0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 3.94 -> DT xxx J0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0094 <- 3.40 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0070 <- 3.20 -> DA xxx I0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0072 <- 3.41 -> DA xxx J0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0073 <- 4.48 -> DT xxx J0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0077 <- 4.18 -> DT xxx I0016 : score x.xxxxx >1z9c_EF:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF OHRR BOUND TO THE OHRA PROMOTER: STRUCTURE OF MARR FAMILY PROTEIN WITH OPERATOR DNA organism=Bacillus subtilis : w : ASP OD1 E0067 <- 6.10 -> DA N6 L0019 : score 3.122 : H : SER OG E0068 <- 2.64 -> DA N7 K0010 : score 4.60695 : H : ARG NH1 E0094 <- 2.87 -> DT O2 K0007 : score 4.24612 : w : ASP OD1 F0067 <- 6.06 -> DA N6 K0019 : score 3.122 : H : SER OG F0068 <- 3.13 -> DA N7 L0010 : score 4.16947 : H : ARG NH1 F0094 <- 2.98 -> DT O2 L0007 : score 4.15138 : x : THR xxxx E0070 <- 3.35 -> DA xxx L0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0072 <- 3.87 -> DT xxx K0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0077 <- 3.41 -> DT xxx L0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0070 <- 3.38 -> DA xxx K0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0072 <- 3.82 -> DA xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0077 <- 3.69 -> DT xxx K0016 : score x.xxxxx >1zaa_C:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZINC FINGER-DNA RECOGNITION: CRYSTAL STRUCTURE OF A ZIF268-DNA COMPLEX AT 2.1 ANGSTROMS organism=? : H : ARG NH1 C0018 <- 2.79 -> DG N7 A0010 : score 6.0621 : H : ARG NH2 C0018 <- 2.67 -> DG O6 A0010 : score 6.7716 : H : ASP OD2 C0020 <- 3.23 -> DA N6 B0002 : score 3.65834 : w : ASP OD2 C0020 <- 6.26 -> DC N4 A0009 : score 3.623 : w : ASP OD2 C0020 <- 6.15 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : H : ARG NH1 C0024 <- 2.93 -> DG O6 A0008 : score 5.92517 : H : ARG NH2 C0024 <- 2.78 -> DG N7 A0008 : score 6.41015 : w : ARG NH1 C0024 <- 5.31 -> DG O6 B0004 : score 2.756 : H : ARG NH1 C0046 <- 2.93 -> DG N7 A0007 : score 5.8927 : H : ARG NH2 C0046 <- 2.85 -> DG O6 A0007 : score 6.534 : w : SER OG C0047 <- 5.71 -> DG N7 B0004 : score 2.749 : H : ASP OD2 C0048 <- 3.00 -> DC N4 B0005 : score 5.952 : w : ASP OD2 C0048 <- 5.20 -> DC N4 B0006 : score 3.623 : H : HIS NE2 C0049 <- 2.81 -> DG N7 A0006 : score 6.78896 : H : ARG NH1 C0074 <- 2.97 -> DG N7 A0004 : score 5.8443 : H : ARG NH2 C0074 <- 2.54 -> DG O6 A0004 : score 6.9432 : H : ASP OD2 C0076 <- 3.19 -> DA N6 B0008 : score 3.69036 : w : ASP OD2 C0076 <- 6.27 -> DC N4 A0003 : score 3.623 : w : ASP OD2 C0076 <- 5.31 -> DC N4 B0009 : score 3.623 : H : ARG NH1 C0080 <- 2.99 -> DG O6 A0002 : score 5.85217 : H : ARG NH2 C0080 <- 2.86 -> DG N7 A0002 : score 6.308 : w : ARG NH1 C0080 <- 5.26 -> DG O6 B0010 : score 2.756 : x : GLU xxxx C0021 <- 3.61 -> DC xxx A0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0052 <- 3.94 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0077 <- 3.90 -> DG xxx A0002 : score x.xxxxx >1zay_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PURINE REPRESSOR-HYPOXANTHINE-MODIFIED-PURF-OPERATOR COMPLEX organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0016 <- 2.93 -> DA N6 M0703 : score 2.68724 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.68 -> DG O6 M0702 : score 6.22933 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.03 -> DG N7 M0702 : score 6.09092 : x : SER xxxx A0014 <- 4.13 -> DG xxx M0702 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0015 <- 4.39 -> DA xxx M0704 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.62 -> DT xxx M0707 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 2.90 -> DA xxx M0706 : score x.xxxxx >1zbb_G:Histone-fold; title=STRUCTURE OF THE 4_601_167 TETRANUCLEOSOME organism=? : H : LYS NZ G0013 <- 2.34 -> DT O2 J0309 : score 3.9172 : x : ARG xxxx G0042 <- 4.18 -> DA xxx J0302 : score x.xxxxx >1zbi_A:Ribonuclease_H-like; title=BACILLUS HALODURANS RNASE H CATALYTIC DOMAIN MUTANT D132N IN COMPLEX WITH 12-MER RNA/DNA HYBRID organism=Bacillus halodurans : H : ASN ND2 A0077 <- 2.82 -> DT O2 D0004 : score 4.72717 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.36 -> DC O2 D0005 : score 3.97778 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.05 -> DC O2 D0005 : score 4.25551 : w : GLN NE2 A0134 <- 5.84 -> DA N3 D0006 : score 1.888 : w : THR OG1 A0135 <- 5.47 -> DA N3 D0006 : score 2.845 >1zbi_AB:Ribonuclease_H-like; title=BACILLUS HALODURANS RNASE H CATALYTIC DOMAIN MUTANT D132N IN COMPLEX WITH 12-MER RNA/DNA HYBRID organism=Bacillus halodurans : H : ASN ND2 A0077 <- 2.82 -> DT O2 D0004 : score 4.72717 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.36 -> DC O2 D0005 : score 3.97778 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.05 -> DC O2 D0005 : score 4.25551 : w : GLN NE2 A0134 <- 5.84 -> DA N3 D0006 : score 1.888 : w : THR OG1 A0135 <- 5.47 -> DA N3 D0006 : score 2.845 : H : ASN ND2 B0077 <- 2.89 -> DT O2 D0009 : score 4.66072 : H : ASN OD1 B0106 <- 3.31 -> DG N2 D0010 : score 4.3104 : H : ASN ND2 B0106 <- 3.05 -> DG N3 D0010 : score 4.65013 : w : THR OG1 B0135 <- 5.53 -> DT O2 D0011 : score 2.522 : x : ASN xxxx B0105 <- 3.63 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >1zbl_AB:Ribonuclease_H-like; title=BACILLUS HALODURANS RNASE H CATALYTIC DOMAIN MUTANT D192N IN COMPLEX WITH 12-MER RNA/DNA HYBRID organism=Bacillus halodurans : H : ASN ND2 A0077 <- 2.53 -> DT O2 D0021 : score 5.00245 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.38 -> DG N3 D0022 : score 4.32707 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.23 -> DG N3 D0022 : score 4.47391 : w : GLN NE2 A0134 <- 5.80 -> DT O2 D0023 : score 1.565 : w : THR OG1 A0135 <- 6.14 -> DT O2 D0023 : score 2.522 : H : ASN ND2 B0077 <- 2.96 -> DA N3 D0015 : score 3.68585 : H : ASN ND2 B0105 <- 3.20 -> DT O2 D0016 : score 4.36646 : H : ASN ND2 B0106 <- 2.85 -> DT O2 D0016 : score 4.69869 : x : GLN xxxx B0134 <- 4.25 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0135 <- 3.31 -> DC xxx D0017 : score x.xxxxx >1zbl_B:Ribonuclease_H-like; title=BACILLUS HALODURANS RNASE H CATALYTIC DOMAIN MUTANT D192N IN COMPLEX WITH 12-MER RNA/DNA HYBRID organism=Bacillus halodurans : H : ASN ND2 B0077 <- 2.96 -> DA N3 D0015 : score 3.68585 : H : ASN ND2 B0105 <- 3.20 -> DT O2 D0016 : score 4.36646 : H : ASN ND2 B0106 <- 2.85 -> DT O2 D0016 : score 4.69869 >1zet_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=X-RAY DATA DO NOT SUPPORT HOOGSTEEN BASE-PAIRING DURING REPLICATION BY HUMAN POLYMERASE IOTA organism=Homo sapiens : w : TYR OH A0039 <- 5.76 -> DG N3 T0006 : score 3.344 : w : GLN OE1 A0059 <- 6.16 -> DG N3 T0006 : score 1.484 : H : ARG NH1 A0343 <- 2.81 -> DG O6 P0008 : score 6.07117 : H : ARG NH2 A0343 <- 2.89 -> DG O6 P0009 : score 6.4812 : x : LEU xxxx A0062 <- 4.12 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0064 <- 4.27 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0099 <- 4.39 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0305 <- 3.01 -> DG xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0357 <- 3.20 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0359 <- 3.30 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 2.48 -> DA xxx P0007 : score x.xxxxx >1zg1_A:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=NARL COMPLEXED TO NIRB PROMOTER NON-PALINDROMIC TAIL-TO-TAIL DNA SITE organism=Escherichia coli : w : LYS NZ A0192 <- 5.91 -> DG O6 C0015 : score 3.005 : V : LYS CG A0188 <- 3.68 -> DT C7 C0013 : score 2.18254 : V : VAL CG1 A0189 <- 3.90 -> DT C7 D0023 : score 5.909 : x : SER xxxx A0185 <- 3.57 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0186 <- 3.59 -> DA xxx D0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0190 <- 3.82 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >1zg1_AB:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=NARL COMPLEXED TO NIRB PROMOTER NON-PALINDROMIC TAIL-TO-TAIL DNA SITE organism=Escherichia coli : w : LYS NZ A0192 <- 5.91 -> DG O6 C0015 : score 3.005 : H : LYS NZ B0192 <- 3.06 -> DA N7 D0035 : score 2.78445 : V : LYS CG A0188 <- 3.68 -> DT C7 C0013 : score 2.18254 : V : VAL CG1 A0189 <- 3.90 -> DT C7 D0023 : score 5.909 : x : SER xxxx A0185 <- 3.57 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0186 <- 3.59 -> DA xxx D0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0190 <- 3.82 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0185 <- 3.78 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0186 <- 3.45 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0188 <- 4.19 -> DA xxx D0032 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0189 <- 3.80 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0190 <- 3.73 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx >1zg1_EF:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=NARL COMPLEXED TO NIRB PROMOTER NON-PALINDROMIC TAIL-TO-TAIL DNA SITE organism=Escherichia coli : w : LYS NZ E0188 <- 5.39 -> DG O6 G0013 : score 3.005 : H : LYS NZ F0192 <- 2.79 -> DG N7 H0035 : score 5.39667 : V : VAL CG1 F0189 <- 3.88 -> DT C7 G0003 : score 5.9393 : V : LYS CG F0188 <- 3.62 -> DT C7 H0033 : score 2.21433 : x : SER xxxx E0185 <- 3.69 -> DC xxx H0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0186 <- 3.59 -> DA xxx H0024 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0189 <- 3.72 -> DC xxx H0025 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0190 <- 3.75 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0192 <- 3.55 -> DA xxx G0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0185 <- 3.57 -> DC xxx G0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0186 <- 3.54 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0190 <- 3.86 -> DT xxx G0003 : score x.xxxxx >1zg5_A:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=NARL COMPLEXED TO NARG-89 PROMOTER PALINDROMIC TAIL-TO-TAIL DNA SITE organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0188 <- 3.10 -> DG N7 C0013 : score 5.06274 : H : LYS NZ A0192 <- 2.79 -> DG N7 C0015 : score 5.39667 : H : LYS NZ A0192 <- 3.35 -> DG O6 C0016 : score 5.14488 : V : VAL CG1 A0189 <- 3.66 -> DT C7 D0023 : score 6.27263 : x : SER xxxx A0185 <- 3.59 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0186 <- 3.63 -> DA xxx D0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0190 <- 3.74 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >1zg5_AB:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=NARL COMPLEXED TO NARG-89 PROMOTER PALINDROMIC TAIL-TO-TAIL DNA SITE organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0188 <- 3.10 -> DG N7 C0013 : score 5.06274 : H : LYS NZ A0192 <- 2.79 -> DG N7 C0015 : score 5.39667 : H : LYS NZ A0192 <- 3.35 -> DG O6 C0016 : score 5.14488 : H : LYS NZ B0188 <- 2.87 -> DG N7 D0033 : score 5.31049 : w : LYS NZ B0188 <- 5.53 -> DG O6 D0034 : score 3.005 : H : LYS NZ B0192 <- 3.17 -> DG N7 D0035 : score 4.98734 : V : VAL CG1 B0189 <- 3.79 -> DT C7 C0003 : score 6.07566 : V : VAL CG1 A0189 <- 3.66 -> DT C7 D0023 : score 6.27263 : x : SER xxxx A0185 <- 3.59 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0186 <- 3.63 -> DA xxx D0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0190 <- 3.74 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0185 <- 3.66 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0186 <- 3.61 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0190 <- 3.72 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx >1zg5_EF:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=NARL COMPLEXED TO NARG-89 PROMOTER PALINDROMIC TAIL-TO-TAIL DNA SITE organism=Escherichia coli : H : LYS NZ E0188 <- 2.94 -> DG N7 G0013 : score 5.23509 : w : LYS NZ E0188 <- 5.48 -> DG O6 G0014 : score 3.005 : H : LYS NZ E0192 <- 2.98 -> DG N7 G0015 : score 5.19201 : H : LYS NZ E0192 <- 3.22 -> DG O6 G0016 : score 5.29518 : H : LYS NZ F0188 <- 2.88 -> DG N7 H0033 : score 5.29972 : w : LYS NZ F0188 <- 5.71 -> DG O6 H0034 : score 3.005 : H : LYS NZ F0192 <- 2.90 -> DG N7 H0035 : score 5.27818 : H : LYS NZ F0192 <- 3.31 -> DG O6 H0036 : score 5.19113 : V : VAL CG1 E0189 <- 3.74 -> DT C7 H0023 : score 6.15142 : V : VAL CG1 F0189 <- 3.71 -> DT C7 G0003 : score 6.19687 : x : SER xxxx E0185 <- 3.65 -> DC xxx H0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0186 <- 3.63 -> DA xxx H0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0190 <- 3.78 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0185 <- 3.57 -> DC xxx G0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0186 <- 3.66 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0190 <- 3.95 -> DT xxx G0003 : score x.xxxxx >1zgw_A:Ada_DNA_repair_protein,_N-terminal_domain_N-Ada_10;Homeodomain-like; title=NMR STRUCTURE OF E. COLI ADA PROTEIN IN COMPLEX WITH DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0045 <- 2.69 -> DT O2 B0195 : score 4.40115 : H : ARG NH2 A0045 <- 2.54 -> DT O2 C0234 : score 4.45347 : H : ARG NH2 A0045 <- 2.43 -> DT O2 B0195 : score 4.5466 : H : ARG NH1 A0118 <- 2.73 -> DG O6 B0202 : score 6.1685 : x : THR xxxx A0034 <- 3.39 -> DT xxx C0234 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0044 <- 4.49 -> DA xxx C0232 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0071 <- 3.34 -> DA xxx B0198 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.13 -> DT xxx C0223 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0115 <- 2.56 -> DC xxx B0201 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0117 <- 4.37 -> DT xxx C0224 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0129 <- 3.92 -> DT xxx C0224 : score x.xxxxx >1zjm_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH DNA CONTAINING AN A-A MISMATCHED PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.33 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.76 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.49 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >1zjn_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH DNA CONTAINING AN A-A MISMATCHED PRIMER TERMINUS WITH DGTP organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0283 <- 5.95 -> DA N3 T0007 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.23 -> DA N3 T0007 : score 2.092 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.64 -> DA N3 T0007 : score 0.995 : x : LYS xxxx A0234 <- 3.40 -> DG xxx P0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0236 <- 3.98 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx >1zla_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=X-RAY STRUCTURE OF A KAPOSI'S SARCOMA HERPESVIRUS LANA PEPTIDE BOUND TO THE NUCLEOSOMAL CORE organism=EXPRESSION VECTOR PET3-H2A / XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 E0640 <- 2.89 -> DA N3 I0082 : score 3.18143 : x : HIS xxxx A0439 <- 3.86 -> DT xxx I0143 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0440 <- 3.59 -> DA xxx J0229 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 4.02 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0842 <- 4.33 -> DA xxx J0257 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1230 <- 4.34 -> DG xxx J0267 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0641 <- 4.40 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 4.04 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 4.09 -> DA xxx I0099 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0245 <- 3.88 -> DG xxx J0214 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H1430 <- 4.36 -> DA xxx J0173 : score x.xxxxx >1zla_C:Histone-fold; title=X-RAY STRUCTURE OF A KAPOSI'S SARCOMA HERPESVIRUS LANA PEPTIDE BOUND TO THE NUCLEOSOMAL CORE organism=? : x : ARG xxxx C0842 <- 4.33 -> DA xxx J0257 : score x.xxxxx >1zlk_A:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS HYPOXIC RESPONSE REGULATOR DOSR C-TERMINAL DOMAIN-DNA COMPLEX organism=Mycobacterium tuberculosis : H : LYS NZ A0179 <- 2.57 -> DG O6 D0016 : score 6.04668 : H : LYS NZ A0182 <- 2.83 -> DA N7 C0022 : score 2.91956 : x : THR xxxx A0180 <- 3.41 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0183 <- 3.18 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0184 <- 3.65 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0186 <- 4.40 -> DT xxx C0024 : score x.xxxxx >1zlk_AB:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS HYPOXIC RESPONSE REGULATOR DOSR C-TERMINAL DOMAIN-DNA COMPLEX organism=Mycobacterium tuberculosis : H : LYS NZ A0179 <- 2.57 -> DG O6 D0016 : score 6.04668 : H : LYS NZ A0182 <- 2.83 -> DA N7 C0022 : score 2.91956 : H : LYS NZ B0179 <- 3.25 -> DG O6 C0016 : score 5.2605 : H : LYS NZ B0182 <- 3.00 -> DA N7 D0022 : score 2.81969 : x : THR xxxx A0180 <- 3.41 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0183 <- 3.18 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0184 <- 3.65 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0186 <- 4.40 -> DT xxx C0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0180 <- 3.67 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0183 <- 3.33 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0184 <- 3.82 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0186 <- 4.10 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx >1zm5_A:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=CONJUGATIVE RELAXASE TRWC IN COMPLEX WITH ORIT DNA, COOPER-BOUND STRUCTURE organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0075 <- 3.02 -> DA N3 B0005 : score 3.52004 : H : ARG NH1 A0128 <- 2.87 -> DG N7 B0015 : score 5.9653 : H : ARG NH2 A0128 <- 2.84 -> DG O6 B0003 : score 6.5472 : H : ARG NH2 A0128 <- 2.82 -> DG O6 B0015 : score 6.5736 : x : ALA xxxx A0073 <- 3.36 -> DG xxx B0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0081 <- 4.23 -> DC xxx B0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0130 <- 3.13 -> DG xxx B0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0178 <- 4.33 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx >1zme_CD:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PUT3/DNA COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : HIS ND1 C0041 <- 2.98 -> DG O6 A0003 : score 5.99905 : H : HIS ND1 D0041 <- 2.43 -> DG O6 B0003 : score 6.68358 : w : LYS NZ D0067 <- 5.25 -> DA N3 A0011 : score 1.538 : x : ILE xxxx D0069 <- 3.40 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0070 <- 3.40 -> DC xxx A0009 : score x.xxxxx >1zme_D:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PUT3/DNA COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : HIS ND1 D0041 <- 2.43 -> DG O6 B0003 : score 6.68358 : w : LYS NZ D0067 <- 5.25 -> DA N3 A0011 : score 1.538 : x : ILE xxxx D0069 <- 3.40 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0070 <- 3.40 -> DC xxx A0009 : score x.xxxxx >1zns_A:His-Me_finger_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF N-COLE7/12-BP DNA/ZN COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI STR. K12 SUBSTR. : H : ASP OD1 A0493 <- 3.18 -> DA N6 B0007 : score 3.21742 : w : ASP OD1 A0493 <- 5.12 -> DT O4 B0006 : score 2.616 : x : ASP xxxx A0494 <- 3.86 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0496 <- 3.20 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0497 <- 3.56 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0538 <- 3.58 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx >1zq3_P:Homeodomain-like; title=NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE BICOID HOMEODOMAIN BOUND TO THE CONSENSUS DNA BINDING SITE TAATCC organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH2 P0004 <- 3.06 -> DG N3 B0091 : score 3.42252 : H : LYS NZ P0051 <- 2.74 -> DG N7 B0085 : score 5.45053 : H : ARG NH1 P0055 <- 3.27 -> DA N7 B0087 : score 2.31959 : x : ILE xxxx P0048 <- 3.67 -> DA xxx A0075 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0052 <- 3.46 -> DA xxx A0074 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0056 <- 4.39 -> DA xxx A0074 : score x.xxxxx >1zqa_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF KCL (150 MILLIMOLAR) AT PH 7.5 organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 6.25 -> DA N3 T0002 : score 1.538 : w : LYS NZ A0234 <- 5.53 -> DT O2 T0003 : score 0.522 : w : LYS NZ A0234 <- 5.67 -> DG N3 P0007 : score 2.232 >1zqb_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF BACL2 (150 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.87 -> DG N3 P0007 : score 2.232 : w : LYS NZ A0234 <- 6.03 -> DA N3 T0002 : score 1.538 : w : LYS NZ A0234 <- 5.65 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >1zqc_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF CACL2 (15 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.56 -> DT O2 T0003 : score 0.522 : w : LYS NZ A0234 <- 5.43 -> DG N3 P0007 : score 2.232 : w : LYS NZ A0234 <- 6.61 -> DA N3 T0002 : score 1.538 >1zqd_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF CACL2 (150 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.70 -> DG N3 P0007 : score 2.232 : w : LYS NZ A0234 <- 5.66 -> DA N3 T0002 : score 1.538 : w : LYS NZ A0234 <- 5.76 -> DT O2 T0003 : score 0.522 : x : MET xxxx A0236 <- 4.44 -> DT xxx P0006 : score x.xxxxx >1zqe_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF CRCL3 (SATURATED SOLUTION) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.55 -> DG N3 P0007 : score 2.232 : w : LYS NZ A0234 <- 5.25 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >1zqf_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF CSCL (150 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.34 -> DT xxx P0006 : score x.xxxxx >1zqg_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF A SODIUM-FREE ARTIFICIAL MOTHER LIQUOR AT PH 6.5 organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.60 -> DG N3 P0007 : score 2.232 : w : LYS NZ A0234 <- 5.58 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >1zqh_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF A SODIUM-FREE ARTIFICIAL MOTHER LIQUOR AT PH 7.5 organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.10 -> DT O2 T0003 : score 0.522 : w : LYS NZ A0234 <- 5.37 -> DG N3 P0007 : score 2.232 >1zqi_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF KCL (150 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 6.59 -> DA N3 T0002 : score 1.538 : w : LYS NZ A0234 <- 5.48 -> DT O2 T0003 : score 0.522 : w : LYS NZ A0234 <- 5.73 -> DG N3 P0007 : score 2.232 >1zqj_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF CACL2 (15 MILLIMOLAR) AND MGCL2 (15 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 5.97 -> DT O2 T0004 : score 1.55 : w : LYS NZ A0234 <- 5.52 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >1zqk_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF KCL (75 MILLIMOLAR) AND MGCL2 (75 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.85 -> DT O2 T0003 : score 0.522 : w : LYS NZ A0234 <- 5.41 -> DG N3 P0007 : score 2.232 >1zql_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF MNCL2 (15 MILLIMOLAR) AND MGCL2 (15 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 6.52 -> DT O2 T0004 : score 1.55 : w : LYS NZ A0234 <- 5.64 -> DG N3 P0007 : score 2.232 : w : LYS NZ A0234 <- 5.96 -> DA N3 T0002 : score 1.538 : w : LYS NZ A0234 <- 5.47 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >1zqm_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF MNCL2 (15 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.89 -> DT O2 T0003 : score 0.522 : w : LYS NZ A0234 <- 5.72 -> DG N3 P0007 : score 2.232 : w : LYS NZ A0234 <- 6.17 -> DA N3 T0002 : score 1.538 >1zqn_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF BACL2 (15 MILLIMOLAR) AND NACL (15 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 6.42 -> DT O2 T0004 : score 1.55 : w : LYS NZ A0234 <- 5.61 -> DT O2 T0003 : score 0.522 : w : LYS NZ A0234 <- 5.74 -> DG N3 P0007 : score 2.232 >1zqo_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF CACL2 (15 MILLIMOLAR) AND NACL (15 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 6.47 -> DA N3 T0002 : score 1.538 : w : LYS NZ A0234 <- 5.13 -> DT O2 T0003 : score 0.522 : w : LYS NZ A0234 <- 5.64 -> DG N3 P0007 : score 2.232 >1zqp_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF KCL (75 MILLIMOLAR) AND NACL (75 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 6.32 -> DA N3 T0002 : score 1.538 : w : LYS NZ A0234 <- 5.65 -> DT O2 T0003 : score 0.522 : w : LYS NZ A0234 <- 5.86 -> DG N3 P0007 : score 2.232 >1zqq_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF MNCL2 (15 MILLIMOLAR) AND NACL (15 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 6.32 -> DA N3 T0002 : score 1.538 : w : LYS NZ A0234 <- 5.58 -> DT O2 T0003 : score 0.522 : w : LYS NZ A0234 <- 5.78 -> DG N3 P0007 : score 2.232 >1zqr_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX, SOAKED IN THE PRESENCE OF NICL2 organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.01 -> DT O2 T0003 : score 0.522 : w : LYS NZ A0234 <- 5.42 -> DG N3 P0007 : score 2.232 >1zqs_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF TLCL (0.5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.52 -> DT O2 T0003 : score 0.522 : w : LYS NZ A0234 <- 5.64 -> DG N3 P0007 : score 2.232 : w : LYS NZ A0234 <- 6.23 -> DA N3 T0002 : score 1.538 >1zqt_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DATP (0.01 MILLIMOLAR) AND ZNCL2 (0.02 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.76 -> DG N3 P0007 : score 2.232 : w : LYS NZ A0234 <- 5.57 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >1zr2_A:Resolvase-like;Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF A SYNAPTIC GAMMA-DELTA RESOLVASE TETRAMER COVALENTLY LINKED TO TWO CLEAVED DNAS organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0130 <- 2.76 -> DA N3 Z0022 : score 3.26566 : H : ARG NH2 A0172 <- 2.65 -> DG N7 X0006 : score 6.57615 : H : ARG NH2 A0172 <- 3.20 -> DG O6 X0006 : score 6.072 : H : SER OG A0173 <- 2.85 -> DG O6 Y0028 : score 4.05012 : x : ARG xxxx A0142 <- 3.47 -> DA xxx X0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0171 <- 3.69 -> DC xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0174 <- 3.69 -> DC xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0176 <- 4.05 -> DG xxx X0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0177 <- 3.99 -> DT xxx Y0026 : score x.xxxxx >1zr4_A:Resolvase-like;Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF A SYNAPTIC GAMMA-DELTA RESOLVASE TETRAMER COVALENTLY LINKED TO TWO CLEAVED DNAS organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0172 <- 2.61 -> DG N7 X0006 : score 6.62723 : H : ARG NH2 A0172 <- 3.24 -> DG O6 X0006 : score 6.0192 : H : SER OG A0173 <- 2.89 -> DG O6 Y0028 : score 4.01739 : x : THR xxxx A0011 <- 3.42 -> DA xxx Z0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0126 <- 3.94 -> DT xxx X0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0130 <- 3.83 -> DA xxx Z0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0140 <- 4.44 -> DT xxx X0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0142 <- 3.40 -> DA xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0171 <- 4.37 -> DG xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0174 <- 4.18 -> DC xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0176 <- 3.57 -> DT xxx X0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0177 <- 4.10 -> DT xxx Y0026 : score x.xxxxx >1zrc_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=4 CRYSTAL STRUCTURES OF CAP-DNA WITH ALL BASE-PAIR SUBSTITUTIONS AT POSITION 6, CAP-ICAP38 DNA organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0180 <- 3.22 -> DG N7 W0005 : score 5.5418 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.93 -> DG O6 W0005 : score 6.4284 : H : GLU OE1 A0181 <- 2.78 -> DC N4 X0007 : score 5.79102 : x : GLN xxxx A0170 <- 4.30 -> DT xxx W0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0179 <- 4.18 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0182 <- 4.36 -> DA xxx X0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0185 <- 3.12 -> DG xxx W0007 : score x.xxxxx >1zrd_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=4 CRYSTAL STRUCTURES OF CAP-DNA WITH ALL BASE-PAIR SUBSTITUTIONS AT POSITION 6, CAP-[6A;17T]ICAP38 DNA organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0180 <- 3.30 -> DG N7 W0005 : score 5.445 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.61 -> DG O6 W0005 : score 6.8508 : H : ARG NH2 A0185 <- 3.07 -> DG O6 W0007 : score 6.2436 : V : GLU CB A0181 <- 3.61 -> DT C7 X0008 : score 1.70501 : x : SER xxxx A0179 <- 3.69 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx >1zre_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=4 CRYSTAL STRUCTURES OF CAP-DNA WITH ALL BASE-PAIR SUBSTITUTIONS AT POSITION 6, CAP-[6G;17C]ICAP38 DNA organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0180 <- 2.98 -> DG N7 W0005 : score 5.8322 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.89 -> DG O6 W0005 : score 6.4812 : H : GLU OE1 A0181 <- 3.20 -> DC N4 X0006 : score 5.30651 : H : ARG NH2 A0185 <- 2.74 -> DT O4 X0008 : score 3.59649 : H : ARG NH2 A0185 <- 2.71 -> DG O6 W0007 : score 6.7188 : x : SER xxxx A0179 <- 3.53 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx >1zrf_B:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=4 CRYSTAL STRUCTURES OF CAP-DNA WITH ALL BASE-PAIR SUBSTITUTIONS AT POSITION 6, CAP-[6C;17G]ICAP38 DNA organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 B0180 <- 3.32 -> DG N7 Y0005 : score 5.4208 : H : ARG NH2 B0180 <- 2.85 -> DG O6 Y0005 : score 6.534 : H : GLU OE1 B0181 <- 2.81 -> DC N4 Z0007 : score 5.75641 : x : GLN xxxx B0170 <- 3.79 -> DT xxx Y0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0179 <- 3.84 -> DT xxx Z0008 : score x.xxxxx >1zs4_ACD: title=STRUCTURE OF BACTERIOPHAGE LAMBDA CII PROTEIN IN COMPLEX WITH DNA organism=Enterobacteria phage lambda : w : ASP OD1 A0036 <- 5.80 -> DA N6 T0020 : score 3.122 : H : LYS NZ A0037 <- 2.86 -> DG N7 U0007 : score 5.32127 : H : SER OG A0038 <- 2.84 -> DC N4 T0019 : score 3.64624 : H : GLN NE2 A0039 <- 2.80 -> DG N7 T0018 : score 4.19872 : H : ARG NH1 A0042 <- 2.97 -> DG O6 U0010 : score 5.8765 : H : ARG NH2 A0042 <- 2.80 -> DG N7 U0010 : score 6.38462 : w : ASP OD1 C0036 <- 5.66 -> DA N6 T0010 : score 3.122 : w : LYS NZ C0037 <- 5.76 -> DA N6 T0010 : score 2.097 : w : LYS NZ C0037 <- 6.02 -> DA N6 T0011 : score 2.097 : H : SER OG C0038 <- 2.93 -> DC N4 T0009 : score 3.58007 : H : GLN NE2 C0039 <- 2.65 -> DG N7 T0008 : score 4.32468 : H : ARG NH1 C0042 <- 2.83 -> DG O6 U0020 : score 6.04683 : H : ARG NH2 C0042 <- 3.01 -> DG N7 U0020 : score 6.11646 : x : SER xxxx A0041 <- 3.59 -> DT xxx U0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0026 <- 4.49 -> DT xxx U0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0027 <- 3.47 -> DT xxx U0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0041 <- 3.94 -> DT xxx U0019 : score x.xxxxx >1zs4_C:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF BACTERIOPHAGE LAMBDA CII PROTEIN IN COMPLEX WITH DNA organism=Enterobacteria phage lambda : w : ASP OD1 C0036 <- 5.66 -> DA N6 T0010 : score 3.122 : w : LYS NZ C0037 <- 5.76 -> DA N6 T0010 : score 2.097 : w : LYS NZ C0037 <- 6.02 -> DA N6 T0011 : score 2.097 : H : SER OG C0038 <- 2.93 -> DC N4 T0009 : score 3.58007 : H : GLN NE2 C0039 <- 2.65 -> DG N7 T0008 : score 4.32468 : H : ARG NH1 C0042 <- 2.83 -> DG O6 U0020 : score 6.04683 : H : ARG NH2 C0042 <- 3.01 -> DG N7 U0020 : score 6.11646 : V : LYS CG C0037 <- 3.81 -> DT C7 U0018 : score 2.11368 : x : THR xxxx C0026 <- 4.49 -> DT xxx U0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0027 <- 3.47 -> DT xxx U0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0041 <- 3.94 -> DT xxx U0019 : score x.xxxxx >1ztg_AC:Eukaryotic_type_KH-domain_KH-domain_type_I; title=HUMAN ALPHA POLYC BINDING PROTEIN KH1 organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 C0040 <- 2.42 -> DC O2 Z0009 : score 3.97982 : H : ARG NH1 C0057 <- 3.35 -> DC N3 Z0008 : score 1.36809 : H : ARG NH2 C0057 <- 2.89 -> DC O2 Z0008 : score 3.63214 : V : ASN CG C0048 <- 3.82 -> DT C7 Z0010 : score 2.63496 >1ztt_A:DNA/RNA_polymerases; title=NETROPSIN BOUND TO D(CTTAATTCGAATTAAG) IN COMPLEX WITH MMLV RT CATALYTIC FRAGMENT organism=Moloney murine leukemia virus : H : ASP OD2 A0114 <- 3.13 -> DG N2 G0016 : score 5.09868 : H : ARG NH1 A0116 <- 3.30 -> DT O2 B0003 : score 3.87577 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.81 -> DT O2 B0002 : score 4.22487 : x : TYR xxxx A0064 <- 3.23 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0099 <- 3.56 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx >1ztw_A:DNA/RNA_polymerases; title=D(CTTAATTCGAATTAAG) COMPLEXED WITH MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS REVERSE TRANSCRIPTASE CATALYTIC FRAGMENT organism=Moloney murine leukemia virus : H : ASP OD2 A0114 <- 2.98 -> DG N2 G0016 : score 5.26245 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.67 -> DT O2 B0002 : score 4.3434 : x : TYR xxxx A0064 <- 3.96 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0099 <- 3.01 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx >1zvv_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A CCPA-CRH-DNA COMPLEX organism=BACILLUS SUBTILIS : H : ARG NH2 A0021 <- 2.48 -> DG O6 O0702 : score 7.0224 : x : SER xxxx A0015 <- 4.17 -> DA xxx O0703 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0017 <- 3.13 -> DA xxx O0703 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0055 <- 3.28 -> DC xxx O0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0056 <- 3.74 -> DC xxx O0707 : score x.xxxxx >1zx4_A:KorB_DNA-binding_domain-like; title=STRUCTURE OF PARB BOUND TO DNA organism=Enterobacteria phage P1 : H : ARG NH1 A0184 <- 2.80 -> DG N7 S0020 : score 6.05 : H : ARG NH2 A0184 <- 2.38 -> DG O6 S0020 : score 7.1544 : H : ARG NH2 A0184 <- 2.63 -> DT O4 T0020 : score 3.67468 : x : SER xxxx A0178 <- 4.20 -> DG xxx S0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0179 <- 3.45 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0180 <- 3.49 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0183 <- 3.32 -> DT xxx T0018 : score x.xxxxx >1zyq_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=T7 DNA POLYMERASE IN COMPLEX WITH 8OG AND INCOMING DDATP organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : LYS NZ A0394 <- 2.62 -> DC O2 P1019 : score 3.05222 : w : ARG NH1 A0429 <- 5.51 -> DT O2 T2006 : score 1.855 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.08 -> DC O2 P1020 : score 3.48796 : H : GLN NE2 A0439 <- 3.24 -> DG N3 T2008 : score 4.53778 : w : HIS NE2 A0653 <- 5.92 -> DA N3 P1021 : score 2.619 : x : LYS xxxx A0114 <- 4.35 -> DC xxx P1014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0436 <- 4.19 -> DG xxx T2007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0611 <- 3.84 -> DC xxx T2005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0615 <- 3.51 -> DC xxx T2005 : score x.xxxxx >1zzi_A:Eukaryotic_type_KH-domain_KH-domain_type_I; title=CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF THE THIRD KH DOMAIN OF HNRNP K IN COMPLEX WITH SSDNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0040 <- 2.91 -> DC O2 C0004 : score 3.5697 : H : ARG NH2 A0040 <- 2.62 -> DC O2 C0004 : score 3.83187 : H : GLU OE2 A0051 <- 2.38 -> DC N4 C0001 : score 5.70768 : H : ARG NH1 A0059 <- 2.81 -> DC N3 C0003 : score 1.53411 : H : ARG NH2 A0059 <- 2.92 -> DC O2 C0003 : score 3.60995 : V : TYR CD1 A0084 <- 3.89 -> DT C7 C0002 : score 4.5757 : x : ALA xxxx A0025 <- 4.30 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0027 <- 3.29 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0029 <- 3.43 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0036 <- 3.44 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0048 <- 3.87 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0049 <- 4.15 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0085 <- 3.06 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx >2a07_IK:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FOXP2 BOUND SPECIFICALLY TO DNA. organism=Homo sapiens : w : ASN OD1 I0550 <- 5.54 -> DT O4 D0015 : score 3.132 : w : ASN ND2 I0550 <- 5.41 -> DT O4 D0015 : score 3.275 : H : ASN OD1 K0550 <- 3.06 -> DA N6 C0013 : score 5.70866 : H : ASN ND2 K0550 <- 3.09 -> DA N7 C0013 : score 5.53002 : H : HIS ND1 K0554 <- 2.86 -> DT O4 D0011 : score 4.66387 : x : HIS xxxx I0554 <- 3.03 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0553 <- 3.61 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0557 <- 3.56 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx K0558 <- 4.23 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx >2a07_J:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FOXP2 BOUND SPECIFICALLY TO DNA. organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 J0550 <- 3.02 -> DA N6 A0013 : score 5.75684 : H : ASN ND2 J0550 <- 3.06 -> DA N7 A0013 : score 5.56525 : w : ASN OD1 J0550 <- 5.81 -> DT O4 B0010 : score 3.132 : w : ARG NE J0553 <- 5.67 -> DT O4 B0010 : score 1.317 : w : ARG NH2 J0553 <- 6.01 -> DT O4 B0010 : score 2.366 : H : HIS ND1 J0554 <- 2.92 -> DT O4 B0011 : score 4.60722 : x : SER xxxx J0557 <- 3.52 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0558 <- 4.30 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx >2a3v_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=STRUCTURAL BASIS FOR BROAD DNA-SPECIFICITY IN INTEGRON RECOMBINATION organism=Vibrio cholerae O1 biovar eltor str. N16961 : H : THR OG1 A0065 <- 2.61 -> DT O4 F0027 : score 4.03489 : H : LYS NZ A0160 <- 2.88 -> DA N3 E0014 : score 2.73249 : H : THR OG1 A0298 <- 3.20 -> DC N4 E0017 : score 3.71067 : V : LEU CD2 B0070 <- 3.85 -> DT C7 F0019 : score 5.65964 : V : LEU CD2 A0072 <- 3.76 -> DT C7 F0028 : score 5.78859 : V : ASN CB A0073 <- 3.51 -> DT C7 F0030 : score 2.0779 : V : LYS CE A0021 <- 3.79 -> DT C7 F0033 : score 2.60753 : x : THR xxxx A0022 <- 3.28 -> DT xxx F0031 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0026 <- 3.56 -> DT xxx F0031 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0029 <- 3.96 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0066 <- 3.13 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0067 <- 3.56 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0068 <- 3.16 -> DT xxx F0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0069 <- 3.36 -> DT xxx F0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0070 <- 3.33 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0076 <- 3.66 -> DT xxx F0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0087 <- 3.98 -> DT xxx F0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0089 <- 3.62 -> DT xxx F0028 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0091 <- 3.63 -> DT xxx F0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0093 <- 3.93 -> DT xxx F0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0095 <- 3.62 -> DT xxx F0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0096 <- 4.47 -> DT xxx F0027 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0248 <- 3.67 -> DA xxx F0034 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0295 <- 3.88 -> DC xxx E0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0297 <- 3.61 -> DC xxx E0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0021 <- 3.54 -> DA xxx E0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0022 <- 3.47 -> DT xxx E0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0025 <- 4.16 -> DA xxx E0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0026 <- 3.40 -> DC xxx E0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0028 <- 3.62 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0029 <- 3.42 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0066 <- 3.00 -> DG xxx F0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0067 <- 3.65 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0073 <- 3.16 -> DC xxx E0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0100 <- 3.82 -> DG xxx F0023 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0243 <- 3.57 -> DC xxx F0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0245 <- 3.06 -> DC xxx F0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0248 <- 3.79 -> DG xxx E0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0249 <- 3.19 -> DG xxx E0029 : score x.xxxxx >2a3v_C:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=STRUCTURAL BASIS FOR BROAD DNA-SPECIFICITY IN INTEGRON RECOMBINATION organism=Vibrio cholerae O1 biovar eltor str. N16961 : H : THR OG1 C0065 <- 2.74 -> DT O4 H0027 : score 3.93383 : H : SER OG C0076 <- 3.20 -> DT O2 H0028 : score 3.40164 : H : LYS NZ C0160 <- 2.92 -> DA N3 G0014 : score 2.71028 : V : ASN CG C0073 <- 3.50 -> DT C7 H0030 : score 2.84682 : V : LYS CE C0021 <- 3.77 -> DT C7 H0033 : score 2.62053 : V : LEU CD1 C0070 <- 3.89 -> DT C7 G0012 : score 5.60233 : x : THR xxxx C0022 <- 3.32 -> DT xxx H0031 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0025 <- 4.43 -> DA xxx H0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0026 <- 3.52 -> DT xxx H0030 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0029 <- 3.45 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0066 <- 3.05 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0067 <- 3.53 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0068 <- 2.90 -> DT xxx H0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0069 <- 3.09 -> DT xxx H0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0072 <- 3.97 -> DT xxx H0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0087 <- 3.74 -> DT xxx H0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0089 <- 3.67 -> DT xxx H0028 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0091 <- 2.93 -> DT xxx H0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0093 <- 4.05 -> DT xxx H0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0095 <- 3.58 -> DT xxx H0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0096 <- 4.21 -> DT xxx H0027 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0248 <- 3.57 -> DA xxx H0034 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0295 <- 3.82 -> DC xxx G0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0297 <- 3.26 -> DC xxx G0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0298 <- 3.11 -> DC xxx G0017 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0301 <- 4.16 -> DC xxx G0017 : score x.xxxxx >2a3v_CD:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=STRUCTURAL BASIS FOR BROAD DNA-SPECIFICITY IN INTEGRON RECOMBINATION organism=Vibrio cholerae O1 biovar eltor str. N16961 : H : THR OG1 C0065 <- 2.74 -> DT O4 H0027 : score 3.93383 : H : SER OG C0076 <- 3.20 -> DT O2 H0028 : score 3.40164 : H : LYS NZ C0160 <- 2.92 -> DA N3 G0014 : score 2.71028 : w : GLU OE2 D0024 <- 6.44 -> DA N6 G0025 : score 2.785 : w : LYS NZ D0066 <- 6.15 -> DG O6 H0023 : score 3.005 : H : LYS NZ D0249 <- 3.11 -> DG O6 H0011 : score 5.42236 : V : ASN CG C0073 <- 3.50 -> DT C7 H0030 : score 2.84682 : V : LYS CE C0021 <- 3.77 -> DT C7 H0033 : score 2.62053 : V : LEU CD1 C0070 <- 3.89 -> DT C7 G0012 : score 5.60233 : x : THR xxxx C0022 <- 3.32 -> DT xxx H0031 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0025 <- 4.43 -> DA xxx H0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0026 <- 3.52 -> DT xxx H0030 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0029 <- 3.45 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0066 <- 3.05 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0067 <- 3.53 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0068 <- 2.90 -> DT xxx H0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0069 <- 3.09 -> DT xxx H0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0072 <- 3.97 -> DT xxx H0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0087 <- 3.74 -> DT xxx H0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0089 <- 3.67 -> DT xxx H0028 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0091 <- 2.93 -> DT xxx H0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0093 <- 4.05 -> DT xxx H0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0095 <- 3.58 -> DT xxx H0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0096 <- 4.21 -> DT xxx H0027 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0248 <- 3.57 -> DA xxx H0034 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0295 <- 3.82 -> DC xxx G0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0297 <- 3.26 -> DC xxx G0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0298 <- 3.11 -> DC xxx G0017 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0301 <- 4.16 -> DC xxx G0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0021 <- 3.61 -> DA xxx G0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0022 <- 3.52 -> DT xxx G0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0025 <- 4.27 -> DA xxx G0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0026 <- 3.56 -> DC xxx G0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0028 <- 3.76 -> DT xxx H0018 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0029 <- 3.67 -> DT xxx H0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0067 <- 3.78 -> DT xxx H0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0070 <- 3.13 -> DT xxx G0023 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0073 <- 3.07 -> DC xxx G0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0100 <- 3.71 -> DG xxx H0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0243 <- 3.70 -> DC xxx H0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0245 <- 3.15 -> DC xxx H0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0248 <- 3.64 -> DG xxx G0026 : score x.xxxxx >2a66_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=HUMAN LIVER RECEPTOR HOMOLOGUE DNA-BINDING DOMAIN (HLRH-1 DBD) IN COMPLEX WITH DSDNA FROM THE HCYP7A1 PROMOTER organism=Homo sapiens : H : GLU OE2 A0104 <- 2.81 -> DC N4 C0305 : score 5.25485 : H : LYS NZ A0107 <- 2.85 -> DG O6 B0207 : score 5.72296 : w : LYS NZ A0107 <- 5.46 -> DA N7 B0206 : score 1.655 : H : LYS NZ A0111 <- 2.62 -> DG N7 B0208 : score 5.57979 : H : ARG NH1 A0112 <- 3.01 -> DG N7 C0303 : score 5.7959 : H : ARG NH1 A0162 <- 3.14 -> DT O2 C0307 : score 4.01357 : H : ARG NH2 A0162 <- 3.08 -> DT O2 C0307 : score 3.99627 : w : ARG NH1 A0162 <- 5.33 -> DA N3 B0206 : score 2.585 : H : ARG NH1 A0165 <- 3.17 -> DT O2 B0203 : score 3.98774 : H : ARG NH2 A0165 <- 2.58 -> DC O2 B0204 : score 3.86146 : w : ARG NH1 A0165 <- 6.07 -> DA N3 C0311 : score 2.585 >2a6o_AB:Transposase_IS200-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ISHP608 TRANSPOSASE IN COMPLEX WITH STEM- LOOP DNA organism=Helicobacter pylori : H : LYS NZ A0082 <- 3.34 -> DC O2 C0008 : score 2.62797 : H : HIS NE2 B0011 <- 2.66 -> DG N7 C0018 : score 6.99304 : w : ASP OD2 B0072 <- 5.30 -> DT O2 C0017 : score 1.008 >2a6o_B:Transposase_IS200-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ISHP608 TRANSPOSASE IN COMPLEX WITH STEM- LOOP DNA organism=Helicobacter pylori : H : HIS NE2 B0011 <- 2.66 -> DG N7 C0018 : score 6.99304 : w : ASP OD2 B0072 <- 5.30 -> DT O2 C0017 : score 1.008 >2ac0_AC: title=STRUCTURAL BASIS OF DNA RECOGNITION BY P53 TETRAMERS (COMPLEX I) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 2.81 -> DG N7 E0003 : score 5.37513 : H : LYS NZ A0120 <- 2.76 -> DG O6 E0004 : score 5.82702 : w : LYS NZ A0139 <- 5.43 -> DG N7 G0012 : score 2.519 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.76 -> DG O6 F0008 : score 6.132 : H : ARG NH2 A0280 <- 2.99 -> DG N7 F0008 : score 6.142 : H : LYS NZ C0120 <- 3.02 -> DG N7 H0003 : score 5.14892 : H : LYS NZ C0120 <- 2.67 -> DG O6 H0003 : score 5.93107 : H : LYS NZ C0120 <- 2.69 -> DG O6 H0004 : score 5.90795 : H : ARG NH1 C0280 <- 2.87 -> DG O6 G0008 : score 5.99817 : H : ARG NH2 C0280 <- 2.93 -> DG N7 G0008 : score 6.21862 : x : SER xxxx A0121 <- 3.24 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0123 <- 3.99 -> DG xxx G0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 3.97 -> DC xxx F0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0277 <- 3.61 -> DC xxx F0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0121 <- 3.79 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0276 <- 4.01 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0277 <- 3.52 -> DC xxx G0009 : score x.xxxxx >2ac0_D:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL BASIS OF DNA RECOGNITION BY P53 TETRAMERS (COMPLEX I) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ D0120 <- 2.79 -> DG N7 G0003 : score 5.39667 : H : LYS NZ D0120 <- 2.71 -> DG O6 G0003 : score 5.88482 : H : LYS NZ D0120 <- 2.50 -> DG O6 G0004 : score 6.12762 : w : SER OG D0121 <- 5.48 -> DG N7 G0002 : score 2.749 : w : ARG NH1 D0248 <- 5.62 -> DG N3 G0008 : score 1.593 : w : ARG NH2 D0248 <- 5.82 -> DG N2 G0008 : score 1.593 : H : ARG NH1 D0280 <- 2.88 -> DG O6 H0008 : score 5.986 : H : ARG NH2 D0280 <- 2.97 -> DG N7 H0008 : score 6.16754 : x : ALA xxxx D0276 <- 4.04 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0277 <- 3.49 -> DC xxx H0009 : score x.xxxxx >2acj_BCD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE B/Z JUNCTION CONTAINING DNA BOUND TO Z-DNA BINDING PROTEINS organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx B0174 <- 3.53 -> DC xxx E0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0177 <- 3.39 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0177 <- 3.36 -> DG xxx F0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0177 <- 3.33 -> DG xxx F0028 : score x.xxxxx >2acj_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE B/Z JUNCTION CONTAINING DNA BOUND TO Z-DNA BINDING PROTEINS organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx C0177 <- 3.36 -> DG xxx F0032 : score x.xxxxx >2ady_AB: title=STRUCTURAL BASIS OF DNA RECOGNITION BY P53 TETRAMERS (COMPLEX IV) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 2.96 -> DT O4 F0009 : score 3.47239 : H : LYS NZ A0120 <- 2.79 -> DG O6 E0003 : score 5.79233 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.59 -> DG O6 F0008 : score 6.33883 : H : ARG NH2 A0280 <- 3.03 -> DG N7 F0008 : score 6.09092 : H : LYS NZ B0120 <- 2.72 -> DG O6 F0003 : score 5.87326 : H : LYS NZ B0120 <- 2.99 -> DT O4 E0009 : score 3.45087 : H : ARG NH1 B0280 <- 3.12 -> DG O6 E0008 : score 5.694 : H : ARG NH2 B0280 <- 3.25 -> DG N7 E0008 : score 5.81 : x : SER xxxx A0121 <- 3.91 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 3.64 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0277 <- 3.79 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0121 <- 4.41 -> DG xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 3.54 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0277 <- 3.60 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx >2ady_B:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL BASIS OF DNA RECOGNITION BY P53 TETRAMERS (COMPLEX IV) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0120 <- 2.72 -> DG O6 F0003 : score 5.87326 : H : LYS NZ B0120 <- 2.99 -> DT O4 E0009 : score 3.45087 : H : ARG NH1 B0280 <- 3.12 -> DG O6 E0008 : score 5.694 : H : ARG NH2 B0280 <- 3.25 -> DG N7 E0008 : score 5.81 : x : SER xxxx B0121 <- 4.41 -> DG xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 3.54 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0277 <- 3.60 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx >2ago_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=FIDELITY OF DPO4: EFFECT OF METAL IONS, NUCLEOTIDE SELECTION AND PYROPHOSPHOROLYSIS organism=Sulfolobus solfataricus : x : ALA xxxx A0042 <- 4.46 -> DT xxx C1905 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 3.49 -> DT xxx C1909 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0297 <- 4.48 -> DG xxx B1809 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0332 <- 3.05 -> DG xxx C1906 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.79 -> DA xxx C1908 : score x.xxxxx >2agp_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=FIDELITY OF DPO4: EFFECT OF METAL IONS, NUCLEOTIDE SELECTION AND PYROPHOSPHOROLYSIS organism=Sulfolobus solfataricus : w : HIS NE2 B0285 <- 5.66 -> DG N7 E1808 : score 3.601 : x : SER xxxx B0244 <- 4.09 -> DT xxx F1909 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0295 <- 4.48 -> DT xxx E1811 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0336 <- 3.77 -> DA xxx F1908 : score x.xxxxx >2agq_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=FIDELITY OF DPO4: EFFECT OF METAL IONS, NUCLEOTIDE SELECTION AND PYROPHOSPHOROLYSIS organism=Sulfolobus solfataricus : x : SER xxxx A0244 <- 4.41 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.20 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >2ahi_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL BASIS OF DNA RECOGNITION BY P53 TETRAMERS (COMPLEX III) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 3.08 -> DG N7 E0003 : score 5.08429 : w : LYS NZ A0120 <- 6.07 -> DA N6 E0004 : score 2.097 : w : GLN NE2 A0136 <- 6.30 -> DG N7 E0002 : score 2.582 : w : ARG NH1 A0248 <- 5.59 -> DA N3 F0006 : score 2.585 : w : ARG NH1 A0248 <- 5.80 -> DG N2 E0008 : score 1.082 : w : ARG NH2 A0248 <- 5.55 -> DA N3 F0006 : score 2.092 : w : CYS SG A0277 <- 5.96 -> DT O4 F0009 : score 4.152 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.74 -> DG O6 F0008 : score 6.15633 : H : ARG NH2 A0280 <- 2.96 -> DG N7 F0008 : score 6.18031 : x : SER xxxx A0121 <- 3.20 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 3.30 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx >2ahi_AB: title=STRUCTURAL BASIS OF DNA RECOGNITION BY P53 TETRAMERS (COMPLEX III) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 3.08 -> DG N7 E0003 : score 5.08429 : w : LYS NZ A0120 <- 6.07 -> DA N6 E0004 : score 2.097 : w : GLN NE2 A0136 <- 6.30 -> DG N7 E0002 : score 2.582 : w : ARG NH1 A0248 <- 5.59 -> DA N3 F0006 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0248 <- 5.55 -> DA N3 F0006 : score 2.092 : w : CYS SG A0277 <- 5.96 -> DT O4 F0009 : score 4.152 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.74 -> DG O6 F0008 : score 6.15633 : H : ARG NH2 A0280 <- 2.96 -> DG N7 F0008 : score 6.18031 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.65 -> DG O6 E0008 : score 6.26583 : H : ARG NH2 B0280 <- 2.93 -> DG N7 E0008 : score 6.21862 : x : SER xxxx A0121 <- 3.20 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 3.30 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 3.44 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0277 <- 3.75 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx >2ajq_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF REPLICATIVE DNA POLYMERASE PROVIDES INSIGTS INTO THE MECHANISMS FOR PROCESSIVITY, FRAMESHIFTING AND EDITING organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : LYS NZ A0394 <- 3.17 -> DC O2 P0819 : score 2.72814 : w : LYS NZ A0394 <- 6.02 -> DG N3 P0818 : score 2.232 : w : LYS NZ A0394 <- 5.42 -> DC O2 T0859 : score 1.3 : w : ARG NH1 A0429 <- 6.08 -> DT O2 T0856 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0436 <- 6.26 -> DG N3 T0857 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0653 <- 6.04 -> DA N3 P0821 : score 2.619 : x : LYS xxxx A0268 <- 4.26 -> DG xxx T0864 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0439 <- 3.15 -> DC xxx P0820 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0615 <- 4.01 -> DA xxx T0855 : score x.xxxxx >2alz_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF HPOLI WITH DNA AND DCTP organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0301 <- 4.43 -> DT xxx T0844 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0305 <- 3.89 -> DG xxx T0842 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 4.33 -> DG xxx P0868 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 4.47 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >2aoq_A:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MUTH-UNMETHYLATED DNA COMPLEX organism=HAEMOPHILUS INFLUENZAE : H : LYS NZ A0048 <- 2.55 -> DT O2 B0007 : score 3.76654 : H : LYS NZ A0048 <- 2.88 -> DT O2 C0007 : score 3.52978 : H : SER OG A0065 <- 3.33 -> DA N3 C0003 : score 2.68544 : w : SER OG A0065 <- 5.76 -> DG N3 B0011 : score 2.344 : H : GLU OE1 A0091 <- 3.09 -> DC N4 C0008 : score 5.43341 : H : ARG NH2 A0129 <- 3.28 -> DA N7 C0009 : score 1.5113 : H : ARG NE A0184 <- 2.83 -> DG N7 B0005 : score 4.39526 : H : ARG NH2 A0184 <- 2.59 -> DG O6 B0005 : score 6.8772 : H : LYS NZ A0186 <- 3.11 -> DG N7 C0005 : score 5.05197 : H : LYS NZ A0186 <- 2.78 -> DG O6 C0005 : score 5.80389 : H : TYR OH A0212 <- 2.86 -> DA N6 C0006 : score 4.61447 : w : LYS NZ A0215 <- 6.23 -> DA N7 B0003 : score 1.655 : x : THR xxxx A0092 <- 4.17 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0094 <- 3.65 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0097 <- 3.66 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0182 <- 4.41 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0185 <- 3.93 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx >2aor_A:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MUTH-HEMIMETHYLATED DNA COMPLEX organism=Haemophilus influenzae : H : LYS NZ A0048 <- 2.65 -> DT O2 C0006 : score 3.69479 : H : LYS NZ A0048 <- 2.86 -> DT O2 D0018 : score 3.54413 : w : LYS NZ A0066 <- 5.74 -> DA N3 C0010 : score 1.538 : w : LYS NZ A0066 <- 5.54 -> DT O2 D0013 : score 0.522 : H : GLU OE1 A0091 <- 3.17 -> DC N4 D0019 : score 5.34112 : w : GLU OE1 A0091 <- 5.86 -> DG O6 C0003 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0091 <- 5.61 -> DC N4 D0020 : score 3.597 : H : ARG NE A0184 <- 2.95 -> DG N7 C0004 : score 4.28914 : H : ARG NH2 A0184 <- 2.78 -> DG O6 C0004 : score 6.6264 : H : LYS NZ A0186 <- 2.90 -> DG N7 D0016 : score 5.27818 : H : LYS NZ A0186 <- 2.81 -> DG O6 D0016 : score 5.76921 : H : TYR OH A0212 <- 2.73 -> DA N6 D0017 : score 4.7359 : x : MET xxxx A0053 <- 4.19 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0094 <- 3.58 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0185 <- 3.72 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >2aor_AB:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MUTH-HEMIMETHYLATED DNA COMPLEX organism=Haemophilus influenzae : H : LYS NZ A0048 <- 2.65 -> DT O2 C0006 : score 3.69479 : H : LYS NZ A0048 <- 2.86 -> DT O2 D0018 : score 3.54413 : w : LYS NZ A0066 <- 5.74 -> DA N3 C0010 : score 1.538 : w : LYS NZ A0066 <- 5.54 -> DT O2 D0013 : score 0.522 : H : GLU OE1 A0091 <- 3.17 -> DC N4 D0019 : score 5.34112 : w : GLU OE1 A0091 <- 5.86 -> DG O6 C0003 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0091 <- 5.61 -> DC N4 D0020 : score 3.597 : H : ARG NE A0184 <- 2.95 -> DG N7 C0004 : score 4.28914 : H : ARG NH2 A0184 <- 2.78 -> DG O6 C0004 : score 6.6264 : H : LYS NZ A0186 <- 2.90 -> DG N7 D0016 : score 5.27818 : H : LYS NZ A0186 <- 2.81 -> DG O6 D0016 : score 5.76921 : H : TYR OH A0212 <- 2.73 -> DA N6 D0017 : score 4.7359 : H : LYS NZ B0048 <- 2.78 -> DT O2 C0018 : score 3.60153 : H : LYS NZ B0048 <- 2.80 -> DT O2 D0006 : score 3.58718 : H : GLU OE1 B0091 <- 3.13 -> DC N4 C0019 : score 5.38726 : w : GLU OE1 B0091 <- 5.93 -> DG O6 D0003 : score 2.669 : w : GLU OE2 B0091 <- 5.48 -> DC N4 C0020 : score 3.597 : H : ARG NE B0184 <- 2.92 -> DG N7 D0004 : score 4.31567 : H : ARG NH2 B0184 <- 2.86 -> DG O6 D0004 : score 6.5208 : H : LYS NZ B0186 <- 2.81 -> DG N7 C0016 : score 5.37513 : H : LYS NZ B0186 <- 2.61 -> DG O6 C0016 : score 6.00044 : H : TYR OH B0212 <- 2.94 -> DA N6 C0017 : score 4.53974 : x : MET xxxx A0053 <- 4.19 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0094 <- 3.58 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0185 <- 3.72 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0053 <- 3.47 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0066 <- 3.13 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0094 <- 3.72 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0185 <- 3.70 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >2aq4_A:DNA/RNA_polymerases; title=TERNARY COMPLEX OF THE CATALYTIC CORE OF REV1 WITH DNA AND DCTP. organism=Saccharomyces cerevisiae : x : SER xxxx A0329 <- 3.94 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0626 <- 3.15 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >2as5_N:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAINS OF NFAT AND FOXP2 BOUND SPECIFICALLY TO DNA. organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 N0421 <- 2.93 -> DG N7 A4005 : score 5.8927 : H : ARG NH2 N0421 <- 2.33 -> DG O6 A4005 : score 7.2204 : H : GLU OE1 N0427 <- 3.08 -> DC N4 B5019 : score 5.44494 : H : ARG NH1 N0430 <- 3.15 -> DG N7 A4004 : score 5.6265 : H : ARG NH2 N0430 <- 3.34 -> DG N7 A4004 : score 5.69508 : H : ARG NH2 N0430 <- 3.04 -> DG O6 A4004 : score 6.2832 : H : GLN OE1 N0571 <- 2.90 -> DA N6 A4006 : score 5.93151 : H : GLN NE2 N0571 <- 2.92 -> DA N7 A4006 : score 5.94359 : w : GLN OE1 N0571 <- 5.92 -> DT O4 B5017 : score 3.068 : x : TYR xxxx N0424 <- 3.30 -> DT xxx B5018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx N0426 <- 4.17 -> DT xxx B5018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0572 <- 3.36 -> DT xxx B5015 : score x.xxxxx >2asd_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=OXOG-MODIFIED INSERTION TERNARY COMPLEX organism=Sulfolobus solfataricus : w : LYS NZ A0221 <- 5.83 -> DG N3 D0810 : score 2.232 : x : SER xxxx A0297 <- 3.41 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.13 -> DA xxx E0909 : score x.xxxxx >2asj_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=OXOG-MODIFIED PREINSERTION BINARY COMPLEX organism=Sulfolobus solfataricus : x : VAL xxxx A0032 <- 3.72 -> DC xxx E0907 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.50 -> DC xxx E0907 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0295 <- 4.07 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0297 <- 4.49 -> DA xxx D0807 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.94 -> DC xxx E0910 : score x.xxxxx >2asl_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=OXOG-MODIFIED POSTINSERTION BINARY COMPLEX organism=Sulfolobus solfataricus : x : SER xxxx B1297 <- 4.03 -> DT xxx H1808 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1332 <- 4.49 -> DC xxx J1907 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1336 <- 3.91 -> DA xxx J1909 : score x.xxxxx >2ata_D:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL BASIS OF DNA RECOGNITION BY P53 TETRAMERS (COMPLEX II) organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 D0248 <- 5.32 -> DA N3 H0006 : score 2.092 : H : ARG NH1 D0280 <- 2.84 -> DG O6 H0008 : score 6.03467 : H : ARG NH2 D0280 <- 3.07 -> DG N7 H0008 : score 6.03985 : x : LYS xxxx D0120 <- 4.33 -> DA xxx G0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0276 <- 4.14 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0277 <- 3.49 -> DC xxx H0009 : score x.xxxxx >2atl_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=UNMODIFIED INSERTION TERNARY COMPLEX organism=Sulfolobus solfataricus : x : SER xxxx B1297 <- 4.10 -> DT xxx H1808 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1336 <- 4.44 -> DA xxx J1909 : score x.xxxxx >2au0_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=UNMODIFIED PREINSERTION BINARY COMPLEX organism=Sulfolobus solfataricus : x : ALA xxxx B1042 <- 3.87 -> DC xxx J1907 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1189 <- 4.09 -> DT xxx H1811 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1295 <- 3.33 -> DT xxx H1808 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1332 <- 3.87 -> DT xxx J1908 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1336 <- 4.00 -> DC xxx J1910 : score x.xxxxx >2axy_AC:Eukaryotic_type_KH-domain_KH-domain_type_I; title=CRYSTAL STRUCTURE OF KH1 DOMAIN OF HUMAN POLY(C)-BINDING PROTEIN-2 WITH C-RICH STRAND OF HUMAN TELOMERIC DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 C0040 <- 2.90 -> DC O2 G0502 : score 3.577 : H : ARG NH2 C0040 <- 2.83 -> DC O2 G0502 : score 3.67653 : w : ARG NE C0046 <- 5.12 -> DT O4 G0504 : score 1.317 : H : GLU OE2 C0051 <- 2.85 -> DC N4 G0503 : score 5.21273 : H : ARG NH1 C0057 <- 2.85 -> DC N3 G0501 : score 1.52181 : H : ARG NH2 C0057 <- 2.90 -> DC O2 G0501 : score 3.62474 >2ayb_AB:Viral_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HPV6A E2 DNA BINDING DOMAIN BOUND TO A 16 BASE PAIR DNA TARGET organism=Human papillomavirus type 6a : H : LYS NZ A0297 <- 2.94 -> DG N7 C0012 : score 5.23509 : H : LYS NZ B0297 <- 3.01 -> DG N7 D0012 : score 5.15969 : V : TYR CZ B0301 <- 3.85 -> DT C7 D0014 : score 5.50974 : V : TYR CZ A0301 <- 3.79 -> DT C7 C0014 : score 5.59344 : x : ASN xxxx A0294 <- 3.46 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0298 <- 3.63 -> DA xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0302 <- 3.33 -> DA xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0294 <- 3.42 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0298 <- 3.72 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0302 <- 3.49 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx >2ayb_B:Viral_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HPV6A E2 DNA BINDING DOMAIN BOUND TO A 16 BASE PAIR DNA TARGET organism=Human papillomavirus type 6a : H : LYS NZ B0297 <- 3.01 -> DG N7 D0012 : score 5.15969 : V : TYR CZ B0301 <- 3.85 -> DT C7 D0014 : score 5.50974 : x : ASN xxxx B0294 <- 3.42 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0298 <- 3.72 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0302 <- 3.49 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx >2ayg_A:Viral_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HPV6A E2 DNA BINDING DOMAIN BOUND TO AN 18 BASE PAIR DNA TARGET organism=Human papillomavirus type 6a : H : ASN OD1 A0294 <- 3.04 -> DC N4 D0005 : score 3.9923 : H : LYS NZ A0297 <- 2.68 -> DG N7 C0013 : score 5.51516 : H : LYS NZ A0297 <- 3.00 -> DG O6 C0014 : score 5.54954 : V : TYR CZ A0301 <- 3.85 -> DT C7 C0015 : score 5.50974 : x : CYS xxxx A0298 <- 3.90 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0302 <- 2.98 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx >2ayg_AB:Viral_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HPV6A E2 DNA BINDING DOMAIN BOUND TO AN 18 BASE PAIR DNA TARGET organism=Human papillomavirus type 6a : H : ASN OD1 A0294 <- 3.04 -> DC N4 D0005 : score 3.9923 : H : LYS NZ A0297 <- 2.68 -> DG N7 C0013 : score 5.51516 : H : LYS NZ A0297 <- 3.00 -> DG O6 C0014 : score 5.54954 : H : ASN OD1 B0294 <- 3.18 -> DC N4 C0005 : score 3.87488 : H : LYS NZ B0297 <- 2.95 -> DG N7 D0013 : score 5.22432 : H : LYS NZ B0297 <- 3.01 -> DG O6 D0014 : score 5.53798 : V : TYR CZ A0301 <- 3.85 -> DT C7 C0015 : score 5.50974 : x : CYS xxxx A0298 <- 3.90 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0302 <- 2.98 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0298 <- 3.85 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0301 <- 3.38 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0302 <- 3.04 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx >2b0d_AB:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV RESTRICTION ENDONUCLEASE/GAATTC/CA2+ organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 A0185 <- 2.90 -> DA N6 D0005 : score 5.90136 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.84 -> DA N7 D0005 : score 5.82355 : H : THR OG1 A0186 <- 3.36 -> DT O4 C0007 : score 3.45182 : H : THR OG1 A0186 <- 2.81 -> DT O4 C0008 : score 3.87941 : H : ASN OD1 B0185 <- 3.03 -> DA N6 C0005 : score 5.74479 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.83 -> DA N7 C0005 : score 5.83529 : H : THR OG1 B0186 <- 2.99 -> DT O4 D0007 : score 3.73947 : H : THR OG1 B0186 <- 2.77 -> DT O4 D0008 : score 3.9105 : V : ASN CG A0188 <- 3.53 -> DT C7 C0008 : score 2.82696 : x : ASN xxxx A0070 <- 4.33 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0106 <- 3.61 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 2.94 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0070 <- 3.29 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.78 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.29 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.34 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >2b0d_B:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV RESTRICTION ENDONUCLEASE/GAATTC/CA2+ organism=Escherichia coli : w : ASN ND2 B0070 <- 5.02 -> DC O2 C0009 : score 1.885 : H : ASN OD1 B0185 <- 3.03 -> DA N6 C0005 : score 5.74479 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.83 -> DA N7 C0005 : score 5.83529 : H : THR OG1 B0186 <- 2.99 -> DT O4 D0007 : score 3.73947 : H : THR OG1 B0186 <- 2.77 -> DT O4 D0008 : score 3.9105 : x : THR xxxx B0106 <- 3.78 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.29 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.34 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >2b0e_AB:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV RESTRICTION ENDONUCLEASE/GAAUTC/CA2+ organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 A0185 <- 3.05 -> DA N6 D0005 : score 5.72071 : H : ASN ND2 A0185 <- 3.00 -> DA N7 D0005 : score 5.63569 : w : THR OG1 A0186 <- 5.59 -> DA N7 C0006 : score 2.152 : H : ASN ND2 B0070 <- 3.05 -> DC O2 C0009 : score 4.25551 : w : LYS NZ B0104 <- 5.13 -> DT O4 D0010 : score 1.7 : H : ASN OD1 B0185 <- 3.21 -> DA N6 C0005 : score 5.52801 : H : ASN ND2 B0185 <- 3.00 -> DA N7 C0005 : score 5.63569 : H : THR OG1 B0186 <- 2.51 -> DT O4 D0008 : score 4.11264 : V : ASN CG A0188 <- 3.60 -> DT C7 C0008 : score 2.78062 : V : SER CB B0183 <- 3.84 -> DT C7 D0008 : score 3.09997 : x : ASN xxxx A0070 <- 2.97 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0106 <- 3.56 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.32 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.71 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.45 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >2b0e_B:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV RESTRICTION ENDONUCLEASE/GAAUTC/CA2+ organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 B0070 <- 3.05 -> DC O2 C0009 : score 4.25551 : w : LYS NZ B0104 <- 5.13 -> DT O4 D0010 : score 1.7 : H : ASN OD1 B0185 <- 3.21 -> DA N6 C0005 : score 5.52801 : H : ASN ND2 B0185 <- 3.00 -> DA N7 C0005 : score 5.63569 : H : THR OG1 B0186 <- 2.51 -> DT O4 D0008 : score 4.11264 : V : SER CB B0183 <- 3.84 -> DT C7 D0008 : score 3.09997 : x : THR xxxx B0106 <- 3.71 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.45 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >2b9s_A:Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_N-terminal_DNA-binding_fragment;DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HETERODIMERIC L. DONOVANI TOPOISOMERASE I- VANADATE-DNA COMPLEX organism=LEISHMANIA DONOVANI : H : ARG NH2 A0190 <- 2.95 -> DG N3 D0012 : score 3.50195 : w : ARG NH2 A0190 <- 5.80 -> DT O2 E0112 : score 2.261 : H : LYS NZ A0352 <- 3.06 -> DT O2 C0010 : score 3.40065 : w : LYS NZ A0352 <- 5.72 -> DT O2 C0009 : score 0.522 : w : ASP OD2 A0353 <- 5.66 -> DA N3 D0011 : score 1.331 : x : LYS xxxx A0041 <- 3.80 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0178 <- 4.45 -> DT xxx E0112 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0250 <- 4.09 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0252 <- 3.32 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0254 <- 3.86 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0262 <- 4.43 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0317 <- 3.95 -> DC xxx E0117 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0391 <- 4.20 -> DT xxx E0118 : score x.xxxxx >2b9s_AB:Eukaryotic_DNA_topoisomerase_I,_N-terminal_DNA-binding_fragment;DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HETERODIMERIC L. DONOVANI TOPOISOMERASE I- VANADATE-DNA COMPLEX organism=LEISHMANIA DONOVANI : H : ARG NH2 A0190 <- 2.95 -> DG N3 D0012 : score 3.50195 : w : ARG NH2 A0190 <- 5.80 -> DT O2 E0112 : score 2.261 : H : LYS NZ A0352 <- 3.06 -> DT O2 C0010 : score 3.40065 : w : LYS NZ A0352 <- 6.00 -> DG N3 E0115 : score 2.232 : w : ASP OD2 A0353 <- 5.40 -> DA N3 E0113 : score 1.331 : x : LYS xxxx A0041 <- 3.80 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0178 <- 4.45 -> DT xxx E0112 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0250 <- 4.09 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0252 <- 3.32 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0254 <- 3.86 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0262 <- 4.43 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0317 <- 3.95 -> DC xxx E0117 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0391 <- 4.20 -> DT xxx E0118 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0221 <- 4.24 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >2b9s_B:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HETERODIMERIC L. DONOVANI TOPOISOMERASE I- VANADATE-DNA COMPLEX organism=LEISHMANIA DONOVANI : x : ASN xxxx B0221 <- 4.24 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >2bam_A:Restriction_endonuclease-like; title=RESTRICTION ENDONUCLEASE BAMHI COMPLEX WITH DNA AND CALCIUM IONS (PRE- REACTIVE COMPLEX). organism=Bacillus amyloliquefaciens : H : ASN ND2 A0116 <- 2.89 -> DG O6 C0005 : score 5.53697 : H : ASN ND2 A0116 <- 2.98 -> DT O4 D0007 : score 5.09437 : H : ASP OD1 A0154 <- 2.95 -> DC N4 D0009 : score 5.18453 : w : ASP OD2 A0154 <- 5.64 -> DT O4 C0003 : score 2.798 : H : ARG NE A0155 <- 2.86 -> DG O6 C0004 : score 3.89373 : H : ARG NH2 A0155 <- 3.18 -> DG N7 C0004 : score 5.89938 : H : ASP OD2 A0196 <- 3.08 -> DG N2 D0005 : score 5.15327 : w : ASP OD2 A0196 <- 5.99 -> DC O2 C0009 : score 1.919 : x : ARG xxxx A0122 <- 4.11 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0153 <- 3.36 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0156 <- 4.20 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0198 <- 3.77 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >2bam_AB:Restriction_endonuclease-like; title=RESTRICTION ENDONUCLEASE BAMHI COMPLEX WITH DNA AND CALCIUM IONS (PRE- REACTIVE COMPLEX). organism=Bacillus amyloliquefaciens : H : ASN ND2 A0116 <- 2.89 -> DG O6 C0005 : score 5.53697 : H : ASN ND2 A0116 <- 2.98 -> DT O4 D0007 : score 5.09437 : H : ASP OD1 A0154 <- 2.95 -> DC N4 D0009 : score 5.18453 : w : ASP OD2 A0154 <- 5.64 -> DT O4 C0003 : score 2.798 : H : ARG NE A0155 <- 2.86 -> DG O6 C0004 : score 3.89373 : H : ARG NH2 A0155 <- 3.18 -> DG N7 C0004 : score 5.89938 : H : ASP OD2 A0196 <- 3.08 -> DG N2 D0005 : score 5.15327 : H : ASN ND2 B0116 <- 2.48 -> DT O4 C0007 : score 5.62283 : H : ASN ND2 B0116 <- 2.94 -> DG O6 D0005 : score 5.48058 : w : ASN OD1 B0116 <- 6.48 -> DA N6 D0006 : score 2.837 : w : SER OG B0118 <- 5.93 -> DA N6 D0006 : score 2.209 : H : ASP OD1 B0154 <- 2.82 -> DC N4 C0009 : score 5.32349 : w : ASP OD1 B0154 <- 5.92 -> DA N6 C0010 : score 3.122 : w : ASP OD2 B0154 <- 5.53 -> DT O4 D0003 : score 2.798 : H : ARG NE B0155 <- 2.58 -> DG O6 D0004 : score 4.11443 : H : ARG NH2 B0155 <- 2.97 -> DG N7 D0004 : score 6.16754 : x : ARG xxxx A0122 <- 4.11 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0153 <- 3.36 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0156 <- 4.20 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0198 <- 3.77 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0122 <- 3.71 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0153 <- 3.44 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >2bcq_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;DNA_polymerase_beta-like,_second_domain; title=DNA POLYMERASE LAMBDA IN COMPLEX WITH A DNA DUPLEX CONTAINING AN UNPAIRED DTMP organism=Homo sapiens : w : GLN OE1 A0372 <- 6.79 -> DG N2 P0003 : score 2.177 : w : GLN NE2 A0372 <- 5.81 -> DC O2 T0010 : score 2.699 : w : LYS NZ A0472 <- 5.67 -> DA N3 P0005 : score 1.538 : H : TYR OH A0505 <- 2.66 -> DC O2 P0006 : score 3.59536 : H : ASN ND2 A0513 <- 3.12 -> DG N3 P0007 : score 4.5816 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.01 -> DG N3 T0006 : score 2.92436 : H : GLU OE2 A0529 <- 2.95 -> DG N2 T0006 : score 4.18095 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.64 -> DG xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.36 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx >2bcr_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE LAMBDA IN COMPLEX WITH A DNA DUPLEX CONTAINING AN UNPAIRED DAMP organism=Homo sapiens : w : GLN OE1 A0372 <- 6.69 -> DG N2 P0003 : score 2.177 : w : GLN NE2 A0372 <- 5.74 -> DC O2 T0010 : score 2.699 : w : LYS NZ A0472 <- 5.63 -> DA N3 P0005 : score 1.538 : H : TYR OH A0505 <- 2.61 -> DC O2 P0006 : score 3.63034 : H : ASN ND2 A0513 <- 3.07 -> DG N3 P0007 : score 4.63055 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.02 -> DG N3 T0006 : score 2.91825 : H : GLU OE2 A0529 <- 3.04 -> DG N2 T0006 : score 4.10336 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.59 -> DG xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.36 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx >2bcs_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE LAMBDA IN COMPLEX WITH A DNA DUPLEX CONTAINING AN UNPAIRED DCMP organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0273 <- 5.65 -> DC N4 T0005 : score 0.048 : w : GLN NE2 A0372 <- 5.82 -> DC O2 T0010 : score 2.699 : w : LYS NZ A0472 <- 5.72 -> DT O2 T0008 : score 0.522 : H : TYR OH A0505 <- 2.65 -> DC O2 P0006 : score 3.60236 : H : ASN ND2 A0513 <- 3.21 -> DG N3 P0007 : score 4.49349 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.02 -> DG N3 T0006 : score 2.91825 : H : GLU OE2 A0529 <- 2.91 -> DG N2 T0006 : score 4.21543 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.69 -> DG xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.34 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx >2bcu_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE LAMBDA IN COMPLEX WITH A DNA DUPLEX CONTAINING AN UNPAIRED DAMP AND A T:T MISMATCH organism=Homo sapiens : w : GLN OE1 A0372 <- 6.54 -> DG N2 P0003 : score 2.177 : w : GLN NE2 A0372 <- 5.85 -> DC O2 T0010 : score 2.699 : H : LYS NZ A0472 <- 3.26 -> DA N3 T0009 : score 2.52145 : w : LYS NZ A0472 <- 5.83 -> DT O2 T0008 : score 0.522 : H : TYR OH A0505 <- 2.69 -> DC O2 P0006 : score 3.57438 : H : ASN ND2 A0513 <- 3.13 -> DG N3 P0007 : score 4.57181 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.07 -> DG N3 T0006 : score 2.88773 : H : GLU OE2 A0529 <- 2.99 -> DG N2 T0006 : score 4.14647 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.68 -> DG xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.39 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx >2bdp_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS DNA POLYMERASE I FRAGMENT COMPLEXED TO 9 BASE PAIRS OF DUPLEX DNA organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.98 -> DA N3 P0013 : score 2.67695 : w : LYS NZ A0582 <- 5.84 -> DT O2 T0030 : score 0.522 : w : LYS NZ A0582 <- 6.10 -> DC O2 T0031 : score 1.3 : w : THR OG1 A0586 <- 6.40 -> DC O2 T0031 : score 2.048 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.83 -> DC O2 P0016 : score 3.6281 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.13 -> DC O2 P0016 : score 3.4546 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.74 -> DC O2 T0028 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 6.06 -> DA N3 T0029 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.91 -> DT O2 P0014 : score 4.64174 : w : ASN ND2 A0625 <- 6.02 -> DT O2 T0030 : score 1.666 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.28 -> DG N3 T0027 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.36 -> DG N3 T0027 : score 1.484 : x : ARG xxxx A0629 <- 2.96 -> DC xxx P0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.39 -> DG xxx T0027 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.13 -> DG xxx P0015 : score x.xxxxx >2bgw_A:Restriction_endonuclease-like;RuvA_domain_2-like; title=XPF FROM AEROPYRUM PERNIX, COMPLEX WITH DNA organism=Aeropyrum pernix : H : ARG NH2 A0182 <- 2.68 -> DG O6 C0014 : score 6.7584 : x : ALA xxxx A0086 <- 3.82 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0087 <- 3.89 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0123 <- 3.71 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx >2bgw_AB:Restriction_endonuclease-like;RuvA_domain_2-like; title=XPF FROM AEROPYRUM PERNIX, COMPLEX WITH DNA organism=Aeropyrum pernix : H : ARG NH2 A0182 <- 2.68 -> DG O6 C0014 : score 6.7584 : x : ALA xxxx A0086 <- 3.82 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0087 <- 3.89 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0123 <- 3.71 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx >2bjc_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=NMR STRUCTURE OF A PROTEIN-DNA COMPLEX OF AN ALTERED SPECIFICITY MUTANT OF THE LAC REPRESSOR HEADPIECE THAT MIMICS THE GAL REPRESSOR organism=ESCHERICHIA COLI : H : TYR OH A0007 <- 2.93 -> DC N4 D0113 : score 4.10454 : V : VAL CG2 A0017 <- 3.86 -> DT C7 D0114 : score 6.03123 : x : LEU xxxx A0006 <- 3.63 -> DC xxx D0113 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0016 <- 3.33 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0018 <- 3.19 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0021 <- 3.24 -> DT xxx D0115 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0029 <- 3.75 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0053 <- 3.37 -> DG xxx D0112 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0056 <- 3.13 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 3.17 -> DC xxx D0113 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0060 <- 3.24 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx >2bjc_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=NMR STRUCTURE OF A PROTEIN-DNA COMPLEX OF AN ALTERED SPECIFICITY MUTANT OF THE LAC REPRESSOR HEADPIECE THAT MIMICS THE GAL REPRESSOR organism=ESCHERICHIA COLI : H : TYR OH A0007 <- 2.93 -> DC N4 D0113 : score 4.10454 : H : TYR OH B0107 <- 2.90 -> DC N4 C0013 : score 4.12982 : V : VAL CG2 B0117 <- 3.84 -> DT C7 C0014 : score 6.06185 : V : VAL CG2 A0017 <- 3.86 -> DT C7 D0114 : score 6.03123 : x : LEU xxxx A0006 <- 3.63 -> DC xxx D0113 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0016 <- 3.33 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0018 <- 3.19 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0021 <- 3.24 -> DT xxx D0115 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0029 <- 3.75 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0053 <- 3.37 -> DG xxx D0112 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0056 <- 3.13 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 3.17 -> DC xxx D0113 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0060 <- 3.24 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0106 <- 3.56 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0116 <- 3.38 -> DG xxx D0106 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0118 <- 3.11 -> DT xxx D0107 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0121 <- 3.23 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0129 <- 3.80 -> DT xxx D0104 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0153 <- 3.40 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0156 <- 3.32 -> DC xxx D0111 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0157 <- 3.12 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0160 <- 3.35 -> DG xxx D0110 : score x.xxxxx >2bnw_BCD:Ribbon-helix-helix; title=STRUCTURAL BASIS FOR COOPERATIVE BINDING OF RIBBON-HELIX-HELIX OMEGA REPRESSOR TO DIRECT DNA HEPTAD REPEATS organism=STREPTOCOCCUS PYOGENES : H : THR OG1 B0029 <- 2.91 -> DC N4 E0005 : score 3.9446 : w : ARG NH2 B0031 <- 6.14 -> DG N7 F0031 : score 2.18 : H : THR OG1 C0029 <- 3.27 -> DG N7 F0024 : score 3.16984 : H : THR OG1 C0029 <- 2.63 -> DG O6 F0024 : score 4.35871 : H : ARG NE C0031 <- 2.88 -> DG N7 F0022 : score 4.35105 : H : ARG NH2 C0031 <- 2.76 -> DG O6 F0022 : score 6.6528 : H : THR OG1 D0029 <- 3.20 -> DC N4 E0012 : score 3.71067 : w : ARG NH1 D0031 <- 5.98 -> DA N6 E0010 : score 1.486 : x : ASP xxxx D0027 <- 4.27 -> DT xxx F0021 : score x.xxxxx >2bnw_C:Ribbon-helix-helix; title=STRUCTURAL BASIS FOR COOPERATIVE BINDING OF RIBBON-HELIX-HELIX OMEGA REPRESSOR TO DIRECT DNA HEPTAD REPEATS organism=STREPTOCOCCUS PYOGENES : H : THR OG1 C0029 <- 3.27 -> DG N7 F0024 : score 3.16984 : H : THR OG1 C0029 <- 2.63 -> DG O6 F0024 : score 4.35871 : H : ARG NE C0031 <- 2.88 -> DG N7 F0022 : score 4.35105 : H : ARG NH2 C0031 <- 2.76 -> DG O6 F0022 : score 6.6528 >2bnz_A:Ribbon-helix-helix; title=STRUCTURAL BASIS FOR COOPERATIVE BINDING OF RIBBON-HELIX-HELIX OMEGA REPRESSOR TO INVERTED DNA HEPTAD REPEATS organism=STREPTOCOCCUS PYOGENES : H : THR OG1 A0029 <- 2.89 -> DC N4 E0005 : score 3.96073 : w : ARG NH1 A0031 <- 5.53 -> DG N7 F0031 : score 2.063 >2bnz_ACD:Ribbon-helix-helix; title=STRUCTURAL BASIS FOR COOPERATIVE BINDING OF RIBBON-HELIX-HELIX OMEGA REPRESSOR TO INVERTED DNA HEPTAD REPEATS organism=STREPTOCOCCUS PYOGENES : H : THR OG1 A0029 <- 2.89 -> DC N4 E0005 : score 3.96073 : w : ARG NH1 A0031 <- 5.53 -> DG N7 F0031 : score 2.063 : H : THR OG1 C0029 <- 3.20 -> DC N4 F0024 : score 3.71067 : H : THR OG1 D0029 <- 3.14 -> DG N7 E0012 : score 3.26081 : H : THR OG1 D0029 <- 2.69 -> DG O6 E0012 : score 4.30812 : H : ARG NE D0031 <- 2.83 -> DG N7 E0010 : score 4.39526 : H : ARG NH2 D0031 <- 2.89 -> DG O6 E0010 : score 6.4812 : x : ARG xxxx C0031 <- 3.32 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >2bop_A:Viral_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE AT 1.7 ANGSTROMS OF THE BOVINE PAPILLOMAVIRUS-1 E2 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO ITS DNA TARGET organism=Bovine papillomavirus type 1 : w : ASN OD1 A0336 <- 6.14 -> DC N4 B0012 : score 2.732 : H : LYS NZ A0339 <- 2.89 -> DG N7 B0013 : score 5.28895 : H : LYS NZ A0339 <- 2.95 -> DG O6 B0014 : score 5.60735 : w : LYS NZ A0339 <- 5.86 -> DG N7 B0014 : score 2.519 : x : CYS xxxx A0340 <- 3.55 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0343 <- 3.53 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx >2bpf_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURES OF TERNARY COMPLEXES OF RAT DNA POLYMERASE BETA, A DNA TEMPLATE-PRIMER, AND DDCTP organism=Rattus norvegicus : H : TYR OH A0271 <- 2.82 -> DC O2 P0007 : score 3.48345 : x : LYS xxxx A0234 <- 2.95 -> DC xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0279 <- 3.95 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0283 <- 2.78 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0295 <- 4.15 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx >2bpg_B:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURES OF TERNARY COMPLEXES OF RAT DNA POLYMERASE BETA, A DNA TEMPLATE-PRIMER, AND DDCTP organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ B0234 <- 2.78 -> DC O2 C0007 : score 2.95794 : H : TYR OH B0271 <- 2.86 -> DC O2 D0007 : score 3.45547 : x : LYS xxxx B0280 <- 4.24 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0283 <- 3.65 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >2bq3_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA ADDUCT BYPASS POLYMERIZATION BY SULFOLOBUS SOLFATARICUS DPO4. ANALYSIS AND CRYSTAL STRUCTURES OF MULTIPLE BASE-PAIR SUBSTITUTION AND FRAMESHIFT PRODUCTS WITH THE ADDUCT 1,N2-ETHENOGUANINE organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : ARG xxxx A0336 <- 4.04 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2bqu_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA ADDUCT BYPASS POLYMERIZATION BY SULFOLOBUS SOLFATARICUS DPO4. ANALYSIS AND CRYSTAL STRUCTURES OF MULTIPLE BASE-PAIR SUBSTITUTION AND FRAMESHIFT PRODUCTS WITH THE ADDUCT 1,N2-ETHENOGUANINE organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : V : ALA CB A0042 <- 3.64 -> DT C7 T0004 : score 5.82293 : x : VAL xxxx A0032 <- 4.00 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.11 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2bsq_E:Ribbon-helix-helix; title=FITAB BOUND TO DNA organism=NEISSERIA GONORRHOEAE : H : ARG NH1 E0007 <- 3.24 -> DG N7 I0026 : score 5.5176 : H : ARG NH2 E0007 <- 3.05 -> DG N7 I0026 : score 6.06538 : H : ARG NH2 E0007 <- 2.32 -> DG O6 I0026 : score 7.2336 : V : VAL CG2 E0005 <- 3.52 -> DT C7 I0028 : score 6.55169 : x : SER xxxx E0003 <- 3.78 -> DT xxx I0028 : score x.xxxxx >2bsq_EFGH:PIN_domain-like;Ribbon-helix-helix; title=FITAB BOUND TO DNA organism=NEISSERIA GONORRHOEAE : H : ARG NH1 E0007 <- 3.24 -> DG N7 I0026 : score 5.5176 : H : ARG NH2 E0007 <- 3.05 -> DG N7 I0026 : score 6.06538 : H : ARG NH2 E0007 <- 2.32 -> DG O6 I0026 : score 7.2336 : H : ARG NH1 F0007 <- 2.88 -> DG O6 I0006 : score 5.986 : H : ARG NH2 F0007 <- 2.61 -> DG N7 I0006 : score 6.62723 : H : ARG NH1 G0007 <- 2.64 -> DG O6 J0062 : score 6.278 : H : ARG NH2 G0007 <- 2.66 -> DG N7 J0062 : score 6.56338 : H : ARG NH1 H0007 <- 2.96 -> DG O6 J0042 : score 5.88867 : H : ARG NH2 H0007 <- 2.75 -> DG N7 J0042 : score 6.44846 : V : VAL CG2 F0005 <- 3.80 -> DT C7 I0008 : score 6.12308 : V : VAL CG2 E0005 <- 3.52 -> DT C7 I0028 : score 6.55169 : x : SER xxxx E0003 <- 3.78 -> DT xxx I0028 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0003 <- 3.66 -> DT xxx I0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0003 <- 3.22 -> DT xxx J0064 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0005 <- 3.83 -> DA xxx J0063 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0003 <- 4.41 -> DT xxx J0044 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx H0005 <- 3.69 -> DT xxx J0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0029 <- 4.28 -> DT xxx I0025 : score x.xxxxx >2c22_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=EFFICIENT AND HIGH FIDELITY INCORPORATION OF DCTP OPPOSITE 7,8- DIHYDRO-8-OXODEOXYGUANOSINE BY SULFOLOBUS SOLFATARICUS DNA POLYMERASE DPO4 organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : ARG xxxx A0336 <- 3.80 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2c28_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=EFFICIENT AND HIGH FIDELITY INCORPORATION OF DCTP OPPOSITE 7,8- DIHYDRO-8-OXODEOXYGUANOSINE BY SULFOLOBUS SOLFATARICUS DNA POLYMERASE DPO4 organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : w : TYR OH A0012 <- 5.32 -> DG N3 A1342 : score 3.344 : x : VAL xxxx A0032 <- 3.92 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 4.41 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0044 <- 3.77 -> DG xxx A1342 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 3.70 -> DG xxx A1342 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.97 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2c2d_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=EFFICIENT AND HIGH FIDELITY INCORPORATION OF DCTP OPPOSITE 7,8- DIHYDRO-8-OXODEOXYGUANOSINE BY SULFOLOBUS SOLFATARICUS DNA POLYMERASE DPO4 organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : SER xxxx A0244 <- 4.02 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0295 <- 3.95 -> DA xxx P0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.91 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx >2c2e_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=EFFICIENT AND HIGH FIDELITY INCORPORATION OF DCTP OPPOSITE 7,8- DIHYDRO-8-OXODEOXYGUANOSINE BY SULFOLOBUS SOLFATARICUS DNA POLYMERASE DPO4 organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : w : ARG NH2 A0332 <- 6.20 -> DG O6 T0006 : score 2.468 : x : PRO xxxx A0060 <- 3.65 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 4.31 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0295 <- 3.44 -> DT xxx P0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.92 -> DA xxx T0008 : score x.xxxxx >2c2r_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=EFFICIENT AND HIGH FIDELITY INCORPORATION OF DCTP OPPOSITE 7,8- DIHYDRO-8-OXODEOXYGUANOSINE BY SULFOLOBUS SOLFATARICUS DNA POLYMERASE DPO4 organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : w : LYS NZ A0339 <- 6.00 -> DA N7 P0007 : score 1.655 : x : SER xxxx A0244 <- 3.82 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0285 <- 4.22 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0295 <- 3.26 -> DA xxx P0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.96 -> DA xxx T0008 : score x.xxxxx >2c62_AB:ssDNA-binding_transcriptional_regulator_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN TRANSCRIPTION COFACTOR PC4 IN COMPLEX WITH SINGLE-STRANDED DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0075 <- 3.36 -> DT O2 C0008 : score 2.28831 : H : ARG NE A0086 <- 2.99 -> DT O2 C0007 : score 2.479 : H : LYS NZ A0097 <- 3.01 -> DT O2 C0006 : score 3.43652 : H : ARG NH1 B0075 <- 2.69 -> DT O2 C0019 : score 4.40115 : H : ARG NH2 B0075 <- 2.85 -> DT O2 C0019 : score 4.191 : H : LYS NZ B0080 <- 2.85 -> DG O6 C0020 : score 5.72296 : H : ARG NE B0086 <- 3.00 -> DT O2 C0018 : score 2.47385 : w : ASP OD2 B0091 <- 5.72 -> DT N3 C0017 : score 2.393 : w : LYS NZ B0097 <- 6.34 -> DT O2 C0017 : score 0.522 : H : ASN ND2 B0106 <- 3.08 -> DG N3 C0020 : score 4.62076 : x : PHE xxxx A0077 <- 3.34 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0080 <- 3.50 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0082 <- 4.27 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0084 <- 2.46 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0089 <- 3.28 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0098 <- 3.52 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0100 <- 3.72 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0104 <- 4.02 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0077 <- 3.29 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0084 <- 3.29 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0088 <- 4.14 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0089 <- 3.36 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0098 <- 3.92 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0100 <- 3.95 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0101 <- 4.48 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0104 <- 3.84 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx >2c62_B:ssDNA-binding_transcriptional_regulator_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN TRANSCRIPTION COFACTOR PC4 IN COMPLEX WITH SINGLE-STRANDED DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 B0075 <- 2.69 -> DT O2 C0019 : score 4.40115 : H : ARG NH2 B0075 <- 2.85 -> DT O2 C0019 : score 4.191 : H : LYS NZ B0080 <- 2.85 -> DG O6 C0020 : score 5.72296 : H : ARG NE B0086 <- 3.00 -> DT O2 C0018 : score 2.47385 : w : ASP OD2 B0091 <- 5.72 -> DT N3 C0017 : score 2.393 : w : LYS NZ B0097 <- 6.34 -> DT O2 C0017 : score 0.522 : H : ASN ND2 B0106 <- 3.08 -> DG N3 C0020 : score 4.62076 : x : PHE xxxx B0077 <- 3.29 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0084 <- 3.29 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0088 <- 4.14 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0089 <- 3.36 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0098 <- 3.92 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0100 <- 3.95 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0101 <- 4.48 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0104 <- 3.84 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx >2c6y_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF INTERLEUKIN ENHANCER-BINDING FACTOR 1 BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : w : SER OG A0050 <- 6.12 -> DA N7 C0007 : score 2.343 : w : ARG NH2 A0052 <- 5.36 -> DG O6 D0008 : score 2.468 : H : HIS NE2 A0053 <- 2.82 -> DT O4 D0011 : score 5.58654 : H : LYS NZ A0073 <- 3.29 -> DA N3 C0014 : score 2.50478 : w : ARG NH1 A0098 <- 6.12 -> DC O2 D0016 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0098 <- 5.04 -> DA N3 D0015 : score 2.092 : V : LEU CD1 A0057 <- 3.76 -> DT C7 D0011 : score 5.78859 : x : ASN xxxx A0049 <- 2.93 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0056 <- 3.48 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx >2c6y_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF INTERLEUKIN ENHANCER-BINDING FACTOR 1 BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : w : SER OG A0050 <- 6.12 -> DA N7 C0007 : score 2.343 : w : ARG NH2 A0052 <- 5.36 -> DG O6 D0008 : score 2.468 : H : HIS NE2 A0053 <- 2.82 -> DT O4 D0011 : score 5.58654 : H : LYS NZ A0073 <- 3.29 -> DA N3 C0014 : score 2.50478 : w : ARG NH1 A0098 <- 6.12 -> DC O2 D0016 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0098 <- 5.04 -> DA N3 D0015 : score 2.092 : w : LYS NZ B0045 <- 5.90 -> DT O4 D0002 : score 1.7 : H : ARG NE B0052 <- 2.80 -> DG N7 D0003 : score 4.42179 : H : ARG NH1 B0052 <- 3.16 -> DG O6 D0003 : score 5.64533 : w : HIS ND1 B0053 <- 5.81 -> DA N7 C0012 : score 2.619 : V : LEU CD1 A0057 <- 3.76 -> DT C7 D0011 : score 5.78859 : x : ASN xxxx A0049 <- 2.93 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0056 <- 3.48 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0049 <- 4.18 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0056 <- 3.50 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >2c7a_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE PROGESTERONE RECEPTOR-DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ A0588 <- 2.56 -> DG N7 C0004 : score 5.64442 : H : ARG NH1 A0593 <- 2.97 -> DG N7 D0013 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0593 <- 2.86 -> DG O6 D0013 : score 6.5208 : H : ARG NE A0637 <- 3.16 -> DC O2 C0002 : score 2.46753 : H : ARG NH2 A0637 <- 3.02 -> DC O2 C0002 : score 3.53597 : x : VAL xxxx A0589 <- 3.40 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx >2c7a_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE PROGESTERONE RECEPTOR-DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ A0588 <- 2.56 -> DG N7 C0004 : score 5.64442 : H : ARG NH1 A0593 <- 2.97 -> DG N7 D0013 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0593 <- 2.86 -> DG O6 D0013 : score 6.5208 : H : ARG NE A0637 <- 3.16 -> DC O2 C0002 : score 2.46753 : H : ARG NH2 A0637 <- 3.02 -> DC O2 C0002 : score 3.53597 : H : LYS NZ B0588 <- 2.60 -> DG N7 D0004 : score 5.60133 : H : ARG NH1 B0593 <- 2.82 -> DG N7 C0013 : score 6.0258 : H : ARG NH2 B0593 <- 2.72 -> DG O6 C0013 : score 6.7056 : x : VAL xxxx A0589 <- 3.40 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0589 <- 3.20 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0637 <- 3.28 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx >2c7o_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=HHAI DNA METHYLTRANSFERASE COMPLEX WITH 13MER OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING 2-AMINOPURINE ADJACENT TO THE TARGET BASE (PCGC:GMGC) AND SAH organism=HAEMOPHILUS HAEMOLYTICUS : H : GLU OE1 A0119 <- 2.83 -> DC N4 D0427 : score 5.73334 : H : ARG NH2 A0163 <- 2.96 -> DC O2 D0427 : score 3.58036 : H : ARG NE A0165 <- 2.76 -> DC O2 D0427 : score 2.68025 : H : ARG NH2 A0165 <- 2.87 -> DC O2 D0427 : score 3.64694 : H : GLN OE1 A0237 <- 2.91 -> DG N2 C0408 : score 5.48432 : w : LYS NZ A0261 <- 5.42 -> DT O4 C0405 : score 1.7 : V : ALA CB A0260 <- 3.61 -> DT C7 C0405 : score 5.86493 : x : CYS xxxx A0081 <- 2.80 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0086 <- 3.66 -> DG xxx C0411 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.26 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0120 <- 4.42 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0121 <- 3.96 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0240 <- 3.28 -> DA xxx D0425 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0252 <- 4.49 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0254 <- 4.34 -> DC xxx D0429 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0304 <- 3.53 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx >2c7p_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=HHAI DNA METHYLTRANSFERASE COMPLEX WITH OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING 2- AMINOPURINE OPPOSITE TO THE TARGET BASE (GCGC:GMPC) AND SAH organism=HAEMOPHILUS HAEMOLYTICUS : H : GLU OE1 A0119 <- 2.81 -> DC N4 D0427 : score 5.75641 : H : ARG NH2 A0163 <- 2.85 -> DC O2 D0427 : score 3.66173 : H : ARG NE A0165 <- 2.86 -> DC O2 D0427 : score 2.62707 : H : ARG NH2 A0165 <- 2.93 -> DC O2 D0427 : score 3.60255 : w : ARG NH2 A0228 <- 5.73 -> DA N7 D0425 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0240 <- 2.84 -> DG N7 D0426 : score 6.0016 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.88 -> DG O6 D0426 : score 6.4944 : w : LYS NZ A0261 <- 5.68 -> DT O4 C0405 : score 1.7 : V : ALA CB A0260 <- 3.61 -> DT C7 C0405 : score 5.86493 : x : CYS xxxx A0081 <- 2.90 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0086 <- 3.12 -> DT xxx C0410 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.29 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0120 <- 4.46 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0121 <- 4.22 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0237 <- 3.38 -> DG xxx D0426 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0252 <- 4.44 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0254 <- 4.30 -> DC xxx D0429 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0304 <- 3.62 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx >2c7q_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=HHAI DNA METHYLTRANSFERASE COMPLEX WITH OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING 2- AMINOPURINE OUTSIDE THE RECOGNITION SEQUENCE (PAIRED WITH G) AND SAH organism=HAEMOPHILUS HAEMOLYTICUS : H : GLU OE1 A0119 <- 2.88 -> DC N4 D0427 : score 5.67566 : H : ARG NH2 A0163 <- 3.08 -> DC O2 D0427 : score 3.49159 : H : ARG NE A0165 <- 2.70 -> DC O2 D0427 : score 2.71215 : H : ARG NH2 A0165 <- 2.84 -> DC O2 D0427 : score 3.66913 : H : GLN OE1 A0237 <- 3.01 -> DG N2 C0408 : score 5.37217 : H : ARG NH1 A0240 <- 2.93 -> DG N7 D0426 : score 5.8927 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.93 -> DG O6 D0426 : score 6.4284 : w : LYS NZ A0261 <- 5.91 -> DG O6 C0405 : score 3.005 : x : ASP xxxx A0042 <- 4.44 -> DT xxx C0401 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0043 <- 3.05 -> DT xxx C0401 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0081 <- 2.67 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0086 <- 3.44 -> DT xxx C0410 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.18 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0120 <- 4.27 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0121 <- 4.06 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0228 <- 4.44 -> DA xxx D0425 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0254 <- 4.36 -> DC xxx D0429 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0304 <- 3.34 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx >2c7r_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=HHAI DNA METHYLTRANSFERASE (T250G MUTANT) COMPLEX WITH OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING 2-AMINOPURINE AS A TARGET BASE (GPGC:GMGC) AND SAH organism=HAEMOPHILUS HAEMOLYTICUS : H : GLN OE1 A0237 <- 2.81 -> DG N2 C0408 : score 5.59648 : H : ARG NH1 A0240 <- 2.93 -> DG N7 D0426 : score 5.8927 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.83 -> DG O6 D0426 : score 6.5604 : w : LYS NZ A0261 <- 5.35 -> DT O4 C0405 : score 1.7 : V : ALA CB A0260 <- 3.54 -> DT C7 C0405 : score 5.96291 : x : ILE xxxx A0086 <- 3.14 -> DT xxx C0410 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.44 -> DG xxx D0426 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0252 <- 4.13 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx >2c9l_YZ:Leucine_zipper_domain; title=STRUCTURE OF THE EPSTEIN-BARR VIRUS ZEBRA PROTEIN organism=HUMAN HERPESVIRUS 4 : H : ASN OD1 Y0182 <- 2.83 -> DC N4 A0012 : score 4.16843 : H : ASN ND2 Y0182 <- 2.80 -> DT O4 B0108 : score 5.28462 : w : ASN ND2 Y0182 <- 6.38 -> DA N6 B0107 : score 2.5 : H : ASN OD1 Z0182 <- 2.65 -> DC N4 B0113 : score 4.3194 : H : ASN ND2 Z0182 <- 2.90 -> DT O4 A0007 : score 5.17892 : H : ARG NH1 Z0190 <- 2.95 -> DG N7 B0111 : score 5.8685 : H : ARG NH2 Z0190 <- 2.41 -> DG O6 B0111 : score 7.1148 : V : ALA CB Y0186 <- 3.68 -> DT C7 A0011 : score 5.76694 : V : ALA CB Z0186 <- 3.54 -> DT C7 B0112 : score 5.96291 : x : ALA xxxx Y0185 <- 3.96 -> DT xxx B0108 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Y0189 <- 4.17 -> DT xxx B0108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0190 <- 4.05 -> DA xxx A0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Z0185 <- 4.08 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Z0189 <- 4.10 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx >2c9l_Z:Leucine_zipper_domain; title=STRUCTURE OF THE EPSTEIN-BARR VIRUS ZEBRA PROTEIN organism=HUMAN HERPESVIRUS 4 : H : ASN OD1 Z0182 <- 2.65 -> DC N4 B0113 : score 4.3194 : H : ASN ND2 Z0182 <- 2.90 -> DT O4 A0007 : score 5.17892 : H : ARG NH1 Z0190 <- 2.95 -> DG N7 B0111 : score 5.8685 : H : ARG NH2 Z0190 <- 2.41 -> DG O6 B0111 : score 7.1148 : V : ALA CB Z0186 <- 3.54 -> DT C7 B0112 : score 5.96291 : x : ALA xxxx Z0185 <- 4.08 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Z0189 <- 4.10 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx >2c9n_Y:Leucine_zipper_domain; title=STRUCTURE OF THE EPSTEIN-BARR VIRUS ZEBRA PROTEIN AT APPROXIMATELY 3. 5 ANGSTROM RESOLUTION organism=HUMAN HERPESVIRUS 4 : H : SER OG Y0186 <- 3.17 -> DT O4 A0011 : score 3.29205 : x : ASN xxxx Y0182 <- 2.78 -> DC xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0185 <- 3.94 -> DT xxx B0108 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx Y0189 <- 4.20 -> DT xxx B0108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0190 <- 3.73 -> DA xxx A0009 : score x.xxxxx >2c9n_YZ:Leucine_zipper_domain; title=STRUCTURE OF THE EPSTEIN-BARR VIRUS ZEBRA PROTEIN AT APPROXIMATELY 3. 5 ANGSTROM RESOLUTION organism=HUMAN HERPESVIRUS 4 : H : SER OG Y0186 <- 3.17 -> DT O4 A0011 : score 3.29205 : H : ASN OD1 Z0182 <- 2.48 -> DC N4 B0113 : score 4.46198 : H : ASN ND2 Z0182 <- 2.72 -> DT O4 A0007 : score 5.36917 : H : SER OG Z0186 <- 3.00 -> DT O4 B0112 : score 3.41292 : H : ARG NH1 Z0190 <- 2.89 -> DG N7 B0111 : score 5.9411 : H : ARG NH2 Z0190 <- 2.21 -> DG O6 B0111 : score 7.3788 : V : ALA CB Z0185 <- 3.77 -> DT C7 A0007 : score 5.64097 : x : ASN xxxx Y0182 <- 2.78 -> DC xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0185 <- 3.94 -> DT xxx B0108 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx Y0189 <- 4.20 -> DT xxx B0108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0190 <- 3.73 -> DA xxx A0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx Z0189 <- 4.12 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx >2cax_CD:Ribbon-helix-helix; title=STRUCTURAL BASIS FOR COOPERATIVE BINDING OF RIBBON-HELIX-HELIX REPRESSOR OMEGA TO MUTATED DIRECT DNA HEPTAD REPEATS organism=STREPTOCOCCUS PYOGENES : H : THR OG1 C0029 <- 3.09 -> DG N7 Y0026 : score 3.29579 : H : THR OG1 C0029 <- 2.80 -> DG O6 Y0026 : score 4.21538 : H : ARG NE C0031 <- 2.80 -> DG N7 Y0024 : score 4.42179 : H : ARG NH2 C0031 <- 2.59 -> DG O6 Y0024 : score 6.8772 : x : ASP xxxx D0027 <- 4.32 -> DT xxx Y0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0029 <- 3.46 -> DC xxx U0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0031 <- 3.45 -> DT xxx U0011 : score x.xxxxx >2cax_D:Ribbon-helix-helix; title=STRUCTURAL BASIS FOR COOPERATIVE BINDING OF RIBBON-HELIX-HELIX REPRESSOR OMEGA TO MUTATED DIRECT DNA HEPTAD REPEATS organism=STREPTOCOCCUS PYOGENES : w : ARG NH1 D0031 <- 6.31 -> DG N7 Y0026 : score 2.063 : x : ASP xxxx D0027 <- 4.32 -> DT xxx Y0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0029 <- 3.46 -> DC xxx U0012 : score x.xxxxx >2ccz_AB:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI PRIMOSOMOL PROTEIN PRIB BOUND TO SSDNA organism=ESCHERICHIA COLI : w : ARG NE A0013 <- 6.31 -> DT O2 C0008 : score 0.757 : V : TRP CB B0047 <- 3.51 -> DT C7 C0003 : score 5.8949 : V : TRP CD1 A0047 <- 3.61 -> DT C7 C0013 : score 7.68167 : x : LEU xxxx A0016 <- 4.49 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0018 <- 3.48 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0020 <- 4.45 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0021 <- 3.94 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0022 <- 4.21 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0032 <- 2.85 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0034 <- 2.70 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0049 <- 4.13 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0085 <- 3.84 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0089 <- 4.36 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0034 <- 3.72 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0082 <- 4.50 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0087 <- 3.76 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx >2ccz_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI PRIMOSOMOL PROTEIN PRIB BOUND TO SSDNA organism=ESCHERICHIA COLI : V : TRP CB B0047 <- 3.51 -> DT C7 C0003 : score 5.8949 : x : ARG xxxx B0034 <- 3.72 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0082 <- 4.50 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0087 <- 3.76 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx >2cdm_A:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=THE STRUCTURE OF TRWC COMPLEXED WITH A 27-MER DNA COMPRISING THE RECOGNITION HAIRPIN AND THE CLEAVAGE SITE organism=? : w : SER OG A0003 <- 6.44 -> DT O2 B0025 : score 1.55 : H : HIS NE2 A0004 <- 3.00 -> DA N3 B0019 : score 4.07631 : H : ARG NH1 A0075 <- 2.96 -> DA N3 B0005 : score 3.56423 : H : ARG NH1 A0081 <- 2.79 -> DG O6 B0017 : score 6.0955 : H : ARG NH2 A0081 <- 2.86 -> DG N7 B0017 : score 6.308 : w : SER OG A0089 <- 5.55 -> DT O2 B0025 : score 1.55 : H : ARG NH1 A0128 <- 3.28 -> DG N7 B0015 : score 5.4692 : H : ARG NH2 A0128 <- 2.89 -> DG O6 B0003 : score 6.4812 : H : ARG NH2 A0128 <- 2.44 -> DG O6 B0015 : score 7.0752 : H : LYS NZ A0130 <- 2.71 -> DG N7 B0013 : score 5.48284 : H : GLN NE2 A0159 <- 2.72 -> DT O2 B0023 : score 3.99627 : H : ASN OD1 A0182 <- 2.93 -> DT N3 B0018 : score 3.70245 : H : ASN ND2 A0182 <- 3.11 -> DT O4 B0018 : score 4.95697 : H : LYS NZ A0262 <- 3.08 -> DG O6 B0022 : score 5.45705 : V : LEU CD2 A0255 <- 3.67 -> DT C7 B0020 : score 5.91755 : x : MET xxxx A0001 <- 3.09 -> DT xxx B0021 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0002 <- 3.97 -> DT xxx B0021 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0005 <- 3.39 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0006 <- 3.30 -> DT xxx B0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0014 <- 4.08 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0073 <- 3.41 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0085 <- 4.48 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.06 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0091 <- 4.11 -> DT xxx B0023 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0183 <- 2.92 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0186 <- 3.65 -> DT xxx B0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0187 <- 3.74 -> DT xxx B0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0189 <- 3.94 -> DT xxx B0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0190 <- 3.55 -> DT xxx B0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0216 <- 4.30 -> DT xxx B0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0218 <- 2.73 -> DT xxx B0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0236 <- 3.28 -> DC xxx B0024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0239 <- 4.48 -> DC xxx B0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0259 <- 3.98 -> DT xxx B0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0266 <- 4.06 -> DT xxx B0025 : score x.xxxxx >2cgp_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN/DNA COMPLEX, ADENOSINE-3',5'-CYCLIC- MONOPHOSPHATE organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 A0180 <- 2.92 -> DG O6 C0540 : score 6.4416 : H : GLU OE2 A0181 <- 3.15 -> DC N4 B0505 : score 4.89681 : H : ARG NH1 A0185 <- 2.96 -> DT O4 B0504 : score 3.16337 : H : ARG NH2 A0185 <- 2.81 -> DG O6 C0542 : score 6.5868 : H : ARG NH2 A0185 <- 2.65 -> DT O4 B0504 : score 3.66046 : x : SER xxxx A0179 <- 3.34 -> DT xxx B0504 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0182 <- 4.04 -> DG xxx B0503 : score x.xxxxx >2crx_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=STRUCTURE OF THE HOLLIDAY JUNCTION INTERMEDIATE IN CRE-LOXP SITE- SPECIFIC RECOMBINATION organism=Enterobacteria phage P1 : H : MET SD A0044 <- 3.30 -> DA N6 D0012 : score 5.37808 : H : LYS NZ A0086 <- 2.69 -> DG O6 D0015 : score 5.90795 : H : LYS NZ A0244 <- 2.97 -> DT O2 D0003 : score 3.46522 : V : GLN CG A0090 <- 3.65 -> DT C7 D0013 : score 3.37746 : x : LYS xxxx A0043 <- 4.27 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.98 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.47 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 4.06 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.91 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0259 <- 3.61 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0317 <- 3.71 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >2cv5_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.95 -> DA N3 J0229 : score 3.14255 : H : ARG NH1 C0011 <- 3.46 -> DT O2 J0263 : score 3.73796 : H : ARG NH2 C0011 <- 2.83 -> DT O2 J0264 : score 4.20793 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.84 -> DA N3 I0082 : score 3.21383 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.48 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.35 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.02 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.77 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0036 <- 4.10 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.33 -> DT xxx J0289 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.18 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.02 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.64 -> DA xxx I0099 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.97 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.22 -> DA xxx J0165 : score x.xxxxx >2cv5_C:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 C0011 <- 3.46 -> DT O2 J0263 : score 3.73796 : H : ARG NH2 C0011 <- 2.83 -> DT O2 J0264 : score 4.20793 >2d45_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MECI-MECA REPRESSOR-OPERATOR COMPLEX organism=Staphylococcus aureus : H : LYS NZ A0043 <- 3.17 -> DT O4 F0201 : score 3.32173 : H : THR OG1 A0047 <- 2.71 -> DA N6 E0213 : score 2.80864 : H : ARG NH1 A0051 <- 3.35 -> DT O4 E0212 : score 2.90847 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.86 -> DG N7 E0211 : score 6.308 : H : ARG NH2 A0051 <- 3.04 -> DG O6 E0211 : score 6.2832 : V : LEU CD2 A0048 <- 3.90 -> DT C7 E0212 : score 5.588 : x : THR xxxx A0044 <- 3.08 -> DA xxx E0213 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0046 <- 4.29 -> DT xxx F0201 : score x.xxxxx >2d45_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MECI-MECA REPRESSOR-OPERATOR COMPLEX organism=Staphylococcus aureus : H : LYS NZ A0043 <- 3.17 -> DT O4 F0201 : score 3.32173 : H : THR OG1 A0047 <- 2.71 -> DA N6 E0213 : score 2.80864 : H : ARG NH1 A0051 <- 3.35 -> DT O4 E0212 : score 2.90847 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.86 -> DG N7 E0211 : score 6.308 : H : ARG NH2 A0051 <- 3.04 -> DG O6 E0211 : score 6.2832 : H : THR OG1 B0047 <- 3.13 -> DA N6 F0213 : score 2.57688 : H : ARG NH2 B0051 <- 3.00 -> DG O6 F0211 : score 6.336 : V : LEU CD2 A0048 <- 3.90 -> DT C7 E0212 : score 5.588 : x : THR xxxx A0044 <- 3.08 -> DA xxx E0213 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0046 <- 4.29 -> DT xxx F0201 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0043 <- 3.44 -> DT xxx E0201 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0044 <- 3.44 -> DT xxx F0212 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0046 <- 4.31 -> DT xxx E0201 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0048 <- 4.46 -> DT xxx F0212 : score x.xxxxx >2d45_CD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MECI-MECA REPRESSOR-OPERATOR COMPLEX organism=Staphylococcus aureus : H : ARG NH2 C0051 <- 3.33 -> DG N7 G0211 : score 5.70785 : H : THR OG1 D0047 <- 3.29 -> DA N6 H0213 : score 2.4886 : V : ARG CZ D0046 <- 3.72 -> DT C7 G0201 : score 2.17495 : x : THR xxxx C0044 <- 3.02 -> DT xxx G0212 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0047 <- 4.03 -> DT xxx G0212 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0048 <- 4.02 -> DT xxx G0212 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0043 <- 3.46 -> DT xxx G0201 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0044 <- 3.47 -> DT xxx H0212 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0051 <- 3.26 -> DT xxx H0212 : score x.xxxxx >2d5v_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HNF-6ALPHA DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH THE TTR PROMOTER organism=Rattus norvegicus : H : SER OG B0035 <- 2.69 -> DA N7 E2009 : score 4.56231 : H : GLN OE1 B0036 <- 2.79 -> DA N6 F2018 : score 6.06467 : H : GLN NE2 B0036 <- 2.94 -> DA N7 F2018 : score 5.91923 : H : ARG NH1 B0101 <- 2.84 -> DA N3 E2009 : score 3.6526 : w : ASN OD1 B0143 <- 5.61 -> DC N4 F2023 : score 2.732 : H : ASN OD1 B0147 <- 3.14 -> DA N6 F2022 : score 5.61231 : H : ASN ND2 B0147 <- 3.02 -> DA N7 F2022 : score 5.61221 : H : ARG NH1 B0150 <- 2.63 -> DA N7 E2005 : score 2.64731 : H : ARG NH1 B0150 <- 2.69 -> DG N7 E2006 : score 6.1831 : H : ARG NH1 B0150 <- 3.20 -> DG O6 E2006 : score 5.59667 : H : ARG NH2 B0150 <- 2.83 -> DG O6 E2006 : score 6.5604 : H : ARG NH1 B0151 <- 3.24 -> DG O6 F2021 : score 5.548 : H : ARG NH2 B0151 <- 2.76 -> DG N7 F2021 : score 6.43569 : x : THR xxxx B0038 <- 3.30 -> DC xxx E2008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0040 <- 3.26 -> DA xxx F2018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0041 <- 3.72 -> DT xxx F2020 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0146 <- 4.22 -> DA xxx E2004 : score x.xxxxx >2ddg_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF URACIL-DNA GLYCOSYLASE IN COMPLEX WITH AP:G CONTAINING DNA organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ARG NH2 A0193 <- 2.95 -> DC O2 D0010 : score 3.58776 : w : ARG NH1 A0193 <- 5.70 -> DA N3 D0011 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0193 <- 5.85 -> DA N3 D0011 : score 2.092 : H : GLN OE1 A0194 <- 3.05 -> DG N2 D0008 : score 5.32731 : H : GLN OE1 A0194 <- 3.17 -> DT N3 C0009 : score 3.16146 : w : GLN OE1 A0194 <- 5.94 -> DT O4 C0009 : score 3.068 : w : ASN ND2 A0195 <- 5.34 -> DT O2 C0009 : score 1.666 : w : ARG NE A0200 <- 5.36 -> DT O2 C0009 : score 0.757 : x : ARG xxxx A0031 <- 3.91 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0152 <- 4.43 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0197 <- 2.66 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0198 <- 3.42 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx >2dem_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF URACIL-DNA GLYCOSYLASE IN COMPLEX WITH AP:A CONTAINING DNA organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ARG NH2 A0193 <- 2.95 -> DC O2 D0010 : score 3.58776 : w : ARG NH1 A0193 <- 5.85 -> DA N3 D0011 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0193 <- 5.94 -> DA N3 D0011 : score 2.092 : H : GLN OE1 A0194 <- 3.13 -> DT N3 C0009 : score 3.18877 : w : GLN OE1 A0194 <- 6.10 -> DT O4 C0009 : score 3.068 : w : ASN ND2 A0195 <- 5.44 -> DT O2 C0009 : score 1.666 : w : ARG NE A0200 <- 5.23 -> DT O2 C0009 : score 0.757 : w : ARG NH1 A0200 <- 5.68 -> DT O2 C0009 : score 1.855 : w : ARG NH1 A0200 <- 6.14 -> DA N3 D0007 : score 2.585 : x : ARG xxxx A0031 <- 3.89 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0152 <- 4.42 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0197 <- 2.71 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0198 <- 3.46 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx >2dgc_A:Leucine_zipper_domain; title=GCN4 BASIC DOMAIN, LEUCINE ZIPPER COMPLEXED WITH ATF/CREB SITE DNA organism=? : H : ASN OD1 A0235 <- 3.00 -> DC N4 B0003 : score 4.02585 : H : ARG NH2 A0243 <- 2.52 -> DG N7 B0001 : score 6.74215 A : V : ALA CB A0239 <- 3.67 -> DT C7 B0002 : score 5.78094 : x : THR xxxx A0236 <- 4.25 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx >2dnj_A:DNase_I-like; title=DNASE I-INDUCED DNA CONFORMATION. 2 ANGSTROMS STRUCTURE OF A DNASE I- OCTAMER COMPLEX organism=BOS TAURUS : w : ARG NH2 A0009 <- 5.86 -> DT O2 C0313 : score 2.261 : w : ARG NH2 A0009 <- 5.55 -> DA N3 B0304 : score 2.092 : w : THR OG1 A0010 <- 5.91 -> DA N3 B0304 : score 2.845 : H : ARG NH1 A0041 <- 2.83 -> DT O2 B0305 : score 4.28057 : H : ARG NH2 A0041 <- 2.94 -> DC O2 B0306 : score 3.59515 : w : SER OG A0075 <- 5.99 -> DG N3 C0311 : score 2.344 : w : SER OG A0075 <- 5.91 -> DA N3 C0312 : score 0.958 : x : TYR xxxx A0076 <- 4.06 -> DA xxx C0312 : score x.xxxxx >2dp6_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF URACIL-DNA GLYCOSYLASE IN COMPLEX WITH AP:C CONTAINING DNA organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ARG NH2 A0193 <- 2.93 -> DC O2 D0010 : score 3.60255 : w : ARG NH1 A0193 <- 5.85 -> DA N3 D0011 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0193 <- 6.03 -> DA N3 D0011 : score 2.092 : H : GLN OE1 A0197 <- 2.79 -> DG N2 D0009 : score 5.61891 : H : GLN OE1 A0197 <- 2.79 -> DG N2 D0009 : score 5.61891 : H : ARG NH1 A0200 <- 3.01 -> DC O2 D0008 : score 3.4967 : x : ARG xxxx A0031 <- 3.94 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0152 <- 4.43 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0194 <- 3.20 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0195 <- 4.26 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0198 <- 3.45 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx >2dpd_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE REPLICATION TERMINATION PROTEIN IN COMPLEX WITH A PSEUDOSYMMETRIC B-SITE organism=Bacillus subtilis : H : HIS NE2 A0054 <- 3.38 -> DG O6 E0005 : score 7.0312 : H : THR OG1 A0055 <- 3.20 -> DT O4 D0015 : score 3.57621 : H : ARG NH1 A0059 <- 2.81 -> DG O6 D0014 : score 6.07117 : H : ARG NH2 A0059 <- 2.58 -> DG N7 D0014 : score 6.66554 : H : ARG NH2 A0059 <- 2.90 -> DG O6 D0014 : score 6.468 : x : LEU xxxx A0035 <- 3.69 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0053 <- 3.90 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0056 <- 4.49 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0058 <- 3.65 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx >2dpd_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE REPLICATION TERMINATION PROTEIN IN COMPLEX WITH A PSEUDOSYMMETRIC B-SITE organism=Bacillus subtilis : H : HIS NE2 A0054 <- 3.38 -> DG O6 E0005 : score 7.0312 : H : THR OG1 A0055 <- 3.20 -> DT O4 D0015 : score 3.57621 : H : ARG NH1 A0059 <- 2.81 -> DG O6 D0014 : score 6.07117 : H : ARG NH2 A0059 <- 2.58 -> DG N7 D0014 : score 6.66554 : H : ARG NH2 A0059 <- 2.90 -> DG O6 D0014 : score 6.468 : H : HIS NE2 B0054 <- 3.34 -> DG O6 D0005 : score 7.09483 : H : ARG NH1 B0059 <- 3.01 -> DG O6 E0014 : score 5.82783 : H : ARG NH2 B0059 <- 2.85 -> DG N7 E0014 : score 6.32077 : H : ARG NH2 B0059 <- 2.79 -> DG O6 E0014 : score 6.6132 : x : LEU xxxx A0035 <- 3.69 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0053 <- 3.90 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0056 <- 4.49 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0058 <- 3.65 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0035 <- 4.18 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0053 <- 4.13 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0055 <- 3.05 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0058 <- 3.82 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0083 <- 4.22 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx >2dpi_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF HPOLI WITH DNA AND DCTP organism=Homo sapiens : w : GLU OE2 A0305 <- 6.40 -> DG N7 T0842 : score 2.669 : w : ARG NH1 A0343 <- 5.12 -> DG O6 P0868 : score 2.756 : x : SER xxxx A0301 <- 4.45 -> DT xxx T0844 : score x.xxxxx >2dpj_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF HPOLI WITH DNA AND DTTP organism=Homo sapiens : w : TYR OH A0039 <- 5.80 -> DG N3 T0841 : score 3.344 : w : TYR OH A0039 <- 5.70 -> DG N2 T0841 : score 2.834 : w : GLN NE2 A0059 <- 5.96 -> DG N3 T0841 : score 1.484 : x : SER xxxx A0301 <- 4.45 -> DT xxx T0844 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0305 <- 3.67 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 4.42 -> DG xxx P0868 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 4.39 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >2dpu_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE REPLICATION TERMINATION PROTEIN IN COMPLEX WITH A PSEUDOSYMMETRIC 21MER B-SITE DNA organism=Bacillus subtilis : H : HIS NE2 A0054 <- 2.75 -> DG O6 E0005 : score 8.03338 : H : THR OG1 A0055 <- 3.43 -> DT O4 D0015 : score 3.39739 : H : ARG NH1 A0059 <- 3.13 -> DG O6 D0014 : score 5.68183 : H : ARG NH2 A0059 <- 2.71 -> DG N7 D0014 : score 6.49954 : x : ARG xxxx A0016 <- 3.20 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0035 <- 3.48 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0053 <- 3.42 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0058 <- 3.00 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx >2drp_D:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF A TWO ZINC-FINGER PEPTIDE REVEALS AN EXTENSION TO THE RULES FOR ZINC-FINGER/DNA RECOGNITION organism=Drosophila melanogaster : H : SER OG D0124 <- 2.89 -> DT O4 E0011 : score 3.49114 : H : ASN OD1 D0125 <- 2.97 -> DA N6 E0010 : score 5.81705 : H : ASN ND2 D0125 <- 2.87 -> DA N7 E0010 : score 5.78833 : w : ASN OD1 D0125 <- 6.08 -> DA N6 F0030 : score 2.837 : H : ARG NH1 D0128 <- 2.73 -> DG O6 E0009 : score 6.1685 : H : ARG NH1 D0128 <- 2.85 -> DT O4 F0031 : score 3.23527 : H : ARG NH2 D0128 <- 2.80 -> DG N7 E0009 : score 6.38462 : H : ARG NH1 D0152 <- 2.81 -> DG N7 E0008 : score 6.0379 : H : ARG NH2 D0152 <- 2.80 -> DG O6 E0008 : score 6.6 : H : ASP OD2 D0154 <- 2.98 -> DC N4 F0032 : score 5.9768 : H : ASN OD1 D0155 <- 3.17 -> DA N6 E0007 : score 5.57618 : H : ASN ND2 D0155 <- 2.93 -> DA N7 E0007 : score 5.71788 : w : ASN OD1 D0155 <- 6.24 -> DA N6 E0006 : score 2.837 : w : ASN OD1 D0155 <- 6.06 -> DC N4 F0033 : score 2.732 : V : ILE CG2 D0123 <- 3.81 -> DT C7 F0028 : score 7.07355 : V : CYS CB D0127 <- 3.74 -> DT C7 F0029 : score 5.27592 >2dtu_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE BETA HAIRPIN LOOP DELETION VARIANT OF RB69 GP43 IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING AN ABASIC SITE ANALOG organism=Enterobacteria phage RB69 : x : LYS xxxx A0706 <- 3.26 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx >2dy4_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RB69 GP43 IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING THYMINE GLYCOL organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.88 -> DC O2 F0114 : score 2.89902 : x : ASP xxxx A0621 <- 4.18 -> DC xxx F0114 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0622 <- 4.14 -> DA xxx F0115 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0707 <- 3.58 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0800 <- 4.21 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx >2e1c_A:Dimeric_alpha+beta_barrel;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Dimeric_alpha+beta_barrel;Dimeric_alpha+beta_barrel; title=STRUCTURE OF PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PH1519/DNA COMPLEX organism=Pyrococcus horikoshii : H : SER OG A0056 <- 2.62 -> DG O6 B0004 : score 4.2383 : w : SER OG A0056 <- 6.19 -> DG N7 B0004 : score 2.749 : x : LEU xxxx A0044 <- 3.52 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0054 <- 4.38 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0055 <- 3.54 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0057 <- 3.46 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0059 <- 3.86 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx >2e2h_ABE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX AT 5 MM MG2+ WITH GTP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : LYS xxxx A0143 <- 3.96 -> DT xxx N0006 : score x.xxxxx >2e2i_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX IN 5 MM MG+2 WITH 2'-DGTP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : GLU xxxx A0833 <- 3.91 -> DC xxx N0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1102 <- 4.31 -> DC xxx N0001 : score x.xxxxx >2e2i_ABE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX IN 5 MM MG+2 WITH 2'-DGTP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : GLU xxxx A0833 <- 3.91 -> DC xxx N0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1102 <- 4.31 -> DC xxx N0001 : score x.xxxxx >2e42_AB:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C/EBPBETA BZIP HOMODIMER V285A MUTANT BOUND TO A HIGH AFFINITY DNA FRAGMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0278 <- 3.03 -> DA N7 C0012 : score 2.44248 : H : ASN OD1 A0281 <- 2.79 -> DA N6 C0012 : score 6.03384 : H : ASN ND2 A0281 <- 2.91 -> DT O4 D0105 : score 5.16835 : w : ASN ND2 A0281 <- 5.58 -> DA N7 D0104 : score 1.989 : H : ARG NH1 A0289 <- 2.63 -> DG O6 C0010 : score 6.29017 : H : ARG NH2 A0289 <- 3.04 -> DG N7 C0010 : score 6.07815 : w : ARG NH1 A0289 <- 5.75 -> DG N7 D0107 : score 2.063 : H : ASN OD1 B0281 <- 2.80 -> DA N6 D0111 : score 6.02179 : H : ASN ND2 B0281 <- 3.05 -> DT O4 C0006 : score 5.02038 : w : ASN ND2 B0281 <- 6.16 -> DA N6 C0005 : score 2.5 : w : ASN OD1 B0282 <- 5.77 -> DC N4 D0110 : score 2.732 : H : ARG NH2 B0289 <- 2.96 -> DG O6 C0008 : score 6.3888 : H : ARG NH2 B0289 <- 2.54 -> DG O6 D0109 : score 6.9432 : x : ALA xxxx A0284 <- 3.98 -> DT xxx D0105 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0285 <- 3.56 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 4.12 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0278 <- 3.01 -> DA xxx D0111 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0284 <- 4.05 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0285 <- 3.68 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 3.96 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx >2e42_B:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C/EBPBETA BZIP HOMODIMER V285A MUTANT BOUND TO A HIGH AFFINITY DNA FRAGMENT organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 B0281 <- 2.80 -> DA N6 D0111 : score 6.02179 : H : ASN ND2 B0281 <- 3.05 -> DT O4 C0006 : score 5.02038 : w : ASN ND2 B0281 <- 6.16 -> DA N6 C0005 : score 2.5 : w : ASN OD1 B0282 <- 5.77 -> DC N4 D0110 : score 2.732 : H : ARG NH2 B0289 <- 2.96 -> DG O6 C0008 : score 6.3888 : H : ARG NH2 B0289 <- 2.54 -> DG O6 D0109 : score 6.9432 : x : ARG xxxx B0278 <- 3.01 -> DA xxx D0111 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0284 <- 4.05 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0285 <- 3.68 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 3.96 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx >2e43_AB:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C/EBPBETA BZIP HOMODIMER K269A MUTANT BOUND TO A HIGH AFFINITY DNA FRAGMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0278 <- 3.04 -> DA N7 C0012 : score 2.43736 : H : ASN OD1 A0281 <- 3.05 -> DA N6 C0012 : score 5.72071 : H : ASN ND2 A0281 <- 2.98 -> DT O4 D0105 : score 5.09437 : w : ASN ND2 A0281 <- 6.17 -> DA N6 D0104 : score 2.5 : H : ARG NH1 A0289 <- 2.67 -> DG O6 C0010 : score 6.2415 : H : ARG NH2 A0289 <- 3.00 -> DG N7 C0010 : score 6.12923 : w : ARG NH1 A0289 <- 6.29 -> DG O6 D0107 : score 2.756 : H : ARG NH1 B0278 <- 2.99 -> DA N7 D0111 : score 2.46297 : H : ASN OD1 B0281 <- 2.82 -> DA N6 D0111 : score 5.99771 : H : ASN ND2 B0281 <- 2.98 -> DT O4 C0006 : score 5.09437 : w : ASN ND2 B0281 <- 6.34 -> DA N6 C0005 : score 2.5 : w : ASN OD1 B0282 <- 5.71 -> DC N4 D0110 : score 2.732 : w : ARG NH1 B0289 <- 5.22 -> DG O6 D0109 : score 2.756 : x : ALA xxxx A0284 <- 4.07 -> DT xxx D0105 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0285 <- 3.31 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 4.09 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0284 <- 4.04 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0285 <- 3.36 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 3.80 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx >2e43_B:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C/EBPBETA BZIP HOMODIMER K269A MUTANT BOUND TO A HIGH AFFINITY DNA FRAGMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0278 <- 2.99 -> DA N7 D0111 : score 2.46297 : H : ASN OD1 B0281 <- 2.82 -> DA N6 D0111 : score 5.99771 : H : ASN ND2 B0281 <- 2.98 -> DT O4 C0006 : score 5.09437 : w : ASN ND2 B0281 <- 6.34 -> DA N6 C0005 : score 2.5 : w : ASN OD1 B0282 <- 5.71 -> DC N4 D0110 : score 2.732 : w : ARG NH1 B0289 <- 5.22 -> DG O6 D0109 : score 2.756 : V : ARG CZ B0289 <- 3.59 -> DT C7 C0007 : score 2.24425 : x : ALA xxxx B0284 <- 4.04 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0285 <- 3.36 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 3.80 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx >2e52_A: title=CRYSTAL STRUCTURAL ANALYSIS OF HINDIII RESTRICTION ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH COGNATE DNA AT 2.0 ANGSTROM RESOLUTION organism=HAEMOPHILUS INFLUENZAE : H : SER OG A0056 <- 2.61 -> DT O2 G0008 : score 3.83794 : w : SER OG A0056 <- 5.54 -> DG N3 E0006 : score 2.344 : w : GLU OE1 A0060 <- 5.51 -> DA N3 E0005 : score 0.995 : H : LYS NZ A0061 <- 2.75 -> DT O2 G0009 : score 3.62305 : w : LYS NZ A0061 <- 5.61 -> DA N3 E0005 : score 1.538 : w : ARG NH2 A0088 <- 5.37 -> DA N3 E0004 : score 2.092 : H : ASN OD1 A0120 <- 3.02 -> DA N6 G0004 : score 5.75684 : H : ASN ND2 A0120 <- 2.92 -> DT O4 E0008 : score 5.15778 : H : LYS NZ A0122 <- 2.75 -> DG O6 G0006 : score 5.83858 : H : ASP OD1 A0123 <- 3.03 -> DC N4 E0007 : score 5.09901 : w : LYS NZ A0125 <- 5.60 -> DA N7 E0005 : score 1.655 : x : ARG xxxx A0116 <- 3.43 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0117 <- 3.29 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0118 <- 3.10 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx >2e52_CD: title=CRYSTAL STRUCTURAL ANALYSIS OF HINDIII RESTRICTION ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH COGNATE DNA AT 2.0 ANGSTROM RESOLUTION organism=HAEMOPHILUS INFLUENZAE : H : SER OG C0056 <- 2.61 -> DT O2 H0008 : score 3.83794 : w : GLU OE1 C0060 <- 5.44 -> DA N3 F0005 : score 0.995 : H : LYS NZ C0061 <- 2.72 -> DT O2 H0009 : score 3.64457 : w : LYS NZ C0061 <- 5.59 -> DA N3 F0005 : score 1.538 : w : ARG NE C0088 <- 6.08 -> DG N3 H0011 : score 1.082 : H : ASN OD1 C0120 <- 2.95 -> DA N6 H0004 : score 5.84114 : H : ASN ND2 C0120 <- 2.82 -> DT O4 F0008 : score 5.26348 : H : LYS NZ C0122 <- 2.79 -> DG O6 H0006 : score 5.79233 : H : ASP OD1 C0123 <- 3.02 -> DC N4 F0007 : score 5.1097 : w : LYS NZ C0125 <- 5.82 -> DA N7 F0005 : score 1.655 : H : SER OG D0056 <- 2.50 -> DT O2 F0008 : score 3.91928 : w : GLU OE1 D0060 <- 5.42 -> DA N3 H0005 : score 0.995 : H : LYS NZ D0061 <- 2.76 -> DT O2 F0009 : score 3.61588 : w : LYS NZ D0061 <- 5.50 -> DA N3 H0005 : score 1.538 : H : ASN OD1 D0120 <- 2.87 -> DA N6 F0004 : score 5.93749 : H : ASN ND2 D0120 <- 2.82 -> DT O4 H0008 : score 5.26348 : H : LYS NZ D0122 <- 2.76 -> DG O6 F0006 : score 5.82702 : H : ASP OD1 D0123 <- 3.08 -> DC N4 H0007 : score 5.04556 : w : LYS NZ D0125 <- 5.56 -> DA N7 H0005 : score 1.655 : x : ARG xxxx C0116 <- 3.47 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0117 <- 3.34 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0118 <- 3.05 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0116 <- 3.50 -> DC xxx H0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0117 <- 3.24 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0118 <- 3.13 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx >2ea0_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA REPAIR ENZYME ENDONUCLEASE-VIII (NEI) FROM E. COLI IN COMPLEX WITH AP-SITE CONTAINING DNA SUBSTRATE organism=Escherichia coli : V : SER CB A0251 <- 3.80 -> DT C7 B0404 : score 3.13128 : x : GLN xxxx A0069 <- 2.76 -> DG xxx C0428 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0070 <- 3.74 -> DA xxx C0426 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0071 <- 3.30 -> DT xxx B0408 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0252 <- 3.81 -> DG xxx C0428 : score x.xxxxx >2efw_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RTP:NRB COMPLEX FROM BACILLUS SUBTILIS organism=Bacillus subtilis : H : HIS NE2 A0054 <- 2.64 -> DG O6 E0005 : score 8.20837 : H : ARG NH1 A0059 <- 2.66 -> DG O6 D0014 : score 6.25367 : H : ARG NH2 A0059 <- 2.72 -> DG N7 D0014 : score 6.48677 : H : HIS NE2 B0054 <- 3.03 -> DG O6 D0005 : score 7.58797 : H : THR OG1 B0055 <- 3.14 -> DT O4 E0015 : score 3.62285 : H : ARG NH1 B0059 <- 2.78 -> DG O6 E0014 : score 6.10767 : H : ARG NH2 B0059 <- 2.94 -> DG N7 E0014 : score 6.20585 : x : ARG xxxx A0016 <- 3.85 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0035 <- 4.00 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0053 <- 4.29 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0055 <- 2.88 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0058 <- 3.31 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0081 <- 3.70 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0083 <- 3.84 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0016 <- 4.30 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0038 <- 3.97 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0053 <- 4.20 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0058 <- 4.47 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx >2efw_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RTP:NRB COMPLEX FROM BACILLUS SUBTILIS organism=Bacillus subtilis : H : ARG NH1 F0059 <- 2.72 -> DG O6 I0014 : score 6.18067 : H : ARG NH2 F0059 <- 2.51 -> DG N7 I0014 : score 6.75492 : H : GLN NE2 F0083 <- 2.94 -> DC O2 I0021 : score 3.59142 : x : ARG xxxx F0016 <- 4.37 -> DT xxx I0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0035 <- 3.64 -> DT xxx J0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0053 <- 3.67 -> DT xxx I0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0054 <- 3.40 -> DG xxx J0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0055 <- 3.18 -> DT xxx I0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0058 <- 3.47 -> DT xxx J0004 : score x.xxxxx >2efw_FG:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RTP:NRB COMPLEX FROM BACILLUS SUBTILIS organism=Bacillus subtilis : H : ARG NH1 F0059 <- 2.72 -> DG O6 I0014 : score 6.18067 : H : ARG NH2 F0059 <- 2.51 -> DG N7 I0014 : score 6.75492 : H : GLN NE2 F0083 <- 2.94 -> DC O2 I0021 : score 3.59142 : H : HIS ND1 G0054 <- 2.67 -> DG O6 I0005 : score 6.38488 : H : HIS ND1 G0054 <- 2.67 -> DG O6 I0005 : score 6.38488 : H : ARG NH1 G0059 <- 2.84 -> DG O6 J0014 : score 6.03467 : H : ARG NH2 G0059 <- 2.65 -> DG N7 J0014 : score 6.57615 : H : ARG NH2 G0059 <- 2.92 -> DG O6 J0014 : score 6.4416 : V : THR CG2 G0055 <- 3.54 -> DT C7 J0015 : score 4.51232 : x : ARG xxxx F0016 <- 4.37 -> DT xxx I0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0035 <- 3.64 -> DT xxx J0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0053 <- 3.67 -> DT xxx I0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0054 <- 3.40 -> DG xxx J0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0055 <- 3.18 -> DT xxx I0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0058 <- 3.47 -> DT xxx J0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0053 <- 3.79 -> DT xxx J0015 : score x.xxxxx >2er8_AB:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LEU3 DNA-BINDING DOMAIN COMPLEXED WITH A 12MER DNA DUPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0044 <- 2.61 -> DG N7 F0016 : score 5.59056 : H : LYS NZ A0044 <- 2.78 -> DG O6 F0017 : score 5.80389 : H : LYS NZ B0044 <- 2.65 -> DG N7 E0004 : score 5.54747 : H : LYS NZ B0044 <- 3.05 -> DG O6 E0005 : score 5.49173 : x : GLN xxxx A0043 <- 3.48 -> DC xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0079 <- 4.39 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0043 <- 3.77 -> DC xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0075 <- 4.37 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx >2er8_C:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LEU3 DNA-BINDING DOMAIN COMPLEXED WITH A 12MER DNA DUPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ C0044 <- 2.70 -> DG N7 H0016 : score 5.49362 : H : LYS NZ C0044 <- 2.97 -> DG O6 H0017 : score 5.58422 : x : GLN xxxx C0043 <- 3.66 -> DC xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0075 <- 4.45 -> DC xxx H0015 : score x.xxxxx >2er8_CD:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LEU3 DNA-BINDING DOMAIN COMPLEXED WITH A 12MER DNA DUPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ C0044 <- 2.70 -> DG N7 H0016 : score 5.49362 : H : LYS NZ C0044 <- 2.97 -> DG O6 H0017 : score 5.58422 : H : LYS NZ D0044 <- 2.49 -> DG N7 G0004 : score 5.71982 : H : LYS NZ D0044 <- 3.01 -> DG O6 G0005 : score 5.53798 : w : LYS NZ D0044 <- 6.23 -> DG N7 G0005 : score 2.519 : w : TYR OH D0077 <- 6.57 -> DG N7 G0005 : score 3.527 : x : GLN xxxx C0043 <- 3.66 -> DC xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0075 <- 4.45 -> DC xxx H0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0043 <- 3.58 -> DC xxx G0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0075 <- 4.31 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx >2ere_AB:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A LEU3 DNA-BINDING DOMAIN COMPLEXED WITH A 15MER DNA DUPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0044 <- 2.70 -> DG N7 D0027 : score 5.49362 : H : LYS NZ A0044 <- 3.32 -> DG O6 D0028 : score 5.17957 : H : LYS NZ B0044 <- 2.78 -> DG N7 C0012 : score 5.40744 : H : LYS NZ B0044 <- 3.23 -> DG O6 C0013 : score 5.28362 : x : GLN xxxx A0043 <- 3.58 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0075 <- 3.96 -> DC xxx D0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0079 <- 4.29 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0043 <- 3.68 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0075 <- 3.87 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0079 <- 4.34 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx >2ere_B:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A LEU3 DNA-BINDING DOMAIN COMPLEXED WITH A 15MER DNA DUPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ B0044 <- 2.78 -> DG N7 C0012 : score 5.40744 : H : LYS NZ B0044 <- 3.23 -> DG O6 C0013 : score 5.28362 : x : GLN xxxx B0043 <- 3.68 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0075 <- 3.87 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0079 <- 4.34 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx >2erg_AB:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LEU3 DNA-BINDING DOMAIN WITH A SINGLE H50C MUTATION COMPLEXED WITH A 15MER DNA DUPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0044 <- 2.64 -> DG N7 D0027 : score 5.55825 : H : LYS NZ A0044 <- 3.12 -> DG O6 D0028 : score 5.4108 : H : LYS NZ B0044 <- 2.52 -> DG N7 C0012 : score 5.68751 : H : LYS NZ B0044 <- 3.11 -> DG O6 C0013 : score 5.42236 : x : GLN xxxx A0043 <- 3.76 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0075 <- 4.26 -> DC xxx D0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0079 <- 4.28 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0043 <- 3.72 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0075 <- 4.13 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0079 <- 4.36 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx >2erg_B:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LEU3 DNA-BINDING DOMAIN WITH A SINGLE H50C MUTATION COMPLEXED WITH A 15MER DNA DUPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ B0044 <- 2.52 -> DG N7 C0012 : score 5.68751 : H : LYS NZ B0044 <- 3.11 -> DG O6 C0013 : score 5.42236 : x : GLN xxxx B0043 <- 3.72 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0075 <- 4.13 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0079 <- 4.36 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx >2etw_A:p53-like_transcription_factors; title=PRINCIPLES OF PROTEIN-DNA RECOGNITION REVEALED IN THE STRUCTURAL ANALYSIS OF NDT80-MSE DNA COMPLEXES organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NH1 A0058 <- 3.02 -> DT O2 C0006 : score 4.11693 : w : ARG NH1 A0058 <- 5.84 -> DA N3 B0012 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0058 <- 5.74 -> DA N3 B0012 : score 2.092 : H : ARG NH1 A0111 <- 2.97 -> DG N7 C0010 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0111 <- 2.73 -> DG O6 C0010 : score 6.6924 : H : ARG NH1 A0177 <- 2.92 -> DG N7 C0008 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0177 <- 2.83 -> DG O6 C0008 : score 6.5604 : w : ASP OD2 A0178 <- 5.85 -> DC N4 B0006 : score 3.623 : x : PRO xxxx A0057 <- 3.25 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0112 <- 4.02 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0326 <- 3.72 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >2euv_A:p53-like_transcription_factors; title=PRINCIPLES OF PROTEIN-DNA RECOGNITION REVEALED IN THE STRUCTURAL ANALYSIS OF NDT80-MSE DNA COMPLEXES organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NH1 A0058 <- 3.23 -> DT O2 C0006 : score 3.93606 : w : ARG NH1 A0058 <- 5.75 -> DT O2 B0012 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0058 <- 5.53 -> DT O2 B0012 : score 2.261 : H : ARG NH1 A0111 <- 3.06 -> DG N7 C0010 : score 5.7354 : H : ARG NH2 A0111 <- 2.79 -> DG O6 C0010 : score 6.6132 : H : ARG NH1 A0177 <- 2.91 -> DG N7 C0008 : score 5.9169 : H : ARG NH2 A0177 <- 2.79 -> DG O6 C0008 : score 6.6132 : x : PRO xxxx A0057 <- 3.27 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0112 <- 4.06 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0178 <- 4.11 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0326 <- 3.73 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >2euw_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF A NDT80-DNA COMPLEX (MSE MUTANT MA4T) organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NH1 A0058 <- 2.98 -> DT O2 C0006 : score 4.15138 : w : ARG NH1 A0058 <- 5.96 -> DA N3 B0012 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0058 <- 5.82 -> DA N3 B0012 : score 2.092 : H : ARG NH1 A0111 <- 3.02 -> DG N7 C0010 : score 5.7838 : H : ARG NH2 A0111 <- 2.75 -> DG O6 C0010 : score 6.666 : H : ARG NH1 A0177 <- 2.90 -> DG N7 C0008 : score 5.929 : H : ARG NH2 A0177 <- 2.83 -> DG O6 C0008 : score 6.5604 : H : ARG NH1 A0326 <- 2.91 -> DG N7 B0004 : score 5.9169 : H : ARG NH2 A0326 <- 2.96 -> DT O4 C0011 : score 3.44012 : H : ARG NH2 A0326 <- 2.89 -> DG O6 B0004 : score 6.4812 : x : PRO xxxx A0057 <- 3.24 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0178 <- 4.27 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0179 <- 3.95 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx >2eux_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF A NDT80-DNA COMPLEX (MSE VARIANT VA4G) organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NH1 A0058 <- 2.99 -> DT O2 C0006 : score 4.14277 : w : ARG NH1 A0058 <- 5.97 -> DA N3 B0012 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0058 <- 5.82 -> DA N3 B0012 : score 2.092 : H : ARG NH1 A0111 <- 2.99 -> DG N7 C0010 : score 5.8201 : H : ARG NH2 A0111 <- 2.77 -> DG O6 C0010 : score 6.6396 : H : ARG NH1 A0177 <- 2.91 -> DG N7 C0008 : score 5.9169 : H : ARG NH2 A0177 <- 2.83 -> DG O6 C0008 : score 6.5604 : H : ARG NH1 A0326 <- 2.88 -> DG N7 B0004 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0326 <- 3.13 -> DT O4 C0011 : score 3.31929 : H : ARG NH2 A0326 <- 2.80 -> DG O6 B0004 : score 6.6 : x : PRO xxxx A0057 <- 3.28 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0178 <- 4.21 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx >2euz_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF A NDT80-DNA COMPLEX (MSE MUTANT MC5T) organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NH1 A0058 <- 3.01 -> DT O2 C0006 : score 4.12554 : w : ARG NH1 A0058 <- 6.00 -> DA N3 B0012 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0058 <- 5.81 -> DA N3 B0012 : score 2.092 : H : ARG NH1 A0111 <- 2.99 -> DG N7 C0010 : score 5.8201 : H : ARG NH2 A0111 <- 2.71 -> DG O6 C0010 : score 6.7188 : H : ARG NH1 A0326 <- 2.96 -> DG N7 B0004 : score 5.8564 : H : ARG NH2 A0326 <- 2.88 -> DG O6 B0004 : score 6.4944 : w : ARG NE A0326 <- 6.29 -> DT O4 C0011 : score 1.317 : w : ARG NH2 A0326 <- 6.52 -> DT O4 C0011 : score 2.366 : x : PRO xxxx A0057 <- 3.25 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0112 <- 4.22 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0177 <- 3.35 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0178 <- 4.09 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx >2evf_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF A NDT80-DNA COMPLEX (MSE MUTANT MA6T) organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NH1 A0058 <- 3.00 -> DT O2 C0006 : score 4.13415 : w : ARG NH1 A0058 <- 6.35 -> DT O2 C0005 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0058 <- 6.25 -> DT O2 C0005 : score 2.261 : H : ARG NH1 A0111 <- 2.96 -> DG N7 C0010 : score 5.8564 : H : ARG NH2 A0111 <- 2.73 -> DG O6 C0010 : score 6.6924 : H : ARG NH1 A0177 <- 2.92 -> DG N7 C0008 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0177 <- 2.88 -> DG O6 C0008 : score 6.4944 : H : ARG NH1 A0326 <- 2.88 -> DG N7 B0004 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0326 <- 2.96 -> DG O6 B0004 : score 6.3888 : H : ARG NH2 A0326 <- 3.03 -> DT O4 C0011 : score 3.39037 : x : PRO xxxx A0057 <- 3.55 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0112 <- 4.24 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0178 <- 3.86 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx >2evg_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF A NDT80-DNA COMPLEX (MSE MUTANT MA7T) organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NH1 A0058 <- 3.19 -> DT O2 C0005 : score 3.97051 : H : ARG NH1 A0058 <- 3.11 -> DA N3 C0006 : score 3.45376 : H : ARG NH1 A0111 <- 3.02 -> DG N7 C0010 : score 5.7838 : H : ARG NH2 A0111 <- 2.68 -> DG O6 C0010 : score 6.7584 : H : ARG NH1 A0177 <- 2.95 -> DG N7 C0008 : score 5.8685 : H : ARG NH2 A0177 <- 2.86 -> DG O6 C0008 : score 6.5208 : w : ASP OD2 A0178 <- 6.42 -> DA N6 B0007 : score 3.409 : H : ARG NH1 A0326 <- 2.88 -> DG N7 B0004 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0326 <- 2.83 -> DG O6 B0004 : score 6.5604 : H : ARG NH2 A0326 <- 2.83 -> DT O4 C0011 : score 3.53252 : x : PRO xxxx A0057 <- 3.28 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0112 <- 4.10 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >2evh_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF A NDT80-DNA COMPLEX (MSE MUTANT MA7G) organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NH1 A0058 <- 3.21 -> DT O2 C0005 : score 3.95328 : H : ARG NH1 A0058 <- 2.99 -> DC O2 C0006 : score 3.5113 : H : ARG NH1 A0111 <- 3.02 -> DG N7 C0010 : score 5.7838 : H : ARG NH2 A0111 <- 2.84 -> DG O6 C0010 : score 6.5472 : H : ARG NH1 A0177 <- 2.96 -> DG N7 C0008 : score 5.8564 : H : ARG NH2 A0177 <- 2.79 -> DG O6 C0008 : score 6.6132 : w : ASP OD2 A0178 <- 5.65 -> DC N4 B0006 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0326 <- 3.04 -> DG N7 B0004 : score 5.7596 : H : ARG NH2 A0326 <- 2.80 -> DG O6 B0004 : score 6.6 : x : PRO xxxx A0057 <- 3.15 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0112 <- 4.19 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >2evi_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF A NDT80-DNA COMPLEX (MSE MUTANT MA8T) organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NH1 A0058 <- 3.02 -> DT O2 C0006 : score 4.11693 : w : ARG NH1 A0058 <- 5.88 -> DA N3 B0012 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0058 <- 5.73 -> DA N3 B0012 : score 2.092 : H : ARG NH1 A0111 <- 3.02 -> DG N7 C0010 : score 5.7838 : H : ARG NH2 A0111 <- 2.71 -> DG O6 C0010 : score 6.7188 : H : ARG NH1 A0177 <- 2.89 -> DG N7 C0008 : score 5.9411 : H : ARG NH2 A0177 <- 2.77 -> DG O6 C0008 : score 6.6396 : w : ASP OD2 A0178 <- 6.20 -> DA N6 B0007 : score 3.409 : H : ARG NH1 A0326 <- 2.94 -> DG N7 B0004 : score 5.8806 : H : ARG NH2 A0326 <- 2.80 -> DG O6 B0004 : score 6.6 : x : PRO xxxx A0057 <- 3.20 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0112 <- 4.17 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >2evj_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF AN NDT80-DNA COMPLEX (MSE MUTANT MA9C) organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NH1 A0058 <- 3.07 -> DT O2 C0006 : score 4.07386 : w : ARG NH1 A0058 <- 5.81 -> DC O2 B0012 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0058 <- 5.66 -> DC O2 B0012 : score 1.669 : H : ARG NH1 A0111 <- 3.03 -> DG N7 C0010 : score 5.7717 : H : ARG NH2 A0111 <- 2.77 -> DG O6 C0010 : score 6.6396 : H : ARG NH1 A0177 <- 2.94 -> DG N7 C0008 : score 5.8806 : H : ARG NH2 A0177 <- 2.85 -> DG O6 C0008 : score 6.534 : H : ARG NH1 A0326 <- 2.91 -> DG N7 B0004 : score 5.9169 : H : ARG NH2 A0326 <- 2.80 -> DG O6 B0004 : score 6.6 : x : PRO xxxx A0057 <- 3.23 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0112 <- 4.09 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0178 <- 3.91 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx >2ewj_A:Replication_terminator_protein_Tus; title=ESCHERICHIA COLI REPLICATION TERMINATOR PROTEIN (TUS) COMPLEXED WITH DNA- LOCKED FORM organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0089 <- 2.58 -> DT O2 C0332 : score 3.74502 : H : LYS NZ A0089 <- 3.01 -> DT O2 B0322 : score 3.43652 : H : LYS NZ A0175 <- 3.16 -> DT O4 C0337 : score 3.3289 : H : ARG NH2 A0232 <- 2.85 -> DG N7 C0333 : score 6.32077 : H : ARG NH2 A0232 <- 3.39 -> DG O6 C0333 : score 5.8212 : w : GLN NE2 A0237 <- 5.98 -> DG O6 C0336 : score 2.87 : H : GLN NE2 A0250 <- 3.01 -> DA N7 B0312 : score 5.83397 : H : GLN OE1 A0252 <- 3.24 -> DA N6 C0338 : score 5.51994 : V : VAL CG1 A0234 <- 3.89 -> DT C7 C0335 : score 5.92415 : V : ALA CB A0173 <- 3.54 -> DT C7 B0314 : score 5.96291 : x : ARG xxxx A0093 <- 3.96 -> DT xxx C0335 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0153 <- 3.78 -> DG xxx C0333 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0177 <- 3.45 -> DA xxx B0319 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0178 <- 3.62 -> DC xxx B0317 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0239 <- 4.27 -> DG xxx B0313 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 3.43 -> DG xxx B0313 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0254 <- 4.36 -> DG xxx C0336 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0288 <- 4.29 -> DA xxx B0312 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0289 <- 3.33 -> DT xxx C0341 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0291 <- 4.09 -> DT xxx B0314 : score x.xxxxx >2ex5_A:Homing_endonucleases; title=GROUP I INTRON-ENCODED HOMING ENDONUCLEASE I-CEUI COMPLEXED WITH DNA organism=Chlamydomonas eugametos : H : LYS NZ A0074 <- 2.56 -> DG N7 Y0720 : score 5.64442 : w : ASP OD1 A0086 <- 6.24 -> DA N7 X0605 : score 2.429 : w : ASP OD2 A0086 <- 6.25 -> DA N7 X0605 : score 2.024 : w : ASP OD2 A0086 <- 6.02 -> DA N6 X0606 : score 3.409 : H : GLU OE1 A0088 <- 2.92 -> DC N4 Y0718 : score 5.62952 : w : GLU OE2 A0088 <- 5.96 -> DG O6 X0608 : score 2.892 : w : GLU OE2 A0088 <- 5.55 -> DC N4 Y0719 : score 3.597 : w : GLU OE2 A0088 <- 5.77 -> DC N4 X0607 : score 3.597 : H : LYS NZ A0116 <- 2.68 -> DG O6 Y0716 : score 5.91951 : w : LYS NZ A0116 <- 6.57 -> DT O4 X0610 : score 1.7 : V : LEU CD1 A0076 <- 3.75 -> DT C7 X0604 : score 5.80292 : x : SER xxxx A0068 <- 4.47 -> DA xxx Y0717 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0070 <- 3.59 -> DC xxx Y0718 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0072 <- 3.74 -> DC xxx Y0719 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0090 <- 3.29 -> DA xxx Y0717 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0092 <- 3.84 -> DG xxx Y0716 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 4.43 -> DC xxx X0607 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0117 <- 3.56 -> DT xxx X0610 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0128 <- 3.68 -> DA xxx X0606 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0192 <- 3.20 -> DA xxx Y0717 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0195 <- 3.29 -> DC xxx X0611 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0197 <- 3.83 -> DT xxx X0610 : score x.xxxxx >2ex5_AB:Homing_endonucleases; title=GROUP I INTRON-ENCODED HOMING ENDONUCLEASE I-CEUI COMPLEXED WITH DNA organism=Chlamydomonas eugametos : H : LYS NZ A0074 <- 2.56 -> DG N7 Y0720 : score 5.64442 : w : ASP OD1 A0086 <- 6.24 -> DA N7 X0605 : score 2.429 : w : ASP OD2 A0086 <- 6.25 -> DA N7 X0605 : score 2.024 : w : ASP OD2 A0086 <- 6.02 -> DA N6 X0606 : score 3.409 : H : GLU OE1 A0088 <- 2.92 -> DC N4 Y0718 : score 5.62952 : w : GLU OE2 A0088 <- 5.96 -> DG O6 X0608 : score 2.892 : w : GLU OE2 A0088 <- 5.55 -> DC N4 Y0719 : score 3.597 : w : GLU OE2 A0088 <- 5.77 -> DC N4 X0607 : score 3.597 : H : LYS NZ A0116 <- 2.68 -> DG O6 Y0716 : score 5.91951 : w : LYS NZ A0116 <- 6.57 -> DT O4 X0610 : score 1.7 : w : GLN OE1 A0195 <- 5.94 -> DT O2 X0610 : score 2.481 : w : ASN OD1 A0197 <- 5.53 -> DT O2 X0610 : score 1.953 : H : LYS NZ B0074 <- 2.83 -> DG N7 X0620 : score 5.35358 : H : LYS NZ B0074 <- 2.76 -> DG O6 X0620 : score 5.82702 : w : GLU OE1 B0088 <- 6.11 -> DA N6 X0619 : score 2.939 : w : GLU OE1 B0088 <- 6.10 -> DC N4 Y0707 : score 3.528 : H : LYS NZ B0116 <- 2.90 -> DG O6 X0616 : score 5.66515 : H : LYS NZ B0116 <- 2.96 -> DG O6 X0617 : score 5.59578 : w : THR OG1 B0122 <- 6.01 -> DA N7 X0615 : score 2.152 : w : ASP OD2 B0128 <- 5.48 -> DG N7 Y0706 : score 2.718 : w : ASP OD2 B0128 <- 6.18 -> DC N4 Y0707 : score 3.623 : H : GLN OE1 B0192 <- 3.04 -> DG N2 X0616 : score 5.33852 : V : LEU CD2 B0076 <- 3.73 -> DT C7 Y0704 : score 5.83158 : V : LEU CD1 A0076 <- 3.75 -> DT C7 X0604 : score 5.80292 : x : SER xxxx A0068 <- 4.47 -> DA xxx Y0717 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0070 <- 3.59 -> DC xxx Y0718 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0072 <- 3.74 -> DC xxx Y0719 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0090 <- 3.29 -> DA xxx Y0717 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0092 <- 3.84 -> DG xxx Y0716 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 4.43 -> DC xxx X0607 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0117 <- 3.56 -> DT xxx X0610 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0128 <- 3.68 -> DA xxx X0606 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0192 <- 3.20 -> DA xxx Y0717 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0070 <- 4.20 -> DT xxx X0618 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0072 <- 4.13 -> DA xxx X0619 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0078 <- 3.28 -> DT xxx Y0703 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0090 <- 4.00 -> DT xxx X0618 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0092 <- 3.46 -> DG xxx X0616 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0114 <- 3.71 -> DC xxx Y0707 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0117 <- 3.36 -> DA xxx Y0709 : score x.xxxxx >2exf_A:Retrovirus_zinc_finger-like_domains; title=SOLUTION STRUCTURE OF THE HIV-1 NUCLEOCAPSID (NCP7(12-55)) COMPLEXED WITH THE DNA (-) PRIMER BINDING SITE organism=? : H : ARG NE A0026 <- 2.84 -> DC O2 B0105 : score 2.6377 : H : ARG NH2 A0026 <- 2.88 -> DC O2 B0105 : score 3.63954 : H : ASN ND2 A0027 <- 2.80 -> DG O6 B0111 : score 5.63846 : x : VAL xxxx A0013 <- 4.49 -> DC xxx B0105 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0024 <- 3.37 -> DC xxx B0105 : score x.xxxxx >2ezv_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF TETRAMERIC RESTRICTION ENDONUCLEASE SFII BOUND TO COGNATE DNA. organism=? : H : GLU OE2 A0106 <- 3.02 -> DC N4 G0036 : score 5.03371 : H : ARG NH1 A0109 <- 2.85 -> DG N7 F0005 : score 5.9895 : H : ARG NH2 A0109 <- 2.81 -> DG O6 F0005 : score 6.5868 : H : LYS NZ A0208 <- 3.31 -> DG O6 F0006 : score 5.19113 : H : LYS NZ A0208 <- 2.68 -> DG N7 G0035 : score 5.51516 : H : LYS NZ A0208 <- 2.76 -> DG O6 G0035 : score 5.82702 : H : GLU OE1 A0215 <- 3.13 -> DC N4 F0008 : score 5.38726 : H : ARG NH1 A0218 <- 3.30 -> DG N7 G0034 : score 5.445 : H : ARG NH2 A0218 <- 2.65 -> DG O6 G0034 : score 6.798 : H : ARG NH1 A0220 <- 2.95 -> DG N7 F0006 : score 5.8685 : H : ARG NH2 A0220 <- 2.68 -> DG O6 F0006 : score 6.7584 : x : GLN xxxx A0113 <- 4.15 -> DT xxx G0033 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0210 <- 3.75 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0213 <- 3.36 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0222 <- 4.39 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx >2ezv_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF TETRAMERIC RESTRICTION ENDONUCLEASE SFII BOUND TO COGNATE DNA. organism=? : H : GLU OE2 A0106 <- 3.02 -> DC N4 G0036 : score 5.03371 : H : ARG NH1 A0109 <- 2.85 -> DG N7 F0005 : score 5.9895 : H : ARG NH2 A0109 <- 2.81 -> DG O6 F0005 : score 6.5868 : H : LYS NZ A0208 <- 2.68 -> DG N7 G0035 : score 5.51516 : H : LYS NZ A0208 <- 2.76 -> DG O6 G0035 : score 5.82702 : H : LYS NZ A0208 <- 3.31 -> DG O6 F0006 : score 5.19113 : H : GLU OE1 A0215 <- 3.13 -> DC N4 F0008 : score 5.38726 : H : ARG NH1 A0218 <- 3.30 -> DG N7 G0034 : score 5.445 : H : ARG NH2 A0218 <- 2.65 -> DG O6 G0034 : score 6.798 : H : ARG NH1 A0220 <- 2.95 -> DG N7 F0006 : score 5.8685 : H : ARG NH2 A0220 <- 2.68 -> DG O6 F0006 : score 6.7584 : H : GLU OE2 B0106 <- 2.92 -> DC N4 F0016 : score 5.13902 : H : LYS NZ B0208 <- 2.85 -> DG N7 F0015 : score 5.33204 : H : LYS NZ B0208 <- 2.74 -> DG O6 F0015 : score 5.85014 : H : GLU OE2 B0215 <- 3.14 -> DC N4 G0028 : score 4.90734 : H : ARG NH1 B0218 <- 3.33 -> DG N7 F0014 : score 5.4087 : H : ARG NH2 B0218 <- 2.89 -> DG O6 F0014 : score 6.4812 : H : ARG NH1 B0220 <- 3.13 -> DG N7 G0026 : score 5.6507 : H : ARG NH2 B0220 <- 2.83 -> DG O6 G0026 : score 6.5604 : x : GLN xxxx A0113 <- 4.15 -> DT xxx G0033 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0210 <- 3.75 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0213 <- 3.36 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0222 <- 4.39 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0210 <- 3.59 -> DC xxx G0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0213 <- 3.29 -> DC xxx G0028 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0222 <- 4.15 -> DA xxx G0024 : score x.xxxxx >2f03_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF TETRAMERIC RESTRICTION ENDONUCLEASE SFII IN COMPLEX WITH COGNATE DNA (PARTIAL BOUND FORM) organism=? : H : ARG NH1 A0109 <- 3.03 -> DG N7 E0005 : score 5.7717 A : H : ARG NH2 A0109 <- 2.88 -> DG O6 E0005 : score 6.4944 A : H : LYS NZ A0208 <- 2.78 -> DG N7 F0015 : score 5.40744 A : H : LYS NZ A0208 <- 2.61 -> DG O6 F0015 : score 6.00044 A : H : LYS NZ A0208 <- 3.36 -> DG O6 E0006 : score 5.13332 A : H : GLU OE1 A0215 <- 3.14 -> DC N4 E0008 : score 5.37573 A : H : ARG NH1 A0218 <- 3.46 -> DG N7 F0014 : score 5.2514 A : H : ARG NH2 A0218 <- 2.94 -> DG O6 F0014 : score 6.4152 A : x : GLU xxxx A0106 <- 3.52 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0108 <- 3.51 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0113 <- 3.49 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0210 <- 3.39 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0213 <- 3.40 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0220 <- 3.01 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0222 <- 4.44 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx >2f55_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=TWO HEPATITIS C VIRUS NS3 HELICASE DOMAINS COMPLEXED WITH THE SAME STRAND OF DNA organism=? : x : SER xxxx A0297 <- 4.27 -> DU xxx D0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0298 <- 3.09 -> DU xxx D0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0372 <- 3.31 -> DU xxx D0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0376 <- 3.90 -> DU xxx D0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0393 <- 3.08 -> DU xxx D0024 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0432 <- 4.11 -> DU xxx D0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0434 <- 4.08 -> DU xxx D0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0448 <- 3.05 -> DU xxx D0021 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0501 <- 3.41 -> DU xxx D0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0502 <- 2.77 -> DU xxx D0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0556 <- 2.80 -> DU xxx D0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0298 <- 3.58 -> DU xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0393 <- 2.89 -> DU xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0413 <- 3.25 -> DU xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0501 <- 3.66 -> DU xxx D0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0502 <- 2.51 -> DU xxx D0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0548 <- 3.49 -> DU xxx D0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0551 <- 2.85 -> DU xxx D0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0552 <- 2.49 -> DU xxx D0018 : score x.xxxxx >2f55_C:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=TWO HEPATITIS C VIRUS NS3 HELICASE DOMAINS COMPLEXED WITH THE SAME STRAND OF DNA organism=? : x : THR xxxx C0298 <- 2.64 -> DU xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0393 <- 3.57 -> DU xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0501 <- 3.35 -> DU xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0502 <- 3.39 -> DU xxx E0008 : score x.xxxxx >2f5n_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM CROSSLINKED TO UNDAMAGED DNA SAMPLING A:T BASE PAIR IC1 organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NE A0076 <- 3.08 -> DG N3 C0008 : score 1.65684 : x : MET xxxx A0077 <- 2.95 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0112 <- 3.02 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.34 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 3.56 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx >2f5o_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM CROSSLINKED TO UNDAMAGED DNA SAMPLING G:C BASE PAIR IC3 organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NE A0076 <- 3.09 -> DG N3 C0008 : score 1.65333 : H : ARG NH2 A0112 <- 3.20 -> DG N3 B0011 : score 3.32144 : H : ARG NH1 A0264 <- 3.02 -> DG N7 C0008 : score 5.7838 : x : MET xxxx A0077 <- 2.67 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.40 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx >2f5p_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM CROSSLINKED TO UNDAMAGED DNA SAMPLING A:T BASE PAIR IC2 organism=Geobacillus stearothermophilus : w : ARG NH1 A0035 <- 5.76 -> DC O2 C0009 : score 1.381 : H : ARG NE A0076 <- 2.98 -> DG N3 D0008 : score 1.69194 : H : ARG NH1 A0112 <- 3.10 -> DT O2 C0011 : score 4.04803 : x : PHE xxxx A0114 <- 3.39 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 4.31 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx >2f5q_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CATALYTICALLY INACTIVE (E3Q) MUTM CROSSLINKED TO OXOG:C CONTAINING DNA CC2 organism=Geobacillus stearothermophilus : w : GLU OE1 A0078 <- 5.53 -> DA N3 C0017 : score 0.995 : H : ARG NE A0112 <- 2.97 -> DC O2 B0007 : score 2.56857 : H : ARG NH1 A0112 <- 3.07 -> DC N3 B0007 : score 1.45417 : w : ARG NH2 A0112 <- 5.53 -> DA N3 C0017 : score 2.092 : x : ARG xxxx A0076 <- 3.00 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0077 <- 3.36 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.33 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0223 <- 3.06 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 3.42 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx >2f5s_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CATALYTICALLY INACTIVE (E3Q) MUTM CROSSLINKED TO OXOG:C CONTAINING DNA CC1 organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NH1 A0076 <- 2.98 -> DA N3 C0019 : score 3.5495 : H : ARG NH1 A0076 <- 2.98 -> DA N3 C0019 : score 3.5495 : w : GLU OE2 A0078 <- 6.00 -> DC O2 C0017 : score 1.988 : H : ARG NE A0112 <- 2.85 -> DC O2 B0007 : score 2.63238 : H : ARG NH2 A0112 <- 2.92 -> DC N3 B0007 : score 2.23604 : w : ARG NH1 A0112 <- 6.41 -> DC O2 C0017 : score 1.381 : x : MET xxxx A0077 <- 3.63 -> DA xxx C0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.42 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 3.72 -> DA xxx C0019 : score x.xxxxx >2f8n_ABDEFGHK:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=2.9 ANGSTROM X-RAY STRUCTURE OF HYBRID MACROH2A NUCLEOSOMES organism=MUS MUSCULUS / XENOPUS LAEVIS / HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.55 -> DA N3 J0227 : score 3.40173 : w : HIS NE2 E0639 <- 5.63 -> DT O2 J0287 : score 3.682 : H : ARG NH2 E0640 <- 3.18 -> DA N3 I0082 : score 2.99352 : H : LYS NZ G1014 <- 2.59 -> DT O2 I0117 : score 3.73784 : H : LYS NZ G1014 <- 3.05 -> DT O2 I0118 : score 3.40782 : H : ARG NH2 G1042 <- 3.02 -> DT O2 I0111 : score 4.04707 : x : HIS xxxx A0439 <- 4.46 -> DA xxx J0150 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.70 -> DT xxx J0236 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 3.57 -> DG xxx J0244 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1230 <- 4.31 -> DG xxx J0266 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 4.44 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 3.93 -> DC xxx J0194 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H1436 <- 4.22 -> DT xxx I0122 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0042 <- 3.74 -> DT xxx J0256 : score x.xxxxx >2f8n_D:Histone-fold; title=2.9 ANGSTROM X-RAY STRUCTURE OF HYBRID MACROH2A NUCLEOSOMES organism=MUS MUSCULUS : x : ARG xxxx D1230 <- 4.31 -> DG xxx J0266 : score x.xxxxx >2f8x_C:p53-like_transcription_factors;DNA-binding_protein_LAG-1_CSL;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ACTIVATED NOTCH, CSL AND MAML ON HES-1 PROMOTER DNA SEQUENCE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 C0051 <- 2.94 -> DG O6 X0008 : score 6.4152 : H : LYS NZ C0152 <- 2.66 -> DT O4 Y0107 : score 3.68762 : H : LYS NZ C0152 <- 2.58 -> DG O6 X0010 : score 6.03512 : x : TYR xxxx C0046 <- 3.66 -> DT xxx Y0107 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0049 <- 4.09 -> DC xxx Y0109 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0151 <- 3.60 -> DT xxx Y0106 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0181 <- 3.47 -> DT xxx X0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0182 <- 2.92 -> DA xxx Y0113 : score x.xxxxx >2fcc_B:T4_endonuclease_V; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T4 PYRIMIDINE DIMER GLYCOSYLASE (T4-PDG) COVALENTLY COMPLEXED WITH A DNA SUBSTRATE CONTAINING ABASIC SITE organism=Enterobacteria phage T4 : x : THR xxxx B0002 <- 3.09 -> DG xxx E0208 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0018 <- 4.14 -> DC xxx F0222 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0021 <- 3.53 -> DA xxx F0220 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0022 <- 4.08 -> DA xxx E0206 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0025 <- 3.54 -> DA xxx F0220 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0026 <- 3.32 -> DC xxx F0219 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0071 <- 3.41 -> DA xxx F0220 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0075 <- 4.03 -> DA xxx F0220 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0087 <- 3.15 -> DA xxx F0220 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0091 <- 4.38 -> DA xxx F0220 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0128 <- 4.22 -> DG xxx E0205 : score x.xxxxx >2fdc_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURAL BASIS OF DNA DAMAGE RECOGNITION AND PROCESSING BY UVRB: CRYSTAL STRUCTURE OF A UVRB/DNA COMPLEX organism=Bacillus caldotenax : x : SER xxxx B0091 <- 4.47 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0093 <- 3.55 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0096 <- 3.21 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0097 <- 3.78 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0098 <- 3.48 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0146 <- 4.00 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0346 <- 4.10 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0350 <- 3.22 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0357 <- 3.33 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx >2ff0_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=SOLUTION STRUCTURE OF STEROIDOGENIC FACTOR 1 DNA BINDING DOMAIN BOUND TO ITS TARGET SEQUENCE IN THE INHIBIN ALPHA-SUBUNIT PROMOTER organism=MUS MUSCULUS : H : GLU OE1 A0031 <- 2.79 -> DC N4 C0022 : score 5.77948 : H : LYS NZ A0034 <- 2.85 -> DG O6 B0008 : score 5.72296 : H : LYS NZ A0034 <- 3.02 -> DG O6 B0009 : score 5.52642 : H : ARG NH2 A0039 <- 2.74 -> DG O6 C0020 : score 6.6792 : x : LYS xxxx A0038 <- 2.78 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 3.20 -> DC xxx C0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0092 <- 2.82 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >2fio_A: title=PHAGE PHI29 TRANSCRIPTION REGULATOR P4-DNA COMPLEX organism=Bacillus phage phi29 : H : GLN NE2 A0005 <- 3.21 -> DT O4 D0032 : score 4.76536 : w : GLN NE2 A0005 <- 5.91 -> DT O4 D0031 : score 2.257 : H : ARG NE A0006 <- 2.87 -> DG N7 D0030 : score 4.35989 : H : ARG NH2 A0006 <- 2.56 -> DG O6 D0030 : score 6.9168 >2fio_AB: title=PHAGE PHI29 TRANSCRIPTION REGULATOR P4-DNA COMPLEX organism=Bacillus phage phi29 : H : GLN NE2 A0005 <- 3.21 -> DT O4 D0032 : score 4.76536 : w : GLN NE2 A0005 <- 5.91 -> DT O4 D0031 : score 2.257 : H : ARG NE A0006 <- 2.87 -> DG N7 D0030 : score 4.35989 : H : ARG NH2 A0006 <- 2.56 -> DG O6 D0030 : score 6.9168 : H : GLN NE2 B0005 <- 3.19 -> DT O4 C0040 : score 4.78613 : H : ARG NE B0006 <- 2.86 -> DG N7 C0038 : score 4.36873 : H : ARG NH2 B0006 <- 2.62 -> DG O6 C0038 : score 6.8376 >2fj7_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING A POLY (DA.DT) SEQUENCE ELEMENT organism=XENOPUS LAEVIS : H : HIS NE2 A0039 <- 2.87 -> DT O2 J0291 : score 5.16639 : x : ARG xxxx A0063 <- 3.92 -> DG xxx J0206 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.35 -> DA xxx I0100 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0031 <- 4.41 -> DT xxx J0209 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0032 <- 3.70 -> DT xxx J0209 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.38 -> DC xxx I0080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.87 -> DG xxx I0122 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0083 <- 4.28 -> DG xxx J0187 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.23 -> DG xxx I0145 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.41 -> DA xxx J0229 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0043 <- 3.71 -> DT xxx I0068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.71 -> DA xxx J0227 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.39 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx >2fj7_B:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING A POLY (DA.DT) SEQUENCE ELEMENT organism=XENOPUS LAEVIS : V : PRO CG B0032 <- 3.70 -> DT C7 J0209 : score 6.51795 : x : LYS xxxx B0031 <- 4.41 -> DT xxx J0209 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.38 -> DC xxx I0080 : score x.xxxxx >2fjv_A:DNA/RNA_polymerases; title=RT29 BOUND TO D(CTTAATTCGAATTAAG) IN COMPLEX WITH MMLV RT CATALYTIC FRAGMENT organism=Moloney murine leukemia virus : H : ASP OD2 A0114 <- 3.25 -> DG N2 G0016 : score 4.96767 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.74 -> DT O2 B0002 : score 4.28413 : x : TYR xxxx A0064 <- 3.14 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0099 <- 3.11 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx >2fjw_A:DNA/RNA_polymerases; title=D(CTTGAATGCATTCAAG) IN COMPLEX WITH MMLV RT CATALYTIC FRAGMENT organism=Moloney murine leukemia virus : H : ASP OD2 A0114 <- 3.00 -> DG N2 G0016 : score 5.24062 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.74 -> DT O2 B0002 : score 4.28413 : x : TYR xxxx A0064 <- 3.06 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0099 <- 2.90 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx >2fjx_A:DNA/RNA_polymerases; title=RT29 BOUND TO D(CTTGAATGCATTCAAG) IN COMPLEX WITH MMLV RT CATALYTIC FRAGMENT organism=Moloney murine leukemia virus : H : ASP OD2 A0114 <- 3.04 -> DG N2 G0016 : score 5.19694 : H : ARG NH1 A0116 <- 3.16 -> DT O2 B0003 : score 3.99635 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.64 -> DT O2 B0002 : score 4.3688 : x : TYR xxxx A0064 <- 3.29 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0099 <- 2.98 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0112 <- 4.41 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx >2fkc_A:LuxS/MPP-like_metallohydrolase; title=CRYSTAL FORM I OF PRE-REACTIVE COMPLEX OF RESTRICTION ENDONUCLEASE HINP1I WITH COGNATE DNA AND CALCIUM ION organism=HAEMOPHILUS INFLUENZAE : H : GLN OE1 A0093 <- 2.99 -> DC N4 C0005 : score 4.40917 : H : LYS NZ A0096 <- 2.64 -> DG O6 C0004 : score 5.96575 : H : ARG NH1 A0210 <- 2.99 -> DC O2 D0012 : score 3.5113 : H : LYS NZ A0223 <- 2.55 -> DG O6 D0016 : score 6.06981 : H : ASP OD1 A0226 <- 2.58 -> DC N4 D0017 : score 5.58005 : w : ARG NH2 A0229 <- 6.01 -> DT O4 D0018 : score 2.366 A : H : GLN NE2 A0236 <- 2.78 -> DG O6 C0006 : score 5.82835 : H : LYS NZ A0238 <- 2.64 -> DG O6 D0014 : score 5.96575 : x : THR xxxx A0010 <- 3.69 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0011 <- 3.31 -> DC xxx D0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0015 <- 3.83 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0087 <- 3.27 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0091 <- 3.17 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0221 <- 3.24 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx >2fkh_B:LuxS/MPP-like_metallohydrolase; title=CRYSTAL FORM II OF PRE-REACTIVE COMPLEX OF RESTRICTION ENDONUCLEASE HINP1I WITH COGNATE DNA AND CALCIUM IONS organism=HAEMOPHILUS INFLUENZAE : H : GLN OE1 B0093 <- 2.78 -> DC N4 E0005 : score 4.60167 : H : LYS NZ B0096 <- 2.73 -> DG O6 E0004 : score 5.8617 : H : LYS NZ B0096 <- 2.73 -> DG O6 E0004 : score 5.8617 : H : LYS NZ B0223 <- 2.64 -> DG O6 F0016 : score 5.96575 : H : ASP OD1 B0226 <- 2.56 -> DC N4 F0017 : score 5.60143 : H : ASP OD1 B0226 <- 2.56 -> DC N4 F0017 : score 5.60143 : H : GLN NE2 B0236 <- 3.00 -> DG O6 E0006 : score 5.57292 : x : THR xxxx B0010 <- 3.82 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0011 <- 3.31 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0015 <- 3.36 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0087 <- 3.04 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0091 <- 3.19 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0210 <- 3.76 -> DC xxx F0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0221 <- 3.17 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0229 <- 4.41 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0231 <- 3.48 -> DA xxx E0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0234 <- 4.02 -> DA xxx E0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0238 <- 3.10 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx >2fl3_A:LuxS/MPP-like_metallohydrolase; title=BINARY COMPLEX OF RESTRICTION ENDONUCLEASE HINP1I WITH COGNATE DNA organism=HAEMOPHILUS INFLUENZAE : H : GLN OE1 A0093 <- 3.14 -> DC N4 C0005 : score 4.27167 : H : LYS NZ A0096 <- 2.84 -> DG O6 C0004 : score 5.73452 : H : GLN NE2 A0221 <- 3.21 -> DG N7 D0014 : score 3.85442 : H : LYS NZ A0223 <- 3.08 -> DG O6 D0016 : score 5.45705 : H : ASP OD1 A0226 <- 3.21 -> DC N4 D0017 : score 4.90659 : w : ARG NH1 A0229 <- 6.28 -> DT O4 D0018 : score 1.768 : w : ARG NH2 A0229 <- 6.55 -> DT O4 D0018 : score 2.366 : H : GLN NE2 A0236 <- 3.08 -> DG O6 C0006 : score 5.48004 : H : LYS NZ A0238 <- 2.87 -> DG O6 D0014 : score 5.69984 : x : THR xxxx A0010 <- 3.89 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0011 <- 3.06 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0015 <- 3.70 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0087 <- 3.21 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0091 <- 3.15 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0210 <- 3.43 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx >2flc_A:LuxS/MPP-like_metallohydrolase; title=POST-REACTIVE COMPLEX OF RESTRICTION ENDONUCLEASE HINP1I WITH NICKED COGNATE DNA AND MAGNESIUM IONS organism=Haemophilus influenzae : H : GLN OE1 A0093 <- 3.33 -> DC N4 D0005 : score 4.0975 : H : LYS NZ A0096 <- 3.14 -> DG O6 C0004 : score 5.38768 : H : GLN NE2 A0221 <- 2.68 -> DG N7 E0014 : score 4.29949 : H : LYS NZ A0223 <- 3.13 -> DG O6 E0016 : score 5.39924 : H : GLN NE2 A0236 <- 2.84 -> DG O6 D0006 : score 5.75869 : x : THR xxxx A0010 <- 3.86 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0011 <- 3.12 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0015 <- 3.84 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0087 <- 3.90 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0091 <- 3.25 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0092 <- 4.33 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0210 <- 3.11 -> DC xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0226 <- 3.28 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0238 <- 3.32 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx >2fld_AB:Homing_endonucleases; title=I-MSOI RE-DESIGNED FOR ALTERED DNA CLEAVAGE SPECIFICITY organism=Monomastix sp. : H : ARG NH1 A0032 <- 3.07 -> DG N7 D0553 : score 5.7233 : H : ARG NH1 A0072 <- 2.88 -> DG N7 D0558 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0072 <- 2.93 -> DG O6 D0558 : score 6.4284 : H : ARG NH1 A0075 <- 3.00 -> DG N7 C0515 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0075 <- 2.81 -> DG O6 C0515 : score 6.5868 : w : ARG NH1 A0075 <- 6.05 -> DA N6 C0516 : score 1.486 : w : ASP OD2 A0081 <- 5.84 -> DA N6 C0516 : score 3.409 : H : ARG NH1 A0083 <- 3.39 -> DG N7 D0557 : score 5.3361 : H : ARG NH2 A0083 <- 2.88 -> DG O6 D0557 : score 6.4944 : H : ARG NH1 B0232 <- 2.86 -> DG O6 C0504 : score 6.01033 : H : ARG NH2 B0232 <- 2.99 -> DG N7 C0504 : score 6.142 : H : ASP OD1 B0234 <- 2.73 -> DC N4 C0502 : score 5.4197 : H : ARG NH1 B0272 <- 3.39 -> DG O6 C0508 : score 5.3655 : H : ARG NH2 B0272 <- 2.66 -> DG N7 C0508 : score 6.56338 : H : ARG NH1 B0275 <- 2.99 -> DG N7 D0565 : score 5.8201 : H : ARG NH2 B0275 <- 2.91 -> DG O6 D0565 : score 6.4548 : w : ASP OD2 B0281 <- 5.64 -> DA N6 D0566 : score 3.409 : H : ARG NH1 B0283 <- 2.56 -> DG O6 C0507 : score 6.37533 : H : ARG NH2 B0283 <- 3.08 -> DG N7 C0507 : score 6.02708 : V : ASP CG A0077 <- 3.83 -> DT C7 D0559 : score 2.66295 : x : SER xxxx A0024 <- 4.10 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0026 <- 3.46 -> DC xxx C0517 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0028 <- 3.75 -> DC xxx C0518 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0034 <- 4.40 -> DG xxx D0552 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0035 <- 3.71 -> DG xxx D0552 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0041 <- 3.67 -> DG xxx D0553 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0049 <- 3.63 -> DG xxx C0515 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0070 <- 4.33 -> DA xxx D0555 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0079 <- 4.00 -> DA xxx C0514 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0224 <- 3.88 -> DA xxx D0566 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0226 <- 3.55 -> DC xxx D0567 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0228 <- 3.66 -> DC xxx D0568 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0230 <- 4.18 -> DT xxx D0570 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0235 <- 3.16 -> DA xxx C0503 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0241 <- 4.26 -> DG xxx C0504 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0249 <- 3.80 -> DG xxx D0565 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0270 <- 4.28 -> DA xxx C0505 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0277 <- 3.87 -> DT xxx C0509 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0279 <- 3.83 -> DC xxx D0564 : score x.xxxxx >2fld_B:Homing_endonucleases; title=I-MSOI RE-DESIGNED FOR ALTERED DNA CLEAVAGE SPECIFICITY organism=Monomastix sp. : H : ARG NH1 B0232 <- 2.86 -> DG O6 C0504 : score 6.01033 : H : ARG NH2 B0232 <- 2.99 -> DG N7 C0504 : score 6.142 : H : ASP OD1 B0234 <- 2.73 -> DC N4 C0502 : score 5.4197 : H : ARG NH1 B0272 <- 3.39 -> DG O6 C0508 : score 5.3655 : H : ARG NH2 B0272 <- 2.66 -> DG N7 C0508 : score 6.56338 : H : ARG NH1 B0275 <- 2.99 -> DG N7 D0565 : score 5.8201 : H : ARG NH2 B0275 <- 2.91 -> DG O6 D0565 : score 6.4548 : w : ASP OD2 B0281 <- 5.64 -> DA N6 D0566 : score 3.409 : H : ARG NH1 B0283 <- 2.56 -> DG O6 C0507 : score 6.37533 : H : ARG NH2 B0283 <- 3.08 -> DG N7 C0507 : score 6.02708 : x : SER xxxx B0224 <- 3.88 -> DA xxx D0566 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0226 <- 3.55 -> DC xxx D0567 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0228 <- 3.66 -> DC xxx D0568 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0230 <- 4.18 -> DT xxx D0570 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0235 <- 3.16 -> DA xxx C0503 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0241 <- 4.26 -> DG xxx C0504 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0249 <- 3.80 -> DG xxx D0565 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0270 <- 4.28 -> DA xxx C0505 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0277 <- 3.87 -> DT xxx C0509 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0279 <- 3.83 -> DC xxx D0564 : score x.xxxxx >2fll_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA WITH DNA AND DTTP organism=Homo sapiens : w : TYR OH A0039 <- 5.54 -> DG N3 T0841 : score 3.344 : w : GLN NE2 A0059 <- 6.24 -> DG N3 T0841 : score 1.484 : x : LEU xxxx A0062 <- 4.36 -> DA xxx T0840 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0064 <- 3.68 -> DA xxx T0840 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0078 <- 4.47 -> DA xxx T0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0301 <- 4.43 -> DT xxx T0844 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0305 <- 3.16 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 4.31 -> DG xxx P0868 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 4.38 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >2fln_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=BINARY COMPLEX OF CATALYTIC CORE OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA WITH DNA (TEMPLATE A) organism=Homo sapiens : w : TYR OH A0039 <- 5.48 -> DG N3 T0841 : score 3.344 : w : GLN NE2 A0059 <- 6.12 -> DG N3 T0841 : score 1.484 : x : SER xxxx A0301 <- 4.35 -> DT xxx T0844 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0305 <- 3.21 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 3.73 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >2flp_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=BINARY COMPLEX OF THE CATALYTIC CORE OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA WITH DNA (TEMPLATE G) organism=Homo sapiens : w : TYR OH A0039 <- 5.56 -> DG N3 T0841 : score 3.344 : w : GLN NE2 A0059 <- 6.19 -> DG N3 T0841 : score 1.484 : w : GLU OE1 A0305 <- 6.41 -> DG N7 T0842 : score 1.976 : w : GLU OE2 A0305 <- 6.54 -> DG N7 T0842 : score 2.669 : x : GLN xxxx A0361 <- 4.30 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >2fmp_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;DNA_polymerase_beta-like,_second_domain; title=DNA POLYMERASE BETA WITH A TERMINATED GAPPED DNA SUBSTRATE AND DDCTP WITH SODIUM IN THE CATALYTIC SITE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.40 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.03 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.61 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >2fmq_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=SODIUM IN ACTIVE SITE OF DNA POLYMERASE BETA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.27 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.92 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.62 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >2fms_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA WITH A GAPPED DNA SUBSTRATE AND DUMPNPP WITH MAGNESIUM IN THE CATALYTIC SITE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.24 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.96 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.60 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >2fo1_A:DNA-binding_protein_LAG-1_CSL;p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE CSL-NOTCH-MASTERMIND TERNARY COMPLEX BOUND TO DNA organism=CAENORHABDITIS ELEGANS : H : ARG NH1 A0234 <- 2.95 -> DG N7 B0008 : score 5.8685 : H : ARG NH2 A0234 <- 3.32 -> DG O6 B0008 : score 5.9136 : x : TYR xxxx A0229 <- 3.62 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0232 <- 3.36 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0367 <- 3.75 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0368 <- 3.00 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0400 <- 3.18 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0401 <- 4.21 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx >2fqz_AB:Restriction_endonuclease-like; title=METAL-DEPLETED ECL18KI IN COMPLEX WITH UNCLEAVED DNA organism=ENTEROBACTER CLOACAE : H : GLN OE1 A0114 <- 2.93 -> DG N2 F0001 : score 5.46189 A : H : SER OG A0118 <- 2.99 -> DC O2 F0003 : score 2.40623 : H : ARG NE A0186 <- 2.74 -> DG O6 E0002 : score 3.98832 : H : ARG NH2 A0186 <- 2.81 -> DG N7 E0002 : score 6.37185 : H : GLU OE1 A0187 <- 3.36 -> DC N4 F-002 : score 5.12194 A : H : GLU OE2 A0187 <- 2.68 -> DC N4 F-001 : score 5.39175 A : H : ARG NE A0188 <- 2.62 -> DG O6 E0001 : score 4.0829 : H : ARG NH2 A0188 <- 2.88 -> DG N7 E0001 : score 6.28246 : H : GLN OE1 B0114 <- 3.11 -> DG N2 E0001 : score 5.26002 A : H : SER OG B0118 <- 3.20 -> DG N2 E0003 : score 3.10441 A : H : ARG NE B0186 <- 2.61 -> DG O6 F0002 : score 4.09078 : H : ARG NH2 B0186 <- 2.77 -> DG N7 F0002 : score 6.42292 : H : GLU OE1 B0187 <- 3.31 -> DC N4 E-002 : score 5.17962 A : H : GLU OE2 B0187 <- 2.81 -> DC N4 E-001 : score 5.25485 A : H : ARG NE B0188 <- 2.69 -> DG O6 F0001 : score 4.02773 : H : ARG NH2 B0188 <- 2.92 -> DG N7 F0001 : score 6.23138 : x : ARG xxxx A0117 <- 3.43 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0184 <- 3.61 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0117 <- 3.27 -> DC xxx F-001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0184 <- 3.65 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx >2fqz_C:Restriction_endonuclease-like; title=METAL-DEPLETED ECL18KI IN COMPLEX WITH UNCLEAVED DNA organism=ENTEROBACTER CLOACAE : H : GLN OE1 C0114 <- 3.01 -> DG N2 H0001 : score 5.37217 A : w : ARG NH1 C0117 <- 5.62 -> DC O2 G-001 : score 1.381 : H : SER OG C0118 <- 3.22 -> DC O2 H0003 : score 2.29117 : H : ARG NE C0186 <- 2.74 -> DG O6 G0002 : score 3.98832 : H : ARG NH2 C0186 <- 2.81 -> DG N7 G0002 : score 6.37185 : H : GLU OE2 C0187 <- 2.90 -> DC N4 H-001 : score 5.16008 A : H : ARG NE C0188 <- 2.76 -> DG O6 G0001 : score 3.97255 : H : ARG NH2 C0188 <- 2.96 -> DG N7 G0001 : score 6.18031 : x : THR xxxx C0184 <- 3.67 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx >2fqz_CD:Restriction_endonuclease-like; title=METAL-DEPLETED ECL18KI IN COMPLEX WITH UNCLEAVED DNA organism=ENTEROBACTER CLOACAE : H : GLN OE1 C0114 <- 3.01 -> DG N2 H0001 : score 5.37217 A : H : SER OG C0118 <- 3.22 -> DC O2 H0003 : score 2.29117 : H : ARG NE C0186 <- 2.74 -> DG O6 G0002 : score 3.98832 : H : ARG NH2 C0186 <- 2.81 -> DG N7 G0002 : score 6.37185 : H : GLU OE2 C0187 <- 2.90 -> DC N4 H-001 : score 5.16008 A : H : ARG NE C0188 <- 2.76 -> DG O6 G0001 : score 3.97255 : H : ARG NH2 C0188 <- 2.96 -> DG N7 G0001 : score 6.18031 : H : GLN OE1 D0114 <- 2.98 -> DG N2 G0001 : score 5.40582 A : H : SER OG D0118 <- 3.10 -> DG N2 G0003 : score 3.1719 A : H : ARG NE D0186 <- 2.80 -> DG O6 H0002 : score 3.94103 : H : ARG NH2 D0186 <- 2.93 -> DG N7 H0002 : score 6.21862 : H : GLU OE1 D0187 <- 3.29 -> DC N4 G-002 : score 5.20269 A : H : GLU OE2 D0187 <- 2.80 -> DC N4 G-001 : score 5.26538 A : H : ARG NE D0188 <- 2.65 -> DG O6 H0001 : score 4.05926 : H : ARG NH2 D0188 <- 2.88 -> DG N7 H0001 : score 6.28246 : x : ARG xxxx C0117 <- 3.22 -> DC xxx G-001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0184 <- 3.67 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0117 <- 3.22 -> DC xxx H-001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0184 <- 3.64 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx >2fr4_B:Immunoglobulin; title=STRUCTURE OF FAB DNA-1 COMPLEXED WITH A STEM-LOOP DNA LIGAND organism=MUS MUSCULUS : x : ARG xxxx B0098 <- 3.43 -> DG xxx M0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0100 <- 3.13 -> DC xxx M0009 : score x.xxxxx >2fr4_BH:Immunoglobulin; title=STRUCTURE OF FAB DNA-1 COMPLEXED WITH A STEM-LOOP DNA LIGAND organism=MUS MUSCULUS : x : ARG xxxx H0098 <- 3.48 -> DG xxx N0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0100 <- 3.19 -> DC xxx N0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0098 <- 3.43 -> DG xxx M0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0100 <- 3.13 -> DC xxx M0009 : score x.xxxxx >2fr4_L:Immunoglobulin; title=STRUCTURE OF FAB DNA-1 COMPLEXED WITH A STEM-LOOP DNA LIGAND organism=MUS MUSCULUS : H : GLU OE2 L0056 <- 2.91 -> DC N4 N0012 : score 5.14955 : H : HIS ND1 L0091 <- 2.96 -> DT O2 N0010 : score -5.85516 : V : ASN CG L0050 <- 3.87 -> DT C7 N0011 : score 2.60186 : x : TYR xxxx L0032 <- 3.52 -> DT xxx N0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0049 <- 3.40 -> DT xxx N0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0092 <- 3.50 -> DT xxx N0010 : score x.xxxxx >2fvp_A:DNA/RNA_polymerases; title=A STRUCTURAL STUDY OF THE CA DINUCLEOTIDE STEP IN THE INTEGRASE PROCESSING SITE OF MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS organism=Moloney murine leukemia virus : w : TYR OH A0064 <- 5.16 -> DT O2 B0001 : score 3.068 : w : ASP OD2 A0114 <- 5.71 -> DT O2 B0001 : score 1.008 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.82 -> DT O2 B0002 : score 4.2164 : x : LEU xxxx A0099 <- 3.29 -> DT xxx B0001 : score x.xxxxx >2fvq_A:DNA/RNA_polymerases; title=A STRUCTURAL STUDY OF THE CA DINUCLEOTIDE STEP IN THE INTEGRASE PROCESSING SITE OF MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS organism=Moloney murine leukemia virus : H : ARG NH2 A0116 <- 2.73 -> DT O2 B0002 : score 4.2926 : x : TYR xxxx A0064 <- 4.03 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0099 <- 3.38 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx >2fvr_A:DNA/RNA_polymerases; title=A STRUCTURAL STUDY OF THE CA DINUCLEOTIDE STEP IN THE INTEGRASE PROCESSING SITE OF MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS organism=Moloney murine leukemia virus : w : TYR OH A0064 <- 5.05 -> DT O2 B0001 : score 3.068 : w : ASP OD2 A0114 <- 5.29 -> DT O2 B0001 : score 1.008 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.93 -> DC O2 B0002 : score 3.60255 : x : LEU xxxx A0099 <- 3.67 -> DT xxx B0001 : score x.xxxxx >2fvs_A:DNA/RNA_polymerases; title=A STRUCTURAL STUDY OF THE CA DINUCLEOTIDE STEP IN THE INTEGRASE PROCESSING SITE OF MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS organism=Moloney murine leukemia virus : H : ARG NH2 A0116 <- 2.97 -> DA N3 B0002 : score 3.12959 : x : TYR xxxx A0064 <- 3.91 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0099 <- 3.06 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx >2g1p_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF E. COLI DNA ADENINE METHYLTRANSFERASE (DAM) organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0009 <- 3.21 -> DG N7 F0005 : score 4.94425 : w : LYS NZ A0009 <- 5.55 -> DA N7 F0004 : score 1.655 : H : ARG NH1 A0124 <- 2.74 -> DG O6 G0005 : score 6.15633 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.92 -> DG N7 G0005 : score 6.23138 : w : ARG NH1 A0124 <- 5.59 -> DT O4 F0007 : score 1.768 : H : TYR OH A0138 <- 2.53 -> DG O6 F0005 : score 3.82953 : x : TYR xxxx A0119 <- 3.33 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0120 <- 3.10 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0122 <- 3.31 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0132 <- 3.71 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0134 <- 3.12 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0137 <- 3.44 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0184 <- 3.93 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0228 <- 3.47 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0260 <- 3.89 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0261 <- 3.25 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx >2g1p_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF E. COLI DNA ADENINE METHYLTRANSFERASE (DAM) organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0009 <- 3.21 -> DG N7 F0005 : score 4.94425 : H : LYS NZ A0009 <- 3.21 -> DG N7 F0005 : score 4.94425 : w : LYS NZ A0009 <- 5.55 -> DA N7 F0004 : score 1.655 : H : ARG NH1 A0124 <- 2.74 -> DG O6 G0005 : score 6.15633 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.92 -> DG N7 G0005 : score 6.23138 : w : ARG NH1 A0124 <- 5.59 -> DT O4 F0007 : score 1.768 : H : TYR OH A0138 <- 2.53 -> DG O6 F0005 : score 3.82953 : H : TYR OH A0138 <- 2.53 -> DG O6 F0005 : score 3.82953 : H : ARG NH1 B0124 <- 2.82 -> DG O6 G0011 : score 6.059 : H : ARG NH2 B0124 <- 2.94 -> DG N7 G0011 : score 6.20585 : w : ARG NH1 B0124 <- 5.78 -> DT O4 F0001 : score 1.768 : x : TYR xxxx A0119 <- 3.33 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0120 <- 3.10 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0122 <- 3.31 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0132 <- 3.71 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0134 <- 3.12 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0137 <- 3.44 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0184 <- 3.93 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0228 <- 3.47 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0260 <- 3.89 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0261 <- 3.25 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0119 <- 3.27 -> DA xxx G0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0122 <- 3.36 -> DT xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0132 <- 3.69 -> DA xxx G0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0134 <- 3.23 -> DA xxx G0012 : score x.xxxxx >2g8f_A:Ribonuclease_H-like; title=B. HALODURANS RNASE H CATALYTIC DOMAIN E188A MUTANT IN COMPLEX WITH MG2+ AND RNA/DNA HYBRID (NON-P NICK AT THE ACTIVE SITE) organism=Bacillus halodurans : H : ASN ND2 A0077 <- 2.82 -> DT O2 C0002 : score 4.72717 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.36 -> DG N3 C0003 : score 4.34665 : H : ASN OD1 A0106 <- 3.30 -> DG N2 C0003 : score 4.32 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.08 -> DG N3 C0003 : score 4.62076 : w : GLN NE2 A0134 <- 6.11 -> DC O2 C0005 : score 2.699 : w : THR OG1 A0135 <- 5.74 -> DT O2 C0004 : score 2.522 >2g8h_A:Ribonuclease_H-like; title=B. HALODURANS RNASE H CATALYTIC DOMAIN D192N MUTANT IN COMPLEX WITH MG2+ AND RNA/DNA HYBRID (NON-P NICK AT THE ACTIVE SITE) organism=Bacillus halodurans : H : ASN ND2 A0077 <- 2.84 -> DT O2 C0002 : score 4.70818 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.33 -> DG N3 C0003 : score 4.37602 : H : ASN OD1 A0106 <- 3.29 -> DG N2 C0003 : score 4.3296 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.05 -> DG N3 C0003 : score 4.65013 : w : GLN NE2 A0134 <- 5.56 -> DT O2 C0004 : score 1.565 : w : THR OG1 A0135 <- 5.50 -> DT O2 C0004 : score 2.522 >2g8i_A:Ribonuclease_H-like; title=B. HALODURANS RNASE H CATALYTIC DOMAIN D192N MUTANT IN COMPLEX WITH MN2+ AND RNA/DNA HYBRID (NON-P NICK AT THE ACTIVE SITE) organism=Bacillus halodurans : H : ASN ND2 A0077 <- 2.84 -> DT O2 C0002 : score 4.70818 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.36 -> DG N3 C0003 : score 4.34665 : H : ASN OD1 A0106 <- 3.27 -> DG N2 C0003 : score 4.3488 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.08 -> DG N3 C0003 : score 4.62076 : w : GLN NE2 A0134 <- 5.62 -> DT O2 C0004 : score 1.565 : w : THR OG1 A0135 <- 5.71 -> DT O2 C0004 : score 2.522 >2g8k_A:Ribonuclease_H-like; title=B. HALODURANS RNASE H CATALYTIC DOMAIN D192N MUTANT IN COMPLEX WITH CA2+ AND RNA/DNA HYBRID (NON-P NICK AT THE ACTIVE SITE) organism=Bacillus halodurans : H : ASN ND2 A0077 <- 2.83 -> DT O2 C0002 : score 4.71768 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.32 -> DG N3 C0003 : score 4.38581 : H : ASN OD1 A0106 <- 3.21 -> DG N2 C0003 : score 4.4064 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.08 -> DG N3 C0003 : score 4.62076 : w : GLN OE1 A0134 <- 5.59 -> DT O2 C0004 : score 2.481 : w : THR OG1 A0135 <- 5.91 -> DT O2 C0004 : score 2.522 >2g8u_A:Ribonuclease_H-like; title=B. HALODURANS RNASE H CATALYTIC DOMAIN D132N MUTANT IN COMPLEX WITH MG2+ AND RNA/DNA HYBRID (NON-P NICK AT THE ACTIVE SITE) organism=Bacillus halodurans : H : ASN ND2 A0077 <- 2.52 -> DT O2 C0002 : score 5.01194 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.39 -> DG N3 C0003 : score 4.31728 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.34 -> DG N3 C0003 : score 4.36623 : x : THR xxxx A0135 <- 3.34 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx >2g8v_A:Ribonuclease_H-like; title=B. HALODURANS RNASE H CATALYTIC DOMAIN E188A MUTANT IN COMPLEX WITH MG2+ AND RNA/DNA HYBRID (REACTION PRODUCT) organism=Bacillus halodurans : H : ASN ND2 A0077 <- 2.69 -> DT O2 C0002 : score 4.85057 : H : ASN OD1 A0106 <- 3.36 -> DG N2 C0003 : score 4.2624 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.15 -> DG N3 C0003 : score 4.55223 : w : GLN NE2 A0134 <- 5.82 -> DT O2 C0004 : score 1.565 : w : THR OG1 A0135 <- 6.00 -> DT O2 C0004 : score 2.522 : x : ASN xxxx A0105 <- 3.53 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx >2g8w_A:Ribonuclease_H-like; title=B. HALODURANS RNASE H CATALYTIC DOMAIN E188A MUTANT IN COMPLEX WITH CA2+ AND RNA/DNA HYBRID organism=Bacillus halodurans : H : ASN ND2 A0077 <- 3.04 -> DA N3 C0001 : score 3.62492 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.32 -> DT O2 C0002 : score 4.25255 : H : ASN ND2 A0106 <- 2.83 -> DT O2 C0002 : score 4.71768 : w : GLN NE2 A0134 <- 5.69 -> DG N2 C0003 : score 1.484 : w : THR OG1 A0135 <- 6.05 -> DG N2 C0003 : score 2.036 >2gat_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=SOLUTION STRUCTURE OF THE C-TERMINAL DOMAIN OF CHICKEN GATA-1 BOUND TO DNA, NMR, REGULARIZED MEAN STRUCTURE organism=GALLUS GALLUS : H : LYS NZ A0057 <- 2.66 -> DT O2 B0109 : score 3.68762 : V : LEU CD2 A0037 <- 3.82 -> DT C7 C0122 : score 5.70263 : V : LEU CB A0033 <- 3.64 -> DT C7 C0123 : score 4.57493 : x : THR xxxx A0016 <- 2.65 -> DT xxx C0125 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0017 <- 2.68 -> DG xxx B0107 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0019 <- 2.86 -> DG xxx B0107 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0029 <- 3.81 -> DT xxx C0125 : score x.xxxxx >2gb7_A:Restriction_endonuclease-like; title=METAL-DEPLETED ECL18KI IN COMPLEX WITH UNCLEAVED, MODIFIED DNA organism=ENTEROBACTER CLOACAE : H : GLN OE1 A0114 <- 3.05 -> DG N2 F0001 : score 5.32731 A : H : SER OG A0118 <- 3.00 -> DG N2 E-003 : score 3.23938 A : H : ARG NE A0186 <- 2.79 -> DG O6 E0002 : score 3.94891 : H : ARG NH2 A0186 <- 3.03 -> DG N7 E0002 : score 6.09092 : H : GLU OE2 A0187 <- 2.84 -> DC N4 F-001 : score 5.22326 A : H : ARG NE A0188 <- 2.70 -> DG O6 E0001 : score 4.01985 : H : ARG NH2 A0188 <- 2.96 -> DG N7 E0001 : score 6.18031 : x : ARG xxxx A0117 <- 3.31 -> DC xxx E-001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0184 <- 3.59 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx >2gb7_AB:Restriction_endonuclease-like; title=METAL-DEPLETED ECL18KI IN COMPLEX WITH UNCLEAVED, MODIFIED DNA organism=ENTEROBACTER CLOACAE : H : GLN OE1 A0114 <- 3.05 -> DG N2 F0001 : score 5.32731 A : H : SER OG A0118 <- 3.00 -> DG N2 E-003 : score 3.23938 A : H : ARG NE A0186 <- 2.79 -> DG O6 E0002 : score 3.94891 : H : ARG NH2 A0186 <- 3.03 -> DG N7 E0002 : score 6.09092 : H : GLU OE2 A0187 <- 2.84 -> DC N4 F-001 : score 5.22326 A : H : ARG NE A0188 <- 2.70 -> DG O6 E0001 : score 4.01985 : H : ARG NH2 A0188 <- 2.96 -> DG N7 E0001 : score 6.18031 : H : GLN OE1 B0114 <- 3.18 -> DG N2 E0001 : score 5.18151 A : H : SER OG B0118 <- 2.98 -> DG N2 E0003 : score 3.25288 A : H : ARG NE B0186 <- 2.89 -> DG O6 F0002 : score 3.87009 : H : ARG NH2 B0186 <- 2.91 -> DG N7 F0002 : score 6.24415 : H : GLU OE2 B0187 <- 2.90 -> DC N4 E-001 : score 5.16008 A : H : ARG NE B0188 <- 2.75 -> DG O6 F0001 : score 3.98044 : H : ARG NH2 B0188 <- 3.02 -> DG N7 F0001 : score 6.10369 : x : ARG xxxx A0117 <- 3.31 -> DC xxx E-001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0184 <- 3.59 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0117 <- 3.24 -> DC xxx F-001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0184 <- 3.72 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx >2gb7_CD:Restriction_endonuclease-like; title=METAL-DEPLETED ECL18KI IN COMPLEX WITH UNCLEAVED, MODIFIED DNA organism=ENTEROBACTER CLOACAE : H : GLN OE1 C0114 <- 3.08 -> DG N2 H0001 : score 5.29366 A : H : ARG NE C0186 <- 2.82 -> DG O6 G0002 : score 3.92526 : H : ARG NH2 C0186 <- 2.84 -> DG N7 G0002 : score 6.33354 : H : GLU OE1 C0187 <- 3.30 -> DC N4 H-002 : score 5.19115 A : H : GLU OE2 C0187 <- 2.86 -> DC N4 H-001 : score 5.2022 A : H : ARG NE C0188 <- 2.70 -> DG O6 G0001 : score 4.01985 : H : ARG NH2 C0188 <- 2.93 -> DG N7 G0001 : score 6.21862 : H : GLN OE1 D0114 <- 3.06 -> DG N2 G0001 : score 5.31609 A : H : SER OG D0118 <- 2.91 -> DG N2 G0003 : score 3.30012 A : H : ARG NE D0186 <- 2.91 -> DG O6 H0002 : score 3.85432 : H : ARG NH2 D0186 <- 3.02 -> DG N7 H0002 : score 6.10369 : H : GLU OE2 D0187 <- 2.85 -> DC N4 G-001 : score 5.21273 A : H : ARG NE D0188 <- 2.75 -> DG O6 H0001 : score 3.98044 : H : ARG NH2 D0188 <- 2.92 -> DG N7 H0001 : score 6.23138 : x : ARG xxxx C0117 <- 3.26 -> DC xxx G-001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0118 <- 3.42 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0184 <- 3.65 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0117 <- 3.29 -> DC xxx H-001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0184 <- 3.68 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx >2ge5_A:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV RESTRICTION ENDONUCLEASE C-TERMINAL DELETION MUTANT/GATATC/CA2+ organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 A0185 <- 3.12 -> DA N6 D0005 : score 5.6364 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.60 -> DA N7 D0005 : score 6.10533 : H : THR OG1 A0186 <- 2.61 -> DT O4 C0008 : score 4.03489 : V : ASN CG A0188 <- 3.78 -> DT C7 C0008 : score 2.66145 : x : ASN xxxx A0070 <- 3.05 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0106 <- 4.05 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.12 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >2ge5_AB:Restriction_endonuclease-like; title=ECORV RESTRICTION ENDONUCLEASE C-TERMINAL DELETION MUTANT/GATATC/CA2+ organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 A0185 <- 3.12 -> DA N6 D0005 : score 5.6364 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.60 -> DA N7 D0005 : score 6.10533 : H : THR OG1 A0186 <- 2.61 -> DT O4 C0008 : score 4.03489 : H : ASN ND2 B0070 <- 2.95 -> DC O2 C0009 : score 4.3451 : H : SER OG B0183 <- 2.68 -> DT O4 D0008 : score 3.64045 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.70 -> DA N6 C0005 : score 6.14223 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.82 -> DA N7 C0005 : score 5.84703 : H : THR OG1 B0186 <- 2.79 -> DT O4 D0008 : score 3.89495 : V : ASN CG A0188 <- 3.78 -> DT C7 C0008 : score 2.66145 : V : THR CG2 B0106 <- 3.74 -> DT C7 D0008 : score 4.30048 : x : ASN xxxx A0070 <- 3.05 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0106 <- 4.05 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.12 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.67 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >2geq_AB:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A P53 CORE DIMER BOUND TO DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0277 <- 2.91 -> DG O6 C0011 : score 5.9495 : H : ARG NH2 A0277 <- 2.91 -> DG N7 C0011 : score 6.24415 : H : ARG NH1 B0277 <- 2.71 -> DG O6 D0011 : score 6.19283 : H : ARG NH2 B0277 <- 2.86 -> DG N7 D0011 : score 6.308 : x : ALA xxxx A0273 <- 3.98 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0274 <- 3.67 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0273 <- 3.81 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0274 <- 3.88 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx >2geq_B:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A P53 CORE DIMER BOUND TO DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 B0277 <- 2.71 -> DG O6 D0011 : score 6.19283 : H : ARG NH2 B0277 <- 2.86 -> DG N7 D0011 : score 6.308 : x : ALA xxxx B0273 <- 3.81 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0274 <- 3.88 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx >2gie_ABCD:Restriction_endonuclease-like; title=HINCII BOUND TO COGNATE DNA GTTAAC organism=Haemophilus influenzae : H : HIS NE2 A0031 <- 3.11 -> DT O2 F0007 : score 4.91488 : w : ASN OD1 A0110 <- 6.16 -> DT O2 F0006 : score 1.953 : w : GLN OE1 A0138 <- 6.02 -> DC O2 F0011 : score 1.091 : H : ASN OD1 A0141 <- 3.25 -> DA N6 F0009 : score 5.47983 : H : ASN ND2 A0141 <- 2.83 -> DA N7 F0008 : score 5.83529 : H : ASN ND2 A0201 <- 3.02 -> DG N7 E0005 : score 4.38412 : H : GLN NE2 A0209 <- 2.93 -> DG O6 E0005 : score 5.65419 : H : GLN NE2 B0109 <- 3.14 -> DT O2 E0007 : score 3.66587 : H : ASN ND2 B0141 <- 2.93 -> DA N7 E0008 : score 5.71788 : H : ASN ND2 B0201 <- 2.96 -> DG N7 F0005 : score 4.43915 : H : GLN NE2 B0209 <- 3.06 -> DG O6 F0005 : score 5.50326 : H : HIS NE2 C0031 <- 3.21 -> DT O2 H0007 : score 4.81008 : H : GLN NE2 C0109 <- 3.16 -> DT O2 H0007 : score 3.65013 : H : ASN OD1 C0141 <- 3.30 -> DA N6 H0009 : score 5.41962 : H : ASN ND2 C0141 <- 2.71 -> DA N7 H0008 : score 5.97618 : H : ASN ND2 C0201 <- 3.03 -> DG N7 G0005 : score 4.37495 : H : GLN NE2 C0209 <- 3.08 -> DG O6 G0005 : score 5.48004 : H : HIS NE2 D0031 <- 2.96 -> DT O2 G0007 : score 5.07207 : H : ASN ND2 D0141 <- 2.78 -> DA N7 G0008 : score 5.89399 : H : ASN ND2 D0201 <- 2.88 -> DG N7 H0005 : score 4.51252 : H : GLN NE2 D0209 <- 2.92 -> DG O6 H0005 : score 5.6658 : V : ALA CB B0205 <- 3.70 -> DT C7 E0006 : score 5.73895 : V : ALA CB C0205 <- 3.54 -> DT C7 H0006 : score 5.96291 : V : ALA CB A0205 <- 3.54 -> DT C7 F0006 : score 5.96291 : V : ALA CB D0205 <- 3.50 -> DT C7 G0007 : score 6.0189 : x : GLN xxxx A0109 <- 3.22 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.47 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.23 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.00 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.53 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 3.30 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0031 <- 2.83 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0136 <- 4.09 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0138 <- 3.16 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.64 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.74 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.23 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.39 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 3.39 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0136 <- 3.89 -> DC xxx H0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0138 <- 2.96 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0140 <- 3.30 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0199 <- 3.59 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0203 <- 4.42 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0204 <- 3.34 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0207 <- 3.66 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0109 <- 2.99 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0110 <- 3.87 -> DG xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0137 <- 4.37 -> DC xxx G0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0138 <- 3.04 -> DG xxx H0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0140 <- 3.49 -> DA xxx G0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0199 <- 2.91 -> DG xxx H0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0204 <- 3.44 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0207 <- 4.02 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx >2gie_D:Restriction_endonuclease-like; title=HINCII BOUND TO COGNATE DNA GTTAAC organism=Haemophilus influenzae : H : HIS NE2 D0031 <- 2.96 -> DT O2 G0007 : score 5.07207 : w : ASN OD1 D0110 <- 6.37 -> DG N3 G0005 : score 3.377 : H : ASN ND2 D0141 <- 2.78 -> DA N7 G0008 : score 5.89399 : H : ASN ND2 D0201 <- 2.88 -> DG N7 H0005 : score 4.51252 : H : GLN NE2 D0209 <- 2.92 -> DG O6 H0005 : score 5.6658 : V : ALA CB D0205 <- 3.50 -> DT C7 G0007 : score 6.0189 : x : GLN xxxx D0109 <- 2.99 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0137 <- 4.37 -> DC xxx G0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0138 <- 3.04 -> DG xxx H0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0140 <- 3.49 -> DA xxx G0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0199 <- 2.91 -> DG xxx H0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0204 <- 3.44 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0207 <- 4.02 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx >2gig_A:Restriction_endonuclease-like; title=ALTERATION OF SEQUENCE SPECIFICITY OF THE TYPE II RESTRICTION ENDONUCLEASE HINCII THROUGH AN INDIRECT READOUT MECHANISM organism=Haemophilus influenzae : w : GLN OE1 A0109 <- 5.54 -> DC O2 E0010 : score 1.091 : w : ASN OD1 A0110 <- 6.49 -> DC O2 E0011 : score 2.172 : w : ASN OD1 A0110 <- 6.28 -> DC O2 E0010 : score 2.172 : w : ASN OD1 A0110 <- 6.38 -> DG N3 F0005 : score 3.377 : H : ASN OD1 A0141 <- 3.05 -> DA N6 F0009 : score 5.72071 : H : ASN ND2 A0141 <- 3.07 -> DG N7 F0008 : score 4.33826 : w : ASN ND2 A0141 <- 5.93 -> DT O4 E0006 : score 3.275 : H : ASN ND2 A0201 <- 3.01 -> DG N7 E0005 : score 4.39329 : H : GLN NE2 A0209 <- 3.02 -> DG O6 E0005 : score 5.5497 : w : GLN OE1 A0209 <- 6.54 -> DG N7 E0004 : score 2.87 : V : ALA CB A0205 <- 3.67 -> DT C7 F0006 : score 5.78094 : x : SER xxxx A0136 <- 3.28 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0138 <- 3.31 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.38 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.36 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.11 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.23 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 4.17 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx >2gig_AB:Restriction_endonuclease-like; title=ALTERATION OF SEQUENCE SPECIFICITY OF THE TYPE II RESTRICTION ENDONUCLEASE HINCII THROUGH AN INDIRECT READOUT MECHANISM organism=Haemophilus influenzae : H : ASN OD1 A0141 <- 3.05 -> DA N6 F0009 : score 5.72071 : H : ASN ND2 A0141 <- 3.07 -> DG N7 F0008 : score 4.33826 : w : ASN ND2 A0141 <- 5.93 -> DT O4 E0006 : score 3.275 : H : ASN ND2 A0201 <- 3.01 -> DG N7 E0005 : score 4.39329 : H : GLN NE2 A0209 <- 3.02 -> DG O6 E0005 : score 5.5497 : w : GLN OE1 A0209 <- 6.54 -> DG N7 E0004 : score 2.87 : w : SER OG B0136 <- 5.57 -> DG N7 E0012 : score 2.749 : H : ASN OD1 B0141 <- 3.01 -> DA N6 E0009 : score 5.76888 : H : ASN ND2 B0141 <- 2.97 -> DG N7 E0008 : score 4.42998 : H : ASN ND2 B0201 <- 3.01 -> DG N7 F0005 : score 4.39329 : H : GLN NE2 B0209 <- 3.04 -> DG O6 F0005 : score 5.52648 : w : GLN OE1 B0209 <- 6.82 -> DG N7 F0004 : score 2.87 : V : ALA CB A0205 <- 3.67 -> DT C7 F0006 : score 5.78094 : x : GLN xxxx A0109 <- 3.03 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0110 <- 4.44 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0136 <- 3.28 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0138 <- 3.31 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.38 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.36 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.11 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.23 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 4.17 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0138 <- 3.36 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.68 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.37 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 3.99 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.26 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0205 <- 3.47 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 3.90 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx >2gih_A:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO COGNATE DNA GTCGAC AND CA2+ organism=Haemophilus influenzae : w : GLN NE2 A0109 <- 5.44 -> DC O2 E0010 : score 2.699 : H : ASN ND2 A0141 <- 2.95 -> DG N7 F0008 : score 4.44832 : H : ASN ND2 A0201 <- 3.08 -> DG N7 E0005 : score 4.32909 : H : GLN NE2 A0209 <- 3.25 -> DG O6 E0005 : score 5.28267 : V : ALA CB A0205 <- 3.62 -> DT C7 F0006 : score 5.85093 : V : ALA CB A0203 <- 3.85 -> DT C7 E0006 : score 5.52899 : x : ASN xxxx A0110 <- 4.07 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0137 <- 4.27 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0138 <- 3.30 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.98 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.26 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.25 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 4.00 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx >2gih_AB:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO COGNATE DNA GTCGAC AND CA2+ organism=Haemophilus influenzae : H : ASN ND2 A0141 <- 2.95 -> DG N7 F0008 : score 4.44832 : H : ASN ND2 A0201 <- 3.08 -> DG N7 E0005 : score 4.32909 : H : GLN NE2 A0209 <- 3.25 -> DG O6 E0005 : score 5.28267 : w : GLN OE1 B0109 <- 6.10 -> DT O2 E0006 : score 2.481 : w : SER OG B0136 <- 5.50 -> DG O6 E0012 : score 2.749 : H : ASN OD1 B0141 <- 2.77 -> DA N6 E0009 : score 6.05793 : H : ASN ND2 B0141 <- 3.00 -> DG N7 E0008 : score 4.40246 : H : ASN ND2 B0201 <- 3.05 -> DG N7 F0005 : score 4.3566 : H : GLN NE2 B0209 <- 3.19 -> DG O6 F0005 : score 5.35233 : w : GLN OE1 B0209 <- 5.88 -> DG N7 F0004 : score 2.87 : V : ALA CB A0205 <- 3.62 -> DT C7 F0006 : score 5.85093 : V : ALA CB A0203 <- 3.85 -> DT C7 E0006 : score 5.52899 : x : GLN xxxx A0109 <- 3.12 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0110 <- 4.07 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0137 <- 4.27 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0138 <- 3.30 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.98 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.26 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.25 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 4.00 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0110 <- 3.39 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0138 <- 3.18 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.56 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.55 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.24 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.60 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0205 <- 3.74 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 4.17 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx >2gii_AB:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO COGNATE DNA GTTAAC organism=Haemophilus influenzae : w : ASN ND2 A0110 <- 5.60 -> DT O2 F0006 : score 1.666 : w : SER OG A0136 <- 6.01 -> DG O6 F0012 : score 2.749 : H : ASN OD1 A0141 <- 2.59 -> DA N6 F0009 : score 6.27471 : w : ASN ND2 A0141 <- 6.20 -> DT O4 E0007 : score 3.275 : H : ASN ND2 A0201 <- 2.97 -> DG N7 E0005 : score 4.42998 : H : GLN NE2 A0209 <- 2.98 -> DG O6 E0005 : score 5.59614 : w : GLN OE1 A0209 <- 6.00 -> DG N7 E0004 : score 2.87 : w : SER OG B0136 <- 5.67 -> DG N7 E0012 : score 2.749 : H : ASN OD1 B0141 <- 2.77 -> DA N6 E0009 : score 6.05793 : w : ASN ND2 B0141 <- 5.54 -> DA N6 E0008 : score 2.5 : w : ASN ND2 B0141 <- 5.62 -> DA N7 E0008 : score 1.989 : H : ASN ND2 B0201 <- 3.24 -> DG N7 F0005 : score 4.18234 : w : GLN OE1 B0207 <- 6.08 -> DA N7 E0008 : score 1.196 : V : ALA CB A0205 <- 3.52 -> DT C7 F0006 : score 5.9909 : V : ALA CB B0205 <- 3.57 -> DT C7 E0006 : score 5.92092 : x : PHE xxxx A0138 <- 3.32 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.39 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.17 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.11 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.16 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0138 <- 3.34 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.83 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.14 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.17 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.33 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0209 <- 3.15 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx >2gii_B:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO COGNATE DNA GTTAAC organism=Haemophilus influenzae : w : SER OG B0136 <- 5.67 -> DG N7 E0012 : score 2.749 : H : ASN OD1 B0141 <- 2.77 -> DA N6 E0009 : score 6.05793 : w : ASN ND2 B0141 <- 5.54 -> DA N6 E0008 : score 2.5 : w : ASN ND2 B0141 <- 5.62 -> DA N7 E0008 : score 1.989 : H : ASN ND2 B0201 <- 3.24 -> DG N7 F0005 : score 4.18234 : w : GLN OE1 B0207 <- 6.08 -> DA N7 E0008 : score 1.196 : V : ALA CB B0205 <- 3.57 -> DT C7 E0006 : score 5.92092 : x : PHE xxxx B0138 <- 3.34 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.83 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.14 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.17 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.33 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0209 <- 3.15 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx >2gij_A:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO COGNATE DNA GTTAAC AND CA2+ organism=Haemophilus influenzae : H : ASN OD1 A0141 <- 2.94 -> DA N6 F0009 : score 5.85318 : w : ASN ND2 A0141 <- 5.63 -> DA N7 F0008 : score 1.989 : w : ASN ND2 A0141 <- 5.89 -> DT O4 E0006 : score 3.275 : H : ASN ND2 A0201 <- 2.94 -> DG N7 E0005 : score 4.45749 : H : GLN NE2 A0209 <- 3.00 -> DG O6 E0005 : score 5.57292 : V : ALA CB A0205 <- 3.80 -> DT C7 F0006 : score 5.59897 : x : GLN xxxx A0109 <- 3.16 -> DC xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0110 <- 4.14 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0136 <- 3.39 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0138 <- 3.30 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.34 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.46 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.06 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.52 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 3.63 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx >2gij_AB:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO COGNATE DNA GTTAAC AND CA2+ organism=Haemophilus influenzae : H : ASN OD1 A0141 <- 2.94 -> DA N6 F0009 : score 5.85318 : w : ASN ND2 A0141 <- 5.63 -> DA N7 F0008 : score 1.989 : w : ASN ND2 A0141 <- 5.89 -> DT O4 E0006 : score 3.275 : H : ASN ND2 A0201 <- 2.94 -> DG N7 E0005 : score 4.45749 : H : GLN NE2 A0209 <- 3.00 -> DG O6 E0005 : score 5.57292 : w : ASN OD1 B0141 <- 5.76 -> DT O4 F0006 : score 3.132 : H : ASN ND2 B0201 <- 3.00 -> DG N7 F0005 : score 4.40246 : H : GLN NE2 B0209 <- 3.05 -> DG O6 F0005 : score 5.51487 : V : ALA CB A0205 <- 3.80 -> DT C7 F0006 : score 5.59897 : V : ALA CB B0205 <- 3.68 -> DT C7 E0006 : score 5.76694 : x : GLN xxxx A0109 <- 3.16 -> DC xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0110 <- 4.14 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0136 <- 3.39 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0138 <- 3.30 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.34 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.46 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.06 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.52 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 3.63 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0110 <- 4.41 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0136 <- 3.69 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0138 <- 3.31 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.63 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.43 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.01 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.37 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 3.86 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx >2gli_A:C2H2_and_C2HC_zinc_fingers; title=FIVE-FINGER GLI/DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : SER OG A0215 <- 2.76 -> DG O6 C0010 : score 4.12375 : H : LYS NZ A0219 <- 2.46 -> DG O6 C0011 : score 6.17386 : w : LYS NZ A0219 <- 6.61 -> DG N7 C0012 : score 2.519 : w : ARG NH2 A0223 <- 6.06 -> DT O4 C0013 : score 2.366 : w : ARG NH2 A0223 <- 6.11 -> DG N7 C0012 : score 2.18 : H : ASP OD1 A0244 <- 2.70 -> DC N4 D0009 : score 5.45177 : H : ASP OD2 A0244 <- 3.15 -> DC N4 D0008 : score 5.766 : H : SER OG A0246 <- 3.05 -> DG N7 C0014 : score 4.25795 : H : SER OG A0246 <- 2.71 -> DG O6 C0014 : score 4.16466 : H : SER OG A0247 <- 2.78 -> DA N7 D0007 : score 4.48196 : H : ARG NH2 A0249 <- 3.26 -> DG N7 C0014 : score 5.79723 : H : LYS NZ A0250 <- 2.55 -> DG N7 D0006 : score 5.65519 : H : LYS NZ A0250 <- 2.90 -> DG O6 D0006 : score 5.66515 : V : ALA CB A0214 <- 3.54 -> DT C7 C0008 : score 5.96291 : x : ALA xxxx A0153 <- 4.41 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0155 <- 3.17 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0183 <- 4.23 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0186 <- 3.90 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0216 <- 3.65 -> DC xxx D0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0245 <- 3.93 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >2glo_A:Homeodomain-like; title=SOLUTION STRUCTURE OF THE BRINKER DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH THE OMB ENHANCER organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH1 A0082 <- 2.65 -> DG O6 C0019 : score 6.26583 : H : LYS NZ A0086 <- 3.07 -> DT O4 B0008 : score 3.39347 : x : ARG xxxx A0045 <- 2.85 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0080 <- 3.32 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0081 <- 3.53 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0083 <- 2.83 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0085 <- 2.91 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx >2gm4_A:Resolvase-like;Homeodomain-like; title=AN ACTIVATED, TETRAMERIC GAMMA-DELTA RESOLVASE: HIN CHIMAERA BOUND TO CLEAVED DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : SER OG A0173 <- 2.82 -> DC N4 X0008 : score 3.66094 : H : SER OG A0173 <- 3.16 -> DG O6 Y0028 : score 3.79647 : V : TYR CG A0176 <- 3.75 -> DT C7 X0007 : score 3.78831 : x : THR xxxx A0011 <- 4.02 -> DA xxx Z0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0126 <- 4.14 -> DT xxx X0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0130 <- 3.68 -> DA xxx Z0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0142 <- 3.69 -> DT xxx Y0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0171 <- 3.60 -> DC xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0172 <- 3.44 -> DT xxx X0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0174 <- 4.18 -> DT xxx Y0026 : score x.xxxxx >2gws_I:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE LAMBDA WITH A G/G MISMATCH IN THE PRIMER TERMINUS organism=? : w : GLN NE2 I0372 <- 6.39 -> DC O2 J0009 : score 2.699 : w : GLU OE2 I0465 <- 5.48 -> DG N2 K0005 : score 1.976 : w : LYS NZ I0472 <- 5.73 -> DG N2 K0005 : score 0.846 : x : TYR xxxx I0505 <- 3.58 -> DG xxx K0006 : score x.xxxxx >2gxa_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PAPILLOMAVIRUS E1 HEXAMERIC HELICASE WITH SSDNA AND MGADP organism=Bovine papillomavirus type 1 : H : HIS NE2 F0507 <- 2.97 -> DT O2 M0003 : score 5.06159 : x : HIS xxxx C0507 <- 4.03 -> DT xxx M0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0507 <- 3.62 -> DT xxx M0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0507 <- 2.98 -> DT xxx M0003 : score x.xxxxx >2gxa_GHIJKL:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PAPILLOMAVIRUS E1 HEXAMERIC HELICASE WITH SSDNA AND MGADP organism=Bovine papillomavirus type 1 : H : HIS NE2 K0507 <- 3.00 -> DT O2 N0004 : score 5.03015 : x : HIS xxxx H0463 <- 4.19 -> DT xxx N0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0464 <- 4.28 -> DT xxx N0003 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0507 <- 3.48 -> DT xxx N0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx I0507 <- 3.41 -> DT xxx N0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx J0507 <- 3.09 -> DT xxx N0003 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0507 <- 3.26 -> DT xxx N0004 : score x.xxxxx >2gxa_L:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PAPILLOMAVIRUS E1 HEXAMERIC HELICASE WITH SSDNA AND MGADP organism=Bovine papillomavirus type 1 : x : HIS xxxx L0507 <- 3.26 -> DT xxx N0004 : score x.xxxxx >2gzk_A:HMG-box; title=STRUCTURE OF A COMPLEX OF TANDEM HMG BOXES AND DNA organism=HOMO SAPIENS, RATTUS RATTUS : H : ARG NH2 A0007 <- 2.61 -> DC O2 B0211 : score 3.83927 : H : ASN OD1 A0032 <- 2.74 -> DG N2 B0215 : score 4.8576 : H : ASN ND2 A0032 <- 2.90 -> DC O2 B0216 : score 4.3899 : H : SER OG A0036 <- 3.06 -> DA N3 C0219 : score 2.84765 : H : ARG NH1 A0091 <- 2.56 -> DC O2 B0206 : score 3.8252 : H : ARG NH2 A0091 <- 2.74 -> DA N3 C0228 : score 3.27862 : x : ASN xxxx A0010 <- 3.16 -> DA xxx B0212 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0012 <- 3.10 -> DT xxx C0220 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0013 <- 3.40 -> DA xxx B0213 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0020 <- 3.13 -> DG xxx B0215 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0074 <- 4.45 -> DA xxx B0210 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0076 <- 3.20 -> DT xxx C0224 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0078 <- 3.20 -> DA xxx B0209 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0081 <- 4.15 -> DA xxx B0208 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0096 <- 4.34 -> DA xxx B0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0097 <- 3.09 -> DT xxx C0229 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0100 <- 3.76 -> DG xxx B0203 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0116 <- 3.33 -> DC xxx C0232 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0120 <- 3.11 -> DG xxx B0203 : score x.xxxxx >2h1k_B:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PDX1 HOMEODOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=Mesocricetus auratus : H : LYS NZ B0002 <- 3.24 -> DT O2 E0110 : score 3.27151 : H : ARG NH1 B0005 <- 2.99 -> DT O2 F0218 : score 4.14277 : H : ARG NH2 B0005 <- 3.19 -> DT O2 F0218 : score 3.90313 : w : GLN OE1 B0050 <- 6.82 -> DT O4 E0106 : score 3.068 : H : ASN OD1 B0051 <- 2.87 -> DA N6 F0220 : score 5.93749 : H : ASN ND2 B0051 <- 2.92 -> DA N7 F0220 : score 5.72962 : V : GLN CG B0050 <- 3.74 -> DT C7 E0106 : score 3.30422 : x : ILE xxxx B0047 <- 3.54 -> DA xxx F0220 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0054 <- 4.43 -> DC xxx E0107 : score x.xxxxx >2h1o_EFGH:PIN_domain-like;Ribbon-helix-helix; title=STRUCTURE OF FITAB BOUND TO IR36 DNA FRAGMENT organism=NEISSERIA GONORRHOEAE : H : ARG NH1 E0007 <- 3.24 -> DG N7 U0026 : score 5.5176 : H : ARG NH2 E0007 <- 3.05 -> DG N7 U0026 : score 6.06538 : H : ARG NH2 E0007 <- 2.32 -> DG O6 U0026 : score 7.2336 : H : ARG NH1 F0007 <- 2.88 -> DG O6 U0006 : score 5.986 : H : ARG NH2 F0007 <- 2.61 -> DG N7 U0006 : score 6.62723 : H : ARG NH1 G0007 <- 2.64 -> DG O6 V0062 : score 6.278 : H : ARG NH2 G0007 <- 2.66 -> DG N7 V0062 : score 6.56338 : H : ARG NH1 H0007 <- 2.96 -> DG O6 V0042 : score 5.88867 : H : ARG NH2 H0007 <- 2.75 -> DG N7 V0042 : score 6.44846 : V : VAL CG2 F0005 <- 3.80 -> DT C7 U0008 : score 6.12308 : V : VAL CG2 E0005 <- 3.52 -> DT C7 U0028 : score 6.55169 : x : SER xxxx E0003 <- 3.78 -> DT xxx U0028 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0003 <- 3.66 -> DT xxx U0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0003 <- 3.22 -> DT xxx V0064 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0005 <- 3.83 -> DA xxx V0063 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0003 <- 4.41 -> DT xxx V0044 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx H0005 <- 3.69 -> DT xxx V0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0029 <- 4.28 -> DT xxx U0025 : score x.xxxxx >2h27_A:Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI SIGMAE REGION 4 BOUND TO ITS-35 ELEMENT DNA organism=Escherichia coli K12 : H : ARG NH1 A0171 <- 3.24 -> DA N7 C0018 : score 2.33495 : H : ARG NH1 A0171 <- 2.86 -> DG N7 C0019 : score 5.9774 : H : SER OG A0172 <- 2.94 -> DG N7 B0005 : score 4.35655 : H : ARG NH1 A0176 <- 2.70 -> DG N7 B0004 : score 6.171 : H : ARG NH2 A0176 <- 2.86 -> DG O6 B0004 : score 6.5208 : V : PHE CG A0175 <- 3.52 -> DT C7 C0021 : score 5.64741 : x : TYR xxxx A0156 <- 3.93 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0169 <- 3.54 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx >2h3a_AB: title=STRUCTURAL BASIS FOR NUCLEIC ACID AND TOXIN RECOGNITION OF THE BACTERIAL ANTITOXIN CCDA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NE A0004 <- 3.17 -> DT O4 D0191 : score 1.72141 : H : ARG NH2 A0004 <- 3.18 -> DG N7 D0190 : score 5.89938 : H : ARG NH1 B0104 <- 2.69 -> DA N7 D0192 : score 2.61658 : H : ARG NH1 B0104 <- 2.99 -> DT O4 D0193 : score 3.14377 : H : ARG NH2 B0104 <- 2.76 -> DA N7 D0192 : score 1.68517 : x : THR xxxx A0006 <- 2.75 -> DT xxx C0178 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0008 <- 3.36 -> DT xxx C0176 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.11 -> DT xxx D0191 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0108 <- 4.20 -> DG xxx D0189 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0162 <- 4.15 -> DG xxx C0177 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0171 <- 3.63 -> DC xxx D0187 : score x.xxxxx >2h3a_B: title=STRUCTURAL BASIS FOR NUCLEIC ACID AND TOXIN RECOGNITION OF THE BACTERIAL ANTITOXIN CCDA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 B0104 <- 2.69 -> DA N7 D0192 : score 2.61658 : H : ARG NH1 B0104 <- 2.99 -> DT O4 D0193 : score 3.14377 : H : ARG NH2 B0104 <- 2.76 -> DA N7 D0192 : score 1.68517 : x : THR xxxx B0106 <- 3.11 -> DT xxx D0191 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0108 <- 4.20 -> DG xxx D0189 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0162 <- 4.15 -> DG xxx C0177 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0171 <- 3.63 -> DC xxx D0187 : score x.xxxxx >2h3c_A: title=STRUCTURAL BASIS FOR NUCLEIC ACID AND TOXIN RECOGNITION OF THE BACTERIAL ANTITOXIN CCDA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0004 <- 2.96 -> DG N7 D0190 : score 5.8564 : H : ARG NH1 A0004 <- 3.30 -> DG O6 D0190 : score 5.475 : H : ARG NH1 A0004 <- 2.72 -> DT O4 D0191 : score 3.32024 : x : THR xxxx A0006 <- 3.24 -> DT xxx C0178 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0008 <- 3.82 -> DT xxx C0176 : score x.xxxxx >2h3c_AB: title=STRUCTURAL BASIS FOR NUCLEIC ACID AND TOXIN RECOGNITION OF THE BACTERIAL ANTITOXIN CCDA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0004 <- 2.96 -> DG N7 D0190 : score 5.8564 : H : ARG NH1 A0004 <- 3.30 -> DG O6 D0190 : score 5.475 : H : ARG NH1 A0004 <- 2.72 -> DT O4 D0191 : score 3.32024 : x : THR xxxx A0006 <- 3.24 -> DT xxx C0178 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0008 <- 3.82 -> DT xxx C0176 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0104 <- 2.88 -> DG xxx C0177 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 2.72 -> DT xxx D0191 : score x.xxxxx >2h7f_X:DNA_breaking-rejoining_enzymes;DNA_topoisomerase_I_domain; title=STRUCTURE OF VARIOLA TOPOISOMERASE COVALENTLY BOUND TO DNA organism=Variola virus : H : GLN OE1 X0069 <- 2.98 -> DA N6 Z0520 : score 5.83467 : H : GLN NE2 X0069 <- 3.45 -> DA N7 Z0520 : score 5.29808 : H : LYS NZ X0133 <- 2.99 -> DG N7 Z0523 : score 5.18123 : H : LYS NZ X0133 <- 2.96 -> DG O6 Z0523 : score 5.59578 : H : TYR OH X0136 <- 3.00 -> DG N7 Z0522 : score 4.11569 : H : LYS NZ X0167 <- 2.80 -> DT O2 Y0511 : score 3.58718 : H : ARG NH2 X0206 <- 2.93 -> DG N7 Y0503 : score 6.21862 : H : ARG NH2 X0206 <- 3.01 -> DG O6 Y0503 : score 6.3228 : x : ARG xxxx X0067 <- 3.97 -> DA xxx Z0520 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx X0070 <- 3.65 -> DC xxx Y0508 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx X0072 <- 3.50 -> DC xxx Y0509 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0080 <- 3.49 -> DT xxx Y0511 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx X0209 <- 3.78 -> DG xxx Z0523 : score x.xxxxx >2h7g_X:DNA_breaking-rejoining_enzymes;DNA_topoisomerase_I_domain; title=STRUCTURE OF VARIOLA TOPOISOMERASE NON-COVALENTLY BOUND TO DNA organism=Variola virus : H : GLN OE1 X0069 <- 2.86 -> DA N6 Z0520 : score 5.97993 : H : GLN NE2 X0069 <- 3.08 -> DA N7 Z0520 : score 5.74872 : w : GLN OE1 X0069 <- 5.72 -> DT O4 Y0510 : score 3.068 : w : GLN OE1 X0069 <- 5.89 -> DA N6 Z0519 : score 3.392 : H : LYS NZ X0133 <- 2.98 -> DG N7 Z0523 : score 5.19201 : H : LYS NZ X0135 <- 3.06 -> DG N7 Y0506 : score 5.10583 : H : TYR OH X0136 <- 2.84 -> DG N7 Z0522 : score 4.25288 : H : LYS NZ X0167 <- 2.83 -> DT O2 Y0511 : score 3.56566 : w : ASP OD2 X0168 <- 5.54 -> DA N3 Z0519 : score 1.331 : w : GLU OE1 X0205 <- 5.33 -> DC N4 Y0505 : score 3.528 : H : ARG NH2 X0206 <- 2.63 -> DG O6 Y0503 : score 6.8244 : x : ARG xxxx X0067 <- 4.01 -> DA xxx Z0520 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx X0070 <- 3.52 -> DC xxx Y0508 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx X0072 <- 3.34 -> DT xxx Y0510 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0080 <- 3.23 -> DT xxx Y0511 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx X0209 <- 3.61 -> DG xxx Z0523 : score x.xxxxx >2h7h_A:Leucine_zipper_domain;A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE JUN BZIP HOMODIMER COMPLEXED WITH AP-1 DNA organism=Avian sarcoma virus : w : ASN OD1 A0009 <- 5.77 -> DA N7 Y0206 : score 2.277 : V : ALA CB A0013 <- 3.53 -> DT C7 X0211 : score 5.97691 : x : ALA xxxx A0012 <- 3.91 -> DT xxx Y0207 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0016 <- 4.43 -> DT xxx Y0207 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0017 <- 2.55 -> DC xxx X0210 : score x.xxxxx >2h7h_AB:Leucine_zipper_domain;A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE JUN BZIP HOMODIMER COMPLEXED WITH AP-1 DNA organism=Avian sarcoma virus : w : ASN OD1 A0009 <- 5.77 -> DA N7 Y0206 : score 2.277 : w : ASN OD1 B0009 <- 5.69 -> DA N7 X0206 : score 2.277 : H : ARG NH2 B0017 <- 3.09 -> DG N7 Y0210 : score 6.01431 A : H : ARG NH2 B0017 <- 2.64 -> DG O6 Y0210 : score 6.8112 A : V : ALA CB B0013 <- 3.59 -> DT C7 Y0211 : score 5.89292 : V : ALA CB A0013 <- 3.53 -> DT C7 X0211 : score 5.97691 : x : ALA xxxx A0012 <- 3.91 -> DT xxx Y0207 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0016 <- 4.43 -> DT xxx Y0207 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0017 <- 2.55 -> DC xxx X0210 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0012 <- 3.93 -> DT xxx X0207 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0016 <- 4.03 -> DT xxx X0207 : score x.xxxxx >2h8c_B:Holliday_junction_resolvase_RusA; title=STRUCTURE OF RUSA D70N IN COMPLEX WITH DNA organism=Escherichia coli : x : ARG xxxx B0067 <- 3.79 -> DG xxx X0005 : score x.xxxxx >2h8r_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 1B BOUND TO DNA: MODY5 GENE PRODUCT organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 A0147 <- 2.75 -> DA N6 E0012 : score 6.11309 : H : SER OG A0148 <- 2.83 -> DA N6 F0009 : score 3.27001 : H : GLN NE2 B0147 <- 3.40 -> DA N7 F0013 : score 5.35897 : H : ASN OD1 B0302 <- 2.97 -> DA N6 E0016 : score 5.81705 : H : LYS NZ B0305 <- 2.63 -> DG N7 F0005 : score 5.56902 : V : THR CG2 B0158 <- 3.89 -> DT C7 E0006 : score 4.14159 : x : ASN xxxx A0146 <- 3.05 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0149 <- 4.22 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0151 <- 3.77 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0152 <- 3.87 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0158 <- 4.34 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0235 <- 3.34 -> DA xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0297 <- 3.79 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0298 <- 3.91 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0302 <- 3.32 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0305 <- 2.72 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0146 <- 3.37 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0148 <- 3.35 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0149 <- 3.81 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0151 <- 3.70 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0152 <- 4.22 -> DT xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0235 <- 3.45 -> DA xxx F0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0297 <- 3.05 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx >2h8r_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 1B BOUND TO DNA: MODY5 GENE PRODUCT organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 B0147 <- 3.40 -> DA N7 F0013 : score 5.35897 : H : ASN OD1 B0302 <- 2.97 -> DA N6 E0016 : score 5.81705 : H : LYS NZ B0305 <- 2.63 -> DG N7 F0005 : score 5.56902 : V : THR CG2 B0158 <- 3.89 -> DT C7 E0006 : score 4.14159 : x : ASN xxxx B0146 <- 3.37 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0148 <- 3.35 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0149 <- 3.81 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0151 <- 3.70 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0152 <- 4.22 -> DT xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0235 <- 3.45 -> DA xxx F0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0297 <- 3.05 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx >2han_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS OF HETERODIMERIC ECDYSTEROID RECEPTOR INTERACTION WITH NATURAL RESPONSE ELEMENT HSP27 GENE PROMOTER organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : GLU OE1 A0025 <- 2.86 -> DA N6 D0015 : score 2.64987 : w : GLU OE1 A0025 <- 5.84 -> DA N6 D0014 : score 2.939 : H : LYS NZ A0028 <- 2.63 -> DG O6 C0006 : score 5.97732 : w : LYS NZ A0028 <- 5.51 -> DG N7 C0005 : score 2.519 : w : LYS NZ A0032 <- 5.17 -> DT O4 C0008 : score 1.7 : H : ARG NH1 A0033 <- 2.98 -> DG N7 D0013 : score 5.8322 : w : ARG NH1 A0033 <- 5.62 -> DG O6 D0013 : score 2.756 : x : ARG xxxx A0081 <- 3.78 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx >2han_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS OF HETERODIMERIC ECDYSTEROID RECEPTOR INTERACTION WITH NATURAL RESPONSE ELEMENT HSP27 GENE PROMOTER organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : GLU OE1 A0025 <- 2.86 -> DA N6 D0015 : score 2.64987 : w : GLU OE1 A0025 <- 5.84 -> DA N6 D0014 : score 2.939 : H : LYS NZ A0028 <- 2.63 -> DG O6 C0006 : score 5.97732 : w : LYS NZ A0028 <- 5.51 -> DG N7 C0005 : score 2.519 : w : LYS NZ A0032 <- 5.17 -> DT O4 C0008 : score 1.7 : H : ARG NH1 A0033 <- 2.98 -> DG N7 D0013 : score 5.8322 : H : GLU OE1 B0025 <- 3.26 -> DA N6 C0015 : score 2.4353 : w : GLU OE1 B0025 <- 5.99 -> DC N4 C0014 : score 3.528 : H : LYS NZ B0028 <- 2.72 -> DG O6 D0006 : score 5.87326 : w : LYS NZ B0028 <- 5.48 -> DA N7 D0005 : score 1.655 : w : ARG NE B0033 <- 5.24 -> DG N7 C0013 : score 1.593 : V : ARG CZ B0032 <- 3.63 -> DT C7 D0007 : score 2.22293 A : x : ARG xxxx A0081 <- 3.78 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0057 <- 4.38 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx >2han_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS OF HETERODIMERIC ECDYSTEROID RECEPTOR INTERACTION WITH NATURAL RESPONSE ELEMENT HSP27 GENE PROMOTER organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : GLU OE1 B0025 <- 3.26 -> DA N6 C0015 : score 2.4353 : w : GLU OE1 B0025 <- 5.99 -> DC N4 C0014 : score 3.528 : H : LYS NZ B0028 <- 2.72 -> DG O6 D0006 : score 5.87326 : w : LYS NZ B0028 <- 5.48 -> DA N7 D0005 : score 1.655 : w : ARG NE B0033 <- 5.24 -> DG N7 C0013 : score 1.593 : V : ARG CZ B0032 <- 3.63 -> DT C7 D0007 : score 2.22293 A : x : ARG xxxx B0057 <- 4.38 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx >2hap_CD:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain;Leucine_zipper_domain; title=STRUCTURE OF A HAP1-18/DNA COMPLEX REVEALS THAT PROTEIN/DNA INTERACTIONS CAN HAVE DIRECT ALLOSTERIC EFFECTS ON TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ C0071 <- 3.40 -> DG N7 A0012 : score 4.73959 : H : ARG NH1 D0057 <- 2.54 -> DT O2 B0012 : score 4.53034 : H : ARG NH2 D0057 <- 2.83 -> DT O2 B0012 : score 4.20793 : H : ARG NH1 D0059 <- 2.82 -> DT O2 A0008 : score 4.28918 : H : ARG NH1 D0059 <- 2.87 -> DA N3 B0014 : score 3.6305 : H : ARG NH2 D0059 <- 2.77 -> DT O2 A0008 : score 4.25873 : H : ARG NH1 D0063 <- 2.79 -> DG N7 B0017 : score 6.0621 : V : VAL CG1 C0072 <- 3.70 -> DT C7 A0010 : score 6.21203 : x : ARG xxxx C0063 <- 4.01 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0070 <- 4.26 -> DA xxx A0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0071 <- 3.27 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0072 <- 3.45 -> DA xxx A0001 : score x.xxxxx >2hap_D:Leucine_zipper_domain;Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF A HAP1-18/DNA COMPLEX REVEALS THAT PROTEIN/DNA INTERACTIONS CAN HAVE DIRECT ALLOSTERIC EFFECTS ON TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NH1 D0057 <- 2.54 -> DT O2 B0012 : score 4.53034 : H : ARG NH2 D0057 <- 2.83 -> DT O2 B0012 : score 4.20793 : H : ARG NH1 D0059 <- 2.82 -> DT O2 A0008 : score 4.28918 : H : ARG NH1 D0059 <- 2.87 -> DA N3 B0014 : score 3.6305 : H : ARG NH2 D0059 <- 2.77 -> DT O2 A0008 : score 4.25873 : H : ARG NH1 D0063 <- 2.79 -> DG N7 B0017 : score 6.0621 : x : ARG xxxx D0070 <- 4.26 -> DA xxx A0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0071 <- 3.27 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0072 <- 3.45 -> DA xxx A0001 : score x.xxxxx >2hax_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS CALDOLYTICUS COLD SHOCK PROTEIN IN COMPLEX WITH HEXATHYMIDINE organism=BACILLUS CALDOLYTICUS : H : GLN NE2 A0059 <- 3.00 -> DT O2 D0003 : score 3.776 : H : GLN NE2 A0059 <- 3.06 -> DT O4 D0004 : score 4.92109 : H : LYS NZ B0007 <- 3.00 -> DT O2 D0005 : score 3.44369 : H : TRP NE1 B0008 <- 3.19 -> DT O2 D0005 : score 5.73058 : H : ASN ND2 B0010 <- 2.71 -> DT O4 D0006 : score 5.37974 : H : ASP OD2 B0025 <- 2.85 -> DT N3 D0005 : score 3.55131 >2hax_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS CALDOLYTICUS COLD SHOCK PROTEIN IN COMPLEX WITH HEXATHYMIDINE organism=BACILLUS CALDOLYTICUS : H : LYS NZ B0007 <- 3.00 -> DT O2 D0005 : score 3.44369 : H : TRP NE1 B0008 <- 3.19 -> DT O2 D0005 : score 5.73058 : H : ASN ND2 B0010 <- 2.71 -> DT O4 D0006 : score 5.37974 : H : ASP OD2 B0025 <- 2.85 -> DT N3 D0005 : score 3.55131 >2hdc_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF TRANSCRIPTION FACTOR GENESIS/DNA COMPLEX organism=RATTUS NORVEGICUS : H : ARG NH1 A0052 <- 2.59 -> DG N7 C0354 : score 6.3041 : H : HIS NE2 A0053 <- 2.97 -> DA N7 B0256 : score 4.10178 : H : ARG NE A0098 <- 3.04 -> DA N3 B0254 : score 2.00164 : H : ARG NH2 A0098 <- 2.76 -> DA N3 B0254 : score 3.26566 : x : GLN xxxx A0048 <- 3.29 -> DG xxx C0354 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0049 <- 2.64 -> DA xxx B0259 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0050 <- 3.23 -> DT xxx B0257 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0054 <- 2.95 -> DT xxx B0257 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0056 <- 4.50 -> DT xxx C0356 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0066 <- 3.86 -> DT xxx C0352 : score x.xxxxx >2hdd_A:Homeodomain-like; title=ENGRAILED HOMEODOMAIN Q50K VARIANT DNA COMPLEX organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 A0005 <- 2.54 -> DT O2 C0011 : score 4.53034 : H : ARG NH2 A0005 <- 2.56 -> DT O2 C0011 : score 4.43653 : w : LYS NZ A0046 <- 6.07 -> DG O6 D0028 : score 3.005 : H : LYS NZ A0050 <- 2.76 -> DG O6 D0029 : score 5.82702 A : w : LYS NZ A0050 <- 6.69 -> DG O6 D0028 : score 3.005 A : H : ASN OD1 A0051 <- 3.09 -> DA N6 C0013 : score 5.67253 : H : ASN ND2 A0051 <- 3.04 -> DA N7 C0013 : score 5.58873 : w : ASN OD1 A0051 <- 6.12 -> DA N6 D0030 : score 2.837 : x : ILE xxxx A0047 <- 3.58 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx >2hdd_AB:Homeodomain-like; title=ENGRAILED HOMEODOMAIN Q50K VARIANT DNA COMPLEX organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 A0005 <- 2.54 -> DT O2 C0011 : score 4.53034 : H : ARG NH2 A0005 <- 2.56 -> DT O2 C0011 : score 4.43653 : w : LYS NZ A0046 <- 6.07 -> DG O6 D0028 : score 3.005 : H : LYS NZ A0050 <- 2.76 -> DG O6 D0029 : score 5.82702 A : w : LYS NZ A0050 <- 6.69 -> DG O6 D0028 : score 3.005 A : H : ASN OD1 A0051 <- 3.09 -> DA N6 C0013 : score 5.67253 : H : ASN ND2 A0051 <- 3.04 -> DA N7 C0013 : score 5.58873 : w : ASN OD1 A0051 <- 6.12 -> DA N6 D0030 : score 2.837 : H : LYS NZ B0050 <- 2.76 -> DG O6 C0020 : score 5.82702 : w : LYS NZ B0050 <- 5.28 -> DG N7 C0020 : score 2.519 : w : LYS NZ B0050 <- 5.51 -> DT O4 D0023 : score 1.7 : w : ASN OD1 B0051 <- 6.41 -> DA N6 C0021 : score 2.837 : w : ASN OD1 B0051 <- 5.10 -> DT O4 D0023 : score 3.132 : x : ILE xxxx A0047 <- 3.58 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0047 <- 3.70 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >2heo_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=GENERAL STRUCTURE-BASED APPROACH TO THE DESIGN OF PROTEIN LIGANDS: APPLICATION TO THE DESIGN OF KV1.2 POTASSIUM CHANNEL BLOCKERS. organism=Mus musculus : x : TYR xxxx D0150 <- 3.48 -> DG xxx E0204 : score x.xxxxx >2hhq_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=O6-METHYL-GUANINE:T PAIR IN THE POLYMERASE-10 BASEPAIR POSITION organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.85 -> DC O2 B0031 : score 2.91669 : w : LYS NZ A0582 <- 5.48 -> DT O2 B0030 : score 0.522 : w : LYS NZ A0582 <- 5.64 -> DA N3 C0008 : score 1.538 : w : THR OG1 A0586 <- 5.43 -> DA N3 C0008 : score 2.845 : w : TYR OH A0587 <- 5.82 -> DG N2 C0007 : score 2.834 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.95 -> DG N3 B0034 : score 2.96099 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.85 -> DC O2 C0005 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.63 -> DT O2 C0006 : score 1.666 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.05 -> DA N3 B0032 : score 3.61731 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.70 -> DG N3 C0007 : score 2.566 : H : ARG NH2 A0629 <- 3.09 -> DG N7 B0034 : score 6.01431 : x : TYR xxxx A0714 <- 3.02 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.52 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.18 -> DG xxx B0033 : score x.xxxxx >2hhs_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=O6-METHYL:C PAIR IN THE POLYMERASE-10 BASEPAIR POSITION organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.78 -> DC O2 B0031 : score 2.95794 : w : LYS NZ A0582 <- 5.45 -> DT O2 B0030 : score 0.522 : w : LYS NZ A0582 <- 5.54 -> DA N3 C0008 : score 1.538 : w : THR OG1 A0586 <- 5.41 -> DA N3 C0008 : score 2.845 : H : ARG NH1 A0615 <- 3.20 -> DG N3 B0034 : score 2.80836 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.53 -> DC O2 C0005 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.60 -> DT O2 C0006 : score 1.666 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.06 -> DA N3 B0032 : score 3.60969 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.74 -> DG N3 C0007 : score 2.566 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.43 -> DA xxx B0032 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0710 <- 3.77 -> DG xxx B0034 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.15 -> DG xxx B0034 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 4.25 -> DG xxx B0034 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.50 -> DG xxx B0033 : score x.xxxxx >2hht_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=C:O6-METHYL-GUANINE PAIR IN THE POLYMERASE-2 BASEPAIR POSITION organism=Geobacillus stearothermophilus : w : TYR OH A0587 <- 5.65 -> DG N2 C0009 : score 2.834 : H : ARG NH1 A0615 <- 3.00 -> DG N3 B0030 : score 2.93046 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.65 -> DA N3 C0008 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.09 -> DT O2 B0028 : score 4.47088 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.44 -> DG N3 C0009 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.72 -> DC O2 B0029 : score 3.208 : x : LYS xxxx A0582 <- 3.34 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0629 <- 3.19 -> DG xxx B0030 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.34 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.53 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >2hhu_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=C:O6-METHYL-GUANINE IN THE POLYMERASE POSTINSERTION SITE (-1 BASEPAIR POSITION) organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 3.01 -> DG N3 B0026 : score 1.39278 : w : LYS NZ A0582 <- 6.14 -> DA N3 B0025 : score 1.538 : w : LYS NZ A0582 <- 5.42 -> DT O2 C0010 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 5.29 -> DT O2 C0010 : score 2.522 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.74 -> DC O2 B0029 : score 3.6938 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.04 -> DC O2 B0029 : score 3.52118 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.83 -> DG N3 C0007 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.85 -> DG N3 C0008 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.05 -> DC O2 B0027 : score 4.25551 : w : ASN ND2 A0625 <- 6.10 -> DC O2 C0009 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0724 <- 5.63 -> DC N4 C0005 : score 2.395 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.66 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.41 -> DC xxx B0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0710 <- 4.27 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.77 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 3.46 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0717 <- 3.63 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0721 <- 3.74 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >2hhv_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=T:O6-METHYL-GUANINE IN THE POLYMERASE-2 BASEPAIR POSITION organism=Geobacillus stearothermophilus : w : LYS NZ A0582 <- 6.28 -> DG N2 C0009 : score 0.846 : w : TYR OH A0587 <- 5.32 -> DG N2 C0009 : score 2.834 : H : ARG NH1 A0615 <- 3.01 -> DG N3 B0030 : score 2.92436 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.90 -> DA N3 C0008 : score 2.277 : w : ASN ND2 A0622 <- 6.09 -> DG N3 C0009 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.90 -> DT O2 B0028 : score 4.65123 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.35 -> DG N3 C0009 : score 2.566 : H : ARG NH2 A0629 <- 3.05 -> DG N7 B0030 : score 6.06538 : w : GLU OE1 A0658 <- 6.27 -> DC O2 C0006 : score 2.68 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.32 -> DC O2 C0006 : score 1.885 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.21 -> DC O2 C0006 : score 2.699 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.76 -> DT O2 B0029 : score 3.682 : x : TYR xxxx A0714 <- 3.27 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >2hhx_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=O6-METHYL-GUANINE IN THE POLYMERASE TEMPLATE PREINSERTION SITE organism=Geobacillus stearothermophilus : w : LYS NZ A0582 <- 5.70 -> DA N3 B0025 : score 1.538 : w : LYS NZ A0582 <- 5.42 -> DT O2 C0008 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 5.76 -> DT O2 C0008 : score 2.522 : H : ARG NH2 A0615 <- 2.74 -> DG N3 B0029 : score 3.65358 : w : ARG NE A0615 <- 6.14 -> DG N3 C0005 : score 1.082 : w : ARG NH2 A0615 <- 5.93 -> DG N3 C0005 : score 0.677 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.99 -> DT O2 B0027 : score 4.5658 : H : ARG NH2 A0629 <- 2.88 -> DG N7 B0029 : score 6.28246 : w : GLU OE2 A0658 <- 6.00 -> DC O2 C0004 : score 1.988 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.45 -> DC O2 C0004 : score 1.885 : w : GLN OE1 A0797 <- 6.29 -> DC O2 C0004 : score 1.091 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.61 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0714 <- 3.35 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx >2hmi_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE/FRAGMENT OF FAB 28/DNA COMPLEX organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.90 -> DG xxx E0804 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0183 <- 3.47 -> DC xxx F0837 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.28 -> DA xxx F0838 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0258 <- 4.16 -> DG xxx F0833 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0266 <- 4.15 -> DG xxx F0835 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.49 -> DG xxx E0817 : score x.xxxxx >2hof_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PRE-CLEAVAGE SYNAPTIC COMPLEX IN THE CRE- LOXP SITE-SPECIFIC RECOMBINATION organism=Enterobacteria phage P1 : H : MET SD A0044 <- 3.38 -> DA N6 D0012 : score 5.28247 : H : LYS NZ A0086 <- 2.83 -> DA N7 D0015 : score 2.91956 : H : GLN NE2 A0090 <- 2.70 -> DT O4 C0023 : score 5.29485 : H : GLN NE2 A0090 <- 3.24 -> DT O4 D0013 : score 4.73422 : w : ARG NH2 A0241 <- 5.58 -> DA N3 D0005 : score 2.092 : w : ARG NH1 A0243 <- 5.36 -> DT O2 C0033 : score 1.855 : H : LYS NZ A0244 <- 2.96 -> DT O2 C0035 : score 3.47239 : H : LYS NZ A0244 <- 2.59 -> DT O2 D0003 : score 3.73784 : H : ARG NE A0259 <- 2.88 -> DG O6 C0028 : score 3.87797 : H : ARG NH2 A0259 <- 2.85 -> DG N7 C0028 : score 6.32077 : w : GLU OE1 A0262 <- 5.82 -> DC N4 C0027 : score 3.528 : H : ARG NH1 A0282 <- 3.27 -> DA N3 D0012 : score 3.33594 : H : ARG NH2 A0282 <- 2.83 -> DA N3 D0012 : score 3.22031 : x : HIS xxxx A0040 <- 3.51 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.71 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0043 <- 3.49 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.92 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.51 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 3.53 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.74 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0320 <- 3.73 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx >2hof_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PRE-CLEAVAGE SYNAPTIC COMPLEX IN THE CRE- LOXP SITE-SPECIFIC RECOMBINATION organism=Enterobacteria phage P1 : H : MET SD A0044 <- 3.38 -> DA N6 D0012 : score 5.28247 : H : LYS NZ A0086 <- 2.83 -> DA N7 D0015 : score 2.91956 : H : GLN NE2 A0090 <- 2.70 -> DT O4 C0023 : score 5.29485 : H : GLN NE2 A0090 <- 3.24 -> DT O4 D0013 : score 4.73422 : w : ARG NH2 A0241 <- 5.58 -> DA N3 D0005 : score 2.092 : w : ARG NH1 A0243 <- 5.36 -> DT O2 C0033 : score 1.855 : H : LYS NZ A0244 <- 2.96 -> DT O2 C0035 : score 3.47239 : H : LYS NZ A0244 <- 2.59 -> DT O2 D0003 : score 3.73784 : H : ARG NE A0259 <- 2.88 -> DG O6 C0028 : score 3.87797 : H : ARG NH2 A0259 <- 2.85 -> DG N7 C0028 : score 6.32077 : w : GLU OE1 A0262 <- 5.82 -> DC N4 C0027 : score 3.528 : H : ARG NH1 A0282 <- 3.27 -> DA N3 D0012 : score 3.33594 : H : ARG NH2 A0282 <- 2.83 -> DA N3 D0012 : score 3.22031 : H : LYS NZ B0043 <- 2.98 -> DG N7 C0010 : score 5.19201 : w : LYS NZ B0043 <- 5.41 -> DT O4 C0011 : score 1.7 : H : MET SD B0044 <- 3.36 -> DA N6 C0012 : score 5.30637 : H : LYS NZ B0086 <- 2.67 -> DG O6 C0015 : score 5.93107 : w : LYS NZ B0086 <- 6.00 -> DG O6 D0021 : score 3.005 : w : GLN OE1 B0089 <- 6.30 -> DG O6 D0021 : score 2.87 : H : GLN NE2 B0090 <- 2.73 -> DT O4 D0023 : score 5.2637 : H : ARG NH1 B0243 <- 2.72 -> DT O2 D0033 : score 4.37531 : w : ARG NH1 B0243 <- 6.03 -> DA N3 D0034 : score 2.585 : H : LYS NZ B0244 <- 3.04 -> DT O2 D0035 : score 3.41499 : H : ARG NE B0259 <- 2.86 -> DG O6 D0028 : score 3.89373 : H : ARG NH2 B0259 <- 2.89 -> DG N7 D0028 : score 6.26969 : w : GLU OE1 B0262 <- 5.60 -> DC N4 D0027 : score 3.528 : H : ARG NH2 B0282 <- 3.14 -> DA N3 C0012 : score 3.01944 : w : ARG NH2 B0282 <- 5.58 -> DA N3 D0026 : score 2.092 : x : HIS xxxx A0040 <- 3.51 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.71 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0043 <- 3.49 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.92 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.51 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 3.53 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.74 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0320 <- 3.73 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0040 <- 3.60 -> DT xxx D0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0041 <- 3.50 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.73 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.68 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 3.81 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0241 <- 4.16 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 3.73 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0317 <- 3.48 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx >2hoi_G:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TETRAMERIC PRE-CLEAVAGE SYNAPTIC COMPLEX IN THE CRE-LOXP SITE-SPECIFIC RECOMBINATION organism=Enterobacteria phage P1 : H : MET SD G0044 <- 3.31 -> DA N6 F0012 : score 5.36613 : H : GLN NE2 G0090 <- 2.48 -> DT O4 E0023 : score 5.52325 : H : LYS NZ G0244 <- 3.11 -> DT O2 F0003 : score 3.36477 : H : ARG NE G0259 <- 2.86 -> DG O6 E0028 : score 3.89373 : H : ARG NH2 G0259 <- 2.79 -> DG N7 E0028 : score 6.39738 : H : ARG NH2 G0282 <- 3.02 -> DA N3 F0012 : score 3.09719 : V : ILE CG1 G0320 <- 3.87 -> DT C7 F0016 : score 4.87219 : x : HIS xxxx G0040 <- 3.42 -> DT xxx E0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0041 <- 3.64 -> DT xxx E0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0043 <- 4.28 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0047 <- 3.81 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0086 <- 2.96 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0087 <- 3.48 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0094 <- 3.68 -> DT xxx E0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0241 <- 4.35 -> DA xxx F0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0257 <- 3.78 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0262 <- 3.35 -> DA xxx E0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0317 <- 3.74 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx >2hoi_GH:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TETRAMERIC PRE-CLEAVAGE SYNAPTIC COMPLEX IN THE CRE-LOXP SITE-SPECIFIC RECOMBINATION organism=Enterobacteria phage P1 : H : MET SD G0044 <- 3.31 -> DA N6 F0012 : score 5.36613 : H : GLN NE2 G0090 <- 2.48 -> DT O4 E0023 : score 5.52325 : H : LYS NZ G0244 <- 3.11 -> DT O2 F0003 : score 3.36477 : H : ARG NE G0259 <- 2.86 -> DG O6 E0028 : score 3.89373 : H : ARG NH2 G0259 <- 2.79 -> DG N7 E0028 : score 6.39738 : H : ARG NH2 G0282 <- 3.02 -> DA N3 F0012 : score 3.09719 : H : LYS NZ H0086 <- 3.10 -> DG N7 E0015 : score 5.06274 : w : LYS NZ H0086 <- 5.56 -> DC N4 E0016 : score 0.048 : H : GLN NE2 H0090 <- 3.19 -> DT O4 E0013 : score 4.78613 : H : GLN NE2 H0090 <- 2.64 -> DT O4 F0023 : score 5.35714 : w : ARG NH2 H0241 <- 5.71 -> DA N3 E0005 : score 2.092 : H : ARG NH1 H0243 <- 2.96 -> DT O2 F0033 : score 4.16861 : H : LYS NZ H0244 <- 2.79 -> DT O2 E0003 : score 3.59435 : H : LYS NZ H0244 <- 2.99 -> DT O2 F0035 : score 3.45087 : H : ARG NE H0259 <- 2.91 -> DG O6 F0028 : score 3.85432 : H : ARG NH2 H0259 <- 3.06 -> DG N7 F0028 : score 6.05262 : w : GLU OE1 H0262 <- 6.21 -> DC N4 F0027 : score 3.528 : H : ARG NH1 H0282 <- 3.24 -> DA N3 E0012 : score 3.35803 : H : ARG NH2 H0282 <- 2.91 -> DA N3 E0012 : score 3.16847 : w : ARG NH2 H0282 <- 5.55 -> DA N3 F0026 : score 2.092 : V : ASN CG H0317 <- 3.62 -> DT C7 E0018 : score 2.76737 : V : ILE CG1 G0320 <- 3.87 -> DT C7 F0016 : score 4.87219 : x : HIS xxxx G0040 <- 3.42 -> DT xxx E0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0041 <- 3.64 -> DT xxx E0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0043 <- 4.28 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0047 <- 3.81 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0086 <- 2.96 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0087 <- 3.48 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0094 <- 3.68 -> DT xxx E0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0241 <- 4.35 -> DA xxx F0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0257 <- 3.78 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0262 <- 3.35 -> DA xxx E0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0317 <- 3.74 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0040 <- 3.59 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0041 <- 3.65 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx : x : MET xxxx H0044 <- 3.36 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0047 <- 3.78 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0087 <- 3.31 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0094 <- 3.58 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0257 <- 3.90 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0260 <- 4.38 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0319 <- 3.56 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx >2hos_A:Homeodomain-like; title=PHAGE-SELECTED HOMEODOMAIN BOUND TO UNMODIFIED DNA organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 A0005 <- 2.66 -> DT O2 C0011 : score 4.42699 : H : LYS NZ A0050 <- 2.56 -> DG O6 D0029 : score 6.05825 : w : LYS NZ A0050 <- 5.39 -> DT O4 C0014 : score 1.7 : H : ASN OD1 A0051 <- 3.06 -> DA N6 C0013 : score 5.70866 : H : ASN ND2 A0051 <- 3.03 -> DA N7 C0013 : score 5.60047 : w : ASN OD1 A0051 <- 5.30 -> DT O4 C0014 : score 3.132 : w : ASN OD1 A0051 <- 6.40 -> DA N6 D0030 : score 2.837 >2hos_AB:Homeodomain-like; title=PHAGE-SELECTED HOMEODOMAIN BOUND TO UNMODIFIED DNA organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 A0005 <- 2.66 -> DT O2 C0011 : score 4.42699 : H : LYS NZ A0050 <- 2.56 -> DG O6 D0029 : score 6.05825 : w : LYS NZ A0050 <- 5.39 -> DT O4 C0014 : score 1.7 : H : ASN OD1 A0051 <- 3.06 -> DA N6 C0013 : score 5.70866 : H : ASN ND2 A0051 <- 3.03 -> DA N7 C0013 : score 5.60047 : w : ASN OD1 A0051 <- 5.30 -> DT O4 C0014 : score 3.132 : w : ASN OD1 A0051 <- 6.40 -> DA N6 D0030 : score 2.837 : H : LYS NZ B0050 <- 3.17 -> DT O4 D0023 : score 3.32173 : H : LYS NZ B0050 <- 2.48 -> DG O6 C0020 : score 6.15074 >2hot_A:Homeodomain-like; title=PHAGE SELECTED HOMEODOMAIN BOUND TO MODIFIED DNA organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH2 A0005 <- 2.53 -> DT O2 C0011 : score 4.46193 : H : LYS NZ A0050 <- 2.46 -> DG O6 D0029 : score 6.17386 : H : LYS NZ A0050 <- 3.37 -> DT O4 C0014 : score 3.17824 : H : ASN OD1 A0051 <- 3.03 -> DA N6 C0013 : score 5.74479 : H : ASN ND2 A0051 <- 3.07 -> DA N7 C0013 : score 5.55351 : w : ASN OD1 A0051 <- 6.57 -> DA N6 C0012 : score 2.837 : w : ASN OD1 A0051 <- 6.14 -> DA N6 D0030 : score 2.837 >2hot_AB:Homeodomain-like; title=PHAGE SELECTED HOMEODOMAIN BOUND TO MODIFIED DNA organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH2 A0005 <- 2.53 -> DT O2 C0011 : score 4.46193 : H : LYS NZ A0050 <- 2.46 -> DG O6 D0029 : score 6.17386 : H : LYS NZ A0050 <- 3.37 -> DT O4 C0014 : score 3.17824 : H : ASN OD1 A0051 <- 3.03 -> DA N6 C0013 : score 5.74479 : H : ASN ND2 A0051 <- 3.07 -> DA N7 C0013 : score 5.55351 : w : ASN OD1 A0051 <- 6.57 -> DA N6 C0012 : score 2.837 : w : ASN OD1 A0051 <- 6.14 -> DA N6 D0030 : score 2.837 : H : LYS NZ B0050 <- 2.68 -> DG O6 C0020 : score 5.91951 : w : LYS NZ B0050 <- 5.73 -> DG N7 C0020 : score 2.519 : w : ASN ND2 B0051 <- 5.90 -> DA N6 C0021 : score 2.5 >2hr1_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=TERNARY STRUCTURE OF WT M.HHAI C5-CYTOSINE DNA METHYLTRANSFERASE WITH UNMODIFIED DNA AND ADOHCY organism=Haemophilus parahaemolyticus : w : ARG NH2 A0228 <- 5.46 -> DA N7 D0425 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0240 <- 2.95 -> DG N7 D0426 : score 5.8685 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.87 -> DG O6 D0426 : score 6.5076 : x : ILE xxxx A0086 <- 3.38 -> DT xxx C0410 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.18 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0237 <- 3.30 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0239 <- 4.32 -> DC xxx C0407 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0254 <- 4.27 -> DC xxx D0429 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0260 <- 4.05 -> DA xxx C0405 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0296 <- 4.13 -> DT xxx C0404 : score x.xxxxx >2ht0_AB:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=IHF BOUND TO DOUBLY NICKED DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0060 <- 3.39 -> DC O2 F0036 : score 3.2193 : H : ARG NH1 B0046 <- 2.87 -> DT O2 F0044 : score 4.24612 : H : ARG NH2 B0046 <- 3.17 -> DT O2 F0044 : score 3.92007 : w : ARG NH1 B0046 <- 6.12 -> DG N3 F0045 : score 1.593 : x : ARG xxxx A0063 <- 3.39 -> DT xxx D0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0064 <- 3.90 -> DA xxx F0038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0065 <- 3.33 -> DA xxx F0037 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0066 <- 3.99 -> DA xxx F0038 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0073 <- 3.55 -> DC xxx F0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0059 <- 3.66 -> DA xxx D0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0062 <- 3.57 -> DA xxx D0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0063 <- 3.75 -> DA xxx D0028 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0064 <- 3.33 -> DA xxx D0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0065 <- 3.54 -> DT xxx E0028 : score x.xxxxx >2ht0_B:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=IHF BOUND TO DOUBLY NICKED DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 B0046 <- 2.87 -> DT O2 F0044 : score 4.24612 : H : ARG NH2 B0046 <- 3.17 -> DT O2 F0044 : score 3.92007 : w : ARG NH1 B0046 <- 6.12 -> DG N3 F0045 : score 1.593 : x : ARG xxxx B0059 <- 3.66 -> DA xxx D0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0062 <- 3.57 -> DA xxx D0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0063 <- 3.75 -> DA xxx D0028 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0064 <- 3.33 -> DA xxx D0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0065 <- 3.54 -> DT xxx E0028 : score x.xxxxx >2hvh_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DDCTP:O6MEG PAIR IN THE POLYMERASE ACTIVE SITE (0 POSITION) organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.54 -> DT O2 F0008 : score 3.77371 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.95 -> DG N3 F0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.57 -> DA N3 F0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.61 -> DT O2 E0027 : score 4.92651 : w : GLU OE1 D0658 <- 5.85 -> DC O2 F0004 : score 2.68 : w : ASN ND2 D0793 <- 5.91 -> DC O2 F0004 : score 1.885 : w : GLN NE2 D0797 <- 5.74 -> DC O2 F0004 : score 2.699 : x : TYR xxxx D0587 <- 4.43 -> DT xxx E0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0629 <- 3.93 -> DC xxx E0028 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0829 <- 4.12 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx >2hvi_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DDCTP:G PAIR IN THE POLYMERASE ACTIVE SITE (0 POSITION) organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.66 -> DT O2 C0008 : score 3.68762 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.68 -> DG N3 C0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.71 -> DA N3 C0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.18 -> DT O2 B0027 : score 4.38545 : w : GLU OE2 A0658 <- 6.20 -> DC O2 C0004 : score 1.988 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.39 -> DC O2 C0004 : score 1.885 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.16 -> DC O2 C0004 : score 2.699 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.55 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : ARG xxxx A0629 <- 3.87 -> DC xxx B0028 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0707 <- 4.00 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0710 <- 3.99 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.22 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 4.10 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx >2hvs_AB:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain; title=STRUCTURE OF T4 RNA LIGASE 2 WITH NICKED 5'-ADENYLATED NUCLEIC ACID DUPLEX CONTAINING A 2'-DEOXYRIBONUCLEOTIDE AT THE NICK organism=Enterobacteria phage T4 : H : LYS NZ B0314 <- 3.14 -> DT O4 E0248 : score 3.34325 : x : VAL xxxx B0290 <- 3.88 -> DA xxx C0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0291 <- 3.44 -> DT xxx E0248 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0294 <- 4.06 -> DT xxx E0248 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0318 <- 3.33 -> DA xxx C0001 : score x.xxxxx >2hvs_B:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain; title=STRUCTURE OF T4 RNA LIGASE 2 WITH NICKED 5'-ADENYLATED NUCLEIC ACID DUPLEX CONTAINING A 2'-DEOXYRIBONUCLEOTIDE AT THE NICK organism=Enterobacteria phage T4 : H : LYS NZ B0314 <- 3.14 -> DT O4 E0248 : score 3.34325 : x : VAL xxxx B0290 <- 3.88 -> DA xxx C0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0291 <- 3.44 -> DT xxx E0248 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0294 <- 4.06 -> DT xxx E0248 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0318 <- 3.33 -> DA xxx C0001 : score x.xxxxx >2hw3_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=T:O6-METHYL-GUANINE PAIR IN THE POLYMERASE POSTINSERTION SITE (-1 BASEPAIR POSITION) organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.93 -> DG N3 B0026 : score 1.41605 : w : LYS NZ A0582 <- 5.98 -> DA N3 B0025 : score 1.538 : w : LYS NZ A0582 <- 5.90 -> DT O2 C0010 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 5.43 -> DT O2 C0010 : score 2.522 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.83 -> DT O2 B0029 : score 4.28057 : w : ARG NH1 A0615 <- 6.57 -> DA N3 C0007 : score 2.585 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.96 -> DG N3 C0008 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.97 -> DC O2 B0027 : score 4.32718 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.71 -> DC O2 C0009 : score 1.885 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.63 -> DT O2 B0028 : score 3.682 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.45 -> DC xxx B0027 : score x.xxxxx >2hzv_A:ACT-like;Ribbon-helix-helix; title=NIKR-OPERATOR DNA COMPLEX organism=Escherichia coli : H : ARG NE A0003 <- 3.21 -> DT O4 J0024 : score 1.70654 : H : ARG NH1 A0003 <- 3.21 -> DG N7 I0006 : score 5.5539 : H : ARG NH1 A0003 <- 2.60 -> DG O6 I0006 : score 6.32667 : H : THR OG1 A0005 <- 2.89 -> DT O4 I0005 : score 3.81721 : x : THR xxxx A0007 <- 3.38 -> DT xxx I0003 : score x.xxxxx >2hzv_ABCD:ACT-like;Ribbon-helix-helix; title=NIKR-OPERATOR DNA COMPLEX organism=Escherichia coli : H : ARG NE A0003 <- 3.21 -> DT O4 J0024 : score 1.70654 : H : ARG NH1 A0003 <- 3.21 -> DG N7 I0006 : score 5.5539 : H : ARG NH1 A0003 <- 2.60 -> DG O6 I0006 : score 6.32667 : H : THR OG1 A0005 <- 2.89 -> DT O4 I0005 : score 3.81721 : H : ARG NE B0003 <- 3.20 -> DT O4 I0003 : score 1.71026 : H : ARG NH1 B0003 <- 3.20 -> DG O6 I0002 : score 5.59667 : H : ARG NE C0003 <- 3.28 -> DT O4 I0024 : score 1.68051 : H : ARG NH1 C0003 <- 2.95 -> DG O6 J0006 : score 5.90083 : H : THR OG1 C0005 <- 2.83 -> DT O4 J0005 : score 3.86386 : H : ARG NE D0003 <- 3.03 -> DT O4 J0003 : score 1.77346 : H : ARG NH1 D0003 <- 3.04 -> DG O6 J0002 : score 5.79133 : x : THR xxxx A0007 <- 3.38 -> DT xxx I0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0005 <- 3.42 -> DC xxx J0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0007 <- 4.00 -> DT xxx J0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0007 <- 3.03 -> DT xxx J0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0005 <- 3.53 -> DA xxx I0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0007 <- 4.02 -> DT xxx I0024 : score x.xxxxx >2hzv_EFGH:ACT-like;Ribbon-helix-helix; title=NIKR-OPERATOR DNA COMPLEX organism=Escherichia coli : H : ARG NE E0003 <- 3.02 -> DT O4 L0024 : score 1.77718 : H : ARG NH1 E0003 <- 3.07 -> DG O6 K0006 : score 5.75483 : H : THR OG1 E0005 <- 2.60 -> DT O4 K0005 : score 4.04267 : H : ARG NE F0003 <- 3.22 -> DT O4 K0003 : score 1.70282 : H : ARG NH1 F0003 <- 2.78 -> DG O6 K0002 : score 6.10767 : H : THR OG1 F0005 <- 3.17 -> DC N4 L0025 : score 3.73487 : H : THR OG1 F0005 <- 3.28 -> DT O4 K0005 : score 3.51401 : H : ARG NE G0003 <- 3.19 -> DT O4 K0024 : score 1.71397 : H : THR OG1 G0005 <- 2.70 -> DT O4 L0005 : score 3.96492 : H : ARG NE H0003 <- 3.17 -> DT O4 L0003 : score 1.72141 : H : ARG NH1 H0003 <- 2.70 -> DG O6 L0002 : score 6.205 : H : THR OG1 H0005 <- 3.22 -> DC N4 K0025 : score 3.69453 : x : THR xxxx E0007 <- 3.32 -> DT xxx K0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0007 <- 4.03 -> DT xxx L0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0007 <- 3.10 -> DT xxx L0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0007 <- 4.17 -> DG xxx K0023 : score x.xxxxx >2i05_A:Replication_terminator_protein_Tus; title=ESCHERICHIA COLI REPLICATION TERMINATOR PROTEIN (TUS) COMPLEXED WITH TERA DNA organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0089 <- 2.73 -> DT O2 C0332 : score 3.6374 : H : LYS NZ A0175 <- 3.02 -> DT O4 C0337 : score 3.42934 : H : ARG NH2 A0232 <- 3.05 -> DG N7 C0333 : score 6.06538 : H : ARG NH2 A0232 <- 3.12 -> DG O6 C0333 : score 6.1776 : w : GLN NE2 A0237 <- 5.74 -> DG O6 C0336 : score 2.87 : H : GLN OE1 A0250 <- 3.15 -> DA N6 B0312 : score 5.62888 : H : GLN OE1 A0252 <- 2.78 -> DA N6 C0338 : score 6.07677 : V : ALA CB A0173 <- 3.79 -> DT C7 B0314 : score 5.61297 : x : ARG xxxx A0093 <- 4.03 -> DT xxx C0335 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0136 <- 4.25 -> DT xxx B0322 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0153 <- 4.06 -> DG xxx C0333 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0177 <- 3.84 -> DT xxx C0334 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0178 <- 3.76 -> DC xxx B0317 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0198 <- 3.11 -> DA xxx C0328 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0234 <- 3.97 -> DT xxx C0334 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0239 <- 4.48 -> DG xxx B0313 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 3.45 -> DA xxx B0312 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0254 <- 4.40 -> DG xxx C0336 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0288 <- 3.79 -> DA xxx B0312 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0289 <- 3.04 -> DT xxx C0341 : score x.xxxxx >2i06_A:Replication_terminator_protein_Tus; title=ESCHERICHIA COLI REPLICATION TERMINATOR PROTEIN (TUS) COMPLEXED WITH DNA- LOCKED FORM organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0089 <- 2.87 -> DT O2 C0332 : score 3.53696 : H : LYS NZ A0175 <- 3.00 -> DT O4 C0337 : score 3.44369 : w : LYS NZ A0175 <- 5.68 -> DG N7 C0336 : score 2.519 : H : ARG NH2 A0232 <- 2.87 -> DG N7 C0333 : score 6.29523 : H : ARG NH2 A0232 <- 3.17 -> DG O6 C0333 : score 6.1116 : w : GLN OE1 A0237 <- 5.40 -> DG N7 C0336 : score 2.87 : w : GLN NE2 A0237 <- 5.68 -> DG O6 C0336 : score 2.87 : H : GLN NE2 A0250 <- 2.89 -> DA N7 B0312 : score 5.98013 : H : GLN OE1 A0252 <- 2.91 -> DA N6 C0338 : score 5.91941 : H : GLN NE2 A0252 <- 3.32 -> DT O4 B0314 : score 4.65116 : V : ALA CB A0173 <- 3.61 -> DT C7 B0314 : score 5.86493 : V : VAL CG1 A0234 <- 3.76 -> DT C7 C0335 : score 6.12112 : x : ARG xxxx A0093 <- 3.53 -> DT xxx C0335 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0136 <- 4.36 -> DT xxx B0322 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0153 <- 3.92 -> DG xxx C0333 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0177 <- 3.42 -> DT xxx C0334 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0178 <- 3.81 -> DC xxx B0317 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0239 <- 4.36 -> DG xxx B0313 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 3.54 -> DA xxx B0312 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0288 <- 4.45 -> DA xxx B0312 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0289 <- 3.08 -> DT xxx C0341 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0291 <- 4.43 -> DT xxx B0314 : score x.xxxxx >2i0q_A:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TELOMERE SINGLE-STRAND DNA-PROTEIN COMPLEX FROM O. NOVA WITH FULL-LENGTH ALPHA AND BETA TELOMERE PROTEINS organism=STERKIELLA NOVA : H : TYR OH A0072 <- 2.61 -> DT O4 D0012 : score 3.63566 : H : LYS NZ A0077 <- 2.77 -> DG O6 D0007 : score 5.81545 : H : GLN OE1 A0135 <- 2.98 -> DG N2 D0006 : score 5.40582 : H : GLN NE2 A0135 <- 3.13 -> DG N3 D0006 : score 4.64725 : H : ASP OD1 A0223 <- 3.14 -> DG N2 D0008 : score 4.7998 : H : ASP OD2 A0223 <- 3.03 -> DG N2 D0007 : score 5.20786 : H : ASP OD2 A0225 <- 2.82 -> DG N2 D0007 : score 5.43714 : H : ARG NE A0274 <- 2.78 -> DG O6 D0008 : score 3.95679 : x : ASP xxxx A0060 <- 3.85 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0062 <- 3.36 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0063 <- 3.43 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0065 <- 3.65 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0066 <- 3.57 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0107 <- 3.74 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0112 <- 3.68 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0114 <- 3.91 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 4.37 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0130 <- 3.43 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0237 <- 4.32 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0239 <- 3.20 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 3.49 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0258 <- 4.06 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0260 <- 3.80 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0261 <- 4.27 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0263 <- 4.38 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0272 <- 3.63 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0275 <- 3.25 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0291 <- 4.39 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0292 <- 3.41 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0293 <- 3.02 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx >2i0q_AB:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TELOMERE SINGLE-STRAND DNA-PROTEIN COMPLEX FROM O. NOVA WITH FULL-LENGTH ALPHA AND BETA TELOMERE PROTEINS organism=STERKIELLA NOVA : H : TYR OH A0072 <- 2.61 -> DT O4 D0012 : score 3.63566 : H : LYS NZ A0077 <- 2.77 -> DG O6 D0007 : score 5.81545 : H : GLN OE1 A0135 <- 2.98 -> DG N2 D0006 : score 5.40582 : H : GLN NE2 A0135 <- 3.13 -> DG N3 D0006 : score 4.64725 : H : ASP OD1 A0223 <- 3.14 -> DG N2 D0008 : score 4.7998 : H : ASP OD2 A0223 <- 3.03 -> DG N2 D0007 : score 5.20786 : H : ASP OD2 A0225 <- 2.82 -> DG N2 D0007 : score 5.43714 : H : ARG NE A0274 <- 2.78 -> DG O6 D0008 : score 3.95679 : H : GLU OE2 B0045 <- 2.89 -> DG N2 D0013 : score 4.23267 : H : LYS NZ B0145 <- 2.85 -> DG N7 D0014 : score 5.33204 : x : ASP xxxx A0060 <- 3.85 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0062 <- 3.36 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0063 <- 3.43 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0065 <- 3.65 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0066 <- 3.57 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0107 <- 3.74 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0112 <- 3.68 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0114 <- 3.91 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 4.37 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0130 <- 3.43 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0237 <- 4.32 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0239 <- 3.20 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 3.49 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0258 <- 4.06 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0260 <- 3.80 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0261 <- 4.27 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0263 <- 4.38 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0272 <- 3.63 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0275 <- 3.25 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0291 <- 4.39 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0292 <- 3.41 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0293 <- 3.02 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0044 <- 3.91 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0048 <- 4.25 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0049 <- 3.41 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0051 <- 3.63 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 4.01 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0106 <- 4.00 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0109 <- 3.12 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0134 <- 3.52 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0140 <- 3.38 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx >2i0q_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TELOMERE SINGLE-STRAND DNA-PROTEIN COMPLEX FROM O. NOVA WITH FULL-LENGTH ALPHA AND BETA TELOMERE PROTEINS organism=STERKIELLA NOVA : H : GLU OE2 B0045 <- 2.89 -> DG N2 D0013 : score 4.23267 : H : LYS NZ B0145 <- 2.85 -> DG N7 D0014 : score 5.33204 : x : LYS xxxx B0044 <- 3.91 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0048 <- 4.25 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0049 <- 3.41 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0051 <- 3.63 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 4.01 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0106 <- 4.00 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0109 <- 3.12 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0134 <- 3.52 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0140 <- 3.38 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx >2i13_A:C2H2_and_C2HC_zinc_fingers; title=AART, A SIX FINGER ZINC FINGER DESIGNED TO RECOGNIZE ANN TRIPLETS organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0033 <- 2.81 -> DG N7 C0021 : score 6.0379 : H : ARG NH1 A0033 <- 3.28 -> DG O6 C0021 : score 5.49933 : H : ARG NH2 A0033 <- 2.85 -> DG O6 C0021 : score 6.534 : H : ASP OD1 A0035 <- 2.95 -> DC N4 D0002 : score 5.18453 : w : ASP OD1 A0035 <- 5.65 -> DC N4 D0003 : score 2.835 : H : HIS NE2 A0036 <- 2.86 -> DG N7 C0020 : score 6.72093 : H : LYS NZ A0063 <- 2.63 -> DG N7 D0005 : score 5.56902 : w : LYS NZ A0063 <- 6.38 -> DG N7 D0006 : score 2.519 : w : ASP OD2 A0064 <- 6.35 -> DC N4 C0018 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0067 <- 2.56 -> DG O6 C0016 : score 6.37533 : w : ARG NE A0067 <- 5.02 -> DG O6 D0007 : score 1.369 : H : GLN OE1 A0089 <- 2.86 -> DA N6 C0015 : score 5.97993 : H : GLN NE2 A0089 <- 3.03 -> DA N7 C0015 : score 5.80962 : H : ASN OD1 A0092 <- 3.07 -> DA N6 C0014 : score 5.69662 : H : ASN ND2 A0092 <- 3.01 -> DA N7 C0014 : score 5.62395 : H : GLN OE1 A0117 <- 2.92 -> DA N6 C0012 : score 5.9073 : H : GLN NE2 A0117 <- 2.99 -> DA N7 C0012 : score 5.85833 : w : GLN OE1 A0117 <- 5.60 -> DT O4 D0011 : score 3.068 : H : HIS NE2 A0120 <- 2.98 -> DG O6 C0011 : score 7.66751 : H : ARG NH1 A0145 <- 2.89 -> DG N7 C0009 : score 5.9411 : H : ARG NH2 A0145 <- 2.73 -> DG O6 C0009 : score 6.6924 : H : ASP OD2 A0147 <- 2.89 -> DC N4 D0014 : score 6.0884 : w : ASP OD2 A0147 <- 5.81 -> DC N4 D0015 : score 3.623 : H : ASN OD1 A0148 <- 3.12 -> DA N6 C0008 : score 5.6364 : H : ASN ND2 A0148 <- 2.97 -> DA N7 C0008 : score 5.67092 : H : ARG NH1 A0173 <- 2.97 -> DG N7 C0006 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0173 <- 2.74 -> DG O6 C0006 : score 6.6792 : H : ASP OD2 A0175 <- 3.00 -> DA N6 D0017 : score 3.84246 : V : ALA CB A0119 <- 3.55 -> DT C7 D0011 : score 5.94891 : x : ARG xxxx A0090 <- 4.33 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0091 <- 3.47 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0151 <- 4.37 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0174 <- 4.27 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0176 <- 4.20 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >2i3p_AB:Homing_endonucleases; title=K28R MUTANT OF HOMING ENDONUCLEASE I-CREI organism=Chlamydomonas reinhardtii : w : GLN NE2 A0026 <- 5.48 -> DA N6 C0518 : score 2.804 : w : ARG NH1 A0028 <- 5.81 -> DA N6 C0518 : score 1.486 : w : ARG NH1 A0028 <- 6.00 -> DA N7 D0555 : score 0.388 : w : ARG NH2 A0028 <- 5.34 -> DA N7 C0519 : score 1.486 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.46 -> DT O4 C0521 : score 3.275 : w : ASN ND2 A0030 <- 5.59 -> DT O4 C0522 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.06 -> DG N7 D0552 : score 4.24898 : w : SER OG A0032 <- 6.25 -> DT O4 C0522 : score 2.338 : H : TYR OH A0033 <- 2.77 -> DA N7 D0553 : score 4.17619 : H : TYR OH A0033 <- 3.06 -> DA N6 D0553 : score 4.42765 : H : GLN OE1 A0038 <- 3.23 -> DA N6 D0554 : score 5.53204 : H : GLN NE2 A0038 <- 3.02 -> DA N7 D0554 : score 5.82179 : w : GLN OE1 A0038 <- 6.33 -> DT O4 C0521 : score 3.068 : H : GLN NE2 A0044 <- 2.98 -> DA N7 C0516 : score 5.87051 : w : GLN OE1 A0044 <- 5.44 -> DC N4 C0517 : score 3.488 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.01 -> DG N7 D0558 : score 5.7959 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.66 -> DG O6 D0558 : score 6.7848 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.82 -> DG O6 C0515 : score 6.059 : H : ARG NH2 A0070 <- 3.01 -> DG N7 C0515 : score 6.11646 : w : THR OG1 A0140 <- 5.58 -> DC O2 C0517 : score 2.048 : w : GLN NE2 B0326 <- 5.68 -> DG O6 D0568 : score 2.87 : w : ARG NH1 B0328 <- 5.12 -> DG O6 D0568 : score 2.756 : w : ARG NH2 B0328 <- 5.19 -> DA N6 C0505 : score 1.997 : w : ASN ND2 B0330 <- 5.69 -> DT O4 D0572 : score 3.275 : w : ASN ND2 B0330 <- 6.44 -> DT O4 D0570 : score 3.275 : H : TYR OH B0333 <- 2.64 -> DA N7 C0503 : score 4.28412 : H : TYR OH B0333 <- 2.97 -> DA N6 C0503 : score 4.51172 : H : GLN OE1 B0338 <- 2.90 -> DA N6 C0504 : score 5.93151 : H : GLN NE2 B0338 <- 2.72 -> DA N7 C0504 : score 6.18718 : w : GLN OE1 B0338 <- 5.82 -> DT O4 D0570 : score 3.068 : w : GLN OE1 B0338 <- 5.50 -> DA N6 C0505 : score 3.392 : w : SER OG B0340 <- 6.12 -> DA N6 C0505 : score 2.209 : H : GLN NE2 B0344 <- 3.16 -> DA N7 D0566 : score 5.65128 : w : GLN OE1 B0344 <- 5.75 -> DC N4 D0567 : score 3.488 : H : ARG NH1 B0368 <- 2.76 -> DG N7 C0508 : score 6.0984 : H : ARG NH2 B0368 <- 2.48 -> DG O6 C0508 : score 7.0224 : H : ARG NH1 B0370 <- 2.84 -> DG O6 D0565 : score 6.03467 : H : ARG NH2 B0370 <- 3.13 -> DG N7 D0565 : score 5.96323 : w : THR OG1 B0440 <- 5.74 -> DC O2 D0567 : score 2.048 : x : SER xxxx A0022 <- 4.39 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.66 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.57 -> DG xxx C0515 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 3.45 -> DT xxx D0556 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.89 -> DA xxx C0514 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 3.81 -> DT xxx D0561 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0322 <- 4.42 -> DA xxx D0566 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0324 <- 3.73 -> DA xxx D0566 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0332 <- 3.75 -> DC xxx C0502 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0346 <- 3.66 -> DG xxx D0565 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0366 <- 3.39 -> DT xxx C0506 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0373 <- 4.29 -> DC xxx D0564 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0439 <- 3.46 -> DG xxx D0565 : score x.xxxxx >2i3p_B:Homing_endonucleases; title=K28R MUTANT OF HOMING ENDONUCLEASE I-CREI organism=Chlamydomonas reinhardtii : w : GLN NE2 B0326 <- 5.68 -> DG O6 D0568 : score 2.87 : w : ARG NH1 B0328 <- 5.12 -> DG O6 D0568 : score 2.756 : w : ARG NH2 B0328 <- 5.19 -> DA N6 C0505 : score 1.997 : w : ASN ND2 B0330 <- 5.69 -> DT O4 D0572 : score 3.275 : w : ASN ND2 B0330 <- 6.44 -> DT O4 D0570 : score 3.275 : H : TYR OH B0333 <- 2.64 -> DA N7 C0503 : score 4.28412 : H : TYR OH B0333 <- 2.97 -> DA N6 C0503 : score 4.51172 : H : GLN OE1 B0338 <- 2.90 -> DA N6 C0504 : score 5.93151 : H : GLN NE2 B0338 <- 2.72 -> DA N7 C0504 : score 6.18718 : w : GLN OE1 B0338 <- 5.82 -> DT O4 D0570 : score 3.068 : w : GLN OE1 B0338 <- 5.50 -> DA N6 C0505 : score 3.392 : w : SER OG B0340 <- 6.12 -> DA N6 C0505 : score 2.209 : H : GLN NE2 B0344 <- 3.16 -> DA N7 D0566 : score 5.65128 : w : GLN OE1 B0344 <- 5.75 -> DC N4 D0567 : score 3.488 : H : ARG NH1 B0368 <- 2.76 -> DG N7 C0508 : score 6.0984 : H : ARG NH2 B0368 <- 2.48 -> DG O6 C0508 : score 7.0224 : H : ARG NH1 B0370 <- 2.84 -> DG O6 D0565 : score 6.03467 : H : ARG NH2 B0370 <- 3.13 -> DG N7 D0565 : score 5.96323 : w : THR OG1 B0440 <- 5.74 -> DC O2 D0567 : score 2.048 : x : SER xxxx B0322 <- 4.42 -> DA xxx D0566 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0324 <- 3.73 -> DA xxx D0566 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0332 <- 3.75 -> DC xxx C0502 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0346 <- 3.66 -> DG xxx D0565 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0366 <- 3.39 -> DT xxx C0506 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0373 <- 4.29 -> DC xxx D0564 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0439 <- 3.46 -> DG xxx D0565 : score x.xxxxx >2i3q_A:Homing_endonucleases; title=Q44V MUTANT OF HOMING ENDONUCLEASE I-CREI organism=Chlamydomonas reinhardtii : w : GLN NE2 A0026 <- 5.50 -> DA N6 C0518 : score 2.804 : w : ASN OD1 A0030 <- 6.36 -> DT O4 C0522 : score 3.132 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.28 -> DT O4 C0522 : score 3.275 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.03 -> DT O4 C0520 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.34 -> DG N7 D0552 : score 3.99799 : w : SER OG A0032 <- 5.91 -> DT O4 C0522 : score 2.338 : H : TYR OH A0033 <- 2.61 -> DA N7 D0553 : score 4.30903 : H : TYR OH A0033 <- 3.00 -> DA N6 D0553 : score 4.48369 : H : GLN OE1 A0038 <- 3.14 -> DA N6 D0554 : score 5.64099 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.84 -> DA N7 D0554 : score 6.04103 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.97 -> DA N6 D0555 : score 3.392 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.95 -> DT O4 C0520 : score 3.068 : w : SER OG A0040 <- 6.25 -> DA N6 D0555 : score 2.209 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.06 -> DG N7 D0558 : score 5.7354 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.70 -> DG O6 D0558 : score 6.732 : w : ARG NH2 A0068 <- 6.12 -> DT O4 C0516 : score 2.366 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.55 -> DG O6 C0515 : score 6.3875 : H : ARG NH2 A0070 <- 2.97 -> DG N7 C0515 : score 6.16754 : w : ASP OD2 A0075 <- 5.67 -> DT O4 C0516 : score 2.798 : w : THR OG1 A0140 <- 5.59 -> DT O2 C0516 : score 2.522 : V : VAL CG1 A0044 <- 3.67 -> DT C7 C0516 : score 6.25748 : x : SER xxxx A0022 <- 4.09 -> DT xxx C0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.46 -> DT xxx C0516 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.69 -> DG xxx C0515 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 4.42 -> DC xxx D0556 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.79 -> DA xxx C0514 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 3.50 -> DT xxx D0561 : score x.xxxxx >2i3q_AB:Homing_endonucleases; title=Q44V MUTANT OF HOMING ENDONUCLEASE I-CREI organism=Chlamydomonas reinhardtii : w : GLN NE2 A0026 <- 5.50 -> DA N6 C0518 : score 2.804 : w : ASN OD1 A0030 <- 6.36 -> DT O4 C0522 : score 3.132 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.28 -> DT O4 C0522 : score 3.275 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.03 -> DT O4 C0520 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.34 -> DG N7 D0552 : score 3.99799 : w : SER OG A0032 <- 5.91 -> DT O4 C0522 : score 2.338 : H : TYR OH A0033 <- 2.61 -> DA N7 D0553 : score 4.30903 : H : TYR OH A0033 <- 3.00 -> DA N6 D0553 : score 4.48369 : H : GLN OE1 A0038 <- 3.14 -> DA N6 D0554 : score 5.64099 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.84 -> DA N7 D0554 : score 6.04103 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.97 -> DA N6 D0555 : score 3.392 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.95 -> DT O4 C0520 : score 3.068 : w : SER OG A0040 <- 6.25 -> DA N6 D0555 : score 2.209 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.06 -> DG N7 D0558 : score 5.7354 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.70 -> DG O6 D0558 : score 6.732 : w : ARG NH2 A0068 <- 6.12 -> DT O4 C0516 : score 2.366 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.55 -> DG O6 C0515 : score 6.3875 : H : ARG NH2 A0070 <- 2.97 -> DG N7 C0515 : score 6.16754 : w : ASP OD2 A0075 <- 5.67 -> DT O4 C0516 : score 2.798 : w : THR OG1 A0140 <- 5.59 -> DT O2 C0516 : score 2.522 : w : GLN NE2 B0326 <- 5.44 -> DG O6 D0568 : score 2.87 : H : SER OG B0332 <- 3.37 -> DC N4 C0502 : score 3.25662 : H : TYR OH B0333 <- 2.58 -> DA N7 C0503 : score 4.33394 : H : TYR OH B0333 <- 3.14 -> DA N6 C0503 : score 4.35292 : H : GLN OE1 B0338 <- 2.95 -> DA N6 C0504 : score 5.87099 : H : GLN NE2 B0338 <- 2.79 -> DA N7 C0504 : score 6.10192 : w : GLN OE1 B0338 <- 5.75 -> DT O4 D0570 : score 3.068 : w : SER OG B0340 <- 6.44 -> DT O4 D0569 : score 2.338 : H : ARG NH2 B0368 <- 2.92 -> DG O6 C0508 : score 6.4416 : w : ARG NH2 B0368 <- 5.99 -> DT O4 D0566 : score 2.366 : H : ARG NH1 B0370 <- 2.76 -> DG O6 D0565 : score 6.132 : H : ARG NH2 B0370 <- 3.29 -> DG N7 D0565 : score 5.75892 : w : ASP OD2 B0375 <- 5.95 -> DT O4 D0566 : score 2.798 : w : THR OG1 B0440 <- 5.61 -> DC O2 D0567 : score 2.048 : V : VAL CG1 B0344 <- 3.72 -> DT C7 D0566 : score 6.18172 : V : VAL CG1 A0044 <- 3.67 -> DT C7 C0516 : score 6.25748 : x : SER xxxx A0022 <- 4.09 -> DT xxx C0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.46 -> DT xxx C0516 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.69 -> DG xxx C0515 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 4.42 -> DC xxx D0556 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.79 -> DA xxx C0514 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 3.50 -> DT xxx D0561 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0322 <- 4.17 -> DT xxx D0566 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0324 <- 4.08 -> DT xxx D0566 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0328 <- 3.92 -> DT xxx D0569 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0330 <- 3.11 -> DT xxx D0571 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0346 <- 3.80 -> DG xxx D0565 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0373 <- 3.85 -> DC xxx D0564 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0439 <- 4.45 -> DG xxx D0565 : score x.xxxxx >2i5w_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURE OF HOGG1 CROSSLINKED TO DNA SAMPLING A NORMAL G ADJACENT TO AN OXOG organism=Homo sapiens : x : CYS xxxx A0149 <- 4.28 -> DA xxx F0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0203 <- 3.71 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0207 <- 3.96 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0293 <- 4.37 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx >2i9g_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA WITH A BENZO[C]PHENANTHRENE DIOL EPOXIDE ADDUCTED GUANINE BASE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.24 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.81 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.50 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >2i9k_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=ENGINEERED EXTRAHELICAL BASE DESTABILIZATION ENHANCES SEQUENCE DISCRIMINATION OF DNA METHYLTRANSFERASE M.HHAI organism=HAEMOPHILUS HAEMOLYTICUS : H : ARG NH1 A0240 <- 2.88 -> DG N7 D0426 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.67 -> DG O6 D0426 : score 6.7716 : x : ILE xxxx A0086 <- 3.25 -> DT xxx C0410 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 2.87 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0228 <- 4.39 -> DA xxx D0425 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0237 <- 3.06 -> DG xxx D0426 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0239 <- 4.23 -> DC xxx C0407 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0252 <- 4.33 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0254 <- 4.10 -> DC xxx D0429 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0260 <- 4.03 -> DA xxx C0405 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0296 <- 4.03 -> DT xxx C0404 : score x.xxxxx >2i9t_AB:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=STRUCTURE OF NF-KB P65-P50 HETERODIMER BOUND TO PRDII ELEMENT OF B- INTERFERON PROMOTER organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0033 <- 3.46 -> DG N7 D0723 : score 5.2514 : H : ARG NH2 A0033 <- 2.49 -> DG O6 D0723 : score 7.0092 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.85 -> DG N7 D0722 : score 6.32077 : H : ARG NH2 A0035 <- 3.03 -> DG O6 D0722 : score 6.2964 : H : GLU OE1 A0039 <- 3.20 -> DC N4 C0712 : score 5.30651 : H : ARG NH1 B0354 <- 3.30 -> DG O6 C0706 : score 5.475 : H : ARG NH2 B0354 <- 2.94 -> DG N7 C0706 : score 6.20585 : H : ARG NH2 B0354 <- 3.18 -> DG O6 C0706 : score 6.0984 : H : ARG NH1 B0356 <- 2.83 -> DG O6 C0705 : score 6.04683 : H : ARG NH2 B0356 <- 2.66 -> DG N7 C0705 : score 6.56338 : H : GLU OE1 B0360 <- 3.01 -> DC N4 D0729 : score 5.52569 : H : HIS ND1 B0364 <- 2.93 -> DG N7 C0704 : score 6.06128 : H : LYS NZ B0541 <- 2.99 -> DT O4 D0727 : score 3.45087 : x : TYR xxxx A0036 <- 3.25 -> DT xxx C0711 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0038 <- 4.04 -> DT xxx C0711 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 4.23 -> DG xxx D0720 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0187 <- 2.85 -> DT xxx C0711 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0357 <- 3.47 -> DT xxx D0728 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0359 <- 3.94 -> DT xxx D0728 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0363 <- 4.15 -> DT xxx C0703 : score x.xxxxx >2i9t_B:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=STRUCTURE OF NF-KB P65-P50 HETERODIMER BOUND TO PRDII ELEMENT OF B- INTERFERON PROMOTER organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 B0354 <- 3.30 -> DG O6 C0706 : score 5.475 : H : ARG NH2 B0354 <- 2.94 -> DG N7 C0706 : score 6.20585 : H : ARG NH2 B0354 <- 3.18 -> DG O6 C0706 : score 6.0984 : H : ARG NH1 B0356 <- 2.83 -> DG O6 C0705 : score 6.04683 : H : ARG NH2 B0356 <- 2.66 -> DG N7 C0705 : score 6.56338 : H : GLU OE1 B0360 <- 3.01 -> DC N4 D0729 : score 5.52569 : H : HIS ND1 B0364 <- 2.93 -> DG N7 C0704 : score 6.06128 : H : LYS NZ B0541 <- 2.99 -> DT O4 D0727 : score 3.45087 : x : TYR xxxx B0357 <- 3.47 -> DT xxx D0728 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0359 <- 3.94 -> DT xxx D0728 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0363 <- 4.15 -> DT xxx C0703 : score x.xxxxx >2ia6_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=BYPASS OF MAJOR BENZOPYRENE-DG ADDUCT BY Y-FAMILY DNA POLYMERASE WITH UNIQUE STRUCTURAL GAP organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : VAL xxxx B0032 <- 3.57 -> DT xxx F1905 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0042 <- 3.51 -> DT xxx F1905 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0244 <- 4.39 -> DT xxx F1909 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0336 <- 3.92 -> DA xxx F1908 : score x.xxxxx >2ibk_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=BYPASS OF MAJOR BENZOPYRENE-DG ADDUCT BY Y-FAMILY DNA POLYMERASE WITH UNIQUE STRUCTURAL GAP organism=Sulfolobus solfataricus : w : LYS NZ A0339 <- 5.54 -> DA N7 D0007 : score 1.655 : x : ALA xxxx A0042 <- 3.78 -> DA xxx E0104 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 4.33 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 3.62 -> DT xxx E0109 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0285 <- 4.24 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0297 <- 4.39 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.54 -> DT xxx E0109 : score x.xxxxx >2ibs_D:DNA_methylase_specificity_domain;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ADENINE-SPECIFIC DNA METHYLTRANSFERASE M.TAQI COMPLEXED WITH THE COFACTOR ANALOG AETA AND A 10 BP DNA CONTAINING 2-AMINOPURINE AT THE TARGET POSITION organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ D0116 <- 2.81 -> DC O2 F0016 : score 2.94026 : w : LYS NZ D0116 <- 5.56 -> DT O2 F0015 : score 0.522 : H : TYR OH D0117 <- 3.03 -> DG N2 F0017 : score 4.66482 : H : LYS NZ D0139 <- 2.77 -> DT O2 E0003 : score 3.6087 : H : LYS NZ D0200 <- 2.86 -> DG N7 E0008 : score 5.32127 : H : LYS NZ D0200 <- 3.25 -> DG O6 E0008 : score 5.2605 : H : LYS NZ D0200 <- 2.74 -> DT O4 E0009 : score 3.63023 : H : ARG NE D0271 <- 2.76 -> DT O4 E0003 : score 1.87385 : H : ARG NH2 D0271 <- 2.78 -> DG O6 F0017 : score 6.6264 : w : GLU OE2 D0274 <- 5.57 -> DT O4 E0002 : score 2.279 : w : ARG NH2 D0296 <- 5.81 -> DC O2 F0013 : score 1.669 : H : HIS NE2 D0394 <- 3.01 -> DG O6 E0005 : score 7.61978 : V : PRO CG D0393 <- 3.79 -> DT C7 F0015 : score 6.37487 : x : PHE xxxx D0268 <- 3.62 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0272 <- 3.55 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0273 <- 4.15 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0323 <- 3.41 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0335 <- 3.79 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0336 <- 3.68 -> DT xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0353 <- 4.04 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0354 <- 3.21 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx >2ibt_A:DNA_methylase_specificity_domain;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ADENINE-SPECIFIC DNA METHYLTRANSFERASE M.TAQI COMPLEXED WITH THE COFACTOR ANALOG AETA AND A 10 BP DNA CONTAINING 2-AMINOPURINE AT THE TARGET POSITION AND AN ABASIC SITE ANALOG AT THE TARGET BASE PARTNER POSITION organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0116 <- 2.77 -> DC O2 C0016 : score 2.96383 : H : TYR OH A0117 <- 2.92 -> DG N2 C0017 : score 4.77239 : H : LYS NZ A0139 <- 2.79 -> DT O2 B0003 : score 3.59435 : H : LYS NZ A0200 <- 2.63 -> DG O6 B0008 : score 5.97732 : H : LYS NZ A0200 <- 2.78 -> DT O4 B0009 : score 3.60153 : H : ARG NE A0271 <- 2.91 -> DT O4 B0003 : score 1.81808 : H : ARG NH2 A0271 <- 2.81 -> DG O6 C0017 : score 6.5868 : w : GLU OE2 A0274 <- 5.55 -> DT O4 B0002 : score 2.279 : w : ARG NH2 A0296 <- 5.60 -> DC O2 C0013 : score 1.669 : H : HIS NE2 A0394 <- 2.96 -> DG O6 B0005 : score 7.69932 : x : PHE xxxx A0268 <- 3.68 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0272 <- 3.44 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0273 <- 4.19 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0323 <- 3.32 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0335 <- 3.68 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0336 <- 4.08 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0353 <- 4.08 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0354 <- 3.17 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0393 <- 3.36 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx >2ief_B:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE COOPERATIVE EXCISIONASE (XIS)-DNA COMPLEX REVEALS A MICRONUCLEOPROTEIN FILAMENT organism=ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA : H : GLU OE2 B0019 <- 3.26 -> DC N4 F0052 : score 4.78097 : w : GLU OE1 B0019 <- 5.44 -> DA N6 F0051 : score 2.939 : w : THR OG1 B0020 <- 6.06 -> DA N7 D0015 : score 2.152 : w : ARG NH2 B0023 <- 5.93 -> DA N7 D0015 : score 1.486 : x : ARG xxxx B0022 <- 3.56 -> DT xxx F0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0026 <- 3.90 -> DC xxx F0052 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0039 <- 3.17 -> DT xxx E0024 : score x.xxxxx >2ih2_D:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases;DNA_methylase_specificity_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ADENINE-SPECIFIC DNA METHYLTRANSFERASE M.TAQI COMPLEXED WITH THE COFACTOR ANALOG AETA AND A 10 BP DNA CONTAINING 5-METHYLPYRIMIDIN-2(1H)-ONE AT THE TARGET BASE PARTNER POSITION organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ D0116 <- 2.77 -> DC O2 F0016 : score 2.96383 : H : LYS NZ D0116 <- 2.77 -> DC O2 F0016 : score 2.96383 : H : TYR OH D0117 <- 3.01 -> DG N2 F0017 : score 4.68437 : H : LYS NZ D0139 <- 2.83 -> DT O2 E0003 : score 3.56566 : H : LYS NZ D0200 <- 2.67 -> DG O6 E0008 : score 5.93107 : w : LYS NZ D0200 <- 6.26 -> DT O4 E0007 : score 1.7 : w : LYS NZ D0200 <- 5.62 -> DA N6 F0012 : score 2.097 : H : ARG NE D0271 <- 2.82 -> DT O4 E0003 : score 1.85154 : H : ARG NH2 D0271 <- 2.80 -> DG O6 F0017 : score 6.6 : w : GLU OE2 D0274 <- 5.66 -> DT O4 E0002 : score 2.279 : w : ARG NH1 D0296 <- 5.66 -> DC O2 F0013 : score 1.381 : w : ARG NH2 D0296 <- 5.65 -> DC O2 F0013 : score 1.669 : H : HIS NE2 D0394 <- 2.98 -> DG O6 E0005 : score 7.66751 : H : HIS NE2 D0394 <- 2.98 -> DG O6 E0005 : score 7.66751 : x : VAL xxxx D0021 <- 3.38 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0105 <- 2.93 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0108 <- 3.26 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0196 <- 3.62 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0199 <- 3.46 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0201 <- 4.31 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0268 <- 3.69 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0272 <- 3.39 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0273 <- 4.14 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0323 <- 3.42 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0335 <- 3.60 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0336 <- 3.98 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0353 <- 4.01 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0354 <- 3.12 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0393 <- 3.39 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx >2ih4_D:DNA_methylase_specificity_domain;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ADENINE-SPECIFIC DNA METHYLTRANSFERASE M.TAQI COMPLEXED WITH THE COFACTOR ANALOG AETA AND A 10 BP DNA CONTAINING PYRROLO-DC AT THE TARGET BASE PARTNER POSITION organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ D0116 <- 2.76 -> DC O2 F0016 : score 2.96972 : H : LYS NZ D0200 <- 2.70 -> DG N7 E0008 : score 5.49362 : H : LYS NZ D0200 <- 2.63 -> DT O4 E0009 : score 3.70914 : H : ARG NH2 D0271 <- 2.92 -> DG O6 F0017 : score 6.4416 : H : HIS NE2 D0394 <- 3.08 -> DG O6 E0005 : score 7.50843 : x : VAL xxxx D0021 <- 3.64 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0105 <- 2.93 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0108 <- 3.21 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0117 <- 3.36 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0139 <- 4.43 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0196 <- 3.88 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0199 <- 3.34 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0201 <- 4.24 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0272 <- 3.72 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0273 <- 4.30 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0296 <- 4.28 -> DC xxx F0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0335 <- 4.27 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0336 <- 3.98 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0353 <- 4.20 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0354 <- 3.19 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0393 <- 3.66 -> DA xxx F0014 : score x.xxxxx >2ih5_A:DNA_methylase_specificity_domain;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ADENINE-SPECIFIC DNA METHYLTRANSFERASE M.TAQI COMPLEXED WITH THE COFACTOR ANALOG AETA AND A 10 BP DNA CONTAINING AN ABASIC SITE ANALOG AT THE TARGET BASE PARTNER POSITION organism=Thermus aquaticus : H : ASN OD1 A0105 <- 2.96 -> DA N6 B0006 : score 5.8291 : H : LYS NZ A0116 <- 2.79 -> DC O2 C0016 : score 2.95205 : H : LYS NZ A0116 <- 2.79 -> DC O2 C0016 : score 2.95205 : w : LYS NZ A0116 <- 6.21 -> DT O2 B0007 : score 0.522 : H : TYR OH A0117 <- 2.94 -> DG N2 C0017 : score 4.75283 : H : LYS NZ A0139 <- 2.78 -> DT O2 B0003 : score 3.60153 : H : LYS NZ A0200 <- 3.19 -> DG N7 B0008 : score 4.9658 : H : LYS NZ A0200 <- 2.68 -> DT O4 B0009 : score 3.67327 : H : ARG NE A0271 <- 2.81 -> DT O4 B0003 : score 1.85526 : H : ARG NH2 A0271 <- 2.83 -> DG O6 C0017 : score 6.5604 : w : GLU OE2 A0274 <- 5.64 -> DT O4 B0002 : score 2.279 : H : HIS NE2 A0394 <- 2.93 -> DG O6 B0005 : score 7.74705 : H : HIS NE2 A0394 <- 2.93 -> DG O6 B0005 : score 7.74705 : V : PRO CG A0393 <- 3.87 -> DT C7 B0007 : score 6.24769 : x : VAL xxxx A0021 <- 3.81 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0108 <- 3.25 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0196 <- 3.69 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0199 <- 3.14 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0201 <- 4.13 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0268 <- 3.61 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0272 <- 3.47 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0273 <- 4.18 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0323 <- 3.25 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0335 <- 3.74 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0336 <- 3.78 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0353 <- 4.08 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0354 <- 3.17 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx >2ihn_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CO-CRYSTAL OF BACTERIOPHAGE T4 RNASE H WITH A FORK DNA SUBSTRATE organism=Enterobacteria phage T4 : H : HIS NE2 A0174 <- 3.34 -> DT O2 C0008 : score 4.67385 : H : ARG NH2 A0220 <- 3.01 -> DT O2 D0005 : score 4.05553 : x : SER xxxx A0026 <- 3.69 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0029 <- 3.45 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0030 <- 3.32 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0173 <- 3.34 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx >2iie_A:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=SINGLE CHAIN INTEGRATION HOST FACTOR PROTEIN (SCIHF2) IN COMPLEX WITH DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0104 <- 3.17 -> DC O2 E0036 : score 3.3799 : w : ARG NH1 A0104 <- 5.81 -> DA N3 C-035 : score 2.585 : H : ARG NH1 A0107 <- 2.84 -> DT O2 C-037 : score 4.27196 : H : ARG NH2 A0147 <- 2.86 -> DT O2 E0044 : score 4.18253 : w : ARG NH2 A0160 <- 6.09 -> DC O2 C-030 : score 1.669 : H : LYS NZ A0166 <- 3.40 -> DT O4 D0028 : score 3.15672 : x : ASN xxxx A0108 <- 3.72 -> DA xxx E0038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0109 <- 3.40 -> DT xxx C-038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0110 <- 3.04 -> DT xxx C-038 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0117 <- 3.33 -> DC xxx E0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0163 <- 3.89 -> DA xxx C-029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0164 <- 3.31 -> DA xxx C-028 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0165 <- 3.53 -> DA xxx C-028 : score x.xxxxx >2iif_A:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=SINGLE CHAIN INTEGRATION HOST FACTOR MUTANT PROTEIN (SCIHF2-K45AE) IN COMPLEX WITH DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0104 <- 3.04 -> DC O2 E0036 : score 3.4748 : w : ARG NH1 A0104 <- 6.23 -> DA N3 C-035 : score 2.585 : H : ARG NH1 A0107 <- 2.87 -> DT O2 C-037 : score 4.24612 : H : ARG NH2 A0147 <- 3.34 -> DT O2 E0044 : score 3.77613 : x : ASN xxxx A0108 <- 3.74 -> DA xxx E0038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0109 <- 3.16 -> DT xxx C-038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0110 <- 3.02 -> DT xxx C-038 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0117 <- 3.12 -> DC xxx E0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0160 <- 3.78 -> DA xxx C-029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0163 <- 3.74 -> DA xxx C-029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0164 <- 3.53 -> DA xxx C-028 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0165 <- 3.29 -> DA xxx C-028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0166 <- 3.28 -> DT xxx D0028 : score x.xxxxx >2imw_P:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=MECHANISM OF TEMPLATE-INDEPENDENT NUCLEOTIDE INCORPORATION CATALYZED BY A TEMPLATE-DEPENDENT DNA POLYMERASE organism=Sulfolobus solfataricus : w : LYS NZ P0221 <- 6.05 -> DC O2 T1915 : score 1.3 : x : SER xxxx P0297 <- 4.36 -> DT xxx T1913 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0336 <- 4.35 -> DG xxx S1803 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx P0348 <- 3.23 -> DG xxx S1805 : score x.xxxxx >2irf_GH:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN IRF-2/DNA COMPLEX. organism=Mus musculus : H : CYS SG G0083 <- 3.62 -> DT O4 F1136 : score 5.9356 : w : HIS NE2 H0240 <- 5.52 -> DA N3 A1002 : score 2.619 : w : LYS NZ H0275 <- 5.34 -> DG O6 A1003 : score 3.005 : w : ARG NH1 H0282 <- 5.82 -> DG O6 A1005 : score 2.756 : w : ARG NH2 H0282 <- 5.38 -> DG O6 A1005 : score 2.468 : H : CYS SG H0283 <- 3.26 -> DT O4 F1130 : score 6.4468 : w : CYS SG H0283 <- 5.89 -> DT O4 F1131 : score 4.152 : w : ASN ND2 H0286 <- 5.70 -> DA N7 A1006 : score 1.989 : x : ASN xxxx G0080 <- 3.48 -> DT xxx F1136 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0087 <- 3.77 -> DC xxx F1134 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0279 <- 4.14 -> DT xxx A1004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0280 <- 3.46 -> DT xxx F1130 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0287 <- 3.62 -> DC xxx F1128 : score x.xxxxx >2irf_IJKL:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN IRF-2/DNA COMPLEX. organism=Mus musculus : w : HIS NE2 I0440 <- 5.48 -> DA N3 A1008 : score 2.619 : H : ARG NH1 I0482 <- 3.30 -> DG N7 A1011 : score 5.445 : H : CYS SG I0483 <- 3.46 -> DT O4 E1124 : score 6.1628 : w : ASN ND2 I0486 <- 5.79 -> DA N7 A1012 : score 1.989 : w : HIS NE2 J0640 <- 5.44 -> DA N3 B1014 : score 2.619 : H : ARG NH1 J0682 <- 3.15 -> DG N7 B1017 : score 5.6265 : H : CYS SG J0683 <- 3.38 -> DT O4 E1118 : score 6.2764 : w : ASN ND2 J0686 <- 5.80 -> DA N7 B1018 : score 1.989 : w : HIS NE2 K0840 <- 5.35 -> DA N3 B1020 : score 2.619 : H : ARG NH1 K0882 <- 3.24 -> DG N7 B1023 : score 5.5176 : H : CYS SG K0883 <- 3.73 -> DT O4 D1112 : score 5.7794 : w : ASN ND2 K0886 <- 5.88 -> DA N7 B1024 : score 1.989 : w : HIS NE2 L2040 <- 5.77 -> DA N3 C1026 : score 2.619 : H : LYS NZ L2075 <- 3.07 -> DG N7 C1027 : score 5.09506 : H : ARG NH1 L2082 <- 3.30 -> DG N7 C1029 : score 5.445 : H : CYS SG L2083 <- 3.22 -> DT O4 D1106 : score 6.5036 : w : ASN ND2 L2086 <- 5.75 -> DA N7 C1030 : score 1.989 : x : ASN xxxx I0480 <- 3.39 -> DT xxx E1124 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0487 <- 3.90 -> DC xxx E1122 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0679 <- 4.26 -> DT xxx B1016 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0680 <- 3.31 -> DT xxx E1118 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0684 <- 4.45 -> DT xxx E1117 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0687 <- 3.75 -> DC xxx E1116 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx K0880 <- 3.42 -> DT xxx D1112 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0887 <- 3.84 -> DC xxx D1110 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx L2079 <- 4.29 -> DT xxx C1028 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L2080 <- 3.31 -> DT xxx D1106 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L2087 <- 3.59 -> DC xxx D1104 : score x.xxxxx >2irf_L:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN IRF-2/DNA COMPLEX. organism=Mus musculus : w : HIS NE2 L2040 <- 5.77 -> DA N3 C1026 : score 2.619 : H : LYS NZ L2075 <- 3.07 -> DG N7 C1027 : score 5.09506 : H : ARG NH1 L2082 <- 3.30 -> DG N7 C1029 : score 5.445 : H : CYS SG L2083 <- 3.22 -> DT O4 D1106 : score 6.5036 : w : ASN ND2 L2086 <- 5.75 -> DA N7 C1030 : score 1.989 : x : ALA xxxx L2079 <- 4.29 -> DT xxx C1028 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L2080 <- 3.31 -> DT xxx D1106 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L2087 <- 3.59 -> DC xxx D1104 : score x.xxxxx >2is1_AB:?;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UVRD-DNA-SO4 COMPLEX organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0421 <- 2.73 -> DG N7 F0009 : score 6.1347 : x : ASP xxxx A0420 <- 3.85 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0621 <- 3.46 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0621 <- 3.09 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx >2is1_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UVRD-DNA-SO4 COMPLEX organism=Escherichia coli : x : TYR xxxx B0621 <- 3.09 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx >2is2_AB:?;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UVRD-DNA BINARY COMPLEX organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0453 <- 2.95 -> DC O2 D0014 : score 3.58776 : H : ARG NH2 B0453 <- 2.52 -> DC O2 C0014 : score 3.90585 : x : ARG xxxx A0421 <- 2.80 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0621 <- 3.10 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0421 <- 3.07 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0621 <- 3.29 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx >2is2_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UVRD-DNA BINARY COMPLEX organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 B0453 <- 2.52 -> DC O2 C0014 : score 3.90585 : x : ARG xxxx B0421 <- 3.07 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0621 <- 3.29 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx >2is4_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UVRD-DNA-ADPNP TERNARY COMPLEX organism=Escherichia coli : x : TYR xxxx A0621 <- 3.03 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx >2is4_AB:?;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UVRD-DNA-ADPNP TERNARY COMPLEX organism=Escherichia coli : x : TYR xxxx A0621 <- 3.03 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0621 <- 3.26 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx >2is6_AB:?;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UVRD-DNA-ADPMGF3 TERNARY COMPLEX organism=Escherichia coli : x : TYR xxxx A0621 <- 3.37 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0621 <- 3.15 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx >2is6_B:?;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UVRD-DNA-ADPMGF3 TERNARY COMPLEX organism=Escherichia coli : x : TYR xxxx B0621 <- 3.15 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx >2iso_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER AND 2'-DEOXYGUANOSINE 5'-BETA, GAMMA-DIFLUOROMETHYLENE TRIPHOSPHATE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.22 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.09 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.67 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >2isp_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER AND 2'-DEOXYGUANOSINE 5'-BETA, GAMMA-METHYLENE TRIPHOSPHATE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.21 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.02 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.63 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >2isz_ABCD:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TWO-DOMAIN IDER-DNA COMPLEX CRYSTAL FORM I organism=Mycobacterium tuberculosis : H : GLN OE1 A0043 <- 3.07 -> DC N4 F0018 : score 4.33583 : w : GLN OE1 A0043 <- 5.54 -> DC N4 F0019 : score 3.488 : w : ARG NH1 A0060 <- 5.45 -> DG N3 E0009 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0060 <- 6.27 -> DG N2 E0009 : score 1.593 : H : GLN OE1 B0043 <- 2.70 -> DC N4 E0020 : score 4.675 : w : GLN OE1 B0043 <- 6.05 -> DC N4 E0021 : score 3.488 : w : GLN NE2 B0043 <- 5.80 -> DG O6 F0013 : score 2.87 : w : ARG NH2 B0060 <- 6.14 -> DT O2 E0028 : score 2.261 : w : ARG NH1 C0060 <- 5.25 -> DG N3 F0012 : score 1.593 : V : PRO CG A0039 <- 3.65 -> DT C7 F0020 : score 6.59744 : V : PRO CG C0039 <- 3.71 -> DT C7 E0017 : score 6.50205 : x : SER xxxx A0037 <- 3.38 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0040 <- 3.13 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0047 <- 3.66 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0037 <- 3.40 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0039 <- 3.19 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0040 <- 3.18 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0042 <- 4.49 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0047 <- 3.67 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0037 <- 3.42 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0040 <- 3.18 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0047 <- 3.56 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0037 <- 3.34 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0039 <- 3.26 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0040 <- 3.39 -> DC xxx F0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 4.15 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0047 <- 3.51 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx >2isz_B:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TWO-DOMAIN IDER-DNA COMPLEX CRYSTAL FORM I organism=Mycobacterium tuberculosis : H : GLN OE1 B0043 <- 2.70 -> DC N4 E0020 : score 4.675 : w : GLN OE1 B0043 <- 6.05 -> DC N4 E0021 : score 3.488 : w : GLN NE2 B0043 <- 5.80 -> DG O6 F0013 : score 2.87 : w : ARG NH2 B0060 <- 6.14 -> DT O2 E0028 : score 2.261 : x : SER xxxx B0037 <- 3.40 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0039 <- 3.19 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0040 <- 3.18 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0042 <- 4.49 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0047 <- 3.67 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx >2it0_ABCD:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TWO-DOMAIN IDER-DNA COMPLEX CRYSTAL FORM II organism=Mycobacterium tuberculosis : H : GLN OE1 A0043 <- 3.38 -> DC N4 F0018 : score 4.05167 : w : GLN NE2 A0043 <- 5.87 -> DG O6 E0014 : score 2.87 : H : GLN OE1 B0043 <- 2.81 -> DC N4 E0020 : score 4.57417 : H : GLN OE1 C0043 <- 3.23 -> DC N4 E0016 : score 4.18917 : H : GLN NE2 C0043 <- 3.35 -> DG O6 F0017 : score 5.16656 : w : ARG NH1 C0060 <- 6.19 -> DG N2 F0012 : score 1.082 : w : ARG NH2 C0060 <- 5.72 -> DG N2 F0012 : score 1.593 : V : PRO CG A0039 <- 3.89 -> DT C7 F0020 : score 6.2159 : V : PRO CG D0039 <- 3.74 -> DT C7 F0025 : score 6.45436 : x : SER xxxx A0037 <- 3.49 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0040 <- 3.37 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0047 <- 3.81 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0060 <- 4.41 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0037 <- 3.28 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0039 <- 3.18 -> DA xxx E0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0040 <- 3.20 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0042 <- 4.23 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0047 <- 3.83 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0037 <- 3.29 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0039 <- 3.13 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0040 <- 3.19 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0047 <- 3.64 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0037 <- 3.22 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0040 <- 3.10 -> DC xxx F0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 4.29 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0047 <- 3.47 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx >2it0_D:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TWO-DOMAIN IDER-DNA COMPLEX CRYSTAL FORM II organism=Mycobacterium tuberculosis : V : PRO CG D0039 <- 3.74 -> DT C7 F0025 : score 6.45436 : x : SER xxxx D0037 <- 3.22 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0040 <- 3.10 -> DC xxx F0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 4.29 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0047 <- 3.47 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx >2itl_AB:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=THE ORIGIN BINDING DOMAIN OF THE SV40 LARGE T ANTIGEN BOUND TO THE FUNCTIONAL PEN PALINDROME DNA (23 BP) organism=Simian virus 40 : H : ARG NE A0204 <- 2.97 -> DG N7 W0032 : score 4.27145 : H : ARG NH2 A0204 <- 2.59 -> DG O6 W0032 : score 6.8772 : H : SER OG B0152 <- 2.71 -> DA N7 W0021 : score 4.54446 : H : ASN ND2 B0153 <- 2.90 -> DG O6 W0023 : score 5.52569 : H : ARG NE B0154 <- 2.91 -> DG N7 W0020 : score 4.32452 : H : ARG NH2 B0154 <- 2.54 -> DG O6 W0020 : score 6.9432 : x : ASN xxxx A0153 <- 3.29 -> DC xxx W0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0154 <- 3.66 -> DT xxx W0035 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0155 <- 4.04 -> DC xxx W0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0204 <- 4.25 -> DC xxx W0024 : score x.xxxxx >2itl_B:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=THE ORIGIN BINDING DOMAIN OF THE SV40 LARGE T ANTIGEN BOUND TO THE FUNCTIONAL PEN PALINDROME DNA (23 BP) organism=Simian virus 40 : H : SER OG B0152 <- 2.71 -> DA N7 W0021 : score 4.54446 : H : ASN ND2 B0153 <- 2.90 -> DG O6 W0023 : score 5.52569 : H : ARG NE B0154 <- 2.91 -> DG N7 W0020 : score 4.32452 : H : ARG NH2 B0154 <- 2.54 -> DG O6 W0020 : score 6.9432 : x : ARG xxxx B0204 <- 4.25 -> DC xxx W0024 : score x.xxxxx >2ivh_A:His-Me_finger_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEASE DOMAIN OF COLE7 (H545Q MUTANT) IN COMPLEX WITH AN 18-BP DUPLEX DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ASP OD2 A0493 <- 2.75 -> DA N6 B0013 : score 4.04259 : w : ASP OD1 A0493 <- 6.26 -> DG O6 B0012 : score 3.411 : w : ASP OD2 A0493 <- 6.34 -> DG O6 B0012 : score 3.228 : H : ARG NH2 A0538 <- 3.09 -> DT O2 C0028 : score 3.9878 : w : ARG NH2 A0538 <- 5.78 -> DT O2 B0010 : score 2.261 : x : ARG xxxx A0496 <- 3.21 -> DA xxx B0013 : score x.xxxxx >2ivk_BC:His-Me_finger_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PERIPLASMIC ENDONUCLEASE VVN COMPLEXED WITH A 16-BP DNA organism=VIBRIO VULNIFICUS : H : ARG NH2 B0072 <- 2.90 -> DC O2 F0032 : score 3.62474 : H : ARG NH2 C0072 <- 2.83 -> DC O2 H0032 : score 3.67653 : x : ARG xxxx B0075 <- 4.49 -> DG xxx J0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0100 <- 3.62 -> DG xxx J0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0131 <- 4.21 -> DT xxx F0031 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0069 <- 4.44 -> DA xxx G0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0100 <- 3.57 -> DG xxx I0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0131 <- 4.24 -> DT xxx H0031 : score x.xxxxx >2ivk_C:His-Me_finger_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PERIPLASMIC ENDONUCLEASE VVN COMPLEXED WITH A 16-BP DNA organism=VIBRIO VULNIFICUS : H : ARG NH2 C0072 <- 2.83 -> DC O2 H0032 : score 3.67653 : x : GLN xxxx C0069 <- 4.44 -> DA xxx G0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0100 <- 3.57 -> DG xxx I0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0131 <- 4.24 -> DT xxx H0031 : score x.xxxxx >2j6s_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF SULFOLOBUS SOLFATARICUS DPO4 DNA POLYMERASE, O6- METHYLGUANINE MODIFIED DNA, AND DATP. organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : VAL xxxx A0032 <- 3.77 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.58 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx >2j6u_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF SULFOLOBUS SOLFATARICUS DPO4 DNA POLYMERASE, O6- METHYLGUANINE MODIFIED DNA, AND DGTP. organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : TYR xxxx A0015 <- 4.40 -> DT xxx P0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0035 <- 3.67 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0045 <- 3.92 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0107 <- 4.23 -> DT xxx P0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0339 <- 4.40 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2ja5_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CPD LESION CONTAINING RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX A organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A0350 <- 4.28 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 4.17 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 3.14 -> DT xxx T0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 3.20 -> DT xxx T0018 : score x.xxxxx >2ja5_AB: title=CPD LESION CONTAINING RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX A organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A0350 <- 4.28 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 4.17 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 3.14 -> DT xxx T0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 3.20 -> DT xxx T0018 : score x.xxxxx >2ja6_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CPD LESION CONTAINING RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX B organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : THR xxxx A0831 <- 4.01 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 4.37 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0833 <- 3.58 -> DT xxx N0000 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1102 <- 4.50 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.64 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >2ja6_AB: title=CPD LESION CONTAINING RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX B organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : THR xxxx A0831 <- 4.01 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 4.37 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0833 <- 3.58 -> DT xxx N0000 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1102 <- 4.50 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.64 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >2ja7_AB: title=CPD LESION CONTAINING RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX C organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 A1386 <- 3.28 -> DT O2 20015 : score 3.89299 >2ja7_M:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CPD LESION CONTAINING RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX C organism=? : H : ARG NH1 M1386 <- 3.41 -> DT O2 50015 : score 3.78103 >2ja7_MN: title=CPD LESION CONTAINING RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX C organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 M1386 <- 3.41 -> DT O2 50015 : score 3.78103 >2ja8_AB: title=CPD LESION CONTAINING RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX D organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : VAL xxxx A0829 <- 4.12 -> DT xxx N0000 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0833 <- 3.51 -> DT xxx N0000 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0836 <- 4.46 -> DT xxx T0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1102 <- 4.34 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 4.20 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >2jef_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=THE MOLECULAR BASIS OF SELECTIVITY OF NUCLEOTIDE TRIPHOSPHATE INCORPORATION OPPOSITE O6-BENZYLGUANINE BY SULFOLOBUS SOLFATARICUS DNA POLYMERASE IV: STEADY-STATE AND PRE-STEADY-STATE AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY OF CORRECT AND INCORRECT PAIRING organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : w : LYS NZ A0078 <- 5.94 -> DG N3 T0006 : score 2.232 : x : ARG xxxx A0336 <- 4.04 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2jeg_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=THE MOLECULAR BASIS OF SELECTIVITY OF NUCLEOSIDE TRIPHOSPHATE INCORPORATION OPPOSITE O6-BENZYLGUANINE BY SULFOLOBUS SOLFATARICUS DNA POLYMERASE IV: STEADY-STATE AND PRE-STEADY-STATE KINETICS AND X- RAY CRYSTALLOGRAPHY OF CORRECT AND INCORRECT PAIRING organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : ARG xxxx A0336 <- 3.87 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2jei_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=THE MOLECULAR BASIS OF SELECTIVITY OF NUCLEOSIDE TRIPHOSPHATE INCORPORATION OPPOSITE O6-BENZYLGUANINE BY SULFOLOBUS SOLFATARICUS DNA POLYMERASE IV: STEADY-STATE AND PRE-STEADY-STATE KINETICS AND X- RAY CRYSTALLOGRAPHY OF CORRECT AND INCORRECT PAIRING organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : VAL xxxx A0032 <- 3.56 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 4.06 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.23 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2jej_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=THE MOLECULAR BASIS OF SELECTIVITY OF NUCLEOSIDE TRIPHOSPHATE INCORPORATION OPPOSITE O6-BENZYLGUANINE BY SULFOLOBUS SOLFATARICUS DNA POLYMERASE IV: STEADY-STATE AND PRE-STEADY-STATE KINETICS AND X- RAY CRYSTALLOGRAPHY OF CORRECT AND INCORRECT PAIRING organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : H : GLU OE1 A0063 <- 2.65 -> DA N6 T0003 : score 2.76251 : x : VAL xxxx A0032 <- 3.68 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0037 <- 4.16 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.96 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0060 <- 3.26 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0062 <- 4.20 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0240 <- 3.58 -> DC xxx P0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.19 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2jg3_D:DNA_methylase_specificity_domain;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=MTAQI WITH BAZ organism=THERMUS AQUATICUS : H : LYS NZ D0116 <- 2.74 -> DC O2 F0016 : score 2.98151 : w : LYS NZ D0116 <- 5.53 -> DT O2 F0015 : score 0.522 : H : TYR OH D0117 <- 2.91 -> DG N2 F0017 : score 4.78217 : H : LYS NZ D0139 <- 2.97 -> DT O2 E0003 : score 3.46522 : H : LYS NZ D0200 <- 2.80 -> DG N7 E0008 : score 5.3859 : H : LYS NZ D0200 <- 3.00 -> DT O4 E0009 : score 3.44369 : H : ARG NE D0271 <- 2.89 -> DT O4 E0003 : score 1.82551 : H : ARG NH2 D0271 <- 2.95 -> DG O6 F0017 : score 6.402 : w : GLU OE2 D0274 <- 5.76 -> DT O4 E0002 : score 2.279 : w : ARG NH2 D0296 <- 5.79 -> DC O2 F0013 : score 1.669 : H : HIS NE2 D0394 <- 2.94 -> DG O6 E0005 : score 7.73114 : V : PRO CG D0393 <- 3.66 -> DT C7 F0015 : score 6.58154 : x : ASN xxxx D0105 <- 3.38 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0108 <- 3.51 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0196 <- 3.81 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0199 <- 3.39 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0268 <- 3.56 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0272 <- 3.60 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0273 <- 4.15 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0323 <- 3.42 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0335 <- 3.61 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0336 <- 3.73 -> DT xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0353 <- 4.05 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0354 <- 3.11 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx >2jlg_B:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURAL EXPLANATION FOR THE ROLE OF MN IN THE ACTIVITY OF PHI6 RNA- DEPENDENT RNA POLYMERASE organism=PSEUDOMONAS PHAGE PHI6 : H : SER OG B0393 <- 2.51 -> DT O2 E0005 : score 3.91189 : V : ARG CZ B0204 <- 3.72 -> DT C7 E0005 : score 2.17495 : x : GLN xxxx B0026 <- 4.45 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0030 <- 3.60 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0144 <- 4.04 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0202 <- 3.31 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0272 <- 4.33 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0288 <- 2.56 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0291 <- 3.06 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0398 <- 4.43 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0530 <- 4.18 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0543 <- 3.66 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0628 <- 4.35 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0629 <- 3.19 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0633 <- 3.03 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0634 <- 2.99 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0642 <- 3.30 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx >2jp9_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=STRUCTURE OF THE WILMS TUMOR SUPPRESSOR PROTEIN ZINC FINGER DOMAIN BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0029 <- 3.04 -> DG N7 C0143 : score 6.07815 : H : ARG NH1 A0050 <- 2.77 -> DG N7 B0133 : score 6.0863 : H : ARG NH1 A0050 <- 2.77 -> DT O4 B0134 : score 3.28756 : H : ARG NH2 A0050 <- 3.15 -> DG N7 B0133 : score 5.93769 : H : ASP OD2 A0052 <- 2.77 -> DC N4 C0148 : score 6.2372 : H : ARG NH1 A0056 <- 2.77 -> DG O6 B0131 : score 6.11983 : H : ARG NH2 A0056 <- 2.74 -> DG O6 C0149 : score 6.6792 : H : ARG NH1 A0078 <- 2.79 -> DG N7 B0130 : score 6.0621 : H : ARG NH2 A0078 <- 2.85 -> DG O6 B0130 : score 6.534 : H : ASP OD2 A0080 <- 3.14 -> DC N4 C0150 : score 5.7784 : H : ARG NH1 A0108 <- 2.78 -> DG N7 B0127 : score 6.0742 : H : ARG NH2 A0108 <- 2.73 -> DG O6 B0127 : score 6.6924 : H : ASP OD2 A0110 <- 2.83 -> DC N4 C0153 : score 6.1628 : H : ARG NH1 A0114 <- 2.82 -> DG O6 B0125 : score 6.059 : H : ARG NH1 A0114 <- 2.82 -> DG O6 C0155 : score 6.059 : H : ARG NH2 A0114 <- 2.78 -> DG O6 C0155 : score 6.6264 : x : GLN xxxx A0025 <- 3.89 -> DC xxx C0142 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0032 <- 3.45 -> DT xxx B0134 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0053 <- 3.19 -> DC xxx B0132 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0079 <- 4.34 -> DG xxx C0149 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0081 <- 2.82 -> DG xxx B0129 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0111 <- 3.27 -> DC xxx B0126 : score x.xxxxx >2jpa_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=STRUCTURE OF THE WILMS TUMOR SUPPRESSOR PROTEIN ZINC FINGER DOMAIN BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : GLN NE2 A0025 <- 2.79 -> DG O6 B0137 : score 5.81674 : H : ARG NH1 A0050 <- 2.65 -> DG O6 B0133 : score 6.26583 : H : ARG NH2 A0050 <- 2.70 -> DG N7 B0133 : score 6.51231 : H : ASP OD2 A0052 <- 2.88 -> DC N4 C0142 : score 6.1008 : H : GLN OE1 A0053 <- 2.72 -> DC N4 B0132 : score 4.65667 : H : ARG NH1 A0056 <- 2.90 -> DG O6 B0131 : score 5.96167 : H : ARG NH2 A0056 <- 2.90 -> DG N7 B0131 : score 6.25692 : H : ARG NH1 A0078 <- 2.87 -> DG N7 B0130 : score 5.9653 : H : ARG NH2 A0078 <- 2.91 -> DG O6 B0130 : score 6.4548 : H : ASP OD2 A0080 <- 2.92 -> DC N4 C0145 : score 6.0512 : H : ARG NH1 A0108 <- 2.81 -> DG N7 B0127 : score 6.0379 : H : ARG NH2 A0108 <- 2.71 -> DG O6 B0127 : score 6.7188 : H : ASP OD2 A0110 <- 2.84 -> DC N4 C0147 : score 6.1504 : H : ARG NH1 A0114 <- 2.80 -> DG O6 C0149 : score 6.08333 : H : ARG NH2 A0114 <- 3.11 -> DG N7 B0125 : score 5.98877 : H : ARG NH2 A0114 <- 2.69 -> DG O6 B0125 : score 6.7452 : H : ARG NH2 A0114 <- 3.04 -> DG O6 C0149 : score 6.2832 : V : MET CE A0026 <- 3.79 -> DT C7 B0136 : score 6.94758 >2jx1_A:CCHHC_domain; title=STRUCTURE OF THE FIFTH ZINC FINGER OF MYELIN TRANSCRIPTION FACTOR 1 IN COMPLEX WITH RARE DNA organism=MUS MUSCULUS : H : ASN ND2 A0026 <- 2.78 -> DT O4 B0009 : score 5.30575 : H : TYR OH A0027 <- 2.97 -> DT N3 B0009 : score 1.39327 : H : SER OG A0034 <- 2.95 -> DG O6 B0008 : score 3.96829 : H : SER OG A0034 <- 2.66 -> DC N3 C0019 : score 2.03623 : H : SER OG A0034 <- 2.66 -> DC N3 C0019 : score 2.03623 : H : SER OG A0034 <- 3.01 -> DT N3 C0020 : score 1.90372 : H : SER OG A0034 <- 2.60 -> DT O4 C0020 : score 3.69733 : x : HIS xxxx A0022 <- 3.78 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0032 <- 3.10 -> DC xxx C0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0033 <- 4.09 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx >2jxi_AB:Ribbon-helix-helix; title=SOLUTION STRUCTURE OF THE DNA-BINDING DOMAIN OF PSEUDOMONAS PUTIDA PROLINE UTILIZATION A (PUTA) BOUND TO GTTGCA DNA SEQUENCE organism=PSEUDOMONAS PUTIDA : x : THR xxxx A0005 <- 3.44 -> DA xxx D0023 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0030 <- 3.88 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0050 <- 3.84 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0075 <- 3.25 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx >2jxi_B:Ribbon-helix-helix; title=SOLUTION STRUCTURE OF THE DNA-BINDING DOMAIN OF PSEUDOMONAS PUTIDA PROLINE UTILIZATION A (PUTA) BOUND TO GTTGCA DNA SEQUENCE organism=PSEUDOMONAS PUTIDA : x : THR xxxx B0050 <- 3.84 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0075 <- 3.25 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx >2jzw_A:Retrovirus_zinc_finger-like_domains; title=HOW THE HIV-1 NUCLEOCAPSID PROTEIN BINDS AND DESTABILISES THE (- )PRIMER BINDING SITE DURING REVERSE TRANSCRIPTION organism=? : H : THR OG1 A0024 <- 3.31 -> DC O2 B0105 : score 2.35783 : x : VAL xxxx A0013 <- 3.21 -> DC xxx B0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0026 <- 3.05 -> DG xxx B0111 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0027 <- 3.07 -> DG xxx B0111 : score x.xxxxx >2k1n_ABCD:AbrB/MazE/MraZ-like; title=DNA BOUND STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF ABRB organism=BACILLUS SUBTILIS : H : ARG NH1 A0015 <- 3.06 -> DG N7 E0007 : score 5.7354 : H : ARG NH1 B0015 <- 3.15 -> DG O6 F0017 : score 5.6575 : H : ARG NH2 B0015 <- 2.82 -> DA N7 E0008 : score 1.66511 : H : ARG NE D0015 <- 2.81 -> DT O4 F0007 : score 1.85526 : H : ARG NH2 D0015 <- 2.83 -> DT O4 F0007 : score 3.53252 : V : LEU CD1 B0013 <- 3.78 -> DT C7 F0015 : score 5.75994 : x : ASP xxxx A0011 <- 2.91 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0013 <- 3.35 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0017 <- 4.41 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0011 <- 4.48 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0024 <- 3.45 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0013 <- 3.23 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0015 <- 2.84 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0017 <- 3.38 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0023 <- 3.56 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0011 <- 4.15 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0013 <- 3.89 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx >2k1n_B:AbrB/MazE/MraZ-like; title=DNA BOUND STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF ABRB organism=BACILLUS SUBTILIS : H : ARG NH1 B0015 <- 3.15 -> DG O6 F0017 : score 5.6575 : H : ARG NH2 B0015 <- 2.82 -> DA N7 E0008 : score 1.66511 : V : LEU CD1 B0013 <- 3.78 -> DT C7 F0015 : score 5.75994 : x : ASP xxxx B0011 <- 4.48 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0024 <- 3.45 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx >2k7f_A:BRCT_domain; title=HADDOCK CALCULATED MODEL OF THE COMPLEX BETWEEN THE BRCT REGION OF RFC P140 AND DSDNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 A0440 <- 3.30 -> DC N4 C0019 : score 3.77423 : H : SER OG A0454 <- 2.81 -> DC N4 B0007 : score 3.66829 : H : SER OG A0457 <- 2.95 -> DA N7 B0009 : score 4.33018 : H : SER OG A0457 <- 3.25 -> DA N6 B0009 : score 2.99367 : x : TYR xxxx A0385 <- 3.21 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0415 <- 3.78 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0452 <- 3.17 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0453 <- 3.42 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0456 <- 4.40 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0458 <- 3.34 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx >2kae_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=DATA-DRIVEN MODEL OF MED1:DNA COMPLEX organism=CAENORHABDITIS ELEGANS : H : ARG NE A0124 <- 2.67 -> DG O6 B0008 : score 4.04349 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.63 -> DG O6 B0008 : score 6.8244 : H : ARG NH2 A0144 <- 3.05 -> DG O6 C0028 : score 6.27 : H : TYR OH A0158 <- 2.77 -> DA N7 C0025 : score 4.17619 : H : TYR OH A0158 <- 2.73 -> DA N6 C0026 : score 4.7359 : H : ARG NH1 A0161 <- 2.69 -> DT O4 B0015 : score 3.33984 : H : ARG NH1 A0161 <- 2.74 -> DT O4 B0016 : score 3.30716 : H : ARG NH2 A0161 <- 2.84 -> DT O4 B0016 : score 3.52542 : V : ILE CB A0141 <- 3.75 -> DT C7 C0029 : score -3.05723 : x : ILE xxxx A0123 <- 3.42 -> DT xxx C0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0126 <- 3.40 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0137 <- 3.30 -> DA xxx C0030 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0142 <- 4.03 -> DT xxx C0029 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0154 <- 3.29 -> DA xxx B0012 : score x.xxxxx >2kdz_A:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF THE R2R3 DNA BINDING DOMAIN OF MYB1 PROTEIN FROM PROTOZOAN PARASITE TRICHOMONAS VAGINALIS IN COMPLEX WITH MRE-1/MRE- 2R DNA organism=TRICHOMONAS VAGINALIS : H : ASN ND2 A0035 <- 2.73 -> DA N7 B0010 : score 5.9527 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.86 -> DT O4 C0023 : score 5.12873 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.58 -> DG O6 B0009 : score 6.06055 : H : GLU OE1 A0041 <- 2.73 -> DC N4 B0008 : score 5.8487 : H : GLU OE2 A0041 <- 2.76 -> DC N4 C0024 : score 5.30751 : H : ASN OD1 A0088 <- 2.81 -> DC N4 C0024 : score 4.1852 : H : ASN ND2 A0088 <- 3.14 -> DG O6 C0025 : score 5.25505 : H : ASN ND2 A0088 <- 3.11 -> DA N7 B0007 : score 5.50654 : H : ASN ND2 A0092 <- 2.81 -> DA N7 B0006 : score 5.85877 : x : ARG xxxx A0037 <- 3.29 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx >2kei_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=REFINED SOLUTION STRUCTURE OF A DIMER OF LAC REPRESSOR DNA-BINDING DOMAIN COMPLEXED TO ITS NATURAL OPERATOR O1 organism=ESCHERICHIA COLI : H : TYR OH A0007 <- 2.96 -> DC N4 D0013 : score 4.07925 : H : GLN NE2 A0018 <- 2.69 -> DT O4 C0006 : score 5.30523 : H : GLN NE2 A0018 <- 2.64 -> DG O6 C0007 : score 5.99089 : H : ARG NH1 A0022 <- 2.87 -> DG N7 C0005 : score 5.9653 : H : ARG NH1 A0022 <- 3.07 -> DG O6 C0005 : score 5.75483 : H : ARG NH2 A0022 <- 2.90 -> DG N7 C0005 : score 6.25692 : H : TYR OH B0017 <- 2.60 -> DT O4 C0014 : score 3.64267 : H : GLN OE1 B0018 <- 2.72 -> DA N6 C0015 : score 6.14941 : H : ARG NH1 B0022 <- 3.00 -> DG N7 D0005 : score 5.808 : H : ARG NH1 B0022 <- 2.83 -> DG O6 D0005 : score 6.04683 : H : ARG NH2 B0022 <- 2.93 -> DG N7 D0005 : score 6.21862 : x : LEU xxxx A0006 <- 3.49 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0016 <- 3.56 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0017 <- 2.69 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0021 <- 3.29 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0029 <- 3.20 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0053 <- 3.92 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0056 <- 2.99 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 3.07 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0007 <- 3.34 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0016 <- 3.42 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0021 <- 2.87 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0029 <- 3.48 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0053 <- 3.88 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0056 <- 3.01 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0057 <- 3.62 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >2kei_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=REFINED SOLUTION STRUCTURE OF A DIMER OF LAC REPRESSOR DNA-BINDING DOMAIN COMPLEXED TO ITS NATURAL OPERATOR O1 organism=ESCHERICHIA COLI : H : TYR OH B0017 <- 2.60 -> DT O4 C0014 : score 3.64267 : H : GLN OE1 B0018 <- 2.72 -> DA N6 C0015 : score 6.14941 : H : ARG NH1 B0022 <- 3.00 -> DG N7 D0005 : score 5.808 : H : ARG NH1 B0022 <- 2.83 -> DG O6 D0005 : score 6.04683 : H : ARG NH2 B0022 <- 2.93 -> DG N7 D0005 : score 6.21862 : x : TYR xxxx B0007 <- 3.34 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0016 <- 3.42 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0021 <- 2.87 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0029 <- 3.48 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0053 <- 3.88 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0056 <- 3.01 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0057 <- 3.62 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >2kej_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=SOLUTION STRUCTURE OF A DIMER OF LAC REPRESSOR DNA-BINDING DOMAIN COMPLEXED TO ITS NATURAL OPERATOR O2 organism=ESCHERICHIA COLI : H : TYR OH A0007 <- 3.25 -> DC N4 D0013 : score 3.83483 : H : TYR OH A0017 <- 2.98 -> DA N6 C0008 : score 4.50237 : H : GLN OE1 A0018 <- 2.77 -> DA N6 D0016 : score 6.08888 : V : HIS CB A0029 <- 3.87 -> DT C7 C0004 : score 4.05294 : x : LEU xxxx A0006 <- 3.65 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0016 <- 3.59 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0021 <- 3.61 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0022 <- 3.21 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0053 <- 3.29 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0056 <- 2.97 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 3.40 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx >2kej_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=SOLUTION STRUCTURE OF A DIMER OF LAC REPRESSOR DNA-BINDING DOMAIN COMPLEXED TO ITS NATURAL OPERATOR O2 organism=ESCHERICHIA COLI : H : TYR OH A0007 <- 3.25 -> DC N4 D0013 : score 3.83483 : H : TYR OH A0017 <- 2.98 -> DA N6 C0008 : score 4.50237 : H : GLN OE1 A0018 <- 2.77 -> DA N6 D0016 : score 6.08888 : H : TYR OH B0007 <- 2.78 -> DA N7 C0012 : score 4.16789 : H : TYR OH B0017 <- 2.87 -> DG N7 C0013 : score 4.22716 : H : GLN OE1 B0018 <- 2.86 -> DA N6 C0015 : score 5.97993 : H : GLN OE1 B0018 <- 2.86 -> DA N6 C0016 : score 5.97993 : H : ARG NH2 B0022 <- 3.05 -> DG O6 D0005 : score 6.27 : V : HIS CB A0029 <- 3.87 -> DT C7 C0004 : score 4.05294 : V : HIS CB B0029 <- 3.55 -> DT C7 D0004 : score 4.38295 : x : LEU xxxx A0006 <- 3.65 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0016 <- 3.59 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0021 <- 3.61 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0022 <- 3.21 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0053 <- 3.29 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0056 <- 2.97 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 3.40 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0016 <- 3.60 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0021 <- 3.42 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0053 <- 3.99 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0056 <- 3.18 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0057 <- 3.01 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx >2kek_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=SOLUTION STRUCTURE OF A DIMER OF LAC REPRESSOR DNA-BINDING DOMAIN COMPLEXED TO ITS NATURAL OPERATOR O3 organism=ESCHERICHIA COLI : H : TYR OH A0007 <- 3.24 -> DC N4 D0013 : score 3.84326 : H : TYR OH A0017 <- 3.04 -> DG O6 C0007 : score 3.45893 : H : GLN OE1 A0018 <- 2.91 -> DC N4 D0015 : score 4.4825 : H : GLN NE2 A0018 <- 2.73 -> DT O4 C0006 : score 5.2637 : x : LEU xxxx A0006 <- 3.70 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0016 <- 3.83 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0021 <- 4.08 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0022 <- 3.02 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0056 <- 3.27 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 2.92 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx >2kek_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=SOLUTION STRUCTURE OF A DIMER OF LAC REPRESSOR DNA-BINDING DOMAIN COMPLEXED TO ITS NATURAL OPERATOR O3 organism=ESCHERICHIA COLI : H : TYR OH A0007 <- 3.24 -> DC N4 D0013 : score 3.84326 : H : TYR OH A0017 <- 3.04 -> DG O6 C0007 : score 3.45893 : H : GLN OE1 A0018 <- 2.91 -> DC N4 D0015 : score 4.4825 : H : GLN NE2 A0018 <- 2.73 -> DT O4 C0006 : score 5.2637 : H : TYR OH B0017 <- 3.13 -> DA N7 C0013 : score 3.8773 : H : GLN OE1 B0018 <- 2.89 -> DC N4 D0006 : score 4.50083 : x : LEU xxxx A0006 <- 3.70 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0016 <- 3.83 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0021 <- 4.08 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0022 <- 3.02 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0056 <- 3.27 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 2.92 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0007 <- 3.20 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0022 <- 4.33 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0029 <- 3.97 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0053 <- 4.11 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0056 <- 3.03 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0057 <- 3.08 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >2kkf_A: title=SOLUTION STRUCTURE OF MLL CXXC DOMAIN IN COMPLEX WITH PALINDROMIC CPG DNA organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ A1186 <- 3.02 -> DG N7 C0107 : score 5.14892 : x : ARG xxxx A1150 <- 2.65 -> DC xxx B0106 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1183 <- 3.24 -> DT xxx B0104 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1185 <- 3.88 -> DG xxx C0105 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1187 <- 2.81 -> DG xxx B0107 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1190 <- 3.80 -> DT xxx C0104 : score x.xxxxx >2kmk_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=GFI-1 ZINC FINGERS 3-5 COMPLEXED WITH DNA organism=RATTUS NORVEGICUS : H : ARG NH1 A0013 <- 2.95 -> DG O6 C0203 : score 5.90083 : H : SER OG A0015 <- 3.06 -> DC N4 C0205 : score 3.48451 : H : GLN OE1 A0041 <- 2.96 -> DA N6 B0109 : score 5.85888 : H : GLN NE2 A0041 <- 3.38 -> DA N7 B0109 : score 5.38333 : H : ASP OD2 A0044 <- 3.09 -> DC N4 B0108 : score 5.8404 : H : GLN OE1 A0069 <- 3.21 -> DA N6 B0106 : score 5.55625 : H : GLN NE2 A0069 <- 3.13 -> DA N7 B0106 : score 5.68782 : H : SER OG A0071 <- 2.37 -> DA N7 C0210 : score 4.84802 : V : THR CG2 A0016 <- 3.74 -> DT C7 B0111 : score 4.30048 : x : PHE xxxx A0002 <- 4.06 -> DA xxx C0202 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0014 <- 3.73 -> DG xxx C0203 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0040 <- 4.22 -> DC xxx B0108 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0043 <- 3.56 -> DT xxx C0208 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0047 <- 4.13 -> DT xxx B0107 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0070 <- 3.96 -> DG xxx C0209 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0072 <- 3.87 -> DA xxx B0105 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0075 <- 3.88 -> DT xxx C0211 : score x.xxxxx >2kn7_AD:RuvA_domain_2-like; title=STRUCTURE OF THE XPF-SINGLE STRAND DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : HIS ND1 D0136 <- 2.79 -> DG N7 C0003 : score 6.23552 >2ko0_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=SOLUTION STRUCTURE OF THE THAP ZINC FINGER OF THAP1 IN COMPLEX WITH ITS DNA TARGET organism=HOMO SAPIENS : H : GLN OE1 A0003 <- 2.83 -> DC N4 B0012 : score 4.55583 : H : GLN NE2 A0003 <- 3.17 -> DT O4 C0020 : score 4.80689 : H : LYS NZ A0024 <- 2.93 -> DT O4 B0008 : score 3.49391 : H : LYS NZ A0024 <- 3.16 -> DG O6 B0009 : score 5.36455 : H : SER OG A0052 <- 3.01 -> DG N7 B0010 : score 4.29381 : x : MET xxxx A0001 <- 3.55 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0047 <- 3.25 -> DC xxx C0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0048 <- 3.03 -> DC xxx C0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0050 <- 3.07 -> DC xxx C0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0051 <- 3.38 -> DC xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0065 <- 3.39 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx >2ktq_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=OPEN TERNARY COMPLEX OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 3.33 -> DC O2 B0109 : score 2.63386 : w : ARG NE A0573 <- 6.25 -> DG N3 D0206 : score 1.082 : w : ARG NH2 A0573 <- 6.11 -> DG N3 D0206 : score 0.677 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.42 -> DC O2 D0207 : score 1.885 : x : TYR xxxx A0545 <- 4.45 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0583 <- 3.30 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0671 <- 3.40 -> DG xxx D0205 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0750 <- 4.49 -> DG xxx D0205 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0754 <- 3.49 -> DG xxx D0205 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0784 <- 4.08 -> DG xxx D0206 : score x.xxxxx >2ky8_A:DNA-binding_domain; title=SOLUTION STRUCTURE AND DYNAMIC ANALYSIS OF CHICKEN MBD2 METHYL BINDING DOMAIN BOUND TO A TARGET METHYLATED DNA SEQUENCE organism=GALLUS GALLUS : H : ARG NH1 A0024 <- 3.31 -> DG N7 B0106 : score 5.4329 : H : ARG NH2 A0024 <- 2.95 -> DG O6 B0106 : score 6.402 : H : LYS NZ A0032 <- 2.96 -> DG N7 C0113 : score 5.21355 : H : ARG NH1 A0046 <- 3.15 -> DG O6 C0116 : score 5.6575 : H : ARG NH1 A0046 <- 3.20 -> DT O4 B0104 : score 3.00651 : H : ARG NH2 A0046 <- 3.30 -> DG N7 C0116 : score 5.74615 >2l1g_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=RDC REFINED SOLUTION STRUCTURE OF THE THAP ZINC FINGER OF THAP1 IN COMPLEX WITH ITS 16BP RRM1 DNA TARGET organism=HOMO SAPIENS : H : GLN OE1 A0003 <- 3.06 -> DC N4 B0012 : score 4.345 : H : GLN NE2 A0003 <- 3.16 -> DT O4 C0020 : score 4.81727 : H : LYS NZ A0024 <- 2.87 -> DT O4 B0008 : score 3.53696 : H : LYS NZ A0024 <- 3.19 -> DG O6 B0009 : score 5.32987 : H : SER OG A0052 <- 3.18 -> DG N7 B0010 : score 4.14142 : x : MET xxxx A0001 <- 3.08 -> DG xxx C0021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0002 <- 3.87 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0047 <- 3.58 -> DC xxx C0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0048 <- 3.11 -> DC xxx C0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0050 <- 3.08 -> DC xxx C0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0051 <- 3.35 -> DC xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0065 <- 3.44 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx >2ld5_A:Homeodomain-like; title=SOLUTION NMR-DERIVED COMPLEX STRUCTURE OF HOXA13 DNA BINDING DOMAIN BOUND TO DNA organism=MUS MUSCULUS : H : LYS NZ A0010 <- 2.87 -> DA N3 C0013 : score 2.73805 : H : ARG NH2 A0011 <- 3.07 -> DT O2 C0017 : score 4.00473 : H : GLN NE2 A0056 <- 3.01 -> DA N7 B0002 : score 5.83397 : H : ASN OD1 A0057 <- 2.80 -> DA N6 C0018 : score 6.02179 : H : ASN ND2 A0057 <- 3.01 -> DA N7 C0018 : score 5.62395 : V : VAL CG1 A0060 <- 3.72 -> DT C7 C0017 : score 6.18172 : V : ILE CG2 A0053 <- 3.67 -> DT C7 C0019 : score 7.32175 : x : ARG xxxx A0049 <- 3.83 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0050 <- 4.45 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0061 <- 4.18 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0064 <- 3.88 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx >2lef_A:HMG-box; title=LEF1 HMG DOMAIN (FROM MOUSE), COMPLEXED WITH DNA (15BP), NMR, 12 STRUCTURES organism=MUS MUSCULUS : H : ASN ND2 A0008 <- 2.79 -> DT O2 B0008 : score 4.75565 : H : ASN ND2 A0008 <- 2.86 -> DG N3 B0009 : score 4.83613 : H : SER OG A0030 <- 2.68 -> DA N3 C0010 : score 3.07594 : H : ASN ND2 A0034 <- 2.82 -> DT O2 B0006 : score 4.72717 : H : TYR OH A0076 <- 2.76 -> DT O2 C0005 : score 3.2424 : H : TYR OH A0076 <- 2.78 -> DG N2 B0012 : score 4.9093 : H : ARG NH2 A0082 <- 2.83 -> DT O4 B0006 : score 3.53252 : H : LYS NZ A0086 <- 2.88 -> DT O4 C0006 : score 3.52978 : H : LYS NZ A0086 <- 2.98 -> DG O6 B0009 : score 5.57266 : x : LYS xxxx A0005 <- 4.07 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0011 <- 3.29 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0014 <- 3.50 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0029 <- 4.43 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0031 <- 3.11 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0081 <- 3.85 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0083 <- 4.50 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx >2lev_A:H-NS_histone-like_proteins; title=STRUCTURE OF THE DNA COMPLEX OF THE C-TERMINAL DOMAIN OF LER organism=ESCHERICHIA COLI : x : ARG xxxx A0021 <- 3.03 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx >2lex_A:WRKY_DNA-binding_domain; title=COMPLEX OF THE C-TERMINAL WRKY DOMAIN OF ATWRKY4 AND A W-BOX DNA organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : LYS NZ A0420 <- 3.32 -> DG N7 C0023 : score 4.82576 : x : ARG xxxx A0415 <- 3.25 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0416 <- 4.04 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0417 <- 3.59 -> DT xxx C0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0419 <- 3.86 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0431 <- 4.09 -> DT xxx C0024 : score x.xxxxx >2lkx_A:Homeodomain-like; title=NMR STRUCTURE OF THE HOMEODOMAIN OF PITX2 IN COMPLEX WITH A TAATCC DNA BINDING SITE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0003 <- 2.91 -> DA N3 B0073 : score 3.60105 : H : ARG NE A0005 <- 2.85 -> DT O2 B0071 : score 2.55115 : H : ARG NH2 A0005 <- 3.03 -> DT O2 B0071 : score 4.0386 : H : LYS NZ A0050 <- 3.09 -> DG O6 C0083 : score 5.44548 : H : LYS NZ A0050 <- 2.94 -> DG O6 C0084 : score 5.61891 : H : ASN OD1 A0051 <- 3.19 -> DA N6 B0073 : score 5.55209 : H : ASN ND2 A0051 <- 2.94 -> DA N7 B0073 : score 5.70614 : H : LYS NZ A0055 <- 2.87 -> DA N7 B0072 : score 2.89606 : V : VAL CG1 A0047 <- 3.55 -> DT C7 B0074 : score 6.43929 >2lt7_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=SOLUTION NMR STRUCTURE OF KAISO ZINC FINGER DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH KAISO BINDING SITE DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0511 <- 2.77 -> DG O6 D0010 : score 6.11983 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.00 -> DG N7 D0010 : score 6.12923 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.02 -> DG O6 D0010 : score 6.3096 : H : GLU OE1 A0535 <- 2.80 -> DC N4 E0029 : score 5.76795 : H : GLN NE2 A0563 <- 2.77 -> DG O6 E0032 : score 5.83996 : H : ARG NH1 A0595 <- 3.05 -> DT O2 E0026 : score 4.09109 : H : ARG NH2 A0595 <- 2.77 -> DG N3 E0027 : score 3.63192 : H : TYR OH A0597 <- 3.16 -> DG N2 E0027 : score 4.53768 : V : THR CB A0507 <- 3.73 -> DT C7 E0026 : score 3.58786 >2ltt_AB: title=SOLUTION NMR STRUCTURE OF YDBC:DT19G1 COMPLEX. NORTHEAST STRUCTURAL GENOMICS CONSORTIUM (NESG) TARGET KR150 organism=LACTOCOCCUS LACTIS SUBSP. LACTIS : H : ARG NE A0042 <- 3.05 -> DT O2 C0004 : score 2.44808 : H : ARG NH2 A0042 <- 3.00 -> DT O2 C0005 : score 4.064 : H : THR OG1 A0043 <- 2.76 -> DT O4 C0002 : score 3.91828 : H : SER OG A0058 <- 2.74 -> DT N3 C0007 : score 2.01103 : H : ARG NE B0042 <- 2.97 -> DT O2 C0014 : score 2.48931 : H : ARG NH2 B0042 <- 3.05 -> DT O2 C0015 : score 4.02167 : H : THR OG1 B0043 <- 2.77 -> DT O4 C0012 : score 3.9105 : H : SER OG B0058 <- 2.68 -> DT N3 C0017 : score 2.03487 : V : PHE CG A0007 <- 3.62 -> DT C7 C0004 : score 5.51546 : V : TRP CG A0032 <- 3.87 -> DT C7 C0005 : score 5.40022 : V : PHE CG B0007 <- 3.56 -> DT C7 C0014 : score 5.59463 : V : TRP CG B0032 <- 3.79 -> DT C7 C0015 : score 5.51015 : V : THR CB B0056 <- 3.87 -> DT C7 C0017 : score 3.46445 : x : LEU xxxx A0005 <- 3.23 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0020 <- 3.81 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0021 <- 3.61 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0023 <- 3.57 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0030 <- 4.33 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0033 <- 3.06 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0035 <- 3.65 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0038 <- 3.27 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0040 <- 3.20 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0044 <- 3.41 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0045 <- 4.16 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0049 <- 4.21 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0050 <- 3.72 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0051 <- 3.40 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0053 <- 4.04 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0056 <- 3.71 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0061 <- 3.74 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0005 <- 3.20 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0020 <- 4.00 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0021 <- 3.55 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0023 <- 3.56 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0025 <- 4.48 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0030 <- 4.34 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0033 <- 3.07 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0035 <- 3.67 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0038 <- 3.18 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0040 <- 3.30 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0044 <- 3.53 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0045 <- 4.17 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0049 <- 4.31 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0050 <- 3.66 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0051 <- 3.40 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0053 <- 3.87 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0061 <- 3.93 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx >2ltt_B: title=SOLUTION NMR STRUCTURE OF YDBC:DT19G1 COMPLEX. NORTHEAST STRUCTURAL GENOMICS CONSORTIUM (NESG) TARGET KR150 organism=LACTOCOCCUS LACTIS SUBSP. LACTIS : H : ARG NE B0042 <- 2.97 -> DT O2 C0014 : score 2.48931 : H : ARG NH2 B0042 <- 3.05 -> DT O2 C0015 : score 4.02167 : H : THR OG1 B0043 <- 2.77 -> DT O4 C0012 : score 3.9105 : H : SER OG B0058 <- 2.68 -> DT N3 C0017 : score 2.03487 : V : PHE CG B0007 <- 3.56 -> DT C7 C0014 : score 5.59463 : V : TRP CG B0032 <- 3.79 -> DT C7 C0015 : score 5.51015 : V : THR CB B0056 <- 3.87 -> DT C7 C0017 : score 3.46445 : x : LEU xxxx B0005 <- 3.20 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0020 <- 4.00 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0021 <- 3.55 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0023 <- 3.56 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0025 <- 4.48 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0030 <- 4.34 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0033 <- 3.07 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0035 <- 3.67 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0038 <- 3.18 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0040 <- 3.30 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0044 <- 3.53 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0045 <- 4.17 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0049 <- 4.31 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0050 <- 3.66 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0051 <- 3.40 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0053 <- 3.87 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0061 <- 3.93 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx >2m2w_A:Nucleotidyltransferase; title=TERNARY COMPLEX OF ASFV POL X WITH DNA AND MGDGTP organism=AFRICAN SWINE FEVER VIRUS : H : GLU OE2 A0083 <- 2.84 -> DG N2 B0011 : score 4.27577 : H : HIS NE2 A0115 <- 2.91 -> DG N2 B0010 : score 3.64618 : H : ARG NH2 A0127 <- 3.11 -> DG N3 B0010 : score 3.38642 : x : VAL xxxx A0120 <- 3.43 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0124 <- 4.01 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0132 <- 4.32 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx >2me6_A:Homeodomain-like; title=NMR STRUCTURE OF THE HOMEODOMAIN TRANSCRIPTION FACTOR GBX1 FROM HOMO SAPIENS IN COMPLEX WITH THE DNA SEQUENCE CGACTAATTAGTCG organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0008 <- 2.93 -> DA N3 C0020 : score 3.58632 : H : ARG NH2 A0008 <- 2.91 -> DT O2 B0009 : score 4.1402 : H : ARG NH1 A0010 <- 2.95 -> DT O2 C0019 : score 4.17722 : H : GLN NE2 A0056 <- 2.95 -> DT O4 C0022 : score 5.0353 : x : VAL xxxx A0049 <- 4.12 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0052 <- 3.29 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0053 <- 3.25 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0057 <- 2.94 -> DA xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0064 <- 3.14 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx >2mf8_A:CCHHC_domain; title=HADDOCK MODEL OF MYT1 F4F5 - DNA COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 A0821 <- 3.05 -> DA N7 B0007 : score 1.58821 : H : SER OG A0822 <- 2.71 -> DA N6 B0006 : score 3.34896 : H : SER OG A0822 <- 2.99 -> DT O4 C0020 : score 3.42003 : H : SER OG A0824 <- 3.09 -> DA N7 B0006 : score 4.20518 : H : SER OG A0824 <- 2.98 -> DA N6 B0006 : score 3.17131 : H : ARG NH2 A0865 <- 2.96 -> DA N7 C0018 : score 1.6183 : H : SER OG A0866 <- 2.85 -> DT O4 B0009 : score 3.51958 : H : SER OG A0868 <- 3.36 -> DA N7 C0017 : score 3.96412 : H : SER OG A0868 <- 3.02 -> DA N6 C0017 : score 3.14499 : V : LEU CD2 A0867 <- 3.63 -> DT C7 B0010 : score 5.97486 : V : LEU CG A0823 <- 3.70 -> DT C7 C0021 : score 4.50895 : x : SER xxxx A0819 <- 3.99 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0863 <- 4.12 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx >2moe_A:DNA-binding_domain; title=SOLUTION STRUCTURE OF MBD4 METHYL-CYTOSINE BINDING DOMAIN BOUND TO METHYLATED DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0097 <- 3.10 -> DG N7 B0206 : score 5.687 : H : ARG NH1 A0097 <- 2.95 -> DG O6 B0206 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0097 <- 3.03 -> DG O6 B0206 : score 6.2964 : H : ARG NH1 A0119 <- 2.89 -> DG N7 C0216 : score 5.9411 : H : ARG NH1 A0119 <- 2.93 -> DG O6 C0216 : score 5.92517 : H : ARG NH2 A0119 <- 2.99 -> DG N7 C0216 : score 6.142 : x : LYS xxxx A0101 <- 3.06 -> DG xxx B0207 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0102 <- 3.38 -> DG xxx B0207 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0105 <- 3.72 -> DC xxx C0214 : score x.xxxxx >2mru_A:AbrB/MazE/MraZ-like; title=STRUCTURE OF TRUNCATED ECMAZE-DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : H : TRP NE1 A0009 <- 3.01 -> DA N7 X0007 : score -8.72885 : x : LYS xxxx A0007 <- 3.82 -> DT xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0011 <- 3.00 -> DA xxx X0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0012 <- 2.82 -> DA xxx X0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0016 <- 3.94 -> DA xxx Y0006 : score x.xxxxx >2mru_AB:AbrB/MazE/MraZ-like; title=STRUCTURE OF TRUNCATED ECMAZE-DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : H : TRP NE1 A0009 <- 3.01 -> DA N7 X0007 : score -8.72885 : H : TRP NE1 B0009 <- 2.92 -> DT O4 Y0007 : score 4.69231 : x : LYS xxxx A0007 <- 3.82 -> DT xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0011 <- 3.00 -> DA xxx X0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0012 <- 2.82 -> DA xxx X0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0016 <- 3.94 -> DA xxx Y0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0011 <- 3.66 -> DA xxx Y0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0012 <- 3.98 -> DC xxx Y0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0016 <- 4.23 -> DA xxx X0007 : score x.xxxxx >2mxf_A: title=STRUCTURE OF THE DNA COMPLEX OF THE C-TERMINAL DOMAIN OF MVAT organism=PSEUDOMONAS AERUGINOSA PAO1 : H : ARG NH1 A0080 <- 2.91 -> DT O2 C0021 : score 4.21167 : H : ARG NH2 A0080 <- 2.86 -> DT O2 C0021 : score 4.18253 : H : ARG NH2 A0080 <- 2.72 -> DT O2 B0005 : score 4.30107 : H : ASN ND2 A0100 <- 3.06 -> DT O2 C0017 : score 4.49935 >2n8a_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=1H, 13C AND 15N CHEMICAL SHIFT ASSIGNMENTS AND SOLUTION STRUCTURE FOR PARP-1 F1F2 DOMAINS IN COMPLEX WITH A DNA SINGLE-STRAND BREAK organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0122 <- 3.33 -> DG N3 B0043 : score 3.22757 : V : VAL CG2 A0048 <- 3.88 -> DT C7 B0023 : score 6.00062 : x : ARG xxxx A0018 <- 3.26 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0041 <- 3.70 -> DT xxx B0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0044 <- 3.11 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0049 <- 4.26 -> DC xxx B0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0150 <- 3.02 -> DC xxx B0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0151 <- 3.12 -> DC xxx B0024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0154 <- 2.94 -> DG xxx B0045 : score x.xxxxx >2nbj_A:Chromosomal_protein_MC1; title=DNA-ARCHEAL MC1 PROTEIN COMPLEX STRUCTURE BY NMR organism=METHANOSARCINA THERMOPHILA CHTI-55 : x : GLN xxxx A0023 <- 3.80 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 4.14 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0073 <- 4.27 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0074 <- 2.95 -> DA xxx B0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0091 <- 3.32 -> DA xxx B0003 : score x.xxxxx >2nl8_A:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=THE ORIGIN BINDING DOMAIN OF THE SV40 LARGE T ANTIGEN BOUND NON SPECIFICALLY TO A 17 BP PALINDROME DNA (SITES 1 AND 3) organism=Simian virus 40 : w : THR OG1 A0155 <- 6.22 -> DC N4 W0016 : score 2.558 : H : ARG NE A0204 <- 3.13 -> DG N7 W0014 : score 4.12996 : H : ARG NH2 A0204 <- 2.64 -> DG O6 W0014 : score 6.8112 : x : ASN xxxx A0153 <- 3.13 -> DC xxx W0015 : score x.xxxxx >2nll_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=RETINOID X RECEPTOR-THYROID HORMONE RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN HETERODIMER BOUND TO THYROID RESPONSE ELEMENT DNA organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ A0156 <- 3.13 -> DG N7 C0504 : score 5.03043 : w : LYS NZ A0160 <- 5.09 -> DA N6 D0534 : score 2.097 : H : GLU OE1 B0321 <- 2.86 -> DC N4 D0525 : score 5.69873 : w : GLU OE1 B0321 <- 6.03 -> DA N6 D0524 : score 2.939 : w : GLU OE2 B0321 <- 5.98 -> DC N4 D0526 : score 3.597 : H : LYS NZ B0324 <- 2.72 -> DG O6 C0514 : score 5.87326 : w : LYS NZ B0324 <- 6.02 -> DA N7 C0513 : score 1.655 : H : ARG NH1 B0328 <- 3.08 -> DG O6 C0515 : score 5.74267 : H : ARG NH2 B0329 <- 2.64 -> DG N7 D0523 : score 6.58892 : H : LYS NZ B0384 <- 3.07 -> DA N3 C0513 : score 2.62697 : x : GLU xxxx A0153 <- 3.17 -> DC xxx D0535 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0161 <- 3.25 -> DG xxx D0533 : score x.xxxxx >2nll_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=RETINOID X RECEPTOR-THYROID HORMONE RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN HETERODIMER BOUND TO THYROID RESPONSE ELEMENT DNA organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 B0321 <- 2.86 -> DC N4 D0525 : score 5.69873 : w : GLU OE1 B0321 <- 6.03 -> DA N6 D0524 : score 2.939 : w : GLU OE2 B0321 <- 5.98 -> DC N4 D0526 : score 3.597 : H : LYS NZ B0324 <- 2.72 -> DG O6 C0514 : score 5.87326 : w : LYS NZ B0324 <- 6.02 -> DA N7 C0513 : score 1.655 : H : ARG NH1 B0328 <- 3.08 -> DG O6 C0515 : score 5.74267 : w : ARG NH2 B0328 <- 6.24 -> DT O4 C0516 : score 2.366 : H : ARG NH2 B0329 <- 2.64 -> DG N7 D0523 : score 6.58892 : w : ARG NH2 B0329 <- 6.49 -> DT O4 C0516 : score 2.366 : H : LYS NZ B0384 <- 3.07 -> DA N3 C0513 : score 2.62697 >2nny_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ETS1 DIMER DNA COMPLEX. organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0387 <- 3.41 -> DC N4 D0018 : score 5.06426 : w : GLU OE1 A0387 <- 6.11 -> DC N4 D0017 : score 3.528 : H : ARG NE A0391 <- 2.88 -> DG O6 C0008 : score 3.87797 : H : ARG NH2 A0391 <- 2.89 -> DG N7 C0008 : score 6.26969 : H : ARG NE A0394 <- 2.87 -> DG N7 C0007 : score 4.35989 : H : ARG NH2 A0394 <- 2.84 -> DG O6 C0007 : score 6.5472 : H : TYR OH A0395 <- 2.92 -> DA N6 C0009 : score 4.55842 : V : LYS CG A0388 <- 3.85 -> DT C7 D0016 : score 2.09249 >2nny_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ETS1 DIMER DNA COMPLEX. organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0387 <- 3.41 -> DC N4 D0018 : score 5.06426 : w : GLU OE1 A0387 <- 6.11 -> DC N4 D0017 : score 3.528 : H : ARG NE A0391 <- 2.88 -> DG O6 C0008 : score 3.87797 : H : ARG NH2 A0391 <- 2.89 -> DG N7 C0008 : score 6.26969 : H : ARG NE A0394 <- 2.87 -> DG N7 C0007 : score 4.35989 : H : ARG NH2 A0394 <- 2.84 -> DG O6 C0007 : score 6.5472 : H : TYR OH A0395 <- 2.92 -> DA N6 C0009 : score 4.55842 : H : ARG NE B0391 <- 2.83 -> DG O6 D0008 : score 3.91738 : H : ARG NH2 B0391 <- 3.32 -> DG N7 D0008 : score 5.72062 : H : ARG NE B0394 <- 2.92 -> DG N7 D0007 : score 4.31567 : H : ARG NH2 B0394 <- 2.97 -> DG O6 D0007 : score 6.3756 : H : TYR OH B0395 <- 2.71 -> DA N6 D0009 : score 4.75458 : x : LYS xxxx A0388 <- 3.85 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0387 <- 4.04 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0388 <- 3.67 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0409 <- 4.34 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx >2nob_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURE OF CATALYTICALLY INACTIVE H270A HUMAN 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE CROSSLINKED TO 8-OXOGUANINE DNA organism=Homo sapiens : H : SER OG A0148 <- 3.14 -> DG N3 C0026 : score 2.58331 : H : SER OG A0148 <- 3.14 -> DG N3 C0026 : score 2.58331 : H : ASN ND2 A0151 <- 3.45 -> DA N3 C0024 : score 3.31269 : w : ASN ND2 A0151 <- 6.19 -> DG N3 B0011 : score 2.566 : H : ARG NH1 A0204 <- 3.07 -> DC O2 B0009 : score 3.4529 : H : ARG NH2 A0204 <- 3.16 -> DC O2 B0009 : score 3.43241 : x : CYS xxxx A0149 <- 3.38 -> DA xxx C0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0154 <- 2.80 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0203 <- 3.57 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0293 <- 4.25 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx >2noe_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURE OF CATALYTICALLY INACTIVE G42A HUMAN 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE COMPLEXED TO 8-OXOGUANINE DNA organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 A0151 <- 3.26 -> DA N3 C0024 : score 3.45738 : w : ASN ND2 A0151 <- 5.96 -> DG N3 B0011 : score 2.566 : H : TYR OH A0203 <- 3.30 -> DG N2 C0026 : score 4.40077 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.67 -> DC O2 B0009 : score 3.7449 : H : ARG NH2 A0204 <- 2.90 -> DC N3 B0009 : score 2.24521 : V : PRO CG A0293 <- 3.89 -> DT C7 B0004 : score 6.2159 : x : ASN xxxx A0149 <- 2.84 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0150 <- 4.23 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0154 <- 2.79 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0207 <- 4.28 -> DT xxx C0027 : score x.xxxxx >2nof_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURE OF Q315F HUMAN 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE PROXIMAL CROSSLINK TO 8-OXOGUANINE DNA organism=Homo sapiens : H : CYS SG A0149 <- 3.39 -> DA N7 C0022 : score 5.06132 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.90 -> DC O2 B0008 : score 3.577 : x : SER xxxx A0148 <- 3.75 -> DG xxx C0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0203 <- 3.37 -> DG xxx C0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0207 <- 4.01 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx >2noh_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURE OF CATALYTICALLY INACTIVE Q315A HUMAN 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE COMPLEXED TO 8-OXOGUANINE DNA organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 A0151 <- 3.12 -> DA N3 C0024 : score 3.564 : w : ASN ND2 A0151 <- 5.86 -> DG N3 B0011 : score 2.566 : H : ARG NH1 A0154 <- 3.17 -> DC O2 B0009 : score 3.3799 : H : TYR OH A0203 <- 3.46 -> DG N2 C0026 : score 4.2443 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.80 -> DC O2 B0009 : score 3.65 : H : ARG NH2 A0204 <- 2.90 -> DC N3 B0009 : score 2.24521 : x : ASN xxxx A0149 <- 2.76 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0150 <- 4.36 -> DA xxx C0024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0293 <- 4.30 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx >2noi_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURE OF G42A HUMAN 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE CROSSLINKED TO UNDAMAGED G-CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : H : SER OG A0148 <- 3.12 -> DG N3 C0024 : score 2.5944 : H : ARG NH1 A0154 <- 2.79 -> DT O2 B0009 : score 4.31502 : H : ARG NH1 A0154 <- 2.79 -> DT O2 B0009 : score 4.31502 : H : ARG NH1 A0204 <- 3.03 -> DC O2 B0008 : score 3.4821 : H : GLN OE1 A0249 <- 3.02 -> DG N2 C0023 : score 5.36095 : x : ALA xxxx A0042 <- 3.49 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0149 <- 3.66 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0152 <- 3.36 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0155 <- 4.01 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0203 <- 3.41 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0207 <- 4.00 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0253 <- 4.25 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0268 <- 3.83 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx >2nol_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURE OF CATALYTICALLY INACTIVE HUMAN 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE DISTAL CROSSLINK TO OXOG DNA organism=Homo sapiens : w : SER OG A0148 <- 5.55 -> DG N3 C0024 : score 2.344 : H : ASN ND2 A0151 <- 3.32 -> DA N3 C0022 : score 3.41169 : H : ASN ND2 A0151 <- 3.32 -> DA N3 C0022 : score 3.41169 : H : ARG NH1 A0154 <- 2.77 -> DC O2 B0008 : score 3.6719 : H : ARG NH2 A0154 <- 2.72 -> DC O2 B0008 : score 3.7579 : w : TYR OH A0203 <- 5.46 -> DG N3 C0024 : score 3.344 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.86 -> DC O2 B0008 : score 3.6062 : x : ASN xxxx A0149 <- 2.74 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0150 <- 4.27 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0207 <- 4.23 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0293 <- 4.16 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx >2noz_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURE OF Q315F HUMAN 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE DISTAL CROSSLINK TO 8-OXOGUANINE DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0154 <- 2.68 -> DC O2 B0008 : score 3.78749 : H : TYR OH A0203 <- 3.43 -> DG N2 C0024 : score 4.27364 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.58 -> DC O2 B0008 : score 3.8106 : H : ARG NH2 A0204 <- 3.20 -> DC N3 B0008 : score 2.10774 : x : ASN xxxx A0149 <- 2.67 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0150 <- 4.20 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0151 <- 3.58 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0207 <- 4.42 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx >2np2_A:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=HBB-DNA COMPLEX organism=BORRELIA BURGDORFERI : H : ARG NH1 A0058 <- 3.17 -> DA N3 C0232 : score 3.40958 : H : ARG NH2 A0058 <- 2.68 -> DT O2 C0231 : score 4.33493 : H : GLN NE2 A0078 <- 2.45 -> DT O2 D0225 : score 4.20867 : x : ARG xxxx A0071 <- 3.38 -> DT xxx C0218 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0075 <- 3.05 -> DT xxx C0216 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0076 <- 3.68 -> DT xxx D0225 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0077 <- 3.22 -> DA xxx D0224 : score x.xxxxx >2np2_AB:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=HBB-DNA COMPLEX organism=BORRELIA BURGDORFERI : H : ARG NH1 A0058 <- 3.17 -> DA N3 C0232 : score 3.40958 : H : ARG NH2 A0058 <- 2.68 -> DT O2 C0231 : score 4.33493 : H : GLN NE2 A0078 <- 2.45 -> DT O2 D0225 : score 4.20867 : H : ARG NH1 B0058 <- 3.06 -> DT O2 D0231 : score 4.08248 : H : ARG NH1 B0071 <- 3.11 -> DT O2 D0218 : score 4.03941 : H : GLN NE2 B0078 <- 2.82 -> DT O2 C0225 : score 3.9176 : x : ARG xxxx A0071 <- 3.38 -> DT xxx C0218 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0075 <- 3.05 -> DT xxx C0216 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0076 <- 3.68 -> DT xxx D0225 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0077 <- 3.22 -> DA xxx D0224 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0075 <- 3.24 -> DT xxx D0216 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0076 <- 4.06 -> DT xxx C0225 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0077 <- 3.11 -> DA xxx C0224 : score x.xxxxx >2np6_A:DNA_methylase_specificity_domain;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ADENINE-SPECIFIC DNA METHYLTRANSFERASE M.TAQI COMPLEXED WITH THE COFACTOR ANALOG AETA AND A 10 BP DNA CONTAINING AN ABASIC SITE ANALOG AT THE TARGET POSITION organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0116 <- 2.66 -> DC O2 C0016 : score 3.02865 : H : TYR OH A0117 <- 3.00 -> DG N2 C0017 : score 4.69415 : H : LYS NZ A0139 <- 3.04 -> DT O2 B0003 : score 3.41499 : H : LYS NZ A0200 <- 2.93 -> DG N7 B0008 : score 5.24586 : H : LYS NZ A0200 <- 2.65 -> DG O6 B0008 : score 5.95419 : H : LYS NZ A0200 <- 2.83 -> DT O4 B0009 : score 3.56566 : H : ARG NE A0271 <- 2.69 -> DT O4 B0003 : score 1.89987 : H : ARG NH2 A0271 <- 2.74 -> DG O6 C0017 : score 6.6792 : w : GLU OE2 A0274 <- 5.45 -> DT O4 B0002 : score 2.279 : H : HIS NE2 A0394 <- 2.80 -> DG O6 B0005 : score 7.95385 : V : PRO CG A0393 <- 3.55 -> DT C7 C0015 : score 6.75641 : x : PHE xxxx A0268 <- 3.46 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0272 <- 3.38 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0273 <- 4.08 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0296 <- 4.09 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0323 <- 3.45 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0335 <- 3.53 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0336 <- 3.85 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0353 <- 4.07 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0354 <- 3.26 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx >2np7_A:DNA_methylase_specificity_domain;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ADENINE-SPECIFIC DNA METHYLTRANSFERASE M.TAQI COMPLEXED WITH THE COFACTOR ANALOG AETA AND A 10 BP DNA CONTAINING AN ABASIC SITE ANALOG AT THE TARGET POSITION AND PYRROLO- DC AT THE TARGET BASE PARTNER POSITION organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0116 <- 2.71 -> DC O2 C0016 : score 2.99918 : H : TYR OH A0117 <- 2.98 -> DG N2 C0017 : score 4.71371 : H : LYS NZ A0139 <- 2.79 -> DT O2 B0003 : score 3.59435 : H : LYS NZ A0200 <- 3.10 -> DT O4 B0009 : score 3.37195 : w : LYS NZ A0200 <- 5.41 -> DG O6 C0011 : score 3.005 : H : ARG NE A0271 <- 2.87 -> DT O4 B0003 : score 1.83295 : H : ARG NH2 A0271 <- 2.97 -> DG O6 C0017 : score 6.3756 : w : GLU OE2 A0274 <- 5.53 -> DT O4 B0002 : score 2.279 : H : HIS NE2 A0394 <- 2.94 -> DG O6 B0005 : score 7.73114 : x : PHE xxxx A0268 <- 3.61 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0272 <- 3.60 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0273 <- 4.37 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0323 <- 3.32 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0335 <- 3.49 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0336 <- 3.74 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0353 <- 4.03 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0354 <- 3.19 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0393 <- 3.66 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx >2nqb_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=DROSOPHILA NUCLEOSOME STRUCTURE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH2 A0440 <- 2.71 -> DA N3 J0229 : score 3.29806 : H : ARG NH1 D1228 <- 3.06 -> DA N3 I0027 : score 3.49058 : H : ARG NH2 D1228 <- 2.43 -> DC O2 I0026 : score 3.97242 : H : ARG NH1 E0640 <- 3.26 -> DA N3 I0082 : score 3.3433 : x : HIS xxxx A0439 <- 4.29 -> DA xxx J0151 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0441 <- 4.44 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.68 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 3.91 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 3.86 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 4.02 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.45 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0245 <- 4.27 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx >2nqj_A:Xylose_isomerase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI ENDONUCLEASE IV (ENDO IV) E261Q MUTANT BOUND TO DAMAGED DNA organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 A0035 <- 3.04 -> DG N2 D0338 : score 4.5696 : H : ASN ND2 A0035 <- 2.75 -> DC O2 C0308 : score 4.52428 : w : GLN NE2 A0038 <- 6.25 -> DC O2 D0337 : score 2.699 : w : GLN NE2 A0150 <- 6.43 -> DC O2 C0305 : score 2.699 : x : GLN xxxx A0036 <- 3.88 -> DC xxx C0308 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0037 <- 3.06 -> DG xxx D0338 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0072 <- 3.58 -> DC xxx C0306 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0073 <- 3.44 -> DG xxx D0340 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0230 <- 3.23 -> DC xxx C0305 : score x.xxxxx >2nra_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PI INITIATOR PROTEIN IN COMPLEX WITH ITERON DNA organism=Escherichia coli : H : SER OG C0071 <- 2.74 -> DG O6 B0027 : score 4.14012 : H : ARG NH2 C0075 <- 3.38 -> DT O4 A0017 : score 3.1416 : H : ARG NH1 C0225 <- 2.79 -> DG N7 A0007 : score 6.0621 : H : ARG NH1 C0225 <- 3.09 -> DG O6 A0007 : score 5.7305 : H : ARG NH2 C0225 <- 3.23 -> DT O4 B0038 : score 3.24822 : H : ASP OD2 C0226 <- 2.44 -> DC N4 B0037 : score 6.6464 : V : LEU CG C0072 <- 3.72 -> DT C7 A0017 : score 4.48695 : x : THR xxxx C0069 <- 3.84 -> DT xxx A0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0074 <- 3.36 -> DA xxx B0025 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0217 <- 3.64 -> DT xxx B0036 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0221 <- 3.59 -> DC xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0222 <- 3.86 -> DT xxx B0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0230 <- 4.23 -> DT xxx B0036 : score x.xxxxx >2ntc_A:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SV40 LARGE T ANTIGEN ORIGIN BINDING DOMAIN WITH DNA organism=Simian virus 40 : H : SER OG A0152 <- 3.02 -> DA N7 C0027 : score 4.26768 : H : ASN ND2 A0153 <- 2.63 -> DG O6 C0029 : score 5.83017 : w : THR OG1 A0155 <- 6.09 -> DC N4 W0017 : score 2.558 : H : ARG NE A0204 <- 2.81 -> DG N7 W0015 : score 4.41295 : H : ARG NH2 A0204 <- 3.13 -> DG O6 W0015 : score 6.1644 : w : ARG NH2 A0204 <- 5.90 -> DG O6 W0014 : score 2.468 : x : ARG xxxx A0154 <- 3.20 -> DG xxx C0026 : score x.xxxxx >2ntc_AB:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SV40 LARGE T ANTIGEN ORIGIN BINDING DOMAIN WITH DNA organism=Simian virus 40 : H : SER OG A0152 <- 3.02 -> DA N7 C0027 : score 4.26768 : H : ASN ND2 A0153 <- 2.63 -> DG O6 C0029 : score 5.83017 : w : THR OG1 A0155 <- 6.09 -> DC N4 W0017 : score 2.558 : H : ARG NE A0204 <- 2.81 -> DG N7 W0015 : score 4.41295 : H : ARG NH2 A0204 <- 3.13 -> DG O6 W0015 : score 6.1644 : w : ARG NH2 A0204 <- 5.90 -> DG O6 W0014 : score 2.468 : H : SER OG B0152 <- 2.67 -> DA N7 W0004 : score 4.58017 : H : ASN ND2 B0153 <- 3.07 -> DG O6 W0006 : score 5.33398 : H : ARG NH1 B0154 <- 2.31 -> DG O6 W0003 : score 6.6795 : w : THR OG1 B0155 <- 5.86 -> DC N4 C0040 : score 2.558 : w : ARG NH2 B0202 <- 5.88 -> DC N4 C0040 : score 0.976 : H : ARG NE B0204 <- 3.05 -> DG N7 C0038 : score 4.20071 : H : ARG NH2 B0204 <- 2.61 -> DG O6 C0038 : score 6.8508 : x : ARG xxxx A0154 <- 3.20 -> DG xxx C0026 : score x.xxxxx >2ntz_A:KorB_DNA-binding_domain-like; title=STRUCTURE OF A PARB-DNA COMPLEX REVEALS A DOUBLE B-BOX INTERACTION organism=ENTEROBACTERIA PHAGE P1 : H : LYS NZ A0287 <- 3.00 -> DT O4 E0031 : score 3.44369 : H : LYS NZ A0287 <- 3.30 -> DG O6 U0009 : score 5.20269 : H : ASP OD2 A0288 <- 2.82 -> DC N4 E0032 : score 6.1752 : H : ARG NH1 A0306 <- 2.70 -> DG O6 U0007 : score 6.205 >2nvt_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX IN 150 MM MG+2 WITH GMPCPP organism=? : x : ASN xxxx A1110 <- 4.49 -> DG xxx N0001 : score x.xxxxx >2nvt_AB: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX IN 150 MM MG+2 WITH GMPCPP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ASN xxxx A1110 <- 4.49 -> DG xxx N0001 : score x.xxxxx >2nvx_ABE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX IN 5 MM MG+2 WITH 2'-DUTP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ALA xxxx B0229 <- 4.46 -> DC xxx N0001 : score x.xxxxx >2nvz_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX WITH UTP, UPDATED 11/2006 organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : LYS xxxx A0143 <- 4.46 -> DT xxx N0006 : score x.xxxxx >2nvz_ABE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX WITH UTP, UPDATED 11/2006 organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : LYS xxxx A0143 <- 4.46 -> DT xxx N0006 : score x.xxxxx >2nzd_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING 145 BP OF DNA organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.70 -> DA N3 J0009 : score 3.30454 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.29 -> DA N3 I0009 : score 3.32121 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.95 -> DA N3 I0009 : score 3.14255 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.82 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.00 -> DA xxx J0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.23 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.20 -> DG xxx J0047 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.17 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.88 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.73 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.69 -> DG xxx I0047 : score x.xxxxx >2nzd_D:Histone-fold; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING 145 BP OF DNA organism=? : x : ARG xxxx D0030 <- 4.20 -> DG xxx J0047 : score x.xxxxx >2o19_B:Prokaryotic_type_I_DNA_topoisomerase; title=STRUCTURE OF E. COLI TOPOISOMERSAE III IN COMPLEX WITH AN 8-BASE SINGLE STRANDED OLIGONUCLEOTIDE. FROZEN IN GLYCEROL AT PH 5.5 organism=Escherichia coli : w : ARG NH2 B0165 <- 5.08 -> DA N3 D0004 : score 2.092 : H : ARG NE B0178 <- 3.21 -> DG N7 D0002 : score 4.05921 : H : ARG NH2 B0178 <- 2.72 -> DG O6 D0002 : score 6.7056 : H : ARG NH1 B0185 <- 2.83 -> DC N3 D0001 : score 1.52796 : H : ARG NH2 B0185 <- 2.96 -> DC O2 D0001 : score 3.58036 : x : HIS xxxx B0044 <- 3.35 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0050 <- 3.06 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0051 <- 3.59 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0061 <- 3.34 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0078 <- 4.02 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0169 <- 3.87 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0170 <- 3.92 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0174 <- 3.56 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0192 <- 3.65 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0317 <- 4.08 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0330 <- 3.34 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0526 <- 4.06 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0527 <- 3.63 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx >2o49_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE N-TERMINAL CUT DOMAIN OF SATB1 BOUND TO MATRIX ATTACHMENT REGION DNA organism=Homo sapiens : w : THR OG1 A0401 <- 5.80 -> DA N6 B0004 : score 3.251 : H : GLN OE1 A0402 <- 2.72 -> DA N6 C0007 : score 6.14941 : H : GLN NE2 A0402 <- 2.79 -> DA N7 C0007 : score 6.10192 : w : GLN OE1 A0402 <- 5.98 -> DA N6 B0005 : score 3.392 : V : LEU CB A0404 <- 3.88 -> DT C7 B0003 : score 4.31099 : x : SER xxxx A0406 <- 3.47 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0407 <- 3.53 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >2o4a_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE N-TERMINAL CUT DOMAIN OF SATB1 BOUND TO MATRIX ATTACHMENT REGION DNA organism=Homo sapiens : w : THR OG1 A0401 <- 5.81 -> DA N6 B0004 : score 3.251 : H : GLN OE1 A0402 <- 2.96 -> DA N6 C0007 : score 5.85888 : H : GLN NE2 A0402 <- 3.01 -> DA N7 C0007 : score 5.83397 : w : GLN OE1 A0402 <- 5.76 -> DA N6 B0005 : score 3.392 : x : LEU xxxx A0404 <- 3.96 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0406 <- 3.57 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0407 <- 3.59 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >2o54_A:Prokaryotic_type_I_DNA_topoisomerase; title=STRUCTURE OF E. COLI TOPOISOMERASE III IN COMPLEX WITH AN 8-BASE SINGLE STRANDED OLIGONUCLEOTIDE. FROZEN IN GLYCEROL AT PH 7.0 organism=Escherichia coli : H : ASP OD2 A0103 <- 2.60 -> DC N4 C0006 : score 6.448 : H : ARG NH1 A0178 <- 3.28 -> DG N7 C0002 : score 5.4692 : H : ARG NH1 A0185 <- 2.80 -> DC N3 C0001 : score 1.53718 : H : ARG NH2 A0185 <- 2.53 -> DC O2 C0001 : score 3.89845 : x : GLU xxxx A0007 <- 3.41 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0008 <- 3.48 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0050 <- 3.34 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0051 <- 3.34 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0061 <- 3.28 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0169 <- 3.87 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0170 <- 3.77 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0174 <- 3.72 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0177 <- 4.49 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0192 <- 3.79 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0317 <- 3.39 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0330 <- 3.31 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0527 <- 4.32 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >2o59_A:Prokaryotic_type_I_DNA_topoisomerase; title=STRUCTURE OF E. COLI TOPOISOMERASE III IN COMPLEX WITH AN 8-BASE SINGLE STRANDED OLIGONUCLEOTIDE. FROZEN IN GLYCEROL PH 8.0 organism=Escherichia coli : H : ARG NE A0178 <- 3.18 -> DG N7 C0002 : score 4.08574 : H : ARG NH2 A0178 <- 2.75 -> DG O6 C0002 : score 6.666 : H : ARG NH1 A0185 <- 2.84 -> DC N3 C0001 : score 1.52488 : H : ARG NH2 A0185 <- 2.43 -> DC O2 C0001 : score 3.97242 : x : GLN xxxx A0050 <- 3.42 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0051 <- 3.32 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0061 <- 3.37 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0169 <- 3.88 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0170 <- 3.76 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0174 <- 3.66 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0192 <- 3.62 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0527 <- 3.57 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx >2o5c_B:Prokaryotic_type_I_DNA_topoisomerase; title=STRUCTURE OF E. COLI TOPOISOMERASE III IN COMPLEX WITH AN 8-BASE SINGLE STRANDED OLIGONUCLEOTIDE. FROZEN IN GLUCOSE PH 5.5 organism=Escherichia coli : H : ASP OD2 B0103 <- 2.59 -> DC N4 D0006 : score 6.4604 : H : ARG NE B0178 <- 3.07 -> DG N7 D0002 : score 4.18302 : H : ARG NH2 B0178 <- 2.96 -> DG O6 D0002 : score 6.3888 : H : ARG NH1 B0185 <- 2.80 -> DC N3 D0001 : score 1.53718 : H : ARG NH2 B0185 <- 2.53 -> DC O2 D0001 : score 3.89845 : x : GLU xxxx B0007 <- 3.35 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0008 <- 3.12 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0050 <- 3.87 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0051 <- 3.44 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0061 <- 3.37 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0169 <- 3.77 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0170 <- 3.67 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0174 <- 3.58 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0192 <- 3.95 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0317 <- 3.61 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0330 <- 3.55 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0527 <- 3.72 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >2o5e_B:Prokaryotic_type_I_DNA_topoisomerase; title=STRUCTURE OF E. COLI TOPOISOMERASE III IN COMPLEX WITH AN 8-BASE SINGLE STRANDED OLIGONUCLEOTIDE. FROZEN IN GLUCOSE PH 7.0 organism=Escherichia coli : H : LYS NZ B0008 <- 3.37 -> DC O2 D0006 : score 2.61029 : w : GLN OE1 B0050 <- 6.41 -> DC N4 D0003 : score 3.488 : H : ASP OD2 B0103 <- 2.46 -> DC N4 D0006 : score 6.6216 : H : ARG NE B0178 <- 3.11 -> DG N7 D0002 : score 4.14764 : H : ARG NH2 B0178 <- 2.77 -> DG O6 D0002 : score 6.6396 : H : ARG NH1 B0185 <- 2.98 -> DC N3 D0001 : score 1.48184 : H : ARG NH2 B0185 <- 2.71 -> DC O2 D0001 : score 3.76529 : x : GLU xxxx B0007 <- 3.63 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0051 <- 3.59 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0061 <- 3.25 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0169 <- 3.62 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0170 <- 3.79 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0174 <- 3.57 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0192 <- 3.97 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0317 <- 4.37 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0328 <- 4.49 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0330 <- 3.28 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0527 <- 4.10 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >2o5i_CD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE T. THERMOPHILUS RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : ARG xxxx C0422 <- 3.19 -> DA xxx I0003 : score x.xxxxx >2o5i_MN: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE T. THERMOPHILUS RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : ARG xxxx M0422 <- 3.00 -> DA xxx Z0003 : score x.xxxxx >2o5j_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE T. THERMOPHILUS RNAP POLYMERASE ELONGATION COMPLEX WITH THE NTP SUBSTRATE ANALOG organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : ARG xxxx C0422 <- 3.65 -> DA xxx I0003 : score x.xxxxx >2o5j_CD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE T. THERMOPHILUS RNAP POLYMERASE ELONGATION COMPLEX WITH THE NTP SUBSTRATE ANALOG organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : ARG xxxx C0422 <- 3.65 -> DA xxx I0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1266 <- 4.36 -> DC xxx I0007 : score x.xxxxx >2o5j_MN: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE T. THERMOPHILUS RNAP POLYMERASE ELONGATION COMPLEX WITH THE NTP SUBSTRATE ANALOG organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : ARG xxxx M0422 <- 4.20 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx >2o61_A:p53-like_transcription_factors;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NFKB, IRF7, IRF3 BOUND TO THE INTERFERON-B ENHANCER organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0033 <- 2.35 -> DG O6 F0007 : score 7.194 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.75 -> DG N7 F0006 : score 6.44846 : H : GLU OE2 A0039 <- 3.12 -> DC N4 E0030 : score 4.9284 : H : ARG NH2 A0041 <- 3.19 -> DT O4 E0032 : score 3.27665 : w : HIS NE2 A1046 <- 5.47 -> DA N3 E0013 : score 2.619 : H : CYS SG A1097 <- 3.65 -> DT O4 F0019 : score 5.893 : H : ARG NH2 A2078 <- 2.81 -> DG O6 E0008 : score 6.5868 : H : ARG NE A2086 <- 3.02 -> DG N7 E0011 : score 4.22724 : V : ARG CZ A0187 <- 3.75 -> DT C7 E0029 : score 2.15896 : x : TYR xxxx A0036 <- 3.41 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0038 <- 4.14 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0218 <- 4.49 -> DA xxx E0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1093 <- 3.98 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1094 <- 3.45 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1096 <- 3.12 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1100 <- 3.80 -> DA xxx E0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1101 <- 3.99 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A2040 <- 4.40 -> DT xxx F0032 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A2042 <- 3.02 -> DT xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A2079 <- 4.29 -> DC xxx F0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A2081 <- 3.53 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A2082 <- 3.53 -> DC xxx F0026 : score x.xxxxx >2o61_AB:p53-like_transcription_factors;E_set_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NFKB, IRF7, IRF3 BOUND TO THE INTERFERON-B ENHANCER organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0033 <- 2.35 -> DG O6 F0007 : score 7.194 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.75 -> DG N7 F0006 : score 6.44846 : H : GLU OE2 A0039 <- 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: score 2.93462 : H : ARG NH1 F0081 <- 3.17 -> DG N7 D0020 : score 5.6023 : H : ARG NH1 F0086 <- 2.82 -> DA N7 D0022 : score 2.55002 : H : ARG NH1 G0078 <- 2.57 -> DG O6 D0026 : score 6.36317 : H : ARG NH1 G0078 <- 3.04 -> DT O4 C0032 : score 3.11109 : H : ARG NH2 G0078 <- 2.35 -> DG O6 D0025 : score 7.194 : H : SER OG G0082 <- 3.19 -> DT O4 C0031 : score 3.27783 : x : LEU xxxx E0042 <- 3.00 -> DT xxx C0050 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0079 <- 4.24 -> DT xxx C0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0081 <- 3.63 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0040 <- 4.05 -> DT xxx C0044 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0042 <- 3.24 -> DT xxx C0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0078 <- 3.10 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0079 <- 3.78 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0082 <- 3.70 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0040 <- 4.40 -> DT xxx C0038 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0042 <- 3.31 -> DT xxx C0038 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0079 <- 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xxx C0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0079 <- 3.80 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0081 <- 3.32 -> DT xxx D0031 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0082 <- 3.66 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0083 <- 4.47 -> DT xxx C0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0086 <- 3.24 -> DC xxx C0023 : score x.xxxxx >2o6m_AB:His-Me_finger_endonucleases; title=H98Q MUTANT OF THE HOMING ENDONUCLEASE I-PPOI COMPLEXED WITH DNA organism=Physarum polycephalum : H : ASN ND2 A0057 <- 3.07 -> DG O6 D0516 : score 5.33398 : H : GLN OE1 A0063 <- 2.79 -> DA N6 D0517 : score 6.06467 : H : GLN NE2 A0063 <- 3.11 -> DA N7 D0517 : score 5.71218 : w : GLN OE1 A0063 <- 6.14 -> DC N4 C0405 : score 3.488 : H : LYS NZ A0065 <- 2.87 -> DG N7 C0403 : score 5.31049 : w : LYS NZ A0065 <- 5.78 -> DA N6 C0404 : score 2.097 : H : ARG NH1 A0074 <- 3.18 -> DG N7 D0518 : score 5.5902 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.98 -> DG O6 D0518 : score 6.3624 : H : LYS NZ A0120 <- 2.88 -> DT O2 C0411 : score 3.52978 : w : LYS NZ A0120 <- 5.53 -> DA N3 C0412 : score 1.538 : H : ASN ND2 B0257 <- 3.06 -> DG O6 C0416 : score 5.34526 : H : GLN OE1 B0263 <- 2.84 -> DA N6 C0417 : score 6.00414 : H : GLN NE2 B0263 <- 2.94 -> DA N7 C0417 : score 5.91923 : H : LYS NZ B0265 <- 2.96 -> DG N7 D0503 : score 5.21355 : w : LYS NZ B0265 <- 6.12 -> DA N6 D0504 : score 2.097 : H : ARG NH1 B0274 <- 3.12 -> DG N7 C0418 : score 5.6628 : H : ARG NH2 B0274 <- 2.75 -> DG O6 C0418 : score 6.666 : H : LYS NZ B0320 <- 2.85 -> DT O2 D0511 : score 3.55131 : w : LYS NZ B0320 <- 5.75 -> DA N3 D0512 : score 1.538 : x : ALA xxxx A0055 <- 3.73 -> DA xxx C0404 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.36 -> DA xxx D0515 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0067 <- 3.65 -> DT xxx C0402 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0072 <- 3.93 -> DT xxx C0402 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0116 <- 3.77 -> DA xxx D0513 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0255 <- 3.85 -> DA xxx D0504 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0261 <- 3.36 -> DA xxx C0415 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0267 <- 3.87 -> DT xxx D0502 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0272 <- 4.25 -> DT xxx D0502 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0316 <- 3.71 -> DT xxx D0511 : score x.xxxxx >2o6m_B:His-Me_finger_endonucleases; title=H98Q MUTANT OF THE HOMING ENDONUCLEASE I-PPOI COMPLEXED WITH DNA organism=Physarum polycephalum : H : ASN ND2 B0257 <- 3.06 -> DG O6 C0416 : score 5.34526 : H : GLN OE1 B0263 <- 2.84 -> DA N6 C0417 : score 6.00414 : H : GLN NE2 B0263 <- 2.94 -> DA N7 C0417 : score 5.91923 : H : LYS NZ B0265 <- 2.96 -> DG N7 D0503 : score 5.21355 : w : LYS NZ B0265 <- 6.12 -> DA N6 D0504 : score 2.097 : H : ARG NH1 B0274 <- 3.12 -> DG N7 C0418 : score 5.6628 : H : ARG NH2 B0274 <- 2.75 -> DG O6 C0418 : score 6.666 : H : LYS NZ B0320 <- 2.85 -> DT O2 D0511 : score 3.55131 : w : LYS NZ B0320 <- 5.75 -> DA N3 D0512 : score 1.538 : x : ALA xxxx B0255 <- 3.85 -> DA xxx D0504 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0261 <- 3.36 -> DA xxx C0415 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0267 <- 3.87 -> DT xxx 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: LYS NZ B0431 <- 2.86 -> DC O2 E0007 : score 2.9108 : H : LYS NZ B0431 <- 2.86 -> DC O2 E0007 : score 2.9108 : H : GLU OE2 B0434 <- 2.90 -> DT N3 F0023 : score 2.58318 : V : PHE CZ B0432 <- 3.77 -> DT C7 F0023 : score 7.16823 : x : VAL xxxx B0429 <- 3.77 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0452 <- 3.70 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0462 <- 3.51 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx >2o8c_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;DNA_repair_protein_MutS,_domain_I;DNA_repair_protein_MutS,_domain_III; title=HUMAN MUTSALPHA (MSH2/MSH6) BOUND TO ADP AND AN O6-METHYL-GUANINE T MISPAIR organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE2 B0434 <- 3.14 -> DT N3 F0023 : score 2.45666 : H : GLU OE2 B0434 <- 3.14 -> DT N3 F0023 : score 2.45666 : V : PHE CZ B0432 <- 3.67 -> DT C7 F0023 : score 7.34611 : x : VAL xxxx B0429 <- 3.92 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0431 <- 3.56 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0452 <- 3.77 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0462 <- 3.73 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx >2o8d_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;DNA_repair_protein_MutS,_domain_I;DNA_repair_protein_MutS,_domain_III; title=HUMAN MUTSALPHA (MSH2/MSH6) BOUND TO ADP AND A G DU MISPAIR organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ B0431 <- 2.73 -> DC O2 E0007 : score 2.9874 : H : LYS NZ B0431 <- 2.73 -> DC O2 E0007 : score 2.9874 : x : VAL xxxx B0429 <- 3.89 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0432 <- 3.24 -> DU xxx F0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0434 <- 2.88 -> DU xxx F0023 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0452 <- 3.91 -> DU xxx F0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0462 <- 3.53 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx >2o8d_B:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HUMAN MUTSALPHA (MSH2/MSH6) BOUND TO ADP AND A G DU MISPAIR organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ B0431 <- 2.73 -> DC O2 E0007 : score 2.9874 : H : LYS NZ B0431 <- 2.73 -> DC O2 E0007 : score 2.9874 : x : VAL xxxx B0429 <- 3.89 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0432 <- 3.24 -> DU xxx F0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0434 <- 2.88 -> DU xxx F0023 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0452 <- 3.91 -> DU xxx F0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0462 <- 3.53 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx >2o8e_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;DNA_repair_protein_MutS,_domain_I;DNA_repair_protein_MutS,_domain_III; title=HUMAN MUTSALPHA (MSH2/MSH6) BOUND TO A G T MISPAIR, WITH ADP BOUND TO MSH2 ONLY organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ B0431 <- 3.19 -> DC O2 E0007 : score 2.71635 : H : GLU OE2 B0434 <- 3.30 -> DT N3 F0023 : score 2.37231 : V : PHE CZ B0432 <- 3.64 -> DT C7 F0023 : score 7.39947 : x : VAL xxxx B0429 <- 3.74 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0452 <- 3.47 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0462 <- 3.71 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx >2o8e_B:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HUMAN MUTSALPHA (MSH2/MSH6) BOUND TO A G T MISPAIR, WITH ADP BOUND TO MSH2 ONLY organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ B0431 <- 3.19 -> DC O2 E0007 : score 2.71635 : H : GLU OE2 B0434 <- 3.30 -> DT N3 F0023 : score 2.37231 : V : PHE CZ B0432 <- 3.64 -> DT C7 F0023 : score 7.39947 : x : VAL xxxx B0429 <- 3.74 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0452 <- 3.47 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0462 <- 3.71 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx >2o8f_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;DNA_repair_protein_MutS,_domain_I;DNA_repair_protein_MutS,_domain_III; title=HUMAN MUTSALPHA (MSH2/MSH6) BOUND TO DNA WITH A SINGLE BASE T INSERT organism=HOMO SAPIENS : x : LYS xxxx B0431 <- 4.04 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0432 <- 3.30 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0462 <- 3.47 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx >2o8f_B:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HUMAN MUTSALPHA (MSH2/MSH6) BOUND TO DNA WITH A SINGLE BASE T INSERT organism=HOMO SAPIENS : x : LYS xxxx B0431 <- 4.04 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0432 <- 3.30 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0462 <- 3.47 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx >2o8k_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=NMR STRUCTURE OF THE SIGMA-54 RPON DOMAIN BOUND TO THE-24 PROMOTER ELEMENT organism=AQUIFEX AEOLICUS : H : LYS NZ A0061 <- 3.01 -> DT O4 C0121 : score 3.43652 : V : ARG CZ A0056 <- 3.79 -> DT C7 B0104 : score 2.13764 : x : ASP xxxx A0040 <- 3.39 -> DT xxx B0104 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0057 <- 2.77 -> DG xxx C0122 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0058 <- 2.95 -> DT xxx C0121 : score x.xxxxx >2o93_LMO:p53-like_transcription_factors;E_set_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NFAT BOUND TO THE HIV-1 LTR TANDEM KAPPAB ENHANCER 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N7 B0002 : score 5.7233 : H : ARG NH2 O0430 <- 2.83 -> DG O6 B0002 : score 6.5604 : H : GLN OE1 O0571 <- 2.81 -> DA N6 B0004 : score 6.04046 : x : TYR xxxx O0424 <- 3.30 -> DT xxx A0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0426 <- 4.42 -> DT xxx A0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0572 <- 3.73 -> DT xxx A0021 : score x.xxxxx >2o9l_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=AMBER REFINED NMR STRUCTURE OF THE SIGMA-54 RPON DOMAIN BOUND TO THE- 24 PROMOTER ELEMENT organism=AQUIFEX AEOLICUS : H : ARG NH1 A0043 <- 2.79 -> DG O6 B0068 : score 6.0955 : H : ARG NH2 A0043 <- 3.13 -> DG N7 B0068 : score 5.96323 : H : LYS NZ A0048 <- 3.21 -> DT O4 C0084 : score 3.29303 : H : ARG NH1 A0059 <- 2.99 -> DT O2 B0065 : score 4.14277 : x : ASP xxxx A0027 <- 3.38 -> DT xxx B0067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0044 <- 3.53 -> DC xxx C0086 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0045 <- 3.25 -> DT xxx C0084 : score x.xxxxx >2oaa_AB: title=RESTRICTION ENDONUCLEASE MVAI-COGNATE DNA SUBSTRATE COMPLEX organism=KOCURIA 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O6 E0001 : score 6.10767 : H : ARG NH2 B0209 <- 2.91 -> DT O4 E0000 : score 3.47566 : H : TYR OH B0213 <- 2.73 -> DT O4 F0003 : score 3.5516 : w : TYR OH B0213 <- 5.67 -> DT O4 E-004 : score 2.914 : w : LYS NZ B0218 <- 5.47 -> DT O4 E-004 : score 1.7 : w : LYS NZ B0218 <- 6.26 -> DA N6 F0004 : score 2.097 : H : LYS NZ B0221 <- 2.86 -> DG N7 E-005 : score 5.32127 : w : LYS NZ B0221 <- 5.72 -> DT O4 E-004 : score 1.7 : w : LYS NZ B0221 <- 5.98 -> DG N7 E-006 : score 2.519 : H : HIS NE2 B0223 <- 2.71 -> DG O6 F0002 : score 8.09702 : H : HIS ND1 B0225 <- 2.80 -> DG O6 F0001 : score 6.22308 : H : ARG NH1 B0230 <- 2.87 -> DG O6 E0002 : score 5.99817 : H : ARG NH2 B0230 <- 3.03 -> DG N7 E0002 : score 6.09092 : x : THR xxxx B0071 <- 3.99 -> DC xxx E-002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0100 <- 3.70 -> DC xxx F-001 : score x.xxxxx >2odi_A:Restriction_endonuclease-like; title=RESTRICTION ENDONUCLEASE BCNI-COGNATE DNA SUBSTRATE COMPLEX organism=BREVIBACILLUS CENTROSPORUS : H : ASP OD1 A0032 <- 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BCNI-COGNATE DNA SUBSTRATE COMPLEX organism=BREVIBACILLUS CENTROSPORUS : H : ASP OD1 A0032 <- 2.95 -> DG N2 D0000 : score 4.9955 : H : ASP OD2 A0033 <- 2.89 -> DG N2 C0001 : score 5.36071 : H : SER OG A0071 <- 3.10 -> DA N7 C0003 : score 4.19626 A : w : ASN ND2 A0072 <- 6.22 -> DC N4 D-004 : score 2.395 A : H : THR OG1 A0074 <- 2.75 -> DG N7 C0001 : score 3.53371 : H : HIS NE2 A0077 <- 2.91 -> DC N4 C0000 : score 3.15342 : H : THR OG1 A0113 <- 2.94 -> DC N4 D-002 : score 3.9204 : H : ASP OD2 A0200 <- 2.99 -> DC N4 D-001 : score 5.9644 : H : HIS NE2 A0214 <- 2.78 -> DG O6 D0002 : score 7.98566 : H : ARG NE A0216 <- 2.92 -> DG N7 D0001 : score 4.31567 : H : HIS NE2 A0219 <- 2.98 -> DG O6 D0000 : score 7.66751 : H : ARG NH1 A0221 <- 2.92 -> DG O6 C0002 : score 5.93733 : H : ARG NH2 A0221 <- 2.91 -> DG N7 C0002 : score 6.24415 : H : ASP OD1 B0032 <- 2.96 -> DG N2 F0000 : score 4.9852 : H : ASP OD2 B0033 <- 2.89 -> DG N2 E0001 : score 5.36071 : w : ASN OD1 B0072 <- 6.03 -> DC N4 F-004 : score 2.732 : H : THR OG1 B0074 <- 2.75 -> DG N7 E0001 : score 3.53371 : H : HIS NE2 B0077 <- 2.96 -> DC N4 E0000 : score 3.12118 : H : THR OG1 B0113 <- 3.02 -> DC N4 F-002 : score 3.85587 : H : ASP OD2 B0200 <- 3.00 -> DC N4 F-001 : score 5.952 : H : HIS NE2 B0214 <- 2.79 -> DG O6 F0002 : score 7.96975 : w : HIS NE2 B0214 <- 6.32 -> DT O4 F0003 : score 2.296 : H : ARG NE B0216 <- 2.94 -> DG N7 F0001 : score 4.29798 : H : HIS NE2 B0219 <- 2.93 -> DG O6 F0000 : score 7.74705 : H : ARG NH1 B0221 <- 2.86 -> DG O6 E0002 : score 6.01033 : H : ARG NH2 B0221 <- 2.91 -> DG N7 E0002 : score 6.24415 : x : ARG xxxx A0030 <- 4.02 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.70 -> DC xxx D-001 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0202 <- 3.30 -> DC xxx D-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0030 <- 4.07 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0038 <- 4.47 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0071 <- 3.30 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0111 <- 3.72 -> DC xxx F-001 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0202 <- 3.39 -> DC xxx F-001 : score x.xxxxx >2oeh_A:ARID-like; title=DETERMINATION OF THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE MRF2-DNA COMPLEX USING PARAMAGNETIC SPIN LABELING organism=HOMO SAPIENS : H : THR OG1 A0071 <- 2.91 -> DT O4 C0021 : score 3.80166 : H : SER OG A0072 <- 2.70 -> DT O4 B0008 : score 3.62623 : x : LYS xxxx A0058 <- 3.20 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0075 <- 3.76 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0076 <- 3.43 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx >2ofi_A:DNA-glycosylase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF 3-METHYLADENINE DNA GLYCOSYLASE I (TAG) BOUND TO DNA/3MA organism=Salmonella typhi : w : HIS NE2 A0088 <- 5.87 -> DC O2 B0009 : score 3.208 : H : LYS NZ A0091 <- 2.68 -> DT O2 C0005 : score 3.67327 : x : ALA xxxx A0042 <- 3.76 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0044 <- 3.37 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0086 <- 3.58 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >2og0_AB:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LAMBDA XIS-DNA COMPLEX organism=ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA : H : GLU OE2 A0019 <- 2.45 -> DC N4 D0036 : score 5.63396 : H : GLU OE2 B0019 <- 3.05 -> DC N4 D0026 : score 5.00212 : w : GLU OE2 B0019 <- 5.21 -> DT O4 D0027 : score 2.279 : H : ARG NH1 B0023 <- 2.88 -> DG N7 C0008 : score 5.9532 : H : ARG NH2 B0023 <- 2.85 -> DT O4 C0009 : score 3.51831 : w : ARG NE B0023 <- 5.60 -> DT O4 D0027 : score 1.317 : w : ARG NH2 B0023 <- 5.77 -> DT O4 D0027 : score 2.366 : w : ARG NH1 B0026 <- 5.71 -> DT O4 D0027 : score 1.768 : H : ARG NH1 B0039 <- 3.14 -> DT O2 C0016 : score 4.01357 : w : ARG NH1 B0039 <- 5.75 -> DA N3 D0021 : score 2.585 : x : ARG xxxx A0023 <- 3.71 -> DT xxx D0034 : score x.xxxxx >2og0_B:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LAMBDA XIS-DNA COMPLEX organism=ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA : H : GLU OE2 B0019 <- 3.05 -> DC N4 D0026 : score 5.00212 : w : GLU OE2 B0019 <- 5.21 -> DT O4 D0027 : score 2.279 : H : ARG NH1 B0023 <- 2.88 -> DG N7 C0008 : score 5.9532 : H : ARG NH2 B0023 <- 2.85 -> DT O4 C0009 : score 3.51831 : w : ARG NE B0023 <- 5.60 -> DT O4 D0027 : score 1.317 : w : ARG NH2 B0023 <- 5.77 -> DT O4 D0027 : score 2.366 : w : ARG NH1 B0026 <- 5.71 -> DT O4 D0027 : score 1.768 : H : ARG NH1 B0039 <- 3.14 -> DT O2 C0016 : score 4.01357 : w : ARG NH1 B0039 <- 5.75 -> DA N3 D0021 : score 2.585 >2oh2_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE organism=Homo sapiens : x : MET xxxx B0135 <- 3.48 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0137 <- 4.20 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0151 <- 4.16 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0419 <- 4.35 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0469 <- 4.14 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0512 <- 3.79 -> DG xxx T0008 : score x.xxxxx >2opf_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA REPAIR ENZYME ENDONUCLEASE-VIII (NEI) FROM E. COLI (R252A) IN COMPLEX WITH AP-SITE CONTAINING DNA SUBSTRATE organism=Escherichia coli : H : GLN OE1 A0069 <- 2.70 -> DG N2 C0428 : score 5.71985 : w : GLN OE1 A0069 <- 6.19 -> DA N3 C0429 : score 1.196 : x : LEU xxxx A0070 <- 3.46 -> DG xxx C0428 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0071 <- 3.25 -> DT xxx B0408 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0251 <- 3.77 -> DT xxx B0404 : score x.xxxxx >2oq4_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA REPAIR ENZYME ENDONUCLEASE-VIII (NEI) FROM E. COLI (E2Q) IN COMPLEX WITH AP-SITE CONTAINING DNA SUBSTRATE organism=Escherichia coli : w : GLN OE1 A0069 <- 5.98 -> DG N2 D0428 : score 2.177 : H : ARG NH2 A0252 <- 3.31 -> DA N7 D0429 : score 1.50127 : x : LEU xxxx A0070 <- 3.03 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0071 <- 3.07 -> DT xxx C0408 : score x.xxxxx >2or1_LR:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=RECOGNITION OF A DNA OPERATOR BY THE REPRESSOR OF PHAGE 434. A VIEW AT HIGH RESOLUTION organism=PHAGE 434 : H : GLN OE1 L0028 <- 2.83 -> DA N6 B0004 : score 6.01625 : H : GLN NE2 L0029 <- 3.01 -> DG O6 A0017 : score 5.56131 : w : ARG NH1 L0043 <- 5.74 -> DA N3 B0011 : score 2.585 : w : ARG NH2 L0043 <- 5.01 -> DA N3 B0011 : score 2.092 : H : GLN NE2 R0029 <- 2.82 -> DG O6 B0016 : score 5.78191 : H : GLN NE2 R0033 <- 2.95 -> DT O4 B0014 : score 5.0353 : V : LYS CE L0038 <- 3.76 -> DT C7 A0013 : score 2.62704 : V : THR CB R0027 <- 3.50 -> DT C7 B0015 : score 3.79062 : x : GLN xxxx L0017 <- 4.07 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0027 <- 4.08 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0030 <- 4.23 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0032 <- 2.96 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0033 <- 3.00 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0039 <- 4.17 -> DT xxx A0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx R0028 <- 3.15 -> DA xxx A0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0030 <- 3.18 -> DT xxx B0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0032 <- 3.25 -> DA xxx A0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx R0038 <- 4.44 -> DC xxx A0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0039 <- 4.05 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx >2or1_R:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=RECOGNITION OF A DNA OPERATOR BY THE REPRESSOR OF PHAGE 434. A VIEW AT HIGH RESOLUTION organism=? : H : GLN NE2 R0029 <- 2.82 -> DG O6 B0016 : score 5.78191 : H : GLN NE2 R0033 <- 2.95 -> DT O4 B0014 : score 5.0353 : V : GLN CG R0028 <- 3.75 -> DT C7 A0004 : score 3.29608 : V : THR CB R0027 <- 3.50 -> DT C7 B0015 : score 3.79062 : x : SER xxxx R0030 <- 3.18 -> DT xxx B0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0032 <- 3.25 -> DA xxx A0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx R0038 <- 4.44 -> DC xxx A0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0039 <- 4.05 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx >2ost_A: title=THE STRUCTURE OF A BACTERIAL HOMING ENDONUCLEASE : I-SSP6803I organism=Synechocystis sp. : H : THR OG1 A0003 <- 2.75 -> DA N3 Y0018 : score 1.36738 : H : ARG NH2 A0067 <- 2.71 -> DG O6 Z0040 : score 6.7188 : H : THR OG1 A0069 <- 3.18 -> DT O4 Z0042 : score 3.59175 : H : THR OG1 A0071 <- 2.56 -> DT O4 Z0043 : score 4.07376 : H : ARG NH2 A0078 <- 2.56 -> DG N7 Z0041 : score 6.69108 : H : ARG NH2 A0078 <- 2.75 -> DG O6 Z0041 : score 6.666 : H : SER OG A0112 <- 2.70 -> DG N7 Z0039 : score 4.57169 : H : GLU OE1 A0113 <- 2.87 -> DC N4 Z0038 : score 5.6872 : H : ARG NH1 A0124 <- 3.40 -> DC O2 Z0035 : score 3.212 : V : HIS CG A0115 <- 3.84 -> DT C7 Z0037 : score 2.96898 : x : LYS xxxx A0004 <- 3.23 -> DT xxx Z0045 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0054 <- 3.54 -> DC xxx Y0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0059 <- 3.71 -> DT xxx Z0036 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0065 <- 3.41 -> DC xxx Y0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0070 <- 3.59 -> DT xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0072 <- 3.16 -> DT xxx Z0045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0073 <- 3.36 -> DC xxx Y0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0076 <- 3.87 -> DT xxx Z0042 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0123 <- 3.47 -> DG xxx Y0028 : score x.xxxxx >2ost_AB: title=THE STRUCTURE OF A BACTERIAL HOMING ENDONUCLEASE : I-SSP6803I organism=Synechocystis sp. : H : THR OG1 A0003 <- 2.75 -> DA N3 Y0018 : score 1.36738 : H : ARG NH2 A0067 <- 2.71 -> DG O6 Z0040 : score 6.7188 : H : THR OG1 A0069 <- 3.18 -> DT O4 Z0042 : score 3.59175 : H : THR OG1 A0071 <- 2.56 -> DT O4 Z0043 : score 4.07376 : H : ARG NH2 A0078 <- 2.56 -> DG N7 Z0041 : score 6.69108 : H : ARG NH2 A0078 <- 2.75 -> DG O6 Z0041 : score 6.666 : H : SER OG A0112 <- 2.70 -> DG N7 Z0039 : score 4.57169 : H : GLU OE1 A0113 <- 2.87 -> DC N4 Z0038 : score 5.6872 : H : ARG NH1 A0124 <- 3.40 -> DC O2 Z0035 : score 3.212 : H : THR OG1 B0003 <- 2.67 -> DA N3 Z0047 : score 1.38905 : H : ARG NH1 B0067 <- 3.17 -> DG N7 Y0011 : score 5.6023 : H : ARG NH2 B0067 <- 3.16 -> DG O6 Y0011 : score 6.1248 : H : ARG NH2 B0078 <- 2.58 -> DG N7 Y0012 : score 6.66554 : H : ARG NH2 B0078 <- 2.76 -> DG O6 Y0012 : score 6.6528 : H : SER OG B0112 <- 2.55 -> DG N7 Y0010 : score 4.70615 : H : GLU OE1 B0113 <- 2.97 -> DC N4 Y0009 : score 5.57184 : V : HIS CG A0115 <- 3.84 -> DT C7 Z0037 : score 2.96898 : x : LYS xxxx A0004 <- 3.23 -> DT xxx Z0045 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0054 <- 3.54 -> DC xxx Y0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0059 <- 3.71 -> DT xxx Z0036 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0065 <- 3.41 -> DC xxx Y0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0070 <- 3.59 -> DT xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0072 <- 3.16 -> DT xxx Z0045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0073 <- 3.36 -> DC xxx Y0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0076 <- 3.87 -> DT xxx Z0042 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0123 <- 3.47 -> DG xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0004 <- 3.35 -> DA xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0054 <- 3.60 -> DC xxx Z0049 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0059 <- 4.12 -> DT xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0065 <- 4.15 -> DC xxx Z0049 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0069 <- 3.45 -> DC xxx Y0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0070 <- 3.85 -> DT xxx Z0045 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0071 <- 3.54 -> DT xxx Y0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0072 <- 4.18 -> DT xxx Z0043 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0076 <- 4.14 -> DC xxx Y0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0115 <- 3.62 -> DT xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0123 <- 4.30 -> DG xxx Z0056 : score x.xxxxx >2owo_A:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;RuvA_domain_2-like;Nucleic_acid-binding_proteins; title=LAST STOP ON THE ROAD TO REPAIR: STRUCTURE OF E.COLI DNA LIGASE BOUND TO NICKED DNA-ADENYLATE organism=Escherichia coli : w : ARG NH1 A0200 <- 6.05 -> DC O2 C0039 : score 1.381 : w : ASN OD1 A0201 <- 5.67 -> DG N3 B0015 : score 3.377 : w : ASN ND2 A0201 <- 6.01 -> DC O2 C0039 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0201 <- 5.78 -> DG N3 B0016 : score 2.566 : w : ARG NH1 A0208 <- 5.40 -> DC O2 B0018 : score 1.381 : w : ARG NH1 A0379 <- 5.70 -> DG N2 B0014 : score 1.082 : H : ARG NH2 A0487 <- 3.19 -> DA N3 B0022 : score 2.98704 : x : HIS xxxx A0359 <- 4.06 -> DC xxx D0042 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0383 <- 3.47 -> DC xxx C0039 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0384 <- 3.28 -> DC xxx D0040 : score x.xxxxx >2oxm_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A UNG2/MODIFIED DNA COMPLEX THAT REPRESENT A STABILIZED SHORT-LIVED EXTRAHELICAL STATE IN EZYMATIC DNA BASE FLIPPING organism=Homo sapiens : H : HIS NE2 A0148 <- 2.62 -> DT O2 B0005 : score 5.42837 : w : TYR OH A0275 <- 6.70 -> DA N3 B0006 : score 1.448 : x : ALA xxxx A0214 <- 3.65 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0271 <- 3.21 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0272 <- 3.80 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx >2oxv_A:Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURE OF THE A138T PROMISCUOUS MUTANT OF THE ECORI RESTRICTION ENDONUCLEASE BOUND TO ITS COGNATE RECOGNITION SITE. organism=Escherichia coli : H : ARG NE A0145 <- 3.08 -> DA N7 C0007 : score -8.60129 : H : ARG NH2 A0145 <- 3.20 -> DA N7 C0007 : score 1.53805 : V : GLN CG A0115 <- 3.52 -> DT C7 C0008 : score 3.48326 : x : MET xxxx A0137 <- 3.83 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0138 <- 4.15 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0141 <- 3.24 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0142 <- 3.29 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >2oyq_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RB69 GP43 IN COMPLEX WITH DNA WITH 5-NIMP OPPOSITE AN ABASIC SITE ANALOG organism=Enterobacteria phage RB69 : x : LYS xxxx A0706 <- 3.26 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0734 <- 4.20 -> DA xxx F0110 : score x.xxxxx >2oyt_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UNG2/DNA(TM) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0218 <- 6.27 -> DA N7 C0022 : score 1.655 : w : ARG NH1 A0276 <- 5.44 -> DT O2 B0007 : score 1.855 : x : PRO xxxx A0271 <- 3.27 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0272 <- 3.46 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx >2ozm_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RB69 GP43 IN COMPLEX WITH DNA WITH 5-NITP OPPOSITE AN ABASIC SITE ANALOG organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0567 <- 5.40 -> DC O2 T0004 : score 1.343 : H : LYS NZ A0706 <- 2.84 -> DA N3 P0013 : score 2.75471 : w : LYS NZ A0734 <- 5.80 -> DA N3 P0010 : score 1.538 >2ozs_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RB69 GP43 IN COMPLEX WITH DNA WITH DATP OPPOSITE DTMP organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.07 -> DA N3 P0113 : score 2.62697 : w : LYS NZ A0706 <- 6.10 -> DT O2 T0006 : score 0.522 : w : LYS NZ A0734 <- 5.01 -> DT O2 P0111 : score 0.522 >2p0j_A:Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURE OF RESTRICTION ENDONUCLEASE BSTYI BOUND TO NON-COGNATE DNA organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : LYS NZ A0133 <- 2.90 -> DG N7 D0004 : score 5.27818 : H : LYS NZ A0133 <- 2.82 -> DG O6 D0005 : score 5.75765 : H : SER OG A0172 <- 2.91 -> DC N4 C0008 : score 3.59478 : w : SER OG A0172 <- 5.58 -> DT O4 D0003 : score 2.338 : x : GLU xxxx A0046 <- 3.53 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0134 <- 3.57 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx >2p0j_AB:Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURE OF RESTRICTION ENDONUCLEASE BSTYI BOUND TO NON-COGNATE DNA organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : LYS NZ A0133 <- 2.90 -> DG N7 D0004 : score 5.27818 : H : LYS NZ A0133 <- 2.82 -> DG O6 D0005 : score 5.75765 : H : SER OG A0172 <- 2.91 -> DC N4 C0008 : score 3.59478 : w : SER OG A0172 <- 5.58 -> DT O4 D0003 : score 2.338 : H : ARG NH1 B0077 <- 3.02 -> DA N3 C0011 : score 3.52004 : H : TYR OH B0115 <- 2.65 -> DA N3 D0002 : score 4.27582 : x : GLU xxxx A0046 <- 3.53 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0134 <- 3.57 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx >2p5l_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A DIMER OF N-TERMINAL DOMAINS OF AHRC IN COMPLEX WITH AN 18BP DNA OPERATOR SITE organism=Bacillus subtilis : H : GLN OE1 D0038 <- 2.82 -> DA N6 A0012 : score 6.02835 : H : GLN NE2 D0038 <- 3.02 -> DA N7 A0012 : score 5.82179 : H : ARG NH1 D0043 <- 2.52 -> DG O6 B0004 : score 6.424 : H : ARG NH1 D0043 <- 2.58 -> DT O4 A0014 : score 3.41174 : H : ARG NH2 D0043 <- 3.37 -> DG N7 B0004 : score 5.65677 : x : MET xxxx D0001 <- 3.73 -> DA xxx E0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0037 <- 3.71 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0039 <- 3.27 -> DT xxx A0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 3.34 -> DA xxx A0012 : score x.xxxxx >2p5l_DH:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A DIMER OF N-TERMINAL DOMAINS OF AHRC IN COMPLEX WITH AN 18BP DNA OPERATOR SITE organism=Bacillus subtilis : H : GLN OE1 D0038 <- 2.82 -> DA N6 A0012 : score 6.02835 : H : GLN NE2 D0038 <- 3.02 -> DA N7 A0012 : score 5.82179 : H : ARG NH1 D0043 <- 2.52 -> DG O6 B0004 : score 6.424 : H : ARG NH1 D0043 <- 2.58 -> DT O4 A0014 : score 3.41174 : H : ARG NH2 D0043 <- 3.37 -> DG N7 B0004 : score 5.65677 : H : GLN OE1 H0038 <- 2.80 -> DA N6 E0012 : score 6.05256 : H : GLN NE2 H0038 <- 3.16 -> DA N7 E0012 : score 5.65128 : H : ARG NH1 H0043 <- 2.70 -> DT O4 E0014 : score 3.33331 : H : ARG NH1 H0043 <- 2.46 -> DG O6 F0004 : score 6.497 : H : ARG NH2 H0043 <- 3.27 -> DG N7 F0004 : score 5.78446 : x : MET xxxx D0001 <- 3.73 -> DA xxx E0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0037 <- 3.71 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0039 <- 3.27 -> DT xxx A0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 3.34 -> DA xxx A0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx H0001 <- 3.39 -> DA xxx A0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0022 <- 4.32 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0037 <- 3.91 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0039 <- 3.08 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0042 <- 3.58 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx >2p5o_C:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RB69 GP43 IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING AN ABASIC SITE ANALOG organism=Enterobacteria phage RB69 : w : LYS NZ C0706 <- 6.45 -> DT O2 I0006 : score 0.522 : w : LYS NZ C0734 <- 6.18 -> DG N3 I0009 : score 2.232 >2p66_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH TETRAHYDROFURAN (ABASIC SITE) CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 6.74 -> DC O2 B0010 : score 1.768 : w : LYS NZ A0234 <- 5.81 -> DG N2 C0009 : score 0.846 >2p6r_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SUPERFAMILY 2 HELICASE HEL308 IN COMPLEX WITH UNWOUND DNA organism=Archaeoglobus fulgidus : H : ARG NH1 A0253 <- 3.08 -> DA N3 Y0015 : score 3.47586 : x : PHE xxxx A0351 <- 3.34 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0355 <- 3.07 -> DA xxx Y0013 : score x.xxxxx >2p7c_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=SOLUTION STRUCTURE OF THE BACILLUS LICHENIFORMIS BLAI MONOMERIC FORM IN COMPLEX WITH THE BLAP HALF-OPERATOR. organism=BACILLUS LICHENIFORMIS : H : GLN NE2 B0045 <- 2.87 -> DT O4 A0008 : score 5.11835 : H : THR OG1 B0046 <- 2.69 -> DG N7 C0015 : score 3.57569 : H : THR OG1 B0046 <- 3.18 -> DG O6 C0015 : score 3.89502 : V : LEU CD2 B0049 <- 3.68 -> DT C7 A0008 : score 5.90322 : x : THR xxxx B0026 <- 2.90 -> DA xxx A0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0042 <- 3.20 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0043 <- 4.43 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0050 <- 2.85 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0054 <- 3.13 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0066 <- 4.21 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0068 <- 3.92 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx >2pe5_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LAC REPRESSOR BOUND TO ONPG IN REPRESSED STATE organism=Escherichia coli : H : TYR OH A0007 <- 3.08 -> DC N4 E0013 : score 3.97811 : H : TYR OH A0017 <- 2.61 -> DG N7 D0008 : score 4.45009 : H : TYR OH A0017 <- 3.00 -> DG O6 D0008 : score 3.488 : H : GLN OE1 A0018 <- 2.46 -> DC N4 E0015 : score 4.895 : H : ARG NH2 A0022 <- 3.20 -> DG N7 D0006 : score 5.87385 : H : ARG NH2 A0022 <- 2.96 -> DG O6 D0006 : score 6.3888 : x : LEU xxxx A0006 <- 4.13 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0016 <- 4.23 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0021 <- 4.31 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0053 <- 3.83 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0056 <- 3.59 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 3.31 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx >2pe5_AB:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LAC REPRESSOR BOUND TO ONPG IN REPRESSED STATE organism=Escherichia coli : H : TYR OH A0007 <- 3.08 -> DC N4 E0013 : score 3.97811 : H : TYR OH A0017 <- 2.61 -> DG N7 D0008 : score 4.45009 : H : TYR OH A0017 <- 3.00 -> DG O6 D0008 : score 3.488 : H : GLN OE1 A0018 <- 2.46 -> DC N4 E0015 : score 4.895 : H : ARG NH2 A0022 <- 3.20 -> DG N7 D0006 : score 5.87385 : H : ARG NH2 A0022 <- 2.96 -> DG O6 D0006 : score 6.3888 : H : TYR OH B0017 <- 2.70 -> DG O6 E0008 : score 3.706 : H : GLN OE1 B0018 <- 2.99 -> DC N4 D0015 : score 4.40917 : H : ARG NH2 B0022 <- 3.09 -> DG O6 E0006 : score 6.2172 : x : LEU xxxx A0006 <- 4.13 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0016 <- 4.23 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0021 <- 4.31 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0053 <- 3.83 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0056 <- 3.59 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 3.31 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0006 <- 3.86 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0007 <- 3.59 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0016 <- 3.47 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0021 <- 4.33 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0029 <- 3.72 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0053 <- 4.06 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0056 <- 3.65 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0057 <- 3.27 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx >2pfj_A:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T7 ENDO I RESOLVASE IN COMPLEX WITH A HOLLIDAY JUNCTION organism=Enterobacteria phage T7 : x : LEU xxxx A0069 <- 3.62 -> DG xxx Y0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0095 <- 4.19 -> DC xxx Y0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0099 <- 4.07 -> DG xxx Y0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0102 <- 3.84 -> DG xxx Z0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0109 <- 4.23 -> DG xxx Y0021 : score x.xxxxx >2pfj_AB:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T7 ENDO I RESOLVASE IN COMPLEX WITH A HOLLIDAY JUNCTION organism=Enterobacteria phage T7 : V : SER CB B0095 <- 3.67 -> DT C7 Z0009 : score 3.23305 : x : LEU xxxx A0069 <- 3.62 -> DG xxx Y0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0095 <- 4.19 -> DC xxx Y0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0099 <- 4.07 -> DG xxx Y0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0102 <- 3.84 -> DG xxx Z0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0109 <- 4.23 -> DG xxx Y0021 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0069 <- 4.18 -> DA xxx Z0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0096 <- 4.42 -> DT xxx Z0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0099 <- 3.64 -> DT xxx Z0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0102 <- 3.22 -> DT xxx Y0003 : score x.xxxxx >2pfq_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=MANGANESE PROMOTES CATALYSIS IN A DNA POLYMERASE LAMBDA-DNA CRYSTAL organism=HOMO SAPIENS : w : GLN NE2 A0372 <- 5.87 -> DC O2 T0009 : score 2.699 : w : LYS NZ A0472 <- 5.42 -> DA N3 P0005 : score 1.538 : w : LYS NZ A0472 <- 5.61 -> DT O2 T0007 : score 0.522 : H : TYR OH A0505 <- 2.51 -> DC O2 P0006 : score 3.70029 : H : ASN ND2 A0513 <- 3.17 -> DC O2 P0007 : score 4.14801 : H : GLU OE2 A0529 <- 2.96 -> DG N2 T0006 : score 4.17233 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.88 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.33 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0517 <- 3.37 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >2pi0_ABCD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF IRF-3 BOUND TO THE PRDIII-I REGULATORY ELEMENT OF THE HUMAN INTERFERON-B ENHANCER organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0040 <- 5.53 -> DA N3 E0005 : score 2.619 : H : ARG NH2 A0078 <- 2.76 -> DG N7 E0006 : score 6.43569 : w : ARG NE A0078 <- 5.31 -> DG N7 E0007 : score 1.593 : w : SER OG A0082 <- 6.01 -> DT O4 F0026 : score 2.338 : w : HIS NE2 B0040 <- 5.61 -> DA N3 E0011 : score 2.619 : H : ARG NH1 B0081 <- 3.25 -> DG N7 E0014 : score 5.5055 : H : SER OG B0082 <- 3.01 -> DT O4 F0019 : score 3.40581 : w : ARG NH1 B0086 <- 5.89 -> DA N6 E0016 : score 1.486 : w : HIS NE2 C0040 <- 5.78 -> DA N3 E0017 : score 2.619 : H : ARG NH1 C0078 <- 3.21 -> DG O6 E0019 : score 5.5845 : H : ARG NH1 C0078 <- 2.95 -> DG O6 E0020 : score 5.90083 : H : ARG NH2 C0078 <- 2.93 -> DG O6 E0019 : score 6.4284 : H : SER OG C0082 <- 3.12 -> DC N4 F0013 : score 3.4404 : w : HIS NE2 D0040 <- 5.80 -> DA N3 E0024 : score 2.619 : w : SER OG D0082 <- 5.19 -> DT O4 F0007 : score 2.338 : x : ASN xxxx A0079 <- 3.37 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0081 <- 3.55 -> DA xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0086 <- 2.99 -> DG xxx F0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0042 <- 2.84 -> DT xxx F0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0078 <- 3.56 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0079 <- 3.31 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0085 <- 4.38 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0042 <- 2.89 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0079 <- 4.15 -> DC xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0081 <- 3.68 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0042 <- 3.28 -> DG xxx E0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0078 <- 3.12 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0079 <- 3.47 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0081 <- 3.25 -> DT xxx E0026 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0083 <- 4.13 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0085 <- 4.25 -> DG xxx E0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0086 <- 3.05 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx >2pi0_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF IRF-3 BOUND TO THE PRDIII-I REGULATORY ELEMENT OF THE HUMAN INTERFERON-B ENHANCER organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 B0040 <- 5.51 -> DT O2 F0025 : score 3.682 : H : ARG NH1 B0081 <- 3.25 -> DG N7 E0014 : score 5.5055 : w : ARG NH2 B0081 <- 6.31 -> DT O4 F0020 : score 2.366 : H : SER OG B0082 <- 3.01 -> DT O4 F0019 : score 3.40581 : w : ARG NH1 B0086 <- 5.89 -> DA N6 E0016 : score 1.486 : V : ARG CZ B0078 <- 3.82 -> DT C7 F0020 : score 2.12165 : x : LEU xxxx B0042 <- 2.84 -> DT xxx F0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0079 <- 3.31 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0085 <- 4.38 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx >2pi4_A:DNA/RNA_polymerases; title=T7RNAP COMPLEXED WITH A PHI10 PROTEIN AND INITIATING GTPS. organism=Enterobacteria phage T7 : H : ARG NH1 A0096 <- 2.77 -> DA N3 P0102 : score 3.70414 : H : ASP OD1 A0240 <- 3.18 -> DG N2 T0010 : score 4.7586 : H : ARG NH1 A0746 <- 3.01 -> DG O6 T0012 : score 5.82783 : H : ARG NH2 A0746 <- 2.89 -> DG N7 T0012 : score 6.26969 : H : ARG NH1 A0756 <- 2.96 -> DG N7 T0014 : score 5.8564 : H : ARG NH1 A0756 <- 3.22 -> DT O4 T0015 : score 2.99344 : H : ARG NH2 A0756 <- 3.17 -> DG O6 T0014 : score 6.1116 : x : LYS xxxx A0098 <- 2.92 -> DA xxx P0105 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0135 <- 3.36 -> DA xxx T0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0139 <- 2.83 -> DA xxx T0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0206 <- 3.41 -> DA xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0231 <- 3.59 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0237 <- 3.18 -> DG xxx T0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0748 <- 3.67 -> DG xxx P0107 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0758 <- 3.48 -> DA xxx T0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0760 <- 4.36 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0761 <- 3.81 -> DA xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0762 <- 3.40 -> DA xxx T0009 : score x.xxxxx >2pi5_A:DNA/RNA_polymerases; title=T7 RNA POLYMERASE COMPLEXED WITH A PHI10 PROMOTER organism=Enterobacteria phage T7 : H : ARG NH1 A0096 <- 3.23 -> DA N3 P0102 : score 3.36539 : H : ASP OD2 A0240 <- 3.38 -> DG N2 T0010 : score 4.82573 : H : ARG NH2 A0746 <- 3.08 -> DG N7 T0012 : score 6.02708 : H : ARG NH1 A0756 <- 2.86 -> DG N7 T0014 : score 5.9774 : H : ARG NH2 A0756 <- 2.82 -> DG O6 T0014 : score 6.5736 : H : GLN OE1 A0758 <- 3.16 -> DA N6 T0013 : score 5.61678 : H : GLN NE2 A0758 <- 3.15 -> DA N7 T0013 : score 5.66346 : x : LYS xxxx A0098 <- 3.08 -> DT xxx P0104 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0231 <- 4.20 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0237 <- 3.51 -> DG xxx T0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0748 <- 3.60 -> DG xxx P0107 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0760 <- 4.33 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx >2pjr_A:?;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HELICASE PRODUCT COMPLEX organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : ASP OD2 A0227 <- 3.11 -> DT N3 C0016 : score 3.36477 : H : ARG NH2 A0260 <- 3.03 -> DT O4 C0017 : score 3.39037 : H : ARG NH2 A0359 <- 2.58 -> DT O2 C0013 : score 4.4196 : H : ARG NH2 A0359 <- 3.08 -> DT O2 C0014 : score 3.99627 : V : TYR CD1 A0257 <- 3.67 -> DT C7 C0016 : score 4.83316 : x : PHE xxxx A0064 <- 3.31 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0065 <- 3.64 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0093 <- 3.07 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0192 <- 3.71 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0259 <- 3.39 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0385 <- 4.47 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0387 <- 3.57 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx >2pjr_AB:?;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HELICASE PRODUCT COMPLEX organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : ASP OD2 A0227 <- 3.11 -> DT N3 C0016 : score 3.36477 : H : ARG NH2 A0260 <- 3.03 -> DT O4 C0017 : score 3.39037 : H : ARG NH2 A0359 <- 2.58 -> DT O2 C0013 : score 4.4196 : H : ARG NH2 A0359 <- 3.08 -> DT O2 C0014 : score 3.99627 : V : TYR CD1 A0257 <- 3.67 -> DT C7 C0016 : score 4.83316 : x : PHE xxxx A0064 <- 3.31 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0065 <- 3.64 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0093 <- 3.07 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0192 <- 3.71 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0259 <- 3.39 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0385 <- 4.47 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0387 <- 3.57 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0565 <- 3.26 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0568 <- 3.75 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0587 <- 3.64 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0589 <- 3.72 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >2pjr_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HELICASE PRODUCT COMPLEX organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : x : HIS xxxx B0565 <- 3.26 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0568 <- 3.75 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0587 <- 3.64 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0589 <- 3.72 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >2ppb_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE T. THERMOPHILUS RNAP POLYMERASE ELONGATION COMPLEX WITH THE NTP SUBSTRATE ANALOG AND ANTIBIOTIC STREPTOLYDIGIN organism=? : x : ARG xxxx C0422 <- 3.56 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx >2ppb_CD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE T. THERMOPHILUS RNAP POLYMERASE ELONGATION COMPLEX WITH THE NTP SUBSTRATE ANALOG AND ANTIBIOTIC STREPTOLYDIGIN organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : ARG xxxx C0422 <- 3.56 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0487 <- 4.45 -> DC xxx G0002 : score x.xxxxx >2ppb_MN: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE T. THERMOPHILUS RNAP POLYMERASE ELONGATION COMPLEX WITH THE NTP SUBSTRATE ANALOG AND ANTIBIOTIC STREPTOLYDIGIN organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : ARG xxxx M0422 <- 3.39 -> DA xxx Z0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx M0423 <- 4.05 -> DA xxx Z0003 : score x.xxxxx >2pqu_AC:Eukaryotic_type_KH-domain_KH-domain_type_I; title=CRYSTAL STRUCTURE OF KH1 DOMAIN OF HUMAN PCBP2 COMPLEXED TO SINGLE- STRANDED 12-MER TELOMERIC DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0040 <- 3.25 -> DC O2 E0508 : score 3.3215 : H : ARG NH2 A0040 <- 2.93 -> DC O2 E0508 : score 3.60255 : w : ASN ND2 A0048 <- 5.74 -> DT O2 E0509 : score 1.666 : w : ASN ND2 A0048 <- 6.17 -> DT N3 E0509 : score 1.666 : H : ARG NH1 A0057 <- 3.05 -> DC N3 E0507 : score 1.46032 : H : ARG NH2 A0057 <- 3.20 -> DC O2 E0507 : score 3.40282 : H : ARG NH1 C0040 <- 2.88 -> DC O2 E0502 : score 3.5916 : H : ARG NH2 C0040 <- 3.11 -> DC O2 E0502 : score 3.4694 : H : ARG NH1 C0057 <- 2.95 -> DC N3 E0501 : score 1.49106 : H : ARG NH2 C0057 <- 2.95 -> DC O2 E0501 : score 3.58776 : x : VAL xxxx A0025 <- 4.22 -> DC xxx E0507 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0027 <- 3.20 -> DC xxx E0506 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0029 <- 3.45 -> DC xxx E0507 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0031 <- 3.06 -> DA xxx E0504 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0036 <- 3.78 -> DC xxx E0508 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0049 <- 3.74 -> DC xxx E0508 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0051 <- 2.85 -> DT xxx E0509 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0027 <- 3.91 -> DC xxx E0500 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0029 <- 3.48 -> DC xxx E0501 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0031 <- 4.22 -> DC xxx E0500 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0036 <- 3.51 -> DC xxx E0502 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0048 <- 3.45 -> DT xxx E0503 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0049 <- 3.60 -> DC xxx E0502 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0051 <- 3.02 -> DT xxx E0503 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0053 <- 3.25 -> DC xxx E0501 : score x.xxxxx >2pqu_C:Eukaryotic_type_KH-domain_KH-domain_type_I; title=CRYSTAL STRUCTURE OF KH1 DOMAIN OF HUMAN PCBP2 COMPLEXED TO SINGLE- STRANDED 12-MER TELOMERIC DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 C0040 <- 2.88 -> DC O2 E0502 : score 3.5916 : H : ARG NH2 C0040 <- 3.11 -> DC O2 E0502 : score 3.4694 : H : ARG NH1 C0057 <- 2.95 -> DC N3 E0501 : score 1.49106 : H : ARG NH2 C0057 <- 2.95 -> DC O2 E0501 : score 3.58776 : x : SER xxxx C0027 <- 3.91 -> DC xxx E0500 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0029 <- 3.48 -> DC xxx E0501 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0031 <- 4.22 -> DC xxx E0500 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0036 <- 3.51 -> DC xxx E0502 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0048 <- 3.45 -> DT xxx E0503 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0049 <- 3.60 -> DC xxx E0502 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0051 <- 3.02 -> DT xxx E0503 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0053 <- 3.25 -> DC xxx E0501 : score x.xxxxx >2prt_A:C2H2_and_C2HC_zinc_fingers; title=STRUCTURE OF THE WILMS TUMOR SUPPRESSOR PROTEIN ZINC FINGER DOMAIN BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0366 <- 2.81 -> DG N7 B0010 : score 6.0379 : H : ARG NH2 A0366 <- 2.52 -> DG O6 B0010 : score 6.9696 : H : ARG NH1 A0372 <- 3.34 -> DG O6 C0054 : score 5.42633 : H : ARG NH1 A0394 <- 3.08 -> DG N7 B0007 : score 5.7112 : H : ARG NH2 A0394 <- 3.02 -> DG O6 B0007 : score 6.3096 : H : ASP OD2 A0396 <- 2.90 -> DC N4 C0055 : score 6.076 : H : HIS NE2 A0397 <- 2.62 -> DG N7 B0006 : score 7.04746 : H : ARG NH1 A0424 <- 2.77 -> DG N7 B0004 : score 6.0863 : H : ARG NH2 A0424 <- 2.66 -> DG O6 B0004 : score 6.7848 : H : ARG NH2 A0430 <- 3.10 -> DG O6 B0002 : score 6.204 : x : ASP xxxx A0368 <- 3.47 -> DA xxx C0052 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0426 <- 3.70 -> DC xxx C0058 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0427 <- 3.41 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >2pua_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LACI FAMILY MEMBER, PURR, BOUND TO DNA: MINOR GROOVE BINDING BY ALPHA HELICES organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0026 <- 2.85 -> DG O6 B0702 : score 6.0225 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.30 -> DG N7 B0702 : score 5.74615 : x : SER xxxx A0014 <- 4.09 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0016 <- 3.15 -> DC xxx B0703 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 4.17 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 2.88 -> DA xxx B0706 : score x.xxxxx >2pub_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LACI FAMILY MEMBER, PURR, BOUND TO DNA: MINOR GROOVE BINDING BY ALPHA HELICES organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0016 <- 3.11 -> DC N4 B0703 : score 3.78327 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.50 -> DG O6 B0702 : score 6.44833 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.04 -> DG N7 B0702 : score 6.07815 : x : SER xxxx A0014 <- 3.72 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.63 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 3.04 -> DA xxx B0706 : score x.xxxxx >2puc_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LACI FAMILY MEMBER, PURR, BOUND TO DNA: MINOR GROOVE BINDING BY ALPHA HELICES organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0016 <- 3.26 -> DC N4 B0703 : score 3.66227 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.54 -> DG O6 B0702 : score 6.39967 : H : ARG NH2 A0026 <- 2.96 -> DG N7 B0702 : score 6.18031 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.09 -> DG O6 B0702 : score 6.2172 : x : SER xxxx A0014 <- 3.97 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.62 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 2.90 -> DA xxx B0706 : score x.xxxxx >2pud_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LACI FAMILY MEMBER, PURR, BOUND TO DNA: MINOR GROOVE BINDING BY ALPHA HELICES organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0016 <- 3.14 -> DC N4 B0703 : score 3.75907 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.50 -> DG O6 B0702 : score 6.44833 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.09 -> DG N7 B0702 : score 6.01431 : x : SER xxxx A0014 <- 3.82 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.50 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 2.85 -> DA xxx B0706 : score x.xxxxx >2pue_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LACI FAMILY MEMBER, PURR, BOUND TO DNA: MINOR GROOVE BINDING BY ALPHA HELICES organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0016 <- 3.34 -> DC N4 B0703 : score 3.59773 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.84 -> DG O6 B0702 : score 6.03467 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.14 -> DG N7 B0702 : score 5.95046 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.21 -> DG O6 B0702 : score 6.0588 : x : SER xxxx A0014 <- 4.20 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.46 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 2.77 -> DA xxx B0706 : score x.xxxxx >2puf_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LACI FAMILY MEMBER, PURR, BOUND TO DNA: MINOR GROOVE BINDING BY ALPHA HELICES organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0016 <- 3.33 -> DC N4 B0703 : score 3.6058 : H : ARG NH1 A0026 <- 3.05 -> DG O6 B0702 : score 5.77917 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.23 -> DG N7 B0702 : score 5.83554 : H : LYS NZ A0055 <- 2.69 -> DA N3 B0706 : score 2.83802 : x : SER xxxx A0014 <- 3.87 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.46 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx >2pug_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LACI FAMILY MEMBER, PURR, BOUND TO DNA: MINOR GROOVE BINDING BY ALPHA HELICES organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0016 <- 3.17 -> DC N4 B0703 : score 3.73487 : H : ARG NH1 A0026 <- 2.63 -> DG O6 B0702 : score 6.29017 : H : ARG NH2 A0026 <- 2.86 -> DG N7 B0702 : score 6.308 : x : SER xxxx A0014 <- 3.97 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.64 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0055 <- 2.93 -> DA xxx B0706 : score x.xxxxx >2pvi_A:Restriction_endonuclease-like; title=PVUII ENDONUCLEASE COMPLEXED TO AN IODINATED COGNATE DNA organism=Proteus vulgaris : H : ASP OD1 A0034 <- 3.26 -> DG N2 D0008 : score 4.6762 : w : THR OG1 A0077 <- 6.31 -> DG N7 D0012 : score 3.422 : H : ASN OD1 A0140 <- 2.99 -> DA N6 C0007 : score 5.79297 : H : ASN ND2 A0140 <- 3.14 -> DA N7 C0007 : score 5.47132 : H : ASN ND2 A0141 <- 3.05 -> DG O6 D0011 : score 5.35654 : H : LYS NZ A0143 <- 3.03 -> DG O6 D0011 : score 5.51485 : x : SER xxxx A0081 <- 3.37 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0084 <- 3.30 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >2pvi_AB:Restriction_endonuclease-like; title=PVUII ENDONUCLEASE COMPLEXED TO AN IODINATED COGNATE DNA organism=Proteus vulgaris : H : ASP OD1 A0034 <- 3.26 -> DG N2 D0008 : score 4.6762 : w : THR OG1 A0077 <- 6.31 -> DG N7 D0012 : score 3.422 : H : ASN OD1 A0140 <- 2.99 -> DA N6 C0007 : score 5.79297 : H : ASN ND2 A0140 <- 3.14 -> DA N7 C0007 : score 5.47132 : H : ASN ND2 A0141 <- 3.05 -> DG O6 D0011 : score 5.35654 : H : LYS NZ A0143 <- 3.03 -> DG O6 D0011 : score 5.51485 : H : ASP OD1 B0034 <- 3.17 -> DG N2 C0008 : score 4.7689 : H : ASN OD1 B0140 <- 2.83 -> DA N6 D0007 : score 5.98566 : H : ASN ND2 B0140 <- 3.01 -> DA N7 D0007 : score 5.62395 : H : ASN ND2 B0141 <- 3.15 -> DG O6 C0011 : score 5.24377 : H : LYS NZ B0143 <- 3.15 -> DG O6 C0011 : score 5.37612 : H : LYS NZ B0143 <- 2.63 -> DG O6 C0012 : score 5.97732 : x : SER xxxx A0081 <- 3.37 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0084 <- 3.30 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0081 <- 3.54 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0084 <- 3.22 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >2pxi_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER AND 2'-DEOXYGUANOSINE 5'-BETA, GAMMA-MONOFLUOROMETHYLENE TRIPHOSPHATE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.14 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.64 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >2py5_B:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PHI29 DNA POLYMERASE COMPLEXED WITH SINGLE-STRANDED DNA organism=BACILLUS PHAGE PHI29 : H : ASN ND2 B0062 <- 2.99 -> DT O2 L0005 : score 4.5658 : w : LYS NZ B0555 <- 6.08 -> DT O4 L0006 : score 1.7 : w : ASP OD1 B0569 <- 6.52 -> DT N3 L0007 : score 2.105 : V : TYR CZ B0148 <- 3.55 -> DT C7 L0007 : score 5.92821 >2pyj_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PHI29 DNA POLYMERASE COMPLEXED WITH PRIMER-TEMPLATE DNA AND INCOMING NUCLEOTIDE SUBSTRATES (TERNARY COMPLEX) organism=BACILLUS PHAGE PHI29 : H : LYS NZ A0498 <- 2.90 -> DA N3 X0009 : score 2.72138 : w : ASP OD2 A0570 <- 6.00 -> DC O2 Y0012 : score 1.919 : x : ALA xxxx A0531 <- 3.47 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0555 <- 4.37 -> DG xxx Y0011 : score x.xxxxx >2pyl_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PHI29 DNA POLYMERASE COMPLEXED WITH PRIMER-TEMPLATE DNA AND INCOMING NUCLEOTIDE SUBSTRATES (TERNARY COMPLEX) organism=Bacillus phage phi29 : w : THR OG1 A0231 <- 5.83 -> DG N2 Y0008 : score 2.036 : w : TYR OH A0390 <- 5.24 -> DT O2 Y0007 : score 3.068 : w : ASP OD1 A0456 <- 6.35 -> DG N2 Y0008 : score 2.312 : H : LYS NZ A0498 <- 2.83 -> DC O2 X0010 : score 2.92848 : w : LYS NZ A0498 <- 5.63 -> DG N2 Y0008 : score 0.846 : w : LYS NZ A0555 <- 5.91 -> DG N3 Y0012 : score 2.232 : x : MET xxxx A0097 <- 4.31 -> DT xxx X0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0384 <- 3.33 -> DA xxx Y0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0387 <- 4.23 -> DA xxx Y0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0388 <- 3.85 -> DA xxx Y0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0531 <- 3.60 -> DA xxx Y0010 : score x.xxxxx >2pyo_A:Histone-fold; title=DROSOPHILA NUCLEOSOME CORE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH2 A0040 <- 2.75 -> DA N3 J0009 : score 3.27214 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.36 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.67 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.68 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx >2pyo_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=DROSOPHILA NUCLEOSOME CORE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH2 A0040 <- 2.75 -> DA N3 J0009 : score 3.27214 : H : ARG NH2 D0028 <- 2.69 -> DC O2 I-049 : score 3.78009 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.75 -> DA N3 I0009 : score 3.27214 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.36 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.67 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.68 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.20 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.42 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.21 -> DA xxx I-069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.21 -> DT xxx I-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.14 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.84 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0032 <- 4.34 -> DT xxx J-012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.09 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0041 <- 4.49 -> DA xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0028 <- 3.00 -> DG xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 2.78 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >2pzs_C:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PHI29 DNA POLYMERASE COMPLEXED WITH PRIMER-TEMPLATE DNA (POST- TRANSLOCATION BINARY COMPLEX) organism=Bacillus phage phi29 : x : ASN xxxx C0091 <- 3.87 -> DC xxx U0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0093 <- 3.35 -> DA xxx U0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0097 <- 3.69 -> DA xxx U0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0102 <- 3.81 -> DC xxx U0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0399 <- 4.11 -> DA xxx U0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0422 <- 3.53 -> DA xxx U0003 : score x.xxxxx >2q10_A:Restriction_endonuclease-like; title=RESTRICTION ENDONUCLEASE BCNI (WILD TYPE)-COGNATE DNA SUBSTRATE COMPLEX organism=BREVIBACILLUS CENTROSPORUS : H : ASP OD1 A0032 <- 2.98 -> DG N2 D0000 : score 4.9646 : H : ASP OD2 A0033 <- 2.90 -> DG N2 C0001 : score 5.34979 : H : SER OG A0071 <- 3.13 -> DA N7 C0003 : score 4.16947 A : w : ASN OD1 A0072 <- 6.36 -> DC N4 D-004 : score 2.732 : H : THR OG1 A0074 <- 2.69 -> DG N7 C0001 : score 3.57569 : H : HIS NE2 A0077 <- 3.02 -> DC N4 C0000 : score 3.08249 : H : THR OG1 A0113 <- 2.93 -> DC N4 D-002 : score 3.92847 : H : ASP OD2 A0200 <- 3.02 -> DC N4 D-001 : score 5.9272 : H : HIS NE2 A0214 <- 2.74 -> DG O6 D0002 : score 8.04929 : H : ARG NE A0216 <- 2.99 -> DG N7 D0001 : score 4.25377 : H : HIS NE2 A0219 <- 2.90 -> DG O6 D0000 : score 7.79477 : H : ARG NH1 A0221 <- 2.90 -> DG O6 C0002 : score 5.96167 : H : ARG NH2 A0221 <- 2.96 -> DG N7 C0002 : score 6.18031 : x : ARG xxxx A0030 <- 4.01 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.64 -> DC xxx D-001 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0202 <- 3.26 -> DC xxx D-001 : score x.xxxxx >2q10_AB:Restriction_endonuclease-like; title=RESTRICTION ENDONUCLEASE BCNI (WILD TYPE)-COGNATE DNA SUBSTRATE COMPLEX organism=BREVIBACILLUS CENTROSPORUS : H : ASP OD1 A0032 <- 2.98 -> DG N2 D0000 : score 4.9646 : H : ASP OD2 A0033 <- 2.90 -> DG N2 C0001 : score 5.34979 : H : SER OG A0071 <- 3.13 -> DA N7 C0003 : score 4.16947 A : w : ASN OD1 A0072 <- 6.36 -> DC N4 D-004 : score 2.732 : H : THR OG1 A0074 <- 2.69 -> DG N7 C0001 : score 3.57569 : H : HIS NE2 A0077 <- 3.02 -> DC N4 C0000 : score 3.08249 : H : THR OG1 A0113 <- 2.93 -> DC N4 D-002 : score 3.92847 : H : ASP OD2 A0200 <- 3.02 -> DC N4 D-001 : score 5.9272 : H : HIS NE2 A0214 <- 2.74 -> DG O6 D0002 : score 8.04929 : H : ARG NE A0216 <- 2.99 -> DG N7 D0001 : score 4.25377 : H : HIS NE2 A0219 <- 2.90 -> DG O6 D0000 : score 7.79477 : H : ARG NH1 A0221 <- 2.90 -> DG O6 C0002 : score 5.96167 : H : ARG NH2 A0221 <- 2.96 -> DG N7 C0002 : score 6.18031 : H : ASP OD1 B0032 <- 2.97 -> DG N2 F0000 : score 4.9749 : H : ASP OD2 B0033 <- 2.97 -> DG N2 E0001 : score 5.27337 : w : ASN OD1 B0072 <- 5.96 -> DC N4 F-004 : score 2.732 : H : THR OG1 B0074 <- 2.71 -> DG N7 E0001 : score 3.56169 : H : HIS NE2 B0077 <- 2.99 -> DC N4 E0000 : score 3.10183 : H : THR OG1 B0113 <- 3.06 -> DC N4 F-002 : score 3.8236 : H : ASP OD2 B0200 <- 2.99 -> DC N4 F-001 : score 5.9644 : H : HIS NE2 B0214 <- 2.87 -> DG O6 F0002 : score 7.84249 : H : ARG NE B0216 <- 3.04 -> DG N7 F0001 : score 4.20955 : H : HIS NE2 B0219 <- 2.90 -> DG O6 F0000 : score 7.79477 : H : ARG NH1 B0221 <- 2.89 -> DG O6 E0002 : score 5.97383 : H : ARG NH2 B0221 <- 3.01 -> DG N7 E0002 : score 6.11646 : x : ARG xxxx A0030 <- 4.01 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.64 -> DC xxx D-001 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0202 <- 3.26 -> DC xxx D-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0030 <- 4.16 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0038 <- 4.41 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0071 <- 3.21 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0111 <- 3.66 -> DC xxx F-001 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0202 <- 3.38 -> DC xxx F-001 : score x.xxxxx >2q2k_AB: title=STRUCTURE OF NUCLEIC-ACID BINDING PROTEIN organism=Staphylococcus aureus : H : LYS NZ B0011 <- 2.74 -> DG N7 F0023 : score 5.45053 : H : LYS NZ B0011 <- 2.81 -> DT O4 F0024 : score 3.58001 >2q2k_B: title=STRUCTURE OF NUCLEIC-ACID BINDING PROTEIN organism=Staphylococcus aureus : H : LYS NZ B0011 <- 2.74 -> DG N7 F0023 : score 5.45053 : H : LYS NZ B0011 <- 2.81 -> DT O4 F0024 : score 3.58001 : x : LYS xxxx B0007 <- 4.39 -> DT xxx F0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0009 <- 3.67 -> DA xxx F0025 : score x.xxxxx >2q2t_A:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=STRUCTURE OF CHLORELLA VIRUS DNA LIGASE-ADENYLATE BOUND TO A 5' PHOSPHORYLATED NICK organism=Paramecium bursaria Chlorella virus 1 : w : ARG NH2 A0048 <- 5.48 -> DA N3 C0028 : score 2.092 : H : THR OG1 A0249 <- 2.85 -> DA N3 D0033 : score 1.34031 : w : ARG NH1 A0285 <- 5.67 -> DC O2 C0031 : score 1.381 : x : PHE xxxx A0286 <- 3.37 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx >2q2u_D:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=STRUCTURE OF CHLORELLA VIRUS DNA LIGASE-PRODUCT DNA COMPLEX organism=Paramecium bursaria Chlorella virus 1 : H : THR OG1 D0249 <- 2.62 -> DA N3 L0033 : score 1.40258 : x : PHE xxxx D0286 <- 3.44 -> DG xxx K0012 : score x.xxxxx >2qby_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A HETERODIMER OF CDC6/ORC1 INITIATORS BOUND TO ORIGIN DNA (FROM S. SOLFATARICUS) organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : H : ARG NH1 A0341 <- 2.74 -> DG N7 C0013 : score 6.1226 : H : ARG NH1 A0341 <- 2.92 -> DG O6 C0013 : score 5.93733 : x : SER xxxx A0122 <- 4.07 -> DA xxx C0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0339 <- 3.38 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0344 <- 4.26 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0365 <- 3.88 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0368 <- 3.77 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >2qby_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A HETERODIMER OF CDC6/ORC1 INITIATORS BOUND TO ORIGIN DNA (FROM S. SOLFATARICUS) organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : H : ARG NH1 A0341 <- 2.74 -> DG N7 C0013 : score 6.1226 : H : ARG NH1 A0341 <- 2.92 -> DG O6 C0013 : score 5.93733 : H : ARG NE B0331 <- 3.33 -> DG O6 C0022 : score 3.52328 : H : ARG NH2 B0331 <- 3.19 -> DG N7 C0022 : score 5.88662 : H : ASN OD1 B0352 <- 2.92 -> DG N2 D0015 : score 4.6848 : H : ASN ND2 B0352 <- 3.09 -> DG N3 D0015 : score 4.61097 : H : ARG NE B0355 <- 3.36 -> DA N3 C0015 : score 1.86708 : x : SER xxxx A0122 <- 4.07 -> DA xxx C0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0339 <- 3.38 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0344 <- 4.26 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0365 <- 3.88 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0368 <- 3.77 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0329 <- 3.97 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0359 <- 3.71 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx >2qby_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A HETERODIMER OF CDC6/ORC1 INITIATORS BOUND TO ORIGIN DNA (FROM S. SOLFATARICUS) organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : H : ARG NE B0331 <- 3.33 -> DG O6 C0022 : score 3.52328 : H : ARG NH2 B0331 <- 3.19 -> DG N7 C0022 : score 5.88662 : H : ASN OD1 B0352 <- 2.92 -> DG N2 D0015 : score 4.6848 : H : ASN ND2 B0352 <- 3.09 -> DG N3 D0015 : score 4.61097 : H : ARG NE B0355 <- 3.36 -> DA N3 C0015 : score 1.86708 : x : SER xxxx B0329 <- 3.97 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0359 <- 3.71 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx >2qhb_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NGTRF COMPLEXED WITH TELOMERIC DNA organism=Nicotiana glutinosa : H : LYS NZ A0620 <- 2.97 -> DG N7 E0005 : score 5.20278 : H : LYS NZ A0620 <- 2.70 -> DG O6 E0005 : score 5.89638 : H : ASP OD2 A0621 <- 2.94 -> DC N4 F0009 : score 6.0264 : x : TYR xxxx A0616 <- 3.35 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0617 <- 4.11 -> DC xxx F0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0624 <- 3.37 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx >2qk9_A:Ribonuclease_H-like; title=HUMAN RNASE H CATALYTIC DOMAIN MUTANT D210N IN COMPLEX WITH 18-MER RNA/DNA HYBRID organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 A0151 <- 2.84 -> DT O2 C0028 : score 4.70818 : H : ASN ND2 A0182 <- 3.15 -> DG N3 C0029 : score 4.55223 : H : GLN OE1 A0183 <- 3.06 -> DG N2 C0029 : score 5.31609 : w : GLN NE2 A0183 <- 6.12 -> DT O2 C0030 : score 1.565 : x : PHE xxxx A0213 <- 4.21 -> DT xxx C0030 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0221 <- 4.20 -> DC xxx C0031 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0233 <- 3.36 -> DC xxx C0033 : score x.xxxxx >2qkb_A:Ribonuclease_H-like; title=HUMAN RNASE H CATALYTIC DOMAIN MUTANT D210N IN COMPLEX WITH 20-MER RNA/DNA HYBRID organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 A0151 <- 2.86 -> DT O2 D0030 : score 4.6892 : H : ASN ND2 A0182 <- 3.11 -> DG N3 D0031 : score 4.59139 : H : GLN OE1 A0183 <- 3.43 -> DG N2 D0031 : score 4.90112 : x : ARG xxxx A0153 <- 4.47 -> DG xxx D0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0213 <- 4.23 -> DT xxx D0032 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0221 <- 4.30 -> DC xxx D0033 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0233 <- 3.47 -> DC xxx D0035 : score x.xxxxx >2qkb_AB:Ribonuclease_H-like; title=HUMAN RNASE H CATALYTIC DOMAIN MUTANT D210N IN COMPLEX WITH 20-MER RNA/DNA HYBRID organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 A0151 <- 2.86 -> DT O2 D0030 : score 4.6892 : H : ASN ND2 A0182 <- 3.11 -> DG N3 D0031 : score 4.59139 : H : GLN OE1 A0183 <- 3.43 -> DG N2 D0031 : score 4.90112 : H : ASN ND2 B0182 <- 3.21 -> DA N3 D0024 : score 3.49546 : w : GLN NE2 B0183 <- 5.88 -> DT O2 D0025 : score 1.565 : w : THR OG1 B0232 <- 6.75 -> DA N7 D0027 : score 2.152 : H : SER OG B0233 <- 3.09 -> DG N7 D0028 : score 4.22209 : x : ARG xxxx A0153 <- 4.47 -> DG xxx D0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0213 <- 4.23 -> DT xxx D0032 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0221 <- 4.30 -> DC xxx D0033 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0233 <- 3.47 -> DC xxx D0035 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0151 <- 2.95 -> DA xxx D0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0213 <- 4.13 -> DT xxx D0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0221 <- 4.29 -> DC 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THE BASIC-HELIX-LOOP-HELIX DOMAINS OF THE HETERODIMER E47/NEUROD1 BOUND TO DNA organism=MUS MUSCULUS : H : GLU OE1 A0551 <- 3.09 -> DC N4 E0006 : score 5.43341 : x : ASN xxxx A0548 <- 3.46 -> DT xxx F0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0550 <- 4.23 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0554 <- 3.34 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx >2ql2_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE BASIC-HELIX-LOOP-HELIX DOMAINS OF THE HETERODIMER E47/NEUROD1 BOUND TO DNA organism=MUS MUSCULUS : H : GLU OE1 A0551 <- 3.09 -> DC N4 E0006 : score 5.43341 : H : GLU OE1 B0110 <- 3.19 -> DC N4 F0025 : score 5.31805 : w : GLU OE2 B0110 <- 5.63 -> DC N4 E0009 : score 3.597 : x : ASN xxxx A0548 <- 3.46 -> DT xxx F0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0550 <- 4.23 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0554 <- 3.34 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0107 <- 3.46 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0113 <- 3.48 -> DC xxx F0025 : score x.xxxxx >2ql2_CD:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE BASIC-HELIX-LOOP-HELIX DOMAINS OF THE HETERODIMER E47/NEUROD1 BOUND TO DNA organism=MUS MUSCULUS : x : ASN xxxx C0548 <- 3.60 -> DT xxx H0029 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0551 <- 4.16 -> DT xxx H0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0554 <- 3.28 -> DC xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0107 <- 3.43 -> DT xxx G0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0110 <- 3.28 -> DT xxx G0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0113 <- 3.59 -> DC xxx H0025 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0114 <- 4.45 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx >2ql2_D:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE BASIC-HELIX-LOOP-HELIX DOMAINS OF THE HETERODIMER E47/NEUROD1 BOUND TO DNA organism=MUS MUSCULUS : x : ASN xxxx D0107 <- 3.43 -> DT xxx G0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0110 <- 3.28 -> DT xxx G0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0113 <- 3.59 -> DC xxx H0025 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0114 <- 4.45 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx >2qnc_A:His-Me_finger_endonucleases;Recombination_endonuclease_VII,_C-terminal_and_dimerization_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T4 ENDONUCLEASE VII N62D MUTANT IN COMPLEX WITH A DNA HOLLIDAY JUNCTION organism=Enterobacteria phage T4 : x : HIS xxxx A0038 <- 3.58 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0062 <- 3.94 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0063 <- 3.66 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx >2qnf_A:His-Me_finger_endonucleases;Recombination_endonuclease_VII,_C-terminal_and_dimerization_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T4 ENDONUCLEASE VII H43N MUTANT IN COMPLEX WITH HETERODUPLEX DNA CONTAINING BASE MISMATCHES organism=Enterobacteria phage T4 : x : HIS xxxx A0038 <- 4.47 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx >2qoj_Z:Homing_endonucleases; title=COEVOLUTION OF A HOMING ENDONUCLEASE AND ITS HOST TARGET SEQUENCE organism=EMERICELLA NIDULANS : w : THR OG1 Z0022 <- 5.56 -> DC N4 Y0521 : score 2.558 : H : LYS NZ Z0024 <- 3.16 -> DG O6 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score x.xxxxx : x : SER xxxx Z0020 <- 3.60 -> DT xxx Y0519 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0027 <- 3.54 -> DT xxx X0405 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Z0064 <- 3.99 -> DA xxx Y0515 : score x.xxxxx : x : MET xxxx Z0066 <- 3.38 -> DA xxx Y0516 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx Z0150 <- 3.75 -> DC xxx X0418 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Z0152 <- 3.49 -> DT xxx X0419 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0154 <- 3.23 -> DG xxx X0420 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Z0156 <- 3.45 -> DA xxx X0422 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0162 <- 3.65 -> DT xxx Y0505 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Z0164 <- 3.51 -> DT xxx Y0506 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Z0166 <- 3.28 -> DT xxx X0419 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx Z0168 <- 3.33 -> DC xxx X0418 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0192 <- 3.65 -> DA xxx Y0510 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx Z0198 <- 3.84 -> DC xxx X0416 : score x.xxxxx >2qsg_A:Cysteine_proteinases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RAD4-RAD23 BOUND TO A UV-DAMAGED DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN ND2 A0554 <- 3.04 -> DT O4 W0017 : score 5.03095 : H : ASN ND2 A0558 <- 3.01 -> DT O4 W0017 : score 5.06266 : H : LYS NZ A0606 <- 2.90 -> DG N7 W0018 : score 5.27818 : V : MET CG A0498 <- 3.81 -> DT C7 W0016 : score 5.78857 : V : PHE CZ A0597 <- 3.79 -> DT C7 W0017 : score 7.13266 : x : ARG xxxx A0129 <- 4.23 -> DA xxx W0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0472 <- 3.38 -> DT xxx W0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0494 <- 4.10 -> DT xxx W0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0495 <- 4.04 -> DT xxx W0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0556 <- 3.30 -> DT xxx W0017 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0560 <- 3.80 -> DT xxx W0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0594 <- 3.80 -> DT xxx W0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0599 <- 3.27 -> DT xxx W0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0600 <- 3.91 -> DT xxx Y0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0601 <- 3.92 -> DG xxx W0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0604 <- 3.54 -> DG xxx W0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0607 <- 3.46 -> DT xxx W0017 : score x.xxxxx >2qsh_A:Cysteine_proteinases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RAD4-RAD23 BOUND TO A MISMATCH DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN ND2 A0554 <- 3.04 -> DT O4 W0017 : score 5.03095 : H : THR OG1 A0604 <- 3.37 -> DG N7 W0018 : score 3.09986 : H : THR OG1 A0604 <- 3.32 -> DG O6 W0018 : score 3.77698 : V : PHE CZ A0597 <- 3.61 -> DT C7 W0017 : score 7.45283 : x : ARG xxxx A0129 <- 2.97 -> DA xxx W0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0472 <- 3.54 -> DG xxx W0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0494 <- 3.91 -> DT xxx W0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0495 <- 3.98 -> DT xxx W0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0498 <- 4.18 -> DT xxx W0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0556 <- 3.18 -> DT xxx W0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0558 <- 3.80 -> DT xxx W0017 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0560 <- 3.77 -> DT xxx W0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0594 <- 3.89 -> DT xxx W0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0599 <- 2.90 -> DT xxx W0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0601 <- 3.41 -> DG xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0606 <- 4.15 -> DG xxx W0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0607 <- 3.90 -> DT xxx W0017 : score x.xxxxx >2r0q_CD:Resolvase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A SERINE RECOMBINASE- DNA REGULATORY COMPLEX organism=Staphylococcus aureus : H : GLN NE2 C0132 <- 3.35 -> DC O2 B0046 : score 3.28844 : H : ARG NE C0148 <- 3.17 -> DA N3 A0012 : score 1.94697 : H : ARG NH1 C0189 <- 3.22 -> DG N7 A0004 : score 5.5418 : H : ARG NH1 C0189 <- 2.87 -> DG O6 A0004 : score 5.99817 : H : ARG NH1 D0148 <- 3.25 -> DA N3 B0038 : score 3.35067 : H : ARG NH1 D0189 <- 3.21 -> DG N7 A0017 : score 5.5539 : H : ARG NH1 D0189 <- 3.21 -> DG O6 A0017 : score 5.5845 : x : TYR xxxx C0145 <- 3.05 -> DG xxx A0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0149 <- 4.31 -> DG xxx A0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0157 <- 4.39 -> DG xxx A0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0188 <- 4.11 -> DC xxx B0053 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0190 <- 3.39 -> DA xxx B0054 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0193 <- 4.37 -> DG xxx A0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0179 <- 3.61 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0188 <- 4.33 -> DT xxx B0040 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0190 <- 3.81 -> DA xxx A0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0193 <- 3.96 -> DT xxx A0018 : score x.xxxxx >2r0q_E:Resolvase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A SERINE RECOMBINASE- DNA REGULATORY COMPLEX organism=Staphylococcus aureus : H : GLN NE2 E0132 <- 3.23 -> DC O2 H0046 : score 3.37711 : H : ARG NE E0148 <- 3.15 -> DA N3 G0012 : score 1.95538 : H : ARG NH1 E0148 <- 2.75 -> DA N3 H0051 : score 3.71887 : H : ARG NH1 E0189 <- 3.33 -> DG N7 G0004 : score 5.4087 : H : ARG NH1 E0189 <- 2.75 -> DG O6 G0004 : score 6.14417 : H : GLN OE1 E0190 <- 3.00 -> DC N4 H0053 : score 4.4 : x : TYR xxxx E0145 <- 2.95 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0149 <- 4.22 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0157 <- 4.36 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0188 <- 4.01 -> DC xxx H0053 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0193 <- 3.86 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx >2r0q_EF:Resolvase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A SERINE RECOMBINASE- DNA REGULATORY COMPLEX organism=Staphylococcus aureus : H : GLN NE2 E0132 <- 3.23 -> DC O2 H0046 : score 3.37711 : H : ARG NE E0148 <- 3.15 -> DA N3 G0012 : score 1.95538 : H : ARG NH1 E0148 <- 2.75 -> DA N3 H0051 : score 3.71887 : H : ARG NH1 E0189 <- 3.33 -> DG N7 G0004 : score 5.4087 : H : ARG NH1 E0189 <- 2.75 -> DG O6 G0004 : score 6.14417 : H : GLN OE1 E0190 <- 3.00 -> DC N4 H0053 : score 4.4 : H : ARG NH1 F0148 <- 3.03 -> DA N3 H0038 : score 3.51268 : H : ARG NH1 F0189 <- 3.08 -> DG N7 G0017 : score 5.7112 : H : ARG NH1 F0189 <- 3.15 -> DG O6 G0017 : score 5.6575 : H : GLN OE1 F0190 <- 2.94 -> DA N6 G0019 : score 5.88309 : x : TYR xxxx E0145 <- 2.95 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0149 <- 4.22 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0157 <- 4.36 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0188 <- 4.01 -> DC xxx H0053 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0193 <- 3.86 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0179 <- 3.52 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0188 <- 4.32 -> DT xxx H0040 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0193 <- 3.54 -> DT xxx G0018 : score x.xxxxx >2r1j_L:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE P22 C2 REPRESSOR PROTEIN IN COMPLEX WITH THE SYNTHETIC OPERATOR 9T organism=Enterobacteria phage P22 : w : ASN ND2 L0032 <- 5.81 -> DT O4 A0024 : score 3.275 : H : GLN NE2 L0037 <- 3.09 -> DT O4 B0014 : score 4.88995 : w : GLN NE2 L0037 <- 6.49 -> DA N6 A0026 : score 2.804 : w : GLU OE1 L0042 <- 6.20 -> DA N6 A0026 : score 2.939 : w : GLU OE1 L0042 <- 5.55 -> DC N4 B0013 : score 3.528 : V : VAL CG2 L0033 <- 3.66 -> DT C7 B0015 : score 6.33738 : x : GLN xxxx L0021 <- 3.98 -> DT xxx A0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0031 <- 3.49 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx L0034 <- 4.41 -> DT xxx B0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0036 <- 3.64 -> DT xxx A0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0040 <- 3.37 -> DT xxx A0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0043 <- 3.91 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx >2r1j_LR:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE P22 C2 REPRESSOR PROTEIN IN COMPLEX WITH THE SYNTHETIC OPERATOR 9T organism=Enterobacteria phage P22 : w : ASN ND2 L0032 <- 5.81 -> DT O4 A0024 : score 3.275 : H : GLN NE2 L0037 <- 3.09 -> DT O4 B0014 : score 4.88995 : w : GLN NE2 L0037 <- 6.49 -> DA N6 A0026 : score 2.804 : w : GLU OE1 L0042 <- 6.20 -> DA N6 A0026 : score 2.939 : w : GLU OE1 L0042 <- 5.55 -> DC N4 B0013 : score 3.528 : w : ASN ND2 R0032 <- 5.61 -> DT O4 B0004 : score 3.275 : H : GLN NE2 R0037 <- 3.06 -> DT O4 A0034 : score 4.92109 : w : GLN NE2 R0037 <- 6.35 -> DA N6 B0006 : score 2.804 : w : GLU OE1 R0042 <- 5.80 -> DC N4 A0033 : score 3.528 : V : VAL CG2 R0033 <- 3.89 -> DT C7 A0035 : score 5.98531 : V : VAL CG2 L0033 <- 3.66 -> DT C7 B0015 : score 6.33738 : x : GLN xxxx L0021 <- 3.98 -> DT xxx A0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0031 <- 3.49 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx L0034 <- 4.41 -> DT xxx B0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0036 <- 3.64 -> DT xxx A0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0040 <- 3.37 -> DT xxx A0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0043 <- 3.91 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx R0021 <- 4.09 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0031 <- 3.52 -> DT xxx A0035 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx R0034 <- 4.44 -> DT xxx A0034 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0036 <- 3.85 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0040 <- 3.36 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0043 <- 3.92 -> DT xxx A0032 : score x.xxxxx >2r2r_A:DNA/RNA_polymerases; title=D(ATTAGTTATAACTAAT) COMPLEXED WITH MMLV RT CATALYTIC FRAGMENT organism=Moloney murine leukemia virus : w : TYR OH A0064 <- 5.28 -> DA N3 B0001 : score 1.448 : w : ASP OD2 A0114 <- 5.63 -> DA N3 B0001 : score 1.331 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.86 -> DT O2 B0002 : score 4.18253 : w : ARG NH1 A0116 <- 6.14 -> DA N3 G0015 : score 2.585 : x : LEU xxxx A0099 <- 3.42 -> DA xxx B0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0112 <- 4.50 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx >2r2s_A:DNA/RNA_polymerases; title=CO(III)BLEOMYCINB2 BOUND TO D(ATTAGTTATAACTAAT) COMPLEXED WITH MMLV RT CATALYTIC FRAGMENT organism=Moloney murine leukemia virus : w : TYR OH A0064 <- 5.50 -> DA N3 B0001 : score 1.448 : w : ASP OD2 A0114 <- 6.27 -> DA N3 B0001 : score 1.331 : H : ARG NH1 A0116 <- 3.12 -> DT O2 B0002 : score 4.0308 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.79 -> DT O2 B0002 : score 4.2418 : x : LEU xxxx A0099 <- 3.23 -> DA xxx B0001 : score x.xxxxx >2r2t_A:DNA/RNA_polymerases; title=D(ATTTAGTTAACTAAAT) COMPLEXED WITH MMLV RT CATALYTIC FRAGMENT organism=Moloney murine leukemia virus : w : TYR OH A0064 <- 5.42 -> DA N3 B0001 : score 1.448 : w : ASP OD2 A0114 <- 5.73 -> DA N3 B0001 : score 1.331 : H : ARG NH1 A0116 <- 3.05 -> DT O2 B0002 : score 4.09109 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.79 -> DT O2 B0002 : score 4.2418 : w : ARG NH1 A0116 <- 6.23 -> DA N3 G0015 : score 2.585 : x : LEU xxxx A0099 <- 3.27 -> DA xxx B0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0112 <- 4.34 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx >2r2u_A:DNA/RNA_polymerases; title=CO(III)BLEOMYCINB2 BITHIAZOLE/C-TERMINAL TAIL DOMAIN BOUND TO D(ATTTAGTTAACTAAAT) COMPLEXED WITH MMLV RT CATALYTIC FRAGMENT organism=Moloney murine leukemia virus : H : ARG NH1 A0116 <- 2.88 -> DT O2 B0002 : score 4.23751 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.82 -> DT O2 B0002 : score 4.2164 : x : TYR xxxx A0064 <- 4.24 -> DA xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0099 <- 3.29 -> DA xxx B0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0112 <- 4.31 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0114 <- 3.23 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx >2r5y_A:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF SCR/EXD COMPLEX BOUND TO A CONSENSUS HOX-EXD SITE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH1 A0105 <- 3.01 -> DA N3 D0032 : score 3.52741 : H : ASN OD1 A0151 <- 3.21 -> DA N6 C0013 : score 5.52801 : H : ASN ND2 A0151 <- 3.01 -> DA N7 C0013 : score 5.62395 : V : ILE CG2 A0147 <- 3.73 -> DT C7 C0014 : score 7.21538 : x : GLN xxxx A0150 <- 3.28 -> DC xxx D0026 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0154 <- 3.88 -> DC xxx D0027 : score x.xxxxx >2r5y_AB:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF SCR/EXD COMPLEX BOUND TO A CONSENSUS HOX-EXD SITE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH1 A0105 <- 3.01 -> DA N3 D0032 : score 3.52741 : H : ASN OD1 A0151 <- 3.21 -> DA N6 C0013 : score 5.52801 : H : ASN ND2 A0151 <- 3.01 -> DA N7 C0013 : score 5.62395 : H : ARG NH2 B0205 <- 2.73 -> DG N3 C0008 : score 3.6608 : H : ARG NH1 B0255 <- 2.75 -> DG N7 C0008 : score 6.1105 : H : ARG NH2 B0255 <- 3.23 -> DT O4 D0033 : score 3.24822 : H : ARG NH2 B0255 <- 2.33 -> DG O6 C0008 : score 7.2204 : V : ILE CG2 A0147 <- 3.73 -> DT C7 C0014 : score 7.21538 : x : GLN xxxx A0150 <- 3.28 -> DC xxx D0026 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0154 <- 3.88 -> DC xxx D0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0247 <- 3.66 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0251 <- 2.96 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0254 <- 3.83 -> DA xxx D0031 : score x.xxxxx >2r5z_A:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF SCR/EXD COMPLEX BOUND TO A DNA SEQUENCE DERIVED FROM THE FKH GENE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : w : HIS NE2 A0089 <- 5.22 -> DT O2 C0014 : score 3.682 : w : GLN OE1 A0150 <- 5.63 -> DT O4 C0014 : score 3.068 : w : GLN OE1 A0150 <- 5.84 -> DC N4 D0026 : score 3.488 : H : ASN OD1 A0151 <- 3.00 -> DA N6 C0013 : score 5.78092 : H : ASN ND2 A0151 <- 2.74 -> DA N7 C0013 : score 5.94096 : w : ASN OD1 A0151 <- 5.64 -> DA N6 D0028 : score 2.837 : w : ASN OD1 A0151 <- 5.50 -> DT O4 C0014 : score 3.132 : w : LYS NZ A0158 <- 6.07 -> DA N7 D0028 : score 1.655 : x : ARG xxxx A0103 <- 4.16 -> DT xxx D0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0105 <- 2.93 -> DA xxx D0032 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0147 <- 3.37 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0154 <- 3.99 -> DG xxx D0027 : score x.xxxxx >2r5z_AB:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF SCR/EXD COMPLEX BOUND TO A DNA SEQUENCE DERIVED FROM THE FKH GENE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : w : HIS NE2 A0089 <- 5.22 -> DT O2 C0014 : score 3.682 : w : GLN OE1 A0150 <- 5.63 -> DT O4 C0014 : score 3.068 : w : GLN OE1 A0150 <- 5.84 -> DC N4 D0026 : score 3.488 : H : ASN OD1 A0151 <- 3.00 -> DA N6 C0013 : score 5.78092 : H : ASN ND2 A0151 <- 2.74 -> DA N7 C0013 : score 5.94096 : w : ASN OD1 A0151 <- 5.64 -> DA N6 D0028 : score 2.837 : w : ASN OD1 A0151 <- 5.50 -> DT O4 C0014 : score 3.132 : w : LYS NZ A0158 <- 6.07 -> DA N7 D0028 : score 1.655 : H : ARG NH1 B0255 <- 2.95 -> DG N7 C0008 : score 5.8685 : H : ARG NH2 B0255 <- 2.73 -> DG O6 C0008 : score 6.6924 : V : ASN CG B0247 <- 3.80 -> DT C7 C0010 : score 2.64821 : x : ARG xxxx A0103 <- 4.16 -> DT xxx D0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0105 <- 2.93 -> DA xxx D0032 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0147 <- 3.37 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0154 <- 3.99 -> DG xxx D0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0251 <- 3.07 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0254 <- 3.72 -> DA xxx D0031 : score x.xxxxx >2r7z_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CISPLATIN LESION CONTAINING RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.53 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx >2r7z_AB: title=CISPLATIN LESION CONTAINING RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.53 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx >2r8j_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF THE EUKARYOTIC DNA POLYMERASE ETA IN COMPLEX WITH 1,2- D(GPG)-CISPLATIN CONTAINING DNA organism=Saccharomyces cerevisiae : x : MET xxxx B0396 <- 4.08 -> DT xxx T0010 : score x.xxxxx >2r9l_A:PLP-dependent_transferases; title=POLYMERASE DOMAIN FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS LIGASE D IN COMPLEX WITH DNA organism=Mycobacterium tuberculosis H37Rv : x : ARG xxxx A0053 <- 3.50 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0055 <- 3.32 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0063 <- 3.41 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx >2ram_A:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=A NOVEL DNA RECOGNITION MODE BY NF-KB P65 HOMODIMER organism=Mus musculus : H : ARG NH2 A0033 <- 3.38 -> DG N7 D0007 : score 5.644 : H : ARG NH2 A0033 <- 2.59 -> DG O6 D0007 : score 6.8772 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.75 -> DG O6 D0006 : score 6.666 : H : GLU OE2 A0039 <- 2.72 -> DC N4 C0014 : score 5.34963 : V : PRO CG A0189 <- 3.63 -> DT C7 C0011 : score 6.62923 : x : ARG xxxx A0187 <- 3.78 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0218 <- 4.09 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx >2ram_AB:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=A NOVEL DNA RECOGNITION MODE BY NF-KB P65 HOMODIMER organism=Mus musculus : H : ARG NH2 A0033 <- 3.38 -> DG N7 D0007 : score 5.644 : H : ARG NH2 A0033 <- 2.59 -> DG O6 D0007 : score 6.8772 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.75 -> DG O6 D0006 : score 6.666 : H : GLU OE2 A0039 <- 2.72 -> DC N4 C0014 : score 5.34963 : w : GLU OE2 B0039 <- 6.56 -> DG O6 C0007 : score 2.892 : w : ARG NH2 B0187 <- 5.71 -> DA N6 C0008 : score 1.997 : V : PRO CG A0189 <- 3.63 -> DT C7 C0011 : score 6.62923 : x : ARG xxxx A0187 <- 3.78 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0218 <- 4.09 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0036 <- 4.39 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx >2rba_AB:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=STRUCTURE OF HUMAN THYMINE DNA GLYCOSYLASE BOUND TO ABASIC AND UNDAMAGED DNA organism=Homo sapiens : H : CYS SG A0276 <- 3.72 -> DG N3 D0012 : score -7.43502 : H : GLN OE1 A0278 <- 3.02 -> DG N2 D0012 : score 5.36095 : H : GLN NE2 A0278 <- 2.97 -> DT O2 D0013 : score 3.7996 : H : CYS SG B0276 <- 3.72 -> DA N3 C0018 : score 4.68258 : x : LYS xxxx A0201 <- 3.76 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0274 <- 3.87 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.29 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 2.83 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0280 <- 4.44 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0275 <- 3.48 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0277 <- 2.98 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx >2rba_B:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=STRUCTURE OF HUMAN THYMINE DNA GLYCOSYLASE BOUND TO ABASIC AND UNDAMAGED DNA organism=Homo sapiens : H : CYS SG B0276 <- 3.72 -> DA N3 C0018 : score 4.68258 : x : ARG xxxx B0275 <- 3.48 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0277 <- 2.98 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx >2rbf_A:Ribbon-helix-helix; title=STRUCTURE OF THE RIBBON-HELIX-HELIX DOMAIN OF ESCHERICHIA COLI PUTA (PUTA52) COMPLEXED WITH OPERATOR DNA (O2) organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0005 <- 2.54 -> DT O4 C0008 : score 4.08931 : H : LYS NZ A0009 <- 3.02 -> DG N7 D0009 : score 5.14892 : H : LYS NZ A0009 <- 2.84 -> DG O6 D0009 : score 5.73452 : x : THR xxxx A0004 <- 3.74 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0006 <- 4.08 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0030 <- 3.60 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >2rbf_AB:Ribbon-helix-helix; title=STRUCTURE OF THE RIBBON-HELIX-HELIX DOMAIN OF ESCHERICHIA COLI PUTA (PUTA52) COMPLEXED WITH OPERATOR DNA (O2) organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0005 <- 2.54 -> DT O4 C0008 : score 4.08931 : H : LYS NZ A0009 <- 3.02 -> DG N7 D0009 : score 5.14892 : H : LYS NZ A0009 <- 2.84 -> DG O6 D0009 : score 5.73452 : H : THR OG1 B0005 <- 2.97 -> DC N4 C0011 : score 3.8962 : H : LYS NZ B0009 <- 3.28 -> DG N7 C0006 : score 4.86885 : H : LYS NZ B0009 <- 2.46 -> DG O6 C0007 : score 6.17386 : x : THR xxxx A0004 <- 3.74 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0006 <- 4.08 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0030 <- 3.60 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0030 <- 3.72 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >2rdj_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=SNAPSHOTS OF A Y-FAMILY DNA POLYMERASE IN REPLICATION: DPO4 IN APO AND BINARY/TERNARY COMPLEX FORMS organism=Sulfolobus solfataricus : w : TYR OH B0012 <- 5.57 -> DT O2 E0014 : score 3.068 : w : LYS NZ B0221 <- 6.26 -> DC O2 E0010 : score 1.3 : x : VAL xxxx B0032 <- 3.36 -> DA xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0042 <- 3.43 -> DA xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0044 <- 3.81 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0057 <- 3.67 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0076 <- 3.59 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0297 <- 4.09 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0332 <- 3.97 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0336 <- 4.43 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx >2rgr_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=TOPOISOMERASE IIA BOUND TO G-SEGMENT DNA organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NH1 A0475 <- 3.02 -> DC O2 D0005 : score 3.4894 : H : ARG NH2 A0475 <- 3.17 -> DC O2 D0005 : score 3.42501 : w : ASP OD1 A0687 <- 5.43 -> DC O2 D0008 : score 1.919 : w : SER OG A0691 <- 6.24 -> DC O2 D0008 : score 1.768 : x : LYS xxxx A0477 <- 3.59 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0833 <- 3.44 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0838 <- 3.62 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >2rve_AB: title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ECORV ENDONUCLEASE AND OF ITS COMPLEXES WITH COGNATE AND NON-COGNATE DNA SEGMENTS organism=ESCHERICHIA COLI : w : LYS NZ A0038 <- 6.50 -> DC O2 E0001 : score 1.3 : w : ASN ND2 A0070 <- 5.62 -> DG N3 E0002 : score 2.566 : w : ASN OD1 B0070 <- 5.72 -> DG N3 C0002 : score 3.377 : w : LYS NZ B0119 <- 5.11 -> DT O2 D0006 : score 0.522 : w : SER OG B0183 <- 6.46 -> DG O6 F0004 : score 2.749 >2rve_B:Restriction_endonuclease-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ECORV ENDONUCLEASE AND OF ITS COMPLEXES WITH COGNATE AND NON-COGNATE DNA SEGMENTS organism=ESCHERICHIA COLI : w : ASN OD1 B0070 <- 5.72 -> DG N3 C0002 : score 3.377 : w : LYS NZ B0119 <- 5.11 -> DT O2 D0006 : score 0.522 : w : SER OG B0183 <- 5.78 -> DG O6 E0004 : score 2.749 >2ssp_E:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=LEUCINE-272-ALANINE URACIL-DNA GLYCOSYLASE BOUND TO ABASIC SITE- CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 E0276 <- 6.22 -> DT O2 A0007 : score 1.855 : x : PRO xxxx E0271 <- 2.98 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0272 <- 4.04 -> DA xxx A0006 : score x.xxxxx >2stt_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE HUMAN ETS1/DNA COMPLEX, 25 STRUCTURES organism=? : x : GLU xxxx A0077 <- 3.18 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0080 <- 3.96 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0081 <- 3.07 -> DC xxx C0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0084 <- 3.79 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0085 <- 4.23 -> DT xxx C0024 : score x.xxxxx >2stw_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE HUMAN ETS1/DNA COMPLEX, RESTRAINED REGULARIZED MEAN STRUCTURE organism=? : H : ARG NH1 A0081 <- 2.37 -> DG O6 B0008 : score 6.6065 : H : ARG NH2 A0081 <- 2.42 -> DG O6 B0008 : score 7.1016 : x : GLU xxxx A0077 <- 3.11 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0084 <- 2.98 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0085 <- 4.20 -> DC xxx C0023 : score x.xxxxx >2up1_A:RNA-binding_domain,_RBD; title=STRUCTURE OF UP1-TELOMERIC DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ A0015 <- 2.82 -> DG N7 B0204 : score 5.36435 : H : ASP OD1 A0042 <- 2.89 -> DG N2 B0205 : score 5.0573 : H : GLU OE1 A0085 <- 2.65 -> DT N3 B0202 : score 1.80118 : H : LYS NZ A0087 <- 3.03 -> DT O2 B0202 : score 3.42217 : H : ARG NH2 A0092 <- 2.92 -> DG N7 B0205 : score 6.23138 : w : ARG NH1 A0092 <- 5.68 -> DT O4 B0207 : score 1.768 : w : ARG NH2 A0092 <- 5.78 -> DT O4 B0207 : score 2.366 : H : SER OG A0095 <- 3.06 -> DG N2 B0204 : score 3.19889 : x : GLU xxxx A0011 <- 4.18 -> DG xxx B0205 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0012 <- 2.83 -> DG xxx B0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0017 <- 3.40 -> DA xxx B0203 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0044 <- 3.45 -> DG xxx B0205 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0046 <- 3.57 -> DG xxx B0205 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0059 <- 3.41 -> DG xxx B0204 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0082 <- 3.14 -> DT xxx B0202 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0089 <- 3.78 -> DG xxx B0204 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0090 <- 3.83 -> DA xxx B0203 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0101 <- 3.51 -> DA xxx B0203 : score x.xxxxx >2uvr_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURES OF MUTANT DPO4 DNA POLYMERASES WITH 8-OXOG CONTAINING DNA TEMPLATE-PRIMER CONSTRUCTS organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : VAL xxxx A0032 <- 4.09 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.52 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.40 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2uvu_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURES OF MUTANT DPO4 DNA POLYMERASES WITH 8-OXOG CONTAINING DNA TEMPLATE-PRIMER CONSTRUCTS organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : VAL xxxx A0032 <- 3.84 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.70 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.27 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2uvv_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURES OF MUTANT DPO4 DNA POLYMERASES WITH 8-OXOG CONTAINING DNA TEMPLATE-PRIMER CONSTRUCTS organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : VAL xxxx A0032 <- 4.09 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.62 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.38 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2uvw_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURES OF MUTANT DPO4 DNA POLYMERASES WITH 8-OXOG CONTAINING DNA TEMPLATE-PRIMER CONSTRUCTS organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : VAL xxxx A0032 <- 3.51 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.51 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.14 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2uyc_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=HHAI DNA METHYLTRANSFERASE R163N MUTANT COMPLEX WITH 13MER GCGC-GMGC OLIGONUCLEOTIDE AND SAH organism=HAEMOPHILUS HAEMOLYTICUS : w : ARG NH2 A0228 <- 5.85 -> DA N7 D0425 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0240 <- 2.84 -> DG N7 D0426 : score 6.0016 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.89 -> DG O6 D0426 : score 6.4812 : x : ILE xxxx A0086 <- 3.48 -> DT xxx C0410 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.28 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0237 <- 3.36 -> DG xxx D0426 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0252 <- 4.47 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0254 <- 4.37 -> DC xxx D0429 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0260 <- 3.99 -> DT xxx C0405 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0261 <- 3.74 -> DT xxx C0405 : score x.xxxxx >2uyh_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=HHAI DNA METHYLTRANSFERASE S87Q-Q237S MUTANT COMPLEX WITH 13MER GCGC- GMGC OLIGONUCLEOTIDE AND SAH organism=HAEMOPHILUS HAEMOLYTICUS : H : GLU OE1 A0119 <- 2.64 -> DC N4 D0427 : score 5.95252 : H : ARG NE A0165 <- 2.94 -> DC O2 D0427 : score 2.58452 : H : ARG NH2 A0165 <- 2.90 -> DC O2 D0427 : score 3.62474 : H : SER OG A0237 <- 3.43 -> DG O6 C0408 : score 3.57556 : H : ARG NH1 A0240 <- 2.83 -> DG N7 D0426 : score 6.0137 : H : ARG NH1 A0240 <- 2.83 -> DG N7 D0426 : score 6.0137 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.91 -> DG O6 D0426 : score 6.4548 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.91 -> DG O6 D0426 : score 6.4548 : x : CYS xxxx A0081 <- 2.81 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0086 <- 3.48 -> DT xxx C0410 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0087 <- 3.21 -> DG xxx D0426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0121 <- 4.16 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0163 <- 2.93 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0252 <- 4.20 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0254 <- 4.31 -> DC xxx D0429 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0260 <- 3.30 -> DT xxx C0405 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0261 <- 3.66 -> DT xxx C0405 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0304 <- 3.48 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx >2uz4_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=HHAI DNA METHYLTRANSFERASE R165N MUTANT COMPLEX WITH 13MER GCGC-GMGC OLIGONUCLEOTIDE AND SAH organism=HAEMOPHILUS PARAHAEMOLYTICUS : H : ARG NH1 A0240 <- 2.85 -> DG N7 D0426 : score 5.9895 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.89 -> DG O6 D0426 : score 6.4812 : V : ALA CB A0260 <- 3.86 -> DT C7 C0405 : score 5.51499 : x : ILE xxxx A0086 <- 3.59 -> DT xxx C0410 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.20 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0228 <- 4.46 -> DA xxx D0425 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0237 <- 3.29 -> DG xxx D0426 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0254 <- 4.27 -> DC xxx D0429 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0261 <- 3.72 -> DT xxx C0405 : score x.xxxxx >2uzk_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN FOXO3A-DBD BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0211 <- 2.62 -> DG O6 E0028 : score 6.8376 : H : HIS NE2 A0212 <- 3.13 -> DT O4 E0031 : score 5.23878 : x : ASN xxxx A0208 <- 3.03 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0209 <- 3.96 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0215 <- 4.12 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0249 <- 3.62 -> DT xxx E0031 : score x.xxxxx >2v1u_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF THE AEROPYRUM PERNIX ORC1 PROTEIN IN COMPLEX WITH DNA organism=AEROPYRUM PERNIX : H : THR OG1 A0122 <- 3.04 -> DG N2 B0018 : score 3.82509 : H : ARG NE A0345 <- 3.19 -> DG O6 B0010 : score 3.63363 : H : ARG NH2 A0345 <- 2.54 -> DG N7 B0010 : score 6.71662 : H : ARG NH1 A0369 <- 2.62 -> DT O2 B0003 : score 4.46144 : H : ARG NH1 A0369 <- 3.03 -> DC O2 B0004 : score 3.4821 : x : THR xxxx A0343 <- 4.37 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0346 <- 3.74 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0366 <- 3.56 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0372 <- 3.28 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx >2v2t_AB: title=X-RAY STRUCTURE OF A NF-KB P50-RELB-DNA COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0117 <- 3.05 -> DG O6 D0015 : score 5.77917 : H : ARG NH2 A0117 <- 3.17 -> DG O6 D0015 : score 6.1116 : H : ARG NH1 A0119 <- 3.15 -> DG N7 D0014 : score 5.6265 : H : ARG NH1 A0119 <- 3.10 -> DG O6 D0014 : score 5.71833 : H : ARG NH2 A0119 <- 3.28 -> DG N7 D0014 : score 5.77169 : H : GLU OE2 A0123 <- 2.90 -> DC N4 C0011 : score 5.16008 : H : ARG NH2 B0054 <- 3.35 -> DT O4 D0020 : score 3.16292 : H : ARG NH1 B0056 <- 2.66 -> DG O6 C0004 : score 6.25367 : x : TYR xxxx A0120 <- 3.57 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0122 <- 4.35 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0274 <- 4.09 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0057 <- 3.30 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0059 <- 4.16 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0060 <- 3.52 -> DC xxx D0021 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0064 <- 2.88 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0241 <- 3.15 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx >2v2t_B:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=X-RAY STRUCTURE OF A NF-KB P50-RELB-DNA COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 B0054 <- 3.35 -> DT O4 D0020 : score 3.16292 : H : ARG NH1 B0056 <- 2.66 -> DG O6 C0004 : score 6.25367 : x : TYR xxxx B0057 <- 3.30 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0059 <- 4.16 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0060 <- 3.52 -> DC xxx D0021 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0064 <- 2.88 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0241 <- 3.15 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx >2v4q_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=POST-INSERTION COMPLEX OF THE Y-FAMILY DNA POLYMERASE DPO4 WITH M1DG CONTAINING TEMPLATE DNA organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : VAL xxxx A0032 <- 3.45 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.65 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0184 <- 3.54 -> DC xxx P0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.17 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2v4r_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=NON-PRODUCTIVE COMPLEX OF THE Y-FAMILY DNA POLYMERASE DPO4 WITH DGTP SKIPPING THE M1DG ADDUCT TO PAIR WITH THE NEXT TEMPLATE CYTOSINE organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : ARG xxxx A0337 <- 3.93 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2v6e_AB: title=PROTELOMERASE TELK COMPLEXED WITH SUBSTRATE DNA organism=KLEBSIELLA PHAGE PHIKO2 : H : ASN ND2 A0067 <- 3.10 -> DT O4 C0007 : score 4.96754 : H : ASN OD1 A0357 <- 2.77 -> DA N6 C0011 : score 6.05793 : H : ASN ND2 A0357 <- 2.96 -> DA N7 C0011 : score 5.68266 : H : THR OG1 A0362 <- 2.37 -> DG O6 C0013 : score 4.57791 : H : ARG NH1 A0492 <- 2.98 -> DG O6 C0023 : score 5.86433 : H : ARG NH2 A0492 <- 2.99 -> DG N7 C0023 : score 6.142 : H : THR OG1 A0498 <- 3.07 -> DT O4 C0024 : score 3.67727 : H : THR OG1 A0498 <- 2.80 -> DC N4 D0026 : score 4.03333 : H : ASN ND2 B0067 <- 3.15 -> DT O4 E0007 : score 4.91469 : H : ASN OD1 B0357 <- 2.74 -> DA N6 E0011 : score 6.09406 : H : ASN ND2 B0357 <- 2.98 -> DA N7 E0011 : score 5.65917 : H : THR OG1 B0362 <- 3.12 -> DC N4 F0038 : score 3.7752 : H : THR OG1 B0362 <- 2.34 -> DG O6 E0013 : score 4.6032 : H : ARG NH1 B0492 <- 2.97 -> DG O6 E0023 : score 5.8765 : H : ARG NH2 B0492 <- 2.99 -> DG N7 E0023 : score 6.142 : H : THR OG1 B0498 <- 2.80 -> DC N4 F0026 : score 4.03333 : H : THR OG1 B0498 <- 3.05 -> DT O4 E0024 : score 3.69282 : V : ALA CB A0361 <- 3.67 -> DT C7 C0012 : score 5.78094 : V : ARG CG A0499 <- 3.81 -> DT C7 C0024 : score 1.00262 : V : ALA CB B0361 <- 3.71 -> DT C7 E0012 : score 5.72495 : V : ARG CG B0499 <- 3.74 -> DT C7 E0024 : score 1.02021 : x : ASN xxxx A0064 <- 2.88 -> DT xxx D0043 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0065 <- 3.56 -> DT xxx D0041 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0068 <- 3.94 -> DA xxx D0042 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0069 <- 3.81 -> DT xxx D0040 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0071 <- 3.39 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0072 <- 3.79 -> DT xxx D0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0212 <- 3.60 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0216 <- 3.19 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0219 <- 3.30 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0259 <- 3.91 -> DG xxx D0035 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0300 <- 3.18 -> DA xxx D0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0302 <- 2.59 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0350 <- 4.10 -> DC xxx D0038 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0358 <- 3.99 -> DC xxx D0038 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0365 <- 3.73 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0418 <- 4.21 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0421 <- 3.80 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0424 <- 3.88 -> DA xxx D0044 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0489 <- 3.19 -> DG xxx C0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0064 <- 2.91 -> DT xxx F0043 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0065 <- 3.53 -> DT xxx F0041 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0068 <- 3.95 -> DA xxx F0042 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0069 <- 3.82 -> DT xxx F0040 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0071 <- 3.40 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0072 <- 3.81 -> DT xxx F0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0212 <- 3.59 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0216 <- 3.19 -> DC xxx E0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0219 <- 3.30 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0259 <- 3.94 -> DG xxx F0035 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0300 <- 3.12 -> DA xxx F0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0302 <- 2.62 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0350 <- 4.14 -> DC xxx F0038 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0358 <- 4.01 -> DC xxx F0038 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0365 <- 3.68 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0418 <- 4.22 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0421 <- 3.78 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : 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: score x.xxxxx >2v9w_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=COMPLEX STRUCTURE OF SULFOLOBUS SOLFATARICUS DPO4 AND DNA DUPLEX CONTAINING A HYDROPHOBIC THYMINE ISOSTERE 2,4-DIFLUOROTOLUENE NUCLEOTIDE IN THE TEMPLATE STRAND organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : VAL xxxx A0032 <- 3.79 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.50 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0044 <- 3.71 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 3.57 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.87 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx >2va2_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=COMPLEX STRUCTURE OF SULFOLOBUS SOLFATARICUS DPO4 AND DNA DUPLEX CONTAINING A HYDROPHOBIC THYMINE ISOSTERE 2,4-DIFLUOROTOLUENE NUCLEOTIDE IN THE TEMPLATE STRAND organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : w : ARG NH2 B0332 <- 6.07 -> DA N6 F0007 : score 1.997 : x : VAL xxxx B0032 <- 4.16 -> DG xxx F0005 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N4 C0021 : score 2.395 : H : TYR OH A0033 <- 2.57 -> DA N7 E0003 : score 4.34224 : H : TYR OH A0033 <- 2.64 -> DA N6 E0003 : score 4.81997 : H : ARG NH1 A0038 <- 2.78 -> DG O6 E0004 : score 6.10767 : H : ARG NH2 A0038 <- 2.50 -> DG N7 E0004 : score 6.76769 : H : LYS NZ A0040 <- 2.75 -> DT O4 C0019 : score 3.62305 : H : LYS NZ A0040 <- 2.32 -> DG O6 E0005 : score 6.33572 : H : LYS NZ A0044 <- 2.93 -> DG N7 C0016 : score 5.24586 : w : LYS NZ A0044 <- 5.41 -> DG O6 C0017 : score 3.005 : w : GLU OE1 A0070 <- 6.59 -> DA N6 C0015 : score 2.939 : w : GLU OE1 A0070 <- 5.36 -> DC N4 E0009 : score 3.528 : w : SER OG A0072 <- 6.35 -> DG N7 C0013 : score 2.749 : w : ASN OD1 A0075 <- 5.74 -> DA N7 C0015 : score 2.277 : w : LYS NZ A0139 <- 5.75 -> DA N3 C0015 : score 1.538 : H : THR OG1 A0140 <- 3.41 -> DG N2 C0016 : score 3.52776 : w : THR OG1 A0140 <- 6.09 -> DG N3 C0017 : score 2.036 : H : GLN NE2 B0026 <- 2.81 -> DA N7 E0018 : score 6.07756 : w : ASN ND2 B0030 <- 5.74 -> DC N4 E0021 : score 2.395 : w : ASN ND2 B0030 <- 5.98 -> DA N6 E0022 : score 2.5 : H : ARG NH1 B0038 <- 3.26 -> DG N7 C0004 : score 5.4934 : H : ARG NH2 B0038 <- 2.43 -> DG O6 C0004 : score 7.0884 : H : LYS NZ B0040 <- 3.05 -> DG N7 E0019 : score 5.1166 : H : LYS NZ B0040 <- 2.47 -> DG O6 E0019 : score 6.1623 : H : GLN NE2 B0044 <- 3.18 -> DA N7 E0016 : score 5.62692 : w : GLN OE1 B0044 <- 5.67 -> DA N6 E0017 : score 3.392 : w : SER OG B0070 <- 5.82 -> DT O4 C0008 : score 2.338 : w : SER OG B0072 <- 5.82 -> DA N7 E0013 : score 2.343 : w : ASN OD1 B0075 <- 5.86 -> DA N7 E0015 : score 2.277 : w : THR OG1 B0140 <- 5.80 -> DA N3 E0017 : score 2.845 : V : SER CB A0032 <- 3.85 -> DT C7 E0001 : score 3.09214 : x : SER xxxx A0022 <- 4.23 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.61 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.59 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0068 <- 3.64 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.92 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x 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H : LYS NZ A0044 <- 2.99 -> DG N7 T0016 : score 5.18123 : H : GLU OE1 A0070 <- 2.94 -> DC N4 E0008 : score 5.60645 : w : SER OG A0072 <- 6.08 -> DG N7 C0013 : score 2.749 : w : ASN OD1 A0075 <- 5.66 -> DA N7 T0015 : score 2.277 : w : LYS NZ A0139 <- 5.73 -> DA N3 T0015 : score 1.538 : w : THR OG1 A0140 <- 5.83 -> DG N3 T0017 : score 2.036 : x : SER xxxx A0022 <- 4.16 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.63 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.61 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0068 <- 3.28 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.86 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >2vbl_AB:Homing_endonucleases; title=MOLECULAR BASIS OF HUMAN XPC GENE RECOGNITION AND CLEAVAGE BY ENGINEERED HOMING ENDONUCLEASE HETERODIMERS organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : w : GLN OE1 A0026 <- 5.79 -> DA N6 T0018 : score 3.392 : w : GLU OE2 A0028 <- 5.88 -> DC N4 T0021 : score 3.597 : w : ASN ND2 A0030 <- 5.77 -> DC N4 T0021 : score 2.395 : w : 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HUMAN XPC GENE RECOGNITION AND CLEAVAGE BY ENGINEERED HOMING ENDONUCLEASE HETERODIMERS organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : H : GLN NE2 A0026 <- 2.91 -> DA N7 C0018 : score 5.95577 : H : LYS NZ A0028 <- 2.90 -> DG N7 C0019 : score 5.27818 : H : LYS NZ A0028 <- 2.71 -> DG O6 C0019 : score 5.88482 : H : ARG NH1 A0038 <- 3.05 -> DG N7 E0004 : score 5.7475 : H : ARG NH2 A0038 <- 2.90 -> DG N7 E0004 : score 6.25692 : H : ARG NH2 A0038 <- 2.41 -> DG O6 E0004 : score 7.1148 : H : GLN NE2 A0044 <- 3.09 -> DA N7 C0016 : score 5.73654 : w : GLN OE1 A0044 <- 6.05 -> DA N6 C0017 : score 3.392 : w : SER OG A0072 <- 6.11 -> DA N7 C0013 : score 2.343 : w : ASN OD1 A0075 <- 5.79 -> DA N7 C0015 : score 2.277 : w : LYS NZ A0139 <- 6.43 -> DA N3 C0015 : score 1.538 : w : LYS NZ A0139 <- 5.82 -> DA N3 C0015 : score 1.538 : w : THR OG1 A0140 <- 5.56 -> DA N3 C0017 : score 2.845 : V : SER CB A0070 <- 3.78 -> DT C7 E0008 : score 3.14694 : x : SER xxxx A0022 <- 4.24 -> DA xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ILE 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AERUGINOSA) organism=PSEUDOMONAS AERUGINOSA : w : SER OG B0766 <- 5.76 -> DC N4 J0007 : score 2.105 : w : GLN OE1 B0769 <- 5.75 -> DC N4 J0007 : score 3.488 : w : GLN NE2 B0769 <- 5.66 -> DT O4 J0008 : score 2.257 : w : SER OG C0766 <- 5.65 -> DG O6 J0004 : score 2.749 : w : SER OG C0766 <- 6.07 -> DC N4 J0005 : score 2.105 : w : GLN OE1 C0769 <- 5.52 -> DC N4 J0005 : score 3.488 : w : GLN NE2 C0769 <- 5.67 -> DG O6 I0011 : score 2.87 : w : ASN OD1 C0777 <- 5.88 -> DC N4 J0007 : score 2.732 : w : ASN OD1 C0777 <- 6.10 -> DA N6 I0009 : score 2.837 : x : TYR xxxx B0776 <- 3.57 -> DC xxx J0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0776 <- 3.38 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx >2ve9_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=XRAY STRUCTURE OF KOPS BOUND GAMMA DOMAIN OF FTSK (P. 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AERUGINOSA) organism=PSEUDOMONAS AERUGINOSA : H : SER OG D0766 <- 2.95 -> DG N7 L0004 : score 4.34759 : w : SER OG D0766 <- 5.85 -> DC N4 L0005 : score 2.105 : w : GLN OE1 D0769 <- 5.45 -> DC N4 L0005 : score 3.488 : w : GLN NE2 D0769 <- 5.77 -> DG O6 K0011 : score 2.87 : w : ASN OD1 D0777 <- 6.23 -> DA N6 K0009 : score 2.837 : w : ASN OD1 D0777 <- 5.85 -> DC N4 L0007 : score 2.732 : w : ASN OD1 D0777 <- 6.07 -> DG O6 K0010 : score 3.125 : w : SER OG E0766 <- 5.63 -> DC N4 L0007 : score 2.105 : w : GLN OE1 E0769 <- 5.77 -> DC N4 L0007 : score 3.488 : w : GLN NE2 E0769 <- 5.74 -> DT O4 L0008 : score 2.257 : x : TYR xxxx D0776 <- 3.38 -> DC xxx L0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0776 <- 3.63 -> DC xxx L0007 : score x.xxxxx >2vic_A:Transposase_IS200-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ISHP608 TRANSPOSASE IN COMPLEX WITH LEFT END 26- MER DNA AND MANGANESE organism=HELICOBACTER PYLORI : H : CYS SG A0024 <- 3.26 -> DG N2 C0019 : score -8.27328 : w : ASN OD1 A0109 <- 6.33 -> DC N4 C0021 : score 2.732 : H : SER OG A0110 <- 2.77 -> DA N3 C0018 : score 3.02187 >2vic_AB:Transposase_IS200-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ISHP608 TRANSPOSASE IN COMPLEX WITH LEFT END 26- MER DNA AND MANGANESE organism=HELICOBACTER PYLORI : H : CYS SG A0024 <- 3.26 -> DG N2 C0019 : score -8.27328 : w : ASN OD1 A0109 <- 6.33 -> DC N4 C0021 : score 2.732 : H : SER OG A0110 <- 2.77 -> DA N3 C0018 : score 3.02187 : H : ASN ND2 B0012 <- 3.15 -> DG N7 C0038 : score 4.26488 : w : ASN OD1 B0012 <- 6.05 -> DG O6 C0039 : score 3.125 : V : ARG CZ B0052 <- 3.89 -> DT C7 C0037 : score 2.08433 >2vih_AB:Transposase_IS200-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE IS608 TRANSPOSASE IN COMPLEX WITH LEFT END 26-MER DNA organism=HELICOBACTER PYLORI : H : CYS SG A0024 <- 3.20 -> DG N2 C0019 : score -8.38262 : w : ASN ND2 A0109 <- 5.91 -> DC N4 C0021 : score 2.395 : H : SER OG A0110 <- 2.86 -> DA N3 C0018 : score 2.9678 : H : SER OG B0009 <- 3.13 -> DA N3 C0017 : score 2.80559 : H : HIS ND1 B0011 <- 3.29 -> DG N7 C0038 : score 5.61322 >2vih_B:Transposase_IS200-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE IS608 TRANSPOSASE IN COMPLEX WITH LEFT END 26-MER DNA organism=HELICOBACTER PYLORI : H : SER OG B0009 <- 3.13 -> DA N3 C0017 : score 2.80559 : H : HIS ND1 B0011 <- 3.29 -> DG N7 C0038 : score 5.61322 >2vju_A:Transposase_IS200-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE IS608 TRANSPOSASE IN COMPLEX WITH THE COMPLETE RIGHT END 35-MER DNA AND MANGANESE organism=HELICOBACTER PYLORI : H : ARG NH1 A0028 <- 2.88 -> DA N3 C-002 : score 3.62314 : H : ARG NH1 A0028 <- 3.20 -> DA N3 C-001 : score 3.38749 : H : LYS NZ A0082 <- 2.94 -> DT O4 C-022 : score 3.48674 : H : LYS NZ A0082 <- 2.95 -> DC O2 C-018 : score 2.85777 : w : THR OG1 A0108 <- 6.26 -> DT O2 C-032 : score 2.522 : H : SER OG A0110 <- 2.66 -> DA N3 C-033 : score 3.08795 : w : SER OG A0110 <- 6.59 -> DT O2 C-032 : score 1.55 >2vju_AB:Transposase_IS200-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE IS608 TRANSPOSASE IN COMPLEX WITH THE COMPLETE RIGHT END 35-MER DNA AND MANGANESE organism=HELICOBACTER PYLORI : H : ASN ND2 A0012 <- 3.14 -> DG N7 D-014 : score 4.27406 : w : ASN OD1 A0012 <- 5.73 -> DG O6 D-013 : score 3.125 : H : ARG NH1 B0028 <- 3.14 -> DA N3 D-002 : score 3.43167 : w : THR OG1 B0108 <- 6.14 -> DT O2 D-032 : score 2.522 : H : SER OG B0110 <- 2.89 -> DA N3 D-033 : score 2.94978 : w : SER OG B0110 <- 6.37 -> DT O2 D-032 : score 1.55 >2vla_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF RESTRICTION ENDONUCLEASE BPUJI RECOGNITION DOMAIN IN COMPLEX WITH COGNATE DNA organism=BACILLUS PUMILUS : H : ARG NH1 A0015 <- 2.86 -> DG N7 L0108 : score 5.9774 : H : ARG NH1 A0015 <- 2.83 -> DG O6 L0108 : score 6.04683 : w : LYS NZ A0017 <- 5.83 -> DC N4 L0107 : score 0.048 : w : LYS NZ A0017 <- 6.37 -> DC N4 M0205 : score 0.048 : w : ASN ND2 A0020 <- 6.13 -> DC O2 M0202 : score 1.885 : H : LYS NZ A0063 <- 3.04 -> DG N7 M0207 : score 5.12737 : H : LYS NZ A0063 <- 2.74 -> DG O6 M0208 : score 5.85014 : w : LYS NZ A0063 <- 5.70 -> DA N6 L0104 : score 2.097 : H : ASN OD1 A0067 <- 2.89 -> DC N4 L0105 : score 4.1181 : H : ASN ND2 A0067 <- 3.07 -> DG N7 M0206 : score 4.33826 : H : ASN ND2 A0067 <- 3.01 -> DG O6 M0207 : score 5.40165 : H : GLU OE2 A0071 <- 2.94 -> DC N4 L0106 : score 5.11795 : w : GLU OE1 A0071 <- 5.90 -> DC N4 L0107 : score 3.528 : w : GLU OE1 A0071 <- 6.08 -> DC N4 L0107 : score 3.528 : H : LYS NZ A0121 <- 2.94 -> DA N3 M0210 : score 2.69917 : w : LYS NZ A0121 <- 5.61 -> DA N3 L0104 : score 1.538 : H : SER OG A0204 <- 2.82 -> DT O4 L0109 : score 3.54091 : H : GLN OE1 A0208 <- 2.90 -> DA N6 M0204 : score 5.93151 : H : GLN NE2 A0208 <- 2.96 -> DA N7 M0204 : score 5.89487 : V : GLU CB A0202 <- 3.65 -> DT C7 L0109 : score 1.68873 : x : THR xxxx A0064 <- 3.28 -> DG xxx M0206 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0070 <- 4.49 -> DC xxx L0105 : score x.xxxxx >2voa_AB:DNase_I-like; title=STRUCTURE OF AN AP ENDONUCLEASE FROM ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS organism=ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS : w : ASN ND2 A0010 <- 5.69 -> DC O2 C0002 : score 1.885 : w : ASN ND2 B0010 <- 6.02 -> DG N3 D0002 : score 2.566 : w : ASP OD2 B0202 <- 5.76 -> DG N3 C0010 : score 2.312 : x : TYR xxxx A0203 <- 3.84 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0204 <- 3.45 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0203 <- 3.31 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0204 <- 3.27 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx >2voa_B:DNase_I-like; title=STRUCTURE OF AN AP ENDONUCLEASE FROM ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS organism=ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS : w : ASN ND2 B0010 <- 6.02 -> DG N3 D0002 : score 2.566 : w : ASP OD2 B0202 <- 5.76 -> DG N3 C0010 : score 2.312 : x : TYR xxxx B0203 <- 3.31 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0204 <- 3.27 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx >2vs7_A:Homing_endonucleases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH DNA AND CA organism=DESULFUROCOCCUS MOBILIS : H : ARG NH1 A0033 <- 2.69 -> DG O6 B0021 : score 6.21717 : H : GLU OE1 A0035 <- 3.06 -> DC N4 C0006 : score 5.46802 : H : ARG NH1 A0037 <- 2.82 -> DG O6 C0008 : score 6.059 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.81 -> DG O6 C0007 : score 6.5868 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.85 -> DG O6 C0008 : score 6.534 : w : ARG NH1 A0037 <- 5.63 -> DT O4 B0017 : score 1.768 : H : THR OG1 A0076 <- 2.70 -> DA N7 B0014 : score 3.48238 : H : THR OG1 A0076 <- 2.57 -> DA N6 B0014 : score 2.88589 : H : ARG NE A0077 <- 2.96 -> DG N7 B0015 : score 4.2803 : H : ARG NH2 A0077 <- 2.88 -> DT O4 B0016 : score 3.49698 : H : GLU OE1 A0079 <- 3.32 -> DA N6 C0009 : score 2.40312 : w : GLU OE2 A0079 <- 5.27 -> DT O4 B0017 : score 2.279 : H : ARG NH1 A0081 <- 3.01 -> DG N7 C0008 : score 5.7959 : H : ARG NH2 A0081 <- 2.99 -> DG N7 C0008 : score 6.142 : H : ARG NH1 A0124 <- 2.83 -> DG O6 B0006 : score 6.04683 : H : ARG NH1 A0124 <- 3.01 -> DG O6 C0019 : score 5.82783 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.87 -> DG N7 B0006 : score 6.29523 : H : ARG NH1 A0126 <- 2.90 -> DG O6 C0018 : score 5.96167 : H : ARG NH2 A0126 <- 2.92 -> DG N7 C0018 : score 6.23138 : w : ARG NH1 A0126 <- 6.37 -> DC N4 B0007 : score 1.892 : H : ASP OD1 A0154 <- 3.03 -> DC N4 B0008 : score 5.09901 : w : ASP OD1 A0154 <- 6.29 -> DC N4 B0007 : score 2.835 : H : ASP OD2 A0155 <- 2.63 -> DC N4 C0015 : score 6.4108 : H : ARG NH1 A0157 <- 2.77 -> DG N7 B0010 : score 6.0863 : H : ARG NH2 A0157 <- 2.65 -> DG O6 B0010 : score 6.798 : x : TYR xxxx A0025 <- 3.45 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0027 <- 3.99 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0029 <- 3.23 -> DC xxx B0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0034 <- 3.34 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0039 <- 4.27 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.95 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0070 <- 3.14 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0072 <- 4.11 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0083 <- 3.85 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0128 <- 3.55 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0158 <- 3.45 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0160 <- 3.85 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx >2vs8_K:Homing_endonucleases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH DNA AND MN organism=DESULFUROCOCCUS MOBILIS : H : ARG NH1 K0033 <- 3.38 -> DG O6 M0020 : score 5.37767 : H : ARG NH1 K0033 <- 2.62 -> DG O6 M0021 : score 6.30233 : H : GLU OE1 K0035 <- 2.78 -> DC N4 N0006 : score 5.79102 : H : ARG NH1 K0037 <- 2.78 -> DG O6 N0008 : score 6.10767 : H : ARG NH2 K0037 <- 2.69 -> DG O6 N0007 : score 6.7452 : H : ARG NH2 K0037 <- 2.97 -> DG O6 N0008 : score 6.3756 : w : ARG NH1 K0037 <- 5.92 -> DT O4 M0017 : score 1.768 : H : THR OG1 K0076 <- 2.95 -> DA N7 L0014 : score 3.31168 : H : THR OG1 K0076 <- 2.86 -> DA N6 L0014 : score 2.72587 : H : ARG NE K0077 <- 3.06 -> DG N7 M0015 : score 4.19186 : H : ARG NH1 K0077 <- 2.95 -> DT O4 M0016 : score 3.16991 : w : GLU OE2 K0079 <- 5.67 -> DT O4 M0017 : score 2.279 : H : ARG NH1 K0081 <- 2.86 -> DG N7 N0007 : score 5.9774 : H : ARG NH1 K0081 <- 3.13 -> DG N7 N0008 : score 5.6507 : H : ARG NH2 K0081 <- 3.00 -> DG N7 N0008 : score 6.12923 : H : ARG NH1 K0124 <- 3.01 -> DG O6 O0019 : score 5.82783 : H : ARG NH2 K0124 <- 2.67 -> DG O6 L0006 : score 6.7716 : H : ARG NH1 K0126 <- 3.04 -> DG O6 O0018 : score 5.79133 : H : ARG NH2 K0126 <- 3.16 -> DG N7 O0018 : score 5.92492 : H : ASP OD1 K0154 <- 3.04 -> DC N4 L0008 : score 5.08832 : H : ASP OD2 K0155 <- 2.93 -> DC N4 N0015 : score 6.0388 : H : ARG NH1 K0157 <- 2.91 -> DG N7 L0010 : score 5.9169 : H : ARG NH2 K0157 <- 2.76 -> DG O6 L0010 : score 6.6528 : x : TYR xxxx K0025 <- 3.70 -> DT xxx M0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx K0027 <- 4.10 -> DT xxx M0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx K0029 <- 3.24 -> DC xxx M0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0034 <- 3.27 -> DG xxx N0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx K0039 <- 4.13 -> DT xxx M0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx K0041 <- 3.87 -> DG xxx M0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx K0070 <- 3.09 -> DG xxx N0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx K0072 <- 4.06 -> DG xxx N0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx K0075 <- 3.50 -> DC xxx N0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0083 <- 3.95 -> DC xxx N0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx K0128 <- 3.61 -> DC xxx O0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx K0158 <- 3.37 -> DA xxx N0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx K0160 <- 3.79 -> DC xxx N0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx K0167 <- 4.41 -> DT xxx L0005 : score x.xxxxx >2vtb_E:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=STRUCTURE OF CRYPTOCHROME 3 - DNA COMPLEX organism=? : H : GLU OE2 E0325 <- 3.01 -> DT N3 K0002 : score 2.52519 : V : TRP CG E0328 <- 3.82 -> DT C7 K0002 : score 5.46893 : x : ARG xxxx E0276 <- 4.19 -> DT xxx K0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx E0321 <- 4.07 -> DT xxx K0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0324 <- 3.47 -> DT xxx K0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0332 <- 4.27 -> DT xxx K0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0431 <- 4.24 -> DT xxx K0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0434 <- 4.47 -> DT xxx K0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0443 <- 4.27 -> DT xxx K0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx E0445 <- 4.03 -> DT xxx K0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0446 <- 3.33 -> DT xxx K0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0447 <- 3.79 -> DT xxx K0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0496 <- 3.28 -> DT xxx K0005 : score x.xxxxx >2vum_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=ALPHA-AMANITIN INHIBITED COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.50 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx >2vum_AB: title=ALPHA-AMANITIN INHIBITED COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.50 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx >2vw9_A:Nucleic_acid-binding_proteins; title=SINGLE STRANDED DNA BINDING PROTEIN COMPLEX FROM HELICOBACTER PYLORI organism=HELICOBACTER PYLORI : w : THR OG1 A1012 <- 6.11 -> DT O2 C0007 : score 2.522 : w : ARG NH1 A1013 <- 5.87 -> DT O2 C0007 : score 1.855 : H : LYS NZ A1018 <- 3.40 -> DT O2 C0003 : score 3.15672 : w : ASP OD1 A1052 <- 6.86 -> DT O2 C0005 : score 2.105 : w : ARG NH2 A1078 <- 5.71 -> DT O4 C0002 : score 2.366 : H : GLU OE1 A1082 <- 2.89 -> DT N3 C0004 : score 1.71724 : H : ARG NH2 A1094 <- 3.24 -> DT O2 C0004 : score 3.8608 : V : PHE CD2 A1056 <- 3.74 -> DT C7 C0002 : score 6.60947 : V : TRP CG A1084 <- 3.75 -> DT C7 C0004 : score 5.56512 : x : ARG xxxx A1010 <- 2.95 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1028 <- 4.18 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A1032 <- 3.62 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1038 <- 4.38 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A1048 <- 4.00 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1050 <- 3.73 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1054 <- 3.25 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1062 <- 3.69 -> DT xxx C0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1066 <- 3.50 -> DT xxx C0031 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1103 <- 4.17 -> DT xxx C0032 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1104 <- 3.24 -> DT xxx C0031 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A1106 <- 3.72 -> DT xxx C0031 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1107 <- 3.58 -> DT xxx C0031 : score x.xxxxx >2vw9_AB:Nucleic_acid-binding_proteins; title=SINGLE STRANDED DNA BINDING PROTEIN COMPLEX FROM HELICOBACTER PYLORI organism=HELICOBACTER PYLORI : w : THR OG1 A1012 <- 6.11 -> DT O2 C0007 : score 2.522 : w : ARG NH1 A1013 <- 5.87 -> DT O2 C0007 : score 1.855 : H : LYS NZ A1018 <- 3.40 -> DT O2 C0003 : score 3.15672 : w : ASP OD1 A1052 <- 6.86 -> DT O2 C0005 : score 2.105 : w : ARG NH2 A1078 <- 5.71 -> DT O4 C0002 : score 2.366 : H : GLU OE1 A1082 <- 2.89 -> DT N3 C0004 : score 1.71724 : H : ARG NH2 A1094 <- 3.24 -> DT O2 C0004 : score 3.8608 : H : LYS NZ B2018 <- 2.27 -> DT O2 C0020 : score 3.96742 : H : GLU OE1 B2082 <- 2.83 -> DT N3 C0022 : score 1.73823 : H : ARG NH1 B2094 <- 2.96 -> DT O2 C0022 : score 4.16861 : V : PHE CD2 A1056 <- 3.74 -> DT C7 C0002 : score 6.60947 : V : TRP CG A1084 <- 3.75 -> DT C7 C0004 : score 5.56512 : V : TRP CB B2084 <- 3.51 -> DT C7 C0022 : score 5.8949 : x : ARG xxxx A1010 <- 2.95 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1028 <- 4.18 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A1032 <- 3.62 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1038 <- 4.38 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A1048 <- 4.00 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1050 <- 3.73 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1054 <- 3.25 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1062 <- 3.69 -> DT xxx C0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1066 <- 3.50 -> DT xxx C0031 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1103 <- 4.17 -> DT xxx C0032 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1104 <- 3.24 -> DT xxx C0031 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A1106 <- 3.72 -> DT xxx C0031 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1107 <- 3.58 -> DT xxx C0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B2010 <- 3.22 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B2012 <- 4.44 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B2020 <- 3.85 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B2026 <- 3.66 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B2028 <- 3.98 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B2032 <- 3.67 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B2044 <- 3.29 -> DT xxx C0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B2048 <- 3.80 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B2050 <- 3.36 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B2054 <- 3.20 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B2056 <- 2.72 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B2062 <- 4.24 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B2066 <- 3.81 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B2078 <- 3.39 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B2103 <- 3.03 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B2104 <- 3.38 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx >2vwj_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=URACIL RECOGNITION IN ARCHAEAL DNA POLYMERASES CAPTURED BY X-RAY CRYSTALLOGRAPHY. organism=THERMOCOCCUS GORGONARIUS : H : ARG NE A0613 <- 3.10 -> DG N3 B0023 : score 1.64982 : H : ARG NH2 A0613 <- 2.31 -> DT O2 B0022 : score 4.6482 : x : ARG xxxx A0265 <- 2.89 -> DC xxx B0025 : score x.xxxxx >2vy1_A:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF LEAFY TRANSCRIPTION FACTOR FROM ARABIDOPSIS THALIANA IN COMPLEX WITH DNA FROM AP1 PROMOTER organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ARG NH1 A0237 <- 3.10 -> DT O2 W0019 : score 4.04803 : H : ARG NH2 A0237 <- 3.17 -> DT O2 W0019 : score 3.92007 : H : LYS NZ A0307 <- 3.18 -> DG N7 W0013 : score 4.97657 : H : LYS NZ A0307 <- 3.04 -> DG N7 W0014 : score 5.12737 : H : LYS NZ A0307 <- 3.15 -> DG O6 W0014 : score 5.37612 : V : ARG CG A0311 <- 3.66 -> DT C7 W0015 : score 1.04031 : x : ASN xxxx A0291 <- 3.37 -> DG xxx W0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0308 <- 3.83 -> DT xxx W0015 : score x.xxxxx >2vy2_A:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF LEAFY TRANSCRIPTION FACTOR FROM ARABIDOPSIS THALIANA IN COMPLEX WITH DNA FROM AG-I PROMOTER organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : LYS NZ A0307 <- 2.98 -> DG N7 W0014 : score 5.19201 : H : LYS NZ A0307 <- 3.16 -> DG O6 W0014 : score 5.36455 : x : ARG xxxx A0237 <- 3.64 -> DA xxx W0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0291 <- 3.45 -> DG xxx W0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0308 <- 4.16 -> DT xxx W0015 : score x.xxxxx >2vz4_A:Putative_DNA-binding_domain; title=THE N-TERMINAL DOMAIN OF MERR-LIKE PROTEIN TIPAL BOUND TO PROMOTER DNA organism=STREPTOMYCES LIVIDANS : x : ARG xxxx A0017 <- 3.60 -> DA xxx B-005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0020 <- 3.50 -> DT xxx B-007 : score x.xxxxx >2w36_A: title=STRUCTURES OF ENDONUCLEASE V WITH DNA REVEAL INITIATION OF DEAMINATED ADENINE REPAIR organism=THERMOTOGA MARITIMA : x : ILE xxxx A0081 <- 3.69 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0082 <- 3.22 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >2w42_A:Ribonuclease_H-like; title=THE STRUCTURE OF A PIWI PROTEIN FROM ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS COMPLEXED WITH A 16NT DNA DUPLEX. organism=ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS : H : ASN OD1 A0148 <- 3.29 -> DA N6 Q0013 : score 5.43166 : V : ILE CG1 A0143 <- 3.69 -> DT C7 P0002 : score 5.09535 : x : PHE xxxx A0151 <- 3.42 -> DA xxx Q0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0152 <- 3.49 -> DT xxx P0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0155 <- 2.99 -> DT xxx P0002 : score x.xxxxx >2w7n_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF KORA BOUND TO OPERATOR DNA: INSIGHT INTO REPRESSOR COOPERATION IN RP4 GENE REGULATION organism=ESCHERICHIA COLI : w : THR OG1 A0047 <- 5.58 -> DA N7 E0012 : score 2.152 : H : ARG NE A0048 <- 2.96 -> DG N7 F0004 : score 4.2803 : H : ARG NH2 A0048 <- 3.07 -> DG O6 F0004 : score 6.2436 : w : ARG NH2 A0048 <- 6.54 -> DA N7 E0014 : score 1.486 : H : GLN NE2 A0053 <- 2.97 -> DT O4 E0011 : score 5.01453 : H : GLN NE2 A0053 <- 3.04 -> DT O4 F0007 : score 4.94186 : w : THR OG1 B0047 <- 5.48 -> DA N7 F0012 : score 2.152 : H : ARG NE B0048 <- 2.98 -> DG N7 E0004 : score 4.26261 : H : ARG NH2 B0048 <- 3.11 -> DG O6 E0004 : score 6.1908 : H : GLN NE2 B0053 <- 3.02 -> DT O4 E0007 : score 4.96262 : H : GLN NE2 B0053 <- 2.81 -> DT O4 F0011 : score 5.18064 : x : ALA xxxx A0050 <- 4.15 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0052 <- 3.76 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0057 <- 4.49 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0050 <- 3.99 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0052 <- 3.59 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0057 <- 4.40 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx >2w7n_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF KORA BOUND TO OPERATOR DNA: INSIGHT INTO REPRESSOR COOPERATION IN RP4 GENE REGULATION organism=ESCHERICHIA COLI : w : THR OG1 B0047 <- 5.48 -> DA N7 F0012 : score 2.152 : H : ARG NE B0048 <- 2.98 -> DG N7 E0004 : score 4.26261 : H : ARG NH2 B0048 <- 3.11 -> DG O6 E0004 : score 6.1908 : H : GLN NE2 B0053 <- 2.81 -> DT O4 F0011 : score 5.18064 : H : GLN NE2 B0053 <- 3.02 -> DT O4 E0007 : score 4.96262 : x : ALA xxxx B0050 <- 3.99 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0052 <- 3.59 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0057 <- 4.40 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx >2w7o_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE AND ACTIVITY OF BYPASS SYNTHESIS BY HUMAN DNA POLYMERASE KAPPA OPPOSITE THE 7,8-DIHYDRO-8-OXODEOXYGUANOSINE ADDUCT organism=HOMO SAPIENS : x : SER xxxx A0415 <- 4.07 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0419 <- 4.25 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0512 <- 3.58 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx >2w7p_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE AND ACTIVITY OF BYPASS SYNTHESIS BY HUMAN DNA POLYMERASE KAPPA OPPOSITE THE 7,8-DIHYDRO-8-OXODEOXYGUANOSINE ADDUCT organism=HOMO SAPIENS : x : SER xxxx A0415 <- 4.11 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0419 <- 4.35 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0469 <- 4.06 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0512 <- 3.44 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx >2w8k_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=Y-FAMILY DNA POLYMERASE DPO4 BYPASSING N2-NAPHTHYL-GUANINE ADDUCT IN SYN ORIENTATION organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : HIS xxxx A0285 <- 4.45 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.73 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2w8l_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=Y-FAMILY DNA POLYMERASE DPO4 BYPASSING N2-NAPHTHYL-GUANINE ADDUCT IN ANTI ORIENTATION organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : ARG xxxx A0336 <- 4.04 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2w9a_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF DPO4 BOUND TO N2,N2-DIMETHYL-DEOXYGUANOSINE MODIFIED DNA WITH INCOMING DGTP organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : ARG xxxx A0336 <- 4.16 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2w9b_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=BINARY COMPLEX OF DPO4 BOUND TO N2,N2-DIMETHYL-DEOXYGUANOSINE MODIFIED DNA organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : ILE xxxx B0295 <- 4.27 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0297 <- 4.32 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0332 <- 3.68 -> DG xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0336 <- 3.91 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx >2w9c_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF DPO4 BOUND TO N2,N2-DIMETHYL-DEOXYGUANOSINE MODIFIED DNA WITH INCOMING DTTP organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : w : SER OG A0297 <- 5.34 -> DG N7 C0009 : score 2.749 : V : SER CB A0244 <- 3.67 -> DT C7 E0009 : score 3.23305 : x : ILE xxxx A0248 <- 4.13 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0332 <- 3.32 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.20 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx >2wb2_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=DROSOPHILA MELANOGASTER (6-4) PHOTOLYASE BOUND TO DOUBLE STRANDED DNA CONTAINING A T(6-4)C PHOTOLESION organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : HIS xxxx A0417 <- 3.69 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0418 <- 3.36 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0420 <- 4.34 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0421 <- 3.42 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx >2wbs_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ZINC FINGER DOMAIN OF KLF4 BOUND TO ITS TARGET DNA organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0443 <- 2.71 -> DG O6 F0006 : score 6.19283 : H : ARG NH2 A0443 <- 3.00 -> DG N7 F0006 : score 6.12923 : w : ASP OD1 A0445 <- 5.51 -> DG O6 G0001 : score 3.411 : w : ASP OD2 A0445 <- 5.82 -> DC N4 F0005 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0449 <- 2.85 -> DG O6 F0004 : score 6.0225 : H : ARG NH2 A0449 <- 2.78 -> DG N7 F0004 : score 6.41015 : w : ARG NH1 A0449 <- 5.89 -> DG O6 G0003 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0471 <- 3.00 -> DG N7 F0003 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0471 <- 2.84 -> DG O6 F0003 : score 6.5472 : w : SER OG A0472 <- 5.68 -> DG N7 G0003 : score 2.749 : H : ASP OD2 A0473 <- 2.88 -> DC N4 G0004 : score 6.1008 : w : ASP OD2 A0473 <- 6.16 -> DA N6 F0002 : score 3.409 : w : ASP OD2 A0473 <- 6.19 -> DC N4 G0005 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0474 <- 2.90 -> DA N7 F0002 : score 4.16123 : x : GLU xxxx A0446 <- 3.45 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx >2wbu_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ZINC FINGER DOMAIN OF KLF4 BOUND TO ITS TARGET DNA organism=MUS MUSCULUS : H : LYS NZ A0413 <- 2.92 -> DG O6 B0009 : score 5.64203 : H : HIS NE2 A0416 <- 2.98 -> DG N7 B0008 : score 6.55767 : H : HIS NE2 A0416 <- 3.14 -> DG O6 B0008 : score 7.41298 : H : ARG NH1 A0443 <- 2.76 -> DG O6 B0006 : score 6.132 : H : ARG NH2 A0443 <- 3.09 -> DG N7 B0006 : score 6.01431 : w : ASP OD2 A0445 <- 6.25 -> DC N4 B0005 : score 3.623 : w : GLU OE1 A0446 <- 6.43 -> DC N4 B0005 : score 3.528 : H : ARG NH1 A0449 <- 3.37 -> DG O6 B0004 : score 5.38983 : H : ARG NH2 A0449 <- 2.58 -> DG N7 B0004 : score 6.66554 : H : ARG NH2 A0449 <- 3.36 -> DG O6 B0004 : score 5.8608 : H : ARG NH1 A0471 <- 2.83 -> DG N7 B0003 : score 6.0137 : H : ARG NH2 A0471 <- 2.86 -> DG O6 B0003 : score 6.5208 : H : ASP OD2 A0473 <- 2.94 -> DC N4 C0007 : score 6.0264 : H : HIS NE2 A0474 <- 3.03 -> DA N7 B0002 : score 4.05083 : x : SER xxxx A0415 <- 3.46 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0444 <- 4.34 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx >2wcc_3:DNA-binding_domain; title=PHAGE LAMBDA INTDBD1-64 COMPLEX WITH P PRIME 2 DNA organism=ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA : H : ARG NE 30019 <- 2.81 -> DG O6 20019 : score 3.93314 : H : ARG NH1 30019 <- 2.63 -> DG N7 20019 : score 6.2557 : H : GLU OE2 30034 <- 3.15 -> DC N4 10006 : score 4.89681 : x : MET xxxx 30001 <- 3.27 -> DT xxx 10011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 30003 <- 3.20 -> DT xxx 20017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx 30017 <- 3.20 -> DT xxx 20018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx 30020 <- 3.64 -> DG xxx 20019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx 30021 <- 3.06 -> DG xxx 10004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx 30023 <- 4.14 -> DA xxx 10003 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx 30025 <- 3.30 -> DT xxx 10005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 30027 <- 3.24 -> DT xxx 20017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 30033 <- 4.07 -> DC xxx 10006 : score x.xxxxx >2wq6_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=STRUCTURE OF THE 6-4 PHOTOLYASE OF D. MELANOGASTER IN COMPLEX WITH THE NON-NATURAL N4-METHYL T(DEWAR)C LESION organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : w : ARG NE A0421 <- 5.71 -> DG O6 C0010 : score 1.369 : w : ARG NH2 A0421 <- 6.11 -> DG O6 C0010 : score 2.468 : x : HIS xxxx A0417 <- 3.76 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0418 <- 3.37 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0420 <- 3.82 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx >2wq7_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=STRUCTURE OF THE 6-4 PHOTOLYASE OF D. MELANOGASTER IN COMPLEX WITH THE NON-NATURAL N4-METHYL T(6-4)C LESION organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : w : GLN OE1 A0418 <- 6.42 -> DG N2 C0007 : score 2.177 : w : ARG NE A0421 <- 5.79 -> DG O6 C0010 : score 1.369 : x : HIS xxxx A0417 <- 3.68 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0420 <- 3.91 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx >2wt7_A:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE BZIP HETERODIMERIC COMPLEX MAFB:CFOS BOUND TO DNA organism=MUS MUSCULUS : H : ASN OD1 A0147 <- 2.84 -> DC N4 C0012 : score 4.16004 : H : ASN ND2 A0147 <- 2.86 -> DT O4 D0004 : score 5.2212 : w : ASN ND2 A0147 <- 5.79 -> DA N6 D0003 : score 2.5 : w : CYS SG A0154 <- 6.49 -> DG N7 D0005 : score 4.764 : w : ARG NH1 A0155 <- 5.81 -> DC N4 C0010 : score 1.892 : V : ALA CB A0151 <- 3.68 -> DT C7 C0011 : score 5.76694 : x : ARG xxxx A0143 <- 3.53 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0150 <- 4.19 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx >2wt7_AB:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors;Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE BZIP HETERODIMERIC COMPLEX MAFB:CFOS BOUND TO DNA organism=MUS MUSCULUS : H : ASN OD1 A0147 <- 2.84 -> DC N4 C0012 : score 4.16004 : H : ASN ND2 A0147 <- 2.86 -> DT O4 D0004 : score 5.2212 : w : ASN ND2 A0147 <- 5.79 -> DA N6 D0003 : score 2.5 : w : CYS SG A0154 <- 6.49 -> DG N7 D0005 : score 4.764 : w : ARG NH1 A0155 <- 5.81 -> DC N4 C0010 : score 1.892 : H : ARG NH1 B0244 <- 2.91 -> DG N7 C0005 : score 5.9169 : H : ARG NH2 B0244 <- 2.87 -> DG O6 C0005 : score 6.5076 : H : ASN OD1 B0248 <- 3.16 -> DC N4 C0006 : score 3.89165 : w : ASN ND2 B0248 <- 6.26 -> DG O6 D0011 : score 2.971 : H : ARG NH1 B0256 <- 2.88 -> DG N7 D0007 : score 5.9532 : H : ARG NH2 B0256 <- 2.84 -> DG O6 D0007 : score 6.5472 : V : ALA CB B0252 <- 3.55 -> DT C7 D0008 : score 5.94891 : V : ALA CB A0151 <- 3.68 -> DT C7 C0011 : score 5.76694 : x : ARG xxxx A0143 <- 3.53 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0150 <- 4.19 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0251 <- 3.49 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0255 <- 3.97 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >2wt7_B:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE BZIP HETERODIMERIC COMPLEX MAFB:CFOS BOUND TO DNA organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 B0244 <- 2.91 -> DG N7 C0005 : score 5.9169 : H : ARG NH2 B0244 <- 2.87 -> DG O6 C0005 : score 6.5076 : H : ASN OD1 B0248 <- 3.16 -> DC N4 C0006 : score 3.89165 : w : ASN ND2 B0248 <- 6.26 -> DG O6 D0011 : score 2.971 : H : ARG NH1 B0256 <- 2.88 -> DG N7 D0007 : score 5.9532 : H : ARG NH2 B0256 <- 2.84 -> DG O6 D0007 : score 6.5472 : V : ALA CB B0252 <- 3.55 -> DT C7 D0008 : score 5.94891 : x : TYR xxxx B0251 <- 3.49 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0255 <- 3.97 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >2wtf_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE ETA IN COMPLEX WITH THE CIS-DIAMMINEPLATINUM (II) 1,3- GTG INTRASTRAND CROSS-LINK organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : GLN xxxx A0055 <- 4.13 -> DG xxx O0002 : score x.xxxxx >2wtu_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI MUTS IN COMPLEX WITH A 16 BASEPAIR OLIGO CONTAINING AN A.A MISMATCH. organism=Escherichia coli : x : MET xxxx A0033 <- 3.31 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0036 <- 3.33 -> DA xxx F0022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0038 <- 2.74 -> DA xxx F0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0058 <- 2.91 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 4.11 -> DA xxx F0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.05 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >2wty_A:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors;Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HOMODIMERIC MAFB IN COMPLEX WITH THE T-MARE BINDING SITE organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0244 <- 3.11 -> DG N7 D0005 : score 5.6749 : H : ARG NH2 A0244 <- 2.71 -> DG O6 D0005 : score 6.7188 : H : ASN OD1 A0248 <- 3.35 -> DC N4 D0006 : score 3.7323 : V : ALA CB A0252 <- 3.81 -> DT C7 C0011 : score 5.58498 : x : TYR xxxx A0251 <- 3.42 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0255 <- 3.90 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0256 <- 3.87 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx >2wty_AB:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors;Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HOMODIMERIC MAFB IN COMPLEX WITH THE T-MARE BINDING SITE organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0244 <- 3.11 -> DG N7 D0005 : score 5.6749 : H : ARG NH2 A0244 <- 2.71 -> DG O6 D0005 : score 6.7188 : H : ASN OD1 A0248 <- 3.35 -> DC N4 D0006 : score 3.7323 : H : ARG NH1 B0244 <- 3.07 -> DG N7 C0005 : score 5.7233 : H : ARG NH2 B0244 <- 3.25 -> DG N7 C0005 : score 5.81 : H : ARG NH2 B0244 <- 2.91 -> DG O6 C0005 : score 6.4548 : H : ASN OD1 B0248 <- 3.34 -> DC N4 C0006 : score 3.74068 : w : ASN ND2 B0248 <- 5.99 -> DA N7 D0013 : score 1.989 : w : ARG NE B0256 <- 5.56 -> DG O6 D0010 : score 1.369 : V : ALA CB B0252 <- 3.76 -> DT C7 D0011 : score 5.65496 : V : ALA CB A0252 <- 3.81 -> DT C7 C0011 : score 5.58498 : x : TYR xxxx A0251 <- 3.42 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0255 <- 3.90 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0256 <- 3.87 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0251 <- 3.49 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0255 <- 4.45 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >2wwy_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF HUMAN RECQ-LIKE HELICASE IN COMPLEX WITH A DNA SUBSTRATE organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ B0393 <- 3.06 -> DC N3 t0015 : score 0.550569 : H : GLU OE2 B0433 <- 3.05 -> DC N4 t0015 : score 5.00212 : V : ALA CB B0565 <- 3.85 -> DT C7 t0014 : score 5.52899 : x : VAL xxxx B0372 <- 4.31 -> DC xxx t0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0429 <- 3.31 -> DT xxx t0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0562 <- 4.10 -> DG xxx r0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0563 <- 4.32 -> DG xxx r0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0564 <- 3.37 -> DG xxx r0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0566 <- 3.79 -> DT xxx t0014 : score x.xxxxx >2x6v_A:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TBX5 IN THE DNA-BOUND AND DNA-FREE FORM organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0081 <- 2.97 -> DG N7 D0018 : score 6.16754 : x : THR xxxx A0215 <- 3.36 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0216 <- 4.45 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0232 <- 3.82 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0236 <- 3.23 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx >2xc9_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=BINARY COMPLEX OF SULFOLOBUS SOLFATARICUS DPO4 DNA POLYMERASE AND 1, N2-ETHENOGUANINE MODIFIED DNA, MAGNESIUM FORM organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : w : SER OG A0297 <- 5.65 -> DG N7 P0009 : score 2.749 : x : ALA xxxx A0042 <- 3.20 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 3.48 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 3.77 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0332 <- 4.08 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.63 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx >2xca_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF SULFOLOBUS SOLFATARICUS DPO4 DNA POLYMERASE, 7,8- DIHYDRO-8-OXODEOXYGUANINE MODIFIED DNA AND DGTP - MAGNESIUM FORM organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : ARG xxxx A0336 <- 4.18 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >2xcp_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF SULFOLOBUS SOLFATARICUS DPO4 DNA POLYMERASE, 7,8- DIHYDRO-8-OXODEOXYGUANINE MODIFIED DNA AND DCTP - MAGNESIUM FORM organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : x : SER xxxx B0244 <- 4.21 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0336 <- 3.54 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx >2xcr_BD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=THE 3.5A CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC CORE (B'A' REGION) OF STAPHYLOCOCCUS AUREUS DNA GYRASE COMPLEXED WITH GSK299423 AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : x : LYS xxxx B0460 <- 3.82 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1084 <- 4.22 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1085 <- 3.54 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1175 <- 3.01 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0458 <- 4.17 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0460 <- 3.89 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D1085 <- 4.05 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1122 <- 4.40 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D1175 <- 2.91 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx >2xcr_SU:Type_II_DNA_topoisomerase; title=THE 3.5A CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC CORE (B'A' REGION) OF STAPHYLOCOCCUS AUREUS DNA GYRASE COMPLEXED WITH GSK299423 AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : x : LYS xxxx S0460 <- 3.72 -> DA xxx V0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx S1025 <- 4.44 -> DA xxx W0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx S1033 <- 4.48 -> DT xxx V0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx S1085 <- 3.76 -> DA xxx V0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx S1088 <- 3.82 -> DT xxx V0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx S1175 <- 3.26 -> DG xxx V0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx U0460 <- 3.79 -> DA xxx W0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx U1085 <- 3.63 -> DA xxx W0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx U1122 <- 4.30 -> DG xxx V0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx U1175 <- 3.10 -> DG xxx W0005 : score x.xxxxx >2xcr_U:Type_II_DNA_topoisomerase; title=THE 3.5A CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC CORE (B'A' REGION) OF STAPHYLOCOCCUS AUREUS DNA GYRASE COMPLEXED WITH GSK299423 AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : x : LYS xxxx U0460 <- 3.79 -> DA xxx W0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx U1085 <- 3.63 -> DA xxx W0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx U1122 <- 4.30 -> DG xxx V0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx U1175 <- 3.10 -> DG xxx W0005 : score x.xxxxx >2xcs_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=THE 2.1A CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS GYRASE COMPLEX WITH GSK299423 AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : w : LYS NZ B0460 <- 5.48 -> DA N3 E0007 : score 1.538 : w : TYR OH B1025 <- 5.56 -> DA N3 F0015 : score 1.448 : w : TYR OH B1025 <- 6.04 -> DA N3 E0007 : score 1.448 : w : SER OG B1085 <- 6.07 -> DA N7 E0007 : score 2.343 : w : SER OG B1173 <- 5.88 -> DC O2 E0004 : score 1.768 : x : ARG xxxx B0458 <- 4.03 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1088 <- 4.48 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1175 <- 3.44 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx >2xcs_BD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=THE 2.1A CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS GYRASE COMPLEX WITH GSK299423 AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : w : LYS NZ B0460 <- 5.48 -> DA N3 E0007 : score 1.538 : w : TYR OH B1025 <- 5.56 -> DA N3 F0015 : score 1.448 : w : TYR OH B1025 <- 6.04 -> DA N3 E0007 : score 1.448 : w : SER OG B1085 <- 6.07 -> DA N7 E0007 : score 2.343 : w : SER OG B1173 <- 5.88 -> DC O2 E0004 : score 1.768 : w : LYS NZ D0460 <- 5.41 -> DA N3 F0007 : score 1.538 : w : TYR OH D1025 <- 5.96 -> DA N3 F0007 : score 1.448 : w : TYR OH D1025 <- 5.43 -> DA N3 E0015 : score 1.448 : w : SER OG D1085 <- 5.84 -> DA N7 F0007 : score 2.343 : x : ARG xxxx B0458 <- 4.03 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1088 <- 4.48 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1175 <- 3.44 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D1175 <- 3.40 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx >2xct_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=THE TWINNED 3.35A STRUCTURE OF S. AUREUS GYRASE COMPLEX WITH CIPROFLOXACIN AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : x : LYS xxxx B0460 <- 3.33 -> DC xxx H0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1085 <- 3.82 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1175 <- 2.97 -> DC xxx H0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B1180 <- 4.39 -> DC xxx H0017 : score x.xxxxx >2xe0_A:Homing_endonucleases; title=MOLECULAR BASIS OF ENGINEERED MEGANUCLEASE TARGETING OF THE ENDOGENOUS HUMAN RAG1 LOCUS organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : w : ASN OD1 A0028 <- 5.72 -> DG N7 C0519 : score 1.873 : w : ASN ND2 A0028 <- 6.08 -> DG O6 C0519 : score 2.971 : w : ASN ND2 A0028 <- 5.59 -> DG N7 C0519 : score 3.259 : H : ARG NH1 A0040 <- 2.71 -> DG N7 D0605 : score 6.1589 : w : ARG NE A0040 <- 5.05 -> DG O6 C0519 : score 1.369 : H : TYR OH A0044 <- 3.23 -> DC N4 C0517 : score 3.85169 : w : TYR OH A0044 <- 5.21 -> DT O4 D0607 : score 2.914 : H : ARG NH1 A0068 <- 2.87 -> DG O6 D0608 : score 5.99817 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.32 -> DG N7 D0608 : score 6.99754 : H : GLN NE2 A0075 <- 2.99 -> DT O4 C0516 : score 4.99377 : V : SER CB A0032 <- 3.75 -> DT C7 D0601 : score 3.17042 : x : SER xxxx A0022 <- 3.74 -> DT xxx C0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.65 -> DT xxx C0516 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0026 <- 2.77 -> DA xxx C0518 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0030 <- 3.81 -> DT xxx D0603 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0038 <- 1.08 -> DG xxx D0604 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.72 -> DC xxx C0515 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.90 -> DC xxx C0514 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0140 <- 4.34 -> DT xxx C0516 : score x.xxxxx >2xe0_AB:Homing_endonucleases; title=MOLECULAR BASIS OF ENGINEERED MEGANUCLEASE TARGETING OF THE ENDOGENOUS HUMAN RAG1 LOCUS organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : w : ASN OD1 A0028 <- 5.72 -> DG N7 C0519 : score 1.873 : w : ASN ND2 A0028 <- 6.08 -> DG O6 C0519 : score 2.971 : w : ASN ND2 A0028 <- 5.59 -> DG N7 C0519 : score 3.259 : H : ARG NH1 A0040 <- 2.71 -> DG N7 D0605 : score 6.1589 : w : ARG NE A0040 <- 5.05 -> DG O6 C0519 : score 1.369 : H : TYR OH A0044 <- 3.23 -> DC N4 C0517 : score 3.85169 : w : TYR OH A0044 <- 5.21 -> DT O4 D0607 : score 2.914 : H : ARG NH1 A0068 <- 2.87 -> DG O6 D0608 : score 5.99817 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.32 -> DG N7 D0608 : score 6.99754 : H : GLN NE2 A0075 <- 2.99 -> DT O4 C0516 : score 4.99377 : H : LYS NZ B0028 <- 2.97 -> DG N7 D0619 : score 5.20278 : H : LYS NZ B0028 <- 2.74 -> DG O6 D0619 : score 5.85014 : H : ARG NH2 B0077 <- 2.89 -> DG O6 D0617 : score 6.4812 : w : THR OG1 B0140 <- 5.13 -> DT O2 D0616 : score 2.522 : V : SER CB A0032 <- 3.75 -> DT C7 D0601 : score 3.17042 : V : SER CB B0032 <- 3.74 -> DT C7 C0501 : score 3.17825 : x : SER xxxx A0022 <- 3.74 -> DT xxx C0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.65 -> DT xxx C0516 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0026 <- 2.77 -> DA xxx C0518 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0030 <- 3.81 -> DT xxx D0603 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0038 <- 1.08 -> DG xxx D0604 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.72 -> DC xxx C0515 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.90 -> DC xxx C0514 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0140 <- 4.34 -> DT xxx C0516 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0022 <- 3.84 -> DT xxx D0616 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0024 <- 3.88 -> DT xxx D0616 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0026 <- 2.91 -> DA xxx D0618 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0030 <- 2.05 -> DG xxx C0503 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0033 <- 3.98 -> DT xxx C0502 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0038 <- 3.67 -> DG xxx C0503 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0040 <- 4.37 -> DT xxx C0504 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0044 <- 3.99 -> DT xxx D0616 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0046 <- 3.64 -> DC xxx D0615 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0068 <- 4.23 -> DT xxx C0507 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0070 <- 3.75 -> DC xxx C0508 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0073 <- 4.16 -> DC xxx D0614 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0075 <- 3.96 -> DT xxx D0616 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0079 <- 4.27 -> DT xxx C0505 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0139 <- 3.85 -> DG xxx C0511 : score x.xxxxx >2xe0_B:Homing_endonucleases; title=MOLECULAR BASIS OF ENGINEERED MEGANUCLEASE TARGETING OF THE ENDOGENOUS HUMAN RAG1 LOCUS organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : H : LYS NZ B0028 <- 2.97 -> DG N7 D0619 : score 5.20278 : H : LYS NZ B0028 <- 2.74 -> DG O6 D0619 : score 5.85014 : H : ARG NH2 B0077 <- 2.89 -> DG O6 D0617 : score 6.4812 : w : THR OG1 B0140 <- 5.13 -> DT O2 D0616 : score 2.522 : V : SER CB B0032 <- 3.74 -> DT C7 C0501 : score 3.17825 : x : SER xxxx B0022 <- 3.84 -> DT xxx D0616 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0024 <- 3.88 -> DT xxx D0616 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0026 <- 2.91 -> DA xxx D0618 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0030 <- 2.05 -> DG xxx C0503 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0033 <- 3.98 -> DT xxx C0502 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0038 <- 3.67 -> DG xxx C0503 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0040 <- 4.37 -> DT xxx C0504 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0044 <- 3.99 -> DT xxx D0616 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0046 <- 3.64 -> DC xxx D0615 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0068 <- 4.23 -> DT xxx C0507 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0070 <- 3.75 -> DC xxx C0508 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0073 <- 4.16 -> DC xxx D0614 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0075 <- 3.96 -> DT xxx D0616 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0079 <- 4.27 -> DT xxx C0505 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0139 <- 3.85 -> DG xxx C0511 : score x.xxxxx >2xgp_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=YEAST DNA POLYMERASE ETA IN COMPLEX WITH C8-2-ACETYLAMINOFLUORENE CONTAINING DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx B0073 <- 3.77 -> DG xxx Q0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0394 <- 3.57 -> DT xxx U0010 : score x.xxxxx >2xgq_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF YEAST DNA POLYMERASE ETA IN COMPLEX WITH C8-N-ACETYL-2- AMINOANTHRACENE CONTAINING DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : GLN xxxx A0055 <- 3.61 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0394 <- 4.08 -> DT xxx T0010 : score x.xxxxx >2xhb_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE FROM THERMOCOCCUS GORGONARIUS IN COMPLEX WITH HYPOXANTHINE-CONTAINING DNA organism=THERMOCOCCUS GORGONARIUS : x : ASP xxxx A0246 <- 4.22 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0261 <- 4.48 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0265 <- 3.03 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0612 <- 3.39 -> DG xxx D0023 : score x.xxxxx >2xhi_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=SEPARATION-OF-FUNCTION MUTANTS UNRAVEL THE DUAL REACTION MODE OF HUMAN 8-OXOGUANINE DNA GLYCOSYLASE organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 A0151 <- 3.11 -> DA N3 C0022 : score 3.57162 : w : ASN ND2 A0151 <- 5.84 -> DG N3 B0010 : score 2.566 : H : ARG NH1 A0154 <- 2.74 -> DC O2 B0008 : score 3.6938 : H : ARG NH2 A0154 <- 2.88 -> DT O2 B0009 : score 4.1656 : H : TYR OH A0203 <- 3.38 -> DG N2 C0024 : score 4.32253 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.98 -> DC N3 B0008 : score 1.48184 : H : ARG NH2 A0204 <- 2.73 -> DC O2 B0008 : score 3.7505 : w : TYR OH A0207 <- 5.61 -> DT O2 C0025 : score 3.068 : x : ASN xxxx A0149 <- 3.11 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0150 <- 4.35 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx >2xkk_AC:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MOXIFLOXACIN, DNA, AND A. BAUMANNII TOPO IV (PARE-PARC FUSION TRUNCATE) organism=ACINETOBACTER BAUMANNII : w : SER OG A1084 <- 6.32 -> DG O6 E0016 : score 2.749 : H : ARG NH1 A1330 <- 3.15 -> DG N3 F0026 : score 2.83888 : x : LYS xxxx A0420 <- 3.46 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0583 <- 3.96 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1176 <- 3.30 -> DC xxx F0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0420 <- 3.20 -> DT xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C1033 <- 4.34 -> DC xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C1085 <- 4.44 -> DT xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C1176 <- 3.13 -> DC xxx E0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C1330 <- 3.16 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx >2xkk_C:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MOXIFLOXACIN, DNA, AND A. BAUMANNII TOPO IV (PARE-PARC FUSION TRUNCATE) organism=ACINETOBACTER BAUMANNII : x : LYS xxxx C0420 <- 3.20 -> DT xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C1033 <- 4.34 -> DC xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C1085 <- 4.44 -> DT xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C1176 <- 3.13 -> DC xxx E0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C1330 <- 3.16 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx >2xo7_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A DA:O-ALLYLHYDROXYLAMINE-DC BASEPAIR IN COMPLEX WITH FRAGMENT DNA POLYMERASE I FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : ARG NH1 A0615 <- 2.73 -> DT O2 B0029 : score 4.3667 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.20 -> DT O2 B0029 : score 3.89467 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.98 -> DC O2 B0027 : score 4.31823 : x : LYS xxxx A0582 <- 3.54 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0587 <- 4.42 -> DC xxx B0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0622 <- 3.88 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.48 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.03 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.41 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx >2xro_ABEF:GAF_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TTGV IN COMPLEX WITH ITS DNA OPERATOR organism=PSEUDOMONAS PUTIDA : H : SER OG B0048 <- 3.14 -> DG N7 Y0036 : score 4.17727 : H : SER OG E0048 <- 3.47 -> DG N7 Y0016 : score 3.88146 : H : SER OG E0048 <- 3.08 -> DG O6 Y0017 : score 3.86193 : H : SER OG F0048 <- 3.01 -> DG N7 X0035 : score 4.29381 : V : LEU CD2 A0036 <- 3.62 -> DT C7 Y0025 : score 5.98919 : V : GLN CB B0051 <- 3.70 -> DT C7 X0004 : score 1.87969 : V : GLN CB E0051 <- 3.75 -> DT C7 X0024 : score 1.85677 : x : SER xxxx A0048 <- 3.27 -> DG xxx X0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0049 <- 3.88 -> DG xxx X0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0051 <- 3.22 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0052 <- 3.41 -> DG xxx X0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0036 <- 4.34 -> DG xxx X0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0049 <- 3.79 -> DG xxx Y0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0052 <- 3.43 -> DT xxx Y0035 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0036 <- 3.36 -> DT xxx X0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0047 <- 4.33 -> DT xxx X0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0049 <- 3.73 -> DG xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0052 <- 3.31 -> DG xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0036 <- 4.06 -> DG xxx Y0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0049 <- 3.79 -> DG xxx X0035 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0051 <- 3.38 -> DA xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0052 <- 3.22 -> DC xxx X0034 : score x.xxxxx >2xro_E:GAF_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TTGV IN COMPLEX WITH ITS DNA OPERATOR organism=PSEUDOMONAS PUTIDA : H : SER OG E0048 <- 3.47 -> DG N7 Y0016 : score 3.88146 : H : SER OG E0048 <- 3.08 -> DG O6 Y0017 : score 3.86193 : V : GLN CB E0051 <- 3.75 -> DT C7 X0024 : score 1.85677 : x : LEU xxxx E0036 <- 3.36 -> DT xxx X0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0047 <- 4.33 -> DT xxx X0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0049 <- 3.73 -> DG xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0052 <- 3.31 -> DG xxx Y0016 : score x.xxxxx >2xrz_B:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=X-RAY STRUCTURE OF ARCHAEAL CLASS II CPD PHOTOLYASE FROM METHANOSARCINA MAZEI IN COMPLEX WITH INTACT CPD-LESION organism=METHANOSARCINA MAZEI : H : ARG NH1 B0450 <- 3.07 -> DG O6 F0002 : score 5.75483 : H : ARG NH1 B0450 <- 2.81 -> DG O6 E0012 : score 6.07117 : x : HIS xxxx B0161 <- 3.99 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0429 <- 3.40 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0431 <- 3.24 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0441 <- 3.85 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx >2xsd_C:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DIMERIC OCT-6 (POU3F1) POU DOMAIN BOUND TO PALINDROMIC MORE DNA organism=MUS MUSCULUS : H : GLN OE1 C0288 <- 2.99 -> DA N6 A0201 : score 5.82257 : H : GLN NE2 C0288 <- 3.08 -> DA N7 A0201 : score 5.74872 : w : GLN OE1 C0288 <- 5.75 -> DA N6 B0210 : score 3.392 : H : THR OG1 C0289 <- 2.83 -> DC N4 B0209 : score 4.00913 : H : THR OG1 C0289 <- 2.51 -> DT O4 A0202 : score 4.11264 : H : ARG NH1 C0293 <- 3.01 -> DG N7 B0208 : score 5.7959 : H : ARG NH2 C0293 <- 2.68 -> DG O6 B0208 : score 6.7584 : H : ASN OD1 C0387 <- 2.67 -> DA N6 A0205 : score 6.17836 : H : ASN ND2 C0387 <- 2.88 -> DA N7 A0205 : score 5.77658 : H : GLN OE1 C0390 <- 3.02 -> DA N6 B0206 : score 5.78625 : H : GLN NE2 C0390 <- 2.91 -> DA N7 B0206 : score 5.95577 : x : SER xxxx C0287 <- 4.34 -> DG xxx B0208 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0292 <- 3.61 -> DT xxx A0202 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0299 <- 4.11 -> DT xxx B0207 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0303 <- 4.39 -> DT xxx B0207 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0382 <- 3.46 -> DC xxx B0203 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0383 <- 3.72 -> DA xxx A0205 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0386 <- 3.50 -> DT xxx B0204 : score x.xxxxx >2xy5_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ARTIFICIAL SALEN-COPPER BASEPAIR IN COMPLEX WITH FRAGMENT DNA POLYMERASE I FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : LYS NZ A0582 <- 2.56 -> DC O2 B0026 : score 3.08757 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.84 -> DT O2 B0029 : score 4.27196 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.23 -> DT O2 B0029 : score 3.86927 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.69 -> DG N3 C0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.85 -> DG N3 C0006 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.91 -> DC O2 B0027 : score 4.38094 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.72 -> DG N3 C0007 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.48 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.37 -> DC xxx B0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.48 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.50 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx >2xy6_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A SALICYLIC ALDEHYDE BASEPAIR IN COMPLEX WITH FRAGMENT DNA POLYMERASE I FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : LYS NZ A0582 <- 2.68 -> DC O2 B0026 : score 3.01686 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.71 -> DT O2 B0029 : score 4.38393 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.94 -> DC O2 B0027 : score 4.35406 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.63 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.30 -> DC xxx B0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0622 <- 4.34 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.44 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.55 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx >2xy7_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A SALICYLIC ALDEHYDE BASE IN THE PRE-INSERTION SITE OF FRAGMENT DNA POLYMERASE I FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : LYS NZ A0582 <- 2.89 -> DT O2 C0008 : score 3.52261 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.34 -> DT O2 B0027 : score 4.23357 : H : ARG NH2 A0629 <- 2.82 -> DG N7 B0029 : score 6.35908 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.41 -> DT xxx B0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0615 <- 3.45 -> DG xxx B0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.55 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.71 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx >2xzf_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THE WILD-TYPE LACTOCOCCUS LACTIS FPG (MUTM) AND AN OXIDIZED PYRIMIDINE CONTAINING DNA AT 293K organism=LACTOCOCCUS LACTIS SUBSP. CREMORIS : H : ARG NH1 A0074 <- 2.87 -> DT O2 B0008 : score 4.24612 : w : ARG NH1 A0074 <- 6.43 -> DT O2 B0009 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0074 <- 6.17 -> DT O2 B0009 : score 2.261 : w : GLU OE2 A0076 <- 5.35 -> DT O2 B0006 : score 2.279 : H : ARG NE A0109 <- 2.71 -> DC O2 C0021 : score 2.70684 : H : ARG NH2 A0109 <- 3.01 -> DC N3 C0021 : score 2.1948 : x : MET xxxx A0075 <- 3.42 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.43 -> DC xxx C0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.42 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >2xzu_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THE WILD-TYPE LACTOCOCCUS LACTIS FPG (MUTM) AND AN OXIDIZED PYRIMIDINE CONTAINING DNA AT 310K organism=LACTOCOCCUS LACTIS : H : ARG NH1 A0074 <- 2.87 -> DT O2 B0008 : score 4.24612 : H : ARG NH1 A0074 <- 2.87 -> DT O2 B0008 : score 4.24612 : w : ARG NH1 A0074 <- 6.70 -> DT O2 B0009 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0074 <- 6.50 -> DT O2 B0009 : score 2.261 : w : GLU OE2 A0076 <- 5.42 -> DT O2 B0006 : score 2.279 : H : ARG NE A0109 <- 2.77 -> DC O2 C0023 : score 2.67493 : H : ARG NH2 A0109 <- 3.02 -> DC N3 C0023 : score 2.19022 : w : ARG NH2 A0109 <- 6.04 -> DT O4 B0006 : score 2.366 : x : MET xxxx A0075 <- 3.49 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.35 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.42 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >2y1j_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A R-DIASTEREOMER ANALOGUE OF THE SPORE PHOTOPRODUCT IN COMPLEX WITH FRAGMENT DNA POLYMERASE I FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : w : ASN ND2 A0622 <- 5.79 -> DG N3 C0006 : score 2.566 >2y7h_ABC:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=ATOMIC MODEL OF THE DNA-BOUND METHYLASE COMPLEX FROM THE TYPE I RESTRICTION-MODIFICATION ENZYME ECOKI (M2S1). BASED ON FITTING INTO EM MAP 1534. organism=ESCHERICHIA COLI : H : TYR OH A0293 <- 2.58 -> DG N7 E0004 : score 4.47582 : H : LYS NZ A0319 <- 2.76 -> DG O6 D0016 : score 5.82702 : H : LYS NZ A0319 <- 2.76 -> DG O6 D0016 : score 5.82702 : V : ARG CZ A0292 <- 3.63 -> DT C7 E0003 : score 2.22293 : V : ASN CG A0145 <- 3.60 -> DT C7 E0015 : score 2.78062 : V : THR CG2 A0026 <- 3.81 -> DT C7 D0002 : score 4.22633 : x : TYR xxxx A0027 <- 3.48 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0070 <- 2.66 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0084 <- 3.60 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0104 <- 3.33 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0146 <- 4.04 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0234 <- 2.75 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0236 <- 2.77 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0294 <- 2.80 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0318 <- 3.48 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0357 <- 3.33 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0358 <- 3.11 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0148 <- 2.74 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0266 <- 3.11 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0269 <- 2.61 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0345 <- 3.05 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0350 <- 4.19 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0148 <- 2.74 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0266 <- 3.01 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0269 <- 2.54 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0345 <- 3.10 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0350 <- 4.29 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0352 <- 4.38 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx >2y7h_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=ATOMIC MODEL OF THE DNA-BOUND METHYLASE COMPLEX FROM THE TYPE I RESTRICTION-MODIFICATION ENZYME ECOKI (M2S1). BASED ON FITTING INTO EM MAP 1534. organism=ESCHERICHIA COLI : x : GLN xxxx B0148 <- 2.74 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0266 <- 3.11 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0269 <- 2.61 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0345 <- 3.05 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0350 <- 4.19 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx >2y9z_B: title=CHROMATIN REMODELING FACTOR ISW1A(DEL_ATPASE) IN DNA COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : LYS NZ B0695 <- 2.87 -> DG O6 E0026 : score 5.69984 : x : ASP xxxx B0693 <- 3.87 -> DC xxx F0022 : score x.xxxxx >2ypa_A:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE SCL:E47:LMO2:LDB1 COMPLEX BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 A0196 <- 3.36 -> DC N4 F0025 : score 5.12194 : x : ARG xxxx A0189 <- 4.07 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0193 <- 3.46 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0195 <- 4.49 -> DG xxx F0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0199 <- 3.85 -> DC xxx F0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0200 <- 4.48 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx >2ypa_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE SCL:E47:LMO2:LDB1 COMPLEX BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 A0196 <- 3.36 -> DC N4 F0025 : score 5.12194 : x : ARG xxxx A0189 <- 4.07 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0193 <- 3.46 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0195 <- 4.49 -> DG xxx F0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0199 <- 3.85 -> DC xxx F0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0200 <- 4.48 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0552 <- 3.58 -> DT xxx F0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0554 <- 4.20 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0555 <- 3.43 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0558 <- 3.76 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx >2ypa_B:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE SCL:E47:LMO2:LDB1 COMPLEX BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : x : ASN xxxx B0552 <- 3.58 -> DT xxx F0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0554 <- 4.20 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0555 <- 3.43 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0558 <- 3.76 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx >2ypb_A:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE SCL:E47 COMPLEX BOUND TO DNA organism=? : H : GLU OE1 A0196 <- 3.18 -> DC N4 F0025 : score 5.32958 : x : ASN xxxx A0193 <- 3.46 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0195 <- 3.55 -> DG xxx F0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0199 <- 3.86 -> DC xxx F0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0200 <- 4.13 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx >2ypb_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE SCL:E47 COMPLEX BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 A0196 <- 3.18 -> DC N4 F0025 : score 5.32958 : x : ASN xxxx A0193 <- 3.46 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0195 <- 3.55 -> DG xxx F0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0199 <- 3.86 -> DC xxx F0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0200 <- 4.13 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0552 <- 3.29 -> DT xxx F0029 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0555 <- 3.52 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0558 <- 3.52 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx >2ypf_A:Thiolase-like; title=STRUCTURE OF THE AVRBS3-DNA COMPLEX PROVIDES NEW INSIGHTS INTO THE INITIAL THYMINE-RECOGNITION MECHANISM organism=XANTHOMONAS CAMPESTRIS : H : ASP OD2 A0301 <- 3.25 -> DA N6 B0001 : score 3.64233 : H : ASP OD2 A0539 <- 3.03 -> DC N4 B0008 : score 5.9148 : H : ASP OD2 A0573 <- 3.15 -> DC N4 B0009 : score 5.766 : H : ASP OD2 A0709 <- 2.90 -> DC N4 B0013 : score 6.076 : H : ASP OD2 A0743 <- 2.56 -> DC N4 B0014 : score 6.4976 : H : ASP OD2 A0845 <- 2.97 -> DC N4 B0017 : score 5.9892 : V : ILE CG2 A0641 <- 3.60 -> DT C7 B0010 : score 7.44585 : x : ARG xxxx A0266 <- 2.71 -> DT xxx B0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0369 <- 2.93 -> DA xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0437 <- 3.56 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0471 <- 3.34 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0505 <- 3.37 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0675 <- 3.28 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0777 <- 3.72 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx >2yvh_A:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE OPERATOR-BINDING FORM OF THE MULTI-DRUG BINDING TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR CGMR organism=Corynebacterium glutamicum : H : LYS NZ A0038 <- 2.59 -> DG N7 F0017 : score 5.61211 : H : SER OG A0039 <- 3.10 -> DG N7 E0013 : score 4.21313 : H : SER OG A0039 <- 2.65 -> DG O6 E0013 : score 4.21376 : x : SER xxxx A0037 <- 3.91 -> DC xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0042 <- 3.81 -> DG xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0043 <- 3.80 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx >2yvh_AC:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE OPERATOR-BINDING FORM OF THE MULTI-DRUG BINDING TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR CGMR organism=Corynebacterium glutamicum : H : LYS NZ A0038 <- 2.59 -> DG N7 F0017 : score 5.61211 : H : SER OG A0039 <- 3.10 -> DG N7 E0013 : score 4.21313 : H : SER OG A0039 <- 2.65 -> DG O6 E0013 : score 4.21376 : H : LYS NZ C0038 <- 2.77 -> DG N7 H0017 : score 5.41821 : H : SER OG C0039 <- 3.16 -> DG N7 G0013 : score 4.15934 : H : SER OG C0039 <- 2.60 -> DG O6 G0013 : score 4.25467 : x : SER xxxx A0037 <- 3.91 -> DC xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0042 <- 3.81 -> DG xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0043 <- 3.80 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0037 <- 3.85 -> DC xxx G0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0042 <- 3.69 -> DG xxx H0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0043 <- 3.90 -> DA xxx G0010 : score x.xxxxx >2z33_A:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=SOLUTION STRUCTURE OF THE DNA COMPLEX OF PHOB DNA- BINDING/TRANSACTIVATION DOMAIN organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 A0076 <- 2.72 -> DG O6 B0004 : score 6.7056 : V : VAL CG2 A0072 <- 3.89 -> DT C7 B0005 : score 5.98531 : x : ARG xxxx A0068 <- 3.62 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0069 <- 4.33 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0075 <- 4.18 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0094 <- 3.27 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx >2z3x_ABC: title=STRUCTURE OF A PROTEIN-DNA COMPLEX ESSENTIAL FOR DNA PROTECTION IN SPORE OF BACILLUS SPECIES organism=Bacillus subtilis : H : THR OG1 A0045 <- 3.07 -> DG N2 D0005 : score 3.80098 : H : THR OG1 A0045 <- 2.67 -> DG N3 D0005 : score 1.76788 : H : SER OG B0034 <- 3.03 -> DG N3 D0008 : score 2.64429 : H : THR OG1 B0045 <- 2.74 -> DC O2 E0012 : score 2.65715 : H : THR OG1 C0045 <- 2.61 -> DC O2 E0019 : score 2.72542 : x : SER xxxx A0034 <- 3.01 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0037 <- 4.10 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0037 <- 4.14 -> DC xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0034 <- 3.81 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0037 <- 4.19 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx >2z3x_B: title=STRUCTURE OF A PROTEIN-DNA COMPLEX ESSENTIAL FOR DNA PROTECTION IN SPORE OF BACILLUS SPECIES organism=Bacillus subtilis : H : SER OG B0034 <- 3.03 -> DG N3 D0008 : score 2.64429 : H : THR OG1 B0045 <- 2.74 -> DC O2 E0012 : score 2.65715 : x : ASN xxxx B0037 <- 4.14 -> DC xxx E0014 : score x.xxxxx >2z6a_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=S-ADENOSYL-L-METHIONINE-DEPENDENT METHYL TRANSFER: OBSERVABLE PRECATALYTIC INTERMEDIATES DURING DNA CYTOSINE METHYLATION organism=Haemophilus parahaemolyticus : H : ARG NH1 A0240 <- 2.94 -> DG N7 D0426 : score 5.8806 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.97 -> DG O6 D0426 : score 6.3756 : x : ILE xxxx A0086 <- 3.84 -> DT xxx C0410 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.30 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0237 <- 2.80 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0239 <- 4.25 -> DC xxx C0407 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0254 <- 4.14 -> DC xxx D0429 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0260 <- 4.11 -> DA xxx C0405 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0296 <- 4.14 -> DT xxx C0404 : score x.xxxxx >2z6q_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=TERNARY STRUCTURE OF ARG165ALA M.HHAI C5-CYTOSINE DNA METHYLTRANSFERASE WITH UNMODIFIED DNA AND ADOHCY organism=Haemophilus parahaemolyticus : H : GLN OE1 A0237 <- 2.99 -> DG N2 c0007 : score 5.3946 : H : ARG NH1 A0240 <- 3.26 -> DG N7 d0006 : score 5.4934 : H : ARG NH2 A0240 <- 3.10 -> DG O6 d0006 : score 6.204 : x : ILE xxxx A0086 <- 3.09 -> DT xxx c0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.12 -> DG xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0228 <- 4.36 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0239 <- 4.24 -> DC xxx c0006 : score x.xxxxx >2z6u_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=TERNARY STRUCTURE OF THE GLU119ALA M.HHAI, C5-CYTOSINE DNA METHYLTRANSFERASE, WITH UNMODIFIED DNA AND ADOHCY organism=Haemophilus parahaemolyticus : H : ARG NE A0165 <- 2.77 -> DC O2 D0427 : score 2.67493 : H : ARG NH2 A0165 <- 2.76 -> DC O2 D0427 : score 3.72831 : H : GLN OE1 A0237 <- 3.25 -> DG N2 C0408 : score 5.103 : H : ARG NH1 A0240 <- 3.08 -> DG N7 D0426 : score 5.7112 : H : ARG NH1 A0240 <- 3.08 -> DG N7 D0426 : score 5.7112 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.83 -> DG O6 D0426 : score 6.5604 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.83 -> DG O6 D0426 : score 6.5604 : x : CYS xxxx A0081 <- 2.77 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0086 <- 3.36 -> DT xxx C0410 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.06 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0120 <- 4.26 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0121 <- 4.00 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0163 <- 3.05 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0228 <- 4.40 -> DA xxx D0425 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0239 <- 4.16 -> DC xxx C0407 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0254 <- 4.16 -> DC xxx D0429 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0260 <- 3.94 -> DA xxx C0405 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0296 <- 4.00 -> DT xxx C0404 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0304 <- 3.26 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx >2z9o_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DIMERIC FORM OF REPE IN COMPLEX WITH THE REPE OPERATOR DNA organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0200 <- 2.54 -> DG O6 D0039 : score 6.9432 : H : ASP OD1 A0203 <- 3.30 -> DC N4 C0026 : score 4.81038 : H : ARG NH2 A0206 <- 2.45 -> DG O6 D0041 : score 7.062 : H : ARG NH1 A0207 <- 2.77 -> DG N7 C0024 : score 6.0863 : H : ARG NH1 A0207 <- 3.17 -> DG O6 C0024 : score 5.63317 : x : SER xxxx A0197 <- 3.91 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0198 <- 3.25 -> DG xxx C0024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0202 <- 3.61 -> DG xxx D0039 : score x.xxxxx >2z9o_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DIMERIC FORM OF REPE IN COMPLEX WITH THE REPE OPERATOR DNA organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0200 <- 2.54 -> DG O6 D0039 : score 6.9432 : H : ASP OD1 A0203 <- 3.30 -> DC N4 C0026 : score 4.81038 : H : ARG NH2 A0206 <- 2.45 -> DG O6 D0041 : score 7.062 : H : ARG NH1 A0207 <- 2.77 -> DG N7 C0024 : score 6.0863 : H : ARG NH1 A0207 <- 3.17 -> DG O6 C0024 : score 5.63317 : H : ARG NH2 B0200 <- 2.80 -> DG O6 C0006 : score 6.6 : H : ASP OD1 B0203 <- 3.01 -> DC N4 D0059 : score 5.12039 : H : ARG NH1 B0207 <- 2.56 -> DG N7 D0057 : score 6.3404 : H : ARG NH2 B0207 <- 3.01 -> DG O6 D0057 : score 6.3228 : V : PRO CG B0202 <- 3.65 -> DT C7 C0005 : score 6.59744 : x : SER xxxx A0197 <- 3.91 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0198 <- 3.25 -> DG xxx C0024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0202 <- 3.61 -> DG xxx D0039 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0197 <- 4.21 -> DT xxx D0058 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0198 <- 4.07 -> DG xxx D0057 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0206 <- 3.21 -> DT xxx D0058 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0233 <- 3.37 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx >2zcj_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=TERNARY STRUCTURE OF THE GLU119GLN M.HHAI, C5-CYTOSINE DNA METHYLTRANSFERASE, WITH UNMODIFIED DNA AND ADOHCY organism=Haemophilus parahaemolyticus : H : GLN OE1 A0119 <- 2.68 -> DC N4 D0427 : score 4.69333 : H : GLN NE2 A0119 <- 3.11 -> DC N3 D0427 : score 1.312 : H : ARG NH1 A0163 <- 2.80 -> DC O2 D0427 : score 3.65 : H : ARG NE A0165 <- 2.67 -> DC O2 D0427 : score 2.72811 : H : ARG NH2 A0165 <- 2.57 -> DC O2 D0427 : score 3.86886 : H : GLN OE1 A0237 <- 3.18 -> DG N2 C0408 : score 5.18151 : H : ARG NH1 A0240 <- 3.14 -> DG N7 D0426 : score 5.6386 : H : ARG NH1 A0240 <- 3.14 -> DG N7 D0426 : score 5.6386 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.80 -> DG O6 D0426 : score 6.6 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.80 -> DG O6 D0426 : score 6.6 : x : CYS xxxx A0081 <- 3.22 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0086 <- 3.36 -> DT xxx C0410 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.09 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0121 <- 3.86 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0228 <- 4.17 -> DA xxx D0425 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0239 <- 4.18 -> DC xxx C0407 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0254 <- 4.16 -> DC xxx D0429 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0260 <- 4.06 -> DA xxx C0405 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0261 <- 4.39 -> DT xxx C0404 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0296 <- 3.98 -> DT xxx C0404 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0304 <- 3.18 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx >2zhg_A:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SOXR IN COMPLEX WITH DNA organism=Escherichia coli : V : SER CB A0026 <- 3.84 -> DT C7 B0015 : score 3.09997 : x : PHE xxxx A0030 <- 3.67 -> DC xxx B0013 : score x.xxxxx >2zkd_B:PUA_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE SRA DOMAIN OF MOUSE NP95 IN COMPLEX WITH HEMI-METHYLATED CPG DNA organism=Mus musculus : H : HIS ND1 B0450 <- 3.46 -> DG N3 E0007 : score -5.25029 : H : HIS ND1 B0450 <- 3.46 -> DG N3 E0007 : score -5.25029 : w : ASN OD1 B0494 <- 5.77 -> DC N4 F0006 : score 2.732 : H : ARG NE B0496 <- 2.73 -> DG O6 E0006 : score 3.9962 : H : ARG NH2 B0496 <- 2.89 -> DG N7 E0006 : score 6.26969 : x : ALA xxxx B0407 <- 3.92 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0408 <- 3.60 -> DC xxx E0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0451 <- 3.53 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0491 <- 3.94 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0495 <- 4.35 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx >2zke_A:PUA_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE SRA DOMAIN OF MOUSE NP95 IN COMPLEX WITH HEMI-METHYLATED CPG DNA organism=Mus musculus : H : ARG NE A0496 <- 2.78 -> DG O6 C0006 : score 3.95679 : H : ARG NH2 A0496 <- 2.88 -> DG N7 C0006 : score 6.28246 : x : ALA xxxx A0407 <- 3.64 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0408 <- 3.99 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0450 <- 2.59 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0451 <- 3.62 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0491 <- 4.05 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0494 <- 3.29 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0495 <- 4.29 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0497 <- 4.35 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx >2zkf_A:PUA_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE SRA DOMAIN OF MOUSE NP95 IN COMPLEX WITH HEMI-METHYLATED CPG DNA organism=Mus musculus : H : ARG NE A0496 <- 2.69 -> DG O6 C0006 : score 4.02773 : H : ARG NH2 A0496 <- 2.71 -> DG N7 C0006 : score 6.49954 : x : ALA xxxx A0407 <- 3.79 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0408 <- 4.03 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0450 <- 2.59 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0451 <- 3.61 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0491 <- 3.86 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0494 <- 3.32 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0544 <- 4.38 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >2zo0_B:PUA_domain-like; title=MOUSE NP95 SRA DOMAIN DNA SPECIFIC COMPLEX 1 organism=Mus musculus : H : HIS NE2 B0450 <- 2.77 -> DC O2 D0409 : score 5.3189 : H : ARG NE B0496 <- 2.28 -> DG O6 D0408 : score 4.35089 : H : ARG NH2 B0496 <- 2.95 -> DG N7 D0408 : score 6.19308 : x : VAL xxxx B0451 <- 3.45 -> DG xxx E0425 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0491 <- 3.69 -> DG xxx E0425 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0494 <- 2.94 -> DC xxx D0407 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0497 <- 4.40 -> DG xxx E0427 : score x.xxxxx >2zo1_B:PUA_domain-like; title=MOUSE NP95 SRA DOMAIN DNA SPECIFIC COMPLEX 2 organism=Mus musculus : H : HIS NE2 B0450 <- 2.69 -> DC O2 D0409 : score 5.4035 : H : HIS NE2 B0450 <- 2.69 -> DC O2 D0409 : score 5.4035 : H : ARG NE B0496 <- 2.37 -> DG O6 D0408 : score 4.27995 : H : ARG NH2 B0496 <- 3.32 -> DG N7 D0408 : score 5.72062 : x : VAL xxxx B0451 <- 3.63 -> DG xxx E0425 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0491 <- 3.85 -> DG xxx E0425 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0494 <- 2.91 -> DC xxx D0407 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0495 <- 4.30 -> DG xxx D0406 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0544 <- 4.15 -> DC xxx E0428 : score x.xxxxx >2zo2_B:PUA_domain-like; title=MOUSE NP95 SRA DOMAIN NON-SPECIFIC DNA COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : x : VAL xxxx B0451 <- 2.92 -> DA xxx E0013 : score x.xxxxx >3a01_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARISTALESS AND CLAWLESS HOMEODOMAINS BOUND TO DNA organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : HIS NE2 A0175 <- 3.03 -> DG N3 C0014 : score 3.55671 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.89 -> DA N3 D0006 : score 3.18143 : H : ARG NH2 A0189 <- 3.00 -> DT O2 C0009 : score 4.064 : H : ASN OD1 A0235 <- 3.06 -> DA N6 C0011 : score 5.70866 : H : ASN ND2 A0235 <- 2.92 -> DA N7 C0011 : score 5.72962 : H : ARG NH2 B0087 <- 3.14 -> DT O2 D0012 : score 3.94547 : H : ARG NH2 B0089 <- 2.64 -> DT O2 C0005 : score 4.3688 : H : ASN OD1 B0135 <- 3.03 -> DA N6 C0007 : score 5.74479 : H : ASN ND2 B0135 <- 3.02 -> DA N7 C0007 : score 5.61221 : V : GLN CG B0134 <- 3.60 -> DT C7 D0008 : score 3.41815 : x : ARG xxxx A0185 <- 4.31 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0230 <- 4.44 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0231 <- 3.80 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0234 <- 3.46 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0130 <- 3.79 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0131 <- 3.99 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >3a01_E:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARISTALESS AND CLAWLESS HOMEODOMAINS BOUND TO DNA organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH2 E0180 <- 2.93 -> DA N3 H0006 : score 3.15551 : H : ARG NH2 E0189 <- 2.56 -> DT O2 G0009 : score 4.43653 : H : ASN OD1 E0235 <- 3.15 -> DA N6 G0011 : score 5.60027 : H : ASN ND2 E0235 <- 3.27 -> DA N7 G0011 : score 5.31868 : V : THR CG2 E0231 <- 3.86 -> DT C7 G0012 : score 4.17337 : x : HIS xxxx E0175 <- 3.10 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0234 <- 3.56 -> DC xxx H0004 : score x.xxxxx >3a01_EF:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARISTALESS AND CLAWLESS HOMEODOMAINS BOUND TO DNA organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH2 E0180 <- 2.93 -> DA N3 H0006 : score 3.15551 : H : ARG NH2 E0189 <- 2.56 -> DT O2 G0009 : score 4.43653 : H : ASN OD1 E0235 <- 3.15 -> DA N6 G0011 : score 5.60027 : H : ASN ND2 E0235 <- 3.27 -> DA N7 G0011 : score 5.31868 : H : ASN OD1 F0135 <- 3.07 -> DA N6 G0007 : score 5.69662 : H : ASN ND2 F0135 <- 3.31 -> DA N7 G0007 : score 5.27172 : V : THR CG2 E0231 <- 3.86 -> DT C7 G0012 : score 4.17337 : x : HIS xxxx E0175 <- 3.10 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0234 <- 3.56 -> DC xxx H0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0087 <- 3.59 -> DT xxx H0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0089 <- 2.15 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0130 <- 3.27 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0131 <- 3.93 -> DA xxx G0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0134 <- 3.31 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx >3a46_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MVNEI1/THF COMPLEX organism=Acanthamoeba polyphaga mimivirus : H : ARG NE A0114 <- 3.00 -> DC O2 C0007 : score 2.55262 : H : ARG NH2 A0114 <- 3.13 -> DC N3 C0007 : score 2.13982 : w : ARG NH1 A0114 <- 5.93 -> DA N7 D0019 : score 0.388 : w : ARG NH1 A0114 <- 6.03 -> DA N3 D0019 : score 2.585 : H : SER OG A0272 <- 2.86 -> DA N7 C0003 : score 4.41053 : H : ASN ND2 A0275 <- 2.57 -> DG O6 C0004 : score 5.89783 : x : LEU xxxx A0084 <- 3.57 -> DG xxx D0021 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0113 <- 3.23 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0116 <- 3.32 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0274 <- 3.41 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0277 <- 3.94 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx >3a4k_AB: title=CRYSTAL STRUCTURAL ANALYSIS OF HINDIII RESTRICTION ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH COGNATE DNA AND DIVALENT CATIONS AT 2.17 ANGSTROM RESOLUTION organism=Haemophilus influenzae : H : SER OG A0056 <- 2.64 -> DT O2 J0004 : score 3.81575 : w : GLU OE1 A0060 <- 5.36 -> DA N3 F0001 : score 0.995 : H : LYS NZ A0061 <- 2.59 -> DT O2 J0005 : score 3.73784 : w : LYS NZ A0061 <- 5.46 -> DA N3 F0001 : score 1.538 : H : ASN OD1 A0120 <- 2.90 -> DA N6 I0004 : score 5.90136 : H : ASN ND2 A0120 <- 2.83 -> DT O4 F0004 : score 5.25291 : H : LYS NZ A0122 <- 2.71 -> DG O6 J0002 : score 5.88482 : H : ASP OD1 A0123 <- 2.98 -> DC N4 F0003 : score 5.15246 : w : LYS NZ A0125 <- 5.57 -> DA N7 F0001 : score 1.655 : H : SER OG B0056 <- 2.57 -> DT O2 F0004 : score 3.86752 : w : GLU OE1 B0060 <- 5.52 -> DA N3 J0001 : score 0.995 : H : LYS NZ B0061 <- 2.69 -> DT O2 F0005 : score 3.6661 : w : LYS NZ B0061 <- 5.23 -> DA N3 J0001 : score 1.538 : H : ASN OD1 B0120 <- 2.81 -> DA N6 E0004 : score 6.00975 : H : ASN ND2 B0120 <- 2.85 -> DT O4 J0004 : score 5.23177 : H : LYS NZ B0122 <- 2.68 -> DG O6 F0002 : score 5.91951 : H : ASP OD1 B0123 <- 2.94 -> DC N4 J0003 : score 5.19522 : w : LYS NZ B0125 <- 5.39 -> DA N7 J0001 : score 1.655 : x : ARG xxxx A0116 <- 3.34 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0117 <- 3.29 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0118 <- 3.15 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0087 <- 4.15 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0116 <- 3.37 -> DC xxx J0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0117 <- 3.22 -> DT xxx J0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0118 <- 3.20 -> DT xxx J0005 : score x.xxxxx >3a4k_B: title=CRYSTAL STRUCTURAL ANALYSIS OF HINDIII RESTRICTION ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH COGNATE DNA AND DIVALENT CATIONS AT 2.17 ANGSTROM RESOLUTION organism=Haemophilus influenzae : H : SER OG B0056 <- 2.57 -> DT O2 F0004 : score 3.86752 : w : SER OG B0056 <- 5.67 -> DG N3 J0002 : score 2.344 : w : GLU OE1 B0060 <- 5.52 -> DA N3 J0001 : score 0.995 : H : LYS NZ B0061 <- 2.69 -> DT O2 F0005 : score 3.6661 : w : LYS NZ B0061 <- 5.23 -> DA N3 J0001 : score 1.538 : w : ARG NH1 B0116 <- 6.20 -> DG N7 J0002 : score 2.063 : w : ARG NH2 B0116 <- 6.47 -> DG N7 J0002 : score 2.18 : H : ASN OD1 B0120 <- 2.81 -> DA N6 E0004 : score 6.00975 : H : ASN ND2 B0120 <- 2.85 -> DT O4 J0004 : score 5.23177 : H : LYS NZ B0122 <- 2.68 -> DG O6 F0002 : score 5.91951 : H : ASP OD1 B0123 <- 2.94 -> DC N4 J0003 : score 5.19522 : w : LYS NZ B0125 <- 5.39 -> DA N7 J0001 : score 1.655 : x : GLN xxxx B0087 <- 4.15 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0117 <- 3.22 -> DT xxx J0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0118 <- 3.20 -> DT xxx J0005 : score x.xxxxx >3a4k_CD: title=CRYSTAL STRUCTURAL ANALYSIS OF HINDIII RESTRICTION ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH COGNATE DNA AND DIVALENT CATIONS AT 2.17 ANGSTROM RESOLUTION organism=Haemophilus influenzae : H : SER OG C0056 <- 2.70 -> DT O2 L0004 : score 3.77138 : w : GLU OE1 C0060 <- 5.36 -> DA N3 H0001 : score 0.995 : H : LYS NZ C0061 <- 2.70 -> DT O2 L0005 : score 3.65892 : w : LYS NZ C0061 <- 5.44 -> DA N3 H0001 : score 1.538 : H : ASN OD1 C0120 <- 2.94 -> DA N6 K0004 : score 5.85318 : H : ASN ND2 C0120 <- 2.86 -> DT O4 H0004 : score 5.2212 : H : LYS NZ C0122 <- 2.84 -> DG O6 L0002 : score 5.73452 : H : ASP OD1 C0123 <- 2.92 -> DC N4 H0003 : score 5.21659 : w : LYS NZ C0125 <- 5.56 -> DA N7 H0001 : score 1.655 : H : SER OG D0056 <- 2.68 -> DT O2 H0004 : score 3.78617 : w : GLU OE1 D0060 <- 5.29 -> DA N3 L0001 : score 0.995 : H : LYS NZ D0061 <- 2.79 -> DT O2 H0005 : score 3.59435 : w : LYS NZ D0061 <- 5.52 -> DA N3 L0001 : score 1.538 : H : ASN OD1 D0120 <- 2.88 -> DA N6 G0004 : score 5.92545 : H : ASN ND2 D0120 <- 2.87 -> DT O4 L0004 : score 5.21063 : H : LYS NZ D0122 <- 2.70 -> DG O6 H0002 : score 5.89638 : H : ASP OD1 D0123 <- 3.00 -> DC N4 L0003 : score 5.13108 : w : LYS NZ D0125 <- 5.57 -> DA N7 L0001 : score 1.655 : x : ARG xxxx C0116 <- 3.39 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0117 <- 3.33 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0118 <- 3.02 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0088 <- 4.32 -> DG xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0116 <- 3.48 -> DC xxx L0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0117 <- 3.22 -> DT xxx L0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0118 <- 3.19 -> DT xxx L0005 : score x.xxxxx >3a5t_AB:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors;Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MAFG-DNA COMPLEX organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0057 <- 3.18 -> DG N7 C0003 : score 5.5902 : H : ARG NH2 A0057 <- 3.12 -> DT O4 D0012 : score 3.3264 : H : ARG NH2 A0057 <- 2.91 -> DG O6 C0003 : score 6.4548 : w : ARG NH1 A0069 <- 5.82 -> DC N4 D0008 : score 1.892 : H : ARG NH1 B0057 <- 2.94 -> DG N7 D0003 : score 5.8806 : H : ARG NH2 B0057 <- 2.78 -> DG O6 D0003 : score 6.6264 : w : ARG NH1 B0069 <- 6.19 -> DG N7 C0008 : score 2.063 : V : ALA CB A0065 <- 3.60 -> DT C7 D0009 : score 5.87892 : V : ALA CB B0065 <- 3.61 -> DT C7 C0009 : score 5.86493 : x : ASN xxxx A0061 <- 3.33 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0064 <- 3.53 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0068 <- 4.13 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0061 <- 3.46 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0064 <- 3.50 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0068 <- 4.07 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx >3a5t_B:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MAFG-DNA COMPLEX organism=Mus musculus : H : ARG NH1 B0057 <- 2.94 -> DG N7 D0003 : score 5.8806 : H : ARG NH2 B0057 <- 2.78 -> DG O6 D0003 : score 6.6264 : w : ARG NH1 B0069 <- 6.19 -> DG N7 C0008 : score 2.063 : V : ALA CB B0065 <- 3.61 -> DT C7 C0009 : score 5.86493 : x : ASN xxxx B0061 <- 3.46 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0064 <- 3.50 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0068 <- 4.07 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx >3a5u_AB:Nucleic_acid-binding_proteins; title=PROMISCUITY AND SPECIFICITY IN DNA BINDING TO SSB: INSIGHTS FROM THE STRUCTURE OF THE MYCOBACTERIUM SMEGMATIS SSB-SSDNA COMPLEX organism=Mycobacterium smegmatis : w : GLU OE2 A0018 <- 5.49 -> DC N4 C0030 : score 3.597 : w : ARG NH1 A0056 <- 5.51 -> DC N4 C0030 : score 1.892 : w : ARG NH2 A0056 <- 5.67 -> DC N4 C0030 : score 0.976 : H : GLU OE2 B0018 <- 2.53 -> DC N4 C0011 : score 5.54972 : H : GLU OE2 B0065 <- 2.44 -> DC N4 C0005 : score 5.64449 : x : THR xxxx A0014 <- 3.12 -> DC xxx C0030 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0015 <- 3.45 -> DC xxx C0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0032 <- 4.26 -> DC xxx C0030 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0055 <- 4.19 -> DC xxx C0029 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0060 <- 3.95 -> DC xxx C0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.25 -> DC xxx C0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0085 <- 3.41 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0086 <- 4.08 -> DC xxx C0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0088 <- 3.49 -> DC xxx C0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0090 <- 3.17 -> DC xxx C0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0091 <- 3.86 -> DC xxx C0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0097 <- 4.01 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0099 <- 3.77 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0100 <- 4.32 -> DC xxx C0029 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0104 <- 4.14 -> DC xxx C0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0105 <- 3.92 -> DC xxx C0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0016 <- 3.70 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0019 <- 3.45 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0020 <- 2.77 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0026 <- 3.53 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0027 <- 3.29 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0038 <- 3.01 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0054 <- 3.59 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0056 <- 3.14 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0061 <- 3.63 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0069 <- 3.02 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0073 <- 3.07 -> DC xxx C0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0085 <- 2.84 -> DC xxx C0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0086 <- 3.35 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0098 <- 4.09 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0099 <- 3.93 -> DC xxx C0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0111 <- 3.55 -> DC xxx C0019 : score x.xxxxx >3a5u_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=PROMISCUITY AND SPECIFICITY IN DNA BINDING TO SSB: INSIGHTS FROM THE STRUCTURE OF THE MYCOBACTERIUM SMEGMATIS SSB-SSDNA COMPLEX organism=Mycobacterium smegmatis : H : GLU OE2 B0018 <- 2.53 -> DC N4 C0011 : score 5.54972 : H : GLU OE2 B0065 <- 2.44 -> DC N4 C0005 : score 5.64449 : x : ASP xxxx B0016 <- 3.70 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0019 <- 3.45 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0020 <- 2.77 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0026 <- 3.53 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0027 <- 3.29 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0038 <- 3.01 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0054 <- 3.59 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0056 <- 3.14 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0061 <- 3.63 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0069 <- 3.02 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0073 <- 3.07 -> DC xxx C0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0085 <- 2.84 -> DC xxx C0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0086 <- 3.35 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0098 <- 4.09 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0099 <- 3.93 -> DC xxx C0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0111 <- 3.55 -> DC xxx C0019 : score x.xxxxx >3a6n_A:Histone-fold; title=THE NUCLEOSOME CONTAINING A TESTIS-SPECIFIC HISTONE VARIANT, HUMAN H3T organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.53 -> DA N3 J0229 : score 3.41469 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.83 -> DT xxx I0142 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.41 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.84 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx >3a6n_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE NUCLEOSOME CONTAINING A TESTIS-SPECIFIC HISTONE VARIANT, HUMAN H3T organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.53 -> DA N3 J0229 : score 3.41469 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.65 -> DA N3 I0082 : score 3.33694 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.83 -> DT xxx I0142 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.41 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.84 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.02 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.06 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.40 -> DG xxx J0277 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.38 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.33 -> DT xxx J0289 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.37 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.23 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.08 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.16 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.90 -> DA xxx I0111 : score x.xxxxx >3aaf_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF WRN RQC DOMAIN BOUND TO DOUBLE-STRANDED DNA organism=Homo sapiens : x : PHE xxxx A1037 <- 3.38 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1038 <- 3.18 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B1037 <- 3.36 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B1038 <- 3.19 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx >3aaf_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF WRN RQC DOMAIN BOUND TO DOUBLE-STRANDED DNA organism=Homo sapiens : x : PHE xxxx B1037 <- 3.36 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B1038 <- 3.19 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx >3afa_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE HUMAN NUCLEOSOME STRUCTURE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.48 -> DA N3 J0229 : score 3.44709 : w : ARG NH1 C0077 <- 5.59 -> DG N3 J0277 : score 1.593 : w : ARG NH2 C0077 <- 5.68 -> DG N3 J0277 : score 0.677 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.68 -> DA N3 I0082 : score 3.3175 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.01 -> DT xxx I0142 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.83 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.72 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.91 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 3.41 -> DG xxx I0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.97 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.49 -> DG xxx J0268 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 3.98 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.14 -> DT xxx J0289 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.23 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.22 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.18 -> DA xxx I0099 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.99 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.36 -> DT xxx I0130 : score x.xxxxx >3afa_C:Histone-fold; title=THE HUMAN NUCLEOSOME STRUCTURE organism=HOMO SAPIENS : w : ARG NH1 C0077 <- 5.59 -> DG N3 J0277 : score 1.593 : w : ARG NH2 C0077 <- 5.68 -> DG N3 J0277 : score 0.677 : x : ARG xxxx C0011 <- 3.41 -> DG xxx I0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.97 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx >3an2_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE STRUCTURE OF THE CENTROMERIC NUCLEOSOME CONTAINING CENP-A organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0045 <- 3.77 -> DT xxx I-004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0031 <- 4.05 -> DT xxx J-011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.34 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0039 <- 4.44 -> DA xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0086 <- 4.16 -> DC xxx J-033 : score x.xxxxx >3an2_B:Histone-fold; title=THE STRUCTURE OF THE CENTROMERIC NUCLEOSOME CONTAINING CENP-A organism=? : x : ARG xxxx B0045 <- 3.77 -> DT xxx I-004 : score x.xxxxx >3aoh_CD: title=RNA POLYMERASE-GFH1 COMPLEX (CRYSTAL TYPE 1) organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : ALA xxxx D0705 <- 4.22 -> DC xxx P0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 2.87 -> DC xxx P0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 4.47 -> DC xxx P0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D1091 <- 2.69 -> DC xxx P0019 : score x.xxxxx >3aoi_CD: title=RNA POLYMERASE-GFH1 COMPLEX (CRYSTAL TYPE 2) organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : PRO xxxx D0706 <- 2.66 -> DC xxx P0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D1091 <- 2.91 -> DC xxx P0015 : score x.xxxxx >3auo_A:PHP_domain-like;Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;RuvA_domain_2-like; title=DNA POLYMERASE X FROM THERMUS THERMOPHILUS HB8 TERNARY COMPLEX WITH 1- NT GAPPED DNA AND DDGTP organism=? : H : ASN ND2 A0023 <- 3.05 -> DG O6 D0001 : score 5.35654 : H : ARG NH2 A0270 <- 3.05 -> DC O2 D0013 : score 3.51378 : w : ARG NH1 A0270 <- 5.94 -> DC O2 D0014 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0270 <- 5.58 -> DC O2 D0014 : score 1.669 : w : GLU OE1 A0282 <- 5.12 -> DC O2 D0014 : score 2.68 : x : PHE xxxx A0025 <- 3.33 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0026 <- 3.75 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0028 <- 3.76 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 4.26 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0263 <- 4.30 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0267 <- 3.85 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0275 <- 3.66 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >3av1_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE HUMAN NUCLEOSOME STRUCTURE CONTAINING THE HISTONE VARIANT H3.2 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.60 -> DA N3 J0229 : score 3.36933 : w : ARG NH1 C0077 <- 5.44 -> DG N3 J0277 : score 1.593 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.69 -> DA N3 I0082 : score 3.31102 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.99 -> DT xxx I0142 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.02 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.51 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.83 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.52 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 3.98 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.29 -> DT xxx J0289 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 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>3ayw_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING H3K56Q MUTATION organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.61 -> DA N3 J0229 : score 3.36285 : H : ARG NH2 C0011 <- 2.82 -> DT O2 J0263 : score 4.2164 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.91 -> DT xxx I0142 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.58 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.82 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.94 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.20 -> DG xxx J0277 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 3.40 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.39 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.03 -> DA xxx I0082 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.66 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.20 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.47 -> DA xxx I0099 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0032 <- 4.36 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.88 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.02 -> DT xxx I0130 : score x.xxxxx >3ayw_D:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING H3K56Q MUTATION organism=HOMO SAPIENS : x : ILE xxxx D0039 <- 3.40 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx >3aze_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING H3K64Q MUTATION organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 E0040 <- 2.77 -> DA N3 I0082 : score 3.25918 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.72 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 2.74 -> DA xxx J0229 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.75 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.77 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.08 -> DG xxx J0246 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 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>3azf_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING H3K79Q MUTATION organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.56 -> DA N3 J0229 : score 3.39525 : H : ARG NH2 C0011 <- 2.78 -> DA N3 I0030 : score 3.2527 : w : ARG NH1 C0077 <- 5.65 -> DG N3 J0277 : score 1.593 : w : ARG NH2 C0077 <- 5.40 -> DG N3 J0277 : score 0.677 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.60 -> DA N3 I0082 : score 3.36933 : w : ARG NH2 E0040 <- 6.72 -> DG N3 I0081 : score 0.677 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.35 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.49 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.62 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.44 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.86 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.71 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 3.32 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : 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>3azg_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING H3K115Q MUTATION organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.79 -> DA N3 J0229 : score 3.24622 : H : ARG NH2 C0011 <- 2.99 -> DG N3 I0031 : score 3.47307 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.81 -> DA N3 I0082 : score 3.23326 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.14 -> DT xxx I0142 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.83 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.73 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.16 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.78 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 3.48 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.40 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.28 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.20 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.99 -> DC xxx J0196 : 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H4K31Q MUTATION organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.75 -> DA N3 J0229 : score 3.27214 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.14 -> DA N3 I0082 : score 3.01944 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.82 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.11 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.43 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.34 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.77 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 4.31 -> DT xxx J0264 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.37 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.38 -> DG xxx J0277 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.08 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 3.90 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.15 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.30 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.71 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.16 -> DG xxx J0214 : 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NH2 E0040 <- 2.72 -> DA N3 I0082 : score 3.29158 : V : ILE CG1 D0039 <- 3.89 -> DT C7 J0269 : score 4.8474 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.50 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.41 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.74 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.77 -> DG xxx J0246 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.91 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.86 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.36 -> DG xxx J0268 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.12 -> DT xxx J0289 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.33 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.34 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.41 -> DA xxx I0099 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0032 <- 4.34 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.13 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.31 -> DA xxx I0111 : score x.xxxxx >3azm_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING H4K79Q MUTATION organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 E0040 <- 3.18 -> DA N3 I0082 : score 2.99352 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.79 -> DT xxx I0142 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 3.46 -> DA xxx J0229 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.02 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.17 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.41 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.73 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.84 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.09 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.00 -> DT xxx J0289 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.28 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.00 -> DA xxx I0099 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.26 -> DG xxx J0214 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.00 -> DC xxx I0129 : score x.xxxxx >3azm_E:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING H4K79Q MUTATION organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 E0040 <- 3.18 -> DA N3 I0082 : score 2.99352 : x : HIS xxxx E0039 <- 4.00 -> DT xxx J0289 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.28 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.00 -> DA xxx I0099 : score x.xxxxx >3azn_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING H4K91Q MUTATION organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.90 -> DA N3 J0229 : score 3.17495 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.08 -> DA N3 I0082 : score 3.05832 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.21 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.69 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.48 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.82 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 3.73 -> DT xxx J0264 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.92 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.10 -> DG xxx J0277 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 3.49 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.36 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.11 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.12 -> DA xxx I0099 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.03 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.94 -> DA xxx I0111 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 4.36 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >3azn_C:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING H4K91Q MUTATION organism=? : x : ARG xxxx C0011 <- 3.73 -> DT xxx J0264 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.92 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.10 -> DG xxx J0277 : score x.xxxxx >3b6f_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE TREATED WITH CISPLATIN organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.93 -> DA N3 J0009 : score 3.15551 : H : ARG NH1 A0083 <- 3.26 -> DC O2 I-024 : score 3.3142 : H : LYS NZ D0024 <- 2.79 -> DT O2 J0050 : score 3.59435 : H : ARG NH1 D0026 <- 3.00 -> DT O2 J-029 : score 4.13415 : H : ARG NH2 D0026 <- 2.73 -> DG N3 I0030 : score 3.6608 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.81 -> DA N3 I0009 : score 3.23326 : H : LYS NZ G0013 <- 2.77 -> DA N3 J-044 : score 2.79358 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.48 -> DT xxx I0070 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.41 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0043 <- 4.16 -> DG xxx J0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.03 -> DG xxx I-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.48 -> DT xxx I-036 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.26 -> DA xxx I-069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.25 -> DT xxx I-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.00 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.48 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.14 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.07 -> DA xxx I0037 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0075 <- 3.94 -> DA xxx I0060 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0027 <- 3.38 -> DG xxx I-028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0028 <- 3.24 -> DG xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.46 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >3b6f_H:Histone-fold; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE TREATED WITH CISPLATIN organism=? : x : ARG xxxx H0027 <- 3.38 -> DG xxx I-028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0028 <- 3.24 -> DG xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.46 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >3b6g_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE TREATED WITH OXALIPLATIN organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.77 -> DA N3 J0009 : score 3.25918 : H : LYS NZ D0024 <- 2.80 -> DT O2 J0050 : score 3.58718 : H : ARG NH1 D0026 <- 3.14 -> DT O2 J-029 : score 4.01357 : H : ARG NH2 D0026 <- 3.35 -> DT O2 J-029 : score 3.76767 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.01 -> DA N3 I0009 : score 3.10367 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.29 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.83 -> DG xxx I-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.17 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.93 -> DT xxx I-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.57 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.11 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.57 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0013 <- 3.11 -> DA xxx J-044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0027 <- 3.36 -> DG xxx I-028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0028 <- 4.32 -> DC xxx J-048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.38 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >3b6g_D:Histone-fold; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE TREATED WITH OXALIPLATIN organism=? : H : LYS NZ D0024 <- 2.80 -> DT O2 J0050 : score 3.58718 : H : ARG NH1 D0026 <- 3.14 -> DT O2 J-029 : score 4.01357 : H : ARG NH2 D0026 <- 3.35 -> DT O2 J-029 : score 3.76767 : x : ARG xxxx D0030 <- 4.17 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx >3bam_A:Restriction_endonuclease-like; title=RESTRICTION ENDONUCLEASE BAMHI COMPLEX WITH DNA AND MANGANESE IONS (POST-REACTIVE COMPLEX) organism=Bacillus amyloliquefaciens : H : ASN ND2 A0116 <- 2.82 -> DG O6 C0005 : score 5.61591 : H : ASN ND2 A0116 <- 3.03 -> DT O4 E0003 : score 5.04152 : H : ASP OD1 A0154 <- 2.94 -> DC N4 E0005 : score 5.19522 : w : ASP OD1 A0154 <- 5.91 -> DT O4 C0003 : score 2.616 : w : ASP OD2 A0154 <- 5.86 -> DT O4 C0003 : score 2.798 : H : ARG NE A0155 <- 2.70 -> DG O6 C0004 : score 4.01985 : H : ARG NH2 A0155 <- 2.94 -> DG N7 C0004 : score 6.20585 : H : ASP OD2 A0196 <- 2.98 -> DG N2 E0001 : score 5.26245 : x : ARG xxxx A0122 <- 3.81 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0153 <- 4.06 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0156 <- 4.49 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0198 <- 3.65 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx >3bam_AB:Restriction_endonuclease-like; title=RESTRICTION ENDONUCLEASE BAMHI COMPLEX WITH DNA AND MANGANESE IONS (POST-REACTIVE COMPLEX) organism=Bacillus amyloliquefaciens : H : ASN ND2 A0116 <- 3.03 -> DT O4 E0003 : score 5.04152 : H : ASN ND2 A0116 <- 2.82 -> DG O6 C0005 : score 5.61591 : H : ASP OD1 A0154 <- 2.94 -> DC N4 E0005 : score 5.19522 : w : ASP OD1 A0154 <- 5.91 -> DT O4 C0003 : score 2.616 : w : ASP OD2 A0154 <- 5.86 -> DT O4 C0003 : score 2.798 : H : ARG NE A0155 <- 2.70 -> DG O6 C0004 : score 4.01985 : H : ARG NH2 A0155 <- 2.94 -> DG N7 C0004 : score 6.20585 : H : ASP OD2 A0196 <- 2.98 -> DG N2 E0001 : score 5.26245 : H : ASN ND2 B0116 <- 2.92 -> DG O6 E0001 : score 5.50314 : H : ASN ND2 B0116 <- 3.05 -> DT O4 C0007 : score 5.02038 : w : SER OG B0118 <- 6.06 -> DA N6 E0002 : score 2.209 : H : ASP OD1 B0154 <- 2.90 -> DC N4 C0009 : score 5.23797 : w : ASP OD1 B0154 <- 6.36 -> DA N6 C0010 : score 3.122 : w : ASP OD2 B0154 <- 5.57 -> DT O4 D0003 : score 2.798 : H : ARG NE B0155 <- 2.60 -> DG O6 D0004 : score 4.09867 : H : ARG NH2 B0155 <- 2.97 -> DG N7 D0004 : score 6.16754 : x : ARG xxxx A0122 <- 3.81 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0153 <- 4.06 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0156 <- 4.49 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0198 <- 3.65 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0122 <- 3.78 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0153 <- 3.46 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >3bdn_A:LexA/Signal_peptidase;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LAMBDA REPRESSOR organism=Enterobacteria phage lambda : H : SER OG A0045 <- 3.14 -> DG N7 D0036 : score 4.17727 : H : SER OG A0045 <- 2.93 -> DG O6 D0036 : score 3.98466 : H : SER OG A0045 <- 2.63 -> DG O6 D0037 : score 4.23012 : H : SER OG A0045 <- 2.84 -> DC N4 C0005 : score 3.64624 : x : GLN xxxx A0033 <- 3.90 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0034 <- 3.96 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0044 <- 3.32 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0055 <- 3.46 -> DA xxx D0033 : score x.xxxxx >3bdn_AB:LexA/Signal_peptidase;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LAMBDA REPRESSOR organism=Enterobacteria phage lambda : H : SER OG A0045 <- 2.84 -> DC N4 C0005 : score 3.64624 : H : SER OG A0045 <- 3.14 -> DG N7 D0036 : score 4.17727 : H : SER OG A0045 <- 2.93 -> DG O6 D0036 : score 3.98466 : H : SER OG A0045 <- 2.63 -> DG O6 D0037 : score 4.23012 : x : GLN xxxx A0033 <- 3.90 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0034 <- 3.96 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0044 <- 3.32 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0055 <- 3.46 -> DA xxx D0033 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0002 <- 3.47 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0033 <- 4.47 -> DA xxx D0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0045 <- 3.63 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0055 <- 3.03 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx >3bdp_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DNA POLYMERASE I/DNA COMPLEX organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 3.01 -> DT O2 P0013 : score 3.43652 : w : LYS NZ A0582 <- 6.29 -> DA N3 T0021 : score 1.538 : w : LYS NZ A0582 <- 5.69 -> DT O2 T0022 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 6.04 -> DT O2 T0022 : score 2.522 : w : ARG NH1 A0615 <- 6.24 -> DG N2 T0019 : score 1.082 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.59 -> DC O2 T0020 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.91 -> DG N3 P0014 : score 4.78718 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.93 -> DA N3 T0021 : score 2.277 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.62 -> DG N3 T0019 : score 1.484 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.60 -> DC O2 P0015 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.44 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0710 <- 3.67 -> DA xxx T0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.34 -> DA xxx T0018 : score x.xxxxx >3bi3_A:Clavaminate_synthase-like; title=X-RAY STRUCTURE OF ALKB PROTEIN BOUND TO DSDNA CONTAINING 1MEA/A WITH COFACTORS organism=Escherichia coli K12 : H : ARG NH1 A0161 <- 2.84 -> DG N7 C0005 : score 6.0016 : H : ARG NH2 A0161 <- 2.75 -> DG O6 C0005 : score 6.666 : x : CYS xxxx A0129 <- 3.70 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx >3bie_A:Clavaminate_synthase-like; title=X-RAY STRUCTURE OF E COLI ALKB BOUND TO DSDNA CONTAINING 1MEA/T WITH MN AND 2KG organism=Escherichia coli K12 : H : ARG NH1 A0161 <- 2.84 -> DG N7 C0005 : score 6.0016 : H : ARG NH2 A0161 <- 2.74 -> DG O6 C0005 : score 6.6792 : x : CYS xxxx A0129 <- 3.77 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx >3bjy_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CATALYTIC CORE OF REV1 IN COMPLEX WITH DNA (MODIFIED TEMPLATE GUANINE) AND INCOMING NUCLEOTIDE organism=Saccharomyces cerevisiae : x : SER xxxx A0329 <- 3.87 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0626 <- 3.19 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >3bkz_A:Clavaminate_synthase-like; title=X-RAY STRUCTURE OF E COLI ALKB CROSSLINKED TO DSDNA IN THE ACTIVE SITE organism=Escherichia coli K12 : w : ARG NH1 A0161 <- 5.37 -> DA N7 C0005 : score 0.388 : w : ARG NH1 A0161 <- 5.61 -> DG N7 C0004 : score 2.063 : w : ARG NH2 A0161 <- 5.88 -> DA N6 B0009 : score 1.997 : w : ARG NH2 A0161 <- 5.21 -> DT O4 B0010 : score 2.366 : x : LYS xxxx A0127 <- 4.15 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0129 <- 3.37 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx >3bm3_A:Restriction_endonuclease-like; title=RESTRICTION ENDONUCLEASE PSPGI-SUBSTRATE DNA COMPLEX organism=Pyrococcus sp. GI-H : H : GLN OE1 A0094 <- 2.89 -> DG N2 D0001 : score 5.50675 : H : GLN NE2 A0094 <- 3.11 -> DG N3 D0001 : score 4.66715 : w : SER OG A0098 <- 6.04 -> DT O2 C-003 : score 1.55 : H : ARG NE A0164 <- 2.81 -> DG O6 C0002 : score 3.93314 : H : ARG NH2 A0164 <- 2.85 -> DG N7 C0002 : score 6.32077 : H : GLU OE1 A0165 <- 3.24 -> DC N4 D-002 : score 5.26037 : H : GLU OE2 A0165 <- 2.84 -> DC N4 D-001 : score 5.22326 : H : ARG NE A0166 <- 2.79 -> DG O6 C0001 : score 3.94891 : H : ARG NH2 A0166 <- 3.01 -> DG N7 C0001 : score 6.11646 : H : ARG NH2 A0166 <- 3.14 -> DG O6 C0001 : score 6.1512 : x : PHE xxxx A0097 <- 3.22 -> DC xxx C-001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0162 <- 4.06 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx >3bm3_AB:Restriction_endonuclease-like; title=RESTRICTION ENDONUCLEASE PSPGI-SUBSTRATE DNA COMPLEX organism=Pyrococcus sp. GI-H : H : GLN OE1 A0094 <- 2.89 -> DG N2 D0001 : score 5.50675 : H : GLN NE2 A0094 <- 3.11 -> DG N3 D0001 : score 4.66715 : w : SER OG A0098 <- 6.12 -> DT O2 D0004 : score 1.55 : H : ARG NE A0164 <- 2.81 -> DG O6 C0002 : score 3.93314 : H : ARG NH2 A0164 <- 2.85 -> DG N7 C0002 : score 6.32077 : H : GLU OE1 A0165 <- 3.24 -> DC N4 D-002 : score 5.26037 : H : GLU OE2 A0165 <- 2.84 -> DC N4 D-001 : score 5.22326 : H : ARG NE A0166 <- 2.79 -> DG O6 C0001 : score 3.94891 : H : ARG NH2 A0166 <- 3.01 -> DG N7 C0001 : score 6.11646 : H : ARG NH2 A0166 <- 3.14 -> DG O6 C0001 : score 6.1512 : H : GLN OE1 B0094 <- 2.83 -> DG N2 C0001 : score 5.57405 : H : GLN NE2 B0094 <- 3.07 -> DG N3 C0001 : score 4.70696 : H : ARG NE B0164 <- 2.78 -> DG O6 D0002 : score 3.95679 : H : ARG NH2 B0164 <- 2.85 -> DG N7 D0002 : score 6.32077 : H : GLU OE1 B0165 <- 3.23 -> DC N4 C-002 : score 5.2719 : H : GLU OE2 B0165 <- 2.78 -> DC N4 C-001 : score 5.28645 : H : ARG NE B0166 <- 2.73 -> DG O6 D0001 : score 3.9962 : H : ARG NH2 B0166 <- 3.12 -> DG N7 D0001 : score 5.976 : H : ARG NH2 B0166 <- 3.13 -> DG O6 D0001 : score 6.1644 : x : PHE xxxx A0097 <- 3.22 -> DC xxx C-001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0162 <- 4.06 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0097 <- 3.24 -> DC xxx D-001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0098 <- 3.39 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0162 <- 4.02 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3bq2_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=POST-INSERTION BINARY COMPLEX OF DBH DNA POLYMERASE organism=Sulfolobus acidocaldarius : x : ALA xxxx A0057 <- 3.60 -> DG xxx P0011 : score x.xxxxx >3brd_A:DNA-binding_protein_LAG-1_CSL;p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CSL (LAG-1) BOUND TO DNA WITH LIN-12 RAM PEPTIDE, P212121 organism=CAENORHABDITIS ELEGANS : w : GLU OE1 A0232 <- 5.76 -> DC N4 C0009 : score 3.528 : w : GLU OE2 A0232 <- 5.77 -> DT O4 B0007 : score 2.279 : w : GLU OE2 A0232 <- 5.90 -> DC N4 C0009 : score 3.597 : H : ARG NH1 A0234 <- 2.75 -> DG O6 B0008 : score 6.14417 : H : ARG NH2 A0234 <- 2.89 -> DG N7 B0008 : score 6.26969 : H : LYS NZ A0368 <- 2.61 -> DG O6 B0010 : score 6.00044 : H : GLN NE2 A0401 <- 3.28 -> DA N3 C0013 : score 3.64034 : x : TYR xxxx A0229 <- 3.70 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0367 <- 3.88 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0371 <- 4.32 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0400 <- 3.98 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx >3brf_A:DNA-binding_protein_LAG-1_CSL;p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CSL (LAG-1) BOUND TO DNA WITH LIN-12 RAM PEPTIDE, C2221 organism=CAENORHABDITIS ELEGANS : H : ARG NH1 A0234 <- 2.60 -> DG O6 B0008 : score 6.32667 : H : ARG NH2 A0234 <- 2.68 -> DG N7 B0008 : score 6.53785 : H : LYS NZ A0368 <- 3.28 -> DG N7 B0010 : score 4.86885 : H : LYS NZ A0368 <- 2.48 -> DG O6 B0010 : score 6.15074 : x : TYR xxxx A0229 <- 3.73 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0232 <- 3.94 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0367 <- 3.82 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0371 <- 4.20 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0400 <- 3.92 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0401 <- 3.25 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx >3brg_C:DNA-binding_protein_LAG-1_CSL;p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CSL (RBP-JK) BOUND TO DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH2 C0091 <- 2.44 -> DG N7 B0008 : score 6.84431 : H : LYS NZ C0192 <- 2.72 -> DG O6 B0010 : score 5.87326 : H : SER OG C0221 <- 2.74 -> DA N3 A0013 : score 3.03989 : x : TYR xxxx C0086 <- 3.50 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0089 <- 3.78 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0191 <- 3.90 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0220 <- 3.14 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx >3bs1_A: title=STRUCTURE OF THE STAPHYLOCOCCUS AUREUS AGRA LYTTR DOMAIN BOUND TO DNA REVEALS A BETA FOLD WITH A NOVEL MODE OF BINDING organism=Staphylococcus aureus : w : SER OG A0168 <- 5.82 -> DA N6 B0012 : score 2.209 : w : SER OG A0168 <- 5.37 -> DA N6 C0004 : score 2.209 : H : HIS NE2 A0169 <- 2.76 -> DG O6 B0013 : score 8.01748 : w : ASN ND2 A0201 <- 5.60 -> DT O2 B0010 : score 1.666 : H : ARG NH1 A0233 <- 2.93 -> DG N7 C0012 : score 5.8927 : H : ARG NH2 A0233 <- 2.84 -> DG O6 C0012 : score 6.5472 : w : ARG NH2 A0233 <- 5.96 -> DA N6 B0005 : score 1.997 : x : TYR xxxx A0183 <- 3.38 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0232 <- 4.04 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >3bsu_A:L9_N-domain-like; title=HYBRID-BINDING DOMAIN OF HUMAN RNASE H1 IN COMPLEX WITH 12-MER RNA/DNA organism=Homo sapiens : w : ASP OD2 A0051 <- 6.00 -> DG N2 E0007 : score 1.62 : x : PHE xxxx A0058 <- 3.47 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx >3bsu_ABC:L9_N-domain-like; title=HYBRID-BINDING DOMAIN OF HUMAN RNASE H1 IN COMPLEX WITH 12-MER RNA/DNA organism=Homo sapiens : w : ASP OD2 A0051 <- 6.00 -> DG N2 E0007 : score 1.62 : w : ASP OD2 C0051 <- 5.98 -> DG N2 E0010 : score 1.62 : x : PHE xxxx A0058 <- 3.47 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0043 <- 4.37 -> DC xxx E0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 3.46 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0058 <- 3.71 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx >3bsu_FGH:L9_N-domain-like; title=HYBRID-BINDING DOMAIN OF HUMAN RNASE H1 IN COMPLEX WITH 12-MER RNA/DNA organism=Homo sapiens : x : PHE xxxx F0058 <- 3.65 -> DG xxx J0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0058 <- 3.78 -> DT xxx J0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx H0043 <- 4.33 -> DT xxx J0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0058 <- 3.56 -> DG xxx J0010 : score x.xxxxx >3btx_A:Clavaminate_synthase-like; title=X-RAY STRUCTURE OF HUMAN ABH2 BOUND TO DSDNA THROUGH ACTIVE SITE CROSS-LINKING organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0104 <- 3.03 -> DA N3 C0279 : score 2.64918 A : w : HIS NE2 A0106 <- 5.83 -> DA N3 B0266 : score 2.619 : x : VAL xxxx A0101 <- 3.65 -> DA xxx B0266 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0102 <- 3.10 -> DT xxx C0278 : score x.xxxxx >3bty_A:Clavaminate_synthase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN ABH2 BOUND TO DSDNA CONTAINING 1MEA THROUGH CROSS-LINKING AWAY FROM ACTIVE SITE organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0106 <- 5.49 -> DA N3 B0008 : score 2.619 : x : VAL xxxx A0101 <- 3.79 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0102 <- 3.11 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0104 <- 3.24 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0105 <- 3.97 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0169 <- 3.69 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0203 <- 4.05 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx >3btz_A:Clavaminate_synthase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN ABH2 CROSS-LINKED TO DSDNA organism=Homo sapiens : x : VAL xxxx A0101 <- 3.51 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0102 <- 3.31 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >3bu0_A:Clavaminate_synthase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN ABH2 CROSS-LINKED TO DSDNA WITH COFACTORS organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0104 <- 2.82 -> DA N3 C0008 : score 2.76582 : V : PHE CZ A0102 <- 3.76 -> DT C7 C0007 : score 7.18602 : x : VAL xxxx A0101 <- 3.70 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0106 <- 4.42 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx >3buc_A:Clavaminate_synthase-like; title=X-RAY STRUCTURE OF HUMAN ABH2 BOUND TO DSDNA WITH MN(II) AND 2KG organism=Homo sapiens : x : VAL xxxx A0101 <- 3.83 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0102 <- 3.09 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0104 <- 3.50 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0105 <- 3.54 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0169 <- 3.57 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx >3c0w_A:Homing_endonucleases; title=I-SCEI IN COMPLEX WITH A BOTTOM NICKED DNA SUBSTRATE organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ASN ND2 A0015 <- 2.93 -> DT O2 B0023 : score 4.62275 : H : ARG NH1 A0048 <- 2.65 -> DG O6 B0018 : score 6.26583 : H : ARG NH2 A0048 <- 2.76 -> DG N7 B0018 : score 6.43569 : H : ARG NH2 A0050 <- 3.23 -> DG N7 B0019 : score 5.83554 : H : ARG NH2 A0050 <- 2.48 -> DG O6 B0019 : score 7.0224 : w : CYS SG A0057 <- 6.74 -> DC N4 C0008 : score 4.371 : H : GLN NE2 A0059 <- 2.91 -> DG O6 B0017 : score 5.67742 : w : GLN OE1 A0059 <- 5.98 -> DC N4 C0008 : score 3.488 : w : GLN NE2 A0059 <- 6.00 -> DA N7 B0016 : score 1.888 : H : GLU OE2 A0061 <- 2.80 -> DC N4 B0015 : score 5.26538 : w : GLU OE1 A0061 <- 5.29 -> DA N6 B0014 : score 2.939 : w : GLU OE2 A0061 <- 5.69 -> DA N6 B0016 : score 2.785 : H : LYS NZ A0086 <- 2.73 -> DT O4 C0011 : score 3.6374 : w : LYS NZ A0086 <- 5.62 -> DC N4 C0010 : score 0.048 : H : ARG NH1 A0088 <- 2.90 -> DG O6 C0012 : score 5.96167 : H : ARG NH2 A0088 <- 2.65 -> DG N7 C0012 : score 6.57615 : w : ARG NH1 A0088 <- 5.96 -> DA N6 B0014 : score 1.486 : w : GLN OE1 A0102 <- 5.94 -> DC N4 C0009 : score 3.488 : H : ASN ND2 A0152 <- 3.10 -> DT O4 B0006 : score 4.96754 : V : ASP CG A0150 <- 3.88 -> DT C7 B0006 : score 2.62942 : x : PRO xxxx A0014 <- 3.28 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0046 <- 3.59 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0090 <- 3.87 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0091 <- 4.41 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0096 <- 3.73 -> DA xxx B0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0098 <- 3.96 -> DA xxx B0013 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0149 <- 4.29 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0151 <- 3.31 -> DC xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0163 <- 3.55 -> DC xxx D0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0165 <- 3.99 -> DC xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0192 <- 3.93 -> DC xxx D0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0193 <- 2.92 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx >3c0x_A:Homing_endonucleases; title=I-SCEI IN COMPLEX WITH A TOP NICKED DNA SUBSTRATE organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ASN ND2 A0015 <- 2.81 -> DT O2 C0023 : score 4.73666 : H : ARG NH1 A0048 <- 2.76 -> DG O6 C0018 : score 6.132 : H : ARG NH2 A0048 <- 2.86 -> DG N7 C0018 : score 6.308 : H : ARG NH2 A0050 <- 2.89 -> DG N7 C0019 : score 6.26969 : H : ARG NH2 A0050 <- 2.76 -> DG O6 C0019 : score 6.6528 : H : GLN NE2 A0059 <- 2.91 -> DG O6 C0017 : score 5.67742 : w : GLN NE2 A0059 <- 5.56 -> DA N7 C0016 : score 1.888 : H : GLU OE2 A0061 <- 2.84 -> DC N4 C0015 : score 5.22326 : w : GLU OE1 A0061 <- 5.51 -> DA N6 B0014 : score 2.939 : w : GLU OE2 A0061 <- 5.38 -> DA N6 C0016 : score 2.785 : H : LYS NZ A0086 <- 2.91 -> DT O4 D0011 : score 3.50826 : w : LYS NZ A0086 <- 5.87 -> DC N4 D0010 : score 0.048 : H : ARG NH1 A0088 <- 2.87 -> DG O6 D0012 : score 5.99817 : H : ARG NH2 A0088 <- 2.78 -> DG N7 D0012 : score 6.41015 : w : ARG NH1 A0088 <- 6.43 -> DA N6 B0014 : score 1.486 : w : GLN OE1 A0102 <- 5.76 -> DC N4 D0009 : score 3.488 : H : ASN ND2 A0152 <- 2.73 -> DT O4 B0006 : score 5.3586 : H : ASN OD1 A0192 <- 3.14 -> DC N4 D0017 : score 3.90843 : H : ASN ND2 A0192 <- 3.14 -> DG O6 B0009 : score 5.25505 : H : LYS NZ A0193 <- 3.01 -> DG N7 B0010 : score 5.15969 : w : LYS NZ A0193 <- 6.46 -> DT O4 D0016 : score 1.7 : V : ASP CG A0150 <- 3.89 -> DT C7 B0006 : score 2.62271 : x : PRO xxxx A0014 <- 3.20 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0046 <- 3.61 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0090 <- 4.26 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0096 <- 3.70 -> DA xxx B0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0098 <- 3.95 -> DA xxx B0013 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0149 <- 4.29 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0151 <- 3.40 -> DC xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0163 <- 3.21 -> DC xxx D0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0165 <- 3.67 -> DC xxx D0017 : score x.xxxxx >3c1b_A:Histone-fold; title=THE EFFECT OF H3 K79 DIMETHYLATION AND H4 K20 TRIMETHYLATION ON NUCLEOSOME AND CHROMATIN STRUCTURE organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.53 -> DA N3 J0229 : score 3.41469 : x : TYR xxxx A0441 <- 4.43 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.39 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 4.00 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx >3c1b_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE EFFECT OF H3 K79 DIMETHYLATION AND H4 K20 TRIMETHYLATION ON NUCLEOSOME AND CHROMATIN STRUCTURE organism=XENOPUS LAEVIS / XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS / XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS / XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS / XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS / XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS / XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.53 -> DA N3 J0229 : score 3.41469 : H : ARG NH1 E0640 <- 3.16 -> DA N3 I0082 : score 3.41694 : w : ARG NH2 E0640 <- 5.72 -> DA N3 I0083 : score 2.092 : w : ARG NH2 G1077 <- 6.18 -> DT O2 I0130 : score 2.261 : x : TYR xxxx A0441 <- 4.43 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.39 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 4.00 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1230 <- 4.05 -> DG xxx J0267 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0639 <- 4.28 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0641 <- 4.42 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 4.18 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 3.72 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.38 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0245 <- 4.13 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx >3c1c_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE EFFECT OF H3 K79 DIMETHYLATION AND H4 K20 TRIMETHYLATION ON NUCLEOSOME AND CHROMATIN STRUCTURE organism=XENOPUS LAEVIS / XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS / XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS / XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS / XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.74 -> DA N3 J0229 : score 3.27862 : H : ARG NH2 E0640 <- 3.23 -> DA N3 I0082 : score 2.96113 : x : LEU xxxx A0465 <- 4.37 -> DT xxx J0237 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0842 <- 3.95 -> DA xxx J0257 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 3.87 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 4.32 -> DA xxx I0099 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.12 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0245 <- 4.25 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H1430 <- 4.47 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >3c25_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF NOTI RESTRICTION ENDONUCLEASE BOUND TO COGNATE DNA organism=Nocardia otitidiscaviarum : w : GLU OE2 A0156 <- 5.77 -> DC O2 D0007 : score 1.988 : H : ASP OD2 A0187 <- 3.14 -> DC N4 D0012 : score 5.7784 : H : HIS ND1 A0189 <- 2.89 -> DG O6 C0008 : score 6.11106 : w : GLU OE1 A0227 <- 5.88 -> DC N4 D0015 : score 3.528 : w : GLU OE1 A0227 <- 5.54 -> DC N4 C0007 : score 3.528 : H : ASN OD1 A0230 <- 2.88 -> DC N4 C0009 : score 4.12649 : H : ASN ND2 A0230 <- 2.93 -> DG O6 C0010 : score 5.49186 : H : ARG NH1 A0237 <- 3.35 -> DG O6 D0011 : score 5.41417 : H : ARG NH2 A0237 <- 2.62 -> DG N7 D0011 : score 6.61446 : w : GLU OE1 B0156 <- 5.67 -> DC O2 C0007 : score 2.68 : H : ASP OD2 B0187 <- 3.22 -> DC N4 C0012 : score 5.6792 : H : HIS ND1 B0189 <- 3.02 -> DG O6 C0014 : score 5.94926 : H : HIS ND1 B0189 <- 2.93 -> DG O6 D0008 : score 6.06128 : w : GLU OE1 B0227 <- 6.03 -> DC N4 C0015 : score 3.528 : H : ASN OD1 B0230 <- 2.87 -> DC N4 D0009 : score 4.13488 : H : ASN ND2 B0230 <- 2.99 -> DG O6 D0010 : score 5.4242 : H : ARG NH1 B0237 <- 2.73 -> DG N7 C0011 : score 6.1347 : H : ARG NH2 B0237 <- 2.80 -> DG O6 C0011 : score 6.6 : x : ASN xxxx A0233 <- 4.37 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0233 <- 4.42 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >3c25_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF NOTI RESTRICTION ENDONUCLEASE BOUND TO COGNATE DNA organism=Nocardia otitidiscaviarum : w : GLU OE1 B0145 <- 5.57 -> DG N2 C0008 : score 1.283 : w : GLU OE1 B0156 <- 5.67 -> DC O2 C0007 : score 2.68 : w : SER OG B0158 <- 5.47 -> DG N3 C0008 : score 2.344 : H : ASP OD2 B0187 <- 3.22 -> DC N4 C0012 : score 5.6792 : H : HIS ND1 B0189 <- 3.02 -> DG O6 C0014 : score 5.94926 : H : HIS ND1 B0189 <- 2.93 -> DG O6 D0008 : score 6.06128 : w : GLU OE1 B0227 <- 6.03 -> DC N4 C0015 : score 3.528 : H : ASN OD1 B0230 <- 2.87 -> DC N4 D0009 : score 4.13488 : H : ASN ND2 B0230 <- 2.99 -> DG O6 D0010 : score 5.4242 : H : ARG NH1 B0237 <- 2.73 -> DG N7 C0011 : score 6.1347 : H : ARG NH2 B0237 <- 2.80 -> DG O6 C0011 : score 6.6 : x : ASN xxxx B0233 <- 4.42 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >3c28_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PRODUCT SYNAPSE COMPLEX organism=Bacteriophage P1 : H : LYS NZ A0086 <- 2.75 -> DG N7 D0015 : score 5.43976 : H : GLN NE2 A0090 <- 3.05 -> DT O4 C0023 : score 4.93147 : H : GLN NE2 A0090 <- 3.06 -> DT O4 D0013 : score 4.92109 : w : ARG NH1 A0243 <- 6.39 -> DT O2 C0033 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0243 <- 6.42 -> DT O2 C0033 : score 2.261 : H : LYS NZ A0244 <- 2.74 -> DT O2 C0035 : score 3.63023 : H : LYS NZ A0244 <- 2.63 -> DT O2 D0003 : score 3.70914 : H : ARG NE A0259 <- 2.80 -> DG O6 C0028 : score 3.94103 : H : ARG NH2 A0259 <- 3.06 -> DG N7 C0028 : score 6.05262 : w : GLU OE1 A0262 <- 5.78 -> DC N4 C0027 : score 3.528 : H : ARG NH2 A0282 <- 3.27 -> DA N3 D0012 : score 2.93521 : H : LYS NZ B0201 <- 2.76 -> DA N3 C0015 : score 2.79914 : w : ARG NH2 B0241 <- 5.56 -> DA N3 C0005 : score 2.092 : H : ARG NH1 B0243 <- 3.20 -> DT O2 D0033 : score 3.9619 : H : LYS NZ B0244 <- 2.84 -> DT O2 D0035 : score 3.55848 : w : LYS NZ B0244 <- 5.14 -> DT O2 C0003 : score 0.522 : H : ARG NE B0259 <- 2.78 -> DG O6 D0028 : score 3.95679 : H : ARG NH2 B0259 <- 3.01 -> DG N7 D0028 : score 6.11646 : w : GLU OE1 B0262 <- 5.72 -> DC N4 D0027 : score 3.528 : H : ARG NH1 B0282 <- 3.36 -> DA N3 C0012 : score 3.26966 : H : ARG NH2 B0282 <- 3.25 -> DA N3 C0012 : score 2.94817 : V : MET CE B0044 <- 3.69 -> DT C7 C0013 : score 7.12084 : V : ASN CG B0319 <- 3.61 -> DT C7 C0018 : score 2.77399 : x : HIS xxxx A0040 <- 3.53 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.85 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0043 <- 4.05 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0044 <- 3.41 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.99 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.55 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 3.64 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 4.25 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.68 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0317 <- 4.10 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0040 <- 3.12 -> DT xxx D0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0041 <- 3.39 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.71 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0086 <- 3.78 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.31 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0090 <- 2.77 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 3.50 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 3.68 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0317 <- 3.62 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx >3c28_B:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PRODUCT SYNAPSE COMPLEX organism=Bacteriophage P1 : H : LYS NZ B0201 <- 2.76 -> DA N3 C0015 : score 2.79914 : w : ARG NH2 B0241 <- 5.56 -> DA N3 C0005 : score 2.092 : H : ARG NH1 B0243 <- 3.20 -> DT O2 D0033 : score 3.9619 : H : LYS NZ B0244 <- 2.84 -> DT O2 D0035 : score 3.55848 : w : LYS NZ B0244 <- 5.14 -> DT O2 C0003 : score 0.522 : H : ARG NE B0259 <- 2.78 -> DG O6 D0028 : score 3.95679 : H : ARG NH2 B0259 <- 3.01 -> DG N7 D0028 : score 6.11646 : w : GLU OE1 B0262 <- 5.72 -> DC N4 D0027 : score 3.528 : H : ARG NH1 B0282 <- 3.36 -> DA N3 C0012 : score 3.26966 : H : ARG NH2 B0282 <- 3.25 -> DA N3 C0012 : score 2.94817 : V : MET CE B0044 <- 3.69 -> DT C7 C0013 : score 7.12084 : V : ASN CG B0319 <- 3.61 -> DT C7 C0018 : score 2.77399 : V : HIS CG B0040 <- 3.57 -> DT C7 D0025 : score 3.17142 : x : THR xxxx B0041 <- 3.39 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.71 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0086 <- 3.78 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.31 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0090 <- 2.77 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 3.50 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 3.68 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0317 <- 3.62 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx >3c29_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRE-LOXP SYNAPTIC STRUCTURE organism=Bacteriophage P1 : H : MET SD A0044 <- 3.39 -> DA N6 D0012 : score 5.27052 : H : LYS NZ A0086 <- 2.84 -> DG N7 D0015 : score 5.34281 : H : LYS NZ A0086 <- 2.62 -> DG O6 D0015 : score 5.98888 : H : GLN NE2 A0090 <- 3.23 -> DT O4 C0023 : score 4.7446 : H : ARG NH1 A0243 <- 2.76 -> DT O2 C0033 : score 4.34086 : H : LYS NZ A0244 <- 2.74 -> DT O2 C0035 : score 3.63023 : H : LYS NZ A0244 <- 2.91 -> DT O2 D0003 : score 3.50826 : H : ARG NE A0259 <- 2.74 -> DG O6 C0028 : score 3.98832 : H : ARG NH2 A0259 <- 2.91 -> DG N7 C0028 : score 6.24415 : w : GLU OE1 A0262 <- 5.98 -> DC N4 C0027 : score 3.528 : H : ARG NH1 A0282 <- 3.21 -> DA N3 D0012 : score 3.38012 : H : ARG NH2 A0282 <- 2.84 -> DA N3 D0012 : score 3.21383 : H : LYS NZ B0043 <- 2.81 -> DG N7 C0010 : score 5.37513 : H : MET SD B0044 <- 3.45 -> DA N6 C0012 : score 5.19881 : H : GLN NE2 B0090 <- 2.96 -> DT O4 C0013 : score 5.02491 : H : GLN NE2 B0090 <- 2.95 -> DT O4 D0023 : score 5.0353 : H : ARG NH1 B0243 <- 2.71 -> DT O2 D0033 : score 4.38393 : w : ARG NH1 B0243 <- 5.69 -> DA N3 D0034 : score 2.585 : H : LYS NZ B0244 <- 3.06 -> DT O2 C0003 : score 3.40065 : H : LYS NZ B0244 <- 2.59 -> DT O2 D0035 : score 3.73784 : H : ARG NE B0259 <- 2.85 -> DG O6 D0028 : score 3.90162 : H : ARG NH2 B0259 <- 2.98 -> DG N7 D0028 : score 6.15477 : w : GLU OE1 B0262 <- 5.72 -> DC N4 D0027 : score 3.528 : H : ARG NH2 B0282 <- 3.06 -> DA N3 C0012 : score 3.07128 : x : HIS xxxx A0040 <- 3.52 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.54 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0043 <- 4.27 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.77 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.47 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 3.46 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 4.22 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.66 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0317 <- 4.38 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0320 <- 3.95 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0040 <- 3.41 -> DT xxx D0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0041 <- 3.64 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.61 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0086 <- 3.71 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.37 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 3.76 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0241 <- 4.13 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 3.75 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0317 <- 3.74 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0319 <- 4.44 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx >3c29_G:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRE-LOXP SYNAPTIC STRUCTURE organism=Bacteriophage P1 : H : LYS NZ G0086 <- 2.72 -> DG O6 F0015 : score 5.87326 : H : GLN NE2 G0090 <- 2.52 -> DT O4 E0023 : score 5.48172 : H : LYS NZ G0244 <- 2.87 -> DT O2 F0003 : score 3.53696 : H : LYS NZ G0244 <- 2.73 -> DT O2 E0035 : score 3.6374 : H : ARG NE G0259 <- 2.87 -> DG O6 E0028 : score 3.88585 : H : ARG NH2 G0259 <- 2.89 -> DG N7 E0028 : score 6.26969 : H : ARG NH1 G0282 <- 3.24 -> DA N3 F0012 : score 3.35803 : H : ARG NH2 G0282 <- 2.99 -> DA N3 F0012 : score 3.11663 : x : HIS xxxx G0040 <- 3.54 -> DT xxx E0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0041 <- 3.63 -> DT xxx E0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0043 <- 4.34 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0044 <- 3.47 -> DA xxx E0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0047 <- 3.86 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0087 <- 3.51 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0094 <- 3.52 -> DT xxx E0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0257 <- 3.65 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0262 <- 3.41 -> DC xxx E0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0317 <- 4.45 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0320 <- 3.99 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx >3c2i_A:DNA-binding_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF METHYL-CPG BINDING DOMAIN OF HUMAN MECP2 IN COMPLEX WITH A METHYLATED DNA SEQUENCE FROM BDNF organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0111 <- 2.66 -> DG N7 B0009 : score 6.2194 : H : ARG NH2 A0111 <- 2.59 -> DG O6 B0009 : score 6.8772 : w : ASP OD1 A0121 <- 5.84 -> DC N4 C0032 : score 2.835 : H : ARG NH1 A0133 <- 3.18 -> DG N7 C0034 : score 5.5902 : H : ARG NH2 A0133 <- 2.76 -> DG O6 C0034 : score 6.6528 : x : TYR xxxx A0123 <- 4.11 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx >3c2k_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA WITH A GAPPED DNA SUBSTRATE AND DUMPNPP WITH MANGANESE IN THE ACTIVE SITE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.27 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.08 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.66 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3c2l_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A C:DAPCPP MISMATCH IN THE ACTIVE SITE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.33 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.82 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.54 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3c2m_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A G:DAPCPP MISMATCH IN THE ACTIVE SITE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.35 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.94 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.58 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3c2p_B: title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE N4 MINI-VRNAP P1 PROMOTER COMPLEX organism=Bacteriophage N4 : H : LYS NZ B0114 <- 2.63 -> DG N7 D0015 : score 5.56902 : H : THR OG1 B0269 <- 3.18 -> DG N2 D0010 : score 3.71258 : H : ASP OD2 B0901 <- 3.03 -> DC N4 D0014 : score 5.9148 : H : ARG NH1 B0904 <- 2.94 -> DG O6 D0013 : score 5.913 : H : ARG NH2 B0904 <- 2.72 -> DG N7 D0013 : score 6.48677 : w : ARG NH1 B0904 <- 6.20 -> DG O6 D0018 : score 2.756 : x : LYS xxxx B0267 <- 4.01 -> DC xxx D0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0268 <- 3.92 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >3c3l_B: title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE N4 MINI-VRNAP P2 PROMOTER COMPLEX organism=Bacteriophage N4 : H : LYS NZ B0114 <- 2.87 -> DG N7 D0015 : score 5.31049 : H : THR OG1 B0269 <- 2.68 -> DG N2 D0010 : score 4.11438 : H : ASP OD2 B0901 <- 2.84 -> DC N4 D0014 : score 6.1504 : w : ASP OD1 B0901 <- 6.11 -> DG O6 D0018 : score 3.411 : H : ARG NH1 B0904 <- 2.80 -> DG O6 D0013 : score 6.08333 : H : ARG NH2 B0904 <- 2.75 -> DG N7 D0013 : score 6.44846 : x : LYS xxxx B0267 <- 3.95 -> DC xxx D0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0268 <- 3.95 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >3c46_B: title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE N4 MINI-VRNAP P2_7A PROMOTER COMPLEX SOAKED WITH MGCL2 organism=Bacteriophage N4 : H : LYS NZ B0114 <- 2.81 -> DG N7 D0015 : score 5.37513 : H : THR OG1 B0269 <- 3.15 -> DG N2 D0010 : score 3.73669 : H : THR OG1 B0269 <- 3.45 -> DG N3 D0010 : score 1.49908 : H : ASP OD2 B0901 <- 3.03 -> DC N4 D0014 : score 5.9148 : H : ARG NH1 B0904 <- 2.78 -> DG O6 D0013 : score 6.10767 : H : ARG NH2 B0904 <- 2.82 -> DG N7 D0013 : score 6.35908 : x : LYS xxxx B0267 <- 3.88 -> DC xxx D0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0268 <- 3.88 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >3c58_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THE WILD-TYPE LACTOCOCCUS LACTIS FPG (MUTM) AND A N7-BENZYL-FAPY-DG CONTAINING DNA organism=Lactococcus lactis : H : ARG NH1 A0074 <- 2.86 -> DT O2 B0008 : score 4.25473 : H : ARG NH1 A0074 <- 2.86 -> DT O2 B0008 : score 4.25473 : w : ARG NH1 A0074 <- 5.93 -> DA N3 C0022 : score 2.585 : w : ARG NH1 A0074 <- 6.35 -> DT O2 B0009 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0074 <- 6.21 -> DT O2 B0009 : score 2.261 : H : ARG NE A0109 <- 2.74 -> DC O2 C0023 : score 2.69088 : H : ARG NH2 A0109 <- 3.08 -> DC N3 C0023 : score 2.16273 : w : ARG NH2 A0109 <- 6.06 -> DT O4 B0006 : score 2.366 : x : MET xxxx A0075 <- 3.45 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.32 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.39 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >3cbb_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 4ALPHA IN COMPLEX WITH DNA: DIABETES GENE PRODUCT organism=Homo sapiens : w : ASP OD1 A0069 <- 6.18 -> DA N6 D0017 : score 3.122 : w : ASP OD2 A0069 <- 5.71 -> DA N7 D0017 : score 2.024 : H : LYS NZ A0072 <- 2.74 -> DG O6 C0005 : score 5.85014 : w : LYS NZ A0072 <- 5.82 -> DA N6 D0017 : score 2.097 : w : ARG NH1 A0076 <- 5.13 -> DC N4 C0007 : score 1.892 : w : ARG NH2 A0076 <- 5.61 -> DG O6 D0016 : score 2.468 : H : ARG NH1 A0077 <- 3.05 -> DG N7 D0015 : score 5.7475 : w : ARG NH1 A0077 <- 5.42 -> DG O6 D0015 : score 2.756 >3cbb_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 4ALPHA IN COMPLEX WITH DNA: DIABETES GENE PRODUCT organism=Homo sapiens : w : ASP OD1 A0069 <- 6.18 -> DA N6 D0017 : score 3.122 : w : ASP OD2 A0069 <- 5.71 -> DA N7 D0017 : score 2.024 : H : LYS NZ A0072 <- 2.74 -> DG O6 C0005 : score 5.85014 : w : LYS NZ A0072 <- 5.82 -> DA N6 D0017 : score 2.097 : w : ARG NH1 A0076 <- 5.13 -> DC N4 C0007 : score 1.892 : w : ARG NH2 A0076 <- 5.61 -> DG O6 D0016 : score 2.468 : H : ARG NH1 A0077 <- 3.05 -> DG N7 D0015 : score 5.7475 : H : LYS NZ B0072 <- 3.00 -> DG O6 C0012 : score 5.54954 : w : LYS NZ B0072 <- 5.50 -> DA N7 C0011 : score 1.655 : w : LYS NZ B0072 <- 6.11 -> DA N6 D0010 : score 2.097 : w : ARG NH2 B0076 <- 5.60 -> DT O4 C0013 : score 2.366 : w : ARG NH2 B0076 <- 5.52 -> DT O4 C0014 : score 2.366 : H : ARG NH1 B0077 <- 3.21 -> DG N7 D0008 : score 5.5539 : w : ARG NH1 B0077 <- 5.93 -> DG O6 D0008 : score 2.756 : x : ASP xxxx B0069 <- 4.27 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx >3cfp_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF THE REPLICATING COMPLEX OF A POL ALPHA FAMILY DNA POLYMERASE, TERNARY COMPLEX 1 organism=Bacteriophage RB69 : w : TYR OH A0416 <- 6.66 -> DG N2 T0004 : score 2.834 : w : ASP OD1 A0621 <- 6.05 -> DG N2 T0005 : score 2.312 : H : LYS NZ A0706 <- 2.54 -> DC O2 P0114 : score 3.09935 : w : LYS NZ A0706 <- 5.92 -> DG N2 T0005 : score 0.846 : H : LYS NZ A0800 <- 2.62 -> DT O2 P0108 : score 3.71632 : x : PRO xxxx A0361 <- 3.99 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0564 <- 4.32 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0734 <- 3.66 -> DT xxx P0112 : score x.xxxxx >3cfr_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF THE REPLICATING COMPLEX OF A POL ALPHA FAMILY DNA POLYMERASE, TERNARY COMPLEX 2 organism=BACTERIOPHAGE RB69 : w : TYR OH A0416 <- 6.07 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : H : LYS NZ A0706 <- 3.04 -> DA N3 P0114 : score 2.64363 : w : LYS NZ A0734 <- 5.26 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : H : LYS NZ A0800 <- 3.31 -> DC O2 P0108 : score 2.64565 : x : PRO xxxx A0361 <- 4.20 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0564 <- 4.24 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx >3clc_ABCD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RESTRICTION-MODIFICATION CONTROLLER PROTEIN C.ESP1396I TETRAMER IN COMPLEX WITH ITS NATURAL 35 BASE-PAIR OPERATOR organism=Enterobacter sp. : H : ARG NH1 A0035 <- 2.89 -> DG N7 E0003 : score 5.9411 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.58 -> DG O6 E0003 : score 6.8904 : H : ARG NH1 B0035 <- 2.93 -> DG N7 E0017 : score 5.8927 : H : ARG NH2 B0035 <- 2.59 -> DG O6 E0017 : score 6.8772 : H : ARG NH1 B0046 <- 3.27 -> DG N7 E0013 : score 5.4813 : H : ARG NH1 C0046 <- 3.24 -> DA N7 F0013 : score 2.33495 : H : ARG NH1 D0035 <- 3.12 -> DG N7 F0003 : score 5.6628 : H : ARG NH2 D0035 <- 2.52 -> DG O6 F0003 : score 6.9696 : H : ARG NH1 D0046 <- 3.16 -> DG N7 E0028 : score 5.6144 : V : ASP CG A0034 <- 3.83 -> DT C7 F0030 : score 2.66295 : x : THR xxxx A0036 <- 3.27 -> DC xxx F0031 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0039 <- 3.94 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0043 <- 3.94 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0046 <- 3.04 -> DA xxx F0028 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0034 <- 3.36 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0036 <- 3.19 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0037 <- 3.93 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0039 <- 4.41 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 3.86 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0024 <- 3.37 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0025 <- 3.90 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0034 <- 3.19 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0036 <- 3.13 -> DA xxx F0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0037 <- 3.98 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0039 <- 3.54 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 3.23 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0034 <- 3.87 -> DC xxx E0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0036 <- 2.92 -> DC xxx E0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0039 <- 4.01 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0043 <- 3.96 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx >3clc_C:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RESTRICTION-MODIFICATION CONTROLLER PROTEIN C.ESP1396I TETRAMER IN COMPLEX WITH ITS NATURAL 35 BASE-PAIR OPERATOR organism=Enterobacter sp. : H : ARG NH1 C0046 <- 3.24 -> DA N7 F0013 : score 2.33495 : x : GLN xxxx C0024 <- 3.37 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0025 <- 3.90 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0034 <- 3.19 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0036 <- 3.13 -> DA xxx F0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0037 <- 3.98 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0039 <- 3.54 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 3.23 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx >3clz_C:PUA_domain-like; title=THE SET AND RING ASSOCIATED (SRA) DOMAIN OF UHRF1 BOUND TO METHYLATED DNA organism=Homo sapiens : w : ASN OD1 C0489 <- 5.95 -> DC N4 I0005 : score 2.732 : H : ARG NE C0491 <- 2.62 -> DG O6 J0007 : score 4.0829 : H : ARG NH1 C0491 <- 2.68 -> DG N7 J0007 : score 6.1952 : w : THR OG1 C0492 <- 5.34 -> DG N7 I0007 : score 3.422 : x : VAL xxxx C0446 <- 3.67 -> DC xxx I0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0486 <- 4.32 -> DC xxx I0005 : score x.xxxxx >3cmu_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;RecA_protein,_C-terminal_domain; title=MECHANISM OF HOMOLOGOUS RECOMBINATION FROM THE RECA-SSDNA/DSDNA STRUCTURES organism=? : H : LYS NZ A0198 <- 3.13 -> DT O4 B1003 : score 3.35043 : H : ARG NH1 A3169 <- 2.90 -> DT O2 B1008 : score 4.22028 : H : ARG NH1 A4169 <- 2.73 -> DT O2 B1011 : score 4.3667 : H : ARG NH1 A5169 <- 2.59 -> DT O2 B1014 : score 4.48728 : x : MET xxxx A0197 <- 4.15 -> DT xxx B1004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0199 <- 3.10 -> DT xxx B1004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1164 <- 4.10 -> DT xxx B1005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1169 <- 4.02 -> DT xxx B1003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1197 <- 3.61 -> DT xxx B1007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1198 <- 3.20 -> DT xxx B1006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1199 <- 3.19 -> DT xxx B1007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A2164 <- 4.44 -> DT xxx B1007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A2169 <- 2.82 -> DT xxx B1005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A2197 <- 3.73 -> DT xxx B1010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A2198 <- 3.27 -> DT xxx B1009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A2199 <- 3.09 -> DT xxx B1010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A3164 <- 4.43 -> DT xxx B1010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A3197 <- 3.81 -> DT xxx B1013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A3198 <- 3.15 -> DT xxx B1012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A3199 <- 3.08 -> DT xxx B1012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A4164 <- 4.28 -> DT xxx B1013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A4196 <- 4.48 -> DT xxx B1015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A4197 <- 3.62 -> DT xxx B1016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A4198 <- 3.21 -> DT xxx B1015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A4199 <- 3.13 -> DT xxx B1015 : score x.xxxxx >3cmw_AC:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;RecA_protein,_C-terminal_domain; title=MECHANISM OF HOMOLOGOUS RECOMBINATION FROM THE RECA-SSDNA/DSDNA STRUCTURES organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A1169 <- 2.61 -> DT O2 B1002 : score 4.47005 : H : ARG NH1 A2169 <- 2.75 -> DT O2 B1005 : score 4.34947 : H : ARG NH1 A3169 <- 2.64 -> DT O2 B1008 : score 4.44422 : H : ARG NH1 A4169 <- 2.27 -> DT O2 B1011 : score 4.76289 : V : PRO CB A0206 <- 3.78 -> DT C7 B1004 : score 5.83518 : V : PRO CB A2206 <- 3.89 -> DT C7 B1010 : score 5.67552 >3cmw_C:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;RecA_protein,_C-terminal_domain; title=MECHANISM OF HOMOLOGOUS RECOMBINATION FROM THE RECA-SSDNA/DSDNA STRUCTURES organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 C1169 <- 3.04 -> DT O2 D1002 : score 4.0997 : H : ARG NH1 C2169 <- 2.65 -> DT O2 D1005 : score 4.4356 : H : ARG NH1 C3169 <- 2.72 -> DT O2 D1008 : score 4.37531 : H : ARG NH1 C4169 <- 2.71 -> DT O2 D1011 : score 4.38393 >3cmy_A:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF A HOMEODOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0002 <- 3.23 -> DA N3 B0006 : score 3.36539 A : H : ARG NH1 A0005 <- 2.70 -> DT O2 B0004 : score 4.39254 A : H : ARG NH2 A0005 <- 3.07 -> DT O2 B0004 : score 4.00473 A : H : SER OG A0050 <- 2.74 -> DG N7 C0008 : score 4.53584 A : H : ASN OD1 A0051 <- 2.88 -> DA N6 B0006 : score 5.92545 A : H : ASN ND2 A0051 <- 3.12 -> DA N7 B0006 : score 5.4948 A : V : VAL CG2 A0047 <- 3.76 -> DT C7 B0007 : score 6.18431 A >3co6_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FOXO1 DBD BOUND TO DBE1 DNA organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 C0211 <- 3.07 -> DA N6 B0020 : score 5.69662 : H : ASN ND2 C0211 <- 2.86 -> DA N7 B0020 : score 5.80007 : w : ASN OD1 C0211 <- 5.85 -> DT O4 A0004 : score 3.132 : w : ASN OD1 C0211 <- 6.17 -> DA N6 B0019 : score 2.837 : w : ARG NH2 C0214 <- 5.10 -> DG O6 A0003 : score 2.468 : H : HIS ND1 C0215 <- 2.90 -> DT O4 A0005 : score 4.6261 : w : HIS NE2 C0215 <- 5.73 -> DG N7 B0017 : score 3.601 : V : ARG CZ C0214 <- 3.58 -> DT C7 A0002 : score 2.24958 : x : SER xxxx C0212 <- 3.53 -> DT xxx B0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0216 <- 4.45 -> DT xxx B0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0218 <- 3.68 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0219 <- 4.37 -> DT xxx A0006 : score x.xxxxx >3co7_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FOXO1 DBD BOUND TO DBE2 DNA organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 F0211 <- 3.27 -> DA N6 E0024 : score 5.45575 : H : ASN ND2 F0211 <- 2.94 -> DA N7 E0024 : score 5.70614 : H : HIS ND1 F0215 <- 3.21 -> DT O4 D0005 : score 4.33343 : x : SER xxxx F0212 <- 3.36 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0214 <- 3.38 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0218 <- 3.43 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx >3coa_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FOXO1 DBD BOUND TO IRE DNA organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 C0211 <- 3.09 -> DA N6 B0020 : score 5.67253 : H : ASN ND2 C0211 <- 3.06 -> DA N7 B0019 : score 5.56525 : w : ASN OD1 C0211 <- 6.17 -> DA N6 B0021 : score 2.837 : w : ASN OD1 C0211 <- 5.84 -> DT O4 A0004 : score 3.132 : w : SER OG C0212 <- 5.56 -> DA N7 B0018 : score 2.343 : w : ARG NE C0214 <- 5.97 -> DT O4 A0004 : score 1.317 : w : ARG NH2 C0214 <- 5.47 -> DG O6 A0003 : score 2.468 : H : HIS ND1 C0215 <- 3.00 -> DT O4 A0005 : score 4.53169 : w : HIS NE2 C0215 <- 5.95 -> DC N4 B0017 : score 3.208 : V : ARG CZ C0214 <- 3.80 -> DT C7 A0002 : score 2.13231 : x : SER xxxx C0218 <- 3.69 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0219 <- 3.97 -> DT xxx A0006 : score x.xxxxx >3coq_A:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS FOR DIMERIZATION IN DNA RECOGNITION BY GAL4 organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0018 <- 2.63 -> DG N7 D0004 : score 5.56902 : H : LYS NZ A0018 <- 2.76 -> DG O6 D0005 : score 5.82702 : x : LEU xxxx A0019 <- 4.08 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx >3coq_AB:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS FOR DIMERIZATION IN DNA RECOGNITION BY GAL4 organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0018 <- 2.63 -> DG N7 D0004 : score 5.56902 : H : LYS NZ A0018 <- 2.76 -> DG O6 D0005 : score 5.82702 : H : LYS NZ B0018 <- 2.75 -> DG N7 E0024 : score 5.43976 : H : LYS NZ B0018 <- 3.18 -> DG O6 E0025 : score 5.34143 : w : LYS NZ B0018 <- 5.90 -> DG O6 E0025 : score 3.005 : x : LEU xxxx A0019 <- 4.08 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx >3cq8_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF THE L415F MUTANT RB69 EXO(-)POLYMERASE organism=Enterobacteria phage : w : TYR OH A0567 <- 5.23 -> DG N3 T0004 : score 3.344 : w : ASP OD1 A0621 <- 6.03 -> DG N2 T0005 : score 2.312 : w : THR OG1 A0622 <- 6.40 -> DG N2 T0005 : score 2.036 : w : THR OG1 A0622 <- 5.58 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 2.72 -> DC O2 P0114 : score 2.99329 : w : LYS NZ A0706 <- 6.36 -> DG N2 T0005 : score 0.846 : H : LYS NZ A0800 <- 2.87 -> DT O2 P0108 : score 3.53696 : x : PRO xxxx A0361 <- 4.24 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0561 <- 3.30 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0565 <- 3.40 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0734 <- 3.89 -> DA xxx T0008 : score x.xxxxx >3cro_LR:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=THE PHAGE 434 CRO/OR1 COMPLEX AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION organism=PHAGE 434 : H : GLN NE2 L0028 <- 3.22 -> DA N7 B0004 : score 5.57821 : H : GLN OE1 R0028 <- 3.39 -> DA N6 A0005 : score 5.33836 : H : GLN NE2 R0028 <- 3.21 -> DA N7 A0005 : score 5.59038 : H : GLN NE2 R0029 <- 3.00 -> DG O6 B0016 : score 5.57292 : w : GLN NE2 R0029 <- 5.58 -> DT O4 B0017 : score 2.257 : w : ARG NH2 R0043 <- 5.85 -> DT O2 A0012 : score 2.261 : V : LEU CD1 L0033 <- 3.66 -> DT C7 A0015 : score 5.93188 : x : THR xxxx L0018 <- 3.95 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0029 <- 3.14 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0030 <- 3.26 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0032 <- 3.07 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0043 <- 4.30 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx R0017 <- 4.17 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0018 <- 3.54 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx R0027 <- 3.76 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0030 <- 4.18 -> DT xxx B0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx R0032 <- 3.45 -> DA xxx A0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0033 <- 2.97 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0039 <- 4.25 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx >3cro_R:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=THE PHAGE 434 CRO/OR1 COMPLEX AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION organism=? : H : GLN OE1 R0028 <- 3.39 -> DA N6 A0005 : score 5.33836 : H : GLN NE2 R0028 <- 3.21 -> DA N7 A0005 : score 5.59038 : H : GLN NE2 R0029 <- 3.00 -> DG O6 B0016 : score 5.57292 : w : GLN NE2 R0029 <- 5.58 -> DT O4 B0017 : score 2.257 : w : ARG NH2 R0043 <- 5.85 -> DT O2 A0012 : score 2.261 : V : LYS CG R0027 <- 3.76 -> DT C7 B0015 : score 2.14016 : x : GLN xxxx R0017 <- 4.17 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0018 <- 3.54 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0030 <- 4.18 -> DT xxx B0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx R0032 <- 3.45 -> DA xxx A0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0033 <- 2.97 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0039 <- 4.25 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx >3crx_B:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRE RECOMBINASE/DNA COMPLEX INTERMEDIATE I organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ B0043 <- 2.98 -> DT O4 D0025 : score 3.45804 : H : GLN NE2 B0090 <- 2.88 -> DT O4 D0023 : score 5.10797 : H : ARG NH1 B0243 <- 3.23 -> DT O2 D0033 : score 3.93606 : H : LYS NZ B0244 <- 3.01 -> DT O2 D0035 : score 3.43652 : H : ARG NE B0259 <- 2.80 -> DG O6 D0028 : score 3.94103 : H : ARG NH2 B0259 <- 2.97 -> DG N7 D0028 : score 6.16754 : H : ARG NH1 B0282 <- 3.13 -> DA N3 C0012 : score 3.43904 : V : MET CE B0044 <- 3.73 -> DT C7 C0013 : score 7.05154 : x : HIS xxxx B0040 <- 3.34 -> DT xxx D0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0041 <- 3.50 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.57 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0086 <- 3.87 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.36 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 3.82 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0241 <- 4.23 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 4.00 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0262 <- 3.29 -> DA xxx D0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0317 <- 3.99 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx >3cvs_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 8OXOGUANINE:ADENINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx A0125 <- 3.52 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx >3cvs_AB:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 8OXOGUANINE:ADENINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx A0125 <- 3.52 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0125 <- 4.36 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx >3cvs_CD:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 8OXOGUANINE:ADENINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx C0125 <- 3.44 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0125 <- 3.34 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx >3cvt_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 8OXOGUANINE:CYTOSINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx A0125 <- 3.45 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0178 <- 4.32 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx >3cvt_AB:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 8OXOGUANINE:CYTOSINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx A0125 <- 3.45 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0178 <- 4.32 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0125 <- 4.21 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx >3cvt_CD:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 8OXOGUANINE:CYTOSINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx C0125 <- 3.66 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0125 <- 3.43 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx >3cvu_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=DROSOPHILA MELANOGASTER (6-4) PHOTOLYASE BOUND TO DS DNA WITH A T-T (6-4) PHOTOLESION organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : w : ARG NE A0421 <- 5.92 -> DG O6 C0010 : score 1.369 : x : HIS xxxx A0417 <- 3.74 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0418 <- 3.35 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0420 <- 3.94 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx >3cvv_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=DROSOPHILA MELANOGASTER (6-4) PHOTOLYASE BOUND TO DS DNA WITH A T-T (6-4) PHOTOLESION AND F0 COFACTOR organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : HIS xxxx A0417 <- 3.71 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0418 <- 3.32 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0420 <- 3.33 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0421 <- 3.70 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx >3cvw_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=DROSOPHILA MELANOGASTER (6-4) PHOTOLYASE H365N MUTANT BOUND TO DS DNA WITH A T-T (6-4) PHOTOLESION AND COFACTOR F0 organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : HIS xxxx A0417 <- 3.78 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0418 <- 3.26 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0420 <- 4.11 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0421 <- 3.60 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx >3cvx_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=DROSOPHILA MELANOGASTER (6-4) PHOTOLYASE H369M MUTANT BOUND TO DS DNA WITH A T-T (6-4) PHOTOLESION organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : HIS xxxx A0417 <- 3.87 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0418 <- 3.28 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0420 <- 3.43 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0421 <- 3.50 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx >3cvy_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=DROSOPHILA MELANOGASTER (6-4) PHOTOLYASE BOUND TO REPAIRED DS DNA organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : GLN OE1 A0299 <- 2.94 -> DT N3 C0008 : score 3.31851 : H : HIS NE2 A0365 <- 2.78 -> DT O4 C0009 : score 5.63141 : V : TRP CG A0302 <- 3.84 -> DT C7 C0008 : score 5.44145 : x : LYS xxxx A0246 <- 3.49 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0247 <- 3.39 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0293 <- 4.33 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0294 <- 3.53 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0306 <- 4.40 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0366 <- 3.79 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0369 <- 3.36 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0409 <- 3.29 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0417 <- 3.91 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0418 <- 3.25 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0420 <- 3.71 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0421 <- 3.82 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0423 <- 4.30 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >3cw7_AB:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 8OXOGUANINE:CYTOSINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx A0125 <- 4.21 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0125 <- 3.85 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx >3cw7_C:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 8OXOGUANINE:CYTOSINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx C0125 <- 3.52 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0177 <- 2.22 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx >3cw7_CD:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 8OXOGUANINE:CYTOSINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx C0125 <- 3.52 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0177 <- 2.22 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0125 <- 3.66 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx >3cwa_AB:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 8OXOGUANINE:CYTOSINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx B0125 <- 3.25 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx >3cwa_CD:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 8OXOGUANINE:CYTOSINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx C0125 <- 3.80 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0177 <- 2.50 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx >3cws_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 2'-FLUORO-2'- DEOXYINOSINE:THYMINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx A0125 <- 3.60 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx >3cws_AB:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 2'-FLUORO-2'- DEOXYINOSINE:THYMINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx A0125 <- 3.60 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0125 <- 3.71 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx >3cws_CD:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 2'-FLUORO-2'- DEOXYINOSINE:THYMINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx C0125 <- 3.53 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0125 <- 3.44 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx >3cwt_AB:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 2'-FLUORO-2'- DEOXYINOSINE:ADENINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx A0125 <- 3.33 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0125 <- 3.44 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx >3cwt_CD:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 2'-FLUORO-2'- DEOXYINOSINE:ADENINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx C0125 <- 3.73 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0125 <- 3.55 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx >3cwt_D:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 2'-FLUORO-2'- DEOXYINOSINE:ADENINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx D0125 <- 3.55 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx >3cwu_AB:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 2'-FLUORO-2'-DEOXY- 1,N6-ETHENOADENINE:THYMINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx A0125 <- 3.26 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0125 <- 3.83 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx >3cwu_CD:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 2'-FLUORO-2'-DEOXY- 1,N6-ETHENOADENINE:THYMINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx C0125 <- 3.67 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0125 <- 3.48 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0178 <- 4.37 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx >3cwu_D:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 2'-FLUORO-2'-DEOXY- 1,N6-ETHENOADENINE:THYMINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx D0125 <- 3.48 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0178 <- 4.37 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx >3d0a_AC: title=HUMAN P53 CORE DOMAIN WITH HOT SPOT MUTATION R249S AND SECOND SITE SUPPRESSOR MUTATION H168R IN SEQUENCE-SPECIFIC COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 3.12 -> DG N7 E0003 : score 5.0412 : H : LYS NZ A0120 <- 2.76 -> DG O6 E0004 : score 5.82702 : w : GLN NE2 A0136 <- 5.99 -> DG N7 E0002 : score 2.582 : H : LYS NZ A0139 <- 2.92 -> DG N7 G0012 : score 5.25664 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.79 -> DG O6 F0008 : score 6.0955 : H : ARG NH2 A0280 <- 2.95 -> DG N7 F0008 : score 6.19308 : H : LYS NZ C0120 <- 3.05 -> DG N7 H0003 : score 5.1166 : H : LYS NZ C0120 <- 2.60 -> DG O6 H0004 : score 6.012 : H : CYS SG C0277 <- 3.41 -> DC N4 G0009 : score -3.04824 : H : ARG NH1 C0280 <- 2.98 -> DG O6 G0008 : score 5.86433 : H : ARG NH2 C0280 <- 3.03 -> DG N7 G0008 : score 6.09092 : x : SER xxxx A0121 <- 3.19 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0123 <- 3.55 -> DG xxx G0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 4.15 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0277 <- 3.97 -> DC xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0276 <- 4.02 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx >3d0a_C:p53-like_transcription_factors; title=HUMAN P53 CORE DOMAIN WITH HOT SPOT MUTATION R249S AND SECOND SITE SUPPRESSOR MUTATION H168R IN SEQUENCE-SPECIFIC COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ C0120 <- 3.05 -> DG N7 H0003 : score 5.1166 : H : LYS NZ C0120 <- 2.60 -> DG O6 H0004 : score 6.012 : H : CYS SG C0277 <- 3.41 -> DC N4 G0009 : score -3.04824 : H : ARG NH1 C0280 <- 2.98 -> DG O6 G0008 : score 5.86433 : H : ARG NH2 C0280 <- 3.03 -> DG N7 G0008 : score 6.09092 : x : ALA xxxx C0276 <- 4.02 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx >3d0p_A:Ribonuclease_H-like; title=INSIGHTS INTO RNA/DNA HYBRID RECOGNITION AND PROCESSING BY RNASE H FROM THE CRYSTAL STRUCTURE OF A NON-SPECIFIC ENZYME-DSDNA COMPLEX organism=? : w : ASN OD1 A0106 <- 5.93 -> DG N2 B0010 : score 2.566 : x : ASN xxxx A0077 <- 3.93 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0105 <- 3.87 -> DC xxx B0011 : score x.xxxxx >3d1n_IK:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN BRN-5 TRANSCRIPTION FACTOR IN COMPLEX WITH CORTICOTROPHIN-RELEASING HORMONE GENE PROMOTER organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 I0182 <- 3.13 -> DA N6 A0011 : score 5.65309 : H : GLN NE2 I0182 <- 2.85 -> DA N7 A0011 : score 6.02885 : H : SER OG I0183 <- 2.89 -> DT O4 A0012 : score 3.49114 : w : ARG NH1 I0235 <- 5.72 -> DT O2 B0009 : score 1.855 : w : ARG NH2 I0235 <- 5.85 -> DT O2 B0009 : score 2.261 : H : ARG NH2 I0238 <- 2.35 -> DT O2 A0005 : score 4.61433 : H : ASN OD1 I0284 <- 3.14 -> DA N6 A0007 : score 5.61231 : H : ASN ND2 I0284 <- 3.24 -> DA N7 A0007 : score 5.35391 : H : GLN NE2 K0182 <- 3.31 -> DA N7 C0011 : score 5.46859 : H : SER OG K0183 <- 2.81 -> DT O4 C0012 : score 3.54802 : H : ARG NH2 K0238 <- 2.49 -> DT O2 C0005 : score 4.4958 : x : GLN xxxx I0165 <- 4.37 -> DA xxx A0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0181 <- 3.39 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0186 <- 3.33 -> DA xxx A0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0280 <- 3.70 -> DA xxx A0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0287 <- 3.29 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx K0165 <- 4.40 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0181 <- 3.21 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0186 <- 3.61 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0187 <- 4.10 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0235 <- 4.10 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0279 <- 3.62 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx K0280 <- 4.12 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx K0287 <- 4.31 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >3d1n_M:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN BRN-5 TRANSCRIPTION FACTOR IN COMPLEX WITH CORTICOTROPHIN-RELEASING HORMONE GENE PROMOTER organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 M0182 <- 3.03 -> DA N6 E0011 : score 5.77415 : H : GLN NE2 M0182 <- 3.04 -> DA N7 E0011 : score 5.79744 : H : SER OG M0183 <- 2.26 -> DT O4 E0012 : score 3.93908 : w : ARG NH1 M0235 <- 6.03 -> DT O2 F0009 : score 1.855 : w : ARG NH2 M0235 <- 5.93 -> DT O2 F0009 : score 2.261 : w : ARG NH2 M0235 <- 6.02 -> DA N3 E0006 : score 2.092 : H : ARG NH2 M0238 <- 2.37 -> DT O2 E0005 : score 4.5974 : H : ASN OD1 M0284 <- 3.19 -> DA N6 E0007 : score 5.55209 : H : ASN ND2 M0284 <- 3.21 -> DA N7 E0007 : score 5.38913 : V : GLN CG M0287 <- 3.56 -> DT C7 F0007 : score 3.45071 : x : GLN xxxx M0165 <- 4.29 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0181 <- 3.40 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0186 <- 3.41 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0187 <- 4.05 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx M0280 <- 3.83 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx >3d1n_MO:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN BRN-5 TRANSCRIPTION FACTOR IN COMPLEX WITH CORTICOTROPHIN-RELEASING HORMONE GENE PROMOTER organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 M0182 <- 3.03 -> DA N6 E0011 : score 5.77415 : H : GLN NE2 M0182 <- 3.04 -> DA N7 E0011 : score 5.79744 : H : SER OG M0183 <- 2.26 -> DT O4 E0012 : score 3.93908 : w : ARG NH1 M0235 <- 6.03 -> DT O2 F0009 : score 1.855 : w : ARG NH2 M0235 <- 5.93 -> DT O2 F0009 : score 2.261 : w : ARG NH2 M0235 <- 6.02 -> DA N3 E0006 : score 2.092 : H : ARG NH2 M0238 <- 2.37 -> DT O2 E0005 : score 4.5974 : H : ASN OD1 M0284 <- 3.19 -> DA N6 E0007 : score 5.55209 : H : ASN ND2 M0284 <- 3.21 -> DA N7 E0007 : score 5.38913 : H : GLN OE1 O0182 <- 3.16 -> DA N6 G0011 : score 5.61678 : H : GLN NE2 O0182 <- 2.97 -> DA N7 G0011 : score 5.88269 : H : SER OG O0183 <- 3.11 -> DT O4 H0002 : score 3.33471 : H : SER OG O0183 <- 2.62 -> DT O4 G0012 : score 3.68311 : w : ARG NH1 O0235 <- 5.83 -> DT O2 H0009 : score 1.855 : w : ARG NH2 O0235 <- 5.52 -> DT O2 H0009 : score 2.261 : H : ARG NH2 O0238 <- 2.21 -> DT O2 G0005 : score 4.73287 : H : ASN ND2 O0284 <- 3.13 -> DA N7 G0007 : score 5.48306 : V : GLN CG O0287 <- 3.86 -> DT C7 H0007 : score 3.20655 : V : GLN CG M0287 <- 3.56 -> DT C7 F0007 : score 3.45071 : x : GLN xxxx M0165 <- 4.29 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0181 <- 3.40 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0186 <- 3.41 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0187 <- 4.05 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx M0280 <- 3.83 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx O0165 <- 4.41 -> DA xxx G0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx O0181 <- 3.41 -> DT xxx H0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx O0186 <- 3.42 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0187 <- 4.03 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0280 <- 3.90 -> DA xxx G0007 : score x.xxxxx >3d4v_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX N7METHYLGUANINE:CYTOSINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx A0125 <- 3.25 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx >3d4v_AB:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX N7METHYLGUANINE:CYTOSINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx A0125 <- 3.25 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0125 <- 3.52 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0177 <- 4.19 -> DG xxx F0015 : score x.xxxxx >3d4v_CD:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX N7METHYLGUANINE:CYTOSINE BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx C0125 <- 3.85 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0125 <- 3.63 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0178 <- 3.99 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx >3d6y_A:Probable_bacterial_effector-binding_domain;Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF R275E MUTANT OF BMRR BOUND TO DNA AND BERBERINE organism=Bacillus subtilis : H : TYR OH A0042 <- 2.97 -> DC O2 B-010 : score 3.37852 : x : LYS xxxx A0020 <- 3.94 -> DC xxx B-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0023 <- 3.61 -> DT xxx B-007 : score x.xxxxx >3d6z_A:Probable_bacterial_effector-binding_domain;Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF R275E MUTANT OF BMRR BOUND TO DNA AND RHODAMINE organism=Bacillus subtilis : x : LYS xxxx A0020 <- 3.84 -> DC xxx B-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0023 <- 3.52 -> DT xxx B-007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0042 <- 3.22 -> DC xxx B-010 : score x.xxxxx >3d70_A:Probable_bacterial_effector-binding_domain;Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E253A MUTANT OF BMRR BOUND TO 22-BP OLIGONUCLEOTIDE organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : x : LYS xxxx A0020 <- 4.44 -> DC xxx B-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0023 <- 3.48 -> DT xxx B-007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0042 <- 3.22 -> DC xxx B-010 : score x.xxxxx >3d71_A:Probable_bacterial_effector-binding_domain;Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E253Q BMRR BOUND TO 22 BASE PAIR PROMOTER SITE organism=Bacillus subtilis : x : ARG xxxx A0023 <- 3.47 -> DT xxx M-007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0042 <- 3.18 -> DC xxx M-010 : score x.xxxxx >3dfv_CD:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ADJACENT GATA DNA BINDING organism=Mus musculus : H : ASN ND2 C0339 <- 3.26 -> DA N7 Z0016 : score 5.33043 : H : ARG NH1 C0364 <- 3.06 -> DT O2 Z0015 : score 4.08248 : H : ARG NH2 C0366 <- 2.93 -> DT O2 Z0017 : score 4.12327 : H : ARG NH1 D0364 <- 2.97 -> DT O2 Y0014 : score 4.15999 A : H : ARG NH2 D0366 <- 2.80 -> DT O2 Y0016 : score 4.23333 A : V : LEU CB C0343 <- 3.60 -> DT C7 Z0015 : score 4.61892 : V : LEU CD2 C0327 <- 3.73 -> DT C7 Y0004 : score 5.83158 : V : LEU CD2 D0347 <- 3.79 -> DT C7 Y0013 : score 5.74561 : V : LEU CB D0343 <- 3.57 -> DT C7 Y0014 : score 4.65192 : x : LEU xxxx D0327 <- 3.71 -> DA xxx Z0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0329 <- 3.26 -> DT xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0339 <- 3.01 -> DT xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0346 <- 3.72 -> DG xxx Z0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0329 <- 3.21 -> DT xxx Z0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0346 <- 3.57 -> DG xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0347 <- 4.12 -> DT xxx Z0014 : score x.xxxxx >3dfv_D:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ADJACENT GATA DNA BINDING organism=Mus musculus : H : ARG NH1 D0364 <- 2.97 -> DT O2 Y0014 : score 4.15999 A : H : ARG NH2 D0366 <- 2.80 -> DT O2 Y0016 : score 4.23333 A : V : LEU CD2 D0347 <- 3.79 -> DT C7 Y0013 : score 5.74561 : V : LEU CB D0343 <- 3.57 -> DT C7 Y0014 : score 4.65192 : x : LEU xxxx D0327 <- 3.71 -> DA xxx Z0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0329 <- 3.26 -> DT xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0339 <- 3.01 -> DT xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0346 <- 3.72 -> DG xxx Z0006 : score x.xxxxx >3dfx_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=OPPOSITE GATA DNA BINDING organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0329 <- 3.48 -> DG N7 Y0013 : score 5.2272 : H : ARG NH2 A0329 <- 3.06 -> DG O6 Y0013 : score 6.2568 : H : ARG NH1 A0364 <- 2.73 -> DA N3 X0007 : score 3.7336 : H : ARG NH2 A0364 <- 3.08 -> DA N3 X0007 : score 3.05832 : H : ARG NH1 B0329 <- 3.38 -> DG N7 X0014 : score 5.3482 : H : ARG NH2 B0329 <- 2.99 -> DG O6 X0014 : score 6.3492 : H : ARG NH1 B0364 <- 2.89 -> DT O2 Y0006 : score 4.22889 : H : ARG NH2 B0364 <- 3.19 -> DT O2 Y0006 : score 3.90313 : V : LEU CB B0343 <- 3.72 -> DT C7 Y0006 : score 4.48695 : x : THR xxxx A0326 <- 3.80 -> DT xxx X0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0327 <- 3.69 -> DT xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0339 <- 3.04 -> DT xxx X0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0343 <- 3.45 -> DA xxx X0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0326 <- 3.41 -> DT xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0327 <- 3.75 -> DG xxx X0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0339 <- 3.11 -> DA xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0347 <- 4.02 -> DT xxx Y0005 : score x.xxxxx >3dfx_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=OPPOSITE GATA DNA BINDING organism=Mus musculus : H : ARG NH1 B0329 <- 3.38 -> DG N7 X0014 : score 5.3482 : H : ARG NH2 B0329 <- 2.99 -> DG O6 X0014 : score 6.3492 : H : ARG NH1 B0364 <- 2.89 -> DT O2 Y0006 : score 4.22889 : H : ARG NH2 B0364 <- 3.19 -> DT O2 Y0006 : score 3.90313 : V : LEU CB B0343 <- 3.72 -> DT C7 Y0006 : score 4.48695 : x : THR xxxx B0326 <- 3.41 -> DT xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0327 <- 3.75 -> DG xxx X0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0339 <- 3.11 -> DA xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0347 <- 4.02 -> DT xxx Y0005 : score x.xxxxx >3dlh_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE GUIDE-STRAND-CONTAINING ARGONAUTE PROTEIN SILENCING COMPLEX organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ARG NH2 A0172 <- 2.79 -> DG O6 X0011 : score 6.6132 : H : ASN ND2 A0449 <- 2.83 -> DG N3 X0002 : score 4.8655 : H : ARG NH1 A0615 <- 3.00 -> DG O6 X0008 : score 5.84 : x : GLU xxxx A0130 <- 3.52 -> DG xxx X0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0200 <- 3.66 -> DA xxx X0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0217 <- 3.58 -> DT xxx X0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0218 <- 3.72 -> DT xxx X0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0226 <- 3.43 -> DT xxx X0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0246 <- 4.33 -> DA xxx X0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0252 <- 3.58 -> DA xxx X0019 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0254 <- 2.98 -> DG xxx X0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0255 <- 3.59 -> DT xxx X0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0266 <- 3.07 -> DT xxx X0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0267 <- 3.23 -> DA xxx X0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0280 <- 4.18 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0413 <- 3.88 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0415 <- 4.32 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0418 <- 3.91 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0434 <- 3.73 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0436 <- 2.95 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0445 <- 3.44 -> DG xxx X0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0446 <- 3.27 -> DG xxx X0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0548 <- 3.40 -> DA xxx X0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0576 <- 3.41 -> DT xxx X0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0610 <- 4.12 -> DG xxx X0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0647 <- 3.72 -> DG xxx X0002 : score x.xxxxx >3dnv_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=MDT PROTEIN organism=ESCHERICHIA COLI : x : SER xxxx B0029 <- 3.78 -> DT xxx T0701 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0038 <- 4.32 -> DC xxx T0704 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0039 <- 2.67 -> DA xxx T0702 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0040 <- 3.22 -> DT xxx T0703 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 3.77 -> DA xxx T0702 : score x.xxxxx >3dnv_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=MDT PROTEIN organism=ESCHERICHIA COLI : x : SER xxxx B0029 <- 3.78 -> DT xxx T0701 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0038 <- 4.32 -> DC xxx T0704 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0039 <- 2.67 -> DA xxx T0702 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0040 <- 3.22 -> DT xxx T0703 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 3.77 -> DA xxx T0702 : score x.xxxxx >3do7_A:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=X-RAY STRUCTURE OF A NF-KB P52/RELB/DNA COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0117 <- 2.86 -> DG N7 D0016 : score 5.9774 : H : ARG NH1 A0117 <- 3.00 -> DG O6 D0016 : score 5.84 : H : ARG NH2 A0117 <- 3.19 -> DG O6 D0016 : score 6.0852 : H : ARG NH1 A0119 <- 3.19 -> DG N7 D0015 : score 5.5781 : H : GLU OE2 A0123 <- 3.02 -> DC N4 C0010 : score 5.03371 : x : TYR xxxx A0120 <- 3.48 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0122 <- 3.58 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0125 <- 3.73 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0274 <- 4.36 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >3dpg_A:Restriction_endonuclease-like; title=SGRAI WITH NONCOGNATE DNA BOUND organism=Streptomyces griseus : H : ARG NH1 A0031 <- 2.88 -> DG N7 D0013 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0031 <- 2.68 -> DG O6 D0013 : score 6.7584 : H : ASN OD1 A0092 <- 3.10 -> DG N2 D0010 : score 4.512 : H : ARG NE A0246 <- 2.80 -> DG O6 C0011 : score 3.94103 : H : ARG NH2 A0246 <- 3.07 -> DG N7 C0011 : score 6.03985 : H : ASP OD2 A0248 <- 2.89 -> DC N4 D0009 : score 6.0884 : H : ARG NE A0249 <- 2.70 -> DG O6 C0010 : score 4.01985 : H : ARG NH2 A0249 <- 3.00 -> DG N7 C0010 : score 6.12923 : x : GLN xxxx A0036 <- 4.11 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0095 <- 4.24 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0096 <- 3.25 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0152 <- 3.25 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 4.19 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0247 <- 3.36 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx >3dpg_AB:Restriction_endonuclease-like; title=SGRAI WITH NONCOGNATE DNA BOUND organism=Streptomyces griseus : H : ARG NH1 A0031 <- 2.88 -> DG N7 D0013 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0031 <- 2.68 -> DG O6 D0013 : score 6.7584 : H : ASN OD1 A0092 <- 3.10 -> DG N2 D0010 : score 4.512 : H : ARG NE A0246 <- 2.80 -> DG O6 C0011 : score 3.94103 : H : ARG NH2 A0246 <- 3.07 -> DG N7 C0011 : score 6.03985 : H : ASP OD2 A0248 <- 2.89 -> DC N4 D0009 : score 6.0884 : H : ARG NE A0249 <- 2.70 -> DG O6 C0010 : score 4.01985 : H : ARG NH2 A0249 <- 3.00 -> DG N7 C0010 : score 6.12923 : H : ARG NH1 B0031 <- 2.91 -> DG N7 C0013 : score 5.9169 : H : ARG NH2 B0031 <- 2.70 -> DG O6 C0013 : score 6.732 : H : ASN OD1 B0092 <- 2.97 -> DG N2 C0010 : score 4.6368 : H : ARG NE B0246 <- 2.80 -> DG O6 D0011 : score 3.94103 : H : ARG NH2 B0246 <- 3.03 -> DG N7 D0011 : score 6.09092 : H : ASP OD2 B0248 <- 2.80 -> DC N4 C0009 : score 6.2 : H : ARG NE B0249 <- 2.76 -> DG O6 D0010 : score 3.97255 : H : ARG NH2 B0249 <- 3.05 -> DG N7 D0010 : score 6.06538 : x : GLN xxxx A0036 <- 4.11 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0095 <- 4.24 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0096 <- 3.25 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0152 <- 3.25 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 4.19 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0247 <- 3.36 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0036 <- 4.24 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0095 <- 4.23 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0096 <- 3.44 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0152 <- 3.05 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0244 <- 4.22 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0247 <- 3.29 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx >3dsc_A:Metallo-dependent_phosphatases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF P. FURIOSUS MRE11 DNA SYNAPTIC COMPLEX organism=Pyrococcus furiosus : H : HIS NE2 A0017 <- 3.22 -> DG N3 B0018 : score 3.41504 >3dsd_AB:Metallo-dependent_phosphatases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF P. FURIOSUS MRE11-H85S BOUND TO A BRANCHED DNA AND MANGANESE organism=Pyrococcus furiosus : x : GLN xxxx A0089 <- 3.00 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0090 <- 3.31 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0017 <- 3.15 -> DG xxx C0020 : score x.xxxxx >3dsd_B:Metallo-dependent_phosphatases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF P. FURIOSUS MRE11-H85S BOUND TO A BRANCHED DNA AND MANGANESE organism=Pyrococcus furiosus : x : HIS xxxx B0017 <- 3.15 -> DG xxx C0020 : score x.xxxxx >3dvo_A:Restriction_endonuclease-like; title=SGRAI WITH COGNATE DNA AND CALCIUM BOUND organism=Streptomyces griseus : H : ARG NH1 A0031 <- 2.97 -> DG N7 E0013 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0031 <- 2.93 -> DG O6 E0013 : score 6.4284 : w : GLN NE2 A0036 <- 5.95 -> DG N7 E0014 : score 2.582 : H : ASN OD1 A0092 <- 2.90 -> DG N2 E0010 : score 4.704 : H : ARG NE A0246 <- 2.70 -> DG O6 F0011 : score 4.01985 : H : ARG NH2 A0246 <- 3.06 -> DG N7 F0011 : score 6.05262 : H : ASP OD1 A0248 <- 3.10 -> DC N4 E0008 : score 5.02418 : H : ASP OD2 A0248 <- 2.69 -> DC N4 E0009 : score 6.3364 : H : ARG NE A0249 <- 3.01 -> DG O6 F0010 : score 3.7755 : H : ARG NH2 A0249 <- 3.20 -> DG N7 F0010 : score 5.87385 : x : LYS xxxx A0096 <- 3.32 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0152 <- 3.32 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 4.22 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0247 <- 3.45 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx >3dvo_AB:Restriction_endonuclease-like; title=SGRAI WITH COGNATE DNA AND CALCIUM BOUND organism=Streptomyces griseus : H : ARG NH1 A0031 <- 2.97 -> DG N7 E0013 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0031 <- 2.93 -> DG O6 E0013 : score 6.4284 : w : GLN NE2 A0036 <- 5.95 -> DG N7 E0014 : score 2.582 : H : ASN OD1 A0092 <- 2.90 -> DG N2 E0010 : score 4.704 : H : ARG NE A0246 <- 2.70 -> DG O6 F0011 : score 4.01985 : H : ARG NH2 A0246 <- 3.06 -> DG N7 F0011 : score 6.05262 : H : ASP OD1 A0248 <- 3.10 -> DC N4 E0008 : score 5.02418 : H : ASP OD2 A0248 <- 2.69 -> DC N4 E0009 : score 6.3364 : H : ARG NE A0249 <- 3.01 -> DG O6 F0010 : score 3.7755 : H : ARG NH2 A0249 <- 3.20 -> DG N7 F0010 : score 5.87385 : H : ARG NH1 B0031 <- 3.01 -> DG N7 F0013 : score 5.7959 : H : ARG NH2 B0031 <- 2.90 -> DG O6 F0013 : score 6.468 : w : GLN NE2 B0036 <- 6.19 -> DG N7 F0014 : score 2.582 : H : ARG NH2 B0152 <- 3.33 -> DA N3 E0007 : score 2.89633 : H : ARG NE B0246 <- 2.75 -> DG O6 E0011 : score 3.98044 : H : ARG NH2 B0246 <- 2.99 -> DG N7 E0011 : score 6.142 : H : ASP OD2 B0248 <- 3.02 -> DC N4 F0009 : score 5.9272 : H : ARG NE B0249 <- 2.92 -> DG O6 E0010 : score 3.84644 : H : ARG NH2 B0249 <- 3.04 -> DG N7 E0010 : score 6.07815 : x : LYS xxxx A0096 <- 3.32 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0152 <- 3.32 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 4.22 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0247 <- 3.45 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0092 <- 3.05 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0095 <- 4.38 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0096 <- 3.15 -> DG xxx F0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0244 <- 4.41 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0247 <- 3.28 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx >3dvo_CD:Restriction_endonuclease-like; title=SGRAI WITH COGNATE DNA AND CALCIUM BOUND organism=Streptomyces griseus : H : ARG NH1 C0031 <- 3.06 -> DG N7 G0013 : score 5.7354 : H : ARG NH2 C0031 <- 2.95 -> DG O6 G0013 : score 6.402 : w : ARG NH2 C0031 <- 6.34 -> DC N4 H0005 : score 0.976 : H : ASN OD1 C0092 <- 2.93 -> DG N2 G0010 : score 4.6752 : H : ARG NE C0246 <- 2.77 -> DG O6 H0011 : score 3.96467 : H : ARG NH2 C0246 <- 3.11 -> DG N7 H0011 : score 5.98877 : H : ASP OD1 C0248 <- 3.33 -> DC N4 G0008 : score 4.77832 : H : ASP OD2 C0248 <- 2.82 -> DC N4 G0009 : score 6.1752 : H : ARG NE C0249 <- 2.77 -> DG O6 H0010 : score 3.96467 : H : ARG NH2 C0249 <- 3.02 -> DG N7 H0010 : score 6.10369 : H : ARG NH1 D0031 <- 3.03 -> DG N7 H0013 : score 5.7717 : H : ARG NH2 D0031 <- 2.95 -> DG O6 H0013 : score 6.402 : w : ARG NH2 D0031 <- 6.55 -> DC N4 G0005 : score 0.976 : H : ARG NE D0246 <- 2.75 -> DG O6 G0011 : score 3.98044 : H : ARG NH2 D0246 <- 3.10 -> DG N7 G0011 : score 6.00154 : H : ASP OD1 D0248 <- 3.35 -> DC N4 H0008 : score 4.75694 : H : ASP OD2 D0248 <- 2.92 -> DC N4 H0009 : score 6.0512 : H : ARG NE D0249 <- 2.69 -> DG O6 G0010 : score 4.02773 : H : ARG NH2 D0249 <- 2.67 -> DG N7 G0010 : score 6.55062 : x : GLN xxxx C0036 <- 4.15 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0095 <- 4.24 -> DC xxx H0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0096 <- 3.08 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0152 <- 3.23 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0244 <- 4.28 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0247 <- 3.41 -> DA xxx G0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0036 <- 4.21 -> DG xxx H0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0092 <- 2.98 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0095 <- 4.38 -> DC xxx G0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0096 <- 3.13 -> DG xxx H0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0152 <- 3.17 -> DC xxx G0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0244 <- 4.03 -> DG xxx G0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0247 <- 3.06 -> DA xxx H0007 : score x.xxxxx >3dw9_AB:Restriction_endonuclease-like; title=SGRAI WITH COGNATE DNA AND MANGANESE BOUND organism=Streptomyces griseus : H : ARG NH1 A0031 <- 2.83 -> DG N7 E0013 : score 6.0137 : H : ARG NH2 A0031 <- 2.82 -> DG O6 E0013 : score 6.5736 : w : ARG NH2 A0031 <- 5.97 -> DC N4 F0005 : score 0.976 : H : ASN OD1 A0092 <- 3.14 -> DG N2 E0010 : score 4.4736 : H : ARG NE A0246 <- 2.75 -> DG O6 F0011 : score 3.98044 : H : ARG NH2 A0246 <- 3.00 -> DG N7 F0011 : score 6.12923 : H : ASP OD1 A0248 <- 3.20 -> DC N4 E0008 : score 4.91728 : H : ASP OD2 A0248 <- 2.62 -> DC N4 E0009 : score 6.4232 : H : ARG NE A0249 <- 2.67 -> DG O6 F0010 : score 4.04349 : H : ARG NH2 A0249 <- 2.90 -> DG N7 F0010 : score 6.25692 : H : ARG NH1 B0031 <- 2.63 -> DG N7 F0013 : score 6.2557 : H : ARG NH2 B0031 <- 2.87 -> DG O6 F0013 : score 6.5076 : w : ARG NH2 B0031 <- 5.96 -> DC N4 E0005 : score 0.976 : H : ARG NE B0246 <- 2.67 -> DG O6 E0011 : score 4.04349 : H : ARG NH2 B0246 <- 2.84 -> DG N7 E0011 : score 6.33354 : H : ASP OD1 B0248 <- 3.28 -> DC N4 F0008 : score 4.83176 : H : ASP OD2 B0248 <- 2.77 -> DC N4 F0009 : score 6.2372 : H : ARG NE B0249 <- 2.73 -> DG O6 E0010 : score 3.9962 : H : ARG NH2 B0249 <- 3.07 -> DG N7 E0010 : score 6.03985 : x : GLN xxxx A0036 <- 3.84 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0095 <- 4.24 -> DC xxx F0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0096 <- 3.06 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0152 <- 3.21 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 4.14 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0247 <- 3.19 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0036 <- 4.18 -> DG xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0092 <- 3.14 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0095 <- 4.34 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0096 <- 3.25 -> DG xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0152 <- 3.02 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0244 <- 4.04 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0247 <- 3.22 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx >3dw9_B:Restriction_endonuclease-like; title=SGRAI WITH COGNATE DNA AND MANGANESE BOUND organism=Streptomyces griseus : H : ARG NH1 B0031 <- 2.63 -> DG N7 F0013 : score 6.2557 : H : ARG NH2 B0031 <- 2.87 -> DG O6 F0013 : score 6.5076 : w : ARG NH2 B0031 <- 5.96 -> DC N4 E0005 : score 0.976 : H : ARG NE B0246 <- 2.67 -> DG O6 E0011 : score 4.04349 : H : ARG NH2 B0246 <- 2.84 -> DG N7 E0011 : score 6.33354 : H : ASP OD1 B0248 <- 3.28 -> DC N4 F0008 : score 4.83176 : H : ASP OD2 B0248 <- 2.77 -> DC N4 F0009 : score 6.2372 : H : ARG NE B0249 <- 2.73 -> DG O6 E0010 : score 3.9962 : H : ARG NH2 B0249 <- 3.07 -> DG N7 E0010 : score 6.03985 : x : GLN xxxx B0036 <- 4.18 -> DG xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0092 <- 3.14 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0095 <- 4.34 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0096 <- 3.25 -> DG xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0152 <- 3.02 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0244 <- 4.04 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0247 <- 3.22 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx >3dzu_AD: title=INTACT PPAR GAMMA - RXR ALPHA NUCLEAR RECEPTOR COMPLEX ON DNA BOUND WITH BVT.13, 9-CIS RETINOIC ACID AND NCOA2 PEPTIDE organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 A0153 <- 2.84 -> DC N4 F4005 : score 5.72181 : H : LYS NZ A0156 <- 2.81 -> DG O6 C3015 : score 5.76921 : H : ARG NH1 A0161 <- 2.99 -> DG N7 F4003 : score 5.8201 : H : GLU OE1 D0129 <- 2.53 -> DC N4 F4012 : score 6.07942 : H : LYS NZ D0132 <- 2.91 -> DG O6 C3008 : score 5.65359 : H : ARG NH1 D0184 <- 3.35 -> DA N3 C3003 : score 3.27703 : x : LYS xxxx A0160 <- 3.42 -> DG xxx C3016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0136 <- 3.63 -> DG xxx C3009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0137 <- 3.39 -> DT xxx F4009 : score x.xxxxx >3dzu_D:Nuclear_receptor_ligand-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=INTACT PPAR GAMMA - RXR ALPHA NUCLEAR RECEPTOR COMPLEX ON DNA BOUND WITH BVT.13, 9-CIS RETINOIC ACID AND NCOA2 PEPTIDE organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 D0129 <- 2.53 -> DC N4 F4012 : score 6.07942 : H : LYS NZ D0132 <- 2.91 -> DG O6 C3008 : score 5.65359 : H : ARG NH1 D0184 <- 3.35 -> DA N3 C3003 : score 3.27703 : x : ARG xxxx D0136 <- 3.63 -> DG xxx C3009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0137 <- 3.39 -> DT xxx F4009 : score x.xxxxx >3dzy_AD: title=INTACT PPAR GAMMA - RXR ALPHA NUCLEAR RECEPTOR COMPLEX ON DNA BOUND WITH ROSIGLITAZONE, 9-CIS RETINOIC ACID AND NCOA2 PEPTIDE organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 A0153 <- 2.78 -> DC N4 F4005 : score 5.79102 : H : ARG NH1 A0161 <- 3.02 -> DG N7 F4003 : score 5.7838 : H : GLU OE2 D0129 <- 3.02 -> DC N4 F4012 : score 5.03371 : H : LYS NZ D0132 <- 3.25 -> DG N7 C3008 : score 4.90117 : H : LYS NZ D0132 <- 2.97 -> DG O6 C3008 : score 5.58422 : H : ARG NH2 D0137 <- 2.73 -> DG N7 F4010 : score 6.474 : H : ARG NE D0184 <- 3.28 -> DA N3 C3003 : score 1.90072 : H : ARG NH2 D0184 <- 3.24 -> DA N3 C3003 : score 2.95465 : x : LYS xxxx A0156 <- 3.80 -> DG xxx C3015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0160 <- 3.85 -> DG xxx C3016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0136 <- 4.05 -> DG xxx C3009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0182 <- 3.73 -> DT xxx F4017 : score x.xxxxx >3dzy_D:Nuclear_receptor_ligand-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=INTACT PPAR GAMMA - RXR ALPHA NUCLEAR RECEPTOR COMPLEX ON DNA BOUND WITH ROSIGLITAZONE, 9-CIS RETINOIC ACID AND NCOA2 PEPTIDE organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE2 D0129 <- 3.02 -> DC N4 F4012 : score 5.03371 : H : LYS NZ D0132 <- 3.25 -> DG N7 C3008 : score 4.90117 : H : LYS NZ D0132 <- 2.97 -> DG O6 C3008 : score 5.58422 : H : ARG NH2 D0137 <- 2.73 -> DG N7 F4010 : score 6.474 : H : ARG NE D0184 <- 3.28 -> DA N3 C3003 : score 1.90072 : H : ARG NH2 D0184 <- 3.24 -> DA N3 C3003 : score 2.95465 : x : ARG xxxx D0136 <- 4.05 -> DG xxx C3009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0182 <- 3.73 -> DT xxx F4017 : score x.xxxxx >3e00_A:Nuclear_receptor_ligand-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=INTACT PPAR GAMMA - RXR ALPHA NUCLEAR RECEPTOR COMPLEX ON DNA BOUND WITH GW9662, 9-CIS RETINOIC ACID AND NCOA2 PEPTIDE organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 A0153 <- 2.79 -> DC N4 F4005 : score 5.77948 : H : LYS NZ A0156 <- 2.95 -> DG O6 C3015 : score 5.60735 : H : ARG NH1 A0161 <- 3.30 -> DG N7 F4003 : score 5.445 : x : LYS xxxx A0160 <- 3.01 -> DG xxx C3016 : score x.xxxxx >3e00_AD: title=INTACT PPAR GAMMA - RXR ALPHA NUCLEAR RECEPTOR COMPLEX ON DNA BOUND WITH GW9662, 9-CIS RETINOIC ACID AND NCOA2 PEPTIDE organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 A0153 <- 2.79 -> DC N4 F4005 : score 5.77948 : H : LYS NZ A0156 <- 2.95 -> DG O6 C3015 : score 5.60735 : H : ARG NH1 A0161 <- 3.30 -> DG N7 F4003 : score 5.445 : H : LYS NZ D0132 <- 3.13 -> DG N7 C3008 : score 5.03043 : H : LYS NZ D0132 <- 2.94 -> DG O6 C3008 : score 5.61891 : H : ARG NH2 D0136 <- 3.30 -> DT O4 C3010 : score 3.19846 : H : ARG NH2 D0137 <- 3.01 -> DG N7 F4010 : score 6.11646 : H : ARG NH2 D0184 <- 2.98 -> DA N3 C3003 : score 3.12311 : x : LYS xxxx A0160 <- 3.01 -> DG xxx C3016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0129 <- 2.83 -> DC xxx F4012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0140 <- 3.95 -> DT xxx C3010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0182 <- 4.38 -> DT xxx C3006 : score x.xxxxx >3e0d_A:PHP_domain-like; title=INSIGHTS INTO THE REPLISOME FROM THE CRYSTRAL STRUCTURE OF THE TERNARY COMPLEX OF THE EUBACTERIAL DNA POLYMERASE III ALPHA-SUBUNIT organism=Thermus aquaticus : x : LYS xxxx A0531 <- 2.99 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0575 <- 3.98 -> DA xxx D0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0576 <- 2.05 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0620 <- 4.21 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >3e2e_A:DNA/RNA_polymerases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN INTERMEDIATE COMPLEX OF T7 RNAP AND 7NT OF RNA organism=Bacteriophage T7 : H : ARG NH1 A0096 <- 3.19 -> DA N3 N0102 : score 3.39485 : H : ARG NH1 A0746 <- 2.89 -> DG O6 T0023 : score 5.97383 : H : ARG NH2 A0746 <- 2.88 -> DG N7 T0023 : score 6.28246 : H : ASN ND2 A0748 <- 2.70 -> DG N7 N0107 : score 4.67762 : H : ARG NH1 A0756 <- 2.88 -> DG N7 T0025 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0756 <- 2.96 -> DG O6 T0025 : score 6.3888 : H : GLN OE1 A0758 <- 3.14 -> DA N6 T0024 : score 5.64099 : x : LYS xxxx A0098 <- 3.28 -> DA xxx N0105 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0135 <- 3.04 -> DA xxx T0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0139 <- 3.50 -> DA xxx T0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0206 <- 3.31 -> DA xxx T0020 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0210 <- 4.23 -> DA xxx T0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0231 <- 4.37 -> DT xxx T0022 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0237 <- 3.70 -> DG xxx T0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0240 <- 3.55 -> DG xxx T0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0385 <- 3.42 -> DT xxx N0119 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0386 <- 3.87 -> DT xxx N0122 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0644 <- 3.46 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0647 <- 3.39 -> DG xxx N0124 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0648 <- 4.04 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0651 <- 4.04 -> DG xxx N0123 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0671 <- 3.08 -> DG xxx N0124 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0760 <- 3.86 -> DT xxx T0022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0761 <- 3.81 -> DA xxx T0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0762 <- 3.57 -> DA xxx T0020 : score x.xxxxx >3e3j_C:DNA/RNA_polymerases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN INTERMEDIATE COMPLEX OF T7 RNAP AND 8NT OF RNA organism=Bacteriophage T7 : H : ARG NH1 C0096 <- 3.14 -> DA N3 N0102 : score 3.43167 : H : ARG NH1 C0746 <- 2.90 -> DG O6 T0022 : score 5.96167 : H : ARG NH2 C0746 <- 3.01 -> DG N7 T0022 : score 6.11646 : H : ASN ND2 C0748 <- 3.00 -> DG N7 N0107 : score 4.40246 : H : ARG NH1 C0756 <- 2.97 -> DG N7 T0024 : score 5.8443 : H : ARG NH1 C0756 <- 2.96 -> DT O4 T0025 : score 3.16337 : H : ARG NH2 C0756 <- 3.24 -> DG O6 T0024 : score 6.0192 : H : ARG NH2 C0756 <- 2.99 -> DT O4 T0025 : score 3.4188 : H : GLN OE1 C0758 <- 2.87 -> DA N6 T0023 : score 5.96783 : x : LYS xxxx C0098 <- 3.45 -> DA xxx N0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0231 <- 4.47 -> DT xxx T0021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0237 <- 3.72 -> DG xxx T0020 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0240 <- 3.63 -> DG xxx T0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0423 <- 4.33 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0427 <- 3.86 -> DA xxx T0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0644 <- 1.61 -> DA xxx N0126 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0647 <- 4.13 -> DA xxx N0126 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0760 <- 3.77 -> DT xxx T0021 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0784 <- 3.24 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx >3e3y_AB:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO GTTAAC AND COCRYSTALLIZED WITH 5 MM CA2+ organism=Haemophilus influenzae : H : SER OG A0136 <- 3.17 -> DG N7 F0012 : score 4.15038 : H : ASN OD1 A0141 <- 2.87 -> DA N6 F0009 : score 5.93749 : w : ASN ND2 A0141 <- 5.89 -> DT O4 E0006 : score 3.275 : H : ASN ND2 A0201 <- 2.97 -> DG N7 E0005 : score 4.42998 : H : GLN NE2 A0209 <- 3.01 -> DG O6 E0005 : score 5.56131 : w : GLN OE1 A0209 <- 6.20 -> DG N7 E0004 : score 2.87 : H : SER OG B0136 <- 3.02 -> DG N7 E0012 : score 4.28484 : w : ASN OD1 B0141 <- 5.61 -> DT O4 F0006 : score 3.132 : H : ASN ND2 B0201 <- 3.00 -> DG N7 F0005 : score 4.40246 : H : GLN NE2 B0209 <- 3.01 -> DG O6 F0005 : score 5.56131 : V : ALA CB B0205 <- 3.75 -> DT C7 E0006 : score 5.66896 : V : ALA CB A0205 <- 3.73 -> DT C7 F0006 : score 5.69696 : x : ASN xxxx A0110 <- 3.59 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0138 <- 3.27 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.38 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.41 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.22 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.49 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 3.52 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0109 <- 2.91 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0110 <- 4.08 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0138 <- 3.33 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.66 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.51 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.16 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.35 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 3.47 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx >3e3y_B:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO GTTAAC AND COCRYSTALLIZED WITH 5 MM CA2+ organism=Haemophilus influenzae : w : GLN OE1 B0109 <- 5.99 -> DC O2 F0010 : score 1.091 : H : SER OG B0136 <- 3.02 -> DG N7 E0012 : score 4.28484 : w : ASN OD1 B0141 <- 5.61 -> DT O4 F0006 : score 3.132 : H : ASN ND2 B0201 <- 3.00 -> DG N7 F0005 : score 4.40246 : H : GLN NE2 B0209 <- 3.01 -> DG O6 F0005 : score 5.56131 : V : ALA CB B0205 <- 3.75 -> DT C7 E0006 : score 5.66896 : x : ASN xxxx B0110 <- 4.08 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0138 <- 3.33 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.66 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.51 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.16 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.35 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 3.47 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx >3e40_AB:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO GTTAAC AND COCRYSTALLIZED WITH 5 MM CA2+ organism=Haemophilus influenzae : w : GLN OE1 A0109 <- 5.55 -> DT O2 F0006 : score 2.481 : H : SER OG A0136 <- 3.16 -> DG N7 F0012 : score 4.15934 : H : ASN OD1 A0141 <- 2.86 -> DA N6 F0009 : score 5.94953 : w : ASN ND2 A0141 <- 5.92 -> DT O4 E0006 : score 3.275 : H : ASN ND2 A0201 <- 2.95 -> DG N7 E0005 : score 4.44832 : H : GLN NE2 A0209 <- 3.00 -> DG O6 E0005 : score 5.57292 : w : GLN OE1 A0209 <- 6.05 -> DG N7 E0004 : score 2.87 : w : ASN OD1 B0141 <- 5.69 -> DT O4 F0006 : score 3.132 : H : ASN ND2 B0201 <- 2.98 -> DG N7 F0005 : score 4.4208 : H : GLN NE2 B0209 <- 2.92 -> DG O6 F0005 : score 5.6658 : V : ALA CB B0205 <- 3.66 -> DT C7 E0006 : score 5.79494 : V : ALA CB A0205 <- 3.70 -> DT C7 F0006 : score 5.73895 : x : ASN xxxx A0110 <- 3.87 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0138 <- 3.12 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.49 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.41 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.22 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.43 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 3.55 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0110 <- 4.15 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0136 <- 3.71 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0138 <- 3.30 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.59 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.39 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.17 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.27 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 3.57 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx >3e40_B:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO GTTAAC AND COCRYSTALLIZED WITH 5 MM CA2+ organism=Haemophilus influenzae : w : ASN OD1 B0141 <- 5.69 -> DT O4 F0006 : score 3.132 : H : ASN ND2 B0201 <- 2.98 -> DG N7 F0005 : score 4.4208 : H : GLN NE2 B0209 <- 2.92 -> DG O6 F0005 : score 5.6658 : V : ALA CB B0205 <- 3.66 -> DT C7 E0006 : score 5.79494 : x : ASN xxxx B0110 <- 4.15 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0136 <- 3.71 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0138 <- 3.30 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.59 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.39 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.17 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.27 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 3.57 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx >3e41_A:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO GTCGAC AND 5 MM CA2+ organism=Haemophilus influenzae : w : ASN OD1 A0110 <- 5.51 -> DG N2 F0005 : score 2.566 : H : ASN OD1 A0141 <- 2.98 -> DA N6 F0009 : score 5.80501 : H : ASN ND2 A0141 <- 2.74 -> DG N7 F0008 : score 4.64093 : H : ASN ND2 A0201 <- 2.93 -> DG N7 E0005 : score 4.46666 : H : GLN NE2 A0209 <- 3.19 -> DG O6 E0005 : score 5.35233 : V : ALA CB A0205 <- 3.55 -> DT C7 F0006 : score 5.94891 : x : GLN xxxx A0109 <- 4.44 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0136 <- 3.95 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0138 <- 3.29 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.18 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 2.84 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.10 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.30 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 4.21 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx >3e41_AB:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO GTCGAC AND 5 MM CA2+ organism=Haemophilus influenzae : H : ASN OD1 A0141 <- 2.98 -> DA N6 F0009 : score 5.80501 : H : ASN ND2 A0141 <- 2.74 -> DG N7 F0008 : score 4.64093 : H : ASN ND2 A0201 <- 2.93 -> DG N7 E0005 : score 4.46666 : H : GLN NE2 A0209 <- 3.19 -> DG O6 E0005 : score 5.35233 : H : ASN OD1 B0141 <- 3.06 -> DA N6 E0009 : score 5.70866 : H : ASN ND2 B0141 <- 3.02 -> DG N7 E0008 : score 4.38412 : w : ASN ND2 B0141 <- 5.99 -> DT O4 F0006 : score 3.275 : H : ASN ND2 B0201 <- 2.84 -> DG N7 F0005 : score 4.54921 : H : GLN NE2 B0209 <- 2.81 -> DG O6 F0005 : score 5.79352 : V : ALA CB B0205 <- 3.60 -> DT C7 E0006 : score 5.87892 : V : ALA CB A0205 <- 3.55 -> DT C7 F0006 : score 5.94891 : x : GLN xxxx A0109 <- 4.44 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0110 <- 4.31 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0136 <- 3.95 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0138 <- 3.29 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.18 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 2.84 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.10 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.30 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 4.21 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0109 <- 3.51 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0110 <- 3.94 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0136 <- 3.95 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0138 <- 3.35 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.47 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.23 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 3.95 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.13 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 4.16 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx >3e42_A:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO GTCGAC AND CA2+ (COCRYSTALLIZED) organism=Haemophilus influenzae : H : GLN NE2 A0109 <- 2.93 -> DC O2 F0007 : score 3.59881 : H : ASN OD1 A0141 <- 2.83 -> DA N6 F0009 : score 5.98566 : H : ASN ND2 A0141 <- 2.69 -> DG N7 F0008 : score 4.68679 : H : ASN ND2 A0201 <- 2.75 -> DG N7 E0005 : score 4.63176 : H : GLN NE2 A0209 <- 3.00 -> DG O6 E0005 : score 5.57292 : V : ALA CB A0205 <- 3.57 -> DT C7 F0006 : score 5.92092 : x : ASN xxxx A0110 <- 4.36 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0136 <- 3.71 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0138 <- 3.31 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.43 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 2.73 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.18 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.40 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 4.26 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx >3e42_AB:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO GTCGAC AND CA2+ (COCRYSTALLIZED) organism=Haemophilus influenzae : H : GLN NE2 A0109 <- 2.93 -> DC O2 F0007 : score 3.59881 : H : ASN OD1 A0141 <- 2.83 -> DA N6 F0009 : score 5.98566 : H : ASN ND2 A0141 <- 2.69 -> DG N7 F0008 : score 4.68679 : H : ASN ND2 A0201 <- 2.75 -> DG N7 E0005 : score 4.63176 : H : GLN NE2 A0209 <- 3.00 -> DG O6 E0005 : score 5.57292 : H : ASN OD1 B0141 <- 3.01 -> DA N6 E0009 : score 5.76888 : w : ASN ND2 B0141 <- 5.62 -> DT O4 F0006 : score 3.275 : H : ASN ND2 B0201 <- 2.94 -> DG N7 F0005 : score 4.45749 : H : GLN NE2 B0209 <- 3.09 -> DG O6 F0005 : score 5.46843 : V : ALA CB B0205 <- 3.73 -> DT C7 E0006 : score 5.69696 : V : ALA CB A0205 <- 3.57 -> DT C7 F0006 : score 5.92092 : x : ASN xxxx A0110 <- 4.36 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0136 <- 3.71 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0138 <- 3.31 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.43 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 2.73 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.18 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.40 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 4.26 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0110 <- 3.69 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0136 <- 3.65 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0138 <- 3.33 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.20 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.18 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.06 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.09 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 4.32 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx >3e43_AB:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO GTTAAC AND COCRYSTALLIZED WITH 2.5 MM MGCL2 organism=Haemophilus influenzae : H : ASN ND2 A0110 <- 3.06 -> DC O2 E0010 : score 4.24655 : H : ASN OD1 A0141 <- 2.56 -> DA N6 F0009 : score 6.31084 : H : ASN ND2 A0201 <- 2.92 -> DG N7 E0005 : score 4.47584 : H : GLN NE2 A0209 <- 3.38 -> DG O6 E0005 : score 5.13173 : H : ASN OD1 B0141 <- 3.04 -> DA N6 E0009 : score 5.73275 : H : ASN ND2 B0201 <- 2.92 -> DG N7 F0005 : score 4.47584 : H : GLN NE2 B0209 <- 2.97 -> DG O6 F0005 : score 5.60775 : V : ALA CB B0205 <- 3.73 -> DT C7 E0006 : score 5.69696 : V : ALA CB A0205 <- 3.76 -> DT C7 F0006 : score 5.65496 : x : GLN xxxx A0109 <- 3.42 -> DC xxx E0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0136 <- 4.20 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0138 <- 3.20 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.43 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.21 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.35 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.27 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 4.21 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0109 <- 3.30 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0110 <- 3.47 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0136 <- 4.18 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0138 <- 3.16 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 4.16 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.62 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.25 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.40 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 4.20 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx >3e43_B:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO GTTAAC AND COCRYSTALLIZED WITH 2.5 MM MGCL2 organism=Haemophilus influenzae : H : ASN OD1 B0141 <- 3.04 -> DA N6 E0009 : score 5.73275 : H : ASN ND2 B0201 <- 2.92 -> DG N7 F0005 : score 4.47584 : H : GLN NE2 B0209 <- 2.97 -> DG O6 F0005 : score 5.60775 : V : ALA CB B0205 <- 3.73 -> DT C7 E0006 : score 5.69696 : x : GLN xxxx B0109 <- 3.30 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0110 <- 3.47 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0136 <- 4.18 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0138 <- 3.16 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 4.16 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.62 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.25 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.40 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 4.20 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx >3e44_AB:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO CLEAVED DNA (GTT | AAC) AND MN2+ organism=Haemophilus influenzae : H : ASN OD1 A0141 <- 2.84 -> DA N6 H0009 : score 5.97362 : w : ASN ND2 A0141 <- 5.87 -> DT O4 E0006 : score 3.275 : H : ASN ND2 A0201 <- 3.02 -> DG N7 E0005 : score 4.38412 : H : GLN NE2 A0209 <- 2.99 -> DG O6 E0005 : score 5.58453 : w : GLN NE2 B0109 <- 5.65 -> DT O2 E0006 : score 1.565 : w : SER OG B0136 <- 5.78 -> DG O6 F0012 : score 2.749 : H : ASN OD1 B0141 <- 2.73 -> DA N6 F0009 : score 6.1061 : H : ASN ND2 B0141 <- 2.88 -> DA N7 F0008 : score 5.77658 : w : ASN ND2 B0141 <- 5.56 -> DT O4 G0006 : score 3.275 : H : ASN ND2 B0201 <- 2.92 -> DG N7 G0005 : score 4.47584 : H : GLN NE2 B0209 <- 2.73 -> DG O6 G0005 : score 5.8864 : V : ALA CB A0205 <- 3.68 -> DT C7 G0007 : score 5.76694 : x : GLN xxxx A0109 <- 3.43 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0110 <- 3.23 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0136 <- 3.89 -> DC xxx H0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0138 <- 3.23 -> DC xxx H0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.59 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.08 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.16 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.68 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 3.26 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0110 <- 4.33 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0138 <- 3.22 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.66 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.47 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.07 -> DG xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.55 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0205 <- 3.36 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 3.29 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx >3e44_B:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO CLEAVED DNA (GTT | AAC) AND MN2+ organism=Haemophilus influenzae : w : GLN NE2 B0109 <- 5.65 -> DT O2 E0006 : score 1.565 : w : SER OG B0136 <- 5.78 -> DG O6 F0012 : score 2.749 : H : ASN OD1 B0141 <- 2.73 -> DA N6 F0009 : score 6.1061 : H : ASN ND2 B0141 <- 2.88 -> DA N7 F0008 : score 5.77658 : w : ASN ND2 B0141 <- 5.56 -> DT O4 G0006 : score 3.275 : H : ASN ND2 B0201 <- 2.92 -> DG N7 G0005 : score 4.47584 : H : GLN NE2 B0209 <- 2.73 -> DG O6 G0005 : score 5.8864 : x : ASN xxxx B0110 <- 4.33 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0138 <- 3.22 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.66 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.47 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.07 -> DG xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.55 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0205 <- 3.36 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 3.29 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx >3e45_A:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO NONCOGNATE DNA (GTGCAC) AND CA2+ organism=Haemophilus influenzae : w : GLN OE1 A0109 <- 5.48 -> DT O2 F0006 : score 2.481 : w : ASN OD1 A0110 <- 6.38 -> DG N3 F0005 : score 3.377 : H : ASN ND2 A0201 <- 3.04 -> DG N7 E0005 : score 4.36577 : H : GLN NE2 A0209 <- 2.93 -> DG O6 E0005 : score 5.65419 : V : ALA CB A0205 <- 3.57 -> DT C7 F0006 : score 5.92092 : x : SER xxxx A0136 <- 3.80 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0138 <- 3.33 -> DC xxx F0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.83 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0141 <- 2.96 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.27 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.24 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.33 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx >3e45_AB:Restriction_endonuclease-like; title=Q138F HINCII BOUND TO NONCOGNATE DNA (GTGCAC) AND CA2+ organism=Haemophilus influenzae : w : GLN OE1 A0109 <- 5.48 -> DT O2 F0006 : score 2.481 : H : ASN ND2 A0201 <- 3.04 -> DG N7 E0005 : score 4.36577 : H : GLN NE2 A0209 <- 2.93 -> DG O6 E0005 : score 5.65419 : w : ASN OD1 B0141 <- 6.60 -> DG O6 F0007 : score 3.125 : w : ASN OD1 B0141 <- 5.71 -> DC N4 E0008 : score 2.732 : H : ASN ND2 B0201 <- 2.92 -> DG N7 F0005 : score 4.47584 : H : GLN NE2 B0209 <- 2.80 -> DG O6 F0005 : score 5.80513 : V : ALA CB B0205 <- 3.70 -> DT C7 E0006 : score 5.73895 : V : ALA CB A0205 <- 3.57 -> DT C7 F0006 : score 5.92092 : x : ASN xxxx A0110 <- 3.62 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0136 <- 3.80 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0138 <- 3.33 -> DC xxx F0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.83 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0141 <- 2.96 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.27 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.24 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.33 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0031 <- 2.47 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0109 <- 3.45 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0110 <- 3.54 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0136 <- 3.85 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0138 <- 3.30 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0140 <- 3.51 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.66 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.20 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.39 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx >3e54_A:Homing_endonucleases; title=ARCHAEAL INTRON-ENCODED HOMING ENDONUCLEASE I-VDI141I COMPLEXED WITH DNA organism=Vulcanisaeta distributa : w : SER OG A0025 <- 6.30 -> DA N6 F0617 : score 2.209 : H : LYS NZ A0027 <- 2.85 -> DG O6 F0618 : score 5.72296 : H : GLN OE1 A0029 <- 3.22 -> DC N4 F0620 : score 4.19833 : H : GLN NE2 A0029 <- 2.98 -> DT O4 C0491 : score 5.00415 : H : ASP OD2 A0031 <- 2.66 -> DC N4 C0490 : score 6.3736 : H : ARG NH1 A0037 <- 3.32 -> DG N7 C0492 : score 5.4208 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.72 -> DG O6 C0492 : score 6.7056 : H : LYS NZ A0067 <- 2.80 -> DG O6 F0614 : score 5.78077 : H : GLN OE1 A0070 <- 2.71 -> DA N6 E0613 : score 6.16151 : H : GLN NE2 A0070 <- 2.95 -> DA N7 E0613 : score 5.90705 : w : ASP OD2 A0079 <- 6.16 -> DC N4 C0494 : score 3.623 : V : VAL CG2 A0032 <- 3.66 -> DT C7 C0491 : score 6.33738 : V : ALA CB A0068 <- 3.55 -> DT C7 C0497 : score 5.94891 : x : SER xxxx A0021 <- 4.01 -> DA xxx F0615 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0023 <- 3.70 -> DG xxx F0616 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0039 <- 3.58 -> DA xxx C0493 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0045 <- 3.96 -> DG xxx F0614 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0063 <- 4.12 -> DC xxx C0494 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0065 <- 4.01 -> DT xxx C0495 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0142 <- 3.16 -> DA xxx E0613 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0144 <- 3.31 -> DT xxx C0497 : score x.xxxxx >3e54_AB:Homing_endonucleases; title=ARCHAEAL INTRON-ENCODED HOMING ENDONUCLEASE I-VDI141I COMPLEXED WITH DNA organism=Vulcanisaeta distributa : w : SER OG A0025 <- 6.30 -> DA N6 F0617 : score 2.209 : H : LYS NZ A0027 <- 2.85 -> DG O6 F0618 : score 5.72296 : H : GLN OE1 A0029 <- 3.22 -> DC N4 F0620 : score 4.19833 : H : GLN NE2 A0029 <- 2.98 -> DT O4 C0491 : score 5.00415 : H : ASP OD2 A0031 <- 2.66 -> DC N4 C0490 : score 6.3736 : H : ARG NH1 A0037 <- 3.32 -> DG N7 C0492 : score 5.4208 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.72 -> DG O6 C0492 : score 6.7056 : H : LYS NZ A0067 <- 2.80 -> DG O6 F0614 : score 5.78077 : H : GLN OE1 A0070 <- 2.71 -> DA N6 E0613 : score 6.16151 : H : GLN NE2 A0070 <- 2.95 -> DA N7 E0613 : score 5.90705 : w : ASP OD2 A0079 <- 6.16 -> DC N4 C0494 : score 3.623 : w : SER OG B0225 <- 6.00 -> DA N7 D0506 : score 2.343 : H : LYS NZ B0227 <- 2.92 -> DG O6 D0507 : score 5.64203 : H : GLN OE1 B0229 <- 3.23 -> DC N4 D0509 : score 4.18917 : H : GLN NE2 B0229 <- 2.90 -> DT O4 E0602 : score 5.0872 : H : ARG NH1 B0237 <- 3.29 -> DG N7 E0603 : score 5.4571 : H : ARG NH2 B0237 <- 2.72 -> DG O6 E0603 : score 6.7056 : H : LYS NZ B0267 <- 2.82 -> DG O6 D0503 : score 5.75765 : H : GLN OE1 B0270 <- 3.01 -> DA N6 C0502 : score 5.79836 : H : GLN NE2 B0270 <- 2.89 -> DA N7 C0502 : score 5.98013 : w : ASP OD2 B0279 <- 6.07 -> DC N4 E0605 : score 3.623 : H : LYS NZ B0342 <- 3.31 -> DT O2 E0611 : score 3.22129 : H : TYR OH B0344 <- 2.85 -> DG N2 D0504 : score 4.84085 : V : VAL CG2 A0032 <- 3.66 -> DT C7 C0491 : score 6.33738 : V : ALA CB A0068 <- 3.55 -> DT C7 C0497 : score 5.94891 : V : ASP CB B0231 <- 3.84 -> DT C7 E0601 : score 2.65625 : V : VAL CG2 B0232 <- 3.67 -> DT C7 E0602 : score 6.32208 : x : SER xxxx A0021 <- 4.01 -> DA xxx F0615 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0023 <- 3.70 -> DG xxx F0616 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0039 <- 3.58 -> DA xxx C0493 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0045 <- 3.96 -> DG xxx F0614 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0063 <- 4.12 -> DC xxx C0494 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0065 <- 4.01 -> DT xxx C0495 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0142 <- 3.16 -> DA xxx E0613 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0144 <- 3.31 -> DT xxx C0497 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0221 <- 4.02 -> DG xxx D0504 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0223 <- 4.03 -> DT xxx D0505 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0239 <- 3.62 -> DG xxx E0604 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0245 <- 4.00 -> DG xxx D0503 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0263 <- 4.09 -> DC xxx E0605 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0265 <- 3.99 -> DT xxx E0606 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0268 <- 3.52 -> DA xxx E0607 : score x.xxxxx >3e6c_C:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CPRK OCPA DNA COMPLEX organism=Desulfitobacterium hafniense : w : THR OG1 C0193 <- 5.98 -> DT O4 B0504 : score 2.809 : H : TYR OH C0232 <- 3.03 -> DA N6 B0503 : score 4.45567 : w : TYR OH C0232 <- 6.82 -> DT O4 B0504 : score 2.914 : V : VAL CG2 C0192 <- 3.70 -> DT C7 B0504 : score 6.27615 : x : HIS xxxx C0190 <- 3.41 -> DT xxx B0505 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0191 <- 3.84 -> DT xxx A0540 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0195 <- 3.79 -> DT xxx A0541 : score x.xxxxx >3ebc_A:Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURE OF N141A HINCII WITH COGNATE DNA organism=Haemophilus influenzae : H : ASN ND2 A0201 <- 3.10 -> DG N7 E0005 : score 4.31074 : w : GLN OE1 A0209 <- 6.10 -> DG O6 E0004 : score 2.87 : V : ALA CB A0205 <- 3.59 -> DT C7 F0006 : score 5.89292 : x : GLN xxxx A0109 <- 3.28 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0110 <- 2.95 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0138 <- 3.26 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.56 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.38 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.55 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 3.88 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx >3ebc_AB:Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURE OF N141A HINCII WITH COGNATE DNA organism=Haemophilus influenzae : H : ASN ND2 A0201 <- 3.10 -> DG N7 E0005 : score 4.31074 : w : GLN OE1 A0209 <- 6.10 -> DG O6 E0004 : score 2.87 : H : ASN ND2 B0201 <- 3.00 -> DG N7 F0005 : score 4.40246 : V : ALA CB B0205 <- 3.77 -> DT C7 E0006 : score 5.64097 : V : ALA CB A0205 <- 3.59 -> DT C7 F0006 : score 5.89292 : x : GLN xxxx A0109 <- 3.28 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0110 <- 2.95 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0138 <- 3.26 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0199 <- 3.56 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.38 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0204 <- 3.55 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0207 <- 3.88 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0109 <- 3.30 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0110 <- 3.74 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0136 <- 3.29 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0138 <- 3.21 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0199 <- 3.89 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.06 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0204 <- 3.46 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 4.06 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0209 <- 3.49 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx >3ecp_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TN5 TRANSPOSASE COMPLEXED WITH 5' PHOSPHORYLATED TRANSPOSON END DNA organism=Escherichia coli : H : GLN OE1 A0243 <- 2.92 -> DA N6 B0015 : score 5.9073 : H : GLN NE2 A0243 <- 2.92 -> DA N7 B0015 : score 5.94359 : H : LYS NZ A0244 <- 2.58 -> DG N7 C0003 : score 5.62288 : H : LYS NZ A0330 <- 2.81 -> DC O2 B0018 : score 2.94026 : H : LYS NZ A0439 <- 2.78 -> DG N7 B0014 : score 5.40744 : H : LYS NZ A0439 <- 3.07 -> DG O6 B0014 : score 5.46861 : V : VAL CG2 A0247 <- 3.79 -> DT C7 B0017 : score 6.13838 : x : GLU xxxx A0326 <- 3.31 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0438 <- 3.27 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0440 <- 4.13 -> DT xxx B0011 : score x.xxxxx >3eeo_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=M. HHAI CO-CRYSTALLIZED WITH SYNTHETIC DSDNA CONTAINING A PROPANE DIOL IN PLACE OF THE DEOXYCYTIDINE RESIDUE TARGETED FOR METHYLATION. organism=Haemophilus parahaemolyticus : H : SER OG A0087 <- 3.02 -> DG N3 D0426 : score 2.64984 : H : ARG NH1 A0240 <- 2.95 -> DG N7 D0426 : score 5.8685 : H : ARG NH2 A0240 <- 3.02 -> DG O6 D0426 : score 6.3096 : V : ALA CB A0260 <- 3.64 -> DT C7 C0405 : score 5.82293 : x : ILE xxxx A0086 <- 3.43 -> DT xxx C0410 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0237 <- 3.38 -> DC xxx C0407 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0239 <- 4.19 -> DG xxx C0406 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0261 <- 4.06 -> DT xxx C0405 : score x.xxxxx >3eh8_G:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF Y2 I-ANII VARIANT (F13Y/S111Y)/DNA COMPLEX WITH CALCIUM organism=Emericella nidulans : H : LYS NZ G0024 <- 2.76 -> DG N7 H0008 : score 5.42898 : H : LYS NZ G0024 <- 2.90 -> DG O6 H0008 : score 5.66515 : H : GLU OE2 G0035 <- 2.66 -> DC N4 I0017 : score 5.41282 : H : GLU OE2 G0035 <- 3.00 -> DC N4 I0018 : score 5.05477 : H : ARG NH1 G0059 <- 3.03 -> DG O6 H0013 : score 5.8035 : H : ARG NH1 G0061 <- 2.80 -> DG O6 H0014 : score 6.08333 : H : ARG NH2 G0061 <- 3.10 -> DG N7 H0014 : score 6.00154 : H : ARG NH2 G0070 <- 2.53 -> DG O6 H0011 : score 6.9564 : H : ARG NH1 G0072 <- 2.64 -> DG O6 H0010 : score 6.278 : H : ARG NH2 G0072 <- 2.92 -> DG N7 H0010 : score 6.23138 : H : LYS NZ G0202 <- 2.76 -> DG O6 H0022 : score 5.82702 : V : ALA CB G0170 <- 3.89 -> DT C7 H0019 : score 5.473 : x : TYR xxxx G0018 <- 3.53 -> DC xxx I0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0020 <- 3.44 -> DT xxx I0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0022 <- 3.65 -> DC xxx I0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0027 <- 3.60 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0031 <- 4.24 -> DT xxx I0019 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0064 <- 3.60 -> DA xxx I0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0066 <- 3.56 -> DA xxx I0016 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx G0150 <- 3.60 -> DC xxx H0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0152 <- 3.64 -> DT xxx H0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0154 <- 3.22 -> DG xxx H0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0156 <- 3.23 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0162 <- 3.50 -> DT xxx I0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0164 <- 3.79 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0166 <- 3.38 -> DT xxx H0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx G0168 <- 3.24 -> DC xxx H0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0192 <- 3.89 -> DA xxx I0010 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx G0198 <- 4.15 -> DC xxx H0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0200 <- 3.40 -> DT xxx H0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0204 <- 3.26 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx >3ei1_B:WD40_repeat-like; title=STRUCTURE OF HSDDB1-DRDDB2 BOUND TO A 14 BP 6-4 PHOTOPRODUCT CONTAINING DNA-DUPLEX organism=DANIO RERIO : x : PHE xxxx B0371 <- 3.69 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0372 <- 3.44 -> DA xxx H0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0373 <- 3.29 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx >3ei2_B:WD40_repeat-like; title=STRUCTURE OF HSDDB1-DRDDB2 BOUND TO A 16 BP ABASIC SITE CONTAINING DNA-DUPLEX organism=DANIO RERIO : w : GLN OE1 B0370 <- 5.89 -> DA N3 G0011 : score 1.196 : H : GLN OE1 B0372 <- 3.11 -> DT N3 H0007 : score 3.20243 : w : GLN OE1 B0372 <- 5.52 -> DT O4 H0007 : score 3.068 : w : HIS NE2 B0373 <- 5.60 -> DT O4 H0007 : score 2.296 : x : ARG xxxx B0148 <- 4.49 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0236 <- 3.33 -> DA xxx G0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0371 <- 3.50 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx >3epg_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA COMPLEXED WITH N2-ETHYLGUANINE organism=HOMO SAPIENS : x : GLU xxxx A0305 <- 3.99 -> DG xxx C0842 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 4.45 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 4.05 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx >3epi_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA COMPLEXED WITH N2-ETHYLGUANINE AND INCOMING TTP organism=HOMO SAPIENS : x : GLU xxxx A0305 <- 3.48 -> DG xxx C0841 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0359 <- 4.41 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 3.98 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx >3ere_D:C-terminal_domain_of_arginine_repressor;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ARGININE REPRESSOR PROTEIN FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN COMPLEX WITH THE DNA OPERATOR organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : H : GLN OE1 D0053 <- 3.02 -> DA N6 B0011 : score 5.78625 : H : GLN NE2 D0053 <- 3.06 -> DA N7 B0011 : score 5.77308 : H : ARG NH2 D0058 <- 2.96 -> DG O6 A0003 : score 6.3888 : x : THR xxxx D0052 <- 4.17 -> DG xxx A0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0054 <- 3.22 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0057 <- 3.44 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx >3exj_A:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A P53 CORE TETRAMER BOUND TO DNA organism=Mus musculus : w : ARG NH2 A0245 <- 6.46 -> DT O2 D0008 : score 2.261 : H : ARG NH1 A0277 <- 2.84 -> DG O6 C0019 : score 6.03467 : H : ARG NH2 A0277 <- 3.08 -> DG N7 C0019 : score 6.02708 : w : ARG NH1 A0277 <- 6.14 -> DG O6 D0005 : score 2.756 : x : ALA xxxx A0273 <- 3.96 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0274 <- 4.16 -> DC xxx C0020 : score x.xxxxx >3exj_AB:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A P53 CORE TETRAMER BOUND TO DNA organism=Mus musculus : w : ARG NH2 A0245 <- 6.46 -> DT O2 D0008 : score 2.261 : H : ARG NH1 A0277 <- 2.84 -> DG O6 C0019 : score 6.03467 : H : ARG NH2 A0277 <- 3.08 -> DG N7 C0019 : score 6.02708 : w : ARG NH1 A0277 <- 6.14 -> DG O6 D0005 : score 2.756 : H : ARG NH1 B0277 <- 2.76 -> DG O6 D0009 : score 6.132 : H : ARG NH2 B0277 <- 3.09 -> DG N7 D0009 : score 6.01431 : w : ARG NH1 B0277 <- 6.26 -> DG O6 C0015 : score 2.756 : x : ALA xxxx A0273 <- 3.96 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0274 <- 4.16 -> DC xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0273 <- 3.95 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0274 <- 4.19 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx >3exl_A:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A P53 CORE TETRAMER BOUND TO DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0277 <- 2.69 -> DG O6 C0019 : score 6.21717 : H : ARG NH2 A0277 <- 3.07 -> DG N7 C0019 : score 6.03985 : x : ALA xxxx A0273 <- 4.15 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0274 <- 4.07 -> DC xxx C0020 : score x.xxxxx >3eyi_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE SECOND Z-DNA BINDING DOMAIN OF HUMAN DAI (ZBP1) IN COMPLEX WITH Z-DNA organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0138 <- 5.74 -> DC O2 D0005 : score 1.3 : w : TYR OH A0145 <- 6.34 -> DG N7 C0004 : score 3.527 : x : ARG xxxx A0142 <- 3.87 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0145 <- 3.60 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >3eyi_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE SECOND Z-DNA BINDING DOMAIN OF HUMAN DAI (ZBP1) IN COMPLEX WITH Z-DNA organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx B0145 <- 3.60 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >3eyz_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=COCRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS FRAGMENT DNA POLYMERASE I WITH DUPLEX DNA (OPEN FORM) organism=Bacillus stearothermophilus : w : LYS NZ A0582 <- 6.04 -> DA N3 C0006 : score 1.538 : w : LYS NZ A0582 <- 5.82 -> DG N3 C0007 : score 2.232 : w : THR OG1 A0586 <- 6.19 -> DG N3 C0007 : score 2.036 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.67 -> DC O2 B0030 : score 3.7449 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.15 -> DC O2 B0030 : score 3.43981 : w : ARG NH1 A0615 <- 6.03 -> DC O2 C0004 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.81 -> DG N3 C0005 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.15 -> DC O2 B0028 : score 4.16592 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.93 -> DA N3 C0006 : score 2.277 : w : GLU OE1 A0658 <- 6.25 -> DG N3 C0003 : score 2.669 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.27 -> DG N3 C0003 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.14 -> DG N3 C0003 : score 1.484 : x : TYR xxxx A0714 <- 3.26 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.26 -> DG xxx B0029 : score x.xxxxx >3ez5_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=COCRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS FRAGMENT DNA POLYMERASE I WITH DUPLEX DNA , DCTP, AND ZINC (CLOSED FORM). organism=Bacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.79 -> DT O2 C0008 : score 3.59435 : w : LYS NZ A0582 <- 6.30 -> DG N2 C0007 : score 0.846 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.96 -> DG N3 B0029 : score 2.95488 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.80 -> DG N3 C0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.87 -> DA N3 C0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.87 -> DT O2 B0027 : score 4.67971 : H : ARG NH2 A0629 <- 2.97 -> DG N7 B0029 : score 6.16754 : w : GLU OE2 A0658 <- 5.90 -> DC O2 C0004 : score 1.988 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.40 -> DC O2 C0004 : score 1.885 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.32 -> DC O2 C0004 : score 2.699 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.66 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : ALA xxxx A0707 <- 3.68 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.39 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 4.12 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0724 <- 4.30 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx >3f21_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZALPHA IN COMPLEX WITH D(CACGTG) organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx A0177 <- 3.49 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >3f22_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZALPHA IN COMPLEX WITH D(CGTACG) organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx A0177 <- 3.33 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx >3f23_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZALPHA IN COMPLEX WITH D(CGGCCG) organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx A0177 <- 3.32 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0177 <- 3.63 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx >3f23_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZALPHA IN COMPLEX WITH D(CGGCCG) organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx B0177 <- 3.63 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx >3f27_D:HMG-box; title=STRUCTURE OF SOX17 BOUND TO DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 D0070 <- 2.82 -> DC O2 B0007 : score 3.6354 : H : ARG NH1 D0070 <- 2.89 -> DT O2 A0011 : score 4.22889 : H : ARG NH2 D0070 <- 2.93 -> DT O2 A0011 : score 4.12327 : H : ASN ND2 D0073 <- 2.92 -> DT O2 A0009 : score 4.63225 : H : ASN ND2 D0073 <- 3.11 -> DG N3 A0010 : score 4.59139 : H : ASN ND2 D0095 <- 2.85 -> DT O2 B0010 : score 4.69869 : H : SER OG D0099 <- 2.74 -> DA N3 A0007 : score 3.03989 : H : TYR OH D0137 <- 2.88 -> DA N3 B0006 : score 4.08486 : x : PHE xxxx D0075 <- 3.26 -> DT xxx A0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0076 <- 3.46 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0083 <- 3.27 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0094 <- 4.13 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx >3f2b_A:PHP_domain-like;Nucleic_acid-binding_proteins; title=DNA POLYMERASE POLC FROM GEOBACILLUS KAUSTOPHILUS COMPLEX WITH DNA, DGTP, MG AND ZN organism=GEOBACILLUS KAUSTOPHILUS : H : ARG NH1 A0893 <- 2.87 -> DC O2 P0017 : score 3.5989 : w : ARG NH1 A0893 <- 5.45 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A1157 <- 5.51 -> DG N3 T0006 : score 2.669 : x : PRO xxxx A1051 <- 4.10 -> DA xxx P0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1186 <- 4.49 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1338 <- 3.89 -> DG xxx P0012 : score x.xxxxx >3f2c_A:PHP_domain-like;Nucleic_acid-binding_proteins;AF1531-like; title=DNA POLYMERASE POLC FROM GEOBACILLUS KAUSTOPHILUS COMPLEX WITH DNA, DGTP AND MN organism=GEOBACILLUS KAUSTOPHILUS : H : ARG NH1 A0893 <- 2.75 -> DC O2 P0017 : score 3.6865 : w : ARG NH1 A0893 <- 5.76 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A1157 <- 5.47 -> DG N3 T0006 : score 2.669 : x : PRO xxxx A1051 <- 4.10 -> DA xxx P0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1186 <- 4.38 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1338 <- 4.12 -> DG xxx P0012 : score x.xxxxx >3f2d_A:PHP_domain-like;Nucleic_acid-binding_proteins;AF1531-like; title=DNA POLYMERASE POLC FROM GEOBACILLUS KAUSTOPHILUS COMPLEX WITH DNA, DGTP, MN AND ZN organism=GEOBACILLUS KAUSTOPHILUS : H : ARG NH1 A0893 <- 2.80 -> DC O2 P0017 : score 3.65 : w : ARG NH1 A0893 <- 5.49 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A1157 <- 5.44 -> DG N3 T0006 : score 2.669 : x : PRO xxxx A1051 <- 4.07 -> DA xxx P0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1186 <- 4.40 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1338 <- 4.01 -> DG xxx P0012 : score x.xxxxx >3f73_B:Ribonuclease_H-like; title=ALIGNMENT OF GUIDE-TARGET SEED DUPLEX WITHIN AN ARGONAUTE SILENCING COMPLEX organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ARG NH2 B0052 <- 2.63 -> DA N3 X0019 : score 3.34989 : H : ASN OD1 B0449 <- 2.93 -> DG N2 X0002 : score 4.6752 : x : GLN xxxx B0048 <- 3.10 -> DT xxx X0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0051 <- 3.73 -> DT xxx X0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0082 <- 4.11 -> DG xxx X0020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0217 <- 3.36 -> DT xxx X0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0218 <- 3.80 -> DT xxx X0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0226 <- 3.84 -> DT xxx X0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0252 <- 3.11 -> DG xxx X0020 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0254 <- 3.32 -> DT xxx X0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0255 <- 3.50 -> DT xxx X0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0266 <- 3.38 -> DG xxx X0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0280 <- 4.20 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0412 <- 4.36 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0413 <- 4.19 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0415 <- 3.49 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0418 <- 3.74 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0434 <- 4.39 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0436 <- 3.35 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0445 <- 3.68 -> DG xxx X0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0446 <- 3.43 -> DG xxx X0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0615 <- 4.31 -> DA xxx X0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0647 <- 3.58 -> DG xxx X0002 : score x.xxxxx >3f8i_B:PUA_domain-like; title=MOUSE UHRF1 SRA DOMAIN BOUND WITH HEMI-METHYLATED CPG, CRYSTAL STRUCTURE IN SPACE GROUP P21 organism=Mus musculus : H : HIS NE2 B0450 <- 2.60 -> DC O2 G0428 : score 5.49867 : H : ARG NE B0496 <- 2.77 -> DG O6 G0427 : score 3.96467 : H : ARG NH2 B0496 <- 3.17 -> DG N7 G0427 : score 5.91215 : x : VAL xxxx B0451 <- 3.92 -> DG xxx F0406 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0491 <- 3.94 -> DG xxx F0406 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0494 <- 3.46 -> DC xxx G0426 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0495 <- 4.49 -> DG xxx G0425 : score x.xxxxx >3f8j_B:PUA_domain-like; title=MOUSE UHRF1 SRA DOMAIN BOUND WITH HEMI-METHYLATED CPG, CRYSTAL STRUCTURE IN SPACE GROUP C222(1) organism=Mus musculus : H : HIS NE2 B0450 <- 2.66 -> DC O2 G0428 : score 5.43522 : H : HIS NE2 B0450 <- 2.66 -> DC O2 G0428 : score 5.43522 : w : ASN OD1 B0494 <- 5.97 -> DG O6 F0406 : score 3.125 : H : ARG NE B0496 <- 2.76 -> DG O6 G0427 : score 3.97255 : H : ARG NH2 B0496 <- 3.05 -> DG N7 G0427 : score 6.06538 : x : VAL xxxx B0451 <- 3.74 -> DG xxx F0406 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0491 <- 3.87 -> DG xxx F0406 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0495 <- 4.42 -> DG xxx G0425 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0497 <- 4.44 -> DG xxx F0408 : score x.xxxxx >3fbd_A:His-Me_finger_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEASE DOMAIN OF COLE7(D493Q MUTANT) IN COMPLEX WITH AN 18-BP DUPLEX DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : GLN NE2 A0493 <- 3.29 -> DT O4 C0023 : score 4.68231 : H : ARG NH2 A0538 <- 2.94 -> DT O2 C0028 : score 4.1148 : x : ARG xxxx A0447 <- 4.34 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0496 <- 3.49 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx >3fc3_AB:His-Me_finger_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE BETA-BETA-ALPHA-ME TYPE II RESTRICTION ENDONUCLEASE HPY99I organism=Helicobacter pylori : w : GLU OE1 A0081 <- 6.02 -> DT O4 C-003 : score 2.749 : H : ASN ND2 A0083 <- 2.97 -> DG O6 D0002 : score 5.44675 : w : ASN ND2 A0083 <- 6.08 -> DT O4 C-003 : score 3.275 : H : GLN NE2 A0084 <- 2.79 -> DG O6 C-001 : score 5.81674 : H : ARG NH1 A0094 <- 3.09 -> DG N7 D0002 : score 5.6991 : H : ARG NH2 A0094 <- 3.23 -> DG N7 D0002 : score 5.83554 : H : ASP OD1 A0162 <- 3.09 -> DG N2 D0002 : score 4.8513 A : H : ARG NH1 A0170 <- 3.13 -> DC O2 D0001 : score 3.4091 : H : ARG NH2 A0170 <- 2.79 -> DT O2 D0000 : score 4.2418 : w : GLU OE1 B0081 <- 6.09 -> DT O4 C0003 : score 2.749 : H : ASN ND2 B0083 <- 2.96 -> DG O6 C0002 : score 5.45803 : H : GLN NE2 B0084 <- 2.83 -> DG O6 D-001 : score 5.7703 : H : ARG NH1 B0094 <- 3.10 -> DG N7 C0002 : score 5.687 : H : ARG NH2 B0094 <- 3.19 -> DG N7 C0002 : score 5.88662 : w : ARG NH2 B0094 <- 6.36 -> DT O4 C0003 : score 2.366 : H : ASP OD1 B0162 <- 3.04 -> DG N2 C0002 : score 4.9028 A : H : ARG NH1 B0170 <- 3.09 -> DC O2 C0001 : score 3.4383 : H : ARG NH2 B0170 <- 2.99 -> DA N3 C0000 : score 3.11663 : V : ILE CG2 A0082 <- 3.90 -> DT C7 C-003 : score 6.914 : x : THR xxxx A0092 <- 4.25 -> DT xxx D0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0101 <- 4.39 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0166 <- 3.23 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0101 <- 4.40 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0166 <- 3.26 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx >3fc3_B:His-Me_finger_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE BETA-BETA-ALPHA-ME TYPE II RESTRICTION ENDONUCLEASE HPY99I organism=Helicobacter pylori : w : GLU OE1 B0081 <- 6.09 -> DT O4 C0003 : score 2.749 : H : ASN ND2 B0083 <- 2.96 -> DG O6 C0002 : score 5.45803 : H : GLN NE2 B0084 <- 2.83 -> DG O6 D-001 : score 5.7703 : H : ARG NH1 B0094 <- 3.10 -> DG N7 C0002 : score 5.687 : H : ARG NH2 B0094 <- 3.19 -> DG N7 C0002 : score 5.88662 : w : ARG NH2 B0094 <- 6.36 -> DT O4 C0003 : score 2.366 : H : ASP OD1 B0162 <- 3.04 -> DG N2 C0002 : score 4.9028 A : H : ARG NH1 B0170 <- 3.09 -> DC O2 C0001 : score 3.4383 : H : ARG NH2 B0170 <- 2.99 -> DA N3 C0000 : score 3.11663 : x : ARG xxxx B0101 <- 4.40 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0166 <- 3.26 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx >3fd2_A:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MMSOI/DNA COMPLEX WITH CALCIUM organism=MONOMASTIX SP. OKE-1, UNIDENTIFIED : H : LYS NZ A0028 <- 2.71 -> DA N7 B0518 : score 2.99005 : H : LYS NZ A0028 <- 3.13 -> DG O6 B0519 : score 5.39924 : H : ARG NH1 A0032 <- 3.26 -> DA N7 C0554 : score 2.32471 : w : SER OG A0047 <- 6.00 -> DA N7 B0516 : score 2.343 : H : ARG NH1 A0072 <- 3.14 -> DG N7 C0558 : score 5.6386 : H : ARG NH2 A0072 <- 2.90 -> DG O6 C0558 : score 6.468 : H : ARG NE A0075 <- 2.63 -> DT O4 C0559 : score 1.92218 : H : ARG NH2 A0075 <- 2.66 -> DG O6 B0515 : score 6.7848 : H : LYS NZ A0231 <- 2.76 -> DG N7 C0568 : score 5.42898 : H : LYS NZ A0231 <- 2.72 -> DT O4 C0569 : score 3.64457 : H : ARG NH1 A0235 <- 2.43 -> DG O6 B0504 : score 6.5335 : H : ARG NH2 A0235 <- 2.85 -> DG N7 B0504 : score 6.32077 : H : ASP OD2 A0237 <- 3.04 -> DC N4 B0502 : score 5.9024 : H : ARG NH1 A0275 <- 2.98 -> DG N7 B0508 : score 5.8322 : H : ARG NH2 A0275 <- 2.70 -> DG O6 B0508 : score 6.732 : H : ARG NH2 A0278 <- 2.75 -> DT O4 B0509 : score 3.58938 : V : ILE CG2 A0233 <- 3.71 -> DT C7 C0570 : score 7.25084 : V : ILE CG2 A0030 <- 3.78 -> DT C7 B0520 : score 7.12674 : x : SER xxxx A0024 <- 4.10 -> DA xxx B0516 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0026 <- 3.24 -> DC xxx B0517 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0034 <- 3.25 -> DC xxx C0551 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0035 <- 3.11 -> DG xxx C0553 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0049 <- 3.30 -> DG xxx B0515 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0077 <- 3.55 -> DT xxx C0559 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0079 <- 3.74 -> DA xxx B0514 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0081 <- 4.25 -> DG xxx C0558 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0085 <- 3.54 -> DA xxx C0555 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0227 <- 3.96 -> DA xxx C0566 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0229 <- 3.34 -> DC xxx C0567 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0234 <- 4.42 -> DT xxx C0569 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0238 <- 3.33 -> DA xxx B0503 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0252 <- 3.64 -> DG xxx C0565 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0273 <- 4.32 -> DA xxx B0505 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0280 <- 3.94 -> DT xxx B0509 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0282 <- 3.33 -> DC xxx C0564 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0284 <- 4.33 -> DG xxx B0508 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0288 <- 3.71 -> DA xxx B0505 : score x.xxxxx >3fde_A:PUA_domain-like; title=MOUSE UHRF1 SRA DOMAIN BOUND WITH HEMI-METHYLATED CPG DNA, CRYSTAL STRUCTURE IN SPACE GROUP C222(1) AT 1.4 A RESOLUTION organism=Mus musculus : H : HIS NE2 A0450 <- 2.71 -> DC O2 E0428 : score 5.38235 : H : HIS NE2 A0450 <- 2.71 -> DC O2 E0428 : score 5.38235 : w : ASN OD1 A0494 <- 5.71 -> DG O6 D0406 : score 3.125 : H : ARG NE A0496 <- 2.82 -> DG O6 E0427 : score 3.92526 : H : ARG NH2 A0496 <- 2.93 -> DG N7 E0427 : score 6.21862 : w : THR OG1 A0497 <- 5.31 -> DG N7 D0408 : score 3.422 : x : VAL xxxx A0451 <- 3.76 -> DG xxx E0427 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0491 <- 3.73 -> DG xxx D0406 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0495 <- 4.48 -> DG xxx E0425 : score x.xxxxx >3fdq_A: title=RECOGNITION OF AT-RICH DNA BINDING SITES BY THE MOGR REPRESSOR organism=Listeria monocytogenes : w : SER OG A0114 <- 5.39 -> DA N7 C0012 : score 2.343 : w : GLN NE2 A0117 <- 5.40 -> DT O4 D0004 : score 2.257 : w : GLN NE2 A0117 <- 5.81 -> DT O4 D0003 : score 2.257 : H : ASN ND2 A0118 <- 3.21 -> DA N7 C0011 : score 5.38913 : w : ASN OD1 A0118 <- 5.51 -> DA N6 C0012 : score 2.837 : w : ASN OD1 A0118 <- 5.77 -> DT O4 D0005 : score 3.132 : H : ARG NE A0140 <- 2.82 -> DT O2 C0005 : score 2.56662 : w : ARG NH1 A0140 <- 5.84 -> DA N3 D0014 : score 2.585 : x : VAL xxxx A0094 <- 4.24 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0121 <- 3.39 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0138 <- 3.29 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >3fdq_AB: title=RECOGNITION OF AT-RICH DNA BINDING SITES BY THE MOGR REPRESSOR organism=Listeria monocytogenes : w : SER OG A0114 <- 5.39 -> DA N7 C0012 : score 2.343 : w : GLN NE2 A0117 <- 5.40 -> DT O4 D0004 : score 2.257 : w : GLN NE2 A0117 <- 5.81 -> DT O4 D0003 : score 2.257 : H : ASN ND2 A0118 <- 3.21 -> DA N7 C0011 : score 5.38913 : w : ASN OD1 A0118 <- 5.51 -> DA N6 C0012 : score 2.837 : w : ASN OD1 A0118 <- 5.77 -> DT O4 D0005 : score 3.132 : H : ARG NE A0140 <- 2.82 -> DT O2 C0005 : score 2.56662 : w : ARG NH1 A0140 <- 5.84 -> DA N3 D0014 : score 2.585 : w : SER OG B0114 <- 5.39 -> DA N7 D0013 : score 2.343 : w : GLN NE2 B0117 <- 5.42 -> DT O4 C0003 : score 2.257 : w : GLN NE2 B0117 <- 5.79 -> DT O4 C0002 : score 2.257 : H : ASN ND2 B0118 <- 3.21 -> DA N7 D0012 : score 5.38913 : w : ASN OD1 B0118 <- 5.78 -> DT O4 C0004 : score 3.132 : H : ARG NE B0140 <- 2.81 -> DT O2 D0006 : score 2.57177 : w : ARG NH1 B0140 <- 5.78 -> DT O2 D0005 : score 1.855 : x : VAL xxxx A0094 <- 4.24 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0121 <- 3.39 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0138 <- 3.29 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0094 <- 4.25 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0121 <- 3.41 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0138 <- 3.34 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >3fhz_A:C-terminal_domain_of_arginine_repressor;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ARGININE REPRESSOR FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS BOUND WITH ITS DNA OPERATOR AND CO-REPRESSOR, L- ARGININE organism=? : H : GLN OE1 A0053 <- 3.10 -> DA N6 K0013 : score 5.68941 : H : GLN NE2 A0053 <- 3.20 -> DA N7 K0013 : score 5.60256 : H : ARG NH2 A0058 <- 2.80 -> DG O6 L0005 : score 6.6 : x : GLN xxxx A0037 <- 4.49 -> DG xxx K0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0052 <- 4.18 -> DG xxx L0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0054 <- 3.42 -> DT xxx K0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0055 <- 4.24 -> DG xxx L0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0057 <- 3.69 -> DA xxx K0013 : score x.xxxxx >3fhz_AD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ARGININE REPRESSOR FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS BOUND WITH ITS DNA OPERATOR AND CO-REPRESSOR, L- ARGININE organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : H : GLN OE1 A0053 <- 3.10 -> DA N6 K0013 : score 5.68941 : H : GLN NE2 A0053 <- 3.20 -> DA N7 K0013 : score 5.60256 : H : ARG NH2 A0058 <- 2.80 -> DG O6 L0005 : score 6.6 : H : GLN OE1 D0053 <- 3.21 -> DA N6 L0013 : score 5.55625 : H : GLN NE2 D0053 <- 3.13 -> DA N7 L0013 : score 5.68782 : H : ARG NH2 D0058 <- 3.01 -> DG O6 K0005 : score 6.3228 : H : ARG NH2 D0058 <- 2.86 -> DG O6 L0015 : score 6.5208 : x : GLN xxxx A0037 <- 4.49 -> DG xxx K0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0052 <- 4.18 -> DG xxx L0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0054 <- 3.42 -> DT xxx K0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0055 <- 4.24 -> DG xxx L0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0057 <- 3.69 -> DA xxx K0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0052 <- 4.38 -> DG xxx K0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0054 <- 3.28 -> DT xxx L0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0055 <- 4.17 -> DT xxx K0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0057 <- 3.73 -> DA xxx L0013 : score x.xxxxx >3fhz_BF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ARGININE REPRESSOR FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS BOUND WITH ITS DNA OPERATOR AND CO-REPRESSOR, L- ARGININE organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : H : GLN OE1 B0053 <- 3.05 -> DA N6 J0013 : score 5.74994 : H : GLN NE2 B0053 <- 3.02 -> DA N7 J0013 : score 5.82179 : H : ARG NH2 B0058 <- 2.97 -> DG O6 I0005 : score 6.3756 : H : GLN OE1 F0053 <- 3.19 -> DA N6 I0013 : score 5.58046 : H : GLN NE2 F0053 <- 3.25 -> DA N7 I0013 : score 5.54167 : H : ARG NH1 F0058 <- 3.30 -> DG N7 J0005 : score 5.445 : H : ARG NH2 F0058 <- 2.85 -> DG O6 J0005 : score 6.534 : x : THR xxxx B0052 <- 3.99 -> DG xxx I0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0054 <- 3.44 -> DT xxx J0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0055 <- 3.99 -> DT xxx I0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0057 <- 4.03 -> DT xxx J0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0037 <- 4.38 -> DG xxx I0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0054 <- 3.42 -> DT xxx I0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0055 <- 4.34 -> DG xxx J0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0057 <- 3.39 -> DA xxx I0013 : score x.xxxxx >3fhz_CE: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ARGININE REPRESSOR FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS BOUND WITH ITS DNA OPERATOR AND CO-REPRESSOR, L- ARGININE organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : H : GLN OE1 C0053 <- 3.26 -> DA N6 H0013 : score 5.49573 : H : GLN NE2 C0053 <- 3.26 -> DA N7 H0013 : score 5.52949 : H : ARG NH1 C0058 <- 3.31 -> DG N7 G0005 : score 5.4329 : H : ARG NH2 C0058 <- 2.70 -> DG O6 G0005 : score 6.732 : H : GLN OE1 E0053 <- 3.26 -> DA N6 G0013 : score 5.49573 : H : ARG NH1 E0058 <- 2.78 -> DG N7 H0005 : score 6.0742 : H : ARG NH2 E0058 <- 2.53 -> DG O6 H0005 : score 6.9564 : H : ARG NH2 E0058 <- 2.67 -> DG O6 G0015 : score 6.7716 : x : THR xxxx C0052 <- 4.07 -> DG xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0054 <- 3.50 -> DC xxx G0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0055 <- 3.99 -> DT xxx G0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0057 <- 3.82 -> DA xxx H0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0037 <- 4.02 -> DG xxx G0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0052 <- 4.38 -> DG xxx H0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0054 <- 3.26 -> DA xxx H0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0055 <- 3.74 -> DG xxx H0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0057 <- 3.08 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx >3fmt_AB:Replication_modulator_SeqA,_C-terminal_DNA-binding_domain;Ribbon-helix-helix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SEQA BOUND TO DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : LYS NZ A0136 <- 2.79 -> DG N7 C0014 : score 5.39667 : H : LYS NZ A0136 <- 3.21 -> DG O6 C0015 : score 5.30675 : H : ASN ND2 A0150 <- 3.11 -> DT O4 D0009 : score 4.95697 : H : ASN ND2 B0150 <- 2.87 -> DT O4 D0018 : score 5.21063 : H : ASN ND2 B0152 <- 2.85 -> DT O4 C0008 : score 5.23177 : w : ARG NE B0155 <- 6.06 -> DG O6 D0016 : score 1.369 : x : ARG xxxx A0116 <- 3.31 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0118 <- 3.19 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0134 <- 4.45 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0152 <- 3.58 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0155 <- 4.32 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0118 <- 3.28 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0134 <- 4.48 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx >3fmt_B:Replication_modulator_SeqA,_C-terminal_DNA-binding_domain;Ribbon-helix-helix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SEQA BOUND TO DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ASN ND2 B0150 <- 2.87 -> DT O4 D0018 : score 5.21063 : H : ASN ND2 B0152 <- 2.85 -> DT O4 C0008 : score 5.23177 : w : ARG NE B0155 <- 6.06 -> DG O6 D0016 : score 1.369 : x : ARG xxxx B0118 <- 3.28 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0134 <- 4.48 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx >3fmt_EF:Replication_modulator_SeqA,_C-terminal_DNA-binding_domain;Ribbon-helix-helix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SEQA BOUND TO DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : LYS NZ E0136 <- 2.79 -> DG N7 G0014 : score 5.39667 : H : LYS NZ E0136 <- 3.22 -> DG O6 G0015 : score 5.29518 : H : ASN ND2 E0150 <- 3.12 -> DT O4 H0009 : score 4.9464 : H : ASN ND2 F0150 <- 2.84 -> DT O4 H0018 : score 5.24234 : H : ASN ND2 F0152 <- 2.86 -> DT O4 G0008 : score 5.2212 : w : ARG NE F0155 <- 6.02 -> DG O6 H0016 : score 1.369 : x : ARG xxxx E0116 <- 3.30 -> DT xxx G0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0118 <- 3.21 -> DA xxx H0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0134 <- 4.47 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0152 <- 3.57 -> DT xxx G0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0155 <- 4.33 -> DG xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0118 <- 3.27 -> DA xxx H0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0134 <- 4.47 -> DT xxx H0018 : score x.xxxxx >3fof_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=STRUCTURAL INSIGHT INTO THE QUINOLONE-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IIA TOPOISOMERASES organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : LYS xxxx C0458 <- 3.79 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx >3fsi_A:DNA/RNA_polymerases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TRYPANOCIDAL 4,4'- BIS(IMIDAZOLINYLAMINO)DIPHENYLAMINE BOUND TO DNA organism=Moloney murine leukemia virus : H : ASP OD2 A0114 <- 3.10 -> DG N2 B0016 : score 5.13144 : H : ARG NH1 A0116 <- 3.17 -> DT O2 G0003 : score 3.98774 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.74 -> DT O2 G0002 : score 4.28413 : x : LEU xxxx A0099 <- 3.27 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0100 <- 4.33 -> DC xxx G0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0101 <- 3.56 -> DC xxx G0001 : score x.xxxxx >3fyl_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN:CGT COMPLEX organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 2.82 -> DG N7 C0003 : score 5.36435 : H : ARG NH1 A0466 <- 3.11 -> DG N7 D0012 : score 5.6749 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.76 -> DG O6 D0012 : score 6.6528 : w : ARG NH2 A0466 <- 6.23 -> DA N6 C0005 : score 1.997 : H : LYS NZ B0461 <- 2.94 -> DG N7 D0003 : score 5.23509 : H : ARG NH1 B0466 <- 2.95 -> DG N7 C0012 : score 5.8685 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.71 -> DG O6 C0012 : score 6.7188 : V : VAL CG1 A0462 <- 3.64 -> DT C7 D0013 : score 6.30293 A : V : VAL CG2 B0462 <- 3.89 -> DT C7 C0013 : score 5.98531 : x : HIS xxxx B0451 <- 4.21 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx >3fyl_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN:CGT COMPLEX organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ B0461 <- 2.94 -> DG N7 D0003 : score 5.23509 : H : ARG NH1 B0466 <- 2.95 -> DG N7 C0012 : score 5.8685 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.71 -> DG O6 C0012 : score 6.7188 : V : VAL CG2 B0462 <- 3.89 -> DT C7 C0013 : score 5.98531 : x : HIS xxxx B0451 <- 4.21 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx >3g00_AB:DNase_I-like; title=MTH0212 IN COMPLEX WITH A 9BP BLUNT END DSDNA AT 1.7 ANGSTROM organism=METHANOTHERMOBACTER THERMAUTOTROPHICUS : w : ASN OD1 A0012 <- 5.99 -> DT O2 H0003 : score 1.953 : w : ASN ND2 A0012 <- 5.81 -> DG N3 H0002 : score 2.566 : w : LYS NZ A0040 <- 6.17 -> DT O2 H0003 : score 0.522 : w : LYS NZ A0040 <- 5.71 -> DC O2 I0008 : score 1.3 : w : SER OG A0207 <- 6.60 -> DC O2 H0001 : score 1.768 : w : ASP OD2 A0247 <- 5.87 -> DG N2 I0009 : score 1.62 : w : ASN OD1 B0012 <- 6.07 -> DT O2 I0003 : score 1.953 : w : ASN ND2 B0012 <- 5.71 -> DG N3 I0002 : score 2.566 : w : LYS NZ B0040 <- 6.01 -> DT O2 I0003 : score 0.522 : w : LYS NZ B0040 <- 5.36 -> DC O2 H0008 : score 1.3 : w : SER OG B0207 <- 6.45 -> DC O2 I0001 : score 1.768 : w : ASP OD2 B0247 <- 5.98 -> DG N2 H0009 : score 1.62 : x : TYR xxxx A0208 <- 3.57 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0209 <- 3.11 -> DG xxx I0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0208 <- 3.58 -> DC xxx I0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0209 <- 3.11 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx >3g00_B:DNase_I-like; title=MTH0212 IN COMPLEX WITH A 9BP BLUNT END DSDNA AT 1.7 ANGSTROM organism=METHANOTHERMOBACTER THERMAUTOTROPHICUS : w : ASN OD1 B0012 <- 6.07 -> DT O2 I0003 : score 1.953 : w : ASN ND2 B0012 <- 5.71 -> DG N3 I0002 : score 2.566 : w : LYS NZ B0040 <- 6.01 -> DT O2 I0003 : score 0.522 : w : LYS NZ B0040 <- 5.36 -> DC O2 H0008 : score 1.3 : w : SER OG B0207 <- 6.45 -> DC O2 I0001 : score 1.768 : w : ASP OD2 B0247 <- 5.98 -> DG N2 H0009 : score 1.62 : x : TYR xxxx B0208 <- 3.58 -> DC xxx I0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0209 <- 3.11 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx >3g0q_A:Nudix;DNA-glycosylase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MUTY BOUND TO ITS INHIBITOR DNA organism=Bacillus Stearothermophilus : w : ARG NH2 A0050 <- 5.14 -> DG N2 B0009 : score 1.593 : x : GLN xxxx A0048 <- 3.49 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0088 <- 3.19 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0164 <- 3.57 -> DA xxx B0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0308 <- 3.90 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0309 <- 3.84 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >3g0r_AB:DNase_I-like; title=COMPLEX OF MTH0212 AND AN 8BP DSDNA WITH DISTORTED ENDS organism=METHANOTHERMOBACTER THERMAUTOTROPHICUS : w : ASN ND2 A0012 <- 5.28 -> DT O2 K0004 : score 1.666 : H : LYS NZ A0040 <- 3.37 -> DG N3 K0005 : score 1.28811 : w : LYS NZ A0040 <- 5.51 -> DA N3 G0008 : score 1.538 : w : ASP OD2 A0247 <- 5.42 -> DG N3 G0009 : score 2.312 : w : ASN ND2 B0012 <- 5.51 -> DT O2 G0003 : score 1.666 : H : LYS NZ B0040 <- 3.39 -> DG N3 G0004 : score 1.28229 : w : LYS NZ B0040 <- 5.50 -> DA N3 K0009 : score 1.538 : w : LYS NZ B0116 <- 5.87 -> DC O2 K0011 : score 1.3 : w : ASP OD2 B0247 <- 6.11 -> DG N3 K0010 : score 2.312 : x : MET xxxx A0117 <- 3.63 -> DA xxx G0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0208 <- 3.29 -> DC xxx K0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0114 <- 3.64 -> DC xxx K0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0117 <- 4.07 -> DA xxx K0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0205 <- 3.54 -> DC xxx K0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0207 <- 4.19 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0208 <- 3.35 -> DG xxx K0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0209 <- 3.18 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx >3g0r_B:DNase_I-like; title=COMPLEX OF MTH0212 AND AN 8BP DSDNA WITH DISTORTED ENDS organism=METHANOTHERMOBACTER THERMAUTOTROPHICUS : w : ASN ND2 B0012 <- 5.51 -> DT O2 G0003 : score 1.666 : H : LYS NZ B0040 <- 3.39 -> DG N3 G0004 : score 1.28229 : w : LYS NZ B0040 <- 5.50 -> DA N3 K0009 : score 1.538 : w : LYS NZ B0116 <- 5.87 -> DC O2 K0011 : score 1.3 : w : ASP OD2 B0247 <- 6.11 -> DG N3 K0010 : score 2.312 : x : ASN xxxx B0114 <- 3.64 -> DC xxx K0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0117 <- 4.07 -> DA xxx K0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0205 <- 3.54 -> DC xxx K0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0207 <- 4.19 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0208 <- 3.35 -> DG xxx K0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0209 <- 3.18 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx >3g2d_B:DNase_I-like; title=COMPLEX OF MTH0212 AND A 4 BP DSDNA WITH 3'-OVERHANG organism=METHANOTHERMOBACTER THERMAUTOTROPHICUS : w : ASN ND2 B0012 <- 6.07 -> DG N3 H0007 : score 2.566 : w : LYS NZ B0040 <- 5.91 -> DG N3 H0006 : score 2.232 : w : ASP OD2 B0247 <- 5.96 -> DG N2 H0007 : score 1.62 : x : TYR xxxx B0208 <- 3.42 -> DC xxx I0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0209 <- 3.56 -> DC xxx I0001 : score x.xxxxx >3g38_A:DNase_I-like; title=THE CATALYTICALLY INACTIVE MUTANT MTH0212 (D151N) IN COMPLEX WITH AN 8 BP DSDNA organism=METHANOTHERMOBACTER THERMAUTOTROPHICUS : w : ASN ND2 A0012 <- 5.76 -> DG N3 K0002 : score 2.566 : x : LYS xxxx A0040 <- 3.85 -> DG xxx K0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0117 <- 3.04 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0208 <- 2.85 -> DC xxx K0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0209 <- 3.61 -> DC xxx K0001 : score x.xxxxx >3g3c_A:DNase_I-like; title=MTH0212 (WT) IN COMPLEX WITH A 6BP DSDNA CONTAINING A SINGLE ONE NUCLEOTIDE LONG 3'-OVERHANG organism=METHANOTHERMOBACTER THERMAUTOTROPHICUS : H : LYS NZ A0040 <- 2.93 -> DT O2 H0003 : score 3.49391 : x : TYR xxxx A0208 <- 4.08 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0209 <- 3.15 -> DG xxx I0009 : score x.xxxxx >3g3c_AB:DNase_I-like; title=MTH0212 (WT) IN COMPLEX WITH A 6BP DSDNA CONTAINING A SINGLE ONE NUCLEOTIDE LONG 3'-OVERHANG organism=METHANOTHERMOBACTER THERMAUTOTROPHICUS : H : LYS NZ A0040 <- 2.93 -> DT O2 H0003 : score 3.49391 : x : TYR xxxx A0208 <- 4.08 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0209 <- 3.15 -> DG xxx I0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0208 <- 4.42 -> DT xxx I0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0209 <- 2.84 -> DA xxx H0007 : score x.xxxxx >3g4t_A:DNase_I-like; title=MTH0212 (WT) IN COMPLEX WITH A 7BP DSDNA organism=METHANOTHERMOBACTER THERMAUTOTROPHICUS : H : LYS NZ A0040 <- 3.42 -> DC O2 I0005 : score 2.58083 : x : TYR xxxx A0208 <- 3.51 -> DT xxx I0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0209 <- 2.83 -> DA xxx H0007 : score x.xxxxx >3g4t_AB:DNase_I-like; title=MTH0212 (WT) IN COMPLEX WITH A 7BP DSDNA organism=METHANOTHERMOBACTER THERMAUTOTROPHICUS : H : LYS NZ A0040 <- 3.42 -> DC O2 I0005 : score 2.58083 : x : TYR xxxx A0208 <- 3.51 -> DT xxx I0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0209 <- 2.83 -> DA xxx H0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0040 <- 3.83 -> DT xxx H0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0208 <- 3.62 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0209 <- 2.78 -> DG xxx I0009 : score x.xxxxx >3g6p_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN:FKBP5 COMPLEX, 18BP organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 2.93 -> DG N7 C0004 : score 5.24586 : H : ARG NH1 A0466 <- 3.07 -> DG N7 D0013 : score 5.7233 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.96 -> DG O6 D0013 : score 6.3888 : x : VAL xxxx A0462 <- 3.75 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0510 <- 3.60 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx >3g6p_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN:FKBP5 COMPLEX, 18BP organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 2.93 -> DG N7 C0004 : score 5.24586 : H : ARG NH1 A0466 <- 3.07 -> DG N7 D0013 : score 5.7233 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.96 -> DG O6 D0013 : score 6.3888 : H : LYS NZ B0461 <- 3.00 -> DG N7 D0004 : score 5.17046 : H : ARG NH1 B0466 <- 3.04 -> DG N7 C0013 : score 5.7596 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.99 -> DG O6 C0013 : score 6.3492 : w : ARG NH2 B0466 <- 6.58 -> DA N6 D0006 : score 1.997 : H : ARG NH1 B0510 <- 3.29 -> DC O2 D0002 : score 3.2923 : H : ARG NH2 B0510 <- 3.32 -> DC O2 D0002 : score 3.31405 : x : VAL xxxx A0462 <- 3.75 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0510 <- 3.60 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0462 <- 3.61 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx >3g6q_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN:FKBP5 BINDING SITE COMPLEX-9 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 2.96 -> DG N7 C0003 : score 5.21355 : H : ARG NH1 A0466 <- 2.92 -> DG N7 D0012 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.74 -> DG O6 D0012 : score 6.6792 : x : VAL xxxx A0462 <- 3.94 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx >3g6q_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN:FKBP5 BINDING SITE COMPLEX-9 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 2.96 -> DG N7 C0003 : score 5.21355 : H : ARG NH1 A0466 <- 2.92 -> DG N7 D0012 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.74 -> DG O6 D0012 : score 6.6792 : H : LYS NZ B0461 <- 2.75 -> DG N7 D0003 : score 5.43976 : H : ARG NH1 B0466 <- 3.09 -> DG N7 C0012 : score 5.6991 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.70 -> DG O6 C0012 : score 6.732 : x : VAL xxxx B0462 <- 3.90 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0462 <- 3.94 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx >3g6r_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN:FKBP5 COMPLEX-52, 18BP organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 3.31 -> DG N7 D0004 : score 4.83654 : H : ARG NH1 A0466 <- 3.02 -> DG N7 C0013 : score 5.7838 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.76 -> DG O6 C0013 : score 6.6528 : H : ARG NH2 A0510 <- 2.73 -> DC O2 D0002 : score 3.7505 : V : VAL CG1 A0462 <- 3.83 -> DT C7 C0014 : score 6.01506 >3g6r_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN:FKBP5 COMPLEX-52, 18BP organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 3.31 -> DG N7 D0004 : score 4.83654 : H : ARG NH1 A0466 <- 3.02 -> DG N7 C0013 : score 5.7838 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.76 -> DG O6 C0013 : score 6.6528 : H : ARG NH2 A0510 <- 2.73 -> DC O2 D0002 : score 3.7505 : H : LYS NZ B0461 <- 2.70 -> DG N7 C0004 : score 5.49362 : H : ARG NH1 B0466 <- 2.91 -> DG N7 D0013 : score 5.9169 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.78 -> DG O6 D0013 : score 6.6264 : V : VAL CG1 A0462 <- 3.83 -> DT C7 C0014 : score 6.01506 : x : VAL xxxx B0462 <- 3.98 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx >3g6t_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR GAMMA DNA-BINDING DOMAIN:FKBP5 16BP COMPLEX-34 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 2.90 -> DG N7 C0003 : score 5.27818 : H : ARG NH1 A0466 <- 3.10 -> DG N7 D0012 : score 5.687 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.80 -> DG O6 D0012 : score 6.6 : x : VAL xxxx A0462 <- 3.94 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx >3g6t_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR GAMMA DNA-BINDING DOMAIN:FKBP5 16BP COMPLEX-34 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 2.90 -> DG N7 C0003 : score 5.27818 : H : ARG NH1 A0466 <- 3.10 -> DG N7 D0012 : score 5.687 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.80 -> DG O6 D0012 : score 6.6 : H : ARG NH1 B0466 <- 3.02 -> DG N7 C0012 : score 5.7838 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.82 -> DG O6 C0012 : score 6.5736 : w : LYS NZ B0491 <- 5.74 -> DG N3 C0010 : score 2.232 : x : VAL xxxx A0462 <- 3.94 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0461 <- 3.22 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0462 <- 3.83 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >3g6u_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA-BINDING DOMAIN:FKBP5 16BP COMPLEX-49 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 2.79 -> DG N7 C0003 : score 5.39667 : H : ARG NH1 A0466 <- 2.92 -> DG N7 D0012 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.81 -> DG O6 D0012 : score 6.5868 : w : ARG NH2 A0466 <- 5.84 -> DA N6 C0005 : score 1.997 : H : LYS NZ B0461 <- 2.72 -> DG N7 D0003 : score 5.47207 : H : ARG NH1 B0466 <- 3.08 -> DG N7 C0012 : score 5.7112 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.86 -> DG O6 C0012 : score 6.5208 : x : VAL xxxx A0462 <- 3.79 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0462 <- 3.93 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >3g6u_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA-BINDING DOMAIN:FKBP5 16BP COMPLEX-49 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ B0461 <- 2.72 -> DG N7 D0003 : score 5.47207 : H : ARG NH1 B0466 <- 3.08 -> DG N7 C0012 : score 5.7112 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.86 -> DG O6 C0012 : score 6.5208 : x : VAL xxxx B0462 <- 3.93 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >3g6v_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA SYNTHESIS ACROSS AN ABASIC LESION BY HUMAN DNA POLYMERASE-IOTA organism=Homo sapiens : w : TYR OH A0039 <- 5.63 -> DG N3 T0841 : score 3.344 : w : TYR OH A0039 <- 5.88 -> DG N2 T0841 : score 2.834 : w : GLN NE2 A0059 <- 6.05 -> DG N3 T0841 : score 1.484 : x : GLU xxxx A0305 <- 3.57 -> DG xxx T0842 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 4.18 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >3g6x_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE IOTA:DNA:DGTP WITH AN ABASIC SITE AT THE TEMPLATING POSITION organism=Homo sapiens : w : GLU OE1 A0305 <- 6.46 -> DG N7 T0842 : score 1.976 : x : SER xxxx A0301 <- 4.38 -> DT xxx T0844 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 4.40 -> DG xxx P0868 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0359 <- 4.33 -> DG xxx P0868 : score x.xxxxx >3g6y_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE IOTA:DNA:DTTP WITH AN ABASIC SITE AT THE TEMPLATING POSITION organism=Homo sapiens : w : TYR OH A0039 <- 5.55 -> DG N3 T0841 : score 3.344 : w : TYR OH A0039 <- 5.64 -> DG N2 T0841 : score 2.834 : w : GLN NE2 A0059 <- 5.98 -> DG N3 T0841 : score 1.484 : x : SER xxxx A0301 <- 4.38 -> DT xxx T0844 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0305 <- 3.73 -> DG xxx T0842 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 4.49 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >3g73_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE FOXM1 DNA BINDING organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 A0283 <- 3.19 -> DA N6 C0013 : score 5.55209 : H : ASN ND2 A0283 <- 2.86 -> DA N7 C0013 : score 5.80007 : w : ASN OD1 A0283 <- 5.35 -> DT O4 D0010 : score 3.132 : w : ASN OD1 A0283 <- 6.14 -> DA N6 C0012 : score 2.837 : H : ARG NE A0286 <- 3.26 -> DG N7 D0009 : score 4.01499 : H : HIS ND1 A0287 <- 3.03 -> DT O4 D0011 : score 4.50337 : V : SER CB A0284 <- 3.87 -> DT C7 C0011 : score 3.07648 : x : SER xxxx A0290 <- 3.59 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >3g73_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE FOXM1 DNA BINDING organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 A0283 <- 3.19 -> DA N6 C0013 : score 5.55209 : H : ASN ND2 A0283 <- 2.86 -> DA N7 C0013 : score 5.80007 : w : ASN OD1 A0283 <- 5.35 -> DT O4 D0010 : score 3.132 : w : ASN OD1 A0283 <- 6.14 -> DA N6 C0012 : score 2.837 : H : ARG NE A0286 <- 3.26 -> DG N7 D0009 : score 4.01499 : H : HIS ND1 A0287 <- 3.03 -> DT O4 D0011 : score 4.50337 : H : HIS ND1 B0287 <- 2.95 -> DT O4 C0008 : score 4.5789 : V : SER CB A0284 <- 3.87 -> DT C7 C0011 : score 3.07648 : x : SER xxxx A0290 <- 3.59 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0284 <- 3.62 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0286 <- 3.39 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0290 <- 3.61 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0291 <- 4.13 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >3g8u_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=DNA BINDING DOMAIN:GILZ 16BP COMPLEX-5 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 3.13 -> DG N7 C0003 : score 5.03043 : w : LYS NZ A0461 <- 5.60 -> DT O4 D0014 : score 1.7 : H : ARG NH1 A0466 <- 3.15 -> DG N7 D0012 : score 5.6265 : H : ARG NH2 A0466 <- 3.13 -> DG O6 D0012 : score 6.1644 : x : VAL xxxx A0462 <- 4.17 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx >3g8u_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=DNA BINDING DOMAIN:GILZ 16BP COMPLEX-5 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 3.13 -> DG N7 C0003 : score 5.03043 : w : LYS NZ A0461 <- 5.60 -> DT O4 D0014 : score 1.7 : H : ARG NH1 A0466 <- 3.15 -> DG N7 D0012 : score 5.6265 : H : ARG NH2 A0466 <- 3.13 -> DG O6 D0012 : score 6.1644 : H : LYS NZ B0461 <- 2.90 -> DG N7 D0003 : score 5.27818 : H : ARG NH1 B0466 <- 3.15 -> DG N7 C0012 : score 5.6265 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.99 -> DG O6 C0012 : score 6.3492 : V : VAL CG1 B0462 <- 3.74 -> DT C7 C0013 : score 6.15142 : x : VAL xxxx A0462 <- 4.17 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx >3g8x_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN:GILZ 16BP COMPLEX-65 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 2.95 -> DG N7 C0003 : score 5.22432 : H : ARG NH1 A0466 <- 3.02 -> DG N7 D0012 : score 5.7838 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.95 -> DG O6 D0012 : score 6.402 : w : ARG NH2 A0466 <- 6.31 -> DA N6 C0005 : score 1.997 : x : VAL xxxx A0462 <- 3.91 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx >3g8x_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN:GILZ 16BP COMPLEX-65 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 2.95 -> DG N7 C0003 : score 5.22432 : H : ARG NH1 A0466 <- 3.02 -> DG N7 D0012 : score 5.7838 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.95 -> DG O6 D0012 : score 6.402 : w : ARG NH2 A0466 <- 6.31 -> DA N6 C0005 : score 1.997 : H : LYS NZ B0461 <- 2.84 -> DG N7 D0003 : score 5.34281 : H : ARG NH1 B0466 <- 3.36 -> DG N7 C0012 : score 5.3724 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.89 -> DG O6 C0012 : score 6.4812 : V : VAL CG1 B0462 <- 3.53 -> DT C7 C0013 : score 6.4696 : x : VAL xxxx A0462 <- 3.91 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0451 <- 4.49 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx >3g97_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA-BINDING DOMAIN:GILZ 16BP COMPLEX-9 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 2.93 -> DG N7 C0003 : score 5.24586 : H : ARG NH1 A0466 <- 2.87 -> DG N7 D0012 : score 5.9653 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.95 -> DG O6 D0012 : score 6.402 : V : VAL CG2 A0462 <- 3.79 -> DT C7 D0013 : score 6.13838 >3g97_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA-BINDING DOMAIN:GILZ 16BP COMPLEX-9 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 2.93 -> DG N7 C0003 : score 5.24586 : H : ARG NH1 A0466 <- 2.87 -> DG N7 D0012 : score 5.9653 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.95 -> DG O6 D0012 : score 6.402 : H : LYS NZ B0461 <- 3.14 -> DG N7 D0003 : score 5.01966 : H : ARG NH1 B0466 <- 3.05 -> DG N7 C0012 : score 5.7475 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.83 -> DG O6 C0012 : score 6.5604 : V : VAL CG2 A0462 <- 3.79 -> DT C7 D0013 : score 6.13838 : x : VAL xxxx B0462 <- 3.36 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >3g99_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN:PAL COMPLEX-9 organism=Rattus norvegicus : H : ARG NH1 A0466 <- 3.03 -> DG N7 D0012 : score 5.7717 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.80 -> DG O6 D0012 : score 6.6 : H : LYS NZ B0461 <- 3.16 -> DG N7 D0003 : score 4.99811 : H : ARG NH1 B0466 <- 2.89 -> DG N7 C0012 : score 5.9411 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.78 -> DG O6 C0012 : score 6.6264 : V : VAL CG1 A0462 <- 3.72 -> DT C7 D0013 : score 6.18172 : x : LYS xxxx A0461 <- 3.23 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0462 <- 3.29 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >3g99_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN:PAL COMPLEX-9 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ B0461 <- 3.16 -> DG N7 D0003 : score 4.99811 : H : ARG NH1 B0466 <- 2.89 -> DG N7 C0012 : score 5.9411 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.78 -> DG O6 C0012 : score 6.6264 : x : VAL xxxx B0462 <- 3.29 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >3g9i_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN: PAL COMPLEX-35 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 2.77 -> DG N7 C0003 : score 5.41821 : H : ARG NH1 A0466 <- 2.96 -> DG N7 D0012 : score 5.8564 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.73 -> DG O6 D0012 : score 6.6924 : x : VAL xxxx A0462 <- 4.06 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx >3g9i_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN: PAL COMPLEX-35 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 2.77 -> DG N7 C0003 : score 5.41821 : H : ARG NH1 A0466 <- 2.96 -> DG N7 D0012 : score 5.8564 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.73 -> DG O6 D0012 : score 6.6924 : H : LYS NZ B0461 <- 3.21 -> DG N7 D0003 : score 4.94425 : w : LYS NZ B0461 <- 5.52 -> DT O4 C0014 : score 1.7 : H : ARG NH1 B0466 <- 3.01 -> DG N7 C0012 : score 5.7959 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.74 -> DG O6 C0012 : score 6.6792 : w : ARG NH2 B0466 <- 6.26 -> DA N6 D0005 : score 1.997 : V : VAL CG1 B0462 <- 3.78 -> DT C7 C0013 : score 6.09082 : x : VAL xxxx A0462 <- 4.06 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx >3g9j_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN:PAL, 18BP COMPLEX-36 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 2.93 -> DG N7 C0004 : score 5.24586 : H : ARG NH1 A0466 <- 2.98 -> DG N7 D0013 : score 5.8322 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.80 -> DG O6 D0013 : score 6.6 : x : VAL xxxx A0462 <- 4.09 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx >3g9j_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN:PAL, 18BP COMPLEX-36 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 2.93 -> DG N7 C0004 : score 5.24586 : H : ARG NH1 A0466 <- 2.98 -> DG N7 D0013 : score 5.8322 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.80 -> DG O6 D0013 : score 6.6 : H : LYS NZ B0461 <- 3.11 -> DG N7 D0004 : score 5.05197 : H : ARG NH1 B0466 <- 3.19 -> DG N7 C0013 : score 5.5781 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.94 -> DG O6 C0013 : score 6.4152 : w : ARG NH2 B0466 <- 6.60 -> DA N6 D0006 : score 1.997 : H : ARG NH2 B0510 <- 2.90 -> DC O2 D0002 : score 3.62474 : V : VAL CG1 B0462 <- 3.83 -> DT C7 C0014 : score 6.01506 : x : VAL xxxx A0462 <- 4.09 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx >3g9m_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA-BINDING DOMAIN:SGK 16BP COMPLEX-44 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0461 <- 2.63 -> DG N7 C0003 : score 5.56902 : w : LYS NZ A0461 <- 5.89 -> DT O4 D0013 : score 1.7 : H : ARG NH1 A0466 <- 3.00 -> DG N7 D0012 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.78 -> DG O6 D0012 : score 6.6264 : w : ARG NH2 A0466 <- 6.00 -> DA N6 C0005 : score 1.997 : H : LYS NZ B0461 <- 2.95 -> DG N7 D0003 : score 5.22432 : w : LYS NZ B0461 <- 6.05 -> DG O6 D0004 : score 3.005 : H : ARG NH1 B0466 <- 2.99 -> DG N7 C0012 : score 5.8201 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.78 -> DG O6 C0012 : score 6.6264 : w : ARG NH2 B0466 <- 6.16 -> DA N6 D0005 : score 1.997 : V : VAL CG1 A0462 <- 3.82 -> DT C7 D0013 : score 6.03021 : x : HIS xxxx B0451 <- 4.28 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0462 <- 4.02 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >3g9m_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA-BINDING DOMAIN:SGK 16BP COMPLEX-44 organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ B0461 <- 2.95 -> DG N7 D0003 : score 5.22432 : w : LYS NZ B0461 <- 6.02 -> DT O4 C0013 : score 1.7 : H : ARG NH1 B0466 <- 2.99 -> DG N7 C0012 : score 5.8201 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.78 -> DG O6 C0012 : score 6.6264 : w : ARG NH2 B0466 <- 6.16 -> DA N6 D0005 : score 1.997 : x : HIS xxxx B0451 <- 4.28 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0462 <- 4.02 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >3g9o_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA-BINDING DOMAIN:SGK 16BP COMPLEX-9 organism=Rattus norvegicus : w : LYS NZ A0461 <- 6.03 -> DC N4 D0014 : score 0.048 : H : ARG NH1 A0466 <- 3.00 -> DG N7 D0012 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.74 -> DG O6 D0012 : score 6.6792 : w : ARG NH2 A0466 <- 6.08 -> DA N6 C0005 : score 1.997 : H : ARG NH1 B0466 <- 3.05 -> DG N7 C0012 : score 5.7475 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.80 -> DG O6 C0012 : score 6.6 : w : ARG NH2 B0466 <- 6.28 -> DA N6 D0005 : score 1.997 : x : LYS xxxx B0461 <- 3.09 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0462 <- 3.99 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0462 <- 3.92 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx >3g9o_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA-BINDING DOMAIN:SGK 16BP COMPLEX-9 organism=Rattus norvegicus : H : ARG NH1 B0466 <- 3.05 -> DG N7 C0012 : score 5.7475 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.80 -> DG O6 C0012 : score 6.6 : w : ARG NH2 B0466 <- 6.28 -> DA N6 D0005 : score 1.997 : x : LYS xxxx B0461 <- 3.09 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0462 <- 3.99 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >3g9p_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN:SGK 16BP COMPLEX-7 organism=Rattus norvegicus : w : LYS NZ A0461 <- 6.03 -> DC N4 D0014 : score 0.048 : H : ARG NH1 A0466 <- 3.00 -> DG N7 D0012 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.74 -> DG O6 D0012 : score 6.6792 : w : ARG NH2 A0466 <- 6.08 -> DA N6 C0005 : score 1.997 : H : ARG NH1 B0466 <- 3.05 -> DG N7 C0012 : score 5.7475 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.80 -> DG O6 C0012 : score 6.6 : w : ARG NH2 B0466 <- 6.28 -> DA N6 D0005 : score 1.997 : x : LYS xxxx B0461 <- 3.09 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0462 <- 3.99 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0462 <- 3.92 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx >3g9p_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN:SGK 16BP COMPLEX-7 organism=Rattus norvegicus : H : ARG NH1 B0466 <- 3.05 -> DG N7 C0012 : score 5.7475 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.80 -> DG O6 C0012 : score 6.6 : w : ARG NH2 B0466 <- 6.28 -> DA N6 D0005 : score 1.997 : x : LYS xxxx B0461 <- 3.09 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0462 <- 3.99 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >3ga6_A:DNase_I-like; title=MTH0212 IN COMPLEX WITH TWO DNA HELICES organism=METHANOTHERMOBACTER THERMAUTOTROPHICUS : H : THR OG1 A1210 <- 3.15 -> DC O2 F0002 : score 2.44185 : w : THR OG1 A1210 <- 5.24 -> DC O2 D0012 : score 2.048 : x : LYS xxxx A1116 <- 3.86 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1207 <- 4.42 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1209 <- 3.28 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx >3gat_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE C-TERMINAL DOMAIN OF CHICKEN GATA-1 BOUND TO DNA, 34 STRUCTURES organism=GALLUS GALLUS : H : LYS NZ A0057 <- 2.79 -> DT O2 B0109 : score 3.59435 : V : LEU CB A0033 <- 3.70 -> DT C7 C0123 : score 4.50895 : x : THR xxxx A0016 <- 2.81 -> DT xxx C0125 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0017 <- 2.69 -> DG xxx B0107 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0019 <- 2.97 -> DG xxx B0107 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0029 <- 3.57 -> DA xxx C0124 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0037 <- 4.13 -> DT xxx C0122 : score x.xxxxx >3gdx_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;DNA_polymerase_beta-like,_second_domain; title=DNA POLYMERASE BETA WITH A GAPPED DND SUBSTRATE AND DTMP(CF2)PP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.24 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.33 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.60 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3gii_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 EXTENSION TERNARY COMPLEX WITH DISORDERED A OPPOSITE AN OXOG IN ANTI CONFORMATION organism=Sulfolobus solfataricus P2 : w : SER OG A0297 <- 6.75 -> DG N7 D0809 : score 2.749 : x : HIS xxxx A0285 <- 3.85 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.63 -> DT xxx E0908 : score x.xxxxx >3gij_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 EXTENSION TERNARY COMPLEX WITH OXOG(SYN)-A(ANTI) AND OXOG(ANTI)- A(SYN) PAIRS organism=Sulfolobus solfataricus P2 : w : SER OG A0297 <- 6.47 -> DG N7 D0809 : score 2.749 : x : HIS xxxx A0285 <- 3.37 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.34 -> DT xxx E0908 : score x.xxxxx >3gik_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 EXTENSION TERNARY COMPLEX WITH THE OXOG(ANTI)-C(ANTI) PAIR organism=Sulfolobus solfataricus P2 : x : HIS xxxx A0285 <- 3.97 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.53 -> DT xxx E0908 : score x.xxxxx >3gil_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 EXTENSION TERNARY COMPLEX WITH OXOG(ANTI)-T(ANTI) PAIR organism=Sulfolobus solfataricus P2 : w : ARG NH2 B1336 <- 5.60 -> DG O6 H1809 : score 2.468 : x : HIS xxxx B1285 <- 3.48 -> DT xxx H1808 : score x.xxxxx >3gim_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 EXTENSION TERNARY COMPLEX WITH OXOG(ANTI)-G(SYN) PAIR organism=Sulfolobus solfataricus P2 : w : SER OG A0244 <- 6.79 -> DA N7 E0909 : score 2.343 : x : HIS xxxx A0285 <- 4.03 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.04 -> DT xxx E0908 : score x.xxxxx >3glf_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;DNA_polymerase_III_clamp_loader_subunits,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ECOLI CLAMP LOADER BOUND TO PRIMER-TEMPLATE DNA organism=ESCHERICHIA COLI : x : TYR xxxx A0316 <- 3.62 -> DA xxx L0010 : score x.xxxxx >3glf_ABCDE:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;DNA_polymerase_III_clamp_loader_subunits,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ECOLI CLAMP LOADER BOUND TO PRIMER-TEMPLATE DNA organism=ESCHERICHIA COLI : x : TYR xxxx A0316 <- 3.62 -> DA xxx L0010 : score x.xxxxx >3glf_FGHIJ:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;DNA_polymerase_III_clamp_loader_subunits,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ECOLI CLAMP LOADER BOUND TO PRIMER-TEMPLATE DNA organism=ESCHERICHIA COLI : x : TYR xxxx F0316 <- 3.24 -> DA xxx N0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0100 <- 4.43 -> DA xxx M0014 : score x.xxxxx >3glg_ABCDE:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;DNA_polymerase_III_clamp_loader_subunits,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MUTANT (GAMMAT157A) E. COLI CLAMP LOADER BOUND TO PRIMER-TEMPLATE DNA organism=ESCHERICHIA COLI : x : TYR xxxx A0316 <- 3.48 -> DA xxx L0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0100 <- 4.45 -> DA xxx K0019 : score x.xxxxx >3glg_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;DNA_polymerase_III_clamp_loader_subunits,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MUTANT (GAMMAT157A) E. COLI CLAMP LOADER BOUND TO PRIMER-TEMPLATE DNA organism=ESCHERICHIA COLI : x : LYS xxxx B0100 <- 4.45 -> DA xxx K0019 : score x.xxxxx >3glg_FGHIJ:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;DNA_polymerase_III_clamp_loader_subunits,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MUTANT (GAMMAT157A) E. COLI CLAMP LOADER BOUND TO PRIMER-TEMPLATE DNA organism=ESCHERICHIA COLI : x : TYR xxxx F0316 <- 3.11 -> DA xxx N0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0100 <- 4.31 -> DA xxx M0019 : score x.xxxxx >3gli_ABCDE:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;DNA_polymerase_III_clamp_loader_subunits,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE E. COLI CLAMP LOADER BOUND TO PRIMER- TEMPLATE DNA AND PSI PEPTIDE organism=ESCHERICHIA COLI : x : TYR xxxx A0316 <- 3.53 -> DA xxx L0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0100 <- 4.39 -> DA xxx K0014 : score x.xxxxx >3gli_FGHIJ:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;DNA_polymerase_III_clamp_loader_subunits,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE E. COLI CLAMP LOADER BOUND TO PRIMER- TEMPLATE DNA AND PSI PEPTIDE organism=ESCHERICHIA COLI : x : TYR xxxx F0316 <- 3.06 -> DA xxx N0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0100 <- 4.14 -> DA xxx M0014 : score x.xxxxx >3gli_G:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;DNA_polymerase_III_clamp_loader_subunits,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE E. COLI CLAMP LOADER BOUND TO PRIMER- TEMPLATE DNA AND PSI PEPTIDE organism=? : x : LYS xxxx G0100 <- 4.14 -> DA xxx M0014 : score x.xxxxx >3gna_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAG1 NONAMER-BINDING DOMAIN WITH DNA organism=Mus musculus : x : ARG xxxx A0391 <- 3.52 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0402 <- 3.48 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0405 <- 3.53 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >3gnb_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAG1 NONAMER-BINDING DOMAIN WITH DNA organism=Mus musculus : x : ARG xxxx A0391 <- 3.37 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0402 <- 3.54 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0405 <- 3.61 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >3go8_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM ENCOUNTERING AN INTRAHELICAL 8-OXOGUANINE (OXOG) LESION IN EC3- LOOP DELETION COMPLEX organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NE A0076 <- 3.00 -> DG N3 C0009 : score 1.68492 : H : ARG NH1 A0112 <- 3.06 -> DG N3 B0011 : score 2.89383 : x : PHE xxxx A0114 <- 3.36 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 3.29 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx >3gox_A:His-Me_finger_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE BETA-BETA-ALPHA-ME TYPE II RESTRICTION ENDONUCLEASE HPY99I IN THE ABSENCE OF EDTA organism=Helicobacter pylori : w : GLU OE1 A0081 <- 5.97 -> DT O4 C-003 : score 2.749 : H : ASN ND2 A0083 <- 2.99 -> DG O6 D0002 : score 5.4242 : w : ASN ND2 A0083 <- 5.94 -> DT O4 C-003 : score 3.275 : H : GLN NE2 A0084 <- 2.86 -> DG O6 C-001 : score 5.73547 : H : ARG NH1 A0094 <- 3.06 -> DG N7 D0002 : score 5.7354 : H : ARG NH2 A0094 <- 3.20 -> DG N7 D0002 : score 5.87385 : H : ASP OD1 A0162 <- 3.13 -> DG N2 D0002 : score 4.8101 A : H : ARG NH1 A0170 <- 3.07 -> DC O2 D0001 : score 3.4529 : H : ARG NH2 A0170 <- 2.77 -> DT O2 D0000 : score 4.25873 : x : ILE xxxx A0082 <- 3.94 -> DT xxx C-003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0092 <- 4.27 -> DT xxx D0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0101 <- 4.33 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0166 <- 3.29 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx >3gox_AB:His-Me_finger_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE BETA-BETA-ALPHA-ME TYPE II RESTRICTION ENDONUCLEASE HPY99I IN THE ABSENCE OF EDTA organism=Helicobacter pylori : w : GLU OE1 A0081 <- 5.97 -> DT O4 C-003 : score 2.749 : H : ASN ND2 A0083 <- 2.99 -> DG O6 D0002 : score 5.4242 : w : ASN ND2 A0083 <- 5.94 -> DT O4 C-003 : score 3.275 : H : GLN NE2 A0084 <- 2.86 -> DG O6 C-001 : score 5.73547 : H : ARG NH1 A0094 <- 3.06 -> DG N7 D0002 : score 5.7354 : H : ARG NH2 A0094 <- 3.20 -> DG N7 D0002 : score 5.87385 : H : ASP OD1 A0162 <- 3.13 -> DG N2 D0002 : score 4.8101 A : H : ARG NH1 A0170 <- 3.07 -> DC O2 D0001 : score 3.4529 : H : ARG NH2 A0170 <- 2.77 -> DT O2 D0000 : score 4.25873 : H : ASN ND2 B0083 <- 2.94 -> DG O6 C0002 : score 5.48058 : H : GLN NE2 B0084 <- 2.84 -> DG O6 D-001 : score 5.75869 : H : ARG NH1 B0094 <- 3.05 -> DG N7 C0002 : score 5.7475 : H : ARG NH2 B0094 <- 3.21 -> DG N7 C0002 : score 5.86108 : H : ASP OD1 B0162 <- 3.11 -> DG N2 C0002 : score 4.8307 A : H : ARG NH1 B0170 <- 3.01 -> DC O2 C0001 : score 3.4967 : H : ARG NH2 B0170 <- 2.92 -> DA N3 C0000 : score 3.16199 : x : ILE xxxx A0082 <- 3.94 -> DT xxx C-003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0092 <- 4.27 -> DT xxx D0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0101 <- 4.33 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0166 <- 3.29 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0081 <- 3.73 -> DT xxx D-004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0101 <- 4.38 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0166 <- 3.31 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx >3gp1_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM ENCOUNTERING AN INTRAHELICAL 8-OXOGUANINE (OXOG) LESION IN EC3- V222P COMPLEX organism=Geobacillus stearothermophilus : w : ARG NH2 A0035 <- 6.04 -> DC O2 B0009 : score 1.669 : H : ARG NE A0076 <- 2.92 -> DG N3 C0009 : score 1.71301 : w : ARG NH2 A0076 <- 5.66 -> DA N3 C0010 : score 2.092 : H : ARG NH1 A0112 <- 2.95 -> DG N3 B0011 : score 2.96099 : w : ARG NH1 A0264 <- 5.86 -> DA N7 C0010 : score 0.388 : w : ARG NH2 A0264 <- 5.81 -> DA N7 C0010 : score 1.486 : x : PHE xxxx A0114 <- 3.35 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx >3gpl_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TERNARY COMPLEX OF RECD2 WITH DNA AND ADPNP organism=Deinococcus radiodurans R1 : H : GLN OE1 A0237 <- 2.78 -> DT N3 X0002 : score 3.42776 : H : GLN NE2 A0237 <- 2.72 -> DT O4 X0003 : score 5.27408 : w : ARG NH1 A0701 <- 5.69 -> DT O2 X0004 : score 1.855 >3gpl_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TERNARY COMPLEX OF RECD2 WITH DNA AND ADPNP organism=Deinococcus radiodurans R1 : H : GLN OE1 B0237 <- 2.75 -> DT N3 Y0002 : score 3.44824 : H : GLN NE2 B0237 <- 2.73 -> DT O4 Y0003 : score 5.2637 >3gpp_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM ENCOUNTERING AN INTRAHELICAL 8-OXOGUANINE (OXOG) LESION IN EC3- T224P COMPLEX organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NE A0076 <- 3.03 -> DG N3 C0009 : score 1.67439 : H : ARG NH2 A0112 <- 2.84 -> DG N3 B0011 : score 3.58137 : x : PHE xxxx A0114 <- 3.25 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 3.60 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx >3gpu_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM ENCOUNTERING AN INTRAHELICAL 8-OXOGUANINE (OXOG) LESION IN EC4- LOOP DELETION COMPLEX organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NE A0076 <- 2.89 -> DA N3 C0009 : score 2.06472 : H : ARG NH1 A0112 <- 2.98 -> DG N3 B0011 : score 2.94267 : w : ARG NH1 A0264 <- 5.50 -> DG N7 C0010 : score 2.063 : x : PHE xxxx A0114 <- 3.39 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx >3gpx_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=SEQUENCE-MATCHED MUTM INTERROGATION COMPLEX 4 (IC4) organism=Geobacillus stearothermophilus : w : ARG NH2 A0035 <- 6.39 -> DT O2 B0009 : score 2.261 : H : ARG NE A0076 <- 2.89 -> DA N3 C0009 : score 2.06472 : H : ARG NH1 A0112 <- 3.02 -> DG N3 B0011 : score 2.91825 : x : MET xxxx A0077 <- 3.57 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.26 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 3.27 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx >3gpy_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=SEQUENCE-MATCHED MUTM LESION RECOGNITION COMPLEX 3 (LRC3) organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NH1 A0076 <- 3.12 -> DG N3 C0009 : score 2.8572 : w : ARG NH1 A0076 <- 5.78 -> DA N3 C0010 : score 2.585 : w : GLU OE1 A0078 <- 5.65 -> DC O2 C0007 : score 2.68 : H : ARG NE A0112 <- 2.76 -> DC O2 B0010 : score 2.68025 : H : ARG NH1 A0112 <- 3.08 -> DC N3 B0010 : score 1.4511 : w : ARG NH2 A0112 <- 5.78 -> DC O2 C0007 : score 1.669 : x : MET xxxx A0077 <- 3.52 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.31 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0223 <- 4.43 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 4.12 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx >3gq3_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM ENCOUNTERING AN INTRAHELICAL 8-OXOGUANINE (OXOG) LESION IN EC5- LOOP DELETION COMPLEX organism=Geobacillus stearothermophilus : w : ARG NH1 A0035 <- 5.91 -> DC O2 B0008 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0035 <- 6.17 -> DC O2 B0008 : score 1.669 : H : ARG NE A0076 <- 2.90 -> DG N3 C0010 : score 1.72003 : w : GLU OE1 A0078 <- 6.44 -> DG N2 C0008 : score 1.283 : H : ARG NH1 A0112 <- 2.83 -> DC O2 B0010 : score 3.6281 : x : PHE xxxx A0114 <- 3.31 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 4.19 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx >3gq4_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=SEQUENCE-MATCHED MUTM LESION RECOGNITION COMPLEX 5 (LRC5) organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NH1 A0076 <- 3.15 -> DG N3 C0010 : score 2.83888 : H : ARG NH1 A0076 <- 3.15 -> DG N3 C0010 : score 2.83888 : w : GLU OE1 A0078 <- 5.83 -> DG N3 C0008 : score 2.669 : w : GLU OE1 A0078 <- 5.83 -> DG N2 C0008 : score 1.283 : H : ARG NE A0112 <- 2.76 -> DC O2 B0009 : score 2.68025 : H : ARG NH1 A0112 <- 3.02 -> DC N3 B0009 : score 1.46954 : w : ARG NH2 A0112 <- 5.91 -> DG N3 C0008 : score 0.677 : x : MET xxxx A0077 <- 3.59 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.30 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 3.39 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx >3gq5_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=SEQUENCE-MATCHED MUTM INTERROGATION COMPLEX 5 (IC5) organism=Geobacillus stearothermophilus : w : ARG NH1 A0035 <- 6.02 -> DC O2 B0008 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0076 <- 6.08 -> DT O2 C0011 : score 2.261 : w : GLU OE1 A0078 <- 5.35 -> DG N2 C0009 : score 1.283 : H : ARG NH2 A0112 <- 2.95 -> DC O2 B0010 : score 3.58776 : x : PHE xxxx A0114 <- 3.37 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 2.82 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx >3gqc_A:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURE OF HUMAN REV1-DNA-DNTP TERNARY COMPLEX organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0362 <- 3.96 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0715 <- 3.09 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx >3gtg_AE: title=BACKTRACKED RNA POLYMERASE II COMPLEX WITH 12MER RNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : HIS xxxx A1387 <- 4.23 -> DT xxx N0002 : score x.xxxxx >3gtk_ABE: title=BACKTRACKED RNA POLYMERASE II COMPLEX WITH 18MER RNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : HIS xxxx A1387 <- 4.18 -> DT xxx N0002 : score x.xxxxx >3gtm_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CO-COMPLEX OF BACKTRACKED RNA POLYMERASE II WITH TFIIS organism=? : x : LYS xxxx A0143 <- 4.33 -> DT xxx O0006 : score x.xxxxx >3gtm_ABE:Elongation_factor_TFIIS_domain_2;Zinc_beta-ribbon; title=CO-COMPLEX OF BACKTRACKED RNA POLYMERASE II WITH TFIIS organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : LYS xxxx A0143 <- 4.33 -> DT xxx O0006 : score x.xxxxx >3gtq_AB: title=BACKTRACKED RNA POLYMERASE II COMPLEX INDUCED BY DAMAGE organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : V : ALA CB A0832 <- 3.54 -> DT C7 T0018 : score 5.96291 : x : PHE xxxx A0252 <- 3.28 -> DT xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0257 <- 4.06 -> DC xxx T0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0317 <- 3.90 -> DC xxx T0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0350 <- 4.50 -> DT xxx T0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0447 <- 4.34 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.15 -> DC xxx T0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 3.60 -> DT xxx T0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1123 <- 4.24 -> DT xxx T0023 : score x.xxxxx >3gtq_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=BACKTRACKED RNA POLYMERASE II COMPLEX INDUCED BY DAMAGE organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : SER xxxx B1123 <- 4.24 -> DT xxx T0023 : score x.xxxxx >3gut_ABD:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A HIGHER-ORDER COMPLEX OF P50:RELA BOUND TO THE HIV-1 LTR organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0033 <- 3.30 -> DG N7 Y0018 : score 5.74615 : H : ARG NH2 B0354 <- 3.09 -> DG O6 X0004 : score 6.2172 : H : ARG NH2 B0356 <- 3.38 -> DG N7 X0003 : score 5.644 : H : LYS NZ B0541 <- 2.85 -> DT O4 Y0023 : score 3.55131 : H : ARG NH2 D0354 <- 3.28 -> DG O6 X0018 : score 5.9664 : H : ARG NH1 D0356 <- 3.16 -> DG O6 X0017 : score 5.64533 : H : ARG NH2 D0356 <- 3.35 -> DG N7 X0017 : score 5.68231 : H : HIS ND1 D0364 <- 3.03 -> DG N7 X0016 : score 5.93682 : H : LYS NZ D0541 <- 2.94 -> DG O6 Y0008 : score 5.61891 : x : ARG xxxx A0035 <- 3.38 -> DG xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0036 <- 3.60 -> DT xxx X0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0038 <- 3.64 -> DT xxx X0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0039 <- 3.44 -> DC xxx X0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0187 <- 3.06 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0357 <- 3.89 -> DG xxx Y0022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0360 <- 3.46 -> DC xxx Y0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0357 <- 4.04 -> DG xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0359 <- 3.92 -> DT xxx Y0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0360 <- 3.37 -> DT xxx Y0009 : score x.xxxxx >3gut_CF:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A HIGHER-ORDER COMPLEX OF P50:RELA BOUND TO THE HIV-1 LTR organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 C0033 <- 3.08 -> DG O6 Y0004 : score 6.2304 : H : ARG NH2 C0035 <- 3.47 -> DG N7 Y0003 : score 5.52908 : H : ARG NH2 F0354 <- 3.03 -> DG O6 I0004 : score 6.2964 : H : ARG NH1 F0356 <- 3.39 -> DG O6 I0003 : score 5.3655 : H : LYS NZ F0541 <- 2.77 -> DT O4 J0023 : score 3.6087 : V : ARG CZ C0187 <- 3.86 -> DT C7 X0022 : score 2.10032 : x : TYR xxxx C0036 <- 4.01 -> DT xxx X0023 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0038 <- 4.18 -> DT xxx X0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0039 <- 3.67 -> DT xxx X0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0357 <- 3.75 -> DG xxx J0022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0360 <- 3.45 -> DT xxx J0023 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0364 <- 4.21 -> DA xxx I0001 : score x.xxxxx >3gut_D:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A HIGHER-ORDER COMPLEX OF P50:RELA BOUND TO THE HIV-1 LTR organism=? : H : ARG NH2 D0354 <- 3.28 -> DG O6 X0018 : score 5.9664 : H : ARG NH1 D0356 <- 3.16 -> DG O6 X0017 : score 5.64533 : H : ARG NH2 D0356 <- 3.35 -> DG N7 X0017 : score 5.68231 : H : HIS ND1 D0364 <- 3.03 -> DG N7 X0016 : score 5.93682 : H : LYS NZ D0541 <- 2.94 -> DG O6 Y0008 : score 5.61891 : x : TYR xxxx D0357 <- 4.04 -> DG xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0359 <- 3.92 -> DT xxx Y0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0360 <- 3.37 -> DT xxx Y0009 : score x.xxxxx >3gut_EGH:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A HIGHER-ORDER COMPLEX OF P50:RELA BOUND TO THE HIV-1 LTR organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 E0033 <- 3.47 -> DG N7 J0018 : score 5.52908 : H : ARG NH2 H0354 <- 3.20 -> DG O6 I0018 : score 6.072 : H : LYS NZ H0541 <- 2.63 -> DT O4 J0009 : score 3.70914 : V : ARG CZ G0187 <- 3.54 -> DT C7 I0022 : score 2.27091 : x : ARG xxxx E0035 <- 3.46 -> DG xxx J0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0036 <- 3.64 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx E0038 <- 3.68 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0039 <- 3.54 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0187 <- 3.10 -> DT xxx I0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0033 <- 3.35 -> DA xxx J0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0035 <- 3.66 -> DG xxx J0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0036 <- 3.93 -> DT xxx I0022 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx G0038 <- 4.07 -> DT xxx I0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0039 <- 3.72 -> DT xxx I0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0356 <- 3.44 -> DG xxx I0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0357 <- 3.77 -> DG xxx J0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx H0359 <- 4.00 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0360 <- 3.69 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0364 <- 3.54 -> DG xxx I0016 : score x.xxxxx >3gv5_D:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE IOTA IN COMPLEX WITH T TEMPLATE DNA AND INCOMING DDADP organism=Homo sapiens : w : TYR OH D0039 <- 5.61 -> DC O2 F0841 : score 1.343 : w : GLN OE1 D0059 <- 5.28 -> DT O2 F0840 : score 2.481 : w : GLN NE2 D0059 <- 6.03 -> DC O2 F0841 : score 2.699 : w : GLN OE1 D0361 <- 6.14 -> DG N7 E0867 : score 2.87 : V : ARG CZ D0357 <- 3.52 -> DT C7 F0842 : score 2.28157 : x : LEU xxxx D0062 <- 4.37 -> DT xxx F0840 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0064 <- 3.60 -> DT xxx F0840 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0078 <- 3.87 -> DT xxx F0840 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0099 <- 4.32 -> DC xxx F0841 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0305 <- 3.48 -> DC xxx F0841 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0343 <- 4.00 -> DG xxx E0867 : score x.xxxxx >3gv7_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE IOTA IN COMPLEX WITH T TEMPLATE DNA AND INCOMING DTTP organism=Homo sapiens : w : TYR OH B0039 <- 5.50 -> DG N3 T0841 : score 3.344 : w : GLN NE2 B0059 <- 6.07 -> DG N3 T0841 : score 1.484 : w : GLU OE1 B0305 <- 5.84 -> DG N7 T0842 : score 1.976 : w : ARG NH2 B0343 <- 5.75 -> DG O6 P0868 : score 2.468 : w : ARG NH1 B0357 <- 5.38 -> DG N7 T0842 : score 2.063 : x : VAL xxxx B0064 <- 3.61 -> DT xxx T0840 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0078 <- 3.76 -> DT xxx T0840 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0361 <- 4.47 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >3gx4_X:Methylated_DNA-protein_cysteine_methyltransferase,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF S. POMBE ATL IN COMPLEX WITH DNA organism=Schizosaccharomyces pombe : w : ARG NH1 X0039 <- 5.90 -> DC N4 Y0208 : score 1.892 : x : GLN xxxx X0040 <- 3.22 -> DC xxx Z0222 : score x.xxxxx >3gxq_A: title=STRUCTURE OF ARTA AND DNA COMPLEX organism=Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300 : H : HIS ND1 A0020 <- 2.98 -> DG N7 D0006 : score 5.99905 : x : SER xxxx A0018 <- 3.59 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0022 <- 3.96 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx >3gxq_AB: title=STRUCTURE OF ARTA AND DNA COMPLEX organism=Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300 : H : HIS ND1 A0020 <- 2.98 -> DG N7 D0006 : score 5.99905 : H : HIS ND1 B0020 <- 2.87 -> DG N7 C0006 : score 6.13595 : x : SER xxxx A0018 <- 3.59 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0022 <- 3.96 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0022 <- 4.11 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx >3gyh_X:Methylated_DNA-protein_cysteine_methyltransferase,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF S. POMBE ATL IN COMPLEX WITH DAMAGED DNA CONTAINING POB organism=Schizosaccharomyces pombe : x : ARG xxxx X0039 <- 3.09 -> DC xxx Y0208 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx X0040 <- 3.20 -> DC xxx Z0222 : score x.xxxxx >3gz6_A:Nudix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SHEWANELLA ONEIDENSIS NRTR COMPLEXED WITH A 27MER DNA organism=Shewanella oneidensis : H : LYS NZ A0191 <- 2.91 -> DG N7 C0009 : score 5.26741 : H : ARG NH1 A0195 <- 2.71 -> DG N7 D0017 : score 6.1589 : H : ARG NH2 A0195 <- 3.03 -> DG O6 D0017 : score 6.2964 : H : ARG NH1 A0215 <- 2.89 -> DA N3 C0006 : score 3.61577 : x : GLN xxxx A0189 <- 3.57 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0192 <- 3.66 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0194 <- 3.83 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0233 <- 4.00 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx >3gz6_AB:Nudix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SHEWANELLA ONEIDENSIS NRTR COMPLEXED WITH A 27MER DNA organism=Shewanella oneidensis : H : LYS NZ A0191 <- 2.91 -> DG N7 C0009 : score 5.26741 : H : ARG NH1 A0195 <- 2.71 -> DG N7 D0017 : score 6.1589 : H : ARG NH2 A0195 <- 3.03 -> DG O6 D0017 : score 6.2964 : H : ARG NH1 A0215 <- 2.89 -> DA N3 C0006 : score 3.61577 : H : LYS NZ B0191 <- 2.94 -> DG N7 D0009 : score 5.23509 : H : ARG NH1 B0195 <- 2.71 -> DG N7 C0017 : score 6.1589 : H : ARG NH2 B0195 <- 3.18 -> DG O6 C0017 : score 6.0984 : H : ARG NH1 B0215 <- 2.95 -> DA N3 D0006 : score 3.57159 : x : GLN xxxx A0189 <- 3.57 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0192 <- 3.66 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0194 <- 3.83 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0233 <- 4.00 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0189 <- 3.49 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0192 <- 3.67 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0194 <- 3.77 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0216 <- 4.48 -> DT xxx C0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0233 <- 3.96 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx >3h0d_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CTSR IN COMPLEX WITH A 26BP DNA DUPLEX organism=BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : ARG NH1 A0028 <- 3.12 -> DG N7 C0018 : score 5.6628 : H : SER OG A0040 <- 2.67 -> DG O6 D0008 : score 4.19739 : H : ARG NH1 A0062 <- 3.07 -> DA N3 D0012 : score 3.48322 : w : ARG NH1 A0062 <- 6.09 -> DT O2 D0011 : score 1.855 : V : VAL CG2 A0038 <- 3.60 -> DT C7 D0007 : score 6.42923 : x : GLN xxxx A0041 <- 3.64 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0043 <- 3.68 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0044 <- 3.30 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx >3h0d_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CTSR IN COMPLEX WITH A 26BP DNA DUPLEX organism=BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : ARG NH1 A0028 <- 3.12 -> DG N7 C0018 : score 5.6628 : H : SER OG A0040 <- 2.67 -> DG O6 D0008 : score 4.19739 : H : ARG NH1 A0062 <- 3.07 -> DA N3 D0012 : score 3.48322 : w : ARG NH1 A0062 <- 6.09 -> DT O2 D0011 : score 1.855 : w : ARG NH2 B0028 <- 5.48 -> DG O6 C0008 : score 2.468 : H : SER OG B0040 <- 3.07 -> DT O4 C0009 : score 3.36315 : H : SER OG B0040 <- 2.67 -> DG O6 D0018 : score 4.19739 : w : SER OG B0040 <- 6.55 -> DT O4 D0017 : score 2.338 : H : ARG NE B0062 <- 3.14 -> DT O2 D0022 : score 2.40169 : V : VAL CG2 A0038 <- 3.60 -> DT C7 D0007 : score 6.42923 : x : GLN xxxx A0041 <- 3.64 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0043 <- 3.68 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0044 <- 3.30 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0038 <- 3.47 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0041 <- 3.48 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0043 <- 3.73 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0044 <- 3.21 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx >3h25_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF PRIMASE REPB' IN COMPLEX WITH INITIATOR DNA organism=Plasmid RSF1010 : x : MET xxxx A0035 <- 3.50 -> DG xxx C0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0037 <- 3.07 -> DG xxx C0027 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0050 <- 3.29 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0053 <- 3.47 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0054 <- 4.47 -> DG xxx C0027 : score x.xxxxx >3h3v_BC: title=YEAST RNAP II CONTAINING POLY(A)-SIGNAL SEQUENCE IN THE ACTIVE SITE organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 B1386 <- 3.38 -> DT O2 T0015 : score 3.80687 >3h40_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=BINARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA WITH TEMPLATE U/T organism=Homo sapiens : w : TYR OH A0039 <- 5.99 -> DG N3 T0841 : score 3.344 : w : TYR OH A0039 <- 5.97 -> DG N2 T0841 : score 2.834 : w : GLN OE1 A0059 <- 6.12 -> DG N3 T0841 : score 1.484 : x : GLU xxxx A0305 <- 3.68 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 4.20 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >3h4b_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA WITH TEMPLATE U/T AND INCOMING DATP organism=Homo sapiens : x : GLU xxxx A0305 <- 3.94 -> DG xxx T0842 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 4.19 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >3h4d_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA WITH TEMPLATE U/T AND INCOMING DGTP organism=Homo sapiens : w : GLU OE1 A0305 <- 5.48 -> DG N7 T0842 : score 1.976 : x : GLN xxxx A0361 <- 4.12 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >3h8o_A:Clavaminate_synthase-like; title=STRUCTURE DETERMINATION OF DNA METHYLATION LESIONS N1-MEA AND N3-MEC IN DUPLEX DNA USING A CROSS-LINKED HOST-GUEST SYSTEM organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0106 <- 5.77 -> DA N3 B0266 : score 2.619 : x : VAL xxxx A0101 <- 3.79 -> DA xxx B0266 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0102 <- 3.33 -> DT xxx C0278 : score x.xxxxx >3h8r_A:Clavaminate_synthase-like; title=STRUCTURE DETERMINATION OF DNA METHYLATION LESIONS N1-MEA AND N3-MEC IN DUPLEX DNA USING A CROSS-LINKED HOST-GUEST SYSTEM organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0106 <- 5.78 -> DA N3 B0266 : score 2.619 : x : VAL xxxx A0101 <- 3.62 -> DA xxx B0266 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0102 <- 3.16 -> DT xxx C0278 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0104 <- 3.48 -> DA xxx C0279 : score x.xxxxx >3h8x_A:Clavaminate_synthase-like; title=STRUCTURE DETERMINATION OF DNA METHYLATION LESIONS N1-MEA AND N3-MEC IN DUPLEX DNA USING A CROSS-LINKED HOST-GUEST SYSTEM organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0106 <- 5.68 -> DA N3 B0266 : score 2.619 : x : VAL xxxx A0101 <- 3.52 -> DA xxx B0266 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0102 <- 3.18 -> DT xxx C0278 : score x.xxxxx >3hdd_A:Homeodomain-like; title=ENGRAILED HOMEODOMAIN DNA COMPLEX organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 A0005 <- 2.48 -> DT O2 C0211 : score 4.58202 : H : ARG NH2 A0005 <- 2.95 -> DT O2 C0211 : score 4.10633 : w : LYS NZ A0046 <- 5.53 -> DG N7 D0327 : score 2.519 : w : GLN OE1 A0050 <- 5.50 -> DG N7 D0327 : score 2.87 : w : GLN NE2 A0050 <- 5.74 -> DT O4 C0215 : score 2.257 : w : GLN NE2 A0050 <- 5.57 -> DT O4 C0214 : score 2.257 : H : ASN OD1 A0051 <- 3.28 -> DA N6 C0213 : score 5.4437 : H : ASN ND2 A0051 <- 3.10 -> DA N7 C0213 : score 5.51828 : w : ASN OD1 A0051 <- 6.32 -> DT O4 C0214 : score 3.132 : w : ASN OD1 A0051 <- 5.84 -> DA N6 D0330 : score 2.837 : V : GLN CG A0050 <- 3.76 -> DT C7 D0328 : score 3.28794 : x : ILE xxxx A0047 <- 3.63 -> DA xxx C0213 : score x.xxxxx >3hdd_AB:Homeodomain-like; title=ENGRAILED HOMEODOMAIN DNA COMPLEX organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 A0005 <- 2.48 -> DT O2 C0211 : score 4.58202 : H : ARG NH2 A0005 <- 2.95 -> DT O2 C0211 : score 4.10633 : w : LYS NZ A0046 <- 5.53 -> DG N7 D0327 : score 2.519 : w : GLN OE1 A0050 <- 5.50 -> DG N7 D0327 : score 2.87 : w : GLN NE2 A0050 <- 5.74 -> DT O4 C0215 : score 2.257 : w : GLN NE2 A0050 <- 5.57 -> DT O4 C0214 : score 2.257 : H : ASN OD1 A0051 <- 3.28 -> DA N6 C0213 : score 5.4437 : H : ASN ND2 A0051 <- 3.10 -> DA N7 C0213 : score 5.51828 : w : ASN OD1 A0051 <- 6.32 -> DT O4 C0214 : score 3.132 : w : ASN OD1 A0051 <- 5.84 -> DA N6 D0330 : score 2.837 : w : GLN OE1 B0050 <- 6.40 -> DT O4 D0324 : score 3.068 : w : GLN NE2 B0050 <- 5.72 -> DT O4 D0323 : score 2.257 : w : ASN OD1 B0051 <- 6.03 -> DT O4 D0323 : score 3.132 : w : ASN OD1 B0051 <- 6.17 -> DA N6 C0221 : score 2.837 : V : GLN CG B0050 <- 3.82 -> DT C7 C0219 : score 3.23911 : V : GLN CG A0050 <- 3.76 -> DT C7 D0328 : score 3.28794 : x : ILE xxxx A0047 <- 3.63 -> DA xxx C0213 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0047 <- 3.98 -> DT xxx D0323 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0057 <- 4.46 -> DA xxx C0220 : score x.xxxxx >3hjf_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. THERMOPHILUS ARGONAUTE E546 MUTANT PROTEIN COMPLEXED WITH DNA GUIDE STRAND AND 15-NT RNA TARGET STRAND organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ASN ND2 A0449 <- 2.87 -> DG N3 X0002 : score 4.82634 : x : GLU xxxx A0040 <- 4.49 -> DT xxx X0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0043 <- 3.84 -> DT xxx X0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0044 <- 3.23 -> DT xxx X0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0412 <- 4.46 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0413 <- 3.78 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0415 <- 3.76 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0418 <- 3.71 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0434 <- 4.25 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0436 <- 3.16 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0445 <- 3.85 -> DG xxx X0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0446 <- 3.28 -> DG xxx X0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0647 <- 3.64 -> DG xxx X0002 : score x.xxxxx >3hk2_AB:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. THERMOPHILUS ARGONAUTE N478 MUTANT PROTEIN COMPLEXED WITH DNA GUIDE STRAND AND 19-NT RNA TARGET STRAND organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ASN ND2 A0449 <- 2.85 -> DG N3 C0002 : score 4.84592 >3hk2_B:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. THERMOPHILUS ARGONAUTE N478 MUTANT PROTEIN COMPLEXED WITH DNA GUIDE STRAND AND 19-NT RNA TARGET STRAND organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ASN ND2 B0449 <- 2.89 -> DG N3 E0002 : score 4.80676 >3hm9_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. THERMOPHILUS ARGONAUTE COMPLEXED WITH DNA GUIDE STRAND AND 19-NT RNA TARGET STRAND organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ASN ND2 A0449 <- 3.15 -> DG N3 X0002 : score 4.55223 : x : TYR xxxx A0043 <- 3.50 -> DT xxx X0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0413 <- 3.64 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0415 <- 3.42 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0418 <- 3.78 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0434 <- 3.89 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0436 <- 3.27 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0445 <- 3.98 -> DG xxx X0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0446 <- 3.06 -> DG xxx X0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0647 <- 3.83 -> DG xxx X0002 : score x.xxxxx >3ho1_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. THERMOPHILUS ARGONAUTE N546 MUTANT PROTEIN COMPLEXED WITH DNA GUIDE STRAND AND 12-NT RNA TARGET STRAND organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ASN OD1 A0449 <- 3.07 -> DG N2 X0002 : score 4.5408 : x : TYR xxxx A0226 <- 2.95 -> DT xxx X0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0252 <- 3.43 -> DG xxx X0020 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0254 <- 3.60 -> DG xxx X0020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0267 <- 3.46 -> DG xxx X0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0413 <- 3.33 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0415 <- 3.85 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0418 <- 4.32 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0434 <- 3.95 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0436 <- 3.38 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0445 <- 3.84 -> DG xxx X0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0446 <- 3.00 -> DG xxx X0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0548 <- 4.23 -> DG xxx X0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0615 <- 3.67 -> DA xxx X0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0647 <- 3.69 -> DG xxx X0002 : score x.xxxxx >3hos_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MARINER MOS1 PAIRED END COMPLEX WITH MG organism=DROSOPHILA MAURITIANA : H : ARG NH1 B0048 <- 3.03 -> DG N7 E0022 : score 5.7717 : H : ARG NH2 B0048 <- 2.61 -> DG O6 E0022 : score 6.8508 : H : HIS ND1 B0065 <- 2.59 -> DC O2 F0040 : score 3.35978 : V : LYS CB B0044 <- 3.81 -> DT C7 E0023 : score 2.29988 : x : GLU xxxx B0047 <- 3.32 -> DA xxx F0031 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0067 <- 4.25 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0068 <- 2.38 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0099 <- 3.72 -> DT xxx F0045 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0100 <- 2.85 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0101 <- 2.91 -> DG xxx F0047 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0102 <- 4.25 -> DT xxx F0045 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0104 <- 3.89 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx >3hot_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MOS1 MARINER PAIRED END COMPLEX WITH MN organism=DROSOPHILA MAURITIANA : H : LYS NZ A0044 <- 2.92 -> DG N7 D0033 : score 5.25664 : H : ARG NH1 A0048 <- 2.98 -> DG N7 C0022 : score 5.8322 : H : ARG NH1 A0048 <- 3.32 -> DG O6 C0022 : score 5.45067 : H : ARG NH2 A0048 <- 3.11 -> DG O6 C0022 : score 6.1908 : H : GLN NE2 A0101 <- 2.71 -> DG O6 D0047 : score 5.90962 : V : ALA CB A0102 <- 3.83 -> DT C7 D0045 : score 5.55698 : x : THR xxxx A0042 <- 3.85 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0047 <- 3.60 -> DC xxx D0032 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0065 <- 3.47 -> DC xxx D0040 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0068 <- 3.03 -> DT xxx D0042 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0099 <- 3.30 -> DT xxx D0046 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0100 <- 2.64 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0104 <- 3.99 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx >3hou_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX I WITH A T-U MISMATCH organism=? : x : ARG xxxx A1386 <- 4.00 -> DG xxx 10015 : score x.xxxxx >3hou_AB: title=COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX I WITH A T-U MISMATCH organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 4.00 -> DG xxx 10015 : score x.xxxxx >3hou_MN: title=COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX I WITH A T-U MISMATCH organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx M1386 <- 4.06 -> DG xxx 40015 : score x.xxxxx >3hov_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX II organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.97 -> DG xxx T0015 : score x.xxxxx >3hov_AB: title=COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX II organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.97 -> DG xxx T0015 : score x.xxxxx >3how_AB: title=COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX III WITH A T-U MISMATCH AND A FRAYED RNA 3'-URIDINE organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 B0504 <- 2.68 -> DG O6 10015 : score 6.22933 : H : ARG NH2 B0504 <- 2.54 -> DG O6 10015 : score 6.9432 : x : ARG xxxx A1386 <- 3.55 -> DG xxx 10015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0505 <- 2.82 -> DA xxx 20001 : score x.xxxxx >3how_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX III WITH A T-U MISMATCH AND A FRAYED RNA 3'-URIDINE organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 B0504 <- 2.68 -> DG O6 10015 : score 6.22933 : H : ARG NH2 B0504 <- 2.54 -> DG O6 10015 : score 6.9432 : x : ASP xxxx B0505 <- 2.82 -> DA xxx 20001 : score x.xxxxx >3hox_AB: title=COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX V organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 B0504 <- 3.13 -> DT O4 T0016 : score 3.31929 : x : ARG xxxx A1386 <- 3.52 -> DG xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0505 <- 2.80 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0507 <- 3.78 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx >3hox_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX V organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 B0504 <- 3.13 -> DT O4 T0016 : score 3.31929 : x : ASP xxxx B0505 <- 2.80 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0507 <- 3.78 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx >3hoy_AB: title=COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX VI organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.44 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0505 <- 3.50 -> DG xxx N0001 : score x.xxxxx >3hoy_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX VI organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ASP xxxx B0505 <- 3.50 -> DG xxx N0001 : score x.xxxxx >3hoz_AB: title=COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX IV WITH A T-U MISMATCH AND A FRAYED RNA 3'-GUANINE organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 B0504 <- 2.43 -> DG O6 T0015 : score 7.0884 : x : ARG xxxx A1386 <- 3.90 -> DG xxx T0015 : score x.xxxxx >3hoz_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=COMPLETE RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX IV WITH A T-U MISMATCH AND A FRAYED RNA 3'-GUANINE organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 B0504 <- 2.43 -> DG O6 T0015 : score 7.0884 >3hp6_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FRAGMENT DNA POLYMERASE I FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS F710Y MUTANT BOUND TO G:T MISMATCH organism=Geobacillus stearothermophilus : w : LYS NZ A0582 <- 6.00 -> DT O2 C0007 : score 0.522 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.57 -> DC O2 C0005 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.95 -> DG N3 C0006 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.98 -> DC O2 B0027 : score 4.31823 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.79 -> DT O2 C0007 : score 1.666 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.46 -> DC xxx B0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0629 <- 4.27 -> DG xxx B0028 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 4.34 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.01 -> DG xxx B0028 : score x.xxxxx >3hpo_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FRAGMENT DNA POLYMERASE I FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS Y714S MUTANT BOUND TO G:T MISMATCH organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.98 -> DA N3 B0026 : score 2.67695 : w : LYS NZ A0582 <- 6.03 -> DG N3 C0008 : score 2.232 : w : LYS NZ A0582 <- 6.06 -> DG N2 C0008 : score 0.846 : w : THR OG1 A0586 <- 5.92 -> DG N3 C0008 : score 2.036 : w : THR OG1 A0586 <- 6.26 -> DG N2 C0008 : score 2.036 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.72 -> DC O2 C0005 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.84 -> DG N3 C0006 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.08 -> DC O2 B0027 : score 4.22864 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.80 -> DT O2 C0007 : score 1.666 : w : GLU OE1 A0658 <- 6.07 -> DG N3 C0004 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0658 <- 5.73 -> DG N2 C0003 : score 1.976 : H : SER OG A0714 <- 3.03 -> DG N2 C0003 : score 3.21914 : w : ASN ND2 A0724 <- 5.80 -> DG N7 C0003 : score 3.259 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.37 -> DG N3 C0004 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.27 -> DG N3 C0004 : score 1.484 : x : ARG xxxx A0629 <- 3.74 -> DG xxx B0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0710 <- 3.88 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 3.91 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.06 -> DG xxx B0028 : score x.xxxxx >3hqf_A:DNA-binding_pseudobarrel_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RESTRICTION ENDONUCLEASE ECORII N-TERMINAL EFFECTOR-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH COGNATE DNA organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0028 <- 3.15 -> DA N7 C0000 : score 5.45958 : H : HIS ND1 A0036 <- 2.47 -> DG O6 C0002 : score 6.6338 : H : GLN OE1 A0037 <- 3.27 -> DA N6 C0000 : score 5.48362 : w : GLN OE1 A0037 <- 5.46 -> DC N4 C-001 : score 3.488 : H : ARG NH1 A0094 <- 2.82 -> DG O6 B0002 : score 6.059 : H : ARG NH2 A0094 <- 2.93 -> DG N7 B0002 : score 6.21862 : w : ARG NH1 A0094 <- 6.00 -> DG O6 B0001 : score 2.756 : H : GLU OE1 A0096 <- 2.89 -> DC N4 C-002 : score 5.66413 : w : GLU OE1 A0096 <- 5.44 -> DG N7 C-003 : score 1.976 : w : GLU OE2 A0096 <- 5.66 -> DC N4 C-001 : score 3.597 : H : ARG NH1 A0098 <- 3.02 -> DT O4 B0000 : score 3.12416 : H : ARG NH2 A0098 <- 2.91 -> DT O4 B0000 : score 3.47566 : w : ARG NH1 A0098 <- 5.91 -> DC N4 B-001 : score 1.892 : w : ARG NH2 A0098 <- 5.82 -> DG O6 B0001 : score 2.468 : x : VAL xxxx A0038 <- 3.71 -> DC xxx B-003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.40 -> DG xxx C-003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0085 <- 3.40 -> DC xxx B-001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0093 <- 3.95 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx >3hqg_A:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RESTRICTION ENDONUCLEASE ECORII CATALYTIC C- TERMINAL DOMAIN IN COMPLEX WITH COGNATE DNA organism=Escherichia coli : w : LYS NZ A0263 <- 5.29 -> DC O2 B-001 : score 1.3 : H : LYS NZ A0328 <- 2.68 -> DG O6 B0002 : score 5.91951 : H : ARG NE A0330 <- 2.72 -> DG O6 B0001 : score 4.00408 : H : ARG NH1 A0330 <- 3.07 -> DG N7 B0001 : score 5.7233 : x : ARG xxxx A0222 <- 3.38 -> DA xxx B0000 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0225 <- 3.19 -> DA xxx B0000 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0226 <- 3.38 -> DA xxx B0000 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0229 <- 3.78 -> DA xxx B0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0262 <- 4.07 -> DA xxx B0000 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0264 <- 3.79 -> DC xxx B-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0265 <- 4.10 -> DA xxx B0000 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0266 <- 3.68 -> DA xxx B0000 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0269 <- 3.85 -> DA xxx B0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0329 <- 4.42 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx >3ht3_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FRAGMENT DNA POLYMERASE I FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS V713P MUTANT BOUND TO G:DCTP organism=Geobacillus stearothermophilus : w : LYS NZ A0582 <- 5.55 -> DT O2 C0007 : score 0.522 : w : LYS NZ A0582 <- 6.24 -> DG N2 C0008 : score 0.846 : w : THR OG1 A0586 <- 6.41 -> DG N2 C0008 : score 2.036 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.73 -> DC O2 C0005 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.81 -> DG N3 C0006 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.05 -> DC O2 B0027 : score 4.25551 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.76 -> DT O2 C0007 : score 1.666 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.40 -> DC xxx B0027 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 4.32 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 3.92 -> DG xxx B0028 : score x.xxxxx >3hts_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HEAT SHOCK TRANSCRIPTION FACTOR/DNA COMPLEX organism=Kluyveromyces lactis : V : ARG CG B0250 <- 3.78 -> DT C7 A0004 : score 1.01015 : x : SER xxxx B0247 <- 3.43 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0251 <- 3.60 -> DT xxx A0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0254 <- 3.90 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx >3hvr_AB:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. THERMOPHILUS ARGONAUTE COMPLEXED WITH DNA GUIDE STRAND AND 19-NT RNA TARGET STRAND WITH TWO MG2+ AT THE CLEAVAGE SITE organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ASN ND2 B0449 <- 2.91 -> DG N3 M0002 : score 4.78718 >3hxm_A:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF AN ARGONAUTE COMPLEXED WITH GUIDE DNA AND TARGET RNA DUPLEX CONTAINING TWO MISMATCHES. organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : TYR xxxx A0226 <- 2.26 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0413 <- 3.81 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0415 <- 4.30 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0418 <- 3.97 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0434 <- 4.02 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0436 <- 3.02 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0445 <- 4.18 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0446 <- 3.04 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0449 <- 2.77 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0615 <- 3.15 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0647 <- 3.83 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >3hxo_A:vWA-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF VON WILLEBRAND FACTOR (VWF) A1 DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA APTAMER ARC1172, AN INHIBITOR OF VWF-PLATELET BINDING organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 A0628 <- 3.14 -> DT N3 B0027 : score 3.18194 : H : ARG NE A0629 <- 3.06 -> DG N7 B0025 : score 4.19186 : H : ARG NH2 A0629 <- 2.99 -> DG O6 B0025 : score 6.3492 : H : ARG NH1 A0632 <- 3.04 -> DC O2 B0007 : score 3.4748 : H : ARG NH2 A0632 <- 3.16 -> DC O2 B0007 : score 3.43241 : H : ASN ND2 A0633 <- 3.24 -> DA N3 B0008 : score 3.47262 : w : ASN OD1 A0633 <- 6.28 -> DG N3 B0009 : score 3.377 : x : ARG xxxx A0524 <- 3.60 -> DG xxx B0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0603 <- 3.21 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0625 <- 3.42 -> DC xxx B0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0627 <- 4.08 -> DG xxx B0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0631 <- 3.58 -> DT xxx B0031 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0634 <- 4.28 -> DT xxx B0031 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0635 <- 4.18 -> DT xxx B0031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0658 <- 3.58 -> DC xxx B0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0659 <- 3.52 -> DC xxx B0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0660 <- 3.21 -> DT xxx B0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0664 <- 4.30 -> DT xxx B0031 : score x.xxxxx >3hxq_A:vWA-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF VON WILLEBRAND FACTOR (VWF) A1 DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA APTAMER ARC1172, AN INHIBITOR OF VWF-PLATELET BINDING organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 A0628 <- 2.86 -> DT N3 B0027 : score 3.37313 : w : GLN NE2 A0628 <- 5.23 -> DT O2 B0031 : score 1.565 : H : ARG NH1 A0629 <- 2.89 -> DG N7 B0025 : score 5.9411 : H : ARG NH1 A0629 <- 2.71 -> DG O6 B0025 : score 6.19283 : H : ARG NH2 A0632 <- 2.59 -> DC O2 B0007 : score 3.85406 : x : ARG xxxx A0524 <- 3.52 -> DG xxx B0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0603 <- 2.97 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0625 <- 3.02 -> DC xxx B0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0627 <- 3.80 -> DT xxx B0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0631 <- 3.26 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0633 <- 3.38 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0634 <- 3.84 -> DT xxx B0031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0658 <- 3.97 -> DC xxx B0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0659 <- 3.38 -> DC xxx B0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0660 <- 3.50 -> DC xxx B0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0664 <- 4.15 -> DT xxx B0031 : score x.xxxxx >3hzi_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF MDT PROTEIN organism=ESCHERICHIA COLI : x : GLN xxxx B0028 <- 4.42 -> DA xxx T0702 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0029 <- 3.27 -> DT xxx T0701 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0039 <- 2.68 -> DA xxx T0702 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0040 <- 3.45 -> DT xxx T0703 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 3.23 -> DA xxx T0702 : score x.xxxxx >3i0w_A:DNA-glycosylase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CLOSTRIDIUM ACETOBUTYLICUM 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE/LYASE IN COMPLEX WITH DSDNA CONTAINING CYTOSINE OPPOSITE TO 8-OXOG organism=CLOSTRIDIUM ACETOBUTYLICUM : w : ASN OD1 A0127 <- 6.47 -> DA N6 B0018 : score 2.837 : w : ASN OD1 A0128 <- 6.44 -> DT O2 C0010 : score 1.953 : H : ARG NH1 A0180 <- 3.00 -> DC O2 C0009 : score 3.504 : H : ARG NH2 A0180 <- 3.06 -> DC N3 C0009 : score 2.17189 : w : TYR OH A0183 <- 5.29 -> DT O2 B0021 : score 3.068 : x : ARG xxxx A0129 <- 2.94 -> DA xxx B0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0179 <- 3.46 -> DG xxx B0020 : score x.xxxxx >3i0x_A:DNA-glycosylase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CLOSTRIDIUM ACETOBUTYLICUM 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE/LYASE IN COMPLEX WITH DSDNA CONTAINING ADENINE OPPOSITE TO 8-OXOG organism=CLOSTRIDIUM ACETOBUTYLICUM : w : ASN OD1 A0127 <- 5.84 -> DA N6 C0018 : score 2.837 : w : ASN ND2 A0127 <- 6.13 -> DA N7 C0018 : score 1.989 : w : ASN OD1 A0128 <- 5.77 -> DT O2 D0010 : score 1.953 : H : ARG NH2 A0129 <- 2.88 -> DC O2 C0017 : score 3.63954 : w : MET SD A0132 <- 6.08 -> DT O2 D0010 : score 3.645 : w : TYR OH A0183 <- 5.30 -> DT O2 C0021 : score 3.068 : x : ALA xxxx A0126 <- 4.43 -> DG xxx C0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0179 <- 3.39 -> DG xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0180 <- 3.46 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx >3i4m_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=8-OXOGUANINE CONTAINING RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX D organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 4.12 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx >3i4m_AB: title=8-OXOGUANINE CONTAINING RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX D organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 4.12 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0504 <- 4.08 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0505 <- 2.99 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx >3i4n_AB: title=8-OXOGUANINE CONTAINING RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX E organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.98 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0505 <- 2.91 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx >3i4n_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=8-OXOGUANINE CONTAINING RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX E organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ASP xxxx B0505 <- 2.91 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx >3i8d_A:Ribonuclease_H-like; title=THE PAIRING GEOMETRY OF THE HYDROPHOBIC THYMINE ANALOG 2,4- DIFLUOROTOLUENE IN DUPLEX DNA AS ANALYZED BY X-RAY CRYSTALLOGRAPHY organism=Bacillus halodurans : w : ASN OD1 A0106 <- 5.85 -> DG N2 B0010 : score 2.566 >3iag_C:DNA-binding_protein_LAG-1_CSL;p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CSL (RBP-JK) BOUND TO HES-1 NONCONSENSUS SITE organism=Mus musculus : H : ARG NH1 C0091 <- 3.07 -> DG N7 B0023 : score 5.7233 : H : ARG NH2 C0091 <- 2.90 -> DG O6 B0023 : score 6.468 : H : LYS NZ C0192 <- 2.98 -> DG O6 B0025 : score 5.57266 : w : SER OG C0221 <- 5.51 -> DT O2 B0022 : score 1.55 : H : GLN OE1 C0222 <- 3.11 -> DG N2 A0013 : score 5.26002 : H : GLN NE2 C0222 <- 3.10 -> DG N3 A0013 : score 4.6771 : x : TYR xxxx C0086 <- 3.70 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0089 <- 3.96 -> DC xxx A0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0191 <- 3.83 -> DT xxx A0006 : score x.xxxxx >3iay_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE DELTA organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0444 <- 2.49 -> DT O4 P0010 : score 3.80958 : w : GLN NE2 A0586 <- 5.75 -> DA N7 T0007 : score 1.888 : H : LYS NZ A0814 <- 3.01 -> DA N3 P0011 : score 2.66029 : w : ARG NH2 A0815 <- 6.26 -> DG N3 T0009 : score 0.677 : H : ARG NH1 A0839 <- 3.12 -> DC O2 P0009 : score 3.4164 : H : ARG NH2 A0839 <- 2.97 -> DC O2 P0008 : score 3.57296 : w : ASN OD1 A0899 <- 5.76 -> DC O2 P0006 : score 2.172 : w : ASN OD1 A0899 <- 5.59 -> DT O2 P0005 : score 1.953 : w : GLN OE1 A0901 <- 6.11 -> DG N2 T0011 : score 2.177 : w : GLN NE2 A0901 <- 5.86 -> DC O2 P0006 : score 2.699 >3igc_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;DNA_topoisomerase_I_domain; title=SMALLPOX VIRUS TOPOISOMERASE-DNA TRANSITION STATE organism=Variola virus : H : GLN OE1 A0069 <- 2.83 -> DA N6 D0524 : score 6.01625 : H : GLN NE2 A0069 <- 3.05 -> DA N7 D0524 : score 5.78526 : w : GLN OE1 A0069 <- 5.97 -> DT O4 B0510 : score 3.068 : w : GLN OE1 A0069 <- 5.99 -> DA N6 D0523 : score 3.392 : H : LYS NZ A0133 <- 2.88 -> DG N7 D0527 : score 5.29972 : w : LYS NZ A0133 <- 5.62 -> DG O6 B0506 : score 3.005 : w : LYS NZ A0135 <- 5.43 -> DC N4 B0507 : score 0.048 : H : TYR OH A0136 <- 2.69 -> DG N7 D0526 : score 4.3815 : H : LYS NZ A0167 <- 2.90 -> DT O2 B0511 : score 3.51544 : w : ASP OD1 A0168 <- 6.07 -> DA N3 C0512 : score 1.331 : w : ASP OD2 A0168 <- 5.23 -> DA N3 D0523 : score 1.331 : w : GLU OE1 A0205 <- 5.50 -> DC N4 D0528 : score 3.528 : w : GLU OE1 A0205 <- 5.73 -> DC N4 B0505 : score 3.528 : H : ARG NH1 A0206 <- 3.24 -> DG O6 B0503 : score 5.548 : H : ARG NH2 A0206 <- 2.34 -> DG N7 B0503 : score 6.972 : w : TYR OH A0209 <- 5.64 -> DC N4 D0528 : score 1.343 : H : ARG NH1 A0272 <- 2.74 -> DT O4 C0513 : score 3.30716 : w : ARG NE A0272 <- 6.50 -> DG N7 D0519 : score 1.593 : w : ARG NH1 A0272 <- 6.14 -> DA N6 C0512 : score 1.486 : w : ARG NH2 A0272 <- 6.42 -> DG N7 D0519 : score 2.18 : V : ILE CB A0269 <- 3.67 -> DT C7 C0513 : score -3.11762 : x : ARG xxxx A0067 <- 4.08 -> DA xxx D0524 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0070 <- 3.59 -> DC xxx B0508 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0072 <- 3.46 -> DC xxx B0509 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0080 <- 3.62 -> DT xxx B0511 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0266 <- 3.92 -> DT xxx C0513 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0268 <- 3.67 -> DT xxx C0514 : score x.xxxxx >3igk_A:p53-like_transcription_factors; title=DIVERSITY IN DNA RECOGNITION BY P53 REVEALED BY CRYSTAL STRUCTURES WITH HOOGSTEEN BASE PAIRS (P53-DNA COMPLEX 2) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 2.75 -> DG N7 B0003 : score 5.43976 : H : LYS NZ A0120 <- 2.90 -> DG O6 B0003 : score 5.66515 : H : LYS NZ A0120 <- 2.74 -> DG O6 B0004 : score 5.85014 : w : SER OG A0121 <- 5.48 -> DG N7 B0002 : score 2.749 : x : ARG xxxx A0280 <- 3.38 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx >3igl_A:p53-like_transcription_factors; title=DIVERSITY IN DNA RECOGNITION BY P53 REVEALED BY CRYSTAL STRUCTURES WITH HOOGSTEEN BASE PAIRS (P53-DNA COMPLEX 1) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 2.97 -> DG N7 B0003 : score 5.20278 : H : LYS NZ A0120 <- 2.95 -> DG O6 B0003 : score 5.60735 : H : LYS NZ A0120 <- 2.74 -> DG O6 B0004 : score 5.85014 : w : SER OG A0121 <- 5.51 -> DG N7 B0002 : score 2.749 : w : ARG NH1 A0280 <- 6.60 -> DG O6 B0004 : score 2.756 >3igm_B: title=A 2.2A CRYSTAL STRUCTURE OF THE AP2 DOMAIN OF PF14_0633 FROM P. FALCIPARUM, BOUND AS A DOMAIN-SWAPPED DIMER TO ITS COGNATE DNA organism=? : H : ASN ND2 B0072 <- 2.91 -> DT O4 X0005 : score 5.16835 : w : ASN ND2 B0072 <- 5.90 -> DA N6 X0004 : score 2.5 : H : ARG NH2 B0074 <- 2.77 -> DG O6 X0006 : score 6.6396 : H : ARG NH2 B0074 <- 2.99 -> DG O6 W0002 : score 6.3492 : H : MET SD B0075 <- 3.27 -> DC N4 W0003 : score -8.25505 : H : ARG NH1 B0088 <- 2.79 -> DG O6 X0002 : score 6.0955 : H : ARG NH2 B0088 <- 2.81 -> DG N7 X0002 : score 6.37185 : w : ARG NH1 B0088 <- 6.35 -> DG O6 W0006 : score 2.756 : H : SER OG B0090 <- 2.79 -> DA N7 W0004 : score 4.47303 : x : SER xxxx B0070 <- 3.45 -> DC xxx X0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0079 <- 3.55 -> DA xxx W0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0081 <- 2.92 -> DT xxx W0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0083 <- 3.15 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0092 <- 3.99 -> DC xxx W0003 : score x.xxxxx >3ih7_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CATALYTICALLY ACTIVE HUMAN 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE DISTALLY CROSSLINKED TO GUANINE-CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 A0151 <- 3.40 -> DA N3 C0024 : score 3.35077 : H : ARG NH2 A0154 <- 2.84 -> DC O2 B0009 : score 3.66913 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.95 -> DC O2 B0009 : score 3.5405 : H : ASP OD1 A0268 <- 3.15 -> DG N2 C0025 : score 4.7895 : x : PHE xxxx A0144 <- 3.81 -> DG xxx C0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0149 <- 2.68 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0203 <- 3.42 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0249 <- 3.51 -> DG xxx C0025 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0253 <- 4.42 -> DG xxx C0025 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0257 <- 3.97 -> DG xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0266 <- 3.34 -> DG xxx C0025 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0271 <- 3.85 -> DG xxx C0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0315 <- 3.34 -> DG xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0319 <- 3.39 -> DG xxx C0025 : score x.xxxxx >3ikt_AB:NADP-binding_Rossmann-fold_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A REX-FAMILY REPRESSOR/DNA/NAD+ COMPLEX FROM THERMUS AQUATICUS organism=Thermus thermophilus HB27 : H : ARG NE A0046 <- 2.68 -> DG N7 C0005 : score 4.52792 : H : ARG NH1 A0046 <- 2.84 -> DG O6 C0005 : score 6.03467 : H : LYS NZ A0047 <- 2.96 -> DG O6 C0007 : score 5.59578 : w : LYS NZ A0047 <- 5.75 -> DA N6 C0008 : score 2.097 : H : ARG NE B0046 <- 2.93 -> DG N7 D0005 : score 4.30683 : H : ARG NH2 B0046 <- 2.82 -> DG O6 D0005 : score 6.5736 : H : LYS NZ B0047 <- 2.64 -> DG O6 D0007 : score 5.96575 : w : LYS NZ B0047 <- 5.43 -> DA N6 D0008 : score 2.097 : x : PHE xxxx A0043 <- 3.19 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0044 <- 4.21 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0050 <- 4.08 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0051 <- 3.20 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0043 <- 3.20 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0044 <- 4.31 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0050 <- 3.91 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0051 <- 3.25 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0058 <- 3.55 -> DG xxx C0020 : score x.xxxxx >3ikt_B:NADP-binding_Rossmann-fold_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A REX-FAMILY REPRESSOR/DNA/NAD+ COMPLEX FROM THERMUS AQUATICUS organism=Thermus thermophilus HB27 : H : ARG NE B0046 <- 2.93 -> DG N7 D0005 : score 4.30683 : H : ARG NH2 B0046 <- 2.82 -> DG O6 D0005 : score 6.5736 : H : LYS NZ B0047 <- 2.64 -> DG O6 D0007 : score 5.96575 : w : LYS NZ B0047 <- 5.43 -> DA N6 D0008 : score 2.097 : x : PHE xxxx B0043 <- 3.20 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0044 <- 4.31 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0050 <- 3.91 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0051 <- 3.25 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0058 <- 3.55 -> DG xxx C0020 : score x.xxxxx >3il2_AB:NADP-binding_Rossmann-fold_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A REX-FAMILY REPRESSOR R90D MUTANT/DNA COMPLEX FROM THERMUS AQUATICUS organism=Thermus thermophilus HB27 : H : ARG NE A0046 <- 2.81 -> DG N7 C0005 : score 4.41295 : H : ARG NH1 A0046 <- 2.81 -> DG O6 C0005 : score 6.07117 : H : LYS NZ A0047 <- 3.06 -> DG O6 C0007 : score 5.48017 : H : ARG NE B0046 <- 2.99 -> DG N7 D0005 : score 4.25377 : H : ARG NH2 B0046 <- 3.06 -> DG O6 D0005 : score 6.2568 : H : LYS NZ B0047 <- 3.04 -> DG O6 D0007 : score 5.50329 : x : PHE xxxx A0043 <- 2.93 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0043 <- 2.79 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0058 <- 3.22 -> DG xxx C0020 : score x.xxxxx >3il2_B:NADP-binding_Rossmann-fold_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A REX-FAMILY REPRESSOR R90D MUTANT/DNA COMPLEX FROM THERMUS AQUATICUS organism=Thermus thermophilus HB27 : H : ARG NE B0046 <- 2.99 -> DG N7 D0005 : score 4.25377 : H : ARG NH2 B0046 <- 3.06 -> DG O6 D0005 : score 6.2568 : H : LYS NZ B0047 <- 3.04 -> DG O6 D0007 : score 5.50329 : x : PHE xxxx B0043 <- 2.79 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0058 <- 3.22 -> DG xxx C0020 : score x.xxxxx >3imb_AC:Restriction_endonuclease-like; title=ALTERNATIVE BINDING MODE OF RESTRICTION ENDONUCLEASE BCNI TO COGNATE DNA organism=BREVIBACILLUS CENTROSPORUS : H : ASP OD1 A0032 <- 2.91 -> DG N2 E0000 : score 5.0367 : H : ASP OD2 A0033 <- 2.85 -> DG N2 E0001 : score 5.40438 : H : ASN ND2 A0050 <- 2.82 -> DA N3 F0003 : score 3.79246 : H : THR OG1 A0074 <- 2.62 -> DG N7 E0001 : score 3.62467 : H : HIS NE2 A0077 <- 3.12 -> DG N7 E0000 : score 6.3672 : H : THR OG1 A0113 <- 2.90 -> DC N4 F-002 : score 3.95267 : w : THR OG1 A0113 <- 6.39 -> DG O6 F-003 : score 2.729 : H : ASP OD2 A0200 <- 2.89 -> DC N4 F-001 : score 6.0884 : H : HIS NE2 A0214 <- 2.54 -> DG O6 F0002 : score 8.36745 : H : ARG NE A0216 <- 3.04 -> DG N7 F0001 : score 4.20955 : H : HIS NE2 A0219 <- 2.86 -> DC N4 F0000 : score 3.18567 : H : ARG NH1 A0221 <- 2.78 -> DG O6 E0002 : score 6.10767 : H : ARG NH2 A0221 <- 2.99 -> DG N7 E0002 : score 6.142 : H : ASP OD1 C0032 <- 3.15 -> DG N2 I0000 : score 4.7895 : w : ASP OD1 C0032 <- 6.10 -> DC O2 J0000 : score 1.919 : H : ASP OD2 C0033 <- 2.80 -> DG N2 I0001 : score 5.45897 : w : ASP OD2 C0033 <- 6.04 -> DC O2 J0000 : score 1.919 : H : ASN ND2 C0050 <- 2.88 -> DA N3 J0003 : score 3.74677 : H : THR OG1 C0074 <- 2.78 -> DG N7 I0001 : score 3.51271 : H : HIS NE2 C0077 <- 2.93 -> DG N7 I0000 : score 6.6257 : w : ARG NH2 C0101 <- 5.89 -> DC O2 J0000 : score 1.669 : H : THR OG1 C0113 <- 2.95 -> DC N4 J-002 : score 3.91233 : w : THR OG1 C0113 <- 6.37 -> DG O6 J-003 : score 2.729 : H : ASP OD2 C0200 <- 3.02 -> DC N4 J-001 : score 5.9272 : H : HIS NE2 C0214 <- 2.69 -> DG O6 J0002 : score 8.12883 : H : ARG NE C0216 <- 3.04 -> DG N7 J0001 : score 4.20955 : H : HIS NE2 C0219 <- 2.98 -> DG O6 I0000 : score 7.66751 : H : ARG NH1 C0221 <- 2.81 -> DG O6 I0002 : score 6.07117 : H : ARG NH2 C0221 <- 2.92 -> DG N7 I0002 : score 6.23138 : x : ARG xxxx A0030 <- 3.97 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0038 <- 4.37 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0071 <- 3.18 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.72 -> DC xxx F-001 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0202 <- 3.14 -> DC xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0215 <- 4.30 -> DT xxx E-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0030 <- 3.88 -> DG xxx J0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0038 <- 4.17 -> DG xxx J0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0071 <- 3.19 -> DG xxx I0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0111 <- 3.58 -> DC xxx J0000 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0202 <- 2.97 -> DC xxx J-001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0215 <- 4.06 -> DT xxx I-003 : score x.xxxxx >3imb_D:Restriction_endonuclease-like; title=ALTERNATIVE BINDING MODE OF RESTRICTION ENDONUCLEASE BCNI TO COGNATE DNA organism=? : H : ASP OD1 D0032 <- 3.02 -> DG N2 K0000 : score 4.9234 : H : ASP OD2 D0033 <- 2.72 -> DG N2 K0001 : score 5.54632 : w : ASP OD2 D0033 <- 5.62 -> DC O2 L0000 : score 1.919 : H : ASN ND2 D0050 <- 2.91 -> DA N3 L0003 : score 3.72392 : H : THR OG1 D0074 <- 2.77 -> DG N7 K0001 : score 3.51971 : H : HIS NE2 D0077 <- 3.04 -> DG N7 K0000 : score 6.47604 : w : ARG NH2 D0101 <- 5.46 -> DC O2 L0000 : score 1.669 : H : THR OG1 D0113 <- 2.94 -> DC N4 L-002 : score 3.9204 : w : THR OG1 D0113 <- 5.51 -> DG N7 L-003 : score 3.422 : H : ASP OD2 D0200 <- 2.97 -> DC N4 L-001 : score 5.9892 : H : HIS NE2 D0214 <- 2.66 -> DG O6 L0002 : score 8.17655 : H : ARG NE D0216 <- 2.99 -> DG N7 L0001 : score 4.25377 : H : HIS NE2 D0219 <- 3.02 -> DG O6 K0000 : score 7.60388 : H : ARG NH1 D0221 <- 2.79 -> DG O6 K0002 : score 6.0955 : H : ARG NH2 D0221 <- 2.90 -> DG N7 K0002 : score 6.25692 : x : ARG xxxx D0030 <- 3.97 -> DG xxx L0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0038 <- 4.33 -> DG xxx L0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0071 <- 3.30 -> DG xxx K0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0111 <- 3.58 -> DC xxx L-001 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0202 <- 3.19 -> DC xxx L-001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0215 <- 4.20 -> DT xxx K-003 : score x.xxxxx >3in5_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE KAPPA INSERTING DATP OPPOSITE AN 8- OXOG DNA LESION organism=Homo sapiens : x : SER xxxx B0415 <- 4.48 -> DT xxx U0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0419 <- 4.33 -> DA xxx U0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0469 <- 4.42 -> DG xxx Q0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0512 <- 3.67 -> DT xxx U0009 : score x.xxxxx >3irq_AD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A Z-Z JUNCTION organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx D0177 <- 3.63 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0177 <- 3.52 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0181 <- 3.90 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx >3irq_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A Z-Z JUNCTION organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx D0177 <- 3.63 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx >3irr_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A Z-Z JUNCTION (WITH HEPES INTERCALATING) organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx A0177 <- 3.58 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0177 <- 3.78 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx >3irr_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A Z-Z JUNCTION (WITH HEPES INTERCALATING) organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx C0177 <- 3.49 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx >3irr_CD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A Z-Z JUNCTION (WITH HEPES INTERCALATING) organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx C0177 <- 3.49 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0177 <- 3.42 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx >3isb_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=BINARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH A GAPPED DNA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.26 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.72 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.66 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3isc_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=BINARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH AN ABASIC SITE (THF) IN THE GAPPED DNA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.24 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.83 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.54 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3isd_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH AN ABASIC SITE (THF): DAPCPP MISMATCH organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.43 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.91 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.38 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3iv5_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP OPTIMAL BINDING SEQUENCE F1 organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0085 <- 2.97 -> DG N7 D0007 : score 6.16754 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.89 -> DG O6 D0007 : score 6.4812 : x : THR xxxx A0075 <- 3.98 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 2.95 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.63 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 4.01 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx >3iv5_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP OPTIMAL BINDING SEQUENCE F1 organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0085 <- 2.97 -> DG N7 D0007 : score 6.16754 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.89 -> DG O6 D0007 : score 6.4812 : H : ARG NH1 B0085 <- 2.93 -> DG N7 C0007 : score 5.8927 : H : ARG NH2 B0085 <- 3.13 -> DG O6 C0007 : score 6.1644 : x : THR xxxx A0075 <- 3.98 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 2.95 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.63 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 4.01 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 3.52 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.29 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 4.37 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.62 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0090 <- 4.12 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx >3iyd_A:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase; title=THREE-DIMENSIONAL EM STRUCTURE OF AN INTACT ACTIVATOR-DEPENDENT TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : x : LYS xxxx A0297 <- 3.20 -> DT xxx J0064 : score x.xxxxx >3iyd_ACDFGH:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators;Translation_proteins_SH3-like_domain;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=THREE-DIMENSIONAL EM STRUCTURE OF AN INTACT ACTIVATOR-DEPENDENT TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI / ESCHERICHIA COLI K-12 : H : ARG NH1 D0352 <- 2.81 -> DC O2 J0021 : score 3.6427 : H : SER OG F0428 <- 3.00 -> DT O2 I0072 : score 3.54954 : H : GLN OE1 F0589 <- 2.87 -> DC N4 I0042 : score 4.51917 : H : ARG NH1 G0185 <- 3.01 -> DT O4 I0021 : score 3.13069 : H : ARG NH2 G0185 <- 2.95 -> DT O4 I0021 : score 3.44723 : H : LYS NZ H0026 <- 3.07 -> DT O2 J0094 : score 3.39347 : V : VAL CG1 F0454 <- 3.65 -> DT C7 I0064 : score 6.28778 : V : PHE CD2 C0390 <- 3.87 -> DT C7 I0079 : score 6.39784 : V : ILE CG1 F0457 <- 3.55 -> DT C7 J0031 : score 5.26891 : x : LYS xxxx A0297 <- 3.20 -> DT xxx J0064 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0063 <- 3.59 -> DG xxx I0074 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0179 <- 3.49 -> DT xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0180 <- 3.05 -> DT xxx I0079 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.19 -> DA xxx I0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 3.23 -> DA xxx I0081 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0389 <- 3.46 -> DC xxx I0077 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0473 <- 4.18 -> DA xxx I0076 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C1240 <- 4.48 -> DC xxx J0022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C1272 <- 2.94 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0319 <- 4.38 -> DA xxx J0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0334 <- 3.44 -> DC xxx J0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0337 <- 3.02 -> DA xxx J0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0339 <- 3.22 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0340 <- 3.10 -> DA xxx J0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0343 <- 3.58 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 3.69 -> DT xxx J0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.32 -> DT xxx J0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0465 <- 3.63 -> DC xxx J0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0798 <- 3.61 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0802 <- 3.35 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0394 <- 3.61 -> DT xxx J0031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0396 <- 4.26 -> DA xxx J0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0397 <- 3.15 -> DT xxx J0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.21 -> DA xxx I0071 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.54 -> DT xxx I0067 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0455 <- 3.19 -> DG xxx I0062 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0458 <- 4.00 -> DT xxx I0064 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0503 <- 3.54 -> DA xxx J0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0584 <- 4.13 -> DT xxx J0051 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0585 <- 3.13 -> DT xxx I0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0586 <- 3.74 -> DC xxx I0042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0588 <- 3.17 -> DA xxx J0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0180 <- 3.40 -> DT xxx J0074 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0181 <- 4.46 -> DT xxx I0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0182 <- 4.29 -> DA xxx I0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0170 <- 3.15 -> DT xxx I0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0179 <- 4.03 -> DT xxx J0085 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0180 <- 3.62 -> DT xxx I0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0181 <- 3.88 -> DT xxx I0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0182 <- 4.32 -> DA xxx J0084 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0185 <- 3.89 -> DA xxx J0084 : score x.xxxxx >3iyd_H:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THREE-DIMENSIONAL EM STRUCTURE OF AN INTACT ACTIVATOR-DEPENDENT TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : H : LYS NZ H0026 <- 3.07 -> DT O2 J0094 : score 3.39347 : x : GLN xxxx H0170 <- 3.15 -> DT xxx I0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0179 <- 4.03 -> DT xxx J0085 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0180 <- 3.62 -> DT xxx I0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0181 <- 3.88 -> DT xxx I0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0182 <- 4.32 -> DA xxx J0084 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0185 <- 3.89 -> DA xxx J0084 : score x.xxxxx >3j9x_A: title=A VIRUS THAT INFECTS A HYPERTHERMOPHILE ENCAPSIDATES A-FORM DNA organism=SULFOLOBUS ISLANDICUS ROD-SHAPED VIRUS 2 : H : TRP NE1 A0017 <- 2.90 -> DT O2 80008 : score 6.09108 : x : ARG xxxx A0013 <- 3.40 -> DA xxx 70343 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0045 <- 4.47 -> DT xxx 70338 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0071 <- 3.81 -> DA xxx 80015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0074 <- 3.83 -> DA xxx 80015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0081 <- 3.62 -> DT xxx 70336 : score x.xxxxx >3jaa_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA IN COMPLEX WITH NORMAL DNA AND INCO NUCLEOTIDE (NRM) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0382 <- 3.03 -> DG O6 P0005 : score 5.8035 : H : ARG NH2 A0382 <- 2.86 -> DG N7 P0005 : score 6.308 : x : SER xxxx A0322 <- 3.88 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.34 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0421 <- 4.38 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.15 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >3jbw_C: title=CRYO-ELECTRON MICROSCOPY STRUCTURE OF RAG PAIRED COMPLEX (WITH NBD, NO SYMMETRY) organism=? : x : ASN xxxx C0872 <- 3.46 -> DT xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0874 <- 4.23 -> DG xxx F0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0877 <- 2.60 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0981 <- 3.20 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0985 <- 3.53 -> DT xxx F0033 : score x.xxxxx >3jbx_C: title=CRYO-ELECTRON MICROSCOPY STRUCTURE OF RAG SIGNAL END COMPLEX (C2 SYMMETRY) organism=DANIO RERIO : H : ASN ND2 C0874 <- 2.69 -> DG O6 F0013 : score 5.76251 : H : SER OG C0985 <- 3.31 -> DT O2 F0014 : score 3.3203 : x : GLU xxxx C0671 <- 4.46 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0872 <- 4.03 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0877 <- 3.02 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0981 <- 2.94 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0988 <- 3.50 -> DG xxx F0013 : score x.xxxxx >3jby_D:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-ELECTRON MICROSCOPY STRUCTURE OF RAG PAIRED COMPLEX (C2 SYMMETRY) organism=? : H : ASN ND2 D0117 <- 3.33 -> DC O2 J0004 : score 4.00466 >3jca_E:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase; title=CORE MODEL OF THE MOUSE MAMMARY TUMOR VIRUS INTASOME organism=MOUSE MAMMARY TUMOR VIRUS : H : ARG NE E0159 <- 2.87 -> DC O2 K0006 : score 2.62175 : H : ARG NH2 E0159 <- 2.80 -> DC O2 K0006 : score 3.69872 : H : GLN OE1 E0162 <- 3.22 -> DG N2 L0018 : score 5.13665 : H : GLN NE2 E0162 <- 3.13 -> DG N3 L0018 : score 4.64725 : H : ARG NH1 E0240 <- 2.92 -> DG O6 L0015 : score 5.93733 : H : ARG NH2 E0240 <- 2.82 -> DG N7 L0015 : score 6.35908 : x : GLN xxxx E0152 <- 3.08 -> DG xxx K0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0155 <- 4.06 -> DG xxx K0004 : score x.xxxxx >3jca_H:DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=CORE MODEL OF THE MOUSE MAMMARY TUMOR VIRUS INTASOME organism=MOUSE MAMMARY TUMOR VIRUS : x : ARG xxxx H0240 <- 3.72 -> DA xxx K0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0242 <- 3.45 -> DA xxx K0002 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx H0244 <- 4.00 -> DA xxx K0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0253 <- 3.49 -> DA xxx K0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx H0255 <- 3.36 -> DA xxx K0001 : score x.xxxxx >3jpn_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER AND 2'-DEOXYGUANOSINE 5'-BETA, GAMMA-DICHLORO METHYLENE TRIPHOSPHATE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.21 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.99 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.66 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3jpo_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER AND 2'-DEOXYGUANOSINE 5'-BETA, GAMMA-MONOCHLOROMETHYLENE TRIPHOSPHATE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.33 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.91 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.60 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3jpp_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER AND 2'-DEOXYGUANOSINE 5'-BETA, GAMMA-MONOMETHYL METHYLENE TRIPHOSPHATE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.02 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.61 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3jpq_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER AND 2'-DEOXYGUANOSINE 5'-BETA, GAMMA-MONOBROMO METHYLENE TRIPHOSPHATE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.33 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.94 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.65 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3jpr_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER AND 2'-DEOXYGUANOSINE 5'-BETA, GAMMA-DIMETHYL METHYLENE TRIPHOSPHATE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.13 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.10 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.70 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3jps_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER AND 2'-DEOXYGUANOSINE 5'-BETA, GAMMA-FLUORO METHYL METHYLENE TRIPHOSPHATE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.35 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.00 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.58 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3jpt_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER AND 2'-DEOXYGUANOSINE 5'-BETA, GAMMA-FLUORO CHLORO METHYLENE TRIPHOSPHATE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.23 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.85 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.72 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3jr4_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM INTERROGATING AN EXTRAHELICAL G organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NE A0112 <- 2.82 -> DC O2 B0009 : score 2.64834 : H : ARG NH2 A0264 <- 3.17 -> DT O4 C0011 : score 3.29086 : H : ARG NH2 A0264 <- 3.30 -> DG O6 B0006 : score 5.94 : x : ARG xxxx A0076 <- 3.57 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0077 <- 3.36 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.38 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx >3jr5_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM LESION RECOGNITION CONTROL COMPLEX WITH N174C CROSSLINKING SITE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NH1 A0076 <- 3.05 -> DA N3 C0009 : score 3.49795 : w : ARG NH1 A0076 <- 5.73 -> DT O2 B0009 : score 1.855 : w : GLU OE1 A0078 <- 5.58 -> DC O2 C0007 : score 2.68 : H : ARG NE A0112 <- 2.69 -> DC O2 B0010 : score 2.71747 : H : ARG NH1 A0112 <- 3.08 -> DC N3 B0010 : score 1.4511 : w : ARG NH1 A0112 <- 5.79 -> DT O4 B0009 : score 1.768 : w : ARG NH2 A0112 <- 5.88 -> DC O2 C0007 : score 1.669 : H : ARG NH1 A0264 <- 2.86 -> DT O4 C0011 : score 3.22873 : H : ARG NH2 A0264 <- 3.03 -> DG N7 B0006 : score 6.09092 : w : ARG NE A0264 <- 5.61 -> DG N7 C0010 : score 1.593 : x : MET xxxx A0077 <- 3.55 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.26 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0223 <- 3.67 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx >3jr9_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP OPTIMAL BINDING SEQUENCE F2 organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0085 <- 3.26 -> DG N7 D0007 : score 5.79723 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.68 -> DG O6 D0007 : score 6.7584 : H : ARG NH2 A0085 <- 3.17 -> DG O6 C0020 : score 6.1116 : H : ARG NH1 B0085 <- 2.88 -> DG N7 C0007 : score 5.9532 : H : ARG NH2 B0085 <- 2.99 -> DG O6 C0007 : score 6.3492 : x : THR xxxx A0075 <- 3.87 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 3.32 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.69 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 4.06 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 3.82 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.07 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.38 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.45 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >3jr9_B:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP OPTIMAL BINDING SEQUENCE F2 organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 B0085 <- 2.88 -> DG N7 C0007 : score 5.9532 : H : ARG NH2 B0085 <- 2.99 -> DG O6 C0007 : score 6.3492 : x : THR xxxx B0075 <- 3.82 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.07 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.38 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.45 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >3jra_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27BP NON CONSENSUS SEQUENCE DNA F6 organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0084 <- 2.73 -> DA N7 C0018 : score 5.9527 : H : ARG NH2 A0085 <- 3.23 -> DA N7 D0007 : score 1.52802 : x : THR xxxx A0075 <- 3.50 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.99 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 3.64 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx >3jra_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27BP NON CONSENSUS SEQUENCE DNA F6 organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0084 <- 2.73 -> DA N7 C0018 : score 5.9527 : H : ARG NH2 A0085 <- 3.23 -> DA N7 D0007 : score 1.52802 : H : ARG NH2 B0085 <- 2.96 -> DG N7 C0007 : score 6.18031 : x : THR xxxx A0075 <- 3.50 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.99 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 3.64 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 3.79 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.18 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.70 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.64 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >3jrb_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP DNA F24 CONTAINING T-TRACT AT CENTER organism=Escherichia coli : x : THR xxxx A0075 <- 3.94 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 3.39 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0085 <- 3.32 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.28 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0090 <- 3.29 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx >3jrb_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP DNA F24 CONTAINING T-TRACT AT CENTER organism=Escherichia coli : w : ASN OD1 B0084 <- 6.49 -> DA N6 D0018 : score 2.837 : H : ARG NH1 B0085 <- 3.01 -> DG N7 C0007 : score 5.7959 : x : THR xxxx A0075 <- 3.94 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 3.39 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0085 <- 3.32 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.28 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0090 <- 3.29 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 4.03 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 4.39 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.79 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >3jrc_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP DNA F29 CONTAINING 5 G/CS AT CENTER organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0085 <- 3.33 -> DG N7 D0007 : score 5.70785 : H : ASN ND2 B0084 <- 3.26 -> DA N7 D0018 : score 5.33043 : H : ARG NH1 B0085 <- 3.11 -> DG N7 C0007 : score 5.6749 : H : ARG NH2 B0085 <- 3.28 -> DG N7 C0007 : score 5.77169 : H : ARG NH2 B0085 <- 3.00 -> DG O6 C0007 : score 6.336 : x : THR xxxx A0075 <- 3.35 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 3.10 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.05 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 3.61 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 3.66 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.66 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >3jrc_B:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP DNA F29 CONTAINING 5 G/CS AT CENTER organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 B0084 <- 3.26 -> DA N7 D0018 : score 5.33043 : H : ARG NH1 B0085 <- 3.11 -> DG N7 C0007 : score 5.6749 : H : ARG NH2 B0085 <- 3.28 -> DG N7 C0007 : score 5.77169 : H : ARG NH2 B0085 <- 3.00 -> DG O6 C0007 : score 6.336 : x : THR xxxx B0075 <- 3.66 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.66 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >3jrd_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP DNA F25 CONTAINING T2A3 SEQUENCE AT CENTER organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0085 <- 3.06 -> DG O6 C0020 : score 5.767 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.86 -> DG N7 D0007 : score 6.308 : H : ARG NH2 A0085 <- 3.11 -> DG O6 D0007 : score 6.1908 : x : THR xxxx A0075 <- 3.88 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 3.36 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.32 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 3.86 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx >3jrd_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP DNA F25 CONTAINING T2A3 SEQUENCE AT CENTER organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0085 <- 3.06 -> DG O6 C0020 : score 5.767 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.86 -> DG N7 D0007 : score 6.308 : H : ARG NH2 A0085 <- 3.11 -> DG O6 D0007 : score 6.1908 : H : ARG NH1 B0085 <- 3.01 -> DG N7 C0007 : score 5.7959 : x : THR xxxx A0075 <- 3.88 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 3.36 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.32 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 3.86 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 3.92 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.17 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.57 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >3jre_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP DNA F26 CONTAINING A-TRACT AT CENTER organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0085 <- 3.44 -> DG O6 C0020 : score 5.7552 : H : ARG NH2 A0085 <- 3.16 -> DG N7 D0007 : score 5.92492 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.72 -> DG O6 D0007 : score 6.7056 : x : THR xxxx A0075 <- 4.33 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 3.50 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.32 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 4.47 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx >3jre_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP DNA F26 CONTAINING A-TRACT AT CENTER organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0085 <- 3.16 -> DG N7 D0007 : score 5.92492 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.72 -> DG O6 D0007 : score 6.7056 : H : ARG NH2 A0085 <- 3.44 -> DG O6 C0020 : score 5.7552 : H : ARG NH1 B0085 <- 3.11 -> DG N7 C0007 : score 5.6749 : x : THR xxxx A0075 <- 4.33 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 3.50 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.32 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 4.47 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 4.23 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.38 -> DC xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 4.01 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >3jrf_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP DNA F27 CONTAINING A C/G AT CENTER organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0085 <- 3.42 -> DG O6 C0020 : score 5.329 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.71 -> DG N7 D0007 : score 6.49954 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.85 -> DG O6 D0007 : score 6.534 : x : THR xxxx A0075 <- 4.09 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 3.02 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.27 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0090 <- 3.42 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx >3jrf_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP DNA F27 CONTAINING A C/G AT CENTER organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0085 <- 3.42 -> DG O6 C0020 : score 5.329 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.71 -> DG N7 D0007 : score 6.49954 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.85 -> DG O6 D0007 : score 6.534 : H : ARG NH1 B0085 <- 2.84 -> DG N7 C0007 : score 6.0016 : H : ARG NH2 B0085 <- 3.02 -> DG O6 C0007 : score 6.3096 : x : THR xxxx A0075 <- 4.09 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 3.02 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.27 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0090 <- 3.42 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 4.10 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.03 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.99 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >3jrg_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP NON CONSENSUS SEQUENCE DNA F18 organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0085 <- 3.07 -> DG N7 D0007 : score 6.03985 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.79 -> DG O6 D0007 : score 6.6132 : x : THR xxxx A0075 <- 3.60 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 3.06 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.35 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 4.12 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx >3jrg_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP NON CONSENSUS SEQUENCE DNA F18 organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0085 <- 3.07 -> DG N7 D0007 : score 6.03985 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.79 -> DG O6 D0007 : score 6.6132 : H : ARG NH1 B0085 <- 2.99 -> DG N7 C0007 : score 5.8201 : x : THR xxxx A0075 <- 3.60 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 3.06 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.35 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 4.12 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 3.65 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 2.98 -> DC xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.40 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >3jrh_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP NON CONSENSUS SEQUENCE DNA F21 organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0084 <- 2.68 -> DG N7 C0018 : score 4.69596 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.67 -> DG N7 D0007 : score 6.55062 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.70 -> DG O6 D0007 : score 6.732 : x : THR xxxx A0075 <- 3.83 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 3.87 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx >3jrh_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP NON CONSENSUS SEQUENCE DNA F21 organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0084 <- 2.68 -> DG N7 C0018 : score 4.69596 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.67 -> DG N7 D0007 : score 6.55062 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.70 -> DG O6 D0007 : score 6.732 : H : ARG NH1 B0085 <- 2.99 -> DG N7 C0007 : score 5.8201 : H : ARG NH2 B0085 <- 3.03 -> DG O6 C0007 : score 6.2964 : x : THR xxxx A0075 <- 3.83 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 3.87 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 3.95 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.34 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.94 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >3jri_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP NON CONSENSUS SEQUENCE DNA F23 organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0085 <- 3.33 -> DG O6 D0007 : score 5.4385 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.82 -> DG N7 D0007 : score 6.35908 : H : ARG NH2 A0085 <- 3.40 -> DG O6 D0007 : score 5.808 : H : ARG NH1 B0085 <- 2.85 -> DG N7 C0007 : score 5.9895 : H : ARG NH1 B0085 <- 3.32 -> DG O6 C0007 : score 5.45067 : x : THR xxxx A0075 <- 3.75 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 3.09 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 3.85 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0090 <- 4.47 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 3.89 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.13 -> DC xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.69 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0090 <- 3.75 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx >3jri_B:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP NON CONSENSUS SEQUENCE DNA F23 organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 B0085 <- 2.85 -> DG N7 C0007 : score 5.9895 : H : ARG NH1 B0085 <- 3.32 -> DG O6 C0007 : score 5.45067 : x : THR xxxx B0075 <- 3.89 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.13 -> DC xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.69 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0090 <- 3.75 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx >3jsm_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=K65R MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CROSS-LINKED TO DS-DNA AND COMPLEXED WITH TENOFOVIR-DIPHOSPHATE AS THE INCOMING NUCLEOTIDE SUBSTRATE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.39 -> DC O2 P0821 : score 3.78423 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.21 -> DT O2 P0806 : score 4.73287 : H : GLN NE2 A0475 <- 2.73 -> DC O2 P0808 : score 3.7466 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.12 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx >3jsm_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=K65R MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CROSS-LINKED TO DS-DNA AND COMPLEXED WITH TENOFOVIR-DIPHOSPHATE AS THE INCOMING NUCLEOTIDE SUBSTRATE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.39 -> DC O2 P0821 : score 3.78423 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.21 -> DT O2 P0806 : score 4.73287 : H : GLN NE2 A0475 <- 2.73 -> DC O2 P0808 : score 3.7466 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.12 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx >3jso_AB:LexA/Signal_peptidase;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CLASSIC PROTEIN WITH A NEW TWIST: CRYSTAL STRUCTURE OF A LEXA REPRESSOR DNA COMPLEX organism=Escherichia coli K-12 : H : SER OG A0039 <- 2.80 -> DG N7 C0007 : score 4.48205 : H : ASN ND2 A0041 <- 2.75 -> DT O4 C0006 : score 5.33746 : w : ASN OD1 A0041 <- 5.48 -> DA N6 D0017 : score 2.837 : H : GLU OE1 A0045 <- 2.68 -> DC N4 C0005 : score 5.90638 : H : SER OG B0039 <- 2.76 -> DG N7 D0007 : score 4.51791 : H : ASN ND2 B0041 <- 2.71 -> DT O4 D0006 : score 5.37974 : w : ASN OD1 B0041 <- 5.51 -> DA N6 C0017 : score 2.837 : H : GLU OE2 B0045 <- 2.57 -> DC N4 D0005 : score 5.50759 : V : ALA CB B0042 <- 3.75 -> DT C7 D0006 : score 5.66896 : V : ALA CB A0042 <- 3.79 -> DT C7 C0006 : score 5.61297 : x : ARG xxxx A0028 <- 3.91 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0040 <- 4.39 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0044 <- 3.65 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0028 <- 3.79 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0040 <- 4.36 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0044 <- 3.85 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx >3jso_B:LexA/Signal_peptidase;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CLASSIC PROTEIN WITH A NEW TWIST: CRYSTAL STRUCTURE OF A LEXA REPRESSOR DNA COMPLEX organism=Escherichia coli K-12 : H : SER OG B0039 <- 2.76 -> DG N7 D0007 : score 4.51791 : H : ASN ND2 B0041 <- 2.71 -> DT O4 D0006 : score 5.37974 : w : ASN OD1 B0041 <- 5.51 -> DA N6 C0017 : score 2.837 : H : GLU OE2 B0045 <- 2.57 -> DC N4 D0005 : score 5.50759 : V : ALA CB B0042 <- 3.75 -> DT C7 D0006 : score 5.66896 : x : ARG xxxx B0028 <- 3.79 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0040 <- 4.36 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0044 <- 3.85 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx >3jsp_A:LexA/Signal_peptidase;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CLASSIC PROTEIN WITH A NEW TWIST: CRYSTAL STRUCTURE OF A LEXA REPRESSOR DNA COMPLEX organism=Escherichia coli K-12 : H : SER OG A0039 <- 2.78 -> DG N7 C0007 : score 4.49998 : H : ASN ND2 A0041 <- 3.14 -> DT O4 C0006 : score 4.92526 : H : ASN ND2 A0041 <- 2.90 -> DG O6 C0007 : score 5.52569 : H : GLU OE2 A0045 <- 2.71 -> DC N4 C0005 : score 5.36016 : V : ALA CB A0042 <- 3.83 -> DT C7 C0006 : score 5.55698 : x : ARG xxxx A0028 <- 3.75 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0040 <- 4.50 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0044 <- 3.41 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx >3jsp_AB:LexA/Signal_peptidase;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CLASSIC PROTEIN WITH A NEW TWIST: CRYSTAL STRUCTURE OF A LEXA REPRESSOR DNA COMPLEX organism=Escherichia coli K-12 : H : SER OG A0039 <- 2.78 -> DG N7 C0007 : score 4.49998 : H : ASN ND2 A0041 <- 3.14 -> DT O4 C0006 : score 4.92526 : H : ASN ND2 A0041 <- 2.90 -> DG O6 C0007 : score 5.52569 : H : GLU OE2 A0045 <- 2.71 -> DC N4 C0005 : score 5.36016 : H : SER OG B0039 <- 2.70 -> DG N7 D0007 : score 4.57169 : H : ASN ND2 B0041 <- 2.49 -> DG O6 D0007 : score 5.98805 : H : GLU OE2 B0045 <- 2.56 -> DC N4 D0005 : score 5.51812 : V : ALA CB A0042 <- 3.83 -> DT C7 C0006 : score 5.55698 : V : ALA CB B0042 <- 3.73 -> DT C7 D0006 : score 5.69696 : x : ARG xxxx A0028 <- 3.75 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0040 <- 4.50 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0044 <- 3.41 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0028 <- 3.88 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0044 <- 3.23 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx >3jtg_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MOUSE ELF3 C-TERMINAL DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH TYPE II TGF-BETA RECEPTOR PROMOTER DNA organism=Mus musculus : w : GLU OE2 A0327 <- 5.74 -> DA N6 C0106 : score 2.785 : H : ARG NE A0331 <- 2.70 -> DG O6 C0108 : score 4.01985 : H : ARG NH2 A0331 <- 2.87 -> DG N7 C0108 : score 6.29523 : H : ARG NE A0334 <- 3.39 -> DG N7 C0107 : score 3.90002 : H : ARG NH2 A0334 <- 3.31 -> DG N7 C0107 : score 5.73338 : w : ARG NH2 A0334 <- 6.00 -> DA N6 C0106 : score 1.997 : H : TYR OH A0335 <- 2.92 -> DA N6 C0109 : score 4.55842 : H : ARG NH1 A0349 <- 2.78 -> DT O2 B0016 : score 4.32364 : H : ARG NH2 A0349 <- 3.01 -> DA N3 C0103 : score 3.10367 : x : LYS xxxx A0328 <- 3.67 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0332 <- 3.97 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >3jx7_A:ARM_repeat; title=BACILLUS CEREUS ALKYLPURINE DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO DNA CONTAINING A 3-METHYLADENINE ANALOG organism=Bacillus cereus : H : TYR OH A0027 <- 2.74 -> DA N3 C0019 : score 4.2011 : w : LYS NZ A0183 <- 5.64 -> DA N7 C0019 : score 1.655 : x : TRP xxxx A0109 <- 3.22 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0215 <- 4.06 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx >3jxb_C:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE P22 C2 REPRESSOR PROTEIN IN COMPLEX WITH SYNTHETIC OPERATOR 9C organism=Enterobacteria phage P22 : w : ASN ND2 C0032 <- 5.79 -> DT O4 B0024 : score 3.275 : H : GLN NE2 C0037 <- 2.98 -> DT O4 A0014 : score 5.00415 : w : GLN NE2 C0037 <- 6.24 -> DA N6 B0026 : score 2.804 : w : GLU OE1 C0042 <- 6.38 -> DA N6 B0026 : score 2.939 : w : GLU OE1 C0042 <- 6.18 -> DA N6 B0027 : score 2.939 : w : GLU OE1 C0042 <- 5.72 -> DC N4 A0013 : score 3.528 : V : VAL CG2 C0033 <- 3.81 -> DT C7 A0015 : score 6.10777 : x : GLN xxxx C0021 <- 3.98 -> DT xxx B0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0031 <- 3.66 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0034 <- 4.47 -> DT xxx A0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0036 <- 3.68 -> DT xxx B0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0040 <- 3.36 -> DT xxx B0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0043 <- 3.96 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx >3jxb_CD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE P22 C2 REPRESSOR PROTEIN IN COMPLEX WITH SYNTHETIC OPERATOR 9C organism=Enterobacteria phage P22 : w : ASN ND2 C0032 <- 5.79 -> DT O4 B0024 : score 3.275 : H : GLN NE2 C0037 <- 2.98 -> DT O4 A0014 : score 5.00415 : w : GLN NE2 C0037 <- 6.24 -> DA N6 B0026 : score 2.804 : w : GLU OE1 C0042 <- 6.38 -> DA N6 B0026 : score 2.939 : w : GLU OE1 C0042 <- 6.18 -> DA N6 B0027 : score 2.939 : w : GLU OE1 C0042 <- 5.72 -> DC N4 A0013 : score 3.528 : w : ASN ND2 D0032 <- 5.68 -> DT O4 A0004 : score 3.275 : H : GLN NE2 D0037 <- 2.98 -> DT O4 B0034 : score 5.00415 : w : GLN NE2 D0037 <- 6.35 -> DA N6 A0006 : score 2.804 : w : GLU OE1 D0042 <- 6.06 -> DA N6 A0006 : score 2.939 : w : GLU OE1 D0042 <- 6.43 -> DA N6 A0007 : score 2.939 : w : GLU OE1 D0042 <- 5.63 -> DC N4 B0033 : score 3.528 : V : VAL CG2 C0033 <- 3.81 -> DT C7 A0015 : score 6.10777 : V : VAL CG2 D0033 <- 3.79 -> DT C7 B0035 : score 6.13838 : x : GLN xxxx C0021 <- 3.98 -> DT xxx B0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0031 <- 3.66 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0034 <- 4.47 -> DT xxx A0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0036 <- 3.68 -> DT xxx B0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0040 <- 3.36 -> DT xxx B0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0043 <- 3.96 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0021 <- 3.91 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0031 <- 3.49 -> DT xxx B0035 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0036 <- 3.65 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0040 <- 3.44 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0043 <- 3.85 -> DT xxx B0032 : score x.xxxxx >3jxc_LR:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE P22 C2 REPRESSOR PROTEIN IN COMPLEX WITH SYNTHETIC OPERATOR 9T IN THE PRESENCE OF TL+ organism=Enterobacteria phage P22 : w : ASN ND2 L0032 <- 5.60 -> DT O4 A0024 : score 3.275 : H : GLN NE2 L0037 <- 2.92 -> DT O4 B0014 : score 5.06644 : w : GLN NE2 L0037 <- 6.45 -> DA N6 A0026 : score 2.804 : w : GLU OE1 L0042 <- 6.23 -> DA N6 A0026 : score 2.939 : w : GLU OE1 L0042 <- 5.63 -> DC N4 B0013 : score 3.528 : w : ASN ND2 R0032 <- 5.50 -> DT O4 B0004 : score 3.275 : H : GLN NE2 R0037 <- 2.92 -> DT O4 A0034 : score 5.06644 : w : GLN NE2 R0037 <- 6.57 -> DA N6 B0006 : score 2.804 : w : GLU OE1 R0042 <- 5.67 -> DC N4 A0033 : score 3.528 : V : VAL CG2 L0033 <- 3.88 -> DT C7 B0015 : score 6.00062 : x : GLN xxxx L0021 <- 3.95 -> DT xxx A0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0031 <- 3.48 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx L0034 <- 4.41 -> DT xxx B0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0036 <- 3.72 -> DT xxx A0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0040 <- 3.30 -> DT xxx A0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0043 <- 3.86 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx R0021 <- 4.06 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0031 <- 3.51 -> DT xxx A0035 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0033 <- 3.33 -> DT xxx A0035 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx R0034 <- 4.43 -> DT xxx A0034 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0036 <- 3.86 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0040 <- 3.33 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0043 <- 3.90 -> DT xxx A0032 : score x.xxxxx >3jxc_R:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE P22 C2 REPRESSOR PROTEIN IN COMPLEX WITH SYNTHETIC OPERATOR 9T IN THE PRESENCE OF TL+ organism=Enterobacteria phage P22 : w : ASN ND2 R0032 <- 5.50 -> DT O4 B0004 : score 3.275 : H : GLN NE2 R0037 <- 2.92 -> DT O4 A0034 : score 5.06644 : w : GLN NE2 R0037 <- 6.57 -> DA N6 B0006 : score 2.804 : w : GLU OE1 R0042 <- 5.67 -> DC N4 A0033 : score 3.528 : x : GLN xxxx R0021 <- 4.06 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0031 <- 3.51 -> DT xxx A0035 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0033 <- 3.33 -> DT xxx A0035 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx R0034 <- 4.43 -> DT xxx A0034 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0036 <- 3.86 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0040 <- 3.33 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0043 <- 3.90 -> DT xxx A0032 : score x.xxxxx >3jxd_L:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE P22 C2 REPRESSOR PROTEIN IN COMPLEX WITH SYNTHETIC OPERATOR 9C IN THE PRESENCE OF RB+ organism=Enterobacteria phage P22 : w : ASN ND2 L0032 <- 5.55 -> DT O4 A0024 : score 3.275 : H : GLN NE2 L0037 <- 2.87 -> DT O4 B0014 : score 5.11835 : w : GLN NE2 L0037 <- 6.31 -> DA N6 A0026 : score 2.804 : w : GLU OE1 L0042 <- 5.90 -> DA N6 A0026 : score 2.939 : w : GLU OE1 L0042 <- 5.64 -> DC N4 B0013 : score 3.528 : V : VAL CG2 L0033 <- 3.79 -> DT C7 B0015 : score 6.13838 : x : GLN xxxx L0021 <- 3.99 -> DT xxx A0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0031 <- 3.38 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx L0034 <- 4.31 -> DT xxx B0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0036 <- 3.75 -> DT xxx A0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0040 <- 3.30 -> DT xxx A0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0043 <- 3.89 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx >3jxd_LR:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE P22 C2 REPRESSOR PROTEIN IN COMPLEX WITH SYNTHETIC OPERATOR 9C IN THE PRESENCE OF RB+ organism=Enterobacteria phage P22 : w : ASN ND2 L0032 <- 5.55 -> DT O4 A0024 : score 3.275 : H : GLN NE2 L0037 <- 2.87 -> DT O4 B0014 : score 5.11835 : w : GLN NE2 L0037 <- 6.31 -> DA N6 A0026 : score 2.804 : w : GLU OE1 L0042 <- 5.90 -> DA N6 A0026 : score 2.939 : w : GLU OE1 L0042 <- 5.64 -> DC N4 B0013 : score 3.528 : w : ASN ND2 R0032 <- 5.33 -> DT O4 B0004 : score 3.275 : H : GLN NE2 R0037 <- 2.88 -> DT O4 A0034 : score 5.10797 : w : GLN NE2 R0037 <- 6.54 -> DA N6 B0006 : score 2.804 : w : GLU OE1 R0042 <- 6.00 -> DA N6 B0007 : score 2.939 : w : GLU OE1 R0042 <- 5.40 -> DC N4 A0033 : score 3.528 : w : GLU OE1 R0042 <- 6.60 -> DA N6 B0006 : score 2.939 : V : VAL CG2 R0033 <- 3.85 -> DT C7 A0035 : score 6.04654 : V : VAL CG2 L0033 <- 3.79 -> DT C7 B0015 : score 6.13838 : x : GLN xxxx L0021 <- 3.99 -> DT xxx A0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0031 <- 3.38 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx L0034 <- 4.31 -> DT xxx B0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0036 <- 3.75 -> DT xxx A0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0040 <- 3.30 -> DT xxx A0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0043 <- 3.89 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx R0021 <- 4.07 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0031 <- 3.45 -> DT xxx A0035 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx R0034 <- 4.24 -> DT xxx A0034 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0036 <- 3.89 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0040 <- 3.29 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0043 <- 3.81 -> DT xxx A0032 : score x.xxxxx >3jxy_A:ARM_repeat; title=BACILLUS CEREUS ALKYLPURINE DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO DNA CONTAINING A GT MISMATCH organism=Bacillus cereus : H : TYR OH A0027 <- 2.77 -> DA N3 C0007 : score 4.17619 : w : TYR OH A0027 <- 5.55 -> DT N3 C0006 : score 1.817 : w : LYS NZ A0183 <- 5.63 -> DA N7 C0007 : score 1.655 : x : TRP xxxx A0109 <- 3.21 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0215 <- 3.82 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx >3jxz_A:ARM_repeat; title=BACILLUS CEREUS ALKYLPURINE DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO DNA CONTAINING AN ABASIC SITE (ACROSS FROM T) organism=Bacillus cereus : H : TYR OH A0027 <- 2.83 -> DC O2 C0018 : score 3.47645 : w : ARG NH1 A0215 <- 5.59 -> DG N7 B0002 : score 2.063 : w : GLU OE2 A0216 <- 5.72 -> DG O6 B0002 : score 2.892 : H : LYS NZ A0219 <- 3.09 -> DG O6 B0003 : score 5.44548 : w : LYS NZ A0219 <- 6.16 -> DG O6 B0002 : score 3.005 : x : LYS xxxx A0183 <- 4.45 -> DC xxx C0019 : score x.xxxxx >3jy1_A:ARM_repeat; title=BACILLUS CEREUS ALKYLPURINE DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO DNA CONTAINING AN ABASIC SITE (ACROSS FROM C) organism=Bacillus cereus : H : TYR OH A0027 <- 3.03 -> DC O2 C0018 : score 3.33655 : w : TYR OH A0027 <- 6.33 -> DG N2 B0006 : score 2.834 : w : ARG NH1 A0215 <- 5.64 -> DG N7 B0002 : score 2.063 : w : GLU OE1 A0216 <- 6.23 -> DC N4 C0018 : score 3.528 : w : GLU OE2 A0216 <- 6.19 -> DG O6 B0003 : score 2.892 : w : LYS NZ A0219 <- 6.41 -> DG O6 B0003 : score 3.005 : x : LYS xxxx A0183 <- 4.43 -> DC xxx C0019 : score x.xxxxx >3jyt_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=K65R MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CROSS-LINKED TO DS-DNA AND COMPLEXED WITH DATP AS THE INCOMING NUCLEOTIDE SUBSTRATE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.39 -> DC O2 P0821 : score 3.78423 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.91 -> DT O2 P0806 : score 4.1402 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.04 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.34 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >3k0s_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI DNA MISMATCH REPAIR PROTEIN MUTS, D693N MUTANT, IN COMPLEX WITH GT MISMATCHED DNA organism=Escherichia coli : w : ASP OD2 A0035 <- 5.79 -> DA N3 E0008 : score 1.331 : H : GLU OE2 A0038 <- 2.76 -> DT N3 F0022 : score 2.65698 : H : ARG NH2 A0058 <- 2.38 -> DC O2 E0011 : score 4.00941 : V : PHE CZ A0036 <- 3.83 -> DT C7 F0022 : score 7.06151 : x : MET xxxx A0033 <- 3.48 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 3.42 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.22 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >3k4x_A:DNA_clamp; title=EUKARYOTIC SLIDING CLAMP PCNA BOUND TO DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A0080 <- 3.96 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0683 <- 4.14 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx >3k57_A:Ribonuclease_H-like;DNA/RNA_polymerases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI POL II-NORMAL DNA-DATP TERNARY COMPLEX organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0615 <- 2.94 -> DA N3 P0912 : score 2.69917 : H : ARG NH1 A0638 <- 3.04 -> DG N3 P0910 : score 2.90604 : w : ARG NH1 A0689 <- 5.98 -> DG N7 P0910 : score 2.063 : w : ASN ND2 A0698 <- 6.20 -> DA N3 P0907 : score 2.277 >3k58_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI POL II-NORMAL DNA-DTTP TERNARY COMPLEX organism=Escherichia coli : w : TYR OH A0500 <- 6.13 -> DG N3 T0805 : score 3.344 : H : LYS NZ A0615 <- 2.87 -> DA N3 P0912 : score 2.73805 : H : ARG NH1 A0638 <- 3.22 -> DG N3 P0910 : score 2.79615 : H : ARG NH2 A0638 <- 3.34 -> DC O2 P0909 : score 3.29926 : w : ASN ND2 A0698 <- 5.61 -> DA N3 P0907 : score 2.277 : x : SER xxxx A0369 <- 3.58 -> DA xxx T0804 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0494 <- 3.94 -> DA xxx T0804 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0497 <- 4.40 -> DA xxx T0804 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0498 <- 3.68 -> DA xxx T0804 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0689 <- 3.46 -> DC xxx P0909 : score x.xxxxx >3k59_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI POL II-NORMAL DNA-DCTP TERNARY COMPLEX organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0615 <- 2.83 -> DA N3 P0912 : score 2.76026 : H : ARG NH1 A0638 <- 3.15 -> DG N3 P0910 : score 2.83888 : w : ASN ND2 A0698 <- 6.01 -> DA N3 P0907 : score 2.277 : x : ARG xxxx A0689 <- 3.34 -> DC xxx P0909 : score x.xxxxx >3k5l_A:Ribonuclease_H-like;DNA/RNA_polymerases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI POL II-ABASIC DNA-DATP LT(0, 3) TERNARY COMPLEX organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0615 <- 3.05 -> DA N3 P0912 : score 2.63808 : H : ARG NH2 A0638 <- 3.42 -> DG N3 P0910 : score 3.16258 : x : ARG xxxx A0689 <- 3.45 -> DC xxx P0909 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0698 <- 4.17 -> DA xxx P0907 : score x.xxxxx >3k5m_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI POL II-ABASIC DNA-DDGTP LT(-2, 2) TERNARY COMPLEX organism=Escherichia coli : w : TYR OH A0500 <- 5.89 -> DC O2 T0803 : score 1.343 : w : THR OG1 A0546 <- 5.72 -> DG N3 P0913 : score 2.036 : H : LYS NZ A0615 <- 3.14 -> DA N3 P0912 : score 2.58809 : H : ARG NH2 A0616 <- 2.75 -> DC O2 T0808 : score 3.73571 : H : ARG NH1 A0638 <- 2.87 -> DG N3 P0910 : score 3.00983 : H : ARG NH2 A0638 <- 2.93 -> DC O2 P0909 : score 3.60255 : x : SER xxxx A0369 <- 3.34 -> DC xxx T0802 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0494 <- 3.90 -> DC xxx T0802 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0498 <- 3.96 -> DC xxx T0802 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0689 <- 3.27 -> DC xxx P0909 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0698 <- 3.79 -> DG xxx T0813 : score x.xxxxx >3k5n_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI POL II-ABASIC DNA BINARY COMPLEX organism=Escherichia coli : x : PHE xxxx A0285 <- 4.35 -> DA xxx P0912 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0638 <- 3.63 -> DC xxx P0909 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0689 <- 3.46 -> DG xxx P0908 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0698 <- 4.04 -> DG xxx T0816 : score x.xxxxx >3k70_BCD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLETE INITIATION COMPLEX OF RECBCD organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : H : ASN OD1 C1078 <- 2.95 -> DA N6 X0011 : score 5.84114 : x : ILE xxxx B0252 <- 4.46 -> DG xxx X0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0824 <- 3.36 -> DC xxx X0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1079 <- 3.63 -> DT xxx X0045 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1080 <- 3.14 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C1081 <- 3.94 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx >3k70_EFG:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLETE INITIATION COMPLEX OF RECBCD organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : H : ASN OD1 F1078 <- 3.18 -> DA N6 Y0011 : score 5.56414 : x : ILE xxxx E0252 <- 4.38 -> DG xxx Y0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0824 <- 3.40 -> DC xxx Y0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F1079 <- 3.74 -> DT xxx Y0045 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F1080 <- 3.25 -> DA xxx Y0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F1081 <- 4.13 -> DA xxx Y0011 : score x.xxxxx >3k9f_AC:Type_II_DNA_topoisomerase; title=DETAILED STRUCTURAL INSIGHT INTO THE QUINOLONE-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IIA TOPOISOMERASES organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : TYR xxxx A0020 <- 4.09 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0079 <- 3.93 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0080 <- 3.96 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0170 <- 3.22 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0458 <- 3.55 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx >3k9f_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=DETAILED STRUCTURAL INSIGHT INTO THE QUINOLONE-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IIA TOPOISOMERASES organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : ARG xxxx B0028 <- 3.85 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0079 <- 4.05 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0080 <- 4.01 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0117 <- 3.92 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0170 <- 3.27 -> DC xxx H0008 : score x.xxxxx >3k9f_BD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=DETAILED STRUCTURAL INSIGHT INTO THE QUINOLONE-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IIA TOPOISOMERASES organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : ARG xxxx B0028 <- 3.85 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0079 <- 4.05 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0080 <- 4.01 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0117 <- 3.92 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0170 <- 3.27 -> DC xxx H0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0458 <- 3.52 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx >3k9f_C:Type_II_DNA_topoisomerase; title=DETAILED STRUCTURAL INSIGHT INTO THE QUINOLONE-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IIA TOPOISOMERASES organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : LYS xxxx C0458 <- 3.55 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx >3kd1_E:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CLOSED BINARY COMPLEX OF AN RB69 GP43 FINGERS DOMAIN MUTANT COMPLEXED WITH AN ACYCLIC GMP TERMINATED PRIMER TEMPLATE PAIR. organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH E0567 <- 5.15 -> DT O2 T0005 : score 3.068 : w : THR OG1 E0622 <- 6.29 -> DA N3 P0113 : score 2.845 : H : LYS NZ E0706 <- 2.81 -> DA N3 P0112 : score 2.77137 : w : LYS NZ E0734 <- 5.47 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >3kd5_E:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CLOSED TERNARY COMPLEX OF AN RB69 GP43 FINGERS DOMAIN MUTANT COMPLEXED WITH AN ACYCLIC GMP TERMINATED PRIMER TEMPLATE PAIR AND PHOSPHONOFORMIC ACID. organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH E0567 <- 5.48 -> DT O2 T0005 : score 3.068 : w : THR OG1 E0622 <- 5.66 -> DA N3 P0113 : score 2.845 : H : LYS NZ E0706 <- 2.92 -> DA N3 P0112 : score 2.71028 : w : LYS NZ E0734 <- 5.59 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >3kde_C:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE THAP DOMAIN FROM D. MELANOGASTER P-ELEMENT TRANSPOSASE IN COMPLEX WITH ITS NATURAL DNA BINDING SITE organism=Drosophila melanogaster : H : HIS NE2 C0018 <- 2.81 -> DG O6 A0006 : score 7.93794 : w : GLN OE1 C0042 <- 5.91 -> DC N4 B0013 : score 3.488 : H : ARG NH1 C0065 <- 2.84 -> DT O2 B0017 : score 4.27196 : H : ARG NH2 C0065 <- 3.12 -> DT O2 B0017 : score 3.9624 : w : ARG NH1 C0065 <- 5.91 -> DA N3 A0004 : score 2.585 : w : ARG NH1 C0067 <- 5.93 -> DA N3 B0018 : score 2.585 : w : ARG NH1 C0067 <- 5.54 -> DA N3 B0019 : score 2.585 : x : TYR xxxx C0003 <- 3.99 -> DC xxx B0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0040 <- 3.80 -> DC xxx B0013 : score x.xxxxx >3ket_A:NADP-binding_Rossmann-fold_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A REX-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN FROM STREPTOCOCCUS AGALACTIAE BOUND TO A PALINDROMIC OPERATOR organism=Streptococcus agalactiae serogroup III : H : ARG NE A0050 <- 2.93 -> DG N7 B0005 : score 4.30683 : H : ARG NH2 A0050 <- 2.98 -> DG O6 B0005 : score 6.3624 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.94 -> DG N7 B0007 : score 6.20585 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.71 -> DG O6 B0007 : score 6.7188 : H : ARG NH1 A0062 <- 3.14 -> DA N3 C0042 : score 3.43167 : V : ALA CB A0047 <- 3.85 -> DT C7 C0037 : score 5.52899 : x : THR xxxx A0048 <- 3.75 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0054 <- 4.36 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0055 <- 4.23 -> DT xxx C0036 : score x.xxxxx >3khc_B:Clavaminate_synthase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI ALKB IN COMPLEX WITH SSDNA CONTAINING A 1-METHYLGUANINE LESION organism=Escherichia coli K-12 : x : TYR xxxx B0055 <- 3.38 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0129 <- 3.77 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0161 <- 3.56 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >3khg_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 EXTENSION TERNARY COMPLEX WITH MISINSERTED A OPPOSITE THE 2- AMINOFLUORENE-GUANINE [AF]G LESION organism=Sulfolobus solfataricus P2 : x : HIS xxxx A0285 <- 3.90 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.36 -> DT xxx E0908 : score x.xxxxx >3khh_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 EXTENSION TERNARY COMPLEX WITH A C BASE OPPOSITE THE 2- AMINOFLUORENE-GUANINE [AF]G LESION organism=Sulfolobus solfataricus P2 : x : HIS xxxx B1285 <- 3.62 -> DT xxx H1808 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1295 <- 4.18 -> DT xxx H1811 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1336 <- 3.34 -> DT xxx J1908 : score x.xxxxx >3khl_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 POST-EXTENSION TERNARY COMPLEX WITH MISINSERTED A OPPOSITE THE 2- AMINOFLUORENE-GUANINE [AF]G LESION organism=Sulfolobus solfataricus P2 : w : LYS NZ B1078 <- 6.03 -> DC O2 J1905 : score 1.3 : w : ARG NH2 B1336 <- 5.21 -> DT O4 J1908 : score 2.366 : V : ARG CZ B1336 <- 3.87 -> DT C7 J1908 : score 2.09499 : x : VAL xxxx B1032 <- 3.39 -> DA xxx J1904 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B1042 <- 3.58 -> DA xxx J1904 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B1044 <- 4.30 -> DA xxx J1904 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1244 <- 4.41 -> DT xxx J1908 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1332 <- 3.76 -> DC xxx J1905 : score x.xxxxx >3khr_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 POST-EXTENSION TERNARY COMPLEX WITH THE CORRECT C OPPOSITE THE 2- AMINOFLUORENE-GUANINE [AF]G LESION organism=Sulfolobus solfataricus P2 : w : LYS NZ B1078 <- 6.06 -> DC O2 J1905 : score 1.3 : w : ARG NH2 B1336 <- 5.45 -> DT O4 J1908 : score 2.366 : x : VAL xxxx B1032 <- 3.45 -> DA xxx J1904 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B1042 <- 3.67 -> DA xxx J1904 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B1044 <- 4.50 -> DA xxx J1904 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1244 <- 4.45 -> DT xxx J1908 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1332 <- 3.94 -> DC xxx J1905 : score x.xxxxx >3kjp_A:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HPOT1V2-GGTTAGGGTTAG organism=Homo sapiens : H : SER OG A0038 <- 3.23 -> DT O2 B0004 : score 3.37946 : H : ASP OD2 A0042 <- 2.67 -> DT N3 B0004 : score 3.68045 : H : THR OG1 A0048 <- 2.78 -> DG N7 B0007 : score 3.51271 : H : ASP OD1 A0224 <- 2.90 -> DG N2 B0012 : score 5.047 : H : SER OG A0243 <- 2.91 -> DT O2 B0009 : score 3.61609 : H : SER OG A0243 <- 2.67 -> DT N3 B0009 : score 2.03885 : H : HIS ND1 A0266 <- 2.92 -> DG N7 B0012 : score 6.07372 : H : ARG NH1 A0273 <- 2.86 -> DT O2 B0009 : score 4.25473 : V : PHE CD2 A0062 <- 3.67 -> DT C7 B0004 : score 6.72343 : x : LYS xxxx A0030 <- 4.14 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0031 <- 3.22 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.43 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0058 <- 3.93 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0060 <- 3.35 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0087 <- 3.02 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0089 <- 3.37 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 2.63 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0096 <- 3.92 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0161 <- 2.78 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0223 <- 3.35 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0245 <- 3.40 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0271 <- 3.33 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx >3kjv_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0115 <- 3.13 -> DG N2 T0706 : score 4.56702 : H : TYR OH A0183 <- 2.87 -> DC O2 P0821 : score 3.44847 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.39 -> DC O2 T0723 : score 3.2193 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.70 -> DT O2 P0806 : score 4.318 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.80 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.73 -> DG xxx T0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.89 -> DG xxx T0706 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.94 -> DG xxx T0721 : score x.xxxxx >3kk1_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE-DNA COMPLEX WITH NUCEOTIDE INHIBITOR GS- 9148-DIPHOSPHATE BOUND IN NUCLEOTIDE SITE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.69 -> DC O2 P0821 : score 3.57438 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.66 -> DT O2 P0806 : score 4.35187 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.69 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.91 -> DG xxx T0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.93 -> DG xxx T0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.84 -> DG xxx T0706 : score x.xxxxx >3kk1_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE-DNA COMPLEX WITH NUCEOTIDE INHIBITOR GS- 9148-DIPHOSPHATE BOUND IN NUCLEOTIDE SITE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.69 -> DC O2 P0821 : score 3.57438 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.66 -> DT O2 P0806 : score 4.35187 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.69 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.91 -> DG xxx T0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.93 -> DG xxx T0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.84 -> DG xxx T0706 : score x.xxxxx >3kk2_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE-DNA COMPLEX WITH DATP BOUND IN THE NUCLEOTIDE BINDING SITE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.39 -> DC O2 P0821 : score 3.78423 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.70 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.37 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.86 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0258 <- 4.36 -> DG xxx P0817 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.39 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.32 -> DT xxx P0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.88 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >3kk2_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE-DNA COMPLEX WITH DATP BOUND IN THE NUCLEOTIDE BINDING SITE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.39 -> DC O2 P0821 : score 3.78423 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.70 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.37 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.86 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0258 <- 4.36 -> DG xxx P0817 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.39 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.32 -> DT xxx P0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.88 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >3kk3_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE-DNA COMPLEX WITH GS-9148 TERMINATED PRIMER organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.90 -> DC O2 P0821 : score 3.42749 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.59 -> DT O2 P0806 : score 4.41113 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.81 -> DC xxx T0709 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.46 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.28 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0258 <- 3.85 -> DG xxx P0817 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.29 -> DC xxx T0711 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.44 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >3kk3_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE-DNA COMPLEX WITH GS-9148 TERMINATED PRIMER organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.90 -> DC O2 P0821 : score 3.42749 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.59 -> DT O2 P0806 : score 4.41113 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.81 -> DC xxx T0709 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.46 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.28 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0258 <- 3.85 -> DG xxx P0817 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.29 -> DC xxx T0711 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.44 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >3kle_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AZT-RESISTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CROSSLINKED TO A DSDNA WITH A BOUND EXCISION PRODUCT, AZTPPPPA organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 3.08 -> DC O2 D0821 : score 3.30158 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.20 -> DT O2 D0806 : score 3.89467 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.07 -> DG xxx C0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.46 -> DT xxx D0813 : score x.xxxxx >3kle_EF:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AZT-RESISTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CROSSLINKED TO A DSDNA WITH A BOUND EXCISION PRODUCT, AZTPPPPA organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH E0183 <- 3.04 -> DC O2 H0821 : score 3.32956 : H : ARG NH2 E0448 <- 3.15 -> DT O2 H0806 : score 3.937 : x : ILE xxxx E0094 <- 3.31 -> DG xxx G0708 : score x.xxxxx >3kle_MN:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AZT-RESISTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CROSSLINKED TO A DSDNA WITH A BOUND EXCISION PRODUCT, AZTPPPPA organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH M0183 <- 2.86 -> DC O2 P0821 : score 3.45547 : H : ARG NH2 M0448 <- 3.26 -> DT O2 P0806 : score 3.84387 : x : ILE xxxx M0094 <- 2.85 -> DG xxx O0708 : score x.xxxxx >3klf_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF WILD-TYPE HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CROSSLINKED TO A DSDNA WITH A BOUND EXCISION PRODUCT, AZTPPPPA organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.93 -> DC O2 D0821 : score 3.4065 : x : ILE xxxx A0094 <- 2.81 -> DG xxx C0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.69 -> DT xxx D0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.44 -> DG xxx C0721 : score x.xxxxx >3klf_EF:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF WILD-TYPE HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CROSSLINKED TO A DSDNA WITH A BOUND EXCISION PRODUCT, AZTPPPPA organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH E0183 <- 2.98 -> DC O2 H0821 : score 3.37153 : x : ILE xxxx E0094 <- 2.97 -> DG xxx G0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0448 <- 3.36 -> DT xxx H0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0475 <- 4.30 -> DG xxx G0721 : score x.xxxxx >3klf_MN:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF WILD-TYPE HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CROSSLINKED TO A DSDNA WITH A BOUND EXCISION PRODUCT, AZTPPPPA organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH M0183 <- 2.86 -> DC O2 P0821 : score 3.45547 : x : ILE xxxx M0094 <- 2.88 -> DG xxx O0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0448 <- 3.26 -> DC xxx O0723 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx M0475 <- 4.32 -> DG xxx O0721 : score x.xxxxx >3klg_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AZT-RESISTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CROSSLINKED TO PRE-TRANSLOCATION AZTMP-TERMINATED DNA (COMPLEX N) organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.55 -> DC O2 D0821 : score 3.67231 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.05 -> DT O2 D0806 : score 4.09109 : x : PHE xxxx A0061 <- 4.05 -> DA xxx C0705 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.68 -> DA xxx C0705 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.53 -> DG xxx C0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.01 -> DT xxx C0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.26 -> DA xxx D0822 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0266 <- 4.44 -> DC xxx D0820 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.17 -> DG xxx C0721 : score x.xxxxx >3klg_EF:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AZT-RESISTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CROSSLINKED TO PRE-TRANSLOCATION AZTMP-TERMINATED DNA (COMPLEX N) organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH E0183 <- 2.82 -> DC O2 H0821 : score 3.48345 : H : ARG NH1 E0448 <- 3.09 -> DT O2 H0806 : score 4.05664 : x : PHE xxxx E0061 <- 4.03 -> DA xxx G0705 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0074 <- 3.78 -> DA xxx G0705 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E0094 <- 3.54 -> DG xxx G0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0157 <- 4.18 -> DT xxx G0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0184 <- 4.39 -> DA xxx H0822 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0475 <- 4.40 -> DG xxx G0721 : score x.xxxxx >3klh_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AZT-RESISTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CROSSLINKED TO POST-TRANSLOCATION AZTMP-TERMINATED DNA (COMPLEX P) organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.71 -> DC O2 F0821 : score 3.56039 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.78 -> DT O2 F0806 : score 4.32364 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.56 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.37 -> DA xxx E0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.18 -> DG xxx E0707 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.49 -> DC xxx E0711 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.19 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0358 <- 4.40 -> DT xxx F0812 : score x.xxxxx >3kmd_ABCD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE P53 CORE DOMAIN BOUND TO A FULL CONSENSUS SITE AS A SELF-ASSEMBLED TETRAMER organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0280 <- 2.85 -> DG O6 E0017 : score 6.0225 : H : ARG NH2 A0280 <- 3.05 -> DG N7 E0017 : score 6.06538 : H : LYS NZ B0120 <- 2.86 -> DG N7 E0012 : score 5.32127 : H : LYS NZ B0120 <- 2.97 -> DG O6 E0013 : score 5.58422 : H : SER OG B0121 <- 3.30 -> DA N7 E0011 : score 4.01769 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.76 -> DG O6 F0007 : score 6.132 : H : ARG NH2 B0280 <- 2.92 -> DG N7 F0007 : score 6.23138 : w : ARG NH1 C0248 <- 5.86 -> DA N3 F0015 : score 2.585 : w : ARG NH2 C0248 <- 6.06 -> DA N3 F0015 : score 2.092 : H : CYS SG C0277 <- 3.21 -> DC N4 F0018 : score -3.18711 : H : ARG NH1 C0280 <- 2.59 -> DG O6 F0017 : score 6.33883 : H : ARG NH2 C0280 <- 2.90 -> DG N7 F0017 : score 6.25692 : H : LYS NZ D0120 <- 2.80 -> DG N7 F0012 : score 5.3859 : H : LYS NZ D0120 <- 2.81 -> DG O6 F0013 : score 5.76921 : H : SER OG D0121 <- 3.01 -> DA N7 F0011 : score 4.27661 : w : ARG NH1 D0248 <- 6.29 -> DA N3 E0005 : score 2.585 : H : ARG NH1 D0280 <- 2.77 -> DG O6 E0007 : score 6.11983 : H : ARG NH2 D0280 <- 3.06 -> DG N7 E0007 : score 6.05262 : x : ALA xxxx A0276 <- 4.15 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0277 <- 3.40 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 3.95 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0277 <- 3.32 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0276 <- 3.85 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0277 <- 3.44 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0120 <- 3.12 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0276 <- 3.99 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx >3kmd_C:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE P53 CORE DOMAIN BOUND TO A FULL CONSENSUS SITE AS A SELF-ASSEMBLED TETRAMER organism=HOMO SAPIENS : w : ARG NH1 C0248 <- 5.86 -> DA N3 F0015 : score 2.585 : w : ARG NH2 C0248 <- 6.06 -> DA N3 F0015 : score 2.092 : H : CYS SG C0277 <- 3.21 -> DC N4 F0018 : score -3.18711 : H : ARG NH1 C0280 <- 2.59 -> DG O6 F0017 : score 6.33883 : H : ARG NH2 C0280 <- 2.90 -> DG N7 F0017 : score 6.25692 : x : LYS xxxx C0120 <- 3.12 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0276 <- 3.99 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx >3kmp_A:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD1-MH1/DNA COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0074 <- 3.10 -> DG N7 D0006 : score 5.687 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.85 -> DG O6 D0006 : score 6.534 : H : GLN OE1 A0076 <- 3.10 -> DA N6 C0009 : score 5.68941 : H : LYS NZ A0081 <- 3.18 -> DA N7 C0009 : score 2.71395 >3kmp_AB:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD1-MH1/DNA COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0074 <- 3.10 -> DG N7 D0006 : score 5.687 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.85 -> DG O6 D0006 : score 6.534 : H : GLN OE1 A0076 <- 3.10 -> DA N6 C0009 : score 5.68941 : H : LYS NZ A0081 <- 3.18 -> DA N7 C0009 : score 2.71395 : H : ARG NH1 B0074 <- 3.18 -> DG N7 C0005 : score 5.5902 : H : ARG NH2 B0074 <- 3.00 -> DG O6 C0005 : score 6.336 : H : GLN OE1 B0076 <- 3.12 -> DA N6 D0010 : score 5.6652 : H : LYS NZ B0081 <- 3.05 -> DA N7 D0010 : score 2.79032 >3knt_A:DNA-glycosylase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF METHANOCALDOCOCCUS JANNASCHII 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE/LYASE IN COMPLEX WITH 15MER DNA CONTAINING 8-OXOGUANINE organism=Methanocaldococcus jannaschii : H : ARG NE A0084 <- 2.76 -> DC O2 F0009 : score 2.68025 : H : ARG NH2 A0084 <- 2.86 -> DC N3 F0009 : score 2.26353 : x : ALA xxxx A0048 <- 4.24 -> DG xxx E0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0049 <- 3.15 -> DG xxx E0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0085 <- 3.33 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 2.99 -> DG xxx E0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0148 <- 3.89 -> DA xxx E0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0166 <- 3.61 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx >3ko2_AB:Homing_endonucleases; title=I-MSOI RE-DESIGNED FOR ALTERED DNA CLEAVAGE SPECIFICITY (-7C) organism=Monomastix sp. : H : ARG NH1 A0028 <- 2.56 -> DG N7 D0018 : score 6.3404 : H : ARG NH2 A0028 <- 3.12 -> DG O6 D0019 : score 6.1776 : H : ARG NE A0032 <- 3.02 -> DA N7 C0003 : score -8.71063 : H : ASP OD1 A0034 <- 2.87 -> DC N4 C0002 : score 5.27004 : H : ARG NH2 A0072 <- 2.81 -> DG N7 C0008 : score 6.37185 : H : ARG NH2 A0072 <- 3.22 -> DG O6 C0008 : score 6.0456 : H : ARG NH1 A0075 <- 2.97 -> DG N7 D0015 : score 5.8443 : H : ARG NH1 A0075 <- 2.95 -> DG O6 D0015 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0075 <- 2.85 -> DG O6 D0015 : score 6.534 : H : ARG NH2 B0028 <- 3.20 -> DG N7 C0019 : score 5.87385 : H : ARG NH1 B0032 <- 2.96 -> DT O4 C0020 : score 3.16337 : H : GLN OE1 B0041 <- 3.27 -> DA N6 D0004 : score 5.48362 : H : ARG NH1 B0072 <- 3.06 -> DG N7 D0008 : score 5.7354 : H : ARG NH2 B0072 <- 2.99 -> DG O6 D0008 : score 6.3492 : H : ARG NH1 B0075 <- 3.15 -> DG N7 C0015 : score 5.6265 : x : SER xxxx A0024 <- 4.19 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0026 <- 3.86 -> DC xxx D0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0035 <- 3.07 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0041 <- 3.92 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0049 <- 3.70 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0077 <- 4.12 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0079 <- 4.02 -> DC xxx D0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0024 <- 3.98 -> DA xxx C0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0026 <- 3.68 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0030 <- 4.21 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0034 <- 3.28 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0035 <- 3.64 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0043 <- 3.65 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0049 <- 3.87 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0077 <- 3.96 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0079 <- 4.09 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0085 <- 3.71 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx >3ko2_FG:Homing_endonucleases; title=I-MSOI RE-DESIGNED FOR ALTERED DNA CLEAVAGE SPECIFICITY (-7C) organism=Monomastix sp. : H : ARG NH2 F0032 <- 3.07 -> DG N7 H0004 : score 6.03985 : H : ARG NH1 F0072 <- 2.98 -> DG O6 H0008 : score 5.86433 : H : ARG NH2 F0072 <- 2.85 -> DG N7 H0008 : score 6.32077 : H : ARG NH1 F0075 <- 3.14 -> DG N7 I0015 : score 5.6386 : H : ARG NH1 F0075 <- 3.00 -> DG O6 I0015 : score 5.84 : H : ARG NH2 F0075 <- 3.04 -> DG O6 I0015 : score 6.2832 : H : ARG NH1 G0032 <- 3.17 -> DA N7 I0004 : score 2.3708 : H : ARG NH2 G0072 <- 3.22 -> DG O6 I0008 : score 6.0456 : x : SER xxxx F0024 <- 3.93 -> DA xxx I0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0026 <- 3.92 -> DC xxx I0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0028 <- 3.46 -> DG xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0034 <- 3.59 -> DC xxx H0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0035 <- 3.81 -> DC xxx H0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0049 <- 3.93 -> DG xxx I0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0077 <- 4.05 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0079 <- 4.32 -> DC xxx I0014 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0085 <- 3.31 -> DA xxx H0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0024 <- 4.05 -> DA xxx H0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0026 <- 3.82 -> DC xxx H0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0028 <- 3.21 -> DA xxx H0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0030 <- 3.38 -> DT xxx H0020 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx G0034 <- 4.05 -> DG xxx I0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0043 <- 3.51 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0049 <- 3.36 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0075 <- 2.85 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx G0077 <- 4.20 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0079 <- 4.08 -> DA xxx H0014 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx G0085 <- 3.85 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx >3ko2_G:Homing_endonucleases; title=I-MSOI RE-DESIGNED FOR ALTERED DNA CLEAVAGE SPECIFICITY (-7C) organism=Monomastix sp. : H : ARG NH1 G0032 <- 3.17 -> DA N7 I0004 : score 2.3708 : H : ARG NH2 G0072 <- 3.22 -> DG O6 I0008 : score 6.0456 : x : SER xxxx G0024 <- 4.05 -> DA xxx H0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0026 <- 3.82 -> DC xxx H0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0028 <- 3.21 -> DA xxx H0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0030 <- 3.38 -> DT xxx H0020 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx G0034 <- 4.05 -> DG xxx I0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0043 <- 3.51 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0049 <- 3.36 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0075 <- 2.85 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx G0077 <- 4.20 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0079 <- 4.08 -> DA xxx H0014 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx G0085 <- 3.85 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx >3kov_AB:SRF-like; title=STRUCTURE OF MEF2A BOUND TO DNA REVEALS A COMPLETELY FOLDED MADS- BOX/MEF2 DOMAIN THAT RECOGNIZES DNA AND RECRUITS TRANSCRIPTION CO- FACTORS organism=Homo sapiens : H : ARG NE B0003 <- 2.72 -> DT O2 D0005 : score 2.61815 : H : LYS NZ B0023 <- 2.69 -> DA N7 C0012 : score 3.0018 : x : ARG xxxx A0003 <- 3.26 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0023 <- 3.08 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx >3kov_I:SRF-like; title=STRUCTURE OF MEF2A BOUND TO DNA REVEALS A COMPLETELY FOLDED MADS- BOX/MEF2 DOMAIN THAT RECOGNIZES DNA AND RECRUITS TRANSCRIPTION CO- FACTORS organism=Homo sapiens : H : ARG NE I0003 <- 2.21 -> DT O2 K0005 : score 2.881 : H : ARG NH2 I0003 <- 2.85 -> DT O2 K0005 : score 4.191 : x : LYS xxxx I0023 <- 2.65 -> DA xxx L0012 : score x.xxxxx >3kov_IJ:SRF-like; title=STRUCTURE OF MEF2A BOUND TO DNA REVEALS A COMPLETELY FOLDED MADS- BOX/MEF2 DOMAIN THAT RECOGNIZES DNA AND RECRUITS TRANSCRIPTION CO- FACTORS organism=Homo sapiens : H : ARG NE I0003 <- 2.21 -> DT O2 K0005 : score 2.881 : H : ARG NH2 I0003 <- 2.85 -> DT O2 K0005 : score 4.191 : H : ARG NE J0003 <- 3.20 -> DT O2 L0005 : score 2.37077 : x : LYS xxxx I0023 <- 2.65 -> DA xxx L0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0023 <- 2.87 -> DA xxx K0012 : score x.xxxxx >3kqh_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=THREE CONFORMATIONAL SNAPSHOTS OF THE HEPATITIS C VIRUS NS3 HELICASE REVEAL A RATCHET TRANSLOCATION MECHANISM organism=Hepatitis C virus : H : ASN OD1 B0556 <- 2.93 -> DA N6 C0003 : score 5.86523 : H : ASN OD1 B0556 <- 3.15 -> DA N6 C0004 : score 5.60027 : x : THR xxxx B0298 <- 3.71 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0369 <- 3.07 -> DA xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0393 <- 3.87 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0432 <- 3.47 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0434 <- 3.10 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0448 <- 4.33 -> DA xxx C0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0449 <- 4.07 -> DA xxx C0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0450 <- 3.47 -> DA xxx C0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0493 <- 3.81 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0501 <- 3.26 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0502 <- 3.31 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx >3kqk_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=THREE CONFORMATIONAL SNAPSHOTS OF THE HEPATITIS C VIRUS NS3 HELICASE REVEAL A RATCHET TRANSLOCATION MECHANISM organism=Hepatitis C virus : H : THR OG1 A0298 <- 2.65 -> DT O2 D0005 : score 2.79553 : V : VAL CG1 A0432 <- 3.88 -> DT C7 D0002 : score 5.9393 : V : TRP CD1 A0501 <- 3.87 -> DT C7 D0006 : score 7.205 >3kql_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=THREE CONFORMATIONAL SNAPSHOTS OF THE HEPATITIS C VIRUS NS3 HELICASE REVEAL A RATCHET TRANSLOCATION MECHANISM organism=Hepatitis C virus : H : THR OG1 B0298 <- 2.66 -> DT O2 F0019 : score 2.7901 : H : ARG NH1 B0393 <- 3.14 -> DT O4 F0019 : score 3.04573 : H : THR OG1 B0448 <- 3.19 -> DT O2 F0016 : score 2.5024 : H : ASN ND2 B0556 <- 3.08 -> DT O4 F0018 : score 4.98868 : V : TRP CD1 B0501 <- 3.76 -> DT C7 F0020 : score 7.40667 : x : ASP xxxx B0296 <- 4.22 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0432 <- 3.82 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0434 <- 3.62 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0493 <- 4.30 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0502 <- 3.43 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0551 <- 3.83 -> DT xxx F0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0552 <- 4.20 -> DT xxx F0021 : score x.xxxxx >3kqu_ABC:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=THREE CONFORMATIONAL SNAPSHOTS OF THE HEPATITIS C VIRUS NS3 HELICASE REVEAL A RATCHET TRANSLOCATION MECHANISM organism=Hepatitis C virus : H : THR OG1 A0448 <- 3.25 -> DT O2 M0016 : score 2.46983 : H : THR OG1 B0298 <- 3.09 -> DT O2 M0013 : score 2.55668 : H : THR OG1 C0298 <- 3.14 -> DT O2 M0007 : score 2.52954 : V : VAL CG1 C0432 <- 3.87 -> DT C7 M0005 : score 5.95445 : V : TRP CG C0501 <- 3.88 -> DT C7 M0008 : score 5.38648 : V : GLN CG C0552 <- 3.89 -> DT C7 M0010 : score 3.18214 : V : VAL CG1 B0432 <- 3.84 -> DT C7 M0011 : score 5.99991 : V : GLN CG B0552 <- 3.79 -> DT C7 M0016 : score 3.26352 : V : VAL CG1 A0432 <- 3.66 -> DT C7 M0017 : score 6.27263 : V : ASN CG A0556 <- 3.83 -> DT C7 M0018 : score 2.62834 : x : ASP xxxx A0296 <- 3.38 -> DT xxx M0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0393 <- 4.43 -> DT xxx M0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0412 <- 4.50 -> DT xxx M0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0434 <- 3.26 -> DT xxx M0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0493 <- 3.06 -> DT xxx M0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0296 <- 3.00 -> DT xxx M0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0393 <- 2.51 -> DT xxx M0013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0412 <- 4.09 -> DT xxx M0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0434 <- 3.64 -> DT xxx M0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0448 <- 3.40 -> DT xxx M0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0493 <- 3.79 -> DT xxx M0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0501 <- 3.31 -> DT xxx M0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0502 <- 3.22 -> DT xxx M0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0556 <- 3.13 -> DT xxx M0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0296 <- 3.05 -> DT xxx M0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0393 <- 2.48 -> DT xxx M0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0412 <- 4.11 -> DT xxx M0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0434 <- 3.62 -> DT xxx M0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0448 <- 3.45 -> DT xxx M0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0493 <- 3.77 -> DT xxx M0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0502 <- 3.28 -> DT xxx M0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0556 <- 3.15 -> DT xxx M0006 : score x.xxxxx >3kqu_DEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=THREE CONFORMATIONAL SNAPSHOTS OF THE HEPATITIS C VIRUS NS3 HELICASE REVEAL A RATCHET TRANSLOCATION MECHANISM organism=Hepatitis C virus : H : THR OG1 D0448 <- 3.29 -> DT O2 N0036 : score 2.44812 : H : THR OG1 E0298 <- 3.07 -> DT O2 N0033 : score 2.56754 : H : THR OG1 F0298 <- 3.13 -> DT O2 N0027 : score 2.53497 : V : VAL CG1 F0432 <- 3.88 -> DT C7 N0025 : score 5.9393 : V : TRP CG F0501 <- 3.86 -> DT C7 N0028 : score 5.41396 : V : VAL CG1 E0432 <- 3.83 -> DT C7 N0031 : score 6.01506 : V : TRP CG E0501 <- 3.90 -> DT C7 N0034 : score 5.359 : V : GLN CG E0552 <- 3.80 -> DT C7 N0036 : score 3.25538 : V : VAL CG1 D0432 <- 3.66 -> DT C7 N0037 : score 6.27263 : V : ASN CG D0556 <- 3.83 -> DT C7 N0038 : score 2.62834 : x : ASP xxxx D0296 <- 3.38 -> DT xxx N0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0393 <- 4.42 -> DT xxx N0038 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0412 <- 4.45 -> DT xxx N0037 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0434 <- 3.28 -> DT xxx N0038 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0493 <- 3.05 -> DT xxx N0038 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx E0296 <- 2.97 -> DT xxx N0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0393 <- 2.50 -> DT xxx N0033 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx E0412 <- 4.08 -> DT xxx N0031 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0434 <- 3.65 -> DT xxx N0031 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0448 <- 3.39 -> DT xxx N0030 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0493 <- 3.76 -> DT xxx N0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0502 <- 3.20 -> DT xxx N0034 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0556 <- 3.15 -> DT xxx N0032 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0296 <- 3.03 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0393 <- 2.49 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0412 <- 4.11 -> DT xxx N0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0434 <- 3.61 -> DT xxx N0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0448 <- 3.42 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0493 <- 3.72 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0502 <- 3.27 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0552 <- 3.57 -> DT xxx N0030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0556 <- 3.16 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx >3kqu_E:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=THREE CONFORMATIONAL SNAPSHOTS OF THE HEPATITIS C VIRUS NS3 HELICASE REVEAL A RATCHET TRANSLOCATION MECHANISM organism=Hepatitis C virus : H : THR OG1 E0298 <- 3.07 -> DT O2 N0033 : score 2.56754 : V : VAL CG1 E0432 <- 3.83 -> DT C7 N0031 : score 6.01506 : V : TRP CG E0501 <- 3.90 -> DT C7 N0034 : score 5.359 : V : GLN CG E0552 <- 3.80 -> DT C7 N0036 : score 3.25538 : x : ASP xxxx E0296 <- 2.97 -> DT xxx N0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0393 <- 2.50 -> DT xxx N0033 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx E0412 <- 4.08 -> DT xxx N0031 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0434 <- 3.65 -> DT xxx N0031 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0448 <- 3.39 -> DT xxx N0030 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0493 <- 3.76 -> DT xxx N0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0502 <- 3.20 -> DT xxx N0034 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0556 <- 3.15 -> DT xxx N0032 : score x.xxxxx >3ksa_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=DETAILED STRUCTURAL INSIGHT INTO THE DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IIA TOPOISOMERASES (CLEAVED FORM) organism=? : x : TYR xxxx A0020 <- 4.42 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0080 <- 4.10 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0170 <- 3.31 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx >3ksa_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=DETAILED STRUCTURAL INSIGHT INTO THE DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IIA TOPOISOMERASES (CLEAVED FORM) organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : TYR xxxx A0020 <- 4.42 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0080 <- 4.10 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0170 <- 3.31 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0028 <- 4.28 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0080 <- 3.93 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0170 <- 3.34 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0458 <- 3.81 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0458 <- 3.76 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx >3ksb_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=DETAILED STRUCTURAL INSIGHT INTO THE DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IIA TOPOISOMERASES (RE-SEALED FORM) organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : ARG xxxx A0028 <- 4.35 -> DA xxx E0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0080 <- 4.21 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0170 <- 3.29 -> DA xxx F0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0028 <- 4.28 -> DC xxx F0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0080 <- 4.06 -> DT xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0170 <- 3.30 -> DA xxx E0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0458 <- 3.91 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0458 <- 3.77 -> DT xxx E0021 : score x.xxxxx >3ksb_C:Type_II_DNA_topoisomerase; title=DETAILED STRUCTURAL INSIGHT INTO THE DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IIA TOPOISOMERASES (RE-SEALED FORM) organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : LYS xxxx C0458 <- 3.91 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx >3ktq_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ACTIVE TERNARY COMPLEX OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.80 -> DC O2 B0109 : score 2.94615 : w : LYS NZ A0540 <- 5.83 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : LYS NZ A0540 <- 5.73 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 5.88 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH2 A0573 <- 6.10 -> DG N3 C0206 : score 0.677 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.88 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.50 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.91 -> DG N3 C0208 : score 3.377 : w : GLU OE1 A0615 <- 6.19 -> DG N3 C0205 : score 2.669 : w : ASN ND2 A0750 <- 6.16 -> DG N3 C0205 : score 2.566 : H : GLN OE1 A0754 <- 3.26 -> DG N2 C0205 : score 5.09178 : w : GLN OE1 A0754 <- 6.34 -> DG N3 C0205 : score 1.484 : x : TYR xxxx A0545 <- 4.36 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0664 <- 3.73 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0667 <- 3.73 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0671 <- 3.19 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0673 <- 4.21 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0677 <- 2.95 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0784 <- 4.10 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >3ktu_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURE OF HUMAN 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE 1 BOUND TO FLUORNINATED OXOG-CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : H : SER OG A0148 <- 3.30 -> DG N3 C0024 : score 2.49462 : H : SER OG A0148 <- 3.30 -> DG N3 C0024 : score 2.49462 : H : ARG NH2 A0204 <- 2.50 -> DC O2 B0008 : score 3.92064 : x : CYS xxxx A0149 <- 3.58 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0151 <- 4.44 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0154 <- 2.72 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0203 <- 3.36 -> DG xxx C0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0207 <- 4.45 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0293 <- 4.41 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx >3kuy_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=DNA STRETCHING IN THE NUCLEOSOME FACILITATES ALKYLATION BY AN INTERCALATING ANTITUMOR AGENT organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.58 -> DA N3 J0009 : score 3.38229 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.28 -> DA N3 I0009 : score 2.92873 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.77 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.83 -> DC xxx I-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.24 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.39 -> DA xxx J0037 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.28 -> DT xxx J0069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.39 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.80 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.99 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.94 -> DT xxx J-035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.61 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >3kwq_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like; title=STRUCTURAL CHARACTERIZATION OF H3K56Q NUCLEOSOMES AND NUCLEOSOMAL ARRAYS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.59 -> DA N3 J0229 : score 3.37581 : H : ARG NH1 E0040 <- 2.86 -> DA N3 I0082 : score 3.63787 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.57 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.71 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 3.74 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.46 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.05 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0032 <- 4.18 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.25 -> DG xxx J0214 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.03 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >3kwq_E:Histone-fold; title=STRUCTURAL CHARACTERIZATION OF H3K56Q NUCLEOSOMES AND NUCLEOSOMAL ARRAYS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 E0040 <- 2.86 -> DA N3 I0082 : score 3.63787 : x : HIS xxxx E0039 <- 3.74 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.46 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.05 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx >3kxb_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL CHARACTERIZATION OF H3K56Q NUCLEOSOMES AND NUCLEOSOMAL ARRAYS organism=XENOPUS LAEVIS : x : LEU xxxx A0065 <- 3.74 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.35 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.04 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.11 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0028 <- 3.94 -> DA xxx J0173 : score x.xxxxx >3kxb_E:Histone-fold; title=STRUCTURAL CHARACTERIZATION OF H3K56Q NUCLEOSOMES AND NUCLEOSOMAL ARRAYS organism=XENOPUS LAEVIS : x : LEU xxxx E0065 <- 4.04 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.11 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx >3kxt_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF SULFOLOBUS CREN7-DSDNA COMPLEX organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : H : TRP NE1 A0026 <- 2.94 -> DA N3 B0104 : score -8.85642 : w : ARG NH1 A0033 <- 5.76 -> DC O2 B0102 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0033 <- 6.03 -> DC O2 B0102 : score 1.669 : H : ARG NE A0051 <- 2.98 -> DT O2 B0105 : score 2.48415 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.90 -> DT O2 B0105 : score 4.14867 : w : ARG NH1 A0051 <- 5.59 -> DC O2 B0106 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0051 <- 6.11 -> DC O2 B0106 : score 1.669 : x : LEU xxxx A0028 <- 3.40 -> DA xxx B0104 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0030 <- 3.40 -> DC xxx B0102 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0036 <- 3.80 -> DC xxx C0114 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0038 <- 3.82 -> DT xxx C0113 : score x.xxxxx >3kz8_AB: title=DIVERSITY IN DNA RECOGNITION BY P53 REVEALED BY CRYSTAL STRUCTURES WITH HOOGSTEEN BASE PAIRS (P53-DNA COMPLEX 3) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 2.73 -> DG N7 C0002 : score 5.4613 : H : LYS NZ A0120 <- 2.97 -> DG O6 C0002 : score 5.58422 : H : LYS NZ A0120 <- 2.94 -> DG O6 C0003 : score 5.61891 : H : LYS NZ B0120 <- 2.77 -> DG N7 C0012 : score 5.41821 : H : LYS NZ B0120 <- 2.94 -> DG O6 C0012 : score 5.61891 : H : LYS NZ B0120 <- 2.90 -> DG O6 C0013 : score 5.66515 : w : SER OG B0121 <- 5.58 -> DG N7 C0011 : score 2.749 : w : ARG NH1 B0280 <- 6.47 -> DG O6 C0013 : score 2.756 : x : ARG xxxx A0280 <- 3.29 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx >3kz8_B:p53-like_transcription_factors; title=DIVERSITY IN DNA RECOGNITION BY P53 REVEALED BY CRYSTAL STRUCTURES WITH HOOGSTEEN BASE PAIRS (P53-DNA COMPLEX 3) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0120 <- 2.77 -> DG N7 C0012 : score 5.41821 : H : LYS NZ B0120 <- 2.94 -> DG O6 C0012 : score 5.61891 : H : LYS NZ B0120 <- 2.90 -> DG O6 C0013 : score 5.66515 : w : SER OG B0121 <- 5.58 -> DG N7 C0011 : score 2.749 : w : ARG NH1 B0280 <- 6.47 -> DG O6 C0013 : score 2.756 >3l1p_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=POU PROTEIN:DNA COMPLEX organism=Mus musculus : H : THR OG1 A0045 <- 2.29 -> DT O4 M0013 : score 4.28367 : H : THR OG1 A0045 <- 2.91 -> DA N6 N0011 : score 2.69828 : H : ARG NH1 A0097 <- 3.14 -> DA N3 M0016 : score 3.43167 : H : ASN OD1 A0143 <- 3.14 -> DA N6 M0018 : score 5.61231 : H : ASN ND2 A0143 <- 3.04 -> DA N7 M0018 : score 5.58873 : V : VAL CG2 A0139 <- 3.85 -> DT C7 M0019 : score 6.04654 : x : GLN xxxx A0027 <- 4.04 -> DT xxx M0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0043 <- 3.66 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0044 <- 3.48 -> DT xxx M0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 4.49 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0048 <- 3.93 -> DT xxx M0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0049 <- 2.15 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0055 <- 4.03 -> DT xxx N0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0059 <- 4.40 -> DT xxx N0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.04 -> DA xxx N0006 : score x.xxxxx >3l1p_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=POU PROTEIN:DNA COMPLEX organism=Mus musculus : H : THR OG1 A0045 <- 2.29 -> DT O4 M0013 : score 4.28367 : H : THR OG1 A0045 <- 2.91 -> DA N6 N0011 : score 2.69828 : H : ARG NH1 A0097 <- 3.14 -> DA N3 M0016 : score 3.43167 : H : ASN OD1 A0143 <- 3.14 -> DA N6 M0018 : score 5.61231 : H : ASN ND2 A0143 <- 3.04 -> DA N7 M0018 : score 5.58873 : H : GLN OE1 B0044 <- 3.09 -> DA N6 N0013 : score 5.70152 : H : THR OG1 B0045 <- 2.77 -> DC N4 M0010 : score 4.05753 : H : ARG NH1 B0049 <- 3.01 -> DG N7 M0009 : score 5.7959 : H : ARG NH1 B0049 <- 2.86 -> DG O6 M0009 : score 6.01033 : H : ARG NH2 B0049 <- 2.49 -> DG O6 M0009 : score 7.0092 : H : ARG NH1 B0097 <- 2.84 -> DA N3 N0017 : score 3.6526 : H : ASN OD1 B0143 <- 2.90 -> DA N6 N0019 : score 5.90136 : H : ASN ND2 B0143 <- 3.18 -> DA N7 N0019 : score 5.42435 : H : GLN NE2 B0146 <- 2.88 -> DA N7 M0005 : score 5.99231 : V : LEU CD2 B0055 <- 3.87 -> DT C7 M0008 : score 5.63098 : V : VAL CG2 A0139 <- 3.85 -> DT C7 M0019 : score 6.04654 : V : VAL CG2 B0139 <- 3.80 -> DT C7 N0020 : score 6.12308 : x : GLN xxxx A0027 <- 4.04 -> DT xxx M0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0043 <- 3.66 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0044 <- 3.48 -> DT xxx M0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 4.49 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0048 <- 3.93 -> DT xxx M0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0049 <- 2.15 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0055 <- 4.03 -> DT xxx N0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0059 <- 4.40 -> DT xxx N0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.04 -> DA xxx N0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 4.00 -> DG xxx M0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0048 <- 4.19 -> DA xxx N0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0142 <- 4.34 -> DC xxx M0003 : score x.xxxxx >3l2c_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF FOXO4 BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 A0148 <- 3.03 -> DA N6 B0008 : score 5.74479 : H : ASN ND2 A0148 <- 2.89 -> DA N7 B0008 : score 5.76484 : w : ASN OD1 A0148 <- 5.80 -> DA N7 B0007 : score 2.277 : w : ASN OD1 A0148 <- 5.61 -> DT O4 C0029 : score 3.132 : w : ARG NE A0151 <- 5.86 -> DT O4 C0029 : score 1.317 : w : ARG NH1 A0151 <- 5.26 -> DG O6 C0028 : score 2.756 : H : HIS ND1 A0152 <- 2.81 -> DT O4 C0030 : score 4.71107 : w : HIS NE2 A0152 <- 5.77 -> DG N7 B0005 : score 3.601 : V : ARG CZ A0151 <- 3.62 -> DT C7 C0027 : score 2.22826 : x : SER xxxx A0142 <- 3.66 -> DT xxx C0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0149 <- 3.49 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0155 <- 3.49 -> DT xxx C0029 : score x.xxxxx >3l2p_A:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=HUMAN DNA LIGASE III RECOGNIZES DNA ENDS BY DYNAMIC SWITCHING BETWEEN TWO DNA BOUND STATES organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx A0192 <- 4.46 -> DC xxx D0029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0487 <- 3.79 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0716 <- 4.45 -> DC xxx B0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0717 <- 3.34 -> DG xxx D0034 : score x.xxxxx >3l2q_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN APO FORM organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.92 -> DC O2 C0006 : score 2.59516 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.79 -> DC O2 C0006 : score 3.70612 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.65 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.97 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.70 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 4.23 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0259 <- 4.07 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >3l2r_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.86 -> DC O2 C0006 : score 2.62707 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.62 -> DC O2 C0006 : score 3.83187 : V : PRO CG A0259 <- 3.81 -> DT C7 C0008 : score 6.34308 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.60 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.88 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.66 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 4.08 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >3l2u_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND GS9137 (ELVITEGRAVIR) organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.72 -> DC O2 C0006 : score 2.70152 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.65 -> DC O2 C0006 : score 3.80968 : V : PRO CG A0259 <- 3.80 -> DT C7 C0008 : score 6.35897 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.78 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 4.02 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.39 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 4.09 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >3l2v_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MANGANESE AND MK0518 (RALTEGRAVIR) organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.87 -> DC O2 C0006 : score 2.62175 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.63 -> DC O2 C0006 : score 3.82447 : V : PRO CG A0259 <- 3.86 -> DT C7 C0008 : score 6.26359 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.64 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.82 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.89 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.44 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >3l2w_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MANGANESE AND GS9137 (ELVITEGRAVIR) organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.71 -> DC O2 C0006 : score 2.70684 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.73 -> DC O2 C0006 : score 3.7505 : V : PRO CG A0259 <- 3.76 -> DT C7 C0008 : score 6.42256 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.73 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 4.08 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.52 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.98 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >3l4j_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=TOPOISOMERASE II-DNA CLEAVAGE COMPLEX, APO organism=Saccharomyces cerevisiae : w : ASP OD1 A0687 <- 5.65 -> DG N3 C0008 : score 2.718 : w : ASP OD1 A0687 <- 6.17 -> DT O2 B0009 : score 2.105 : w : ARG NE A0690 <- 5.92 -> DT O2 B0009 : score 0.757 : w : ARG NH2 A0690 <- 5.84 -> DT O2 B0009 : score 2.261 : x : LYS xxxx A0477 <- 3.19 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0740 <- 3.31 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0831 <- 3.93 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0833 <- 3.48 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0838 <- 4.07 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx >3l4k_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=TOPOISOMERASE II-DNA CLEAVAGE COMPLEX, METAL-BOUND organism=Saccharomyces cerevisiae : x : LYS xxxx A0477 <- 3.31 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0739 <- 4.46 -> DC xxx B0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0740 <- 3.74 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0831 <- 4.28 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0833 <- 3.23 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0838 <- 3.80 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx >3l8b_B:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A REPLICATIVE DNA POLYMERASE BOUND TO THE OXIDIZED GUANINE LESION GUANIDINOHYDANTOIN organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH B0567 <- 5.62 -> DT O2 E0005 : score 3.068 : w : THR OG1 B0622 <- 5.88 -> DA N3 F0113 : score 2.845 : H : LYS NZ B0706 <- 2.97 -> DA N3 F0112 : score 2.68251 : w : LYS NZ B0734 <- 5.72 -> DT O2 F0110 : score 0.522 : w : LYS NZ B0734 <- 5.98 -> DC O2 F0109 : score 1.3 : w : LYS NZ B0734 <- 6.16 -> DG N3 E0009 : score 2.232 : x : LYS xxxx B0800 <- 3.47 -> DC xxx F0106 : score x.xxxxx >3laj_AD:C-terminal_domain_of_arginine_repressor;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE STRUCTURE OF THE INTERMEDIATE COMPLEX OF THE ARGININE REPRESSOR FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS BOUND TO ITS DNA OPERATOR AND L- ARGININE. organism=Mycobacterium tuberculosis : H : GLN OE1 A0053 <- 2.69 -> DA N6 L0011 : score 6.18572 : H : GLN NE2 A0053 <- 3.12 -> DA N7 L0011 : score 5.7 : H : ARG NH1 A0058 <- 3.13 -> DG N7 K0003 : score 5.6507 : H : ARG NH2 A0058 <- 2.88 -> DG O6 L0013 : score 6.4944 : H : ARG NH2 A0058 <- 2.70 -> DG O6 K0003 : score 6.732 : H : GLN OE1 D0053 <- 2.95 -> DA N6 K0011 : score 5.87099 : H : GLN NE2 D0053 <- 3.05 -> DA N7 K0011 : score 5.78526 : H : ARG NH1 D0058 <- 3.13 -> DG N7 L0003 : score 5.6507 : H : ARG NH2 D0058 <- 3.10 -> DG O6 L0003 : score 6.204 : H : ARG NH2 D0058 <- 2.68 -> DG O6 K0013 : score 6.7584 : w : ARG NH2 D0058 <- 6.22 -> DG O6 K0013 : score 2.468 : x : THR xxxx A0052 <- 4.18 -> DG xxx K0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0054 <- 3.03 -> DT xxx L0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0057 <- 3.64 -> DA xxx L0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0052 <- 4.05 -> DG xxx L0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0054 <- 3.22 -> DT xxx K0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0057 <- 3.75 -> DA xxx K0011 : score x.xxxxx >3laj_BF:C-terminal_domain_of_arginine_repressor;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE STRUCTURE OF THE INTERMEDIATE COMPLEX OF THE ARGININE REPRESSOR FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS BOUND TO ITS DNA OPERATOR AND L- ARGININE. organism=Mycobacterium tuberculosis : H : GLN OE1 B0053 <- 2.65 -> DA N6 J0011 : score 6.23414 : H : GLN NE2 B0053 <- 3.07 -> DA N7 J0011 : score 5.7609 : H : ARG NH1 B0058 <- 3.15 -> DG N7 I0003 : score 5.6265 : H : ARG NH2 B0058 <- 2.73 -> DG O6 I0003 : score 6.6924 : H : ARG NH2 B0058 <- 2.90 -> DG O6 J0013 : score 6.468 : H : GLN OE1 F0053 <- 2.94 -> DA N6 I0011 : score 5.88309 : H : GLN NE2 F0053 <- 3.05 -> DA N7 I0011 : score 5.78526 : H : ARG NH1 F0058 <- 3.10 -> DG N7 J0003 : score 5.687 : H : ARG NH2 F0058 <- 2.72 -> DG O6 I0013 : score 6.7056 : w : ARG NH2 F0058 <- 6.24 -> DG O6 I0013 : score 2.468 : x : THR xxxx B0052 <- 4.17 -> DG xxx I0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0054 <- 3.02 -> DT xxx J0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0057 <- 3.60 -> DA xxx J0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0052 <- 4.15 -> DG xxx J0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0054 <- 3.31 -> DT xxx I0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0057 <- 3.75 -> DA xxx I0011 : score x.xxxxx >3laj_C:C-terminal_domain_of_arginine_repressor;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE STRUCTURE OF THE INTERMEDIATE COMPLEX OF THE ARGININE REPRESSOR FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS BOUND TO ITS DNA OPERATOR AND L- ARGININE. organism=Mycobacterium tuberculosis : H : GLN OE1 C0053 <- 2.68 -> DA N6 H0011 : score 6.19783 : H : GLN NE2 C0053 <- 3.11 -> DA N7 H0011 : score 5.71218 : H : ARG NH1 C0058 <- 3.17 -> DG N7 G0003 : score 5.6023 : H : ARG NH2 C0058 <- 2.74 -> DG O6 G0003 : score 6.6792 : H : ARG NH2 C0058 <- 2.91 -> DG O6 H0013 : score 6.4548 : w : ARG NH2 C0058 <- 6.22 -> DG O6 H0013 : score 2.468 : x : THR xxxx C0052 <- 4.23 -> DG xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0054 <- 3.00 -> DT xxx H0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0057 <- 3.63 -> DA xxx H0011 : score x.xxxxx >3laj_CE:C-terminal_domain_of_arginine_repressor;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE STRUCTURE OF THE INTERMEDIATE COMPLEX OF THE ARGININE REPRESSOR FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS BOUND TO ITS DNA OPERATOR AND L- ARGININE. organism=Mycobacterium tuberculosis : H : GLN OE1 C0053 <- 2.68 -> DA N6 H0011 : score 6.19783 : H : GLN NE2 C0053 <- 3.11 -> DA N7 H0011 : score 5.71218 : H : ARG NH1 C0058 <- 3.17 -> DG N7 G0003 : score 5.6023 : H : ARG NH2 C0058 <- 2.91 -> DG O6 H0013 : score 6.4548 : H : ARG NH2 C0058 <- 2.74 -> DG O6 G0003 : score 6.6792 : H : GLN OE1 E0053 <- 2.96 -> DA N6 G0011 : score 5.85888 : H : GLN NE2 E0053 <- 3.09 -> DA N7 G0011 : score 5.73654 : H : ARG NH1 E0058 <- 3.22 -> DG N7 H0003 : score 5.5418 : H : ARG NH2 E0058 <- 3.12 -> DG O6 H0003 : score 6.1776 : H : ARG NH2 E0058 <- 2.79 -> DG O6 G0013 : score 6.6132 : w : ARG NH2 E0058 <- 6.23 -> DG O6 G0013 : score 2.468 : x : THR xxxx C0052 <- 4.23 -> DG xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0054 <- 3.00 -> DT xxx H0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0057 <- 3.63 -> DA xxx H0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0052 <- 4.11 -> DG xxx H0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0054 <- 3.29 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0057 <- 3.83 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx >3lap_AD:C-terminal_domain_of_arginine_repressor;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE STRUCTURE OF THE INTERMEDIATE COMPLEX OF THE ARGININE REPRESSOR FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS BOUND TO ITS DNA OPERATOR AND L- CANAVANINE. organism=Mycobacterium tuberculosis : H : GLN OE1 A0053 <- 2.70 -> DA N6 L0011 : score 6.17362 : H : GLN NE2 A0053 <- 3.09 -> DA N7 L0011 : score 5.73654 : H : ARG NH1 A0058 <- 3.09 -> DG N7 K0003 : score 5.6991 : H : ARG NH2 A0058 <- 2.66 -> DG O6 K0003 : score 6.7848 : H : ARG NH2 A0058 <- 2.85 -> DG O6 L0013 : score 6.534 : H : GLN OE1 D0053 <- 2.91 -> DA N6 K0011 : score 5.91941 : H : GLN NE2 D0053 <- 3.14 -> DA N7 K0011 : score 5.67564 : w : GLN OE1 D0053 <- 6.88 -> DT O4 L0006 : score 3.068 : H : ARG NH1 D0058 <- 2.98 -> DG N7 L0003 : score 5.8322 : H : ARG NH2 D0058 <- 2.85 -> DG O6 K0013 : score 6.534 : H : ARG NH2 D0058 <- 2.77 -> DG O6 L0003 : score 6.6396 : x : THR xxxx A0052 <- 4.15 -> DG xxx K0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0054 <- 3.05 -> DT xxx L0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0057 <- 3.67 -> DA xxx L0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0052 <- 4.06 -> DG xxx L0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0054 <- 3.15 -> DT xxx K0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0057 <- 3.70 -> DA xxx K0011 : score x.xxxxx >3lap_B:C-terminal_domain_of_arginine_repressor;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE STRUCTURE OF THE INTERMEDIATE COMPLEX OF THE ARGININE REPRESSOR FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS BOUND TO ITS DNA OPERATOR AND L- CANAVANINE. organism=Mycobacterium tuberculosis : H : GLN OE1 B0053 <- 2.69 -> DA N6 J0011 : score 6.18572 : H : GLN NE2 B0053 <- 3.08 -> DA N7 J0011 : score 5.74872 : w : GLN OE1 B0053 <- 6.23 -> DA N6 I0005 : score 3.392 : H : ARG NH1 B0058 <- 3.06 -> DG N7 I0003 : score 5.7354 : H : ARG NH2 B0058 <- 2.66 -> DG O6 I0003 : score 6.7848 : H : ARG NH2 B0058 <- 2.82 -> DG O6 J0013 : score 6.5736 : w : ARG NH2 B0058 <- 6.57 -> DG O6 J0013 : score 2.468 : x : THR xxxx B0052 <- 4.17 -> DG xxx I0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0054 <- 3.06 -> DT xxx J0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0057 <- 3.64 -> DA xxx J0011 : score x.xxxxx >3lap_BF:C-terminal_domain_of_arginine_repressor;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE STRUCTURE OF THE INTERMEDIATE COMPLEX OF THE ARGININE REPRESSOR FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS BOUND TO ITS DNA OPERATOR AND L- CANAVANINE. organism=Mycobacterium tuberculosis : H : GLN OE1 B0053 <- 2.69 -> DA N6 J0011 : score 6.18572 : H : GLN NE2 B0053 <- 3.08 -> DA N7 J0011 : score 5.74872 : w : GLN OE1 B0053 <- 6.23 -> DA N6 I0005 : score 3.392 : H : ARG NH1 B0058 <- 3.06 -> DG N7 I0003 : score 5.7354 : H : ARG NH2 B0058 <- 2.82 -> DG O6 J0013 : score 6.5736 : H : ARG NH2 B0058 <- 2.66 -> DG O6 I0003 : score 6.7848 : H : GLN OE1 F0053 <- 2.93 -> DA N6 I0011 : score 5.8952 : H : GLN NE2 F0053 <- 3.17 -> DA N7 I0011 : score 5.6391 : w : GLN OE1 F0053 <- 6.59 -> DT O4 J0006 : score 3.068 : H : ARG NH1 F0058 <- 3.03 -> DG N7 J0003 : score 5.7717 : H : ARG NH2 F0058 <- 2.83 -> DG O6 J0003 : score 6.5604 : H : ARG NH2 F0058 <- 2.86 -> DG O6 I0013 : score 6.5208 : x : THR xxxx B0052 <- 4.17 -> DG xxx I0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0054 <- 3.06 -> DT xxx J0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0057 <- 3.64 -> DA xxx J0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0052 <- 4.13 -> DG xxx J0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0054 <- 3.17 -> DT xxx I0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0057 <- 3.76 -> DA xxx I0011 : score x.xxxxx >3lap_CE:C-terminal_domain_of_arginine_repressor;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE STRUCTURE OF THE INTERMEDIATE COMPLEX OF THE ARGININE REPRESSOR FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS BOUND TO ITS DNA OPERATOR AND L- CANAVANINE. organism=Mycobacterium tuberculosis : H : GLN OE1 C0053 <- 2.71 -> DA N6 H0011 : score 6.16151 : H : GLN NE2 C0053 <- 3.17 -> DA N7 H0011 : score 5.6391 : H : ARG NH1 C0058 <- 3.04 -> DG N7 G0003 : score 5.7596 : H : ARG NH2 C0058 <- 2.68 -> DG O6 G0003 : score 6.7584 : H : ARG NH2 C0058 <- 2.85 -> DG O6 H0013 : score 6.534 : H : GLN OE1 E0053 <- 2.87 -> DA N6 G0011 : score 5.96783 : H : GLN NE2 E0053 <- 3.12 -> DA N7 G0011 : score 5.7 : H : ARG NH1 E0058 <- 3.06 -> DG N7 H0003 : score 5.7354 : H : ARG NH2 E0058 <- 2.83 -> DG O6 G0013 : score 6.5604 : H : ARG NH2 E0058 <- 2.86 -> DG O6 H0003 : score 6.5208 : x : THR xxxx C0052 <- 4.17 -> DG xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0054 <- 3.05 -> DT xxx H0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0057 <- 3.65 -> DA xxx H0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0052 <- 4.08 -> DG xxx H0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0054 <- 3.12 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0057 <- 3.72 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx >3lds_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RB69 GP43 WITH DNA AND DATP OPPOSITE 8-OXOG organism=Escherichia phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.57 -> DT O2 T0006 : score 3.75219 : x : LYS xxxx A0734 <- 3.67 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx >3ldy_A:FYVE/PHD_zinc_finger; title=AN EXTRAORDINARY MECHANISM OF DNA PERTURBATION EXHIBITED BY THE RARE- CUTTING HNH RESTRICTION ENDONUCLEASE PACI organism=Pseudomonas alcaligenes : w : GLN NE2 A0031 <- 5.81 -> DG O6 B0004 : score 2.87 : H : ASN OD1 A0032 <- 2.63 -> DA N6 C0013 : score 6.22654 : H : ASN ND2 A0032 <- 2.91 -> DA N7 C0013 : score 5.74136 : H : LYS NZ A0039 <- 2.74 -> DT O4 C0011 : score 3.63023 : H : LYS NZ A0039 <- 2.65 -> DT O4 B0007 : score 3.69479 : V : ASN CG A0036 <- 3.60 -> DT C7 C0011 : score 2.78062 : x : SER xxxx A0021 <- 4.08 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0028 <- 3.39 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0035 <- 3.66 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0040 <- 3.51 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0078 <- 4.34 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0080 <- 3.66 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0081 <- 3.28 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0082 <- 2.94 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0084 <- 3.83 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0110 <- 3.59 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.41 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx >3lel_ABCDEF:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL INSIGHT INTO THE SEQUENCE-DEPENDENCE OF NUCLEOSOME POSITIONING organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.81 -> DA N3 J0009 : score 3.23326 : H : ARG NH2 D0026 <- 3.37 -> DT O2 J-029 : score 3.75073 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.29 -> DA N3 I0009 : score 2.92225 : x : ARG xxxx A0083 <- 3.23 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.24 -> DA xxx J0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0024 <- 4.45 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 3.95 -> DT xxx J0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0042 <- 4.03 -> DG xxx J0071 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.09 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 2.99 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx >3lel_GH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL INSIGHT INTO THE SEQUENCE-DEPENDENCE OF NUCLEOSOME POSITIONING organism=XENOPUS LAEVIS : H : LYS NZ G0013 <- 2.73 -> DT O2 I0045 : score 3.6374 : H : LYS NZ G0013 <- 3.06 -> DA N3 J-044 : score 2.63252 >3lel_KLMOPQR:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL INSIGHT INTO THE SEQUENCE-DEPENDENCE OF NUCLEOSOME POSITIONING organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 K0040 <- 3.22 -> DA N3 T0009 : score 2.96761 : x : HIS xxxx K0039 <- 4.30 -> DT xxx S0070 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx K0065 <- 4.24 -> DT xxx T0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0083 <- 4.05 -> DC xxx S-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0045 <- 4.44 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0042 <- 4.32 -> DA xxx T0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0040 <- 3.17 -> DA xxx S0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0065 <- 4.41 -> DT xxx S0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0083 <- 3.69 -> DC xxx T-024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Q0013 <- 3.70 -> DA xxx T-044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0027 <- 3.95 -> DG xxx T0030 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx R0028 <- 4.37 -> DC xxx T-048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0030 <- 4.21 -> DG xxx S0048 : score x.xxxxx >3lel_M:Histone-fold; title=STRUCTURAL INSIGHT INTO THE SEQUENCE-DEPENDENCE OF NUCLEOSOME POSITIONING organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx M0042 <- 4.32 -> DA xxx T0038 : score x.xxxxx >3lja_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=USING SOFT X-RAYS FOR A DETAILED PICTURE OF DIVALENT METAL BINDING IN THE NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.91 -> DA N3 J0009 : score 3.16847 : H : ARG NH2 D0026 <- 3.42 -> DT O2 J-029 : score 3.7084 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.79 -> DA N3 I0009 : score 3.24622 : H : LYS NZ G0013 <- 3.33 -> DT O2 I0046 : score 3.20694 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.85 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.49 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.09 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0024 <- 3.35 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0027 <- 3.66 -> DG xxx J0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.50 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.43 -> DA xxx I-069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.35 -> DT xxx I-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.90 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.15 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.06 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0027 <- 4.25 -> DG xxx I-028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.67 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >3lja_E:Histone-fold; title=USING SOFT X-RAYS FOR A DETAILED PICTURE OF DIVALENT METAL BINDING IN THE NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 E0040 <- 2.79 -> DA N3 I0009 : score 3.24622 : x : HIS xxxx E0039 <- 4.43 -> DA xxx I-069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.35 -> DT xxx I-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.90 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.15 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx >3lk9_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA WITH A GAPPED DNA SUBSTRATE AND DTMP(CF2)P(CF2)P organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.43 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.83 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.50 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3lnq_A:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF ARISTALESS HOMEODOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH2 A0089 <- 2.61 -> DT O2 B0006 : score 4.3942 : w : GLN OE1 A0134 <- 5.89 -> DT O4 B0009 : score 3.068 : H : ASN OD1 A0135 <- 3.03 -> DA N6 B0008 : score 5.74479 : H : ASN ND2 A0135 <- 3.08 -> DA N7 B0008 : score 5.54176 : w : ASN OD1 A0135 <- 5.91 -> DT O4 B0009 : score 3.132 : V : GLN CG A0134 <- 3.86 -> DT C7 C0004 : score 3.20655 : x : ARG xxxx A0087 <- 3.13 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0131 <- 3.68 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx >3lsp_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DEST BOUND TO DESCB PROMOTER AND OLEOYL-COA organism=PSEUDOMONAS AERUGINOSA : H : ARG NH1 A0036 <- 2.83 -> DG N7 B0018 : score 6.0137 : H : ARG NH1 A0036 <- 2.83 -> DG O6 B0018 : score 6.04683 >3lsr_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DEST IN COMPLEX WITH DUPLEX DNA organism=PSEUDOMONAS AERUGINOSA : H : ARG NE A0036 <- 2.97 -> DG N7 B0019 : score 4.27145 : H : ARG NH2 A0036 <- 2.60 -> DG O6 B0019 : score 6.864 : V : PRO CB A0046 <- 3.84 -> DT C7 B0020 : score 5.74809 : V : ALA CB A0047 <- 3.77 -> DT C7 B0021 : score 5.64097 : x : LEU xxxx A0035 <- 4.06 -> DT xxx B0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0050 <- 3.67 -> DT xxx B0020 : score x.xxxxx >3ltn_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=INHIBITOR-STABILIZED TOPOISOMERASE IV-DNA CLEAVAGE COMPLEX (S. PNEUMONIAE) organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : TYR xxxx A0020 <- 4.38 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0028 <- 4.15 -> DA xxx E0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0079 <- 3.84 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0080 <- 4.01 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0117 <- 4.02 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0170 <- 2.83 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0028 <- 3.86 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0079 <- 3.80 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0080 <- 3.98 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0117 <- 4.13 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0170 <- 2.74 -> DC xxx H0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0458 <- 3.48 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0458 <- 3.62 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx >3ltn_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=INHIBITOR-STABILIZED TOPOISOMERASE IV-DNA CLEAVAGE COMPLEX (S. PNEUMONIAE) organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : ARG xxxx B0028 <- 3.86 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0079 <- 3.80 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0080 <- 3.98 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0117 <- 4.13 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0170 <- 2.74 -> DC xxx H0008 : score x.xxxxx >3lwh_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CREN7-DSDNA COMPLEX organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : H : TRP NE1 A0026 <- 2.91 -> DA N3 B0104 : score -8.91108 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.69 -> DT O2 B0106 : score 4.32647 : x : LEU xxxx A0028 <- 3.39 -> DA xxx B0103 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0030 <- 3.29 -> DT xxx B0102 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0036 <- 4.03 -> DT xxx C0114 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0038 <- 4.01 -> DT xxx C0113 : score x.xxxxx >3lwi_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CREN7-DSDNA COMPLEX organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS : H : TRP NE1 B0026 <- 3.03 -> DA N3 E0104 : score -8.69241 : H : ARG NH1 B0033 <- 2.69 -> DC O2 F0116 : score 3.7303 : H : ARG NE B0051 <- 2.85 -> DT O2 E0105 : score 2.55115 : H : ARG NH1 B0051 <- 2.96 -> DT O2 E0105 : score 4.16861 : H : ARG NH1 B0051 <- 3.01 -> DC O2 E0106 : score 3.4967 : w : ARG NH1 B0051 <- 6.19 -> DC O2 E0106 : score 1.381 : w : ARG NH2 B0051 <- 5.90 -> DC O2 E0106 : score 1.669 : w : ARG NH2 B0051 <- 6.17 -> DA N3 F0112 : score 2.092 : x : LEU xxxx B0028 <- 3.19 -> DG xxx E0103 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0030 <- 3.54 -> DC xxx E0102 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0036 <- 3.47 -> DC xxx F0114 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0038 <- 3.93 -> DT xxx F0113 : score x.xxxxx >3lwl_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF KLENOW FRAGMENT OF TAQ POLYMERASE IN COMPLEX WITH AN ABASIC SITE organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 3.02 -> DC O2 B0109 : score 2.81652 : w : LYS NZ A0540 <- 5.74 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 5.57 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.66 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.60 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.82 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.00 -> DG N3 B0110 : score 4.69908 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.58 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0545 <- 4.42 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0587 <- 4.01 -> DC xxx B0111 : score x.xxxxx >3lwm_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF THERMUS AQUATICUS DNA POLYMERASE I IN COMPLEX WITH A BLUNT-ENDED DNA AND DDATP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.85 -> DC O2 B0109 : score 2.91669 : w : LYS NZ A0540 <- 5.58 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 5.57 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.74 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.71 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.72 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.14 -> DG N3 B0110 : score 4.56202 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.68 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.61 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0545 <- 4.48 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0587 <- 3.98 -> DC xxx B0111 : score x.xxxxx >3lz0_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE COMPOSED OF THE WIDOM 601 DNA SEQUENCE (ORIENTATION 1) organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 A0040 <- 3.32 -> DT O2 J0009 : score 3.85854 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.73 -> DG N3 I0009 : score 3.6608 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.26 -> DT xxx J-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.43 -> DG xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.50 -> DG xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.40 -> DA xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 4.09 -> DA xxx J0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.45 -> DG xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.77 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.07 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >3lz0_F:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE COMPOSED OF THE WIDOM 601 DNA SEQUENCE (ORIENTATION 1) organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx F0045 <- 3.77 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx >3lz1_A:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE COMPOSED OF THE WIDOM 601 DNA SEQUENCE (ORIENTATION 2) organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx A0040 <- 3.94 -> DG xxx J0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.27 -> DC xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.05 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx >3lz1_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE COMPOSED OF THE WIDOM 601 DNA SEQUENCE (ORIENTATION 2) organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 E0040 <- 2.56 -> DT O2 I0009 : score 4.43653 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.94 -> DG xxx J0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.27 -> DC xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.05 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 4.13 -> DA xxx J0039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.35 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.26 -> DA xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.00 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >3lzi_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DATP OPPOSITE 7,8- DIHYDRO-8-OXOGUANINE organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.02 -> DA N3 P0114 : score 2.65474 : x : ARG xxxx A0707 <- 4.09 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0734 <- 3.75 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx >3lzj_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DCTP OPPOSITE 7,8- DIHYDRO-8-OXOGUANINE organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.02 -> DA N3 P0114 : score 2.65474 : w : LYS NZ A0734 <- 5.93 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0734 <- 5.16 -> DT O2 P0112 : score 0.522 >3m4a_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A BACTERIAL TOPOISOMERASE IB IN COMPLEX WITH DNA REVEALS A SECONDARY DNA BINDING SITE organism=Deinococcus radiodurans : H : ARG NH1 A0114 <- 2.97 -> DG N3 D0010 : score 2.94878 : w : ARG NH1 A0114 <- 5.94 -> DG N3 D0009 : score 1.593 : H : ARG NH1 A0186 <- 2.85 -> DG O6 D0012 : score 6.0225 : H : ARG NH2 A0186 <- 3.17 -> DG N7 D0012 : score 5.91215 : w : ARG NH1 A0186 <- 5.89 -> DG N7 E0110 : score 2.063 >3m4o_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX B organism=? : x : ARG xxxx A1386 <- 3.77 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx >3m4o_AE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX B organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.77 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx >3m7k_A:FYVE/PHD_zinc_finger; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PACI-DNA ENZYME PRODUCT COMPLEX organism=PSEUDOMONAS ALCALIGENES : w : SER OG A0021 <- 6.66 -> DC N4 C0015 : score 2.105 : H : ASN OD1 A0032 <- 2.90 -> DA N6 C0013 : score 5.90136 : H : ASN ND2 A0032 <- 3.08 -> DA N7 C0013 : score 5.54176 : H : ASN OD1 A0036 <- 2.97 -> DA N6 C0012 : score 5.81705 : H : ASN ND2 A0036 <- 3.09 -> DA N7 C0012 : score 5.53002 : H : LYS NZ A0039 <- 2.84 -> DT O4 B0007 : score 3.55848 : H : LYS NZ A0039 <- 2.96 -> DT O4 C0011 : score 3.47239 : H : ARG NH1 A0082 <- 2.84 -> DC O2 B0005 : score 3.6208 : w : TYR OH A0084 <- 5.78 -> DG N3 C0014 : score 3.344 : x : ARG xxxx A0006 <- 4.07 -> DG xxx B0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0023 <- 4.37 -> DG xxx B0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0028 <- 3.49 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0031 <- 3.77 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0035 <- 3.79 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0040 <- 3.68 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0078 <- 4.16 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0080 <- 3.84 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0081 <- 3.25 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0110 <- 3.50 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.40 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx >3m8r_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH TRAPPED 4'- ETHYLATED DTTP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.98 -> DC O2 B0109 : score 2.84009 : w : LYS NZ A0540 <- 5.80 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 6.12 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.69 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.77 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.72 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.87 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.81 -> DG N3 C0208 : score 3.377 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.56 -> DC O2 B0111 : score 3.208 >3m8s_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH TRAPPED 4'- METHYLATED DTTP organism=THERMUS AQUATICUS : H : LYS NZ A0540 <- 3.02 -> DC O2 B0109 : score 2.81652 : w : LYS NZ A0540 <- 5.66 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 6.38 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.52 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.94 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.84 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.65 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.18 -> DG N3 B0110 : score 4.52286 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.66 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.63 -> DC O2 B0111 : score 3.208 >3m9e_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THYROID HORMONE BETA DNA BINDING DOMAIN HOMODIMER WITH INVERTED PALINDROME TRE organism=Rattus norvegicus : H : GLU OE1 A0124 <- 2.64 -> DC N4 D0006 : score 5.95252 : w : GLU OE1 A0124 <- 6.17 -> DA N6 D0005 : score 2.939 : H : LYS NZ A0127 <- 2.72 -> DG O6 C0016 : score 5.87326 : w : LYS NZ A0127 <- 6.26 -> DA N6 C0015 : score 2.097 : w : ARG NH1 A0131 <- 5.37 -> DG O6 C0017 : score 2.756 : w : ARG NH2 A0131 <- 5.84 -> DG O6 C0017 : score 2.468 : H : ARG NH2 A0132 <- 2.57 -> DG N7 D0004 : score 6.67831 : H : GLU OE1 B0124 <- 2.48 -> DC N4 C0006 : score 6.1371 : H : LYS NZ B0127 <- 2.66 -> DG O6 D0016 : score 5.94263 : w : LYS NZ B0127 <- 6.07 -> DA N6 D0015 : score 2.097 : w : ARG NH1 B0131 <- 5.90 -> DG O6 D0017 : score 2.756 : H : ARG NH2 B0132 <- 2.57 -> DG N7 C0004 : score 6.67831 : x : LYS xxxx A0187 <- 3.46 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0187 <- 3.44 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx >3m9e_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THYROID HORMONE BETA DNA BINDING DOMAIN HOMODIMER WITH INVERTED PALINDROME TRE organism=Rattus norvegicus : H : GLU OE1 B0124 <- 2.48 -> DC N4 C0006 : score 6.1371 : H : LYS NZ B0127 <- 2.66 -> DG O6 D0016 : score 5.94263 : w : LYS NZ B0127 <- 6.07 -> DA N6 D0015 : score 2.097 : w : ARG NH1 B0131 <- 5.90 -> DG O6 D0017 : score 2.756 : H : ARG NH2 B0132 <- 2.57 -> DG N7 C0004 : score 6.67831 : x : LYS xxxx B0187 <- 3.44 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx >3m9e_EF:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THYROID HORMONE BETA DNA BINDING DOMAIN HOMODIMER WITH INVERTED PALINDROME TRE organism=Rattus norvegicus : H : GLU OE1 E0124 <- 2.62 -> DC N4 H0006 : score 5.97559 : w : GLU OE1 E0124 <- 6.39 -> DA N6 H0005 : score 2.939 : H : LYS NZ E0127 <- 2.87 -> DG O6 G0016 : score 5.69984 : w : LYS NZ E0127 <- 5.77 -> DA N7 G0015 : score 1.655 : w : ARG NH1 E0131 <- 5.80 -> DG O6 G0017 : score 2.756 A : H : ARG NH2 E0132 <- 2.52 -> DG N7 H0004 : score 6.74215 : H : GLU OE1 F0124 <- 2.59 -> DC N4 G0006 : score 6.0102 : w : GLU OE1 F0124 <- 6.24 -> DA N6 G0005 : score 2.939 : H : LYS NZ F0127 <- 2.77 -> DG O6 H0016 : score 5.81545 : w : LYS NZ F0127 <- 5.98 -> DA N6 H0015 : score 2.097 : w : ARG NH1 F0131 <- 5.93 -> DG O6 H0017 : score 2.756 : H : ARG NH2 F0132 <- 2.53 -> DG N7 G0004 : score 6.72938 : w : ARG NE F0132 <- 5.92 -> DG O6 G0004 : score 1.369 : w : ARG NH2 F0132 <- 5.93 -> DG O6 G0004 : score 2.468 : x : LYS xxxx E0187 <- 3.96 -> DA xxx G0015 : score x.xxxxx >3m9m_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DPO4 IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING THE MAJOR CISPLATIN LESION organism=Sulfolobus solfataricus : x : SER xxxx B0244 <- 4.41 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0336 <- 4.01 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >3m9n_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DPO4 IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING THE MAJOR CISPLATIN LESION organism=Sulfolobus solfataricus : x : SER xxxx B0244 <- 4.09 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0332 <- 4.49 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0336 <- 3.91 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >3m9o_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DPO4 IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING THE MAJOR CISPLATIN LESION organism=Sulfolobus solfataricus : w : TYR OH B0012 <- 5.58 -> DG N2 T0004 : score 2.834 : x : VAL xxxx B0032 <- 3.33 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0042 <- 3.63 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0244 <- 3.97 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0332 <- 4.21 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx >3maq_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI POL II-NORMAL DNA-DGTP TERNARY COMPLEX organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0615 <- 2.88 -> DA N3 P0912 : score 2.73249 : H : ARG NH1 A0638 <- 3.28 -> DG N3 P0910 : score 2.75952 : w : ARG NH1 A0689 <- 6.36 -> DG N7 P0910 : score 2.063 >3mby_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH TEMPLATE BASE A AND 8OXODGTP IN THE ACTIVE SITE WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.99 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.71 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3mfh_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE ETA IN COMPLEX WITH UNDAMAGED DNA organism=Saccharomyces cerevisiae : x : MET xxxx A0396 <- 3.72 -> DG xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0456 <- 3.94 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0458 <- 3.62 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx >3mfi_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE ETA IN COMPLEX WITH A CIS-SYN THYMIDINE DIMER organism=Saccharomyces cerevisiae : x : MET xxxx A0396 <- 3.84 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0456 <- 3.82 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0458 <- 3.71 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx >3mfk_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ETS1 COMPLEX WITH STROMELYSIN-1 PROMOTER DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0391 <- 2.88 -> DG O6 C0005 : score 3.87797 : H : ARG NH2 A0391 <- 2.54 -> DG N7 C0005 : score 6.71662 : H : ARG NH2 A0391 <- 3.12 -> DG O6 C0005 : score 6.1776 : H : ARG NE A0394 <- 2.95 -> DG N7 C0004 : score 4.28914 : H : ARG NH2 A0394 <- 3.08 -> DG O6 C0004 : score 6.2304 : H : TYR OH A0395 <- 2.92 -> DA N6 C0006 : score 4.55842 : x : LYS xxxx A0388 <- 3.95 -> DT xxx D0112 : score x.xxxxx >3mfk_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ETS1 COMPLEX WITH STROMELYSIN-1 PROMOTER DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0391 <- 2.88 -> DG O6 C0005 : score 3.87797 : H : ARG NH2 A0391 <- 2.54 -> DG N7 C0005 : score 6.71662 : H : ARG NH2 A0391 <- 3.12 -> DG O6 C0005 : score 6.1776 : H : ARG NE A0394 <- 2.95 -> DG N7 C0004 : score 4.28914 : H : ARG NH2 A0394 <- 3.08 -> DG O6 C0004 : score 6.2304 : H : TYR OH A0395 <- 2.92 -> DA N6 C0006 : score 4.55842 : H : ARG NE B0391 <- 2.85 -> DG O6 D0104 : score 3.90162 : H : ARG NH2 B0391 <- 2.50 -> DG N7 D0104 : score 6.76769 : H : ARG NH2 B0394 <- 2.92 -> DG N7 D0103 : score 6.23138 : H : TYR OH B0395 <- 3.31 -> DA N6 D0105 : score 4.19412 : x : LYS xxxx A0388 <- 3.95 -> DT xxx D0112 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0388 <- 4.43 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >3mgp_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=BINDING OF COBALT IONS TO THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.75 -> DA N3 J0010 : score 3.27214 : H : ARG NH2 D0026 <- 2.91 -> DT O2 J-029 : score 4.1402 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.74 -> DG N3 I0008 : score 3.65358 : H : LYS NZ G0013 <- 2.85 -> DA N3 J-044 : score 2.74915 : x : LEU xxxx A0065 <- 4.18 -> DT xxx J0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.91 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.27 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.27 -> DA xxx J0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0024 <- 3.83 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.89 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.94 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.34 -> DG xxx I0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0027 <- 3.32 -> DG xxx I-028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.65 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >3mgp_G:Histone-fold; title=BINDING OF COBALT IONS TO THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=? : H : LYS NZ G0013 <- 2.85 -> DA N3 J-044 : score 2.74915 >3mgq_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=BINDING OF NICKEL IONS TO THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.05 -> DA N3 J0010 : score 3.07776 : H : ARG NH2 D0026 <- 3.24 -> DT O2 J-029 : score 3.8608 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.81 -> DG N3 I0008 : score 3.60304 : H : LYS NZ G0013 <- 2.43 -> DT O2 I0045 : score 3.85263 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.81 -> DT xxx J0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.36 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.29 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0027 <- 4.32 -> DG xxx J0049 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.78 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.01 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.08 -> DG xxx I0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0027 <- 4.14 -> DG xxx I-028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.02 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >3mgq_E:Histone-fold; title=BINDING OF NICKEL IONS TO THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 E0040 <- 2.81 -> DG N3 I0008 : score 3.60304 : x : LEU xxxx E0065 <- 3.78 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.01 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx >3mgr_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=BINDING OF RUBIDIUM IONS TO THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.81 -> DA N3 J0009 : score 3.23326 : H : LYS NZ D0024 <- 2.80 -> DT O2 J0050 : score 3.58718 : H : ARG NH2 D0026 <- 2.90 -> DT O2 J-029 : score 4.14867 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.82 -> DA N3 I0009 : score 3.22678 : H : LYS NZ G0013 <- 3.18 -> DT O2 I0046 : score 3.31455 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.21 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.76 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.06 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.26 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0027 <- 3.66 -> DG xxx J0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.48 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 3.99 -> DA xxx I-069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.27 -> DT xxx I-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.77 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.71 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.07 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0027 <- 3.67 -> DG xxx I-028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.54 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >3mgr_D:Histone-fold; title=BINDING OF RUBIDIUM IONS TO THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=? : H : LYS NZ D0024 <- 2.80 -> DT O2 J0050 : score 3.58718 : H : ARG NH2 D0026 <- 2.90 -> DT O2 J-029 : score 4.14867 : x : ARG xxxx D0027 <- 3.66 -> DG xxx J0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.48 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx >3mgs_A:Histone-fold; title=BINDING OF CESIUM IONS TO THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.88 -> DA N3 J0009 : score 3.18791 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.39 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.99 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.27 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx >3mgs_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=BINDING OF CESIUM IONS TO THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.88 -> DA N3 J0009 : score 3.18791 : H : LYS NZ D0024 <- 2.95 -> DT O2 J0050 : score 3.47956 : H : ARG NH2 D0026 <- 3.26 -> DT O2 J-029 : score 3.84387 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.94 -> DA N3 I0009 : score 3.14903 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.39 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.99 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.27 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.44 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0027 <- 3.54 -> DG xxx J0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.06 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.01 -> DA xxx I-069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.16 -> DT xxx I-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.91 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.05 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.16 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0013 <- 3.06 -> DA xxx J-044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0027 <- 3.86 -> DG xxx I-028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.59 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >3mgv_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRE RECOMBINASE-DNA TRANSITION STATE organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ A0043 <- 2.81 -> DT O4 F0010 : score 3.58001 : H : MET SD A0044 <- 3.39 -> DA N6 G0012 : score 5.27052 : H : LYS NZ A0086 <- 2.70 -> DG O6 G0015 : score 5.89638 : H : GLN NE2 A0090 <- 2.71 -> DT O4 F0008 : score 5.28446 : H : GLN NE2 A0090 <- 3.19 -> DT O4 G0013 : score 4.78613 : w : ARG NH2 A0241 <- 5.67 -> DA N3 G0005 : score 2.092 : H : ARG NH1 A0243 <- 3.21 -> DT O2 F0018 : score 3.95328 : H : LYS NZ A0244 <- 2.88 -> DT O2 F0020 : score 3.52978 : H : LYS NZ A0244 <- 3.12 -> DT O2 G0003 : score 3.3576 : H : ARG NE A0259 <- 2.84 -> DG O6 F0013 : score 3.9095 : H : ARG NH2 A0259 <- 3.00 -> DG N7 F0013 : score 6.12923 : w : GLU OE2 A0262 <- 5.99 -> DC N4 F0012 : score 3.597 : H : ARG NH2 A0282 <- 2.85 -> DA N3 G0012 : score 3.20735 : H : LYS NZ B0043 <- 2.87 -> DT O4 H0010 : score 3.53696 : w : LYS NZ B0043 <- 6.32 -> DA N6 H0011 : score 2.097 : H : MET SD B0044 <- 3.41 -> DA N6 E0012 : score 5.24661 : H : GLN NE2 B0090 <- 2.80 -> DT O4 E0013 : score 5.19103 : H : GLN NE2 B0090 <- 2.91 -> DT O4 H0008 : score 5.07682 : H : LYS NZ B0201 <- 3.28 -> DG N3 E0015 : score 1.31428 : w : ARG NH2 B0241 <- 5.46 -> DA N3 E0005 : score 2.092 : H : ARG NH1 B0243 <- 2.94 -> DT O2 H0018 : score 4.18583 : H : LYS NZ B0244 <- 2.89 -> DT O2 E0003 : score 3.52261 : H : LYS NZ B0244 <- 2.67 -> DT O2 H0020 : score 3.68045 : H : ARG NE B0259 <- 2.72 -> DG O6 H0013 : score 4.00408 : H : ARG NH2 B0259 <- 2.81 -> DG N7 H0013 : score 6.37185 : w : GLU OE1 B0262 <- 5.66 -> DC N4 H0012 : score 3.528 : H : ARG NH2 B0282 <- 3.10 -> DA N3 E0012 : score 3.04536 : V : HIS CG A0040 <- 3.79 -> DT C7 F0010 : score 3.00647 : V : HIS CG B0040 <- 3.61 -> DT C7 H0010 : score 3.14143 : x : THR xxxx A0041 <- 3.49 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.84 -> DT xxx G0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.44 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 3.60 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.82 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0260 <- 4.42 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0320 <- 3.42 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0041 <- 3.68 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.77 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0086 <- 3.46 -> DG xxx E0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.39 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 3.79 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 3.97 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0317 <- 4.38 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx >3mgv_CD:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRE RECOMBINASE-DNA TRANSITION STATE organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ C0043 <- 2.67 -> DT O4 K0010 : score 3.68045 : H : LYS NZ C0086 <- 2.60 -> DG O6 L0015 : score 6.012 : w : LYS NZ C0201 <- 5.58 -> DT O2 K0008 : score 0.522 : w : ARG NH2 C0241 <- 5.79 -> DA N3 L0005 : score 2.092 : H : ARG NH1 C0243 <- 3.05 -> DT O2 K0018 : score 4.09109 : H : LYS NZ C0244 <- 2.83 -> DT O2 L0003 : score 3.56566 : H : LYS NZ C0244 <- 2.58 -> DT O2 K0020 : score 3.74502 : H : ARG NE C0259 <- 2.82 -> DG O6 K0013 : score 3.92526 : H : ARG NH2 C0259 <- 2.89 -> DG N7 K0013 : score 6.26969 : w : GLU OE2 C0262 <- 5.87 -> DC N4 K0012 : score 3.597 : H : ARG NH1 C0282 <- 3.17 -> DA N3 L0012 : score 3.40958 : H : ARG NH2 C0282 <- 2.97 -> DA N3 L0012 : score 3.12959 : H : LYS NZ D0043 <- 2.81 -> DT O4 M0010 : score 3.58001 : H : MET SD D0044 <- 3.38 -> DA N6 I0012 : score 5.28247 : H : LYS NZ D0086 <- 3.02 -> DG N7 I0015 : score 5.14892 : H : GLN NE2 D0090 <- 2.84 -> DT O4 M0008 : score 5.1495 : H : GLN NE2 D0090 <- 2.79 -> DT O4 I0013 : score 5.20141 : H : LYS NZ D0201 <- 3.15 -> DG N3 I0015 : score 1.35208 : w : ARG NH2 D0241 <- 5.78 -> DA N3 I0005 : score 2.092 : H : ARG NH1 D0243 <- 3.01 -> DT O2 M0018 : score 4.12554 : w : ARG NH1 D0243 <- 5.73 -> DA N3 M0019 : score 2.585 : H : LYS NZ D0244 <- 3.15 -> DT O2 M0020 : score 3.33608 : H : LYS NZ D0244 <- 2.66 -> DT O2 I0003 : score 3.68762 : H : ARG NE D0259 <- 2.96 -> DG O6 M0013 : score 3.81491 : H : ARG NH2 D0259 <- 3.01 -> DG N7 M0013 : score 6.11646 : w : GLU OE1 D0262 <- 5.85 -> DC N4 M0012 : score 3.528 : H : ARG NH1 D0282 <- 3.02 -> DA N3 I0012 : score 3.52004 : H : ARG NH2 D0282 <- 3.25 -> DA N3 I0012 : score 2.94817 : V : HIS CG D0040 <- 3.61 -> DT C7 M0010 : score 3.14143 : x : HIS xxxx C0040 <- 3.39 -> DT xxx K0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0041 <- 3.56 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0044 <- 3.43 -> DT xxx L0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0047 <- 3.95 -> DT xxx L0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0087 <- 3.52 -> DT xxx L0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0090 <- 2.80 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0094 <- 3.66 -> DT xxx K0008 : score 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score x.xxxxx >3mht_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=TERNARY STRUCTURE OF HHAI METHYLTRANSFERASE WITH UNMODIFIED DNA AND ADOHCY organism=HAEMOPHILUS HAEMOLYTICUS : H : ARG NH1 A0240 <- 2.82 -> DG N7 D0426 : score 6.0258 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.71 -> DG O6 D0426 : score 6.7188 : x : ILE xxxx A0086 <- 3.45 -> DG xxx D0426 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.06 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0237 <- 2.76 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0239 <- 4.31 -> DG xxx C0406 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0254 <- 4.23 -> DC xxx D0429 : score x.xxxxx >3mip_AB:Homing_endonucleases; title=I-MSOI RE-DESIGNED FOR ALTERED DNA CLEAVAGE SPECIFICITY (-8GCG) organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : ARG NH1 A0028 <- 2.95 -> DG O6 D0007 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0028 <- 3.01 -> DG N7 D0007 : score 6.11646 : H : GLU OE2 A0030 <- 3.36 -> DC N4 D0008 : score 4.67566 : H : ARG NH2 A0032 <- 2.67 -> DA N7 C-010 : score 1.71526 : H : ASP OD2 A0034 <- 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DG N7 D-005 : score 6.2678 : H : ARG NH2 B0072 <- 2.77 -> DG N7 D-005 : score 6.42292 : H : ARG NH2 B0072 <- 2.52 -> DG O6 D-005 : score 6.9696 : H : ARG NH1 B0075 <- 3.07 -> DG N7 C0003 : score 5.7233 : H : ARG NH2 B0075 <- 2.80 -> DG O6 C0003 : score 6.6 : H : ARG NH1 B0083 <- 2.80 -> DG O6 D-006 : score 6.08333 : H : ARG NH2 B0083 <- 3.27 -> DG N7 D-006 : score 5.78446 : x : SER xxxx A0024 <- 3.92 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0026 <- 3.69 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0035 <- 3.25 -> DC xxx C-011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0041 <- 4.04 -> DA xxx C-010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0049 <- 3.36 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0070 <- 4.49 -> DG xxx C-008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0077 <- 3.93 -> DT xxx C-004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0079 <- 3.82 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0085 <- 3.54 -> DC xxx C-007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0024 <- 3.83 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0026 <- 3.57 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0032 <- 2.89 -> DG xxx D-010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0035 <- 3.74 -> DG xxx D-010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0041 <- 4.04 -> DG xxx D-010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0049 <- 3.35 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0077 <- 3.87 -> DT xxx D-004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0079 <- 3.66 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0085 <- 3.67 -> DC xxx D-007 : score x.xxxxx >3mip_B:Homing_endonucleases; title=I-MSOI RE-DESIGNED FOR ALTERED DNA CLEAVAGE SPECIFICITY (-8GCG) organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : ARG NH1 B0028 <- 3.33 -> DG O6 C0007 : score 5.4385 : H : ARG NH2 B0028 <- 3.22 -> DG N7 C0007 : score 5.84831 : H : GLU OE2 B0030 <- 3.14 -> DC N4 C0008 : score 4.90734 : w : ASP OD2 B0034 <- 5.60 -> DG O6 D-011 : score 3.228 : H : ARG NH1 B0043 <- 3.21 -> DG O6 D-008 : score 5.5845 : H : ARG NH2 B0043 <- 2.91 -> DG N7 D-008 : score 6.24415 : H : ARG NH2 B0043 <- 2.74 -> DG O6 D-008 : score 6.6792 : H : ARG NH1 B0072 <- 2.62 -> DG N7 D-005 : score 6.2678 : H : ARG NH2 B0072 <- 2.77 -> DG N7 D-005 : score 6.42292 : H : ARG NH2 B0072 <- 2.52 -> DG O6 D-005 : score 6.9696 : H : ARG NH1 B0075 <- 3.07 -> DG N7 C0003 : score 5.7233 : H : ARG NH2 B0075 <- 2.80 -> DG O6 C0003 : score 6.6 : H : ARG NH1 B0083 <- 2.80 -> DG O6 D-006 : score 6.08333 : H : ARG NH2 B0083 <- 3.27 -> DG N7 D-006 : score 5.78446 : x : SER xxxx B0024 <- 3.83 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0026 <- 3.57 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0032 <- 2.89 -> DG xxx D-010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0035 <- 3.74 -> DG xxx D-010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0041 <- 4.04 -> DG xxx D-010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0049 <- 3.35 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0077 <- 3.87 -> DT xxx D-004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0079 <- 3.66 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0085 <- 3.67 -> DC xxx D-007 : score x.xxxxx >3mis_A:Homing_endonucleases; title=I-MSOI RE-DESIGNED FOR ALTERED DNA CLEAVAGE SPECIFICITY (-8G) organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : LYS NZ A0028 <- 2.62 -> DG N7 D0006 : score 5.57979 : H : LYS NZ A0028 <- 2.68 -> DT O4 D0007 : score 3.67327 : H : GLU OE2 A0030 <- 2.62 -> DC N4 D0008 : score 5.45494 : H : ARG NH1 A0032 <- 2.76 -> DG O6 C-009 : score 6.132 : H : ARG NH2 A0032 <- 3.05 -> DG O6 C-009 : score 6.27 : H : ASP OD2 A0034 <- 2.98 -> DC N4 C-011 : score 5.9768 : H : ARG NH2 A0043 <- 3.07 -> DG N7 C-008 : score 6.03985 : H : ARG NH2 A0043 <- 2.55 -> DG O6 C-008 : score 6.93 : x : SER xxxx A0024 <- 4.01 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0026 <- 3.28 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0035 <- 3.17 -> DA xxx C-010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0041 <- 3.33 -> DA xxx C-010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0049 <- 4.04 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0072 <- 3.40 -> DC xxx C-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0075 <- 2.89 -> DT xxx C-004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0077 <- 3.83 -> DT xxx C-004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0079 <- 4.13 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0085 <- 3.51 -> DA xxx C-007 : score x.xxxxx >3mis_AB:Homing_endonucleases; title=I-MSOI RE-DESIGNED FOR ALTERED DNA CLEAVAGE SPECIFICITY (-8G) organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : LYS NZ A0028 <- 2.62 -> DG N7 D0006 : score 5.57979 : H : LYS NZ A0028 <- 2.68 -> DT O4 D0007 : score 3.67327 : H : GLU OE2 A0030 <- 2.62 -> DC N4 D0008 : score 5.45494 : H : ARG NH1 A0032 <- 2.76 -> DG O6 C-009 : score 6.132 : H : ARG NH2 A0032 <- 3.05 -> DG O6 C-009 : score 6.27 : H : ASP OD2 A0034 <- 2.98 -> DC N4 C-011 : score 5.9768 : H : ARG NH2 A0043 <- 3.07 -> DG N7 C-008 : score 6.03985 : H : ARG NH2 A0043 <- 2.55 -> DG O6 C-008 : score 6.93 : H : LYS NZ B0028 <- 2.98 -> DA N7 C0006 : score 2.83144 : H : GLU OE1 B0030 <- 2.52 -> DC N4 C0008 : score 6.09095 : H : ARG NH2 B0032 <- 2.62 -> DG O6 D-010 : score 6.8376 : H : ARG NH1 B0043 <- 2.89 -> DG O6 D-008 : score 5.97383 : H : ARG 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x.xxxxx : x : SER xxxx B0024 <- 3.94 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0026 <- 3.47 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0034 <- 3.66 -> DC xxx D-012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0035 <- 3.39 -> DG xxx D-010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0041 <- 3.50 -> DG xxx D-010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0049 <- 3.98 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0079 <- 3.92 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx >3mkw_B:KorB_DNA-binding_domain-like; title=STRUCTURE OF SOPB(155-272)-18MER COMPLEX, I23 FORM organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 B0190 <- 2.87 -> DG N7 U0003 : score 5.9653 : H : ARG NH2 B0190 <- 2.53 -> DG O6 U0003 : score 6.9564 : H : LYS NZ B0191 <- 2.88 -> DG N7 U0005 : score 5.29972 : H : LYS NZ B0191 <- 2.63 -> DG O6 U0005 : score 5.97732 : H : ARG NH1 B0195 <- 2.96 -> DG N7 T0012 : score 5.8564 : H : ARG NH1 B0219 <- 2.45 -> DG N7 T0011 : score 6.4735 : H : ARG NH1 B0219 <- 2.72 -> DG O6 T0011 : score 6.18067 : x : SER xxxx B0180 <- 3.79 -> DT 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COMPLEX, P21 FORM organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0190 <- 3.25 -> DG N7 D0003 : score 5.81 : H : LYS NZ A0191 <- 2.58 -> DG N7 D0005 : score 5.62288 : H : LYS NZ A0191 <- 2.60 -> DG O6 D0005 : score 6.012 : H : ARG NH1 A0195 <- 2.81 -> DG N7 C0012 : score 6.0379 : H : ARG NH1 A0219 <- 3.02 -> DG O6 C0011 : score 5.81567 : H : ARG NH2 A0219 <- 2.85 -> DG O6 C0012 : score 6.534 : x : SER xxxx A0180 <- 3.36 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0189 <- 3.54 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0192 <- 3.76 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >3mkz_AN:KorB_DNA-binding_domain-like; title=STRUCTURE OF SOPB(155-272)-18MER COMPLEX, P21 FORM organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0190 <- 3.25 -> DG N7 D0003 : score 5.81 : H : LYS NZ A0191 <- 2.58 -> DG N7 D0005 : score 5.62288 : H : LYS NZ A0191 <- 2.60 -> DG O6 D0005 : score 6.012 : H : ARG NH1 A0195 <- 2.81 -> DG N7 C0012 : score 6.0379 : H : ARG NH1 A0219 <- 3.02 -> DG O6 C0011 : score 5.81567 : H : ARG NH2 A0219 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>3mlp_EF:E_set_domains; title=EARLY B-CELL FACTOR 1 (EBF1) BOUND TO DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 E0063 <- 2.86 -> DG O6 G0013 : score 6.01033 : H : ARG NH2 E0063 <- 3.16 -> DG N7 G0013 : score 5.92492 : H : ARG NH1 E0163 <- 3.36 -> DC O2 G0008 : score 3.2412 : H : ASN ND2 E0204 <- 2.98 -> DT O2 H0004 : score 4.57529 : H : SER OG E0238 <- 3.07 -> DG N7 G0014 : score 4.24002 : H : LYS NZ E0239 <- 2.81 -> DG N7 G0015 : score 5.37513 : H : ARG NH1 F0063 <- 2.76 -> DG O6 H0013 : score 6.132 : H : ARG NH2 F0063 <- 3.15 -> DG N7 H0013 : score 5.93769 : w : SER OG F0065 <- 5.22 -> DT O4 H0012 : score 2.338 : H : ARG NH1 F0163 <- 3.26 -> DC O2 H0008 : score 3.3142 : w : ASN OD1 F0237 <- 5.99 -> DT O4 G0007 : score 3.132 : H : SER OG F0238 <- 2.66 -> DG N7 H0014 : score 4.60755 : w : SER OG F0238 <- 6.03 -> DG O6 H0015 : score 2.749 : H : LYS NZ F0239 <- 2.27 -> DG N7 H0015 : score 5.9568 : w : LYS NZ F0239 <- 5.90 -> DT O4 G0007 : score 1.7 : x : SER xxxx E0065 <- 3.93 -> DT xxx 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P0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0036 <- 3.84 -> DG xxx O0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0095 <- 4.34 -> DC xxx P0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0096 <- 3.27 -> DT xxx O0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0152 <- 3.19 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0244 <- 4.23 -> DG xxx P0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0247 <- 3.05 -> DA xxx O0007 : score x.xxxxx >3mq6_G:Restriction_endonuclease-like; title=DOMAIN SWAPPED SGRAI WITH DNA AND CALCIUM BOUND organism=Streptomyces griseus : H : ARG NH1 G0031 <- 2.90 -> DG N7 R0013 : score 5.929 : H : ARG NH2 G0031 <- 2.83 -> DG O6 R0013 : score 6.5604 : w : ARG NH2 G0031 <- 5.51 -> DC N4 Q0005 : score 0.976 : H : ARG NE G0246 <- 2.85 -> DG O6 Q0011 : score 3.90162 : H : ARG NH2 G0246 <- 3.10 -> DG N7 Q0011 : score 6.00154 : H : ASP OD2 G0248 <- 2.91 -> DC N4 R0009 : score 6.0636 : H : ARG NE G0249 <- 2.80 -> DG O6 Q0010 : score 3.94103 : H : ARG NH2 G0249 <- 3.02 -> DG N7 Q0010 : score 6.10369 : x : GLN xxxx G0036 <- 4.04 -> DG xxx R0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0092 <- 3.18 -> DG xxx R0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0095 <- 4.35 -> DC xxx Q0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0096 <- 3.13 -> DT xxx R0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0152 <- 3.32 -> DC xxx Q0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0244 <- 4.30 -> DG xxx Q0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0247 <- 3.27 -> DA xxx R0007 : score x.xxxxx >3mq6_GH:Restriction_endonuclease-like; title=DOMAIN SWAPPED SGRAI WITH DNA AND CALCIUM BOUND organism=Streptomyces griseus : H : ARG NH1 G0031 <- 2.90 -> DG N7 R0013 : score 5.929 : H : ARG NH2 G0031 <- 2.83 -> DG O6 R0013 : score 6.5604 : w : ARG NH2 G0031 <- 5.51 -> DC N4 Q0005 : score 0.976 : H : ARG NE G0246 <- 2.85 -> DG O6 Q0011 : score 3.90162 : H : ARG NH2 G0246 <- 3.10 -> DG N7 Q0011 : score 6.00154 : H : ASP OD2 G0248 <- 2.91 -> DC N4 R0009 : score 6.0636 : H : ARG NE G0249 <- 2.80 -> DG O6 Q0010 : score 3.94103 : H : ARG NH2 G0249 <- 3.02 -> DG N7 Q0010 : score 6.10369 : H : ARG NH1 H0029 <- 3.03 -> DG N7 R0003 : score 5.7717 : H : ARG NH1 H0029 <- 2.84 -> DG O6 R0003 : score 6.03467 : H : ARG NH1 H0031 <- 2.97 -> DG N7 Q0013 : score 5.8443 : H : ARG NH2 H0031 <- 2.83 -> DG O6 Q0013 : score 6.5604 : w : ARG NH2 H0031 <- 5.86 -> DC N4 R0005 : score 0.976 : H : ASN OD1 H0092 <- 3.06 -> DG N2 Q0010 : score 4.5504 : H : ARG NE H0246 <- 2.79 -> DG O6 R0011 : score 3.94891 : H : ARG NH2 H0246 <- 2.99 -> DG N7 R0011 : score 6.142 : H : ASP OD1 H0248 <- 3.31 -> DC N4 Q0008 : score 4.7997 : H : ASP OD2 H0248 <- 2.62 -> DC N4 Q0009 : score 6.4232 : H : ARG NE H0249 <- 2.76 -> DG O6 R0010 : score 3.97255 : H : ARG NH2 H0249 <- 3.07 -> DG N7 R0010 : score 6.03985 : x : GLN xxxx G0036 <- 4.04 -> DG xxx R0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0092 <- 3.18 -> DG xxx R0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0095 <- 4.35 -> DC xxx Q0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0096 <- 3.13 -> DT xxx R0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0152 <- 3.32 -> DC xxx Q0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0244 <- 4.30 -> DG xxx Q0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0247 <- 3.27 -> DA xxx R0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0036 <- 4.42 -> DG xxx Q0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0096 <- 3.04 -> DT xxx Q0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0152 <- 3.25 -> DC xxx R0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0244 <- 4.13 -> DG xxx R0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0247 <- 3.04 -> DA xxx Q0007 : score x.xxxxx >3mqy_A:Restriction_endonuclease-like; title=SGRAI WITH CLEAVED DNA AND MAGNESIUM BOUND organism=Streptomyces griseus : H : ARG NH1 A0031 <- 2.87 -> DG N7 D0013 : score 5.9653 : H : ARG NH2 A0031 <- 2.98 -> DG O6 D0013 : score 6.3624 : H : ASN OD1 A0092 <- 3.18 -> DG N2 D0010 : score 4.4352 : H : ARG NE A0152 <- 2.94 -> DC O2 E0006 : score 2.58452 : H : ARG NH2 A0152 <- 3.00 -> DA N3 E0007 : score 3.11015 : H : ARG NE A0246 <- 2.89 -> DG O6 F0011 : score 3.87009 : H : ARG NH2 A0246 <- 3.15 -> DG N7 F0011 : score 5.93769 : H : ASP OD2 A0248 <- 2.69 -> DC N4 D0009 : score 6.3364 : H : ARG NE A0249 <- 2.89 -> DG O6 F0010 : score 3.87009 : H : ARG NH2 A0249 <- 3.24 -> DG N7 F0010 : score 5.82277 : x : GLN xxxx A0036 <- 3.88 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0095 <- 4.38 -> DC xxx F0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0096 <- 3.33 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 4.20 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0247 <- 3.42 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx >3mqy_AB:Restriction_endonuclease-like; title=SGRAI WITH CLEAVED DNA AND MAGNESIUM BOUND organism=Streptomyces griseus : H : ARG NH1 A0031 <- 2.87 -> DG N7 D0013 : score 5.9653 : H : ARG NH2 A0031 <- 2.98 -> DG O6 D0013 : score 6.3624 : H : ASN OD1 A0092 <- 3.18 -> DG N2 D0010 : score 4.4352 : H : ARG NE A0152 <- 2.94 -> DC O2 E0006 : score 2.58452 : H : ARG NH2 A0152 <- 3.00 -> DA N3 E0007 : score 3.11015 : H : ARG NE A0246 <- 2.89 -> DG O6 F0011 : score 3.87009 : H : ARG NH2 A0246 <- 3.15 -> DG N7 F0011 : score 5.93769 : H : ASP OD2 A0248 <- 2.69 -> DC N4 D0009 : score 6.3364 : H : ARG NE A0249 <- 2.89 -> DG O6 F0010 : score 3.87009 : H : ARG NH2 A0249 <- 3.24 -> DG N7 F0010 : score 5.82277 : H : ARG NH1 B0031 <- 3.01 -> DG N7 F0013 : score 5.7959 : H : ARG NH2 B0031 <- 3.00 -> DG O6 F0013 : score 6.336 : w : ARG NH2 B0031 <- 6.23 -> DC N4 C0005 : score 0.976 : w : GLN NE2 B0036 <- 5.87 -> DG N7 F0014 : score 2.582 : H : ASN OD1 B0092 <- 3.11 -> DG N2 F0010 : score 4.5024 : H : LYS NZ B0096 <- 3.00 -> DG N3 F0013 : score 1.39569 : H : ARG NE B0152 <- 3.09 -> DC O2 C0006 : score 2.50475 : H : ARG NH2 B0152 <- 2.91 -> DA N3 C0007 : score 3.16847 : H : ARG NE B0246 <- 2.73 -> DG O6 D0011 : score 3.9962 : H : ARG NH2 B0246 <- 3.13 -> DG N7 D0011 : score 5.96323 : H : ASP OD2 B0248 <- 3.00 -> DC N4 F0009 : score 5.952 : H : ARG NE B0249 <- 2.52 -> DG O6 D0010 : score 4.16172 : H : ARG NH2 B0249 <- 2.63 -> DG N7 D0010 : score 6.60169 : x : GLN xxxx A0036 <- 3.88 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0095 <- 4.38 -> DC xxx F0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0096 <- 3.33 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 4.20 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0247 <- 3.42 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0095 <- 4.25 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0244 <- 4.16 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0247 <- 3.51 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx >3mr2_A:DNA/RNA_polymerases; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA IN COMPLEX WITH NORMAL DNA AND INCOMING NUCLEOTIDE (NRM) organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.03 -> DG O6 P0005 : score 5.8035 : H : ARG NH2 A0382 <- 2.86 -> DG N7 P0005 : score 6.308 : x : SER xxxx A0322 <- 3.88 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.34 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0421 <- 4.38 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.15 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >3mr3_A:DNA/RNA_polymerases; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX WITH THE 3'T OF A CPD IN THE ACTIVE SITE (TT1) organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.14 -> DG O6 P0005 : score 5.66967 A : H : ARG NH2 A0382 <- 2.93 -> DG N7 P0005 : score 6.21862 A : x : SER xxxx A0322 <- 4.02 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.45 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.15 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx >3mr5_A:DNA/RNA_polymerases; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX WITH A CPD 1BP UPSTREAM OF THE ACTIVE SITE (TT3) organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 2.99 -> DC O2 T0004 : score 3.55447 : V : ARG CZ A0382 <- 3.86 -> DT C7 P0004 : score 2.10032 : x : ILE xxxx A0048 <- 3.32 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 2.78 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0062 <- 3.10 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0318 <- 4.42 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >3mr6_A:DNA/RNA_polymerases; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX WITH A CPD 2BP UPSTREAM OF THE ACTIVE SITE (TT4) organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 2.87 -> DC O2 T0004 : score 3.64314 : x : TYR xxxx A0039 <- 3.77 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 2.38 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.12 -> DT xxx P0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0062 <- 3.94 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.97 -> DA xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.74 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx >3mu6_AB:SRF-like; title=INHIBITING THE BINDING OF CLASS IIA HISTONE DEACETYLASES TO MYOCYTE ENHANCER FACTOR-2 BY SMALL MOLECULES organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0003 <- 2.66 -> DT O2 F0006 : score 2.64908 : H : ARG NH2 A0003 <- 3.00 -> DT O2 F0006 : score 4.064 : H : LYS NZ A0023 <- 3.40 -> DA N7 E0013 : score 2.58472 : H : LYS NZ A0023 <- 2.86 -> DG O6 E0014 : score 5.7114 : H : ARG NE B0003 <- 2.75 -> DT O2 E0006 : score 2.60269 : H : ARG NH2 B0003 <- 3.07 -> DT O2 E0006 : score 4.00473 : H : LYS NZ B0023 <- 3.33 -> DA N7 F0013 : score 2.62584 : H : LYS NZ B0023 <- 2.85 -> DG O6 F0014 : score 5.72296 >3mu6_CD:SRF-like; title=INHIBITING THE BINDING OF CLASS IIA HISTONE DEACETYLASES TO MYOCYTE ENHANCER FACTOR-2 BY SMALL MOLECULES organism=Homo sapiens : H : ARG NE C0003 <- 2.66 -> DT O2 H0006 : score 2.64908 : H : ARG NH2 C0003 <- 2.97 -> DT O2 H0006 : score 4.0894 : H : LYS NZ C0023 <- 3.38 -> DA N7 G0013 : score 2.59647 : H : LYS NZ C0023 <- 2.86 -> DG O6 G0014 : score 5.7114 : H : ARG NE D0003 <- 2.76 -> DT O2 G0006 : score 2.59754 : H : ARG NH2 D0003 <- 3.05 -> DT O2 G0006 : score 4.02167 : H : LYS NZ D0023 <- 3.33 -> DA N7 H0013 : score 2.62584 : H : LYS NZ D0023 <- 2.84 -> DG O6 H0014 : score 5.73452 >3mu6_D:SRF-like; title=INHIBITING THE BINDING OF CLASS IIA HISTONE DEACETYLASES TO MYOCYTE ENHANCER FACTOR-2 BY SMALL MOLECULES organism=Homo sapiens : H : ARG NE D0003 <- 2.76 -> DT O2 G0006 : score 2.59754 : H : ARG NH2 D0003 <- 3.05 -> DT O2 G0006 : score 4.02167 : H : LYS NZ D0023 <- 3.33 -> DA N7 H0013 : score 2.62584 : H : LYS NZ D0023 <- 2.84 -> DG O6 H0014 : score 5.73452 >3mva_O: title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MTERF1 BOUND TO THE TERMINATION SEQUENCE organism=Homo sapiens : w : TYR OH O0128 <- 5.74 -> DT O4 E0006 : score 2.914 : w : ARG NH2 O0130 <- 6.25 -> DA N6 E0005 : score 1.997 : w : GLU OE1 O0165 <- 5.82 -> DC N4 D0016 : score 3.528 : H : ARG NH1 O0169 <- 3.15 -> DG N7 E0007 : score 5.6265 : H : ARG NH2 O0169 <- 2.71 -> DG O6 E0007 : score 6.7188 : H : ASN OD1 O0199 <- 2.76 -> DT N3 D0011 : score 3.83169 : H : ARG NH1 O0202 <- 3.01 -> DG O6 D0014 : score 5.82783 : H : ARG NH2 O0202 <- 2.48 -> DG O6 E0008 : score 7.0224 : H : ARG NH1 O0251 <- 2.98 -> DG O6 E0011 : score 5.86433 : H : ARG NH2 O0251 <- 2.93 -> DA N7 E0010 : score 1.62833 : H : GLU OE2 O0280 <- 2.83 -> DC N4 D0012 : score 5.23379 : w : GLU OE1 O0280 <- 6.47 -> DC N4 D0010 : score 3.528 : H : SER OG O0285 <- 2.90 -> DA N6 E0012 : score 3.22395 : w : ASP OD2 O0319 <- 6.67 -> DG O6 D0008 : score 3.228 : H : ARG NH1 O0350 <- 2.86 -> DG O6 D0007 : score 6.01033 : H : ARG NH2 O0350 <- 2.90 -> DG N7 D0007 : score 6.25692 : H : ARG NH1 O0387 <- 2.77 -> DG O6 E0018 : score 6.11983 : H : ARG NH2 O0387 <- 2.87 -> DG N7 E0018 : score 6.29523 : x : ARG xxxx O0162 <- 3.49 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0198 <- 3.31 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0243 <- 3.35 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx O0246 <- 4.01 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx O0247 <- 4.37 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx O0283 <- 3.35 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0284 <- 4.18 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx O0288 <- 3.13 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx O0353 <- 3.48 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx O0384 <- 4.20 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx >3mvb_O: title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TRIPLE RFY MUTANT OF HUMAN MTERF1 BOUND TO THE TERMINATION SEQUENCE organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 O0165 <- 2.84 -> DC N4 D0015 : score 5.72181 : H : ARG 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score 6.03985 : x : ARG xxxx C0086 <- 4.04 -> DG xxx M0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0104 <- 3.87 -> DG xxx M0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0162 <- 3.15 -> DC xxx M0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0164 <- 3.96 -> DC xxx N0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0162 <- 3.40 -> DC xxx N0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0164 <- 3.38 -> DC xxx M0008 : score x.xxxxx >3mx4_D: title=DNA BINDING AND CLEAVAGE BY THE GIY-YIG ENDONUCLEASE R.ECO29KI INACTIVE VARIANT E142Q organism=ESCHERICHIA COLI : H : HIS ND1 D0163 <- 2.63 -> DG O6 J0014 : score 6.43466 : H : ARG NH1 D0169 <- 2.77 -> DG O6 I0011 : score 6.11983 : H : ARG NH2 D0169 <- 2.98 -> DG N7 I0011 : score 6.15477 : x : ARG xxxx D0086 <- 3.85 -> DG xxx J0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0104 <- 3.57 -> DG xxx J0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0162 <- 3.07 -> DC xxx J0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0164 <- 3.59 -> DC xxx I0008 : score x.xxxxx >3mx4_DF: title=DNA BINDING AND CLEAVAGE BY THE GIY-YIG ENDONUCLEASE R.ECO29KI INACTIVE VARIANT E142Q organism=ESCHERICHIA COLI : H : HIS ND1 D0163 <- 2.63 -> DG O6 J0014 : score 6.43466 : H : ARG NH1 D0169 <- 2.77 -> DG O6 I0011 : score 6.11983 : H : ARG NH2 D0169 <- 2.98 -> DG N7 I0011 : score 6.15477 : H : HIS ND1 F0163 <- 2.69 -> DG O6 I0014 : score 6.35998 : H : ARG NH1 F0169 <- 2.76 -> DG O6 J0011 : score 6.132 : H : ARG NH2 F0169 <- 3.00 -> DG N7 J0011 : score 6.12923 : x : ARG xxxx D0086 <- 3.85 -> DG xxx J0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0104 <- 3.57 -> DG xxx J0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0162 <- 3.07 -> DC xxx J0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0164 <- 3.59 -> DC xxx I0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0162 <- 3.43 -> DC xxx I0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0164 <- 3.39 -> DC xxx J0008 : score x.xxxxx >3mx9_A:Homing_endonucleases; title=MOLECULAR BASIS OF ENGINEERED MEGANUCLEASE TARGETING OF THE ENDOGENOUS HUMAN RAG1 LOCUS organism=Chlamydomonas reinhardtii : H : GLN NE2 A0026 <- 3.30 -> DA N7 C0518 : score 5.48077 : H : ARG NH1 A0038 <- 2.92 -> DG O6 D0604 : score 5.93733 : H : ARG NH2 A0038 <- 2.66 -> DG N7 D0604 : score 6.56338 : H : ARG NH1 A0040 <- 2.51 -> DG O6 D0605 : score 6.43617 : H : ARG NH2 A0040 <- 3.04 -> DG N7 D0605 : score 6.07815 : H : TYR OH A0044 <- 3.05 -> DC N4 C0517 : score 4.0034 : H : ARG NH1 A0068 <- 2.85 -> DG N7 D0608 : score 5.9895 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.67 -> DG O6 D0608 : score 6.7716 : H : GLN NE2 A0075 <- 2.74 -> DT O4 C0516 : score 5.25332 : H : GLN NE2 A0217 <- 2.82 -> DA N7 D0618 : score 6.06538 : H : LYS NZ A0219 <- 2.77 -> DG N7 D0619 : score 5.41821 : H : LYS NZ A0219 <- 2.60 -> DG O6 D0619 : score 6.012 : H : ARG NH1 A0221 <- 3.21 -> DG N7 C0503 : score 5.5539 : H : ARG NH2 A0221 <- 2.29 -> DG O6 C0503 : score 7.2732 : H : ARG NH2 A0268 <- 2.85 -> DG O6 D0617 : score 6.534 : w : THR OG1 A0331 <- 5.66 -> DT O2 D0616 : score 2.522 : V : SER CB A0032 <- 3.79 -> DT C7 D0601 : score 3.13911 : V : ALA CB A0235 <- 3.77 -> DT C7 D0616 : score 5.64097 : V : SER CB A0223 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BASIS OF ENGINEERED MEGANUCLEASE TARGETING OF THE ENDOGENOUS HUMAN RAG1 LOCUS organism=Chlamydomonas reinhardtii : w : GLN NE2 A0026 <- 5.34 -> DA N6 D0518 : score 2.804 : H : ARG NH1 A0038 <- 3.32 -> DG N7 E0604 : score 5.4208 : H : ARG NH2 A0038 <- 3.13 -> DG N7 E0604 : score 5.96323 : H : ARG NH2 A0038 <- 2.50 -> DG O6 E0604 : score 6.996 : H : ARG NH1 A0040 <- 2.77 -> DG O6 E0605 : score 6.11983 : H : ARG NH2 A0040 <- 3.02 -> DG N7 E0605 : score 6.10369 : H : TYR OH A0044 <- 3.02 -> DC N4 D0517 : score 4.02868 : w : TYR OH A0044 <- 5.82 -> DA N6 D0518 : score 2.545 : w : TYR OH A0044 <- 5.46 -> DT O4 E0607 : score 2.914 : H : ARG NH1 A0068 <- 2.87 -> DG N7 E0608 : score 5.9653 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.79 -> DG O6 E0608 : score 6.6132 : H : GLN NE2 A0075 <- 2.81 -> DT O4 D0516 : score 5.18064 : H : LYS NZ A0219 <- 3.02 -> DG N7 F0619 : score 5.14892 : H : LYS NZ A0219 <- 2.85 -> DG O6 F0619 : score 5.72296 : w : LYS NZ A0219 <- 5.66 -> DT O4 C0505 : score 1.7 : H : ARG NH1 A0221 <- 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A0030 <- 3.89 -> DT xxx E0603 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.74 -> DC xxx C0515 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 3.32 -> DC xxx E0606 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.86 -> DC xxx C0514 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 4.07 -> DG xxx E0611 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0140 <- 4.39 -> DC xxx C0517 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0022 <- 3.87 -> DT xxx E0616 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0024 <- 3.66 -> DT xxx E0616 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0028 <- 3.12 -> DG xxx E0619 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0032 <- 2.97 -> DT xxx C0502 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0033 <- 3.64 -> DT xxx C0502 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0038 <- 3.87 -> DT xxx C0504 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0040 <- 4.48 -> DT xxx C0504 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0044 <- 3.77 -> DT xxx E0616 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0046 <- 3.60 -> DC xxx E0615 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0068 <- 3.79 -> DT xxx C0507 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0070 <- 4.16 -> DC xxx C0508 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0073 <- 3.96 -> DC xxx E0614 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0075 <- 3.74 -> DT xxx E0616 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0079 <- 3.79 -> DT xxx C0505 : score x.xxxxx >3mxb_B:Homing_endonucleases; title=MOLECULAR BASIS OF ENGINEERED MEGANUCLEASE TARGETING OF THE ENDOGENOUS HUMAN RAG1 LOCUS organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : H : GLN NE2 B0026 <- 3.06 -> DA N7 E0618 : score 5.77308 : H : ARG NH1 B0030 <- 3.20 -> DG N7 C0503 : score 5.566 : H : ARG NH2 B0030 <- 2.29 -> DG O6 C0503 : score 7.2732 : H : ARG NH2 B0077 <- 2.69 -> DG O6 E0617 : score 6.7452 : w : LYS NZ B0139 <- 5.56 -> DG N2 C0511 : score 0.846 : w : THR OG1 B0140 <- 5.71 -> DT O2 E0616 : score 2.522 : V : ALA CB B0044 <- 3.77 -> DT C7 E0616 : score 5.64097 : x : SER xxxx B0022 <- 3.87 -> DT xxx E0616 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0024 <- 3.66 -> DT xxx E0616 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0028 <- 3.12 -> DG xxx E0619 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0032 <- 2.97 -> DT xxx C0502 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0033 <- 3.64 -> DT xxx C0502 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0038 <- 3.87 -> DT xxx C0504 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0040 <- 4.48 -> DT xxx C0504 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0046 <- 3.60 -> DC xxx E0615 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0068 <- 3.79 -> DT xxx C0507 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0070 <- 4.16 -> DC xxx C0508 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0073 <- 3.96 -> DC xxx E0614 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0075 <- 3.74 -> DT xxx E0616 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0079 <- 3.79 -> DT xxx C0505 : score x.xxxxx >3mxb_RS:Homing_endonucleases; title=MOLECULAR BASIS OF ENGINEERED MEGANUCLEASE TARGETING OF THE ENDOGENOUS HUMAN RAG1 LOCUS organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : H : GLN NE2 R0026 <- 2.96 -> DA N7 T0518 : score 5.89487 : w : ASN ND2 R0030 <- 5.50 -> DT O4 V0603 : score 3.275 : H : ARG NH1 R0038 <- 2.61 -> DG N7 V0604 : score 6.2799 : H : ARG NH1 R0040 <- 3.20 -> DG N7 V0605 : score 5.566 : H : ARG NH2 R0040 <- 2.66 -> DG N7 V0605 : score 6.56338 : H : ARG NH2 R0040 <- 2.20 -> DG O6 V0605 : score 7.392 : H : TYR OH R0044 <- 3.29 -> DC N4 T0517 : score 3.80112 : H : ARG NH1 R0068 <- 2.58 -> DG O6 V0608 : score 6.351 : H : ARG NH2 R0068 <- 2.35 -> DG N7 V0608 : score 6.95923 : H : GLN NE2 R0075 <- 2.54 -> DT O4 T0516 : score 5.46096 : w : LYS NZ R0139 <- 5.67 -> DG N2 V0611 : score 0.846 : w : THR OG1 R0140 <- 5.68 -> DG N2 V0610 : score 2.036 : H : GLN NE2 S0026 <- 3.08 -> DA N7 V0618 : score 5.74872 : H : LYS NZ S0028 <- 2.93 -> DG N7 V0619 : score 5.24586 : w : LYS NZ S0028 <- 6.16 -> DT O4 T0505 : score 1.7 : H : ARG NH1 S0030 <- 3.03 -> DG N7 T0503 : score 5.7717 : H : ARG NH2 S0030 <- 2.31 -> DG O6 T0503 : score 7.2468 : w : SER OG S0040 <- 5.89 -> DT O4 T0505 : score 2.338 : H : ARG NH1 S0077 <- 2.71 -> DT O4 T0507 : score 3.32677 : w : THR OG1 S0140 <- 5.52 -> DG N3 V0617 : score 2.036 : w : THR OG1 S0140 <- 5.73 -> DT O2 V0616 : score 2.522 : V : SER CB S0032 <- 3.84 -> DT C7 T0502 : score 3.09997 : x : SER xxxx R0022 <- 3.80 -> DT xxx T0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0024 <- 3.51 -> DT xxx T0516 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0028 <- 4.10 -> DG xxx T0519 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0032 <- 3.85 -> DT xxx V0601 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0046 <- 3.72 -> DC xxx T0515 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx R0066 <- 3.42 -> DC xxx V0606 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0073 <- 3.92 -> DC xxx T0514 : score x.xxxxx : x : SER xxxx S0022 <- 3.89 -> DT xxx V0616 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx S0024 <- 4.48 -> DG xxx V0617 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx S0033 <- 4.07 -> DT xxx T0502 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx S0038 <- 3.78 -> DT xxx T0504 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx S0044 <- 3.81 -> DT xxx V0616 : score x.xxxxx : x : THR xxxx S0046 <- 3.60 -> DC xxx V0615 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx S0068 <- 3.78 -> DC xxx T0506 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx S0073 <- 3.85 -> DC xxx V0614 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx S0075 <- 3.74 -> DT xxx V0616 : score x.xxxxx : x : SER xxxx S0079 <- 3.83 -> DT xxx T0505 : score x.xxxxx >3mzh_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CAMP RECEPTOR PROTEIN FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN COMPLEX WITH CAMP AND ITS DNA BINDING ELEMENT organism=Mycobacterium tuberculosis : H : ARG NH2 A0188 <- 2.80 -> DG N7 C0007 : score 6.38462 : H : GLU OE1 A0189 <- 3.15 -> DC N4 D0017 : score 5.36419 : V : LYS CE A0193 <- 3.72 -> DT C7 C0008 : score 2.65305 : x : SER xxxx A0187 <- 4.08 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0190 <- 3.58 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0192 <- 3.36 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >3mzh_AB:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CAMP RECEPTOR PROTEIN FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN COMPLEX WITH CAMP AND ITS DNA BINDING ELEMENT organism=Mycobacterium tuberculosis : H : ARG NH2 A0188 <- 2.80 -> DG N7 C0007 : score 6.38462 : H : GLU OE1 A0189 <- 3.15 -> DC N4 D0017 : score 5.36419 : H : LYS NZ B0193 <- 3.08 -> DG N7 D0008 : score 5.08429 : x : SER xxxx A0187 <- 4.08 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0190 <- 3.58 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0192 <- 3.36 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0193 <- 3.38 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0187 <- 4.26 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0188 <- 3.67 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0189 <- 3.42 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0190 <- 3.28 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0192 <- 3.00 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >3n4m_ABC:C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=E. COLI RNA POLYMERASE ALPHA SUBUNIT C-TERMINAL DOMAIN IN COMPLEX WITH CAP AND DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0180 <- 3.09 -> DG N7 D0016 : score 5.6991 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.79 -> DG O6 D0016 : score 6.6132 : H : GLU OE1 A0181 <- 2.91 -> DC N4 E0027 : score 5.64105 : H : ARG NH2 A0185 <- 3.14 -> DT O4 E0026 : score 3.31218 : H : ARG NH2 A0185 <- 2.99 -> DG N7 D0018 : score 6.142 : H : ARG NH2 A0185 <- 2.96 -> DG O6 D0018 : score 6.3888 : x : GLN xxxx A0170 <- 4.33 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0179 <- 3.99 -> DT xxx E0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0265 <- 4.29 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0265 <- 4.23 -> DA xxx E0041 : score x.xxxxx >3n4m_B:C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit; title=E. COLI RNA POLYMERASE ALPHA SUBUNIT C-TERMINAL DOMAIN IN COMPLEX WITH CAP AND DNA organism=ESCHERICHIA COLI : x : ARG xxxx B0265 <- 4.29 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >3n6s_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MITOCHONDRIAL MTERF IN COMPLEX WITH A 15- MER DNA ENCOMPASSING THE TRNALEU(UUR) BINDING SEQUENCE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0387 <- 2.99 -> DG N7 C0006 : score 5.8201 : H : ARG NH1 A0387 <- 3.05 -> DG O6 C0007 : score 5.77917 : H : ARG NH2 A0387 <- 2.78 -> DG O6 C0006 : score 6.6264 : x : ARG xxxx A0350 <- 3.67 -> DG xxx B0013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0353 <- 4.29 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0384 <- 4.18 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx >3n78_A:Restriction_endonuclease-like; title=SGRAI BOUND TO SECONDARY SITE DNA AND MG(II) organism=Streptomyces griseus : H : ARG NH1 A0031 <- 2.85 -> DG N7 C0013 : score 5.9895 : H : ARG NH2 A0031 <- 2.91 -> DG O6 C0013 : score 6.4548 : H : ASN OD1 A0092 <- 3.13 -> DG N2 C0010 : score 4.4832 A : H : ARG NH2 A0152 <- 2.95 -> DC O2 D0007 : score 3.58776 : H : ARG NE A0246 <- 2.93 -> DG O6 D0011 : score 3.83856 : H : ARG NH2 A0246 <- 2.95 -> DG N7 D0011 : score 6.19308 : H : ASP OD1 A0248 <- 3.37 -> DC N4 C0008 : score 4.73556 A : H : ASP OD2 A0248 <- 2.79 -> DC N4 C0009 : score 6.2124 A : H : ARG NE A0249 <- 2.61 -> DG O6 D0010 : score 4.09078 : x : GLN xxxx A0036 <- 4.34 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0096 <- 3.14 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 3.87 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0247 <- 3.20 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx >3n78_AB:Restriction_endonuclease-like; title=SGRAI BOUND TO SECONDARY SITE DNA AND MG(II) organism=Streptomyces griseus : H : ARG NH1 A0031 <- 2.85 -> DG N7 C0013 : score 5.9895 : H : ARG NH2 A0031 <- 2.91 -> DG O6 C0013 : score 6.4548 : H : ASN OD1 A0092 <- 3.13 -> DG N2 C0010 : score 4.4832 A : H : ARG NH2 A0152 <- 2.95 -> DC O2 D0007 : score 3.58776 : H : ARG NE A0246 <- 2.93 -> DG O6 D0011 : score 3.83856 : H : ARG NH2 A0246 <- 2.95 -> DG N7 D0011 : score 6.19308 : H : ASP OD1 A0248 <- 3.37 -> DC N4 C0008 : score 4.73556 A : H : ASP OD2 A0248 <- 2.79 -> DC N4 C0009 : score 6.2124 A : H : ARG NE A0249 <- 2.61 -> DG O6 D0010 : score 4.09078 : H : ARG NH1 B0031 <- 3.30 -> DG N7 D0013 : score 5.445 : H : ARG NH2 B0031 <- 2.87 -> DG O6 D0013 : score 6.5076 : H : ARG NE B0246 <- 2.96 -> DG O6 C0011 : score 3.81491 : H : ARG NH2 B0246 <- 3.10 -> DG N7 C0011 : score 6.00154 : H : ARG NE B0249 <- 2.59 -> DG O6 C0010 : score 4.10655 : H : ARG NH2 B0249 <- 3.01 -> DG N7 C0010 : score 6.11646 : x : GLN xxxx A0036 <- 4.34 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0096 <- 3.14 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 3.87 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0247 <- 3.20 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0036 <- 4.25 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0092 <- 3.21 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0096 <- 3.22 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0152 <- 3.30 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0244 <- 4.16 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0247 <- 3.49 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0248 <- 3.11 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx >3n7b_A:Restriction_endonuclease-like; title=SGRAI BOUND TO SECONDARY SITE DNA AND CA(II) organism=Streptomyces griseus : H : ARG NH1 A0031 <- 2.98 -> DG N7 C0013 : score 5.8322 : H : ARG NH2 A0031 <- 3.07 -> DG O6 C0013 : score 6.2436 : H : ASN OD1 A0092 <- 2.93 -> DG N2 C0010 : score 4.6752 A : H : ARG NE A0152 <- 3.25 -> DC O2 D0007 : score 2.41967 : H : ARG NH2 A0152 <- 2.93 -> DC O2 D0007 : score 3.60255 : H : ARG NE A0246 <- 2.79 -> DG O6 D0011 : score 3.94891 : H : ARG NH2 A0246 <- 2.98 -> DG N7 D0011 : score 6.15477 : H : ASP OD2 A0248 <- 2.81 -> DC N4 C0009 : score 6.1876 A : H : ARG NE A0249 <- 2.88 -> DG O6 D0010 : score 3.87797 : H : ARG NH2 A0249 <- 3.14 -> DG N7 D0010 : score 5.95046 : x : GLN xxxx A0036 <- 4.34 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0095 <- 4.38 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0096 <- 3.31 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 4.29 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0247 <- 3.76 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx >3n7b_AB:Restriction_endonuclease-like; title=SGRAI BOUND TO SECONDARY SITE DNA AND CA(II) organism=Streptomyces griseus : H : ARG NH1 A0031 <- 2.98 -> DG N7 C0013 : score 5.8322 : H : ARG NH2 A0031 <- 3.07 -> DG O6 C0013 : score 6.2436 : H : ASN OD1 A0092 <- 2.93 -> DG N2 C0010 : score 4.6752 A : H : ARG NE A0152 <- 3.25 -> DC O2 D0007 : score 2.41967 : H : ARG NH2 A0152 <- 2.93 -> DC O2 D0007 : score 3.60255 : H : ARG NE A0246 <- 2.79 -> DG O6 D0011 : score 3.94891 : H : ARG NH2 A0246 <- 2.98 -> DG N7 D0011 : score 6.15477 : H : ASP OD2 A0248 <- 2.81 -> DC N4 C0009 : score 6.1876 A : H : ARG NE A0249 <- 2.88 -> DG O6 D0010 : score 3.87797 : H : ARG NH2 A0249 <- 3.14 -> DG N7 D0010 : score 5.95046 : H : ARG NH1 B0031 <- 2.94 -> DG N7 D0013 : score 5.8806 : H : ARG NH2 B0031 <- 2.91 -> DG O6 D0013 : score 6.4548 : H : ARG NE B0246 <- 2.87 -> DG O6 C0011 : score 3.88585 : H : ARG NH2 B0246 <- 2.93 -> DG N7 C0011 : score 6.21862 : H : ASP OD1 B0248 <- 3.27 -> DC N4 D0008 : score 4.84245 A : H : ASP OD2 B0248 <- 3.08 -> DC N4 D0009 : score 5.8528 A : H : ARG NE B0249 <- 2.89 -> DG O6 C0010 : score 3.87009 : H : ARG NH2 B0249 <- 2.97 -> DG N7 C0010 : score 6.16754 : x : GLN xxxx A0036 <- 4.34 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0095 <- 4.38 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0096 <- 3.31 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 4.29 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0247 <- 3.76 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0036 <- 4.36 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0092 <- 3.18 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0095 <- 4.21 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0096 <- 3.18 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0152 <- 3.21 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0244 <- 4.26 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0247 <- 3.35 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx >3n7q_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MITOCHONDRIAL MTERF FRAGMENT (AA 99-399) IN COMPLEX WITH A 12-MER DNA ENCOMPASSING THE TRNALEU(UUR) BINDING SEQUENCE organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0387 <- 3.09 -> DG O6 B0005 : score 6.2172 : x : ARG xxxx A0350 <- 4.07 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0383 <- 3.30 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0384 <- 4.13 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >3n97_A:Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=RNA POLYMERASE ALPHA C-TERMINAL DOMAIN (E. COLI) AND SIGMA REGION 4 (T. AQ. MUTANT) BOUND TO (UP,-35 ELEMENT) DNA organism=THERMUS AQUATICUS : x : LEU xxxx A0398 <- 4.07 -> DT xxx N0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0399 <- 4.12 -> DT xxx N0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0408 <- 3.84 -> DT xxx M0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0409 <- 3.46 -> DA xxx M0017 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0410 <- 2.63 -> DC xxx N0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0411 <- 3.47 -> DC xxx M0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0413 <- 3.15 -> DC xxx N0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0414 <- 3.31 -> DC xxx M0013 : score x.xxxxx >3n97_ABC:Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=RNA POLYMERASE ALPHA C-TERMINAL DOMAIN (E. COLI) AND SIGMA REGION 4 (T. AQ. MUTANT) BOUND TO (UP,-35 ELEMENT) DNA organism=ESCHERICHIA COLI / THERMUS AQUATICUS : x : LEU xxxx A0398 <- 4.07 -> DT xxx N0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0399 <- 4.12 -> DT xxx N0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0408 <- 3.84 -> DT xxx M0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0409 <- 3.46 -> DA xxx M0017 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0410 <- 2.63 -> DC xxx N0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0411 <- 3.47 -> DC xxx M0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0413 <- 3.15 -> DC xxx N0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0414 <- 3.31 -> DC xxx M0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0265 <- 3.74 -> DA xxx M0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0265 <- 4.20 -> DA xxx M0007 : score x.xxxxx >3nae_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DATP OPPOSITE GUANIDINOHYDANTOIN organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.10 -> DA N3 P0114 : score 2.61031 : w : LYS NZ A0734 <- 6.04 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >3nbn_AD:DNA-binding_protein_LAG-1_CSL;p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A DIMER OF NOTCH TRANSCRIPTION COMPLEX TRIMERS ON HES1 DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0051 <- 2.97 -> DG N7 X0007 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0051 <- 3.12 -> DG O6 X0007 : score 6.1776 : H : LYS NZ A0152 <- 2.55 -> DG N7 X0009 : score 5.65519 : H : LYS NZ A0152 <- 2.52 -> DG O6 X0009 : score 6.10449 : H : ARG NH1 D0051 <- 3.27 -> DG N7 Y0007 : score 5.4813 : H : LYS NZ D0152 <- 2.55 -> DG O6 Y0009 : score 6.06981 : V : GLU CB D0049 <- 3.85 -> DT C7 Y0006 : score 1.60735 : x : TYR xxxx A0046 <- 3.02 -> DT xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0049 <- 3.30 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0151 <- 3.18 -> DT xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0156 <- 3.07 -> DT xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0181 <- 3.64 -> DG xxx X0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0182 <- 2.73 -> DA xxx Y0035 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0046 <- 3.07 -> DT xxx X0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0151 <- 3.40 -> DT xxx X0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0156 <- 3.47 -> DT xxx X0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0181 <- 4.07 -> DT xxx Y0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0182 <- 3.83 -> DG xxx X0035 : score x.xxxxx >3nbn_D:p53-like_transcription_factors;DNA-binding_protein_LAG-1_CSL;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A DIMER OF NOTCH TRANSCRIPTION COMPLEX TRIMERS ON HES1 DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 D0051 <- 3.27 -> DG N7 Y0007 : score 5.4813 : H : LYS NZ D0152 <- 2.55 -> DG O6 Y0009 : score 6.06981 : V : GLU CB D0049 <- 3.85 -> DT C7 Y0006 : score 1.60735 : x : TYR xxxx D0046 <- 3.07 -> DT xxx X0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0151 <- 3.40 -> DT xxx X0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0156 <- 3.47 -> DT xxx X0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0181 <- 4.07 -> DT xxx Y0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0182 <- 3.83 -> DG xxx X0035 : score x.xxxxx >3nci_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DCTP OPPOSITE DG AT 1.8 ANGSTROM RESOLUTION organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.00 -> DA N3 P0114 : score 2.66585 : w : LYS NZ A0734 <- 5.63 -> DT O2 P0112 : score 0.522 : w : LYS NZ A0734 <- 5.98 -> DC O2 T0010 : score 1.3 >3ndh_AB:TTHA0583/YokD-like; title=RESTRICTION ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH SUBSTRATE DNA organism=Thermoplasma acidophilum : H : GLU OE1 A0048 <- 3.33 -> DG N2 D0006 : score 3.85337 A : w : SER OG A0051 <- 5.84 -> DC O2 C0007 : score 1.768 : H : LYS NZ A0104 <- 2.87 -> DG N7 C0008 : score 5.31049 : H : ARG NE A0171 <- 3.33 -> DG N7 D0006 : score 3.95308 : H : ARG NE A0171 <- 2.98 -> DG O6 D0006 : score 3.79915 : H : ARG NH2 A0171 <- 3.01 -> DG N7 D0006 : score 6.11646 : H : GLU OE1 B0048 <- 3.29 -> DG N2 C0006 : score 3.88785 A : w : SER OG B0051 <- 5.86 -> DC O2 D0007 : score 1.768 : w : THR OG1 B0077 <- 6.34 -> DT O2 D0004 : score 2.522 : H : LYS NZ B0104 <- 2.90 -> DG N7 D0008 : score 5.27818 : H : LYS NZ B0104 <- 2.90 -> DG N7 D0008 : score 5.27818 : H : ARG NE B0171 <- 2.91 -> DG O6 C0006 : score 3.85432 : H : ARG NH2 B0171 <- 3.00 -> DG N7 C0006 : score 6.12923 : x : MET xxxx A0047 <- 3.06 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0077 <- 3.51 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0107 <- 3.17 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0168 <- 4.39 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0169 <- 3.39 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0047 <- 3.05 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0095 <- 4.43 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0107 <- 3.25 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0169 <- 3.37 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >3ndh_B:TTHA0583/YokD-like; title=RESTRICTION ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH SUBSTRATE DNA organism=Thermoplasma acidophilum : H : GLU OE1 B0048 <- 3.29 -> DG N2 C0006 : score 3.88785 A : w : SER OG B0051 <- 5.86 -> DC O2 D0007 : score 1.768 : w : THR OG1 B0077 <- 6.34 -> DT O2 D0004 : score 2.522 : H : LYS NZ B0104 <- 2.90 -> DG N7 D0008 : score 5.27818 : H : LYS NZ B0104 <- 2.90 -> DG N7 D0008 : score 5.27818 : H : ARG NE B0171 <- 2.91 -> DG O6 C0006 : score 3.85432 : H : ARG NH2 B0171 <- 3.00 -> DG N7 C0006 : score 6.12923 : x : MET xxxx B0047 <- 3.05 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0095 <- 4.43 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0107 <- 3.25 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0169 <- 3.37 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >3ndk_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DCTP OPPOSITE DG organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.07 -> DA N3 P0114 : score 2.62697 : w : LYS NZ A0734 <- 5.56 -> DT O2 P0112 : score 0.522 : x : LYS xxxx A0800 <- 3.86 -> DC xxx P0108 : score x.xxxxx >3ne6_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (S565G/Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DCTP OPPOSITE DG organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.98 -> DA N3 P0114 : score 2.67695 : w : LYS NZ A0734 <- 5.74 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >3ngd_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURAL BASIS FOR PROFICIENT INCORPORATION OF DTTP OPPOSITE O6- METHYLGUANINE BY HUMAN DNA POLYMERASE IOTA organism=HOMO SAPIENS : x : GLU xxxx A0305 <- 3.92 -> DG xxx D0842 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 4.04 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx >3ngi_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DTTP OPPOSITE DG organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0416 <- 6.05 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : H : LYS NZ A0706 <- 2.99 -> DA N3 P0114 : score 2.6714 : H : LYS NZ A0800 <- 3.35 -> DC O2 P0108 : score 2.62208 : w : LYS NZ A0800 <- 6.47 -> DT O2 T0013 : score 0.522 : x : PRO xxxx A0361 <- 4.34 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0561 <- 3.55 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0565 <- 3.52 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0567 <- 4.49 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx >3nh2_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RNASE T IN COMPLEX WITH A STEM DNA WITH A 3' OVERHANG organism=Escherichia coli : w : ARG NH2 A0114 <- 5.44 -> DC O2 D0004 : score 1.669 : w : HIS NE2 A0144 <- 6.00 -> DA N3 D0005 : score 2.619 >3nhg_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (S565G/Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DTTP OPPOSITE DG organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0416 <- 5.95 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : H : LYS NZ A0706 <- 3.11 -> DA N3 P0114 : score 2.60475 : x : PRO xxxx A0361 <- 4.20 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0561 <- 3.86 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0564 <- 4.44 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0567 <- 4.41 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0734 <- 4.46 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx >3nic_AH: title=DNA BINDING AND CLEAVAGE BY THE GIY-YIG ENDONUCLEASE R.ECO29KI INACTIVE VARIANT Y49F organism=ESCHERICHIA COLI : H : HIS ND1 A0163 <- 2.68 -> DG O6 N0014 : score 6.37243 : H : ARG NH1 A0169 <- 2.81 -> DG O6 M0011 : score 6.07117 : H : ARG NH2 A0169 <- 2.89 -> DG N7 M0011 : score 6.26969 : H : HIS ND1 H0163 <- 2.55 -> DG O6 M0014 : score 6.53423 : H : ARG NH1 H0169 <- 2.87 -> DG O6 N0011 : score 5.99817 : H : ARG NH2 H0169 <- 3.04 -> DG N7 N0011 : score 6.07815 : H : ARG NH2 H0169 <- 3.28 -> DG O6 N0011 : score 5.9664 : x : ASN xxxx A0162 <- 3.46 -> DC xxx N0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0164 <- 3.38 -> DC xxx M0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0086 <- 3.50 -> DG xxx M0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0104 <- 3.53 -> DG xxx M0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0162 <- 3.26 -> DC xxx M0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0164 <- 2.92 -> DC xxx N0008 : score x.xxxxx >3nic_BD: title=DNA BINDING AND CLEAVAGE BY THE GIY-YIG ENDONUCLEASE R.ECO29KI INACTIVE VARIANT Y49F organism=ESCHERICHIA COLI : H : HIS ND1 B0163 <- 2.73 -> DG O6 L0014 : score 6.3102 : H : ARG NH1 B0169 <- 2.79 -> DG O6 K0011 : score 6.0955 : H : ARG NH2 B0169 <- 3.00 -> DG N7 K0011 : score 6.12923 : H : HIS ND1 D0163 <- 2.70 -> DG O6 K0014 : score 6.34754 : H : ARG NH1 D0169 <- 2.80 -> DG O6 L0011 : score 6.08333 : H : ARG NH2 D0169 <- 3.27 -> DG N7 L0011 : score 5.78446 : x : ASN xxxx B0162 <- 3.07 -> DC xxx L0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0164 <- 3.55 -> DC xxx K0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0086 <- 3.42 -> DG xxx K0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0104 <- 4.17 -> DG xxx K0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0162 <- 3.31 -> DC xxx K0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0164 <- 3.02 -> DC xxx L0008 : score x.xxxxx >3nic_CG: title=DNA BINDING AND CLEAVAGE BY THE GIY-YIG ENDONUCLEASE R.ECO29KI INACTIVE VARIANT Y49F organism=ESCHERICHIA COLI : H : HIS ND1 C0163 <- 2.51 -> DG O6 J0014 : score 6.58402 : H : ARG NH1 C0169 <- 2.77 -> DG O6 I0011 : score 6.11983 : H : ARG NH2 C0169 <- 2.99 -> DG N7 I0011 : score 6.142 : w : ARG NH1 C0169 <- 6.22 -> DC N4 J0012 : score 1.892 : w : GLN OE1 C0172 <- 6.39 -> DC N4 J0012 : score 3.488 : H : HIS ND1 G0163 <- 2.48 -> DG O6 I0014 : score 6.62135 : H : ARG NH1 G0169 <- 2.80 -> DG O6 J0011 : score 6.08333 : H : ARG NH2 G0169 <- 3.09 -> DG N7 J0011 : score 6.01431 : x : ARG xxxx C0104 <- 3.86 -> DG xxx J0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0162 <- 2.88 -> DC xxx J0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0164 <- 3.24 -> DC xxx I0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0162 <- 3.27 -> DC xxx I0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0164 <- 3.50 -> DC xxx J0008 : score x.xxxxx >3nic_EF: title=DNA BINDING AND CLEAVAGE BY THE GIY-YIG ENDONUCLEASE R.ECO29KI INACTIVE VARIANT Y49F organism=ESCHERICHIA COLI : H : HIS ND1 E0163 <- 2.54 -> DG O6 O0014 : score 6.54668 : H : ARG NH1 E0169 <- 2.70 -> DG O6 P0011 : score 6.205 : H : ARG NH2 E0169 <- 2.81 -> DG N7 P0011 : score 6.37185 : H : HIS ND1 F0163 <- 2.42 -> DG O6 P0014 : score 6.69603 : H : ARG NH1 F0169 <- 3.04 -> DG O6 O0011 : score 5.79133 : H : ARG NH2 F0169 <- 3.26 -> DG N7 O0011 : score 5.79723 : w : ARG NH1 F0169 <- 6.11 -> DC N4 P0012 : score 1.892 : w : GLN OE1 F0172 <- 6.68 -> DC N4 P0012 : score 3.488 : x : ASN xxxx E0162 <- 3.14 -> DC xxx O0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0164 <- 3.51 -> DC xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0104 <- 4.11 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0162 <- 2.80 -> DC xxx P0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0164 <- 4.16 -> DC xxx O0008 : score x.xxxxx >3nic_H: title=DNA BINDING AND CLEAVAGE BY THE GIY-YIG ENDONUCLEASE R.ECO29KI INACTIVE VARIANT Y49F organism=ESCHERICHIA COLI : H : HIS ND1 H0163 <- 2.55 -> DG O6 M0014 : score 6.53423 : H : ARG NH1 H0169 <- 2.87 -> DG O6 N0011 : score 5.99817 : H : ARG NH2 H0169 <- 3.04 -> DG N7 N0011 : score 6.07815 : H : ARG NH2 H0169 <- 3.28 -> DG O6 N0011 : score 5.9664 : x : ARG xxxx H0086 <- 3.50 -> DG xxx M0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0104 <- 3.53 -> DG xxx M0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0162 <- 3.26 -> DC xxx M0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0164 <- 2.92 -> DC xxx N0008 : score x.xxxxx >3nm9_DGJ: title=HMGD(M13A)-DNA COMPLEX organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH1 D0007 <- 3.15 -> DG N3 L0001 : score 2.83888 : w : SER OG D0010 <- 5.98 -> DG N3 E0010 : score 2.344 : H : ARG NH2 G0007 <- 2.80 -> DT O2 F0008 : score 4.23333 : x : TYR xxxx D0012 <- 4.12 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0032 <- 3.77 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0033 <- 4.19 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0036 <- 3.35 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0020 <- 4.42 -> DG xxx H0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0032 <- 3.12 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0033 <- 3.57 -> DG xxx I0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0036 <- 3.76 -> DG xxx I0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx J0032 <- 4.45 -> DA xxx L0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0036 <- 3.98 -> DC xxx K0009 : score x.xxxxx >3nm9_G:HMG-box; title=HMGD(M13A)-DNA COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 G0007 <- 2.80 -> DT O2 F0008 : score 4.23333 : x : ARG xxxx G0020 <- 4.42 -> DG xxx H0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0032 <- 3.12 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0033 <- 3.57 -> DG xxx I0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0036 <- 3.76 -> DG xxx I0010 : score x.xxxxx >3o1m_A:Clavaminate_synthase-like; title=IRON-CATALYZED OXIDATION INTERMEDIATES CAPTURED IN A DNA REPAIR DIOXYGENASE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0161 <- 2.89 -> DG N7 C0005 : score 5.9411 : H : ARG NH2 A0161 <- 2.79 -> DG O6 C0005 : score 6.6132 : x : CYS xxxx A0129 <- 3.67 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx >3o1o_A:Clavaminate_synthase-like; title=IRON-CATALYZED OXIDATION INTERMEDIATES CAPTURED IN A DNA REPAIR DIOXYGENASE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0161 <- 2.81 -> DG N7 C0005 : score 6.0379 : H : ARG NH2 A0161 <- 2.80 -> DG O6 C0005 : score 6.6 : x : CYS xxxx A0129 <- 3.69 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx >3o1p_A:Clavaminate_synthase-like; title=IRON-CATALYZED OXIDATION INTERMEDIATES CAPTURED IN A DNA REPAIR DIOXYGENASE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0161 <- 2.81 -> DG N7 C0005 : score 6.0379 : H : ARG NH2 A0161 <- 2.76 -> DG O6 C0005 : score 6.6528 : x : CYS xxxx A0129 <- 3.75 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx >3o1r_A:Clavaminate_synthase-like; title=IRON-CATALYZED OXIDATION INTERMEDIATES CAPTURED IN A DNA REPAIR DIOXYGENASE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0161 <- 2.79 -> DG N7 C0005 : score 6.0621 : H : ARG NH2 A0161 <- 2.82 -> DG O6 C0005 : score 6.5736 : x : CYS xxxx A0129 <- 3.68 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx >3o1s_A:Clavaminate_synthase-like; title=IRON-CATALYZED OXIDATION INTERMEDIATES CAPTURED IN A DNA REPAIR DIOXYGENASE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0161 <- 2.80 -> DG N7 C0005 : score 6.05 : H : ARG NH2 A0161 <- 2.80 -> DG O6 C0005 : score 6.6 : x : CYS xxxx A0129 <- 3.72 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx >3o1t_A:Clavaminate_synthase-like; title=IRON-CATALYZED OXIDATION INTERMEDIATES CAPTURED IN A DNA REPAIR DIOXYGENASE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0161 <- 2.83 -> DG N7 C0005 : score 6.0137 : H : ARG NH2 A0161 <- 2.68 -> DG O6 C0005 : score 6.7584 : x : CYS xxxx A0129 <- 3.70 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx >3o1u_A:Clavaminate_synthase-like; title=IRON-CATALYZED OXIDATION INTERMEDIATES CAPTURED IN A DNA REPAIR DIOXYGENASE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0161 <- 2.82 -> DG N7 C0005 : score 6.0258 : H : ARG NH2 A0161 <- 2.77 -> DG O6 C0005 : score 6.6396 : x : CYS xxxx A0129 <- 3.74 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx >3o1v_A:Clavaminate_synthase-like; title=IRON-CATALYZED OXIDATION INTERMEDIATES CAPTURED IN A DNA REPAIR DIOXYGENASE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0161 <- 2.93 -> DG N7 C0005 : score 5.8927 : H : ARG NH2 A0161 <- 2.88 -> DG O6 C0005 : score 6.4944 : x : CYS xxxx A0129 <- 3.72 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx >3o3f_A:Ribonuclease_H-like; title=T. MARITIMA RNASE H2 D107N IN COMPLEX WITH NUCLEIC ACID SUBSTRATE AND MAGNESIUM IONS organism=Thermotoga maritima : w : ARG NE A0022 <- 5.82 -> DT O2 C0009 : score 0.757 : x : TYR xxxx A0163 <- 3.79 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >3o3g_A:Ribonuclease_H-like; title=T. MARITIMA RNASE H2 IN COMPLEX WITH NUCLEIC ACID SUBSTRATE AND CALCIUM IONS organism=Thermotoga maritima : x : ARG xxxx A0022 <- 3.98 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0109 <- 3.09 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0163 <- 3.85 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >3o3h_A:Ribonuclease_H-like; title=T. MARITIMA RNASE H2 D107N IN COMPLEX WITH NUCLEIC ACID SUBSTRATE AND MANGANESE IONS organism=Thermotoga maritima : x : ARG xxxx A0022 <- 3.80 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0163 <- 3.96 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >3o62_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE MODIFIED WITH A CISPLATIN 1,3-CIS- {PT(NH3)2}2+-D(GPTPG) INTRASTRAND CROSS-LINK organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx A0040 <- 3.55 -> DA xxx J0229 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.44 -> DA xxx J0152 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0042 <- 3.49 -> DC xxx I0144 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0049 <- 4.29 -> DA xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.72 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.61 -> DA xxx J0245 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.66 -> DA xxx J0256 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.32 -> DG xxx J0277 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.77 -> DG xxx J0267 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.53 -> DA xxx I0082 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.98 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0042 <- 3.81 -> DG xxx J0290 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.96 -> DT xxx I0099 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.05 -> DT xxx I0080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.41 -> DT xxx I0110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 3.53 -> DC xxx I0131 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0028 <- 3.31 -> DG xxx J0171 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0083 <- 4.18 -> DT xxx J0187 : score x.xxxxx >3o62_D:Histone-fold; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE MODIFIED WITH A CISPLATIN 1,3-CIS- {PT(NH3)2}2+-D(GPTPG) INTRASTRAND CROSS-LINK organism=? : x : ARG xxxx D0030 <- 3.77 -> DG xxx J0267 : score x.xxxxx >3o9x_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF THE E. COLI ANTITOXIN MQSA (YGIT/B3021) IN COMPLEX WITH ITS GENE PROMOTER organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 A0097 <- 3.25 -> DA N6 E0007 : score 5.47983 : H : ASN ND2 A0097 <- 2.79 -> DG O6 F0018 : score 5.64974 : H : ASN ND2 A0097 <- 2.73 -> DT O4 F0019 : score 5.3586 : w : ASN OD1 A0097 <- 5.08 -> DT O4 E0006 : score 3.132 : H : ARG NH1 A0101 <- 3.01 -> DG O6 F0018 : score 5.82783 : H : ARG NH2 A0101 <- 3.02 -> DG N7 F0017 : score 6.10369 : w : ARG NH1 A0101 <- 6.01 -> DA N6 E0008 : score 1.486 : V : VAL CG2 A0096 <- 3.73 -> DT C7 F0019 : score 6.23023 : x : GLN xxxx A0085 <- 4.24 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0100 <- 3.60 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx >3o9x_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF THE E. COLI ANTITOXIN MQSA (YGIT/B3021) IN COMPLEX WITH ITS GENE PROMOTER organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 A0097 <- 3.25 -> DA N6 E0007 : score 5.47983 : H : ASN ND2 A0097 <- 2.79 -> DG O6 F0018 : score 5.64974 : H : ASN ND2 A0097 <- 2.73 -> DT O4 F0019 : score 5.3586 : w : ASN OD1 A0097 <- 5.08 -> DT O4 E0006 : score 3.132 : H : ARG NH1 A0101 <- 3.01 -> DG O6 F0018 : score 5.82783 : H : ARG NH2 A0101 <- 3.02 -> DG N7 F0017 : score 6.10369 : w : ARG NH1 A0101 <- 6.01 -> DA N6 E0008 : score 1.486 : H : ASN ND2 B0097 <- 2.70 -> DT O4 E0018 : score 5.39031 : H : ARG NH1 B0101 <- 3.09 -> DG O6 E0017 : score 5.7305 : H : ARG NH2 B0101 <- 3.05 -> DG N7 E0016 : score 6.06538 : w : ARG NH1 B0101 <- 5.95 -> DA N6 F0009 : score 1.486 : V : VAL CG2 B0096 <- 3.71 -> DT C7 E0018 : score 6.26085 : V : VAL CG2 A0096 <- 3.73 -> DT C7 F0019 : score 6.23023 : x : GLN xxxx A0085 <- 4.24 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0100 <- 3.60 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0100 <- 3.67 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx >3od8_CD:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=HUMAN PARP-1 ZINC FINGER 1 (ZN1) BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 C0018 <- 5.75 -> DG N3 K0008 : score 0.677 : w : ARG NH1 D0018 <- 5.28 -> DG N3 L0008 : score 1.593 : x : MET xxxx C0043 <- 3.85 -> DG xxx K0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0044 <- 3.26 -> DG xxx K0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0048 <- 3.57 -> DG xxx K0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0044 <- 3.36 -> DG xxx K0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0048 <- 4.34 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0049 <- 3.83 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx >3od8_EF:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=HUMAN PARP-1 ZINC FINGER 1 (ZN1) BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 F0018 <- 5.24 -> DG N3 N0008 : score 0.677 : x : ARG xxxx E0018 <- 4.19 -> DG xxx M0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0044 <- 3.15 -> DG xxx M0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0048 <- 3.16 -> DG xxx M0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0049 <- 4.42 -> DG xxx M0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0044 <- 3.27 -> DG xxx M0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0049 <- 4.06 -> DC xxx N0010 : score x.xxxxx >3od8_G:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=HUMAN PARP-1 ZINC FINGER 1 (ZN1) BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : w : SER OG G0041 <- 5.76 -> DG N3 O0010 : score 2.344 : x : ARG xxxx G0018 <- 4.23 -> DG xxx O0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0043 <- 4.01 -> DC xxx P0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0044 <- 3.34 -> DC xxx P0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0048 <- 3.58 -> DG xxx O0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0049 <- 3.90 -> DG xxx O0010 : score x.xxxxx >3od8_GH:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=HUMAN PARP-1 ZINC FINGER 1 (ZN1) BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : w : SER OG G0041 <- 5.76 -> DG N3 O0010 : score 2.344 : x : ARG xxxx G0018 <- 4.23 -> DG xxx O0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0043 <- 4.01 -> DC xxx P0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0044 <- 3.34 -> DC xxx P0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0048 <- 3.58 -> DG xxx O0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0049 <- 3.90 -> DG xxx O0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0018 <- 4.00 -> DG xxx O0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0044 <- 3.35 -> DG xxx O0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx H0048 <- 4.18 -> DC xxx P0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0049 <- 3.77 -> DC xxx P0010 : score x.xxxxx >3oda_C:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=HUMAN PARP-1 ZINC FINGER 1 (ZN1) BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 C0018 <- 6.07 -> DG N3 L0005 : score 0.677 : x : MET xxxx C0043 <- 3.35 -> DC xxx K0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0044 <- 3.17 -> DG xxx L0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0048 <- 3.86 -> DC xxx K0010 : score x.xxxxx >3oda_CD:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=HUMAN PARP-1 ZINC FINGER 1 (ZN1) BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 C0018 <- 6.07 -> DG N3 L0005 : score 0.677 : x : MET xxxx C0043 <- 3.35 -> DC xxx K0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0044 <- 3.17 -> DG xxx L0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0048 <- 3.86 -> DC xxx K0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0018 <- 4.03 -> DG xxx L0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0044 <- 3.41 -> DG xxx K0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0048 <- 3.76 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0049 <- 3.96 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx >3oda_EF:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=HUMAN PARP-1 ZINC FINGER 1 (ZN1) BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx E0018 <- 3.50 -> DG xxx M0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0043 <- 3.69 -> DC xxx M0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0044 <- 3.27 -> DG xxx N0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0048 <- 4.03 -> DC xxx M0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0018 <- 3.81 -> DG xxx N0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0044 <- 3.28 -> DG xxx M0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0048 <- 3.82 -> DC xxx N0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0049 <- 3.98 -> DC xxx N0010 : score x.xxxxx >3oda_GH:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=HUMAN PARP-1 ZINC FINGER 1 (ZN1) BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 G0018 <- 5.79 -> DA N3 O0007 : score 2.092 A : w : SER OG G0041 <- 5.71 -> DC O2 O0010 : score 1.768 : x : MET xxxx G0043 <- 3.46 -> DG xxx P0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0044 <- 3.18 -> DG xxx P0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0048 <- 3.62 -> DC xxx O0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0049 <- 4.19 -> DC xxx O0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0018 <- 4.14 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0044 <- 3.31 -> DG xxx O0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx H0048 <- 3.86 -> DC xxx P0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0049 <- 3.92 -> DC xxx P0010 : score x.xxxxx >3odc_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=HUMAN PARP-1 ZINC FINGER 2 (ZN2) BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 B0122 <- 3.07 -> DC O2 F0004 : score 3.49899 : x : LYS xxxx B0148 <- 4.21 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0151 <- 3.32 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0154 <- 3.72 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx >3ode_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=HUMAN PARP-1 ZINC FINGER 2 (ZN2) BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 B0122 <- 2.36 -> DT O2 F0004 : score 4.60587 : H : ARG NH2 B0122 <- 3.18 -> DT O2 F0005 : score 3.9116 : x : LYS xxxx B0148 <- 4.14 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0151 <- 3.32 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0154 <- 3.60 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx >3odh_AB:Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURE OF OKRAI/DNA COMPLEX organism=Oceanobacter kriegii : H : ASN ND2 A0104 <- 2.93 -> DG O6 C0005 : score 5.49186 : H : ASN ND2 A0104 <- 2.60 -> DT O4 D0007 : score 5.496 : H : ASP OD2 A0142 <- 2.96 -> DC N4 D0009 : score 6.0016 : w : ASP OD1 A0142 <- 5.79 -> DT O4 C0003 : score 2.616 : w : ASP OD2 A0142 <- 5.85 -> DT O4 C0003 : score 2.798 : H : ARG NE A0143 <- 2.72 -> DG O6 C0004 : score 4.00408 : H : ARG NH2 A0143 <- 2.96 -> DG N7 C0004 : score 6.18031 : H : ASP OD2 A0189 <- 2.85 -> DG N2 D0005 : score 5.40438 : w : ARG NH1 A0191 <- 5.67 -> DA N3 C0006 : score 2.585 : H : ASN ND2 B0104 <- 2.75 -> DT O4 C0007 : score 5.33746 : H : ASN ND2 B0104 <- 2.83 -> DG O6 D0005 : score 5.60463 : w : ASN OD1 B0104 <- 6.21 -> DA N6 D0006 : score 2.837 : w : SER OG B0106 <- 6.01 -> DA N6 D0006 : score 2.209 : H : ASP OD2 B0142 <- 2.89 -> DC N4 C0009 : score 6.0884 : w : ASP OD1 B0142 <- 5.50 -> DT O4 D0003 : score 2.616 : w : ASP OD2 B0142 <- 5.65 -> DA N6 C0010 : score 3.409 : H : ARG NE B0143 <- 3.29 -> DG N7 D0004 : score 3.98846 : H : ARG NE B0143 <- 2.91 -> DG O6 D0004 : score 3.85432 : H : ARG NH2 B0143 <- 3.04 -> DG N7 D0004 : score 6.07815 : x : ARG xxxx A0110 <- 4.31 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0137 <- 4.29 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0141 <- 3.86 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0144 <- 4.08 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0110 <- 3.81 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0134 <- 3.78 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0137 <- 3.94 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0141 <- 3.62 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0149 <- 4.48 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx >3odh_EF:Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURE OF OKRAI/DNA COMPLEX organism=Oceanobacter kriegii : H : ASN ND2 E0104 <- 2.85 -> DT O4 H0007 : score 5.23177 : H : ASN ND2 E0104 <- 2.73 -> DG O6 G0005 : score 5.7174 : H : ASP OD2 E0142 <- 2.85 -> DC N4 H0009 : score 6.138 : w : ASP OD1 E0142 <- 5.70 -> DT O4 G0003 : score 2.616 : w : ASP OD2 E0142 <- 5.40 -> DT O4 G0003 : score 2.798 : H : ARG NE E0143 <- 2.81 -> DG O6 G0004 : score 3.93314 : H : ARG NH2 E0143 <- 3.08 -> DG N7 G0004 : score 6.02708 : H : ASP OD2 E0189 <- 3.11 -> DG N2 H0005 : score 5.12052 : w : ARG NH1 E0191 <- 5.54 -> DA N3 G0006 : score 2.585 : H : ARG NH2 F0081 <- 3.38 -> DT O2 G0001 : score 3.74227 : H : ASN ND2 F0104 <- 2.71 -> DG O6 H0005 : score 5.73995 : H : ASN ND2 F0104 <- 2.84 -> DT O4 G0007 : score 5.24234 : w : SER OG F0106 <- 6.04 -> DA N6 H0006 : score 2.209 : H : ASP OD2 F0142 <- 2.76 -> DC N4 G0009 : score 6.2496 : w : ASP OD1 F0142 <- 5.66 -> DT O4 H0003 : score 2.616 : w : ASP OD2 F0142 <- 5.83 -> DA N6 G0010 : score 3.409 : H : ARG NE F0143 <- 2.91 -> DG O6 H0004 : score 3.85432 : H : ARG NH2 F0143 <- 2.85 -> DG N7 H0004 : score 6.32077 : x : ARG xxxx E0110 <- 4.36 -> DG xxx H0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0137 <- 4.06 -> DT xxx G0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0141 <- 3.74 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0144 <- 4.18 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0110 <- 3.84 -> DG xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0134 <- 3.87 -> DT xxx H0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0137 <- 3.92 -> DT xxx H0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0141 <- 3.83 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx >3odh_F:Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURE OF OKRAI/DNA COMPLEX organism=Oceanobacter kriegii : H : ARG NH2 F0081 <- 3.38 -> DT O2 G0001 : score 3.74227 : H : ASN ND2 F0104 <- 2.84 -> DT O4 G0007 : score 5.24234 : H : ASN ND2 F0104 <- 2.71 -> DG O6 H0005 : score 5.73995 : w : SER OG F0106 <- 6.04 -> DA N6 H0006 : score 2.209 : w : ARG NH1 F0110 <- 5.81 -> DG N7 G0005 : score 2.063 : w : ARG NH2 F0110 <- 5.96 -> DG N7 G0005 : score 2.18 : H : ASP OD2 F0142 <- 2.76 -> DC N4 G0009 : score 6.2496 : w : ASP OD1 F0142 <- 5.66 -> DT O4 H0003 : score 2.616 : w : ASP OD2 F0142 <- 5.83 -> DA N6 G0010 : score 3.409 : H : ARG NE F0143 <- 2.91 -> DG O6 H0004 : score 3.85432 : H : ARG NH2 F0143 <- 2.85 -> DG N7 H0004 : score 6.32077 : x : ARG xxxx F0134 <- 3.87 -> DT xxx H0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0137 <- 3.92 -> DT xxx H0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0141 <- 3.83 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx >3ogd_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=ALKA UNDAMAGED DNA COMPLEX: INTERROGATION OF A G*:C BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : CYS xxxx A0125 <- 3.81 -> DG xxx B0018 : score x.xxxxx >3ogu_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA MUTANT 5P20 COMPLEXED WITH 6BP OF DNA organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.80 -> DG N2 P0006 : score 0.846 >3oh6_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=ALKA UNDAMAGED DNA COMPLEX: INTERROGATION OF A C:G BASE PAIR organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx A0125 <- 4.48 -> DC xxx B0020 : score x.xxxxx >3oha_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=YEAST DNA POLYMERASE ETA INSERTING DCTP OPPOSITE AN 8OXOG LESION organism=Saccharomyces cerevisiae : x : MET xxxx A0396 <- 3.97 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0456 <- 3.87 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0458 <- 3.60 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx >3ohb_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=YEAST DNA POLYMERASE ETA EXTENDING FROM AN 8-OXOG LESION organism=Saccharomyces cerevisiae : x : MET xxxx A0396 <- 3.89 -> DG xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0456 <- 3.96 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0458 <- 3.66 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx >3ojs_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=SNAPSHOTS OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS PROCESSING C5 MODIFIED THYMIDINES organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.81 -> DC O2 B0109 : score 2.94026 : w : LYS NZ A0540 <- 5.64 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : LYS NZ A0540 <- 5.55 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 5.57 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.91 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.70 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.80 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.10 -> DG N3 B0110 : score 4.60118 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.57 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.68 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : GLN xxxx A0754 <- 4.49 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >3oju_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=SNAPSHOT OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS PROCESSING C5 MODIFIED THYMIDIES organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.82 -> DC O2 B0109 : score 2.93437 : w : LYS NZ A0540 <- 6.09 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : LYS NZ A0540 <- 5.58 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 5.58 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.71 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.66 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.41 -> DG N3 B0110 : score 4.2977 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.57 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0545 <- 4.46 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0754 <- 4.48 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >3on0_ABCD:TraM-like;IHF-like_DNA-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PED208 TRAM-SBMA COMPLEX organism=Escherichia coli : H : LYS NZ B0003 <- 2.77 -> DT O4 P0016 : score 3.6087 : H : GLN OE1 B0005 <- 3.23 -> DA N6 P0015 : score 5.53204 : H : GLN NE2 B0005 <- 2.85 -> DA N7 P0015 : score 6.02885 : H : TYR OH B0007 <- 2.79 -> DG N7 P0014 : score 4.29575 : H : LYS NZ D0003 <- 2.74 -> DT O4 P0004 : score 3.63023 : H : GLN OE1 D0005 <- 2.84 -> DA N6 P0003 : score 6.00414 : H : GLN NE2 D0005 <- 2.77 -> DA N7 P0003 : score 6.12628 : H : TYR OH D0007 <- 2.72 -> DG N7 P0002 : score 4.35577 : x : LYS xxxx A0003 <- 3.84 -> DA xxx P0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0003 <- 3.59 -> DA xxx P0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0005 <- 4.44 -> DT xxx P0016 : score x.xxxxx >3on0_D:TraM-like;IHF-like_DNA-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PED208 TRAM-SBMA COMPLEX organism=Escherichia coli : H : LYS NZ D0003 <- 2.74 -> DT O4 P0004 : score 3.63023 : H : GLN OE1 D0005 <- 2.84 -> DA N6 P0003 : score 6.00414 : H : GLN NE2 D0005 <- 2.77 -> DA N7 P0003 : score 6.12628 : H : TYR OH D0007 <- 2.72 -> DG N7 P0002 : score 4.35577 >3ool_A:Homing_endonucleases; title=I-SCEI COMPLEXED WITH C/G+4 DNA SUBSTRATE organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ASN ND2 A0015 <- 3.01 -> DT O2 C0023 : score 4.54682 : H : ARG NH1 A0048 <- 2.85 -> DG O6 C0018 : score 6.0225 : H : ARG NH2 A0048 <- 3.21 -> DG N7 C0018 : score 5.86108 : H : ARG NH2 A0050 <- 3.20 -> DG N7 C0019 : score 5.87385 : H : GLN NE2 A0059 <- 3.05 -> DG O6 C0017 : score 5.51487 : H : GLU OE2 A0061 <- 3.18 -> DC N4 C0015 : score 4.86522 : H : LYS NZ A0086 <- 3.28 -> DG O6 D0011 : score 5.22582 : w : LYS NZ A0086 <- 5.50 -> DC N4 D0010 : score 0.048 : H : ARG NH1 A0088 <- 2.74 -> DG O6 D0012 : score 6.15633 : H : ARG NH2 A0088 <- 2.79 -> DG N7 D0012 : score 6.39738 : H : ASN ND2 A0152 <- 3.04 -> DT O4 C0006 : score 5.03095 : H : ASN OD1 A0192 <- 3.25 -> DC N4 D0017 : score 3.81617 : H : LYS NZ A0193 <- 2.79 -> DG N7 C0009 : score 5.39667 : H : LYS NZ A0193 <- 3.22 -> DG N7 C0010 : score 4.93348 : H : LYS NZ A0193 <- 2.91 -> DG O6 C0010 : score 5.65359 : V : ASP CG A0150 <- 3.64 -> DT C7 C0006 : score 2.7904 : x : PRO xxxx A0014 <- 3.31 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0046 <- 3.46 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0090 <- 4.36 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0096 <- 3.57 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0098 <- 4.45 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0102 <- 3.81 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0151 <- 3.39 -> DC xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0163 <- 3.73 -> DC xxx D0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0165 <- 4.02 -> DC xxx D0017 : score x.xxxxx >3oor_A:Homing_endonucleases; title=I-SCEI MUTANT (K86R/G100T)COMPLEXED WITH C/G+4 DNA SUBSTRATE organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ASN ND2 A0015 <- 3.18 -> DT O2 C0023 : score 4.38545 : H : ARG NH1 A0048 <- 3.02 -> DG O6 C0018 : score 5.81567 : H : ARG NH2 A0048 <- 2.94 -> DG N7 C0018 : score 6.20585 : H : ARG NH2 A0050 <- 2.91 -> DG N7 C0019 : score 6.24415 : H : ARG NH2 A0050 <- 2.70 -> DG O6 C0019 : score 6.732 : H : GLN NE2 A0059 <- 3.05 -> DG O6 C0017 : score 5.51487 : H : GLU OE2 A0061 <- 2.83 -> DC N4 C0015 : score 5.23379 : H : ARG NH2 A0086 <- 2.77 -> DG N7 D0011 : score 6.42292 : H : ARG NH1 A0088 <- 2.92 -> DG O6 D0012 : score 5.93733 : H : ARG NH2 A0088 <- 2.88 -> DG N7 D0012 : score 6.28246 : H : ASN ND2 A0152 <- 2.78 -> DT O4 C0006 : score 5.30575 : H : ASN OD1 A0192 <- 3.22 -> DC N4 D0017 : score 3.84133 : H : LYS NZ A0193 <- 2.87 -> DG N7 C0010 : score 5.31049 : H : LYS NZ A0193 <- 2.78 -> DG O6 C0010 : score 5.80389 : V : ASP CG A0150 <- 3.90 -> DT C7 C0006 : score 2.616 : x : PRO xxxx A0014 <- 3.48 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0046 <- 3.64 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0090 <- 4.08 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0091 <- 3.95 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0096 <- 3.78 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0102 <- 4.05 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0149 <- 4.38 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0151 <- 3.48 -> DC xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0163 <- 3.30 -> DC xxx D0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0165 <- 3.72 -> DC xxx D0017 : score x.xxxxx >3oqg_A: title=RESTRICTION ENDONUCLEASE HPY188I IN COMPLEX WITH SUBSTRATE DNA organism=HELICOBACTER PYLORI : H : GLN OE1 A0086 <- 2.51 -> DC N4 C0004 : score 4.84917 A : H : SER OG A0087 <- 2.69 -> DA N7 C0002 : score 4.56231 : H : CYS SG A0090 <- 2.88 -> DT O4 D-002 : score 6.9864 : H : SER OG A0102 <- 2.93 -> DG N7 C0001 : score 4.36552 : w : ASN ND2 A0105 <- 5.78 -> DG O6 C0001 : score 2.971 : w : GLN NE2 A0169 <- 5.02 -> DA N3 C0003 : score 1.888 A : x : ARG xxxx A0084 <- 3.87 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0095 <- 3.62 -> DT xxx D-003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0100 <- 3.52 -> DT xxx D-002 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0101 <- 3.94 -> DT xxx D-002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0103 <- 3.29 -> DT xxx C0000 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0104 <- 3.12 -> DT xxx C0000 : score x.xxxxx >3oqg_AB: title=RESTRICTION ENDONUCLEASE HPY188I IN COMPLEX WITH SUBSTRATE DNA organism=HELICOBACTER PYLORI : H : GLN OE1 A0086 <- 2.51 -> DC N4 C0004 : score 4.84917 A : H : SER OG A0087 <- 2.69 -> DA N7 C0002 : score 4.56231 : H : CYS SG A0090 <- 2.88 -> DT O4 D-002 : score 6.9864 : H : SER OG A0102 <- 2.93 -> DG N7 C0001 : score 4.36552 : w : GLN NE2 A0169 <- 5.02 -> DA N3 C0003 : score 1.888 A : H : SER OG B0087 <- 2.74 -> DA N7 D0002 : score 4.51767 : H : CYS SG B0090 <- 3.09 -> DT O4 C-002 : score 6.6882 : H : SER OG B0102 <- 2.90 -> DG N7 D0001 : score 4.39241 : x : ARG xxxx A0084 <- 3.87 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0095 <- 3.62 -> DT xxx D-003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0100 <- 3.52 -> DT xxx D-002 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0101 <- 3.94 -> DT xxx D-002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0103 <- 3.29 -> DT xxx C0000 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0104 <- 3.12 -> DT xxx C0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0105 <- 3.29 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0083 <- 4.13 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0084 <- 3.89 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0086 <- 3.00 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0095 <- 3.77 -> DA xxx C-003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0100 <- 3.47 -> DT xxx C-002 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0101 <- 4.20 -> DT xxx C-002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0103 <- 3.71 -> DC xxx D-001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0104 <- 3.19 -> DA xxx D0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0105 <- 3.18 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0169 <- 3.54 -> DC xxx C-001 : score x.xxxxx >3oqm_AC:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF CCPA-HPR-SER46P-ACKA2 COMPLEX organism=BACILLUS SUBTILIS : H : ARG NH2 A0022 <- 2.86 -> DG N7 E0702 : score 6.308 : H : ARG NH2 A0022 <- 2.79 -> DG O6 E0702 : score 6.6132 : w : TYR OH C0007 <- 6.42 -> DA N6 B0705 : score 2.545 : H : ARG NH2 C0022 <- 2.89 -> DG N7 B0702 : score 6.26969 : H : ARG NH2 C0022 <- 2.71 -> DG O6 B0702 : score 6.7188 : V : ALA CB A0018 <- 3.59 -> DT C7 E0703 : score 5.89292 : V : MET CE C0017 <- 3.74 -> DT C7 E0709 : score 7.03421 : x : SER xxxx A0016 <- 3.67 -> DG xxx E0702 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0021 <- 3.96 -> DT xxx B0711 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0029 <- 3.70 -> DT xxx E0700 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0053 <- 3.42 -> DG xxx B0708 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0056 <- 3.02 -> DC xxx E0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 3.49 -> DG xxx E0706 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0006 <- 3.56 -> DT xxx E0710 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0016 <- 3.76 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0018 <- 3.23 -> DA xxx B0703 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0021 <- 4.00 -> DT xxx E0710 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0029 <- 4.32 -> DT xxx B0700 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0053 <- 3.51 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0056 <- 3.53 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0057 <- 3.14 -> DT xxx E0709 : score x.xxxxx >3oqm_C:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF CCPA-HPR-SER46P-ACKA2 COMPLEX organism=BACILLUS SUBTILIS : w : TYR OH C0007 <- 6.42 -> DA N6 B0705 : score 2.545 : H : ARG NH2 C0022 <- 2.89 -> DG N7 B0702 : score 6.26969 : H : ARG NH2 C0022 <- 2.71 -> DG O6 B0702 : score 6.7188 : V : MET CE C0017 <- 3.74 -> DT C7 E0709 : score 7.03421 : x : ILE xxxx C0006 <- 3.56 -> DT xxx E0710 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0016 <- 3.76 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0018 <- 3.23 -> DA xxx B0703 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0021 <- 4.00 -> DT xxx E0710 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0029 <- 4.32 -> DT xxx B0700 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0053 <- 3.51 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0056 <- 3.53 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0057 <- 3.14 -> DT xxx E0709 : score x.xxxxx >3oqn_A:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF CCPA-HPR-SER46-P-GNTR-DOWN CRE organism=BACILLUS SUBTILIS : H : ARG NH2 A0022 <- 3.05 -> DG N7 B0702 : score 6.06538 : V : ASN CB A0029 <- 3.83 -> DT C7 B0701 : score 1.92291 : x : SER xxxx A0016 <- 3.74 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0017 <- 3.62 -> DT xxx E0710 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0018 <- 3.09 -> DG xxx B0703 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0021 <- 4.01 -> DT xxx E0710 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0053 <- 3.46 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0056 <- 3.36 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 3.80 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx >3oqn_AC:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF CCPA-HPR-SER46-P-GNTR-DOWN CRE organism=BACILLUS SUBTILIS : H : ARG NH2 A0022 <- 3.05 -> DG N7 B0702 : score 6.06538 : H : TYR OH C0007 <- 3.30 -> DC N4 B0709 : score 3.79269 : H : ARG NH2 C0022 <- 3.41 -> DG N7 E0702 : score 5.60569 : H : ARG NH2 C0022 <- 2.55 -> DG O6 E0702 : score 6.93 : V : ASN CB A0029 <- 3.83 -> DT C7 B0701 : score 1.92291 : x : SER xxxx A0016 <- 3.74 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0017 <- 3.62 -> DT xxx E0710 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0018 <- 3.09 -> DG xxx B0703 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0021 <- 4.01 -> DT xxx E0710 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0053 <- 3.46 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0056 <- 3.36 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 3.80 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0006 <- 3.60 -> DC xxx B0709 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0016 <- 3.59 -> DG xxx E0702 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0017 <- 3.34 -> DA xxx E0704 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0018 <- 3.23 -> DA xxx E0703 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0019 <- 4.46 -> DG xxx E0702 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0021 <- 3.55 -> DT xxx B0711 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0029 <- 3.54 -> DT xxx E0700 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0053 <- 3.63 -> DG xxx B0708 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0056 <- 3.48 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0057 <- 3.32 -> DC xxx B0709 : score x.xxxxx >3oqo_AC:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CCPA-HPR-SER46P-SYN CRE organism=BACILLUS SUBTILIS : H : ARG NH1 A0022 <- 3.36 -> DG N7 E0702 : score 5.3724 : H : ARG NH2 A0022 <- 3.21 -> DG O6 E0702 : score 6.0588 : w : ARG NH2 A0022 <- 6.63 -> DA N6 B0712 : score 1.997 : H : ARG NH1 C0022 <- 2.95 -> DG N7 B0702 : score 5.8685 : H : ARG NH2 C0022 <- 3.35 -> DG O6 B0702 : score 5.874 : V : ASN CB A0029 <- 3.74 -> DT C7 E0701 : score 1.9665 : x : ILE xxxx A0006 <- 3.84 -> DT xxx B0710 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0016 <- 3.27 -> DG xxx E0702 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0017 <- 4.14 -> DT xxx B0710 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0018 <- 3.05 -> DA xxx B0711 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0021 <- 4.42 -> DT xxx B0710 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0053 <- 3.31 -> DG xxx B0708 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0056 <- 3.54 -> DC xxx E0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 3.72 -> DC xxx B0709 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0006 <- 4.11 -> DT xxx E0710 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0016 <- 3.25 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0017 <- 3.69 -> DC xxx E0709 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0018 <- 3.29 -> DA xxx B0703 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0021 <- 3.89 -> DT xxx E0711 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0029 <- 3.35 -> DT xxx B0701 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0053 <- 3.62 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0056 <- 3.71 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0057 <- 3.31 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx >3oqo_C:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CCPA-HPR-SER46P-SYN CRE organism=BACILLUS SUBTILIS : H : ARG NH1 C0022 <- 2.95 -> DG N7 B0702 : score 5.8685 : H : ARG NH2 C0022 <- 3.35 -> DG O6 B0702 : score 5.874 : x : ILE xxxx C0006 <- 4.11 -> DT xxx E0710 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0016 <- 3.25 -> DG xxx B0702 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0017 <- 3.69 -> DC xxx E0709 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0018 <- 3.29 -> DA xxx B0703 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0021 <- 3.89 -> DT xxx E0711 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0029 <- 3.35 -> DT xxx B0701 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0053 <- 3.62 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0056 <- 3.71 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0057 <- 3.31 -> DC xxx B0707 : score x.xxxxx >3or3_AB: title=RESTRICTION ENDONUCLEASE HPY188I IN COMPLEX WITH PRODUCT DNA organism=Helicobacter pylori : H : GLN NE2 A0086 <- 2.93 -> DT O4 D-003 : score 5.05606 A : H : SER OG A0087 <- 2.58 -> DA N7 E0002 : score 4.66052 : H : CYS SG A0090 <- 3.01 -> DT O4 D-002 : score 6.8018 : H : SER OG A0102 <- 2.85 -> DG N7 E0001 : score 4.43723 : H : SER OG B0087 <- 2.70 -> DA N7 F0002 : score 4.55338 : H : CYS SG B0090 <- 2.79 -> DT O4 C-002 : score 7.1142 : H : SER OG B0102 <- 2.77 -> DG N7 F0001 : score 4.50894 : w : GLN OE1 B0169 <- 5.74 -> DT O2 F0003 : score 2.481 : V : CYS CB A0101 <- 3.83 -> DT C7 D-002 : score 5.15896 : V : LYS CB B0083 <- 3.87 -> DT C7 F0003 : score 2.26529 : x : ARG xxxx A0084 <- 4.02 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0092 <- 4.49 -> DT xxx D-003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0095 <- 3.66 -> DT xxx D-003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0100 <- 3.62 -> DT xxx D-002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0103 <- 3.41 -> DT xxx C0000 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0104 <- 3.18 -> DT xxx C0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0105 <- 3.34 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0084 <- 3.98 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0086 <- 2.65 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0095 <- 3.69 -> DT xxx C-002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0100 <- 3.82 -> DT xxx C-002 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0101 <- 4.34 -> DT xxx C-002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0103 <- 3.52 -> DC xxx D-001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0104 <- 3.01 -> DA xxx D0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0105 <- 3.37 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx >3or3_B: title=RESTRICTION ENDONUCLEASE HPY188I IN COMPLEX WITH PRODUCT DNA organism=Helicobacter pylori : H : SER OG B0087 <- 2.70 -> DA N7 F0002 : score 4.55338 : H : CYS SG B0090 <- 2.79 -> DT O4 C-002 : score 7.1142 : H : SER OG B0102 <- 2.77 -> DG N7 F0001 : score 4.50894 : w : GLN OE1 B0169 <- 5.74 -> DT O2 F0003 : score 2.481 : V : TYR CD2 B0095 <- 3.69 -> DT C7 C-002 : score 3.84443 : V : LYS CB B0083 <- 3.87 -> DT C7 F0003 : score 2.26529 : x : ARG xxxx B0084 <- 3.98 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0086 <- 2.65 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0100 <- 3.82 -> DT xxx C-002 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0101 <- 4.34 -> DT xxx C-002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0103 <- 3.52 -> DC xxx D-001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0104 <- 3.01 -> DA xxx D0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0105 <- 3.37 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx >3orc_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN ENGINEERED CRO MONOMER BOUND NONSPECIFICALLY TO DNA organism=ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA : x : SER xxxx A0065 <- 4.01 -> DT xxx S0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0066 <- 3.32 -> DC xxx S0004 : score x.xxxxx >3os0_A:Ribonuclease_H-like; title=PFV STRAND TRANSFER COMPLEX (STC) AT 2.81 A RESOLUTION organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.93 -> DC O2 C0006 : score 2.58984 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.75 -> DC O2 C0006 : score 3.73571 : V : PRO CG A0259 <- 3.74 -> DT C7 C0008 : score 6.45436 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.71 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.74 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.51 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 4.29 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >3os1_A:Ribonuclease_H-like; title=PFV TARGET CAPTURE COMPLEX (TCC) AT 2.97 A RESOLUTION organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.81 -> DC O2 C0006 : score 2.65366 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.92 -> DC O2 C0006 : score 3.60995 : V : PRO CB A0259 <- 3.57 -> DT C7 C0008 : score 6.14001 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.67 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 4.15 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.61 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 4.13 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >3os2_A:Ribonuclease_H-like; title=PFV TARGET CAPTURE COMPLEX (TCC) AT 3.32 A RESOLUTION organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.71 -> DC O2 C0006 : score 2.70684 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.90 -> DC O2 C0006 : score 3.62474 : V : PRO CG A0259 <- 3.66 -> DT C7 C0008 : score 6.58154 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.82 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 4.22 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.46 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 4.27 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0260 <- 4.36 -> DC xxx D0011 : score x.xxxxx >3osf_A:Homeodomain-like; title=THE STRUCTURE OF PROTOZOAN PARASITE TRICHOMONAS VAGINALIS MYB2 IN COMPLEX WITH MRE-2F-13 DNA organism=TRICHOMONAS VAGINALIS : H : LYS NZ A0049 <- 3.17 -> DT O2 C0009 : score 3.32173 : H : LYS NZ A0049 <- 2.57 -> DT O2 B0006 : score 3.75219 : w : LYS NZ A0051 <- 5.53 -> DC O2 C0011 : score 1.3 : H : ARG NH1 A0084 <- 3.11 -> DG N7 B0008 : score 5.6749 : H : ARG NH2 A0084 <- 2.57 -> DG O6 B0008 : score 6.9036 : w : ARG NH2 A0087 <- 5.73 -> DG N7 C0004 : score 2.18 : w : ARG NH2 A0087 <- 5.98 -> DA N7 C0003 : score 1.486 : w : ASP OD1 A0088 <- 5.73 -> DA N6 C0005 : score 3.122 : w : ASP OD2 A0088 <- 5.82 -> DC N4 B0007 : score 3.623 : H : LYS NZ A0138 <- 2.82 -> DG N7 C0007 : score 5.36435 : H : LYS NZ A0138 <- 2.65 -> DG O6 C0007 : score 5.95419 : H : ASN OD1 A0139 <- 3.31 -> DA N6 B0005 : score 5.40757 : H : ASN ND2 A0139 <- 2.99 -> DA N7 B0005 : score 5.64743 : V : VAL CG1 A0142 <- 3.72 -> DT C7 B0004 : score 6.18172 : V : ILE CG2 A0135 <- 3.66 -> DT C7 B0006 : score 7.33948 : x : TYR xxxx A0093 <- 3.39 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0134 <- 4.10 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0143 <- 4.18 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx >3osg_A:Homeodomain-like; title=THE STRUCTURE OF PROTOZOAN PARASITE TRICHOMONAS VAGINALIS MYB2 IN COMPLEX WITH MRE-1-12 DNA organism=TRICHOMONAS VAGINALIS : H : LYS NZ A0049 <- 2.68 -> DT O2 B0006 : score 3.67327 : H : LYS NZ A0049 <- 2.85 -> DT O2 C0008 : score 3.55131 : H : ARG NH1 A0084 <- 2.92 -> DG N7 B0008 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0084 <- 2.63 -> DG O6 B0008 : score 6.8244 : w : ARG NH2 A0084 <- 6.36 -> DA N6 C0004 : score 1.997 : w : ARG NH2 A0087 <- 5.74 -> DA N7 C0003 : score 1.486 : w : ASP OD1 A0088 <- 5.91 -> DA N6 C0004 : score 3.122 : w : ASP OD2 A0088 <- 5.80 -> DC N4 B0007 : score 3.623 : H : LYS NZ A0138 <- 3.15 -> DG N7 C0006 : score 5.00888 : H : LYS NZ A0138 <- 2.86 -> DG O6 C0006 : score 5.7114 : w : LYS NZ A0138 <- 6.00 -> DA N6 C0007 : score 2.097 : H : ASN OD1 A0139 <- 3.10 -> DA N6 B0005 : score 5.66049 : H : ASN ND2 A0139 <- 2.93 -> DA N7 B0005 : score 5.71788 : V : VAL CG1 A0142 <- 3.80 -> DT C7 B0004 : score 6.06051 : V : ILE CG2 A0135 <- 3.57 -> DT C7 B0006 : score 7.49903 : x : TYR xxxx A0093 <- 3.51 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx >3osn_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURAL BASIS FOR PROFICIENT INCORPORATION OF DTTP OPPOSITE O6- METHYLGUANINE BY HUMAN DNA POLYMERASE IOTA organism=HOMO SAPIENS : w : TYR OH A0039 <- 5.53 -> DG N3 C0841 : score 3.344 : w : TYR OH A0039 <- 5.98 -> DG N2 C0841 : score 2.834 : w : GLN NE2 A0059 <- 6.04 -> DG N3 C0841 : score 1.484 : w : ARG NH1 A0343 <- 5.55 -> DG O6 B0008 : score 2.756 : x : GLU xxxx A0305 <- 3.60 -> DG xxx C0842 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 4.25 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx >3osp_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF REV1 organism=Saccharomyces cerevisiae : x : SER xxxx A0329 <- 4.19 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0626 <- 3.56 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >3oy9_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MANGANESE AT 2.55 RESOLUTION organism=Human spumaretrovirus : H : ARG NE A0222 <- 2.83 -> DC O2 C0006 : score 2.64302 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.72 -> DC O2 C0006 : score 3.7579 : w : SER OG A0225 <- 5.48 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.86 -> DT C7 C0008 : score 6.26359 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.60 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.90 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.73 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.98 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >3oya_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND RALTEGRAVIR AT 2.65 RESOLUTION organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.80 -> DC O2 C0006 : score 2.65897 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.77 -> DC O2 C0006 : score 3.72091 : w : SER OG A0225 <- 5.61 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.66 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.93 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.77 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.78 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0259 <- 3.93 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >3oyb_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND THE INSTI MK2048 organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.76 -> DC O2 C0006 : score 2.68025 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.66 -> DC O2 C0006 : score 3.80228 : w : SER OG A0225 <- 5.48 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.76 -> DT C7 C0008 : score 6.42256 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.58 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.90 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.58 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.93 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >3oyc_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND THE INSTI PICA organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.81 -> DC O2 C0006 : score 2.65366 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.66 -> DC O2 C0006 : score 3.80228 : w : SER OG A0225 <- 5.85 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.68 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.90 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.83 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.86 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0259 <- 4.08 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >3oyd_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND THE INSTI GS9160 organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.78 -> DC O2 C0006 : score 2.66961 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.76 -> DC O2 C0006 : score 3.72831 : w : SER OG A0225 <- 5.47 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.80 -> DT C7 C0008 : score 6.35897 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.59 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.82 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.76 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.76 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >3oye_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND THE INSTI COMPOUND2 organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.73 -> DC O2 C0006 : score 2.6962 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.64 -> DC O2 C0006 : score 3.81708 : w : SER OG A0225 <- 5.46 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.76 -> DT C7 C0008 : score 6.42256 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.74 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.95 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.69 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.97 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >3oyf_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND THE INSTI L-870,810 organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.82 -> DC O2 C0006 : score 2.64834 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.66 -> DC O2 C0006 : score 3.80228 : w : SER OG A0225 <- 5.55 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.83 -> DT C7 C0008 : score 6.31128 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.51 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.85 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.73 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.82 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >3oyg_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND THE INSTI COMPOUND1 (COMPOUNDG) organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.68 -> DC O2 C0006 : score 2.72279 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.60 -> DC O2 C0006 : score 3.84667 : w : SER OG A0225 <- 5.56 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.76 -> DT C7 C0008 : score 6.42256 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.61 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.81 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.71 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.98 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >3oyh_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND THE INSTI MK0536 organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.70 -> DC O2 C0006 : score 2.71215 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.78 -> DC O2 C0006 : score 3.71351 : w : SER OG A0225 <- 5.47 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.80 -> DT C7 C0008 : score 6.35897 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.64 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.88 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.67 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.89 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >3oyi_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PFV S217Q MUTANT INTASOME IN COMPLEX WITH MANGANESE organism=Human spumaretrovirus : H : ARG NE A0222 <- 2.95 -> DC O2 C0006 : score 2.57921 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.76 -> DC O2 C0006 : score 3.72831 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.77 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.98 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.50 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 4.09 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0259 <- 3.98 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >3oyj_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PFV S217Q MUTANT INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND THE INSTI MK2048 organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.78 -> DC O2 C0006 : score 2.66961 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.70 -> DC O2 C0006 : score 3.77269 : w : SER OG A0225 <- 5.67 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.82 -> DT C7 C0008 : score 6.32718 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.79 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.96 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.55 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.98 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >3oyk_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PFV S217H MUTANT INTASOME BOUND TO MANGANESE organism=Human spumaretrovirus : H : ARG NE A0222 <- 2.85 -> DC O2 C0006 : score 2.63238 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.82 -> DC O2 C0006 : score 3.68392 : w : SER OG A0225 <- 5.80 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.82 -> DT C7 C0008 : score 6.32718 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.60 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.88 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.89 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.97 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >3oyl_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PFV S217H MUTANT INTASOME BOUND TO MAGNESIUM AND THE INSTI MK2048 organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.69 -> DC O2 C0006 : score 2.71747 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.76 -> DC O2 C0006 : score 3.72831 : w : SER OG A0225 <- 5.70 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.64 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.96 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.68 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.99 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0259 <- 3.93 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >3oym_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PFV N224H MUTANT INTASOME BOUND TO MANGANESE organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.84 -> DC O2 C0006 : score 2.6377 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.90 -> DC O2 C0006 : score 3.62474 : V : PRO CG A0259 <- 3.88 -> DT C7 C0008 : score 6.23179 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.56 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.84 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.71 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 4.24 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >3oyn_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PFV N224H MUTANT INTASOME BOUND TO MAGNESIUM AND THE INSTI MK2048 organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.87 -> DC O2 C0006 : score 2.62175 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.71 -> DC O2 C0006 : score 3.76529 : V : PRO CG A0259 <- 3.88 -> DT C7 C0008 : score 6.23179 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.70 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.89 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.66 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 4.01 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >3p57_AB:SRF-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE P300 TAZ2 DOMAIN BOUND TO MEF2 ON DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0003 <- 2.80 -> DT O2 F0005 : score 2.57692 : H : ARG NH2 A0003 <- 3.05 -> DT O2 F0005 : score 4.02167 : H : LYS NZ A0023 <- 2.60 -> DA N7 E0012 : score 3.05467 : H : ARG NE B0003 <- 2.77 -> DT O2 E0005 : score 2.59238 : H : ARG NH2 B0003 <- 3.14 -> DT O2 E0005 : score 3.94547 : H : LYS NZ B0023 <- 2.59 -> DA N7 F0012 : score 3.06054 : w : LYS NZ B0023 <- 5.26 -> DG O6 F0013 : score 3.005 : w : LYS NZ B0023 <- 5.57 -> DG N7 F0013 : score 2.519 >3p57_CD:SRF-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE P300 TAZ2 DOMAIN BOUND TO MEF2 ON DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE C0003 <- 2.85 -> DT O2 G0005 : score 2.55115 : H : ARG NH2 C0003 <- 3.20 -> DT O2 G0005 : score 3.89467 : H : LYS NZ C0023 <- 2.66 -> DA N7 H0012 : score 3.01942 : x : ARG xxxx D0003 <- 3.41 -> DA xxx G0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0015 <- 4.05 -> DT xxx H0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0023 <- 3.11 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx >3p57_I:SRF-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE P300 TAZ2 DOMAIN BOUND TO MEF2 ON DNA organism=? : H : ARG NE I0003 <- 2.71 -> DT O2 K0005 : score 2.62331 : H : ARG NH2 I0003 <- 2.73 -> DT O2 K0005 : score 4.2926 : x : LYS xxxx I0023 <- 3.27 -> DA xxx L0012 : score x.xxxxx >3p57_IJ:SRF-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE P300 TAZ2 DOMAIN BOUND TO MEF2 ON DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE I0003 <- 2.71 -> DT O2 K0005 : score 2.62331 : H : ARG NH2 I0003 <- 2.73 -> DT O2 K0005 : score 4.2926 : H : ARG NE J0003 <- 3.01 -> DT O2 L0005 : score 2.46869 : H : LYS NZ J0023 <- 2.86 -> DA N7 K0012 : score 2.90193 : x : LYS xxxx I0023 <- 3.27 -> DA xxx L0012 : score x.xxxxx >3pih_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=T. MARITIMA UVRA IN COMPLEX WITH FLUORESCEIN-MODIFIED DNA organism=Thermotoga maritima : w : LYS NZ A0682 <- 6.02 -> DG O6 D0026 : score 3.005 >3pky_A:PLP-dependent_transferases; title=POLYMERASE DOMAIN FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS LIGASE D IN COMPLEX WITH DNA, UTP AND MANGANESE. organism=Mycobacterium tuberculosis : x : ARG xxxx A0053 <- 2.89 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0055 <- 3.42 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0063 <- 3.36 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx >3pky_AB:PLP-dependent_transferases; title=POLYMERASE DOMAIN FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS LIGASE D IN COMPLEX WITH DNA, UTP AND MANGANESE. organism=Mycobacterium tuberculosis : H : ARG NH2 B0053 <- 2.80 -> DC O2 D0003 : score 3.69872 : x : ARG xxxx A0053 <- 2.89 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0055 <- 3.42 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0063 <- 3.36 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0055 <- 3.54 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0063 <- 3.30 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0064 <- 3.15 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0065 <- 4.45 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0066 <- 3.70 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0236 <- 3.70 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >3pmn_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY CRYSTAL STRUCTURE OF POLYMERASE LAMBDA VARIANT WITH A GT MISPAIR AT THE PRIMER TERMINUS WITH MN2+ IN THE ACTIVE SITE organism=HOMO SAPIENS : w : GLN NE2 A0372 <- 5.93 -> DC O2 B0009 : score 2.699 : w : LYS NZ A0472 <- 5.36 -> DT O2 B0007 : score 0.522 : w : LYS NZ A0472 <- 6.08 -> DA N3 B0008 : score 1.538 : w : LYS NZ A0472 <- 5.68 -> DA N3 C0005 : score 1.538 : H : TYR OH A0505 <- 2.69 -> DG N3 C0006 : score 3.18261 : w : ARG NH1 A0517 <- 5.84 -> DG N2 C0006 : score 1.082 : w : GLU OE1 A0529 <- 5.42 -> DG N2 C0006 : score 1.283 >3pnc_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY CRYSTAL STRUCTURE OF A POLYMERASE LAMBDA VARIANT WITH A GT MISPAIR AT THE PRIMER TERMINUS AND SODIUM AT CATALYTIC METAL SITE organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 A0372 <- 6.06 -> DC O2 C0009 : score 2.699 : w : LYS NZ A0472 <- 5.34 -> DA N3 B0005 : score 1.538 : w : LYS NZ A0472 <- 5.35 -> DT O2 C0007 : score 0.522 : w : LYS NZ A0472 <- 5.63 -> DA N3 C0008 : score 1.538 : H : TYR OH A0505 <- 2.73 -> DG N3 B0006 : score 3.1577 : w : ARG NH1 A0517 <- 5.77 -> DG N2 B0006 : score 1.082 : w : GLU OE1 A0529 <- 5.43 -> DG N2 B0006 : score 1.283 : w : GLU OE2 A0529 <- 5.91 -> DG N2 B0006 : score 1.976 >3po2_AB: title=ARRESTED RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 A1386 <- 2.95 -> DC O2 T0015 : score 3.58776 : x : THR xxxx A0831 <- 3.59 -> DG xxx T0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 3.94 -> DG xxx T0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0398 <- 3.87 -> DA xxx N0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0399 <- 3.08 -> DA xxx N0000 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0404 <- 3.46 -> DA xxx N0000 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0500 <- 4.25 -> DA xxx N0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0502 <- 3.51 -> DA xxx N0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0505 <- 3.07 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0507 <- 3.40 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0510 <- 3.36 -> DA xxx N0000 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0511 <- 3.63 -> DA xxx N0000 : score x.xxxxx >3po2_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=ARRESTED RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx B0398 <- 3.87 -> DA xxx N0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0399 <- 3.08 -> DA xxx N0000 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0404 <- 3.46 -> DA xxx N0000 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0500 <- 4.25 -> DA xxx N0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0502 <- 3.51 -> DA xxx N0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0505 <- 3.07 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0507 <- 3.40 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0510 <- 3.36 -> DA xxx N0000 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0511 <- 3.63 -> DA xxx N0000 : score x.xxxxx >3po3_AB:Elongation_factor_TFIIS_domain_2;Zinc_beta-ribbon; title=ARRESTED RNA POLYMERASE II REACTIVATION INTERMEDIATE organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.44 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx >3po4_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF A MUTANT OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN COMPLEX WITH A BLUNT-ENDED DNA AND DDATP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.85 -> DC O2 B0109 : score 2.91669 : w : LYS NZ A0540 <- 5.86 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 6.08 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.54 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.79 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.74 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.72 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.00 -> DG N3 B0110 : score 4.69908 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.60 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.67 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : ARG xxxx A0587 <- 3.96 -> DC xxx B0111 : score x.xxxxx >3po5_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF A MUTANT OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AUQATICUS IN COMPLEX WITH AN ABASIC SITE AND DDATP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.94 -> DC O2 B0109 : score 2.86366 : w : LYS NZ A0540 <- 5.76 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 5.67 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.91 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.75 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.72 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.67 -> DG N3 C0208 : score 3.377 : w : ASN OD1 A0583 <- 6.14 -> DG N2 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.33 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0545 <- 4.49 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0587 <- 4.12 -> DC xxx B0111 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0754 <- 4.44 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >3pov_A:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A SOX-DNA COMPLEX organism=Human herpesvirus 8 type M : x : LYS xxxx A0286 <- 3.07 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0319 <- 3.08 -> DG xxx D0031 : score x.xxxxx >3pr4_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 Y12A MUTANT INCORPORATING DADP OPPOSITE TEMPLATE DT organism=Sulfolobus solfataricus : w : ARG NH2 A0332 <- 6.71 -> DA N7 T0006 : score 1.486 : x : VAL xxxx A0032 <- 3.69 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.56 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 4.31 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.92 -> DG xxx T0007 : score x.xxxxx >3pr5_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 Y12A MUTANT INCORPORATING ADP OPPOSITE TEMPLATE DT organism=Sulfolobus solfataricus : w : LYS NZ B0221 <- 5.83 -> DA N3 P0010 : score 1.538 : x : VAL xxxx B0032 <- 3.31 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0042 <- 3.81 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0244 <- 4.34 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0332 <- 3.84 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0336 <- 4.18 -> DG xxx T0007 : score x.xxxxx >3pt6_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MOUSE DNMT1(650-1602) IN COMPLEX WITH DNA organism=Mus musculus : H : LYS NZ B0686 <- 3.28 -> DG O6 J0026 : score 5.22582 : H : GLN NE2 B0687 <- 2.65 -> DG O6 D0015 : score 5.97928 : x : ARG xxxx B1241 <- 4.32 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx >3pta_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNMT1(646-1600) IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0683 <- 3.03 -> DG N7 C0025 : score 5.13815 : H : LYS NZ A0683 <- 3.05 -> DG O6 C0026 : score 5.49173 : x : SER xxxx A0682 <- 4.33 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0684 <- 3.37 -> DC xxx B0014 : score x.xxxxx >3pv8_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT BOUND TO DNA AND DDTTP-DA IN CLOSED CONFORMATION organism=Geobacillus kaustophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.81 -> DT O2 C0008 : score 3.58001 : w : LYS NZ A0582 <- 5.90 -> DC O2 B0026 : score 1.3 : w : TYR OH A0587 <- 6.03 -> DC O2 B0026 : score 1.343 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.74 -> DG N3 C0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.91 -> DA N3 C0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.91 -> DT O2 B0027 : score 4.64174 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.73 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : GLN xxxx A0797 <- 4.45 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx >3pvi_AB:Restriction_endonuclease-like; title=D34G MUTANT OF PVUII ENDONUCLEASE COMPLEXED WITH COGNATE DNA SHOWS THAT ASP34 IS DIRECTLY INVOLVED IN DNA RECOGNITION AND INDIRECTLY INVOLVED IN CATALYSIS organism=Proteus vulgaris : H : HIS ND1 A0084 <- 2.87 -> DG O6 C0008 : score 6.13595 : H : ASN OD1 A0140 <- 2.95 -> DA N6 C0007 : score 5.84114 : H : ASN ND2 A0140 <- 3.24 -> DA N7 C0007 : score 5.35391 : H : ASN ND2 A0141 <- 3.14 -> DG O6 D0011 : score 5.25505 : H : LYS NZ A0143 <- 3.03 -> DG O6 D0011 : score 5.51485 : w : GLN NE2 B0033 <- 5.65 -> DC O2 D0009 : score 2.699 : H : HIS ND1 B0084 <- 2.96 -> DG O6 D0008 : score 6.02394 : H : ASN OD1 B0140 <- 2.92 -> DA N6 D0007 : score 5.87727 : H : ASN ND2 B0140 <- 3.18 -> DA N7 D0007 : score 5.42435 : H : ASN ND2 B0141 <- 3.11 -> DG O6 C0011 : score 5.28888 : H : LYS NZ B0143 <- 2.97 -> DG O6 C0011 : score 5.58422 : H : LYS NZ B0143 <- 2.76 -> DG O6 C0012 : score 5.82702 : x : SER xxxx A0081 <- 3.60 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0081 <- 3.58 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx >3pvi_B:Restriction_endonuclease-like; title=D34G MUTANT OF PVUII ENDONUCLEASE COMPLEXED WITH COGNATE DNA SHOWS THAT ASP34 IS DIRECTLY INVOLVED IN DNA RECOGNITION AND INDIRECTLY INVOLVED IN CATALYSIS organism=Proteus vulgaris : w : GLN NE2 B0033 <- 5.65 -> DC O2 D0009 : score 2.699 : H : HIS ND1 B0084 <- 2.96 -> DG O6 D0008 : score 6.02394 : H : ASN OD1 B0140 <- 2.92 -> DA N6 D0007 : score 5.87727 : H : ASN ND2 B0140 <- 3.18 -> DA N7 D0007 : score 5.42435 : H : ASN ND2 B0141 <- 3.11 -> DG O6 C0011 : score 5.28888 : H : LYS NZ B0143 <- 2.97 -> DG O6 C0011 : score 5.58422 : H : LYS NZ B0143 <- 2.76 -> DG O6 C0012 : score 5.82702 : x : SER xxxx B0081 <- 3.58 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx >3pvp_B:TrpR-like; title=STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS DNAA-DBD IN COMPLEX WITH BOX2 DNA organism=Mycobacterium tuberculosis : H : LYS NZ B0436 <- 3.12 -> DA N3 F0211 : score 2.5992 : w : LYS NZ B0436 <- 5.69 -> DA N3 E0105 : score 1.538 : H : HIS NE2 B0470 <- 2.78 -> DG N7 F0204 : score 6.82977 : H : THR OG1 B0471 <- 3.00 -> DC N4 E0108 : score 3.872 : w : THR OG1 B0471 <- 6.10 -> DC N4 E0107 : score 2.558 : V : PRO CG B0460 <- 3.73 -> DT C7 F0203 : score 6.47026 : x : ASP xxxx B0469 <- 3.69 -> DC xxx E0108 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0472 <- 3.76 -> DC xxx E0107 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0474 <- 3.57 -> DG xxx F0204 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0475 <- 3.47 -> DT xxx E0106 : score x.xxxxx >3pvv_B:TrpR-like; title=STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS DNAA-DBD IN COMPLEX WITH BOX1 DNA organism=Mycobacterium tuberculosis : H : LYS NZ B0436 <- 3.26 -> DA N3 F0211 : score 2.52145 : H : LYS NZ B0436 <- 2.73 -> DT O2 E0104 : score 3.6374 : w : LYS NZ B0436 <- 5.61 -> DG N3 E0105 : score 2.232 : w : ASP OD2 B0469 <- 6.04 -> DA N6 E0109 : score 3.409 : H : HIS NE2 B0470 <- 2.78 -> DG N7 F0204 : score 6.82977 : H : THR OG1 B0471 <- 2.94 -> DC N4 E0108 : score 3.9204 : V : PRO CG B0460 <- 3.69 -> DT C7 F0203 : score 6.53385 : x : MET xxxx B0474 <- 3.57 -> DG xxx F0204 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0475 <- 3.60 -> DT xxx E0106 : score x.xxxxx >3pvx_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=BINARY COMPLEX OF AFLATOXIN B1 ADDUCT MODIFIED DNA (AFB1-FAPY) WITH DNA POLYMERASE IV organism=Sulfolobus solfataricus : H : TYR OH A0012 <- 3.24 -> DT O2 B0373 : score 2.9336 : H : LYS NZ A0078 <- 2.84 -> DT O2 B0373 : score 3.55848 : w : ARG NH1 A0336 <- 6.62 -> DG O6 C0355 : score 2.756 : w : ARG NH2 A0336 <- 6.37 -> DG O6 C0355 : score 2.468 : x : VAL xxxx A0032 <- 4.28 -> DT xxx B0373 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0044 <- 4.08 -> DT xxx B0373 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0076 <- 3.87 -> DT xxx B0373 : score x.xxxxx >3pw0_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF AFLATOXIN B1 ADDUCT MODIFIED DNA (AFB1-FAPY) WITH DNA POLYMERASE IV AND INCOMING DATP organism=Sulfolobus solfataricus : V : ALA CB A0042 <- 3.84 -> DT C7 B0373 : score 5.54298 : x : VAL xxxx A0032 <- 3.83 -> DT xxx B0373 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 3.70 -> DT xxx B0377 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.56 -> DT xxx B0377 : score x.xxxxx >3pw2_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF AFLATOXIN B1 ADDUCT MODIFIED DNA (AFB1-FAPY) WITH DNA POLYMERASE IV AND INCOMING DTTP organism=Sulfolobus solfataricus : x : VAL xxxx A0033 <- 3.43 -> DT xxx B0373 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0043 <- 4.21 -> DT xxx B0373 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0045 <- 3.91 -> DT xxx B0373 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0077 <- 3.23 -> DT xxx B0373 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0079 <- 4.36 -> DT xxx B0373 : score x.xxxxx >3pw4_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF AFLATOXIN B1 ADDUCT MODIFIED DNA (AFB1-N7-GUA) WITH DNA POLYMERASE IV AND INCOMING DATP organism=Sulfolobus solfataricus : x : SER xxxx A0245 <- 4.42 -> DT xxx B0377 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0333 <- 3.76 -> DG xxx B0374 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0337 <- 4.03 -> DA xxx B0376 : score x.xxxxx >3pw5_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF AFLATOXIN B1 ADDUCT MODIFIED DNA (AFB1-N7-GUA) WITH DNA POLYMERASE IV AND INCOMING DTTP organism=Sulfolobus solfataricus : x : ARG xxxx A0337 <- 4.00 -> DA xxx B0375 : score x.xxxxx >3pw7_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF AFLATOXIN B1 ADDUCT MODIFIED DNA (AFB1-N7-GUA) WITH DNA POLYMERASE IV AND INCOMING DCTP organism=Sulfolobus solfataricus : x : SER xxxx A0300 <- 4.35 -> DG xxx C0354 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0339 <- 4.02 -> DA xxx B0376 : score x.xxxxx >3px0_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT BOUND TO DNA AND DCTP-DA MISMATCH (TAUTOMER) IN CLOSED CONFORMATION organism=Geobacillus kaustophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.75 -> DT O2 F0008 : score 3.62305 : w : LYS NZ D0582 <- 5.76 -> DC O2 E0026 : score 1.3 : w : TYR OH D0587 <- 5.97 -> DC O2 E0026 : score 1.343 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.76 -> DG N3 F0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.92 -> DA N3 F0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.88 -> DT O2 E0027 : score 4.67022 : w : HIS NE2 D0829 <- 5.70 -> DC O2 E0028 : score 3.208 : x : GLN xxxx D0797 <- 4.40 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx >3px4_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT BOUND TO DNA AND DDCTP-DA MISMATCH (WOBBLE) IN AJAR CONFORMATION organism=Geobacillus kaustophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.76 -> DT O2 F0008 : score 3.61588 : w : LYS NZ D0582 <- 5.68 -> DC O2 E0026 : score 1.3 : w : TYR OH D0587 <- 6.02 -> DC O2 E0026 : score 1.343 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.77 -> DG N3 F0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.87 -> DA N3 F0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.95 -> DT O2 E0027 : score 4.60377 : w : HIS NE2 D0829 <- 5.67 -> DC O2 E0028 : score 3.208 : x : TYR xxxx D0710 <- 3.88 -> DA xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.73 -> DA xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0716 <- 3.98 -> DA xxx F0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0797 <- 3.31 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx >3px6_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT BOUND TO DNA AND DDCTP-DA MISMATCH (TAUTOMER) IN CLOSED CONFORMATION organism=Geobacillus kaustophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.76 -> DT O2 F0008 : score 3.61588 : w : LYS NZ D0582 <- 5.88 -> DC O2 E0026 : score 1.3 : w : TYR OH D0587 <- 5.95 -> DC O2 E0026 : score 1.343 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.84 -> DG N3 F0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.90 -> DA N3 F0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.94 -> DT O2 E0027 : score 4.61326 : w : ASN ND2 D0724 <- 6.00 -> DA N7 F0003 : score 1.989 : w : ASN ND2 D0793 <- 6.41 -> DG N3 F0004 : score 2.566 : w : GLN NE2 D0797 <- 6.29 -> DG N3 F0004 : score 1.484 : w : HIS NE2 D0829 <- 5.71 -> DC O2 E0028 : score 3.208 : x : ALA xxxx D0707 <- 3.92 -> DA xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0710 <- 3.99 -> DA xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.81 -> DA xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0716 <- 4.07 -> DA xxx F0003 : score x.xxxxx >3py8_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MUTANT OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH DNA AND DDCTP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.92 -> DC O2 B0109 : score 2.87545 : w : LYS NZ A0540 <- 5.68 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.86 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.59 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.70 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.69 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.79 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.68 -> DG N3 C0208 : score 3.377 : H : THR OG1 A0664 <- 3.43 -> DG O6 C0204 : score 3.68425 : w : THR OG1 A0664 <- 5.39 -> DG N7 C0204 : score 3.422 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.64 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : PHE xxxx A0667 <- 3.85 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0671 <- 3.38 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0673 <- 4.04 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0754 <- 3.38 -> DG xxx C0205 : score x.xxxxx >3pzp_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE KAPPA EXTENDING OPPOSITE A CIS-SYN THYMINE DIMER organism=Homo sapiens : H : THR OG1 B0044 <- 2.68 -> DC N4 U0005 : score 4.13013 : x : PHE xxxx B0049 <- 3.00 -> DC xxx U0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0153 <- 3.27 -> DC xxx U0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0155 <- 3.85 -> DC xxx U0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0156 <- 3.26 -> DC xxx U0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0415 <- 4.37 -> DT xxx U0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0469 <- 4.29 -> DG xxx Q0008 : score x.xxxxx >3q05_ABCD:p53-like_transcription_factors;p53_tetramerization_domain; title=AN INDUCED FIT MECHANISM REGULATES P53 DNA BINDING KINETICS TO CONFER SEQUENCE SPECIFICITY organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0280 <- 2.88 -> DG O6 K0021 : score 5.986 : H : ARG NH2 A0280 <- 3.02 -> DG N7 K0021 : score 6.10369 : H : LYS NZ B0120 <- 3.31 -> DG N7 K0016 : score 4.83654 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.73 -> DG O6 L0035 : score 6.1685 : H : ARG NH2 B0280 <- 3.02 -> DG N7 L0035 : score 6.10369 : H : ARG NH1 C0280 <- 3.03 -> DG O6 K0011 : score 5.8035 : H : ARG NH2 C0280 <- 3.32 -> DG N7 K0011 : score 5.72062 : H : ARG NH1 D0280 <- 3.15 -> DG O6 L0045 : score 5.6575 : H : ARG NH2 D0280 <- 3.32 -> DG N7 L0045 : score 5.72062 : x : ARG xxxx A0248 <- 3.68 -> DG xxx L0035 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 4.43 -> DG xxx K0021 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0277 <- 3.95 -> DC xxx K0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0120 <- 4.14 -> DG xxx L0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0248 <- 3.73 -> DG xxx L0045 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0276 <- 4.47 -> DG xxx K0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0277 <- 3.90 -> DC xxx K0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0248 <- 3.71 -> DG xxx K0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0276 <- 3.53 -> DT xxx L0046 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0277 <- 3.74 -> DT xxx L0046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0248 <- 3.67 -> DG xxx K0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 3.48 -> DT xxx L0036 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0277 <- 3.38 -> DT xxx L0036 : score x.xxxxx >3q05_B:p53-like_transcription_factors;p53_tetramerization_domain; title=AN INDUCED FIT MECHANISM REGULATES P53 DNA BINDING KINETICS TO CONFER SEQUENCE SPECIFICITY organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ B0120 <- 3.31 -> DG N7 K0016 : score 4.83654 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.73 -> DG O6 L0035 : score 6.1685 : H : ARG NH2 B0280 <- 3.02 -> DG N7 L0035 : score 6.10369 : x : ARG xxxx B0248 <- 3.67 -> DG xxx K0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 3.48 -> DT xxx L0036 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0277 <- 3.38 -> DT xxx L0036 : score x.xxxxx >3q06_ABCD:p53-like_transcription_factors;p53_tetramerization_domain; title=AN INDUCED FIT MECHANISM REGULATES P53 DNA BINDING KINETICS TO CONFER SEQUENCE SPECIFICITY organism=HOMO SAPIENS : H : CYS SG A0277 <- 3.12 -> DC N4 K0022 : score -3.2496 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.96 -> DG O6 K0021 : score 5.88867 : H : ARG NH2 A0280 <- 2.78 -> DG N7 K0021 : score 6.41015 : H : LYS NZ B0120 <- 2.62 -> DA N7 K0015 : score 3.04292 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.51 -> DG O6 L0035 : score 6.43617 : H : ARG NH2 B0280 <- 3.25 -> DG N7 L0035 : score 5.81 : H : LYS NZ C0120 <- 2.88 -> DG N7 L0040 : score 5.29972 : H : LYS NZ C0120 <- 2.94 -> DG O6 L0040 : score 5.61891 : H : ARG NH1 C0280 <- 2.74 -> DG O6 K0011 : score 6.15633 : H : ARG NH2 C0280 <- 3.06 -> DG N7 K0011 : score 6.05262 : H : ARG NH1 D0280 <- 3.21 -> DG O6 L0045 : score 5.5845 : H : ARG NH2 D0280 <- 2.97 -> DG N7 L0045 : score 6.16754 : x : CYS xxxx C0277 <- 3.42 -> DC xxx K0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0276 <- 3.79 -> DT xxx L0046 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0277 <- 3.35 -> DT xxx L0046 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 3.80 -> DT xxx L0036 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0277 <- 3.80 -> DT xxx L0036 : score x.xxxxx >3q06_D:p53-like_transcription_factors;p53_tetramerization_domain; title=AN INDUCED FIT MECHANISM REGULATES P53 DNA BINDING KINETICS TO CONFER SEQUENCE SPECIFICITY organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 D0280 <- 3.21 -> DG O6 L0045 : score 5.5845 : H : ARG NH2 D0280 <- 2.97 -> DG N7 L0045 : score 6.16754 : V : ALA CB D0276 <- 3.79 -> DT C7 L0046 : score 5.61297 : x : CYS xxxx D0277 <- 3.35 -> DT xxx L0046 : score x.xxxxx >3q0a_B: title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX OF THE N4 MINI-VRNAP WITH P2 PROMOTER: MISMATCH COMPLEX organism=Enterobacteria phage N4 : H : LYS NZ B0114 <- 2.80 -> DG N7 D0015 : score 5.3859 : H : ARG NH1 B0119 <- 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x : SER xxxx B0208 <- 4.11 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0267 <- 3.64 -> DC xxx D0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0268 <- 3.81 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0318 <- 3.22 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0675 <- 3.31 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0678 <- 3.22 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0680 <- 4.20 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0817 <- 4.20 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0821 <- 3.97 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0917 <- 4.16 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0921 <- 4.14 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0925 <- 3.70 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx >3q0c_AX:PUA_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SUVH5 SRA-FULLY METHYLATED CG DNA COMPLEX IN SPACE GROUP P6122 organism=Arabidopsis thaliana : H : SER OG A0391 <- 2.61 -> DT O2 C0007 : score 3.83794 : H : GLN OE1 A0392 <- 2.73 -> DG N2 C0006 : score 5.6862 : w : 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C0005 : score 2.41624 : H : ASP OD2 X0418 <- 2.88 -> DC N4 C0005 : score 6.1008 A : x : TYR xxxx X0416 <- 3.21 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx X0428 <- 2.98 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >3q0d_X:PUA_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SUVH5 SRA- HEMI METHYLATED CG DNA COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : H : SER OG X0391 <- 2.76 -> DT O2 B0007 : score 3.72702 : H : GLN OE1 X0392 <- 2.31 -> DG N2 B0006 : score 6.15725 A : H : SER OG X0413 <- 2.97 -> DC O2 C0005 : score 2.41624 : H : ASP OD2 X0418 <- 2.88 -> DC N4 C0005 : score 6.1008 A : x : TYR xxxx X0416 <- 3.21 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx X0428 <- 2.98 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >3q0f_A:PUA_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SUVH5 SRA- METHYLATED CHH DNA COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : x : SER xxxx A0391 <- 3.81 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0392 <- 3.15 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0395 <- 4.45 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0412 <- 4.08 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0413 <- 3.88 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0416 <- 3.27 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0418 <- 2.40 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0428 <- 3.14 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0429 <- 3.95 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0431 <- 4.15 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx >3q0f_AX:PUA_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SUVH5 SRA- METHYLATED CHH DNA COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : x : SER xxxx X0391 <- 4.05 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx X0392 <- 3.18 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0391 <- 3.81 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0392 <- 3.15 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0395 <- 4.45 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0412 <- 4.08 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0413 <- 3.88 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0416 <- 3.27 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0418 <- 2.40 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0428 <- 3.14 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0429 <- 3.95 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0431 <- 4.15 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx >3q1m_A:Probable_bacterial_effector-binding_domain;Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BMRR DIMER BOUND TO DNA AND THE LIGAND 4-AMINO- QUINALDINE organism=Bacillus subtilis : x : ARG xxxx A0023 <- 3.60 -> DT xxx B-007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0042 <- 3.38 -> DC xxx B-010 : score x.xxxxx >3q22_B: title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE N4 MINI-VRNAP AND P2_7A PROMOTER TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH GTP AND MAGNESIUM: SUBSTRATE COMPLEX I organism=Enterobacteria phage N4 : H : LYS NZ B0114 <- 3.02 -> DG N7 D0015 : score 5.14892 : H : ARG NH1 B0119 <- 2.76 -> DG O6 D0016 : score 6.132 : H : ARG NH2 B0119 <- 2.84 -> DG N7 D0016 : score 6.33354 : H : THR OG1 B0202 <- 2.86 -> DA N3 D0009 : score 1.3376 : w : GLU OE2 B0205 <- 5.71 -> DA N6 D0008 : score 2.785 : H : THR OG1 B0269 <- 2.84 -> DG N2 D0010 : score 3.98581 : H : ASP OD2 B0901 <- 2.88 -> DC N4 D0014 : score 6.1008 : H : ARG NH1 B0904 <- 2.79 -> DG O6 D0013 : score 6.0955 : H : ARG NH2 B0904 <- 2.71 -> DG N7 D0013 : score 6.49954 : V : VAL CG1 B0917 <- 3.83 -> DT C7 D0003 : score 6.01506 : x : VAL xxxx B0116 <- 3.76 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0129 <- 3.45 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0171 <- 3.49 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0173 <- 3.66 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0174 <- 3.73 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0177 <- 3.24 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0181 <- 3.47 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0204 <- 3.97 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0267 <- 3.73 -> DC xxx D0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0268 <- 3.81 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0318 <- 3.10 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0671 <- 4.38 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0675 <- 3.28 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0678 <- 3.49 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0680 <- 4.09 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0817 <- 3.64 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0925 <- 3.93 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx >3q23_B: title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE N4 MINI-VRNAP AND P2_7A PROMOTER TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH GMPCPP AND MANGANESE: SUSTRATE COMPLEX II organism=Enterobacteria phage N4 : H : LYS NZ B0114 <- 2.93 -> DG N7 D0015 : score 5.24586 : H : ARG NH1 B0119 <- 2.82 -> DG O6 D0016 : score 6.059 : H : ARG NH2 B0119 <- 2.90 -> DG N7 D0016 : score 6.25692 : w : ASP OD1 B0174 <- 6.20 -> DA N6 D0006 : score 3.122 : H : THR OG1 B0202 <- 2.75 -> DA N3 D0009 : score 1.36738 : w : GLU OE2 B0205 <- 5.74 -> DA N6 D0008 : score 2.785 : H : THR OG1 B0269 <- 2.93 -> DG N2 D0010 : score 3.91348 : w : ARG NH1 B0424 <- 5.84 -> DA N3 D0006 : score 2.585 : H : ASP OD2 B0901 <- 2.84 -> DC N4 D0014 : score 6.1504 : H : ARG NH1 B0904 <- 2.88 -> DG O6 D0013 : score 5.986 : H : ARG NH2 B0904 <- 2.76 -> DG N7 D0013 : score 6.43569 : V : VAL CG1 B0917 <- 3.64 -> DT C7 D0003 : score 6.30293 : x : VAL xxxx B0116 <- 3.97 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0129 <- 3.33 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0171 <- 3.60 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0173 <- 3.62 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0177 <- 3.46 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0181 <- 3.46 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0204 <- 4.23 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0258 <- 4.47 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0267 <- 3.70 -> DC xxx D0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0268 <- 3.81 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0318 <- 3.37 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0675 <- 3.22 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0678 <- 3.51 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0680 <- 4.25 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0817 <- 3.75 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0821 <- 4.29 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0925 <- 3.79 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx >3q2y_A:Probable_bacterial_effector-binding_domain;Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BMRR BOUND TO ETHIDIUM organism=Bacillus subtilis : x : LYS xxxx A0020 <- 4.02 -> DC xxx B-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0023 <- 3.45 -> DT xxx B-007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0042 <- 3.55 -> DC xxx B-010 : score x.xxxxx >3q3d_A:Probable_bacterial_effector-binding_domain;Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BMRR BOUND TO PUROMYCIN organism=Bacillus subtilis : x : ARG xxxx A0023 <- 3.57 -> DT xxx B-007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0042 <- 3.10 -> DC xxx B-010 : score x.xxxxx >3q5f_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE SALMONELLA TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SLYA IN COMPLEX WITH DNA organism=Salmonella enterica : H : ARG NH1 A0065 <- 2.77 -> DG N7 C0014 : score 6.0863 : H : ARG NH2 A0065 <- 2.98 -> DG O6 C0014 : score 6.3624 : H : ARG NE A0086 <- 2.74 -> DT O2 D0004 : score 2.60785 : V : PRO CG A0061 <- 3.78 -> DT C7 C0016 : score 6.39077 : V : GLN CB A0060 <- 3.83 -> DT C7 D0007 : score 1.82009 : V : VAL CG1 A0064 <- 3.85 -> DT C7 D0008 : score 5.98476 : x : GLU xxxx A0059 <- 3.78 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0062 <- 3.09 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx >3q5f_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE SALMONELLA TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SLYA IN COMPLEX WITH DNA organism=Salmonella enterica : H : ARG NH1 A0065 <- 2.77 -> DG N7 C0014 : score 6.0863 : H : ARG NH2 A0065 <- 2.98 -> DG O6 C0014 : score 6.3624 : H : ARG NE A0086 <- 2.74 -> DT O2 D0004 : score 2.60785 : H : ARG NH1 B0065 <- 2.80 -> DG N7 D0014 : score 6.05 : H : ARG NH2 B0065 <- 3.28 -> DG O6 D0014 : score 5.9664 : V : GLN CB A0060 <- 3.83 -> DT C7 D0007 : score 1.82009 : V : VAL CG1 A0064 <- 3.85 -> DT C7 D0008 : score 5.98476 : V : PRO CG B0061 <- 3.67 -> DT C7 D0016 : score 6.56564 : V : VAL CG1 B0064 <- 3.61 -> DT C7 C0008 : score 6.34839 : V : PRO CG A0061 <- 3.78 -> DT C7 C0016 : score 6.39077 : x : GLU xxxx A0059 <- 3.78 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0062 <- 3.09 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0017 <- 4.47 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0059 <- 4.10 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0060 <- 3.43 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0062 <- 3.32 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0086 <- 3.32 -> DA xxx D0022 : score x.xxxxx >3q5p_A:Probable_bacterial_effector-binding_domain;Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BMRR BOUND TO TETRACYCLINE organism=Bacillus subtilis : x : ARG xxxx A0023 <- 3.44 -> DT xxx B-007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0042 <- 3.44 -> DC xxx B-010 : score x.xxxxx >3q5r_A:Probable_bacterial_effector-binding_domain;Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BMRR BOUND TO KANAMYCIN organism=Bacillus subtilis : x : ARG xxxx A0023 <- 3.42 -> DT xxx B-007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0042 <- 3.42 -> DC xxx B-010 : score x.xxxxx >3q5s_A:Probable_bacterial_effector-binding_domain;Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BMRR BOUND TO ACETYLCHOLINE organism=Bacillus subtilis : x : ARG xxxx A0023 <- 3.49 -> DT xxx B-007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0042 <- 3.60 -> DC xxx B-009 : score x.xxxxx >3q8k_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN FLAP ENDONUCLEASE FEN1 (WT) IN COMPLEX WITH PRODUCT 5'-FLAP DNA, SM3+, AND K+ organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 A0048 <- 3.23 -> DC N4 F0006 : score 4.18917 : w : ARG NH1 A0320 <- 5.69 -> DT O2 F0005 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0320 <- 5.50 -> DT O2 F0005 : score 2.261 : x : ALA xxxx A0045 <- 4.03 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0046 <- 3.87 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0053 <- 4.09 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0065 <- 3.13 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx >3q8l_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN FLAP ENDONUCLEASE FEN1 (WT) IN COMPLEX WITH SUBSTRATE 5'-FLAP DNA, SM3+, AND K+ organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx A0040 <- 3.07 -> DT xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0044 <- 3.47 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0245 <- 3.55 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx >3q8m_B:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN FLAP ENDONUCLEASE FEN1 (D181A) IN COMPLEX WITH SUBSTRATE 5'-FLAP DNA AND K+ organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 B0048 <- 3.42 -> DC N4 F0006 : score 4.015 : x : ALA xxxx B0045 <- 4.04 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0046 <- 3.44 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0053 <- 3.95 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0065 <- 3.68 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0320 <- 3.66 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx >3q8p_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE IOTA INCORPORATING DCTP OPPOSITE 8-OXO-GUANINE organism=Homo sapiens : w : TYR OH B0039 <- 5.67 -> DG N3 T0841 : score 3.344 : w : TYR OH B0039 <- 5.82 -> DG N2 T0841 : score 2.834 : w : GLN NE2 B0059 <- 6.19 -> DG N3 T0841 : score 1.484 : w : GLU OE1 B0305 <- 6.22 -> DG N7 T0842 : score 1.976 : w : GLU OE2 B0305 <- 6.23 -> DG N7 T0842 : score 2.669 : w : GLN OE1 B0361 <- 5.90 -> DA N7 P0867 : score 1.196 : w : GLN NE2 B0361 <- 5.78 -> DA N7 P0867 : score 1.888 : x : LEU xxxx B0099 <- 4.46 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0343 <- 4.35 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >3q8q_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE IOTA INCORPORATING DATP OPPOSITE 8-OXO-GUANINE organism=Homo sapiens : w : TYR OH B0039 <- 5.61 -> DG N3 T0841 : score 3.344 : w : TYR OH B0039 <- 5.78 -> DG N2 T0841 : score 2.834 : w : GLN NE2 B0059 <- 6.14 -> DG N3 T0841 : score 1.484 : w : GLU OE1 B0305 <- 5.98 -> DG N7 T0842 : score 1.976 : w : GLU OE2 B0305 <- 6.16 -> DG N7 T0842 : score 2.669 : x : LEU xxxx B0099 <- 4.47 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0343 <- 4.41 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0361 <- 4.17 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >3q8r_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE IOTA INCORPORATING DGTP OPPOSITE 8-OXO-GUANINE organism=Homo sapiens : w : TYR OH B0039 <- 5.62 -> DG N3 T0841 : score 3.344 : w : ARG NH1 B0357 <- 5.86 -> DG N7 T0841 : score 2.063 : x : LEU xxxx B0099 <- 4.47 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0305 <- 3.64 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx >3q8s_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE IOTA INCORPORATING DTTP OPPOSITE 8-OXO-GUANINE organism=Homo sapiens : w : TYR OH B0039 <- 5.51 -> DG N3 T0841 : score 3.344 : w : TYR OH B0039 <- 5.94 -> DG N2 T0841 : score 2.834 : w : GLN NE2 B0059 <- 6.11 -> DG N3 T0841 : score 1.484 : w : GLU OE1 B0305 <- 5.89 -> DG N7 T0842 : score 1.976 : x : GLN xxxx B0361 <- 4.23 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >3qe9_Z:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN EXONUCLEASE 1 EXO1 (D173A) IN COMPLEX WITH DNA (COMPLEX I) organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 Z0121 <- 2.77 -> DG O6 A0019 : score 6.11983 : x : GLN xxxx Z0004 <- 3.49 -> DT xxx A0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx Z0036 <- 3.00 -> DT xxx B0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Z0040 <- 3.56 -> DA xxx A0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Z0120 <- 3.37 -> DA xxx A0020 : score x.xxxxx >3qea_Z:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN EXONUCLEASE 1 EXO1 (WT) IN COMPLEX WITH DNA (COMPLEX II) organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 Z0004 <- 3.12 -> DA N7 A0015 : score 5.7 : H : ARG NH2 Z0121 <- 3.06 -> DG O6 A0019 : score 6.2568 : x : HIS xxxx Z0036 <- 3.53 -> DT xxx B0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Z0040 <- 4.37 -> DA xxx A0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Z0117 <- 4.46 -> DG xxx A0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Z0120 <- 4.10 -> DA xxx A0020 : score x.xxxxx >3qeb_Z:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN EXONUCLEASE 1 EXO1 (WT) IN COMPLEX WITH DNA AND MN2+ (COMPLEX III) organism=Homo sapiens : x : GLN xxxx Z0004 <- 3.49 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0121 <- 4.45 -> DG xxx A0019 : score x.xxxxx >3qei_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (L561A/S565G/Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DCTP OPPOSITE DIFLUOROTOLUENE NUCLEOSIDE organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.90 -> DA N3 P0114 : score 2.72138 : w : LYS NZ A0734 <- 5.19 -> DT O2 P0112 : score 0.522 : x : LYS xxxx A0800 <- 3.54 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx >3qep_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (L561A/S565G/Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DTTP OPPOSITE DIFLUOROTOLUENE NUCLEOSIDE organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0416 <- 5.82 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : H : LYS NZ A0706 <- 2.96 -> DA N3 P0114 : score 2.68806 : w : LYS NZ A0734 <- 5.61 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0734 <- 5.48 -> DC O2 T0010 : score 1.3 >3qer_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (L561A/S565G/Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DATP OPPOSITE DIFLUOROTOLUENE NUCLEOSIDE organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.95 -> DA N3 P0114 : score 2.69362 : w : LYS NZ A0734 <- 5.60 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0734 <- 5.89 -> DC O2 T0010 : score 1.3 >3qes_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (L561A/S565G/Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DGTP OPPOSITE DIFLUOROTOLUENE NUCLEOSIDE organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.95 -> DA N3 P0114 : score 2.69362 : w : LYS NZ A0734 <- 5.45 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >3qet_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (L561A/S565G/Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DTTP OPPOSITE DT organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0416 <- 5.82 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : H : LYS NZ A0706 <- 2.94 -> DA N3 P0114 : score 2.69917 : w : ARG NH1 A0707 <- 5.43 -> DT O2 P0113 : score 1.855 A : w : ARG NH2 A0707 <- 5.34 -> DG N3 T0009 : score 0.677 A : w : LYS NZ A0734 <- 5.50 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >3qev_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (L561A/S565G/Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DCTP OPPOSITE DT organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.99 -> DA N3 P0114 : score 2.6714 : w : LYS NZ A0734 <- 5.70 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0734 <- 5.58 -> DC O2 T0010 : score 1.3 >3qew_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (L561A/S565G/Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DDTP OPPOSITE DT organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.98 -> DA N3 P0114 : score 2.67695 : w : LYS NZ A0734 <- 6.01 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0734 <- 5.70 -> DT O2 P0112 : score 0.522 >3qex_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (L561A/S565G/Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DGTP OPPOSITE DT organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.95 -> DA N3 P0114 : score 2.69362 : w : LYS NZ A0734 <- 5.55 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >3qfq_ABE:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=ASYMMETRIC ASSEMBLY OF MERKEL CELL POLYOMAVIRUS LARGE T-ANTIGEN ORIGIN BINDING DOMAINS AT THE VIRAL ORIGIN organism=Merkel cell polyomavirus : H : SER OG A0329 <- 2.92 -> DA N7 W0005 : score 4.35696 : H : ASN ND2 A0330 <- 3.10 -> DG O6 W0007 : score 5.30015 : H : ARG NH2 A0380 <- 3.20 -> DG O6 C0020 : score 6.072 : H : LYS NZ B0331 <- 2.82 -> DG N7 C0003 : score 5.36435 : H : ARG NH2 B0380 <- 3.07 -> DG O6 W0021 : score 6.2436 : H : SER OG E0329 <- 3.40 -> DG N7 W0012 : score 3.94421 : H : ASN ND2 E0330 <- 3.25 -> DG O6 W0014 : score 5.131 : H : LYS NZ E0331 <- 3.34 -> DG O6 W0011 : score 5.15645 : H : ARG NH2 E0380 <- 2.81 -> DG N7 C0013 : score 6.37185 : H : ARG NH2 E0380 <- 2.73 -> DG O6 C0013 : score 6.6924 : x : LYS xxxx A0331 <- 3.40 -> DG xxx W0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0332 <- 4.13 -> DC xxx C0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0329 <- 3.71 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0330 <- 3.36 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0332 <- 3.97 -> DC xxx W0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0332 <- 3.81 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >3qfq_B:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=ASYMMETRIC ASSEMBLY OF MERKEL CELL POLYOMAVIRUS LARGE T-ANTIGEN ORIGIN BINDING DOMAINS AT THE VIRAL ORIGIN organism=Merkel cell polyomavirus : H : LYS NZ B0331 <- 2.82 -> DG N7 C0003 : score 5.36435 : H : ARG NH2 B0380 <- 3.07 -> DG O6 W0021 : score 6.2436 : x : SER xxxx B0329 <- 3.71 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0330 <- 3.36 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0332 <- 3.97 -> DC xxx W0022 : score x.xxxxx >3qi5_A:FMT_C-terminal_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN ALKYLADENINE DNA GLYCOSYLASE IN COMPLEX WITH 3,N4-ETHENOCYSTOSINE CONTAINING DUPLEX DNA organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx A0162 <- 3.41 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0165 <- 3.34 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >3qlp_H:Trypsin-like_serine_proteases; title=X-RAY STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN HUMAN ALPHA THROMBIN AND A MODIFIED THROMBIN BINDING APTAMER (MTBA) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 H0075 <- 3.15 -> DT O4 D0013 : score 3.03919 : H : ARG NH2 H0075 <- 3.06 -> DT O2 D0004 : score 4.0132 : H : ARG NH2 H0075 <- 2.58 -> DT O4 D0013 : score 3.71022 : H : GLU OE2 H0077 <- 2.89 -> DT N3 D0012 : score 2.58845 : H : ARG NH1 H0077 <- 2.95 -> DT O4 D0004 : score 3.16991 : x : ILE xxxx H0024 <- 4.01 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0038 <- 3.80 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0065 <- 3.02 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0071 <- 4.27 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0076 <- 3.65 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0078 <- 4.34 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0079 <- 3.60 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0082 <- 4.00 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx >3qmb_A: title=STRUCTURAL BASIS OF SELECTIVE BINDING OF NONMETHYLATED CPG ISLANDS BY THE CXXC DOMAIN OF CFP1 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0204 <- 2.96 -> DG O6 B0007 : score 3.81491 : H : ARG NH2 A0204 <- 2.61 -> DG O6 B0008 : score 6.8508 : H : GLN NE2 A0205 <- 2.91 -> DG O6 C0007 : score 5.67742 : H : ARG NH1 A0217 <- 3.34 -> DG N7 C0008 : score 5.3966 : H : ARG NH2 A0217 <- 2.56 -> DG O6 C0008 : score 6.9168 : x : ILE xxxx A0203 <- 4.16 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0220 <- 3.52 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >3qmc_A: title=STRUCTURAL BASIS OF SELECTIVE BINDING OF NONMETHYLATED CPG ISLANDS BY THE CXXC DOMAIN OF CFP1 organism=Homo sapiens : w : ASN OD1 A0201 <- 5.46 -> DG N7 C0005 : score 1.873 : H : ARG NE A0204 <- 2.95 -> DG O6 B0007 : score 3.82279 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.34 -> DG N7 B0007 : score 6.6066 : H : GLN NE2 A0205 <- 2.81 -> DG O6 C0007 : score 5.79352 : H : ARG NH1 A0217 <- 2.81 -> DG O6 C0008 : score 6.07117 : H : ARG NH2 A0217 <- 2.88 -> DG N7 C0008 : score 6.28246 : w : ARG NH1 A0217 <- 5.57 -> DA N6 B0004 : score 1.486 : w : TYR OH A0220 <- 6.52 -> DC N4 B0005 : score 1.343 : w : TYR OH A0220 <- 6.03 -> DA N6 B0004 : score 2.545 : x : ILE xxxx A0203 <- 4.32 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >3qmd_A: title=STRUCTURAL BASIS OF SELECTIVE BINDING OF NONMETHYLATED CPG ISLANDS BY THE CXXC DOMAIN OF CFP1 organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0204 <- 2.86 -> DG O6 B0007 : score 3.89373 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.51 -> DG N7 B0007 : score 6.4009 : H : GLN NE2 A0205 <- 2.90 -> DG O6 C0007 : score 5.68903 : w : GLN OE1 A0205 <- 5.43 -> DG N7 C0007 : score 2.87 : w : GLN NE2 A0205 <- 5.89 -> DA N6 B0005 : score 2.804 : x : ASN xxxx A0201 <- 3.85 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0217 <- 3.29 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0220 <- 4.30 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >3qmg_A: title=STRUCTURAL BASIS OF SELECTIVE BINDING OF NON-METHYLATED CPG ISLANDS BY THE CXXC DOMAIN OF CFP1 organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0200 <- 2.66 -> DG N7 C0007 : score 6.2194 : H : ARG NH1 A0200 <- 3.23 -> DG O6 C0007 : score 5.56017 : H : GLN NE2 A0201 <- 2.81 -> DG O6 B0007 : score 5.79352 : H : ARG NH1 A0213 <- 3.09 -> DG O6 B0008 : score 5.7305 : H : ARG NH2 A0213 <- 3.26 -> DG N7 B0008 : score 5.79723 : x : ILE xxxx A0199 <- 4.41 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0216 <- 3.87 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >3qmh_A: title=STRUCTURAL BASIS OF SELECTIVE BINDING OF NON-METHYLATED CPG ISLANDS (DNA-TCGA) BY THE CXXC DOMAIN OF CFP1 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0200 <- 2.71 -> DG N7 C0007 : score 6.1589 : H : GLN NE2 A0201 <- 3.03 -> DG O6 B0007 : score 5.53809 : x : ASN xxxx A0197 <- 4.12 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0199 <- 3.47 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0213 <- 3.34 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0216 <- 3.80 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >3qmi_A: title=STRUCTURAL BASIS OF SELECTIVE BINDING OF NON-METHYLATED CPG ISLANDS (DNA-ACGT) BY THE CXXC DOMAIN OF CFP1 organism=HOMO SAPIENS : w : ASN OD1 A0197 <- 5.97 -> DA N6 B0005 : score 2.837 : H : ARG NH1 A0200 <- 2.85 -> DG N7 C0007 : score 5.9895 : H : ARG NH1 A0200 <- 3.24 -> DG O6 C0007 : score 5.548 : H : GLN NE2 A0201 <- 2.90 -> DG O6 B0007 : score 5.68903 : w : GLN OE1 A0201 <- 5.57 -> DG N7 B0007 : score 2.87 : w : GLN NE2 A0201 <- 6.09 -> DA N6 C0005 : score 2.804 : x : ARG xxxx A0213 <- 3.30 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0216 <- 4.36 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >3qnn_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DGT OPPOSITE 3TCO organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.00 -> DA N3 P0114 : score 2.66585 : w : LYS NZ A0734 <- 5.49 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0734 <- 5.64 -> DC O2 T0010 : score 1.3 >3qno_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DATP OPPOSITE 3TCO organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.99 -> DA N3 P0114 : score 2.6714 : w : LYS NZ A0734 <- 5.59 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0734 <- 5.55 -> DC O2 T0010 : score 1.3 >3qoq_ABCD:Ribbon-helix-helix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRANSCRIPTION FACTOR AMRZ IN COMPLEX WITH THE 18 BASE PAIR AMRZ1 BINDING SITE organism=Pseudomonas aeruginosa : H : LYS NZ A0018 <- 2.81 -> DG N7 F0023 : score 5.37513 : H : LYS NZ A0018 <- 2.63 -> DG O6 F0024 : score 5.97732 : H : ARG NH2 B0022 <- 2.57 -> DG N7 E0012 : score 6.67831 : H : ARG NH2 B0022 <- 2.71 -> DG O6 E0012 : score 6.7188 : H : LYS NZ C0018 <- 2.79 -> DG N7 E0004 : score 5.39667 : H : LYS NZ C0018 <- 2.75 -> DG O6 E0004 : score 5.83858 : H : LYS NZ C0018 <- 2.88 -> DG O6 E0005 : score 5.68828 : H : ARG NH2 D0022 <- 2.83 -> DG N7 F0031 : score 6.34631 : H : ARG NH2 D0022 <- 2.60 -> DG O6 F0031 : score 6.864 : x : SER xxxx A0013 <- 3.44 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0020 <- 3.76 -> DC xxx F0021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0020 <- 3.41 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0013 <- 3.75 -> DT xxx F0029 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0020 <- 4.09 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0020 <- 3.42 -> DC xxx F0032 : score x.xxxxx >3qoq_B:Ribbon-helix-helix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRANSCRIPTION FACTOR AMRZ IN COMPLEX WITH THE 18 BASE PAIR AMRZ1 BINDING SITE organism=Pseudomonas aeruginosa : H : ARG NH2 B0022 <- 2.57 -> DG N7 E0012 : score 6.67831 : H : ARG NH2 B0022 <- 2.71 -> DG O6 E0012 : score 6.7188 : x : VAL xxxx B0020 <- 3.41 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx >3qqy_A:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A NOVEL LAGLIDADG HOMING ENDONUCLEASE, I-ONUI (FROM OPHIOSTOMA NOVO-ULMI SUBSP. AMERICANA) organism=Ophiostoma novo-ulmi subsp. americana : H : ARG NH1 A0028 <- 2.90 -> DG O6 C0020 : score 5.96167 : H : ARG NH2 A0028 <- 2.84 -> DG N7 C0020 : score 6.33354 : H : ARG NH1 A0030 <- 2.78 -> DG O6 C0021 : score 6.10767 : H : ARG NH2 A0030 <- 2.88 -> DG N7 C0021 : score 6.28246 : w : ARG NH1 A0030 <- 5.69 -> DT O4 B0004 : score 1.768 : H : GLU OE1 A0042 <- 3.22 -> DC N4 B0005 : score 5.28344 : w : GLU OE1 A0042 <- 5.28 -> DT O4 B0004 : score 2.749 : w : SER OG A0072 <- 5.36 -> DT O4 B0009 : score 2.338 : w : SER OG A0078 <- 5.83 -> DC N4 B0008 : score 2.105 : H : LYS NZ A0080 <- 2.79 -> DG O6 C0018 : score 5.79233 : H : ASN ND2 A0184 <- 3.01 -> DT O4 B0019 : score 5.06266 : H : GLN OE1 A0195 <- 3.08 -> DA N6 C0005 : score 5.71362 : H : GLN NE2 A0195 <- 2.86 -> DA N7 C0005 : score 6.01667 : w : GLN NE2 A0197 <- 5.88 -> DA N6 C0007 : score 2.804 : w : TYR OH A0223 <- 6.13 -> DA N7 C0007 : score 3.238 : H : LYS NZ A0225 <- 2.89 -> DG N7 C0008 : score 5.28895 : w : LYS NZ A0225 <- 5.53 -> DA N7 C0007 : score 1.655 : H : LYS NZ A0227 <- 2.84 -> DG N7 C0009 : score 5.34281 : H : LYS NZ A0229 <- 3.09 -> DG O6 C0012 : score 5.44548 : H : LYS NZ A0229 <- 3.14 -> DT O4 B0013 : score 3.34325 : w : TRP NE1 A0234 <- 5.78 -> DA N6 B0015 : score 4.074 : w : ASP OD2 A0236 <- 5.71 -> DA N6 B0015 : score 3.409 : V : ALA CB A0076 <- 3.59 -> DT C7 C0015 : score 5.89292 : V : LYS CB A0034 <- 3.54 -> DT C7 B0002 : score 2.45551 : V : ILE CG2 A0186 <- 3.68 -> DT C7 B0020 : score 7.30402 : x : SER xxxx A0024 <- 4.44 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0032 <- 3.96 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0035 <- 4.18 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0040 <- 3.96 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0046 <- 3.54 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0048 <- 4.13 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0180 <- 3.97 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0182 <- 3.63 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0203 <- 3.20 -> DA xxx B0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0232 <- 3.96 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 4.30 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx >3qrf_G:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF A DOMAIN-SWAPPED FOXP3 DIMER organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE G0386 <- 2.83 -> DG N7 C4013 : score 4.39526 : H : ARG NH2 G0386 <- 2.88 -> DG O6 C4013 : score 6.4944 : w : ARG NH2 G0386 <- 5.98 -> DA N6 D5010 : score 1.997 : H : HIS ND1 G0387 <- 2.97 -> DT O4 C4015 : score 4.56002 : x : SER xxxx G0390 <- 3.07 -> DT xxx C4014 : score x.xxxxx >3qsv_AD:SMAD_MH1_domain; title=STRUCTURAL BASIS FOR DNA RECOGNITION BY CONSTITUTIVE SMAD4 MH1 DIMERS organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0081 <- 3.41 -> DG N7 F2004 : score 5.3119 : H : ARG NH2 A0081 <- 3.22 -> DG O6 F2004 : score 6.0456 : H : GLN OE1 A0083 <- 2.88 -> DA N6 E1008 : score 5.95572 : H : LYS NZ A0088 <- 3.02 -> DA N7 E1008 : score 2.80794 : H : LYS NZ A0088 <- 2.97 -> DG O6 E1009 : score 5.58422 : H : ARG NH1 D0081 <- 3.01 -> DG N7 E1004 : score 5.7959 : H : ARG NH2 D0081 <- 2.97 -> DG O6 E1004 : score 6.3756 : H : GLN OE1 D0083 <- 2.91 -> DA N6 F2008 : score 5.91941 : H : LYS NZ D0088 <- 2.96 -> DA N7 F2008 : score 2.84319 : H : LYS NZ D0088 <- 2.93 -> DG O6 F2009 : score 5.63047 >3qsv_BC:SMAD_MH1_domain; title=STRUCTURAL BASIS FOR DNA RECOGNITION BY CONSTITUTIVE SMAD4 MH1 DIMERS organism=Mus musculus : H : ARG NH1 B0081 <- 3.23 -> DG N7 H2004 : score 5.5297 : H : ARG NH2 B0081 <- 3.07 -> DG O6 H2004 : score 6.2436 : H : GLN OE1 B0083 <- 3.11 -> DA N6 G1008 : score 5.67731 : H : LYS NZ B0088 <- 3.08 -> DA N7 G1008 : score 2.7727 : H : LYS NZ B0088 <- 3.04 -> DG O6 G1009 : score 5.50329 : H : ARG NH1 C0081 <- 3.19 -> DG N7 G1004 : score 5.5781 : H : ARG NH2 C0081 <- 2.98 -> DG O6 G1004 : score 6.3624 : H : GLN OE1 C0083 <- 2.96 -> DA N6 H2008 : score 5.85888 : H : LYS NZ C0088 <- 2.87 -> DG O6 H2009 : score 5.69984 >3qsv_D:SMAD_MH1_domain; title=STRUCTURAL BASIS FOR DNA RECOGNITION BY CONSTITUTIVE SMAD4 MH1 DIMERS organism=Mus musculus : H : ARG NH1 D0081 <- 3.01 -> DG N7 E1004 : score 5.7959 : H : ARG NH2 D0081 <- 2.97 -> DG O6 E1004 : score 6.3756 : H : GLN OE1 D0083 <- 2.91 -> DA N6 F2008 : score 5.91941 : H : LYS NZ D0088 <- 2.96 -> DA N7 F2008 : score 2.84319 : H : LYS NZ D0088 <- 2.93 -> DG O6 F2009 : score 5.63047 >3qx3_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=HUMAN TOPOISOMERASE IIBETA IN COMPLEX WITH DNA AND ETOPOSIDE organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 B0503 <- 5.68 -> DG N3 D0013 : score 0.677 A : w : LYS NZ B0505 <- 5.63 -> DG N3 E0007 : score 2.232 : w : GLU OE1 B0522 <- 6.21 -> DG N2 D0013 : score 1.283 : w : ASP OD1 B0726 <- 5.46 -> DC O2 D0016 : score 1.919 : w : ASP OD1 B0726 <- 6.09 -> DA N3 E0006 : score 1.331 : w : ARG NH2 B0729 <- 5.92 -> DA N3 E0006 : score 2.092 : w : SER OG B0730 <- 6.45 -> DC O2 D0016 : score 1.768 : w : SER OG B0730 <- 5.91 -> DA N3 E0006 : score 0.958 : w : MET SD B0782 <- 5.90 -> DG N7 E0007 : score 4.257 : w : GLU OE1 B0870 <- 5.83 -> DC O2 E0004 : score 2.68 : w : LYS NZ B0879 <- 6.41 -> DG N3 D0018 : score 2.232 : x : ALA xxxx B0779 <- 4.04 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0872 <- 3.43 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0877 <- 4.24 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx >3qym_ACDEFH:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P63 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A 10 BASE PAIR A/T RICH RESPONSE ELEMENT HALF SITE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0311 <- 2.91 -> DG O6 I0007 : score 5.9495 : H : ARG NH2 A0311 <- 2.95 -> DG N7 I0007 : score 6.19308 : H : ARG NH1 C0311 <- 3.20 -> DG O6 K0007 : score 5.59667 : H : ARG NH2 C0311 <- 3.14 -> DG N7 K0007 : score 5.95046 : H : ARG NH1 D0311 <- 2.77 -> DG O6 L0007 : score 6.11983 : H : ARG NH2 D0311 <- 2.60 -> DG N7 L0007 : score 6.64 : H : ARG NH1 E0311 <- 3.21 -> DG O6 M0007 : score 5.5845 : H : ARG NH2 E0311 <- 2.93 -> DG N7 M0007 : score 6.21862 : H : ARG NH1 F0311 <- 2.81 -> DG O6 N0007 : score 6.07117 : H : ARG NH2 F0311 <- 2.72 -> DG N7 N0007 : score 6.48677 : H : ARG NH1 H0311 <- 3.02 -> DG O6 P0007 : score 5.81567 : H : ARG NH2 H0311 <- 3.03 -> DG N7 P0007 : score 6.09092 : x : ALA xxxx A0307 <- 3.96 -> DT xxx I0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0308 <- 3.76 -> DT xxx I0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0307 <- 3.89 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0308 <- 3.85 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0307 <- 3.91 -> DT xxx L0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0308 <- 3.94 -> DT xxx L0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0307 <- 4.09 -> DT xxx M0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx E0308 <- 4.24 -> DT xxx M0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0307 <- 4.00 -> DT xxx N0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx F0308 <- 3.40 -> DT xxx N0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0307 <- 3.95 -> DG xxx P0007 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx H0308 <- 3.83 -> DT xxx P0008 : score x.xxxxx >3qym_C:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P63 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A 10 BASE PAIR A/T RICH RESPONSE ELEMENT HALF SITE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 C0311 <- 3.20 -> DG O6 K0007 : score 5.59667 : H : ARG NH2 C0311 <- 3.14 -> DG N7 K0007 : score 5.95046 : V : ALA CB C0307 <- 3.89 -> DT C7 K0008 : score 5.473 : x : CYS xxxx C0308 <- 3.85 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx >3qyn_ABCD:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P63 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A 22 BASE PAIR A/T RICH RESPONSE ELEMENT CONTAINING 2 BASE PAIR SPACER BETWEEN HALF SITES organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0311 <- 3.17 -> DG O6 E0019 : score 5.63317 : H : ARG NH2 A0311 <- 3.18 -> DG N7 E0019 : score 5.89938 : H : ARG NH1 B0311 <- 3.26 -> DG O6 F0007 : score 5.52367 : H : ARG NH2 B0311 <- 3.30 -> DG N7 F0007 : score 5.74615 : H : ARG NH1 C0311 <- 3.12 -> DG N7 F0019 : score 5.6628 : H : ARG NH1 C0311 <- 2.82 -> DG O6 F0019 : score 6.059 : H : ARG NH2 C0311 <- 3.00 -> DG N7 F0019 : score 6.12923 : w : CYS SG D0308 <- 7.10 -> DA N6 F0014 : score 4.476 : H : ARG NH1 D0311 <- 3.08 -> DG O6 E0007 : score 5.74267 : H : ARG NH2 D0311 <- 2.98 -> DG N7 E0007 : score 6.15477 : x : ALA xxxx A0307 <- 3.80 -> DT xxx E0020 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0308 <- 3.78 -> DT xxx E0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0307 <- 3.85 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0308 <- 4.32 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0307 <- 3.81 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0308 <- 3.70 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0307 <- 3.82 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx >3qyn_C:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P63 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A 22 BASE PAIR A/T RICH RESPONSE ELEMENT CONTAINING 2 BASE PAIR SPACER BETWEEN HALF SITES organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 C0311 <- 3.12 -> DG N7 F0019 : score 5.6628 : H : ARG NH1 C0311 <- 2.82 -> DG O6 F0019 : score 6.059 : H : ARG NH2 C0311 <- 3.00 -> DG N7 F0019 : score 6.12923 : x : ALA xxxx C0307 <- 3.81 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0308 <- 3.70 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx >3qz7_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=T-3 TERNARY COMPLEX OF DPO4 organism=Sulfolobus solfataricus : x : GLN xxxx A0082 <- 3.76 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0086 <- 3.81 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0242 <- 3.12 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx >3qz8_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TT-4 TERNARY COMPLEX OF DPO4 organism=Sulfolobus solfataricus : V : ILE CG2 A0101 <- 3.58 -> DT C7 T0009 : score 7.4813 : x : GLN xxxx A0082 <- 3.10 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0104 <- 3.40 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.95 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx >3r7p_A:Homing_endonucleases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-LTRI organism=Leptographium truncatum : H : ARG NH1 A0042 <- 3.07 -> DA N7 D0004 : score 2.422 : H : ARG NH1 A0049 <- 2.54 -> DG O6 D0006 : score 6.39967 : H : ARG NH2 A0049 <- 2.89 -> DG N7 D0006 : score 6.26969 : H : ARG NH1 A0051 <- 2.73 -> DG O6 C0021 : score 6.1685 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.77 -> DG O6 C0021 : score 6.6396 : H : ARG NH2 A0053 <- 2.83 -> DG N7 C0018 : score 6.34631 : H : ARG NH2 A0053 <- 2.72 -> DG N7 C0019 : score 6.48677 : H : ARG NH1 A0083 <- 3.00 -> DG O6 C0019 : score 5.84 : H : ARG NH2 A0083 <- 2.35 -> DG O6 C0018 : score 7.194 : H : GLU OE1 A0087 <- 3.09 -> DC N4 D0007 : score 5.43341 : H : TYR OH A0188 <- 2.89 -> DC N4 E0018 : score 4.13825 : H : ARG NH1 A0190 <- 3.18 -> DA N7 B0007 : score 2.36568 : H : GLN OE1 A0204 <- 3.36 -> DA N6 B0007 : score 5.37468 : H : GLN NE2 A0204 <- 3.11 -> DA N7 B0007 : score 5.71218 : H : GLN NE2 A0208 <- 3.09 -> DA N7 E0017 : score 5.73654 : H : ARG NH2 A0232 <- 2.76 -> DG N7 B0010 : score 6.43569 : H : ARG NH2 A0232 <- 2.64 -> DG O6 B0010 : score 6.8112 : H : ARG NH1 A0234 <- 2.43 -> DG O6 E0016 : score 6.5335 : H : ARG NH2 A0234 <- 2.86 -> DG N7 E0016 : score 6.308 : V : THR CB A0196 <- 3.74 -> DT C7 B0003 : score 3.57905 : V : LEU CD1 A0197 <- 3.87 -> DT C7 B0005 : score 5.63098 : V : ASP CB A0081 <- 3.87 -> DT C7 B0016 : score 2.63612 : V : ALA CB A0192 <- 3.75 -> DT C7 E0020 : score 5.66896 : x : SER xxxx A0031 <- 4.26 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0033 <- 3.88 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0035 <- 3.71 -> DA xxx C0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0037 <- 3.77 -> DG xxx C0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0085 <- 3.66 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0186 <- 4.38 -> DA xxx E0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0194 <- 4.31 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0202 <- 2.98 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0210 <- 3.91 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0246 <- 3.73 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0252 <- 3.90 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx >3r8f_ABCD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;TrpR-like; title=REPLICATION INITIATOR DNAA BOUND TO AMPPCP AND SINGLE-STRANDED DNA organism=Aquifex aeolicus : x : VAL xxxx A0156 <- 4.18 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0156 <- 4.03 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0156 <- 3.58 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0160 <- 4.07 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0156 <- 3.86 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0160 <- 4.35 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx >3r8f_C:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;TrpR-like; title=REPLICATION INITIATOR DNAA BOUND TO AMPPCP AND SINGLE-STRANDED DNA organism=Aquifex aeolicus : x : VAL xxxx C0156 <- 3.58 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0160 <- 4.07 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx >3rad_AC:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE(CLINAFLOXACIN)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IV TOPOISOMERASE FROM S. PNEUMONIAE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : w : TYR OH A0020 <- 5.40 -> DT O2 F0007 : score 3.068 : x : SER xxxx A0079 <- 4.47 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0080 <- 3.53 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0170 <- 3.20 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0175 <- 4.46 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0458 <- 3.49 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx >3rad_BD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE(CLINAFLOXACIN)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IV TOPOISOMERASE FROM S. PNEUMONIAE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : TYR xxxx B0020 <- 4.50 -> DG xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0028 <- 4.35 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0080 <- 3.68 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0170 <- 3.36 -> DT xxx G0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0458 <- 3.60 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx >3rad_C:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE(CLINAFLOXACIN)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IV TOPOISOMERASE FROM S. PNEUMONIAE organism=? : x : LYS xxxx C0458 <- 3.49 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx >3rae_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE(LEVOFLOXACIN)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IV TOPOISOMERASE FROM S. PNEUMONIAE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : w : TYR OH A0020 <- 5.01 -> DT O2 F0007 : score 3.068 : x : SER xxxx A0079 <- 4.25 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0080 <- 3.38 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0117 <- 2.99 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0170 <- 3.31 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0028 <- 4.29 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0080 <- 3.49 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0117 <- 3.14 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0170 <- 3.23 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0458 <- 3.80 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0458 <- 3.18 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx >3rae_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE(LEVOFLOXACIN)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IV TOPOISOMERASE FROM S. PNEUMONIAE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : ARG xxxx B0028 <- 4.29 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0080 <- 3.49 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0117 <- 3.14 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0170 <- 3.23 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx >3raf_AC:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINAZOLINEDIONE-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IV TOPOISOMERASE FROM S. PNEUMONIAE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : w : TYR OH A0020 <- 5.33 -> DT O2 F0007 : score 3.068 : x : ARG xxxx A0028 <- 4.27 -> DA xxx E0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0079 <- 4.04 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0080 <- 3.76 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0170 <- 3.37 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0458 <- 3.58 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx >3raf_BD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINAZOLINEDIONE-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IV TOPOISOMERASE FROM S. PNEUMONIAE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : ARG xxxx B0028 <- 4.49 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0079 <- 4.33 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0080 <- 3.45 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0117 <- 3.37 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0170 <- 3.07 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0458 <- 3.53 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx >3raf_D:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINAZOLINEDIONE-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IV TOPOISOMERASE FROM S. PNEUMONIAE organism=? : x : LYS xxxx D0458 <- 3.53 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx >3raq_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 EXTENSION TERNARY COMPLEX WITH 3'-TERMINAL PRIMER C BASE OPPOSITE THE 1-METHYLGUANINE (MG1) LESION organism=Sulfolobus solfataricus : x : HIS xxxx B1285 <- 3.86 -> DT xxx H1808 : score x.xxxxx >3rax_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 EXTENSION TERNARY COMPLEX WITH 3'-TERMINAL PRIMER T BASE OPPOSITE THE 1-METHYLGUANINE (M1G) LESION organism=Sulfolobus solfataricus : x : HIS xxxx B1285 <- 3.65 -> DT xxx H1808 : score x.xxxxx >3rb0_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 EXTENSION TERNARY COMPLEX WITH 3'-TERMINAL PRIMER G BASE OPPOSITE THE 1-METHYLGUANINE (M1G) LESION organism=Sulfolobus solfataricus : x : HIS xxxx A0285 <- 3.58 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0297 <- 4.30 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx >3rb3_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 EXTENSION TERNARY COMPLEX WITH 3'-TERMINAL PRIMER A BASE OPPOSITE THE 1-METHYLGUANINE (M1G) LESION organism=Sulfolobus solfataricus : x : HIS xxxx A0285 <- 3.78 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.17 -> DT xxx D0808 : score x.xxxxx >3rb4_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 EXTENSION TERNARY COMPLEX WITH 3'-TERMINAL PRIMER G BASE OPPOSITE THE 3-METHYLCYTOSINE (M3C) LESION organism=Sulfolobus solfataricus : x : HIS xxxx B1285 <- 4.37 -> DT xxx H1808 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1336 <- 3.85 -> DT xxx J1908 : score x.xxxxx >3rb6_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 EXTENSION TERNARY COMPLEX WITH 3'-TERMINAL PRIMER A BASE OPPOSITE THE 3-METHYLCYTOSINE (M3C) LESION organism=Sulfolobus solfataricus : x : HIS xxxx B1285 <- 4.14 -> DT xxx H1808 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1336 <- 3.51 -> DT xxx J1908 : score x.xxxxx >3rbd_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 EXTENSION TERNARY COMPLEX WITH 3'-TERMINAL PRIMER C BASE OPPOSITE THE 3-METHYLCYTOSINE (M3C) LESION organism=Sulfolobus solfataricus : x : HIS xxxx B1285 <- 3.87 -> DT xxx H1808 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1336 <- 3.46 -> DT xxx J1908 : score x.xxxxx >3rbe_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 EXTENSION TERNARY COMPLEX WITH 3'-TERMINAL PRIMER T BASE OPPOSITE THE 3-METHYLCYTOSINE (M3C) LESION organism=Sulfolobus solfataricus : x : ARG xxxx B1336 <- 3.47 -> DT xxx J1908 : score x.xxxxx >3reh_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=2.5 ANGSTROM CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE ASSEMBLED WITH A 145 BP ALPHA-SATELLITE DNA (NCP145) organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.69 -> DA N3 J0009 : score 3.31102 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.14 -> DA N3 I0009 : score 3.43167 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.15 -> DA N3 I0009 : score 3.01296 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.82 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.33 -> DA xxx J0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.19 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.11 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.72 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.88 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.72 -> DG xxx I0047 : score x.xxxxx >3rei_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=2.65 ANGSTROM CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE ASSEMBLED WITH A 145 BP ALPHA-SATELLITE DNA (NCP145) DERIVATIZED WITH TRIAMMINECHLOROPLATINUM(II) CHLORIDE organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.71 -> DA N3 J0009 : score 3.29806 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.26 -> DA N3 I0009 : score 3.3433 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.08 -> DA N3 I0009 : score 3.05832 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.81 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.26 -> DC xxx I-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.14 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.16 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.72 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.90 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.22 -> DT xxx J-035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.48 -> DG xxx I0047 : score x.xxxxx >3rei_B:Histone-fold; title=2.65 ANGSTROM CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE ASSEMBLED WITH A 145 BP ALPHA-SATELLITE DNA (NCP145) DERIVATIZED WITH TRIAMMINECHLOROPLATINUM(II) CHLORIDE organism=? : x : ARG xxxx B0045 <- 4.14 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx >3rej_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=2.55 ANGSTROM CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE ASSEMBLED WITH A 146 BP ALPHA-SATELLITE DNA (NCP146B) organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.03 -> DA N3 J0009 : score 3.09072 : H : ARG NH1 D0026 <- 2.91 -> DT O2 J-029 : score 4.21167 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.86 -> DA N3 I0009 : score 3.20087 : w : ARG NH2 G0077 <- 5.55 -> DG N2 J-056 : score 1.593 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.17 -> DC xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.88 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.14 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.37 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 4.45 -> DT xxx J0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.38 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.40 -> DC xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.83 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.18 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.41 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.19 -> DC xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.50 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx >3rej_G:Histone-fold; title=2.55 ANGSTROM CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE ASSEMBLED WITH A 146 BP ALPHA-SATELLITE DNA (NCP146B) organism=? : w : ARG NH2 G0077 <- 5.55 -> DG N2 J-056 : score 1.593 : x : ARG xxxx G0042 <- 4.19 -> DC xxx I0038 : score x.xxxxx >3rek_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=2.6 ANGSTROM CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE ASSEMBLED WITH A 146 BP ALPHA-SATELLITE DNA (NCP146B) DERIVATIZED WITH OXALIPLATIN organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.05 -> DA N3 J0009 : score 3.07776 : H : ARG NH1 D0026 <- 3.24 -> DT O2 J-029 : score 3.92745 : H : ARG NH2 D0026 <- 3.05 -> DT O2 J-029 : score 4.02167 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.89 -> DA N3 I0009 : score 3.18143 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.05 -> DC xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.77 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.01 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.41 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 4.29 -> DT xxx J0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.39 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.29 -> DC xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.07 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.04 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.28 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.02 -> DC xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.66 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx >3rek_C:Histone-fold; title=2.6 ANGSTROM CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE ASSEMBLED WITH A 146 BP ALPHA-SATELLITE DNA (NCP146B) DERIVATIZED WITH OXALIPLATIN organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx C0035 <- 4.29 -> DT xxx J0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.39 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx >3rel_A:Histone-fold; title=2.7 ANGSTROM CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE ASSEMBLED WITH A 146 BP ALPHA-SATELLITE DNA (NCP146B) DERIVATIZED WITH TRIAMMINECHLOROPLATINUM(II) CHLORIDE organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 3.10 -> DA N3 J0009 : score 3.04536 : x : TYR xxxx A0041 <- 3.94 -> DC xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.73 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.81 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx >3rel_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=2.7 ANGSTROM CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE ASSEMBLED WITH A 146 BP ALPHA-SATELLITE DNA (NCP146B) DERIVATIZED WITH TRIAMMINECHLOROPLATINUM(II) CHLORIDE organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.10 -> DA N3 J0009 : score 3.04536 : H : ARG NH1 D0026 <- 3.11 -> DT O2 J-029 : score 4.03941 : H : ARG NH2 D0026 <- 3.18 -> DT O2 J-029 : score 3.9116 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.82 -> DA N3 I0009 : score 3.22678 : x : TYR xxxx A0041 <- 3.94 -> DC xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.73 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.81 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.25 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 4.08 -> DT xxx J0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.48 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.12 -> DC xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.87 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.08 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.83 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.77 -> DC xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.54 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx >3rh4_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY-TERMINATED PRIMER WITH AN INCOMING RIBONUCLEOTIDE (RCTP) organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.19 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.08 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.48 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3rh5_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA MUTANT (Y271) WITH A DIDEOXY-TERMINATED PRIMER WITH AN INCOMING DEOXYNUCLEOTIDE (DCTP) organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.49 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.11 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.50 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3rh6_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA MUTANT (Y271) WITH A DIDEOXY-TERMINATED PRIMER WITH AN INCOMING RIBONUCLEOTIDE (RCTP) organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.32 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.85 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.81 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3ri4_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ETS1 COOPERATIVE BINDING TO WIDELY SEPARATED SITES ON PROMOTER DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NE D0391 <- 2.83 -> DG O6 F0306 : score 3.91738 : H : ARG NH2 D0391 <- 3.45 -> DG N7 F0306 : score 5.55462 : H : ARG NE D0394 <- 2.95 -> DG N7 F0305 : score 4.28914 : x : LYS xxxx D0388 <- 3.94 -> DT xxx E0211 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0395 <- 3.25 -> DA xxx E0210 : score x.xxxxx >3rje_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A GAPPED DNA CONTAINING 8ODG AT TEMPLATE POSITION organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.31 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.79 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.48 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3rjf_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A GAPPED DNA CONTAINING (SYN)8ODG AT TEMPLATE POSITION PAIRED WITH NON-HYDROLYZABLE DATP ANALOG (DAPCPP) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 2.91 -> DG N3 T0009 : score 1.42186 : w : LYS NZ A0234 <- 5.32 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : TYR OH A0271 <- 2.92 -> DA N3 P0010 : score 4.05165 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.64 -> DT O2 T0007 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0283 <- 5.79 -> DT O2 T0007 : score 2.261 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.73 -> DT O2 T0007 : score 2.462 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.65 -> DC O2 T0008 : score 1.988 >3rjg_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=BINARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A GAPPED DNA CONTAINING 8ODG:DA BASE-PAIR AT PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.31 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.81 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.64 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3rjh_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A GAPPED DNA CONTAINING (SYN)8ODG:DA AT PRIMER TERMINUS AND DG:DCMP(CF2)PPIN THE ACTIVE SITE organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0037 <- 6.41 -> DG N7 T0006 : score 3.259 : H : LYS NZ A0234 <- 2.86 -> DG N3 T0009 : score 1.4364 : w : LYS NZ A0234 <- 5.41 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : ARG NH1 A0258 <- 6.27 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : H : TYR OH A0271 <- 2.78 -> DA N3 P0010 : score 4.16789 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.79 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : ASN xxxx A0279 <- 3.94 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.20 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0283 <- 3.14 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >3rji_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A GAPPED DNA CONTAINING 8ODG AT TEMPLATE POSITION PAIRED WITH NON-HYDROLYZABLE DCTP ANALOG (DCMP(CF2)PP) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 2.79 -> DG N3 T0009 : score 1.45675 : w : LYS NZ A0234 <- 5.31 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0234 <- 6.20 -> DG N2 P0009 : score 0.846 : H : TYR OH A0271 <- 2.99 -> DA N3 P0010 : score 3.99353 : w : ARG NH1 A0283 <- 6.33 -> DT O2 T0007 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.34 -> DT O2 T0007 : score 2.261 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.93 -> DT O2 T0007 : score 2.462 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.73 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : MET xxxx A0236 <- 4.45 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx >3rjj_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH TEMPLATE 8ODG PROVIDES INSIGHT INTO MUTAGENIC LESION BYPASS organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.82 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.58 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3rjk_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A GAPPED DNA CONTAINING 8ODG:DC BASE PAIR AT PRIMER TERMINUS AND DG:DCMP(CF2)PP IN THE ACTIVE SITE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.20 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.01 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.59 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3rkq_AB:Homeodomain-like; title=NKX2.5 HOMEODOMAIN DIMER BOUND TO ANF-242 DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0142 <- 3.07 -> DG N3 C0002 : score 2.88773 : H : ARG NH2 A0142 <- 2.93 -> DT O2 C0001 : score 4.12327 : w : GLN NE2 A0187 <- 5.72 -> DG O6 C0005 : score 2.87 : H : ASN OD1 A0188 <- 3.10 -> DA N6 C0004 : score 5.66049 : H : ASN ND2 A0188 <- 2.97 -> DA N7 C0004 : score 5.67092 : w : ASN OD1 A0188 <- 5.42 -> DG O6 C0005 : score 3.125 : w : ASN OD1 A0188 <- 5.56 -> DC N4 D0015 : score 2.732 : w : LYS NZ A0192 <- 5.92 -> DA N7 C0003 : score 1.655 : H : ARG NH1 B0142 <- 2.99 -> DC O2 D0002 : score 3.5113 : H : ARG NH2 B0142 <- 3.04 -> DT O2 D0001 : score 4.03013 : w : GLN NE2 B0187 <- 5.56 -> DG O6 D0005 : score 2.87 : w : GLN NE2 B0187 <- 5.80 -> DA N6 D0006 : score 2.804 : H : ASN OD1 B0188 <- 3.06 -> DA N6 D0004 : score 5.70866 : H : ASN ND2 B0188 <- 3.12 -> DA N7 D0004 : score 5.4948 : w : ASN OD1 B0188 <- 5.28 -> DC N4 C0015 : score 2.732 : w : ASN OD1 B0188 <- 5.76 -> DG O6 D0005 : score 3.125 : x : ILE xxxx A0184 <- 3.69 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0191 <- 3.51 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0184 <- 3.64 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0191 <- 3.40 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx >3rkq_B:Homeodomain-like; title=NKX2.5 HOMEODOMAIN DIMER BOUND TO ANF-242 DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0142 <- 2.99 -> DC O2 D0002 : score 3.5113 : H : ARG NH2 B0142 <- 3.04 -> DT O2 D0001 : score 4.03013 : w : GLN NE2 B0187 <- 6.23 -> DT O4 C0014 : score 2.257 : w : GLN NE2 B0187 <- 5.80 -> DA N6 D0006 : score 2.804 : H : ASN OD1 B0188 <- 3.06 -> DA N6 D0004 : score 5.70866 : H : ASN ND2 B0188 <- 3.12 -> DA N7 D0004 : score 5.4948 : w : ASN OD1 B0188 <- 5.28 -> DC N4 C0015 : score 2.732 : w : ASN OD1 B0188 <- 6.43 -> DT O4 C0014 : score 3.132 : x : ILE xxxx B0184 <- 3.64 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0191 <- 3.40 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx >3rma_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A REPLICATIVE DNA POLYMERASE BOUND TO DNA CONTAINING THYMINE GLYCOL organism=Enterobacteria phage RB69 : x : LYS xxxx D0800 <- 3.91 -> DA xxx K0012 : score x.xxxxx >3rmb_B:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A REPLICATIVE DNA POLYMERASE BOUND TO DNA CONTAINING THYMINE GLYCOL organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ B0706 <- 3.08 -> DA N3 G0006 : score 2.62142 >3rmc_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A REPLICATIVE DNA POLYMERASE BOUND TO DNA CONTAINING THYMINE GLYCOL organism=Enterobacteria phage RB69 : x : ASP xxxx A0621 <- 3.92 -> DC xxx F0113 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0622 <- 4.17 -> DA xxx F0114 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0706 <- 2.56 -> DC xxx F0113 : score x.xxxxx >3rmd_C:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A REPLICATIVE DNA POLYMERASE BOUND TO DNA CONTAINING THYMINE GLYCOL organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ C0279 <- 2.91 -> DG O6 I0002 : score 5.65359 : H : LYS NZ C0800 <- 2.92 -> DT O2 J0108 : score 3.50109 : x : PRO xxxx C0361 <- 3.87 -> DG xxx I0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0565 <- 3.84 -> DG xxx I0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0567 <- 3.45 -> DT xxx I0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0706 <- 3.32 -> DG xxx I0005 : score x.xxxxx >3rmp_A: title=STRUCTURAL BASIS FOR THE RECOGNITION OF ATTP SUBSTRATES BY P4-LIKE INTEGRASES organism=Yersinia pestis : H : LYS NZ A0019 <- 2.87 -> DG N7 H0008 : score 5.31049 : H : LYS NZ A0019 <- 2.88 -> DG O6 H0009 : score 5.68828 : H : LYS NZ A0041 <- 3.11 -> DG N7 H0006 : score 5.05197 : H : LYS NZ A0041 <- 2.77 -> DG O6 H0006 : score 5.81545 : H : ARG NH1 A0043 <- 2.99 -> DG N7 H0005 : score 5.8201 : H : GLU OE1 A0048 <- 3.19 -> DC N4 G0008 : score 5.31805 : w : GLU OE2 A0048 <- 5.73 -> DC N4 G0007 : score 3.597 : H : ARG NE A0050 <- 3.17 -> DG N7 G0005 : score 4.09458 : H : ARG NH2 A0050 <- 2.94 -> DG O6 G0005 : score 6.4152 : x : LYS xxxx A0031 <- 3.94 -> DA xxx G0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0039 <- 3.41 -> DT xxx G0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0049 <- 3.35 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx >3rn2_AB:HIN-2000_domain-like; title=STRUCTURAL BASIS OF CYTOSOLIC DNA RECOGNITION BY INNATE IMMUNE RECEPTORS organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx B0163 <- 3.55 -> DT xxx L0011 : score x.xxxxx >3rn2_B:HIN-2000_domain-like; title=STRUCTURAL BASIS OF CYTOSOLIC DNA RECOGNITION BY INNATE IMMUNE RECEPTORS organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx B0163 <- 3.55 -> DT xxx L0011 : score x.xxxxx >3rn5_C:HIN-2000_domain-like; title=STRUCTURAL BASIS OF CYTOSOLIC DNA RECOGNITION BY INNATE IMMUNE RECEPTORS organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx C0163 <- 3.32 -> DC xxx N0010 : score x.xxxxx >3rnu_ABCD:HIN-2000_domain-like; title=STRUCTURAL BASIS OF CYTOSOLIC DNA SENSING BY INNATE IMMUNE RECEPTORS organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0667 <- 4.04 -> DC xxx L0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0667 <- 3.05 -> DA xxx K0007 : score x.xxxxx >3rnu_B:HIN-2000_domain-like; title=STRUCTURAL BASIS OF CYTOSOLIC DNA SENSING BY INNATE IMMUNE RECEPTORS organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx B0667 <- 3.05 -> DA xxx K0007 : score x.xxxxx >3rr7_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BINARY STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF TAQ DNA POLYMERASE BOUND TO AN ABASIC SITE organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.80 -> DC O2 B0109 : score 2.94615 : w : LYS NZ A0540 <- 5.38 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 6.10 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.59 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.68 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 6.01 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.68 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0583 <- 2.99 -> DG N3 B0110 : score 4.70887 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.85 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN OD1 A0750 <- 6.44 -> DG N3 C0205 : score 3.377 : w : GLN NE2 A0754 <- 6.13 -> DG N3 C0205 : score 1.484 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.55 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0671 <- 4.09 -> DG xxx C0205 : score x.xxxxx >3rr8_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF TAQ DNA POLYMERASE BOUND TO AN ABASIC SITE AND A DDGTP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.87 -> DC O2 B0109 : score 2.90491 : w : LYS NZ A0540 <- 5.48 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 5.60 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.79 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.85 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.21 -> DG N3 B0110 : score 4.49349 : w : GLU OE1 A0615 <- 6.15 -> DC O2 C0205 : score 2.68 : w : ASN ND2 A0750 <- 6.01 -> DC O2 C0205 : score 1.885 : w : GLN NE2 A0754 <- 5.84 -> DC O2 C0205 : score 2.699 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.36 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : ARG xxxx A0587 <- 3.93 -> DC xxx B0111 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0671 <- 3.38 -> DC xxx C0205 : score x.xxxxx >3rrg_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF TAQ DNA POLYMERASE BOUND TO AN ABASIC SITE AND A DDGTP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.77 -> DC O2 B0109 : score 2.96383 : w : LYS NZ A0540 <- 5.45 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 5.53 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.87 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.83 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.58 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.06 -> DG N3 B0110 : score 4.64034 : w : GLU OE2 A0615 <- 6.13 -> DC O2 C0205 : score 1.988 : w : ASN ND2 A0750 <- 6.12 -> DC O2 C0205 : score 1.885 : w : GLN NE2 A0754 <- 6.01 -> DC O2 C0205 : score 2.699 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.46 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0545 <- 4.49 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0587 <- 4.02 -> DC xxx B0111 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0671 <- 3.33 -> DC xxx C0205 : score x.xxxxx >3rrh_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF TAQ DNA POLYMERASE BOUND TO AN ABASIC SITE AND A DDTTP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.89 -> DC O2 B0109 : score 2.89312 : w : LYS NZ A0540 <- 5.65 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.97 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.63 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : TYR OH A0545 <- 6.32 -> DG N2 C0208 : score 2.834 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.76 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.69 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.82 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.01 -> DG N3 B0110 : score 4.68929 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.52 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0583 <- 6.82 -> DC O2 C0209 : score 1.885 : w : GLU OE1 A0615 <- 6.28 -> DA N3 C0205 : score 0.995 : w : ASN ND2 A0750 <- 6.40 -> DA N3 C0205 : score 2.277 : w : GLN NE2 A0754 <- 6.25 -> DA N3 C0205 : score 1.888 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.59 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0671 <- 3.24 -> DA xxx C0205 : score x.xxxxx >3rtv_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH NATURAL PRIMER/TEMPLATE DNA organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.80 -> DC O2 B0109 : score 2.94615 : w : LYS NZ A0540 <- 5.91 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.81 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.63 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.67 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.74 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.81 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.01 -> DG N3 B0110 : score 4.68929 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.73 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : GLN xxxx A0754 <- 4.46 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >3rwu_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DATP OPPOSITE DIFLUOROTOLUENE NUCLEOSIDE organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.27 -> DA N3 P0114 : score 2.51589 >3rzd_AB: title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH A 5-NT RNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : V : ALA CB A0832 <- 3.82 -> DT C7 T0019 : score 5.57098 : x : PRO xxxx A0448 <- 4.08 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 4.23 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.46 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx >3rzg_A:Clavaminate_synthase-like; title=DUPLEX INTERROGATION BY A DIRECT DNA REPAIR PROTEIN IN THE SEARCH OF DAMAGE organism=Homo sapiens : x : VAL xxxx A0101 <- 3.55 -> DA xxx B0266 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0102 <- 3.21 -> DT xxx C0278 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0169 <- 3.50 -> DA xxx B0266 : score x.xxxxx >3rzh_A:Clavaminate_synthase-like; title=DUPLEX INTERROGATION BY A DIRECT DNA REPAIR PROTEIN IN THE SEARCH OF DAMAGE organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0106 <- 5.73 -> DA N3 B0266 : score 2.619 : x : VAL xxxx A0101 <- 3.83 -> DA xxx B0266 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0102 <- 3.21 -> DT xxx C0278 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0169 <- 3.50 -> DA xxx B0266 : score x.xxxxx >3rzj_A:Clavaminate_synthase-like; title=DUPLEX INTERROGATION BY A DIRECT DNA REPAIR PROTEIN IN THE SEARCH OF DAMAGE organism=Homo sapiens : x : VAL xxxx A0101 <- 3.78 -> DA xxx B0266 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0102 <- 3.18 -> DT xxx C0278 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0169 <- 3.57 -> DA xxx B0266 : score x.xxxxx >3rzk_A:Clavaminate_synthase-like; title=DUPLEX INTERROGATION BY A DIRECT DNA REPAIR PROTEIN IN THE SEARCH OF DAMAGE organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0098 <- 4.31 -> DA xxx C0280 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0101 <- 3.64 -> DA xxx B0266 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0102 <- 3.09 -> DT xxx C0278 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0104 <- 4.04 -> DA xxx C0280 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0105 <- 3.62 -> DA xxx C0280 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0169 <- 3.75 -> DA xxx B0266 : score x.xxxxx >3rzl_D:Clavaminate_synthase-like; title=DUPLEX INTERROGATION BY A DIRECT DNA REPAIR PROTEIN IN THE SEARCH OF DAMAGE organism=Homo sapiens : H : TYR OH D0122 <- 3.23 -> DC N4 E0265 : score 3.85169 : H : GLU OE2 D0175 <- 3.12 -> DC N4 E0265 : score 4.9284 : x : VAL xxxx D0101 <- 3.86 -> DA xxx E0266 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0102 <- 3.15 -> DT xxx F0278 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0110 <- 3.77 -> DC xxx E0265 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0124 <- 3.17 -> DC xxx E0265 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0125 <- 3.45 -> DC xxx E0265 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0168 <- 3.22 -> DC xxx E0265 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0169 <- 3.84 -> DA xxx E0266 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0171 <- 3.40 -> DC xxx E0265 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0173 <- 3.72 -> DC xxx E0265 : score x.xxxxx >3rzm_A:Clavaminate_synthase-like; title=DUPLEX INTERROGATION BY A DIRECT DNA REPAIR PROTEIN IN THE SEARCH OF DAMAGE organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0122 <- 2.78 -> DA N6 B0267 : score 4.68919 : x : VAL xxxx A0101 <- 3.56 -> DA xxx B0268 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0102 <- 3.29 -> DT xxx C0280 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0104 <- 4.37 -> DT xxx C0280 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0124 <- 3.07 -> DA xxx B0267 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0125 <- 3.03 -> DA xxx B0267 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0157 <- 4.06 -> DA xxx B0267 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0168 <- 3.74 -> DA xxx B0267 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0169 <- 3.77 -> DA xxx B0268 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0171 <- 3.22 -> DA xxx B0267 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0173 <- 4.46 -> DA xxx B0267 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0175 <- 3.89 -> DA xxx B0267 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0236 <- 4.17 -> DA xxx B0267 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0254 <- 3.24 -> DA xxx B0267 : score x.xxxxx >3rzo_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH A 4-NT RNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C : H : ARG NH2 A1386 <- 2.96 -> DG N3 T0017 : score 3.49473 : x : THR xxxx A0831 <- 4.27 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx >3rzo_AB: title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH A 4-NT RNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C : H : ARG NH2 A1386 <- 2.96 -> DG N3 T0017 : score 3.49473 : H : GLU OE2 B1120 <- 3.40 -> DC N4 T0023 : score 4.63354 : x : THR xxxx A0831 <- 4.27 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx >3s14_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH A 6-NT RNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C : V : ALA CB A0832 <- 3.90 -> DT C7 T0019 : score 5.459 : x : GLN xxxx A0447 <- 4.27 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.88 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 4.38 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.28 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1387 <- 4.49 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx >3s14_AB: title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH A 6-NT RNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C : V : ALA CB A0832 <- 3.90 -> DT C7 T0019 : score 5.459 : x : GLN xxxx A0447 <- 4.27 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.88 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 4.38 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.28 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1387 <- 4.49 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx >3s15_AB: title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH A 7-NT RNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 A1386 <- 3.03 -> DG N3 T0017 : score 3.44418 : x : GLN xxxx A0447 <- 4.22 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.84 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 4.01 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 4.03 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0836 <- 3.91 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx >3s16_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH AN 8-NT RNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : GLN xxxx A0447 <- 4.19 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.84 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 4.31 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0836 <- 4.13 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1102 <- 3.64 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.85 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx >3s16_AB: title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH AN 8-NT RNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : GLN xxxx A0447 <- 4.19 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.84 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 4.31 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0836 <- 4.13 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1102 <- 3.64 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.85 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx >3s17_AB: title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH A 9-NT RNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : V : ALA CB A0832 <- 3.87 -> DT C7 T0019 : score 5.50099 : x : ARG xxxx A0350 <- 4.41 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0447 <- 4.06 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 4.10 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0836 <- 4.49 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1385 <- 4.47 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.29 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1387 <- 3.62 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx >3s1m_AB: title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH A 5-NT RNA (VARIANT 1) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : THR xxxx A0831 <- 4.19 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0836 <- 4.15 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.72 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx >3s1n_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH A 5-NT RNA (VARIANT 2) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : THR xxxx A0831 <- 4.15 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 4.37 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0836 <- 3.82 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1385 <- 4.25 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.51 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx >3s1n_AB: title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH A 5-NT RNA (VARIANT 2) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : THR xxxx A0831 <- 4.15 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 4.37 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0836 <- 3.82 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1385 <- 4.25 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.51 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx >3s1q_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH A 5-NT 3'-DEOXY RNA SOAKED WITH ATP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 A1386 <- 3.19 -> DC O2 T0016 : score 3.3653 : H : ARG NH2 A1386 <- 3.16 -> DC O2 T0016 : score 3.43241 : V : ALA CB A0832 <- 3.76 -> DT C7 T0019 : score 5.65496 : x : GLN xxxx A0447 <- 4.32 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 4.07 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 3.56 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx >3s1q_AB: title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH A 5-NT 3'-DEOXY RNA SOAKED WITH ATP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 A1386 <- 3.19 -> DC O2 T0016 : score 3.3653 : H : ARG NH2 A1386 <- 3.16 -> DC O2 T0016 : score 3.43241 : V : ALA CB A0832 <- 3.76 -> DT C7 T0019 : score 5.65496 : x : GLN xxxx A0447 <- 4.32 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 4.07 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 3.56 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0942 <- 4.03 -> DG xxx T0026 : score x.xxxxx >3s1r_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH A 5-NT 3'-DEOXY RNA SOAKED WITH GTP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ALA xxxx A0832 <- 4.15 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.42 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx >3s1r_AB: title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH A 5-NT 3'-DEOXY RNA SOAKED WITH GTP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ALA xxxx A0832 <- 4.15 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.42 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1120 <- 4.24 -> DC xxx T0023 : score x.xxxxx >3s2d_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH A 5-NT RNA CONTAINING A 5BR- U organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C : H : ARG NH2 A1386 <- 3.15 -> DG N3 T0017 : score 3.35754 : x : GLN xxxx A0447 <- 4.09 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.65 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 4.22 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 3.96 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1387 <- 4.25 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx >3s2d_AB: title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH A 5-NT RNA CONTAINING A 5BR- U organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C : H : ARG NH2 A1386 <- 3.15 -> DG N3 T0017 : score 3.35754 : x : GLN xxxx A0447 <- 4.09 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.65 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 4.22 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 3.96 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1387 <- 4.25 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx >3s2h_AB: title=RNA POLYMERASE II INITIATION COMPLEX WITH A 6-NT RNA CONTAINING A 2[PRIME]-IODO ATP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A0320 <- 4.10 -> DA xxx T0027 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 4.20 -> DA xxx T0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0836 <- 4.35 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.61 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx >3s3m_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND DOLUTEGRAVIR (S/GSK1349572) organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.74 -> DC O2 C0006 : score 2.69088 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.66 -> DC O2 C0006 : score 3.80228 : w : SER OG A0225 <- 5.68 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.70 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.81 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 4.09 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.88 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0259 <- 3.97 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >3s3n_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) S217H MUTANT INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND DOLUTEGRAVIR (S/GSK1349572) organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.76 -> DC O2 C0006 : score 2.68025 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.81 -> DC O2 C0006 : score 3.69132 : w : SER OG A0225 <- 5.66 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.80 -> DT C7 C0008 : score 6.35897 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.58 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.95 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.79 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.92 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >3s3o_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) N224H MUTANT INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND DOLUTEGRAVIR (S/GSK1349572) organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.81 -> DC O2 C0006 : score 2.65366 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.80 -> DC O2 C0006 : score 3.69872 : V : PRO CG A0259 <- 3.86 -> DT C7 C0008 : score 6.26359 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.57 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.82 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.99 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.93 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >3s57_A:Clavaminate_synthase-like; title=ABH2 CROSS-LINKED WITH UNDAMAGED DSDNA-1 CONTAINING COFACTORS organism=Homo sapiens : x : VAL xxxx A0101 <- 3.63 -> DA xxx B0267 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0102 <- 3.15 -> DG xxx C0280 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0169 <- 3.51 -> DA xxx B0267 : score x.xxxxx >3s5a_A:Clavaminate_synthase-like; title=ABH2 CROSS-LINKED TO UNDAMAGED DSDNA-2 WITH COFACTORS organism=Homo sapiens : x : VAL xxxx A0101 <- 3.71 -> DA xxx B0266 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0102 <- 3.14 -> DG xxx C0279 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0169 <- 3.45 -> DA xxx B0266 : score x.xxxxx >3s6i_D:DNA-glycosylase; title=SCHIZOSACCAROMYCES POMBE 3-METHYLADENINE DNA GLYCOSYLASE (MAG1) IN COMPLEX WITH ABASIC-DNA. organism=Schizosaccharomyces pombe : H : GLN OE1 D0062 <- 2.85 -> DT N3 F0017 : score 3.37996 : H : GLN NE2 D0062 <- 3.04 -> DT O4 F0017 : score 4.94186 : H : HIS NE2 D0064 <- 3.04 -> DG N3 F0019 : score 3.54925 : x : LEU xxxx D0063 <- 3.86 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0067 <- 3.36 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0104 <- 4.30 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0107 <- 4.16 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx >3s8q_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE R-M CONTROLLER PROTEIN C.ESP1396I OL OPERATOR COMPLEX organism=Enterobacter sp. RFL1396 : H : ARG NH1 A0035 <- 3.22 -> DG N7 C0003 : score 5.5418 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.75 -> DG O6 C0003 : score 6.666 : H : THR OG1 A0036 <- 2.83 -> DC N4 D0016 : score 4.00913 : w : THR OG1 A0036 <- 5.79 -> DT O4 D0015 : score 2.809 : H : ARG NH2 A0046 <- 3.05 -> DG O6 D0014 : score 6.27 : w : ARG NH2 A0046 <- 5.67 -> DT O4 D0015 : score 2.366 : V : ASP CG A0034 <- 3.73 -> DT C7 D0015 : score 2.73003 : x : GLU xxxx A0025 <- 3.40 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0037 <- 3.88 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0039 <- 3.58 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx >3s8q_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE R-M CONTROLLER PROTEIN C.ESP1396I OL OPERATOR COMPLEX organism=Enterobacter sp. RFL1396 : H : ARG NH1 A0035 <- 3.22 -> DG N7 C0003 : score 5.5418 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.75 -> DG O6 C0003 : score 6.666 : H : THR OG1 A0036 <- 2.83 -> DC N4 D0016 : score 4.00913 : w : THR OG1 A0036 <- 6.53 -> DG O6 C0005 : score 2.729 : H : ARG NH2 A0046 <- 3.05 -> DG O6 D0014 : score 6.27 : w : ARG NH2 A0046 <- 6.41 -> DG O6 C0005 : score 2.468 : w : ASP OD2 B0034 <- 6.03 -> DC N4 C0016 : score 3.623 : H : ARG NH1 B0035 <- 3.27 -> DG N7 C0017 : score 5.4813 : H : ARG NH2 B0035 <- 2.72 -> DG O6 C0017 : score 6.7056 : w : ARG NH2 B0035 <- 5.86 -> DA N6 D0003 : score 1.997 : H : THR OG1 B0036 <- 3.10 -> DC N4 C0015 : score 3.79133 : H : ARG NH2 B0046 <- 3.20 -> DG N7 C0013 : score 5.87385 : w : ARG NH1 B0046 <- 5.48 -> DT O4 C0014 : score 1.768 : x : GLU xxxx A0025 <- 3.40 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0034 <- 3.67 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0037 <- 3.88 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0039 <- 3.58 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0037 <- 3.78 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0039 <- 3.74 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 3.44 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx >3s9h_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TRIPLE MUTANT(L561A/S565G/Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DUPNPP AND A DIDEOXY-TERMINATED PRIMER IN THE PRESENCE OF CA2+ organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.04 -> DA N3 P0114 : score 2.64363 : w : LYS NZ A0734 <- 5.72 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0734 <- 5.77 -> DC O2 T0010 : score 1.3 >3sar_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM SLANTED COMPLEX 1 organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NH1 A0076 <- 2.72 -> DG N3 D0008 : score 3.10141 : w : ARG NH1 A0076 <- 5.85 -> DG N3 D0007 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0076 <- 5.53 -> DT O2 D0009 : score 2.261 : w : ARG NH2 A0157 <- 6.38 -> DA N6 C0006 : score 1.997 : w : ARG NH1 A0264 <- 6.05 -> DT O4 D0009 : score 1.768 : x : MET xxxx A0077 <- 3.35 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0112 <- 2.74 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.34 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx >3sas_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM SLANTED COMPLEX 4 WITH R112A MUTATION organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NH1 A0076 <- 2.64 -> DA N3 C0009 : score 3.79988 : w : ARG NH2 A0076 <- 5.69 -> DG N3 C0010 : score 0.677 : x : MET xxxx A0077 <- 4.34 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.45 -> DC xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 4.07 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx >3sat_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM SLANTED COMPLEX 6 WITH R112A MUTATION organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NH2 A0076 <- 2.72 -> DG N3 C0008 : score 3.66802 : w : ARG NE A0076 <- 5.98 -> DT O2 C0007 : score 0.757 : w : ARG NH2 A0076 <- 5.97 -> DT O2 C0007 : score 2.261 : x : PHE xxxx A0114 <- 3.39 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx >3sau_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM INTERROGATION COMPLEX 6 organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NE A0076 <- 2.91 -> DG N3 C0008 : score 1.71652 : H : ARG NH1 A0112 <- 2.83 -> DT O2 C0007 : score 4.28057 : x : PHE xxxx A0114 <- 3.32 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 2.88 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx >3sav_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM SLANTED COMPLEX 8 organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NH1 A0076 <- 2.75 -> DG N3 D0010 : score 3.08309 : w : ARG NH2 A0076 <- 5.78 -> DT O2 D0011 : score 2.261 : x : MET xxxx A0077 <- 3.60 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0112 <- 3.65 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.37 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx >3saw_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM SLANTED COMPLEX 8 WITH R112A MUTATION organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NH2 A0076 <- 3.06 -> DG N3 C0008 : score 3.42252 : w : ARG NH2 A0076 <- 5.81 -> DT O2 C0009 : score 2.261 : H : ARG NH2 A0264 <- 3.34 -> DT O4 C0009 : score 3.17003 : x : MET xxxx A0077 <- 3.53 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.23 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >3sbj_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM SLANTED COMPLEX 7 organism=Geobacillus stearothermophilus : w : ARG NH2 A0076 <- 5.28 -> DT O2 C0010 : score 2.261 : x : MET xxxx A0077 <- 3.81 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.57 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0157 <- 3.52 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 3.71 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx >3scx_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TRIPLE MUTANT(L561A/S565G/Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DUPNPP AND A DEOXY-TERMINATED PRIMER IN THE PRESENCE OF CA2+ organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0416 <- 6.22 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : w : THR OG1 A0622 <- 5.63 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 3.07 -> DA N3 P0114 : score 2.62697 : w : LYS NZ A0734 <- 6.38 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : H : LYS NZ A0800 <- 3.37 -> DT O2 T0013 : score 3.17824 : w : LYS NZ A0800 <- 5.88 -> DG N2 T0012 : score 0.846 >3si6_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TRIPLE MUTANT (L561A/S565G/Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DUPNPP AND A DEOXY-TERMINATED PRIMER IN THE PRESENCE OF MG2+ organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.59 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 3.06 -> DA N3 P0114 : score 2.63252 : w : LYS NZ A0734 <- 5.71 -> DT O2 P0112 : score 0.522 : w : LYS NZ A0800 <- 5.64 -> DG N3 T0012 : score 2.232 >3si8_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX WITH THE 5'T OF A CPD IN THE ACTIVE SITE (TT2) organism=HOMO SAPIENS : w : ARG NH1 A0382 <- 5.36 -> DT O4 P0005 : score 1.768 : x : SER xxxx A0062 <- 4.31 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0064 <- 3.60 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.91 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 3.71 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.17 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >3sjj_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TRIPLE MUTANT (L561A/S565G/Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DUPNPP AND A DEOXY-TERMINATED PRIMER IN THE PRESENCE OF MN2+ organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.82 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 2.80 -> DA N3 P0114 : score 2.77692 : x : LYS xxxx A0734 <- 4.02 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx >3sjm_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF TRF2-DBD-DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0447 <- 2.84 -> DT O2 C0016 : score 3.55848 : H : LYS NZ A0447 <- 2.96 -> DA N3 D0005 : score 2.68806 : H : LYS NZ A0488 <- 2.83 -> DG N7 C0012 : score 5.35358 : H : LYS NZ A0488 <- 2.77 -> DG O6 C0012 : score 5.81545 : H : ASP OD1 A0489 <- 2.88 -> DC N4 D0007 : score 5.25935 : w : ASP OD2 A0489 <- 6.48 -> DC N4 D0006 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0492 <- 3.01 -> DG N7 C0013 : score 5.7959 : H : ARG NH2 A0492 <- 2.79 -> DG O6 C0013 : score 6.6132 : w : ARG NH1 A0496 <- 5.57 -> DG O6 C0014 : score 2.756 : w : ARG NH2 A0496 <- 5.68 -> DG O6 C0014 : score 2.468 : x : VAL xxxx A0485 <- 3.95 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0493 <- 4.36 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx >3sjm_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF TRF2-DBD-DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0447 <- 2.96 -> DA N3 D0005 : score 2.68806 : H : LYS NZ A0447 <- 2.84 -> DT O2 C0016 : score 3.55848 : H : LYS NZ A0488 <- 2.83 -> DG N7 C0012 : score 5.35358 : H : LYS NZ A0488 <- 2.77 -> DG O6 C0012 : score 5.81545 : H : ASP OD1 A0489 <- 2.88 -> DC N4 D0007 : score 5.25935 : w : ASP OD2 A0489 <- 6.48 -> DC N4 D0006 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0492 <- 3.01 -> DG N7 C0013 : score 5.7959 : H : ARG NH2 A0492 <- 2.79 -> DG O6 C0013 : score 6.6132 : w : ARG NH1 A0496 <- 5.57 -> DG O6 C0014 : score 2.756 : w : ARG NH2 A0496 <- 5.68 -> DG O6 C0014 : score 2.468 : H : LYS NZ B0447 <- 2.89 -> DA N3 C0011 : score 2.72694 : w : LYS NZ B0447 <- 5.60 -> DA N3 D0010 : score 1.538 : H : LYS NZ B0488 <- 2.86 -> DG N7 C0006 : score 5.32127 : H : LYS NZ B0488 <- 2.77 -> DG O6 C0006 : score 5.81545 : H : ASP OD1 B0489 <- 2.89 -> DC N4 D0013 : score 5.24866 : H : ARG NH1 B0492 <- 2.99 -> DG N7 C0007 : score 5.8201 : H : ARG NH2 B0492 <- 2.53 -> DG O6 C0007 : score 6.9564 : w : THR OG1 B0493 <- 6.22 -> DA N7 D0011 : score 2.152 : w : THR OG1 B0493 <- 6.72 -> DC N4 D0012 : score 2.558 : w : ARG NH1 B0496 <- 5.62 -> DA N6 D0011 : score 1.486 : w : ARG NH2 B0496 <- 6.13 -> DG O6 C0008 : score 2.468 : V : VAL CG2 B0485 <- 3.84 -> DT C7 C0004 : score 6.06185 : x : VAL xxxx A0485 <- 3.95 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0493 <- 4.36 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx >3slp_ABC:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LAMBDA EXONUCLEASE IN COMPLEX WITH A 12 BP SYMMETRIC DNA DUPLEX organism=ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA : H : ARG NH1 C0045 <- 2.38 -> DC O2 D0005 : score 3.9566 : w : ARG NH2 C0045 <- 6.38 -> DG N2 E0008 : score 1.593 : x : MET xxxx B0053 <- 3.82 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0073 <- 3.59 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0075 <- 3.17 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0077 <- 3.72 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0078 <- 3.79 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx >3slp_C:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LAMBDA EXONUCLEASE IN COMPLEX WITH A 12 BP SYMMETRIC DNA DUPLEX organism=ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA : H : ARG NH1 C0045 <- 2.38 -> DC O2 D0005 : score 3.9566 : w : ARG NH2 C0045 <- 6.38 -> DG N2 E0008 : score 1.593 >3sm4_ABC:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE K131A MUTANT OF LAMBDA EXONUCLEASE IN COMPLEX WITH A 5'-PHOSPHORYLATED 14-MER/12-MER DUPLEX AND MAGNESIUM organism=ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA : H : ARG NH1 C0045 <- 3.20 -> DC O2 E0011 : score 3.358 : w : ARG NH1 C0045 <- 6.00 -> DA N3 E0010 : score 2.585 : x : MET xxxx B0053 <- 3.59 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0073 <- 3.91 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0075 <- 3.33 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0077 <- 3.54 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0078 <- 3.39 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx >3sm4_B:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE K131A MUTANT OF LAMBDA EXONUCLEASE IN COMPLEX WITH A 5'-PHOSPHORYLATED 14-MER/12-MER DUPLEX AND MAGNESIUM organism=ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA : x : MET xxxx B0053 <- 3.59 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0073 <- 3.91 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0075 <- 3.33 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0077 <- 3.54 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0078 <- 3.39 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx >3snn_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (L561A/S565G/Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DCTP OPPOSITE DG IN THE PRESENCE OF MG2+ organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.08 -> DA N3 P0114 : score 2.62142 : w : LYS NZ A0734 <- 6.30 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0734 <- 5.85 -> DT O2 P0112 : score 0.522 >3spd_A:HIT-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF APRATAXIN ORTHOLOG HNT3 IN COMPLEX WITH DNA organism=Schizosaccharomyces pombe : x : PHE xxxx A0034 <- 3.02 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0142 <- 3.65 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx >3spd_AB:HIT-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF APRATAXIN ORTHOLOG HNT3 IN COMPLEX WITH DNA organism=Schizosaccharomyces pombe : x : PHE xxxx A0034 <- 3.02 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0142 <- 3.65 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0034 <- 3.17 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0142 <- 3.39 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx >3spl_AB:HIT-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF APRATAXIN ORTHOLOG HNT3 IN COMPLEX WITH DNA AND AMP organism=Schizosaccharomyces pombe : x : PHE xxxx A0034 <- 3.09 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0142 <- 3.60 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0034 <- 3.24 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0142 <- 4.08 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx >3spl_D:HIT-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF APRATAXIN ORTHOLOG HNT3 IN COMPLEX WITH DNA AND AMP organism=Schizosaccharomyces pombe : x : PHE xxxx D0034 <- 3.15 -> DT xxx H0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0142 <- 4.11 -> DT xxx H0002 : score x.xxxxx >3spy_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE(L415A/L561A/S565G/Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DUPCPP OPPOSITE DA organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.56 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 3.01 -> DA N3 P0114 : score 2.66029 : w : LYS NZ A0734 <- 5.54 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >3spz_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DNA POLYMERASE(L415A/L561A/S565G/Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DUPCPP OPPOSITE DA (CA2+) organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.67 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 2.91 -> DA N3 P0114 : score 2.71583 >3sq0_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DNA POLYMERASE(L561A/S565G/Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DUPNPP OPPOSITE DA (MN2+) organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.99 -> DA N3 P0114 : score 2.6714 : x : LYS xxxx A0734 <- 4.16 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx >3sq1_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DUPCPP OPPOSITE DA organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.95 -> DA N3 P0114 : score 2.69362 : w : LYS NZ A0734 <- 5.65 -> DT O2 P0112 : score 0.522 : x : LYS xxxx A0800 <- 3.56 -> DC xxx P0108 : score x.xxxxx >3sq2_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DTTP OPPOSITE 2AP (AT RICH SEQUENCE) organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.84 -> DT O2 P0114 : score 3.55848 : w : LYS NZ A0734 <- 6.19 -> DA N3 P0111 : score 1.538 : H : LYS NZ A0800 <- 2.70 -> DA N3 P0108 : score 2.83246 >3sq4_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DTTP OPPOSITE 2AP (GC RICH SEQUENCE) organism=Enterobacteria phage RB69 : w : ASP OD1 A0621 <- 5.85 -> DG N2 P0114 : score 2.312 : w : THR OG1 A0622 <- 6.24 -> DG N2 P0114 : score 2.036 : H : LYS NZ A0706 <- 2.98 -> DG N3 P0114 : score 1.40151 : w : LYS NZ A0706 <- 5.57 -> DG N2 P0114 : score 0.846 : x : LYS xxxx A0734 <- 4.02 -> DG xxx P0111 : score x.xxxxx >3sqi_A: title=DNA BINDING DOMAIN OF NDC10 organism=KLUYVEROMYCES LACTIS : H : LYS NZ A0237 <- 2.79 -> DT O2 B0014 : score 3.59435 : H : LYS NZ A0237 <- 3.25 -> DT O2 C0004 : score 3.26433 : x : LYS xxxx A0128 <- 4.05 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0246 <- 3.62 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx >3ssc_AB: title=DNA BINDING DOMAIN OF RESTRICTION ENDONUCLEASE BOUND TO DNA organism=Escherichia coli : w : GLN OE1 A0021 <- 5.95 -> DT O2 C0010 : score 2.481 : H : ASN OD1 A0043 <- 3.29 -> DG N2 C0008 : score 4.3296 A : w : ASN OD1 B0043 <- 6.38 -> DG N3 D0008 : score 3.377 : x : TYR xxxx A0041 <- 3.02 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0021 <- 3.94 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0041 <- 3.16 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >3ssc_B: title=DNA BINDING DOMAIN OF RESTRICTION ENDONUCLEASE BOUND TO DNA organism=Escherichia coli : w : ASN OD1 B0043 <- 6.38 -> DG N3 D0008 : score 3.377 : w : ASN ND2 B0043 <- 5.55 -> DG N3 C0008 : score 2.566 : x : GLN xxxx B0021 <- 3.94 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0041 <- 3.16 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >3ssd_AB: title=DNA BINDING DOMAIN OF RESTRICTION ENDONUCLEASE BOUND TO DNA organism=Escherichia coli : w : ASN OD1 A0043 <- 6.36 -> DG N3 C0008 : score 3.377 : w : ASN ND2 A0043 <- 5.71 -> DG N3 D0008 : score 2.566 : H : THR OG1 A0085 <- 2.76 -> DC O2 D0006 : score 2.64665 : w : ASN OD1 B0043 <- 6.34 -> DG N3 D0008 : score 3.377 : w : ASN ND2 B0043 <- 5.69 -> DG N3 C0008 : score 2.566 : x : GLN xxxx A0021 <- 3.72 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.16 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0049 <- 3.80 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0060 <- 4.41 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0064 <- 2.70 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0083 <- 4.13 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0084 <- 3.68 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0117 <- 3.24 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0021 <- 4.00 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0041 <- 3.17 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >3ssd_B: title=DNA BINDING DOMAIN OF RESTRICTION ENDONUCLEASE BOUND TO DNA organism=Escherichia coli : w : ASN OD1 B0043 <- 6.34 -> DG N3 D0008 : score 3.377 : w : ASN ND2 B0043 <- 5.69 -> DG N3 C0008 : score 2.566 : x : GLN xxxx B0021 <- 4.00 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0041 <- 3.17 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >3sse_A: title=DNA BINDING DOMAIN OF RESTRICTION ENDONUCLEASE BOUND TO DNA organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0085 <- 2.57 -> DC O2 D0006 : score 2.74642 : x : GLN xxxx A0021 <- 3.81 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.19 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0043 <- 2.95 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0049 <- 3.88 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0059 <- 4.38 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0064 <- 2.78 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0083 <- 3.95 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0084 <- 3.92 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0117 <- 3.34 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx >3sse_AB: title=DNA BINDING DOMAIN OF RESTRICTION ENDONUCLEASE BOUND TO DNA organism=Escherichia coli : H : THR OG1 A0085 <- 2.57 -> DC O2 D0006 : score 2.74642 : H : THR OG1 B0085 <- 2.69 -> DC O2 C0006 : score 2.68341 : x : GLN xxxx A0021 <- 3.81 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.19 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0043 <- 2.95 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0049 <- 3.88 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0059 <- 4.38 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0064 <- 2.78 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0083 <- 3.95 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0084 <- 3.92 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0117 <- 3.34 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0021 <- 3.65 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0041 <- 3.21 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0043 <- 3.24 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0049 <- 4.00 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0059 <- 4.25 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0064 <- 2.94 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0083 <- 4.05 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0084 <- 3.79 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0117 <- 3.40 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >3sun_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DTTP OPPOSITE 2AP (AT RICH SEQUENCE) organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.81 -> DT O2 P0114 : score 3.58001 : H : LYS NZ A0800 <- 3.36 -> DT O2 T0013 : score 3.18542 : x : LYS xxxx A0734 <- 3.96 -> DA xxx P0112 : score x.xxxxx >3suo_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DTTP OPPOSITE 2AP (GC RICH SEQUENCE) organism=Enterobacteria phage RB69 : w : ASP OD1 A0621 <- 6.35 -> DG N2 P0114 : score 2.312 : H : LYS NZ A0706 <- 3.22 -> DG N3 P0114 : score 1.33172 : w : LYS NZ A0706 <- 5.75 -> DG N2 P0114 : score 0.846 : x : LYS xxxx A0734 <- 3.96 -> DG xxx P0111 : score x.xxxxx >3sup_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DCTP OPPOSITE 2AP (GC RICH SEQUENCE) organism=Enterobacteria phage RB69 : w : ASP OD1 A0621 <- 5.98 -> DG N2 P0114 : score 2.312 : H : LYS NZ A0706 <- 2.99 -> DG N3 P0114 : score 1.3986 : w : LYS NZ A0706 <- 5.72 -> DG N2 P0114 : score 0.846 : x : LYS xxxx A0734 <- 4.31 -> DG xxx P0111 : score x.xxxxx >3suq_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE (Y567A) TERNARY COMPLEX WITH DCTP OPPOSITE 2AP (AT RICH SEQUENCE) organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.83 -> DT O2 P0114 : score 3.56566 : H : LYS NZ A0800 <- 2.82 -> DA N3 P0108 : score 2.76582 >3sv3_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH THE ARTIFICIAL BASE PAIR DNAM-D5SICSTP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.85 -> DC O2 B0109 : score 2.91669 : w : LYS NZ A0540 <- 5.37 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 5.78 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.93 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.68 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.68 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.00 -> DG N3 B0110 : score 4.69908 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.67 -> DC O2 B0111 : score 3.208 >3sv4_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN AN OPEN BINARY COMPLEX WITH DT AS TEMPLATING NUCLEOBASE organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.88 -> DC O2 B0109 : score 2.89902 : w : LYS NZ A0540 <- 5.50 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 6.34 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.64 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.72 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.72 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 6.02 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.08 -> DG N3 B0110 : score 4.62076 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.69 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : H : GLU OE1 A0615 <- 2.72 -> DA N6 C0202 : score 2.72496 : w : ASN ND2 A0750 <- 6.58 -> DG N3 C0205 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0754 <- 6.09 -> DG N3 C0205 : score 1.484 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.32 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : ARG xxxx A0587 <- 4.03 -> DC xxx B0111 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0663 <- 4.38 -> DA xxx C0202 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0664 <- 4.07 -> DT xxx C0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0667 <- 3.16 -> DA xxx C0202 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0671 <- 3.54 -> DT xxx C0204 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0681 <- 4.06 -> DT xxx C0204 : score x.xxxxx >3swm_A:NAC_domain; title=THE NAC DOMAIN OF ANAC019 IN COMPLEX WITH DNA, GOLD DERIVATIVE organism=Arabidopsis thaliana : H : THR OG1 A0098 <- 3.03 -> DC N4 F0020 : score 3.8478 : V : LYS CG A0096 <- 3.83 -> DT C7 E0005 : score 2.10308 : x : ASN xxxx A0087 <- 2.88 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0097 <- 4.40 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0100 <- 3.83 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0120 <- 3.15 -> DG xxx F0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0129 <- 3.84 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx >3swm_ABD:NAC_domain; title=THE NAC DOMAIN OF ANAC019 IN COMPLEX WITH DNA, GOLD DERIVATIVE organism=Arabidopsis thaliana : H : THR OG1 A0098 <- 3.03 -> DC N4 F0020 : score 3.8478 : V : LYS CG A0096 <- 3.83 -> DT C7 E0005 : score 2.10308 : x : ASN xxxx A0087 <- 2.88 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0097 <- 4.40 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0100 <- 3.83 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0120 <- 3.15 -> DG xxx F0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0129 <- 3.84 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0087 <- 2.99 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0096 <- 2.65 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0097 <- 4.31 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0098 <- 2.86 -> DC xxx E0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0120 <- 4.22 -> DA xxx E0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0125 <- 3.19 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0129 <- 2.99 -> DC xxx E0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0098 <- 3.77 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0100 <- 4.42 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0129 <- 4.46 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx >3swp_A:NAC_domain; title=ANAC019 NAC DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=Arabidopsis thaliana : H : THR OG1 A0098 <- 3.29 -> DC N4 F0020 : score 3.63807 : x : ASN xxxx A0087 <- 3.22 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0096 <- 3.27 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0100 <- 3.44 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0120 <- 4.13 -> DG xxx F0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0124 <- 4.01 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0125 <- 3.06 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0129 <- 4.33 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx >3swp_ABCD:NAC_domain; title=ANAC019 NAC DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=Arabidopsis thaliana : H : THR OG1 A0098 <- 3.29 -> DC N4 F0020 : score 3.63807 : H : THR OG1 D0098 <- 2.75 -> DT O4 E0012 : score 3.92605 : x : ASN xxxx A0087 <- 3.22 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0096 <- 3.27 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0100 <- 3.44 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0120 <- 4.13 -> DG xxx F0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0124 <- 4.01 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0125 <- 3.06 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0129 <- 4.33 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0087 <- 3.50 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0096 <- 2.27 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0097 <- 4.13 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0098 <- 3.87 -> DA xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0120 <- 4.05 -> DA xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0087 <- 3.55 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0096 <- 3.96 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0097 <- 4.28 -> DC xxx F0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0100 <- 3.98 -> DA xxx F0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0120 <- 4.24 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0129 <- 4.04 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx >3syz_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN AN OPEN BINARY COMPLEX WITH DNAM AS TEMPLATING NUCLEOBASE organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.97 -> DC O2 B0109 : score 2.84598 : w : LYS NZ A0540 <- 5.47 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 6.20 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.72 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.80 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.71 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.70 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.55 -> DG N3 C0208 : score 3.377 : w : ASN OD1 A0583 <- 6.86 -> DC O2 C0209 : score 2.172 : w : TYR OH A0671 <- 6.56 -> DG N3 C0205 : score 3.344 : w : ASN ND2 A0750 <- 6.41 -> DG N3 C0205 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0754 <- 6.23 -> DG N3 C0205 : score 1.484 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.55 -> DC O2 B0111 : score 3.208 >3sz2_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN AN OPEN BINARY COMPLEX WITH DG AS TEMPLATING NUCLEOBASE organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.76 -> DC O2 B0109 : score 2.96972 : w : LYS NZ A0540 <- 5.28 -> DC O2 D0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 6.43 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.57 -> DC O2 D0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.75 -> DG N3 D0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.71 -> DC O2 D0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 6.19 -> DG N3 D0208 : score 2.566 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.62 -> DG N3 D0208 : score 3.377 : w : ASN OD1 A0583 <- 6.84 -> DC O2 D0209 : score 2.172 : w : GLU OE2 A0615 <- 6.22 -> DC O2 D0205 : score 1.988 : w : ASN ND2 A0750 <- 6.47 -> DC O2 D0205 : score 1.885 : w : GLN NE2 A0754 <- 6.25 -> DC O2 D0205 : score 2.699 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.46 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : ARG xxxx A0587 <- 3.94 -> DC xxx B0111 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0671 <- 3.42 -> DC xxx D0205 : score x.xxxxx >3szq_A:HIT-like; title=STRUCTURE OF AN S. POMBE APTX/DNA/AMP/ZN COMPLEX organism=Schizosaccharomyces pombe : x : PHE xxxx A0034 <- 3.19 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0142 <- 3.88 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0143 <- 4.48 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx >3t3f_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF TAQ DNA POLYMERASE BOUND TO AN ABASIC SITE AND DNITP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.90 -> DC O2 B0109 : score 2.88723 : w : LYS NZ A0540 <- 5.63 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 6.14 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.61 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.75 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.88 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.66 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.04 -> DG N3 B0110 : score 4.65992 : w : GLU OE1 A0615 <- 6.17 -> DG N3 C0205 : score 2.669 : w : ASN ND2 A0750 <- 6.29 -> DG N3 C0205 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0754 <- 6.23 -> DG N3 C0205 : score 1.484 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.60 -> DC O2 B0111 : score 3.208 >3t5h_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF HNE ADDUCT MODIFIED DNA (5'-CXG-3' VS 13-MER) WITH DPO4 AND INCOMING DDGT organism=Sulfolobus solfataricus P2 : x : ARG xxxx A0336 <- 4.23 -> DA xxx B0407 : score x.xxxxx >3t5j_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF HNE ADDUCT MODIFIED DNA (5'-TXG-3' VS 13-MER) WITH DPO4 AND INCOMING DDTP organism=Sulfolobus solfataricus P2 : x : ARG xxxx A0336 <- 4.13 -> DA xxx B0407 : score x.xxxxx >3t5k_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF HNE ADDUCT MODIFIED DNA (5'-TXG-3' VS 14-MER) WITH DPO4 AND INCOMING DDTP organism=Sulfolobus solfataricus P2 : V : ALA CB A0042 <- 3.87 -> DT C7 B0404 : score 5.50099 : x : VAL xxxx A0032 <- 3.97 -> DT xxx B0404 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.49 -> DA xxx B0407 : score x.xxxxx >3t5l_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF HNE ADDUCT MODIFIED DNA (5'-CXG-3' VS 14-MER) WITH DPO4 AND INCOMING DDGT organism=Sulfolobus solfataricus P2 : x : VAL xxxx A0032 <- 4.01 -> DC xxx B0404 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.68 -> DC xxx B0404 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.77 -> DA xxx B0407 : score x.xxxxx >3t79_A: title=NDC10: A PLATFORM FOR INNER KINETOCHORE ASSEMBLY IN BUDDING YEAST organism=KLUYVEROMYCES LACTIS : H : LYS NZ A0237 <- 3.16 -> DT O2 B0014 : score 3.3289 : H : LYS NZ A0237 <- 3.02 -> DT O2 C0005 : score 3.42934 : V : LEU CD1 A0246 <- 3.62 -> DT C7 C0007 : score 5.98919 : x : LYS xxxx A0128 <- 3.78 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx >3tab_C:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=5-HYDROXYCYTOSINE PAIRED WITH DGMP IN RB69 GP43 organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ C0706 <- 2.74 -> DG N3 I0005 : score 1.47129 : w : LYS NZ C0734 <- 5.89 -> DA N3 I0007 : score 1.538 : H : LYS NZ C0800 <- 3.09 -> DT O2 J0108 : score 3.37912 >3tae_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=5-HYDROXYCYTOSINE PAIRED WITH DAMP IN RB69 GP43 organism=Enterobacteria phage RB69 : H : GLU OE2 A0219 <- 2.74 -> DC N4 E0002 : score 5.32857 : w : ASP OD2 A0275 <- 6.30 -> DC N4 E0002 : score 3.623 : x : PHE xxxx A0359 <- 3.49 -> DC xxx E0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0706 <- 3.22 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0734 <- 4.25 -> DA xxx F0110 : score x.xxxxx >3taf_B:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=5-FLUOROCYTOSINE PAIRED WITH DDGMP IN RB69 GP43 organism=Bacteriophage RB69 : w : THR OG1 B0622 <- 5.82 -> DG N3 H0115 : score 2.036 : w : LYS NZ B0706 <- 6.12 -> DG N2 G0004 : score 0.846 : w : LYS NZ B0734 <- 5.69 -> DA N3 G0007 : score 1.538 : w : LYS NZ B0734 <- 5.97 -> DA N3 H0112 : score 1.538 : H : LYS NZ B0800 <- 2.81 -> DT O2 H0108 : score 3.58001 >3tag_B:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=5-FLUOROCYTOSINE PAIRED WITH DAMP IN RB69 GP43 organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ B0706 <- 2.97 -> DC O2 H0113 : score 2.84598 : H : LYS NZ B0706 <- 3.13 -> DT O2 G0006 : score 3.35043 : x : LYS xxxx B0734 <- 3.91 -> DT xxx H0111 : score x.xxxxx >3tan_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT BOUND TO DUPLEX DNA WITH CYTOSINE-ADENINE MISMATCH AT (N-1) POSITION organism=GEOBACILLUS : H : LYS NZ A0582 <- 2.86 -> DA N3 B0026 : score 2.7436 : w : LYS NZ A0582 <- 6.09 -> DG N3 C0008 : score 2.232 : w : THR OG1 A0586 <- 5.95 -> DG N3 C0008 : score 2.036 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.95 -> DC O2 B0029 : score 3.5405 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.71 -> DC O2 C0005 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.84 -> DG N3 C0006 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.93 -> DC O2 B0027 : score 4.36302 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.87 -> DT O2 C0007 : score 1.666 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.29 -> DA N3 C0004 : score 2.277 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.20 -> DA N3 C0004 : score 1.888 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.40 -> DC xxx B0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.44 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.17 -> DG xxx B0028 : score x.xxxxx >3tap_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT BOUND TO DUPLEX DNA WITH CYTOSINE-ADENINE MISMATCH AT (N-3) POSITION organism=GEOBACILLUS : H : LYS NZ A0582 <- 2.95 -> DG N3 B0026 : score 1.41023 : w : LYS NZ A0582 <- 5.63 -> DG N3 C0008 : score 2.232 : w : LYS NZ A0582 <- 6.35 -> DC O2 B0025 : score 1.3 : w : THR OG1 A0586 <- 5.55 -> DG N3 C0008 : score 2.036 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.80 -> DC O2 B0029 : score 3.65 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.66 -> DT O2 C0005 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.78 -> DA N3 C0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.90 -> DC O2 B0027 : score 4.3899 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.48 -> DC O2 C0007 : score 1.885 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.66 -> DA N3 B0028 : score 2.619 : x : TYR xxxx A0714 <- 3.39 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.52 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >3taq_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT BOUND TO DUPLEX DNA WITH CYTOSINE-ADENINE MISMATCH AT (N-4) POSITION organism=GEOBACILLUS : H : LYS NZ A0582 <- 3.03 -> DC O2 B0026 : score 2.81063 : w : LYS NZ A0582 <- 5.90 -> DC O2 C0008 : score 1.3 : w : THR OG1 A0586 <- 5.80 -> DC O2 C0008 : score 2.048 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.92 -> DG N3 B0029 : score 2.9793 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.82 -> DG N3 C0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.72 -> DT O2 C0006 : score 1.666 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.10 -> DA N3 B0027 : score 3.57923 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.69 -> DA N3 C0007 : score 2.277 : H : ARG NH2 A0629 <- 3.01 -> DG N7 B0029 : score 6.11646 : w : GLU OE2 A0658 <- 6.35 -> DC O2 C0004 : score 1.988 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.21 -> DC O2 C0004 : score 1.885 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.09 -> DC O2 C0004 : score 2.699 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.58 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.41 -> DA xxx B0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.37 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx >3tar_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT BOUND TO DUPLEX DNA WITH CYTOSINE-ADENINE MISMATCH AT (N-6) POSITION organism=GEOBACILLUS : H : LYS NZ A0582 <- 2.83 -> DC O2 B0031 : score 2.92848 : w : LYS NZ A0582 <- 5.87 -> DA N3 B0030 : score 1.538 : w : LYS NZ A0582 <- 5.34 -> DT O2 C0008 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 5.29 -> DT O2 C0008 : score 2.522 : w : TYR OH A0587 <- 5.96 -> DG N2 C0007 : score 2.834 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.79 -> DC O2 B0034 : score 3.6573 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.27 -> DC O2 B0034 : score 3.35104 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.76 -> DA N3 C0005 : score 2.585 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.81 -> DC O2 C0006 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0622 <- 6.09 -> DG N3 C0007 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.98 -> DG N3 B0032 : score 4.71866 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.80 -> DG N3 C0007 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.42 -> DG N3 C0004 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.35 -> DG N3 C0004 : score 1.484 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.57 -> DT O2 B0033 : score 3.682 : x : TYR xxxx A0714 <- 3.37 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >3ted_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE CHD1 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A DNA DUPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NH2 A1113 <- 3.22 -> DG O6 C0001 : score 6.0456 : w : ARG NH1 A1255 <- 5.77 -> DA N6 C0005 : score 1.486 : w : ARG NH2 A1255 <- 5.95 -> DA N7 C0005 : score 1.486 : x : ILE xxxx A1251 <- 3.81 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx >3tfr_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A GAPPED DNA SUBSTRATE AND A, B DAMP(CF2)PP IN THE ACTIVE SITE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.16 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.83 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.67 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3tfs_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A GAPPED DNA SUBSTRATE AND A, B DAMP(CFH)PP IN THE ACTIVE SITE: STEREOSELECTIVE BINDING OF (S) ISOMER organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.10 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.83 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.66 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >3thv_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT BOUND TO DNA AND DDATP-DT IN CLOSED CONFORMATION organism=GEOBACILLUS : H : LYS NZ D0582 <- 2.92 -> DT O2 F0008 : score 3.50109 : w : LYS NZ D0582 <- 5.92 -> DC O2 E0026 : score 1.3 : w : TYR OH D0587 <- 6.02 -> DC O2 E0026 : score 1.343 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.84 -> DG N3 F0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.88 -> DA N3 F0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.91 -> DT O2 E0027 : score 4.64174 : w : HIS NE2 D0829 <- 5.71 -> DC O2 E0028 : score 3.208 : x : ARG xxxx D0629 <- 3.78 -> DC xxx E0028 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0797 <- 4.38 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx >3thw_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HUMAN MUTSBETA COMPLEXED WITH AN IDL OF 4 BASES (LOOP4) AND ADP organism=HOMO SAPIENS : V : ASN CG A0547 <- 3.81 -> DT C7 D0033 : score 2.64158 : x : TYR xxxx B0245 <- 3.50 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0246 <- 4.38 -> DG xxx D0035 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0279 <- 3.24 -> DA xxx D0039 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0314 <- 3.25 -> DA xxx D0028 : score x.xxxxx >3thw_B:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HUMAN MUTSBETA COMPLEXED WITH AN IDL OF 4 BASES (LOOP4) AND ADP organism=HOMO SAPIENS : x : TYR xxxx B0245 <- 3.50 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0246 <- 4.38 -> DG xxx D0035 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0279 <- 3.24 -> DA xxx D0039 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0314 <- 3.25 -> DA xxx D0028 : score x.xxxxx >3thx_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HUMAN MUTSBETA COMPLEXED WITH AN IDL OF 3 BASES (LOOP3) AND ADP organism=HOMO SAPIENS : x : ASP xxxx A0041 <- 3.58 -> DG xxx E0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0042 <- 3.30 -> DG xxx E0039 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0079 <- 3.67 -> DG xxx E0039 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0081 <- 3.97 -> DG xxx E0039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0245 <- 2.99 -> DG xxx E0035 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0246 <- 3.75 -> DG xxx E0035 : score x.xxxxx >3thx_B:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HUMAN MUTSBETA COMPLEXED WITH AN IDL OF 3 BASES (LOOP3) AND ADP organism=HOMO SAPIENS : x : TYR xxxx B0245 <- 2.99 -> DG xxx E0035 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0246 <- 3.75 -> DG xxx E0035 : score x.xxxxx >3thy_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HUMAN MUTSBETA COMPLEXED WITH AN IDL OF 2 BASES (LOOP2) AND ADP organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ B0246 <- 3.25 -> DG N3 E0035 : score 1.323 : x : ASN xxxx A0547 <- 3.35 -> DT xxx E0033 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0245 <- 3.40 -> DG xxx E0035 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0277 <- 4.00 -> DG xxx E0038 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0279 <- 3.50 -> DG xxx E0038 : score x.xxxxx >3thy_B:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HUMAN MUTSBETA COMPLEXED WITH AN IDL OF 2 BASES (LOOP2) AND ADP organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ B0246 <- 3.25 -> DG N3 E0035 : score 1.323 : x : TYR xxxx B0245 <- 3.40 -> DG xxx E0035 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0277 <- 4.00 -> DG xxx E0038 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0279 <- 3.50 -> DG xxx E0038 : score x.xxxxx >3thz_A:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HUMAN MUTSBETA COMPLEXED WITH AN IDL OF 6 BASES (LOOP6) AND ADP organism=HOMO SAPIENS : x : ASP xxxx A0041 <- 4.35 -> DA xxx E0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0042 <- 3.23 -> DA xxx E0039 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0079 <- 4.06 -> DA xxx E0039 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0081 <- 3.96 -> DA xxx E0039 : score x.xxxxx >3thz_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HUMAN MUTSBETA COMPLEXED WITH AN IDL OF 6 BASES (LOOP6) AND ADP organism=HOMO SAPIENS : x : ASP xxxx A0041 <- 4.35 -> DA xxx E0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0042 <- 3.23 -> DA xxx E0039 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0079 <- 4.06 -> DA xxx E0039 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0081 <- 3.96 -> DA xxx E0039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0245 <- 3.14 -> DG xxx E0035 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0246 <- 4.26 -> DA xxx E0037 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0277 <- 4.31 -> DA xxx E0037 : score x.xxxxx >3ti0_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT BOUND TO DNA AND DDGTP-DC IN CLOSED CONFORMATION organism=GEOBACILLUS SP. : H : LYS NZ A0582 <- 2.82 -> DT O2 C0008 : score 3.57283 : w : LYS NZ A0582 <- 5.79 -> DC O2 B0026 : score 1.3 : w : TYR OH A0587 <- 6.00 -> DC O2 B0026 : score 1.343 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.74 -> DG N3 C0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.70 -> DA N3 C0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.90 -> DT O2 B0027 : score 4.65123 : w : GLU OE1 A0658 <- 6.06 -> DC O2 C0004 : score 2.68 : w : ASN ND2 A0724 <- 5.99 -> DC N4 C0003 : score 2.395 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.27 -> DC O2 C0004 : score 1.885 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.25 -> DC O2 C0004 : score 2.699 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.55 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : ARG xxxx A0629 <- 3.68 -> DC xxx B0028 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0707 <- 3.94 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.49 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 4.06 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx >3tmm_A:HMG-box; title=TFAM IMPOSES A U-TURN ON MITOCHONDRIAL DNA organism=Homo sapiens : w : SER OG A0013 <- 5.40 -> DT O2 B0021 : score 1.55 : H : TYR OH A0015 <- 2.84 -> DG N3 B0020 : score 3.08919 : H : SER OG A0019 <- 2.91 -> DG N2 B0020 : score 3.30012 : w : SER OG A0019 <- 5.30 -> DC O2 C0009 : score 1.768 : H : ARG NH2 A0115 <- 3.17 -> DT O2 C0024 : score 3.92007 : H : ASN ND2 A0121 <- 3.05 -> DT O2 B0007 : score 4.50885 : H : GLN NE2 A0137 <- 3.14 -> DC O2 C0019 : score 3.44362 : x : LYS xxxx A0010 <- 3.83 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0016 <- 3.01 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0023 <- 4.36 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0035 <- 3.49 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0036 <- 3.95 -> DC xxx B0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0039 <- 3.24 -> DT xxx B0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0101 <- 4.18 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0105 <- 3.48 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0120 <- 3.56 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0124 <- 3.64 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0128 <- 3.93 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0136 <- 3.63 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0140 <- 3.53 -> DC xxx C0020 : score x.xxxxx >3tq1_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA IN BINARY COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0061 <- 4.46 -> DT xxx P0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 4.18 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >3tq6_AB:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTION FACTOR A, TFAM OR MTTFA, BOUND TO THE LIGHT STRAND PROMOTER LSP organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0057 <- 2.92 -> DG N3 d0019 : score 3.03936 : H : SER OG A0061 <- 3.10 -> DG N2 d0019 : score 3.1719 : H : ASN ND2 A0163 <- 2.95 -> DT O2 d0006 : score 4.60377 : H : ASN ND2 A0163 <- 3.03 -> DT O2 d0007 : score 4.52783 : w : GLN OE1 A0179 <- 6.45 -> DG N2 d0009 : score 2.177 : H : SER OG B0055 <- 3.48 -> DT O2 d0043 : score 3.19458 : w : SER OG B0055 <- 5.33 -> DT O2 d0042 : score 1.55 : H : TYR OH B0057 <- 2.81 -> DG N3 d0041 : score 3.10787 : H : SER OG B0061 <- 2.98 -> DG N2 d0041 : score 3.25288 : w : LYS NZ B0147 <- 5.84 -> DT O2 d0036 : score 0.522 : H : ASN ND2 B0163 <- 3.20 -> DT O2 d0028 : score 4.36646 : H : ASN ND2 B0163 <- 2.91 -> DT O2 d0029 : score 4.64174 >3tq6_B:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTION FACTOR A, TFAM OR MTTFA, BOUND TO THE LIGHT STRAND PROMOTER LSP organism=Homo sapiens : w : SER OG B0055 <- 5.96 -> DA N3 c0024 : score 0.958 : w : SER OG B0061 <- 5.89 -> DC O2 c0025 : score 1.768 : w : LYS NZ B0147 <- 5.70 -> DA N3 c0030 : score 1.538 : w : LYS NZ B0147 <- 6.12 -> DC O2 c0031 : score 1.3 : w : SER OG B0160 <- 5.93 -> DC O2 c0039 : score 1.768 : H : TYR OH B0162 <- 2.86 -> DA N3 c0037 : score 4.10147 : H : GLN NE2 B0179 <- 2.90 -> DC O2 c0035 : score 3.62097 >3ts8_A:p53-like_transcription_factors;p53_tetramerization_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MULTIDOMAIN HUMAN P53 TETRAMER BOUND TO THE NATURAL CDKN1A(P21) P53-RESPONSE ELEMENT organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0280 <- 3.26 -> DG O6 K0021 : score 5.52367 : H : ARG NH2 A0280 <- 3.25 -> DG N7 K0021 : score 5.81 : x : ARG xxxx A0248 <- 4.22 -> DG xxx L0035 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 4.07 -> DT xxx K0022 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0277 <- 3.77 -> DT xxx K0022 : score x.xxxxx >3ts8_ABCD:p53-like_transcription_factors;p53_tetramerization_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MULTIDOMAIN HUMAN P53 TETRAMER BOUND TO THE NATURAL CDKN1A(P21) P53-RESPONSE ELEMENT organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0280 <- 3.26 -> DG O6 K0021 : score 5.52367 : H : ARG NH2 A0280 <- 3.25 -> DG N7 K0021 : score 5.81 : H : LYS NZ B0120 <- 3.10 -> DA N7 K0016 : score 2.76095 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.97 -> DG O6 L0035 : score 5.8765 : H : ARG NH1 C0280 <- 2.72 -> DG O6 K0011 : score 6.18067 : H : ARG NH2 C0280 <- 2.99 -> DG N7 K0011 : score 6.142 : H : ARG NH1 D0280 <- 3.23 -> DG O6 L0045 : score 5.56017 : H : ARG NH2 D0280 <- 3.37 -> DG N7 L0045 : score 5.65677 : x : ARG xxxx A0248 <- 4.22 -> DG xxx L0035 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 4.07 -> DT xxx K0022 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0277 <- 3.77 -> DT xxx K0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0248 <- 3.88 -> DG xxx K0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 3.71 -> DT xxx L0036 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0277 <- 4.12 -> DT xxx L0036 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0120 <- 3.65 -> DG xxx L0039 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0276 <- 3.52 -> DT xxx K0012 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0277 <- 4.01 -> DT xxx K0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0248 <- 4.39 -> DG xxx K0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0276 <- 3.81 -> DT xxx L0046 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0277 <- 3.99 -> DT xxx L0046 : score x.xxxxx >3twm_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARABIDOPSIS THALIANA FPG organism=Arabidopsis thaliana : H : ARG NE A0126 <- 2.97 -> DG N7 D0009 : score 4.27145 : H : ARG NH2 A0126 <- 2.70 -> DG O6 D0009 : score 6.732 : x : MET xxxx A0078 <- 3.28 -> DG xxx C0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0128 <- 3.43 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0267 <- 3.71 -> DG xxx C0024 : score x.xxxxx >3u2b_C:HMG-box; title=STRUCTURE OF THE SOX4 HMG DOMAIN BOUND TO DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 C0005 <- 3.06 -> DT O2 A0011 : score 4.08248 : H : ARG NH1 C0005 <- 2.84 -> DC O2 B0007 : score 3.6208 : H : ARG NH2 C0005 <- 2.95 -> DT O2 A0011 : score 4.10633 : H : ASN ND2 C0008 <- 3.00 -> DT O2 A0009 : score 4.55631 : H : HIS NE2 C0029 <- 2.89 -> DG N3 B0012 : score 3.6611 : H : SER OG C0034 <- 2.76 -> DA N3 A0007 : score 3.02788 : H : TYR OH C0072 <- 2.70 -> DA N3 B0006 : score 4.23431 : x : PHE xxxx C0010 <- 3.72 -> DT xxx A0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0011 <- 3.74 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0018 <- 3.36 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0030 <- 3.33 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0031 <- 3.37 -> DT xxx A0006 : score x.xxxxx >3u3w_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;TPR-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS THURINGIENSIS PLCR IN COMPLEX WITH THE PEPTIDE PAPR7 AND DNA organism=Bacillus thuringiensis : H : GLN OE1 A0031 <- 2.98 -> DA N6 Y0003 : score 5.83467 : H : SER OG A0032 <- 2.81 -> DC N4 Z0014 : score 3.66829 : H : ARG NH2 A0036 <- 3.00 -> DG N7 Y0005 : score 6.12923 : H : ARG NH2 A0036 <- 2.81 -> DG O6 Y0005 : score 6.5868 : H : ARG NH2 A0036 <- 3.20 -> DG O6 Z0013 : score 6.072 : H : GLN NE2 B0031 <- 2.96 -> DA N7 Z0003 : score 5.89487 : H : SER OG B0032 <- 3.03 -> DC N4 Y0014 : score 3.50656 : H : ARG NH2 B0036 <- 2.64 -> DT O4 Y0013 : score 3.66757 : H : ARG NH2 B0036 <- 2.46 -> DG O6 Z0005 : score 7.0488 : V : VAL CG1 B0042 <- 3.76 -> DT C7 Y0012 : score 6.12112 : V : VAL CG2 A0042 <- 3.69 -> DT C7 Z0012 : score 6.29146 : x : HIS xxxx A0030 <- 3.19 -> DC xxx Z0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0033 <- 3.40 -> DT xxx Z0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0035 <- 3.48 -> DA xxx Y0003 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0030 <- 3.24 -> DC xxx Y0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0033 <- 3.29 -> DT xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0035 <- 3.59 -> DA xxx Z0003 : score x.xxxxx >3u3w_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;TPR-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS THURINGIENSIS PLCR IN COMPLEX WITH THE PEPTIDE PAPR7 AND DNA organism=Bacillus thuringiensis : H : GLN NE2 B0031 <- 2.96 -> DA N7 Z0003 : score 5.89487 : H : SER OG B0032 <- 3.03 -> DC N4 Y0014 : score 3.50656 : H : ARG NH2 B0036 <- 2.46 -> DG O6 Z0005 : score 7.0488 : H : ARG NH2 B0036 <- 2.64 -> DT O4 Y0013 : score 3.66757 : V : VAL CG1 B0042 <- 3.76 -> DT C7 Y0012 : score 6.12112 : x : HIS xxxx B0030 <- 3.24 -> DC xxx Y0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0033 <- 3.29 -> DT xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0035 <- 3.59 -> DA xxx Z0003 : score x.xxxxx >3u44_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ADDAB-DNA COMPLEX organism=BACILLUS SUBTILIS : H : ARG NH2 B1059 <- 2.47 -> DC O2 X0037 : score 3.94283 : x : MET xxxx A0816 <- 4.02 -> DA xxx X0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1074 <- 3.56 -> DC xxx X0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B1076 <- 3.87 -> DG xxx X0007 : score x.xxxxx >3u44_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ADDAB-DNA COMPLEX organism=BACILLUS SUBTILIS : H : ARG NH2 B1059 <- 2.47 -> DC O2 X0037 : score 3.94283 : x : ARG xxxx B1074 <- 3.56 -> DC xxx X0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B1076 <- 3.87 -> DG xxx X0007 : score x.xxxxx >3u4q_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURE OF ADDAB-DNA COMPLEX AT 2.8 ANGSTROMS organism=BACILLUS SUBTILIS : x : ARG xxxx B1074 <- 4.20 -> DC xxx X0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B1076 <- 4.40 -> DG xxx X0007 : score x.xxxxx >3u4q_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF ADDAB-DNA COMPLEX AT 2.8 ANGSTROMS organism=BACILLUS SUBTILIS : x : ARG xxxx B1074 <- 4.20 -> DC xxx X0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B1076 <- 4.40 -> DG xxx X0007 : score x.xxxxx >3u58_C:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TETRAHYMENA TELOMERASE PROCESSIVITY FACTOR TEB1 AB organism=Tetrahymena thermophila : H : ASN OD1 C0263 <- 2.90 -> DT N3 G0004 : score 3.72526 : H : ASN ND2 C0263 <- 3.17 -> DT O4 G0004 : score 4.89355 : H : LYS NZ C0291 <- 2.63 -> DG O6 G0003 : score 5.97732 : H : GLU OE1 C0298 <- 2.88 -> DG N2 G0003 : score 4.24129 : H : LYS NZ C0300 <- 2.82 -> DG N7 G0002 : score 5.36435 : H : LYS NZ C0300 <- 2.69 -> DG O6 G0003 : score 5.90795 >3u5z_ABCDE:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF T4 BACTERIOPHAGE CLAMP LOADER BOUND TO THE T4 CLAMP, PRIMER-TEMPLATE DNA, AND ATP ANALOG organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T4 : x : ASN xxxx E0300 <- 3.82 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0063 <- 3.24 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx >3u5z_E:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF T4 BACTERIOPHAGE CLAMP LOADER BOUND TO THE T4 CLAMP, PRIMER-TEMPLATE DNA, AND ATP ANALOG organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T4 : x : ASN xxxx E0300 <- 3.82 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx >3u5z_KLMNO:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF T4 BACTERIOPHAGE CLAMP LOADER BOUND TO THE T4 CLAMP, PRIMER-TEMPLATE DNA, AND ATP ANALOG organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T4 : x : ASN xxxx O0300 <- 4.08 -> DT xxx S0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0301 <- 4.48 -> DA xxx T0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx K0063 <- 3.50 -> DT xxx S0011 : score x.xxxxx >3u60_ABCDE:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF T4 BACTERIOPHAGE CLAMP LOADER BOUND TO OPEN CLAMP, DNA AND ATP ANALOG organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T4 : V : PHE CG A0063 <- 3.69 -> DT C7 I0011 : score 5.42309 : x : ALA xxxx E0299 <- 4.45 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx >3u6c_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM SET 1 APGO organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NE A0076 <- 2.95 -> DG N3 C0009 : score 1.70247 : w : ARG NH1 A0264 <- 6.05 -> DA N6 C0010 : score 1.486 : x : ARG xxxx A0112 <- 3.22 -> DC xxx B0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.41 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx >3u6d_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM SET 1 GPGO organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NE A0076 <- 2.87 -> DG N3 C0009 : score 1.73056 : w : ARG NH1 A0264 <- 5.62 -> DA N7 C0010 : score 0.388 : x : ARG xxxx A0112 <- 3.12 -> DC xxx B0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.26 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx >3u6e_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM SET 1 TPGO organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NE A0076 <- 3.01 -> DG N3 C0009 : score 1.68141 : w : ARG NH2 A0076 <- 5.41 -> DA N3 C0010 : score 2.092 : H : ARG NH1 A0112 <- 2.75 -> DA N3 B0011 : score 3.71887 : x : PHE xxxx A0114 <- 3.27 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 3.52 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx >3u6l_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM SET 2 CPGO organism=Geobacillus stearothermophilus : w : ARG NH2 A0035 <- 6.13 -> DC O2 B0009 : score 1.669 : H : ARG NE A0076 <- 3.10 -> DG N3 C0010 : score 1.64982 : H : ARG NH1 A0112 <- 2.88 -> DG N3 B0011 : score 3.00372 : x : PHE xxxx A0114 <- 3.26 -> DC xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 3.57 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx >3u6m_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL EFFECTS OF SEQUENCE CONTEXT ON LESION RECOGNITION BY MUTM organism=Geobacillus stearothermophilus : w : ARG NH2 A0035 <- 6.39 -> DC O2 B0009 : score 1.669 : H : ARG NE A0076 <- 3.11 -> DG N3 C0009 : score 1.64631 : x : ARG xxxx A0112 <- 3.42 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.16 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0157 <- 4.15 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx >3u6o_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM SET 1 APG organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NE A0076 <- 3.01 -> DG N3 C0009 : score 1.68141 : H : ARG NH1 A0112 <- 2.78 -> DT O2 B0011 : score 4.32364 : H : ARG NH1 A0264 <- 3.31 -> DG N7 C0009 : score 5.4329 : x : MET xxxx A0077 <- 3.81 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.38 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx >3u6p_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM SET 1 GPG organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NE A0076 <- 2.94 -> DG N3 C0009 : score 1.70598 : H : ARG NH1 A0112 <- 2.92 -> DC O2 B0011 : score 3.5624 : H : ARG NH1 A0264 <- 2.96 -> DG N7 C0009 : score 5.8564 : x : MET xxxx A0077 <- 4.22 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0114 <- 3.42 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx >3u6q_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM SET 2 APGO organism=Geobacillus stearothermophilus : w : ARG NH1 A0035 <- 6.53 -> DC O2 B0009 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0035 <- 6.63 -> DC O2 B0009 : score 1.669 : H : ARG NE A0076 <- 3.14 -> DG N3 C0009 : score 1.63578 : H : ARG NH1 A0112 <- 2.76 -> DT O2 B0011 : score 4.34086 : x : PHE xxxx A0114 <- 3.14 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx >3u6s_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM SET 1 TPG organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NE A0076 <- 3.04 -> DG N3 C0009 : score 1.67088 : w : ARG NH2 A0076 <- 5.61 -> DA N3 C0010 : score 2.092 : w : GLU OE1 A0078 <- 6.40 -> DG N2 C0008 : score 1.283 : H : ARG NH1 A0112 <- 2.88 -> DA N3 B0011 : score 3.62314 : H : ARG NH1 A0264 <- 3.02 -> DG N7 C0009 : score 5.7838 : x : PHE xxxx A0114 <- 3.29 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx >3ubt_ABY: title=CRYSTAL STRUCTURE OF C71S MUTANT OF DNA CYTOSINE-5 METHYLTRANSFERASE M.HAEIII BOUND TO DNA organism=HAEMOPHILUS AEGYPTIUS : H : SER OG A0219 <- 2.66 -> DG O6 E0006 : score 4.20557 : H : SER OG A0224 <- 3.10 -> DC N4 E0007 : score 3.4551 : H : ARG NE A0225 <- 2.82 -> DG N7 F0008 : score 4.40411 : H : ARG NH2 A0225 <- 2.93 -> DG O6 F0008 : score 6.4284 : H : ARG NH1 A0227 <- 3.10 -> DG N7 F0009 : score 5.687 : H : ARG NH2 A0227 <- 2.92 -> DG O6 F0009 : score 6.4416 : H : ARG NH1 A0243 <- 3.15 -> DG N7 E0005 : score 5.6265 : H : ARG NH2 A0243 <- 2.85 -> DG O6 E0005 : score 6.534 : w : GLN OE1 A0244 <- 5.68 -> DC N4 F0010 : score 3.488 : H : SER OG B0219 <- 2.99 -> DG O6 D0006 : score 3.93557 : H : SER OG B0224 <- 3.00 -> DC N4 D0007 : score 3.52862 : H : ARG NE B0225 <- 2.92 -> DG N7 C0008 : score 4.31567 : H : ARG NH2 B0225 <- 2.82 -> DG O6 C0008 : score 6.5736 : H : ARG NH1 B0227 <- 3.08 -> DG N7 C0009 : score 5.7112 : H : ARG NH2 B0227 <- 2.94 -> DG O6 C0009 : score 6.4152 : H : ARG NH1 B0243 <- 2.73 -> DG O6 D0005 : score 6.1685 : H : ARG NH2 B0243 <- 2.98 -> DG N7 D0005 : score 6.15477 : H : GLN NE2 B0244 <- 3.13 -> DG O6 D0006 : score 5.42199 : w : GLN OE1 B0244 <- 6.59 -> DC N4 C0010 : score 3.488 : H : SER OG Y0219 <- 2.78 -> DG O6 G0006 : score 4.10739 : H : ARG NE Y0225 <- 2.97 -> DG N7 H0008 : score 4.27145 : H : ARG NH2 Y0225 <- 3.06 -> DG O6 H0008 : score 6.2568 : H : ARG NH1 Y0227 <- 3.23 -> DG N7 H0009 : score 5.5297 : H : ARG NH2 Y0227 <- 3.17 -> DG O6 H0009 : score 6.1116 : H : ARG NH2 Y0243 <- 2.88 -> DG O6 G0005 : score 6.4944 : w : GLN OE1 Y0244 <- 6.26 -> DC N4 H0010 : score 3.488 : x : THR xxxx Y0220 <- 3.39 -> DG xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Y0221 <- 3.36 -> DG xxx G0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Y0224 <- 3.53 -> DC xxx G0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Y0239 <- 3.38 -> DC xxx H0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0220 <- 3.19 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0221 <- 3.48 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0239 <- 3.50 -> DC xxx F0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0220 <- 3.16 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0221 <- 3.40 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0239 <- 3.56 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx >3ubt_Y:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C71S MUTANT OF DNA CYTOSINE-5 METHYLTRANSFERASE M.HAEIII BOUND TO DNA organism=? : H : SER OG Y0219 <- 2.78 -> DG O6 G0006 : score 4.10739 : H : ARG NE Y0225 <- 2.97 -> DG N7 H0008 : score 4.27145 : H : ARG NH2 Y0225 <- 3.06 -> DG O6 H0008 : score 6.2568 : H : ARG NH1 Y0227 <- 3.23 -> DG N7 H0009 : score 5.5297 : H : ARG NH2 Y0227 <- 3.17 -> DG O6 H0009 : score 6.1116 : H : ARG NH2 Y0243 <- 2.88 -> DG O6 G0005 : score 6.4944 : w : GLN OE1 Y0244 <- 6.26 -> DC N4 H0010 : score 3.488 : x : THR xxxx Y0220 <- 3.39 -> DG xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Y0221 <- 3.36 -> DG xxx G0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Y0224 <- 3.53 -> DC xxx G0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Y0239 <- 3.38 -> DC xxx H0010 : score x.xxxxx >3uby_A:FMT_C-terminal_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN ALKLYADENINE DNA GLYCOSYLASE IN A LOWER AND HIGHER-AFFINITY COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : w : TYR OH A0165 <- 5.23 -> DT O2 C0009 : score 3.068 : x : TYR xxxx A0162 <- 3.24 -> DA xxx D0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0164 <- 3.39 -> DA xxx D0002 : score x.xxxxx >3udg_A:Nucleic_acid-binding_proteins; title=STRUCTURE OF DEINOCOCCUS RADIODURANS SSB BOUND TO SSDNA organism=? : H : ASN ND2 A0006 <- 3.10 -> DT O4 G0001 : score 4.96754 : H : ARG NH2 A0021 <- 3.01 -> DT O2 G0004 : score 4.05553 : H : SER OG A0057 <- 2.88 -> DT O4 G0004 : score 3.49825 : H : THR OG1 A0082 <- 3.29 -> DT O2 G0001 : score 2.44812 : H : LYS NZ A0102 <- 2.87 -> DT O2 G0001 : score 3.53696 : V : LEU CD1 A0059 <- 3.70 -> DT C7 G0004 : score 5.87456 >3ufd_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=C.ESP1396I BOUND TO ITS HIGHEST AFFINITY OPERATOR SITE OM organism=Enterobacter sp. RFL1396 : H : ARG NH1 A0035 <- 3.19 -> DG O6 C0003 : score 5.60883 : H : ARG NH2 A0035 <- 3.10 -> DG N7 C0003 : score 6.00154 : H : THR OG1 A0036 <- 3.07 -> DC N4 D0015 : score 3.81553 : H : ARG NH2 A0046 <- 3.05 -> DG N7 D0013 : score 6.06538 : H : ARG NH1 B0035 <- 3.33 -> DG O6 D0003 : score 5.4385 : H : ARG NH2 B0035 <- 3.07 -> DG N7 D0003 : score 6.03985 : H : THR OG1 B0036 <- 2.92 -> DC N4 C0015 : score 3.93653 : H : ARG NH2 B0046 <- 3.06 -> DG N7 C0013 : score 6.05262 : x : ASP xxxx A0034 <- 3.10 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0037 <- 3.95 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0039 <- 3.70 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0034 <- 3.18 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0037 <- 3.94 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0039 <- 3.94 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx >3ufd_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=C.ESP1396I BOUND TO ITS HIGHEST AFFINITY OPERATOR SITE OM organism=Enterobacter sp. RFL1396 : H : ARG NH1 B0035 <- 3.33 -> DG O6 D0003 : score 5.4385 : H : ARG NH2 B0035 <- 3.07 -> DG N7 D0003 : score 6.03985 : H : THR OG1 B0036 <- 2.92 -> DC N4 C0015 : score 3.93653 : H : ARG NH2 B0046 <- 3.06 -> DG N7 C0013 : score 6.05262 : x : ASP xxxx B0034 <- 3.18 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0037 <- 3.94 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0039 <- 3.94 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx >3ufj_AB:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=HUMAN THYMINE DNA GLYCOSYLASE BOUND TO SUBSTRATE ANALOG 2'-FLUORO-2'- DEOXYURIDINE organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0200 <- 4.30 -> DG xxx d0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0233 <- 4.05 -> DT xxx d0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0274 <- 3.88 -> DA xxx d0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.28 -> DA xxx d0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 2.85 -> DG xxx c0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0280 <- 4.22 -> DG xxx c0012 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0233 <- 4.19 -> DT xxx c0035 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0274 <- 3.18 -> DA xxx c0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0275 <- 2.86 -> DA xxx c0033 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0277 <- 2.71 -> DA xxx c0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0280 <- 4.06 -> DG xxx d0034 : score x.xxxxx >3ufj_B:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=HUMAN THYMINE DNA GLYCOSYLASE BOUND TO SUBSTRATE ANALOG 2'-FLUORO-2'- DEOXYURIDINE organism=Homo sapiens : x : CYS xxxx B0233 <- 4.19 -> DT xxx c0035 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0274 <- 3.18 -> DA xxx c0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0275 <- 2.86 -> DA xxx c0033 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0277 <- 2.71 -> DA xxx c0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0280 <- 4.06 -> DG xxx d0034 : score x.xxxxx >3ugm_A:Thiolase-like; title=STRUCTURE OF TAL EFFECTOR PTHXO1 BOUND TO ITS DNA TARGET organism=Xanthomonas oryzae : H : ASN ND2 A0301 <- 2.88 -> DG N7 B0001 : score 4.51252 : H : ASP OD2 A0437 <- 2.68 -> DC N4 B0005 : score 6.3488 : H : ASP OD2 A0538 <- 2.92 -> DC N4 B0008 : score 6.0512 : w : ASP OD2 A0538 <- 5.53 -> DC N4 B0007 : score 3.623 : H : ASP OD2 A0572 <- 2.83 -> DC N4 B0009 : score 6.1628 : w : ASP OD2 A0742 <- 5.40 -> DT O4 B0015 : score 2.798 : H : ASN ND2 A0810 <- 2.72 -> DG N7 B0016 : score 4.65927 : V : TRP CD1 A0232 <- 3.80 -> DT C7 B0000 : score 7.33333 : x : ARG xxxx A0266 <- 3.42 -> DA xxx C0026 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0335 <- 3.87 -> DC xxx B0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0369 <- 3.39 -> DA xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0606 <- 3.78 -> DC xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0708 <- 3.00 -> DA xxx B0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0878 <- 3.76 -> DA xxx B0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0912 <- 4.04 -> DC xxx B0019 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0946 <- 4.01 -> DA xxx B0020 : score x.xxxxx >3ugp_A:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RNA-POLYMERASE SIGMA SUBUNIT DOMAIN 2 COMPLEXED WITH -10 PROMOTER ELEMENT SSDNA OLIGO (TATAAT) organism=THERMUS AQUATICUS : H : ASN OD1 A0206 <- 2.73 -> DT N3 B0008 : score 3.8545 >3uiq_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX CONTAINING DUPNPP organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0567 <- 5.35 -> DG N3 T0005 : score 3.344 : w : THR OG1 A0622 <- 5.62 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 3.03 -> DA N3 P0114 : score 2.64918 : H : LYS NZ A0800 <- 2.79 -> DC O2 P0108 : score 2.95205 : H : LYS NZ A0800 <- 3.13 -> DT O2 T0013 : score 3.35043 >3uk3_C:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZNF217 BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 C0481 <- 2.62 -> DG N7 A0018 : score 6.2678 : H : ARG NH2 C0481 <- 2.69 -> DG O6 A0018 : score 6.7452 : H : GLN OE1 C0510 <- 3.19 -> DC N4 A0016 : score 4.22583 : H : THR OG1 C0512 <- 2.48 -> DG O6 B0007 : score 4.48517 : V : TYR CB C0484 <- 3.88 -> DT C7 B0003 : score 4.77134 : V : TYR CB C0516 <- 3.64 -> DT C7 A0014 : score 5.06347 >3uk3_CD:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZNF217 BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 C0481 <- 2.62 -> DG N7 A0018 : score 6.2678 : H : ARG NH2 C0481 <- 2.69 -> DG O6 A0018 : score 6.7452 : H : GLN OE1 C0510 <- 3.19 -> DC N4 A0016 : score 4.22583 : H : THR OG1 C0512 <- 2.48 -> DG O6 B0007 : score 4.48517 : H : ARG NH1 D0481 <- 3.00 -> DG N7 B0018 : score 5.808 : H : ARG NH2 D0481 <- 2.82 -> DG O6 B0018 : score 6.5736 : H : GLN OE1 D0510 <- 3.24 -> DC N4 B0016 : score 4.18 : H : THR OG1 D0512 <- 2.57 -> DG O6 A0007 : score 4.40929 : V : TYR CB C0484 <- 3.88 -> DT C7 B0003 : score 4.77134 : x : SER xxxx C0482 <- 3.77 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0485 <- 3.21 -> DC xxx A0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0513 <- 3.21 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0515 <- 3.49 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0516 <- 3.64 -> DT xxx A0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0482 <- 3.98 -> DT xxx A0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0484 <- 3.68 -> DG xxx A0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0485 <- 3.23 -> DC xxx B0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0513 <- 3.31 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0515 <- 3.38 -> DA xxx A0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0516 <- 3.60 -> DT xxx B0014 : score x.xxxxx >3ukg_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RAP1/DNA COMPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0360 <- 2.84 -> DA N3 C0013 : score 2.75471 : H : HIS NE2 A0385 <- 2.65 -> DG O6 D0013 : score 8.19246 : H : ARG NH1 A0404 <- 2.88 -> DG N7 D0013 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0404 <- 2.78 -> DG N7 D0013 : score 6.41015 : H : LYS NZ A0446 <- 2.85 -> DA N3 C0021 : score 2.74915 A : H : ARG NH2 A0542 <- 2.84 -> DG O6 D0005 : score 6.5472 : H : ASP OD1 A0543 <- 3.12 -> DA N6 C0023 : score 3.2592 : H : ASP OD2 A0543 <- 2.88 -> DC N4 C0022 : score 6.1008 : H : ARG NH1 A0546 <- 2.94 -> DG O6 D0006 : score 5.913 : H : ARG NH2 A0546 <- 2.62 -> DG N7 D0006 : score 6.61446 : H : LYS NZ A0547 <- 2.76 -> DT O4 D0007 : score 3.61588 : H : ARG NH2 A0580 <- 2.87 -> DG N7 D0008 : score 6.29523 : H : ARG NH2 A0580 <- 2.85 -> DG O6 D0008 : score 6.534 : x : THR xxxx A0383 <- 3.89 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0401 <- 3.34 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0402 <- 3.80 -> DC xxx C0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0405 <- 3.27 -> DC xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0408 <- 3.29 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0410 <- 3.80 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0539 <- 3.89 -> DA xxx C0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0578 <- 3.74 -> DC xxx C0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0588 <- 3.60 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0589 <- 3.28 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0591 <- 2.95 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx >3ulp_ABD:Nucleic_acid-binding_proteins; title=PLASMODIUM FALCIPARUM SSB COMPLEX WITH SSDNA organism=Plasmodium falciparum : w : ASN ND2 A0078 <- 5.86 -> DT O4 R0028 : score 3.275 : H : SER OG A0110 <- 3.04 -> DT O2 R0008 : score 3.51996 : w : ASN ND2 A0114 <- 6.10 -> DT O2 R0009 : score 1.666 : w : THR OG1 A0129 <- 5.92 -> DT N3 R0009 : score 2.117 : w : TYR OH A0137 <- 5.78 -> DT N3 R0004 : score 1.817 : w : GLU OE1 A0180 <- 5.85 -> DT N3 R0004 : score 2.056 : H : ASN OD1 B0078 <- 2.79 -> DT N3 R0010 : score 3.80888 : w : ASN OD1 B0078 <- 5.84 -> DT N3 R0009 : score 1.666 : H : SER OG B0110 <- 2.38 -> DT O2 R0023 : score 4.00802 : H : SER OG B0110 <- 2.95 -> DT N3 R0025 : score 1.92756 : H : LYS NZ B0128 <- 2.82 -> DT O4 R0001 : score 3.57283 : w : THR OG1 B0129 <- 5.26 -> DT N3 R0026 : score 2.117 : w : ARG NH2 B0133 <- 6.10 -> DT O4 R0019 : score 2.366 : w : TYR OH B0137 <- 5.65 -> DT N3 R0021 : score 1.817 : w : GLU OE1 B0180 <- 6.09 -> DT N3 R0021 : score 2.056 : V : VAL CG2 A0106 <- 3.90 -> DT C7 R0002 : score 5.97 : V : ARG CZ D0153 <- 3.64 -> DT C7 R0012 : score 2.2176 >3ulp_D:Nucleic_acid-binding_proteins; title=PLASMODIUM FALCIPARUM SSB COMPLEX WITH SSDNA organism=Plasmodium falciparum : H : ASN OD1 D0078 <- 2.95 -> DT N3 Q0010 : score 3.68724 : w : ASN OD1 D0078 <- 6.00 -> DT N3 Q0009 : score 1.666 : H : SER OG D0110 <- 2.73 -> DT O2 Q0023 : score 3.7492 : H : SER OG D0110 <- 2.91 -> DT N3 Q0025 : score 1.94346 : w : ASN ND2 D0114 <- 5.52 -> DT O2 Q0026 : score 1.666 : w : ASN ND2 D0114 <- 5.86 -> DT N3 Q0026 : score 1.666 : w : THR OG1 D0129 <- 5.47 -> DT N3 Q0026 : score 2.117 : H : ARG NH2 D0133 <- 3.19 -> DT O2 Q0021 : score 3.90313 : H : ARG NH1 D0164 <- 2.83 -> DT O2 Q0022 : score 4.28057 : H : ARG NH2 D0164 <- 3.17 -> DT O2 Q0022 : score 3.92007 : V : GLU CB D0115 <- 3.69 -> DT C7 Q0001 : score 1.67245 : V : HIS CB D0162 <- 3.67 -> DT C7 Q0018 : score 4.25919 : V : VAL CG1 D0106 <- 3.59 -> DT C7 Q0019 : score 6.37869 >3uo7_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN THYMINE DNA GLYCOSYLASE BOUND TO SUBSTRATE 5-CARBOXYLCYTOSINE organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0278 <- 2.22 -> DT O2 D0013 : score 4.3896 : x : SER xxxx A0200 <- 4.29 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0201 <- 3.53 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0274 <- 2.76 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.88 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 3.76 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >3uo7_AB:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN THYMINE DNA GLYCOSYLASE BOUND TO SUBSTRATE 5-CARBOXYLCYTOSINE organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0278 <- 2.22 -> DT O2 D0013 : score 4.3896 : x : SER xxxx A0200 <- 4.29 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0201 <- 3.53 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0274 <- 2.76 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.88 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 3.76 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >3uob_AB:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN THYMINE DNA GLYCOSYLASE BOUND TO SUBSTRATE ANALOG 2'-DEOXY-2'-BETA-FLUORO-CYTIDINE organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 A0278 <- 3.04 -> DG N2 D0012 : score 5.33852 : x : SER xxxx A0200 <- 4.19 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0274 <- 3.56 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.24 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0276 <- 3.99 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 3.48 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx >3uq0_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE POST-CATALYTIC PRODUCT COMPLEX OF POLYMERASE LAMBDA WITH AN RAMP AT THE PRIMER TERMINUS. organism=Homo sapiens : x : TRP xxxx A0274 <- 3.19 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.54 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0277 <- 4.19 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx >3uq2_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE POST-CATALYTIC PRODUCT COMPLEX OF POLYMERASE LAMBDA WITH AN RCMP INSERTED OPPOSITE A TEMPLATING G AND DAMP INSERTED OPPOSITE A TEMPLATING T AT THE PRIMER TERMINUS. organism=Homo sapiens : x : TRP xxxx A0274 <- 3.33 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.66 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0277 <- 3.71 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx >3us0_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P63 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A 22 BASE PAIR A/T RICH RESPONSE ELEMENT CONTAINING A TWO BASE PAIR "AT" SPACER BETWEEN HALF SITES organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0311 <- 3.05 -> DG O6 E0019 : score 5.77917 : H : ARG NH2 A0311 <- 3.23 -> DG N7 E0019 : score 5.83554 : x : ALA xxxx A0307 <- 3.74 -> DT xxx E0020 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0308 <- 3.85 -> DT xxx E0020 : score x.xxxxx >3us0_ABCD:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P63 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A 22 BASE PAIR A/T RICH RESPONSE ELEMENT CONTAINING A TWO BASE PAIR "AT" SPACER BETWEEN HALF SITES organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0311 <- 3.05 -> DG O6 E0019 : score 5.77917 : H : ARG NH2 A0311 <- 3.23 -> DG N7 E0019 : score 5.83554 : H : ARG NH1 B0311 <- 3.25 -> DG O6 F0007 : score 5.53583 : H : ARG NH2 B0311 <- 3.06 -> DG N7 F0007 : score 6.05262 : H : ARG NH1 C0311 <- 3.30 -> DG N7 F0019 : score 5.445 : H : ARG NH1 C0311 <- 2.93 -> DG O6 F0019 : score 5.92517 : H : ARG NH2 C0311 <- 3.10 -> DG N7 F0019 : score 6.00154 : H : ARG NH1 D0311 <- 3.09 -> DG O6 E0007 : score 5.7305 : H : ARG NH2 D0311 <- 3.05 -> DG N7 E0007 : score 6.06538 : x : ALA xxxx A0307 <- 3.74 -> DT xxx E0020 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0308 <- 3.85 -> DT xxx E0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0307 <- 3.85 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0308 <- 4.12 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0307 <- 3.93 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0308 <- 3.77 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0307 <- 3.78 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0308 <- 4.12 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx >3us2_ABCD:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P63 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A 19 BASE PAIR A/T RICH RESPONSE ELEMENT CONTAINING TWO HALF SITES WITH A SINGLE BASE PAIR OVERLAP organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0311 <- 3.06 -> DG O6 E0016 : score 5.767 : H : ARG NH2 A0311 <- 3.15 -> DG N7 E0016 : score 5.93769 : H : ARG NH1 B0311 <- 2.71 -> DG O6 F0007 : score 6.19283 : H : ARG NH2 B0311 <- 3.06 -> DG N7 F0007 : score 6.05262 : H : ARG NH1 C0311 <- 2.92 -> DG O6 E0007 : score 5.93733 : H : ARG NH2 C0311 <- 3.04 -> DG N7 E0007 : score 6.07815 : H : ARG NH1 D0311 <- 2.89 -> DG O6 F0016 : score 5.97383 : H : ARG NH2 D0311 <- 3.19 -> DG N7 F0016 : score 5.88662 : x : ALA xxxx A0307 <- 3.75 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0308 <- 3.95 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0307 <- 3.50 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0308 <- 3.78 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0307 <- 3.69 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0308 <- 4.08 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0307 <- 3.56 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0308 <- 3.94 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx >3us2_G:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P63 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A 19 BASE PAIR A/T RICH RESPONSE ELEMENT CONTAINING TWO HALF SITES WITH A SINGLE BASE PAIR OVERLAP organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 G0311 <- 3.03 -> DG O6 K0016 : score 5.8035 : H : ARG NH2 G0311 <- 3.15 -> DG N7 K0016 : score 5.93769 : x : ALA xxxx G0307 <- 3.74 -> DT xxx K0017 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx G0308 <- 3.95 -> DT xxx K0017 : score x.xxxxx >3us2_GHIJ:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P63 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A 19 BASE PAIR A/T RICH RESPONSE ELEMENT CONTAINING TWO HALF SITES WITH A SINGLE BASE PAIR OVERLAP organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 G0311 <- 3.03 -> DG O6 K0016 : score 5.8035 : H : ARG NH2 G0311 <- 3.15 -> DG N7 K0016 : score 5.93769 : H : ARG NH1 H0311 <- 2.72 -> DG O6 L0007 : score 6.18067 : H : ARG NH2 H0311 <- 3.08 -> DG N7 L0007 : score 6.02708 : H : ARG NH1 I0311 <- 2.93 -> DG O6 K0007 : score 5.92517 : H : ARG NH2 I0311 <- 3.06 -> DG N7 K0007 : score 6.05262 : H : ARG NH1 J0311 <- 2.88 -> DG O6 L0016 : score 5.986 : H : ARG NH2 J0311 <- 3.18 -> DG N7 L0016 : score 5.89938 : x : ALA xxxx G0307 <- 3.74 -> DT xxx K0017 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx G0308 <- 3.95 -> DT xxx K0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0307 <- 3.50 -> DT xxx L0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx H0308 <- 3.75 -> DT xxx L0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0307 <- 3.72 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx I0308 <- 4.04 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0307 <- 3.58 -> DT xxx L0017 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx J0308 <- 3.99 -> DT xxx L0017 : score x.xxxxx >3ut9_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE ASSEMBLED WITH A PALINDROMIC WIDOM '601' DERIVATIVE (NCP-601L) organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 E0040 <- 3.13 -> DT O2 I0009 : score 4.02219 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.24 -> DT O2 I0009 : score 3.8608 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.28 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.28 -> DA xxx J-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0027 <- 3.88 -> DG xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.37 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.19 -> DA xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.34 -> DG xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.10 -> DG xxx I0038 : score x.xxxxx >3uta_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE ASSEMBLED WITH AN ALPHA- SATELLITE SEQUENCE CONTAINING TWO TTAAA ELEMENTS (NCP-TA2) organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.83 -> DA N3 J0009 : score 3.22031 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.68 -> DA N3 I0009 : score 3.3175 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.69 -> DT xxx I0069 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.88 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.10 -> DC xxx I-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.06 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.46 -> DT xxx J0069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.13 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.34 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.53 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.97 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.59 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx >3utb_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE ASSEMBLED WITH THE 146B ALPHA-SATELLITE SEQUENCE (NCP146B) organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 A0040 <- 3.11 -> DA N3 J0009 : score 3.45376 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.03 -> DC xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.85 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.67 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.31 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 4.28 -> DT xxx J0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.23 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0026 <- 3.13 -> DG xxx I0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.06 -> DC xxx J0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.40 -> DA xxx I0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.83 -> DC xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.70 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.01 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.27 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.15 -> DC xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 2.99 -> DA xxx J-047 : score x.xxxxx >3utb_G:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE ASSEMBLED WITH THE 146B ALPHA-SATELLITE SEQUENCE (NCP146B) organism=? : x : ARG xxxx G0042 <- 4.15 -> DC xxx I0038 : score x.xxxxx >3uvf_B:Homing_endonucleases; title=EXPANDING LAGALIDADG ENDONUCLEASE SCAFFOLD DIVERSITY BY RAPIDLY SURVEYING EVOLUTIONARY SEQUENCE SPACE organism=Trichoderma reesei : H : GLU OE1 B0037 <- 2.72 -> DC N4 F0516 : score 5.86024 : H : ARG NH1 B0061 <- 2.47 -> DG O6 E0411 : score 6.48483 : H : ARG NH1 B0063 <- 2.62 -> DG N7 E0412 : score 6.2678 : H : ARG NH1 B0074 <- 3.04 -> DG N7 E0408 : score 5.7596 : H : ARG NE B0202 <- 2.67 -> DT O4 E0417 : score 1.90731 : H : ARG NH2 B0202 <- 2.85 -> DG O6 F0510 : score 6.534 : V : LYS CE B0204 <- 3.85 -> DT C7 E0419 : score 2.56851 : V : TYR CD1 B0020 <- 3.59 -> DT C7 F0518 : score 4.92678 : x : SER xxxx B0022 <- 3.39 -> DT xxx F0518 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0024 <- 3.06 -> DC xxx F0519 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0026 <- 2.04 -> DG xxx E0406 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0029 <- 3.44 -> DC xxx E0404 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0031 <- 4.34 -> DG xxx E0406 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0033 <- 3.52 -> DT xxx F0518 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0068 <- 3.51 -> DA xxx F0515 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0072 <- 3.48 -> DG xxx E0409 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0152 <- 3.77 -> DC xxx E0418 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0154 <- 3.68 -> DT xxx E0419 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0156 <- 3.32 -> DG xxx E0420 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0158 <- 3.62 -> DT xxx E0422 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0159 <- 3.81 -> DT xxx E0422 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0164 <- 2.85 -> DT xxx F0504 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0166 <- 4.36 -> DT xxx E0421 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0168 <- 4.36 -> DT xxx E0419 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0170 <- 3.61 -> DT xxx E0419 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0172 <- 3.16 -> DT xxx E0417 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0194 <- 3.53 -> DA xxx F0509 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0198 <- 4.45 -> DT xxx E0415 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0200 <- 4.02 -> DC xxx E0416 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0206 <- 3.41 -> DA xxx F0506 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0245 <- 4.02 -> DT xxx F0505 : score x.xxxxx >3uxp_B:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CO-CRYSTAL STRUCTURE OF RAT DNA POLYMERASE BETA MUTATOR I260Q: ENZYME- DNA-DDTTP organism=Rattus norvegicus : x : TYR xxxx B0271 <- 3.70 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0283 <- 3.97 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0295 <- 4.08 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx >3v1z_B:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TYPE IIF RESTRICTION ENDONUCLEASE BSE634I WITH COGNATE DNA organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NE B0202 <- 3.10 -> DG O6 D0009 : score 3.70456 : H : ARG NH2 B0202 <- 2.83 -> DG N7 D0009 : score 6.34631 : H : ARG NE B0205 <- 2.85 -> DG O6 D0008 : score 3.90162 : H : ARG NH2 B0205 <- 2.94 -> DG N7 D0008 : score 6.20585 : x : SER xxxx B0072 <- 4.04 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0073 <- 3.22 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0106 <- 4.40 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0200 <- 4.13 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx >3v20_B:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TYPE IIF RESTRICTION ENDONUCLEASE BSE634I WITH COGNATE DNA organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NE B0202 <- 2.94 -> DG O6 D0009 : score 3.83068 : H : ARG NH2 B0202 <- 2.87 -> DG N7 D0009 : score 6.29523 : H : ARG NE B0205 <- 2.87 -> DG O6 D0008 : score 3.88585 : H : ARG NH2 B0205 <- 3.00 -> DG N7 D0008 : score 6.12923 : x : SER xxxx B0072 <- 4.17 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0073 <- 3.66 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0106 <- 4.47 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0200 <- 4.24 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx >3v21_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF TYPE IIF RESTRICTION ENDONUCLEASE BSE634I WITH COGNATE DNA organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : ASN ND2 A0073 <- 2.71 -> DT O2 J0010 : score 4.83158 : H : ARG NE A0202 <- 2.76 -> DG O6 I0009 : score 3.97255 : H : ARG NH2 A0202 <- 2.96 -> DG N7 I0009 : score 6.18031 : H : ASP OD1 A0204 <- 3.19 -> DC N4 J0006 : score 4.92797 : H : ASP OD2 A0204 <- 2.81 -> DC N4 J0007 : score 6.1876 : H : ARG NE A0205 <- 2.79 -> DG O6 I0008 : score 3.94891 : H : ARG NH2 A0205 <- 3.10 -> DG N7 I0008 : score 6.00154 : H : ASN ND2 B0073 <- 2.71 -> DT O2 I0010 : score 4.83158 : H : ARG NE B0202 <- 2.70 -> DG O6 J0009 : score 4.01985 : H : ARG NH2 B0202 <- 2.92 -> DG N7 J0009 : score 6.23138 : H : ASP OD1 B0204 <- 3.18 -> DC N4 I0006 : score 4.93866 : H : ASP OD2 B0204 <- 2.85 -> DC N4 I0007 : score 6.138 : H : ARG NE B0205 <- 2.84 -> DG O6 J0008 : score 3.9095 : H : ARG NH2 B0205 <- 3.13 -> DG N7 J0008 : score 5.96323 : x : SER xxxx A0072 <- 3.53 -> DC xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0106 <- 4.36 -> 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DG N7 M0009 : score 6.43569 : H : ASP OD1 E0204 <- 3.23 -> DC N4 N0006 : score 4.88521 : H : ASP OD2 E0204 <- 2.85 -> DC N4 N0007 : score 6.138 : H : ARG NE E0205 <- 2.81 -> DG O6 M0008 : score 3.93314 : H : ARG NH2 E0205 <- 2.99 -> DG N7 M0008 : score 6.142 : H : ASN ND2 F0073 <- 2.69 -> DT O2 M0010 : score 4.85057 : H : LYS NZ F0108 <- 2.80 -> DC O2 N0003 : score 2.94615 : H : ARG NE F0202 <- 2.83 -> DG O6 N0009 : score 3.91738 : H : ARG NH2 F0202 <- 2.88 -> DG N7 N0009 : score 6.28246 : H : ASP OD1 F0204 <- 3.15 -> DC N4 M0006 : score 4.97073 : H : ASP OD2 F0204 <- 2.74 -> DC N4 M0007 : score 6.2744 : H : ARG NE F0205 <- 2.95 -> DG O6 N0008 : score 3.82279 : x : SER xxxx E0072 <- 3.97 -> DC xxx M0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0200 <- 4.03 -> DG xxx M0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0203 <- 3.18 -> DA xxx N0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0072 <- 3.91 -> DG xxx M0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0200 <- 4.23 -> DG xxx N0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0203 <- 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NE G0202 <- 2.57 -> DG O6 O0009 : score 4.12231 : H : ARG NH2 G0202 <- 2.79 -> DG N7 O0009 : score 6.39738 : H : ASP OD1 G0204 <- 3.14 -> DC N4 P0006 : score 4.98142 : H : ASP OD2 G0204 <- 2.80 -> DC N4 P0007 : score 6.2 : H : ARG NE G0205 <- 2.68 -> DG O6 O0008 : score 4.03561 : H : ARG NH2 G0205 <- 2.91 -> DG N7 O0008 : score 6.24415 : H : ASN ND2 H0073 <- 2.77 -> DT O2 O0010 : score 4.77463 : H : ARG NE H0202 <- 2.65 -> DG O6 P0009 : score 4.05926 : H : ARG NH2 H0202 <- 2.81 -> DG N7 P0009 : score 6.37185 : H : ASP OD1 H0204 <- 3.12 -> DC N4 O0006 : score 5.0028 : H : ASP OD2 H0204 <- 2.85 -> DC N4 O0007 : score 6.138 : H : ARG NE H0205 <- 2.81 -> DG O6 P0008 : score 3.93314 : H : ARG NH2 H0205 <- 3.03 -> DG N7 P0008 : score 6.09092 : x : SER xxxx G0072 <- 3.69 -> DC xxx O0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0106 <- 4.47 -> DG xxx P0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0200 <- 4.06 -> DG xxx O0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0203 <- 3.24 -> DA xxx P0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0072 <- 3.59 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0200 <- 4.08 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0203 <- 3.27 -> DA xxx O0005 : score x.xxxxx >3v4i_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) WITH DNA AND AZTTP organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH A0183 <- 3.03 -> DC O2 P0821 : score 3.33655 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.64 -> DT O2 P0806 : score 4.3688 : x : PHE xxxx A0061 <- 3.89 -> DA xxx T0705 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0063 <- 4.26 -> DA xxx T0705 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.73 -> DA xxx T0705 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.14 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.17 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.45 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >3v4i_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) WITH DNA AND AZTTP organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH A0183 <- 3.03 -> DC O2 P0821 : score 3.33655 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.64 -> DT O2 P0806 : score 4.3688 : x : PHE xxxx A0061 <- 3.89 -> DA xxx T0705 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0063 <- 4.26 -> DA xxx T0705 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.73 -> DA xxx T0705 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.14 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.17 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.45 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >3v4i_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) WITH DNA AND AZTTP organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH C0183 <- 2.85 -> DC O2 F0821 : score 3.46246 : x : PHE xxxx C0061 <- 4.22 -> DA xxx E0705 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0063 <- 4.24 -> DA xxx E0705 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0074 <- 4.00 -> DA xxx E0705 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0094 <- 3.29 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 4.22 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.04 -> DT xxx F0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.96 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >3v4r_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A UVRB DIMER-DNA COMPLEX organism=Bacillus subtilis : H : GLN NE2 B0346 <- 2.74 -> DT O2 C0004 : score 3.98053 : H : ARG NH2 B0357 <- 2.81 -> DT O2 C0007 : score 4.22487 : V : TYR CG B0096 <- 3.56 -> DT C7 C0007 : score 3.96603 : x : PRO xxxx B0098 <- 4.06 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0146 <- 3.96 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0350 <- 3.59 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0503 <- 3.73 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0527 <- 3.26 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0528 <- 4.47 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx >3v6d_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) CROSS-LINKED WITH AZT-TERMINATED DNA organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH A0183 <- 2.86 -> DC O2 P0821 : score 3.45547 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.04 -> DT O2 P0806 : score 4.0997 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.21 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 4.16 -> DA xxx T0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.28 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx >3v6d_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) CROSS-LINKED WITH AZT-TERMINATED DNA organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH C0183 <- 2.81 -> DC O2 F0821 : score 3.49044 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.00 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.45 -> DG xxx E0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 4.39 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.53 -> DT xxx F0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 4.28 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >3v6h_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=REPLICATION OF N2,3-ETHENOGUANINE BY DNA POLYMERASES organism=Sulfolobus solfataricus P2 : x : LYS xxxx B0243 <- 3.66 -> DC xxx T0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0244 <- 4.25 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0336 <- 3.63 -> DA xxx T0008 : score x.xxxxx >3v6j_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=REPLICATION OF N2,3-ETHENOGUANINE BY DNA POLYMERASES organism=Sulfolobus solfataricus P2 : w : LYS NZ A0221 <- 5.93 -> DA N3 P0010 : score 1.538 : x : SER xxxx A0244 <- 4.34 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.68 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx >3v6k_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=REPLICATION OF N2,3-ETHENOGUANINE BY DNA POLYMERASES organism=Sulfolobus solfataricus P2 : x : SER xxxx A0244 <- 4.40 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0332 <- 3.31 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.23 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx >3v6t_B:Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA-BOUND DHAX3, A TAL EFFECTOR, AT 1.85 ANGSTROM organism=XANTHOMONAS : H : ARG NH1 B0266 <- 2.69 -> DG O6 H-003 : score 6.21717 : H : ARG NH2 B0266 <- 3.00 -> DG N7 H-003 : score 6.12923 : H : ASP OD2 B0301 <- 2.93 -> DC N4 G0001 : score 6.0388 : w : ASP OD2 B0301 <- 5.61 -> DG O6 H-002 : score 3.228 : H : ASP OD2 B0335 <- 2.61 -> DC N4 G0002 : score 6.4356 : H : ASP OD2 B0369 <- 2.88 -> DC N4 G0003 : score 6.1008 : w : ASP OD2 B0369 <- 5.49 -> DA N6 H-004 : score 3.409 : H : SER OG B0505 <- 2.68 -> DA N7 G0007 : score 4.57124 : H : ASP OD2 B0573 <- 2.89 -> DC N4 G0009 : score 6.0884 : H : ASP OD1 B0641 <- 2.77 -> DC N4 G0011 : score 5.37694 : w : ASP OD1 B0641 <- 5.89 -> DA N6 H-012 : score 3.122 >3v72_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RAT DNA POLYMERASE BETA MUTATOR E295K: ENZYME- DSDNA organism=Rattus norvegicus : H : LYS NZ A0234 <- 3.36 -> DT O2 T0006 : score 3.18542 >3v79_C:p53-like_transcription_factors;DNA-binding_protein_LAG-1_CSL;E_set_domains; title=STRUCTURE OF HUMAN NOTCH1 TRANSCRIPTION COMPLEX INCLUDING CSL, RAM, ANK, AND MAML-1 ON HES-1 PROMOTER DNA SEQUENCE organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ C0152 <- 2.66 -> DG O6 X0010 : score 5.94263 : V : ARG CZ C0051 <- 3.68 -> DT C7 X0007 : score 2.19628 : x : TYR xxxx C0046 <- 3.31 -> DT xxx Y0107 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0049 <- 4.03 -> DC xxx Y0109 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0151 <- 3.47 -> DT xxx Y0106 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0181 <- 3.84 -> DT xxx X0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0182 <- 3.18 -> DA xxx Y0113 : score x.xxxxx >3v7j_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CO-CRYSTAL STRUCTURE OF WILD TYPE RAT POLYMERASE BETA: ENZYME-DNA BINARY COMPLEX organism=Rattus norvegicus : x : LYS xxxx A0234 <- 3.53 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >3v7k_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CO-CRYSTAL STRUCTURE OF K72E VARIANT OF RAT POLYMERASE BETA: ENZYME- DNA BINARY COMPLEX organism=Rattus norvegicus : x : LYS xxxx A0234 <- 4.24 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >3v81_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) WITH DNA AND THE NONNUCLEOSIDE INHIBITOR NEVIRAPINE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.15 -> DT O2 P0806 : score 4.00496 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.92 -> DC O2 T0723 : score 3.60995 : x : ILE xxxx A0063 <- 4.11 -> DA xxx T0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0230 <- 4.13 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.71 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >3v81_C:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) WITH DNA AND THE NONNUCLEOSIDE INHIBITOR NEVIRAPINE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : x : ILE xxxx C0094 <- 4.21 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0230 <- 3.78 -> DC xxx F0820 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 4.34 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.52 -> DT xxx F0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 4.01 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >3v81_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) WITH DNA AND THE NONNUCLEOSIDE INHIBITOR NEVIRAPINE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : x : ILE xxxx C0094 <- 4.21 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0230 <- 3.78 -> DC xxx F0820 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 4.34 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.52 -> DT xxx F0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 4.01 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >3v9w_AB:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RNASE T IN COMPLEX WITH A PREFERRED SSDNA (TTA) WITH TWO MG IN THE ACTIVE SITE organism=Escherichia coli : V : PHE CZ A0029 <- 3.79 -> DT C7 E0006 : score 7.13266 >3va3_AB:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RNASE T IN COMPLEX WITH A DUPLEX DNA PRODUCT (STEM LOOP DNA WITH 2 NUCLEOTIDE 3' OVERHANG) organism=Escherichia coli : x : PHE xxxx A0029 <- 3.19 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0145 <- 3.87 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0146 <- 3.79 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >3va3_B:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RNASE T IN COMPLEX WITH A DUPLEX DNA PRODUCT (STEM LOOP DNA WITH 2 NUCLEOTIDE 3' OVERHANG) organism=Escherichia coli : x : PRO xxxx B0145 <- 3.87 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0146 <- 3.79 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >3vaf_A:RNA-binding_domain,_RBD; title=STRUCTURE OF U2AF65 VARIANT WITH BRU3 DNA organism=HOMO SAPIENS : x : SER xxxx A0147 <- 4.43 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0150 <- 2.78 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0199 <- 3.30 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0229 <- 3.46 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0230 <- 3.67 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0231 <- 3.20 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx >3vai_A:RNA-binding_domain,_RBD; title=STRUCTURE OF U2AF65 VARIANT WITH BRU3C5 DNA organism=? : x : SER xxxx A0147 <- 4.27 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0150 <- 2.97 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0195 <- 3.42 -> DU xxx P0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0196 <- 3.51 -> DU xxx P0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0199 <- 3.56 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0229 <- 3.46 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0230 <- 4.03 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0231 <- 3.17 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx >3vak_A:RNA-binding_domain,_RBD; title=STRUCTURE OF U2AF65 VARIANT WITH BRU5 DNA organism=? : x : SER xxxx A0147 <- 4.40 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0150 <- 3.08 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0195 <- 3.51 -> DU xxx P0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0196 <- 3.65 -> DU xxx P0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0199 <- 3.42 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0229 <- 3.41 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0230 <- 3.86 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0231 <- 3.37 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx >3val_D:RNA-binding_domain,_RBD; title=STRUCTURE OF U2AF65 VARIANT WITH BRU5C1 DNA organism=HOMO SAPIENS : x : LYS xxxx D0260 <- 3.66 -> DU xxx K0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0262 <- 3.32 -> DU xxx K0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0289 <- 3.09 -> DU xxx K0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0291 <- 3.97 -> DU xxx K0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0304 <- 3.43 -> DU xxx K0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0328 <- 3.01 -> DU xxx K0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0331 <- 3.61 -> DU xxx K0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0333 <- 3.13 -> DU xxx K0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0335 <- 3.67 -> DU xxx K0003 : score x.xxxxx >3vam_A:RNA-binding_domain,_RBD; title=STRUCTURE OF U2AF65 VARIANT WITH BRU5C2 DNA organism=? : x : SER xxxx A0147 <- 4.44 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0150 <- 3.13 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0195 <- 3.45 -> DU xxx P0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0196 <- 3.60 -> DU xxx P0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0199 <- 3.44 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0229 <- 3.36 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0230 <- 4.37 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0231 <- 3.11 -> DU xxx P0006 : score x.xxxxx >3vd0_BD:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN TETRAMER MODULATES P73 TRANSACTIVATION organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0138 <- 2.81 -> DG N7 F0412 : score 5.37513 : H : ARG NH1 B0300 <- 3.09 -> DG O6 E0405 : score 5.7305 : H : ARG NH2 B0300 <- 3.04 -> DG N7 E0405 : score 6.07815 : H : LYS NZ D0138 <- 2.77 -> DG N7 G0502 : score 5.41821 : H : LYS NZ D0138 <- 2.62 -> DG O6 G0503 : score 5.98888 : H : CYS SG D0297 <- 3.05 -> DC N4 H0520 : score -3.29821 : H : ARG NH1 D0300 <- 2.95 -> DG O6 H0519 : score 5.90083 : H : ARG NH2 D0300 <- 3.20 -> DG N7 H0519 : score 5.87385 : x : ARG xxxx B0268 <- 4.13 -> DA xxx E0403 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0296 <- 4.22 -> DC xxx E0406 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0297 <- 3.88 -> DC xxx E0406 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0139 <- 4.43 -> DA xxx G0501 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0268 <- 4.11 -> DG xxx G0507 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0296 <- 3.86 -> DC xxx H0520 : score x.xxxxx >3vd0_D:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN TETRAMER MODULATES P73 TRANSACTIVATION organism=Homo sapiens : H : LYS NZ D0138 <- 2.77 -> DG N7 G0502 : score 5.41821 : H : LYS NZ D0138 <- 2.62 -> DG O6 G0503 : score 5.98888 : H : CYS SG D0297 <- 3.05 -> DC N4 H0520 : score -3.29821 : H : ARG NH1 D0300 <- 2.95 -> DG O6 H0519 : score 5.90083 : H : ARG NH2 D0300 <- 3.20 -> DG N7 H0519 : score 5.87385 : x : SER xxxx D0139 <- 4.43 -> DA xxx G0501 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0268 <- 4.11 -> DG xxx G0507 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0296 <- 3.86 -> DC xxx H0520 : score x.xxxxx >3vd0_IJ:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN TETRAMER MODULATES P73 TRANSACTIVATION organism=Homo sapiens : H : LYS NZ I0138 <- 3.03 -> DG N7 M0412 : score 5.13815 : H : LYS NZ I0138 <- 2.57 -> DG O6 M0413 : score 6.04668 : H : CYS SG I0297 <- 3.42 -> DC N4 N0406 : score -3.04129 : H : ARG NH1 I0300 <- 2.90 -> DG O6 N0405 : score 5.96167 : H : ARG NH2 I0300 <- 2.53 -> DG N7 N0405 : score 6.72938 : H : ARG NH1 J0300 <- 2.73 -> DG N7 M0417 : score 6.1347 : H : ARG NH2 J0300 <- 2.62 -> DG O6 M0417 : score 6.8376 : x : SER xxxx I0139 <- 4.18 -> DC xxx M0410 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0138 <- 3.21 -> DG xxx N0400 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0139 <- 4.38 -> DA xxx N0399 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0296 <- 4.08 -> DG xxx M0417 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx J0297 <- 3.58 -> DC xxx M0418 : score x.xxxxx >3vd1_CD:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN TETRAMER MODULATES P73 TRANSACTIVATION organism=Homo sapiens : H : LYS NZ C0138 <- 2.77 -> DG N7 H0514 : score 5.41821 : H : ARG NH1 C0300 <- 2.63 -> DG O6 G0507 : score 6.29017 : H : ARG NH2 C0300 <- 2.91 -> DG N7 G0507 : score 6.24415 : H : ARG NH1 D0300 <- 3.02 -> DG O6 H0519 : score 5.81567 : H : ARG NH2 D0300 <- 2.95 -> DG N7 H0519 : score 6.19308 : x : SER xxxx C0139 <- 4.08 -> DC xxx H0512 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0296 <- 3.64 -> DG xxx G0507 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0297 <- 3.95 -> DC xxx G0508 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0138 <- 3.05 -> DG xxx G0502 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0268 <- 4.12 -> DG xxx G0507 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0296 <- 3.92 -> DC xxx H0520 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0297 <- 3.44 -> DC xxx H0520 : score x.xxxxx >3vd1_IJ:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN TETRAMER MODULATES P73 TRANSACTIVATION organism=Homo sapiens : H : LYS NZ I0138 <- 3.08 -> DG N7 M0602 : score 5.08429 : H : CYS SG I0297 <- 3.11 -> DC N4 N0620 : score -3.25654 : H : ARG NH1 I0300 <- 2.59 -> DG N7 N0619 : score 6.3041 : H : ARG NH2 I0300 <- 3.11 -> DG O6 N0619 : score 6.1908 : H : LYS NZ J0138 <- 2.86 -> DG N7 N0614 : score 5.32127 : H : ARG NH1 J0300 <- 3.00 -> DG N7 M0607 : score 5.808 : H : ARG NH2 J0300 <- 2.95 -> DG O6 M0607 : score 6.402 : x : ALA xxxx I0296 <- 3.91 -> DG xxx N0619 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0139 <- 4.36 -> DG xxx N0613 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx J0297 <- 3.60 -> DC xxx M0608 : score x.xxxxx >3vd1_J:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN TETRAMER MODULATES P73 TRANSACTIVATION organism=Homo sapiens : H : LYS NZ J0138 <- 2.86 -> DG N7 N0614 : score 5.32127 : H : ARG NH1 J0300 <- 3.00 -> DG N7 M0607 : score 5.808 : H : ARG NH2 J0300 <- 2.95 -> DG O6 M0607 : score 6.402 : x : SER xxxx J0139 <- 4.36 -> DG xxx N0613 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx J0297 <- 3.60 -> DC xxx M0608 : score x.xxxxx >3vd1_KL:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN TETRAMER MODULATES P73 TRANSACTIVATION organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 K0300 <- 2.78 -> DG N7 O0707 : score 6.41015 : H : ARG NH2 K0300 <- 3.24 -> DG O6 O0707 : score 6.0192 : H : LYS NZ L0138 <- 3.02 -> DG N7 O0702 : score 5.14892 : H : LYS NZ L0138 <- 2.67 -> DG O6 O0703 : score 5.93107 : H : CYS SG L0297 <- 3.12 -> DC N4 P0720 : score -3.2496 : H : ARG NH1 L0300 <- 2.79 -> DG O6 P0719 : score 6.0955 : H : ARG NH2 L0300 <- 2.62 -> DG N7 P0719 : score 6.61446 : x : LYS xxxx K0138 <- 3.39 -> DG xxx P0713 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx K0296 <- 4.33 -> DG xxx O0707 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx K0297 <- 3.62 -> DC xxx O0708 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx L0296 <- 3.69 -> DG xxx P0719 : score x.xxxxx >3vd2_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN TETRAMER MODULATES P73 TRANSACTIVATION organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0138 <- 3.19 -> DG N7 E0405 : score 4.9658 : H : ARG NH1 A0300 <- 3.33 -> DG N7 F0508 : score 5.4087 : H : ARG NH2 A0300 <- 2.74 -> DG O6 F0508 : score 6.6792 : x : SER xxxx A0139 <- 4.44 -> DG xxx E0404 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0296 <- 4.15 -> DT xxx F0509 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0297 <- 3.67 -> DT xxx F0509 : score x.xxxxx >3vd2_BC:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN TETRAMER MODULATES P73 TRANSACTIVATION organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0300 <- 3.32 -> DG N7 E0410 : score 5.4208 : H : ARG NH2 B0300 <- 2.65 -> DG O6 E0410 : score 6.798 : H : LYS NZ C0138 <- 2.91 -> DG N7 G0605 : score 5.26741 : H : ARG NH2 C0300 <- 2.84 -> DG N7 H0708 : score 6.33354 : x : LYS xxxx B0138 <- 3.55 -> DG xxx F0502 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0139 <- 3.88 -> DG xxx F0502 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0296 <- 4.02 -> DT xxx E0411 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0297 <- 3.83 -> DT xxx E0411 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0139 <- 4.49 -> DG xxx G0604 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0296 <- 3.84 -> DT xxx H0709 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0297 <- 3.93 -> DT xxx H0709 : score x.xxxxx >3vd2_IJ:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN TETRAMER MODULATES P73 TRANSACTIVATION organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 I0300 <- 3.19 -> DG N7 K0910 : score 5.5781 : H : ARG NH1 I0300 <- 2.64 -> DG O6 K0910 : score 6.278 : H : ARG NH2 I0300 <- 3.11 -> DG N7 K0910 : score 5.98877 : H : LYS NZ J0138 <- 3.18 -> DG N7 K0905 : score 4.97657 : H : ARG NH1 J0300 <- 3.11 -> DG N7 L0808 : score 5.6749 : H : ARG NH1 J0300 <- 3.04 -> DG O6 L0808 : score 5.79133 : H : ARG NH2 J0300 <- 2.58 -> DG N7 L0808 : score 6.66554 : x : LYS xxxx I0138 <- 3.75 -> DG xxx L0803 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0296 <- 3.12 -> DT xxx K0911 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx I0297 <- 3.82 -> DT xxx K0911 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0139 <- 3.48 -> DG xxx K0904 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0296 <- 3.19 -> DT xxx L0809 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx J0297 <- 3.61 -> DT xxx L0809 : score x.xxxxx >3vd6_C:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=BOTH ZN FINGERS OF GATA1 BOUND TO PALINDROMIC DNA RECOGNITION SITE, P21 CRYSTAL FORM organism=Mus musculus : H : ARG NH1 C0216 <- 2.97 -> DG N7 A0012 : score 5.8443 : H : ARG NH2 C0216 <- 3.06 -> DT O4 B0030 : score 3.36905 : H : ARG NH2 C0216 <- 2.93 -> DG O6 A0012 : score 6.4284 : H : ARG NH1 C0270 <- 3.00 -> DG N7 B0033 : score 5.808 : H : ARG NH2 C0270 <- 2.89 -> DG O6 B0033 : score 6.4812 : H : ARG NH2 C0270 <- 3.09 -> DT O4 A0009 : score 3.34772 : H : ARG NH1 C0305 <- 2.73 -> DT O2 A0007 : score 4.3667 : H : ARG NH1 C0307 <- 2.79 -> DT O2 B0035 : score 4.31502 : w : ARG NH2 C0307 <- 5.50 -> DC O2 A0010 : score 1.669 : V : LEU CB C0214 <- 3.81 -> DT C7 B0030 : score 4.38798 : V : LEU CB C0284 <- 3.78 -> DT C7 A0007 : score 4.42097 : x : PRO xxxx C0213 <- 4.13 -> DT xxx B0030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0226 <- 2.95 -> DA xxx B0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0230 <- 3.64 -> DC xxx B0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0267 <- 3.53 -> DT xxx A0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0268 <- 3.50 -> DT xxx B0032 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0280 <- 2.99 -> DA xxx A0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0288 <- 4.00 -> DT xxx A0006 : score x.xxxxx >3vea_A:Ribbon-helix-helix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MATP-MATS23MER organism=Yersinia pestis : H : ARG NE A0088 <- 2.88 -> DG N7 M0006 : score 4.35105 : H : ARG NH2 A0088 <- 2.83 -> DG O6 M0006 : score 6.5604 : w : ARG NH2 A0088 <- 6.02 -> DC N4 M0005 : score 0.976 : H : ARG NH1 A0093 <- 2.97 -> DG N7 N0014 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0093 <- 2.75 -> DG O6 N0014 : score 6.666 : H : SER OG A0106 <- 3.20 -> DA N7 N0011 : score 4.10697 : w : SER OG A0106 <- 6.36 -> DT O4 N0012 : score 2.338 : H : ASP OD2 A0108 <- 3.03 -> DC N4 N0010 : score 5.9148 : V : ALA CB A0089 <- 3.73 -> DT C7 N0015 : score 5.69696 : x : GLN xxxx A0085 <- 3.74 -> DC xxx N0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0086 <- 4.15 -> DT xxx N0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0092 <- 4.41 -> DT xxx M0007 : score x.xxxxx >3vea_AB:Ribbon-helix-helix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MATP-MATS23MER organism=Yersinia pestis : H : ARG NE A0088 <- 2.88 -> DG N7 M0006 : score 4.35105 : H : ARG NH2 A0088 <- 2.83 -> DG O6 M0006 : score 6.5604 : w : ARG NH2 A0088 <- 6.02 -> DC N4 M0005 : score 0.976 : H : ARG NH1 A0093 <- 2.97 -> DG N7 N0014 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0093 <- 2.75 -> DG O6 N0014 : score 6.666 : H : SER OG A0106 <- 3.20 -> DA N7 N0011 : score 4.10697 : w : SER OG A0106 <- 6.36 -> DT O4 N0012 : score 2.338 : H : ASP OD2 A0108 <- 3.03 -> DC N4 N0010 : score 5.9148 : H : ARG NE B0088 <- 2.98 -> DG N7 N0006 : score 4.26261 : H : ARG NH2 B0088 <- 2.68 -> DG O6 N0006 : score 6.7584 : H : ARG NH1 B0093 <- 3.23 -> DG N7 M0014 : score 5.5297 : H : ARG NH2 B0093 <- 3.32 -> DG N7 M0014 : score 5.72062 : H : ARG NH2 B0093 <- 2.79 -> DG O6 M0014 : score 6.6132 : H : SER OG B0106 <- 3.29 -> DA N6 M0012 : score 2.96735 : H : ASP OD2 B0108 <- 3.08 -> DC N4 M0010 : score 5.8528 : w : ASP OD1 B0108 <- 6.37 -> DT O4 N0012 : score 2.616 : V : ALA CB A0089 <- 3.73 -> DT C7 N0015 : score 5.69696 : x : GLN xxxx B0085 <- 3.65 -> DC xxx M0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0086 <- 4.35 -> DT xxx M0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0089 <- 3.92 -> DT xxx M0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0092 <- 4.37 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0085 <- 3.74 -> DC xxx N0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0086 <- 4.15 -> DT xxx N0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0092 <- 4.41 -> DT xxx M0007 : score x.xxxxx >3veb_AB:Ribbon-helix-helix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MATP-MATS organism=Yersinia pestis : H : ARG NE A0088 <- 2.24 -> DG N7 M0003 : score 4.91704 : H : ARG NH2 A0088 <- 2.37 -> DG O6 M0003 : score 7.1676 : H : ARG NH1 A0093 <- 3.02 -> DG N7 N0011 : score 5.7838 : H : ARG NH2 A0093 <- 3.24 -> DG N7 N0011 : score 5.82277 : H : ARG NH2 A0093 <- 2.95 -> DG O6 N0011 : score 6.402 : H : ASP OD2 A0108 <- 3.38 -> DC N4 N0007 : score 5.4808 : H : ARG NE B0088 <- 2.51 -> DG N7 N0003 : score 4.67826 : H : ARG NH2 B0088 <- 2.58 -> DG O6 N0003 : score 6.8904 : H : ARG NH1 B0093 <- 2.85 -> DG N7 M0011 : score 5.9895 : H : ARG NH2 B0093 <- 2.69 -> DG O6 M0011 : score 6.7452 : H : ASP OD2 B0108 <- 3.27 -> DC N4 M0007 : score 5.6172 : V : ALA CB A0089 <- 3.60 -> DT C7 N0012 : score 5.87892 : V : ALA CB B0089 <- 3.80 -> DT C7 M0012 : score 5.59897 : x : GLN xxxx B0085 <- 3.59 -> DC xxx M0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0092 <- 4.50 -> DT xxx N0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0104 <- 3.77 -> DT xxx M0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0106 <- 4.28 -> DA xxx M0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0084 <- 3.72 -> DC xxx M0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0085 <- 3.76 -> DC xxx N0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0092 <- 4.15 -> DT xxx M0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0106 <- 3.74 -> DT xxx N0009 : score x.xxxxx >3veb_B:Ribbon-helix-helix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MATP-MATS organism=Yersinia pestis : H : ARG NE B0088 <- 2.51 -> DG N7 N0003 : score 4.67826 : H : ARG NH2 B0088 <- 2.58 -> DG O6 N0003 : score 6.8904 : H : ARG NH1 B0093 <- 2.85 -> DG N7 M0011 : score 5.9895 : H : ARG NH2 B0093 <- 2.69 -> DG O6 M0011 : score 6.7452 : H : ASP OD2 B0108 <- 3.27 -> DC N4 M0007 : score 5.6172 : V : ALA CB B0089 <- 3.80 -> DT C7 M0012 : score 5.59897 : x : GLN xxxx B0085 <- 3.59 -> DC xxx M0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0092 <- 4.50 -> DT xxx N0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0104 <- 3.77 -> DT xxx M0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0106 <- 4.28 -> DA xxx M0009 : score x.xxxxx >3vek_C:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=BOTH ZN FINGERS OF GATA1 BOUND TO PALINDROMIC DNA RECOGNITION SITE, P1 CRYSTAL FORM organism=Mus musculus : H : ARG NH1 C0216 <- 3.10 -> DG N7 A0012 : score 5.687 : H : ARG NH2 C0216 <- 3.06 -> DG O6 A0012 : score 6.2568 : H : ARG NH1 C0270 <- 2.94 -> DG N7 B0033 : score 5.8806 : H : ARG NH2 C0270 <- 2.99 -> DT O4 A0009 : score 3.4188 : H : ARG NH2 C0270 <- 2.92 -> DG O6 B0033 : score 6.4416 : H : ARG NH1 C0305 <- 2.81 -> DT O2 A0007 : score 4.2978 : H : ARG NH2 C0305 <- 3.22 -> DT O2 A0007 : score 3.87773 : H : ARG NH1 C0307 <- 3.31 -> DT O2 B0035 : score 3.86716 : H : ARG NH2 C0307 <- 3.02 -> DT O2 B0035 : score 4.04707 : V : LEU CD2 C0288 <- 3.72 -> DT C7 A0006 : score 5.84591 : V : LEU CB C0284 <- 3.66 -> DT C7 A0007 : score 4.55294 : V : PRO CB C0213 <- 3.85 -> DT C7 B0030 : score 5.73358 : V : LEU CD1 C0268 <- 3.80 -> DT C7 B0032 : score 5.73128 : x : LEU xxxx C0214 <- 3.58 -> DA xxx A0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0226 <- 2.90 -> DA xxx B0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0230 <- 3.60 -> DC xxx B0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0267 <- 3.33 -> DT xxx A0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0280 <- 3.03 -> DA xxx A0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0287 <- 3.74 -> DG xxx B0033 : score x.xxxxx >3vh0_A:C-terminal_heme_d1_domain_of_cytochrome_cd1-nitrite_reductase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI YNCE COMPLEXED WITH DNA organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0144 <- 2.69 -> DG N7 F0011 : score 6.52508 : x : ARG xxxx A0139 <- 2.81 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0160 <- 4.35 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0186 <- 2.91 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0232 <- 3.32 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0234 <- 3.64 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx >3vh0_AD:C-terminal_heme_d1_domain_of_cytochrome_cd1-nitrite_reductase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI YNCE COMPLEXED WITH DNA organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0144 <- 2.69 -> DG N7 F0011 : score 6.52508 : H : ARG NH2 D0144 <- 2.73 -> DG N7 E0011 : score 6.474 : x : ARG xxxx A0139 <- 2.81 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0160 <- 4.35 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0186 <- 2.91 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0232 <- 3.32 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0234 <- 3.64 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0139 <- 2.84 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0160 <- 4.38 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0186 <- 2.92 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0232 <- 3.33 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0234 <- 3.67 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx >3vk7_B:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA-GLYCOSYLASE BOUND TO DNA CONTAINING 5- HYDROXYURACIL organism=Acanthamoeba polyphaga mimivirus : H : ARG NE B0114 <- 3.11 -> DG N7 E0007 : score 4.14764 : H : ARG NH2 B0114 <- 2.82 -> DG O6 E0007 : score 6.5736 : w : ARG NH1 B0114 <- 6.21 -> DA N3 F0019 : score 2.585 : H : SER OG B0272 <- 3.21 -> DA N7 E0003 : score 4.09805 : x : LEU xxxx B0084 <- 3.39 -> DG xxx F0021 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0113 <- 3.65 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0116 <- 3.44 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0274 <- 3.51 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0275 <- 2.89 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0277 <- 3.55 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx >3vk8_B:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA-GLYCOSYLASE BOUND TO DNA CONTAINING THYMINE GLYCOL organism=Acanthamoeba polyphaga mimivirus : w : ARG NH1 B0032 <- 6.69 -> DG N2 F0021 : score 1.082 : H : ARG NE B0114 <- 2.76 -> DC O2 E0007 : score 2.68025 : H : ARG NH2 B0114 <- 3.00 -> DC N3 E0007 : score 2.19938 : w : ARG NH1 B0114 <- 6.39 -> DA N3 F0019 : score 2.585 : H : SER OG B0272 <- 3.00 -> DA N7 E0003 : score 4.28554 : x : LEU xxxx B0084 <- 3.70 -> DG xxx F0021 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0113 <- 3.14 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0116 <- 3.35 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0274 <- 3.37 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0275 <- 2.90 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0277 <- 3.60 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx >3vke_A:Eukaryotic_type_KH-domain_KH-domain_type_I; title=CONTRIBUTION OF THE FIRST K-HOMOLOGY DOMAIN OF POLY(C)-BINDING PROTEIN 1 TO ITS AFFINITY AND SPECIFICITY FOR C-RICH OLIGONUCLEOTIDES organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 A0066 <- 3.06 -> DA N6 S0001 : score 5.70866 : H : LYS NZ A0070 <- 2.81 -> DC O2 S0005 : score 2.94026 : w : LYS NZ A0070 <- 6.30 -> DC O2 S0005 : score 1.3 >3vok_A:Homeodomain-like; title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF WILD TYPE HRTR IN THE APO FORM WITH THE TARGET DNA. organism=Lactococcus lactis : x : GLN xxxx A0051 <- 3.45 -> DA xxx U0001 : score x.xxxxx >3vw3_H:Immunoglobulin; title=ANTIBODY 64M-5 FAB IN COMPLEX WITH A DOUBLE-STRANDED DNA (6-4) PHOTOPRODUCT organism=MUS MUSCULUS : x : TYR xxxx H0100 <- 3.03 -> DA xxx A0008 : score x.xxxxx >3vw3_HL:Immunoglobulin; title=ANTIBODY 64M-5 FAB IN COMPLEX WITH A DOUBLE-STRANDED DNA (6-4) PHOTOPRODUCT organism=MUS MUSCULUS : H : TYR OH L0032 <- 2.62 -> DA N3 A0008 : score 4.30073 : x : GLN xxxx L0027 <- 3.37 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0028 <- 3.89 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0030 <- 3.22 -> DA xxx A0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0050 <- 3.84 -> DA xxx A0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0067 <- 2.92 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0093 <- 3.09 -> DA xxx A0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0100 <- 3.03 -> DA xxx A0008 : score x.xxxxx >3vw3_L:Immunoglobulin; title=ANTIBODY 64M-5 FAB IN COMPLEX WITH A DOUBLE-STRANDED DNA (6-4) PHOTOPRODUCT organism=MUS MUSCULUS : H : TYR OH L0032 <- 2.62 -> DA N3 A0008 : score 4.30073 : x : GLN xxxx L0027 <- 3.37 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0028 <- 3.89 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0030 <- 3.22 -> DA xxx A0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0050 <- 3.84 -> DA xxx A0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0067 <- 2.92 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0093 <- 3.09 -> DA xxx A0011 : score x.xxxxx >3vw4_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA-BINDING DOMAIN OF COLE2-P9 REP IN COMPLEX WITH THE REPLICATION ORIGIN organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0252 <- 2.73 -> DC O2 C0020 : score 3.7011 : H : SER OG A0260 <- 3.26 -> DA N3 C0017 : score 2.72749 : H : ARG NH1 A0262 <- 3.01 -> DT O2 C0015 : score 4.12554 : H : ARG NH2 A0270 <- 2.70 -> DG N7 D0027 : score 6.51231 : H : ARG NH2 A0270 <- 2.75 -> DG O6 D0027 : score 6.666 : w : ARG NH1 A0270 <- 5.97 -> DC N4 C0010 : score 1.892 : H : ARG NH1 A0282 <- 2.62 -> DG N7 D0028 : score 6.2678 : H : ARG NH1 A0287 <- 2.48 -> DG N7 C0006 : score 6.4372 : H : ARG NH2 A0287 <- 3.36 -> DT O4 D0031 : score 3.15582 : V : TYR CB A0286 <- 3.52 -> DT C7 D0029 : score 5.20953 : x : LYS xxxx A0185 <- 3.64 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0189 <- 2.51 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0195 <- 4.17 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0240 <- 3.12 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0245 <- 3.91 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0248 <- 3.28 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0249 <- 2.78 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0281 <- 4.34 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0283 <- 3.31 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx >3vwb_A:KorB_DNA-binding_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF VIRB CORE DOMAIN (SE-MET DERIVATIVE) COMPLEXED WITH THE CIS-ACTING SITE (5-BRU MODIFICATIONS) UPSTREAM ICSB PROMOTER organism=Shigella flexneri 2a : H : ARG NH1 A0167 <- 2.88 -> DG N7 C0017 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0167 <- 2.82 -> DT O4 B0012 : score 3.53963 : H : ARG NH2 A0167 <- 2.77 -> DG O6 C0017 : score 6.6396 : V : ARG CB A0162 <- 3.87 -> DT C7 B0010 : score 0.987539 : x : SER xxxx A0161 <- 4.28 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0163 <- 3.23 -> DT xxx B0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0166 <- 3.68 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0190 <- 3.93 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx >3vxv_A:DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF METHYL CPG BINDING DOMAIN OF MBD4 IN COMPLEX WITH THE 5MCG/TG SEQUENCE organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0084 <- 2.88 -> DG N7 C0005 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0084 <- 2.86 -> DG O6 C0005 : score 6.5208 : w : LYS NZ A0104 <- 6.13 -> DC N4 C0003 : score 0.048 : H : ARG NH1 A0106 <- 3.13 -> DT O4 C0004 : score 3.05226 : H : ARG NH1 A0106 <- 2.93 -> DG O6 B0010 : score 5.92517 : H : ARG NH2 A0106 <- 2.98 -> DG N7 B0010 : score 6.15477 : x : THR xxxx A0089 <- 4.15 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0092 <- 4.03 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0094 <- 3.65 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx >3vxx_A:DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF METHYL CPG BINDING DOMAIN OF MBD4 IN COMPLEX WITH THE 5MCG/5MCG SEQUENCE organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0084 <- 2.80 -> DG N7 C0005 : score 6.05 : H : ARG NH2 A0084 <- 2.86 -> DG O6 C0005 : score 6.5208 : H : ARG NH1 A0106 <- 2.61 -> DG O6 B0010 : score 6.3145 : H : ARG NH2 A0106 <- 3.21 -> DG N7 B0010 : score 5.86108 : x : THR xxxx A0089 <- 4.45 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0092 <- 4.14 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0104 <- 3.87 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx >3vyb_A:DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF METHYL CPG BINDING DOMAIN OF MBD4 IN COMPLEX WITH THE 5MCG/HMCG SEQUENCE organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0084 <- 2.68 -> DG N7 C0005 : score 6.1952 : H : ARG NH2 A0084 <- 2.75 -> DG O6 C0005 : score 6.666 : H : ARG NH1 A0106 <- 2.85 -> DG O6 B0010 : score 6.0225 : H : ARG NH2 A0106 <- 2.94 -> DG N7 B0010 : score 6.20585 : x : THR xxxx A0089 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THE COMPLEX COMPRISED OF PHOSPHORYLATED ETS1, RUNX1, CBFBETA, AND THE TCRALPHA GENE ENHANCER DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE H0391 <- 2.82 -> DG O6 J0005 : score 3.92526 : H : ARG NH2 H0391 <- 3.25 -> DG N7 J0005 : score 5.81 : H : ARG NE H0394 <- 2.86 -> DG N7 J0004 : score 4.36873 : H : ARG NH2 H0394 <- 3.03 -> DG O6 J0004 : score 6.2964 : H : TYR OH H0395 <- 2.77 -> DA N6 I0009 : score 4.69854 : H : TYR OH H0395 <- 2.86 -> DA N6 J0006 : score 4.61447 : x : LYS xxxx H0388 <- 3.91 -> DT xxx I0010 : score x.xxxxx >3wtu_AC:p53-like_transcription_factors;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX COMPRISED OF ETS1 (V170A), RUNX1, CBFBETA, AND THE TCRALPHA GENE ENHANCER DNA organism=MUS MUSCULUS / HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0080 <- 2.82 -> DG N7 E0008 : score 6.0258 : H : ARG NH2 A0080 <- 2.82 -> DG O6 E0008 : score 6.5736 : H : ARG NH1 A0142 <- 3.14 -> DA N3 D0003 : score 3.43167 : H : ASP OD1 A0171 <- 2.82 -> DC N4 D0005 : score 5.32349 : H : ASP 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>3wtx_AC:p53-like_transcription_factors;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX COMPRISED OF ETS1(Y329A), RUNX1, CBFBETA, AND THE TCRALPHA GENE ENHANCER DNA organism=MUS MUSCULUS / HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0080 <- 2.88 -> DG N7 E0108 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0080 <- 2.91 -> DG O6 E0108 : score 6.4548 : H : ARG NH1 A0142 <- 3.06 -> DA N3 D0003 : score 3.49058 : H : ASP OD1 A0171 <- 2.74 -> DC N4 D0005 : score 5.40901 : H : ASP OD2 A0171 <- 2.92 -> DC N4 D0006 : score 6.0512 : H : ARG NH1 A0174 <- 2.90 -> DG O6 E0110 : score 5.96167 : H : ARG NH2 A0174 <- 3.25 -> DG N7 E0110 : score 5.81 : H : ARG NH1 A0177 <- 2.95 -> DG N7 E0111 : score 5.8685 : H : ARG NH2 A0177 <- 3.30 -> DG O6 E0111 : score 5.94 : H : ARG NE C0391 <- 2.59 -> DG O6 E0105 : score 4.10655 : H : ARG NH2 C0391 <- 3.05 -> DG N7 E0105 : score 6.06538 : H : ARG NE C0394 <- 2.84 -> DG N7 E0104 : score 4.38642 : H : ARG NH2 C0394 <- 3.04 -> DG O6 E0104 : score 6.2832 : H : TYR OH C0395 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THR xxxx D0117 <- 3.32 -> DT xxx L0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0118 <- 3.17 -> DT xxx L0005 : score x.xxxxx >3wvp_A: title=TIME-RESOLVED CRYSTAL STRUCTURE OF HINDIII WITH 60SEC SOAKING organism=? : H : SER OG A0056 <- 2.71 -> DT O2 G0008 : score 3.76399 : w : SER OG A0056 <- 5.33 -> DG N3 H0006 : score 2.344 : w : GLU OE1 A0060 <- 5.18 -> DA N3 H0005 : score 0.995 : H : LYS NZ A0061 <- 2.85 -> DT O2 G0009 : score 3.55131 : w : LYS NZ A0061 <- 5.58 -> DA N3 H0005 : score 1.538 : w : ARG NE A0088 <- 5.71 -> DG N3 G0011 : score 1.082 A : w : ARG NH2 A0088 <- 5.35 -> DA N3 H0004 : score 2.092 A : H : ASN OD1 A0120 <- 2.94 -> DA N6 G0004 : score 5.85318 A : H : LYS NZ A0122 <- 2.85 -> DG O6 G0006 : score 5.72296 : w : LYS NZ A0122 <- 5.70 -> DA N7 G0005 : score 1.655 : H : ASP OD1 A0123 <- 3.15 -> DC N4 H0007 : score 4.97073 A : w : LYS NZ A0125 <- 5.82 -> DA N7 H0005 : score 1.655 : x : ARG xxxx A0116 <- 3.53 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0117 <- 3.25 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0118 <- 3.23 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx >3wvp_AB: title=TIME-RESOLVED CRYSTAL STRUCTURE OF HINDIII WITH 60SEC SOAKING organism=HAEMOPHILUS INFLUENZAE : H : SER OG A0056 <- 2.71 -> DT O2 G0008 : score 3.76399 : w : GLU OE1 A0060 <- 5.18 -> DA N3 H0005 : score 0.995 : H : LYS NZ A0061 <- 2.85 -> DT O2 G0009 : score 3.55131 : w : LYS NZ A0061 <- 5.58 -> DA N3 H0005 : score 1.538 : w : ARG NE A0088 <- 5.71 -> DG N3 G0011 : score 1.082 A : H : ASN OD1 A0120 <- 2.94 -> DA N6 G0004 : score 5.85318 A : H : LYS NZ A0122 <- 2.85 -> DG O6 G0006 : score 5.72296 : w : LYS NZ A0122 <- 5.70 -> DA N7 G0005 : score 1.655 : H : ASP OD1 A0123 <- 3.15 -> DC N4 H0007 : score 4.97073 A : w : LYS NZ A0125 <- 5.82 -> DA N7 H0005 : score 1.655 : H : SER OG B0056 <- 2.66 -> DT O2 H0008 : score 3.80096 : w : GLU OE1 B0060 <- 5.51 -> DA N3 G0005 : score 0.995 : H : LYS NZ B0061 <- 2.86 -> DT O2 H0009 : score 3.54413 : w : LYS NZ B0061 <- 5.48 -> DA N3 G0005 : score 1.538 : w : ARG NE B0088 <- 5.87 -> DG N3 H0011 : score 1.082 A : H : ASN OD1 B0120 <- 2.93 -> DA N6 H0004 : score 5.86523 A : H : LYS NZ B0122 <- 2.83 -> DG O6 H0006 : score 5.74608 : w : LYS NZ B0122 <- 5.98 -> DA N7 H0005 : score 1.655 : H : ASP OD1 B0123 <- 2.86 -> DC N4 G0007 : score 5.28073 A : w : LYS NZ B0125 <- 5.51 -> DA N7 G0005 : score 1.655 : x : ARG xxxx A0116 <- 3.53 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0117 <- 3.25 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0118 <- 3.23 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0116 <- 3.58 -> DC xxx G0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0117 <- 3.39 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0118 <- 3.15 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx >3wvp_CD: title=TIME-RESOLVED CRYSTAL STRUCTURE OF HINDIII WITH 60SEC SOAKING organism=HAEMOPHILUS INFLUENZAE : H : SER OG C0056 <- 2.65 -> DT O2 E0008 : score 3.80836 : w : GLU OE1 C0060 <- 5.46 -> DA N3 F0005 : score 0.995 : H : LYS NZ C0061 <- 2.86 -> DT O2 E0009 : score 3.54413 : w : LYS NZ C0061 <- 5.71 -> DA N3 F0005 : score 1.538 : w : ARG NE C0088 <- 5.81 -> DG N3 E0011 : score 1.082 A : H : ASN OD1 C0120 <- 2.93 -> DA N6 E0004 : score 5.86523 A : H : LYS NZ C0122 <- 3.02 -> DG O6 E0006 : score 5.52642 : w : LYS NZ C0122 <- 5.83 -> DA N7 E0005 : score 1.655 : H : ASP OD1 C0123 <- 3.21 -> DC N4 F0007 : score 4.90659 A : w : LYS NZ C0125 <- 5.86 -> DA N7 F0005 : score 1.655 : H : SER OG D0056 <- 2.62 -> DT O2 F0008 : score 3.83054 : w : GLU OE1 D0060 <- 5.64 -> DA N3 E0005 : score 0.995 : H : LYS NZ D0061 <- 2.89 -> DT O2 F0009 : score 3.52261 : w : LYS NZ D0061 <- 5.77 -> DA N3 E0005 : score 1.538 : w : ARG NE D0088 <- 5.70 -> DG N3 F0011 : score 1.082 A : H : ASN OD1 D0120 <- 2.86 -> DA N6 F0004 : score 5.94953 A : H : LYS NZ D0122 <- 2.77 -> DG O6 F0006 : score 5.81545 : w : LYS NZ D0122 <- 5.86 -> DA N7 F0005 : score 1.655 : H : ASP OD1 D0123 <- 3.09 -> DC N4 E0007 : score 5.03487 A : w : LYS NZ D0125 <- 5.50 -> DA N7 E0005 : score 1.655 : x : ARG xxxx C0116 <- 3.46 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0117 <- 3.38 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0118 <- 3.13 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0116 <- 3.47 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0117 <- 3.24 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0118 <- 3.14 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx >3x1l_ABCDEFGH: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE CRISPR-CAS RNA SILENCING CMR COMPLEX BOUND TO A TARGET ANALOG organism=ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS DSM 4304 / PYROCOCCUS FURIOSUS DSM 3638 : H : ARG NE A0790 <- 3.07 -> DC O2 J0026 : score 2.51539 : H : SER OG D0117 <- 2.78 -> DA N3 J0030 : score 3.01586 : H : ARG NH1 D0266 <- 3.35 -> DC O2 J0022 : score 3.2485 : V : ASP CB C0031 <- 3.64 -> DT C7 J0027 : score 2.7904 : x : VAL xxxx B0158 <- 3.39 -> DA xxx J0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0163 <- 3.88 -> DA xxx J0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0032 <- 3.69 -> DT xxx J0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0265 <- 4.42 -> DA xxx J0025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0274 <- 3.54 -> DA xxx J0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0279 <- 3.44 -> DA xxx J0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0280 <- 3.68 -> DT xxx J0027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0031 <- 4.07 -> DG xxx J0021 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0032 <- 3.37 -> DG xxx J0021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0274 <- 3.72 -> DC xxx J0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0279 <- 3.53 -> DC xxx J0019 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0280 <- 3.27 -> DG xxx J0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx E0031 <- 4.15 -> DA xxx J0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0032 <- 4.05 -> DA xxx J0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0116 <- 3.92 -> DA xxx J0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0117 <- 4.13 -> DT xxx J0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0279 <- 3.91 -> DC xxx J0013 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx E0280 <- 3.23 -> DA xxx J0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0040 <- 3.20 -> DC xxx J0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0037 <- 3.38 -> DA xxx J0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0040 <- 3.52 -> DA xxx J0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0041 <- 4.31 -> DA xxx J0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0120 <- 4.18 -> DC xxx J0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0121 <- 4.33 -> DC xxx J0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0234 <- 3.46 -> DG xxx J0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx H0263 <- 4.28 -> DC xxx J0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0286 <- 3.62 -> DC xxx J0010 : score x.xxxxx >3x1l_D: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE CRISPR-CAS RNA SILENCING CMR COMPLEX BOUND TO A TARGET ANALOG organism=ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS DSM 4304 : H : SER OG D0117 <- 2.78 -> DA N3 J0030 : score 3.01586 : H : ARG NH1 D0266 <- 3.35 -> DC O2 J0022 : score 3.2485 : x : ASP xxxx D0031 <- 4.07 -> DG xxx J0021 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0032 <- 3.37 -> DG xxx J0021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0274 <- 3.72 -> DC xxx J0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0279 <- 3.53 -> DC xxx J0019 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0280 <- 3.27 -> DG xxx J0021 : score x.xxxxx >3x1s_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.70 -> DA N3 J0229 : score 3.30454 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.05 -> DA N3 I0082 : score 3.07776 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.10 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.26 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.78 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.89 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.38 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.38 -> DG xxx J0277 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.05 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0115 <- 4.50 -> DG xxx I0071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.65 -> DG xxx J0214 : score x.xxxxx >3x1s_B:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0045 <- 3.89 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx >3x1t_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONSISTING OF MOUSE TESTIS SPECIFIC HISTONE VARIANTS H2AA AND H2BA organism=HOMO SAPIENS / MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.20 -> DA N3 J0229 : score 2.98056 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.22 -> DA N3 I0082 : score 3.37276 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.88 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.58 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.02 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.97 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.36 -> DT xxx I0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.94 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.88 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.24 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.14 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.48 -> DA xxx I0111 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.45 -> DT xxx I0130 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.47 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >3x1t_G:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONSISTING OF MOUSE TESTIS SPECIFIC HISTONE VARIANTS H2AA AND H2BA organism=MUS MUSCULUS : x : ARG xxxx G0042 <- 3.48 -> DA xxx I0111 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.45 -> DT xxx I0130 : score x.xxxxx >3x1t_H:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONSISTING OF MOUSE TESTIS SPECIFIC HISTONE VARIANTS H2AA AND H2BA organism=MUS MUSCULUS : x : ARG xxxx H0033 <- 3.47 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >3x1u_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE IN THE PRESENCE OF HISTONE VARIANTS INVOLVED IN REPROGRAMMING organism=HOMO SAPIENS / MUS MUSCULUS : x : LEU xxxx A0065 <- 4.13 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0115 <- 4.45 -> DA xxx J0219 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.03 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.57 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.44 -> DG xxx J0214 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.34 -> DA xxx I0111 : score x.xxxxx >3x1u_G:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE IN THE PRESENCE OF HISTONE VARIANTS INVOLVED IN REPROGRAMMING organism=? : x : ARG xxxx G0042 <- 4.34 -> DA xxx I0111 : score x.xxxxx >3x1v_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE IN THE PRESENCE OF HISTONE VARIANT INVOLVED IN REPROGRAMMING organism=HOMO SAPIENS / MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.81 -> DA N3 J0229 : score 3.23326 : H : LYS NZ D0030 <- 2.57 -> DT O2 J0191 : score 3.75219 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.04 -> DA N3 I0082 : score 3.08424 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.36 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.39 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.59 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.18 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.00 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.11 -> DT xxx I0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.05 -> DG xxx J0268 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.50 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.13 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.93 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.35 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.30 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.31 -> DT xxx I0130 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.88 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >3x1v_G:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE IN THE PRESENCE OF HISTONE VARIANT INVOLVED IN REPROGRAMMING organism=? : x : ARG xxxx G0077 <- 4.31 -> DT xxx I0130 : score x.xxxxx >3zdb_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=STRUCTURE OF E. COLI EXOIX IN COMPLEX WITH THE PALINDROMIC 5OV4 DNA OLIGONUCLEOTIDE, DI-MAGNESIUM AND POTASSIUM organism=ESCHERICHIA COLI : x : SER xxxx A0175 <- 3.81 -> DG xxx X0011 : score x.xxxxx >3zdc_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=STRUCTURE OF E. COLI EXOIX IN COMPLEX WITH THE PALINDROMIC 5OV4 DNA OLIGONUCLEOTIDE, POTASSIUM AND CALCIUM organism=ESCHERICHIA COLI : x : SER xxxx A0175 <- 4.01 -> DG xxx X0011 : score x.xxxxx >3zdd_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=STRUCTURE OF E. COLI EXOIX IN COMPLEX WITH THE PALINDROMIC 5OV6 OLIGONUCLEOTIDE AND POTASSIUM organism=ESCHERICHIA COLI : x : SER xxxx A0175 <- 4.19 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx >3zh2_AB:LDH_C-terminal_domain-like;NADP-binding_Rossmann-fold_domains; title=STRUCTURE OF PLASMODIUM FALCIPARUM LACTATE DEHYDROGENASE IN COMPLEX WITH A DNA APTAMER organism=PLASMODIUM FALCIPARUM : H : ASP OD1 A0035 <- 2.98 -> DT N3 E0009 : score 1.24578 : H : SER OG A0089 <- 2.82 -> DC N4 E0006 : score 3.66094 : H : SER OG A0089 <- 2.65 -> DG O6 E0011 : score 4.21376 : H : ASP OD2 A0090 <- 2.91 -> DG N2 E0007 : score 5.33888 : H : ASP OD2 A0090 <- 3.07 -> DG N2 E0008 : score 5.16419 : H : HIS ND1 A0232 <- 3.11 -> DT O2 E0017 : score -5.6737 : w : ASP OD1 B0035 <- 5.69 -> DA N3 E0016 : score 1.331 : V : ALA CB A0080 <- 3.81 -> DT C7 E0009 : score 5.58498 : x : PHE xxxx A0034 <- 3.64 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0036 <- 3.25 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0037 <- 4.20 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0067 <- 3.36 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0084 <- 3.13 -> DA xxx E0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0085 <- 3.59 -> DA xxx E0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0086 <- 3.49 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0088 <- 3.65 -> DC xxx E0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0091 <- 3.71 -> DC xxx E0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0101 <- 4.23 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0105 <- 3.72 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0036 <- 3.44 -> DA xxx E0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0037 <- 3.35 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0040 <- 4.48 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0067 <- 4.17 -> DA xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0080 <- 3.72 -> DA xxx E0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0082 <- 3.54 -> DA xxx E0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0084 <- 4.34 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0105 <- 3.67 -> DA xxx E0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0108 <- 3.87 -> DA xxx E0016 : score x.xxxxx >3zh2_C:LDH_C-terminal_domain-like;NADP-binding_Rossmann-fold_domains; title=STRUCTURE OF PLASMODIUM FALCIPARUM LACTATE DEHYDROGENASE IN COMPLEX WITH A DNA APTAMER organism=PLASMODIUM FALCIPARUM : H : ASP OD1 C0035 <- 3.11 -> DT N3 G0009 : score 1.21218 : H : SER OG C0089 <- 2.85 -> DC N4 G0006 : score 3.63888 : H : SER OG C0089 <- 2.89 -> DG O6 G0011 : score 4.01739 : H : ASP OD2 C0090 <- 2.88 -> DG N2 G0007 : score 5.37163 : H : HIS NE2 C0232 <- 2.60 -> DA N3 G0018 : score 4.416 : V : ALA CB C0080 <- 3.70 -> DT C7 G0009 : score 5.73895 : x : PHE xxxx C0034 <- 3.99 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0036 <- 3.52 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0037 <- 4.44 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0067 <- 3.39 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0084 <- 2.88 -> DA xxx G0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0085 <- 4.03 -> DA xxx G0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0086 <- 3.47 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0088 <- 3.72 -> DC xxx G0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0091 <- 3.30 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0093 <- 3.84 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0101 <- 4.27 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0105 <- 3.66 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx >3zh2_CD:LDH_C-terminal_domain-like;NADP-binding_Rossmann-fold_domains; title=STRUCTURE OF PLASMODIUM FALCIPARUM LACTATE DEHYDROGENASE IN COMPLEX WITH A DNA APTAMER organism=PLASMODIUM FALCIPARUM : H : ASP OD1 C0035 <- 3.11 -> DT N3 G0009 : score 1.21218 : H : SER OG C0089 <- 2.85 -> DC N4 G0006 : score 3.63888 : H : SER OG C0089 <- 2.89 -> DG O6 G0011 : score 4.01739 : H : ASP OD2 C0090 <- 2.88 -> DG N2 G0007 : score 5.37163 : H : HIS NE2 C0232 <- 2.60 -> DA N3 G0018 : score 4.416 : V : ALA CB C0080 <- 3.70 -> DT C7 G0009 : score 5.73895 : x : PHE xxxx C0034 <- 3.99 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0036 <- 3.52 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0037 <- 4.44 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0067 <- 3.39 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0084 <- 2.88 -> DA xxx G0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0085 <- 4.03 -> DA xxx G0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0086 <- 3.47 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0088 <- 3.72 -> DC xxx G0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0091 <- 3.30 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0093 <- 3.84 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0101 <- 4.27 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0105 <- 3.66 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0036 <- 3.29 -> DA xxx G0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0037 <- 3.31 -> DT xxx G0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0040 <- 4.18 -> DT xxx G0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0067 <- 4.21 -> DA xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0080 <- 3.74 -> DA xxx G0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0082 <- 3.46 -> DA xxx G0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0084 <- 3.20 -> DC xxx G0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0105 <- 3.45 -> DA xxx G0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0108 <- 4.35 -> DA xxx G0016 : score x.xxxxx >3zhm_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=N-TERMINAL DOMAIN OF THE CI REPRESSOR FROM BACTERIOPHAGE TP901-1 IN COMPLEX WITH THE OL2 OPERATOR HALF-SITE organism=LACTOCOCCUS PHAGE TP901-1 : H : LYS NZ A0040 <- 3.16 -> DG N7 B0032 : score 4.99811 : H : LYS NZ A0040 <- 2.87 -> DG O6 B0032 : score 5.69984 : H : SER OG A0041 <- 3.23 -> DG N7 C0006 : score 4.09659 : H : SER OG A0041 <- 3.08 -> DG O6 C0006 : score 3.86193 : H : GLN OE1 A0045 <- 3.06 -> DC N4 B0035 : score 4.345 : w : GLN OE1 A0051 <- 6.19 -> DG O6 C0004 : score 2.87 : x : THR xxxx A0042 <- 3.39 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0044 <- 3.89 -> DT xxx B0033 : score x.xxxxx >3zi5_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF RESTRICTION ENDONUCLEASE BFII C-TERMINAL RECOGNITION DOMAIN IN COMPLEX WITH COGNATE DNA organism=BACILLUS FIRMUS : H : ARG NH2 A0212 <- 3.24 -> DA N7 C0007 : score 1.52468 : H : ARG NH2 A0212 <- 2.81 -> DG N7 C0008 : score 6.37185 : H : THR OG1 A0225 <- 2.68 -> DA N7 B0004 : score 3.49604 : H : THR OG1 A0225 <- 2.67 -> DA N6 B0004 : score 2.83071 : H : TYR OH A0227 <- 2.77 -> DC N4 B0005 : score 4.23939 : H : ARG NH2 A0247 <- 2.96 -> DA N3 B0004 : score 3.13607 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.80 -> DG N7 B0007 : score 4.5859 : H : ASN ND2 A0280 <- 3.12 -> DG O6 B0007 : score 5.2776 : H : ASN ND2 A0280 <- 2.76 -> DG O6 B0008 : score 5.68357 : H : ASP OD1 A0282 <- 2.63 -> DC N4 C0005 : score 5.5266 : H : ASP OD2 A0282 <- 3.12 -> DC N4 C0006 : score 5.8032 : H : ARG NH1 A0284 <- 3.14 -> DT O4 B0006 : score 3.04573 : H : ARG NH2 A0284 <- 3.02 -> DT O4 B0006 : score 3.39748 : H : ARG NH2 A0284 <- 2.73 -> DG O6 B0007 : score 6.6924 : H : ASN ND2 A0337 <- 3.11 -> DC O2 B0011 : score 4.20176 : x : ALA xxxx A0208 <- 4.06 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0223 <- 4.24 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0229 <- 3.49 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0276 <- 3.35 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0281 <- 3.91 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0291 <- 3.84 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >3zkc_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MASTER REGULATOR FOR BIOFILM FORMATION SINR IN COMPLEX WITH DNA. organism=BACILLUS SUBTILIS : H : LYS NZ A0028 <- 2.78 -> DG N7 D0004 : score 5.40744 : H : SER OG A0029 <- 2.68 -> DG O6 C0016 : score 4.18921 : H : SER OG A0029 <- 2.92 -> DT O4 D0006 : score 3.46981 : x : SER xxxx A0018 <- 3.53 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0027 <- 3.33 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0030 <- 4.33 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0032 <- 3.51 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0036 <- 3.37 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0039 <- 3.69 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx >3zkc_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MASTER REGULATOR FOR BIOFILM FORMATION SINR IN COMPLEX WITH DNA. organism=BACILLUS SUBTILIS : H : LYS NZ A0028 <- 2.78 -> DG N7 D0004 : score 5.40744 : H : SER OG A0029 <- 2.92 -> DT O4 D0006 : score 3.46981 : H : SER OG A0029 <- 2.68 -> DG O6 C0016 : score 4.18921 : H : SER OG B0029 <- 3.24 -> DG N7 D0016 : score 4.08763 : H : SER OG B0029 <- 2.86 -> DG O6 D0016 : score 4.04193 : H : SER OG B0029 <- 2.91 -> DT O4 C0006 : score 3.47692 : x : SER xxxx A0018 <- 3.53 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0027 <- 3.33 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0030 <- 4.33 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0032 <- 3.51 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0036 <- 3.37 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0039 <- 3.69 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0018 <- 3.72 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0027 <- 3.54 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0028 <- 3.47 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0030 <- 3.54 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0032 <- 3.71 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0036 <- 3.91 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0039 <- 3.90 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx >3zlj_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FULL-LENGTH E.COLI DNA MISMATCH REPAIR PROTEIN MUTS D835R MUTANT IN COMPLEX WITH GT MISMATCHED DNA organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : H : GLU OE2 A0038 <- 2.68 -> DT N3 F0013 : score 2.69916 : H : ARG NH2 A0058 <- 2.43 -> DC O2 E0011 : score 3.97242 : V : PHE CZ A0036 <- 3.54 -> DT C7 F0013 : score 7.57734 : x : MET xxxx A0033 <- 3.94 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 4.16 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.34 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx >3zp5_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING ETS DOMAIN OF THE HUMAN PROTEIN FEV IN COMPLEX WITH DNA organism=HOMO SAPIENS : w : ASP OD1 A0099 <- 5.80 -> DC N4 G0003 : score 2.835 : H : ARG NE A0103 <- 2.85 -> DG O6 G0005 : score 3.90162 : H : ARG NH2 A0103 <- 3.03 -> DG N7 G0005 : score 6.09092 : H : ARG NE A0106 <- 2.95 -> DG N7 G0004 : score 4.28914 : H : ARG NH2 A0106 <- 2.94 -> DG O6 G0004 : score 6.4152 : w : ARG NH2 A0106 <- 5.89 -> DC N4 G0003 : score 0.976 : V : LYS CB A0100 <- 3.90 -> DT C7 C0005 : score 2.248 : x : SER xxxx A0044 <- 3.36 -> DG xxx G0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0107 <- 3.87 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx >3zpl_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SCO3205, A MARR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR FROM STREPTOMYCES COELICOLOR, IN COMPLEX WITH DNA organism=STREPTOMYCES COELICOLOR : H : ARG NH1 A0072 <- 2.97 -> DA N7 C0005 : score 2.47321 : H : SER OG A0073 <- 2.58 -> DT O4 C0007 : score 3.71155 : H : SER OG A0073 <- 2.85 -> DC N4 D0015 : score 3.63888 : H : HIS NE2 A0077 <- 2.79 -> DG O6 C0008 : score 7.96975 : H : ARG NE A0098 <- 2.93 -> DA N3 C0003 : score 2.0479 : H : SER OG B0073 <- 2.72 -> DC N4 C0015 : score 3.73445 : H : SER OG B0073 <- 2.53 -> DT O4 D0007 : score 3.74711 : H : HIS NE2 B0077 <- 2.73 -> DG O6 D0008 : score 8.0652 : H : ARG NE B0098 <- 2.90 -> DA N3 D0003 : score 2.06051 : x : ARG xxxx A0074 <- 4.31 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0076 <- 3.45 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0072 <- 3.38 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0074 <- 4.07 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0076 <- 3.59 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx >3zpl_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SCO3205, A MARR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR FROM STREPTOMYCES COELICOLOR, IN COMPLEX WITH DNA organism=STREPTOMYCES COELICOLOR : H : SER OG B0073 <- 2.53 -> DT O4 D0007 : score 3.74711 : H : SER OG B0073 <- 2.72 -> DC N4 C0015 : score 3.73445 : H : HIS NE2 B0077 <- 2.73 -> DG O6 D0008 : score 8.0652 : H : ARG NE B0098 <- 2.90 -> DA N3 D0003 : score 2.06051 : x : ARG xxxx B0072 <- 3.38 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0074 <- 4.07 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0076 <- 3.59 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx >3zpl_EF:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SCO3205, A MARR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR FROM STREPTOMYCES COELICOLOR, IN COMPLEX WITH DNA organism=STREPTOMYCES COELICOLOR : H : SER OG E0073 <- 2.68 -> DT O4 G0007 : score 3.64045 : H : SER OG E0073 <- 2.65 -> DC N4 H0015 : score 3.78591 : H : HIS NE2 E0077 <- 2.88 -> DG O6 G0008 : score 7.82658 : H : ARG NE E0098 <- 3.05 -> DA N3 G0003 : score 1.99744 : H : SER OG F0073 <- 2.73 -> DC N4 G0015 : score 3.7271 : H : SER OG F0073 <- 2.49 -> DT O4 H0007 : score 3.77555 : H : HIS NE2 F0077 <- 2.72 -> DG O6 H0008 : score 8.08111 : H : ARG NE F0098 <- 2.95 -> DA N3 H0003 : score 2.03949 : V : ARG CB F0072 <- 3.70 -> DT C7 H0006 : score 1.03026 : x : ARG xxxx E0072 <- 3.24 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0074 <- 4.16 -> DT xxx H0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0076 <- 3.39 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0074 <- 4.06 -> DT xxx G0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0076 <- 3.44 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx >3zqc_A:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF THE TRICHOMONAS VAGINALIS MYB3 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO A PROMOTER SEQUENCE REVEALS A UNIQUE C-TERMINAL BETA-HAIRPIN CONFORMATION organism=TRICHOMONAS VAGINALIS : H : LYS NZ A0089 <- 2.89 -> DG N7 B0009 : score 5.28895 : H : ASN ND2 A0144 <- 3.12 -> DA N7 B0006 : score 5.4948 : V : SER CB A0148 <- 3.71 -> DT C7 B0005 : score 3.20174 : x : ARG xxxx A0092 <- 3.84 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0093 <- 3.52 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0139 <- 3.95 -> DC xxx C0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0140 <- 2.96 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0143 <- 2.92 -> DG xxx C0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0147 <- 4.03 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx >3zql_AB:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=DNA-BOUND FORM OF TETR-LIKE REPRESSOR SIMR organism=STREPTOMYCES ANTIBIOTICUS : H : ARG NH2 A0051 <- 3.11 -> DG N7 E0011 : score 5.98877 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.62 -> DG O6 E0011 : score 6.8376 : H : ARG NH2 B0051 <- 3.00 -> DG N7 F0011 : score 6.12923 : H : ARG NH2 B0051 <- 2.51 -> DG O6 F0011 : score 6.9828 : V : TYR CD1 A0066 <- 3.51 -> DT C7 F0002 : score 5.0204 : V : THR CG2 B0061 <- 3.78 -> DT C7 F0012 : score 4.25811 : V : TYR CD1 B0066 <- 3.83 -> DT C7 E0002 : score 4.64592 : V : THR CG2 A0061 <- 3.80 -> DT C7 E0012 : score 4.23692 : x : MET xxxx A0050 <- 4.05 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0062 <- 3.22 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0063 <- 3.60 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0065 <- 3.55 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0050 <- 4.10 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0062 <- 3.19 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0063 <- 3.50 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0065 <- 3.65 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx >3zql_B:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=DNA-BOUND FORM OF TETR-LIKE REPRESSOR SIMR organism=STREPTOMYCES ANTIBIOTICUS : H : ARG NH2 B0051 <- 3.00 -> DG N7 F0011 : score 6.12923 : H : ARG NH2 B0051 <- 2.51 -> DG O6 F0011 : score 6.9828 : V : THR CG2 B0061 <- 3.78 -> DT C7 F0012 : score 4.25811 : V : TYR CD1 B0066 <- 3.83 -> DT C7 E0002 : score 4.64592 : x : MET xxxx B0050 <- 4.10 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0062 <- 3.19 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0063 <- 3.50 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0065 <- 3.65 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx >3zql_CD:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=DNA-BOUND FORM OF TETR-LIKE REPRESSOR SIMR organism=STREPTOMYCES ANTIBIOTICUS : H : ARG NH2 C0051 <- 2.99 -> DG N7 G0011 : score 6.142 : H : ARG NH2 C0051 <- 2.48 -> DG O6 G0011 : score 7.0224 : H : ARG NH2 D0051 <- 3.00 -> DG N7 H0011 : score 6.12923 : H : ARG NH2 D0051 <- 2.49 -> DG O6 H0011 : score 7.0092 : V : TYR CD1 C0066 <- 3.60 -> DT C7 H0002 : score 4.91508 : V : THR CG2 D0061 <- 3.69 -> DT C7 H0012 : score 4.35344 : V : TYR CD1 D0066 <- 3.70 -> DT C7 G0002 : score 4.79805 : V : THR CG2 C0061 <- 3.88 -> DT C7 G0012 : score 4.15218 : x : MET xxxx C0050 <- 4.04 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0062 <- 3.32 -> DG xxx H0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0063 <- 3.69 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0065 <- 3.62 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0050 <- 4.00 -> DT xxx H0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0062 <- 3.21 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0063 <- 3.44 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0065 <- 3.61 -> DT xxx H0012 : score x.xxxxx >3zvk_EFGH:AbrB/MazE/MraZ-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF VAPBC2 FROM RICKETTSIA FELIS BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THEIR PROMOTER organism=RICKETTSIA FELIS : H : ASN ND2 E0009 <- 2.87 -> DT O4 X0020 : score 5.21063 : H : ASN ND2 F0009 <- 2.96 -> DT O4 X0006 : score 5.11551 : w : ASN ND2 F0009 <- 5.89 -> DA N6 Y0022 : score 2.5 : H : ASN ND2 G0009 <- 2.80 -> DT O4 Y0021 : score 5.28462 : w : ASN ND2 G0009 <- 5.67 -> DA N6 X0007 : score 2.5 : w : GLN NE2 G0011 <- 5.69 -> DA N6 X0009 : score 2.804 : H : ASN ND2 H0009 <- 2.90 -> DT O4 Y0007 : score 5.17892 : w : ASN ND2 H0009 <- 5.75 -> DA N6 X0021 : score 2.5 : V : PHE CD2 G0007 <- 3.74 -> DT C7 X0006 : score 6.60947 : V : PHE CD2 H0007 <- 3.67 -> DT C7 X0020 : score 6.72343 : V : PHE CD2 F0007 <- 3.89 -> DT C7 Y0021 : score 6.36528 : x : PHE xxxx E0007 <- 3.86 -> DT xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0011 <- 3.39 -> DA xxx X0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0012 <- 3.39 -> DG xxx X0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0016 <- 3.41 -> DT xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0011 <- 3.43 -> DA xxx X0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0012 <- 3.28 -> DG xxx X0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0016 <- 3.53 -> DA xxx Y0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0012 <- 3.39 -> DA xxx Y0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0016 <- 3.45 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0011 <- 3.47 -> DA xxx Y0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0012 <- 3.34 -> DA xxx Y0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0016 <- 3.50 -> DT xxx X0018 : score x.xxxxx >3zvk_G:AbrB/MazE/MraZ-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF VAPBC2 FROM RICKETTSIA FELIS BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THEIR PROMOTER organism=RICKETTSIA FELIS : H : ASN ND2 G0009 <- 2.80 -> DT O4 Y0021 : score 5.28462 : w : ASN ND2 G0009 <- 5.67 -> DA N6 X0007 : score 2.5 : w : GLN NE2 G0011 <- 5.69 -> DA N6 X0009 : score 2.804 : V : PHE CD2 G0007 <- 3.74 -> DT C7 X0006 : score 6.60947 : x : SER xxxx G0012 <- 3.39 -> DA xxx Y0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0016 <- 3.45 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx >4a04_AB:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF THE DNA-BOUND T-BOX DOMAIN OF HUMAN TBX1, A TRANSCRIPTION FACTOR ASSOCIATED WITH THE DIGEORGE SYNDROME organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0137 <- 2.96 -> DG N7 E0017 : score 6.18031 : H : ARG NH2 B0137 <- 2.93 -> DG N7 D0017 : score 6.21862 : V : ALA CB B0275 <- 3.81 -> DT C7 E0004 : score 5.58498 : V : ALA CB A0275 <- 3.77 -> DT C7 D0004 : score 5.64097 : x : THR xxxx A0274 <- 3.67 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0291 <- 3.60 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0295 <- 3.22 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0274 <- 3.66 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0291 <- 3.65 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0295 <- 3.29 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx >4a04_B:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF THE DNA-BOUND T-BOX DOMAIN OF HUMAN TBX1, A TRANSCRIPTION FACTOR ASSOCIATED WITH THE DIGEORGE SYNDROME organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 B0137 <- 2.93 -> DG N7 D0017 : score 6.21862 : V : ALA CB B0275 <- 3.81 -> DT C7 E0004 : score 5.58498 : x : THR xxxx B0274 <- 3.66 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0291 <- 3.65 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0295 <- 3.29 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx >4a08_B:WD40_repeat-like; title=STRUCTURE OF HSDDB1-DRDDB2 BOUND TO A 13 BP CPD-DUPLEX (PURINE AT D-1 POSITION) AT 3.0 A RESOLUTION (CPD 1) organism=DANIO RERIO : H : GLN OE1 B0372 <- 2.61 -> DC N4 H0008 : score 4.7575 : w : GLN NE2 B0372 <- 6.12 -> DG O6 G0009 : score 2.87 : x : PHE xxxx B0371 <- 3.22 -> DC xxx H0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0373 <- 3.27 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx >4a09_B:WD40_repeat-like; title=STRUCTURE OF HSDDB1-DRDDB2 BOUND TO A 15 BP CPD-DUPLEX (PURINE AT D-1 POSITION) AT 3.1 A RESOLUTION (CPD 2) organism=DANIO RERIO : x : PHE xxxx B0371 <- 3.55 -> DC xxx H0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0372 <- 3.30 -> DA xxx G0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0373 <- 3.36 -> DA xxx G0007 : score x.xxxxx >4a0a_B:WD40_repeat-like; title=STRUCTURE OF HSDDB1-DRDDB2 BOUND TO A 16 BP CPD-DUPLEX (PYRIMIDINE AT D-1 POSITION) AT 3.6 A RESOLUTION (CPD 3) organism=DANIO RERIO : H : GLN OE1 B0372 <- 3.35 -> DC N4 D0007 : score 4.07917 : H : GLN OE1 B0372 <- 3.14 -> DA N6 C0011 : score 5.64099 : x : ARG xxxx B0148 <- 3.86 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0371 <- 3.53 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0373 <- 3.32 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx >4a0b_AD:WD40_repeat-like; title=STRUCTURE OF HSDDB1-DRDDB2 BOUND TO A 16 BP CPD-DUPLEX (PYRIMIDINE AT D-1 POSITION) AT 3.8 A RESOLUTION (CPD 4) organism=DANIO RERIO / HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0198 <- 3.40 -> DG xxx I0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0371 <- 3.35 -> DC xxx J0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0372 <- 3.14 -> DA xxx I0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0373 <- 3.20 -> DT xxx I0008 : score x.xxxxx >4a0b_D:WD40_repeat-like; title=STRUCTURE OF HSDDB1-DRDDB2 BOUND TO A 16 BP CPD-DUPLEX (PYRIMIDINE AT D-1 POSITION) AT 3.8 A RESOLUTION (CPD 4) organism=? : x : PHE xxxx D0371 <- 3.35 -> DC xxx J0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0372 <- 3.14 -> DA xxx I0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0373 <- 3.20 -> DT xxx I0008 : score x.xxxxx >4a0k_D:WD40_repeat-like; title=STRUCTURE OF DDB1-DDB2-CUL4A-RBX1 BOUND TO A 12 BP ABASIC SITE CONTAINING DNA-DUPLEX organism=DANIO RERIO : H : GLN OE1 D0372 <- 3.16 -> DT N3 F0005 : score 3.16829 : x : TRP xxxx D0236 <- 3.36 -> DA xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0371 <- 3.49 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0373 <- 3.17 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx >4a0l_B:WD40_repeat-like; title=STRUCTURE OF DDB1-DDB2-CUL4B-RBX1 BOUND TO A 12 BP ABASIC SITE CONTAINING DNA-DUPLEX organism=DANIO RERIO : H : GLN OE1 B0372 <- 3.11 -> DT N3 S0007 : score 3.20243 : x : ARG xxxx B0148 <- 4.49 -> DT xxx R0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0236 <- 3.33 -> DA xxx R0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0371 <- 3.50 -> DT xxx S0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0373 <- 3.21 -> DT xxx R0008 : score x.xxxxx >4a12_ABCD:Thioesterase/thiol_ester_dehydrase-isomerase;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE GLOBAL TRANSCRIPTION REGULATOR FAPR FROM STAPHYLOCOCCUS AUREUS IN COMPLEX WITH DNA OPERATOR organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : H : ARG NH1 A0056 <- 3.20 -> DA N3 F0028 : score 3.38749 : H : ARG NH2 A0056 <- 2.78 -> DT O2 F0027 : score 4.25027 : H : GLN NE2 B0041 <- 3.12 -> DG N7 F0022 : score 3.93 : H : ARG NH1 B0056 <- 3.08 -> DG N3 G0015 : score 2.88162 : H : ARG NH2 B0056 <- 3.08 -> DA N3 G0014 : score 3.05832 : H : GLN NE2 C0041 <- 3.21 -> DA N7 G0022 : score 5.59038 : H : ARG NH1 C0056 <- 3.13 -> DT O2 F0014 : score 4.02219 : H : ARG NH2 C0056 <- 2.76 -> DT O2 F0014 : score 4.2672 : H : ARG NH1 D0056 <- 3.22 -> DG N3 G0028 : score 2.79615 : H : ARG NH2 D0056 <- 3.23 -> DA N3 G0027 : score 2.96113 : V : LEU CD1 B0045 <- 3.76 -> DT C7 F0020 : score 5.78859 : V : LEU CD1 A0045 <- 3.86 -> DT C7 G0007 : score 5.64531 : V : LEU CD1 C0045 <- 3.79 -> DT C7 G0020 : score 5.74561 : x : GLN xxxx A0041 <- 3.51 -> DA xxx G0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0042 <- 4.14 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0044 <- 3.37 -> DG xxx F0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0039 <- 3.90 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0042 <- 3.54 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0044 <- 3.54 -> DT xxx G0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0039 <- 3.83 -> DT xxx G0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0042 <- 3.53 -> DT xxx G0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0044 <- 3.52 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0039 <- 4.19 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0041 <- 3.46 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0042 <- 4.36 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0044 <- 3.35 -> DT xxx G0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0045 <- 4.02 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx >4a12_B:Thioesterase/thiol_ester_dehydrase-isomerase;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE GLOBAL TRANSCRIPTION REGULATOR FAPR FROM STAPHYLOCOCCUS AUREUS IN COMPLEX WITH DNA OPERATOR organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : H : GLN NE2 B0041 <- 3.12 -> DG N7 F0022 : score 3.93 : H : ARG NH1 B0056 <- 3.08 -> DG N3 G0015 : score 2.88162 : H : ARG NH2 B0056 <- 3.08 -> DA N3 G0014 : score 3.05832 : V : LEU CD1 B0045 <- 3.76 -> DT C7 F0020 : score 5.78859 : x : SER xxxx B0039 <- 3.90 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0042 <- 3.54 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0044 <- 3.54 -> DT xxx G0017 : score x.xxxxx >4a3b_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX WITH A 4NT DNA-RNA HYBRID organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 B1124 <- 2.69 -> DG O6 T0024 : score 6.7452 : x : GLU xxxx B1120 <- 3.22 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx >4a3c_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX WITH A 5NT DNA-RNA HYBRID organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.91 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >4a3d_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX WITH A 6NT DNA-RNA HYBRID organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.81 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >4a3e_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX WITH A 5NT DNA-RNA HYBRID AND SOAKED WITH AMPCPP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.77 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx >4a3f_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX WITH A 6NT DNA-RNA HYBRID AND SOAKED WITH AMPCPP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.78 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx >4a3f_AB: title=RNA POLYMERASE II INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX WITH A 6NT DNA-RNA HYBRID AND SOAKED WITH AMPCPP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.78 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx >4a3g_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX WITH A 2NT DNA-RNA HYBRID organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 A1386 <- 3.10 -> DG N3 T0015 : score 3.39364 >4a3g_AB: title=RNA POLYMERASE II INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX WITH A 2NT DNA-RNA HYBRID organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 A1386 <- 3.10 -> DG N3 T0015 : score 3.39364 >4a3i_AB: title=RNA POLYMERASE II BINARY COMPLEX WITH DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 2.99 -> DG xxx T0015 : score x.xxxxx >4a3k_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX WITH A 7NT DNA-RNA HYBRID organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 4.17 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >4a3l_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX WITH A 7NT DNA-RNA HYBRID AND SOAKED WITH AMPCPP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.65 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx >4a3l_AB: title=RNA POLYMERASE II INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX WITH A 7NT DNA-RNA HYBRID AND SOAKED WITH AMPCPP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.65 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx >4a3m_AB: title=RNA POLYMERASE II INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX WITH A 4NT DNA-RNA HYBRID AND SOAKED WITH AMPCPP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : LYS xxxx A0143 <- 4.49 -> DT xxx N0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0836 <- 4.48 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.05 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx >4a75_AC:Nucleic_acid-binding_proteins; title=THE LIN28B COLD SHOCK DOMAIN IN COMPLEX WITH HEXATHYMIDINE. organism=XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS / XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS / XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS / XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS : H : TRP NE1 C0039 <- 3.08 -> DT O2 D0006 : score 5.86732 : H : ASN ND2 C0041 <- 2.95 -> DT O4 D0007 : score 5.12608 : H : ASP OD2 C0064 <- 2.77 -> DT N3 D0006 : score 3.6087 : H : SER OG C0093 <- 2.90 -> DT O4 D0005 : score 3.48403 A : w : GLU OE2 C0098 <- 5.54 -> DT O2 D0004 : score 2.279 : V : MET CE C0044 <- 3.53 -> DT C7 D0007 : score 7.39805 >4a75_C:Nucleic_acid-binding_proteins; title=THE LIN28B COLD SHOCK DOMAIN IN COMPLEX WITH HEXATHYMIDINE. organism=XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS / XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS : H : TRP NE1 C0039 <- 3.08 -> DT O2 D0006 : score 5.86732 : H : ASN ND2 C0041 <- 2.95 -> DT O4 D0007 : score 5.12608 : H : ASP OD2 C0064 <- 2.77 -> DT N3 D0006 : score 3.6087 : H : SER OG C0093 <- 2.90 -> DT O4 D0005 : score 3.48403 A : w : GLU OE2 C0098 <- 5.54 -> DT O2 D0004 : score 2.279 : V : MET CE C0044 <- 3.53 -> DT C7 D0007 : score 7.39805 >4a8s_C:DNA/RNA_polymerases; title=NON-CATALYTIC IONS DIRECT THE RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE OF BACTERIAL DSRNA VIRUS PHI6 FROM DE NOVO INITIATION TO ELONGATION organism=PSEUDOMONAS PHAGE PHI6 : H : ASP OD1 C0618 <- 2.65 -> DG N2 H0006 : score 5.3045 : H : GLN OE1 C0629 <- 2.71 -> DT N3 H0004 : score 3.47556 : V : ALA CB C0272 <- 3.89 -> DT C7 H0003 : score 5.473 : x : ARG xxxx C0030 <- 3.73 -> DT xxx H0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0146 <- 3.80 -> DC xxx H0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0202 <- 4.41 -> DT xxx H0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0204 <- 3.16 -> DT xxx H0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0393 <- 3.34 -> DT xxx H0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0398 <- 3.44 -> DT xxx H0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0617 <- 3.74 -> DG xxx H0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0621 <- 4.48 -> DG xxx H0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0628 <- 3.29 -> DC xxx H0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0646 <- 3.94 -> DC xxx H0005 : score x.xxxxx >4a93_AB: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX CONTAINING A CPD LESION organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ALA xxxx A0832 <- 4.45 -> DA xxx N0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0833 <- 3.39 -> DA xxx N0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0836 <- 4.21 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.80 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx >4aa6_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THE OESTROGEN RECEPTOR RECOGNIZES AN IMPERFECTLY PALINDROMIC RESPONSE ELEMENT THROUGH AN ALTERNATIVE SIDE-CHAIN CONFORMATION organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE2 A0203 <- 3.05 -> DC N4 D0015 : score 5.00212 : H : LYS NZ A0206 <- 2.67 -> DA N7 C0004 : score 3.01355 : w : LYS NZ A0210 <- 5.73 -> DG O6 C0005 : score 3.005 : H : ARG NH1 A0211 <- 2.65 -> DG N7 D0013 : score 6.2315 : H : GLU OE1 B0203 <- 3.28 -> DC N4 C0015 : score 5.21423 : H : LYS NZ B0206 <- 2.74 -> DG O6 D0004 : score 5.85014 : w : LYS NZ B0206 <- 5.65 -> DA N7 D0003 : score 1.655 : H : LYS NZ B0210 <- 3.23 -> DG N7 D0005 : score 4.92271 : w : LYS NZ B0210 <- 5.66 -> DG O6 C0013 : score 3.005 : H : ARG NH1 B0211 <- 2.86 -> DG N7 C0013 : score 5.9774 : w : ARG NH1 B0211 <- 5.31 -> DG O6 C0013 : score 2.756 : x : ALA xxxx A0207 <- 3.46 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0207 <- 3.22 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >4aa6_E:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THE OESTROGEN RECEPTOR RECOGNIZES AN IMPERFECTLY PALINDROMIC RESPONSE ELEMENT THROUGH AN ALTERNATIVE SIDE-CHAIN CONFORMATION organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 E0203 <- 3.30 -> DC N4 H0015 : score 5.19115 : w : LYS NZ E0210 <- 5.43 -> DG O6 G0005 : score 3.005 : H : ARG NH1 E0211 <- 2.86 -> DG N7 H0013 : score 5.9774 : w : ARG NH1 E0211 <- 5.46 -> DG O6 H0013 : score 2.756 : x : LYS xxxx E0206 <- 3.39 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0207 <- 3.54 -> DG xxx H0013 : score x.xxxxx >4aa6_EF:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THE OESTROGEN RECEPTOR RECOGNIZES AN IMPERFECTLY PALINDROMIC RESPONSE ELEMENT THROUGH AN ALTERNATIVE SIDE-CHAIN CONFORMATION organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 E0203 <- 3.30 -> DC N4 H0015 : score 5.19115 : w : LYS NZ E0210 <- 5.43 -> DG O6 G0005 : score 3.005 : H : ARG NH1 E0211 <- 2.86 -> DG N7 H0013 : score 5.9774 : H : GLU OE1 F0203 <- 3.01 -> DC N4 G0015 : score 5.52569 : H : LYS NZ F0206 <- 3.03 -> DG O6 H0004 : score 5.51485 : w : LYS NZ F0206 <- 5.74 -> DA N7 H0003 : score 1.655 : H : LYS NZ F0210 <- 2.84 -> DT O4 H0006 : score 3.55848 : w : LYS NZ F0210 <- 6.22 -> DG O6 H0005 : score 3.005 : w : LYS NZ F0210 <- 5.86 -> DG O6 G0013 : score 3.005 : H : ARG NH1 F0211 <- 2.70 -> DG N7 G0013 : score 6.171 : w : ARG NH1 F0211 <- 6.07 -> DG O6 G0013 : score 2.756 : x : LYS xxxx E0206 <- 3.39 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0207 <- 3.54 -> DG xxx H0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0207 <- 3.53 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx >4aab_A:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MUTANT D75N I-CREI IN COMPLEX WITH ITS WILD- TYPE TARGET (THE FOUR CENTRAL BASES, 2NN REGION, ARE COMPOSED BY GTAC FROM 5' TO 3') organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : w : GLN NE2 A0026 <- 5.29 -> DG O6 E0518 : score 2.87 : H : LYS NZ A0028 <- 3.10 -> DT O4 E0519 : score 3.37195 : w : LYS NZ A0028 <- 5.73 -> DG O6 E0518 : score 3.005 : w : LYS NZ A0028 <- 5.98 -> DA N6 F0605 : score 2.097 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.45 -> DT O4 E0521 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 2.98 -> DC N4 F0602 : score 3.54332 : H : TYR OH A0033 <- 2.59 -> DA N7 F0603 : score 4.32564 : H : TYR OH A0033 <- 3.03 -> DA N6 F0603 : score 4.45567 : H : GLN OE1 A0038 <- 3.13 -> DA N6 F0604 : score 5.65309 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.80 -> DA N7 F0604 : score 6.08974 : w : GLN OE1 A0038 <- 6.40 -> DA N6 F0605 : score 3.392 : w : GLN OE1 A0038 <- 6.35 -> DT O4 E0521 : score 3.068 : w : SER OG A0040 <- 6.35 -> DA N6 F0605 : score 2.209 : w : GLN NE2 A0044 <- 5.64 -> DA N6 E0516 : score 2.804 : w : THR OG1 A0046 <- 6.20 -> DG N7 E0515 : score 3.422 : H : ARG NH1 A0070 <- 3.10 -> DG O6 E0515 : score 5.71833 : w : ARG NH2 A0070 <- 6.08 -> DA N6 E0516 : score 1.997 : w : ASN OD1 A0075 <- 6.01 -> DG N7 E0515 : score 1.873 : w : ASN ND2 A0075 <- 5.74 -> DG N7 E0515 : score 3.259 : w : THR OG1 A0140 <- 5.76 -> DA N3 E0516 : score 2.845 : x : SER xxxx A0022 <- 4.15 -> DA xxx E0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.77 -> DA xxx E0516 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0068 <- 3.75 -> DA xxx F0606 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 4.11 -> DC xxx D0514 : score x.xxxxx >4aab_AB:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MUTANT D75N I-CREI IN COMPLEX WITH ITS WILD- TYPE TARGET (THE FOUR CENTRAL BASES, 2NN REGION, ARE COMPOSED BY GTAC FROM 5' TO 3') organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : w : GLN NE2 A0026 <- 5.29 -> DG O6 E0518 : score 2.87 : H : LYS NZ A0028 <- 3.10 -> DT O4 E0519 : score 3.37195 : w : LYS NZ A0028 <- 5.73 -> DG O6 E0518 : score 3.005 : w : LYS NZ A0028 <- 5.98 -> DA N6 F0605 : score 2.097 : w : ASN ND2 A0030 <- 6.45 -> DT O4 E0521 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 2.98 -> DC N4 F0602 : score 3.54332 : H : TYR OH A0033 <- 2.59 -> DA N7 F0603 : score 4.32564 : H : TYR OH A0033 <- 3.03 -> DA N6 F0603 : score 4.45567 : H : GLN OE1 A0038 <- 3.13 -> DA N6 F0604 : score 5.65309 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.80 -> DA N7 F0604 : score 6.08974 : w : GLN OE1 A0038 <- 6.40 -> DA N6 F0605 : score 3.392 : w : GLN OE1 A0038 <- 6.35 -> DT O4 E0521 : score 3.068 : w : SER OG A0040 <- 6.35 -> DA N6 F0605 : score 2.209 : w : GLN NE2 A0044 <- 5.64 -> DA N6 E0516 : score 2.804 : H : ARG NH1 A0070 <- 3.10 -> DG O6 E0515 : score 5.71833 : w : ARG NH2 A0070 <- 6.08 -> DA N6 E0516 : score 1.997 : w : THR OG1 A0140 <- 5.76 -> DA N3 E0516 : score 2.845 : w : GLN NE2 B0026 <- 5.28 -> DG O6 G0618 : score 2.87 : H : LYS NZ B0028 <- 2.90 -> DT O4 G0619 : score 3.51544 : w : LYS NZ B0028 <- 5.20 -> DG O6 G0618 : score 3.005 : w : LYS NZ B0028 <- 5.86 -> DA N6 D0505 : score 2.097 : w : ASN ND2 B0030 <- 5.78 -> DT O4 G0620 : score 3.275 : H : SER OG B0032 <- 3.35 -> DC N4 D0502 : score 3.27132 : H : TYR OH B0033 <- 2.69 -> DA N7 D0503 : score 4.24261 : H : TYR OH B0033 <- 3.21 -> DA N6 D0503 : score 4.28753 : H : GLN OE1 B0038 <- 3.10 -> DA N6 D0504 : score 5.68941 : H : GLN NE2 B0038 <- 2.88 -> DA N7 D0504 : score 5.99231 : w : GLN OE1 B0038 <- 5.73 -> DA N6 D0505 : score 3.392 : w : GLN OE1 B0038 <- 5.57 -> DT O4 G0620 : score 3.068 : w : GLN NE2 B0044 <- 5.29 -> DA N6 G0616 : score 2.804 : w : THR OG1 B0046 <- 6.15 -> DG N7 G0615 : score 3.422 : H : ARG NH2 B0070 <- 2.82 -> DG O6 G0615 : score 6.5736 : w : ARG NH2 B0070 <- 5.84 -> DG N7 G0615 : score 2.18 : w : ASN OD1 B0075 <- 6.04 -> DG N7 G0615 : score 1.873 : w : ASN ND2 B0075 <- 5.73 -> DG N7 G0615 : score 3.259 : w : LYS NZ B0139 <- 5.91 -> DG N3 G0615 : score 2.232 : w : THR OG1 B0140 <- 5.59 -> DT O2 D0509 : score 2.522 : w : THR OG1 B0140 <- 5.49 -> DA N3 G0616 : score 2.845 : x : SER xxxx A0022 <- 4.15 -> DA xxx E0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.77 -> DA xxx E0516 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.67 -> DG xxx E0515 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0068 <- 3.75 -> DA xxx F0606 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 4.11 -> DC xxx D0514 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0022 <- 4.17 -> DA xxx G0616 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0024 <- 3.81 -> DA xxx G0616 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0068 <- 3.53 -> DA xxx D0506 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0073 <- 4.04 -> DC xxx F0614 : score x.xxxxx >4aad_A:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MUTANT D75N I-CREI IN COMPLEX WITH ITS WILD- TYPE TARGET IN ABSENCE OF METAL IONS AT THE ACTIVE SITE (THE FOUR CENTRAL BASES, 2NN REGION, ARE COMPOSED BY GTAC FROM 5' TO 3') organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : H : LYS NZ A0028 <- 3.07 -> DT O4 E0519 : score 3.39347 : H : TYR OH A0033 <- 2.39 -> DA N7 F0603 : score 4.49169 : H : TYR OH A0033 <- 3.22 -> DA N6 F0603 : score 4.27819 : H : GLN OE1 A0038 <- 2.67 -> DA N6 F0604 : score 6.20993 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.43 -> DA N7 F0604 : score 6.54038 : H : GLN NE2 A0044 <- 3.07 -> DA N7 E0516 : score 5.7609 : H : ARG NH2 A0070 <- 2.97 -> DG N7 F0608 : score 6.16754 : x : ILE xxxx A0024 <- 4.14 -> DA xxx E0516 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0026 <- 2.77 -> DG xxx E0518 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0030 <- 3.33 -> DT xxx E0521 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0032 <- 3.93 -> DC xxx F0602 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0068 <- 3.78 -> DA xxx F0606 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 4.28 -> DG xxx F0611 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0140 <- 4.03 -> DC xxx E0517 : score x.xxxxx >4aad_AB:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MUTANT D75N I-CREI IN COMPLEX WITH ITS WILD- TYPE TARGET IN ABSENCE OF METAL IONS AT THE ACTIVE SITE (THE FOUR CENTRAL BASES, 2NN REGION, ARE COMPOSED BY GTAC FROM 5' TO 3') organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : H : LYS NZ A0028 <- 3.07 -> DT O4 E0519 : score 3.39347 : H : TYR OH A0033 <- 2.39 -> DA N7 F0603 : score 4.49169 : H : TYR OH A0033 <- 3.22 -> DA N6 F0603 : score 4.27819 : H : GLN OE1 A0038 <- 2.67 -> DA N6 F0604 : score 6.20993 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.43 -> DA N7 F0604 : score 6.54038 : H : GLN NE2 A0044 <- 3.07 -> DA N7 E0516 : score 5.7609 : H : ARG NH2 A0070 <- 2.97 -> DG N7 F0608 : score 6.16754 : H : LYS NZ B0028 <- 2.40 -> DT O4 F0619 : score 3.87415 : H : SER OG B0032 <- 2.59 -> DC N4 E0502 : score 3.83002 : H : TYR OH B0033 <- 2.51 -> DA N7 E0503 : score 4.39206 : H : TYR OH B0033 <- 3.05 -> DA N6 E0503 : score 4.43699 : w : GLN OE1 B0038 <- 5.94 -> DA N6 E0505 : score 3.392 : w : SER OG B0040 <- 6.02 -> DA N6 E0505 : score 2.209 : H : GLN NE2 B0044 <- 3.30 -> DA N7 F0616 : score 5.48077 : H : ARG NH2 B0070 <- 2.77 -> DG N7 E0508 : score 6.42292 : H : ARG NH2 B0070 <- 2.74 -> DG O6 E0508 : score 6.6792 : x : ILE xxxx A0024 <- 4.14 -> DA xxx E0516 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0026 <- 2.77 -> DG xxx E0518 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0030 <- 3.33 -> DT xxx E0521 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0032 <- 3.93 -> DC xxx F0602 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0068 <- 3.78 -> DA xxx F0606 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 4.28 -> DG xxx F0611 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0140 <- 4.03 -> DC xxx E0517 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0024 <- 4.15 -> DA xxx F0616 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0026 <- 2.76 -> DG xxx F0618 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0030 <- 3.31 -> DT xxx F0621 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0046 <- 3.99 -> DG xxx F0615 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0068 <- 3.61 -> DA xxx E0506 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0139 <- 3.25 -> DG xxx F0615 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0140 <- 3.69 -> DC xxx F0617 : score x.xxxxx >4aae_A:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MUTANT D75N I-CREI IN COMPLEX WITH AN ALTERED TARGET (THE FOUR CENTRAL BASES, 2NN REGION, ARE COMPOSED BY AGCG FROM 5' TO 3') organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : w : GLN NE2 A0026 <- 5.47 -> DG O6 E0518 : score 2.87 : w : LYS NZ A0028 <- 5.61 -> DG O6 E0518 : score 3.005 : w : LYS NZ A0028 <- 5.44 -> DA N6 G0605 : score 2.097 : w : ASN ND2 A0030 <- 5.79 -> DT O4 E0520 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.34 -> DC N4 G0602 : score 3.27867 : H : TYR OH A0033 <- 2.44 -> DA N7 G0603 : score 4.45017 : H : TYR OH A0033 <- 3.11 -> DA N6 G0603 : score 4.38094 : w : GLN NE2 A0038 <- 5.44 -> DT O4 E0520 : score 2.257 : H : GLN NE2 A0044 <- 3.40 -> DA N7 E0516 : score 5.35897 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.18 -> DG O6 G0608 : score 5.621 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.92 -> DG N7 G0608 : score 6.23138 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.56 -> DG O6 E0515 : score 6.37533 : H : ARG NH2 A0070 <- 3.10 -> DG N7 E0515 : score 6.00154 : w : LYS NZ A0139 <- 5.46 -> DG N3 G0612 : score 2.232 : w : THR OG1 A0140 <- 5.75 -> DC O2 E0517 : score 2.048 : x : ILE xxxx A0024 <- 4.11 -> DA xxx E0516 : score x.xxxxx >4aae_AB:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MUTANT D75N I-CREI IN COMPLEX WITH AN ALTERED TARGET (THE FOUR CENTRAL BASES, 2NN REGION, ARE COMPOSED BY AGCG FROM 5' TO 3') organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : w : GLN NE2 A0026 <- 5.47 -> DG O6 E0518 : score 2.87 : w : LYS NZ A0028 <- 5.61 -> DG O6 E0518 : score 3.005 : w : LYS NZ A0028 <- 5.44 -> DA N6 G0605 : score 2.097 : w : ASN ND2 A0030 <- 5.79 -> DT O4 E0520 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.34 -> DC N4 G0602 : score 3.27867 : H : TYR OH A0033 <- 2.44 -> DA N7 G0603 : score 4.45017 : H : TYR OH A0033 <- 3.11 -> DA N6 G0603 : score 4.38094 : w : GLN NE2 A0038 <- 5.44 -> DT O4 E0520 : score 2.257 : H : GLN NE2 A0044 <- 3.40 -> DA N7 E0516 : score 5.35897 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.18 -> DG O6 G0608 : score 5.621 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.92 -> DG N7 G0608 : score 6.23138 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.56 -> DG O6 E0515 : score 6.37533 : H : ARG NH2 A0070 <- 3.10 -> DG N7 E0515 : score 6.00154 : w : LYS NZ A0139 <- 5.46 -> DG N3 G0612 : score 2.232 : w : THR OG1 A0140 <- 5.75 -> DC O2 E0517 : score 2.048 : w : GLN NE2 B0026 <- 5.32 -> DG O6 G0618 : score 2.87 : H : LYS NZ B0028 <- 2.96 -> DT O4 G0619 : score 3.47239 : w : LYS NZ B0028 <- 5.72 -> DG O6 G0618 : score 3.005 : w : LYS NZ B0028 <- 5.86 -> DA N6 E0505 : score 2.097 : H : ASN ND2 B0030 <- 3.15 -> DT O4 G0621 : score 4.91469 : w : ASN ND2 B0030 <- 5.53 -> DT O4 G0620 : score 3.275 : H : SER OG B0032 <- 3.29 -> DC N4 E0502 : score 3.31543 : H : TYR OH B0033 <- 2.56 -> DA N7 E0503 : score 4.35054 : H : TYR OH B0033 <- 2.99 -> DA N6 E0503 : score 4.49303 : w : GLN NE2 B0038 <- 5.46 -> DT O4 G0620 : score 2.257 : w : SER OG B0040 <- 5.91 -> DA N6 E0505 : score 2.209 : H : GLN NE2 B0044 <- 3.26 -> DA N7 G0616 : score 5.52949 : w : GLN OE1 B0044 <- 5.88 -> DC N4 G0617 : score 3.488 : H : ARG NH1 B0070 <- 3.21 -> DG O6 E0508 : score 5.5845 : H : ARG NH2 B0070 <- 2.61 -> DG N7 E0508 : score 6.62723 : w : ASN ND2 B0075 <- 6.11 -> DG N7 G0615 : score 3.259 : w : THR OG1 B0140 <- 5.63 -> DC O2 G0617 : score 2.048 : x : ILE xxxx A0024 <- 4.11 -> DA xxx E0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0024 <- 3.57 -> DA xxx G0616 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0068 <- 3.53 -> DA xxx E0506 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0073 <- 4.24 -> DT xxx G0614 : score x.xxxxx >4aaf_AB:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MUTANT D75N I-CREI IN COMPLEX WITH AN ALTERED TARGET (THE FOUR CENTRAL BASES, 2NN REGION, ARE COMPOSED BY TGCA FROM 5' TO 3') organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : w : GLN NE2 A0026 <- 5.31 -> DG O6 E0518 : score 2.87 : w : ASN ND2 A0030 <- 5.62 -> DT O4 E0520 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.44 -> DC N4 G0602 : score 3.20516 : H : TYR OH A0033 <- 2.50 -> DA N7 G0603 : score 4.40036 : H : TYR OH A0033 <- 3.04 -> DA N6 G0603 : score 4.44633 : w : GLN NE2 A0038 <- 6.33 -> DT O4 E0520 : score 2.257 : H : GLN NE2 A0044 <- 3.14 -> DA N7 E0516 : score 5.67564 : H : ARG NH1 A0068 <- 2.92 -> DG O6 G0608 : score 5.93733 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.75 -> DG N7 G0608 : score 6.44846 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.88 -> DG O6 E0515 : score 5.986 : H : ARG NH2 A0070 <- 3.00 -> DG N7 E0515 : score 6.12923 : H : LYS NZ A0139 <- 3.20 -> DT O2 G0611 : score 3.3002 : w : LYS NZ A0139 <- 5.50 -> DG N3 G0612 : score 2.232 : w : THR OG1 A0140 <- 5.60 -> DC O2 E0517 : score 2.048 : H : LYS NZ B0028 <- 2.97 -> DT O4 G0619 : score 3.46522 : w : LYS NZ B0028 <- 5.65 -> DA N6 E0505 : score 2.097 : w : ASN ND2 B0030 <- 5.72 -> DT O4 G0620 : score 3.275 : H : SER OG B0032 <- 3.24 -> DC N4 E0502 : score 3.35218 : H : TYR OH B0033 <- 2.68 -> DA N7 E0503 : score 4.25091 : H : TYR OH B0033 <- 3.08 -> DA N6 E0503 : score 4.40896 : w : GLN NE2 B0038 <- 5.68 -> DA N6 E0505 : score 2.804 : w : GLN NE2 B0038 <- 5.72 -> DT O4 G0620 : score 2.257 : w : GLN NE2 B0044 <- 5.72 -> DA N6 G0616 : score 2.804 : H : ARG NH2 B0070 <- 2.94 -> DG O6 E0508 : score 6.4152 : w : ASN OD1 B0075 <- 6.42 -> DA N6 G0616 : score 2.837 : x : ILE xxxx A0024 <- 3.86 -> DA xxx E0516 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0028 <- 3.09 -> DT xxx E0519 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0024 <- 3.63 -> DA xxx G0616 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0026 <- 3.22 -> DG xxx G0618 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0068 <- 3.43 -> DA xxx E0506 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0140 <- 4.12 -> DC xxx G0617 : score x.xxxxx >4aaf_B:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MUTANT D75N I-CREI IN COMPLEX WITH AN ALTERED TARGET (THE FOUR CENTRAL BASES, 2NN REGION, ARE COMPOSED BY TGCA FROM 5' TO 3') organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : H : LYS NZ B0028 <- 2.97 -> DT O4 G0619 : score 3.46522 : w : LYS NZ B0028 <- 5.65 -> DA N6 E0505 : score 2.097 : w : ASN ND2 B0030 <- 5.72 -> DT O4 G0620 : score 3.275 : H : SER OG B0032 <- 3.24 -> DC N4 E0502 : score 3.35218 : H : TYR OH B0033 <- 2.68 -> DA N7 E0503 : score 4.25091 : H : TYR OH B0033 <- 3.08 -> DA N6 E0503 : score 4.40896 : w : GLN NE2 B0038 <- 5.68 -> DA N6 E0505 : score 2.804 : w : GLN NE2 B0038 <- 5.72 -> DT O4 G0620 : score 2.257 : w : GLN NE2 B0044 <- 5.72 -> DA N6 G0616 : score 2.804 : H : ARG NH2 B0070 <- 2.94 -> DG O6 E0508 : score 6.4152 : w : ASN OD1 B0075 <- 6.42 -> DA N6 G0616 : score 2.837 : x : ILE xxxx B0024 <- 3.63 -> DA xxx G0616 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0026 <- 3.22 -> DG xxx G0618 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0068 <- 3.43 -> DA xxx E0506 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0140 <- 4.12 -> DC xxx G0617 : score x.xxxxx >4aag_AB:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MUTANT D75N I-CREI IN COMPLEX WITH ITS WILD- TYPE TARGET IN PRESENCE OF CA AT THE ACTIVE SITE (THE FOUR CENTRAL BASES, 2NN REGION, ARE COMPOSED BY GTAC FROM 5' TO 3') organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : H : LYS NZ A0028 <- 2.62 -> DT O4 E0519 : score 3.71632 : H : TYR OH A0033 <- 2.68 -> DA N7 G0603 : score 4.25091 : H : GLN OE1 A0038 <- 3.01 -> DA N6 G0604 : score 5.79836 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.96 -> DA N7 G0604 : score 5.89487 : w : GLN NE2 A0044 <- 5.62 -> DA N6 E0516 : score 2.804 : H : ARG NH2 A0070 <- 2.92 -> DG O6 E0515 : score 6.4416 : w : ARG NH1 A0070 <- 6.11 -> DC N4 E0514 : score 1.892 : w : SER OG A0072 <- 6.47 -> DC N4 E0514 : score 2.105 : w : ASN OD1 A0075 <- 6.22 -> DA N6 E0516 : score 2.837 : w : GLN NE2 B0026 <- 5.23 -> DG O6 G0618 : score 2.87 : H : LYS NZ B0028 <- 2.57 -> DT O4 G0619 : score 3.75219 : w : LYS NZ B0028 <- 5.76 -> DG O6 G0618 : score 3.005 : w : ASN ND2 B0030 <- 5.51 -> DT O4 G0620 : score 3.275 : H : SER OG B0032 <- 3.38 -> DC N4 E0502 : score 3.24927 : H : TYR OH B0033 <- 2.79 -> DA N7 E0503 : score 4.15958 : H : TYR OH B0033 <- 3.25 -> DA N6 E0503 : score 4.25017 : w : GLN NE2 B0038 <- 5.38 -> DT O4 G0620 : score 2.257 : H : ARG NH1 B0070 <- 3.26 -> DG O6 G0615 : score 5.52367 : H : ARG NH2 B0070 <- 3.09 -> DG O6 G0615 : score 6.2172 : w : THR OG1 B0140 <- 5.63 -> DC O2 G0617 : score 2.048 : x : SER xxxx A0022 <- 4.30 -> DA xxx E0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.93 -> DA xxx E0516 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0026 <- 3.19 -> DG xxx E0518 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0030 <- 3.24 -> DT xxx E0521 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0032 <- 3.50 -> DC xxx G0602 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.61 -> DG xxx E0515 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0068 <- 3.89 -> DC xxx G0607 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.65 -> DC xxx E0514 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 4.33 -> DG xxx G0611 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0140 <- 4.05 -> DC xxx G0610 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0022 <- 4.35 -> DA xxx G0616 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0024 <- 3.74 -> DA xxx G0616 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0044 <- 3.92 -> DA xxx G0616 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0046 <- 3.45 -> DG xxx G0615 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0068 <- 4.14 -> DC xxx E0507 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0073 <- 4.03 -> DA xxx G0613 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0139 <- 4.35 -> DG xxx G0615 : score x.xxxxx >4aag_B:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MUTANT D75N I-CREI IN COMPLEX WITH ITS WILD- TYPE TARGET IN PRESENCE OF CA AT THE ACTIVE SITE (THE FOUR CENTRAL BASES, 2NN REGION, ARE COMPOSED BY GTAC FROM 5' TO 3') organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : w : GLN NE2 B0026 <- 5.23 -> DG O6 G0618 : score 2.87 : H : LYS NZ B0028 <- 2.57 -> DT O4 G0619 : score 3.75219 : w : LYS NZ B0028 <- 5.76 -> DG O6 G0618 : score 3.005 : w : ASN ND2 B0030 <- 5.51 -> DT O4 G0620 : score 3.275 : H : SER OG B0032 <- 3.38 -> DC N4 E0502 : score 3.24927 : H : TYR OH B0033 <- 2.79 -> DA N7 E0503 : score 4.15958 : H : TYR OH B0033 <- 3.25 -> DA N6 E0503 : score 4.25017 : w : GLN NE2 B0038 <- 5.38 -> DT O4 G0620 : score 2.257 : H : ARG NH1 B0070 <- 3.26 -> DG O6 G0615 : score 5.52367 : H : ARG NH2 B0070 <- 3.09 -> DG O6 G0615 : score 6.2172 : w : THR OG1 B0140 <- 5.63 -> DC O2 G0617 : score 2.048 : x : SER xxxx B0022 <- 4.35 -> DA xxx G0616 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0024 <- 3.74 -> DA xxx G0616 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0044 <- 3.92 -> DA xxx G0616 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0046 <- 3.45 -> DG xxx G0615 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0068 <- 4.14 -> DC xxx E0507 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0073 <- 4.03 -> DA xxx G0613 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0139 <- 4.35 -> DG xxx G0615 : score x.xxxxx >4abt_B:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TYPE IIF RESTRICTION ENDONUCLEASE NGOMIV WITH COGNATE UNCLEAVED DNA organism=NEISSERIA GONORRHOEAE : H : ASP OD2 B0034 <- 2.92 -> DC N4 G0009 : score 6.0512 : H : ARG NE B0191 <- 2.82 -> DG O6 G0008 : score 3.92526 : H : ARG NH2 B0191 <- 2.93 -> DG N7 G0008 : score 6.21862 : H : ARG NE B0194 <- 2.97 -> DG O6 G0007 : score 3.80703 : H : ARG NH2 B0194 <- 2.97 -> DG N7 G0007 : score 6.16754 : x : SER xxxx B0036 <- 2.85 -> DC xxx G0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0063 <- 3.63 -> DC xxx G0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0099 <- 4.32 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0100 <- 3.61 -> DG xxx G0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0227 <- 3.41 -> DC xxx G0009 : score x.xxxxx >4aij_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ROVA FROM YERSINIA IN COMPLEX WITH A ROVA PROMOTER FRAGMENT organism=YERSINIA PSEUDOTUBERCULOSIS : H : GLN OE1 A0060 <- 3.04 -> DA N6 C0005 : score 5.76204 : V : PRO CG A0061 <- 3.60 -> DT C7 D0016 : score 6.67692 : V : VAL CG1 A0064 <- 3.89 -> DT C7 C0006 : score 5.92415 : V : PRO CB B0061 <- 3.90 -> DT C7 C0013 : score 5.661 : x : ILE xxxx A0050 <- 3.95 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0059 <- 3.76 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0086 <- 4.26 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0060 <- 3.94 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0062 <- 3.39 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0064 <- 3.97 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0065 <- 3.68 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx >4aij_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ROVA FROM YERSINIA IN COMPLEX WITH A ROVA PROMOTER FRAGMENT organism=YERSINIA PSEUDOTUBERCULOSIS : V : PRO CB B0061 <- 3.90 -> DT C7 C0013 : score 5.661 : x : GLN xxxx B0060 <- 3.94 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0062 <- 3.39 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0064 <- 3.97 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0065 <- 3.68 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx >4aik_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ROVA FROM YERSINIA IN COMPLEX WITH AN INVASIN PROMOTER FRAGMENT organism=YERSINIA PSEUDOTUBERCULOSIS : H : GLN OE1 A0060 <- 3.21 -> DA N6 C0015 : score 5.55625 : H : ARG NH1 A0086 <- 2.76 -> DT O2 C0012 : score 4.34086 : V : VAL CG1 A0064 <- 3.73 -> DT C7 C0016 : score 6.16657 : x : PRO xxxx A0061 <- 3.36 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0062 <- 4.32 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx >4ail_C:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AN EVOLVED REPLICATING DNA POLYMERASE organism=PYROCOCCUS FURIOSUS : w : TYR OH C0495 <- 5.90 -> DG N3 A0004 : score 3.344 : H : ARG NH1 C0613 <- 3.16 -> DT O2 B0005 : score 3.99635 : H : ARG NH2 C0613 <- 3.34 -> DT O2 B0004 : score 3.77613 : x : LYS xxxx C0593 <- 3.24 -> DT xxx A0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0615 <- 4.47 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx >4aqu_AB:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF I-CREI COMPLEXED WITH ITS TARGET METHYLATED AT POSITION PLUS 2 (IN THE B STRAND) IN THE PRESENCE OF CALCIUM organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : w : GLN OE1 A0026 <- 5.45 -> DG O6 D0518 : score 2.87 : H : LYS NZ A0028 <- 2.71 -> DT O4 D0519 : score 3.65175 : w : LYS NZ A0028 <- 5.88 -> DG O6 D0518 : score 3.005 : w : LYS NZ A0028 <- 6.06 -> DA N6 C0405 : score 2.097 : w : ASN ND2 A0030 <- 5.86 -> DT O4 D0520 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.41 -> DC N4 C0402 : score 3.22721 : H : TYR OH A0033 <- 2.51 -> DA N7 C0403 : score 4.39206 : H : TYR OH A0033 <- 3.21 -> DA N6 C0403 : score 4.28753 : H : GLN OE1 A0038 <- 3.07 -> DA N6 C0404 : score 5.72573 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.80 -> DA N7 C0404 : score 6.08974 : w : GLN OE1 A0038 <- 6.70 -> DA N6 C0405 : score 3.392 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.80 -> DT O4 D0520 : score 3.068 : w : SER OG A0040 <- 6.13 -> DA N6 C0405 : score 2.209 : H : GLN NE2 A0044 <- 2.89 -> DA N7 D0516 : score 5.98013 : w : GLN OE1 A0044 <- 5.82 -> DC N4 D0517 : score 3.488 : H : ARG NH1 A0068 <- 2.99 -> DG N7 C0408 : score 5.8201 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.91 -> DG O6 C0408 : score 6.4548 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.57 -> DG O6 D0515 : score 6.36317 : H : ARG NH2 A0070 <- 3.03 -> DG N7 D0515 : score 6.09092 : w : SER OG A0079 <- 6.45 -> DA N7 C0405 : score 2.343 : w : THR OG1 A0140 <- 5.50 -> DC O2 D0517 : score 2.048 : H : GLN NE2 B0226 <- 2.71 -> DA N7 C0418 : score 6.19936 : H : LYS NZ B0228 <- 2.34 -> DG O6 C0419 : score 6.3126 : w : ASN ND2 B0230 <- 6.04 -> DT O4 C0420 : score 3.275 : H : SER OG B0232 <- 3.00 -> DC N4 D0502 : score 3.52862 : H : TYR OH B0233 <- 2.65 -> DA N7 D0503 : score 4.27582 : H : TYR OH B0233 <- 3.18 -> DA N6 D0503 : score 4.31555 : H : GLN OE1 B0238 <- 3.11 -> DA N6 D0504 : score 5.67731 : H : GLN NE2 B0238 <- 2.92 -> DA N7 D0504 : score 5.94359 : w : GLN OE1 B0238 <- 6.08 -> DA N6 D0505 : score 3.392 : w : GLN OE1 B0238 <- 5.42 -> DT O4 C0420 : score 3.068 : w : SER OG B0240 <- 6.08 -> DA N6 D0505 : score 2.209 : H : GLN NE2 B0244 <- 2.87 -> DA N7 C0416 : score 6.00449 : w : GLN OE1 B0244 <- 5.76 -> DC N4 C0417 : score 3.488 : H : ARG NH1 B0268 <- 3.24 -> DG N7 D0508 : score 5.5176 : H : ARG NH2 B0268 <- 2.76 -> DG O6 D0508 : score 6.6528 : H : ARG NH1 B0270 <- 2.77 -> DG O6 C0415 : score 6.11983 : H : ARG NH2 B0270 <- 3.08 -> DG N7 C0415 : score 6.02708 : x : SER xxxx A0022 <- 4.20 -> DA xxx D0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.64 -> DA xxx D0516 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.81 -> DG xxx D0515 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 4.46 -> DA xxx D0513 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 4.17 -> DG xxx C0411 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0222 <- 4.21 -> DA xxx C0416 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0224 <- 3.56 -> DA xxx C0416 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0246 <- 3.69 -> DG xxx C0415 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0266 <- 4.46 -> DC xxx D0506 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0273 <- 4.03 -> DA xxx C0414 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0339 <- 3.85 -> DT xxx D0511 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0340 <- 3.85 -> DC xxx D0510 : score x.xxxxx >4aqu_B:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF I-CREI COMPLEXED WITH ITS TARGET METHYLATED AT POSITION PLUS 2 (IN THE B STRAND) IN THE PRESENCE OF CALCIUM organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : H : GLN NE2 B0226 <- 2.71 -> DA N7 C0418 : score 6.19936 : H : LYS NZ B0228 <- 2.34 -> DG O6 C0419 : score 6.3126 : w : ASN ND2 B0230 <- 6.04 -> DT O4 C0420 : score 3.275 : H : SER OG B0232 <- 3.00 -> DC N4 D0502 : score 3.52862 : H : TYR OH B0233 <- 2.65 -> DA N7 D0503 : score 4.27582 : H : TYR OH B0233 <- 3.18 -> DA N6 D0503 : score 4.31555 : H : GLN OE1 B0238 <- 3.11 -> DA N6 D0504 : score 5.67731 : H : GLN NE2 B0238 <- 2.92 -> DA N7 D0504 : score 5.94359 : w : GLN OE1 B0238 <- 6.08 -> DA N6 D0505 : score 3.392 : w : GLN OE1 B0238 <- 5.42 -> DT O4 C0420 : score 3.068 : w : SER OG B0240 <- 6.08 -> DA N6 D0505 : score 2.209 : H : GLN NE2 B0244 <- 2.87 -> DA N7 C0416 : score 6.00449 : w : GLN OE1 B0244 <- 5.76 -> DC N4 C0417 : score 3.488 : H : ARG NH1 B0268 <- 3.24 -> DG N7 D0508 : score 5.5176 : H : ARG NH2 B0268 <- 2.76 -> DG O6 D0508 : score 6.6528 : H : ARG NH1 B0270 <- 2.77 -> DG O6 C0415 : score 6.11983 : H : ARG NH2 B0270 <- 3.08 -> DG N7 C0415 : score 6.02708 : x : SER xxxx B0222 <- 4.21 -> DA xxx C0416 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0224 <- 3.56 -> DA xxx C0416 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0246 <- 3.69 -> DG xxx C0415 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0266 <- 4.46 -> DC xxx D0506 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0273 <- 4.03 -> DA xxx C0414 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0339 <- 3.85 -> DT xxx D0511 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0340 <- 3.85 -> DC xxx D0510 : score x.xxxxx >4aqx_A:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF I-CREI COMPLEXED WITH ITS TARGET METHYLATED AT POSITION PLUS 2 (IN THE B STRAND) IN THE PRESENCE OF MAGNESIUM organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : w : GLN NE2 A0026 <- 5.63 -> DA N6 D0518 : score 2.804 : H : LYS NZ A0028 <- 2.79 -> DG O6 D0519 : score 5.79233 : w : LYS NZ A0028 <- 5.83 -> DA N6 D0518 : score 2.097 : w : LYS NZ A0028 <- 5.92 -> DA N6 E0605 : score 2.097 : w : ASN ND2 A0030 <- 5.72 -> DT O4 D0522 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.36 -> DC N4 E0602 : score 3.26397 : w : SER OG A0032 <- 6.14 -> DT O4 D0522 : score 2.338 : H : TYR OH A0033 <- 2.43 -> DA N7 E0603 : score 4.45848 : H : TYR OH A0033 <- 3.10 -> DA N6 E0603 : score 4.39028 : H : GLN OE1 A0038 <- 2.97 -> DA N6 E0604 : score 5.84678 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.85 -> DA N7 E0604 : score 6.02885 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.65 -> DA N6 E0605 : score 3.392 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.46 -> DT O4 D0520 : score 3.068 : w : GLN NE2 A0044 <- 5.84 -> DA N6 D0516 : score 2.804 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.04 -> DG N7 E0608 : score 5.7596 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.92 -> DG O6 E0608 : score 6.4416 : w : ARG NH2 A0068 <- 6.15 -> DA N6 D0516 : score 1.997 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.84 -> DG O6 D0515 : score 6.03467 : H : ARG NH2 A0070 <- 3.30 -> DG N7 D0515 : score 5.74615 : w : LYS NZ A0139 <- 6.53 -> DC O2 E0612 : score 1.3 : w : THR OG1 A0140 <- 6.15 -> DC O2 D0517 : score 2.048 : x : SER xxxx A0022 <- 4.19 -> DA xxx D0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.71 -> DA xxx D0516 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.90 -> DG xxx D0515 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 4.32 -> DC xxx E0606 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.81 -> DG xxx C0513 : score x.xxxxx >4aqx_AB:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF I-CREI COMPLEXED WITH ITS TARGET METHYLATED AT POSITION PLUS 2 (IN THE B STRAND) IN THE PRESENCE OF MAGNESIUM organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : w : GLN NE2 A0026 <- 5.63 -> DA N6 D0518 : score 2.804 : H : LYS NZ A0028 <- 2.79 -> DG O6 D0519 : score 5.79233 : w : LYS NZ A0028 <- 5.83 -> DA N6 D0518 : score 2.097 : w : LYS NZ A0028 <- 5.92 -> DA N6 E0605 : score 2.097 : w : ASN ND2 A0030 <- 5.72 -> DT O4 D0522 : score 3.275 : H : SER OG A0032 <- 3.36 -> DC N4 E0602 : score 3.26397 : w : SER OG A0032 <- 6.14 -> DT O4 D0522 : score 2.338 : H : TYR OH A0033 <- 2.43 -> DA N7 E0603 : score 4.45848 : H : TYR OH A0033 <- 3.10 -> DA N6 E0603 : score 4.39028 : H : GLN OE1 A0038 <- 2.97 -> DA N6 E0604 : score 5.84678 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.85 -> DA N7 E0604 : score 6.02885 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.65 -> DA N6 E0605 : score 3.392 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.46 -> DT O4 D0520 : score 3.068 : w : GLN NE2 A0044 <- 5.84 -> DA N6 D0516 : score 2.804 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.04 -> DG N7 E0608 : score 5.7596 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.92 -> DG O6 E0608 : score 6.4416 : w : ARG NH2 A0068 <- 6.15 -> DA N6 D0516 : score 1.997 : H : ARG NH1 A0070 <- 2.84 -> DG O6 D0515 : score 6.03467 : H : ARG NH2 A0070 <- 3.30 -> DG N7 D0515 : score 5.74615 : w : LYS NZ A0139 <- 6.53 -> DC O2 E0612 : score 1.3 : w : THR OG1 A0140 <- 6.34 -> DT O2 E0609 : score 2.522 : H : GLN NE2 B0026 <- 2.99 -> DG N7 F0618 : score 4.03917 : H : LYS NZ B0028 <- 2.86 -> DT O4 F0619 : score 3.54413 : w : ASN ND2 B0030 <- 5.81 -> DT O4 F0620 : score 3.275 : H : TYR OH B0033 <- 2.40 -> DA N7 C0503 : score 4.48338 : H : TYR OH B0033 <- 3.08 -> DA N6 C0503 : score 4.40896 : H : GLN OE1 B0038 <- 3.06 -> DA N6 C0504 : score 5.73783 : H : GLN NE2 B0038 <- 2.91 -> DA N7 C0504 : score 5.95577 : w : GLN OE1 B0038 <- 5.63 -> DT O4 F0620 : score 3.068 : H : GLN NE2 B0044 <- 2.95 -> DA N7 F0616 : score 5.90705 : w : GLN OE1 B0044 <- 5.93 -> DC N4 F0617 : score 3.488 : H : ARG NH1 B0068 <- 3.11 -> DG N7 C0508 : score 5.6749 : H : ARG NH2 B0068 <- 2.42 -> DG O6 C0508 : score 7.1016 : H : ARG NH1 B0070 <- 2.73 -> DG O6 F0615 : score 6.1685 : H : ARG NH2 B0070 <- 3.09 -> DG N7 F0615 : score 6.01431 : w : THR OG1 B0140 <- 5.37 -> DC O2 F0617 : score 2.048 : x : SER xxxx A0022 <- 4.19 -> DA xxx D0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.71 -> DA xxx D0516 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.90 -> DG xxx D0515 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 4.32 -> DC xxx E0606 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.81 -> DG xxx C0513 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0022 <- 4.07 -> DA xxx F0616 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0024 <- 3.66 -> DA xxx F0616 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0032 <- 3.53 -> DC xxx C0502 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0046 <- 4.07 -> DG xxx F0615 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0066 <- 4.41 -> DA xxx C0505 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0073 <- 4.29 -> DA xxx E0613 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0139 <- 4.31 -> DG xxx C0511 : score x.xxxxx >4aso_ABC:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=TUBR BOUND TO 24 BP OF TUBC FROM BACILLUS THURINGIENSIS SEROVAR ISRAELENSIS PBTOXIS organism=BACILLUS THURINGIENSIS : V : PRO CB B0055 <- 3.67 -> DT C7 T0015 : score 5.99485 : V : SER CB B0053 <- 3.70 -> DT C7 S0008 : score 3.20956 : x : SER xxxx A0053 <- 3.28 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0054 <- 3.50 -> DG xxx S0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0055 <- 2.34 -> DT xxx S0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0054 <- 3.85 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0053 <- 4.18 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0054 <- 3.99 -> DA xxx S0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0055 <- 3.32 -> DT xxx S0019 : score x.xxxxx >4aso_EFG:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=TUBR BOUND TO 24 BP OF TUBC FROM BACILLUS THURINGIENSIS SEROVAR ISRAELENSIS PBTOXIS organism=BACILLUS THURINGIENSIS : x : SER xxxx E0053 <- 2.73 -> DA xxx V0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0054 <- 4.32 -> DG xxx U0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0055 <- 3.05 -> DT xxx U0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0058 <- 4.46 -> DG xxx U0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0053 <- 1.93 -> DT xxx U0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0054 <- 1.84 -> DT xxx V0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0055 <- 2.03 -> DT xxx V0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0056 <- 4.25 -> DT xxx U0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0058 <- 4.28 -> DT xxx V0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0077 <- 3.58 -> DA xxx U0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0053 <- 3.72 -> DA xxx V0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0054 <- 3.35 -> DG xxx U0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0055 <- 3.02 -> DT xxx U0019 : score x.xxxxx >4aso_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=TUBR BOUND TO 24 BP OF TUBC FROM BACILLUS THURINGIENSIS SEROVAR ISRAELENSIS PBTOXIS organism=BACILLUS THURINGIENSIS : x : SER xxxx F0053 <- 1.93 -> DT xxx U0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0054 <- 1.84 -> DT xxx V0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0055 <- 2.03 -> DT xxx V0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0056 <- 4.25 -> DT xxx U0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0058 <- 4.28 -> DT xxx V0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0077 <- 3.58 -> DA xxx U0017 : score x.xxxxx >4aso_HL:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=TUBR BOUND TO 24 BP OF TUBC FROM BACILLUS THURINGIENSIS SEROVAR ISRAELENSIS PBTOXIS organism=BACILLUS THURINGIENSIS : V : SER CB H0053 <- 3.87 -> DT C7 U0020 : score 3.07648 : V : SER CB L0053 <- 3.87 -> DT C7 W0021 : score 3.07648 : x : LYS xxxx H0054 <- 3.08 -> DT xxx V0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0055 <- 2.29 -> DT xxx V0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0054 <- 2.61 -> DT xxx X0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx L0055 <- 2.12 -> DT xxx X0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0056 <- 4.10 -> DT xxx W0020 : score x.xxxxx >4aso_IJK:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=TUBR BOUND TO 24 BP OF TUBC FROM BACILLUS THURINGIENSIS SEROVAR ISRAELENSIS PBTOXIS organism=BACILLUS THURINGIENSIS : V : PRO CG J0055 <- 3.88 -> DT C7 X0014 : score 6.23179 : V : PRO CG I0055 <- 3.63 -> DT C7 W0008 : score 6.62923 : V : PRO CB K0055 <- 3.54 -> DT C7 W0019 : score 6.18355 : x : SER xxxx I0053 <- 3.04 -> DA xxx X0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0054 <- 2.99 -> DG xxx W0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0056 <- 3.91 -> DT xxx X0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0058 <- 3.48 -> DG xxx W0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0053 <- 3.30 -> DT xxx W0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0054 <- 2.81 -> DT xxx X0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0056 <- 4.03 -> DT xxx W0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx K0044 <- 4.24 -> DA xxx W0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0053 <- 2.54 -> DA xxx X0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx K0054 <- 2.85 -> DG xxx W0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx K0056 <- 4.09 -> DT xxx X0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx K0058 <- 3.33 -> DG xxx W0018 : score x.xxxxx >4aso_MNOP:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=TUBR BOUND TO 24 BP OF TUBC FROM BACILLUS THURINGIENSIS SEROVAR ISRAELENSIS PBTOXIS organism=BACILLUS THURINGIENSIS : H : SER OG O0053 <- 3.01 -> DA N7 Z0004 : score 4.27661 : V : LYS CE P0054 <- 3.52 -> DT C7 Z0002 : score 2.7831 : V : PRO CB N0055 <- 3.59 -> DT C7 Z0015 : score 6.11098 : x : SER xxxx M0053 <- 3.34 -> DA xxx Z0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0054 <- 4.45 -> DA xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx M0055 <- 2.92 -> DT xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx N0053 <- 2.49 -> DT xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx N0054 <- 3.04 -> DT xxx Z0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx N0056 <- 4.35 -> DT xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0077 <- 4.45 -> DC xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0044 <- 4.40 -> DA xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx O0054 <- 2.54 -> DG xxx Y0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0055 <- 2.34 -> DT xxx Y0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0056 <- 4.32 -> DT xxx Z0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0058 <- 3.71 -> DG xxx Y0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx P0053 <- 2.79 -> DT xxx Y0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0055 <- 2.54 -> DT xxx Z0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0058 <- 4.40 -> DT xxx Z0002 : score x.xxxxx >4ass_EFGHI:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=TUBR BOUND TO TUBC - 26 BP - FROM BACILLUS THURINGIENSIS SEROVAR ISRAELENSIS PBTOXIS organism=BACILLUS THURINGIENSIS : V : PRO CG G0055 <- 3.65 -> DT C7 Y0015 : score 6.59744 : V : PHE CD2 H0058 <- 3.86 -> DT C7 Z0009 : score 6.41412 : V : LYS CE F0054 <- 3.77 -> DT C7 Z0021 : score 2.62053 : x : LYS xxxx E0054 <- 2.80 -> DC xxx Y0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0055 <- 2.50 -> DT xxx Y0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0053 <- 2.77 -> DT xxx Y0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0055 <- 3.49 -> DT xxx Z0022 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0058 <- 4.47 -> DT xxx Z0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0077 <- 3.94 -> DA xxx Y0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0044 <- 3.99 -> DA xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0053 <- 3.67 -> DT xxx Y0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0054 <- 2.28 -> DC xxx Y0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0058 <- 2.94 -> DC xxx Y0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 3.29 -> DA xxx Z0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0044 <- 3.52 -> DC xxx Z0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0053 <- 2.44 -> DT xxx Y0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0054 <- 1.41 -> DT xxx Z0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0055 <- 3.04 -> DT xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0056 <- 3.79 -> DT xxx Y0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0077 <- 3.43 -> DT xxx Y0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0054 <- 4.45 -> DA xxx Z0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0077 <- 1.93 -> DA xxx Z0006 : score x.xxxxx >4ass_G:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=TUBR BOUND TO TUBC - 26 BP - FROM BACILLUS THURINGIENSIS SEROVAR ISRAELENSIS PBTOXIS organism=BACILLUS THURINGIENSIS : V : SER CB G0053 <- 3.89 -> DT C7 Y0014 : score 3.06083 : V : PRO CG G0055 <- 3.65 -> DT C7 Y0015 : score 6.59744 : x : THR xxxx G0044 <- 3.99 -> DA xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0054 <- 2.28 -> DC xxx Y0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0058 <- 2.94 -> DC xxx Y0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 3.29 -> DA xxx Z0019 : score x.xxxxx >4ati_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=MITF:M-BOX COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : H : HIS NE2 A0209 <- 3.17 -> DG O6 C0011 : score 7.36526 : H : HIS NE2 A0209 <- 2.73 -> DA N6 C0012 : score -6.1334 : H : GLU OE2 A0213 <- 2.85 -> DC N4 D0006 : score 5.21273 : w : ARG NH2 A0216 <- 5.30 -> DA N7 D0007 : score 1.486 : H : HIS NE2 B0209 <- 2.61 -> DG O6 D0011 : score 8.25609 : H : GLU OE1 B0213 <- 2.58 -> DC N4 C0006 : score 6.02174 : V : ILE CG2 A0212 <- 3.69 -> DT C7 D0005 : score 7.28629 : x : ASN xxxx A0210 <- 3.80 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0217 <- 2.72 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0210 <- 3.18 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0212 <- 3.04 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0216 <- 3.19 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0217 <- 3.51 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >4ati_B:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=MITF:M-BOX COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : H : HIS NE2 B0209 <- 2.61 -> DG O6 D0011 : score 8.25609 : H : GLU OE1 B0213 <- 2.58 -> DC N4 C0006 : score 6.02174 : x : ASN xxxx B0210 <- 3.18 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0212 <- 3.04 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0216 <- 3.19 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0217 <- 3.51 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >4atk_A:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=MITF:E-BOX COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : H : HIS NE2 A0209 <- 2.79 -> DC N4 C0012 : score 3.23081 : H : HIS NE2 A0209 <- 2.51 -> DG O6 D0005 : score 8.41517 : H : GLU OE1 A0213 <- 2.83 -> DC N4 D0006 : score 5.73334 : x : ASN xxxx A0210 <- 3.25 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0216 <- 3.98 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0217 <- 4.11 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx >4atk_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=MITF:E-BOX COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : H : HIS NE2 A0209 <- 2.51 -> DG O6 D0005 : score 8.41517 : H : HIS NE2 A0209 <- 2.79 -> DC N4 C0012 : score 3.23081 : H : GLU OE1 A0213 <- 2.83 -> DC N4 D0006 : score 5.73334 : H : HIS NE2 B0209 <- 2.70 -> DC N4 D0012 : score 3.28885 : H : GLU OE1 B0213 <- 2.62 -> DC N4 C0006 : score 5.97559 : x : ASN xxxx A0210 <- 3.25 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0216 <- 3.98 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0217 <- 4.11 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0210 <- 3.94 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0216 <- 3.58 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0217 <- 2.81 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx >4auw_AB:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors;Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE BZIP HOMODIMERIC MAFB IN COMPLEX WITH THE C- MARE BINDING SITE organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 A0244 <- 2.82 -> DG N7 D0006 : score 6.35908 : H : ARG NH2 A0244 <- 2.71 -> DG O6 D0006 : score 6.7188 : H : ARG NH2 A0256 <- 2.53 -> DG N7 C0012 : score 6.72938 : H : ARG NH2 B0244 <- 3.17 -> DG N7 C0006 : score 5.91215 : H : ARG NH2 B0244 <- 2.67 -> DG O6 C0006 : score 6.7716 : H : ARG NH2 B0244 <- 3.30 -> DG O6 D0016 : score 5.94 : H : ASN OD1 B0248 <- 3.38 -> DC N4 C0007 : score 3.70713 : H : ARG NH2 B0256 <- 2.73 -> DG N7 D0012 : score 6.474 : V : ALA CB A0252 <- 3.61 -> DT C7 C0013 : score 5.86493 : V : ALA CB B0252 <- 3.78 -> DT C7 D0013 : score 5.62697 : x : ASN xxxx A0248 <- 3.67 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0251 <- 3.68 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0255 <- 3.87 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0259 <- 4.43 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0251 <- 3.60 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0255 <- 3.85 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >4auw_B:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors;Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE BZIP HOMODIMERIC MAFB IN COMPLEX WITH THE C- MARE BINDING SITE organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 B0244 <- 3.30 -> DG O6 D0016 : score 5.94 : H : ARG NH2 B0244 <- 3.17 -> DG N7 C0006 : score 5.91215 : H : ARG NH2 B0244 <- 2.67 -> DG O6 C0006 : score 6.7716 : H : ASN OD1 B0248 <- 3.38 -> DC N4 C0007 : score 3.70713 : H : ARG NH2 B0256 <- 2.73 -> DG N7 D0012 : score 6.474 : V : ALA CB B0252 <- 3.78 -> DT C7 D0013 : score 5.62697 : x : TYR xxxx B0251 <- 3.60 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0255 <- 3.85 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >4auw_EF:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors;Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE BZIP HOMODIMERIC MAFB IN COMPLEX WITH THE C- MARE BINDING SITE organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 E0244 <- 3.11 -> DG N7 G0006 : score 5.98877 : H : ARG NH2 E0244 <- 3.01 -> DG O6 G0006 : score 6.3228 : H : ARG NH1 E0256 <- 2.73 -> DG N7 H0012 : score 6.1347 : H : ARG NH1 F0244 <- 2.88 -> DG N7 H0006 : score 5.9532 : H : ARG NH2 F0244 <- 2.37 -> DG O6 H0006 : score 7.1676 : H : ARG NH2 F0256 <- 2.88 -> DG N7 G0012 : score 6.28246 : V : ALA CB F0252 <- 3.55 -> DT C7 G0013 : score 5.94891 : x : ASN xxxx E0248 <- 3.40 -> DC xxx G0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0251 <- 3.92 -> DG xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0252 <- 3.42 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx E0255 <- 3.97 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0248 <- 3.81 -> DC xxx H0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0251 <- 3.70 -> DG xxx H0006 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx F0255 <- 4.09 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx >4av1_ABCD:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN PARP-1 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0018 <- 2.73 -> DG O6 X0003 : score 6.6924 : w : ARG NE D0122 <- 6.34 -> DG N3 Y0005 : score 1.082 : x : SER xxxx A0016 <- 3.16 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0122 <- 3.40 -> DG xxx X0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0148 <- 4.32 -> DT xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0151 <- 3.49 -> DT xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0154 <- 3.92 -> DT xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0016 <- 3.23 -> DT xxx Y0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0018 <- 2.75 -> DA xxx Y0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0148 <- 4.45 -> DT xxx X0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0151 <- 3.43 -> DA xxx Y0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0154 <- 3.68 -> DT xxx X0012 : score x.xxxxx >4av1_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN PARP-1 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0122 <- 3.40 -> DG xxx X0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0148 <- 4.32 -> DT xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0151 <- 3.49 -> DT xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0154 <- 3.92 -> DT xxx Y0012 : score x.xxxxx >4awl_A: title=THE NF-Y TRANSCRIPTION FACTOR IS STRUCTURALLY AND FUNCTIONALLY A SEQUENCE SPECIFIC HISTONE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0274 <- 2.45 -> DC O2 I0013 : score 3.95763 : H : HIS NE2 A0277 <- 2.83 -> DA N3 I0011 : score 4.22068 : H : ARG NH1 A0281 <- 2.89 -> DA N3 I0010 : score 3.61577 : H : ARG NH1 A0283 <- 3.18 -> DG N3 J-009 : score 2.82057 : x : ARG xxxx A0288 <- 3.69 -> DC xxx I0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0289 <- 3.10 -> DC xxx I0009 : score x.xxxxx >4awl_ABC:Histone-fold; title=THE NF-Y TRANSCRIPTION FACTOR IS STRUCTURALLY AND FUNCTIONALLY A SEQUENCE SPECIFIC HISTONE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0274 <- 2.45 -> DC O2 I0013 : score 3.95763 : H : HIS NE2 A0277 <- 2.83 -> DA N3 I0011 : score 4.22068 : H : ARG NH1 A0281 <- 2.89 -> DA N3 I0010 : score 3.61577 : H : ARG NH1 A0283 <- 3.18 -> DG N3 J-009 : score 2.82057 : x : ARG xxxx A0288 <- 3.69 -> DC xxx I0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0289 <- 3.10 -> DC xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0060 <- 3.99 -> DT xxx J-011 : score x.xxxxx >4awl_B:Histone-fold; title=THE NF-Y TRANSCRIPTION FACTOR IS STRUCTURALLY AND FUNCTIONALLY A SEQUENCE SPECIFIC HISTONE organism=HOMO SAPIENS : x : ALA xxxx B0060 <- 3.99 -> DT xxx J-011 : score x.xxxxx >4b21_A:DNA-glycosylase; title=UNPRECEDENTED SCULPTING OF DNA AT ABASIC SITES BY DNA GLYCOSYLASE HOMOLOG MAG2 organism=SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE : H : LYS NZ A0053 <- 2.47 -> DG O6 Y0017 : score 6.1623 : H : SER OG A0055 <- 3.14 -> DG N2 Y0017 : score 3.1449 : w : SER OG A0055 <- 5.41 -> DG N3 Y0018 : score 2.344 : H : LYS NZ A0099 <- 2.87 -> DC N3 Y0016 : score 0.572638 : x : GLN xxxx A0052 <- 3.49 -> DG xxx X0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.64 -> DG xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0058 <- 3.43 -> DG xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0096 <- 3.85 -> DC xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0098 <- 3.67 -> DT xxx X0009 : score x.xxxxx >4b22_A:DNA-glycosylase; title=UNPRECEDENTED SCULPTING OF DNA AT ABASIC SITES BY DNA GLYCOSYLASE HOMOLOG MAG2 organism=SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE : H : LYS NZ A0053 <- 2.87 -> DG O6 Y0017 : score 5.69984 : H : SER OG A0055 <- 3.13 -> DG N2 Y0017 : score 3.15165 : w : SER OG A0055 <- 5.52 -> DG N3 Y0018 : score 2.344 : w : LYS NZ A0099 <- 5.69 -> DG N3 Y0016 : score 2.232 : x : GLN xxxx A0052 <- 3.24 -> DC xxx X0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.53 -> DG xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0058 <- 3.38 -> DG xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0096 <- 3.87 -> DG xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0098 <- 3.70 -> DT xxx X0009 : score x.xxxxx >4b23_A:DNA-glycosylase; title=UNPRECEDENTED SCULPTING OF DNA AT ABASIC SITES BY DNA GLYCOSYLASE HOMOLOG MAG2 organism=SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE : w : GLN OE1 A0052 <- 5.28 -> DA N3 X0007 : score 1.196 : H : LYS NZ A0053 <- 2.92 -> DG O6 Y0017 : score 5.64203 : H : SER OG A0055 <- 3.08 -> DG N2 Y0017 : score 3.1854 : w : SER OG A0055 <- 5.59 -> DG N3 Y0018 : score 2.344 : H : LYS NZ A0099 <- 3.06 -> DT O2 Y0016 : score 3.40065 : x : LEU xxxx A0054 <- 3.70 -> DT xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0058 <- 3.35 -> DG xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0096 <- 3.70 -> DT xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0098 <- 3.60 -> DT xxx X0009 : score x.xxxxx >4b24_A:DNA-glycosylase; title=UNPRECEDENTED SCULPTING OF DNA AT ABASIC SITES BY DNA GLYCOSYLASE HOMOLOG MAG2 organism=SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE : H : SER OG A0055 <- 2.85 -> DG N2 Y0017 : score 3.34062 : w : SER OG A0055 <- 5.36 -> DG N3 Y0018 : score 2.344 : H : LYS NZ A0099 <- 3.19 -> DA N3 Y0016 : score 2.56032 : x : GLN xxxx A0052 <- 3.45 -> DT xxx X0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0053 <- 3.13 -> DG xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.52 -> DG xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0058 <- 3.35 -> DG xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0096 <- 4.01 -> DA xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0098 <- 3.87 -> DT xxx X0009 : score x.xxxxx >4b3o_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURES OF HIV-1 RT AND RNA-DNA COMPLEX REVEAL A UNIQUE RT CONFORMATION AND SUBSTRATE INTERFACE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : x : MET xxxx A0230 <- 3.71 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.39 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0358 <- 3.97 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 4.48 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.93 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0418 <- 4.29 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx >4b3o_B:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURES OF HIV-1 RT AND RNA-DNA COMPLEX REVEAL A UNIQUE RT CONFORMATION AND SUBSTRATE INTERFACE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : x : ASN xxxx B0418 <- 4.29 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx >4b3p_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURES OF HIV-1 RT AND RNA-DNA COMPLEX REVEAL A UNIQUE RT CONFORMATION AND SUBSTRATE INTERFACE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : x : ARG xxxx A0448 <- 3.39 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.51 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >4b3q_B:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURES OF HIV-1 RT AND RNA-DNA COMPLEX REVEAL A UNIQUE RT CONFORMATION AND SUBSTRATE INTERFACE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : x : ASN xxxx B0418 <- 3.22 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >4b5f_A:DNase_I-like; title=SUBSTRATE BOUND NEISSERIA AP ENDONUCLEASE IN ABSENCE OF METAL IONS (CRYSTAL FORM 1) organism=NEISSERIA MENINGITIDIS : w : LYS NZ A0038 <- 5.42 -> DT O2 V0049 : score 0.522 : w : LYS NZ A0038 <- 5.50 -> DA N3 V0050 : score 1.538 : w : ASN ND2 A0161 <- 5.63 -> DT O4 U0039 : score 3.275 : w : ASN OD1 A0168 <- 5.65 -> DG N7 U0037 : score 1.873 : w : ASN ND2 A0168 <- 5.79 -> DA N6 U0038 : score 2.5 : H : ASN OD1 A0207 <- 2.87 -> DG N2 V0047 : score 4.7328 A : x : SER xxxx A0115 <- 3.34 -> DC xxx U0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0208 <- 3.08 -> DG xxx U0037 : score x.xxxxx >4b5g_A:DNase_I-like; title=SUBSTRATE BOUND NEISSERIA AP ENDONUCLEASE IN ABSENCE OF METAL IONS (CRYSTAL FORM 2) organism=NEISSERIA MENINGITIDIS : H : ASN OD1 A0207 <- 2.36 -> DG N2 V0047 : score 5.2224 : H : ASN ND2 A0207 <- 3.09 -> DG N3 V0047 : score 4.61097 : x : SER xxxx A0115 <- 3.58 -> DC xxx U0035 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0168 <- 3.91 -> DC xxx U0037 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0206 <- 4.37 -> DG xxx V0047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0208 <- 3.32 -> DG xxx V0047 : score x.xxxxx >4b5g_BC:DNase_I-like; title=SUBSTRATE BOUND NEISSERIA AP ENDONUCLEASE IN ABSENCE OF METAL IONS (CRYSTAL FORM 2) organism=NEISSERIA MENINGITIDIS : H : ASN OD1 B0207 <- 2.53 -> DG N2 x0006 : score 5.0592 : H : ASN ND2 B0207 <- 3.09 -> DG N3 x0006 : score 4.61097 >4b5h_A:DNase_I-like; title=SUBSTATE BOUND INACTIVE MUTANT OF NEISSERIA AP ENDONUCLEASE IN PRESENCE OF METAL IONS organism=NEISSERIA MENINGITIDIS : H : ASN OD1 A0207 <- 3.31 -> DG N2 V0047 : score 4.3104 : x : LYS xxxx A0038 <- 4.27 -> DA xxx V0050 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0115 <- 2.96 -> DC xxx U0035 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0161 <- 3.28 -> DT xxx U0039 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0168 <- 3.00 -> DC xxx U0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0208 <- 2.81 -> DG xxx V0046 : score x.xxxxx >4b5i_A:DNase_I-like; title=PRODUCT COMPLEX OF NEISSERIA AP ENDONUCLEASE IN PRESENCE OF METAL IONS organism=NEISSERIA MENINGITIDIS : x : ASN xxxx A0161 <- 3.63 -> DT xxx X0039 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0168 <- 4.35 -> DC xxx X0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0208 <- 3.01 -> DG xxx V0046 : score x.xxxxx >4b5j_A:DNase_I-like; title=NEISSERIA AP ENDONUCLEASE BOUND TO THE SUBSTRATE WITH AN ORPHAN ADENINE BASE organism=NEISSERIA MENINGITIDIS : x : SER xxxx A0115 <- 3.09 -> DC xxx U0035 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0161 <- 3.93 -> DT xxx U0039 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0168 <- 3.27 -> DC xxx U0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0207 <- 3.61 -> DG xxx V0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0208 <- 2.68 -> DG xxx V0046 : score x.xxxxx >4b5m_BC:DNase_I-like; title=NEISSERIA AP ENDONUCLEASE BOUND TO THE SUBSTRATE WITH A CYTOSINE ORPHAN BASE organism=NEISSERIA MENINGITIDIS : x : ASN xxxx B0168 <- 2.99 -> DC xxx M0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0208 <- 3.27 -> DC xxx M0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0168 <- 3.06 -> DC xxx N0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0208 <- 2.78 -> DG xxx Z0046 : score x.xxxxx >4b5m_C:DNase_I-like; title=NEISSERIA AP ENDONUCLEASE BOUND TO THE SUBSTRATE WITH A CYTOSINE ORPHAN BASE organism=NEISSERIA MENINGITIDIS : x : ASN xxxx C0168 <- 3.06 -> DC xxx N0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0208 <- 2.78 -> DG xxx Z0046 : score x.xxxxx >4b9l_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF THE HIGH FIDELITY DNA POLYMERASE I WITH THE OXIDATIVE FORMAMIDOPYRIMIDINE-DA DNA LESION IN THE PRE-INSERTION SITE. organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : LYS NZ A0582 <- 2.92 -> DT O2 C0009 : score 3.50109 : w : LYS NZ A0582 <- 6.30 -> DG N2 C0008 : score 0.846 : H : ARG NH2 A0615 <- 2.55 -> DT O2 B0010 : score 4.445 : w : ARG NE A0615 <- 6.01 -> DG N3 C0006 : score 1.082 : w : ARG NH2 A0615 <- 5.64 -> DG N3 C0006 : score 0.677 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.72 -> DA N3 C0007 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.80 -> DT O2 B0008 : score 4.74615 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.49 -> DC O2 B0009 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.49 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.44 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.45 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx >4b9m_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF THE HIGH FIDELITY DNA POLYMERASE I WITH AN OXIDATIVE FORMAMIDOPYRIMIDINE-DA DNA LESION -THYMINE BASEPAIR IN THE POST- INSERTION SITE. organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : LYS NZ A0582 <- 2.48 -> DT O2 B0026 : score 3.81676 : w : TYR OH A0587 <- 5.84 -> DC O2 B0027 : score 1.343 : w : ASN ND2 A0622 <- 6.02 -> DG N3 C0006 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.92 -> DC O2 B0027 : score 4.37198 >4b9n_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF THE HIGH FIDELITY DNA POLYMERASE I CORRECTLY BYPASSING THE OXIDATIVE FORMAMIDOPYRIMIDINE-DA DNA LESION. organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : LYS NZ A0582 <- 2.50 -> DT O2 B0010 : score 3.80241 : w : TYR OH A0587 <- 6.30 -> DT O2 B0011 : score 3.068 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.87 -> DT O2 B0011 : score 4.67971 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.50 -> DA N3 C0005 : score 2.277 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.99 -> DT O2 B0012 : score 3.682 : x : PHE xxxx A0710 <- 3.73 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.37 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 4.43 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx >4b9s_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF THE HIGH FIDELITY DNA POLYMERASE I WITH AN OXIDATIVE FORMAMIDOPYRIMIDINE-DG DNA LESION OUTSIDE OF THE PRE-INSERTION SITE. organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : LYS NZ A0582 <- 2.33 -> DC O2 B0008 : score 3.22309 : w : LYS NZ A0582 <- 5.20 -> DT O2 C0009 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 5.31 -> DT O2 C0009 : score 2.522 : w : TYR OH A0587 <- 5.79 -> DG N2 C0008 : score 2.834 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.86 -> DT O2 B0011 : score 4.25473 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.05 -> DT O2 B0011 : score 4.02167 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.98 -> DG N2 C0006 : score 1.082 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.82 -> DA N3 C0007 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.89 -> DT O2 B0009 : score 4.66072 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.67 -> DC O2 B0010 : score 3.208 : x : PHE xxxx A0710 <- 3.51 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 2.99 -> DT xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 4.49 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx >4b9t_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF THE HIGH FIDELITY DNA POLYMERASE I WITH AN OXIDATIVE FORMAMIDOPYRIMIDINE-DG DNA LESION -DC BASEPAIR IN THE POST-INSERTION SITE. organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : LYS NZ A0582 <- 2.32 -> DT O2 B0026 : score 3.93155 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.12 -> DC O2 B0027 : score 4.1928 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.32 -> DC xxx B0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0622 <- 4.33 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0710 <- 3.90 -> DC xxx B0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.41 -> DC xxx B0029 : score x.xxxxx >4b9u_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF THE HIGH FIDELITY DNA POLYMERASE I WITH AN OXIDATIVE FORMAMIDOPYRIMIDINE-DG DNA LESION -DA BASEPAIR IN THE POST-INSERTION SITE. organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : LYS NZ A0582 <- 2.68 -> DT O2 B0008 : score 3.67327 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.86 -> DC O2 B0009 : score 4.42573 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.50 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0615 <- 3.56 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0622 <- 4.49 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0629 <- 3.43 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0710 <- 3.83 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.21 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx >4b9v_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF THE HIGH FIDELITY DNA POLYMERASE I WITH EXTENDING FROM AN OXIDATIVE FORMAMIDOPYRIMIDINE-DG DNA LESION -DA BASEPAIR. organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : LYS NZ A0582 <- 2.79 -> DC O2 B0008 : score 2.95205 : w : TYR OH A0587 <- 6.04 -> DG N2 C0007 : score 2.834 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.97 -> DA N3 C0006 : score 2.277 : w : ASN ND2 A0622 <- 6.02 -> DG N3 C0007 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.93 -> DT O2 B0009 : score 4.62275 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.64 -> DG N3 C0007 : score 2.566 : x : ARG xxxx A0615 <- 4.19 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0710 <- 3.67 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.18 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 4.22 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx >4bac_A:Ribonuclease_H-like; title=PROTOTYPE FOAMY VIRUS STRAND TRANSFER COMPLEXES ON PRODUCT DNA organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : SER OG A0218 <- 2.97 -> DG N2 C0004 : score 3.25963 : H : SER OG A0218 <- 2.67 -> DG N3 C0004 : score 2.84386 : H : ARG NE A0222 <- 2.88 -> DC O2 C0006 : score 2.61643 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.86 -> DC O2 C0006 : score 3.65433 : V : PRO CG A0259 <- 3.73 -> DT C7 C0008 : score 6.47026 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.80 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.49 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.67 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >4bbs_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=STRUCTURE OF AN INITIALLY TRANSCRIBING RNA POLYMERASE II-TFIIB COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx A1386 <- 3.34 -> DG xxx T0015 : score x.xxxxx >4bbs_AB:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=STRUCTURE OF AN INITIALLY TRANSCRIBING RNA POLYMERASE II-TFIIB COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.34 -> DG xxx T0015 : score x.xxxxx >4bdp_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS DNA POLYMERASE I FRAGMENT COMPLEXED TO 11 BASE PAIRS OF DUPLEX DNA AFTER ADDITION OF TWO DATP RESIDUES organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.92 -> DG N3 P0026 : score 1.41895 : w : LYS NZ A0582 <- 5.84 -> DT O2 P0025 : score 0.522 : w : LYS NZ A0582 <- 5.53 -> DA N3 T0008 : score 1.538 : w : THR OG1 A0586 <- 5.50 -> DA N3 T0008 : score 2.845 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.92 -> DA N3 P0029 : score 3.59368 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.73 -> DT O2 T0005 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.72 -> DG N3 T0006 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.01 -> DC O2 P0027 : score 4.29135 : w : ASN ND2 A0625 <- 6.42 -> DC O2 T0007 : score 1.885 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.68 -> DA N3 P0028 : score 2.619 : x : ARG xxxx A0629 <- 3.51 -> DA xxx P0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.49 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.24 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx >4bdy_A:Ribonuclease_H-like; title=PFV INTASOME WITH INHIBITOR XZ-89 organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.89 -> DC O2 C0006 : score 2.61111 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.80 -> DC O2 C0006 : score 3.69872 : w : SER OG A0225 <- 5.38 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.83 -> DT C7 C0008 : score 6.31128 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.57 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.89 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.62 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.82 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >4bdz_A:Ribonuclease_H-like; title=PFV INTASOME WITH INHIBITOR XZ-90 organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.78 -> DC O2 C0006 : score 2.66961 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.85 -> DC O2 C0006 : score 3.66173 : w : SER OG A0225 <- 5.70 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.61 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.82 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.76 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.87 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0259 <- 3.90 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >4be0_A:Ribonuclease_H-like; title=PFV INTASOME WITH INHIBITOR XZ-115 organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.80 -> DC O2 C0006 : score 2.65897 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.74 -> DC O2 C0006 : score 3.7431 : w : SER OG A0225 <- 5.49 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.89 -> DT C7 C0008 : score 6.2159 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.61 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.92 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.78 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.86 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >4be1_A:Ribonuclease_H-like; title=PFV INTASOME WITH INHIBITOR XZ-116 organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.93 -> DC O2 C0006 : score 2.58984 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.76 -> DC O2 C0006 : score 3.72831 : w : SER OG A0225 <- 5.45 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.85 -> DT C7 C0008 : score 6.27949 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.68 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.99 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.71 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.87 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >4be2_A:Ribonuclease_H-like; title=PFV INTASOME WITH INHIBITOR XZ-259 organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.84 -> DC O2 C0006 : score 2.6377 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.70 -> DC O2 C0006 : score 3.77269 : w : SER OG A0225 <- 5.29 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.82 -> DT C7 C0008 : score 6.32718 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.50 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.85 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.60 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.81 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >4bhk_A:EF-hand; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MOSS LEAFY BOUND TO DNA organism=PHYSCOMITRELLA PATENS : H : ARG NH1 A0190 <- 3.36 -> DG N3 W0024 : score 2.71068 : H : ARG NH2 A0190 <- 2.66 -> DT O2 W0023 : score 4.35187 : H : ASN ND2 A0244 <- 3.22 -> DG N7 W0017 : score 4.20068 : H : LYS NZ A0260 <- 3.17 -> DG N7 W0017 : score 4.98734 : H : LYS NZ A0260 <- 2.96 -> DG N7 W0018 : score 5.21355 : H : LYS NZ A0260 <- 2.89 -> DG O6 W0018 : score 5.67672 : H : ARG NH1 A0264 <- 2.73 -> DA N7 W0019 : score 2.5961 : H : ARG NH2 A0264 <- 2.72 -> DA N7 W0019 : score 1.69854 : H : ASP OD2 A0265 <- 2.79 -> DC N4 X0009 : score 6.2124 : w : ASP OD1 A0265 <- 5.55 -> DC N4 W0020 : score 2.835 : x : ASN xxxx A0259 <- 3.65 -> DC xxx X0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0261 <- 3.16 -> DG xxx X0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0262 <- 4.34 -> DC xxx X0009 : score x.xxxxx >4bhk_AB:EF-hand; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MOSS LEAFY BOUND TO DNA organism=PHYSCOMITRELLA PATENS : H : ARG NH1 A0190 <- 3.36 -> DG N3 W0024 : score 2.71068 : H : ARG NH2 A0190 <- 2.66 -> DT O2 W0023 : score 4.35187 : H : ASN ND2 A0244 <- 3.22 -> DG N7 W0017 : score 4.20068 : H : LYS NZ A0260 <- 3.17 -> DG N7 W0017 : score 4.98734 : H : LYS NZ A0260 <- 2.96 -> DG N7 W0018 : score 5.21355 : H : LYS NZ A0260 <- 2.89 -> DG O6 W0018 : score 5.67672 : H : ARG NH1 A0264 <- 2.73 -> DA N7 W0019 : score 2.5961 : H : ARG NH2 A0264 <- 2.72 -> DA N7 W0019 : score 1.69854 : H : ASP OD2 A0265 <- 2.79 -> DC N4 X0009 : score 6.2124 : w : ASP OD1 A0265 <- 5.55 -> DC N4 W0020 : score 2.835 : H : ARG NH1 B0190 <- 2.80 -> DC O2 X0024 : score 3.65 : H : ARG NH2 B0190 <- 2.95 -> DC O2 X0023 : score 3.58776 : H : ASN ND2 B0244 <- 3.36 -> DG N7 X0017 : score 4.07228 : H : LYS NZ B0260 <- 3.04 -> DG N7 X0017 : score 5.12737 : H : LYS NZ B0260 <- 2.86 -> DG N7 X0018 : score 5.32127 : H : LYS NZ B0260 <- 2.90 -> DG O6 X0018 : score 5.66515 : H : ASP OD2 B0265 <- 2.80 -> DC N4 W0009 : score 6.2 : w : ASP OD1 B0265 <- 5.97 -> DC N4 X0020 : score 2.835 : x : ASN xxxx A0259 <- 3.65 -> DC xxx X0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0261 <- 3.16 -> DG xxx X0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0262 <- 4.34 -> DC xxx X0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0259 <- 3.73 -> DC xxx W0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0261 <- 3.04 -> DG xxx W0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0262 <- 4.20 -> DC xxx W0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0264 <- 3.35 -> DT xxx X0019 : score x.xxxxx >4bhm_AB:ssDNA-binding_transcriptional_regulator_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF MOSUB1-DNA COMPLEX REVEALS A NOVEL DNA BINDING MODE organism=MAGNAPORTHE ORYZAE : H : SER OG B0060 <- 2.36 -> DT O2 H0003 : score 4.02281 : w : ASN OD1 B0069 <- 5.81 -> DT O2 H0002 : score 1.953 : w : ARG NE B0071 <- 5.74 -> DT O2 H0002 : score 0.757 : w : ARG NH2 B0071 <- 5.90 -> DT O2 H0002 : score 2.261 : w : TYR OH B0073 <- 5.55 -> DT O2 H0002 : score 3.068 : V : PHE CZ B0062 <- 3.72 -> DT C7 H0003 : score 7.25717 >4bhm_EF:ssDNA-binding_transcriptional_regulator_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF MOSUB1-DNA COMPLEX REVEALS A NOVEL DNA BINDING MODE organism=MAGNAPORTHE ORYZAE : V : TYR CZ F0074 <- 3.74 -> DT C7 H0005 : score 5.66318 : V : PHE CZ F0062 <- 3.55 -> DT C7 H0007 : score 7.55955 : x : SER xxxx F0060 <- 2.18 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0063 <- 3.42 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0065 <- 3.87 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0067 <- 4.08 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0069 <- 3.44 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0071 <- 3.96 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0073 <- 3.08 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0082 <- 3.82 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0084 <- 4.08 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0090 <- 4.42 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx >4bhm_F:ssDNA-binding_transcriptional_regulator_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF MOSUB1-DNA COMPLEX REVEALS A NOVEL DNA BINDING MODE organism=MAGNAPORTHE ORYZAE : V : TYR CZ F0074 <- 3.74 -> DT C7 H0005 : score 5.66318 : V : PHE CZ F0062 <- 3.55 -> DT C7 H0007 : score 7.55955 : x : SER xxxx F0060 <- 2.18 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0063 <- 3.42 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0065 <- 3.87 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0067 <- 4.08 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0069 <- 3.44 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0071 <- 3.96 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0073 <- 3.08 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0082 <- 3.82 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0084 <- 4.08 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0090 <- 4.42 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx >4bnc_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA-BINDING DOMAIN OF HUMAN ETV1 COMPLEXED WITH DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0391 <- 3.22 -> DG O6 B0005 : score 3.60998 : H : ARG NH2 A0394 <- 2.97 -> DG N7 B0004 : score 6.16754 : H : ARG NH2 A0394 <- 2.80 -> DG O6 B0004 : score 6.6 : H : TYR OH A0395 <- 3.07 -> DA N6 B0006 : score 4.41831 : x : ASP xxxx A0387 <- 3.83 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0388 <- 3.95 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0392 <- 3.45 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx >4boc_A:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURE OF MITOCHONDRIAL RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : SER OG A0611 <- 3.27 -> DC O2 T0009 : score 2.26616 : H : GLU OE1 A0778 <- 3.32 -> DG N2 T0005 : score 3.86199 : H : GLN NE2 A0992 <- 2.94 -> DG O6 T0001 : score 5.64258 : H : ARG NH2 A1113 <- 2.91 -> DG N3 T-001 : score 3.53083 : x : GLN xxxx A0493 <- 3.28 -> DG xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0613 <- 3.92 -> DG xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0620 <- 3.82 -> DC xxx T0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0774 <- 3.29 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0996 <- 3.23 -> DG xxx T0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0999 <- 3.86 -> DG xxx T0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A1001 <- 3.38 -> DG xxx T0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1004 <- 3.35 -> DT xxx T0000 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1009 <- 3.49 -> DG xxx T0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A1026 <- 3.30 -> DG xxx N-010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1027 <- 3.69 -> DG xxx N-010 : score x.xxxxx >4bqa_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ETS DOMAIN OF HUMAN ETS2 IN COMPLEX WITH DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0419 <- 2.78 -> DG O6 B0005 : score 3.95679 : H : ARG NH2 A0419 <- 2.73 -> DG N7 B0005 : score 6.474 : H : ARG NE A0422 <- 2.82 -> DG N7 B0004 : score 4.40411 : H : ARG NH2 A0422 <- 2.84 -> DG O6 B0004 : score 6.5472 : H : TYR OH A0423 <- 3.18 -> DA N6 B0006 : score 4.31555 : x : LYS xxxx A0416 <- 3.80 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >4bqa_ADG:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ETS DOMAIN OF HUMAN ETS2 IN COMPLEX WITH DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0419 <- 2.78 -> DG O6 B0005 : score 3.95679 : H : ARG NH2 A0419 <- 2.73 -> DG N7 B0005 : score 6.474 : H : ARG NE A0422 <- 2.82 -> DG N7 B0004 : score 4.40411 : H : ARG NH2 A0422 <- 2.84 -> DG O6 B0004 : score 6.5472 : H : TYR OH A0423 <- 3.18 -> DA N6 B0006 : score 4.31555 : H : ARG NE D0419 <- 2.56 -> DG O6 E0005 : score 4.1302 : H : ARG NH2 D0419 <- 2.57 -> DG N7 E0005 : score 6.67831 : H : ARG NE D0422 <- 2.95 -> DG N7 E0004 : score 4.28914 : H : ARG NH2 D0422 <- 2.99 -> DG O6 E0004 : score 6.3492 : H : TYR OH D0423 <- 3.40 -> DA N6 E0006 : score 4.11005 : H : ARG NE G0419 <- 3.01 -> DG O6 H0005 : score 3.7755 : H : ARG NH2 G0419 <- 2.32 -> DG N7 H0005 : score 6.99754 : H : ARG NE G0422 <- 2.89 -> DG N7 H0004 : score 4.3422 : H : ARG NH2 G0422 <- 2.84 -> DG O6 H0004 : score 6.5472 : H : TYR OH G0423 <- 2.72 -> DA N6 H0006 : score 4.74524 : x : LYS xxxx A0416 <- 3.80 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0416 <- 3.54 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0416 <- 4.07 -> DT xxx I0005 : score x.xxxxx >4bul_AC:Type_II_DNA_topoisomerase; title=NOVEL HYDROXYL TRICYCLICS (E.G. GSK966587) AS POTENT INHIBITORS OF BACTERIAL TYPE IIA TOPOISOMERASES organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : w : TYR OH C1025 <- 5.79 -> DA N3 E0015 : score 1.448 : w : SER OG C1084 <- 5.56 -> DG O6 F0009 : score 2.749 : w : SER OG C1085 <- 5.70 -> DA N7 F0007 : score 2.343 : x : ARG xxxx A0458 <- 4.39 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0460 <- 3.56 -> DC xxx F0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1025 <- 3.94 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1085 <- 3.47 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1175 <- 3.31 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0460 <- 3.50 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C1092 <- 4.18 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C1122 <- 4.26 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C1175 <- 3.53 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx >4bul_C:Type_II_DNA_topoisomerase; title=NOVEL HYDROXYL TRICYCLICS (E.G. GSK966587) AS POTENT INHIBITORS OF BACTERIAL TYPE IIA TOPOISOMERASES organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : w : TYR OH C1025 <- 5.79 -> DA N3 E0015 : score 1.448 : w : SER OG C1084 <- 5.56 -> DG O6 F0009 : score 2.749 : w : SER OG C1085 <- 5.70 -> DA N7 F0007 : score 2.343 : x : LYS xxxx C0460 <- 3.50 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C1092 <- 4.18 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C1122 <- 4.26 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C1175 <- 3.53 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx >4bwj_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=KLENTAQ MUTANT IN COMPLEX WITH DNA AND DDCTP organism=THERMUS AQUATICUS : H : LYS NZ A0540 <- 2.89 -> DC O2 B0109 : score 2.89312 : w : LYS NZ A0540 <- 5.55 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.81 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.46 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.71 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.80 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.86 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.03 -> DG N3 B0110 : score 4.66971 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.73 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.66 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : THR xxxx A0664 <- 3.61 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0667 <- 3.85 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0671 <- 3.35 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0673 <- 3.67 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0677 <- 4.25 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0750 <- 4.48 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0754 <- 3.32 -> DG xxx C0205 : score x.xxxxx >4bwm_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=KLENTAQ MUTANT IN COMPLEX WITH A RNA/DNA HYBRID organism=THERMUS AQUATICUS : H : GLN NE2 A0582 <- 2.62 -> DC O2 B0111 : score 3.82789 : H : ASN OD1 A0583 <- 3.12 -> DG N2 B0110 : score 4.4928 >4bxx_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=ARRESTED RNA POLYMERASE II-BYE1 COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 A1386 <- 2.76 -> DC O2 T0015 : score 3.72831 : x : HIS xxxx A1387 <- 4.42 -> DT xxx N0004 : score x.xxxxx >4bxx_AB: title=ARRESTED RNA POLYMERASE II-BYE1 COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 A1386 <- 2.76 -> DC O2 T0015 : score 3.72831 : x : HIS xxxx A1387 <- 4.42 -> DT xxx N0004 : score x.xxxxx >4by7_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=ELONGATING RNA POLYMERASE II-BYE1 TLD COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 4.02 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx >4c2t_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FULL LENGTH DEINOCOCCUS RADIODURANS UVRD IN COMPLEX WITH DNA organism=DEINOCOCCUS RADIODURANS : x : ARG xxxx A0459 <- 4.24 -> DG xxx N0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0633 <- 3.16 -> DC xxx M0021 : score x.xxxxx >4c2t_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FULL LENGTH DEINOCOCCUS RADIODURANS UVRD IN COMPLEX WITH DNA organism=DEINOCOCCUS RADIODURANS : x : ARG xxxx A0459 <- 4.24 -> DG xxx N0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0633 <- 3.16 -> DC xxx M0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0633 <- 3.37 -> DC xxx M0002 : score x.xxxxx >4c2t_CD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FULL LENGTH DEINOCOCCUS RADIODURANS UVRD IN COMPLEX WITH DNA organism=DEINOCOCCUS RADIODURANS : x : ARG xxxx C0422 <- 4.31 -> DG xxx O0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0633 <- 3.45 -> DG xxx P0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0633 <- 3.36 -> DG xxx O0001 : score x.xxxxx >4c2u_AD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DEINOCOCCUS RADIODURANS UVRD IN COMPLEX WITH DNA, FORM 1 organism=DEINOCOCCUS RADIODURANS : x : ARG xxxx A0459 <- 4.27 -> DG xxx Y0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0459 <- 2.88 -> DG xxx X0012 : score x.xxxxx >4c2u_D:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DEINOCOCCUS RADIODURANS UVRD IN COMPLEX WITH DNA, FORM 1 organism=DEINOCOCCUS RADIODURANS : x : ARG xxxx D0459 <- 2.88 -> DG xxx X0012 : score x.xxxxx >4c30_AD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DEINOCOCCUS RADIODURANS UVRD IN COMPLEX WITH DNA, FORM 2 organism=DEINOCOCCUS RADIODURANS : V : PHE CD2 A0633 <- 3.87 -> DT C7 X0018 : score 6.39784 : x : PHE xxxx D0633 <- 3.20 -> DG xxx X0001 : score x.xxxxx >4c30_F:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DEINOCOCCUS RADIODURANS UVRD IN COMPLEX WITH DNA, FORM 2 organism=DEINOCOCCUS RADIODURANS : x : PHE xxxx F0633 <- 2.93 -> DT xxx K0018 : score x.xxxxx >4c30_FI:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DEINOCOCCUS RADIODURANS UVRD IN COMPLEX WITH DNA, FORM 2 organism=DEINOCOCCUS RADIODURANS : x : PHE xxxx F0633 <- 2.93 -> DT xxx K0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0633 <- 3.15 -> DG xxx K0001 : score x.xxxxx >4c8k_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN A PARTIALLY CLOSED COMPLEX WITH THE ARTIFICIAL BASE PAIR D5SICS-DNAMTP organism=THERMUS AQUATICUS : H : LYS NZ A0540 <- 2.94 -> DC O2 B0109 : score 2.86366 : w : LYS NZ A0540 <- 5.44 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.98 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.78 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 6.01 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.49 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.88 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.23 -> DG N3 B0110 : score 4.47391 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.60 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : TYR OH A0671 <- 6.32 -> DG N3 C0205 : score 3.344 : w : ASN ND2 A0750 <- 6.21 -> DG N3 C0205 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0754 <- 5.81 -> DG N3 C0205 : score 1.484 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.75 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : GLU xxxx A0615 <- 4.46 -> DG xxx C0205 : score x.xxxxx >4c8l_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BINARY COMPLEX OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS WITH THE ARTIFICIAL BASE PAIR DNAM-D5SICS AT THE POSTINSERTION SITE (SEQUENCE CONTEXT 1) organism=THERMUS AQUATICUS : H : LYS NZ A0540 <- 2.84 -> DC O2 B0109 : score 2.92258 : w : LYS NZ A0540 <- 6.13 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 6.18 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : H : ASN OD1 A0583 <- 2.87 -> DG N2 B0110 : score 4.7328 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.19 -> DC O2 B0111 : score 4.13009 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.38 -> DG N3 C0208 : score 3.377 >4c8m_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BINARY COMPLEX OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS WITH THE ARITIFICIAL BASE PAIR D5SICS-DNAM AT THE POSTINSERTION SITE (SEQUENCE CONTEXT 2) organism=THERMUS AQUATICUS : w : LYS NZ A0540 <- 5.74 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 6.21 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : x : ASN xxxx A0583 <- 3.48 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx >4c8n_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BINARY COMPLEX OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS WITH THE ARITIFICIAL BASE PAIR DNAM-D5SICS AT THE POSTINSERTION SITE (SEQUENCE CONTEXT 3) organism=THERMUS AQUATICUS : H : LYS NZ A0540 <- 2.87 -> DC O2 B0109 : score 2.90491 : w : THR OG1 A0544 <- 6.13 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : H : ASN OD1 A0583 <- 2.89 -> DG N2 B0110 : score 4.7136 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.25 -> DC O2 B0111 : score 4.07633 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.46 -> DG N3 C0208 : score 3.377 >4c8o_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BINARY COMPLEX OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS WITH THE ARITIFICIAL BASE PAIR DNAM-D5SICS AT THE POSTINSERTION SITE (SEQUENCE CONTEXT 2) organism=THERMUS AQUATICUS : H : LYS NZ A0540 <- 2.73 -> DC O2 B0109 : score 2.9874 : w : LYS NZ A0540 <- 5.44 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 6.21 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : x : ASN xxxx A0583 <- 3.33 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx >4cch_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN AN OPEN BINARY COMPLEX WITH D5SICS AS TEMPLATING NUCLEOTIDE organism=THERMUS AQUATICUS : w : ASP OD2 A0488 <- 6.53 -> DT O2 C0212 : score 1.008 : H : LYS NZ A0540 <- 3.03 -> DC O2 B0109 : score 2.81063 : w : LYS NZ A0540 <- 5.33 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 5.82 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 6.48 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.84 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.32 -> DG N3 B0110 : score 4.38581 : w : GLU OE1 A0615 <- 6.41 -> DG N3 C0205 : score 2.669 : w : ASN ND2 A0750 <- 6.72 -> DG N3 C0205 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0754 <- 6.01 -> DG N3 C0205 : score 1.484 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.62 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0671 <- 3.65 -> DG xxx C0205 : score x.xxxxx >4ceh_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ADDAB WITH A FORKED DNA SUBSTRATE organism=BACILLUS SUBTILIS SUBSP. SUBTILIS STR. 168 : H : ARG NH1 A0288 <- 2.89 -> DT O2 X0040 : score 4.22889 : H : ARG NH2 A0288 <- 2.50 -> DC O2 X0039 : score 3.92064 : x : ARG xxxx B1059 <- 4.33 -> DA xxx X0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1074 <- 3.84 -> DG xxx X0013 : score x.xxxxx >4ceh_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ADDAB WITH A FORKED DNA SUBSTRATE organism=? : x : ARG xxxx B1059 <- 4.33 -> DA xxx X0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1074 <- 3.84 -> DG xxx X0013 : score x.xxxxx >4cei_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ADPNP-BOUND ADDAB WITH A FORKED DNA SUBSTRATE organism=BACILLUS SUBTILIS SUBSP. SUBTILIS STR. 168 : H : GLN NE2 A0135 <- 2.77 -> DT O4 X0055 : score 5.22217 : H : ARG NH1 A0288 <- 3.01 -> DT O2 X0040 : score 4.12554 : H : ARG NH2 A0288 <- 3.21 -> DC O2 X0039 : score 3.39542 : H : ARG NH2 A0590 <- 3.06 -> DT O2 X0053 : score 4.0132 : V : PHE CZ A0368 <- 3.51 -> DT C7 X0056 : score 7.6307 : x : HIS xxxx A0110 <- 4.19 -> DT xxx X0055 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0132 <- 3.59 -> DT xxx X0056 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0134 <- 4.25 -> DT xxx X0056 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0186 <- 4.32 -> DG xxx X0054 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0446 <- 3.31 -> DT xxx X0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0447 <- 3.79 -> DG xxx X0054 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0794 <- 3.96 -> DT xxx X0053 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0814 <- 3.55 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0817 <- 4.24 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx >4cei_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ADPNP-BOUND ADDAB WITH A FORKED DNA SUBSTRATE organism=BACILLUS SUBTILIS SUBSP. SUBTILIS STR. 168 : H : GLN NE2 A0135 <- 2.77 -> DT O4 X0055 : score 5.22217 : H : ARG NH1 A0288 <- 3.01 -> DT O2 X0040 : score 4.12554 : H : ARG NH2 A0288 <- 3.21 -> DC O2 X0039 : score 3.39542 : H : ARG NH2 A0590 <- 3.06 -> DT O2 X0053 : score 4.0132 : H : ASN ND2 B1117 <- 2.97 -> DT O4 X0051 : score 5.10494 : V : PHE CZ A0368 <- 3.51 -> DT C7 X0056 : score 7.6307 : x : HIS xxxx A0110 <- 4.19 -> DT xxx X0055 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0132 <- 3.59 -> DT xxx X0056 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0134 <- 4.25 -> DT xxx X0056 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0186 <- 4.32 -> DG xxx X0054 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0446 <- 3.31 -> DT xxx X0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0447 <- 3.79 -> DG xxx X0054 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0794 <- 3.96 -> DT xxx X0053 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0814 <- 3.55 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0817 <- 4.24 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1059 <- 4.05 -> DA xxx X0044 : score x.xxxxx >4cej_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ADDAB-DNA-ADPNP COMPLEX AT 3 ANGSTROM RESOLUTION organism=BACILLUS SUBTILIS SUBSP. SUBTILIS STR. 168 : H : LYS NZ A0118 <- 3.23 -> DT O2 X0057 : score 3.27868 : H : LYS NZ A0118 <- 3.16 -> DT O2 X0058 : score 3.3289 : H : ARG NH2 A0288 <- 2.76 -> DC O2 X0039 : score 3.72831 : H : ARG NH1 A0590 <- 3.36 -> DT O2 X0052 : score 3.82409 : H : ARG NH2 A0590 <- 2.73 -> DT O2 X0053 : score 4.2926 : H : LYS NZ A1013 <- 2.96 -> DC O2 X0064 : score 2.85188 : H : LYS NZ A1013 <- 2.93 -> DC N3 X0064 : score 0.565669 : H : GLN OE1 A1155 <- 2.91 -> DG N2 X0065 : score 5.48432 : H : THR OG1 B0044 <- 2.73 -> DG N7 X0063 : score 3.5477 : H : GLU OE2 B0048 <- 2.96 -> DG N2 X0065 : score 4.17233 : H : ARG NE B0070 <- 3.27 -> DG O6 X0066 : score 3.57057 : H : ARG NH2 B0070 <- 3.08 -> DG N7 X0066 : score 6.02708 : H : ARG NH2 B0070 <- 3.00 -> DG O6 X0066 : score 6.336 : H : GLU OE1 B0217 <- 2.65 -> DA N6 X0062 : score 2.76251 : V : PHE CG A0368 <- 3.80 -> DT C7 X0056 : score 5.27795 : V : ARG CG B0125 <- 3.50 -> DT C7 X0061 : score 1.08051 : x : HIS xxxx A0110 <- 3.16 -> DT xxx X0055 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0114 <- 3.79 -> DT xxx X0057 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0131 <- 3.52 -> DT xxx X0057 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0132 <- 3.20 -> DT xxx X0057 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0446 <- 3.34 -> DT xxx X0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0447 <- 3.34 -> DT xxx X0055 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0794 <- 4.10 -> DT xxx X0053 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0814 <- 3.82 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0816 <- 3.17 -> DT xxx X0051 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0817 <- 3.57 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1017 <- 3.63 -> DT xxx X0068 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1065 <- 4.04 -> DT xxx X0067 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1129 <- 4.10 -> DT xxx X0067 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1131 <- 3.88 -> DG xxx X0066 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1133 <- 4.27 -> DG xxx X0066 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1157 <- 3.56 -> DT xxx X0067 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0040 <- 4.12 -> DA xxx X0062 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0041 <- 3.88 -> DA xxx X0062 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0042 <- 3.81 -> DA xxx X0062 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0045 <- 3.35 -> DG xxx X0063 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0046 <- 3.57 -> DG xxx X0063 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0064 <- 4.12 -> DG xxx X0066 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0073 <- 3.62 -> DT xxx X0067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0132 <- 4.42 -> DT xxx X0061 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0210 <- 3.56 -> DA xxx X0062 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0213 <- 4.37 -> DA xxx X0062 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0351 <- 4.29 -> DT xxx X0059 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0371 <- 3.71 -> DG xxx X0063 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0373 <- 3.43 -> DG xxx X0063 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0589 <- 3.96 -> DG xxx X0063 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0597 <- 4.27 -> DA xxx X0062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0646 <- 3.18 -> DT xxx X0060 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1059 <- 3.86 -> DA xxx X0044 : score x.xxxxx >4cej_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ADDAB-DNA-ADPNP COMPLEX AT 3 ANGSTROM RESOLUTION organism=? : H : THR OG1 B0044 <- 2.73 -> DG N7 X0063 : score 3.5477 : H : GLU OE2 B0048 <- 2.96 -> DG N2 X0065 : score 4.17233 : H : ARG NE B0070 <- 3.27 -> DG O6 X0066 : score 3.57057 : H : ARG NH2 B0070 <- 3.08 -> DG N7 X0066 : score 6.02708 : H : ARG NH2 B0070 <- 3.00 -> DG O6 X0066 : score 6.336 : H : GLU OE1 B0217 <- 2.65 -> DA N6 X0062 : score 2.76251 : V : ARG CG B0125 <- 3.50 -> DT C7 X0061 : score 1.08051 : x : PRO xxxx B0040 <- 4.12 -> DA xxx X0062 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0041 <- 3.88 -> DA xxx X0062 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0042 <- 3.81 -> DA xxx X0062 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0045 <- 3.35 -> DG xxx X0063 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0046 <- 3.57 -> DG xxx X0063 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0064 <- 4.12 -> DG xxx X0066 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0073 <- 3.62 -> DT xxx X0067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0132 <- 4.42 -> DT xxx X0061 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0210 <- 3.56 -> DA xxx X0062 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0213 <- 4.37 -> DA xxx X0062 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0351 <- 4.29 -> DT xxx X0059 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0371 <- 3.71 -> DG xxx X0063 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0373 <- 3.43 -> DG xxx X0063 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0589 <- 3.96 -> DG xxx X0063 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0597 <- 4.27 -> DA xxx X0062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0646 <- 3.18 -> DT xxx X0060 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1059 <- 3.86 -> DA xxx X0044 : score x.xxxxx >4cgz_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;HRDC-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE BLOOM'S SYNDROME HELICASE BLM IN COMPLEX WITH DNA organism=HOMO SAPIENS : x : SER xxxx A1123 <- 4.40 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1162 <- 3.30 -> DA xxx B0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A1163 <- 4.48 -> DA xxx B0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1164 <- 2.96 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1166 <- 4.22 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx >4chu_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=E. COLI ISCR-DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : H : SER OG A0040 <- 2.69 -> DA N7 C0019 : score 4.56231 : H : GLU OE1 A0043 <- 3.19 -> DA N6 D0008 : score 2.47285 : H : GLU OE2 A0043 <- 3.07 -> DC N4 D0007 : score 4.98105 : H : GLN NE2 A0044 <- 2.86 -> DT O4 C0018 : score 5.12873 : x : SER xxxx A0038 <- 3.97 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.50 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0059 <- 3.45 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0061 <- 3.06 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx >4chu_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=E. COLI ISCR-DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : H : SER OG A0040 <- 2.69 -> DA N7 C0019 : score 4.56231 : H : GLU OE1 A0043 <- 3.19 -> DA N6 D0008 : score 2.47285 : H : GLU OE2 A0043 <- 3.07 -> DC N4 D0007 : score 4.98105 : H : GLN NE2 A0044 <- 2.86 -> DT O4 C0018 : score 5.12873 : H : SER OG B0040 <- 3.30 -> DG N7 D0020 : score 4.03385 : H : SER OG B0040 <- 2.95 -> DG O6 D0020 : score 3.96829 : H : GLU OE1 B0043 <- 2.65 -> DC N4 C0007 : score 5.94099 : H : GLU OE2 B0043 <- 3.00 -> DC N4 C0006 : score 5.05477 : H : GLN NE2 B0044 <- 2.74 -> DT O4 D0019 : score 5.25332 : H : ARG NH1 B0059 <- 2.82 -> DT O2 D0025 : score 4.28918 : H : ARG NH1 B0059 <- 2.61 -> DT O2 C0005 : score 4.47005 : x : SER xxxx A0038 <- 3.97 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.50 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0059 <- 3.45 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0061 <- 3.06 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0038 <- 4.23 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0041 <- 3.69 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0061 <- 3.05 -> DT xxx D0027 : score x.xxxxx >4cis_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF MUTM IN COMPLEX WITH CARBOCYCLIC 8-OXO-G CONTAINING DNA organism=Lactococcus lactis subsp. cremoris : H : ARG NH1 A0074 <- 2.79 -> DT O2 D0002 : score 4.31502 : x : MET xxxx A0075 <- 3.46 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.24 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0161 <- 3.76 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0162 <- 3.77 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0163 <- 3.99 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.76 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx >4cis_AB:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF MUTM IN COMPLEX WITH CARBOCYCLIC 8-OXO-G CONTAINING DNA organism=Lactococcus lactis subsp. cremoris : H : ARG NH1 A0074 <- 2.79 -> DT O2 D0002 : score 4.31502 : H : ARG NH1 B0074 <- 2.84 -> DT O2 D0008 : score 4.27196 : w : ARG NH1 B0074 <- 5.99 -> DT O2 D0009 : score 1.855 : w : ARG NH2 B0074 <- 5.82 -> DT O2 D0009 : score 2.261 : H : ARG NE B0109 <- 2.72 -> DC O2 C0009 : score 2.70152 : H : ARG NH2 B0109 <- 3.01 -> DC N3 C0009 : score 2.1948 : x : MET xxxx A0075 <- 3.46 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.24 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0161 <- 3.76 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0162 <- 3.77 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0163 <- 3.99 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.76 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0075 <- 3.42 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0111 <- 3.25 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0260 <- 3.44 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >4cja_A:Ankyrin_repeat; title=BURRH DNA-BINDING PROTEIN FROM BURKHOLDERIA RHIZOXINICA IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA organism=BURKHOLDERIA RHIZOXINICA : H : ASN ND2 A0325 <- 3.05 -> DG N7 B0008 : score 4.3566 : H : ASP OD2 A0358 <- 3.23 -> DC N4 B0009 : score 5.6668 : H : ARG NH1 A0490 <- 3.18 -> DG O6 C0005 : score 5.621 : H : ARG NH2 A0490 <- 2.83 -> DG N7 C0005 : score 6.34631 : H : ARG NH2 A0490 <- 3.31 -> DG O6 C0005 : score 5.9268 : H : SER OG A0523 <- 2.70 -> DA N7 B0014 : score 4.55338 : H : ASP OD2 A0556 <- 2.90 -> DC N4 B0015 : score 6.076 : H : ASN ND2 A0589 <- 2.86 -> DG N7 B0016 : score 4.53087 : H : ASN ND2 A0589 <- 2.61 -> DG O6 B0016 : score 5.85272 : H : SER OG A0688 <- 2.56 -> DA N7 B0019 : score 4.67838 : H : SER OG A0688 <- 3.15 -> DA N6 B0019 : score 3.05946 : w : ARG NH2 A0753 <- 5.97 -> DT O4 B0020 : score 2.366 : V : TYR CB A0029 <- 3.52 -> DT C7 B-001 : score 5.20953 : V : ASP CB A0061 <- 3.82 -> DT C7 B0000 : score 2.66966 : x : CYS xxxx A0062 <- 4.02 -> DT xxx B-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.51 -> DA xxx B0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0127 <- 3.44 -> DA xxx B0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0160 <- 4.11 -> DG xxx B0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0193 <- 3.38 -> DG xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0226 <- 3.81 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0259 <- 3.41 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0292 <- 3.61 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0391 <- 3.27 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0424 <- 3.40 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0457 <- 3.38 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx >4cn2_CD:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN RETINOID X RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO THE HUMAN RAMP2 RESPONSE ELEMENT organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 C0153 <- 3.03 -> DA N6 B0013 : score 2.55868 : w : GLU OE1 C0153 <- 6.26 -> DA N6 B0012 : score 2.939 : H : LYS NZ C0156 <- 2.75 -> DG O6 A0004 : score 5.83858 : w : LYS NZ C0156 <- 5.79 -> DA N7 A0003 : score 1.655 : H : ARG NH1 C0161 <- 3.04 -> DG N7 B0011 : score 5.7596 : w : ARG NH1 C0209 <- 5.76 -> DA N3 A0003 : score 2.585 : w : ARG NH2 C0209 <- 5.66 -> DA N3 A0003 : score 2.092 : w : GLU OE1 D0153 <- 5.64 -> DA N6 B0005 : score 2.939 : H : LYS NZ D0156 <- 2.82 -> DG O6 A0011 : score 5.75765 : w : LYS NZ D0156 <- 6.57 -> DG O6 A0010 : score 3.005 : w : LYS NZ D0160 <- 5.84 -> DG N7 A0012 : score 2.519 : w : LYS NZ D0160 <- 5.72 -> DT O4 A0013 : score 1.7 : H : ARG NH1 D0161 <- 3.21 -> DG N7 B0004 : score 5.5539 : w : ARG NH1 D0161 <- 5.80 -> DG O6 B0004 : score 2.756 : w : ARG NH1 D0209 <- 5.66 -> DG N3 A0010 : score 1.593 : w : ARG NH2 D0209 <- 5.86 -> DG N3 A0010 : score 0.677 : x : LYS xxxx C0160 <- 3.88 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx >4cn2_D:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; 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title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN RETINOID X RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO THE HUMAN NR1D1 RESPONSE ELEMENT organism=HOMO SAPIENS : w : SER OG B0143 <- 6.22 -> DC N4 D0007 : score 2.105 : H : GLU OE1 B0153 <- 2.94 -> DA N6 D0006 : score 2.60695 : w : GLU OE1 B0153 <- 5.54 -> DA N6 D0005 : score 2.939 : w : GLU OE2 B0153 <- 5.75 -> DC N4 D0007 : score 3.597 : H : LYS NZ B0156 <- 2.67 -> DG O6 C0011 : score 5.93107 : w : LYS NZ B0156 <- 6.26 -> DA N6 C0010 : score 2.097 : w : LYS NZ B0160 <- 5.98 -> DG O6 D0004 : score 3.005 : w : LYS NZ B0160 <- 5.06 -> DT O4 C0013 : score 1.7 : H : ARG NH1 B0161 <- 3.07 -> DG N7 D0004 : score 5.7233 : w : ARG NH1 B0161 <- 5.63 -> DG O6 D0004 : score 2.756 : w : ARG NH1 B0209 <- 5.82 -> DA N3 C0010 : score 2.585 : w : ARG NH2 B0209 <- 5.95 -> DA N3 C0010 : score 2.092 >4cn7_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN RETINOID X RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO AN IDEALIZED DR1 RESPONSE ELEMENT organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 A0153 <- 2.69 -> DC N4 D0012 : score 5.89484 : w : GLU OE1 A0153 <- 5.82 -> DA N6 D0011 : score 2.939 : H : LYS NZ A0156 <- 2.55 -> DG O6 C0004 : score 6.06981 : H : LYS NZ A0160 <- 2.84 -> DG N7 C0005 : score 5.34281 : w : LYS NZ A0160 <- 5.82 -> DG O6 D0010 : score 3.005 : H : ARG NH1 A0161 <- 3.09 -> DG N7 D0010 : score 5.6991 : w : ARG NH1 A0161 <- 5.34 -> DG O6 D0010 : score 2.756 >4cn7_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN RETINOID X RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO AN IDEALIZED DR1 RESPONSE ELEMENT organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 A0153 <- 2.69 -> DC N4 D0012 : score 5.89484 : w : GLU OE1 A0153 <- 5.82 -> DA N6 D0011 : score 2.939 : H : LYS NZ A0156 <- 2.55 -> DG O6 C0004 : score 6.06981 : H : LYS NZ A0160 <- 2.84 -> DG N7 C0005 : score 5.34281 : H : ARG NH1 A0161 <- 3.09 -> DG N7 D0010 : score 5.6991 : H : GLU OE1 B0153 <- 2.81 -> DC N4 D0005 : score 5.75641 : w : GLU OE1 B0153 <- 5.97 -> DA N6 D0004 : score 2.939 : w : GLU OE2 B0153 <- 5.78 -> DC N4 D0006 : score 3.597 : H : LYS NZ B0156 <- 2.73 -> DG O6 C0011 : score 5.8617 : w : LYS NZ B0160 <- 5.86 -> DT O4 C0013 : score 1.7 : H : ARG NH1 B0161 <- 2.94 -> DG N7 D0003 : score 5.8806 : w : ARG NH1 B0161 <- 5.74 -> DG O6 D0003 : score 2.756 >4cn7_EF:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN RETINOID X RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO AN IDEALIZED DR1 RESPONSE ELEMENT organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 E0153 <- 2.65 -> DC N4 H0012 : score 5.94099 : w : GLU OE1 E0153 <- 5.87 -> DA N6 H0011 : score 2.939 : H : LYS NZ E0156 <- 2.70 -> DG O6 G0004 : score 5.89638 : H : ARG NH1 E0161 <- 2.88 -> DG N7 H0010 : score 5.9532 : H : GLU OE1 F0153 <- 2.80 -> DC N4 H0005 : score 5.76795 : w : GLU OE2 F0153 <- 5.61 -> DC N4 H0006 : score 3.597 : H : LYS NZ F0156 <- 2.70 -> DG O6 G0011 : score 5.89638 : w : LYS NZ F0156 <- 6.05 -> DA N6 G0010 : score 2.097 : H : ARG NH1 F0161 <- 3.12 -> DG N7 H0003 : score 5.6628 : w : ARG NH1 F0161 <- 5.56 -> DG O6 H0003 : score 2.756 : w : ARG NH1 F0209 <- 6.00 -> DA N3 G0010 : score 2.585 : w : ARG NH2 F0209 <- 6.01 -> DA N3 G0010 : score 2.092 : x : LYS xxxx E0160 <- 3.71 -> DG xxx G0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0160 <- 3.46 -> DG xxx G0012 : score x.xxxxx >4crx_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=ASYMMETRIC DNA-BENDING IN THE CRE-LOXP SITE-SPECIFIC RECOMBINATION SYNAPSE organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ A0086 <- 2.30 -> DG O6 D0015 : score 6.35885 : H : GLN NE2 A0090 <- 3.31 -> DT O4 D0013 : score 4.66154 : H : GLN NE2 A0090 <- 2.97 -> DT O4 C0023 : score 5.01453 : w : ARG NH1 A0241 <- 5.66 -> DT O2 C0032 : score 1.855 : H : LYS NZ A0244 <- 2.98 -> DT O2 D0003 : score 3.45804 : H : LYS NZ A0244 <- 2.87 -> DT O2 C0035 : score 3.53696 : H : ARG NE A0259 <- 2.81 -> DG O6 C0028 : score 3.93314 : H : ARG NH2 A0259 <- 2.97 -> DG N7 C0028 : score 6.16754 : w : GLU OE1 A0262 <- 6.27 -> DC N4 C0027 : score 3.528 : H : ARG NH2 A0282 <- 2.99 -> DA N3 D0012 : score 3.11663 : H : LYS NZ B0086 <- 2.41 -> DG O6 C0015 : score 6.23167 : w : LYS NZ B0086 <- 5.95 -> DG O6 D0021 : score 3.005 : H : GLN NE2 B0090 <- 3.05 -> DT O4 D0023 : score 4.93147 : H : LYS NZ B0201 <- 2.98 -> DG N3 C0015 : score 1.40151 : w : ARG NH2 B0241 <- 5.51 -> DA N3 C0005 : score 2.092 : H : ARG NH1 B0243 <- 2.87 -> DT O2 D0033 : score 4.24612 : H : LYS NZ B0244 <- 2.82 -> DT O2 D0035 : score 3.57283 : H : ARG NE B0259 <- 2.81 -> DG O6 D0028 : score 3.93314 : H : ARG NH2 B0259 <- 2.94 -> DG N7 D0028 : score 6.20585 : w : GLU OE1 B0262 <- 5.88 -> DC N4 D0027 : score 3.528 : H : ARG NH2 B0282 <- 3.02 -> DA N3 C0012 : score 3.09719 : x : HIS xxxx A0040 <- 3.42 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.81 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0044 <- 3.58 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.80 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.69 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 3.81 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.76 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0040 <- 3.46 -> DT xxx D0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0041 <- 3.54 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0044 <- 3.56 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.62 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.25 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 3.85 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 3.61 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >4crx_B:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=ASYMMETRIC DNA-BENDING IN THE CRE-LOXP SITE-SPECIFIC RECOMBINATION SYNAPSE organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ B0086 <- 2.41 -> DG O6 C0015 : score 6.23167 : w : LYS NZ B0086 <- 5.95 -> DG O6 D0021 : score 3.005 : H : GLN NE2 B0090 <- 3.05 -> DT O4 D0023 : score 4.93147 : H : LYS NZ B0201 <- 2.98 -> DG N3 C0015 : score 1.40151 : w : ARG NH2 B0241 <- 5.51 -> DA N3 C0005 : score 2.092 : H : ARG NH1 B0243 <- 2.87 -> DT O2 D0033 : score 4.24612 : H : LYS NZ B0244 <- 2.82 -> DT O2 D0035 : score 3.57283 : H : ARG NE B0259 <- 2.81 -> DG O6 D0028 : score 3.93314 : H : ARG NH2 B0259 <- 2.94 -> DG N7 D0028 : score 6.20585 : w : GLU OE1 B0262 <- 5.88 -> DC N4 D0027 : score 3.528 : H : ARG NH2 B0282 <- 3.02 -> DA N3 C0012 : score 3.09719 : V : HIS CG B0040 <- 3.79 -> DT C7 D0025 : score 3.00647 : x : THR xxxx B0041 <- 3.54 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0044 <- 3.56 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.62 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.25 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0094 <- 3.85 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 3.61 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >4cyc_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A UBX-EXD-DNA COMPLEX INCLUDING THE HEXAPEPTIDE AND UBDA MOTIFS organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH2 A0005 <- 2.87 -> DA N3 C0011 : score 3.19439 : H : ASN OD1 A0051 <- 3.01 -> DA N6 D0025 : score 5.76888 : H : ASN ND2 A0051 <- 2.90 -> DA N7 D0025 : score 5.7531 : w : ASN OD1 A0051 <- 6.33 -> DT O4 D0024 : score 3.132 : w : LYS NZ A0058 <- 5.62 -> DT O4 C0008 : score 1.7 : V : ILE CG2 A0047 <- 3.65 -> DT C7 D0026 : score 7.3572 : x : GLN xxxx A0050 <- 3.61 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0054 <- 4.24 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >4cyc_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A UBX-EXD-DNA COMPLEX INCLUDING THE HEXAPEPTIDE AND UBDA MOTIFS organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH2 A0005 <- 2.87 -> DA N3 C0011 : score 3.19439 : H : ASN OD1 A0051 <- 3.01 -> DA N6 D0025 : score 5.76888 : H : ASN ND2 A0051 <- 2.90 -> DA N7 D0025 : score 5.7531 : w : ASN OD1 A0051 <- 6.33 -> DT O4 D0024 : score 3.132 : w : LYS NZ A0058 <- 5.62 -> DT O4 C0008 : score 1.7 : H : ARG NH2 B0003 <- 2.82 -> DT O2 D0019 : score 4.2164 : H : ASN OD1 B0051 <- 2.86 -> DA N6 D0021 : score 5.94953 : H : ASN ND2 B0051 <- 3.03 -> DA N7 D0021 : score 5.60047 : H : ARG NH1 B0055 <- 3.04 -> DG N7 D0020 : score 5.7596 : H : ARG NH2 B0055 <- 2.80 -> DG O6 D0020 : score 6.6 : x : ILE xxxx A0047 <- 3.42 -> DA xxx D0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0050 <- 3.61 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0054 <- 4.24 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0047 <- 3.52 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0054 <- 4.32 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx >4d1q_H:Ribonuclease_H-like;Hermes_dimerisation_domain; title=HERMES TRANSPOSASE BOUND TO ITS TERMINAL INVERTED REPEAT organism=? : H : ARG NE H0573 <- 3.10 -> DA N3 K0001 : score 1.97641 : H : SER OG H0576 <- 2.57 -> DC O2 L0014 : score 2.61634 : x : ARG xxxx H0318 <- 3.36 -> DT xxx L0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0372 <- 3.77 -> DA xxx K0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0375 <- 3.66 -> DA xxx K0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0572 <- 4.35 -> DT xxx L0015 : score x.xxxxx >4d6n_F:Homing_endonucleases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 10 DAYS INCUBATION IN 5MM MG (STATE 7) organism=DESULFUROCOCCUS MOBILIS : H : ARG NH1 F0033 <- 2.30 -> DG O6 H0021 : score 6.69167 : H : GLU OE1 F0035 <- 3.24 -> DC N4 I0006 : score 5.26037 : H : ARG NH1 F0037 <- 2.93 -> DG O6 I0008 : score 5.92517 : H : ARG NH2 F0037 <- 2.82 -> DG O6 I0007 : score 6.5736 : H : ARG NH2 F0037 <- 2.88 -> DG O6 I0008 : score 6.4944 : w : ARG NH1 F0037 <- 5.61 -> DT O4 H0017 : score 1.768 : H : ASP OD2 F0075 <- 3.37 -> DC N4 I0011 : score 5.4932 : H : THR OG1 F0076 <- 2.77 -> DA N7 G0014 : score 3.43459 : H : THR OG1 F0076 <- 3.15 -> DA N6 G0014 : score 2.56585 : H : ARG NH1 F0077 <- 2.28 -> DG O6 H0015 : score 6.716 : H : ARG NH2 F0077 <- 2.71 -> DG O6 H0015 : score 6.7188 : H : ARG NH2 F0077 <- 2.84 -> DT O4 H0016 : score 3.52542 : H : GLU OE1 F0079 <- 3.13 -> DA N6 I0009 : score 2.50504 : w : GLU OE2 F0079 <- 5.36 -> DT O4 H0017 : score 2.279 : H : ARG NH1 F0081 <- 3.07 -> DG N7 I0008 : score 5.7233 : H : ARG NH2 F0081 <- 3.19 -> DG N7 I0008 : score 5.88662 : H : ARG NH1 F0124 <- 2.95 -> DG O6 J0019 : score 5.90083 : H : ARG NH1 F0124 <- 3.18 -> DG O6 G0006 : score 5.621 : H : ARG NH2 F0124 <- 3.11 -> DG O6 G0006 : score 6.1908 : H : ARG NH1 F0126 <- 2.77 -> DG O6 J0018 : score 6.11983 : H : ARG NH2 F0126 <- 3.04 -> DG N7 J0018 : score 6.07815 : H : ASP OD1 F0154 <- 2.91 -> DC N4 G0008 : score 5.22728 : H : ASP OD2 F0155 <- 3.10 -> DC N4 I0015 : score 5.828 : H : ARG NH1 F0157 <- 3.20 -> DG N7 G0010 : score 5.566 : H : ARG NH1 F0157 <- 3.30 -> DG O6 G0010 : score 5.475 : x : TYR xxxx F0025 <- 3.42 -> DT xxx H0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0027 <- 4.05 -> DT xxx H0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0029 <- 3.15 -> DC xxx H0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0034 <- 3.40 -> DG xxx I0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0039 <- 4.39 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0041 <- 4.07 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0070 <- 3.16 -> DG xxx I0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0072 <- 4.03 -> DA xxx I0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0083 <- 3.95 -> DC xxx I0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0128 <- 3.62 -> DC xxx J0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0158 <- 3.61 -> DA xxx I0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0160 <- 4.08 -> DC xxx I0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0167 <- 4.18 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx >4d6o_A:Homing_endonucleases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 1H INCUBATION IN 5MM MG (STATE 2) organism=DESULFUROCOCCUS MOBILIS : H : ARG NH1 A0033 <- 2.64 -> DG O6 B0021 : score 6.278 : H : GLU OE1 A0035 <- 2.98 -> DC N4 C0006 : score 5.5603 : H : ARG NH1 A0037 <- 2.80 -> DG O6 C0008 : score 6.08333 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.77 -> DG O6 C0007 : score 6.6396 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.94 -> DG O6 C0008 : score 6.4152 : w : ARG NH1 A0037 <- 5.60 -> DT O4 B0017 : score 1.768 : w : ASP OD2 A0075 <- 5.46 -> DC N4 C0011 : score 3.623 : H : THR OG1 A0076 <- 2.73 -> DA N7 B0014 : score 3.4619 : H : THR OG1 A0076 <- 2.71 -> DA N6 B0014 : score 2.80864 : H : ARG NH1 A0077 <- 2.22 -> DG O6 B0015 : score 6.789 : H : ARG NH2 A0077 <- 2.91 -> DG O6 B0015 : score 6.4548 : H : ARG NH2 A0077 <- 2.82 -> DT O4 B0016 : score 3.53963 : H : GLU OE1 A0079 <- 3.31 -> DA N6 C0009 : score 2.40848 : w : GLU OE2 A0079 <- 5.28 -> DT O4 B0017 : score 2.279 : H : ARG NH1 A0081 <- 3.04 -> DG N7 C0008 : score 5.7596 : H : ARG NH2 A0081 <- 3.15 -> DG N7 C0008 : score 5.93769 : H : ARG NH1 A0124 <- 3.07 -> DG O6 C0019 : score 5.75483 A : H : ARG NH2 A0124 <- 3.13 -> DG N7 B0006 : score 5.96323 A : H : ARG NH2 A0124 <- 3.27 -> DG O6 B0006 : score 5.9796 A : H : ARG NH1 A0126 <- 2.83 -> DG O6 C0018 : score 6.04683 : H : ARG NH2 A0126 <- 3.03 -> DG N7 C0018 : score 6.09092 : H : ASP OD1 A0154 <- 2.88 -> DC N4 B0008 : score 5.25935 : H : ASP OD2 A0155 <- 2.64 -> DC N4 C0015 : score 6.3984 : H : ARG NH1 A0157 <- 2.81 -> DG N7 B0010 : score 6.0379 : H : ARG NH2 A0157 <- 2.62 -> DG O6 B0010 : score 6.8376 : x : TYR xxxx A0025 <- 3.45 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0027 <- 4.29 -> DC xxx B0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0029 <- 2.93 -> DC xxx B0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0032 <- 4.37 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0034 <- 3.46 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0039 <- 4.48 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 4.16 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0070 <- 3.30 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0072 <- 4.27 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0083 <- 4.09 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0128 <- 3.58 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0158 <- 3.55 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0160 <- 3.91 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx >4d8j_AB:Ribbon-helix-helix; title=STRUCTURE OF E. COLI MATP-MATS COMPLEX organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0080 <- 2.87 -> DG N7 N0012 : score 6.29523 : H : ASP OD2 A0095 <- 2.70 -> DC N4 N0008 : score 6.324 : H : ARG NE B0075 <- 2.83 -> DG N7 N0004 : score 4.39526 : H : ARG NH2 B0075 <- 2.32 -> DG N7 N0004 : score 6.99754 : H : ARG NH2 B0075 <- 2.25 -> DG O6 N0004 : score 7.326 : H : ARG NH2 B0080 <- 3.33 -> DG N7 M0012 : score 5.70785 : V : ALA CB B0076 <- 3.66 -> DT C7 M0013 : score 5.79494 : V : ALA CB A0076 <- 3.80 -> DT C7 N0013 : score 5.59897 : x : LYS xxxx B0071 <- 4.49 -> DC xxx N0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0072 <- 4.14 -> DC xxx M0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0073 <- 4.08 -> DT xxx M0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0093 <- 3.42 -> DA xxx M0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0095 <- 3.91 -> DA xxx M0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0072 <- 3.06 -> DC xxx N0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0073 <- 4.39 -> DT xxx N0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0075 <- 3.06 -> DC xxx M0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0093 <- 4.19 -> DT xxx N0010 : score x.xxxxx >4d8j_B:Ribbon-helix-helix; title=STRUCTURE OF E. COLI MATP-MATS COMPLEX organism=Escherichia coli : H : ARG NE B0075 <- 2.83 -> DG N7 N0004 : score 4.39526 : H : ARG NH2 B0075 <- 2.32 -> DG N7 N0004 : score 6.99754 : H : ARG NH2 B0075 <- 2.25 -> DG O6 N0004 : score 7.326 : H : ARG NH2 B0080 <- 3.33 -> DG N7 M0012 : score 5.70785 : V : ALA CB B0076 <- 3.66 -> DT C7 M0013 : score 5.79494 : x : LYS xxxx B0071 <- 4.49 -> DC xxx N0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0072 <- 4.14 -> DC xxx M0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0073 <- 4.08 -> DT xxx M0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0093 <- 3.42 -> DA xxx M0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0095 <- 3.91 -> DA xxx M0007 : score x.xxxxx >4d8j_CD:Ribbon-helix-helix; title=STRUCTURE OF E. COLI MATP-MATS COMPLEX organism=Escherichia coli : H : GLN OE1 C0072 <- 2.90 -> DA N6 F0015 : score 5.93151 : H : GLN NE2 C0072 <- 3.32 -> DA N7 F0015 : score 5.45641 : H : ARG NE C0075 <- 3.01 -> DT O4 E0005 : score 1.7809 : H : ARG NH2 C0075 <- 2.85 -> DT O4 E0005 : score 3.51831 : H : ARG NH1 C0080 <- 3.19 -> DG N7 F0012 : score 5.5781 : H : ARG NH2 C0080 <- 2.64 -> DG O6 F0012 : score 6.8112 : H : ARG NH2 D0075 <- 2.70 -> DG O6 F0004 : score 6.732 : H : ARG NH2 D0080 <- 2.81 -> DG N7 E0012 : score 6.37185 : H : SER OG D0093 <- 3.02 -> DA N6 E0010 : score 3.14499 : H : ASP OD2 D0095 <- 2.74 -> DC N4 E0008 : score 6.2744 : V : ALA CB D0076 <- 3.83 -> DT C7 E0013 : score 5.55698 : x : GLN xxxx D0072 <- 3.01 -> DC xxx E0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0073 <- 4.36 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0073 <- 4.46 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 4.18 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0091 <- 4.44 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0093 <- 2.97 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0095 <- 3.48 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx >4d8j_GH:Ribbon-helix-helix; title=STRUCTURE OF E. COLI MATP-MATS COMPLEX organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 G0080 <- 2.96 -> DG N7 J0012 : score 6.18031 : H : SER OG G0093 <- 2.69 -> DA N7 J0009 : score 4.56231 : H : SER OG G0093 <- 3.33 -> DA N6 J0009 : score 2.94103 : H : ARG NH2 H0080 <- 2.59 -> DG N7 I0012 : score 6.65277 : H : SER OG H0093 <- 2.81 -> DA N7 I0009 : score 4.45517 : V : ALA CB H0076 <- 3.71 -> DT C7 J0005 : score 5.72495 : x : GLN xxxx H0072 <- 4.29 -> DC xxx I0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0075 <- 2.99 -> DC xxx J0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0079 <- 4.40 -> DT xxx J0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx H0095 <- 3.24 -> DC xxx I0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0072 <- 3.36 -> DC xxx J0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0073 <- 4.47 -> DT xxx J0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0075 <- 3.11 -> DC xxx I0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0076 <- 4.03 -> DT xxx I0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0079 <- 4.17 -> DT xxx I0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx G0095 <- 3.33 -> DC xxx J0008 : score x.xxxxx >4d8j_KL:Ribbon-helix-helix; title=STRUCTURE OF E. COLI MATP-MATS COMPLEX organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 K0080 <- 3.06 -> DT O4 P0013 : score 3.36905 : H : SER OG K0093 <- 3.05 -> DA N7 P0009 : score 4.2409 : H : ARG NH2 L0075 <- 2.34 -> DG O6 P0004 : score 7.2072 : H : ARG NH2 L0075 <- 2.48 -> DT O4 P0005 : score 3.78129 : H : ARG NH2 L0080 <- 2.76 -> DG N7 O0012 : score 6.43569 : H : ASP OD2 L0095 <- 2.82 -> DC N4 O0008 : score 6.1752 : V : ALA CB K0076 <- 3.69 -> DT C7 P0013 : score 5.75295 : x : GLN xxxx L0072 <- 3.95 -> DC xxx O0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0073 <- 3.91 -> DT xxx O0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx L0076 <- 3.98 -> DT xxx O0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0079 <- 4.45 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0093 <- 4.39 -> DA xxx O0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx K0072 <- 3.10 -> DC xxx P0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx K0073 <- 4.21 -> DT xxx P0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0075 <- 3.32 -> DG xxx O0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx K0095 <- 3.44 -> DC xxx P0008 : score x.xxxxx >4da4_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF MOUSE DNMT1 (731-1602) BOUND TO HEMIMETHYLATED CPG DNA organism=Mus musculus : H : LYS NZ B0985 <- 2.90 -> DG O6 F0017 : score 5.66515 : x : MET xxxx B1235 <- 3.77 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1237 <- 3.53 -> DG xxx F0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B1238 <- 3.69 -> DG xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B1239 <- 4.34 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B1509 <- 3.64 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B1510 <- 3.89 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1533 <- 3.87 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B1535 <- 4.49 -> DC xxx E0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B1537 <- 3.09 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B1538 <- 3.74 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx >4dav_AB:Phospholipase_D/nuclease; title=THE STRUCTURE OF PYROCOCCUS FURIOSUS SFSA IN COMPLEX WITH DNA organism=Pyrococcus furiosus : w : THR OG1 A0037 <- 5.60 -> DT O2 a0004 : score 2.522 : H : GLU OE1 B0108 <- 3.31 -> DG N2 a0010 : score 3.87061 >4dav_B:Phospholipase_D/nuclease; title=THE STRUCTURE OF PYROCOCCUS FURIOSUS SFSA IN COMPLEX WITH DNA organism=Pyrococcus furiosus : w : THR OG1 B0037 <- 5.48 -> DT O2 a0004 : score 2.522 >4df4_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH 7-(N-(10- HYDROXYDECANOYL)-AMINOPENTINYL)-7-DEAZA-2 -DATP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.83 -> DC O2 B0109 : score 2.92848 : w : LYS NZ A0540 <- 5.19 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 6.01 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.67 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.93 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.65 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.90 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.13 -> DG N3 B0110 : score 4.57181 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.45 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.44 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : GLN xxxx A0754 <- 4.50 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >4df8_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH AMINOPENTINYL-7- DEAZA-2-DATP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.81 -> DC O2 B0109 : score 2.94026 : w : LYS NZ A0540 <- 5.29 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 6.13 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.62 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.85 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.68 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.86 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.19 -> DG N3 B0110 : score 4.51307 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.49 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.66 -> DC O2 B0111 : score 3.208 >4dfj_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH 5-(AMINOPENTINYL)- DTTP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.78 -> DC O2 B0109 : score 2.95794 : w : LYS NZ A0540 <- 5.50 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 6.23 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.54 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 6.05 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.76 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.62 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.10 -> DG N3 B0110 : score 4.60118 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.66 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.59 -> DC O2 B0111 : score 3.208 >4dfk_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH 5-(N-(10-HYDROXYDECANOYL)-AMINOPENTINYL)-2-DUTP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.82 -> DC O2 B0109 : score 2.93437 : w : LYS NZ A0540 <- 5.58 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.89 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.56 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.81 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.83 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.70 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.72 -> DG N3 C0208 : score 3.377 : w : ASN OD1 A0583 <- 6.22 -> DG N2 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.57 -> DC O2 B0111 : score 3.208 >4dfm_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN TERNARY COMPLEX WITH 5-(AMINOPENTINYL)-2-DCTP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.82 -> DC O2 B0109 : score 2.93437 : w : LYS NZ A0540 <- 5.48 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.95 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.54 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.77 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.74 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.93 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.12 -> DG N3 B0110 : score 4.5816 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.53 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.60 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : GLN xxxx A0754 <- 4.47 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >4dfp_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQAUTICUS IN A TERNARY COMPLEX WITH 7-(AMINOPENTINYL)-7- DEAZA-DGTP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.81 -> DC O2 B0109 : score 2.94026 : w : LYS NZ A0540 <- 5.88 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : LYS NZ A0540 <- 5.36 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 5.59 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 6.04 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.68 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.93 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.22 -> DG N3 B0110 : score 4.4837 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.58 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.42 -> DC O2 B0111 : score 3.208 >4dk9_A:DNA-glycosylase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MBD4 CATALYTIC DOMAIN BOUND TO ABASIC DNA organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0468 <- 3.06 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0469 <- 3.70 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0508 <- 3.43 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >4dkj_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CPG SPECIFIC METHYLTRANSFERASE IN COMPLEX WITH TARGET DNA organism=Mycoplasma penetrans : H : GLN OE1 A0141 <- 2.99 -> DG N2 C0008 : score 5.3946 : H : ASN ND2 A0303 <- 2.75 -> DG O6 B0007 : score 5.69485 : H : SER OG A0304 <- 2.76 -> DG O6 C0008 : score 4.12375 : H : ARG NH1 A0326 <- 2.99 -> DA N7 C0005 : score 2.46297 : H : ARG NH2 A0326 <- 3.08 -> DG O6 C0006 : score 6.2304 : x : VAL xxxx A0140 <- 3.71 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0302 <- 3.18 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0305 <- 4.39 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0321 <- 3.54 -> DC xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0323 <- 3.84 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.30 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx >4dl2_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING DCMPNPP OPPOSITE CG TEMPLATE (GG0A) organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.24 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 4.42 -> DT xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.52 -> DG xxx P0003 : score x.xxxxx >4dl3_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING DCMPNPP OPPOSITE GG TEMPLATE (GG0B). organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.09 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.50 -> DT xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.42 -> DT xxx P0004 : score x.xxxxx >4dl4_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING DCMPNPP OPPOSITE THE 3'G OF CISPLATIN CROSSLINKED GS (PT-GG1). organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.18 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.01 -> DT xxx P0004 : score x.xxxxx >4dl5_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING DCMPNPP OPPOSITE THE 5'G OF CISPLATIN CROSSLINKED GS (PT-GG2). organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0382 <- 3.58 -> DT xxx P0004 : score x.xxxxx >4dl6_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA EXTENDING PRIMER IMMEDIATELY AFTER CISPLATIN CROSSLINK (PT-GG3). organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0382 <- 3.36 -> DT xxx P0004 : score x.xxxxx >4dl7_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA FAILS TO EXTEND PRIMER 2 NUCLEOTIDE AFTER CISPLATIN CROSSLINK (PT-GG4). organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0061 <- 3.60 -> DG xxx P0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 4.21 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.57 -> DT xxx P0004 : score x.xxxxx >4dle_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF TAQ DNA POLYMERASE: 4- FLUOROPROLINE VARIANT organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 3.20 -> DC O2 B0109 : score 2.71046 : w : LYS NZ A0540 <- 5.31 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.86 -> DG N2 B0108 : score 0.846 : w : THR OG1 A0544 <- 5.84 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 6.00 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.89 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.61 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.39 -> DG N3 B0110 : score 4.31728 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.69 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : GLU OE1 A0615 <- 6.46 -> DG N3 C0205 : score 2.669 : H : THR OG1 A0664 <- 3.16 -> DG O6 C0204 : score 3.91188 : w : ARG NH2 A0677 <- 6.01 -> DG O6 C0204 : score 2.468 : w : GLN NE2 A0754 <- 6.18 -> DG N3 C0205 : score 1.484 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.95 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : PHE xxxx A0667 <- 3.95 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0671 <- 3.30 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0750 <- 4.30 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx >4dlg_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF TAQ DNA POLYMERASE organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 3.05 -> DC O2 B0109 : score 2.79885 : w : LYS NZ A0540 <- 5.18 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.82 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.54 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.87 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.67 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.73 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.33 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : GLU OE1 A0615 <- 6.46 -> DG N3 C0205 : score 2.669 : w : ASN ND2 A0750 <- 6.59 -> DG N3 C0205 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0754 <- 6.24 -> DG N3 C0205 : score 1.484 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.61 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : THR xxxx A0664 <- 3.59 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0667 <- 3.69 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0671 <- 3.20 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0677 <- 3.52 -> DG xxx C0204 : score x.xxxxx >4dm0_A:Ribonuclease_H-like; title=TN5 TRANSPOSASE: 20MER OUTSIDE END 2 MN COMPLEX organism=Escherichia coli : H : GLN OE1 A0243 <- 3.00 -> DA N6 B0115 : score 5.81046 : H : GLN NE2 A0243 <- 2.93 -> DA N7 B0115 : score 5.93141 : H : LYS NZ A0244 <- 2.81 -> DG N7 C0203 : score 5.37513 : w : LYS NZ A0244 <- 6.45 -> DT O4 B0117 : score 1.7 : H : LYS NZ A0330 <- 3.15 -> DC O2 B0118 : score 2.73992 : w : LYS NZ A0330 <- 5.56 -> DA N3 C0204 : score 1.538 : w : LYS NZ A0330 <- 5.57 -> DT O2 B0117 : score 0.522 : H : SER OG A0438 <- 2.96 -> DC N4 C0207 : score 3.55802 : H : LYS NZ A0439 <- 2.98 -> DG O6 B0114 : score 5.57266 : x : VAL xxxx A0247 <- 4.14 -> DT xxx B0117 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0440 <- 3.71 -> DA xxx B0112 : score x.xxxxx >4do9_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER AND 2'-DEOXYGUANOSINE 5'-BETA, GAMMA-MONOFLUOROMETHYLENE TRIPHOSPHATE: STEREOSELECTIVE BINDING OF R-ISOMER organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.27 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.04 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.60 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4doa_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER AND 2'-DEOXYGUANOSINE 5'-BETA, GAMMA-MONOFLUOROMETHYLENE TRIPHOSPHATE: NON-INTERACTIVE BINDING OF S-ISOMER organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.18 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.05 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.65 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4dob_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER AND 2'-DEOXYGUANOSINE 5'-BETA, GAMMA-MONOCHLOROROMETHYLENE TRIPHOSPHATE: STEREOSELECTIVE BINDING OF R-ISOMER organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.06 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.69 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.66 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4doc_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER AND 2'-DEOXYGUANOSINE 5'-BETA, GAMMA-MONOCHLOROROMETHYLENE TRIPHOSPHATE:BINDING OF S-ISOMER organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.27 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.98 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.63 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4dpv_Z:ssDNA_viruses; title=PARVOVIRUS/DNA COMPLEX organism=CANINE PARVOVIRUS : H : GLN NE2 Z0143 <- 3.10 -> DT O4 N0002 : score 4.87956 : H : TYR OH Z0244 <- 3.39 -> DC O2 N0005 : score 3.08474 : V : PHE CB Z0266 <- 3.83 -> DT C7 N0002 : score 5.75752 : x : PHE xxxx Z0141 <- 3.34 -> DT xxx N0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Z0142 <- 4.25 -> DT xxx N0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Z0177 <- 3.73 -> DT xxx N0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Z0179 <- 3.47 -> DT xxx N0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Z0263 <- 3.33 -> DT xxx N0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Z0267 <- 3.18 -> DA xxx N0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Z0492 <- 3.61 -> DC xxx N0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Z0493 <- 3.72 -> DA xxx N0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx Z0495 <- 3.58 -> DT xxx N0002 : score x.xxxxx >4dqi_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT, DNA DUPLEX, AND DCTP (PAIRED WITH DG OF TEMPLATE) organism=Geobacillus kaustophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.76 -> DT O2 C0008 : score 3.61588 : w : LYS NZ A0582 <- 5.61 -> DC O2 B0026 : score 1.3 : w : TYR OH A0587 <- 5.95 -> DC O2 B0026 : score 1.343 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.63 -> DG N3 C0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.83 -> DA N3 C0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.85 -> DT O2 B0027 : score 4.69869 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.73 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : GLN xxxx A0797 <- 4.42 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx >4dqp_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT, DNA DUPLEX, AND DDCTP (PAIRED WITH DG OF TEMPLATE) organism=Geobacillus kaustophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.63 -> DT O2 F0008 : score 3.70914 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.74 -> DG N3 F0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.92 -> DA N3 F0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.88 -> DT O2 E0027 : score 4.67022 : w : ASN ND2 D0724 <- 5.89 -> DG N7 F0003 : score 3.259 : w : HIS NE2 D0829 <- 5.69 -> DC O2 E0028 : score 3.208 : x : ALA xxxx D0707 <- 4.49 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0710 <- 3.59 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.26 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0716 <- 4.07 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0793 <- 3.94 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0797 <- 3.20 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx >4dqq_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT E658A, DNA DUPLEX, AND RCTP (PAIRED WITH DG OF TEMPLATE) IN PRESENCE OF MG2+ organism=Geobacillus kaustophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.76 -> DT O2 F0008 : score 3.61588 : w : LYS NZ D0582 <- 5.84 -> DC O2 E0026 : score 1.3 : w : TYR OH D0587 <- 5.84 -> DC O2 E0026 : score 1.343 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.75 -> DG N3 F0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.83 -> DA N3 F0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.92 -> DT O2 E0027 : score 4.63225 : w : HIS NE2 D0829 <- 5.62 -> DC O2 E0028 : score 3.208 : x : ARG xxxx D0629 <- 3.69 -> DC xxx E0028 : score x.xxxxx >4dqr_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT E658A, DNA DUPLEX, AND RCTP (PAIRED WITH DG OF TEMPLATE) IN PRESENCE OF MN2+ organism=Geobacillus kaustophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.74 -> DT O2 C0008 : score 3.63023 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.60 -> DG N3 C0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.78 -> DA N3 C0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.97 -> DT O2 B0027 : score 4.58478 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.60 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : ARG xxxx A0629 <- 3.79 -> DC xxx B0028 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 4.45 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx >4dqs_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BINARY COMPLEX OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT AND DUPLEX DNA WITH RC IN PRIMER TERMINUS PAIRED WITH DG OF TEMPLATE organism=Geobacillus kaustophilus : w : LYS NZ A0582 <- 5.76 -> DG N3 C0008 : score 2.232 : w : THR OG1 A0586 <- 5.49 -> DG N3 C0008 : score 2.036 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.58 -> DT O2 C0005 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.88 -> DA N3 C0006 : score 2.277 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.60 -> DC O2 C0007 : score 1.885 : x : ALA xxxx A0707 <- 4.23 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0710 <- 4.27 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.34 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 3.60 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0717 <- 4.08 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0721 <- 3.78 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0724 <- 3.58 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.46 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >4dqy_AD:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain;ADP-ribosylation;Domain_of_polyADP-ribose_polymerase;WGR_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN PARP-1 BOUND TO A DNA DOUBLE STRAND BREAK organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0018 <- 3.79 -> DG xxx N0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0044 <- 3.35 -> DG xxx M0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0048 <- 2.91 -> DC xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0018 <- 3.52 -> DG xxx M0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0044 <- 3.28 -> DG xxx N0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0048 <- 3.09 -> DC xxx M0026 : score x.xxxxx >4ds4_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT, DNA DUPLEX, AND RCTP IN PRESENCE OF MN2+ organism=Geobacillus kaustophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.75 -> DT O2 C0008 : score 3.62305 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.76 -> DG N3 C0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.86 -> DA N3 C0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.94 -> DT O2 B0027 : score 4.61326 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.16 -> DG N3 C0004 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.33 -> DG N3 C0004 : score 1.484 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.55 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : ARG xxxx A0629 <- 4.21 -> DC xxx B0028 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.55 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >4ds5_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT, DNA DUPLEX, AND RCTP IN PRESENCE OF MG2+ organism=Geobacillus kaustophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.59 -> DT O2 F0008 : score 3.73784 : w : LYS NZ D0582 <- 6.29 -> DG N2 F0007 : score 0.846 : H : ARG NH1 D0615 <- 2.76 -> DC O2 E0029 : score 3.6792 : H : ARG NH2 D0615 <- 3.08 -> DC O2 E0029 : score 3.49159 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.76 -> DG N3 F0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.91 -> DA N3 F0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.80 -> DT O2 E0027 : score 4.74615 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.55 -> DG N3 F0004 : score 2.669 : w : ASN ND2 D0793 <- 6.39 -> DG N3 F0004 : score 2.566 : w : GLN NE2 D0797 <- 6.38 -> DG N3 F0004 : score 1.484 : w : HIS NE2 D0829 <- 5.55 -> DC O2 E0028 : score 3.208 : x : ARG xxxx D0629 <- 3.37 -> DC xxx E0029 : score x.xxxxx >4dse_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT F710Y, DNA DUPLEX, AND RCTP (PAIRED WITH DG OF TEMPLATE) IN PRESENCE OF MG2+ organism=Geobacillus kaustophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.73 -> DT O2 F0008 : score 3.6374 : w : LYS NZ D0582 <- 5.68 -> DC O2 E0026 : score 1.3 : w : TYR OH D0587 <- 5.90 -> DC O2 E0026 : score 1.343 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.79 -> DG N3 F0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.86 -> DA N3 F0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.89 -> DT O2 E0027 : score 4.66072 : w : HIS NE2 D0829 <- 5.65 -> DC O2 E0028 : score 3.208 : x : GLN xxxx D0797 <- 4.48 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx >4dsf_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT F710Y, DNA DUPLEX, AND RCTP (PAIRED WITH DG OF TEMPLATE) IN PRESENCE OF MN2+ organism=Geobacillus kaustophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.74 -> DT O2 F0008 : score 3.63023 : w : LYS NZ D0582 <- 5.71 -> DC O2 E0026 : score 1.3 : w : TYR OH D0587 <- 5.90 -> DC O2 E0026 : score 1.343 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.74 -> DG N3 F0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.86 -> DA N3 F0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.85 -> DT O2 E0027 : score 4.69869 : w : HIS NE2 D0829 <- 5.65 -> DC O2 E0028 : score 3.208 : x : GLN xxxx D0797 <- 4.46 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx >4dsi_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FRAGMENT DNA POLYMERASE I FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS WITH DUPLEX DNA, SE-DGTP AND CALCIUM organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.75 -> DC O2 B0009 : score 2.97562 : w : LYS NZ A0582 <- 5.85 -> DA N3 C0005 : score 1.538 : w : LYS NZ A0582 <- 5.41 -> DT O2 B0008 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 5.52 -> DA N3 C0005 : score 2.845 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.84 -> DG N3 B0012 : score 3.02814 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.75 -> DC O2 C0002 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.93 -> DT O2 C0003 : score 1.666 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.07 -> DA N3 B0010 : score 3.60208 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.33 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0629 <- 3.30 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0710 <- 3.34 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.70 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0793 <- 4.41 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.41 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.16 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx >4dsj_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FRAGMENT DNA POLYMERASE I FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS WITH DUPLEX DNA, DGTP AND CALCIUM organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NH1 A0615 <- 2.95 -> DG N3 C0012 : score 2.96099 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.81 -> DA N3 C0010 : score 3.80008 : x : LYS xxxx A0582 <- 3.07 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0629 <- 3.47 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.38 -> DC xxx D0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0793 <- 4.48 -> DC xxx D0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.04 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.18 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx >4dsk_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FRAGMENT DNA POLYMERASE I FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS WITH DUPLEX DNA, PPI AND CALCIUM organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.75 -> DT O2 C0008 : score 3.62305 : H : ARG NH1 A0615 <- 3.03 -> DG N3 B0014 : score 2.91215 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.77 -> DG N3 C0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.72 -> DA N3 C0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.80 -> DT O2 B0012 : score 4.74615 : w : GLU OE1 A0658 <- 6.20 -> DC O2 C0004 : score 2.68 : w : ASN ND2 A0793 <- 5.83 -> DC O2 C0004 : score 1.885 : w : GLN NE2 A0797 <- 5.74 -> DC O2 C0004 : score 2.699 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.50 -> DC O2 B0013 : score 3.208 : x : ARG xxxx A0629 <- 3.22 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.41 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx >4dsl_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FRAGMENT DNA POLYMERASE I FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS WITH DUPLEX DNA AND CALCIUM organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.79 -> DA N3 B0010 : score 2.78248 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.59 -> DC O2 B0013 : score 3.8033 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.21 -> DC O2 B0013 : score 3.39542 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.62 -> DA N3 C0006 : score 2.585 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.97 -> DC O2 B0011 : score 4.32718 : H : GLN NE2 A0797 <- 2.94 -> DG N3 C0005 : score 4.83632 : x : ASN xxxx A0622 <- 4.21 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.35 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0793 <- 4.17 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.29 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx >4dtj_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DTTP OPPOSITE AN ABASIC SITE AND DDT/DA AS THE PENULTIMATE BASE-PAIR organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.48 -> DT O2 P0115 : score 2.522 : H : LYS NZ A0706 <- 2.98 -> DA N3 P0114 : score 2.67695 : w : LYS NZ A0734 <- 5.67 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0734 <- 5.88 -> DC O2 T0010 : score 1.3 : w : LYS NZ A0734 <- 5.90 -> DT O2 P0112 : score 0.522 >4dtm_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DCTP OPPOSITE AN ABASIC SITE AND DDG/DC AS THE PENULTIMATE BASE-PAIR organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.67 -> DG N3 P0115 : score 2.036 : H : LYS NZ A0706 <- 2.97 -> DA N3 P0114 : score 2.68251 : w : LYS NZ A0734 <- 6.00 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >4dtn_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DATP OPPOSITE AN ABASIC SITE AND DDA/DT AS THE PENULTIMATE BASE-PAIR organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.70 -> DA N3 P0115 : score 2.845 : H : LYS NZ A0706 <- 2.93 -> DA N3 P0114 : score 2.70472 : w : ARG NH1 A0707 <- 6.23 -> DA N3 T0008 : score 2.585 A : w : ARG NH2 A0707 <- 5.50 -> DG N3 T0009 : score 0.677 A : w : LYS NZ A0734 <- 5.46 -> DT O2 P0112 : score 0.522 >4dto_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DCTP OPPOSITE AN ABASIC SITE AND DDA/DT AS THE PENULTIMATE BASE-PAIR organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.74 -> DA N3 P0115 : score 2.845 : H : LYS NZ A0706 <- 3.00 -> DA N3 P0114 : score 2.66585 : w : LYS NZ A0734 <- 5.44 -> DT O2 P0112 : score 0.522 : w : LYS NZ A0734 <- 5.95 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >4dtp_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DGTP OPPOSITE AN ABASIC SITE AND DDA/DT AS THE PENULTIMATE BASE-PAIR organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.73 -> DA N3 P0115 : score 2.845 : H : LYS NZ A0706 <- 2.86 -> DA N3 P0114 : score 2.7436 : w : ARG NH1 A0707 <- 5.66 -> DT O2 P0113 : score 1.855 A : w : LYS NZ A0734 <- 5.89 -> DC O2 T0010 : score 1.3 >4dtr_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DATP OPPOSITE AN ABASIC SITE AND DDC/DG AS THE PENULTIMATE BASE-PAIR organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.97 -> DA N3 P0114 : score 2.68251 : x : LYS xxxx A0734 <- 4.35 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx >4dts_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DCTP OPPOSITE AN ABASIC SITE AND DDC/DG AS THE PENULTIMATE BASE-PAIR organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.02 -> DA N3 P0114 : score 2.65474 : w : LYS NZ A0734 <- 5.56 -> DT O2 P0112 : score 0.522 >4dtu_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DGTP OPPOSITE AN ABASIC SITE AND DDC/DG AS THE PENULTIMATE BASE-PAIR organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.07 -> DA N3 P0114 : score 2.62697 : w : LYS NZ A0734 <- 5.81 -> DT O2 P0112 : score 0.522 : w : LYS NZ A0734 <- 6.36 -> DC O2 P0111 : score 1.3 : x : LYS xxxx A0800 <- 4.27 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx >4dtx_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DTTP OPPOSITE AN ABASIC SITE AND DDC/DG AS THE PENULTIMATE BASE-PAIR organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0416 <- 6.09 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : H : LYS NZ A0706 <- 3.03 -> DA N3 P0114 : score 2.64918 : w : LYS NZ A0734 <- 5.68 -> DT O2 P0112 : score 0.522 >4du1_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DATP OPPOSITE DT organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.26 -> DA N3 P0114 : score 2.52145 : w : LYS NZ A0734 <- 5.46 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : x : LYS xxxx A0800 <- 2.77 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx >4du3_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DDTP OPPOSITE DT WITH 3- DEAZA-ADENINE AT THE N-1 POSITION OF TEMPLATE STRAND organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.97 -> DA N3 P0114 : score 2.68251 : w : LYS NZ A0734 <- 5.57 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : x : LYS xxxx A0800 <- 3.16 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx >4du4_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DATP OPPOSITE DT WITH 3- DEAZA-ADENINE AT THE N-3 POSITION OF PRIMER STRAND organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.80 -> DA N3 P0114 : score 2.77692 : x : LYS xxxx A0734 <- 4.41 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx >4dwi_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FRAGMENT DNA POLYMERASE I FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS WITH SELF COMPLEMENTARY DNA, SE-DGTP AND CALCIUM organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : LYS NZ A0582 <- 2.62 -> DT O2 C0007 : score 3.71632 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.93 -> DA N3 C0010 : score 3.58632 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.94 -> DG N3 B0004 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.87 -> DG N3 B0005 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.01 -> DC O2 C0008 : score 4.29135 : w : GLU OE1 A0658 <- 6.04 -> DT O2 B0003 : score 2.462 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.47 -> DT O2 B0003 : score 1.666 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.32 -> DT O2 B0003 : score 1.565 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.64 -> DC O2 C0009 : score 3.208 : V : TYR CD2 A0714 <- 3.87 -> DT C7 B0003 : score 3.67606 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.09 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0629 <- 3.62 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx >4dwp_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=SEMET PROTELOMERASE TELA COVALENTLY COMPLEXED WITH SUBSTRATE DNA organism=AGROBACTERIUM TUMEFACIENS : H : ARG NE A0126 <- 3.29 -> DA N3 D0027 : score 1.89651 : H : SER OG A0171 <- 2.95 -> DA N6 C0011 : score 3.19105 : w : THR OG1 A0174 <- 5.88 -> DA N6 D0021 : score 3.251 : w : LYS NZ A0175 <- 5.75 -> DC N4 C0009 : score 0.048 : H : LYS NZ A0286 <- 2.85 -> DA N3 C0013 : score 2.74915 : w : SER OG A0335 <- 6.61 -> DG O6 D0024 : score 2.749 : V : ILE CG2 A0170 <- 3.59 -> DT C7 D0020 : score 7.46357 : V : LEU CD1 A0340 <- 3.89 -> DT C7 D0025 : score 5.60233 : x : ALA xxxx A0124 <- 4.22 -> DT xxx D0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0167 <- 3.11 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0168 <- 3.65 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0172 <- 3.49 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0201 <- 4.16 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0208 <- 3.66 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0331 <- 4.07 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0339 <- 3.82 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 3.75 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx >4e0d_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BINARY COMPLEX OF BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT E658A AND DUPLEX DNA organism=Geobacillus kaustophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.82 -> DC O2 B0026 : score 2.93437 : w : LYS NZ A0582 <- 5.87 -> DA N3 B0025 : score 1.538 : w : LYS NZ A0582 <- 5.35 -> DT O2 C0008 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 5.36 -> DT O2 C0008 : score 2.522 : w : TYR OH A0587 <- 5.77 -> DG N2 C0007 : score 2.834 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.94 -> DG N2 C0005 : score 1.082 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.85 -> DA N3 C0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.99 -> DT O2 B0027 : score 4.5658 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.55 -> DG N3 C0007 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.68 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : ARG xxxx A0629 <- 3.13 -> DC xxx B0028 : score x.xxxxx >4e0g_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=PROTELOMERASE TELA/DNA HAIRPIN PRODUCT/VANADATE COMPLEX organism=AGROBACTERIUM TUMEFACIENS : H : ARG NE A0126 <- 3.02 -> DA N3 D0027 : score 2.01005 : H : SER OG A0171 <- 2.88 -> DA N6 C0011 : score 3.23711 : w : THR OG1 A0174 <- 6.08 -> DA N6 D0021 : score 3.251 : w : LYS NZ A0175 <- 6.21 -> DA N6 C0010 : score 2.097 : w : LYS NZ A0175 <- 5.62 -> DC N4 C0009 : score 0.048 : H : LYS NZ A0208 <- 3.00 -> DT O4 D0014 : score 3.44369 A : H : LYS NZ A0286 <- 3.38 -> DA N3 C0013 : score 2.4548 : H : LYS NZ A0288 <- 2.78 -> DT O2 D0014 : score 3.60153 : H : LYS NZ A0288 <- 3.21 -> DT O2 D0020 : score 3.29303 : w : LYS NZ A0288 <- 6.10 -> DA N3 D0019 : score 1.538 : w : SER OG A0335 <- 6.24 -> DG N7 D0024 : score 2.749 : w : ARG NE A0339 <- 5.80 -> DG N7 D0024 : score 1.593 : V : ILE CG2 A0170 <- 3.52 -> DT C7 D0020 : score 7.58767 : x : ALA xxxx A0124 <- 3.23 -> DT xxx D0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0167 <- 3.33 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0168 <- 3.60 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0172 <- 3.58 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0201 <- 3.65 -> DA xxx D0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0205 <- 4.43 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0331 <- 4.10 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0340 <- 3.80 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 3.68 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0401 <- 4.36 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx >4e0j_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=PROTELOMERASE TELA R255A MUTANT COMPLEXED WITH DNA HAIRPIN PRODUCT organism=AGROBACTERIUM TUMEFACIENS : H : ARG NE A0126 <- 2.99 -> DA N3 D0027 : score 2.02267 : H : SER OG A0171 <- 2.99 -> DA N6 C0011 : score 3.16473 : w : THR OG1 A0174 <- 6.19 -> DA N6 D0021 : score 3.251 : w : LYS NZ A0175 <- 5.73 -> DC N4 C0009 : score 0.048 : H : LYS NZ A0208 <- 2.65 -> DT O4 D0014 : score 3.69479 : w : LYS NZ A0208 <- 6.02 -> DG O6 D0018 : score 3.005 : H : LYS NZ A0286 <- 3.00 -> DA N3 C0013 : score 2.66585 : H : LYS NZ A0288 <- 3.06 -> DT O2 D0014 : score 3.40065 : w : LYS NZ A0288 <- 5.84 -> DT O2 D0020 : score 0.522 : w : ARG NE A0339 <- 5.91 -> DG N7 D0024 : score 1.593 : x : ALA xxxx A0124 <- 3.61 -> DT xxx D0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0167 <- 3.18 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0168 <- 3.48 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0170 <- 3.49 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0172 <- 3.64 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0201 <- 3.52 -> DA xxx D0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0205 <- 3.82 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0331 <- 3.94 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0335 <- 3.78 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0340 <- 3.35 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 3.64 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0401 <- 4.41 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx >4e0p_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=PROTELOMERASE TELA COVALENTLY COMPLEXED WITH SUBSTRATE DNA organism=AGROBACTERIUM TUMEFACIENS : H : ARG NH1 A0126 <- 2.98 -> DA N3 D0027 : score 3.5495 : w : SER OG A0171 <- 6.48 -> DA N6 C0010 : score 2.209 A : w : THR OG1 A0174 <- 5.75 -> DA N6 D0021 : score 3.251 : H : LYS NZ A0286 <- 2.99 -> DA N3 C0013 : score 2.6714 : w : SER OG A0335 <- 6.17 -> DG N7 D0024 : score 2.749 : w : ARG NE A0339 <- 5.64 -> DG N7 D0024 : score 1.593 : x : ALA xxxx A0124 <- 3.40 -> DT xxx D0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0167 <- 3.43 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0168 <- 3.52 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0170 <- 3.43 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0172 <- 3.58 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0201 <- 4.47 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0208 <- 3.51 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0331 <- 4.02 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0340 <- 3.69 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 3.81 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx >4e0y_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=PROTELOMERASE TELA COVALENTLY COMPLEXED WITH MUTATED SUBSTRATE DNA organism=AGROBACTERIUM TUMEFACIENS : H : ARG NE A0126 <- 3.15 -> DA N3 D0027 : score 1.95538 : H : SER OG A0171 <- 3.36 -> DA N6 C0011 : score 2.92129 : w : THR OG1 A0174 <- 5.75 -> DA N6 D0021 : score 3.251 : H : LYS NZ A0286 <- 2.98 -> DA N3 C0013 : score 2.67695 : V : LEU CD1 A0340 <- 3.68 -> DT C7 D0025 : score 5.90322 : x : ALA xxxx A0124 <- 3.31 -> DT xxx D0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0167 <- 3.47 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0168 <- 3.55 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0170 <- 3.49 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0172 <- 3.55 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0201 <- 4.21 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0208 <- 4.32 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0331 <- 4.00 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0335 <- 3.74 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0339 <- 3.34 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 4.02 -> DT xxx D0025 : score x.xxxxx >4e0z_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=PROTELOMERASE TELA R205A COVALENTLY COMPLEXED WITH SUBSTRATE DNA organism=AGROBACTERIUM TUMEFACIENS : H : ARG NE A0126 <- 3.14 -> DA N3 D0027 : score 1.95959 : H : SER OG A0171 <- 3.02 -> DA N6 C0011 : score 3.14499 : w : THR OG1 A0174 <- 5.93 -> DA N6 D0021 : score 3.251 : w : LYS NZ A0175 <- 5.89 -> DC N4 C0009 : score 0.048 : H : LYS NZ A0286 <- 3.11 -> DA N3 C0013 : score 2.60475 : w : SER OG A0335 <- 6.95 -> DG O6 D0024 : score 2.749 : w : ARG NH2 A0339 <- 6.72 -> DG O6 D0024 : score 2.468 : x : ALA xxxx A0124 <- 3.87 -> DT xxx D0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0167 <- 3.43 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0168 <- 3.72 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0170 <- 3.45 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0172 <- 3.61 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0201 <- 4.36 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0208 <- 3.60 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0331 <- 4.01 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0340 <- 3.43 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 3.86 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx >4e10_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=PROTELOMERASE TELA Y201A COVALENTLY COMPLEXED WITH SUBSTRATE DNA organism=AGROBACTERIUM TUMEFACIENS : V : ILE CG2 A0170 <- 3.74 -> DT C7 a0020 : score 7.19765 >4e3s_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DQTP OPPOSITE DT organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0416 <- 6.00 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : H : LYS NZ A0706 <- 2.95 -> DA N3 P0114 : score 2.69362 : w : LYS NZ A0734 <- 5.30 -> DT O2 P0112 : score 0.522 : w : LYS NZ A0734 <- 6.01 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >4e54_B:WD40_repeat-like; title=DAMAGED DNA INDUCED UV-DAMAGED DNA-BINDING PROTEIN (UV-DDB) DIMERIZATION AND ITS ROLES IN CHROMATINIZED DNA REPAIR organism=HOMO SAPIENS : H : GLN OE1 B0335 <- 2.40 -> DG N2 F0013 : score 6.05631 : x : ARG xxxx B0113 <- 4.48 -> DG xxx G0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0201 <- 3.55 -> DC xxx G0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0203 <- 4.42 -> DC xxx G0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0334 <- 3.20 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0336 <- 3.02 -> DG xxx G0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0413 <- 4.21 -> DG xxx G0010 : score x.xxxxx >4e5z_B:WD40_repeat-like; title=DAMAGED DNA INDUCED UV-DAMAGED DNA-BINDING PROTEIN (UV-DDB) DIMERIZATION AND ITS ROLES IN CHROMATINIZED DNA REPAIR organism=HOMO SAPIENS : H : GLN OE1 B0335 <- 2.49 -> DG N2 F0013 : score 5.95537 : x : MET xxxx B0177 <- 3.46 -> DC xxx G0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0334 <- 3.62 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0336 <- 3.74 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx >4e68_A:p53-like_transcription_factors;STAT;SH2_domain; title=UNPHOSPHORYLATED STAT3B CORE PROTEIN BINDING TO DSDNA organism=Mus musculus : H : ASN ND2 A0466 <- 2.75 -> DT O4 B1007 : score 5.33746 : x : SER xxxx A0465 <- 3.40 -> DT xxx B1006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0469 <- 4.03 -> DT xxx B1006 : score x.xxxxx >4e7h_A:Ribonuclease_H-like; title=PFV INTASOME PRIOR TO 3'-PROCESSING, APO FORM (UI-APO) organism=Human spumaretrovirus : H : ARG NE A0222 <- 2.80 -> DC O2 C0006 : score 2.65897 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.75 -> DC O2 C0006 : score 3.73571 : w : SER OG A0225 <- 5.84 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.76 -> DT C7 C0008 : score 6.42256 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.64 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.85 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.80 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 4.05 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >4e7i_A:Ribonuclease_H-like; title=PFV INTASOME FREEZE-TRAPPED PRIOR TO 3'-PROCESSING, MN-BOUND FORM (UI- MN) organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.98 -> DC O2 C0006 : score 2.56325 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.92 -> DC O2 C0006 : score 3.60995 : w : SER OG A0225 <- 5.63 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.76 -> DT C7 C0008 : score 6.42256 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.63 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.88 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.71 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.87 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >4e7j_A:Ribonuclease_H-like; title=PFV INTEGRASE TARGET CAPTURE COMPLEX, APO FORM (TCC-APO), AT 3.15 A RESOLUTION organism=Human spumaretrovirus : H : ARG NE A0222 <- 2.67 -> DC O2 C0006 : score 2.72811 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.56 -> DC O2 C0006 : score 3.87626 : V : PRO CG A0259 <- 3.61 -> DT C7 C0008 : score 6.66103 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.64 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 4.01 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.69 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.85 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >4e7k_A:Ribonuclease_H-like; title=PFV INTEGRASE TARGET CAPTURE COMPLEX (TCC-MN), FREEZE-TRAPPED PRIOR TO STRAND TRANSFER, AT 3.0 A RESOLUTION organism=Human spumaretrovirus : H : ARG NE A0222 <- 2.78 -> DC O2 C0006 : score 2.66961 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.89 -> DC O2 C0006 : score 3.63214 : V : PRO CG A0259 <- 3.53 -> DT C7 C0008 : score 6.78821 : x : ILE xxxx A0112 <- 4.14 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 4.39 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.80 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 4.32 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >4e7l_A:Ribonuclease_H-like; title=PFV INTEGRASE STRAND TRANSFER COMPLEX (STC-MN*) FOLLOWING REACTION IN CRYSTALLO, AT 3.0 A RESOLUTION. organism=Human spumaretrovirus : H : ARG NE A0222 <- 2.65 -> DC O2 C0006 : score 2.73874 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.50 -> DC O2 C0006 : score 3.92064 : V : PRO CG A0259 <- 3.79 -> DT C7 C0008 : score 6.37487 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.65 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 4.04 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.69 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.91 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >4e9f_A:DNA-glycosylase; title=STRUCTURE OF THE GLYCOSYLASE DOMAIN OF MBD4 BOUND TO AP SITE CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : w : SER OG A0470 <- 5.41 -> DG N2 C0006 : score 1.651 : x : ASN xxxx A0467 <- 4.33 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0468 <- 3.39 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0469 <- 3.35 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0508 <- 3.53 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0511 <- 3.26 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0512 <- 4.43 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx >4e9g_A:DNA-glycosylase; title=STRUCTURE OF THE GLYCOSYLASE DOMAIN OF MBD4 BOUND TO THYMINE CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 A0449 <- 3.06 -> DT N3 C0007 : score 3.23657 : H : GLN NE2 A0449 <- 3.22 -> DT O2 C0007 : score 3.60293 : H : TYR OH A0540 <- 2.77 -> DT O2 C0007 : score 3.23597 : x : LEU xxxx A0447 <- 3.99 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0448 <- 3.73 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0466 <- 3.48 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0467 <- 4.29 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0468 <- 3.34 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0469 <- 3.55 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0508 <- 3.40 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0511 <- 3.48 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0562 <- 3.64 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0563 <- 4.28 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >4e9h_A:DNA-glycosylase; title=STRUCTURE OF GLYCOSYLASE DOMAIN OF MBD4 BOUND TO 5HMU CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : H : THR OG1 A0469 <- 2.88 -> DG N2 D0006 : score 3.95366 : x : ASN xxxx A0467 <- 4.07 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0468 <- 3.50 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0470 <- 4.28 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0508 <- 3.40 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0511 <- 3.18 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0512 <- 3.84 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx >4ea4_A:DNA-glycosylase; title=STRUCTURE OF THE GLYCOSYLASE DOMAIN OF MBD4 BOUND TO 5HMU-CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0467 <- 5.43 -> DG N3 C0008 : score 2.566 : H : ARG NE A0468 <- 2.89 -> DG O6 D0006 : score 3.87009 : H : ARG NH2 A0468 <- 3.12 -> DG O6 D0006 : score 6.1776 : x : THR xxxx A0469 <- 3.37 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0508 <- 3.48 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0511 <- 3.19 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx >4ea5_A:DNA-glycosylase; title=STRUCTURE OF THE GLYCOSLYASE DOMAIN OF MBD4 BOUND TO A 5HMU CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0467 <- 5.48 -> DG N3 C0008 : score 2.566 : H : ARG NE A0468 <- 2.83 -> DG O6 D0006 : score 3.91738 : H : ARG NH2 A0468 <- 3.20 -> DG O6 D0006 : score 6.072 : x : THR xxxx A0469 <- 3.46 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0508 <- 3.55 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0511 <- 3.36 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0512 <- 3.89 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx >4ebc_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CONFORMATIONALLY RESTRAINED NORTH-METHANOCARBA-2'-DEOXYADENOSINE CORRECTS THE ERROR-PRONE NATURE OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA organism=Homo sapiens : x : GLU xxxx A0305 <- 3.47 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 4.42 -> DA xxx P0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 4.00 -> DA xxx P0001 : score x.xxxxx >4ebd_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CONFORMATIONALLY RESTRAINED NORTH-METHANOCARBA-2'-DEOXYADENOSINE CORRECTS THE ERROR-PRONE NATURE OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA organism=Homo sapiens : x : GLU xxxx A0305 <- 3.68 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 3.79 -> DA xxx P0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 4.21 -> DA xxx P0001 : score x.xxxxx >4ebe_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CONFORMATIONALLY RESTRAINED NORTH-METHANOCARBA-2'-DEOXYADENOSINE CORRECTS THE ERROR-PRONE NATURE OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0357 <- 6.60 -> DG O6 T0007 : score 2.756 : x : GLU xxxx A0305 <- 3.81 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 3.48 -> DA xxx P0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 4.22 -> DA xxx P0001 : score x.xxxxx >4ecq_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA- DNA TERNARY COMPLEX: AT CRYSTAL AT PH6.8(K+ MES) WITH 1 CA2+ ION organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0382 <- 5.99 -> DG N7 P0002 : score 2.063 : x : SER xxxx A0322 <- 4.32 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4ecr_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX: REACTION IN THE AT CRYSTAL AT PH 7.0 FOR 40 SEC organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.22 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 4.11 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 2.98 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >4ecs_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX: REACTION IN THE AT CRYSTAL AT PH 7.0 FOR 80 SEC organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.12 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.15 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >4ect_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX: REACTION IN THE AT CRYSTAL AT PH 7.0 FOR 140 SEC organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 A0382 <- 5.77 -> DG N7 P0002 : score 2.18 : x : SER xxxx A0322 <- 4.10 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4ecu_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX: REACTION IN THE AT CRYSTAL AT PH 7.0 FOR 200 SEC organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0382 <- 3.17 -> DG N7 P0004 : score 5.91215 : x : SER xxxx A0322 <- 4.15 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.84 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4ecv_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX: REACTION IN THE AT CRYSTAL AT PH 7.0 FOR 230 SEC organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0382 <- 6.06 -> DG N7 P0002 : score 2.063 : x : SER xxxx A0322 <- 4.13 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4ecw_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX: REACTION IN THE AT CRYSTAL AT PH 7.0 FOR 250 SEC organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.43 -> DG O6 P0004 : score 5.31683 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.20 -> DG N7 P0004 : score 5.87385 : x : SER xxxx A0322 <- 4.24 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 4.08 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx >4ecx_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX: REACTION IN THE AT CRYSTAL AT PH 7.0 FOR 300 SEC organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0382 <- 5.73 -> DG N7 P0002 : score 2.063 : x : SER xxxx A0322 <- 4.06 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4ecy_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX: AT CRYSTAL AT PH 6.0 (NA+ MES) WITH 1 CA2+ ION organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0382 <- 5.90 -> DG N7 P0002 : score 2.063 : w : ARG NH2 A0382 <- 6.11 -> DG N7 P0002 : score 2.18 : x : SER xxxx A0322 <- 4.29 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4ecz_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX: AT CRYSTAL AT PH 6.5 (NA+ MES) WITH 1 CA2+ ION organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.16 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.24 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >4ed0_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX: AT CRYSTAL AT PH 6.8 (NA+ MES) WITH 1 CA2+ ION organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0382 <- 6.00 -> DG N7 P0002 : score 2.063 : x : SER xxxx A0322 <- 4.12 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4ed1_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX: AT CRYSTAL AT PH 7.0 (NA+ MES) WITH 1 CA2+ ION organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0382 <- 5.74 -> DG N7 P0002 : score 2.063 : x : SER xxxx A0322 <- 4.17 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4ed2_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX: AT CRYSTAL AT PH 7.2 (NA+ HEPES) WITH 1 CA2+ ION organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0382 <- 6.00 -> DG N7 P0002 : score 2.063 : x : SER xxxx A0322 <- 4.14 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4ed3_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX: AT CRYSTAL AT PH 7.5 (NA+ HEPES) WITH 1 CA2+ ION organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.17 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.41 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >4ed6_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX: REACTION IN THE AT CRYSTAL AT PH 6.7 FOR 15 HR, SIDEWAY TRANSLOCATION organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 2.66 -> DT O2 T0004 : score 4.04347 : H : ARG NH2 A0061 <- 2.62 -> DT O4 T0004 : score 3.68178 : H : ARG NH1 A0382 <- 3.29 -> DG O6 P0004 : score 5.48717 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.10 -> DG N7 P0004 : score 6.00154 : x : PHE xxxx A0018 <- 3.82 -> DA xxx P0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 3.59 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0089 <- 3.07 -> DA xxx P0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0114 <- 3.76 -> DA xxx P0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 4.01 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.96 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4ed7_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX: TG CRYSTAL AT PH 7.0 (K+ MES) WITH 1 CA2+ ION organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.42 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.36 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >4ed8_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA - DNA TERNARY COMPLEX: REACTION IN THE TG CRYSTAL AT PH 7.0, NORMAL TRANSLOCATION organism=Homo sapiens : V : PHE CZ A0423 <- 3.90 -> DT C7 T0006 : score 6.937 : x : ASN xxxx A0324 <- 4.36 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.48 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >4eey_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA IN TERNARY COMPLEX WITH A CISPLATIN DNA ADDUCT organism=Homo sapiens : x : LEU xxxx A0089 <- 4.14 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.32 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.63 -> DA xxx P0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.11 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx >4efj_A:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF I-GZEII LAGLIDADG HOMING ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH DNA TARGET SITE organism=Gibberella zeae : H : GLU OE2 A0027 <- 2.40 -> DC N4 F0021 : score 5.68662 : H : ARG NH1 A0034 <- 3.13 -> DG N7 E0005 : score 5.6507 : H : ARG NH1 A0034 <- 2.75 -> DG O6 E0005 : score 6.14417 : H : ARG NH2 A0034 <- 2.54 -> DG N7 E0005 : score 6.71662 : H : ARG NH1 A0036 <- 2.83 -> DG O6 E0006 : score 6.04683 : H : ARG NH2 A0036 <- 2.73 -> DG N7 E0006 : score 6.474 : H : GLN NE2 A0040 <- 3.03 -> DG N7 F0017 : score 4.00558 : H : LYS NZ A0042 <- 2.79 -> DG O6 F0016 : score 5.79233 : H : LYS NZ A0042 <- 2.67 -> DG O6 F0017 : score 5.93107 : H : LYS NZ A0074 <- 2.77 -> DT O4 F0018 : score 3.6087 : H : ARG NH1 A0076 <- 2.99 -> DG N7 E0007 : score 5.8201 : H : ARG NH2 A0076 <- 2.99 -> DG O6 E0007 : score 6.3492 : w : SER OG A0194 <- 5.78 -> DT O4 E0019 : score 2.338 : H : ARG NH1 A0196 <- 2.77 -> DG O6 E0018 : score 6.11983 : H : ARG NH2 A0196 <- 2.88 -> DG N7 E0018 : score 6.28246 : H : HIS NE2 A0222 <- 2.78 -> DT O4 E0016 : score 5.63141 : H : HIS NE2 A0222 <- 3.14 -> DG O6 E0017 : score 7.41298 : H : ARG NE A0234 <- 2.99 -> DG N7 F0006 : score 4.25377 : H : ARG NH2 A0234 <- 2.75 -> DG O6 F0006 : score 6.666 : V : SER CB A0192 <- 3.80 -> DT C7 F0005 : score 3.13128 : V : ALA CB A0228 <- 3.83 -> DT C7 E0015 : score 5.55698 : V : SER CB A0198 <- 3.71 -> DT C7 E0016 : score 3.20174 : x : MET xxxx A0023 <- 3.33 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0025 <- 3.48 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0065 <- 2.78 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0070 <- 3.30 -> DT xxx F0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0118 <- 3.82 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0179 <- 3.88 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0183 <- 3.83 -> DA xxx E0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0190 <- 3.07 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0220 <- 4.06 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0223 <- 3.85 -> DC xxx F0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0232 <- 4.20 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx >4egy_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARAR(DBD) IN COMPLEX WITH OPERATOR ORA1 organism=Bacillus subtilis : H : ARG NH1 A0041 <- 3.00 -> DG O6 U0028 : score 5.84 : H : ARG NH2 A0041 <- 2.88 -> DG N7 U0028 : score 6.28246 : w : ARG NH1 A0041 <- 6.02 -> DA N6 T0015 : score 1.486 : H : GLN NE2 A0061 <- 2.88 -> DA N3 T0018 : score 3.96249 : H : ARG NH1 B0041 <- 3.04 -> DG O6 T0009 : score 5.79133 : H : ARG NH2 B0041 <- 2.90 -> DG N7 T0009 : score 6.25692 : w : ARG NH1 B0041 <- 6.11 -> DA N6 U0034 : score 1.486 : w : HIS ND1 B0042 <- 5.47 -> DG O6 U0032 : score 4.006 : H : GLN NE2 B0061 <- 3.11 -> DA N3 U0037 : score 3.77725 : x : GLU xxxx A0030 <- 4.25 -> DT xxx U0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0040 <- 3.88 -> DC xxx T0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0042 <- 3.41 -> DC xxx T0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0045 <- 3.59 -> DT xxx U0029 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0030 <- 4.47 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0040 <- 4.13 -> DC xxx U0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.42 -> DT xxx T0010 : score x.xxxxx >4egy_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARAR(DBD) IN COMPLEX WITH OPERATOR ORA1 organism=Bacillus subtilis : H : ARG NH1 B0041 <- 3.04 -> DG O6 T0009 : score 5.79133 : H : ARG NH2 B0041 <- 2.90 -> DG N7 T0009 : score 6.25692 : w : ARG NH1 B0041 <- 6.11 -> DA N6 U0034 : score 1.486 : w : HIS ND1 B0042 <- 5.47 -> DG O6 U0032 : score 4.006 : H : GLN NE2 B0061 <- 3.11 -> DA N3 U0037 : score 3.77725 : x : GLU xxxx B0030 <- 4.47 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0040 <- 4.13 -> DC xxx U0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.42 -> DT xxx T0010 : score x.xxxxx >4egz_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARAR(DBD) IN COMPLEX WITH OPERATOR ORR3 organism=Bacillus subtilis : H : ARG NH1 A0041 <- 3.09 -> DG O6 T0705 : score 5.7305 : H : ARG NH2 A0041 <- 2.62 -> DG N7 T0705 : score 6.61446 : H : GLN NE2 A0061 <- 2.99 -> DA N3 U0716 : score 3.8739 : x : GLU xxxx A0030 <- 4.14 -> DT xxx T0704 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0040 <- 4.09 -> DC xxx U0710 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0045 <- 3.42 -> DT xxx T0706 : score x.xxxxx >4egz_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARAR(DBD) IN COMPLEX WITH OPERATOR ORR3 organism=Bacillus subtilis : H : ARG NH1 A0041 <- 3.09 -> DG O6 T0705 : score 5.7305 : H : ARG NH2 A0041 <- 2.62 -> DG N7 T0705 : score 6.61446 : H : GLN NE2 A0061 <- 2.99 -> DA N3 U0716 : score 3.8739 : H : ARG NH1 B0041 <- 3.03 -> DG O6 U0705 : score 5.8035 : H : ARG NH2 B0041 <- 2.66 -> DG N7 U0705 : score 6.56338 : H : GLN NE2 B0061 <- 2.47 -> DT O2 T0716 : score 4.19293 : V : HIS CG B0042 <- 3.55 -> DT C7 T0710 : score 3.18641 : x : GLU xxxx A0030 <- 4.14 -> DT xxx T0704 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0040 <- 4.09 -> DC xxx U0710 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0045 <- 3.42 -> DT xxx T0706 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0030 <- 4.26 -> DT xxx U0704 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0040 <- 3.67 -> DT xxx T0710 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.47 -> DT xxx U0706 : score x.xxxxx >4ejy_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURE OF MBOGG1 IN COMPLEX WITH HIGH AFFINITY DNA LIGAND organism=Thermoanaerobacter tengcongensis : w : GLN NE2 A0125 <- 5.77 -> DT O2 C0021 : score 1.565 : w : ASN OD1 A0127 <- 6.05 -> DT O2 D0010 : score 1.953 : H : ARG NH1 A0179 <- 2.85 -> DC O2 D0009 : score 3.6135 : H : ARG NH2 A0179 <- 3.10 -> DC N3 D0009 : score 2.15356 : w : TYR OH A0182 <- 5.67 -> DT O2 C0021 : score 3.068 : w : TYR OH A0182 <- 6.80 -> DC O2 C0022 : score 1.343 : x : ASN xxxx A0126 <- 3.13 -> DG xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 3.23 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0178 <- 3.66 -> DG xxx C0020 : score x.xxxxx >4ejz_A:DNA-glycosylase;TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURE OF MBOGG1 IN COMPLEX WITH LOW AFFINITY DNA LIGAND organism=Thermoanaerobacter tengcongensis : H : ARG NH1 A0179 <- 2.83 -> DT O2 D0009 : score 4.28057 : x : GLN xxxx A0125 <- 4.14 -> DG xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0126 <- 3.22 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 3.93 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0178 <- 3.55 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx >4elt_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=SNAPSHOT OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS PROCESSING MODIFIED PYRIMIDINES organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.80 -> DC O2 B0109 : score 2.94615 : w : LYS NZ A0540 <- 5.65 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 6.15 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.67 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 6.01 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.60 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.78 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.25 -> DG N3 B0110 : score 4.45433 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.81 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : ARG xxxx A0587 <- 4.49 -> DC xxx B0111 : score x.xxxxx >4elu_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=SNAPSHOT OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS PROCESSING MODIFIED PYRIMIDINES organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.82 -> DC O2 B0109 : score 2.93437 : w : LYS NZ A0540 <- 5.64 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 5.67 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.69 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.80 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.59 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN OD1 A0583 <- 6.81 -> DC O2 C0209 : score 2.172 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.60 -> DG N3 C0208 : score 3.377 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.58 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : ARG xxxx A0587 <- 3.92 -> DC xxx B0111 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0754 <- 4.41 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >4elv_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=SNAPSHOT OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS PROCESSING MODIFIED PYRIMIDINES organism=THERMUS AQUATICUS : H : LYS NZ A0540 <- 2.76 -> DC O2 B0109 : score 2.96972 : w : LYS NZ A0540 <- 5.57 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.98 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.56 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.89 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.91 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.74 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.75 -> DG N3 C0208 : score 3.377 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.67 -> DC O2 B0111 : score 3.208 >4enj_A:Methylated_DNA-protein_cysteine_methyltransferase,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. POMBE ATL1 IN COMPLEX WITH DAMAGED DNA CONTAINING O6-HYDROXYETHYLGUANINE organism=Schizosaccharomyces pombe : H : ARG NH2 A0039 <- 2.93 -> DC O2 C0021 : score 3.60255 : x : GLN xxxx A0040 <- 3.74 -> DC xxx C0022 : score x.xxxxx >4enk_A:Methylated_DNA-protein_cysteine_methyltransferase,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. POMBE ATL1 IN COMPLEX WITH DAMAGED DNA CONTAINING O6-PROPYLGUANINE organism=Schizosaccharomyces pombe : x : ARG xxxx A0039 <- 2.46 -> DC xxx C0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0040 <- 4.04 -> DC xxx C0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0043 <- 4.30 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx >4enm_A:Methylated_DNA-protein_cysteine_methyltransferase,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. POMBE ATL1 IN COMPLEX WITH DAMAGED DNA CONTAINING O6-BENZYLGUANINE organism=Schizosaccharomyces pombe : H : ARG NH2 A0039 <- 2.72 -> DC N3 C0021 : score 2.32768 : x : GLN xxxx A0040 <- 3.57 -> DC xxx C0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0043 <- 3.38 -> DA xxx C0023 : score x.xxxxx >4enn_B:Methylated_DNA-protein_cysteine_methyltransferase,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. POMBE ATL1 IN COMPLEX WITH DAMAGED DNA CONTAINING O6-CARBOXYMETHYLGUANINE organism=SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE 972H- : H : ARG NH1 B0039 <- 2.99 -> DC N3 F0002 : score 1.47877 : H : ARG NH2 B0039 <- 3.19 -> DC O2 F0002 : score 3.41022 >4eot_A:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors;Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MAFA HOMODIMER BOUND TO THE CONSENSUS MARE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0260 <- 3.00 -> DG N7 C0006 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0260 <- 2.57 -> DG O6 C0006 : score 6.9036 : H : ASN OD1 A0264 <- 3.14 -> DC N4 C0007 : score 3.90843 : V : ALA CB A0268 <- 3.77 -> DT C7 D0011 : score 5.64097 : x : TYR xxxx A0267 <- 3.38 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0272 <- 2.86 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx >4eot_AB:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors;Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MAFA HOMODIMER BOUND TO THE CONSENSUS MARE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0260 <- 3.00 -> DG N7 C0006 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0260 <- 2.57 -> DG O6 C0006 : score 6.9036 : H : ASN OD1 A0264 <- 3.14 -> DC N4 C0007 : score 3.90843 : H : ARG NH1 B0260 <- 2.98 -> DG N7 D0005 : score 5.8322 : H : ARG NH2 B0260 <- 3.26 -> DG N7 D0005 : score 5.79723 : H : ARG NH2 B0260 <- 2.61 -> DG O6 D0005 : score 6.8508 : H : ASN OD1 B0264 <- 3.19 -> DC N4 D0006 : score 3.86649 : H : ARG NH2 B0272 <- 2.48 -> DG N7 C0011 : score 6.79323 A : H : ARG NH2 B0272 <- 3.08 -> DG O6 C0011 : score 6.2304 A : V : ALA CB A0268 <- 3.77 -> DT C7 D0011 : score 5.64097 : V : ALA CB B0268 <- 3.66 -> DT C7 C0012 : score 5.79494 : x : TYR xxxx A0267 <- 3.38 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0272 <- 2.86 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0267 <- 3.44 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0271 <- 4.07 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >4er8_A:Transposase_IS200-like; title=STRUCTURE OF THE REP ASSOCIATES TYROSINE TRANSPOSASE BOUND TO A REP HAIRPIN organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0082 <- 3.14 -> DC N3 B0027 : score 0.541277 : H : ARG NH1 A0097 <- 3.02 -> DG N7 B0032 : score 5.7838 : x : ARG xxxx A0078 <- 3.30 -> DT xxx B0029 : score x.xxxxx >4esj_A:Zinc_beta-ribbon; title=RESTRICTION ENDONUCLEASE DPNI IN COMPLEX WITH TARGET DNA organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : H : LYS NZ A0229 <- 2.98 -> DG N7 D0004 : score 5.19201 : H : ARG NE A0231 <- 3.12 -> DG N7 C0004 : score 4.1388 : H : ARG NH2 A0231 <- 2.95 -> DG O6 C0004 : score 6.402 : w : ARG NH2 A0231 <- 5.82 -> DG O6 C0003 : score 2.468 : H : GLN NE2 A0232 <- 2.89 -> DG O6 D0004 : score 5.70064 : H : GLN NE2 A0232 <- 2.92 -> DT O4 C0006 : score 5.06644 : V : HIS CG A0225 <- 3.81 -> DT C7 D0006 : score 2.99148 : x : SER xxxx A0185 <- 3.62 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0223 <- 3.73 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0228 <- 3.32 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0235 <- 3.55 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx >4esv_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;N-terminal_domain_of_DnaB_helicase; title=A NEW TWIST ON THE TRANSLOCATION MECHANISM OF HELICASES FROM THE STRUCTURE OF DNAB WITH ITS SUBSTRATES organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ASN ND2 F0334 <- 3.00 -> DT O2 V0003 : score 4.55631 : x : ASN xxxx A0334 <- 3.76 -> DT xxx V0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0334 <- 4.12 -> DT xxx V0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0365 <- 4.35 -> DT xxx V0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0334 <- 3.82 -> DT xxx V0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0336 <- 4.27 -> DT xxx V0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0334 <- 3.86 -> DT xxx V0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0336 <- 4.33 -> DT xxx V0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0334 <- 3.71 -> DT xxx V0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0336 <- 4.41 -> DT xxx V0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0336 <- 3.60 -> DT xxx V0003 : score x.xxxxx >4esv_GHIJKL:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;N-terminal_domain_of_DnaB_helicase; title=A NEW TWIST ON THE TRANSLOCATION MECHANISM OF HELICASES FROM THE STRUCTURE OF DNAB WITH ITS SUBSTRATES organism=Geobacillus stearothermophilus : x : GLN xxxx H0336 <- 4.20 -> DT xxx W0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0334 <- 3.63 -> DT xxx W0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx K0334 <- 4.37 -> DT xxx W0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0334 <- 3.30 -> DT xxx W0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0336 <- 3.97 -> DT xxx W0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0371 <- 3.90 -> DT xxx W0013 : score x.xxxxx >4esv_L:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;N-terminal_domain_of_DnaB_helicase; title=A NEW TWIST ON THE TRANSLOCATION MECHANISM OF HELICASES FROM THE STRUCTURE OF DNAB WITH ITS SUBSTRATES organism=Geobacillus stearothermophilus : x : ASN xxxx L0334 <- 3.30 -> DT xxx W0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0336 <- 3.97 -> DT xxx W0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0371 <- 3.90 -> DT xxx W0013 : score x.xxxxx >4euw_A:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A HMG DOMAIN OF TRANSCRIPTION FACTOR SOX-9 BOUND TO DNA (SOX-9/DNA) FROM HOMO SAPIENS AT 2.77 A RESOLUTION organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0107 <- 2.98 -> DT O2 C0005 : score 4.15138 : H : ARG NH1 A0107 <- 2.75 -> DC O2 C0006 : score 3.6865 : H : ASN ND2 A0110 <- 2.80 -> DT O2 B0006 : score 4.74615 : H : ASN ND2 A0110 <- 3.07 -> DG N3 B0007 : score 4.63055 : H : SER OG A0136 <- 2.58 -> DT O2 B0004 : score 3.86012 : H : SER OG A0136 <- 2.90 -> DT O2 B0005 : score 3.62349 : H : TYR OH A0174 <- 3.21 -> DA N3 B0008 : score 3.81088 : x : PHE xxxx A0112 <- 3.56 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0113 <- 3.43 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0120 <- 3.43 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0131 <- 3.42 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0132 <- 3.39 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0133 <- 3.81 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >4evv_A:DNA-glycosylase; title=MOUSE MBD4 GLYCOSYLASE DOMAIN IN COMPLEX WITH A G:T MISMATCH organism=Mus musculus : H : GLN OE1 A0423 <- 3.00 -> DT N3 C0017 : score 3.27754 : H : GLN NE2 A0423 <- 2.81 -> DT O2 C0017 : score 3.92547 : H : TYR OH A0514 <- 2.49 -> DT O2 C0017 : score 3.4161 : x : LEU xxxx A0421 <- 3.96 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0422 <- 3.80 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0440 <- 3.43 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0441 <- 4.31 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.28 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0443 <- 3.23 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0482 <- 3.50 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0485 <- 4.01 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0534 <- 4.09 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0536 <- 3.55 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx >4ew0_A:DNA-glycosylase; title=MOUSE MBD4 GLYCOSYLASE DOMAIN IN COMPLEX WITH A G:5HMU (5- HYDROXYMETHYLURACIL) MISMATCH organism=Mus musculus : H : THR OG1 A0443 <- 3.08 -> DG N2 B0006 : score 3.79294 : x : ASN xxxx A0441 <- 4.22 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.44 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0482 <- 3.41 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0485 <- 3.50 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0486 <- 4.37 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx >4ew4_A:DNA-glycosylase; title=MOUSE MBD4 GLYCOSYLASE DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING A RIBOSE SUGAR organism=Mus musculus : H : THR OG1 A0443 <- 3.06 -> DG N2 B0006 : score 3.80902 : x : ASN xxxx A0441 <- 4.00 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.25 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0482 <- 3.47 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx >4eyh_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE IOTA INCORPORATING DCTP OPPOSITE N- (DEOXYGUANOSIN-8-YL)-1-AMINOPYRENE LESION organism=Homo sapiens : x : LEU xxxx B0123 <- 4.49 -> DC xxx P0872 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0305 <- 3.62 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0361 <- 4.34 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >4eyi_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE IOTA INCORPORATING DATP OPPOSITE N- (DEOXYGUANOSIN-8-YL)-1-AMINOPYRENE LESION organism=Homo sapiens : x : GLU xxxx B0305 <- 4.19 -> DG xxx T0842 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0357 <- 3.91 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0361 <- 4.49 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >4ez6_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT COMPLEX 1 organism=Geobacillus kaustophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.86 -> DT O2 F0008 : score 3.54413 : w : LYS NZ D0582 <- 6.07 -> DC O2 E0026 : score 1.3 : w : TYR OH D0587 <- 5.84 -> DC O2 E0026 : score 1.343 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.80 -> DG N3 F0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.86 -> DA N3 F0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.94 -> DT O2 E0027 : score 4.61326 : w : ASN ND2 D0724 <- 5.29 -> DG N7 F0003 : score 3.259 : w : HIS NE2 D0829 <- 5.61 -> DC O2 E0028 : score 3.208 : x : ARG xxxx D0629 <- 3.70 -> DC xxx E0028 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0707 <- 4.01 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0710 <- 3.90 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.30 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0716 <- 3.74 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0793 <- 4.31 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0797 <- 3.40 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx >4ez9_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BACILLUS DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT COMPLEX 2 organism=Geobacillus kaustophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.75 -> DT O2 C0008 : score 3.62305 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.60 -> DG N3 C0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.81 -> DA N3 C0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.93 -> DT O2 B0027 : score 4.62275 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.64 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : GLN xxxx A0797 <- 4.43 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx >4f2j_C:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZNF217 BOUND TO DNA, P6522 CRYSTAL FORM organism=Homo sapiens : H : THR OG1 C0512 <- 2.22 -> DG O6 A0006 : score 4.70437 : H : ARG NH2 C0515 <- 2.81 -> DG N7 A0006 : score 6.37185 : x : ARG xxxx C0481 <- 3.16 -> DG xxx A0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0484 <- 3.72 -> DG xxx A0003 : score x.xxxxx >4f2r_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT COMPLEX 3 organism=Geobacillus kaustophilus : H : LYS NZ D0582 <- 3.26 -> DT O2 F0008 : score 3.25716 : w : TYR OH D0587 <- 6.04 -> DC O2 E0026 : score 1.343 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.81 -> DG N3 F0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.96 -> DA N3 F0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.84 -> DT O2 E0027 : score 4.70818 : w : HIS NE2 D0829 <- 5.61 -> DC O2 E0028 : score 3.208 : x : ARG xxxx D0629 <- 3.10 -> DC xxx E0028 : score x.xxxxx >4f2s_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT COMPLEX 4 organism=Geobacillus kaustophilus : w : LYS NZ D0582 <- 6.09 -> DC O2 F0009 : score 1.3 : w : TYR OH D0587 <- 6.03 -> DC O2 E0026 : score 1.343 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.85 -> DG N3 F0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.93 -> DA N3 F0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.86 -> DT O2 E0027 : score 4.6892 : w : HIS NE2 D0829 <- 5.58 -> DC O2 E0028 : score 3.208 >4f3o_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT COMPLEX 5 organism=Geobacillus kaustophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.86 -> DT O2 C0008 : score 3.54413 : w : LYS NZ A0582 <- 5.82 -> DC O2 B0026 : score 1.3 : w : TYR OH A0587 <- 5.97 -> DC O2 B0026 : score 1.343 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.75 -> DG N3 C0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.82 -> DA N3 C0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.95 -> DT O2 B0027 : score 4.60377 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.74 -> DC O2 B0028 : score 3.208 : x : GLN xxxx A0797 <- 4.43 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx >4f41_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=PROTELOMERASE TELA MUTANT R255A COMPLEXED WITH CTTG HAIRPIN DNA organism=AGROBACTERIUM TUMEFACIENS : H : ARG NE A0126 <- 3.09 -> DA N3 C0027 : score 1.98062 : H : SER OG A0171 <- 3.07 -> DA N6 C0011 : score 3.1121 : w : THR OG1 A0174 <- 6.08 -> DA N6 C0021 : score 3.251 : H : ARG NH2 A0205 <- 3.00 -> DG N7 C0018 : score 6.12923 : H : LYS NZ A0286 <- 3.32 -> DA N3 C0013 : score 2.48812 : w : LYS NZ A0286 <- 6.38 -> DT O2 C0022 : score 0.522 : w : LYS NZ A0288 <- 5.43 -> DT O2 C0020 : score 0.522 : V : ILE CG2 A0170 <- 3.52 -> DT C7 C0020 : score 7.58767 : x : ALA xxxx A0124 <- 3.23 -> DT xxx C0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0167 <- 3.49 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0168 <- 3.43 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0172 <- 3.49 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0201 <- 3.34 -> DA xxx C0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0208 <- 3.02 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0331 <- 3.74 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0335 <- 3.88 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0339 <- 3.31 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0340 <- 3.89 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 3.83 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0401 <- 4.28 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx >4f43_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=PROTELOMERASE TELA MUTANT R255A COMPLEXED WITH CAAG HAIRPIN DNA organism=AGROBACTERIUM TUMEFACIENS : H : ARG NE A0126 <- 2.85 -> DA N3 C0027 : score 2.08154 : H : SER OG A0171 <- 3.30 -> DA N6 C0011 : score 2.96077 : w : THR OG1 A0174 <- 6.19 -> DA N6 C0021 : score 3.251 : H : LYS NZ A0286 <- 2.96 -> DA N3 C0013 : score 2.68806 : w : LYS NZ A0286 <- 6.45 -> DT O2 C0022 : score 0.522 : H : LYS NZ A0288 <- 3.15 -> DC O2 C0015 : score 2.73992 : w : LYS NZ A0288 <- 5.63 -> DA N3 C0019 : score 1.538 : w : ARG NE A0339 <- 5.30 -> DG N7 C0024 : score 1.593 : V : ILE CG2 A0170 <- 3.52 -> DT C7 C0020 : score 7.58767 : x : ALA xxxx A0124 <- 3.21 -> DT xxx C0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0167 <- 3.46 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0168 <- 3.44 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0172 <- 3.46 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0201 <- 3.81 -> DA xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0205 <- 4.35 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0208 <- 3.17 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0331 <- 4.05 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0335 <- 4.18 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0340 <- 3.95 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 3.76 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0401 <- 4.42 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx >4f4k_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT COMPLEX 6 organism=Geobacillus kaustophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.79 -> DT O2 F0008 : score 3.59435 : w : LYS NZ D0582 <- 5.96 -> DC O2 E0026 : score 1.3 : w : TYR OH D0587 <- 5.87 -> DC O2 E0026 : score 1.343 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.90 -> DG N3 F0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.91 -> DA N3 F0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.92 -> DT O2 E0027 : score 4.63225 : w : GLU OE2 D0658 <- 6.11 -> DC O2 F0004 : score 1.988 : w : ASN ND2 D0793 <- 6.44 -> DC O2 F0004 : score 1.885 : w : GLN NE2 D0797 <- 6.40 -> DC O2 F0004 : score 2.699 : w : HIS NE2 D0829 <- 5.65 -> DC O2 E0028 : score 3.208 : x : ARG xxxx D0629 <- 3.75 -> DC xxx E0028 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0707 <- 3.78 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.45 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0716 <- 3.96 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0724 <- 3.85 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx >4f4w_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=Y-FAMILY DNA POLYMERASE CHIMERA DBH-DPO4-DPO4 #1 organism=? : w : LYS NZ A0244 <- 5.85 -> DT O4 T0011 : score 1.7 : w : LYS NZ A0244 <- 6.07 -> DA N7 T0010 : score 1.655 : H : ARG NH1 A0337 <- 2.91 -> DG O6 T0009 : score 5.9495 : H : ARG NH2 A0337 <- 2.95 -> DG N7 T0009 : score 6.19308 : w : LYS NZ A0340 <- 5.40 -> DG N7 P0007 : score 2.519 : x : HIS xxxx A0286 <- 4.06 -> DA xxx P0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0298 <- 3.57 -> DT xxx P0009 : score x.xxxxx >4f4x_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=Y-FAMILY DNA POLYMERASE CHIMERA DBH-DPO4-DPO4 #2 organism=? : w : LYS NZ A0078 <- 5.44 -> DC O2 T0006 : score 1.3 : w : SER OG A0298 <- 5.88 -> DC N4 P0010 : score 2.105 : H : ARG NH1 A0337 <- 2.69 -> DG O6 T0010 : score 6.21717 : H : ARG NH2 A0337 <- 3.09 -> DG N7 T0010 : score 6.01431 : x : ARG xxxx A0243 <- 3.25 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0249 <- 4.30 -> DC xxx T0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0286 <- 4.21 -> DA xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0296 <- 3.82 -> DC xxx P0010 : score x.xxxxx >4f4y_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=Y-FAMILY DNA POLYMERASE CHIMERA DBH-DPO4-DBH organism=? : x : VAL xxxx B0032 <- 3.88 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0042 <- 3.69 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0060 <- 3.61 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0222 <- 3.44 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0249 <- 3.45 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0293 <- 3.46 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0297 <- 3.53 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0333 <- 3.32 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx >4f4z_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=Y-FAMILY DNA POLYMERASE CHIMERA DPO4-DPO4-DBH organism=? : w : TYR OH A0248 <- 6.59 -> DC N4 T0009 : score 1.343 : w : SER OG A0296 <- 6.83 -> DA N6 P0008 : score 2.209 : x : ALA xxxx A0042 <- 3.41 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 3.62 -> DG xxx P0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 3.53 -> DT xxx T0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0282 <- 3.92 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0332 <- 3.76 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0336 <- 4.07 -> DT xxx T0010 : score x.xxxxx >4f50_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=Y-FAMILY DNA POLYMERASE CHIMERA DBH-DBH-DPO4 organism=? : x : ALA xxxx A0057 <- 3.73 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx >4f5n_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=OPEN TERNARY COMPLEX OF R283K DNA POLYMERASE BETA WITH A METAL FREE DCTP ANALOG organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.36 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.73 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.52 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4f5o_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=OPEN TERNARY COMPLEX OF R283K DNA POLYMERASE BETA WITH A ONE METAL BOUND DCTP ANALOG organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.36 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.79 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.45 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4f5p_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=OPEN TERNARY MISMATCH COMPLEX OF R283K DNA POLYMERASE BETA WITH A DATP ANALOG organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.32 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.78 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.47 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4f5q_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CLOSED TERNARY COMPLEX OF R283K DNA POLYMERASE BETA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.51 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.66 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.46 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4f5r_B:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=OPEN AND CLOSED TERNARY COMPLEX OF R283K DNA POLYMERASE BETA WITH A DCTP ANALOG IN THE SAME ASYMMETRIC UNIT organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx B0034 <- 3.30 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0035 <- 3.89 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0038 <- 3.52 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx >4f6m_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF KAISO ZINC FINGER DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH KAISO BINDING SITE DNA organism=Homo sapiens : w : THR OG1 A0507 <- 5.74 -> DC N4 D0011 : score 2.558 : w : SER OG A0508 <- 5.78 -> DC N4 D0011 : score 2.105 : H : ARG NH1 A0511 <- 2.85 -> DG O6 E0028 : score 6.0225 : H : ARG NH1 A0511 <- 3.02 -> DG O6 D0010 : score 5.81567 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.17 -> DG N7 D0010 : score 5.91215 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.09 -> DG O6 D0010 : score 6.2172 : H : GLU OE1 A0535 <- 2.74 -> DC N4 E0029 : score 5.83716 : H : GLN NE2 A0563 <- 3.02 -> DG O6 E0032 : score 5.5497 : w : GLN OE1 A0563 <- 5.72 -> DC N4 D0007 : score 3.488 : w : GLN NE2 A0563 <- 5.93 -> DG O6 E0031 : score 2.87 : H : ARG NH1 A0595 <- 2.85 -> DT O2 E0026 : score 4.26335 : H : ARG NH2 A0595 <- 2.68 -> DG N3 E0027 : score 3.6969 : w : ARG NH1 A0595 <- 6.49 -> DA N3 D0014 : score 2.585 : V : LEU CD2 A0533 <- 3.72 -> DT C7 D0009 : score 5.84591 : x : TYR xxxx A0536 <- 3.77 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0561 <- 3.68 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0562 <- 3.59 -> DG xxx E0031 : score x.xxxxx >4f6n_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF KAISO ZINC FINGER DNA BINDING PROTEIN IN COMPLEX WITH METHYLATED CPG SITE DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0511 <- 2.84 -> DG O6 E0029 : score 6.03467 : H : ARG NH1 A0511 <- 3.04 -> DG O6 D0009 : score 5.79133 : H : ARG NH2 A0511 <- 2.82 -> DG O6 D0009 : score 6.5736 : H : ARG NH2 A0595 <- 2.77 -> DA N3 E0027 : score 3.25918 : H : TYR OH 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x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.53 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx >4fb3_A:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=POLYOMAVIRUS T-AG BINDS SYMMETRICAL REPEATS AT THE VIRAL ORIGIN IN AN ASYMMETRICAL MANNER organism=Mouse polyomavirus : H : SER OG A0306 <- 2.63 -> DG N7 W0012 : score 4.63444 : H : ARG NH2 A0357 <- 2.53 -> DG N7 C0013 : score 6.72938 : x : ASN xxxx A0307 <- 3.22 -> DG xxx W0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0308 <- 3.18 -> DG xxx W0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0309 <- 3.75 -> DC xxx C0014 : score x.xxxxx >4fb3_ABE:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=POLYOMAVIRUS T-AG BINDS SYMMETRICAL REPEATS AT THE VIRAL ORIGIN IN AN ASYMMETRICAL MANNER organism=Mouse polyomavirus : H : SER OG A0306 <- 2.63 -> DG N7 W0012 : score 4.63444 : H : ARG NH2 A0357 <- 2.53 -> DG N7 C0013 : score 6.72938 : H : SER OG B0306 <- 3.36 -> DA N7 C0004 : score 3.96412 : H : LYS NZ B0308 <- 2.49 -> DG N7 C0003 : score 5.71982 : H : SER OG E0306 <- 2.78 -> DA N7 W0005 : score 4.48196 : H : LYS NZ E0308 <- 2.41 -> DG N7 W0004 : score 5.806 : H : ARG NE E0357 <- 3.25 -> DG N7 C0020 : score 4.02383 : H : ARG NH2 E0357 <- 2.84 -> DG N7 C0019 : score 6.33354 : H : ARG NH2 E0357 <- 2.87 -> DG O6 C0020 : score 6.5076 : x : ASN xxxx A0307 <- 3.22 -> DG xxx W0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0308 <- 3.18 -> DG xxx W0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0309 <- 3.75 -> DC xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0307 <- 3.36 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0309 <- 4.33 -> DC xxx W0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0357 <- 3.03 -> DG xxx W0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0307 <- 3.27 -> DG xxx W0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0309 <- 4.34 -> DG xxx C0020 : score x.xxxxx >4fbt_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 POST-INSERTION COMPLEX WITH THE N-(DEOXYGUANOSIN-8-YL)-1- AMINOPYRENE LESION organism=Sulfolobus solfataricus : x : VAL xxxx A0032 <- 3.56 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.37 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0297 <- 3.92 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.97 -> DA xxx T0008 : score x.xxxxx >4fbu_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DPO4 POLYMERASE PRE-INSERTION BINARY COMPLEX WITH THE N- (DEOXYGUANOSIN-8-YL)-1-AMINOPYRENE LESION organism=Sulfolobus solfataricus : w : TYR OH B0012 <- 5.13 -> DC O2 D0014 : score 1.343 : w : ARG NE B0336 <- 5.05 -> DG O6 C0008 : score 1.369 : w : ARG NH2 B0336 <- 5.35 -> DG O6 C0008 : score 2.468 : x : VAL xxxx B0032 <- 3.76 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0042 <- 3.74 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0044 <- 3.84 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0057 <- 3.56 -> DC xxx D0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0076 <- 4.18 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0285 <- 4.21 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0339 <- 3.53 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx >4fcy_AB:Ribonuclease_H-like;Homeodomain-like;mu_transposase,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE BACTERIOPHAGE MU TRANSPOSOSOME organism=ENTEROBACTERIA PHAGE MU : H : ASP OD2 B0147 <- 2.40 -> DC N4 D0048 : score 6.696 : H : ARG NH1 B0201 <- 3.00 -> DG N7 D0033 : score 5.808 : V : PHE CD2 B0225 <- 3.83 -> DT C7 D0035 : score 6.46296 : x : ARG xxxx A0146 <- 4.05 -> DT xxx C0027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0147 <- 3.87 -> DC xxx C0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0150 <- 3.50 -> DT xxx C0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 2.95 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0226 <- 3.84 -> DT xxx C0040 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0143 <- 3.31 -> DC xxx D0048 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0144 <- 4.24 -> DG xxx D0047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0146 <- 3.29 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0150 <- 3.24 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0220 <- 2.88 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0221 <- 4.11 -> DA xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0222 <- 3.84 -> DA xxx C0020 : score x.xxxxx >4fcy_B:Ribonuclease_H-like;Homeodomain-like;mu_transposase,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE BACTERIOPHAGE MU TRANSPOSOSOME organism=ENTEROBACTERIA PHAGE MU : H : ASP OD2 B0147 <- 2.40 -> DC N4 D0048 : score 6.696 : H : ARG NH1 B0201 <- 3.00 -> DG N7 D0033 : score 5.808 : V : PHE CD2 B0225 <- 3.83 -> DT C7 D0035 : score 6.46296 : x : SER xxxx B0143 <- 3.31 -> DC xxx D0048 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0144 <- 4.24 -> DG xxx D0047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0146 <- 3.29 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0150 <- 3.24 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0220 <- 2.88 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0221 <- 4.11 -> DA xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0222 <- 3.84 -> DA xxx C0020 : score x.xxxxx >4ff1_A: title=N4 MINI-VRNAP TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX, 1 MIN AFTER SOAKING GTP, ATP AND MN organism=Enterobacteria phage N4 : H : LYS NZ A0114 <- 2.75 -> DG N7 C0015 : score 5.43976 : H : ARG NH1 A0119 <- 2.84 -> DG O6 C0016 : score 6.03467 : H : ARG NH2 A0119 <- 3.08 -> DG N7 C0016 : score 6.02708 : H : THR OG1 A0202 <- 2.89 -> DA N3 C0009 : score 1.32948 : H : THR OG1 A0269 <- 3.00 -> DG N2 C0010 : score 3.85723 : H : THR OG1 A0269 <- 3.39 -> DG N3 C0010 : score 1.51975 : H : ASP OD2 A0901 <- 3.15 -> DC N4 C0014 : score 5.766 : H : ARG NH1 A0904 <- 2.79 -> DG O6 C0013 : score 6.0955 : H : ARG NH2 A0904 <- 2.90 -> DG N7 C0013 : score 6.25692 : x : VAL xxxx A0116 <- 4.22 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0129 <- 3.27 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0171 <- 3.40 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0173 <- 3.65 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0174 <- 3.39 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0177 <- 3.37 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0181 <- 3.39 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLN 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TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX, 2 MIN AFTER SOAKING GTP, ATP AND MN organism=Enterobacteria phage N4 : H : LYS NZ A0114 <- 2.69 -> DG N7 C0015 : score 5.50439 : H : ARG NH1 A0119 <- 2.87 -> DG O6 C0016 : score 5.99817 : H : ARG NH2 A0119 <- 3.05 -> DG N7 C0016 : score 6.06538 : w : ASP OD2 A0174 <- 5.62 -> DA N7 C0006 : score 2.024 : H : THR OG1 A0202 <- 3.30 -> DA N3 C0009 : score 1.21846 : w : GLU OE2 A0205 <- 5.75 -> DA N6 C0008 : score 2.785 : H : THR OG1 A0269 <- 3.31 -> DG N2 C0010 : score 3.60812 : w : ARG NH1 A0424 <- 5.88 -> DA N3 C0006 : score 2.585 : H : LYS NZ A0688 <- 3.14 -> DT O4 C0004 : score 3.34325 : H : ASP OD2 A0901 <- 3.00 -> DC N4 C0014 : score 5.952 : w : ASP OD1 A0901 <- 6.18 -> DG O6 C0018 : score 3.411 : H : ARG NH1 A0904 <- 2.88 -> DG O6 C0013 : score 5.986 : H : ARG NH2 A0904 <- 2.87 -> DG N7 C0013 : score 6.29523 : w : GLN OE1 A0914 <- 6.42 -> DT O2 C0003 : score 2.481 : V : VAL CG1 A0917 <- 3.90 -> DT C7 C0003 : score 5.909 : x : VAL xxxx A0116 <- 4.17 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x.xxxxx : x : GLN xxxx A0821 <- 3.97 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0925 <- 3.80 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >4ff3_B: title=N4 MINI-VRNAP TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX, 3 MIN AFTER SOAKING GTP, ATP AND MN organism=Enterobacteria phage N4 : H : LYS NZ B0114 <- 2.59 -> DG N7 D0015 : score 5.61211 : H : ARG NH1 B0119 <- 2.94 -> DG O6 D0016 : score 5.913 : H : ARG NH2 B0119 <- 3.01 -> DG N7 D0016 : score 6.11646 : H : ASP OD2 B0174 <- 3.14 -> DA N6 D0006 : score 3.73039 : H : THR OG1 B0202 <- 2.81 -> DA N3 D0009 : score 1.35114 : w : GLU OE2 B0205 <- 5.57 -> DA N6 D0008 : score 2.785 : H : THR OG1 B0269 <- 2.80 -> DG N2 D0010 : score 4.01795 : H : ASP OD2 B0901 <- 2.86 -> DC N4 D0014 : score 6.1256 : w : ASP OD1 B0901 <- 6.06 -> DG O6 D0018 : score 3.411 : H : ARG NH1 B0904 <- 2.91 -> DG O6 D0013 : score 5.9495 : H : ARG NH2 B0904 <- 2.73 -> DG N7 D0013 : score 6.474 : x : VAL xxxx B0116 <- 3.93 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0129 <- 3.39 -> DG xxx 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x : ILE xxxx B0925 <- 3.63 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx >4ff4_A: title=N4 MINI-VRNAP TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX, 4 MIN AFTER SOAKING GTP, ATP AND MN organism=Enterobacteria phage N4 : H : LYS NZ A0114 <- 2.70 -> DG N7 C0015 : score 5.49362 : H : ARG NH1 A0119 <- 2.94 -> DG O6 C0016 : score 5.913 : H : ARG NH2 A0119 <- 3.06 -> DG N7 C0016 : score 6.05262 : H : THR OG1 A0202 <- 2.96 -> DA N3 C0009 : score 1.31052 : H : THR OG1 A0269 <- 3.03 -> DG N2 C0010 : score 3.83312 : H : THR OG1 A0269 <- 3.35 -> DG N3 C0010 : score 1.53354 : H : ASP OD2 A0901 <- 3.05 -> DC N4 C0014 : score 5.89 : w : ASP OD1 A0901 <- 5.99 -> DG O6 C0018 : score 3.411 : H : ARG NH1 A0904 <- 2.95 -> DG O6 C0013 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0904 <- 2.86 -> DG N7 C0013 : score 6.308 : V : VAL CG1 A0917 <- 3.80 -> DT C7 C0003 : score 6.06051 : x : VAL xxxx A0116 <- 4.15 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0129 <- 3.24 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0171 <- 3.34 -> DA xxx C0007 : 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ND2 A0153 <- 3.20 -> DG O6 Y0019 : score 5.18738 : H : ARG NE A0154 <- 3.18 -> DG N7 Y0016 : score 4.08574 : H : ARG NH2 A0154 <- 2.60 -> DG O6 Y0016 : score 6.864 : H : ARG NE A0204 <- 3.37 -> DG N7 Z0003 : score 3.91771 : H : ARG NH2 A0204 <- 2.94 -> DG O6 Z0003 : score 6.4152 : H : SER OG B0152 <- 2.53 -> DA N7 Y0005 : score 4.70516 : H : ASN ND2 B0153 <- 2.80 -> DG O6 Y0007 : score 5.63846 : H : ARG NE B0154 <- 3.08 -> DG N7 Y0004 : score 4.17417 : H : ARG NE B0204 <- 3.27 -> DG N7 Z0015 : score 4.00615 : H : ARG NH2 B0204 <- 3.32 -> DG O6 Z0015 : score 5.9136 : x : THR xxxx A0155 <- 3.93 -> DC xxx Z0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0202 <- 4.48 -> DC xxx Z0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0155 <- 4.12 -> DG xxx Z0015 : score x.xxxxx >4fj5_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DATP/DT organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.52 -> DT O2 P0115 : score 2.522 : H : LYS NZ A0706 <- 3.12 -> DA N3 P0114 : score 2.5992 : x : LYS xxxx A0734 <- 3.91 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx >4fj7_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DGTP/DT organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.59 -> DG N3 P0115 : score 2.036 : H : LYS NZ A0706 <- 3.02 -> DA N3 P0114 : score 2.65474 : H : LYS NZ A0800 <- 3.06 -> DC O2 P0108 : score 2.79295 : x : LYS xxxx A0734 <- 4.48 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx >4fj8_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DCTP/DT organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.17 -> DA N3 P0114 : score 2.57143 : x : LYS xxxx A0734 <- 4.50 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0800 <- 3.26 -> DC xxx P0108 : score x.xxxxx >4fj9_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DTTP/DT organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0416 <- 5.94 -> DG N2 P0115 : score 2.834 : w : THR OG1 A0622 <- 5.56 -> DG N3 P0115 : score 2.036 : H : LYS NZ A0706 <- 3.11 -> DA N3 P0114 : score 2.60475 : w : LYS NZ A0734 <- 5.75 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : H : LYS NZ A0800 <- 3.17 -> DC O2 P0108 : score 2.72814 >4fjg_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DATP/DC organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.00 -> DA N3 P0114 : score 2.66585 : w : LYS NZ A0734 <- 5.76 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >4fjh_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DGTP/DC organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.45 -> DT O2 P0115 : score 2.522 : H : LYS NZ A0706 <- 3.09 -> DA N3 P0114 : score 2.61586 : w : LYS NZ A0734 <- 5.77 -> DT O2 P0112 : score 0.522 >4fji_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DCTP/DC organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 2.84 -> DA N3 P0114 : score 2.75471 >4fjj_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DTTP/DC organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0416 <- 6.07 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : H : LYS NZ A0706 <- 3.01 -> DA N3 P0114 : score 2.66029 : w : LYS NZ A0734 <- 5.89 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >4fjk_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DATP/DA organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0416 <- 5.97 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : w : THR OG1 A0622 <- 5.43 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 3.03 -> DA N3 P0114 : score 2.64918 : w : LYS NZ A0734 <- 5.60 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >4fjl_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DGTP/DA organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0416 <- 5.88 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : w : THR OG1 A0622 <- 5.36 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 3.01 -> DA N3 P0114 : score 2.66029 : w : LYS NZ A0734 <- 5.63 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0734 <- 5.56 -> DC O2 T0010 : score 1.3 >4fjm_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DCTP/DA organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.02 -> DA N3 P0114 : score 2.65474 : w : LYS NZ A0734 <- 5.75 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >4fjn_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DTTP/DA organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.10 -> DA N3 P0114 : score 2.61031 : w : LYS NZ A0734 <- 5.87 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : x : PRO xxxx A0361 <- 3.88 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx >4fjx_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DATP/DG organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0416 <- 6.00 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : w : THR OG1 A0622 <- 5.46 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 3.01 -> DA N3 P0114 : score 2.66029 : w : LYS NZ A0734 <- 6.07 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >4fk0_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DCTP/DG organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.15 -> DA N3 P0114 : score 2.58254 : w : LYS NZ A0734 <- 5.79 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >4fk2_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DTTP/DG organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0416 <- 5.79 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : H : LYS NZ A0706 <- 2.97 -> DA N3 P0114 : score 2.68251 : w : LYS NZ A0734 <- 5.64 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0734 <- 5.54 -> DC O2 T0010 : score 1.3 : x : PRO xxxx A0361 <- 4.22 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0567 <- 4.50 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx >4fk4_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DGTP/DG organism=Enterobacteria phage RB69 : H : LYS NZ A0706 <- 3.08 -> DA N3 P0114 : score 2.62142 : w : LYS NZ A0734 <- 5.87 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >4flt_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PYROCOCCUS ABYSSI B FAMILY DNA POLYMERASE BOUND TO A DSDNA, IN EDITION MODE organism=Pyrococcus abyssi : x : ASP xxxx A0246 <- 4.11 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0265 <- 3.18 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0612 <- 3.47 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx >4flu_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PYROCOCCUS ABYSSI B FAMILY DNA POLYMERASE BOUND TO A DSDNA, IN EDITION MODE organism=Pyrococcus abyssi : x : ASP xxxx A0246 <- 4.18 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0265 <- 3.13 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0612 <- 3.48 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx >4flv_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PYROCOCCUS ABYSSI B FAMILY DNA POLYMERASE BOUND TO A DSDNA, IN EDITION MODE organism=Pyrococcus abyssi : x : ASP xxxx A0246 <- 4.14 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0265 <- 3.16 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0612 <- 3.45 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx >4flw_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PYROCOCCUS ABYSSI B FAMILY DNA POLYMERASE BOUND TO A DSDNA, IN EDITION MODE organism=Pyrococcus abyssi : w : ASP OD2 A0614 <- 6.74 -> DG N2 T0009 : score 1.62 : x : ASP xxxx A0246 <- 4.06 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0265 <- 3.10 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0612 <- 3.49 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx >4flx_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PYROCOCCUS ABYSSI B FAMILY DNA POLYMERASE BOUND TO A DSDNA, IN EDITION MODE organism=Pyrococcus abyssi : x : ARG xxxx A0265 <- 3.38 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0612 <- 3.34 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx >4fly_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PYROCOCCUS ABYSSI B FAMILY DNA POLYMERASE BOUND TO A DSDNA, IN EDITION MODE organism=Pyrococcus abyssi : x : ARG xxxx A0265 <- 3.65 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0612 <- 3.61 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx >4flz_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PYROCOCCUS ABYSSI B FAMILY DNA POLYMERASE BOUND TO A DSDNA, IN EDITION MODE organism=Pyrococcus abyssi : x : ARG xxxx A0612 <- 3.55 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx >4fm0_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PYROCOCCUS ABYSSI B FAMILY DNA POLYMERASE BOUND TO A DSDNA, IN EDITION MODE organism=Pyrococcus abyssi : x : ARG xxxx A0265 <- 3.42 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0612 <- 3.55 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx >4fm1_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PYROCOCCUS ABYSSI B FAMILY DNA POLYMERASE BOUND TO A DSDNA, IN EDITION MODE organism=Pyrococcus abyssi : x : ARG xxxx A0265 <- 3.64 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0612 <- 3.57 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx >4fm2_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PYROCOCCUS ABYSSI B FAMILY DNA POLYMERASE (TRIPLE MUTANT) BOUND TO A DSDNA, IN EDITION MODE organism=Pyrococcus abyssi : x : ARG xxxx A0265 <- 3.36 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0612 <- 3.52 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx >4fm9_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=HUMAN TOPOISOMERASE II ALPHA BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : SER OG A0861 <- 3.19 -> DG N3 D0009 : score 2.55559 : x : LYS xxxx A0489 <- 3.64 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0710 <- 4.47 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0854 <- 4.18 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0856 <- 3.06 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >4fnc_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=HUMAN TDG IN A POST-REACTIVE COMPLEX WITH 5-HYDROXYMETHYLURACIL (5HMU) organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0158 <- 6.15 -> DT O2 C0013 : score 3.682 : H : GLN OE1 A0278 <- 2.40 -> DG N2 D0018 : score 6.05631 : x : SER xxxx A0200 <- 4.25 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0201 <- 3.16 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0274 <- 3.29 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.40 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 3.22 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >4fs1_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=BASE PAIRING MECHANISM OF N2,3-ETHENOGUANINE WITH DTTP BY HUMAN POLYMERASE IOTA organism=HOMO SAPIENS : x : GLU xxxx A0305 <- 3.47 -> DG xxx C0842 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 4.03 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 4.04 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx >4fs2_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=BASE PAIRING MECHANISM OF N2,3-ETHENOGUANINE WITH DCTP BY HUMAN POLYMERASE IOTA organism=HOMO SAPIENS : w : GLU OE1 A0305 <- 5.49 -> DG N7 C0842 : score 1.976 : x : SER xxxx A0301 <- 4.43 -> DT xxx C0844 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0343 <- 3.68 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 4.36 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx >4fth_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NTRC4 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO DOUBLE- STRANDED DNA organism=Aquifex aeolicus : H : SER OG A0063 <- 3.33 -> DC N4 C0013 : score 3.28602 : H : ASN ND2 A0064 <- 2.87 -> DG N7 C0012 : score 4.5217 : H : ARG NH1 A0067 <- 2.81 -> DG O6 C0012 : score 6.07117 : H : ARG NH2 A0067 <- 3.30 -> DG O6 D0010 : score 5.94 : V : TYR CG A0066 <- 3.63 -> DT C7 D0008 : score 3.90055 : x : ASP xxxx A0061 <- 3.51 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0062 <- 4.29 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0070 <- 4.32 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx >4fth_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NTRC4 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO DOUBLE- STRANDED DNA organism=Aquifex aeolicus : H : SER OG A0063 <- 3.33 -> DC N4 C0013 : score 3.28602 : H : ASN ND2 A0064 <- 2.87 -> DG N7 C0012 : score 4.5217 : H : ARG NH1 A0067 <- 2.81 -> DG O6 C0012 : score 6.07117 : H : ARG NH2 A0067 <- 3.30 -> DG O6 D0010 : score 5.94 : H : SER OG B0063 <- 3.19 -> DC N4 D0019 : score 3.38894 : H : ARG NH1 B0067 <- 2.89 -> DG O6 D0018 : score 5.97383 : H : ARG NH2 B0067 <- 2.96 -> DG O6 C0004 : score 6.3888 : V : TYR CG B0066 <- 3.79 -> DT C7 C0002 : score 3.75089 : V : TYR CG A0066 <- 3.63 -> DT C7 D0008 : score 3.90055 : x : ASP xxxx A0061 <- 3.51 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0062 <- 4.29 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0070 <- 4.32 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0061 <- 3.36 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0064 <- 2.86 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx >4fx4_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF M. TUBERCULOSIS TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MOSR (RV1049) IN COMPEX WITH DNA organism=Mycobacterium tuberculosis : H : ARG NH2 A0070 <- 2.75 -> DG N7 D0010 : score 6.44846 : H : ARG NH2 A0070 <- 2.51 -> DG O6 D0010 : score 6.9828 : H : ARG NH1 A0075 <- 2.74 -> DG O6 D0012 : score 6.15633 : H : ARG NH2 A0075 <- 2.82 -> DG N7 D0012 : score 6.35908 : H : ARG NH2 B0070 <- 2.62 -> DG N7 C0010 : score 6.61446 : H : ARG NH2 B0070 <- 2.68 -> DG O6 C0010 : score 6.7584 : H : THR OG1 B0071 <- 3.12 -> DA N7 D0018 : score 3.1956 : H : ARG NH2 B0075 <- 2.88 -> DG N7 C0012 : score 6.28246 : x : THR xxxx A0071 <- 3.51 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0072 <- 3.06 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0076 <- 3.93 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0072 <- 3.19 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0076 <- 4.01 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0095 <- 3.15 -> DT xxx D0025 : score x.xxxxx >4fx4_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF M. TUBERCULOSIS TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MOSR (RV1049) IN COMPEX WITH DNA organism=Mycobacterium tuberculosis : H : ARG NH2 B0070 <- 2.62 -> DG N7 C0010 : score 6.61446 : H : ARG NH2 B0070 <- 2.68 -> DG O6 C0010 : score 6.7584 : H : THR OG1 B0071 <- 3.12 -> DA N7 D0018 : score 3.1956 : H : ARG NH2 B0075 <- 2.88 -> DG N7 C0012 : score 6.28246 : x : THR xxxx B0072 <- 3.19 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0076 <- 4.01 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0095 <- 3.15 -> DT xxx D0025 : score x.xxxxx >4fxd_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF YEAST DNA POLYMERASE ALPHA BOUND TO DNA/RNA organism=Saccharomyces cerevisiae : x : ARG xxxx A0793 <- 3.96 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx >4fyd_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF YEAST DNA POLYMERASE ALPHA BOUND TO DNA/RNA AND DGTP organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ASP OD1 A0689 <- 3.04 -> DG N2 C0002 : score 4.9028 : H : LYS NZ A1047 <- 2.86 -> DC O2 C0008 : score 2.9108 >4fyd_B:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF YEAST DNA POLYMERASE ALPHA BOUND TO DNA/RNA AND DGTP organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ASP OD1 B0689 <- 2.94 -> DG N2 D0002 : score 5.0058 >4fzx_CD:Ribonuclease_H-like; title=EXONUCLEASE X IN COMPLEX WITH 3' OVERHANGING DUPLEX DNA organism=Escherichia coli : w : ARG NH2 C0104 <- 6.16 -> DA N3 A0004 : score 2.092 : H : ARG NH1 D0104 <- 3.00 -> DC O2 B0003 : score 3.504 : H : ARG NH2 D0104 <- 2.87 -> DC O2 B0003 : score 3.64694 : H : TYR OH D0112 <- 2.67 -> DA N3 A0014 : score 4.25922 : x : ASN xxxx C0081 <- 3.92 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0081 <- 3.73 -> DC xxx A0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0100 <- 3.51 -> DC xxx A0015 : score x.xxxxx >4fzx_D:Ribonuclease_H-like; title=EXONUCLEASE X IN COMPLEX WITH 3' OVERHANGING DUPLEX DNA organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 D0104 <- 3.00 -> DC O2 B0003 : score 3.504 : H : ARG NH2 D0104 <- 2.87 -> DC O2 B0003 : score 3.64694 : H : TYR OH D0112 <- 2.67 -> DA N3 A0014 : score 4.25922 : x : ASN xxxx D0081 <- 3.73 -> DC xxx A0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0100 <- 3.51 -> DC xxx A0015 : score x.xxxxx >4fzy_AB:Ribonuclease_H-like; title=EXONUCLEASE X IN COMPLEX WITH 12BP BLUNT-ENDED DSDNA organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 B0081 <- 3.28 -> DA N3 D0010 : score 3.44215 : x : LEU xxxx A0012 <- 3.44 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0046 <- 3.42 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0050 <- 3.23 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0081 <- 4.32 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0084 <- 4.27 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0012 <- 3.00 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0013 <- 4.01 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0084 <- 3.65 -> DC xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0087 <- 3.22 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >4fzy_B:Ribonuclease_H-like; title=EXONUCLEASE X IN COMPLEX WITH 12BP BLUNT-ENDED DSDNA organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 B0081 <- 3.28 -> DA N3 D0010 : score 3.44215 : x : LEU xxxx B0012 <- 3.00 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0013 <- 4.01 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0084 <- 3.65 -> DC xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0087 <- 3.22 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >4fzz_AB:Ribonuclease_H-like; title=EXONUCLEASE X IN COMPLEX WITH 5' OVERHANGING DUPLEX DNA organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx A0012 <- 3.16 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0013 <- 4.03 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0081 <- 4.15 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0084 <- 4.38 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0087 <- 4.18 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0012 <- 3.40 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0013 <- 4.00 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0081 <- 3.95 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0084 <- 4.16 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0087 <- 3.92 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >4fzz_B:Ribonuclease_H-like; title=EXONUCLEASE X IN COMPLEX WITH 5' OVERHANGING DUPLEX DNA organism=Escherichia coli : x : LEU xxxx B0012 <- 3.40 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0013 <- 4.00 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0081 <- 3.95 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0084 <- 4.16 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0087 <- 3.92 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >4g0r_A:ssDNA_viruses; title=STRUCTURAL CHARACTERIZATION OF H-1 PARVOVIRUS: COMPARISON OF INFECTIOUS VIRIONS TO REPLICATION DEFECTIVE PARTICLES organism=H-1 PARVOVIRUS : H : GLN NE2 A0148 <- 2.85 -> DT O4 C0002 : score 5.13912 : V : TYR CB A0275 <- 3.61 -> DT C7 C0002 : score 5.09998 : x : LEU xxxx A0146 <- 3.64 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0184 <- 3.75 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0186 <- 3.70 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0272 <- 2.94 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0276 <- 3.61 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0497 <- 2.54 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0498 <- 3.83 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0500 <- 3.93 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx >4g0u_AB:Type_II_DNA_topoisomerase; title=HUMAN TOPOISOMERASE IIBETA IN COMPLEX WITH DNA AND AMSACRINE organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0505 <- 5.82 -> DG N3 C0007 : score 2.232 : w : ASP OD1 A0726 <- 6.33 -> DA N3 C0006 : score 1.331 : w : ASP OD1 A0726 <- 5.74 -> DC O2 F0016 : score 1.919 : w : ARG NH2 A0729 <- 5.90 -> DA N3 C0006 : score 2.092 : w : GLU OE1 A0870 <- 5.80 -> DC O2 C0004 : score 2.68 : w : LYS NZ B0505 <- 6.48 -> DT O2 D0015 : score 0.522 : w : ASP OD1 B0726 <- 5.39 -> DC O2 D0016 : score 1.919 : w : ASP OD1 B0726 <- 6.10 -> DA N3 E0006 : score 1.331 : w : ASP OD1 B0726 <- 6.25 -> DT O2 D0015 : score 2.105 : w : ARG NH2 B0729 <- 5.85 -> DA N3 E0006 : score 2.092 : w : SER OG B0730 <- 5.86 -> DA N3 E0006 : score 0.958 : w : SER OG B0730 <- 6.43 -> DC O2 D0016 : score 1.768 : w : LYS NZ B0879 <- 5.88 -> DG N3 D0018 : score 2.232 : x : ARG xxxx A0503 <- 3.71 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0778 <- 3.32 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0779 <- 4.32 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0820 <- 3.82 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0872 <- 3.41 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0877 <- 4.07 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0503 <- 3.77 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0778 <- 3.57 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0779 <- 4.35 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0820 <- 3.07 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0870 <- 4.19 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0872 <- 3.36 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0877 <- 4.10 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx >4g0u_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=HUMAN TOPOISOMERASE IIBETA IN COMPLEX WITH DNA AND AMSACRINE organism=Homo sapiens : w : LYS NZ B0505 <- 6.48 -> DT O2 D0015 : score 0.522 : w : ASP OD1 B0726 <- 5.39 -> DC O2 D0016 : score 1.919 : w : ASP OD1 B0726 <- 6.10 -> DA N3 E0006 : score 1.331 : w : ASP OD1 B0726 <- 6.25 -> DT O2 D0015 : score 2.105 : w : ARG NH2 B0729 <- 5.85 -> DA N3 E0006 : score 2.092 : w : SER OG B0730 <- 5.86 -> DA N3 E0006 : score 0.958 : w : SER OG B0730 <- 6.43 -> DC O2 D0016 : score 1.768 : w : LYS NZ B0879 <- 5.88 -> DG N3 D0018 : score 2.232 : V : ARG CZ B0820 <- 3.84 -> DT C7 D0009 : score 2.11098 : x : ARG xxxx B0503 <- 3.77 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0778 <- 3.57 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0779 <- 4.35 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0870 <- 4.19 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0872 <- 3.36 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0877 <- 4.10 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx >4g0v_AB:Type_II_DNA_topoisomerase; title=HUMAN TOPOISOMERASE IIBETA IN COMPLEX WITH DNA AND MITOXANTRONE organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0503 <- 3.05 -> DT O2 D0009 : score 2.44808 : H : ARG NH2 A0503 <- 2.97 -> DT O2 D0009 : score 4.0894 : w : ARG NH1 A0503 <- 6.66 -> DG N3 D0010 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0503 <- 6.46 -> DG N3 D0010 : score 0.677 : w : LYS NZ A0505 <- 5.43 -> DG N3 C0007 : score 2.232 : w : ASP OD1 A0726 <- 5.50 -> DC O2 F0016 : score 1.919 : w : ASP OD1 A0726 <- 6.25 -> DA N3 C0006 : score 1.331 : w : ARG NH2 A0729 <- 6.01 -> DA N3 C0006 : score 2.092 : w : SER OG A0730 <- 6.10 -> DA N3 C0006 : score 0.958 : w : LYS NZ A0879 <- 6.23 -> DG N3 F0018 : score 2.232 : H : ARG NH1 B0503 <- 2.89 -> DT O2 F0009 : score 4.22889 : H : ARG NH1 B0503 <- 3.29 -> DG N3 F0010 : score 2.75341 : w : LYS NZ B0505 <- 5.42 -> DG N3 E0007 : score 2.232 : w : ASP OD1 B0726 <- 5.67 -> DC O2 D0016 : score 1.919 : w : ASP OD1 B0726 <- 6.19 -> DA N3 E0006 : score 1.331 : w : ARG NH2 B0729 <- 5.71 -> DA N3 E0006 : score 2.092 : w : SER OG B0730 <- 6.05 -> DA N3 E0006 : score 0.958 : w : SER OG B0730 <- 6.46 -> DC O2 D0016 : score 1.768 : w : GLN OE1 B0778 <- 5.51 -> DC N4 E0008 : score 3.488 : w : MET SD B0782 <- 6.13 -> DG N7 E0007 : score 4.257 : x : GLN xxxx A0778 <- 3.22 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0779 <- 4.17 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0872 <- 3.55 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0877 <- 4.16 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0779 <- 4.04 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0820 <- 3.78 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0872 <- 3.56 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0877 <- 4.27 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx >4g0v_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=HUMAN TOPOISOMERASE IIBETA IN COMPLEX WITH DNA AND MITOXANTRONE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0503 <- 2.89 -> DT O2 F0009 : score 4.22889 : H : ARG NH1 B0503 <- 3.29 -> DG N3 F0010 : score 2.75341 : w : LYS NZ B0505 <- 5.42 -> DG N3 E0007 : score 2.232 : w : ASP OD1 B0726 <- 5.67 -> DC O2 D0016 : score 1.919 : w : ASP OD1 B0726 <- 6.19 -> DA N3 E0006 : score 1.331 : w : ARG NH2 B0729 <- 5.71 -> DA N3 E0006 : score 2.092 : w : SER OG B0730 <- 6.05 -> DA N3 E0006 : score 0.958 : w : SER OG B0730 <- 6.46 -> DC O2 D0016 : score 1.768 : w : GLN OE1 B0778 <- 5.51 -> DC N4 E0008 : score 3.488 : w : MET SD B0782 <- 6.13 -> DG N7 E0007 : score 4.257 : x : ALA xxxx B0779 <- 4.04 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0820 <- 3.78 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0872 <- 3.56 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0877 <- 4.27 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx >4g0w_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=HUMAN TOPOISOMERASE IIBETA IN COMPLEX WITH DNA AND AMETANTRONE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0503 <- 2.37 -> DT O2 D0009 : score 4.67676 : w : ARG NH2 A0503 <- 6.31 -> DG N2 D0010 : score 1.593 : w : LYS NZ A0505 <- 5.47 -> DG N3 C0007 : score 2.232 : w : ASP OD1 A0726 <- 5.45 -> DC O2 F0016 : score 1.919 : w : ASP OD1 A0726 <- 6.02 -> DA N3 C0006 : score 1.331 : w : ARG NH2 A0729 <- 6.04 -> DA N3 C0006 : score 2.092 : w : SER OG A0730 <- 5.97 -> DA N3 C0006 : score 0.958 : H : GLN NE2 A0778 <- 3.05 -> DT O4 D0009 : score 4.93147 : V : ARG CZ A0820 <- 3.72 -> DT C7 F0009 : score 2.17495 A : x : ALA xxxx A0779 <- 4.10 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0872 <- 3.36 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0877 <- 4.18 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx >4g0w_AB:Type_II_DNA_topoisomerase; title=HUMAN TOPOISOMERASE IIBETA IN COMPLEX WITH DNA AND AMETANTRONE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0503 <- 2.37 -> DT O2 D0009 : score 4.67676 : w : ARG NH2 A0503 <- 6.31 -> DG N2 D0010 : score 1.593 : w : LYS NZ A0505 <- 5.47 -> DG N3 C0007 : score 2.232 : w : ASP OD1 A0726 <- 5.45 -> DC O2 F0016 : score 1.919 : w : ASP OD1 A0726 <- 6.02 -> DA N3 C0006 : score 1.331 : w : ARG NH2 A0729 <- 6.04 -> DA N3 C0006 : score 2.092 : w : SER OG A0730 <- 5.97 -> DA N3 C0006 : score 0.958 : H : GLN NE2 A0778 <- 3.05 -> DT O4 D0009 : score 4.93147 : H : ARG NH1 B0503 <- 2.96 -> DT O2 F0009 : score 4.16861 : H : ARG NH1 B0503 <- 3.14 -> DG N3 F0010 : score 2.84499 : w : LYS NZ B0505 <- 5.73 -> DG N3 E0007 : score 2.232 : w : LYS NZ B0671 <- 5.58 -> DG O6 D0018 : score 3.005 : w : ASP OD1 B0726 <- 5.56 -> DC O2 D0016 : score 1.919 : w : ASP OD1 B0726 <- 6.20 -> DA N3 E0006 : score 1.331 : w : ARG NH2 B0729 <- 6.08 -> DA N3 E0006 : score 2.092 : w : SER OG B0730 <- 6.32 -> DC O2 D0016 : score 1.768 : w : SER OG B0730 <- 6.02 -> DA N3 E0006 : score 0.958 : w : GLU OE1 B0870 <- 6.06 -> DC O2 E0004 : score 2.68 : V : ARG CZ A0820 <- 3.72 -> DT C7 F0009 : score 2.17495 A : x : ALA xxxx A0779 <- 4.10 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0872 <- 3.36 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0877 <- 4.18 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0778 <- 3.18 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0779 <- 4.18 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0872 <- 3.42 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0877 <- 4.15 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx >4g3i_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DPO4 IN COMPLEX WITH DNA DUPLEX organism=Sulfolobus solfataricus : x : VAL xxxx B0032 <- 3.53 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0042 <- 3.55 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0044 <- 4.04 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0057 <- 3.42 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0076 <- 4.26 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0295 <- 3.61 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0332 <- 3.45 -> DG xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0336 <- 3.67 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx >4g4n_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM CONTAINING M77A MUTATION BOUND TO UNDAMAGED DNA organism=Geobacillus stearothermophilus : w : ARG NH2 A0035 <- 6.03 -> DT O2 B0009 : score 2.261 : H : ARG NE A0076 <- 2.90 -> DA N3 C0009 : score 2.06051 : H : ARG NH1 A0112 <- 3.00 -> DG N3 B0011 : score 2.93046 : x : PHE xxxx A0114 <- 3.28 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 3.34 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx >4g4o_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM CONTAINING M77A MUTATION BOUND TO OXOG-CONTAINING DNA organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NH1 A0112 <- 2.70 -> DG N3 B0011 : score 3.11362 >4g4q_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM CONTAINING F114A MUTATION BOUND TO UNDAMAGED DNA organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NE A0076 <- 3.25 -> DA N3 C0009 : score 1.91333 : H : ARG NH1 A0112 <- 2.96 -> DG N3 B0011 : score 2.95488 : x : MET xxxx A0077 <- 3.55 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 3.27 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx >4g4r_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MUTM CONTAINING F114A MUTATION BOUND TO OXOG-CONTAINING DNA organism=Geobacillus stearothermophilus : w : ARG NH1 A0112 <- 6.02 -> DC O2 C0007 : score 1.381 >4g7h_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : GLU xxxx C0421 <- 4.01 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 4.48 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >4g7h_MNP: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : GLU xxxx M0421 <- 3.92 -> DA xxx Q0013 : score x.xxxxx >4g7o_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING 2 NT OF RNA organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : GLU xxxx C0421 <- 3.64 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 3.19 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0491 <- 4.24 -> DT xxx H0022 : score x.xxxxx >4g7o_MNP: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING 2 NT OF RNA organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : GLU xxxx M0421 <- 3.63 -> DT xxx R0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0422 <- 3.26 -> DT xxx R0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx N0491 <- 4.41 -> DT xxx R0022 : score x.xxxxx >4g7z_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING 5-BRU AT TEMPLATE-STRAND POSITION +1 organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : GLU xxxx C0421 <- 3.47 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0491 <- 3.76 -> DT xxx H0022 : score x.xxxxx >4g7z_MNP: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING 5-BRU AT TEMPLATE-STRAND POSITION +1 organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : GLU xxxx M0421 <- 3.35 -> DT xxx R0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0422 <- 4.33 -> DT xxx R0015 : score x.xxxxx >4g82_A:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF P73 DNA-BINDING DOMAIN TETRAMER BOUND TO A FULL RESPONSE-ELEMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0300 <- 2.65 -> DG N7 F0416 : score 6.2315 : H : ARG NH2 A0300 <- 2.99 -> DG O6 F0416 : score 6.3492 : x : ALA xxxx A0296 <- 3.86 -> DT xxx F0417 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0297 <- 3.92 -> DT xxx F0417 : score x.xxxxx >4g82_AB:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF P73 DNA-BINDING DOMAIN TETRAMER BOUND TO A FULL RESPONSE-ELEMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0300 <- 2.65 -> DG N7 F0416 : score 6.2315 : H : ARG NH2 A0300 <- 2.99 -> DG O6 F0416 : score 6.3492 : H : ARG NH1 B0300 <- 2.51 -> DG O6 E0406 : score 6.43617 : H : ARG NH2 B0300 <- 3.28 -> DG N7 E0406 : score 5.77169 : x : ALA xxxx A0296 <- 3.86 -> DT xxx F0417 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0297 <- 3.92 -> DT xxx F0417 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0268 <- 3.91 -> DG xxx F0416 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0296 <- 3.85 -> DT xxx E0407 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0297 <- 4.12 -> DT xxx E0407 : score x.xxxxx >4g83_AB:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF P73 DNA-BINDING DOMAIN TETRAMER BOUND TO A FULL RESPONSE-ELEMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0300 <- 3.32 -> DG O6 F0416 : score 5.45067 : H : ARG NH2 A0300 <- 2.79 -> DG N7 F0416 : score 6.39738 : H : ARG NH1 B0300 <- 3.02 -> DG N7 E0406 : score 5.7838 : H : ARG NH2 B0300 <- 3.44 -> DG O6 E0406 : score 5.7552 : x : ALA xxxx A0296 <- 4.50 -> DT xxx F0417 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0297 <- 3.78 -> DT xxx F0417 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0296 <- 4.02 -> DT xxx E0407 : score x.xxxxx >4g83_B:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF P73 DNA-BINDING DOMAIN TETRAMER BOUND TO A FULL RESPONSE-ELEMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0300 <- 3.02 -> DG N7 E0406 : score 5.7838 : H : ARG NH2 B0300 <- 3.44 -> DG O6 E0406 : score 5.7552 : x : ALA xxxx B0296 <- 4.02 -> DT xxx E0407 : score x.xxxxx >4g92_A: title=CCAAT-BINDING COMPLEX FROM ASPERGILLUS NIDULANS WITH DNA organism=EMERICELLA NIDULANS : H : ARG NH1 A0273 <- 2.95 -> DC O2 E0013 : score 3.5405 : H : ARG NH2 A0273 <- 2.77 -> DC O2 E0013 : score 3.72091 : w : ARG NH1 A0273 <- 5.72 -> DT O2 D0017 : score 1.855 : H : HIS NE2 A0276 <- 2.96 -> DA N3 E0011 : score 4.11028 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.91 -> DA N3 E0010 : score 3.60105 : w : ARG NH1 A0280 <- 5.83 -> DT O2 D0018 : score 1.855 : H : ARG NH1 A0282 <- 2.96 -> DG N3 D0019 : score 2.95488 : x : ARG xxxx A0287 <- 3.41 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0288 <- 3.27 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx >4g92_ABC:Histone-fold;Leucine_zipper_domain; title=CCAAT-BINDING COMPLEX FROM ASPERGILLUS NIDULANS WITH DNA organism=ASPERGILLUS NIDULANS / EMERICELLA NIDULANS : H : ARG NH1 A0273 <- 2.95 -> DC O2 E0013 : score 3.5405 : H : ARG NH2 A0273 <- 2.77 -> DC O2 E0013 : score 3.72091 : w : ARG NH1 A0273 <- 5.69 -> DT O2 E0012 : score 1.855 : H : HIS NE2 A0276 <- 2.96 -> DA N3 E0011 : score 4.11028 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.91 -> DA N3 E0010 : score 3.60105 : w : ARG NH1 A0280 <- 5.83 -> DT O2 D0018 : score 1.855 : H : ARG NH1 A0282 <- 2.96 -> DG N3 D0019 : score 2.95488 : w : LYS NZ B0066 <- 5.65 -> DG N3 E0006 : score 2.232 : x : ARG xxxx A0287 <- 3.41 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0288 <- 3.27 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0051 <- 3.87 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx >4g92_B:Histone-fold; title=CCAAT-BINDING COMPLEX FROM ASPERGILLUS NIDULANS WITH DNA organism=ASPERGILLUS NIDULANS : w : LYS NZ B0066 <- 5.65 -> DG N3 E0006 : score 2.232 : x : ALA xxxx B0051 <- 3.87 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx >4gat_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE WILD TYPE DNA BINDING DOMAIN OF AREA COMPLEXED TO A 13BP DNA CONTAINING A CGATA SITE, REGULARIZED MEAN STRUCTURE organism=EMERICELLA NIDULANS : H : ARG NH1 A0024 <- 2.70 -> DG N7 B0105 : score 6.171 : H : ARG NH2 A0024 <- 2.72 -> DG N7 B0105 : score 6.48677 : x : LEU xxxx A0022 <- 4.17 -> DC xxx B0104 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0038 <- 3.15 -> DA xxx B0106 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0039 <- 4.17 -> DT xxx C0119 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0042 <- 4.18 -> DT xxx C0119 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0059 <- 4.27 -> DG xxx B0109 : score x.xxxxx >4gc6_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DPO4 IN COMPLEX WITH N-MC-DAMP OPPOSITE DT organism=Sulfolobus solfataricus P2 : x : ARG xxxx A0332 <- 3.62 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.71 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx >4gc7_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DPO4 IN COMPLEX WITH S-MC-DADP OPPOSITE DT organism=Sulfolobus solfataricus P2 : x : ILE xxxx B0248 <- 4.10 -> DG xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0295 <- 3.93 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0332 <- 3.24 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0336 <- 3.86 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx >4gck_A:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF NO-DNA COMPLEX organism=Klebsiella pneumoniae : H : GLU OE1 A0045 <- 2.95 -> DC N4 Z0030 : score 5.59491 : w : GLU OE2 A0045 <- 6.64 -> DG O6 W0006 : score 2.892 : V : ALA CB A0046 <- 3.81 -> DT C7 W0003 : score 5.58498 : x : THR xxxx A0034 <- 3.18 -> DA xxx Z0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0044 <- 3.55 -> DT xxx W0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0047 <- 4.38 -> DT xxx W0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0049 <- 3.40 -> DT xxx Z0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0050 <- 3.48 -> DG xxx W0002 : score x.xxxxx >4gck_ABCD:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF NO-DNA COMPLEX organism=Klebsiella pneumoniae : H : GLU OE1 A0045 <- 2.95 -> DC N4 Z0030 : score 5.59491 : w : GLU OE2 A0045 <- 6.64 -> DG O6 W0006 : score 2.892 : H : GLU OE2 B0045 <- 2.37 -> DC N4 W0013 : score 5.71821 : H : GLU OE2 C0045 <- 2.86 -> DC N4 W0009 : score 5.2022 : w : GLU OE1 C0045 <- 6.65 -> DA N6 W0008 : score 2.939 : w : GLU OE2 C0045 <- 6.54 -> DA N6 W0008 : score 2.785 : H : GLU OE1 D0045 <- 2.52 -> DC N4 Z0034 : score 6.09095 : V : ALA CB A0046 <- 3.81 -> DT C7 W0003 : score 5.58498 : V : ALA CB C0046 <- 3.62 -> DT C7 Z0024 : score 5.85093 : x : THR xxxx A0034 <- 3.18 -> DA xxx Z0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0044 <- 3.55 -> DT xxx W0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0047 <- 4.38 -> DT xxx W0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0049 <- 3.40 -> DT xxx Z0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0050 <- 3.48 -> DG xxx W0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0034 <- 3.41 -> DA xxx W0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0049 <- 3.54 -> DC xxx W0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0034 <- 3.21 -> DA xxx W0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0044 <- 3.40 -> DT xxx Z0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0047 <- 4.13 -> DT xxx Z0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0049 <- 3.45 -> DT xxx W0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0050 <- 3.72 -> DG xxx Z0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0034 <- 3.31 -> DA xxx Z0033 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0049 <- 3.47 -> DC xxx Z0034 : score x.xxxxx >4gcl_ABCD:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF NO-DNA FACTOR organism=Escherichia coli : H : GLU OE1 A0045 <- 3.05 -> DC N4 Z0030 : score 5.47955 : H : ARG NH2 A0050 <- 2.60 -> DA N7 W0001 : score 1.73867 : H : ARG NH2 A0050 <- 2.95 -> DG O6 W0002 : score 6.402 : H : GLU OE2 B0045 <- 2.63 -> DC N4 W0013 : score 5.44441 : H : GLU OE2 C0045 <- 3.12 -> DC N4 W0009 : score 4.9284 : H : ARG NE C0050 <- 3.09 -> DG N7 Z0023 : score 4.16533 : H : ARG NH2 C0050 <- 2.77 -> DG N7 Z0023 : score 6.42292 : H : GLU OE1 D0045 <- 2.76 -> DC N4 Z0034 : score 5.81409 : V : ALA CB A0046 <- 3.55 -> DT C7 W0003 : score 5.94891 : x : THR xxxx A0034 <- 3.52 -> DA xxx Z0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0044 <- 3.71 -> DT xxx W0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0047 <- 4.14 -> DT xxx W0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0049 <- 3.48 -> DC xxx Z0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0034 <- 3.14 -> DA xxx W0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0046 <- 4.44 -> DT xxx W0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0049 <- 2.85 -> DC xxx W0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0034 <- 3.14 -> DA xxx W0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0044 <- 3.50 -> DT xxx Z0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0046 <- 3.19 -> DG xxx Z0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0047 <- 4.35 -> DT xxx Z0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0049 <- 3.67 -> DC xxx W0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0034 <- 3.23 -> DA xxx Z0033 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0046 <- 4.45 -> DT xxx Z0035 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0049 <- 3.25 -> DC xxx Z0034 : score x.xxxxx >4gcl_C:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF NO-DNA FACTOR organism=Escherichia coli : H : GLU OE2 C0045 <- 3.12 -> DC N4 W0009 : score 4.9284 : H : ARG NE C0050 <- 3.09 -> DG N7 Z0023 : score 4.16533 : H : ARG NH2 C0050 <- 2.77 -> DG N7 Z0023 : score 6.42292 : x : THR xxxx C0034 <- 3.14 -> DA xxx W0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0044 <- 3.50 -> DT xxx Z0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0046 <- 3.19 -> DG xxx Z0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0047 <- 4.35 -> DT xxx Z0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0049 <- 3.67 -> DC xxx W0009 : score x.xxxxx >4gcl_EGH:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF NO-DNA FACTOR organism=Escherichia coli : H : GLU OE1 E0045 <- 3.08 -> DC N4 R0009 : score 5.44494 : w : ARG NH2 E0050 <- 5.36 -> DT O4 T0024 : score 2.366 : w : THR OG1 G0034 <- 6.39 -> DA N7 T0029 : score 2.152 : H : GLU OE2 G0045 <- 2.90 -> DC N4 T0030 : score 5.16008 : w : GLU OE2 G0045 <- 5.63 -> DA N6 T0029 : score 2.785 : H : ARG NH1 G0050 <- 2.70 -> DG N7 R0002 : score 6.171 : H : ARG NH2 G0050 <- 2.93 -> DG O6 R0002 : score 6.4284 : x : THR xxxx E0034 <- 3.47 -> DA xxx R0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0044 <- 3.41 -> DT xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0046 <- 3.00 -> DG xxx T0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0047 <- 4.01 -> DT xxx T0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0049 <- 3.65 -> DT xxx R0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0044 <- 3.49 -> DT xxx R0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0046 <- 3.38 -> DC xxx T0032 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0047 <- 4.31 -> DT xxx R0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0049 <- 3.19 -> DC xxx T0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0034 <- 3.24 -> DA xxx R0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0045 <- 2.56 -> DC xxx R0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0046 <- 3.69 -> DT xxx R0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0049 <- 3.12 -> DC xxx R0013 : score x.xxxxx >4gct_ABCD:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF NO FACTOR PROTEIN-DNA COMPLEX organism=Vibrio cholerae O1 biovar El Tor : H : GLU OE1 A0043 <- 2.85 -> DC N4 Z0030 : score 5.71027 : H : GLU OE2 C0043 <- 2.92 -> DC N4 W0012 : score 5.13902 : w : GLU OE1 C0043 <- 6.18 -> DA N6 W0011 : score 2.939 : w : GLU OE2 C0043 <- 5.94 -> DA N6 W0011 : score 2.785 : H : GLU OE2 D0043 <- 2.46 -> DC N4 Z0034 : score 5.62343 : V : ALA CB D0044 <- 3.63 -> DT C7 W0002 : score 5.83693 : V : ALA CB A0044 <- 3.74 -> DT C7 W0006 : score 5.68296 : V : ALA CB C0044 <- 3.60 -> DT C7 Z0024 : score 5.87892 : x : THR xxxx A0032 <- 3.56 -> DA xxx Z0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 3.58 -> DT xxx W0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0045 <- 4.27 -> DT xxx W0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0047 <- 3.73 -> DC xxx Z0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0048 <- 3.37 -> DC xxx W0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0032 <- 3.34 -> DA xxx W0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0043 <- 3.04 -> DC xxx W0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0044 <- 3.33 -> DT xxx Z0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0047 <- 3.47 -> DC xxx W0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0048 <- 3.00 -> DT xxx Z0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0032 <- 3.54 -> DA xxx W0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0042 <- 3.78 -> DT xxx Z0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0045 <- 4.32 -> DT xxx Z0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0047 <- 3.60 -> DC xxx W0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0048 <- 3.36 -> DC xxx Z0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0032 <- 3.14 -> DA xxx Z0033 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 3.76 -> DT xxx W0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0047 <- 3.61 -> DC xxx Z0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0048 <- 2.89 -> DT xxx W0001 : score x.xxxxx >4gct_D:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF NO FACTOR PROTEIN-DNA COMPLEX organism=Vibrio cholerae O1 biovar El Tor : H : GLU OE2 D0043 <- 2.46 -> DC N4 Z0034 : score 5.62343 : V : ALA CB D0044 <- 3.63 -> DT C7 W0002 : score 5.83693 : x : THR xxxx D0032 <- 3.14 -> DA xxx Z0033 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 3.76 -> DT xxx W0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0047 <- 3.61 -> DC xxx Z0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0048 <- 2.89 -> DT xxx W0001 : score x.xxxxx >4gdf_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=A CRYSTAL STRUCTURE OF SV40 LARGE T ANTIGEN organism=Simian virus 40 : H : SER OG A0152 <- 2.58 -> DA N7 C0022 : score 4.66052 : H : ASN ND2 A0153 <- 2.96 -> DG O6 C0024 : score 5.45803 : H : ARG NH2 A0154 <- 3.10 -> DG O6 C0021 : score 6.204 : H : ARG NE A0204 <- 2.90 -> DG N7 D0008 : score 4.33336 : H : ARG NH2 A0204 <- 2.73 -> DG O6 D0008 : score 6.6924 : x : PHE xxxx A0151 <- 4.28 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0155 <- 4.19 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0267 <- 3.86 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0270 <- 4.40 -> DA xxx D0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0332 <- 3.51 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0513 <- 3.79 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx >4gdf_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=A CRYSTAL STRUCTURE OF SV40 LARGE T ANTIGEN organism=Simian virus 40 : H : SER OG A0152 <- 2.58 -> DA N7 C0022 : score 4.66052 : H : ASN ND2 A0153 <- 2.96 -> DG O6 C0024 : score 5.45803 : H : ARG NH2 A0154 <- 3.10 -> DG O6 C0021 : score 6.204 : H : ARG NE A0204 <- 2.90 -> DG N7 D0008 : score 4.33336 : H : ARG NH2 A0204 <- 2.73 -> DG O6 D0008 : score 6.6924 : H : ASN ND2 B0153 <- 2.67 -> DG O6 D0016 : score 5.78506 : H : ARG NE B0204 <- 2.99 -> DG N7 C0016 : score 4.25377 : H : ARG NH2 B0204 <- 3.14 -> DG N7 C0016 : score 5.95046 : H : ARG NH2 B0204 <- 3.20 -> DG O6 C0016 : score 6.072 : x : PHE xxxx A0151 <- 4.28 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0155 <- 4.19 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0267 <- 3.86 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0270 <- 4.40 -> DA xxx D0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0332 <- 3.51 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0513 <- 3.79 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0154 <- 3.78 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0155 <- 3.89 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0202 <- 3.64 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0513 <- 3.62 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >4gdf_EF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=A CRYSTAL STRUCTURE OF SV40 LARGE T ANTIGEN organism=Simian virus 40 : H : SER OG E0152 <- 2.57 -> DA N7 G0022 : score 4.66945 : H : ASN ND2 E0153 <- 2.98 -> DG O6 G0024 : score 5.43548 : H : ARG NE E0154 <- 3.16 -> DG N7 G0021 : score 4.10343 : H : ARG NH2 E0154 <- 3.08 -> DG O6 G0021 : score 6.2304 : H : ARG NH1 E0204 <- 2.96 -> DG N7 H0008 : score 5.8564 : H : ARG NH1 E0204 <- 2.90 -> DG O6 H0008 : score 5.96167 : H : ASN ND2 F0153 <- 2.67 -> DG O6 H0016 : score 5.78506 : H : ARG NH1 F0204 <- 2.80 -> DG N7 G0016 : score 6.05 : x : PHE xxxx E0151 <- 4.32 -> DG xxx G0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0155 <- 4.18 -> DC xxx H0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0267 <- 3.85 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx E0270 <- 4.41 -> DA xxx H0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0332 <- 3.52 -> DT xxx H0020 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0513 <- 3.86 -> DC xxx G0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0154 <- 3.76 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0155 <- 3.93 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0202 <- 3.67 -> DT xxx G0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0513 <- 3.61 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx >4gfb_A:Homeodomain-like; title=RAP1/DNA COMPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0360 <- 2.83 -> DA N3 C0017 : score 2.76026 : H : LYS NZ A0360 <- 2.90 -> DT O2 D0018 : score 3.51544 : H : HIS NE2 A0385 <- 3.08 -> DG O6 D0012 : score 7.50843 : H : HIS NE2 A0385 <- 2.64 -> DG O6 D0013 : score 8.20837 : H : ASN OD1 A0401 <- 3.05 -> DC N4 C0020 : score 3.98391 : H : ARG NH2 A0404 <- 2.78 -> DG N7 D0013 : score 6.41015 : H : ARG NH2 A0542 <- 2.95 -> DG N7 D0005 : score 6.19308 : H : ARG NH2 A0542 <- 2.80 -> DG O6 D0005 : score 6.6 : H : ASP OD2 A0543 <- 3.24 -> DC N4 C0026 : score 5.6544 : H : ARG NH1 A0546 <- 2.80 -> DG O6 D0006 : score 6.08333 : H : ARG NH2 A0546 <- 2.84 -> DG N7 D0006 : score 6.33354 : H : LYS NZ A0547 <- 2.47 -> DT O4 D0007 : score 3.82393 : H : ARG NH1 A0580 <- 3.16 -> DG O6 D0008 : score 5.64533 : H : ARG NH2 A0580 <- 2.59 -> DG N7 D0008 : score 6.65277 : x : SER xxxx A0402 <- 4.16 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0405 <- 3.26 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0408 <- 3.73 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0410 <- 3.62 -> DA xxx C0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0446 <- 3.60 -> DA xxx C0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0539 <- 3.76 -> DA xxx C0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0578 <- 3.65 -> DC xxx C0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0588 <- 3.69 -> DC xxx C0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0589 <- 3.51 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0591 <- 3.33 -> DC xxx C0020 : score x.xxxxx >4gfh_AF:Type_II_DNA_topoisomerase;ATPase_domain_of_HSP90_chaperone/DNA_topoisomerase_II/histidine_kinase;Ribosomal_protein_S5_domain_2-like; title=TOPOISOMERASE II-DNA-AMPPNP COMPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : x : LYS xxxx A0477 <- 3.41 -> DT xxx c0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0739 <- 3.15 -> DC xxx b0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0740 <- 3.26 -> DA xxx b0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0781 <- 4.26 -> DC xxx c0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0831 <- 3.44 -> DG xxx b0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0833 <- 3.42 -> DG xxx b0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0838 <- 3.98 -> DC xxx c0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0739 <- 3.51 -> DC xxx c0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0781 <- 3.76 -> DC xxx b0012 : score x.xxxxx >4gfh_F:Type_II_DNA_topoisomerase;ATPase_domain_of_HSP90_chaperone/DNA_topoisomerase_II/histidine_kinase;Ribosomal_protein_S5_domain_2-like; title=TOPOISOMERASE II-DNA-AMPPNP COMPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : x : GLN xxxx F0739 <- 3.51 -> DC xxx c0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0781 <- 3.76 -> DC xxx b0012 : score x.xxxxx >4gg4_A:Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TAL EFFECTOR DHAX3 BOUND TO SPECIFIC DNA-RNA HYBRID organism=XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ARMORACIAE : H : ASP OD2 A0301 <- 3.02 -> DC N4 G0001 : score 5.9272 : H : ASP OD2 A0335 <- 2.76 -> DC N4 G0002 : score 6.2496 : H : ASP OD2 A0369 <- 3.07 -> DC N4 G0003 : score 5.8652 : H : ASP OD2 A0573 <- 2.92 -> DC N4 G0009 : score 6.0512 : H : ASP OD2 A0641 <- 2.80 -> DC N4 G0011 : score 6.2 : x : ILE xxxx A0505 <- 3.28 -> DA xxx G0007 : score x.xxxxx >4gjp_A:Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TAL EFFECTOR DHAX3 BOUND TO DSDNA CONTAINING REPETITIVE METHYL-CPG organism=XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ARMORACIAE : H : ARG NH1 A0266 <- 2.93 -> DG N7 J-003 : score 5.8927 : H : ARG NH2 A0266 <- 2.87 -> DG O6 J-003 : score 6.5076 : H : ASP OD2 A0301 <- 2.87 -> DC N4 I0001 : score 6.1132 : w : ASP OD2 A0301 <- 5.42 -> DG O6 J-002 : score 3.228 : H : ASP OD2 A0335 <- 2.85 -> DC N4 I0002 : score 6.138 : H : ASP OD2 A0369 <- 2.74 -> DC N4 I0003 : score 6.2744 : w : ASP OD2 A0369 <- 5.77 -> DA N6 J-004 : score 3.409 : w : ASP OD2 A0369 <- 6.02 -> DT O4 I0004 : score 2.798 : H : ASN ND2 A0505 <- 3.13 -> DG N7 I0007 : score 4.28323 : H : ASN ND2 A0505 <- 2.96 -> DG O6 I0007 : score 5.45803 : H : ASN ND2 A0573 <- 3.04 -> DG N7 I0009 : score 4.36577 : w : ASN ND2 A0573 <- 6.00 -> DC N4 J-009 : score 2.395 : H : ASP OD2 A0641 <- 2.73 -> DC N4 I0011 : score 6.2868 >4gjr_B:Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TAL EFFECTOR DHAX3 BOUND TO METHYLATED DSDNA organism=XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ARMORACIAE : H : ARG NH1 B0266 <- 2.62 -> DG O6 H0010 : score 6.30233 : H : ARG NH2 B0266 <- 3.00 -> DG N7 H0010 : score 6.12923 : H : ASP OD2 B0301 <- 2.86 -> DC N4 G0004 : score 6.1256 : H : ASP OD2 B0335 <- 2.60 -> DC N4 G0005 : score 6.448 : H : ASP OD2 B0369 <- 2.99 -> DC N4 G0006 : score 5.9644 : w : ASP OD2 B0369 <- 5.80 -> DA N6 H0009 : score 3.409 : w : ASP OD2 B0369 <- 5.80 -> DT O4 G0007 : score 2.798 : H : SER OG B0505 <- 2.86 -> DA N7 G0010 : score 4.41053 : H : ASP OD2 B0573 <- 2.84 -> DC N4 G0012 : score 6.1504 : H : ASP OD1 B0641 <- 2.86 -> DC N4 G0014 : score 5.28073 >4gle_A:Xylose_isomerase-like; title=SACUVDE IN COMPLEX WITH 6-4PP-CONTAINING DNA organism=Sulfolobus acidocaldarius : H : LYS NZ A0021 <- 2.93 -> DT O2 B0006 : score 3.49391 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.35 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0067 <- 3.09 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0068 <- 3.22 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0103 <- 2.82 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0104 <- 3.34 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0121 <- 3.71 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx >4glx_A:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;RuvA_domain_2-like;Nucleic_acid-binding_proteins; title=DNA LIGASE A IN COMPLEX WITH INHIBITOR organism=Escherichia coli : w : ARG NH1 A0200 <- 6.23 -> DC O2 C0039 : score 1.381 : w : ASN OD1 A0201 <- 5.84 -> DG N3 B0015 : score 3.377 : w : ASN ND2 A0201 <- 5.83 -> DC O2 C0039 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0201 <- 5.81 -> DC O2 C0038 : score 1.885 : H : ARG NH1 A0208 <- 2.69 -> DC O2 C0037 : score 3.7303 : w : THR OG1 A0357 <- 6.07 -> DT O2 B0012 : score 2.522 : w : ARG NH1 A0379 <- 5.80 -> DG N2 B0014 : score 1.082 : H : ARG NH2 A0487 <- 2.82 -> DA N3 B0022 : score 3.22678 : w : ARG NH1 A0487 <- 5.83 -> DG N3 C0033 : score 1.593 : x : ARG xxxx A0136 <- 4.40 -> DC xxx C0039 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0359 <- 4.18 -> DC xxx D0042 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0383 <- 3.66 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0384 <- 3.12 -> DC xxx D0040 : score x.xxxxx >4gnx_AZ:Nucleic_acid-binding_proteins; title=STRUCTURE OF U. MAYDIS REPLICATION PROTEIN A BOUND TO SSDNA organism=USTILAGO MAYDIS : H : ASN ND2 Z0237 <- 3.04 -> DT O2 L0002 : score 4.51834 : H : LYS NZ Z0384 <- 2.60 -> DT O4 L0007 : score 3.73067 : H : SER OG Z0394 <- 3.33 -> DT O4 L0007 : score 3.17828 : H : ARG NH2 Z0522 <- 3.41 -> DT O2 L0013 : score 3.71687 : H : SER OG Z0526 <- 2.85 -> DT O2 L0018 : score 3.66046 : H : ASP OD2 Z0588 <- 2.86 -> DT N3 L0016 : score 3.54413 : H : ARG NH2 Z0597 <- 2.78 -> DT O4 L0014 : score 3.56806 : V : PHE CZ Z0236 <- 3.62 -> DT C7 L0003 : score 7.43504 : V : PHE CD2 Z0267 <- 3.68 -> DT C7 L0004 : score 6.70715 : V : TRP CD1 Z0359 <- 3.71 -> DT C7 L0006 : score 7.49833 : V : PHE CZ Z0541 <- 3.72 -> DT C7 L0013 : score 7.25717 : V : PHE CB Z0590 <- 3.52 -> DT C7 L0016 : score 6.2071 : V : ARG CZ Z0595 <- 3.67 -> DT C7 L0017 : score 2.20161 : V : TRP CD1 Z0537 <- 3.63 -> DT C7 L0018 : score 7.645 : x : ARG xxxx Z0208 <- 3.31 -> DT xxx L0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx Z0210 <- 3.99 -> DT xxx L0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Z0219 <- 3.83 -> DT xxx L0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0259 <- 2.66 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Z0264 <- 3.83 -> DT xxx L0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx Z0339 <- 3.23 -> DT xxx L0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Z0341 <- 3.67 -> DT xxx L0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Z0357 <- 4.18 -> DT xxx L0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Z0388 <- 3.13 -> DT xxx L0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Z0396 <- 4.14 -> DT xxx L0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Z0397 <- 3.18 -> DT xxx L0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Z0446 <- 3.38 -> DT xxx L0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx Z0448 <- 3.35 -> DT xxx L0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Z0450 <- 4.40 -> DT xxx L0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx Z0469 <- 3.96 -> DT xxx L0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0470 <- 3.44 -> DT xxx L0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx Z0478 <- 3.28 -> DT xxx L0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0479 <- 3.43 -> DT xxx L0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Z0481 <- 3.13 -> DT xxx L0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Z0484 <- 3.93 -> DT xxx L0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0487 <- 4.40 -> DT xxx L0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Z0496 <- 3.68 -> DT xxx L0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Z0524 <- 3.99 -> DT xxx L0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Z0528 <- 4.44 -> DT xxx L0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Z0543 <- 4.41 -> DT xxx L0012 : score x.xxxxx >4gnx_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=STRUCTURE OF U. MAYDIS REPLICATION PROTEIN A BOUND TO SSDNA organism=USTILAGO MAYDIS : H : THR OG1 B0135 <- 2.58 -> DT N3 K0021 : score 2.44805 : H : THR OG1 B0135 <- 2.65 -> DT O4 K0021 : score 4.00379 : H : SER OG B0146 <- 2.69 -> DT O2 K0021 : score 3.77878 : V : LEU CD2 B0133 <- 3.63 -> DT C7 K0021 : score 5.97486 : V : GLN CG B0140 <- 3.79 -> DT C7 K0025 : score 3.26352 >4gnx_BY:Nucleic_acid-binding_proteins; title=STRUCTURE OF U. MAYDIS REPLICATION PROTEIN A BOUND TO SSDNA organism=USTILAGO MAYDIS : H : THR OG1 B0135 <- 2.58 -> DT N3 K0021 : score 2.44805 : H : THR OG1 B0135 <- 2.65 -> DT O4 K0021 : score 4.00379 : H : SER OG B0146 <- 2.69 -> DT O2 K0021 : score 3.77878 : V : LEU CD2 B0133 <- 3.63 -> DT C7 K0021 : score 5.97486 : V : GLN CG B0140 <- 3.79 -> DT C7 K0025 : score 3.26352 >4gnx_CX:Nucleic_acid-binding_proteins; title=STRUCTURE OF U. MAYDIS REPLICATION PROTEIN A BOUND TO SSDNA organism=USTILAGO MAYDIS : H : LYS NZ C0384 <- 3.18 -> DT O4 K0007 : score 3.31455 : H : SER OG C0526 <- 2.77 -> DT O2 K0018 : score 3.71962 : H : ARG NH2 C0597 <- 2.58 -> DT O4 K0014 : score 3.71022 : V : PHE CD2 C0236 <- 3.72 -> DT C7 K0002 : score 6.64203 : V : PHE CD2 C0267 <- 3.79 -> DT C7 K0005 : score 6.52807 : V : TRP CD1 C0359 <- 3.52 -> DT C7 K0006 : score 7.84667 : V : PHE CZ C0541 <- 3.68 -> DT C7 K0013 : score 7.32832 : V : PHE CD1 C0590 <- 3.66 -> DT C7 K0016 : score 4.29605 : V : ARG CG C0595 <- 3.75 -> DT C7 K0017 : score 1.01769 : V : TRP CD1 C0537 <- 3.59 -> DT C7 K0018 : score 7.71833 : x : ARG xxxx C0208 <- 3.36 -> DT xxx K0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0210 <- 3.91 -> DT xxx K0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0214 <- 4.09 -> DT xxx K0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0219 <- 3.95 -> DT xxx K0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0232 <- 4.03 -> DT xxx K0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0237 <- 3.64 -> DT xxx K0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0264 <- 4.07 -> DT xxx K0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0277 <- 4.47 -> DT xxx K0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0339 <- 3.10 -> DT xxx K0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0341 <- 3.18 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0357 <- 3.76 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0388 <- 3.06 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0394 <- 3.39 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0396 <- 4.00 -> DT xxx K0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0397 <- 2.96 -> DT xxx K0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0446 <- 3.46 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0448 <- 3.24 -> DT xxx K0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0450 <- 3.95 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0467 <- 3.38 -> DT xxx K0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0469 <- 3.88 -> DT xxx K0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0470 <- 3.54 -> DT xxx K0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0478 <- 4.37 -> DT xxx K0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0479 <- 3.61 -> DT xxx K0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0481 <- 3.28 -> DT xxx K0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0484 <- 3.92 -> DT xxx K0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0487 <- 4.02 -> DT xxx K0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0496 <- 4.11 -> DT xxx K0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0522 <- 3.62 -> DT xxx K0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0524 <- 4.24 -> DT xxx K0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0528 <- 4.35 -> DT xxx K0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0584 <- 3.61 -> DT xxx K0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0586 <- 3.83 -> DT xxx K0011 : score x.xxxxx >4gnx_Z:Nucleic_acid-binding_proteins; title=STRUCTURE OF U. MAYDIS REPLICATION PROTEIN A BOUND TO SSDNA organism=USTILAGO MAYDIS : H : ASN ND2 Z0237 <- 3.04 -> DT O2 L0002 : score 4.51834 : H : LYS NZ Z0384 <- 2.60 -> DT O4 L0007 : score 3.73067 : H : SER OG Z0394 <- 3.33 -> DT O4 L0007 : score 3.17828 : H : ARG NH2 Z0522 <- 3.41 -> DT O2 L0013 : score 3.71687 : H : SER OG Z0526 <- 2.85 -> DT O2 L0018 : score 3.66046 : H : ASP OD2 Z0588 <- 2.86 -> DT N3 L0016 : score 3.54413 : H : ARG NH2 Z0597 <- 2.78 -> DT O4 L0014 : score 3.56806 : V : PHE CZ Z0236 <- 3.62 -> DT C7 L0003 : score 7.43504 : V : PHE CD2 Z0267 <- 3.68 -> DT C7 L0004 : score 6.70715 : V : TRP CD1 Z0359 <- 3.71 -> DT C7 L0006 : score 7.49833 : V : PHE CZ Z0541 <- 3.72 -> DT C7 L0013 : score 7.25717 : V : PHE CB Z0590 <- 3.52 -> DT C7 L0016 : score 6.2071 : V : ARG CZ Z0595 <- 3.67 -> DT C7 L0017 : score 2.20161 : V : TRP CD1 Z0537 <- 3.63 -> DT C7 L0018 : score 7.645 : x : ARG xxxx Z0208 <- 3.31 -> DT xxx L0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx Z0210 <- 3.99 -> DT xxx L0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Z0219 <- 3.83 -> DT xxx L0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0259 <- 2.66 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Z0264 <- 3.83 -> DT xxx L0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx Z0339 <- 3.23 -> DT xxx L0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Z0341 <- 3.67 -> DT xxx L0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Z0357 <- 4.18 -> DT xxx L0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Z0388 <- 3.13 -> DT xxx L0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Z0396 <- 4.14 -> DT xxx L0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Z0397 <- 3.18 -> DT xxx L0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Z0446 <- 3.38 -> DT xxx L0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx Z0448 <- 3.35 -> DT xxx L0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Z0450 <- 4.40 -> DT xxx L0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx Z0469 <- 3.96 -> DT xxx L0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0470 <- 3.44 -> DT xxx L0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx Z0478 <- 3.28 -> DT xxx L0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0479 <- 3.43 -> DT xxx L0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Z0481 <- 3.13 -> DT xxx L0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Z0484 <- 3.93 -> DT xxx L0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0487 <- 4.40 -> DT xxx L0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Z0496 <- 3.68 -> DT xxx L0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Z0524 <- 3.99 -> DT xxx L0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Z0528 <- 4.44 -> DT xxx L0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Z0543 <- 4.41 -> DT xxx L0012 : score x.xxxxx >4gop_AYZ:Nucleic_acid-binding_proteins; title=STRUCTURE AND CONFORMATIONAL CHANGE OF A REPLICATION PROTEIN A HETEROTRIMER BOUND TO SSDNA organism=USTILAGO MAYDIS : H : THR OG1 Y0135 <- 3.05 -> DT N3 L0021 : score 2.22763 : H : SER OG Y0146 <- 3.11 -> DT O2 L0021 : score 3.46819 : H : LYS NZ Z0384 <- 2.61 -> DT O4 L0007 : score 3.72349 : H : LYS NZ Z0481 <- 3.02 -> DT O2 L0017 : score 3.42934 : H : ARG NH2 Z0522 <- 2.72 -> DT O2 L0013 : score 4.30107 : H : SER OG Z0526 <- 3.22 -> DT O2 L0018 : score 3.38685 : H : ASP OD2 Z0588 <- 2.76 -> DT N3 L0016 : score 3.61588 : H : ARG NH2 Z0595 <- 2.89 -> DT O4 L0018 : score 3.48988 : H : ARG NH2 Z0597 <- 2.66 -> DT O4 L0014 : score 3.65335 : V : PHE CZ Z0236 <- 3.61 -> DT C7 L0003 : score 7.45283 : V : PHE CD2 Z0267 <- 3.82 -> DT C7 L0004 : score 6.47924 : V : TRP CD1 Z0359 <- 3.83 -> DT C7 L0006 : score 7.27833 : V : PHE CZ Z0541 <- 3.56 -> DT C7 L0013 : score 7.54176 : V : TRP CD1 Z0537 <- 3.65 -> DT C7 L0018 : score 7.60833 : x : ASN xxxx Y0046 <- 3.78 -> DT xxx L0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Y0077 <- 2.88 -> DT xxx L0021 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx Y0110 <- 3.60 -> DT xxx L0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Y0137 <- 3.24 -> DT xxx L0022 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Y0139 <- 4.17 -> DT xxx L0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx Y0149 <- 3.46 -> DT xxx L0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0208 <- 3.63 -> DT xxx L0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx Z0210 <- 3.66 -> DT xxx L0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Z0219 <- 3.67 -> DT xxx L0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Z0237 <- 3.79 -> DT xxx L0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0259 <- 2.70 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Z0264 <- 3.86 -> DT xxx L0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx Z0339 <- 3.14 -> DT xxx L0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Z0341 <- 3.70 -> DT xxx L0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Z0357 <- 3.93 -> DT xxx L0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Z0388 <- 3.12 -> DT xxx L0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Z0394 <- 3.61 -> DT xxx L0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Z0396 <- 3.92 -> DT xxx L0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Z0397 <- 3.20 -> DT xxx L0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Z0446 <- 3.34 -> DT xxx L0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx Z0448 <- 2.97 -> DT xxx L0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Z0450 <- 4.22 -> DT xxx L0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0470 <- 3.49 -> DT xxx L0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx Z0478 <- 3.19 -> DT xxx L0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0479 <- 3.25 -> DT xxx L0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Z0484 <- 3.67 -> DT xxx L0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0487 <- 4.31 -> DT xxx L0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Z0496 <- 3.71 -> DT xxx L0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Z0524 <- 3.93 -> DT xxx L0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Z0528 <- 4.02 -> DT xxx L0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Z0543 <- 4.49 -> DT xxx L0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Z0590 <- 3.24 -> DT xxx L0016 : score x.xxxxx >4gop_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=STRUCTURE AND CONFORMATIONAL CHANGE OF A REPLICATION PROTEIN A HETEROTRIMER BOUND TO SSDNA organism=USTILAGO MAYDIS : H : THR OG1 B0135 <- 3.10 -> DT N3 K0021 : score 2.20418 : H : THR OG1 B0135 <- 2.88 -> DT O4 K0021 : score 3.82498 : H : SER OG B0146 <- 2.74 -> DT O2 K0021 : score 3.74181 : V : LEU CD2 B0133 <- 3.59 -> DT C7 K0021 : score 6.03217 >4guo_BD:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN COMPLEX WITH 12 BP DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0138 <- 2.63 -> DG N7 F0412 : score 5.56902 : H : LYS NZ B0138 <- 2.70 -> DG O6 F0413 : score 5.89638 : H : CYS SG B0297 <- 3.21 -> DC N4 E0406 : score -3.18711 : H : ARG NH1 B0300 <- 2.94 -> DG N7 E0405 : score 5.8806 : H : ARG NH2 B0300 <- 3.03 -> DG O6 E0405 : score 6.2964 : H : LYS NZ D0138 <- 2.71 -> DG N7 G0502 : score 5.48284 : H : LYS NZ D0138 <- 2.99 -> DG O6 G0502 : score 5.5611 : H : LYS NZ D0138 <- 2.65 -> DG O6 G0503 : score 5.95419 : H : CYS SG D0297 <- 3.21 -> DC N4 H0520 : score -3.18711 : H : ARG NH1 D0300 <- 3.07 -> DG O6 H0519 : score 5.75483 : H : ARG NH2 D0300 <- 3.17 -> DG N7 H0519 : score 5.91215 : x : ARG xxxx B0268 <- 3.98 -> DG xxx F0417 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0296 <- 4.12 -> DC xxx E0406 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0296 <- 4.16 -> DG xxx H0519 : score x.xxxxx >4guo_I:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN COMPLEX WITH 12 BP DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ I0138 <- 2.87 -> DG N7 M0602 : score 5.31049 : H : LYS NZ I0138 <- 2.86 -> DG O6 M0603 : score 5.7114 : H : CYS SG I0297 <- 3.33 -> DC N4 N0620 : score -3.10378 : H : ARG NH1 I0300 <- 2.80 -> DG N7 N0619 : score 6.05 : H : ARG NH2 I0300 <- 3.02 -> DG O6 N0619 : score 6.3096 : x : SER xxxx I0139 <- 3.68 -> DG xxx M0601 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0296 <- 4.04 -> DG xxx N0619 : score x.xxxxx >4guo_IJ:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN COMPLEX WITH 12 BP DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ I0138 <- 2.87 -> DG N7 M0602 : score 5.31049 : H : LYS NZ I0138 <- 2.86 -> DG O6 M0603 : score 5.7114 : H : CYS SG I0297 <- 3.33 -> DC N4 N0620 : score -3.10378 : H : ARG NH1 I0300 <- 2.80 -> DG N7 N0619 : score 6.05 : H : ARG NH2 I0300 <- 3.02 -> DG O6 N0619 : score 6.3096 : H : LYS NZ J0138 <- 2.64 -> DG N7 N0614 : score 5.55825 : H : ARG NH1 J0300 <- 3.04 -> DG N7 M0607 : score 5.7596 : H : ARG NH2 J0300 <- 3.20 -> DG O6 M0607 : score 6.072 : x : SER xxxx I0139 <- 3.68 -> DG xxx M0601 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0296 <- 4.04 -> DG xxx N0619 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0139 <- 3.96 -> DG xxx N0613 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0268 <- 4.29 -> DG xxx N0619 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0296 <- 4.42 -> DC xxx M0608 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx J0297 <- 3.53 -> DC xxx M0608 : score x.xxxxx >4guo_KL:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN COMPLEX WITH 12 BP DNA organism=Homo sapiens : H : CYS SG K0297 <- 3.39 -> DC N4 O0708 : score -3.06212 : H : ARG NH1 K0300 <- 2.84 -> DG O6 O0707 : score 6.03467 : H : ARG NH2 K0300 <- 2.31 -> DG N7 O0707 : score 7.01031 : H : LYS NZ L0138 <- 2.80 -> DG N7 O0702 : score 5.3859 : H : LYS NZ L0138 <- 2.55 -> DG O6 O0703 : score 6.06981 : H : ARG NH1 L0300 <- 3.27 -> DG N7 P0719 : score 5.4813 : H : ARG NH1 L0300 <- 2.98 -> DG O6 P0719 : score 5.86433 : H : ARG NH2 L0300 <- 2.93 -> DG N7 P0719 : score 6.21862 : x : LYS xxxx K0138 <- 3.25 -> DG xxx P0714 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx K0296 <- 4.27 -> DG xxx O0707 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx L0296 <- 4.11 -> DG xxx P0719 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx L0297 <- 3.48 -> DC xxx P0720 : score x.xxxxx >4guq_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF MUTS139F P73 DNA BINDING DOMAIN COMPLEXED WITH 20BP DNA RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0300 <- 3.14 -> DG N7 F0416 : score 5.6386 : H : ARG NH2 A0300 <- 3.13 -> DG O6 F0416 : score 6.1644 : x : ALA xxxx A0296 <- 3.69 -> DT xxx F0417 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0297 <- 3.35 -> DT xxx F0417 : score x.xxxxx >4guq_AB:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF MUTS139F P73 DNA BINDING DOMAIN COMPLEXED WITH 20BP DNA RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0300 <- 3.14 -> DG N7 F0416 : score 5.6386 : H : ARG NH2 A0300 <- 3.13 -> DG O6 F0416 : score 6.1644 : H : ARG NH1 B0300 <- 3.13 -> DG O6 E0406 : score 5.68183 : x : ALA xxxx A0296 <- 3.69 -> DT xxx F0417 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0297 <- 3.35 -> DT xxx F0417 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0296 <- 3.51 -> DT xxx E0407 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0297 <- 3.74 -> DT xxx E0407 : score x.xxxxx >4gxi_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=R283K DNA POLYMERASE BETA BINARY COMPLEX WITH A TEMPLATING 8OG organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.24 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.80 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.47 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4gxj_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=R283K DNA POLYMERASE BETA TERNARY COMPLEX WITH A TEMPLATING 8OG AND INCOMING DCTP ANALOG organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 3.25 -> DG N3 T0009 : score 1.323 : w : LYS NZ A0234 <- 6.04 -> DG N2 P0009 : score 0.846 : H : TYR OH A0271 <- 3.29 -> DA N3 P0010 : score 3.74446 : w : LYS NZ A0283 <- 6.72 -> DT O2 T0007 : score 0.522 : x : GLU xxxx A0295 <- 4.40 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >4gxk_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=R283K DNA POLYMERASE BETA TERNARY COMPLEX WITH A TEMPLATING 8OG AND INCOMING DATP ANALOG organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.41 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.81 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.52 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4gz0_AG:DNase_I-like; title=MUS MUSCULUS TDP2-DNA SUBSTRATE ANALOG (5'-6-AMINOHEXANOL) COMPLEX organism=Mus musculus : w : TYR OH A0321 <- 6.00 -> DC O2 D0003 : score 1.343 : w : TYR OH G0321 <- 5.89 -> DC O2 H0003 : score 1.343 : x : ARG xxxx A0316 <- 3.66 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0317 <- 3.49 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0318 <- 3.72 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0316 <- 3.87 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0317 <- 3.54 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0318 <- 3.91 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >4gz0_BI:DNase_I-like; title=MUS MUSCULUS TDP2-DNA SUBSTRATE ANALOG (5'-6-AMINOHEXANOL) COMPLEX organism=Mus musculus : w : TYR OH B0321 <- 5.62 -> DC O2 C0003 : score 1.343 : w : TYR OH I0321 <- 6.06 -> DC O2 J0003 : score 1.343 : x : ARG xxxx B0316 <- 4.09 -> DG xxx J0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0317 <- 3.52 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0318 <- 3.45 -> DG xxx J0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0316 <- 3.93 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0317 <- 3.46 -> DC xxx J0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0318 <- 3.48 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx >4gz0_EK:DNase_I-like; title=MUS MUSCULUS TDP2-DNA SUBSTRATE ANALOG (5'-6-AMINOHEXANOL) COMPLEX organism=Mus musculus : w : TYR OH E0321 <- 5.89 -> DC O2 F0003 : score 1.343 : w : TYR OH K0321 <- 5.93 -> DC O2 L0003 : score 1.343 : x : ARG xxxx E0316 <- 3.94 -> DG xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E0317 <- 3.47 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0318 <- 3.70 -> DG xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0316 <- 4.04 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx K0317 <- 3.34 -> DC xxx L0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx K0318 <- 3.91 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx >4gz0_G:DNase_I-like; title=MUS MUSCULUS TDP2-DNA SUBSTRATE ANALOG (5'-6-AMINOHEXANOL) COMPLEX organism=Mus musculus : w : TYR OH G0321 <- 5.89 -> DC O2 H0003 : score 1.343 : x : ARG xxxx G0316 <- 3.87 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0317 <- 3.54 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0318 <- 3.91 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >4gz1_A:DNase_I-like; title=MUS MUSCULUS TDP2 REACTION PRODUCT (5'-PHOSPHORYLATED DNA)-MG2+ COMPLEX AT 1.5 ANGSTROMS RESOLUTION organism=Mus musculus : x : ILE xxxx A0317 <- 3.64 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0318 <- 3.39 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0319 <- 3.86 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0321 <- 3.44 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx >4gz1_AB:DNase_I-like; title=MUS MUSCULUS TDP2 REACTION PRODUCT (5'-PHOSPHORYLATED DNA)-MG2+ COMPLEX AT 1.5 ANGSTROMS RESOLUTION organism=Mus musculus : x : ILE xxxx A0317 <- 3.64 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0318 <- 3.39 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0319 <- 3.86 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0321 <- 3.44 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0307 <- 4.31 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0317 <- 3.48 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0318 <- 3.54 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0319 <- 4.20 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0321 <- 3.45 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx >4gz2_AB:DNase_I-like; title=MUS MUSCULUS TDP2 EXCLUDED SSDNA COMPLEX organism=Mus musculus : w : TYR OH B0321 <- 5.45 -> DG N2 D0012 : score 2.834 : x : ILE xxxx A0317 <- 3.70 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0318 <- 3.77 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0319 <- 4.46 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0321 <- 3.39 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0317 <- 3.54 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0318 <- 3.49 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0319 <- 4.04 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx >4gz2_B:DNase_I-like; title=MUS MUSCULUS TDP2 EXCLUDED SSDNA COMPLEX organism=Mus musculus : w : TYR OH B0321 <- 5.45 -> DG N2 D0012 : score 2.834 : x : ILE xxxx B0317 <- 3.54 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0318 <- 3.49 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0319 <- 4.04 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx >4gzn_C:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=MOUSE ZFP57 ZINC FINGERS IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=Mus musculus : w : ASP OD2 C0151 <- 5.82 -> DA N6 B0009 : score 3.409 : H : SER OG C0153 <- 2.90 -> DC N4 B0008 : score 3.60213 : H : ARG NH1 C0157 <- 2.86 -> DG O6 B0007 : score 6.01033 : H : ARG NH1 C0157 <- 2.91 -> DG O6 A0005 : score 5.9495 : H : ARG NH2 C0157 <- 3.06 -> DG N7 A0005 : score 6.05262 : H : ARG NH2 C0157 <- 3.21 -> DG O6 A0005 : score 6.0588 : H : ARG NH1 C0178 <- 3.06 -> DG N7 B0006 : score 5.7354 : H : ARG NH2 C0178 <- 2.81 -> DG O6 B0006 : score 6.5868 : w : ARG NH2 C0178 <- 5.90 -> DC N4 A0006 : score 0.976 : H : ARG NH1 C0185 <- 2.96 -> DG N7 B0004 : score 5.8564 : H : ARG NH2 C0185 <- 2.84 -> DG O6 B0004 : score 6.5472 : w : ARG NH2 C0185 <- 5.69 -> DG O6 A0008 : score 2.468 : x : ALA xxxx C0152 <- 4.06 -> DT xxx A0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0181 <- 3.72 -> DG xxx A0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0182 <- 4.45 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx >4gzy_CD: title=CRYSTAL STRUCTURES OF BACTERIAL RNA POLYMERASE PAUSED ELONGATION COMPLEXES organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : ARG xxxx C0422 <- 4.06 -> DA xxx N0003 : score x.xxxxx >4gzz_CD: title=CRYSTAL STRUCTURES OF BACTERIAL RNA POLYMERASE PAUSED ELONGATION COMPLEXES organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : ARG xxxx C0422 <- 4.30 -> DA xxx N0003 : score x.xxxxx >4h0e_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MUTANT ORR3 IN COMPLEX WITH NTD OF ARAR organism=Bacillus Subtilis : H : ARG NH1 A0041 <- 2.95 -> DG O6 U0007 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0041 <- 2.78 -> DG N7 U0007 : score 6.41015 : H : HIS ND1 A0042 <- 3.11 -> DC N4 T0012 : score 3.02445 : w : HIS ND1 A0042 <- 5.73 -> DG O6 T0013 : score 4.006 : H : GLN NE2 A0061 <- 2.94 -> DA N3 T0018 : score 3.91417 : x : GLU xxxx A0030 <- 4.05 -> DT xxx U0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0031 <- 4.32 -> DT xxx U0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0040 <- 3.85 -> DC xxx T0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0045 <- 3.39 -> DT xxx U0008 : score x.xxxxx >4h0e_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MUTANT ORR3 IN COMPLEX WITH NTD OF ARAR organism=Bacillus Subtilis : H : ARG NH1 A0041 <- 2.95 -> DG O6 U0007 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0041 <- 2.78 -> DG N7 U0007 : score 6.41015 : H : HIS ND1 A0042 <- 3.11 -> DC N4 T0012 : score 3.02445 : w : HIS ND1 A0042 <- 5.73 -> DG O6 T0013 : score 4.006 : H : GLN NE2 A0061 <- 2.94 -> DA N3 T0018 : score 3.91417 : H : ARG NH1 B0041 <- 3.03 -> DG O6 T0009 : score 5.8035 : H : ARG NH2 B0041 <- 2.84 -> DG N7 T0009 : score 6.33354 : w : ARG NH1 B0041 <- 5.91 -> DA N6 U0013 : score 1.486 : H : GLN NE2 B0061 <- 2.75 -> DT O2 U0016 : score 3.97267 : x : GLU xxxx A0030 <- 4.05 -> DT xxx U0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0031 <- 4.32 -> DT xxx U0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0040 <- 3.85 -> DC xxx T0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0045 <- 3.39 -> DT xxx U0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0030 <- 4.28 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0040 <- 3.81 -> DC xxx U0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0042 <- 3.20 -> DC xxx U0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.47 -> DT xxx T0010 : score x.xxxxx >4h10_A:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=INTERMOLECULAR RECOGNITION REVEALED BY THE COMPLEX STRUCTURE OF HUMAN CLOCK-BMAL1 BASIC HELIX-LOOP-HELIX DOMAINS WITH E-BOX DNA organism=HOMO SAPIENS : H : HIS NE2 A0077 <- 2.72 -> DG O6 C0113 : score 8.08111 : H : GLU OE2 A0081 <- 3.29 -> DC N4 D0308 : score 4.74938 : w : GLU OE1 A0081 <- 5.48 -> DG O6 C0111 : score 2.669 : w : ARG NH1 A0084 <- 5.97 -> DA N7 D0309 : score 0.388 : w : ARG NH1 A0085 <- 5.45 -> DG O6 C0111 : score 2.756 : V : ILE CG2 A0080 <- 3.66 -> DT C7 D0307 : score 7.33948 : V : SER CB A0078 <- 3.85 -> DT C7 C0112 : score 3.09214 >4h10_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=INTERMOLECULAR RECOGNITION REVEALED BY THE COMPLEX STRUCTURE OF HUMAN CLOCK-BMAL1 BASIC HELIX-LOOP-HELIX DOMAINS WITH E-BOX DNA organism=HOMO SAPIENS : H : HIS NE2 A0077 <- 2.72 -> DG O6 C0113 : score 8.08111 : H : GLU OE2 A0081 <- 3.29 -> DC N4 D0308 : score 4.74938 : w : GLU OE1 A0081 <- 5.48 -> DG O6 C0111 : score 2.669 : w : ARG NH1 A0084 <- 5.97 -> DA N7 D0309 : score 0.388 : w : ARG NH1 A0085 <- 5.45 -> DG O6 C0111 : score 2.756 : H : ARG NH1 B0039 <- 2.97 -> DG O6 D0313 : score 5.8765 : H : ARG NH2 B0039 <- 2.99 -> DG N7 D0313 : score 6.142 : H : GLU OE1 B0043 <- 3.06 -> DC N4 C0108 : score 5.46802 : w : GLU OE2 B0043 <- 5.34 -> DG O6 D0311 : score 2.892 : w : ARG NH1 B0047 <- 5.79 -> DG O6 D0311 : score 2.756 : V : SER CB A0078 <- 3.85 -> DT C7 C0112 : score 3.09214 : V : ILE CG2 A0080 <- 3.66 -> DT C7 D0307 : score 7.33948 : x : ASN xxxx B0040 <- 3.23 -> DT xxx D0312 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0046 <- 3.78 -> DC xxx C0108 : score x.xxxxx >4h10_B:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=INTERMOLECULAR RECOGNITION REVEALED BY THE COMPLEX STRUCTURE OF HUMAN CLOCK-BMAL1 BASIC HELIX-LOOP-HELIX DOMAINS WITH E-BOX DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 B0039 <- 2.97 -> DG O6 D0313 : score 5.8765 : H : ARG NH2 B0039 <- 2.99 -> DG N7 D0313 : score 6.142 : H : GLU OE1 B0043 <- 3.06 -> DC N4 C0108 : score 5.46802 : w : GLU OE2 B0043 <- 5.34 -> DG O6 D0311 : score 2.892 : w : ARG NH1 B0047 <- 5.79 -> DG O6 D0311 : score 2.756 : x : ASN xxxx B0040 <- 3.23 -> DT xxx D0312 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0046 <- 3.78 -> DC xxx C0108 : score x.xxxxx >4h5q_ABC:UBA-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RIFT VALLEY FEVER VIRUS NUCLEOCAPSID PROTEIN HEXAMER BOUND TO SINGLE-STRANDED DNA organism=Rift valley fever virus : H : SER OG A0177 <- 3.17 -> DT N3 D0006 : score 1.84013 : H : ASN ND2 A0181 <- 3.17 -> DT O2 D0006 : score 4.39494 : H : SER OG B0105 <- 2.64 -> DT O2 D0012 : score 3.81575 : H : GLN NE2 B0198 <- 2.64 -> DT O2 D0009 : score 4.0592 : H : SER OG C0105 <- 2.49 -> DT O2 D0003 : score 3.92668 : V : PHE CZ C0176 <- 3.80 -> DT C7 D0004 : score 7.11487 : V : PRO CB A0199 <- 3.52 -> DT C7 D0006 : score 6.21258 : V : TYR CB B0030 <- 3.90 -> DT C7 D0010 : score 4.747 >4h5q_B:UBA-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RIFT VALLEY FEVER VIRUS NUCLEOCAPSID PROTEIN HEXAMER BOUND TO SINGLE-STRANDED DNA organism=Rift valley fever virus : H : SER OG B0105 <- 2.64 -> DT O2 D0012 : score 3.81575 : H : GLN NE2 B0198 <- 2.64 -> DT O2 D0009 : score 4.0592 : V : TYR CB B0030 <- 3.90 -> DT C7 D0010 : score 4.747 : x : ASN xxxx B0066 <- 3.63 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0096 <- 3.33 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0127 <- 3.43 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0176 <- 3.57 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0180 <- 3.57 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0199 <- 3.40 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0202 <- 4.05 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >4h8k_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LC11-RNASE H1 IN COMPLEX WITH RNA/DNA HYBRID organism=uncultured organism : H : ASN ND2 A0045 <- 3.35 -> DG N3 D0011 : score 4.35644 : H : ASN ND2 A0046 <- 3.28 -> DG N3 D0011 : score 4.42496 : x : ASN xxxx A0015 <- 3.03 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0080 <- 3.58 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0089 <- 4.24 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx >4h8k_AB:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LC11-RNASE H1 IN COMPLEX WITH RNA/DNA HYBRID organism=uncultured organism : H : ASN ND2 A0045 <- 3.35 -> DG N3 D0011 : score 4.35644 : H : ASN ND2 A0046 <- 3.28 -> DG N3 D0011 : score 4.42496 : H : ASN ND2 B0045 <- 3.02 -> DT O2 D0005 : score 4.53732 : H : ASN ND2 B0046 <- 2.92 -> DT O2 D0005 : score 4.63225 : x : ASN xxxx A0015 <- 3.03 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0080 <- 3.58 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0089 <- 4.24 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0015 <- 3.14 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0080 <- 3.68 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx >4hc7_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE FULL DNA BINDING DOMAIN OF GATA3-COMPLEX 2 organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0330 <- 3.11 -> DG N7 W0014 : score 5.6749 : H : ARG NH2 A0330 <- 2.94 -> DG O6 W0014 : score 6.4152 : H : ARG NH1 A0365 <- 2.96 -> DT O2 X0006 : score 4.16861 : w : ARG NH1 A0365 <- 6.11 -> DA N3 W0017 : score 2.585 : V : LEU CB A0344 <- 3.79 -> DT C7 X0006 : score 4.40997 : x : THR xxxx A0327 <- 3.65 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0328 <- 3.66 -> DG xxx W0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0340 <- 3.00 -> DA xxx X0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0348 <- 3.96 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx >4hc9_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=DNA BINDING BY GATA TRANSCRIPTION FACTOR-COMPLEX 3 organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0276 <- 2.97 -> DG N7 Z0013 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0276 <- 3.04 -> DT O4 Y0009 : score 3.38326 : H : ARG NH2 A0276 <- 2.97 -> DG O6 Z0013 : score 6.3756 : x : PRO xxxx A0273 <- 4.35 -> DT xxx Y0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0274 <- 3.39 -> DC xxx Y0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0286 <- 3.11 -> DA xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0290 <- 3.67 -> DA xxx Y0008 : score x.xxxxx >4hca_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=DNA BINDING BY GATA TRANSCRIPTION FACTOR-COMPLEX 1 organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0276 <- 2.82 -> DG N7 Y0013 : score 6.0258 : H : ARG NH2 A0276 <- 2.81 -> DG O6 Y0013 : score 6.5868 : H : ARG NH1 A0330 <- 2.82 -> DG N7 X0012 : score 6.0258 : H : ARG NH2 A0330 <- 2.83 -> DG O6 X0012 : score 6.5604 : H : ARG NH1 A0365 <- 2.77 -> DT O2 Y0008 : score 4.33225 : H : ARG NH2 A0365 <- 2.82 -> DT O2 Y0008 : score 4.2164 : H : ARG NH2 A0367 <- 2.68 -> DT O2 X0014 : score 4.33493 : H : ARG NH2 A0367 <- 2.81 -> DT O2 Y0010 : score 4.22487 : V : LEU CB A0344 <- 3.88 -> DT C7 Y0008 : score 4.31099 : x : PRO xxxx A0273 <- 3.96 -> DT xxx X0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0274 <- 3.70 -> DC xxx X0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0286 <- 3.19 -> DA xxx X0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0290 <- 3.53 -> DA xxx X0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0327 <- 3.55 -> DT xxx Y0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0328 <- 3.66 -> DG xxx X0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0340 <- 3.36 -> DT xxx Y0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0347 <- 3.66 -> DG xxx X0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0348 <- 4.36 -> DT xxx Y0007 : score x.xxxxx >4hcb_A:Ribonuclease_H-like; title=THE METAL-FREE FORM OF CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI EXOI-SSDNA COMPLEX organism=Escherichia coli : w : ASP OD2 A0122 <- 5.66 -> DA N3 C0001 : score 1.331 >4hcb_AB:Ribonuclease_H-like; title=THE METAL-FREE FORM OF CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI EXOI-SSDNA COMPLEX organism=Escherichia coli : w : TRP NE1 B0251 <- 6.56 -> DA N6 C0003 : score 4.074 >4hdu_A:Methylated_DNA-protein_cysteine_methyltransferase,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. POMBE ATL1 IN COMPLEX WITH DAMAGED DNA CONTAINING 2-AMINOPURINE organism=Schizosaccharomyces pombe : H : GLN NE2 A0043 <- 3.22 -> DA N3 C0023 : score 3.68866 : x : ARG xxxx A0039 <- 3.27 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0040 <- 3.71 -> DC xxx C0022 : score x.xxxxx >4hdv_A:Methylated_DNA-protein_cysteine_methyltransferase,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. POMBE ATL1 IN COMPLEX WITH DAMAGED DNA CONTAINING 2,6-DIAMINOPURINE organism=Schizosaccharomyces pombe : H : GLN NE2 A0043 <- 3.29 -> DA N3 C0023 : score 3.63228 : x : ARG xxxx A0039 <- 3.10 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0040 <- 3.11 -> DC xxx C0022 : score x.xxxxx >4hf1_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ISCR BOUND TO ITS PROMOTER organism=Escherichia coli : H : SER OG A0040 <- 2.87 -> DA N7 C0020 : score 4.40161 : H : SER OG A0040 <- 3.45 -> DA N6 C0020 : score 2.86208 : H : GLU OE2 A0043 <- 2.81 -> DC N4 D0007 : score 5.25485 : H : GLN NE2 A0044 <- 3.17 -> DT O4 C0019 : score 4.80689 : H : ARG NH2 A0059 <- 3.29 -> DT O2 C0025 : score 3.81847 : x : SER xxxx A0038 <- 4.26 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.88 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0061 <- 3.13 -> DT xxx C0027 : score x.xxxxx >4hf1_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ISCR BOUND TO ITS PROMOTER organism=Escherichia coli : H : SER OG A0040 <- 2.87 -> DA N7 C0020 : score 4.40161 : H : SER OG A0040 <- 3.45 -> DA N6 C0020 : score 2.86208 : H : GLU OE2 A0043 <- 2.81 -> DC N4 D0007 : score 5.25485 : H : GLN NE2 A0044 <- 3.17 -> DT O4 C0019 : score 4.80689 : H : ARG NH2 A0059 <- 3.29 -> DT O2 C0025 : score 3.81847 : H : SER OG B0040 <- 2.74 -> DG N7 D0020 : score 4.53584 : H : GLU OE1 B0043 <- 3.06 -> DC N4 C0008 : score 5.46802 : H : GLU OE2 B0043 <- 2.65 -> DC N4 C0007 : score 5.42335 : H : GLN NE2 B0044 <- 2.99 -> DT O4 D0019 : score 4.99377 : x : SER xxxx A0038 <- 4.26 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.88 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0061 <- 3.13 -> DT xxx C0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0038 <- 4.33 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0041 <- 3.77 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0059 <- 3.26 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0061 <- 3.09 -> DT xxx D0027 : score x.xxxxx >4hf2_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E43A ISCR MUTANT BOUND TO ITS PROMOTER organism=Escherichia coli : H : SER OG A0040 <- 2.99 -> DA N7 C0020 : score 4.29447 : H : SER OG A0040 <- 3.06 -> DA N6 C0020 : score 3.11868 : x : SER xxxx A0038 <- 4.16 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.93 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0044 <- 3.17 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0059 <- 3.38 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0061 <- 3.16 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx >4hf2_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E43A ISCR MUTANT BOUND TO ITS PROMOTER organism=Escherichia coli : H : SER OG A0040 <- 2.99 -> DA N7 C0020 : score 4.29447 : H : SER OG A0040 <- 3.06 -> DA N6 C0020 : score 3.11868 : H : SER OG B0040 <- 2.74 -> DG N7 D0020 : score 4.53584 : H : GLN NE2 B0044 <- 3.02 -> DT O4 D0019 : score 4.96262 : x : SER xxxx A0038 <- 4.16 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.93 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0044 <- 3.17 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0059 <- 3.38 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0061 <- 3.16 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0041 <- 3.60 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0059 <- 3.65 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0061 <- 3.13 -> DT xxx D0027 : score x.xxxxx >4hht_A:Ribonuclease_H-like; title=T. MARITIMA RNASE H2 G21S IN COMPLEX WITH NUCLEIC ACID SUBSTRATE AND CALCIUM IONS organism=Thermotoga maritima : x : ARG xxxx A0022 <- 4.47 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0163 <- 3.86 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >4hja_A:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE POT1PC BOUND TO SSDNA (ACGGTTACGGT) organism=Schizosaccharomyces pombe : H : LYS NZ A0025 <- 2.76 -> DG N7 B0009 : score 5.42898 : H : ARG NH1 A0068 <- 3.30 -> DT O2 B0006 : score 3.87577 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.92 -> DT O2 B0006 : score 4.13173 : H : ASP OD1 A0073 <- 2.73 -> DG N2 B0003 : score 5.2221 : H : LYS NZ A0097 <- 2.86 -> DG O6 B0004 : score 5.7114 : H : ASP OD2 A0099 <- 2.73 -> DT N3 B0006 : score 3.6374 : H : ASP OD2 A0099 <- 3.09 -> DA N6 B0007 : score 3.77042 : H : GLU OE2 A0105 <- 2.92 -> DG N2 B0004 : score 4.20681 : H : HIS ND1 A0109 <- 2.78 -> DG O6 B0003 : score 6.24797 : V : LEU CD2 A0101 <- 3.85 -> DT C7 B0006 : score 5.65964 : x : TRP xxxx A0027 <- 3.30 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0028 <- 3.21 -> DT xxx B0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0036 <- 3.83 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0047 <- 3.46 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0049 <- 4.32 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0055 <- 4.15 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0056 <- 4.22 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0057 <- 3.27 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0070 <- 4.29 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0072 <- 3.34 -> DG xxx B0003 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0100 <- 3.05 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0103 <- 3.27 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0107 <- 3.91 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx >4hje_A:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF P53 CORE DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 2.99 -> DG N7 F0002 : score 5.18123 : w : LYS NZ A0120 <- 6.35 -> DG O6 F0003 : score 3.005 : H : SER OG A0121 <- 3.35 -> DA N7 F0001 : score 3.97305 : w : ARG NH1 A0248 <- 5.45 -> DA N3 E0016 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0248 <- 5.73 -> DA N3 E0016 : score 2.092 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.81 -> DG O6 E0018 : score 6.07117 : H : ARG NH2 A0280 <- 3.02 -> DG N7 E0018 : score 6.10369 : w : ARG NH1 A0280 <- 6.37 -> DG O6 F0003 : score 2.756 : x : ALA xxxx A0276 <- 4.16 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0277 <- 3.65 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx >4hje_ABCD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF P53 CORE DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 2.99 -> DG N7 F0002 : score 5.18123 : w : LYS NZ A0120 <- 6.35 -> DG O6 F0003 : score 3.005 : H : SER OG A0121 <- 3.35 -> DA N7 F0001 : score 3.97305 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.81 -> DG O6 E0018 : score 6.07117 : H : ARG NH2 A0280 <- 3.02 -> DG N7 E0018 : score 6.10369 : w : ARG NH1 A0280 <- 6.37 -> DG O6 F0003 : score 2.756 : w : LYS NZ B0120 <- 5.24 -> DT O4 F0008 : score 1.7 : w : SER OG B0121 <- 6.08 -> DG O6 E0011 : score 2.749 : w : ARG NH2 B0248 <- 5.23 -> DT O2 F0005 : score 2.261 : w : CYS SG B0277 <- 6.01 -> DT O4 F0008 : score 4.152 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.87 -> DG O6 F0007 : score 5.99817 : H : ARG NH2 B0280 <- 2.97 -> DG N7 F0007 : score 6.16754 : w : ARG NH1 C0248 <- 5.27 -> DT O2 F0016 : score 1.855 : w : ARG NH2 C0248 <- 5.42 -> DT O2 F0016 : score 2.261 : H : ARG NH1 C0280 <- 2.68 -> DG O6 F0018 : score 6.22933 : H : ARG NH2 C0280 <- 2.94 -> DG N7 F0018 : score 6.20585 : w : ARG NH1 D0248 <- 5.32 -> DA N3 E0005 : score 2.585 : w : ARG NH2 D0248 <- 5.63 -> DA N3 E0005 : score 2.092 : H : ARG NH1 D0280 <- 2.88 -> DG O6 E0007 : score 5.986 : H : ARG NH2 D0280 <- 3.04 -> DG N7 E0007 : score 6.07815 : x : ALA xxxx A0276 <- 4.16 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0277 <- 3.65 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 3.81 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0120 <- 2.84 -> DC xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0276 <- 3.26 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0277 <- 3.71 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0120 <- 3.58 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0121 <- 4.10 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0276 <- 3.69 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0277 <- 3.62 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx >4hkq_A:DNA/RNA_polymerases; title=XMRV REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH RNA/DNA HYBRID organism=Xenotropic MuLV-related virus : H : TYR OH A0222 <- 2.90 -> DT O2 F0046 : score 3.15233 : x : PRO xxxx A0196 <- 4.14 -> DG xxx F0047 : score x.xxxxx >4hly_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF VIRF-1 FROM THE ONCOGENIC KSHV WITH DNA organism=HUMAN HERPESVIRUS 8 : H : ARG NH1 B0084 <- 2.63 -> DG O6 D0003 : score 6.29017 >4hn5_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN - TSLP NGRE COMPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0442 <- 2.84 -> DG N7 C0865 : score 5.34281 : w : LYS NZ A0442 <- 5.91 -> DG N7 C0864 : score 2.519 : w : LYS NZ B0442 <- 5.50 -> DG N7 D0852 : score 2.519 : H : ARG NH1 B0447 <- 2.97 -> DG N7 C0858 : score 5.8443 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.89 -> DG O6 C0858 : score 6.4812 : x : VAL xxxx A0443 <- 3.38 -> DC xxx D0846 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0447 <- 4.29 -> DT xxx D0845 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0443 <- 3.97 -> DC xxx C0859 : score x.xxxxx >4hn5_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN - TSLP NGRE COMPLEX organism=Homo sapiens : w : LYS NZ B0442 <- 5.50 -> DG N7 D0852 : score 2.519 : H : ARG NH1 B0447 <- 2.97 -> DG N7 C0858 : score 5.8443 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.89 -> DG O6 C0858 : score 6.4812 : x : VAL xxxx B0443 <- 3.97 -> DC xxx C0859 : score x.xxxxx >4hn6_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN R460D/D462R - TSLP NGRE COMPLEX organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0442 <- 5.81 -> DG N7 C0864 : score 2.519 : H : ARG NH1 B0447 <- 2.78 -> DG N7 C0858 : score 6.0742 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.87 -> DG O6 C0858 : score 6.5076 : x : VAL xxxx A0443 <- 3.52 -> DC xxx D0846 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0447 <- 3.42 -> DT xxx D0845 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0442 <- 4.01 -> DG xxx D0851 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0443 <- 4.04 -> DG xxx C0858 : score x.xxxxx >4hn6_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GR DNA BINDING DOMAIN R460D/D462R - TSLP NGRE COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0447 <- 2.78 -> DG N7 C0858 : score 6.0742 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.87 -> DG O6 C0858 : score 6.5076 : x : LYS xxxx B0442 <- 4.01 -> DG xxx D0851 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0443 <- 4.04 -> DG xxx C0858 : score x.xxxxx >4hp1_C: title=CRYSTAL STRUCTURE OF TET3 IN COMPLEX WITH A NON-CPG DSDNA organism=XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS / XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS : H : LYS NZ C0061 <- 3.34 -> DG N3 B0010 : score 1.29683 : w : LYS NZ C0061 <- 5.52 -> DA N3 A0004 : score 1.538 : H : HIS ND1 C0090 <- 2.66 -> DG O6 B0008 : score 6.39732 : x : GLN xxxx C0091 <- 4.19 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx >4hp3_C: title=CRYSTAL STRUCTURE OF TET3 IN COMPLEX WITH A CPG DSDNA organism=XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS / XENOPUS (SILURANA) TROPICALIS : H : LYS NZ C0061 <- 2.70 -> DT O2 B0009 : score 3.65892 : w : LYS NZ C0061 <- 5.70 -> DA N3 A0005 : score 1.538 : w : LYS NZ C0061 <- 5.98 -> DG N3 B0010 : score 2.232 : H : HIS ND1 C0090 <- 2.73 -> DG O6 B0007 : score 6.3102 : H : GLN NE2 C0091 <- 2.53 -> DG O6 A0007 : score 6.11861 : w : GLN OE1 C0091 <- 5.83 -> DG N7 A0007 : score 2.87 >4hqe_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF QSRR-DNA COMPLEX organism=Staphylococcus aureus : w : THR OG1 A0048 <- 5.98 -> DA N6 D0013 : score 3.251 : H : ARG NE A0050 <- 3.25 -> DT O4 D0012 : score 1.69167 : w : ARG NH1 A0050 <- 6.58 -> DA N6 C0004 : score 1.486 : V : PRO CB A0049 <- 3.76 -> DT C7 C0003 : score 5.86422 : x : PHE xxxx A0037 <- 3.64 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0051 <- 4.12 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 4.45 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx >4hqe_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF QSRR-DNA COMPLEX organism=Staphylococcus aureus : w : THR OG1 A0048 <- 5.98 -> DA N6 D0013 : score 3.251 : H : ARG NE A0050 <- 3.25 -> DT O4 D0012 : score 1.69167 : w : ARG NH1 A0050 <- 6.58 -> DA N6 C0004 : score 1.486 : w : THR OG1 B0048 <- 5.79 -> DA N6 C0013 : score 3.251 : w : ARG NH1 B0050 <- 6.25 -> DA N6 D0004 : score 1.486 : V : PRO CB A0049 <- 3.76 -> DT C7 C0003 : score 5.86422 : V : PRO CB B0049 <- 3.65 -> DT C7 D0003 : score 6.02388 : x : PHE xxxx A0037 <- 3.64 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0051 <- 4.12 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 4.45 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0037 <- 3.75 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0038 <- 4.09 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0051 <- 4.41 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx >4hqu_A:Cystine-knot_cytokines; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN PDGF-BB IN COMPLEX WITH A MODIFIED NUCLEOTIDE APTAMER (SOMAMER SL5) organism=Homo sapiens : x : ILE xxxx A0083 <- 3.55 -> DA xxx C0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0084 <- 3.23 -> DA xxx C0019 : score x.xxxxx >4hqx_A:Cystine-knot_cytokines; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN PDGF-BB IN COMPLEX WITH A MODIFIED NUCLEOTIDE APTAMER (SOMAMER SL4) organism=Homo sapiens : x : ILE xxxx A0083 <- 3.65 -> DA xxx C0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0084 <- 3.35 -> DA xxx C0019 : score x.xxxxx >4hri_AB:Periplasmic_binding_protein-like_II; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HETR IN COMPLEX WITH A 21-BP PALINDROMIC DNA AT THE UPSTREAM OF THE HETP PROMOTER FROM ANABAENA organism=NOSTOC : H : LYS NZ A0073 <- 2.54 -> DG N7 D0006 : score 5.66596 : H : ARG NH1 B0062 <- 2.46 -> DG N7 C0003 : score 6.4614 : H : LYS NZ B0073 <- 3.03 -> DG N7 C0006 : score 5.13815 : x : GLU xxxx B0071 <- 2.92 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0062 <- 2.02 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0071 <- 3.32 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx >4hri_B:Periplasmic_binding_protein-like_II; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HETR IN COMPLEX WITH A 21-BP PALINDROMIC DNA AT THE UPSTREAM OF THE HETP PROMOTER FROM ANABAENA organism=NOSTOC : H : ARG NH1 B0062 <- 2.46 -> DG N7 C0003 : score 6.4614 : H : LYS NZ B0073 <- 3.03 -> DG N7 C0006 : score 5.13815 : x : GLU xxxx B0071 <- 2.92 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx >4hsb_A:DNA-glycosylase; title=S. POMBE 3-METHYLADENINE DNA GLYCOSYLASE-LIKE PROTEIN MAG2 BOUND TO DAMAGED DNA organism=Schizosaccharomyces pombe 972h- : w : GLN OE1 A0052 <- 5.37 -> DA N3 B0008 : score 1.196 : w : SER OG A0096 <- 5.58 -> DT O2 C0006 : score 1.55 : H : LYS NZ A0099 <- 2.83 -> DT O2 C0007 : score 3.56566 : x : LYS xxxx A0053 <- 3.85 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.63 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0058 <- 4.15 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx >4ht4_A: title=MOLECULAR BASIS OF VANCOMYCIN RESISTANCE TRANSFER IN STAPHYLOCOCCUS AUREUS organism=Staphylococcus aureus : H : ARG NH1 A0078 <- 3.05 -> DT O2 B0016 : score 4.09109 : H : ARG NH2 A0078 <- 2.78 -> DT O2 B0016 : score 4.25027 : H : ARG NH2 A0151 <- 2.33 -> DG N7 B0018 : score 6.98477 : H : ARG NH2 A0151 <- 2.84 -> DG O6 B0018 : score 6.5472 : H : ASN OD1 A0154 <- 2.75 -> DC N4 B0004 : score 4.23553 : H : ASN OD1 A0154 <- 2.87 -> DC N4 B0017 : score 4.13488 : H : TYR OH A0156 <- 2.95 -> DC N4 B0019 : score 4.08768 >4htu_B:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF 5-CHLOROURACIL MODIFIED A:U BASE PAIR organism=BACILLUS HALODURANS : H : ASN ND2 B0077 <- 3.34 -> DC O2 E0001 : score 3.9957 : w : THR OG1 B0135 <- 6.09 -> DC O2 E0003 : score 2.048 >4hue_A:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF 5-CHLOROURACIL MODIFIED G:U BASE PAIR organism=BACILLUS HALODURANS : H : ASN ND2 A0077 <- 3.11 -> DC O2 C0001 : score 4.20176 : w : ASN ND2 A0106 <- 5.88 -> DG N3 C0002 : score 2.566 : w : THR OG1 A0135 <- 6.07 -> DC O2 C0003 : score 2.048 >4huf_B:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF 5-CHLOROURACIL MODIFIED A:U BASE PAIR organism=BACILLUS HALODURANS : w : ASN ND2 B0077 <- 5.73 -> DC O2 E0001 : score 1.885 : w : THR OG1 B0135 <- 6.11 -> DC O2 E0003 : score 2.048 >4hug_A:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF 5-CHLOROURACIL MODIFIED A:U BASE PAIRS organism=BACILLUS HALODURANS : H : ASN ND2 A0077 <- 2.99 -> DC O2 C0001 : score 4.30927 : w : THR OG1 A0135 <- 6.07 -> DC O2 C0003 : score 2.048 >4i2o_AB:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE STRUCTURE OF FIXK2 FROM BRADYRHIZOBIUM JAPONICUM organism=Bradyrhizobium japonicum : H : GLU OE2 A0196 <- 2.98 -> DC N4 X0019 : score 5.07583 : H : ARG NH1 A0200 <- 2.95 -> DG N7 W0010 : score 5.8685 : H : ARG NH2 A0200 <- 2.97 -> DT O4 X0018 : score 3.43302 : H : ARG NH2 A0200 <- 2.80 -> DG O6 W0010 : score 6.6 : H : GLU OE2 B0196 <- 2.92 -> DC N4 W0019 : score 5.13902 : w : THR OG1 B0197 <- 6.30 -> DT O4 W0018 : score 2.809 : H : ARG NH1 B0200 <- 2.92 -> DG N7 X0010 : score 5.9048 : H : ARG NH2 B0200 <- 2.83 -> DG O6 X0010 : score 6.5604 : H : ARG NH2 B0200 <- 2.85 -> DT O4 W0018 : score 3.51831 : w : ARG NE B0200 <- 6.21 -> DT O4 W0018 : score 1.317 : x : THR xxxx A0194 <- 3.76 -> DT xxx X0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0195 <- 3.50 -> DT xxx W0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0197 <- 4.38 -> DA xxx X0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0199 <- 3.68 -> DT xxx W0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0194 <- 3.78 -> DT xxx W0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0195 <- 3.46 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0199 <- 3.67 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx >4i2o_B:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE STRUCTURE OF FIXK2 FROM BRADYRHIZOBIUM JAPONICUM organism=Bradyrhizobium japonicum : H : GLU OE2 B0196 <- 2.92 -> DC N4 W0019 : score 5.13902 : w : THR OG1 B0197 <- 6.30 -> DT O4 W0018 : score 2.809 : H : ARG NH1 B0200 <- 2.92 -> DG N7 X0010 : score 5.9048 : H : ARG NH2 B0200 <- 2.83 -> DG O6 X0010 : score 6.5604 : H : ARG NH2 B0200 <- 2.85 -> DT O4 W0018 : score 3.51831 : w : ARG NE B0200 <- 6.21 -> DT O4 W0018 : score 1.317 : x : THR xxxx B0194 <- 3.78 -> DT xxx W0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0195 <- 3.46 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0199 <- 3.67 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx >4i3h_A:Type_II_DNA_topoisomerase;Ribosomal_protein_S5_domain_2-like;ATPase_domain_of_HSP90_chaperone/DNA_topoisomerase_II/histidine_kinase; title=A THREE-GATE STRUCTURE OF TOPOISOMERASE IV FROM STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : LYS xxxx A0458 <- 4.01 -> DT xxx G0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1020 <- 4.43 -> DC xxx G0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1080 <- 4.05 -> DA xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1170 <- 3.34 -> DG xxx H0012 : score x.xxxxx >4i3h_AB:Type_II_DNA_topoisomerase;Ribosomal_protein_S5_domain_2-like;ATPase_domain_of_HSP90_chaperone/DNA_topoisomerase_II/histidine_kinase; title=A THREE-GATE STRUCTURE OF TOPOISOMERASE IV FROM STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : LYS xxxx A0458 <- 4.01 -> DT xxx G0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1020 <- 4.43 -> DC xxx G0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1080 <- 4.05 -> DA xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1170 <- 3.34 -> DG xxx H0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0458 <- 3.96 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1080 <- 4.06 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1170 <- 3.29 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx >4i7y_H:Trypsin-like_serine_proteases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN ALPHA THROMBIN IN COMPLEX WITH A 27-MER APTAMER BOUND TO EXOSITE II organism=HOMO SAPIENS : w : CYS SG H0168 <- 6.30 -> DT O4 D0024 : score 4.152 : H : TRP NE1 H0237 <- 2.99 -> DT O2 D0018 : score 5.9792 : x : TYR xxxx H0089 <- 3.78 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0092 <- 3.41 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0093 <- 3.34 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0095 <- 3.84 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0101 <- 3.30 -> DG xxx D0021 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0130 <- 4.02 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0162 <- 3.98 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0165 <- 3.89 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx H0178 <- 4.16 -> DG xxx D0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0181 <- 3.28 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0230 <- 3.59 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0233 <- 3.25 -> DG xxx D0022 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx H0241 <- 4.38 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0245 <- 3.38 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx >4i9q_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TERNARY COMPLEX OF THE D714A MUTANT OF RB69 DNA POLYMERASE organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.61 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 3.13 -> DA N3 P0114 : score 2.59365 : w : LYS NZ A0734 <- 6.27 -> DG N3 T0009 : score 2.232 >4ibu_AC: title=HUMAN P53 CORE DOMAIN WITH HOT SPOT MUTATION R273C AND SECOND-SITE SUPPRESSOR MUTATION T284R IN SEQUENCE-SPECIFIC COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 2.69 -> DG N7 E0003 : score 5.50439 : H : LYS NZ A0120 <- 2.64 -> DG O6 E0004 : score 5.96575 : w : GLN NE2 A0136 <- 6.09 -> DG N7 E0002 : score 2.582 : H : LYS NZ A0139 <- 3.19 -> DG N7 G0012 : score 4.9658 : w : ARG NH1 A0248 <- 6.00 -> DA N3 F0006 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0248 <- 6.18 -> DA N3 F0006 : score 2.092 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.86 -> DG O6 F0008 : score 6.01033 : H : ARG NH2 A0280 <- 2.97 -> DG N7 F0008 : score 6.16754 : H : LYS NZ C0120 <- 3.06 -> DG N7 H0003 : score 5.10583 : H : LYS NZ C0120 <- 2.63 -> DG O6 H0004 : score 5.97732 : w : SER OG C0121 <- 6.27 -> DC N4 G0010 : score 2.105 : w : ARG NH1 C0248 <- 5.82 -> DG N3 H0008 : score 1.593 A : w : ARG NH2 C0248 <- 5.68 -> DA N3 G0006 : score 2.092 A : w : ARG NH2 C0248 <- 5.65 -> DG N3 H0008 : score 0.677 A : H : ARG NH1 C0280 <- 2.91 -> DG O6 G0008 : score 5.9495 : H : ARG NH2 C0280 <- 2.89 -> DG N7 G0008 : score 6.26969 : x : SER xxxx A0121 <- 3.31 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0123 <- 3.44 -> DG xxx G0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 3.99 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0277 <- 3.84 -> DC xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0284 <- 4.32 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0276 <- 3.92 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0277 <- 3.49 -> DC xxx G0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0284 <- 3.39 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx >4ibu_B:p53-like_transcription_factors; title=HUMAN P53 CORE DOMAIN WITH HOT SPOT MUTATION R273C AND SECOND-SITE SUPPRESSOR MUTATION T284R IN SEQUENCE-SPECIFIC COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : w : LYS NZ B0120 <- 6.63 -> DG O6 F0004 : score 3.005 : H : CYS SG B0277 <- 3.38 -> DC N4 E0009 : score -3.06907 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.85 -> DG O6 E0008 : score 6.0225 : H : ARG NH2 B0280 <- 2.95 -> DG N7 E0008 : score 6.19308 : w : ARG NH1 B0280 <- 6.31 -> DG O6 F0004 : score 2.756 : x : ALA xxxx B0276 <- 4.18 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx >4ibv_A:p53-like_transcription_factors; title=HUMAN P53 CORE DOMAIN WITH HOT SPOT MUTATION R273C AND SECOND-SITE SUPPRESSOR MUTATION S240R IN SEQUENCE-SPECIFIC COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 A0248 <- 6.31 -> DA N3 B0006 : score 2.092 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.95 -> DG O6 B0008 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0280 <- 3.07 -> DG N7 B0008 : score 6.03985 : x : LYS xxxx A0120 <- 3.89 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 4.08 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0277 <- 3.55 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx >4ibw_A:p53-like_transcription_factors; title=HUMAN P53 CORE DOMAIN WITH HOT SPOT MUTATION R273H AND SECOND-SITE SUPPRESSOR MUTATION T284R IN SEQUENCE-SPECIFIC COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0248 <- 3.34 -> DA N3 B0006 : score 2.88985 : H : CYS SG A0277 <- 3.44 -> DC N4 B0009 : score -3.02741 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.93 -> DG O6 B0008 : score 5.92517 : H : ARG NH2 A0280 <- 3.03 -> DG N7 B0008 : score 6.09092 : x : LYS xxxx A0120 <- 4.31 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 3.99 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0284 <- 3.79 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx >4iem_C:DNase_I-like; title=HUMAN APURINIC/APYRIMIDINIC ENDONUCLEASE (APE1) WITH PRODUCT DNA AND MG2+ organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 C0177 <- 6.28 -> DG O6 L0507 : score 2.468 : x : ASN xxxx C0229 <- 3.25 -> DG xxx L0507 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0270 <- 3.66 -> DG xxx L0507 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0271 <- 3.38 -> DA xxx L0508 : score x.xxxxx >4ihs_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BENM_DBD/CATB SITE 1 DNA COMPLEX organism=Acinetobacter sp. : H : GLN OE1 A0029 <- 3.18 -> DA N6 F0006 : score 5.59257 : H : GLN NE2 A0029 <- 3.21 -> DA N7 F0006 : score 5.59038 : H : ARG NH2 A0034 <- 2.70 -> DG O6 E0017 : score 6.732 : H : ARG NH2 A0053 <- 2.85 -> DT O2 F0003 : score 4.191 : x : ALA xxxx A0028 <- 3.49 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0030 <- 3.32 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0031 <- 3.77 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx >4ihs_CD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BENM_DBD/CATB SITE 1 DNA COMPLEX organism=Acinetobacter sp. : H : GLN OE1 C0029 <- 3.45 -> DA N6 H0006 : score 5.26573 : H : ARG NH1 C0034 <- 2.69 -> DG O6 G0017 : score 6.21717 : H : ARG NH2 C0034 <- 2.64 -> DG O6 G0017 : score 6.8112 : H : GLN OE1 D0029 <- 3.19 -> DA N6 G0006 : score 5.58046 : H : GLN NE2 D0029 <- 2.97 -> DA N7 G0006 : score 5.88269 : H : ARG NH1 D0034 <- 2.61 -> DG O6 H0017 : score 6.3145 : H : ARG NH2 D0034 <- 3.19 -> DG N7 H0017 : score 5.88662 : H : ARG NH2 D0034 <- 2.98 -> DG O6 H0017 : score 6.3624 : H : ARG NH1 D0053 <- 2.84 -> DA N3 H0024 : score 3.6526 : V : PRO CG D0030 <- 3.86 -> DT C7 H0018 : score 6.26359 : x : THR xxxx C0019 <- 4.50 -> DC xxx H0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0028 <- 3.51 -> DT xxx G0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0030 <- 3.30 -> DA xxx G0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0031 <- 3.62 -> DG xxx G0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0053 <- 3.20 -> DA xxx G0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0019 <- 3.77 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0028 <- 3.65 -> DT xxx H0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0031 <- 3.60 -> DG xxx H0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0033 <- 4.34 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx >4iht_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BENM_DBD/BENA SITE 1 DNA COMPLEX organism=Acinetobacter sp. : H : GLN OE1 A0029 <- 3.49 -> DA N6 F0006 : score 5.21731 : H : GLN NE2 A0029 <- 2.88 -> DA N7 F0006 : score 5.99231 : H : ARG NH2 A0053 <- 2.70 -> DA N3 E0024 : score 3.30454 : H : GLN NE2 B0029 <- 3.27 -> DA N7 E0006 : score 5.51731 : H : ARG NH1 B0034 <- 2.95 -> DA N7 F0016 : score 2.48345 : H : ARG NH2 B0034 <- 2.33 -> DG O6 F0017 : score 7.2204 : x : ALA xxxx A0028 <- 3.63 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0030 <- 3.37 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0031 <- 3.60 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0028 <- 4.08 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0030 <- 3.29 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0031 <- 3.67 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0053 <- 3.43 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx >4iht_CD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BENM_DBD/BENA SITE 1 DNA COMPLEX organism=Acinetobacter sp. : H : GLN OE1 C0029 <- 3.18 -> DA N6 H0006 : score 5.59257 : H : GLN NE2 C0029 <- 3.31 -> DA N7 H0006 : score 5.46859 : H : ARG NH2 C0053 <- 2.81 -> DA N3 G0024 : score 3.23326 : H : GLN NE2 D0029 <- 3.09 -> DA N7 G0006 : score 5.73654 : H : ARG NH1 D0034 <- 3.04 -> DA N7 H0016 : score 2.43736 : H : ARG NH2 D0034 <- 2.32 -> DG O6 H0017 : score 7.2336 : x : ALA xxxx C0028 <- 3.64 -> DT xxx G0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0030 <- 3.15 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0031 <- 3.73 -> DG xxx G0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0033 <- 4.17 -> DA xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0028 <- 3.67 -> DT xxx H0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0030 <- 3.31 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0031 <- 3.64 -> DG xxx H0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0053 <- 3.33 -> DT xxx H0024 : score x.xxxxx >4iht_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BENM_DBD/BENA SITE 1 DNA COMPLEX organism=Acinetobacter sp. : H : GLN NE2 D0029 <- 3.09 -> DA N7 G0006 : score 5.73654 : H : ARG NH1 D0034 <- 3.04 -> DA N7 H0016 : score 2.43736 : H : ARG NH2 D0034 <- 2.32 -> DG O6 H0017 : score 7.2336 : x : ALA xxxx D0028 <- 3.67 -> DT xxx H0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0030 <- 3.31 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0031 <- 3.64 -> DG xxx H0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0053 <- 3.33 -> DT xxx H0024 : score x.xxxxx >4ihv_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP SEQUENCE DNA F28 (AAATTTGTTTGAGCGTTGAGCAAATTT) organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0084 <- 3.05 -> DG N7 C0018 : score 4.3566 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.87 -> DG N7 D0007 : score 6.29523 : H : ARG NH2 A0085 <- 3.07 -> DG O6 D0007 : score 6.2436 : H : ASN ND2 B0084 <- 3.19 -> DA N7 D0018 : score 5.41261 : H : ARG NH1 B0085 <- 2.91 -> DG N7 C0007 : score 5.9169 : H : ARG NH2 B0085 <- 2.99 -> DG O6 C0007 : score 6.3492 : x : THR xxxx A0075 <- 4.13 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.09 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 4.20 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 3.76 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 4.42 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.79 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >4ihv_B:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP SEQUENCE DNA F28 (AAATTTGTTTGAGCGTTGAGCAAATTT) organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 B0084 <- 3.19 -> DA N7 D0018 : score 5.41261 : H : ARG NH1 B0085 <- 2.91 -> DG N7 C0007 : score 5.9169 : H : ARG NH2 B0085 <- 2.99 -> DG O6 C0007 : score 6.3492 : x : THR xxxx B0075 <- 3.76 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 4.42 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.79 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >4ihw_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP INOSINE SUBSTITUTED DNA F28- DI (AAATTTGTTTGAICITTGAGCAAATTT) organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0084 <- 3.06 -> DG N7 C0018 : score 4.34743 : H : ARG NH2 A0085 <- 3.01 -> DG N7 D0007 : score 6.11646 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.82 -> DG O6 D0007 : score 6.5736 : x : THR xxxx A0075 <- 3.91 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.01 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 4.33 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0090 <- 4.49 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx >4ihw_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP INOSINE SUBSTITUTED DNA F28- DI (AAATTTGTTTGAICITTGAGCAAATTT) organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0084 <- 3.06 -> DG N7 C0018 : score 4.34743 : H : ARG NH2 A0085 <- 3.01 -> DG N7 D0007 : score 6.11646 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.82 -> DG O6 D0007 : score 6.5736 : H : ARG NH1 B0085 <- 2.86 -> DG N7 C0007 : score 5.9774 : H : ARG NH2 B0085 <- 3.20 -> DG O6 C0007 : score 6.072 : x : THR xxxx A0075 <- 3.91 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.01 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 4.33 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0090 <- 4.49 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 3.95 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.32 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.59 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >4ihx_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP 2-AMINOPURINE SUBSTITUTED DNA F28-2AP (AAATTTGTTTGA2T2TTGAGCAAATTT) organism=Escherichia coli : H : ARG NH2 A0085 <- 2.55 -> DG N7 D0007 : score 6.70385 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.74 -> DG O6 D0007 : score 6.6792 : H : ARG NH1 B0085 <- 2.87 -> DG N7 C0007 : score 5.9653 : H : ARG NH2 B0085 <- 3.37 -> DG O6 C0007 : score 5.8476 : x : THR xxxx A0075 <- 4.28 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 3.40 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.36 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 4.16 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 3.98 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.10 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 4.48 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.65 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >4ihx_B:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27 BP 2-AMINOPURINE SUBSTITUTED DNA F28-2AP (AAATTTGTTTGA2T2TTGAGCAAATTT) organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 B0085 <- 2.87 -> DG N7 C0007 : score 5.9653 : H : ARG NH2 B0085 <- 3.37 -> DG O6 C0007 : score 5.8476 : x : THR xxxx B0075 <- 3.98 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.10 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 4.48 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.65 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >4ihy_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27BP INOSINE SUBSTITUTED DNA F29-DI (AAATTTGTTTGIICICTGAGCAAATTT) organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0084 <- 3.07 -> DG N7 C0018 : score 4.33826 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.45 -> DG N7 D0007 : score 6.83154 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.75 -> DG O6 D0007 : score 6.666 : H : ARG NH1 B0085 <- 3.06 -> DG N7 C0007 : score 5.7354 : H : ARG NH2 B0085 <- 3.32 -> DG O6 C0007 : score 5.9136 : x : THR xxxx A0075 <- 4.08 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.08 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 3.99 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 4.13 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 2.95 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.43 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >4ihy_B:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27BP INOSINE SUBSTITUTED DNA F29-DI (AAATTTGTTTGIICICTGAGCAAATTT) organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 B0085 <- 3.06 -> DG N7 C0007 : score 5.7354 : H : ARG NH2 B0085 <- 3.32 -> DG O6 C0007 : score 5.9136 : x : THR xxxx B0075 <- 4.13 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 2.95 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.43 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >4ikf_A:Ribonuclease_H-like; title=PFV INTASOME WITH INHIBITOR MB-76 organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.70 -> DC O2 C0006 : score 2.71215 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.36 -> DC O2 C0006 : score 4.02421 : V : PRO CG A0259 <- 3.61 -> DT C7 C0008 : score 6.66103 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.84 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 4.09 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.69 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.69 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >4iqj_A:PHP_domain-like;AF1531-like; title=STRUCTURE OF POLIIIALPHA-TAUC-DNA COMPLEX SUGGESTS AN ATOMIC MODEL OF THE REPLISOME organism=THERMUS AQUATICUS : x : LYS xxxx A0233 <- 3.18 -> DA xxx E0020 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0510 <- 4.27 -> DA xxx E0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0511 <- 3.08 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx >4iqr_AB:Nuclear_receptor_ligand-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MULTI-DOMAIN ORGANIZATION OF THE HNF4ALPHA NUCLEAR RECEPTOR COMPLEX ON DNA organism=Homo sapiens : H : ASP OD1 A0069 <- 3.34 -> DC N4 D4012 : score 4.76763 : H : LYS NZ A0072 <- 3.15 -> DG N7 C3008 : score 5.00888 : H : ARG NH1 A0076 <- 3.00 -> DG N7 C3009 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0076 <- 3.26 -> DG N7 C3009 : score 5.79723 : H : LYS NZ B0072 <- 3.06 -> DG N7 C3015 : score 5.10583 : H : ARG NH1 B0077 <- 3.34 -> DG N7 D4003 : score 5.3966 : x : ARG xxxx A0077 <- 3.27 -> DT xxx D4009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0069 <- 3.27 -> DA xxx D4004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0076 <- 2.98 -> DG xxx C3015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0125 <- 3.95 -> DT xxx D4008 : score x.xxxxx >4iqr_B:Nuclear_receptor_ligand-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MULTI-DOMAIN ORGANIZATION OF THE HNF4ALPHA NUCLEAR RECEPTOR COMPLEX ON DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0072 <- 3.06 -> DG N7 C3015 : score 5.10583 : H : ARG NH1 B0077 <- 3.34 -> DG N7 D4003 : score 5.3966 : x : ASP xxxx B0069 <- 3.27 -> DA xxx D4004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0076 <- 2.98 -> DG xxx C3015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0125 <- 3.95 -> DT xxx D4008 : score x.xxxxx >4iqr_EF:Nuclear_receptor_ligand-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=MULTI-DOMAIN ORGANIZATION OF THE HNF4ALPHA NUCLEAR RECEPTOR COMPLEX ON DNA organism=Homo sapiens : H : ASP OD2 E0069 <- 2.98 -> DC N4 H4012 : score 5.9768 : H : ARG NH2 E0076 <- 2.62 -> DG N7 G3009 : score 6.61446 : H : ARG NH2 F0076 <- 3.09 -> DG N7 G3016 : score 6.01431 : H : ARG NH1 F0077 <- 3.04 -> DG N7 H4003 : score 5.7596 : x : LYS xxxx E0072 <- 3.48 -> DG xxx G3008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0077 <- 3.38 -> DG xxx H4010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0069 <- 3.48 -> DA xxx H4004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0072 <- 3.22 -> DG xxx G3015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0125 <- 3.77 -> DT xxx H4008 : score x.xxxxx >4ir1_F:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=POLYMERASE-DNA COMPLEX organism=Escherichia coli : w : GLU OE2 F0246 <- 5.55 -> DG N7 G0842 : score 2.669 : x : ARG xxxx F0285 <- 3.93 -> DT xxx H0866 : score x.xxxxx >4ir9_F:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=POLYMERASE-DNA COMPLEX organism=Escherichia coli : x : GLU xxxx F0246 <- 3.88 -> DG xxx G0841 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0285 <- 3.83 -> DT xxx H0866 : score x.xxxxx >4irc_F:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=POLYMERASE-DNA COMPLEX organism=Escherichia coli : x : GLU xxxx F0246 <- 3.56 -> DG xxx G0841 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0285 <- 3.41 -> DT xxx H0866 : score x.xxxxx >4ird_F:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF POLYMERASE-DNA COMPLEX organism=Escherichia coli : x : GLU xxxx F0246 <- 3.76 -> DG xxx G0841 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0285 <- 3.88 -> DT xxx H0866 : score x.xxxxx >4iri_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=AUTO-INHIBITED ERG ETS DOMAIN-DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0350 <- 2.68 -> DG O6 B0006 : score 4.03561 : H : ARG NH2 A0350 <- 2.77 -> DG N7 B0006 : score 6.42292 : H : ARG NH1 A0353 <- 2.90 -> DG N7 B0005 : score 5.929 : H : ARG NH1 A0353 <- 2.75 -> DG O6 B0005 : score 6.14417 : H : TYR OH A0354 <- 3.19 -> DA N6 B0007 : score 4.30621 : x : LYS xxxx A0347 <- 3.97 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0351 <- 4.31 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx >4irk_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF POLYMERASE-DNA COMPLEX, DNA organism=Escherichia coli : w : GLU OE2 A0246 <- 6.08 -> DG N7 F0842 : score 2.669 : w : THR OG1 A0299 <- 5.68 -> DG N7 H0868 : score 3.422 : x : ARG xxxx A0285 <- 3.29 -> DT xxx H0866 : score x.xxxxx >4is1_CD:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZNF217 BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 C0481 <- 2.50 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score 3.623 : H : ARG NH1 F0035 <- 3.26 -> DG O6 G0017 : score 5.52367 : H : THR OG1 F0036 <- 3.01 -> DC N4 G0015 : score 3.86393 : x : GLU xxxx E0025 <- 3.25 -> DA xxx G0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx E0034 <- 3.90 -> DT xxx H0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0037 <- 4.02 -> DT xxx H0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0039 <- 3.70 -> DG xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0043 <- 3.87 -> DT xxx G0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0037 <- 3.80 -> DT xxx G0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0039 <- 3.77 -> DA xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0043 <- 3.88 -> DC xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0046 <- 3.30 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx >4ix7_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE INSV-BEN DOMAIN COMPLEXED TO ITS DNA TARGET SITE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : SER OG A0304 <- 2.82 -> DA N3 C0007 : score 2.99183 : H : ASP OD1 A0351 <- 2.86 -> DC N4 D0004 : score 5.28073 : H : LYS NZ A0354 <- 2.71 -> DG O6 C0010 : score 5.88482 : H : LYS NZ A0354 <- 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xxxx B0306 <- 3.32 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0307 <- 3.52 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0346 <- 3.69 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0347 <- 3.57 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0355 <- 3.99 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx >4ix7_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE INSV-BEN DOMAIN COMPLEXED TO ITS DNA TARGET SITE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : SER OG B0304 <- 2.77 -> DA N3 D0007 : score 3.02187 : w : ASN OD1 B0343 <- 6.63 -> DA N6 C0006 : score 2.837 : H : ASP OD1 B0351 <- 2.86 -> DC N4 C0004 : score 5.28073 : H : LYS NZ B0354 <- 2.55 -> DG O6 D0010 : score 6.06981 : H : LYS NZ B0354 <- 2.89 -> DG O6 D0011 : score 5.67672 : V : ALA CB B0350 <- 3.66 -> DT C7 D0009 : score 5.79494 : x : ARG xxxx B0282 <- 3.73 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0305 <- 3.34 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0306 <- 3.32 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0307 <- 3.52 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0346 <- 3.69 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0347 <- 3.57 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0355 <- 3.99 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx >4izz_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF FISCHERELLA TRANSCRIPTION FACTOR HETR COMPLEXED WITH 21MER DNA TARGET organism=FISCHERELLA THERMALIS : H : ARG NH1 A0062 <- 3.27 -> DG N7 D-008 : score 5.4813 : H : GLU OE1 A0071 <- 2.69 -> DC N4 C0005 : score 5.89484 : H : GLU OE2 A0071 <- 3.12 -> DC N4 C0004 : score 4.9284 : x : LYS xxxx A0073 <- 3.53 -> DG xxx D-005 : score x.xxxxx >4izz_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF FISCHERELLA TRANSCRIPTION FACTOR HETR COMPLEXED WITH 21MER DNA TARGET organism=FISCHERELLA THERMALIS : H : ARG NH1 A0062 <- 3.27 -> DG N7 D-008 : score 5.4813 : H : GLU OE1 A0071 <- 2.69 -> DC N4 C0005 : score 5.89484 : H : GLU OE2 A0071 <- 3.12 -> DC N4 C0004 : score 4.9284 : w : ARG NE B0062 <- 6.51 -> DG O6 C-008 : score 1.369 : H : GLU OE1 B0071 <- 2.65 -> DC N4 D0003 : score 5.94099 : H : GLU OE2 B0071 <- 2.91 -> DC N4 D0004 : score 5.14955 : w : GLU OE2 B0071 <- 5.68 -> DC N4 D0005 : score 3.597 : H : LYS NZ B0073 <- 2.54 -> DG N7 C-006 : score 5.66596 : x : LYS xxxx A0073 <- 3.53 -> DG xxx D-005 : score x.xxxxx >4j00_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF FISCHERELLA TRANSCRIPTION FACTOR HETR COMPLEXED WITH 24MER DNA TARGET organism=FISCHERELLA THERMALIS : H : ARG NE A0062 <- 3.05 -> DG N7 D0005 : score 4.20071 : H : ARG NH2 A0062 <- 2.62 -> DG N7 D0005 : score 6.61446 : x : GLU xxxx A0071 <- 2.83 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0073 <- 4.21 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0062 <- 3.45 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0071 <- 3.55 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0073 <- 3.82 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >4j00_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF FISCHERELLA TRANSCRIPTION FACTOR HETR COMPLEXED WITH 24MER DNA TARGET organism=FISCHERELLA THERMALIS : x : ARG xxxx B0062 <- 3.45 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0071 <- 3.55 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0073 <- 3.82 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >4j01_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF FISCHERELLA TRANSCRIPTION FACTOR HETR COMPLEXED WITH 29MER DNA TARGET organism=FISCHERELLA THERMALIS : H : GLU OE2 A0071 <- 2.68 -> DC N4 C0019 : score 5.39175 : H : LYS NZ A0073 <- 2.55 -> DG O6 D0011 : score 6.06981 : H : GLU OE1 B0071 <- 3.14 -> DC N4 D0018 : score 5.37573 : H : LYS NZ B0073 <- 3.03 -> DG N7 C0009 : score 5.13815 : H : LYS NZ B0073 <- 3.05 -> DG O6 C0010 : score 5.49173 : x : LEU xxxx A0061 <- 4.42 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0062 <- 3.02 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0062 <- 3.34 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >4j01_E: title=CRYSTAL STRUCTURE OF FISCHERELLA TRANSCRIPTION FACTOR HETR COMPLEXED WITH 29MER DNA TARGET organism=FISCHERELLA THERMALIS : H : ARG NH1 E0062 <- 2.89 -> DG N7 H0007 : score 5.9411 : H : ARG NH1 E0062 <- 2.39 -> DG O6 H0007 : score 6.58217 : x : GLU xxxx E0071 <- 3.28 -> DC xxx G0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0073 <- 3.01 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx >4j01_EF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF FISCHERELLA TRANSCRIPTION FACTOR HETR COMPLEXED WITH 29MER DNA TARGET organism=FISCHERELLA THERMALIS : H : ARG NH1 E0062 <- 2.89 -> DG N7 H0007 : score 5.9411 : H : ARG NH1 E0062 <- 2.39 -> DG O6 H0007 : score 6.58217 : H : GLU OE1 F0071 <- 2.43 -> DC N4 H0018 : score 6.19478 : H : GLU OE2 F0071 <- 3.02 -> DC N4 H0019 : score 5.03371 : H : LYS NZ F0073 <- 2.67 -> DG O6 G0010 : score 5.93107 : x : GLU xxxx E0071 <- 3.28 -> DC xxx G0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0073 <- 3.01 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0062 <- 3.74 -> DC xxx G0006 : score x.xxxxx >4j19_AB:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF A NOVEL TELOMERE REPEAT BINDING PROTEIN BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0271 <- 2.39 -> DT O2 D0003 : score 4.58047 : H : ASN OD1 A0332 <- 3.12 -> DA N6 D0005 : score 5.6364 : H : ASN ND2 A0332 <- 3.08 -> DA N7 D0005 : score 5.54176 : H : LYS NZ A0335 <- 2.69 -> DG O6 C0014 : score 5.90795 : H : ARG NH2 B0271 <- 2.61 -> DT O2 D0009 : score 4.3942 : w : ARG NH1 B0271 <- 5.90 -> DA N3 C0012 : score 2.585 : w : TYR OH B0327 <- 6.04 -> DA N6 C0006 : score 2.545 : H : LYS NZ B0335 <- 2.64 -> DG O6 C0008 : score 5.96575 : H : LYS NZ B0335 <- 3.38 -> DG N7 C0009 : score 4.76113 : H : LYS NZ B0335 <- 3.04 -> DG O6 C0009 : score 5.50329 : x : TYR xxxx A0327 <- 3.87 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0328 <- 4.34 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0267 <- 3.22 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0328 <- 3.56 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0332 <- 3.21 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx >4j19_B:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF A NOVEL TELOMERE REPEAT BINDING PROTEIN BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 B0271 <- 2.61 -> DT O2 D0009 : score 4.3942 : w : ARG NH1 B0271 <- 5.90 -> DA N3 C0012 : score 2.585 : w : TYR OH B0327 <- 6.04 -> DA N6 C0006 : score 2.545 : H : LYS NZ B0335 <- 2.64 -> DG O6 C0008 : score 5.96575 : H : LYS NZ B0335 <- 3.38 -> DG N7 C0009 : score 4.76113 : H : LYS NZ B0335 <- 3.04 -> DG O6 C0009 : score 5.50329 : x : ARG xxxx B0267 <- 3.22 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0328 <- 3.56 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0332 <- 3.21 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx >4j1j_A: title=LEANYER ORTHOBUNYAVIRUS NUCLEOPROTEIN-SSDNA COMPLEX organism=LEANYER VIRUS : H : HIS ND1 A0049 <- 3.24 -> DA N6 H0006 : score 3.06222 : H : HIS NE2 A0049 <- 2.78 -> DC N4 H0003 : score 3.23726 : H : ASN ND2 A0078 <- 3.19 -> DC O2 H0002 : score 4.13009 : H : THR OG1 A0094 <- 2.61 -> DC O2 H0002 : score 2.72542 : H : HIS ND1 A0096 <- 2.98 -> DC N3 H0003 : score 3.10828 : H : LYS NZ A0184 <- 2.73 -> DA N7 H0001 : score 2.9783 >4j1j_ABCD: title=LEANYER ORTHOBUNYAVIRUS NUCLEOPROTEIN-SSDNA COMPLEX organism=LEANYER VIRUS : H : HIS ND1 A0049 <- 3.24 -> DA N6 H0006 : score 3.06222 : H : HIS NE2 A0049 <- 2.78 -> DC N4 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A0734 <- 5.82 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0734 <- 5.58 -> DC O2 T0010 : score 1.3 : x : PRO xxxx A0361 <- 4.22 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0561 <- 3.45 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0565 <- 3.33 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx >4j2e_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE L415M TERNARY COMPLEX organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0567 <- 5.31 -> DC O2 T0005 : score 1.343 : w : THR OG1 A0622 <- 5.64 -> DG N3 P0115 : score 2.036 : H : LYS NZ A0706 <- 2.95 -> DA N3 P0114 : score 2.69362 : x : LYS xxxx A0279 <- 3.93 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0361 <- 4.20 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0561 <- 3.31 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0565 <- 3.39 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0734 <- 3.99 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx >4j2x_A:DNA-binding_protein_LAG-1_CSL;p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CSL (RBP-JK) WITH COREPRESSOR KYOT2 BOUND TO DNA organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0091 <- 2.98 -> DG N7 H0009 : score 5.8322 : H : ARG NH2 A0091 <- 2.65 -> DG O6 H0009 : score 6.798 : H : GLN NE2 A0222 <- 2.79 -> DC O2 G0012 : score 3.70226 : V : LYS CG A0192 <- 3.67 -> DT C7 G0005 : score 2.18784 : x : TYR xxxx A0086 <- 3.42 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0089 <- 4.42 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0191 <- 3.85 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0221 <- 4.39 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx >4j3n_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=HUMAN TOPOISOMERASE IIBETA IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0505 <- 5.54 -> DG N3 C0007 : score 2.232 : w : ASP OD1 A0726 <- 5.51 -> DC O2 F0016 : score 1.919 : w : ASP OD1 A0726 <- 6.09 -> DA N3 C0006 : score 1.331 : w : ASP OD1 A0726 <- 6.28 -> DT O2 F0015 : score 2.105 : w : ARG NH2 A0729 <- 5.99 -> DA N3 C0006 : score 2.092 : w : SER OG A0730 <- 6.04 -> DA N3 C0006 : score 0.958 : w : MET SD A0782 <- 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>4j8v_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=X-RAY STRUCTURE OF NCP145 WITH BOUND CHLORIDO(ETA-6-P-CYMENE)(N- PHENYL-2-PYRIDINECARBOTHIOAMIDE)RUTHENIUM(II) organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.73 -> DA N3 J0009 : score 3.2851 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.15 -> DA N3 I0009 : score 3.42431 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.13 -> DA N3 I0009 : score 3.02592 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.80 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.37 -> DC xxx I-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.25 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.38 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.62 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.93 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.11 -> DT xxx J-035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.18 -> DG xxx I0047 : score x.xxxxx >4j8w_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=X-RAY STRUCTURE OF NCP145 WITH CHLORIDO(ETA-6-P-CYMENE)(N- FLUOROPHENYL-2-PYRIDINECARBOTHIOAMIDE)OSMIUM(II) organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.77 -> DA N3 J0009 : score 3.25918 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.02 -> DA N3 I0009 : score 3.52004 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.21 -> DA N3 I0009 : score 2.97408 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.84 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.40 -> DC xxx I-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.23 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.41 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.69 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.93 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.26 -> DT xxx J-035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.23 -> DG xxx I0047 : score x.xxxxx >4j8w_H:Histone-fold; title=X-RAY STRUCTURE OF NCP145 WITH CHLORIDO(ETA-6-P-CYMENE)(N- FLUOROPHENYL-2-PYRIDINECARBOTHIOAMIDE)OSMIUM(II) organism=? : x : ARG xxxx H0030 <- 4.23 -> DG xxx I0047 : score x.xxxxx >4j8x_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=X-RAY STRUCTURE OF NCP145 WITH BOUND CHLORIDO(ETA-6-P-CYMENE)(N- FLUOROPHENYL-2-PYRIDINECARBOTHIOAMIDE)RUTHENIUM(II) organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.90 -> DA N3 J0009 : score 3.17495 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.33 -> DA N3 I0009 : score 3.29175 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.25 -> DA N3 I0009 : score 2.94817 : x : ARG xxxx A0063 <- 4.37 -> DT xxx J0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.05 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.15 -> DC xxx I-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.95 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.16 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.67 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.80 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 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PRIMER 3' END (CA/G) organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0324 <- 6.01 -> DG N7 T0005 : score 3.259 : H : ARG NH1 A0382 <- 2.86 -> DG O6 P0004 : score 6.01033 A : V : PHE CZ A0423 <- 3.62 -> DT C7 T0007 : score 7.43504 : x : ARG xxxx A0061 <- 3.10 -> DC xxx P0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.32 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx >4j9m_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: MISINCORPORATION G OPPOSITE T AFTER AN A AT THE PRIMER 3' END (AA/G) organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 A0382 <- 6.27 -> DG O6 T0008 : score 2.468 : V : PHE CZ A0423 <- 3.64 -> DT C7 T0007 : score 7.39947 : x : ARG xxxx A0061 <- 3.09 -> DA xxx P0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 4.37 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 3.64 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.42 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx >4j9n_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: MISINCORPORATION G OPPOSITE T AFTER A G AT THE PRIMER 3' END (GA/G) organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0382 <- 5.91 -> DG N7 P0003 : score 2.063 : w : ARG NH2 A0382 <- 6.01 -> DG N7 P0003 : score 2.18 : x : ARG xxxx A0061 <- 3.15 -> DG xxx P0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 4.32 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.67 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4j9o_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: PRIMER EXTENSION AFTER A T:G MISPAIR organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 A0382 <- 6.25 -> DG O6 T0008 : score 2.468 : x : ASN xxxx A0324 <- 4.10 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 4.30 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx >4j9p_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA POSTINSERTION BINARY COMPLEX WITH TA BASE PAIR organism=Homo sapiens : x : GLN xxxx A0038 <- 3.60 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 3.85 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.66 -> DA xxx P0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.97 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.71 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 2.85 -> DG xxx P0005 : score x.xxxxx >4j9q_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA POSTINSERTION BINARY COMPLEX WITH TG MISPAIR organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 2.84 -> DT O2 T0005 : score 3.90187 A : H : ARG NE A0061 <- 3.20 -> DG N7 P0010 : score 4.06805 : H : ARG NH1 A0061 <- 2.81 -> DG O6 P0010 : score 6.07117 : H : ARG NH1 A0382 <- 3.04 -> DG O6 P0005 : score 5.79133 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.02 -> DG N7 P0005 : score 6.10369 : x : PHE xxxx A0018 <- 3.96 -> DG xxx P0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 3.56 -> DG xxx P0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0089 <- 4.27 -> DG xxx P0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.84 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.25 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >4j9r_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TRANSLOCATED BINARY COMPLEX WITH TG MISPAIR organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.27 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 3.09 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.76 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 2.86 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 3.93 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >4j9s_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TRANSLOCATED BINARY COMPLEX: WITH TA BASE PAIR organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0061 <- 3.43 -> DA xxx P0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.10 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.76 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.26 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >4jbk_ABCD:HIN-2000_domain-like; title=MOLECULAR BASIS FOR ABROGATION OF ACTIVATION OF PRO-INFLAMMATORY CYTOKINES organism=Mus musculus : H : LYS NZ C0010 <- 2.22 -> DC O2 E0013 : score 3.28791 : x : ARG xxxx A0181 <- 3.44 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0010 <- 3.25 -> DC xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0181 <- 3.39 -> DG xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0184 <- 4.18 -> DA xxx F0004 : score x.xxxxx >4jbk_B:HIN-2000_domain-like; title=MOLECULAR BASIS FOR ABROGATION OF ACTIVATION OF PRO-INFLAMMATORY CYTOKINES organism=Mus musculus : x : LYS xxxx B0010 <- 3.25 -> DC xxx F0013 : score x.xxxxx >4jbm_A:HIN-2000_domain-like; title=STRUCTURE OF MURINE DNA BINDING PROTEIN BOUND WITH DS DNA organism=Mus musculus : w : ASN ND2 A0089 <- 6.08 -> DG N7 T0009 : score 3.259 : H : LYS NZ A0092 <- 2.92 -> DG O6 R0003 : score 5.64203 : H : LYS NZ A0092 <- 2.85 -> DG O6 T0011 : score 5.72296 >4jcx_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RESTRICTION-MODIFICATION CONTROLLER PROTEIN C.CSP231I OL OPERATOR COMPLEX organism=Citrobacter sp. RFL231 : H : SER OG A0032 <- 3.30 -> DC N4 C0004 : score 3.30808 : H : GLN NE2 A0037 <- 3.00 -> DT O4 D0015 : score 4.98338 : H : HIS NE2 A0043 <- 3.41 -> DC N4 D0014 : score 2.83099 : V : ALA CB A0033 <- 3.79 -> DT C7 D0016 : score 5.61297 : x : ARG xxxx A0034 <- 4.44 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0036 <- 3.47 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx >4jcx_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RESTRICTION-MODIFICATION CONTROLLER PROTEIN C.CSP231I OL OPERATOR COMPLEX organism=Citrobacter sp. RFL231 : H : SER OG A0032 <- 3.30 -> DC N4 C0004 : score 3.30808 : H : GLN NE2 A0037 <- 3.00 -> DT O4 D0015 : score 4.98338 : H : HIS NE2 A0043 <- 3.41 -> DC N4 D0014 : score 2.83099 : H : SER OG B0032 <- 3.03 -> DC N4 D0004 : score 3.50656 : H : GLN NE2 B0037 <- 3.09 -> DT O4 C0015 : score 4.88995 : w : GLN NE2 B0037 <- 5.96 -> DA N6 D0006 : score 2.804 : H : HIS NE2 B0043 <- 3.39 -> DC N4 C0014 : score 2.84388 : V : ALA CB B0033 <- 3.87 -> DT C7 C0016 : score 5.50099 : V : ALA CB A0033 <- 3.79 -> DT C7 D0016 : score 5.61297 : x : ARG xxxx A0034 <- 4.44 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0036 <- 3.47 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0034 <- 4.11 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0036 <- 3.17 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx >4jcy_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RESTRICTION-MODIFICATION CONTROLLER PROTEIN C.CSP231I OR OPERATOR COMPLEX organism=Citrobacter sp. RFL231 : H : SER OG A0032 <- 2.92 -> DC N4 C0004 : score 3.58743 : w : SER OG A0032 <- 5.41 -> DA N7 C0003 : score 2.343 : H : GLN NE2 A0037 <- 2.89 -> DT O4 D0015 : score 5.09759 : w : GLN NE2 A0037 <- 6.18 -> DA N6 C0006 : score 2.804 : w : HIS NE2 A0043 <- 5.63 -> DA N6 C0007 : score 2.619 : x : SER xxxx A0030 <- 3.84 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0033 <- 3.26 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0034 <- 3.28 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0036 <- 3.34 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx >4jcy_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RESTRICTION-MODIFICATION CONTROLLER PROTEIN C.CSP231I OR OPERATOR COMPLEX organism=Citrobacter sp. RFL231 : H : SER OG A0032 <- 2.92 -> DC N4 C0004 : score 3.58743 : w : SER OG A0032 <- 5.41 -> DA N7 C0003 : score 2.343 : H : GLN NE2 A0037 <- 2.89 -> DT O4 D0015 : score 5.09759 : w : GLN NE2 A0037 <- 6.18 -> DA N6 C0006 : score 2.804 : w : HIS NE2 A0043 <- 5.63 -> DA N6 C0007 : score 2.619 : H : SER OG B0032 <- 2.86 -> DC N4 D0004 : score 3.63153 : w : SER OG B0032 <- 5.30 -> DG N7 D0003 : score 2.749 : H : GLN NE2 B0037 <- 2.89 -> DT O4 C0015 : score 5.09759 : w : GLN NE2 B0037 <- 6.17 -> DA N6 D0006 : score 2.804 : H : HIS NE2 B0043 <- 3.35 -> DC N4 C0014 : score 2.86968 : w : HIS NE2 B0043 <- 5.99 -> DA N6 D0007 : score 2.619 : x : SER xxxx A0030 <- 3.84 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0033 <- 3.26 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0034 <- 3.28 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0036 <- 3.34 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0030 <- 3.91 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0033 <- 3.17 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0034 <- 3.31 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0036 <- 3.35 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx >4jgc_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=HUMAN TDG N140A MUTANT IN A COMPLEX WITH 5-CARBOXYLCYTOSINE (5CAC) organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 A0278 <- 2.53 -> DG N2 D0018 : score 5.91051 : x : SER xxxx A0200 <- 3.75 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0248 <- 3.42 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0274 <- 3.29 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.50 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0276 <- 4.43 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 3.23 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >4jjn_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HETEROCHROMATIN PROTEIN SIR3 IN COMPLEX WITH A SILENCED YEAST NUCLEOSOME organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 D0036 <- 3.31 -> DC O2 I0123 : score 3.2777 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.96 -> DG xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 3.18 -> DG xxx J0066 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.28 -> DC xxx I0092 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.62 -> DG xxx I0100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.30 -> DC xxx I0080 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.33 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.66 -> DA xxx J0100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0035 <- 3.61 -> DT xxx J0083 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0043 <- 3.57 -> DG xxx J0112 : score x.xxxxx >4jjn_E:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HETEROCHROMATIN PROTEIN SIR3 IN COMPLEX WITH A SILENCED YEAST NUCLEOSOME organism=? : x : TYR xxxx E0041 <- 4.33 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.66 -> DA xxx J0100 : score x.xxxxx >4jl3_ABCD:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MS6564-DNA COMPLEX organism=Mycobacterium smegmatis : H : LYS NZ A0047 <- 3.17 -> DG N7 E0024 : score 4.98734 : H : LYS NZ A0047 <- 2.74 -> DG O6 E0024 : score 5.85014 : H : GLN OE1 A0048 <- 2.94 -> DC N4 E0026 : score 4.455 : w : THR OG1 A0049 <- 6.02 -> DA N7 F0004 : score 2.152 : H : LYS NZ B0047 <- 2.91 -> DG O6 F0019 : score 5.65359 : H : GLN OE1 B0048 <- 2.91 -> DC N4 F0021 : score 4.4825 : H : SER OG C0008 <- 3.13 -> DG N2 F0006 : score 3.15165 : w : GLU OE2 C0037 <- 6.24 -> DC N4 E0018 : score 3.597 : H : LYS NZ C0047 <- 2.72 -> DG N7 E0019 : score 5.47207 : H : LYS NZ C0047 <- 2.89 -> DG O6 E0019 : score 5.67672 : H : GLN OE1 C0048 <- 2.43 -> DC N4 E0021 : score 4.9225 : w : GLU OE1 D0037 <- 6.15 -> DC N4 F0013 : score 3.528 : w : GLU OE2 D0037 <- 6.25 -> DC N4 F0013 : score 3.597 : H : LYS NZ D0047 <- 2.91 -> DG N7 F0014 : score 5.26741 : H : LYS NZ D0047 <- 2.57 -> DG O6 F0014 : score 6.04668 : H : GLN NE2 D0048 <- 2.78 -> DA N7 F0016 : score 6.1141 : x : GLU xxxx A0037 <- 4.24 -> DC xxx E0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0051 <- 3.38 -> DT xxx E0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0009 <- 3.46 -> DT xxx F0027 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0037 <- 3.69 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0049 <- 4.10 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0051 <- 3.45 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0052 <- 3.50 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0051 <- 3.45 -> DT xxx E0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0052 <- 3.56 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0009 <- 3.06 -> DC xxx F0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0051 <- 3.40 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0052 <- 3.88 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx >4jl3_B:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MS6564-DNA COMPLEX organism=Mycobacterium smegmatis : H : LYS NZ B0047 <- 2.91 -> DG O6 F0019 : score 5.65359 : H : GLN OE1 B0048 <- 2.91 -> DC N4 F0021 : score 4.4825 : x : ARG xxxx B0009 <- 3.46 -> DT xxx F0027 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0037 <- 3.69 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0049 <- 4.10 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0051 <- 3.45 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0052 <- 3.50 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx >4jqd_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RESTRICTION-MODIFICATION CONTROLLER PROTEIN C.CSP231I OL OPERATOR COMPLEX organism=Citrobacter sp. RFL231 : H : SER OG A0032 <- 2.98 -> DC N4 H0004 : score 3.54332 : H : GLN NE2 A0037 <- 2.89 -> DT O4 G0015 : score 5.09759 : H : SER OG B0032 <- 3.06 -> DC N4 G0004 : score 3.48451 : H : GLN NE2 B0037 <- 3.01 -> DT O4 H0015 : score 4.973 : V : ALA CB B0033 <- 3.81 -> DT C7 H0016 : score 5.58498 : V : ASN CB B0036 <- 3.89 -> DT C7 G0005 : score 1.89384 : V : ALA CB A0033 <- 3.80 -> DT C7 G0016 : score 5.59897 : x : SER xxxx A0030 <- 4.04 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0034 <- 3.50 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0036 <- 3.25 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0043 <- 3.70 -> DC xxx G0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0030 <- 3.79 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0034 <- 3.66 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0043 <- 3.52 -> DC xxx H0014 : score x.xxxxx >4jqd_E:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RESTRICTION-MODIFICATION CONTROLLER PROTEIN C.CSP231I OL OPERATOR COMPLEX organism=Citrobacter sp. RFL231 : H : SER OG E0032 <- 3.11 -> DC N4 D0004 : score 3.44775 : V : ALA CB E0033 <- 3.63 -> DT C7 C0016 : score 5.83693 : V : ASN CB E0036 <- 3.83 -> DT C7 D0005 : score 1.92291 : x : SER xxxx E0030 <- 4.36 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0034 <- 3.91 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0037 <- 2.83 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0043 <- 3.68 -> DC xxx C0014 : score x.xxxxx >4jqd_EF:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RESTRICTION-MODIFICATION CONTROLLER PROTEIN C.CSP231I OL OPERATOR COMPLEX organism=Citrobacter sp. RFL231 : H : SER OG E0032 <- 3.11 -> DC N4 D0004 : score 3.44775 : H : SER OG F0032 <- 3.12 -> DC N4 C0004 : score 3.4404 : H : GLN NE2 F0037 <- 2.98 -> DT O4 D0015 : score 5.00415 : H : HIS NE2 F0043 <- 3.44 -> DC N4 D0014 : score 2.81164 : V : ASN CB E0036 <- 3.83 -> DT C7 D0005 : score 1.92291 : V : ALA CB F0033 <- 3.87 -> DT C7 D0015 : score 5.50099 : V : ALA CB E0033 <- 3.63 -> DT C7 C0016 : score 5.83693 : x : SER xxxx E0030 <- 4.36 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0034 <- 3.91 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0037 <- 2.83 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0043 <- 3.68 -> DC xxx C0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0030 <- 3.59 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0034 <- 3.59 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0036 <- 3.29 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >4jrp_A:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF E. COLI EXONUCLEASE I IN COMPLEX WITH A 5CY-DT13 OLIGONUCLEOTIDE organism=Escherichia coli : w : ASP OD1 A0206 <- 5.51 -> DT N3 D0001 : score 2.105 : H : THR OG1 A0210 <- 2.49 -> DT O2 D0001 : score 2.88238 : w : THR OG1 A0210 <- 5.48 -> DT N3 D0001 : score 2.117 : w : LYS NZ A0216 <- 5.47 -> DT O4 D0002 : score 1.7 >4jrp_AB:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF E. COLI EXONUCLEASE I IN COMPLEX WITH A 5CY-DT13 OLIGONUCLEOTIDE organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0103 <- 2.99 -> DT O2 C0011 : score 4.5658 : w : ASP OD1 A0122 <- 5.26 -> DT O2 C0001 : score 2.105 : w : ASP OD2 A0122 <- 6.00 -> DT O2 C0001 : score 1.008 : w : TRP NE1 A0128 <- 5.52 -> DT O2 C0001 : score 4.848 : w : ARG NH1 A0142 <- 6.10 -> DT O2 C0010 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0142 <- 5.63 -> DT O2 C0010 : score 2.261 : V : MET CB B0218 <- 3.71 -> DT C7 C0001 : score 5.93365 : V : SER CB A0360 <- 3.59 -> DT C7 C0005 : score 3.29567 >4jrq_AB:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI EXONUCLEASE I IN COMPLEX WITH A 5CY-DA13 OLIGONUCLEOTIDE organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 B0103 <- 3.08 -> DA N3 D0011 : score 3.59446 >4js5_AB:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI EXONUCLEASE I IN COMPLEX WITH A DT13 OLIGONUCLEOTIDE organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0103 <- 3.22 -> DT O2 C0011 : score 4.34748 : V : ASN CG A0257 <- 3.61 -> DT C7 C0003 : score 2.77399 : V : ASN CG A0255 <- 3.51 -> DT C7 C0004 : score 2.8402 >4juo_AC:Type_II_DNA_topoisomerase;Ribosomal_protein_S5_domain_2-like;ATPase_domain_of_HSP90_chaperone/DNA_topoisomerase_II/histidine_kinase; title=A LOW-RESOLUTION THREE-GATE STRUCTURE OF TOPOISOMERASE IV FROM STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE IN SPACE GROUP H32 organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE / STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE SEROTYPE 4 : x : SER xxxx A0079 <- 4.10 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0080 <- 3.29 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0170 <- 3.16 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0458 <- 4.27 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx >4juo_C:Type_II_DNA_topoisomerase;Ribosomal_protein_S5_domain_2-like;ATPase_domain_of_HSP90_chaperone/DNA_topoisomerase_II/histidine_kinase; title=A LOW-RESOLUTION THREE-GATE STRUCTURE OF TOPOISOMERASE IV FROM STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE IN SPACE GROUP H32 organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE SEROTYPE 4 : x : LYS xxxx C0458 <- 4.27 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx >4juz_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF GAMMA-OHPDG ADDUCT MODIFIED DNA (ZERO PRIMER) WITH DNA POLYMERASE IV AND INCOMING DGTP organism=Sulfolobus solfataricus : x : VAL xxxx A0032 <- 3.41 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.49 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx >4jv0_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=RING-OPENING OF THE -OH-PDG ADDUCT IN TERNARY COMPLEXES WITH THE SULFOLOBUS SOLFATARICUS DNA POLYMERASE DPO4 organism=Sulfolobus solfataricus : x : VAL xxxx A0032 <- 3.81 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.84 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.41 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx >4jv1_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF GAMMA-OHPDG ADDUCT MODIFIED DNA WITH DNA (-1 PRIMER) POLYMERASE IV AND INCOMING DGTP organism=Sulfolobus solfataricus : x : ARG xxxx A0336 <- 4.31 -> DA xxx B0607 : score x.xxxxx >4jv2_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF GAMMA-OHPDG ADDUCT MODIFIED DNA WITH DNA (-1 PRIMER) POLYMERASE IV AND INCOMING DATP organism=Sulfolobus solfataricus : x : ARG xxxx A0336 <- 4.22 -> DA xxx B0607 : score x.xxxxx >4jwm_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF D256E MUTANT OF DNA POLYMERASE BETA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.26 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.10 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.66 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4jwn_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF D256A MUTANT OF DNA POLYMERASE BETA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 2.95 -> DG N3 T0009 : score 1.41023 : w : LYS NZ A0234 <- 5.49 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : TYR OH A0271 <- 2.82 -> DC O2 P0010 : score 3.48345 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.69 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.05 -> DG N3 T0007 : score 0.677 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.38 -> DG N3 T0007 : score 2.669 >4k1g_A:Xylose_isomerase-like; title=STRUCTURE OF E. COLI NFO(ENDO IV)-H69A MUTANT BOUND TO A CLEAVED DNA DUPLEX CONTAINING A ALPHADA:T BASEPAIR organism=Escherichia coli : w : ARG NH1 A0037 <- 5.98 -> DC N4 E0305 : score 1.892 : w : GLN NE2 A0150 <- 5.71 -> DC O2 F0343 : score 2.699 : w : ARG NH2 A0230 <- 5.78 -> DC O2 F0343 : score 1.669 : w : ARG NH2 A0230 <- 5.85 -> DG N3 F0344 : score 0.677 : x : TYR xxxx A0072 <- 3.31 -> DC xxx E0305 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0073 <- 3.51 -> DG xxx F0341 : score x.xxxxx >4k8x_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BINARY COMPLEX OF 9N DNA POLYMERASE IN THE REPLICATIVE STATE organism=THERMOCOCCUS : w : TYR OH A0409 <- 5.84 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : w : TYR OH A0494 <- 5.41 -> DG N3 T0005 : score 3.344 : H : LYS NZ A0592 <- 2.97 -> DG N3 P0011 : score 1.40442 : H : ARG NH1 A0612 <- 3.13 -> DG N3 P0009 : score 2.85109 : H : ARG NH2 A0612 <- 3.01 -> DT O2 P0008 : score 4.05553 : x : ASP xxxx A0614 <- 4.37 -> DT xxx P0008 : score x.xxxxx >4k8z_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=KOD POLYMERASE IN BINARY COMPLEX WITH DSDNA organism=THERMOCOCCUS KODAKARENSIS : w : TYR OH A0494 <- 5.21 -> DT O2 T0005 : score 3.068 : H : LYS NZ A0592 <- 2.79 -> DG N3 P0011 : score 1.45675 : w : LYS NZ A0593 <- 5.74 -> DA N3 T0009 : score 1.538 : H : ARG NH1 A0612 <- 3.30 -> DG N3 P0009 : score 2.74731 : H : ARG NH2 A0612 <- 3.12 -> DT O2 P0008 : score 3.9624 >4k96_B: title=STRUCTURE OF BINARY COMPLEX OF CGAS WITH BOUND DSDNA organism=Mus musculus : w : HIS NE2 B0203 <- 6.16 -> DA N3 G0010 : score 2.619 : x : ARG xxxx B0161 <- 3.60 -> DG xxx G0012 : score x.xxxxx >4k97_A: title=STRUCTURE OF TERNARY COMPLEX OF CGAS WITH DSDNA AND BOUND ATP organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0161 <- 2.52 -> DT O2 E0008 : score 4.54757 : H : ARG NH2 A0161 <- 3.17 -> DT O2 E0008 : score 3.92007 : w : HIS NE2 A0203 <- 5.95 -> DA N3 D0010 : score 2.619 >4k98_A: title=STRUCTURE OF TERNARY COMPLEX OF CGAS WITH DSDNA AND BOUND 5 -PPPG(2 ,5 )PG organism=Mus musculus : H : ARG NH2 A0161 <- 2.59 -> DT O2 E0008 : score 4.41113 >4k99_A: title=STRUCTURE OF TERNARY COMPLEX OF CGAS WITH DSDNA AND BOUND 5 -PPPDG(2 ,5 )PDG organism=Mus musculus : H : ARG NH2 A0161 <- 2.62 -> DG N3 D0012 : score 3.74023 >4k9a_A: title=STRUCTURE OF TERNARY COMPLEX OF CGAS WITH DSDNA AND BOUND 5 -PG(2 ,5 )PA organism=Mus musculus : H : ARG NH2 A0161 <- 2.36 -> DT O2 E0008 : score 4.60587 >4k9b_A: title=STRUCTURE OF TERNARY COMPLEX OF CGAS WITH DSDNA AND BOUND C[G(2 ,5 )PA(3 ,5 )P] organism=Mus musculus : x : ARG xxxx A0161 <- 2.86 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx >4ka4_ADE:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A PROTEOLYTICALLY DEFINED ZBETA DOMAIN OF HUMAN DAI (ZBP1, DLM-1) organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx A0145 <- 3.68 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0145 <- 3.56 -> DG xxx H0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0145 <- 3.60 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx >4ka4_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A PROTEOLYTICALLY DEFINED ZBETA DOMAIN OF HUMAN DAI (ZBP1, DLM-1) organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx B0145 <- 3.50 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx >4kaz_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RNASE T IN COMPLEX WITH A Y STRUCTURED DNA organism=Escherichia coli : w : LYS NZ A0166 <- 5.81 -> DC N4 B0018 : score 0.048 : x : VAL xxxx A0163 <- 4.34 -> DC xxx B0018 : score x.xxxxx >4kb1_AB:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RNASE T IN COMPLEX WITH A BLUGE DNA (TWO NUCLEOTIDE INSERTION CT ) organism=Escherichia coli : w : ARG NH1 B0114 <- 6.38 -> DC O2 C0015 : score 1.381 >4kb6_A: title=STRUCTURE OF PORCINE CYCLIC GMP AMP SYNTHASE (CGAS) IN COMPLEX WITH DNA, ATP AND GTP organism=SUS SCROFA : H : ARG NH2 A0150 <- 2.73 -> DA N3 C0008 : score 3.2851 : x : ARG xxxx A0192 <- 3.72 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx >4kdp_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=TCAR-SSDNA COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE REVEALS THE NOVEL SSDNA BINDING MECHANISM OF THE MARR FAMILY PROTEINS organism=Staphylococcus epidermidis : H : SER OG A0037 <- 2.53 -> DG O6 H0002 : score 4.31194 : H : SER OG B0037 <- 3.03 -> DA N6 H0004 : score 3.13842 : x : LYS xxxx A0065 <- 2.70 -> DG xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0070 <- 4.45 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0074 <- 3.02 -> DG xxx H0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0092 <- 2.64 -> DG xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0093 <- 2.62 -> DA xxx H0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0039 <- 4.06 -> DA xxx H0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0065 <- 3.05 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0070 <- 3.41 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0071 <- 2.49 -> DA xxx H0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0074 <- 2.69 -> DG xxx H0005 : score x.xxxxx >4kdp_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=TCAR-SSDNA COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE REVEALS THE NOVEL SSDNA BINDING MECHANISM OF THE MARR FAMILY PROTEINS organism=Staphylococcus epidermidis : H : SER OG B0037 <- 3.03 -> DA N6 H0004 : score 3.13842 : x : GLU xxxx B0039 <- 4.06 -> DA xxx H0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0065 <- 3.05 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0070 <- 3.41 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0071 <- 2.49 -> DA xxx H0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0074 <- 2.69 -> DG xxx H0005 : score x.xxxxx >4kfc_AB:CheY-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A HYPERACTIVE MUTANT OF RESPONSE REGULATOR KDPE COMPLEXED TO ITS PROMOTER DNA organism=Escherichia coli : H : HIS NE2 B0190 <- 3.26 -> DT O4 Y0018 : score 5.09295 : x : HIS xxxx A0190 <- 3.70 -> DT xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0191 <- 4.33 -> DT xxx Y0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0193 <- 3.64 -> DT xxx Z0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0194 <- 3.25 -> DT xxx Y0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0195 <- 3.68 -> DT xxx Y0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0193 <- 3.36 -> DT xxx Z0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0194 <- 3.64 -> DT xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0195 <- 3.69 -> DT xxx Y0016 : score x.xxxxx >4kfc_B:CheY-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A HYPERACTIVE MUTANT OF RESPONSE REGULATOR KDPE COMPLEXED TO ITS PROMOTER DNA organism=Escherichia coli : H : HIS NE2 B0190 <- 3.26 -> DT O4 Y0018 : score 5.09295 : x : ARG xxxx B0193 <- 3.36 -> DT xxx Z0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0194 <- 3.64 -> DT xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0195 <- 3.69 -> DT xxx Y0016 : score x.xxxxx >4kgc_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING (ETA6-P-CYMENE)-(1, 2- ETHYLENEDIAMINE)-RUTHENIUM organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.82 -> DA N3 J0009 : score 3.22678 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.83 -> DA N3 I0009 : score 3.22031 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.89 -> DT xxx I0069 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.44 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.22 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.00 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.42 -> DT xxx J0038 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.27 -> DT xxx J0069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.25 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.74 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.49 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.98 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.98 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx >4khn_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TERNARY COMPLEX OF THE D714A MUTANT OF RB69 DNA POLYMERASE organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.54 -> DC O2 D0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 3.21 -> DA N3 D0114 : score 2.54922 : w : LYS NZ A0734 <- 5.63 -> DG N3 C0009 : score 2.232 >4khq_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF RB69 MUTANT L415F WIT DUMPNPP organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0567 <- 5.28 -> DG N3 T0004 : score 3.344 : w : ASP OD1 A0621 <- 6.00 -> DG N2 T0005 : score 2.312 : w : THR OG1 A0622 <- 6.58 -> DG N2 T0005 : score 2.036 : w : THR OG1 A0622 <- 5.65 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 2.85 -> DC O2 P0114 : score 2.91669 : w : LYS NZ A0706 <- 6.07 -> DG N2 T0005 : score 0.846 : w : LYS NZ A0734 <- 5.63 -> DT O2 P0111 : score 0.522 : H : LYS NZ A0800 <- 3.09 -> DT O2 P0108 : score 3.37912 >4khs_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF RB69 MUTANT L415F WITH A RIBONUCLEOTIDE AT 0 POSITION organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.58 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 2.70 -> DC O2 P0114 : score 3.00508 : w : LYS NZ A0734 <- 6.24 -> DT O2 P0112 : score 0.522 >4khu_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF RB69 MUTANT L415F WITH A RIBONUCLEOTIDE AT -1 POSITION organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.37 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 2.70 -> DC O2 P0114 : score 3.00508 >4khw_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF RB69 MUTANT L415F WITH RIBONUCLEOTIDE AT -2 POSITION organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.30 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 2.65 -> DC O2 P0114 : score 3.03454 : w : LYS NZ A0734 <- 5.35 -> DT O2 P0111 : score 0.522 >4khy_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF RB69 MUTANT L415F WITH RIBONUCLEOTIDE AT -3 POSITION organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.45 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 2.79 -> DC O2 P0114 : score 2.95205 : w : LYS NZ A0734 <- 6.01 -> DT O2 P0112 : score 0.522 : w : LYS NZ A0734 <- 5.29 -> DT O2 P0111 : score 0.522 : H : LYS NZ A0800 <- 2.88 -> DT O2 P0108 : score 3.52978 >4ki4_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF RB69 MUTANT L415F WITH RIBONUCLEOTIDES AT 0 AND -1 POSITION organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.53 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 2.58 -> DC O2 P0114 : score 3.07578 : w : LYS NZ A0734 <- 5.36 -> DT O2 P0112 : score 0.522 : H : LYS NZ A0800 <- 2.94 -> DT O2 P0108 : score 3.48674 >4ki6_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF RB69 MUTANT L415F WITH RIBONUCLEOTIDES AT -1 AND - 2 POSITION organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.98 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 2.93 -> DC O2 P0114 : score 2.86955 : H : LYS NZ A0800 <- 2.85 -> DT O2 P0108 : score 3.55131 >4kis_D: title=CRYSTAL STRUCTURE OF A LSR-DNA COMPLEX organism=Listeria innocua : H : ARG NH2 D0156 <- 3.10 -> DT O2 K0045 : score 3.97933 : H : ASN ND2 D0208 <- 3.14 -> DT O4 K0040 : score 4.92526 : H : ASN OD1 D0259 <- 2.76 -> DG N2 L0014 : score 4.8384 : H : ASN ND2 D0259 <- 3.29 -> DG N3 L0014 : score 4.41517 : H : THR OG1 D0288 <- 3.48 -> DT O4 K0028 : score 3.35852 : H : THR OG1 D0288 <- 3.05 -> DA N6 K0029 : score 2.62103 : H : THR OG1 D0288 <- 2.61 -> DT O4 L0021 : score 4.03489 : V : SER CB D0290 <- 3.69 -> DT C7 K0026 : score 3.21739 : V : TYR CZ D0207 <- 3.76 -> DT C7 K0039 : score 5.63528 : x : MET xxxx D0136 <- 3.03 -> DA xxx L0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0140 <- 2.85 -> DT xxx K0048 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0262 <- 3.23 -> DC xxx K0036 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0286 <- 3.07 -> DG xxx K0030 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0287 <- 4.13 -> DA xxx L0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0295 <- 3.51 -> DT xxx K0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0297 <- 3.13 -> DT xxx K0028 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0299 <- 3.80 -> DT xxx K0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0306 <- 2.63 -> DG xxx L0016 : score x.xxxxx >4kle_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA MATCHED REACTANT COMPLEX WITH MG2+, 10 S organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.20 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.93 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.59 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4klf_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA MATCHED REACTANT COMPLEX WITH MG2+, 20 S organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.92 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.59 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4klg_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA MATCHED PRODUCT COMPLEX WITH MG2+, 40 S organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0037 <- 6.19 -> DG N7 T0006 : score 3.259 : w : SER OG A0229 <- 6.07 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.93 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : LYS NZ A0234 <- 5.89 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : ARG NH1 A0258 <- 6.50 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : H : TYR OH A0271 <- 2.77 -> DC O2 P0010 : score 3.51842 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.81 -> DC O2 P0011 : score 4.47053 : w : LYS NZ A0280 <- 6.00 -> DG N7 T0006 : score 2.519 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.72 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.46 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.79 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : ASP xxxx A0276 <- 3.47 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx >4klh_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA MATCHED PRODUCT COMPLEX WITH MN2+, 40 S organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 6.29 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 6.23 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : LYS NZ A0234 <- 5.74 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : ARG NH1 A0258 <- 6.24 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : H : TYR OH A0271 <- 2.76 -> DC O2 P0010 : score 3.52542 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.94 -> DC O2 P0011 : score 4.35406 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.45 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.33 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.50 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : ASP xxxx A0276 <- 3.40 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.05 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >4kli_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA MATCHED PRODUCT COMPLEX WITH MG2+, 90 S organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0037 <- 6.20 -> DG N7 T0006 : score 3.259 : w : SER OG A0229 <- 6.14 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 6.06 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : LYS NZ A0234 <- 5.67 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : TYR OH A0271 <- 2.79 -> DC O2 P0010 : score 3.50443 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.83 -> DC O2 P0011 : score 4.45261 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.49 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.50 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.62 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : ASP xxxx A0276 <- 3.38 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.12 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >4klj_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA MATCHED PRODUCT COMPLEX WITH MG2+, 5 MIN organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0037 <- 6.27 -> DG N7 T0006 : score 3.259 : w : SER OG A0229 <- 6.18 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.87 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : ARG NH1 A0258 <- 6.31 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : H : TYR OH A0271 <- 2.77 -> DC O2 P0010 : score 3.51842 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.86 -> DC O2 P0011 : score 4.42573 : H : LYS NZ A0280 <- 2.62 -> DG N7 T0006 : score 5.57979 : w : LYS NZ A0280 <- 5.62 -> DG N7 T0006 : score 2.519 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.59 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.47 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.62 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : ASP xxxx A0276 <- 3.42 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx >4kll_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA MATCHED PRODUCT COMPLEX WITH MG2+, 45 MIN organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0037 <- 6.25 -> DG N7 T0006 : score 3.259 : w : SER OG A0229 <- 6.10 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.63 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : ARG NH1 A0258 <- 6.27 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : H : TYR OH A0271 <- 2.72 -> DC O2 P0010 : score 3.55339 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.83 -> DC O2 P0011 : score 4.45261 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.49 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.47 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.53 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : ASP xxxx A0276 <- 3.48 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.37 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >4klm_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA MATCHED PRODUCT COMPLEX WITH MG2+, 11 H organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 2.85 -> DG N3 T0009 : score 1.43931 : w : LYS NZ A0234 <- 5.45 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : ARG NH1 A0258 <- 6.38 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : H : TYR OH A0271 <- 2.65 -> DC O2 P0010 : score 3.60236 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.88 -> DC O2 P0011 : score 4.40782 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.51 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.44 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.57 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : ASP xxxx A0276 <- 3.36 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.40 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >4klo_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA MATCHED NICK COMPLEX WITH MG2+ AND PPI, 30 MIN organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0037 <- 6.25 -> DG N7 T0006 : score 3.259 : w : SER OG A0229 <- 6.18 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 6.04 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : LYS NZ A0234 <- 5.75 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : ARG NH1 A0258 <- 6.32 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : H : TYR OH A0271 <- 2.71 -> DC O2 P0010 : score 3.56039 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.89 -> DC O2 P0011 : score 4.39886 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.51 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.46 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.63 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : ASP xxxx A0276 <- 3.48 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.25 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >4klq_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=OBSERVING A DNA POLYMERASE CHOOSE RIGHT FROM WRONG. organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.02 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.85 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.40 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4kls_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA MISMATCHED REACTANT COMPLEX WITH MN2+, 10 MIN organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.37 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.79 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.49 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4klt_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA MISMATCHED PRODUCT COMPLEX WITH MN2+, 30 MIN organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 5.93 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : H : LYS NZ A0234 <- 2.93 -> DG N3 T0009 : score 1.41605 : w : LYS NZ A0234 <- 5.70 -> DG N2 T0009 : score 0.846 >4klu_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA MISMATCHED PRODUCT COMPLEX WITH MN2+, 15 H organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 6.09 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.96 -> DC O2 T0008 : score 1.3 >4kny_AB:CheY-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RESPONSE REGULATOR KDPE COMPLEXED TO DNA IN AN ACTIVE-LIKE CONFORMATION organism=Escherichia coli : H : HIS NE2 B0190 <- 2.83 -> DT O4 Y0018 : score 5.57532 : x : HIS xxxx A0190 <- 4.15 -> DT xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0191 <- 4.36 -> DT xxx Y0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0193 <- 3.73 -> DT xxx Z0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0194 <- 3.23 -> DT xxx Y0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0195 <- 3.81 -> DT xxx Y0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0193 <- 3.26 -> DT xxx Z0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0194 <- 3.73 -> DA xxx Z0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0195 <- 3.74 -> DT xxx Y0015 : score x.xxxxx >4kny_B:CheY-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RESPONSE REGULATOR KDPE COMPLEXED TO DNA IN AN ACTIVE-LIKE CONFORMATION organism=Escherichia coli : H : HIS NE2 B0190 <- 2.83 -> DT O4 Y0018 : score 5.57532 : x : ARG xxxx B0193 <- 3.26 -> DT xxx Z0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0194 <- 3.73 -> DA xxx Z0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0195 <- 3.74 -> DT xxx Y0015 : score x.xxxxx >4koe_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE(TROVAFLOXACIN)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IV TOPOISOMERASE FROM S. PNEUMONIAE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE SEROTYPE 4 : x : TYR xxxx A0020 <- 4.24 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0080 <- 3.58 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0117 <- 3.56 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0170 <- 3.25 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0028 <- 4.02 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0080 <- 3.71 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0117 <- 3.84 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0170 <- 3.21 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0458 <- 3.66 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0458 <- 3.41 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx >4koe_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE(TROVAFLOXACIN)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IV TOPOISOMERASE FROM S. PNEUMONIAE organism=? : x : ARG xxxx B0028 <- 4.02 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0080 <- 3.71 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0117 <- 3.84 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0170 <- 3.21 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx >4kpe_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=NOVEL FLUOROQUINOLONES IN COMPLEX WITH TOPOISOMERASE IV FROM S. PNEUMONIAE AND E-SITE G-GATE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE / STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE SEROTYPE 4 : w : TYR OH A0020 <- 5.28 -> DT O2 F0007 : score 3.068 : x : SER xxxx A0080 <- 3.88 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0117 <- 3.40 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0170 <- 3.33 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0028 <- 4.29 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0080 <- 3.50 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0117 <- 3.44 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0170 <- 3.39 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0458 <- 3.50 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0458 <- 2.99 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx >4kpe_C:Type_II_DNA_topoisomerase; title=NOVEL FLUOROQUINOLONES IN COMPLEX WITH TOPOISOMERASE IV FROM S. PNEUMONIAE AND E-SITE G-GATE organism=? : x : LYS xxxx C0458 <- 3.50 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx >4kpf_AC:Type_II_DNA_topoisomerase; title=NOVEL FLUOROQUINOLONES IN COMPLEX WITH TOPOISOMERASE IV FROM S. PNEUMONIAE AND E-SITE G-GATE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : w : TYR OH A0020 <- 5.15 -> DT O2 F0007 : score 3.068 : x : SER xxxx A0080 <- 3.71 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0170 <- 3.29 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0458 <- 3.55 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx >4kpf_BD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=NOVEL FLUOROQUINOLONES IN COMPLEX WITH TOPOISOMERASE IV FROM S. PNEUMONIAE AND E-SITE G-GATE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : ARG xxxx B0028 <- 4.41 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0080 <- 3.72 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0170 <- 3.36 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0458 <- 3.14 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx >4kpf_D:Type_II_DNA_topoisomerase; title=NOVEL FLUOROQUINOLONES IN COMPLEX WITH TOPOISOMERASE IV FROM S. PNEUMONIAE AND E-SITE G-GATE organism=? : x : LYS xxxx D0458 <- 3.14 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx >4kpy_B:Ribonuclease_H-like; title=DNA BINDING PROTEIN AND DNA COMPLEX STRUCTURE organism=Thermus thermophilus : H : ASN ND2 B0449 <- 3.09 -> DG N3 E0002 : score 4.61097 : x : TYR xxxx B0043 <- 3.44 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0044 <- 3.63 -> DA xxx M0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0047 <- 3.75 -> DA xxx M0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0059 <- 3.80 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0267 <- 3.77 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0445 <- 3.70 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0446 <- 3.55 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0548 <- 4.42 -> DA xxx M0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0610 <- 3.72 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0611 <- 4.13 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0615 <- 3.75 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0647 <- 3.78 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx >4ktq_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BINARY COMPLEX OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM T. AQUATICUS BOUND TO A PRIMER/TEMPLATE DNA organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.83 -> DC O2 B0109 : score 2.92848 : H : GLN OE1 A0754 <- 2.90 -> DG N2 C0205 : score 5.49554 : x : ARG xxxx A0573 <- 2.92 -> DG xxx C0205 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0583 <- 3.92 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0615 <- 4.38 -> DG xxx C0205 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0671 <- 4.24 -> DG xxx C0205 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0750 <- 4.11 -> DG xxx C0205 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0784 <- 3.91 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >4kud_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF N-TERMINAL ACETYLATED SIR3 BAH DOMAIN D205N MUTANT IN COMPLEX WITH YEAST NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 A0040 <- 3.18 -> DA N3 J0229 : score 3.40222 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.79 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.83 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.82 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.00 -> DG xxx I0081 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.69 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.74 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0032 <- 4.23 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0078 <- 4.35 -> DG xxx I0131 : score x.xxxxx >4l0y_A:p53-like_transcription_factors; 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title=CRYSTAL STRUCTURE OF RUNX1 AND ETS1 BOUND TO TCR ALPHA PROMOTER (CRYSTAL FORM 2) organism=MUS MUSCULUS / HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0080 <- 3.25 -> DG N7 D0109 : score 5.5055 : H : ARG NH2 A0080 <- 2.93 -> DG O6 D0109 : score 6.4284 : H : ARG NH1 A0142 <- 2.64 -> DT O2 D0115 : score 4.44422 : H : ASP OD1 A0171 <- 2.55 -> DC N4 C0006 : score 5.61212 : H : ASP OD2 A0171 <- 3.20 -> DC N4 C0007 : score 5.704 : H : ARG NH1 A0174 <- 2.64 -> DG O6 D0111 : score 6.278 : H : ARG NH2 A0174 <- 2.42 -> DG N7 D0111 : score 6.86985 : H : ARG NH2 A0177 <- 2.57 -> DG N7 D0112 : score 6.67831 : H : ARG NE B0391 <- 2.62 -> DG O6 D0106 : score 4.0829 : H : ARG NH2 B0391 <- 2.91 -> DG N7 D0106 : score 6.24415 : H : ARG NE B0394 <- 3.05 -> DG N7 D0105 : score 4.20071 : H : ARG NH2 B0394 <- 2.94 -> DG O6 D0105 : score 6.4152 : H : TYR OH B0395 <- 2.75 -> DA N6 D0107 : score 4.71722 : w : TYR OH B0395 <- 5.59 -> DA N7 D0107 : score 3.238 : x : VAL xxxx A0170 <- 4.29 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0387 <- 4.31 -> DA xxx D0102 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0388 <- 3.95 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx >4l0z_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; 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title=CRYSTAL STRUCTURE OF RUNX1 AND ETS1 BOUND TO TCR ALPHA PROMOTER (CRYSTAL FORM 3) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE B0391 <- 2.69 -> DG O6 D0106 : score 4.02773 : H : ARG NH2 B0391 <- 2.53 -> DG N7 D0106 : score 6.72938 : H : ARG NE B0394 <- 3.20 -> DG N7 D0105 : score 4.06805 : H : ARG NH2 B0394 <- 3.09 -> DG O6 D0105 : score 6.2172 : H : TYR OH B0395 <- 2.88 -> DA N6 D0107 : score 4.59578 : H : TYR OH B0395 <- 2.82 -> DA N6 C0010 : score 4.65183 : x : LYS xxxx B0388 <- 3.90 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx >4l18_E:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RUNX1 AND ETS1 BOUND TO TCR ALPHA PROMOTER (CRYSTAL FORM 3) organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 E0080 <- 2.88 -> DG N7 H0309 : score 5.9532 : H : ARG NH2 E0080 <- 2.69 -> DG O6 H0309 : score 6.7452 : H : ARG NH1 E0142 <- 2.89 -> DT O2 H0315 : score 4.22889 : H : ARG NH1 E0142 <- 3.04 -> DA N3 G0204 : score 3.50531 : H : ASP OD1 E0171 <- 2.83 -> DC N4 G0206 : score 5.3128 : H : ASP OD2 E0171 <- 2.79 -> DC N4 G0207 : score 6.2124 : H : ARG NH1 E0174 <- 2.68 -> DG O6 H0311 : score 6.22933 : H : ARG NH2 E0174 <- 3.18 -> DG N7 H0311 : score 5.89938 : H : ARG NH1 E0177 <- 3.28 -> DG O6 H0312 : score 5.49933 : H : ARG NH2 E0177 <- 2.71 -> DG N7 H0312 : score 6.49954 : w : ARG NH1 E0177 <- 5.42 -> DG O6 G0205 : score 2.756 : x : VAL xxxx E0170 <- 3.79 -> DC xxx G0207 : score x.xxxxx >4l18_EF:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RUNX1 AND ETS1 BOUND TO TCR ALPHA PROMOTER (CRYSTAL FORM 3) organism=HOMO SAPIENS / MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 E0080 <- 2.88 -> DG N7 H0309 : score 5.9532 : H : ARG NH2 E0080 <- 2.69 -> DG O6 H0309 : score 6.7452 : H : ARG NH1 E0142 <- 3.04 -> DA N3 G0204 : score 3.50531 : H : ARG NH1 E0142 <- 2.89 -> DT O2 H0315 : score 4.22889 : H : ASP OD1 E0171 <- 2.83 -> DC N4 G0206 : score 5.3128 : H : ASP OD2 E0171 <- 2.79 -> DC N4 G0207 : score 6.2124 : H : ARG NH1 E0174 <- 2.68 -> DG O6 H0311 : score 6.22933 : H : ARG NH2 E0174 <- 3.18 -> DG N7 H0311 : score 5.89938 : H : ARG NH1 E0177 <- 3.28 -> DG O6 H0312 : score 5.49933 : H : ARG NH2 E0177 <- 2.71 -> DG N7 H0312 : score 6.49954 : w : ARG NH1 E0177 <- 5.42 -> DG O6 G0205 : score 2.756 : H : ARG NE F0391 <- 2.70 -> DG O6 H0306 : score 4.01985 : H : ARG NH2 F0391 <- 3.04 -> DG N7 H0306 : score 6.07815 : H : ARG NE F0394 <- 3.14 -> DG N7 H0305 : score 4.12111 : H : ARG NH2 F0394 <- 3.01 -> DG O6 H0305 : score 6.3228 : H : TYR OH F0395 <- 3.20 -> DA N6 H0307 : score 4.29687 : w : TYR OH F0395 <- 5.19 -> DT O4 H0308 : score 2.914 : x : VAL xxxx E0170 <- 3.79 -> DC xxx G0207 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0388 <- 3.91 -> DT xxx G0211 : score x.xxxxx >4l5r_C:HIN-2000_domain-like; 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title=CRYSTAL STRUCTURE OF PSEUDOMONAS AERUGINOSA TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PA2196 BOUND TO ITS OPERATOR DNA organism=Pseudomonas aeruginosa : H : LYS NZ E0041 <- 2.87 -> DG N7 S0016 : score 5.31049 : w : LYS NZ E0041 <- 6.33 -> DT O4 S0017 : score 1.7 : H : LYS NZ F0041 <- 3.05 -> DG O6 T0016 : score 5.49173 : w : ASN ND2 G0031 <- 6.56 -> DA N6 S0012 : score 2.5 : w : LYS NZ G0041 <- 5.69 -> DA N7 S0012 : score 1.655 : x : LEU xxxx E0030 <- 4.47 -> DG xxx S0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0043 <- 3.38 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0045 <- 3.20 -> DT xxx S0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0046 <- 3.73 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0031 <- 4.45 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0040 <- 3.90 -> DG xxx S0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0043 <- 3.88 -> DT xxx S0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0045 <- 3.25 -> DT xxx T0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0046 <- 3.81 -> DC xxx S0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0040 <- 4.23 -> DC xxx T0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0043 <- 3.75 -> DA xxx T0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0045 <- 3.35 -> DT xxx S0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0046 <- 4.06 -> DG xxx T0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0030 <- 4.08 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0031 <- 3.83 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0045 <- 3.17 -> DA xxx T0020 : score x.xxxxx >4l62_IJKL:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PSEUDOMONAS AERUGINOSA TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PA2196 BOUND TO ITS OPERATOR DNA organism=Pseudomonas aeruginosa : H : LYS NZ I0041 <- 2.75 -> DG N7 U0016 : score 5.43976 : H : LYS NZ J0041 <- 3.14 -> DG O6 V0016 : score 5.38768 : w : LYS NZ L0041 <- 5.89 -> DA N6 U0012 : score 2.097 : x : SER xxxx I0043 <- 3.28 -> DT xxx V0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx I0045 <- 3.10 -> DT xxx U0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx I0046 <- 3.97 -> DT xxx V0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0031 <- 4.13 -> DT xxx V0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0040 <- 3.83 -> DG xxx U0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0043 <- 3.79 -> DT xxx U0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0045 <- 3.36 -> DT xxx V0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx J0046 <- 3.83 -> DC xxx U0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx K0030 <- 3.80 -> DT xxx V0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx K0031 <- 4.01 -> DT xxx V0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0043 <- 3.63 -> DT xxx U0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx K0045 <- 3.36 -> DA xxx V0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx L0040 <- 4.16 -> DC xxx V0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0043 <- 3.94 -> DA xxx V0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0045 <- 3.35 -> DT xxx U0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0046 <- 3.91 -> DG xxx V0008 : score x.xxxxx >4l62_M:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PSEUDOMONAS AERUGINOSA TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PA2196 BOUND TO ITS OPERATOR DNA organism=Pseudomonas aeruginosa : H : LYS NZ M0041 <- 2.69 -> DG N7 W0016 : score 5.50439 : x : LEU xxxx M0030 <- 4.21 -> DG xxx W0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0043 <- 3.58 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx M0045 <- 3.23 -> DT xxx W0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx M0046 <- 3.99 -> DT xxx X0005 : score x.xxxxx >4l62_MNOP:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PSEUDOMONAS AERUGINOSA TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PA2196 BOUND TO ITS OPERATOR DNA organism=Pseudomonas aeruginosa : H : LYS NZ M0041 <- 2.69 -> DG N7 W0016 : score 5.50439 : H : LYS NZ N0041 <- 3.41 -> DG O6 X0016 : score 5.07552 : H : LYS NZ P0041 <- 3.08 -> DA N7 W0012 : score 2.7727 : x : LEU xxxx M0030 <- 4.21 -> DG xxx W0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0043 <- 3.58 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx M0045 <- 3.23 -> DT xxx W0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx M0046 <- 3.99 -> DT xxx X0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx N0040 <- 3.94 -> DA xxx W0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx N0043 <- 3.77 -> DT xxx W0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx N0045 <- 3.40 -> DT xxx X0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx N0046 <- 4.06 -> DC xxx W0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0030 <- 4.34 -> DT xxx X0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx O0031 <- 3.88 -> DT xxx X0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx O0043 <- 4.07 -> DT xxx W0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx O0045 <- 3.29 -> DA xxx X0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0040 <- 4.10 -> DC xxx X0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx P0043 <- 4.00 -> DA xxx X0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx P0045 <- 3.36 -> DT xxx W0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx P0046 <- 3.85 -> DG xxx X0008 : score x.xxxxx >4lb5_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PKZ ZALPHA IN COMPLEX WITH DS(CG)6 (HEXAGONAL FORM) organism=Danio rerio : w : LYS NZ A0037 <- 6.14 -> DG N2 C0002 : score 0.846 : w : LYS NZ B0037 <- 5.74 -> DG N2 C0006 : score 0.846 : x : TYR xxxx A0045 <- 3.69 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0045 <- 3.62 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx >4lb5_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PKZ ZALPHA IN COMPLEX WITH DS(CG)6 (HEXAGONAL FORM) organism=Danio rerio : w : LYS NZ B0037 <- 5.74 -> DG N2 C0006 : score 0.846 : x : TYR xxxx B0045 <- 3.62 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx >4ld0_B:Ribonuclease_H-like; title=T. THERMOPHILUS RUVC IN COMPLEX WITH HOLLIDAY JUNCTION SUBSTRATE organism=Thermus thermophilus : x : PHE xxxx B0074 <- 3.65 -> DA xxx F0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0076 <- 3.24 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0077 <- 3.71 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0080 <- 3.94 -> DA xxx F0025 : score x.xxxxx >4ld9_A:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE N-TERMINALLY ACETYLATED BAH DOMAIN OF SIR3 BOUND TO THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=XENOPUS LAEVIS : x : HIS xxxx A0039 <- 4.27 -> DA xxx J-069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.85 -> DA xxx J-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.32 -> DC xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.10 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx >4ld9_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE N-TERMINALLY ACETYLATED BAH DOMAIN OF SIR3 BOUND TO THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=XENOPUS LAEVIS : x : HIS xxxx A0039 <- 4.27 -> DA xxx J-069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.85 -> DA xxx J-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.32 -> DC xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.10 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.36 -> DA xxx J0057 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0035 <- 4.01 -> DA xxx I0039 : score x.xxxxx >4ldx_A:DNA-binding_pseudobarrel_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF ARABIDOPSIS THALIANA AUXIN RESPONSE FACTOR 1 (ARF1) IN COMPLEX WITH PROTOMOR-LIKE SEQUENCE ER7 organism=Arabidopsis thaliana : H : HIS ND1 A0136 <- 3.10 -> DG N7 C0014 : score 5.84969 : H : ARG NH2 A0186 <- 2.57 -> DG O6 D0003 : score 6.9036 : x : SER xxxx A0131 <- 3.62 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0181 <- 3.50 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0184 <- 3.18 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx >4ldx_AB:DNA-binding_pseudobarrel_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF ARABIDOPSIS THALIANA AUXIN RESPONSE FACTOR 1 (ARF1) IN COMPLEX WITH PROTOMOR-LIKE SEQUENCE ER7 organism=Arabidopsis thaliana : H : HIS ND1 A0136 <- 3.10 -> DG N7 C0014 : score 5.84969 : H : ARG NH2 A0186 <- 2.57 -> DG O6 D0003 : score 6.9036 : H : HIS ND1 B0136 <- 2.99 -> DG O6 D0014 : score 5.9866 : H : ARG NH1 B0186 <- 2.95 -> DG O6 C0003 : score 5.90083 : V : PRO CG B0184 <- 3.61 -> DT C7 C0001 : score 6.66103 : x : SER xxxx A0131 <- 3.62 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0181 <- 3.50 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0184 <- 3.18 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0131 <- 3.74 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0181 <- 3.58 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx >4ley_D: title=STRUCTURE OF MOUSE CGAS BOUND TO 18 BP DNA organism=? : x : ARG xxxx D0161 <- 3.35 -> DA xxx K0017 : score x.xxxxx >4lez_C: title=STRUCTURE OF MOUSE CGAS BOUND TO AN 18BP DNA AND CGAS PRODUCT organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 C0161 <- 3.33 -> DT O2 I0012 : score 3.84993 >4lg0_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF A TERNARY FOXO1-ETS1 DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 A0211 <- 3.06 -> DA N6 D0008 : score 5.70866 : H : ASN ND2 A0211 <- 2.98 -> DA N7 D0008 : score 5.65917 : w : ASN OD1 A0211 <- 5.45 -> DT O4 C0015 : score 3.132 : w : SER OG A0212 <- 5.45 -> DA N7 D0006 : score 2.343 : H : HIS ND1 A0215 <- 2.85 -> DT O4 C0016 : score 4.67331 : w : GLU OE2 B0387 <- 6.44 -> DC N4 C0012 : score 3.597 : H : ARG NE B0391 <- 2.86 -> DG O6 D0013 : score 3.89373 : H : ARG NH2 B0391 <- 2.78 -> DG N7 D0013 : score 6.41015 : H : ARG NE B0394 <- 2.89 -> DG N7 D0012 : score 4.3422 : H : ARG NH2 B0394 <- 3.14 -> DG O6 D0012 : score 6.1512 : H : TYR OH B0395 <- 2.94 -> DA N6 D0014 : score 4.53974 : V : ARG CZ A0214 <- 3.55 -> DT C7 C0013 : score 2.26558 : x : SER xxxx A0205 <- 4.14 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0218 <- 3.38 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0219 <- 4.38 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0388 <- 3.86 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >4lg0_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF A TERNARY FOXO1-ETS1 DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : w : GLU OE2 B0387 <- 6.44 -> DC N4 C0012 : score 3.597 : H : ARG NE B0391 <- 2.86 -> DG O6 D0013 : score 3.89373 : H : ARG NH2 B0391 <- 2.78 -> DG N7 D0013 : score 6.41015 : H : ARG NE B0394 <- 2.89 -> DG N7 D0012 : score 4.3422 : H : ARG NH2 B0394 <- 3.14 -> DG O6 D0012 : score 6.1512 : H : TYR OH B0395 <- 2.94 -> DA N6 D0014 : score 4.53974 : x : LYS xxxx B0388 <- 3.86 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >4lg7_A:DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE MBD4 MBD DOMAIN IN COMPLEX WITH METHYLATED CPG DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0097 <- 2.62 -> DG N7 C0007 : score 6.2678 : H : ARG NH2 A0097 <- 2.76 -> DG O6 C0007 : score 6.6528 : H : ARG NH1 A0105 <- 2.90 -> DT O4 C0008 : score 3.20259 : H : ARG NH1 A0119 <- 2.61 -> DG O6 B0007 : score 6.3145 : H : ARG NH2 A0119 <- 2.88 -> DG N7 B0007 : score 6.28246 : x : THR xxxx A0102 <- 3.74 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >4lll_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS MEPR-DNA COMPLEX organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : H : ARG NH1 A0087 <- 2.93 -> DT O2 G0004 : score 4.19444 : V : ASN CG B0066 <- 3.83 -> DT C7 G0014 : score 2.62834 : V : PRO CG B0062 <- 3.56 -> DT C7 G0016 : score 6.74051 : V : ASN CB A0066 <- 3.80 -> DT C7 H0014 : score 1.93744 : V : PRO CG A0062 <- 3.71 -> DT C7 H0016 : score 6.50205 : x : THR xxxx A0060 <- 3.51 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0063 <- 3.55 -> DC xxx H0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0065 <- 4.14 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0060 <- 3.43 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0063 <- 3.46 -> DC xxx G0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0065 <- 3.71 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0087 <- 3.41 -> DT xxx H0004 : score x.xxxxx >4lll_CD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS MEPR-DNA COMPLEX organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : H : ARG NH1 C0087 <- 3.15 -> DT O2 E0004 : score 4.00496 : H : ARG NH1 D0087 <- 2.66 -> DT O2 F0004 : score 4.42699 : V : PRO CG D0062 <- 3.60 -> DT C7 E0016 : score 6.67692 : V : ASN CB C0066 <- 3.76 -> DT C7 F0014 : score 1.95681 : V : PRO CG C0062 <- 3.58 -> DT C7 F0016 : score 6.70872 : x : THR xxxx C0060 <- 3.26 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0063 <- 3.39 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0065 <- 4.27 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0060 <- 3.31 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0063 <- 3.86 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0065 <- 3.98 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0066 <- 4.11 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx >4lll_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS MEPR-DNA COMPLEX organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : H : ARG NH1 D0087 <- 2.66 -> DT O2 F0004 : score 4.42699 : V : PRO CG D0062 <- 3.60 -> DT C7 E0016 : score 6.67692 : x : THR xxxx D0060 <- 3.31 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0063 <- 3.86 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0065 <- 3.98 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0066 <- 4.11 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx >4lll_IJ:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS MEPR-DNA COMPLEX organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : H : ARG NH1 I0087 <- 3.29 -> DT O2 K0004 : score 3.88438 : V : PRO CG J0062 <- 3.90 -> DT C7 K0016 : score 6.2 : V : PRO CG I0062 <- 3.51 -> DT C7 L0016 : score 6.82 : x : THR xxxx I0060 <- 3.35 -> DT xxx L0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0063 <- 3.84 -> DC xxx L0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0065 <- 4.37 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0066 <- 3.68 -> DT xxx L0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0060 <- 3.49 -> DT xxx K0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0063 <- 3.49 -> DC xxx K0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0065 <- 4.18 -> DT xxx L0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0066 <- 4.26 -> DT xxx K0014 : score x.xxxxx >4lln_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS MEPR-DNA COMPLEX organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : H : ARG NH1 A0087 <- 3.30 -> DT O2 G0004 : score 3.87577 : V : PRO CG A0062 <- 3.57 -> DT C7 H0016 : score 6.72462 : V : PRO CG B0062 <- 3.84 -> DT C7 G0016 : score 6.29538 : x : THR xxxx A0060 <- 3.75 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0063 <- 3.82 -> DC xxx H0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0065 <- 4.31 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0066 <- 3.79 -> DT xxx H0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0060 <- 3.68 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0063 <- 3.64 -> DC xxx G0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0065 <- 4.41 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0066 <- 3.74 -> DT xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0087 <- 3.21 -> DT xxx H0004 : score x.xxxxx >4lln_CD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS MEPR-DNA COMPLEX organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : H : ARG NH1 C0087 <- 2.35 -> DT O2 E0004 : score 4.69399 : V : PRO CG D0062 <- 3.68 -> DT C7 E0016 : score 6.54974 : V : PRO CG C0062 <- 3.77 -> DT C7 F0016 : score 6.40667 : x : THR xxxx C0060 <- 3.69 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0063 <- 3.61 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0065 <- 4.09 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0066 <- 3.82 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0060 <- 3.54 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0063 <- 3.70 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0065 <- 4.17 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0066 <- 4.30 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx >4lln_I:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS MEPR-DNA COMPLEX organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : H : ARG NH1 I0087 <- 3.08 -> DT O2 K0004 : score 4.06525 : V : PRO CG I0062 <- 3.65 -> DT C7 L0016 : score 6.59744 : x : THR xxxx I0060 <- 3.77 -> DT xxx L0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0063 <- 3.35 -> DC xxx L0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0065 <- 4.44 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0066 <- 3.90 -> DT xxx L0014 : score x.xxxxx >4lln_IJ:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS MEPR-DNA COMPLEX organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : H : ARG NH1 I0087 <- 3.08 -> DT O2 K0004 : score 4.06525 : H : ARG NH1 J0087 <- 2.99 -> DT O2 L0004 : score 4.14277 : V : PRO CG I0062 <- 3.65 -> DT C7 L0016 : score 6.59744 : V : PRO CG J0062 <- 3.79 -> DT C7 K0016 : score 6.37487 : x : THR xxxx I0060 <- 3.77 -> DT xxx L0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0063 <- 3.35 -> DC xxx L0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0065 <- 4.44 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0066 <- 3.90 -> DT xxx L0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0060 <- 3.61 -> DT xxx K0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0063 <- 3.85 -> DC xxx K0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0066 <- 3.35 -> DT xxx K0014 : score x.xxxxx >4lmg_AD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF AFT2 IN COMPLEX WITH DNA organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NE A0076 <- 3.06 -> DG N7 H0016 : score 4.19186 : H : ARG NH2 A0076 <- 3.04 -> DG N7 H0016 : score 6.07815 : H : ASP OD2 A0078 <- 3.11 -> DA N6 H0015 : score 3.75441 : H : LYS NZ A0081 <- 2.69 -> DA N7 H0015 : score 3.0018 : H : ARG NE D0076 <- 2.76 -> DG O6 G0007 : score 3.97255 : H : ARG NH2 D0076 <- 2.90 -> DG N7 G0007 : score 6.25692 : H : ASP OD2 D0078 <- 3.03 -> DC N4 H0022 : score 5.9148 : w : ASP OD2 D0078 <- 6.57 -> DC N4 H0023 : score 3.623 : H : LYS NZ D0081 <- 3.03 -> DG O6 G0005 : score 5.51485 : H : LYS NZ D0081 <- 2.64 -> DG O6 G0006 : score 5.96575 : w : LYS NZ D0081 <- 5.54 -> DG N7 G0006 : score 2.519 : x : SER xxxx A0077 <- 3.34 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0077 <- 3.34 -> DA xxx H0020 : score x.xxxxx >4lmg_BC: title=CRYSTAL STRUCTURE OF AFT2 IN COMPLEX WITH DNA organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NE B0076 <- 3.17 -> DG O6 F0016 : score 3.64939 : H : ARG NH2 B0076 <- 3.00 -> DG N7 F0016 : score 6.12923 : H : ASP OD2 B0078 <- 3.23 -> DA N6 F0015 : score 3.65834 : H : ARG NE C0076 <- 3.27 -> DG N7 E0007 : score 4.00615 : H : ARG NE C0076 <- 2.93 -> DG O6 E0007 : score 3.83856 : H : ARG NH2 C0076 <- 2.88 -> DG N7 E0007 : score 6.28246 : H : ASP OD2 C0078 <- 2.97 -> DC N4 F0022 : score 5.9892 : H : LYS NZ C0081 <- 2.96 -> DG O6 E0005 : score 5.59578 : H : LYS NZ C0081 <- 2.63 -> DG O6 E0006 : score 5.97732 : w : LYS NZ C0081 <- 5.87 -> DG N7 E0006 : score 2.519 : x : SER xxxx B0077 <- 3.26 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0077 <- 3.25 -> DA xxx F0020 : score x.xxxxx >4lmg_C: title=CRYSTAL STRUCTURE OF AFT2 IN COMPLEX WITH DNA organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ARG NE C0076 <- 3.27 -> DG N7 E0007 : score 4.00615 : H : ARG NE C0076 <- 2.93 -> DG O6 E0007 : score 3.83856 : H : ARG NH2 C0076 <- 2.88 -> DG N7 E0007 : score 6.28246 : H : ASP OD2 C0078 <- 2.97 -> DC N4 F0022 : score 5.9892 : H : LYS NZ C0081 <- 2.96 -> DG O6 E0005 : score 5.59578 : H : LYS NZ C0081 <- 2.63 -> DG O6 E0006 : score 5.97732 : w : LYS NZ C0081 <- 5.87 -> DG N7 E0006 : score 2.519 : x : SER xxxx C0077 <- 3.25 -> DA xxx F0020 : score x.xxxxx >4lnq_A:HIN-2000_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF IFI202 HINA DOMAIN IN COMPLEX WITH 20BP DSDNA organism=Mus musculus : w : ARG NH1 A0224 <- 6.31 -> DT O4 D0013 : score 1.768 : w : ARG NH1 A0224 <- 5.65 -> DA N7 C0007 : score 0.388 >4lnq_AB:HIN-2000_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF IFI202 HINA DOMAIN IN COMPLEX WITH 20BP DSDNA organism=Mus musculus : w : ARG NH1 A0224 <- 6.31 -> DT O4 D0013 : score 1.768 : w : ARG NH1 A0224 <- 5.65 -> DA N7 C0007 : score 0.388 : w : ARG NH1 B0224 <- 5.90 -> DA N6 D0007 : score 1.486 : w : ARG NH1 B0224 <- 5.57 -> DA N7 D0007 : score 0.388 >4lox_A:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE I-SMAMI LAGLIDADG HOMING ENDONUCLEASE BOUND TO CLEAVED DNA organism=Sordaria macrospora : H : ARG NH1 A0026 <- 3.03 -> DG O6 C0019 : score 5.8035 : H : ARG NH2 A0026 <- 2.69 -> DG N7 C0019 : score 6.52508 : H : ARG NH1 A0028 <- 2.78 -> DG O6 C0020 : score 6.10767 : H : ARG NH2 A0028 <- 2.82 -> DG N7 C0020 : score 6.35908 : H : TYR OH A0033 <- 2.67 -> DA N7 D0004 : score 4.25922 : H : TYR OH A0033 <- 3.18 -> DA N6 D0004 : score 4.31555 : w : SER OG A0044 <- 6.19 -> DG N7 C0016 : score 2.749 : w : THR OG1 A0046 <- 5.66 -> DG O6 C0016 : score 2.729 : w : THR OG1 A0046 <- 6.10 -> DG N7 C0016 : score 3.422 : w : SER OG A0071 <- 5.46 -> DG O6 C0016 : score 2.749 : w : SER OG A0077 <- 5.44 -> DG O6 C0016 : score 2.749 : H : ARG NH1 A0079 <- 2.82 -> DG O6 C0017 : score 6.059 : H : ARG NH2 A0079 <- 3.00 -> DG O6 C0017 : score 6.336 : w : GLU OE1 A0081 <- 5.25 -> DC N4 D0007 : score 3.528 : H : LYS NZ A0183 <- 2.86 -> DG N7 E0018 : score 5.32127 : H : LYS NZ A0187 <- 2.98 -> DG N7 E0021 : score 5.19201 : H : LYS NZ A0187 <- 2.80 -> DT O4 E0022 : score 3.58718 : H : SER OG A0191 <- 2.70 -> DG N7 B0002 : score 4.57169 : H : GLN OE1 A0197 <- 2.97 -> DA N6 B0004 : score 5.84678 : H : GLN NE2 A0197 <- 2.91 -> DA N7 B0004 : score 5.95577 : w : GLN NE2 A0203 <- 5.58 -> DA N7 E0017 : score 1.888 : w : ASP OD2 A0229 <- 5.69 -> DT O4 B0009 : score 2.798 : H : ARG NH1 A0231 <- 2.70 -> DG N7 B0010 : score 6.171 : H : ARG NH2 A0231 <- 2.72 -> DG O6 B0010 : score 6.7056 : H : TYR OH A0236 <- 3.24 -> DC N4 E0016 : score 3.84326 : V : VAL CG2 A0040 <- 3.82 -> DT C7 D0005 : score 6.09246 : V : ILE CG2 A0185 <- 3.70 -> DT C7 E0020 : score 7.26856 : x : SER xxxx A0022 <- 4.21 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0024 <- 3.76 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0032 <- 3.93 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0038 <- 3.62 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0069 <- 3.87 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0181 <- 4.37 -> DA xxx E0017 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0192 <- 3.84 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0199 <- 4.40 -> DA xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0205 <- 3.51 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0227 <- 3.80 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0234 <- 3.57 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 3.78 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >4lq0_A:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE I-LTRWI LAGLIDADG HOMING ENDONUCLEASE BOUND TO TARGET DNA. organism=Leptographium truncatum : H : HIS NE2 A0032 <- 3.21 -> DG O6 B0003 : score 7.30163 : H : GLU OE2 A0046 <- 2.71 -> DC N4 C0018 : score 5.36016 : H : ASP OD1 A0076 <- 3.24 -> DC N4 C0015 : score 4.87452 : H : LYS NZ A0080 <- 2.81 -> DT O4 C0017 : score 3.58001 : H : LYS NZ A0082 <- 2.65 -> DG O6 B0006 : score 5.95419 : H : LYS NZ A0082 <- 3.30 -> DT O4 B0007 : score 3.22846 : H : TYR OH A0189 <- 2.97 -> DA N6 C0005 : score 4.51172 : H : GLN NE2 A0201 <- 2.88 -> DA N7 C0006 : score 5.99231 : H : ARG NH1 A0231 <- 2.58 -> DG O6 B0015 : score 6.351 : H : ARG NH2 A0231 <- 2.84 -> DG N7 B0015 : score 6.33354 : V : ALA CB A0236 <- 3.78 -> DT C7 B0014 : score 5.62697 : V : PHE CG A0185 <- 3.71 -> DT C7 B0017 : score 5.3967 : V : LYS CB A0193 <- 3.85 -> DT C7 C0003 : score 2.27682 : V : ALA CB A0199 <- 3.81 -> DT C7 C0004 : score 5.58498 : V : ALA CB A0048 <- 3.68 -> DT C7 C0016 : score 5.76694 : x : SER xxxx A0024 <- 4.44 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0028 <- 4.23 -> DA xxx C0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0030 <- 4.05 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0034 <- 3.63 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0035 <- 3.41 -> DA xxx B0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0040 <- 4.25 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0042 <- 3.55 -> DC xxx C0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0044 <- 3.78 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0071 <- 3.60 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0073 <- 3.24 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0075 <- 3.59 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0078 <- 4.40 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0084 <- 3.40 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0183 <- 3.95 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0187 <- 3.38 -> DT xxx B0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0191 <- 4.15 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0194 <- 3.59 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0205 <- 3.15 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0207 <- 3.31 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0227 <- 4.15 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0229 <- 3.66 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0238 <- 4.43 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0242 <- 3.98 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx >4lt5_A:Regulatory_protein_AraC;Clavaminate_synthase-like; title=STRUCTURE OF A NAEGLERIA TET-LIKE DIOXYGENASE IN COMPLEX WITH 5- METHYLCYTOSINE DNA organism=Naegleria gruberi : H : SER OG A0148 <- 3.13 -> DG N2 B0009 : score 3.15165 : H : GLN OE1 A0310 <- 2.83 -> DG N2 C0021 : score 5.57405 : H : GLN OE1 A0310 <- 2.83 -> DG N2 C0021 : score 5.57405 : H : GLN NE2 A0310 <- 3.24 -> DG N3 C0021 : score 4.53778 : H : GLN NE2 A0310 <- 3.24 -> DG N3 C0021 : score 4.53778 : x : LYS xxxx A0137 <- 4.24 -> DC xxx C0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0149 <- 3.64 -> DG xxx C0021 : score x.xxxxx >4lup_A:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX FORMED BY REGION OF E. COLI SIGMAE BOUND TO ITS -10 ELEMENT NON TEMPLATE STRAND organism=Escherichia coli : w : LYS NZ A0056 <- 5.69 -> DG O6 B0108 : score 3.005 : H : ASN ND2 A0080 <- 2.79 -> DT O2 B0109 : score 4.75565 : w : ASN OD1 A0080 <- 5.94 -> DG N2 B0108 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0084 <- 2.98 -> DG O6 B0108 : score 5.43548 : x : ALA xxxx A0060 <- 3.36 -> DT xxx B0109 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0064 <- 3.26 -> DC xxx B0110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0065 <- 3.18 -> DC xxx B0110 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0067 <- 3.61 -> DC xxx B0110 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0068 <- 4.41 -> DC xxx B0110 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0071 <- 4.14 -> DA xxx B0113 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0072 <- 3.49 -> DA xxx B0112 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0073 <- 3.79 -> DC xxx B0110 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0075 <- 3.27 -> DA xxx B0113 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0076 <- 2.94 -> DA xxx B0113 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0077 <- 3.69 -> DT xxx B0109 : score x.xxxxx >4lvi_A: title=MOBM RELAXASE DOMAIN (MOBV; MOB_PRE) BOUND TO PLASMID PMV158 ORIT DNA (22NT). MN-BOUND CRYSTAL STRUCTURE AT PH 4.6 organism=Streptococcus agalactiae : H : ARG NH1 A0074 <- 2.71 -> DA N3 C0016 : score 3.74833 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.90 -> DT O2 B0004 : score 4.14867 : w : ARG NH1 A0074 <- 5.51 -> DA N3 C0015 : score 2.585 : H : LYS NZ A0149 <- 2.93 -> DG O6 C0017 : score 5.63047 : H : LYS NZ A0149 <- 3.18 -> DT O4 C0018 : score 3.31455 : w : LYS NZ A0149 <- 5.61 -> DA N6 B0001 : score 2.097 : x : LYS xxxx A0010 <- 4.41 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0071 <- 3.61 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx >4lvj_A: title=MOBM RELAXASE DOMAIN (MOBV; MOB_PRE) BOUND TO PLASMID PMV158 ORIT DNA (22NT). MN-BOUND CRYSTAL STRUCTURE AT PH 5.5 organism=Streptococcus agalactiae : w : ARG NH2 A0071 <- 5.39 -> DT O2 B0005 : score 2.261 : H : ARG NH1 A0074 <- 2.94 -> DA N3 C0016 : score 3.57895 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.98 -> DT O2 B0004 : score 4.08093 : w : ARG NH1 A0074 <- 5.81 -> DA N3 C0015 : score 2.585 : H : LYS NZ A0149 <- 2.80 -> DG O6 C0017 : score 5.78077 : w : LYS NZ A0149 <- 5.78 -> DA N6 B0001 : score 2.097 : x : LYS xxxx A0010 <- 4.22 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx >4lvk_A: title=MOBM RELAXASE DOMAIN (MOBV; MOB_PRE) BOUND TO PLASMID PMV158 ORIT DNA (22NT+3'PHOSPHATE). MN-BOUND CRYSTAL STRUCTURE AT PH 4.6 organism=Streptococcus agalactiae : H : ARG NH1 A0074 <- 2.69 -> DA N3 C0016 : score 3.76306 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.93 -> DT O2 B0004 : score 4.12327 : H : LYS NZ A0149 <- 2.96 -> DG O6 C0017 : score 5.59578 : w : LYS NZ A0149 <- 5.67 -> DA N6 B0001 : score 2.097 : x : LYS xxxx A0010 <- 4.40 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0071 <- 2.98 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx >4lvl_A: title=MOBM RELAXASE DOMAIN (MOBV; MOB_PRE) BOUND TO PLASMID PMV158 ORIT DNA (22NT+3'THIOPHOSPHATE). MN-BOUND CRYSTAL STRUCTURE AT PH 6.8 organism=Streptococcus agalactiae : w : ARG NH2 A0071 <- 5.52 -> DA N3 C0014 : score 2.092 : H : ARG NH1 A0074 <- 2.80 -> DA N3 C0016 : score 3.68205 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.72 -> DT O2 B0004 : score 4.30107 : w : ARG NH1 A0074 <- 5.68 -> DA N3 C0015 : score 2.585 : H : LYS NZ A0149 <- 2.86 -> DG O6 C0017 : score 5.7114 : x : LYS xxxx A0010 <- 4.22 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx >4lvm_A: title=MOBM RELAXASE DOMAIN (MOBV; MOB_PRE) BOUND TO PLASMID PMV158 ORIT DNA (23NT). MN-BOUND CRYSTAL STRUCTURE AT PH 6.5 organism=Streptococcus agalactiae : H : ARG NH1 A0074 <- 3.19 -> DA N3 E0016 : score 3.39485 : H : ARG NH2 A0074 <- 3.07 -> DT O2 B0004 : score 4.00473 : H : LYS NZ A0149 <- 2.72 -> DG O6 E0017 : score 5.87326 : x : ARG xxxx A0071 <- 3.71 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx >4lvs_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA MISMATCHED SUBSTRATE COMPLEX WITH MN2+, 2.5 MIN organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.35 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.83 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.55 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4lz1_H:Trypsin-like_serine_proteases; title=X-RAY STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN HUMAN THROMBIN AND THE TBA DELETION MUTANT LACKING THYMINE 12 NUCLEOBASE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 H0075 <- 2.80 -> DT O4 D0004 : score 3.26795 : H : ARG NH1 H0075 <- 2.98 -> DT O2 D0013 : score 4.15138 : H : ARG NH2 H0075 <- 2.82 -> DT O4 D0004 : score 3.53963 : H : GLU OE2 H0077 <- 2.85 -> DT N3 D0003 : score 2.60954 : H : ARG NH1 H0077 <- 2.97 -> DT O2 D0004 : score 4.15999 : x : ILE xxxx H0024 <- 3.70 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0071 <- 4.19 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0076 <- 3.60 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0079 <- 3.52 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx >4lz4_CD:Trypsin-like_serine_proteases; title=X-RAY STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN HUMAN THROMBIN AND THE TBA DELETION MUTANT LACKING THYMINE 3 NUCLEOBASE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE D0075 <- 3.10 -> DT O2 F0004 : score 2.42231 : H : ARG NH1 D0075 <- 3.28 -> DT O2 F0004 : score 3.89299 : H : ARG NH1 D0075 <- 2.68 -> DT O4 F0013 : score 3.34638 : H : GLU OE2 D0077 <- 2.94 -> DT N3 F0012 : score 2.56209 : H : ARG NH1 D0077 <- 3.08 -> DT O2 F0013 : score 4.06525 : x : ILE xxxx D0024 <- 3.93 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0071 <- 4.40 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0076 <- 3.82 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0079 <- 3.40 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx >4m0a_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE MU POST-CATALYTIC COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0387 <- 3.15 -> DA N3 T0007 : score 3.42431 : w : ARG NH1 A0387 <- 5.49 -> DT O2 P0003 : score 1.855 : w : LYS NZ A0438 <- 5.06 -> DT O4 P0005 : score 1.7 : H : ARG NH1 A0445 <- 3.05 -> DT O2 T0006 : score 4.09109 : x : PHE xxxx A0389 <- 3.83 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0441 <- 4.12 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.53 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >4m2y_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH 8-BRG AS THE TEMPLATE BASE IN A 1-NUCLEOTIDE GAPPED DNA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.36 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.77 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.55 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4m3r_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DT/DG AT POSITION N-1 OF PRIMER/TEMPLATE DUPLEX organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH A0416 <- 5.66 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : w : THR OG1 A0622 <- 5.76 -> DT O2 P0115 : score 2.522 : H : LYS NZ A0706 <- 2.92 -> DA N3 P0114 : score 2.71028 : w : LYS NZ A0734 <- 5.63 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : x : LYS xxxx A0279 <- 4.33 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0361 <- 3.94 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx >4m3t_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DT/DG AT POSITION N-2 OF PRIMER/TEMPLATE DUPLEX organism=Enterobacteria phage RB69 : w : ASP OD1 A0621 <- 5.92 -> DG N2 T0006 : score 2.312 : w : THR OG1 A0622 <- 6.46 -> DG N2 T0006 : score 2.036 : w : THR OG1 A0622 <- 5.44 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 3.00 -> DT O2 P0114 : score 3.44369 : w : LYS NZ A0706 <- 5.84 -> DG N2 T0006 : score 0.846 : w : LYS NZ A0734 <- 5.67 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : x : LYS xxxx A0279 <- 4.33 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0361 <- 3.94 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx >4m3u_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DT/DG AT POSITION N-3 OF PRIMER/TEMPLATE DUPLEX organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.43 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 3.04 -> DA N3 P0114 : score 2.64363 : x : LYS xxxx A0279 <- 4.16 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0361 <- 3.97 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx >4m3w_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DT/DG AT POSITION N-4 OF PRIMER/TEMPLATE DUPLEX organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.45 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 2.96 -> DA N3 P0114 : score 2.68806 : w : LYS NZ A0734 <- 5.74 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : x : LYS xxxx A0279 <- 4.21 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0361 <- 3.96 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx >4m3x_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DT/DG AT POSITION N-5 OF PRIMER/TEMPLATE DUPLEX organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.50 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 3.12 -> DA N3 P0114 : score 2.5992 : x : LYS xxxx A0279 <- 4.30 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0361 <- 4.09 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0734 <- 4.30 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0800 <- 4.33 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx >4m3y_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DG/DT AT POSITION N-1 OF PRIMER/TEMPLATE DUPLEX organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.38 -> DG N3 P0115 : score 2.036 : H : LYS NZ A0706 <- 3.00 -> DA N3 P0114 : score 2.66585 : w : LYS NZ A0734 <- 5.81 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : x : LYS xxxx A0279 <- 4.19 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0361 <- 3.85 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx >4m3z_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DG/DT AT POSITION N-2 OF PRIMER/TEMPLATE DUPLEX organism=Enterobacteria phage RB69 : w : ASP OD1 A0621 <- 6.16 -> DG N2 P0114 : score 2.312 : w : THR OG1 A0622 <- 5.43 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 3.17 -> DG N3 P0114 : score 1.34626 : w : LYS NZ A0706 <- 5.55 -> DG N2 P0114 : score 0.846 : w : LYS NZ A0734 <- 5.69 -> DG N3 T0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0734 <- 5.42 -> DC O2 T0010 : score 1.3 : x : LYS xxxx A0279 <- 4.39 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0361 <- 3.98 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx >4m41_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DG/DT AT POSITION N-3 OF PRIMER/TEMPLATE DUPLEX organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.39 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 2.75 -> DA N3 P0114 : score 2.80469 : x : LYS xxxx A0279 <- 4.28 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0361 <- 3.92 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0734 <- 4.49 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx >4m42_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DG/DT AT POSITION N-4 OF PRIMER/TEMPLATE DUPLEX organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.59 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 2.84 -> DA N3 P0114 : score 2.75471 : x : LYS xxxx A0279 <- 4.35 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0361 <- 3.97 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx >4m45_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RB69 DNA POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DG/DT AT POSITION N-5 OF PRIMER/TEMPLATE DUPLEX organism=Enterobacteria phage RB69 : w : THR OG1 A0622 <- 5.37 -> DC O2 P0115 : score 2.048 : H : LYS NZ A0706 <- 2.96 -> DA N3 P0114 : score 2.68806 : w : ARG NH1 A0707 <- 6.45 -> DT O2 T0009 : score 1.855 : x : LYS xxxx A0279 <- 4.04 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0361 <- 3.95 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx >4m47_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE COMPLEXED WITH 8-BRG IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE GTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.27 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.89 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.59 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4m6f_A:Resolvase-like;Homeodomain-like; title=DIMER OF THE G-SEGMENT INVERTASE BOUND TO A DNA SUBSTRATE organism=ENTEROBACTERIA PHAGE MU : H : THR OG1 A0123 <- 2.73 -> DT O2 C0031 : score 2.7521 : H : SER OG A0173 <- 3.35 -> DA N7 B0010 : score 3.97305 : V : LEU CB A0172 <- 3.87 -> DT C7 B0011 : score 4.32199 : V : LEU CD2 A0175 <- 3.50 -> DT C7 C0019 : score 6.16113 : x : ILE xxxx A0119 <- 3.91 -> DT xxx C0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0127 <- 3.22 -> DG xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0136 <- 3.91 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0139 <- 3.04 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0140 <- 3.36 -> DA xxx C0028 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0171 <- 3.50 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0174 <- 2.74 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0177 <- 3.67 -> DA xxx C0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0183 <- 3.14 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0184 <- 3.00 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0186 <- 3.76 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0187 <- 2.75 -> DA xxx C0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 2.91 -> DA xxx B0013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0189 <- 2.55 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx >4m8b_R: title=FUNGAL PROTEIN organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 R0062 <- 2.84 -> DT O2 B0013 : score 4.27196 : H : ARG NH2 R0062 <- 3.10 -> DT O2 B0013 : score 3.97933 : H : SER OG R0072 <- 2.61 -> DG N7 A0011 : score 4.65237 : w : SER OG R0072 <- 6.32 -> DA N6 B0009 : score 2.209 : w : SER OG R0072 <- 6.17 -> DT O4 A0012 : score 2.338 : w : ARG NH1 R0073 <- 5.83 -> DA N7 B0009 : score 0.388 : w : ASN OD1 R0183 <- 5.78 -> DA N6 B0007 : score 2.837 : H : ARG NE R0185 <- 2.80 -> DG N7 B0005 : score 4.42179 : H : ARG NH2 R0185 <- 2.56 -> DG O6 B0005 : score 6.9168 : x : ILE xxxx R0074 <- 4.03 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0079 <- 3.63 -> DG xxx A0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx R0081 <- 4.07 -> DT xxx A0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0181 <- 4.16 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx >4m8o_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE EPSILON WITH AN INCOMING DATP organism=Saccharomyces cerevisiae : w : TYR OH A0645 <- 6.00 -> DG N2 T0006 : score 2.834 : w : TYR OH A0831 <- 5.28 -> DG N3 T0006 : score 3.344 >4m94_A:DNA/RNA_polymerases; title=D(ATCCGTTATAACGGAT) COMPLEXED WITH MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS REVERSE TRANSCRIPTASE CATALYTIC FRAGMENT organism=Moloney murine leukemia virus isolate Shinnick : w : TYR OH A0064 <- 5.57 -> DA N3 B0001 : score 1.448 : w : ASP OD2 A0114 <- 5.57 -> DA N3 B0001 : score 1.331 : H : ARG NH1 A0116 <- 3.14 -> DT O2 B0002 : score 4.01357 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.73 -> DT O2 B0002 : score 4.2926 : x : LEU xxxx A0099 <- 3.35 -> DA xxx B0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0112 <- 4.27 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx >4m95_A:DNA/RNA_polymerases; title=D(ATCCGTTATAACGGAT)COMPLEXED WITH MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS REVERSE TRANSCRIPTASE CATALYTIC FRAGMENT organism=Moloney murine leukemia virus isolate Shinnick : w : TYR OH A0064 <- 5.59 -> DA N3 B0001 : score 1.448 : w : ASP OD2 A0114 <- 5.70 -> DA N3 B0001 : score 1.331 : H : ARG NH1 A0116 <- 3.00 -> DT O2 B0002 : score 4.13415 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.78 -> DT O2 B0002 : score 4.25027 : x : LEU xxxx A0099 <- 3.39 -> DA xxx B0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0112 <- 4.42 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx >4m9e_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=STRUCTURE OF KLF4 ZINC FINGER DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=Mus musculus : H : LYS NZ A0413 <- 2.60 -> DG O6 C0001 : score 6.012 : w : LYS NZ A0413 <- 5.46 -> DG N7 B0009 : score 2.519 : H : HIS NE2 A0416 <- 2.84 -> DG N7 B0008 : score 6.74814 : H : ARG NH1 A0443 <- 2.86 -> DG O6 B0006 : score 6.01033 : H : ARG NH2 A0443 <- 3.01 -> DG N7 B0006 : score 6.11646 : w : ASP OD2 A0445 <- 5.90 -> DG O6 C0006 : score 3.228 : H : ARG NH1 A0449 <- 2.93 -> DG O6 B0004 : score 5.92517 : H : ARG NH2 A0449 <- 2.88 -> DG N7 B0004 : score 6.28246 : w : ARG NH1 A0449 <- 5.74 -> DG O6 C0006 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0471 <- 2.94 -> DG N7 B0003 : score 5.8806 : H : ARG NH2 A0471 <- 2.92 -> DG O6 B0003 : score 6.4416 : w : SER OG A0472 <- 6.07 -> DG N7 C0006 : score 2.749 : H : ASP OD2 A0473 <- 2.84 -> DC N4 C0007 : score 6.1504 : w : ASP OD1 A0473 <- 6.15 -> DG O6 C0006 : score 3.411 : w : ASP OD2 A0473 <- 5.83 -> DC N4 C0008 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0474 <- 2.94 -> DA N7 B0002 : score 4.12726 : x : SER xxxx A0415 <- 3.46 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0444 <- 4.11 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx >4m9g_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA E295K BINARY COMPLEX organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.28 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.71 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.52 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4m9h_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA E295K SOAKED WITH DTTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.25 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.79 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.64 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4m9j_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA E295K SOAKED WITH DUMPNPP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.33 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.66 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.59 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4m9l_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA E295K SOAKED WITH DCTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.42 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.81 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.50 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4m9n_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA E295K SOAKED WITH DATP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.72 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.54 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4m9v_C:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZFP57 MUTANT (E182Q) IN COMPLEX WITH 5-CARBOXYLCYTOSINE DNA organism=Mus musculus : w : ASP OD1 C0151 <- 5.75 -> DA N6 B0009 : score 3.122 : H : SER OG C0153 <- 2.88 -> DC N4 B0008 : score 3.61683 : H : ARG NH1 C0157 <- 2.93 -> DG O6 A0005 : score 5.92517 : H : ARG NH1 C0157 <- 2.82 -> DG O6 B0007 : score 6.059 : H : ARG NH2 C0157 <- 3.09 -> DG N7 A0005 : score 6.01431 : H : ARG NH2 C0157 <- 3.16 -> DG O6 A0005 : score 6.1248 : H : ARG NH1 C0178 <- 3.06 -> DG N7 B0006 : score 5.7354 : H : ARG NH2 C0178 <- 2.76 -> DG O6 B0006 : score 6.6528 : w : ARG NH2 C0178 <- 5.91 -> DC N4 A0006 : score 0.976 : w : ASP OD2 C0179 <- 5.85 -> DC N4 A0006 : score 3.623 : w : GLN OE1 C0182 <- 5.84 -> DC N4 A0006 : score 3.488 : w : GLN NE2 C0182 <- 5.93 -> DG O6 A0008 : score 2.87 : H : ARG NH1 C0185 <- 2.99 -> DG N7 B0004 : score 5.8201 : H : ARG NH2 C0185 <- 2.76 -> DG O6 B0004 : score 6.6528 >4mde_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF BACTERIAL POLYNUCLEOTIDE KINASE PRODUCT COMPLEX BOUND TO GDP AND DNA organism=CLOSTRIDIUM THERMOCELLUM : w : HIS NE2 B0062 <- 5.68 -> DC N4 D0002 : score 3.208 : w : ARG NH2 B0131 <- 5.92 -> DG N2 D0004 : score 1.593 : H : HIS NE2 B0133 <- 2.90 -> DC O2 D0001 : score 5.18144 : V : THR CG2 B0054 <- 3.89 -> DT C7 D0003 : score 4.14159 : x : GLN xxxx B0051 <- 3.60 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0052 <- 3.92 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 3.45 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0086 <- 3.46 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0125 <- 3.89 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0128 <- 3.51 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0129 <- 3.57 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx >4mf2_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH O6MG AS THE TEMPLATE BASE IN A 1-NUCLEOTIDE GAPPED DNA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.32 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.60 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.61 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4mfc_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH O6MG IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE CTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.34 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.59 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.64 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4mff_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH O6MG IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE TTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.32 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.55 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.71 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4mg2_A:Clavaminate_synthase-like; title=ALKBH2 F102A CROSS-LINKED TO UNDAMAGED DSDNA organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0098 <- 3.64 -> DG xxx C0040 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0107 <- 3.89 -> DG xxx C0040 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0169 <- 3.70 -> DC xxx B0014 : score x.xxxxx >4mgt_A:Clavaminate_synthase-like; title=ALKBH2 R110A CROSS-LINKED TO UNDAMAGED DSDNA organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0098 <- 3.41 -> DG xxx C0040 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0107 <- 4.07 -> DG xxx C0040 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0169 <- 3.78 -> DC xxx B0014 : score x.xxxxx >4mhg_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ETV6 BOUND TO A SPECIFIC DNA SEQUENCE organism=Mus musculus : H : GLU OE2 A0388 <- 3.40 -> DC N4 B0004 : score 4.63354 : w : GLU OE1 A0388 <- 5.82 -> DC N4 C0010 : score 3.528 : w : GLU OE1 A0388 <- 5.74 -> DC N4 B0005 : score 3.528 : w : SER OG A0391 <- 6.80 -> DC N4 B0005 : score 2.105 : H : ARG NE A0392 <- 2.81 -> DG O6 B0007 : score 3.93314 : H : ARG NH2 A0392 <- 2.87 -> DG N7 B0007 : score 6.29523 : H : ARG NE A0395 <- 2.78 -> DG N7 B0006 : score 4.43948 : H : ARG NH2 A0395 <- 3.08 -> DG O6 B0006 : score 6.2304 : w : ARG NH2 A0395 <- 6.42 -> DC N4 B0005 : score 0.976 : H : HIS NE2 A0396 <- 2.85 -> DT O4 C0007 : score 5.55288 : w : ARG NH1 A0410 <- 6.26 -> DA N3 B0002 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0410 <- 5.76 -> DT O2 C0014 : score 2.261 : x : LYS xxxx A0389 <- 4.01 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0393 <- 3.91 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >4mht_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=TERNARY STRUCTURE OF HHAI METHYLTRANSFERASE WITH NATIVE DNA AND ADOHCY organism=HAEMOPHILUS HAEMOLYTICUS : H : ARG NH2 A0240 <- 2.80 -> DG N7 D0426 : score 6.38462 : H : ARG NH2 A0240 <- 3.24 -> DG O6 D0426 : score 6.0192 : x : ILE xxxx A0086 <- 3.55 -> DT xxx C0410 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.60 -> DG xxx D0426 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0237 <- 3.32 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0254 <- 4.01 -> DC xxx D0429 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0296 <- 4.13 -> DT xxx C0404 : score x.xxxxx >4mtd_ABCD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ZINC UPTAKE REGULATOR COMPLEXED WITH ZINC AND DNA organism=Escherichia coli : H : TYR OH A0045 <- 2.66 -> DA N7 Y0015 : score 4.26752 : H : TYR OH A0045 <- 3.37 -> DA N6 Y0015 : score 4.13807 : H : TYR OH B0045 <- 2.66 -> DA N7 Z0016 : score 4.26752 : H : TYR OH B0045 <- 3.33 -> DA N6 Z0016 : score 4.17544 : H : ARG NH1 B0065 <- 2.95 -> DA N7 Y0012 : score 2.48345 : H : TYR OH C0045 <- 2.64 -> DA N7 Y0020 : score 4.28412 : H : TYR OH C0045 <- 3.26 -> DA N6 Y0020 : score 4.24083 : H : ARG NH1 C0065 <- 3.03 -> DG N7 Z0008 : score 5.7717 : H : ARG NH2 C0065 <- 2.89 -> DG O6 Z0008 : score 6.4812 : H : TYR OH D0045 <- 2.77 -> DA N7 Z0021 : score 4.17619 : H : TYR OH D0045 <- 3.25 -> DA N6 Z0021 : score 4.25017 : H : ARG NH1 D0065 <- 3.04 -> DG N7 Y0007 : score 5.7596 : H : ARG NH2 D0065 <- 2.81 -> DG O6 Y0007 : score 6.5868 : V : PRO CG D0061 <- 3.85 -> DT C7 Y0008 : score 6.27949 : x : LYS xxxx A0059 <- 3.42 -> DT xxx Z0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0060 <- 3.82 -> DT xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0061 <- 3.48 -> DT xxx Z0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0064 <- 3.34 -> DT xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0065 <- 3.10 -> DT xxx Z0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0059 <- 3.56 -> DT xxx Y0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0060 <- 3.63 -> DT xxx Z0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0061 <- 3.36 -> DA xxx Z0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0064 <- 3.28 -> DT xxx Z0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0059 <- 4.02 -> DA xxx Z0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0060 <- 3.80 -> DT xxx Y0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0061 <- 3.43 -> DT xxx Y0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0064 <- 3.34 -> DT xxx Y0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0059 <- 4.06 -> DT xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0060 <- 3.97 -> DT xxx Z0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0064 <- 3.42 -> DT xxx Z0022 : score x.xxxxx >4mtd_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ZINC UPTAKE REGULATOR COMPLEXED WITH ZINC AND DNA organism=Escherichia coli : H : TYR OH D0045 <- 2.77 -> DA N7 Z0021 : score 4.17619 : H : TYR OH D0045 <- 3.25 -> DA N6 Z0021 : score 4.25017 : H : ARG NH1 D0065 <- 3.04 -> DG N7 Y0007 : score 5.7596 : H : ARG NH2 D0065 <- 2.81 -> DG O6 Y0007 : score 6.5868 : V : PRO CG D0061 <- 3.85 -> DT C7 Y0008 : score 6.27949 : x : LYS xxxx D0059 <- 4.06 -> DT xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0060 <- 3.97 -> DT xxx Z0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0064 <- 3.42 -> DT xxx Z0022 : score x.xxxxx >4mte_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ZINC UPTAKE REGULATOR COMPLEXED WITH ZINC AND DNA organism=Escherichia coli : H : TYR OH A0045 <- 2.78 -> DA N7 Y0015 : score 4.16789 : x : LYS xxxx A0059 <- 3.45 -> DT xxx Z0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0060 <- 3.92 -> DT xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0061 <- 3.61 -> DT xxx Z0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0064 <- 3.40 -> DT xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0065 <- 3.39 -> DT xxx Z0012 : score x.xxxxx >4mte_ABCD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ZINC UPTAKE REGULATOR COMPLEXED WITH ZINC AND DNA organism=Escherichia coli : H : TYR OH A0045 <- 2.78 -> DA N7 Y0015 : score 4.16789 : H : TYR OH B0045 <- 2.80 -> DA N7 Z0016 : score 4.15128 : H : ARG NH1 B0065 <- 3.16 -> DA N7 Y0012 : score 2.37592 : H : TYR OH C0045 <- 2.70 -> DA N7 Y0020 : score 4.23431 : H : ARG NH1 C0065 <- 3.14 -> DG N7 Z0008 : score 5.6386 : H : ARG NH2 C0065 <- 2.97 -> DG O6 Z0008 : score 6.3756 : H : TYR OH D0045 <- 2.89 -> DA N7 Z0021 : score 4.07656 : H : ARG NH1 D0065 <- 3.08 -> DG N7 Y0007 : score 5.7112 : H : ARG NH2 D0065 <- 3.01 -> DG O6 Y0007 : score 6.3228 : V : PRO CG D0061 <- 3.78 -> DT C7 Y0008 : score 6.39077 : x : LYS xxxx A0059 <- 3.45 -> DT xxx Z0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0060 <- 3.92 -> DT xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0061 <- 3.61 -> DT xxx Z0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0064 <- 3.40 -> DT xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0065 <- 3.39 -> DT xxx Z0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0059 <- 3.59 -> DT xxx Y0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0060 <- 3.73 -> DT xxx Z0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0061 <- 3.57 -> DA xxx Z0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0064 <- 3.24 -> DT xxx Z0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0059 <- 3.95 -> DA xxx Z0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0060 <- 3.87 -> DT xxx Y0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0061 <- 3.39 -> DT xxx Y0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0064 <- 3.32 -> DT xxx Y0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0059 <- 4.12 -> DT xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0060 <- 4.14 -> DT xxx Z0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0064 <- 3.64 -> DT xxx Z0022 : score x.xxxxx >4mzr_ABCD:p53-like_transcription_factors;p53_tetramerization_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A POLYPEPTIDE P53 MUTANT BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0280 <- 2.83 -> DG O6 K0021 : score 6.04683 : H : ARG NH2 A0280 <- 2.87 -> DG N7 K0021 : score 6.29523 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.79 -> DG O6 L0035 : score 6.0955 : H : ARG NH2 B0280 <- 3.25 -> DG N7 L0035 : score 5.81 : H : ARG NH1 C0280 <- 2.82 -> DG O6 K0011 : score 6.059 : H : ARG NH2 C0280 <- 3.06 -> DG N7 K0011 : score 6.05262 : H : ARG NH1 D0280 <- 3.04 -> DG O6 L0045 : score 5.79133 : H : ARG NH2 D0280 <- 3.04 -> DG N7 L0045 : score 6.07815 : x : ARG xxxx A0248 <- 4.06 -> DG xxx L0035 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0277 <- 4.11 -> DC xxx K0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0120 <- 4.05 -> DA xxx K0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0121 <- 3.08 -> DC xxx L0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0248 <- 3.89 -> DG xxx K0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 3.47 -> DT xxx L0036 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0277 <- 3.87 -> DT xxx L0036 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0120 <- 3.69 -> DG xxx L0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0121 <- 3.21 -> DG xxx L0039 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0277 <- 3.85 -> DC xxx K0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0248 <- 4.00 -> DG xxx K0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0276 <- 3.74 -> DT xxx L0046 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0277 <- 3.66 -> DT xxx L0046 : score x.xxxxx >4mzr_D:p53-like_transcription_factors;p53_tetramerization_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A POLYPEPTIDE P53 MUTANT BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 D0280 <- 3.04 -> DG O6 L0045 : score 5.79133 : H : ARG NH2 D0280 <- 3.04 -> DG N7 L0045 : score 6.07815 : x : ARG xxxx D0248 <- 4.00 -> DG xxx K0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0276 <- 3.74 -> DT xxx L0046 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0277 <- 3.66 -> DT xxx L0046 : score x.xxxxx >4n0o_AE:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=COMPLEX STRUCTURE OF ARTERIVIRUS NONSTRUCTURAL PROTEIN 10 (HELICASE) WITH DNA organism=Equine arteritis virus : H : TYR OH A0081 <- 3.20 -> DT O4 B0003 : score 3.22236 : H : ARG NH2 A0374 <- 2.38 -> DT O2 B0002 : score 4.58893 : V : TYR CD2 A0338 <- 3.86 -> DT C7 B0001 : score 3.68542 >4n0o_CG:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=COMPLEX STRUCTURE OF ARTERIVIRUS NONSTRUCTURAL PROTEIN 10 (HELICASE) WITH DNA organism=Equine arteritis virus : H : ARG NH2 C0374 <- 2.85 -> DT O2 D0002 : score 4.191 >4n41_A:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS ARGONAUTE BOUND TO GUIDE DNA AND 15- MER TARGET DNA organism=? : H : ASN ND2 A0449 <- 3.10 -> DG N3 C0002 : score 4.60118 : x : ARG xxxx A0192 <- 4.31 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0267 <- 3.73 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0445 <- 3.54 -> DC xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0446 <- 3.39 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0548 <- 3.45 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0576 <- 4.36 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0610 <- 3.79 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0611 <- 3.84 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0647 <- 3.64 -> DC xxx D0014 : score x.xxxxx >4n47_A:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS ARGONAUTE BOUND TO GUIDE DNA AND 12- MER TARGET DNA organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ASN OD1 A0449 <- 2.77 -> DG N2 C0002 : score 4.8288 : x : HIS xxxx A0445 <- 3.39 -> DC xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0446 <- 3.40 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0610 <- 4.03 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0611 <- 3.72 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0647 <- 3.63 -> DC xxx D0011 : score x.xxxxx >4n56_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BINARY COMPLEX STRUCTURE OF KLENOW FRAGMENT OF TAQ DNA POLYMERASE I707L MUTANT (CS3C KLENTAQ) WITH DNA organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.79 -> DC O2 B0109 : score 2.95205 : w : LYS NZ A0540 <- 6.40 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : LYS NZ A0540 <- 5.57 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 5.67 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH2 A0573 <- 5.87 -> DG N3 C0206 : score 0.677 : H : GLN OE1 A0754 <- 3.29 -> DG N2 C0205 : score 5.05814 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.29 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : ASN xxxx A0580 <- 4.04 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0583 <- 3.08 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0671 <- 4.17 -> DG xxx C0205 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0750 <- 4.27 -> DG xxx C0205 : score x.xxxxx >4n5s_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX STRUCTURE OF KLENOW FRAGMENT OF TAQ DNA POLYMERASE I707L MUTANT (CS3C KLENTAQ) WITH DNA AND DDCTP organism=THERMUS AQUATICUS : H : LYS NZ A0540 <- 2.82 -> DC O2 B0109 : score 2.93437 : w : LYS NZ A0540 <- 5.56 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.97 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.54 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.69 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.71 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.91 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.79 -> DG N3 C0208 : score 3.377 : w : ASN OD1 A0583 <- 6.07 -> DG N2 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.69 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : GLN xxxx A0754 <- 4.48 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >4n76_B:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS ARGONAUTE BOUND TO GUIDE DNA AND CLEAVED TARGET DNA WITH MN2+ organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ASN ND2 B0449 <- 2.91 -> DG N3 E0002 : score 4.78718 : w : SER OG B0645 <- 6.70 -> DA N3 E0003 : score 0.958 : x : HIS xxxx B0445 <- 3.42 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0446 <- 3.40 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0611 <- 4.20 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0615 <- 4.07 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0647 <- 3.50 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx >4nca_A:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS ARGONAUTE BOUND TO GUIDE DNA 19-MER AND TARGET DNA IN THE PRESENCE OF MN2+ organism=? : H : ASN ND2 A0449 <- 3.02 -> DG N3 C0002 : score 4.6795 : w : ARG NH2 A0486 <- 5.20 -> DC O2 G0006 : score 1.669 : w : ARG NE A0611 <- 5.78 -> DG N3 C0004 : score 1.082 : w : ARG NH2 A0611 <- 5.94 -> DG N3 C0004 : score 0.677 : x : TYR xxxx A0043 <- 3.48 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0044 <- 3.69 -> DA xxx G0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0047 <- 3.85 -> DA xxx G0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0059 <- 4.11 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0081 <- 4.26 -> DA xxx G0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0267 <- 3.86 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0280 <- 3.12 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0445 <- 3.68 -> DC xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0446 <- 3.33 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0610 <- 3.51 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0647 <- 3.86 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >4ncb_B:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS ARGONAUTE BOUND TO GUIDE DNA AND 19- MER TARGET DNA WITH MG2+ organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ASN ND2 B0449 <- 3.17 -> DG N3 E0002 : score 4.53265 : w : ARG NE B0611 <- 5.49 -> DG N3 E0004 : score 1.082 : w : ARG NH2 B0611 <- 5.53 -> DG N3 E0004 : score 0.677 : x : TYR xxxx B0043 <- 3.68 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0044 <- 3.60 -> DA xxx H0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0047 <- 4.02 -> DA xxx H0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0059 <- 3.56 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0267 <- 3.51 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0445 <- 3.45 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0446 <- 3.57 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0548 <- 3.15 -> DA xxx H0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0610 <- 3.59 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0615 <- 3.38 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0647 <- 3.75 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx >4ndh_B:HIT-like; title=HUMAN APRATAXIN (APTX) BOUND TO DNA, AMP, AND ZN - PRODUCT COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : LYS xxxx B0277 <- 4.07 -> DT xxx G0002 : score x.xxxxx >4ndy_IKLM: title=HUMAN MHF1-MHF2 DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : V : ARG CZ M0017 <- 3.83 -> DT C7 F0024 : score 2.11632 : x : ARG xxxx I0110 <- 4.13 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0013 <- 3.88 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0017 <- 3.96 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0029 <- 4.04 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx M0013 <- 3.51 -> DT xxx F0024 : score x.xxxxx >4ndy_L:Histone-fold; title=HUMAN MHF1-MHF2 DNA COMPLEX organism=? : x : GLU xxxx L0013 <- 3.88 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0017 <- 3.96 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0029 <- 4.04 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx >4ndy_QTUV: title=HUMAN MHF1-MHF2 DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : V : ARG CZ V0017 <- 3.88 -> DT C7 P0024 : score 2.08966 : x : ARG xxxx Q0110 <- 4.20 -> DT xxx P0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx T0110 <- 3.55 -> DT xxx P0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx U0013 <- 4.47 -> DT xxx P0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx U0017 <- 3.08 -> DT xxx P0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx V0013 <- 3.72 -> DT xxx P0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx V0035 <- 4.42 -> DT xxx P0022 : score x.xxxxx >4ne1_IKf: title=HUMAN MHF1 MHF2 DNA COMPLEXES organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx K0110 <- 3.29 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx >4ne1_LMj: title=HUMAN MHF1 MHF2 DNA COMPLEXES organism=HOMO SAPIENS : V : ARG CZ M0017 <- 3.84 -> DT C7 F0024 : score 2.11098 : x : ARG xxxx L0017 <- 3.76 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx >4ne1_QTUV: title=HUMAN MHF1 MHF2 DNA COMPLEXES organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ U0029 <- 2.62 -> DT O2 t0012 : score 3.71632 : x : ARG xxxx Q0110 <- 3.47 -> DT xxx t0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx T0110 <- 3.44 -> DT xxx t0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx U0017 <- 2.45 -> DT xxx t0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx V0011 <- 3.53 -> DA xxx s0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx V0013 <- 3.62 -> DT xxx t0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx V0017 <- 3.44 -> DT xxx t0023 : score x.xxxxx >4ne1_Wknop: title=HUMAN MHF1 MHF2 DNA COMPLEXES organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ o0029 <- 2.64 -> DT O2 P0012 : score 3.70197 : V : ARG CZ o0017 <- 3.77 -> DT C7 P0015 : score 2.1483 : x : ARG xxxx p0011 <- 2.79 -> DA xxx O0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx p0013 <- 3.40 -> DT xxx P0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx p0017 <- 3.88 -> DT xxx P0024 : score x.xxxxx >4ne1_h:Histone-fold; title=HUMAN MHF1 MHF2 DNA COMPLEXES organism=? : x : ARG xxxx h0017 <- 4.31 -> DT xxx v0015 : score x.xxxxx >4ne1_hi: title=HUMAN MHF1 MHF2 DNA COMPLEXES organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx h0017 <- 4.31 -> DT xxx v0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx i0017 <- 3.82 -> DT xxx v0024 : score x.xxxxx >4nhj_A:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF KLEBSIELLA PNEUMONIAE RSTA DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH RSTA BOX organism=Klebsiella pneumoniae : H : ARG NH1 A0199 <- 2.81 -> DG N7 D0017 : score 6.0379 : H : ARG NH1 A0199 <- 2.44 -> DG O6 D0017 : score 6.52133 : H : ARG NH2 A0207 <- 3.04 -> DG N7 C0005 : score 6.07815 : w : ARG NH1 A0226 <- 5.33 -> DC O2 C0012 : score 1.381 : x : ASP xxxx A0202 <- 4.08 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0203 <- 3.26 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0206 <- 4.33 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx >4nhj_AB:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF KLEBSIELLA PNEUMONIAE RSTA DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH RSTA BOX organism=Klebsiella pneumoniae : H : ARG NH1 A0199 <- 2.81 -> DG N7 D0017 : score 6.0379 : H : ARG NH1 A0199 <- 2.44 -> DG O6 D0017 : score 6.52133 : H : ARG NH2 A0207 <- 3.04 -> DG N7 C0005 : score 6.07815 : w : ARG NH1 A0226 <- 5.33 -> DC O2 C0012 : score 1.381 : H : ARG NH1 B0199 <- 2.41 -> DG N7 D0007 : score 6.5219 : H : ARG NH1 B0207 <- 3.08 -> DG N7 C0014 : score 5.7112 : H : ARG NH2 B0207 <- 2.37 -> DG O6 C0014 : score 7.1676 : w : ARG NH1 B0226 <- 5.24 -> DC O2 C0021 : score 1.381 : V : VAL CG2 B0203 <- 3.69 -> DT C7 C0015 : score 6.29146 : x : ASP xxxx A0202 <- 4.08 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0203 <- 3.26 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0206 <- 4.33 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0200 <- 3.98 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0202 <- 3.96 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >4ni7_A:4-helical_cytokines; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN INTERLEUKIN 6 IN COMPLEX WITH A MODIFIED NUCLEOTIDE APTAMER (SOMAMER SL1025) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0016 <- 2.43 -> DG N7 B0029 : score 6.85708 : w : ASP OD1 A0034 <- 5.41 -> DG N2 B0026 : score 2.312 : w : ASP OD1 A0034 <- 5.72 -> DG N2 B0026 : score 2.312 >4nid_A:Clavaminate_synthase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ALKB PROTEIN WITH COFACTORS BOUND TO DSDNA CONTAINING M6A organism=Escherichia coli : w : LYS NZ A0134 <- 6.07 -> DA N7 B0006 : score 1.655 : H : ARG NH1 A0161 <- 2.94 -> DG N7 C0005 : score 5.8806 : H : ARG NH2 A0161 <- 2.90 -> DG O6 C0005 : score 6.468 : x : CYS xxxx A0129 <- 3.75 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx >4nig_A:Clavaminate_synthase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ALKB D135I/E136H MUTANT PROTEIN WITH COFACTORS BOUND TO DSDNA CONTAINING M6A/A organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0161 <- 2.85 -> DG N7 C0005 : score 5.9895 : H : ARG NH2 A0161 <- 2.86 -> DG O6 C0005 : score 6.5208 : x : CYS xxxx A0129 <- 3.75 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx >4nih_A:Clavaminate_synthase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ALKB E136L MUTANT PROTEIN WITH COFACTORS BOUND TO DSDNA CONTAINING M6A/A organism=Escherichia coli : w : LYS NZ A0134 <- 6.03 -> DA N7 B0006 : score 1.655 : H : ARG NH1 A0161 <- 2.99 -> DG N7 C0005 : score 5.8201 : H : ARG NH2 A0161 <- 2.86 -> DG O6 C0005 : score 6.5208 : x : CYS xxxx A0129 <- 3.73 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx >4nii_A:Clavaminate_synthase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ALKB D135I MUTANT PROTEIN WITH COFACTORS BOUND TO DSDNA CONTAINING M6A/A organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0161 <- 2.91 -> DG N7 C0005 : score 5.9169 : H : ARG NH2 A0161 <- 2.89 -> DG O6 C0005 : score 6.4812 : x : CYS xxxx A0129 <- 3.74 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx >4nlg_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=Y-FAMILY DNA POLYMERASE CHIMERA DBH-DPO4(243-245)-DBH organism=Sulfolobus acidocaldarius : x : SER xxxx A0245 <- 4.05 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0249 <- 3.77 -> DC xxx T0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0297 <- 3.72 -> DT xxx P0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0337 <- 4.44 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx >4nlk_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH 8BRG IN THE TEMPLATE BASE-PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE CTP organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 3.04 -> DG N3 T0009 : score 1.38406 : w : LYS NZ A0234 <- 5.73 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : TYR OH A0271 <- 2.87 -> DA N3 P0010 : score 4.09316 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.41 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : ARG xxxx A0283 <- 3.24 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >4nln_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH NICKED DNA CONTAINING A TEMPLATE 8BRG AND INCOMING CTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.29 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.81 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.47 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4nlz_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH NICKED DNA CONTAINING A MISMATCHED TEMPLATE 8BRG AND INCOMING GTP organism=Homo sapiens : w : TYR OH A0271 <- 6.23 -> DG N2 P0011 : score 2.834 : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0234 <- 3.49 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0276 <- 3.10 -> DG xxx P0011 : score x.xxxxx >4nm1_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH A NICKED DNA CONTAINING A 8BRG-C AT N-1 POSITION AND G-C AT N POSITION organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.36 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : ARG NH1 A0258 <- 6.08 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : H : TYR OH A0271 <- 2.72 -> DC O2 P0010 : score 3.55339 : H : ASN ND2 A0279 <- 3.08 -> DC O2 P0011 : score 4.22864 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.47 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : HIS xxxx A0034 <- 3.21 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0276 <- 3.46 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.76 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0283 <- 3.23 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >4nm2_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH A NICKED DNA CONTAINING A 8BRG-G AT N-1 POSITION AND G-C AT N POSITION organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.34 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.45 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.68 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4nm6_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF TET2-DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : TRP xxxx A1291 <- 4.01 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1293 <- 3.25 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1294 <- 3.25 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1295 <- 3.39 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1302 <- 3.72 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx >4nnu_A:HMG-box; title=DISTINCT STRUCTURAL FEATURES OF TFAM DRIVE MITOCHONDRIAL DNA PACKAGING VERSUS TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION organism=? : H : TYR OH A0057 <- 2.78 -> DC O2 d0019 : score 3.51143 : H : ASN ND2 A0163 <- 3.35 -> DT O2 d0006 : score 4.22408 : H : ASN ND2 A0163 <- 3.04 -> DC O2 d0007 : score 4.26447 >4nnu_AB:HMG-box; title=DISTINCT STRUCTURAL FEATURES OF TFAM DRIVE MITOCHONDRIAL DNA PACKAGING VERSUS TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION organism=HOMO SAPIENS : H : TYR OH A0057 <- 2.78 -> DC O2 d0019 : score 3.51143 : H : ASN ND2 A0163 <- 3.35 -> DT O2 d0006 : score 4.22408 : H : ASN ND2 A0163 <- 3.04 -> DC O2 d0007 : score 4.26447 : H : TYR OH B0057 <- 2.92 -> DC O2 d0041 : score 3.4135 : H : ASN ND2 B0163 <- 3.28 -> DT O2 d0028 : score 4.29052 >4nod_A:HMG-box; title=DISTINCT STRUCTURAL FEATURES OF TFAM DRIVE MITOCHONDRIAL DNA PACKAGING VERSUS TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION organism=? : H : TYR OH A0057 <- 2.43 -> DC O2 d0017 : score 3.75625 : H : ASN ND2 A0163 <- 3.25 -> DA N3 d0004 : score 3.465 >4noe_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF DDRB BOUND TO 30B SSDNA organism=Deinococcus radiodurans : H : SER OG A0104 <- 2.58 -> DT O2 F0002 : score 3.86012 : V : LEU CG A0097 <- 3.61 -> DT C7 F0001 : score 4.60793 : x : ARG xxxx A0085 <- 3.63 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0087 <- 3.70 -> DT xxx F0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0095 <- 4.07 -> DC xxx F0030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0098 <- 3.82 -> DT xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0100 <- 3.94 -> DT xxx F0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0102 <- 2.96 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0117 <- 3.05 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0119 <- 3.18 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0123 <- 3.44 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0125 <- 3.51 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0132 <- 3.67 -> DT xxx F0001 : score x.xxxxx >4noe_ABCDE: title=CRYSTAL STRUCTURE OF DDRB BOUND TO 30B SSDNA organism=Deinococcus radiodurans : H : SER OG A0104 <- 2.58 -> DT O2 F0002 : score 3.86012 : H : SER OG B0104 <- 2.51 -> DT O2 F0008 : score 3.91189 : H : ARG NH1 B0132 <- 3.28 -> DT O4 F0007 : score 2.95423 : H : SER OG C0104 <- 2.58 -> DT O2 F0014 : score 3.86012 : H : ARG NH1 C0132 <- 3.36 -> DT O4 F0013 : score 2.90194 : w : LYS NZ D0102 <- 6.37 -> DT O2 F0019 : score 0.522 : H : SER OG D0104 <- 2.51 -> DT O2 F0020 : score 3.91189 : w : TYR OH D0125 <- 6.50 -> DG N2 F0021 : score 2.834 : H : SER OG E0104 <- 2.53 -> DT O2 F0026 : score 3.8971 : H : ARG NH1 E0132 <- 3.33 -> DT O4 F0025 : score 2.92155 : V : LEU CG A0097 <- 3.61 -> DT C7 F0001 : score 4.60793 : V : LEU CB B0097 <- 3.52 -> DT C7 F0007 : score 4.7069 : V : LEU CB C0097 <- 3.58 -> DT C7 F0013 : score 4.64092 : V : LEU CB D0097 <- 3.74 -> DT C7 F0019 : score 4.46496 : V : LEU CB E0087 <- 3.79 -> DT C7 F0025 : score 4.40997 : x : ARG xxxx A0085 <- 3.63 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0087 <- 3.70 -> DT xxx F0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0095 <- 4.07 -> DC xxx F0030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0098 <- 3.82 -> DT xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0100 <- 3.94 -> DT xxx F0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0102 <- 2.96 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0117 <- 3.05 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0119 <- 3.18 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0123 <- 3.44 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0125 <- 3.51 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0132 <- 3.67 -> DT xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0085 <- 3.85 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0087 <- 3.84 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0098 <- 4.03 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0100 <- 3.90 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0102 <- 2.84 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0117 <- 2.82 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0119 <- 3.33 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0123 <- 3.19 -> DC xxx F0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0125 <- 3.65 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0085 <- 3.49 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0087 <- 3.58 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0098 <- 4.13 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0100 <- 3.95 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0102 <- 3.08 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0117 <- 3.02 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0119 <- 3.19 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0123 <- 3.24 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0125 <- 3.49 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0085 <- 3.20 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0087 <- 3.70 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0098 <- 4.01 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0100 <- 3.89 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0117 <- 3.01 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0119 <- 2.90 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0120 <- 4.26 -> DG xxx F0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0123 <- 3.40 -> DG xxx F0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0132 <- 3.49 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0085 <- 3.50 -> DT xxx F0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0097 <- 3.56 -> DC xxx F0024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0098 <- 4.49 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0100 <- 3.91 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0102 <- 2.93 -> DT xxx F0026 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0117 <- 3.05 -> DT xxx F0026 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0119 <- 3.13 -> DT xxx F0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E0123 <- 3.50 -> DC xxx F0028 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0125 <- 3.55 -> DT xxx F0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E0130 <- 4.45 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx >4nqa_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF LIGANDED HRXR-ALPHA/HLXR-BETA HETERODIMER ON DNA organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 A0153 <- 2.50 -> DC N4 F0516 : score 6.11403 : H : GLU OE1 B0105 <- 2.54 -> DC N4 F0506 : score 6.06788 : H : LYS NZ B0108 <- 3.02 -> DA N7 E0513 : score 2.80794 : H : ARG NH2 B0113 <- 3.23 -> DG N7 F0504 : score 5.83554 : x : LYS xxxx A0156 <- 3.18 -> DG xxx E0504 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0160 <- 3.20 -> DG xxx E0505 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0161 <- 3.18 -> DT xxx F0513 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0077 <- 3.79 -> DA xxx E0508 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0112 <- 3.12 -> DG xxx E0515 : score x.xxxxx >4nqa_HI: title=CRYSTAL STRUCTURE OF LIGANDED HRXR-ALPHA/HLXR-BETA HETERODIMER ON DNA organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 H0153 <- 2.72 -> DC N4 M0516 : score 5.86024 : H : LYS NZ H0156 <- 3.03 -> DG O6 L0504 : score 5.51485 : H : GLU OE1 I0105 <- 2.91 -> DC N4 M0506 : score 5.64105 : H : LYS NZ I0108 <- 3.03 -> DA N7 L0513 : score 2.80207 : H : ARG NH2 I0112 <- 2.88 -> DG N7 L0515 : score 6.28246 : H : ARG NH2 I0113 <- 2.95 -> DG N7 M0504 : score 6.19308 : x : LYS xxxx H0160 <- 3.68 -> DG xxx L0505 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0161 <- 3.33 -> DG xxx M0514 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0078 <- 4.33 -> DC xxx L0509 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0079 <- 4.07 -> DT xxx M0513 : score x.xxxxx >4nqa_I:Nuclear_receptor_ligand-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LIGANDED HRXR-ALPHA/HLXR-BETA HETERODIMER ON DNA organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 I0105 <- 2.91 -> DC N4 M0506 : score 5.64105 : H : LYS NZ I0108 <- 3.03 -> DA N7 L0513 : score 2.80207 : H : ARG NH2 I0112 <- 2.88 -> DG N7 L0515 : score 6.28246 : H : ARG NH2 I0113 <- 2.95 -> DG N7 M0504 : score 6.19308 : x : ALA xxxx I0078 <- 4.33 -> DC xxx L0509 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0079 <- 4.07 -> DT xxx M0513 : score x.xxxxx >4nrw_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain; title=MVNEI1-G86D organism=Acanthamoeba polyphaga mimivirus : H : ARG NE A0114 <- 2.84 -> DC O2 C0007 : score 2.6377 : H : ARG NH2 A0114 <- 2.93 -> DC N3 C0007 : score 2.23146 : H : SER OG A0272 <- 2.93 -> DA N7 C0003 : score 4.34804 : x : LEU xxxx A0084 <- 3.71 -> DG xxx D0021 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0113 <- 3.66 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0116 <- 3.38 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0274 <- 4.10 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0275 <- 2.83 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0277 <- 3.53 -> DG xxx D0021 : score x.xxxxx >4nw3_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MLL CXXC DOMAIN IN COMPLEX WITH A CPG DNA organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ A1186 <- 3.00 -> DG N7 C0007 : score 5.17046 : H : GLN NE2 A1187 <- 3.05 -> DG O6 B0007 : score 5.51487 : x : LYS xxxx A1185 <- 4.33 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >4nxz_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA WITH O6MG IN THE TEMPLATE BASE OPPOSITE TO INCOMING NON-HYDROLYZABLE TTP WITH MANGANESE IN THE ACTIVE SITE organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 3.15 -> DG N3 T0009 : score 1.35208 : H : TYR OH A0271 <- 3.00 -> DA N3 P0010 : score 3.98523 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.52 -> DT O2 T0007 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0283 <- 5.84 -> DT O2 T0007 : score 2.261 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.15 -> DT O2 T0007 : score 2.462 >4ny8_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA WITH O6MG IN THE TEMPLATE BASE OPPOSITE TO INCOMING NON-HYDROLYZABLE CTP WITH MANGANESE IN THE ACTIVE SITE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.32 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.63 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.59 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4o0i_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FRAGMENT DNA POLYMERASE I FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS WITH 2'-MESE-ARABINO-GUANOSINE DERIVATIZED DNA organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : LYS NZ A0582 <- 2.74 -> DC O2 B0011 : score 2.98151 : w : LYS NZ A0582 <- 5.79 -> DA N3 C0008 : score 1.538 : w : THR OG1 A0586 <- 5.54 -> DA N3 C0008 : score 2.845 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.21 -> DG N3 B0012 : score 4.49349 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.35 -> DC O2 B0013 : score 3.208 : x : ASN xxxx A0622 <- 4.11 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0629 <- 3.65 -> DC xxx B0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0710 <- 3.48 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.93 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx >4o3m_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;HRDC-like; title=TERNARY COMPLEX OF BLOOM'S SYNDROME HELICASE organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A1166 <- 2.84 -> DG N3 T0014 : score 4.93584 : w : GLN NE2 A1166 <- 5.85 -> DG N3 P0004 : score 1.484 : x : SER xxxx A1123 <- 4.09 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1162 <- 3.72 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1164 <- 3.02 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx >4o3n_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA IN TERNARY COMPLEX WITH NATIVE DNA AND INCOMING NUCLEOTIDE (DCP) organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.25 -> DG O6 P0004 : score 5.53583 : H : ARG NH2 A0382 <- 2.90 -> DG N7 P0004 : score 6.25692 : x : SER xxxx A0322 <- 3.98 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.88 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4o3o_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN POLYMERASE ETA INSERTING DATP OPPOSITE AN 8-OXOG CONTAINING DNA TEMPLATE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 2.86 -> DG N7 P0004 : score 5.9774 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.14 -> DG O6 P0004 : score 6.1512 : x : SER xxxx A0322 <- 3.87 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.83 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.29 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4o3p_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN POLYMERASE ETA INSERTING DCTP OPPOSITE AN 8-OXOG CONTAINING DNA TEMPLATE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.14 -> DG O6 P0004 : score 5.66967 : H : ARG NH2 A0382 <- 2.90 -> DG N7 P0004 : score 6.25692 : x : SER xxxx A0322 <- 3.87 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.63 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4o3q_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN POLYMERASE ETA INSERTING DGTP OPPOSITE AN 8-OXOG CONTAINING DNA TEMPLATE organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0324 <- 5.94 -> DA N7 T0005 : score 1.989 : H : ARG NH1 A0382 <- 2.73 -> DG N7 P0004 : score 6.1347 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.08 -> DG O6 P0004 : score 6.2304 : V : LEU CD1 A0378 <- 3.77 -> DT C7 T0006 : score 5.77427 : x : ARG xxxx A0061 <- 3.13 -> DT xxx P0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.66 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0421 <- 4.02 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.32 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4o3r_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN POLYMERASE ETA EXTENDING AN 8-OXOG DNA LESION: POST INSERTION OF 8-OXOG-DA PAIR organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 3.16 -> DG N3 T0004 : score 4.61739 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.64 -> DG N2 T0004 : score 2.177 : x : ILE xxxx A0048 <- 3.59 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 4.29 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.34 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >4o3s_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN POLYMERASE ETA EXTENDING AN 8-OXOG DNA LESION: POST INSERTION OF 8-OXOG-DC PAIR organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 3.19 -> DG N3 T0004 : score 4.58754 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.26 -> DG N2 T0004 : score 2.177 : w : ARG NE A0382 <- 6.13 -> DG O6 P0004 : score 1.369 : x : ILE xxxx A0048 <- 3.53 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 4.32 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 4.35 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx >4o5c_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE COMPLEXED WITH N7-MG AS THE TEMPLATE BASE IN A 1-NUCLEOTIDE GAPPED DNA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.65 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.54 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4o5e_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE COMPLEXED WITH N7MG IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE TTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.31 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.48 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.59 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4o5k_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE COMPLEXED WITH N7MG IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE CTP organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0271 <- 2.74 -> DA N3 P0010 : score 4.2011 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.96 -> DT O2 T0007 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.07 -> DT O2 T0007 : score 2.261 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.57 -> DT O2 T0007 : score 2.462 : x : LYS xxxx A0234 <- 3.05 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx >4o6a_A: title=MOUSE CYCLIC GMP-AMP SYNTHASE (CGAS) IN COMPLEX WITH DNA organism=Mus musculus : x : ARG xxxx A0161 <- 3.62 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx >4o9m_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH ADENYLATED TETRAHYDROFURAN (ABASIC SITE) CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 6.69 -> DG N3 B0009 : score 2.344 : w : LYS NZ A0234 <- 5.92 -> DC O2 B0008 : score 1.3 : x : TYR xxxx A0271 <- 2.95 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0276 <- 3.26 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0279 <- 3.57 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 4.35 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0283 <- 4.12 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >4ofa_A:DNA-glycosylase; title=STRUCTURAL BASIS FOR THYMINE GLYCOSYLASE ACTIVITY ON T:O6-METHYLG MISMATCH BY METHYL-CPG BINDING DOMAIN PROTEIN 4: IMPLICATIONS FOR ROLES OF ARG468 IN MISMATCH RECOGNITION AND CATALYSIS organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 A0449 <- 2.91 -> DT N3 C0007 : score 3.33899 : H : GLN NE2 A0449 <- 2.94 -> DT O2 C0007 : score 3.8232 : w : ASN OD1 A0467 <- 5.99 -> DG N3 C0008 : score 3.377 : w : ARG NH2 A0468 <- 6.00 -> DG N7 C0006 : score 2.18 : w : SER OG A0470 <- 5.50 -> DG N2 C0006 : score 1.651 : H : TYR OH A0540 <- 2.76 -> DT O2 C0007 : score 3.2424 : x : LEU xxxx A0447 <- 4.06 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0448 <- 3.74 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0466 <- 3.59 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0469 <- 3.27 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0508 <- 3.47 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0511 <- 3.32 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0512 <- 4.17 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0560 <- 4.16 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0562 <- 3.69 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >4ofe_A:DNA-glycosylase; title=STRUCTURAL BASIS FOR THYMINE GLYCOSYLASE ACTIVITY ON T:O6-METHYLG MISMATCH BY METHYL-CPG BINDING DOMAIN PROTEIN 4: IMPLICATIONS FOR ROLES OF ARG468 IN MISMATCH RECOGNITION AND CATALYSIS organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 A0449 <- 2.86 -> DT N3 C0007 : score 3.37313 : H : GLN NE2 A0449 <- 2.77 -> DT O2 C0007 : score 3.95693 : w : ASN OD1 A0467 <- 5.97 -> DG N3 C0008 : score 3.377 : w : LYS NZ A0468 <- 5.85 -> DG N7 C0006 : score 2.519 : w : LYS NZ A0468 <- 6.11 -> DG N7 C0008 : score 2.519 : w : SER OG A0470 <- 5.57 -> DG N2 C0006 : score 1.651 : H : TYR OH A0540 <- 2.74 -> DT O2 C0007 : score 3.25527 : x : LEU xxxx A0447 <- 4.00 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0448 <- 3.84 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0466 <- 3.55 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0469 <- 3.22 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0508 <- 3.48 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0511 <- 3.24 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0512 <- 4.09 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0560 <- 4.28 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0562 <- 3.53 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0563 <- 4.48 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >4ofh_A:DNA-glycosylase; title=STRUCTURAL BASIS FOR THYMINE GLYCOSYLASE ACTIVITY ON T:O6-METHYLG MISMATCH BY METHYL-CPG BINDING DOMAIN PROTEIN 4: IMPLICATIONS FOR ROLES OF ARG468 IN MISMATCH RECOGNITION AND CATALYSIS organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 A0449 <- 2.91 -> DT N3 C0007 : score 3.33899 : H : GLN NE2 A0449 <- 2.98 -> DT O2 C0007 : score 3.79173 : w : ASN OD1 A0467 <- 5.86 -> DG N3 C0008 : score 3.377 : w : ARG NE A0468 <- 6.54 -> DG O6 C0008 : score 1.369 : H : TYR OH A0540 <- 2.86 -> DT O2 C0007 : score 3.17807 : x : LEU xxxx A0447 <- 3.95 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0448 <- 3.63 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0466 <- 3.51 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0508 <- 3.52 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0511 <- 3.26 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0560 <- 4.12 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0562 <- 3.80 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >4oin_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX SOAKED WITH GE23077 organism=THERMUS THERMOPHILUS : V : ARG CG C0422 <- 3.70 -> DT C7 H0015 : score 1.03026 : x : GLU xxxx C0421 <- 4.04 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx >4oin_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX SOAKED WITH GE23077 organism=THERMUS THERMOPHILUS : V : ARG CG C0422 <- 3.70 -> DT C7 H0015 : score 1.03026 : x : GLU xxxx C0421 <- 4.04 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx >4oio_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS PRE-INSERTION SUBSTRATE COMPLEX FOR DE NOVO TRANSCRIPTION INITIATION organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ASP OD1 C0326 <- 2.76 -> DG N2 H0014 : score 5.1912 : H : ARG NH2 C0422 <- 2.68 -> DT O4 H0015 : score 3.63914 : H : ARG NH2 F0082 <- 2.82 -> DG O6 H0009 : score 6.5736 : H : ASP OD1 F0326 <- 2.74 -> DG N2 G0019 : score 5.2118 : H : ASP OD2 F0326 <- 2.36 -> DA N6 G0018 : score 4.35479 : w : ASP OD2 F0326 <- 5.17 -> DA N6 G0018 : score 3.409 : x : ARG xxxx C0142 <- 3.46 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0166 <- 4.21 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0171 <- 3.70 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0187 <- 3.11 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0243 <- 2.84 -> DA xxx H0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0256 <- 4.19 -> DA xxx H0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0325 <- 4.13 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0331 <- 3.34 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0418 <- 3.40 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0421 <- 4.35 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0426 <- 4.39 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0427 <- 3.85 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0491 <- 4.23 -> DT xxx H0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0705 <- 4.01 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 3.71 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.35 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 3.83 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0079 <- 4.38 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0321 <- 3.83 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0324 <- 3.32 -> DA xxx G0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0327 <- 3.54 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0332 <- 3.74 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx >4oio_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS PRE-INSERTION SUBSTRATE COMPLEX FOR DE NOVO TRANSCRIPTION INITIATION organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ARG NH2 F0082 <- 2.82 -> DG O6 H0009 : score 6.5736 : H : ASP OD1 F0326 <- 2.74 -> DG N2 G0019 : score 5.2118 : H : ASP OD2 F0326 <- 2.36 -> DA N6 G0018 : score 4.35479 : w : ASP OD2 F0326 <- 5.17 -> DA N6 G0018 : score 3.409 : x : ASP xxxx F0079 <- 4.38 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0321 <- 3.83 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0324 <- 3.32 -> DA xxx G0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0327 <- 3.54 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0332 <- 3.74 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx >4oip_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX SOAKED WITH GE23077, ATP, AND CMPCPP organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : GLU xxxx C0421 <- 4.46 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 3.93 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >4oiq_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX SOAKED WITH GE23077 AND RIFAMPICIN organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : GLU xxxx C0421 <- 3.88 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 4.02 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >4oir_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX SOAKED WITH GE23077 AND RIFAMYCIN SV organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : GLU xxxx C0421 <- 3.23 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 3.54 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >4ol8_AB:DNA/RNA_polymerases; title=TY3 REVERSE TRANSCRIPTASE BOUND TO DNA/RNA organism=Saccharomyces cerevisiae : H : TYR OH A0211 <- 2.93 -> DT O2 D0046 : score 3.13303 : x : TYR xxxx A0156 <- 4.46 -> DC xxx D0047 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0185 <- 4.46 -> DC xxx D0047 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0212 <- 3.70 -> DC xxx D0047 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0290 <- 4.34 -> DT xxx D0042 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0297 <- 4.32 -> DT xxx D0044 : score x.xxxxx >4ol8_E:DNA/RNA_polymerases; title=TY3 REVERSE TRANSCRIPTASE BOUND TO DNA/RNA organism=Saccharomyces cerevisiae : H : TYR OH E0156 <- 3.24 -> DC O2 H0047 : score 3.18966 : H : TYR OH E0211 <- 2.88 -> DT O2 H0046 : score 3.1652 : x : PHE xxxx E0185 <- 4.44 -> DC xxx H0047 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0212 <- 3.82 -> DC xxx H0047 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0297 <- 4.19 -> DT xxx H0044 : score x.xxxxx >4ol8_EF:DNA/RNA_polymerases; title=TY3 REVERSE TRANSCRIPTASE BOUND TO DNA/RNA organism=Saccharomyces cerevisiae : H : TYR OH E0156 <- 3.24 -> DC O2 H0047 : score 3.18966 : H : TYR OH E0211 <- 2.88 -> DT O2 H0046 : score 3.1652 : x : PHE xxxx E0185 <- 4.44 -> DC xxx H0047 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0212 <- 3.82 -> DC xxx H0047 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0297 <- 4.19 -> DT xxx H0044 : score x.xxxxx >4oln_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCESTRAL STEROID RECEPTOR 1 IN COMPLEX WITH ESTROGEN RESPONSE ELEMENT DNA organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : GLU OE1 A0025 <- 2.83 -> DC N4 F0015 : score 5.73334 : w : GLU OE1 A0025 <- 5.80 -> DA N6 F0014 : score 2.939 : H : LYS NZ A0028 <- 3.00 -> DG O6 E0004 : score 5.54954 : w : LYS NZ A0028 <- 6.05 -> DA N6 E0003 : score 2.097 : H : LYS NZ A0032 <- 3.11 -> DG N7 E0005 : score 5.05197 : H : ARG NH1 A0033 <- 2.98 -> DG N7 F0013 : score 5.8322 : H : GLU OE1 B0025 <- 2.76 -> DC N4 E0015 : score 5.81409 : w : GLU OE1 B0025 <- 5.95 -> DA N6 E0014 : score 2.939 : H : LYS NZ B0028 <- 2.93 -> DG O6 F0004 : score 5.63047 : w : LYS NZ B0028 <- 6.02 -> DA N6 F0003 : score 2.097 : H : LYS NZ B0032 <- 2.99 -> DG N7 F0005 : score 5.18123 : H : LYS NZ B0032 <- 3.08 -> DT O4 F0006 : score 3.3863 : H : ARG NH1 B0033 <- 3.04 -> DG N7 E0013 : score 5.7596 : x : ALA xxxx A0029 <- 3.44 -> DG xxx F0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0019 <- 4.26 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0029 <- 3.49 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx >4oln_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCESTRAL STEROID RECEPTOR 1 IN COMPLEX WITH ESTROGEN RESPONSE ELEMENT DNA organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : GLU OE1 B0025 <- 2.76 -> DC N4 E0015 : score 5.81409 : w : GLU OE1 B0025 <- 5.95 -> DA N6 E0014 : score 2.939 : H : LYS NZ B0028 <- 2.93 -> DG O6 F0004 : score 5.63047 : w : LYS NZ B0028 <- 6.02 -> DA N6 F0003 : score 2.097 : H : LYS NZ B0032 <- 2.99 -> DG N7 F0005 : score 5.18123 : H : LYS NZ B0032 <- 3.08 -> DT O4 F0006 : score 3.3863 : w : LYS NZ B0032 <- 5.73 -> DG O6 E0013 : score 3.005 : H : ARG NH1 B0033 <- 3.04 -> DG N7 E0013 : score 5.7596 : w : ARG NH1 B0033 <- 5.71 -> DG O6 E0013 : score 2.756 : x : TYR xxxx B0019 <- 4.26 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0029 <- 3.49 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx >4omy_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SEMET NOLR FROM SINORHIZOBIUM FREDII IN COMPLEX WITH OLIGO AT DNA organism=SINORHIZOBIUM FREDII : H : SER OG A0057 <- 2.62 -> DT O4 E0003 : score 3.68311 : H : SER OG A0057 <- 2.79 -> DA N6 F0020 : score 3.29632 : H : GLN OE1 A0061 <- 2.96 -> DC N4 F0018 : score 4.43667 : H : GLN NE2 A0061 <- 2.89 -> DT O4 F0019 : score 5.09759 : H : SER OG B0057 <- 2.54 -> DG O6 E0015 : score 4.30376 : H : SER OG B0057 <- 2.68 -> DT O4 F0008 : score 3.64045 : H : GLN NE2 B0061 <- 2.87 -> DT O4 E0014 : score 5.11835 : x : GLN xxxx B0056 <- 3.66 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0060 <- 3.81 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0079 <- 3.59 -> DA xxx E0021 : score x.xxxxx >4omy_CD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SEMET NOLR FROM SINORHIZOBIUM FREDII IN COMPLEX WITH OLIGO AT DNA organism=SINORHIZOBIUM FREDII : H : SER OG C0057 <- 2.89 -> DT O4 H0008 : score 3.49114 : H : SER OG C0057 <- 2.74 -> DG O6 G0015 : score 4.14012 : H : GLN OE1 C0061 <- 3.21 -> DC N4 G0013 : score 4.2075 : H : GLN NE2 C0061 <- 2.57 -> DT O4 G0014 : score 5.42981 : H : GLN NE2 C0079 <- 3.07 -> DT O2 G0020 : score 3.72093 : H : SER OG D0057 <- 2.77 -> DT O4 G0003 : score 3.57646 : H : GLN OE1 D0061 <- 3.19 -> DC N4 H0018 : score 4.22583 : H : GLN NE2 D0061 <- 2.67 -> DT O4 H0019 : score 5.32599 : x : SER xxxx C0060 <- 3.50 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0065 <- 4.23 -> DT xxx H0017 : score x.xxxxx >4omy_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SEMET NOLR FROM SINORHIZOBIUM FREDII IN COMPLEX WITH OLIGO AT DNA organism=SINORHIZOBIUM FREDII : H : SER OG D0057 <- 2.77 -> DT O4 G0003 : score 3.57646 : H : GLN OE1 D0061 <- 3.19 -> DC N4 H0018 : score 4.22583 : H : GLN NE2 D0061 <- 2.67 -> DT O4 H0019 : score 5.32599 : x : LYS xxxx D0065 <- 4.23 -> DT xxx H0017 : score x.xxxxx >4on0_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NOLR FROM SINORHIZOBIUM FREDII IN COMPLEX WITH OLIGO AA DNA organism=SINORHIZOBIUM FREDII : H : SER OG A0057 <- 3.13 -> DT O4 E0003 : score 3.32049 : H : SER OG A0057 <- 2.67 -> DA N6 F0020 : score 3.37528 : H : GLN OE1 A0061 <- 3.22 -> DC N4 F0018 : score 4.19833 : H : GLN NE2 A0061 <- 2.76 -> DT O4 F0019 : score 5.23255 : H : GLN NE2 B0056 <- 2.88 -> DA N7 F0007 : score 5.99231 : H : SER OG B0057 <- 2.30 -> DG O6 E0015 : score 4.50013 : H : SER OG B0057 <- 3.00 -> DT O4 F0008 : score 3.41292 : H : GLN NE2 B0061 <- 2.83 -> DT O4 E0014 : score 5.15988 : H : GLN NE2 B0079 <- 2.83 -> DA N3 E0021 : score 4.00276 : V : ALA CB B0058 <- 3.70 -> DT C7 E0014 : score 5.73895 : V : ALA CB A0058 <- 3.72 -> DT C7 F0019 : score 5.71095 : x : SER xxxx A0055 <- 4.03 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0060 <- 3.52 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0065 <- 4.25 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0055 <- 4.19 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0060 <- 3.06 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx >4on0_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NOLR FROM SINORHIZOBIUM FREDII IN COMPLEX WITH OLIGO AA DNA organism=SINORHIZOBIUM FREDII : H : GLN NE2 B0056 <- 2.88 -> DA N7 F0007 : score 5.99231 : H : SER OG B0057 <- 3.00 -> DT O4 F0008 : score 3.41292 : H : SER OG B0057 <- 2.30 -> DG O6 E0015 : score 4.50013 : H : GLN NE2 B0061 <- 2.83 -> DT O4 E0014 : score 5.15988 : H : GLN NE2 B0079 <- 2.83 -> DA N3 E0021 : score 4.00276 : V : ALA CB B0058 <- 3.70 -> DT C7 E0014 : score 5.73895 : x : SER xxxx B0055 <- 4.19 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0060 <- 3.06 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx >4on0_CD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NOLR FROM SINORHIZOBIUM FREDII IN COMPLEX WITH OLIGO AA DNA organism=SINORHIZOBIUM FREDII : H : SER OG C0057 <- 2.95 -> DT O4 G0003 : score 3.44847 : H : SER OG C0057 <- 2.79 -> DA N6 H0020 : score 3.29632 : H : GLN OE1 C0061 <- 3.44 -> DC N4 H0018 : score 3.99667 : H : GLN NE2 C0061 <- 2.92 -> DT O4 H0019 : score 5.06644 : H : GLN NE2 D0056 <- 3.02 -> DA N7 H0007 : score 5.82179 : H : GLN OE1 D0061 <- 3.05 -> DC N4 G0013 : score 4.35417 : H : GLN NE2 D0061 <- 2.74 -> DT O4 G0014 : score 5.25332 : V : ALA CB D0058 <- 3.62 -> DT C7 G0014 : score 5.85093 : V : ALA CB C0058 <- 3.75 -> DT C7 H0019 : score 5.66896 : x : SER xxxx C0055 <- 3.94 -> DT xxx H0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0060 <- 3.27 -> DT xxx G0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0065 <- 4.47 -> DT xxx H0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0057 <- 3.24 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0060 <- 3.04 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0079 <- 3.56 -> DA xxx G0021 : score x.xxxxx >4ond_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCESTRAL STEROID RECEPTOR 2 DBD HELIX MUTANT - ERE DNA COMPLEX organism=synthetic construct : H : GLU OE1 A0025 <- 3.13 -> DC N4 I0015 : score 5.38726 : H : ARG NH1 A0033 <- 3.04 -> DG N7 I0013 : score 5.7596 A : H : ARG NH2 A0033 <- 2.34 -> DG O6 I0013 : score 7.2072 A : H : GLU OE1 B0025 <- 3.09 -> DC N4 J0015 : score 5.43341 : w : GLU OE1 B0025 <- 6.33 -> DA N6 J0014 : score 2.939 : H : LYS NZ B0028 <- 2.91 -> DG N7 I0004 : score 5.26741 : x : LYS xxxx A0028 <- 3.77 -> DG xxx J0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0029 <- 3.79 -> DG xxx I0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0029 <- 3.71 -> DG xxx J0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0033 <- 3.65 -> DT xxx J0012 : score x.xxxxx >4ond_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCESTRAL STEROID RECEPTOR 2 DBD HELIX MUTANT - ERE DNA COMPLEX organism=synthetic construct : H : GLU OE1 B0025 <- 3.09 -> DC N4 J0015 : score 5.43341 : w : GLU OE1 B0025 <- 6.33 -> DA N6 J0014 : score 2.939 : H : LYS NZ B0028 <- 2.91 -> DG N7 I0004 : score 5.26741 : x : ALA xxxx B0029 <- 3.71 -> DG xxx J0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0033 <- 3.65 -> DT xxx J0012 : score x.xxxxx >4ond_EF:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCESTRAL STEROID RECEPTOR 2 DBD HELIX MUTANT - ERE DNA COMPLEX organism=synthetic construct : H : GLU OE1 E0025 <- 3.18 -> DC N4 K0015 : score 5.32958 : H : LYS NZ E0028 <- 2.90 -> DG N7 L0004 : score 5.27818 : H : GLU OE2 F0025 <- 2.39 -> DC N4 L0015 : score 5.69715 : w : GLU OE2 F0025 <- 6.38 -> DA N6 L0014 : score 2.785 : x : ALA xxxx E0029 <- 3.49 -> DG xxx K0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0033 <- 3.75 -> DT xxx K0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0028 <- 3.07 -> DG xxx K0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0029 <- 3.65 -> DG xxx L0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0033 <- 3.60 -> DT xxx L0012 : score x.xxxxx >4oo8_D: title=CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTOCOCCUS PYOGENES CAS9 IN COMPLEX WITH GUIDE RNA AND TARGET DNA organism=Streptococcus pyogenes serotype M1 : w : TYR OH D0072 <- 5.44 -> DG O6 F0001 : score 3.344 : x : ARG xxxx D0447 <- 4.27 -> DA xxx F0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0450 <- 3.50 -> DG xxx F0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0495 <- 3.49 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0588 <- 4.00 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0694 <- 3.27 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D1107 <- 3.25 -> DC xxx F-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D1108 <- 3.19 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx >4oor_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCESTRAL STEROID RECEPTOR 2 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A STEROID RESPONSE ELEMENT organism=synthetic construct : H : ARG NH1 A0033 <- 3.26 -> DG N7 I0013 : score 5.4934 : H : ARG NH2 A0033 <- 2.82 -> DG O6 I0013 : score 6.5736 : x : LYS xxxx A0028 <- 3.15 -> DG xxx J0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0029 <- 4.17 -> DG xxx I0013 : score x.xxxxx >4oor_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCESTRAL STEROID RECEPTOR 2 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A STEROID RESPONSE ELEMENT organism=synthetic construct : H : ARG NH1 A0033 <- 3.26 -> DG N7 I0013 : score 5.4934 : H : ARG NH2 A0033 <- 2.82 -> DG O6 I0013 : score 6.5736 : H : LYS NZ B0028 <- 2.97 -> DG N7 I0004 : score 5.20278 : H : ARG NH1 B0033 <- 3.17 -> DG N7 J0013 : score 5.6023 : H : ARG NH2 B0033 <- 2.67 -> DG O6 J0013 : score 6.7716 : x : LYS xxxx A0028 <- 3.15 -> DG xxx J0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0029 <- 4.17 -> DG xxx I0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0029 <- 3.76 -> DT xxx J0014 : score x.xxxxx >4oor_EF:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCESTRAL STEROID RECEPTOR 2 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A STEROID RESPONSE ELEMENT organism=synthetic construct : H : ARG NH1 E0033 <- 3.13 -> DG N7 K0013 : score 5.6507 : H : ARG NH2 E0033 <- 2.67 -> DG O6 K0013 : score 6.7716 : H : LYS NZ F0028 <- 3.30 -> DG N7 K0004 : score 4.84731 : H : ARG NH1 F0033 <- 3.09 -> DG N7 L0013 : score 5.6991 : H : ARG NH2 F0033 <- 2.58 -> DG O6 L0013 : score 6.8904 : w : ARG NH2 F0033 <- 6.49 -> DA N6 K0006 : score 1.997 : x : LYS xxxx E0028 <- 3.21 -> DG xxx L0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0029 <- 4.08 -> DT xxx K0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0029 <- 3.45 -> DT xxx L0014 : score x.xxxxx >4opj_A:Ribonuclease_H-like; title=BH-RNASEH:TCDA-DNA COMPLEX organism=Bacillus halodurans : H : ASN ND2 A0077 <- 3.31 -> DG N3 B0002 : score 4.3956 : w : ASN ND2 A0106 <- 6.02 -> DG N3 B0004 : score 2.566 : w : THR OG1 A0135 <- 5.65 -> DG N3 B0004 : score 2.036 >4opk_C:Ribonuclease_H-like; title=BH-RNASEH:2'-SME-DNA COMPLEX organism=Bacillus halodurans : w : ASN OD1 C0106 <- 5.64 -> DG N2 D0010 : score 2.566 : x : ASN xxxx C0077 <- 4.23 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0105 <- 3.90 -> DC xxx D0011 : score x.xxxxx >4opx_AD:ADP-ribosylation;Domain_of_polyADP-ribose_polymerase;WGR_domain-like;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF HUMAN PARP-1 BOUND TO A DNA DOUBLE STRAND BREAK IN COMPLEX WITH (2R)-5-FLUORO-2-METHYL-2,3-DIHYDRO-1-BENZOFURAN-7- CARBOXAMIDE organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0018 <- 3.71 -> DG xxx N0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0044 <- 3.39 -> DG xxx M0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0048 <- 3.05 -> DC xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0018 <- 3.60 -> DG xxx M0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0044 <- 3.32 -> DG xxx N0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0048 <- 3.10 -> DC xxx M0026 : score x.xxxxx >4opx_D:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF HUMAN PARP-1 BOUND TO A DNA DOUBLE STRAND BREAK IN COMPLEX WITH (2R)-5-FLUORO-2-METHYL-2,3-DIHYDRO-1-BENZOFURAN-7- CARBOXAMIDE organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx D0018 <- 3.60 -> DG xxx M0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0044 <- 3.32 -> DG xxx N0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0048 <- 3.10 -> DC xxx M0026 : score x.xxxxx >4oqa_AD:ADP-ribosylation;Domain_of_polyADP-ribose_polymerase;WGR_domain-like;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF HUMAN PARP-1 BOUND TO A DNA DOUBLE STRAND BREAK IN COMPLEX WITH (2Z)-2-(2,4-DIHYDROXYBENZYLIDENE)-3-OXO-2,3-DIHYDRO-1- BENZOFURAN-7-CARBOXAMIDE organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0018 <- 3.83 -> DG xxx N0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0044 <- 3.42 -> DG xxx M0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0048 <- 3.08 -> DC xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0018 <- 3.72 -> DG xxx M0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0044 <- 3.29 -> DG xxx N0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0048 <- 3.12 -> DC xxx M0026 : score x.xxxxx >4oqb_AD:ADP-ribosylation;Domain_of_polyADP-ribose_polymerase;WGR_domain-like;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF HUMAN PARP-1 BOUND TO A DNA DOUBLE STRAND BREAK IN COMPLEX WITH (2Z)-2-{4-[2-(MORPHOLIN-4-YL)ETHOXY]BENZYLIDENE}-3-OXO- 2,3-DIHYDRO-1-BENZOFURAN-7-CARBOXAMIDE organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0018 <- 3.88 -> DG xxx N0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0044 <- 3.38 -> DG xxx M0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0048 <- 3.07 -> DC xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0018 <- 3.76 -> DG xxx M0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0044 <- 3.37 -> DG xxx N0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0048 <- 3.21 -> DC xxx M0026 : score x.xxxxx >4osh_B:Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TAL EFFECTOR DHAX3 WITH NI RVD AT 2.2 ANGSTROM RESOLUTION organism=XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ARMORACIAE : H : ASP OD2 B0301 <- 2.84 -> DC N4 G0004 : score 6.1504 : w : ASP OD1 B0301 <- 6.27 -> DG O6 H0010 : score 3.411 : w : ASP OD2 B0301 <- 5.85 -> DG O6 H0011 : score 3.228 : H : ASP OD2 B0335 <- 2.81 -> DC N4 G0005 : score 6.1876 : w : ASP OD2 B0335 <- 5.50 -> DG O6 H0010 : score 3.228 : H : ASP OD2 B0369 <- 2.59 -> DC N4 G0006 : score 6.4604 : w : ASP OD2 B0369 <- 6.18 -> DA N6 H0009 : score 3.409 : H : ASP OD2 B0573 <- 2.69 -> DC N4 G0012 : score 6.3364 : w : ASP OD2 B0573 <- 5.91 -> DA N6 H0003 : score 3.409 : H : ASP OD1 B0641 <- 2.82 -> DC N4 G0014 : score 5.32349 : w : ASP OD1 B0641 <- 6.13 -> DA N6 H0001 : score 3.122 : V : ILE CG2 B0505 <- 3.86 -> DT C7 G0009 : score 6.98491 : x : ARG xxxx B0266 <- 3.80 -> DA xxx H0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0368 <- 4.08 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx >4osi_A:Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TAL EFFECTOR DHAX3 WITH NI RVD AT 2.8 ANGSTROM RESOLUTION organism=XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ARMORACIAE : H : ASP OD2 A0301 <- 2.86 -> DC N4 I0004 : score 6.1256 : H : ASP OD2 A0335 <- 3.00 -> DC N4 I0005 : score 5.952 : H : ASP OD2 A0369 <- 3.27 -> DC N4 I0006 : score 5.6172 : H : ASP OD2 A0641 <- 3.34 -> DC N4 I0014 : score 5.5304 : V : ILE CG2 A0505 <- 3.51 -> DT C7 I0009 : score 7.6054 : x : ARG xxxx A0266 <- 3.77 -> DG xxx J0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0573 <- 3.37 -> DC xxx I0012 : score x.xxxxx >4osj_A:Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TAL EFFECTOR REVEALS THE RECOGNITION BETWEEN ASPARAGINE AND ADENINE organism=? : H : ARG NH1 A0266 <- 2.80 -> DG N7 J0010 : score 6.05 : H : ARG NH2 A0266 <- 2.83 -> DG O6 J0010 : score 6.5604 : H : ASP OD2 A0301 <- 3.31 -> DC N4 I0004 : score 5.5676 : H : ASP OD2 A0335 <- 2.83 -> DC N4 I0005 : score 6.1628 : H : ASP OD2 A0369 <- 3.22 -> DC N4 I0006 : score 5.6792 : H : ASN ND2 A0505 <- 3.07 -> DA N7 I0010 : score 5.55351 : H : ASP OD2 A0641 <- 2.97 -> DC N4 I0014 : score 5.9892 : x : HIS xxxx A0368 <- 3.96 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0573 <- 3.68 -> DC xxx I0012 : score x.xxxxx >4osk_B:PLP-dependent_transferases;Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TAL EFFECTOR REVEALS THE RECOGNITION BETWEEN ASPARAGINE AND GUANINE organism=XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ARMORACIAE : w : GLN OE1 B0231 <- 6.38 -> DA N6 H0013 : score 3.392 : H : ASP OD2 B0301 <- 2.87 -> DC N4 G0004 : score 6.1132 : H : ASP OD2 B0335 <- 2.99 -> DC N4 G0005 : score 5.9644 : H : SER OG B0369 <- 2.68 -> DA N7 G0006 : score 4.57124 : H : SER OG B0403 <- 2.90 -> DA N7 G0007 : score 4.37482 : H : ASP OD1 B0437 <- 2.90 -> DC N4 G0008 : score 5.23797 : H : SER OG B0505 <- 2.74 -> DA N7 G0010 : score 4.51767 : H : ASP OD2 B0539 <- 2.64 -> DC N4 G0011 : score 6.3984 : H : SER OG B0607 <- 2.63 -> DA N7 G0013 : score 4.61588 : H : ASN ND2 B0641 <- 3.15 -> DG N7 G0014 : score 4.26488 : x : ARG xxxx B0266 <- 3.31 -> DT xxx H0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0675 <- 3.45 -> DA xxx G0015 : score x.xxxxx >4osl_B:Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TAL EFFECTOR REVEALS THE RECOGNITION BETWEEN HISTIDINE AND GUANINE organism=XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ARMORACIAE : H : ARG NH1 B0266 <- 2.61 -> DG O6 H-003 : score 6.3145 : H : ARG NH2 B0266 <- 2.84 -> DG N7 H-003 : score 6.33354 : H : ASP OD2 B0301 <- 3.16 -> DC N4 G0001 : score 5.7536 : w : ASP OD2 B0301 <- 5.67 -> DG O6 H-002 : score 3.228 : H : ASP OD2 B0335 <- 2.61 -> DC N4 G0002 : score 6.4356 : H : ASP OD2 B0369 <- 3.02 -> DC N4 G0003 : score 5.9272 : w : ASP OD2 B0369 <- 5.48 -> DA N6 H-004 : score 3.409 : w : ASP OD2 B0369 <- 5.97 -> DT O4 G0004 : score 2.798 : H : HIS ND1 B0505 <- 2.86 -> DG N7 G0007 : score 6.1484 : H : ASP OD2 B0573 <- 3.12 -> DC N4 G0009 : score 5.8032 : H : ASP OD2 B0641 <- 2.78 -> DC N4 G0011 : score 6.2248 : x : ASN xxxx B0436 <- 4.49 -> DG xxx H-009 : score x.xxxxx >4osm_B:Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE S505H MUTANT OF TAL EFFECTOR DHAX3 organism=XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ARMORACIAE : H : ARG NH1 B0266 <- 2.61 -> DG O6 H-003 : score 6.3145 : H : ARG NH2 B0266 <- 2.79 -> DG N7 H-003 : score 6.39738 : H : ASP OD2 B0301 <- 2.93 -> DC N4 G0001 : score 6.0388 : w : ASP OD2 B0301 <- 6.03 -> DG O6 H-002 : score 3.228 : H : ASP OD2 B0335 <- 2.44 -> DC N4 G0002 : score 6.6464 : H : ASP OD2 B0369 <- 2.96 -> DC N4 G0003 : score 6.0016 : w : ASP OD2 B0369 <- 5.32 -> DA N6 H-004 : score 3.409 : H : ASP OD2 B0573 <- 3.11 -> DC N4 G0009 : score 5.8156 : H : ASP OD1 B0641 <- 2.85 -> DC N4 G0011 : score 5.29142 : x : ASN xxxx B0436 <- 4.25 -> DG xxx H-009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0505 <- 3.52 -> DA xxx G0007 : score x.xxxxx >4osq_A:Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE S505R MUTANT OF TAL EFFECTOR DHAX3 organism=? : H : ARG NH1 A0266 <- 3.02 -> DG N7 J-003 : score 5.7838 : H : ARG NH2 A0266 <- 2.73 -> DG O6 J-003 : score 6.6924 : H : ASP OD2 A0301 <- 2.79 -> DC N4 I0001 : score 6.2124 : H : ASP OD2 A0335 <- 2.99 -> DC N4 I0002 : score 5.9644 : H : ASP OD2 A0369 <- 3.11 -> DC N4 I0003 : score 5.8156 : w : ASP OD2 A0369 <- 5.40 -> DA N6 J-004 : score 3.409 : w : ASP OD2 A0369 <- 5.72 -> DT O4 I0004 : score 2.798 : w : ASN ND2 A0436 <- 6.25 -> DA N7 J-008 : score 1.989 : w : ARG NH1 A0505 <- 5.22 -> DA N7 J-008 : score 0.388 : H : ASP OD2 A0573 <- 2.81 -> DC N4 I0009 : score 6.1876 : w : ASP OD2 A0573 <- 5.87 -> DT O4 I0008 : score 2.798 : H : ASP OD2 A0641 <- 2.73 -> DC N4 I0011 : score 6.2868 : w : ASP OD2 A0641 <- 5.97 -> DA N6 J-012 : score 3.409 : x : ASN xxxx A0470 <- 3.56 -> DA xxx J-010 : score x.xxxxx >4osr_A:Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE S505K MUTANT OF TAL EFFECTOR DHAX3 organism=? : H : ARG NH1 A0266 <- 2.94 -> DG N7 J-003 : score 5.8806 : H : ARG NH2 A0266 <- 2.75 -> DG O6 J-003 : score 6.666 : H : ASP OD2 A0301 <- 2.82 -> DC N4 I0001 : score 6.1752 : w : ASP OD2 A0301 <- 5.32 -> DG O6 J-002 : score 3.228 : H : ASP OD2 A0335 <- 2.98 -> DC N4 I0002 : score 5.9768 : H : ASP OD2 A0369 <- 2.94 -> DC N4 I0003 : score 6.0264 : w : ASP OD2 A0369 <- 5.47 -> DA N6 J-004 : score 3.409 : w : ASP OD2 A0369 <- 5.83 -> DT O4 I0004 : score 2.798 : H : LYS NZ A0505 <- 2.75 -> DG O6 I0007 : score 5.83858 : w : LYS NZ A0505 <- 5.45 -> DT O4 I0006 : score 1.7 : H : ASP OD2 A0573 <- 2.79 -> DC N4 I0009 : score 6.2124 : w : ASP OD2 A0573 <- 6.27 -> DA N6 J-010 : score 3.409 : H : ASP OD2 A0641 <- 2.83 -> DC N4 I0011 : score 6.1628 : w : ASP OD2 A0641 <- 6.39 -> DA N6 J-012 : score 3.409 >4oss_B:Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE S505Q MUTANT OF TAL EFFECTOR DHAX3 organism=XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ARMORACIAE : H : ARG NH1 B0266 <- 2.75 -> DG O6 H-003 : score 6.14417 : H : ARG NH2 B0266 <- 3.00 -> DG N7 H-003 : score 6.12923 : H : ASP OD2 B0301 <- 2.97 -> DC N4 G0001 : score 5.9892 : H : ASP OD2 B0335 <- 2.68 -> DC N4 G0002 : score 6.3488 : H : ASP OD2 B0369 <- 2.97 -> DC N4 G0003 : score 5.9892 : H : ASP OD2 B0573 <- 2.97 -> DC N4 G0009 : score 5.9892 : H : ASP OD1 B0641 <- 2.97 -> DC N4 G0011 : score 5.16315 : x : GLN xxxx B0505 <- 2.07 -> DG xxx G0007 : score x.xxxxx >4ost_B:Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE S505C MUTANT OF TAL EFFECTOR DHAX3 organism=XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ARMORACIAE : H : ARG NH1 B0266 <- 2.67 -> DG O6 H-003 : score 6.2415 : H : ARG NH2 B0266 <- 3.01 -> DG N7 H-003 : score 6.11646 : H : ASP OD2 B0301 <- 2.96 -> DC N4 G0001 : score 6.0016 : w : ASP OD2 B0301 <- 5.83 -> DG O6 H-002 : score 3.228 : H : ASP OD2 B0335 <- 2.82 -> DC N4 G0002 : score 6.1752 : H : ASP OD2 B0369 <- 2.92 -> DC N4 G0003 : score 6.0512 : w : ASP OD2 B0369 <- 5.51 -> DA N6 H-004 : score 3.409 : w : ASP OD2 B0369 <- 6.00 -> DT O4 G0004 : score 2.798 : H : ASP OD2 B0573 <- 2.88 -> DC N4 G0009 : score 6.1008 : H : ASP OD1 B0641 <- 2.84 -> DC N4 G0011 : score 5.30211 : x : CYS xxxx B0505 <- 3.33 -> DA xxx G0007 : score x.xxxxx >4osv_A:Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE S505M MUTANT OF TAL EFFECTOR DHAX3 organism=? : H : ARG NH1 A0266 <- 3.00 -> DG N7 J-003 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0266 <- 2.86 -> DG O6 J-003 : score 6.5208 : H : ASP OD2 A0301 <- 2.89 -> DC N4 I0001 : score 6.0884 : w : ASP OD2 A0301 <- 5.43 -> DG O6 J-002 : score 3.228 : H : ASP OD2 A0335 <- 2.90 -> DC N4 I0002 : score 6.076 : H : ASP OD2 A0369 <- 2.88 -> DC N4 I0003 : score 6.1008 : w : ASP OD2 A0369 <- 5.62 -> DA N6 J-004 : score 3.409 : w : ASP OD2 A0369 <- 5.71 -> DT O4 I0004 : score 2.798 : H : ASP OD2 A0573 <- 2.71 -> DC N4 I0009 : score 6.3116 : w : ASP OD2 A0573 <- 5.94 -> DA N6 J-010 : score 3.409 : H : ASP OD2 A0641 <- 3.09 -> DC N4 I0011 : score 5.8404 : x : MET xxxx A0505 <- 3.29 -> DA xxx I0007 : score x.xxxxx >4osw_A:Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE S505E MUTANT OF TAL EFFECTOR DHAX3 organism=? : H : ARG NH1 A0266 <- 2.98 -> DG N7 J-003 : score 5.8322 : H : ARG NH2 A0266 <- 2.91 -> DG O6 J-003 : score 6.4548 : H : ASP OD2 A0301 <- 2.78 -> DC N4 I0001 : score 6.2248 : w : ASP OD2 A0301 <- 5.26 -> DG O6 J-002 : score 3.228 : H : ASP OD2 A0335 <- 2.73 -> DC N4 I0002 : score 6.2868 : H : ASP OD2 A0369 <- 2.93 -> DC N4 I0003 : score 6.0388 : w : ASP OD2 A0369 <- 5.96 -> DA N6 J-004 : score 3.409 : H : GLU OE1 A0505 <- 3.06 -> DA N6 I0007 : score 2.54258 : w : GLU OE2 A0505 <- 6.43 -> DA N6 J-008 : score 2.785 : H : ASP OD2 A0573 <- 2.98 -> DC N4 I0009 : score 5.9768 : w : ASP OD2 A0573 <- 6.25 -> DT O4 I0008 : score 2.798 : H : ASP OD2 A0641 <- 2.88 -> DC N4 I0011 : score 6.1008 >4osz_B:Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE S505P MUTANT OF TAL EFFECTOR DHAX3 organism=XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. 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ARMORACIAE : H : ARG NH1 B0266 <- 2.73 -> DG O6 H-003 : score 6.1685 : H : ARG NH2 B0266 <- 2.97 -> DG N7 H-003 : score 6.16754 : H : ASP OD2 B0301 <- 2.95 -> DC N4 G0001 : score 6.014 : H : ASP OD2 B0335 <- 2.72 -> DC N4 G0002 : score 6.2992 : H : ASP OD2 B0369 <- 3.02 -> DC N4 G0003 : score 5.9272 : H : THR OG1 B0505 <- 3.21 -> DA N7 G0007 : score 3.13415 : H : ASP OD2 B0573 <- 2.87 -> DC N4 G0009 : score 6.1132 : H : ASP OD1 B0641 <- 2.91 -> DC N4 G0011 : score 5.22728 >4ot3_B:Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE S505L MUTANT OF TAL EFFECTOR DHAX3 organism=XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. ARMORACIAE : H : ARG NH1 B0266 <- 2.78 -> DG O6 H-003 : score 6.10767 : H : ARG NH2 B0266 <- 3.05 -> DG N7 H-003 : score 6.06538 : H : ASP OD2 B0301 <- 3.11 -> DC N4 G0001 : score 5.8156 : w : ASP OD2 B0301 <- 5.99 -> DG O6 H-002 : score 3.228 : H : ASP OD2 B0335 <- 2.59 -> DC N4 G0002 : score 6.4604 : H : ASP OD2 B0369 <- 2.80 -> DC N4 G0003 : score 6.2 : w : ASP OD2 B0369 <- 5.82 -> DA N6 H-004 : score 3.409 : w : ASP OD2 B0369 <- 5.87 -> DT O4 G0004 : score 2.798 : H : ASP OD2 B0573 <- 2.93 -> DC N4 G0009 : score 6.0388 : w : ASP OD2 B0573 <- 5.64 -> DT O4 G0010 : score 2.798 : H : ASP OD1 B0641 <- 2.82 -> DC N4 G0011 : score 5.32349 : x : LEU xxxx B0505 <- 2.99 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx >4oto_B:Thiolase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE S505W MUTANT OF TAL EFFECTOR DHAX3 organism=XANTHOMONAS CAMPESTRIS PV. 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RECEPTOR 2 DBD HELIX MUTANT - SRE DNA COMPLEX organism=synthetic construct : H : ARG NH1 A0033 <- 3.26 -> DG N7 I0013 : score 5.4934 : H : ARG NH2 A0033 <- 2.82 -> DG O6 I0013 : score 6.5736 : x : LYS xxxx A0028 <- 3.15 -> DG xxx J0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0029 <- 4.17 -> DG xxx I0013 : score x.xxxxx >4ov7_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCESTRAL STEROID RECEPTOR 2 DBD HELIX MUTANT - SRE DNA COMPLEX organism=synthetic construct : H : ARG NH1 A0033 <- 3.26 -> DG N7 I0013 : score 5.4934 : H : ARG NH2 A0033 <- 2.82 -> DG O6 I0013 : score 6.5736 : H : LYS NZ B0028 <- 2.97 -> DG N7 I0004 : score 5.20278 : H : ARG NH1 B0033 <- 3.17 -> DG N7 J0013 : score 5.6023 : H : ARG NH2 B0033 <- 2.67 -> DG O6 J0013 : score 6.7716 : x : LYS xxxx A0028 <- 3.15 -> DG xxx J0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0029 <- 4.17 -> DG xxx I0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0029 <- 3.76 -> DT xxx J0014 : score x.xxxxx >4ov7_EF:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCESTRAL STEROID RECEPTOR 2 DBD HELIX MUTANT - SRE DNA COMPLEX organism=synthetic construct : H : ARG NH1 E0033 <- 3.13 -> DG N7 K0013 : score 5.6507 : H : ARG NH2 E0033 <- 2.67 -> DG O6 K0013 : score 6.7716 : H : LYS NZ F0028 <- 3.30 -> DG N7 K0004 : score 4.84731 : H : ARG NH1 F0033 <- 3.09 -> DG N7 L0013 : score 5.6991 : H : ARG NH2 F0033 <- 2.58 -> DG O6 L0013 : score 6.8904 : w : ARG NH2 F0033 <- 6.49 -> DA N6 K0006 : score 1.997 : x : LYS xxxx E0028 <- 3.21 -> DG xxx L0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0029 <- 4.08 -> DT xxx K0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0029 <- 3.45 -> DT xxx L0014 : score x.xxxxx >4p0p_A:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MUS81-EME1 IN COMPLEX WITH 5'-FLAP DNA, AND MG2+ organism=HOMO SAPIENS : x : ILE xxxx A0344 <- 3.49 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0345 <- 3.51 -> DT xxx G0038 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0379 <- 4.05 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0383 <- 4.10 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0530 <- 4.09 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx >4p0p_AB:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MUS81-EME1 IN COMPLEX WITH 5'-FLAP DNA, AND MG2+ organism=HOMO SAPIENS : x : ILE xxxx A0344 <- 3.49 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0345 <- 3.51 -> DT xxx G0038 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0379 <- 4.05 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0383 <- 4.10 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0530 <- 4.09 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx >4p0q_AB:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MUS81-EME1 IN COMPLEX WITH 5'-FLAP DNA organism=HOMO SAPIENS : x : ILE xxxx A0344 <- 3.67 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0345 <- 3.98 -> DT xxx G0038 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0379 <- 4.00 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0383 <- 4.25 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0530 <- 4.44 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx >4p2h_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE COMPLEXED WITH N7MG IN THE TEMPLATE OPPOSITE TO INCOMING NON-HYDROLYZABLE TTP WITH MANGANESE IN THE ACTIVE SITE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.25 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.63 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.57 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4p4m_A:Nucleotidyltransferase;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LEISHMANIA INFANTUM POLYMERASE BETA: TERNARY P/T COMPLEX organism=Leishmania infantum : w : GLN OE1 A0138 <- 6.01 -> DT O2 E0010 : score 2.481 : w : GLN NE2 A0138 <- 6.70 -> DG N2 D0003 : score 1.484 : H : LYS NZ A0241 <- 3.18 -> DC O2 E0009 : score 2.72225 : w : LYS NZ A0241 <- 5.27 -> DT O2 D0004 : score 0.522 : w : LYS NZ A0241 <- 5.94 -> DA N3 E0008 : score 1.538 : w : MET SD A0243 <- 6.15 -> DT O2 D0004 : score 3.645 : H : ARG NH1 A0298 <- 3.27 -> DT O2 E0007 : score 3.90161 : w : ARG NH1 A0298 <- 5.99 -> DT O2 E0007 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0298 <- 6.04 -> DT O2 E0007 : score 2.261 : w : GLU OE1 A0310 <- 5.56 -> DT O2 E0007 : score 2.462 >4p4o_A:Nucleotidyltransferase;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LEISHMANIA INFANTUM POLYMERASE BETA: TERNARY GAP COMPLEX organism=Leishmania infantum : w : GLN NE2 A0138 <- 5.78 -> DT O2 E0004 : score 1.565 : w : LYS NZ A0241 <- 6.18 -> DT O2 F0007 : score 0.522 : w : ARG NH1 A0273 <- 6.47 -> DT O2 F0007 : score 1.855 : w : ARG NH1 A0298 <- 6.05 -> DA N3 F0006 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0298 <- 6.15 -> DA N3 F0006 : score 2.092 : w : GLU OE1 A0310 <- 5.89 -> DA N3 F0006 : score 0.995 : w : GLU OE2 A0310 <- 5.98 -> DT O2 F0007 : score 2.279 >4p4p_A:Nucleotidyltransferase;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LEISHMANIA INFANTUM POLYMERASE BETA: NICK COMPLEX organism=Leishmania infantum : w : GLN NE2 A0138 <- 5.80 -> DC O2 B0009 : score 2.699 : w : LYS NZ A0241 <- 5.71 -> DA N3 B0008 : score 1.538 : w : ARG NH2 A0273 <- 5.61 -> DC O2 C0006 : score 1.669 : H : ASN ND2 A0294 <- 2.96 -> DT O2 C0007 : score 4.59428 : H : ARG NH1 A0298 <- 2.86 -> DA N3 B0005 : score 3.63787 : w : ARG NH1 A0298 <- 6.08 -> DG N3 B0006 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0298 <- 6.00 -> DG N3 B0006 : score 0.677 : w : GLU OE1 A0310 <- 5.59 -> DG N3 B0006 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0310 <- 5.78 -> DT O2 B0007 : score 2.279 : x : LYS xxxx A0032 <- 3.72 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0286 <- 4.24 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0291 <- 3.67 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0295 <- 3.77 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx >4p9u_F:GntR_ligand-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=FADR, FATTY ACID RESPONSIVE TRANSCRIPTION FACTOR FROM VIBRIO CHOLERAE, IN COMPLEX WITH DNA organism=Vibrio cholerae : H : ARG NH1 F0035 <- 3.02 -> DG N7 G0012 : score 5.7838 : H : ARG NH2 F0035 <- 3.05 -> DG O6 G0012 : score 6.27 : H : ARG NH1 F0045 <- 3.23 -> DG O6 G0013 : score 5.56017 : H : ARG NH2 F0045 <- 3.00 -> DG N7 G0013 : score 6.12923 : H : THR OG1 F0046 <- 2.53 -> DT O4 H0016 : score 4.09709 : x : GLU xxxx F0034 <- 4.49 -> DG xxx G0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0044 <- 3.05 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0047 <- 4.26 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0049 <- 3.57 -> DT xxx G0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0050 <- 4.08 -> DT xxx H0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0065 <- 3.89 -> DA xxx H0021 : score x.xxxxx >4par_AD: title=THE 5-HYDROXYMETHYLCYTOSINE-SPECIFIC RESTRICTION ENZYME ABASI IN A COMPLEX WITH PRODUCT-LIKE DNA organism=Acinetobacter baumannii : H : GLN OE1 A0209 <- 2.46 -> DG N2 H0038 : score 5.98902 >4par_BC: title=THE 5-HYDROXYMETHYLCYTOSINE-SPECIFIC RESTRICTION ENZYME ABASI IN A COMPLEX WITH PRODUCT-LIKE DNA organism=Acinetobacter baumannii : H : GLN NE2 C0209 <- 2.68 -> DT O2 f0003 : score 4.02773 >4pba_ABCD: title=THE 5-HYDROXYMETHYLCYTOSINE-SPECIFIC RESTRICTION ENZYME ABASI IN A COMPLEX WITH SUBSTRATE-LIKE DNA organism=Acinetobacter baumannii : H : GLN NE2 A0209 <- 2.99 -> DT O2 F0030 : score 3.78387 : x : GLN xxxx C0209 <- 2.92 -> DT xxx E0020 : score x.xxxxx >4pba_C: title=THE 5-HYDROXYMETHYLCYTOSINE-SPECIFIC RESTRICTION ENZYME ABASI IN A COMPLEX WITH SUBSTRATE-LIKE DNA organism=Acinetobacter baumannii : x : GLN xxxx C0209 <- 2.92 -> DT xxx E0020 : score x.xxxxx >4pcb_AC:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=CONJUGATIVE RELAXASE TRWC IN COMPLEX WITH MUTANT ORIT DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : HIS NE2 C0004 <- 2.96 -> DA N3 D0019 : score 4.11028 : H : ARG NH2 C0075 <- 2.72 -> DA N3 D0005 : score 3.29158 : H : ARG NH1 C0081 <- 3.00 -> DG O6 D0017 : score 5.84 : H : ARG NH2 C0081 <- 2.59 -> DG N7 D0017 : score 6.65277 : H : SER OG C0089 <- 3.18 -> DG N3 D0025 : score 2.56114 : H : ARG NH1 C0128 <- 2.99 -> DG O6 D0015 : score 5.85217 : H : GLN NE2 C0159 <- 2.91 -> DT O2 D0023 : score 3.8468 : H : ASP OD1 C0183 <- 3.19 -> DG N2 D0017 : score 4.7483 : H : ASN ND2 C0218 <- 2.58 -> DT O2 D0021 : score 4.95498 : H : LYS NZ C0262 <- 3.32 -> DG O6 D0025 : score 5.17957 >4pcb_C:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=CONJUGATIVE RELAXASE TRWC IN COMPLEX WITH MUTANT ORIT DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : HIS NE2 C0004 <- 2.96 -> DA N3 D0019 : score 4.11028 : H : ARG NH2 C0075 <- 2.72 -> DA N3 D0005 : score 3.29158 : H : ARG NH1 C0081 <- 3.00 -> DG O6 D0017 : score 5.84 : H : ARG NH2 C0081 <- 2.59 -> DG N7 D0017 : score 6.65277 : H : SER OG C0089 <- 3.18 -> DG N3 D0025 : score 2.56114 : H : ARG NH1 C0128 <- 2.99 -> DG O6 D0015 : score 5.85217 : H : GLN NE2 C0159 <- 2.91 -> DT O2 D0023 : score 3.8468 : H : ASP OD1 C0183 <- 3.19 -> DG N2 D0017 : score 4.7483 : H : ASN ND2 C0218 <- 2.58 -> DT O2 D0021 : score 4.95498 : H : LYS NZ C0262 <- 3.32 -> DG O6 D0025 : score 5.17957 >4pcz_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN R247G LLFPG MUTANT AND A THF CONTAINING DNA organism=Lactococcus lactis subsp. cremoris : H : ARG NH1 A0074 <- 2.89 -> DT O2 B0008 : score 4.22889 : w : ARG NH1 A0074 <- 6.57 -> DT O2 B0009 : score 1.855 : w : ARG NH1 A0074 <- 6.03 -> DA N3 C0022 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0074 <- 6.23 -> DT O2 B0009 : score 2.261 : w : GLU OE1 A0076 <- 6.19 -> DT O2 B0006 : score 2.462 : w : GLU OE1 A0076 <- 5.24 -> DT O2 B0006 : score 2.462 : H : ARG NE A0109 <- 2.78 -> DC O2 C0023 : score 2.66961 : H : ARG NH2 A0109 <- 3.01 -> DC N3 C0023 : score 2.1948 : w : ARG NH1 A0109 <- 6.27 -> DT O2 B0006 : score 1.855 : x : MET xxxx A0075 <- 3.42 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.35 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.40 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >4pd2_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN A C248GH LLFPG MUTANT AND A THF CONTAINING DNA organism=Lactococcus lactis subsp. cremoris : H : ARG NH1 A0074 <- 2.93 -> DT O2 B0008 : score 4.19444 : H : ARG NH1 A0074 <- 2.93 -> DT O2 B0008 : score 4.19444 : w : ARG NH1 A0074 <- 5.81 -> DT O2 B0009 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0074 <- 6.08 -> DT O2 B0009 : score 2.261 : H : ARG NE A0109 <- 2.72 -> DC O2 C0023 : score 2.70152 : H : ARG NH2 A0109 <- 3.04 -> DC N3 C0023 : score 2.18106 : w : ARG NH2 A0109 <- 5.88 -> DT O4 B0006 : score 2.366 : x : MET xxxx A0075 <- 3.38 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0076 <- 4.47 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.32 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0261 <- 3.43 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >4pdg_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN AN INHIBITED LLFPG AND A THF CONTAINING DNA organism=Lactococcus lactis subsp. cremoris : H : ARG NH1 A0074 <- 2.63 -> DT O2 B0008 : score 4.45283 : w : ARG NH2 A0074 <- 6.48 -> DT O2 B0009 : score 2.261 : H : ARG NE A0109 <- 2.57 -> DC O2 C0023 : score 2.78129 : H : ARG NH2 A0109 <- 2.88 -> DC N3 C0023 : score 2.25437 : x : MET xxxx A0075 <- 3.42 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.17 -> DC xxx C0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.44 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >4pdi_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN AN INHIBITED LLFPG AND A N7- BENZYL-FAPY-DG CONTAINING DNA organism=Lactococcus lactis subsp. cremoris : H : ARG NH1 A0074 <- 2.84 -> DT O2 B0008 : score 4.27196 : w : ARG NH1 A0074 <- 6.21 -> DT O2 B0009 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0074 <- 6.21 -> DT O2 B0009 : score 2.261 : H : ARG NE A0109 <- 2.72 -> DC O2 C0023 : score 2.70152 : H : ARG NH2 A0109 <- 2.99 -> DC N3 C0023 : score 2.20397 : x : MET xxxx A0075 <- 3.49 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.38 -> DC xxx C0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.54 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >4pei_D:Metallo-dependent_phosphatases; title=DBR1 IN COMPLEX WITH SYNTHETIC BRANCHED RNA ANALOG organism=Entamoeba histolytica : x : HIS xxxx D0016 <- 2.71 -> A xxx Y0501 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0047 <- 3.12 -> A xxx Y0501 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0060 <- 4.17 -> A xxx Y0501 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0064 <- 3.35 -> A xxx Y0501 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0091 <- 3.39 -> A xxx Y0501 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0249 <- 2.89 -> A xxx Y0501 : score x.xxxxx >4pgq_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH G IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE TTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.27 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.80 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.64 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4pgx_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH G IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE TTP AND MANGANESE organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 6.40 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.79 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0234 <- 5.85 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : H : TYR OH A0271 <- 2.73 -> DA N3 P0010 : score 4.2094 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.79 -> DT O2 T0007 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.00 -> DT O2 T0007 : score 2.261 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.46 -> DT O2 T0007 : score 2.462 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.66 -> DC O2 T0008 : score 1.988 >4pgy_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH A NICKED DNA CONTAINING A GT AT N-1 POSITION AND GC AT N POSITION organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.33 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.65 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.42 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4ph5_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH A NICKED DNA CONTAINING A AC AT N-1 POSITION AND GC AT N POSITION organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0037 <- 5.89 -> DG N7 T0006 : score 3.259 : H : LYS NZ A0234 <- 2.79 -> DG N3 T0009 : score 1.45675 : w : LYS NZ A0234 <- 6.05 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : TYR OH A0271 <- 2.86 -> DC O2 P0010 : score 3.45547 : w : TYR OH A0271 <- 5.77 -> DC O2 T0008 : score 1.343 : H : ASN ND2 A0279 <- 3.00 -> DC O2 P0011 : score 4.30031 : x : PHE xxxx A0272 <- 4.41 -> DC xxx P0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0276 <- 3.56 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.33 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0283 <- 3.42 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >4pha_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH A IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE CTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.29 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.82 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.66 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4phd_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH A IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE CTP AND MANGANESE organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 2.90 -> DG N3 T0009 : score 1.42477 : x : TYR xxxx A0271 <- 3.24 -> DA xxx P0010 : score x.xxxxx >4phe_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH T IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE GTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.35 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.78 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.51 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4php_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH T IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE GTP AND MANGANESE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.27 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.13 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.76 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4plb_BD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S.A. GYRASE-AM8191 COMPLEX organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : x : ARG xxxx B0458 <- 3.94 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0460 <- 3.43 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1085 <- 3.56 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1092 <- 3.82 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1122 <- 4.44 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1175 <- 3.45 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0458 <- 3.81 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0460 <- 3.34 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1033 <- 4.42 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D1085 <- 3.31 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1122 <- 4.26 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D1175 <- 3.37 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx >4plb_D:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S.A. GYRASE-AM8191 COMPLEX organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : x : ARG xxxx D0458 <- 3.81 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0460 <- 3.34 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1033 <- 4.42 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D1085 <- 3.31 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1122 <- 4.26 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D1175 <- 3.37 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx >4pog_AEF:Nucleic_acid-binding_proteins; title=MCM-SSDNA CO-CRYSTAL STRUCTURE organism=Pyrococcus furiosus : H : ARG NH2 E0124 <- 3.34 -> DT O2 X0007 : score 3.77613 : H : ARG NH1 E0186 <- 3.14 -> DT O2 X0006 : score 4.01357 : H : ARG NH2 E0186 <- 2.67 -> DT O2 X0006 : score 4.3434 : H : ARG NH2 F0124 <- 2.77 -> DT O2 X0003 : score 4.25873 : H : ARG NH1 F0186 <- 3.15 -> DT O2 X0002 : score 4.00496 : H : ARG NH2 F0186 <- 2.96 -> DT O2 X0002 : score 4.09787 : x : GLU xxxx A0127 <- 2.90 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0129 <- 3.86 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0199 <- 4.46 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0201 <- 3.87 -> DT xxx X0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0202 <- 3.17 -> DT xxx X0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0241 <- 4.43 -> DT xxx X0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0127 <- 2.93 -> DT xxx X0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0129 <- 4.10 -> DT xxx X0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0201 <- 3.30 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0202 <- 3.14 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx >4pog_BCD:Nucleic_acid-binding_proteins; title=MCM-SSDNA CO-CRYSTAL STRUCTURE organism=Pyrococcus furiosus : H : ARG NH1 C0186 <- 3.12 -> DT O2 Z0002 : score 4.0308 : H : ARG NH2 C0186 <- 2.67 -> DT O2 Z0002 : score 4.3434 : x : ARG xxxx B0124 <- 3.50 -> DT xxx Z0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0186 <- 3.46 -> DT xxx Z0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0199 <- 4.10 -> DT xxx Z0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0201 <- 3.73 -> DT xxx Z0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0202 <- 3.12 -> DT xxx Z0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0124 <- 3.36 -> DT xxx Z0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0127 <- 3.16 -> DT xxx Z0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0129 <- 4.43 -> DT xxx Z0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0201 <- 4.19 -> DT xxx Z0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0202 <- 3.17 -> DT xxx Z0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0233 <- 3.75 -> DT xxx Z0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0241 <- 4.35 -> DT xxx Z0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0127 <- 2.91 -> DT xxx Z0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0129 <- 4.01 -> DT xxx Z0001 : score x.xxxxx >4pog_GHI:Nucleic_acid-binding_proteins; title=MCM-SSDNA CO-CRYSTAL STRUCTURE organism=Pyrococcus furiosus : H : ARG NH2 H0124 <- 3.01 -> DT O2 Y0007 : score 4.05553 : H : ARG NH1 H0186 <- 3.01 -> DT O2 Y0006 : score 4.12554 : H : ARG NH2 H0186 <- 2.95 -> DT O2 Y0006 : score 4.10633 : H : ARG NH1 I0186 <- 3.01 -> DT O2 Y0002 : score 4.12554 : H : ARG NH2 I0186 <- 2.72 -> DT O2 Y0002 : score 4.30107 : V : GLU CB H0127 <- 3.55 -> DT C7 Y0009 : score 1.72942 : x : ARG xxxx G0186 <- 3.60 -> DT xxx Y0010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0199 <- 3.47 -> DT xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0201 <- 4.14 -> DT xxx Y0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0202 <- 3.16 -> DT xxx Y0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0129 <- 3.81 -> DT xxx Y0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx H0199 <- 3.65 -> DT xxx Y0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0201 <- 3.87 -> DT xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0202 <- 3.47 -> DT xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0241 <- 4.46 -> DT xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0124 <- 3.82 -> DT xxx Y0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0127 <- 3.17 -> DT xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0129 <- 4.15 -> DT xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx I0199 <- 3.69 -> DT xxx Y0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0201 <- 3.58 -> DT xxx Y0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0202 <- 3.09 -> DT xxx Y0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0233 <- 4.21 -> DT xxx Y0003 : score x.xxxxx >4pog_H:Nucleic_acid-binding_proteins; title=MCM-SSDNA CO-CRYSTAL STRUCTURE organism=Pyrococcus furiosus : H : ARG NH2 H0124 <- 3.01 -> DT O2 Y0007 : score 4.05553 : H : ARG NH1 H0186 <- 3.01 -> DT O2 Y0006 : score 4.12554 : H : ARG NH2 H0186 <- 2.95 -> DT O2 Y0006 : score 4.10633 : V : GLU CB H0127 <- 3.55 -> DT C7 Y0009 : score 1.72942 : x : LYS xxxx H0129 <- 3.81 -> DT xxx Y0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx H0199 <- 3.65 -> DT xxx Y0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0201 <- 3.87 -> DT xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0202 <- 3.47 -> DT xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0241 <- 4.46 -> DT xxx Y0005 : score x.xxxxx >4pog_KL:Nucleic_acid-binding_proteins; title=MCM-SSDNA CO-CRYSTAL STRUCTURE organism=Pyrococcus furiosus : H : ARG NH1 K0186 <- 3.05 -> DT O2 V0002 : score 4.09109 : H : ARG NH2 K0186 <- 3.16 -> DT O2 V0002 : score 3.92853 : x : ARG xxxx K0124 <- 3.47 -> DT xxx V0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0201 <- 3.66 -> DT xxx V0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx K0202 <- 3.34 -> DT xxx V0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx K0233 <- 3.14 -> DT xxx V0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0127 <- 3.09 -> DT xxx V0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0129 <- 4.07 -> DT xxx V0001 : score x.xxxxx >4ppx_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA E295K WITH SPIROIMINODIHYDANTOIN IN TEMPLATING POSITION organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.27 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.65 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.42 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4pqu_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH RNA/DNA AND DATP organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.43 -> DC O2 P0821 : score 3.75625 : H : GLN NE2 A0475 <- 3.07 -> DC O2 P0807 : score 3.49535 : x : TYR xxxx A0115 <- 4.29 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.65 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx >4pqu_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH RNA/DNA AND DATP organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH C0183 <- 2.79 -> DC O2 F0821 : score 3.50443 : x : TYR xxxx C0115 <- 3.91 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.89 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.33 -> DC xxx F0807 : score x.xxxxx >4pso_ABCD:FMN-linked_oxidoreductases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF APETHERMO-DBP-RP2 BOUND TO SSDNA DT10 organism=Aeropyrum pernix : H : GLN NE2 A0025 <- 3.46 -> DT O2 L0007 : score 3.41413 : H : ASN ND2 A0037 <- 3.11 -> DT O4 L0002 : score 4.95697 : H : ARG NE B0005 <- 2.46 -> DT O4 L0007 : score 1.98538 : w : GLN NE2 B0025 <- 5.81 -> DT N3 L0008 : score 0.872 >4pso_B:FMN-linked_oxidoreductases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF APETHERMO-DBP-RP2 BOUND TO SSDNA DT10 organism=Aeropyrum pernix : H : ARG NE B0005 <- 2.46 -> DT O4 L0007 : score 1.98538 : w : GLN NE2 B0025 <- 5.81 -> DT N3 L0008 : score 0.872 >4pso_FH:FMN-linked_oxidoreductases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF APETHERMO-DBP-RP2 BOUND TO SSDNA DT10 organism=Aeropyrum pernix : V : ARG CB F0005 <- 3.78 -> DT C7 X0007 : score 1.01015 >4ptf_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY CRYSTAL STRUCTURE OF YEAST DNA POLYMERASE EPSILON WITH TEMPLATE G organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0967 <- 3.07 -> DA N3 P0011 : score 2.62697 : H : ARG NH1 A0988 <- 3.19 -> DC O2 P0009 : score 3.3653 : H : ARG NH2 A0988 <- 3.09 -> DC O2 P0008 : score 3.48419 >4pu3_ABCD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=SHEWANELLA ONEIDENSIS MR-1 TOXIN ANTITOXIN SYSTEM HIPA, HIPB AND ITS OPERATOR DNA COMPLEX (SPACE GROUP P212121) organism=SHEWANELLA ONEIDENSIS : H : LYS NZ C0055 <- 3.31 -> DG O6 P0005 : score 5.19113 : x : THR xxxx D0054 <- 4.06 -> DT xxx P0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0055 <- 3.38 -> DT xxx Q0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0056 <- 3.30 -> DT xxx Q0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0059 <- 3.34 -> DT xxx Q0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0068 <- 4.16 -> DA xxx Q0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0044 <- 4.16 -> DA xxx P0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0054 <- 3.56 -> DA xxx Q0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0056 <- 3.28 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0059 <- 3.69 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0068 <- 3.95 -> DT xxx P0013 : score x.xxxxx >4pu3_C:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=SHEWANELLA ONEIDENSIS MR-1 TOXIN ANTITOXIN SYSTEM HIPA, HIPB AND ITS OPERATOR DNA COMPLEX (SPACE GROUP P212121) organism=SHEWANELLA ONEIDENSIS : H : LYS NZ C0055 <- 3.31 -> DG O6 P0005 : score 5.19113 : x : GLN xxxx C0044 <- 4.16 -> DA xxx P0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0054 <- 3.56 -> DA xxx Q0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0056 <- 3.28 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0059 <- 3.69 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0068 <- 3.95 -> DT xxx P0013 : score x.xxxxx >4pu4_ABCD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=SHEWANELLA ONEIDENSIS MR-1 TOXIN ANTITOXIN SYSTEM HIPA, HIPB AND ITS OPERATOR DNA COMPLEX (SPACE GROUP P21) organism=SHEWANELLA ONEIDENSIS : x : GLN xxxx D0045 <- 4.38 -> DG xxx Q0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0055 <- 4.23 -> DC xxx P0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0057 <- 3.30 -> DT xxx Q0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0069 <- 4.12 -> DT xxx P0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0045 <- 3.03 -> DA xxx P0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0055 <- 3.18 -> DA xxx Q0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0056 <- 3.26 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0057 <- 3.38 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0060 <- 3.14 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0069 <- 3.30 -> DT xxx P0013 : score x.xxxxx >4puo_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH RNA/DNA AND NEVIRAPINE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.47 -> DT O2 P0806 : score 4.59063 : H : GLN NE2 A0475 <- 2.89 -> DC O2 P0808 : score 3.62836 >4puo_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH RNA/DNA AND NEVIRAPINE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : x : GLN xxxx C0475 <- 3.13 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >4pw5_AB:PUA_domain-like; title=STRUCTURE OF UHRF2-SRA IN COMPLEX WITH A 5HMC-CONTAINING DNA, COMPLEX I organism=Homo sapiens : H : GLU OE2 B0498 <- 2.96 -> DC N4 C0001 : score 5.09689 : x : VAL xxxx A0475 <- 3.67 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0492 <- 3.25 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0495 <- 4.00 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0507 <- 3.31 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0508 <- 3.83 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx >4pw5_EF:PUA_domain-like; title=STRUCTURE OF UHRF2-SRA IN COMPLEX WITH A 5HMC-CONTAINING DNA, COMPLEX I organism=Homo sapiens : H : GLU OE2 F0498 <- 3.07 -> DC N4 G0001 : score 4.98105 : x : VAL xxxx E0475 <- 3.65 -> DC xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0492 <- 3.28 -> DC xxx G0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0495 <- 3.98 -> DC xxx G0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0507 <- 3.32 -> DC xxx G0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0508 <- 3.84 -> DC xxx G0001 : score x.xxxxx >4pw6_A:PUA_domain-like; title=STRUCTURE OF UHRF2-SRA IN COMPLEX WITH A 5HMC-CONTAINING DNA, COMPLEX II organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0474 <- 3.95 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0475 <- 3.37 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx >4pw6_AB:PUA_domain-like; title=STRUCTURE OF UHRF2-SRA IN COMPLEX WITH A 5HMC-CONTAINING DNA, COMPLEX II organism=Homo sapiens : H : GLU OE2 B0498 <- 2.46 -> DC N4 D0006 : score 5.62343 : x : HIS xxxx A0474 <- 3.95 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0475 <- 3.37 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0474 <- 3.64 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0475 <- 3.36 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0492 <- 3.19 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0495 <- 3.86 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0507 <- 3.28 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0508 <- 4.37 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx >4pw7_AB:PUA_domain-like; title=STRUCTURE OF UHRF2-SRA IN COMPLEX WITH A 5MC-CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0520 <- 2.72 -> DG N3 D0007 : score 3.66802 : x : VAL xxxx A0475 <- 3.71 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0521 <- 4.24 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx >4pw7_E:PUA_domain-like; title=STRUCTURE OF UHRF2-SRA IN COMPLEX WITH A 5MC-CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 E0520 <- 2.67 -> DG N3 H0007 : score 3.70412 : x : VAL xxxx E0475 <- 3.50 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E0521 <- 4.26 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx >4pw7_EF:PUA_domain-like; title=STRUCTURE OF UHRF2-SRA IN COMPLEX WITH A 5MC-CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 E0520 <- 2.67 -> DG N3 H0007 : score 3.70412 : x : VAL xxxx E0475 <- 3.50 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E0521 <- 4.26 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx >4pwd_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH BULGE-RNA/DNA AND NEVIRAPINE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : GLN NE2 A0475 <- 3.15 -> DC O2 P0808 : score 3.43623 : x : MET xxxx A0230 <- 3.93 -> DC xxx P0820 : score x.xxxxx >4pwd_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH BULGE-RNA/DNA AND NEVIRAPINE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : x : MET xxxx C0230 <- 3.78 -> DC xxx F0820 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 2.95 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >4pxi_ABCD:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=ELUCIDATION OF THE STRUCTURAL AND FUNCTIONAL MECHANISM OF ACTION OF THE TETR FAMILY PROTEIN, CPRB FROM S. COELICOLOR A3(2) organism=STREPTOMYCES COELICOLOR : H : LYS NZ D0043 <- 2.78 -> DT O4 E0018 : score 3.60153 : x : TYR xxxx A0047 <- 3.97 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0042 <- 4.19 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0043 <- 2.96 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0047 <- 3.53 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0048 <- 3.27 -> DA xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0006 <- 4.27 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0042 <- 3.82 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0043 <- 3.27 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0047 <- 2.93 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0048 <- 3.63 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0047 <- 3.50 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx >4pxi_B:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=ELUCIDATION OF THE STRUCTURAL AND FUNCTIONAL MECHANISM OF ACTION OF THE TETR FAMILY PROTEIN, CPRB FROM S. COELICOLOR A3(2) organism=STREPTOMYCES COELICOLOR : x : THR xxxx B0042 <- 4.19 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0043 <- 2.96 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0047 <- 3.53 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0048 <- 3.27 -> DA xxx F0004 : score x.xxxxx >4py5_A:Ribonuclease_H-like; title=THERMOVIBRIO AMMONIFICANS RNASE H3 IN COMPLEX WITH 19-MER RNA/DNA organism=THERMOVIBRIO AMMONIFICANS : w : TYR OH A0043 <- 5.74 -> DT O2 C0005 : score 3.068 : H : LYS NZ A0082 <- 3.08 -> DC O2 C0015 : score 2.78117 : w : LYS NZ A0082 <- 5.73 -> DG N2 C0014 : score 0.846 : w : ASN ND2 A0154 <- 5.93 -> DA N3 C0016 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0241 <- 3.08 -> DC O2 C0013 : score 4.22864 >4pzi_A: title=ZINC FINGER REGION OF MLL2 IN COMPLEX WITH CPG DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0962 <- 2.67 -> DC O2 C0005 : score 3.7449 : H : ARG NH2 A0962 <- 3.21 -> DC O2 C0005 : score 3.39542 : H : LYS NZ A0997 <- 2.77 -> DG N7 B0007 : score 5.41821 : H : LYS NZ A0997 <- 3.07 -> DG O6 B0008 : score 5.46861 : H : GLN NE2 A0998 <- 2.95 -> DG O6 C0007 : score 5.63097 : w : GLN OE1 A0998 <- 5.43 -> DG N7 C0007 : score 2.87 >4q0b_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH GAP- RNA/DNA AND NEVIRAPINE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.65 -> DT O2 P0806 : score 4.36033 : H : GLN NE2 A0475 <- 3.38 -> DC O2 P0808 : score 3.26627 >4q0b_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH GAP- RNA/DNA AND NEVIRAPINE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.65 -> DT O2 P0806 : score 4.36033 : H : GLN NE2 A0475 <- 3.38 -> DC O2 P0808 : score 3.26627 >4q0b_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH GAP- RNA/DNA AND NEVIRAPINE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : x : MET xxxx C0230 <- 4.48 -> DC xxx F0820 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.29 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >4q0w_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=HE CATALYTIC CORE OF RAD2 IN COMPLEX WITH DNA SUBSTRATE (COMPLEX II) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : GLN NE2 A0037 <- 2.88 -> DT O2 C0001 : score 3.8704 : V : LYS CG A0040 <- 3.79 -> DT C7 C0001 : score 2.12427 : x : ILE xxxx A0033 <- 3.79 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0036 <- 3.58 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0041 <- 3.28 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx >4q0w_AB:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=HE CATALYTIC CORE OF RAD2 IN COMPLEX WITH DNA SUBSTRATE (COMPLEX II) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : GLN NE2 A0037 <- 2.88 -> DT O2 C0001 : score 3.8704 : w : GLN NE2 B0037 <- 5.78 -> DA N3 D0002 : score 1.888 : V : LYS CG A0040 <- 3.79 -> DT C7 C0001 : score 2.12427 : x : ILE xxxx A0033 <- 3.79 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0036 <- 3.58 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0041 <- 3.28 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0033 <- 4.44 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0036 <- 3.84 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx >4q0z_AB:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=THE CATALYTIC CORE OF RAD2 IN COMPLEX WITH DNA SUBSTRATE (COMPLEX III) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : GLN NE2 A0037 <- 2.62 -> DC O2 D0001 : score 3.82789 : x : TYR xxxx A0036 <- 3.90 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0040 <- 3.44 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0041 <- 3.34 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0036 <- 3.85 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0037 <- 3.30 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0040 <- 3.63 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0041 <- 3.56 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx >4q0z_EF:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=THE CATALYTIC CORE OF RAD2 IN COMPLEX WITH DNA SUBSTRATE (COMPLEX III) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : GLN NE2 E0037 <- 3.21 -> DC O2 H0001 : score 3.39189 : H : GLN NE2 F0037 <- 2.97 -> DG N3 G0001 : score 4.80647 : x : TYR xxxx E0036 <- 3.65 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0040 <- 3.32 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0041 <- 3.80 -> DG xxx G0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0036 <- 3.96 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0040 <- 3.53 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0041 <- 3.64 -> DC xxx H0015 : score x.xxxxx >4q0z_F:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=THE CATALYTIC CORE OF RAD2 IN COMPLEX WITH DNA SUBSTRATE (COMPLEX III) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : GLN NE2 F0037 <- 2.97 -> DG N3 G0001 : score 4.80647 : x : TYR xxxx F0036 <- 3.96 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0040 <- 3.53 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0041 <- 3.64 -> DC xxx H0015 : score x.xxxxx >4q10_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=THE CATALYTIC CORE OF RAD2 IN COMPLEX WITH DNA SUBSTRATE (COMPLEX IV) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : GLN xxxx A0037 <- 3.16 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0040 <- 3.98 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0041 <- 3.67 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx >4q10_AB:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=THE CATALYTIC CORE OF RAD2 IN COMPLEX WITH DNA SUBSTRATE (COMPLEX IV) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : GLN xxxx A0037 <- 3.16 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0040 <- 3.98 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0041 <- 3.67 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0036 <- 3.64 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0037 <- 3.52 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0040 <- 3.56 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0041 <- 3.88 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx >4q43_F:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=POLYMERASE-DAMAGED DNA COMPLEX organism=Escherichia coli : x : GLU xxxx F0246 <- 3.85 -> DG xxx G0841 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0285 <- 3.68 -> DT xxx H0866 : score x.xxxxx >4q44_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=POLYMERASE-DAMAGED DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : x : VAL xxxx A0040 <- 3.42 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 3.44 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0056 <- 3.62 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0246 <- 4.39 -> DG xxx B0842 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0285 <- 4.27 -> DT xxx C0866 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0299 <- 4.40 -> DG xxx C0868 : score x.xxxxx >4q45_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE- DAMAGED DNA COMPLEX organism=Escherichia coli : w : GLU OE2 A0246 <- 5.72 -> DG N7 B0842 : score 2.669 : x : VAL xxxx A0040 <- 3.42 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 3.69 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0056 <- 3.49 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0285 <- 3.69 -> DT xxx C0866 : score x.xxxxx >4q4z_CDF: title=THERMUS THERMOPHILUS RNA POLYMERASE DE NOVO TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ARG NH1 C0243 <- 2.39 -> DG O6 H0009 : score 6.58217 : H : ASP OD1 C0326 <- 2.57 -> DG N2 H0014 : score 5.3869 : H : ARG NE C0331 <- 3.12 -> DG O6 H0014 : score 3.6888 : H : ARG NE F0082 <- 3.21 -> DG O6 H0008 : score 3.61786 : H : GLU OE1 F0324 <- 2.83 -> DG N2 G0019 : score 4.28439 : H : ASP OD1 F0326 <- 2.49 -> DG N2 G0019 : score 5.4693 : V : ARG CG C0422 <- 3.85 -> DT C7 H0015 : score 0.992564 : x : ARG xxxx C0142 <- 3.40 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0167 <- 3.34 -> DC xxx H0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0171 <- 3.82 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0187 <- 3.87 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0256 <- 3.46 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0325 <- 3.38 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0418 <- 3.46 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0421 <- 3.93 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0427 <- 3.72 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0705 <- 3.73 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 3.17 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.58 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 4.29 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D1238 <- 3.94 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0079 <- 2.67 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0081 <- 3.86 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0085 <- 3.83 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0321 <- 4.20 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0327 <- 3.38 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0332 <- 3.73 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx >4q4z_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=THERMUS THERMOPHILUS RNA POLYMERASE DE NOVO TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ARG NE F0082 <- 3.21 -> DG O6 H0008 : score 3.61786 : H : GLU OE1 F0324 <- 2.83 -> DG N2 G0019 : score 4.28439 : H : ASP OD1 F0326 <- 2.49 -> DG N2 G0019 : score 5.4693 : x : ASP xxxx F0079 <- 2.67 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0081 <- 3.86 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0085 <- 3.83 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0321 <- 4.20 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0327 <- 3.38 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0332 <- 3.73 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx >4q5s_CDF: title=THERMUS THERMOPHILUS RNA POLYMERASE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX CONTAINING 6-MER RNA organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : GLU xxxx C0421 <- 3.80 -> DC xxx G0009 : score x.xxxxx >4q5v_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC CORE OF HUMAN DNA POLYMERASE ALPHA IN TERNARY COMPLEX WITH AN RNA-PRIMED DNA TEMPLATE AND APHIDICOLIN organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0834 <- 2.68 -> DG O6 C0113 : score 6.22933 : H : ARG NH2 A0834 <- 3.21 -> DG N7 C0113 : score 5.86108 : w : TYR OH A0865 <- 5.97 -> DG N2 C0111 : score 2.834 : H : SER OG A0955 <- 2.70 -> DG N7 C0110 : score 4.57169 : x : ARG xxxx A0784 <- 3.42 -> DG xxx C0110 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0957 <- 4.30 -> DG xxx C0111 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0959 <- 3.84 -> DG xxx C0110 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1053 <- 3.35 -> DG xxx C0113 : score x.xxxxx >4q8e_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING DCMPNPP OPPOSITE A PHENANTHRIPLATIN ADDUCTED G organism=Homo sapiens : V : ARG CZ A0382 <- 3.79 -> DT C7 P0003 : score 2.13764 : x : SER xxxx A0322 <- 4.26 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4q8f_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA EXTENDING PRIMER IMMEDIATELY AFTER A PHENANTHRIPLATIN ADDUCTED G organism=Homo sapiens : V : ARG CZ A0382 <- 3.73 -> DT C7 P0003 : score 2.16962 : x : GLN xxxx A0038 <- 3.68 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 3.75 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.61 -> DC xxx P0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0062 <- 4.41 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx >4qcb_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=PROTEIN-DNA COMPLEX OF VACCINIA VIRUS D4 WITH DOUBLE-STRANDED NON- SPECIFIC DNA organism=Vaccinia virus : x : THR xxxx A0161 <- 3.20 -> DA xxx D0025 : score x.xxxxx >4qcb_AB:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=PROTEIN-DNA COMPLEX OF VACCINIA VIRUS D4 WITH DOUBLE-STRANDED NON- SPECIFIC DNA organism=Vaccinia virus : x : THR xxxx A0161 <- 3.20 -> DA xxx D0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0161 <- 3.15 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >4qcl_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC CORE OF HUMAN DNA POLYMERASE ALPHA IN TERNARY COMPLEX WITH AN RNA-PRIMED DNA TEMPLATE AND DCTP organism=HOMO SAPIENS : w : ARG NE A0784 <- 6.03 -> DG N7 C0110 : score 1.593 : H : ARG NH1 A0834 <- 2.61 -> DG O6 C0113 : score 6.3145 : H : ARG NH2 A0834 <- 2.90 -> DG N7 C0113 : score 6.25692 : w : TYR OH A0865 <- 5.96 -> DG N2 C0111 : score 2.834 : w : TYR OH A0957 <- 5.46 -> DG N3 C0111 : score 3.344 : w : LYS NZ A1054 <- 6.71 -> DT O2 C0115 : score 0.522 : w : LYS NZ A1054 <- 6.24 -> DT O2 C0115 : score 0.522 : w : ASP OD1 A1083 <- 6.12 -> DC O2 C0116 : score 1.919 : x : LEU xxxx A0951 <- 3.41 -> DG xxx C0110 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0954 <- 4.42 -> DG xxx C0110 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0955 <- 3.46 -> DG xxx C0110 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0962 <- 3.60 -> DA xxx C0109 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0964 <- 3.18 -> DA xxx C0109 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1053 <- 3.39 -> DG xxx C0113 : score x.xxxxx >4qen_A:SET_domain;PUA_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF KRYPTONITE IN COMPLEX WITH MCHH DNA AND SAH organism=Arabidopsis thaliana : H : ARG NH1 A0126 <- 2.95 -> DA N3 C0008 : score 3.57159 : w : ARG NH1 A0126 <- 5.44 -> DT O2 D0006 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0177 <- 5.85 -> DC O2 C0005 : score 1.885 : x : TRP xxxx A0175 <- 3.45 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0176 <- 3.54 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0227 <- 3.95 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx >4qeo_A:SET_domain;PUA_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF KRYPTONITE IN COMPLEX WITH MCHH DNA, H3(1-15) PEPTIDE AND SAH organism=Arabidopsis thaliana : H : ARG NH1 A0126 <- 3.14 -> DA N3 C0008 : score 3.43167 : w : ARG NH1 A0126 <- 5.66 -> DT O2 D0006 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0177 <- 5.62 -> DC O2 C0005 : score 1.885 : x : TRP xxxx A0175 <- 3.34 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0176 <- 3.55 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0227 <- 3.70 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0228 <- 3.68 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx >4qep_A:SET_domain;PUA_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF KRYPTONITE IN COMPLEX WITH MCHG DNA AND SAH organism=Arabidopsis thaliana : H : ARG NH1 A0126 <- 3.46 -> DA N3 C0008 : score 3.19602 : H : ARG NH1 A0126 <- 3.46 -> DA N3 C0008 : score 3.19602 : H : TRP NE1 A0175 <- 3.13 -> DA N3 D0008 : score -8.51018 : x : LEU xxxx A0176 <- 3.56 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0177 <- 3.35 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0227 <- 3.46 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0228 <- 3.86 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0231 <- 4.42 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx >4qju_AB:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA-BOUND NUCLEOID ASSOCIATED PROTEIN, SAV1473 organism=Staphylococcus aureus : w : ARG NH1 A0058 <- 6.12 -> DT O2 D0011 : score 1.855 : H : ARG NH1 A0061 <- 2.89 -> DT O2 D0005 : score 4.22889 : w : GLN NE2 A0064 <- 5.59 -> DT O2 C0016 : score 1.565 : w : GLU OE1 A0068 <- 5.22 -> DC O2 D0008 : score 2.68 : H : ARG NH1 B0058 <- 3.03 -> DT O2 D0013 : score 4.10832 : H : ARG NH1 B0061 <- 2.82 -> DT O2 C0005 : score 4.28918 : w : GLU OE1 B0068 <- 5.50 -> DC O2 C0008 : score 2.68 : x : PRO xxxx A0063 <- 3.57 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0043 <- 4.27 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0045 <- 3.97 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0063 <- 3.59 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >4qju_B:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA-BOUND NUCLEOID ASSOCIATED PROTEIN, SAV1473 organism=Staphylococcus aureus : H : ARG NH1 B0058 <- 3.03 -> DT O2 D0013 : score 4.10832 : H : ARG NH1 B0061 <- 2.82 -> DT O2 C0005 : score 4.28918 : w : GLU OE1 B0068 <- 5.50 -> DC O2 C0008 : score 2.68 : x : GLN xxxx B0043 <- 4.27 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0045 <- 3.97 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0063 <- 3.59 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >4qlc_D:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CHROMATOSOME AT 3.5 ANGSTROM RESOLUTION organism=? : x : ARG xxxx D0030 <- 3.92 -> DT xxx I0037 : score x.xxxxx >4qpq_ABCDEFGH:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=MECHANISTIC BASIS OF PLASMID-SPECIFIC DNA BINDING OF THE F PLASMID REGULATORY PROTEIN, TRAM organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0003 <- 2.34 -> DG O6 P0006 : score 6.3126 : H : ASN OD1 A0005 <- 2.40 -> DC N4 P0004 : score 4.52908 : H : TYR OH A0007 <- 2.61 -> DA N7 P0003 : score 4.30903 : H : TYR OH A0007 <- 2.64 -> DA N6 P0003 : score 4.81997 : H : LYS NZ B0003 <- 2.28 -> DG O6 Q0013 : score 6.38197 : H : ASN OD1 B0005 <- 3.07 -> DC N4 Q0011 : score 3.96714 : H : TYR OH B0007 <- 2.30 -> DG N7 Q0010 : score 4.7159 : H : LYS NZ C0003 <- 2.31 -> DG O6 P0018 : score 6.34728 : H : ASN OD1 C0005 <- 2.79 -> DC N4 P0016 : score 4.20198 : H : TYR OH C0007 <- 2.45 -> DG N7 P0015 : score 4.58728 : H : LYS NZ D0003 <- 2.70 -> DG O6 Q0025 : score 5.89638 : H : ASN OD1 D0005 <- 2.84 -> DC N4 Q0023 : score 4.16004 : H : TYR OH D0007 <- 2.35 -> DG N7 Q0022 : score 4.67303 : H : LYS NZ E0003 <- 2.88 -> DG O6 P0010 : score 5.68828 : H : LYS NZ E0003 <- 3.26 -> DG O6 P0011 : score 5.24894 : H : ASN OD1 E0005 <- 2.78 -> DC N4 Q0016 : score 4.21036 : H : TYR OH E0007 <- 2.38 -> DG N7 Q0015 : score 4.6473 : H : TYR OH E0007 <- 3.00 -> DG O6 Q0015 : score 3.488 : H : LYS NZ F0003 <- 2.73 -> DG O6 P0025 : score 5.8617 : H : ASN OD1 F0005 <- 2.77 -> DC N4 P0023 : score 4.21875 : H : TYR OH F0007 <- 2.46 -> DG N7 P0022 : score 4.57871 : H : TYR OH F0007 <- 2.98 -> DG O6 P0022 : score 3.50253 : H : LYS NZ G0003 <- 2.33 -> DG O6 Q0006 : score 6.32416 : H : ASN OD1 G0005 <- 2.57 -> DC N4 Q0004 : score 4.3865 : H : TYR OH G0007 <- 2.56 -> DA N7 Q0003 : score 4.35054 : H : TYR OH G0007 <- 2.71 -> DA N6 Q0003 : score 4.75458 : H : LYS NZ H0003 <- 2.29 -> DG O6 P0013 : score 6.37041 : H : TYR OH H0007 <- 2.40 -> DG N7 P0010 : score 4.63015 : x : ASN xxxx H0005 <- 3.04 -> DG xxx P0011 : score x.xxxxx >4qpq_H:IHF-like_DNA-binding_proteins; title=MECHANISTIC BASIS OF PLASMID-SPECIFIC DNA BINDING OF THE F PLASMID REGULATORY PROTEIN, TRAM organism=Escherichia coli : H : LYS NZ H0003 <- 2.29 -> DG O6 P0013 : score 6.37041 : H : TYR OH H0007 <- 2.40 -> DG N7 P0010 : score 4.63015 : x : ASN xxxx H0005 <- 3.04 -> DG xxx P0011 : score x.xxxxx >4qqx_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. FUSCA CAS3-ATP organism=Thermobifida fusca : H : SER OG A0733 <- 3.24 -> DA N7 B0001 : score 4.07126 >4qqx_AC:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. FUSCA CAS3-ATP organism=Thermobifida fusca : H : SER OG A0733 <- 3.24 -> DA N7 B0001 : score 4.07126 >4qqx_EG:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. FUSCA CAS3-ATP organism=Thermobifida fusca : H : SER OG G0733 <- 3.22 -> DA N7 H0001 : score 4.08912 : H : ARG NH2 G0884 <- 3.23 -> DA N7 H0002 : score 1.52802 >4qqy_EG:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. FUSCA CAS3-ADP organism=Thermobifida fusca : H : SER OG G0733 <- 3.26 -> DA N7 H0001 : score 4.05341 >4qr9_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF TWO HMGB1 BOX A DOMAINS COOPERATING TO UNDERWIND AND KINK A DNA organism=RATTUS NORVEGICUS : w : SER OG A0013 <- 5.40 -> DA N3 D0019 : score 0.958 : H : SER OG A0041 <- 2.73 -> DA N3 D0017 : score 3.0459 : w : SER OG B0013 <- 5.41 -> DA N3 C0009 : score 0.958 : H : SER OG B0041 <- 2.75 -> DA N3 C0007 : score 3.03388 : x : VAL xxxx A0019 <- 4.30 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0037 <- 3.54 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0040 <- 3.94 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0015 <- 4.49 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0019 <- 4.27 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0037 <- 3.56 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0040 <- 3.92 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx >4qr9_B:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TWO HMGB1 BOX A DOMAINS COOPERATING TO UNDERWIND AND KINK A DNA organism=? : w : SER OG B0013 <- 5.41 -> DA N3 C0009 : score 0.958 : H : SER OG B0041 <- 2.75 -> DA N3 C0007 : score 3.03388 : x : TYR xxxx B0015 <- 4.49 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0019 <- 4.27 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0037 <- 3.56 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0040 <- 3.92 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx >4qtj_A: title=COMPLEX OF WOPR DOMAIN OF WOR1 IN CANDIDA ALBICANS WITH THE 13BP DSDNA organism=Candida albicans SC5314 : H : ARG NH1 A0065 <- 2.68 -> DT O2 B0008 : score 4.40976 : w : ARG NH1 A0065 <- 5.93 -> DA N3 C0006 : score 2.585 : H : SER OG A0075 <- 2.91 -> DC N4 C0009 : score 3.59478 : w : SER OG A0075 <- 5.82 -> DT O4 C0010 : score 2.338 : w : SER OG A0075 <- 6.13 -> DA N6 B0004 : score 2.209 : w : ARG NH1 A0076 <- 5.68 -> DA N7 B0004 : score 0.388 : x : ILE xxxx A0077 <- 4.13 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0082 <- 3.75 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0084 <- 3.33 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx >4qtk_A: title=COMPLEX OF WOPR DOMAIN OF WOR1 IN CANDIDA ALBICANS WITH THE 17BP DSDNA organism=Candida albicans SC5314 : H : ARG NH1 A0065 <- 2.86 -> DT O2 C0012 : score 4.25473 : H : ARG NH2 A0065 <- 3.12 -> DT O2 C0012 : score 3.9624 : H : SER OG A0075 <- 3.40 -> DC N4 D0009 : score 3.23456 : x : ARG xxxx A0076 <- 3.58 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0077 <- 4.20 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0082 <- 3.66 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0084 <- 3.34 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx >4qtr_AB:Homeodomain-like; title=COMPUTATIONAL DESIGN OF CO-ASSEMBLING PROTEIN-DNA NANOWIRES organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ASN OD1 B0051 <- 3.24 -> DA N6 E0011 : score 5.49188 : x : ILE xxxx B0047 <- 3.44 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx >4qtr_CD:Homeodomain-like; title=COMPUTATIONAL DESIGN OF CO-ASSEMBLING PROTEIN-DNA NANOWIRES organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ASN ND2 C0051 <- 3.13 -> DA N7 G0006 : score 5.48306 : H : ASN OD1 D0051 <- 3.29 -> DA N6 H0006 : score 5.43166 : H : ASN ND2 D0051 <- 3.16 -> DA N7 H0006 : score 5.44784 : x : ILE xxxx C0047 <- 3.64 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0047 <- 3.30 -> DA xxx H0006 : score x.xxxxx >4qtr_D:Homeodomain-like; title=COMPUTATIONAL DESIGN OF CO-ASSEMBLING PROTEIN-DNA NANOWIRES organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ASN OD1 D0051 <- 3.29 -> DA N6 H0006 : score 5.43166 : H : ASN ND2 D0051 <- 3.16 -> DA N7 H0006 : score 5.44784 : x : ILE xxxx D0047 <- 3.30 -> DA xxx H0006 : score x.xxxxx >4qw8_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY CRYSTAL STRUCTURES OF A Y-FAMILY DNA POLYMERASE DPO4 FROM SULFOLOBUS SOLFATARICUS IN COMPLEX WITH DNA AND D-DCTP organism=Sulfolobus solfataricus : w : LYS NZ A0078 <- 6.06 -> DG N3 D0006 : score 2.232 : w : SER OG A0297 <- 6.05 -> DG N7 C0008 : score 2.749 : w : ARG NH2 A0332 <- 6.32 -> DA N7 D0007 : score 1.486 : x : SER xxxx A0244 <- 4.32 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.87 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx >4qw9_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY CRYSTAL STRUCTURES OF A Y-FAMILY DNA POLYMERASE DPO4 FROM SULFOLOBUS SOLFATARICUS IN COMPLEX WITH DNA AND (-)FTC-PPNP organism=Sulfolobus solfataricus : x : SER xxxx A0244 <- 4.49 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0332 <- 3.76 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.05 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx >4qwa_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY CRYSTAL STRUCTURES OF A Y-FAMILY DNA POLYMERASE DPO4 FROM SULFOLOBUS SOLFATARICUS IN COMPLEX WITH DNA AND (-)3TC-DP organism=Sulfolobus solfataricus : w : LYS NZ A0078 <- 5.65 -> DG N2 D0006 : score 0.846 : w : LYS NZ A0078 <- 5.78 -> DG N3 D0006 : score 2.232 : w : ARG NH1 A0332 <- 5.94 -> DG N7 D0006 : score 2.063 : w : ARG NH2 A0332 <- 6.30 -> DA N7 D0007 : score 1.486 : x : SER xxxx A0244 <- 4.43 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.22 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx >4qwb_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DPO4 LINKER REGION P236A MUTANT WITH AN INCOMING D-DCDP organism=Sulfolobus solfataricus : x : SER xxxx A0244 <- 4.23 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.25 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >4qwc_D:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY CRYSTAL STRUCTURES OF A Y-FAMILY DNA POLYMERASE DPO4 FROM SULFOBUS SOLFATARICUS IN COMPLES WITH DNA AND L-DCDP organism=Saccharolobus solfataricus P2 : x : SER xxxx D0244 <- 4.02 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0336 <- 3.75 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx >4qwd_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY CRYSTAL STRUCTURES OF A Y-FAMILY DNA POLYMERASE DPO4 FROM SULFOLOBUS SOLFATARICUS IN COMPLEX WITH DNA AND (-)3TC-PPNP organism=Sulfolobus solfataricus : w : LYS NZ A0078 <- 5.96 -> DG N2 D0006 : score 0.846 : w : LYS NZ A0078 <- 6.43 -> DG N3 D0006 : score 2.232 : x : SER xxxx A0244 <- 4.27 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0332 <- 4.08 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.19 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx >4qwe_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY CRYSTAL STRUCTURES OF A Y-FAMILY DNA POLYMERASE DPO4 FROM SULFOLOBUS SOLFATARICUS IN COMPLEX WITH DNA AND (-)FTC-DP organism=Sulfolobus solfataricus : x : SER xxxx A0244 <- 4.30 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0332 <- 4.16 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.21 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx >4qyz_C: title=CRYSTAL STRUCTURE OF A CRISPR RNA-GUIDED SURVEILLANCE COMPLEX, CASCADE, BOUND TO A SSDNA TARGET organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 C0027 <- 2.57 -> DC O2 M0020 : score 3.86886 : x : ALA xxxx C0023 <- 4.46 -> DC xxx M0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0100 <- 3.98 -> DT xxx M0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0101 <- 3.41 -> DA xxx M0026 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0123 <- 2.98 -> DA xxx M0026 : score x.xxxxx >4qz8_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=MOUSE TDT IN COMPLEX WITH A DSB SUBSTRATE, C-G BASE PAIR organism=MUS MUSCULUS : x : LEU xxxx A0189 <- 3.87 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0190 <- 3.56 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0193 <- 3.91 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx >4qz9_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=MOUSE TDT IN COMPLEX WITH A DSB SUBSTRATE, C-A BASE PAIR organism=MUS MUSCULUS : w : ARG NH1 A0193 <- 5.91 -> DT O2 T0005 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0193 <- 5.95 -> DT O2 T0005 : score 2.261 : w : ARG NH2 A0193 <- 5.74 -> DA N3 D0002 : score 2.092 : x : SER xxxx A0187 <- 4.38 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0189 <- 4.10 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0190 <- 3.62 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx >4qza_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=MOUSE TDT IN COMPLEX WITH A DSB SUBSTRATE, C-C BASE PAIR organism=MUS MUSCULUS : x : SER xxxx A0187 <- 4.46 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0189 <- 4.27 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0190 <- 3.67 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0193 <- 4.04 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx >4qzb_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=MOUSE TDT IN COMPLEX WITH A DSB SUBSTRATE, C-T BASE PAIR organism=MUS MUSCULUS : w : ARG NH1 A0193 <- 5.93 -> DT O2 T0005 : score 1.855 : x : LEU xxxx A0189 <- 3.99 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0190 <- 3.68 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx >4qzc_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=MOUSE TDT, F405A MUTANT, IN COMPLEX WITH A DSB SUBSTRATE, C-G BASE PAIR organism=MUS MUSCULUS : x : LEU xxxx A0189 <- 3.86 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0190 <- 3.51 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0193 <- 4.07 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx >4qzd_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=MOUSE TDT, F405A MUTANT, IN COMPLEX WITH A DSB SUBSTRATE, C-C BASE PAIR organism=MUS MUSCULUS : x : SER xxxx A0187 <- 4.40 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0189 <- 3.73 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0190 <- 3.56 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0193 <- 3.96 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx >4qze_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=MOUSE TDT, F401A MUTANT, IN COMPLEX WITH A DSB SUBSTRATE, C-G BASE PAIR organism=MUS MUSCULUS : w : ARG NH1 A0193 <- 6.11 -> DT O2 T0005 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0193 <- 5.96 -> DT O2 T0005 : score 2.261 : x : LEU xxxx A0189 <- 3.91 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0190 <- 3.49 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx >4qzf_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=MOUSE TDT, F401A MUTANT, IN COMPLEX WITH A DSB SUBSTRATE, C-A BASE PAIR organism=MUS MUSCULUS : x : SER xxxx A0187 <- 3.96 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0189 <- 3.80 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0190 <- 3.32 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0193 <- 4.04 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx >4qzg_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=MOUSE TDT, F401A MUTANT, IN COMPLEX WITH A DSB SUBSTRATE, C-C BASE PAIR organism=MUS MUSCULUS : x : LEU xxxx A0189 <- 3.77 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0190 <- 3.24 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0193 <- 3.72 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx >4qzh_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=MOUSE TDT, F401A MUTANT, IN COMPLEX WITH A DSB SUBSTRATE, C-T BASE PAIR organism=MUS MUSCULUS : w : ARG NH1 A0193 <- 6.25 -> DT O2 T0005 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0193 <- 6.10 -> DT O2 T0005 : score 2.261 : x : SER xxxx A0187 <- 4.40 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0189 <- 3.86 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0190 <- 3.51 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx >4r22_B:Putative_DNA-binding_domain; title=TNRA-DNA COMPLEX organism=Bacillus megaterium : x : ARG xxxx B0028 <- 3.29 -> DA xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0031 <- 3.20 -> DT xxx G0014 : score x.xxxxx >4r24_B:Putative_DNA-binding_domain; title=COMPLETE DISSECTION OF B. SUBTILIS NITROGEN HOMEOSTATIC CIRCUITRY organism=Bacillus megaterium : w : ARG NH2 B0031 <- 5.32 -> DT O4 G0014 : score 2.366 : x : ARG xxxx B0028 <- 3.81 -> DA xxx G0016 : score x.xxxxx >4r28_C:Restriction_endonuclease-like; title=MSPJI RESTRICTION ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH 27-MER OLIGONUCLEOTIDE organism=Mycobacterium sp. JLS : H : GLN OE1 C0033 <- 2.97 -> DG N2 X0406 : score 5.41703 : H : GLU OE1 C0065 <- 2.68 -> DG N2 Y0423 : score 4.4137 : x : ALA xxxx C0066 <- 3.99 -> DC xxx X0404 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0173 <- 4.01 -> DG xxx X0407 : score x.xxxxx >4r2a_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=EGR1/ZIF268 ZINC FINGERS IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0351 <- 2.90 -> DG N7 B0010 : score 5.929 : H : ARG NH2 A0351 <- 2.84 -> DG O6 B0010 : score 6.5472 : w : ASP OD2 A0353 <- 5.78 -> DA N7 C0002 : score 2.024 : H : ARG NH1 A0357 <- 2.97 -> DG O6 B0008 : score 5.8765 : H : ARG NH2 A0357 <- 2.87 -> DG N7 B0008 : score 6.29523 : w : ARG NH1 A0357 <- 5.58 -> DG O6 C0004 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0379 <- 2.87 -> DG N7 B0007 : score 5.9653 : H : ARG NH2 A0379 <- 2.76 -> DG O6 B0007 : score 6.6528 : H : ASP OD2 A0381 <- 3.03 -> DC N4 C0005 : score 5.9148 : w : ASP OD2 A0381 <- 5.73 -> DC N4 C0006 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0382 <- 2.78 -> DG N7 B0006 : score 6.82977 : H : ARG NH1 A0407 <- 2.92 -> DG N7 B0004 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0407 <- 2.81 -> DG O6 B0004 : score 6.5868 : H : ASP OD2 A0409 <- 3.15 -> DA N6 C0008 : score 3.72238 : w : ASP OD1 A0409 <- 5.91 -> DC N4 C0007 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0409 <- 5.92 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0413 <- 2.89 -> DG O6 B0002 : score 5.97383 : H : ARG NH2 A0413 <- 2.75 -> DG N7 B0002 : score 6.44846 : w : ARG NH1 A0413 <- 5.49 -> DG O6 C0010 : score 2.756 : x : GLU xxxx A0354 <- 3.56 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0385 <- 4.15 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0410 <- 3.98 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >4r2c_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=EGR1/ZIF268 ZINC FINGERS IN COMPLEX WITH HYDROXYMETHYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0351 <- 2.86 -> DG N7 B0010 : score 5.9774 : H : ARG NH2 A0351 <- 2.79 -> DG O6 B0010 : score 6.6132 : H : ARG NH1 A0357 <- 3.08 -> DG O6 B0008 : score 5.74267 : H : ARG NH2 A0357 <- 2.94 -> DG N7 B0008 : score 6.20585 : w : ARG NH1 A0357 <- 5.19 -> DG O6 C0004 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0379 <- 2.90 -> DG N7 B0007 : score 5.929 : H : ARG NH2 A0379 <- 2.54 -> DG O6 B0007 : score 6.9432 : H : ASP OD2 A0381 <- 3.04 -> DC N4 C0005 : score 5.9024 : w : ASP OD2 A0381 <- 5.42 -> DC N4 C0006 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0382 <- 2.76 -> DG N7 B0006 : score 6.85698 : H : ARG NH1 A0407 <- 2.89 -> DG N7 B0004 : score 5.9411 : H : ARG NH2 A0407 <- 2.86 -> DG O6 B0004 : score 6.5208 : w : ASP OD1 A0409 <- 5.81 -> DC N4 C0007 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0409 <- 5.68 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0413 <- 2.84 -> DG O6 B0002 : score 6.03467 : H : ARG NH2 A0413 <- 2.78 -> DG N7 B0002 : score 6.41015 : w : ARG NH1 A0413 <- 5.67 -> DG O6 C0010 : score 2.756 : x : ASP xxxx A0353 <- 3.37 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0354 <- 3.97 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0385 <- 4.23 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0410 <- 3.15 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >4r2d_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=EGR1/ZIF268 ZINC FINGERS IN COMPLEX WITH FORMYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0351 <- 2.90 -> DG N7 B0010 : score 5.929 : H : ARG NH2 A0351 <- 2.94 -> DG O6 B0010 : score 6.4152 : H : ASP OD2 A0353 <- 3.09 -> DA N6 C0002 : score 3.77042 : H : ARG NH1 A0357 <- 2.95 -> DG O6 B0008 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0357 <- 2.83 -> DG N7 B0008 : score 6.34631 : w : ARG NH1 A0357 <- 5.10 -> DG O6 C0004 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0379 <- 2.72 -> DG N7 B0007 : score 6.1468 : H : ARG NH2 A0379 <- 2.63 -> DG O6 B0007 : score 6.8244 : w : SER OG A0380 <- 6.55 -> DG N7 C0004 : score 2.749 : H : ASP OD2 A0381 <- 3.30 -> DC N4 C0005 : score 5.58 : w : ASP OD2 A0381 <- 5.93 -> DC N4 C0006 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0382 <- 2.64 -> DG N7 B0006 : score 7.02025 : H : ARG NH1 A0407 <- 2.92 -> DG N7 B0004 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0407 <- 3.01 -> DG O6 B0004 : score 6.3228 : H : ASP OD1 A0409 <- 3.26 -> DA N6 C0008 : score 3.1617 : w : ASP OD1 A0409 <- 5.68 -> DC N4 B0003 : score 2.835 : H : ARG NH1 A0413 <- 2.89 -> DG O6 B0002 : score 5.97383 : H : ARG NH2 A0413 <- 2.86 -> DG N7 B0002 : score 6.308 : w : ARG NH1 A0413 <- 5.42 -> DG O6 C0010 : score 2.756 : x : GLU xxxx A0354 <- 4.02 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0385 <- 4.13 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0410 <- 3.45 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >4r2e_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=WILMS TUMOR PROTEIN (WT1) ZINC FINGERS IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0366 <- 2.84 -> DG N7 B0010 : score 6.0016 : H : ARG NH2 A0366 <- 2.82 -> DG O6 B0010 : score 6.5736 : H : ARG NH1 A0372 <- 2.87 -> DG O6 B0008 : score 5.99817 : H : ARG NH2 A0372 <- 2.81 -> DG N7 B0008 : score 6.37185 : w : ARG NH1 A0372 <- 5.74 -> DG O6 C0004 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0394 <- 3.10 -> DG N7 B0007 : score 5.687 : H : ARG NH2 A0394 <- 2.83 -> DG O6 B0007 : score 6.5604 : w : SER OG A0395 <- 6.38 -> DG N7 C0004 : score 2.749 : H : ASP OD2 A0396 <- 2.84 -> DC N4 C0005 : score 6.1504 : w : ASP OD2 A0396 <- 5.91 -> DC N4 C0006 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0397 <- 2.86 -> DG N7 B0006 : score 6.72093 : H : ARG NH1 A0424 <- 2.94 -> DG N7 B0004 : score 5.8806 : H : ARG NH2 A0424 <- 2.86 -> DG O6 B0004 : score 6.5208 : w : ASP OD1 A0426 <- 5.90 -> DC N4 C0007 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0426 <- 5.94 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0430 <- 3.00 -> DG O6 B0002 : score 5.84 : H : ARG NH2 A0430 <- 2.93 -> DG N7 B0002 : score 6.21862 : w : ARG NH1 A0430 <- 5.78 -> DG O6 C0010 : score 2.756 : x : ASP xxxx A0368 <- 3.47 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0369 <- 4.37 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0400 <- 4.18 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0425 <- 4.30 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0427 <- 4.01 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >4r2p_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=WILMS TUMOR PROTEIN (WT1) ZINC FINGERS IN COMPLEX WITH HYDROXYMETHYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0366 <- 2.93 -> DG N7 B0010 : score 5.8927 : H : ARG NH2 A0366 <- 2.79 -> DG O6 B0010 : score 6.6132 : H : ASP OD2 A0368 <- 2.98 -> DA N6 C0052 : score 3.85847 A : H : ARG NH1 A0372 <- 3.05 -> DG O6 B0008 : score 5.77917 : H : ARG NH2 A0372 <- 3.18 -> DG N7 B0008 : score 5.89938 : H : ARG NH2 A0372 <- 3.22 -> DG O6 B0008 : score 6.0456 : w : ARG NH1 A0372 <- 5.79 -> DG N7 C0054 : score 2.063 : H : ARG NH1 A0394 <- 3.00 -> DG N7 B0007 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0394 <- 2.84 -> DG O6 B0007 : score 6.5472 : H : ASP OD2 A0396 <- 3.18 -> DC N4 C0055 : score 5.7288 A : H : HIS NE2 A0397 <- 2.82 -> DG N7 B0006 : score 6.77535 : H : ARG NH1 A0424 <- 3.03 -> DG N7 B0004 : score 5.7717 : H : ARG NH2 A0424 <- 2.83 -> DG O6 B0004 : score 6.5604 : w : ASP OD2 A0426 <- 5.91 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : w : ASP OD2 A0426 <- 6.55 -> DC N4 C0059 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0430 <- 2.98 -> DG O6 B0002 : score 5.86433 : H : ARG NH2 A0430 <- 2.82 -> DG N7 B0002 : score 6.35908 : x : GLN xxxx A0369 <- 3.07 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0395 <- 3.64 -> DG xxx C0054 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0400 <- 4.39 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0425 <- 4.35 -> DC xxx C0056 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0427 <- 3.98 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >4r2q_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=WILMS TUMOR PROTEIN (WT1) ZINC FINGERS IN COMPLEX WITH FORMYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0366 <- 2.86 -> DG N7 B0010 : score 5.9774 : H : ARG NH2 A0366 <- 2.94 -> DG O6 B0010 : score 6.4152 : H : ARG NH1 A0372 <- 2.88 -> DG O6 B0008 : score 5.986 : H : ARG NH2 A0372 <- 2.88 -> DG N7 B0008 : score 6.28246 : H : ARG NH1 A0394 <- 2.92 -> DG N7 B0007 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0394 <- 2.80 -> DG O6 B0007 : score 6.6 : w : SER OG A0395 <- 5.95 -> DG N7 C0004 : score 2.749 : H : ASP OD2 A0396 <- 2.85 -> DC N4 C0005 : score 6.138 : w : ASP OD2 A0396 <- 6.05 -> DC N4 C0006 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0397 <- 2.85 -> DG N7 B0006 : score 6.73454 : H : ARG NH1 A0424 <- 2.96 -> DG N7 B0004 : score 5.8564 : H : ARG NH2 A0424 <- 2.81 -> DG O6 B0004 : score 6.5868 : w : ASP OD1 A0426 <- 5.71 -> DC N4 C0007 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0426 <- 5.84 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0430 <- 2.97 -> DG O6 B0002 : score 5.8765 : H : ARG NH2 A0430 <- 2.83 -> DG N7 B0002 : score 6.34631 : w : ARG NH1 A0430 <- 5.54 -> DG O6 C0010 : score 2.756 : x : ASP xxxx A0368 <- 3.50 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0369 <- 4.27 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0400 <- 4.29 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0427 <- 3.88 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >4r2r_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=WILMS TUMOR PROTEIN (WT1) ZINC FINGERS IN COMPLEX WITH CARBOXYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0366 <- 2.99 -> DG N7 B0010 : score 5.8201 : H : ARG NH2 A0366 <- 2.97 -> DG O6 B0010 : score 6.3756 : H : ASP OD2 A0368 <- 3.31 -> DA N6 C0002 : score 3.5943 : H : ARG NH1 A0372 <- 2.95 -> DG O6 B0008 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0372 <- 2.86 -> DG N7 B0008 : score 6.308 : w : ARG NH1 A0372 <- 5.57 -> DG O6 C0004 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0394 <- 2.92 -> DG N7 B0007 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0394 <- 2.88 -> DG O6 B0007 : score 6.4944 : w : SER OG A0395 <- 5.76 -> DG N7 C0004 : score 2.749 : H : ASP OD2 A0396 <- 2.87 -> DC N4 C0005 : score 6.1132 : w : ASP OD2 A0396 <- 6.22 -> DG O6 C0004 : score 3.228 : H : HIS NE2 A0397 <- 2.88 -> DG N7 B0006 : score 6.69372 : H : ARG NH1 A0424 <- 2.98 -> DG N7 B0004 : score 5.8322 : H : ARG NH2 A0424 <- 2.99 -> DG O6 B0004 : score 6.3492 : H : ASP OD2 A0426 <- 3.33 -> DA N6 C0008 : score 3.57829 : w : ASP OD1 A0426 <- 5.66 -> DC N4 C0007 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0426 <- 6.10 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0430 <- 2.94 -> DG O6 B0002 : score 5.913 : H : ARG NH2 A0430 <- 2.82 -> DG N7 B0002 : score 6.35908 : w : ARG NH1 A0430 <- 5.68 -> DG O6 C0010 : score 2.756 : x : THR xxxx A0400 <- 4.35 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0427 <- 4.07 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >4r2s_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=WILMS TUMOR PROTEIN (WT1) Q369P ZINC FINGERS IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0366 <- 3.01 -> DG N7 B0010 : score 5.7959 : H : ARG NH2 A0366 <- 3.05 -> DG O6 B0010 : score 6.27 : H : ARG NH1 A0372 <- 2.98 -> DG O6 B0008 : score 5.86433 : H : ARG NH2 A0372 <- 2.98 -> DG N7 B0008 : score 6.15477 : H : ARG NH1 A0394 <- 3.01 -> DG N7 B0007 : score 5.7959 : H : ARG NH2 A0394 <- 2.97 -> DG O6 B0007 : score 6.3756 : H : ASP OD2 A0396 <- 3.05 -> DC N4 C0005 : score 5.89 A : H : HIS NE2 A0397 <- 2.76 -> DG N7 B0006 : score 6.85698 : H : ARG NH1 A0424 <- 2.84 -> DG N7 B0004 : score 6.0016 : H : ARG NH2 A0424 <- 2.83 -> DG O6 B0004 : score 6.5604 : H : ARG NH1 A0430 <- 2.97 -> DG O6 B0002 : score 5.8765 : H : ARG NH2 A0430 <- 2.82 -> DG N7 B0002 : score 6.35908 : x : ASP xxxx A0368 <- 3.62 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0400 <- 4.25 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0426 <- 3.59 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0427 <- 3.36 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >4r4e_B:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF GLNR-DNA COMPLEX organism=Bacillus subtilis subsp. subtilis : H : ARG NE B0026 <- 3.05 -> DG N7 E0003 : score 4.20071 : H : ARG NE B0026 <- 2.87 -> DT O4 E0004 : score 1.83295 : H : ARG NH2 B0026 <- 2.69 -> DG O6 E0003 : score 6.7452 : H : ARG NH2 B0046 <- 2.52 -> DT O2 D0011 : score 4.4704 : V : ARG CZ B0029 <- 3.62 -> DT C7 D0013 : score 2.22826 >4r55_A: title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF A CREN7 MUTANT PROTEIN GR AND DSDNA COMPLEX organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS P2 : H : TRP NE1 A0026 <- 2.92 -> DA N3 B0104 : score -8.89286 : H : ARG NE A0046 <- 2.92 -> DT O2 B0105 : score 2.51508 : H : ARG NH1 A0046 <- 3.01 -> DT O2 B0105 : score 4.12554 : x : LEU xxxx A0028 <- 3.38 -> DG xxx B0103 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0031 <- 3.54 -> DC xxx C0114 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0033 <- 3.94 -> DT xxx C0113 : score x.xxxxx >4r56_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF SULFOLOBUS CREN7-DSDNA(GTGATCAC) COMPLEX organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS P2 : H : TRP NE1 A0026 <- 3.00 -> DA N3 C0104 : score -8.74708 : H : ARG NH1 A0033 <- 2.79 -> DC O2 D0116 : score 3.6573 : H : ARG NE A0051 <- 2.92 -> DT O2 C0105 : score 2.51508 : H : ARG NH1 A0051 <- 3.08 -> DT O2 C0105 : score 4.06525 : H : ARG NH1 A0051 <- 2.91 -> DC O2 C0106 : score 3.5697 : x : LEU xxxx A0028 <- 3.38 -> DA xxx C0104 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0030 <- 3.33 -> DT xxx C0102 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0036 <- 3.40 -> DC xxx D0114 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0038 <- 3.91 -> DT xxx D0113 : score x.xxxxx >4r5p_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) WITH DNA AND A NUCLEOSIDE TRIPHOSPHATE MIMIC ALPHA-CARBOXY NUCLEOSIDE PHOSPHONATE INHIBITOR organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.63 -> DC O2 P0821 : score 3.61635 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.15 -> DC O2 T0723 : score 3.43981 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.19 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.28 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.15 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.41 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.48 -> DC xxx T0711 : score x.xxxxx >4r5p_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) WITH DNA AND A NUCLEOSIDE TRIPHOSPHATE MIMIC ALPHA-CARBOXY NUCLEOSIDE PHOSPHONATE INHIBITOR organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH C0183 <- 2.64 -> DC O2 F0821 : score 3.60935 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.18 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 3.67 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 3.98 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.21 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.49 -> DC xxx E0711 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 4.30 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.16 -> DT xxx F0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.96 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >4r63_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=BINARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF R258A MUTANT OF DNA POLYMERASE BETA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.28 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.71 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.56 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4r64_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=BINARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF E295K MUTANT OF DNA POLYMERASE BETA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.23 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.77 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.58 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4r65_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF R258A MUTANT OF DNA POLYMERASE BETA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.18 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.81 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.53 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4r66_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF E295K MUTANT OF DNA POLYMERASE BETA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.31 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.97 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.56 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4r79_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=MOS1 TRANSPOSASE PAIRED-END COMPLEX WITH LEFT TRANSPOSON END organism=? : H : LYS NZ A0044 <- 2.83 -> DG N7 D0033 : score 5.35358 : H : ARG NH1 A0048 <- 3.06 -> DG N7 C0022 : score 5.7354 : H : ARG NH2 A0048 <- 2.83 -> DG O6 C0022 : score 6.5604 : H : GLN OE1 A0100 <- 2.98 -> DA N6 C0009 : score 5.83467 : H : GLN NE2 A0100 <- 2.56 -> DA N7 C0009 : score 6.38205 : H : GLN NE2 A0101 <- 2.53 -> DG O6 D0047 : score 6.11861 : x : THR xxxx A0042 <- 4.20 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0047 <- 3.23 -> DC xxx D0031 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0065 <- 3.13 -> DC xxx D0040 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0068 <- 3.22 -> DT xxx D0042 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0099 <- 3.37 -> DT xxx D0046 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0102 <- 3.98 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0104 <- 3.52 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0105 <- 4.39 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx >4r89_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF PAFAN1 - 5' FLAP DNA COMPLEX WITH MANGANASE organism=Pseudomonas aeruginosa : x : TRP xxxx A0184 <- 3.51 -> DC xxx B-001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0192 <- 3.58 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0197 <- 3.74 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 2.96 -> DC xxx B-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0257 <- 3.31 -> DC xxx B-001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0419 <- 3.90 -> DA xxx B-002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0422 <- 4.38 -> DA xxx B-002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0528 <- 4.21 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0529 <- 3.32 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0531 <- 4.02 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx >4r8a_F: title=CRYSTAL STRUCTURE OF PAFAN1 - 5' FLAP DNA COMPLEX organism=Pseudomonas aeruginosa : H : ASN ND2 F0182 <- 2.41 -> DC O2 G-001 : score 4.82889 : H : TRP NE1 F0184 <- 3.31 -> DC O2 G-001 : score 5.83355 : H : TYR OH F0221 <- 3.04 -> DC N4 G0000 : score 4.01183 : H : ARG NH1 F0529 <- 3.32 -> DG O6 I0005 : score 5.45067 : H : ARG NH2 F0529 <- 2.84 -> DG N7 I0005 : score 6.33354 : x : LEU xxxx F0183 <- 3.18 -> DC xxx G0000 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0185 <- 3.14 -> DA xxx G-002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0192 <- 3.51 -> DC xxx I0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0197 <- 3.98 -> DC xxx I0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0198 <- 4.48 -> DC xxx I0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0225 <- 3.23 -> DC xxx G0000 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0253 <- 3.17 -> DC xxx G-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0257 <- 3.34 -> DC xxx G0000 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0411 <- 3.17 -> DC xxx G-001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0412 <- 3.17 -> DA xxx G-002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0415 <- 3.03 -> DA xxx G-002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0416 <- 3.56 -> DA xxx G-002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0419 <- 4.19 -> DC xxx G-001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0528 <- 3.46 -> DC xxx G0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0531 <- 3.47 -> DC xxx G0004 : score x.xxxxx >4r8p_L:UBC-like;RING/U-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RING1B/BMI1/UBCH5C PRC1 UBIQUITYLATION MODULE BOUND TO THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=HOMO SAPIENS : x : ASN xxxx L0281 <- 3.61 -> DC xxx J0070 : score x.xxxxx >4r8u_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=S-SAD STRUCTURE OF DINB-DNA COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : x : SER xxxx B0243 <- 4.46 -> DT xxx C0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0247 <- 4.16 -> DG xxx C0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0286 <- 4.34 -> DT xxx D0047 : score x.xxxxx >4rb1_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE MSR-1 FUR-MN2+- E. COLI FUR BOX organism=Magnetospirillum gryphiswaldense : H : LYS NZ A0015 <- 2.98 -> DT O2 D0623 : score 3.45804 : H : ARG NH1 A0057 <- 3.00 -> DT O4 D0617 : score 3.13723 : x : ALA xxxx A0053 <- 3.96 -> DA xxx D0616 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0056 <- 3.74 -> DT xxx D0614 : score x.xxxxx >4rb1_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE MSR-1 FUR-MN2+- E. COLI FUR BOX organism=Magnetospirillum gryphiswaldense : H : LYS NZ A0015 <- 2.98 -> DT O2 D0623 : score 3.45804 : H : ARG NH1 A0057 <- 3.00 -> DT O4 D0617 : score 3.13723 : H : ARG NH1 B0057 <- 3.08 -> DG N7 D0606 : score 5.7112 : H : ARG NH2 B0057 <- 2.65 -> DG O6 D0606 : score 6.798 : x : ALA xxxx A0053 <- 3.96 -> DA xxx D0616 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0056 <- 3.74 -> DT xxx D0614 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0051 <- 4.09 -> DG xxx D0606 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0052 <- 3.96 -> DT xxx D0608 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0053 <- 3.88 -> DA xxx D0607 : score x.xxxxx >4rb2_CD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE MSR-1 SEMET-FUR- MN2+-FEOAB1 OPERATOR organism=Magnetospirillum gryphiswaldense : H : ARG NH2 C0057 <- 2.75 -> DG O6 A0018 : score 6.666 : H : ARG NH2 C0057 <- 3.13 -> DG N7 B0007 : score 5.96323 : H : LYS NZ D0015 <- 2.86 -> DA N3 B0024 : score 2.7436 : H : ARG NH1 D0057 <- 3.12 -> DG O6 B0018 : score 5.694 : H : ARG NH2 D0057 <- 2.73 -> DG N7 A0007 : score 6.474 : x : ALA xxxx C0053 <- 3.39 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0054 <- 4.46 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0056 <- 3.69 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0051 <- 4.30 -> DG xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0053 <- 3.74 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0056 <- 3.00 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx >4rb2_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE MSR-1 SEMET-FUR- MN2+-FEOAB1 OPERATOR organism=Magnetospirillum gryphiswaldense : H : LYS NZ D0015 <- 2.86 -> DA N3 B0024 : score 2.7436 : H : ARG NH1 D0057 <- 3.12 -> DG O6 B0018 : score 5.694 : H : ARG NH2 D0057 <- 2.73 -> DG N7 A0007 : score 6.474 : x : SER xxxx D0051 <- 4.30 -> DG xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0053 <- 3.74 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0056 <- 3.00 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx >4rb3_CD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE MSR-1 FUR-MN2+- FEOAB1 OPERATOR organism=Magnetospirillum gryphiswaldense : H : LYS NZ D0015 <- 2.89 -> DA N3 B0024 : score 2.72694 : H : ARG NH2 D0057 <- 2.64 -> DG N7 A0007 : score 6.58892 : H : ARG NH2 D0057 <- 3.24 -> DG O6 A0007 : score 6.0192 : x : ALA xxxx C0053 <- 3.55 -> DT xxx A0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0056 <- 3.55 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0057 <- 3.00 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0051 <- 4.31 -> DG xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0053 <- 3.65 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0056 <- 3.46 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx >4rb3_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE MSR-1 FUR-MN2+- FEOAB1 OPERATOR organism=Magnetospirillum gryphiswaldense : H : LYS NZ D0015 <- 2.89 -> DA N3 B0024 : score 2.72694 : H : ARG NH2 D0057 <- 2.64 -> DG N7 A0007 : score 6.58892 : H : ARG NH2 D0057 <- 3.24 -> DG O6 A0007 : score 6.0192 : x : SER xxxx D0051 <- 4.31 -> DG xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0053 <- 3.65 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0056 <- 3.46 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx >4rbo_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A NANOG HOMEOBOX (NANOG) FROM HOMO SAPIENS AT 3.30 A RESOLUTION organism=? : H : ASN OD1 A0145 <- 3.42 -> DA N6 C0006 : score 5.27509 : H : ASN ND2 A0145 <- 3.39 -> DA N7 C0006 : score 5.17779 : x : LYS xxxx A0140 <- 4.16 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0141 <- 3.57 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0144 <- 3.92 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0148 <- 3.16 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >4rd5_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF R.NGOAVII RESTRICTION ENDONUCLEASE B3 DOMAIN WITH COGNATE DNA organism=Neisseria gonorrhoeae : H : ARG NE A0227 <- 2.96 -> DG O6 C0007 : score 3.81491 : H : ARG NH2 A0227 <- 3.02 -> DG N7 C0007 : score 6.10369 : H : ARG NH1 A0237 <- 2.67 -> DG O6 D0026 : score 6.2415 : H : ARG NH2 A0237 <- 2.64 -> DG N7 D0026 : score 6.58892 : H : GLU OE1 A0243 <- 3.32 -> DC N4 D0024 : score 5.16808 : H : ASP OD2 A0279 <- 2.90 -> DC N4 C0011 : score 6.076 : H : LYS NZ A0282 <- 3.11 -> DG N7 D0023 : score 5.05197 : H : LYS NZ A0282 <- 3.04 -> DG O6 D0023 : score 5.50329 : H : LYS NZ A0282 <- 2.61 -> DG O6 C0010 : score 6.00044 : H : ASN ND2 A0283 <- 2.89 -> DG O6 C0010 : score 5.53697 : H : ARG NH1 A0285 <- 3.09 -> DG N7 C0009 : score 5.6991 : H : ARG NH2 A0285 <- 2.57 -> DG O6 C0009 : score 6.9036 : x : SER xxxx A0217 <- 3.74 -> DC xxx D0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0241 <- 4.06 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0245 <- 3.57 -> DG xxx D0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0277 <- 4.17 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0280 <- 3.52 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0290 <- 3.68 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx >4rdm_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF R.NGOAVII RESTRICTION ENDONUCLEASE B3 DOMAIN WITH COGNATE DNA organism=Neisseria gonorrhoeae : H : ARG NE B0227 <- 2.95 -> DG O6 E0007 : score 3.82279 : H : ARG NH2 B0227 <- 2.83 -> DG N7 E0007 : score 6.34631 : H : ARG NH1 B0237 <- 2.67 -> DG O6 F0026 : score 6.2415 : H : ARG NH2 B0237 <- 2.58 -> DG N7 F0026 : score 6.66554 : H : ASP OD2 B0279 <- 3.23 -> DC N4 E0011 : score 5.6668 : H : LYS NZ B0282 <- 2.64 -> DG O6 E0010 : score 5.96575 : H : LYS NZ B0282 <- 3.05 -> DG N7 F0023 : score 5.1166 : H : LYS NZ B0282 <- 3.14 -> DG O6 F0023 : score 5.38768 : H : ASN ND2 B0283 <- 2.76 -> DG O6 E0010 : score 5.68357 : H : ARG NH1 B0285 <- 3.15 -> DG N7 E0009 : score 5.6265 : H : ARG NH2 B0285 <- 2.55 -> DG O6 E0009 : score 6.93 : x : SER xxxx B0217 <- 3.64 -> DC xxx F0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0241 <- 3.76 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0243 <- 3.24 -> DC xxx F0024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0245 <- 3.53 -> DG xxx F0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0277 <- 4.07 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0280 <- 3.45 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0290 <- 3.49 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx >4rdu_D:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A DISTAL-LESS HOMEOBOX PROTEIN 5 (DLX5) FROM HOMO SAPIENS AT 1.85 A RESOLUTION organism=? : w : ARG NH2 D0138 <- 5.92 -> DA N3 F0006 : score 2.092 : H : ARG NH1 D0141 <- 2.84 -> DT O2 F0005 : score 4.27196 : H : ARG NH2 D0141 <- 3.01 -> DT O2 F0005 : score 4.05553 : w : ARG NH1 D0141 <- 5.84 -> DA N3 E0010 : score 2.585 : w : GLN OE1 D0186 <- 5.87 -> DT O4 F0008 : score 3.068 : H : ASN OD1 D0187 <- 3.00 -> DA N6 F0007 : score 5.78092 : H : ASN ND2 D0187 <- 3.07 -> DA N7 F0007 : score 5.55351 : w : ASN OD1 D0187 <- 5.68 -> DT O4 F0008 : score 3.132 : w : ASN OD1 D0187 <- 5.97 -> DA N6 E0007 : score 2.837 : x : ILE xxxx D0183 <- 3.68 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx >4rec_A: title=A NUCLEASE-DNA COMPLEX FORM 3 organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx A0374 <- 3.19 -> DG xxx B0332 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0577 <- 3.55 -> DG xxx B0332 : score x.xxxxx >4ri8_A: title=FAN1 NUCLEASE BOUND TO 5' PHOSPHORYLATED P(DG)/3'(DT-DT-DT-DT) DOUBLE FLAP DNA organism=Homo sapiens : x : ASN xxxx A0980 <- 3.08 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0982 <- 3.89 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx >4ri9_B: title=FAN1 NUCLEASE BOUND TO 5' PHOSPHORYLATED P(DT)/3'(DT-DT-DT-DT-DT-DT- DT-DT) DOUBLE FLAP DNA organism=Homo sapiens : x : ASN xxxx B0980 <- 3.91 -> DC xxx W0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0982 <- 4.27 -> DG xxx T0010 : score x.xxxxx >4ria_A: title=FAN1 NUCLEASE BOUND TO 5' PHOSPHORYLATED NICKED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0982 <- 2.86 -> DG N7 G0012 : score 6.308 : H : ARG NH2 A0982 <- 3.30 -> DG O6 G0012 : score 5.94 : x : ASN xxxx A0980 <- 3.40 -> DA xxx F0005 : score x.xxxxx >4rib_A: title=FAN1 NUCLEASE BOUND TO 5' PHOSPHORYLATED P(DT) SINGLE FLAP DNA organism=Homo sapiens : x : GLU xxxx A0561 <- 3.93 -> DA xxx U0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0980 <- 3.51 -> DC xxx U0006 : score x.xxxxx >4rib_AB: title=FAN1 NUCLEASE BOUND TO 5' PHOSPHORYLATED P(DT) SINGLE FLAP DNA organism=Homo sapiens : x : GLU xxxx A0561 <- 3.93 -> DA xxx U0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0980 <- 3.51 -> DC xxx U0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0374 <- 3.69 -> DC xxx U0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0573 <- 3.51 -> DG xxx V0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0577 <- 4.05 -> DC xxx U0019 : score x.xxxxx >4ric_A: title=FAN1 NUCLEASE BOUND TO 5' HYDROXYL (DT-DT) SINGLE FLAP DNA organism=Homo sapiens : x : ASN xxxx A0980 <- 4.41 -> DC xxx U0006 : score x.xxxxx >4ric_AB: title=FAN1 NUCLEASE BOUND TO 5' HYDROXYL (DT-DT) SINGLE FLAP DNA organism=Homo sapiens : H : THR OG1 B0573 <- 2.96 -> DG O6 V0004 : score 4.08049 : x : ASN xxxx A0980 <- 4.41 -> DC xxx U0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0374 <- 3.42 -> DC xxx U0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0577 <- 3.65 -> DC xxx U0019 : score x.xxxxx >4rkg_AB: title=STRUCTURE OF THE MSL2 CXC DOMAIN BOUND WITH A NON-SPECIFIC (GC)6 DNA organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 A0526 <- 2.96 -> DG O6 I0007 : score 5.88867 : H : ARG NH2 A0526 <- 3.20 -> DG N7 I0007 : score 5.87385 : H : ARG NH1 A0543 <- 2.70 -> DC O2 I0004 : score 3.723 : H : ARG NH1 B0526 <- 2.93 -> DG N7 I0011 : score 5.8927 : H : ARG NH2 B0526 <- 2.99 -> DG O6 I0011 : score 6.3492 : H : ARG NH1 B0543 <- 2.65 -> DG N3 H0007 : score 3.14414 : H : ARG NH2 B0543 <- 3.05 -> DC O2 H0006 : score 3.51378 >4rkg_B: title=STRUCTURE OF THE MSL2 CXC DOMAIN BOUND WITH A NON-SPECIFIC (GC)6 DNA organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 B0526 <- 2.93 -> DG N7 I0011 : score 5.8927 : H : ARG NH2 B0526 <- 2.99 -> DG O6 I0011 : score 6.3492 : H : ARG NH1 B0543 <- 2.65 -> DG N3 H0007 : score 3.14414 : H : ARG NH2 B0543 <- 3.05 -> DC O2 H0006 : score 3.51378 >4rkh_CDEF: title=STRUCTURE OF THE MSL2 CXC DOMAIN BOUND WITH A SPECIFIC MRE SEQUENCE organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 C0543 <- 2.64 -> DT O2 B0009 : score 4.44422 : H : ARG NH2 C0543 <- 2.79 -> DC O2 B0010 : score 3.70612 : H : ARG NH1 D0543 <- 3.07 -> DG N3 A0012 : score 2.88773 : w : ARG NH2 E0526 <- 5.98 -> DA N6 B0006 : score 1.997 : H : ARG NH2 E0543 <- 2.90 -> DG N3 A0007 : score 3.53805 : w : ARG NH1 E0543 <- 5.75 -> DC O2 B0012 : score 1.381 : H : SER OG F0530 <- 2.75 -> DA N7 B0015 : score 4.50874 : H : SER OG F0530 <- 3.39 -> DA N6 B0015 : score 2.90155 : H : ARG NH1 F0543 <- 2.97 -> DC O2 B0014 : score 3.5259 : H : ARG NH2 F0543 <- 3.28 -> DC O2 B0014 : score 3.34364 : x : ARG xxxx C0526 <- 3.38 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0532 <- 3.78 -> DC xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0526 <- 3.46 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0526 <- 4.05 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0529 <- 4.33 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx >4rkh_F: title=STRUCTURE OF THE MSL2 CXC DOMAIN BOUND WITH A SPECIFIC MRE SEQUENCE organism=Drosophila melanogaster : H : SER OG F0530 <- 2.75 -> DA N7 B0015 : score 4.50874 : H : SER OG F0530 <- 3.39 -> DA N6 B0015 : score 2.90155 : H : ARG NH1 F0543 <- 2.97 -> DC O2 B0014 : score 3.5259 : H : ARG NH2 F0543 <- 3.28 -> DC O2 B0014 : score 3.34364 : x : ARG xxxx F0526 <- 4.05 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0529 <- 4.33 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx >4rnm_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN POLYMERASE ETA INSERTING DAMPNPP OPPOSITE DNA TEMPLATE CONTAINING AN ABASIC SITE organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0324 <- 6.18 -> DA N7 T0005 : score 1.989 : H : ARG NH1 A0382 <- 2.90 -> DG N7 P0004 : score 5.929 : H : ARG NH2 A0382 <- 2.96 -> DG O6 P0004 : score 6.3888 : x : SER xxxx A0322 <- 3.72 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.67 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0421 <- 4.41 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.15 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4rnn_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN POLYMERASE ETA INSERTING DGMPNPP OPPOSITE DNA TEMPLATE CONTAINING AN ABASIC SITE organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0324 <- 5.93 -> DA N7 T0005 : score 1.989 : H : ARG NH1 A0382 <- 2.81 -> DG N7 P0004 : score 6.0379 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.00 -> DG O6 P0004 : score 6.336 : x : ARG xxxx A0061 <- 3.35 -> DT xxx P0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.82 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.57 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0421 <- 4.02 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4rno_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN POLYMERASE ETA EXTENDING AN ABASIC SITE-DA PAIR BY INSERTING DCTP OPPOSITE TEMPLATE G organism=Homo sapiens : x : GLN xxxx A0038 <- 3.85 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 3.63 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.62 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.19 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >4roc_AB:TATA-box_binding_protein-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=HUMAN TFIIB-RELATED FACTOR 2 (BRF2) AND TBP BOUND TO U6#2 PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0110 <- 3.24 -> DA N3 T0008 : score 3.35803 : H : ARG NH2 A0110 <- 3.12 -> DC O2 T0009 : score 3.462 : H : TYR OH A0260 <- 2.84 -> DC N4 T0022 : score 4.18039 : H : ASN ND2 B0167 <- 2.98 -> DT O2 T0014 : score 4.57529 : H : ASN ND2 B0167 <- 3.19 -> DT O2 T0015 : score 4.37595 : H : ASN ND2 B0257 <- 3.19 -> DA N3 N0014 : score 3.51069 : H : THR OG1 B0313 <- 2.99 -> DA N3 N0014 : score 1.3024 : x : ALA xxxx A0108 <- 3.52 -> DC xxx T0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0169 <- 3.47 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0197 <- 3.21 -> DA xxx T0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0212 <- 3.45 -> DA xxx T0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0214 <- 3.42 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0220 <- 3.61 -> DA xxx N0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0222 <- 3.45 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0259 <- 3.44 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0288 <- 3.05 -> DT xxx N0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0289 <- 3.37 -> DA xxx T0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0303 <- 3.26 -> DT xxx N0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0305 <- 3.71 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0311 <- 3.15 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >4roc_B:TATA-box_binding_protein-like; title=HUMAN TFIIB-RELATED FACTOR 2 (BRF2) AND TBP BOUND TO U6#2 PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 B0167 <- 2.98 -> DT O2 T0014 : score 4.57529 : H : ASN ND2 B0167 <- 3.19 -> DT O2 T0015 : score 4.37595 : H : ASN ND2 B0257 <- 3.19 -> DA N3 N0014 : score 3.51069 : H : THR OG1 B0313 <- 2.99 -> DA N3 N0014 : score 1.3024 : x : VAL xxxx B0169 <- 3.47 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0197 <- 3.21 -> DA xxx T0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0212 <- 3.45 -> DA xxx T0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0214 <- 3.42 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0220 <- 3.61 -> DA xxx N0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0222 <- 3.45 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0259 <- 3.44 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0288 <- 3.05 -> DT xxx N0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0289 <- 3.37 -> DA xxx T0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0303 <- 3.26 -> DT xxx N0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0305 <- 3.71 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0311 <- 3.15 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >4rod_A:Cyclin-like; title=HUMAN TFIIB-RELATED FACTOR 2 (BRF2) AND TBP BOUND TO TRNAU1 PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0110 <- 3.16 -> DA N3 T0008 : score 3.41694 : H : TYR OH A0260 <- 2.74 -> DC N4 T0022 : score 4.26467 : x : ALA xxxx A0108 <- 3.59 -> DC xxx T0007 : score x.xxxxx >4rod_AB:TATA-box_binding_protein-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=HUMAN TFIIB-RELATED FACTOR 2 (BRF2) AND TBP BOUND TO TRNAU1 PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0110 <- 3.16 -> DA N3 T0008 : score 3.41694 : H : TYR OH A0260 <- 2.74 -> DC N4 T0022 : score 4.26467 : H : ASN ND2 B0257 <- 3.17 -> DA N3 N0014 : score 3.52592 : H : ASN ND2 B0257 <- 3.23 -> DT O2 N0015 : score 4.33798 : H : THR OG1 B0313 <- 2.90 -> DA N3 N0014 : score 1.32677 : x : ALA xxxx A0108 <- 3.59 -> DC xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0167 <- 3.43 -> DA xxx T0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0169 <- 3.24 -> DT xxx N0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0197 <- 3.17 -> DA xxx T0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0212 <- 3.48 -> DA xxx T0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0214 <- 3.37 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0220 <- 3.61 -> DA xxx N0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0222 <- 3.39 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0259 <- 3.43 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0288 <- 2.94 -> DT xxx N0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0289 <- 3.37 -> DG xxx T0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0303 <- 3.56 -> DT xxx N0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0305 <- 3.66 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0311 <- 3.38 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx >4roe_A:Cyclin-like; title=HUMAN TFIIB-RELATED FACTOR 2 (BRF2) AND TBP BOUND TO RPPH1 PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0110 <- 3.09 -> DC O2 N0023 : score 2.50475 : H : ARG NH2 A0110 <- 2.73 -> DT O2 N0022 : score 4.2926 : w : ARG NH2 A0110 <- 5.57 -> DA N3 T0009 : score 2.092 : x : ALA xxxx A0108 <- 3.77 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0260 <- 3.42 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx >4roe_AB:TATA-box_binding_protein-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=HUMAN TFIIB-RELATED FACTOR 2 (BRF2) AND TBP BOUND TO RPPH1 PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0110 <- 3.09 -> DC O2 N0023 : score 2.50475 : H : ARG NH2 A0110 <- 2.73 -> DT O2 N0022 : score 4.2926 : w : ARG NH2 A0110 <- 5.57 -> DA N3 T0009 : score 2.092 : H : ASN ND2 B0167 <- 2.99 -> DA N3 T0014 : score 3.663 : H : ASN ND2 B0167 <- 3.30 -> DT O2 T0015 : score 4.27154 : H : ASN ND2 B0257 <- 3.10 -> DA N3 N0015 : score 3.57923 : H : ASN ND2 B0257 <- 3.31 -> DT O2 N0016 : score 4.26205 : H : THR OG1 B0313 <- 2.84 -> DA N3 N0015 : score 1.34302 : x : ALA xxxx A0108 <- 3.77 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0260 <- 3.42 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0169 <- 3.35 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0197 <- 3.16 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0198 <- 4.30 -> DG xxx N0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0212 <- 3.31 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0214 <- 3.56 -> DA xxx N0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0220 <- 3.40 -> DA xxx N0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0222 <- 3.34 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0259 <- 3.31 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0288 <- 3.15 -> DT xxx N0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0289 <- 3.20 -> DG xxx T0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0303 <- 3.40 -> DT xxx N0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0305 <- 3.71 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0311 <- 3.34 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx >4rpy_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH GAPPED DNA CONTAINING AN 8-OXO-7,8- DIHYDRO-GUANINE(8-OXOG) AND DCTP SOAKED WITH MGCL2 FOR 30 S organism=HOMO SAPIENS : w : SER OG A0229 <- 5.75 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.74 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : LYS NZ A0234 <- 5.87 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : TYR OH A0271 <- 2.61 -> DC O2 P0010 : score 3.63034 : H : ASN ND2 A0279 <- 3.03 -> DC O2 P0011 : score 4.27343 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.75 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.69 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.71 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : HIS xxxx A0034 <- 3.35 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0276 <- 3.59 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx >4rpz_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH GAPPED DNA CONTAINING AN 8-OXO-7,8- DIHYDRO-GUANINE (8-OXOG)AND DCTP SOAKED WITH MGCL2 FOR 60 S organism=HOMO SAPIENS : w : LYS NZ A0234 <- 5.93 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : TYR OH A0271 <- 2.56 -> DC O2 P0010 : score 3.66531 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.97 -> DC O2 P0011 : score 4.32718 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.74 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.63 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.66 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : HIS xxxx A0034 <- 3.31 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0276 <- 3.37 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx >4rq0_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH GAPPED DNA CONTAINING AN 8-OXO-7,8- DIHYDRO-GUANINE (8-OXOG)AND DCTP SOAKED WITH MGCL2 FOR 80 S organism=HOMO SAPIENS : w : SER OG A0229 <- 5.93 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.85 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0234 <- 5.86 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : H : TYR OH A0271 <- 2.62 -> DC O2 P0010 : score 3.62334 : H : ASN ND2 A0279 <- 3.01 -> DC O2 P0011 : score 4.29135 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.58 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0276 <- 3.42 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0283 <- 3.56 -> DG xxx T0007 : score x.xxxxx >4rq1_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH GAPPED DNA CONTAINING AN 8-OXO-7,8- DIHYDRO-GUANINE(8-OXOG) AND DCTP SOAKED WITH MGCL2 FOR 1HR organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.49 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.75 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.83 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4rq2_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH GAPPED DNA CONTAINING AN 8-OXO-7,8- DIHYDRO-GUANINE (8-OXOG)AND DCTP SOAKED WITH MNCL2 FOR 35 S organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 5.85 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.74 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0234 <- 5.97 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : H : TYR OH A0271 <- 2.62 -> DC O2 P0010 : score 3.62334 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.60 -> DC O2 P0011 : score 4.65867 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.50 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.84 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : x : ASP xxxx A0276 <- 3.54 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx >4rq3_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=PRECATALYTIC TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH GAPPED DNA CONTAINING AN 8-OXO-7,8-DIHYDRO-GUANINE (8-OXOG) AND DATP IN THE PRESENCE OF CACL2 organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.20 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.83 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.58 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4rq4_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH GAPPED DNA CONTAINING AN 8-OXO-7,8- DIHYDRO-GUANINE(8-OXOG) AND DATP SOAKED WITH MGCL2 FOR 30 S organism=HOMO SAPIENS : w : SER OG A0229 <- 5.80 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.73 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0234 <- 5.96 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : H : TYR OH A0271 <- 2.68 -> DC O2 P0010 : score 3.58137 : w : TYR OH A0271 <- 6.50 -> DC O2 T0008 : score 1.343 : w : ASP OD2 A0276 <- 6.35 -> DA N7 P0011 : score 2.024 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.98 -> DA N3 P0011 : score 3.67062 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.91 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.08 -> DG N3 T0007 : score 0.677 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.87 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.87 -> DC O2 T0008 : score 1.988 >4rq5_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH GAPPED DNA CONTAINING AN 8-OXO-7,8- DIHYDRO-GUANINE (8-OXOG)AND DATP SOAKED WITH MGCL2 FOR 60 S organism=HOMO SAPIENS : w : SER OG A0229 <- 5.86 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.99 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : LYS NZ A0234 <- 6.10 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : TYR OH A0271 <- 2.89 -> DC O2 P0010 : score 3.43448 : H : ASN ND2 A0279 <- 3.23 -> DA N3 P0011 : score 3.48023 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.88 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.17 -> DG N3 T0007 : score 0.677 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.66 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.73 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : MET xxxx A0236 <- 4.21 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0276 <- 3.35 -> DA xxx P0011 : score x.xxxxx >4rq6_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH GAPPED DNA CONTAINING AN 8-OXO-7,8- DIHYDRO-GUANINE(8-OXOG) AND DATP SOAKED WITH MGCL2 FOR 80 S organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 6.21 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.94 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : LYS NZ A0234 <- 5.89 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : TYR OH A0271 <- 2.65 -> DC O2 P0010 : score 3.60236 : H : ASN ND2 A0279 <- 3.07 -> DA N3 P0011 : score 3.60208 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.89 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.21 -> DG N3 T0007 : score 0.677 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.62 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : x : ASP xxxx A0276 <- 3.44 -> DA xxx P0011 : score x.xxxxx >4rq7_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH GAPPED DNA CONTAINING AN 8-OXO-7,8- DIHYDRO-GUANINE (8-OXOG)AND DATP SOAKED WITH MGCL2 FOR 1HR organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 6.10 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 6.06 -> DG N2 T0009 : score 0.846 >4rq8_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH GAPPED DNA CONTAINING AN 8-OXO-7,8- DIHYDRO-GUANINE(8-OXOG) AND DATP SOAKED WITH MNCL2 FOR 35 S organism=HOMO SAPIENS : w : SER OG A0229 <- 5.97 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.89 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : LYS NZ A0234 <- 5.83 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : TYR OH A0271 <- 2.60 -> DC O2 P0010 : score 3.63733 : w : ASP OD2 A0276 <- 6.50 -> DA N6 P0011 : score 3.409 : H : ASN ND2 A0279 <- 3.05 -> DA N3 P0011 : score 3.61731 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.95 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.19 -> DG N3 T0007 : score 0.677 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.46 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.63 -> DC O2 T0008 : score 1.988 >4rt2_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH (ALPHA,BETA)-CH2-(BETA,GAMMA)-NH-DTTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.16 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.04 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.47 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4rt3_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH (ALPHA, BETA)-NH-(BETA,GAMMA)-CH2-DTTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.38 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.89 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.50 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4rtj_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=A NON-COGNATE COMPLEX OF ESCHERICHIA COLI DNA ADENINE METHYLTRANSFERASE (DAM) WITH DNA AND SINEFUNGIN organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0124 <- 2.78 -> DG O6 G0011 : score 6.10767 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.98 -> DG N7 G0011 : score 6.15477 : x : TYR xxxx A0092 <- 3.50 -> DA xxx G0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0095 <- 3.97 -> DA xxx G0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0132 <- 3.87 -> DA xxx G0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0134 <- 3.54 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx >4rtk_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=COMPLEX OF ESCHERICHIA COLI DNA ADENINE METHYLTRANSFERASE (DAM) WITH SAH AND WITH DNA CONTAINING DISTAL PAP REGULON SEQUENCE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0124 <- 2.68 -> DG O6 G0011 : score 6.22933 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.99 -> DG N7 G0011 : score 6.142 : x : ASN xxxx A0132 <- 3.87 -> DA xxx G0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0134 <- 3.55 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx >4rtl_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=COMPLEX OF ESCHERICHIA COLI DNA ADENINE METHYLTRANSFERASE (DAM) WITH SINEFUNGIN AND WITH DNA CONTAINING DISTAL PAP REGULON SEQUENCE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0124 <- 3.19 -> DG O6 G0011 : score 5.60883 : H : ARG NH2 A0124 <- 3.32 -> DG N7 G0011 : score 5.72062 : x : ASN xxxx A0132 <- 3.97 -> DA xxx G0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0134 <- 3.95 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx >4rtm_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=COMPLEX OF ESCHERICHIA COLI DNA ADENINE METHYLTRANSFERASE (DAM) WITH ADOMET AND WITH DNA CONTAINING DISTAL PAP REGULON SEQUENCE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0124 <- 2.67 -> DG O6 G0011 : score 6.2415 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.96 -> DG N7 G0011 : score 6.18031 : x : ASN xxxx A0132 <- 3.88 -> DA xxx G0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0134 <- 3.61 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx >4rtn_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=COMPLEX OF ESCHERICHIA COLI DNA ADENINE METHYLTRANSFERASE (DAM) WITH ADOHCY AND WITH DNA CONTAINING PROXIMAL PAP REGULON SEQUENCE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0124 <- 2.66 -> DG O6 F0011 : score 6.25367 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.98 -> DG N7 F0011 : score 6.15477 : x : ASN xxxx A0132 <- 4.06 -> DC xxx F0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0134 <- 3.48 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx >4rto_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=COMPLEX OF ESCHERICHIA COLI DNA ADENINE METHYLTRANSFERASE (DAM) WITH SINEFUNGIN AND WITH DNA CONTAINING PROXIMAL PAP REGULON SEQUENCE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0124 <- 2.60 -> DG O6 F0011 : score 6.32667 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.96 -> DG N7 F0011 : score 6.18031 : x : ASN xxxx A0132 <- 3.75 -> DC xxx F0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0134 <- 3.52 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx >4rtp_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=COMPLEX OF ESCHERICHIA COLI DNA ADENINE METHYLTRANSFERASE (DAM) WITH ADOMET AND WITH DNA CONTAINING PROXIMAL PAP REGULON SEQUENCE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0124 <- 2.80 -> DG O6 F0011 : score 6.08333 : H : ARG NH2 A0124 <- 3.03 -> DG N7 F0011 : score 6.09092 : x : ASN xxxx A0132 <- 3.84 -> DC xxx F0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0134 <- 3.54 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx >4rtq_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=COMPLEX OF ESCHERICHIA COLI DNA ADENINE METHYLTRANSFERASE (DAM) WITH ADOHCY AND A 5-BP NON-CANONICAL SITE (GTTTA ) organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0124 <- 2.84 -> DG O6 G0012 : score 6.03467 : H : ARG NH2 A0124 <- 3.06 -> DG N7 G0012 : score 6.05262 : x : ASN xxxx A0132 <- 3.90 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0134 <- 3.63 -> DG xxx G0012 : score x.xxxxx >4rtr_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=COMPLEX OF ESCHERICHIA COLI DNA ADENINE METHYLTRANSFERASE (DAM) WITH ADOMET AND A 5-BP NON-CANONICAL SITE (GTTTA ) organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0124 <- 2.81 -> DG O6 G0012 : score 6.07117 : H : ARG NH2 A0124 <- 3.10 -> DG N7 G0012 : score 6.00154 : x : ASN xxxx A0132 <- 4.02 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0134 <- 3.60 -> DG xxx G0012 : score x.xxxxx >4rts_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=COMPLEX OF ESCHERICHIA COLI DNA ADENINE METHYLTRANSFERASE (DAM) WITH ADOMET AND A 5-BP NON-CANONICAL SITE (GTCTA) organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0124 <- 2.75 -> DG O6 G0012 : score 6.14417 : H : ARG NH2 A0124 <- 3.13 -> DG N7 G0012 : score 5.96323 : x : ASN xxxx A0132 <- 3.99 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0134 <- 3.81 -> DG xxx G0012 : score x.xxxxx >4ru9_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING DCMPNPP OPPOSITE A MEFAPY-DG ADDUCTED DNA TEMPLATE organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.02 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.83 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.56 -> DG xxx P0004 : score x.xxxxx >4rua_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF Y-FAMILY DNA POLYMERASE DPO4 BYPASSING A MEFAPY- DG ADDUCT organism=Sulfolobus solfataricus P2 : x : ARG xxxx A0336 <- 4.15 -> DA xxx T0407 : score x.xxxxx >4ruc_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF Y-FAMILY DNA POLYMERASE DPO4 EXTENDING FROM A MEFAPY-DG:DC PAIR organism=Sulfolobus solfataricus P2 : x : VAL xxxx A0032 <- 3.77 -> DT xxx T0404 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.69 -> DT xxx T0404 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0332 <- 4.13 -> DT xxx T0406 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.02 -> DA xxx T0407 : score x.xxxxx >4rul_A:Prokaryotic_type_I_DNA_topoisomerase;Zinc_beta-ribbon; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FULL-LENGTH E.COLI TOPOISOMERASE I IN COMPLEX WITH SSDNA organism=Escherichia coli DH1 : H : THR OG1 A0633 <- 3.03 -> DG N7 B0028 : score 3.33778 : H : ASN OD1 A0635 <- 3.20 -> DG N2 B0028 : score 4.416 : H : THR OG1 A0792 <- 2.84 -> DG O6 B0022 : score 4.18166 : V : SER CB A0852 <- 3.89 -> DT C7 B0019 : score 3.06083 : x : ARG xxxx A0609 <- 3.48 -> DG xxx B0029 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0611 <- 4.19 -> DG xxx B0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0613 <- 3.23 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0616 <- 3.40 -> DG xxx B0028 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0622 <- 3.35 -> DG xxx B0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0631 <- 4.37 -> DG xxx B0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0724 <- 3.15 -> DT xxx B0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0725 <- 3.11 -> DT xxx B0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0728 <- 3.48 -> DT xxx B0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0739 <- 4.12 -> DT xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0773 <- 3.69 -> DA xxx B0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0777 <- 3.26 -> DG xxx B0022 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0780 <- 3.14 -> DG xxx B0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0782 <- 3.52 -> DA xxx B0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0786 <- 3.19 -> DA xxx B0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0787 <- 3.18 -> DT xxx B0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0790 <- 4.04 -> DA xxx B0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0833 <- 3.86 -> DC xxx B0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0839 <- 3.53 -> DT xxx B0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0841 <- 4.33 -> DT xxx B0019 : score x.xxxxx >4rve_AB:Restriction_endonuclease-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ECORV ENDONUCLEASE AND OF ITS COMPLEXES WITH COGNATE AND NON-COGNATE DNA SEGMENTS organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 2.73 -> DC O2 D0008 : score 4.5422 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.29 -> DA N6 D0004 : score 6.63602 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.97 -> DA N7 D0004 : score 5.67092 : H : THR OG1 A0186 <- 2.87 -> DT O4 E0007 : score 3.83276 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.67 -> DA N6 E0004 : score 6.17836 : H : ASN ND2 B0185 <- 3.05 -> DA N7 E0004 : score 5.57699 : H : THR OG1 B0186 <- 3.25 -> DA N6 E0004 : score 2.51067 : H : THR OG1 B0186 <- 2.71 -> DT O4 D0007 : score 3.95715 : V : THR CG2 B0106 <- 3.79 -> DT C7 D0007 : score 4.24752 : x : LYS xxxx A0038 <- 3.30 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0069 <- 4.46 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0106 <- 3.73 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 2.93 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.76 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0038 <- 3.73 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0070 <- 3.69 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.47 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.36 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >4rve_C:Restriction_endonuclease-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ECORV ENDONUCLEASE AND OF ITS COMPLEXES WITH COGNATE AND NON-COGNATE DNA SEGMENTS organism=Escherichia coli : H : THR OG1 C0186 <- 2.47 -> DT O4 F0007 : score 4.14373 : V : SER CB C0183 <- 3.74 -> DT C7 F0007 : score 3.17825 : x : LYS xxxx C0038 <- 3.99 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0070 <- 3.54 -> DA xxx F0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0106 <- 4.02 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0188 <- 3.61 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx >4rzr_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=BYPASS OF A BULKY ADDUCT DG1,8 BY DPO4 organism=Sulfolobus solfataricus : w : ARG NH1 A0332 <- 6.57 -> DA N6 B0007 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0336 <- 2.72 -> DG O6 B0010 : score 6.18067 : H : ARG NH2 A0336 <- 2.82 -> DG N7 B0010 : score 6.35908 : x : HIS xxxx A0285 <- 3.94 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0297 <- 3.89 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx >4s04_EF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF KLEBSIELLA PNEUMONIAE PMRA IN COMPLEX WITH PMRA BOX DNA organism=Klebsiella pneumoniae : H : ASN ND2 E0188 <- 3.06 -> DT O4 H0016 : score 5.00982 : H : ARG NH2 E0210 <- 2.94 -> DT O2 G0013 : score 4.1148 : H : ASN OD1 F0188 <- 3.32 -> DA N6 G0019 : score 5.39553 : H : ASN ND2 F0188 <- 2.90 -> DT O4 H0005 : score 5.17892 : H : ARG NH1 F0210 <- 3.05 -> DT O2 H0001 : score 4.09109 : V : VAL CG2 E0192 <- 3.83 -> DT C7 G0007 : score 6.07715 : V : VAL CG1 F0192 <- 3.88 -> DT C7 H0006 : score 5.9393 : x : HIS xxxx E0193 <- 3.68 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0195 <- 3.37 -> DT xxx H0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0187 <- 3.59 -> DT xxx G0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0191 <- 3.32 -> DC xxx H0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0195 <- 3.50 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx >4s04_F:CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF KLEBSIELLA PNEUMONIAE PMRA IN COMPLEX WITH PMRA BOX DNA organism=Klebsiella pneumoniae : H : ASN OD1 F0188 <- 3.32 -> DA N6 G0019 : score 5.39553 : H : ASN ND2 F0188 <- 2.90 -> DT O4 H0005 : score 5.17892 : H : ARG NH1 F0210 <- 3.05 -> DT O2 H0001 : score 4.09109 : V : VAL CG1 F0192 <- 3.88 -> DT C7 H0006 : score 5.9393 : x : THR xxxx F0187 <- 3.59 -> DT xxx G0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0191 <- 3.32 -> DC xxx H0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0195 <- 3.50 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx >4s05_A:CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF KLEBSIELLA PNEUMONIAE PMRA IN COMPLEX WITH PMRA BOX DNA organism=Klebsiella pneumoniae : H : ASN ND2 A0188 <- 2.51 -> DA N7 C0008 : score 6.211 : x : THR xxxx A0187 <- 4.36 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0191 <- 3.95 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0192 <- 3.20 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0193 <- 3.67 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0195 <- 3.18 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0210 <- 3.32 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >4s05_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF KLEBSIELLA PNEUMONIAE PMRA IN COMPLEX WITH PMRA BOX DNA organism=Klebsiella pneumoniae : H : ASN ND2 A0188 <- 2.51 -> DA N7 C0008 : score 6.211 : V : GLU CB B0191 <- 3.83 -> DT C7 D0006 : score 1.61548 : x : THR xxxx A0187 <- 4.36 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0191 <- 3.95 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0192 <- 3.20 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0193 <- 3.67 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0195 <- 3.18 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0210 <- 3.32 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0187 <- 4.10 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.34 -> DA xxx C0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0189 <- 3.88 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0192 <- 3.49 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0195 <- 3.44 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >4s0h_AB:p53-like_transcription_factors;Homeodomain-like; title=TBX5 DB, NKX2.5 HD, ANF DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0081 <- 2.84 -> DG N7 D0014 : score 6.33354 : H : ARG NH1 B0142 <- 2.52 -> DG N3 C0013 : score 3.22351 : H : GLN OE1 B0187 <- 3.01 -> DC N4 D0002 : score 4.39083 : H : ASN OD1 B0188 <- 2.89 -> DA N6 C0015 : score 5.9134 : H : ASN ND2 B0188 <- 2.93 -> DA N7 C0015 : score 5.71788 : x : THR xxxx A0215 <- 3.59 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0232 <- 3.92 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0236 <- 3.44 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0184 <- 4.01 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0191 <- 3.56 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx >4s0h_B:Homeodomain-like; title=TBX5 DB, NKX2.5 HD, ANF DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 B0142 <- 2.52 -> DG N3 C0013 : score 3.22351 : H : GLN OE1 B0187 <- 3.01 -> DC N4 D0002 : score 4.39083 : H : ASN OD1 B0188 <- 2.89 -> DA N6 C0015 : score 5.9134 : H : ASN ND2 B0188 <- 2.93 -> DA N7 C0015 : score 5.71788 : x : ILE xxxx B0184 <- 4.01 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0191 <- 3.56 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx >4s0h_EF:p53-like_transcription_factors;Homeodomain-like; title=TBX5 DB, NKX2.5 HD, ANF DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 E0081 <- 2.96 -> DG N7 H0014 : score 6.18031 : H : ASN OD1 F0151 <- 2.90 -> DA N6 G0015 : score 5.90136 : H : ASN ND2 F0151 <- 2.54 -> DA N7 G0015 : score 6.17578 : x : THR xxxx E0215 <- 4.01 -> DC xxx G0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0232 <- 3.94 -> DG xxx H0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0236 <- 3.29 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0147 <- 3.88 -> DA xxx G0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0150 <- 3.14 -> DC xxx H0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0154 <- 3.48 -> DC xxx H0004 : score x.xxxxx >4s0n_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF HLTF HIRAN DOMAIN BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0073 <- 2.87 -> DT N3 E0009 : score 1.42212 : H : ASN ND2 A0091 <- 3.08 -> DT O2 E0010 : score 4.48037 : H : HIS ND1 A0110 <- 2.70 -> DT O2 E0009 : score -6.16969 : V : PHE CD1 A0142 <- 3.61 -> DT C7 E0006 : score 4.34793 : x : TYR xxxx A0072 <- 3.44 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0093 <- 3.27 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0112 <- 3.25 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx >4s2q_D:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HMG DOMAIN OF THE CHONDROGENESIS MASTER REGULATOR, SOX9 IN COMPLEX WITH CHIP-SEQ IDENTIFIED DNA ELEMENT organism=Mus musculus : H : ARG NH1 D0070 <- 3.22 -> DC O2 B0007 : score 3.3434 : H : ARG NH1 D0070 <- 2.66 -> DT O2 A0011 : score 4.42699 : H : ARG NH2 D0070 <- 2.89 -> DT O2 A0011 : score 4.15713 : H : ASN ND2 D0073 <- 2.96 -> DT O2 A0009 : score 4.59428 : H : ASN ND2 D0073 <- 3.11 -> DG N3 A0010 : score 4.59139 : H : ASN ND2 D0095 <- 2.85 -> DG N3 B0011 : score 4.84592 : H : SER OG D0099 <- 2.60 -> DT O2 A0007 : score 3.84533 : H : TYR OH D0137 <- 2.48 -> DA N3 B0006 : score 4.41696 : x : PHE xxxx D0075 <- 3.61 -> DT xxx A0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0076 <- 3.32 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0083 <- 3.42 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0096 <- 4.45 -> DC xxx A0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0141 <- 4.38 -> DT xxx A0014 : score x.xxxxx >4skn_E:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=A NUCLEOTIDE-FLIPPING MECHANISM FROM THE STRUCTURE OF HUMAN URACIL- DNA GLYCOSYLASE BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : x : PRO xxxx E0271 <- 3.13 -> DG xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0272 <- 2.62 -> DG xxx A0004 : score x.xxxxx >4tnt_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE HUMAN MINERALOCORTICOID RECEPTOR IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0624 <- 2.76 -> DG N7 C0003 : score 5.42898 : H : ARG NH1 A0629 <- 3.03 -> DG N7 D0012 : score 5.7717 : H : ARG NH2 A0629 <- 2.79 -> DG O6 D0012 : score 6.6132 : H : LYS NZ B0624 <- 2.63 -> DG N7 D0003 : score 5.56902 : H : ARG NH1 B0629 <- 3.01 -> DG N7 C0012 : score 5.7959 : H : ARG NH2 B0629 <- 2.75 -> DG O6 C0012 : score 6.666 : x : VAL xxxx A0625 <- 4.07 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0625 <- 4.01 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >4tnt_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE HUMAN MINERALOCORTICOID RECEPTOR IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0624 <- 2.63 -> DG N7 D0003 : score 5.56902 : H : ARG NH1 B0629 <- 3.01 -> DG N7 C0012 : score 5.7959 : H : ARG NH2 B0629 <- 2.75 -> DG O6 C0012 : score 6.666 : x : VAL xxxx B0625 <- 4.01 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >4tqr_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF Y-FAMILY DNA POLYMERASE DPO4 WITH (5'S)-8,5'-CYCLO- 2'-DEOXYGUANOSINE AND DTTP organism=Sulfolobus solfataricus : x : SER xxxx A0244 <- 3.91 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0297 <- 3.60 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.99 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx >4tqs_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF Y-FAMILY DNA POLYMERASE DPO4 WITH (5'S)-8,5'-CYCLO- 2'-DEOXYGUANOSINE AND DCTP organism=Sulfolobus solfataricus : w : HIS NE2 B0285 <- 6.56 -> DA N6 C0007 : score 2.619 : w : SER OG B0297 <- 6.22 -> DG N7 C0008 : score 2.749 : x : ILE xxxx B0295 <- 4.48 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx >4tu9_A:RNA-binding_domain,_RBD; title=STRUCTURE OF U2AF65 VARIANT WITH BRU5G6 DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0150 <- 2.40 -> DG N7 P0006 : score 6.89538 : x : SER xxxx A0147 <- 4.19 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0195 <- 3.32 -> DU xxx P0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0196 <- 3.63 -> DU xxx P0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0199 <- 3.78 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0229 <- 2.98 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0230 <- 4.13 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0231 <- 2.58 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >4tug_AB:Metallo-dependent_phosphatases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MJMRE11-DNA2 COMPLEX organism=Methanocaldococcus jannaschii : x : ASN xxxx B0017 <- 3.47 -> DG xxx G0005 : score x.xxxxx >4tug_B:Metallo-dependent_phosphatases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MJMRE11-DNA2 COMPLEX organism=Methanocaldococcus jannaschii : x : ASN xxxx B0017 <- 3.47 -> DG xxx G0005 : score x.xxxxx >4tui_AB:Metallo-dependent_phosphatases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MJMRE11-DNA1 COMPLEX organism=Methanocaldococcus jannaschii : x : ASN xxxx B0017 <- 3.94 -> DC xxx G0014 : score x.xxxxx >4tup_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH GG AS THE TEMPLATE (GG0B) IN A 1-NUCLEOTIDE GAPPED DNA organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.76 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.54 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4tuq_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA INSERTING DCMPNPP OPPOSITE GG TEMPLATE (GG0B). organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ A0234 <- 2.77 -> DC O2 T0009 : score 2.96383 : H : LYS NZ A0280 <- 2.46 -> DG N7 T0006 : score 5.75214 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.87 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.24 -> DG N3 T0007 : score 2.669 >4tur_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA INSERTING DCMPNPP OPPOSITE THE 5'G OF CISPLATIN CROSSLINKED GS (PT-GG2) organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.38 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.79 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.56 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4tus_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA INSERTING DCMPNPP OPPOSITE THE 5'G OF CISPLATIN CROSSLINKED GS (PT-GG2) WITH MANGANESE IN THE ACTIVE SITE. organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.40 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.90 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.52 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4u0y_ABCD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA-BINDING DOMAINS OF YVOA IN COMPLEX WITH PALINDROMIC OPERATOR DNA organism=Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 : w : GLU OE2 A0037 <- 5.95 -> DC N4 E0012 : score 3.597 : w : GLU OE2 A0037 <- 5.47 -> DA N6 E0013 : score 2.785 : w : ARG NH1 A0048 <- 5.87 -> DC N4 E0012 : score 1.892 : H : ARG NH1 B0038 <- 3.02 -> DG N7 F0003 : score 5.7838 : H : ARG NH2 B0038 <- 2.97 -> DG O6 F0003 : score 6.3756 : H : ARG NH2 B0048 <- 2.46 -> DG O6 F0004 : score 7.0488 : w : ARG NE B0048 <- 6.07 -> DA N6 E0010 : score 1.081 : w : ARG NH2 B0048 <- 5.95 -> DA N6 E0010 : score 1.997 : w : GLU OE2 C0037 <- 5.82 -> DC N4 F0012 : score 3.597 : w : GLU OE2 C0037 <- 6.04 -> DA N6 F0013 : score 2.785 : H : SER OG C0047 <- 3.06 -> DG O6 E0001 : score 3.87829 : w : ARG NH1 C0048 <- 5.86 -> DC N4 F0012 : score 1.892 : H : ARG NH1 D0038 <- 2.99 -> DG N7 E0003 : score 5.8201 : H : ARG NH2 D0038 <- 2.99 -> DG O6 E0003 : score 6.3492 : H : ARG NH1 D0048 <- 2.91 -> DG O6 E0004 : score 5.9495 : H : ARG NH2 D0048 <- 2.81 -> DG N7 E0004 : score 6.37185 : w : ARG NH1 D0048 <- 5.80 -> DA N6 F0010 : score 1.486 : x : SER xxxx A0047 <- 3.85 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0049 <- 3.23 -> DC xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.36 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0049 <- 3.41 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0050 <- 4.36 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0052 <- 3.21 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0049 <- 3.45 -> DC xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0047 <- 3.40 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0049 <- 3.42 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0050 <- 4.40 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0052 <- 3.25 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx >4u0y_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA-BINDING DOMAINS OF YVOA IN COMPLEX WITH PALINDROMIC OPERATOR DNA organism=Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 : H : ARG NH1 B0038 <- 3.02 -> DG N7 F0003 : score 5.7838 : H : ARG NH2 B0038 <- 2.97 -> DG O6 F0003 : score 6.3756 : H : ARG NH2 B0048 <- 2.46 -> DG O6 F0004 : score 7.0488 : w : ARG NE B0048 <- 6.07 -> DA N6 E0010 : score 1.081 : w : ARG NH2 B0048 <- 5.95 -> DA N6 E0010 : score 1.997 : x : SER xxxx B0047 <- 3.36 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0049 <- 3.41 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0050 <- 4.36 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0052 <- 3.21 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx >4u6p_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURAL MECHANISM OF ERROR-FREE BYPASS OF MAJOR BENZO[A]PYRENE ADDUCT BY HUMAN POLYMERASE KAPPA organism=Homo sapiens : w : THR OG1 B0469 <- 6.10 -> DG N7 P0008 : score 3.422 : x : MET xxxx B0135 <- 3.56 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0151 <- 3.47 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0419 <- 3.47 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0459 <- 4.11 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >4u7b_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A PRE-CLEAVAGE MOS1 TRANSPOSOSOME organism=Drosophila mauritiana : H : ARG NH1 B0048 <- 2.76 -> DG N7 E0022 : score 6.0984 : H : ARG NH2 B0048 <- 2.57 -> DG O6 E0022 : score 6.9036 : H : HIS ND1 B0065 <- 3.01 -> DC O2 F0040 : score 3.08894 : H : GLN OE1 B0100 <- 2.99 -> DA N6 E0009 : score 5.82257 : H : GLN NE2 B0100 <- 2.83 -> DA N7 E0009 : score 6.05321 : H : GLN NE2 B0101 <- 2.44 -> DG O6 F0047 : score 6.2231 : V : LYS CG B0044 <- 3.52 -> DT C7 E0023 : score 2.2673 : x : GLU xxxx B0047 <- 3.45 -> DC xxx F0032 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0067 <- 4.46 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0068 <- 3.07 -> DT xxx F0042 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0099 <- 3.68 -> DT xxx F0046 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0102 <- 4.43 -> DT xxx F0045 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0104 <- 4.08 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx >4u7c_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF DNA POLYMERASE KAPPA IN COMPLEX WITH BENZOPYRENE ADDUCTED DNA organism=Homo sapiens : x : GLU xxxx A0419 <- 3.39 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0459 <- 4.39 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0512 <- 3.96 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >4uaw_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA SUBSTRATE COMPLEX WITH A TEMPLATING ADENINE AND INCOMING 8-OXODGTP, 0 S organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.16 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.91 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.65 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4uay_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA PRODUCT COMPLEX WITH A TEMPLATING ADENINE AND INSERTED 8-OXODGMP, 40 S organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.14 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.94 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.64 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4uaz_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA REACTANT COMPLEX WITH A TEMPLATING ADENINE AND INCOMING 8-OXODGTP, 20 S organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.19 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.91 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.61 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4ub1_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA PRODUCT COMPLEX WITH A TEMPLATING ADENINE AND 8- OXODGMP, 90 S organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.16 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.65 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.74 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4ub2_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA PRODUCT COMPLEX WITH A TEMPLATING CYTOSINE AND 8- OXODGMP, 120 S organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.34 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.84 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.53 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4ub3_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA CLOSED PRODUCT COMPLEX WITH A TEMPLATING CYTOSINE AND 8-OXODGMP, 60 S organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 6.25 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 6.10 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : LYS NZ A0234 <- 6.28 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : ARG NH1 A0258 <- 6.12 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : H : TYR OH A0271 <- 2.75 -> DC O2 P0010 : score 3.53241 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.51 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0283 <- 5.87 -> DG N3 T0007 : score 0.677 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.35 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.40 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : LYS xxxx A0280 <- 3.53 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx >4ub4_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA SUBSTRATE COMPLEX WITH A TEMPLATING CYTOSINE AND INCOMING DGTP, 0 S organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.28 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.94 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.66 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4ub5_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA SUBSTRATE COMPLEX WITH A TEMPLATING CYTOSINE, INCOMING 8-OXODGTP, AND MN2+, 5 S organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0041 <- 6.13 -> DG N2 D0001 : score 0.846 : x : HIS xxxx A0034 <- 3.49 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.45 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.50 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4ubb_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA REACTANT COMPLEX WITH A TEMPLATING CYTOSINE AND INCOMING 8-OXODGTP, 40 S organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.32 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.93 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.71 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4ubc_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA SUBSTRATE COMPLEX WITH A TEMPLATING CYTOSINE AND INCOMING 8-OXODGTP, 0 S organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.23 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.00 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.68 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4umk_D:KorB_DNA-binding_domain-like;ParB/Sulfiredoxin; title=THE COMPLEX OF SPO0J AND PARS DNA IN CHROMOSOMAL PARTITION SYSTEM organism=HELICOBACTER PYLORI : H : ARG NH1 D0159 <- 2.82 -> DG N7 Z0006 : score 6.0258 : H : ARG NH2 D0159 <- 2.29 -> DG O6 Z0006 : score 7.2732 : H : ASN ND2 D0164 <- 3.34 -> DT O4 Z0008 : score 4.71388 : H : ARG NH1 D0215 <- 2.65 -> DT O4 Y0014 : score 3.36599 : H : GLU OE2 D0218 <- 2.57 -> DC N4 Z0010 : score 5.50759 : V : ALA CB D0163 <- 3.86 -> DT C7 Z0007 : score 5.51499 : x : GLU xxxx D0149 <- 3.79 -> DT xxx Z0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0158 <- 3.65 -> DG xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0160 <- 3.15 -> DT xxx Z0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0167 <- 3.85 -> DT xxx Z0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0190 <- 2.98 -> DC xxx Z0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0214 <- 3.85 -> DT xxx Y0014 : score x.xxxxx >4umm_AE:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain;Nuclear_receptor_ligand-binding_domain; title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF THE PALINDROMIC DNA-BOUND USP-ECR NUCLEAR RECEPTOR REVEALS AN ASYMMETRIC ORGANIZATION WITH ALLOSTERIC DOMAIN POSITIONING organism=HELIOTHIS VIRESCENS : H : GLU OE1 A0131 <- 2.87 -> DA N6 D0015 : score 2.6445 : H : LYS NZ A0134 <- 2.69 -> DG O6 C0006 : score 5.90795 : H : ARG NH1 A0139 <- 2.96 -> DG N7 D0013 : score 5.8564 : H : GLU OE1 E0165 <- 3.36 -> DA N6 C0015 : score 2.38166 : H : LYS NZ E0168 <- 2.70 -> DG O6 D0006 : score 5.89638 : V : ARG CZ E0172 <- 3.57 -> DT C7 D0007 : score 2.25492 : x : LYS xxxx A0138 <- 3.84 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0187 <- 3.83 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0173 <- 3.67 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0197 <- 4.43 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx >4umm_E:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF THE PALINDROMIC DNA-BOUND USP-ECR NUCLEAR RECEPTOR REVEALS AN ASYMMETRIC ORGANIZATION WITH ALLOSTERIC DOMAIN POSITIONING organism=HELIOTHIS VIRESCENS : H : GLU OE1 E0165 <- 3.36 -> DA N6 C0015 : score 2.38166 : H : LYS NZ E0168 <- 2.70 -> DG O6 D0006 : score 5.89638 : V : ARG CZ E0172 <- 3.57 -> DT C7 D0007 : score 2.25492 : x : ARG xxxx E0173 <- 3.67 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0197 <- 4.43 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx >4un3_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CAS9 BOUND TO PAM-CONTAINING DNA TARGET organism=STREPTOCOCCUS PYOGENES : H : LYS NZ B1107 <- 2.82 -> DC O2 C0007 : score 2.93437 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.26 -> DG N7 D0006 : score 5.4934 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.72 -> DG O6 D0006 : score 6.7056 : H : ARG NH1 B1335 <- 2.59 -> DG O6 D0007 : score 6.33883 : H : ARG NH2 B1335 <- 3.02 -> DG N7 D0007 : score 6.10369 : x : GLU xxxx B1219 <- 3.97 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx >4un7_G:Homing_endonucleases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA BEFORE INCUBATION IN 5MM MN (STATE 1) organism=? : H : ARG NH1 G0033 <- 2.30 -> DG O6 H0021 : score 6.69167 : H : ARG NH2 G0033 <- 3.03 -> DG N7 H0020 : score 6.09092 : H : GLU OE1 G0035 <- 2.94 -> DC N4 I0006 : score 5.60645 : H : ARG NH1 G0037 <- 2.55 -> DG O6 I0008 : score 6.3875 : H : ARG NH2 G0037 <- 2.81 -> DG O6 I0007 : score 6.5868 : H : ARG NH2 G0037 <- 3.03 -> DG O6 I0008 : score 6.2964 : w : ARG NH1 G0037 <- 5.80 -> DT O4 H0017 : score 1.768 : H : ASP OD2 G0075 <- 3.33 -> DC N4 I0011 : score 5.5428 : H : THR OG1 G0076 <- 2.65 -> DA N7 H0014 : score 3.51653 : H : THR OG1 G0076 <- 3.29 -> DA N6 H0014 : score 2.4886 : H : ARG NE G0077 <- 2.67 -> DG N7 H0015 : score 4.53676 : H : ARG NE G0077 <- 3.07 -> DG O6 H0015 : score 3.72821 : H : ARG NH2 G0077 <- 2.74 -> DT O4 H0016 : score 3.59649 : w : GLU OE2 G0079 <- 5.39 -> DT O4 H0017 : score 2.279 : H : ARG NH1 G0081 <- 2.90 -> DG N7 I0008 : score 5.929 : H : ARG NH2 G0081 <- 3.25 -> DG N7 I0008 : score 5.81 : H : ARG NH1 G0124 <- 2.75 -> DG O6 H0006 : score 6.14417 : H : ARG NH1 G0124 <- 3.03 -> DG O6 I0019 : score 5.8035 : H : ARG NH2 G0124 <- 2.34 -> DG O6 I0019 : score 7.2072 : H : ARG NH1 G0126 <- 2.95 -> DG O6 I0018 : score 5.90083 : H : ARG NH2 G0126 <- 3.23 -> DG N7 I0018 : score 5.83554 : H : ASP OD1 G0154 <- 2.87 -> DC N4 H0008 : score 5.27004 : H : ASP OD2 G0155 <- 3.07 -> DC N4 I0015 : score 5.8652 : H : ARG NH1 G0157 <- 2.93 -> DG N7 H0010 : score 5.8927 : H : ARG NH1 G0157 <- 3.17 -> DG O6 H0011 : score 5.63317 : H : ARG NH2 G0157 <- 2.40 -> DG O6 H0010 : score 7.128 : x : TYR xxxx G0025 <- 3.63 -> DT xxx H0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0027 <- 4.14 -> DT xxx H0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0029 <- 3.32 -> DC xxx H0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0034 <- 3.36 -> DG xxx I0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0039 <- 4.48 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0041 <- 4.25 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0070 <- 3.28 -> DG xxx I0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0072 <- 4.48 -> DA xxx I0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0083 <- 4.24 -> DC xxx I0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx G0128 <- 3.52 -> DC xxx I0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0158 <- 3.11 -> DA xxx I0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0160 <- 3.88 -> DC xxx I0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0167 <- 4.21 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx >4un8_D:Homing_endonucleases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 1H INCUBATION IN 5MM MN (STATE 2) organism=DESULFUROCOCCUS MOBILIS : H : ARG NH1 D0033 <- 2.27 -> DG O6 E0021 : score 6.72817 : H : GLU OE1 D0035 <- 2.84 -> DC N4 F0006 : score 5.72181 : H : ARG NH1 D0037 <- 2.74 -> DG O6 F0008 : score 6.15633 : H : ARG NH2 D0037 <- 2.70 -> DG O6 F0007 : score 6.732 : H : ARG NH2 D0037 <- 3.03 -> DG O6 F0008 : score 6.2964 : w : ARG NH1 D0037 <- 5.89 -> DT O4 E0017 : score 1.768 : H : ASP OD2 D0075 <- 3.41 -> DC N4 F0011 : score 5.4436 : H : THR OG1 D0076 <- 2.62 -> DA N7 E0014 : score 3.53701 : H : THR OG1 D0076 <- 2.91 -> DA N6 E0014 : score 2.69828 : H : GLU OE1 D0079 <- 3.34 -> DA N6 F0009 : score 2.39239 : w : GLU OE2 D0079 <- 5.54 -> DT O4 E0017 : score 2.279 : H : ARG NH1 D0081 <- 2.88 -> DG N7 F0008 : score 5.9532 : H : ARG NH2 D0081 <- 2.97 -> DG N7 F0008 : score 6.16754 : H : ARG NH1 D0124 <- 2.95 -> DG O6 F0019 : score 5.90083 : H : ARG NH2 D0124 <- 2.68 -> DG O6 E0006 : score 6.7584 : H : ARG NH2 D0124 <- 2.97 -> DG O6 F0019 : score 6.3756 : H : ARG NH1 D0126 <- 2.99 -> DG O6 F0018 : score 5.85217 : H : ARG NH2 D0126 <- 2.99 -> DG N7 F0018 : score 6.142 : H : ASP OD1 D0154 <- 3.40 -> DC N4 E0008 : score 4.70349 : H : ASP OD2 D0155 <- 3.06 -> DC N4 F0015 : score 5.8776 : H : ARG NH1 D0157 <- 2.61 -> DG N7 E0010 : score 6.2799 : H : ARG NH2 D0157 <- 2.64 -> DG O6 E0010 : score 6.8112 : x : TYR xxxx D0025 <- 3.49 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0027 <- 3.90 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0029 <- 3.56 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0034 <- 3.51 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0039 <- 4.36 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0041 <- 3.78 -> DG xxx E0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0070 <- 3.42 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0072 <- 4.13 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0077 <- 2.93 -> DG xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0083 <- 3.98 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0128 <- 3.48 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0158 <- 3.61 -> DA xxx F0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0160 <- 3.74 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0167 <- 3.95 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx >4un9_A:Homing_endonucleases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 8H INCUBATION IN 5MM MN (STATE 3) organism=? : H : ARG NH1 A0033 <- 2.83 -> DG O6 B0021 : score 6.04683 : H : GLU OE1 A0035 <- 2.84 -> DC N4 C0006 : score 5.72181 : H : ARG NH1 A0037 <- 2.89 -> DG O6 C0008 : score 5.97383 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.85 -> DG O6 C0007 : score 6.534 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.82 -> DG O6 C0008 : score 6.5736 : w : ARG NH1 A0037 <- 5.54 -> DT O4 B0017 : score 1.768 : H : ASP OD2 A0075 <- 3.24 -> DC N4 C0011 : score 5.6544 : H : THR OG1 A0076 <- 2.55 -> DA N7 B0014 : score 3.58481 : H : THR OG1 A0076 <- 3.02 -> DA N6 B0014 : score 2.63758 : H : ARG NE A0077 <- 2.98 -> DG O6 B0015 : score 3.79915 : H : ARG NH2 A0077 <- 3.24 -> DT O4 B0016 : score 3.24111 : H : GLU OE1 A0079 <- 3.36 -> DA N6 C0009 : score 2.38166 : w : GLU OE2 A0079 <- 5.29 -> DT O4 B0017 : score 2.279 : H : ARG NH1 A0081 <- 3.06 -> DG N7 C0008 : score 5.7354 : H : ARG NH2 A0081 <- 3.13 -> DG N7 C0008 : score 5.96323 : w : ARG NH2 A0081 <- 6.01 -> DT O4 B0017 : score 2.366 : H : ARG NH1 A0124 <- 3.07 -> DG O6 C0019 : score 5.75483 : H : ARG NH2 A0124 <- 3.24 -> DG O6 C0019 : score 6.0192 : H : ARG NH1 A0126 <- 2.89 -> DG O6 C0018 : score 5.97383 : H : ARG NH2 A0126 <- 2.91 -> DG N7 C0018 : score 6.24415 : w : ARG NH1 A0126 <- 6.59 -> DC N4 B0007 : score 1.892 : H : ASP OD1 A0154 <- 2.54 -> DC N4 B0008 : score 5.62281 : w : ASP OD1 A0154 <- 6.61 -> DC N4 B0007 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0154 <- 6.39 -> DG O6 B0009 : score 3.228 : H : ASP OD2 A0155 <- 3.03 -> DC N4 C0015 : score 5.9148 : H : ARG NH1 A0157 <- 2.73 -> DG N7 B0010 : score 6.1347 : H : ARG NH2 A0157 <- 2.54 -> DG O6 B0010 : score 6.9432 : x : TYR xxxx A0025 <- 3.42 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0027 <- 4.17 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0029 <- 3.20 -> DC xxx B0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0034 <- 3.75 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.84 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0070 <- 3.16 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0072 <- 4.16 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0083 <- 4.23 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0128 <- 3.61 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0158 <- 3.18 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0160 <- 3.77 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0167 <- 4.29 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx >4una_A:Homing_endonucleases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 2 DAYS INCUBATION IN 5MM MN (STATE 4) organism=DESULFUROCOCCUS MOBILIS : H : TYR OH A0029 <- 3.06 -> DC N4 B0018 : score 3.99497 : H : ARG NH1 A0033 <- 2.85 -> DG O6 B0021 : score 6.0225 : H : GLU OE1 A0035 <- 3.11 -> DC N4 C0006 : score 5.41034 : H : ARG NH1 A0037 <- 2.95 -> DG O6 C0008 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.87 -> DG O6 C0007 : score 6.5076 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.76 -> DG O6 C0008 : score 6.6528 : w : ARG NH1 A0037 <- 5.62 -> DT O4 B0017 : score 1.768 : H : THR OG1 A0076 <- 2.45 -> DA N7 B0014 : score 3.65309 : H : THR OG1 A0076 <- 2.96 -> DA N6 B0014 : score 2.67069 : H : ARG NH2 A0077 <- 2.34 -> DG O6 B0015 : score 7.2072 : H : GLU OE1 A0079 <- 3.15 -> DA N6 C0009 : score 2.49431 : w : GLU OE2 A0079 <- 5.42 -> DT O4 B0017 : score 2.279 : H : ARG NH1 A0081 <- 3.10 -> DG N7 C0008 : score 5.687 : H : ARG NH2 A0081 <- 3.01 -> DG N7 C0008 : score 6.11646 : H : ARG NH1 A0124 <- 2.82 -> DG O6 K0019 : score 6.059 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.67 -> DG O6 B0006 : score 6.7716 : H : ARG NH2 A0124 <- 3.15 -> DG O6 K0019 : score 6.138 : H : ARG NH1 A0126 <- 2.73 -> DG O6 K0018 : score 6.1685 : H : ARG NH2 A0126 <- 3.04 -> DG N7 K0018 : score 6.07815 : H : ASP OD1 A0154 <- 2.89 -> DC N4 B0008 : score 5.24866 : H : ASP OD2 A0155 <- 2.66 -> DC N4 C0015 : score 6.3736 : H : ARG NH1 A0157 <- 2.93 -> DG N7 B0010 : score 5.8927 : H : ARG NH2 A0157 <- 2.65 -> DG O6 B0010 : score 6.798 : x : TYR xxxx A0025 <- 3.43 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0027 <- 4.15 -> DC xxx B0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0032 <- 4.27 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0034 <- 3.60 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.98 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0070 <- 3.23 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0072 <- 4.10 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0075 <- 3.62 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0083 <- 4.16 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0128 <- 3.65 -> DC xxx K0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0158 <- 3.24 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0160 <- 3.91 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0167 <- 4.33 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx >4unb_G:Homing_endonucleases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 6 DAYS INCUBATION IN 5MM MN (STATE 5) organism=DESULFUROCOCCUS MOBILIS : H : ARG NH1 G0033 <- 2.60 -> DG O6 N0021 : score 6.32667 : H : ARG NH2 G0033 <- 3.28 -> DG N7 N0020 : score 5.77169 : H : GLU OE1 G0035 <- 3.07 -> DC N4 I0006 : score 5.45648 : H : ARG NH1 G0037 <- 2.70 -> DG O6 I0008 : score 6.205 : H : ARG NH2 G0037 <- 2.92 -> DG O6 I0007 : score 6.4416 : H : ARG NH2 G0037 <- 2.93 -> DG O6 I0008 : score 6.4284 : w : ARG NH1 G0037 <- 5.67 -> DT O4 N0017 : score 1.768 : H : THR OG1 G0076 <- 2.90 -> DA N7 H0014 : score 3.34582 : H : THR OG1 G0076 <- 3.16 -> DA N6 H0014 : score 2.56033 : H : ARG NE G0077 <- 2.87 -> DG N7 N0015 : score 4.35989 : H : ARG NE G0077 <- 2.64 -> DG O6 N0015 : score 4.06714 : H : ARG NH2 G0077 <- 2.67 -> DT O4 N0016 : score 3.64625 : H : GLU OE1 G0079 <- 3.31 -> DA N6 I0009 : score 2.40848 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SER xxxx G0034 <- 3.25 -> DG xxx I0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0041 <- 4.00 -> DG xxx N0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0070 <- 3.47 -> DG xxx I0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0072 <- 4.20 -> DA xxx I0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0083 <- 4.05 -> DC xxx I0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx G0128 <- 3.58 -> DC xxx O0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0158 <- 3.18 -> DA xxx I0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0160 <- 3.76 -> DC xxx I0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0167 <- 4.26 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx >4unc_G:Homing_endonucleases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 8 DAYS INCUBATION IN 5MM MN (STATE 6) organism=DESULFUROCOCCUS MOBILIS : H : TYR OH G0029 <- 3.02 -> DC N4 N0018 : score 4.02868 : H : GLU OE1 G0035 <- 2.97 -> DC N4 I0006 : score 5.57184 : H : ARG NH1 G0037 <- 2.85 -> DG O6 I0008 : score 6.0225 : H : ARG NH2 G0037 <- 2.80 -> DG O6 I0007 : score 6.6 : H : ARG NH2 G0037 <- 3.09 -> DG O6 I0008 : score 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: ARG NH2 G0157 <- 2.73 -> DG O6 H0010 : score 6.6924 : x : TYR xxxx G0025 <- 3.57 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0027 <- 4.42 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0033 <- 2.16 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0034 <- 3.44 -> DG xxx I0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0039 <- 4.50 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0041 <- 4.18 -> DG xxx N0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0070 <- 3.33 -> DG xxx I0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0072 <- 4.24 -> DA xxx I0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0083 <- 3.94 -> DC xxx I0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx G0128 <- 3.72 -> DC xxx O0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0158 <- 3.33 -> DA xxx I0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0160 <- 3.80 -> DC xxx I0015 : score x.xxxxx >4uno_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ETS DOMAIN OF HUMAN ETV5 IN COMPLEX WITH DNA organism=HOMO SAPIENS : w : ASP OD1 A0420 <- 5.70 -> DC N4 B0003 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0420 <- 5.88 -> DC N4 C0005 : score 3.623 : H : ARG NE A0424 <- 2.80 -> DG O6 B0005 : score 3.94103 : H : ARG NH2 A0424 <- 3.06 -> DG N7 B0005 : score 6.05262 : H : ARG NE A0427 <- 2.90 -> DG N7 B0004 : score 4.33336 : H : ARG NH2 A0427 <- 2.95 -> DG O6 B0004 : score 6.402 : w : ARG NH2 A0427 <- 5.87 -> DC N4 B0003 : score 0.976 : x : LYS xxxx A0421 <- 3.86 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0425 <- 3.50 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0428 <- 3.94 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx >4uqg_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=A NEW BIO-ISOSTERIC BASE PAIR BASED ON REVERSIBLE BONDING organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : LYS NZ A0582 <- 2.75 -> DC O2 B0026 : score 2.97562 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.69 -> DT O2 B0029 : score 4.40115 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.09 -> DT O2 B0029 : score 3.9878 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.72 -> DG N3 C0005 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.79 -> DG N3 C0006 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.97 -> DC O2 B0027 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score 0.388 : w : ARG NH2 A0077 <- 5.91 -> DA N7 D0009 : score 1.486 : w : GLU OE2 A0079 <- 5.47 -> DT O4 C0017 : score 2.279 : H : ARG NH1 A0081 <- 2.99 -> DG N7 D0008 : score 5.8201 : H : ARG NH2 A0081 <- 2.95 -> DG N7 D0008 : score 6.19308 : w : ARG NH1 A0081 <- 5.72 -> DG N7 D0007 : score 2.063 : H : ARG NH1 A0124 <- 2.86 -> DG O6 E0019 : score 6.01033 : H : ARG NH2 A0124 <- 3.00 -> DG O6 B0006 : score 6.336 : H : ARG NH1 A0126 <- 2.85 -> DG O6 E0018 : score 6.0225 : H : ARG NH2 A0126 <- 3.04 -> DG N7 E0018 : score 6.07815 : H : ASP OD1 A0154 <- 2.86 -> DC N4 B0008 : score 5.28073 : H : ASP OD2 A0155 <- 2.53 -> DC N4 D0015 : score 6.5348 : H : ARG NH1 A0157 <- 2.87 -> DG N7 B0010 : score 5.9653 : H : ARG NH2 A0157 <- 2.65 -> DG O6 B0010 : score 6.798 : x : TYR xxxx A0025 <- 3.35 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0027 <- 3.66 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0029 <- 3.00 -> DC xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0032 <- 4.34 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0034 <- 3.35 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0039 <- 4.46 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 4.05 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0072 <- 4.29 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0083 <- 4.24 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0128 <- 3.70 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0158 <- 3.56 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0160 <- 3.69 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0167 <- 4.48 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx >4uus_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A UBX-EXD-DNA COMPLEX INCLUDING THE UBDA MOTIF organism=? : H : ARG NH1 A0005 <- 2.79 -> DA N3 C0011 : score 3.68942 : H : ASN OD1 A0051 <- 3.10 -> DA N6 D0025 : score 5.66049 : H : ASN ND2 A0051 <- 2.95 -> DA N7 D0025 : score 5.6944 : w : ASN OD1 A0051 <- 5.70 -> DT O4 D0026 : score 3.132 : w : LYS NZ A0058 <- 6.19 -> DT O4 C0008 : score 1.7 : V : ILE CG2 A0047 <- 3.65 -> DT C7 D0026 : score 7.3572 : x : LYS xxxx A0046 <- 4.10 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0050 <- 3.21 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0054 <- 3.67 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >4uus_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A UBX-EXD-DNA COMPLEX INCLUDING THE UBDA MOTIF organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH1 A0005 <- 2.79 -> DA N3 C0011 : score 3.68942 : H : ASN OD1 A0051 <- 3.10 -> DA N6 D0025 : score 5.66049 : H : ASN ND2 A0051 <- 2.95 -> DA N7 D0025 : score 5.6944 : w : ASN OD1 A0051 <- 5.70 -> DT O4 D0026 : score 3.132 : w : LYS NZ A0058 <- 6.19 -> DT O4 C0008 : score 1.7 : H : ASN OD1 B0051 <- 3.11 -> DA N6 D0021 : score 5.64844 : H : ASN ND2 B0051 <- 3.14 -> DA N7 D0021 : score 5.47132 : w : ASN OD1 B0051 <- 6.29 -> DT O4 D0022 : score 3.132 : H : ARG NH1 B0055 <- 3.01 -> DG N7 D0020 : score 5.7959 : H : ARG NH2 B0055 <- 3.02 -> DG O6 D0020 : score 6.3096 : x : LYS xxxx A0046 <- 4.10 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0047 <- 3.49 -> 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x : TYR xxxx D0401 <- 3.51 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx >4uuv_DP:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE DNA BINDING ETS DOMAIN OF HUMAN ETV4 IN COMPLEX WITH DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASP OD2 D0393 <- 3.18 -> DC N4 F0006 : score 5.7288 : H : ARG NE D0397 <- 3.03 -> DG O6 E0005 : score 3.75974 : H : ARG NH2 D0397 <- 3.10 -> DG N7 E0005 : score 6.00154 : H : ARG NE D0400 <- 3.18 -> DG N7 E0004 : score 4.08574 : H : ARG NH2 D0400 <- 3.07 -> DG O6 E0004 : score 6.2436 : H : ASP OD2 P0393 <- 2.93 -> DC N4 R0006 : score 6.0388 : H : ARG NE P0397 <- 2.91 -> DG O6 Q0005 : score 3.85432 : H : ARG NH2 P0397 <- 2.95 -> DG N7 Q0005 : score 6.19308 : H : ARG NE P0400 <- 3.13 -> DG N7 Q0004 : score 4.12996 : H : ARG NH2 P0400 <- 3.10 -> DG O6 Q0004 : score 6.204 : x : LYS xxxx D0394 <- 4.07 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0398 <- 3.72 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0401 <- 3.51 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx P0394 <- 3.68 -> DT xxx R0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx P0398 <- 3.63 -> DT xxx R0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx P0401 <- 3.47 -> DA xxx R0001 : score x.xxxxx >4uuv_GJ:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE DNA BINDING ETS DOMAIN OF HUMAN ETV4 IN COMPLEX WITH DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASP OD2 G0393 <- 3.33 -> DC N4 I0006 : score 5.5428 : H : ARG NE G0397 <- 2.78 -> DG O6 H0005 : score 3.95679 : H : ARG NH2 G0397 <- 2.91 -> DG N7 H0005 : score 6.24415 : H : ARG NE G0400 <- 3.17 -> DG N7 H0004 : score 4.09458 : H : ARG NH2 G0400 <- 3.23 -> DG O6 H0004 : score 6.0324 : H : ASP OD2 J0393 <- 3.43 -> DC N4 L0006 : score 5.4188 : H : ARG NE J0397 <- 2.88 -> DG O6 K0005 : score 3.87797 : H : ARG NH2 J0397 <- 3.00 -> DG N7 K0005 : score 6.12923 : H : ARG NE J0400 <- 2.99 -> DG N7 K0004 : score 4.25377 : H : ARG NH2 J0400 <- 3.00 -> DG O6 K0004 : score 6.336 : x : LYS xxxx G0394 <- 3.84 -> DT xxx I0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0398 <- 3.45 -> DT xxx I0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0401 <- 3.24 -> DA xxx I0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0394 <- 4.05 -> DT xxx L0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0398 <- 3.55 -> DT xxx L0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0401 <- 3.86 -> DC xxx L0002 : score x.xxxxx >4uuv_SV:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE DNA BINDING ETS DOMAIN OF HUMAN ETV4 IN COMPLEX WITH DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASP OD2 S0393 <- 3.25 -> DC N4 U0006 : score 5.642 : H : ARG NE S0397 <- 3.15 -> DG O6 T0005 : score 3.66515 : H : ARG NH2 S0397 <- 3.02 -> DG N7 T0005 : score 6.10369 : H : ARG NE S0400 <- 3.03 -> DG N7 T0004 : score 4.21839 : H : ARG NH2 S0400 <- 2.98 -> DG O6 T0004 : score 6.3624 : H : ARG NE V0397 <- 2.59 -> DG O6 W0005 : score 4.10655 : H : ARG NH2 V0397 <- 2.73 -> DG N7 W0005 : score 6.474 : H : ARG NE V0400 <- 2.69 -> DG N7 W0004 : score 4.51907 : H : ARG NH2 V0400 <- 2.69 -> DG O6 W0004 : score 6.7452 : x : LYS xxxx S0394 <- 3.66 -> DT xxx U0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx S0398 <- 3.58 -> DT xxx U0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx S0401 <- 3.47 -> DA xxx U0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx V0393 <- 3.19 -> DC xxx X0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx V0394 <- 3.78 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx V0398 <- 3.53 -> DT xxx X0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx V0401 <- 3.41 -> DA xxx X0001 : score x.xxxxx >4ux5_A:DNA-binding_domain_of_Mlu1-box_binding_protein_MBP1; title=STRUCTURE OF DNA COMPLEX OF PCG2 organism=MAGNAPORTHE ORYZAE : H : LYS NZ A0062 <- 2.94 -> DG N7 C0010 : score 5.23509 : H : GLN NE2 A0082 <- 3.11 -> DC O2 C0009 : score 3.46579 : H : GLN NE2 A0082 <- 3.05 -> DG N3 C0010 : score 4.72686 : H : GLN OE1 A0089 <- 3.04 -> DG N2 C0008 : score 5.33852 : H : GLN NE2 A0089 <- 3.05 -> DG N3 C0008 : score 4.72686 : x : PRO xxxx A0063 <- 4.45 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0085 <- 4.41 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx >4ux5_AB:DNA-binding_domain_of_Mlu1-box_binding_protein_MBP1; title=STRUCTURE OF DNA COMPLEX OF PCG2 organism=MAGNAPORTHE ORYZAE : H : LYS NZ A0062 <- 2.94 -> DG N7 C0010 : score 5.23509 : H : GLN NE2 A0082 <- 3.11 -> DC O2 C0009 : score 3.46579 : H : GLN NE2 A0082 <- 3.05 -> DG N3 C0010 : score 4.72686 : H : GLN OE1 A0089 <- 3.04 -> DG N2 C0008 : score 5.33852 : H : GLN NE2 A0089 <- 3.05 -> DG N3 C0008 : score 4.72686 : w : GLN NE2 B0089 <- 5.46 -> DC O2 D0007 : score 2.699 : x : PRO xxxx A0063 <- 4.45 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0085 <- 4.41 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0085 <- 3.23 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx >4uzb_AB:Viral_DNA-binding_domain; title=KSHV LANA (ORF73) C-TERMINAL DOMAIN MUTANT BOUND TO LBS1 DNA (R1039Q, R1040Q, K1055E, K1109A, D1110A, A1121E, K1138S, K1140D, K1141D) organism=HUMAN HERPESVIRUS 8 : H : ARG NH1 A1013 <- 2.73 -> DT O2 C0014 : score 4.3667 : w : ARG NH2 A1013 <- 6.28 -> DG N3 C0016 : score 0.677 : H : LYS NZ A1030 <- 2.22 -> DG O6 D-006 : score 6.45134 : w : LYS NZ A1030 <- 6.05 -> DG O6 D-007 : score 3.005 : H : TYR OH A1066 <- 2.98 -> DC N4 C0008 : score 4.06239 : w : LYS NZ A1070 <- 5.62 -> DG N7 C0005 : score 2.519 : H : HIS NE2 B1011 <- 2.64 -> DG O6 C0010 : score 8.20837 : H : ARG NE B1013 <- 2.92 -> DG O6 C0009 : score 3.84644 : H : ARG NH2 B1013 <- 2.78 -> DG N7 C0009 : score 6.41015 : w : TYR OH B1014 <- 6.84 -> DG O6 D-008 : score 3.344 : H : LYS NZ B1030 <- 2.82 -> DG O6 C0018 : score 5.75765 : x : PRO xxxx A1012 <- 3.73 -> DG xxx D-012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A1128 <- 3.49 -> DG xxx D-002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B1012 <- 4.46 -> DC xxx D-011 : score x.xxxxx >4uzb_B:Viral_DNA-binding_domain; title=KSHV LANA (ORF73) C-TERMINAL DOMAIN MUTANT BOUND TO LBS1 DNA (R1039Q, R1040Q, K1055E, K1109A, D1110A, A1121E, K1138S, K1140D, K1141D) organism=HUMAN HERPESVIRUS 8 : H : HIS NE2 B1011 <- 2.64 -> DG O6 C0010 : score 8.20837 : H : ARG NE B1013 <- 2.92 -> DG O6 C0009 : score 3.84644 : H : ARG NH2 B1013 <- 2.78 -> DG N7 C0009 : score 6.41015 : w : TYR OH B1014 <- 6.84 -> DG O6 D-008 : score 3.344 : H : LYS NZ B1030 <- 2.82 -> DG O6 C0018 : score 5.75765 : x : PRO xxxx B1012 <- 4.46 -> DC xxx D-011 : score x.xxxxx >4v1n_ABMO:TATA-box_binding_protein-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=ARCHITECTURE OF THE RNA POLYMERASE II-MEDIATOR CORE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 M0064 <- 2.56 -> DT O4 T0022 : score 3.42481 : H : ARG NH2 M0064 <- 2.49 -> DT O4 T0022 : score 3.77418 : H : ASP OD2 M0069 <- 2.72 -> DT N3 T0022 : score 3.64457 : H : ASN ND2 O0069 <- 2.72 -> DA N3 T0047 : score 3.86862 : H : ASN ND2 O0069 <- 3.32 -> DT O2 T0048 : score 4.25255 : H : THR OG1 O0124 <- 3.26 -> DA N3 T0047 : score 1.22929 : H : ASN ND2 O0159 <- 3.36 -> DA N3 N0025 : score 3.38123 : H : ASN ND2 O0159 <- 2.88 -> DT O2 N0026 : score 4.67022 : H : THR OG1 O0215 <- 3.18 -> DA N3 N0025 : score 1.25095 : x : ARG xxxx A0350 <- 4.19 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.53 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 2.75 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 2.97 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.29 -> DG xxx T0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0272 <- 4.21 -> DA xxx T0053 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0308 <- 4.13 -> DC xxx T0054 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0071 <- 3.24 -> DA xxx T0047 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0099 <- 3.10 -> DT xxx T0045 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0114 <- 3.49 -> DT xxx T0045 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0116 <- 3.38 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0122 <- 3.40 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0161 <- 3.19 -> DT xxx T0048 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0190 <- 3.45 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0191 <- 3.97 -> DA xxx T0051 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0205 <- 3.37 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0207 <- 4.23 -> DT xxx T0050 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0213 <- 3.40 -> DA xxx T0049 : score x.xxxxx >4v1n_O:TATA-box_binding_protein-like; title=ARCHITECTURE OF THE RNA POLYMERASE II-MEDIATOR CORE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX organism=? : H : ASN ND2 O0069 <- 2.72 -> DA N3 T0047 : score 3.86862 : H : ASN ND2 O0069 <- 3.32 -> DT O2 T0048 : score 4.25255 : H : THR OG1 O0124 <- 3.26 -> DA N3 T0047 : score 1.22929 : H : ASN ND2 O0159 <- 3.36 -> DA N3 N0025 : score 3.38123 : H : ASN ND2 O0159 <- 2.88 -> DT O2 N0026 : score 4.67022 : H : THR OG1 O0215 <- 3.18 -> DA N3 N0025 : score 1.25095 : x : VAL xxxx O0071 <- 3.24 -> DA xxx T0047 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0099 <- 3.10 -> DT xxx T0045 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0114 <- 3.49 -> DT xxx T0045 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0116 <- 3.38 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0122 <- 3.40 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0161 <- 3.19 -> DT xxx T0048 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0190 <- 3.45 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0191 <- 3.97 -> DA xxx T0051 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0205 <- 3.37 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0207 <- 4.23 -> DT xxx T0050 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0213 <- 3.40 -> DA xxx T0049 : score x.xxxxx >4v1o_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=ARCHITECTURE OF THE RNA POLYMERASE II-MEDIATOR CORE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A0350 <- 4.19 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.53 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 2.75 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 2.97 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.29 -> DG xxx T0012 : score x.xxxxx >4v1o_ABMO:TATA-box_binding_protein-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=ARCHITECTURE OF THE RNA POLYMERASE II-MEDIATOR CORE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 M0064 <- 2.56 -> DT O4 T0022 : score 3.42481 : H : ARG NH2 M0064 <- 2.49 -> DT O4 T0022 : score 3.77418 : H : ASP OD2 M0069 <- 2.72 -> DT N3 T0022 : score 3.64457 : H : ASN ND2 O0069 <- 2.72 -> DA N3 T0047 : score 3.86862 : H : ASN ND2 O0069 <- 3.32 -> DT O2 T0048 : score 4.25255 : H : THR OG1 O0124 <- 3.26 -> DA N3 T0047 : score 1.22929 : H : ASN ND2 O0159 <- 3.36 -> DA N3 N0025 : score 3.38123 : H : ASN ND2 O0159 <- 2.88 -> DT O2 N0026 : score 4.67022 : H : THR OG1 O0215 <- 3.18 -> DA N3 N0025 : score 1.25095 : x : ARG xxxx A0350 <- 4.19 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.53 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 2.75 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 2.97 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.29 -> DG xxx T0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0272 <- 4.21 -> DA xxx T0053 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0308 <- 4.13 -> DC xxx T0054 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0071 <- 3.24 -> DA xxx T0047 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0099 <- 3.10 -> DT xxx T0045 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0114 <- 3.49 -> DT xxx T0045 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0116 <- 3.38 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0122 <- 3.40 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0161 <- 3.19 -> DT xxx T0048 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0190 <- 3.45 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0191 <- 3.97 -> DA xxx T0051 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0205 <- 3.37 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0207 <- 4.23 -> DT xxx T0050 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0213 <- 3.40 -> DA xxx T0049 : score x.xxxxx >4wcg_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE BINDING MODE OF CYPRINID HERPESVIRUS3 ORF112-ZALPHA TO Z-DNA organism=CYPRINID HERPESVIRUS 3 : H : ARG NH2 A0258 <- 2.90 -> DG O6 D0006 : score 6.468 : w : ARG NE A0258 <- 6.10 -> DG N7 D0006 : score 1.593 >4wcg_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE BINDING MODE OF CYPRINID HERPESVIRUS3 ORF112-ZALPHA TO Z-DNA organism=CYPRINID HERPESVIRUS 3 : H : ARG NH2 A0258 <- 2.90 -> DG O6 D0006 : score 6.468 : H : ARG NH2 B0258 <- 2.83 -> DG O6 C0006 : score 6.5604 A : w : ARG NE B0258 <- 5.96 -> DG N7 C0006 : score 1.593 A : w : ARG NH2 B0258 <- 6.20 -> DG N7 C0006 : score 2.18 A >4wk8_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=FOXP3 FORMS A DOMAIN-SWAPPED DIMER TO BRIDGE DNA organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 F0383 <- 3.31 -> DA N6 B5013 : score 5.40757 : H : ASN ND2 F0383 <- 3.04 -> DA N7 B5013 : score 5.58873 : V : ARG CB F0386 <- 3.74 -> DT C7 A4010 : score 1.02021 : x : HIS xxxx F0387 <- 3.22 -> DT xxx A4011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0390 <- 3.32 -> DT xxx A4010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0391 <- 4.45 -> DT xxx A4011 : score x.xxxxx >4wk8_FG: title=FOXP3 FORMS A DOMAIN-SWAPPED DIMER TO BRIDGE DNA organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 F0383 <- 3.31 -> DA N6 B5013 : score 5.40757 : H : ASN ND2 F0383 <- 3.04 -> DA N7 B5013 : score 5.58873 : V : ARG CB F0386 <- 3.74 -> DT C7 A4010 : score 1.02021 : x : HIS xxxx F0387 <- 3.22 -> DT xxx A4011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0390 <- 3.32 -> DT xxx A4010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0391 <- 4.45 -> DT xxx A4011 : score x.xxxxx >4wls_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE METAL-FREE (REPRESSOR) FORM OF E. COLI CUER, A COPPER EFFLUX REGULATOR, BOUND TO COPA PROMOTER DNA organism=Escherichia coli DH5[alpha] / Escherichia coli DH5[alpha] / Escherichia coli DH5[alpha] / Escherichia coli DH5[alpha] : H : LYS NZ A0015 <- 2.99 -> DG N7 Y0018 : score 5.18123 : H : LYS NZ A0015 <- 3.19 -> DG N7 Y0019 : score 4.9658 : H : LYS NZ B0015 <- 3.16 -> DG N7 X0018 : score 4.99811 A : H : LYS NZ B0015 <- 2.47 -> DG O6 X0018 : score 6.1623 A : H : TYR OH B0036 <- 3.04 -> DG N2 X0022 : score 4.65504 A : x : ARG xxxx A0018 <- 3.40 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0019 <- 3.43 -> DG xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0036 <- 3.37 -> DG xxx Y0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0018 <- 3.56 -> DT xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0019 <- 3.71 -> DC xxx X0015 : score x.xxxxx >4wls_B:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE METAL-FREE (REPRESSOR) FORM OF E. COLI CUER, A COPPER EFFLUX REGULATOR, BOUND TO COPA PROMOTER DNA organism=Escherichia coli DH5[alpha] / Escherichia coli DH5[alpha] : H : LYS NZ B0015 <- 3.16 -> DG N7 X0018 : score 4.99811 A : H : LYS NZ B0015 <- 2.47 -> DG O6 X0018 : score 6.1623 A : H : TYR OH B0036 <- 3.04 -> DG N2 X0022 : score 4.65504 A : x : ARG xxxx B0018 <- 3.56 -> DT xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0019 <- 3.71 -> DC xxx X0015 : score x.xxxxx >4wlw_A:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE AG(I) (ACTIVATOR) FORM OF E. COLI CUER, A COPPER EFFLUX REGULATOR, BOUND TO COPA PROMOTER DNA organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0015 <- 2.99 -> DG N7 X0016 : score 5.18123 : H : LYS NZ A0015 <- 2.77 -> DG N7 X0017 : score 5.41821 : H : LYS NZ A0015 <- 3.11 -> DG O6 X0017 : score 5.42236 : H : TYR OH A0036 <- 2.46 -> DG N2 X0021 : score 5.22225 : x : ARG xxxx A0018 <- 3.53 -> DT xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0019 <- 3.58 -> DC xxx X0014 : score x.xxxxx >4wqs_CD: title=THERMUS THERMOPHILUS RNA POLYMERASE BACKTRACKED COMPLEX organism=THERMUS THERMOPHILUS HB8 : x : ARG xxxx C0422 <- 3.14 -> DG xxx I0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0423 <- 4.34 -> DG xxx I0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0487 <- 4.33 -> DC xxx G0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D1093 <- 3.60 -> DA xxx G0017 : score x.xxxxx >4wu4_A:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. FAECALIS DNA BINDING DOMAIN LIARD191N COMPLEXED WITH 22BP DNA organism=? : H : LYS NZ A0174 <- 2.65 -> DG O6 G-086 : score 5.95419 : x : LYS xxxx A0177 <- 3.36 -> DG xxx H-089 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0181 <- 4.08 -> DT xxx H-088 : score x.xxxxx >4wu4_AB:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. FAECALIS DNA BINDING DOMAIN LIARD191N COMPLEXED WITH 22BP DNA organism=? : H : LYS NZ A0174 <- 2.65 -> DG O6 G-086 : score 5.95419 : H : LYS NZ B0174 <- 2.65 -> DG O6 H-097 : score 5.95419 : w : LYS NZ B0174 <- 6.29 -> DT O4 H-096 : score 1.7 : H : LYS NZ B0177 <- 3.28 -> DG N7 G-094 : score 4.86885 : H : LYS NZ B0177 <- 3.17 -> DG O6 G-094 : score 5.35299 : w : ASN ND2 B0182 <- 6.54 -> DT O4 H-099 : score 3.275 : x : LYS xxxx A0177 <- 3.36 -> DG xxx H-089 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0181 <- 4.08 -> DT xxx H-088 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0172 <- 4.44 -> DC xxx H-098 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0175 <- 3.33 -> DC xxx H-098 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0178 <- 3.27 -> DC xxx H-098 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0179 <- 3.63 -> DT xxx H-099 : score x.xxxxx >4wu8_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF TRPTNAP-NCP145 organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.12 -> DA N3 J0009 : score 3.0324 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.37 -> DA N3 I0009 : score 3.2623 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.52 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.93 -> DC xxx I-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.07 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.25 -> DT xxx J0069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.29 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.53 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.30 -> DC xxx J-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.96 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.04 -> DG xxx I0047 : score x.xxxxx >4wu9_A:Histone-fold; title=STRUCTURE OF CISPTNAP-NCP145 organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.06 -> DA N3 J0009 : score 3.07128 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.34 -> DT xxx J-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.93 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.20 -> DC xxx I-023 : score x.xxxxx >4wu9_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF CISPTNAP-NCP145 organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.06 -> DA N3 J0009 : score 3.07128 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.89 -> DA N3 I0009 : score 3.18143 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.34 -> DT xxx J-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.93 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.20 -> DC xxx I-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.04 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.36 -> DA xxx J0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.43 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.86 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.01 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.27 -> DA xxx I0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.48 -> DA xxx J-046 : score x.xxxxx >4wuh_B:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. FAECALIS DNA BINDING DOMAIN LIAR WILD TYPE COMPLEXED WITH 22BP DNA organism=Enterococcus faecalis S613 : H : LYS NZ B0175 <- 2.68 -> DG O6 C0005 : score 5.91951 : H : LYS NZ B0178 <- 3.30 -> DG O6 G0094 : score 5.20269 : x : THR xxxx B0176 <- 3.21 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0179 <- 3.24 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0180 <- 3.75 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx >4wul_A:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. FAECALIS DNA BINDING DOMAIN LIARD191N COMPLEXED WITH 26BP DNA organism=? : H : THR OG1 A0178 <- 3.10 -> DC N4 C-108 : score 3.79133 : H : THR OG1 A0178 <- 3.29 -> DA N6 C-109 : score 2.4886 : w : SER OG A0181 <- 6.08 -> DA N7 H-111 : score 2.343 : w : ASN ND2 A0182 <- 6.35 -> DT O4 C-107 : score 3.275 : V : LYS CE A0177 <- 3.59 -> DT C7 H-112 : score 2.73758 : x : LYS xxxx A0174 <- 3.70 -> DT xxx C-110 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0175 <- 3.54 -> DC xxx C-108 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0179 <- 3.52 -> DT xxx C-107 : score x.xxxxx >4wul_AB:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. FAECALIS DNA BINDING DOMAIN LIARD191N COMPLEXED WITH 26BP DNA organism=? : H : THR OG1 A0178 <- 3.10 -> DC N4 C-108 : score 3.79133 : H : THR OG1 A0178 <- 3.29 -> DA N6 C-109 : score 2.4886 : w : SER OG A0181 <- 6.08 -> DA N7 H-111 : score 2.343 : w : ASN ND2 A0182 <- 6.35 -> DT O4 C-107 : score 3.275 : w : THR OG1 B0178 <- 6.23 -> DT O4 H-119 : score 2.809 : w : SER OG B0181 <- 6.26 -> DA N6 C-119 : score 2.209 : w : ASN ND2 B0182 <- 6.21 -> DT O4 H-122 : score 3.275 : V : LYS CE A0177 <- 3.59 -> DT C7 H-112 : score 2.73758 : x : LYS xxxx A0174 <- 3.70 -> DT xxx C-110 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0175 <- 3.54 -> DC xxx C-108 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0179 <- 3.52 -> DT xxx C-107 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0174 <- 3.51 -> DT xxx H-119 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0175 <- 3.66 -> DA xxx H-121 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0177 <- 4.36 -> DA xxx C-116 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0179 <- 3.63 -> DT xxx H-122 : score x.xxxxx >4wuz_ABC:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LAMBDA EXONUCLEASE IN COMPLEX WITH DNA AND CA2+ organism=ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA : x : MET xxxx B0053 <- 3.52 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0073 <- 3.84 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0075 <- 3.33 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0077 <- 3.46 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0078 <- 3.06 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0151 <- 4.41 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0045 <- 3.31 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx >4wuz_C:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LAMBDA EXONUCLEASE IN COMPLEX WITH DNA AND CA2+ organism=? : x : ARG xxxx C0045 <- 3.31 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx >4wwc_AB:Chorismate_lyase-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FULL LENGTH YVOA IN COMPLEX WITH PALINDROMIC OPERATOR DNA organism=Bacillus subtilis : H : ARG NH1 A0038 <- 2.71 -> DG N7 F0005 : score 6.1589 : H : ARG NH2 A0038 <- 3.09 -> DG O6 F0005 : score 6.2172 : H : SER OG A0047 <- 3.28 -> DA N7 E0010 : score 4.03555 : H : ARG NH1 A0048 <- 3.01 -> DG O6 F0006 : score 5.82783 : H : ARG NH2 A0048 <- 3.02 -> DG N7 F0006 : score 6.10369 : H : ARG NH1 B0038 <- 2.83 -> DG N7 E0005 : score 6.0137 : H : ARG NH2 B0038 <- 3.19 -> DG O6 E0005 : score 6.0852 : H : SER OG B0047 <- 2.89 -> DA N7 F0010 : score 4.38375 : H : ARG NH1 B0048 <- 2.97 -> DG O6 E0006 : score 5.8765 : H : ARG NH2 B0048 <- 2.66 -> DG N7 E0006 : score 6.56338 : V : MET CB B0049 <- 3.59 -> DT C7 F0009 : score 6.10774 : x : GLU xxxx A0037 <- 4.41 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0049 <- 3.59 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0050 <- 4.11 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0052 <- 3.11 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0037 <- 4.49 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0050 <- 3.98 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0052 <- 3.06 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx >4wwc_B:Chorismate_lyase-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FULL LENGTH YVOA IN COMPLEX WITH PALINDROMIC OPERATOR DNA organism=Bacillus subtilis : H : ARG NH1 B0038 <- 2.83 -> DG N7 E0005 : score 6.0137 : H : ARG NH2 B0038 <- 3.19 -> DG O6 E0005 : score 6.0852 : H : SER OG B0047 <- 2.89 -> DA N7 F0010 : score 4.38375 : H : ARG NH1 B0048 <- 2.97 -> DG O6 E0006 : score 5.8765 : H : ARG NH2 B0048 <- 2.66 -> DG N7 E0006 : score 6.56338 : V : MET CB B0049 <- 3.59 -> DT C7 F0009 : score 6.10774 : x : GLU xxxx B0037 <- 4.49 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0050 <- 3.98 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0052 <- 3.06 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx >4wx9_A:Methylated_DNA-protein_cysteine_methyltransferase,_C-terminal_domain;Methylated_DNA-protein_cysteine_methyltransferase_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS OGT IN COMPLEX WITH DNA organism=Mycobacterium tuberculosis : x : ARG xxxx A0109 <- 3.18 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0110 <- 3.82 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0113 <- 3.49 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx >4wzs_ABD:Histone-fold;TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MOT1 N-TERMINAL DOMAIN IN COMPLEX WITH TBP AND NC2 BOUND TO A PROMOTER DNA FRAGMENT organism=ENCEPHALITOZOON CUNICULI (STRAIN GB-M1) / ENCEPHALITOZOON CUNICULI (STRAIN GB-M1) / ENCEPHALITOZOON CUNICULI (STRAIN GB-M1) / ENCEPHALITOZOON CUNICULI (STRAIN GB-M1) : H : ASN ND2 D0027 <- 2.99 -> DT O2 E0012 : score 4.5658 : H : ASN ND2 D0117 <- 2.89 -> DA N3 F0012 : score 3.73915 : H : THR OG1 D0173 <- 3.26 -> DA N3 F0012 : score 1.22929 : x : VAL xxxx D0029 <- 3.98 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0057 <- 3.23 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0072 <- 3.49 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0074 <- 3.59 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0080 <- 3.53 -> DA xxx F0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0082 <- 3.40 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0119 <- 3.68 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0148 <- 3.22 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0149 <- 3.54 -> DA xxx E0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0163 <- 3.61 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0165 <- 3.28 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0171 <- 4.30 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx >4wzs_D:TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MOT1 N-TERMINAL DOMAIN IN COMPLEX WITH TBP AND NC2 BOUND TO A PROMOTER DNA FRAGMENT organism=ENCEPHALITOZOON CUNICULI (STRAIN GB-M1) / ENCEPHALITOZOON CUNICULI (STRAIN GB-M1) : H : ASN ND2 D0027 <- 2.99 -> DT O2 E0012 : score 4.5658 : H : ASN ND2 D0117 <- 2.89 -> DA N3 F0012 : score 3.73915 : H : THR OG1 D0173 <- 3.26 -> DA N3 F0012 : score 1.22929 : x : VAL xxxx D0029 <- 3.98 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0057 <- 3.23 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0072 <- 3.49 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0074 <- 3.59 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0080 <- 3.53 -> DA xxx F0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0082 <- 3.40 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0119 <- 3.68 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0148 <- 3.22 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0149 <- 3.54 -> DA xxx E0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0163 <- 3.61 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0165 <- 3.28 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0171 <- 4.30 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx >4wzw_A:ARM_repeat; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN PUF-A IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : x : ASP xxxx A0261 <- 4.05 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx >4x0g_AB: title=STRUCTURE OF BSG25A BINDING WITH DNA organism=Drosophila melanogaster : H : SER OG A0055 <- 2.75 -> DA N3 E0007 : score 3.03388 : H : LYS NZ A0105 <- 2.77 -> DG N7 E0010 : score 5.41821 : H : LYS NZ A0105 <- 2.75 -> DG O6 E0010 : score 5.83858 : H : SER OG B0055 <- 2.65 -> DA N3 F0007 : score 3.09396 : H : LYS NZ B0105 <- 2.60 -> DG O6 F0010 : score 6.012 : H : LYS NZ B0105 <- 2.72 -> DG O6 F0011 : score 5.87326 : V : ASP CG B0102 <- 3.53 -> DT C7 E0003 : score 2.86418 : V : ASP CG A0102 <- 3.59 -> DT C7 F0003 : score 2.82394 : V : ALA CB B0101 <- 3.89 -> DT C7 F0009 : score 5.473 : x : ARG xxxx A0033 <- 4.33 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0056 <- 3.31 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 3.91 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0058 <- 4.16 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0097 <- 4.39 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0101 <- 4.06 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0106 <- 4.47 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0033 <- 4.36 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0056 <- 3.34 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0057 <- 3.53 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 3.91 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0097 <- 4.46 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0106 <- 4.35 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx >4x0g_B: title=STRUCTURE OF BSG25A BINDING WITH DNA organism=Drosophila melanogaster : H : SER OG B0055 <- 2.65 -> DA N3 F0007 : score 3.09396 : H : LYS NZ B0105 <- 2.60 -> DG O6 F0010 : score 6.012 : H : LYS NZ B0105 <- 2.72 -> DG O6 F0011 : score 5.87326 : V : ASP CG B0102 <- 3.53 -> DT C7 E0003 : score 2.86418 : V : ALA CB B0101 <- 3.89 -> DT C7 F0009 : score 5.473 : x : ARG xxxx B0033 <- 4.36 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0056 <- 3.34 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0057 <- 3.53 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0058 <- 3.91 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0097 <- 4.46 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0106 <- 4.35 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx >4x0g_CD: title=STRUCTURE OF BSG25A BINDING WITH DNA organism=Drosophila melanogaster : H : SER OG C0055 <- 2.68 -> DA N3 G0007 : score 3.07594 : H : LYS NZ C0105 <- 2.96 -> DG O6 G0011 : score 5.59578 : H : SER OG D0055 <- 2.85 -> DA N3 H0007 : score 2.97381 : H : LYS NZ D0105 <- 2.76 -> DG N7 H0010 : score 5.42898 : H : LYS NZ D0105 <- 3.08 -> DG O6 H0010 : score 5.45705 : H : LYS NZ D0105 <- 3.06 -> DG O6 H0011 : score 5.48017 : V : ASP CG D0102 <- 3.52 -> DT C7 G0003 : score 2.87089 : V : ASP CB C0102 <- 3.83 -> DT C7 H0003 : score 2.66295 : x : PRO xxxx C0056 <- 3.29 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0057 <- 3.56 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0058 <- 4.05 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0097 <- 4.45 -> DA xxx G0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0101 <- 3.91 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0106 <- 3.62 -> DT xxx H0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.26 -> DT xxx G0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0056 <- 3.31 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0057 <- 4.16 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0058 <- 4.43 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0097 <- 4.17 -> DA xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0101 <- 4.00 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0106 <- 4.44 -> DT xxx G0002 : score x.xxxxx >4x0p_C:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE THETA C-TERMINAL DOMAIN BINDING DDATP OPPOSITE A TETRAHYDROFURAN AP SITE ANALOG organism=Homo sapiens : H : LYS NZ C2209 <- 2.40 -> DG N3 I0009 : score 1.57015 : H : ARG NH1 C2241 <- 3.10 -> DC O2 J0013 : score 3.431 : H : ASN ND2 C2251 <- 3.29 -> DT O2 J0011 : score 4.28103 : H : GLN NE2 C2474 <- 2.69 -> DG N3 I0005 : score 5.0851 : x : ASN xxxx C2205 <- 4.11 -> DA xxx J0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C2384 <- 3.49 -> DC xxx J0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C2539 <- 4.33 -> DC xxx J0013 : score x.xxxxx >4x0q_B:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE THETA C-TERMINAL DOMAIN BINDING DDGTP OPPOSITE DCMP organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B2241 <- 3.17 -> DG N3 H0013 : score 2.82667 : H : ASN ND2 B2251 <- 3.18 -> DT O2 H0011 : score 4.38545 : H : GLN NE2 B2474 <- 2.55 -> DC O2 G0005 : score 3.87962 : x : ASN xxxx B2205 <- 4.32 -> DA xxx H0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B2209 <- 4.31 -> DA xxx G0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B2384 <- 3.42 -> DC xxx G0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B2391 <- 3.95 -> DC xxx G0004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B2393 <- 3.41 -> DC xxx G0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B2401 <- 4.19 -> DC xxx G0004 : score x.xxxxx >4x23_ABCDEFG:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CENP-C IN COMPLEX WITH THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : TYR xxxx A0041 <- 4.16 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0041 <- 3.39 -> DC xxx J0111 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.17 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.37 -> DC xxx I0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0041 <- 3.48 -> DT xxx I0112 : score x.xxxxx >4x23_KLMNOPQ:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CENP-C IN COMPLEX WITH THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH2 Q0041 <- 2.65 -> DT O2 S0112 : score 4.36033 : x : ARG xxxx M0041 <- 3.45 -> DG xxx T0112 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0074 <- 4.41 -> DC xxx T0132 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0043 <- 4.23 -> DG xxx T0068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0083 <- 3.95 -> DT xxx T0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0034 <- 3.59 -> DA xxx S0113 : score x.xxxxx >4x4b_ABCD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=RADIATION DAMAGE TO THE NUCLEOPROTEIN COMPLEX C.ESP1396I: DOSE (DWD) 2.1 MGY organism=Enterobacter sp. RFL1396 : H : ARG NH1 A0035 <- 3.30 -> DG N7 E0003 : score 5.445 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.54 -> DG O6 E0003 : score 6.9432 : H : ARG NH2 A0046 <- 3.32 -> DG O6 F0029 : score 5.9136 : H : ARG NH2 D0035 <- 3.34 -> DG N7 F0003 : score 5.69508 : H : ARG NH2 D0035 <- 2.71 -> DG O6 F0003 : score 6.7188 : x : GLU xxxx A0025 <- 4.25 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0034 <- 3.32 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0036 <- 3.14 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0039 <- 3.77 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0034 <- 2.90 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 3.01 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0036 <- 3.44 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0037 <- 3.88 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0039 <- 4.15 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 3.69 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0024 <- 4.36 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0034 <- 3.21 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 2.66 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0036 <- 3.23 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0037 <- 3.86 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0039 <- 4.12 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 3.46 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0046 <- 3.62 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0025 <- 3.77 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0034 <- 3.83 -> DC xxx E0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0036 <- 3.44 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0037 <- 3.82 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0039 <- 4.01 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0043 <- 4.20 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0046 <- 2.96 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx >4x4b_D:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=RADIATION DAMAGE TO THE NUCLEOPROTEIN COMPLEX C.ESP1396I: DOSE (DWD) 2.1 MGY organism=Enterobacter sp. RFL1396 : H : ARG NH2 D0035 <- 3.34 -> DG N7 F0003 : score 5.69508 : H : ARG NH2 D0035 <- 2.71 -> DG O6 F0003 : score 6.7188 : x : GLU xxxx D0025 <- 3.77 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0034 <- 3.83 -> DC xxx E0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0036 <- 3.44 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0037 <- 3.82 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0039 <- 4.01 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0043 <- 4.20 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0046 <- 2.96 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx >4x4c_ABCD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=RADIATION DAMAGE TO THE NUCLEOPROTEIN COMPLEX C.ESP1396I: DOSE (DWD) 6.2 MGY organism=Enterobacter sp. RFL1396 : H : ARG NH1 A0035 <- 3.30 -> DG N7 E0003 : score 5.445 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.54 -> DG O6 E0003 : score 6.9432 : H : ARG NH2 A0046 <- 3.32 -> DG O6 F0029 : score 5.9136 : H : ARG NH2 D0035 <- 3.34 -> DG N7 F0003 : score 5.69508 : H : ARG NH2 D0035 <- 2.71 -> DG O6 F0003 : score 6.7188 : x : GLU xxxx A0025 <- 4.25 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0034 <- 3.32 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0036 <- 3.14 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0039 <- 3.77 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0034 <- 2.90 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 3.01 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0036 <- 3.44 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0037 <- 3.88 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0039 <- 4.16 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 3.69 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0024 <- 4.36 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0034 <- 3.21 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 2.66 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0036 <- 3.23 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0037 <- 3.86 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0039 <- 4.12 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 3.46 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0046 <- 3.62 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0025 <- 3.77 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0034 <- 3.83 -> DC xxx E0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0036 <- 3.44 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0037 <- 3.82 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0039 <- 4.01 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0043 <- 4.20 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0046 <- 2.95 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx >4x4c_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=RADIATION DAMAGE TO THE NUCLEOPROTEIN COMPLEX C.ESP1396I: DOSE (DWD) 6.2 MGY organism=Enterobacter sp. RFL1396 : x : ASP xxxx B0034 <- 2.90 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 3.01 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0036 <- 3.44 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0037 <- 3.88 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0039 <- 4.16 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 3.69 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx >4x4d_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=RADIATION DAMAGE TO THE NUCLEOPROTEIN COMPLEX C.ESP1396I: DOSE (DWD) 10.3 MGY organism=Enterobacter sp. RFL1396 : H : ARG NH1 A0035 <- 3.30 -> DG N7 E0003 : score 5.445 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.54 -> DG O6 E0003 : score 6.9432 : H : ARG NH2 A0046 <- 3.32 -> DG O6 F0029 : score 5.9136 : V : ASP CG A0034 <- 3.58 -> DT C7 F0030 : score 2.83065 : x : GLU xxxx A0025 <- 4.25 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0036 <- 3.14 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0039 <- 3.77 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx >4x4d_ABCD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=RADIATION DAMAGE TO THE NUCLEOPROTEIN COMPLEX C.ESP1396I: DOSE (DWD) 10.3 MGY organism=Enterobacter sp. RFL1396 : H : ARG NH1 A0035 <- 3.30 -> DG N7 E0003 : score 5.445 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.54 -> DG O6 E0003 : score 6.9432 : H : ARG NH2 A0046 <- 3.32 -> DG O6 F0029 : score 5.9136 : H : ARG NH2 D0035 <- 3.34 -> DG N7 F0003 : score 5.69508 : H : ARG NH2 D0035 <- 2.71 -> DG O6 F0003 : score 6.7188 : x : GLU xxxx A0025 <- 4.25 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0034 <- 3.32 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0036 <- 3.14 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0039 <- 3.77 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0034 <- 2.90 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 3.01 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0036 <- 3.44 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0037 <- 3.88 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0039 <- 4.15 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 3.69 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0024 <- 4.36 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0034 <- 3.21 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 2.66 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0036 <- 3.23 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0037 <- 3.86 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0039 <- 4.12 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 3.46 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0046 <- 3.62 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0025 <- 3.77 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0034 <- 3.83 -> DC xxx E0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0036 <- 3.44 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0037 <- 3.82 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0039 <- 4.01 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0043 <- 4.20 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0046 <- 2.95 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx >4x4e_ABCD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=RADIATION DAMAGE TO THE NUCLEOPROTEIN COMPLEX C.ESP1396I: DOSE (DWD) 14.4 MGY organism=Enterobacter sp. RFL1396 : H : ARG NH1 A0035 <- 3.30 -> DG N7 E0003 : score 5.445 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.54 -> DG O6 E0003 : score 6.9432 : H : ARG NH2 A0046 <- 3.32 -> DG O6 F0029 : score 5.9136 : H : ARG NH2 D0035 <- 3.34 -> DG N7 F0003 : score 5.69508 : H : ARG NH2 D0035 <- 2.71 -> DG O6 F0003 : score 6.7188 : x : GLU xxxx A0025 <- 4.25 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0034 <- 3.32 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0036 <- 3.14 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0039 <- 3.77 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0034 <- 2.90 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 3.01 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0036 <- 3.44 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0037 <- 3.88 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0039 <- 4.15 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 3.69 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0024 <- 4.36 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0034 <- 3.21 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 2.66 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0036 <- 3.23 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0037 <- 3.86 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0039 <- 4.12 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 3.46 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0046 <- 3.62 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0025 <- 3.77 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0034 <- 3.83 -> DC xxx E0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0036 <- 3.44 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0037 <- 3.82 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0039 <- 4.01 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0043 <- 4.20 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0046 <- 2.96 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx >4x4e_D:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=RADIATION DAMAGE TO THE NUCLEOPROTEIN COMPLEX C.ESP1396I: DOSE (DWD) 14.4 MGY organism=Enterobacter sp. RFL1396 : H : ARG NH2 D0035 <- 3.34 -> DG N7 F0003 : score 5.69508 : H : ARG NH2 D0035 <- 2.71 -> DG O6 F0003 : score 6.7188 : x : GLU xxxx D0025 <- 3.77 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0034 <- 3.83 -> DC xxx E0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0036 <- 3.44 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0037 <- 3.82 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0039 <- 4.01 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0043 <- 4.20 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0046 <- 2.96 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx >4x4f_ABCD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=RADIATION DAMAGE TO THE NUCLEOPROTEIN COMPLEX C.ESP1396I: DOSE (DWD) 20.6 MGY organism=Enterobacter sp. RFL1396 : H : ARG NH1 A0035 <- 3.30 -> DG N7 E0003 : score 5.445 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.54 -> DG O6 E0003 : score 6.9432 : H : ARG NH2 A0046 <- 3.32 -> DG O6 F0029 : score 5.9136 : H : ARG NH2 D0035 <- 3.34 -> DG N7 F0003 : score 5.69508 : H : ARG NH2 D0035 <- 2.71 -> DG O6 F0003 : score 6.7188 : x : GLU xxxx A0025 <- 4.25 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0034 <- 3.32 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0036 <- 3.14 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0039 <- 3.77 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0034 <- 2.90 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 3.01 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0036 <- 3.44 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0037 <- 3.88 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0039 <- 4.16 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 3.69 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0024 <- 4.36 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0034 <- 3.21 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 2.66 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0036 <- 3.23 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0037 <- 3.85 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0039 <- 4.12 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 3.46 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0046 <- 3.62 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0025 <- 3.77 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0034 <- 3.83 -> DC xxx E0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0036 <- 3.44 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0037 <- 3.82 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0039 <- 4.01 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0043 <- 4.20 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0046 <- 2.95 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx >4x4f_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=RADIATION DAMAGE TO THE NUCLEOPROTEIN COMPLEX C.ESP1396I: DOSE (DWD) 20.6 MGY organism=Enterobacter sp. RFL1396 : x : ASP xxxx B0034 <- 2.90 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 3.01 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0036 <- 3.44 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0037 <- 3.88 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0039 <- 4.16 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 3.69 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx >4x4g_ABCD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=RADIATION DAMAGE TO THE NUCLEOPROTEIN COMPLEX C.ESP1396I: DOSE (DWD) 26.8 MGY organism=Enterobacter sp. RFL1396 : H : ARG NH1 A0035 <- 3.30 -> DG N7 E0003 : score 5.445 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.54 -> DG O6 E0003 : score 6.9432 : H : ARG NH2 A0046 <- 3.32 -> DG O6 F0029 : score 5.9136 : H : ARG NH2 D0035 <- 3.34 -> DG N7 F0003 : score 5.69508 : H : ARG NH2 D0035 <- 2.71 -> DG O6 F0003 : score 6.7188 : x : GLU xxxx A0025 <- 4.25 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0034 <- 3.32 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0036 <- 3.14 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0039 <- 3.77 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0034 <- 2.90 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 3.01 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0036 <- 3.44 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0037 <- 3.88 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0039 <- 4.15 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 3.69 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0024 <- 4.36 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0034 <- 3.21 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 2.66 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0036 <- 3.23 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0037 <- 3.86 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0039 <- 4.12 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 3.46 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0046 <- 3.62 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0025 <- 3.77 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0034 <- 3.83 -> DC xxx E0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0036 <- 3.44 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0037 <- 3.82 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0039 <- 4.01 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0043 <- 4.20 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0046 <- 2.95 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx >4x4g_C:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=RADIATION DAMAGE TO THE NUCLEOPROTEIN COMPLEX C.ESP1396I: DOSE (DWD) 26.8 MGY organism=Enterobacter sp. RFL1396 : x : GLN xxxx C0024 <- 4.36 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0034 <- 3.21 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 2.66 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0036 <- 3.23 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0037 <- 3.86 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0039 <- 4.12 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 3.46 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0046 <- 3.62 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx >4x4h_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=RADIATION DAMAGE TO THE NUCLEOPROTEIN COMPLEX C.ESP1396I: DOSE (DWD) 35.7 MGY organism=Enterobacter sp. RFL1396 : H : ARG NH1 A0035 <- 3.30 -> DG N7 E0003 : score 5.445 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.54 -> DG O6 E0003 : score 6.9432 : H : ARG NH2 A0046 <- 3.32 -> DG O6 F0029 : score 5.9136 : V : ASP CG A0034 <- 3.58 -> DT C7 F0030 : score 2.83065 : x : GLU xxxx A0025 <- 4.25 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0036 <- 3.14 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0039 <- 3.77 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx >4x4h_ABCD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=RADIATION DAMAGE TO THE NUCLEOPROTEIN COMPLEX C.ESP1396I: DOSE (DWD) 35.7 MGY organism=Enterobacter sp. RFL1396 : H : ARG NH1 A0035 <- 3.30 -> DG N7 E0003 : score 5.445 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.54 -> DG O6 E0003 : score 6.9432 : H : ARG NH2 A0046 <- 3.32 -> DG O6 F0029 : score 5.9136 : H : ARG NH2 D0035 <- 3.34 -> DG N7 F0003 : score 5.69508 : H : ARG NH2 D0035 <- 2.71 -> DG O6 F0003 : score 6.7188 : x : GLU xxxx A0025 <- 4.25 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0034 <- 3.32 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0036 <- 3.14 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0039 <- 3.77 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0034 <- 2.90 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 3.01 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0036 <- 3.44 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0037 <- 3.88 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0039 <- 4.15 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 3.69 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0024 <- 4.36 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0034 <- 3.21 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 2.66 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0036 <- 3.23 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0037 <- 3.86 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0039 <- 4.12 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 3.46 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0046 <- 3.62 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0025 <- 3.77 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0034 <- 3.83 -> DC xxx E0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0036 <- 3.44 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0037 <- 3.82 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0039 <- 4.01 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0043 <- 4.20 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0046 <- 2.95 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx >4x4i_ABCD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=RADIATION DAMAGE TO THE NUCLEOPROTEIN COMPLEX C.ESP1396I: DOSE (DWD) 44.6 MGY organism=Enterobacter sp. RFL1396 : H : ARG NH1 A0035 <- 3.30 -> DG N7 E0003 : score 5.445 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.54 -> DG O6 E0003 : score 6.9432 : H : ARG NH2 A0046 <- 3.32 -> DG O6 F0029 : score 5.9136 : H : ARG NH2 D0035 <- 3.34 -> DG N7 F0003 : score 5.69508 : H : ARG NH2 D0035 <- 2.71 -> DG O6 F0003 : score 6.7188 : x : GLU xxxx A0025 <- 4.25 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0034 <- 3.32 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0036 <- 3.14 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0039 <- 3.77 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0034 <- 2.90 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 3.01 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0036 <- 3.44 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0037 <- 3.88 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0039 <- 4.16 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 3.69 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0024 <- 4.36 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0034 <- 3.21 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 2.66 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0036 <- 3.23 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0037 <- 3.86 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0039 <- 4.12 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 3.46 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0046 <- 3.62 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0025 <- 3.77 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0034 <- 3.83 -> DC xxx E0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0036 <- 3.44 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0037 <- 3.82 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0039 <- 4.01 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0043 <- 4.20 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0046 <- 2.95 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx >4x4i_C:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=RADIATION DAMAGE TO THE NUCLEOPROTEIN COMPLEX C.ESP1396I: DOSE (DWD) 44.6 MGY organism=Enterobacter sp. RFL1396 : x : GLN xxxx C0024 <- 4.36 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0034 <- 3.21 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 2.66 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0036 <- 3.23 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0037 <- 3.86 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0039 <- 4.12 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 3.46 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0046 <- 3.62 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx >4x67_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ELONGATING YEAST RNA POLYMERASE II STALLED AT OXIDATIVE CYCLOPURINE DNA LESIONS. organism=? : x : ARG xxxx A0350 <- 3.74 -> DT xxx T0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0447 <- 4.31 -> DT xxx T0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 4.17 -> DA xxx T0020 : score x.xxxxx >4x67_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF ELONGATING YEAST RNA POLYMERASE II STALLED AT OXIDATIVE CYCLOPURINE DNA LESIONS. organism=? : x : ARG xxxx A0350 <- 3.74 -> DT xxx T0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0447 <- 4.31 -> DT xxx T0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 4.17 -> DA xxx T0020 : score x.xxxxx >4x6a_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF YEAST RNA POLYMERASE II ENCOUNTERING OXIDATIVE CYCLOPURINE DNA LESIONS organism=? : x : ARG xxxx A0350 <- 4.06 -> DT xxx T0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0447 <- 3.67 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.96 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx >4x9j_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=EGR-1 WITH DOUBLY METHYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0118 <- 2.93 -> DG N7 B0010 : score 5.8927 : H : ARG NH2 A0118 <- 2.87 -> DG O6 B0010 : score 6.5076 : w : ASP OD2 A0120 <- 5.59 -> DA N7 C0052 : score 2.024 : H : ARG NH1 A0124 <- 3.05 -> DG O6 B0008 : score 5.77917 : H : ARG NH2 A0124 <- 2.85 -> DG N7 B0008 : score 6.32077 : w : ARG NH1 A0124 <- 5.53 -> DG O6 C0054 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0146 <- 3.07 -> DG N7 B0007 : score 5.7233 : H : ARG NH2 A0146 <- 2.84 -> DG O6 B0007 : score 6.5472 : H : ASP OD2 A0148 <- 3.01 -> DC N4 C0055 : score 5.9396 A : H : HIS NE2 A0149 <- 2.71 -> DG N7 B0006 : score 6.92501 : H : ARG NH1 A0174 <- 2.92 -> DG N7 B0004 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0174 <- 2.90 -> DG O6 B0004 : score 6.468 : w : ASP OD1 A0176 <- 5.98 -> DC N4 C0057 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0176 <- 5.71 -> DA N7 C0058 : score 2.024 : H : ARG NH1 A0180 <- 2.91 -> DG O6 B0002 : score 5.9495 : H : ARG NH2 A0180 <- 2.88 -> DG N7 B0002 : score 6.28246 : w : ARG NH1 A0180 <- 5.65 -> DG O6 C0060 : score 2.756 >4xeg_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=STRUCTURE OF THE ENZYME-PRODUCT COMPLEX RESULTING FROM TDG ACTION ON A G/HMU MISMATCH organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0158 <- 6.39 -> DT O2 C0013 : score 3.682 : H : LYS NZ A0201 <- 3.17 -> DG N7 D0018 : score 4.98734 : H : LYS NZ A0201 <- 2.48 -> DT O4 D0019 : score 3.81676 : H : GLN OE1 A0278 <- 2.95 -> DG N2 D0018 : score 5.43946 : H : GLN NE2 A0278 <- 2.71 -> DT O2 D0019 : score 4.00413 : x : ALA xxxx A0274 <- 3.51 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.54 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0276 <- 3.37 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 3.52 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0280 <- 3.49 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >4xic_D:Homeodomain-like; title=ANTPHD WITH 15BP DI-THIOATE MODIFIED DNA DUPLEX organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 D0005 <- 2.45 -> DT O2 F0027 : score 4.60786 : H : ASN OD1 D0051 <- 2.89 -> DA N6 F0029 : score 5.9134 : H : ASN ND2 D0051 <- 3.16 -> DA N7 F0029 : score 5.44784 : V : ILE CG2 D0047 <- 3.72 -> DT C7 F0030 : score 7.23311 : x : GLN xxxx D0050 <- 3.38 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx >4xid_D:Homeodomain-like; title=ANTPHD WITH 15BP DNA DUPLEX organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 D0005 <- 2.65 -> DT O2 F0028 : score 4.4356 : H : ASN OD1 D0051 <- 2.87 -> DA N6 F0030 : score 5.93749 : H : ASN ND2 D0051 <- 3.14 -> DA N7 F0030 : score 5.47132 : V : ILE CG2 D0047 <- 3.60 -> DT C7 F0031 : score 7.44585 : x : LYS xxxx D0046 <- 4.32 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0050 <- 3.42 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0054 <- 3.63 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx >4xiu_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BINARY COMPLEX STRUCTURE OF KLENOW FRAGMENT OF TAQ DNA POLYMERASE I707L MUTANT WITH DNA CONTAINING TTT OVERHANG organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.81 -> DC O2 B0109 : score 2.94026 : x : ARG xxxx A0573 <- 3.26 -> DG xxx C0205 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0580 <- 4.16 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0583 <- 3.05 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0671 <- 3.24 -> DG xxx C0205 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0754 <- 3.44 -> DG xxx C0205 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0784 <- 3.84 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >4xln_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. AQUATICUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING BUBBLE PROMOTER AND RNA organism=THERMUS AQUATICUS : H : TYR OH C0256 <- 2.88 -> DA N6 O0034 : score 4.59578 : H : ASP OD1 C0326 <- 2.58 -> DG N2 O0038 : score 5.3766 : H : ARG NH1 D0534 <- 2.54 -> DT O2 P0019 : score 4.53034 : H : ASN OD1 F0206 <- 2.82 -> DT N3 O0030 : score 3.78608 : H : GLU OE2 F0243 <- 3.25 -> DA N6 O0026 : score 2.77667 : H : ARG NH2 F0264 <- 2.88 -> DG N7 O0023 : score 6.28246 : H : GLU OE2 F0281 <- 3.01 -> DC N4 P0026 : score 5.04424 : H : ARG NH2 F0291 <- 2.76 -> DA N3 P0023 : score 3.26566 : H : GLU OE1 F0410 <- 2.78 -> DC N4 P0045 : score 5.79102 : V : ILE CG2 F0283 <- 3.59 -> DT C7 P0022 : score 7.46357 : V : VAL CG1 F0277 <- 3.69 -> DT C7 O0022 : score 6.22718 : x : ASN xxxx C0130 <- 4.00 -> DT xxx P0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0142 <- 3.22 -> DG xxx O0038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0170 <- 3.51 -> DC xxx O0036 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0171 <- 3.16 -> DT xxx O0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0187 <- 3.38 -> DC xxx O0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0243 <- 4.13 -> DA xxx O0034 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0246 <- 3.14 -> DG xxx O0033 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0247 <- 4.06 -> DG xxx O0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0260 <- 3.65 -> DG xxx O0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0266 <- 2.62 -> DG xxx O0035 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0325 <- 3.89 -> DG xxx O0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0331 <- 3.20 -> DG xxx O0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0376 <- 4.06 -> DA xxx P0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0383 <- 3.09 -> DA xxx P0021 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0418 <- 4.37 -> DG xxx O0038 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0421 <- 3.61 -> DT xxx O0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 3.64 -> DT xxx O0039 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0426 <- 3.19 -> DG xxx O0038 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0427 <- 4.20 -> DG xxx O0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C1004 <- 4.21 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0628 <- 4.24 -> DC xxx P0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0705 <- 4.00 -> DT xxx P0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 3.23 -> DG xxx P0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.86 -> DG xxx P0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 3.83 -> DG xxx P0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0094 <- 4.15 -> DG xxx O0032 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0096 <- 3.24 -> DG xxx O0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0097 <- 2.98 -> DG xxx O0032 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0100 <- 3.30 -> DG xxx O0032 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0101 <- 3.21 -> DG xxx O0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0108 <- 3.38 -> DT xxx O0030 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0109 <- 4.13 -> DT xxx O0030 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0114 <- 3.93 -> DT xxx O0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0208 <- 2.88 -> DG xxx O0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0209 <- 3.42 -> DT xxx O0030 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0217 <- 4.34 -> DA xxx P0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0224 <- 4.18 -> DG xxx O0032 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0242 <- 3.41 -> DA xxx O0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0246 <- 3.37 -> DA xxx O0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0248 <- 3.85 -> DA xxx O0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0249 <- 3.34 -> DT xxx O0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0251 <- 3.76 -> DT xxx O0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0252 <- 3.20 -> DA xxx O0028 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0253 <- 3.35 -> DA xxx O0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0255 <- 2.87 -> DC xxx O0029 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0256 <- 3.84 -> DT xxx O0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0257 <- 4.12 -> DT xxx O0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0259 <- 3.48 -> DC xxx O0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0260 <- 3.03 -> DT xxx O0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0263 <- 3.45 -> DA xxx P0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0271 <- 2.93 -> DT xxx P0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0278 <- 3.36 -> DT xxx O0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0288 <- 3.08 -> DA xxx P0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0326 <- 3.66 -> DT xxx P0022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0336 <- 3.22 -> DG xxx P0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0338 <- 4.43 -> DG xxx P0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0339 <- 2.63 -> DG xxx P0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0342 <- 3.93 -> DG xxx P0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0347 <- 3.21 -> DG xxx P0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0398 <- 3.86 -> DT xxx P0044 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0408 <- 3.99 -> DT xxx O0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0409 <- 3.23 -> DG xxx P0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0411 <- 3.19 -> DC xxx O0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0413 <- 3.79 -> DT xxx P0044 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0414 <- 3.29 -> DC xxx O0001 : score x.xxxxx >4xln_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. AQUATICUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING BUBBLE PROMOTER AND RNA organism=THERMUS AQUATICUS : H : ASN OD1 F0206 <- 2.82 -> DT N3 O0030 : score 3.78608 : H : GLU OE2 F0243 <- 3.25 -> DA N6 O0026 : score 2.77667 : H : ARG NH2 F0264 <- 2.88 -> DG N7 O0023 : score 6.28246 : H : GLU OE2 F0281 <- 3.01 -> DC N4 P0026 : score 5.04424 : H : ARG NH2 F0291 <- 2.76 -> DA N3 P0023 : score 3.26566 : H : GLU OE1 F0410 <- 2.78 -> DC N4 P0045 : score 5.79102 : V : ILE CG2 F0283 <- 3.59 -> DT C7 P0022 : score 7.46357 : V : VAL CG1 F0277 <- 3.69 -> DT C7 O0022 : score 6.22718 : x : ASP xxxx F0094 <- 4.15 -> DG xxx O0032 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0096 <- 3.24 -> DG xxx O0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0097 <- 2.98 -> DG xxx O0032 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0100 <- 3.30 -> DG xxx O0032 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0101 <- 3.21 -> DG xxx O0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0108 <- 3.38 -> DT xxx O0030 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0109 <- 4.13 -> DT xxx O0030 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0114 <- 3.93 -> DT xxx O0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0208 <- 2.88 -> DG xxx O0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0209 <- 3.42 -> DT xxx O0030 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0217 <- 4.34 -> DA xxx P0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0224 <- 4.18 -> DG xxx O0032 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0242 <- 3.41 -> DA xxx O0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0246 <- 3.37 -> DA xxx O0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0248 <- 3.85 -> DA xxx O0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0249 <- 3.34 -> DT xxx O0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0251 <- 3.76 -> DT xxx O0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0252 <- 3.20 -> DA xxx O0028 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0253 <- 3.35 -> DA xxx O0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0255 <- 2.87 -> DC xxx O0029 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0256 <- 3.84 -> DT xxx O0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0257 <- 4.12 -> DT xxx O0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0259 <- 3.48 -> DC xxx O0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0260 <- 3.03 -> DT xxx O0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0263 <- 3.45 -> DA xxx P0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0271 <- 2.93 -> DT xxx P0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0278 <- 3.36 -> DT xxx O0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0288 <- 3.08 -> DA xxx P0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0326 <- 3.66 -> DT xxx P0022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0336 <- 3.22 -> DG xxx P0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0338 <- 4.43 -> DG xxx P0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0339 <- 2.63 -> DG xxx P0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0342 <- 3.93 -> DG xxx P0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0347 <- 3.21 -> DG xxx P0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0398 <- 3.86 -> DT xxx P0044 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0408 <- 3.99 -> DT xxx O0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0409 <- 3.23 -> DG xxx P0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0411 <- 3.19 -> DC xxx O0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0413 <- 3.79 -> DT xxx P0044 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0414 <- 3.29 -> DC xxx O0001 : score x.xxxxx >4xln_IJL: title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. AQUATICUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING BUBBLE PROMOTER AND RNA organism=THERMUS AQUATICUS : H : TYR OH I0256 <- 2.89 -> DA N6 R0034 : score 4.58644 : H : ARG NH2 I0266 <- 2.69 -> DG N7 R0035 : score 6.52508 : H : ARG NH2 I0266 <- 2.71 -> DG O6 R0035 : score 6.7188 : H : ASP OD1 I0326 <- 2.48 -> DG N2 R0038 : score 5.4796 : H : ASN OD1 L0206 <- 2.76 -> DT N3 R0030 : score 3.83169 : H : ARG NH2 L0264 <- 2.88 -> DG N7 R0023 : score 6.28246 : H : GLU OE2 L0281 <- 2.97 -> DC N4 S0026 : score 5.08636 : H : ARG NH2 L0409 <- 2.66 -> DG N7 S0043 : score 6.56338 : H : ARG NH2 L0409 <- 2.72 -> DG O6 S0043 : score 6.7056 : H : GLU OE1 L0410 <- 2.66 -> DC N4 S0045 : score 5.92945 : V : VAL CG1 L0277 <- 3.63 -> DT C7 R0022 : score 6.31808 : x : ARG xxxx I0142 <- 3.19 -> DG xxx R0038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0170 <- 3.50 -> DC xxx R0036 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0171 <- 2.94 -> DT xxx R0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0187 <- 3.64 -> DC xxx R0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0243 <- 4.07 -> DA xxx R0034 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0246 <- 3.39 -> DG xxx R0033 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0247 <- 4.18 -> DG xxx R0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0260 <- 3.50 -> DG xxx R0035 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0325 <- 3.89 -> DG xxx R0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0331 <- 3.06 -> DG xxx R0038 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0418 <- 4.33 -> DG xxx R0038 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0421 <- 3.44 -> DT xxx R0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0422 <- 3.49 -> DT xxx R0039 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0426 <- 3.08 -> DG xxx R0038 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0427 <- 4.16 -> DG xxx R0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I1004 <- 4.31 -> DG xxx S0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0628 <- 4.31 -> DC xxx S0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0705 <- 3.97 -> DT xxx S0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0706 <- 3.18 -> DG xxx S0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J1088 <- 3.74 -> DG xxx S0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J1089 <- 3.75 -> DG xxx S0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0094 <- 4.08 -> DG xxx R0032 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx L0096 <- 3.16 -> DG xxx R0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0097 <- 2.88 -> DG xxx R0033 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0100 <- 3.19 -> DG xxx R0032 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0101 <- 3.12 -> DG xxx R0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0108 <- 3.39 -> DT xxx R0030 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0109 <- 4.08 -> DT xxx R0030 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0114 <- 3.89 -> DT xxx R0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0208 <- 2.84 -> DG xxx R0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0209 <- 3.43 -> DT xxx R0030 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0217 <- 4.39 -> DA xxx S0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0224 <- 4.24 -> DG xxx R0032 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0242 <- 3.48 -> DA xxx R0026 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0243 <- 3.36 -> DA xxx R0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0246 <- 3.40 -> DA xxx R0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0248 <- 3.80 -> DA xxx R0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0249 <- 3.32 -> DT xxx R0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0251 <- 3.78 -> DT xxx R0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0252 <- 3.24 -> DA xxx R0028 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0253 <- 3.37 -> DA xxx R0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0255 <- 2.91 -> DC xxx R0029 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0256 <- 3.80 -> DT xxx R0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0257 <- 4.32 -> DT xxx R0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0259 <- 3.56 -> DC xxx R0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0260 <- 3.18 -> DT xxx R0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0263 <- 3.55 -> DA xxx S0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0278 <- 3.43 -> DT xxx R0020 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0336 <- 3.13 -> DG xxx S0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0338 <- 4.41 -> DG xxx S0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0339 <- 2.55 -> DG xxx S0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0342 <- 3.96 -> DG xxx S0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0347 <- 3.11 -> DG xxx S0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx 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AQUATICUS : H : ARG NH2 L0264 <- 3.14 -> DG N7 R0023 : score 5.95046 : H : GLU OE2 L0281 <- 2.97 -> DC N4 S0004 : score 5.08636 : H : ARG NH2 L0409 <- 2.94 -> DG N7 S0021 : score 6.20585 : H : GLU OE1 L0410 <- 2.53 -> DC N4 S0023 : score 6.07942 : V : ARG CB L0411 <- 3.64 -> DT C7 R0002 : score 1.04533 : V : VAL CG2 L0277 <- 3.57 -> DT C7 R0022 : score 6.47515 : x : TRP xxxx L0256 <- 3.23 -> DT xxx R0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0257 <- 4.10 -> DT xxx R0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0259 <- 4.35 -> DA xxx S0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0260 <- 2.63 -> DC xxx R0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0263 <- 3.63 -> DA xxx S0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0278 <- 3.23 -> DT xxx R0020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0398 <- 3.50 -> DT xxx S0022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0399 <- 4.37 -> DT xxx S0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0408 <- 3.84 -> DT xxx R0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0413 <- 3.65 -> DT xxx S0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0414 <- 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x.xxxxx : x : LEU xxxx L0398 <- 3.50 -> DT xxx S0022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0399 <- 4.37 -> DT xxx S0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0408 <- 3.84 -> DT xxx R0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0413 <- 3.65 -> DT xxx S0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0414 <- 3.64 -> DC xxx R0001 : score x.xxxxx >4xlr_CDFM: title=CRYSTAL STRUCTURE OF T.AQUATICUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH CARD CONTAINING BUBBLE PROMOTER AND RNA organism=THERMUS THERMOPHILUS JL-18 / THERMUS AQUATICUS : H : ASN OD1 C0187 <- 2.91 -> DG N2 O0035 : score 4.6944 : H : ARG NE C0331 <- 2.94 -> DG O6 O0038 : score 3.83068 : H : ARG NH2 C0331 <- 2.70 -> DG O6 O0038 : score 6.732 : H : ARG NH1 D0534 <- 2.72 -> DA N3 P0020 : score 3.74096 : H : GLU OE2 F0243 <- 2.81 -> DA N6 O0026 : score 3.04518 : H : ARG NH2 F0264 <- 2.91 -> DG N7 O0023 : score 6.24415 : H : ARG NH2 F0264 <- 2.88 -> DG O6 O0023 : score 6.4944 : H : SER OG F0342 <- 2.48 -> DG N2 P0017 : score 3.59032 : H : GLU OE1 F0410 <- 2.79 -> DC N4 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x.xxxxx : x : THR xxxx F0255 <- 2.89 -> DC xxx O0029 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0256 <- 2.91 -> DC xxx O0029 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0257 <- 3.63 -> DT xxx O0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0260 <- 3.18 -> DC xxx O0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0263 <- 2.95 -> DA xxx P0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0278 <- 3.40 -> DT xxx O0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0281 <- 3.10 -> DC xxx P0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0291 <- 2.78 -> DT xxx P0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0327 <- 2.85 -> DA xxx P0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0336 <- 3.50 -> DG xxx P0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0338 <- 3.11 -> DG xxx P0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0339 <- 3.53 -> DG xxx P0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0347 <- 3.08 -> DG xxx P0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0398 <- 4.41 -> DT xxx P0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0399 <- 3.98 -> DT xxx P0042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0409 <- 3.19 -> DA xxx O0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 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: H : SER OG L0342 <- 2.73 -> DG N2 S0017 : score 3.4216 : H : ARG NH1 L0409 <- 2.96 -> DG O6 S0043 : score 5.88867 : H : ARG NH2 L0409 <- 2.68 -> DG O6 S0043 : score 6.7584 : H : ARG NH2 L0409 <- 2.70 -> DT O4 S0044 : score 3.62492 : H : GLU OE1 L0410 <- 2.54 -> DC N4 S0045 : score 6.06788 : V : HIS CG L0278 <- 3.51 -> DT C7 R0020 : score 3.2164 : V : VAL CB L0277 <- 3.57 -> DT C7 R0022 : score 4.15408 : V : TRP CD1 L0257 <- 3.67 -> DT C7 R0025 : score 7.57167 : x : ASP xxxx I0087 <- 4.41 -> DT xxx S0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0142 <- 3.26 -> DG xxx R0038 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0163 <- 3.54 -> DT xxx R0037 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0166 <- 3.95 -> DT xxx R0037 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0167 <- 4.18 -> DC xxx R0036 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0170 <- 3.33 -> DC xxx R0036 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0171 <- 3.25 -> DT xxx R0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0187 <- 3.13 -> DG xxx R0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0243 <- 3.16 -> DA xxx R0034 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0246 <- 3.04 -> DG xxx R0033 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0247 <- 3.21 -> DG xxx R0031 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx I0256 <- 3.36 -> DG xxx R0035 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0260 <- 3.15 -> DG xxx R0035 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0326 <- 3.19 -> DG xxx R0038 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0374 <- 4.32 -> DT xxx S0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0377 <- 4.29 -> DT xxx S0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0418 <- 3.39 -> DG xxx R0038 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0421 <- 3.17 -> DT xxx R0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0422 <- 3.56 -> DT xxx R0039 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0427 <- 3.16 -> DG xxx R0038 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0709 <- 3.73 -> DT xxx S0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0816 <- 3.71 -> DA xxx S0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0817 <- 3.67 -> DA xxx S0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I1004 <- 3.66 -> DG xxx S0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0628 <- 4.34 -> DG xxx S0014 : score x.xxxxx : x : ALA 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xxx R0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0248 <- 3.49 -> DA xxx R0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0249 <- 3.27 -> DT xxx R0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0251 <- 3.97 -> DC xxx R0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0252 <- 3.26 -> DA xxx R0028 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0253 <- 3.42 -> DA xxx R0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0255 <- 2.98 -> DC xxx R0029 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0256 <- 2.91 -> DC xxx R0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0260 <- 3.15 -> DT xxx R0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0263 <- 3.00 -> DA xxx S0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0281 <- 3.11 -> DC xxx S0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0291 <- 2.70 -> DT xxx S0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0327 <- 3.02 -> DA xxx S0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0336 <- 3.33 -> DG xxx S0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0338 <- 4.38 -> DG xxx S0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0347 <- 3.08 -> DG xxx S0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0398 <- 3.85 -> DT xxx S0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0399 <- 4.06 -> DT xxx S0042 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0408 <- 3.74 -> DT xxx R0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0411 <- 3.31 -> DC xxx R0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0413 <- 3.95 -> DT xxx S0044 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0414 <- 3.91 -> DC xxx R0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx N0086 <- 3.00 -> DT xxx R0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0091 <- 3.50 -> DT xxx R0027 : score x.xxxxx >4xlr_L:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T.AQUATICUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH CARD CONTAINING BUBBLE PROMOTER AND RNA organism=? : H : GLU OE2 L0243 <- 2.99 -> DA N6 R0026 : score 2.93533 : H : ARG NH2 L0264 <- 2.92 -> DG N7 R0023 : score 6.23138 : H : GLU OE1 L0339 <- 3.24 -> DA N6 S0015 : score 2.44603 : H : GLU OE1 L0339 <- 2.75 -> DG N2 S0016 : score 4.35336 : H : SER OG L0342 <- 3.22 -> DG O6 S0016 : score 3.74738 : H : SER OG L0342 <- 2.73 -> DG N2 S0017 : score 3.4216 : H : ARG NH1 L0409 <- 2.96 -> DG O6 S0043 : score 5.88867 : H : ARG NH2 L0409 <- 2.68 -> DG O6 S0043 : score 6.7584 : H : ARG NH2 L0409 <- 2.70 -> DT O4 S0044 : score 3.62492 : H : GLU OE1 L0410 <- 2.54 -> DC N4 S0045 : score 6.06788 : V : HIS CG L0278 <- 3.51 -> DT C7 R0020 : score 3.2164 : V : VAL CB L0277 <- 3.57 -> DT C7 R0022 : score 4.15408 : V : TRP CD1 L0257 <- 3.67 -> DT C7 R0025 : score 7.57167 : x : VAL xxxx L0096 <- 3.71 -> DG xxx R0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0097 <- 3.16 -> DG xxx R0032 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0100 <- 3.21 -> DG xxx R0031 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0101 <- 3.14 -> DG xxx R0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0108 <- 4.05 -> DT xxx R0030 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0109 <- 3.27 -> DT xxx R0030 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0114 <- 3.43 -> DT xxx R0030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0206 <- 3.20 -> DT xxx R0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0208 <- 3.01 -> DG xxx R0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0209 <- 3.46 -> DT xxx R0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0220 <- 3.75 -> DA xxx S0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0224 <- 3.27 -> DG xxx R0032 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0242 <- 3.49 -> DA xxx R0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0246 <- 3.29 -> DA xxx R0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0248 <- 3.49 -> DA xxx R0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0249 <- 3.27 -> DT xxx R0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0251 <- 3.97 -> DC xxx R0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0252 <- 3.26 -> DA xxx R0028 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0253 <- 3.42 -> DA xxx R0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0255 <- 2.98 -> DC xxx R0029 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0256 <- 2.91 -> DC xxx R0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0260 <- 3.15 -> DT xxx R0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0263 <- 3.00 -> DA xxx S0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0281 <- 3.11 -> DC xxx S0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0291 <- 2.70 -> DT xxx S0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0327 <- 3.02 -> DA xxx S0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0336 <- 3.33 -> DG xxx S0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0338 <- 4.38 -> DG xxx S0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0347 <- 3.08 -> DG xxx S0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0398 <- 3.85 -> DT xxx S0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0399 <- 4.06 -> DT xxx S0042 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0408 <- 3.74 -> DT xxx R0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0411 <- 3.31 -> DC xxx R0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0413 <- 3.95 -> DT xxx S0044 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0414 <- 3.91 -> DC xxx R0001 : score x.xxxxx >4xls_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. AQUATICUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH CARD CONTAINING UPSTREAM FORK PROMOTER. organism=? : H : ARG NH2 F0264 <- 2.83 -> DG O6 O0023 : score 6.5604 : H : ARG NH2 F0409 <- 2.90 -> DG O6 P0020 : score 6.468 : H : ARG NH2 F0409 <- 2.76 -> DT O4 P0021 : score 3.58228 : H : GLU OE1 F0410 <- 2.62 -> DC N4 P0022 : score 5.97559 : V : VAL CG2 F0277 <- 3.69 -> DT C7 O0022 : score 6.29146 : x : TRP xxxx F0257 <- 4.16 -> DC xxx O0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0260 <- 3.24 -> DC xxx O0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0278 <- 3.36 -> DT xxx O0020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0398 <- 3.98 -> DT xxx P0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0399 <- 4.47 -> DT xxx P0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0408 <- 4.34 -> DT xxx O0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0411 <- 3.22 -> DC xxx O0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0413 <- 4.10 -> DC xxx P0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0414 <- 3.28 -> DT xxx O0002 : score x.xxxxx >4xls_FM: title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. AQUATICUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH CARD CONTAINING UPSTREAM FORK PROMOTER. organism=THERMUS AQUATICUS / THERMUS THERMOPHILUS JL-18 : H : ARG NH2 F0264 <- 2.83 -> DG O6 O0023 : score 6.5604 : H : ARG NH2 F0409 <- 2.90 -> DG O6 P0020 : score 6.468 : H : ARG NH2 F0409 <- 2.76 -> DT O4 P0021 : score 3.58228 : H : GLU OE1 F0410 <- 2.62 -> DC N4 P0022 : score 5.97559 : V : VAL CG2 F0277 <- 3.69 -> DT C7 O0022 : score 6.29146 : x : TRP xxxx F0257 <- 4.16 -> DC xxx O0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0260 <- 3.24 -> DC xxx O0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0278 <- 3.36 -> DT xxx O0020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0398 <- 3.98 -> DT xxx P0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0399 <- 4.47 -> DT xxx P0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0408 <- 4.34 -> DT xxx O0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0411 <- 3.22 -> DC xxx O0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0413 <- 4.10 -> DC xxx P0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0414 <- 3.28 -> DT xxx O0002 : score x.xxxxx >4xls_LN: title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. AQUATICUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH CARD CONTAINING UPSTREAM FORK PROMOTER. organism=THERMUS THERMOPHILUS JL-18 / THERMUS AQUATICUS : H : ARG NH2 L0264 <- 3.42 -> DG N7 R0023 : score 5.59292 : H : ARG NH2 L0264 <- 2.78 -> DG O6 R0023 : score 6.6264 : H : ARG NE L0409 <- 2.85 -> DT O4 S0021 : score 1.84038 : H : ARG NH2 L0409 <- 2.52 -> DG O6 S0020 : score 6.9696 : H : ARG NH2 L0409 <- 2.78 -> DT O4 S0021 : score 3.56806 : H : GLU OE1 L0410 <- 2.53 -> DC N4 S0022 : score 6.07942 : V : VAL CG2 L0277 <- 3.57 -> DT C7 R0022 : score 6.47515 : x : TRP xxxx L0257 <- 4.08 -> DC xxx R0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0260 <- 3.31 -> DC xxx R0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0278 <- 3.35 -> DT xxx R0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0281 <- 3.59 -> DC xxx S0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0398 <- 4.06 -> DT xxx S0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0399 <- 4.24 -> DT xxx S0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0408 <- 3.86 -> DT xxx R0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0411 <- 3.29 -> DC xxx R0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0413 <- 4.17 -> DT xxx S0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0414 <- 3.84 -> DC xxx R0001 : score x.xxxxx >4xo0_A:DNA/RNA_polymerases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF 5'-CTTATPPTAZZATAAG IN A HOST-GUEST COMPLEX organism=Moloney murine leukemia virus (isolate Shinnick) / Moloney murine leukemia virus (isolate Shinnick) : H : ASP OD2 A0114 <- 3.01 -> DG N2 G0016 : score 5.2297 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.63 -> DT O2 B0002 : score 4.37727 : x : TYR xxxx A0064 <- 4.18 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0099 <- 3.42 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0112 <- 4.43 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx >4xpc_A:DNA/RNA_polymerases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF 5'- CTTATAAATTTATAAG IN A HOST-GUEST COMPLEX organism=Moloney murine leukemia virus (isolate Shinnick) / Moloney murine leukemia virus (isolate Shinnick) : H : ASP OD2 A0114 <- 3.06 -> DG N2 G0016 : score 5.17511 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.68 -> DT O2 B0002 : score 4.33493 : x : TYR xxxx A0064 <- 3.13 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0099 <- 3.33 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0100 <- 4.20 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0101 <- 3.87 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx >4xpe_A:DNA/RNA_polymerases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF 5'-CTTATGGGCCCATAAG IN A HOST-GUEST COMPLEX organism=Moloney murine leukemia virus (isolate Shinnick) / Moloney murine leukemia virus (isolate Shinnick) : H : ASP OD2 A0114 <- 3.02 -> DG N2 G0016 : score 5.21878 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.68 -> DT O2 B0002 : score 4.33493 : x : TYR xxxx A0064 <- 4.13 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0099 <- 3.19 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0100 <- 3.97 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0101 <- 3.58 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0112 <- 4.45 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx >4xq8_B:Nucleotidyltransferase;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE LAMBDA- MGDATP BINARY COMPLEX AND COMPLEX WITH 6 PAIRED DNA organism=Homo sapiens : H : TYR OH B0505 <- 2.80 -> DA N3 P0005 : score 4.15128 : H : ASN ND2 B0513 <- 2.95 -> DC O2 P0006 : score 4.3451 : H : ARG NH1 B0514 <- 3.17 -> DG O6 T0006 : score 5.63317 : x : GLN xxxx B0464 <- 4.33 -> DC xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0510 <- 3.73 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0517 <- 3.24 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >4xqj_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF AGRA LYTTR DOMAIN IN COMPLEX WITH PROMOTERS organism=Staphylococcus aureus (strain COL) / Staphylococcus aureus (strain COL) : w : SER OG A0168 <- 6.37 -> DC N4 C0005 : score 2.105 : H : HIS NE2 A0169 <- 2.75 -> DG O6 B0013 : score 8.03338 : w : ASN ND2 A0201 <- 5.52 -> DT O2 B0010 : score 1.666 : H : ARG NH1 A0233 <- 2.92 -> DG N7 C0012 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0233 <- 2.93 -> DG O6 C0012 : score 6.4284 : x : ARG xxxx A0170 <- 3.76 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0183 <- 3.41 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0232 <- 3.96 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >4xqk_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=ATP-DEPENDENT TYPE ISP RESTRICTION-MODIFICATION ENZYME LLABIII BOUND TO DNA organism=LACTOCOCCUS LACTIS SUBSP. CREMORIS : H : LYS NZ A0385 <- 2.68 -> DG O6 c0025 : score 5.91951 : H : LYS NZ A1024 <- 2.86 -> DT O2 c0010 : score 3.54413 : H : LYS NZ A1024 <- 3.21 -> DC O2 c0011 : score 2.70457 : H : ASN OD1 A1056 <- 2.84 -> DG N2 c0008 : score 4.7616 : H : ASN ND2 A1056 <- 2.67 -> DC O2 c0009 : score 4.59595 : H : ASN ND2 A1058 <- 2.92 -> DC O2 d0021 : score 4.37198 : H : LYS NZ A1231 <- 2.53 -> DG N7 d0020 : score 5.67674 : H : LYS NZ A1231 <- 2.59 -> DG O6 d0020 : score 6.02356 : H : LYS NZ A1231 <- 2.99 -> DG O6 c0008 : score 5.5611 : H : ASP OD2 A1318 <- 2.84 -> DC N4 d0021 : score 6.1504 : H : ARG NE A1319 <- 3.20 -> DG N7 c0007 : score 4.06805 : H : ARG NH2 A1319 <- 2.88 -> DG O6 c0007 : score 6.4944 : H : TYR OH A1321 <- 2.77 -> DG N7 c0008 : score 4.3129 : H : ASN OD1 A1360 <- 2.96 -> DA N6 d0019 : score 5.8291 : H : ASN ND2 A1360 <- 3.14 -> DA N7 d0019 : score 5.47132 : x : VAL xxxx A0867 <- 3.73 -> DA xxx c0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1018 <- 2.93 -> DA xxx c0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1020 <- 4.37 -> DA xxx c0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1021 <- 3.29 -> DA xxx c0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1026 <- 4.40 -> DT xxx d0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1055 <- 3.85 -> DG xxx c0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1118 <- 3.52 -> DG xxx c0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1119 <- 3.69 -> DT xxx d0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1123 <- 3.73 -> DC xxx d0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1134 <- 3.79 -> DA xxx c0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1136 <- 3.76 -> DA xxx c0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1137 <- 3.20 -> DG xxx c0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1278 <- 4.32 -> DC xxx d0021 : score x.xxxxx >4xqk_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=ATP-DEPENDENT TYPE ISP RESTRICTION-MODIFICATION ENZYME LLABIII BOUND TO DNA organism=LACTOCOCCUS LACTIS SUBSP. CREMORIS : H : LYS NZ A0385 <- 2.68 -> DG O6 c0025 : score 5.91951 : H : LYS NZ A1024 <- 2.86 -> DT O2 c0010 : score 3.54413 : H : LYS NZ A1024 <- 3.21 -> DC O2 c0011 : score 2.70457 : H : ASN OD1 A1056 <- 2.84 -> DG N2 c0008 : score 4.7616 : H : ASN ND2 A1056 <- 2.67 -> DC O2 c0009 : score 4.59595 : H : ASN ND2 A1058 <- 2.92 -> DC O2 d0021 : score 4.37198 : H : LYS NZ A1231 <- 2.53 -> DG N7 d0020 : score 5.67674 : H : LYS NZ A1231 <- 2.59 -> DG O6 d0020 : score 6.02356 : H : LYS NZ A1231 <- 2.99 -> DG O6 c0008 : score 5.5611 : H : ASP OD2 A1318 <- 2.84 -> DC N4 d0021 : score 6.1504 : H : ARG NE A1319 <- 3.20 -> DG N7 c0007 : score 4.06805 : H : ARG NH2 A1319 <- 2.88 -> DG O6 c0007 : score 6.4944 : H : TYR OH A1321 <- 2.77 -> DG N7 c0008 : score 4.3129 : H : ASN OD1 A1360 <- 2.96 -> DA N6 d0019 : score 5.8291 : H : ASN ND2 A1360 <- 3.14 -> DA N7 d0019 : score 5.47132 : x : VAL xxxx A0867 <- 3.73 -> DA xxx c0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1018 <- 2.93 -> DA xxx c0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1020 <- 4.37 -> DA xxx c0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1021 <- 3.29 -> DA xxx c0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1026 <- 4.40 -> DT xxx d0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1055 <- 3.85 -> DG xxx c0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1118 <- 3.52 -> DG xxx c0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1119 <- 3.69 -> DT xxx d0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1123 <- 3.73 -> DC xxx d0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1134 <- 3.79 -> DA xxx c0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1136 <- 3.76 -> DA xxx c0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1137 <- 3.20 -> DG xxx c0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1278 <- 4.32 -> DC xxx d0021 : score x.xxxxx >4xqn_G: title=CRYSTAL STRUCTURE OF AGRA LYTTR DOMAIN IN COMPLEX WITH PROMOTERS organism=Staphylococcus aureus (strain COL) / Staphylococcus aureus (strain COL) : w : SER OG G0168 <- 6.04 -> DA N7 H0012 : score 2.343 : w : SER OG G0168 <- 5.78 -> DC N4 I0005 : score 2.105 : H : HIS NE2 G0169 <- 2.68 -> DG O6 H0013 : score 8.14474 : w : ASN ND2 G0201 <- 5.76 -> DT O2 H0010 : score 1.666 : H : ARG NH1 G0233 <- 2.69 -> DG N7 I0012 : score 6.1831 : H : ARG NH2 G0233 <- 2.62 -> DG O6 I0012 : score 6.8376 : V : SER CB G0168 <- 3.51 -> DT C7 I0004 : score 3.3583 : x : ARG xxxx G0170 <- 3.71 -> DT xxx I0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0183 <- 3.46 -> DA xxx I0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0232 <- 3.74 -> DT xxx I0013 : score x.xxxxx >4xr0_A:Replication_terminator_protein_Tus; title=ESCHERICHIA COLI REPLICATION TERMINATOR PROTEIN (TUS) COMPLEXED WITH DNA- G/T MISMATCH. organism=Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) : H : LYS NZ A0089 <- 2.91 -> DT O2 C0332 : score 3.50826 : H : LYS NZ A0175 <- 2.81 -> DT O4 C0337 : score 3.58001 : H : GLN OE1 A0250 <- 3.47 -> DA N6 B0312 : score 5.24152 : H : GLN OE1 A0252 <- 3.12 -> DA N6 C0338 : score 5.6652 : H : GLN NE2 A0252 <- 2.93 -> DT O4 B0314 : score 5.05606 : x : ARG xxxx A0093 <- 3.73 -> DT xxx C0335 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0136 <- 4.27 -> DT xxx B0322 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0153 <- 4.04 -> DG xxx C0333 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0173 <- 3.42 -> DT xxx B0314 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0177 <- 3.88 -> DT xxx C0334 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0178 <- 3.79 -> DC xxx B0317 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0232 <- 2.85 -> DG xxx C0333 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0234 <- 3.98 -> DT xxx C0334 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0237 <- 3.53 -> DT xxx C0335 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0239 <- 4.14 -> DG xxx B0313 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 3.44 -> DG xxx B0313 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0254 <- 4.35 -> DG xxx C0336 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0288 <- 3.87 -> DA xxx B0312 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0289 <- 2.90 -> DT xxx C0341 : score x.xxxxx >4xr1_A:Replication_terminator_protein_Tus; title=ESCHERICHIA COLI REPLICATION TERMINATOR PROTEIN (TUS) COMPLEXED WITH DNA- AG/AT MISMATCH. organism=Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) : H : LYS NZ A0089 <- 3.03 -> DT O2 C0332 : score 3.42217 : H : LYS NZ A0175 <- 2.80 -> DT O4 C0337 : score 3.58718 : w : LYS NZ A0175 <- 5.52 -> DG N7 C0336 : score 2.519 : H : ARG NH1 A0232 <- 3.16 -> DG O6 C0333 : score 5.64533 : H : ARG NH2 A0232 <- 2.40 -> DG N7 C0333 : score 6.89538 : w : GLN OE1 A0237 <- 5.52 -> DG N7 C0336 : score 2.87 : w : GLN NE2 A0237 <- 5.57 -> DG O6 C0336 : score 2.87 : H : GLN OE1 A0250 <- 3.06 -> DA N6 B0312 : score 5.73783 : H : GLN NE2 A0250 <- 3.20 -> DA N7 B0312 : score 5.60256 : H : GLN OE1 A0252 <- 2.94 -> DA N6 C0338 : score 5.88309 : H : GLN NE2 A0252 <- 3.12 -> DT O4 B0314 : score 4.8588 : V : VAL CG1 A0234 <- 3.81 -> DT C7 C0334 : score 6.04536 : V : ALA CB A0173 <- 3.56 -> DT C7 B0314 : score 5.93491 : x : ARG xxxx A0093 <- 3.79 -> DT xxx C0335 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0136 <- 4.22 -> DT xxx B0322 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0153 <- 3.93 -> DG xxx C0333 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0177 <- 3.29 -> DT xxx C0334 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0178 <- 3.94 -> DC xxx B0317 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0239 <- 4.10 -> DG xxx B0313 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 3.60 -> DA xxx B0312 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0254 <- 4.26 -> DG xxx C0336 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0288 <- 4.15 -> DA xxx B0312 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0289 <- 3.20 -> DT xxx C0341 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0291 <- 4.40 -> DT xxx B0314 : score x.xxxxx >4xr2_A:Replication_terminator_protein_Tus; title=ESCHERICHIA COLI REPLICATION TERMINATOR PROTEIN (TUS) H114A MUTANT COMPLEXED WITH DNA- TERA LOCK. organism=Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) : H : LYS NZ A0089 <- 2.86 -> DT O2 C0332 : score 3.54413 : w : LYS NZ A0089 <- 6.03 -> DT O2 B0322 : score 0.522 : H : LYS NZ A0175 <- 2.83 -> DT O4 C0337 : score 3.56566 : w : LYS NZ A0175 <- 5.56 -> DG N7 C0336 : score 2.519 : H : ARG NH1 A0232 <- 3.11 -> DG N7 C0333 : score 5.6749 : H : ARG NH2 A0232 <- 2.85 -> DG O6 C0333 : score 6.534 : w : GLN OE1 A0237 <- 5.42 -> DG N7 C0336 : score 2.87 : w : GLN NE2 A0237 <- 5.64 -> DG O6 C0336 : score 2.87 : H : GLN OE1 A0250 <- 3.09 -> DA N6 B0312 : score 5.70152 : H : GLN NE2 A0250 <- 3.32 -> DA N7 B0312 : score 5.45641 : H : GLN OE1 A0252 <- 2.97 -> DA N6 C0338 : score 5.84678 : H : GLN NE2 A0252 <- 3.17 -> DT O4 B0314 : score 4.80689 : V : VAL CG1 A0234 <- 3.89 -> DT C7 C0335 : score 5.92415 : V : ALA CB A0173 <- 3.61 -> DT C7 B0314 : score 5.86493 : x : ARG xxxx A0093 <- 3.81 -> DT xxx C0335 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0136 <- 3.93 -> DT xxx B0322 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0153 <- 4.24 -> DG xxx C0333 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0177 <- 3.51 -> DT xxx C0334 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0178 <- 3.84 -> DC xxx B0317 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0239 <- 4.22 -> DG xxx B0313 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 3.57 -> DA xxx B0312 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0254 <- 4.22 -> DG xxx C0336 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0288 <- 4.11 -> DA xxx B0312 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0289 <- 3.09 -> DT xxx C0341 : score x.xxxxx >4xr3_A:Replication_terminator_protein_Tus; title=ESCHERICHIA COLI REPLICATION TERMINATOR PROTEIN (TUS) COMPLEXED WITH DNA- GC(6) SWAPPED. organism=Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) : H : LYS NZ A0089 <- 2.88 -> DT O2 C0332 : score 3.52978 : H : LYS NZ A0175 <- 2.92 -> DT O4 C0337 : score 3.50109 : H : ARG NH2 A0232 <- 3.32 -> DG N7 C0333 : score 5.72062 : H : ARG NH2 A0232 <- 2.67 -> DG O6 C0333 : score 6.7716 : w : GLN NE2 A0237 <- 5.20 -> DG O6 C0336 : score 2.87 : H : GLN NE2 A0250 <- 3.01 -> DA N7 B0312 : score 5.83397 : H : GLN NE2 A0250 <- 2.64 -> DG O6 B0313 : score 5.99089 : H : GLN OE1 A0252 <- 3.06 -> DA N6 C0338 : score 5.73783 : H : GLN NE2 A0252 <- 3.01 -> DT O4 B0314 : score 4.973 : x : ARG xxxx A0093 <- 3.84 -> DT xxx C0335 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0136 <- 4.20 -> DT xxx B0322 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0137 <- 3.82 -> DA xxx C0328 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0153 <- 4.22 -> DG xxx C0333 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0173 <- 3.39 -> DT xxx B0314 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0177 <- 3.79 -> DT xxx C0334 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0178 <- 3.73 -> DC xxx B0317 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0198 <- 3.58 -> DA xxx C0328 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0234 <- 4.00 -> DT xxx C0334 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0239 <- 3.96 -> DG xxx B0313 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 3.39 -> DA xxx B0312 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0254 <- 4.40 -> DG xxx C0336 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0288 <- 3.96 -> DA xxx B0312 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0289 <- 3.30 -> DT xxx C0341 : score x.xxxxx >4xrh_B:Nucleotidyltransferase;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE LAMBDA- MGDTTP BINARY AND COMPLEX WITH 6 PAIRED DNA organism=Homo sapiens : H : TYR OH B0505 <- 2.62 -> DA N3 P0005 : score 4.30073 : H : ASN ND2 B0513 <- 3.06 -> DC O2 P0006 : score 4.24655 : x : ALA xxxx B0510 <- 3.88 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0514 <- 3.38 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0517 <- 3.47 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >4xrm_AB:Homeodomain-like; title=HOMODIMER OF TALE TYPE HOMEOBOX TRANSCRIPTION FACTOR MEIS1 COMPLEXES WITH SPECIFIC DNA organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 A0325 <- 3.12 -> DA N6 L0026 : score 5.6364 : H : ASN ND2 A0325 <- 3.03 -> DA N7 L0026 : score 5.60047 : H : ARG NH1 A0328 <- 3.02 -> DG N7 M0012 : score 5.7838 : H : ARG NH2 A0328 <- 2.70 -> DG O6 M0012 : score 6.732 : H : ARG NH1 A0329 <- 2.87 -> DG N7 L0025 : score 5.9653 : H : ARG NH2 A0329 <- 2.78 -> DG O6 L0025 : score 6.6264 : w : ARG NH2 A0329 <- 5.89 -> DT O4 M0013 : score 2.366 : H : ASN OD1 B0325 <- 3.13 -> DA N6 M0006 : score 5.62436 : H : ASN ND2 B0325 <- 3.02 -> DA N7 M0006 : score 5.61221 : H : ARG NH1 B0328 <- 3.02 -> DG N7 L0032 : score 5.7838 : H : ARG NH2 B0328 <- 2.73 -> DG O6 L0032 : score 6.6924 : H : ARG NH1 B0329 <- 2.87 -> DG N7 M0005 : score 5.9653 : H : ARG NH2 B0329 <- 2.74 -> DG O6 M0005 : score 6.6792 : w : ARG NH2 B0329 <- 5.87 -> DT O4 L0033 : score 2.366 : x : ASN xxxx A0321 <- 3.99 -> DC xxx L0027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0324 <- 3.34 -> DT xxx M0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0321 <- 3.90 -> DC xxx M0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0324 <- 3.35 -> DT xxx L0031 : score x.xxxxx >4xrm_B:Homeodomain-like; title=HOMODIMER OF TALE TYPE HOMEOBOX TRANSCRIPTION FACTOR MEIS1 COMPLEXES WITH SPECIFIC DNA organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 B0325 <- 3.13 -> DA N6 M0006 : score 5.62436 : H : ASN ND2 B0325 <- 3.02 -> DA N7 M0006 : score 5.61221 : H : ARG NH1 B0328 <- 3.02 -> DG N7 L0032 : score 5.7838 : H : ARG NH2 B0328 <- 2.73 -> DG O6 L0032 : score 6.6924 : H : ARG NH1 B0329 <- 2.87 -> DG N7 M0005 : score 5.9653 : H : ARG NH2 B0329 <- 2.74 -> DG O6 M0005 : score 6.6792 : w : ARG NH2 B0329 <- 5.87 -> DT O4 L0033 : score 2.366 : x : ASN xxxx B0321 <- 3.90 -> DC xxx M0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0324 <- 3.35 -> DT xxx L0031 : score x.xxxxx >4xrs_BI:Homeodomain-like; title=HETERODIMERIC COMPLEX OF TRANSCRIPTION FACTORS MEIS1 AND DLX3 ON SPECIFIC DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 B0325 <- 2.71 -> DG N7 E0004 : score 4.66844 : H : ASN ND2 B0325 <- 3.33 -> DA N7 E0005 : score 5.24824 : H : ASN OD1 I0179 <- 2.50 -> DA N6 E0012 : score 6.3831 : H : ASN ND2 I0179 <- 2.29 -> DA N7 E0012 : score 6.46931 : x : ASN xxxx B0321 <- 4.44 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0328 <- 4.35 -> DT xxx D0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0133 <- 2.17 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx >4xrs_G:Homeodomain-like; title=HETERODIMERIC COMPLEX OF TRANSCRIPTION FACTORS MEIS1 AND DLX3 ON SPECIFIC DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 G0133 <- 2.37 -> DT O2 L0011 : score 4.67676 : H : ARG NH2 G0133 <- 2.56 -> DT O2 L0011 : score 4.43653 : H : ARG NH2 G0133 <- 2.32 -> DA N3 L0012 : score 3.55076 : x : ILE xxxx G0175 <- 3.69 -> DA xxx L0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0179 <- 2.67 -> DA xxx L0012 : score x.xxxxx >4xuj_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING ADDUCTS FROM TREATMENT WITH A THIOMORPHOLINE-SUBSTITUTED [(ETA-6-P-CYMENE)RU(3-HYDROXY-2- PYRIDONE)CL] COMPOUND organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.64 -> DA N3 J0009 : score 3.34342 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.17 -> DA N3 I0009 : score 3.40958 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.98 -> DA N3 I0009 : score 3.12311 : x : ARG xxxx A0063 <- 4.26 -> DT xxx J0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.06 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.43 -> DA xxx J0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.92 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.32 -> DG xxx J0047 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.64 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.87 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.08 -> DT xxx J-035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.42 -> DG xxx I0047 : score x.xxxxx >4xuj_F:Histone-fold; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING ADDUCTS FROM TREATMENT WITH A THIOMORPHOLINE-SUBSTITUTED [(ETA-6-P-CYMENE)RU(3-HYDROXY-2- PYRIDONE)CL] COMPOUND organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx F0045 <- 3.87 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx >4xvi_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BINARY COMPLEX OF HUMAN POLYMERASE NU AND DNA WITH THE FINGER DOMAIN AJAR organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0540 <- 2.91 -> DT O2 P0011 : score 3.50826 : H : ARG NH1 A0571 <- 2.77 -> DG N3 P0014 : score 3.07088 : x : TYR xxxx A0686 <- 3.49 -> DC xxx T0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0765 <- 3.75 -> DC xxx T0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0769 <- 3.26 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0802 <- 4.25 -> DG xxx P0013 : score x.xxxxx >4xvk_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BINARY COMPLEX OF HUMAN POLYMERASE NU AND DNA WITH THE FINGER DOMAIN CLOSED organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0540 <- 2.29 -> DT O2 P0011 : score 3.95307 : H : ARG NH1 A0571 <- 2.81 -> DG N3 P0014 : score 3.04646 : H : LYS NZ A0679 <- 2.95 -> DG O6 P0015 : score 5.60735 : x : GLU xxxx A0628 <- 4.15 -> DG xxx P0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0682 <- 3.26 -> DG xxx P0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0683 <- 3.99 -> DC xxx T0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0686 <- 3.03 -> DC xxx T0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0688 <- 4.36 -> DC xxx T0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0692 <- 3.93 -> DC xxx T0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0765 <- 3.48 -> DG xxx P0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0769 <- 2.95 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0802 <- 4.49 -> DC xxx P0013 : score x.xxxxx >4xvl_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BINARY COMPLEX OF HUMAN POLYMERASE NU AND DNA WITH THE FINGER DOMAIN OPEN organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0540 <- 2.84 -> DT O2 P0011 : score 3.55848 : H : ARG NH1 A0571 <- 2.72 -> DG N3 P0014 : score 3.10141 : H : TYR OH A0682 <- 3.23 -> DG O6 P0014 : score 3.32087 : x : ASN xxxx A0481 <- 4.44 -> DG xxx P0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0686 <- 3.80 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0688 <- 3.86 -> DC xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0692 <- 3.69 -> DC xxx P0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0765 <- 3.49 -> DC xxx T0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0769 <- 2.90 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0802 <- 4.05 -> DC xxx P0013 : score x.xxxxx >4xvm_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BINARY COMPLEX OF HUMAN POLYMERASE NU AND DNA WITH THE FINGER DOMAIN CLOSED AND THUMB DOMAIN ROTATED OUT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0571 <- 2.77 -> DA N3 P0012 : score 3.70414 : H : LYS NZ A0679 <- 2.89 -> DG O6 P0013 : score 5.67672 : V : ARG CZ A0692 <- 3.75 -> DT C7 T0002 : score 2.15896 : x : LYS xxxx A0540 <- 3.68 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0578 <- 4.11 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0628 <- 4.11 -> DG xxx P0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0682 <- 3.44 -> DG xxx P0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0683 <- 3.57 -> DC xxx T0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0686 <- 3.21 -> DC xxx T0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0688 <- 4.19 -> DC xxx T0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0765 <- 4.12 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0769 <- 3.51 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0802 <- 4.39 -> DA xxx P0012 : score x.xxxxx >4xxe_A: title=STRUCTURE OF AGRA LYTTR DOMAIN IN COMPLEX WITH PROMOTERS organism=Staphylococcus aureus (strain COL) / Staphylococcus aureus (strain COL) : H : HIS NE2 A0169 <- 2.89 -> DG O6 B0013 : score 7.81068 : H : HIS NE2 A0169 <- 3.17 -> DG O6 C0004 : score 7.36526 : x : SER xxxx A0168 <- 3.60 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0170 <- 3.47 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0183 <- 3.68 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0233 <- 3.38 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx >4xyq_A: title=STRUCTURE OF AGRA LYTTR DOMAIN IN COMPLEX WITH PROMOTERS organism=Staphylococcus aureus (strain COL) / Staphylococcus aureus (strain COL) : H : HIS NE2 A0169 <- 3.10 -> DG N7 B0013 : score 6.39441 : H : ARG NH1 A0233 <- 3.08 -> DG N7 C0012 : score 5.7112 : H : ARG NH2 A0233 <- 2.91 -> DG O6 C0012 : score 6.4548 : x : ARG xxxx A0170 <- 3.53 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0183 <- 3.29 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0232 <- 4.14 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >4xzf_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIRAN DOMAIN OF HUMAN HLTF IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0073 <- 2.73 -> DC N3 B0012 : score 2.6455 : H : ASN ND2 A0091 <- 2.95 -> DC O2 B0013 : score 4.3451 : H : HIS ND1 A0110 <- 2.66 -> DC O2 B0012 : score 3.31464 : x : TYR xxxx A0072 <- 3.50 -> DC xxx B0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0093 <- 3.35 -> DC xxx B0013 : score x.xxxxx >4xzq_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like; title=NUCLEOSOME DISASSEMBLY BY RSC AND SWI/SNF IS ENHANCED BY H3 ACETYLATION NEAR THE NUCLEOSOME DYAD AXIS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.58 -> DA N3 J0230 : score 3.38229 : H : ARG NH1 E0640 <- 3.30 -> DA N3 I0083 : score 3.31385 : x : TYR xxxx A0441 <- 4.42 -> DT xxx J0153 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 3.55 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0032 <- 4.30 -> DT xxx I0062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1230 <- 4.00 -> DG xxx J0269 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0639 <- 4.06 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0641 <- 4.08 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 4.14 -> DT xxx I0092 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 4.14 -> DC xxx J0197 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0245 <- 3.94 -> DC xxx I0080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H1430 <- 4.15 -> DG xxx I0122 : score x.xxxxx >4xzq_E:Histone-fold; title=NUCLEOSOME DISASSEMBLY BY RSC AND SWI/SNF IS ENHANCED BY H3 ACETYLATION NEAR THE NUCLEOSOME DYAD AXIS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 E0640 <- 3.30 -> DA N3 I0083 : score 3.31385 : x : HIS xxxx E0639 <- 4.06 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0641 <- 4.08 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 4.14 -> DT xxx I0092 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 4.14 -> DC xxx J0197 : score x.xxxxx >4y00_A:RNA-binding_domain,_RBD; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TDP-43 RRM1 DOMAIN WITH D169G MUTATION IN COMPLEX WITH AN UNMODIFIED SINGLE-STRANDED DNA organism=Homo sapiens : V : TRP CD1 A0113 <- 3.66 -> DT C7 E0003 : score 7.59 >4y0f_A:RNA-binding_domain,_RBD; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TDP-43 RRM1 DOMAIN IN COMPLEX WITH AN UNMODIFIED SINGLE-STRANDED DNA organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0136 <- 5.60 -> DT O4 C0010 : score 1.7 : V : TRP CD1 A0113 <- 3.64 -> DT C7 C0003 : score 7.62667 : x : ASP xxxx A0105 <- 3.54 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0107 <- 3.56 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0109 <- 3.51 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0134 <- 3.58 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0139 <- 3.26 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0145 <- 4.28 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0147 <- 3.23 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0149 <- 3.27 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0171 <- 3.42 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0178 <- 3.14 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0179 <- 3.17 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0180 <- 3.27 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx >4y5w_AC:p53-like_transcription_factors;SH2_domain;STAT; title=TRANSCRIPTION FACTOR-DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : HIS NE2 A0415 <- 2.97 -> DG O6 M0014 : score 7.68342 : H : HIS NE2 C0415 <- 3.11 -> DG O6 N0014 : score 7.46071 : x : ARG xxxx A0373 <- 3.61 -> DA xxx M0022 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0414 <- 4.28 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0417 <- 4.04 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0418 <- 4.40 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0284 <- 4.18 -> DA xxx N0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0414 <- 3.24 -> DT xxx M0007 : score x.xxxxx >4y5w_B:p53-like_transcription_factors;SH2_domain;STAT; title=TRANSCRIPTION FACTOR-DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : HIS NE2 B0415 <- 2.91 -> DG O6 E0014 : score 7.77886 : x : LYS xxxx B0374 <- 3.54 -> DA xxx E0022 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0414 <- 4.13 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0417 <- 3.96 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0418 <- 4.27 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx >4y5w_BD:p53-like_transcription_factors;SH2_domain;STAT; title=TRANSCRIPTION FACTOR-DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : HIS NE2 B0415 <- 2.91 -> DG O6 E0014 : score 7.77886 : H : HIS NE2 D0415 <- 3.09 -> DG O6 F0014 : score 7.49252 : x : VAL xxxx B0414 <- 4.13 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0417 <- 3.96 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0418 <- 4.27 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0414 <- 3.15 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx >4y60_C:HMG-box; title=STRUCTURE OF SOX18-HMG/PROX1-DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 C0005 <- 2.82 -> DT O2 A0011 : score 4.28918 : H : ARG NH1 C0005 <- 2.90 -> DC O2 B0007 : score 3.577 : H : ARG NH2 C0005 <- 2.88 -> DT O2 A0011 : score 4.1656 : H : ASN ND2 C0008 <- 2.96 -> DT O2 A0009 : score 4.59428 : H : ASN ND2 C0008 <- 3.14 -> DG N3 A0010 : score 4.56202 : H : ASN ND2 C0030 <- 3.03 -> DG N3 B0011 : score 4.66971 : H : SER OG C0034 <- 2.75 -> DA N3 A0007 : score 3.03388 : H : SER OG C0034 <- 3.41 -> DT O2 A0008 : score 3.24635 : H : TYR OH C0072 <- 2.63 -> DA N3 B0006 : score 4.29243 : x : PHE xxxx C0010 <- 3.74 -> DT xxx A0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0011 <- 3.12 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0018 <- 3.22 -> DT xxx A0008 : score x.xxxxx >4y7n_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=THE STRUCTURE INSIGHT INTO 5-CARBOXYCYTOSINE RECOGNITION BY RNA POLYMERASE II DURING TRANSCRIPTION ELONGATION. organism=? : x : LYS xxxx A0143 <- 3.70 -> DT xxx N0005 : score x.xxxxx >4y7n_ABE: title=THE STRUCTURE INSIGHT INTO 5-CARBOXYCYTOSINE RECOGNITION BY RNA POLYMERASE II DURING TRANSCRIPTION ELONGATION. organism=? : x : LYS xxxx A0143 <- 3.70 -> DT xxx N0005 : score x.xxxxx >4yfu_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF OPEN BACILLUS FRAGMENT DNA POLYMERASE BOUND TO DNA AND DTTP organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ D0582 <- 3.02 -> DT O2 F0010 : score 3.42934 : H : LYS NZ D0582 <- 3.11 -> DT O2 E0026 : score 3.36477 : w : LYS NZ D0582 <- 5.73 -> DA N3 F0009 : score 1.538 : w : LYS NZ D0582 <- 6.26 -> DC O2 F0011 : score 1.3 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.68 -> DG N3 F0007 : score 1.593 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.83 -> DC O2 F0008 : score 1.885 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.90 -> DG N3 E0027 : score 4.79697 : w : ASN ND2 D0625 <- 5.98 -> DA N3 F0009 : score 2.277 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.12 -> DA N3 F0006 : score 0.995 : w : ASN ND2 D0793 <- 6.30 -> DA N3 F0006 : score 2.277 : w : GLN NE2 D0797 <- 6.25 -> DA N3 F0006 : score 1.888 : w : HIS NE2 D0829 <- 5.59 -> DC O2 E0028 : score 3.208 : x : TYR xxxx D0587 <- 4.47 -> DG xxx E0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0629 <- 3.33 -> DC xxx E0028 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.32 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx >4yg1_ABCD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=HIPB-O1-O2 COMPLEX/P21212 CRYSTAL FORM organism=Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) : H : LYS NZ A0038 <- 2.81 -> DG O6 T0715 : score 5.76921 : H : GLN OE1 A0039 <- 3.26 -> DA N6 F0729 : score 5.49573 : H : LYS NZ B0038 <- 3.51 -> DG N7 F0742 : score 4.6211 : H : LYS NZ B0038 <- 2.79 -> DG O6 F0742 : score 5.79233 : H : GLN OE1 B0039 <- 3.22 -> DA N6 T0702 : score 5.54415 : H : GLN NE2 C0039 <- 3.07 -> DA N7 T0730 : score 5.7609 : H : LYS NZ D0038 <- 2.88 -> DG N7 T0742 : score 5.29972 : H : GLN OE1 D0039 <- 2.93 -> DA N6 F0701 : score 5.8952 : H : GLN NE2 D0039 <- 3.15 -> DA N7 F0701 : score 5.66346 : V : SER CB B0029 <- 3.65 -> DT C7 T0701 : score 3.24871 : V : ALA CB B0040 <- 3.84 -> DT C7 T0703 : score 5.54298 : V : ALA CB C0040 <- 3.67 -> DT C7 T0731 : score 5.78094 : x : SER xxxx A0029 <- 4.41 -> DT xxx F0728 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0040 <- 3.52 -> DT xxx F0730 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0043 <- 3.54 -> DA xxx F0729 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 3.15 -> DA xxx T0702 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0044 <- 3.91 -> DT xxx T0703 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0038 <- 3.09 -> DG xxx F0713 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0043 <- 3.54 -> DA xxx T0730 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0029 <- 3.39 -> DT xxx F0700 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0040 <- 3.38 -> DT xxx F0702 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0043 <- 3.65 -> DA xxx F0701 : score x.xxxxx >4yg1_C:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=HIPB-O1-O2 COMPLEX/P21212 CRYSTAL FORM organism=Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) : H : GLN NE2 C0039 <- 3.07 -> DA N7 T0730 : score 5.7609 : V : ALA CB C0040 <- 3.67 -> DT C7 T0731 : score 5.78094 : x : LYS xxxx C0038 <- 3.09 -> DG xxx F0713 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0043 <- 3.54 -> DA xxx T0730 : score x.xxxxx >4yg4_ABCD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=HIPB-O1-O1* COMPLEX organism=Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) : H : GLN OE1 A0039 <- 3.22 -> DA N6 F0730 : score 5.54415 : H : LYS NZ B0038 <- 2.65 -> DG N7 F0742 : score 5.54747 : H : LYS NZ B0038 <- 3.44 -> DG N7 F0743 : score 4.6965 : H : GLN OE1 B0039 <- 3.29 -> DA N6 F0744 : score 5.45941 : V : ALA CB A0040 <- 3.57 -> DT C7 F0731 : score 5.92092 : x : LYS xxxx A0038 <- 3.28 -> DG xxx T0714 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0043 <- 3.10 -> DA xxx F0730 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0040 <- 4.42 -> DA xxx F0744 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 3.40 -> DT xxx T0703 : score x.xxxxx >4yg7_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF FL AUTOREPRESSION PROMOTER COMPLEX organism=? : H : LYS NZ B0038 <- 3.37 -> DG N7 T0714 : score 4.77191 : H : LYS NZ B0038 <- 2.91 -> DG O6 T0715 : score 5.65359 : V : ALA CB B0040 <- 3.88 -> DT C7 R0703 : score 5.48699 : x : SER xxxx B0029 <- 3.97 -> DT xxx R0700 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0039 <- 3.73 -> DA xxx R0702 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 3.32 -> DT xxx R0703 : score x.xxxxx >4yg7_BCDEGK:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF FL AUTOREPRESSION PROMOTER COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : LYS NZ B0038 <- 3.37 -> DG N7 T0714 : score 4.77191 : H : LYS NZ B0038 <- 2.91 -> DG O6 T0715 : score 5.65359 : H : LYS NZ C0038 <- 2.63 -> DG O6 T0687 : score 5.97732 : H : LYS NZ E0038 <- 3.38 -> DG N7 R0714 : score 4.76113 : H : LYS NZ G0038 <- 3.50 -> DG N7 R0743 : score 4.63187 : V : ALA CB B0040 <- 3.88 -> DT C7 R0703 : score 5.48699 : V : ALA CB C0040 <- 3.89 -> DT C7 R0731 : score 5.473 : x : SER xxxx B0029 <- 3.97 -> DT xxx R0700 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0039 <- 3.73 -> DA xxx R0702 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 3.32 -> DT xxx R0703 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0039 <- 3.00 -> DT xxx T0701 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0043 <- 3.75 -> DA xxx T0702 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0029 <- 3.17 -> DT xxx R0729 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0039 <- 3.24 -> DA xxx R0730 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0043 <- 3.31 -> DA xxx R0730 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0028 <- 4.49 -> DT xxx T0673 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0029 <- 4.22 -> DT xxx T0673 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0039 <- 3.12 -> DT xxx T0673 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0040 <- 4.46 -> DA xxx R0744 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0043 <- 3.32 -> DA xxx T0674 : score x.xxxxx >4yhx_A:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LAGLIDADG MEGANUCLEASE I-GPEMI BOUND TO UNCLEAVED DNA organism=Grosmannia penicillata : H : ARG NH1 A0025 <- 3.12 -> DG O6 C0020 : score 5.694 : H : ARG NH2 A0025 <- 2.85 -> DG N7 C0020 : score 6.32077 : H : ARG NH1 A0027 <- 2.72 -> DG O6 C0021 : score 6.18067 : H : ARG NH2 A0027 <- 2.93 -> DG N7 C0021 : score 6.21862 : H : GLU OE1 A0039 <- 3.17 -> DC N4 B0006 : score 5.34112 : H : GLN NE2 A0043 <- 3.00 -> DG N7 C0018 : score 4.03077 : w : GLN NE2 A0043 <- 5.54 -> DA N7 C0017 : score 1.888 : w : THR OG1 A0045 <- 5.58 -> DA N7 C0017 : score 2.152 : w : SER OG A0075 <- 5.66 -> DC N4 B0009 : score 2.105 : H : LYS NZ A0077 <- 2.92 -> DG O6 C0018 : score 5.64203 : w : LYS NZ A0077 <- 6.06 -> DG N7 B0008 : score 2.519 : w : SER OG A0189 <- 5.56 -> DC N4 B0020 : score 2.105 : w : SER OG A0193 <- 5.66 -> DA N6 C0004 : score 2.209 : H : GLN OE1 A0200 <- 3.05 -> DA N6 C0005 : score 5.74994 : H : GLN NE2 A0200 <- 2.99 -> DA N7 C0005 : score 5.85833 : w : GLN OE1 A0200 <- 5.89 -> DA N6 C0004 : score 3.392 : H : GLN OE1 A0202 <- 3.20 -> DA N6 C0006 : score 5.56836 : H : GLN NE2 A0202 <- 2.92 -> DA N7 C0006 : score 5.94359 : w : GLN OE1 A0202 <- 5.68 -> DG O6 C0007 : score 2.87 : w : TYR OH A0228 <- 5.75 -> DG N7 C0007 : score 3.527 : H : LYS NZ A0230 <- 2.77 -> DG N7 C0008 : score 5.41821 : w : LYS NZ A0230 <- 5.49 -> DG N7 C0007 : score 2.519 : H : LYS NZ A0232 <- 2.52 -> DG N7 C0009 : score 5.68751 : H : LYS NZ A0234 <- 3.02 -> DG O6 C0012 : score 5.52642 : w : TRP NE1 A0239 <- 6.06 -> DA N6 B0016 : score 4.074 : H : GLU OE2 A0241 <- 2.90 -> DA N6 B0017 : score 2.99026 : w : GLU OE1 A0241 <- 6.19 -> DC N4 B0018 : score 3.528 : w : GLU OE2 A0241 <- 5.59 -> DA N6 B0016 : score 2.785 : V : ALA CB A0073 <- 3.79 -> DT C7 C0015 : score 5.61297 : V : PHE CB A0237 <- 3.56 -> DT C7 B0014 : score 6.14909 : V : ILE CG2 A0191 <- 3.79 -> DT C7 B0021 : score 7.10901 : x : SER xxxx A0021 <- 4.23 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0029 <- 3.75 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0031 <- 3.90 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0032 <- 4.01 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0037 <- 3.92 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0069 <- 3.19 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0185 <- 3.92 -> DA xxx B0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0187 <- 3.73 -> DC xxx B0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0195 <- 4.18 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0208 <- 3.37 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0245 <- 4.30 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx >4yig_E:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=VACCINIA VIRUS D4/A20(1-50) IN COMPLEX WITH DSDNA CONTAINING AN ABASIC SITE AND FREE URACYL organism=VACCINIA VIRUS (STRAIN COPENHAGEN) / VACCINIA VIRUS (STRAIN COPENHAGEN) : x : LYS xxxx E0087 <- 3.25 -> DT xxx G0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0161 <- 3.50 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0185 <- 3.26 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx >4yir_A:Cysteine_proteinases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RAD4-RAD23 CROSSLINKED TO AN UNDAMAGED DNA organism=? : x : ARG xxxx A0129 <- 3.51 -> DA xxx W0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0137 <- 4.20 -> DT xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0494 <- 4.30 -> DC xxx W0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0498 <- 4.01 -> DC xxx W0016 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0554 <- 3.53 -> DC xxx W0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0556 <- 3.02 -> DC xxx W0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0558 <- 3.44 -> DC xxx W0017 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0560 <- 4.17 -> DC xxx W0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0594 <- 3.65 -> DC xxx W0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0597 <- 3.51 -> DC xxx W0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0599 <- 3.21 -> DC xxx W0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0600 <- 3.91 -> DG xxx W0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0604 <- 3.38 -> DG xxx W0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0606 <- 4.42 -> DG xxx W0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0607 <- 3.39 -> DC xxx W0017 : score x.xxxxx >4yis_A:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LAGLIDADG MEGANUCLEASE I-CPAMI BOUND TO UNCLEAVED DNA organism=Cryphonectria parasitica : H : GLN NE2 A0026 <- 2.83 -> DG N7 F0021 : score 4.17353 : H : TYR OH A0031 <- 2.85 -> DA N7 E0004 : score 4.10977 : H : ARG NH1 A0036 <- 3.06 -> DG O6 E0005 : score 5.767 : H : ARG NH2 A0036 <- 3.03 -> DG N7 E0005 : score 6.09092 : H : ARG NH2 A0036 <- 3.31 -> DG O6 E0005 : score 5.9268 : H : LYS NZ A0038 <- 2.75 -> DG O6 F0021 : score 5.83858 : H : LYS NZ A0038 <- 2.79 -> DG O6 F0022 : score 5.79233 : H : HIS NE2 A0068 <- 2.66 -> DG O6 F0018 : score 8.17655 : H : GLN NE2 A0074 <- 3.02 -> DT O4 F0019 : score 4.96262 : H : ARG NH1 A0076 <- 3.23 -> DT O4 F0019 : score 2.98691 : H : LYS NZ A0183 <- 2.79 -> DG O6 E0020 : score 5.79233 : H : LYS NZ A0183 <- 2.82 -> DG O6 F0007 : score 5.75765 : H : SER OG A0185 <- 2.71 -> DC N4 E0021 : score 3.7418 : H : THR OG1 A0189 <- 2.50 -> DA N7 F0004 : score 3.61895 : H : ARG NH1 A0195 <- 2.56 -> DG O6 F0006 : score 6.37533 : H : ARG NH2 A0195 <- 2.62 -> DG N7 F0006 : score 6.61446 : H : ARG NH2 A0199 <- 2.93 -> DG N7 E0019 : score 6.21862 : H : ARG NH2 A0199 <- 2.76 -> DG O6 E0019 : score 6.6528 : H : ARG NH2 A0236 <- 3.29 -> DT O4 F0011 : score 3.20557 : H : GLU OE2 A0238 <- 3.16 -> DA N6 E0018 : score 2.83159 : x : SER xxxx A0020 <- 3.99 -> DG xxx F0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0022 <- 4.09 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0024 <- 3.74 -> DG xxx F0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0030 <- 4.24 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0040 <- 4.11 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0066 <- 3.57 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0078 <- 3.66 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0179 <- 3.73 -> DA xxx E0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0181 <- 4.10 -> DA xxx E0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0187 <- 3.92 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0190 <- 3.37 -> DA xxx F0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0197 <- 3.44 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0229 <- 3.38 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0240 <- 3.56 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx >4yit_A:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LAGLIDADG MEGANUCLEASE I-AABMI BOUND TO UNCLEAVED DNA organism=Gremmeniella abietina : H : ARG NH1 A0030 <- 2.79 -> DG N7 B0003 : score 6.0621 : H : ARG NH2 A0030 <- 2.58 -> DG N7 B0004 : score 6.66554 : H : ASN ND2 A0038 <- 2.55 -> DG O6 C0017 : score 5.92038 : H : SER OG A0062 <- 3.14 -> DC N4 B0009 : score 3.4257 : H : ARG NH2 A0070 <- 2.59 -> DG O6 C0019 : score 6.8772 : H : GLN OE1 A0072 <- 3.30 -> DA N6 B0006 : score 5.44731 : H : GLN NE2 A0072 <- 2.89 -> DA N7 B0006 : score 5.98013 : H : GLN NE2 A0187 <- 3.11 -> DA N7 C0005 : score 5.71218 : H : TYR OH A0189 <- 3.27 -> DA N6 B0019 : score 4.23148 : w : THR OG1 A0195 <- 6.09 -> DA N6 B0015 : score 3.251 : V : THR CG2 A0021 <- 3.75 -> DT C7 C0020 : score 4.28988 : x : CYS xxxx A0015 <- 3.63 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0017 <- 3.41 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0019 <- 3.31 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0022 <- 3.52 -> DA xxx C0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0032 <- 3.57 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0034 <- 4.01 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0036 <- 3.56 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0060 <- 3.60 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0066 <- 3.16 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0068 <- 3.48 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0171 <- 3.81 -> DC xxx B0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0173 <- 3.42 -> DT xxx B0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0177 <- 3.64 -> DC xxx B0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0179 <- 4.37 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0181 <- 3.28 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0193 <- 3.93 -> DC xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0215 <- 3.15 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0219 <- 3.06 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0220 <- 1.62 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0222 <- 4.34 -> DA xxx B0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0224 <- 3.52 -> DC xxx B0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0226 <- 3.72 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >4yj0_ABC:Cysteine-rich_DNA_binding_domain,_DM_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DM DOMAIN OF HUMAN DMRT1 BOUND TO 25MER TARGET DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 B0123 <- 2.85 -> DG O6 E0013 : score 6.534 : H : ARG NH1 C0072 <- 2.66 -> DA N3 E0008 : score 3.78515 : H : ARG NH1 C0122 <- 2.65 -> DA N7 E0007 : score 2.63706 : H : ARG NH1 C0123 <- 3.04 -> DG N7 D0017 : score 5.7596 : H : ARG NH2 C0123 <- 3.31 -> DG N7 D0017 : score 5.73338 : H : ARG NH2 C0123 <- 2.53 -> DG O6 D0017 : score 6.9564 : V : VAL CG1 B0119 <- 3.76 -> DT C7 E0014 : score 6.12112 : x : ARG xxxx A0111 <- 3.09 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0072 <- 2.94 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0111 <- 4.41 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0115 <- 4.08 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0122 <- 3.35 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0111 <- 3.18 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0115 <- 3.26 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0118 <- 3.21 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0119 <- 3.53 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx >4yj0_C:Cysteine-rich_DNA_binding_domain,_DM_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DM DOMAIN OF HUMAN DMRT1 BOUND TO 25MER TARGET DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 C0072 <- 2.66 -> DA N3 E0008 : score 3.78515 : H : ARG NH1 C0122 <- 2.65 -> DA N7 E0007 : score 2.63706 : H : ARG NH1 C0123 <- 3.04 -> DG N7 D0017 : score 5.7596 : H : ARG NH2 C0123 <- 3.31 -> DG N7 D0017 : score 5.73338 : H : ARG NH2 C0123 <- 2.53 -> DG O6 D0017 : score 6.9564 : x : ARG xxxx C0111 <- 3.18 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0115 <- 3.26 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0118 <- 3.21 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0119 <- 3.53 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx >4yln_CDF: title=E. COLI TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX - 17-BP SPACER AND 4-NT RNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 C0394 <- 3.07 -> DT O4 10045 : score 3.09148 : H : ASP OD2 F0096 <- 2.35 -> DG N2 10044 : score 5.95028 : H : ARG NE F0099 <- 2.66 -> DG O6 10044 : score 4.05137 : H : GLN OE1 F0437 <- 2.30 -> DA N6 20027 : score 6.65782 : H : GLN NE2 F0437 <- 3.05 -> DG O6 20028 : score 5.51487 : H : HIS NE2 F0455 <- 2.80 -> DT O4 10031 : score 5.60897 : V : GLU CB F0585 <- 3.73 -> DT C7 10014 : score 1.65618 : V : VAL CG2 F0454 <- 3.74 -> DT C7 10033 : score 6.21492 : V : TRP CG F0434 <- 3.60 -> DT C7 10036 : score 5.77123 : V : ILE CG2 F0460 <- 3.86 -> DT C7 20026 : score 6.98491 : x : ARG xxxx C0143 <- 4.36 -> DG xxx 20020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0151 <- 2.85 -> DT xxx 10050 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0182 <- 4.30 -> DG xxx 10046 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 2.79 -> DC xxx 10047 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.40 -> DG xxx 10046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 3.23 -> DT xxx 10050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0201 <- 4.35 -> DG xxx 10046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.08 -> DT xxx 10045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 2.19 -> DG xxx 10042 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0375 <- 3.45 -> DG xxx 10042 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0496 <- 4.22 -> DT xxx 20024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0508 <- 3.42 -> DG xxx 20021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0514 <- 3.54 -> DA xxx 20019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0541 <- 3.40 -> DG xxx 20012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 2.84 -> DG xxx 10049 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0546 <- 4.07 -> DT xxx 10050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0259 <- 3.31 -> DA xxx 20022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.04 -> DA xxx 20013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.93 -> DA xxx 20013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.92 -> DG xxx 10044 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 2.70 -> DG xxx 10042 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 3.46 -> DG xxx 10042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 2.76 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0112 <- 4.37 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0116 <- 3.77 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 3.50 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0385 <- 3.30 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 3.77 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 3.80 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 2.84 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 4.21 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 2.98 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 2.90 -> DA xxx 10039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.13 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0432 <- 3.05 -> DA xxx 10040 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.96 -> DA xxx 10040 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 4.29 -> DA xxx 20027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0443 <- 4.14 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0448 <- 3.89 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0457 <- 4.48 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0458 <- 2.66 -> DG xxx 20028 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0461 <- 2.90 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0464 <- 2.80 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0468 <- 4.27 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0503 <- 3.57 -> DT xxx 20024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0505 <- 4.02 -> DA xxx 20022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0513 <- 3.65 -> DA xxx 20019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0516 <- 3.35 -> DG xxx 20017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0573 <- 4.13 -> DG xxx 20046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0584 <- 3.64 -> DG xxx 20046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0586 <- 3.96 -> DT xxx 10013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0588 <- 3.38 -> DT xxx 20047 : score x.xxxxx >4yln_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=E. COLI TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX - 17-BP SPACER AND 4-NT RNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ASP OD2 F0096 <- 2.35 -> DG N2 10044 : score 5.95028 : H : ARG NE F0099 <- 2.66 -> DG O6 10044 : score 4.05137 : H : GLN NE2 F0437 <- 3.05 -> DG O6 20028 : score 5.51487 : H : HIS NE2 F0455 <- 2.80 -> DT O4 10031 : score 5.60897 : V : ILE CG2 F0460 <- 3.86 -> DT C7 20026 : score 6.98491 : V : GLU CB F0585 <- 3.73 -> DT C7 10014 : score 1.65618 : V : VAL CG2 F0454 <- 3.74 -> DT C7 10033 : score 6.21492 : V : TRP CG F0434 <- 3.60 -> DT C7 10036 : score 5.77123 : x : VAL xxxx F0098 <- 3.92 -> DG xxx 10044 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 2.70 -> DG xxx 10042 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 3.46 -> DG xxx 10042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 2.76 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0112 <- 4.37 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0116 <- 3.77 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 3.50 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0385 <- 3.30 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 3.77 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 3.80 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 2.84 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 4.21 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 2.98 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 2.90 -> DA xxx 10039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.13 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0432 <- 3.05 -> DA xxx 10040 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.96 -> DA xxx 10040 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 4.29 -> DA xxx 20027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0443 <- 4.14 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0448 <- 3.89 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0457 <- 4.48 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0458 <- 2.66 -> DG xxx 20028 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0461 <- 2.90 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0464 <- 2.80 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0468 <- 4.27 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0503 <- 3.57 -> DT xxx 20024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0505 <- 4.02 -> DA xxx 20022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0513 <- 3.65 -> DA xxx 20019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0516 <- 3.35 -> DG xxx 20017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0573 <- 4.13 -> DG xxx 20046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0584 <- 3.64 -> DG xxx 20046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0586 <- 3.96 -> DT xxx 10013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0588 <- 3.38 -> DT xxx 20047 : score x.xxxxx >4yln_IJL: title=E. COLI TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX - 17-BP SPACER AND 4-NT RNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : GLU OE2 I0374 <- 2.85 -> DG N2 40042 : score 4.26715 : H : ASN ND2 L0383 <- 2.91 -> DT O4 40041 : score 5.16835 : H : THR OG1 L0432 <- 2.49 -> DA N7 40040 : score 3.62578 : H : GLN OE1 L0437 <- 2.74 -> DA N6 50027 : score 6.1252 : H : GLN OE1 L0437 <- 2.74 -> DA N6 50027 : score 6.1252 : H : ASN OD1 L0464 <- 2.27 -> DA N6 50025 : score 6.66011 : V : ARG CB L0586 <- 3.55 -> DT C7 40013 : score 1.06795 : V : HIS CG L0455 <- 3.56 -> DT C7 40031 : score 3.17891 : V : ARG CZ I0542 <- 3.67 -> DT C7 40050 : score 2.20161 : V : LYS CE I0496 <- 3.67 -> DT C7 50024 : score 2.68556 : V : ARG CG L0588 <- 3.60 -> DT C7 50047 : score 1.05538 : x : ARG xxxx I0143 <- 3.71 -> DG xxx 50020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0151 <- 3.35 -> DT xxx 40050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0175 <- 4.47 -> DT xxx 40050 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 2.70 -> DA xxx 40048 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.85 -> DG xxx 40049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 2.85 -> DG xxx 40049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0201 <- 3.83 -> DG xxx 40046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0371 <- 3.82 -> DT xxx 40045 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0375 <- 3.29 -> DG xxx 40042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0394 <- 3.80 -> DT xxx 40045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0504 <- 3.92 -> DG xxx 50021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0508 <- 2.21 -> DG xxx 50021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0514 <- 2.74 -> DA xxx 50019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0541 <- 3.22 -> DG xxx 50012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0314 <- 3.15 -> DG xxx 40044 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0320 <- 3.46 -> DA xxx 50022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 3.67 -> DC xxx 50014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.53 -> DA xxx 50013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.49 -> DA xxx 50013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0096 <- 4.06 -> DG xxx 40044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0099 <- 2.97 -> DG xxx 40044 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0102 <- 2.82 -> DG xxx 40042 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0105 <- 3.97 -> DG xxx 40042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0110 <- 3.65 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0385 <- 3.45 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0386 <- 3.07 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0401 <- 3.62 -> DG xxx 40044 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0419 <- 4.13 -> DA xxx 40037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0423 <- 3.01 -> DA xxx 40037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0425 <- 3.80 -> DA xxx 40037 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0426 <- 4.31 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0428 <- 2.73 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0429 <- 2.64 -> DA xxx 40039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0430 <- 3.13 -> DA xxx 40037 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0433 <- 3.79 -> DA xxx 50027 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0434 <- 2.99 -> DT xxx 40036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0436 <- 4.41 -> DA xxx 40040 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0440 <- 3.75 -> DA xxx 50027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0443 <- 3.86 -> DT xxx 50026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0448 <- 3.62 -> DT xxx 50026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx L0454 <- 3.21 -> DT xxx 40033 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0458 <- 3.28 -> DC xxx 50029 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0460 <- 3.32 -> DT xxx 50026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0461 <- 3.27 -> DT xxx 50026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0468 <- 3.07 -> DA xxx 50025 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0503 <- 3.32 -> DT xxx 50024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0505 <- 3.97 -> DA xxx 50022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0509 <- 3.40 -> DA xxx 50022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0513 <- 3.69 -> DA xxx 50019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0516 <- 3.02 -> DG xxx 50017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0573 <- 3.40 -> DG xxx 50046 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0574 <- 3.25 -> DT xxx 50045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0584 <- 4.30 -> DG xxx 50046 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0585 <- 2.72 -> DC xxx 50048 : score x.xxxxx >4yln_OPR: title=E. COLI TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX - 17-BP SPACER AND 4-NT RNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 O0200 <- 2.51 -> DT O2 70050 : score 4.55618 : H : SER OG O0508 <- 2.57 -> DG N2 80021 : score 3.52958 : H : THR OG1 P0790 <- 2.91 -> DA N6 80013 : score 2.69828 : H : GLN OE1 R0437 <- 2.63 -> DA N6 80027 : score 6.25835 : H : GLN OE1 R0437 <- 2.63 -> DA N6 80027 : score 6.25835 : V : ARG CB R0586 <- 3.58 -> DT C7 70013 : score 1.06041 : V : HIS CG R0455 <- 3.62 -> DT C7 70031 : score 3.13393 : V : TRP CD2 R0434 <- 3.78 -> DT C7 70036 : score 5.52389 : V : ILE CG2 R0460 <- 3.74 -> DT C7 80026 : score 7.19765 : V : ARG CG R0588 <- 3.52 -> DT C7 80047 : score 1.07549 : x : ARG xxxx O0151 <- 3.17 -> DT xxx 70050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0175 <- 4.38 -> DT xxx 70050 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx O0183 <- 2.53 -> DA xxx 70048 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx O0199 <- 3.55 -> DG xxx 70049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0201 <- 4.15 -> DG xxx 70046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0371 <- 3.95 -> DT xxx 70043 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx O0374 <- 3.92 -> DT xxx 70043 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0375 <- 3.94 -> DG xxx 70042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0394 <- 4.19 -> DT xxx 70045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0473 <- 4.41 -> DT xxx 70045 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx O0496 <- 3.48 -> DT xxx 80023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx O0541 <- 2.88 -> DC xxx 70051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0542 <- 3.35 -> DG xxx 70049 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx O1263 <- 4.40 -> DT xxx 80018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0320 <- 4.19 -> DA xxx 80022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx P0426 <- 4.32 -> DT xxx 80015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0427 <- 4.12 -> DC xxx 80014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx P0791 <- 3.94 -> DA xxx 80013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx R0096 <- 4.03 -> DG xxx 70044 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0098 <- 3.61 -> DG xxx 70044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0099 <- 2.64 -> DG xxx 70044 : score x.xxxxx : x : MET xxxx R0102 <- 2.66 -> DG xxx 70042 : score x.xxxxx : x : MET xxxx R0105 <- 4.01 -> DG xxx 70042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0110 <- 4.19 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0116 <- 3.92 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0383 <- 2.86 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0385 <- 3.18 -> DG xxx 70042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0386 <- 3.21 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0423 <- 2.87 -> DA xxx 70037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx R0425 <- 3.40 -> DA xxx 70037 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx R0426 <- 4.07 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0428 <- 3.05 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0429 <- 2.93 -> DA xxx 70039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx R0430 <- 3.26 -> DA xxx 70037 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0432 <- 2.95 -> DA xxx 70040 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx R0433 <- 3.18 -> DT xxx 70036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0436 <- 4.07 -> DA xxx 70040 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0440 <- 3.98 -> DA xxx 80027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0448 <- 3.27 -> DT xxx 80026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0454 <- 3.08 -> DA xxx 70032 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0458 <- 3.00 -> DC xxx 80029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0461 <- 3.40 -> DT xxx 80026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0464 <- 2.21 -> DA xxx 80025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx R0502 <- 4.46 -> DA xxx 80022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0505 <- 4.06 -> DA xxx 80022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0509 <- 2.94 -> DA xxx 80022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0511 <- 3.94 -> DG xxx 80021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx R0513 <- 3.83 -> DG xxx 80020 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx R0516 <- 3.27 -> DG xxx 80017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0573 <- 3.88 -> DG xxx 80046 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0574 <- 3.92 -> DT xxx 80045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0584 <- 3.46 -> DG xxx 80046 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0585 <- 3.15 -> DC xxx 80048 : score x.xxxxx >4ylo_CDF: title=E. COLI TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX - 16-BP SPACER AND 4-NT RNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : SER OG C0508 <- 2.77 -> DG N2 20021 : score 3.39461 : H : ARG NH2 C0542 <- 2.42 -> DG N7 10049 : score 6.86985 : H : ARG NH1 F0099 <- 2.72 -> DG O6 10044 : score 6.18067 : H : THR OG1 F0432 <- 2.66 -> DA N7 10040 : score 3.5097 : H : GLN OE1 F0437 <- 2.80 -> DA N6 20027 : score 6.05256 : H : LYS NZ F0502 <- 3.06 -> DT O4 20023 : score 3.40065 : H : ARG NH2 F0584 <- 2.81 -> DG O6 20045 : score 6.5868 : V : TRP CG F0434 <- 3.73 -> DT C7 10036 : score 5.5926 : x : ARG xxxx C0143 <- 3.69 -> DG xxx 20020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0151 <- 2.68 -> DT xxx 10050 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 2.89 -> DC xxx 10047 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.22 -> DG xxx 10046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 3.75 -> DG xxx 10049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.42 -> DT xxx 10045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 3.37 -> DG xxx 10042 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0375 <- 4.18 -> DG xxx 10042 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0496 <- 3.58 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0504 <- 3.61 -> DG xxx 20021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0514 <- 3.31 -> DA xxx 20019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0541 <- 3.54 -> DC xxx 10051 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0546 <- 3.84 -> DT xxx 10050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0259 <- 3.31 -> DA xxx 20022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 4.43 -> DG xxx 10046 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0320 <- 3.19 -> DA xxx 20022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 3.29 -> DC xxx 20014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.58 -> DA xxx 20013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.78 -> DA xxx 20013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0096 <- 4.09 -> DG xxx 10044 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.10 -> DG xxx 10044 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.15 -> DT xxx 10043 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 3.28 -> DG xxx 10042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 4.35 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0112 <- 4.16 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0116 <- 3.76 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 3.18 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0385 <- 3.77 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 3.14 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0392 <- 3.26 -> DG xxx 10044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 3.22 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 2.90 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0426 <- 4.16 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 2.89 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 2.92 -> DA xxx 10039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.29 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.25 -> DT xxx 10036 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 4.19 -> DA xxx 20027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0454 <- 3.65 -> DT xxx 10033 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0455 <- 3.21 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0458 <- 2.72 -> DG xxx 20028 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0460 <- 3.40 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0461 <- 3.73 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0464 <- 3.00 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0468 <- 3.03 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0505 <- 3.88 -> DA xxx 20022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0509 <- 3.45 -> DA xxx 20022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0513 <- 4.09 -> DA xxx 20019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0516 <- 3.88 -> DG xxx 20017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0573 <- 3.42 -> DG xxx 20045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0574 <- 3.79 -> DG xxx 20045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0585 <- 2.25 -> DT xxx 20046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0586 <- 3.54 -> DC xxx 10013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0588 <- 4.13 -> DT xxx 20046 : score x.xxxxx >4ylo_IJL: title=E. COLI TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX - 16-BP SPACER AND 4-NT RNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 I0394 <- 2.73 -> DT O4 40045 : score 3.3137 : H : SER OG I0508 <- 2.41 -> DG N2 50021 : score 3.63756 : H : LYS NZ L0426 <- 3.18 -> DT O4 40041 : score 3.31455 : H : THR OG1 L0432 <- 2.71 -> DA N7 40040 : score 3.47556 : H : ARG NH1 L0468 <- 2.60 -> DA N7 50025 : score 2.66267 : H : LYS NZ L0502 <- 2.82 -> DT O4 50023 : score 3.57283 : V : VAL CG2 L0454 <- 3.84 -> DT C7 40033 : score 6.06185 : V : TRP CG L0434 <- 3.63 -> DT C7 40036 : score 5.73001 : V : ILE CG2 L0460 <- 3.82 -> DT C7 50026 : score 7.05583 : x : ARG xxxx I0151 <- 2.90 -> DT xxx 40050 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 2.56 -> DA xxx 40048 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.35 -> DG xxx 40049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 3.45 -> DT xxx 40050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0201 <- 4.01 -> DG xxx 40046 : score x.xxxxx : x : MET xxxx I0370 <- 4.50 -> DG xxx 40046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0371 <- 4.35 -> DG xxx 40044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0374 <- 3.17 -> DG xxx 40042 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0375 <- 4.16 -> DG xxx 40042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0473 <- 3.81 -> DT xxx 40045 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0496 <- 4.30 -> DT xxx 50024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0514 <- 3.39 -> DA xxx 50019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0541 <- 2.91 -> DC xxx 40051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 2.06 -> DG xxx 40049 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0546 <- 3.67 -> DT xxx 40050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0314 <- 4.14 -> DC xxx 40047 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0320 <- 3.32 -> DA xxx 50022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0322 <- 4.15 -> DA xxx 50022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.63 -> DA xxx 50013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 2.91 -> DA xxx 50013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.68 -> DA xxx 50013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx J0932 <- 3.97 -> DA xxx 50013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0096 <- 3.46 -> DG xxx 40044 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx L0098 <- 4.33 -> DG xxx 40044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0099 <- 4.47 -> DG xxx 40044 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0102 <- 2.54 -> DG xxx 40042 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0105 <- 4.36 -> DG xxx 40042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0110 <- 3.79 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0112 <- 3.53 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0116 <- 3.76 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0383 <- 2.66 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0385 <- 4.12 -> DG xxx 40042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0386 <- 2.79 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0392 <- 3.59 -> DG xxx 40044 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0401 <- 3.24 -> DG xxx 40044 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0419 <- 3.56 -> DA xxx 40037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0423 <- 3.25 -> DA xxx 40037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0425 <- 3.94 -> DA xxx 40037 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0428 <- 3.15 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0429 <- 2.68 -> DA xxx 40039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0430 <- 3.38 -> DA xxx 40037 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0433 <- 4.07 -> DT xxx 40036 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0437 <- 2.12 -> DA xxx 50027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0440 <- 3.82 -> DA xxx 50027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0443 <- 3.40 -> DT xxx 50026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0448 <- 3.30 -> DT xxx 50026 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0455 <- 2.97 -> DT xxx 40031 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0458 <- 3.71 -> DC xxx 50029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0461 <- 3.37 -> DT xxx 50026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0464 <- 2.82 -> DA xxx 50025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0465 <- 4.44 -> DA xxx 50025 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0503 <- 3.35 -> DT xxx 50024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0505 <- 3.43 -> DA xxx 50022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0509 <- 2.84 -> DA xxx 50022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx L0510 <- 4.45 -> DG xxx 50021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0511 <- 4.17 -> DG xxx 50021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0513 <- 2.78 -> DG xxx 50020 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0514 <- 2.99 -> DG xxx 50017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0516 <- 4.05 -> DG xxx 50017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0517 <- 4.23 -> DT xxx 50018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0573 <- 4.38 -> DG xxx 50045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0574 <- 4.46 -> DG xxx 50045 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0583 <- 4.42 -> DT xxx 40014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0585 <- 3.26 -> DT xxx 50046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0586 <- 3.32 -> DC xxx 40013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0589 <- 4.01 -> DC xxx 40013 : score x.xxxxx >4ylo_OPR: title=E. COLI TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX - 16-BP SPACER AND 4-NT RNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 O0151 <- 3.05 -> DT O4 70050 : score 3.10455 : H : GLU OE2 O0374 <- 2.88 -> DG N2 70042 : score 4.24129 : H : THR OG1 R0432 <- 2.90 -> DA N7 70040 : score 3.34582 : H : GLN OE1 R0437 <- 2.26 -> DA N6 80027 : score 6.70624 : V : ASN CB R0461 <- 3.73 -> DT C7 80026 : score 1.97134 : V : VAL CG1 R0454 <- 3.85 -> DT C7 70033 : score 5.98476 : x : ARG xxxx O0143 <- 2.99 -> DG xxx 80020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0175 <- 3.64 -> DT xxx 70050 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx O0183 <- 3.26 -> DA xxx 70048 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx O0199 <- 3.26 -> DG xxx 70046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0200 <- 2.89 -> DT xxx 70050 : score x.xxxxx : x : MET xxxx O0370 <- 4.34 -> DG xxx 70046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0371 <- 3.55 -> DT xxx 70045 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0375 <- 3.79 -> DG xxx 70042 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0377 <- 4.39 -> DG xxx 70042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0394 <- 4.09 -> DT xxx 70045 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx O0445 <- 4.35 -> DT xxx 70050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0470 <- 3.96 -> DT xxx 70045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0473 <- 4.46 -> DT xxx 70045 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx O0496 <- 4.30 -> DA xxx 80025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0514 <- 2.76 -> DA xxx 80019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx O0541 <- 2.76 -> DG xxx 80012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0542 <- 3.16 -> DG xxx 70049 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx O0546 <- 3.58 -> DT xxx 70050 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx P0426 <- 4.14 -> DT xxx 80015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0790 <- 3.62 -> DA xxx 80013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx P0791 <- 3.62 -> DA xxx 80013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx R0096 <- 3.58 -> DG xxx 70044 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0098 <- 3.00 -> DG xxx 70044 : score x.xxxxx : x : MET xxxx R0102 <- 3.17 -> DG xxx 70042 : score x.xxxxx : x : MET xxxx R0105 <- 4.46 -> DG xxx 70042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0110 <- 3.20 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0112 <- 3.39 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0116 <- 3.48 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0383 <- 2.96 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0385 <- 3.75 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0386 <- 3.29 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx R0392 <- 4.08 -> DG xxx 70044 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0419 <- 3.70 -> DA xxx 70037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0423 <- 3.68 -> DA xxx 70037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx R0425 <- 4.11 -> DA xxx 70037 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx R0426 <- 3.68 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0428 <- 2.64 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0429 <- 2.87 -> DA xxx 70039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx R0430 <- 3.19 -> DA xxx 70037 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx R0433 <- 3.64 -> DA xxx 80027 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx R0434 <- 2.78 -> DT xxx 70036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0441 <- 3.12 -> DG xxx 70034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0448 <- 4.29 -> DT xxx 80024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx R0455 <- 3.03 -> DC xxx 80029 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0457 <- 4.44 -> DT xxx 80026 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0458 <- 3.03 -> DG xxx 80028 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0460 <- 4.39 -> DT xxx 80026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0464 <- 2.60 -> DA xxx 80025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0465 <- 4.20 -> DT xxx 80026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0468 <- 3.02 -> DA xxx 80025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx R0502 <- 4.07 -> DT xxx 80023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0505 <- 4.10 -> DA xxx 80022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0509 <- 3.82 -> DA xxx 80022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx R0513 <- 3.08 -> DG xxx 80020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0573 <- 3.40 -> DG xxx 80045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0574 <- 3.92 -> DT xxx 80044 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0583 <- 3.54 -> DT xxx 70014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0584 <- 3.53 -> DG xxx 70016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0585 <- 2.93 -> DC xxx 80047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0586 <- 3.98 -> DC xxx 70013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0588 <- 4.27 -> DT xxx 80046 : score x.xxxxx >4ylo_R:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=E. COLI TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX - 16-BP SPACER AND 4-NT RNA organism=? : H : THR OG1 R0432 <- 2.90 -> DA N7 70040 : score 3.34582 : H : GLN OE1 R0437 <- 2.26 -> DA N6 80027 : score 6.70624 : V : ASN CB R0461 <- 3.73 -> DT C7 80026 : score 1.97134 : V : VAL CG1 R0454 <- 3.85 -> DT C7 70033 : score 5.98476 : x : ASP xxxx R0096 <- 3.58 -> DG xxx 70044 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0098 <- 3.00 -> DG xxx 70044 : score x.xxxxx : x : MET xxxx R0102 <- 3.17 -> DG xxx 70042 : score x.xxxxx : x : MET xxxx R0105 <- 4.46 -> DG xxx 70042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0110 <- 3.20 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0112 <- 3.39 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0116 <- 3.48 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0383 <- 2.96 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0385 <- 3.75 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0386 <- 3.29 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx R0392 <- 4.08 -> DG xxx 70044 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0419 <- 3.70 -> DA xxx 70037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0423 <- 3.68 -> DA xxx 70037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx R0425 <- 4.11 -> DA xxx 70037 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx R0426 <- 3.68 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0428 <- 2.64 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0429 <- 2.87 -> DA xxx 70039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx R0430 <- 3.19 -> DA xxx 70037 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx R0433 <- 3.64 -> DA xxx 80027 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx R0434 <- 2.78 -> DT xxx 70036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0441 <- 3.12 -> DG xxx 70034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0448 <- 4.29 -> DT xxx 80024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx R0455 <- 3.03 -> DC xxx 80029 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0457 <- 4.44 -> DT xxx 80026 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0458 <- 3.03 -> DG xxx 80028 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0460 <- 4.39 -> DT xxx 80026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0464 <- 2.60 -> DA xxx 80025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0465 <- 4.20 -> DT xxx 80026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0468 <- 3.02 -> DA xxx 80025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx R0502 <- 4.07 -> DT xxx 80023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0505 <- 4.10 -> DA xxx 80022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0509 <- 3.82 -> DA xxx 80022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx R0513 <- 3.08 -> DG xxx 80020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0573 <- 3.40 -> DG xxx 80045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0574 <- 3.92 -> DT xxx 80044 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0583 <- 3.54 -> DT xxx 70014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0584 <- 3.53 -> DG xxx 70016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0585 <- 2.93 -> DC xxx 80047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0586 <- 3.98 -> DC xxx 70013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0588 <- 4.27 -> DT xxx 80046 : score x.xxxxx >4ylp_CDF: title=E. COLI TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX - 16-BP SPACER AND 5-NT RNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : GLU OE1 C0541 <- 2.72 -> DT N3 10052 : score 1.7767 : H : GLU OE1 C0541 <- 3.10 -> DA N6 20011 : score 2.52113 : H : ARG NH1 F0099 <- 3.17 -> DT O4 10045 : score 3.02612 : H : THR OG1 F0432 <- 2.86 -> DA N7 10040 : score 3.37313 : H : GLN OE1 F0437 <- 2.30 -> DA N6 20027 : score 6.65782 : H : GLN OE1 F0437 <- 2.30 -> DA N6 20027 : score 6.65782 : H : HIS NE2 F0455 <- 3.42 -> DA N6 20030 : score -5.29868 : H : LYS NZ F0502 <- 3.38 -> DT O4 20023 : score 3.17107 : V : VAL CG2 F0454 <- 3.74 -> DT C7 10033 : score 6.21492 : V : GLU CB F0585 <- 3.65 -> DT C7 20046 : score 1.68873 : x : ARG xxxx C0143 <- 4.29 -> DG xxx 20020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0151 <- 3.06 -> DC xxx 10051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0175 <- 4.13 -> DC xxx 10051 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.24 -> DG xxx 10049 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.84 -> DA xxx 10048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 3.04 -> DT xxx 10050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.74 -> DT xxx 10045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 3.05 -> DG xxx 10042 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0375 <- 3.40 -> DG xxx 10042 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0380 <- 4.24 -> DT xxx 10043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0394 <- 4.07 -> DC xxx 10047 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0496 <- 4.00 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0514 <- 3.75 -> DT xxx 20018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 2.03 -> DT xxx 10050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0259 <- 4.08 -> DA xxx 20022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 3.94 -> DC xxx 20014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.64 -> DG xxx 20012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.33 -> DG xxx 20012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 4.01 -> DG xxx 20012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0932 <- 4.15 -> DG xxx 20012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 2.90 -> DG xxx 10044 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 3.06 -> DG xxx 10042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.04 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0112 <- 4.39 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0116 <- 4.08 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 3.17 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0385 <- 3.94 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 3.27 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0401 <- 4.11 -> DT xxx 10045 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 3.77 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 4.07 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 2.71 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0426 <- 3.67 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 3.48 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 2.89 -> DA xxx 10039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.08 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.64 -> DA xxx 20027 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0434 <- 3.32 -> DT xxx 10036 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 3.94 -> DA xxx 20027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0441 <- 3.02 -> DG xxx 10034 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0443 <- 4.08 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0448 <- 4.01 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0458 <- 3.19 -> DG xxx 20028 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0460 <- 4.20 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0461 <- 3.75 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0464 <- 3.12 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0468 <- 2.64 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0505 <- 3.75 -> DA xxx 20022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0513 <- 3.88 -> DA xxx 20019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0514 <- 4.11 -> DG xxx 20017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0516 <- 3.10 -> DG xxx 20017 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0574 <- 3.68 -> DT xxx 20044 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0583 <- 3.61 -> DT xxx 10014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0584 <- 3.49 -> DG xxx 10016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0586 <- 4.36 -> DC xxx 10013 : score x.xxxxx >4ylp_IJL: title=E. COLI TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX - 16-BP SPACER AND 5-NT RNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : GLU OE2 I0374 <- 2.64 -> DG N2 40042 : score 4.44818 : H : THR OG1 L0432 <- 2.87 -> DA N7 40040 : score 3.36631 : H : GLN OE1 L0437 <- 2.71 -> DA N6 50027 : score 6.16151 : H : GLN OE1 L0437 <- 2.71 -> DA N6 50027 : score 6.16151 : V : HIS CG L0455 <- 3.83 -> DT C7 40031 : score 2.97648 : V : ASN CG L0464 <- 3.68 -> DT C7 50026 : score 2.72765 : x : ARG xxxx I0143 <- 3.66 -> DG xxx 50020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0151 <- 3.14 -> DC xxx 40051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0175 <- 4.29 -> DC xxx 40051 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.06 -> DG xxx 40049 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.26 -> DG xxx 40049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 3.04 -> DC xxx 40051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0201 <- 4.42 -> DG xxx 40049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0371 <- 3.45 -> DG xxx 40044 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0375 <- 3.26 -> DG xxx 40042 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0379 <- 4.40 -> DT xxx 40043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0394 <- 4.30 -> DG xxx 40046 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0504 <- 4.47 -> DG xxx 50021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0508 <- 4.21 -> DG xxx 50021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0514 <- 3.12 -> DT xxx 50018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0541 <- 2.09 -> DT xxx 40052 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 2.78 -> DT xxx 40050 : score x.xxxxx : x : MET xxxx I1273 <- 4.49 -> DG xxx 50012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0259 <- 3.79 -> DG xxx 50021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 3.55 -> DA xxx 50013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.08 -> DG xxx 50012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.45 -> DG xxx 50012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 4.22 -> DG xxx 50012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0099 <- 3.27 -> DT xxx 40045 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0102 <- 2.86 -> DG xxx 40042 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0112 <- 4.09 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0383 <- 3.77 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0385 <- 3.43 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0386 <- 3.41 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0392 <- 4.35 -> DG xxx 40044 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0401 <- 4.25 -> DT xxx 40045 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0419 <- 4.34 -> DA xxx 40037 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0420 <- 4.03 -> DA xxx 40037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0423 <- 3.21 -> DA xxx 40037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0425 <- 3.66 -> DA xxx 40037 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0428 <- 3.07 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0429 <- 2.84 -> DA xxx 40039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0430 <- 3.34 -> DA xxx 40037 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0433 <- 3.50 -> DT xxx 40036 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0434 <- 3.02 -> DT xxx 40036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0436 <- 4.06 -> DA xxx 40040 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0440 <- 4.49 -> DA xxx 50027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0448 <- 3.77 -> DT xxx 50026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx L0454 <- 3.20 -> DA xxx 40032 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0458 <- 2.64 -> DG xxx 50028 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0460 <- 3.85 -> DT xxx 50026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0461 <- 3.60 -> DT xxx 50026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0468 <- 2.85 -> DA xxx 50025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0502 <- 3.68 -> DA xxx 50022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0503 <- 2.87 -> DT xxx 50024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0505 <- 3.08 -> DA xxx 50022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0513 <- 4.26 -> DA xxx 50019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0514 <- 3.61 -> DG xxx 50017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0516 <- 2.83 -> DG xxx 50017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0517 <- 4.41 -> DG xxx 50017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0573 <- 3.68 -> DG xxx 50045 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0583 <- 3.57 -> DT xxx 40014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0584 <- 3.93 -> DT xxx 40015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0585 <- 2.69 -> DC xxx 50047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0586 <- 3.60 -> DC xxx 40013 : score x.xxxxx >4ylp_L:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=E. COLI TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX - 16-BP SPACER AND 5-NT RNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : THR OG1 L0432 <- 2.87 -> DA N7 40040 : score 3.36631 : H : GLN OE1 L0437 <- 2.71 -> DA N6 50027 : score 6.16151 : V : ASN CG L0464 <- 3.68 -> DT C7 50026 : score 2.72765 : V : HIS CG L0455 <- 3.83 -> DT C7 40031 : score 2.97648 : x : ARG xxxx L0099 <- 3.27 -> DT xxx 40045 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0102 <- 2.86 -> DG xxx 40042 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0112 <- 4.09 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0383 <- 3.77 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0385 <- 3.43 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0386 <- 3.41 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0392 <- 4.35 -> DG xxx 40044 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0401 <- 4.25 -> DT xxx 40045 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0419 <- 4.34 -> DA xxx 40037 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0420 <- 4.03 -> DA xxx 40037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0423 <- 3.21 -> DA xxx 40037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0425 <- 3.66 -> DA xxx 40037 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0428 <- 3.07 -> DT xxx 40041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0429 <- 2.84 -> DA xxx 40039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0430 <- 3.34 -> DA xxx 40037 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0433 <- 3.50 -> DT xxx 40036 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0434 <- 3.02 -> DT xxx 40036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0436 <- 4.06 -> DA xxx 40040 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0440 <- 4.49 -> DA xxx 50027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0448 <- 3.77 -> DT xxx 50026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx L0454 <- 3.20 -> DA xxx 40032 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0458 <- 2.64 -> DG xxx 50028 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0460 <- 3.85 -> DT xxx 50026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0461 <- 3.60 -> DT xxx 50026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0468 <- 2.85 -> DA xxx 50025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0502 <- 3.68 -> DA xxx 50022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0503 <- 2.87 -> DT xxx 50024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0505 <- 3.08 -> DA xxx 50022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0513 <- 4.26 -> DA xxx 50019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0514 <- 3.61 -> DG xxx 50017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0516 <- 2.83 -> DG xxx 50017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0517 <- 4.41 -> DG xxx 50017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0573 <- 3.68 -> DG xxx 50045 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0583 <- 3.57 -> DT xxx 40014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0584 <- 3.93 -> DT xxx 40015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0585 <- 2.69 -> DC xxx 50047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0586 <- 3.60 -> DC xxx 40013 : score x.xxxxx >4ylp_OPR: title=E. COLI TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX - 16-BP SPACER AND 5-NT RNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : THR OG1 R0432 <- 2.56 -> DA N7 70040 : score 3.57798 : H : GLN OE1 R0437 <- 2.65 -> DA N6 80027 : score 6.23414 : H : GLN OE1 R0437 <- 2.65 -> DA N6 80027 : score 6.23414 : H : LYS NZ R0502 <- 2.43 -> DA N7 80022 : score 3.15453 : H : LYS NZ R0502 <- 3.38 -> DT O4 80023 : score 3.17107 : V : HIS CG R0455 <- 3.65 -> DT C7 70031 : score 3.11144 : V : VAL CG1 R0454 <- 3.83 -> DT C7 70033 : score 6.01506 : V : TRP CD1 R0434 <- 3.55 -> DT C7 70036 : score 7.79167 : V : ARG CZ O0542 <- 3.63 -> DT C7 70050 : score 2.22293 : V : ASN CB R0461 <- 3.53 -> DT C7 80026 : score 2.06821 : V : GLU CB R0585 <- 3.84 -> DT C7 80046 : score 1.61142 : x : ARG xxxx O0151 <- 3.43 -> DC xxx 70051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0175 <- 4.02 -> DC xxx 70051 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx O0183 <- 2.53 -> DG xxx 70049 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx O0199 <- 3.14 -> DG xxx 70049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0200 <- 3.15 -> DC xxx 70051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0201 <- 3.53 -> DG xxx 70049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0371 <- 4.07 -> DG xxx 70044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx O0374 <- 3.49 -> DG xxx 70042 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0375 <- 4.23 -> DG xxx 70042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0394 <- 3.36 -> DG xxx 70046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0473 <- 4.47 -> DG xxx 70044 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0514 <- 2.55 -> DT xxx 80018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx O0541 <- 3.53 -> DT xxx 70052 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0259 <- 3.22 -> DG xxx 80021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0320 <- 4.05 -> DA xxx 80022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx P0426 <- 3.55 -> DA xxx 80013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0427 <- 2.72 -> DG xxx 80012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0790 <- 3.62 -> DG xxx 80012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx P0791 <- 4.28 -> DG xxx 80012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx P0932 <- 3.61 -> DG xxx 80012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0099 <- 3.00 -> DT xxx 70045 : score x.xxxxx : x : MET xxxx R0102 <- 3.12 -> DG xxx 70042 : score x.xxxxx : x : MET xxxx R0105 <- 4.11 -> DG xxx 70042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0110 <- 3.60 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0112 <- 3.44 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0116 <- 4.36 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0383 <- 3.90 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0385 <- 3.33 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0386 <- 3.25 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx R0392 <- 3.80 -> DG xxx 70044 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0401 <- 2.89 -> DT xxx 70045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0423 <- 2.69 -> DA xxx 70037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx R0425 <- 4.42 -> DA xxx 70037 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx R0426 <- 3.83 -> DT xxx 70041 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0428 <- 3.58 -> DA xxx 70040 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0429 <- 2.76 -> DA xxx 70039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx R0430 <- 3.32 -> DA xxx 70037 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx R0433 <- 3.57 -> DT xxx 70036 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0440 <- 4.28 -> DA xxx 80027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0443 <- 3.90 -> DT xxx 80026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0448 <- 3.46 -> DT xxx 80026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0457 <- 4.39 -> DT xxx 80026 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0458 <- 2.57 -> DG xxx 80028 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0464 <- 3.23 -> DA xxx 80025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0468 <- 3.74 -> DA xxx 80025 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0505 <- 2.94 -> DA xxx 80022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0509 <- 4.29 -> DG xxx 80021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0511 <- 4.23 -> DA xxx 80019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx R0514 <- 3.69 -> DG xxx 80017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx R0516 <- 3.80 -> DC xxx 80016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0583 <- 4.12 -> DT xxx 70014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0584 <- 3.46 -> DG xxx 80045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0586 <- 3.98 -> DA xxx 70012 : score x.xxxxx >4ym5_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME CONTAINING 6-4PP (INSIDE) organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0040 <- 3.32 -> DA xxx J0081 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.94 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.24 -> DT xxx J0090 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.48 -> DT xxx J0078 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.42 -> DT xxx J0110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.49 -> DG xxx J0129 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.88 -> DA xxx I0081 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.75 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.42 -> DT xxx I0090 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.33 -> DT xxx I0078 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.20 -> DA xxx I0109 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.11 -> DG xxx I0129 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0031 <- 3.18 -> DA xxx I0122 : score x.xxxxx >4ym5_G:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME CONTAINING 6-4PP (INSIDE) organism=? : x : ARG xxxx G0042 <- 4.20 -> DA xxx I0109 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.11 -> DG xxx I0129 : score x.xxxxx >4ym6_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME CONTAINING 6-4PP (OUTSIDE) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.91 -> DA N3 J0228 : score 3.16847 : H : ARG NH1 A0083 <- 3.14 -> DC O2 I0049 : score 3.4018 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.72 -> DT xxx I0142 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.26 -> DT xxx J0237 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.26 -> DT xxx J0225 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 3.42 -> DG xxx I0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.29 -> DT xxx I0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.19 -> DT xxx J0267 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 3.98 -> DT xxx J0267 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0037 <- 3.87 -> DA xxx J0289 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 3.55 -> DT xxx J0287 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.10 -> DG xxx I0081 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.46 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.83 -> DG xxx I0098 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.97 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >4ym6_H:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME CONTAINING 6-4PP (OUTSIDE) organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx H0033 <- 3.97 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >4ymm_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH 7BG AS THE TEMPLATE BASE IN A 1-NUCLEOTIDE GAPPED DNA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.26 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.69 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.59 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4ymn_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH N7BG IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE CTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.33 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.73 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.49 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4ymo_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH N7BG IN THE TEMPLATE OPPOSITE TO INCOMING NON-HYDROLYZABLE CTP WITH MANGANESE IN THE ACTIVE SITE organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 2.76 -> DG N3 T0009 : score 1.46548 : w : LYS NZ A0234 <- 5.42 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : TYR OH A0271 <- 2.89 -> DA N3 P0010 : score 4.07656 : w : TYR OH A0271 <- 6.18 -> DC O2 T0008 : score 1.343 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.87 -> DT O2 T0007 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.07 -> DT O2 T0007 : score 2.261 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.45 -> DT O2 T0007 : score 2.462 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.76 -> DC O2 T0008 : score 1.988 >4yn4_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH N7BG IN THE TEMPLATE OPPOSITE TO INCOMING NON-HYDROLYZABLE DTTP WITH MANGANESE IN THE ACTIVE SITE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.26 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.73 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.54 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4yo2_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF E2F8, AN ATYPICAL MEMBER OF E2F FAMILY OF TRANSCRIPTION FACTORS organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0155 <- 3.13 -> DG N7 D0007 : score 4.12996 : H : ARG NH1 A0156 <- 2.73 -> DG O6 C0008 : score 6.1685 : H : ARG NH2 A0156 <- 3.17 -> DG O6 C0008 : score 6.1116 : H : ARG NH2 A0314 <- 2.43 -> DG N7 D0009 : score 6.85708 : H : ARG NH2 A0314 <- 2.77 -> DG O6 D0009 : score 6.6396 : x : ARG xxxx A0113 <- 3.37 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0153 <- 3.18 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0154 <- 4.50 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0158 <- 3.29 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0310 <- 3.90 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0313 <- 3.29 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0316 <- 3.46 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >4yoq_A:DNA-glycosylase;Nudix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MUTY BOUND TO ITS ANTI-SUBSTRATE organism=Geobacillus stearothermophilus : w : GLN OE1 A0047 <- 6.27 -> DG N3 C0019 : score 1.484 : w : GLN OE1 A0048 <- 6.40 -> DG N3 C0019 : score 1.484 : H : ARG NH2 A0050 <- 2.53 -> DC O2 C0016 : score 3.89845 : H : ARG NH1 A0167 <- 2.75 -> DC O2 C0018 : score 3.6865 : x : TYR xxxx A0088 <- 3.15 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0148 <- 3.86 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0164 <- 3.63 -> DA xxx B0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 4.01 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0308 <- 3.80 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0309 <- 3.99 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >4yox_E: title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TRIMERIC EXONUCLEASE PHOEXO I FROM PYROCOCCUS HORIKOSHII OT3 IN COMPLEX WITH POLY-DT organism=Pyrococcus horikoshii : w : ASN ND2 E0214 <- 5.98 -> DT O2 F0007 : score 1.666 : V : PHE CZ E0220 <- 3.52 -> DT C7 F0007 : score 7.61291 >4yoy_E: title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TRIMERIC EXONUCLEASE PHOEXO I FROM PYROCOCCUS HORIKOSHII OT3 IN COMPLEX WITH POLY-DT AND MG2+ ION organism=Pyrococcus horikoshii : w : ASN ND2 E0214 <- 6.10 -> DT O2 F0007 : score 1.666 >4yp3_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=MUTANT HUMAN DNA POLYMERASE ETA Q38A/R61A INSERTING DCTP OPPOSITE AN 8-OXOGUANINE LESION organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.19 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4yph_A:DNA-glycosylase;Nudix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MUTY BOUND TO ITS ANTI-SUBSTRATE WITH THE DISULFIDE CROSS-LINKER REDUCED organism=Geobacillus stearothermophilus : w : GLN OE1 A0047 <- 5.95 -> DG N3 C0019 : score 1.484 : w : GLN OE1 A0048 <- 6.27 -> DG N3 C0019 : score 1.484 : H : ARG NH1 A0050 <- 2.76 -> DC O2 C0016 : score 3.6792 : H : ARG NH1 A0167 <- 2.58 -> DC O2 C0018 : score 3.8106 : x : TYR xxxx A0088 <- 3.15 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0148 <- 3.96 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.80 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0308 <- 3.79 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0309 <- 3.77 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >4ypr_B:DNA-glycosylase;Nudix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF D144N MUTY BOUND TO ITS ANTI-SUBSTRATE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NH1 B0050 <- 2.80 -> DG N3 F0009 : score 3.05256 : H : GLU OE1 B0192 <- 3.14 -> DC N4 E0018 : score 5.37573 : x : ARG xxxx B0026 <- 3.66 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0028 <- 3.43 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0030 <- 4.34 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0031 <- 3.14 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0043 <- 2.62 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0046 <- 3.52 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0048 <- 3.31 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0051 <- 3.60 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0088 <- 3.17 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0126 <- 3.14 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0146 <- 4.45 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0164 <- 3.29 -> DA xxx F0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0188 <- 3.99 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0191 <- 3.22 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0201 <- 4.41 -> DA xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0306 <- 4.27 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0308 <- 3.67 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0309 <- 3.74 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx >4yqw_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=MUTANT HUMAN DNA POLYMERASE ETA Q38A/R61A INSERTING DCTP OPPOSITE TEMPLATE G organism=Homo sapiens : w : ASN OD1 A0324 <- 5.83 -> DA N7 T0005 : score 2.277 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.31 -> DG N7 P0004 : score 5.73338 : x : SER xxxx A0322 <- 4.33 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4yr0_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=MUTANT HUMAN DNA POLYMERASE ETA R61M INSERTING DCTP OPPOSITE AN 8- OXOGUANINE LESION organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.16 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.40 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >4yr2_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=MUTANT HUMAN DNA POLYMERASE ETA R61M INSERTING DATP OPPOSITE AN 8- OXOGUANINE LESION organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.08 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.56 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >4yr3_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=MUTANT HUMAN DNA POLYMERASE ETA R61M INSERTING DCTP OPPOSITE TEMPLATE G organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0382 <- 5.93 -> DG N7 P0002 : score 2.063 : x : SER xxxx A0322 <- 4.07 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4yrv_AB:Periplasmic_binding_protein-like_II; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ANABAENA TRANSCRIPTION FACTOR HETR COMPLEXED WITH 21-BP DNA FROM HETP PROMOTER organism=Nostoc sp. PCC 7120 : H : ARG NH1 A0062 <- 2.59 -> DG N7 C0003 : score 6.3041 : H : ARG NH1 A0062 <- 3.38 -> DG O6 C0003 : score 5.37767 : H : ARG NH1 B0062 <- 2.57 -> DG N7 D0003 : score 6.3283 : H : GLU OE1 B0071 <- 2.90 -> DC N4 C0015 : score 5.65259 : H : GLU OE2 B0071 <- 3.37 -> DC N4 C0016 : score 4.66513 : H : LYS NZ B0073 <- 3.01 -> DG O6 D0006 : score 5.53798 : x : GLU xxxx A0071 <- 3.72 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0073 <- 3.29 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx >4yrv_B:Periplasmic_binding_protein-like_II; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ANABAENA TRANSCRIPTION FACTOR HETR COMPLEXED WITH 21-BP DNA FROM HETP PROMOTER organism=Nostoc sp. PCC 7120 : H : ARG NH1 B0062 <- 2.57 -> DG N7 D0003 : score 6.3283 : H : GLU OE1 B0071 <- 2.90 -> DC N4 C0015 : score 5.65259 : H : GLU OE2 B0071 <- 3.37 -> DC N4 C0016 : score 4.66513 : H : LYS NZ B0073 <- 3.01 -> DG O6 D0006 : score 5.53798 >4ys3_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like; title=NUCLEOSOME DISASSEMBLY BY RSC AND SWI/SNF IS ENHANCED BY H3 ACETYLATION NEAR THE NUCLEOSOME DYAD AXIS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.66 -> DA N3 J0230 : score 3.33046 : H : ARG NH2 E0640 <- 3.14 -> DA N3 I0083 : score 3.01944 : x : LEU xxxx A0465 <- 3.38 -> DT xxx J0239 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 4.00 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0032 <- 4.16 -> DT xxx I0062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0842 <- 4.32 -> DA xxx J0259 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1230 <- 3.95 -> DG xxx J0269 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0639 <- 4.33 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0641 <- 4.22 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 3.75 -> DT xxx I0092 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 4.37 -> DA xxx I0100 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0232 <- 4.18 -> DT xxx J0209 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0245 <- 4.15 -> DC xxx I0080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H1430 <- 4.15 -> DG xxx I0122 : score x.xxxxx >4ys3_H:Histone-fold; title=NUCLEOSOME DISASSEMBLY BY RSC AND SWI/SNF IS ENHANCED BY H3 ACETYLATION NEAR THE NUCLEOSOME DYAD AXIS organism=? : x : ARG xxxx H1430 <- 4.15 -> DG xxx I0122 : score x.xxxxx >4z1x_B:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LAGLIDADG HOMING ENDONUCLEASE I-GZEII IN COMPLEX WITH DNA TARGET organism=Fusarium graminearum PH-1 : H : GLU OE2 B0027 <- 3.31 -> DC N4 D0021 : score 4.72832 : H : ARG NH1 B0034 <- 2.76 -> DG O6 C0005 : score 6.132 : H : ARG NH2 B0034 <- 2.98 -> DG N7 C0005 : score 6.15477 : H : ARG NH1 B0036 <- 2.86 -> DG O6 C0006 : score 6.01033 : H : ARG NH2 B0036 <- 2.98 -> DG N7 C0006 : score 6.15477 : H : GLN NE2 B0040 <- 3.05 -> DG N7 D0017 : score 3.98878 : H : LYS NZ B0042 <- 2.78 -> DG O6 D0016 : score 5.80389 : H : LYS NZ B0042 <- 2.81 -> DG O6 D0017 : score 5.76921 : H : LYS NZ B0074 <- 3.07 -> DT O4 D0018 : score 3.39347 : H : LYS NZ B0074 <- 3.11 -> DT O4 C0008 : score 3.36477 : H : ARG NH1 B0076 <- 2.90 -> DG N7 C0007 : score 5.929 : H : ARG NH2 B0076 <- 2.87 -> DG O6 C0007 : score 6.5076 : H : ARG NH1 B0196 <- 2.86 -> DG O6 C0018 : score 6.01033 : H : ARG NH2 B0196 <- 3.01 -> DG N7 C0018 : score 6.11646 : H : HIS NE2 B0222 <- 2.69 -> DT O4 C0016 : score 5.73237 : H : HIS NE2 B0222 <- 3.08 -> DG O6 C0017 : score 7.50843 : H : ARG NE B0234 <- 3.05 -> DG N7 D0006 : score 4.20071 : H : ARG NH2 B0234 <- 2.67 -> DG O6 D0006 : score 6.7716 : V : SER CB B0192 <- 3.71 -> DT C7 D0005 : score 3.20174 : V : ALA CB B0228 <- 3.83 -> DT C7 C0015 : score 5.55698 : V : TYR CD1 B0183 <- 3.69 -> DT C7 C0019 : score 4.80975 : x : MET xxxx B0023 <- 3.33 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0025 <- 3.72 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0029 <- 4.27 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0065 <- 3.71 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0070 <- 3.25 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0179 <- 4.24 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0190 <- 3.44 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0198 <- 3.38 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0220 <- 4.02 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0223 <- 4.19 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0232 <- 4.08 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >4z1z_A:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MEGANUCLEASE I-SMAMI BOUND TO UNCLEAVEABLE DNA WITH A TTCT CENTRAL FOUR organism=Sordaria macrospora (strain ATCC MYA-333 / DSM 997 / K(L3346) / K-hell) / Sordaria macrospora (strain ATCC MYA-333 / DSM 997 / K(L3346) / K-hell) : H : ARG NH1 A0026 <- 3.08 -> DG N7 C0021 : score 5.7112 : H : ARG NH2 A0026 <- 2.71 -> DG N7 C0021 : score 6.49954 : H : TYR OH A0033 <- 2.39 -> DA N7 D0004 : score 4.49169 : H : ARG NH1 A0079 <- 3.19 -> DG O6 C0019 : score 5.60883 : H : LYS NZ A0183 <- 3.42 -> DA N7 D0017 : score 2.57297 : H : LYS NZ A0187 <- 2.97 -> DG N7 D0021 : score 5.20278 : H : SER OG A0191 <- 2.57 -> DG N7 C0004 : score 4.68823 : H : GLN OE1 A0197 <- 3.31 -> DA N6 C0006 : score 5.4352 : H : GLN NE2 A0197 <- 2.91 -> DA N7 C0006 : score 5.95577 : H : ARG NH2 A0231 <- 2.60 -> DG N7 C0012 : score 6.64 : V : ILE CG2 A0185 <- 3.81 -> DT C7 D0020 : score 7.07355 : x : MET xxxx A0024 <- 3.80 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0028 <- 2.99 -> DG xxx C0021 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0038 <- 4.07 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0071 <- 3.78 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0192 <- 3.81 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0203 <- 3.60 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0205 <- 4.13 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0227 <- 4.15 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0230 <- 4.21 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0234 <- 4.28 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0236 <- 4.05 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 4.21 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx >4z20_D:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MEGANUCLEASE I-SMAMI BOUND TO UNCLEAVEABLE DNA WITH A TTGT CENTRAL FOUR organism=Sordaria macrospora (strain ATCC MYA-333 / DSM 997 / K(L3346) / K-hell) / Sordaria macrospora (strain ATCC MYA-333 / DSM 997 / K(L3346) / K-hell) : H : ARG NH2 D0026 <- 2.54 -> DG N7 E0020 : score 6.71662 : H : ARG NH2 D0028 <- 3.03 -> DG N7 E0021 : score 6.09092 : H : TYR OH D0033 <- 2.73 -> DA N7 F0003 : score 4.2094 : H : TYR OH D0033 <- 3.43 -> DA N6 F0003 : score 4.08203 : H : ARG NH2 D0079 <- 3.20 -> DG N7 E0018 : score 5.87385 : H : LYS NZ D0183 <- 3.34 -> DA N7 F0016 : score 2.61996 : H : LYS NZ D0183 <- 2.90 -> DG N7 F0017 : score 5.27818 : H : LYS NZ D0187 <- 3.14 -> DG N7 F0020 : score 5.01966 : H : LYS NZ D0187 <- 2.82 -> DG O6 F0020 : score 5.75765 : H : LYS NZ D0187 <- 2.62 -> DT O4 F0021 : score 3.71632 : H : SER OG D0191 <- 2.78 -> DG N7 E0003 : score 4.49998 : H : GLN NE2 D0197 <- 3.08 -> DA N7 E0005 : score 5.74872 : H : GLN NE2 D0203 <- 3.15 -> DA N7 F0016 : score 5.66346 : H : ARG NH1 D0231 <- 3.05 -> DG N7 E0011 : score 5.7475 : H : ARG NH2 D0231 <- 3.06 -> DG O6 E0011 : score 6.2568 : H : TYR OH D0236 <- 2.95 -> DC N4 F0015 : score 4.08768 : V : ILE CG2 D0185 <- 3.84 -> DT C7 F0019 : score 7.02037 : x : MET xxxx D0024 <- 3.94 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0038 <- 4.36 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0046 <- 3.91 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0069 <- 4.34 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0071 <- 3.80 -> DC xxx F0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0181 <- 4.40 -> DA xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0192 <- 4.12 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0205 <- 3.88 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0227 <- 3.35 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0229 <- 3.41 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0234 <- 3.95 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0240 <- 4.23 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx >4z2c_AD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE(MOXIFLOXACIN)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF GYRASE FROM S. PNEUMONIAE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : ARG xxxx A0030 <- 4.21 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0172 <- 3.36 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0458 <- 3.65 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx >4z2c_BC:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE(MOXIFLOXACIN)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF GYRASE FROM S. PNEUMONIAE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : LYS xxxx C0458 <- 4.28 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0172 <- 3.33 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx >4z2c_D:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE(MOXIFLOXACIN)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF GYRASE FROM S. PNEUMONIAE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : LYS xxxx D0458 <- 3.65 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx >4z2d_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE(LEVOFLOXACIN)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF GYRASE FROM S. PNEUMONIAE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : TYR xxxx A0022 <- 4.45 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0030 <- 4.45 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0172 <- 2.93 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0458 <- 4.24 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0172 <- 3.04 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0458 <- 3.82 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx >4z2d_D:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE(LEVOFLOXACIN)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF GYRASE FROM S. PNEUMONIAE organism=? : x : LYS xxxx D0458 <- 3.82 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx >4z2e_AD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE(TROVAFLOXACIN)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF GYRASE FROM S. PNEUMONIAE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : TYR xxxx A0022 <- 4.43 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0030 <- 4.15 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0172 <- 2.98 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0458 <- 3.41 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx >4z2e_BC:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE(TROVAFLOXACIN)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF GYRASE FROM S. PNEUMONIAE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : ILE xxxx B0172 <- 3.92 -> DG xxx G0012 : score x.xxxxx >4z3a_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=ACETATE-FREE STRUCTURE OF THE ENZYME-PRODUCT COMPLEX RESULTING FROM TDG ACTION ON A GU MISMATCH organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0158 <- 6.59 -> DT O2 C0013 : score 3.682 : H : LYS NZ A0201 <- 2.91 -> DT O4 C0009 : score 3.50826 : H : GLN OE1 A0278 <- 2.97 -> DG N2 D0018 : score 5.41703 : H : GLN OE1 A0278 <- 2.97 -> DG N2 D0018 : score 5.41703 : H : GLN NE2 A0278 <- 2.86 -> DT O2 D0019 : score 3.88613 : x : HIS xxxx A0107 <- 2.91 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0200 <- 4.14 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0274 <- 3.43 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.33 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0276 <- 4.18 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 3.51 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0280 <- 3.39 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >4z3c_C: title=ZINC FINGER REGION OF HUMAN TET3 IN COMPLEX WITH CPG DNA organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ C0053 <- 2.81 -> DT O2 B0008 : score 3.58001 A : H : HIS ND1 C0081 <- 2.74 -> DG O6 B0007 : score 6.29775 : H : GLN NE2 C0082 <- 2.70 -> DG O6 A0007 : score 5.92123 : w : GLN OE1 C0082 <- 5.53 -> DG N7 A0007 : score 2.87 : x : THR xxxx C0080 <- 4.38 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx >4z3o_AB:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE(MOXIFLOXACIN)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TOPOISOMERASE IV FROM S. PNEUMONIAE organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : w : TYR OH B1020 <- 5.95 -> DC O2 F0008 : score 1.343 : x : LYS xxxx A0458 <- 3.88 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1028 <- 4.25 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1080 <- 3.66 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1117 <- 3.54 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1170 <- 3.27 -> DC xxx H0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0458 <- 3.57 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1028 <- 4.30 -> DA xxx E0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1080 <- 3.58 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1117 <- 3.57 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1170 <- 3.27 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx >4z3o_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE(MOXIFLOXACIN)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TOPOISOMERASE IV FROM S. PNEUMONIAE organism=? : w : TYR OH B1020 <- 5.95 -> DC O2 F0008 : score 1.343 : x : LYS xxxx B0458 <- 3.57 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1028 <- 4.30 -> DA xxx E0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1080 <- 3.58 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1117 <- 3.57 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1170 <- 3.27 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx >4z47_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=STRUCTURE OF THE ENZYME-PRODUCT COMPLEX RESULTING FROM TDG ACTION ON A GU MISMATCH IN THE PRESENCE OF EXCESS BASE organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0158 <- 6.30 -> DT O2 C0013 : score 3.682 : H : LYS NZ A0201 <- 2.74 -> DT O4 D0019 : score 3.63023 : H : GLN OE1 A0278 <- 2.93 -> DG N2 D0018 : score 5.46189 : H : GLN NE2 A0278 <- 2.84 -> DT O2 D0019 : score 3.90187 : x : ALA xxxx A0274 <- 3.35 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.51 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0276 <- 3.45 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 3.57 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0280 <- 3.44 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >4z4q_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINAZOLINEDIONE(PD 0305970)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TOPOISOMERASE IV FROM S. PNEUMONIAE organism=? : x : LYS xxxx B0458 <- 3.79 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B1020 <- 4.36 -> DC xxx H0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1080 <- 3.60 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1170 <- 3.15 -> DC xxx H0008 : score x.xxxxx >4z53_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE(TROVAFLOXACIN)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TOPOISOMERASE IV FROM S. PNEUMONIAE organism=? : x : LYS xxxx B0458 <- 3.46 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1028 <- 3.99 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1080 <- 3.67 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1117 <- 4.13 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1170 <- 3.29 -> DT xxx G0011 : score x.xxxxx >4z58_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=HIPB-O3 20MER COMPLEX organism=Escherichia coli : H : GLN OE1 A0039 <- 2.89 -> DA N6 B0003 : score 5.94362 : H : GLN NE2 A0039 <- 3.11 -> DA N7 B0003 : score 5.71218 : w : ASN ND2 A0044 <- 6.61 -> DC N4 B0005 : score 2.395 : x : SER xxxx A0029 <- 3.50 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0038 <- 4.46 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0040 <- 3.18 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0043 <- 3.48 -> DA xxx B0003 : score x.xxxxx >4z59_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=HIPB-O4 20MER COMPLEX organism=Escherichia coli : H : GLN OE1 A0039 <- 2.92 -> DA N6 B0003 : score 5.9073 : H : GLN NE2 A0039 <- 3.11 -> DA N7 B0003 : score 5.71218 : w : ASN ND2 A0044 <- 6.48 -> DC N4 B0005 : score 2.395 A : x : SER xxxx A0029 <- 3.63 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0038 <- 4.40 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0040 <- 3.28 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0043 <- 3.43 -> DA xxx B0003 : score x.xxxxx >4z5c_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=HIPB-O3 21MER COMPLEX organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0038 <- 2.65 -> DG N7 C0016 : score 5.54747 : H : LYS NZ A0038 <- 2.77 -> DG O6 C0017 : score 5.81545 : H : GLN OE1 A0039 <- 3.18 -> DA N6 D0025 : score 5.59257 : H : GLN NE2 A0039 <- 3.18 -> DA N7 D0025 : score 5.62692 : H : LYS NZ B0038 <- 2.56 -> DG N7 D0037 : score 5.64442 : H : LYS NZ B0038 <- 2.75 -> DG O6 D0038 : score 5.83858 : w : LYS NZ B0038 <- 6.13 -> DG O6 D0036 : score 3.005 : H : GLN OE1 B0039 <- 2.85 -> DA N6 C0004 : score 5.99204 : H : GLN NE2 B0039 <- 2.94 -> DA N7 C0004 : score 5.91923 : V : ALA CB A0040 <- 3.88 -> DT C7 D0026 : score 5.48699 : V : ALA CB B0040 <- 3.87 -> DT C7 C0005 : score 5.50099 : x : SER xxxx A0029 <- 3.88 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0043 <- 3.86 -> DA xxx D0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0029 <- 3.98 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 3.64 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx >4z5c_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=HIPB-O3 21MER COMPLEX organism=Escherichia coli : H : LYS NZ B0038 <- 2.56 -> DG N7 D0037 : score 5.64442 : H : LYS NZ B0038 <- 2.75 -> DG O6 D0038 : score 5.83858 : w : LYS NZ B0038 <- 6.13 -> DG O6 D0036 : score 3.005 : H : GLN OE1 B0039 <- 2.85 -> DA N6 C0004 : score 5.99204 : H : GLN NE2 B0039 <- 2.94 -> DA N7 C0004 : score 5.91923 : V : ALA CB B0040 <- 3.87 -> DT C7 C0005 : score 5.50099 : x : SER xxxx B0029 <- 3.98 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 3.64 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx >4z5d_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=HIPB-O4 21MER COMPLEX organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0038 <- 3.00 -> DG N7 C0016 : score 5.17046 : H : LYS NZ A0038 <- 3.16 -> DG O6 C0016 : score 5.36455 : H : LYS NZ A0038 <- 2.76 -> DG O6 C0017 : score 5.82702 : w : LYS NZ A0038 <- 5.77 -> DC N4 C0015 : score 0.048 : H : GLN OE1 A0039 <- 3.17 -> DA N6 D0025 : score 5.60467 : H : GLN NE2 A0039 <- 3.19 -> DA N7 D0025 : score 5.61474 : x : SER xxxx A0029 <- 3.90 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0040 <- 3.43 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0043 <- 3.93 -> DA xxx D0025 : score x.xxxxx >4z5d_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=HIPB-O4 21MER COMPLEX organism=Escherichia coli : H : LYS NZ A0038 <- 3.00 -> DG N7 C0016 : score 5.17046 : H : LYS NZ A0038 <- 3.16 -> DG O6 C0016 : score 5.36455 : H : LYS NZ A0038 <- 2.76 -> DG O6 C0017 : score 5.82702 : w : LYS NZ A0038 <- 5.77 -> DC N4 C0015 : score 0.048 : H : GLN OE1 A0039 <- 3.17 -> DA N6 D0025 : score 5.60467 : H : GLN NE2 A0039 <- 3.19 -> DA N7 D0025 : score 5.61474 : H : LYS NZ B0038 <- 2.91 -> DG N7 D0037 : score 5.26741 : H : LYS NZ B0038 <- 3.03 -> DG O6 D0037 : score 5.51485 : H : LYS NZ B0038 <- 2.75 -> DG O6 D0038 : score 5.83858 : w : LYS NZ B0038 <- 5.90 -> DC N4 D0036 : score 0.048 : H : GLN OE1 B0039 <- 3.03 -> DA N6 C0004 : score 5.77415 : H : GLN NE2 B0039 <- 2.96 -> DA N7 C0004 : score 5.89487 : x : SER xxxx A0029 <- 3.90 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0040 <- 3.43 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0043 <- 3.93 -> DA xxx D0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0029 <- 3.76 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0040 <- 3.55 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 3.75 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx >4z5h_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=HIPB(S29A)-O2 20MER COMPLEX organism=Escherichia coli : H : GLN OE1 A0039 <- 2.97 -> DA N6 B0003 : score 5.84678 : H : GLN NE2 A0039 <- 3.08 -> DA N7 B0003 : score 5.74872 : x : ALA xxxx A0029 <- 4.44 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0040 <- 3.18 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0043 <- 3.54 -> DA xxx B0003 : score x.xxxxx >4z5t_A:Histone-fold; title=THE NUCLEOSOME CONTAINING HUMAN H3.5 organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0039 <- 3.36 -> DA xxx J0229 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0064 <- 3.95 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx >4z5t_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE NUCLEOSOME CONTAINING HUMAN H3.5 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 E0039 <- 3.13 -> DA N3 I0082 : score 3.02592 : x : ARG xxxx A0039 <- 3.36 -> DA xxx J0229 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0064 <- 3.95 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.03 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.38 -> DT xxx I0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0040 <- 3.81 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0064 <- 3.93 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.09 -> DG xxx J0214 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.93 -> DA xxx I0111 : score x.xxxxx >4z66_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME DISASSEMBLY BY RSC AND SWI/SNF IS ENHANCED BY H3 ACETYLATION NEAR THE NUCLEOSOME DYAD AXIS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0440 <- 2.53 -> DA N3 J0230 : score 3.41469 : H : ARG NH1 E0640 <- 3.21 -> DA N3 I0083 : score 3.38012 : x : TYR xxxx A0441 <- 4.20 -> DT xxx J0153 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.72 -> DT xxx J0239 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0483 <- 3.75 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0032 <- 4.42 -> DT xxx I0062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0842 <- 4.04 -> DA xxx J0259 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1230 <- 4.16 -> DG xxx J0269 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0639 <- 4.36 -> DT xxx J0291 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0641 <- 4.23 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0665 <- 3.96 -> DT xxx I0092 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 4.21 -> DC xxx J0197 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0245 <- 3.83 -> DC xxx I0080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H1430 <- 3.73 -> DG xxx I0122 : score x.xxxxx >4z66_C:Histone-fold; title=NUCLEOSOME DISASSEMBLY BY RSC AND SWI/SNF IS ENHANCED BY H3 ACETYLATION NEAR THE NUCLEOSOME DYAD AXIS organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx C0842 <- 4.04 -> DA xxx J0259 : score x.xxxxx >4z6c_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA 279NA MUTANT COMPLEXED WITH G IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE CTP organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 2.76 -> DG N3 T0009 : score 1.46548 : H : TYR OH A0271 <- 2.91 -> DA N3 P0010 : score 4.05995 : H : ARG NH1 A0283 <- 3.25 -> DT O2 T0007 : score 3.91883 >4z6d_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA 279NA MUTANT COMPLEXED WITH G IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE TTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.28 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.82 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.59 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >4z6e_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA 279NA MUTANT COMPLEXED WITH G IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE TTP AND MANGANESE organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0271 <- 2.93 -> DA N3 P0010 : score 4.04335 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.56 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : LYS xxxx A0234 <- 3.13 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0283 <- 3.74 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >4z6f_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA 279NA MUTANT COMPLEXED WITH G IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE TTP AND MANGANESE organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 2.89 -> DG N3 T0009 : score 1.42768 : H : TYR OH A0271 <- 3.24 -> DA N3 P0010 : score 3.78597 : x : ARG xxxx A0283 <- 3.21 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >4z7b_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=STRUCTURE OF THE ENZYME-PRODUCT COMPLEX RESULTING FROM TDG ACTION ON A GFC MISMATCH organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0158 <- 6.41 -> DT O2 C0013 : score 3.682 : H : LYS NZ A0201 <- 2.78 -> DT O4 D0019 : score 3.60153 : H : GLN OE1 A0278 <- 3.08 -> DG N2 D0018 : score 5.29366 : H : GLN OE1 A0278 <- 3.08 -> DG N2 D0018 : score 5.29366 : H : GLN NE2 A0278 <- 2.78 -> DT O2 D0019 : score 3.94907 : x : SER xxxx A0200 <- 4.12 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0274 <- 3.29 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.53 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0276 <- 4.30 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 3.44 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0280 <- 3.32 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >4z7z_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=STRUCTURE OF THE ENZYME-PRODUCT COMPLEX RESULTING FROM TDG ACTION ON A GT MISMATCH IN THE PRESENCE OF EXCESS BASE organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0158 <- 6.34 -> DT O2 C0013 : score 3.682 : H : GLN OE1 A0278 <- 2.91 -> DG N2 D0018 : score 5.48432 : H : GLN OE1 A0278 <- 2.91 -> DG N2 D0018 : score 5.48432 : H : GLN NE2 A0278 <- 2.81 -> DT O2 D0019 : score 3.92547 : x : ALA xxxx A0274 <- 3.32 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.46 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0276 <- 3.35 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 3.64 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0280 <- 3.53 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >4zbn_AB:Cystine-knot_cytokines; title=NON-HELICAL DNA TRIPLEX FORMS A UNIQUE APTAMER SCAFFOLD FOR HIGH AFFINITY RECOGNITION OF NERVE GROWTH FACTOR organism=Homo sapiens : H : TRP NE1 B0021 <- 2.98 -> DC O2 E0022 : score 6.26229 >4zcf_ABC:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURAL BASIS OF ASYMMETRIC DNA METHYLATION AND ATP-TRIGGERED LONG- RANGE DIFFUSION BY ECOP15I organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 A0305 <- 2.58 -> DG O6 E0018 : score 6.351 : H : ARG NH2 A0305 <- 2.82 -> DG N7 E0018 : score 6.35908 : H : GLN OE1 A0319 <- 2.67 -> DC N4 D0004 : score 4.7025 : H : SER OG A0320 <- 2.95 -> DC N4 E0016 : score 3.56537 : H : HIS NE2 A0322 <- 2.79 -> DG N7 D0006 : score 6.81617 : H : ASN OD1 A0323 <- 3.26 -> DC N4 E0013 : score 3.80778 : H : ARG NH1 A0350 <- 2.87 -> DG N7 E0015 : score 5.9653 : H : ARG NH1 A0350 <- 2.87 -> DG N7 E0015 : score 5.9653 : H : ARG NH2 A0350 <- 2.69 -> DG O6 E0015 : score 6.7452 : H : ARG NH2 A0350 <- 2.69 -> DG O6 E0015 : score 6.7452 : H : ASP OD1 B0123 <- 2.73 -> DA N6 D0008 : score 3.5308 : H : ASN ND2 B0232 <- 3.09 -> DG N3 E0015 : score 4.61097 : H : ASN ND2 B0232 <- 3.09 -> DG N3 E0015 : score 4.61097 : H : ASN OD1 B0233 <- 2.73 -> DG N2 D0009 : score 4.8672 : H : ASN ND2 B0233 <- 3.28 -> DG N3 D0009 : score 4.42496 : w : ASN OD1 B0233 <- 5.46 -> DT O2 D0010 : score 1.953 : H : ARG NH1 B0397 <- 2.93 -> DT O2 E0017 : score 4.19444 : H : ARG NH2 B0397 <- 3.08 -> DT O2 E0017 : score 3.99627 : H : LYS NZ B0418 <- 3.20 -> DA N7 D0008 : score 2.70221 : V : PRO CG A0324 <- 3.79 -> DT C7 E0014 : score 6.37487 : x : SER xxxx A0318 <- 4.42 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0329 <- 3.60 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0126 <- 3.47 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0128 <- 4.10 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0130 <- 3.98 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0131 <- 3.34 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0230 <- 3.97 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0231 <- 4.17 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0242 <- 4.40 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0416 <- 3.56 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx >4zcf_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURAL BASIS OF ASYMMETRIC DNA METHYLATION AND ATP-TRIGGERED LONG- RANGE DIFFUSION BY ECOP15I organism=ESCHERICHIA COLI : H : ASP OD1 B0123 <- 2.73 -> DA N6 D0008 : score 3.5308 : w : THR OG1 B0230 <- 6.16 -> DG N2 D0006 : score 2.036 : H : ASN ND2 B0232 <- 3.09 -> DG N3 E0015 : score 4.61097 : H : ASN ND2 B0232 <- 3.09 -> DG N3 E0015 : score 4.61097 : H : ASN OD1 B0233 <- 2.73 -> DG N2 D0009 : score 4.8672 : H : ASN ND2 B0233 <- 3.28 -> DG N3 D0009 : score 4.42496 : w : ASN OD1 B0233 <- 5.46 -> DT O2 D0010 : score 1.953 : w : ASP OD2 B0395 <- 6.37 -> DG N2 D0006 : score 1.62 : H : ARG NH1 B0397 <- 2.93 -> DT O2 E0017 : score 4.19444 : H : ARG NH2 B0397 <- 3.08 -> DT O2 E0017 : score 3.99627 : w : ARG NH1 B0397 <- 5.99 -> DA N3 D0005 : score 2.585 : w : ARG NH2 B0397 <- 6.51 -> DG N2 D0006 : score 1.593 : H : LYS NZ B0418 <- 3.20 -> DA N7 D0008 : score 2.70221 : x : TYR xxxx B0126 <- 3.47 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0128 <- 4.10 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0130 <- 3.98 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0131 <- 3.34 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0231 <- 4.17 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0242 <- 4.40 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0416 <- 3.56 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx >4zm0_A:YefM-like; title=ANTITOXIN PHD FROM PHAGE P1 IN COMPLEX WITH ITS OPERATOR DNA INVERTED REPEAT organism=Enterobacteria phage P1 : H : ARG NE A0007 <- 2.90 -> DG N7 H0004 : score 4.33336 : H : ARG NH2 A0007 <- 2.79 -> DG O6 H0004 : score 6.6132 : H : ARG NH1 A0010 <- 2.72 -> DG N7 H0006 : score 6.1468 : H : ARG NH1 A0010 <- 3.12 -> DG O6 H0006 : score 5.694 : H : ARG NH2 A0010 <- 2.88 -> DG O6 H0006 : score 6.4944 : H : ARG NH1 A0031 <- 3.22 -> DT O2 H0003 : score 3.94467 : H : ARG NH2 A0031 <- 3.19 -> DT O2 H0003 : score 3.90313 : V : PHE CD1 A0006 <- 3.69 -> DT C7 H0005 : score 4.26492 >4zm0_BC:YefM-like; title=ANTITOXIN PHD FROM PHAGE P1 IN COMPLEX WITH ITS OPERATOR DNA INVERTED REPEAT organism=Enterobacteria phage P1 : H : ARG NE B0007 <- 2.91 -> DG N7 G0005 : score 4.32452 : H : ARG NH1 B0007 <- 3.19 -> DG O6 G0005 : score 5.60883 : H : ARG NH1 B0010 <- 2.75 -> DG O6 G0007 : score 6.14417 : H : ARG NH2 B0010 <- 2.96 -> DG N7 G0007 : score 6.18031 : H : ARG NH1 B0031 <- 3.16 -> DT O2 G0003 : score 3.99635 : H : ARG NH1 B0031 <- 3.40 -> DT O2 G0004 : score 3.78964 : H : ARG NE C0007 <- 2.84 -> DG N7 F0004 : score 4.38642 : H : ARG NH2 C0007 <- 2.96 -> DG O6 F0004 : score 6.3888 : H : ARG NH1 C0010 <- 2.89 -> DG N7 F0006 : score 5.9411 : H : ARG NH1 C0010 <- 3.23 -> DG O6 F0006 : score 5.56017 : H : ARG NH2 C0010 <- 2.96 -> DG O6 F0006 : score 6.3888 : H : ARG NH1 C0031 <- 2.80 -> DT O2 F0003 : score 4.30641 : H : ARG NH1 C0031 <- 2.97 -> DT O2 E0014 : score 4.15999 : H : ARG NH2 C0031 <- 3.06 -> DT O2 E0014 : score 4.0132 : V : PHE CD1 C0006 <- 3.69 -> DT C7 F0005 : score 4.26492 : V : PHE CD1 B0006 <- 3.69 -> DT C7 G0006 : score 4.26492 >4zm2_AB:YefM-like; title=ANTITOXIN PHD FROM PHAGE P1 IN COMPLEX WITH ITS OPERATOR DNA INVERTED REPEAT IN A MONOCLINIC SPACE GROUP organism=Enterobacteria phage P1 : H : ARG NH1 A0010 <- 2.86 -> DG N7 H0006 : score 5.9774 : H : ARG NH1 A0010 <- 2.90 -> DG O6 H0006 : score 5.96167 : H : ARG NH2 A0010 <- 2.80 -> DG O6 H0006 : score 6.6 : H : ARG NE B0007 <- 2.66 -> DG N7 G0005 : score 4.54561 : H : ARG NH1 B0007 <- 2.99 -> DG O6 G0005 : score 5.85217 : H : ARG NH2 B0031 <- 3.25 -> DT O2 G0004 : score 3.85233 : V : PHE CD2 A0006 <- 3.76 -> DT C7 H0005 : score 6.57691 : x : ARG xxxx A0007 <- 4.33 -> DG xxx H0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0031 <- 3.90 -> DT xxx G0014 : score x.xxxxx >4zm2_C:YefM-like; title=ANTITOXIN PHD FROM PHAGE P1 IN COMPLEX WITH ITS OPERATOR DNA INVERTED REPEAT IN A MONOCLINIC SPACE GROUP organism=Enterobacteria phage P1 : V : ARG CZ C0010 <- 3.84 -> DT C7 F0005 : score 2.11098 : x : PHE xxxx C0006 <- 3.68 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0031 <- 3.22 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx >4zm2_CD:YefM-like; title=ANTITOXIN PHD FROM PHAGE P1 IN COMPLEX WITH ITS OPERATOR DNA INVERTED REPEAT IN A MONOCLINIC SPACE GROUP organism=Enterobacteria phage P1 : H : ARG NH2 D0007 <- 2.80 -> DG N7 E0005 : score 6.38462 : H : ARG NH1 D0010 <- 2.54 -> DG O6 E0007 : score 6.39967 : H : ARG NH1 D0010 <- 2.87 -> DT O4 E0008 : score 3.2222 : H : ARG NH1 D0031 <- 3.31 -> DT O2 E0003 : score 3.86716 : x : PHE xxxx C0006 <- 3.68 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0010 <- 3.24 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0031 <- 3.22 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0006 <- 3.81 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx >4zpk_A:PYP-like_sensor_domain_PAS_domain;HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETERODIMERIC HIF-2A:ARNT COMPLEX WITH HRE DNA organism=MUS MUSCULUS : H : GLU OE2 A0098 <- 2.87 -> DC N4 D0010 : score 5.19167 : H : ARG NH2 A0102 <- 2.46 -> DG O6 C0011 : score 7.0488 : x : HIS xxxx A0094 <- 3.45 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0101 <- 3.33 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >4zpk_AB:PYP-like_sensor_domain_PAS_domain;HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETERODIMERIC HIF-2A:ARNT COMPLEX WITH HRE DNA organism=MUS MUSCULUS : H : GLU OE2 A0098 <- 2.87 -> DC N4 D0010 : score 5.19167 : H : ARG NH2 A0102 <- 2.46 -> DG O6 C0011 : score 7.0488 : V : ALA CB B0023 <- 3.59 -> DT C7 D0014 : score 5.89292 : x : HIS xxxx A0094 <- 3.45 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0101 <- 3.33 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0019 <- 3.79 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0026 <- 3.87 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0027 <- 2.57 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx >4zpk_B:PYP-like_sensor_domain_PAS_domain;HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETERODIMERIC HIF-2A:ARNT COMPLEX WITH HRE DNA organism=MUS MUSCULUS : V : ALA CB B0023 <- 3.59 -> DT C7 D0014 : score 5.89292 : x : SER xxxx B0019 <- 3.79 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0026 <- 3.87 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0027 <- 2.57 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx >4zpr_AB:PYP-like_sensor_domain_PAS_domain;HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETERODIMERIC HIF-1A:ARNT COMPLEX WITH HRE DNA organism=MUS MUSCULUS : H : HIS NE2 A0094 <- 3.18 -> DG O6 C0013 : score 7.34935 : H : ARG NH2 A0102 <- 2.22 -> DG O6 C0011 : score 7.3656 : H : ARG NH2 B0030 <- 2.35 -> DG N7 D0013 : score 6.95923 : V : SER CB B0022 <- 3.71 -> DT C7 D0014 : score 3.20174 : x : GLU xxxx A0098 <- 3.15 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0101 <- 4.11 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0018 <- 3.93 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0023 <- 4.40 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0026 <- 3.99 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0029 <- 3.64 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >4zpr_B:PYP-like_sensor_domain_PAS_domain;HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETERODIMERIC HIF-1A:ARNT COMPLEX WITH HRE DNA organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 B0030 <- 2.35 -> DG N7 D0013 : score 6.95923 : V : SER CB B0022 <- 3.71 -> DT C7 D0014 : score 3.20174 : x : ARG xxxx B0018 <- 3.93 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0023 <- 4.40 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0026 <- 3.99 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0029 <- 3.64 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >4zq9_ABC:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=X-RAY STRUCTURE OF AAV-2 OBD BOUND TO AAVS1 SITE 3:1 organism=Adeno-associated virus 2 (isolate Srivastava/1982) / Adeno-associated virus 2 (isolate Srivastava/1982) / Adeno-associated virus 2 (isolate Srivastava/1982) / Adeno-associated virus 2 (isolate Srivastava/1982) / Adeno-associated virus 2 (isolate Srivastava/1982) / Adeno-associated virus 2 (isolate Srivastava/1982) : H : ARG NH1 A0107 <- 2.89 -> DC O2 D0010 : score 3.5843 : H : ARG NH2 A0107 <- 2.96 -> DT O2 D0009 : score 4.09787 : H : ARG NH1 A0138 <- 2.94 -> DG O6 D0003 : score 5.913 : H : ARG NH2 A0138 <- 2.57 -> DG O6 E0040 : score 6.9036 : H : ARG NH1 B0107 <- 3.19 -> DG N3 D0018 : score 2.81446 : H : ARG NH2 B0107 <- 3.10 -> DT O2 D0017 : score 3.97933 : H : ARG NH1 B0138 <- 2.74 -> DG O6 D0011 : score 6.15633 : H : ARG NH2 B0138 <- 2.56 -> DG O6 E0032 : score 6.9168 : H : ARG NH1 C0107 <- 2.80 -> DC O2 D0014 : score 3.65 : H : ARG NH2 C0107 <- 2.94 -> DT O2 D0013 : score 4.1148 : H : ARG NH1 C0138 <- 2.71 -> DG O6 D0007 : score 6.19283 : H : ARG NH2 C0138 <- 2.62 -> DG O6 E0036 : score 6.8376 : x : MET xxxx A0103 <- 3.53 -> DG xxx E0036 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0141 <- 4.46 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0103 <- 3.07 -> DG xxx E0028 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0103 <- 3.59 -> DG xxx E0032 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0141 <- 4.36 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx >4zq9_C:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=X-RAY STRUCTURE OF AAV-2 OBD BOUND TO AAVS1 SITE 3:1 organism=Adeno-associated virus 2 (isolate Srivastava/1982) / Adeno-associated virus 2 (isolate Srivastava/1982) : H : ARG NH1 C0107 <- 2.80 -> DC O2 D0014 : score 3.65 : H : ARG NH2 C0107 <- 2.94 -> DT O2 D0013 : score 4.1148 : w : ARG NH2 C0107 <- 6.06 -> DG N3 E0032 : score 0.677 : H : ARG NH1 C0138 <- 2.71 -> DG O6 D0007 : score 6.19283 : H : ARG NH2 C0138 <- 2.62 -> DG O6 E0036 : score 6.8376 : x : MET xxxx C0103 <- 3.59 -> DG xxx E0032 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0141 <- 4.36 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx >4zsf_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF PRE-SPECIFIC RESTRICTION ENDONUCLEASE BSAWI-DNA COMPLEX organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ASN OD1 A0081 <- 3.20 -> DG N2 B0008 : score 4.416 : x : LYS xxxx A0084 <- 3.83 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0085 <- 3.29 -> DC xxx B0011 : score x.xxxxx >4ztf_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS INTASOME WITH A 2- PYRIDINONE AMINAL INHIBITOR organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.89 -> DC O2 C0006 : score 2.61111 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.93 -> DC O2 C0006 : score 3.60255 : V : PRO CG A0259 <- 3.79 -> DT C7 C0008 : score 6.37487 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.56 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.94 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.67 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.88 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >4ztj_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS INTASOME WITH A 2- PYRIDINONE AMINAL INHIBITOR organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.80 -> DC O2 C0006 : score 2.65897 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.89 -> DC O2 C0006 : score 3.63214 : V : PRO CG A0259 <- 3.75 -> DT C7 C0008 : score 6.43846 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.43 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.88 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.55 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.78 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >4ztu_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURAL BASIS FOR PROCESSIVITY AND ANTIVIRAL DRUG TOXICITY IN HUMAN MITOCHONDRIAL DNA REPLICASE organism=HOMO SAPIENS : x : ASN xxxx A0803 <- 4.21 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0853 <- 4.21 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0861 <- 3.48 -> DT xxx P0022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0948 <- 3.95 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0951 <- 3.93 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0955 <- 2.82 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0961 <- 3.62 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1098 <- 3.34 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1102 <- 4.33 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4ztz_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURAL BASIS FOR PROCESSIVITY AND ANTIVIRAL DRUG TOXICITY IN HUMAN MITOCHONDRIAL DNA REPLICASE organism=HOMO SAPIENS : x : ASN xxxx A0803 <- 4.23 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0853 <- 4.21 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0861 <- 3.46 -> DT xxx P0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1102 <- 4.32 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >4zux_ABCDEFGH: title=SAGA DUB MODULE UBP8/SGF11/SUS1/SGF73 BOUND TO UBIQITINATED NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 A0040 <- 3.10 -> DT O2 J0009 : score 4.04803 : H : ARG NH2 D0030 <- 2.96 -> DG N3 J0048 : score 3.49473 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.58 -> DG N3 I0009 : score 3.76911 : H : ARG NH2 F0045 <- 2.96 -> DC O2 I0006 : score 3.58036 : x : ARG xxxx A0083 <- 3.51 -> DG xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.65 -> DA xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 3.61 -> DA xxx J0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.10 -> DT xxx I-036 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.09 -> DA xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.41 -> DC xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.12 -> DA xxx I0057 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.63 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >4zux_C:Histone-fold; title=SAGA DUB MODULE UBP8/SGF11/SUS1/SGF73 BOUND TO UBIQITINATED NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx C0035 <- 3.61 -> DA xxx J0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.10 -> DT xxx I-036 : score x.xxxxx >5a0m_A:Homing_endonucleases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-SCEI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA IN THE PRESENCE OF MN organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN ND2 A0315 <- 2.87 -> DT O2 K0023 : score 4.67971 : H : ARG NH1 A0348 <- 3.04 -> DG O6 K0018 : score 5.79133 : H : ARG NH2 A0348 <- 2.96 -> DG N7 K0018 : score 6.18031 : H : ARG NH2 A0350 <- 2.62 -> DG N7 K0019 : score 6.61446 : H : ARG NH2 A0350 <- 2.46 -> DG O6 K0019 : score 7.0488 : H : GLN NE2 A0359 <- 2.53 -> DG O6 K0017 : score 6.11861 : H : GLU OE1 A0361 <- 2.96 -> DC N4 K0015 : score 5.58337 : H : LYS NZ A0386 <- 2.64 -> DT O4 D0011 : score 3.70197 : H : ARG NH1 A0388 <- 3.03 -> DG O6 D0012 : score 5.8035 : H : ARG NH2 A0388 <- 3.20 -> DG N7 D0012 : score 5.87385 : H : ASN ND2 A0452 <- 3.25 -> DT O4 C0006 : score 4.809 : H : ASN ND2 A0492 <- 3.19 -> DG O6 C0009 : score 5.19866 : H : LYS NZ A0493 <- 3.07 -> DG N7 C0010 : score 5.09506 : H : LYS NZ A0493 <- 2.68 -> DG O6 C0010 : score 5.91951 : x : PRO xxxx A0314 <- 3.37 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0346 <- 3.06 -> DG xxx K0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0384 <- 3.78 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0390 <- 3.96 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0391 <- 4.37 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0396 <- 3.73 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0402 <- 3.61 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0450 <- 3.31 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0451 <- 3.84 -> DC xxx L0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0463 <- 2.87 -> DC xxx L0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0465 <- 4.32 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx >5a0w_A:Homing_endonucleases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI E117A IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AND IN THE PRESENCE OF 2MM MN organism=DESULFUROCOCCUS MOBILIS : H : ARG NH1 A0033 <- 2.66 -> DG O6 B0021 : score 6.25367 : H : GLU OE1 A0035 <- 3.09 -> DC N4 C0006 : score 5.43341 : H : ARG NH1 A0037 <- 2.84 -> DG O6 C0008 : score 6.03467 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.77 -> DG O6 C0007 : score 6.6396 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.91 -> DG O6 C0008 : score 6.4548 : w : ARG NH1 A0037 <- 5.67 -> DT O4 B0017 : score 1.768 : H : THR OG1 A0076 <- 2.78 -> DA N7 B0014 : score 3.42776 : H : THR OG1 A0076 <- 2.72 -> DA N6 B0014 : score 2.80312 : H : ARG NE A0077 <- 3.07 -> DG N7 B0015 : score 4.18302 : H : ARG NH2 A0077 <- 2.92 -> DT O4 B0016 : score 3.46855 : w : ARG NH1 A0077 <- 6.22 -> DA N7 C0009 : score 0.388 : w : ARG NH2 A0077 <- 6.27 -> DA N7 C0009 : score 1.486 : w : GLU OE2 A0079 <- 5.32 -> DT O4 B0017 : score 2.279 : H : ARG NH1 A0081 <- 3.14 -> DG N7 C0008 : score 5.6386 : H : ARG NH2 A0081 <- 3.11 -> DG N7 C0008 : score 5.98877 : H : ARG NH1 A0124 <- 3.10 -> DG O6 C0019 : score 5.71833 A : H : ARG NH1 A0124 <- 2.95 -> DG O6 B0006 : score 5.90083 A : H : ARG NH2 A0124 <- 2.76 -> DG N7 B0006 : score 6.43569 A : H : ARG NH1 A0126 <- 2.77 -> DG O6 C0018 : score 6.11983 : H : ARG NH2 A0126 <- 2.95 -> DG N7 C0018 : score 6.19308 : w : ARG NH1 A0126 <- 6.60 -> DC N4 B0007 : score 1.892 : H : ASP OD1 A0154 <- 2.98 -> DC N4 B0008 : score 5.15246 : w : ASP OD1 A0154 <- 6.23 -> DC N4 B0007 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0155 <- 5.37 -> DC N4 C0015 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0157 <- 3.07 -> DG N7 B0010 : score 5.7233 : H : ARG NH2 A0157 <- 2.79 -> DG O6 B0010 : score 6.6132 : w : HIS ND1 A0158 <- 5.94 -> DC N4 C0015 : score 2.515 : x : TYR xxxx A0025 <- 3.53 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0027 <- 4.11 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0029 <- 2.99 -> DC xxx B0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0032 <- 4.30 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0034 <- 3.29 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0039 <- 4.30 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.98 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0070 <- 3.21 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0072 <- 4.25 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0083 <- 4.00 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0128 <- 3.72 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0167 <- 4.45 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx >5a39_B:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF RAD14 IN COMPLEX WITH CISPLATIN CONTAINING DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : THR xxxx B0142 <- 3.93 -> DA xxx G0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0145 <- 3.97 -> DT xxx G0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0168 <- 3.51 -> DG xxx G0000 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0170 <- 2.99 -> DG xxx G0000 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0174 <- 3.46 -> DC xxx C0014 : score x.xxxxx >5a3d_A:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL INSIGHTS INTO THE RECOGNITION OF CISPLATIN AND AAF-DG LESIONS BY RAD14 (XPA) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN ND2 A0256 <- 2.80 -> DC O2 C0002 : score 4.47949 : x : THR xxxx A0230 <- 3.65 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0233 <- 4.26 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0240 <- 3.52 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0258 <- 3.18 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0262 <- 3.24 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx >5a3d_AB:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL INSIGHTS INTO THE RECOGNITION OF CISPLATIN AND AAF-DG LESIONS BY RAD14 (XPA) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN ND2 A0256 <- 2.80 -> DC O2 C0002 : score 4.47949 : x : THR xxxx A0230 <- 3.65 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0233 <- 4.26 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0240 <- 3.52 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0258 <- 3.18 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0262 <- 3.24 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0230 <- 3.75 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0262 <- 3.28 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx >5a72_AB:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HOMING ENDONUCLEASE I-CVUI IN COMPLEX WITH ITS TARGET (SRO1.3) IN THE PRESENCE OF 2 MM CA organism=CHLORELLA VULGARIS : w : GLN NE2 A0029 <- 5.10 -> DG O6 C0518 : score 2.87 : H : ARG NH1 A0033 <- 2.96 -> DG O6 D0604 : score 5.88867 : H : ARG NH2 A0033 <- 2.89 -> DG N7 D0604 : score 6.26969 : H : ASP OD2 A0035 <- 2.66 -> DC N4 D0602 : score 6.3736 : w : ASP OD1 A0035 <- 5.76 -> DA N6 D0603 : score 3.122 : H : ARG NH1 A0043 <- 2.62 -> DT O4 C0519 : score 3.38559 : w : ARG NH1 A0043 <- 5.78 -> DG O6 C0518 : score 2.756 : w : ARG NH2 A0043 <- 5.76 -> DT O4 C0520 : score 2.366 : H : ARG NH1 A0071 <- 3.01 -> DG N7 D0608 : score 5.7959 : H : ARG NH2 A0071 <- 2.78 -> DG O6 D0608 : score 6.6264 : H : ARG NH2 A0073 <- 3.06 -> DG O6 C0515 : score 6.2568 : w : ASP OD2 A0075 <- 5.45 -> DC N4 C0514 : score 3.623 : H : GLU OE2 A0079 <- 3.09 -> DA N6 C0516 : score 2.87431 : w : CYS SG A0081 <- 6.83 -> DC N4 D0607 : score 4.371 : H : LYS NZ A0143 <- 3.00 -> DT O2 D0609 : score 3.44369 : w : GLN NE2 B0029 <- 5.17 -> DG O6 D0618 : score 2.87 : H : ARG NH1 B0033 <- 3.00 -> DG O6 C0504 : score 5.84 : H : ARG NH2 B0033 <- 2.97 -> DG N7 C0504 : score 6.16754 : H : ASP OD2 B0035 <- 2.82 -> DC N4 C0502 : score 6.1752 : w : ASP OD1 B0035 <- 5.64 -> DA N6 C0503 : score 3.122 : H : ARG NH1 B0043 <- 2.61 -> DT O4 D0619 : score 3.39213 : w : ARG NH1 B0043 <- 5.53 -> DG O6 D0618 : score 2.756 : w : ARG NH2 B0043 <- 5.80 -> DT O4 D0620 : score 2.366 : H : ARG NH1 B0071 <- 3.05 -> DG N7 C0508 : score 5.7475 : H : ARG NH2 B0071 <- 2.70 -> DG O6 C0508 : score 6.732 : H : ARG NH2 B0073 <- 2.63 -> DG O6 D0615 : score 6.8244 : w : ASP OD2 B0075 <- 5.15 -> DC N4 D0614 : score 3.623 : H : GLU OE2 B0079 <- 2.90 -> DA N6 D0616 : score 2.99026 : V : ASP CG A0075 <- 3.72 -> DT C7 D0609 : score 2.73674 : x : CYS xxxx A0025 <- 4.50 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0031 <- 4.14 -> DT xxx C0519 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0036 <- 3.31 -> DA xxx D0603 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0049 <- 3.50 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0074 <- 3.26 -> DT xxx D0609 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0077 <- 3.63 -> DC xxx C0514 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0025 <- 4.37 -> DA xxx D0616 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0031 <- 4.19 -> DT xxx D0619 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0036 <- 3.37 -> DA xxx C0503 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0049 <- 3.38 -> DA xxx D0616 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0074 <- 3.38 -> DT xxx C0509 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0077 <- 3.70 -> DC xxx D0614 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0143 <- 3.32 -> DC xxx D0617 : score x.xxxxx >5a72_B:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HOMING ENDONUCLEASE I-CVUI IN COMPLEX WITH ITS TARGET (SRO1.3) IN THE PRESENCE OF 2 MM CA organism=CHLORELLA VULGARIS : w : GLN NE2 B0029 <- 5.17 -> DG O6 D0618 : score 2.87 : H : ARG NH1 B0033 <- 3.00 -> DG O6 C0504 : score 5.84 : H : ARG NH2 B0033 <- 2.97 -> DG N7 C0504 : score 6.16754 : H : ASP OD2 B0035 <- 2.82 -> DC N4 C0502 : score 6.1752 : w : ASP OD1 B0035 <- 5.64 -> DA N6 C0503 : score 3.122 : H : ARG NH1 B0043 <- 2.61 -> DT O4 D0619 : score 3.39213 : w : ARG NH1 B0043 <- 5.53 -> DG O6 D0618 : score 2.756 : w : ARG NH2 B0043 <- 5.80 -> DT O4 D0620 : score 2.366 : H : ARG NH1 B0071 <- 3.05 -> DG N7 C0508 : score 5.7475 : H : ARG NH2 B0071 <- 2.70 -> DG O6 C0508 : score 6.732 : H : ARG NH2 B0073 <- 2.63 -> DG O6 D0615 : score 6.8244 : w : ASP OD2 B0075 <- 5.15 -> DC N4 D0614 : score 3.623 : H : GLU OE2 B0079 <- 2.90 -> DA N6 D0616 : score 2.99026 : x : CYS xxxx B0025 <- 4.37 -> DA xxx D0616 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0031 <- 4.19 -> DT xxx D0619 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0036 <- 3.37 -> DA xxx C0503 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0049 <- 3.38 -> DA xxx D0616 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0074 <- 3.38 -> DT xxx C0509 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0077 <- 3.70 -> DC xxx D0614 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0143 <- 3.32 -> DC xxx D0617 : score x.xxxxx >5a74_AB:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HOMING ENDONUCLEASE I-CVUI IN COMPLEX WITH ITS TARGET (SRO1.3) IN THE PRESENCE OF 2 MM MN organism=CHLORELLA VULGARIS : H : ARG NH1 A0033 <- 3.13 -> DG O6 D0604 : score 5.68183 : H : ARG NH2 A0033 <- 3.02 -> DG N7 D0604 : score 6.10369 : H : ASP OD2 A0035 <- 2.89 -> DC N4 D0602 : score 6.0884 : w : ASP OD1 A0035 <- 5.91 -> DA N6 D0603 : score 3.122 : H : ARG NH1 A0043 <- 2.53 -> DT O4 E0519 : score 3.44442 : w : ARG NH1 A0043 <- 5.86 -> DG O6 E0518 : score 2.756 : w : ARG NH2 A0043 <- 5.66 -> DT O4 E0520 : score 2.366 : H : ARG NH1 A0071 <- 2.93 -> DG N7 D0608 : score 5.8927 : H : ARG NH2 A0071 <- 2.65 -> DG O6 D0608 : score 6.798 : H : ARG NH2 A0073 <- 2.79 -> DG O6 E0515 : score 6.6132 : w : ASP OD2 A0075 <- 5.90 -> DC N4 C0514 : score 3.623 : H : GLU OE2 A0079 <- 2.82 -> DA N6 E0516 : score 3.03908 : w : GLU OE2 A0079 <- 6.55 -> DC N4 E0517 : score 3.597 : w : GLN OE1 B0029 <- 6.18 -> DG O6 F0618 : score 2.87 : w : GLN NE2 B0029 <- 5.94 -> DG O6 F0618 : score 2.87 : H : ARG NH1 B0033 <- 3.07 -> DG O6 C0504 : score 5.75483 : H : ARG NH2 B0033 <- 2.91 -> DG N7 C0504 : score 6.24415 : H : ASP OD2 B0035 <- 2.67 -> DC N4 C0502 : score 6.3612 : w : ASP OD1 B0035 <- 5.72 -> DA N6 C0503 : score 3.122 : H : ARG NH1 B0043 <- 2.83 -> DT O4 F0619 : score 3.24834 : w : ARG NH1 B0043 <- 5.57 -> DG O6 F0618 : score 2.756 : w : ARG NH2 B0043 <- 5.19 -> DT O4 F0620 : score 2.366 : H : ARG NH1 B0071 <- 2.96 -> DG N7 C0508 : score 5.8564 : H : ARG NH2 B0071 <- 2.58 -> DG O6 C0508 : score 6.8904 : H : ARG NH2 B0073 <- 2.61 -> DG O6 F0615 : score 6.8508 : w : ASP OD2 B0075 <- 5.68 -> DC N4 D0614 : score 3.623 : H : GLU OE2 B0079 <- 2.95 -> DA N6 F0616 : score 2.95974 : V : ASP CG B0075 <- 3.84 -> DT C7 C0509 : score 2.65625 : V : ASP CG A0075 <- 3.70 -> DT C7 D0609 : score 2.75015 : x : CYS xxxx A0025 <- 4.46 -> DA xxx E0516 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0029 <- 3.35 -> DG xxx E0518 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0031 <- 4.16 -> DT xxx E0519 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0036 <- 3.25 -> DA xxx D0603 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0049 <- 3.37 -> DA xxx E0516 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0074 <- 3.62 -> DT xxx D0609 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0077 <- 3.72 -> DC xxx C0514 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0143 <- 3.06 -> DT xxx D0609 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0025 <- 4.49 -> DA xxx F0616 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0031 <- 4.29 -> DT xxx F0619 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0036 <- 3.32 -> DA xxx C0503 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0049 <- 3.44 -> DA xxx F0616 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0074 <- 3.40 -> DT xxx C0509 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0077 <- 3.62 -> DC xxx D0614 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0143 <- 3.04 -> DT xxx C0509 : score x.xxxxx >5a74_B:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HOMING ENDONUCLEASE I-CVUI IN COMPLEX WITH ITS TARGET (SRO1.3) IN THE PRESENCE OF 2 MM MN organism=CHLORELLA VULGARIS : w : GLN OE1 B0029 <- 6.18 -> DG O6 F0618 : score 2.87 : w : GLN NE2 B0029 <- 5.94 -> DG O6 F0618 : score 2.87 : H : ARG NH1 B0033 <- 3.07 -> DG O6 C0504 : score 5.75483 : H : ARG NH2 B0033 <- 2.91 -> DG N7 C0504 : score 6.24415 : H : ASP OD2 B0035 <- 2.67 -> DC N4 C0502 : score 6.3612 : w : ASP OD1 B0035 <- 5.72 -> DA N6 C0503 : score 3.122 : H : ARG NH1 B0043 <- 2.83 -> DT O4 F0619 : score 3.24834 : w : ARG NH1 B0043 <- 5.57 -> DG O6 F0618 : score 2.756 : w : ARG NH2 B0043 <- 5.19 -> DT O4 F0620 : score 2.366 : H : ARG NH1 B0071 <- 2.96 -> DG N7 C0508 : score 5.8564 : H : ARG NH2 B0071 <- 2.58 -> DG O6 C0508 : score 6.8904 : H : ARG NH2 B0073 <- 2.61 -> DG O6 F0615 : score 6.8508 : w : ASP OD2 B0075 <- 5.68 -> DC N4 D0614 : score 3.623 : H : GLU OE2 B0079 <- 2.95 -> DA N6 F0616 : score 2.95974 : V : ASP CG B0075 <- 3.84 -> DT C7 C0509 : score 2.65625 : x : CYS xxxx B0025 <- 4.49 -> DA xxx F0616 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0031 <- 4.29 -> DT xxx F0619 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0036 <- 3.32 -> DA xxx C0503 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0049 <- 3.44 -> DA xxx F0616 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0074 <- 3.40 -> DT xxx C0509 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0077 <- 3.62 -> DC xxx D0614 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0143 <- 3.04 -> DT xxx C0509 : score x.xxxxx >5a77_AB:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HOMING ENDONUCLEASE I-CVUI IN COMPLEX WITH I- CREI TARGET (C1221) IN THE PRESENCE OF 2 MM MG REVEALING DNA CLEAVED organism=CHLORELLA VULGARIS : H : ARG NH1 A0033 <- 3.17 -> DT O4 E0521 : score 3.02612 : H : ARG NH2 A0033 <- 3.11 -> DT O4 E0521 : score 3.33351 : w : ARG NH1 A0033 <- 5.69 -> DA N6 D0603 : score 1.486 : H : ASP OD2 A0035 <- 3.00 -> DC N4 D0602 : score 5.952 : w : ASP OD1 A0035 <- 6.30 -> DA N6 D0603 : score 3.122 : w : ASP OD2 A0035 <- 6.46 -> DA N6 D0603 : score 3.409 : w : GLN OE1 A0041 <- 6.19 -> DA N6 D0604 : score 3.392 : H : ARG NH1 A0043 <- 2.60 -> DT O4 E0519 : score 3.39867 : w : ARG NH2 A0043 <- 5.01 -> DT O4 E0520 : score 2.366 : w : ARG NH2 A0043 <- 6.31 -> DA N6 D0604 : score 1.997 : H : ARG NH1 A0071 <- 2.99 -> DG N7 D0608 : score 5.8201 : H : ARG NH2 A0071 <- 2.76 -> DG O6 D0608 : score 6.6528 : H : ARG NH1 A0073 <- 3.45 -> DG N7 E0515 : score 5.2635 : H : ARG NH2 A0073 <- 2.74 -> DG O6 E0515 : score 6.6792 : H : GLU OE2 A0079 <- 3.05 -> DA N6 E0516 : score 2.89872 : H : ARG NH1 B0033 <- 2.95 -> DT O4 F0620 : score 3.16991 : H : ARG NH1 B0033 <- 2.99 -> DT O4 F0621 : score 3.14377 : H : ARG NH2 B0033 <- 2.62 -> DT O4 F0621 : score 3.68178 : H : ARG NH1 B0043 <- 2.62 -> DT O4 F0619 : score 3.38559 : H : ARG NH1 B0071 <- 2.85 -> DG N7 C0508 : score 5.9895 : H : ARG NH2 B0071 <- 2.69 -> DG O6 C0508 : score 6.7452 : H : ARG NH1 B0073 <- 3.38 -> DG N7 F0615 : score 5.3482 : H : ARG NH2 B0073 <- 2.86 -> DG O6 F0615 : score 6.5208 : H : GLU OE2 B0079 <- 3.06 -> DA N6 F0616 : score 2.89262 : x : GLN xxxx A0029 <- 2.92 -> DG xxx E0518 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0036 <- 3.26 -> DA xxx D0603 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0049 <- 3.36 -> DG xxx E0515 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0074 <- 3.40 -> DT xxx D0609 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0075 <- 3.73 -> DC xxx C0514 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0077 <- 3.51 -> DC xxx C0514 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0143 <- 2.89 -> DG xxx E0515 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0025 <- 4.22 -> DA xxx F0616 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0029 <- 3.29 -> DG xxx F0618 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0031 <- 4.06 -> DT xxx F0619 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0035 <- 3.40 -> DC xxx C0502 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0036 <- 3.42 -> DA xxx C0503 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0049 <- 3.19 -> DA xxx F0616 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0074 <- 3.54 -> DT xxx C0509 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0075 <- 3.20 -> DT xxx C0509 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0077 <- 3.43 -> DC xxx D0614 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0143 <- 3.08 -> DA xxx F0616 : score x.xxxxx >5a77_B:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HOMING ENDONUCLEASE I-CVUI IN COMPLEX WITH I- CREI TARGET (C1221) IN THE PRESENCE OF 2 MM MG REVEALING DNA CLEAVED organism=CHLORELLA VULGARIS : H : ARG NH1 B0033 <- 2.95 -> DT O4 F0620 : score 3.16991 : H : ARG NH1 B0033 <- 2.99 -> DT O4 F0621 : score 3.14377 : H : ARG NH2 B0033 <- 2.62 -> DT O4 F0621 : score 3.68178 : H : ARG NH1 B0043 <- 2.62 -> DT O4 F0619 : score 3.38559 : H : ARG NH1 B0071 <- 2.85 -> DG N7 C0508 : score 5.9895 : H : ARG NH2 B0071 <- 2.69 -> DG O6 C0508 : score 6.7452 : H : ARG NH1 B0073 <- 3.38 -> DG N7 F0615 : score 5.3482 : H : ARG NH2 B0073 <- 2.86 -> DG O6 F0615 : score 6.5208 : H : GLU OE2 B0079 <- 3.06 -> DA N6 F0616 : score 2.89262 : x : CYS xxxx B0025 <- 4.22 -> DA xxx F0616 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0029 <- 3.29 -> DG xxx F0618 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0031 <- 4.06 -> DT xxx F0619 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0035 <- 3.40 -> DC xxx C0502 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0036 <- 3.42 -> DA xxx C0503 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0049 <- 3.19 -> DA xxx F0616 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0074 <- 3.54 -> DT xxx C0509 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0075 <- 3.20 -> DT xxx C0509 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0077 <- 3.43 -> DC xxx D0614 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0143 <- 3.08 -> DA xxx F0616 : score x.xxxxx >5a78_AB:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HOMING ENDONUCLEASE I-CVUI IN COMPLEX WITH I- CREI TARGET (C1221) IN THE PRESENCE OF 2 MM MG REVEALING DNA NOT CLEAVED organism=CHLORELLA VULGARIS : H : ARG NH1 A0033 <- 3.20 -> DT O4 C0521 : score 3.00651 : H : ARG NH2 A0033 <- 2.82 -> DT O4 C0520 : score 3.53963 : H : ARG NH2 A0033 <- 3.04 -> DT O4 C0521 : score 3.38326 : w : ARG NH1 A0033 <- 5.92 -> DA N6 D0603 : score 1.486 : H : ASP OD2 A0035 <- 3.06 -> DC N4 D0602 : score 5.8776 : w : ASP OD1 A0035 <- 6.51 -> DA N6 D0603 : score 3.122 : w : ASP OD2 A0035 <- 6.33 -> DA N6 D0603 : score 3.409 : w : GLN OE1 A0041 <- 6.09 -> DA N6 D0604 : score 3.392 : H : ARG NH1 A0043 <- 2.64 -> DT O4 C0519 : score 3.37252 : w : ARG NH2 A0043 <- 6.04 -> DA N6 D0604 : score 1.997 : H : ARG NH1 A0071 <- 3.12 -> DG N7 D0608 : score 5.6628 : H : ARG NH2 A0071 <- 2.95 -> DG O6 D0608 : score 6.402 : H : ARG NH2 A0073 <- 3.02 -> DG O6 C0515 : score 6.3096 : H : GLU OE2 A0079 <- 3.06 -> DA N6 C0516 : score 2.89262 : H : LYS NZ A0143 <- 2.91 -> DA N3 C0516 : score 2.71583 : w : GLN NE2 B0029 <- 5.49 -> DG O6 D0618 : score 2.87 : H : ARG NH2 B0033 <- 3.14 -> DT O4 D0621 : score 3.31218 : w : ARG NH2 B0033 <- 5.39 -> DA N7 C0503 : score 1.486 : H : ASP OD2 B0035 <- 2.91 -> DC N4 C0502 : score 6.0636 : w : ASP OD1 B0035 <- 5.40 -> DA N7 C0503 : score 2.429 : w : GLN OE1 B0041 <- 5.57 -> DA N7 C0504 : score 1.196 : H : ARG NH1 B0043 <- 2.74 -> DT O4 D0619 : score 3.30716 : w : ARG NH1 B0043 <- 5.36 -> DG O6 D0618 : score 2.756 : w : ARG NH2 B0043 <- 5.63 -> DA N7 C0504 : score 1.486 : H : ARG NH1 B0071 <- 2.82 -> DG N7 C0508 : score 6.0258 : H : ARG NH2 B0071 <- 2.56 -> DG O6 C0508 : score 6.9168 : H : ARG NH2 B0073 <- 2.71 -> DG O6 D0615 : score 6.7188 : H : GLU OE2 B0079 <- 3.06 -> DA N6 D0616 : score 2.89262 : V : ASP CG B0075 <- 3.53 -> DT C7 C0509 : score 2.86418 : x : GLN xxxx A0029 <- 2.83 -> DG xxx C0518 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0031 <- 4.06 -> DT xxx C0519 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0036 <- 3.37 -> DA xxx D0603 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0049 <- 3.28 -> DG xxx C0515 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0074 <- 3.39 -> DT xxx D0609 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0075 <- 3.59 -> DC xxx C0514 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0077 <- 3.24 -> DC xxx C0514 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0025 <- 4.45 -> DA xxx D0616 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0031 <- 4.02 -> DT xxx D0619 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0036 <- 3.40 -> DA xxx C0503 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0049 <- 3.31 -> DG xxx D0615 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0074 <- 3.67 -> DT xxx C0509 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0077 <- 3.36 -> DC xxx D0614 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0143 <- 1.26 -> DG xxx D0615 : score x.xxxxx >5a78_B:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HOMING ENDONUCLEASE I-CVUI IN COMPLEX WITH I- CREI TARGET (C1221) IN THE PRESENCE OF 2 MM MG REVEALING DNA NOT CLEAVED organism=CHLORELLA VULGARIS : w : GLN NE2 B0029 <- 5.49 -> DG O6 D0618 : score 2.87 : H : ARG NH2 B0033 <- 3.14 -> DT O4 D0621 : score 3.31218 : w : ARG NH2 B0033 <- 5.39 -> DA N7 C0503 : score 1.486 : H : ASP OD2 B0035 <- 2.91 -> DC N4 C0502 : score 6.0636 : w : ASP OD1 B0035 <- 5.40 -> DA N7 C0503 : score 2.429 : w : GLN OE1 B0041 <- 5.57 -> DA N7 C0504 : score 1.196 : H : ARG NH1 B0043 <- 2.74 -> DT O4 D0619 : score 3.30716 : w : ARG NH1 B0043 <- 5.36 -> DG O6 D0618 : score 2.756 : w : ARG NH2 B0043 <- 5.63 -> DA N7 C0504 : score 1.486 : H : ARG NH1 B0071 <- 2.82 -> DG N7 C0508 : score 6.0258 : H : ARG NH2 B0071 <- 2.56 -> DG O6 C0508 : score 6.9168 : H : ARG NH2 B0073 <- 2.71 -> DG O6 D0615 : score 6.7188 : H : GLU OE2 B0079 <- 3.06 -> DA N6 D0616 : score 2.89262 : V : ASP CG B0075 <- 3.53 -> DT C7 C0509 : score 2.86418 : x : CYS xxxx B0025 <- 4.45 -> DA xxx D0616 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0031 <- 4.02 -> DT xxx D0619 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0036 <- 3.40 -> DA xxx C0503 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0049 <- 3.31 -> DG xxx D0615 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0074 <- 3.67 -> DT xxx C0509 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0077 <- 3.36 -> DC xxx D0614 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0143 <- 1.26 -> DG xxx D0615 : score x.xxxxx >5ak9_A:Homing_endonucleases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI Q42AK120M IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA IN THE PRESENCE OF 2MM MN organism=DESULFUROCOCCUS MOBILIS : H : ARG NH1 A0033 <- 2.29 -> DG O6 C0021 : score 6.70383 : H : ARG NH2 A0033 <- 3.24 -> DG N7 C0020 : score 5.82277 : H : GLU OE1 A0035 <- 3.18 -> DC N4 D0006 : score 5.32958 : H : ARG NH1 A0037 <- 2.81 -> DG O6 D0008 : score 6.07117 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.77 -> DG O6 D0007 : score 6.6396 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.76 -> DG O6 D0008 : score 6.6528 : H : ASP OD2 A0075 <- 3.20 -> DC N4 D0011 : score 5.704 : H : THR OG1 A0076 <- 2.94 -> DA N7 B0014 : score 3.31851 : H : THR OG1 A0076 <- 2.90 -> DA N6 B0014 : score 2.70379 : H : ARG NE A0077 <- 3.00 -> DG N7 C0015 : score 4.24492 : H : ARG NH2 A0077 <- 2.80 -> DT O4 C0016 : score 3.55385 : w : ARG NH1 A0077 <- 5.73 -> DA N7 D0009 : score 0.388 : w : ARG NH2 A0077 <- 5.89 -> DA N7 D0009 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0081 <- 3.28 -> DG N7 D0008 : score 5.4692 : H : ARG NH2 A0081 <- 3.17 -> DG N7 D0008 : score 5.91215 : H : ARG NH1 A0124 <- 3.31 -> DG N7 B0006 : score 5.4329 A : H : ARG NH1 A0126 <- 2.77 -> DG O6 D0018 : score 6.11983 : H : ARG NH2 A0126 <- 2.93 -> DG N7 D0018 : score 6.21862 : H : ASP OD2 A0155 <- 2.88 -> DC N4 D0015 : score 6.1008 : H : ARG NH1 A0157 <- 2.88 -> DG N7 B0010 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0157 <- 2.66 -> DG O6 B0010 : score 6.7848 : x : TYR xxxx A0025 <- 3.50 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0027 <- 3.75 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0029 <- 3.36 -> DC xxx C0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0034 <- 3.10 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0039 <- 4.33 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.86 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0070 <- 3.43 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0072 <- 4.11 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0079 <- 3.42 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0083 <- 3.98 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0128 <- 3.56 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0152 <- 3.79 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0154 <- 3.12 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0158 <- 3.41 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0160 <- 4.08 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0167 <- 4.14 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx >5akf_I:Homing_endonucleases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI Q42AK120M IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA NICKED IN THE CODING STRAND A AND IN THE PRESENCE OF 2MM MN organism=DESULFUROCOCCUS MOBILIS : H : ARG NH1 I0033 <- 2.52 -> DG O6 K0021 : score 6.424 : H : ARG NH2 I0033 <- 3.22 -> DG N7 K0020 : score 5.84831 : H : GLU OE1 I0035 <- 2.90 -> DC N4 L0006 : score 5.65259 : H : ARG NH1 I0037 <- 2.83 -> DG O6 L0008 : score 6.04683 : H : ARG NH2 I0037 <- 2.84 -> DG O6 L0007 : score 6.5472 : H : ARG NH2 I0037 <- 2.93 -> DG O6 L0008 : score 6.4284 : w : ARG NH1 I0037 <- 5.74 -> DT O4 K0017 : score 1.768 : H : THR OG1 I0076 <- 2.80 -> DA N7 J0014 : score 3.4141 : H : THR OG1 I0076 <- 2.65 -> DA N6 J0014 : score 2.84174 : H : ARG NE I0077 <- 2.98 -> DG N7 K0015 : score 4.26261 : H : ARG NH2 I0077 <- 2.84 -> DT O4 K0016 : score 3.52542 : w : GLU OE2 I0079 <- 5.46 -> DT O4 K0017 : score 2.279 : H : ARG NH1 I0081 <- 3.15 -> DG N7 L0008 : score 5.6265 : H : ARG NH2 I0081 <- 3.07 -> DG N7 L0008 : score 6.03985 : H : ARG NH1 I0124 <- 2.98 -> DG O6 L0019 : score 5.86433 : H : ARG NH2 I0124 <- 2.56 -> DG O6 L0019 : score 6.9168 : w : ARG NE I0124 <- 5.81 -> DG N7 J0006 : score 1.593 : w : ARG NH2 I0124 <- 5.98 -> DG N7 J0006 : score 2.18 : H : ARG NH1 I0126 <- 2.70 -> DG O6 L0018 : score 6.205 : H : ARG NH2 I0126 <- 2.96 -> DG N7 L0018 : score 6.18031 : w : ARG NH1 I0126 <- 6.18 -> DC N4 J0007 : score 1.892 : H : ASP OD1 I0154 <- 3.18 -> DC N4 J0008 : score 4.93866 : w : ASP OD1 I0154 <- 6.42 -> DC N4 J0007 : score 2.835 : H : ASP OD2 I0155 <- 2.91 -> DC N4 L0015 : score 6.0636 : H : ARG NH1 I0157 <- 3.00 -> DG N7 J0010 : score 5.808 : H : ARG NH2 I0157 <- 2.85 -> DG O6 J0010 : score 6.534 : x : TYR xxxx I0025 <- 3.55 -> DT xxx K0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0027 <- 4.09 -> DT xxx K0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx I0029 <- 3.05 -> DC xxx K0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0034 <- 3.27 -> DG xxx L0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0039 <- 4.37 -> DT xxx K0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0041 <- 3.91 -> DG xxx K0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0070 <- 3.43 -> DG xxx L0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0075 <- 3.45 -> DC xxx L0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0083 <- 3.97 -> DC xxx L0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0128 <- 3.60 -> DC xxx L0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx I0158 <- 3.46 -> DA xxx L0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0160 <- 4.02 -> DC xxx L0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0167 <- 4.47 -> DT xxx J0005 : score x.xxxxx >5akm_A:Homing_endonucleases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI G20S IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA IN THE PRESENCE OF 2MM MG organism=DESULFUROCOCCUS MOBILIS : H : ARG NH1 A0033 <- 2.63 -> DG O6 C0021 : score 6.29017 : H : ARG NH1 A0037 <- 2.81 -> DG O6 D0008 : score 6.07117 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.89 -> DG O6 D0007 : score 6.4812 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.88 -> DG O6 D0008 : score 6.4944 : w : ARG NH1 A0037 <- 6.03 -> DT O4 C0017 : score 1.768 : H : THR OG1 A0076 <- 2.52 -> DA N7 B0014 : score 3.60529 : H : THR OG1 A0076 <- 3.03 -> DA N6 B0014 : score 2.63206 : H : ARG NE A0077 <- 3.07 -> DG N7 C0015 : score 4.18302 : w : GLU OE2 A0079 <- 5.46 -> DT O4 C0017 : score 2.279 : H : ARG NH1 A0081 <- 3.00 -> DG N7 D0008 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0081 <- 3.24 -> DG N7 D0008 : score 5.82277 : H : ASP OD2 A0155 <- 2.70 -> DC N4 D0015 : score 6.324 : x : TYR xxxx A0025 <- 3.62 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0027 <- 4.14 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0029 <- 3.12 -> DC xxx C0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0034 <- 3.54 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0035 <- 3.35 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 4.31 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0070 <- 3.59 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0083 <- 4.07 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0157 <- 3.24 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0158 <- 3.54 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0160 <- 3.87 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx >5akn_K:Homing_endonucleases; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI Q42AK120M IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA NICKED IN THE NON-CODING STRAND B AND IN THE PRESENCE OF 2MM MN organism=DESULFUROCOCCUS MOBILIS : H : ARG NH1 K0033 <- 2.53 -> DG O6 M0021 : score 6.41183 : H : GLU OE1 K0035 <- 2.72 -> DC N4 M1031 : score 5.86024 : H : ARG NH1 K0037 <- 2.82 -> DG O6 M1033 : score 6.059 : H : ARG NH2 K0037 <- 2.70 -> DG O6 M1032 : score 6.732 : w : ARG NH1 K0037 <- 5.46 -> DT O4 M0017 : score 1.768 : H : THR OG1 K0076 <- 3.22 -> DA N7 L0014 : score 3.12732 : H : THR OG1 K0076 <- 2.92 -> DA N6 L0014 : score 2.69276 : H : ARG NH1 K0077 <- 2.85 -> DG N7 M0015 : score 5.9895 : H : ARG NH1 K0077 <- 2.58 -> DG O6 M0015 : score 6.351 : H : ARG NH1 K0077 <- 3.21 -> DT O4 M0016 : score 2.99998 : w : GLU OE2 K0079 <- 5.66 -> DT O4 M0017 : score 2.279 : H : ARG NH1 K0081 <- 3.34 -> DG N7 M1033 : score 5.3966 : H : ARG NH2 K0081 <- 3.08 -> DG N7 M1033 : score 6.02708 : H : ARG NH1 K0124 <- 3.00 -> DG O6 O0019 : score 5.84 : H : ARG NH2 K0124 <- 2.64 -> DG O6 L0006 : score 6.8112 : H : ARG NH1 K0126 <- 2.76 -> DG O6 O0018 : score 6.132 : H : ARG NH2 K0126 <- 2.99 -> DG N7 O0018 : score 6.142 : H : ASP OD1 K0154 <- 3.25 -> DC N4 L0008 : score 4.86383 : H : ASP OD2 K0155 <- 2.92 -> DC N4 M1040 : score 6.0512 : H : ARG NH1 K0157 <- 2.96 -> DG N7 L0010 : score 5.8564 : H : ARG NH2 K0157 <- 2.66 -> DG O6 L0010 : score 6.7848 : x : TYR xxxx K0025 <- 3.54 -> DT xxx M0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx K0027 <- 4.30 -> DT xxx M0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx K0029 <- 3.29 -> DC xxx M0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0034 <- 3.34 -> DG xxx M1029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx K0041 <- 4.13 -> DG xxx M0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx K0070 <- 3.49 -> DG xxx M1032 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx K0072 <- 4.44 -> DG xxx M1033 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx K0075 <- 3.62 -> DC xxx M1036 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0083 <- 3.92 -> DC xxx M1030 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx K0128 <- 3.61 -> DC xxx O0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx K0158 <- 3.62 -> DA xxx M1039 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx K0160 <- 4.17 -> DC xxx M1040 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx K0167 <- 4.42 -> DT xxx L0005 : score x.xxxxx >5av5_A:Histone-fold; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.50 -> DA N3 J0009 : score 3.43413 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.20 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.71 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.66 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx >5av5_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.50 -> DA N3 J0009 : score 3.43413 : H : ARG NH1 D0029 <- 3.16 -> DT O2 J-029 : score 3.99635 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.84 -> DA N3 I0009 : score 3.21383 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.20 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.71 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.66 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.13 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.44 -> DA xxx J0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0030 <- 3.70 -> DG xxx J0049 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.32 -> DT xxx I-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.07 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.07 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.17 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.81 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >5av6_A:Histone-fold; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.46 -> DA N3 J0009 : score 3.46005 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.27 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.88 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.52 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx >5av6_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.46 -> DA N3 J0009 : score 3.46005 : H : ARG NH1 D0029 <- 2.65 -> DT O2 J-029 : score 4.4356 : H : ARG NH2 D0029 <- 3.22 -> DT O2 J-029 : score 3.87773 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.80 -> DA N3 I0009 : score 3.23974 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.27 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.88 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.52 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.26 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0030 <- 3.98 -> DG xxx J0049 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.31 -> DT xxx I-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.16 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.68 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.11 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 4.37 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >5av8_A:Histone-fold; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.46 -> DA N3 J0009 : score 3.46005 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.26 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.80 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.71 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx >5av8_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.46 -> DA N3 J0009 : score 3.46005 : H : ARG NH1 D0029 <- 2.79 -> DT O2 J-029 : score 4.31502 : H : ARG NH2 D0029 <- 3.11 -> DT O2 J-029 : score 3.97087 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.79 -> DA N3 I0009 : score 3.24622 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.26 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.80 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.71 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.18 -> DG xxx I-006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0030 <- 3.43 -> DG xxx J0049 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.34 -> DT xxx I-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.85 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.92 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.11 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 4.01 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >5av9_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.59 -> DA N3 J0009 : score 3.37581 : H : ARG NH1 D0029 <- 2.76 -> DT O2 J-029 : score 4.34086 : H : ARG NH2 D0029 <- 3.24 -> DT O2 J-029 : score 3.8608 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.84 -> DA N3 I0009 : score 3.21383 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.28 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.91 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.49 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.22 -> DG xxx I-006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0030 <- 3.69 -> DG xxx J0049 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.30 -> DT xxx I-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.04 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.63 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.15 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx >5av9_F:Histone-fold; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=? : x : ARG xxxx F0045 <- 4.15 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx >5avb_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.51 -> DA N3 J0009 : score 3.42765 : H : ARG NH1 D0029 <- 3.38 -> DT O2 J-029 : score 3.80687 : H : ARG NH2 D0029 <- 3.36 -> DT O2 J-029 : score 3.7592 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.86 -> DA N3 I0009 : score 3.20087 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.27 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.81 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.68 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.15 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.44 -> DA xxx J0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0030 <- 4.32 -> DG xxx J0049 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.44 -> DT xxx I-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.12 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.17 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.08 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.95 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >5avb_H:Histone-fold; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=? : x : ARG xxxx H0033 <- 3.95 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >5avc_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.55 -> DA N3 J0009 : score 3.40173 : H : ARG NH1 D0029 <- 3.32 -> DT O2 J-029 : score 3.85854 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.82 -> DA N3 I0009 : score 3.22678 : H : ARG NH2 H0033 <- 3.05 -> DC O2 J-048 : score 3.51378 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.33 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.78 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.58 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.16 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0030 <- 4.29 -> DG xxx J0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.47 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.49 -> DA xxx I-069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.30 -> DT xxx I-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.14 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.03 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.13 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx >5awh_B:Ribonuclease_H-like; title=RHODOBACTER SPHAEROIDES ARGONAUTE IN COMPLEX WITH GUIDE RNA/TARGET DNA HETERODUPLEX organism=Rhodobacter sphaeroides : H : TYR OH B0329 <- 2.97 -> DA N6 F0018 : score 4.51172 : w : GLU OE1 B0532 <- 6.25 -> DG N2 F0008 : score 1.283 : w : ARG NH2 B0606 <- 5.46 -> DG N3 F0008 : score 0.677 : w : LYS NZ B0692 <- 5.30 -> DT O2 F0016 : score 0.522 : x : PRO xxxx B0045 <- 3.37 -> DG xxx F0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0063 <- 3.43 -> DG xxx F0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0245 <- 3.70 -> DG xxx F0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0341 <- 3.54 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0491 <- 4.23 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0494 <- 3.55 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0495 <- 4.19 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0498 <- 3.70 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0541 <- 3.82 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0640 <- 4.17 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0670 <- 3.70 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0687 <- 4.31 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0689 <- 3.11 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0690 <- 3.38 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0727 <- 4.06 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0734 <- 3.79 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0735 <- 4.05 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx >5axw_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF STAPHYLOCOCCUS AUREUS CAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA (TTGGGT PAM) organism=Staphylococcus aureus subsp. aureus : H : ASN ND2 A0985 <- 2.66 -> DG N7 D0004 : score 4.7143 : w : ASN OD1 A0985 <- 5.51 -> DG O6 D0005 : score 3.125 : w : ASN OD1 A0985 <- 6.19 -> DG O6 D0005 : score 3.125 : w : ASN ND2 A0986 <- 6.52 -> DG O6 D0005 : score 2.971 : H : ARG NH2 A0991 <- 2.41 -> DT O4 D0006 : score 3.83105 : w : ARG NH2 A0991 <- 6.07 -> DG O6 D0005 : score 2.468 : H : ARG NH1 A1015 <- 2.64 -> DG O6 D0003 : score 6.278 : H : ARG NH2 A1015 <- 3.03 -> DG N7 D0003 : score 6.09092 : V : LEU CD2 A0989 <- 3.76 -> DT C7 D0006 : score 5.78859 : x : ARG xxxx A1002 <- 4.22 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1013 <- 4.02 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx >5ay8_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NUCLEOSOME CONTAINING H3.Y organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0040 <- 3.27 -> DA N3 J0229 : score 3.33594 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.15 -> DA N3 I0082 : score 3.01296 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.76 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.28 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.83 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.84 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.05 -> DG xxx J0290 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.81 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.46 -> DA xxx I0099 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.11 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx >5ay8_E:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NUCLEOSOME CONTAINING H3.Y organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 E0040 <- 3.15 -> DA N3 I0082 : score 3.01296 : x : HIS xxxx E0039 <- 4.05 -> DG xxx J0290 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.81 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.46 -> DA xxx I0099 : score x.xxxxx >5b0y_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING HISTONE H3 WITH THE CROTONYLATED LYSINE 122 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.73 -> DA N3 J0229 : score 3.2851 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.71 -> DA N3 I0082 : score 3.29806 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.41 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.05 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.72 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.00 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.88 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.34 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.76 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.83 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.09 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx >5b0z_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING H3.2, AT 1.98 A RESOLUTION organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.64 -> DA N3 J0229 : score 3.34342 : w : ARG NH1 C0077 <- 5.46 -> DG N3 J0277 : score 1.593 : w : ARG NH2 C0077 <- 5.70 -> DG N3 J0277 : score 0.677 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.98 -> DA N3 I0082 : score 3.12311 : w : ARG NH2 F0045 <- 5.71 -> DT O2 I0080 : score 2.261 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.32 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.84 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.00 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.27 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.90 -> DG xxx J0268 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.17 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.95 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.83 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.88 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0032 <- 4.40 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.47 -> DA xxx I0111 : score x.xxxxx >5b0z_G:Histone-fold; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING H3.2, AT 1.98 A RESOLUTION organism=? : x : ARG xxxx G0042 <- 4.47 -> DA xxx I0111 : score x.xxxxx >5b1l_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE MOUSE NUCLEOSOME STRUCTURE CONTAINING H3T organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.61 -> DA N3 J0229 : score 3.36285 : H : ARG NH2 C0011 <- 2.85 -> DT O2 J0263 : score 4.191 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.75 -> DA N3 I0082 : score 3.27214 : H : ARG NH1 E0083 <- 3.22 -> DC O2 J0196 : score 3.3434 : w : ARG NH1 G0042 <- 5.79 -> DT O2 J0184 : score 1.855 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.32 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0043 <- 4.30 -> DA xxx I0067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.61 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.66 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.67 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.44 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.33 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.04 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.47 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.88 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.71 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >5b1l_B:Histone-fold; title=THE MOUSE NUCLEOSOME STRUCTURE CONTAINING H3T organism=? : x : ARG xxxx B0045 <- 3.67 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx >5b1m_A:Histone-fold; title=THE MOUSE NUCLEOSOME STRUCTURE CONTAINING H3.1 organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.41 -> DA N3 J0229 : score 3.49244 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.33 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx >5b1m_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE MOUSE NUCLEOSOME STRUCTURE CONTAINING H3.1 organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.41 -> DA N3 J0229 : score 3.49244 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.41 -> DA N3 I0082 : score 3.23284 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.33 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.01 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 4.10 -> DA xxx I0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.23 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.41 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.14 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.01 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.23 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0032 <- 4.40 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.20 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx >5b24_A:Histone-fold; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING CYCLOBUTANE PYRIMIDINE DIMER organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0039 <- 4.20 -> DT xxx J0151 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 3.25 -> DA xxx J0228 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.94 -> DA xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.21 -> DT xxx J0237 : score x.xxxxx >5b24_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING CYCLOBUTANE PYRIMIDINE DIMER organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0039 <- 4.20 -> DT xxx J0151 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 3.25 -> DA xxx J0228 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.94 -> DA xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.21 -> DT xxx J0237 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 4.27 -> DG xxx I0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.79 -> DT xxx J0257 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.47 -> DG xxx J0275 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.23 -> DG xxx J0266 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.46 -> DT xxx J0287 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.29 -> DA xxx I0082 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.82 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.18 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.08 -> DT xxx I0129 : score x.xxxxx >5b2i_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=HUMAN NUCLEOSOME CONTAINING CPG UNMETHYLATED DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.39 -> DA N3 J0009 : score 2.85745 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.46 -> DA xxx J-069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.74 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.55 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.89 -> DA xxx J0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.39 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.40 -> DA xxx J0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0026 <- 3.30 -> DT xxx J-029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.11 -> DG xxx J0047 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.44 -> DT xxx J0069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.33 -> DG xxx I0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.31 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.89 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx >5b2i_C:Histone-fold; title=HUMAN NUCLEOSOME CONTAINING CPG UNMETHYLATED DNA organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx C0042 <- 4.40 -> DA xxx J0037 : score x.xxxxx >5b2j_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=HUMAN NUCLEOSOME CONTAINING CPG METHYLATED DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.01 -> DA N3 J0009 : score 3.10367 : H : ARG NH2 D0026 <- 2.84 -> DT O2 J-029 : score 4.19947 : H : ARG NH1 D0030 <- 3.17 -> DG N3 J0048 : score 2.82667 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.73 -> DA N3 I0009 : score 3.2851 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.19 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.62 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.22 -> DA xxx I-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.08 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.48 -> DA xxx J0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.41 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.95 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx >5b2o_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF FRANCISELLA NOVICIDA CAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA (TGG PAM) organism=FRANCISELLA TULARENSIS SUBSP. NOVICIDA U112 : w : ARG NH1 A1241 <- 5.53 -> DC O2 C0008 : score 1.381 : w : ARG NH2 A1241 <- 5.77 -> DC O2 C0008 : score 1.669 : w : GLU OE1 A1449 <- 5.30 -> DC O2 C0008 : score 2.68 : H : SER OG A1473 <- 2.69 -> DG N3 D0002 : score 2.83277 : H : ARG NH1 A1556 <- 3.04 -> DG N7 D0003 : score 5.7596 : H : ARG NH2 A1556 <- 2.89 -> DG O6 D0003 : score 6.4812 : w : ARG NH2 A1556 <- 5.85 -> DA N6 C0006 : score 1.997 : H : ARG NH1 A1585 <- 3.01 -> DG O6 D0002 : score 5.82783 : H : ARG NH2 A1585 <- 2.95 -> DG N7 D0002 : score 6.19308 : x : ASP xxxx A1472 <- 3.67 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1474 <- 3.29 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1555 <- 3.42 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1586 <- 3.47 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx >5b2p_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF FRANCISELLA NOVICIDA CAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA (TGA PAM) organism=FRANCISELLA TULARENSIS SUBSP. NOVICIDA U112 : w : ARG NH1 A1241 <- 5.68 -> DC O2 C0008 : score 1.381 : w : ARG NH2 A1241 <- 5.82 -> DC O2 C0008 : score 1.669 : w : GLU OE1 A1449 <- 5.31 -> DC O2 C0008 : score 2.68 : H : SER OG A1473 <- 2.75 -> DG N3 D0002 : score 2.79951 : H : ARG NH1 A1556 <- 2.98 -> DA N7 D0003 : score 2.46809 : H : ARG NH1 A1585 <- 3.02 -> DG O6 D0002 : score 5.81567 : H : ARG NH2 A1585 <- 2.88 -> DG N7 D0002 : score 6.28246 : x : ASP xxxx A1472 <- 3.54 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1474 <- 3.24 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1555 <- 3.62 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1586 <- 3.53 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx >5b2q_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF FRANCISELLA NOVICIDA CAS9 RHA IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA (TGG PAM) organism=FRANCISELLA TULARENSIS SUBSP. NOVICIDA U112 : w : ARG NH1 A1241 <- 5.75 -> DC O2 C0008 : score 1.381 : w : LYS NZ A1451 <- 5.80 -> DG N3 D0003 : score 2.232 : H : SER OG A1473 <- 2.99 -> DG N3 D0002 : score 2.66647 : H : ARG NH1 A1585 <- 2.70 -> DG O6 D0002 : score 6.205 : H : ARG NH2 A1585 <- 2.82 -> DG N7 D0002 : score 6.35908 : x : ASP xxxx A1472 <- 3.44 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1474 <- 3.23 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1555 <- 3.34 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1586 <- 3.38 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx >5b2r_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE STREPTOCOCCUS PYOGENES CAS9 VQR VARIANT IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA (TGA PAM) organism=Streptococcus pyogenes serotype M1 : H : LYS NZ B1107 <- 2.85 -> DC O2 C0007 : score 2.91669 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.27 -> DG N7 D0006 : score 5.4813 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.78 -> DG O6 D0006 : score 6.6264 : w : ARG NH2 B1333 <- 5.90 -> DT O4 C0006 : score 2.366 : H : GLN OE1 B1335 <- 2.85 -> DA N6 D0007 : score 5.99204 : H : GLN NE2 B1335 <- 3.25 -> DA N7 D0007 : score 5.54167 : w : GLN OE1 B1335 <- 6.49 -> DC N4 C0005 : score 3.488 : H : ARG NH1 B1337 <- 2.91 -> DG N7 D0008 : score 5.9169 : H : ARG NH2 B1337 <- 2.81 -> DG O6 D0008 : score 6.5868 : x : GLU xxxx B1219 <- 3.88 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx >5b2s_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE STREPTOCOCCUS PYOGENES CAS9 EQR VARIANT IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA (TGAG PAM) organism=Streptococcus pyogenes serotype M1 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.34 -> DG N7 D0006 : score 5.3966 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.70 -> DG O6 D0006 : score 6.732 : H : GLN OE1 B1335 <- 2.76 -> DA N6 D0007 : score 6.10098 : H : GLN NE2 B1335 <- 3.32 -> DA N7 D0007 : score 5.45641 : w : GLN OE1 B1335 <- 6.12 -> DC N4 C0005 : score 3.488 : H : ARG NH1 B1337 <- 2.84 -> DG N7 D0008 : score 6.0016 : H : ARG NH2 B1337 <- 2.91 -> DG O6 D0008 : score 6.4548 : x : LYS xxxx B1107 <- 3.55 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1219 <- 3.92 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx >5b2t_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE STREPTOCOCCUS PYOGENES CAS9 VRER VARIANT IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA (TGCG PAM) organism=Streptococcus pyogenes serotype M1 : H : LYS NZ B1107 <- 2.86 -> DC O2 C0007 : score 2.9108 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.26 -> DG N7 D0006 : score 5.4934 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.56 -> DG O6 D0006 : score 6.9168 : H : GLU OE2 B1335 <- 2.80 -> DC N4 D0007 : score 5.26538 : w : GLU OE2 B1335 <- 6.06 -> DC N4 C0005 : score 3.597 : H : ARG NH1 B1337 <- 2.84 -> DG N7 D0008 : score 6.0016 : H : ARG NH2 B1337 <- 2.81 -> DG O6 D0008 : score 6.5868 : w : ARG NH2 B1337 <- 5.85 -> DT O4 C0004 : score 2.366 : x : GLU xxxx B1219 <- 3.84 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx >5b31_A:Histone-fold; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETEROTYPIC H2AZ/H2A NUCLEOSOME WITH H3.1. organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.83 -> DA N3 J0229 : score 3.22031 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.23 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.65 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx >5b31_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETEROTYPIC H2AZ/H2A NUCLEOSOME WITH H3.1. organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.83 -> DA N3 J0229 : score 3.22031 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.78 -> DA N3 I0082 : score 3.2527 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.23 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.65 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.05 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.62 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.24 -> DG xxx J0277 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.37 -> DT xxx J0289 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.26 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.11 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.32 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.16 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0080 <- 4.00 -> DT xxx I0130 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0039 <- 4.09 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >5b32_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETEROTYPIC H2AZ/H2A NUCLEOSOME WITH H3.3. organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.66 -> DA N3 J0229 : score 3.33046 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.54 -> DA N3 I0082 : score 3.40821 : w : TYR OH E0041 <- 5.27 -> DT O2 I0006 : score 3.068 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.48 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.17 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.69 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.06 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.19 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 3.63 -> DT xxx J0264 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.88 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.40 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.78 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.73 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.46 -> DG xxx J0214 : score x.xxxxx >5b32_D:Histone-fold; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETEROTYPIC H2AZ/H2A NUCLEOSOME WITH H3.3. organism=HOMO SAPIENS : x : ILE xxxx D0039 <- 4.40 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx >5b33_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE H2AZ NUCLEOSOME WITH H3.3. organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.82 -> DA N3 J0229 : score 3.22678 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.79 -> DA N3 I0082 : score 3.24622 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.43 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.56 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.16 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.05 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0045 <- 4.12 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.05 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.72 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.18 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0045 <- 4.43 -> DA xxx I0110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0080 <- 3.86 -> DT xxx I0130 : score x.xxxxx >5b40_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE NUCLEOSOME STRUCTURE CONTAINING H2B-K120 AND H4-K31 MONOUBIQUITINATIONS organism=HOMO SAPIENS : x : TYR xxxx A0041 <- 3.95 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0049 <- 3.74 -> DT xxx J0154 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.23 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.18 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.52 -> DT xxx I0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.26 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.06 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.74 -> DG xxx J0214 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.21 -> DT xxx J0184 : score x.xxxxx >5b43_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF ACIDAMINOCOCCUS SP. CPF1 IN COMPLEX WITH CRRNA AND TARGET DNA organism=Acidaminococcus sp. BV3L6 : w : SER OG A0542 <- 6.54 -> DA N7 C0002 : score 2.343 : H : LYS NZ A0548 <- 3.21 -> DA N7 C0003 : score 2.69633 : w : ASN OD1 A0552 <- 6.83 -> DA N7 C0002 : score 2.277 : H : LYS NZ A0607 <- 3.16 -> DA N3 C0003 : score 2.57698 : H : LYS NZ A0607 <- 2.89 -> DT O2 D-002 : score 3.52261 : x : THR xxxx A0167 <- 3.81 -> DT xxx D-003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0539 <- 3.91 -> DT xxx D-004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0599 <- 4.46 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0603 <- 3.67 -> DA xxx D-001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0604 <- 3.66 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx >5b7j_A: title=STRUCTURE MODEL OF SAP1-DNA COMPLEX organism=? : H : ASN OD1 A0083 <- 2.72 -> DA N6 C0216 : score 6.11814 : V : ILE CG2 A0086 <- 3.72 -> DT C7 C0217 : score 7.23311 : x : LYS xxxx A0026 <- 2.61 -> DT xxx C0222 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0082 <- 4.07 -> DT xxx C0215 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0084 <- 3.38 -> DA xxx B0207 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.19 -> DC xxx B0206 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0090 <- 3.01 -> DT xxx C0218 : score x.xxxxx >5bk4_C:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MCM2-7 DOUBLE HEXAMER ON DSDNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx C0449 <- 3.07 -> DG xxx S-022 : score x.xxxxx >5bmz_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PUTATIVE MARR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR HCAR FROM ACINETOBACTER SP. ADP COMPLEXED WITH 24MER DNA. organism=? : H : ARG NH2 A0098 <- 2.39 -> DT O2 F0009 : score 4.58047 : x : ASN xxxx A0060 <- 3.63 -> DT xxx E-006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0070 <- 4.30 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0071 <- 4.19 -> DT xxx E-006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0072 <- 2.84 -> DT xxx E-006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0073 <- 3.78 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0075 <- 3.71 -> DT xxx E-006 : score x.xxxxx >5bmz_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF PUTATIVE MARR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR HCAR FROM ACINETOBACTER SP. ADP COMPLEXED WITH 24MER DNA. organism=? : H : ARG NH2 A0098 <- 2.39 -> DT O2 F0009 : score 4.58047 : H : LYS NZ B0076 <- 2.91 -> DA N7 E0002 : score 2.87256 : H : ARG NH2 B0098 <- 2.32 -> DT O2 E0009 : score 4.63973 : V : GLN CG B0072 <- 3.56 -> DT C7 E0004 : score 3.45071 : x : ASN xxxx A0060 <- 3.63 -> DT xxx E-006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0070 <- 4.30 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0071 <- 4.19 -> DT xxx E-006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0072 <- 2.84 -> DT xxx E-006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0073 <- 3.78 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0075 <- 3.71 -> DT xxx E-006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0060 <- 3.98 -> DT xxx F-006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0070 <- 4.01 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0071 <- 4.13 -> DT xxx F-006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0073 <- 3.77 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0075 <- 3.85 -> DT xxx F-006 : score x.xxxxx >5bmz_CD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF PUTATIVE MARR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR HCAR FROM ACINETOBACTER SP. ADP COMPLEXED WITH 24MER DNA. organism=? : H : ARG NH1 C0098 <- 2.97 -> DT O2 G-008 : score 4.15999 : H : ARG NH2 C0098 <- 2.91 -> DT O2 H0009 : score 4.1402 : H : ARG NH2 C0098 <- 2.96 -> DT O2 G-008 : score 4.09787 : V : PRO CB D0071 <- 3.76 -> DT C7 H-006 : score 5.86422 : V : GLN CG C0072 <- 3.58 -> DT C7 H0004 : score 3.43443 : V : GLN CG D0072 <- 3.59 -> DT C7 G0004 : score 3.42629 : x : ASN xxxx C0060 <- 3.80 -> DT xxx G-006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0071 <- 4.12 -> DT xxx G-006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0073 <- 3.30 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0075 <- 3.99 -> DT xxx G-006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0060 <- 3.45 -> DT xxx H-006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0070 <- 3.75 -> DT xxx G0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0073 <- 3.25 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0076 <- 3.06 -> DA xxx G0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0098 <- 3.55 -> DT xxx H-008 : score x.xxxxx >5bng_B:Homeodomain-like; title=MONOMER OF TALE TYPE HOMEOBOX TRANSCRIPTION FACTOR MEIS1 COMPLEXES WITH SPECIFIC DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0054 <- 2.94 -> DG N7 L0032 : score 5.8806 : H : ARG NH2 B0054 <- 2.68 -> DG O6 L0032 : score 6.7584 : H : ARG NH1 B0055 <- 3.33 -> DG N7 M0005 : score 5.4087 : V : ILE CG2 B0050 <- 3.65 -> DT C7 L0031 : score 7.3572 : x : ASN xxxx B0047 <- 3.89 -> DC xxx M0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0051 <- 3.59 -> DA xxx M0006 : score x.xxxxx >5bol_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA TERNARY COMPLEX WITH A TEMPLATING 5CLC AND INCOMING DGTP ANALOG organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.20 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.83 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.56 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5bom_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA BINARY COMPLEX WITH A TEMPLATING 5CLC organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.72 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.53 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5box_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Phospholipase_D/nuclease; title=STRUCTURE OF TRMBL2, AN ARCHAEAL CHROMATIN PROTEIN, SHOWS A NOVEL MODE OF DNA BINDING. organism=Pyrococcus furiosus : H : ARG NH1 A0048 <- 3.21 -> DA N7 E0019 : score 2.35032 : x : TYR xxxx A0019 <- 3.63 -> DA xxx E0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0045 <- 3.97 -> DT xxx E0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0047 <- 3.41 -> DT xxx E0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0050 <- 4.12 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx >5box_ABCD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Phospholipase_D/nuclease; title=STRUCTURE OF TRMBL2, AN ARCHAEAL CHROMATIN PROTEIN, SHOWS A NOVEL MODE OF DNA BINDING. organism=Pyrococcus furiosus : H : ARG NH1 A0048 <- 3.21 -> DA N7 E0019 : score 2.35032 : H : ARG NH1 B0048 <- 3.20 -> DA N7 F0019 : score 2.35544 : V : PRO CB C0045 <- 3.53 -> DT C7 F0017 : score 6.19807 : V : PRO CG D0045 <- 3.55 -> DT C7 E0017 : score 6.75641 : x : TYR xxxx A0019 <- 3.63 -> DA xxx E0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0045 <- 3.97 -> DT xxx E0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0047 <- 3.41 -> DT xxx E0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0050 <- 4.12 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0019 <- 3.68 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0045 <- 4.07 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0047 <- 3.33 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0050 <- 3.32 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0019 <- 3.86 -> DA xxx F0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0047 <- 3.11 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0048 <- 3.71 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0050 <- 3.23 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0019 <- 3.87 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0047 <- 3.42 -> DA xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0048 <- 3.97 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0050 <- 3.21 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx >5bpc_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA TERNARY COMPLEX WITH A TEMPLATING 5CLC AND INCOMING DATP ANALOG organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.31 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.84 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.41 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5bpd_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Phospholipase_D/nuclease; title=STRUCTURE OF TRMBL2, AN ARCHAEAL CHROMATIN PROTEIN, SHOWS A NOVEL MODE OF DNA BINDING. organism=PYROCOCCUS FURIOSUS : w : ASP OD2 A0051 <- 6.36 -> DT O4 F0005 : score 2.798 : V : PRO CB A0045 <- 3.66 -> DT C7 E0018 : score 6.00937 : x : TYR xxxx A0019 <- 3.62 -> DA xxx E0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0047 <- 3.07 -> DA xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0048 <- 3.18 -> DA xxx E0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0050 <- 3.34 -> DA xxx F0002 : score x.xxxxx >5bpd_ABCD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Phospholipase_D/nuclease; title=STRUCTURE OF TRMBL2, AN ARCHAEAL CHROMATIN PROTEIN, SHOWS A NOVEL MODE OF DNA BINDING. organism=PYROCOCCUS FURIOSUS : w : ASP OD2 A0051 <- 6.36 -> DT O4 F0005 : score 2.798 : H : ARG NH1 B0048 <- 3.31 -> DA N7 F0017 : score 2.29911 : w : ASP OD2 B0051 <- 5.91 -> DT O4 E0005 : score 2.798 : V : PRO CG C0045 <- 3.66 -> DT C7 F0015 : score 6.58154 : V : PRO CB B0045 <- 3.81 -> DT C7 F0018 : score 5.79164 : V : PRO CG D0045 <- 3.78 -> DT C7 E0015 : score 6.39077 : V : PRO CB A0045 <- 3.66 -> DT C7 E0018 : score 6.00937 : x : TYR xxxx A0019 <- 3.62 -> DA xxx E0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0047 <- 3.07 -> DA xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0048 <- 3.18 -> DA xxx E0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0050 <- 3.34 -> DA xxx F0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0019 <- 3.64 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0047 <- 3.29 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0050 <- 2.98 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0019 <- 3.95 -> DA xxx F0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0047 <- 3.16 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0048 <- 4.36 -> DG xxx F0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0050 <- 3.12 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0019 <- 4.00 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0047 <- 3.21 -> DA xxx E0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0048 <- 4.12 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0050 <- 3.16 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx >5bpi_ABCD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Phospholipase_D/nuclease; title=STRUCTURE OF TRMBL2, AN ARCHAEAL CHROMATIN PROTEIN, SHOWS A NOVEL MODE OF DNA BINDING. organism=PYROCOCCUS FURIOSUS : V : PRO CG C0045 <- 3.76 -> DT C7 F0015 : score 6.42256 : V : PRO CG B0045 <- 3.72 -> DT C7 F0018 : score 6.48615 : V : PRO CB D0045 <- 3.63 -> DT C7 E0015 : score 6.05292 : x : TYR xxxx A0019 <- 3.85 -> DA xxx E0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0045 <- 3.47 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0047 <- 3.16 -> DA xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0048 <- 3.76 -> DA xxx E0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0050 <- 3.49 -> DA xxx F0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0019 <- 3.48 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0047 <- 2.95 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0048 <- 3.22 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0050 <- 3.14 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0019 <- 3.89 -> DA xxx F0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0047 <- 3.21 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0048 <- 4.07 -> DG xxx F0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0050 <- 3.25 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0019 <- 4.08 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0047 <- 3.36 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0048 <- 3.79 -> DA xxx E0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0050 <- 3.16 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx >5bpi_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Phospholipase_D/nuclease; title=STRUCTURE OF TRMBL2, AN ARCHAEAL CHROMATIN PROTEIN, SHOWS A NOVEL MODE OF DNA BINDING. organism=PYROCOCCUS FURIOSUS : V : PRO CG C0045 <- 3.76 -> DT C7 F0015 : score 6.42256 : x : TYR xxxx C0019 <- 3.89 -> DA xxx F0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0047 <- 3.21 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0048 <- 4.07 -> DG xxx F0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0050 <- 3.25 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx >5bs3_BD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S.A. GYRASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 7 organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : x : ARG xxxx B0458 <- 3.78 -> G xxx E0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0460 <- 3.42 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1085 <- 3.38 -> A xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1088 <- 4.28 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1092 <- 3.67 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1175 <- 3.53 -> G xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0458 <- 3.99 -> G xxx F0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0460 <- 3.57 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D1085 <- 3.32 -> A xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1122 <- 4.37 -> G xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D1175 <- 3.36 -> C xxx E0016 : score x.xxxxx >5bs3_D:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S.A. GYRASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 7 organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : x : ARG xxxx D0458 <- 3.99 -> G xxx F0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0460 <- 3.57 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D1085 <- 3.32 -> A xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1122 <- 4.37 -> G xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D1175 <- 3.36 -> C xxx E0016 : score x.xxxxx >5bs8_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : w : TYR OH A0031 <- 5.29 -> DT O2 F0017 : score 3.068 : x : SER xxxx A0091 <- 4.34 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 4.10 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0181 <- 3.29 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx >5bs8_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : w : TYR OH A0031 <- 5.29 -> DT O2 F0017 : score 3.068 : w : TYR OH C0031 <- 5.90 -> DG N3 E0017 : score 3.344 : x : SER xxxx A0091 <- 4.34 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 4.10 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0181 <- 3.29 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0484 <- 3.60 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0128 <- 4.07 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0181 <- 3.27 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0484 <- 3.50 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx >5bs8_D:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : x : LYS xxxx D0484 <- 3.50 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx >5bt2_A:DNA-binding_domain; title=MECP2 MBD DOMAIN (A140V) IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0111 <- 2.86 -> DG N7 B0009 : score 5.9774 : H : ARG NH2 A0111 <- 2.84 -> DG O6 B0009 : score 6.5472 : w : SER OG A0116 <- 5.68 -> DG O6 B0010 : score 2.749 : w : ASP OD1 A0121 <- 5.67 -> DC N4 C0032 : score 2.835 : w : TYR OH A0123 <- 6.51 -> DA N6 B0007 : score 2.545 : H : ARG NH1 A0133 <- 3.22 -> DG N7 C0034 : score 5.5418 : H : ARG NH2 A0133 <- 2.59 -> DG O6 C0034 : score 6.8772 >5bta_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : w : SER OG A0090 <- 5.56 -> DG O6 E0011 : score 2.749 : x : TYR xxxx A0031 <- 4.29 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0091 <- 4.25 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 3.50 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0181 <- 3.28 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0484 <- 3.61 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0091 <- 4.44 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0128 <- 3.69 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0181 <- 3.29 -> DA xxx E0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0484 <- 3.69 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx >5bta_C:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : x : SER xxxx C0091 <- 4.44 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0128 <- 3.69 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0181 <- 3.29 -> DA xxx E0019 : score x.xxxxx >5btc_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : w : SER OG A0090 <- 5.61 -> DG O6 E0011 : score 2.749 : w : TYR OH C0031 <- 5.89 -> DG N3 E0017 : score 3.344 : w : LYS NZ C0049 <- 6.42 -> DG N3 F0007 : score 2.232 : x : SER xxxx A0091 <- 4.22 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 3.79 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0181 <- 3.34 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0484 <- 3.52 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0090 <- 4.49 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0091 <- 4.31 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0128 <- 3.90 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0181 <- 3.28 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0484 <- 3.64 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx >5btc_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : x : LYS xxxx B0484 <- 3.52 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx >5btd_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : w : TYR OH A0031 <- 5.90 -> DT O2 F0017 : score 3.068 : x : SER xxxx A0091 <- 3.98 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 3.84 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0181 <- 3.47 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx >5btd_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : w : TYR OH A0031 <- 5.90 -> DT O2 F0017 : score 3.068 : x : SER xxxx A0091 <- 3.98 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 3.84 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0181 <- 3.47 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0484 <- 3.58 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0091 <- 4.35 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0128 <- 4.13 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0181 <- 3.42 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0484 <- 3.52 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx >5btf_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : w : SER OG A0090 <- 5.27 -> DG O6 E0011 : score 2.749 : x : SER xxxx A0091 <- 4.13 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 3.70 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0181 <- 3.38 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx >5btf_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : w : SER OG A0090 <- 5.27 -> DG O6 E0011 : score 2.749 : x : SER xxxx A0091 <- 4.13 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 3.70 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0181 <- 3.38 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0484 <- 3.64 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0090 <- 4.47 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0091 <- 4.49 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0128 <- 3.73 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0181 <- 3.29 -> DA xxx E0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0484 <- 3.67 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx >5btg_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : w : TYR OH A0031 <- 5.53 -> DT O2 F0017 : score 3.068 : V : SER CB A0091 <- 3.89 -> DT C7 E0010 : score 3.06083 : x : ARG xxxx A0128 <- 3.34 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0181 <- 3.28 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0484 <- 3.62 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0091 <- 4.25 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0128 <- 3.99 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0181 <- 3.32 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0484 <- 3.58 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx >5btg_D:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : x : LYS xxxx D0484 <- 3.58 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx >5bti_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : w : TYR OH A0031 <- 5.66 -> DT O2 F0017 : score 3.068 : w : SER OG A0090 <- 5.34 -> DG O6 E0011 : score 2.749 : x : SER xxxx A0091 <- 4.10 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0181 <- 3.28 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx >5bti_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : w : TYR OH A0031 <- 5.66 -> DT O2 F0017 : score 3.068 : w : SER OG A0090 <- 5.34 -> DG O6 E0011 : score 2.749 : x : SER xxxx A0091 <- 4.10 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0181 <- 3.28 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0484 <- 3.50 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0091 <- 4.33 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0181 <- 3.38 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0484 <- 3.54 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx >5btl_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : w : TYR OH A0031 <- 5.53 -> DT O2 F0017 : score 3.068 : x : SER xxxx A0091 <- 4.07 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 3.79 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0181 <- 3.46 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx >5btl_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : w : TYR OH A0031 <- 5.53 -> DT O2 F0017 : score 3.068 : x : SER xxxx A0091 <- 4.07 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 3.79 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0181 <- 3.46 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0484 <- 3.55 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0091 <- 4.18 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0128 <- 3.96 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0181 <- 3.29 -> DA xxx E0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0484 <- 3.53 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx >5btn_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : w : SER OG A0090 <- 5.54 -> DG O6 E0011 : score 2.749 : x : TYR xxxx A0031 <- 4.49 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0091 <- 4.01 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 3.97 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0181 <- 3.41 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx >5btn_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TOPOISOMERASE II COMPLEX organism=? : w : SER OG A0090 <- 5.54 -> DG O6 E0011 : score 2.749 : x : TYR xxxx A0031 <- 4.49 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0091 <- 4.01 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 3.97 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0181 <- 3.41 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0484 <- 3.47 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0128 <- 3.94 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0181 <- 3.33 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0484 <- 3.56 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx >5byg_AB:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=X-RAY STRUCTURE OF AAV2 OBD-AAVS1 COMPLEX 2:1 organism=Adeno-associated virus 2 : H : ARG NH1 A0107 <- 3.09 -> DC O2 E0014 : score 3.4383 : H : ARG NH2 A0107 <- 2.96 -> DT O2 E0013 : score 4.09787 : H : ARG NH2 A0138 <- 3.02 -> DG O6 E0007 : score 6.3096 : H : ARG NH1 B0138 <- 2.58 -> DG O6 E0011 : score 6.351 : H : ARG NH2 B0138 <- 2.77 -> DG O6 F0032 : score 6.6396 : w : ARG NH2 B0138 <- 5.87 -> DA N7 F0031 : score 1.486 : x : MET xxxx A0103 <- 3.82 -> DG xxx F0032 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0141 <- 4.23 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0103 <- 3.61 -> DG xxx F0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0107 <- 3.23 -> DG xxx F0026 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0141 <- 4.18 -> DC xxx E0012 : score x.xxxxx >5byg_CD:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=X-RAY STRUCTURE OF AAV2 OBD-AAVS1 COMPLEX 2:1 organism=Adeno-associated virus 2 : H : MET SD C0103 <- 3.39 -> DG N2 H0028 : score -8.03638 : H : ARG NH1 C0107 <- 3.22 -> DC O2 G0018 : score 3.3434 : H : ARG NH1 C0138 <- 2.67 -> DG O6 G0011 : score 6.2415 : H : ARG NH2 C0138 <- 2.83 -> DG N7 G0011 : score 6.34631 : H : ARG NH2 D0107 <- 3.15 -> DT O2 G0013 : score 3.937 : H : ARG NH2 D0138 <- 2.61 -> DG N7 G0007 : score 6.62723 : x : ALA xxxx C0141 <- 4.45 -> DC xxx G0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0103 <- 3.55 -> DG xxx H0032 : score x.xxxxx >5byg_D:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=X-RAY STRUCTURE OF AAV2 OBD-AAVS1 COMPLEX 2:1 organism=Adeno-associated virus 2 : H : ARG NH2 D0107 <- 3.15 -> DT O2 G0013 : score 3.937 : H : ARG NH2 D0138 <- 2.61 -> DG N7 G0007 : score 6.62723 : x : MET xxxx D0103 <- 3.55 -> DG xxx H0032 : score x.xxxxx >5c3e_ABE: title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TRANSCRIBING RNA POLYMERASE II COMPLEX REVEALS A COMPLETE TRANSCRIPTION BUBBLE organism=? : x : LYS xxxx A0143 <- 4.17 -> DT xxx S0030 : score x.xxxxx >5c4a_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TRANSCRIBING RNA POLYMERASE II COMPLEX REVEALS A COMPLETE TRANSCRIPTION BUBBLE organism=? : x : LYS xxxx A0143 <- 4.26 -> DT xxx S0030 : score x.xxxxx >5c4a_AE: title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TRANSCRIBING RNA POLYMERASE II COMPLEX REVEALS A COMPLETE TRANSCRIPTION BUBBLE organism=? : x : LYS xxxx A0143 <- 4.26 -> DT xxx S0030 : score x.xxxxx >5c4j_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TRANSCRIBING RNA POLYMERASE II COMPLEX REVEALS A COMPLETE TRANSCRIPTION BUBBLE organism=? : H : ARG NH2 A1386 <- 2.90 -> DA N3 U0016 : score 3.17495 : x : LYS xxxx A0143 <- 4.37 -> DT xxx S0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0315 <- 3.34 -> DA xxx S0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0317 <- 3.47 -> DA xxx S0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0318 <- 3.78 -> DA xxx U0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.68 -> DT xxx U0020 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0829 <- 4.43 -> DC xxx S0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 4.49 -> DA xxx U0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 3.83 -> DA xxx U0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0836 <- 3.44 -> DC xxx U0017 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1403 <- 3.40 -> DC xxx U0017 : score x.xxxxx >5c4j_ABE: title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TRANSCRIBING RNA POLYMERASE II COMPLEX REVEALS A COMPLETE TRANSCRIPTION BUBBLE organism=? : H : ARG NH2 A1386 <- 2.90 -> DA N3 U0016 : score 3.17495 : H : LYS NZ B0257 <- 2.78 -> DT O4 S0021 : score 3.60153 : H : ASP OD1 B0505 <- 2.87 -> DC N4 S0020 : score 5.27004 : x : LYS xxxx A0143 <- 4.37 -> DT xxx S0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0315 <- 3.34 -> DA xxx S0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0317 <- 3.47 -> DA xxx S0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0318 <- 3.78 -> DA xxx U0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.68 -> DT xxx U0020 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0829 <- 4.43 -> DC xxx S0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 4.49 -> DA xxx U0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 3.83 -> DA xxx U0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0836 <- 3.44 -> DC xxx U0017 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1403 <- 3.40 -> DC xxx U0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0228 <- 3.90 -> DA xxx S0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0241 <- 3.17 -> DC xxx S0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0250 <- 3.35 -> DC xxx S0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0252 <- 3.64 -> DC xxx S0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0274 <- 3.35 -> DC xxx S0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0275 <- 4.48 -> DC xxx S0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0359 <- 3.45 -> DC xxx S0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0398 <- 4.46 -> DC xxx S0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0470 <- 3.70 -> DA xxx U0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0471 <- 3.29 -> DA xxx S0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0502 <- 3.33 -> DG xxx S0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0504 <- 3.65 -> DC xxx S0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0507 <- 3.45 -> DA xxx S0022 : score x.xxxxx >5c4x_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TRANSCRIBING RNA POLYMERASE II COMPLEX REVEALS A COMPLETE TRANSCRIPTION BUBBLE organism=? : x : HIS xxxx A0299 <- 3.83 -> DA xxx S0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0315 <- 3.38 -> DA xxx S0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0316 <- 4.31 -> DA xxx S0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0317 <- 3.80 -> DA xxx S0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0350 <- 4.27 -> DC xxx U0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0447 <- 3.69 -> DT xxx U0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.43 -> DT xxx U0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.38 -> DA xxx U0015 : score x.xxxxx >5c4x_ABE: title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TRANSCRIBING RNA POLYMERASE II COMPLEX REVEALS A COMPLETE TRANSCRIPTION BUBBLE organism=? : H : ASP OD1 B0505 <- 3.03 -> DG N2 S0022 : score 4.9131 : H : GLN OE1 B0531 <- 2.81 -> DA N6 U0018 : score 6.04046 : V : TYR CD1 B0275 <- 3.80 -> DT C7 S0018 : score 4.68103 : x : HIS xxxx A0299 <- 3.83 -> DA xxx S0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0315 <- 3.38 -> DA xxx S0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0316 <- 4.31 -> DA xxx S0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0317 <- 3.80 -> DA xxx S0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0350 <- 4.27 -> DC xxx U0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0447 <- 3.69 -> DT xxx U0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.43 -> DT xxx U0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 3.38 -> DA xxx U0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0337 <- 3.80 -> DC xxx S0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0508 <- 3.94 -> DC xxx S0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0510 <- 4.18 -> DC xxx S0023 : score x.xxxxx >5c51_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PROBING THE STRUCTURAL AND MOLECULAR BASIS OF NUCLEOTIDE SELECTIVITY BY HUMAN MITOCHONDRIAL DNA POLYMERASE GAMMA organism=HOMO SAPIENS : x : ASN xxxx A0803 <- 3.80 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0853 <- 3.76 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0861 <- 3.32 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0948 <- 3.43 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1098 <- 3.70 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1102 <- 3.67 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx >5c52_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PROBING THE STRUCTURAL AND MOLECULAR BASIS OF NUCLEOTIDE SELECTIVITY BY HUMAN MITOCHONDRIAL DNA POLYMERASE GAMMA organism=HOMO SAPIENS : x : ASN xxxx A0803 <- 4.43 -> DG xxx P0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0853 <- 3.92 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0861 <- 3.71 -> DC xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1098 <- 4.48 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1102 <- 3.91 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5c53_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PROBING THE STRUCTURAL AND MOLECULAR BASIS OF NUCLEOTIDE SELECTIVITY BY HUMAN MITOCHONDRIAL DNA POLYMERASE GAMMA organism=HOMO SAPIENS : x : ASN xxxx A0803 <- 4.35 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0853 <- 4.26 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0861 <- 3.92 -> DT xxx P0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1102 <- 4.33 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5c5j_F:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=POYMERASE NUCLEOTIDE COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : w : GLU OE2 F0246 <- 6.19 -> DG N7 G0842 : score 2.669 : x : ARG xxxx F0285 <- 4.09 -> DT xxx H0866 : score x.xxxxx >5c8e_AF:Putative_DNA-binding_domain;Cobalamin_vitamin_B12-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS CARH BOUND TO ADENOSYLCOBALAMIN AND A 26-BP DNA SEGMENT organism=Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) / Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) / Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) / Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) : H : GLN NE2 F0025 <- 2.43 -> DT O4 i0048 : score 5.57516 : V : VAL CG2 A0022 <- 3.72 -> DT C7 i0052 : score 6.24554 >5c8e_BC:Putative_DNA-binding_domain;Cobalamin_vitamin_B12-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS CARH BOUND TO ADENOSYLCOBALAMIN AND A 26-BP DNA SEGMENT organism=Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) / Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) / Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) / Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) : H : GLN NE2 B0025 <- 2.28 -> DT O4 I0022 : score 5.73089 : H : ARG NH1 C0028 <- 3.29 -> DG N7 J0015 : score 5.4571 : V : ARG CZ C0029 <- 3.77 -> DT C7 I0009 : score 2.1483 : x : VAL xxxx B0022 <- 4.49 -> DT xxx I0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0029 <- 3.48 -> DG xxx I0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0021 <- 4.48 -> DC xxx I0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0024 <- 3.68 -> DT xxx J0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0025 <- 3.44 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0042 <- 3.99 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx >5c8e_C:Putative_DNA-binding_domain;Cobalamin_vitamin_B12-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS CARH BOUND TO ADENOSYLCOBALAMIN AND A 26-BP DNA SEGMENT organism=Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) / Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) : H : ARG NH1 C0028 <- 3.29 -> DG N7 J0015 : score 5.4571 : V : ARG CZ C0029 <- 3.77 -> DT C7 I0009 : score 2.1483 : V : GLN CG C0025 <- 3.52 -> DT C7 I0011 : score 3.48326 : x : GLU xxxx C0021 <- 4.48 -> DC xxx I0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0024 <- 3.68 -> DT xxx J0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0042 <- 3.99 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx >5c8e_EG:Putative_DNA-binding_domain;Cobalamin_vitamin_B12-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS CARH BOUND TO ADENOSYLCOBALAMIN AND A 26-BP DNA SEGMENT organism=Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) / Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) / Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) / Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) : H : ARG NH2 G0029 <- 3.20 -> DG O6 K0010 : score 6.072 : V : GLN CG G0025 <- 3.66 -> DT C7 K0011 : score 3.36932 : x : ARG xxxx E0024 <- 3.38 -> DT xxx L0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0025 <- 3.57 -> DA xxx K0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0042 <- 4.19 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0024 <- 3.51 -> DT xxx L0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0028 <- 3.72 -> DG xxx L0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0042 <- 4.20 -> DT xxx K0018 : score x.xxxxx >5ca7_B:Nucleotidyltransferase;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE LAMBDA- MGDGTP BINARY AND COMPLEX WITH 6 PAIRED DNA organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 B0464 <- 6.42 -> DC O2 T0009 : score 2.699 : H : TYR OH B0505 <- 2.77 -> DA N3 P0005 : score 4.17619 : H : ASN ND2 B0513 <- 3.10 -> DC O2 P0006 : score 4.21072 : H : ARG NH1 B0514 <- 2.62 -> DG O6 T0006 : score 6.30233 : x : ALA xxxx B0510 <- 3.71 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0517 <- 3.27 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >5cbx_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCGR DNA BINDING DOMAIN - (+)GRE COMPLEX organism=UNCLASSIFIED : H : ARG NH1 A0447 <- 3.02 -> DG N7 D0013 : score 5.7838 : H : ARG NH2 A0447 <- 2.76 -> DG O6 D0013 : score 6.6528 : H : ARG NH1 B0447 <- 3.08 -> DG N7 C0013 : score 5.7112 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.75 -> DG O6 C0013 : score 6.666 : x : LYS xxxx A0442 <- 3.11 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0443 <- 4.19 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0442 <- 3.21 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0443 <- 4.00 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >5cbx_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCGR DNA BINDING DOMAIN - (+)GRE COMPLEX organism=UNCLASSIFIED : H : ARG NH1 B0447 <- 3.08 -> DG N7 C0013 : score 5.7112 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.75 -> DG O6 C0013 : score 6.666 : x : LYS xxxx B0442 <- 3.21 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0443 <- 4.00 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >5cbx_EF:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCGR DNA BINDING DOMAIN - (+)GRE COMPLEX organism=UNCLASSIFIED : H : ARG NH1 E0447 <- 3.02 -> DG N7 H0013 : score 5.7838 : H : ARG NH2 E0447 <- 2.53 -> DG O6 H0013 : score 6.9564 : H : LYS NZ F0442 <- 2.88 -> DG N7 H0004 : score 5.29972 : H : ARG NH1 F0447 <- 3.16 -> DG N7 G0013 : score 5.6144 : H : ARG NH2 F0447 <- 2.79 -> DG O6 G0013 : score 6.6132 : w : ARG NH2 F0447 <- 6.05 -> DA N6 H0006 : score 1.997 : x : LYS xxxx E0442 <- 3.12 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0443 <- 3.87 -> DG xxx H0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0443 <- 3.66 -> DT xxx G0014 : score x.xxxxx >5cby_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCGR2 DNA BINDING DOMAIN - (+)GRE COMPLEX organism=UNCLASSIFIED : H : LYS NZ A0442 <- 2.73 -> DG N7 C0004 : score 5.4613 : H : ARG NH1 A0447 <- 2.88 -> DG N7 D0013 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0447 <- 2.70 -> DG O6 D0013 : score 6.732 : x : VAL xxxx A0443 <- 3.93 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx >5cby_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCGR2 DNA BINDING DOMAIN - (+)GRE COMPLEX organism=UNCLASSIFIED : H : LYS NZ A0442 <- 2.73 -> DG N7 C0004 : score 5.4613 : H : ARG NH1 A0447 <- 2.88 -> DG N7 D0013 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0447 <- 2.70 -> DG O6 D0013 : score 6.732 : H : LYS NZ B0442 <- 3.01 -> DG N7 D0004 : score 5.15969 : H : ARG NH1 B0447 <- 2.88 -> DG N7 C0013 : score 5.9532 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.69 -> DG O6 C0013 : score 6.7452 : x : VAL xxxx A0443 <- 3.93 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0443 <- 3.93 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >5cbz_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCMR DNA BINDING DOMAIN - (+)GRE COMPLEX organism=UNIDENTIFIED : H : LYS NZ A0442 <- 2.97 -> DG N7 C0004 : score 5.20278 : H : ARG NH1 A0447 <- 2.97 -> DG N7 D0013 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0447 <- 2.79 -> DG O6 D0013 : score 6.6132 : H : LYS NZ B0442 <- 2.94 -> DG N7 D0004 : score 5.23509 : H : ARG NH1 B0447 <- 3.05 -> DG N7 C0013 : score 5.7475 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.79 -> DG O6 C0013 : score 6.6132 : x : VAL xxxx A0443 <- 4.03 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0443 <- 3.95 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >5cbz_E:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCMR DNA BINDING DOMAIN - (+)GRE COMPLEX organism=UNIDENTIFIED : H : LYS NZ E0442 <- 2.74 -> DG N7 G0004 : score 5.45053 : H : ARG NH1 E0447 <- 3.01 -> DG N7 H0013 : score 5.7959 : H : ARG NH2 E0447 <- 2.72 -> DG O6 H0013 : score 6.7056 : w : ARG NH2 E0447 <- 6.42 -> DA N6 G0006 : score 1.997 : x : VAL xxxx E0443 <- 3.65 -> DT xxx H0014 : score x.xxxxx >5cbz_EF:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCMR DNA BINDING DOMAIN - (+)GRE COMPLEX organism=UNIDENTIFIED : H : LYS NZ E0442 <- 2.74 -> DG N7 G0004 : score 5.45053 : H : ARG NH1 E0447 <- 3.01 -> DG N7 H0013 : score 5.7959 : H : ARG NH2 E0447 <- 2.72 -> DG O6 H0013 : score 6.7056 : w : ARG NH2 E0447 <- 6.42 -> DA N6 G0006 : score 1.997 : H : LYS NZ F0442 <- 2.92 -> DG N7 H0004 : score 5.25664 : H : ARG NH1 F0447 <- 2.97 -> DG N7 G0013 : score 5.8443 : H : ARG NH2 F0447 <- 2.61 -> DG O6 G0013 : score 6.8508 : x : VAL xxxx E0443 <- 3.65 -> DT xxx H0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0443 <- 3.94 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx >5cc0_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCSR2 - TSLP NGRE COMPLEX organism=synthetic construct : H : LYS NZ A0442 <- 2.69 -> DG N7 C0009 : score 5.50439 : H : ARG NH1 B0447 <- 3.03 -> DG N7 C0002 : score 5.7717 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.86 -> DG O6 C0002 : score 6.5208 : x : VAL xxxx A0443 <- 3.66 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0447 <- 3.38 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0442 <- 4.08 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0443 <- 4.32 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >5cc0_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ANCSR2 - TSLP NGRE COMPLEX organism=synthetic construct : H : ARG NH1 B0447 <- 3.03 -> DG N7 C0002 : score 5.7717 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.86 -> DG O6 C0002 : score 6.5208 : x : LYS xxxx B0442 <- 4.08 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0443 <- 4.32 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >5cc1_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=S425G GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN - (+)GRE COMPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0442 <- 3.01 -> DG N7 C0004 : score 5.15969 : H : ARG NH1 A0447 <- 2.97 -> DG N7 D0013 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0447 <- 2.78 -> DG O6 D0013 : score 6.6264 : x : VAL xxxx A0443 <- 4.08 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx >5cc1_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=S425G GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN - (+)GRE COMPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0442 <- 3.01 -> DG N7 C0004 : score 5.15969 : H : ARG NH1 A0447 <- 2.97 -> DG N7 D0013 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0447 <- 2.78 -> DG O6 D0013 : score 6.6264 : H : LYS NZ B0442 <- 2.96 -> DG N7 D0004 : score 5.21355 : H : ARG NH1 B0447 <- 2.85 -> DG N7 C0013 : score 5.9895 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.65 -> DG O6 C0013 : score 6.798 : x : VAL xxxx A0443 <- 4.08 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0443 <- 3.93 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >5cc1_WX:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=S425G GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN - (+)GRE COMPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ W0442 <- 3.03 -> DG N7 Z0004 : score 5.13815 : H : ARG NH1 W0447 <- 2.97 -> DG N7 Y0013 : score 5.8443 : H : ARG NH2 W0447 <- 2.74 -> DG O6 Y0013 : score 6.6792 : H : LYS NZ X0442 <- 2.95 -> DG N7 Y0004 : score 5.22432 : H : ARG NH1 X0447 <- 2.83 -> DG N7 Z0013 : score 6.0137 : H : ARG NH2 X0447 <- 2.63 -> DG O6 Z0013 : score 6.8244 : x : VAL xxxx W0443 <- 4.06 -> DG xxx Y0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx X0443 <- 3.93 -> DG xxx Z0013 : score x.xxxxx >5cdm_AB:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.5A STRUCTURE OF QPT-1 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : w : TYR OH A0025 <- 5.78 -> DA N3 E0007 : score 1.448 : w : TYR OH A0025 <- 5.50 -> DA N3 N2015 : score 1.448 : w : LYS NZ B0460 <- 5.54 -> DA N3 E0007 : score 1.538 : x : SER xxxx A0085 <- 3.66 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0092 <- 4.21 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0175 <- 3.38 -> DC xxx N2016 : score x.xxxxx >5cdm_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.5A STRUCTURE OF QPT-1 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=? : w : LYS NZ B0460 <- 5.54 -> DA N3 E0007 : score 1.538 >5cdm_CD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.5A STRUCTURE OF QPT-1 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : w : TYR OH C0025 <- 6.13 -> DA N3 F0007 : score 1.448 : w : LYS NZ D0460 <- 5.37 -> DA N3 F0007 : score 1.538 : x : SER xxxx C0085 <- 3.21 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0175 <- 3.45 -> DC xxx I2016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0330 <- 3.66 -> DT xxx I2019 : score x.xxxxx >5cdn_AB:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.8A STRUCTURE OF ETOPOSIDE WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : x : SER xxxx A0085 <- 3.42 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0175 <- 3.43 -> DC xxx G2016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0460 <- 3.42 -> DT xxx G2014 : score x.xxxxx >5cdn_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.8A STRUCTURE OF ETOPOSIDE WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=? : x : LYS xxxx B0460 <- 3.42 -> DT xxx G2014 : score x.xxxxx >5cdn_CD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.8A STRUCTURE OF ETOPOSIDE WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : x : SER xxxx C0085 <- 3.57 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0175 <- 3.44 -> DC xxx O2016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0460 <- 3.43 -> DT xxx O2014 : score x.xxxxx >5cdn_RS:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.8A STRUCTURE OF ETOPOSIDE WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : x : TYR xxxx R0025 <- 4.42 -> DA xxx N2015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0085 <- 3.32 -> DA xxx W0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0175 <- 3.58 -> DC xxx N2016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx S0460 <- 3.49 -> DT xxx N2014 : score x.xxxxx >5cdn_TU:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.8A STRUCTURE OF ETOPOSIDE WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : x : SER xxxx T0085 <- 3.54 -> DA xxx V0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx T0175 <- 3.43 -> DC xxx P2016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx U0460 <- 3.53 -> DT xxx P2014 : score x.xxxxx >5cdo_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=3.15A STRUCTURE OF QPT-1 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : x : TYR xxxx A0025 <- 4.38 -> DA xxx F2015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0085 <- 3.47 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0175 <- 3.34 -> DG xxx F2017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0458 <- 3.58 -> DG xxx E2009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0460 <- 3.46 -> DT xxx F2014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0025 <- 4.43 -> DA xxx E2015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0085 <- 3.97 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0088 <- 4.17 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0175 <- 3.31 -> DC xxx E2016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0180 <- 4.47 -> DG xxx E2017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0460 <- 3.35 -> DT xxx E2014 : score x.xxxxx >5cdo_D:Type_II_DNA_topoisomerase; title=3.15A STRUCTURE OF QPT-1 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : x : LYS xxxx D0460 <- 3.35 -> DT xxx E2014 : score x.xxxxx >5cdo_RSTU:Type_II_DNA_topoisomerase; title=3.15A STRUCTURE OF QPT-1 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : w : TYR OH T0025 <- 5.10 -> DA N3 W2015 : score 1.448 : x : TYR xxxx R0025 <- 4.39 -> DA xxx V2015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0085 <- 3.56 -> DA xxx W0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0175 <- 3.27 -> DC xxx V2016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx S0458 <- 3.92 -> DG xxx W2009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx S0460 <- 3.55 -> DA xxx W0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx T0033 <- 4.27 -> DT xxx V0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx T0085 <- 3.88 -> DA xxx V0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx T0088 <- 4.16 -> DT xxx V0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx T0122 <- 4.18 -> DG xxx W2009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx T0175 <- 3.34 -> DC xxx W2016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx U0458 <- 4.46 -> DG xxx V2009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx U0460 <- 3.77 -> DT xxx W2014 : score x.xxxxx >5cdp_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.45A STRUCTURE OF ETOPOSIDE WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : w : TYR OH A0025 <- 5.80 -> DA N3 H2015 : score 1.448 : w : TYR OH A0025 <- 6.09 -> DA N3 E0007 : score 1.448 : x : SER xxxx A0085 <- 3.54 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0092 <- 4.13 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0175 <- 3.42 -> DG xxx H2017 : score x.xxxxx >5cdp_AB:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.45A STRUCTURE OF ETOPOSIDE WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : w : TYR OH A0025 <- 5.80 -> DA N3 H2015 : score 1.448 : w : TYR OH A0025 <- 6.09 -> DA N3 E0007 : score 1.448 : w : LYS NZ B0460 <- 5.58 -> DA N3 E0007 : score 1.538 : x : SER xxxx A0085 <- 3.54 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0092 <- 4.13 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0175 <- 3.42 -> DG xxx H2017 : score x.xxxxx >5cdp_CD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.45A STRUCTURE OF ETOPOSIDE WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : w : TYR OH C0025 <- 5.63 -> DA N3 G2015 : score 1.448 : w : TYR OH C0025 <- 5.99 -> DA N3 F0007 : score 1.448 : w : SER OG C0085 <- 5.80 -> DA N7 F0007 : score 2.343 : w : LYS NZ D0460 <- 5.52 -> DA N3 F0007 : score 1.538 : x : ARG xxxx C0033 <- 4.46 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0175 <- 3.39 -> DG xxx G2017 : score x.xxxxx >5cdq_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.95A STRUCTURE OF MOXIFLOXACIN WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : w : TYR OH A0025 <- 5.67 -> DA N3 E2015 : score 1.448 : w : TYR OH A0025 <- 6.04 -> DA N3 F0007 : score 1.448 : w : LYS NZ B0460 <- 5.52 -> DA N3 F0007 : score 1.538 : w : TYR OH C0025 <- 6.50 -> DT O2 E0006 : score 3.068 : w : TYR OH C0025 <- 6.43 -> DC O2 F2016 : score 1.343 : w : ARG NH1 C0033 <- 6.40 -> DT O2 E0006 : score 1.855 : x : SER xxxx A0085 <- 3.59 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0122 <- 4.01 -> DG xxx E2009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0175 <- 3.55 -> DC xxx E2016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0122 <- 3.50 -> DG xxx F2009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0175 <- 3.38 -> DC xxx F2016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0460 <- 3.57 -> DT xxx F2014 : score x.xxxxx >5cdq_R:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.95A STRUCTURE OF MOXIFLOXACIN WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=? : w : TYR OH R0025 <- 5.53 -> DA N3 V2015 : score 1.448 : w : TYR OH R0025 <- 5.99 -> DA N3 W0007 : score 1.448 : x : SER xxxx R0085 <- 3.63 -> DT xxx W0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0122 <- 3.28 -> DG xxx V2009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0175 <- 3.58 -> DG xxx V2017 : score x.xxxxx >5cdq_RSTU:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.95A STRUCTURE OF MOXIFLOXACIN WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : w : TYR OH R0025 <- 5.53 -> DA N3 V2015 : score 1.448 : w : TYR OH R0025 <- 5.99 -> DA N3 W0007 : score 1.448 : w : LYS NZ S0460 <- 5.59 -> DA N3 W0007 : score 1.538 : w : SER OG T0085 <- 6.02 -> DA N7 V0007 : score 2.343 : x : SER xxxx R0085 <- 3.63 -> DT xxx W0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0122 <- 3.28 -> DG xxx V2009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0175 <- 3.58 -> DG xxx V2017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx T0025 <- 4.47 -> DA xxx W2015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx T0122 <- 3.10 -> DG xxx W2009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx T0175 <- 3.39 -> DC xxx W2016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx U0460 <- 3.53 -> DT xxx W2014 : score x.xxxxx >5cdr_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.65 STRUCTURE OF S.AUREUS DNA GYRASE AND ARTIFICIALLY NICKED DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : w : TYR OH A0025 <- 5.76 -> DA N3 F2015 : score 1.448 : w : TYR OH A0025 <- 6.08 -> DA N3 E0007 : score 1.448 : x : SER xxxx A0085 <- 3.43 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0092 <- 4.06 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0175 <- 3.43 -> DC xxx F2016 : score x.xxxxx >5cdr_AB:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.65 STRUCTURE OF S.AUREUS DNA GYRASE AND ARTIFICIALLY NICKED DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : w : TYR OH A0025 <- 5.76 -> DA N3 F2015 : score 1.448 : w : TYR OH A0025 <- 6.71 -> DA N3 F2015 : score 1.448 : w : LYS NZ B0460 <- 6.25 -> DA N3 F2015 : score 1.538 : x : SER xxxx A0085 <- 3.43 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0092 <- 4.06 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0175 <- 3.43 -> DC xxx F2016 : score x.xxxxx >5cdr_CD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.65 STRUCTURE OF S.AUREUS DNA GYRASE AND ARTIFICIALLY NICKED DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : w : TYR OH C0025 <- 5.60 -> DA N3 G2015 : score 1.448 : w : TYR OH C0025 <- 6.09 -> DA N3 F0007 : score 1.448 : w : LYS NZ D0460 <- 5.58 -> DA N3 F0007 : score 1.538 : x : SER xxxx C0085 <- 3.39 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0175 <- 3.44 -> DC xxx G2016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0458 <- 3.17 -> DC xxx G2013 : score x.xxxxx >5cg8_A:Regulatory_protein_AraC; title=NGTET1 IN COMPLEX WITH 5HMC DNA organism=Naegleria gruberi : H : SER OG A0148 <- 3.15 -> DG N2 B0009 : score 3.13815 : H : GLN NE2 A0310 <- 3.23 -> DG N3 C0021 : score 4.54774 : x : MET xxxx A0149 <- 3.36 -> DG xxx C0021 : score x.xxxxx >5cg9_A:Regulatory_protein_AraC; title=NGTET1 IN COMPLEX WITH 5MC DNA IN SPACE GROUP P3221 organism=Naegleria gruberi : H : SER OG A0148 <- 2.96 -> DG N2 B0008 : score 3.26638 : H : GLN OE1 A0310 <- 3.00 -> DG N2 C0021 : score 5.38338 : H : GLN OE1 A0310 <- 3.00 -> DG N2 C0021 : score 5.38338 : H : GLN NE2 A0310 <- 3.21 -> DG N3 C0021 : score 4.56764 : H : GLN NE2 A0310 <- 3.21 -> DG N3 C0021 : score 4.56764 : x : MET xxxx A0149 <- 3.46 -> DG xxx C0021 : score x.xxxxx >5chg_A:Nucleotidyltransferase;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE LAMBDA L431A MUTANT- MGDGTP BINARY AND COMPLEX WITH 6 PAIRED DNA organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0505 <- 2.66 -> DA N3 P0005 : score 4.26752 : H : ASN ND2 A0513 <- 3.07 -> DC O2 P0006 : score 4.2376 : H : ARG NE A0514 <- 3.12 -> DG O6 T0006 : score 3.6888 : x : GLU xxxx A0465 <- 4.48 -> DC xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0510 <- 3.89 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0517 <- 3.05 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >5chi_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF PF2046 IN COMPLEX WITH SSDNA organism=Pyrococcus furiosus (strain ATCC 43587 / DSM 3638 / JCM 8422 / Vc1) / Pyrococcus furiosus (strain ATCC 43587 / DSM 3638 / JCM 8422 / Vc1) : H : LYS NZ A0104 <- 3.26 -> DT O4 D0005 : score 3.25716 >5chz_A:DNA-glycosylase; title=STRUCTURE OF WILD-TYPE HUMAN MBD4 BOUND TO A G:T MISMATCH organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0468 <- 4.19 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0469 <- 4.20 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0470 <- 4.45 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx >5ciy_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURAL BASIS OF THE RECOGNITION OF H3K36ME3 BY DNMT3B PWWP DOMAIN organism=Haemophilus parahaemolyticus : H : SER OG A0087 <- 2.91 -> DG N3 D0426 : score 2.71082 : w : ARG NH2 A0228 <- 5.71 -> DA N7 D0425 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0240 <- 2.87 -> DG N7 D0426 : score 5.9653 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.85 -> DG O6 D0426 : score 6.534 : w : LYS NZ A0261 <- 5.58 -> DT O4 C0405 : score 1.7 : V : ALA CB A0260 <- 3.61 -> DT C7 C0405 : score 5.86493 : x : ILE xxxx A0086 <- 3.65 -> DT xxx C0410 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0237 <- 3.27 -> DG xxx D0426 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0239 <- 4.18 -> DC xxx C0407 : score x.xxxxx >5ciz_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=E. COLI RNA POLYMERASE ALPHA SUBUNIT CTD IN COMPLEX WITH CAP AND DNA: A(5)-TRACT BINDING SITE FOR ALPHA CTD organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NH2 A0180 <- 3.17 -> DG O6 D0016 : score 6.1116 : H : GLU OE2 A0181 <- 2.83 -> DC N4 E0027 : score 5.23379 : H : ARG NH2 A0185 <- 3.24 -> DG N7 D0018 : score 5.82277 : H : ARG NH2 A0185 <- 2.74 -> DT O4 E0026 : score 3.59649 : x : GLN xxxx A0170 <- 3.96 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0179 <- 3.93 -> DT xxx E0026 : score x.xxxxx >5ciz_AB:C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=E. COLI RNA POLYMERASE ALPHA SUBUNIT CTD IN COMPLEX WITH CAP AND DNA: A(5)-TRACT BINDING SITE FOR ALPHA CTD organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NH2 A0180 <- 3.17 -> DG O6 D0016 : score 6.1116 : H : GLU OE2 A0181 <- 2.83 -> DC N4 E0027 : score 5.23379 : H : ARG NH2 A0185 <- 3.24 -> DG N7 D0018 : score 5.82277 : H : ARG NH2 A0185 <- 2.74 -> DT O4 E0026 : score 3.59649 : x : GLN xxxx A0170 <- 3.96 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0179 <- 3.93 -> DT xxx E0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0265 <- 4.22 -> DA xxx E0043 : score x.xxxxx >5cj7_A:Nucleotidyltransferase;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE LAMBDA L431A MUTANT- MGDTTP BINARY AND COMPLEX WITH 6 PAIRED DNA organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0505 <- 2.67 -> DA N3 P0005 : score 4.25922 : x : GLN xxxx A0464 <- 4.41 -> DC xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0510 <- 3.74 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0513 <- 3.54 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.47 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0517 <- 3.09 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >5cky_O: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MTERF1 R162A SUBSTITUTION BOUND TO THE TERMINATION SEQUENCE. organism=Homo sapiens : H : GLU OE2 O0165 <- 2.94 -> DC N4 D0015 : score 5.11795 : H : ARG NH1 O0169 <- 3.20 -> DG N7 E0007 : score 5.566 : H : ARG NH2 O0169 <- 2.82 -> DG O6 E0007 : score 6.5736 : H : ARG NH1 O0202 <- 2.80 -> DG O6 D0014 : score 6.08333 : H : ARG NH2 O0202 <- 2.79 -> DG O6 E0008 : score 6.6132 : H : ARG NH1 O0251 <- 3.07 -> DG O6 E0011 : score 5.75483 : H : ARG NH2 O0251 <- 2.78 -> DA N7 E0010 : score 1.67848 : H : SER OG O0285 <- 2.91 -> DA N6 E0012 : score 3.21737 : H : ARG NH1 O0350 <- 2.94 -> DG O6 D0007 : score 5.913 : H : ARG NH2 O0350 <- 2.93 -> DG N7 D0007 : score 6.21862 : H : ARG NH2 O0350 <- 3.06 -> DG O6 D0007 : score 6.2568 : H : ASP OD2 O0353 <- 3.36 -> DC N4 E0015 : score 5.5056 : H : ARG NH1 O0387 <- 2.58 -> DG O6 E0018 : score 6.351 : H : ARG NH2 O0387 <- 2.82 -> DG N7 E0018 : score 6.35908 : V : ASN CG O0199 <- 3.58 -> DT C7 D0011 : score 2.79386 : x : TYR xxxx O0128 <- 4.19 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0130 <- 3.47 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx O0159 <- 3.82 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx O0162 <- 3.27 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0195 <- 3.07 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0198 <- 4.09 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0242 <- 3.84 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0243 <- 3.67 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx O0280 <- 4.28 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0284 <- 4.32 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx O0288 <- 3.28 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx O0319 <- 4.11 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx O0384 <- 4.47 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx >5cl3_A:ARM_repeat; title=ALKYLPURINE DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO DNA CONTAINING A 3- METHYLADENINE ANALOG (100% SUBSTRATE AT 4 HOURS) organism=BACILLUS CEREUS : H : TYR OH A0027 <- 2.75 -> DA N3 B0007 : score 4.19279 : w : LYS NZ A0183 <- 5.75 -> DA N7 B0007 : score 1.655 : x : ARG xxxx A0215 <- 3.98 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx >5cl4_A:ARM_repeat; title=ALKYLPURINE DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO DNA CONTAINING A 3- METHYLADENINE ANALOG OR DNA CONTAINING AN ABASIC SITE AND A FREE NUCLEOBASE (71% SUBSTRATE/29% PRODUCT AT 24 HOURS) organism=BACILLUS CEREUS : H : TYR OH A0027 <- 2.71 -> DA N3 B0007 : score 4.22601 : w : LYS NZ A0183 <- 5.65 -> DA N7 B0007 : score 1.655 : x : ARG xxxx A0215 <- 3.72 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx >5cl5_A:ARM_repeat; title=ALKYLPURINE DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO DNA CONTAINING A 3- METHYLADENINE ANALOG OR DNA CONTAINING AN ABASIC SITE AND A FREE NUCLEOBASE (51% SUBSTRATE/49% PRODUCT AT 48 HOURS) organism=BACILLUS CEREUS : H : TYR OH A0027 <- 2.74 -> DA N3 B0007 : score 4.2011 : w : LYS NZ A0183 <- 5.77 -> DA N7 B0007 : score 1.655 : x : ARG xxxx A0215 <- 4.20 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx >5cl6_A:ARM_repeat; title=ALKYLPURINE DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO DNA CONTAINING A 3- METHYLADENINE ANALOG OR DNA CONTAINING AN ABASIC SITE AND A FREE NUCLEOBASE (33% SUBSTRATE/67% PRODUCT AT 72 HOURS) organism=BACILLUS CEREUS : H : TYR OH A0027 <- 2.76 -> DA N3 B0007 : score 4.18449 : w : LYS NZ A0183 <- 5.81 -> DA N7 B0007 : score 1.655 : x : ARG xxxx A0215 <- 4.19 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx >5cl7_A:ARM_repeat; title=ALKYLPURINE DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO DNA CONTAINING A 3- METHYLADENINE ANALOG OR DNA CONTAINING AN ABASIC SITE AND A FREE NUCLEOBASE (18% SUBSTRATE/82% PRODUCT AT 96 HOURS) organism=BACILLUS CEREUS : H : TYR OH A0027 <- 2.75 -> DA N3 B0007 : score 4.19279 : w : LYS NZ A0183 <- 5.67 -> DA N7 B0007 : score 1.655 : x : ARG xxxx A0215 <- 4.08 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx >5cl8_A:ARM_repeat; title=ALKYLPURINE DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO DNA CONTAINING AN ABASIC SITE AND A FREE NUCLEOBASE (100% PRODUCT AT 144 HOURS) organism=BACILLUS CEREUS : H : TYR OH A0027 <- 2.80 -> DA N3 B0007 : score 4.15128 : w : LYS NZ A0183 <- 5.73 -> DA N7 B0007 : score 1.655 : x : ARG xxxx A0215 <- 4.27 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx >5cl9_A:ARM_repeat; title=ALKYLPURINE DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO DNA CONTAINING AN ABASIC SITE AND A FREE NUCLEOBASE (100% PRODUCT AT 240 HOURS) organism=BACILLUS CEREUS : H : TYR OH A0027 <- 2.74 -> DA N3 B0007 : score 4.2011 : w : LYS NZ A0183 <- 5.70 -> DA N7 B0007 : score 1.655 : x : ARG xxxx A0215 <- 3.88 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx >5cla_A:ARM_repeat; title=ALKYLPURINE DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO DNA CONTAINING AN ABASIC SITE AND A FREE NUCLEOBASE (100% PRODUCT AT 360 HOURS) organism=BACILLUS CEREUS : H : TYR OH A0027 <- 2.72 -> DA N3 B0007 : score 4.2177 : w : LYS NZ A0183 <- 5.77 -> DA N7 B0007 : score 1.655 : x : ARG xxxx A0215 <- 4.14 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx >5clb_A:ARM_repeat; title=ALKYLPURINE DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO DNA CONTAINING A 3- METHYLADENINE ANALOG (9-MER A) organism=BACILLUS CEREUS : H : TYR OH A0027 <- 2.77 -> DA N3 B0007 : score 4.17619 : w : TYR OH A0027 <- 5.63 -> DT O2 C0014 : score 3.068 : w : LYS NZ A0183 <- 5.68 -> DA N7 B0007 : score 1.655 >5clc_A:ARM_repeat; title=ALKYLPURINE DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO DNA CONTAINING A 3- METHYLADENINE ANALOG (9-MER B) organism=BACILLUS CEREUS : H : TYR OH A0027 <- 2.64 -> DC O2 B0007 : score 3.60935 >5cld_A:ARM_repeat; title=ALKYLPURINE DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO DNA CONTAINING AN OXOCARBENIUM-INTERMEDIATE ANALOG AND A FREE 3-METHYLADENINE NUCLEOBASE organism=BACILLUS CEREUS : H : TYR OH A0027 <- 2.75 -> DA N3 B0007 : score 4.19279 : w : LYS NZ A0183 <- 5.72 -> DA N7 B0007 : score 1.655 : x : ARG xxxx A0215 <- 4.32 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx >5cle_A:ARM_repeat; title=ALKYLPURINE DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO DNA CONTAINING AN ABASIC- SITE ANALOG AND A FREE 3-METHYLADENINE NUCLEOBASE organism=BACILLUS CEREUS : H : TYR OH A0027 <- 2.73 -> DA N3 B0007 : score 4.2094 : w : LYS NZ A0183 <- 5.52 -> DA N7 B0007 : score 1.655 >5clv_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF KORA-OPERATOR DNA COMPLEX (KORA-OA) organism=? : w : THR OG1 A0047 <- 6.22 -> DA N6 D0013 : score 3.251 : H : ARG NH2 A0048 <- 2.80 -> DG O6 C0005 : score 6.6 : H : GLN NE2 A0053 <- 2.93 -> DT O4 D0012 : score 5.05606 : H : GLN NE2 A0053 <- 2.68 -> DT O4 C0008 : score 5.31561 : x : ALA xxxx A0050 <- 4.20 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0052 <- 3.62 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0057 <- 3.23 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >5clv_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF KORA-OPERATOR DNA COMPLEX (KORA-OA) organism=ESCHERICHIA COLI : w : THR OG1 A0047 <- 6.22 -> DA N6 D0013 : score 3.251 : H : ARG NH2 A0048 <- 2.80 -> DG O6 C0005 : score 6.6 : H : GLN NE2 A0053 <- 2.93 -> DT O4 D0012 : score 5.05606 : H : GLN NE2 A0053 <- 2.68 -> DT O4 C0008 : score 5.31561 : w : THR OG1 B0047 <- 6.17 -> DA N6 C0013 : score 3.251 : H : GLN OE1 B0053 <- 3.20 -> DC N4 C0011 : score 4.21667 : H : GLN NE2 B0053 <- 2.98 -> DT O4 D0008 : score 5.00415 : H : GLN NE2 B0053 <- 2.97 -> DT O4 C0012 : score 5.01453 : V : ALA CB B0050 <- 3.69 -> DT C7 C0012 : score 5.75295 : x : ALA xxxx A0050 <- 4.20 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0052 <- 3.62 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0057 <- 3.23 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0048 <- 3.06 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0052 <- 3.72 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0057 <- 3.39 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx >5clv_IJ: title=CRYSTAL STRUCTURE OF KORA-OPERATOR DNA COMPLEX (KORA-OA) organism=ESCHERICHIA COLI : w : THR OG1 I0047 <- 5.64 -> DA N6 L0013 : score 3.251 : H : GLN NE2 I0053 <- 2.78 -> DT O4 L0012 : score 5.21179 : H : GLN NE2 I0053 <- 2.85 -> DT O4 K0008 : score 5.13912 : H : ARG NH2 J0048 <- 2.28 -> DG O6 L0005 : score 7.2864 : H : GLN OE1 J0053 <- 2.65 -> DC N4 K0011 : score 4.72083 : H : GLN NE2 J0053 <- 2.48 -> DT O4 L0008 : score 5.52325 : H : GLN NE2 J0053 <- 3.29 -> DT O4 K0012 : score 4.68231 : V : ALA CB I0050 <- 3.72 -> DT C7 L0012 : score 5.71095 : x : ARG xxxx I0048 <- 3.85 -> DA xxx K0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0052 <- 3.29 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0057 <- 3.42 -> DG xxx L0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0047 <- 3.96 -> DT xxx K0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0050 <- 4.38 -> DT xxx K0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0052 <- 3.44 -> DT xxx L0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0057 <- 3.87 -> DG xxx K0010 : score x.xxxxx >5clv_MN: title=CRYSTAL STRUCTURE OF KORA-OPERATOR DNA COMPLEX (KORA-OA) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NE M0048 <- 3.09 -> DG N7 P0005 : score 4.16533 : H : ARG NH2 M0048 <- 2.25 -> DG O6 P0005 : score 7.326 : H : GLN NE2 N0053 <- 2.61 -> DT O4 O0008 : score 5.38828 : H : GLN NE2 N0053 <- 3.06 -> DT O4 P0012 : score 4.92109 : w : GLN OE1 N0053 <- 6.42 -> DC N4 P0011 : score 3.488 : V : ALA CB N0050 <- 3.82 -> DT C7 P0012 : score 5.57098 : x : THR xxxx M0047 <- 4.28 -> DT xxx O0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx M0050 <- 4.01 -> DT xxx O0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0052 <- 3.68 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx M0053 <- 2.81 -> DT xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0057 <- 3.77 -> DG xxx O0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx N0047 <- 3.90 -> DT xxx P0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0048 <- 3.30 -> DA xxx O0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx N0052 <- 3.61 -> DT xxx O0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0057 <- 3.27 -> DG xxx P0010 : score x.xxxxx >5cm3_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF KORA, A PLASMID-ENCODED, GLOBAL TRANSCRIPTION REGULATOR organism=Escherichia coli : w : THR OG1 A0047 <- 5.91 -> DA N6 D0013 : score 3.251 : H : ARG NH2 A0048 <- 2.84 -> DG N7 C0005 : score 6.33354 A : H : ARG NH2 A0048 <- 2.77 -> DG O6 C0005 : score 6.6396 A : H : GLN OE1 A0053 <- 3.23 -> DC N4 D0011 : score 4.18917 : H : GLN NE2 A0053 <- 3.05 -> DT O4 D0012 : score 4.93147 : H : GLN NE2 A0053 <- 3.09 -> DT O4 C0008 : score 4.88995 : x : ALA xxxx A0050 <- 4.05 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0052 <- 3.72 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0057 <- 3.82 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx >5cm3_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF KORA, A PLASMID-ENCODED, GLOBAL TRANSCRIPTION REGULATOR organism=Escherichia coli : w : THR OG1 A0047 <- 5.91 -> DA N6 D0013 : score 3.251 : H : ARG NH2 A0048 <- 2.84 -> DG N7 C0005 : score 6.33354 A : H : ARG NH2 A0048 <- 2.77 -> DG O6 C0005 : score 6.6396 A : H : GLN OE1 A0053 <- 3.23 -> DC N4 D0011 : score 4.18917 : H : GLN NE2 A0053 <- 3.05 -> DT O4 D0012 : score 4.93147 : H : GLN NE2 A0053 <- 3.09 -> DT O4 C0008 : score 4.88995 : w : THR OG1 B0047 <- 5.78 -> DA N6 C0013 : score 3.251 : H : ARG NE B0048 <- 2.71 -> DG N7 D0005 : score 4.50139 : H : ARG NH2 B0048 <- 2.69 -> DG O6 D0005 : score 6.7452 : H : GLN OE1 B0053 <- 3.12 -> DC N4 C0011 : score 4.29 : H : GLN NE2 B0053 <- 2.99 -> DT O4 C0012 : score 4.99377 : V : ALA CB B0050 <- 3.89 -> DT C7 C0012 : score 5.473 : x : ALA xxxx A0050 <- 4.05 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0052 <- 3.72 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0057 <- 3.82 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0052 <- 3.71 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0057 <- 4.32 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx >5cmx_H:Trypsin-like_serine_proteases; title=X-RAY STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN HUMAN ALPHA THROMBIN AND A DUPLEX/QUADRUPLEX 31-MER DNA APTAMER organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE H0075 <- 2.68 -> DT O2 A0021 : score 2.63877 : H : ARG NH2 H0075 <- 2.21 -> DT O4 A0012 : score 3.9732 : H : GLU OE2 H0077 <- 2.73 -> DT N3 A0011 : score 2.6728 : H : ARG NH1 H0077 <- 2.94 -> DT O2 A0012 : score 4.18583 : x : ILE xxxx H0024 <- 3.71 -> DT xxx A0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0071 <- 3.96 -> DT xxx A0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0076 <- 3.71 -> DT xxx A0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0078 <- 4.06 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0079 <- 3.47 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0082 <- 4.36 -> DT xxx A0020 : score x.xxxxx >5cnq_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HOLLIDAY JUNCTION-RESOLVING ENZYME GEN1 (WT) IN COMPLEX WITH PRODUCT DNA, MG2+ AND MN2+ IONS organism=Chaetomium thermophilum : H : LYS NZ A0004 <- 3.15 -> DG O6 H0019 : score 5.37612 >5co0_O: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MTERF1 Y288A SUBSTITUTION BOUND TO THE TERMINATION SEQUENCE. organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 O0165 <- 2.89 -> DC N4 D0015 : score 5.66413 : H : ARG NH1 O0169 <- 3.24 -> DG N7 E0007 : score 5.5176 : H : ARG NH2 O0169 <- 2.81 -> DG O6 E0007 : score 6.5868 : H : ARG NH1 O0202 <- 2.98 -> DG O6 D0014 : score 5.86433 : H : ARG NH2 O0202 <- 2.50 -> DG O6 E0008 : score 6.996 : H : ARG NH1 O0251 <- 2.63 -> DG O6 E0011 : score 6.29017 : H : ARG NH2 O0251 <- 2.82 -> DA N7 E0010 : score 1.66511 : H : ARG NH2 O0251 <- 2.82 -> DA N7 E0010 : score 1.66511 : H : ARG NH1 O0350 <- 2.75 -> DG O6 D0007 : score 6.14417 : H : ARG NH2 O0350 <- 2.68 -> DG N7 D0007 : score 6.53785 : H : ARG NH2 O0350 <- 2.95 -> DG O6 D0007 : score 6.402 : H : ARG NH1 O0387 <- 2.52 -> DG O6 E0018 : score 6.424 : H : ARG NH2 O0387 <- 2.72 -> DG N7 E0018 : score 6.48677 : V : ASN CG O0199 <- 3.50 -> DT C7 D0011 : score 2.84682 : x : TYR xxxx O0128 <- 4.11 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0130 <- 3.39 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0195 <- 4.02 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx O0240 <- 4.37 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0242 <- 3.50 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0243 <- 3.67 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx O0246 <- 3.74 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx O0283 <- 3.93 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0284 <- 3.19 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx O0285 <- 3.58 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx O0288 <- 3.49 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx O0319 <- 3.92 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx O0353 <- 3.56 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx O0384 <- 4.32 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx >5co8_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HOLLIDAY JUNCTION-RESOLVING ENZYME GEN1 (WT) IN COMPLEX WITH PRODUCT DNA AND MG2+ ION organism=? : x : LYS xxxx A0004 <- 3.59 -> DA xxx H0018 : score x.xxxxx >5cp2_B:Nucleotidyltransferase;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE LAMBDA L431A MUTANT- APOENZYME AND COMPLEX WITH 6 PAIRED DNA organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 B0464 <- 6.05 -> DC O2 T0009 : score 2.699 : H : TYR OH B0505 <- 2.49 -> DA N3 P0005 : score 4.40866 : H : ASN ND2 B0513 <- 3.17 -> DC O2 P0006 : score 4.14801 : H : ARG NH2 B0514 <- 3.12 -> DG O6 T0006 : score 6.1776 : x : ALA xxxx B0510 <- 3.71 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0517 <- 3.60 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >5cp6_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH ADDUCTS FROM THE ANTICANCER COMPOUND, [(ETA6-5,8,9,10-TETRAHYDROANTHRACENE)RU(ETHYLENEDIAMINE)CL][PF6] organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.79 -> DA N3 J0009 : score 3.24622 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.32 -> DA N3 I0009 : score 2.90281 : H : ARG NH2 H0030 <- 2.99 -> DG N3 I0048 : score 3.47307 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.44 -> DT xxx I0069 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.73 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.87 -> DC xxx I-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.20 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.31 -> DT xxx J0069 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.90 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.71 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx >5cp6_H:Histone-fold; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH ADDUCTS FROM THE ANTICANCER COMPOUND, [(ETA6-5,8,9,10-TETRAHYDROANTHRACENE)RU(ETHYLENEDIAMINE)CL][PF6] organism=? : H : ARG NH2 H0030 <- 2.99 -> DG N3 I0048 : score 3.47307 >5cpi_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME CONTAINING UNMETHYLATED SAT2R DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 C0011 <- 2.81 -> DT O2 I0031 : score 4.2978 : H : ARG NH1 D0033 <- 2.68 -> DG N3 J0123 : score 3.12583 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.16 -> DG xxx J0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0049 <- 4.33 -> DT xxx J0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.26 -> DC xxx J0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.46 -> DG xxx J0100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.90 -> DT xxx J0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.14 -> DT xxx J0131 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.16 -> DT xxx J0142 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0063 <- 4.31 -> DC xxx J0059 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.70 -> DA xxx I0099 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0035 <- 4.16 -> DT xxx I0082 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.24 -> DT xxx I0110 : score x.xxxxx >5cpi_E:Histone-fold; title=NUCLEOSOME CONTAINING UNMETHYLATED SAT2R DNA organism=HOMO SAPIENS : x : TYR xxxx E0041 <- 4.16 -> DT xxx J0142 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0063 <- 4.31 -> DC xxx J0059 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.70 -> DA xxx I0099 : score x.xxxxx >5cpj_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME CONTAINING METHYLATED SAT2R DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 E0040 <- 2.99 -> DT O2 I0082 : score 4.14277 : x : TYR xxxx A0041 <- 3.75 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0064 <- 4.32 -> DA xxx J0093 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.75 -> DT xxx J0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.50 -> DT xxx J0131 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.95 -> DT xxx I0026 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.05 -> DG xxx J0143 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.44 -> DA xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.59 -> DA xxx I0099 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.11 -> DG xxx I0111 : score x.xxxxx >5cpk_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME CONTAINING METHYLATED SAT2L DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.93 -> DT O2 J0083 : score 4.12327 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.08 -> DT O2 I0082 : score 4.06525 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.91 -> DT O2 I0082 : score 4.1402 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.65 -> DT xxx J0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.13 -> DA xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.09 -> DT xxx J0111 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.09 -> DT xxx I0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.96 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.18 -> DT xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.42 -> DG xxx I0110 : score x.xxxxx >5cpk_C:Histone-fold; title=NUCLEOSOME CONTAINING METHYLATED SAT2L DNA organism=? : x : ARG xxxx C0042 <- 4.09 -> DT xxx J0111 : score x.xxxxx >5cqq_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DROSOPHILA ZESTE DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=Drosophila melanogaster : H : LYS NZ A0117 <- 2.70 -> DG O6 D0009 : score 5.89638 : H : ASN ND2 A0121 <- 3.07 -> DA N7 D0008 : score 5.55351 : H : ARG NH1 A0125 <- 2.35 -> DG O6 D0007 : score 6.63083 : H : ARG NH2 A0125 <- 3.23 -> DG N7 D0007 : score 5.83554 : x : ARG xxxx A0055 <- 3.55 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0120 <- 4.29 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0124 <- 4.01 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >5cr0_A:Nucleotidyltransferase;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE LAMBDA L431A MUTANT- MGDCTP BINARY AND COMPLEX WITH 6 PAIRED DNA organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0505 <- 2.87 -> DA N3 P0005 : score 4.09316 : H : ASN ND2 A0513 <- 3.10 -> DC O2 P0006 : score 4.21072 : x : GLN xxxx A0464 <- 4.42 -> DC xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0510 <- 3.56 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.55 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0517 <- 3.07 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0529 <- 4.41 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >5cr2_A:Cell_growth_inhibitor/plasmid_maintenance_toxic_component; title=E. COLI MAZF IN COMPLEX WITH SINGLE STRAND DNA SUBSTRATE ANALOG organism=Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) : H : LYS NZ A0056 <- 3.02 -> DA N7 D0005 : score 2.80794 : x : TRP xxxx A0014 <- 4.16 -> DU xxx D0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0020 <- 4.17 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0023 <- 3.10 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0025 <- 2.16 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0026 <- 4.09 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0029 <- 3.68 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0030 <- 3.53 -> DU xxx D0002 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0051 <- 4.17 -> DU xxx D0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0053 <- 3.23 -> DU xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0058 <- 3.27 -> DU xxx D0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0061 <- 4.02 -> DU xxx D0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0068 <- 3.07 -> DU xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0069 <- 3.41 -> DU xxx D0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 4.31 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0077 <- 4.26 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx >5crj_O: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MTERF1 F322A SUBSTITUTION BOUND TO THE TERMINATION SEQUENCE. organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 O0165 <- 2.93 -> DC N4 D0015 : score 5.61798 : H : ARG NH1 O0169 <- 3.38 -> DG N7 E0007 : score 5.3482 : H : ARG NH2 O0169 <- 2.88 -> DG O6 E0007 : score 6.4944 : w : ASN OD1 O0199 <- 6.81 -> DC N4 D0012 : score 2.732 : H : ARG NH1 O0202 <- 2.52 -> DG O6 D0014 : score 6.424 : H : ARG NH1 O0202 <- 3.17 -> DG O6 E0008 : score 5.63317 : H : ARG NH2 O0202 <- 2.80 -> DG O6 E0008 : score 6.6 : H : ARG NH1 O0251 <- 3.06 -> DG O6 E0011 : score 5.767 : H : ARG NH2 O0251 <- 3.00 -> DA N7 E0010 : score 1.60492 : H : SER OG O0285 <- 2.43 -> DA N6 E0012 : score 3.53318 : H : ARG NH1 O0350 <- 3.02 -> DG O6 D0007 : score 5.81567 : H : ARG NH2 O0350 <- 2.77 -> DG N7 D0007 : score 6.42292 : H : ARG NH2 O0350 <- 3.07 -> DG O6 D0007 : score 6.2436 : H : ARG NH1 O0387 <- 2.69 -> DG O6 E0018 : score 6.21717 : H : ARG NH2 O0387 <- 2.95 -> DG N7 E0018 : score 6.19308 : V : ASN CG O0199 <- 3.53 -> DT C7 D0011 : score 2.82696 : x : TYR xxxx O0128 <- 4.17 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0130 <- 3.30 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx O0159 <- 3.92 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0162 <- 3.05 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0195 <- 3.46 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0198 <- 3.90 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx O0240 <- 4.23 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0242 <- 3.36 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0243 <- 3.48 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx O0247 <- 4.37 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx O0280 <- 3.17 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0284 <- 3.48 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx O0288 <- 3.25 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx O0319 <- 3.96 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx O0353 <- 3.49 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx O0384 <- 4.33 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx >5crk_O: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MTERF1 F243A SUBSTITUTION BOUND TO THE TERMINATION SEQUENCE. organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 O0165 <- 3.07 -> DC N4 D0015 : score 5.45648 : H : ARG NH1 O0169 <- 3.13 -> DG N7 E0007 : score 5.6507 : H : ARG NH2 O0169 <- 2.75 -> DG O6 E0007 : score 6.666 : H : ARG NH1 O0202 <- 2.72 -> DG O6 D0014 : score 6.18067 : H : ARG NH2 O0202 <- 2.31 -> DG O6 E0008 : score 7.2468 : H : ARG NH1 O0251 <- 2.93 -> DG O6 E0011 : score 5.92517 : H : ARG NH1 O0251 <- 2.93 -> DG O6 E0011 : score 5.92517 : H : ARG NH2 O0251 <- 2.97 -> DA N7 E0010 : score 1.61495 : H : ASP OD2 O0283 <- 3.05 -> DC N4 D0012 : score 5.89 : H : ASP OD2 O0283 <- 3.05 -> DC N4 D0012 : score 5.89 : H : ARG NH1 O0350 <- 2.87 -> DG O6 D0007 : score 5.99817 : H : ARG NH2 O0350 <- 3.09 -> DG N7 D0007 : score 6.01431 : H : ASP OD2 O0353 <- 3.16 -> DC N4 E0015 : score 5.7536 : H : ARG NH1 O0387 <- 2.72 -> DG O6 E0018 : score 6.18067 : H : ARG NH2 O0387 <- 3.05 -> DG N7 E0018 : score 6.06538 : x : TYR xxxx O0128 <- 4.13 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0130 <- 3.54 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0162 <- 3.53 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0198 <- 3.94 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx O0199 <- 2.76 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx O0243 <- 3.63 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx O0246 <- 4.18 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx O0247 <- 3.75 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0284 <- 4.32 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx O0285 <- 3.49 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx O0288 <- 3.50 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx O0317 <- 4.35 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0322 <- 3.36 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx O0384 <- 4.34 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx >5crx_A:lambda_integrase-like,_N-terminal_domain;DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=ASYMMETRIC DNA-BENDING IN THE CRE-LOXP SITE-SPECIFIC RECOMBINATION SYNAPSE organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ A0086 <- 2.54 -> DG O6 D0015 : score 6.08137 : H : GLN NE2 A0090 <- 3.20 -> DT O4 C0023 : score 4.77574 : w : LYS NZ A0132 <- 6.61 -> DT O2 C0025 : score 0.522 : w : ARG NH1 A0243 <- 5.50 -> DT O2 C0033 : score 1.855 : H : LYS NZ A0244 <- 2.41 -> DT O2 D0003 : score 3.86698 : H : ARG NE A0259 <- 2.89 -> DG O6 C0028 : score 3.87009 : H : ARG NH2 A0259 <- 2.77 -> DG N7 C0028 : score 6.42292 : x : HIS xxxx A0040 <- 3.70 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.72 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0044 <- 3.42 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 4.22 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.15 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 4.18 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 3.74 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.52 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0262 <- 3.36 -> DC xxx C0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0282 <- 3.30 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx >5crx_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=ASYMMETRIC DNA-BENDING IN THE CRE-LOXP SITE-SPECIFIC RECOMBINATION SYNAPSE organism=Enterobacteria phage P1 : H : LYS NZ A0086 <- 2.54 -> DG O6 D0015 : score 6.08137 : H : GLN NE2 A0090 <- 3.20 -> DT O4 C0023 : score 4.77574 : w : LYS NZ A0132 <- 6.61 -> DT O2 C0025 : score 0.522 : w : ARG NH1 A0243 <- 5.50 -> DT O2 C0033 : score 1.855 : H : LYS NZ A0244 <- 2.41 -> DT O2 D0003 : score 3.86698 : H : ARG NE A0259 <- 2.89 -> DG O6 C0028 : score 3.87009 : H : ARG NH2 A0259 <- 2.77 -> DG N7 C0028 : score 6.42292 : H : LYS NZ B0086 <- 2.87 -> DG N7 C0015 : score 5.31049 : H : LYS NZ B0201 <- 3.06 -> DT O2 D0023 : score 3.40065 : H : ARG NH2 B0243 <- 2.93 -> DT O2 D0033 : score 4.12327 : H : LYS NZ B0244 <- 2.74 -> DT O2 C0003 : score 3.63023 : H : ARG NE B0259 <- 2.52 -> DG O6 D0028 : score 4.16172 : H : ARG NH2 B0259 <- 2.59 -> DG N7 D0028 : score 6.65277 : w : ARG NH2 B0282 <- 5.58 -> DA N3 D0026 : score 2.092 : x : HIS xxxx A0040 <- 3.70 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.72 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0044 <- 3.42 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 4.22 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.15 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 4.18 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 3.74 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 3.52 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0262 <- 3.36 -> DC xxx C0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0282 <- 3.30 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0040 <- 3.58 -> DT xxx D0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0041 <- 3.96 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0044 <- 3.65 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.70 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.70 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0090 <- 3.63 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0241 <- 4.02 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 3.71 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0262 <- 3.16 -> DA xxx D0026 : score x.xxxxx >5cy1_AB:Resolvase-like;Homeodomain-like; title=TN3 RESOLVASE - SITE III COMPLEX CRYSTAL FORM I organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0172 <- 2.77 -> DG N7 C0005 : score 6.0863 : H : ARG NH2 A0172 <- 2.87 -> DG O6 C0005 : score 6.5076 : H : SER OG A0173 <- 3.13 -> DA N7 D0024 : score 4.16947 : H : THR OG1 B0126 <- 2.47 -> DG N3 D0017 : score 1.8368 : H : ASN OD1 B0127 <- 3.47 -> DG N2 C0016 : score 4.1568 : H : ARG NH2 B0130 <- 2.69 -> DT O2 C0018 : score 4.32647 : H : ARG NH1 B0172 <- 2.95 -> DG N7 D0005 : score 5.8685 : H : ARG NH2 B0172 <- 3.02 -> DG O6 D0005 : score 6.3096 : H : SER OG B0173 <- 2.56 -> DG N7 C0024 : score 4.69719 : H : SER OG B0173 <- 3.26 -> DG O6 C0024 : score 3.71465 : H : LYS NZ B0177 <- 3.26 -> DA N7 C0022 : score 2.66696 : x : PHE xxxx A0140 <- 3.53 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0142 <- 3.43 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0171 <- 4.18 -> DC xxx D0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0174 <- 3.73 -> DC xxx D0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0176 <- 3.49 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0177 <- 3.72 -> DC xxx D0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0123 <- 3.92 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0140 <- 4.28 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0142 <- 3.51 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0162 <- 4.38 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0171 <- 4.07 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0174 <- 3.72 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0176 <- 3.35 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx >5cy1_B:Resolvase-like;Homeodomain-like; title=TN3 RESOLVASE - SITE III COMPLEX CRYSTAL FORM I organism=Escherichia coli : H : THR OG1 B0126 <- 2.47 -> DG N3 D0017 : score 1.8368 : H : ASN OD1 B0127 <- 3.47 -> DG N2 C0016 : score 4.1568 : H : ARG NH2 B0130 <- 2.69 -> DT O2 C0018 : score 4.32647 : H : ARG NH1 B0172 <- 2.95 -> DG N7 D0005 : score 5.8685 : H : ARG NH2 B0172 <- 3.02 -> DG O6 D0005 : score 6.3096 : H : SER OG B0173 <- 2.56 -> DG N7 C0024 : score 4.69719 : H : SER OG B0173 <- 3.26 -> DG O6 C0024 : score 3.71465 : H : LYS NZ B0177 <- 3.26 -> DA N7 C0022 : score 2.66696 : V : TYR CG B0176 <- 3.56 -> DT C7 D0006 : score 3.96603 : x : LEU xxxx B0123 <- 3.92 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0140 <- 4.28 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0142 <- 3.51 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0162 <- 4.38 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0171 <- 4.07 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0174 <- 3.72 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx >5cy2_A:Resolvase-like;Homeodomain-like; title=TN3 RESOLVASE - SITE III COMPLEX CRYSTAL FORM II organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0172 <- 3.06 -> DG N7 C0005 : score 5.7354 : H : SER OG A0173 <- 2.83 -> DA N7 D0024 : score 4.43732 : x : PHE xxxx A0140 <- 3.38 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0142 <- 3.19 -> DA xxx D0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0171 <- 4.41 -> DA xxx D0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0174 <- 3.46 -> DC xxx D0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0176 <- 3.45 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0177 <- 3.59 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >5cy2_AB:Resolvase-like;Homeodomain-like; title=TN3 RESOLVASE - SITE III COMPLEX CRYSTAL FORM II organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0172 <- 3.06 -> DG N7 C0005 : score 5.7354 : H : SER OG A0173 <- 2.83 -> DA N7 D0024 : score 4.43732 : H : THR OG1 B0126 <- 2.69 -> DG N3 D0017 : score 1.76098 : H : ARG NH2 B0130 <- 2.98 -> DT O2 C0018 : score 4.08093 : H : ARG NH1 B0172 <- 2.95 -> DG N7 D0005 : score 5.8685 : H : ARG NH2 B0172 <- 3.11 -> DG O6 D0005 : score 6.1908 : H : SER OG B0173 <- 2.45 -> DG N7 C0024 : score 4.79579 : H : LYS NZ B0177 <- 2.61 -> DA N7 C0022 : score 3.04879 : x : PHE xxxx A0140 <- 3.38 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0142 <- 3.19 -> DA xxx D0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0171 <- 4.41 -> DA xxx D0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0174 <- 3.46 -> DC xxx D0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0176 <- 3.45 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0177 <- 3.59 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0123 <- 4.25 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0127 <- 3.19 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0140 <- 3.93 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0142 <- 3.35 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0174 <- 3.85 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0176 <- 3.29 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx >5cy2_EF:Resolvase-like;Homeodomain-like; title=TN3 RESOLVASE - SITE III COMPLEX CRYSTAL FORM II organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 E0142 <- 3.15 -> DA N3 H0021 : score 3.42431 : H : ARG NH1 E0172 <- 2.87 -> DG N7 G0005 : score 5.9653 : H : ARG NH2 E0172 <- 2.78 -> DG O6 G0005 : score 6.6264 : H : SER OG E0173 <- 2.94 -> DA N7 H0024 : score 4.33911 : H : THR OG1 F0126 <- 2.79 -> DG N3 H0017 : score 1.72652 : H : ARG NH2 F0130 <- 3.05 -> DT O2 G0018 : score 4.02167 : H : ARG NH1 F0172 <- 3.32 -> DG N7 H0005 : score 5.4208 : H : ARG NH2 F0172 <- 3.25 -> DG O6 H0005 : score 6.006 : H : SER OG F0173 <- 2.59 -> DG N7 G0024 : score 4.6703 : H : LYS NZ F0177 <- 3.27 -> DA N7 G0022 : score 2.66108 : x : PHE xxxx E0140 <- 3.47 -> DC xxx G0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0174 <- 4.03 -> DC xxx H0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0176 <- 3.35 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0177 <- 3.78 -> DC xxx H0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0123 <- 4.26 -> DG xxx H0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0127 <- 3.35 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0140 <- 4.34 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0142 <- 3.47 -> DA xxx H0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0162 <- 4.40 -> DT xxx H0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0171 <- 4.44 -> DG xxx G0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0174 <- 3.79 -> DG xxx G0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0176 <- 2.89 -> DG xxx H0005 : score x.xxxxx >5cys_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=STRUCTURE OF THE ENZYME-PRODUCT COMPLEX RESULTING FROM TDG ACTION ON A GCAC MISMATCH organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0158 <- 6.20 -> DT O2 C0013 : score 3.682 : H : GLN OE1 A0278 <- 2.86 -> DG N2 D0018 : score 5.5404 : H : GLN OE1 A0278 <- 2.86 -> DG N2 D0018 : score 5.5404 : H : GLN NE2 A0278 <- 2.80 -> DT O2 D0019 : score 3.93333 : x : SER xxxx A0200 <- 4.31 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0274 <- 3.34 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.67 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0276 <- 3.30 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 3.56 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0280 <- 3.54 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >5czz_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF STAPHYLOCOCCUS AUREUS CAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA (TTGAAT PAM) organism=Staphylococcus aureus subsp. aureus : w : ASN OD1 A0885 <- 6.26 -> DC O2 C0006 : score 2.172 : H : ASN ND2 A0985 <- 2.57 -> DA N7 D0004 : score 6.14056 : w : ASN OD1 A0985 <- 5.41 -> DA N7 D0005 : score 2.277 : w : ASN OD1 A0985 <- 5.63 -> DA N6 D0005 : score 2.837 : w : ASN ND2 A0986 <- 5.63 -> DA N7 D0005 : score 1.989 : H : ARG NH2 A0991 <- 2.58 -> DT O4 D0006 : score 3.71022 : w : ARG NH2 A0991 <- 5.36 -> DA N7 D0005 : score 1.486 : H : ARG NH1 A1015 <- 2.88 -> DG O6 D0003 : score 5.986 : H : ARG NH2 A1015 <- 3.23 -> DG N7 D0003 : score 5.83554 : V : PRO CG A1013 <- 3.63 -> DT C7 C0004 : score 6.62923 : V : LEU CD2 A0989 <- 3.68 -> DT C7 D0006 : score 5.90322 : x : ARG xxxx A1002 <- 4.19 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx >5d23_A: title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF STPR FROM BOMBYX MORI IN COMPLEX WITH 13-BP DNA DERIVED FROM THE +290 SITE OF FIBROIN GENE organism=Bombyx mori : w : ARG NH1 A0130 <- 6.26 -> DA N7 B-007 : score 0.388 : w : ARG NH1 A0153 <- 5.55 -> DT O4 B-010 : score 1.768 : V : MET CG A0134 <- 3.56 -> DT C7 B-008 : score 6.15126 : x : SER xxxx A0135 <- 4.21 -> DT xxx B-008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0137 <- 3.66 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0138 <- 3.81 -> DT xxx B-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0141 <- 4.25 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0142 <- 4.11 -> DT xxx B-010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0157 <- 3.38 -> DT xxx B-010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0158 <- 4.27 -> DT xxx B-012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0160 <- 3.60 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0161 <- 3.86 -> DC xxx B-013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0165 <- 3.96 -> DT xxx B-014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0176 <- 3.96 -> DT xxx B-014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0180 <- 3.02 -> DA xxx B-016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0183 <- 3.50 -> DA xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0187 <- 4.42 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx >5d2q_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF STPR FROM BOMBYX MORI IN COMPLEX WITH 20-BP DNA DERIVED FROM +290 SITE OF THE FIBROIN GENE organism=Bombyx mori : w : ARG NH1 A0141 <- 5.70 -> DG O6 B-009 : score 2.756 : w : ARG NH1 A0153 <- 6.21 -> DT O4 B-010 : score 1.768 : w : ARG NE A0176 <- 5.99 -> DT O4 B-014 : score 1.317 : H : ARG NH1 A0179 <- 2.85 -> DG N7 B0013 : score 5.9895 : V : ARG CZ A0164 <- 3.74 -> DT C7 B0011 : score 2.16429 : x : ALA xxxx A0115 <- 4.02 -> DT xxx B-004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0117 <- 4.34 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0134 <- 2.97 -> DA xxx B-007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0135 <- 4.13 -> DT xxx B-008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0137 <- 3.31 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0138 <- 4.11 -> DT xxx B-008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0157 <- 2.82 -> DT xxx B-012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0160 <- 3.50 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0161 <- 4.07 -> DT xxx B-012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0165 <- 4.12 -> DT xxx B-014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0180 <- 3.39 -> DA xxx B0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0183 <- 3.62 -> DA xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0187 <- 3.65 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx >5d2s_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF STPR FROM BOMBYX MORI IN COMPLEX WITH 18-BP DNA CONTAINING FOUR REPETITIVE UNITS OF ATAC organism=Bombyx mori : w : ARG NH1 A0107 <- 5.96 -> DT O4 B-006 : score 1.768 : w : ARG NH1 A0118 <- 5.68 -> DT O4 B0007 : score 1.768 : w : ARG NH1 A0118 <- 6.10 -> DG O6 B-009 : score 2.756 : w : ARG NH1 A0130 <- 6.14 -> DT O4 B-010 : score 1.768 : w : ARG NH1 A0153 <- 5.83 -> DT O4 B-014 : score 1.768 : H : MET SD A0157 <- 3.44 -> DA N6 B-015 : score 5.21076 : w : ARG NH1 A0164 <- 5.86 -> DT O4 B0015 : score 1.768 : w : ARG NH1 A0176 <- 5.63 -> DT O4 B-018 : score 1.768 : H : MET SD A0180 <- 3.22 -> DA N6 B-019 : score 5.47369 : V : LEU CD1 A0142 <- 3.76 -> DT C7 B-014 : score 5.78859 : V : LEU CD1 A0165 <- 3.83 -> DT C7 B-018 : score 5.6883 : V : ARG CZ A0118 <- 3.57 -> DT C7 B0007 : score 2.25492 : x : MET xxxx A0111 <- 3.42 -> DT xxx B-006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0112 <- 3.81 -> DT xxx B-008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0114 <- 3.74 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0115 <- 4.30 -> DT xxx B-008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0119 <- 4.28 -> DT xxx B-010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0134 <- 3.08 -> DT xxx B-012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0135 <- 4.28 -> DT xxx B-012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0137 <- 3.65 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0138 <- 4.28 -> DT xxx B-012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0158 <- 3.99 -> DT xxx B-016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0160 <- 4.22 -> DC xxx B0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0161 <- 4.22 -> DT xxx B-016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0183 <- 3.72 -> DA xxx B0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0184 <- 3.97 -> DT xxx B-020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0187 <- 3.91 -> DT xxx B0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0188 <- 3.91 -> DT xxx B-022 : score x.xxxxx >5d39_AC:p53-like_transcription_factors;SH2_domain;STAT; title=TRANSCRIPTION FACTOR-DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : HIS NE2 A0415 <- 2.97 -> DG O6 M0013 : score 7.68342 : H : ASN ND2 A0417 <- 3.03 -> DT O4 N0007 : score 5.04152 : H : HIS NE2 C0415 <- 3.04 -> DG O6 N0013 : score 7.57206 : H : ASN ND2 C0417 <- 3.20 -> DT O4 M0007 : score 4.86185 : V : VAL CG1 A0414 <- 3.66 -> DT C7 N0008 : score 6.27263 : x : LYS xxxx A0284 <- 4.49 -> DT xxx M0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0418 <- 3.95 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0284 <- 4.12 -> DA xxx N0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0414 <- 3.91 -> DT xxx M0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0418 <- 3.84 -> DT xxx M0007 : score x.xxxxx >5d39_B:p53-like_transcription_factors;SH2_domain;STAT; title=TRANSCRIPTION FACTOR-DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : HIS NE2 B0415 <- 2.88 -> DG O6 E0013 : score 7.82658 : H : ASN ND2 B0417 <- 3.14 -> DT O4 F0007 : score 4.92526 : V : VAL CG1 B0414 <- 3.62 -> DT C7 F0008 : score 6.33324 : x : LYS xxxx B0284 <- 4.06 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0418 <- 4.02 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx >5d39_BD:p53-like_transcription_factors;SH2_domain;STAT; title=TRANSCRIPTION FACTOR-DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : HIS NE2 B0415 <- 2.88 -> DG O6 E0013 : score 7.82658 : H : ASN ND2 B0417 <- 3.14 -> DT O4 F0007 : score 4.92526 : H : ASN ND2 D0417 <- 3.24 -> DT O4 E0007 : score 4.81957 : V : VAL CG1 B0414 <- 3.62 -> DT C7 F0008 : score 6.33324 : x : LYS xxxx B0284 <- 4.06 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0418 <- 4.02 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0284 <- 3.86 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0414 <- 4.42 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0415 <- 3.24 -> DG xxx F0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0418 <- 3.69 -> DT xxx E0007 : 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x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 3.52 -> DG xxx F0033 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 3.83 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.18 -> DG xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.47 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 4.06 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx >5d4b_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURAL BASIS FOR A NEW TEMPLATED ACTIVITY BY TERMINAL DEOXYNUCLEOTIDYL TRANSFERASE: IMPLICATIONS FOR V(D)J RECOMBINATION organism=? : x : SER xxxx A0187 <- 3.37 -> DT xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0190 <- 3.52 -> DT xxx F0001 : score x.xxxxx >5d4b_AB: title=STRUCTURAL BASIS FOR A NEW TEMPLATED ACTIVITY BY TERMINAL DEOXYNUCLEOTIDYL TRANSFERASE: IMPLICATIONS FOR V(D)J RECOMBINATION organism=MUS MUSCULUS : x : SER xxxx A0187 <- 3.37 -> DT xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0190 <- 3.52 -> DT xxx F0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0189 <- 4.38 -> DT xxx 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>5d4e_M:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS PRODUCT COMPLEX FOR TRANSCRIPTION INITIATION WITH 3'-DEPHOSPHATE-COA AND CTP organism=? : H : ARG NH1 M0243 <- 2.54 -> DG O6 S0009 : score 6.39967 : H : ARG NH2 M0243 <- 2.73 -> DG O6 S0009 : score 6.6924 : x : PRO xxxx M0247 <- 3.63 -> DG xxx S0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx M0256 <- 3.72 -> DG xxx S0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0266 <- 3.10 -> DG xxx S0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx M0421 <- 4.49 -> DG xxx R0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0422 <- 3.49 -> DC xxx S0016 : score x.xxxxx >5d4e_MNP: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS PRODUCT COMPLEX FOR TRANSCRIPTION INITIATION WITH 3'-DEPHOSPHATE-COA AND CTP organism=? : H : ARG NH1 M0243 <- 2.54 -> DG O6 S0009 : score 6.39967 : H : ARG NH2 M0243 <- 2.73 -> DG O6 S0009 : score 6.6924 : H : ARG NE P0082 <- 2.90 -> DG O6 S0008 : score 3.86221 : H : ASN OD1 P0191 <- 2.93 -> DT N3 S0006 : score 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6.15 -> DA N6 U0034 : score 1.486 : H : HIS NE2 B0042 <- 2.55 -> DG O6 U0032 : score 8.35154 A : x : GLU xxxx B0030 <- 4.22 -> DA xxx T0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0040 <- 3.95 -> DC xxx U0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.49 -> DT xxx T0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0061 <- 2.92 -> DA xxx U0037 : score x.xxxxx >5d4s_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARAR(DBD) IN COMPLEX WITH OPERATOR ORX1 organism=Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) : H : HIS NE2 A0042 <- 2.78 -> DG O6 T0013 : score 7.98566 : w : HIS ND1 A0042 <- 6.43 -> DC N4 T0012 : score 2.515 : H : GLN NE2 A0061 <- 2.85 -> DT O2 T0018 : score 3.894 : x : GLU xxxx A0030 <- 3.98 -> DC xxx U0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0040 <- 3.98 -> DC xxx T0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0045 <- 3.41 -> DT xxx U0008 : score x.xxxxx >5d4s_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARAR(DBD) IN COMPLEX WITH OPERATOR ORX1 organism=Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) : H : HIS NE2 A0042 <- 2.78 -> DG O6 T0013 : score 7.98566 : w : HIS ND1 A0042 <- 6.43 -> DC N4 T0012 : score 2.515 : H : GLN NE2 A0061 <- 2.85 -> DT O2 T0018 : score 3.894 : H : ARG NH1 B0041 <- 2.80 -> DG O6 T0009 : score 6.08333 : H : ARG NH2 B0041 <- 2.65 -> DG N7 T0009 : score 6.57615 : w : ARG NH1 B0041 <- 6.33 -> DA N6 U0013 : score 1.486 : w : HIS ND1 B0042 <- 5.41 -> DG O6 U0011 : score 4.006 : x : GLU xxxx A0030 <- 3.98 -> DC xxx U0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0040 <- 3.98 -> DC xxx T0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0045 <- 3.41 -> DT xxx U0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0030 <- 4.14 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0031 <- 4.46 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0040 <- 3.58 -> DC xxx U0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.47 -> DT xxx T0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0061 <- 3.06 -> DA xxx U0016 : score x.xxxxx >5d5u_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN HSF1 WITH HSE DNA organism=Homo sapiens : V : ARG CG B0071 <- 3.67 -> DT C7 A0004 : score 1.03779 : x : SER xxxx B0068 <- 3.50 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0072 <- 3.52 -> DT xxx A0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0075 <- 4.47 -> DT xxx A0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0117 <- 3.55 -> DG xxx A0002 : score x.xxxxx >5d5v_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN HSF1 WITH SATELLITE III REPEAT DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NE B0071 <- 2.88 -> DG O6 A0008 : score 3.87797 : H : ARG NH2 B0071 <- 2.97 -> DG N7 A0008 : score 6.16754 : w : ASN OD1 B0074 <- 5.73 -> DG N7 A0007 : score 1.873 : w : ARG NH1 B0117 <- 6.03 -> DA N6 C0002 : score 1.486 : x : SER xxxx B0068 <- 3.63 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0070 <- 4.46 -> DT xxx A0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0072 <- 3.49 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0075 <- 4.07 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx >5d5v_BD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN HSF1 WITH SATELLITE III REPEAT DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NE B0071 <- 2.88 -> DG O6 A0008 : score 3.87797 : H : ARG NH2 B0071 <- 2.97 -> DG N7 A0008 : score 6.16754 : w : ASN OD1 B0074 <- 5.73 -> DG N7 A0007 : score 1.873 : w : ARG NH1 B0117 <- 6.03 -> DA N6 C0002 : score 1.486 : H : ARG NE D0071 <- 2.89 -> DG O6 A0003 : score 3.87009 : H : ARG NH2 D0071 <- 2.83 -> DG N7 A0003 : score 6.34631 : w : ASN OD1 D0074 <- 5.78 -> DG N7 A0002 : score 1.873 : x : SER xxxx B0068 <- 3.63 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0070 <- 4.46 -> DT xxx A0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0072 <- 3.49 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0075 <- 4.07 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0068 <- 3.59 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0072 <- 3.60 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0117 <- 3.56 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx >5d5w_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CHAETOMIUM THERMOPHILUM SKN7 WITH HSE DNA organism=Chaetomium thermophilum : w : LYS NZ B0087 <- 6.08 -> DG N2 A0001 : score 0.846 : V : ARG CB B0096 <- 3.75 -> DT C7 A0004 : score 1.01769 >5d5x_BE:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CHAETOMIUM THERMOPHILUM SKN7 WITH SSRE DNA organism=Chaetomium thermophilum : H : ARG NE B0096 <- 2.87 -> DG O6 D0010 : score 3.88585 : H : ARG NH2 B0096 <- 2.82 -> DG N7 D0010 : score 6.35908 : w : ASN OD1 B0099 <- 5.59 -> DG N7 D0009 : score 1.873 : H : LYS NZ B0100 <- 2.61 -> DG O6 D0011 : score 6.00044 : w : LYS NZ B0100 <- 6.27 -> DG N7 A0002 : score 2.519 : H : ARG NE E0096 <- 2.88 -> DG O6 A0007 : score 3.87797 : H : ARG NH2 E0096 <- 2.91 -> DG N7 A0007 : score 6.24415 : w : ASN OD1 E0099 <- 5.41 -> DA N7 A0006 : score 2.277 : H : LYS NZ E0100 <- 2.69 -> DG O6 D0006 : score 5.90795 : x : SER xxxx B0093 <- 3.51 -> DC xxx A0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0095 <- 4.18 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0142 <- 3.81 -> DG xxx A0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0093 <- 3.88 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0142 <- 3.66 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >5d5x_E:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CHAETOMIUM THERMOPHILUM SKN7 WITH SSRE DNA organism=Chaetomium thermophilum : H : ARG NE E0096 <- 2.88 -> DG O6 A0007 : score 3.87797 : H : ARG NH2 E0096 <- 2.91 -> DG N7 A0007 : score 6.24415 : w : ASN OD1 E0099 <- 5.41 -> DA N7 A0006 : score 2.277 : H : LYS NZ E0100 <- 2.69 -> DG O6 D0006 : score 5.90795 : x : SER xxxx E0093 <- 3.88 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0142 <- 3.66 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >5d8c_A:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HINMLR, A MERR FAMILY REGULATOR LACKING THE SENSOR DOMAIN, BOUND TO PROMOTER DNA organism=Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) / Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) : V : PHE CB A0021 <- 3.63 -> DT C7 C0013 : score 6.04757 : V : TYR CZ A0017 <- 3.71 -> DT C7 C0015 : score 5.70503 : x : ARG xxxx A0020 <- 3.31 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0024 <- 3.28 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx >5d8c_AB:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HINMLR, A MERR FAMILY REGULATOR LACKING THE SENSOR DOMAIN, BOUND TO PROMOTER DNA organism=Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) / Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) / Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) / Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) : w : LYS NZ B0024 <- 5.69 -> DA N6 C0004 : score 2.097 : w : ASN OD1 B0038 <- 5.51 -> DC O2 C0001 : score 2.172 : V : PHE CB A0021 <- 3.63 -> DT C7 C0013 : score 6.04757 : V : TYR CZ A0017 <- 3.71 -> DT C7 C0015 : score 5.70503 : V : PHE CB B0021 <- 3.71 -> DT C7 D0013 : score 5.93155 : V : TYR CZ B0017 <- 3.84 -> DT C7 D0015 : score 5.52369 : x : ARG xxxx A0020 <- 3.31 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0024 <- 3.28 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0020 <- 3.39 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx >5d8k_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN HSF2 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO 2-SITE HSE DNA AT 1.73 ANGSTROMS RESOLUTION organism=Homo sapiens : w : LYS NZ B0054 <- 5.52 -> DG N3 A0002 : score 2.232 A : w : ARG NH2 B0109 <- 5.38 -> DT O4 A0003 : score 2.366 : V : ARG CB B0063 <- 3.80 -> DT C7 A0004 : score 1.00513 : x : SER xxxx B0060 <- 3.57 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0064 <- 3.61 -> DT xxx A0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0067 <- 4.39 -> DT xxx A0003 : score x.xxxxx >5d8l_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN HSF2 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH 3-SITE HSE DNA AT 2.1 ANGSTROMS RESOLUTION organism=Homo sapiens : H : ARG NE D0063 <- 2.80 -> DG O6 A0013 : score 3.94103 : H : ARG NH2 D0063 <- 3.02 -> DG N7 A0013 : score 6.10369 : w : ASN ND2 D0066 <- 5.89 -> DA N7 A0012 : score 1.989 : x : SER xxxx D0060 <- 3.78 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0062 <- 4.35 -> DT xxx A0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0064 <- 3.60 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0067 <- 4.18 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0109 <- 3.02 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >5d8l_DF:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN HSF2 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH 3-SITE HSE DNA AT 2.1 ANGSTROMS RESOLUTION organism=Homo sapiens : H : ARG NE D0063 <- 2.80 -> DG O6 A0013 : score 3.94103 : H : ARG NH2 D0063 <- 3.02 -> DG N7 A0013 : score 6.10369 : w : ASN ND2 D0066 <- 5.89 -> DA N7 A0012 : score 1.989 : w : LYS NZ F0054 <- 6.06 -> DG N3 E0002 : score 2.232 : H : ARG NE F0063 <- 2.87 -> DG O6 G0013 : score 3.88585 : H : ARG NH2 F0063 <- 3.09 -> DG N7 G0013 : score 6.01431 : w : ASN ND2 F0066 <- 5.64 -> DA N7 G0012 : score 1.989 : w : ARG NH2 F0109 <- 5.96 -> DG O6 E0002 : score 2.468 : x : SER xxxx D0060 <- 3.78 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0062 <- 4.35 -> DT xxx A0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0064 <- 3.60 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0067 <- 4.18 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0109 <- 3.02 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0060 <- 3.45 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0062 <- 4.36 -> DT xxx G0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0064 <- 3.42 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0067 <- 4.37 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx >5d9i_A:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=SV40 LARGE T ANTIGEN ORIGIN BINDING DOMAIN BOUND TO ARTIFICIAL DNA FORK organism=SIMIAN VIRUS 40 : x : ASN xxxx A0153 <- 3.93 -> DG xxx Y0021 : score x.xxxxx >5d9i_AB:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=SV40 LARGE T ANTIGEN ORIGIN BINDING DOMAIN BOUND TO ARTIFICIAL DNA FORK organism=SIMIAN VIRUS 40 : x : ASN xxxx A0153 <- 3.93 -> DG xxx Y0021 : score x.xxxxx >5d9y_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF TET2-5FC COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : w : ARG NH2 A1302 <- 5.48 -> DA N3 B0008 : score 2.092 : x : TRP xxxx A1291 <- 4.06 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1293 <- 3.32 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1294 <- 3.29 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1295 <- 3.34 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1386 <- 3.84 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx >5dac_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=ATP-GAMMA-S BOUND RAD50 FROM CHAETOMIUM THERMOPHILUM IN COMPLEX WITH DNA organism=? : x : ARG xxxx A0061 <- 2.75 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >5db6_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA HOST-GUEST COMPLEX WITH THE N7MG BASE PAIRED WITH A DC organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.37 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.54 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.65 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5db7_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA HOST-GUEST COMPLEX WITH THE N7MG BASE PAIRED WITH A DT organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.26 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.79 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.54 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5db8_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA HOST-GUEST COMPLEX WITH THE N7MG BASE PAIRED WITH A DA organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.08 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.72 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.74 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5db9_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA HOST-GUEST COMPLEX WITH THE N7MG BASE PAIRED WITH A DG organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.26 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.79 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.63 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5dba_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA HOST-GUEST COMPLEX WITH THE DG BASE PAIRED WITH A DT organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.34 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.72 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.53 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5dbb_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA HOST-GUEST COMPLEX WITH THE DG BASE PAIRED WITH A DA organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.71 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.59 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5dbc_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA HOST-GUEST COMPLEX WITH THE DG BASE PAIRED WITH A DG organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.32 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.84 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.54 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5ddg_A:Nudix;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE STRUCTURE OF TRANSCRIPTIONAL FACTOR ARAR FROM BACTEROIDES THETAIOTAOMICRON VPI IN COMPLEX WITH TARGET DOUBLE STRAND DNA organism=? : H : LYS NZ A0179 <- 2.79 -> DG N7 C0007 : score 5.39667 : H : LYS NZ A0179 <- 2.82 -> DG O6 C0007 : score 5.75765 : H : ASN OD1 A0181 <- 2.97 -> DA N6 D0018 : score 5.81705 : H : ASN ND2 A0181 <- 3.15 -> DA N7 D0018 : score 5.45958 : H : LYS NZ A0204 <- 2.98 -> DG N3 D0026 : score 1.40151 : H : ARG NH1 A0205 <- 2.76 -> DA N3 C0006 : score 3.71151 : H : ARG NH1 A0205 <- 3.07 -> DT O2 D0023 : score 4.07386 : x : ASP xxxx A0178 <- 3.22 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0180 <- 3.10 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0183 <- 3.60 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0184 <- 3.20 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >5ddg_AB: title=THE STRUCTURE OF TRANSCRIPTIONAL FACTOR ARAR FROM BACTEROIDES THETAIOTAOMICRON VPI IN COMPLEX WITH TARGET DOUBLE STRAND DNA organism=? : H : LYS NZ A0179 <- 2.79 -> DG N7 C0007 : score 5.39667 : H : LYS NZ A0179 <- 2.82 -> DG O6 C0007 : score 5.75765 : H : ASN OD1 A0181 <- 2.97 -> DA N6 D0018 : score 5.81705 : H : ASN ND2 A0181 <- 3.15 -> DA N7 D0018 : score 5.45958 : H : LYS NZ A0204 <- 2.98 -> DG N3 D0026 : score 1.40151 : H : ARG NH1 A0205 <- 2.76 -> DA N3 C0006 : score 3.71151 : H : ARG NH1 A0205 <- 3.07 -> DT O2 D0023 : score 4.07386 : H : ASP OD2 B0178 <- 3.18 -> DC N4 C0019 : score 5.7288 : H : LYS NZ B0179 <- 2.63 -> DG N7 D0007 : score 5.56902 : H : LYS NZ B0179 <- 2.91 -> DG O6 D0007 : score 5.65359 : H : ASN OD1 B0181 <- 3.04 -> DA N6 C0018 : score 5.73275 : H : ASN ND2 B0181 <- 3.06 -> DA N7 C0018 : score 5.56525 : H : LYS NZ B0204 <- 2.93 -> DG N3 C0026 : score 1.41605 : H : ARG NH1 B0205 <- 2.99 -> DG N3 D0006 : score 2.93657 : x : ASP xxxx A0178 <- 3.22 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0180 <- 3.10 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0183 <- 3.60 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0184 <- 3.20 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0180 <- 3.13 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0183 <- 3.79 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0184 <- 3.71 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >5ddm_B:Nucleotidyltransferase;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE LAMBDA- APOENZYME AND COMPLEX WITH 6 PAIRED DNA organism=Homo sapiens : H : TYR OH B0505 <- 2.35 -> DA N3 P0005 : score 4.5249 : H : ASN ND2 B0513 <- 3.10 -> DC O2 P0006 : score 4.21072 : H : ARG NE B0514 <- 3.21 -> DG O6 T0006 : score 3.61786 : x : GLN xxxx B0464 <- 4.34 -> DC xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0510 <- 3.53 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0517 <- 3.42 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >5deu_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF TET2-5HMC COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : w : SER OG A1292 <- 6.14 -> DG N3 B0007 : score 2.344 : w : TYR OH A1295 <- 5.42 -> DG N3 B0008 : score 3.344 : x : TRP xxxx A1291 <- 3.61 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1293 <- 3.29 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1294 <- 3.37 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1302 <- 3.62 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx >5dff_A:DNase_I-like; title=HUMAN APE1 PRODUCT COMPLEX organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0177 <- 3.36 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0229 <- 4.14 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 3.71 -> DG xxx V0010 : score x.xxxxx >5dfh_A:DNase_I-like; title=HUMAN APE1 MISMATCH PRODUCT COMPLEX organism=Homo sapiens : w : ASN OD1 A0226 <- 5.91 -> DG N7 D0003 : score 1.873 : x : ARG xxxx A0177 <- 3.49 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0229 <- 4.03 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 4.14 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx >5dfi_A:DNase_I-like; title=HUMAN APE1 PHOSPHOROTHIOATE SUBSTRATE COMPLEX organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0098 <- 6.40 -> DC O2 V0015 : score 1.3 : w : LYS NZ A0098 <- 5.53 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : TYR OH A0128 <- 2.62 -> DC O2 P0008 : score 3.62334 : w : ARG NH1 A0177 <- 6.09 -> DG O6 V0012 : score 2.756 : w : ARG NH2 A0177 <- 5.93 -> DG O6 V0012 : score 2.468 : w : ASN OD1 A0226 <- 5.75 -> DG N7 P0013 : score 1.873 : x : ASN xxxx A0229 <- 2.85 -> DC xxx P0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0269 <- 4.29 -> DG xxx V0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 3.32 -> DG xxx V0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0271 <- 3.87 -> DG xxx P0013 : score x.xxxxx >5dfj_A:DNase_I-like; title=HUMAN APE1 E96Q/D210N MISMATCH SUBSTRATE COMPLEX organism=Homo sapiens : w : ASP OD1 A0070 <- 6.42 -> DT O2 P0010 : score 2.105 : w : ASP OD2 A0070 <- 5.36 -> DC O2 V0013 : score 1.919 : w : LYS NZ A0098 <- 5.54 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0098 <- 6.31 -> DC O2 V0015 : score 1.3 : H : TYR OH A0128 <- 2.68 -> DC O2 P0008 : score 3.58137 : w : ASN OD1 A0226 <- 6.16 -> DG N7 P0013 : score 1.873 : w : ASN ND2 A0229 <- 5.68 -> DG O6 P0013 : score 2.971 : w : ASP OD2 A0308 <- 5.84 -> DG N2 V0012 : score 1.62 : x : ARG xxxx A0177 <- 4.22 -> DT xxx P0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0269 <- 3.91 -> DG xxx V0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 3.18 -> DG xxx V0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0271 <- 2.99 -> DG xxx V0010 : score x.xxxxx >5dg0_A:DNase_I-like; title=HUMAN APE1 PHOSPHOROTHIOATE SUBSTRATE COMPLEX WITH MN2+ organism=Homo sapiens : w : ASP OD1 A0070 <- 5.35 -> DC O2 V0013 : score 1.919 : H : TYR OH A0128 <- 2.57 -> DC O2 P0008 : score 3.65832 : x : LYS xxxx A0098 <- 3.81 -> DG xxx V0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0177 <- 3.39 -> DG xxx V0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0229 <- 3.24 -> DC xxx P0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0269 <- 4.21 -> DG xxx V0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 3.48 -> DG xxx V0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0271 <- 3.66 -> DC xxx P0012 : score x.xxxxx >5dg7_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING DTTP ACROSS A DNA TEMPLATE CONTAINING 1,N6-ETHENODEOXYADENOSINE LESION organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0324 <- 6.06 -> DA N7 T0005 : score 1.989 : H : ARG NH1 A0382 <- 3.06 -> DG N7 P0004 : score 5.7354 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.11 -> DG O6 P0004 : score 6.1908 : x : SER xxxx A0322 <- 4.07 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.62 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0421 <- 3.96 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5dg8_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING DAMPNPP ACROSS A DNA TEMPLATE CONTAINING 1,N6-ETHENODEOXYADENOSINE LESION organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0324 <- 6.25 -> DA N7 T0005 : score 1.989 : H : ARG NH1 A0382 <- 3.25 -> DG N7 P0004 : score 5.5055 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.09 -> DG O6 P0004 : score 6.2172 : x : SER xxxx A0322 <- 3.83 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.55 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 3.84 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5dg9_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING DGMPNPP ACROSS A DNA TEMPLATE CONTAINING 1,N6-ETHENODEOXYADENOSINE LESION organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 2.83 -> DG N7 P0004 : score 6.0137 : H : ARG NH2 A0382 <- 2.99 -> DG O6 P0004 : score 6.3492 : x : SER xxxx A0322 <- 3.86 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.15 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.14 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5dga_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA EXTENDING AN 1,N6- ETHENODEOXYADENOSINE : DT PAIR BY INSERTING DTMPNPP OPPOSITE TEMPLATE DA organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 3.11 -> DA N3 T0004 : score 3.77725 : H : ARG NH1 A0382 <- 2.93 -> DG N7 P0004 : score 5.8927 : H : ARG NH2 A0382 <- 2.96 -> DG O6 P0004 : score 6.3888 : x : ILE xxxx A0048 <- 3.59 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.97 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.40 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.13 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5dgb_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA EXTENDING AN 1,N6- ETHENODEOXYADENOSINE : DA PAIR BY INSERTING DTMPNPP OPPOSITE TEMPLATE DA organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 3.09 -> DA N3 T0004 : score 3.79336 : H : ARG NH1 A0382 <- 2.92 -> DG N7 P0004 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.07 -> DG O6 P0004 : score 6.2436 : x : ILE xxxx A0048 <- 3.83 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.61 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.77 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.56 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.42 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5dlf_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING DATP OPPOSITE O4-METHYLHYMIDINE organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.32 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.51 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >5dlg_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING DGMPNPP OPPOSITE O4-METHYLHYMIDINE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.20 -> DG N7 P0004 : score 5.566 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.22 -> DG O6 P0004 : score 6.0456 : x : ARG xxxx A0061 <- 3.47 -> DT xxx P0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.43 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5dlj_ABCDEF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CAS-DNA-N1 COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI K12 : x : TYR xxxx D0022 <- 3.23 -> DG xxx G0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0056 <- 3.79 -> DG xxx G0029 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0080 <- 4.07 -> DG xxx G0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0022 <- 3.19 -> DG xxx H0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0056 <- 3.75 -> DG xxx H0029 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0080 <- 4.09 -> DG xxx H0029 : score x.xxxxx >5dlj_D: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CAS-DNA-N1 COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI K12 : x : TYR xxxx D0022 <- 3.23 -> DG xxx G0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0056 <- 3.79 -> DG xxx G0029 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0080 <- 4.07 -> DG xxx G0029 : score x.xxxxx >5dnm_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING ADDUCTS OF RUTHENIUM(II)-TOLUENE PTA COMPLEX organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.76 -> DA N3 J0009 : score 3.26566 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.29 -> DA N3 I0009 : score 3.32121 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.95 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.92 -> DC xxx I-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.86 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.14 -> DG xxx J0047 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.05 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.11 -> DC xxx J-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.98 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.07 -> DT xxx J-036 : score x.xxxxx >5dnn_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING ADDUCTS OF GOLD(I)- TRIETHYLPHOSPHANE AND RUTHENIUM(II)-TOLUENE PTA COMPLEXES organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.71 -> DA N3 J0009 : score 3.29806 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.28 -> DA N3 I0009 : score 3.32857 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.89 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.85 -> DC xxx I-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.84 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.10 -> DG xxx J0047 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.94 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.17 -> DC xxx J-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.99 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.98 -> DT xxx J-036 : score x.xxxxx >5dnn_D:Histone-fold; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING ADDUCTS OF GOLD(I)- TRIETHYLPHOSPHANE AND RUTHENIUM(II)-TOLUENE PTA COMPLEXES organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx D0030 <- 4.10 -> DG xxx J0047 : score x.xxxxx >5dny_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF THE ATPRS-MRE11/RAD50-DNA COMPLEX organism=? : H : SER OG B0054 <- 2.36 -> DT O2 F-010 : score 4.02281 : x : ARG xxxx B0092 <- 3.16 -> DA xxx F-005 : score x.xxxxx >5dny_BD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF THE ATPRS-MRE11/RAD50-DNA COMPLEX organism=? : H : SER OG B0054 <- 2.36 -> DT O2 F-010 : score 4.02281 : H : SER OG D0054 <- 3.21 -> DT O2 F-020 : score 3.39425 : x : ARG xxxx B0092 <- 3.16 -> DA xxx F-005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0092 <- 3.69 -> DC xxx E0025 : score x.xxxxx >5dqg_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING DAMPNPP OPPOSITE O4-ETHYLTHYMIDINE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 2.60 -> DG N7 P0004 : score 6.292 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.11 -> DG O6 P0004 : score 6.1908 : x : SER xxxx A0322 <- 3.75 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.36 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.46 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5dqh_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING DGMPNPP OPPOSITE O4-ETHYLTHYMIDINE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 2.95 -> DG N7 P0004 : score 5.8685 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.16 -> DG O6 P0004 : score 6.1248 : x : SER xxxx A0322 <- 3.77 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.44 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.49 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5dqi_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA EXTENDING AN O4- ETHYLTHYMIDINE : DA PAIR BY INSERTING DCTP OPPOSITE DG organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0111 <- 2.86 -> DC N3 P0009 : score 1.51873 : H : ARG NH2 A0111 <- 2.99 -> DC O2 P0009 : score 3.55817 : V : SER CB A0062 <- 3.51 -> DT C7 T0003 : score 3.3583 : x : GLN xxxx A0038 <- 3.15 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 3.33 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.24 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0064 <- 4.28 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0113 <- 4.08 -> DC xxx P0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0114 <- 3.68 -> DC xxx P0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 4.27 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 4.14 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.50 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >5dqt_ABCDEFK: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CAS-DNA-22 COMPLEX organism=? : x : TYR xxxx D0022 <- 2.94 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0056 <- 3.42 -> DT xxx G0029 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0080 <- 4.19 -> DT xxx G0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0022 <- 3.10 -> DC xxx G0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0056 <- 4.08 -> DG xxx H0028 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0080 <- 3.88 -> DG xxx H0028 : score x.xxxxx >5dqt_IJLMN: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CAS-DNA-22 COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI K12 : x : TYR xxxx L0022 <- 3.11 -> DT xxx P0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx L0056 <- 3.49 -> DT xxx O0029 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0080 <- 3.99 -> DT xxx O0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx I0022 <- 3.03 -> DC xxx O0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0056 <- 3.99 -> DG xxx P0028 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0080 <- 3.77 -> DG xxx P0028 : score x.xxxxx >5dqu_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CAS-DNA-10 COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI K12 : x : TYR xxxx A0022 <- 2.60 -> DC xxx H0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0056 <- 3.47 -> DC xxx H0010 : score x.xxxxx >5dqu_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CAS-DNA-10 COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI K12 : x : TYR xxxx D0022 <- 2.68 -> DC xxx I0610 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0056 <- 3.60 -> DC xxx I0610 : score x.xxxxx >5dqz_ABCDEF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CAS-DNA-PAM COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI K12 : x : TYR xxxx D0022 <- 3.08 -> DG xxx H0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0056 <- 4.13 -> DG xxx H0029 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0080 <- 3.49 -> DG xxx H0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0022 <- 3.10 -> DG xxx G0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0056 <- 4.18 -> DG xxx G0029 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0080 <- 3.50 -> DG xxx G0029 : score x.xxxxx >5ds4_ABCDEF: title=CRYSTAL STRUCTURE THE ESCHERICHIA COLI CAS1-CAS2 COMPLEX BOUND TO PROTOSPACER DNA organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : TYR xxxx A0022 <- 3.04 -> DT xxx G0023 : score x.xxxxx : x 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ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : TYR xxxx A0022 <- 3.04 -> DT xxx G0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0056 <- 4.11 -> DT xxx G0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0022 <- 3.19 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0037 <- 4.40 -> DA xxx G0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0056 <- 4.02 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0080 <- 4.24 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx >5ds5_C: title=CRYSTAL STRUCTURE THE ESCHERICHIA COLI CAS1-CAS2 COMPLEX BOUND TO PROTOSPACER DNA AND MG organism=? : x : TYR xxxx C0022 <- 3.19 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0037 <- 4.40 -> DA xxx G0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0056 <- 4.02 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0080 <- 4.24 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx >5ds6_ABCDEF: title=CRYSTAL STRUCTURE THE ESCHERICHIA COLI CAS1-CAS2 COMPLEX BOUND TO PROTOSPACER DNA WITH SPLAYED 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DG N2 D0004 : score 5.5404 : H : GLN NE2 A0086 <- 3.04 -> DG N3 D0004 : score 4.73681 : H : ARG NE A0090 <- 2.79 -> DC O2 D0007 : score 2.66429 : H : ARG NH2 A0090 <- 3.12 -> DC O2 D0007 : score 3.462 : H : ARG NE A0174 <- 3.03 -> DG O6 C0004 : score 3.75974 : H : ARG NH2 A0174 <- 2.96 -> DG N7 C0004 : score 6.18031 : H : LYS NZ A0200 <- 2.84 -> DT O4 C0006 : score 3.55848 : w : GLU OE2 A0214 <- 5.25 -> DA N6 D0001 : score 2.785 : w : GLU OE2 A0214 <- 6.18 -> DA N7 D0001 : score 1.687 : w : GLU OE2 A0214 <- 6.22 -> DG N7 D0000 : score 2.669 : w : LYS NZ A0224 <- 6.07 -> DA N7 D0001 : score 1.655 : H : GLN OE1 B0086 <- 2.93 -> DG N2 C0004 : score 5.46189 : H : GLN NE2 B0086 <- 3.08 -> DG N3 C0004 : score 4.69701 : H : ARG NE B0090 <- 2.70 -> DC O2 C0007 : score 2.71215 : H : ARG NH2 B0090 <- 3.05 -> DC O2 C0007 : score 3.51378 : H : LYS NZ B0200 <- 2.98 -> DT O4 D0006 : score 3.45804 : w : GLU OE2 B0214 <- 6.17 -> DA N6 C0001 : score 2.785 : V : PHE CD1 A0202 <- 3.86 -> DT C7 C0006 : 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: ARG NE A0090 <- 2.88 -> DC O2 C0007 : score 2.61643 : H : ARG NH2 A0090 <- 3.15 -> DC O2 C0007 : score 3.43981 : H : GLU OE2 A0173 <- 2.96 -> DC N4 C0003 : score 5.09689 : H : ARG NE A0174 <- 2.94 -> DG O6 D0004 : score 3.83068 : H : ARG NH2 A0174 <- 3.22 -> DG N7 D0004 : score 5.84831 : H : LYS NZ A0200 <- 2.88 -> DT O4 D0006 : score 3.52978 : w : GLU OE1 A0214 <- 5.91 -> DA N6 C0001 : score 2.939 : w : LYS NZ A0224 <- 5.63 -> DA N7 C0001 : score 1.655 : H : GLN OE1 B0086 <- 2.88 -> DG N2 D0004 : score 5.51797 : H : GLN NE2 B0086 <- 2.95 -> DG N3 D0004 : score 4.82637 : H : ARG NE B0090 <- 2.92 -> DC O2 D0007 : score 2.59516 : H : ARG NH2 B0090 <- 3.17 -> DC O2 D0007 : score 3.42501 : H : GLU OE1 B0173 <- 3.22 -> DC N4 D0002 : score 5.28344 : H : GLU OE2 B0173 <- 2.90 -> DC N4 D0003 : score 5.16008 : H : ARG NE B0174 <- 2.98 -> DG O6 C0004 : score 3.79915 : H : ARG NH2 B0174 <- 3.20 -> DG N7 C0004 : score 5.87385 : H : LYS NZ B0200 <- 2.94 -> DT O4 C0006 : score 3.48674 : w : GLU OE1 B0214 <- 5.86 -> DA N6 D0001 : score 2.939 : w : LYS NZ B0224 <- 5.71 -> DA N7 D0001 : score 1.655 : V : PHE CD2 B0202 <- 3.89 -> DT C7 C0006 : score 6.36528 : x : VAL xxxx A0089 <- 3.33 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0120 <- 2.73 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0170 <- 4.29 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0172 <- 4.24 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0202 <- 3.50 -> DG xxx C0000 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0203 <- 3.70 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0089 <- 3.33 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0120 <- 2.91 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0170 <- 4.32 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0172 <- 4.16 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0203 <- 3.80 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx >5dy0_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL OF AMTR FROM CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM IN COMPLEX WITH DNA organism=Corynebacterium glutamicum : H : GLN OE1 A0053 <- 3.29 -> DA N6 E0016 : score 5.45941 : H : GLN NE2 A0053 <- 3.20 -> DA N7 E0016 : score 5.60256 : x : VAL xxxx A0005 <- 3.70 -> DA xxx E0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0007 <- 3.28 -> DT xxx E0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0042 <- 4.30 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0043 <- 3.98 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0052 <- 3.78 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0054 <- 3.21 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0055 <- 3.40 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0057 <- 3.50 -> DA xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0058 <- 3.43 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx >5dy0_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL OF AMTR FROM CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM IN COMPLEX WITH DNA organism=Corynebacterium glutamicum : H : GLN OE1 A0053 <- 3.29 -> DA N6 E0016 : score 5.45941 : H : GLN NE2 A0053 <- 3.20 -> DA N7 E0016 : score 5.60256 : H : GLN OE1 B0053 <- 2.85 -> DA N6 F0016 : score 5.99204 : H : GLN NE2 B0053 <- 2.81 -> DA N7 F0016 : score 6.07756 : x : VAL xxxx A0005 <- 3.70 -> DA xxx E0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0007 <- 3.28 -> DT xxx E0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0042 <- 4.30 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0043 <- 3.98 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0052 <- 3.78 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0054 <- 3.21 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0055 <- 3.40 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0057 <- 3.50 -> DA xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0058 <- 3.43 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0052 <- 4.16 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0054 <- 3.24 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0057 <- 3.52 -> DA xxx F0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0058 <- 3.61 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx >5dy0_CD:Homeodomain-like; title=CRYSTAL OF AMTR FROM CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM IN COMPLEX WITH DNA organism=Corynebacterium glutamicum : H : GLN OE1 C0053 <- 2.94 -> DA N6 H0016 : score 5.88309 : H : GLN NE2 C0053 <- 2.53 -> DA N7 H0016 : score 6.41859 : H : ARG NH1 D0007 <- 3.43 -> DT O2 G0021 : score 3.7638 : H : GLN OE1 D0053 <- 2.76 -> DA N6 G0016 : score 6.10098 : H : GLN NE2 D0053 <- 2.76 -> DA N7 G0016 : score 6.13846 : x : ARG xxxx C0007 <- 3.27 -> DT xxx H0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0052 <- 3.97 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0054 <- 3.10 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0055 <- 3.79 -> DC xxx G0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0057 <- 3.60 -> DT xxx H0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0058 <- 3.55 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0005 <- 3.74 -> DT xxx H0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0042 <- 4.46 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0043 <- 4.14 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0052 <- 3.80 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0054 <- 3.10 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0055 <- 3.78 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0057 <- 3.64 -> DT xxx G0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0058 <- 3.45 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx >5e01_AB:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HINMLR, A MERR FAMILY REGULATOR LACKING THE SENSOR DOMAIN, BOUND TO PALYNDROMIC PROMOTER DNA organism=Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) / Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) / Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) / Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) : w : LYS NZ B0024 <- 5.85 -> DA N6 C0004 : score 2.097 : V : PHE CB B0021 <- 3.75 -> DT C7 D0013 : score 5.87354 : V : TYR CZ B0017 <- 3.89 -> DT C7 D0015 : score 5.45395 : V : PHE CB A0021 <- 3.62 -> DT C7 C0013 : score 6.06207 : V : TYR CZ A0017 <- 3.79 -> DT C7 C0015 : score 5.59344 : x : ARG xxxx A0020 <- 3.44 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0024 <- 3.04 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0020 <- 3.37 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx >5e01_B:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HINMLR, A MERR FAMILY REGULATOR LACKING THE SENSOR DOMAIN, BOUND TO PALYNDROMIC PROMOTER DNA organism=Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) / Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) : w : LYS NZ B0024 <- 5.85 -> DA N6 C0004 : score 2.097 : V : PHE CB B0021 <- 3.75 -> DT C7 D0013 : score 5.87354 : V : TYR CZ B0017 <- 3.89 -> DT C7 D0015 : score 5.45395 : x : ARG xxxx B0020 <- 3.37 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx >5e17_CDF: title=T. THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX HAVING A RRR DISCRIMINATOR SEQUENCE AND A NONTEMPLATE-STRAND LENGTH CORRESPONDING TO TSS SELECTION AT POSITION 7 (RPO-GGG-7) organism=? : x : GLU xxxx C0421 <- 3.88 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 3.41 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >5e18_CDF: title=T. THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX HAVING A YYY DISCRIMINATOR SEQUENCE AND A NONTEMPLATE-STRAND LENGTH CORRESPONDING TO TSS SELECTION AT POSITION 8 (RPO-CCC-8) organism=? : x : GLU xxxx C0421 <- 4.29 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 3.04 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx >5e24_E:DNA-binding_protein_LAG-1_CSL;p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=STRUCTURE OF THE SU(H)-HAIRLESS-DNA REPRESSOR COMPLEX organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : w : GLU OE1 E0137 <- 5.59 -> DC N4 G0009 : score 3.528 : w : GLU OE1 E0137 <- 5.52 -> DC N4 G0010 : score 3.528 : H : ARG NH2 E0139 <- 2.71 -> DG N7 H0008 : score 6.49954 A : H : LYS NZ E0240 <- 2.80 -> DG N7 H0009 : score 5.3859 : H : LYS NZ E0240 <- 3.04 -> DG O6 H0010 : score 5.50329 : H : ARG NH1 E0268 <- 2.93 -> DC O2 G0012 : score 3.5551 : H : ARG NH1 E0268 <- 2.78 -> DT O2 H0007 : score 4.32364 : H : SER OG E0269 <- 3.15 -> DA N3 G0013 : score 2.79358 : x : TYR xxxx E0134 <- 3.44 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0239 <- 4.18 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx >5e3l_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27BP DNA F1-8G (AAATTGGTTTGAATTTTGAGCCAATTT) organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0085 <- 2.90 -> DG N7 D0007 : score 5.929 : H : ARG NH2 A0085 <- 3.03 -> DG O6 D0007 : score 6.2964 : x : ASN xxxx A0084 <- 3.46 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.09 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 4.33 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx >5e3l_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27BP DNA F1-8G (AAATTGGTTTGAATTTTGAGCCAATTT) organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0085 <- 2.90 -> DG N7 D0007 : score 5.929 : H : ARG NH2 A0085 <- 3.03 -> DG O6 D0007 : score 6.2964 : H : ARG NH1 B0085 <- 2.90 -> DG N7 C0007 : score 5.929 : H : ARG NH2 B0085 <- 2.92 -> DG O6 C0007 : score 6.4416 : x : ASN xxxx A0084 <- 3.46 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.09 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 4.33 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.46 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.70 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >5e3m_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27BP DNA F35 (AAATTAGTTTGAATCTCGAGCTAATTT) organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0085 <- 2.80 -> DG N7 D0007 : score 6.05 : H : ARG NH2 A0085 <- 3.17 -> DG O6 D0007 : score 6.1116 : x : ASN xxxx A0084 <- 3.20 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0090 <- 4.37 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx >5e3m_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27BP DNA F35 (AAATTAGTTTGAATCTCGAGCTAATTT) organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0085 <- 2.80 -> DG N7 D0007 : score 6.05 : H : ARG NH2 A0085 <- 3.17 -> DG O6 D0007 : score 6.1116 : H : ARG NH1 B0085 <- 2.97 -> DG N7 C0007 : score 5.8443 : H : ARG NH2 B0085 <- 3.10 -> DG O6 C0007 : score 6.204 : x : ASN xxxx A0084 <- 3.20 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0090 <- 4.37 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.29 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.92 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >5e3n_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27BP DNA F31 (AAATTTGTAGGAATTTTCTGCAAATTT) organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0085 <- 2.94 -> DG O6 D0007 : score 5.913 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.71 -> DG N7 D0007 : score 6.49954 : x : THR xxxx A0075 <- 4.30 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 3.86 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.02 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 3.36 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx >5e3n_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27BP DNA F31 (AAATTTGTAGGAATTTTCTGCAAATTT) organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0085 <- 2.94 -> DG O6 D0007 : score 5.913 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.71 -> DG N7 D0007 : score 6.49954 : H : ARG NH1 B0085 <- 2.97 -> DG N7 C0007 : score 5.8443 : H : ARG NH2 B0085 <- 3.14 -> DG O6 C0007 : score 6.1512 : x : THR xxxx A0075 <- 4.30 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 3.86 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.02 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 3.36 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 4.15 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.86 -> DC xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.26 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >5e3o_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27BP DNA F32 (AAATTTGGAGGAATTTTCTCCAAATTT) organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0085 <- 2.70 -> DG N7 D0007 : score 6.171 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.70 -> DG O6 D0007 : score 6.732 : H : ARG NH1 B0085 <- 2.86 -> DG N7 C0007 : score 5.9774 : H : ARG NH2 B0085 <- 3.12 -> DG O6 C0007 : score 6.1776 : x : THR xxxx A0075 <- 4.24 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 3.75 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.96 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 3.33 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 4.32 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.75 -> DC xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.39 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx >5e3o_B:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FIS BOUND TO 27BP DNA F32 (AAATTTGGAGGAATTTTCTCCAAATTT) organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 B0085 <- 2.86 -> DG N7 C0007 : score 5.9774 : H : ARG NH2 B0085 <- 3.12 -> DG O6 C0007 : score 6.1776 : x : THR xxxx B0075 <- 4.32 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.75 -> DC xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.39 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx >5e41_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH 5-(N-(10- HYDROXYDECANOYL)-AMINOPENTENYL)-2'-DEOXYURIDINE-TRIPHOSPHATE organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.88 -> DC O2 B0109 : score 2.89902 : w : LYS NZ A0540 <- 5.48 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.98 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.60 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.91 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.73 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.67 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.03 -> DG N3 B0110 : score 4.66971 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.57 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : GLN xxxx A0754 <- 4.43 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >5e5a_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE CHROMATIN-TETHERING DOMAIN OF HUMAN CYTOMEGALOVIRUS IE1 PROTEIN BOUND TO THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.04 -> DA N3 J0229 : score 3.08424 : H : ARG NH1 D0026 <- 3.19 -> DT O2 J0191 : score 3.97051 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.08 -> DA N3 I0082 : score 3.47586 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.58 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.79 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.69 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.28 -> DG xxx J0268 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.47 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.77 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.11 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.14 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.02 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >5e5a_E:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE CHROMATIN-TETHERING DOMAIN OF HUMAN CYTOMEGALOVIRUS IE1 PROTEIN BOUND TO THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 E0040 <- 3.08 -> DA N3 I0082 : score 3.47586 : x : TYR xxxx E0041 <- 4.47 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.77 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.11 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx >5e5o_A:Homing_endonucleases; title=I-SMAMI BOUND TO UNCLEAVED DNA TARGET IN THE PRESENCE OF CALCIUM IONS organism=Sordaria macrospora (strain ATCC MYA-333 / DSM 997 / K(L3346) / K-hell) / Sordaria macrospora (strain ATCC MYA-333 / DSM 997 / K(L3346) / K-hell) : H : ARG NH1 A0026 <- 3.17 -> DG N7 B0019 : score 5.6023 : H : ARG NH1 A0028 <- 3.32 -> DG O6 B0020 : score 5.45067 : H : ARG NH2 A0028 <- 3.21 -> DG N7 B0020 : score 5.86108 : H : TYR OH A0033 <- 2.63 -> DA N7 C0004 : score 4.29243 : H : TYR OH A0033 <- 3.05 -> DA N6 C0004 : score 4.43699 : w : SER OG A0044 <- 6.30 -> DG N7 B0016 : score 2.749 : w : THR OG1 A0046 <- 6.21 -> DG N7 B0016 : score 3.422 : w : THR OG1 A0046 <- 5.39 -> DG O6 B0016 : score 2.729 : H : SER OG A0071 <- 3.08 -> DC N4 C0010 : score 3.46981 : w : SER OG A0071 <- 5.27 -> DG O6 B0016 : score 2.749 : w : SER OG A0077 <- 5.77 -> DC N4 C0009 : score 2.105 : H : ARG NH1 A0079 <- 2.72 -> DG O6 B0017 : score 6.18067 : H : ARG NH2 A0079 <- 3.28 -> DG N7 B0017 : score 5.77169 : H : ARG NH2 A0079 <- 3.07 -> DG O6 B0017 : score 6.2436 : H : GLU OE1 A0081 <- 2.99 -> DC N4 C0007 : score 5.54877 : H : LYS NZ A0183 <- 2.88 -> DG N7 C0018 : score 5.29972 : H : LYS NZ A0187 <- 3.16 -> DG N7 C0021 : score 4.99811 : H : LYS NZ A0187 <- 2.80 -> DT O4 C0022 : score 3.58718 : H : SER OG A0191 <- 2.70 -> DG N7 B0002 : score 4.57169 : H : GLN OE1 A0197 <- 3.07 -> DA N6 B0004 : score 5.72573 : H : GLN NE2 A0197 <- 2.98 -> DA N7 B0004 : score 5.87051 : w : GLU OE2 A0227 <- 5.96 -> DC N4 B0008 : score 3.597 : H : ARG NH1 A0231 <- 2.65 -> DG N7 B0010 : score 6.2315 : H : ARG NH2 A0231 <- 2.64 -> DG O6 B0010 : score 6.8112 : H : TYR OH A0236 <- 3.16 -> DC N4 C0016 : score 3.91069 : V : LYS CB A0032 <- 3.71 -> DT C7 C0003 : score 2.35752 : V : LEU CD1 A0038 <- 3.85 -> DT C7 C0005 : score 5.65964 : x : SER xxxx A0022 <- 3.99 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0024 <- 3.56 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0040 <- 3.50 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0069 <- 3.88 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0185 <- 3.72 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0189 <- 4.42 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0192 <- 3.89 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0203 <- 3.93 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0205 <- 3.83 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0229 <- 4.23 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0234 <- 3.40 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 3.64 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >5e5s_A:Homing_endonucleases; title=I-SMAMI K103A MUTANT organism=Sordaria macrospora (strain ATCC MYA-333 / DSM 997 / K(L3346) / K-hell) / Sordaria macrospora (strain ATCC MYA-333 / DSM 997 / K(L3346) / K-hell) : H : ARG NH1 A0026 <- 2.92 -> DG O6 B0019 : score 5.93733 : H : ARG NH2 A0026 <- 2.67 -> DG N7 B0019 : score 6.55062 : H : ARG NH1 A0028 <- 2.74 -> DG O6 B0020 : score 6.15633 : H : ARG NH2 A0028 <- 2.86 -> DG N7 B0020 : score 6.308 : H : TYR OH A0033 <- 2.78 -> DA N7 C0004 : score 4.16789 : H : TYR OH A0033 <- 3.13 -> DA N6 C0004 : score 4.36226 : H : ARG NH1 A0079 <- 3.03 -> DG O6 B0017 : score 5.8035 : H : ARG NH2 A0079 <- 2.98 -> DG O6 B0017 : score 6.3624 : H : LYS NZ A0183 <- 3.06 -> DG N7 D0018 : score 5.10583 : H : LYS NZ A0187 <- 2.37 -> DG O6 D0021 : score 6.27792 : H : SER OG A0191 <- 2.54 -> DG N7 B0002 : score 4.71512 : H : GLN OE1 A0197 <- 2.94 -> DA N6 B0004 : score 5.88309 : H : GLN NE2 A0197 <- 2.96 -> DA N7 B0004 : score 5.89487 : H : ARG NH1 A0231 <- 2.63 -> DG N7 B0010 : score 6.2557 : H : ARG NH2 A0231 <- 2.61 -> DG O6 B0010 : score 6.8508 : H : TYR OH A0236 <- 3.09 -> DC N4 D0016 : score 3.96968 : V : LYS CB A0032 <- 3.61 -> DT C7 C0003 : score 2.41516 : V : VAL CG2 A0040 <- 3.56 -> DT C7 C0005 : score 6.49046 : V : THR CG2 A0046 <- 3.74 -> DT C7 B0015 : score 4.30048 : x : SER xxxx A0022 <- 4.24 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0024 <- 3.57 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0038 <- 3.97 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0069 <- 3.76 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0071 <- 3.15 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0075 <- 4.50 -> DA xxx B0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0081 <- 3.15 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0185 <- 3.55 -> DG xxx D0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0189 <- 4.49 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0192 <- 3.71 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0203 <- 3.39 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0205 <- 3.57 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0227 <- 3.60 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0229 <- 3.96 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0230 <- 4.40 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0234 <- 3.56 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 3.82 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >5e63_A:Homing_endonucleases; title=K262A MUTANT OF I-SMAMI organism=Sordaria macrospora (strain ATCC MYA-333 / DSM 997 / K(L3346) / K-hell) / Sordaria macrospora (strain ATCC MYA-333 / DSM 997 / K(L3346) / K-hell) : H : ARG NH1 A0026 <- 3.00 -> DG O6 C0019 : score 5.84 : H : ARG NH2 A0026 <- 2.58 -> DG N7 C0019 : score 6.66554 : H : ARG NH1 A0028 <- 2.92 -> DG O6 C0020 : score 5.93733 : H : ARG NH2 A0028 <- 2.89 -> DG N7 C0020 : score 6.26969 : H : TYR OH A0033 <- 2.60 -> DA N7 D0004 : score 4.31733 : H : SER OG A0071 <- 3.06 -> DC N4 D0010 : score 3.48451 : H : ARG NH1 A0079 <- 2.87 -> DG O6 C0017 : score 5.99817 : H : ARG NH2 A0079 <- 3.25 -> DG N7 C0017 : score 5.81 : H : GLU OE1 A0081 <- 3.36 -> DC N4 D0007 : score 5.12194 : H : LYS NZ A0183 <- 3.21 -> DG N7 E0018 : score 4.94425 : H : LYS NZ A0187 <- 2.47 -> DG N7 E0021 : score 5.74137 : H : LYS NZ A0187 <- 2.76 -> DG O6 E0021 : score 5.82702 : H : LYS NZ A0187 <- 2.81 -> DT O4 E0022 : score 3.58001 : H : SER OG A0191 <- 2.72 -> DG N7 B0002 : score 4.55376 : H : GLN OE1 A0197 <- 2.82 -> DA N6 B0004 : score 6.02835 : H : GLN NE2 A0197 <- 3.02 -> DA N7 B0004 : score 5.82179 : H : ARG NH1 A0231 <- 2.72 -> DG N7 B0010 : score 6.1468 : H : ARG NH2 A0231 <- 2.59 -> DG O6 B0010 : score 6.8772 : H : TYR OH A0236 <- 3.11 -> DC N4 E0016 : score 3.95283 : V : LYS CB A0032 <- 3.55 -> DT C7 D0003 : score 2.44974 : V : VAL CG2 A0040 <- 3.55 -> DT C7 D0005 : score 6.50577 : V : ILE CG2 A0185 <- 3.73 -> DT C7 E0020 : score 7.21538 : x : SER xxxx A0022 <- 4.08 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0024 <- 3.96 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0038 <- 3.79 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.35 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0069 <- 3.56 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0075 <- 4.28 -> DA xxx B0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0189 <- 4.34 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0192 <- 3.42 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0203 <- 3.29 -> DA xxx E0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0205 <- 3.68 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0227 <- 3.47 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0229 <- 4.05 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0234 <- 3.58 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 3.75 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >5e67_A:Homing_endonucleases; title=K103A/K262A DOUBLE MUTANT OF I-SMAMI organism=Sordaria macrospora (strain ATCC MYA-333 / DSM 997 / K(L3346) / K-hell) / Sordaria macrospora (strain ATCC MYA-333 / DSM 997 / K(L3346) / K-hell) : H : ARG NH1 A0026 <- 3.13 -> DG N7 B0019 : score 5.6507 : H : ARG NH1 A0026 <- 3.23 -> DG O6 B0019 : score 5.56017 : H : ARG NH2 A0026 <- 3.01 -> DG N7 B0019 : score 6.11646 : H : ARG NH1 A0028 <- 2.87 -> DG O6 B0020 : score 5.99817 : H : ARG NH2 A0028 <- 3.12 -> DG N7 B0020 : score 5.976 : H : TYR OH A0033 <- 2.82 -> DA N7 C0004 : score 4.13468 : w : SER OG A0044 <- 5.94 -> DG N7 B0016 : score 2.749 : w : THR OG1 A0046 <- 5.74 -> DG N7 B0016 : score 3.422 : w : THR OG1 A0046 <- 5.51 -> DG O6 B0016 : score 2.729 : H : SER OG A0071 <- 2.95 -> DC N4 C0010 : score 3.56537 : w : SER OG A0071 <- 5.35 -> DG O6 B0016 : score 2.749 : w : SER OG A0077 <- 5.65 -> DC N4 C0009 : score 2.105 : H : ARG NH1 A0079 <- 2.90 -> DG O6 B0017 : score 5.96167 : H : ARG NH2 A0079 <- 3.32 -> DG N7 B0017 : score 5.72062 : H : ARG NH2 A0079 <- 3.20 -> DG O6 B0017 : score 6.072 : w : ARG NH1 A0079 <- 5.66 -> DT O4 C0008 : score 1.768 : H : GLU OE1 A0081 <- 3.36 -> DC N4 C0007 : score 5.12194 : H : GLU OE2 A0081 <- 3.27 -> DC N4 C0007 : score 4.77044 : w : GLU OE1 A0081 <- 5.59 -> DC N4 C0006 : score 3.528 : w : GLU OE2 A0081 <- 5.68 -> DT O4 C0008 : score 2.279 : H : LYS NZ A0183 <- 2.75 -> DG N7 C0018 : score 5.43976 : w : LYS NZ A0183 <- 6.46 -> DG O6 C0019 : score 3.005 : H : LYS NZ A0187 <- 2.73 -> DG N7 C0021 : score 5.4613 : w : LYS NZ A0187 <- 6.29 -> DT O4 C0022 : score 1.7 : H : SER OG A0191 <- 2.73 -> DG N7 B0002 : score 4.5448 : H : GLN OE1 A0197 <- 3.05 -> DA N6 B0004 : score 5.74994 : H : GLN NE2 A0197 <- 3.06 -> DA N7 B0004 : score 5.77308 : w : GLN OE1 A0197 <- 6.30 -> DT O4 C0022 : score 3.068 : H : GLN NE2 A0203 <- 3.19 -> DA N7 C0017 : score 5.61474 : H : GLU OE1 A0227 <- 3.36 -> DC N4 B0007 : score 5.12194 : w : GLU OE1 A0227 <- 5.57 -> DC N4 B0008 : score 3.528 : H : ARG NH1 A0231 <- 2.91 -> DG N7 B0010 : score 5.9169 : H : ARG NH2 A0231 <- 2.83 -> DG O6 B0010 : score 6.5604 : H : TYR OH A0236 <- 2.82 -> DC N4 C0016 : score 4.19725 : V : THR CB A0046 <- 3.56 -> DT C7 B0015 : score 3.73772 : V : LYS CB A0032 <- 3.65 -> DT C7 C0003 : score 2.3921 : V : VAL CG2 A0040 <- 3.80 -> DT C7 C0005 : score 6.12308 : V : ILE CG2 A0185 <- 3.81 -> DT C7 C0020 : score 7.07355 : x : SER xxxx A0022 <- 3.85 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0024 <- 3.55 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0038 <- 3.94 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0069 <- 3.80 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0075 <- 4.26 -> DA xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0192 <- 3.81 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0199 <- 4.22 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0205 <- 3.33 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0229 <- 3.59 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0234 <- 3.68 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 3.64 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >5e69_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN - IL8 NF-KB RESPONSE ELEMENT COMPLEX organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0442 <- 5.08 -> DT O4 D0044 : score 1.7 : x : VAL xxxx A0443 <- 3.78 -> DA xxx D0042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0447 <- 3.40 -> DA xxx D0042 : score x.xxxxx >5e69_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN - IL8 NF-KB RESPONSE ELEMENT COMPLEX organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0442 <- 5.08 -> DT O4 D0044 : score 1.7 : H : ARG NH1 B0447 <- 2.88 -> DG N7 C0031 : score 5.9532 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.96 -> DG O6 C0031 : score 6.3888 : x : VAL xxxx A0443 <- 3.78 -> DA xxx D0042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0447 <- 3.40 -> DA xxx D0042 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0443 <- 4.43 -> DG xxx C0031 : score x.xxxxx >5e6a_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN - PLAU NF-KB RESPONSE ELEMENT COMPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0442 <- 2.62 -> DG N7 C0005 : score 5.57979 : H : ARG NH1 B0447 <- 2.87 -> DG N7 C0014 : score 5.9653 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.77 -> DG O6 C0014 : score 6.6396 : x : VAL xxxx A0443 <- 3.64 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0447 <- 3.49 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx >5e6a_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN - PLAU NF-KB RESPONSE ELEMENT COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0447 <- 2.87 -> DG N7 C0014 : score 5.9653 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.77 -> DG O6 C0014 : score 6.6396 >5e6b_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN - RELB NF-KB RESPONSE ELEMENT COMPLEX organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0442 <- 5.89 -> DG O6 C0006 : score 3.005 : H : ARG NH1 A0447 <- 3.19 -> DA N7 D0008 : score 2.36056 : x : VAL xxxx A0443 <- 3.52 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx >5e6b_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN - RELB NF-KB RESPONSE ELEMENT COMPLEX organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0442 <- 5.89 -> DG O6 C0006 : score 3.005 : H : ARG NH1 A0447 <- 3.19 -> DA N7 D0008 : score 2.36056 : H : ARG NH1 B0447 <- 3.21 -> DG N7 C0015 : score 5.5539 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.86 -> DG O6 C0015 : score 6.5208 : x : VAL xxxx A0443 <- 3.52 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx >5e6c_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN - CCL2 NF-KB RESPONSE ELEMENT COMPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0442 <- 2.96 -> DA N7 C0006 : score 2.84319 : H : ARG NH1 A0447 <- 3.08 -> DA N7 D0008 : score 2.41688 : H : ARG NH1 A0491 <- 3.21 -> DG N3 C0004 : score 2.80225 : V : VAL CG1 A0443 <- 3.88 -> DT C7 D0009 : score 5.9393 >5e6d_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN - ICAM1 NF-KB RESPONSE ELEMENT COMPLEX organism=Homo sapiens : x : VAL xxxx B0443 <- 4.10 -> DA xxx C0016 : score x.xxxxx >5e8i_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF HUMAN TRANSCRIPTION FACTOR FLI1 IN COMPLEX WITH A 10-MER DNA ACCGGAAGTG organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0337 <- 3.03 -> DG O6 B0006 : score 3.75974 : H : ARG NH2 A0337 <- 2.95 -> DG N7 B0006 : score 6.19308 : H : TYR OH A0341 <- 3.11 -> DA N6 B0007 : score 4.38094 : x : ASP xxxx A0333 <- 3.65 -> DC xxx C0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0334 <- 3.99 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0338 <- 4.47 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0340 <- 3.37 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx >5ean_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA2 IN COMPLEX WITH A 5' OVERHANG DNA organism=Mus musculus : H : TYR OH A0678 <- 2.66 -> DT O2 B0005 : score 3.30673 : H : ARG NH1 A1001 <- 2.97 -> DT O2 B0003 : score 4.15999 : x : THR xxxx A0129 <- 4.27 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0157 <- 3.37 -> DG xxx B0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0161 <- 4.30 -> DA xxx B0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0396 <- 3.85 -> DA xxx B0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0398 <- 3.40 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0457 <- 4.24 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0518 <- 3.31 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0568 <- 3.03 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0705 <- 4.20 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0745 <- 4.15 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0795 <- 3.48 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0797 <- 3.72 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0995 <- 3.76 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx >5eax_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA2 IN COMPLEX WITH AN SSDNA organism=Mus musculus : V : ARG CG A0518 <- 3.55 -> DT C7 E0009 : score 1.06795 : V : MET CE A0157 <- 3.85 -> DT C7 E0014 : score 6.84363 : x : THR xxxx A0129 <- 3.69 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0148 <- 3.47 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0161 <- 3.49 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0396 <- 4.44 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0457 <- 3.38 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0494 <- 3.44 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0496 <- 3.71 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0533 <- 3.68 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0549 <- 3.36 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0566 <- 3.46 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0567 <- 4.48 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0568 <- 3.40 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0571 <- 2.78 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0573 <- 3.99 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0678 <- 1.99 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0745 <- 3.40 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0795 <- 3.19 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0797 <- 3.77 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0995 <- 4.15 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1001 <- 3.51 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx >5ed4_A:CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=STRUCTURE OF A PHOP-DNA COMPLEX organism=Mycobacterium tuberculosis : H : ASN OD1 A0212 <- 2.89 -> DC N4 C0007 : score 4.1181 : H : ASN ND2 A0212 <- 2.82 -> DT O4 D0020 : score 5.26348 : w : ASN OD1 A0212 <- 5.79 -> DA N7 C0006 : score 2.277 : w : SER OG A0216 <- 5.63 -> DA N7 C0006 : score 2.343 : H : TYR OH A0220 <- 2.83 -> DC N4 C0005 : score 4.18882 : w : TYR OH A0220 <- 5.35 -> DT O4 D0022 : score 2.914 : H : ARG NH1 A0237 <- 2.83 -> DA N3 D0017 : score 3.65996 : x : VAL xxxx A0213 <- 4.40 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0215 <- 3.61 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0217 <- 3.42 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0219 <- 4.42 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx >5ed4_AB:CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=STRUCTURE OF A PHOP-DNA COMPLEX organism=Mycobacterium tuberculosis : H : ASN OD1 A0212 <- 2.89 -> DC N4 C0007 : score 4.1181 : H : ASN ND2 A0212 <- 2.82 -> DT O4 D0020 : score 5.26348 : w : ASN OD1 A0212 <- 5.79 -> DA N7 C0006 : score 2.277 : w : SER OG A0216 <- 5.63 -> DA N7 C0006 : score 2.343 : H : TYR OH A0220 <- 2.83 -> DC N4 C0005 : score 4.18882 : w : TYR OH A0220 <- 5.35 -> DT O4 D0022 : score 2.914 : H : ARG NH1 A0237 <- 2.83 -> DA N3 D0017 : score 3.65996 : H : ASN OD1 B0212 <- 3.14 -> DC N4 C0018 : score 3.90843 : H : ASN ND2 B0212 <- 2.82 -> DT O4 D0009 : score 5.26348 : H : TYR OH B0220 <- 2.82 -> DC N4 C0016 : score 4.19725 : H : ARG NH2 B0237 <- 3.13 -> DA N3 D0005 : score 3.02592 : x : VAL xxxx A0213 <- 4.40 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0215 <- 3.61 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0217 <- 3.42 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0219 <- 4.42 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0215 <- 3.31 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0216 <- 3.84 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0217 <- 3.56 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0219 <- 4.12 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx >5ed4_EF:CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=STRUCTURE OF A PHOP-DNA COMPLEX organism=Mycobacterium tuberculosis : H : ASN OD1 E0212 <- 2.72 -> DC N4 G0007 : score 4.26069 : H : ASN ND2 E0212 <- 2.82 -> DT O4 H0020 : score 5.26348 : w : ASN OD1 E0212 <- 5.84 -> DA N7 G0006 : score 2.277 : w : GLU OE1 E0215 <- 5.64 -> DC N4 H0019 : score 3.528 : w : SER OG E0216 <- 5.53 -> DA N7 G0006 : score 2.343 : w : SER OG E0216 <- 5.38 -> DG O6 H0021 : score 2.749 : H : TYR OH E0220 <- 2.88 -> DC N4 G0005 : score 4.14668 : w : ARG NH2 E0223 <- 6.13 -> DG N7 H0021 : score 2.18 : H : ARG NH1 E0237 <- 3.07 -> DA N3 H0017 : score 3.48322 : H : ASN OD1 F0212 <- 2.92 -> DC N4 G0018 : score 4.09294 : H : ASN ND2 F0212 <- 3.04 -> DT O4 H0009 : score 5.03095 : w : ASN OD1 F0212 <- 6.07 -> DA N7 G0017 : score 2.277 : w : SER OG F0216 <- 5.45 -> DA N7 G0017 : score 2.343 : w : SER OG F0216 <- 5.79 -> DG O6 H0010 : score 2.749 : H : TYR OH F0220 <- 2.75 -> DC N4 G0016 : score 4.25624 : w : ARG NH2 F0223 <- 5.75 -> DG N7 H0010 : score 2.18 : x : VAL xxxx E0213 <- 4.38 -> DC xxx G0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0217 <- 3.30 -> DT xxx G0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0219 <- 4.36 -> DT xxx H0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0215 <- 3.28 -> DC xxx H0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0217 <- 3.48 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0219 <- 4.29 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0237 <- 3.79 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx >5edn_AJ:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF HOXB13-DNA(TCG) COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 A0266 <- 3.41 -> DA N6 C0011 : score 5.28714 : H : ASN ND2 A0266 <- 3.09 -> DA N7 C0011 : score 5.53002 : H : ARG NE J0220 <- 3.24 -> DA N3 L0012 : score 1.91754 : H : ASN OD1 J0266 <- 2.78 -> DA N6 K0011 : score 6.04588 : H : ASN ND2 J0266 <- 2.56 -> DA N7 K0011 : score 6.1523 : x : ARG xxxx A0217 <- 4.05 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0218 <- 3.66 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0220 <- 3.10 -> DA xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0262 <- 3.69 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0265 <- 3.27 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0269 <- 4.25 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0218 <- 3.34 -> DA xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J0262 <- 3.53 -> DC xxx K0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx J0265 <- 3.42 -> DT xxx L0006 : score x.xxxxx >5edn_BG:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF HOXB13-DNA(TCG) COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NE B0220 <- 3.07 -> DA N3 E0012 : score 1.98903 : H : ASN ND2 B0266 <- 2.91 -> DA N7 D0011 : score 5.74136 : H : GLN OE1 G0265 <- 3.38 -> DC N4 I0005 : score 4.05167 : H : ASN OD1 G0266 <- 3.20 -> DC N4 H0012 : score 3.8581 : V : VAL CG2 G0269 <- 3.69 -> DT C7 I0006 : score 6.29146 : x : ILE xxxx B0262 <- 3.58 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0265 <- 3.99 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0220 <- 3.74 -> DA xxx I0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0262 <- 4.02 -> DC xxx H0012 : score x.xxxxx >5edn_G:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF HOXB13-DNA(TCG) COMPLEX organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 G0265 <- 3.38 -> DC N4 I0005 : score 4.05167 : H : ASN OD1 G0266 <- 3.20 -> DC N4 H0012 : score 3.8581 : V : VAL CG2 G0269 <- 3.69 -> DT C7 I0006 : score 6.29146 : x : ARG xxxx G0220 <- 3.74 -> DA xxx I0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0262 <- 4.02 -> DC xxx H0012 : score x.xxxxx >5edw_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY STRUCTURE OF DPO4 BOUND TO G IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING DTTP organism=Sulfolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) / Sulfolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) : x : VAL xxxx A0032 <- 4.04 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.75 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0044 <- 4.06 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0076 <- 4.16 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0332 <- 4.00 -> DG xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 4.40 -> DA xxx T0009 : score x.xxxxx >5eea_G:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF HOXB13-DNA(CAA) COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NE G0220 <- 3.05 -> DA N3 I0012 : score 1.99744 : H : ARG NH2 G0220 <- 2.95 -> DA N3 I0012 : score 3.14255 : w : ARG NH1 G0258 <- 5.46 -> DT O4 H0012 : score 1.768 : H : GLN OE1 G0265 <- 3.03 -> DC N4 I0006 : score 4.3725 : w : GLN NE2 G0265 <- 5.68 -> DT O4 H0011 : score 2.257 : w : GLN NE2 G0265 <- 5.67 -> DT O4 H0012 : score 2.257 : w : ASN ND2 G0266 <- 5.39 -> DT O4 H0011 : score 3.275 : w : ASN ND2 G0266 <- 5.35 -> DA N6 I0008 : score 2.5 : V : ASN CG G0266 <- 3.61 -> DT C7 H0009 : score 2.77399 : V : ILE CG2 G0262 <- 3.61 -> DT C7 H0011 : score 7.42812 >5ef6_G:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF HOXB13 COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NE G0220 <- 2.78 -> DA N3 I0012 : score 2.11097 : H : ASN OD1 G0266 <- 3.20 -> DA N6 H0010 : score 5.54005 : H : ASN ND2 G0266 <- 3.20 -> DA N7 H0010 : score 5.40087 : x : ILE xxxx G0262 <- 3.61 -> DA xxx H0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0265 <- 4.19 -> DC xxx I0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0273 <- 4.25 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx >5eg0_A:Homeodomain-like; title=HOXB13-MEIS1 HETERODIMER BOUND TO DNA organism=? : w : ASN ND2 A0321 <- 5.67 -> DC N4 D0025 : score 2.395 : w : ASN OD1 A0325 <- 6.24 -> DC N4 D0025 : score 2.732 : H : ARG NH1 A0328 <- 2.66 -> DG N7 E0013 : score 6.2194 : H : ARG NH2 A0328 <- 2.53 -> DG O6 E0013 : score 6.9564 : V : ARG CZ A0329 <- 3.88 -> DT C7 D0022 : score 2.08966 : x : ILE xxxx A0324 <- 3.93 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx >5eg0_AB:Homeodomain-like; title=HOXB13-MEIS1 HETERODIMER BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : w : ASN ND2 A0321 <- 5.67 -> DC N4 D0025 : score 2.395 : w : ASN OD1 A0325 <- 6.24 -> DC N4 D0025 : score 2.732 : H : ARG NH1 A0328 <- 2.66 -> DG N7 E0013 : score 6.2194 : H : ARG NH2 A0328 <- 2.53 -> DG O6 E0013 : score 6.9564 : H : ARG NH2 B0217 <- 2.43 -> DA N3 E0007 : score 3.47948 : H : ARG NH2 B0220 <- 2.89 -> DA N3 E0008 : score 3.18143 : H : ASN ND2 B0266 <- 3.30 -> DA N7 D0032 : score 5.28346 : V : ARG CZ A0329 <- 3.88 -> DT C7 D0022 : score 2.08966 : x : ILE xxxx A0324 <- 3.93 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0262 <- 3.88 -> DA xxx D0032 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0265 <- 3.94 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0270 <- 3.19 -> DT xxx D0030 : score x.xxxxx >5eg6_C:DNA-binding_protein_LAG-1_CSL;p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=CSL-RITA COMPLEX BOUND TO DNA organism=Mus musculus : w : GLU OE1 C0089 <- 5.61 -> DC N4 B0009 : score 3.528 : H : ARG NH1 C0091 <- 2.89 -> DG N7 A0008 : score 5.9411 : H : ARG NH2 C0091 <- 2.94 -> DG O6 A0008 : score 6.4152 : H : LYS NZ C0192 <- 2.69 -> DG O6 A0010 : score 5.90795 : x : TYR xxxx C0086 <- 3.77 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0191 <- 3.70 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx >5egb_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=HUMAN PRDM9 ALLELE-A ZNF DOMAIN WITH ASSOCIATED RECOMBINATION HOTSPOT DNA SEQUENCE II organism=Homo sapiens : w : SER OG A0729 <- 5.24 -> DC N4 C0019 : score 2.105 : H : ASN ND2 A0730 <- 3.01 -> DG O6 D0004 : score 5.40165 : w : ASN ND2 A0730 <- 5.85 -> DG O6 D0003 : score 2.971 : H : SER OG A0732 <- 2.89 -> DG N7 D0004 : score 4.40137 : w : SER OG A0732 <- 6.32 -> DC N4 D0005 : score 2.105 : H : HIS NE2 A0733 <- 2.64 -> DG O6 C0018 : score 8.20837 : H : ARG NH1 A0736 <- 2.75 -> DG O6 C0017 : score 6.14417 : H : ARG NH2 A0736 <- 2.93 -> DG N7 C0017 : score 6.21862 : w : ARG NH1 A0736 <- 6.14 -> DC N4 D0006 : score 1.892 : H : ASP OD2 A0758 <- 3.13 -> DA N6 C0016 : score 3.73839 : w : ASP OD2 A0758 <- 5.72 -> DC N4 D0006 : score 3.623 : w : SER OG A0760 <- 5.96 -> DC N4 D0006 : score 2.105 : H : HIS NE2 A0761 <- 2.90 -> DG O6 C0015 : score 7.79477 : H : ARG NH1 A0764 <- 2.89 -> DG O6 C0014 : score 5.97383 : H : ARG NH2 A0764 <- 2.96 -> DG N7 C0014 : score 6.18031 : w : ARG NH1 A0764 <- 5.86 -> DC N4 D0008 : score 1.892 : H : ARG NH1 A0785 <- 2.97 -> DG N7 C0013 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0785 <- 2.81 -> DG O6 C0013 : score 6.5868 : w : ARG NH2 A0785 <- 6.20 -> DC N4 D0010 : score 0.976 : H : ASP OD2 A0786 <- 3.14 -> DC N4 D0009 : score 5.7784 : w : ASP OD1 A0786 <- 5.98 -> DC N4 D0010 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0786 <- 6.14 -> DC N4 D0010 : score 3.623 : w : ASP OD2 A0786 <- 5.85 -> DC N4 D0008 : score 3.623 : H : ASN OD1 A0789 <- 2.87 -> DA N6 C0012 : score 5.93749 : H : ASN ND2 A0789 <- 2.92 -> DA N7 C0012 : score 5.72962 : w : ASN OD1 A0789 <- 5.61 -> DC N4 D0010 : score 2.732 : H : ASN OD1 A0814 <- 3.20 -> DC N4 C0010 : score 3.8581 : w : ASN ND2 A0814 <- 5.72 -> DT O4 C0011 : score 3.275 : H : SER OG A0816 <- 3.21 -> DA N7 D0012 : score 4.09805 : H : SER OG A0816 <- 2.98 -> DA N6 D0012 : score 3.17131 : H : HIS NE2 A0817 <- 2.58 -> DG N7 C0009 : score 7.10188 : w : HIS ND1 A0817 <- 5.33 -> DG O6 D0013 : score 4.006 : H : ARG NH1 A0820 <- 3.02 -> DG O6 C0008 : score 5.81567 : H : ARG NH2 A0820 <- 2.99 -> DG N7 C0008 : score 6.142 : w : ARG NH1 A0820 <- 5.84 -> DC N4 D0014 : score 1.892 : x : ARG xxxx A0767 <- 4.03 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0788 <- 3.21 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0815 <- 4.00 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx >5ego_AB:Homeodomain-like; title=HOXB13-MEIS1 HETERODIMER BOUND TO METHYLATED DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0328 <- 2.86 -> DG N7 E0013 : score 5.9774 : H : ARG NH2 A0328 <- 2.61 -> DG O6 E0013 : score 6.8508 : H : ARG NH1 A0329 <- 2.63 -> DG N7 D0023 : score 6.2557 : H : ARG NH2 A0329 <- 2.53 -> DG O6 D0023 : score 6.9564 : H : ARG NH2 B0217 <- 2.94 -> DA N3 D0032 : score 3.14903 : w : ARG NH1 B0217 <- 5.79 -> DT O2 E0006 : score 1.855 : H : ARG NH1 B0220 <- 2.79 -> DA N3 E0009 : score 3.68942 : V : ASN CB B0266 <- 3.77 -> DT C7 D0031 : score 1.95197 : V : ILE CG2 A0324 <- 3.68 -> DT C7 E0012 : score 7.30402 : x : ASN xxxx A0321 <- 4.06 -> DA xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0325 <- 2.99 -> DA xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0262 <- 3.73 -> DA xxx D0032 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0265 <- 3.32 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx >5ego_B:Homeodomain-like; title=HOXB13-MEIS1 HETERODIMER BOUND TO METHYLATED DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 B0217 <- 2.94 -> DA N3 D0032 : score 3.14903 : w : ARG NH1 B0217 <- 5.79 -> DT O2 E0006 : score 1.855 : H : ARG NH1 B0220 <- 2.79 -> DA N3 E0009 : score 3.68942 : V : ASN CB B0266 <- 3.77 -> DT C7 D0031 : score 1.95197 : x : ILE xxxx B0262 <- 3.73 -> DA xxx D0032 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0265 <- 3.32 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx >5eh2_E:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=HUMAN PRDM9 ALLELE-A ZNF DOMAIN WITH ASSOCIATED RECOMBINATION HOTSPOT DNA SEQUENCE III organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 E0730 <- 3.09 -> DG O6 B0005 : score 5.31143 : H : SER OG E0732 <- 2.72 -> DG N7 B0005 : score 4.55376 : H : HIS NE2 E0733 <- 2.81 -> DG O6 A0017 : score 7.93794 : H : ARG NH1 E0736 <- 2.77 -> DG O6 A0016 : score 6.11983 : H : ARG NH2 E0736 <- 2.91 -> DG N7 A0016 : score 6.24415 : H : ASP OD2 E0758 <- 3.05 -> DA N6 A0015 : score 3.80244 : H : SER OG E0760 <- 2.88 -> DC N4 B0007 : score 3.61683 : H : HIS NE2 E0761 <- 2.88 -> DG N7 A0014 : score 6.69372 A : H : ARG NH1 E0764 <- 2.92 -> DG O6 A0013 : score 5.93733 : H : ARG NH2 E0764 <- 2.88 -> DG N7 A0013 : score 6.28246 : w : ARG NH1 E0764 <- 5.67 -> DC N4 B0009 : score 1.892 : H : ARG NH1 E0785 <- 3.07 -> DG N7 A0012 : score 5.7233 : H : ARG NH2 E0785 <- 2.76 -> DG O6 A0012 : score 6.6528 : w : ARG NH2 E0785 <- 6.49 -> DC N4 B0011 : score 0.976 : w : ASP OD1 E0786 <- 6.16 -> DC N4 B0011 : score 2.835 : w : ASP OD2 E0786 <- 5.69 -> DC N4 B0009 : score 3.623 : w : ASP OD2 E0786 <- 5.97 -> DC N4 B0011 : score 3.623 : H : ASN OD1 E0789 <- 3.11 -> DA N6 A0011 : score 5.64844 : H : ASN ND2 E0789 <- 2.90 -> DA N7 A0011 : score 5.7531 : w : ASN OD1 E0789 <- 6.18 -> DC N4 B0011 : score 2.732 : w : ASN OD1 E0814 <- 6.02 -> DT O4 B0012 : score 3.132 : w : ASN ND2 E0814 <- 5.68 -> DT O4 A0010 : score 3.275 : H : SER OG E0816 <- 2.94 -> DA N7 B0013 : score 4.33911 : H : SER OG E0816 <- 2.86 -> DA N6 B0013 : score 3.25027 : H : HIS NE2 E0817 <- 2.52 -> DG N7 A0008 : score 7.18351 : w : HIS ND1 E0817 <- 5.09 -> DG O6 B0014 : score 4.006 : H : ARG NH1 E0820 <- 2.98 -> DG O6 A0007 : score 5.86433 : H : ARG NH2 E0820 <- 2.76 -> DG N7 A0007 : score 6.43569 : w : ARG NH1 E0820 <- 5.23 -> DC N4 B0015 : score 1.892 : w : ARG NH2 E0823 <- 5.89 -> DG N7 B0014 : score 2.18 : x : SER xxxx E0788 <- 3.53 -> DC xxx B0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0815 <- 3.67 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx >5ei9_F:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=HUMAN PRDM9 ALLELE-A ZNF DOMAIN WITH ASSOCIATED RECOMBINATION HOTSPOT DNA SEQUENCE I organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 F0730 <- 2.94 -> DG O6 D0024 : score 5.48058 : H : SER OG F0732 <- 2.69 -> DG N7 D0024 : score 4.58066 : H : HIS NE2 F0733 <- 2.80 -> DG O6 C0019 : score 7.95385 : H : ARG NH1 F0736 <- 2.62 -> DG O6 C0018 : score 6.30233 : H : ARG NH2 F0736 <- 2.81 -> DG N7 C0018 : score 6.37185 : H : ASP OD2 F0758 <- 3.04 -> DA N6 C0017 : score 3.81044 : H : SER OG F0760 <- 3.11 -> DC N4 D0026 : score 3.44775 : H : HIS NE2 F0761 <- 2.80 -> DG N7 C0016 : score 6.80256 : H : ARG NH1 F0764 <- 2.84 -> DG O6 C0015 : score 6.03467 : H : ARG NH2 F0764 <- 2.98 -> DG N7 C0015 : score 6.15477 : w : ARG NH1 F0764 <- 5.98 -> DC N4 D0028 : score 1.892 : H : ARG NH1 F0785 <- 2.92 -> DG N7 C0014 : score 5.9048 : H : ARG NH2 F0785 <- 2.55 -> DG O6 C0014 : score 6.93 : w : ARG NH2 F0785 <- 6.38 -> DC N4 D0030 : score 0.976 : H : ASP OD2 F0786 <- 3.32 -> DC N4 D0029 : score 5.5552 : w : ASP OD1 F0786 <- 5.93 -> DC N4 D0030 : score 2.835 : w : ASP OD2 F0786 <- 5.89 -> DC N4 D0030 : score 3.623 : w : ASP OD2 F0786 <- 5.98 -> DC N4 D0028 : score 3.623 : H : ASN OD1 F0789 <- 2.99 -> DA N6 C0013 : score 5.79297 : H : ASN ND2 F0789 <- 2.82 -> DA N7 C0013 : score 5.84703 : w : ASN OD1 F0789 <- 5.85 -> DC N4 D0030 : score 2.732 : w : SER OG F0792 <- 6.32 -> DT O4 C0012 : score 2.338 : w : ASN ND2 F0814 <- 5.63 -> DT O4 C0012 : score 3.275 : H : SER OG F0816 <- 2.99 -> DA N7 D0032 : score 4.29447 : H : SER OG F0816 <- 2.84 -> DA N6 D0032 : score 3.26343 : H : HIS NE2 F0817 <- 2.57 -> DG N7 C0010 : score 7.11548 : w : HIS ND1 F0817 <- 5.41 -> DG O6 D0033 : score 4.006 : H : ARG NH1 F0820 <- 2.87 -> DG O6 C0009 : score 5.99817 : H : ARG NH2 F0820 <- 2.76 -> DG N7 C0009 : score 6.43569 : w : ARG NH1 F0820 <- 5.45 -> DC N4 D0034 : score 1.892 : x : SER xxxx F0788 <- 3.25 -> DC xxx D0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0815 <- 3.90 -> DT xxx D0031 : score x.xxxxx >5eix_BJ:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE-STABILIZED CLEAVAGE COMPLEX OF TOPOISOMERASE IV FROM KLEBSIELLA PNEUMONIAE organism=KLEBSIELLA PNEUMONIAE : x : LYS xxxx B0444 <- 3.97 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B1021 <- 4.30 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1080 <- 3.81 -> DG xxx L0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B1081 <- 4.30 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1119 <- 3.84 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1172 <- 3.52 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1326 <- 3.29 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0444 <- 4.04 -> DT xxx K0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J1081 <- 4.39 -> DA xxx K0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J1119 <- 3.54 -> DG xxx L0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J1172 <- 3.28 -> DC xxx L0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J1326 <- 3.58 -> DT xxx K0011 : score x.xxxxx >5eix_G:Type_II_DNA_topoisomerase; title=QUINOLONE-STABILIZED CLEAVAGE COMPLEX OF TOPOISOMERASE IV FROM KLEBSIELLA PNEUMONIAE organism=? : x : LYS xxxx G0444 <- 3.74 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G1021 <- 4.15 -> DA xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G1029 <- 4.43 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G1081 <- 4.27 -> DA xxx H0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G1084 <- 4.20 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G1172 <- 3.52 -> DA xxx I0009 : score x.xxxxx >5ejk_A:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ROUS SARCOMA VIRUS INTASOME organism=ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN PRAGUE C) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN PRAGUE C) : H : ARG NH1 A0244 <- 3.06 -> DT O4 M0008 : score 3.09802 : H : ARG NH2 A0244 <- 2.65 -> DG N7 M0007 : score 6.57615 : x : ALA xxxx A0154 <- 3.30 -> DG xxx M0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0157 <- 3.59 -> DC xxx L0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0158 <- 3.04 -> DT xxx M0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0161 <- 3.88 -> DA xxx L0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0203 <- 3.26 -> DT xxx M0008 : score x.xxxxx >5ejk_ABG:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ROUS SARCOMA VIRUS INTASOME organism=ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN PRAGUE C) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN PRAGUE C) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN PRAGUE C) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN PRAGUE C) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN PRAGUE C) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN PRAGUE C) : H : ARG NH1 A0244 <- 3.06 -> DT O4 M0008 : score 3.09802 : H : ARG NH2 A0244 <- 2.65 -> DG N7 M0007 : score 6.57615 : x : ALA xxxx A0154 <- 3.30 -> DG xxx M0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0157 <- 3.59 -> DC xxx L0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0158 <- 3.04 -> DT xxx M0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0161 <- 3.88 -> DA xxx L0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0203 <- 3.26 -> DT xxx M0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0263 <- 3.32 -> DG xxx M0004 : score x.xxxxx >5ejk_CE:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ROUS SARCOMA VIRUS INTASOME organism=ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN PRAGUE C) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN PRAGUE C) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN PRAGUE C) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN PRAGUE C) : H : ARG NH1 E0161 <- 3.09 -> DT O2 J0006 : score 4.05664 : H : ARG NH2 E0161 <- 3.04 -> DT O2 J0006 : score 4.03013 : H : ARG NH1 E0244 <- 2.78 -> DT O4 J0008 : score 3.28102 : H : ARG NH2 E0244 <- 2.90 -> DG N7 J0007 : score 6.25692 : x : ARG xxxx C0263 <- 3.75 -> DG xxx J0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0154 <- 3.18 -> DG xxx J0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0157 <- 3.57 -> DC xxx I0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0158 <- 4.18 -> DT xxx J0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0203 <- 3.50 -> DT xxx J0008 : score x.xxxxx >5emc_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=TRANSCRIPTION FACTOR GRDBD AND SMGRE COMPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0461 <- 2.93 -> DG N7 C0004 : score 5.24586 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.79 -> DG N7 D0039 : score 6.39738 : V : VAL CG2 A0462 <- 3.88 -> DT C7 D0040 : score 6.00062 >5emc_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=TRANSCRIPTION FACTOR GRDBD AND SMGRE COMPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0461 <- 2.93 -> DG N7 C0004 : score 5.24586 : w : LYS NZ A0461 <- 5.64 -> DT O4 D0041 : score 1.7 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.79 -> DG N7 D0039 : score 6.39738 : H : LYS NZ B0461 <- 3.29 -> DG N7 D0030 : score 4.85808 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.86 -> DG O6 C0013 : score 6.5208 : w : ARG NH1 B0466 <- 6.31 -> DA N6 D0032 : score 1.486 : w : ARG NH2 B0466 <- 6.29 -> DA N6 D0032 : score 1.997 : V : VAL CG1 B0462 <- 3.89 -> DT C7 C0014 : score 5.92415 : V : VAL CG2 A0462 <- 3.88 -> DT C7 D0040 : score 6.00062 >5emp_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=TRANSCRIPTION FACTOR GRDBD AND MMGRE COMPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0461 <- 3.20 -> DG N7 C0004 : score 4.95503 : H : LYS NZ A0461 <- 3.28 -> DG O6 C0004 : score 5.22582 : H : ARG NH2 A0466 <- 3.01 -> DG N7 D0014 : score 6.11646 : H : LYS NZ B0461 <- 2.89 -> DG N7 D0005 : score 5.28895 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.89 -> DG N7 C0013 : score 6.26969 : H : ARG NH2 B0466 <- 3.29 -> DG O6 C0013 : score 5.9532 : x : VAL xxxx A0462 <- 3.82 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0462 <- 3.80 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx >5emp_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=TRANSCRIPTION FACTOR GRDBD AND MMGRE COMPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0461 <- 2.89 -> DG N7 D0005 : score 5.28895 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.89 -> DG N7 C0013 : score 6.26969 : H : ARG NH2 B0466 <- 3.29 -> DG O6 C0013 : score 5.9532 : x : VAL xxxx B0462 <- 3.80 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx >5emq_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=TRANSCRIPTION FACTOR GRDBD AND GRE COMPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0461 <- 3.20 -> DG N7 C0004 : score 4.95503 : H : ARG NH2 A0466 <- 2.70 -> DG N7 D0014 : score 6.51231 : H : LYS NZ B0461 <- 3.01 -> DG N7 D0005 : score 5.15969 : H : ARG NH1 B0466 <- 3.39 -> DG O6 C0013 : score 5.3655 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.72 -> DG N7 C0013 : score 6.48677 : V : VAL CG2 B0462 <- 3.84 -> DT C7 C0014 : score 6.06185 : x : VAL xxxx A0462 <- 3.84 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx >5emq_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=TRANSCRIPTION FACTOR GRDBD AND GRE COMPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0461 <- 3.01 -> DG N7 D0005 : score 5.15969 : H : ARG NH1 B0466 <- 3.39 -> DG O6 C0013 : score 5.3655 : H : ARG NH2 B0466 <- 2.72 -> DG N7 C0013 : score 6.48677 : V : VAL CG2 B0462 <- 3.84 -> DT C7 C0014 : score 6.06185 >5eoz_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=MUTAGENICITY OF 7-BENZYL GUANINE LESION AND REPLICATION BY HUMAN DNA POLYMERASE BETA organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0271 <- 2.85 -> DA N3 P0010 : score 4.10977 : w : ARG NH1 A0283 <- 6.04 -> DT O2 T0007 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.04 -> DT O2 T0007 : score 2.261 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.54 -> DT O2 T0007 : score 2.462 : x : LYS xxxx A0234 <- 3.98 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx >5esp_A:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LAGLIDADG MEGANUCLEASE I-PANMI WITH COORDINATED CALCIUM IONS organism=PODOSPORA ANSERINA : H : ARG NH1 A0042 <- 2.95 -> DA N7 H0020 : score 2.48345 : H : ARG NH2 A0042 <- 2.53 -> DG O6 H0021 : score 6.9564 : H : GLN NE2 A0076 <- 2.89 -> DT O4 H0018 : score 5.09759 : H : GLN NE2 A0076 <- 3.36 -> DG O6 H0019 : score 5.15495 : H : ARG NH1 A0078 <- 2.71 -> DG O6 H0019 : score 6.19283 : H : GLU OE2 A0080 <- 2.94 -> DC N4 G0008 : score 5.11795 : H : LYS NZ A0197 <- 3.29 -> DG O6 H0007 : score 5.21425 : H : ARG NH1 A0229 <- 3.06 -> DG O6 H0012 : score 5.767 : H : ARG NH1 A0229 <- 2.74 -> DG O6 H0013 : score 6.15633 : H : ARG NH2 A0229 <- 2.70 -> DG O6 H0012 : score 6.732 : H : LYS NZ A0235 <- 2.65 -> DT O4 H0009 : score 3.69479 : V : VAL CG1 A0044 <- 3.85 -> DT C7 H0018 : score 5.98476 : V : SER CB A0181 <- 3.78 -> DT C7 G0019 : score 3.14694 : x : SER xxxx A0022 <- 4.19 -> DT xxx H0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0024 <- 3.36 -> DG xxx H0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0032 <- 4.08 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0033 <- 3.62 -> DC xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0038 <- 2.84 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0046 <- 3.04 -> DA xxx H0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0068 <- 3.57 -> DC xxx G0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0070 <- 3.06 -> DC xxx G0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0074 <- 3.02 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0179 <- 4.14 -> DT xxx G0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0183 <- 3.87 -> DA xxx G0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0185 <- 3.17 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0187 <- 4.01 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0189 <- 3.98 -> DC xxx H0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0190 <- 3.90 -> DC xxx H0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0195 <- 4.12 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0201 <- 3.37 -> DT xxx G0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0203 <- 3.00 -> DC xxx G0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0225 <- 3.13 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0227 <- 3.75 -> DA xxx H0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0231 <- 4.38 -> DC xxx G0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0237 <- 3.66 -> DG xxx H0007 : score x.xxxxx >5ew1_H:Trypsin-like_serine_proteases; title=HUMAN THROMBIN SANDWICHED BETWEEN TWO DNA APTAMERS: HD22 AND HD1- DELTAT3 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 H0101 <- 3.01 -> DG O6 D0021 : score 6.3228 : H : ARG NH1 H0233 <- 2.54 -> DG N3 D0022 : score 3.2113 : H : TRP NE1 H0237 <- 2.68 -> DT O2 D0018 : score 6.36455 : V : PHE CZ H0245 <- 3.70 -> DT C7 D0018 : score 7.29274 : V : PHE CB H0181 <- 3.84 -> DT C7 D0024 : score 5.74302 >5ewe_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING RCTP OPPOSITE TEMPLATE G organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.02 -> DG O6 P0004 : score 5.81567 : H : ARG NH2 A0382 <- 2.85 -> DG N7 P0004 : score 6.32077 : x : SER xxxx A0322 <- 3.81 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 3.91 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5ewf_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING RCTP OPPOSITE AN 8-OXODEOXYGUANOSINE LESION organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.12 -> DG O6 P0004 : score 5.694 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.02 -> DG N7 P0004 : score 6.10369 : x : SER xxxx A0322 <- 3.84 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.07 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5ewg_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING RATP OPPOSITE AN 8-OXODEOXYGUANOSINE LESION organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.27 -> DG N7 P0004 : score 5.4813 : H : ARG NH1 A0382 <- 3.29 -> DG O6 P0004 : score 5.48717 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.02 -> DG N7 P0004 : score 6.10369 : x : SER xxxx A0322 <- 3.86 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.18 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5exh_C: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MTET3-CXXC DOMAIN IN COMPLEX WITH 5- CARBOXYLCYTOSINE DNA AT 1.3 ANGSTROMS RESOLUTION. organism=MUS MUSCULUS : H : LYS NZ C0053 <- 2.59 -> DT O2 B0010 : score 3.73784 : w : LYS NZ C0053 <- 5.79 -> DA N3 B0009 : score 1.538 : w : LYS NZ C0053 <- 5.27 -> DT O2 A0004 : score 0.522 : H : HIS ND1 C0081 <- 2.78 -> DG O6 B0008 : score 6.24797 : w : GLN OE1 C0082 <- 5.78 -> DC N4 B0005 : score 3.488 : x : THR xxxx C0080 <- 4.46 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx >5eyb_B:Homeodomain-like; title=X-RAY STRUCTURE OF REB1-TER COMPLEX organism=Schizosaccharomyces pombe : H : ARG NH1 B0212 <- 2.63 -> DG O6 F0008 : score 6.29017 : H : ARG NH2 B0212 <- 3.12 -> DG N7 F0008 : score 5.976 : H : LYS NZ B0297 <- 3.14 -> DG N7 E0008 : score 5.01966 : H : HIS NE2 B0301 <- 2.88 -> DT O4 F0018 : score 5.51923 : H : ARG NH1 B0350 <- 2.82 -> DG N7 E0012 : score 6.0258 : H : ARG NH2 B0350 <- 2.66 -> DG O6 E0012 : score 6.7848 : H : ASP OD2 B0351 <- 2.93 -> DC N4 F0015 : score 6.0388 : H : ARG NH2 B0354 <- 2.98 -> DG O6 E0013 : score 6.3624 : w : ASP OD2 B0355 <- 6.28 -> DA N6 F0013 : score 3.409 : H : ARG NH1 B0407 <- 3.25 -> DG N7 E0014 : score 5.5055 : H : ARG NH2 B0407 <- 2.53 -> DG O6 E0014 : score 6.9564 : V : LEU CB B0408 <- 3.60 -> DT C7 F0012 : score 4.61892 : x : ARG xxxx B0216 <- 3.92 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0229 <- 4.17 -> DA xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0300 <- 3.53 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0304 <- 4.00 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0305 <- 3.28 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0347 <- 3.60 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0411 <- 3.36 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0412 <- 3.59 -> DA xxx F0010 : score x.xxxxx >5eyo_A:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE MAX BHLH DOMAIN IN COMPLEX WITH 5- CARBOXYL CYTOSINE DNA organism=Homo sapiens : H : HIS NE2 A0028 <- 2.76 -> DG O6 B0014 : score 8.01748 : H : ARG NH1 A0036 <- 2.84 -> DG N7 B0012 : score 6.0016 : H : ARG NH2 A0036 <- 2.48 -> DG O6 B0012 : score 7.0224 : x : ASN xxxx A0029 <- 3.36 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0032 <- 4.12 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx >5f0q_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF C-TERMINAL DOMAIN OF THE HUMAN DNA PRIMASE LARGE SUBUNIT WITH BOUND DNA TEMPLATE/RNA PRIMER organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 A0348 <- 2.95 -> DC N4 D0006 : score 4.06778 : w : HIS ND1 A0351 <- 5.35 -> DA N7 D0007 : score 2.619 : w : SER OG A0352 <- 5.96 -> DA N6 D0007 : score 2.209 : x : HIS xxxx A0303 <- 3.09 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0307 <- 3.43 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0347 <- 3.43 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0360 <- 3.46 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0362 <- 3.64 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0363 <- 3.39 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0364 <- 3.72 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0443 <- 3.63 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0445 <- 3.84 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0449 <- 4.12 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx >5f0s_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF C-TERMINAL DOMAIN OF THE HUMAN DNA PRIMASE LARGE SUBUNIT WITH BOUND DNA TEMPLATE/RNA PRIMER AND MANGANESE ION organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 B0348 <- 3.05 -> DC N4 F0006 : score 3.98391 : x : HIS xxxx B0303 <- 3.51 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0307 <- 3.58 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0347 <- 3.47 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0351 <- 4.00 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0360 <- 2.91 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0362 <- 3.21 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0363 <- 3.39 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx >5f3w_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF THE ATPRS-MRE11/RAD50-DNA COMPLEX organism=METHANOCALDOCOCCUS JANNASCHII DSM 2661 : H : SER OG B0054 <- 2.35 -> DT O2 F0020 : score 4.03021 : x : ARG xxxx B0092 <- 3.06 -> DA xxx F0025 : score x.xxxxx >5f3w_BD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF THE ATPRS-MRE11/RAD50-DNA COMPLEX organism=METHANOCALDOCOCCUS JANNASCHII DSM 2661 : H : SER OG B0054 <- 2.35 -> DT O2 F0020 : score 4.03021 : H : SER OG D0054 <- 2.96 -> DT O2 F0010 : score 3.57912 : x : ARG xxxx B0092 <- 3.06 -> DA xxx F0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0092 <- 3.31 -> DC xxx E0025 : score x.xxxxx >5f55_A:DHH_phosphoesterases; title=STRUCTURE OF RECJ COMPLEXED WITH DNA organism=Deinococcus radiodurans : H : ASN ND2 A0515 <- 2.39 -> DT O4 C0203 : score 5.71795 : V : VAL CG1 A0224 <- 3.80 -> DT C7 C0196 : score 6.06051 : V : PHE CB A0269 <- 3.87 -> DT C7 C0198 : score 5.69951 : x : TYR xxxx A0080 <- 3.84 -> DG xxx C0194 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0114 <- 3.38 -> DG xxx C0194 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0265 <- 3.01 -> DT xxx C0198 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0268 <- 4.16 -> DG xxx C0197 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0349 <- 3.69 -> DT xxx C0196 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0352 <- 3.95 -> DT xxx C0196 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0353 <- 3.60 -> DT xxx C0196 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0356 <- 4.26 -> DG xxx C0197 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0373 <- 3.96 -> DA xxx C0195 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0393 <- 4.27 -> DG xxx C0194 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0400 <- 3.82 -> DA xxx C0195 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0485 <- 3.11 -> DC xxx C0202 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0492 <- 3.51 -> DT xxx C0203 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0494 <- 3.73 -> DC xxx C0202 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0496 <- 3.36 -> DG xxx C0201 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0517 <- 2.23 -> DT xxx C0203 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0524 <- 3.53 -> DC xxx C0202 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0526 <- 4.13 -> DC xxx C0202 : score x.xxxxx >5f7q_C:Actin-like_ATPase_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ROK REPRESSOR LMO0178 FROM LISTERIA MONOCYTOGENES BOUND TO OPERATOR organism=Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) / Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) : H : LYS NZ C0009 <- 3.14 -> DT O2 K0013 : score 3.34325 : H : SER OG C0044 <- 2.56 -> DG N7 K0018 : score 4.69719 : H : SER OG C0044 <- 3.09 -> DG O6 K0018 : score 3.85375 : H : TYR OH C0048 <- 2.92 -> DC N4 F0014 : score 4.11296 : V : MET CB C0043 <- 3.79 -> DT C7 F0012 : score 5.81758 : x : THR xxxx C0045 <- 3.72 -> DT xxx K0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0047 <- 3.63 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0071 <- 3.17 -> DG xxx K0022 : score x.xxxxx >5f7q_CEJL:Actin-like_ATPase_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ROK REPRESSOR LMO0178 FROM LISTERIA MONOCYTOGENES BOUND TO OPERATOR organism=Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) / Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) / Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) / Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) / Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) / Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) / Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) / Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) : H : LYS NZ C0009 <- 3.14 -> DT O2 K0013 : score 3.34325 : H : SER OG C0044 <- 2.56 -> DG N7 K0018 : score 4.69719 : H : SER OG C0044 <- 3.09 -> DG O6 K0018 : score 3.85375 : H : TYR OH C0048 <- 2.92 -> DC N4 F0014 : score 4.11296 : H : LYS NZ E0009 <- 2.72 -> DT O2 F0017 : score 3.64457 : H : SER OG E0044 <- 2.39 -> DT O4 F0022 : score 3.84665 : H : LYS NZ J0009 <- 2.83 -> DT O2 K0017 : score 3.56566 : H : SER OG J0044 <- 3.35 -> DG N7 K0022 : score 3.98903 : H : SER OG J0044 <- 3.01 -> DG O6 K0022 : score 3.9192 : H : TYR OH J0048 <- 2.54 -> DC N4 F0010 : score 4.43324 A : H : LYS NZ L0009 <- 2.63 -> DT O2 F0013 : score 3.70914 : H : SER OG L0044 <- 2.59 -> DG N7 F0018 : score 4.6703 : H : SER OG L0044 <- 3.11 -> DG O6 F0018 : score 3.83738 : H : TYR OH L0048 <- 2.98 -> DC N4 K0014 : score 4.06239 : H : ARG NH1 L0071 <- 3.42 -> DA N3 F0023 : score 3.22548 : V : MET CB E0043 <- 3.83 -> DT C7 K0008 : score 5.75955 : V : MET CB L0043 <- 3.77 -> DT C7 K0012 : score 5.8466 : V : MET CB J0043 <- 3.60 -> DT C7 F0008 : score 6.09323 : V : MET CB C0043 <- 3.79 -> DT C7 F0012 : score 5.81758 : x : THR xxxx C0045 <- 3.72 -> DT xxx K0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0047 <- 3.63 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0071 <- 3.17 -> DG xxx K0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0045 <- 3.15 -> DT xxx F0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0047 <- 3.59 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0048 <- 3.51 -> DT xxx K0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0071 <- 3.38 -> DA xxx K0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0045 <- 3.76 -> DC xxx K0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0047 <- 3.59 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0071 <- 3.41 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0045 <- 3.54 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0047 <- 3.66 -> DT xxx K0012 : score x.xxxxx >5f8a_A:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TERNARY ECORV-DNA-LU COMPLEX WITH UNCLEAVED DNA SUBSTRATE. LANTHANIDE BINDING TO ECORV-DNA COMPLEX INHIBITS CLEAVAGE. organism=Escherichia coli : w : LYS NZ A0038 <- 6.26 -> DA N3 D0007 : score 1.538 : w : ASN ND2 A0070 <- 5.76 -> DT O2 D0008 : score 1.666 : w : ASN ND2 A0070 <- 5.67 -> DC O2 D0009 : score 1.885 : w : LYS NZ A0104 <- 5.54 -> DT O4 C0010 : score 1.7 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.92 -> DA N6 D0005 : score 5.87727 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.94 -> DA N7 D0005 : score 5.70614 : H : THR OG1 A0186 <- 2.63 -> DT O4 C0008 : score 4.01934 : V : THR CB A0106 <- 3.81 -> DT C7 C0008 : score 3.51734 : x : LEU xxxx A0180 <- 3.96 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.28 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.47 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >5f8a_AB:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TERNARY ECORV-DNA-LU COMPLEX WITH UNCLEAVED DNA SUBSTRATE. LANTHANIDE BINDING TO ECORV-DNA COMPLEX INHIBITS CLEAVAGE. organism=Escherichia coli : w : LYS NZ A0038 <- 6.26 -> DA N3 D0007 : score 1.538 : w : LYS NZ A0104 <- 5.54 -> DT O4 C0010 : score 1.7 : H : ASN OD1 A0185 <- 2.92 -> DA N6 D0005 : score 5.87727 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.94 -> DA N7 D0005 : score 5.70614 : H : THR OG1 A0186 <- 2.63 -> DT O4 C0008 : score 4.01934 : w : ASN ND2 B0070 <- 5.88 -> DT O2 D0006 : score 1.666 : H : ASN OD1 B0185 <- 2.96 -> DA N6 C0005 : score 5.8291 : H : ASN ND2 B0185 <- 3.02 -> DA N7 C0005 : score 5.61221 : H : THR OG1 B0186 <- 2.69 -> DT O4 D0008 : score 3.9727 : V : THR CB A0106 <- 3.81 -> DT C7 C0008 : score 3.51734 : V : THR CB B0106 <- 3.82 -> DT C7 D0008 : score 3.50852 : x : ASN xxxx A0070 <- 4.01 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0180 <- 3.96 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.28 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.47 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0038 <- 4.03 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.34 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0188 <- 3.51 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >5f99_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=X-RAY STRUCTURE OF THE MMTV-A NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 A0040 <- 2.82 -> DG N3 J0009 : score 3.04035 : w : TYR OH A0041 <- 6.27 -> DT O2 I0070 : score 3.068 : H : ARG NH2 D0033 <- 3.01 -> DT O2 I-048 : score 4.05553 : H : ARG NH2 D0033 <- 3.26 -> DG N3 J0049 : score 3.27811 : w : HIS NE2 E0039 <- 5.98 -> DA N3 J0070 : score 2.619 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.11 -> DT O2 I0009 : score 4.03941 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.35 -> DT O2 I0009 : score 3.76767 : w : ARG NH2 E0040 <- 5.76 -> DT O2 I0008 : score 2.261 : w : ARG NH2 F0045 <- 5.68 -> DC O2 I0007 : score 1.669 : H : ARG NH2 H0029 <- 3.16 -> DT O2 I-028 : score 3.92853 : w : ARG NH2 H0033 <- 5.92 -> DC O2 J-046 : score 1.669 : x : ARG xxxx A0083 <- 3.30 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.98 -> DG xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 3.99 -> DA xxx J0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.57 -> DA xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.37 -> DT xxx J0057 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0086 <- 3.82 -> DT xxx I-033 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.66 -> DC xxx I-068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.71 -> DG xxx J-025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0013 <- 4.07 -> DT xxx I0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 3.80 -> DG xxx J-056 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.47 -> DG xxx J-049 : score x.xxxxx >5f99_C:Histone-fold; title=X-RAY STRUCTURE OF THE MMTV-A NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=? : x : ARG xxxx C0011 <- 3.99 -> DA xxx J0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.57 -> DA xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.37 -> DT xxx J0057 : score x.xxxxx >5f9l_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING DAMPNPP ACROSS A DNA TEMPLATE CONTAINING 1,N2-ETHENODEOXYGUANOSINE LESION organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 2.73 -> DG N7 P0004 : score 6.1347 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.02 -> DG O6 P0004 : score 6.3096 : x : SER xxxx A0322 <- 3.72 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 4.35 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0421 <- 4.48 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.29 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5f9n_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING DCMPNPP ACROSS A DNA TEMPLATE CONTAINING 1,N2-ETHENODEOXYGUANOSINE LESION organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 2.96 -> DG N7 P0004 : score 5.8564 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.05 -> DG O6 P0004 : score 6.27 : x : SER xxxx A0322 <- 3.77 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.15 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.08 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5f9r_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CATALYTICALLY-ACTIVE STREPTOCOCCUS PYOGENES CRISPR-CAS9 IN COMPLEX WITH SINGLE-GUIDED RNA AND DOUBLE-STRANDED DNA PRIMED FOR TARGET DNA CLEAVAGE organism=Streptococcus pyogenes serotype M1 : H : LYS NZ B1107 <- 2.60 -> DC O2 C0009 : score 3.064 : H : ARG NH2 B1333 <- 3.24 -> DG N7 D0022 : score 5.82277 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.99 -> DG O6 D0022 : score 6.3492 : H : ARG NH1 B1335 <- 3.22 -> DG O6 D0023 : score 5.57233 : H : ARG NH2 B1335 <- 3.10 -> DG N7 D0023 : score 6.00154 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.34 -> DG xxx D0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B1337 <- 4.43 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >5fd3_A: title=STRUCTURE OF LIN54 TESMIN DOMAIN BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0536 <- 2.56 -> DA N3 H0009 : score 4.35054 : H : TYR OH A0610 <- 2.47 -> DA N3 I0010 : score 4.42527 >5fdk_ABD:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RECU(D88N) IN COMPLEX WITH PALINDROMIC DNA DUPLEX organism=Bacillus subtilis : x : GLN xxxx A0114 <- 3.68 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0107 <- 4.17 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0114 <- 3.23 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0068 <- 3.32 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx >5fdk_D:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RECU(D88N) IN COMPLEX WITH PALINDROMIC DNA DUPLEX organism=Bacillus subtilis : x : TYR xxxx D0068 <- 3.32 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx >5ff8_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=TDG ENZYME-PRODUCT COMPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0201 <- 2.95 -> DG O6 D0030 : score 5.60735 : H : GLN OE1 A0278 <- 3.12 -> DG N2 D0030 : score 5.2488 : H : GLN NE2 A0278 <- 2.96 -> DT O2 D0031 : score 3.80747 : x : SER xxxx A0200 <- 3.66 -> DG xxx D0030 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0274 <- 3.39 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.39 -> DG xxx D0030 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0276 <- 4.15 -> DG xxx D0030 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 3.46 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >5ffj_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF A NUCLEASE-DELETION MUTANT OF THE TYPE ISP RESTRICTION- MODIFICATION ENZYME LLAGI IN COMPLEX WITH A DNA SUBSTRATE MIMIC organism=Lactococcus lactis : H : GLN OE1 B1118 <- 2.77 -> DC N4 F0013 : score 4.61083 : H : GLN OE1 B1118 <- 2.77 -> DC N4 F0013 : score 4.61083 : H : LYS NZ B1131 <- 2.90 -> DG N7 E0012 : score 5.27818 : H : LYS NZ B1131 <- 2.50 -> DG O6 E0012 : score 6.12762 : H : LYS NZ B1131 <- 2.90 -> DG N7 E0012 : score 5.27818 : H : LYS NZ B1131 <- 2.50 -> DG O6 E0012 : score 6.12762 : H : ARG NH1 B1138 <- 2.86 -> DG N3 E0012 : score 3.01593 : w : ASN OD1 B1228 <- 5.99 -> DT O4 F0018 : score 3.132 : H : ARG NH1 B1286 <- 2.99 -> DG N7 F0019 : score 5.8201 : H : ARG NH2 B1286 <- 2.67 -> DG O6 F0019 : score 6.7716 : H : ASN OD1 B1327 <- 2.79 -> DA N6 E0007 : score 6.03384 : w : ASN OD1 B1327 <- 6.05 -> DT O4 F0018 : score 3.132 : H : ARG NH2 B1329 <- 2.62 -> DA N7 E0007 : score 1.73198 : H : HIS NE2 B1368 <- 2.84 -> DG N7 F0016 : score 6.74814 : H : GLN OE1 B1373 <- 2.88 -> DC N4 E0009 : score 4.51 : x : VAL xxxx B0867 <- 3.58 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B1018 <- 3.08 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B1021 <- 3.21 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B1023 <- 3.39 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1056 <- 3.42 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B1058 <- 3.43 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1119 <- 3.45 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1125 <- 3.88 -> DC xxx F0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B1133 <- 3.76 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1135 <- 3.92 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1137 <- 3.41 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1223 <- 3.21 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B1226 <- 4.07 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1326 <- 3.40 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B1367 <- 3.50 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1375 <- 4.14 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx >5fhd_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF BACTEROIDES SP PIF1 COMPLEXED WITH TAILED DSDNA RESULTING IN SSDNA BOUND COMPLEX organism=Bacteroides sp. 2_1_16 : w : HIS NE2 A0068 <- 5.67 -> DT O2 C0006 : score 3.682 : w : ARG NH2 A0111 <- 5.37 -> DT O2 C0006 : score 2.261 A : w : GLU OE1 A0154 <- 5.71 -> DT N3 C0005 : score 2.056 : V : PHE CD1 A0075 <- 3.51 -> DT C7 C0007 : score 4.4517 >5fj8_ABE: title=CRYO-EM STRUCTURE OF YEAST RNA POLYMERASE III ELONGATION COMPLEX AT 3. 9 A organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1373 <- 2.98 -> DT xxx R0012 : score x.xxxxx >5flm_ABE: title=STRUCTURE OF TRANSCRIBING MAMMALIAN RNA POLYMERASE II organism=BOS TAURUS : x : MET xxxx A0266 <- 4.46 -> DT xxx T0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0364 <- 4.18 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0461 <- 4.17 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 3.78 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.19 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 4.12 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1416 <- 4.10 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0492 <- 3.55 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx >5flv_I:p53-like_transcription_factors;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NKX2-5 AND TBX5 BOUND TO THE NPPA PROMOTER REGION organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 I0141 <- 2.80 -> DA N3 K0013 : score 3.23974 : H : ASN ND2 I0187 <- 3.22 -> DA N7 J0015 : score 5.37739 : x : ILE xxxx I0183 <- 3.54 -> DA xxx J0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0186 <- 3.39 -> DC xxx K0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx I0190 <- 3.52 -> DC xxx K0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0191 <- 3.29 -> DG xxx J0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I1081 <- 3.24 -> DG xxx K0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I1215 <- 4.02 -> DC xxx J0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I1232 <- 3.91 -> DG xxx K0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I1236 <- 3.36 -> DT xxx K0017 : score x.xxxxx >5fmf_1AMPQUV:TATA-box_binding_protein-like;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain;Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;TFB5-like; title=THE P-LOBE OF RNA POLYMERASE II PRE-INITIATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN ND2 Q0069 <- 2.93 -> DT O2 T0145 : score 4.62275 : H : THR OG1 Q0124 <- 3.01 -> DT O2 T0144 : score 2.60011 : V : PHE CD2 Q0099 <- 3.55 -> DT C7 T0143 : score 6.91878 : x : MET xxxx 10459 <- 4.15 -> DT xxx T0104 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 10785 <- 3.24 -> DT xxx T0106 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0195 <- 1.22 -> DC xxx T0118 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx Q0071 <- 3.77 -> DA xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Q0100 <- 1.11 -> DG xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Q0101 <- 3.53 -> DT xxx T0143 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Q0103 <- 4.46 -> DT xxx T0143 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Q0114 <- 2.42 -> DT xxx T0143 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Q0116 <- 2.14 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx Q0122 <- 2.94 -> DA xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Q0159 <- 4.32 -> DA xxx N0021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx Q0161 <- 4.14 -> DA xxx N0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Q0190 <- 3.38 -> DA xxx T0149 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx Q0191 <- 3.27 -> DA xxx T0149 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Q0205 <- 3.72 -> DT xxx N0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Q0215 <- 4.13 -> DA xxx N0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx V0291 <- 1.42 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx V0292 <- 2.98 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : MET xxxx V0294 <- 3.87 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx V0295 <- 4.02 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx V0323 <- 1.90 -> DT xxx T0133 : score x.xxxxx >5fmf_V:Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE P-LOBE OF RNA POLYMERASE II PRE-INITIATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : SER xxxx V0291 <- 1.42 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx V0292 <- 2.98 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : MET xxxx V0294 <- 3.87 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx V0295 <- 4.02 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx V0323 <- 1.90 -> DT xxx T0133 : score x.xxxxx >5fmp_AB:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=KSTR, TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR OF CHOLESTEROL DEGRADATION IN MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS, BOUND TO THE DNA OPERATOR organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : H : ARG NH1 A0061 <- 2.85 -> DG N7 D0010 : score 5.9895 : H : ARG NH2 A0061 <- 2.93 -> DG O6 D0010 : score 6.4284 : H : ARG NH1 B0061 <- 2.94 -> DG N7 C0010 : score 5.8806 : H : ARG NH2 B0061 <- 3.05 -> DG O6 C0010 : score 6.27 : x : MET xxxx A0060 <- 3.93 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0070 <- 3.74 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0071 <- 3.59 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0073 <- 3.44 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0075 <- 3.55 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0060 <- 3.91 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0070 <- 3.88 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0071 <- 3.82 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0073 <- 3.32 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0075 <- 3.55 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx >5fmp_B:Homeodomain-like; title=KSTR, TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR OF CHOLESTEROL DEGRADATION IN MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS, BOUND TO THE DNA OPERATOR organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : H : ARG NH1 B0061 <- 2.94 -> DG N7 C0010 : score 5.8806 : H : ARG NH2 B0061 <- 3.05 -> DG O6 C0010 : score 6.27 : x : MET xxxx B0060 <- 3.91 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0070 <- 3.88 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0071 <- 3.82 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0073 <- 3.32 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0075 <- 3.55 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx >5frm_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND THE INSTI XZ384 (COMPOUND 4A) organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.89 -> DC O2 C0006 : score 2.61111 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.76 -> DC O2 C0006 : score 3.72831 : w : SER OG A0225 <- 5.58 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.79 -> DT C7 C0008 : score 6.37487 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.68 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.93 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.57 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.89 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >5frn_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND THE INSTI XZ419 (COMPOUND 4C) organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.91 -> DC O2 C0006 : score 2.60048 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.78 -> DC O2 C0006 : score 3.71351 : V : PRO CG A0259 <- 3.76 -> DT C7 C0008 : score 6.42256 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.69 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 4.01 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.61 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 4.08 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >5fro_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND THE INSTI XZ446 (COMPOUND 4F) organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.98 -> DC O2 C0006 : score 2.56325 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.79 -> DC O2 C0006 : score 3.70612 : V : PRO CG A0259 <- 3.71 -> DT C7 C0008 : score 6.50205 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.63 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.86 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.81 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 4.08 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >5fur_ACGI: title=STRUCTURE OF HUMAN TFIID-IIA BOUND TO CORE PROMOTER DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 A0167 <- 3.27 -> DT O2 F0148 : score 4.30002 : H : ASN ND2 A0167 <- 3.14 -> DT O2 F0149 : score 4.42342 : H : ASN ND2 A0257 <- 3.31 -> DA N3 E0012 : score 3.41931 : H : THR OG1 A0313 <- 2.88 -> DA N3 E0012 : score 1.33218 : H : ARG NH2 G0875 <- 2.82 -> DA N3 E0069 : score 3.22678 : x : VAL xxxx A0169 <- 3.75 -> DT xxx F0148 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0197 <- 2.91 -> DT xxx F0146 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0198 <- 4.09 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0212 <- 3.40 -> DT xxx F0147 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0214 <- 3.28 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0220 <- 3.57 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0222 <- 3.87 -> DT xxx F0147 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0259 <- 3.61 -> DT xxx F0149 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0288 <- 3.14 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0289 <- 3.21 -> DA xxx F0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0303 <- 3.52 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0305 <- 3.16 -> DT xxx F0151 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0311 <- 3.39 -> DA xxx F0150 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0861 <- 4.42 -> DC xxx F0096 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0864 <- 3.45 -> DG xxx F0095 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0865 <- 3.87 -> DC xxx E0062 : score x.xxxxx >5fur_G: title=STRUCTURE OF HUMAN TFIID-IIA BOUND TO CORE PROMOTER DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 G0875 <- 2.82 -> DA N3 E0069 : score 3.22678 : x : SER xxxx G0861 <- 4.42 -> DC xxx F0096 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0864 <- 3.45 -> DG xxx F0095 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0865 <- 3.87 -> DC xxx E0062 : score x.xxxxx >5fw1_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF SPYCAS9 VARIANT VQR BOUND TO SGRNA AND TGAG PAM TARGET DNA organism=STREPTOCOCCUS PYOGENES : H : LYS NZ B1107 <- 3.06 -> DC O2 C0007 : score 2.79295 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.03 -> DG N7 D0006 : score 5.7717 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.59 -> DG O6 D0006 : score 6.8772 : w : ARG NH2 B1333 <- 5.98 -> DT O4 C0006 : score 2.366 : H : GLN OE1 B1335 <- 2.83 -> DA N6 D0007 : score 6.01625 : H : GLN NE2 B1335 <- 3.24 -> DA N7 D0007 : score 5.55385 : w : GLN OE1 B1335 <- 5.86 -> DC N4 C0005 : score 3.488 : H : ARG NH1 B1337 <- 2.67 -> DG N7 D0008 : score 6.2073 : H : ARG NH2 B1337 <- 2.67 -> DG O6 D0008 : score 6.7716 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.05 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx >5fw2_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF SPCAS9 VARIANT EQR BOUND TO SGRNA AND TGAG PAM TARGET DNA organism=STREPTOCOCCUS PYOGENES : H : LYS NZ B1107 <- 2.87 -> DA N3 C0008 : score 2.73805 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.21 -> DG N7 D0006 : score 5.5539 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.44 -> DG O6 D0006 : score 7.0752 : H : GLN OE1 B1335 <- 2.62 -> DA N6 D0007 : score 6.27046 : H : ARG NH1 B1337 <- 2.83 -> DG O6 D0008 : score 6.04683 : H : ARG NH2 B1337 <- 2.62 -> DG N7 D0008 : score 6.61446 : x : GLU xxxx B1219 <- 3.46 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx >5fw3_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF SPCAS9 VARIANT VRER BOUND TO SGRNA AND TGCG PAM TARGET DNA organism=STREPTOCOCCUS PYOGENES : H : LYS NZ B1107 <- 3.09 -> DC O2 C0007 : score 2.77528 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.23 -> DG N7 D0006 : score 5.5297 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.51 -> DG O6 D0006 : score 6.9828 : H : ARG NH1 B1337 <- 2.88 -> DG O6 D0008 : score 5.986 : H : ARG NH2 B1337 <- 2.89 -> DG N7 D0008 : score 6.26969 : x : GLU xxxx B1219 <- 3.88 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1335 <- 3.51 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx >5fyw_ABMORU:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;TATA-box_binding_protein-like;Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain; title=TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX STRUCTURES ELUCIDATE DNA OPENING (OC) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : V : ALA CB R0327 <- 3.55 -> DT C7 N0032 : score 5.94891 : x : ALA xxxx A0832 <- 3.96 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0531 <- 3.48 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0201 <- 3.65 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx O0069 <- 3.35 -> DT xxx T0048 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0071 <- 3.74 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0099 <- 2.72 -> DT xxx T0045 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0114 <- 3.26 -> DT xxx T0046 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0116 <- 3.31 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0122 <- 3.67 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0124 <- 3.52 -> DA xxx T0047 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx O0159 <- 3.47 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0161 <- 3.88 -> DT xxx T0048 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0190 <- 3.47 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0191 <- 4.16 -> DA xxx T0051 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0205 <- 3.80 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0213 <- 4.01 -> DA xxx T0049 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0215 <- 3.79 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx >5fyw_M:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX STRUCTURES ELUCIDATE DNA OPENING (OC) organism=? : x : LYS xxxx M0201 <- 3.65 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx >5fz5_AMORUW:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;TATA-box_binding_protein-like;Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain; title=TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX STRUCTURES ELUCIDATE DNA OPENING (CC) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN ND2 O0069 <- 2.82 -> DT O2 T0061 : score 4.72717 : H : THR OG1 O0124 <- 3.14 -> DA N3 T0060 : score 1.26178 : x : LYS xxxx M0201 <- 3.65 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0071 <- 3.58 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0099 <- 2.00 -> DT xxx T0058 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0114 <- 2.49 -> DT xxx T0059 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0116 <- 2.53 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0122 <- 3.24 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx O0159 <- 3.52 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0161 <- 4.10 -> DA xxx T0062 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0190 <- 4.05 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0205 <- 4.44 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0215 <- 4.40 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx W0080 <- 4.40 -> DC xxx T0041 : score x.xxxxx >5fz5_W:Zinc_beta-ribbon; title=TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX STRUCTURES ELUCIDATE DNA OPENING (CC) organism=? : x : LYS xxxx W0080 <- 4.40 -> DC xxx T0041 : score x.xxxxx >5g32_A:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF RAD14 IN COMPLEX WITH ACETYLAMINOPHENYL-GUANINE CONTAINING DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : w : LYS NZ A0233 <- 5.67 -> DT O4 C0005 : score 1.7 : H : ASN ND2 A0256 <- 3.11 -> DC O2 C0002 : score 4.20176 : x : THR xxxx A0230 <- 3.75 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0231 <- 3.94 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0234 <- 2.62 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0240 <- 3.33 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0258 <- 3.06 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0262 <- 3.27 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx >5g32_AB:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF RAD14 IN COMPLEX WITH ACETYLAMINOPHENYL-GUANINE CONTAINING DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : w : LYS NZ A0233 <- 5.67 -> DT O4 C0005 : score 1.7 : H : ASN ND2 A0256 <- 3.11 -> DC O2 C0002 : score 4.20176 : H : ASN ND2 B0256 <- 2.90 -> DT O2 D0002 : score 4.65123 : x : THR xxxx A0230 <- 3.75 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0231 <- 3.94 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0234 <- 2.62 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0240 <- 3.33 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0258 <- 3.06 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0262 <- 3.27 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0230 <- 3.94 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0240 <- 3.55 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0258 <- 2.98 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0262 <- 3.30 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx >5g33_A:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF RAD14 IN COMPLEX WITH ACETYLNAPHTYL-GUANINE CONTAINING DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN ND2 A0256 <- 3.09 -> DC O2 C0002 : score 4.21968 : x : THR xxxx A0230 <- 3.99 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0231 <- 4.07 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0234 <- 2.69 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0240 <- 3.58 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0258 <- 3.16 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0262 <- 3.25 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx >5g33_AB:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF RAD14 IN COMPLEX WITH ACETYLNAPHTYL-GUANINE CONTAINING DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN ND2 A0256 <- 3.09 -> DC O2 C0002 : score 4.21968 : H : ASN ND2 B0256 <- 2.51 -> DT O2 D0002 : score 5.02143 : x : THR xxxx A0230 <- 3.99 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0231 <- 4.07 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0234 <- 2.69 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0240 <- 3.58 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0258 <- 3.16 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0262 <- 3.25 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0230 <- 3.85 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0240 <- 3.88 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0258 <- 3.68 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0262 <- 3.28 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx >5g34_AB:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF RAD14 IN COMPLEX WITH ACETYLAMINOANTHRACENE-C8-GUANINE CONTAINING DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : GLU OE1 A0234 <- 3.19 -> DG N2 C0001 : score 3.97406 A : H : ASN ND2 A0256 <- 2.68 -> DC O2 C0002 : score 4.58699 : H : ASN ND2 B0256 <- 2.66 -> DT O2 D0002 : score 4.87905 : x : THR xxxx A0230 <- 3.66 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0231 <- 3.63 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0233 <- 4.45 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0240 <- 2.75 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0258 <- 3.23 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0262 <- 3.40 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0230 <- 3.94 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0240 <- 3.04 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0258 <- 3.48 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0262 <- 3.38 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx >5g34_B:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF RAD14 IN COMPLEX WITH ACETYLAMINOANTHRACENE-C8-GUANINE CONTAINING DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ASN ND2 B0256 <- 2.66 -> DT O2 D0002 : score 4.87905 : x : THR xxxx B0230 <- 3.94 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0240 <- 3.04 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0258 <- 3.48 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0262 <- 3.38 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx >5g5t_A:Ribonuclease_H-like;PAZ_domain; title=STRUCTURE OF THE ARGONAUTE PROTEIN FROM METHANOCALDCOCCUS JANASCHII IN COMPLEX WITH GUIDE DNA organism=METHANOCALDOCOCCUS JANNASCHII : H : LYS NZ A0107 <- 3.07 -> DG N7 D0020 : score 5.09506 : x : PHE xxxx A0045 <- 3.43 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0209 <- 3.39 -> DT xxx D0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0210 <- 3.64 -> DT xxx D0021 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0213 <- 3.39 -> DT xxx D0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0217 <- 3.18 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0243 <- 3.61 -> DA xxx D0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0246 <- 3.62 -> DT xxx D0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0458 <- 4.47 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx >5gat_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE WILD TYPE DNA BINDING DOMAIN OF AREA COMPLEXED TO A 13BP DNA CONTAINING A CGATA SITE, 35 STRUCTURES organism=EMERICELLA NIDULANS : H : ARG NH1 A0024 <- 2.72 -> DG N7 B0105 : score 6.1468 : H : ARG NH2 A0024 <- 2.66 -> DG N7 B0105 : score 6.56338 : x : LEU xxxx A0022 <- 3.95 -> DC xxx B0104 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0038 <- 3.24 -> DA xxx C0120 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0039 <- 4.15 -> DT xxx C0119 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0042 <- 4.48 -> DT xxx C0119 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0059 <- 4.13 -> DA xxx C0120 : score x.xxxxx >5gke_A: title=STRUCTURE OF ENDOMS-DSDNA1 COMPLEX organism=Thermococcus kodakarensis KOD1 : x : ARG xxxx A0183 <- 3.62 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0186 <- 3.81 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx >5gke_AB: title=STRUCTURE OF ENDOMS-DSDNA1 COMPLEX organism=Thermococcus kodakarensis KOD1 : x : ARG xxxx A0183 <- 3.62 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0186 <- 3.81 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0183 <- 3.12 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0186 <- 3.09 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx >5gkf_A: title=STRUCTURE OF ENDOMS-DSDNA1' COMPLEX organism=Thermococcus kodakarensis KOD1 : x : ARG xxxx A0183 <- 3.31 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0186 <- 3.25 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx >5gkf_AB: title=STRUCTURE OF ENDOMS-DSDNA1' COMPLEX organism=Thermococcus kodakarensis KOD1 : x : ARG xxxx A0183 <- 3.31 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0186 <- 3.25 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0183 <- 3.80 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0186 <- 3.65 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx >5gkg_AB: title=STRUCTURE OF ENDOMS-DSDNA1'' COMPLEX organism=Thermococcus kodakarensis KOD1 : x : ARG xxxx A0183 <- 3.24 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0186 <- 3.38 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0183 <- 3.82 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0186 <- 3.58 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx >5gkg_B: title=STRUCTURE OF ENDOMS-DSDNA1'' COMPLEX organism=Thermococcus kodakarensis KOD1 : x : ARG xxxx B0183 <- 3.82 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0186 <- 3.58 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx >5gkh_A: title=STRUCTURE OF ENDOMS-DSDNA2 COMPLEX organism=Thermococcus kodakarensis KOD1 : x : ARG xxxx A0183 <- 4.07 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0186 <- 3.87 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >5gkh_AB: title=STRUCTURE OF ENDOMS-DSDNA2 COMPLEX organism=Thermococcus kodakarensis KOD1 : x : ARG xxxx A0183 <- 4.07 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0186 <- 3.87 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0183 <- 3.47 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0186 <- 4.04 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >5gki_AB: title=STRUCTURE OF ENDOMS-DSDNA3 COMPLEX organism=Thermococcus kodakarensis KOD1 : x : ARG xxxx A0183 <- 3.69 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0186 <- 3.39 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0183 <- 4.02 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0186 <- 3.49 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx >5gki_B: title=STRUCTURE OF ENDOMS-DSDNA3 COMPLEX organism=Thermococcus kodakarensis KOD1 : x : ARG xxxx B0183 <- 4.02 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0186 <- 3.49 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx >5gnj_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF A TRANSCRIPTION FACTOR AND DNA COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : H : HIS NE2 A0453 <- 2.98 -> DG O6 C0613 : score 7.66751 : H : GLU OE1 A0457 <- 3.35 -> DC N4 D0808 : score 5.13347 : H : ARG NH1 A0461 <- 3.10 -> DG N7 C0611 : score 5.687 : H : HIS NE2 B0453 <- 3.17 -> DG N7 D0813 : score 6.29917 : H : GLU OE2 B0457 <- 3.27 -> DC N4 C0608 : score 4.77044 : w : GLU OE1 B0457 <- 5.19 -> DG O6 D0811 : score 2.669 : x : ARG xxxx A0460 <- 4.12 -> DC xxx D0808 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0460 <- 4.20 -> DC xxx C0608 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0461 <- 3.37 -> DG xxx D0811 : score x.xxxxx >5gnj_GIN:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF A TRANSCRIPTION FACTOR AND DNA COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : H : GLU OE1 G0457 <- 3.39 -> DC N4 L0808 : score 5.08733 : H : ARG NH2 G0461 <- 2.91 -> DG N7 K0611 : score 6.24415 : H : HIS NE2 I0453 <- 3.16 -> DG N7 L0813 : score 6.31278 : H : ARG NH1 I0461 <- 3.26 -> DG N7 L0811 : score 5.4934 : w : ARG NH1 I0461 <- 5.49 -> DG O6 L0811 : score 2.756 : x : HIS xxxx G0453 <- 3.30 -> DA xxx K0614 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0460 <- 3.99 -> DC xxx L0808 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0457 <- 3.17 -> DT xxx L0812 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0460 <- 3.88 -> DC xxx K0608 : score x.xxxxx >5gnj_I:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF A TRANSCRIPTION FACTOR AND DNA COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : H : HIS NE2 I0453 <- 3.16 -> DG N7 L0813 : score 6.31278 : H : ARG NH1 I0461 <- 3.26 -> DG N7 L0811 : score 5.4934 : w : ARG NH1 I0461 <- 5.49 -> DG O6 L0811 : score 2.756 : x : GLU xxxx I0457 <- 3.17 -> DT xxx L0812 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0460 <- 3.88 -> DC xxx K0608 : score x.xxxxx >5gpc_ABCD:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=STRUCTURAL ANALYSIS OF FATTY ACID DEGRADATION REGULATOR FADR FROM BACILLUS HALODURANS organism=Bacillus halodurans : w : ASP OD2 D0041 <- 6.59 -> DA N6 E0005 : score 3.409 : V : LEU CD1 C0046 <- 3.84 -> DT C7 G0007 : score 5.67397 : x : VAL xxxx A0030 <- 3.60 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0040 <- 3.99 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0041 <- 3.67 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0043 <- 3.93 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0045 <- 3.22 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0046 <- 3.73 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0030 <- 3.93 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0040 <- 3.84 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0041 <- 3.94 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0043 <- 3.57 -> DT xxx G0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0045 <- 3.54 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0046 <- 3.63 -> DA xxx G0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0040 <- 4.02 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0041 <- 3.97 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0043 <- 3.65 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0045 <- 3.44 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0030 <- 3.81 -> DT xxx G0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0040 <- 3.75 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0043 <- 3.97 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0045 <- 3.73 -> DT xxx G0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0046 <- 3.62 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx >5gpc_B:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=STRUCTURAL ANALYSIS OF FATTY ACID DEGRADATION REGULATOR FADR FROM BACILLUS HALODURANS organism=Bacillus halodurans : x : VAL xxxx B0030 <- 3.93 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0040 <- 3.84 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0041 <- 3.94 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0043 <- 3.57 -> DT xxx G0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0045 <- 3.54 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0046 <- 3.63 -> DA xxx G0002 : score x.xxxxx >5gq9_B:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS ARGONAUTE IN COMPLEX WITH G1C SIDNA AND DNA TARGET organism=Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) / Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) : H : ASN ND2 B0449 <- 2.83 -> DG N3 E0002 : score 4.8655 : x : TYR xxxx B0043 <- 4.07 -> DA xxx F0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0044 <- 3.74 -> DA xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0059 <- 3.24 -> DA xxx F0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0267 <- 3.70 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0445 <- 3.60 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0446 <- 3.52 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0548 <- 4.46 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0610 <- 3.78 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0611 <- 3.50 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0615 <- 4.05 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0647 <- 3.78 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx >5gse_D:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UNUSUAL NUCLEOSOME organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx D0033 <- 3.33 -> DG xxx J0225 : score x.xxxxx >5gsu_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONSISTING OF HUMAN TESTIS-SPECIFIC HISTONE VARIANTS, TH2A AND TH2B organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.98 -> DA N3 J0229 : score 3.12311 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.46 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.95 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.79 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.53 -> DG xxx I0081 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.19 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.00 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.99 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.84 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0032 <- 4.16 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.29 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0044 <- 3.93 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0044 <- 4.09 -> DA xxx I0111 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0037 <- 4.18 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx >5gsu_C:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONSISTING OF HUMAN TESTIS-SPECIFIC HISTONE VARIANTS, TH2A AND TH2B organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx C0044 <- 3.93 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx >5gt0_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME COMPLEX WITH HUMAN TESTIS-SPECIFIC HISTONE VARIANTS, TH2A organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 E0040 <- 2.99 -> DA N3 I0082 : score 3.11663 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.27 -> DA xxx J0229 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.22 -> DT xxx J0237 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.04 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.15 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.88 -> DG xxx J0214 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.56 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0029 <- 3.55 -> DT xxx J0191 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.21 -> DC xxx I0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0039 <- 4.39 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.44 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >5gt0_C:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME COMPLEX WITH HUMAN TESTIS-SPECIFIC HISTONE VARIANTS, TH2A organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx C0042 <- 3.56 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx >5gt3_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME PARTICLE IN THE PRESENCE OF HUMAN TESTIS-SPECIFIC HISTONE VARIANT, HTH2B organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.73 -> DA N3 J0229 : score 3.2851 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.07 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.65 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.26 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.89 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.88 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.43 -> DG xxx J0277 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.03 -> DA xxx I0082 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.90 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.11 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.11 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx >5gt3_C:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME PARTICLE IN THE PRESENCE OF HUMAN TESTIS-SPECIFIC HISTONE VARIANT, HTH2B organism=? : x : ARG xxxx C0042 <- 3.88 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.43 -> DG xxx J0277 : score x.xxxxx >5gtc_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF COMPLEX BETWEEN DMAP-SH CONJUGATED WITH A KAPOSI'S SARCOMA HERPESVIRUS LANA PEPTIDE (5-15) AND NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.92 -> DA N3 J0229 : score 3.16199 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.81 -> DA N3 I0082 : score 3.23326 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.36 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.43 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.26 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.55 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.79 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.97 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.42 -> DG xxx J0268 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.30 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.22 -> DT xxx J0289 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.38 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0063 <- 4.04 -> DG xxx J0205 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.09 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.88 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.35 -> DA xxx I0111 : score x.xxxxx >5gwi_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=STRUCTURE OF A HUMAN TOPOISOMERASE IIBETA FRAGMENT IN COMPLEX WITH DNA AND E7873R organism=Homo sapiens : w : LYS NZ B0505 <- 5.76 -> DT O2 D0015 : score 0.522 : w : ASP OD1 B0726 <- 5.33 -> DC O2 D0016 : score 1.919 : w : ASP OD2 B0726 <- 5.46 -> DC O2 D0016 : score 1.919 : H : GLN OE1 B0778 <- 3.18 -> DC N4 E0008 : score 4.235 : w : GLN OE1 B0778 <- 5.59 -> DG N7 E0007 : score 2.87 : x : ALA xxxx B0779 <- 3.86 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0870 <- 3.56 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0872 <- 3.38 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0877 <- 4.35 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx >5gwj_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=STRUCTURE OF A HUMAN TOPOISOMERASE IIBETA FRAGMENT IN COMPLEX WITH DNA AND E7873S organism=Homo sapiens : w : LYS NZ B0505 <- 6.02 -> DT O2 D0015 : score 0.522 : w : ASP OD1 B0726 <- 6.28 -> DA N3 E0006 : score 1.331 : w : ARG NH2 B0729 <- 5.58 -> DA N3 E0006 : score 2.092 : w : LYS NZ B0879 <- 6.56 -> DG N3 D0018 : score 2.232 : x : ALA xxxx B0779 <- 4.01 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0870 <- 4.17 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0872 <- 3.40 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0877 <- 4.28 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx >5gwk_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=HUMAN TOPOISOMERASE IIALPHA IN COMPLEX WITH DNA AND ETOPOSIDE organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx B0489 <- 4.16 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0655 <- 4.19 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0763 <- 3.38 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0856 <- 3.42 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0861 <- 4.28 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx >5gxq_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING H3.6 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.61 -> DA N3 J0229 : score 3.36285 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.74 -> DA N3 I0082 : score 3.27862 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.31 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.78 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.11 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.73 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 4.06 -> DT xxx J0263 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.36 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.27 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.89 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.35 -> DA xxx I0099 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.81 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.47 -> DT xxx J0184 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.19 -> DT xxx I0130 : score x.xxxxx >5gxq_D:Histone-fold; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING H3.6 organism=HOMO SAPIENS : x : ILE xxxx D0039 <- 4.27 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx >5gzb_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSCRIPTION FACTOR TEAD4 IN COMPLEX WITH M-CAT DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0095 <- 3.29 -> DG N7 C0005 : score 5.4571 : H : LYS NZ A0096 <- 3.21 -> DG N7 C0006 : score 4.94425 : H : LYS NZ A0096 <- 2.55 -> DG O6 C0006 : score 6.06981 : H : SER OG A0100 <- 2.49 -> DA N7 B0005 : score 4.74088 : H : GLN NE2 A0103 <- 2.92 -> DA N7 C0008 : score 5.94359 : x : MET xxxx A0074 <- 3.23 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0099 <- 4.47 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0104 <- 3.56 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0107 <- 3.66 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >5h1c_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Rad51_N-terminal_domain-like; title=HUMAN RAD51 POST-SYNAPTIC COMPLEXES organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0235 <- 4.36 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0238 <- 3.85 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0270 <- 4.44 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0273 <- 3.80 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0274 <- 3.09 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0283 <- 4.27 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >5h1c_ABC:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Rad51_N-terminal_domain-like; title=HUMAN RAD51 POST-SYNAPTIC COMPLEXES organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0235 <- 4.36 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0238 <- 3.85 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0270 <- 4.44 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0273 <- 3.80 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0274 <- 3.09 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0283 <- 4.27 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0235 <- 3.48 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0238 <- 3.25 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0239 <- 3.32 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0273 <- 3.93 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0274 <- 3.01 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0283 <- 4.27 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0235 <- 3.32 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0238 <- 3.36 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0239 <- 3.48 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0270 <- 4.41 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0273 <- 4.40 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0274 <- 2.97 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx >5h3r_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MUTANT MARR C80S FROM E.COLI COMPLEXED WITH OPERATOR DNA organism=Escherichia coli : H : ASP OD2 A0067 <- 3.15 -> DC N4 C0015 : score 5.766 : H : ARG NH1 A0073 <- 2.87 -> DG O6 D0008 : score 5.99817 : H : ARG NH2 A0073 <- 3.11 -> DG N7 C0013 : score 5.98877 : H : ARG NH2 A0073 <- 2.78 -> DG O6 C0014 : score 6.6264 : H : ARG NE A0094 <- 3.24 -> DA N3 D0003 : score 1.91754 : V : LEU CG A0068 <- 3.65 -> DT C7 D0006 : score 4.56394 : V : THR CB A0072 <- 3.75 -> DT C7 D0007 : score 3.57023 : x : ALA xxxx A0070 <- 3.65 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0077 <- 3.36 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >5h3r_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MUTANT MARR C80S FROM E.COLI COMPLEXED WITH OPERATOR DNA organism=Escherichia coli : H : ASP OD2 A0067 <- 3.15 -> DC N4 C0015 : score 5.766 : H : ARG NH1 A0073 <- 2.87 -> DG O6 D0008 : score 5.99817 : H : ARG NH2 A0073 <- 3.11 -> DG N7 C0013 : score 5.98877 : H : ARG NH2 A0073 <- 2.78 -> DG O6 C0014 : score 6.6264 : H : ARG NE A0094 <- 3.24 -> DA N3 D0003 : score 1.91754 : H : ASP OD2 B0067 <- 3.25 -> DC N4 D0015 : score 5.642 : H : ARG NH1 B0073 <- 2.80 -> DG O6 C0008 : score 6.08333 : H : ARG NH2 B0073 <- 2.94 -> DG O6 D0014 : score 6.4152 : H : ARG NH1 B0094 <- 3.04 -> DT O2 C0003 : score 4.0997 : V : LEU CG B0068 <- 3.77 -> DT C7 C0006 : score 4.43197 : V : LEU CG A0068 <- 3.65 -> DT C7 D0006 : score 4.56394 : V : THR CB A0072 <- 3.75 -> DT C7 D0007 : score 3.57023 : x : ALA xxxx A0070 <- 3.65 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0077 <- 3.36 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0070 <- 3.96 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0072 <- 3.85 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx >5h58_A:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=STRUCTURAL AND DYNAMICS STUDIES OF THE TETR FAMILY PROTEIN, CPRB FROM STREPTOMYCES COELICOLOR IN COMPLEX WITH ITS BIOLOGICAL OPERATOR SEQUENCE organism=? : x : LEU xxxx A0032 <- 3.94 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0047 <- 3.46 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx >5h58_ABCD:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=STRUCTURAL AND DYNAMICS STUDIES OF THE TETR FAMILY PROTEIN, CPRB FROM STREPTOMYCES COELICOLOR IN COMPLEX WITH ITS BIOLOGICAL OPERATOR SEQUENCE organism=STREPTOMYCES COELICOLOR A3(2) / STREPTOMYCES COELICOLOR A3(2) / STREPTOMYCES COELICOLOR A3(2) / STREPTOMYCES COELICOLOR A3(2) / STREPTOMYCES COELICOLOR A3(2) / STREPTOMYCES COELICOLOR A3(2) / STREPTOMYCES COELICOLOR A3(2) / STREPTOMYCES COELICOLOR A3(2) : H : LYS NZ D0043 <- 3.34 -> DG N7 E0019 : score 4.80422 : H : LYS NZ D0043 <- 2.67 -> DT O4 E0020 : score 3.68045 : x : LEU xxxx A0032 <- 3.94 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0047 <- 3.46 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0032 <- 3.64 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0042 <- 3.85 -> DC xxx F0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0043 <- 3.12 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0047 <- 3.59 -> DC xxx E0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0048 <- 3.39 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0042 <- 3.29 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0043 <- 3.15 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0047 <- 3.51 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0048 <- 3.45 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0032 <- 4.21 -> DT xxx E0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0033 <- 3.97 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0047 <- 3.57 -> DT xxx E0020 : score x.xxxxx >5h9e_AC: title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI CASCADE BOUND TO A PAM-CONTAINING DSDNA TARGET (32-NT SPACER) AT 3.20 ANGSTROM RESOLUTION. organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : LYS NZ A0268 <- 3.16 -> DT O2 N0035 : score 3.3289 : H : SER OG C0086 <- 3.20 -> DT O4 M0028 : score 3.27072 : H : ASP OD2 C0151 <- 2.43 -> DT N3 M0028 : score 3.85263 : V : THR CG2 A0301 <- 3.68 -> DT C7 M0021 : score 4.36403 : V : THR CG2 A0302 <- 3.71 -> DT C7 M0022 : score 4.33225 : V : HIS CG A0472 <- 3.59 -> DT C7 N0027 : score 3.15642 : x : GLN xxxx A0354 <- 3.14 -> DT xxx M0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0355 <- 3.15 -> DC xxx N0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0393 <- 3.87 -> DA xxx M0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0397 <- 3.46 -> DA xxx M0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0398 <- 3.67 -> DT xxx M0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0401 <- 3.40 -> DT xxx M0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0408 <- 3.83 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0416 <- 2.93 -> DA xxx M0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0417 <- 3.55 -> DT xxx M0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0473 <- 3.35 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0481 <- 3.58 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0484 <- 4.38 -> DA xxx M0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0083 <- 4.49 -> DT xxx M0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0089 <- 3.37 -> DT xxx M0028 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0144 <- 3.36 -> DT xxx M0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0147 <- 3.20 -> DT xxx M0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0154 <- 3.44 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0155 <- 4.27 -> DA xxx M0027 : score x.xxxxx >5h9e_BDEFGHIJ: title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI CASCADE BOUND TO A PAM-CONTAINING DSDNA TARGET (32-NT SPACER) AT 3.20 ANGSTROM RESOLUTION. organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : GLN NE2 B0024 <- 3.11 -> DG O6 N0003 : score 5.44521 : H : ARG NH2 B0027 <- 2.52 -> DG N7 N0003 : score 6.74215 : H : GLN NE2 G0209 <- 2.77 -> DC O2 N0012 : score 3.71704 : H : GLN NE2 G0209 <- 3.13 -> DC O2 N0013 : score 3.45101 : H : THR OG1 H0168 <- 3.41 -> DC O2 N0029 : score 2.30531 : H : GLN NE2 H0209 <- 3.48 -> DT O2 N0018 : score 3.3984 : H : GLN NE2 H0209 <- 2.70 -> DC O2 N0019 : score 3.76877 : V : TRP CD1 I0199 <- 3.72 -> DT C7 N0027 : score 7.48 : x : ALA xxxx B0023 <- 3.78 -> DG xxx N0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0101 <- 3.49 -> DA xxx N0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0123 <- 3.31 -> DA xxx N0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0110 <- 3.27 -> DT xxx N0004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0166 <- 3.69 -> DG xxx N0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0168 <- 3.46 -> DG xxx N0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0177 <- 4.30 -> DG xxx N0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0110 <- 3.31 -> DG xxx N0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0166 <- 3.37 -> DG xxx N0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0168 <- 3.76 -> DG xxx N0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx E0199 <- 3.80 -> DG xxx N0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0200 <- 4.40 -> DT xxx N0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0211 <- 4.13 -> DT xxx N0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0213 <- 3.42 -> DT xxx N0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0214 <- 3.67 -> DT xxx N0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0110 <- 3.58 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0111 <- 4.19 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0166 <- 3.54 -> DA xxx N0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0168 <- 3.99 -> DA xxx N0017 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0199 <- 3.66 -> DA xxx N0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0200 <- 4.20 -> DA xxx N0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0211 <- 3.46 -> DC xxx N0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0213 <- 3.38 -> DA xxx N0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0214 <- 3.19 -> DC xxx N0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0110 <- 3.42 -> DA xxx N0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0166 <- 3.79 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0168 <- 3.70 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0200 <- 4.33 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0202 <- 4.42 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0211 <- 4.07 -> DA xxx N0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0213 <- 3.31 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0214 <- 3.54 -> DG xxx N0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0110 <- 3.59 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0200 <- 4.13 -> DA xxx N0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0211 <- 3.80 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0213 <- 3.30 -> DA xxx N0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0214 <- 3.51 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0209 <- 3.58 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0211 <- 3.79 -> DA xxx N0026 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx I0213 <- 3.15 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0214 <- 3.43 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0216 <- 4.07 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0085 <- 4.40 -> DT xxx N0032 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0103 <- 3.49 -> DT xxx N0032 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx J0105 <- 3.33 -> DT xxx N0032 : score x.xxxxx >5h9e_C: title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI CASCADE BOUND TO A PAM-CONTAINING DSDNA TARGET (32-NT SPACER) AT 3.20 ANGSTROM RESOLUTION. organism=? : H : SER OG C0086 <- 3.20 -> DT O4 M0028 : score 3.27072 : H : ASP OD2 C0151 <- 2.43 -> DT N3 M0028 : score 3.85263 : x : THR xxxx C0083 <- 4.49 -> DT xxx M0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0089 <- 3.37 -> DT xxx M0028 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0144 <- 3.36 -> DT xxx M0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0147 <- 3.20 -> DT xxx M0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0154 <- 3.44 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0155 <- 4.27 -> DA xxx M0027 : score x.xxxxx >5h9f_ACI: title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI CASCADE BOUND TO A PAM-CONTAINING DSDNA TARGET AT 2.45 ANGSTROM RESOLUTION. organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : LYS NZ A0268 <- 2.86 -> DC O2 N0036 : score 2.9108 : w : LYS NZ A0268 <- 6.39 -> DT O2 N0035 : score 0.522 : H : GLN OE1 A0354 <- 3.23 -> DT N3 M0019 : score 3.12049 : w : HIS NE2 A0416 <- 6.19 -> DA N6 M0023 : score 2.619 : w : GLU OE2 A0417 <- 5.28 -> DA N6 M0023 : score 2.785 : H : TRP NE1 I0199 <- 3.46 -> DT O4 N0027 : score 4.17308 : V : THR CG2 A0301 <- 3.55 -> DT C7 M0021 : score 4.50173 : V : THR CG2 A0302 <- 3.78 -> DT C7 M0022 : score 4.25811 : V : LEU CD1 A0481 <- 3.80 -> DT C7 M0026 : score 5.73128 : V : HIS CG A0472 <- 3.70 -> DT C7 N0027 : score 3.07395 : x : ALA xxxx A0355 <- 3.22 -> DC xxx N0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0393 <- 3.60 -> DA xxx M0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0397 <- 3.30 -> DA xxx M0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0398 <- 3.98 -> DT xxx M0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0401 <- 3.47 -> DT xxx M0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0408 <- 3.90 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0473 <- 3.71 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0154 <- 3.37 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0209 <- 3.31 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0211 <- 4.10 -> DA xxx N0026 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx I0213 <- 3.36 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0214 <- 3.42 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0216 <- 3.96 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx >5h9f_BDEFGHJ: title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI CASCADE BOUND TO A PAM-CONTAINING DSDNA TARGET AT 2.45 ANGSTROM RESOLUTION. organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : GLN NE2 B0024 <- 3.15 -> DG O6 N0003 : score 5.39877 : H : ARG NH2 B0027 <- 2.76 -> DG N7 N0003 : score 6.43569 : H : ARG NH2 B0101 <- 3.27 -> DA N3 N0009 : score 2.93521 : w : THR OG1 G0168 <- 5.74 -> DA N3 N0023 : score 2.845 : H : GLN NE2 G0209 <- 3.02 -> DC O2 N0012 : score 3.5323 : H : GLN NE2 G0209 <- 2.69 -> DC O2 N0013 : score 3.77616 : w : ASN ND2 H0024 <- 6.04 -> DA N6 N0023 : score 2.5 : w : THR OG1 H0168 <- 5.93 -> DC O2 N0029 : score 2.048 : H : GLN NE2 H0209 <- 3.16 -> DT O2 N0018 : score 3.65013 : H : GLN NE2 H0209 <- 2.76 -> DC O2 N0019 : score 3.72443 : x : ALA xxxx B0023 <- 3.93 -> DG xxx N0003 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0123 <- 3.19 -> DA xxx N0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0110 <- 3.27 -> DT xxx N0004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0166 <- 3.67 -> DT xxx N0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0168 <- 3.46 -> DG xxx N0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0110 <- 3.28 -> DG xxx N0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0166 <- 3.30 -> DG xxx N0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0168 <- 3.92 -> DG xxx N0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx E0199 <- 3.89 -> DG xxx N0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0211 <- 4.40 -> DT xxx N0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0213 <- 3.30 -> DT xxx N0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0214 <- 3.70 -> DT xxx N0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0110 <- 3.65 -> DA xxx N0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0166 <- 3.62 -> DA xxx N0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0168 <- 3.93 -> DT xxx N0018 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0199 <- 3.86 -> DA xxx N0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0200 <- 4.33 -> DA xxx N0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0211 <- 3.78 -> DC xxx N0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0213 <- 3.46 -> DA xxx N0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0214 <- 3.51 -> DC xxx N0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0110 <- 3.62 -> DA xxx N0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0166 <- 3.43 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0200 <- 4.29 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0211 <- 4.23 -> DA xxx N0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0213 <- 3.41 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0214 <- 3.64 -> DG xxx N0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0110 <- 3.52 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0200 <- 4.20 -> DA xxx N0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0211 <- 4.19 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0213 <- 3.41 -> DA xxx N0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0214 <- 3.61 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0085 <- 4.41 -> DT xxx N0032 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0103 <- 3.44 -> DT xxx N0032 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx J0105 <- 3.24 -> DT xxx N0032 : score x.xxxxx >5h9f_G: title=CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI CASCADE BOUND TO A PAM-CONTAINING DSDNA TARGET AT 2.45 ANGSTROM RESOLUTION. organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : w : THR OG1 G0168 <- 5.74 -> DA N3 N0023 : score 2.845 : H : GLN NE2 G0209 <- 3.02 -> DC O2 N0012 : score 3.5323 : H : GLN NE2 G0209 <- 2.69 -> DC O2 N0013 : score 3.77616 : x : ALA xxxx G0110 <- 3.62 -> DA xxx N0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0166 <- 3.43 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0200 <- 4.29 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0211 <- 4.23 -> DA xxx N0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0213 <- 3.41 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0214 <- 3.64 -> DG xxx N0015 : score x.xxxxx >5haw_A:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURES OF THE NO FACTOR SLMA BOUND TO DNA AND THE CYTOSKELETAL CELL DIVISION PROTEIN FTSZ organism=Vibrio cholerae serotype O1 (strain ATCC 39315 / El Tor Inaba N16961) / Vibrio cholerae serotype O1 (strain ATCC 39315 / El Tor Inaba N16961) : w : THR OG1 A0032 <- 6.08 -> DA N7 Z0029 : score 2.152 : H : GLU OE1 A0043 <- 2.84 -> DC N4 Z0030 : score 5.72181 : x : ALA xxxx A0044 <- 3.35 -> DC xxx Z0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0047 <- 3.60 -> DC xxx Z0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0048 <- 4.35 -> DA xxx Z0033 : score x.xxxxx >5haw_AB:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURES OF THE NO FACTOR SLMA BOUND TO DNA AND THE CYTOSKELETAL CELL DIVISION PROTEIN FTSZ organism=Vibrio cholerae serotype O1 (strain ATCC 39315 / El Tor Inaba N16961) / Vibrio cholerae serotype O1 (strain ATCC 39315 / El Tor Inaba N16961) / Vibrio cholerae serotype O1 (strain ATCC 39315 / El Tor Inaba N16961) / Vibrio cholerae serotype O1 (strain ATCC 39315 / El Tor Inaba N16961) : w : THR OG1 A0032 <- 6.08 -> DA N7 Z0029 : score 2.152 : H : GLU OE1 A0043 <- 2.84 -> DC N4 Z0030 : score 5.72181 : x : ALA xxxx A0044 <- 3.35 -> DC xxx Z0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0047 <- 3.60 -> DC xxx Z0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0048 <- 4.35 -> DA xxx Z0033 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0043 <- 4.34 -> DG xxx Z0023 : score x.xxxxx >5hbu_ABCD:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF THE E. COLI NUCLEOID OCCLUSION PROTEIN SLMA BOUND TO DNA AND THE C-TERMINAL TAIL OF THE CYTOSKELETAL CELL DIVISION PROTEIN FTSZ organism=Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) : H : GLU OE1 A0045 <- 2.88 -> DC N4 Z0030 : score 5.67566 : w : GLU OE2 A0045 <- 6.23 -> DA N7 Z0029 : score 1.687 : H : ARG NE A0050 <- 3.05 -> DG N7 W0002 : score 4.20071 : H : ARG NH2 A0050 <- 2.67 -> DG O6 W0002 : score 6.7716 : w : THR OG1 B0034 <- 5.97 -> DA N7 W0012 : score 2.152 : H : GLU OE2 B0045 <- 2.55 -> DC N4 W0013 : score 5.52865 : H : GLU OE2 C0045 <- 2.83 -> DC N4 W0009 : score 5.23379 : w : GLU OE2 C0045 <- 6.09 -> DA N7 W0008 : score 1.687 : H : ARG NH2 C0050 <- 2.80 -> DG N7 Z0023 : score 6.38462 : H : ARG NH2 C0050 <- 2.67 -> DG O6 Z0023 : score 6.7716 : H : GLU OE1 D0045 <- 2.68 -> DC N4 Z0034 : score 5.90638 : V : ALA CB C0046 <- 3.60 -> DT C7 Z0024 : score 5.87892 : V : ALA CB A0046 <- 3.72 -> DT C7 W0003 : score 5.71095 : x : THR xxxx A0034 <- 3.23 -> DA xxx Z0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0044 <- 3.61 -> DT xxx W0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0047 <- 4.34 -> DT xxx W0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0049 <- 3.35 -> DC xxx Z0030 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0049 <- 3.14 -> DC xxx W0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0034 <- 3.50 -> DA xxx W0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0044 <- 3.62 -> DT xxx Z0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0047 <- 4.36 -> DT xxx Z0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0049 <- 3.51 -> DC xxx W0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0034 <- 3.11 -> DA xxx Z0033 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0049 <- 3.35 -> DC xxx Z0034 : score x.xxxxx >5hbu_EGH:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF THE E. COLI NUCLEOID OCCLUSION PROTEIN SLMA BOUND TO DNA AND THE C-TERMINAL TAIL OF THE CYTOSKELETAL CELL DIVISION PROTEIN FTSZ organism=Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) : H : GLU OE1 E0045 <- 3.05 -> DC N4 R0009 : score 5.47955 : H : ARG NH2 E0050 <- 2.69 -> DG O6 T0023 : score 6.7452 : H : ARG NH2 E0050 <- 2.91 -> DT O4 T0024 : score 3.47566 : H : GLU OE2 G0045 <- 2.76 -> DC N4 T0030 : score 5.30751 : H : ARG NH2 G0050 <- 2.83 -> DG O6 R0002 : score 6.5604 : w : ARG NE G0050 <- 5.44 -> DT O4 R0003 : score 1.317 : H : GLU OE1 H0045 <- 2.56 -> DC N4 R0013 : score 6.04481 : V : ALA CB E0046 <- 3.84 -> DT C7 T0024 : score 5.54298 : V : ALA CB G0046 <- 3.65 -> DT C7 R0003 : score 5.80894 : x : THR xxxx E0034 <- 3.39 -> DA xxx R0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0044 <- 3.89 -> DT xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0047 <- 4.38 -> DT xxx T0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0049 <- 3.33 -> DC xxx R0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0034 <- 3.20 -> DA xxx T0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0044 <- 3.69 -> DT xxx R0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0049 <- 3.15 -> DC xxx T0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0034 <- 3.11 -> DA xxx R0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0049 <- 3.02 -> DC xxx R0013 : score x.xxxxx >5hbu_G:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF THE E. COLI NUCLEOID OCCLUSION PROTEIN SLMA BOUND TO DNA AND THE C-TERMINAL TAIL OF THE CYTOSKELETAL CELL DIVISION PROTEIN FTSZ organism=Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) : H : GLU OE2 G0045 <- 2.76 -> DC N4 T0030 : score 5.30751 : H : ARG NH2 G0050 <- 2.83 -> DG O6 R0002 : score 6.5604 : w : ARG NE G0050 <- 5.44 -> DT O4 R0003 : score 1.317 : V : ALA CB G0046 <- 3.65 -> DT C7 R0003 : score 5.80894 : x : THR xxxx G0034 <- 3.20 -> DA xxx T0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0044 <- 3.69 -> DT xxx R0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0049 <- 3.15 -> DC xxx T0030 : score x.xxxxx >5hch_A:Calcium-mediated_lectin; title=X-RAY STRUCTURE OF A LECTIN-BOUND DNA DUPLEX CONTAINING AN UNNATURAL PHENANTHRENYL PAIR organism=Pseudomonas aeruginosa : x : THR xxxx A0045 <- 4.45 -> DC xxx B0013 : score x.xxxxx >5hdn_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HEAT SHOCK FACTOR1-DBD COMPLEX WITH DS-DNA AND TTT organism=HOMO SAPIENS : H : HIS ND1 C0063 <- 2.90 -> DG N7 G0002 : score 6.09862 : H : HIS ND1 C0063 <- 2.97 -> DG O6 G0002 : score 6.01149 : w : HIS NE2 C0063 <- 5.88 -> DG N7 G0001 : score 3.601 : V : LYS CB C0062 <- 3.68 -> DT C7 G0003 : score 2.37481 >5hf7_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=TDG ENZYME-SUBSTRATE COMPLEX organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0158 <- 6.39 -> DT O2 C0013 : score 3.682 : H : GLN OE1 A0278 <- 3.06 -> DG N2 D0018 : score 5.31609 : H : GLN NE2 A0278 <- 2.88 -> DT O2 D0019 : score 3.8704 : V : LYS CE A0201 <- 3.85 -> DT C7 C0009 : score 2.56851 : x : SER xxxx A0200 <- 4.05 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0274 <- 3.38 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.56 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0276 <- 4.14 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 3.36 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >5hhh_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA HOST-GUEST COMPLEXED WITH THE CONTROL G FOR N7-CBZ-PLATINATION organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.33 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.88 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.62 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5hhi_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA HOST-GUEST COMPLEXED WITH CBZ- PLATINATED N7-G organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.42 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.73 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.49 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5hlf_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH A 38-MER HAIRPIN TEMPLATE-PRIMER DNA APTAMER AND AN ALPHA-CARBOXYPHOSPHONATE INHIBITOR organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.86 -> DG N2 F0032 : score 4.83107 : H : TYR OH A0183 <- 2.29 -> DG N3 F0032 : score 3.43174 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.25 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.61 -> DG xxx F0033 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.54 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.71 -> DG xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.21 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.91 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx >5hlf_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH A 38-MER HAIRPIN TEMPLATE-PRIMER DNA APTAMER AND AN ALPHA-CARBOXYPHOSPHONATE INHIBITOR organism=? : H : TYR OH C0115 <- 3.15 -> DG N2 E0033 : score 4.54746 : H : TYR OH C0183 <- 3.07 -> DG N2 E0032 : score 4.6257 : H : TYR OH C0183 <- 2.59 -> DG N3 E0032 : score 3.24489 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.40 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 3.19 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.30 -> DG xxx E0033 : score x.xxxxx >5hlg_AC:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF REDUCED ABFR BOUND TO DNA organism=Staphylococcus epidermidis : H : SER OG A0066 <- 2.63 -> DA N7 I0008 : score 4.61588 : H : ASN ND2 A0067 <- 3.13 -> DG N7 J0017 : score 4.28323 : H : ASN ND2 A0067 <- 3.28 -> DG O6 J0017 : score 5.09717 : H : ARG NH1 A0092 <- 2.99 -> DT O2 I0005 : score 4.14277 : H : SER OG C0066 <- 2.61 -> DA N7 K0008 : score 4.63374 : H : ASN ND2 C0067 <- 3.12 -> DG N7 L0017 : score 4.2924 : H : ARG NH1 C0092 <- 2.79 -> DT O2 K0005 : score 4.31502 : x : THR xxxx A0068 <- 3.46 -> DG xxx J0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0070 <- 3.75 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0068 <- 3.37 -> DG xxx L0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0070 <- 3.78 -> DT xxx K0009 : score x.xxxxx >5hlg_E:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF REDUCED ABFR BOUND TO DNA organism=Staphylococcus epidermidis : H : SER OG E0066 <- 2.66 -> DA N7 M0008 : score 4.5891 : H : ASN ND2 E0067 <- 3.16 -> DG N7 N0017 : score 4.25571 : H : ARG NH1 E0092 <- 2.88 -> DT O2 M0005 : score 4.23751 : x : THR xxxx E0068 <- 3.47 -> DG xxx N0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0070 <- 3.57 -> DT xxx M0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0071 <- 4.42 -> DT xxx M0009 : score x.xxxxx >5hlg_FH:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF REDUCED ABFR BOUND TO DNA organism=Staphylococcus epidermidis : H : SER OG F0066 <- 2.47 -> DA N7 N0008 : score 4.75873 : H : ASN ND2 F0067 <- 3.15 -> DG N7 M0017 : score 4.26488 : H : ARG NH1 F0092 <- 2.95 -> DT O2 N0005 : score 4.17722 : H : SER OG H0066 <- 2.67 -> DA N7 P0008 : score 4.58017 : H : ASN ND2 H0067 <- 3.17 -> DG N7 O0017 : score 4.24654 : H : ARG NH1 H0092 <- 3.17 -> DT O2 P0005 : score 3.98774 : x : THR xxxx F0068 <- 3.43 -> DG xxx M0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0070 <- 3.69 -> DT xxx N0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0071 <- 4.43 -> DT xxx N0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0068 <- 3.44 -> DG xxx O0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0070 <- 3.71 -> DT xxx P0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0071 <- 4.42 -> DT xxx P0009 : score x.xxxxx >5hlh_AC:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE OVEROXIDIZED ABFR BOUND TO DNA organism=Staphylococcus epidermidis : H : SER OG A0066 <- 2.69 -> DA N7 I0008 : score 4.56231 : H : ASN ND2 A0067 <- 3.13 -> DG N7 J0017 : score 4.28323 : H : ASN ND2 A0067 <- 3.31 -> DG O6 J0017 : score 5.06334 : H : ARG NH1 A0092 <- 3.01 -> DT O2 I0005 : score 4.12554 : H : SER OG C0066 <- 2.68 -> DA N7 K0008 : score 4.57124 : H : ASN ND2 C0067 <- 3.16 -> DG N7 L0017 : score 4.25571 : H : ASN ND2 C0067 <- 3.34 -> DG O6 L0017 : score 5.02951 : H : ARG NH1 C0092 <- 3.18 -> DT O2 K0005 : score 3.97912 : x : THR xxxx A0068 <- 3.54 -> DG xxx J0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0070 <- 3.79 -> DA xxx I0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0071 <- 4.48 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0068 <- 3.45 -> DG xxx L0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0070 <- 3.86 -> DA xxx K0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0071 <- 4.34 -> DT xxx K0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0075 <- 4.41 -> DC xxx L0014 : score x.xxxxx >5hlh_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE OVEROXIDIZED ABFR BOUND TO DNA organism=Staphylococcus epidermidis : H : SER OG D0066 <- 2.53 -> DA N7 L0008 : score 4.70516 : H : ASN ND2 D0067 <- 3.15 -> DG N7 K0017 : score 4.26488 : H : ASN ND2 D0067 <- 3.21 -> DG O6 K0017 : score 5.17611 : H : ARG NH1 D0092 <- 2.82 -> DT O2 L0005 : score 4.28918 : x : THR xxxx D0068 <- 3.56 -> DG xxx K0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0070 <- 3.81 -> DA xxx L0008 : score x.xxxxx >5hlh_FH:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE OVEROXIDIZED ABFR BOUND TO DNA organism=Staphylococcus epidermidis : H : SER OG F0066 <- 2.38 -> DA N7 N0008 : score 4.83909 : H : ASN ND2 F0067 <- 3.11 -> DG N7 M0017 : score 4.30157 : H : ASN ND2 F0067 <- 3.32 -> DG O6 M0017 : score 5.05206 : H : ARG NH1 F0092 <- 2.94 -> DT O2 N0005 : score 4.18583 : H : SER OG H0066 <- 2.56 -> DA N7 P0008 : score 4.67838 : H : ASN ND2 H0067 <- 3.15 -> DG N7 O0017 : score 4.26488 : H : ARG NH1 H0092 <- 2.98 -> DT O2 P0005 : score 4.15138 : x : THR xxxx F0068 <- 3.56 -> DG xxx M0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0070 <- 3.78 -> DA xxx N0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0068 <- 3.59 -> DG xxx O0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0070 <- 3.70 -> DA xxx P0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0071 <- 4.43 -> DT xxx P0009 : score x.xxxxx >5hlk_AB:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TERNARY ECORV-DNA-LU COMPLEX WITH CLEAVED DNA SUBSTRATE. organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0070 <- 3.07 -> DC O2 F0009 : score 4.2376 : H : ASN OD1 A0185 <- 3.08 -> DA N6 D0005 : score 5.68457 : H : ASN ND2 A0185 <- 3.01 -> DA N7 D0005 : score 5.62395 : H : THR OG1 A0186 <- 2.86 -> DT O4 E0008 : score 3.84053 : H : ASN ND2 B0070 <- 2.93 -> DC O2 E0009 : score 4.36302 : H : ASN OD1 B0185 <- 3.03 -> DA N6 C0005 : score 5.74479 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.82 -> DA N7 C0005 : score 5.84703 : H : THR OG1 B0186 <- 2.66 -> DT O4 F0008 : score 3.99602 : V : ASN CG B0188 <- 3.52 -> DT C7 F0008 : score 2.83358 : V : ASN CG A0188 <- 3.60 -> DT C7 E0008 : score 2.78062 : x : THR xxxx A0106 <- 3.54 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.32 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0104 <- 4.18 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.63 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.26 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >5hlk_B:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TERNARY ECORV-DNA-LU COMPLEX WITH CLEAVED DNA SUBSTRATE. organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 B0070 <- 2.93 -> DC O2 E0009 : score 4.36302 : H : ASN OD1 B0185 <- 3.03 -> DA N6 C0005 : score 5.74479 : H : ASN ND2 B0185 <- 2.82 -> DA N7 C0005 : score 5.84703 : H : THR OG1 B0186 <- 2.66 -> DT O4 F0008 : score 3.99602 : V : ASN CG B0188 <- 3.52 -> DT C7 F0008 : score 2.83358 : x : LYS xxxx B0104 <- 4.18 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0106 <- 3.63 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.26 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >5hlt_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF PYRENE- AND PHENANTHRENE-MODIFIED DNA IN COMPLEX WITH THE BPUJ1 ENDONUCLEASE BINDING DOMAIN organism=Bacillus pumilus : H : ARG NH1 A0015 <- 3.06 -> DG N7 C0108 : score 5.7354 : H : ARG NH1 A0015 <- 2.56 -> DG O6 C0108 : score 6.37533 : H : LYS NZ A0063 <- 3.19 -> DG N7 D0207 : score 4.9658 : H : LYS NZ A0063 <- 2.85 -> DG O6 D0208 : score 5.72296 : H : ASN OD1 A0067 <- 2.73 -> DC N4 C0105 : score 4.2523 : H : ASN ND2 A0067 <- 2.89 -> DG N7 D0206 : score 4.50335 : H : GLU OE2 A0071 <- 3.04 -> DC N4 C0106 : score 5.01265 : w : GLU OE1 A0071 <- 6.08 -> DC N4 C0107 : score 3.528 : w : THR OG1 A0203 <- 6.53 -> DC N4 D0203 : score 2.558 : H : SER OG A0204 <- 2.88 -> DT O4 C0109 : score 3.49825 : H : GLN OE1 A0208 <- 2.90 -> DA N6 D0204 : score 5.93151 : H : GLN NE2 A0208 <- 2.77 -> DA N7 D0204 : score 6.12628 : x : LYS xxxx A0017 <- 3.47 -> DG xxx D0206 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0064 <- 3.43 -> DG xxx D0206 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0121 <- 3.60 -> DA xxx C0104 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0202 <- 3.65 -> DT xxx C0109 : score x.xxxxx >5hnf_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF PYRENE- AND PHENANTHRENE-MODIFIED DNA IN COMPLEX WITH THE BPUJ1 ENDONUCLEASE BINDING DOMAIN organism=Bacillus pumilus : H : ARG NH1 A0015 <- 2.95 -> DG N7 L0107 : score 5.8685 : H : ARG NH1 A0015 <- 2.86 -> DG O6 L0107 : score 6.01033 : w : LYS NZ A0017 <- 5.82 -> DC N4 L0106 : score 0.048 : w : LYS NZ A0017 <- 6.42 -> DC N4 M0205 : score 0.048 : w : ASN ND2 A0020 <- 5.98 -> DC O2 M0202 : score 1.885 : H : LYS NZ A0063 <- 3.07 -> DG N7 M0207 : score 5.09506 : H : LYS NZ A0063 <- 2.75 -> DG O6 M0208 : score 5.83858 : H : ASN OD1 A0067 <- 2.91 -> DC N4 L0104 : score 4.10133 : H : ASN ND2 A0067 <- 3.02 -> DG N7 M0206 : score 4.38412 : H : ASN ND2 A0067 <- 2.97 -> DG O6 M0207 : score 5.44675 : H : GLU OE2 A0071 <- 2.96 -> DC N4 L0105 : score 5.09689 : w : GLU OE1 A0071 <- 5.98 -> DC N4 L0106 : score 3.528 : w : GLU OE1 A0071 <- 6.02 -> DC N4 L0106 : score 3.528 : H : LYS NZ A0121 <- 2.84 -> DA N3 L0103 : score 2.75471 : H : LYS NZ A0121 <- 3.00 -> DC O2 L0104 : score 2.82831 : H : SER OG A0204 <- 2.75 -> DT O4 L0108 : score 3.59068 : H : GLN OE1 A0208 <- 2.87 -> DA N6 M0204 : score 5.96783 : H : GLN NE2 A0208 <- 2.95 -> DA N7 M0204 : score 5.90705 : V : GLU CB A0202 <- 3.76 -> DT C7 L0108 : score 1.64397 : x : THR xxxx A0064 <- 3.36 -> DG xxx M0206 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0070 <- 4.41 -> DC xxx L0104 : score x.xxxxx >5hnh_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF PYRENE- AND PHENANTHRENE-MODIFIED DNA IN COMPLEX WITH THE BPUJ1 ENDONUCLEASE BINDING DOMAIN organism=Bacillus pumilus : H : ARG NH1 A0015 <- 2.93 -> DG N7 L0107 : score 5.8927 : H : ARG NH1 A0015 <- 2.91 -> DG O6 L0107 : score 5.9495 : w : LYS NZ A0017 <- 6.27 -> DC N4 M0205 : score 0.048 : w : ASN ND2 A0020 <- 6.11 -> DC O2 M0202 : score 1.885 : H : LYS NZ A0063 <- 3.16 -> DG N7 M0207 : score 4.99811 : H : LYS NZ A0063 <- 2.81 -> DG O6 M0208 : score 5.76921 : H : ASN OD1 A0067 <- 2.98 -> DC N4 L0104 : score 4.04262 : H : ASN ND2 A0067 <- 3.10 -> DG N7 M0206 : score 4.31074 : H : ASN ND2 A0067 <- 3.01 -> DG O6 M0207 : score 5.40165 : H : GLU OE2 A0071 <- 2.97 -> DC N4 L0105 : score 5.08636 : w : GLU OE1 A0071 <- 5.77 -> DC N4 L0106 : score 3.528 : w : GLU OE1 A0071 <- 5.86 -> DC N4 L0106 : score 3.528 : H : LYS NZ A0121 <- 2.97 -> DA N3 L0103 : score 2.68251 : H : SER OG A0204 <- 2.74 -> DT O4 L0108 : score 3.59779 : H : GLN OE1 A0208 <- 2.92 -> DA N6 M0204 : score 5.9073 : H : GLN NE2 A0208 <- 2.97 -> DA N7 M0204 : score 5.88269 : x : THR xxxx A0064 <- 3.47 -> DG xxx M0206 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0070 <- 4.41 -> DC xxx L0104 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0202 <- 3.75 -> DT xxx L0108 : score x.xxxxx >5hnk_AB:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T5FEN IN COMPLEX INTACT SUBSTRATE AND METAL IONS. organism=ESCHERICHIA PHAGE T5 : w : THR OG1 B0152 <- 6.45 -> DG N3 Y0005 : score 2.036 : x : PHE xxxx B0032 <- 3.35 -> DG xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0035 <- 3.76 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0169 <- 4.09 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0170 <- 3.97 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0202 <- 3.93 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx >5hod_A:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF LHX4 TRANSCRIPTION FACTOR COMPLEXED WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0089 <- 2.85 -> DT O2 B0014 : score 4.26335 : H : ARG NH2 A0089 <- 3.01 -> DT O2 B0014 : score 4.05553 : x : VAL xxxx A0131 <- 3.51 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0134 <- 3.70 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0135 <- 3.34 -> DA xxx B0015 : score x.xxxxx >5hod_AD:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF LHX4 TRANSCRIPTION FACTOR COMPLEXED WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0089 <- 2.85 -> DT O2 B0014 : score 4.26335 : H : ARG NH2 A0089 <- 3.01 -> DT O2 B0014 : score 4.05553 : x : VAL xxxx A0131 <- 3.51 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0134 <- 3.70 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0135 <- 3.34 -> DA xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0089 <- 3.19 -> DG xxx C0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0127 <- 3.64 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0131 <- 3.69 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0134 <- 3.01 -> DT xxx C0032 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0135 <- 2.66 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0137 <- 3.98 -> DC xxx C0031 : score x.xxxxx >5hoo_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MOS1 STRAND TRANSFER COMPLEX organism=Drosophila mauritiana : H : LYS NZ A0044 <- 2.98 -> DG N7 D0033 : score 5.19201 : H : ARG NH1 A0048 <- 3.17 -> DG N7 C0022 : score 5.6023 : H : ARG NH2 A0048 <- 3.24 -> DG O6 C0022 : score 6.0192 : H : GLN OE1 A0100 <- 2.84 -> DA N6 C0009 : score 6.00414 : H : GLN NE2 A0100 <- 3.25 -> DA N7 C0009 : score 5.54167 : H : GLN NE2 A0101 <- 3.16 -> DG O6 D0047 : score 5.38716 : x : GLU xxxx A0047 <- 3.20 -> DA xxx D0031 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0065 <- 3.71 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0068 <- 2.98 -> DT xxx D0042 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0099 <- 3.64 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0102 <- 4.33 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0104 <- 3.61 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx >5hp1_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH A DNA APTAMER AND FOSCARNET, A PYROPHOSPHATE ANALOG organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.77 -> DG N2 F0032 : score 4.91908 : H : TYR OH A0183 <- 2.41 -> DG N3 F0032 : score 3.357 : x : PHE xxxx A0061 <- 3.32 -> DA xxx F0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.44 -> DA xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.35 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.75 -> DG xxx F0033 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.77 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.29 -> DG xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.07 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.74 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx >5hp1_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH A DNA APTAMER AND FOSCARNET, A PYROPHOSPHATE ANALOG organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.91 -> DG N2 E0032 : score 4.78217 : H : TYR OH C0183 <- 2.45 -> DG N3 E0032 : score 3.33209 : x : PHE xxxx C0061 <- 3.99 -> DA xxx E0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0074 <- 3.24 -> DA xxx E0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0094 <- 3.41 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 3.97 -> DG xxx E0033 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0151 <- 4.45 -> DA xxx E0000 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 3.56 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 4.28 -> DG xxx E0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.16 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.82 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx >5hp4_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE BACTERIOHAGE T5 D15 FLAP ENDONUCLEASE (D155K) PSEUDO-ENZYME-PRODUCT COMPLEX WITH DNA AND METAL IONS organism=ESCHERICHIA PHAGE T5 : w : ARG NH2 A0033 <- 6.06 -> DC N4 X0015 : score 0.976 : w : TYR OH A0058 <- 5.55 -> DT O4 X0014 : score 2.914 : w : THR OG1 A0170 <- 5.48 -> DC O2 X0012 : score 2.048 : x : PHE xxxx A0032 <- 3.96 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.95 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0036 <- 3.30 -> DA xxx X0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0037 <- 3.56 -> DG xxx X0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0038 <- 3.34 -> DA xxx X0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0039 <- 3.71 -> DA xxx X0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0054 <- 3.46 -> DT xxx X0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0089 <- 4.49 -> DC xxx X0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0094 <- 2.88 -> DG xxx X0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0096 <- 3.40 -> DG xxx X0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0097 <- 3.11 -> DG xxx X0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0100 <- 3.63 -> DG xxx X0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0167 <- 3.37 -> DT xxx X0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0169 <- 3.70 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0172 <- 3.96 -> DT xxx X0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0202 <- 4.08 -> DA xxx X0006 : score x.xxxxx >5hr4_C:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF TYPE IIL RESTRICTION-MODIFICATION ENZYME MMEI IN COMPLEX WITH DNA HAS IMPLICATIONS FOR ENGINEERING OF NEW SPECIFICITIES organism=METHYLOPHILUS METHYLOTROPHUS : H : SER OG C0488 <- 2.72 -> DG N2 I0026 : score 3.42835 : H : LYS NZ C0489 <- 3.19 -> DG N3 H0006 : score 1.34045 : H : TYR OH C0642 <- 2.96 -> DC N4 H0004 : score 4.07925 : H : LYS NZ C0645 <- 2.66 -> DG N7 I0026 : score 5.5367 : H : LYS NZ C0645 <- 3.10 -> DG O6 I0026 : score 5.43392 : H : LYS NZ C0645 <- 3.03 -> DT O4 H0003 : score 3.42217 : w : THR OG1 C0726 <- 5.95 -> DA N6 I0027 : score 3.251 : H : GLU OE2 C0751 <- 3.16 -> DC N4 H0005 : score 4.88628 : w : GLU OE1 C0751 <- 5.48 -> DC N4 I0024 : score 3.528 : H : ASN ND2 C0773 <- 3.09 -> DG N7 I0025 : score 4.31992 : H : GLU OE1 C0806 <- 2.76 -> DC N4 H0008 : score 5.81409 : H : ARG NE C0808 <- 2.83 -> DG O6 I0022 : score 3.91738 : V : PRO CG C0725 <- 3.60 -> DT C7 I0028 : score 6.67692 : x : HIS xxxx C0314 <- 3.47 -> DA xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0481 <- 3.20 -> DA xxx H0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0484 <- 3.38 -> DA xxx H0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0487 <- 3.54 -> DC xxx H0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0570 <- 3.40 -> DA xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0578 <- 4.21 -> DA xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0579 <- 3.74 -> DC xxx H0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0580 <- 3.38 -> DA xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0723 <- 3.44 -> DA xxx I0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0737 <- 3.33 -> DT xxx H0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0738 <- 3.57 -> DT xxx H0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0752 <- 4.37 -> DT xxx I0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0805 <- 3.62 -> DC xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0810 <- 3.04 -> DG xxx H0006 : score x.xxxxx >5hr9_B:Nucleotidyltransferase; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF SE-ASFVPOLX(L52/163M MUTANT) IN COMPLEX WITH 1NT-GAP DNA1 organism=? : w : LYS NZ B0085 <- 5.35 -> DA N3 F0013 : score 1.538 : w : HIS NE2 B0115 <- 5.48 -> DA N3 F0014 : score 2.619 : w : ARG NH1 B0127 <- 5.56 -> DT O2 G0002 : score 1.855 : w : GLN OE1 B0139 <- 5.46 -> DT O2 G0002 : score 2.481 : w : GLN NE2 B0139 <- 5.87 -> DT O2 G0003 : score 1.565 : x : VAL xxxx B0120 <- 3.35 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0123 <- 3.96 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0124 <- 3.68 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx >5hrb_A:Nucleotidyltransferase; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVPOLX:DNA1 BINARY COMPLEX organism=AFRICAN SWINE FEVER VIRUS : H : LYS NZ A0085 <- 2.94 -> DT O2 E0005 : score 3.48674 : w : LYS NZ A0085 <- 6.33 -> DC O2 D0008 : score 1.3 : w : HIS NE2 A0115 <- 5.54 -> DC O2 D0008 : score 3.208 : w : ARG NH1 A0127 <- 5.60 -> DG N3 E0003 : score 1.593 : w : GLN OE1 A0139 <- 5.68 -> DG N3 E0003 : score 1.484 : w : GLN NE2 A0139 <- 5.95 -> DA N3 E0004 : score 1.888 : x : VAL xxxx A0120 <- 3.46 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0123 <- 3.33 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0124 <- 3.51 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx >5hrd_B:Nucleotidyltransferase; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVPOLX:DNA2 BINARY COMPLEX organism=African swine fever virus : w : ARG NH1 B0127 <- 5.76 -> DC O2 E0002 : score 1.381 : w : GLN OE1 B0139 <- 5.70 -> DC O2 E0002 : score 1.091 : w : GLN NE2 B0139 <- 6.04 -> DG N3 E0003 : score 1.484 : x : HIS xxxx B0115 <- 3.47 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0120 <- 3.41 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0123 <- 3.27 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0124 <- 3.55 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx >5hrd_CD:Nucleotidyltransferase; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVPOLX:DNA2 BINARY COMPLEX organism=African swine fever virus : w : LYS NZ C0085 <- 6.00 -> DT O2 H0005 : score 0.522 : w : ARG NH1 C0127 <- 5.61 -> DC O2 H0002 : score 1.381 : w : GLN OE1 C0139 <- 5.61 -> DC O2 H0002 : score 1.091 : w : GLN NE2 C0139 <- 6.07 -> DG N3 H0003 : score 1.484 : w : LYS NZ D0085 <- 5.59 -> DC O2 H0006 : score 1.3 : w : ARG NH1 D0127 <- 5.72 -> DC O2 G0002 : score 1.381 : w : GLN OE1 D0139 <- 5.54 -> DC O2 G0002 : score 1.091 : w : GLN NE2 D0139 <- 5.93 -> DG N3 G0003 : score 1.484 : x : HIS xxxx C0115 <- 3.41 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0120 <- 3.50 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0123 <- 3.40 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0124 <- 3.60 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0115 <- 3.36 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0120 <- 3.47 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0123 <- 3.49 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0124 <- 3.56 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx >5hrf_AB:Nucleotidyltransferase; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVPOLX: DNA5: DGTP TERNARY COMPLEX organism=African swine fever virus : w : LYS NZ A0085 <- 5.27 -> DC O2 D0008 : score 1.3 : w : HIS NE2 A0115 <- 5.81 -> DT O2 D0009 : score 3.682 : w : ARG NH1 A0127 <- 5.62 -> DA N3 C0002 : score 2.585 : w : GLN OE1 A0139 <- 5.76 -> DA N3 C0002 : score 1.196 : w : GLN NE2 A0139 <- 6.06 -> DG N3 C0003 : score 1.484 : w : HIS NE2 B0115 <- 5.22 -> DT O2 C0009 : score 3.682 : w : ARG NH1 B0127 <- 5.91 -> DA N3 D0002 : score 2.585 : w : GLN OE1 B0139 <- 5.53 -> DA N3 D0002 : score 1.196 : x : LYS xxxx B0085 <- 4.48 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >5hrf_B:Nucleotidyltransferase; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVPOLX: DNA5: DGTP TERNARY COMPLEX organism=African swine fever virus : w : HIS NE2 B0115 <- 5.22 -> DT O2 C0009 : score 3.682 : w : ARG NH1 B0127 <- 5.91 -> DA N3 D0002 : score 2.585 : w : GLN OE1 B0139 <- 5.53 -> DA N3 D0002 : score 1.196 : x : LYS xxxx B0085 <- 4.48 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >5hrg_AB:Nucleotidyltransferase; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVPOLX(D51N MUTANT):DNA4 BINARY COMPLEX organism=African swine fever virus : w : ARG NH1 A0127 <- 5.67 -> DC O2 D0002 : score 1.381 : w : GLN OE1 A0139 <- 5.42 -> DC O2 D0002 : score 1.091 : w : GLN NE2 A0139 <- 6.08 -> DG N3 D0003 : score 1.484 : w : ARG NH1 B0127 <- 5.75 -> DC O2 C0002 : score 1.381 : w : GLN OE1 B0139 <- 5.59 -> DC O2 C0002 : score 1.091 : w : GLN NE2 B0139 <- 6.04 -> DG N2 D0007 : score 1.484 : x : HIS xxxx A0115 <- 3.11 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0120 <- 3.31 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0123 <- 3.47 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0124 <- 3.53 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0085 <- 4.42 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0115 <- 3.39 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0120 <- 3.27 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0123 <- 3.33 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0124 <- 3.55 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx >5hrg_B:Nucleotidyltransferase; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVPOLX(D51N MUTANT):DNA4 BINARY COMPLEX organism=African swine fever virus : w : ARG NH1 B0127 <- 5.75 -> DC O2 C0002 : score 1.381 : w : GLN OE1 B0139 <- 5.59 -> DC O2 C0002 : score 1.091 : w : GLN NE2 B0139 <- 6.04 -> DG N2 D0007 : score 1.484 : x : LYS xxxx B0085 <- 4.42 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0115 <- 3.39 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0120 <- 3.27 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0123 <- 3.33 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0124 <- 3.55 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx >5hrh_B:Nucleotidyltransferase; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVPOLX(H115F/R127A MUTANT): 1NT-GAP(P) DNA2:DGTP TERNARY COMPLEX organism=African swine fever virus : x : ILE xxxx B0124 <- 4.47 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0125 <- 3.50 -> DA xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0128 <- 3.31 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx >5hri_B:Nucleotidyltransferase; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVPOLX:DNA1 BINARY COMPLEX organism=African swine fever virus : x : ILE xxxx B0124 <- 4.26 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0125 <- 3.53 -> DA xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0128 <- 3.61 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx >5hrk_B:Nucleotidyltransferase; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVPOLX(H115F MUTANT): 1NT-GAP(P) DNA2:DGTP TERNARY COMPLEX organism=African swine fever virus : x : ARG xxxx B0125 <- 3.08 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0128 <- 3.44 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx >5hrl_B:Nucleotidyltransferase; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVPOLX: 1NT-GAP(P) DNA2: DGTP TERNARY COMPLEX. organism=African swine fever virus : x : ILE xxxx B0124 <- 4.16 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0125 <- 3.72 -> DA xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0128 <- 3.30 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx >5hro_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH A DNA APTAMER AND AN ALPHA-CARBOXY NUCLEOSIDE PHOSPHONATE INHIBITOR (ALPHA- CNP) organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.81 -> DG N2 E0036 : score 4.87996 : H : TYR OH A0183 <- 2.29 -> DG N3 E0036 : score 3.43174 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.07 -> DG xxx E0035 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.71 -> DG xxx E0037 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.84 -> DC xxx E0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.26 -> DG xxx E0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.36 -> DC xxx E0010 : score x.xxxxx >5hro_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH A DNA APTAMER AND AN ALPHA-CARBOXY NUCLEOSIDE PHOSPHONATE INHIBITOR (ALPHA- CNP) organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.81 -> DG N2 E0036 : score 4.87996 : H : TYR OH A0183 <- 2.29 -> DG N3 E0036 : score 3.43174 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.07 -> DG xxx E0035 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.71 -> DG xxx E0037 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.84 -> DC xxx E0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.26 -> DG xxx E0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.36 -> DC xxx E0010 : score x.xxxxx >5hro_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH A DNA APTAMER AND AN ALPHA-CARBOXY NUCLEOSIDE PHOSPHONATE INHIBITOR (ALPHA- CNP) organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.72 -> DG N3 F0036 : score 3.16393 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.20 -> DG xxx F0035 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 3.67 -> DG xxx F0037 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.42 -> DG xxx F0037 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 4.29 -> DG xxx F0037 : score x.xxxxx >5hrt_A:Alkaline_phosphatase-like;His-Me_finger_endonucleases;Somatomedin_B_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MOUSE AUTOTAXIN IN COMPLEX WITH A DNA APTAMER organism=MUS MUSCULUS : w : CYS SG A0366 <- 6.52 -> DA N6 B2010 : score 4.476 : H : LYS NZ A0467 <- 2.55 -> DC O2 B2028 : score 3.09346 : H : LYS NZ A0467 <- 2.77 -> DT O2 B2029 : score 3.6087 : V : ARG CB A0244 <- 3.87 -> DT C7 B2021 : score 0.987539 : V : PHE CZ A0469 <- 3.81 -> DT C7 B2027 : score 7.09708 : x : HIS xxxx A0242 <- 3.79 -> DT xxx B2022 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0470 <- 3.37 -> DA xxx B2011 : score x.xxxxx >5hru_AB:LDH_C-terminal_domain-like;NADP-binding_Rossmann-fold_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PLASMODIUM VIVAX LDH IN COMPLEX WITH A DNA APTAMER CALLED PL1 organism=Plasmodium vivax : w : THR OG1 A0083 <- 5.62 -> DG O6 C0025 : score 2.729 : x : PHE xxxx A0082 <- 3.42 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0084 <- 3.80 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0097 <- 3.07 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0098 <- 3.77 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0101 <- 3.82 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx >5hso_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS MARR FAMILY PROTEIN RV2887 COMPLEX WITH DNA organism=Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) : x : GLN xxxx A0064 <- 3.25 -> DC xxx E0025 : score x.xxxxx >5hso_ABCD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS MARR FAMILY PROTEIN RV2887 COMPLEX WITH DNA organism=Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) : x : GLN xxxx A0064 <- 3.25 -> DC xxx E0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0064 <- 3.28 -> DA xxx F0040 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0064 <- 3.37 -> DA xxx F0055 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0064 <- 3.54 -> DC xxx E0010 : score x.xxxxx >5ht2_AB:DNase_I-like; title=MOUSE TDP2 REACTION PRODUCT (5'-PHOSPHORYLATED DNA)-MG2+ COMPLEX WITH 1-N6-ETHENO-ADENINE organism=MUS MUSCULUS : w : ARG NH1 A0241 <- 5.55 -> DA N7 D0004 : score 0.388 A : w : GLU OE2 A0242 <- 6.06 -> DA N7 D0004 : score 1.687 : w : TYR OH A0321 <- 6.21 -> DG N3 D0003 : score 3.344 : w : TYR OH B0321 <- 6.43 -> DG N2 D0009 : score 2.834 : x : ILE xxxx A0317 <- 3.58 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0318 <- 3.40 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0319 <- 3.76 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0307 <- 4.45 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0317 <- 3.46 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0318 <- 3.49 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0319 <- 4.22 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >5ht2_B:DNase_I-like; title=MOUSE TDP2 REACTION PRODUCT (5'-PHOSPHORYLATED DNA)-MG2+ COMPLEX WITH 1-N6-ETHENO-ADENINE organism=MUS MUSCULUS : w : TYR OH B0321 <- 6.43 -> DG N2 D0009 : score 2.834 : x : TRP xxxx B0307 <- 4.45 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0317 <- 3.46 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0318 <- 3.49 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0319 <- 4.22 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >5hto_A:LDH_C-terminal_domain-like;NADP-binding_Rossmann-fold_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PLASMODIUM VIVAX LDH IN COMPLEX WITH A DNA APTAMER CALLED PL1 (TETRAMERIC LDH IN AN ASYMMETRIC UNIT) organism=Plasmodium vivax : w : THR OG1 A0083 <- 5.60 -> DG O6 C0025 : score 2.729 : x : PHE xxxx A0082 <- 3.41 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0098 <- 3.58 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0101 <- 4.23 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx >5hto_AB:LDH_C-terminal_domain-like;NADP-binding_Rossmann-fold_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PLASMODIUM VIVAX LDH IN COMPLEX WITH A DNA APTAMER CALLED PL1 (TETRAMERIC LDH IN AN ASYMMETRIC UNIT) organism=Plasmodium vivax : w : THR OG1 A0083 <- 5.60 -> DG O6 C0025 : score 2.729 : x : PHE xxxx A0082 <- 3.41 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0098 <- 3.58 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0101 <- 4.23 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx >5hto_DE:LDH_C-terminal_domain-like;NADP-binding_Rossmann-fold_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PLASMODIUM VIVAX LDH IN COMPLEX WITH A DNA APTAMER CALLED PL1 (TETRAMERIC LDH IN AN ASYMMETRIC UNIT) organism=Plasmodium vivax : w : THR OG1 D0083 <- 5.68 -> DG O6 F0025 : score 2.729 : x : PHE xxxx D0082 <- 3.36 -> DG xxx F0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0084 <- 3.41 -> DG xxx F0023 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0097 <- 4.01 -> DG xxx F0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0098 <- 3.46 -> DG xxx F0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0101 <- 4.13 -> DG xxx F0023 : score x.xxxxx >5i2d_CDFGH:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. THERMOPHILUS TTHB099 CLASS II TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX: TAP-RPO organism=? : H : ARG NH1 C0243 <- 3.10 -> DG O6 I-004 : score 5.71833 : H : ARG NH2 C0243 <- 2.32 -> DG O6 I-004 : score 7.2336 : H : ARG NH1 C0266 <- 2.67 -> DG O6 I-002 : score 6.2415 : H : ASP OD1 C0326 <- 2.67 -> DG N2 I0001 : score 5.2839 : H : ARG NH2 C0331 <- 2.62 -> DG O6 I0001 : score 6.8376 : H : ASP OD2 F0079 <- 2.90 -> DG N2 I-005 : score 5.34979 : H : ASN OD1 F0191 <- 3.09 -> DT N3 I-007 : score 3.58081 : H : THR OG1 F0240 <- 3.02 -> DA N7 I-008 : score 3.26388 : H : ARG NH1 F0256 <- 3.11 -> DT O4 J0010 : score 3.06534 : H : GLU OE2 F0313 <- 2.62 -> DA N6 J0009 : score 3.16113 : H : ARG NH1 F0394 <- 3.03 -> DG N7 J0031 : score 5.7717 : H : ARG NH2 F0394 <- 3.29 -> DG N7 J0031 : score 5.75892 : H : ARG NH2 G0153 <- 2.36 -> DG O6 J0035 : score 7.1808 : H : GLU OE1 G0154 <- 2.34 -> DC N4 I-037 : score 6.2986 : H : LYS NZ G0158 <- 2.96 -> DG N7 J0037 : score 5.21355 : H : ARG NH2 H0153 <- 2.62 -> DG N7 I-048 : score 6.61446 : H : LYS NZ H0158 <- 2.84 -> DG N7 I-046 : score 5.34281 : H : LYS NZ H0158 <- 2.69 -> DG O6 I-046 : score 5.90795 : V : GLN CB F0245 <- 3.64 -> DT C7 I-012 : score 1.9072 : x : ARG xxxx C0134 <- 4.19 -> DG xxx J0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0142 <- 3.37 -> DG xxx I0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0167 <- 3.51 -> DC xxx I-001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0171 <- 4.26 -> DT xxx I0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0187 <- 4.23 -> DG xxx I-002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0247 <- 3.84 -> DG xxx I-006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0256 <- 4.01 -> DG xxx I-002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0260 <- 4.49 -> DG xxx I-002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0325 <- 3.32 -> DG xxx I0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0358 <- 3.43 -> DA xxx J0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0388 <- 4.07 -> DG xxx J0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0394 <- 3.98 -> DG xxx J0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0418 <- 3.41 -> DG xxx I0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0421 <- 3.70 -> DT xxx I0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0426 <- 3.93 -> DG xxx I0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0427 <- 3.26 -> DG xxx I0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0705 <- 3.46 -> DT xxx J0000 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 3.92 -> DT xxx J0000 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.29 -> DG xxx J-001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 3.92 -> DG xxx J-001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0081 <- 3.40 -> DG xxx I-005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0082 <- 3.39 -> DG xxx I-005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0085 <- 3.53 -> DG xxx I-006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0088 <- 4.40 -> DG xxx I-006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0093 <- 3.97 -> DT xxx I-007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0099 <- 3.90 -> DT xxx I-007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0193 <- 3.48 -> DG xxx I-006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0194 <- 3.31 -> DT xxx I-007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0227 <- 3.43 -> DA xxx I-011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0228 <- 3.63 -> DA xxx I-011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0231 <- 3.14 -> DA xxx I-011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0233 <- 4.25 -> DA xxx I-011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0236 <- 3.38 -> DA xxx I-008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0237 <- 3.07 -> DA xxx I-009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0238 <- 3.45 -> DA xxx I-011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0241 <- 4.10 -> DT xxx I-012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0242 <- 4.32 -> DG xxx I-013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0244 <- 3.57 -> DA xxx J0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0248 <- 3.29 -> DA xxx J0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0262 <- 4.33 -> DG xxx I-016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0263 <- 3.20 -> DT xxx I-017 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0266 <- 3.13 -> DC xxx J0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0268 <- 4.11 -> DT xxx J0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0269 <- 3.92 -> DT xxx J0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0272 <- 3.31 -> DT xxx J0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0276 <- 4.03 -> DA xxx J0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0315 <- 3.47 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0319 <- 3.93 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0321 <- 4.17 -> DG xxx J0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0329 <- 4.10 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0383 <- 4.46 -> DG xxx J0031 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0395 <- 3.01 -> DA xxx I-034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0398 <- 4.09 -> DC xxx J0033 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0152 <- 3.53 -> DT xxx I-038 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0155 <- 3.67 -> DC xxx I-039 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0157 <- 4.15 -> DG xxx J0035 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0152 <- 3.65 -> DT xxx J0045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0154 <- 3.88 -> DC xxx J0046 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0155 <- 3.50 -> DC xxx J0044 : score x.xxxxx >5i2d_NOQRS:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. THERMOPHILUS TTHB099 CLASS II TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX: TAP-RPO organism=? : H : ARG NH1 N0243 <- 3.03 -> DG O6 T-004 : score 5.8035 : H : ARG NH2 N0243 <- 2.36 -> DG O6 T-004 : score 7.1808 : H : ARG NH1 N0266 <- 2.78 -> DG N7 T-002 : score 6.0742 : H : ARG NH1 N0266 <- 2.55 -> DG O6 T-002 : score 6.3875 : H : ARG NH2 N0266 <- 3.12 -> DG O6 T-002 : score 6.1776 : H : ASP OD1 N0326 <- 2.53 -> DG N2 T0001 : score 5.4281 : H : ARG NH2 N0331 <- 2.43 -> DG O6 T0001 : score 7.0884 : H : ASP OD2 Q0079 <- 3.16 -> DG N2 T-005 : score 5.06593 : H : ASN OD1 Q0191 <- 3.20 -> DT N3 T-007 : score 3.49718 : H : ARG NH1 Q0256 <- 3.17 -> DT O4 U0010 : score 3.02612 : H : GLU OE2 Q0313 <- 2.85 -> DA N6 U0009 : score 3.02077 : H : ARG NH1 Q0394 <- 3.25 -> DG N7 U0031 : score 5.5055 : H : ARG NH2 R0153 <- 2.39 -> DG O6 U0035 : score 7.1412 : H : GLU OE1 R0154 <- 2.21 -> DC N4 T-037 : score 6.44857 : H : LYS NZ R0158 <- 2.74 -> DG N7 U0037 : score 5.45053 : H : ARG NH2 S0153 <- 2.70 -> DG N7 T-048 : score 6.51231 : H : GLU OE2 S0154 <- 2.39 -> DC N4 U0046 : score 5.69715 : H : LYS NZ S0158 <- 2.79 -> DG N7 T-046 : score 5.39667 : V : GLN CB Q0245 <- 3.67 -> DT C7 T-012 : score 1.89345 : x : ARG xxxx N0134 <- 4.02 -> DG xxx U0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0142 <- 3.45 -> DG xxx T0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx N0166 <- 4.41 -> DT xxx T0000 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx N0167 <- 3.50 -> DC xxx T-001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx N0171 <- 4.17 -> DT xxx T0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx N0187 <- 4.15 -> DG xxx T-002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx N0247 <- 3.82 -> DG xxx T-006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx N0256 <- 3.99 -> DG xxx T-002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx N0260 <- 4.48 -> DG xxx T-002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx N0325 <- 3.37 -> DG xxx T0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0358 <- 3.45 -> DA xxx U0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0388 <- 3.84 -> DG xxx U0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx N0394 <- 3.95 -> DG xxx U0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx N0418 <- 3.46 -> DG xxx T0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx N0421 <- 3.42 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0422 <- 4.49 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx N0426 <- 4.09 -> DG xxx T0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx N0427 <- 3.28 -> DG xxx T0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx N0447 <- 4.40 -> DG xxx U-001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx O0705 <- 3.79 -> DT xxx U0000 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0706 <- 3.88 -> DT xxx U0000 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O1088 <- 3.35 -> DG xxx U-001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx O1089 <- 4.02 -> DG xxx U-001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx Q0081 <- 3.49 -> DG xxx T-005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0082 <- 3.36 -> DG xxx T-005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Q0085 <- 3.61 -> DG xxx T-005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx Q0086 <- 4.47 -> DG xxx T-006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Q0093 <- 3.85 -> DT xxx T-007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Q0099 <- 3.86 -> DT xxx T-007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0193 <- 3.31 -> DG xxx T-006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Q0194 <- 3.27 -> DT xxx T-007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Q0227 <- 3.47 -> DA xxx T-011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Q0228 <- 3.76 -> DA xxx T-011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0231 <- 2.96 -> DA xxx T-011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Q0233 <- 4.20 -> DA xxx T-011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Q0234 <- 4.24 -> DT xxx T-007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Q0236 <- 3.70 -> DA xxx T-008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Q0237 <- 3.09 -> DA xxx T-009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Q0238 <- 3.34 -> DA xxx T-011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Q0240 <- 3.41 -> DA xxx T-008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx Q0241 <- 4.19 -> DT xxx T-012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0244 <- 3.56 -> DA xxx U0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Q0248 <- 3.29 -> DA xxx U0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx Q0262 <- 4.20 -> DG xxx T-016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx Q0263 <- 3.19 -> DT xxx T-017 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Q0266 <- 3.33 -> DC xxx U0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Q0268 <- 4.41 -> DT xxx U0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Q0269 <- 4.12 -> DT xxx U0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Q0272 <- 3.50 -> DT xxx U0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0273 <- 4.42 -> DA xxx U0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0276 <- 3.89 -> DA xxx U0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx Q0315 <- 3.42 -> DT xxx U0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Q0319 <- 3.93 -> DT xxx U0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Q0321 <- 4.22 -> DG xxx U0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Q0329 <- 4.31 -> DT xxx U0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Q0395 <- 3.17 -> DT xxx U0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0398 <- 4.28 -> DC xxx U0033 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0152 <- 3.77 -> DT xxx T-038 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0155 <- 3.54 -> DC xxx T-039 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0157 <- 3.90 -> DG xxx U0035 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx S0152 <- 3.65 -> DT xxx U0045 : score x.xxxxx >5i2d_R:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. THERMOPHILUS TTHB099 CLASS II TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX: TAP-RPO organism=? : H : ARG NH2 R0153 <- 2.39 -> DG O6 U0035 : score 7.1412 : H : GLU OE1 R0154 <- 2.21 -> DC N4 T-037 : score 6.44857 : H : LYS NZ R0158 <- 2.74 -> DG N7 U0037 : score 5.45053 : x : ILE xxxx R0152 <- 3.77 -> DT xxx T-038 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0155 <- 3.54 -> DC xxx T-039 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0157 <- 3.90 -> DG xxx U0035 : score x.xxxxx >5i3u_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE N-SITE COMPLEX; CATALYTIC INCORPORATION OF AZTMP TO A DNA APTAMER IN CRYSTAL organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.92 -> DG N2 E0032 : score 4.77239 : H : TYR OH A0183 <- 2.36 -> DG N3 E0032 : score 3.38814 : x : PHE xxxx A0061 <- 3.34 -> DA xxx E0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0063 <- 4.48 -> DA xxx E0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.75 -> DA xxx E0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.35 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.74 -> DG xxx E0033 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.86 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.11 -> DG xxx E0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.16 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.65 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx >5i3u_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE N-SITE COMPLEX; CATALYTIC INCORPORATION OF AZTMP TO A DNA APTAMER IN CRYSTAL organism=? : H : TYR OH C0183 <- 3.04 -> DG N2 F0032 : score 4.65504 : H : TYR OH C0183 <- 2.54 -> DG N3 F0032 : score 3.27604 : x : PHE xxxx C0061 <- 3.93 -> DA xxx F0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0074 <- 3.30 -> DA xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0094 <- 3.44 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 4.05 -> DG xxx F0033 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 3.83 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.32 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.89 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx >5i42_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH A DNA APTAMER, AZTTP, AND CA(2+) ION organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.76 -> DG N2 E0033 : score 4.92886 : H : TYR OH A0183 <- 2.52 -> DG N3 E0033 : score 3.28849 : x : PHE xxxx A0061 <- 3.94 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0063 <- 4.29 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.45 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.31 -> DG xxx E0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.24 -> DG xxx E0034 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.85 -> DG xxx E0034 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.83 -> DG xxx E0034 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 3.88 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx >5i42_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH A DNA APTAMER, AZTTP, AND CA(2+) ION organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.76 -> DG N2 E0033 : score 4.92886 : H : TYR OH A0183 <- 2.52 -> DG N3 E0033 : score 3.28849 : x : PHE xxxx A0061 <- 3.94 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0063 <- 4.29 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.45 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.31 -> DG xxx E0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.24 -> DG xxx E0034 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.85 -> DG xxx E0034 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.83 -> DG xxx E0034 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 3.88 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx >5i42_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH A DNA APTAMER, AZTTP, AND CA(2+) ION organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.71 -> DG N3 F0033 : score 3.17016 : x : PHE xxxx C0061 <- 3.98 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0074 <- 3.63 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0094 <- 3.16 -> DG xxx F0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 3.65 -> DG xxx F0034 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.45 -> DG xxx F0034 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 4.25 -> DG xxx F0034 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.26 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx >5i44_AB:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF RACA-DNA COMPLEX; P21 FORM organism=Bacillus subtilis : H : LYS NZ A0019 <- 3.22 -> DG N7 U0011 : score 4.93348 : H : LYS NZ A0019 <- 2.96 -> DG O6 U0011 : score 5.59578 : w : GLN OE1 A0022 <- 5.60 -> DC N4 U0010 : score 3.488 : H : ARG NH1 A0023 <- 3.09 -> DG N7 W0002 : score 5.6991 : H : ARG NH2 A0023 <- 2.67 -> DG O6 W0002 : score 6.7716 : H : ARG NH2 A0023 <- 3.10 -> DT O4 U0012 : score 3.34062 : H : LYS NZ B0019 <- 2.41 -> DG O6 W0005 : score 6.23167 : H : LYS NZ B0019 <- 2.75 -> DG O6 U0009 : score 5.83858 : w : LYS NZ B0019 <- 5.98 -> DG O6 U0008 : score 3.005 : x : ARG xxxx B0023 <- 4.00 -> DC xxx U0007 : score x.xxxxx >5i44_DEFGHI:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF RACA-DNA COMPLEX; P21 FORM organism=Bacillus subtilis : H : LYS NZ D0019 <- 3.07 -> DG N7 W0011 : score 5.09506 : H : LYS NZ D0019 <- 3.07 -> DG O6 W0011 : score 5.46861 : H : ARG NH2 D0023 <- 2.90 -> DG N7 U0002 : score 6.25692 : H : ARG NH2 D0023 <- 3.28 -> DG O6 U0002 : score 5.9664 : H : LYS NZ E0019 <- 2.73 -> DG O6 U0005 : score 5.8617 : H : LYS NZ F0019 <- 3.07 -> DG N7 R0011 : score 5.09506 : H : LYS NZ F0019 <- 3.11 -> DG O6 R0011 : score 5.42236 : H : ARG NH1 F0023 <- 3.21 -> DG N7 P0002 : score 5.5539 : H : ARG NH2 F0023 <- 2.80 -> DG O6 P0002 : score 6.6 : H : LYS NZ G0017 <- 2.64 -> DG O6 P0005 : score 5.96575 : H : LYS NZ G0017 <- 2.62 -> DG O6 R0009 : score 5.98888 : H : LYS NZ H0015 <- 3.00 -> DG N7 T0011 : score 5.17046 : H : ARG NH2 H0019 <- 2.80 -> DG N7 Z0002 : score 6.38462 : H : LYS NZ I0015 <- 2.70 -> DG N7 P0011 : score 5.49362 : H : ARG NH1 I0019 <- 3.20 -> DG N7 R0002 : score 5.566 : H : ARG NH2 I0019 <- 3.08 -> DT O4 P0012 : score 3.35483 : x : GLN xxxx D0022 <- 3.30 -> DC xxx W0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0023 <- 3.78 -> DC xxx W0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0020 <- 4.29 -> DC xxx P0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0022 <- 3.41 -> DG xxx R0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0018 <- 3.56 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0035 <- 3.87 -> DC xxx T0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0018 <- 3.51 -> DG xxx P0009 : score x.xxxxx >5i44_I:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF RACA-DNA COMPLEX; P21 FORM organism=Bacillus subtilis : H : LYS NZ I0015 <- 2.70 -> DG N7 P0011 : score 5.49362 : H : ARG NH1 I0019 <- 3.20 -> DG N7 R0002 : score 5.566 : H : ARG NH2 I0019 <- 3.08 -> DT O4 P0012 : score 3.35483 : x : GLN xxxx I0018 <- 3.51 -> DG xxx P0009 : score x.xxxxx >5i44_JK:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF RACA-DNA COMPLEX; P21 FORM organism=Bacillus subtilis : H : LYS NZ J0019 <- 2.71 -> DG O6 T0005 : score 5.88482 : H : LYS NZ J0019 <- 2.64 -> DG O6 Z0009 : score 5.96575 : H : LYS NZ K0017 <- 2.93 -> DG N7 Z0011 : score 5.24586 : x : ARG xxxx J0023 <- 4.36 -> DC xxx Z0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx K0020 <- 3.94 -> DC xxx Z0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0021 <- 2.86 -> DG xxx T0002 : score x.xxxxx >5i50_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF OMOMYC BOUND TO DOUBLE-STRANDED DNA organism=Homo sapiens : H : HIS NE2 A0012 <- 3.23 -> DG N7 D0014 : score 6.21754 : H : HIS NE2 A0012 <- 3.14 -> DG O6 D0014 : score 7.41298 : H : GLU OE2 A0016 <- 2.25 -> DC N4 C0009 : score 5.84458 : H : ARG NH1 A0020 <- 2.96 -> DG N7 D0012 : score 5.8564 : H : HIS NE2 B0012 <- 2.47 -> DG O6 C0014 : score 8.4788 : H : GLU OE2 B0016 <- 2.26 -> DC N4 D0009 : score 5.83405 : x : ASN xxxx A0013 <- 3.67 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0015 <- 3.94 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0019 <- 3.61 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0013 <- 3.44 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0015 <- 3.93 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0019 <- 3.81 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0020 <- 3.55 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >5i50_B:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF OMOMYC BOUND TO DOUBLE-STRANDED DNA organism=Homo sapiens : H : HIS NE2 B0012 <- 2.47 -> DG O6 C0014 : score 8.4788 : H : GLU OE2 B0016 <- 2.26 -> DC N4 D0009 : score 5.83405 : x : ASN xxxx B0013 <- 3.44 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0015 <- 3.93 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0019 <- 3.81 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0020 <- 3.55 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >5iff_AB:Transglycosidases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF R.PABI-NONSPECIFIC DNA COMPLEX organism=Pyrococcus abyssi : w : GLN NE2 A0155 <- 5.07 -> DT O2 C0009 : score 1.565 : w : ARG NH1 B0156 <- 6.27 -> DA N6 C0013 : score 1.486 >5iff_B:Transglycosidases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF R.PABI-NONSPECIFIC DNA COMPLEX organism=Pyrococcus abyssi : w : ARG NH1 B0156 <- 6.27 -> DA N6 C0013 : score 1.486 >5iik_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE POST-CATALYTIC NICK COMPLEX OF DNA POLYMERASE LAMBDA WITH A TEMPLATING 8-OXO-DG AND INCORPORATED DC organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0273 <- 5.54 -> DA N7 T0005 : score 1.655 : w : GLN NE2 A0372 <- 5.78 -> DC O2 T0009 : score 2.699 : w : LYS NZ A0472 <- 5.57 -> DA N3 P0005 : score 1.538 : H : TYR OH A0505 <- 2.71 -> DC O2 P0006 : score 3.56039 : H : ASN ND2 A0513 <- 2.88 -> DT O2 P0007 : score 4.67022 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.84 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.39 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0517 <- 3.34 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0529 <- 4.02 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >5iil_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE POST-CATALYTIC NICK COMPLEX OF DNA POLYMERASE LAMBDA WITH A TEMPLATING 8-OXO-DG AND INCORPORATED DA organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0273 <- 5.36 -> DA N7 T0005 : score 1.655 : w : GLN NE2 A0372 <- 5.66 -> DC O2 T0009 : score 2.699 : w : LYS NZ A0472 <- 5.88 -> DA N3 P0005 : score 1.538 : w : LYS NZ A0472 <- 5.80 -> DT O2 T0007 : score 0.522 : H : TYR OH A0505 <- 2.84 -> DA N3 P0006 : score 4.11807 : w : TYR OH A0505 <- 6.13 -> DT O2 T0007 : score 3.068 : H : ASN ND2 A0513 <- 2.87 -> DT O2 P0007 : score 4.67971 : w : GLU OE1 A0529 <- 5.64 -> DT O2 T0007 : score 2.462 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.74 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.50 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0517 <- 3.09 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >5iim_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PRE-CATALYTIC TERNARY EXTENSION COMPLEX OF DNA POLYMERASE LAMBDA WITH AN 8-OXO-DG:DA BASE-PAIR organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 A0372 <- 5.76 -> DC O2 T0009 : score 2.699 : w : LYS NZ A0472 <- 5.97 -> DA N3 P0005 : score 1.538 : w : LYS NZ A0472 <- 5.86 -> DT O2 T0007 : score 0.522 : H : TYR OH A0505 <- 2.84 -> DA N3 P0006 : score 4.11807 : w : TYR OH A0505 <- 6.08 -> DT O2 T0007 : score 3.068 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.14 -> DA N3 T0005 : score 3.43167 : w : GLU OE1 A0529 <- 5.49 -> DT O2 T0007 : score 2.462 : x : ARG xxxx A0514 <- 3.41 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >5iio_E:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA POLYMERASE LAMBDA BINARY COMPLEX organism=Homo sapiens : x : TRP xxxx E0274 <- 3.42 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0275 <- 3.90 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0277 <- 3.70 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx >5iio_EI:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;DNA_polymerase_beta-like,_second_domain;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA POLYMERASE LAMBDA BINARY COMPLEX organism=Homo sapiens : w : LYS NZ I0281 <- 6.27 -> DG N2 L0001 : score 0.846 : x : TRP xxxx E0274 <- 3.42 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0275 <- 3.90 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0277 <- 3.70 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0274 <- 3.32 -> DC xxx J0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0275 <- 3.87 -> DG xxx L0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0277 <- 3.50 -> DC xxx J0004 : score x.xxxxx >5ink_AB:DNase_I-like; title=MOUSE TDP2 REACTION PRODUCT (5'-PHOSPHORYLATED DNA)-ABASIC/THF-MG2+ COMPLEX organism=Mus musculus : w : TYR OH A0321 <- 5.90 -> DG N3 D0003 : score 3.344 : w : TYR OH B0321 <- 5.78 -> DG N2 D0009 : score 2.834 : x : ILE xxxx A0317 <- 3.50 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0318 <- 3.37 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0319 <- 3.86 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0307 <- 4.18 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0317 <- 3.45 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0318 <- 3.22 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >5ink_B:DNase_I-like; title=MOUSE TDP2 REACTION PRODUCT (5'-PHOSPHORYLATED DNA)-ABASIC/THF-MG2+ COMPLEX organism=Mus musculus : w : TYR OH B0321 <- 5.19 -> DC O2 C0002 : score 1.343 : x : TRP xxxx B0307 <- 4.18 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0317 <- 3.45 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0318 <- 3.22 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >5inl_A:DNase_I-like; title=MOUSE TDP2 REACTION PRODUCT (5'-PHOSPHORYLATED DNA)-MG2+ COMPLEX WITH DEOXYADENOSINE organism=Mus musculus : w : TYR OH A0321 <- 6.14 -> DG N3 D0003 : score 3.344 : x : ILE xxxx A0317 <- 3.55 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0318 <- 3.43 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0319 <- 3.73 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx >5inl_AB:DNase_I-like; title=MOUSE TDP2 REACTION PRODUCT (5'-PHOSPHORYLATED DNA)-MG2+ COMPLEX WITH DEOXYADENOSINE organism=Mus musculus : w : TYR OH A0321 <- 6.14 -> DG N3 D0003 : score 3.344 : x : ILE xxxx A0317 <- 3.55 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0318 <- 3.43 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0319 <- 3.73 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0317 <- 3.53 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0318 <- 3.49 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0319 <- 4.44 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0321 <- 3.71 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx >5ino_A:DNase_I-like; title=HUMAN TDP2 REACTION PRODUCT (5'-PHOSPHORYLATED DNA)-MG2+ COMPLEX organism=Homo sapiens : x : ILE xxxx A0307 <- 3.42 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0309 <- 4.45 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx >5ino_AB:DNase_I-like; title=HUMAN TDP2 REACTION PRODUCT (5'-PHOSPHORYLATED DNA)-MG2+ COMPLEX organism=Homo sapiens : x : ILE xxxx A0307 <- 3.42 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0309 <- 4.45 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0307 <- 3.71 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0309 <- 4.27 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx >5inp_AB:DNase_I-like; title=MOUSE TDP2 REACTION PRODUCT (5'-PHOSPHORYLATED DNA)-MN2+ COMPLEX organism=Mus musculus : x : TRP xxxx A0307 <- 4.49 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0317 <- 3.50 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0318 <- 3.42 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0319 <- 4.02 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0321 <- 3.45 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0307 <- 4.22 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0317 <- 3.48 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0318 <- 3.52 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0321 <- 3.30 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx >5inp_B:DNase_I-like; title=MOUSE TDP2 REACTION PRODUCT (5'-PHOSPHORYLATED DNA)-MN2+ COMPLEX organism=Mus musculus : x : TRP xxxx B0307 <- 4.22 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0317 <- 3.48 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0318 <- 3.52 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0321 <- 3.30 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx >5inq_A:DNase_I-like; title=MOUSE TDP2 REACTION PRODUCT (5'-PHOSPHORYLATED DNA)-CA2+ COMPLEX organism=Mus musculus : x : ILE xxxx A0317 <- 3.51 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0318 <- 3.27 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0319 <- 3.96 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0321 <- 3.36 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx >5inq_AB:DNase_I-like; title=MOUSE TDP2 REACTION PRODUCT (5'-PHOSPHORYLATED DNA)-CA2+ COMPLEX organism=Mus musculus : x : ILE xxxx A0317 <- 3.51 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0318 <- 3.27 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0319 <- 3.96 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0321 <- 3.36 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0307 <- 4.35 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0317 <- 3.14 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0318 <- 3.32 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0319 <- 4.45 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0321 <- 3.43 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx >5ip3_C: title=TOMATO SPOTTED WILT TOSPOVIRUS NUCLEOCAPSID PROTEIN-SSDNA COMPLEX organism=TOMATO SPOTTED WILT VIRUS : V : LYS CB C0081 <- 3.66 -> DT C7 E0005 : score 2.38634 : V : TYR CG C0184 <- 3.71 -> DT C7 E0007 : score 3.82572 >5ipl_CDF: title=SIGMAS-TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH 4-NT NASCENT RNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NE C0175 <- 2.48 -> DT O4 10050 : score 1.97795 : H : GLU OE1 C0374 <- 2.61 -> DG N2 10044 : score 4.47405 : H : SER OG C0508 <- 2.85 -> DG N2 20021 : score 3.34062 : H : GLU OE2 C0541 <- 3.30 -> DG N2 20012 : score 3.87923 : H : SER OG D0319 <- 3.14 -> DT O4 20023 : score 3.31338 : H : ASN OD1 F0098 <- 2.49 -> DT N3 10041 : score 4.03696 : H : ARG NH1 F0112 <- 2.23 -> DT O2 20023 : score 4.79734 : H : THR OG1 F0147 <- 3.42 -> DA N7 10040 : score 2.99075 : H : ARG NE F0163 <- 3.19 -> DT O4 20026 : score 1.71397 : H : HIS NE2 F0170 <- 2.85 -> DA N7 10032 : score 4.20369 : H : LYS NZ F0173 <- 2.72 -> DG N7 20028 : score 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>5itr_B:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1(P2G) BOUND TO DUPLEX DNA CONTAINING THF organism=Homo sapiens : H : ARG NE B0118 <- 2.58 -> DC O2 E0021 : score 2.77597 : H : ARG NH2 B0118 <- 3.11 -> DC N3 E0021 : score 2.14898 : w : ARG NE B0277 <- 6.65 -> DG N7 E0008 : score 1.593 : w : ARG NH2 B0277 <- 6.44 -> DG N7 E0008 : score 2.18 : x : MET xxxx B0081 <- 4.21 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0120 <- 3.31 -> DC xxx E0020 : score x.xxxxx >5itt_B:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1 BOUND TO DUPLEX DNA CONTAINING THF organism=Homo sapiens : H : ARG NE B0118 <- 2.59 -> DC O2 E0021 : score 2.77065 : H : ARG NH2 B0118 <- 2.96 -> DC N3 E0021 : score 2.21771 : w : ARG NH1 B0118 <- 6.09 -> DA N3 E0006 : score 2.585 : w : ARG NE B0277 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: LYS NZ B0460 <- 5.52 -> DA N3 E0007 : score 1.538 : x : ILE xxxx A0175 <- 3.39 -> DC xxx G2016 : score x.xxxxx >5iwi_C:Type_II_DNA_topoisomerase; title=1.98A STRUCTURE OF GSK945237 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND SINGLY NICKED DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : w : TYR OH C0025 <- 5.91 -> DG N3 F1007 : score 3.344 : w : TYR OH C0025 <- 5.44 -> DC O2 E0015 : score 1.343 : w : SER OG C0084 <- 6.18 -> DT O4 G2010 : score 2.338 : w : SER OG C0085 <- 5.74 -> DG N7 F1007 : score 2.749 : x : ARG xxxx C0122 <- 3.75 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0175 <- 3.20 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx >5iwi_CD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=1.98A STRUCTURE OF GSK945237 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND SINGLY NICKED DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : w : TYR OH C0025 <- 6.07 -> DC O2 E0015 : score 1.343 : w : TYR OH C0025 <- 5.44 -> DC O2 E0015 : score 1.343 : w : SER OG C0084 <- 6.18 -> DT O4 G2010 : score 2.338 : w : SER OG C0085 <- 5.74 -> DG N7 F1007 : score 2.749 : w : LYS NZ D0460 <- 5.54 -> DC O2 E0015 : score 1.3 : x : ARG xxxx C0122 <- 3.75 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0175 <- 3.20 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx >5iwi_D:Type_II_DNA_topoisomerase; title=1.98A STRUCTURE OF GSK945237 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND SINGLY NICKED DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : w : LYS NZ D0460 <- 5.38 -> DG N3 F1007 : score 2.232 >5iwm_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.5A STRUCTURE OF GSK945237 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA. organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : w : TYR OH A0025 <- 5.98 -> DA N3 F0015 : score 1.448 : w : TYR OH C0025 <- 6.27 -> DG N3 F0007 : score 3.344 : w : TYR OH C0025 <- 5.32 -> DC O2 E0015 : score 1.343 : w : LYS NZ D0460 <- 5.48 -> DG N3 F0007 : score 2.232 : x : LYS xxxx B0460 <- 3.71 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0033 <- 4.43 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0085 <- 3.59 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0175 <- 3.21 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0085 <- 3.44 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0175 <- 3.33 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0180 <- 4.41 -> DC xxx E0017 : score x.xxxxx >5iwm_C:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.5A STRUCTURE OF GSK945237 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA. organism=? : w : TYR OH C0025 <- 5.96 -> DC O2 E0015 : score 1.343 : w : TYR OH C0025 <- 5.32 -> DC O2 E0015 : score 1.343 : x : SER xxxx C0085 <- 3.44 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0175 <- 3.33 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0180 <- 4.41 -> DC xxx E0017 : score x.xxxxx >5iy6_AMPTV:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain;TATA-box_binding_protein-like;Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HUMAN HOLO-PIC IN THE CLOSED STATE organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 P0167 <- 2.79 -> DT O2 Y0079 : score 4.75565 : H : THR OG1 P0313 <- 3.46 -> DA N3 X0014 : score 1.17514 : H : HIS NE2 T0229 <- 2.72 -> DC O2 Y0067 : score 5.37177 : x : VAL xxxx P0169 <- 3.75 -> DT xxx Y0079 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 3.22 -> DC xxx Y0076 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.91 -> DT xxx Y0077 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.74 -> DA xxx X0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0222 <- 3.93 -> DT xxx Y0078 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0257 <- 3.64 -> DA xxx X0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 3.20 -> DT xxx Y0080 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 2.97 -> DT xxx Y0082 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0289 <- 4.09 -> DA xxx Y0083 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 3.55 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 3.76 -> DT xxx Y0082 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 3.95 -> DA xxx Y0081 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx T0174 <- 3.52 -> DG xxx X0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx V0413 <- 3.76 -> DC xxx X0055 : score x.xxxxx >5iy6_N:Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain; title=HUMAN HOLO-PIC IN THE CLOSED STATE organism=? : x : LYS xxxx N0346 <- 3.80 -> DT xxx Y0080 : score x.xxxxx >5iy6_P:TATA-box_binding_protein-like; title=HUMAN HOLO-PIC IN THE CLOSED STATE organism=? : H : ASN ND2 P0167 <- 2.79 -> DT O2 Y0079 : score 4.75565 : H : THR OG1 P0313 <- 3.46 -> DA N3 X0014 : score 1.17514 : x : VAL xxxx P0169 <- 3.75 -> DT xxx Y0079 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 3.22 -> DC xxx Y0076 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.91 -> DT xxx Y0077 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.74 -> DA xxx X0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0222 <- 3.93 -> DT xxx Y0078 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0257 <- 3.64 -> DA xxx X0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 3.20 -> DT xxx Y0080 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 2.97 -> DT xxx Y0082 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0289 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SAPIENS : H : SER OG M0056 <- 2.89 -> DG N7 Y0056 : score 4.40137 : H : SER OG M0099 <- 2.51 -> DA N6 X0034 : score 3.48055 : H : ASN ND2 P0167 <- 2.22 -> DT O2 Y0079 : score 5.29671 : H : ASN ND2 P0257 <- 3.05 -> DA N3 X0014 : score 3.61731 : H : HIS NE2 T0229 <- 3.04 -> DG N2 X0028 : score 3.54925 : V : ASN CG M0098 <- 3.59 -> DT C7 X0036 : score 2.78724 : x : LYS xxxx A0331 <- 2.19 -> DG xxx Y0063 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0346 <- 4.09 -> DT xxx Y0052 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1416 <- 3.26 -> DC xxx Y0048 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0262 <- 3.46 -> DT xxx X0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0458 <- 3.69 -> DT xxx X0037 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0492 <- 3.20 -> DC xxx Y0051 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0518 <- 4.30 -> DC xxx Y0051 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx M0057 <- 3.87 -> DA xxx Y0054 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx M0058 <- 3.40 -> DG xxx Y0053 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0059 <- 4.42 -> DG xxx Y0053 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx M0060 <- 3.83 -> DG xxx Y0056 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0061 <- 4.11 -> DG xxx Y0056 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0066 <- 4.49 -> DG xxx Y0059 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx M0069 <- 4.04 -> DA xxx Y0061 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0070 <- 4.37 -> DG xxx Y0059 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx M0071 <- 4.41 -> DG xxx Y0063 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0086 <- 3.72 -> DT xxx X0037 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0100 <- 3.56 -> DT xxx X0036 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx M0103 <- 2.81 -> DA xxx X0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0104 <- 3.58 -> DG xxx Y0063 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0106 <- 4.16 -> DG xxx Y0063 : score x.xxxxx : x : MET xxxx M0107 <- 3.11 -> DG xxx Y0063 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0112 <- 3.24 -> DG xxx Y0063 : score x.xxxxx : x : MET xxxx M0115 <- 3.36 -> DC xxx Y0062 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0169 <- 3.60 -> DA xxx X0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 2.99 -> DC xxx Y0076 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.44 -> DT xxx Y0077 : score 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BETA WITH T:G MISMATCH AT THE PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.26 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.82 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.58 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5j0y_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=BINARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH T:T MISMATCH AT THE PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.28 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.71 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.45 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5j29_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A:A MISMATCH AT THE PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 2.90 -> DG N3 T0009 : score 1.42477 : w : LYS NZ A0234 <- 5.04 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : ARG NH1 A0283 <- 6.30 -> DA N3 T0007 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.51 -> DA N3 T0007 : score 2.092 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.91 -> DA N3 T0007 : score 0.995 >5j2a_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A:C MISMATCH AT THE PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.32 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.88 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.68 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5j2b_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A:C MISMATCH AT THE PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0258 <- 6.34 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.73 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : LYS xxxx A0234 <- 3.33 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx >5j2c_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH C:A MISMATCH AT THE PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : w : TYR OH A0036 <- 5.98 -> DA N3 P0010 : score 1.448 : w : SER OG A0229 <- 6.23 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : H : LYS NZ A0234 <- 2.87 -> DG N3 T0009 : score 1.43349 : w : LYS NZ A0234 <- 5.74 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : ARG NH1 A0258 <- 6.66 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : w : TYR OH A0271 <- 6.16 -> DA N6 P0010 : score 2.545 : w : ARG NH1 A0283 <- 6.09 -> DC O2 T0007 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.42 -> DC O2 T0007 : score 1.669 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.91 -> DC O2 T0007 : score 2.68 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.99 -> DC O2 T0008 : score 1.988 >5j2d_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH C:C MISMATCH AT THE PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.34 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.09 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.59 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5j2e_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH C:T MISMATCH AT THE PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.20 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.87 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.61 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5j2f_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH G:A MISMATCH AT THE PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 2.83 -> DG N3 T0009 : score 1.44512 : w : LYS NZ A0234 <- 5.59 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0234 <- 5.91 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : ARG NH1 A0258 <- 6.56 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : w : ARG NH1 A0283 <- 6.00 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.64 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.86 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : TYR xxxx A0271 <- 3.13 -> DG xxx T0007 : score x.xxxxx >5j2g_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH G:G MISMATCH AT THE PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : w : TYR OH A0036 <- 6.13 -> DG N3 P0010 : score 3.344 : w : SER OG A0229 <- 6.15 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : H : LYS NZ A0234 <- 2.72 -> DG N3 T0009 : score 1.47711 : w : LYS NZ A0234 <- 5.41 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0234 <- 6.03 -> DG N2 P0009 : score 0.846 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.72 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.07 -> DG N3 T0007 : score 0.677 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.62 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.85 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : TYR xxxx A0271 <- 3.36 -> DG xxx T0007 : score x.xxxxx >5j2h_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH G:T MISMATCH AT THE PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.39 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.00 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.57 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5j2i_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH T:C MISMATCH AT THE PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.38 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.14 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.64 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5j2j_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH T:G MISMATCH AT THE PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 2.95 -> DG N3 T0009 : score 1.41023 : w : LYS NZ A0234 <- 5.82 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : TYR OH A0271 <- 6.25 -> DC O2 T0008 : score 1.343 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.84 -> DT O2 T0007 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.24 -> DT O2 T0007 : score 2.261 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.74 -> DT O2 T0007 : score 2.462 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.60 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : w : GLU OE2 A0295 <- 6.55 -> DT O2 T0007 : score 2.279 >5j2k_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH T:T MISMATCH AT THE PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.44 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.08 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.65 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5j2m_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA AND EFDA- TRIPHOSPHATE, A TRANSLOCATION-DEFECTIVE RT INHIBITOR organism=? : w : GLN NE2 A0161 <- 6.03 -> DG N3 T0707 : score 1.484 : H : TYR OH A0183 <- 2.64 -> DC O2 P0821 : score 3.60935 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.72 -> DT O2 P0806 : score 4.37531 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.16 -> DC O2 T0723 : score 3.43241 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.45 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.38 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.26 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.12 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.61 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >5j2n_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA THAT HAS INCORPORATED EFDA-MP AT THE P-(POST-TRANSLOCATION) SITE AND DTMP AT THE N-(PRE- TRANSLOCATION) SITE organism=? : w : TYR OH A0115 <- 5.47 -> DT O2 P0823 : score 3.068 : H : TYR OH A0183 <- 2.47 -> DC O2 P0821 : score 3.72827 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.02 -> DC O2 T0723 : score 3.53597 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.88 -> DT O2 P0806 : score 4.1656 : V : ARG CZ A0072 <- 3.57 -> DT C7 P0823 : score 2.25492 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.57 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0151 <- 3.62 -> DT xxx P0823 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.46 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 3.88 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.78 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >5j2p_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA THAT HAS INCORPORATED EFDA-MP AT THE P-(POST-TRANSLOCATION) SITE AND A SECOND EFDA-MP AT THE N-(PRE-TRANSLOCATION) SITE organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.66 -> DC O2 P0821 : score 3.59536 : w : ASN ND2 A0265 <- 5.40 -> DC O2 T0711 : score 1.885 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.82 -> DT O2 P0806 : score 4.28918 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.70 -> DT O2 P0806 : score 4.318 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.45 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.12 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.72 -> DG xxx T0721 : score x.xxxxx >5j2q_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA THAT HAS INCORPORATED A MISMATCHED EFDA-MP AT THE N-(PRE-TRANSLOCATION) SITE organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.63 -> DC O2 P0821 : score 3.61635 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.62 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.17 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.27 -> DT xxx P0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.01 -> DG xxx T0721 : score x.xxxxx >5j2q_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA THAT HAS INCORPORATED A MISMATCHED EFDA-MP AT THE N-(PRE-TRANSLOCATION) SITE organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.63 -> DC O2 P0821 : score 3.61635 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.62 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.17 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.27 -> DT xxx P0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.01 -> DG xxx T0721 : score x.xxxxx >5j2y_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=MOLECULAR INSIGHT INTO THE REGULATORY MECHANISM OF THE QUORUM-SENSING REPRESSOR RSAL IN PSEUDOMONAS AERUGINOSA organism=Pseudomonas aeruginosa : H : GLN OE1 A0038 <- 2.87 -> DA N6 F0008 : score 5.96783 : H : GLN NE2 A0038 <- 3.03 -> DA N7 F0008 : score 5.80962 : H : ARG NH1 A0043 <- 2.83 -> DG O6 F0010 : score 6.04683 : H : ARG NH2 A0043 <- 3.02 -> DG N7 F0010 : score 6.10369 : V : SER CB A0039 <- 3.83 -> DT C7 r0017 : score 3.1078 : x : CYS xxxx A0040 <- 4.26 -> DT xxx r0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 3.48 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0048 <- 3.71 -> DT xxx r0016 : score x.xxxxx >5j3e_B:PUA_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN THYN1 PROTEIN IN COMPLEX WITH 5- METHYLCYTOSINE CONTAINING DNA organism=? : H : ARG NH2 B0202 <- 2.89 -> DT O2 D0009 : score 4.15713 : x : ASN xxxx B0117 <- 3.76 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx >5j5p_A:ATPase_domain_of_HSP90_chaperone/DNA_topoisomerase_II/histidine_kinase;Ribosomal_protein_S5_domain_2-like; title=AMP-PNP-STABILIZED ATPASE DOMAIN OF TOPOISOMERASE IV FROM STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE, COMPLEX TYPE I organism=? : w : SER OG A0292 <- 5.95 -> DC O2 E0002 : score 1.768 >5j5q_AB:ATPase_domain_of_HSP90_chaperone/DNA_topoisomerase_II/histidine_kinase;Ribosomal_protein_S5_domain_2-like; title=AMP-PNP-STABILIZED ATPASE DOMAIN OF TOPOISOMERASE IV FROM STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE, COMPLEX TYPE II organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : SER xxxx B0318 <- 3.92 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx >5j5q_B:ATPase_domain_of_HSP90_chaperone/DNA_topoisomerase_II/histidine_kinase;Ribosomal_protein_S5_domain_2-like; title=AMP-PNP-STABILIZED ATPASE DOMAIN OF TOPOISOMERASE IV FROM STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE, COMPLEX TYPE II organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE : x : SER xxxx B0318 <- 3.92 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx >5j70_A:Homeodomain-like; title=THE CHD1 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH 17MER DNA DUPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) : x : ARG xxxx A1255 <- 3.35 -> DA xxx X0008 : score x.xxxxx >5jgh_A:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MITOCHONDRIAL DNA PACKAGING PROTEIN ABF2P IN COMPLEX WITH DNA AT 2.6 ANGSTROM RESOLUTION organism=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) : H : THR OG1 A0047 <- 2.71 -> DA N3 c0030 : score 1.37822 : H : ARG NH1 A0058 <- 2.32 -> DT O2 c0031 : score 4.71983 : H : GLN NE2 A0143 <- 3.00 -> DA N3 c0021 : score 3.86585 >5jgh_ADGJ:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MITOCHONDRIAL DNA PACKAGING PROTEIN ABF2P IN COMPLEX WITH DNA AT 2.6 ANGSTROM RESOLUTION organism=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) : H : ARG NH2 A0045 <- 2.80 -> DT O2 b0040 : score 4.23333 : H : SER OG A0048 <- 2.56 -> DT O2 b0037 : score 3.87491 : H : SER OG A0074 <- 2.67 -> DT O2 b0035 : score 3.79357 : H : ARG NH1 D0045 <- 3.18 -> DT O2 b0018 : score 3.97912 : H : SER OG D0048 <- 2.73 -> DT O2 b0015 : score 3.7492 : H : SER OG D0074 <- 3.19 -> DT O2 b0013 : score 3.40904 : H : ARG NH1 G0045 <- 2.60 -> DT O2 b0084 : score 4.47867 : H : SER OG G0048 <- 2.35 -> DT O2 b0081 : score 4.03021 : H : TYR OH G0050 <- 3.38 -> DA N3 b0080 : score 3.66973 : H : SER OG G0074 <- 2.20 -> DA N3 b0080 : score 3.36431 : H : ARG NH1 J0045 <- 2.83 -> DT O2 b0062 : score 4.28057 : H : ARG NH2 J0045 <- 3.07 -> DT O2 b0062 : score 4.00473 : H : SER OG J0048 <- 2.38 -> DT O2 b0059 : score 4.00802 : H : TYR OH J0050 <- 3.45 -> DA N3 b0058 : score 3.61162 : H : SER OG J0074 <- 2.31 -> DT O2 b0057 : score 4.05978 : H : SER OG J0074 <- 3.21 -> DA N3 b0058 : score 2.75753 >5jh0_AD:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MITOCHONDRIAL DNA PACKAGING PROTEIN ABF2P IN COMPLEX WITH DNA AT 2.18 ANGSTROM RESOLUTION organism=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) : H : ARG NH1 A0045 <- 2.83 -> DT O2 b0040 : score 4.28057 : H : SER OG A0048 <- 2.25 -> DT O2 b0037 : score 4.10415 : H : TYR OH A0050 <- 3.05 -> DA N3 b0036 : score 3.94372 : H : SER OG A0074 <- 2.80 -> DT O2 b0035 : score 3.69744 : H : ARG NH1 D0045 <- 2.68 -> DT O2 b0018 : score 4.40976 : H : SER OG D0048 <- 2.26 -> DT O2 b0015 : score 4.09676 : H : TYR OH D0050 <- 3.29 -> DA N3 b0014 : score 3.74446 : H : SER OG D0074 <- 2.64 -> DT O2 b0013 : score 3.81575 >5jh0_D:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MITOCHONDRIAL DNA PACKAGING PROTEIN ABF2P IN COMPLEX WITH DNA AT 2.18 ANGSTROM RESOLUTION organism=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) : H : THR OG1 D0047 <- 3.37 -> DA N3 c0008 : score 1.19951 : w : ARG NH2 D0131 <- 5.17 -> DA N3 c0042 : score 2.092 A >5jjv_B:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=CRYSTAL STRUCTURE OF XERH SITE-SPECIFIC RECOMBINASE BOUND TO PALINDROMIC DIFH SUBSTRATE: POST-CLEAVAGE COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 B0065 <- 2.99 -> DG N7 C0008 : score 5.8201 : H : ARG NH2 B0065 <- 2.56 -> DG O6 C0008 : score 6.9168 : H : ASN OD1 B0073 <- 3.09 -> DA N6 C0009 : score 5.67253 : H : ASN ND2 B0073 <- 3.08 -> DT O4 D0021 : score 4.98868 : H : THR OG1 B0074 <- 2.77 -> DT O4 D0020 : score 3.9105 : H : ASN OD1 B0127 <- 3.41 -> DA N6 C0011 : score 5.28714 : H : ASN ND2 B0127 <- 3.20 -> DA N7 C0011 : score 5.40087 : H : LYS NZ B0239 <- 2.96 -> DA N3 C0012 : score 2.68806 : H : GLN OE1 B0285 <- 2.75 -> DA N6 D0024 : score 6.11309 : H : GLN NE2 B0285 <- 3.38 -> DA N7 D0024 : score 5.38333 : H : LYS NZ B0290 <- 3.15 -> DG O6 C0003 : score 5.37612 : V : ILE CG2 B0130 <- 3.67 -> DT C7 D0019 : score 7.32175 : V : LEU CB B0070 <- 3.56 -> DT C7 D0021 : score 4.66291 : V : TYR CB B0287 <- 3.79 -> DT C7 C0004 : score 4.88089 : V : ALA CB B0286 <- 3.89 -> DT C7 C0005 : score 5.473 : x : TYR xxxx B0075 <- 3.36 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0123 <- 3.78 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0124 <- 3.60 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0284 <- 3.75 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0289 <- 3.69 -> DT xxx D0025 : score x.xxxxx >5jk0_B:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=CRYSTAL STRUCTURE OF XERH SITE-SPECIFIC RECOMBINASE BOUND TO DIFH SUBSTRATE: PRE-CLEAVAGE COMPLEX organism=Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) / Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) : H : ARG NH1 B0065 <- 3.17 -> DG N7 G0008 : score 5.6023 : H : ARG NH2 B0065 <- 2.96 -> DG O6 G0008 : score 6.3888 : w : ARG NE B0065 <- 5.84 -> DT O4 H0022 : score 1.317 : w : ARG NH2 B0065 <- 5.89 -> DT O4 H0022 : score 2.366 : H : ASN OD1 B0073 <- 3.18 -> DA N6 G0009 : score 5.56414 : H : ASN ND2 B0073 <- 3.11 -> DT O4 H0021 : score 4.95697 : H : THR OG1 B0074 <- 2.72 -> DT O4 H0020 : score 3.94937 : H : LYS NZ B0126 <- 2.28 -> DG O6 H0018 : score 6.38197 : w : LYS NZ B0126 <- 5.72 -> DT O4 H0019 : score 1.7 : H : ASN OD1 B0127 <- 3.41 -> DA N6 G0011 : score 5.28714 : H : ASN ND2 B0127 <- 3.15 -> DA N7 G0011 : score 5.45958 : w : ASN OD1 B0127 <- 5.35 -> DT O4 H0019 : score 3.132 : w : ASN ND2 B0127 <- 6.16 -> DA N7 G0010 : score 1.989 : H : GLN OE1 B0285 <- 2.71 -> DA N6 H0024 : score 6.16151 : H : GLN NE2 B0285 <- 3.41 -> DA N7 H0024 : score 5.34679 : w : GLN OE1 B0285 <- 6.07 -> DC N4 H0023 : score 3.488 : H : LYS NZ B0290 <- 2.82 -> DT O4 G0004 : score 3.57283 : V : ILE CG2 B0130 <- 3.82 -> DT C7 H0019 : score 7.05583 : V : LEU CB B0070 <- 3.71 -> DT C7 H0021 : score 4.49795 : V : TYR CB B0287 <- 3.86 -> DT C7 G0004 : score 4.79569 : V : ALA CB B0286 <- 3.86 -> DT C7 G0005 : score 5.51499 : x : ASN xxxx B0066 <- 4.18 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0075 <- 3.58 -> DT xxx H0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0123 <- 3.92 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0124 <- 3.61 -> DA xxx G0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0284 <- 3.80 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0289 <- 3.93 -> DA xxx H0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0340 <- 4.08 -> DT xxx G0014 : score x.xxxxx >5jlt_A:DNA-binding_C-terminal_domain_of_the_transcription_factor_MotA; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE BACTERIOPHAGE T4 MOTA C-TERMINAL DOMAIN IN COMPLEX WITH DSDNA REVEALS A NOVEL PROTEIN-DNA RECOGNITION MOTIF organism=Enterobacteria phage T4 : H : TYR OH A0134 <- 3.06 -> DC N4 E0010 : score 3.99497 : x : ARG xxxx A0101 <- 3.46 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0135 <- 3.44 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0150 <- 3.83 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0165 <- 4.28 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0187 <- 3.66 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx >5jlt_AD:DNA-binding_C-terminal_domain_of_the_transcription_factor_MotA; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE BACTERIOPHAGE T4 MOTA C-TERMINAL DOMAIN IN COMPLEX WITH DSDNA REVEALS A NOVEL PROTEIN-DNA RECOGNITION MOTIF organism=Enterobacteria phage T4 : H : TYR OH A0134 <- 3.06 -> DC N4 E0010 : score 3.99497 : x : ARG xxxx A0101 <- 3.46 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0135 <- 3.44 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0150 <- 3.83 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0165 <- 4.28 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0187 <- 3.66 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0135 <- 2.97 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0150 <- 3.45 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0165 <- 3.97 -> DA xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0187 <- 4.23 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0191 <- 4.10 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx >5jlt_BC:DNA-binding_C-terminal_domain_of_the_transcription_factor_MotA; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE BACTERIOPHAGE T4 MOTA C-TERMINAL DOMAIN IN COMPLEX WITH DSDNA REVEALS A NOVEL PROTEIN-DNA RECOGNITION MOTIF organism=Enterobacteria phage T4 : H : ARG NH2 B0135 <- 2.80 -> DG N7 G0004 : score 6.38462 : H : ARG NH2 B0135 <- 3.20 -> DG O6 G0004 : score 6.072 : H : TYR OH C0134 <- 3.05 -> DC N4 H0010 : score 4.0034 : H : ARG NE C0135 <- 3.46 -> DG N7 H0009 : score 3.83812 : V : TYR CZ C0165 <- 3.64 -> DT C7 G0009 : score 5.80267 : x : ARG xxxx B0150 <- 4.08 -> DA xxx H0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0165 <- 4.36 -> DA xxx H0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0191 <- 4.05 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0150 <- 3.87 -> DT xxx G0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0187 <- 3.19 -> DT xxx H0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0189 <- 4.27 -> DT xxx H0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0191 <- 4.44 -> DT xxx H0011 : score x.xxxxx >5jlw_D:Homeodomain-like; title=ANTPHD WITH 15BP DNA DUPLEX R-MONOTHIOATED AT CYTIDINE-8 organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 D0005 <- 2.61 -> DT O2 F0005 : score 4.47005 : w : GLN OE1 D0050 <- 5.58 -> DT O4 F0008 : score 3.068 : w : GLN OE1 D0050 <- 5.63 -> DG O6 F0009 : score 2.87 : H : ASN OD1 D0051 <- 2.80 -> DA N6 F0007 : score 6.02179 : H : ASN ND2 D0051 <- 2.94 -> DA N7 F0007 : score 5.70614 : w : ASN OD1 D0051 <- 5.83 -> DT O4 F0008 : score 3.132 : V : ILE CG2 D0047 <- 3.76 -> DT C7 F0008 : score 7.16219 : x : ARG xxxx D0043 <- 4.20 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx >5jlx_D:Homeodomain-like; title=ANTPHD WITH 15BP DNA DUPLEX S-MONOTHIOATED AT CYTIDINE-8 organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 D0005 <- 2.71 -> DT O2 F0005 : score 4.38393 : H : ASN OD1 D0051 <- 2.91 -> DA N6 F0007 : score 5.88932 : H : ASN ND2 D0051 <- 3.00 -> DA N7 F0007 : score 5.63569 : x : ILE xxxx D0047 <- 3.50 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0050 <- 3.50 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx >5jrg_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING THE DNA WITH TETRAHYDROFURAN (THF) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.77 -> DA N3 J0082 : score 3.25918 : w : ARG NH1 C0042 <- 6.57 -> DA N3 J0109 : score 2.585 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.53 -> DA N3 I0082 : score 3.41469 : H : ARG NH2 G0011 <- 2.88 -> DC O2 I0115 : score 3.63954 : w : ARG NH2 G0042 <- 5.73 -> DT O2 J0037 : score 2.261 : H : ARG NH1 H0029 <- 2.79 -> DT O2 I0045 : score 4.31502 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.88 -> DT xxx J0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.97 -> DC xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.62 -> DT xxx J0079 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0030 <- 2.79 -> DG xxx I0102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.47 -> DG xxx J0121 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 3.37 -> DT xxx J0122 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.46 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.64 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.32 -> DA xxx I0098 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.93 -> DT xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.20 -> DG xxx I0120 : score x.xxxxx >5jrg_G:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING THE DNA WITH TETRAHYDROFURAN (THF) organism=? : H : ARG NH2 G0011 <- 2.88 -> DC O2 I0115 : score 3.63954 : w : ARG NH2 G0042 <- 5.94 -> DA N3 I0110 : score 2.092 >5jub_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF COMR FROM S.THERMOPHILUS IN COMPLEX WITH DNA AND ITS SIGNALLING PEPTIDE COMS. organism=Streptococcus thermophilus LMD-9 : H : ARG NE A0035 <- 2.92 -> DG O6 X0005 : score 3.84644 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.85 -> DG N7 X0005 : score 6.32077 : H : ARG NH2 A0039 <- 2.86 -> DG N7 Z0014 : score 6.308 : H : ARG NE B0035 <- 2.87 -> DG O6 Z0005 : score 3.88585 : H : ARG NH2 B0035 <- 3.09 -> DG N7 Z0005 : score 6.01431 : H : ARG NH1 B0039 <- 3.28 -> DG N7 X0014 : score 5.4692 : H : ARG NH2 B0039 <- 2.79 -> DG O6 X0014 : score 6.6132 : x : THR xxxx A0033 <- 4.31 -> DT xxx Z0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0036 <- 3.11 -> DT xxx Z0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0045 <- 3.74 -> DT xxx Z0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0033 <- 4.31 -> DT xxx X0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0036 <- 3.11 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0038 <- 3.80 -> DT xxx Z0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0045 <- 3.58 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx >5jub_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF COMR FROM S.THERMOPHILUS IN COMPLEX WITH DNA AND ITS SIGNALLING PEPTIDE COMS. organism=Streptococcus thermophilus LMD-9 : H : ARG NE B0035 <- 2.87 -> DG O6 Z0005 : score 3.88585 : H : ARG NH2 B0035 <- 3.09 -> DG N7 Z0005 : score 6.01431 : H : ARG NH1 B0039 <- 3.28 -> DG N7 X0014 : score 5.4692 : H : ARG NH2 B0039 <- 2.79 -> DG O6 X0014 : score 6.6132 : x : THR xxxx B0033 <- 4.31 -> DT xxx X0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0036 <- 3.11 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0038 <- 3.80 -> DT xxx Z0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0045 <- 3.58 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx >5jum_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING DCTP OPPOSITE N-(2'-DEOXYGUANOSIN-8- YL)-3-AMINOBENZANTHRONE (C8-DG-ABA) organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 3.84 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.28 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >5jvt_AD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF TRANSCRIPTION FACTOR FLI1 IN COMPLEX WITH AN 11-MER DNA GACCGGAAGTG organism=Homo sapiens : H : ASP OD2 A0333 <- 3.41 -> DC N4 C0020 : score 5.4436 : H : ARG NE A0337 <- 2.80 -> DG O6 B0006 : score 3.94103 : H : ARG NH2 A0337 <- 3.17 -> DG N7 B0006 : score 5.91215 : H : ARG NH2 A0340 <- 2.86 -> DG N7 B0005 : score 6.308 : H : ARG NH2 A0340 <- 2.78 -> DG O6 B0005 : score 6.6264 : H : TYR OH A0341 <- 3.12 -> DA N6 B0007 : score 4.3716 : H : ARG NE D0337 <- 2.82 -> DG O6 E0006 : score 3.92526 : H : ARG NH2 D0337 <- 3.13 -> DG N7 E0006 : score 5.96323 : H : ARG NH2 D0340 <- 2.88 -> DG N7 E0005 : score 6.28246 : H : ARG NH2 D0340 <- 2.74 -> DG O6 E0005 : score 6.6792 : H : TYR OH D0341 <- 2.97 -> DA N6 E0007 : score 4.51172 : x : LYS xxxx A0334 <- 4.05 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0345 <- 4.33 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0333 <- 3.80 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0334 <- 3.91 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0338 <- 4.39 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0345 <- 4.28 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx >5jvt_G:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF TRANSCRIPTION FACTOR FLI1 IN COMPLEX WITH AN 11-MER DNA GACCGGAAGTG organism=Homo sapiens : H : ARG NE G0337 <- 3.12 -> DG O6 H0006 : score 3.6888 : H : ARG NH2 G0337 <- 3.35 -> DG N7 H0006 : score 5.68231 : H : ARG NH2 G0340 <- 3.00 -> DG N7 H0005 : score 6.12923 : H : ARG NH2 G0340 <- 3.06 -> DG O6 H0005 : score 6.2568 : H : TYR OH G0341 <- 2.93 -> DA N6 H0007 : score 4.54908 : x : ASP xxxx G0333 <- 3.60 -> DC xxx I0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0334 <- 3.97 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0338 <- 4.46 -> DT xxx I0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0345 <- 4.47 -> DA xxx I0015 : score x.xxxxx >5jxy_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=ENZYME-SUBSTRATE COMPLEX OF TDG CATALYTIC DOMAIN BOUND TO A G/U ANALOG organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0158 <- 6.28 -> DT O2 C0013 : score 3.682 : H : LYS NZ A0201 <- 2.77 -> DT O4 D0019 : score 3.6087 : H : GLN OE1 A0278 <- 3.01 -> DG N2 D0018 : score 5.37217 : H : GLN NE2 A0278 <- 2.81 -> DT O2 D0019 : score 3.92547 : x : ALA xxxx A0274 <- 3.29 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.68 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0276 <- 3.38 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 3.50 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >5k07_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CREN7-DSDNA (GTAATTGC) COMPLEX organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS P2 : H : TRP NE1 A0026 <- 2.93 -> DA N3 B0104 : score -8.87464 : H : ARG NE A0051 <- 2.97 -> DT O2 B0105 : score 2.48931 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.89 -> DT O2 B0105 : score 4.15713 : H : ARG NH2 A0051 <- 3.09 -> DT O2 B0106 : score 3.9878 : w : ARG NH1 A0051 <- 5.80 -> DA N3 C0112 : score 2.585 : x : LEU xxxx A0028 <- 3.40 -> DA xxx B0103 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0030 <- 3.58 -> DA xxx B0103 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0036 <- 4.06 -> DT xxx C0114 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0038 <- 3.95 -> DT xxx C0113 : score x.xxxxx >5k17_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CREN7-DSDNA (GTGATCGC) COMPLEX organism=SULFOLOBUS SOLFATARICUS P2 : H : TRP NE1 B0026 <- 2.98 -> DA N3 E0104 : score -8.78352 : H : ARG NE B0051 <- 2.90 -> DT O2 E0105 : score 2.52538 : H : ARG NH2 B0051 <- 2.92 -> DT O2 E0105 : score 4.13173 : w : ARG NH1 B0051 <- 5.92 -> DA N3 F0112 : score 2.585 : w : ARG NH1 B0051 <- 5.73 -> DC O2 E0106 : score 1.381 : w : ARG NH2 B0051 <- 5.90 -> DC O2 E0106 : score 1.669 : x : LEU xxxx B0028 <- 3.40 -> DG xxx E0103 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0030 <- 3.29 -> DG xxx F0115 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0033 <- 3.01 -> DC xxx F0116 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0036 <- 3.65 -> DC xxx F0114 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0038 <- 3.86 -> DT xxx F0113 : score x.xxxxx >5k1y_ABCDEF:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=P2(1) STRUCTURE OF PNOB8 ASPA-DNA COMPLEX organism=SULFOLOBUS SP. 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PNEUMONIA SLMA-DNA COMPLEX BOUND TO THE C- TERMINAL OF THE CELL DIVISION PROTEIN FTSZ organism=Escherichia coli O139:H28 (strain E24377A / ETEC) / Escherichia coli O139:H28 (strain E24377A / ETEC) / Escherichia coli O139:H28 (strain E24377A / ETEC) / Escherichia coli O139:H28 (strain E24377A / ETEC) / Escherichia coli O139:H28 (strain E24377A / ETEC) / Escherichia coli O139:H28 (strain E24377A / ETEC) / Escherichia coli O139:H28 (strain E24377A / ETEC) / Escherichia coli O139:H28 (strain E24377A / ETEC) : H : GLU OE1 A0045 <- 2.89 -> DC N4 R0009 : score 5.66413 : H : GLU OE2 B0045 <- 2.30 -> DC N4 T0013 : score 5.79192 : H : GLU OE1 E0045 <- 2.96 -> DC N4 T0009 : score 5.58337 : H : ARG NH2 E0050 <- 2.97 -> DG O6 R0002 : score 6.3756 : H : GLU OE2 F0045 <- 2.68 -> DC N4 R0013 : score 5.39175 : V : ALA CB A0046 <- 3.57 -> DT C7 T0003 : score 5.92092 : x : THR xxxx E0034 <- 3.53 -> DA xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0046 <- 3.20 -> DG xxx R0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0047 <- 4.33 -> DT xxx R0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0049 <- 3.48 -> DC xxx T0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0034 <- 3.14 -> DA xxx R0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0049 <- 3.60 -> DC xxx R0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0034 <- 3.62 -> DA xxx R0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0044 <- 4.01 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0047 <- 4.38 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0049 <- 3.44 -> DC xxx R0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0050 <- 2.95 -> DG xxx T0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0034 <- 3.48 -> DA xxx T0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0049 <- 3.38 -> DC xxx T0013 : score x.xxxxx >5k58_B:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF THE K. PNEUMONIA SLMA-DNA COMPLEX BOUND TO THE C- TERMINAL OF THE CELL DIVISION PROTEIN FTSZ organism=Escherichia coli O139:H28 (strain E24377A / ETEC) / Escherichia coli O139:H28 (strain E24377A / ETEC) : H : GLU OE2 B0045 <- 2.30 -> DC N4 T0013 : score 5.79192 : x : THR xxxx B0034 <- 3.48 -> DA xxx T0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0049 <- 3.38 -> DC xxx T0013 : score x.xxxxx >5k5h_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=HOMO SAPIENS CCCTC-BINDING FACTOR (CTCF) ZNF4-7 AND DNA COMPLEX STRUCTURE organism=Homo sapiens : w : GLU OE1 A0362 <- 5.84 -> DC N4 B0011 : score 3.528 : H : LYS NZ A0365 <- 2.78 -> DG N7 B0010 : score 5.40744 : w : LYS NZ A0365 <- 5.56 -> DC N4 B0011 : score 0.048 : H : ARG NH1 A0368 <- 2.68 -> DG N7 B0009 : score 6.1952 : H : ARG NH2 A0368 <- 3.06 -> DG O6 B0009 : score 6.2568 : H : LYS NZ A0393 <- 2.67 -> DG N7 B0007 : score 5.52593 : H : ARG NH2 A0396 <- 2.46 -> DG N7 B0006 : score 6.81877 : H : GLN OE1 A0418 <- 3.28 -> DA N6 B0005 : score 5.47152 : H : GLN NE2 A0418 <- 3.10 -> DA N7 B0005 : score 5.72436 : H : THR OG1 A0421 <- 3.22 -> DC N4 B0004 : score 3.69453 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.15 -> DA N7 B0002 : score 2.38104 : x : SER xxxx A0364 <- 4.07 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0390 <- 4.46 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0392 <- 3.50 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0450 <- 3.47 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0451 <- 3.46 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0454 <- 4.34 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >5k5i_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=HOMO SAPIENS CCCTC-BINDING FACTOR (CTCF) ZNF5-8 AND DNA COMPLEX STRUCTURE IN SPACE GROUP P65 organism=Homo sapiens : H : ASP OD2 A0390 <- 2.82 -> DC N4 B0001 : score 6.1752 : H : LYS NZ A0393 <- 3.00 -> DG N7 C0011 : score 5.17046 : H : ARG NH1 A0396 <- 2.78 -> DG O6 C0010 : score 6.10767 : H : ARG NH2 A0396 <- 2.81 -> DG N7 C0010 : score 6.37185 : H : GLN OE1 A0418 <- 2.82 -> DA N6 C0009 : score 6.02835 : H : GLN NE2 A0418 <- 3.02 -> DA N7 C0009 : score 5.82179 : H : THR OG1 A0421 <- 3.12 -> DC N4 C0008 : score 3.7752 : w : SER OG A0450 <- 5.53 -> DT O4 B0007 : score 2.338 : H : ASP OD1 A0451 <- 2.96 -> DC N4 C0005 : score 5.17384 : w : ASP OD1 A0451 <- 5.45 -> DT O4 B0007 : score 2.616 : w : ASP OD1 A0451 <- 5.70 -> DC N4 C0004 : score 2.835 >5k5j_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=HOMO SAPIENS CCCTC-BINDING FACTOR (CTCF) ZNF5-8 AND DNA COMPLEX STRUCTURE IN SPACE GROUP P41212 organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0392 <- 2.86 -> DC N4 B0002 : score 4.16353 : H : LYS NZ A0393 <- 2.42 -> DG N7 C0011 : score 5.79523 : H : ARG NH1 A0396 <- 2.96 -> DG O6 C0010 : score 5.88867 : H : ARG NH2 A0396 <- 2.93 -> DG N7 C0010 : score 6.21862 : H : GLN OE1 A0418 <- 2.89 -> DA N6 C0009 : score 5.94362 : H : GLN NE2 A0418 <- 3.00 -> DA N7 C0009 : score 5.84615 : H : THR OG1 A0421 <- 3.27 -> DC N4 C0008 : score 3.6542 : H : ASP OD1 A0451 <- 2.78 -> DC N4 C0005 : score 5.36625 : w : ASP OD1 A0451 <- 5.57 -> DC N4 C0004 : score 2.835 : V : VAL CG2 A0454 <- 3.72 -> DT C7 B0007 : score 6.24554 : x : ARG xxxx A0448 <- 3.81 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0450 <- 3.56 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx >5k5l_F:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=HOMO SAPIENS CCCTC-BINDING FACTOR (CTCF) ZNF6-8 AND H19 SEQUENCE DNA COMPLEX STRUCTURE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 F0448 <- 3.05 -> DG O6 C0007 : score 5.77917 : H : ARG NH2 F0448 <- 2.60 -> DG N7 C0007 : score 6.64 : H : ARG NH2 F0448 <- 3.33 -> DG O6 C0007 : score 5.9004 : H : ASP OD1 F0451 <- 2.93 -> DC N4 C0006 : score 5.2059 : x : SER xxxx F0450 <- 3.54 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >5k5o_ABCD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF ASPA-26MER DNA COMPLEX organism=SULFOLOBUS SP. 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NOB8H2 : H : GLN OE1 D0042 <- 3.03 -> DA N6 N0017 : score 5.77415 : H : GLN NE2 D0046 <- 3.06 -> DG N7 P0031 : score 3.98038 : x : LYS xxxx D0003 <- 3.20 -> DC xxx N0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0041 <- 4.37 -> DA xxx N0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0043 <- 3.90 -> DC xxx P0032 : score x.xxxxx >5k5r_ABCDEF:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ASPA-32MER DNA,CRYSTAL FORM 2 organism=SULFOLOBUS SP. NOB8H2 : H : GLN NE2 A0042 <- 2.97 -> DT O4 P0016 : score 5.01453 : H : GLN NE2 B0042 <- 2.86 -> DT O4 N0023 : score 5.12873 : H : GLN OE1 B0046 <- 3.08 -> DC N4 P0025 : score 4.32667 : H : LYS NZ D0003 <- 3.07 -> DT O2 N0021 : score 3.39347 : H : GLN NE2 D0042 <- 2.97 -> DT O4 N0016 : score 5.01453 : H : GLN OE1 D0046 <- 2.85 -> DC N4 P0032 : score 4.5375 : V : ILE CG2 D0045 <- 3.73 -> DT C7 N0016 : score 7.21538 : V : ILE CG2 F0045 <- 3.87 -> DT C7 P0009 : score 6.96719 : x : TYR xxxx C0041 <- 4.11 -> DA xxx P0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0042 <- 2.76 -> DA xxx P0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0043 <- 4.17 -> DT xxx N0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0046 <- 3.69 -> DT xxx N0025 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0041 <- 4.14 -> DT xxx N0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0043 <- 3.87 -> DC xxx P0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0049 <- 4.12 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 2.95 -> DC xxx P0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0043 <- 3.80 -> DC xxx N0032 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0045 <- 3.27 -> DT xxx P0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0046 <- 4.50 -> DC xxx N0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0049 <- 4.23 -> DT xxx P0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0003 <- 3.33 -> DT xxx N0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0041 <- 2.77 -> DC xxx N0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0043 <- 4.02 -> DC xxx P0025 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0045 <- 3.48 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0049 <- 3.71 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.99 -> DT xxx N0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0042 <- 3.29 -> DA xxx N0031 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0043 <- 4.05 -> DT xxx P0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0046 <- 3.59 -> DT xxx P0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0003 <- 3.38 -> DA xxx N0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0041 <- 3.39 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0042 <- 3.10 -> DT xxx P0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0043 <- 4.10 -> DC xxx N0039 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0046 <- 3.05 -> DC xxx N0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0049 <- 3.89 -> DT xxx P0010 : score x.xxxxx >5k5r_E:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ASPA-32MER DNA,CRYSTAL FORM 2 organism=SULFOLOBUS SP. NOB8H2 : V : GLN CG E0046 <- 3.59 -> DT C7 P0018 : score 3.42629 : x : TYR xxxx E0041 <- 3.99 -> DT xxx N0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0042 <- 3.29 -> DA xxx N0031 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0043 <- 4.05 -> DT xxx P0018 : score x.xxxxx >5k7z_AB:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AIBR IN COMPLEX WITH ISOVALERYL COENZYME A AND OPERATOR DNA organism=Myxococcus xanthus DK 1622 : H : LYS NZ A0047 <- 2.67 -> DG N7 a0011 : score 5.52593 : H : LYS NZ A0047 <- 2.59 -> DG N7 a0012 : score 5.61211 : H : LYS NZ A0047 <- 2.67 -> DG O6 a0012 : score 5.93107 >5k97_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=FLAP ENDONUCLEASE 1 (FEN1) D233N WITH CLEAVED PRODUCT FRAGMENT AND SM3+ organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 A0048 <- 2.82 -> DC N4 F0006 : score 4.565 : w : GLU OE1 A0198 <- 6.26 -> DG O6 D0016 : score 2.669 : w : ARG NH1 A0320 <- 5.67 -> DT O2 F0005 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0320 <- 5.80 -> DT O2 F0005 : score 2.261 : x : ALA xxxx A0045 <- 3.94 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0046 <- 3.66 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0053 <- 4.02 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0065 <- 3.62 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx >5k98_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF HIPA-HIPB-O2-O3 COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI MP020980.2 : x : SER xxxx B0029 <- 3.93 -> DT xxx T0701 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0038 <- 2.70 -> DG xxx E0715 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0039 <- 3.80 -> DA xxx T0702 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0040 <- 3.28 -> DT xxx T0703 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0041 <- 3.28 -> DG xxx E0713 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 3.15 -> DA xxx T0702 : score x.xxxxx >5k98_BP:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF HIPA-HIPB-O2-O3 COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI MP020980.2 : H : LYS NZ P0038 <- 2.63 -> DG N7 T0714 : score 5.56902 : H : LYS NZ P0038 <- 2.31 -> DG O6 T0715 : score 6.34728 : x : SER xxxx B0029 <- 3.93 -> DT xxx T0701 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0038 <- 2.70 -> DG xxx E0715 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0039 <- 3.80 -> DA xxx T0702 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0040 <- 3.28 -> DT xxx T0703 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0041 <- 3.28 -> DG xxx E0713 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 3.15 -> DA xxx T0702 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx P0039 <- 2.66 -> DA xxx E0702 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx P0040 <- 3.24 -> DG xxx T0715 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0041 <- 4.06 -> DG xxx T0713 : score x.xxxxx : x : SER xxxx P0043 <- 3.70 -> DA xxx E0702 : score x.xxxxx >5kbd_AB:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL STUDIES OF TRANSCRIPTION FACTOR P73 DNA BINDING DOMAIN BOUND TO PA26 20-MER RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0300 <- 2.68 -> DG N7 C0007 : score 6.1952 : H : ARG NH1 A0300 <- 3.15 -> DG O6 C0007 : score 5.6575 : H : ARG NH2 A0300 <- 3.33 -> DG O6 C0007 : score 5.9004 : H : ARG NH1 B0300 <- 2.38 -> DG N7 D0017 : score 6.5582 : H : ARG NH2 B0300 <- 2.85 -> DG O6 D0017 : score 6.534 : x : ARG xxxx A0268 <- 3.31 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0296 <- 3.15 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0297 <- 3.54 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0268 <- 3.93 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0296 <- 3.30 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0297 <- 3.52 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx >5kbd_B:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL STUDIES OF TRANSCRIPTION FACTOR P73 DNA BINDING DOMAIN BOUND TO PA26 20-MER RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0300 <- 2.38 -> DG N7 D0017 : score 6.5582 : H : ARG NH2 B0300 <- 2.85 -> DG O6 D0017 : score 6.534 : x : ARG xxxx B0268 <- 3.93 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0296 <- 3.30 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0297 <- 3.52 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx >5kbj_ABG:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF REP-DNA COMPLEX organism=Staphylococcus aureus : H : LYS NZ A0079 <- 2.75 -> DG O6 W0011 : score 5.83858 : H : LYS NZ B0079 <- 2.91 -> DG O6 R0011 : score 5.65359 : H : GLU OE2 B0080 <- 3.31 -> DA N6 W0023 : score 2.74005 : H : ASN ND2 B0103 <- 2.96 -> DC O2 R0006 : score 4.33614 : x : GLU xxxx A0080 <- 3.14 -> DG xxx R0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0083 <- 3.92 -> DT xxx W0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0084 <- 3.74 -> DT xxx R0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0099 <- 3.25 -> DC xxx R0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0102 <- 4.27 -> DG xxx W0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0099 <- 2.89 -> DG xxx R0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0102 <- 3.78 -> DG xxx W0031 : score x.xxxxx >5kbj_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF REP-DNA COMPLEX organism=Staphylococcus aureus : H : LYS NZ B0079 <- 2.91 -> DG O6 R0011 : score 5.65359 : H : GLU OE2 B0080 <- 3.31 -> DA N6 W0023 : score 2.74005 : H : ASN ND2 B0103 <- 2.96 -> DC O2 R0006 : score 4.33614 : x : ARG xxxx B0099 <- 2.89 -> DG xxx R0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0102 <- 3.78 -> DG xxx W0031 : score x.xxxxx >5ke6_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=MOUSE KLF4 ZNF1-3 AND TPG/CPA SEQUENCE DNA COMPLEX STRUCTURE organism=Mus musculus : H : LYS NZ A0413 <- 2.74 -> DG O6 C0001 : score 5.85014 : w : LYS NZ A0413 <- 6.08 -> DC N4 C0002 : score 0.048 : w : LYS NZ A0413 <- 5.62 -> DG N7 B0009 : score 2.519 : w : SER OG A0415 <- 5.84 -> DC N4 C0002 : score 2.105 : H : HIS NE2 A0416 <- 2.82 -> DG N7 B0008 : score 6.77535 : w : HIS NE2 A0416 <- 5.99 -> DC N4 C0002 : score 3.208 : H : ARG NH1 A0443 <- 2.83 -> DG O6 B0006 : score 6.04683 : H : ARG NH2 A0443 <- 3.05 -> DG N7 B0006 : score 6.06538 : w : ASP OD1 A0445 <- 6.04 -> DC N4 C0003 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0445 <- 5.51 -> DT O4 B0005 : score 2.798 : H : ARG NH1 A0449 <- 2.95 -> DG O6 B0004 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0449 <- 2.73 -> DG N7 B0004 : score 6.474 : w : ARG NH1 A0449 <- 6.21 -> DA N6 C0006 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0471 <- 2.83 -> DG N7 B0003 : score 6.0137 : H : ARG NH2 A0471 <- 2.95 -> DG O6 B0003 : score 6.402 : H : ASP OD2 A0473 <- 2.95 -> DC N4 C0007 : score 6.014 : H : HIS NE2 A0474 <- 2.96 -> DA N7 B0002 : score 4.11028 : x : SER xxxx A0444 <- 3.78 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0446 <- 3.53 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx >5ke7_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=MOUSE KLF4 ZNF1-3 AND TPG/MPA SEQUENCE DNA COMPLEX STRUCTURE organism=Mus musculus : H : LYS NZ A0413 <- 2.70 -> DG O6 C0001 : score 5.89638 : H : LYS NZ A0413 <- 2.74 -> DG O6 B0009 : score 5.85014 : H : HIS NE2 A0416 <- 2.86 -> DG N7 B0008 : score 6.72093 : H : ARG NH1 A0443 <- 2.69 -> DG O6 B0006 : score 6.21717 : H : ARG NH2 A0443 <- 3.04 -> DG N7 B0006 : score 6.07815 : w : ASP OD2 A0445 <- 5.71 -> DT O4 B0005 : score 2.798 : H : ARG NH1 A0449 <- 2.91 -> DG O6 B0004 : score 5.9495 : H : ARG NH2 A0449 <- 2.76 -> DG N7 B0004 : score 6.43569 : w : ARG NH1 A0449 <- 5.70 -> DA N6 C0006 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0471 <- 2.95 -> DG N7 B0003 : score 5.8685 : H : ARG NH2 A0471 <- 2.95 -> DG O6 B0003 : score 6.402 : H : ASP OD2 A0473 <- 2.73 -> DC N4 C0007 : score 6.2868 : w : ASP OD2 A0473 <- 5.98 -> DA N6 C0006 : score 3.409 : H : HIS NE2 A0474 <- 2.95 -> DA N7 B0002 : score 4.11877 : x : SER xxxx A0415 <- 3.61 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0444 <- 3.83 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0446 <- 3.67 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx >5ke8_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=MOUSE KLF4 E446P ZNF1-3 AND MPG/MPG SEQUENCE DNA COMPLEX STRUCTURE organism=Mus musculus : H : LYS NZ A0413 <- 3.06 -> DG N7 B0009 : score 5.10583 : H : HIS NE2 A0416 <- 2.90 -> DG N7 B0008 : score 6.66651 : H : ARG NH1 A0443 <- 2.96 -> DG O6 B0006 : score 5.88867 : H : ARG NH2 A0443 <- 3.25 -> DG N7 B0006 : score 5.81 : H : ARG NH1 A0449 <- 2.79 -> DG N7 B0004 : score 6.0621 : H : ARG NH2 A0449 <- 2.88 -> DG O6 B0004 : score 6.4944 : w : ARG NH2 A0449 <- 5.54 -> DG O6 C0006 : score 2.468 : H : ARG NH1 A0471 <- 2.85 -> DG O6 B0003 : score 6.0225 : H : ARG NH2 A0471 <- 3.10 -> DG N7 B0003 : score 6.00154 : H : ASP OD2 A0473 <- 2.96 -> DC N4 C0007 : score 6.0016 : H : HIS NE2 A0474 <- 3.18 -> DA N7 B0002 : score 3.92345 : x : SER xxxx A0415 <- 3.73 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0445 <- 3.67 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 4.27 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx >5ke9_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=MOUSE KLF4 E446P ZNF1-3 AND TPG/CPA SEQUENCE DNA COMPLEX STRUCTURE organism=Mus musculus : H : HIS NE2 A0416 <- 3.20 -> DG N7 B0008 : score 6.25836 : H : ARG NH1 A0443 <- 3.05 -> DG N7 B0006 : score 5.7475 : H : ARG NH2 A0443 <- 2.77 -> DG O6 B0006 : score 6.6396 : H : ARG NH1 A0449 <- 2.82 -> DG O6 B0004 : score 6.059 : H : ARG NH2 A0449 <- 2.82 -> DG N7 B0004 : score 6.35908 : w : ARG NH1 A0449 <- 6.04 -> DA N6 C0006 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0471 <- 3.03 -> DG N7 B0003 : score 5.7717 : H : ARG NH2 A0471 <- 2.90 -> DG O6 B0003 : score 6.468 : H : ASP OD2 A0473 <- 3.01 -> DC N4 C0007 : score 5.9396 : H : HIS NE2 A0474 <- 2.90 -> DA N7 B0002 : score 4.16123 : V : PRO CB A0446 <- 3.87 -> DT C7 B0005 : score 5.70455 : x : LYS xxxx A0413 <- 3.46 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0415 <- 3.70 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0444 <- 3.92 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0445 <- 3.08 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx >5kea_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=MOUSE KLF4 ZNF1-3 (E446D) AND CPG/CPG SEQUENCE DNA COMPLEX STRUCTURE: FORM I organism=Mus musculus : H : HIS NE2 A0416 <- 3.10 -> DG N7 B0008 : score 6.39441 : H : ARG NH1 A0443 <- 3.04 -> DG N7 B0006 : score 5.7596 : H : ARG NH2 A0443 <- 2.94 -> DG O6 B0006 : score 6.4152 : H : ASP OD2 A0445 <- 2.82 -> DA N6 C0004 : score 3.98655 : H : ASP OD1 A0446 <- 3.06 -> DC N4 B0005 : score 5.06694 : H : ARG NH1 A0449 <- 3.12 -> DG O6 B0004 : score 5.694 : H : ARG NH2 A0449 <- 2.96 -> DG N7 B0004 : score 6.18031 : w : ARG NH1 A0449 <- 5.81 -> DG O6 C0006 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0471 <- 2.75 -> DG O6 B0003 : score 6.14417 : H : ARG NH2 A0471 <- 3.00 -> DG N7 B0003 : score 6.12923 : H : ASP OD2 A0473 <- 2.77 -> DC N4 C0007 : score 6.2372 : H : HIS NE2 A0474 <- 2.92 -> DA N7 B0002 : score 4.14425 : x : LYS xxxx A0413 <- 3.45 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0415 <- 3.76 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 4.44 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx >5keb_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=MOUSE KLF4 ZNF1-3 (E446D) AND CPG/CPG SEQUENCE DNA COMPLEX STRUCTURE: FORM II organism=Mus musculus : H : LYS NZ A0413 <- 2.78 -> DG O6 C0001 : score 5.80389 : H : ARG NH1 A0443 <- 2.95 -> DG O6 B0006 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0443 <- 3.05 -> DG N7 B0006 : score 6.06538 : H : ARG NH1 A0449 <- 2.73 -> DG O6 B0004 : score 6.1685 : H : ARG NH2 A0449 <- 2.85 -> DG N7 B0004 : score 6.32077 : H : ARG NH1 A0471 <- 2.85 -> DG N7 B0003 : score 5.9895 : H : ARG NH2 A0471 <- 2.95 -> DG O6 B0003 : score 6.402 : H : ASP OD2 A0473 <- 2.98 -> DC N4 C0007 : score 5.9768 : H : HIS NE2 A0474 <- 2.92 -> DA N7 B0002 : score 4.14425 : V : HIS CG A0416 <- 3.63 -> DT C7 B0007 : score 3.12643 : x : SER xxxx A0415 <- 3.30 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0444 <- 3.74 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0445 <- 3.36 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0446 <- 4.17 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 4.39 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx >5kfa_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: GROUND STATE AT PH7.0 (K+ MES) WITH 1 CA2+ ION organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.26 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.32 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >5kfb_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION WITH 1 MM MN2+ FOR 90S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.13 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.84 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 4.47 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >5kfc_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION WITH 1 MM MN2+ FOR 180S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.18 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.65 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 4.02 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >5kfd_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION WITH 1 MM MN2+ FOR 300S organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0382 <- 2.99 -> DG N7 P0004 : score 6.142 : x : SER xxxx A0322 <- 4.05 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.51 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5kfe_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION WITH 1 MM MN2+ FOR 600S organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.35 -> DG O6 P0004 : score 5.41417 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.00 -> DG N7 P0004 : score 6.12923 : x : SER xxxx A0322 <- 4.02 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.81 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5kff_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION WITH 1 MM MN2+ FOR 1800S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.06 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.64 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.67 -> DG xxx P0004 : score x.xxxxx >5kfg_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION WITH 10 MM MN2+ FOR 30S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.10 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.87 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.55 -> DG xxx P0004 : score x.xxxxx >5kfh_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION WITH 10 MM MN2+ FOR 90S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.11 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.83 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.19 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >5kfi_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION WITH 10 MM MN2+ FOR 120S organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0382 <- 5.78 -> DG N7 P0002 : score 2.063 : x : SER xxxx A0322 <- 4.08 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5kfj_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION WITH 10 MM MN2+ FOR 180S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.20 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.12 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >5kfk_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION WITH 10 MM MN2+ FOR 300S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.16 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.24 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >5kfl_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION WITH 10 MM MN2+ FOR 600S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.34 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.37 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >5kfm_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX WITH SP-DATP-ALPHA-S: GROUND STATE AT PH7.0 (K+ MES) WITH 1 CA2+ ION organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.39 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 4.28 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >5kfn_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX WITH SP-DATP-ALPHA-S: REACTION WITH 1 MM MG2+ FOR 1800S organism=Homo sapiens : V : LEU CD2 A0378 <- 3.55 -> DT C7 P0005 : score 6.08949 : x : SER xxxx A0322 <- 4.06 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5kfo_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX WITH SP-DATP-ALPHA-S: REACTION WITH 1 MM MN2+ FOR 1800S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.06 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.80 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5kfp_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX WITH SP-DATP-ALPHA-S: REACTION WITH 20 MM MG2+ FOR 600S organism=Homo sapiens : V : LEU CD2 A0378 <- 3.74 -> DT C7 P0005 : score 5.81725 : x : SER xxxx A0322 <- 4.02 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.70 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >5kfq_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX WITH SP-DATP-ALPHA-S: REACTION WITH 10 MM MN2+ FOR 600S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.16 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.54 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >5kfr_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX WITH SP-DATP-ALPHA-S: REACTION WITH 20 MM MN2+ FOR 600S organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 A0382 <- 5.81 -> DG N7 P0002 : score 2.18 : x : SER xxxx A0322 <- 4.20 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.68 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5kfs_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA R61A-DNA TERNARY COMPLEX: GROUND STATE AT PH7.0 (K+ MES) WITH 1 CA2+ ION organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.21 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.68 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >5kft_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA R61A-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION WITH 1 MM MG2+ FOR 40S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.15 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.74 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 4.41 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >5kfu_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA R61A-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION WITH 1 MM MG2+ FOR 80S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.14 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.63 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 4.34 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >5kfv_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA R61A-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION WITH 1 MM MG2+ FOR 140S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.16 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.59 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.64 -> DG xxx P0004 : score x.xxxxx >5kfw_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA R61A-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION WITH 1 MM MG2+ FOR 200S organism=HOMO SAPIENS : x : SER xxxx A0322 <- 4.16 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5kfx_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA R61A-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION WITH 1 MM MG2+ FOR 300S organism=HOMO SAPIENS : x : SER xxxx A0322 <- 4.11 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.45 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx >5kfy_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION FIRST WITH 1 MM MN2+ FOR 1800S THEN WITH 5 MM MN2+ FOR 60S AT 4 DEGREE organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.13 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.94 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 4.25 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >5kfz_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION FIRST WITH 1 MM MN2+ FOR 1800S THEN WITH 5 MM MN2+ FOR 60S AT 14 DEGREE organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.18 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 4.15 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx >5kg0_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION FIRST WITH 1 MM MN2+ FOR 1800S THEN WITH 5 MM MN2+ FOR 60S AT 22 DEGREE organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.15 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 4.23 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 4.28 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >5kg1_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION FIRST WITH 1 MM MN2+ FOR 1800S THEN WITH 5 MM MN2+ FOR 60S AT 30 DEGREE organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.12 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 4.34 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 4.17 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >5kg2_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION FIRST WITH 1 MM MN2+ FOR 1800S THEN WITH 5 MM MN2+ FOR 60S AT 37 DEGREE organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.14 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 4.24 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 4.28 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >5kg3_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION FIRST WITH 1 MM MN2+ FOR 1800S THEN WITH 10 MM MN2+ FOR 60S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.21 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 4.30 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >5kg4_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION FIRST WITH 1 MM MN2+ FOR 1800S THEN WITH 10 MM MG2+ FOR 60S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.15 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.41 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.94 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >5kg5_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION FIRST WITH 1 MM MN2+ FOR 1800S THEN WITH 10 MM CD2+ FOR 60S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.17 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.95 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5kg6_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION FIRST WITH 1 MM MN2+ FOR 1800S THEN WITH 10 MM CA2+ FOR 60S organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0382 <- 6.20 -> DA N6 T0008 : score 1.486 : x : SER xxxx A0322 <- 4.16 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 4.24 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5kg7_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION FIRST WITH 1 MM MN2+ FOR 1800S THEN WITH 10 MM ZN2+ FOR 60S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.16 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.85 -> DG xxx P0004 : score x.xxxxx >5kgf_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL MODEL OF 53BP1 BOUND TO A UBIQUITYLATED AND METHYLATED NUCLEOSOME, AT 4.5 A RESOLUTION organism=HOMO SAPIENS / XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.78 -> DT O2 J0009 : score 4.25027 : H : ARG NH1 C0011 <- 2.71 -> DT O2 I-043 : score 4.38393 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.05 -> DG N3 I0009 : score 3.42974 : H : ARG NH2 G0011 <- 2.69 -> DG N3 J-042 : score 3.68968 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.02 -> DG xxx J-069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 3.74 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.49 -> DC xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.47 -> DG xxx J0038 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.08 -> DT xxx J0069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0063 <- 3.60 -> DA xxx I0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.71 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0028 <- 3.75 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >5kgf_G:Histone-fold; title=STRUCTURAL MODEL OF 53BP1 BOUND TO A UBIQUITYLATED AND METHYLATED NUCLEOSOME, AT 4.5 A RESOLUTION organism=? : H : ARG NH2 G0011 <- 2.69 -> DG N3 J-042 : score 3.68968 >5kk1_ABCDEF:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF PNOB8 ASPA-DNA COMPLEX. organism=SULFOLOBUS SP. NOB8H2 : H : GLN OE1 A0042 <- 2.93 -> DA N6 P0017 : score 5.8952 : H : GLN NE2 A0042 <- 2.87 -> DT O4 P0016 : score 5.11835 : H : LYS NZ B0003 <- 2.94 -> DT O2 P0024 : score 3.48674 : H : GLN NE2 B0042 <- 2.88 -> DT O4 N0023 : score 5.10797 : H : GLN OE1 B0046 <- 3.26 -> DC N4 P0025 : score 4.16167 : H : GLN NE2 C0042 <- 3.22 -> DA N7 P0023 : score 5.57821 : H : LYS NZ F0003 <- 2.85 -> DT O2 P0014 : score 3.55131 : V : ILE CG2 D0045 <- 3.66 -> DT C7 N0016 : score 7.33948 : x : TYR xxxx C0041 <- 3.58 -> DA xxx P0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0043 <- 3.88 -> DT xxx N0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0046 <- 3.65 -> DT xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0003 <- 3.32 -> DG xxx P0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0041 <- 3.13 -> DA xxx N0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0042 <- 2.58 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0043 <- 3.79 -> DC xxx P0032 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0046 <- 2.78 -> DC xxx P0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0049 <- 3.99 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 2.81 -> DC xxx P0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0043 <- 3.95 -> DC xxx N0032 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0045 <- 3.35 -> DT xxx P0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0046 <- 3.81 -> DA xxx N0031 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0041 <- 2.72 -> DC xxx N0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0043 <- 3.74 -> DC xxx P0025 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0045 <- 3.37 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0049 <- 4.24 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.45 -> DT xxx N0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0042 <- 3.08 -> DA xxx N0031 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0046 <- 4.14 -> DT xxx P0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0041 <- 3.11 -> DA xxx P0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0042 <- 3.17 -> DA xxx N0041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0043 <- 3.81 -> DC xxx N0039 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0046 <- 3.68 -> DG xxx N0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0049 <- 3.74 -> DT xxx P0010 : score x.xxxxx >5kk1_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF PNOB8 ASPA-DNA COMPLEX. organism=SULFOLOBUS SP. NOB8H2 : V : GLN CG D0042 <- 3.84 -> DT C7 P0034 : score 3.22283 : V : ILE CG2 D0045 <- 3.66 -> DT C7 N0016 : score 7.33948 : x : LYS xxxx D0003 <- 3.32 -> DG xxx P0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0041 <- 3.13 -> DA xxx N0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0043 <- 3.79 -> DC xxx P0032 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0046 <- 2.78 -> DC xxx P0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0049 <- 3.99 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx >5kk5_A: title=ASCPF1(E993A)-CRRNA-DNA TERNARY COMPLEX organism=Acidaminococcus sp. (strain BV3L6) / Acidaminococcus sp. (strain BV3L6) : H : LYS NZ A0607 <- 2.62 -> DA N3 C0003 : score 2.87689 : x : THR xxxx A0167 <- 3.93 -> DT xxx D-003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0170 <- 4.24 -> DT xxx D-003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0548 <- 3.07 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0603 <- 3.01 -> DC xxx D-001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0604 <- 3.46 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx >5kkq_D:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=HOMO SAPIENS CCCTC-BINDING FACTOR (CTCF) ZNF3-7 AND DNA COMPLEX STRUCTURE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 D0339 <- 2.78 -> DG N7 F0014 : score 6.0742 : H : ARG NH2 D0339 <- 2.90 -> DG O6 F0014 : score 6.468 : w : ARG NH2 D0339 <- 5.71 -> DG O6 E0003 : score 2.468 : w : GLU OE1 D0362 <- 5.43 -> DG O6 E0003 : score 2.669 : H : LYS NZ D0365 <- 2.94 -> DG N7 F0012 : score 5.23509 : H : LYS NZ D0365 <- 2.81 -> DG O6 F0012 : score 5.76921 : H : ARG NH1 D0368 <- 2.87 -> DG O6 F0011 : score 5.99817 : H : ARG NH2 D0368 <- 2.87 -> DG N7 F0011 : score 6.29523 : H : LYS NZ D0393 <- 2.67 -> DG N7 F0009 : score 5.52593 : H : LYS NZ D0393 <- 2.76 -> DG O6 F0009 : score 5.82702 : H : ARG NH1 D0396 <- 2.87 -> DG O6 F0008 : score 5.99817 : H : ARG NH2 D0396 <- 2.95 -> DG N7 F0008 : score 6.19308 : w : ARG NH1 D0396 <- 6.44 -> DC N4 E0009 : score 1.892 : H : GLN OE1 D0418 <- 2.90 -> DA N6 F0007 : score 5.93151 : H : GLN NE2 D0418 <- 3.00 -> DA N7 F0007 : score 5.84615 : H : THR OG1 D0421 <- 3.02 -> DC N4 F0006 : score 3.85587 : H : ARG NH2 D0448 <- 3.04 -> DA N7 F0004 : score 1.59155 : w : ARG NH1 D0448 <- 6.19 -> DC N4 E0013 : score 1.892 : w : ARG NH1 D0448 <- 5.92 -> DG O6 F0005 : score 2.756 : w : SER OG D0450 <- 5.47 -> DT O4 E0014 : score 2.338 : w : SER OG D0450 <- 5.83 -> DC N4 E0013 : score 2.105 : H : ASP OD1 D0451 <- 3.08 -> DC N4 F0003 : score 5.04556 : w : ASP OD1 D0451 <- 5.41 -> DT O4 E0014 : score 2.616 : w : ASP OD1 D0451 <- 5.74 -> DC N4 F0002 : score 2.835 : V : VAL CG2 D0454 <- 3.69 -> DT C7 E0014 : score 6.29146 : x : THR xxxx D0333 <- 4.16 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0336 <- 3.50 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0343 <- 3.55 -> DG xxx F0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0364 <- 3.57 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0390 <- 4.39 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0392 <- 3.38 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx >5kl2_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=WILMS TUMOR PROTEIN (WT1) ZNF2-4 IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0366 <- 3.02 -> DG N7 B0010 : score 5.7838 : H : ARG NH2 A0366 <- 2.72 -> DG O6 B0010 : score 6.7056 : H : ARG NH1 A0372 <- 2.87 -> DG O6 B0008 : score 5.99817 : H : ARG NH2 A0372 <- 2.85 -> DG N7 B0008 : score 6.32077 : w : ARG NH1 A0372 <- 5.59 -> DT O4 C0004 : score 1.768 : H : ARG NH1 A0394 <- 2.97 -> DG N7 B0007 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0394 <- 2.79 -> DG O6 B0007 : score 6.6132 : H : ASP OD2 A0396 <- 2.89 -> DC N4 C0005 : score 6.0884 : w : ASP OD2 A0396 <- 5.89 -> DT O4 C0004 : score 2.798 : w : ASP OD2 A0396 <- 6.37 -> DC N4 C0006 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0397 <- 2.81 -> DG N7 B0006 : score 6.78896 : w : THR OG1 A0400 <- 5.94 -> DT O4 B0005 : score 2.809 : H : ARG NH1 A0424 <- 2.89 -> DG N7 B0004 : score 5.9411 : H : ARG NH2 A0424 <- 2.73 -> DG O6 B0004 : score 6.6924 : w : ASP OD1 A0426 <- 5.60 -> DC N4 C0007 : score 2.835 : H : ARG NH1 A0430 <- 2.95 -> DG O6 B0002 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0430 <- 2.86 -> DG N7 B0002 : score 6.308 : w : ARG NH1 A0430 <- 5.90 -> DG O6 C0010 : score 2.756 : x : ASP xxxx A0368 <- 3.43 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0369 <- 3.13 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0395 <- 3.70 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0425 <- 3.67 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0427 <- 3.50 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >5kl3_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=WILMS TUMOR PROTEIN (WT1) ZNF2-4 Q369H IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0366 <- 2.87 -> DG N7 B0010 : score 5.9653 : H : ARG NH2 A0366 <- 2.85 -> DG O6 B0010 : score 6.534 : H : HIS NE2 A0369 <- 2.81 -> DA N7 B0009 : score 4.23766 : H : ARG NH1 A0372 <- 2.93 -> DG O6 B0008 : score 5.92517 : H : ARG NH2 A0372 <- 2.86 -> DG N7 B0008 : score 6.308 : w : ARG NH1 A0372 <- 5.96 -> DT O4 C0004 : score 1.768 : H : ARG NH1 A0394 <- 2.85 -> DG N7 B0007 : score 5.9895 : H : ARG NH2 A0394 <- 2.81 -> DG O6 B0007 : score 6.5868 : H : ASP OD2 A0396 <- 2.98 -> DC N4 C0005 : score 5.9768 : w : ASP OD1 A0396 <- 6.09 -> DT O4 C0004 : score 2.616 : w : ASP OD2 A0396 <- 5.77 -> DC N4 C0006 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0397 <- 2.75 -> DG N7 B0006 : score 6.87059 : H : ARG NH1 A0424 <- 2.96 -> DG N7 B0004 : score 5.8564 : H : ARG NH2 A0424 <- 2.92 -> DG O6 B0004 : score 6.4416 : w : ASP OD1 A0426 <- 5.75 -> DC N4 C0007 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0426 <- 5.89 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : w : ASP OD2 A0426 <- 6.19 -> DA N7 C0008 : score 2.024 : H : ARG NH1 A0430 <- 3.00 -> DG O6 B0002 : score 5.84 : H : ARG NH2 A0430 <- 2.79 -> DG N7 B0002 : score 6.39738 : w : ARG NH1 A0430 <- 5.61 -> DG O6 C0010 : score 2.756 >5kl4_D:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=WILMS TUMOR PROTEIN (WT1) ZNF2-4 Q369H IN COMPLEX WITH FORMYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 D0366 <- 2.89 -> DT O4 E0011 : score 3.20913 : H : ARG NH2 D0366 <- 2.70 -> DG O6 E0010 : score 6.732 : w : ASP OD2 D0368 <- 5.45 -> DA N7 F0002 : score 2.024 : w : HIS ND1 D0369 <- 5.70 -> DG O6 F0004 : score 4.006 : H : ARG NH1 D0372 <- 2.92 -> DG O6 E0008 : score 5.93733 : H : ARG NH2 D0372 <- 3.02 -> DG N7 E0008 : score 6.10369 : w : ARG NH1 D0372 <- 6.18 -> DG O6 F0004 : score 2.756 : H : ARG NH1 D0394 <- 2.88 -> DG N7 E0007 : score 5.9532 : H : ARG NH2 D0394 <- 2.75 -> DG O6 E0007 : score 6.666 : H : ASP OD2 D0396 <- 2.95 -> DC N4 F0005 : score 6.014 : w : ASP OD2 D0396 <- 6.66 -> DG O6 F0004 : score 3.228 : w : ASP OD2 D0396 <- 6.22 -> DC N4 F0006 : score 3.623 : H : HIS NE2 D0397 <- 2.81 -> DG N7 E0006 : score 6.78896 : H : ARG NH1 D0424 <- 3.00 -> DG N7 E0004 : score 5.808 : H : ARG NH2 D0424 <- 2.87 -> DG O6 E0004 : score 6.5076 : H : ASP OD2 D0426 <- 3.36 -> DA N6 F0008 : score 3.55428 : w : ASP OD2 D0426 <- 6.07 -> DC N4 E0003 : score 3.623 : H : ARG NH1 D0430 <- 2.91 -> DG O6 E0002 : score 5.9495 : H : ARG NH2 D0430 <- 2.77 -> DG N7 E0002 : score 6.42292 : w : ARG NH1 D0430 <- 5.79 -> DG O6 F0010 : score 2.756 : x : THR xxxx D0400 <- 4.14 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0427 <- 4.15 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx >5kl5_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=WILMS TUMOR PROTEIN (WT1) ZNF2-4 Q369H IN COMPLEX WITH CARBOXYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0366 <- 2.80 -> DT O4 B0011 : score 3.26795 : H : ARG NH2 A0366 <- 2.65 -> DG O6 B0010 : score 6.798 : H : ARG NH1 A0372 <- 3.05 -> DG O6 B0008 : score 5.77917 : H : ARG NH2 A0372 <- 2.98 -> DG N7 B0008 : score 6.15477 : w : ARG NH1 A0372 <- 5.51 -> DG O6 C0004 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0394 <- 2.93 -> DG N7 B0007 : score 5.8927 : H : ARG NH2 A0394 <- 2.84 -> DG O6 B0007 : score 6.5472 : H : ASP OD2 A0396 <- 2.98 -> DC N4 C0005 : score 5.9768 : w : ASP OD2 A0396 <- 6.34 -> DG O6 C0004 : score 3.228 : H : HIS NE2 A0397 <- 2.84 -> DG N7 B0006 : score 6.74814 : H : ARG NH1 A0424 <- 2.91 -> DG N7 B0004 : score 5.9169 : H : ARG NH2 A0424 <- 2.82 -> DG O6 B0004 : score 6.5736 : w : ASP OD2 A0426 <- 5.82 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0430 <- 2.91 -> DG O6 B0002 : score 5.9495 : H : ARG NH2 A0430 <- 2.88 -> DG N7 B0002 : score 6.28246 : x : ASP xxxx A0368 <- 4.28 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0369 <- 3.69 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0400 <- 4.36 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0427 <- 3.71 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx >5kl6_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=WILMS TUMOR PROTEIN (WT1) Q369R ZNF2-4 IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0366 <- 2.78 -> DG N7 B0010 : score 6.0742 : H : ARG NH2 A0366 <- 2.89 -> DG O6 B0010 : score 6.4812 : H : ARG NH1 A0369 <- 2.50 -> DG N7 B0009 : score 6.413 : H : ARG NH2 A0369 <- 2.85 -> DG O6 B0009 : score 6.534 : H : ARG NH1 A0372 <- 2.94 -> DG O6 B0008 : score 5.913 : H : ARG NH2 A0372 <- 2.91 -> DG N7 B0008 : score 6.24415 : H : ARG NH1 A0394 <- 2.90 -> DG N7 B0007 : score 5.929 : H : ARG NH2 A0394 <- 2.90 -> DG O6 B0007 : score 6.468 : H : ASP OD2 A0396 <- 2.99 -> DC N4 C0005 : score 5.9644 : w : ASP OD2 A0396 <- 5.68 -> DC N4 C0006 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0397 <- 2.80 -> DG N7 B0006 : score 6.80256 : H : ARG NH1 A0424 <- 2.90 -> DG N7 B0004 : score 5.929 : H : ARG NH2 A0424 <- 2.89 -> DG O6 B0004 : score 6.4812 : w : ASP OD1 A0426 <- 5.90 -> DC N4 C0007 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0426 <- 5.93 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : w : ASP OD2 A0426 <- 5.93 -> DC N4 C0009 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0430 <- 3.01 -> DG O6 B0002 : score 5.82783 : H : ARG NH2 A0430 <- 2.74 -> DG N7 B0002 : score 6.46123 : x : ASP xxxx A0368 <- 3.92 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0400 <- 4.26 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0427 <- 3.98 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >5kl7_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=WILMS TUMOR PROTEIN (WT1) ZNF2-4Q369R IN COMPLEX WITH CARBOXYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0366 <- 2.86 -> DT O4 B0011 : score 3.22873 : H : ARG NH2 A0366 <- 2.93 -> DG O6 B0010 : score 6.4284 : w : ASP OD2 A0368 <- 5.35 -> DA N7 C0002 : score 2.024 : H : ARG NH1 A0369 <- 3.06 -> DG N7 B0010 : score 5.7354 : H : ARG NH1 A0372 <- 2.91 -> DG O6 B0008 : score 5.9495 : H : ARG NH2 A0372 <- 2.93 -> DG N7 B0008 : score 6.21862 : w : ARG NH1 A0372 <- 5.81 -> DG O6 C0004 : score 2.756 : H : ARG NH1 A0394 <- 2.89 -> DG N7 B0007 : score 5.9411 : H : ARG NH2 A0394 <- 2.84 -> DG O6 B0007 : score 6.5472 : w : SER OG A0395 <- 6.02 -> DG N7 C0004 : score 2.749 : H : ASP OD2 A0396 <- 2.84 -> DC N4 C0005 : score 6.1504 A : H : HIS NE2 A0397 <- 2.88 -> DG N7 B0006 : score 6.69372 : H : ARG NH1 A0424 <- 2.96 -> DG N7 B0004 : score 5.8564 : H : ARG NH2 A0424 <- 2.85 -> DG O6 B0004 : score 6.534 : H : ASP OD2 A0426 <- 3.17 -> DA N6 C0008 : score 3.70637 : w : ASP OD1 A0426 <- 5.80 -> DC N4 C0007 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0426 <- 6.09 -> DC N4 B0003 : score 3.623 : w : ASP OD2 A0426 <- 5.92 -> DC N4 C0009 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0430 <- 2.95 -> DG O6 B0002 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0430 <- 2.75 -> DG N7 B0002 : score 6.44846 : w : ARG NH1 A0430 <- 5.66 -> DG O6 C0010 : score 2.756 : x : THR xxxx A0400 <- 4.29 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0427 <- 4.00 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >5kn8_A:DNA-glycosylase; title=MUTY N-TERMINAL DOMAIN IN COMPLEX WITH UNDAMAGED DNA organism=Geobacillus stearothermophilus : H : TYR OH A0088 <- 3.14 -> DG N2 C0008 : score 4.55724 : H : TYR OH A0088 <- 3.28 -> DG N3 C0008 : score 2.81515 : w : ARG NH1 A0091 <- 5.97 -> DA N3 D0018 : score 2.585 A : w : ARG NH2 A0091 <- 5.34 -> DA N3 D0018 : score 2.092 A : w : ARG NH2 A0091 <- 6.05 -> DT O2 C0007 : score 2.261 A : H : ARG NH1 A0167 <- 3.00 -> DG O6 D0020 : score 5.84 : H : ARG NH2 A0167 <- 3.04 -> DG N7 D0019 : score 6.07815 : x : ALA xxxx A0162 <- 3.83 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >5kn9_A:DNA-glycosylase; title=MUTY N-TERMINAL DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING AN INTRAHELICAL OXOG:A BASE-PAIR organism= Geobacillus stearothermophilus : H : TYR OH A0088 <- 3.04 -> DG N2 C0008 : score 4.65504 : H : TYR OH A0088 <- 3.24 -> DG N3 C0008 : score 2.84006 : H : ARG NH1 A0167 <- 2.90 -> DG O6 D0020 : score 5.96167 : H : ARG NH2 A0167 <- 2.97 -> DG N7 D0019 : score 6.16754 : x : ALA xxxx A0162 <- 3.90 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >5krb_BG:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GCNF DNA BINDING DOMAIN - OCT4 DR0 COMPLEX organism=Mus musculus : H : GLU OE1 B0093 <- 3.03 -> DC N4 E0100 : score 5.50262 : H : LYS NZ B0096 <- 2.54 -> DG O6 A0108 : score 6.08137 : H : ARG NH1 B0101 <- 3.04 -> DG N7 E0098 : score 5.7596 : H : GLU OE1 G0093 <- 2.81 -> DC N4 E0094 : score 5.75641 : H : LYS NZ G0096 <- 2.70 -> DG O6 A0114 : score 5.89638 : H : ARG NH1 G0101 <- 2.85 -> DA N7 E0092 : score 2.53465 : H : ARG NH2 G0154 <- 3.03 -> DT O2 A0110 : score 4.0386 : H : ARG NH2 G0154 <- 2.98 -> DC O2 A0111 : score 3.56556 : x : PRO xxxx G0151 <- 3.98 -> DA xxx A0113 : score x.xxxxx >5krb_G:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GCNF DNA BINDING DOMAIN - OCT4 DR0 COMPLEX organism=Mus musculus : H : GLU OE1 G0093 <- 2.81 -> DC N4 E0094 : score 5.75641 : H : LYS NZ G0096 <- 2.70 -> DG O6 A0114 : score 5.89638 : H : ARG NH1 G0101 <- 2.85 -> DA N7 E0092 : score 2.53465 : H : ARG NH2 G0154 <- 3.03 -> DT O2 A0110 : score 4.0386 : H : ARG NH2 G0154 <- 2.98 -> DC O2 A0111 : score 3.56556 : x : PRO xxxx G0151 <- 3.98 -> DA xxx A0113 : score x.xxxxx >5kse_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=FLAP ENDONUCLEASE 1 (FEN1) R100A WITH 5'-FLAP SUBSTRATE DNA AND SM3+ organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx A0040 <- 2.89 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0041 <- 3.84 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0044 <- 3.51 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0128 <- 3.72 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0245 <- 3.56 -> DG xxx E0015 : score x.xxxxx >5kt2_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERANRY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA(26-445) INSERTING DCMPNPP OPPOSITE TEMPLATE G IN THE PRESENCE OF MG2+ organism=Homo sapiens : w : TYR OH A0064 <- 5.57 -> DG N3 T0841 : score 3.344 : w : GLN NE2 A0084 <- 6.06 -> DG N3 T0841 : score 1.484 : x : GLU xxxx A0330 <- 3.50 -> DG xxx T0842 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0368 <- 4.33 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0386 <- 3.94 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >5kt3_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERANRY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA(26-445) INSERTING DCMPNPP OPPOSITE TEMPLATE G IN THE PRESENCE OF MN2+ organism=Homo sapiens : w : TYR OH A0064 <- 5.37 -> DG N3 T0841 : score 3.344 : x : GLU xxxx A0330 <- 3.62 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0368 <- 4.31 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0386 <- 3.95 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >5kt4_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERANRY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA R96G INSERTING DCMPNPP OPPOSITE TEMPLATE G IN THE PRESENCE OF MG2+ organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx A0064 <- 4.42 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0330 <- 3.37 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0368 <- 4.15 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0386 <- 3.97 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >5kt5_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERANRY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA R96G INSERTING DCMPNPP OPPOSITE TEMPLATE G IN THE PRESENCE OF MN2+ organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx A0064 <- 4.22 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0330 <- 3.52 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0368 <- 4.22 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0386 <- 3.47 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >5kt6_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERANRY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA(1-445) INSERTING DCMPNPP OPPOSITE TEMPLATE G IN THE PRESENCE OF MG2+ organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx A0064 <- 4.17 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0330 <- 3.57 -> DG xxx T0842 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0368 <- 4.22 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0386 <- 3.76 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >5kt7_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERANRY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA(1-445) INSERTING DCMPNPP OPPOSITE TEMPLATE G IN THE PRESENCE OF MN2+ organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx A0039 <- 4.22 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0305 <- 3.69 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 3.58 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >5kub_A:ARM_repeat; title=BACILLUS CEREUS DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO 7-METHYLGUANINE NUCLEOBASE AND DNA CONTAINING AN OXOCARBENIUM-INTERMEDIATE ANALOG organism=Bacillus cereus : H : TYR OH A0027 <- 2.79 -> DA N3 B0007 : score 4.15958 : w : LYS NZ A0183 <- 5.76 -> DA N7 B0007 : score 1.655 : x : ARG xxxx A0215 <- 4.26 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >5l0m_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=HLRH-1 DNA BINDING DOMAIN - 12BP OCT4 PROMOTER COMPLEX organism=Homo sapiens : H : GLU OE2 A0104 <- 2.82 -> DC N4 C0093 : score 5.24432 : H : LYS NZ A0107 <- 2.79 -> DG O6 B0113 : score 5.79233 : w : LYS NZ A0107 <- 6.03 -> DA N6 B0112 : score 2.097 : H : LYS NZ A0111 <- 3.02 -> DG N7 B0114 : score 5.14892 : w : LYS NZ A0111 <- 5.95 -> DC N4 B0115 : score 0.048 : H : ARG NH1 A0112 <- 2.98 -> DA N7 C0091 : score 2.46809 : H : ARG NE A0162 <- 3.14 -> DT O2 C0095 : score 2.40169 : H : ARG NH2 A0165 <- 2.87 -> DC O2 B0110 : score 3.64694 >5l1i_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING DCTP OPPOSITE O6-METHYL-2'-DEOXYGUANOSINE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0111 <- 2.85 -> DC O2 P0009 : score 3.6135 : H : ARG NH2 A0111 <- 3.11 -> DC O2 P0009 : score 3.4694 : V : SER CB A0062 <- 3.74 -> DT C7 T0003 : score 3.17825 : x : ILE xxxx A0048 <- 4.02 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.18 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0113 <- 4.30 -> DC xxx P0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0114 <- 4.21 -> DC xxx P0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 4.35 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.77 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.37 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >5l1j_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING DTMPNPP OPPOSITE O6-METHYL-2'-DEOXYGUANOSINE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 2.85 -> DG N7 P0004 : score 5.9895 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.05 -> DG O6 P0004 : score 6.27 : V : LEU CD2 A0378 <- 3.52 -> DT C7 P0005 : score 6.13247 : x : ARG xxxx A0061 <- 4.11 -> DT xxx P0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.94 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 3.85 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5l1k_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=POSTINSERTION COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA BYPASSING AN O6- METHYL-2'-DEOXYGUANOSINE : DC SITE organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 3.01 -> DG N3 T0004 : score 4.76666 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.45 -> DG N2 T0004 : score 2.177 : x : ILE xxxx A0048 <- 3.54 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 4.31 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 4.37 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 4.49 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >5l1l_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=POSTINSERTION COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA BYPASSING AN O6- METHYL-2'-DEOXYGUANOSINE : DT SITE organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 3.22 -> DG N3 T0004 : score 4.55769 : H : ARG NH1 A0382 <- 2.85 -> DG N7 P0004 : score 5.9895 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.23 -> DG O6 P0004 : score 6.0324 : x : ILE xxxx A0048 <- 3.56 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 4.10 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.41 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5l6l_ADEH:AbrB/MazE/MraZ-like; title=STRUCTURE OF CAULOBACTER CRESCENTUS VAPBC1 BOUND TO OPERATOR DNA organism=CAULOBACTER CRESCENTUS : H : ASN ND2 A0013 <- 3.32 -> DG O6 N0006 : score 5.05206 : H : ASN ND2 D0013 <- 2.61 -> DG O6 M0015 : score 5.85272 : H : ASN OD1 H0013 <- 3.12 -> DA N6 N0016 : score 5.6364 : V : PHE CD2 E0009 <- 3.76 -> DT C7 N0019 : score 6.57691 : V : PHE CD2 A0009 <- 3.77 -> DT C7 M0018 : score 6.56063 : x : SER xxxx A0011 <- 4.47 -> DA xxx N0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0014 <- 3.59 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0018 <- 3.70 -> DA xxx M0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0009 <- 4.41 -> DT xxx N0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0011 <- 4.11 -> DT xxx M0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0014 <- 3.15 -> DT xxx M0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0018 <- 3.78 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0011 <- 3.28 -> DA xxx M0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0013 <- 2.98 -> DA xxx N0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0014 <- 3.44 -> DG xxx M0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0018 <- 3.62 -> DA xxx N0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0011 <- 4.22 -> DT xxx N0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0014 <- 3.37 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0018 <- 3.66 -> DT xxx M0006 : score x.xxxxx >5l6l_D:AbrB/MazE/MraZ-like; title=STRUCTURE OF CAULOBACTER CRESCENTUS VAPBC1 BOUND TO OPERATOR DNA organism=CAULOBACTER CRESCENTUS : H : ASN ND2 D0013 <- 2.61 -> DG O6 M0015 : score 5.85272 : x : PHE xxxx D0009 <- 4.41 -> DT xxx N0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0011 <- 4.11 -> DT xxx M0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0014 <- 3.15 -> DT xxx M0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0018 <- 3.78 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx >5l9x_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA TERNARY COMPLEX: REACTION WITH 10 MM MN2+ FOR 60S organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0382 <- 5.87 -> DG N7 P0002 : score 2.063 : x : SER xxxx A0322 <- 4.21 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >5lcl_AB:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE RAD14 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH C8- AMINOFLUORENE- GUANINE CONTAINING DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C : H : ASN ND2 A0256 <- 2.95 -> DC O2 C0002 : score 4.3451 : x : THR xxxx A0230 <- 3.73 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0233 <- 3.87 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0240 <- 2.95 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0258 <- 3.09 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0262 <- 3.36 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0230 <- 3.95 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0233 <- 3.98 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0240 <- 3.00 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0262 <- 3.42 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0294 <- 4.07 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >5lcl_B:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE RAD14 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH C8- AMINOFLUORENE- GUANINE CONTAINING DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C : x : THR xxxx B0230 <- 3.95 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0233 <- 3.98 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0240 <- 3.00 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0262 <- 3.42 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0294 <- 4.07 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >5lcm_AB:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE RAD14 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH N2- ACETYLAMINONAPHTYL- GUANINE CONTAINING DNA organism=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) : H : ASN ND2 A0256 <- 2.85 -> DC O2 C0002 : score 4.43469 : H : ASN ND2 B0256 <- 2.85 -> DT O2 D0002 : score 4.69869 : x : THR xxxx A0230 <- 4.00 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0231 <- 3.93 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0234 <- 2.85 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0240 <- 3.39 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0258 <- 3.23 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0262 <- 3.25 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0230 <- 3.79 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0240 <- 3.35 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0258 <- 3.48 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0262 <- 3.27 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx >5lcm_B:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE RAD14 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH N2- ACETYLAMINONAPHTYL- GUANINE CONTAINING DNA organism=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) : x : THR xxxx B0230 <- 3.79 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0240 <- 3.35 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0262 <- 3.27 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx >5ld2_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RECBCD+DNA COMPLEX REVEALING ACTIVATED NUCLEASE DOMAIN organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NE B0423 <- 3.00 -> DT O2 X0070 : score 2.47385 : H : ARG NE B0559 <- 2.71 -> DT O2 X0068 : score 2.62331 : V : PHE CD1 B0422 <- 3.84 -> DT C7 X0069 : score 4.10926 : x : SER xxxx B0249 <- 3.93 -> DA xxx X0025 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0252 <- 4.23 -> DC xxx X0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0254 <- 4.37 -> DT xxx X0058 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0560 <- 4.36 -> DT xxx X0068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0584 <- 3.44 -> DT xxx X0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0761 <- 3.36 -> DT xxx X0068 : score x.xxxxx >5ld2_BCD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RECBCD+DNA COMPLEX REVEALING ACTIVATED NUCLEASE DOMAIN organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NE B0423 <- 3.00 -> DT O2 X0070 : score 2.47385 : H : ARG NE B0559 <- 2.71 -> DT O2 X0068 : score 2.62331 : V : PHE CD1 B0422 <- 3.84 -> DT C7 X0069 : score 4.10926 : x : SER xxxx B0249 <- 3.93 -> DA xxx X0025 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0252 <- 4.23 -> DC xxx X0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0254 <- 4.37 -> DT xxx X0058 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0560 <- 4.36 -> DT xxx X0068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0584 <- 3.44 -> DT xxx X0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0761 <- 3.36 -> DT xxx X0068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0556 <- 4.43 -> DT xxx X0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0875 <- 3.39 -> DT xxx X0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0878 <- 3.83 -> DT xxx X0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C1078 <- 2.92 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1079 <- 3.32 -> DA xxx X0067 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1080 <- 3.32 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C1081 <- 4.22 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0014 <- 3.89 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0241 <- 3.85 -> DT xxx X0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0246 <- 4.27 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0247 <- 3.37 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0248 <- 3.35 -> DT xxx X0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0304 <- 3.95 -> DT xxx X0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0486 <- 4.42 -> DT xxx X0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0539 <- 3.66 -> DT xxx X0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0559 <- 3.79 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0560 <- 3.71 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx >5lej_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PRFA FROM LISTERIA MONOCYTOGENES IN COMPLEX WITH A 30-BP OPERATOR PRFA-BOX MOTIF organism=Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) / Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) : H : SER OG A0184 <- 2.85 -> DT O4 D0005 : score 3.51958 : H : ARG NH1 A0188 <- 3.16 -> DG O6 D0003 : score 5.64533 : H : ARG NH2 A0188 <- 3.17 -> DG N7 D0003 : score 5.91215 : x : HIS xxxx A0182 <- 4.04 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0185 <- 3.92 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0187 <- 3.79 -> DT xxx C-006 : score x.xxxxx >5lej_AB:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PRFA FROM LISTERIA MONOCYTOGENES IN COMPLEX WITH A 30-BP OPERATOR PRFA-BOX MOTIF organism=Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) / Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) / Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) / Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) : H : SER OG A0184 <- 2.85 -> DT O4 D0005 : score 3.51958 : H : ARG NH1 A0188 <- 3.16 -> DG O6 D0003 : score 5.64533 : H : ARG NH2 A0188 <- 3.17 -> DG N7 D0003 : score 5.91215 : H : SER OG B0184 <- 2.66 -> DT O4 C0005 : score 3.65467 : H : ARG NH2 B0188 <- 2.91 -> DG O6 C0003 : score 6.4548 : V : ALA CB B0185 <- 3.90 -> DT C7 C0004 : score 5.459 : x : HIS xxxx A0182 <- 4.04 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0185 <- 3.92 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0187 <- 3.79 -> DT xxx C-006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0182 <- 3.85 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0187 <- 4.07 -> DT xxx D-006 : score x.xxxxx >5lek_AB:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PRFA-G145S MUTANT FROM LISTERIA MONOCYTOGENES IN COMPLEX WITH A 30-BP OPERATOR PRFA-BOX MOTIF organism=Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) / Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) / Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) / Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) : H : SER OG A0184 <- 2.85 -> DT O4 D0005 : score 3.51958 : H : ARG NH1 A0188 <- 3.13 -> DG O6 D0003 : score 5.68183 : H : ARG NH2 A0188 <- 3.11 -> DG N7 D0003 : score 5.98877 : H : SER OG B0184 <- 2.73 -> DT O4 C0005 : score 3.6049 : H : ARG NH2 B0188 <- 3.22 -> DG N7 C0003 : score 5.84831 : H : ARG NH2 B0188 <- 2.88 -> DG O6 C0003 : score 6.4944 : V : ALA CB B0185 <- 3.85 -> DT C7 C0004 : score 5.52899 : V : ALA CB A0185 <- 3.89 -> DT C7 D0004 : score 5.473 : x : HIS xxxx A0182 <- 4.06 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0187 <- 3.75 -> DT xxx C-006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0182 <- 3.78 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0187 <- 4.10 -> DT xxx D-006 : score x.xxxxx >5lek_B:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PRFA-G145S MUTANT FROM LISTERIA MONOCYTOGENES IN COMPLEX WITH A 30-BP OPERATOR PRFA-BOX MOTIF organism=Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) / Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) : H : SER OG B0184 <- 2.73 -> DT O4 C0005 : score 3.6049 : H : ARG NH2 B0188 <- 3.22 -> DG N7 C0003 : score 5.84831 : H : ARG NH2 B0188 <- 2.88 -> DG O6 C0003 : score 6.4944 : V : ALA CB B0185 <- 3.85 -> DT C7 C0004 : score 5.52899 : x : HIS xxxx B0182 <- 3.78 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0187 <- 4.10 -> DT xxx D-006 : score x.xxxxx >5lgy_A:p53-like_transcription_factors; title=LYSINE 120-ACETYLATED P53 DNA BINDING DOMAIN IN A COMPLEX WITH THE BAX RESPONSE ELEMENT. organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0280 <- 3.27 -> DG O6 E0018 : score 5.5115 : H : ARG NH2 A0280 <- 3.24 -> DG N7 E0018 : score 5.82277 : x : ALA xxxx A0276 <- 4.33 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0277 <- 3.76 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx >5lgy_ABCD: title=LYSINE 120-ACETYLATED P53 DNA BINDING DOMAIN IN A COMPLEX WITH THE BAX RESPONSE ELEMENT. organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0280 <- 3.27 -> DG O6 E0018 : score 5.5115 : H : ARG NH2 A0280 <- 3.24 -> DG N7 E0018 : score 5.82277 : H : ARG NH1 B0280 <- 3.25 -> DG O6 F0007 : score 5.53583 : H : ARG NH2 B0280 <- 3.15 -> DG N7 F0007 : score 5.93769 : H : ARG NH1 C0280 <- 2.98 -> DG O6 E0007 : score 5.86433 : H : ARG NH2 C0280 <- 3.19 -> DG N7 E0007 : score 5.88662 : H : ARG NH2 D0280 <- 3.02 -> DG N7 F0018 : score 6.10369 : x : ALA xxxx A0276 <- 4.33 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0277 <- 3.76 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 4.00 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0277 <- 4.25 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0276 <- 3.80 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0277 <- 3.81 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0281 <- 4.41 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0276 <- 3.64 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0277 <- 3.68 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx >5lrs_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PRFA FROM LISTERIA MONOCYTOGENES IN COMPLEX WITH GLUTATHIONE AND A 30-BP OPERATOR PRFA-BOX MOTIF organism=Listeria monocytogenes : H : SER OG A0184 <- 2.83 -> DT O4 D0005 : score 3.5338 : H : ARG NH1 A0188 <- 3.21 -> DG O6 D0003 : score 5.5845 : H : ARG NH2 A0188 <- 3.10 -> DG N7 D0003 : score 6.00154 : x : HIS xxxx A0182 <- 3.60 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0185 <- 4.09 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0187 <- 3.52 -> DT xxx C-006 : score x.xxxxx >5lrs_AB:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PRFA FROM LISTERIA MONOCYTOGENES IN COMPLEX WITH GLUTATHIONE AND A 30-BP OPERATOR PRFA-BOX MOTIF organism=Listeria monocytogenes : H : SER OG A0184 <- 2.83 -> DT O4 D0005 : score 3.5338 : H : ARG NH1 A0188 <- 3.21 -> DG O6 D0003 : score 5.5845 : H : ARG NH2 A0188 <- 3.10 -> DG N7 D0003 : score 6.00154 : H : SER OG B0184 <- 3.06 -> DT O4 C0005 : score 3.37026 : H : ARG NH1 B0188 <- 3.14 -> DG O6 C0003 : score 5.66967 : H : ARG NH2 B0188 <- 2.89 -> DG N7 C0003 : score 6.26969 : x : HIS xxxx A0182 <- 3.60 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0185 <- 4.09 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0187 <- 3.52 -> DT xxx C-006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0182 <- 3.78 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0185 <- 3.96 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0187 <- 3.78 -> DT xxx D-007 : score x.xxxxx >5lty_K:Homeodomain-like; title=HOMEOBOX TRANSCRIPTION FACTOR CDX2 BOUND TO METHYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : TYR OH K0189 <- 2.94 -> DA N3 F0028 : score 4.03505 : H : ARG NE K0190 <- 3.16 -> DA N3 F0030 : score 1.95118 : H : ASN ND2 K0236 <- 3.26 -> DA N7 A0010 : score 5.33043 : x : ILE xxxx K0232 <- 3.78 -> DA xxx A0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx K0235 <- 3.14 -> DT xxx F0024 : score x.xxxxx >5lux_K:Homeodomain-like; title=HOMEOBOX TRANSCRIPTION FACTOR CDX1 BOUND TO METHYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : TYR OH K0157 <- 2.95 -> DA N3 F0028 : score 4.02674 : H : ASN OD1 K0204 <- 2.93 -> DA N6 A0010 : score 5.86523 : H : ASN ND2 K0204 <- 2.74 -> DA N7 A0010 : score 5.94096 : x : ARG xxxx K0158 <- 3.38 -> DT xxx A0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx K0200 <- 3.76 -> DA xxx A0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx K0203 <- 3.38 -> DT xxx F0024 : score x.xxxxx >5lxu_A:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF THE DNA-BINDING DOMAIN OF LUX ARRHYTHMO organism=Arabidopsis thaliana : w : ARG NE A0146 <- 5.97 -> DG N3 B0022 : score 1.082 : w : ARG NH1 A0185 <- 5.81 -> DG N7 U0005 : score 2.063 : w : ARG NH2 A0185 <- 5.47 -> DG O6 U0005 : score 2.468 : H : SER OG A0190 <- 2.75 -> DA N7 B0023 : score 4.50874 A : H : GLN OE1 A0193 <- 2.94 -> DA N6 U0007 : score 5.88309 : H : GLN NE2 A0193 <- 2.93 -> DA N7 U0007 : score 5.93141 : H : LYS NZ A0194 <- 2.82 -> DG O6 B0022 : score 5.75765 : x : GLU xxxx A0186 <- 4.38 -> DT xxx B0024 : score x.xxxxx >5m0r_AI:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=CRYO-EM RECONSTRUCTION OF THE MAEDI-VISNA VIRUS (MVV) STRAND TRANSFER COMPLEX organism=MAEDI VISNA VIRUS (STRAIN KV1772) / MAEDI VISNA VIRUS (STRAIN KV1772) / MAEDI VISNA VIRUS (STRAIN KV1772) / MAEDI VISNA VIRUS (STRAIN KV1772) : x : HIS xxxx A0069 <- 3.97 -> DG xxx T0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0094 <- 3.84 -> DG xxx U0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0121 <- 2.87 -> DT xxx U0019 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx I0069 <- 3.44 -> DG xxx V0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0094 <- 3.87 -> DA xxx T0027 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0121 <- 1.73 -> DC xxx T0028 : score x.xxxxx >5m0r_FL:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=CRYO-EM RECONSTRUCTION OF THE MAEDI-VISNA VIRUS (MVV) STRAND TRANSFER COMPLEX organism=MAEDI VISNA VIRUS (STRAIN KV1772) / MAEDI VISNA VIRUS (STRAIN KV1772) / MAEDI VISNA VIRUS (STRAIN KV1772) / MAEDI VISNA VIRUS (STRAIN KV1772) : x : ARG xxxx F0231 <- 4.09 -> DG xxx T0020 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0245 <- 3.60 -> DC xxx S0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0252 <- 4.46 -> DG xxx S0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0231 <- 3.50 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx >5m1s_AD:DNA_clamp; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE E. COLI REPLICATIVE DNA POLYMERASE-CLAMP- EXONUCLASE-THETA COMPLEX BOUND TO DNA IN THE EDITING MODE organism=ESCHERICHIA COLI K12 : x : TYR xxxx A0453 <- 3.79 -> DA xxx P0018 : score x.xxxxx >5m5x_AB: title=RNA POLYMERASE I ELONGATION COMPLEX 1 organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : HIS NE2 A0378 <- 2.33 -> DT O2 T0025 : score 5.73228 : x : ARG xxxx A0481 <- 4.46 -> DC xxx T0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0592 <- 3.89 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0593 <- 3.75 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1013 <- 3.28 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1014 <- 3.17 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1600 <- 4.08 -> DG xxx S0028 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1601 <- 4.34 -> DT xxx S0029 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0451 <- 4.37 -> DT xxx S0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0479 <- 4.25 -> DG xxx S0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0508 <- 3.35 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0511 <- 4.33 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0513 <- 3.22 -> DA xxx T0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B1061 <- 4.13 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx >5m5x_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE I ELONGATION COMPLEX 1 organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : MET xxxx B0451 <- 4.37 -> DT xxx S0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0479 <- 4.25 -> DG xxx S0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0508 <- 3.35 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0511 <- 4.33 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0513 <- 3.22 -> DA xxx T0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B1061 <- 4.13 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx >5mct_A:p53-like_transcription_factors; title=NEW INSIGHTS INTO THE ROLE OF DNA SHAPE ON ITS RECOGNITION BY P53 PROTEINS (COMPLEX P53DBD-LHG1) organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0280 <- 2.90 -> DG O6 C0007 : score 5.96167 : H : ARG NH2 A0280 <- 3.03 -> DG N7 C0007 : score 6.09092 : x : LYS xxxx A0120 <- 4.24 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 3.91 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0277 <- 3.50 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx >5mct_AB: title=NEW INSIGHTS INTO THE ROLE OF DNA SHAPE ON ITS RECOGNITION BY P53 PROTEINS (COMPLEX P53DBD-LHG1) organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0280 <- 2.90 -> DG O6 C0007 : score 5.96167 : H : ARG NH2 A0280 <- 3.03 -> DG N7 C0007 : score 6.09092 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.88 -> DG O6 C0017 : score 5.986 : H : ARG NH2 B0280 <- 3.01 -> DG N7 C0017 : score 6.11646 : x : LYS xxxx A0120 <- 4.24 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 3.91 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0277 <- 3.50 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0120 <- 4.23 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 3.88 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0277 <- 3.53 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx >5mcu_AB: title=NEW INSIGHTS INTO THE ROLE OF DNA SHAPE ON ITS RECOGNITION BY P53 PROTEINS (COMPLEX P53DBD-LHG2) organism=Homo sapiens : H : CYS SG A0277 <- 3.40 -> DC N4 C0018 : score -3.05518 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.87 -> DG O6 C0017 : score 5.99817 : H : ARG NH2 A0280 <- 2.95 -> DG N7 C0017 : score 6.19308 : H : CYS SG B0277 <- 3.45 -> DC N4 C0008 : score -3.02046 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.89 -> DG O6 C0007 : score 5.97383 : H : ARG NH2 B0280 <- 3.00 -> DG N7 C0007 : score 6.12923 : x : LYS xxxx A0120 <- 3.92 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 3.93 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0120 <- 3.96 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 3.92 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >5mcu_B:p53-like_transcription_factors; title=NEW INSIGHTS INTO THE ROLE OF DNA SHAPE ON ITS RECOGNITION BY P53 PROTEINS (COMPLEX P53DBD-LHG2) organism=Homo sapiens : H : CYS SG B0277 <- 3.45 -> DC N4 C0008 : score -3.02046 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.89 -> DG O6 C0007 : score 5.97383 : H : ARG NH2 B0280 <- 3.00 -> DG N7 C0007 : score 6.12923 : x : LYS xxxx B0120 <- 3.96 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 3.92 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >5mcv_A:p53-like_transcription_factors; title=NEW INSIGHTS INTO THE ROLE OF DNA SHAPE ON ITS RECOGNITION BY P53 PROTEINS (COMPLEX P53DBD-LWC1) organism=Homo sapiens : H : CYS SG A0277 <- 3.46 -> DC N4 C0008 : score -3.01352 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.95 -> DG O6 C0007 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0280 <- 3.02 -> DG N7 C0007 : score 6.10369 : x : LYS xxxx A0120 <- 4.10 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 3.99 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >5mcv_AB: title=NEW INSIGHTS INTO THE ROLE OF DNA SHAPE ON ITS RECOGNITION BY P53 PROTEINS (COMPLEX P53DBD-LWC1) organism=Homo sapiens : H : CYS SG A0277 <- 3.46 -> DC N4 C0008 : score -3.01352 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.95 -> DG O6 C0007 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0280 <- 3.02 -> DG N7 C0007 : score 6.10369 : H : CYS SG B0277 <- 3.46 -> DC N4 C0018 : score -3.01352 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.96 -> DG O6 C0017 : score 5.88867 : H : ARG NH2 B0280 <- 3.01 -> DG N7 C0017 : score 6.11646 >5mcw_A:p53-like_transcription_factors; title=NEW INSIGHTS INTO THE ROLE OF DNA SHAPE ON ITS RECOGNITION BY P53 PROTEINS (COMPLEX P53DBD-LWC2) organism=Homo sapiens : H : CYS SG A0277 <- 3.39 -> DC N4 C0008 : score -3.06212 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.94 -> DG N7 C0007 : score 5.8806 : H : ARG NH2 A0280 <- 2.90 -> DG O6 C0007 : score 6.468 : x : LYS xxxx A0120 <- 4.16 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 3.93 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >5mcw_AB: title=NEW INSIGHTS INTO THE ROLE OF DNA SHAPE ON ITS RECOGNITION BY P53 PROTEINS (COMPLEX P53DBD-LWC2) organism=Homo sapiens : H : CYS SG A0277 <- 3.39 -> DC N4 C0008 : score -3.06212 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.94 -> DG N7 C0007 : score 5.8806 : H : ARG NH2 A0280 <- 2.90 -> DG O6 C0007 : score 6.468 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.99 -> DG N7 C0017 : score 5.8201 : H : ARG NH2 B0280 <- 2.97 -> DG O6 C0017 : score 6.3756 : x : LYS xxxx A0120 <- 4.16 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 3.93 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0120 <- 3.99 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 3.98 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0277 <- 3.50 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx >5mey_A:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD4-MH1 BOUND TO THE GGCGC SITE. organism=Homo sapiens : w : ASP OD2 A0079 <- 6.18 -> DC N4 D0012 : score 3.623 : w : ASP OD2 A0079 <- 6.27 -> DC N4 D0013 : score 3.623 : H : LYS NZ A0088 <- 2.68 -> DG O6 D0011 : score 5.91951 : w : LYS NZ A0088 <- 5.91 -> DC N4 D0012 : score 0.048 : x : GLN xxxx A0083 <- 3.15 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx >5mez_A:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD4-MH1 BOUND TO THE GGCT SITE. organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0081 <- 3.25 -> DG N7 E0005 : score 5.5055 : H : GLN OE1 A0083 <- 2.83 -> DA N6 D0009 : score 6.01625 : H : LYS NZ A0088 <- 3.28 -> DA N7 D0009 : score 2.65521 : H : LYS NZ A0088 <- 2.76 -> DG O6 D0010 : score 5.82702 >5mf0_A:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD4-MH1 BOUND TO THE GGCCG SITE. organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0081 <- 3.09 -> DG N7 F0003 : score 5.6991 : H : LYS NZ A0088 <- 3.40 -> DG N7 E0011 : score 4.73959 : H : LYS NZ A0088 <- 2.78 -> DG O6 E0011 : score 5.80389 : x : ASP xxxx A0079 <- 3.67 -> DC xxx E0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0083 <- 3.02 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx >5mf7_AB: title=NEW INSIGHTS INTO THE ROLE OF DNA SHAPE ON ITS RECOGNITION BY P53 PROTEINS (COMPLEX P53DBD-GADD45) organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 B0280 <- 5.85 -> DG O6 C0013 : score 2.756 >5mf7_B:p53-like_transcription_factors; title=NEW INSIGHTS INTO THE ROLE OF DNA SHAPE ON ITS RECOGNITION BY P53 PROTEINS (COMPLEX P53DBD-GADD45) organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 B0280 <- 5.85 -> DG O6 C0013 : score 2.756 >5mg7_A:p53-like_transcription_factors; title=NEW INSIGHTS INTO THE ROLE OF DNA SHAPE ON ITS RECOGNITION BY P53 PROTEINS (COMPLEX P53DBD-P53R2) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 2.48 -> DG N7 C0002 : score 5.73059 : x : SER xxxx A0121 <- 3.96 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0280 <- 3.50 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx >5mg7_AB: title=NEW INSIGHTS INTO THE ROLE OF DNA SHAPE ON ITS RECOGNITION BY P53 PROTEINS (COMPLEX P53DBD-P53R2) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 2.48 -> DG N7 C0002 : score 5.73059 : H : LYS NZ B0120 <- 2.59 -> DG N7 C0012 : score 5.61211 : H : LYS NZ B0120 <- 2.82 -> DG O6 C0013 : score 5.75765 >5mga_A: title=STRUCTURE OF THE CPF1 ENDONUCLEASE R-LOOP COMPLEX AFTER DNA CLEAVAGE organism=Francisella tularensis subsp. novicida U112 : H : LYS NZ A0613 <- 2.54 -> DA N7 C0003 : score 3.08991 : x : THR xxxx A0177 <- 3.50 -> DG xxx D-004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0180 <- 4.00 -> DT xxx D-003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0616 <- 4.28 -> DC xxx D-005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0663 <- 3.96 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0667 <- 3.55 -> DA xxx D-001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0668 <- 3.38 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0671 <- 3.11 -> DT xxx D-002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0827 <- 4.29 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx >5mhj_A: title=ICP4 DNA-BINDING DOMAIN, LACKING INTRINSICALLY DISORDERED REGION, IN COMPLEX WITH 12MER DNA DUPLEX FROM ITS OWN PROMOTER organism=Human herpesvirus 1 (strain 17) / Human herpesvirus 1 (strain 17) : H : SER OG A0418 <- 3.00 -> DC O2 E0006 : score 2.40123 : H : ARG NH1 A0456 <- 3.09 -> DG O6 E0007 : score 5.7305 : H : ARG NH2 A0456 <- 2.96 -> DG N7 E0007 : score 6.18031 : x : SER xxxx A0419 <- 3.74 -> DT xxx F0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0457 <- 3.95 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx >5mhj_AB: title=ICP4 DNA-BINDING DOMAIN, LACKING INTRINSICALLY DISORDERED REGION, IN COMPLEX WITH 12MER DNA DUPLEX FROM ITS OWN PROMOTER organism=Human herpesvirus 1 (strain 17) / Human herpesvirus 1 (strain 17) / Human herpesvirus 1 (strain 17) / Human herpesvirus 1 (strain 17) : H : SER OG A0418 <- 3.00 -> DC O2 E0006 : score 2.40123 : H : ARG NH1 A0456 <- 3.09 -> DG O6 E0007 : score 5.7305 : H : ARG NH2 A0456 <- 2.96 -> DG N7 E0007 : score 6.18031 : H : ARG NH1 B0456 <- 3.10 -> DT O2 E0005 : score 4.04803 : H : ARG NH1 B0456 <- 3.07 -> DT O2 F0036 : score 4.07386 : H : ARG NH2 B0456 <- 2.73 -> DC O2 F0037 : score 3.7505 : x : SER xxxx A0419 <- 3.74 -> DT xxx F0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0457 <- 3.95 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0420 <- 3.92 -> DA xxx F0032 : score x.xxxxx >5mhk_AB: title=ICP4 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH 19MER DNA DUPLEX FROM ITS OWN PROMOTER organism=HUMAN HERPESVIRUS 1 : H : SER OG A0418 <- 2.74 -> DC O2 F0006 : score 2.5313 : H : ARG NH1 A0456 <- 2.51 -> DG O6 F0007 : score 6.43617 : H : ARG NH2 A0456 <- 2.76 -> DG N7 F0007 : score 6.43569 : w : ARG NH1 A0456 <- 5.83 -> DA N6 E0032 : score 1.486 : H : SER OG B0419 <- 2.87 -> DC N4 F0006 : score 3.62418 : H : ARG NH1 B0456 <- 2.82 -> DT O2 F0005 : score 4.28918 : H : ARG NH1 B0456 <- 2.93 -> DT O2 E0036 : score 4.19444 : H : ARG NH2 B0456 <- 2.93 -> DT O2 E0036 : score 4.12327 : x : ASN xxxx A0393 <- 4.16 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0419 <- 4.47 -> DT xxx E0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0457 <- 4.35 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx >5mhk_C: title=ICP4 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH 19MER DNA DUPLEX FROM ITS OWN PROMOTER organism=? : w : SER OG C0417 <- 5.90 -> DA N3 G0035 : score 0.958 : H : SER OG C0418 <- 2.84 -> DC O2 H0006 : score 2.48127 : w : SER OG C0418 <- 6.23 -> DG N2 G0034 : score 1.651 : H : ARG NH1 C0456 <- 3.10 -> DG O6 H0007 : score 5.71833 : H : ARG NH2 C0456 <- 3.08 -> DG N7 H0007 : score 6.02708 : x : ASN xxxx C0393 <- 3.78 -> DT xxx G0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0395 <- 4.43 -> DT xxx G0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0457 <- 4.13 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx >5mhk_CDJ: title=ICP4 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH 19MER DNA DUPLEX FROM ITS OWN PROMOTER organism=HUMAN HERPESVIRUS 1 : w : SER OG C0417 <- 5.90 -> DA N3 G0035 : score 0.958 : H : SER OG C0418 <- 2.84 -> DC O2 H0006 : score 2.48127 : w : SER OG C0418 <- 6.23 -> DG N2 G0034 : score 1.651 : H : ARG NH1 C0456 <- 3.10 -> DG O6 H0007 : score 5.71833 : H : ARG NH2 C0456 <- 3.08 -> DG N7 H0007 : score 6.02708 : H : ARG NH1 D0456 <- 3.03 -> DT O2 H0005 : score 4.10832 : H : ARG NH1 D0456 <- 2.79 -> DT O2 G0036 : score 4.31502 : H : ARG NH2 D0456 <- 3.19 -> DT O2 G0036 : score 3.90313 : x : ASN xxxx C0393 <- 3.78 -> DT xxx G0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0395 <- 4.43 -> DT xxx G0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0457 <- 4.13 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0417 <- 4.26 -> DA xxx G0032 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0418 <- 3.53 -> DG xxx G0034 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0419 <- 3.59 -> DA xxx G0032 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx J0283 <- 3.21 -> DC xxx H0014 : score x.xxxxx >5mht_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=TERNARY STRUCTURE OF HHAI METHYLTRANSFERASE WITH HEMIMETHYLATED DNA AND ADOHCY organism=HAEMOPHILUS HAEMOLYTICUS : H : GLU OE1 A0119 <- 2.84 -> DC N4 D0427 : score 5.72181 : H : ARG NE A0165 <- 3.00 -> DC O2 D0427 : score 2.55262 : H : ARG NH2 A0165 <- 2.86 -> DC O2 D0427 : score 3.65433 : H : GLN OE1 A0237 <- 3.04 -> DG N2 C0408 : score 5.33852 : H : ARG NH2 A0240 <- 3.31 -> DG O6 D0426 : score 5.9268 : V : ALA CB A0260 <- 3.84 -> DT C7 C0405 : score 5.54298 : x : CYS xxxx A0081 <- 2.61 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0086 <- 4.00 -> DT xxx C0410 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0087 <- 3.51 -> DG xxx D0428 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0120 <- 4.32 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0121 <- 4.25 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0163 <- 2.92 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0261 <- 4.37 -> DT xxx C0405 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0304 <- 4.09 -> DC xxx D0427 : score x.xxxxx >5mlu_ABCDEFGH:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PFV GAG CBS BOUND TO A MONONUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 E0040 <- 2.85 -> DT O2 I0009 : score 4.191 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.45 -> DG xxx J0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.27 -> DA xxx J-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.49 -> DC xxx J0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 3.99 -> DC xxx J0069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.36 -> DA xxx I0006 : score x.xxxxx >5mlu_F:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PFV GAG CBS BOUND TO A MONONUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx F0045 <- 4.36 -> DA xxx I0006 : score x.xxxxx >5mma_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND THE INSTI XZ379 (COMPOUND 5'G) organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.86 -> DC O2 C0006 : score 2.62707 : H : ARG NH2 A0222 <- 3.04 -> DC O2 C0006 : score 3.52118 : w : SER OG A0225 <- 5.71 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.87 -> DT C7 C0008 : score 6.24769 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.62 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.90 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.91 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.82 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >5mmb_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND THE INSTI XZ434 (COMPOUND 6P) organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.86 -> DC O2 C0006 : score 2.62707 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.74 -> DC O2 C0006 : score 3.7431 : w : SER OG A0225 <- 5.48 -> DA N3 D0015 : score 0.958 : V : PRO CG A0259 <- 3.70 -> DT C7 C0008 : score 6.51795 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.73 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.96 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.90 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 4.09 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >5mpf_AB: title=STRUCTURAL BASIS OF GENE REGULATION BY THE GRAINYHEAD TRANSCRIPTION FACTOR SUPERFAMILY organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0427 <- 2.91 -> DG N7 E0008 : score 6.24415 : H : ARG NH2 A0427 <- 2.61 -> DG O6 E0008 : score 6.8508 : H : ARG NH2 B0427 <- 2.81 -> DG N7 F0008 : score 6.37185 : H : ARG NH2 B0427 <- 2.61 -> DG O6 F0008 : score 6.8508 : x : ASP xxxx A0422 <- 3.68 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0430 <- 3.57 -> DA xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0422 <- 3.84 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0430 <- 3.29 -> DA xxx E0003 : score x.xxxxx >5mpf_B: title=STRUCTURAL BASIS OF GENE REGULATION BY THE GRAINYHEAD TRANSCRIPTION FACTOR SUPERFAMILY organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 B0427 <- 2.81 -> DG N7 F0008 : score 6.37185 : H : ARG NH2 B0427 <- 2.61 -> DG O6 F0008 : score 6.8508 : x : ASP xxxx B0422 <- 3.84 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0430 <- 3.29 -> DA xxx E0003 : score x.xxxxx >5ms0_CDF: title=PSEUDO-ATOMIC MODEL OF THE RNA POLYMERASE LAMBDA-BASED ANTITERMINATION COMPLEX SOLVED BY CRYO-EM organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : x : SER xxxx D0319 <- 3.26 -> DT xxx J0027 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 3.32 -> DG xxx J0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0789 <- 3.34 -> DA xxx J0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.49 -> DG xxx J0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0793 <- 3.66 -> DG xxx J0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0928 <- 4.08 -> DA xxx J0016 : score x.xxxxx >5n2q_A: title=MOBM RELAXASE DOMAIN (MOBV; MOB_PRE) BOUND TO 26NT PMV158 ORIT DNA organism=STREPTOCOCCUS AGALACTIAE : H : ARG NH1 A0071 <- 3.00 -> DA N3 B0006 : score 3.53477 A : H : ARG NH2 A0071 <- 2.60 -> DA N3 B0006 : score 3.36933 A : H : ARG NH1 A0074 <- 2.92 -> DA N3 B0016 : score 3.59368 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.87 -> DT O2 B0004 : score 4.17407 : w : ARG NH1 A0074 <- 6.00 -> DA N3 B0015 : score 2.585 : H : LYS NZ A0149 <- 2.75 -> DG O6 B0017 : score 5.83858 : w : LYS NZ A0149 <- 5.78 -> DA N6 B0001 : score 2.097 : x : LYS xxxx A0010 <- 4.40 -> DT xxx B0018 : score x.xxxxx >5n6i_AD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MOUSE CGAS IN COMPLEX WITH 39 BP DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 D0161 <- 2.65 -> DT O2 G0034 : score 4.4356 : x : ARG xxxx A0161 <- 3.07 -> DC xxx G0008 : score x.xxxxx >5n6i_BC: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MOUSE CGAS IN COMPLEX WITH 39 BP DNA organism=Mus musculus : x : ARG xxxx B0161 <- 2.58 -> DA xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0161 <- 3.06 -> DA xxx I0033 : score x.xxxxx >5n6i_D: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MOUSE CGAS IN COMPLEX WITH 39 BP DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 D0161 <- 2.65 -> DT O2 G0034 : score 4.4356 >5n8o_A:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO EM STRUCTURE OF THE CONJUGATIVE RELAXASE TRAI OF THE F/R1 PLASMID SYSTEM organism=ESCHERICHIA COLI : H : GLN NE2 A0333 <- 2.40 -> DT O4 C0016 : score 5.60631 : H : SER OG A0832 <- 3.29 -> DT O2 C0015 : score 3.33509 : H : LYS NZ A1424 <- 2.53 -> DT O2 C0008 : score 3.78089 : V : HIS CB A0221 <- 3.62 -> DT C7 C0007 : score 4.31076 : V : ILE CG2 A1106 <- 3.63 -> DT C7 C0012 : score 7.39266 : V : PHE CZ A0833 <- 3.56 -> DT C7 C0017 : score 7.54176 : V : LYS CG A0723 <- 3.76 -> DT C7 C0022 : score 2.14016 : x : MET xxxx A0001 <- 4.28 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0194 <- 3.28 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0198 <- 3.62 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0330 <- 4.00 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0470 <- 3.45 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0540 <- 3.61 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0543 <- 3.41 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0636 <- 3.64 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0638 <- 3.13 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0721 <- 3.30 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0878 <- 3.70 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1048 <- 3.09 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1055 <- 3.39 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1079 <- 3.86 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A1105 <- 3.54 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1266 <- 4.16 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1270 <- 3.36 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A1271 <- 3.98 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A1289 <- 3.31 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1403 <- 3.17 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1426 <- 3.35 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >5n8r_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DROSOPHILIA DHX36 HELICASE IN COMPLEX WITH GAGCACTGC organism=Drosophila melanogaster : H : GLN OE1 B0264 <- 3.02 -> DC N4 D0010 : score 4.38167 : H : SER OG B0265 <- 3.03 -> DC N3 D0010 : score 1.88965 : w : GLU OE1 B0286 <- 5.59 -> DC O2 D0007 : score 2.68 : w : GLU OE1 B0286 <- 5.59 -> DC O2 D0007 : score 2.68 : w : THR OG1 B0510 <- 5.48 -> DC O2 D0005 : score 2.048 : w : THR OG1 B0513 <- 6.57 -> DC N3 D0005 : score 0.951 : w : ASP OD1 B0637 <- 5.78 -> DG O6 D0009 : score 3.411 : w : SER OG B0664 <- 5.50 -> DG O6 D0009 : score 2.749 : H : ASP OD2 B0680 <- 2.71 -> DG N2 D0002 : score 5.55724 : x : ARG xxxx B0239 <- 3.24 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0261 <- 4.25 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0262 <- 3.72 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0432 <- 3.23 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0433 <- 4.49 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0465 <- 3.42 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0490 <- 4.36 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0524 <- 3.71 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0568 <- 3.38 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0576 <- 3.55 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0635 <- 3.75 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0665 <- 3.78 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0671 <- 3.53 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0676 <- 3.91 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0793 <- 3.44 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0809 <- 4.24 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0810 <- 3.48 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0811 <- 4.14 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx >5n8s_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DROSOPHILA DHX36 HELICASE IN COMPLEX WITH POLYT organism=Drosophila melanogaster : V : LEU CD1 A0524 <- 3.85 -> DT C7 C0004 : score 5.65964 : x : ARG xxxx A0239 <- 3.32 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0261 <- 3.49 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0262 <- 3.85 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0264 <- 3.15 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0265 <- 3.80 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0432 <- 3.12 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.45 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0513 <- 3.06 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0633 <- 3.32 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0635 <- 3.69 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0664 <- 4.20 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0665 <- 3.81 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0671 <- 3.37 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0676 <- 3.87 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0680 <- 3.59 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0740 <- 4.22 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0793 <- 2.87 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0809 <- 3.18 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0810 <- 3.62 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0811 <- 3.32 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0831 <- 3.74 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx >5n8u_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DROSOPHILA DHX36 HELICASE IN COMPLEX WITH CTCTCCT organism=Drosophila melanogaster : w : SER OG B0664 <- 5.86 -> DT O4 D0008 : score 2.338 : x : ARG xxxx B0239 <- 3.18 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0261 <- 3.99 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0432 <- 3.53 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0465 <- 3.77 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0513 <- 3.29 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0524 <- 3.59 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0568 <- 4.35 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0635 <- 4.05 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0665 <- 3.47 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0671 <- 3.49 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0676 <- 3.27 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0680 <- 4.02 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0793 <- 3.23 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0809 <- 3.81 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0810 <- 3.66 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0811 <- 3.94 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0831 <- 4.24 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >5n8z_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DROSOPHILA DHX36 HELICASE IN COMPLEX WITH CTCTCCCTT organism=Drosophila melanogaster : H : SER OG B0265 <- 2.76 -> DT O4 D0009 : score 3.58357 : H : THR OG1 B0513 <- 3.30 -> DT O4 D0004 : score 3.49846 : H : SER OG B0664 <- 3.09 -> DT O4 D0008 : score 3.34893 : V : LEU CD1 B0524 <- 3.69 -> DT C7 D0004 : score 5.88889 : x : ARG xxxx B0239 <- 3.24 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0261 <- 4.02 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0262 <- 4.10 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0264 <- 3.46 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0432 <- 3.49 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0465 <- 3.82 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0635 <- 3.83 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0637 <- 3.93 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0665 <- 3.51 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0671 <- 3.57 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0676 <- 2.98 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0680 <- 3.94 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0793 <- 2.90 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0809 <- 3.78 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0810 <- 3.68 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0811 <- 3.91 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0815 <- 4.27 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx >5n90_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DROSOPHILA DHX36 HELICASE IN COMPLEX WITH TTGTGGTGT organism=Drosophila melanogaster : H : SER OG B0265 <- 2.79 -> DT O4 D0009 : score 3.56224 : H : THR OG1 B0513 <- 2.79 -> DT O4 D0004 : score 3.89495 : V : PHE CD1 B0665 <- 3.67 -> DT C7 D0007 : score 4.28567 : x : ARG xxxx B0239 <- 3.77 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0261 <- 4.16 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0262 <- 3.60 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0264 <- 3.19 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0286 <- 4.18 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0432 <- 3.13 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0433 <- 4.16 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0465 <- 3.54 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0490 <- 3.84 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0510 <- 4.45 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0524 <- 3.91 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0568 <- 3.19 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0571 <- 3.33 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0576 <- 3.36 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0635 <- 4.04 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0637 <- 3.60 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0664 <- 3.39 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0671 <- 3.55 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0676 <- 3.37 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0680 <- 3.53 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0793 <- 3.27 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0809 <- 3.46 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0810 <- 2.96 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0811 <- 3.88 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx >5n96_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DROSOPHILA DHX36 HELICASE IN COMPLEX WITH AGGGTTTTTT organism=Drosophila melanogaster : H : SER OG A0265 <- 3.22 -> DT O2 C0010 : score 3.38685 : H : THR OG1 A0513 <- 3.03 -> DG O6 C0005 : score 4.02148 : V : GLN CG A0261 <- 3.77 -> DT C7 C0010 : score 3.2798 : x : ARG xxxx A0239 <- 3.56 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0262 <- 3.78 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0264 <- 3.30 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0432 <- 3.14 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0433 <- 3.91 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.86 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0524 <- 3.60 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0568 <- 3.89 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0571 <- 3.64 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0635 <- 3.65 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0637 <- 3.99 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0664 <- 3.35 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0665 <- 3.89 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0671 <- 3.54 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0676 <- 3.49 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0680 <- 3.10 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0793 <- 2.95 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0809 <- 4.21 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0810 <- 3.46 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0811 <- 3.47 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx >5n98_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DROSOPHILA DHX36 HELICASE IN COMPLEX WITH TAGGGTTTT organism=Drosophila melanogaster : H : SER OG A0265 <- 3.17 -> DT O2 C0010 : score 3.42383 : w : ASP OD2 A0433 <- 6.38 -> DG N2 C0004 : score 1.62 : H : THR OG1 A0513 <- 2.82 -> DG O6 C0005 : score 4.19852 : x : ARG xxxx A0239 <- 3.36 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0261 <- 3.40 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0262 <- 4.34 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0264 <- 3.31 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0432 <- 3.19 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 4.02 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0524 <- 3.73 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0568 <- 3.55 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0571 <- 4.01 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0635 <- 3.59 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0637 <- 4.35 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0664 <- 3.48 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0665 <- 4.04 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0671 <- 4.14 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0676 <- 3.29 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0680 <- 3.42 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0793 <- 3.56 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0809 <- 4.48 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0810 <- 3.19 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0811 <- 4.12 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx >5n9a_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DROSOPHILA DHX36 HELICASE IN COMPLEX WITH GTTAGGGTT organism=Drosophila melanogaster : H : THR OG1 A0513 <- 2.74 -> DA N6 C0005 : score 2.79208 : H : GLU OE1 A0568 <- 3.17 -> DG N2 C0006 : score 3.9913 : H : GLU OE2 A0568 <- 2.79 -> DG N2 C0007 : score 4.31888 : H : ASP OD2 A0680 <- 2.72 -> DG N2 C0002 : score 5.54632 : x : ARG xxxx A0239 <- 3.60 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0286 <- 3.52 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0432 <- 3.35 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.44 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0511 <- 4.33 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0524 <- 4.22 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0571 <- 3.72 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0635 <- 3.65 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0664 <- 3.35 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0671 <- 3.60 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0676 <- 3.74 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0793 <- 3.43 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0809 <- 4.05 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0810 <- 3.83 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0811 <- 3.91 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx >5n9d_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DROSOPHILA DHX36 HELICASE IN COMPLEX WITH GGGTTAGGGT organism=Drosophila melanogaster : H : SER OG A0265 <- 2.27 -> DG O6 C0010 : score 4.52467 : H : THR OG1 A0513 <- 2.65 -> DT O4 C0005 : score 4.00379 : H : ASP OD2 A0680 <- 3.10 -> DG N2 C0002 : score 5.13144 : V : LEU CD1 A0524 <- 3.54 -> DT C7 C0005 : score 6.10382 : V : LEU CD2 A0740 <- 3.86 -> DT C7 C0011 : score 5.64531 : x : ARG xxxx A0239 <- 4.11 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0261 <- 3.46 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0262 <- 3.74 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0264 <- 3.24 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0432 <- 3.22 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0433 <- 3.80 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0465 <- 3.56 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0568 <- 2.94 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0576 <- 4.01 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0633 <- 4.48 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0635 <- 3.75 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0637 <- 3.21 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0664 <- 4.40 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0671 <- 3.59 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0676 <- 4.04 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0793 <- 3.47 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0809 <- 4.34 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0810 <- 3.51 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0811 <- 3.56 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0815 <- 4.50 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >5n9e_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DROSOPHILA DHX36 HELICASE IN COMPLEX WITH TGGGGATTT organism=Drosophila melanogaster : H : SER OG B0265 <- 2.45 -> DT N3 D0010 : score 2.12628 : H : THR OG1 B0513 <- 3.27 -> DG N7 D0005 : score 3.16984 : H : THR OG1 B0513 <- 2.92 -> DG O6 D0005 : score 4.11422 : H : GLU OE2 B0568 <- 3.04 -> DG N2 D0006 : score 4.10336 : H : SER OG B0671 <- 3.38 -> DG N7 D0004 : score 3.96213 : x : ARG xxxx B0239 <- 3.52 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0261 <- 3.79 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0262 <- 3.90 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0264 <- 3.01 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0432 <- 3.21 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0465 <- 3.45 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0524 <- 3.87 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0571 <- 3.34 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0633 <- 4.40 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0635 <- 3.45 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0637 <- 4.23 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0664 <- 3.47 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0665 <- 3.94 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0676 <- 3.86 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0680 <- 3.81 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0744 <- 4.09 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0793 <- 3.30 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0810 <- 3.08 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0811 <- 3.65 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0815 <- 4.36 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx >5n9f_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DROSOPHILA DHX36 HELICASE IN COMPLEX WITH SSDNA CPG_A organism=Drosophila melanogaster : H : SER OG B0265 <- 2.45 -> DT O4 D0010 : score 3.80399 : H : THR OG1 B0513 <- 2.30 -> DG O6 D0005 : score 4.63692 : H : ASP OD1 B0637 <- 2.77 -> DA N6 D0009 : score 3.50294 : H : ASP OD2 B0680 <- 3.17 -> DG N2 D0002 : score 5.05501 : x : ARG xxxx B0239 <- 4.37 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0261 <- 3.39 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0262 <- 4.20 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0264 <- 4.08 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0286 <- 4.38 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0432 <- 3.23 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0433 <- 3.88 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0465 <- 3.50 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0524 <- 3.75 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0568 <- 3.60 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0571 <- 4.11 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0576 <- 3.69 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0635 <- 3.97 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0671 <- 3.58 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0676 <- 3.18 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0684 <- 3.79 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0793 <- 3.24 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0810 <- 3.48 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0811 <- 3.74 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0815 <- 3.90 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx >5n9g_AC:Homeodomain-like;TATA-box_binding_protein-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=TFIIIB -TBP/BRF2/DNA AND SANT DOMAIN OF BDP1- organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0110 <- 2.90 -> DA N3 D0008 : score 3.17495 : x : ARG xxxx A0067 <- 3.12 -> DC xxx E0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0260 <- 4.26 -> G xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0297 <- 3.11 -> C xxx D0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0299 <- 3.84 -> G xxx E0007 : score x.xxxxx >5n9g_C:Homeodomain-like; title=TFIIIB -TBP/BRF2/DNA AND SANT DOMAIN OF BDP1- organism=HOMO SAPIENS : x : ASN xxxx C0297 <- 3.11 -> C xxx D0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0299 <- 3.84 -> G xxx E0007 : score x.xxxxx >5n9g_FH:Homeodomain-like;TATA-box_binding_protein-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=TFIIIB -TBP/BRF2/DNA AND SANT DOMAIN OF BDP1- organism=? : H : ARG NH2 F0110 <- 2.88 -> DA N3 I0008 : score 3.18791 : w : ARG NH1 F0110 <- 6.04 -> DT O2 J0023 : score 1.855 : x : TYR xxxx F0260 <- 3.82 -> G xxx J0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0297 <- 3.45 -> G xxx J0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0299 <- 3.98 -> DT xxx I0023 : score x.xxxxx >5n9g_G:TATA-box_binding_protein-like; title=TFIIIB -TBP/BRF2/DNA AND SANT DOMAIN OF BDP1- organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 G0167 <- 2.76 -> DT O2 I0014 : score 4.78412 : x : VAL xxxx G0169 <- 3.57 -> DT xxx I0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0197 <- 3.19 -> A xxx I0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0212 <- 3.45 -> A xxx I0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0214 <- 3.37 -> DT xxx J0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0220 <- 3.50 -> A xxx J0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0222 <- 3.34 -> DT xxx I0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0257 <- 3.08 -> A xxx J0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0259 <- 3.34 -> DT xxx I0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0288 <- 2.99 -> DT xxx J0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0289 <- 3.08 -> A xxx I0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0303 <- 3.34 -> DT xxx J0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0305 <- 3.62 -> A xxx I0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0311 <- 3.30 -> DT xxx I0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0313 <- 2.86 -> A xxx J0014 : score x.xxxxx >5nfv_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CATALYTICALLY INACTIVE FNCAS12 MUTANT BOUND TO AN R-LOOP STRUCTURE CONTAINING A PRE-CRRNA MIMIC AND FULL-LENGTH DNA TARGET organism=Francisella tularensis subsp. novicida (strain U112) / Francisella tularensis subsp. novicida (strain U112) : H : LYS NZ A0613 <- 2.57 -> DA N7 C0002 : score 3.07229 : H : LYS NZ A0671 <- 2.99 -> DT O2 D-001 : score 3.45087 : H : LYS NZ A0671 <- 2.97 -> DA N3 C0002 : score 2.68251 : H : ARG NH1 A0755 <- 2.59 -> DC O2 D0002 : score 3.8033 : H : ARG NH2 A0755 <- 3.20 -> DC N3 D0002 : score 2.10774 : x : THR xxxx A0177 <- 3.46 -> DT xxx D-003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0185 <- 3.93 -> DT xxx C-003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0289 <- 3.75 -> DT xxx C-014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0471 <- 4.30 -> DA xxx D0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0583 <- 4.18 -> DA xxx C-012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0584 <- 4.41 -> DA xxx C-012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0604 <- 4.47 -> DT xxx D-003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0616 <- 4.24 -> DC xxx D-004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0663 <- 3.99 -> DT xxx C0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0666 <- 3.32 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0667 <- 3.03 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0668 <- 3.38 -> DA xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0751 <- 3.06 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0754 <- 3.95 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0827 <- 3.89 -> DT xxx C0000 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0883 <- 3.61 -> DT xxx C-001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0894 <- 3.59 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1155 <- 4.27 -> DA xxx D0023 : score x.xxxxx >5nj8_AB:PYP-like_sensor_domain_PAS_domain;HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS FOR ARYL HYDROCARBON RECEPTOR MEDIATED GENE ACTIVATION organism=MUS MUSCULUS / HOMO SAPIENS : H : HIS NE2 B0094 <- 3.22 -> DG N7 F0009 : score 6.23115 : H : HIS NE2 B0094 <- 3.17 -> DG O6 F0009 : score 7.36526 : H : GLU OE1 B0098 <- 2.76 -> DC N4 E0004 : score 5.81409 : x : SER xxxx A0036 <- 3.55 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0039 <- 3.28 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 4.12 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0095 <- 4.36 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0097 <- 4.45 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0101 <- 3.57 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0102 <- 3.38 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx >5nj8_C:PYP-like_sensor_domain_PAS_domain;HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS FOR ARYL HYDROCARBON RECEPTOR MEDIATED GENE ACTIVATION organism=HOMO SAPIENS : x : SER xxxx C0036 <- 3.28 -> DC xxx G0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0039 <- 3.05 -> DT xxx H0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0040 <- 3.69 -> DC xxx G0006 : score x.xxxxx >5nj8_D:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS FOR ARYL HYDROCARBON RECEPTOR MEDIATED GENE ACTIVATION organism=MUS MUSCULUS : H : HIS NE2 D0094 <- 2.81 -> DG O6 H0009 : score 7.93794 : H : ARG NH2 D0102 <- 2.59 -> DG N7 H0007 : score 6.65277 : x : GLU xxxx D0098 <- 3.15 -> DC xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0101 <- 3.81 -> DC xxx G0004 : score x.xxxxx >5nkl_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH THE ARTIFICIAL BASE PAIR DDS-DPXTP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.80 -> DC O2 B0109 : score 2.94615 : w : LYS NZ A0540 <- 5.66 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.81 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.58 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.68 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.73 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.72 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.05 -> DG N3 B0110 : score 4.65013 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.62 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : GLU OE1 A0615 <- 6.08 -> DG N3 C0205 : score 2.669 : w : ASN ND2 A0750 <- 6.37 -> DG N3 C0205 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0754 <- 6.24 -> DG N3 C0205 : score 1.484 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.68 -> DC O2 B0111 : score 3.208 >5nl0_D:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A 197-BP PALINDROMIC 601L NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH LINKER HISTONE H1 organism=? : x : ARG xxxx D0027 <- 4.14 -> DG xxx J0050 : score x.xxxxx >5nl0_KLMN:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A 197-BP PALINDROMIC 601L NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH LINKER HISTONE H1 organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx K0040 <- 3.34 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0045 <- 4.33 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0027 <- 3.93 -> DG xxx T0050 : score x.xxxxx >5nm9_A:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PLACOZOA TRICHOPLAX ADHAERENS SMAD4-MH1 BOUND TO THE GGCGC SITE. organism=Trichoplax adhaerens : H : ARG NH2 A0075 <- 3.01 -> DG N7 D0006 : score 6.11646 : H : LYS NZ A0082 <- 2.74 -> DG O6 D0007 : score 5.85014 : H : LYS NZ A0082 <- 2.87 -> DG O6 C0011 : score 5.69984 : x : GLN xxxx A0077 <- 2.83 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx >5nnu_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=KSHV URACIL-DNA GLYCOSYLASE, PRODUCT COMPLEX WITH DSDNA EXHIBITING DUPLEX NUCLEOTIDE FLIPPING organism=Human herpesvirus 8 : x : PRO xxxx A0216 <- 3.30 -> DT xxx S0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0217 <- 3.71 -> DT xxx S0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0220 <- 3.69 -> DT xxx T0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0223 <- 3.43 -> DT xxx T0026 : score x.xxxxx >5nnx_A:Homeodomain-like; title=TEAD1 BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 A0087 <- 5.98 -> DG O6 F0012 : score 2.468 : H : LYS NZ A0088 <- 2.84 -> DG O6 F0013 : score 5.73452 : H : LYS NZ A0088 <- 2.81 -> DT O4 C0006 : score 3.58001 : H : SER OG A0092 <- 3.21 -> DA N7 C0004 : score 4.09805 : H : GLN OE1 A0095 <- 3.16 -> DA N6 F0015 : score 5.61678 : H : GLN NE2 A0095 <- 2.63 -> DA N7 F0015 : score 6.29679 : x : ILE xxxx A0058 <- 4.12 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0091 <- 4.24 -> DG xxx F0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0096 <- 3.95 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx >5no1_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND THE INSTI XZ407 (COMPOUND 5G) organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.81 -> DC O2 C0006 : score 2.65366 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.74 -> DC O2 C0006 : score 3.7431 : V : PRO CG A0259 <- 3.81 -> DT C7 C0008 : score 6.34308 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.55 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.87 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.92 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.96 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >5no6_AN:Homeodomain-like; title=TEAD4-HOXB13 COMPLEX BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0220 <- 3.22 -> DA N3 F0016 : score 1.92595 : H : ASN ND2 A0266 <- 3.14 -> DA N7 C0025 : score 5.47132 : H : ARG NH1 N0095 <- 2.89 -> DG N7 F0004 : score 5.9411 : H : LYS NZ N0096 <- 2.92 -> DG O6 F0005 : score 5.64203 : H : SER OG N0099 <- 3.34 -> DG N7 F0005 : score 3.99799 : H : SER OG N0100 <- 2.73 -> DA N7 C0030 : score 4.5266 : H : GLN OE1 N0103 <- 2.82 -> DA N6 F0007 : score 6.02835 : H : GLN NE2 N0103 <- 3.08 -> DA N7 F0007 : score 5.74872 : V : ILE CG1 A0262 <- 3.77 -> DT C7 C0026 : score 4.99617 : x : LYS xxxx A0218 <- 3.37 -> DT xxx C0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0258 <- 3.99 -> DT xxx C0027 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0265 <- 3.51 -> DC xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx N0078 <- 4.16 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx N0104 <- 3.80 -> DC xxx C0029 : score x.xxxxx >5no6_BI:Homeodomain-like; title=TEAD4-HOXB13 COMPLEX BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 B0266 <- 3.28 -> DA N7 D0025 : score 5.30694 : H : LYS NZ I0096 <- 3.26 -> DT O4 D0032 : score 3.25716 : H : LYS NZ I0096 <- 2.75 -> DG O6 E0005 : score 5.83858 : H : SER OG I0100 <- 3.10 -> DA N7 D0030 : score 4.19626 : H : GLN OE1 I0103 <- 2.76 -> DA N6 E0007 : score 6.10098 : H : GLN NE2 I0103 <- 2.84 -> DA N7 E0007 : score 6.04103 : V : ILE CG1 B0262 <- 3.64 -> DT C7 D0026 : score 5.15733 : x : ARG xxxx B0220 <- 3.15 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0258 <- 4.00 -> DT xxx D0027 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0265 <- 3.41 -> DC xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0066 <- 3.93 -> DG xxx D0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0095 <- 3.15 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0099 <- 4.39 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0104 <- 4.21 -> DC xxx D0029 : score x.xxxxx >5no6_N:Homeodomain-like; title=TEAD4-HOXB13 COMPLEX BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 N0095 <- 2.89 -> DG N7 F0004 : score 5.9411 : H : LYS NZ N0096 <- 2.92 -> DG O6 F0005 : score 5.64203 : H : SER OG N0099 <- 3.34 -> DG N7 F0005 : score 3.99799 : H : SER OG N0100 <- 2.73 -> DA N7 C0030 : score 4.5266 : H : GLN OE1 N0103 <- 2.82 -> DA N6 F0007 : score 6.02835 : H : GLN NE2 N0103 <- 3.08 -> DA N7 F0007 : score 5.74872 : x : ASN xxxx N0078 <- 4.16 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx N0104 <- 3.80 -> DC xxx C0029 : score x.xxxxx >5npk_bd:Type_II_DNA_topoisomerase; title=1.98A STRUCTURE OF THIOPHENE1 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : H : ARG NH1 b0458 <- 2.29 -> DC O2 f0004 : score 4.0223 A : H : ARG NH2 b0458 <- 2.55 -> DC O2 f0004 : score 3.88365 A : w : LYS NZ b0460 <- 5.43 -> DA N3 e-002 : score 1.538 : w : GLU OE2 b0477 <- 6.02 -> DC O2 f0005 : score 1.988 : w : TYR OH b1025 <- 5.44 -> DA N3 f0007 : score 1.448 : w : TYR OH b1025 <- 6.08 -> DA N3 e-002 : score 1.448 : H : SER OG b1084 <- 2.71 -> DG O6 e0001 : score 4.16466 : w : SER OG b1085 <- 6.02 -> DA N7 e-002 : score 2.343 : w : LYS NZ d0460 <- 5.24 -> DA N3 f-002 : score 1.538 : w : TYR OH d1025 <- 5.99 -> DA N3 f-002 : score 1.448 : w : TYR OH d1025 <- 5.57 -> DA N3 e0007 : score 1.448 : x : ARG xxxx b1092 <- 3.81 -> DT xxx e-003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx b1175 <- 3.34 -> DC xxx f0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx d0458 <- 3.37 -> DC xxx e0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx d1085 <- 3.32 -> DA xxx f-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx d1122 <- 2.96 -> DG xxx e0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx d1175 <- 3.29 -> DG xxx e0009 : score x.xxxxx >5npk_d:Type_II_DNA_topoisomerase; title=1.98A STRUCTURE OF THIOPHENE1 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : w : LYS NZ d0460 <- 5.24 -> DA N3 f-002 : score 1.538 : w : TYR OH d1025 <- 5.99 -> DA N3 f-002 : score 1.448 : w : TYR OH d1025 <- 5.57 -> DA N3 e0007 : score 1.448 : x : ARG xxxx d0458 <- 3.37 -> DC xxx e0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx d1085 <- 3.32 -> DA xxx f-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx d1122 <- 2.96 -> DG xxx e0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx d1175 <- 3.29 -> DG xxx e0009 : score x.xxxxx >5npp_D:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.22A STRUCTURE OF THIOPHENE2 AND GSK945237 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=? : w : LYS NZ D0460 <- 5.71 -> DA N3 F-002 : score 1.538 : w : TYR OH D1025 <- 5.40 -> DA N3 A0007 : score 1.448 : w : TYR OH D1025 <- 6.25 -> DA N3 F-002 : score 1.448 : w : SER OG D1085 <- 6.17 -> DA N7 F-002 : score 2.343 : x : ARG xxxx D0458 <- 4.21 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D1175 <- 3.14 -> DC xxx A0008 : score x.xxxxx >5nsr_M: title=CRYO-EM STRUCTURE OF RNA POLYMERASE-SIGMA54 HOLO ENZYME WITH PROMOTER DNA CLOSED COMPLEX organism=KLEBSIELLA PNEUMONIAE : H : SER OG M0379 <- 3.24 -> DC N4 F0076 : score 3.35218 : H : SER OG M0379 <- 3.34 -> DT O4 G-015 : score 3.17117 : x : ALA xxxx M0020 <- 4.34 -> DG xxx F0073 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx M0021 <- 4.30 -> DC xxx G-013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0440 <- 3.88 -> DT xxx G-027 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx M0454 <- 3.34 -> DT xxx F0085 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0456 <- 2.46 -> DG xxx F0086 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0457 <- 2.74 -> DT xxx F0085 : score x.xxxxx >5nss_GJKMN:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators;Translation_proteins_SH3-like_domain;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RNA POLYMERASE-SIGMA54 HOLOENZYME WITH PROMOTER DNA AND TRANSCRIPTION ACTIVATOR PSPF INTERMEDATE COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI K-12 / KLEBSIELLA PNEUMONIAE : V : ALA CB M0012 <- 3.60 -> DT C7 H0071 : score 5.87892 : x : ALA xxxx M0013 <- 1.92 -> DC xxx H0072 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx M0014 <- 3.22 -> DA xxx I-011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx M0016 <- 3.56 -> DC xxx H0072 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx M0017 <- 2.99 -> DA xxx I-011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx M0018 <- 4.43 -> DA xxx I-011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0456 <- 3.99 -> DT xxx H0085 : score x.xxxxx >5nw5_AB:ARM_repeat; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RIF1 N-TERMINAL DOMAIN (RIF1-NTD) FROM SACCHAROMYCES CEREVISIAE IN COMPLEX WITH DNA organism=Saccharomyces cerevisiae S288c : x : ARG xxxx B1207 <- 2.99 -> DA xxx C0026 : score x.xxxxx >5nw5_B:ARM_repeat; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RIF1 N-TERMINAL DOMAIN (RIF1-NTD) FROM SACCHAROMYCES CEREVISIAE IN COMPLEX WITH DNA organism=Saccharomyces cerevisiae S288c : x : ARG xxxx B1207 <- 2.99 -> DA xxx C0026 : score x.xxxxx >5nwa_A:Phospholipase_D/nuclease; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX OF TDP1 WITH DUPLEX DNA organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx A0204 <- 3.52 -> DT xxx C-001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0258 <- 3.91 -> DA xxx C-003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0259 <- 3.23 -> DA xxx C-003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0261 <- 4.14 -> DT xxx C-002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0400 <- 3.93 -> DT xxx C-001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0461 <- 3.72 -> DT xxx C-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0535 <- 3.24 -> DA xxx C-003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0590 <- 4.42 -> DT xxx C-001 : score x.xxxxx >5o63_B:DNA-binding_pseudobarrel_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UBALAI RESTRICTION ENDONUCLEASE B3 DOMAIN DOMAIN (MUTANT L24M L53M L95M) WITH COGNATE DNA organism=UNIDENTIFIED : H : ASN ND2 B0032 <- 3.11 -> DA N7 F0000 : score 5.50654 : H : ARG NE B0037 <- 2.76 -> DG O6 F0002 : score 3.97255 : H : ARG NH2 B0037 <- 3.05 -> DG N7 F0002 : score 6.06538 : H : HIS NE2 B0038 <- 2.76 -> DG N7 F0001 : score 6.85698 : H : ARG NH1 B0086 <- 2.96 -> DG N7 E0002 : score 5.8564 : H : TYR OH B0087 <- 2.64 -> DG O6 E0001 : score 3.7496 : H : GLU OE1 B0089 <- 2.97 -> DC N4 F-002 : score 5.57184 : w : GLU OE1 B0089 <- 5.40 -> DG N7 F-003 : score 1.976 : w : GLU OE2 B0089 <- 5.68 -> DC N4 F-001 : score 3.597 : H : ARG NH1 B0091 <- 2.97 -> DT O4 E0000 : score 3.15684 : H : ARG NH2 B0091 <- 2.96 -> DT O4 E0000 : score 3.44012 : x : LEU xxxx B0041 <- 3.63 -> DC xxx F-002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0084 <- 3.41 -> DC xxx E-001 : score x.xxxxx >5o6b_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF SCPIF1 IN COMPLEX WITH GGGTTTT AND ADP-ALF4 organism=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) : w : HIS NE2 A0303 <- 6.47 -> DT O2 C0006 : score 3.682 : H : LYS NZ A0387 <- 3.23 -> DG N7 C0004 : score 4.92271 : H : GLU OE1 A0724 <- 3.38 -> DG N2 C0004 : score 3.81027 : w : THR OG1 B0464 <- 5.83 -> DG O6 C0003 : score 2.729 : H : ARG NH1 B0502 <- 2.93 -> DT O4 C0007 : score 3.18298 : w : ARG NH1 B0721 <- 5.85 -> DG N7 C0003 : score 2.063 : V : LEU CD1 A0310 <- 3.58 -> DT C7 C0007 : score 6.0465 >5o6b_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF SCPIF1 IN COMPLEX WITH GGGTTTT AND ADP-ALF4 organism=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) : w : THR OG1 B0464 <- 5.83 -> DG O6 C0003 : score 2.729 : H : ARG NH1 B0502 <- 2.93 -> DT O4 C0007 : score 3.18298 : w : ARG NH2 B0502 <- 5.91 -> DT O4 C0007 : score 2.366 : w : ARG NH1 B0721 <- 5.85 -> DG N7 C0003 : score 2.063 >5o6d_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF SCPIF1 IN COMPLEX WITH POLYDT AND ATPGS organism=Saccharomyces cerevisiae S288C : H : ARG NH1 B0721 <- 2.56 -> DT O4 C0003 : score 3.42481 : V : PHE CG A0723 <- 3.68 -> DT C7 C0003 : score 5.43629 >5o6d_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF SCPIF1 IN COMPLEX WITH POLYDT AND ATPGS organism=Saccharomyces cerevisiae S288C : H : ARG NH1 B0721 <- 2.56 -> DT O4 C0003 : score 3.42481 >5o6e_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF SCPIF1 IN COMPLEX WITH TTTGGGTT AND ADP-ALF4 organism=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) : H : LYS NZ A0387 <- 3.27 -> DG O6 C0004 : score 5.23738 >5o6g_A:Homing_endonucleases; title=STRUCTURES AND DYNAMICS OF MESOPHILIC VARIANTS FROM THE HOMING ENDONUCLEASE I-DMOI organism=Desulfurococcus mucosus : H : TYR OH A0029 <- 3.19 -> DC N4 B0018 : score 3.8854 : H : ARG NH1 A0037 <- 2.78 -> DG O6 C0008 : score 6.10767 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.71 -> DG O6 C0007 : score 6.7188 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.94 -> DG O6 C0008 : score 6.4152 : H : THR OG1 A0076 <- 2.62 -> DA N7 B0014 : score 3.53701 : H : THR OG1 A0076 <- 2.88 -> DA N6 B0014 : score 2.71483 : H : ARG NE A0077 <- 2.94 -> DG N7 B0015 : score 4.29798 : H : ARG NH2 A0077 <- 2.73 -> DT O4 B0016 : score 3.6036 : H : ARG NH1 A0081 <- 3.37 -> DG N7 C0008 : score 5.3603 : H : ARG NH2 A0081 <- 3.29 -> DG N7 C0008 : score 5.75892 : H : ARG NH1 A0124 <- 2.85 -> DG O6 C0019 : score 6.0225 : H : ARG NH2 A0124 <- 3.02 -> DG O6 B0006 : score 6.3096 : H : ARG NH1 A0126 <- 2.64 -> DG O6 C0018 : score 6.278 : H : ARG NH2 A0126 <- 2.83 -> DG N7 C0018 : score 6.34631 : H : ASP OD1 A0154 <- 3.12 -> DC N4 B0008 : score 5.0028 : H : ASP OD2 A0155 <- 2.88 -> DC N4 C0015 : score 6.1008 : H : ARG NH1 A0157 <- 2.54 -> DG N7 B0010 : score 6.3646 : H : ARG NH2 A0157 <- 2.22 -> DG O6 B0010 : score 7.3656 : x : TYR xxxx A0025 <- 3.35 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0027 <- 4.16 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0033 <- 2.14 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0034 <- 3.63 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0035 <- 3.25 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0039 <- 4.40 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.84 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0070 <- 3.32 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0072 <- 3.88 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0075 <- 3.32 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0079 <- 3.47 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0083 <- 4.07 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0128 <- 3.46 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0152 <- 3.94 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0158 <- 3.33 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0160 <- 3.92 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx >5o6i_K:Homing_endonucleases; title=STRUCTURES AND DYNAMICS OF MESOPHILIC VARIANTS FROM THE HOMING ENDONUCLEASE I-DMOI organism=Desulfurococcus mucosus : H : ARG NH1 K0033 <- 2.47 -> DG O6 L0021 : score 6.48483 : H : GLU OE2 K0035 <- 2.84 -> DC N4 N0006 : score 5.22326 : H : ARG NH1 K0037 <- 2.88 -> DG O6 N0008 : score 5.986 : H : ARG NH2 K0037 <- 2.77 -> DG O6 N0007 : score 6.6396 : H : ARG NH2 K0037 <- 2.90 -> DG O6 N0008 : score 6.468 : w : ARG NH1 K0037 <- 5.69 -> DT O4 L0017 : score 1.768 : H : ASP OD1 K0075 <- 3.20 -> DC N4 N0011 : score 4.91728 : H : THR OG1 K0076 <- 2.57 -> DA N7 L0014 : score 3.57115 : H : THR OG1 K0076 <- 2.91 -> DA N6 L0014 : score 2.69828 : H : ARG NE K0077 <- 3.05 -> DG N7 L0015 : score 4.20071 : H : GLU OE1 K0079 <- 3.30 -> DA N6 N0009 : score 2.41385 : w : GLU OE2 K0079 <- 5.36 -> DT O4 L0017 : score 2.279 : H : ARG NH1 K0081 <- 3.19 -> DG N7 N0008 : score 5.5781 : H : ARG NH2 K0081 <- 3.19 -> DG N7 N0008 : score 5.88662 : H : ARG NH1 K0124 <- 3.20 -> DG O6 L0006 : score 5.59667 : H : ARG NH1 K0124 <- 2.93 -> DG O6 N0019 : score 5.92517 : H : ARG NH2 K0124 <- 3.28 -> DG N7 L0006 : score 5.77169 : H : ARG NH1 K0126 <- 2.88 -> DG O6 N0018 : score 5.986 : H : ARG NH2 K0126 <- 3.07 -> DG N7 N0018 : score 6.03985 : w : ARG NH1 K0126 <- 6.13 -> DC N4 L0007 : score 1.892 : H : ASP OD1 K0154 <- 3.00 -> DC N4 L0008 : score 5.13108 : w : ASP OD1 K0154 <- 6.19 -> DC N4 L0007 : score 2.835 : w : ASP OD2 K0154 <- 5.58 -> DC N4 N0016 : score 3.623 : H : ASP OD2 K0155 <- 2.70 -> DC N4 N0015 : score 6.324 : H : ARG NH1 K0157 <- 3.04 -> DG N7 L0010 : score 5.7596 : H : ARG NH2 K0157 <- 2.78 -> DG O6 L0010 : score 6.6264 : x : TYR xxxx K0025 <- 3.42 -> DT xxx L0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx K0027 <- 4.17 -> DT xxx L0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx K0029 <- 3.14 -> DC xxx L0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0034 <- 3.41 -> DG xxx N0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx K0039 <- 4.45 -> DT xxx L0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx K0041 <- 3.81 -> DG xxx L0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx K0070 <- 3.33 -> DG xxx N0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx K0072 <- 4.23 -> DG xxx N0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0083 <- 3.87 -> DC xxx N0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx K0128 <- 3.64 -> DC xxx N0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx K0158 <- 3.40 -> DA xxx N0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx K0160 <- 3.91 -> DC xxx N0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx K0167 <- 4.29 -> DT xxx L0005 : score x.xxxxx >5o6u_CD:GHMP_Kinase,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF THE CASCADE-I-FV R-LOOP COMPLEX FROM SHEWANELLA PUTREFACIENS organism=SHEWANELLA PUTREFACIENS CN-32 : V : PRO CB D0027 <- 3.65 -> DT C7 I0004 : score 6.02388 : x : VAL xxxx C0120 <- 4.32 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0122 <- 4.04 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0125 <- 2.58 -> DA xxx I0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0038 <- 3.31 -> DT xxx I0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0040 <- 3.53 -> DT xxx I0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0042 <- 3.53 -> DT xxx I0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0127 <- 3.99 -> DG xxx I0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0158 <- 4.40 -> DT xxx I0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0159 <- 3.05 -> DG xxx I0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0160 <- 1.63 -> DG xxx I0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0161 <- 3.14 -> DT xxx I0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0163 <- 4.49 -> DT xxx I0004 : score x.xxxxx >5o6u_EF:GHMP_Kinase,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF THE CASCADE-I-FV R-LOOP COMPLEX FROM SHEWANELLA PUTREFACIENS organism=SHEWANELLA PUTREFACIENS CN-32 : H : LYS NZ F0253 <- 2.85 -> DG O6 I0016 : score 5.72296 : H : ASP OD2 F0254 <- 3.33 -> DC N4 H0013 : score 5.5428 : x : SER xxxx F0110 <- 3.78 -> DG xxx I0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0111 <- 3.52 -> DG xxx I0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0251 <- 3.29 -> DC xxx H0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0264 <- 3.57 -> DT xxx H0012 : score x.xxxxx >5o7t_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF KLENTAQ MUTANT M747K IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH A DG:DCTP BASE PAIR organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.85 -> DC O2 B0109 : score 2.91669 : w : LYS NZ A0540 <- 5.72 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.77 -> DG N2 B0108 : score 0.846 : w : THR OG1 A0544 <- 5.78 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.68 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.68 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.83 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.12 -> DG N3 B0110 : score 4.5816 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.74 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : GLN xxxx A0754 <- 4.38 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >5o9g_E:Histone-fold; title=STRUCTURE OF NUCLEOSOME-CHD1 COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 E0040 <- 2.68 -> DC O2 I0008 : score 3.78749 >5o9g_F:Histone-fold; title=STRUCTURE OF NUCLEOSOME-CHD1 COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 F0045 <- 3.20 -> DC O2 I0006 : score 3.40282 >5o9g_G:Histone-fold; title=STRUCTURE OF NUCLEOSOME-CHD1 COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx G0035 <- 4.35 -> DA xxx I0039 : score x.xxxxx >5oa1_4ABU: title=RNA POLYMERASE I PRE-INITIATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C : H : ARG NH1 B0817 <- 3.48 -> DC O2 T0035 : score 3.1536 : H : ARG NH1 B0817 <- 3.17 -> DC N3 T0035 : score 1.42343 : x : MET xxxx B0451 <- 4.11 -> DA xxx S0035 : score x.xxxxx >5od6_A:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD3-MH1 BOUND TO THE GGCGC SITE. organism=Homo sapiens : w : ASP OD2 A0072 <- 5.64 -> DC N4 D0011 : score 3.623 : w : ASP OD2 A0072 <- 5.90 -> DG N7 D0010 : score 2.718 : H : ARG NH1 A0074 <- 2.88 -> DG N7 C0005 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.79 -> DG O6 C0005 : score 6.6132 : H : GLN OE1 A0076 <- 2.92 -> DC N4 D0009 : score 4.47333 : w : GLN OE1 A0076 <- 6.07 -> DC N4 C0007 : score 3.488 : w : GLN NE2 A0076 <- 6.31 -> DG O6 C0008 : score 2.87 : H : LYS NZ A0081 <- 2.66 -> DG O6 D0010 : score 5.94263 : w : LYS NZ A0081 <- 6.28 -> DG O6 C0006 : score 3.005 : w : LYS NZ A0081 <- 5.71 -> DG N7 D0010 : score 2.519 >5odg_A:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD3-MH1 BOUND TO THE GGCT SITE. organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0074 <- 2.86 -> DG N7 E0005 : score 5.9774 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.81 -> DG O6 E0005 : score 6.5868 : H : GLN OE1 A0076 <- 2.82 -> DA N6 D0009 : score 6.02835 : w : GLN NE2 A0076 <- 5.75 -> DT O4 E0008 : score 2.257 : H : LYS NZ A0081 <- 3.06 -> DA N7 D0009 : score 2.78445 : H : LYS NZ A0081 <- 2.85 -> DG O6 D0010 : score 5.72296 : x : HIS xxxx A0079 <- 4.49 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >5odn_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=SALINIBACTER RUBER SINGLE-STRAND BINDING PROTEIN organism=Salinibacter ruber (strain DSM 13855 / M31) / Salinibacter ruber (strain DSM 13855 / M31) : H : SER OG B0033 <- 2.80 -> DT N3 K0001 : score 1.98718 : H : ASN OD1 B0037 <- 2.87 -> DT N3 K0002 : score 3.74806 : H : ASN ND2 B0037 <- 2.85 -> DT O2 K0002 : score 4.69869 : H : GLN OE1 B0049 <- 3.35 -> DT N3 K0004 : score 3.03855 : H : THR OG1 B0051 <- 3.01 -> DT O4 K0002 : score 3.72392 : V : TRP CD1 B0053 <- 3.60 -> DT C7 K0001 : score 7.7 >5odn_BC:Nucleic_acid-binding_proteins; title=SALINIBACTER RUBER SINGLE-STRAND BINDING PROTEIN organism=Salinibacter ruber (strain DSM 13855 / M31) / Salinibacter ruber (strain DSM 13855 / M31) / Salinibacter ruber (strain DSM 13855 / M31) / Salinibacter ruber (strain DSM 13855 / M31) : H : ARG NH2 B0003 <- 3.19 -> DT O2 N0003 : score 3.90313 : H : SER OG C0033 <- 3.15 -> DT N3 N0001 : score 1.84808 : H : ASN OD1 C0037 <- 3.12 -> DT N3 N0002 : score 3.558 : H : ASN ND2 C0037 <- 3.04 -> DT O2 N0002 : score 4.51834 : H : THR OG1 C0051 <- 2.84 -> DT O4 N0002 : score 3.85608 : V : TRP CD1 C0053 <- 3.74 -> DT C7 N0001 : score 7.44333 >5odn_EH:Nucleic_acid-binding_proteins; title=SALINIBACTER RUBER SINGLE-STRAND BINDING PROTEIN organism=Salinibacter ruber (strain DSM 13855 / M31) / Salinibacter ruber (strain DSM 13855 / M31) / Salinibacter ruber (strain DSM 13855 / M31) / Salinibacter ruber (strain DSM 13855 / M31) : H : SER OG H0033 <- 3.18 -> DT N3 L0001 : score 1.83615 : H : THR OG1 H0051 <- 2.72 -> DT O4 L0002 : score 3.94937 : V : TRP CD1 H0053 <- 3.69 -> DT C7 L0001 : score 7.535 >5oik_ABEZ:Translation_proteins_SH3-like_domain; title=STRUCTURE OF AN RNA POLYMERASE II-DSIF TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX organism=HOMO SAPIENS / BOS TAURUS : x : LYS xxxx A0149 <- 3.53 -> DT xxx N0033 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0331 <- 3.83 -> DA xxx T0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0364 <- 4.12 -> DC xxx T0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0461 <- 4.37 -> DG xxx T0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 3.89 -> DA xxx T0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.56 -> DA xxx T0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 4.04 -> DA xxx T0020 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0200 <- 3.21 -> DG xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0222 <- 4.08 -> DG xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0385 <- 3.47 -> DG xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0386 <- 2.98 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0391 <- 4.28 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0489 <- 3.29 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0492 <- 4.32 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0498 <- 3.88 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx >5ola_ABE:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX IN COMPLEX WITH ELONGATION FACTOR TEFM organism=HOMO SAPIENS : H : SER OG E0774 <- 3.07 -> DC O2 T0006 : score 2.36621 : x : GLN xxxx E0493 <- 3.87 -> DG xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0759 <- 4.26 -> DA xxx N-018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0778 <- 4.04 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0803 <- 4.40 -> DC xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0805 <- 4.12 -> DG xxx T0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0807 <- 4.09 -> DC xxx T0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0992 <- 3.55 -> DT xxx T0000 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0996 <- 3.73 -> DT xxx T0000 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0999 <- 3.20 -> DG xxx T0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E1001 <- 3.54 -> DT xxx T0000 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E1004 <- 3.35 -> DG xxx T-001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E1009 <- 3.15 -> DT xxx T0000 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx E1026 <- 3.84 -> DA xxx N-009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E1113 <- 4.37 -> DG xxx T-003 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E1125 <- 3.55 -> DG xxx T0001 : score x.xxxxx >5ola_C:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX IN COMPLEX WITH ELONGATION FACTOR TEFM organism=HOMO SAPIENS : V : LYS CE C0153 <- 3.77 -> DT C7 G-019 : score 2.62053 >5ola_CDF:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX IN COMPLEX WITH ELONGATION FACTOR TEFM organism=HOMO SAPIENS : H : SER OG F0774 <- 3.08 -> DC O2 I0006 : score 2.36121 : V : LYS CE C0153 <- 3.77 -> DT C7 G-019 : score 2.62053 : x : GLN xxxx F0493 <- 4.02 -> DG xxx I0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0778 <- 3.96 -> DG xxx I0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0803 <- 4.05 -> DG xxx I0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0805 <- 4.06 -> DG xxx I0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0807 <- 4.15 -> DC xxx I0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0992 <- 3.62 -> DT xxx I0000 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0996 <- 3.81 -> DT xxx I0000 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0999 <- 3.25 -> DG xxx I0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F1001 <- 3.47 -> DT xxx I0000 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F1004 <- 3.13 -> DA xxx G-009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F1009 <- 2.94 -> DT xxx I0000 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F1125 <- 3.42 -> DG xxx I0001 : score x.xxxxx >5omf_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CLOSED, TERNARY STRUCTURE OF KOD DNA POLYMERASE organism=? : w : TYR OH A0409 <- 6.26 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : w : TYR OH A0494 <- 5.21 -> DG N3 T0005 : score 3.344 : w : THR OG1 A0541 <- 5.65 -> DC O2 P0012 : score 2.048 : H : LYS NZ A0592 <- 2.92 -> DA N3 P0011 : score 2.71028 : H : ARG NH1 A0612 <- 3.09 -> DC O2 P0009 : score 3.4383 >5omq_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF 9N DNA POLYMERASE IN THE REPLICATIVE STATE WITH THREE METAL IONS IN THE ACTIVE SITE organism=Thermococcus sp. (strain 9oN-7) / Thermococcus sp. (strain 9oN-7) : w : TYR OH A0409 <- 5.97 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : w : TYR OH A0494 <- 5.04 -> DG N3 T0005 : score 3.344 : w : THR OG1 A0541 <- 5.48 -> DC O2 P0012 : score 2.048 : H : LYS NZ A0592 <- 3.00 -> DA N3 P0011 : score 2.66585 : H : ARG NH1 A0612 <- 3.04 -> DC O2 P0009 : score 3.4748 >5omv_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TERNARY COMPLEX OF 9N DNA POLYMERASE IN THE REPLICATIVE STATE WITH TWO METAL IONS IN THE ACTIVE SITE organism=Thermococcus sp. 9oN-7 : w : TYR OH A0409 <- 6.06 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : w : TYR OH A0494 <- 5.12 -> DG N3 T0005 : score 3.344 : w : THR OG1 A0541 <- 5.29 -> DC O2 P0012 : score 2.048 : H : LYS NZ A0592 <- 3.12 -> DA N3 P0011 : score 2.5992 : H : ARG NH1 A0612 <- 3.03 -> DC O2 P0009 : score 3.4821 >5omx_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=X-RAY STRUCTURE OF THE H2A-N38C NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.64 -> DA N3 J0009 : score 3.34342 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.91 -> DA N3 I0009 : score 3.16847 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.30 -> DT xxx I0070 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.20 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.16 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.79 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.88 -> DG xxx I-006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.21 -> DA xxx I-069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.24 -> DT xxx I-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.07 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.94 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.99 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 4.26 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >5ond_B:N-utilization_substance_G_protein_NusG,_N-terminal_domain; title=RFAH FROM ESCHERICHIA COLI IN COMPLEX WITH OPS DNA organism=Escherichia coli : H : LYS NZ B0010 <- 2.61 -> DG N7 D0003 : score 5.59056 : x : ALA xxxx B0071 <- 4.10 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx >5ong_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF A NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH ITS DNA SITE-SPECIFICALLY CROSSLINKED TO THE HISTONE OCTAMER organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 H0030 <- 3.25 -> DG N3 I0048 : score 2.77783 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.75 -> DA xxx J0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.02 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0032 <- 4.10 -> DT xxx I-012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.22 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.52 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.28 -> DT xxx I-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.34 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.79 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx >5onw_A:Histone-fold; title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF A NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH ITS DNA SITE-SPECIFICALLY CROSSLINKED TO THE HISTONE OCTAMER AND THE TWO H2A/H2B DIMERS CROSSLINKED VIA H2A N38C organism=? : x : TYR xxxx A0041 <- 4.38 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.97 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx >5onw_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF A NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH ITS DNA SITE-SPECIFICALLY CROSSLINKED TO THE HISTONE OCTAMER AND THE TWO H2A/H2B DIMERS CROSSLINKED VIA H2A N38C organism=XENOPUS LAEVIS : x : TYR xxxx A0041 <- 4.38 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.97 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0032 <- 4.23 -> DT xxx I-012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0026 <- 3.07 -> DG xxx I0030 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.96 -> DT xxx I-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.85 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.97 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.93 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.23 -> DA xxx J-047 : score x.xxxxx >5oqj_7AMOQRU:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;TATA-box_binding_protein-like;Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain; title=STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH organism=? : H : THR OG1 O0124 <- 2.58 -> DA N3 T0081 : score 1.41342 : x : ASN xxxx O0069 <- 3.70 -> DA xxx T0081 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0071 <- 3.23 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0099 <- 3.63 -> DA xxx T0078 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0114 <- 4.01 -> DT xxx T0080 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0116 <- 3.44 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0122 <- 4.24 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx O0159 <- 2.74 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0161 <- 3.72 -> DT xxx T0082 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0190 <- 3.73 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0205 <- 3.55 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0207 <- 3.30 -> DT xxx T0084 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0213 <- 3.91 -> DA xxx T0083 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0215 <- 3.26 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx >5oqj_O:TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH organism=? : H : THR OG1 O0124 <- 2.58 -> DA N3 T0081 : score 1.41342 : x : ASN xxxx O0069 <- 3.70 -> DA xxx T0081 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0071 <- 3.23 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0099 <- 3.63 -> DA xxx T0078 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0114 <- 4.01 -> DT xxx T0080 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0116 <- 3.44 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0122 <- 4.24 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx O0159 <- 2.74 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0161 <- 3.72 -> DT xxx T0082 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0190 <- 3.73 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0205 <- 3.55 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0207 <- 3.30 -> DT xxx T0084 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0213 <- 3.91 -> DA xxx T0083 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0215 <- 3.26 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx >5oqm_7AMOQRU:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;TATA-box_binding_protein-like;Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain; title=STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH AND CORE MEDIATOR organism=? : H : THR OG1 O0124 <- 2.75 -> DA N3 T0081 : score 1.36738 : H : ASN ND2 O0159 <- 2.98 -> DA N3 N0025 : score 3.67062 : x : ASN xxxx O0069 <- 3.92 -> DA xxx T0081 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0071 <- 3.23 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0099 <- 3.39 -> DT xxx T0079 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0114 <- 3.81 -> DT xxx T0080 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0116 <- 3.26 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0122 <- 4.18 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0161 <- 4.10 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0190 <- 3.86 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0205 <- 3.88 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0207 <- 3.85 -> DT xxx T0084 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0215 <- 3.58 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx >5oqp_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE S. CEREVISIAE CONDENSIN YCG1-BRN1 SUBCOMPLEX BOUND TO DNA (CRYSTAL FORM I) organism=? : x : ARG xxxx B0411 <- 2.91 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >5oqp_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE S. CEREVISIAE CONDENSIN YCG1-BRN1 SUBCOMPLEX BOUND TO DNA (CRYSTAL FORM I) organism=? : x : ARG xxxx B0411 <- 2.91 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >5orq_A:HCP-like;TPR-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DESIGNED CPPR-TELO1 IN COMPLEX WITH SSDNA organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : ASN ND2 A0044 <- 2.96 -> DT O2 B0002 : score 4.59428 : H : THR OG1 A0114 <- 2.96 -> DG N2 B0004 : score 3.88937 : H : THR OG1 A0149 <- 3.06 -> DG N2 B0005 : score 3.80902 : H : THR OG1 A0184 <- 3.04 -> DG N2 B0006 : score 3.82509 : H : ASP OD1 A0214 <- 2.80 -> DG N2 B0006 : score 5.15 : H : ASN ND2 A0219 <- 2.76 -> DT O2 B0007 : score 4.78412 : H : ASN ND2 A0254 <- 2.80 -> DT O2 B0008 : score 4.74615 : H : THR OG1 A0324 <- 2.87 -> DG N2 B0010 : score 3.9617 : H : ASP OD1 A0354 <- 2.79 -> DG N2 B0010 : score 5.1603 : x : VAL xxxx A0041 <- 3.79 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0075 <- 4.16 -> DA xxx B0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0076 <- 3.68 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0079 <- 3.36 -> DA xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0109 <- 2.89 -> DA xxx B0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0110 <- 3.56 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0111 <- 3.64 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0144 <- 2.74 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0145 <- 3.61 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0146 <- 3.62 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0147 <- 3.30 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0179 <- 2.80 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0180 <- 3.69 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0181 <- 3.48 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0182 <- 3.37 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0216 <- 3.43 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0217 <- 3.23 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0251 <- 3.43 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0285 <- 4.46 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0286 <- 3.63 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0289 <- 3.39 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0290 <- 4.50 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0319 <- 2.92 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0320 <- 3.69 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0321 <- 3.53 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0356 <- 3.61 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0357 <- 3.23 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx >5ot2_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX IN THE PRESENCE OF 3D-NAPHT-A organism=? : H : ARG NH2 A1386 <- 2.91 -> DT O2 T0015 : score 4.1402 >5ot2_AB: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX IN THE PRESENCE OF 3D-NAPHT-A organism=? : H : ARG NH2 A1386 <- 2.91 -> DT O2 T0015 : score 4.1402 : x : LYS xxxx B0507 <- 4.33 -> DA xxx N0001 : score x.xxxxx >5oxj_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF KLENTAQ MUTANT M747K IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH A O6-MEG:BENZITP BASE PAIR organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.85 -> DC O2 B0109 : score 2.91669 : w : LYS NZ A0540 <- 6.52 -> DG N2 B0108 : score 0.846 : w : LYS NZ A0540 <- 5.39 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 5.46 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.63 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.63 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.05 -> DG N3 B0110 : score 4.65013 : w : GLU OE1 A0615 <- 6.06 -> DC O2 C0205 : score 2.68 : w : ASN ND2 A0750 <- 6.29 -> DC O2 C0205 : score 1.885 : w : GLN NE2 A0754 <- 6.18 -> DC O2 C0205 : score 2.699 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.60 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : ARG xxxx A0587 <- 3.79 -> DC xxx B0111 : score x.xxxxx >5oy7_C:Histone-fold; title=STRUCTURE OF THE 4_601_157 TETRANUCLEOSOME (P1 FORM) organism=? : x : ARG xxxx C0035 <- 4.09 -> DA xxx h-352 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.45 -> DG xxx h-353 : score x.xxxxx >5sva_AZcdfjn:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;TATA-box_binding_protein-like;Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MEDIATOR-RNA POLYMERASE II PRE-INITIATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : THR OG1 j0124 <- 2.79 -> DT O2 m0144 : score 2.71953 : V : PHE CB j0099 <- 3.78 -> DT C7 m0143 : score 5.83003 : x : MET xxxx Z0459 <- 3.21 -> DT xxx m0103 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0785 <- 2.65 -> DC xxx m0105 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx j0069 <- 2.76 -> DA xxx m0145 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx j0071 <- 2.73 -> DA xxx m0145 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx j0100 <- 2.86 -> DA xxx m0142 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx j0101 <- 3.61 -> DT xxx m0143 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx j0114 <- 2.35 -> DT xxx m0143 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx j0116 <- 1.89 -> DA xxx l0023 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx j0122 <- 2.61 -> DA xxx l0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx j0159 <- 4.02 -> DA xxx l0020 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx j0161 <- 3.47 -> DA xxx l0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx j0190 <- 1.74 -> DA xxx l0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx j0191 <- 3.54 -> DA xxx m0149 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx j0205 <- 3.54 -> DA xxx l0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx j0207 <- 3.11 -> DT xxx m0148 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx j0213 <- 4.11 -> DT xxx m0148 : score x.xxxxx : x : THR xxxx j0215 <- 3.53 -> DA xxx l0020 : score x.xxxxx >5sva_Z:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MEDIATOR-RNA POLYMERASE II PRE-INITIATION COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : MET xxxx Z0459 <- 3.21 -> DT xxx m0103 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0785 <- 2.65 -> DC xxx m0105 : score x.xxxxx >5swm_A:Ribonuclease_H-like; title=BACILLUS HALODURANS RNASE H MUTANT D132N IN COMPLEX WITH 12-MER FRNA/DNA HYBRID organism=Bacillus halodurans : H : ASN ND2 A0077 <- 2.98 -> DG N3 D0008 : score 4.71866 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.15 -> DT O2 D0009 : score 4.41392 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.13 -> DT O2 D0009 : score 4.43291 : w : GLN OE1 A0134 <- 6.28 -> DT O2 D0011 : score 2.481 : w : GLN OE1 A0134 <- 5.60 -> DT O2 D0011 : score 2.481 : x : THR xxxx A0135 <- 3.95 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >5swm_AB:Ribonuclease_H-like; title=BACILLUS HALODURANS RNASE H MUTANT D132N IN COMPLEX WITH 12-MER FRNA/DNA HYBRID organism=Bacillus halodurans : H : ASN ND2 A0077 <- 2.98 -> DG N3 D0008 : score 4.71866 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.15 -> DT O2 D0009 : score 4.41392 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.13 -> DT O2 D0009 : score 4.43291 : w : GLN OE1 A0134 <- 6.28 -> DT O2 D0011 : score 2.481 : w : GLN OE1 A0134 <- 5.60 -> DT O2 D0011 : score 2.481 : H : ASN ND2 B0077 <- 3.07 -> DA N3 D0002 : score 3.60208 : H : ASN ND2 B0106 <- 3.20 -> DA N3 D0003 : score 3.50308 >5sww_A:Cytidine_deaminase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN APOBEC3A COMPLEXED WITH SSDNA organism=Homo sapiens : H : ASP OD1 A0131 <- 2.37 -> DT N3 E-001 : score 1.40345 : x : ILE xxxx A0026 <- 3.69 -> DA xxx E-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0028 <- 3.01 -> DA xxx E-002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0029 <- 3.36 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0030 <- 3.20 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0031 <- 3.01 -> DC xxx E0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0057 <- 3.13 -> DC xxx E0000 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0070 <- 3.28 -> DC xxx E0000 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0098 <- 3.25 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0130 <- 3.43 -> DC xxx E0000 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0132 <- 3.52 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx >5sww_BD:Cytidine_deaminase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN APOBEC3A COMPLEXED WITH SSDNA organism=Homo sapiens : H : ASP OD1 B0131 <- 2.34 -> DT N3 F-001 : score 1.4112 >5sy7_AB:PYP-like_sensor_domain_PAS_domain;HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETERODIMERIC NPAS3-ARNT COMPLEX WITH HRE DNA organism=MUS MUSCULUS : H : HIS NE2 A0094 <- 2.82 -> DG O6 C0013 : score 7.92203 : H : ARG NH2 A0102 <- 2.54 -> DG O6 C0011 : score 6.9432 : H : ARG NH2 B0071 <- 2.69 -> DG N7 D0013 : score 6.52508 : x : SER xxxx A0095 <- 4.08 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0098 <- 3.20 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0101 <- 2.98 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0063 <- 3.95 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0067 <- 4.03 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0070 <- 3.80 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >5sy7_B:PYP-like_sensor_domain_PAS_domain;HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETERODIMERIC NPAS3-ARNT COMPLEX WITH HRE DNA organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 B0071 <- 2.69 -> DG N7 D0013 : score 6.52508 : x : SER xxxx B0063 <- 3.95 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0067 <- 4.03 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0070 <- 3.80 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >5szt_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH 7-(N-(10- HYDROXYDECANOYL)-AMINOPENTENYL)-7-DEAZA-2'-DATP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.87 -> DC O2 B0109 : score 2.90491 : w : LYS NZ A0540 <- 5.68 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.97 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.69 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.83 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.63 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.72 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.25 -> DG N3 B0110 : score 4.45433 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.39 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : GLN xxxx A0754 <- 4.49 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >5szx_AB:Leucine_zipper_domain; title=EPSTEIN-BARR VIRUS ZTA DNA BINDING DOMAIN HOMODIMER IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=Epstein-Barr virus : H : ASN OD1 A0182 <- 3.17 -> DC N4 C0012 : score 3.88326 : H : ASN ND2 A0182 <- 2.66 -> DT O4 D0108 : score 5.43258 : H : SER OG A0186 <- 2.99 -> DT O4 C0011 : score 3.42003 : w : ARG NH1 A0190 <- 5.92 -> DC N4 C0010 : score 1.892 : H : ASN ND2 B0182 <- 2.48 -> DG N7 D0113 : score 4.8794 : H : ARG NH1 B0190 <- 3.13 -> DG N7 D0111 : score 5.6507 : H : ARG NH2 B0190 <- 2.80 -> DG O6 D0111 : score 6.6 : H : ARG NH2 B0190 <- 2.67 -> DG O6 C0009 : score 6.7716 : V : ALA CB A0185 <- 3.88 -> DT C7 D0108 : score 5.48699 : x : SER xxxx A0189 <- 4.25 -> DT xxx D0108 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0185 <- 4.04 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0189 <- 4.08 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >5szx_B:Leucine_zipper_domain; title=EPSTEIN-BARR VIRUS ZTA DNA BINDING DOMAIN HOMODIMER IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=Epstein-Barr virus : H : ASN ND2 B0182 <- 2.48 -> DG N7 D0113 : score 4.8794 : H : ARG NH1 B0190 <- 3.13 -> DG N7 D0111 : score 5.6507 : H : ARG NH2 B0190 <- 2.80 -> DG O6 D0111 : score 6.6 : H : ARG NH2 B0190 <- 2.67 -> DG O6 C0009 : score 6.7716 : w : ARG NH2 B0190 <- 6.23 -> DG N7 C0009 : score 2.18 : x : ALA xxxx B0185 <- 4.04 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0189 <- 4.08 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >5t00_D:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=HUMAN CTCF ZNF3-7 AND METHYLATED DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 D0339 <- 2.57 -> DG N7 F0014 : score 6.3283 : H : ARG NH2 D0339 <- 2.81 -> DG O6 F0014 : score 6.5868 : H : LYS NZ D0365 <- 2.60 -> DG O6 F0012 : score 6.012 : H : ARG NH1 D0368 <- 3.22 -> DG N7 F0011 : score 5.5418 : H : ARG NH2 D0368 <- 3.06 -> DG N7 F0011 : score 6.05262 : H : LYS NZ D0393 <- 2.66 -> DG O6 F0009 : score 5.94263 : H : LYS NZ D0393 <- 2.23 -> DG O6 F0010 : score 6.43978 : H : ARG NH1 D0396 <- 2.52 -> DA N7 F0007 : score 2.70363 : H : ARG NH2 D0396 <- 3.09 -> DG N7 F0008 : score 6.01431 : H : GLN OE1 D0418 <- 2.98 -> DA N6 F0007 : score 5.83467 : H : GLN NE2 D0418 <- 3.19 -> DA N7 F0007 : score 5.61474 : H : THR OG1 D0421 <- 2.74 -> DC N4 F0006 : score 4.08173 : w : SER OG D0450 <- 5.19 -> DT O4 E0014 : score 2.338 : H : ASP OD2 D0451 <- 2.76 -> DC N4 F0003 : score 6.2496 : w : ASP OD2 D0451 <- 5.11 -> DT O4 E0014 : score 2.798 : V : VAL CG2 D0454 <- 3.62 -> DT C7 E0014 : score 6.39862 : V : THR CG2 D0333 <- 3.60 -> DT C7 F0016 : score 4.44877 : x : GLU xxxx D0336 <- 3.27 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0343 <- 3.96 -> DG xxx F0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0362 <- 4.02 -> DG xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0390 <- 4.07 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0392 <- 3.34 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0448 <- 3.49 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx >5t01_AB:Leucine_zipper_domain;A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors; title=HUMAN C-JUN DNA BINDING DOMAIN HOMODIMER IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0258 <- 5.49 -> DG O6 D0027 : score 3.005 : w : LYS NZ A0258 <- 5.17 -> DG O6 C0013 : score 3.005 : w : ARG NH1 A0270 <- 6.28 -> DC N4 C0010 : score 1.892 : H : ASN OD1 B0262 <- 2.81 -> DC N4 D0034 : score 4.1852 : H : ASN ND2 B0262 <- 2.80 -> DT O4 C0007 : score 5.28462 : w : ASN ND2 B0262 <- 6.27 -> DA N6 C0006 : score 2.5 : H : ARG NH1 B0270 <- 3.04 -> DG N7 D0032 : score 5.7596 : H : ARG NH2 B0270 <- 2.79 -> DG O6 D0032 : score 6.6132 : V : ALA CB B0266 <- 3.61 -> DT C7 D0033 : score 5.86493 : x : ASN xxxx A0262 <- 3.87 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0266 <- 4.00 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0265 <- 3.94 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >5t01_B:Leucine_zipper_domain;A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors; title=HUMAN C-JUN DNA BINDING DOMAIN HOMODIMER IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 B0262 <- 2.81 -> DC N4 D0034 : score 4.1852 : H : ASN ND2 B0262 <- 2.80 -> DT O4 C0007 : score 5.28462 : w : ASN ND2 B0262 <- 6.27 -> DA N6 C0006 : score 2.5 : H : ARG NH1 B0270 <- 3.04 -> DG N7 D0032 : score 5.7596 : H : ARG NH2 B0270 <- 2.79 -> DG O6 D0032 : score 6.6132 : V : ALA CB B0266 <- 3.61 -> DT C7 D0033 : score 5.86493 : x : ALA xxxx B0265 <- 3.94 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >5t0u_D:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CTCF ZNF2-7 AND DNA COMPLEX STRUCTURE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 D0339 <- 2.75 -> DG N7 F0014 : score 6.1105 : H : GLU OE2 D0362 <- 2.97 -> DC N4 F0013 : score 5.08636 : H : LYS NZ D0365 <- 2.51 -> DG O6 F0012 : score 6.11605 : H : ARG NH2 D0368 <- 2.91 -> DG N7 F0011 : score 6.24415 : H : LYS NZ D0393 <- 2.79 -> DG N7 F0009 : score 5.39667 : H : LYS NZ D0393 <- 2.89 -> DG O6 F0009 : score 5.67672 : H : ARG NH1 D0396 <- 3.31 -> DG O6 F0008 : score 5.46283 : H : ARG NH2 D0396 <- 3.08 -> DG N7 F0008 : score 6.02708 : H : GLN OE1 D0418 <- 3.13 -> DA N6 F0007 : score 5.65309 : H : GLN NE2 D0418 <- 3.14 -> DA N7 F0007 : score 5.67564 : H : THR OG1 D0421 <- 2.96 -> DC N4 F0006 : score 3.90427 : H : ASP OD1 D0451 <- 2.83 -> DC N4 F0003 : score 5.3128 : x : THR xxxx D0305 <- 4.45 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0307 <- 4.05 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0308 <- 3.75 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0333 <- 4.17 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0334 <- 4.20 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0336 <- 3.00 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0343 <- 3.63 -> DG xxx F0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0364 <- 4.12 -> DC xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0390 <- 4.47 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0392 <- 3.40 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0417 <- 4.33 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0448 <- 3.66 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0450 <- 3.38 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx >5t14_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE KAPPA EXTENDING BEYOND A BULKY MAJOR BENZO[A]PYRENE ADDUCT organism=Homo sapiens : x : MET xxxx B0135 <- 3.59 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0151 <- 3.41 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0419 <- 3.44 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0459 <- 4.44 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >5t1j_B:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TBOX DNA BINDING DOMAIN OF THE TRANSCRIPTION FACTOR T-BET organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 B0164 <- 3.01 -> DG N7 D0517 : score 6.11646 : x : THR xxxx B0303 <- 3.57 -> DT xxx C0505 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0320 <- 3.68 -> DG xxx D0515 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0324 <- 3.34 -> DT xxx D0516 : score x.xxxxx >5t2h_A:Homing_endonucleases; title=ENGINEERED VARIANT OF I-ONUI MEGANUCLEASE TARGETING THE HUMAN TCRA GENE; HARBORS 43 POINT MUTATIONS RELATIVE TO WILD-TYPE I-ONUI organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : ARG NH1 A0032 <- 2.67 -> DG O6 B0003 : score 6.2415 : H : ARG NH2 A0032 <- 2.96 -> DG N7 B0003 : score 6.18031 : H : ARG NH1 A0044 <- 3.13 -> DT O4 B0006 : score 3.05226 : H : ARG NH2 A0044 <- 2.77 -> DT O4 B0006 : score 3.57517 : H : GLN NE2 A0046 <- 2.95 -> DG N7 C0017 : score 4.07276 : H : GLN NE2 A0046 <- 3.34 -> DG N7 C0018 : score 3.74526 : H : ARG NH1 A0080 <- 2.75 -> DG O6 B0007 : score 6.14417 : H : ARG NH2 A0080 <- 3.19 -> DG N7 B0007 : score 5.88662 : H : ASN OD1 A0184 <- 2.94 -> DA N6 B0019 : score 5.85318 : H : ARG NH1 A0199 <- 2.88 -> DG O6 B0018 : score 5.986 : H : ARG NH2 A0199 <- 3.33 -> DG N7 B0018 : score 5.70785 : H : SER OG A0203 <- 3.24 -> DA N7 B0015 : score 4.07126 : H : LYS NZ A0227 <- 2.35 -> DG O6 C0010 : score 6.30104 : H : LYS NZ A0229 <- 2.63 -> DG O6 C0012 : score 5.97732 : H : GLU OE1 A0236 <- 2.92 -> DC N4 B0016 : score 5.62952 : w : GLU OE1 A0238 <- 5.96 -> DC N4 C0008 : score 3.528 : w : GLU OE2 A0238 <- 5.97 -> DC N4 C0008 : score 3.597 : V : ALA CB A0076 <- 3.59 -> DT C7 C0015 : score 5.89292 : V : PHE CB A0232 <- 3.66 -> DT C7 B0013 : score 6.00406 : V : LYS CB A0186 <- 3.83 -> DT C7 B0020 : score 2.28835 : x : ARG xxxx A0030 <- 3.51 -> DA xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0038 <- 4.41 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 2.79 -> DG xxx C0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 4.03 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0048 <- 3.54 -> DA xxx C0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0072 <- 3.19 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0078 <- 3.41 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0082 <- 3.58 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0180 <- 3.84 -> DC xxx B0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0195 <- 3.52 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0225 <- 3.57 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0234 <- 3.15 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 3.98 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >5t2n_A:Homing_endonucleases; title=ENGINEERED VARIANT OF I-ONUI MEGANUCLEASE TARGETING THE ANOPHELES AGAP007280 GENE; HARBORS 38 POINT MUTATIONS RELATIVE TO WILD-TYPE I- ONUI organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : ARG NH2 A0028 <- 2.74 -> DG N7 C0020 : score 6.46123 : H : ARG NH1 A0030 <- 2.96 -> DG O6 C0021 : score 5.88867 : H : ARG NH2 A0030 <- 2.93 -> DG N7 C0021 : score 6.21862 : H : GLU OE1 A0042 <- 3.26 -> DC N4 B0005 : score 5.2373 : w : GLU OE2 A0042 <- 5.97 -> DC N4 B0006 : score 3.597 : w : SER OG A0046 <- 6.15 -> DG O6 C0018 : score 2.749 : H : LYS NZ A0048 <- 2.87 -> DG O6 C0016 : score 5.69984 : w : LYS NZ A0048 <- 6.05 -> DA N6 C0015 : score 2.097 : w : THR OG1 A0070 <- 5.60 -> DC N4 B0008 : score 2.558 : H : ASN OD1 A0072 <- 2.83 -> DA N6 B0009 : score 5.98566 : H : ASN ND2 A0072 <- 3.22 -> DA N7 B0009 : score 5.37739 : H : ARG NH2 A0080 <- 2.55 -> DT O4 B0007 : score 3.73154 : w : ASN ND2 A0184 <- 5.80 -> DC N4 B0018 : score 2.395 : H : ARG NH1 A0188 <- 2.75 -> DG O6 C0004 : score 6.14417 : H : ARG NH2 A0188 <- 2.93 -> DG N7 C0004 : score 6.21862 : H : GLN NE2 A0197 <- 2.98 -> DG N7 C0006 : score 4.04756 : w : GLN OE1 A0197 <- 5.67 -> DA N6 C0007 : score 3.392 : w : TYR OH A0223 <- 5.26 -> DA N7 C0007 : score 3.238 : H : ARG NH1 A0229 <- 3.04 -> DG O6 C0012 : score 5.79133 : H : ARG NH2 A0229 <- 3.05 -> DT O4 B0013 : score 3.37615 : H : ARG NH1 A0238 <- 3.01 -> DG O6 C0008 : score 5.82783 : H : ARG NH2 A0238 <- 3.15 -> DG O6 C0008 : score 6.138 : H : ARG NH2 A0238 <- 2.65 -> DG O6 C0009 : score 6.798 : w : ARG NH1 A0238 <- 5.97 -> DA N7 C0007 : score 0.388 : V : THR CB A0070 <- 3.82 -> DT C7 B0007 : score 3.50852 : V : LEU CD1 A0232 <- 3.85 -> DT C7 B0013 : score 5.65964 : V : SER CB A0203 <- 3.51 -> DT C7 B0015 : score 3.3583 : x : SER xxxx A0024 <- 4.15 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0026 <- 3.91 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0035 <- 3.82 -> DC xxx B0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0040 <- 3.58 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0078 <- 3.34 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0082 <- 4.37 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0140 <- 3.35 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0180 <- 3.93 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0186 <- 3.44 -> DC xxx B0020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0225 <- 4.21 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0227 <- 3.15 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0234 <- 3.09 -> DC xxx B0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 3.64 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx >5t2o_A:Homing_endonucleases; title=ENGINEERED VARIANT OF I-ONUI MEGANUCLEASE TARGETING THE ANOPHELES AGAP011377 GENE; HARBORS 53 POINT MUTATIONS RELATIVE TO WILD-TYPE I- ONUI organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : ARG NH2 A0042 <- 2.43 -> DG O6 B0005 : score 7.0884 : w : THR OG1 A0044 <- 5.83 -> DG O6 B0006 : score 2.729 : H : GLN NE2 A0078 <- 3.30 -> DT O4 C0017 : score 4.67192 : H : ARG NH1 A0080 <- 2.81 -> DT O4 C0018 : score 3.26141 : w : ARG NE A0080 <- 6.27 -> DG O6 B0006 : score 1.369 : w : ARG NH2 A0080 <- 5.49 -> DG O6 B0006 : score 2.468 : H : GLN OE1 A0195 <- 3.06 -> DA N6 C0005 : score 5.73783 : H : GLN NE2 A0195 <- 3.06 -> DA N7 C0005 : score 5.77308 : H : ARG NH1 A0197 <- 3.11 -> DG O6 C0006 : score 5.70617 : H : ARG NH1 A0197 <- 2.76 -> DT O4 B0019 : score 3.29409 : H : ARG NH1 A0199 <- 2.31 -> DG O6 B0018 : score 6.6795 : H : ARG NH2 A0199 <- 2.36 -> DG N7 B0018 : score 6.94646 : w : ARG NH1 A0199 <- 5.80 -> DA N6 C0007 : score 1.486 : H : GLU OE2 A0201 <- 2.39 -> DC N4 B0017 : score 5.69715 : H : LYS NZ A0227 <- 2.60 -> DG O6 C0009 : score 6.012 : H : LYS NZ A0229 <- 3.08 -> DG N7 C0012 : score 5.08429 : H : LYS NZ A0229 <- 3.05 -> DG O6 C0012 : score 5.49173 : H : LYS NZ A0229 <- 3.22 -> DT O4 B0013 : score 3.28586 : V : SER CB A0026 <- 3.70 -> DT C7 C0018 : score 3.20956 : V : ALA CB A0186 <- 3.76 -> DT C7 B0019 : score 5.65496 : x : SER xxxx A0024 <- 3.81 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0028 <- 3.40 -> DC xxx C0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0040 <- 3.33 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0070 <- 2.98 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0072 <- 3.60 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0076 <- 3.66 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0140 <- 3.77 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0180 <- 3.33 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0225 <- 3.77 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0232 <- 3.77 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0234 <- 3.24 -> DC xxx B0014 : score x.xxxxx >5t2w_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=STRUCTURE OF THYMINE DNA GLYCOSYLASE BOUND TO SUBSTRATE ANALOG 2'-F-5- FORMYL-DC organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0158 <- 5.75 -> DT O2 C0013 : score 3.682 : H : LYS NZ A0201 <- 3.11 -> DT O4 C0009 : score 3.36477 : H : GLN OE1 A0278 <- 2.74 -> DG N2 D0018 : score 5.67498 : H : GLN NE2 A0278 <- 2.79 -> DT O2 D0019 : score 3.9412 : x : SER xxxx A0200 <- 4.23 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0248 <- 3.66 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0274 <- 3.25 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.60 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0276 <- 3.90 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 3.34 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >5t4i_A:His-Me_finger_endonucleases; title=A NOVEL DOMAIN IN HUMAN EXOG CONVERTS APOPTOTIC ENDONUCLEASE TO DNA- REPAIR ENZYME organism=Homo sapiens : H : SER OG A0172 <- 2.67 -> DT O2 E0002 : score 3.79357 : H : ASN ND2 A0176 <- 3.02 -> DC O2 E0001 : score 4.28239 : H : LYS NZ A0315 <- 3.00 -> DG O6 F0010 : score 5.54954 : x : ARG xxxx A0109 <- 3.80 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0110 <- 3.26 -> DG xxx F0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0168 <- 4.22 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0307 <- 4.33 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0311 <- 3.49 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0314 <- 3.81 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0324 <- 4.23 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx >5t5c_B:His-Me_finger_endonucleases; title=A NOVEL DOMAIN IN HUMAN EXOG CONVERTS APOPTOTIC ENDONUCLEASE TO DNA- REPAIR ENZYME organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0110 <- 2.72 -> DG O6 E0003 : score 5.87326 : H : LYS NZ B0110 <- 3.13 -> DT O4 F0007 : score 3.35043 : H : ASN ND2 B0176 <- 2.97 -> DC O2 E0001 : score 4.32718 : x : ARG xxxx B0109 <- 3.68 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0168 <- 4.17 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0172 <- 3.24 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0307 <- 4.43 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0311 <- 3.66 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0314 <- 3.80 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0315 <- 3.07 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0320 <- 3.80 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx >5t5k_ABCDEF:Histone-fold; title=STRUCTURE OF HISTONE-BASED CHROMATIN IN ARCHAEA organism=Methanothermus fervidus : x : ARG xxxx A0019 <- 3.42 -> DA xxx I0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0019 <- 3.64 -> DA xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0019 <- 3.65 -> DT xxx I0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0019 <- 3.80 -> DT xxx I0058 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0019 <- 3.39 -> DG xxx J0067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0019 <- 4.48 -> DT xxx I0010 : score x.xxxxx >5t5k_E:Histone-fold; title=STRUCTURE OF HISTONE-BASED CHROMATIN IN ARCHAEA organism=Methanothermus fervidus : x : ARG xxxx E0019 <- 3.39 -> DG xxx J0067 : score x.xxxxx >5t7x_AB:Viral_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HHV-4 EBNA1 DNA BINDING DOMAIN (PATIENT-DERIVED, NASOPHARYNGEAL CARCINOMA) BOUND TO DNA organism=Human herpesvirus 4 (strain B95-8) / Human herpesvirus 4 (strain B95-8) / Human herpesvirus 4 (strain B95-8) / Human herpesvirus 4 (strain B95-8) : H : LYS NZ A0477 <- 2.98 -> DG O6 D0202 : score 5.57266 : H : LYS NZ A0477 <- 3.09 -> DG O6 D0203 : score 5.44548 : w : LYS NZ A0477 <- 5.41 -> DA N6 C0115 : score 2.097 : w : LYS NZ A0514 <- 5.38 -> DG N7 C0112 : score 2.519 : H : LYS NZ B0461 <- 2.99 -> DT O2 C0104 : score 3.45087 : H : LYS NZ B0477 <- 3.08 -> DG O6 C0102 : score 5.45705 : w : LYS NZ B0477 <- 5.49 -> DA N6 D0215 : score 2.097 : w : LYS NZ B0514 <- 5.45 -> DG N7 D0212 : score 2.519 : x : TRP xxxx A0464 <- 3.47 -> DG xxx C0112 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0465 <- 3.49 -> DT xxx C0114 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0469 <- 3.80 -> DT xxx C0111 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0478 <- 4.50 -> DT xxx C0114 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0515 <- 3.44 -> DG xxx D0203 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0518 <- 3.46 -> DC xxx C0113 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0519 <- 3.85 -> DG xxx D0202 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0522 <- 4.19 -> DT xxx C0114 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0464 <- 3.68 -> DC xxx C0107 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0465 <- 3.56 -> DT xxx D0214 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0515 <- 3.40 -> DA xxx C0103 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0518 <- 3.43 -> DC xxx D0213 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0519 <- 3.79 -> DG xxx C0102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0522 <- 4.22 -> DT xxx D0214 : score x.xxxxx >5t7x_B:Viral_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HHV-4 EBNA1 DNA BINDING DOMAIN (PATIENT-DERIVED, NASOPHARYNGEAL CARCINOMA) BOUND TO DNA organism=Human herpesvirus 4 (strain B95-8) / Human herpesvirus 4 (strain B95-8) : H : LYS NZ B0461 <- 2.99 -> DT O2 C0104 : score 3.45087 : H : LYS NZ B0477 <- 3.08 -> DG O6 C0102 : score 5.45705 : w : LYS NZ B0477 <- 5.49 -> DA N6 D0215 : score 2.097 : w : LYS NZ B0514 <- 5.45 -> DG N7 D0212 : score 2.519 : x : TRP xxxx B0464 <- 3.68 -> DC xxx C0107 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0465 <- 3.56 -> DT xxx D0214 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0515 <- 3.40 -> DA xxx C0103 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0518 <- 3.43 -> DC xxx D0213 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0519 <- 3.79 -> DG xxx C0102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0522 <- 4.22 -> DT xxx D0214 : score x.xxxxx >5t8d_A:Homing_endonucleases; title=ENGINEERED VARIANT OF I-ONUI MEGANUCLEASE TARGETING THE HIV INTEGRASE GENE; HARBORS 47 POINT MUTATIONS RELATIVE TO WILD-TYPE I-ONUI organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : ARG NH1 A0042 <- 2.71 -> DG O6 B0007 : score 6.19283 : H : ARG NH2 A0042 <- 2.41 -> DG N7 B0007 : score 6.88262 : H : LYS NZ A0044 <- 2.76 -> DG O6 C0019 : score 5.82702 : w : LYS NZ A0044 <- 5.12 -> DT O4 C0018 : score 1.7 : w : LYS NZ A0044 <- 5.64 -> DG O6 B0008 : score 3.005 : w : THR OG1 A0046 <- 5.41 -> DT O4 C0018 : score 2.809 : H : THR OG1 A0048 <- 2.81 -> DC N4 C0017 : score 4.02527 : H : ASN OD1 A0072 <- 2.81 -> DA N6 B0010 : score 6.00975 : H : ASN ND2 A0072 <- 2.93 -> DG O6 B0011 : score 5.49186 : H : GLU OE2 A0184 <- 2.82 -> DC N4 B0020 : score 5.24432 : w : GLU OE1 A0184 <- 5.79 -> DA N6 B0021 : score 2.939 : w : GLU OE2 A0184 <- 6.09 -> DC N4 B0019 : score 3.597 : w : ARG NH1 A0190 <- 5.92 -> DA N7 C0003 : score 0.388 : w : ARG NH2 A0190 <- 5.40 -> DA N7 C0003 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0197 <- 3.20 -> DG N7 C0006 : score 5.566 : H : ARG NH2 A0197 <- 2.81 -> DG O6 C0006 : score 6.5868 : w : ARG NH2 A0197 <- 5.73 -> DA N6 B0021 : score 1.997 : H : ARG NH1 A0199 <- 2.85 -> DG O6 C0008 : score 6.0225 : H : ARG NH2 A0199 <- 2.89 -> DT O4 C0007 : score 3.48988 : w : GLU OE2 A0201 <- 5.79 -> DC N4 B0019 : score 3.597 : H : GLN OE1 A0227 <- 3.13 -> DA N6 C0010 : score 5.65309 : H : GLN NE2 A0227 <- 2.59 -> DA N7 C0010 : score 6.34551 : H : ARG NH1 A0236 <- 3.07 -> DG O6 C0009 : score 5.75483 : H : ARG NH2 A0236 <- 2.63 -> DG N7 C0009 : score 6.60169 : H : ARG NH2 A0236 <- 2.86 -> DG O6 C0009 : score 6.5208 : w : LYS NZ A0299 <- 6.69 -> DG N2 C0012 : score 0.846 : V : ARG CG A0232 <- 3.69 -> DT C7 B0015 : score 1.03277 : V : ALA CB A0076 <- 3.55 -> DT C7 C0015 : score 5.94891 : x : SER xxxx A0024 <- 4.07 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0028 <- 3.62 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0068 <- 3.89 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0070 <- 3.76 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0080 <- 3.41 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0140 <- 4.43 -> DA xxx C0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0180 <- 3.80 -> DT xxx B0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0186 <- 3.66 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0195 <- 3.55 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 4.01 -> DA xxx B0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0225 <- 3.88 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0229 <- 3.59 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0234 <- 3.37 -> DC xxx B0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0238 <- 4.24 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0240 <- 4.12 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >5t9j_B:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN GEN1 IN COMPLEX WITH HOLLIDAY JUNCTION DNA IN THE UPPER INTERFACE organism=Homo sapiens : x : VAL xxxx B0041 <- 4.19 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0043 <- 3.18 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0044 <- 3.21 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 4.48 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0051 <- 3.93 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0054 <- 2.83 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0055 <- 3.36 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx >5tb8_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=PRECATALYTIC TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA IN CLOSED CONFORMATION WITH GAPPED DNA SUBSTRATE INCOMING (-)3TC-TP AND MN2+. organism=HOMO SAPIENS : w : LYS NZ A0234 <- 5.92 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : ARG NH1 A0258 <- 5.99 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : H : TYR OH A0271 <- 3.22 -> DG N2 T0007 : score 4.47901 : w : TYR OH A0271 <- 6.02 -> DC O2 T0008 : score 1.343 : w : ARG NH1 A0283 <- 6.01 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A0295 <- 6.09 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.74 -> DC O2 T0008 : score 1.988 >5tba_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=POSTCATALYTIC TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH GAPPED DNA SUBSTRATE, INCORPORATED (-)3TC AND PPI. organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.28 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.77 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.71 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5tbb_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=POSTCATALYTIC TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH GAPPED DNA SUBSTRATE, INCORPORATED (-)FTC AND PPI. organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.28 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.66 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.67 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5tbc_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=PRECATALYTIC TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH GAPPED DNA SUBSTRATE, INCORPORATED (-)3TC-MP AND AN ANOTHER INCOMING (-)3TC- TP NUCLEOTIDE. organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0041 <- 6.44 -> DG N2 D0001 : score 0.846 : x : HIS xxxx A0034 <- 3.39 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.85 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.59 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5tgx_A: title=RESTRICTION/MODIFICATION SYSTEM-TYPE II R-SWAI COMPLEXED WITH PARTIALLY CLEAVED DNA organism=Staphylococcus warneri : H : ARG NH1 A0035 <- 2.87 -> DA N3 H0026 : score 3.6305 : H : ARG NH1 A0035 <- 2.87 -> DA N3 H0026 : score 3.6305 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.90 -> DT O2 I0014 : score 4.14867 : H : LYS NZ A0072 <- 2.82 -> DT O2 I0028 : score 3.57283 : H : LYS NZ A0072 <- 2.86 -> DT O2 H0012 : score 3.54413 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.02 -> DT O4 H0028 : score 5.05209 : H : ASP OD2 A0107 <- 3.02 -> DA N6 H0026 : score 3.82645 : H : LYS NZ A0166 <- 2.97 -> DT O4 I0013 : score 3.46522 : H : LYS NZ A0166 <- 2.97 -> DT O4 I0013 : score 3.46522 : H : GLN OE1 A0170 <- 3.06 -> DA N6 I0011 : score 5.73783 : H : GLN NE2 A0170 <- 2.97 -> DT O4 I0012 : score 5.01453 : V : ASN CG A0164 <- 3.68 -> DT C7 I0012 : score 2.72765 : x : ASP xxxx A0103 <- 4.07 -> DT xxx H0028 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0104 <- 3.71 -> DA xxx H0027 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0106 <- 3.97 -> DA xxx H0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0162 <- 3.52 -> DC xxx I0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0168 <- 3.71 -> DT xxx H0014 : score x.xxxxx >5tgx_AB: title=RESTRICTION/MODIFICATION SYSTEM-TYPE II R-SWAI COMPLEXED WITH PARTIALLY CLEAVED DNA organism=Staphylococcus warneri : H : ARG NH1 A0035 <- 2.87 -> DA N3 H0026 : score 3.6305 : H : ARG NH1 A0035 <- 2.87 -> DA N3 H0026 : score 3.6305 : H : ARG NH2 A0035 <- 2.90 -> DT O2 I0014 : score 4.14867 : H : LYS NZ A0072 <- 2.82 -> DT O2 I0028 : score 3.57283 : H : LYS NZ A0072 <- 2.86 -> DT O2 H0012 : score 3.54413 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.02 -> DT O4 H0028 : score 5.05209 : H : ASP OD2 A0107 <- 3.02 -> DA N6 H0026 : score 3.82645 : H : LYS NZ A0166 <- 2.97 -> DT O4 I0013 : score 3.46522 : H : LYS NZ A0166 <- 2.97 -> DT O4 I0013 : score 3.46522 : H : GLN OE1 A0170 <- 3.06 -> DA N6 I0011 : score 5.73783 : H : GLN NE2 A0170 <- 2.97 -> DT O4 I0012 : score 5.01453 : H : ARG NH1 B0035 <- 2.86 -> DA N3 I0026 : score 3.63787 : H : ARG NH2 B0035 <- 2.88 -> DT O2 H0014 : score 4.1656 : H : LYS NZ B0072 <- 2.93 -> DT O2 I0012 : score 3.49391 : H : LYS NZ B0072 <- 2.79 -> DT O2 H0028 : score 3.59435 : H : ASN ND2 B0105 <- 2.91 -> DT O4 I0028 : score 5.16835 : H : LYS NZ B0166 <- 2.94 -> DT O4 H0013 : score 3.48674 : H : GLN OE1 B0170 <- 3.06 -> DA N6 H0011 : score 5.73783 : H : GLN NE2 B0170 <- 2.98 -> DT O4 H0012 : score 5.00415 : V : ASN CG A0164 <- 3.68 -> DT C7 I0012 : score 2.72765 : V : ASN CG B0164 <- 3.70 -> DT C7 H0012 : score 2.71441 : x : ASP xxxx A0103 <- 4.07 -> DT xxx H0028 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0104 <- 3.71 -> DA xxx H0027 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0106 <- 3.97 -> DA xxx H0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0162 <- 3.52 -> DC xxx I0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0168 <- 3.71 -> DT xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0038 <- 4.33 -> DA xxx I0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0103 <- 4.00 -> DT xxx I0028 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0104 <- 3.70 -> DA xxx I0027 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0106 <- 4.02 -> DA xxx I0026 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0107 <- 3.13 -> DA xxx I0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0162 <- 3.61 -> DC xxx H0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0168 <- 3.79 -> DT xxx I0014 : score x.xxxxx >5tgx_CD: title=RESTRICTION/MODIFICATION SYSTEM-TYPE II R-SWAI COMPLEXED WITH PARTIALLY CLEAVED DNA organism=Staphylococcus warneri : H : ARG NH1 C0035 <- 2.86 -> DA N3 J0026 : score 3.63787 : H : ARG NH2 C0035 <- 2.95 -> DT O2 K0014 : score 4.10633 : H : LYS NZ C0072 <- 2.84 -> DT O2 J0012 : score 3.55848 : H : LYS NZ C0072 <- 2.75 -> DT O2 K0028 : score 3.62305 : H : ASN ND2 C0105 <- 2.88 -> DT O4 J0028 : score 5.20006 : H : LYS NZ C0166 <- 2.97 -> DT O4 K0013 : score 3.46522 : H : GLN OE1 C0170 <- 3.05 -> DA N6 K0011 : score 5.74994 : H : GLN NE2 C0170 <- 2.93 -> DT O4 K0012 : score 5.05606 : H : ARG NH1 D0035 <- 2.97 -> DA N3 K0026 : score 3.55686 : H : ARG NH1 D0035 <- 2.97 -> DA N3 K0026 : score 3.55686 : H : ARG NH2 D0035 <- 2.93 -> DT O2 J0014 : score 4.12327 : H : LYS NZ D0072 <- 2.86 -> DT O2 J0028 : score 3.54413 : H : LYS NZ D0072 <- 2.95 -> DT O2 K0012 : score 3.47956 : H : ASN ND2 D0105 <- 2.81 -> DT O4 K0028 : score 5.27405 : H : LYS NZ D0166 <- 2.99 -> DT O4 J0013 : score 3.45087 : H : LYS NZ D0166 <- 2.99 -> DT O4 J0013 : score 3.45087 : H : GLN OE1 D0170 <- 3.03 -> DA N6 J0011 : score 5.77415 : H : GLN NE2 D0170 <- 3.05 -> DT O4 J0012 : score 4.93147 : V : ASN CG D0164 <- 3.75 -> DT C7 J0012 : score 2.68131 : V : ASN CG C0164 <- 3.73 -> DT C7 K0012 : score 2.69455 : x : ASP xxxx C0103 <- 3.89 -> DT xxx J0028 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0104 <- 3.66 -> DA xxx J0027 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0106 <- 4.00 -> DA xxx J0026 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0107 <- 3.16 -> DA xxx J0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0162 <- 3.56 -> DC xxx K0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0168 <- 3.68 -> DT xxx J0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0103 <- 3.98 -> DT xxx K0028 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0104 <- 3.70 -> DA xxx K0027 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0106 <- 3.96 -> DA xxx K0026 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0107 <- 3.18 -> DA xxx K0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0162 <- 3.58 -> DC xxx J0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0168 <- 3.70 -> DT xxx K0014 : score x.xxxxx >5th3_AB: title=RESTRICTION/MODIFICATION SYSTEM-TYPE II R.SWAI CLEAVED DNA COMPLEX organism=Staphylococcus warneri : H : ARG NH2 A0035 <- 2.77 -> DT O2 I0014 : score 4.25873 : H : LYS NZ A0166 <- 2.85 -> DT O4 I0013 : score 3.55131 : H : GLN OE1 A0170 <- 3.11 -> DA N6 I0011 : score 5.67731 : H : GLN NE2 A0170 <- 3.02 -> DT O4 I0012 : score 4.96262 : H : LYS NZ B0072 <- 2.90 -> DT O2 I0012 : score 3.51544 : V : ASN CG A0164 <- 3.73 -> DT C7 I0012 : score 2.69455 >5th3_C: title=RESTRICTION/MODIFICATION SYSTEM-TYPE II R.SWAI CLEAVED DNA COMPLEX organism=Staphylococcus warneri : H : ARG NH2 C0035 <- 2.85 -> DT O2 K0014 : score 4.191 : H : LYS NZ C0166 <- 2.82 -> DT O4 K0013 : score 3.57283 : H : GLN OE1 C0170 <- 3.03 -> DA N6 K0011 : score 5.77415 : H : GLN NE2 C0170 <- 2.93 -> DT O4 K0012 : score 5.05606 : V : ASN CG C0164 <- 3.66 -> DT C7 K0012 : score 2.74089 >5th3_CD: title=RESTRICTION/MODIFICATION SYSTEM-TYPE II R.SWAI CLEAVED DNA COMPLEX organism=Staphylococcus warneri : H : ARG NH2 C0035 <- 2.85 -> DT O2 K0014 : score 4.191 : H : LYS NZ C0166 <- 2.82 -> DT O4 K0013 : score 3.57283 : H : GLN OE1 C0170 <- 3.03 -> DA N6 K0011 : score 5.77415 : H : GLN NE2 C0170 <- 2.93 -> DT O4 K0012 : score 5.05606 : H : LYS NZ D0072 <- 2.90 -> DT O2 K0012 : score 3.51544 : V : ASN CG C0164 <- 3.66 -> DT C7 K0012 : score 2.74089 >5thg_A:Homing_endonucleases; title=ENGINEERED VARIANT OF I-ONUI MEGANUCLEASE TARGETING THE HIV CCR5 GENE; HARBORS 43 POINT MUTATIONS RELATIVE TO WILD-TYPE I-ONUI organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : ARG NH1 A0028 <- 2.78 -> DG O6 C0022 : score 6.10767 : H : ARG NH2 A0028 <- 3.07 -> DG N7 C0022 : score 6.03985 : H : ARG NH1 A0030 <- 2.94 -> DG O6 C0023 : score 5.913 : H : ARG NH2 A0030 <- 3.35 -> DG N7 C0023 : score 5.68231 : H : GLU OE2 A0046 <- 3.23 -> DC N4 C0020 : score 4.81256 : H : ARG NH2 A0072 <- 3.28 -> DG N7 B0011 : score 5.77169 : H : ARG NH1 A0078 <- 2.94 -> DG O6 B0011 : score 5.913 : H : ARG NH2 A0078 <- 2.88 -> DG O6 B0011 : score 6.4944 : H : ARG NH2 A0078 <- 3.04 -> DG O6 B0012 : score 6.2832 : H : ARG NE A0197 <- 2.61 -> DG N7 C0007 : score 4.58982 : H : ARG NH1 A0197 <- 2.45 -> DG O6 C0007 : score 6.50917 : H : ARG NH2 A0199 <- 2.36 -> DG O6 B0022 : score 7.1808 : H : GLN OE1 A0225 <- 3.42 -> DC N4 C0010 : score 4.015 : H : LYS NZ A0227 <- 2.66 -> DA N7 C0012 : score 3.01942 : V : TYR CD2 A0040 <- 3.51 -> DT C7 B0006 : score 4.0128 : V : THR CB A0048 <- 3.79 -> DT C7 C0018 : score 3.53497 : x : SER xxxx A0024 <- 4.40 -> DC xxx C0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0026 <- 3.20 -> DC xxx C0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 4.04 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0076 <- 4.31 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0140 <- 4.40 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0180 <- 4.05 -> DT xxx B0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0182 <- 3.66 -> DT xxx B0020 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0184 <- 3.22 -> DG xxx B0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0195 <- 4.35 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0201 <- 3.64 -> DT xxx B0020 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0234 <- 3.18 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0236 <- 3.61 -> DT xxx B0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 4.21 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0299 <- 4.49 -> DT xxx B0018 : score x.xxxxx >5tkz_AB:RNA-binding_domain,_RBD; title=MEC-8 N-TERMINAL RRM BOUND TO TANDEM GCAC LIGAND organism=Caenorhabditis elegans : H : THR OG1 A0065 <- 3.16 -> DG N2 C0036 : score 3.72866 : w : SER OG A0073 <- 6.39 -> DA N6 C0035 : score 2.209 : H : ARG NH2 A0107 <- 2.46 -> DG N7 C0036 : score 6.81877 : H : SER OG A0113 <- 2.87 -> DC N4 C0039 : score 3.62418 : w : SER OG B0073 <- 5.89 -> DA N6 C0015 : score 2.209 : H : GLU OE1 B0109 <- 3.05 -> DC N4 C0017 : score 5.47955 : H : SER OG B0113 <- 2.96 -> DC N4 C0019 : score 3.55802 : w : SER OG B0113 <- 5.86 -> DA N7 C0018 : score 2.343 : x : THR xxxx A0032 <- 4.42 -> DA xxx C0038 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0034 <- 3.47 -> DC xxx C0037 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0036 <- 3.54 -> DG xxx C0036 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0061 <- 4.15 -> DA xxx C0038 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0072 <- 4.09 -> DG xxx C0036 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0075 <- 3.49 -> DG xxx C0036 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0077 <- 3.48 -> DA xxx C0038 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0109 <- 3.18 -> DC xxx C0037 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0111 <- 3.74 -> DC xxx C0037 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0112 <- 3.66 -> DC xxx C0037 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0115 <- 2.80 -> DA xxx C0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0116 <- 3.15 -> DC xxx C0039 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0117 <- 3.36 -> DC xxx C0039 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0032 <- 4.35 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0034 <- 3.47 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0036 <- 3.17 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0061 <- 4.08 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0063 <- 2.94 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0065 <- 3.20 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0072 <- 3.80 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0075 <- 3.53 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0077 <- 3.43 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0107 <- 3.10 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0111 <- 3.77 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0112 <- 3.27 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0115 <- 2.71 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0116 <- 3.32 -> DC xxx C0019 : score x.xxxxx >5tkz_B:RNA-binding_domain,_RBD; title=MEC-8 N-TERMINAL RRM BOUND TO TANDEM GCAC LIGAND organism=Caenorhabditis elegans : w : SER OG B0073 <- 5.89 -> DA N6 C0015 : score 2.209 : H : GLU OE1 B0109 <- 3.05 -> DC N4 C0017 : score 5.47955 : H : SER OG B0113 <- 2.96 -> DC N4 C0019 : score 3.55802 : w : SER OG B0113 <- 5.86 -> DA N7 C0018 : score 2.343 : x : THR xxxx B0032 <- 4.35 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0034 <- 3.47 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0036 <- 3.17 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0061 <- 4.08 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0063 <- 2.94 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0065 <- 3.20 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0072 <- 3.80 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0075 <- 3.53 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0077 <- 3.43 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0107 <- 3.10 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0111 <- 3.77 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0112 <- 3.27 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0115 <- 2.71 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0116 <- 3.32 -> DC xxx C0019 : score x.xxxxx >5trd_AB:Riboflavin_kinase-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF RBKR (RIBOFLAVIN KINASE) FROM THERMOPLASMA ACIDOPHILUM DETERMINED IN COMPLEX WITH CTP AND ITS COGNATE DNA OPERATOR organism=Thermoplasma acidophilum : H : GLN OE1 A0039 <- 2.86 -> DA N6 H0004 : score 5.97993 : H : GLN NE2 A0039 <- 3.08 -> DA N7 H0004 : score 5.74872 : H : GLN NE2 A0040 <- 3.06 -> DG O6 G0016 : score 5.50326 : H : GLN OE1 B0039 <- 2.89 -> DA N6 G0004 : score 5.94362 : H : GLN NE2 B0039 <- 2.99 -> DA N7 G0004 : score 5.85833 : H : GLN NE2 B0040 <- 3.14 -> DG O6 H0016 : score 5.41038 : w : ARG NH1 B0044 <- 5.86 -> DT O4 G0006 : score 1.768 : x : SER xxxx A0038 <- 3.57 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0041 <- 3.78 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0043 <- 3.19 -> DA xxx H0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0044 <- 3.93 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0028 <- 4.36 -> DT xxx G0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0038 <- 4.01 -> DT xxx H0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0041 <- 3.32 -> DT xxx H0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 3.26 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0061 <- 3.78 -> DT xxx G0002 : score x.xxxxx >5trd_B:Riboflavin_kinase-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF RBKR (RIBOFLAVIN KINASE) FROM THERMOPLASMA ACIDOPHILUM DETERMINED IN COMPLEX WITH CTP AND ITS COGNATE DNA OPERATOR organism=Thermoplasma acidophilum : H : GLN OE1 B0039 <- 2.89 -> DA N6 G0004 : score 5.94362 : H : GLN NE2 B0039 <- 2.99 -> DA N7 G0004 : score 5.85833 : H : GLN NE2 B0040 <- 3.14 -> DG O6 H0016 : score 5.41038 : w : ARG NH1 B0044 <- 5.86 -> DT O4 G0006 : score 1.768 : x : SER xxxx B0028 <- 4.36 -> DT xxx G0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0038 <- 4.01 -> DT xxx H0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0041 <- 3.32 -> DT xxx H0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 3.26 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0061 <- 3.78 -> DT xxx G0002 : score x.xxxxx >5tvp_AB:DNase_I-like; title=SUMO2 BOUND TO MOUSE TDP2 CATALYTIC DOMAIN WITH A 5'-PHOSPHORYLATED DNA TERNARY COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : x : ARG xxxx B0316 <- 3.88 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0317 <- 3.48 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0318 <- 3.56 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0321 <- 4.05 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0307 <- 4.44 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0316 <- 2.94 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0317 <- 3.29 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0318 <- 3.43 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0321 <- 4.15 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx >5tvp_EI:DNase_I-like; title=SUMO2 BOUND TO MOUSE TDP2 CATALYTIC DOMAIN WITH A 5'-PHOSPHORYLATED DNA TERNARY COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : w : TYR OH E0321 <- 5.96 -> DC O2 F0003 : score 1.343 : x : ILE xxxx I0317 <- 3.55 -> DC xxx J0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0318 <- 3.54 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx I0321 <- 4.14 -> DC xxx J0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0316 <- 3.50 -> DG xxx J0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E0317 <- 3.58 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0318 <- 3.82 -> DG xxx J0010 : score x.xxxxx >5tvp_GO:DNase_I-like; title=SUMO2 BOUND TO MOUSE TDP2 CATALYTIC DOMAIN WITH A 5'-PHOSPHORYLATED DNA TERNARY COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : x : TRP xxxx O0307 <- 4.40 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0316 <- 4.26 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx O0317 <- 3.41 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0318 <- 3.39 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx O0321 <- 4.15 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx G0307 <- 4.36 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0316 <- 4.38 -> DG xxx P0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0317 <- 3.40 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0318 <- 3.31 -> DG xxx P0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0321 <- 3.74 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx >5tvp_KM:DNase_I-like; title=SUMO2 BOUND TO MOUSE TDP2 CATALYTIC DOMAIN WITH A 5'-PHOSPHORYLATED DNA TERNARY COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : x : TRP xxxx K0307 <- 4.48 -> DC xxx L0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0316 <- 4.13 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx K0317 <- 3.56 -> DC xxx L0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx K0318 <- 3.42 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx K0321 <- 4.21 -> DC xxx L0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0316 <- 3.72 -> DG xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx M0317 <- 3.65 -> DC xxx N0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx M0318 <- 3.41 -> DG xxx L0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx M0321 <- 4.13 -> DC xxx N0003 : score x.xxxxx >5tvp_M:DNase_I-like; title=SUMO2 BOUND TO MOUSE TDP2 CATALYTIC DOMAIN WITH A 5'-PHOSPHORYLATED DNA TERNARY COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : x : ARG xxxx M0316 <- 3.72 -> DG xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx M0317 <- 3.65 -> DC xxx N0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx M0318 <- 3.41 -> DG xxx L0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx M0321 <- 4.13 -> DC xxx N0003 : score x.xxxxx >5tw1_FT:C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MYCOBACTERIUM SMEGMATIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH RBPA organism=? : H : GLN OE1 F0291 <- 2.65 -> DC N4 O0025 : score 4.72083 : H : ARG NH1 F0295 <- 3.29 -> DG N7 O0024 : score 5.4571 : H : ARG NH2 F0295 <- 2.57 -> DG O6 O0024 : score 6.9036 : w : ARG NE F0295 <- 6.00 -> DG O6 P0002 : score 1.369 : w : ARG NH2 F0295 <- 6.43 -> DG O6 P0002 : score 2.468 : H : ARG NH1 F0438 <- 2.53 -> DG N7 P0020 : score 6.3767 : H : ARG NH1 F0438 <- 2.40 -> DG O6 P0020 : score 6.57 : H : GLU OE1 F0439 <- 2.96 -> DC N4 P0022 : score 5.58337 : H : GLN NE2 F0443 <- 2.96 -> DT O4 O0003 : score 5.02491 : V : VAL CB F0308 <- 3.82 -> DT C7 O0023 : score 3.90856 : x : TRP xxxx F0287 <- 3.21 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0288 <- 3.56 -> DC xxx O0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0294 <- 4.36 -> DA xxx P0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0309 <- 3.23 -> DT xxx O0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0312 <- 3.40 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0427 <- 4.45 -> DG xxx P0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0437 <- 3.94 -> DT xxx O0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0440 <- 3.44 -> DC xxx O0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0442 <- 3.75 -> DT xxx P0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx T0259 <- 3.62 -> DG xxx O0012 : score x.xxxxx >5tw1_T:C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MYCOBACTERIUM SMEGMATIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH RBPA organism=? : x : ARG xxxx T0259 <- 3.62 -> DG xxx O0012 : score x.xxxxx >5twq_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=POST-CATALYTIC NICKED COMPLEX OF HUMAN POLYMERASE MU WITH NEWLY INCORPORATED UTP organism=HOMO SAPIENS : H : THR OG1 A0178 <- 3.13 -> DG N2 D0001 : score 3.75276 : H : THR OG1 A0178 <- 2.59 -> DG N3 D0001 : score 1.79545 : w : ARG NH1 A0181 <- 5.76 -> DC O2 T0004 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0181 <- 5.66 -> DC O2 T0004 : score 1.669 : x : ARG xxxx A0175 <- 3.70 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0177 <- 4.02 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx >5tws_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=POST-CATALYTIC COMPLEX OF HUMAN POLYMERASE MU (H329A) WITH NEWLY INCORPORATED UTP organism=HOMO SAPIENS : H : THR OG1 A0178 <- 3.10 -> DG N2 D0001 : score 3.77687 : H : THR OG1 A0178 <- 2.64 -> DG N3 D0001 : score 1.77822 : w : ARG NH1 A0181 <- 5.75 -> DC O2 T0004 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0181 <- 5.65 -> DC O2 T0004 : score 1.669 : x : ARG xxxx A0175 <- 3.78 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0177 <- 3.97 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx >5txl_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.64 -> DC O2 P0821 : score 3.60935 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.56 -> DT O2 P0806 : score 4.43653 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.24 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.84 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.25 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.08 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.12 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.82 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >5txl_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.64 -> DC O2 P0821 : score 3.60935 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.56 -> DT O2 P0806 : score 4.43653 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.24 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.84 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.25 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.08 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.12 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.82 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >5txl_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.71 -> DC O2 F0821 : score 3.56039 : H : ARG NH1 C0448 <- 2.43 -> DT O2 F0806 : score 4.62508 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.25 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 3.95 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.17 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 4.04 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 4.42 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.87 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >5txm_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DDATP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.67 -> DC O2 P0821 : score 3.58837 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.61 -> DT O2 P0806 : score 4.3942 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.36 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.80 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.24 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.06 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.17 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.90 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >5txm_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DDATP organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.52 -> DC O2 F0821 : score 3.69329 : H : ARG NH1 C0448 <- 2.50 -> DT O2 F0806 : score 4.5648 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.21 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 4.08 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.20 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 4.15 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 4.32 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 4.12 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >5txn_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF Q151M MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.48 -> DC O2 P0821 : score 3.72127 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.94 -> DT O2 P0806 : score 4.1148 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.14 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.70 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.20 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.13 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.33 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.73 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >5txn_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF Q151M MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.48 -> DC O2 P0821 : score 3.72127 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.94 -> DT O2 P0806 : score 4.1148 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.14 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.70 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.20 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.13 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.33 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.73 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >5txn_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF Q151M MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.68 -> DC O2 F0821 : score 3.58137 : H : ARG NH1 C0448 <- 2.64 -> DT O2 F0806 : score 4.44422 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.26 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 3.75 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.21 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 4.12 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 4.11 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx >5txo_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF Q151M COMPLEX (A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M) MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.47 -> DC O2 P0821 : score 3.72827 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.96 -> DT O2 P0806 : score 4.09787 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.09 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.62 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.08 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.17 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.20 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.79 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >5txo_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF Q151M COMPLEX (A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M) MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.72 -> DC O2 F0821 : score 3.55339 : H : ARG NH1 C0448 <- 2.57 -> DT O2 F0806 : score 4.50451 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.18 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 3.93 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.15 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 4.21 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 4.20 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx >5txp_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF Q151M COMPLEX (A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M) MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DDATP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.61 -> DC O2 P0821 : score 3.63034 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.74 -> DT O2 P0806 : score 4.28413 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.25 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.83 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.08 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.03 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.39 -> DC xxx T0711 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 3.99 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx >5txp_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF Q151M COMPLEX (A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M) MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DDATP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.61 -> DC O2 P0821 : score 3.63034 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.74 -> DT O2 P0806 : score 4.28413 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.25 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.83 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.08 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.03 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.39 -> DC xxx T0711 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 3.99 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx >5txp_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF Q151M COMPLEX (A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M) MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DDATP organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.53 -> DC O2 F0821 : score 3.6863 : H : ARG NH1 C0448 <- 2.57 -> DT O2 F0806 : score 4.50451 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.29 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 4.09 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.05 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 4.15 -> DG xxx F0822 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 4.30 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.87 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >5tye_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE MU PRODUCT COMPLEX, 10 MM MG2+ (60 MIN) organism=HOMO SAPIENS : w : GLN NE2 A0275 <- 6.27 -> DG N3 P0002 : score 1.484 : H : ARG NH1 A0387 <- 3.16 -> DA N3 T0007 : score 3.41694 : w : ARG NH1 A0387 <- 5.38 -> DT O2 P0003 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0387 <- 6.40 -> DT O2 T0006 : score 2.261 : w : LYS NZ A0438 <- 5.18 -> DT O4 P0005 : score 1.7 : H : ARG NH1 A0445 <- 3.15 -> DT O2 T0006 : score 4.00496 : x : PHE xxxx A0389 <- 3.82 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0441 <- 4.01 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.42 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >5tyf_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE MU PRODUCT COMPLEX, 10 MM MG2+ (270 MIN) organism=HOMO SAPIENS : w : GLN OE1 A0275 <- 6.29 -> DG N3 P0002 : score 1.484 : H : ARG NH1 A0387 <- 3.13 -> DA N3 T0007 : score 3.43904 : w : ARG NH1 A0387 <- 5.57 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : w : LYS NZ A0438 <- 5.25 -> DT O4 P0005 : score 1.7 : H : ARG NH1 A0445 <- 3.04 -> DT O2 T0006 : score 4.0997 : x : PHE xxxx A0389 <- 3.88 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0441 <- 3.93 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.50 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >5tyg_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE MU PRODUCT COMPLEX, 10 MM MG2+ (960 MIN) organism=HOMO SAPIENS : w : GLN NE2 A0275 <- 6.29 -> DG N3 P0002 : score 1.484 : H : ARG NH1 A0387 <- 3.17 -> DA N3 T0007 : score 3.40958 : w : ARG NH1 A0387 <- 5.52 -> DT O2 P0003 : score 1.855 : H : ARG NH1 A0445 <- 3.07 -> DT O2 T0006 : score 4.07386 : x : PHE xxxx A0389 <- 3.91 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0438 <- 3.38 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0441 <- 3.93 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.49 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >5tyx_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE MU PRODUCT COMPLEX, MN2+ (15 MIN) organism=HOMO SAPIENS : w : GLN NE2 A0275 <- 6.15 -> DG N3 P0002 : score 1.484 : H : ARG NH1 A0387 <- 3.14 -> DA N3 T0007 : score 3.43167 : w : ARG NH1 A0387 <- 5.59 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : H : ARG NH1 A0445 <- 3.04 -> DT O2 T0006 : score 4.0997 : w : SER OG A0458 <- 6.77 -> DT O2 T0006 : score 1.55 : x : PHE xxxx A0389 <- 3.93 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0438 <- 3.46 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0441 <- 4.07 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.47 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >5tyy_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE MU PRODUCT COMPLEX, MN2+ (60 MIN) organism=HOMO SAPIENS : w : GLN NE2 A0275 <- 6.14 -> DG N3 P0002 : score 1.484 : H : ARG NH1 A0387 <- 3.21 -> DA N3 T0007 : score 3.38012 : w : ARG NH1 A0387 <- 5.48 -> DT O2 P0003 : score 1.855 : w : LYS NZ A0438 <- 5.30 -> DT O4 P0005 : score 1.7 : H : ARG NH1 A0445 <- 3.07 -> DT O2 T0006 : score 4.07386 : w : ARG NH1 A0445 <- 6.49 -> DT O2 T0006 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0445 <- 6.44 -> DT O2 T0006 : score 2.261 : x : PHE xxxx A0389 <- 3.93 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0441 <- 4.05 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.56 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >5tyz_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE MU PRODUCT COMPLEX, MN2+ (960 MIN) organism=HOMO SAPIENS : w : GLN NE2 A0275 <- 6.23 -> DG N3 P0002 : score 1.484 : H : ARG NH1 A0387 <- 3.20 -> DA N3 T0007 : score 3.38749 : w : ARG NH1 A0387 <- 5.66 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : w : LYS NZ A0438 <- 5.26 -> DT O4 P0005 : score 1.7 : w : LYS NZ A0438 <- 6.23 -> DA N6 T0005 : score 2.097 : H : ARG NH1 A0445 <- 3.02 -> DT O2 T0006 : score 4.11693 : w : ARG NH1 A0445 <- 6.50 -> DT O2 T0006 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0445 <- 6.45 -> DT O2 T0006 : score 2.261 : x : PHE xxxx A0389 <- 3.97 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0441 <- 3.94 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.47 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >5tzv_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=BINARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH G:T MISMATCH AT THE PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.69 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.49 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5u01_A:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=COOPERATIVE DNA BINDING BY TWO RELA DIMERS organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0033 <- 2.98 -> DG O6 E0216 : score 5.86433 : H : ARG NH1 A0035 <- 2.94 -> DG N7 E0215 : score 5.8806 : H : ARG NH2 A0035 <- 3.02 -> DG O6 E0215 : score 6.3096 : H : GLU OE1 A0039 <- 2.96 -> DC N4 F0211 : score 5.58337 : H : ARG NH2 A0041 <- 2.52 -> DG O6 E0214 : score 6.9696 : x : TYR xxxx A0036 <- 3.34 -> DT xxx F0210 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0038 <- 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C0041 <- 2.93 -> DG O6 F0214 : score 6.4284 : H : ARG NH1 D0033 <- 3.21 -> DG O6 E0205 : score 5.5845 : H : ARG NH2 D0033 <- 3.38 -> DG N7 E0205 : score 5.644 : H : ARG NH2 D0035 <- 3.31 -> DG N7 E0204 : score 5.73338 : H : GLU OE2 D0039 <- 3.16 -> DC N4 F0222 : score 4.88628 : x : TYR xxxx A0036 <- 3.34 -> DT xxx F0210 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0038 <- 3.72 -> DT xxx F0210 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0187 <- 4.24 -> DT xxx F0210 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0036 <- 3.24 -> DT xxx E0221 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0038 <- 4.20 -> DT xxx E0221 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0042 <- 3.56 -> DC xxx F0203 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0187 <- 3.12 -> DT xxx E0221 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0036 <- 3.33 -> DT xxx E0210 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0187 <- 3.99 -> DT xxx E0209 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0036 <- 3.50 -> DT xxx F0221 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0038 <- 4.43 -> DT xxx F0221 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 3.28 -> DC xxx F0223 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0187 <- 3.31 -> DT xxx F0221 : score x.xxxxx >5u07_CHN: title=CRISPR RNA-GUIDED SURVEILLANCE COMPLEX organism=THERMOBIFIDA FUSCA YX : H : ARG NE C0208 <- 2.96 -> DT O2 M0046 : score 2.49446 : H : ARG NH2 C0208 <- 2.50 -> DC O2 M0047 : score 3.92064 : H : GLN OE1 C0384 <- 2.59 -> DG N2 O0011 : score 5.84322 : x : MET xxxx C0196 <- 2.79 -> DT xxx M0046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0386 <- 4.19 -> DC xxx M0044 : score x.xxxxx >5u07_D: title=CRISPR RNA-GUIDED SURVEILLANCE COMPLEX organism=THERMOBIFIDA FUSCA YX : x : PHE xxxx D0204 <- 4.10 -> DA xxx M0039 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0216 <- 3.92 -> DA xxx M0036 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0218 <- 3.21 -> DT xxx M0037 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0220 <- 3.04 -> DA xxx M0039 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0221 <- 3.09 -> DT xxx M0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0222 <- 3.35 -> DA xxx M0039 : score x.xxxxx >5u07_DG: title=CRISPR RNA-GUIDED SURVEILLANCE COMPLEX organism=THERMOBIFIDA FUSCA YX : x : PHE xxxx D0204 <- 4.10 -> DA xxx M0039 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0216 <- 3.92 -> DA xxx M0036 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0218 <- 3.21 -> DT xxx M0037 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0220 <- 3.04 -> DA xxx M0039 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0221 <- 3.09 -> DT xxx M0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0222 <- 3.35 -> DA xxx M0039 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0173 <- 4.22 -> DT xxx M0034 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0175 <- 3.24 -> DT xxx M0034 : score x.xxxxx >5u0a_ACHJLN: title=CRISPR RNA-GUIDED SURVEILLANCE COMPLEX organism=THERMOBIFIDA FUSCA (STRAIN YX) / THERMOBIFIDA FUSCA (STRAIN YX) / THERMOBIFIDA FUSCA (STRAIN YX) / THERMOBIFIDA FUSCA (STRAIN YX) / THERMOBIFIDA FUSCA (STRAIN YX) / THERMOBIFIDA FUSCA (STRAIN YX) / THERMOBIFIDA FUSCA (STRAIN YX) / THERMOBIFIDA FUSCA (STRAIN YX) / THERMOBIFIDA FUSCA (STRAIN YX) / THERMOBIFIDA FUSCA (STRAIN YX) / THERMOBIFIDA FUSCA (STRAIN YX) / THERMOBIFIDA FUSCA (STRAIN YX) : H : GLN NE2 A0166 <- 2.22 -> DG N7 M0023 : score 4.68577 : H : SER OG H0218 <- 2.88 -> DC O2 M0042 : score 2.46126 : H : ARG NH1 J0033 <- 3.42 -> DC O2 M0037 : score 3.1974 : H : ARG NH2 L0033 <- 2.79 -> DC O2 M0025 : score 3.70612 : x : ALA xxxx A0165 <- 4.49 -> DG xxx M0023 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0196 <- 3.06 -> DA xxx O0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0318 <- 4.18 -> DA xxx O0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0319 <- 3.70 -> DA xxx O0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0322 <- 3.51 -> DA xxx O0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0384 <- 2.51 -> DG xxx O0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0522 <- 3.49 -> DC xxx M0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0524 <- 4.10 -> DC xxx M0049 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0220 <- 3.21 -> DC xxx M0044 : score x.xxxxx : x : MET xxxx H0221 <- 3.46 -> DC xxx M0042 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0222 <- 3.61 -> DC xxx M0044 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0005 <- 3.58 -> DG xxx O0034 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0026 <- 3.52 -> DC xxx M0037 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0029 <- 3.52 -> DC 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x : ALA xxxx F0175 <- 3.69 -> DT xxx M0039 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0218 <- 3.53 -> DC xxx M0030 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0220 <- 3.30 -> DC xxx M0032 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0221 <- 3.33 -> DC xxx M0030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0222 <- 3.41 -> DC xxx M0032 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0115 <- 4.24 -> DT xxx M0045 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0173 <- 3.89 -> DT xxx M0045 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0175 <- 3.18 -> DT xxx M0045 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0204 <- 4.32 -> DA xxx M0038 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0216 <- 4.42 -> DG xxx M0035 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0220 <- 3.32 -> DA xxx M0038 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0221 <- 3.29 -> DG xxx M0036 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0222 <- 3.19 -> DA xxx M0038 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0115 <- 4.19 -> DG xxx M0027 : score x.xxxxx : x : MET xxxx I0173 <- 4.01 -> DG xxx M0027 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0175 <- 4.27 -> DG xxx M0027 : score x.xxxxx >5u0a_E: title=CRISPR RNA-GUIDED SURVEILLANCE COMPLEX organism=THERMOBIFIDA FUSCA (STRAIN YX) / THERMOBIFIDA FUSCA (STRAIN YX) : H : ASP OD1 E0215 <- 2.91 -> DG N2 M0023 : score 5.0367 : H : SER OG E0218 <- 2.50 -> DA N3 M0024 : score 3.18408 : x : VAL xxxx E0115 <- 4.07 -> DA xxx M0033 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0173 <- 3.47 -> DA xxx M0033 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0175 <- 3.89 -> DA xxx M0033 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0204 <- 4.49 -> DA xxx M0026 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0216 <- 4.02 -> DG xxx M0023 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0220 <- 3.08 -> DA xxx M0026 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0221 <- 3.36 -> DA xxx M0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0222 <- 2.75 -> DA xxx M0026 : score x.xxxxx >5u1c_A:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF TETRAMERIC HIV-1 STRAND TRANSFER COMPLEX INTASOME organism=? : H : SER OG A0153 <- 3.30 -> DT O2 I0020 : score 3.32769 : x : HIS xxxx A0051 <- 3.18 -> DG xxx I0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.48 -> DG xxx I0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0152 <- 4.06 -> DG xxx I0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0156 <- 3.49 -> DG xxx J0019 : score x.xxxxx >5u1c_AB:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF TETRAMERIC HIV-1 STRAND TRANSFER COMPLEX INTASOME organism=? : H : SER OG A0153 <- 3.30 -> DT O2 I0020 : score 3.32769 : x : HIS xxxx A0051 <- 3.18 -> DG xxx I0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.48 -> DG xxx I0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0152 <- 4.06 -> DG xxx I0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0156 <- 3.49 -> DG xxx J0019 : score x.xxxxx >5u1c_CD:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF TETRAMERIC HIV-1 STRAND TRANSFER COMPLEX INTASOME organism=? : H : SER OG C0153 <- 3.27 -> DT O2 E0020 : score 3.34988 : x : HIS xxxx C0051 <- 3.17 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0146 <- 3.45 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0152 <- 4.05 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0156 <- 3.49 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx >5u2r_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=PRECATALYTIC TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH GAPPED DNA SUBSTARTE, INCOMING L-DCTP AND CA2+ organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.32 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.84 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.62 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5u2s_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=PRE-CATALYTIC TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH GAPPED DNA SUBSTRATE INCOMING (-)3TC-TP AND CA2+. organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.32 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.79 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.53 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5u2t_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=PRE-CATALYTIC TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH GAPPED DNA SUBSTRATE INCOMING (-)FTC-TP AND CA2+. organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.33 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.86 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.56 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5u30_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF AACC2C1-SGRNA-EXTENDED TARGET DNA TERNARY COMPLEX organism=Alicyclobacillus acidoterrestris : H : ARG NH1 A0122 <- 3.12 -> DT O4 D0006 : score 3.0588 : H : ASN OD1 A0400 <- 2.68 -> DA N6 C0023 : score 6.16632 : H : ASN ND2 A0400 <- 3.18 -> DA N7 C0022 : score 5.42435 : x : GLN xxxx A0118 <- 3.18 -> DG xxx C0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0119 <- 3.39 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0142 <- 3.33 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0144 <- 3.26 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0208 <- 3.58 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0218 <- 3.68 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx >5u33_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF AACC2C1-SGRNA-EXTENDED NON-TARGET DNA TERNARY COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 A0122 <- 3.06 -> DT O4 D0006 : score 3.09802 : H : ASN OD1 A0400 <- 2.93 -> DA N6 C0023 : score 5.86523 : H : ASN ND2 A0400 <- 3.13 -> DA N7 C0022 : score 5.48306 : x : GLN xxxx A0118 <- 3.16 -> DG xxx C0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0119 <- 3.39 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0123 <- 4.26 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0142 <- 3.52 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0144 <- 3.32 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0208 <- 3.63 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0218 <- 3.95 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx >5u8g_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA CRYSTALLIZED IN PEG 400 organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.27 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.68 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.47 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5u8h_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA G231D CRYSTALLIZED IN PEG 400 organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.28 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.69 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.49 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5u8i_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA S229L CRYSTALLIZED IN PEG 400 organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.33 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.68 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.51 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5u8s_25:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF EUKARYOTIC CMG HELICASE AT A REPLICATION FORK organism=? : x : ARG xxxx 20581 <- 3.13 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx 20615 <- 4.46 -> DT xxx F0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 20633 <- 4.19 -> DT xxx F0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 50455 <- 3.25 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 50460 <- 3.32 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx >5u8s_3467:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF EUKARYOTIC CMG HELICASE AT A REPLICATION FORK organism=? : x : GLN xxxx 40450 <- 4.10 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 70364 <- 4.23 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx >5u8t_234567: title=STRUCTURE OF EUKARYOTIC CMG HELICASE AT A REPLICATION FORK AND IMPLICATIONS organism=? : H : THR OG1 30447 <- 3.43 -> DT O2 F0007 : score 2.37213 : H : ARG NH2 60614 <- 3.43 -> DT O2 F0011 : score 3.69993 : H : LYS NZ 70364 <- 3.23 -> DT O2 F0003 : score 3.27868 : x : TRP xxxx 20589 <- 4.21 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx 20615 <- 3.90 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx 30448 <- 3.65 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx 40450 <- 4.36 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx 50454 <- 3.24 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 50455 <- 3.22 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 50460 <- 2.96 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx 70363 <- 3.82 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx 70366 <- 4.38 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx >5u8t_6:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF EUKARYOTIC CMG HELICASE AT A REPLICATION FORK AND IMPLICATIONS organism=? : H : ARG NH2 60614 <- 3.43 -> DT O2 F0011 : score 3.69993 >5u91_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TRE/LOXLTR COMPLEX organism=synthetic construct : H : GLN NE2 A0090 <- 2.81 -> DT O4 D0113 : score 5.18064 : H : ARG NH1 A0244 <- 2.65 -> DC O2 D0103 : score 3.7595 : H : ARG NH2 A0282 <- 2.93 -> DA N3 D0112 : score 3.15551 : w : GLU OE1 B0043 <- 5.50 -> DT O4 D0125 : score 2.749 : H : MET SD B0044 <- 3.44 -> DA N6 C0112 : score 5.21076 : H : GLN NE2 B0090 <- 2.89 -> DT O4 D0122 : score 5.09759 : H : ARG NH2 B0094 <- 3.27 -> DA N7 D0123 : score 1.51465 : H : LYS NZ B0201 <- 2.78 -> DA N3 C0115 : score 2.78803 : H : ARG NH1 B0244 <- 2.46 -> DC O2 C0103 : score 3.8982 : w : TYR OH B0259 <- 6.11 -> DC N4 C0106 : score 1.343 : H : ARG NH2 B0282 <- 3.21 -> DA N3 C0112 : score 2.97408 : V : MET CE B0097 <- 3.69 -> DT C7 D0122 : score 7.12084 : V : TYR CB B0259 <- 3.82 -> DT C7 C0108 : score 4.84437 : V : LYS CB B0086 <- 3.53 -> DT C7 C0114 : score 2.46127 : x : HIS xxxx A0040 <- 3.89 -> DT xxx C0125 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 3.81 -> DT xxx C0123 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0044 <- 3.59 -> DT xxx D0113 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 3.87 -> DC xxx D0111 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0086 <- 4.41 -> DA xxx D0114 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.47 -> DT xxx D0113 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0094 <- 3.75 -> DT xxx C0123 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 4.17 -> DT xxx D0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0243 <- 3.65 -> DT xxx C0133 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0245 <- 4.36 -> DG xxx C0135 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 4.43 -> DT xxx D0108 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0259 <- 3.28 -> DC xxx C0128 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0262 <- 3.37 -> DC xxx C0127 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0040 <- 3.51 -> DT xxx D0125 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0041 <- 3.82 -> DA xxx D0123 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.95 -> DT xxx C0111 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.80 -> DT xxx C0113 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0089 <- 3.83 -> DT xxx D0120 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0093 <- 4.25 -> DT xxx D0122 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0241 <- 4.19 -> DA xxx C0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0243 <- 3.57 -> DT xxx D0133 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 4.19 -> DA xxx C0107 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0262 <- 3.59 -> DG xxx D0127 : score x.xxxxx >5u91_B:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TRE/LOXLTR COMPLEX organism=synthetic construct : w : GLU OE1 B0043 <- 5.50 -> DT O4 D0125 : score 2.749 : H : MET SD B0044 <- 3.44 -> DA N6 C0112 : score 5.21076 : H : GLN NE2 B0090 <- 2.89 -> DT O4 D0122 : score 5.09759 : H : ARG NH2 B0094 <- 3.27 -> DA N7 D0123 : score 1.51465 : H : LYS NZ B0201 <- 2.78 -> DA N3 C0115 : score 2.78803 : H : ARG NH1 B0244 <- 2.46 -> DC O2 C0103 : score 3.8982 : w : TYR OH B0259 <- 6.11 -> DC N4 C0106 : score 1.343 : H : ARG NH2 B0282 <- 3.21 -> DA N3 C0112 : score 2.97408 : V : MET CE B0097 <- 3.69 -> DT C7 D0122 : score 7.12084 : V : HIS CG B0040 <- 3.57 -> DT C7 D0125 : score 3.17142 : V : TYR CB B0259 <- 3.82 -> DT C7 C0108 : score 4.84437 : V : LYS CB B0086 <- 3.53 -> DT C7 C0114 : score 2.46127 : x : THR xxxx B0041 <- 3.82 -> DA xxx D0123 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 3.95 -> DT xxx C0111 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.80 -> DT xxx C0113 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0089 <- 3.83 -> DT xxx D0120 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0093 <- 4.25 -> DT xxx D0122 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0241 <- 4.19 -> DA xxx C0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0243 <- 3.57 -> DT xxx D0133 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 4.19 -> DA xxx C0107 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0262 <- 3.59 -> DG xxx D0127 : score x.xxxxx >5u91_EF:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TRE/LOXLTR COMPLEX organism=synthetic construct : H : MET SD E0044 <- 3.32 -> DA N6 H0112 : score 5.35417 : H : GLN NE2 E0090 <- 3.10 -> DT O4 G0123 : score 4.87956 : H : GLN NE2 F0090 <- 3.05 -> DT O4 H0122 : score 4.93147 : H : TYR OH F0259 <- 2.84 -> DG N7 H0128 : score 4.25288 : H : ARG NH2 F0282 <- 2.92 -> DA N3 G0112 : score 3.16199 : V : LYS CB F0086 <- 3.54 -> DT C7 G0114 : score 2.45551 : V : LYS CE E0086 <- 3.86 -> DT C7 H0115 : score 2.56201 : x : HIS xxxx E0040 <- 4.23 -> DT xxx G0125 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0041 <- 3.48 -> DT xxx G0123 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0047 <- 4.27 -> DC xxx H0111 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0087 <- 3.90 -> DT xxx H0113 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0094 <- 3.12 -> DA xxx G0122 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0241 <- 3.59 -> DT xxx H0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0243 <- 3.47 -> DT xxx G0133 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0244 <- 3.11 -> DC xxx H0103 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0257 <- 4.28 -> DT xxx H0107 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0259 <- 3.30 -> DT xxx H0107 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0260 <- 4.07 -> DT xxx H0107 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0262 <- 3.54 -> DC xxx G0127 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0263 <- 3.61 -> DG xxx H0106 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0282 <- 3.39 -> DG xxx G0126 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0040 <- 3.46 -> DT xxx H0125 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0041 <- 3.78 -> DA xxx H0123 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0043 <- 4.05 -> DC xxx G0110 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0044 <- 3.52 -> DA xxx G0112 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0047 <- 3.88 -> DT xxx G0111 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0087 <- 3.62 -> DT xxx G0113 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0089 <- 3.63 -> DT xxx H0120 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx F0093 <- 4.17 -> DT xxx H0122 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0094 <- 3.50 -> DA xxx H0123 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0201 <- 3.39 -> DA xxx G0115 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0241 <- 3.66 -> DA xxx G0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0243 <- 3.33 -> DT xxx H0133 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0244 <- 3.47 -> DA xxx G0102 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0245 <- 3.39 -> DC xxx H0136 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0257 <- 4.14 -> DA xxx G0107 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0262 <- 3.84 -> DG xxx H0127 : score x.xxxxx >5u9h_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA PRODUCT COMPLEX WITH INSERTED SP-ISOMER OF DCTP- ALPHA-S organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.28 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.01 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.53 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5ua1_A:Homeodomain-like; title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS KSTR IN COMPLEX WITH A 18-BP DNA OPERATOR organism=Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) : H : ARG NH1 A0040 <- 2.97 -> DG O6 D0011 : score 5.8765 : H : ARG NH2 A0040 <- 3.05 -> DG N7 D0011 : score 6.06538 : V : VAL CG1 A0050 <- 3.87 -> DT C7 D0013 : score 5.95445 : x : MET xxxx A0039 <- 3.89 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0049 <- 3.71 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0052 <- 3.37 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0054 <- 3.45 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx >5ua1_AB:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS KSTR IN COMPLEX WITH A 18-BP DNA OPERATOR organism=Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) : H : ARG NH1 A0040 <- 2.97 -> DG O6 D0011 : score 5.8765 : H : ARG NH2 A0040 <- 3.05 -> DG N7 D0011 : score 6.06538 : H : ARG NH1 B0040 <- 2.88 -> DG O6 C0011 : score 5.986 : H : ARG NH2 B0040 <- 2.90 -> DG N7 C0011 : score 6.25692 : V : VAL CG1 A0050 <- 3.87 -> DT C7 D0013 : score 5.95445 : x : MET xxxx B0039 <- 3.90 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0049 <- 3.72 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0050 <- 4.24 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0052 <- 3.60 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0054 <- 3.44 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0039 <- 3.89 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0049 <- 3.71 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0052 <- 3.37 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0054 <- 3.45 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx >5ua2_A:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS KSTR IN COMPLEX WITH A 26-BP DNA OPERATOR organism=Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) : x : ARG xxxx A0061 <- 3.11 -> DA xxx M0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0070 <- 3.85 -> DT xxx M0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0073 <- 4.22 -> DT xxx M0007 : score x.xxxxx >5uan_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MULTI-DOMAIN RAR-BETA-RXR-ALPHA HETERODIMER ON DNA organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 A0153 <- 3.22 -> DC N4 F0006 : score 5.28344 : H : LYS NZ A0156 <- 3.33 -> DG N7 E0011 : score 4.81499 : H : GLU OE1 B0099 <- 2.84 -> DC N4 F0013 : score 5.72181 : H : LYS NZ B0102 <- 2.96 -> DG O6 E0004 : score 5.59578 : H : ARG NH1 B0107 <- 2.75 -> DG N7 F0011 : score 6.1105 : x : LYS xxxx A0160 <- 3.72 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0161 <- 3.46 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0106 <- 2.94 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx >5uan_B:Nuclear_receptor_ligand-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MULTI-DOMAIN RAR-BETA-RXR-ALPHA HETERODIMER ON DNA organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 B0099 <- 2.84 -> DC N4 F0013 : score 5.72181 : H : LYS NZ B0102 <- 2.96 -> DG O6 E0004 : score 5.59578 : H : ARG NH1 B0107 <- 2.75 -> DG N7 F0011 : score 6.1105 : x : ARG xxxx B0106 <- 2.94 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx >5uc6_A:Cytokine; title=STRUCTURAL INSIGHTS INTO IL-1 ALPHA RECOGNITION BY A NAPHTHYL- MODIFIED APTAMER THAT MIMICS IL-1RI DOMAIN III organism=Homo sapiens : x : ASP xxxx A0064 <- 4.20 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0067 <- 3.52 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0068 <- 3.55 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0113 <- 3.11 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0115 <- 3.72 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx >5ugn_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA IMIDODIPHOSPHATE REACTANT COMPLEX organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.19 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.91 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.55 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5ugo_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA NICK COMPLEX WITH IMIDODIPHOSPHATE organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 6.26 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.66 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : ARG NH1 A0258 <- 6.47 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : H : TYR OH A0271 <- 2.67 -> DC O2 P0010 : score 3.58837 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.87 -> DC O2 P0011 : score 4.41677 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.48 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.41 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.72 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : ASP xxxx A0276 <- 3.43 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.47 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >5ugp_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA COMPLEX WITH A 1NT GAP AND DCMPPNP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.22 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.92 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.56 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5uh5_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING 3 NT OF RNA organism=? : x : GLU xxxx C0466 <- 3.72 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.61 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >5uh6_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING 2NTRNA IN COMPLEX WITH RIFAMPIN organism=? : x : GLU xxxx C0466 <- 3.23 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.70 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >5uh6_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING 2NTRNA IN COMPLEX WITH RIFAMPIN organism=? : x : GLU xxxx C0466 <- 3.23 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.70 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >5uh8_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING 4NT RNA organism=? : x : GLU xxxx C0466 <- 3.33 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.45 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >5uh9_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING 2NT RNA organism=? : x : GLU xxxx C0466 <- 4.10 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.85 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >5uha_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX organism=? : V : ARG CZ C0467 <- 3.62 -> DT C7 H0015 : score 2.22826 : x : GLU xxxx C0466 <- 2.46 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx >5uhb_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX IN COMPLEX WITH RIFAMPIN organism=? : x : GLU xxxx C0466 <- 3.66 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.38 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >5uhb_CD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX IN COMPLEX WITH RIFAMPIN organism=? : x : GLU xxxx C0466 <- 3.66 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.38 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >5uhc_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING 3NT RNA IN COMPLEX WITH RIFAMPIN organism=? : x : GLU xxxx C0466 <- 3.33 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.14 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >5uhd_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING 4NT RNA IN COMPLEX WITH RIFAMPIN organism=? : x : GLU xxxx C0466 <- 3.03 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.43 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >5uhe_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX IN COMPLEX WITH D-AAP1 organism=? : x : GLU xxxx C0466 <- 3.28 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.62 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >5uhf_CD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX IN COMPLEX WITH D-IX336 organism=? : x : GLU xxxx C0466 <- 2.94 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.09 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >5uhg_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX IN COMPLEX WITH D-AAP1 AND RIFAMPIN organism=? : x : GLU xxxx C0466 <- 3.07 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.76 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >5uhg_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX IN COMPLEX WITH D-AAP1 AND RIFAMPIN organism=? : x : GLU xxxx C0466 <- 3.07 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.76 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >5ui5_I:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AQUIFEX AEOLICUS SIGMAN BOUND TO PROMOTER DNA organism=Aquifex aeolicus (strain VF5) / Aquifex aeolicus (strain VF5) : H : ARG NH2 I0295 <- 2.46 -> DA N7 A0018 : score 1.78548 : H : SER OG I0306 <- 2.52 -> DC N4 B0044 : score 3.88148 : H : SER OG I0306 <- 3.00 -> DT O4 A0020 : score 3.41292 : H : ARG NH1 I0378 <- 3.21 -> DG O6 A0009 : score 5.5845 : H : ARG NH2 I0378 <- 3.01 -> DG N7 A0009 : score 6.11646 : x : GLU xxxx I0305 <- 3.68 -> DT xxx A0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0309 <- 4.11 -> DT xxx A0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0310 <- 3.14 -> DT xxx A0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0379 <- 2.11 -> DG xxx B0054 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0380 <- 3.10 -> DT xxx B0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0394 <- 4.32 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx >5uk7_A:Sm-like_ribonucleoproteins; title=ESCHERICHIA COLI HFQ BOUND TO DSDNA organism=Escherichia coli : x : LYS xxxx A0003 <- 3.68 -> DA xxx N0020 : score x.xxxxx >5ulw_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA BOUND TO TEMPLATE 1-METHYL- DEOXYADENOSINE organism=Homo sapiens : w : TYR OH A0039 <- 5.36 -> DG N3 T0841 : score 3.344 : w : TYR OH A0039 <- 5.98 -> DG N2 T0841 : score 2.834 : x : GLU xxxx A0305 <- 3.75 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 3.96 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >5ulx_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE IOTA BOUND TO TEMPLATE 1-METHYL- DEOXYADENOSINE CRYSTALLIZED IN THE PRESENCE OF DCTP organism=Homo sapiens : w : TYR OH A0039 <- 5.96 -> DG N2 T0841 : score 2.834 : w : TYR OH A0039 <- 5.50 -> DG N3 T0841 : score 3.344 : w : GLN NE2 A0059 <- 6.19 -> DG N3 T0841 : score 1.484 : w : ARG NH1 A0357 <- 6.08 -> DG N7 T0842 : score 2.063 : x : GLU xxxx A0305 <- 3.49 -> DG xxx T0841 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0361 <- 4.03 -> DA xxx P0867 : score x.xxxxx >5um9_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=FLAP ENDONUCLEASE 1 (FEN1) D86N WITH 5'-FLAP SUBSTRATE DNA AND SM3+ organism=Homo sapiens : x : MET xxxx A0037 <- 3.44 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0040 <- 3.33 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0041 <- 3.75 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0044 <- 3.34 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0100 <- 3.76 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0103 <- 3.47 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0129 <- 3.88 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx >5und_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CTCF(ZNF 4-10) WITH 28-MER DNA organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0362 <- 2.93 -> DC N4 D0027 : score 5.61798 : H : LYS NZ A0365 <- 3.01 -> DG N7 D0026 : score 5.15969 : H : ARG NH1 A0368 <- 2.99 -> DG O6 D0025 : score 5.85217 : H : ARG NH2 A0368 <- 2.72 -> DG N7 D0025 : score 6.48677 : H : LYS NZ A0393 <- 3.12 -> DG O6 D0023 : score 5.4108 : H : LYS NZ A0393 <- 2.84 -> DG O6 D0024 : score 5.73452 : H : ARG NH1 A0396 <- 2.97 -> DG O6 D0022 : score 5.8765 : H : ARG NH2 A0396 <- 2.97 -> DG N7 D0022 : score 6.16754 : H : GLN OE1 A0418 <- 2.91 -> DA N6 D0021 : score 5.91941 : H : GLN NE2 A0418 <- 2.84 -> DA N7 D0021 : score 6.04103 : w : THR OG1 A0421 <- 6.44 -> DG N7 D0019 : score 3.422 : w : SER OG A0450 <- 5.31 -> DT O4 C0011 : score 2.338 : H : ASP OD1 A0451 <- 2.81 -> DC N4 D0017 : score 5.33418 : w : ASP OD1 A0451 <- 5.44 -> DT O4 C0011 : score 2.616 : V : VAL CG2 A0454 <- 3.71 -> DT C7 C0011 : score 6.26085 >5und_AB:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CTCF(ZNF 4-10) WITH 28-MER DNA organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0362 <- 2.93 -> DC N4 D0027 : score 5.61798 : H : LYS NZ A0365 <- 3.01 -> DG N7 D0026 : score 5.15969 : H : ARG NH1 A0368 <- 2.99 -> DG O6 D0025 : score 5.85217 : H : ARG NH2 A0368 <- 2.72 -> DG N7 D0025 : score 6.48677 : H : LYS NZ A0393 <- 3.12 -> DG O6 D0023 : score 5.4108 : H : LYS NZ A0393 <- 2.84 -> DG O6 D0024 : score 5.73452 : H : ARG NH1 A0396 <- 2.97 -> DG O6 D0022 : score 5.8765 : H : ARG NH2 A0396 <- 2.97 -> DG N7 D0022 : score 6.16754 : H : GLN OE1 A0418 <- 2.91 -> DA N6 D0021 : score 5.91941 : H : GLN NE2 A0418 <- 2.84 -> DA N7 D0021 : score 6.04103 : w : THR OG1 A0421 <- 6.44 -> DG N7 D0019 : score 3.422 : w : SER OG A0450 <- 5.31 -> DT O4 C0011 : score 2.338 : H : ASP OD1 A0451 <- 2.81 -> DC N4 D0017 : score 5.33418 : w : ASP OD1 A0451 <- 5.44 -> DT O4 C0011 : score 2.616 : H : GLU OE2 B0362 <- 2.59 -> DC N4 F0027 : score 5.48653 : H : LYS NZ B0365 <- 3.14 -> DG O6 E0002 : score 5.38768 : H : ARG NH1 B0368 <- 3.12 -> DG O6 F0025 : score 5.694 : H : ARG NH2 B0368 <- 2.37 -> DG N7 F0025 : score 6.93369 : H : LYS NZ B0393 <- 2.83 -> DG O6 F0023 : score 5.74608 : H : ARG NH1 B0396 <- 3.06 -> DG O6 F0022 : score 5.767 : H : ARG NH2 B0396 <- 3.05 -> DG N7 F0022 : score 6.06538 : H : GLN OE1 B0418 <- 3.09 -> DA N6 F0021 : score 5.70152 : H : GLN NE2 B0418 <- 2.99 -> DA N7 F0021 : score 5.85833 : H : SER OG B0450 <- 2.49 -> DC N4 E0010 : score 3.90353 : w : SER OG B0450 <- 5.97 -> DT O4 E0011 : score 2.338 : H : ASP OD1 B0451 <- 2.81 -> DC N4 F0017 : score 5.33418 : w : ASP OD1 B0451 <- 5.91 -> DT O4 E0011 : score 2.616 : V : VAL CG2 A0454 <- 3.71 -> DT C7 C0011 : score 6.26085 : V : VAL CG2 B0454 <- 3.70 -> DT C7 E0011 : score 6.27615 : x : SER xxxx A0364 <- 3.48 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0390 <- 4.19 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0391 <- 4.47 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0392 <- 3.42 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.77 -> DC xxx D0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0364 <- 3.83 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0390 <- 4.00 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0392 <- 3.42 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0421 <- 4.01 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0448 <- 3.78 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0449 <- 4.49 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0457 <- 4.21 -> DC xxx E0010 : score x.xxxxx >5uop_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS INTASOME WITH A 2- PYRIDINONE AMINAL INHIBITOR (COMPOUND 18) organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.92 -> DC O2 C0006 : score 2.59516 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.86 -> DC O2 C0006 : score 3.65433 : V : PRO CG A0259 <- 3.64 -> DT C7 C0008 : score 6.61333 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.61 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.88 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.62 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.89 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >5uoq_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS INTASOME WITH A 2- PYRIDINONE AMINAL INHIBITOR (COMPOUND 31) organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.82 -> DC O2 C0006 : score 2.64834 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.95 -> DC O2 C0006 : score 3.58776 : V : PRO CG A0259 <- 3.84 -> DT C7 C0008 : score 6.29538 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.49 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.92 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.57 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.92 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >5uuf_A:ARM_repeat; title=BACILLUS CEREUS DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO A YATAKEMYCIN-ADENINE NUCLEOBASE ADDUCT AND DNA CONTAINING AN ABASIC SITE (12-MER PRODUCT COMPLEX) organism=Bacillus cereus : H : TYR OH A0027 <- 2.77 -> DA N3 B0007 : score 4.17619 : w : LYS NZ A0183 <- 5.50 -> DA N7 B0007 : score 1.655 : w : ARG NH1 A0215 <- 5.65 -> DG N7 C0003 : score 2.063 >5uug_A:ARM_repeat; title=BACILLUS CEREUS DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO A YATAKEMYCIN-ADENINE NUCLEOBASE ADDUCT AND DNA CONTAINING AN ABASIC SITE (9-MER PRODUCT COMPLEX) organism=Bacillus cereus : H : TYR OH A0027 <- 2.77 -> DA N3 B0007 : score 4.17619 : w : LYS NZ A0183 <- 5.37 -> DA N7 B0007 : score 1.655 >5uuh_A:ARM_repeat; title=BACILLUS CEREUS DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO A YATAKEMYCIN-ADENINE NUCLEOBASE ADDUCT AND DNA CONTAINING A FLUORINATED ABASIC SITE (9- MER PRODUCT COMPLEX) organism=Bacillus cereus : H : TYR OH A0027 <- 2.75 -> DA N3 B0007 : score 4.19279 : w : LYS NZ A0183 <- 5.58 -> DA N7 B0007 : score 1.655 >5ux0_A:Ribonuclease_H-like; title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF MARINITOGA PIEZOPHILA ARGONAUTE IN COMPLEX WITH 5' OH GUIDE RNA AND TARGET DNA organism=Marinitoga piezophila : H : LYS NZ A0105 <- 3.26 -> DG N7 C0010 : score 4.89039 : H : THR OG1 A0210 <- 2.48 -> DT O2 C0015 : score 2.88781 : x : LYS xxxx A0408 <- 3.47 -> DC xxx C0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0410 <- 3.14 -> DC xxx C0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0573 <- 4.20 -> DA xxx C0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0574 <- 3.09 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0611 <- 3.56 -> DC xxx C0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0612 <- 3.77 -> DC xxx C0020 : score x.xxxxx >5uzv_Z:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN EXONUCLEASE 1 EXO1 (WT) IN COMPLEX WITH 5' RECESSED-END DNA (RI) organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx Z0121 <- 3.74 -> DA xxx A0010 : score x.xxxxx >5v04_Z:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN EXONUCLEASE 1 EXO1 (WT) IN COMPLEX WITH 5' RECESSED-END DNA (RII) organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 Z0121 <- 2.60 -> DG N7 A0009 : score 6.64 : x : GLN xxxx Z0004 <- 3.84 -> DA xxx A0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx Z0036 <- 3.52 -> DT xxx B0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Z0040 <- 3.68 -> DA xxx A0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Z0117 <- 3.30 -> DG xxx A0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Z0120 <- 3.47 -> DA xxx A0010 : score x.xxxxx >5v05_Z:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN EXONUCLEASE 1 EXO1 (WT) IN COMPLEX WITH 5' RECESSED-END DNA (RIII) organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx Z0036 <- 3.47 -> DT xxx B0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Z0040 <- 3.50 -> DA xxx A0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Z0117 <- 3.74 -> DG xxx A0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Z0120 <- 4.00 -> DA xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0121 <- 3.16 -> DG xxx A0009 : score x.xxxxx >5v06_Z:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN EXONUCLEASE 1 EXO1 (WT) IN COMPLEX WITH 5' RECESSED-END DNA (RIV) organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 Z0121 <- 2.97 -> DG N7 A0009 : score 5.8443 : x : GLN xxxx Z0004 <- 4.49 -> DA xxx A0005 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx Z0033 <- 4.12 -> DT xxx B0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx Z0036 <- 3.29 -> DT xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Z0037 <- 3.56 -> DA xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Z0040 <- 3.44 -> DA xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0092 <- 4.23 -> DT xxx B0001 : score x.xxxxx >5v07_Z:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN EXONUCLEASE 1 EXO1 (D173A) IN COMPLEX WITH 5' RECESSED-END DNA (RV) organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 Z0121 <- 2.92 -> DG N7 A0009 : score 6.23138 : x : CYS xxxx Z0033 <- 4.42 -> DT xxx B0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx Z0036 <- 3.04 -> DT xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 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5.76 -> DG N7 A0009 : score 2.063 : x : HIS xxxx Z0036 <- 3.28 -> DA xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Z0037 <- 3.78 -> DT xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Z0040 <- 3.45 -> DT xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0092 <- 3.97 -> DC xxx B0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Z0120 <- 4.31 -> DT xxx A0010 : score x.xxxxx >5v0a_Z:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN EXONUCLEASE 1 EXO1 (D225A) IN COMPLEX WITH 5' RECESSED-END DNA (RVIII) organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 Z0095 <- 3.14 -> DG O6 A0009 : score 6.1512 : x : HIS xxxx Z0036 <- 3.47 -> DA xxx B0102 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Z0037 <- 4.10 -> DT xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Z0040 <- 3.38 -> DT xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0092 <- 3.64 -> DA xxx B0102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0096 <- 4.03 -> DA xxx B0102 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Z0120 <- 4.18 -> DT xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0121 <- 3.83 -> DC xxx 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>5v0e_Z:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN EXONUCLEASE 1 EXO1 (WT) IN COMPLEX WITH 5' FLAP DNA (F5I) organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 Z0121 <- 2.76 -> DT O4 A0010 : score 3.58228 : x : GLU xxxx Z0117 <- 3.23 -> DT xxx A0010 : score x.xxxxx >5v0l_A:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain;PYP-like_sensor_domain_PAS_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE AHR-ARNT HETERODIMER IN COMPLEX WITH THE DRE organism=HOMO SAPIENS : H : HIS NE2 A0094 <- 3.04 -> DG O6 C0013 : score 7.57206 : x : GLU xxxx A0098 <- 4.35 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0101 <- 3.65 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0102 <- 3.16 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx >5v0l_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain;PYP-like_sensor_domain_PAS_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE AHR-ARNT HETERODIMER IN COMPLEX WITH THE DRE organism=HOMO SAPIENS / MUS MUSCULUS : H : HIS NE2 A0094 <- 3.04 -> DG O6 C0013 : score 7.57206 : x : GLU xxxx A0098 <- 4.35 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0101 <- 3.65 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0102 <- 3.16 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0039 <- 2.24 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx >5v0l_B:PYP-like_sensor_domain_PAS_domain;HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE AHR-ARNT HETERODIMER IN COMPLEX WITH THE DRE organism=MUS MUSCULUS : x : ARG xxxx B0039 <- 2.24 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx >5v0q_A:Homing_endonucleases; title=ORIGINAL ENGINEERED VARIANT OF I-ONUI MEGANUCLEASE TARGETING THE HIV INTEGRASE GENE; HARBORS 49 POINT MUTATIONS RELATIVE TO WILD-TYPE I- ONUI organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : ARG NH1 A0042 <- 3.23 -> DG N7 B0005 : score 5.5297 : H : ARG NH2 A0042 <- 2.53 -> DG O6 B0005 : score 6.9564 : H : ARG NH1 A0044 <- 2.64 -> DG O6 B0006 : score 6.278 : H : ARG NH2 A0044 <- 3.13 -> DG N7 B0006 : score 5.96323 : w : ARG NH1 A0044 <- 5.37 -> DG O6 C0019 : score 2.756 : H : THR OG1 A0048 <- 2.83 -> DC N4 C0017 : score 4.00913 : H : ASN ND2 A0072 <- 3.04 -> DG O6 B0009 : score 5.36782 : H : GLU OE2 A0184 <- 2.70 -> DC N4 B0018 : score 5.37069 : w : GLU OE2 A0184 <- 6.15 -> DC N4 B0017 : score 3.597 : H : ARG NH1 A0197 <- 2.97 -> DG N7 C0006 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0197 <- 2.80 -> DG O6 C0006 : score 6.6 : H : ARG NH1 A0199 <- 3.14 -> DT O4 C0007 : score 3.04573 : H : ARG NH2 A0199 <- 2.33 -> DG O6 C0008 : score 7.2204 : w : GLU OE2 A0201 <- 6.11 -> DC N4 B0017 : score 3.597 : H : GLN OE1 A0227 <- 3.07 -> DA N6 C0010 : score 5.72573 : H : GLN NE2 A0227 <- 2.94 -> DA N7 C0010 : score 5.91923 : H : ARG NH1 A0236 <- 3.23 -> DG N7 C0009 : score 5.5297 : H : ARG NH1 A0236 <- 3.09 -> DG O6 C0009 : score 5.7305 : H : ARG NH2 A0236 <- 2.99 -> DG O6 C0009 : score 6.3492 : V : ALA CB A0076 <- 3.67 -> DT C7 C0015 : score 5.78094 : x : SER xxxx A0024 <- 4.35 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0028 <- 3.34 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0030 <- 3.24 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0032 <- 3.25 -> DA xxx B0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.98 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0068 <- 4.18 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0070 <- 3.56 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0078 <- 4.48 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0080 <- 3.14 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0180 <- 3.84 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0186 <- 3.78 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0190 <- 3.17 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0195 <- 3.71 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 3.90 -> DA xxx B0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0225 <- 3.79 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0229 <- 3.24 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0232 <- 3.87 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0234 <- 3.41 -> DC xxx B0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0240 <- 4.39 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >5v1f_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA SUBSTRATE COMPLEX WITH 8-OXOG AT THE PRIMER TERMINUS AND INCOMING DCTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.16 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.69 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.49 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5v1g_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA BINARY COMPLEX WITH 8-OXOG AT THE PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.33 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.67 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.50 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5v1h_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA BINARY COMPLEX WITH 8-OXOG:A AT THE PRIMER TERMINUS organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.88 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.57 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5v1i_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA TERNARY PRODUCT COMPLEX WITH 8-OXOG:C AND INSERTED DCTP organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0037 <- 6.33 -> DG N7 T0006 : score 3.259 : H : LYS NZ A0234 <- 2.92 -> DG N3 T0009 : score 1.41895 : w : LYS NZ A0234 <- 5.73 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.90 -> DC O2 P0011 : score 4.3899 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.59 -> DC O2 T0007 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0283 <- 5.99 -> DC O2 T0007 : score 1.669 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.37 -> DC O2 T0007 : score 2.68 : x : TYR xxxx A0271 <- 3.31 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0276 <- 3.54 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.47 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >5v1j_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA OPEN PRODUCT COMPLEX WITH 8-OXOG:C AND INSERTED DCTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.23 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.55 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.78 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5v1n_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA SUBSTRATE COMPLEX WITH 8-OXOG:A AT THE PRIMER TERMINUS AND INCOMING DCTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.14 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.96 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.64 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5v1o_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA PRODUCT COMPLEX WITH 8-OXOG:A AND INSERTED DCTP organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 2.91 -> DG N3 T0009 : score 1.42186 : w : LYS NZ A0234 <- 5.84 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : LYS NZ A0234 <- 5.74 -> DG N2 P0009 : score 0.846 : w : ARG NH1 A0258 <- 6.11 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : w : ASP OD2 A0276 <- 5.96 -> DC N4 P0011 : score 3.623 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.82 -> DC O2 P0011 : score 4.46157 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.55 -> DA N3 T0007 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.03 -> DA N3 T0007 : score 2.092 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.58 -> DA N3 T0007 : score 0.995 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.58 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : TYR xxxx A0271 <- 3.38 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.39 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >5v1p_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA SUBSTRATE COMPLEX WITH 8-OXOG:C AT THE PRIMER TERMINUS AND INCOMING DCTP ANALOG organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.31 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.00 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.59 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5v1r_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA REACTANT COMPLEX WITH 8-OXOG:C AT THE PRIMER TERMINUS AND INCOMING DCTP organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.20 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.98 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.55 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5v3g_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=PRDM9-ALLELE-C ZNF8-13 organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0730 <- 5.84 -> DT O4 C0020 : score 3.275 : H : SER OG A0732 <- 2.77 -> DG N7 B0002 : score 4.50894 : H : HIS NE2 A0733 <- 2.74 -> DG N7 C0019 : score 6.88419 : H : ARG NH1 A0736 <- 2.68 -> DG O6 C0018 : score 6.22933 : H : ARG NH2 A0736 <- 2.84 -> DG N7 C0018 : score 6.33354 : H : ARG NH1 A0757 <- 2.69 -> DG N7 C0017 : score 6.1831 : H : ARG NH2 A0757 <- 2.68 -> DG O6 C0017 : score 6.7584 : H : ASP OD2 A0758 <- 2.85 -> DC N4 B0005 : score 6.138 : H : HIS NE2 A0761 <- 2.55 -> DG O6 C0016 : score 8.35154 : H : SER OG A0788 <- 2.73 -> DA N7 B0008 : score 4.5266 : H : SER OG A0788 <- 3.32 -> DA N6 B0008 : score 2.94761 : H : ASN OD1 A0789 <- 3.18 -> DA N6 C0013 : score 5.56414 : H : ASN ND2 A0789 <- 2.93 -> DA N7 C0013 : score 5.71788 : w : SER OG A0816 <- 5.48 -> DT O4 C0011 : score 2.338 : H : ARG NH1 A0820 <- 2.84 -> DG O6 C0009 : score 6.03467 : H : ARG NH2 A0820 <- 2.77 -> DG N7 C0009 : score 6.42292 : H : ASP OD2 A0842 <- 2.65 -> DC N4 C0008 : score 6.386 : H : SER OG A0844 <- 2.76 -> DG O6 B0015 : score 4.12375 : H : ASN OD1 A0845 <- 2.97 -> DA N6 C0007 : score 5.81705 : H : ASN ND2 A0845 <- 2.84 -> DA N7 C0007 : score 5.82355 : H : HIS NE2 A0873 <- 3.07 -> DG N7 C0004 : score 6.43523 : H : HIS NE2 A0873 <- 3.34 -> DG O6 C0004 : score 7.09483 : H : ARG NH1 A0876 <- 3.06 -> DG N7 C0003 : score 5.7354 : H : ARG NH2 A0876 <- 2.26 -> DG N7 C0002 : score 7.07415 : V : TRP CD1 A0814 <- 3.78 -> DT C7 C0011 : score 7.37 : x : SER xxxx A0760 <- 4.33 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0786 <- 4.04 -> DC xxx C0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0817 <- 3.62 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0872 <- 2.96 -> DT xxx B0017 : score x.xxxxx >5v3j_F:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=MOUSEZFP568-ZNF1-10 IN COMPLEX WITH DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 F0430 <- 3.03 -> DG O6 C0025 : score 5.8035 : H : ARG NH2 F0430 <- 2.99 -> DG N7 C0025 : score 6.142 : w : ARG NH1 F0430 <- 5.45 -> DG O6 D0001 : score 2.756 : w : SER OG F0432 <- 5.63 -> DG O6 D0001 : score 2.749 : H : HIS NE2 F0433 <- 2.91 -> DG N7 C0024 : score 6.65291 : H : ARG NH1 F0436 <- 2.94 -> DG O6 C0023 : score 5.913 : H : ARG NH2 F0436 <- 2.98 -> DG N7 C0023 : score 6.15477 : w : ASP OD2 F0459 <- 5.21 -> DC N4 D0003 : score 3.623 : w : THR OG1 F0460 <- 5.66 -> DA N7 C0021 : score 2.152 : w : THR OG1 F0460 <- 5.67 -> DA N6 C0022 : score 3.251 : H : HIS NE2 F0517 <- 3.01 -> DT O4 C0017 : score 5.3734 : H : ARG NH1 F0520 <- 2.81 -> DG O6 C0016 : score 6.07117 : H : ARG NH2 F0520 <- 2.86 -> DG N7 C0016 : score 6.308 : H : ARG NH1 F0542 <- 2.92 -> DG O6 C0015 : score 5.93733 : H : ARG NH2 F0542 <- 2.86 -> DG N7 C0015 : score 6.308 : w : GLU OE2 F0545 <- 5.95 -> DC N4 C0013 : score 3.597 : w : CYS SG F0570 <- 6.97 -> DC N4 C0013 : score 4.371 : H : THR OG1 F0572 <- 2.54 -> DG O6 D0014 : score 4.43458 : w : GLU OE1 F0573 <- 5.92 -> DA N6 C0012 : score 2.939 : H : ARG NH2 F0576 <- 3.14 -> DG N7 C0010 : score 5.95046 : H : ARG NH2 F0576 <- 2.60 -> DG O6 C0010 : score 6.864 : H : ARG NH1 F0598 <- 3.09 -> DG O6 C0009 : score 5.7305 : H : ARG NH2 F0598 <- 2.92 -> DG N7 C0009 : score 6.23138 : H : ARG NH1 F0626 <- 3.21 -> DG N7 C0007 : score 5.5539 : H : ARG NH2 F0626 <- 2.61 -> DG O6 C0007 : score 6.8508 : H : SER OG F0628 <- 3.43 -> DA N6 D0019 : score 2.87524 : H : GLU OE2 F0629 <- 3.02 -> DC N4 C0006 : score 5.03371 : w : GLU OE2 F0629 <- 5.45 -> DC N4 D0020 : score 3.597 : H : ARG NH1 F0632 <- 3.04 -> DG O6 D0021 : score 5.79133 : H : ARG NH1 F0632 <- 3.18 -> DG O6 C0005 : score 5.621 : H : ARG NH2 F0632 <- 2.97 -> DG N7 C0005 : score 6.16754 : H : ARG NH2 F0632 <- 2.77 -> DG O6 C0005 : score 6.6396 : V : LEU CD1 F0492 <- 3.72 -> DT C7 D0007 : score 5.84591 : V : SER CB F0514 <- 3.51 -> DT C7 D0008 : score 3.3583 : V : SER CB F0516 <- 3.66 -> DT C7 D0009 : score 3.24088 >5v3m_C:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=MOUSEZFP568-ZNF1-11 IN COMPLEX WITH DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 C0430 <- 2.95 -> DG N7 B0002 : score 5.8685 : H : ARG NH1 C0430 <- 2.80 -> DG O6 B0002 : score 6.08333 : w : ARG NH2 C0430 <- 5.78 -> DG N7 A0026 : score 2.18 : H : HIS NE2 C0433 <- 3.15 -> DG N7 A0025 : score 6.32638 : H : ARG NH1 C0436 <- 2.87 -> DG O6 A0024 : score 5.99817 : H : ARG NH2 C0436 <- 2.94 -> DG N7 A0024 : score 6.20585 : w : THR OG1 C0460 <- 5.38 -> DA N7 A0022 : score 2.152 : w : THR OG1 C0460 <- 5.69 -> DA N6 A0023 : score 3.251 : w : GLN OE1 C0489 <- 5.61 -> DT O4 B0007 : score 3.068 : H : HIS NE2 C0517 <- 3.00 -> DT O4 A0018 : score 5.38462 : H : ARG NH2 C0520 <- 3.26 -> DG N7 A0017 : score 5.79723 : H : ARG NH2 C0520 <- 2.72 -> DG O6 A0017 : score 6.7056 : H : ARG NH1 C0542 <- 3.01 -> DG O6 A0016 : score 5.82783 : H : ARG NH2 C0542 <- 3.16 -> DG N7 A0016 : score 5.92492 : w : CYS SG C0570 <- 5.94 -> DA N6 A0013 : score 4.476 : H : THR OG1 C0572 <- 2.52 -> DG O6 B0015 : score 4.45145 : w : GLU OE1 C0573 <- 6.06 -> DA N6 A0013 : score 2.939 : H : ARG NH2 C0576 <- 2.64 -> DG O6 B0017 : score 6.8112 : H : ARG NH2 C0576 <- 3.35 -> DG O6 A0011 : score 5.874 : H : ARG NH1 C0598 <- 3.18 -> DG O6 A0010 : score 5.621 : H : ARG NH2 C0598 <- 3.13 -> DG N7 A0010 : score 5.96323 : H : ARG NH2 C0626 <- 2.97 -> DG O6 A0008 : score 6.3756 : H : ARG NH1 C0632 <- 2.70 -> DG O6 A0006 : score 6.205 : H : ARG NH2 C0632 <- 2.88 -> DG N7 A0006 : score 6.28246 : V : SER CB C0516 <- 3.67 -> DT C7 B0010 : score 3.23305 : V : THR CG2 C0571 <- 3.76 -> DT C7 B0014 : score 4.27929 : x : SER xxxx C0432 <- 3.63 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0458 <- 4.26 -> DA xxx A0022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0459 <- 4.40 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0486 <- 3.80 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0488 <- 3.46 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0492 <- 4.28 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0513 <- 4.32 -> DT xxx A0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0514 <- 3.41 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0545 <- 2.96 -> DA xxx A0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0548 <- 3.97 -> DA xxx A0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0601 <- 3.12 -> DT xxx A0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0628 <- 3.36 -> DA xxx B0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0629 <- 2.92 -> DC xxx A0007 : score x.xxxxx >5v8f_E:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURAL BASIS OF MCM2-7 REPLICATIVE HELICASE LOADING BY ORC-CDC6 AND CDT1 organism=? : x : LYS xxxx E0447 <- 3.65 -> DA xxx N0066 : score x.xxxxx >5v9x_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM SMEGMATIS HELICASE LHR BOUND TO SSDNA AND AMP-PNP organism=Mycobacterium smegmatis : H : ARG NE A0519 <- 3.27 -> DG N7 B0011 : score 4.00615 : H : ARG NH2 A0519 <- 3.16 -> DG O6 B0011 : score 6.1248 : H : ARG NH2 A0777 <- 2.61 -> DC O2 B0010 : score 3.83927 : V : ILE CG2 A0528 <- 3.74 -> DT C7 B0008 : score 7.19765 : x : ARG xxxx A0180 <- 3.72 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0362 <- 3.81 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0383 <- 3.89 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0411 <- 3.36 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0522 <- 4.03 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0523 <- 3.65 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0529 <- 4.19 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0531 <- 3.91 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0597 <- 3.79 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0600 <- 2.54 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0601 <- 3.14 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0847 <- 3.99 -> DA xxx B0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0848 <- 3.59 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0851 <- 3.39 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx >5va0_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH AP-1 RESPONSE ELEMENT FROM VCAM-1 PROMOTER organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0447 <- 3.11 -> DG N7 D0507 : score 5.6749 : w : ARG NH1 A0447 <- 5.57 -> DG O6 D0507 : score 2.756 : x : VAL xxxx A0443 <- 3.86 -> DG xxx D0507 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0443 <- 3.94 -> DC xxx C0517 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0447 <- 3.39 -> DC xxx C0517 : score x.xxxxx >5va0_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH AP-1 RESPONSE ELEMENT FROM VCAM-1 PROMOTER organism=Homo sapiens : x : VAL xxxx B0443 <- 3.94 -> DC xxx C0517 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0447 <- 3.39 -> DC xxx C0517 : score x.xxxxx >5va7_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN - IL11 AP-1 RECOGNITION ELEMENT COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0447 <- 2.94 -> DG N7 D0846 : score 5.8806 : H : ARG NH2 A0447 <- 2.55 -> DG O6 D0846 : score 6.93 : x : LYS xxxx A0442 <- 3.54 -> DA xxx C0865 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0443 <- 3.85 -> DG xxx D0846 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0447 <- 3.94 -> DA xxx C0859 : score x.xxxxx >5va7_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN - IL11 AP-1 RECOGNITION ELEMENT COMPLEX organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx B0447 <- 3.94 -> DA xxx C0859 : score x.xxxxx >5vaj_A:Ribonuclease_H-like; title=BHRNASE H - AMIDE-RNA/DNA COMPLEX organism=Bacillus halodurans : H : ASN ND2 A0077 <- 2.78 -> DT O2 D0004 : score 4.76514 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.18 -> DC O2 D0005 : score 4.13905 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.13 -> DC O2 D0005 : score 4.18384 : w : GLN NE2 A0134 <- 5.91 -> DA N3 D0006 : score 1.888 : w : THR OG1 A0135 <- 5.66 -> DA N3 D0006 : score 2.845 >5vaj_AB:Ribonuclease_H-like; title=BHRNASE H - AMIDE-RNA/DNA COMPLEX organism=Bacillus halodurans : H : ASN ND2 A0077 <- 2.78 -> DT O2 D0004 : score 4.76514 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.18 -> DC O2 D0005 : score 4.13905 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.13 -> DC O2 D0005 : score 4.18384 : w : GLN NE2 A0134 <- 5.91 -> DA N3 D0006 : score 1.888 : w : THR OG1 A0135 <- 5.66 -> DA N3 D0006 : score 2.845 : H : ASN ND2 B0077 <- 2.93 -> DT O2 D0009 : score 4.62275 : H : ASN OD1 B0106 <- 3.39 -> DG N2 D0010 : score 4.2336 : H : ASN ND2 B0106 <- 3.08 -> DG N3 D0010 : score 4.62076 : w : GLN NE2 B0134 <- 5.42 -> DT O2 D0011 : score 1.565 A : w : THR OG1 B0135 <- 5.65 -> DT O2 D0011 : score 2.522 : x : ASN xxxx B0105 <- 3.50 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >5vbs_A:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURAL BASIS FOR A SIX LETTER ALPHABET INCLUDING GATCKX organism=Moloney murine leukemia virus (isolate Shinnick) / Moloney murine leukemia virus (isolate Shinnick) : H : ASP OD2 A0114 <- 3.02 -> DG N2 G0016 : score 5.21878 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.62 -> DT O2 B0002 : score 4.38573 : x : LEU xxxx A0099 <- 3.29 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0100 <- 4.41 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0101 <- 4.43 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx >5vc9_F: title=ZINC FINGER OF HUMAN CXXC4 IN COMPLEX WITH CPG DNA organism=HOMO SAPIENS : H : HIS ND1 F0164 <- 2.84 -> DG O6 E0007 : score 6.17329 : H : GLN NE2 F0165 <- 2.79 -> DG O6 D0007 : score 5.81674 >5vez_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA SUBSTRATE COMPLEX WITH 8-OXOG:A AT THE PRIMER TERMINUS AND INCOMING DCTP ANALOG organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.40 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.97 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.52 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5vfx_A:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF AN ACCESSORY PROTEIN OF THE PCW3 RELAXOSOME IN COMPLEX WITH THE ORIGIN OF TRANSFER (ORIT) DNA organism=CLOSTRIDIUM PERFRINGENS : H : ARG NH1 A0071 <- 2.73 -> DG N7 I0014 : score 6.1347 : H : ARG NH1 A0075 <- 2.67 -> DG O6 I0016 : score 6.2415 : H : ARG NH2 A0075 <- 2.88 -> DG N7 I0016 : score 6.28246 : H : LYS NZ A0077 <- 2.83 -> DG O6 J0005 : score 5.74608 : H : ASN OD1 A0082 <- 3.04 -> DA N6 I0017 : score 5.73275 : H : ASN ND2 A0082 <- 2.82 -> DT O4 J0006 : score 5.26348 : H : TYR OH A0084 <- 2.81 -> DG N7 I0015 : score 4.2786 : x : ARG xxxx A0028 <- 3.04 -> DT xxx I0022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0070 <- 3.57 -> DA xxx I0011 : score x.xxxxx >5vfx_BC:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF AN ACCESSORY PROTEIN OF THE PCW3 RELAXOSOME IN COMPLEX WITH THE ORIGIN OF TRANSFER (ORIT) DNA organism=CLOSTRIDIUM PERFRINGENS : H : ARG NH2 B0028 <- 3.17 -> DT O2 K0010 : score 3.92007 : H : ARG NH1 B0075 <- 2.78 -> DG O6 K0004 : score 6.10767 : H : ARG NH2 B0075 <- 3.09 -> DG N7 K0004 : score 6.01431 : H : LYS NZ B0077 <- 2.77 -> DG O6 L0017 : score 5.81545 : H : TYR OH B0084 <- 2.84 -> DG N7 K0003 : score 4.25288 : H : ARG NH1 C0071 <- 2.82 -> DG N7 K0014 : score 6.0258 : H : ARG NH1 C0075 <- 2.74 -> DG O6 K0016 : score 6.15633 : H : ARG NH2 C0075 <- 2.91 -> DG N7 K0016 : score 6.24415 : H : LYS NZ C0077 <- 2.78 -> DG O6 L0005 : score 5.80389 : H : ASN OD1 C0082 <- 3.28 -> DA N6 K0017 : score 5.4437 : H : ASN ND2 C0082 <- 2.83 -> DT O4 L0006 : score 5.25291 : H : TYR OH C0084 <- 2.86 -> DG N7 K0015 : score 4.23573 : x : ASN xxxx B0082 <- 3.04 -> DT xxx L0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0028 <- 3.64 -> DT xxx K0022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0070 <- 3.69 -> DA xxx K0011 : score x.xxxxx >5vfx_FG:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF AN ACCESSORY PROTEIN OF THE PCW3 RELAXOSOME IN COMPLEX WITH THE ORIGIN OF TRANSFER (ORIT) DNA organism=CLOSTRIDIUM PERFRINGENS : H : ARG NH1 F0028 <- 2.91 -> DT O2 O0010 : score 4.21167 : H : ARG NH2 F0071 <- 2.88 -> DA N7 O0001 : score 1.64505 : H : ARG NH1 F0075 <- 3.05 -> DG O6 O0004 : score 5.77917 : H : ARG NH2 F0075 <- 2.80 -> DG N7 O0004 : score 6.38462 : H : ARG NH2 F0075 <- 3.10 -> DG O6 O0004 : score 6.204 : H : LYS NZ F0077 <- 2.82 -> DG O6 P0017 : score 5.75765 : H : TYR OH F0084 <- 2.70 -> DG N7 O0003 : score 4.37292 : H : ARG NH1 G0075 <- 2.73 -> DG O6 O0016 : score 6.1685 : H : ARG NH2 G0075 <- 2.87 -> DG N7 O0016 : score 6.29523 : H : LYS NZ G0077 <- 2.79 -> DG O6 P0005 : score 5.79233 : H : TYR OH G0084 <- 2.78 -> DG N7 O0015 : score 4.30433 : x : ASN xxxx F0082 <- 2.83 -> DT xxx P0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0028 <- 3.80 -> DA xxx P0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx G0070 <- 3.71 -> DA xxx O0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0071 <- 2.80 -> DG xxx O0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0082 <- 2.80 -> DT xxx P0006 : score x.xxxxx >5vhe_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=DHX36 IN COMPLEX WITH THE C-MYC G-QUADRUPLEX organism=Bos taurus : x : ILE xxxx A0065 <- 3.36 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0069 <- 3.37 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0070 <- 3.71 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0073 <- 3.83 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx >5vhv_B:ARM_repeat; title=PSEUDOMONAS FLUORESCENS ALKYLPURINE DNA GLYCOSYLASE ALKC BOUND TO DNA CONTAINING AN OXOCARBENIUM-INTERMEDIATE ANALOG organism=Pseudomonas fluorescens : H : TRP NE1 B0164 <- 2.82 -> DT O2 F0007 : score 6.19052 : H : THR OG1 B0337 <- 3.24 -> DC N4 E0005 : score 3.6784 : w : THR OG1 B0337 <- 5.85 -> DA N6 E0006 : score 3.251 : x : PRO xxxx B0163 <- 4.46 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0336 <- 3.77 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx >5vi0_A:ARM_repeat; title=PSEUDOMONAS FLUORESCENS ALKYLPURINE DNA GLYCOSYLASE ALKC BOUND TO DNA CONTAINING AN ABASIC SITE ANALOG organism=Pseudomonas fluorescens : H : TRP NE1 A0164 <- 3.19 -> DG N3 E0008 : score -8.40084 : x : PRO xxxx A0163 <- 4.28 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0337 <- 3.94 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx >5vi5_CDF: title=STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM SMEGMATIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH A FULL TRANSCRIPTION BUBBLE organism=? : H : ASN OD1 F0237 <- 3.12 -> DT N3 O0031 : score 3.558 : H : ARG NH1 F0239 <- 2.28 -> DG N7 O0032 : score 6.6792 : H : GLN OE1 F0291 <- 3.03 -> DC N4 O0025 : score 4.3725 : H : ARG NH1 F0295 <- 3.21 -> DG N7 O0024 : score 5.5539 : H : ARG NH2 F0295 <- 2.72 -> DG O6 O0024 : score 6.7056 : H : ARG NH1 F0438 <- 2.32 -> DG O6 P0043 : score 6.66733 : H : GLN NE2 F0443 <- 2.95 -> DT O4 O0003 : score 5.0353 : V : HIS CG F0309 <- 3.74 -> DT C7 O0021 : score 3.04396 : V : VAL CG1 F0308 <- 3.70 -> DT C7 O0023 : score 6.21203 : V : TRP CD2 F0288 <- 3.69 -> DT C7 O0026 : score 5.64756 : x : ARG xxxx C0164 <- 3.39 -> DA xxx P0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0196 <- 3.49 -> DC xxx O0038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0197 <- 4.07 -> DC xxx O0038 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0201 <- 4.30 -> DG xxx O0036 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0202 <- 2.78 -> DC xxx O0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0219 <- 3.30 -> DC xxx O0037 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0276 <- 3.60 -> DG xxx O0032 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0361 <- 3.80 -> DG xxx O0039 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0362 <- 3.92 -> DG xxx O0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0367 <- 3.70 -> DG xxx O0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0430 <- 3.69 -> DA xxx P0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0454 <- 3.87 -> DG xxx O0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0458 <- 3.58 -> DT xxx O0040 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0462 <- 4.32 -> DG xxx O0039 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0463 <- 3.00 -> DG xxx O0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0291 <- 3.41 -> DG xxx P0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0389 <- 3.59 -> DG xxx O0033 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0501 <- 4.46 -> DT xxx P0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0502 <- 3.76 -> DT xxx P0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0866 <- 3.15 -> DG xxx P0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0867 <- 4.01 -> DG xxx P0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0164 <- 2.99 -> DG xxx O0033 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0166 <- 3.59 -> DG xxx O0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0167 <- 3.19 -> DG xxx O0033 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0170 <- 3.40 -> DG xxx O0033 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0173 <- 4.29 -> DG xxx O0032 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0178 <- 3.69 -> DT xxx O0031 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0184 <- 3.98 -> DT xxx O0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0240 <- 3.53 -> DT xxx O0031 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0255 <- 4.41 -> DG xxx O0033 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0273 <- 3.63 -> DA xxx O0027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0274 <- 3.30 -> DA xxx O0027 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0277 <- 3.78 -> DA xxx O0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0279 <- 4.37 -> DA xxx O0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0282 <- 3.82 -> DT xxx O0031 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0283 <- 2.91 -> DA xxx O0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0284 <- 3.33 -> DA xxx O0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0286 <- 3.39 -> DC xxx O0030 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0287 <- 3.28 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0294 <- 4.32 -> DA xxx P0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0312 <- 3.73 -> DC xxx P0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0365 <- 3.95 -> DG xxx P0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0437 <- 4.10 -> DT xxx O0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0439 <- 3.67 -> DT xxx O0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0440 <- 3.52 -> DT xxx O0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0442 <- 3.14 -> DC xxx P0045 : score x.xxxxx >5vi8_FT: title=STRUCTURE OF A MYCOBACTERIUM SMEGMATIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH AN UPSTREAM-FORK PROMOTER FRAGMENT organism=? : H : GLN OE1 F0291 <- 2.66 -> DC N4 O0025 : score 4.71167 : H : ARG NH1 F0295 <- 3.31 -> DG N7 O0024 : score 5.4329 : H : ARG NH2 F0295 <- 2.57 -> DG O6 O0024 : score 6.9036 : w : ARG NE F0295 <- 5.98 -> DG O6 P0002 : score 1.369 : w : ARG NH2 F0295 <- 6.40 -> DG O6 P0002 : score 2.468 : H : ARG NH1 F0438 <- 2.54 -> DG N7 P0020 : score 6.3646 : H : ARG NH1 F0438 <- 2.40 -> DG O6 P0020 : score 6.57 : H : GLU OE1 F0439 <- 2.92 -> DC N4 P0022 : score 5.62952 : H : GLN NE2 F0443 <- 2.94 -> DT O4 O0003 : score 5.04568 : w : ARG NH2 T0259 <- 5.62 -> DG N3 O0012 : score 0.677 : w : ASN OD1 T0288 <- 5.95 -> DG N3 O0012 : score 3.377 : V : VAL CG1 F0308 <- 3.52 -> DT C7 O0023 : score 6.48475 : x : TRP xxxx F0287 <- 3.23 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0288 <- 3.56 -> DC xxx O0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0294 <- 4.41 -> DA xxx P0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0309 <- 3.24 -> DT xxx O0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0312 <- 3.37 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0427 <- 4.48 -> DG xxx P0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0437 <- 3.98 -> DT xxx O0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0440 <- 3.45 -> DC xxx O0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0442 <- 3.72 -> DT xxx P0021 : score x.xxxxx >5vi8_T:C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit; title=STRUCTURE OF A MYCOBACTERIUM SMEGMATIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH AN UPSTREAM-FORK PROMOTER FRAGMENT organism=? : w : ARG NH2 T0259 <- 5.62 -> DG N3 O0012 : score 0.677 : w : ASN OD1 T0288 <- 5.95 -> DG N3 O0012 : score 3.377 >5vl9_A:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF EILR IN COMPLEX WITH EILO DNA ELEMENT organism=Enterobacter lignolyticus : H : TYR OH A0003 <- 3.24 -> DG N2 H0005 : score 4.45945 : H : TYR OH A0003 <- 2.71 -> DT O2 G0011 : score 3.27457 : H : ARG NH1 A0032 <- 3.12 -> DG N7 G0004 : score 5.6628 : H : ARG NH2 A0032 <- 2.90 -> DG O6 G0004 : score 6.468 : w : HIS ND1 A0046 <- 5.36 -> DC N4 G0006 : score 2.515 : H : HIS NE2 A0047 <- 2.87 -> DT O4 H0007 : score 5.53045 : x : VAL xxxx A0031 <- 3.93 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0041 <- 3.69 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0044 <- 3.60 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx >5vl9_AD:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF EILR IN COMPLEX WITH EILO DNA ELEMENT organism=Enterobacter lignolyticus : H : TYR OH A0003 <- 3.24 -> DG N2 H0005 : score 4.45945 : H : TYR OH A0003 <- 2.71 -> DT O2 G0011 : score 3.27457 : H : ARG NH1 A0032 <- 3.12 -> DG N7 G0004 : score 5.6628 : H : ARG NH2 A0032 <- 2.90 -> DG O6 G0004 : score 6.468 : w : HIS ND1 A0046 <- 5.36 -> DC N4 G0006 : score 2.515 : H : HIS NE2 A0047 <- 2.87 -> DT O4 H0007 : score 5.53045 : x : VAL xxxx A0031 <- 3.93 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0041 <- 3.69 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0044 <- 3.60 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0046 <- 3.69 -> DA xxx G0008 : score x.xxxxx >5vl9_BC:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF EILR IN COMPLEX WITH EILO DNA ELEMENT organism=Enterobacter lignolyticus : H : TYR OH C0003 <- 2.80 -> DT O2 E0011 : score 3.21667 : H : TYR OH C0003 <- 3.35 -> DG N2 F0005 : score 4.35187 : H : ARG NH1 C0032 <- 2.99 -> DG N7 E0004 : score 5.8201 : H : ARG NH2 C0032 <- 2.89 -> DG O6 E0004 : score 6.4812 : w : HIS ND1 C0046 <- 6.04 -> DC N4 E0006 : score 2.515 : H : HIS NE2 C0047 <- 2.89 -> DT O4 F0007 : score 5.50801 : x : ARG xxxx B0032 <- 3.74 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0046 <- 3.63 -> DA xxx E0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0031 <- 3.88 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0041 <- 3.87 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0042 <- 4.44 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0044 <- 3.77 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx >5vmu_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=KAISO (ZBTB33) ZINC FINGER DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A DOUBLE CPG-METHYLATED DNA RESEMBLING THE SPECIFIC KAISO BINDING SEQUENCE (KBS) organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0511 <- 2.80 -> DG O6 D0009 : score 6.08333 : H : ARG NH1 A0511 <- 2.71 -> DG O6 E0027 : score 6.19283 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.09 -> DG N7 D0009 : score 6.01431 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.07 -> DG O6 D0009 : score 6.2436 : w : GLU OE2 A0535 <- 5.79 -> DC N4 D0007 : score 3.597 : H : GLN NE2 A0563 <- 3.03 -> DG O6 E0031 : score 5.53809 : H : ARG NH2 A0595 <- 2.67 -> DT O2 E0025 : score 4.3434 : H : TYR OH A0597 <- 3.20 -> DG N2 D0011 : score 4.49856 : V : THR CG2 A0507 <- 3.77 -> DT C7 E0025 : score 4.2687 : x : SER xxxx A0508 <- 3.48 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0536 <- 3.73 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0561 <- 4.15 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0562 <- 3.62 -> DG xxx E0030 : score x.xxxxx >5vmv_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=KAISO (ZBTB33) ZINC FINGER DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH ITS DOUBLE CPG-METHYLATED DNA CONSENSUS BINDING SITE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0511 <- 2.88 -> DG O6 D0009 : score 5.986 : H : ARG NH1 A0511 <- 2.43 -> DG O6 E0027 : score 6.5335 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.22 -> DG N7 D0009 : score 5.84831 : H : ARG NH2 A0511 <- 2.74 -> DG O6 D0009 : score 6.6792 : H : ARG NH1 A0595 <- 2.64 -> DT O2 E0025 : score 4.44422 : V : THR CG2 A0507 <- 3.61 -> DT C7 E0025 : score 4.43818 : x : SER xxxx A0508 <- 3.31 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0535 <- 3.80 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0536 <- 3.61 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0539 <- 3.66 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0562 <- 3.56 -> DA xxx E0030 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0563 <- 3.56 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx >5vmw_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=KAISO (ZBTB33) ZINC FINGER DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A DOUBLE CPG-METHYLATED DNA RESEMBLING THE SPECIFIC KAISO BINDING SEQUENCE (KBS) organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0511 <- 2.69 -> DG O6 E0027 : score 6.21717 : H : ARG NH1 A0511 <- 3.01 -> DG O6 D0009 : score 5.82783 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.10 -> DG N7 D0009 : score 6.00154 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.19 -> DG O6 D0009 : score 6.0852 : w : GLU OE2 A0535 <- 5.60 -> DC N4 D0007 : score 3.597 : H : GLN NE2 A0563 <- 3.02 -> DG O6 E0031 : score 5.5497 : H : ARG NH2 A0595 <- 2.67 -> DT O2 E0025 : score 4.3434 : H : TYR OH A0597 <- 3.27 -> DG N2 D0011 : score 4.43011 : V : THR CG2 A0507 <- 3.64 -> DT C7 E0025 : score 4.4064 : x : SER xxxx A0508 <- 3.64 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0536 <- 3.79 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0561 <- 4.13 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0562 <- 3.53 -> DG xxx E0030 : score x.xxxxx >5vmx_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=KAISO (ZBTB33) ZINC FINGER DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A HEMI CPG-METHYLATED DNA RESEMBLING THE SPECIFIC KAISO BINDING SEQUENCE (KBS) organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0511 <- 2.88 -> DG O6 D0009 : score 5.986 : H : ARG NH1 A0511 <- 2.86 -> DG O6 E0027 : score 6.01033 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.00 -> DG N7 D0009 : score 6.12923 : H : GLU OE1 A0535 <- 2.84 -> DC N4 E0028 : score 5.72181 : w : GLU OE2 A0535 <- 5.69 -> DG O6 E0029 : score 2.892 : w : GLU OE2 A0535 <- 5.81 -> DC N4 D0007 : score 3.597 : w : LYS NZ A0539 <- 5.35 -> DC N4 D0006 : score 0.048 : w : LYS NZ A0539 <- 6.03 -> DG O6 E0030 : score 3.005 : w : LYS NZ A0539 <- 5.95 -> DC N4 D0007 : score 0.048 : H : GLN NE2 A0563 <- 3.05 -> DG O6 E0031 : score 5.51487 : w : GLN NE2 A0563 <- 5.61 -> DG O6 E0030 : score 2.87 : H : ARG NH1 A0595 <- 2.95 -> DC O2 E0026 : score 3.5405 : H : ARG NH2 A0595 <- 2.74 -> DT O2 E0025 : score 4.28413 : H : TYR OH A0597 <- 3.21 -> DG N2 D0011 : score 4.48878 : H : TYR OH A0597 <- 3.01 -> DG N3 E0027 : score 2.98331 : V : THR CG2 A0507 <- 3.73 -> DT C7 E0025 : score 4.31107 : x : SER xxxx A0508 <- 3.63 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0536 <- 3.75 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0561 <- 3.71 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0562 <- 3.51 -> DG xxx E0030 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0564 <- 4.45 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >5vmy_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=KAISO (ZBTB33) ZINC FINGER DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A HEMI CPG-METHYLATED DNA RESEMBLING THE SPECIFIC KAISO BINDING SEQUENCE (KBS) organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0511 <- 2.91 -> DG O6 D0009 : score 5.9495 : H : ARG NH1 A0511 <- 2.80 -> DG O6 E0027 : score 6.08333 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.05 -> DG N7 D0009 : score 6.06538 : H : GLU OE1 A0535 <- 2.85 -> DC N4 E0028 : score 5.71027 : w : GLU OE2 A0535 <- 5.82 -> DC N4 D0007 : score 3.597 : w : GLU OE2 A0535 <- 5.80 -> DG O6 E0029 : score 2.892 : H : GLN NE2 A0563 <- 2.92 -> DG O6 E0031 : score 5.6658 : w : GLN OE1 A0563 <- 6.13 -> DC N4 D0006 : score 3.488 : w : GLN NE2 A0563 <- 5.55 -> DG O6 E0030 : score 2.87 : H : ARG NH1 A0595 <- 2.86 -> DC O2 E0026 : score 3.6062 : H : ARG NH2 A0595 <- 2.61 -> DT O2 E0025 : score 4.3942 : H : TYR OH A0597 <- 3.21 -> DG N2 D0011 : score 4.48878 : H : TYR OH A0597 <- 2.95 -> DG N3 E0027 : score 3.02068 : V : THR CG2 A0507 <- 3.77 -> DT C7 E0025 : score 4.2687 : x : SER xxxx A0508 <- 3.67 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0536 <- 3.78 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0561 <- 3.68 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0562 <- 3.50 -> DG xxx E0030 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0564 <- 4.42 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >5vmz_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=KAISO (ZBTB33) E535Q MUTANT ZINC FINGER DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A DOUBLE CPG-METHYLATED DNA RESEMBLING THE SPECIFIC KAISO BINDING SEQUENCE (KBS) organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0511 <- 2.71 -> DG O6 E0027 : score 6.19283 : H : ARG NH1 A0511 <- 2.88 -> DG O6 D0009 : score 5.986 : H : ARG NH2 A0511 <- 2.90 -> DG N7 D0009 : score 6.25692 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.06 -> DG O6 D0009 : score 6.2568 : H : GLN NE2 A0563 <- 2.81 -> DG O6 E0031 : score 5.79352 : H : ARG NH2 A0595 <- 2.65 -> DT O2 E0025 : score 4.36033 : H : TYR OH A0597 <- 2.83 -> DG N3 E0027 : score 3.09542 : H : TYR OH A0597 <- 3.24 -> DG N2 D0011 : score 4.45945 : V : THR CG2 A0507 <- 3.78 -> DT C7 E0025 : score 4.25811 : x : SER xxxx A0508 <- 3.65 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0535 <- 3.18 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0536 <- 3.71 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0561 <- 4.11 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0562 <- 3.54 -> DG xxx E0030 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0564 <- 4.04 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >5voi_CDF: title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF BACTERIAL RNA POLYMERASE AND PYRG PROMOTER COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx C0422 <- 2.85 -> DC xxx H0016 : score x.xxxxx >5vpe_C:Leucine_zipper_domain; title=TRANSCRIPTION FACTOR FOSB/JUND BZIP DOMAIN IN COMPLEX WITH COGNATE DNA, TYPE-I CRYSTAL organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 C0161 <- 2.75 -> DG O6 G0006 : score 6.666 : H : ASN OD1 C0165 <- 2.85 -> DC N4 H0012 : score 4.15165 : H : ASN ND2 C0165 <- 2.73 -> DT O4 G0007 : score 5.3586 : H : ARG NH1 C0173 <- 2.93 -> DG N7 H0010 : score 5.8927 : H : ARG NH2 C0173 <- 2.50 -> DG O6 H0010 : score 6.996 : V : ALA CB C0169 <- 3.70 -> DT C7 H0011 : score 5.73895 : x : ALA xxxx C0168 <- 4.02 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx >5vpe_D:Leucine_zipper_domain;A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors; title=TRANSCRIPTION FACTOR FOSB/JUND BZIP DOMAIN IN COMPLEX WITH COGNATE DNA, TYPE-I CRYSTAL organism=HOMO SAPIENS : w : LYS NZ D0274 <- 5.66 -> DC N4 G0014 : score 0.048 : H : ASN OD1 D0278 <- 2.83 -> DC N4 G0012 : score 4.16843 : H : ASN ND2 D0278 <- 2.83 -> DT O4 H0007 : score 5.25291 : w : ASN ND2 D0278 <- 5.73 -> DG N7 H0006 : score 3.259 : V : ALA CB D0282 <- 3.71 -> DT C7 G0011 : score 5.72495 : x : ARG xxxx D0279 <- 4.14 -> DT xxx G0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0281 <- 4.15 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0285 <- 4.29 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0286 <- 4.09 -> DA xxx G0009 : score x.xxxxx >5vpf_B:Leucine_zipper_domain;A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors; title=TRANSCRIPTION FACTOR FOSB/JUND BZIP DOMAIN IN COMPLEX WITH COGNATE DNA, TYPE-II CRYSTAL organism=HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 B0278 <- 3.01 -> DC N4 E0012 : score 4.01746 : H : ASN ND2 B0278 <- 2.84 -> DT O4 F0007 : score 5.24234 : V : ALA CB B0282 <- 3.62 -> DT C7 E0011 : score 5.85093 : V : ALA CB B0281 <- 3.89 -> DT C7 F0007 : score 5.473 : x : CYS xxxx B0285 <- 4.27 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0286 <- 2.82 -> DC xxx E0010 : score x.xxxxx >5vrx_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA PRE-CATALYTIC 8-OXOG:DC EXTENSION COMPLEX WITH DTTP BOUND IN WATSON-CRICK CONFORMATION organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.20 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.75 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.52 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5vry_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA 8-OXOG:DC EXTENSION WITH DTTP AFTER 20 S organism=HOMO SAPIENS : w : ASN OD1 A0037 <- 6.51 -> DA N6 T0006 : score 2.837 : w : ASN ND2 A0037 <- 6.37 -> DA N6 T0006 : score 2.5 : H : TYR OH A0271 <- 2.82 -> DC O2 P0010 : score 3.48345 : H : ARG NH1 A0283 <- 3.02 -> DA N3 T0006 : score 3.52004 : x : LYS xxxx A0234 <- 3.43 -> DC xxx T0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.53 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx >5vrz_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA 8-OXOG:DC EXTENSION WITH DTTP AFTER 60 S organism=HOMO SAPIENS : w : SER OG A0229 <- 6.75 -> DC O2 T0009 : score 1.768 : w : LYS NZ A0234 <- 5.60 -> DC O2 T0009 : score 1.3 : H : TYR OH A0271 <- 2.71 -> DC O2 P0010 : score 3.56039 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.94 -> DT O2 P0011 : score 4.61326 : H : ARG NH1 A0283 <- 3.00 -> DA N3 T0006 : score 3.53477 : V : ASP CB A0276 <- 3.80 -> DT C7 P0011 : score 2.68308 : x : LYS xxxx A0280 <- 3.47 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx >5vs0_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA 8-OXOG:DC EXTENSION WITH DTTP AFTER 80 S organism=Homo sapiens : w : ASN OD1 A0037 <- 6.37 -> DA N6 T0006 : score 2.837 : H : LYS NZ A0234 <- 3.38 -> DC O2 T0009 : score 2.6044 : H : TYR OH A0271 <- 2.57 -> DC O2 P0010 : score 3.65832 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.89 -> DT O2 P0011 : score 4.66072 : H : ARG NH1 A0283 <- 3.10 -> DA N3 T0006 : score 3.46113 : x : ASP xxxx A0276 <- 3.49 -> DT xxx P0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.21 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx >5vs1_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA PRE-CATALYTIC 8-OXOG:DA EXTENSION COMPLEX WITH DTTP BOUND IN NON-PLANAR CONFORMATION organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0280 <- 3.03 -> DA N7 T0006 : score 2.80207 : H : ARG NH1 A0283 <- 2.86 -> DA N3 T0006 : score 3.63787 : x : LYS xxxx A0234 <- 3.77 -> DC xxx T0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0271 <- 2.80 -> DA xxx P0010 : score x.xxxxx >5vs2_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA PRE-CATALYTIC 8-OXOG:DA EXTENSION COMPLEX WITH DTTP BOUND IN WATSON-CRICK CONFORMATION organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0037 <- 5.93 -> DA N7 T0006 : score 1.989 : H : TYR OH A0271 <- 2.77 -> DA N3 P0010 : score 4.17619 : x : LYS xxxx A0234 <- 3.73 -> DC xxx T0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.45 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0283 <- 3.14 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx >5vs3_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA 8-OXOG:DA EXTENSION WITH DTTP AFTER 90 S organism=HOMO SAPIENS : w : ASN OD1 A0037 <- 6.09 -> DA N6 T0006 : score 2.837 : w : ASN ND2 A0037 <- 5.72 -> DA N7 T0006 : score 1.989 : H : TYR OH A0271 <- 2.83 -> DA N3 P0010 : score 4.12637 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.97 -> DT O2 P0011 : score 4.58478 : w : LYS NZ A0280 <- 6.33 -> DA N7 T0006 : score 1.655 : H : ARG NH1 A0283 <- 2.99 -> DA N3 T0006 : score 3.54213 : x : LYS xxxx A0234 <- 3.43 -> DC xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0276 <- 3.68 -> DT xxx P0011 : score x.xxxxx >5vs4_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA 8-OXOG:DA EXTENSION WITH DTTP AFTER 120 S organism=Homo sapiens : w : ASN OD1 A0037 <- 6.09 -> DA N6 T0006 : score 2.837 : w : ASN ND2 A0037 <- 5.82 -> DA N7 T0006 : score 1.989 : w : SER OG A0229 <- 6.71 -> DC O2 T0009 : score 1.768 : w : LYS NZ A0234 <- 5.32 -> DC O2 P0009 : score 1.3 : w : LYS NZ A0234 <- 5.52 -> DC O2 T0009 : score 1.3 : H : TYR OH A0271 <- 2.79 -> DA N3 P0010 : score 4.15958 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.94 -> DT O2 P0011 : score 4.61326 : H : ARG NH1 A0283 <- 3.16 -> DA N3 T0006 : score 3.41694 : x : ASP xxxx A0276 <- 3.52 -> DT xxx P0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.50 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx >5vu6_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TNA POLYMERASE BINARY COMPLEX WITH PRIMER/TEMPLATE DUPLEX organism=Thermococcus kodakarensis : H : LYS NZ A0592 <- 3.50 -> DG N3 P0011 : score 1.25031 : H : ARG NH1 A0612 <- 3.03 -> DG N3 P0009 : score 2.91215 : H : ARG NH2 A0612 <- 3.04 -> DT O2 P0008 : score 4.03013 >5vu7_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TNA POLYMERASE, OPEN TERNARY COMPLEX organism=Thermococcus kodakarensis : H : LYS NZ A0592 <- 2.81 -> DG N3 P0011 : score 1.45094 : H : ARG NH1 A0612 <- 3.01 -> DG N3 P0009 : score 2.92436 : H : ARG NH2 A0612 <- 3.39 -> DT O2 P0008 : score 3.7338 >5vu8_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TNA POLYMERASE, CLOSED TERNARY COMPLEX organism=Thermococcus kodakarensis : H : LYS NZ A0592 <- 2.42 -> DG N3 T0007 : score 1.56434 : H : LYS NZ A0592 <- 3.10 -> DG N3 P0011 : score 1.36662 : H : ARG NH2 A0612 <- 2.64 -> DT O2 P0008 : score 4.3688 : x : ASP xxxx A0614 <- 4.46 -> DT xxx P0008 : score x.xxxxx >5vu9_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TNA POLYMERASE, TRANSLOCATED PRODUCT organism=Thermococcus kodakarensis : H : ARG NH1 A0612 <- 2.99 -> DC O2 P0010 : score 3.5113 : x : LYS xxxx A0592 <- 3.24 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx >5vvj_A: title=CAS1-CAS2 BOUND TO HALF-SITE INTERMEDIATE organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : TYR xxxx A0022 <- 3.34 -> DA xxx G0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0037 <- 3.82 -> DA xxx G0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0056 <- 4.27 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0080 <- 3.78 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx >5vvj_ABCDEF: title=CAS1-CAS2 BOUND TO HALF-SITE INTERMEDIATE organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : TYR xxxx A0022 <- 3.34 -> DA xxx G0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0037 <- 3.82 -> DA xxx G0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0056 <- 4.27 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0080 <- 3.78 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0022 <- 3.26 -> DT xxx G0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0037 <- 3.63 -> DA xxx H0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0056 <- 4.38 -> DT xxx G0023 : score x.xxxxx >5vvr_ABEM:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=TERNARY COMPLEX OF RNA POL II, TRANSCRIPTION SCAFFOLD AND RAD26 organism=? : H : ARG NH1 B0504 <- 3.09 -> DG N7 N0031 : score 5.6991 : H : TYR OH B0866 <- 2.77 -> DC N4 T0032 : score 4.23939 : H : ARG NH1 M0614 <- 3.04 -> DC O2 T0032 : score 3.4748 : V : LEU CB M0617 <- 3.66 -> DT C7 T0033 : score 4.55294 : x : ASN xxxx A0253 <- 3.72 -> DG xxx T0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0255 <- 4.24 -> DG xxx T0031 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0256 <- 3.49 -> DG xxx T0031 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.81 -> DT xxx T0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 3.54 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 3.45 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 4.39 -> DG xxx N0032 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0865 <- 4.03 -> DG xxx T0030 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0924 <- 3.93 -> DG xxx T0031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx M0476 <- 3.54 -> DT xxx N0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0613 <- 4.46 -> DC xxx T0032 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx M0615 <- 3.14 -> DC xxx T0032 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx M0618 <- 3.39 -> DT xxx T0033 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx M0621 <- 3.91 -> DT xxx T0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0731 <- 3.33 -> DT xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx M0751 <- 3.83 -> DA xxx N0015 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx M0752 <- 3.65 -> DA xxx N0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0791 <- 3.82 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx >5vvr_M:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=TERNARY COMPLEX OF RNA POL II, TRANSCRIPTION SCAFFOLD AND RAD26 organism=? : H : ARG NH1 M0614 <- 3.04 -> DC O2 T0032 : score 3.4748 : V : LEU CB M0617 <- 3.66 -> DT C7 T0033 : score 4.55294 : x : ASN xxxx M0476 <- 3.54 -> DT xxx N0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0613 <- 4.46 -> DC xxx T0032 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx M0615 <- 3.14 -> DC xxx T0032 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx M0618 <- 3.39 -> DT xxx T0033 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx M0621 <- 3.91 -> DT xxx T0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0731 <- 3.33 -> DT xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx M0751 <- 3.83 -> DA xxx N0015 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx M0752 <- 3.65 -> DA xxx N0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0791 <- 3.82 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx >5vvs_ABE: title=RNA POL II ELONGATION COMPLEX organism=? : x : PRO xxxx A0448 <- 3.32 -> DT xxx T0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 2.97 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 3.50 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0505 <- 3.51 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx >5vvs_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POL II ELONGATION COMPLEX organism=? : x : ASP xxxx B0505 <- 3.51 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx >5vxn_C:CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=STRUCTURE OF TWO RCSB DIMERS BOUND TO TWO PARALLEL DNAS. organism=Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) : H : LYS NZ C0180 <- 3.23 -> DT O4 H0030 : score 3.27868 : H : LYS NZ C0180 <- 2.65 -> DG O6 G0006 : score 5.95419 : x : ILE xxxx C0179 <- 4.18 -> DT xxx H0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0181 <- 3.07 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0183 <- 3.59 -> DT xxx H0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0184 <- 3.20 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0185 <- 4.15 -> DT xxx G0003 : score x.xxxxx >5vxn_CD:CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=STRUCTURE OF TWO RCSB DIMERS BOUND TO TWO PARALLEL DNAS. organism=Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) : H : LYS NZ C0180 <- 3.23 -> DT O4 H0030 : score 3.27868 : H : LYS NZ C0180 <- 2.65 -> DG O6 G0006 : score 5.95419 : H : LYS NZ D0180 <- 2.35 -> DG O6 H0024 : score 6.30104 : H : LYS NZ D0180 <- 3.30 -> DT O4 G0012 : score 3.22846 : H : SER OG D0184 <- 3.07 -> DA N6 H0022 : score 3.1121 : x : ILE xxxx C0179 <- 4.18 -> DT xxx H0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0181 <- 3.07 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0183 <- 3.59 -> DT xxx H0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0184 <- 3.20 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0185 <- 4.15 -> DT xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0179 <- 4.29 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0181 <- 3.05 -> DA xxx H0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0183 <- 3.84 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0185 <- 3.90 -> DT xxx H0021 : score x.xxxxx >5vz9_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=POST-CATALYTIC COMPLEX OF HUMAN POLYMERASE MU (G433A) MUTANT WITH INCOMING DTTP organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0387 <- 3.12 -> DA N3 T0007 : score 3.4464 : w : ARG NH1 A0387 <- 5.62 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : w : LYS NZ A0438 <- 5.43 -> DT O4 P0005 : score 1.7 : H : ARG NH1 A0445 <- 3.14 -> DT O2 T0006 : score 4.01357 : x : PHE xxxx A0389 <- 3.85 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0441 <- 4.09 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.59 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >5vzc_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=POST-CATALYTIC COMPLEX OF HUMAN POLYMERASE MU (G433S) MUTANT WITH INCOMING DTTP organism=HOMO SAPIENS : w : GLN OE1 A0275 <- 6.61 -> DG N2 T0009 : score 2.177 : w : GLN NE2 A0275 <- 6.42 -> DG N3 P0002 : score 1.484 : H : ARG NH1 A0387 <- 3.16 -> DA N3 T0007 : score 3.41694 : w : ARG NH1 A0387 <- 5.51 -> DT O2 P0003 : score 1.855 : w : LYS NZ A0438 <- 5.23 -> DT O4 P0005 : score 1.7 : H : ARG NH1 A0445 <- 3.15 -> DT O2 T0006 : score 4.00496 : x : PHE xxxx A0389 <- 3.84 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0441 <- 4.03 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.59 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >5vzf_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=POST-CATALYTIC COMPLEX OF HUMAN POLYMERASE MU (W434A) MUTANT WITH INCOMING DTTP organism=Homo sapiens : w : GLN OE1 A0275 <- 6.37 -> DG N2 T0009 : score 2.177 : H : ARG NH1 A0387 <- 3.11 -> DA N3 T0007 : score 3.45376 : w : ARG NH1 A0387 <- 5.56 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : w : LYS NZ A0438 <- 5.10 -> DT O4 P0005 : score 1.7 : w : ARG NH2 A0445 <- 5.86 -> DT O2 P0005 : score 2.261 : x : PHE xxxx A0389 <- 3.67 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0441 <- 4.30 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.45 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >5vzi_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=POST-CATALYTIC COMPLEX OF HUMAN POLYMERASE MU (W434H) MUTANT WITH INCOMING DTTP organism=Homo sapiens : w : GLN OE1 A0275 <- 6.39 -> DG N2 T0009 : score 2.177 : H : ARG NH1 A0387 <- 3.22 -> DA N3 T0007 : score 3.37276 : w : ARG NH1 A0387 <- 5.66 -> DT O2 P0003 : score 1.855 : w : LYS NZ A0438 <- 5.27 -> DT O4 P0005 : score 1.7 : w : ARG NH1 A0445 <- 5.81 -> DT O2 T0006 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0445 <- 6.20 -> DT O2 P0005 : score 2.261 : x : PHE xxxx A0389 <- 3.73 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0441 <- 4.18 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.48 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >5w0u_B:Periplasmic_binding_protein-like_II;Cytidine_deaminase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MBP FUSED ACTIVATION-INDUCED CYTIDINE DEAMINASE (AID) IN COMPLEX WITH DCMP organism=ESCHERICHIA COLI O157:H7, HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B1019 <- 3.01 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B1020 <- 4.00 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx >5w1c_B:Periplasmic_binding_protein-like_II;Cytidine_deaminase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MBP FUSED ACTIVATION-INDUCED CYTIDINE DEAMINASE (AID) IN COMPLEX WITH CYTIDINE organism=ESCHERICHIA COLI O157:H7, HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B1019 <- 3.39 -> DG xxx G0003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B1020 <- 3.97 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx >5w2a_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE KAPPA IN COMPLEX WITH LUCIDIN- DERIVED DNA ADDUCT AND INCOMING DCMPNPP organism=Homo sapiens : x : GLU xxxx B0419 <- 3.45 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0512 <- 4.07 -> DG xxx T0008 : score x.xxxxx >5w2c_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE KAPPA IN COMPLEX WITH LUCIDIN- DERIVED DNA ADDUCT AND INCOMING DAMPNPP organism=Homo sapiens : x : MET xxxx A0135 <- 3.70 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0151 <- 3.68 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0419 <- 3.27 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0459 <- 3.62 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >5w2m_ABC:Cytidine_deaminase-like; title=APOBEC3F CATALYTIC DOMAIN COMPLEX WITH A SINGLE-STRANDED DNA organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0333 <- 3.21 -> DT O2 E0902 : score 2.9529 : V : LYS CB B0355 <- 3.85 -> DT C7 E0906 : score 2.27682 : V : PHE CG B0351 <- 3.86 -> DT C7 E0908 : score 5.19878 : x : PRO xxxx A0350 <- 3.11 -> DT xxx E0902 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0353 <- 3.27 -> DT xxx E0902 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0357 <- 4.00 -> DT xxx E0903 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0358 <- 3.12 -> DT xxx E0903 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0333 <- 2.64 -> DT xxx E0908 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0337 <- 3.37 -> DT xxx E0908 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0350 <- 3.64 -> DT xxx E0908 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0353 <- 3.57 -> DT xxx E0908 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0357 <- 4.26 -> DT xxx E0907 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0358 <- 4.10 -> DT xxx E0907 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0359 <- 3.58 -> DT xxx E0906 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0333 <- 3.12 -> DT xxx E0909 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0352 <- 4.18 -> DT xxx E0910 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0355 <- 3.26 -> DT xxx E0910 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0357 <- 3.81 -> DT xxx E0909 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0358 <- 3.39 -> DT xxx E0909 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0359 <- 3.32 -> DT xxx E0908 : score x.xxxxx >5w2m_D:Cytidine_deaminase-like; title=APOBEC3F CATALYTIC DOMAIN COMPLEX WITH A SINGLE-STRANDED DNA organism=Homo sapiens : V : TYR CB D0333 <- 3.59 -> DT C7 E0901 : score 5.12433 >5w2m_DM:Cytidine_deaminase-like; title=APOBEC3F CATALYTIC DOMAIN COMPLEX WITH A SINGLE-STRANDED DNA organism=Homo sapiens : V : TYR CB D0333 <- 3.59 -> DT C7 E0901 : score 5.12433 >5w2m_JKL:Cytidine_deaminase-like; title=APOBEC3F CATALYTIC DOMAIN COMPLEX WITH A SINGLE-STRANDED DNA organism=Homo sapiens : H : TYR OH J0333 <- 3.24 -> DT O2 N0902 : score 2.9336 : V : LYS CB K0355 <- 3.79 -> DT C7 N0906 : score 2.31141 : V : PHE CG K0351 <- 3.84 -> DT C7 N0908 : score 5.22517 : x : PRO xxxx J0350 <- 3.09 -> DT xxx N0902 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0353 <- 3.31 -> DT xxx N0902 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0357 <- 3.96 -> DT xxx N0903 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0358 <- 3.15 -> DT xxx N0903 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx K0333 <- 2.63 -> DT xxx N0908 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx K0337 <- 3.31 -> DT xxx N0908 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx K0350 <- 3.64 -> DT xxx N0908 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx K0353 <- 3.60 -> DT xxx N0908 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx K0357 <- 4.27 -> DT xxx N0907 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx K0358 <- 4.12 -> DT xxx N0907 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx K0359 <- 3.59 -> DT xxx N0906 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0333 <- 3.18 -> DT xxx N0909 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0352 <- 4.20 -> DT xxx N0910 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0355 <- 3.23 -> DT xxx N0910 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0357 <- 3.86 -> DT xxx N0909 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0358 <- 3.40 -> DT xxx N0909 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0359 <- 3.33 -> DT xxx N0908 : score x.xxxxx >5w43_AB:CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=STRUCTURE OF THE TWO-COMPONENT RESPONSE REGULATOR RCSB-DNA COMPLEX organism=Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 : H : LYS NZ A0180 <- 2.88 -> DG N7 E0008 : score 5.29972 : H : LYS NZ A0180 <- 2.75 -> DG O6 E0008 : score 5.83858 : H : LYS NZ B0180 <- 2.66 -> DG N7 F0030 : score 5.5367 : V : ILE CG2 A0179 <- 3.64 -> DT C7 F0035 : score 7.37493 : x : THR xxxx A0181 <- 3.48 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.64 -> DT xxx F0036 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0184 <- 3.63 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0185 <- 4.12 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0179 <- 4.33 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0181 <- 3.10 -> DA xxx F0028 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.45 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0184 <- 3.42 -> DA xxx F0028 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0185 <- 3.94 -> DT xxx F0027 : score x.xxxxx >5w43_B:CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=STRUCTURE OF THE TWO-COMPONENT RESPONSE REGULATOR RCSB-DNA COMPLEX organism=Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 : H : LYS NZ B0180 <- 2.66 -> DG N7 F0030 : score 5.5367 : x : ILE xxxx B0179 <- 4.33 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0181 <- 3.10 -> DA xxx F0028 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.45 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0184 <- 3.42 -> DA xxx F0028 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0185 <- 3.94 -> DT xxx F0027 : score x.xxxxx >5w51_AE: title=POL II ELONGATION COMPLEX WITH AN N6-METHYLADENINE-CONTAINING TEMPLATE AND A MATCHED UMPNPP organism=? : x : HIS xxxx A1387 <- 3.18 -> DC xxx N0001 : score x.xxxxx >5w5y_ABPQ: title=RNA POLYMERASE I INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX organism=? : H : SER OG A1014 <- 2.24 -> DT O2 T0015 : score 4.11155 : H : ARG NH2 B0817 <- 2.65 -> DT O2 S0025 : score 4.36033 : H : HIS NE2 P0294 <- 2.83 -> DC N4 T0049 : score 3.20501 : V : PHE CZ B0508 <- 3.81 -> DT C7 S0041 : score 7.09708 : x : ARG xxxx A0481 <- 4.40 -> DC xxx T0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0592 <- 3.83 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1013 <- 3.14 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1018 <- 3.15 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1600 <- 4.18 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1616 <- 3.54 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0463 <- 3.81 -> DG xxx T0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0479 <- 3.23 -> DT xxx S0039 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0480 <- 4.14 -> DT xxx S0039 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0511 <- 2.96 -> DT xxx S0041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0512 <- 4.33 -> DT xxx S0041 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx P0214 <- 4.09 -> DC xxx T0044 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Q0010 <- 4.48 -> DT xxx T0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0011 <- 3.39 -> DG xxx S0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Q0288 <- 3.87 -> DT xxx T0037 : score x.xxxxx >5w5y_P: title=RNA POLYMERASE I INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX organism=? : H : HIS NE2 P0294 <- 2.83 -> DC N4 T0049 : score 3.20501 : x : ILE xxxx P0214 <- 4.09 -> DC xxx T0044 : score x.xxxxx >5w5y_Q: title=RNA POLYMERASE I INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX organism=? : x : ASN xxxx Q0010 <- 4.48 -> DT xxx T0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0011 <- 3.39 -> DG xxx S0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Q0288 <- 3.87 -> DT xxx T0037 : score x.xxxxx >5w64_ABPQ: title=RNA POLYMERASE I INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX STATE 1 organism=? : H : ARG NH2 A0481 <- 2.92 -> DC O2 T0017 : score 3.60995 : H : GLN NE2 A0592 <- 2.47 -> DT O2 T0016 : score 4.19293 : H : SER OG A1014 <- 3.26 -> DT O2 T0015 : score 3.35727 : H : SER OG B0459 <- 2.95 -> DT O4 T0026 : score 3.44847 : H : HIS NE2 P0294 <- 2.20 -> DC N4 T0049 : score 3.61128 : V : PHE CD1 B0508 <- 3.70 -> DT C7 S0041 : score 4.25454 : V : TYR CD2 A1018 <- 3.54 -> DT C7 T0014 : score 3.98474 : V : LYS CG B0460 <- 3.89 -> DT C7 T0026 : score 2.0713 : x : THR xxxx A1013 <- 3.62 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0454 <- 3.23 -> DT xxx T0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0456 <- 2.94 -> DT xxx T0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0457 <- 4.12 -> DT xxx T0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0463 <- 3.46 -> DG xxx T0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0464 <- 3.33 -> DG xxx T0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0467 <- 3.30 -> DG xxx T0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0469 <- 1.64 -> DG xxx T0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0511 <- 2.75 -> DT xxx S0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0817 <- 3.86 -> DC xxx T0032 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B1043 <- 3.97 -> DC xxx T0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B1064 <- 4.26 -> DT xxx T0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx P0210 <- 2.58 -> DT xxx T0042 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx P0214 <- 4.06 -> DC xxx T0044 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0295 <- 4.07 -> DC xxx T0047 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Q0010 <- 3.91 -> DT xxx T0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0011 <- 4.29 -> DG xxx S0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Q0288 <- 4.00 -> DT xxx T0037 : score x.xxxxx >5w64_Q: title=RNA POLYMERASE I INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX STATE 1 organism=? : x : ASN xxxx Q0010 <- 3.91 -> DT xxx T0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0011 <- 4.29 -> DG xxx S0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Q0288 <- 4.00 -> DT xxx T0037 : score x.xxxxx >5w65_ABPQ: title=RNA POLYMERASE I INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX STATE 2 organism=? : x : HIS xxxx A0378 <- 3.79 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0481 <- 4.06 -> DC xxx T0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0592 <- 1.89 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0593 <- 4.32 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1013 <- 3.23 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1014 <- 1.81 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1018 <- 3.06 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1227 <- 3.88 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1616 <- 4.09 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0479 <- 3.54 -> DT xxx S0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0508 <- 3.05 -> DT xxx S0041 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0511 <- 3.99 -> DT xxx S0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0817 <- 1.85 -> DT xxx S0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx P0046 <- 2.85 -> DT xxx T0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0049 <- 3.47 -> DA xxx T0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx P0210 <- 3.77 -> DT xxx T0042 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx P0214 <- 3.83 -> DC xxx T0044 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx P0294 <- 1.09 -> DA xxx T0048 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Q0010 <- 4.38 -> DT xxx T0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0011 <- 3.78 -> DA xxx S0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Q0284 <- 4.32 -> DT xxx S0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Q0288 <- 3.89 -> DT xxx T0037 : score x.xxxxx >5w65_Q: title=RNA POLYMERASE I INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX STATE 2 organism=? : x : ASN xxxx Q0010 <- 4.38 -> DT xxx T0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0011 <- 3.78 -> DA xxx S0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Q0284 <- 4.32 -> DT xxx S0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Q0288 <- 3.89 -> DT xxx T0037 : score x.xxxxx >5w66_ABMPQ: title=RNA POLYMERASE I INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX STATE 3 organism=? : H : SER OG A1014 <- 2.59 -> DT O2 T0015 : score 3.85273 : V : TYR CZ A1018 <- 3.85 -> DT C7 T0014 : score 5.50974 : x : GLU xxxx A0376 <- 3.71 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0378 <- 3.34 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0481 <- 4.25 -> DC xxx T0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0592 <- 3.83 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0593 <- 4.38 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1013 <- 3.70 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1227 <- 4.49 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1600 <- 4.31 -> DG xxx T0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1616 <- 4.43 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0479 <- 2.48 -> DT xxx S0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0508 <- 3.03 -> DT xxx S0039 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx P0214 <- 3.80 -> DC xxx T0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0293 <- 3.79 -> DC xxx T0047 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx P0294 <- 1.99 -> DA xxx T0048 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0295 <- 4.09 -> DC xxx T0047 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Q0010 <- 3.87 -> DT xxx T0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0011 <- 4.27 -> DG xxx S0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Q0288 <- 3.56 -> DT xxx T0037 : score x.xxxxx >5w6k_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF MUTANT TAQ POLYMERASE INCORPORATING UNNATURAL BASE PAIRS Z:P organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 3.18 -> DC O2 B0109 : score 2.72225 : w : LYS NZ A0540 <- 5.49 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 5.70 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.98 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 6.11 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.33 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.71 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.70 -> DC O2 B0111 : score 3.208 >5w6q_G:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURAL BASIS FOR RECOGNITION OF ARTIFICIAL DNA BY AN EVOLVED KLENTAQ VARIANT organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ G0540 <- 3.19 -> DC O2 H0109 : score 2.71635 : H : ASN ND2 G0583 <- 3.18 -> DG N3 H0110 : score 4.52286 : w : HIS NE2 G0784 <- 5.56 -> DC O2 H0111 : score 3.208 : x : TYR xxxx G0545 <- 4.50 -> DG xxx H0110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0573 <- 3.98 -> DG xxx I0206 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0580 <- 3.95 -> DG xxx H0110 : score x.xxxxx >5w7g_H: title=AN ENVELOPE OF A FILAMENTOUS HYPERTHERMOPHILIC VIRUS CARRIES LIPIDS IN A HORSESHOE CONFORMATION organism=ACIDIANUS FILAMENTOUS VIRUS 1 : H : TYR OH H0016 <- 2.65 -> DT O2 r0294 : score 3.31317 : H : TRP NE1 H0044 <- 3.36 -> DA N3 r0293 : score -8.09105 : x : TYR xxxx H0019 <- 2.72 -> DA xxx q0211 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0055 <- 4.03 -> DT xxx q0214 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0076 <- 3.82 -> DA xxx q0215 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0080 <- 3.63 -> DA xxx r0291 : score x.xxxxx >5w7g_I: title=AN ENVELOPE OF A FILAMENTOUS HYPERTHERMOPHILIC VIRUS CARRIES LIPIDS IN A HORSESHOE CONFORMATION organism=ACIDIANUS FILAMENTOUS VIRUS 1 : H : TYR OH I0016 <- 2.85 -> DA N3 q0197 : score 4.10977 : x : ASP xxxx I0045 <- 3.03 -> DT xxx q0196 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx I0049 <- 3.33 -> DA xxx r0311 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0075 <- 3.12 -> DA xxx q0193 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0078 <- 4.18 -> DT xxx r0312 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0079 <- 4.27 -> DA xxx q0193 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0082 <- 4.22 -> DT xxx q0194 : score x.xxxxx >5w9q_A: title=ZINC FINGER REGION OF MBD1 IN COMPLEX WITH CPG DNA organism=? : H : ARG NH1 A0333 <- 2.91 -> DT O2 D0009 : score 4.21167 : H : ARG NH1 A0369 <- 2.70 -> DG N7 D0007 : score 6.171 : H : GLN NE2 A0370 <- 2.80 -> DG O6 C0007 : score 5.80513 : w : GLN OE1 A0370 <- 5.48 -> DG N7 C0007 : score 2.87 : w : GLN NE2 A0370 <- 5.79 -> DA N7 D0005 : score 1.888 : w : ARG NH1 A0384 <- 5.38 -> DT O4 C0009 : score 1.768 A : x : MET xxxx A0382 <- 4.16 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >5w9s_C: title=ZINC FINGER OF HUMAN CXXC5 IN COMPLEX WITH CPG DNA organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ C0259 <- 2.64 -> DT O2 B0009 : score 3.70197 : H : HIS ND1 C0288 <- 2.75 -> DG O6 B0007 : score 6.28531 : H : GLN NE2 C0289 <- 2.78 -> DG O6 A0007 : score 5.82835 : w : GLN OE1 C0289 <- 5.48 -> DG N7 A0007 : score 2.87 >5wc9_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=HUMAN PIT-1 AND 4XCATT DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0044 <- 2.95 -> DA N7 C0172 : score 5.90705 : H : ARG NH2 A0049 <- 2.68 -> DT O4 C0174 : score 3.63914 : H : ARG NH2 A0049 <- 2.72 -> DG O6 D0184 : score 6.7056 : H : ARG NH1 A0095 <- 2.66 -> DA N3 D0186 : score 3.78515 : H : ASN OD1 A0141 <- 2.56 -> DA N6 C0176 : score 6.31084 : H : ASN ND2 A0141 <- 3.05 -> DA N7 C0176 : score 5.57699 : H : GLN OE1 A0144 <- 3.36 -> DA N6 D0182 : score 5.37468 : H : GLN NE2 A0144 <- 3.11 -> DA N7 D0182 : score 5.71218 : V : THR CG2 A0045 <- 3.56 -> DT C7 C0173 : score 4.49114 : x : SER xxxx A0043 <- 4.20 -> DG xxx D0184 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0048 <- 3.78 -> DA xxx C0172 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0137 <- 3.40 -> DA xxx C0176 : score x.xxxxx >5wc9_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=HUMAN PIT-1 AND 4XCATT DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0044 <- 2.95 -> DA N7 C0172 : score 5.90705 : H : ARG NH2 A0049 <- 2.68 -> DT O4 C0174 : score 3.63914 : H : ARG NH2 A0049 <- 2.72 -> DG O6 D0184 : score 6.7056 : H : ARG NH1 A0095 <- 2.66 -> DA N3 D0186 : score 3.78515 : H : ASN OD1 A0141 <- 2.56 -> DA N6 C0176 : score 6.31084 : H : ASN ND2 A0141 <- 3.05 -> DA N7 C0176 : score 5.57699 : H : GLN OE1 A0144 <- 3.36 -> DA N6 D0182 : score 5.37468 : H : GLN NE2 A0144 <- 3.11 -> DA N7 D0182 : score 5.71218 : H : THR OG1 B0045 <- 3.22 -> DT O4 C0181 : score 3.56066 : H : THR OG1 B0045 <- 3.27 -> DA N6 D0177 : score 2.49963 : H : ARG NH1 B0049 <- 2.99 -> DG N7 D0176 : score 5.8201 : H : ARG NH2 B0049 <- 2.61 -> DT O4 C0182 : score 3.68889 : H : ARG NH2 B0049 <- 2.56 -> DG O6 D0176 : score 6.9168 : H : ASN OD1 B0141 <- 2.78 -> DA N6 C0184 : score 6.04588 : H : ASN ND2 B0141 <- 2.86 -> DA N7 C0184 : score 5.80007 : x : GLN xxxx B0027 <- 4.43 -> DC xxx C0179 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0043 <- 4.14 -> DG xxx D0176 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0044 <- 2.81 -> DA xxx C0180 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0048 <- 3.73 -> DT xxx C0181 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0095 <- 3.11 -> DT xxx C0182 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0137 <- 3.87 -> DA xxx C0184 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0144 <- 3.09 -> DA xxx D0173 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0148 <- 4.40 -> DT xxx C0182 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0043 <- 4.20 -> DG xxx D0184 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0045 <- 3.14 -> DT xxx C0173 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0048 <- 3.78 -> DA xxx C0172 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0137 <- 3.40 -> DA xxx C0176 : score x.xxxxx >5wc9_EF:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=HUMAN PIT-1 AND 4XCATT DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 E0044 <- 2.72 -> DA N6 G0180 : score 6.14941 : H : THR OG1 E0045 <- 3.32 -> DT O4 G0181 : score 3.48291 : H : ARG NH1 E0049 <- 3.20 -> DG N7 H0176 : score 5.566 : H : ARG NH2 E0049 <- 3.31 -> DG N7 H0176 : score 5.73338 : H : ARG NH2 E0049 <- 2.56 -> DG O6 H0176 : score 6.9168 : H : ASN OD1 E0141 <- 2.89 -> DA N6 G0184 : score 5.9134 : H : ASN ND2 E0141 <- 2.78 -> DA N7 G0184 : score 5.89399 : H : ARG NH1 F0049 <- 3.31 -> DG N7 H0184 : score 5.4329 : H : ARG NH2 F0049 <- 2.53 -> DG O6 H0184 : score 6.9564 : H : ARG NH2 F0049 <- 2.41 -> DT O4 G0174 : score 3.83105 : H : ASN OD1 F0141 <- 2.42 -> DA N6 G0176 : score 6.47945 : H : ASN ND2 F0141 <- 3.01 -> DA N7 G0176 : score 5.62395 : H : GLN NE2 F0144 <- 2.97 -> DA N7 H0182 : score 5.88269 : V : VAL CG1 E0137 <- 3.65 -> DT C7 G0185 : score 6.28778 : x : GLN xxxx E0027 <- 4.00 -> DC xxx G0179 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0043 <- 4.17 -> DG xxx H0176 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx E0048 <- 3.38 -> DA xxx G0180 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0054 <- 4.42 -> DT xxx G0181 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0095 <- 3.15 -> DT xxx G0182 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0144 <- 2.96 -> DA xxx H0173 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0148 <- 4.41 -> DT xxx G0182 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0043 <- 4.29 -> DG xxx H0184 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0044 <- 3.18 -> DA xxx H0186 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0045 <- 3.23 -> DA xxx H0185 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx F0048 <- 3.81 -> DA xxx G0172 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0095 <- 2.14 -> DA xxx H0186 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0137 <- 4.14 -> DT xxx G0177 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0148 <- 4.32 -> DT xxx G0174 : score x.xxxxx >5wcu_N:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF 167 BP NUCLEOSOME BOUND TO THE GLOBULAR DOMAIN OF LINKER HISTONE H5 organism=? : H : ARG NH1 N0030 <- 3.09 -> DT O2 S0037 : score 4.05664 : H : ARG NH2 N0030 <- 2.67 -> DG N3 T0132 : score 3.70412 >5wfe_AB: title=CAS1-CAS2-IHF-DNA HOLO-COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : H : ARG NH1 A0146 <- 3.26 -> DT O2 h0102 : score 3.91022 : H : ARG NH1 B0132 <- 2.22 -> DC O2 i0071 : score 4.0734 : x : ARG xxxx A0138 <- 4.25 -> DA xxx h0105 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0143 <- 4.01 -> DT xxx i0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0131 <- 3.21 -> DA xxx i0069 : score x.xxxxx >5wfe_B: title=CAS1-CAS2-IHF-DNA HOLO-COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 B0132 <- 2.22 -> DC O2 i0071 : score 4.0734 : x : ARG xxxx B0131 <- 3.21 -> DA xxx i0069 : score x.xxxxx >5wfe_CDEF: title=CAS1-CAS2-IHF-DNA HOLO-COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : x : TYR xxxx C0022 <- 2.68 -> DT xxx G0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0037 <- 4.05 -> DA xxx H0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0056 <- 4.35 -> DT xxx G0023 : score x.xxxxx >5wfe_KL: title=CAS1-CAS2-IHF-DNA HOLO-COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI S88 : H : ARG NH2 K0060 <- 2.49 -> DA N3 J0035 : score 3.44061 : H : ARG NH2 K0060 <- 3.16 -> DT O2 J0036 : score 3.92853 : H : ARG NH1 K0063 <- 3.14 -> DT O2 I0036 : score 4.01357 : H : ARG NH1 K0063 <- 3.03 -> DA N3 I0037 : score 3.51268 : H : ARG NH1 L0046 <- 3.14 -> DT O2 J0044 : score 4.01357 : H : ARG NH1 L0046 <- 2.72 -> DA N3 I0030 : score 3.74096 : V : ARG CB L0062 <- 3.56 -> DT C7 J0029 : score 1.06544 : x : ASN xxxx K0064 <- 3.05 -> DA xxx J0038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx K0065 <- 3.20 -> DA xxx J0037 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx K0066 <- 3.05 -> DT xxx J0039 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx K0073 <- 3.79 -> DT xxx J0036 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0063 <- 3.84 -> DA xxx I0045 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx L0064 <- 1.89 -> DT xxx J0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0065 <- 3.35 -> DA xxx I0045 : score x.xxxxx >5wjq_D:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=MOUSEZFP568-ZNF2-11 IN COMPLEX WITH DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH2 D0430 <- 2.56 -> DG O6 A0026 : score 6.9168 : H : HIS NE2 D0433 <- 2.99 -> DG N7 A0025 : score 6.54407 : H : ARG NH1 D0436 <- 2.69 -> DG O6 A0024 : score 6.21717 : H : ARG NH2 D0436 <- 3.03 -> DG N7 A0024 : score 6.09092 : H : ASP OD2 D0459 <- 3.04 -> DC N4 B0004 : score 5.9024 : H : HIS NE2 D0517 <- 2.90 -> DT O4 A0018 : score 5.49679 : H : ARG NH1 D0520 <- 2.55 -> DG O6 A0017 : score 6.3875 : H : ARG NH2 D0520 <- 2.85 -> DG N7 A0017 : score 6.32077 : H : ARG NH1 D0542 <- 2.93 -> DA N7 A0015 : score 2.49369 : H : ARG NH1 D0542 <- 3.09 -> DG O6 A0016 : score 5.7305 : H : ARG NH2 D0542 <- 2.84 -> DG N7 A0016 : score 6.33354 : w : GLU OE1 D0545 <- 5.91 -> DC N4 A0014 : score 3.528 : w : CYS SG D0570 <- 6.51 -> DC N4 A0014 : score 4.371 : H : THR OG1 D0572 <- 2.91 -> DG O6 B0015 : score 4.12265 : H : ARG NH1 D0576 <- 3.18 -> DG O6 B0017 : score 5.621 : H : ARG NH2 D0576 <- 3.05 -> DG N7 A0011 : score 6.06538 : H : ARG NH2 D0576 <- 3.17 -> DG O6 A0011 : score 6.1116 : H : ARG NH1 D0598 <- 3.18 -> DG O6 A0010 : score 5.621 : H : ARG NH2 D0598 <- 2.79 -> DG N7 A0010 : score 6.39738 : H : ARG NH1 D0626 <- 2.87 -> DG N7 A0008 : score 5.9653 : H : ARG NH2 D0626 <- 2.51 -> DG O6 A0008 : score 6.9828 : H : SER OG D0628 <- 3.10 -> DA N7 B0020 : score 4.19626 : H : ARG NH1 D0654 <- 2.86 -> DG O6 A0005 : score 6.01033 : H : ARG NH2 D0654 <- 2.42 -> DG N7 A0005 : score 6.86985 : H : HIS NE2 D0657 <- 2.87 -> DG N7 A0004 : score 6.70733 : V : SER CB D0514 <- 3.67 -> DT C7 B0009 : score 3.23305 : x : SER xxxx D0432 <- 3.76 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0458 <- 4.42 -> DA xxx A0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0460 <- 3.94 -> DA xxx A0023 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0486 <- 3.83 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0488 <- 3.35 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0492 <- 3.93 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0513 <- 4.47 -> DT xxx A0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0516 <- 3.51 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0548 <- 3.98 -> DA xxx A0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0573 <- 3.79 -> DC xxx A0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0601 <- 3.56 -> DT xxx A0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0629 <- 4.32 -> DC xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0632 <- 3.56 -> DG xxx A0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0660 <- 3.12 -> DT xxx A0003 : score x.xxxxx >5wjr_A:Ribonuclease_H-like; title=HIGH RESOLUTION NATIVE HEXAMER DNA AND RNA HYBRID IN COMPLEX WITH RNASE H CATALYTIC DOMAIN D132N MUTANT organism=Bacillus halodurans : H : ASN ND2 A0077 <- 2.76 -> DT O2 C0002 : score 4.78412 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.39 -> DG N3 C0003 : score 4.31728 : H : ASN OD1 A0106 <- 3.24 -> DG N2 C0003 : score 4.3776 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.13 -> DG N3 C0003 : score 4.57181 : w : GLN NE2 A0134 <- 5.68 -> DT O2 C0004 : score 1.565 : w : THR OG1 A0135 <- 5.78 -> DT O2 C0004 : score 2.522 >5wm1_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF THE 10S (+)-TRANS-BP-DG MODIFIED REV1 TERNARY COMPLEX organism=? : w : SER OG A0329 <- 6.37 -> DT O2 T0007 : score 1.55 : x : ASP xxxx A0626 <- 3.52 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0692 <- 3.57 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx >5wm8_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF THE 10R (+)-CIS-BP-DG MODIFIED REV1 TERNARY COMPLEX organism=? : w : SER OG A0329 <- 6.19 -> DT O2 T0007 : score 1.55 : x : ASP xxxx A0626 <- 3.62 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0692 <- 4.40 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx >5wmb_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF THE 10S (-)-CIS-BP-DG MODIFIED REV1 TERNARY COMPLEX (THE BP RESIDUE IS DISORDERED) organism=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) : x : SER xxxx A0329 <- 4.37 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0626 <- 3.35 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0692 <- 3.80 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx >5wn0_A:DNase_I-like; title=APE1 EXONUCLEASE SUBSTRATE COMPLEX WITH A C/G MATCH organism=Homo sapiens : w : ASP OD2 A0308 <- 5.97 -> DG N2 E0012 : score 1.62 : x : LYS xxxx A0098 <- 4.26 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0177 <- 3.66 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0229 <- 3.84 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0269 <- 3.84 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 3.42 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0271 <- 3.17 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx >5wn1_A:DNase_I-like; title=APE1 EXONUCLEASE PRODUCT COMPLEX organism=Homo sapiens : w : ASP OD2 A0070 <- 6.64 -> DG N3 D0009 : score 2.312 : H : LYS NZ A0098 <- 2.97 -> DC O2 E0015 : score 2.84598 : w : ASP OD2 A0308 <- 6.48 -> DG N3 D0009 : score 2.312 : x : TYR xxxx A0269 <- 3.90 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 3.07 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx >5wn2_A:DNase_I-like; title=APE1 EXONUCLEASE SUBSTRATE COMPLEX WITH PHOSPHOGLYCOLATE organism=Homo sapiens : w : ASP OD2 A0070 <- 5.95 -> DG N3 E0014 : score 2.312 : w : ASP OD2 A0070 <- 6.42 -> DG N2 E0014 : score 1.62 : H : LYS NZ A0098 <- 3.08 -> DC O2 E0015 : score 2.78117 : w : LYS NZ A0098 <- 5.34 -> DC O2 D0008 : score 1.3 : w : LYS NZ A0098 <- 6.29 -> DG N2 E0014 : score 0.846 : H : ARG NH1 A0177 <- 2.87 -> DG O6 D0009 : score 5.99817 : x : TYR xxxx A0269 <- 3.70 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 3.14 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx >5wn3_B:DNase_I-like; title=APE1 F266A EXONUCLEASE SUBSTRATE COMPLEX WITH A C/T MISMATCH organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx B0098 <- 3.59 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0177 <- 3.84 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0269 <- 3.70 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0270 <- 3.69 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx >5wn4_B:DNase_I-like; title=APE1 EXONUCLEASE SUBSTRATE COMPLEX WITH A C/T MISMATCH organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx B0098 <- 3.76 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0177 <- 3.83 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0269 <- 3.72 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0270 <- 4.11 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx >5wn5_B:DNase_I-like; title=APE1 EXONUCLEASE SUBSTRATE COMPLEX WITH A C/T MISMATCH AND MN2+ organism=Homo sapiens : H : ARG NE B0177 <- 2.73 -> DG N7 D0009 : score 4.4837 : x : LYS xxxx B0098 <- 3.74 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0269 <- 3.64 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0270 <- 3.74 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx >5wnx_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA SUBSTRATE COMPLEX WITH INCOMING 6-TDGTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.24 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.91 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.56 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5wny_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA SUBSTRATE COMPLEX WITH INCOMING 5-FDUTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.14 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.00 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.54 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5wnz_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA SUBSTRATE COMPLEX WITH INCOMING 5-FODCTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.20 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.95 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.53 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5wo0_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA SUBSTRATE COMPLEX WITH INCOMING 5-FODUTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.89 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.56 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5wti_Z: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE CRISPR-ASSOCIATED PROTEIN IN COMPLEX WITH CRRNA AND DNA organism=BACILLUS THERMOAMYLOVORANS : H : ASN ND2 Z0118 <- 2.77 -> DG O6 E0020 : score 5.67229 : H : ARG NE Z0140 <- 3.37 -> DA N3 E0021 : score 1.86287 : w : LYS NZ Z0217 <- 5.53 -> DT O4 H0008 : score 1.7 : H : SER OG Z0397 <- 2.90 -> DA N7 E0022 : score 4.37482 : H : SER OG Z0397 <- 2.56 -> DA N6 E0022 : score 3.44765 : H : ASN OD1 Z0398 <- 2.88 -> DA N6 E0021 : score 5.92545 : H : ASN ND2 Z0398 <- 2.98 -> DA N7 E0021 : score 5.65917 : w : ASN OD1 Z0398 <- 5.09 -> DT O4 H0008 : score 3.132 : x : ASN xxxx Z0114 <- 3.39 -> DG xxx E0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Z0115 <- 3.24 -> DC xxx H0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0122 <- 3.37 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Z0138 <- 3.79 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0214 <- 3.83 -> DG xxx H0006 : score x.xxxxx >5wvw_A: title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF CREN7 MUTANT L28A IN COMPLEX WITH DSDNA organism=? : H : TRP NE1 A0026 <- 2.92 -> DA N3 C0104 : score -8.89286 : H : ARG NH1 A0033 <- 2.89 -> DC O2 D0116 : score 3.5843 : H : ARG NE A0051 <- 2.81 -> DT O2 C0105 : score 2.57177 : H : ARG NH2 A0051 <- 3.04 -> DT O2 C0105 : score 4.03013 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.95 -> DC O2 C0106 : score 3.58776 : w : ARG NH1 A0051 <- 5.63 -> DC O2 C0106 : score 1.381 : w : ARG NH1 A0051 <- 6.13 -> DA N3 D0112 : score 2.585 : x : ALA xxxx A0028 <- 3.89 -> DG xxx C0103 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0030 <- 3.19 -> DT xxx C0102 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0036 <- 3.23 -> DC xxx D0114 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0038 <- 3.28 -> DT xxx D0113 : score x.xxxxx >5wvy_B: title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF CREN7 MUTANT L28V IN COMPLEX WITH DSDNA organism=? : H : TRP NE1 B0026 <- 3.01 -> DA N3 E0104 : score -8.72885 : H : ARG NH1 B0033 <- 2.90 -> DC O2 F0116 : score 3.577 : H : ARG NE B0051 <- 2.89 -> DT O2 E0105 : score 2.53054 : H : ARG NH1 B0051 <- 2.98 -> DT O2 E0105 : score 4.15138 : H : ARG NH1 B0051 <- 2.93 -> DC O2 E0106 : score 3.5551 : w : ARG NH2 B0051 <- 6.19 -> DC O2 E0106 : score 1.669 : w : ARG NH2 B0051 <- 6.33 -> DA N3 F0112 : score 2.092 : x : VAL xxxx B0028 <- 3.51 -> DG xxx E0103 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0030 <- 3.31 -> DT xxx E0102 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0036 <- 3.38 -> DC xxx F0114 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0038 <- 3.90 -> DT xxx F0113 : score x.xxxxx >5wvz_B: title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF CREN7 MUTANT L28F IN COMPLEX WITH DSDNA organism=? : H : TRP NE1 B0026 <- 3.07 -> DA N3 E0104 : score -8.61952 : H : ARG NH1 B0033 <- 2.55 -> DC O2 F0116 : score 3.8325 : H : ARG NE B0051 <- 2.92 -> DT O2 E0105 : score 2.51508 : H : ARG NH1 B0051 <- 2.88 -> DT O2 E0105 : score 4.23751 : x : PHE xxxx B0028 <- 3.20 -> DG xxx E0103 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0030 <- 3.45 -> DC xxx E0102 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0036 <- 3.79 -> DC xxx F0114 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0038 <- 3.89 -> DT xxx F0113 : score x.xxxxx >5wwc_B: title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF CREN7 MUTANT L28M IN COMPLEX WITH DSDNA organism=? : H : TRP NE1 B0026 <- 2.96 -> DA N3 E0104 : score -8.81997 : H : ARG NH2 B0051 <- 2.73 -> DT O2 E0105 : score 4.2926 : H : ARG NH2 B0051 <- 3.19 -> DT O2 E0106 : score 3.90313 : x : MET xxxx B0028 <- 3.31 -> DA xxx E0104 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0030 <- 3.34 -> DA xxx E0103 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0033 <- 3.51 -> DC xxx F0116 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0036 <- 4.19 -> DT xxx F0114 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0038 <- 3.98 -> DT xxx F0113 : score x.xxxxx >5wx9_A:DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ATERF96 WITH GCC-BOX organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ARG NH1 A0021 <- 2.72 -> DT O4 B0001 : score 3.32024 : H : ARG NH2 A0021 <- 2.27 -> DG O6 B0003 : score 7.2996 : w : GLU OE2 A0029 <- 5.83 -> DC N4 B0004 : score 3.597 : x : GLN xxxx A0003 <- 2.09 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0019 <- 2.08 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0031 <- 2.21 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0039 <- 2.15 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0041 <- 3.03 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx >5x07_L:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FOXA2 DNA BINDING DOMAIN BOUND TO A FULL CONSENSUS DNA SITE organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 L0205 <- 3.27 -> DA N7 K0010 : score 5.31868 : V : ARG CZ L0208 <- 3.79 -> DT C7 J0004 : score 2.13764 : x : SER xxxx L0206 <- 3.75 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0209 <- 3.14 -> DT xxx J0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0212 <- 3.67 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0213 <- 4.36 -> DT xxx K0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0229 <- 3.57 -> DG xxx K0015 : score x.xxxxx >5x0x_A:Histone-fold; title=COMPLEX OF SNF2-NUCLEOSOME COMPLEX WITH SNF2 BOUND TO POSITION +6 OF THE NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.78 -> DG N3 I0083 : score 3.6247 : x : LEU xxxx A0065 <- 4.28 -> DC xxx I0092 : score x.xxxxx >5x11_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS SUBTILIS PADR IN COMPLEX WITH OPERATOR DNA organism=Bacillus subtilis subsp. spizizenii strain W23 : H : HIS NE2 A0038 <- 2.67 -> DG O6 I0009 : score 8.16065 : H : SER OG A0039 <- 2.69 -> DT O4 J0018 : score 3.63334 : V : LYS CG A0037 <- 3.68 -> DT C7 J0018 : score 2.18254 : x : TYR xxxx A0020 <- 3.50 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0040 <- 3.76 -> DT xxx J0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0042 <- 3.47 -> DT xxx I0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0043 <- 4.23 -> DT xxx I0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.75 -> DG xxx J0023 : score x.xxxxx >5x11_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS SUBTILIS PADR IN COMPLEX WITH OPERATOR DNA organism=Bacillus subtilis subsp. spizizenii strain W23 : H : HIS NE2 A0038 <- 2.67 -> DG O6 I0009 : score 8.16065 : H : SER OG A0039 <- 2.69 -> DT O4 J0018 : score 3.63334 : H : HIS NE2 B0038 <- 2.82 -> DG O6 J0009 : score 7.92203 : H : SER OG B0039 <- 2.54 -> DT O4 I0018 : score 3.74 : V : LYS CG B0037 <- 3.73 -> DT C7 I0018 : score 2.15606 : V : LYS CG A0037 <- 3.68 -> DT C7 J0018 : score 2.18254 : x : TYR xxxx A0020 <- 3.50 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0040 <- 3.76 -> DT xxx J0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0042 <- 3.47 -> DT xxx I0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0043 <- 4.23 -> DT xxx I0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.75 -> DG xxx J0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0020 <- 3.46 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0040 <- 3.81 -> DG xxx I0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0042 <- 3.61 -> DT xxx J0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0043 <- 4.38 -> DT xxx J0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0065 <- 3.89 -> DG xxx I0023 : score x.xxxxx >5x11_CD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS SUBTILIS PADR IN COMPLEX WITH OPERATOR DNA organism=Bacillus subtilis subsp. spizizenii strain W23 : H : HIS NE2 C0038 <- 2.72 -> DG O6 M0023 : score 8.08111 : H : HIS NE2 D0038 <- 2.67 -> DG O6 I0023 : score 8.16065 : x : TYR xxxx C0020 <- 3.71 -> DC xxx M0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0039 <- 2.96 -> DA xxx M0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0042 <- 3.37 -> DT xxx M0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0065 <- 3.50 -> DG xxx N0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0020 <- 3.71 -> DC xxx I0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0039 <- 3.02 -> DA xxx I0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0042 <- 3.71 -> DT xxx I0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0065 <- 3.57 -> DG xxx J0009 : score x.xxxxx >5x11_EFGH:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS SUBTILIS PADR IN COMPLEX WITH OPERATOR DNA organism=Bacillus subtilis subsp. spizizenii strain W23 : H : HIS NE2 E0038 <- 2.73 -> DG O6 M0009 : score 8.0652 : H : SER OG E0039 <- 2.55 -> DT O4 N0018 : score 3.73288 : H : HIS NE2 F0038 <- 2.75 -> DG O6 N0009 : score 8.03338 : H : SER OG F0039 <- 2.79 -> DT O4 M0018 : score 3.56224 : H : HIS NE2 H0038 <- 3.00 -> DG O6 N0023 : score 7.63569 : V : LYS CG E0037 <- 3.80 -> DT C7 N0018 : score 2.11897 : x : TYR xxxx E0020 <- 3.30 -> DC xxx M0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0040 <- 3.59 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0042 <- 3.64 -> DT xxx M0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0043 <- 4.07 -> DT xxx M0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.61 -> DG xxx N0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0020 <- 3.80 -> DC xxx N0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0037 <- 3.92 -> DT xxx M0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0040 <- 3.54 -> DT xxx M0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0042 <- 3.55 -> DT xxx N0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0065 <- 3.74 -> DG xxx M0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0020 <- 3.67 -> DC xxx N0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0039 <- 3.07 -> DA xxx M0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0040 <- 3.92 -> DG xxx M0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0042 <- 3.51 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0043 <- 4.37 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0065 <- 3.41 -> DG xxx M0009 : score x.xxxxx >5x21_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH GPA AND PSEUDOURIDIMYCIN (PUM) organism=? : H : ARG NH1 C0243 <- 3.09 -> DG O6 H0009 : score 5.7305 : H : ARG NH2 C0243 <- 2.31 -> DG O6 H0009 : score 7.2468 : H : ARG NH1 C0266 <- 2.73 -> DG O6 H0011 : score 6.1685 : H : ASP OD1 C0326 <- 2.83 -> DG N2 H0014 : score 5.1191 : H : ARG NH2 C0331 <- 2.35 -> DG O6 H0014 : score 7.194 : H : ARG NH2 F0082 <- 2.98 -> DG O6 H0009 : score 6.3624 : H : ASP OD1 F0326 <- 2.86 -> DG N2 G0019 : score 5.0882 : H : ASP OD2 F0326 <- 2.87 -> DA N6 G0018 : score 3.94653 : V : ARG CG C0422 <- 3.80 -> DT C7 H0015 : score 1.00513 : x : ARG xxxx C0142 <- 3.39 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0167 <- 4.18 -> DC xxx H0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0171 <- 3.46 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0187 <- 3.59 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0256 <- 3.56 -> DA xxx H0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0260 <- 3.34 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0325 <- 3.40 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0418 <- 3.45 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0427 <- 3.39 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0705 <- 4.15 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 3.24 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.02 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 3.65 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1234 <- 4.40 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D1238 <- 3.50 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0321 <- 4.43 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0324 <- 3.34 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0327 <- 3.61 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0332 <- 3.70 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx >5x21_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH GPA AND PSEUDOURIDIMYCIN (PUM) organism=? : x : ALA xxxx D0705 <- 4.15 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 3.24 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.02 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 3.65 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1234 <- 4.40 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D1238 <- 3.50 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx >5x22_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH GPA AND CMPCPP organism=? : H : ARG NH1 C0243 <- 2.76 -> DG O6 H0009 : score 6.132 : H : ARG NH2 C0243 <- 2.50 -> DG O6 H0009 : score 6.996 : H : ARG NH1 C0266 <- 3.24 -> DA N7 H0010 : score 2.33495 : H : ARG NH2 F0082 <- 2.73 -> DG O6 H0009 : score 6.6924 : H : ASP OD1 F0326 <- 2.51 -> DG N2 G0019 : score 5.4487 : x : ARG xxxx C0142 <- 3.60 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0167 <- 3.13 -> DC xxx H0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0171 <- 3.67 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0187 <- 3.54 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0256 <- 3.52 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0260 <- 4.22 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0325 <- 3.39 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0326 <- 2.85 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0331 <- 3.26 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0418 <- 3.41 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0421 <- 4.20 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 3.92 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0427 <- 3.68 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0597 <- 3.28 -> DC xxx H0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0705 <- 4.32 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 3.40 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.43 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 3.70 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D1238 <- 3.95 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0079 <- 4.46 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0327 <- 3.47 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0332 <- 3.66 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx >5x22_M:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH GPA AND CMPCPP organism=? : H : ARG NH2 M0243 <- 2.45 -> DG O6 R0009 : score 7.062 : H : ASP OD1 M0326 <- 2.88 -> DG N2 R0014 : score 5.0676 : x : ARG xxxx M0142 <- 3.66 -> DG xxx R0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0167 <- 3.22 -> DC xxx R0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx M0171 <- 3.65 -> DT xxx R0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx M0187 <- 3.67 -> DG xxx R0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx M0256 <- 4.00 -> DG xxx R0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0266 <- 2.93 -> DG xxx R0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx M0325 <- 3.45 -> DG xxx R0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0331 <- 3.29 -> DG xxx R0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx M0418 <- 3.44 -> DG xxx R0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0422 <- 3.74 -> DT xxx R0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx M0426 <- 4.32 -> DG xxx R0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx M0427 <- 3.74 -> DG xxx R0014 : score x.xxxxx >5x22_MP: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH GPA AND CMPCPP organism=? : H : ARG NH2 M0243 <- 2.45 -> DG O6 R0009 : score 7.062 : H : ASP OD1 M0326 <- 2.88 -> DG N2 R0014 : score 5.0676 : H : ARG NH2 P0082 <- 3.01 -> DG O6 R0009 : score 6.3228 : H : ASP OD2 P0326 <- 3.27 -> DA N6 Q0018 : score 3.62632 : H : SER OG P0327 <- 2.76 -> DG O6 Q0019 : score 4.12375 : x : ARG xxxx M0142 <- 3.66 -> DG xxx R0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0167 <- 3.22 -> DC xxx R0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx M0171 <- 3.65 -> DT xxx R0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx M0187 <- 3.67 -> DG xxx R0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx M0256 <- 4.00 -> DG xxx R0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0266 <- 2.93 -> DG xxx R0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx M0325 <- 3.45 -> DG xxx R0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0331 <- 3.29 -> DG xxx R0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx M0418 <- 3.44 -> DG xxx R0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0422 <- 3.74 -> DT xxx R0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx M0426 <- 4.32 -> DG xxx R0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx M0427 <- 3.74 -> DG xxx R0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx P0079 <- 4.36 -> DG xxx R0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx P0321 <- 4.49 -> DG xxx Q0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx P0324 <- 3.87 -> DA xxx Q0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0332 <- 3.72 -> DG xxx Q0019 : score x.xxxxx >5x2g_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CAMPYLOBACTER JEJUNI CAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA (AGAAACC PAM) organism=? : H : ARG NH1 A0866 <- 2.31 -> DG N7 C-006 : score 6.6429 : H : ARG NH2 A0866 <- 3.16 -> DG O6 C-006 : score 6.1248 : w : THR OG1 A0913 <- 5.42 -> DA N7 D0004 : score 2.152 : H : SER OG A0915 <- 2.60 -> DA N7 D0005 : score 4.64267 : w : THR OG1 A0916 <- 5.55 -> DG O6 C-005 : score 2.729 : w : LYS NZ A0950 <- 5.62 -> DT O4 C-003 : score 1.7 : H : SER OG A0951 <- 2.76 -> DG N7 C-005 : score 4.51791 : w : SER OG A0951 <- 6.21 -> DG O6 C-005 : score 2.749 : w : SER OG A0951 <- 6.21 -> DT O4 C-004 : score 2.338 : x : LYS xxxx A0869 <- 3.90 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx >5x2h_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CAMPYLOBACTER JEJUNI CAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA (AGAAACA PAM) organism=? : H : ARG NH2 A0866 <- 2.30 -> DT O4 C-006 : score 3.90923 : w : THR OG1 A0913 <- 5.50 -> DA N7 D0004 : score 2.152 : H : SER OG A0915 <- 2.59 -> DA N7 D0005 : score 4.6516 : w : THR OG1 A0916 <- 5.26 -> DG O6 C-005 : score 2.729 : H : SER OG A0951 <- 2.71 -> DG N7 C-005 : score 4.56273 : w : SER OG A0951 <- 5.65 -> DG O6 C-005 : score 2.749 : x : SER xxxx A0918 <- 4.42 -> DT xxx C-006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0950 <- 4.27 -> DT xxx C-004 : score x.xxxxx >5x5l_AE:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RESPONSE REGULATOR ADER DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH AN INTERCISTRONIC REGION organism=ACINETOBACTER BAUMANNII : H : ARG NH2 A0231 <- 2.86 -> DA N3 F0014 : score 3.20087 : H : LYS NZ E0213 <- 2.99 -> DG O6 F0009 : score 5.5611 : H : ARG NH2 E0231 <- 3.14 -> DA N3 F0003 : score 3.01944 : x : ARG xxxx A0205 <- 4.05 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0206 <- 3.61 -> DC xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0208 <- 3.49 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0209 <- 3.34 -> DC xxx G0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0210 <- 4.47 -> DC xxx G0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0212 <- 3.65 -> DG xxx F0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0213 <- 3.06 -> DC xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0205 <- 4.26 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0206 <- 3.48 -> DC xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx E0208 <- 3.57 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0209 <- 3.07 -> DC xxx G0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0210 <- 4.44 -> DC xxx G0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0212 <- 3.63 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx >5x5l_BH:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RESPONSE REGULATOR ADER DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH AN INTERCISTRONIC REGION organism=ACINETOBACTER BAUMANNII : H : SER OG B0209 <- 2.92 -> DC N4 D0005 : score 3.58743 : H : LYS NZ B0213 <- 2.67 -> DG O6 C0020 : score 5.93107 : H : ARG NH1 B0231 <- 3.33 -> DA N3 C0014 : score 3.29175 : H : ARG NH2 H0205 <- 2.62 -> DT O4 C0006 : score 3.68178 : H : LYS NZ H0213 <- 2.78 -> DG O6 C0009 : score 5.80389 : H : ARG NH2 H0231 <- 3.24 -> DA N3 C0003 : score 2.95465 : x : ARG xxxx B0205 <- 3.88 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0206 <- 3.77 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0208 <- 3.52 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0212 <- 3.58 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0206 <- 3.71 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx H0208 <- 3.65 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0209 <- 3.20 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0212 <- 3.60 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >5x5l_H:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RESPONSE REGULATOR ADER DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH AN INTERCISTRONIC REGION organism=ACINETOBACTER BAUMANNII : H : ARG NH2 H0205 <- 2.62 -> DT O4 C0006 : score 3.68178 : H : LYS NZ H0213 <- 2.78 -> DG O6 C0009 : score 5.80389 : H : ARG NH2 H0231 <- 3.24 -> DA N3 C0003 : score 2.95465 : x : THR xxxx H0206 <- 3.71 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx H0208 <- 3.65 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0209 <- 3.20 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0212 <- 3.60 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >5x6d_GH:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PRFA-DNA BINARY COMPLEX organism=Listeria monocytogenes : H : SER OG G0184 <- 2.88 -> DT O4 L0020 : score 3.49825 : H : SER OG H0184 <- 2.91 -> DT O4 K0020 : score 3.47692 : H : ARG NH1 H0188 <- 2.66 -> DG N7 K0018 : score 6.2194 : H : ARG NH1 H0188 <- 2.57 -> DG O6 K0018 : score 6.36317 : H : ARG NH2 H0188 <- 2.92 -> DG N7 K0018 : score 6.23138 : x : HIS xxxx G0182 <- 3.54 -> DT xxx L0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0185 <- 3.45 -> DT xxx L0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0188 <- 2.15 -> DG xxx L0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0182 <- 3.78 -> DT xxx K0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0185 <- 4.12 -> DT xxx K0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0187 <- 3.64 -> DT xxx L0009 : score x.xxxxx >5x6d_MN:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PRFA-DNA BINARY COMPLEX organism=Listeria monocytogenes : H : SER OG M0184 <- 2.80 -> DT O4 O0020 : score 3.55513 : H : ARG NH2 N0188 <- 3.22 -> DG N7 P0018 : score 5.84831 : V : SER CB N0187 <- 3.66 -> DT C7 O0010 : score 3.24088 : x : HIS xxxx M0182 <- 3.61 -> DT xxx O0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0183 <- 3.69 -> DT xxx P0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx M0185 <- 4.03 -> DT xxx O0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0187 <- 3.86 -> DT xxx P0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0188 <- 3.10 -> DG xxx O0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx N0182 <- 3.78 -> DT xxx P0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx N0183 <- 4.41 -> DT xxx O0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx N0184 <- 3.15 -> DT xxx P0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx N0185 <- 4.08 -> DT xxx P0019 : score x.xxxxx >5x6d_N:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PRFA-DNA BINARY COMPLEX organism=Listeria monocytogenes : H : ARG NH2 N0188 <- 3.22 -> DG N7 P0018 : score 5.84831 : V : SER CB N0187 <- 3.66 -> DT C7 O0010 : score 3.24088 : x : HIS xxxx N0182 <- 3.78 -> DT xxx P0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx N0183 <- 4.41 -> DT xxx O0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx N0184 <- 3.15 -> DT xxx P0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx N0185 <- 4.08 -> DT xxx P0019 : score x.xxxxx >5x6e_EF:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PRFA-DNA BINARY COMPLEX organism=Listeria monocytogenes : H : SER OG E0184 <- 2.57 -> DT O4 G0020 : score 3.71866 : H : ARG NH1 E0188 <- 2.32 -> DG N7 G0018 : score 6.6308 : H : SER OG F0184 <- 3.28 -> DT O4 H0019 : score 3.21384 : H : SER OG F0184 <- 2.87 -> DT O4 H0020 : score 3.50536 : H : ARG NH1 F0188 <- 2.47 -> DT O4 H0019 : score 3.48363 : H : ARG NH2 F0188 <- 2.39 -> DG N7 H0018 : score 6.90815 : V : SER CB F0187 <- 3.66 -> DT C7 G0010 : score 3.24088 : V : SER CB E0187 <- 3.67 -> DT C7 H0010 : score 3.23305 : V : ALA CB F0185 <- 3.64 -> DT C7 H0019 : score 5.82293 : x : HIS xxxx E0182 <- 3.46 -> DT xxx G0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0183 <- 4.48 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0185 <- 3.45 -> DT xxx G0019 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0182 <- 4.16 -> DT xxx H0020 : score x.xxxxx >5x6e_MN:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PRFA-DNA BINARY COMPLEX organism=Listeria monocytogenes : H : SER OG M0184 <- 3.02 -> DT O4 O0020 : score 3.3987 : H : ARG NH1 M0188 <- 2.70 -> DG N7 O0018 : score 6.171 : H : ARG NH1 M0188 <- 3.11 -> DG O6 O0018 : score 5.70617 : H : SER OG N0184 <- 2.45 -> DT O4 P0020 : score 3.80399 : H : ARG NH2 N0188 <- 2.66 -> DG N7 P0018 : score 6.56338 : V : ALA CB M0185 <- 3.54 -> DT C7 O0019 : score 5.96291 : V : ALA CB N0185 <- 3.64 -> DT C7 P0019 : score 5.82293 : x : HIS xxxx M0182 <- 3.72 -> DT xxx O0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0183 <- 4.42 -> DT xxx P0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0187 <- 3.73 -> DT xxx P0010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx N0171 <- 4.31 -> DT xxx O0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx N0182 <- 3.68 -> DT xxx P0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx N0187 <- 3.81 -> DT xxx O0009 : score x.xxxxx >5x6e_N:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PRFA-DNA BINARY COMPLEX organism=Listeria monocytogenes : H : SER OG N0184 <- 2.45 -> DT O4 P0020 : score 3.80399 : H : ARG NH2 N0188 <- 2.66 -> DG N7 P0018 : score 6.56338 : V : ALA CB N0185 <- 3.64 -> DT C7 P0019 : score 5.82293 : x : MET xxxx N0171 <- 4.31 -> DT xxx O0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx N0182 <- 3.68 -> DT xxx P0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx N0187 <- 3.81 -> DT xxx O0009 : score x.xxxxx >5x6g_A:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD5-MH1/PALINDROMIC SBE DNA COMPLEX organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0075 <- 3.32 -> DG N7 D0006 : score 5.4208 : H : ARG NH2 A0075 <- 2.75 -> DG O6 D0006 : score 6.666 : H : GLN OE1 A0077 <- 3.09 -> DA N6 C0009 : score 5.70152 : H : LYS NZ A0082 <- 2.43 -> DG O6 C0010 : score 6.20855 : x : HIS xxxx A0080 <- 4.30 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >5x6g_AB:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD5-MH1/PALINDROMIC SBE DNA COMPLEX organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0075 <- 3.32 -> DG N7 D0006 : score 5.4208 : H : ARG NH2 A0075 <- 2.75 -> DG O6 D0006 : score 6.666 : H : GLN OE1 A0077 <- 3.09 -> DA N6 C0009 : score 5.70152 : H : LYS NZ A0082 <- 2.43 -> DG O6 C0010 : score 6.20855 : H : ARG NH2 B0075 <- 3.25 -> DG O6 C0005 : score 6.006 : H : GLN OE1 B0077 <- 2.85 -> DA N6 D0010 : score 5.99204 : H : LYS NZ B0082 <- 3.27 -> DA N7 D0010 : score 2.66108 : x : HIS xxxx A0080 <- 4.30 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >5x6h_B:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD5-MH1/GC-BRE DNA COMPLEX organism=Mus musculus : x : ASP xxxx B0073 <- 3.49 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0075 <- 3.55 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0077 <- 2.99 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0082 <- 3.10 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx >5x6m_AB:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD5-MH1 IN COMPLEX WITH A COMPOSITE DNA SEQUENCE organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0075 <- 2.89 -> DG N7 D0017 : score 5.9411 : H : ARG NH2 A0075 <- 2.87 -> DG N7 D0017 : score 6.29523 : H : ARG NH2 A0075 <- 2.30 -> DG O6 D0017 : score 7.26 : H : LYS NZ A0082 <- 2.36 -> DG O6 C0005 : score 6.28948 : H : LYS NZ A0082 <- 2.62 -> DT O4 D0018 : score 3.71632 : H : ARG NH1 B0075 <- 2.86 -> DG N7 C0012 : score 5.9774 : H : ARG NH2 B0075 <- 2.21 -> DG O6 C0012 : score 7.3788 : x : ASP xxxx B0073 <- 3.94 -> DC xxx D0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0077 <- 2.75 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0082 <- 2.90 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0073 <- 4.38 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0077 <- 3.55 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx >5x6m_EF:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD5-MH1 IN COMPLEX WITH A COMPOSITE DNA SEQUENCE organism=Mus musculus : H : ARG NH1 E0075 <- 3.04 -> DG N7 G0012 : score 5.7596 : H : ARG NH2 E0075 <- 2.41 -> DG O6 G0012 : score 7.1148 : H : LYS NZ E0082 <- 2.55 -> DG O6 H0010 : score 6.06981 : H : ARG NH1 F0075 <- 3.30 -> DG N7 H0017 : score 5.445 : H : ARG NH2 F0075 <- 3.38 -> DG N7 H0017 : score 5.644 : H : ARG NH2 F0075 <- 2.91 -> DG O6 H0017 : score 6.4548 : H : GLN OE1 F0077 <- 3.39 -> DA N6 G0004 : score 5.33836 : H : LYS NZ F0082 <- 2.73 -> DG O6 G0005 : score 5.8617 : H : LYS NZ F0082 <- 2.29 -> DT O4 H0018 : score 3.95307 : x : ASP xxxx E0073 <- 3.89 -> DC xxx H0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0077 <- 2.89 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0073 <- 4.45 -> DG xxx G0005 : score x.xxxxx >5x6m_F:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD5-MH1 IN COMPLEX WITH A COMPOSITE DNA SEQUENCE organism=Mus musculus : H : ARG NH1 F0075 <- 3.30 -> DG N7 H0017 : score 5.445 : H : ARG NH2 F0075 <- 3.38 -> DG N7 H0017 : score 5.644 : H : ARG NH2 F0075 <- 2.91 -> DG O6 H0017 : score 6.4548 : H : GLN OE1 F0077 <- 3.39 -> DA N6 G0004 : score 5.33836 : H : LYS NZ F0082 <- 2.73 -> DG O6 G0005 : score 5.8617 : H : LYS NZ F0082 <- 2.29 -> DT O4 H0018 : score 3.95307 : x : ASP xxxx F0073 <- 4.45 -> DG xxx G0005 : score x.xxxxx >5x7x_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING H3.3 AT 2.18 ANGSTROM RESOLUTION organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.85 -> DA N3 J0229 : score 3.20735 : w : ARG NH2 B0045 <- 6.06 -> DG N3 I0068 : score 0.677 : w : ARG NH1 C0042 <- 5.60 -> DA N3 J0257 : score 2.585 : w : ARG NH2 C0042 <- 6.19 -> DT O2 I0036 : score 2.261 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.70 -> DA N3 I0082 : score 3.30454 : H : ARG NH1 E0083 <- 3.33 -> DA N3 I0099 : score 3.29175 : w : ARG NH2 E0083 <- 5.67 -> DG N3 I0098 : score 0.677 : w : ARG NH1 G0077 <- 5.41 -> DA N3 J0165 : score 2.585 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.34 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.06 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.07 -> DG xxx J0246 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.39 -> DG xxx J0268 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.98 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.70 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.33 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx >5x7x_B:Histone-fold; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING H3.3 AT 2.18 ANGSTROM RESOLUTION organism=? : w : ARG NH2 B0045 <- 6.06 -> DG N3 I0068 : score 0.677 >5xf3_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH AN ADDUCT OF A BINUCLEAR RAPTA (RU- ARENE-PHOSPHAADAMANTANE) COMPOUND HAVING A 1,2- DIPHENYLETHYLENEDIAMINE LINKER (R,R-CONFIGURATION) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.02 -> DA N3 J0009 : score 3.09719 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.11 -> DA N3 I0009 : score 3.45376 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.21 -> DA N3 I0009 : score 2.97408 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.91 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.89 -> DA xxx J0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.19 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.82 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.01 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.87 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.42 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0036 <- 4.17 -> DT xxx I0049 : score x.xxxxx >5xf3_H:Histone-fold; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH AN ADDUCT OF A BINUCLEAR RAPTA (RU- ARENE-PHOSPHAADAMANTANE) COMPOUND HAVING A 1,2- DIPHENYLETHYLENEDIAMINE LINKER (R,R-CONFIGURATION) organism=? : x : ILE xxxx H0036 <- 4.17 -> DT xxx I0049 : score x.xxxxx >5xf4_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH AN ADDUCT OF A BINUCLEAR RAPTA (RU- ARENE-PHOSPHAADAMANTANE) COMPOUND HAVING A 1,2- DIPHENYLETHYLENEDIAMINE LINKER (S,S-CONFIGURATION) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.98 -> DA N3 J0009 : score 3.12311 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.14 -> DA N3 I0009 : score 3.43167 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.04 -> DA N3 I0009 : score 3.08424 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.82 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.87 -> DA xxx J0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.05 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.92 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.85 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.89 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.19 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.35 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >5xf4_H:Histone-fold; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH AN ADDUCT OF A BINUCLEAR RAPTA (RU- ARENE-PHOSPHAADAMANTANE) COMPOUND HAVING A 1,2- DIPHENYLETHYLENEDIAMINE LINKER (S,S-CONFIGURATION) organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx H0030 <- 4.35 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >5xf5_A:Histone-fold; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH AN ADDUCT OF A BINUCLEAR RAPTA (RU- ARENE-PHOSPHAADAMANTANE) COMPOUND HAVING A 1,2- DIPHENYLETHYLENEDIAMINE LINKER (R,S-CONFIGURATION) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.87 -> DA N3 J0009 : score 3.19439 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.97 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.23 -> DA xxx J0025 : score x.xxxxx >5xf5_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH AN ADDUCT OF A BINUCLEAR RAPTA (RU- ARENE-PHOSPHAADAMANTANE) COMPOUND HAVING A 1,2- DIPHENYLETHYLENEDIAMINE LINKER (R,S-CONFIGURATION) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.87 -> DA N3 J0009 : score 3.19439 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.28 -> DA N3 I0009 : score 3.32857 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.09 -> DA N3 I0009 : score 3.05184 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.97 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.23 -> DA xxx J0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.16 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.42 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.82 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.95 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.86 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.34 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.35 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >5xf6_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH AN ADDUCT OF A BINUCLEAR RAPTA (RU- ARENE-PHOSPHAADAMANTANE) COMPOUND HAVING AN ETHYLENEDIAMINE LINKER organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.67 -> DA N3 J0009 : score 3.32398 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.20 -> DA N3 I0009 : score 3.38749 : x : LEU xxxx A0065 <- 4.09 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.97 -> DC xxx I-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.79 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.06 -> DG xxx J0047 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.08 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.95 -> DC xxx J-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.94 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.16 -> DT xxx J-036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.49 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >5xf6_G:Histone-fold; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH AN ADDUCT OF A BINUCLEAR RAPTA (RU- ARENE-PHOSPHAADAMANTANE) COMPOUND HAVING AN ETHYLENEDIAMINE LINKER organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx G0042 <- 4.16 -> DT xxx J-036 : score x.xxxxx >5xfp_B:FYVE/PHD_zinc_finger;Tudor/PWWP/MBT; title=BINARY COMPLEX OF PHF1 AND A DOUBLE STRANDED DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0323 <- 2.99 -> DG N7 D0005 : score 5.18123 : H : LYS NZ B0323 <- 3.00 -> DG O6 D0006 : score 5.54954 : H : LYS NZ B0324 <- 2.86 -> DG N7 D0003 : score 5.32127 : H : LYS NZ B0324 <- 2.70 -> DG O6 D0003 : score 5.89638 : H : LYS NZ B0324 <- 2.86 -> DG O6 C0009 : score 5.7114 >5xfq_A:FYVE/PHD_zinc_finger;Tudor/PWWP/MBT; title=TERNARY COMPLEX OF PHF1, A DNA DUPLEX AND A HISTONE PEPTIDE organism=Mus musculus : H : LYS NZ A0323 <- 2.73 -> DG N7 C0005 : score 5.4613 : H : LYS NZ A0324 <- 2.61 -> DG O6 D0009 : score 6.00044 : H : LYS NZ A0324 <- 2.89 -> DG O6 C0003 : score 5.67672 >5xfr_B:FYVE/PHD_zinc_finger;Tudor/PWWP/MBT; title=TERNARY COMPLEX OF MTF2, DNA AND HISTONE organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0338 <- 2.88 -> DG N7 E0005 : score 5.29972 : H : LYS NZ B0339 <- 2.73 -> DG O6 F0009 : score 5.8617 : H : LYS NZ B0339 <- 2.80 -> DG O6 E0003 : score 5.78077 >5xh6_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ACIDAMINOCOCCUS SP. BV3L6 CPF1 RVR VARIANT IN COMPLEX WITH CRRNA AND TARGET DNA (TATA PAM) organism=Acidaminococcus sp. (strain BV3L6) / Acidaminococcus sp. (strain BV3L6) : H : ARG NH2 A0552 <- 2.82 -> DT O4 C0003 : score 3.53963 : w : ARG NH1 A0552 <- 5.56 -> DT O4 D-004 : score 1.768 : w : ARG NH2 A0552 <- 6.47 -> DA N7 C0002 : score 1.486 : H : LYS NZ A0607 <- 2.90 -> DT O2 C0003 : score 3.51544 : H : LYS NZ A0607 <- 2.71 -> DT O2 D-002 : score 3.65175 : V : VAL CG1 A0548 <- 3.71 -> DT C7 C0003 : score 6.19687 : x : THR xxxx A0167 <- 4.22 -> DT xxx D-004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0539 <- 3.83 -> DT xxx D-004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0599 <- 4.06 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0603 <- 3.31 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0604 <- 3.60 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0784 <- 4.46 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx >5xh7_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ACIDAMINOCOCCUS SP. BV3L6 CPF1 RR VARIANT IN COMPLEX WITH CRRNA AND TARGET DNA (TCCA PAM) organism=Acidaminococcus sp. (strain BV3L6) / Acidaminococcus sp. (strain BV3L6) : H : ARG NH1 A0542 <- 3.07 -> DG N7 C0002 : score 5.7233 : H : ARG NH2 A0542 <- 2.77 -> DG O6 C0002 : score 6.6396 : H : LYS NZ A0548 <- 3.07 -> DG O6 C0003 : score 5.46861 : w : LYS NZ A0548 <- 5.24 -> DT O4 D-004 : score 1.7 : V : THR CG2 A0539 <- 3.79 -> DT C7 D-004 : score 4.24752 : x : THR xxxx A0167 <- 4.37 -> DT xxx D-004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0599 <- 4.26 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0603 <- 3.49 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0604 <- 3.62 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0607 <- 3.16 -> DC xxx D-002 : score x.xxxxx >5xm0_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE MOUSE NUCLEOSOME STRUCTURE CONTAINING H2A, H2B TYPE3-A, H3.3, AND H4 organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.10 -> DA N3 J0229 : score 3.04536 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.81 -> DA N3 I0082 : score 3.23326 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.22 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.85 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.09 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.79 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.74 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.26 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.48 -> DT xxx J0289 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.34 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.04 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.26 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.92 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.35 -> DT xxx J0184 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.42 -> DT xxx I0130 : score x.xxxxx >5xm0_E:Histone-fold; title=THE MOUSE NUCLEOSOME STRUCTURE CONTAINING H2A, H2B TYPE3-A, H3.3, AND H4 organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 E0040 <- 2.81 -> DA N3 I0082 : score 3.23326 : x : HIS xxxx E0039 <- 4.48 -> DT xxx J0289 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.34 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.04 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.26 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx >5xm1_A:Histone-fold; title=THE MOUSE NUCLEOSOME STRUCTURE CONTAINING H2A, H2B TYPE3-A, H3MM7, AND H4 organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.73 -> DA N3 J0229 : score 3.2851 >5xm1_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE MOUSE NUCLEOSOME STRUCTURE CONTAINING H2A, H2B TYPE3-A, H3MM7, AND H4 organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.73 -> DA N3 J0229 : score 3.2851 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.93 -> DA N3 I0082 : score 3.15551 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.64 -> DT xxx J0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.81 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.26 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.78 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.76 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.48 -> DG xxx J0268 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.40 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.42 -> DT xxx J0289 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.83 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.17 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.76 -> DT xxx J0184 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.24 -> DT xxx I0130 : score x.xxxxx >5xm8_AB:Nucleotidyltransferase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVPOLX IN COMPLEX WITH DNA ENZYME AND PB. organism=African swine fever virus (strain Badajoz 1971 Vero-adapted) / African swine fever virus (strain Badajoz 1971 Vero-adapted) / African swine fever virus (strain Badajoz 1971 Vero-adapted) / African swine fever virus (strain Badajoz 1971 Vero-adapted) : H : ARG NH1 B0127 <- 2.91 -> DA N3 F0001 : score 3.60105 >5xm9_AB:Nucleotidyltransferase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVPOLX IN COMPLEX WITH DNA ENZYME. organism=African swine fever virus (strain Badajoz 1971 Vero-adapted) / African swine fever virus (strain Badajoz 1971 Vero-adapted) / African swine fever virus (strain Badajoz 1971 Vero-adapted) / African swine fever virus (strain Badajoz 1971 Vero-adapted) : H : ARG NH1 A0127 <- 2.70 -> DT O2 E0001 : score 4.39254 : V : VAL CG2 B0120 <- 3.80 -> DT C7 E0036 : score 6.12308 >5xn0_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE Q151M:DNA BINARY COMPLEX organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH A0115 <- 3.04 -> DG N2 E0001 : score 4.65504 : H : TYR OH A0183 <- 3.04 -> DG N2 E0032 : score 4.65504 : H : TYR OH A0183 <- 2.65 -> DG N3 E0032 : score 3.20753 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.42 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.75 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.14 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.49 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx >5xn0_C:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE Q151M:DNA BINARY COMPLEX organism=? : H : TYR OH C0115 <- 3.36 -> DG N2 F0001 : score 4.34209 : H : TYR OH C0183 <- 3.10 -> DG N2 F0032 : score 4.59636 : H : TYR OH C0183 <- 2.60 -> DG N3 F0032 : score 3.23867 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.35 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 3.90 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.70 -> DC xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.45 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.98 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx >5xn0_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE Q151M:DNA BINARY COMPLEX organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH C0115 <- 3.36 -> DG N2 F0001 : score 4.34209 : H : TYR OH C0183 <- 3.10 -> DG N2 F0032 : score 4.59636 : H : TYR OH C0183 <- 2.60 -> DG N3 F0032 : score 3.23867 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.35 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 3.90 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.70 -> DC xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.45 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.98 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx >5xn1_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE Q151M:DNA:ENTECAVIR-TRIPHOSPHATE TERNARY COMPLEX organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH A0183 <- 3.02 -> DG N2 E0032 : score 4.67459 : H : TYR OH A0183 <- 2.71 -> DG N3 E0032 : score 3.17016 : x : TRP xxxx A0024 <- 3.55 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0025 <- 4.36 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0061 <- 3.70 -> DC xxx E0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0063 <- 3.90 -> DC xxx E0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.28 -> DC xxx E0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0076 <- 4.25 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0078 <- 3.52 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.34 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.67 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.22 -> DC xxx E0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.11 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0266 <- 3.85 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0269 <- 3.26 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx >5xn1_C:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE Q151M:DNA:ENTECAVIR-TRIPHOSPHATE TERNARY COMPLEX organism=? : H : TYR OH C0183 <- 3.05 -> DG N2 F0032 : score 4.64526 : H : TYR OH C0183 <- 2.73 -> DG N3 F0032 : score 3.1577 : V : TRP CD1 C0024 <- 3.84 -> DT C7 F-001 : score 7.26 : x : PHE xxxx C0061 <- 4.16 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0063 <- 4.39 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0074 <- 3.45 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0076 <- 3.58 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0078 <- 3.29 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0094 <- 3.23 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 3.84 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 4.20 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.34 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 4.07 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 4.02 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0501 <- 3.70 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx >5xn1_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE Q151M:DNA:ENTECAVIR-TRIPHOSPHATE TERNARY COMPLEX organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH C0183 <- 3.05 -> DG N2 F0032 : score 4.64526 : H : TYR OH C0183 <- 2.73 -> DG N3 F0032 : score 3.1577 : V : TRP CD1 C0024 <- 3.84 -> DT C7 F-001 : score 7.26 : x : PHE xxxx C0061 <- 4.16 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0063 <- 4.39 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0074 <- 3.45 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0076 <- 3.58 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0078 <- 3.29 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0094 <- 3.23 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 3.84 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 4.20 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.34 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 4.07 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 4.02 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0501 <- 3.70 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx >5xn2_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE Q151M:DNA:DGTP TERNARY COMPLEX organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH A0183 <- 3.09 -> DG N2 E0032 : score 4.60614 : H : TYR OH A0183 <- 2.72 -> DG N3 E0032 : score 3.16393 : V : TRP CD1 A0024 <- 3.76 -> DT C7 E-001 : score 7.40667 : x : PRO xxxx A0025 <- 4.45 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0061 <- 3.55 -> DC xxx E0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0063 <- 3.63 -> DC xxx E0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.37 -> DC xxx E0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0078 <- 3.58 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.32 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.80 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.80 -> DC xxx E0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.14 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0266 <- 3.73 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0269 <- 3.24 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx >5xn2_C:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE Q151M:DNA:DGTP TERNARY COMPLEX organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH C0183 <- 3.13 -> DG N2 F0032 : score 4.56702 : H : TYR OH C0183 <- 2.76 -> DG N3 F0032 : score 3.13902 : x : TRP xxxx C0024 <- 3.15 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0061 <- 3.83 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0063 <- 3.99 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0074 <- 3.35 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0076 <- 3.81 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0078 <- 3.50 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0094 <- 3.38 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 3.88 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.30 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.86 -> DC xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.77 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.93 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0501 <- 3.81 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx >5xn2_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE Q151M:DNA:DGTP TERNARY COMPLEX organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH C0183 <- 3.13 -> DG N2 F0032 : score 4.56702 : H : TYR OH C0183 <- 2.76 -> DG N3 F0032 : score 3.13902 : x : TRP xxxx C0024 <- 3.15 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0061 <- 3.83 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0063 <- 3.99 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0074 <- 3.35 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0076 <- 3.81 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0078 <- 3.50 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0094 <- 3.38 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 3.88 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.30 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.86 -> DC xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.77 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.93 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0501 <- 3.81 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx >5xog_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH SPT5 KOW5 AND ELF1 organism=? : x : ARG xxxx A1389 <- 3.32 -> DA xxx T-003 : score x.xxxxx >5xog_ABE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH SPT5 KOW5 AND ELF1 organism=? : x : ARG xxxx A1389 <- 3.32 -> DA xxx T-003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0498 <- 3.24 -> DC xxx T-001 : score x.xxxxx >5xon_ABEW:Elongation_factor_TFIIS_domain_2;Zinc_beta-ribbon;Translation_proteins_SH3-like_domain; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH SPT4/5 AND TFIIS organism=? : x : LEU xxxx A0316 <- 3.77 -> DA xxx N-007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0318 <- 3.77 -> DG xxx N-009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0351 <- 4.24 -> DC xxx T0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0449 <- 4.26 -> DA xxx T0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0832 <- 4.28 -> DT xxx T0000 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0833 <- 3.58 -> DT xxx T0000 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0464 <- 3.99 -> DA xxx N-006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0498 <- 3.81 -> DG xxx T-001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0524 <- 4.49 -> DT xxx T0000 : score x.xxxxx >5xou_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. THERMOPHILUS ARGONAUTE PROTEIN COMPLEXED WITH A BULGE 7T8 ON THE GUIDE STRAND organism=Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) / Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) : H : ARG NH2 A0059 <- 3.03 -> DT O2 C0017 : score 4.0386 : H : ASN ND2 A0449 <- 2.94 -> DG N3 C0002 : score 4.75782 : x : TYR xxxx A0043 <- 3.95 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0044 <- 3.26 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0047 <- 4.46 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0413 <- 3.73 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0415 <- 3.52 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0418 <- 4.03 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0434 <- 4.33 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0436 <- 3.41 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0445 <- 3.69 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0446 <- 3.34 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0548 <- 4.02 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0610 <- 4.02 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0647 <- 3.75 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >5xow_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. THERMOPHILUS ARGONAUTE PROTEIN COMPLEXED WITH A BULGE 6'A7' ON THE TARGET STRAND organism=Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) / Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) : H : ARG NH1 A0192 <- 2.97 -> DT O2 C0009 : score 4.15999 : H : ARG NH2 A0192 <- 2.64 -> DT O2 C0009 : score 4.3688 : H : ASN ND2 A0449 <- 3.08 -> DG N3 C0002 : score 4.62076 : H : ASP OD1 A0609 <- 3.28 -> DG N2 C0004 : score 4.6556 : V : ARG CZ A0039 <- 3.76 -> DT C7 C0018 : score 2.15363 : x : GLU xxxx A0040 <- 4.06 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0042 <- 3.72 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0043 <- 3.38 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0044 <- 4.13 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0266 <- 3.99 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0280 <- 3.98 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0413 <- 4.02 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0415 <- 2.88 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0418 <- 4.04 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0434 <- 3.82 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0436 <- 4.27 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0445 <- 3.38 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0446 <- 3.36 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0486 <- 3.83 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0608 <- 4.20 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0647 <- 3.57 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >5xp8_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. THERMOPHILUS ARGONAUTE PROTEIN COMPLEXED WITH A BULGE 4A5 ON THE GUIDE STRAND organism=? : H : ASN ND2 A0449 <- 3.26 -> DG N3 E0002 : score 4.44454 : x : PRO xxxx A0044 <- 3.87 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0047 <- 3.56 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0267 <- 3.43 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0445 <- 3.16 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0446 <- 3.40 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0486 <- 3.72 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0610 <- 3.96 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0615 <- 3.70 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0647 <- 3.27 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx >5xpa_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. THERMOPHILUS ARGONAUTE PROTEIN COMPLEXED WITH A BULGE 9'U10' ON THE TARGET STRAND organism=Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) / Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) : H : ASN ND2 A0449 <- 2.74 -> DG N3 C0002 : score 4.95361 : x : LEU xxxx A0267 <- 3.70 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0280 <- 3.68 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0413 <- 3.83 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0415 <- 3.66 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0418 <- 4.06 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0434 <- 4.34 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0436 <- 3.10 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0445 <- 3.54 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0446 <- 3.35 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0610 <- 4.36 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0647 <- 3.64 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >5xpg_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. THERMOPHILUS ARGONAUTE PROTEIN COMPLEXED WITH A BULGE 6'U7' ON THE TARGET STRAND organism=Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) / Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) : H : ARG NH1 A0192 <- 3.22 -> DT O2 C0009 : score 3.94467 : H : ARG NH2 A0192 <- 2.72 -> DT O2 C0009 : score 4.30107 : H : ASN ND2 A0449 <- 3.15 -> DG N3 C0002 : score 4.55223 : x : ARG xxxx A0039 <- 3.37 -> DA xxx C0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0042 <- 3.63 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0043 <- 3.22 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0044 <- 3.80 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0413 <- 3.83 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0415 <- 2.97 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0418 <- 4.40 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0434 <- 4.38 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0436 <- 3.63 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0445 <- 3.62 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0446 <- 3.25 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0486 <- 4.23 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0609 <- 3.55 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0647 <- 3.79 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >5xq2_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. THERMOPHILUS ARGONAUTE PROTEIN COMPLEXED WITH A BULGE 5A6 ON THE GUIDE STRAND organism=Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) / Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) : H : HIS ND1 A0445 <- 2.90 -> DC O2 Y0018 : score 3.15987 : H : ARG NH2 A0486 <- 3.21 -> DC O2 Y0009 : score 3.39542 : H : ARG NH2 A0548 <- 2.57 -> DA N3 Y0007 : score 3.38877 : x : TYR xxxx A0043 <- 4.01 -> DA xxx Y0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0044 <- 3.76 -> DA xxx Y0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0059 <- 3.63 -> DT xxx X0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0267 <- 3.67 -> DA xxx Y0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0443 <- 3.99 -> DG xxx X0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0446 <- 4.18 -> DG xxx X0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0449 <- 3.37 -> DG xxx X0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0483 <- 3.05 -> DT xxx Y0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0611 <- 4.38 -> DG xxx X0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0615 <- 3.45 -> DT xxx X0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0647 <- 3.48 -> DC xxx Y0018 : score x.xxxxx >5xrz_I:dsRNA-binding_domain-like; title=STRUCTURE OF A SSDNA BOUND TO THE INNER DNA BINDING SITE OF RAD52 organism=Homo sapiens : V : ARG CB I0055 <- 3.85 -> DT C7 L0033 : score 0.992564 : x : VAL xxxx I0063 <- 3.42 -> DT xxx L0032 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0141 <- 3.23 -> DT xxx L0034 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0145 <- 3.63 -> DT xxx L0034 : score x.xxxxx >5xs0_FGHNOP:dsRNA-binding_domain-like; title=STRUCTURE OF A SSDNA BOUND TO THE OUTER DNA BINDING SITE OF RAD52 organism=Homo sapiens : x : LEU xxxx F0132 <- 3.55 -> DC xxx Y0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0133 <- 3.43 -> DC xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0134 <- 3.37 -> DC xxx Y0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0102 <- 4.00 -> DC xxx Y0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0132 <- 3.77 -> DC xxx Y0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0133 <- 3.40 -> DC xxx Y0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0134 <- 3.23 -> DC xxx Y0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx N0132 <- 3.55 -> DC xxx Y0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx N0133 <- 3.21 -> DC xxx Y0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx N0134 <- 3.96 -> DC xxx Y0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx N0137 <- 3.95 -> DC xxx Y0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx O0102 <- 3.93 -> DC xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0132 <- 3.87 -> DC xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx O0133 <- 3.24 -> DC xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx O0134 <- 3.56 -> DC xxx Y0007 : score x.xxxxx >5xs0_I:dsRNA-binding_domain-like; title=STRUCTURE OF A SSDNA BOUND TO THE OUTER DNA BINDING SITE OF RAD52 organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx I0102 <- 4.24 -> DC xxx Z0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0132 <- 3.24 -> DC xxx Z0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0133 <- 3.24 -> DC xxx Z0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0134 <- 3.54 -> DC xxx Z0005 : score x.xxxxx >5xs0_IJ:dsRNA-binding_domain-like; title=STRUCTURE OF A SSDNA BOUND TO THE OUTER DNA BINDING SITE OF RAD52 organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx I0102 <- 4.24 -> DC xxx Z0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0132 <- 3.24 -> DC xxx Z0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0133 <- 3.24 -> DC xxx Z0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0134 <- 3.54 -> DC xxx Z0005 : score x.xxxxx >5xs0_QR:dsRNA-binding_domain-like; title=STRUCTURE OF A SSDNA BOUND TO THE OUTER DNA BINDING SITE OF RAD52 organism=Homo sapiens : x : LEU xxxx Q0132 <- 3.48 -> DC xxx W0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Q0133 <- 3.36 -> DC xxx W0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Q0134 <- 3.65 -> DC xxx W0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx R0102 <- 4.34 -> DC xxx W0005 : score x.xxxxx >5xs0_TUV:dsRNA-binding_domain-like; title=STRUCTURE OF A SSDNA BOUND TO THE OUTER DNA BINDING SITE OF RAD52 organism=Homo sapiens : x : LEU xxxx T0132 <- 3.26 -> DC xxx X0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx T0133 <- 3.34 -> DC xxx X0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx T0134 <- 3.51 -> DC xxx X0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx U0132 <- 3.72 -> DC xxx X0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx U0133 <- 3.46 -> DC xxx X0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx U0134 <- 3.48 -> DC xxx X0008 : score x.xxxxx >5xus_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF LACHNOSPIRACEAE BACTERIUM ND2006 CPF1 IN COMPLEX WITH CRRNA AND TARGET DNA (TTTA PAM) organism=LACHNOSPIRACEAE BACTERIUM ND2006 : w : GLN OE1 A0529 <- 5.71 -> DT O4 D-004 : score 3.068 : H : LYS NZ A0538 <- 2.96 -> DA N7 C0003 : score 2.84319 : w : LYS NZ A0538 <- 5.51 -> DT O4 D-004 : score 1.7 : w : ASP OD2 A0541 <- 6.88 -> DA N6 C0004 : score 3.409 : w : TYR OH A0542 <- 5.79 -> DA N6 C0002 : score 2.545 : H : LYS NZ A0595 <- 2.83 -> DT O2 D-002 : score 3.56566 : H : LYS NZ A0595 <- 3.03 -> DA N3 C0003 : score 2.64918 : x : THR xxxx A0149 <- 3.63 -> DT xxx D-004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0587 <- 4.11 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0591 <- 3.81 -> DA xxx D-001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0592 <- 3.78 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx >5xut_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF LACHNOSPIRACEAE BACTERIUM ND2006 CPF1 IN COMPLEX WITH CRRNA AND TARGET DNA (TCTA PAM) organism=LACHNOSPIRACEAE BACTERIUM ND2006 : x : THR xxxx A0149 <- 4.03 -> DT xxx D-004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0529 <- 3.46 -> DT xxx D-004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0538 <- 3.28 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0541 <- 4.15 -> DC xxx D-005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0542 <- 3.22 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0587 <- 4.47 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0591 <- 3.42 -> DA xxx D-001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0592 <- 4.27 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0595 <- 3.47 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0601 <- 4.29 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx >5xuu_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF LACHNOSPIRACEAE BACTERIUM ND2006 CPF1 IN COMPLEX WITH CRRNA AND TARGET DNA (TCCA PAM) organism=LACHNOSPIRACEAE BACTERIUM ND2006 : H : LYS NZ A0538 <- 3.09 -> DG N7 C0003 : score 5.07352 : H : LYS NZ A0595 <- 2.90 -> DC O2 D-002 : score 2.88723 : x : THR xxxx A0149 <- 4.13 -> DT xxx D-004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0529 <- 3.66 -> DT xxx D-004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0541 <- 4.38 -> DC xxx D-005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0542 <- 3.28 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0591 <- 4.24 -> DA xxx D-001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0592 <- 4.34 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >5xuz_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF LACHNOSPIRACEAE BACTERIUM ND2006 CPF1 IN COMPLEX WITH CRRNA AND TARGET DNA (CCCA PAM) organism=LACHNOSPIRACEAE BACTERIUM ND2006 : H : GLN OE1 A0529 <- 3.14 -> DC N4 D-003 : score 4.27167 : w : GLN NE2 A0529 <- 5.61 -> DG O6 C0002 : score 2.87 : H : LYS NZ A0538 <- 2.87 -> DG N7 C0003 : score 5.31049 : w : ASP OD2 A0541 <- 5.87 -> DC N4 D-004 : score 3.623 : H : LYS NZ A0595 <- 2.57 -> DC O2 D-002 : score 3.08168 : H : LYS NZ A0595 <- 2.98 -> DA N3 D-001 : score 2.67695 : x : THR xxxx A0149 <- 4.18 -> DC xxx D-004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0542 <- 3.11 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0591 <- 3.76 -> DA xxx D-001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0592 <- 3.27 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >5xvn_ABCDEF: title=E. FAR CAS1-CAS2/PRESPACER BINARY COMPLEX organism=ENTEROCOCCUS FAECALIS TX0027 : x : HIS xxxx A0011 <- 4.11 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0046 <- 4.09 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0011 <- 3.49 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0045 <- 4.11 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0046 <- 3.96 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0052 <- 4.01 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0016 <- 3.71 -> DC xxx H0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0025 <- 3.33 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0026 <- 3.50 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0030 <- 3.64 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0016 <- 3.97 -> DC xxx G0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0025 <- 3.28 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0026 <- 3.49 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0030 <- 4.27 -> DA xxx H0006 : score x.xxxxx >5xvn_IJKLMN: title=E. FAR CAS1-CAS2/PRESPACER BINARY COMPLEX organism=ENTEROCOCCUS FAECALIS TX0027 : x : HIS xxxx I0011 <- 4.33 -> DC xxx O0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0045 <- 4.44 -> DC xxx O0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0046 <- 4.36 -> DC xxx O0003 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx K0011 <- 4.03 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx K0046 <- 4.47 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0052 <- 4.28 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0016 <- 3.74 -> DC xxx P0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx M0025 <- 3.36 -> DT xxx P0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0026 <- 3.75 -> DT xxx O0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0030 <- 4.31 -> DA xxx O0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx N0016 <- 4.21 -> DC xxx O0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx N0025 <- 3.47 -> DT xxx O0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0026 <- 3.43 -> DT xxx P0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx N0030 <- 3.54 -> DA xxx P0006 : score x.xxxxx >5xvn_L: title=E. FAR CAS1-CAS2/PRESPACER BINARY COMPLEX organism=? : x : MET xxxx L0052 <- 4.28 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >5xvo_ACF: title=E. FAE CAS1-CAS2/PRESPACER/TARGET TERNARY COMPLEX REVEALING DNA SAMPLING AND HALF-INTEGRATION STATES organism=ENTEROCOCCUS FAECALIS TX0027 : x : THR xxxx C0045 <- 4.09 -> DC xxx R-020 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0046 <- 3.97 -> DC xxx R-020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0016 <- 4.49 -> DC xxx G0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0025 <- 3.46 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0026 <- 3.44 -> DT xxx R-014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0030 <- 3.95 -> DA xxx R-017 : score x.xxxxx >5xvo_BDE: title=E. FAE CAS1-CAS2/PRESPACER/TARGET TERNARY COMPLEX REVEALING DNA SAMPLING AND HALF-INTEGRATION STATES organism=ENTEROCOCCUS FAECALIS TX0027 : H : ASN ND2 B0146 <- 3.04 -> DT O2 Q0043 : score 4.51834 : H : HIS NE2 B0150 <- 2.73 -> DC O2 Q0044 : score 5.3612 : H : ARG NH2 B0153 <- 2.65 -> DC O2 H0002 : score 3.80968 : H : ARG NH1 E0004 <- 2.94 -> DG O6 R0019 : score 5.913 : H : ARG NH2 E0004 <- 2.98 -> DG N7 R0019 : score 6.15477 : H : ARG NH2 E0004 <- 3.05 -> DG O6 R0019 : score 6.27 : H : ASP OD2 E0052 <- 3.18 -> DC N4 Q0028 : score 5.7288 : H : THR OG1 E0053 <- 3.02 -> DA N7 R0017 : score 3.26388 : H : THR OG1 E0053 <- 3.33 -> DA N6 R0017 : score 2.46652 : x : ASN xxxx B0206 <- 3.56 -> DT xxx R0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 3.57 -> DT xxx R0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0208 <- 3.57 -> DT xxx R0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0051 <- 3.70 -> DT xxx R0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0056 <- 4.38 -> DC xxx Q0028 : score x.xxxxx >5xvo_IJLMN: title=E. FAE CAS1-CAS2/PRESPACER/TARGET TERNARY COMPLEX REVEALING DNA SAMPLING AND HALF-INTEGRATION STATES organism=ENTEROCOCCUS FAECALIS TX0027 : x : HIS xxxx I0011 <- 3.80 -> DC xxx O0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0046 <- 3.64 -> DC xxx O0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0016 <- 4.21 -> DC xxx P0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx M0025 <- 3.51 -> DT xxx P0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0026 <- 3.56 -> DT xxx O0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0030 <- 3.74 -> DA xxx O0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx N0016 <- 4.21 -> DC xxx O0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx N0025 <- 3.60 -> DT xxx O0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0026 <- 3.44 -> DT xxx P0009 : score x.xxxxx >5xvp_ACEF: title=E. FAE CAS1-CAS2/PRESPACER/TARGET TERNARY COMPLEX REVEALING THE FULLY INTEGRATED STATES organism=ENTEROCOCCUS FAECALIS TX0027 : H : ARG NH1 E0004 <- 2.60 -> DG O6 H0042 : score 6.32667 : H : ARG NH2 E0004 <- 2.76 -> DG N7 H0042 : score 6.43569 : H : ASP OD1 E0052 <- 3.23 -> DC N4 G0051 : score 4.88521 : H : THR OG1 E0053 <- 3.31 -> DA N7 H0040 : score 3.06586 : x : HIS xxxx A0084 <- 3.78 -> DC xxx H0058 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0084 <- 3.24 -> DT xxx G0059 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0051 <- 3.00 -> DT xxx H0041 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0051 <- 3.08 -> DT xxx G0041 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0052 <- 3.65 -> DA xxx H0051 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0053 <- 3.66 -> DA xxx G0040 : score x.xxxxx >5xvp_B: title=E. FAE CAS1-CAS2/PRESPACER/TARGET TERNARY COMPLEX REVEALING THE FULLY INTEGRATED STATES organism=ENTEROCOCCUS FAECALIS TX0027 : H : ASN ND2 B0146 <- 3.44 -> DT O2 h0064 : score 4.13865 : H : HIS NE2 B0150 <- 2.91 -> DC O2 h0065 : score 5.17086 : H : SER OG B0185 <- 3.32 -> DT N3 g0024 : score 1.78051 : V : PHE CZ B0208 <- 3.71 -> DT C7 g0031 : score 7.27496 : x : LYS xxxx B0070 <- 3.86 -> DT xxx g0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0071 <- 3.26 -> DT xxx g0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0072 <- 4.08 -> DT xxx g0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0153 <- 2.84 -> DC xxx g0077 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0174 <- 3.22 -> DT xxx g0025 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0178 <- 3.54 -> DT xxx g0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0182 <- 3.52 -> DT xxx g0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0184 <- 4.05 -> DC xxx g0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0189 <- 3.74 -> DT xxx g0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0206 <- 3.75 -> DT xxx g0030 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 3.29 -> DT xxx g0031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0209 <- 3.48 -> DC xxx g0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0215 <- 3.49 -> DC xxx g0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0237 <- 3.25 -> DT xxx g0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0245 <- 4.19 -> DT xxx g0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0248 <- 4.03 -> DT xxx g0024 : score x.xxxxx >5xvp_BD: title=E. FAE CAS1-CAS2/PRESPACER/TARGET TERNARY COMPLEX REVEALING THE FULLY INTEGRATED STATES organism=ENTEROCOCCUS FAECALIS TX0027 : H : ASN ND2 B0146 <- 3.44 -> DT O2 h0064 : score 4.13865 : H : HIS NE2 B0150 <- 2.91 -> DC O2 h0065 : score 5.17086 : H : SER OG B0185 <- 3.32 -> DT N3 g0024 : score 1.78051 : H : ASN ND2 D0146 <- 3.17 -> DT O2 g0065 : score 4.39494 : H : HIS NE2 D0150 <- 3.30 -> DC O2 g0066 : score 4.75846 : H : ARG NH2 D0153 <- 2.20 -> DC O2 h0076 : score 4.14256 : V : PHE CZ B0208 <- 3.71 -> DT C7 g0031 : score 7.27496 : V : PHE CZ D0208 <- 3.84 -> DT C7 h0030 : score 7.04372 : x : LYS xxxx B0070 <- 3.86 -> DT xxx g0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0071 <- 3.26 -> DT xxx g0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0072 <- 4.08 -> DT xxx g0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0153 <- 2.84 -> DC xxx g0077 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0174 <- 3.22 -> DT xxx g0025 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0178 <- 3.54 -> DT xxx g0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0182 <- 3.52 -> DT xxx g0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0184 <- 4.05 -> DC xxx g0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0189 <- 3.74 -> DT xxx g0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0206 <- 3.75 -> DT xxx g0030 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0207 <- 3.29 -> DT xxx g0031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0209 <- 3.48 -> DC xxx g0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0215 <- 3.49 -> DC xxx g0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0237 <- 3.25 -> DT xxx g0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0245 <- 4.19 -> DT xxx g0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0248 <- 4.03 -> DT xxx g0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0070 <- 4.05 -> DT xxx h0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0071 <- 3.12 -> DT xxx h0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0174 <- 3.56 -> DT xxx h0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0178 <- 3.73 -> DT xxx h0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0182 <- 3.29 -> DT xxx h0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0184 <- 4.24 -> DC xxx h0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0185 <- 4.20 -> DT xxx h0023 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0206 <- 3.71 -> DT xxx h0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0207 <- 3.49 -> DT xxx h0030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0209 <- 3.24 -> DC xxx h0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0215 <- 3.96 -> DC xxx h0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0237 <- 3.36 -> DT xxx h0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0245 <- 4.15 -> DT xxx h0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0248 <- 4.39 -> DT xxx h0023 : score x.xxxxx >5xxp_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CBNR_DBD-DNA COMPLEX organism=Cupriavidus necator : H : ARG NH1 A0034 <- 3.08 -> DG O6 E0017 : score 5.74267 : H : ARG NH2 A0034 <- 3.41 -> DG N7 E0017 : score 5.60569 : x : SER xxxx A0028 <- 3.68 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0029 <- 4.18 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0030 <- 3.26 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0031 <- 4.42 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0033 <- 3.40 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0052 <- 2.75 -> DT xxx E0024 : score x.xxxxx >5xxp_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CBNR_DBD-DNA COMPLEX organism=Cupriavidus necator : H : ARG NH1 A0034 <- 3.08 -> DG O6 E0017 : score 5.74267 : H : ARG NH2 A0034 <- 3.41 -> DG N7 E0017 : score 5.60569 : H : ARG NH1 B0034 <- 2.91 -> DG O6 F0017 : score 5.9495 : H : ARG NH2 B0034 <- 3.27 -> DG N7 F0017 : score 5.78446 : V : PRO CG B0030 <- 3.86 -> DT C7 F0018 : score 6.26359 : V : THR CG2 B0033 <- 3.58 -> DT C7 E0006 : score 4.46995 : x : SER xxxx A0028 <- 3.68 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0029 <- 4.18 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0030 <- 3.26 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0031 <- 4.42 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0033 <- 3.40 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0052 <- 2.75 -> DT xxx E0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0028 <- 3.55 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0029 <- 4.36 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0031 <- 4.31 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0052 <- 4.13 -> DA xxx F0024 : score x.xxxxx >5xzb_A: title=MOUSE CGAS BOUND TO THE INHIBITOR RU365 organism=Mus musculus : w : HIS NE2 A0203 <- 5.74 -> DA N3 E0010 : score 2.619 : x : ARG xxxx A0161 <- 3.34 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx >5xze_A: title=MOUSE CGAS BOUND TO THE INHIBITOR RU332 organism=Mus musculus : x : ARG xxxx A0161 <- 3.26 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx >5xzg_A: title=MOUSE CGAS BOUND TO THE INHIBITOR RU521 organism=Mus musculus : w : HIS NE2 A0203 <- 5.79 -> DA N3 E0010 : score 2.619 : x : ARG xxxx A0161 <- 3.19 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx >5y0c_A:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME AT 2.09 ANGSTROM RESOLUTION organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.46 -> DA N3 J0229 : score 3.46005 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.75 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.67 -> DG xxx J0246 : score x.xxxxx >5y0c_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME AT 2.09 ANGSTROM RESOLUTION organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.46 -> DA N3 J0229 : score 3.46005 : H : ARG NH1 C0011 <- 3.22 -> DT O2 J0263 : score 3.94467 : w : ARG NH1 C0042 <- 5.92 -> DT O2 J0258 : score 1.855 : w : ARG NH2 C0042 <- 6.06 -> DT O2 J0258 : score 2.261 : w : ARG NH2 C0042 <- 5.87 -> DA N3 J0257 : score 2.092 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.11 -> DA N3 I0082 : score 3.45376 : w : ARG NH1 G0042 <- 6.38 -> DT O2 J0184 : score 1.855 : w : ARG NH2 G0042 <- 5.06 -> DT O2 J0183 : score 2.261 : w : ARG NH1 G0077 <- 5.72 -> DA N3 J0165 : score 2.585 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.75 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.67 -> DG xxx J0246 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.09 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.14 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.69 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.73 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.43 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx >5y0d_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME CONTAINING THE H2B E76K MUTANT organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.54 -> DA N3 J0229 : score 3.40821 : H : ARG NH1 C0011 <- 3.27 -> DT O2 J0263 : score 3.90161 : H : ARG NH2 C0011 <- 3.00 -> DT O2 J0264 : score 4.064 : w : ARG NH2 C0042 <- 5.98 -> DT O2 I0036 : score 2.261 : w : ARG NH2 C0077 <- 5.95 -> DG N3 I0018 : score 0.677 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.88 -> DA N3 I0082 : score 3.18791 : w : ARG NH1 E0040 <- 6.22 -> DA N3 I0083 : score 2.585 : w : ARG NH2 E0040 <- 6.39 -> DC O2 J0212 : score 1.669 : w : ARG NH2 G0042 <- 5.58 -> DA N3 I0110 : score 2.092 : w : ARG NH1 G0077 <- 5.49 -> DA N3 J0165 : score 2.585 : w : ARG NH2 G0077 <- 5.98 -> DT O2 I0130 : score 2.261 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.85 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.44 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.95 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.27 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.33 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.62 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.47 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.10 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx >5y36_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF SPCAS9-SGRNA-DNA TERNARY COMPLEX organism=STREPTOCOCCUS PYOGENES SEROTYPE M1 : H : ARG NH1 A1335 <- 3.29 -> DG N7 C0015 : score 5.4571 : H : ARG NH2 A1335 <- 2.50 -> DG O6 C0015 : score 6.996 : x : ARG xxxx A1333 <- 4.28 -> DG xxx D0038 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1337 <- 4.22 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >5y3j_B:L_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HORSE TLR9 IN COMPLEX WITH TWO DNAS (CPG DNA AND TCGCAC DNA) organism=Equus caballus : H : ARG NH1 B0377 <- 3.17 -> DG N7 F0003 : score 5.6023 : H : ARG NH2 B0377 <- 3.00 -> DG N7 F0003 : score 6.12923 >5y3k_A:L_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HORSE TLR9 IN COMPLEX WITH TWO DNAS (CPG DNA AND GCGCAC DNA) organism=Equus caballus : H : SER OG A0072 <- 2.89 -> DT O4 C0007 : score 3.49114 : H : ARG NE A0074 <- 2.62 -> DG O6 C0005 : score 4.0829 : H : ARG NH1 A0074 <- 3.30 -> DG N7 C0005 : score 5.445 : H : SER OG A0104 <- 2.89 -> DC O2 C0004 : score 2.45626 : H : SER OG A0104 <- 2.87 -> DC N3 C0004 : score 1.95304 : H : SER OG A0151 <- 2.80 -> DT O4 C0010 : score 3.55513 : H : ARG NH1 A0152 <- 2.80 -> DT O4 C0009 : score 3.26795 : H : ASP OD2 A0175 <- 2.60 -> DT N3 C0010 : score 3.73067 : H : LYS NZ A0207 <- 2.67 -> DT O2 C0010 : score 3.68045 : V : PRO CG A0105 <- 3.72 -> DT C7 C0007 : score 6.48615 : V : SER CB A0131 <- 3.82 -> DT C7 C0009 : score 3.11563 >5y3l_A:L_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HORSE TLR9 IN COMPLEX WITH TWO DNAS (CPG DNA AND CCGCAC DNA) organism=Equus caballus : H : SER OG A0072 <- 2.86 -> DT O4 C0007 : score 3.51247 : H : ARG NE A0074 <- 2.58 -> DG O6 C0005 : score 4.11443 : H : ARG NH1 A0074 <- 2.98 -> DG N7 C0005 : score 5.8322 : H : ARG NH1 A0074 <- 3.13 -> DG O6 C0005 : score 5.68183 : H : SER OG A0104 <- 3.03 -> DC O2 C0004 : score 2.38622 : H : SER OG A0104 <- 2.79 -> DC N3 C0004 : score 1.98473 : H : ARG NH2 A0262 <- 2.97 -> DT O2 C0009 : score 4.0894 : V : PRO CG A0105 <- 3.79 -> DT C7 C0007 : score 6.37487 >5y3r_A:SPOC_domain-like;vWA-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN DNA-PK HOLOENZYME organism=? : x : LEU xxxx A0256 <- 3.10 -> DA xxx E0038 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0278 <- 2.86 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0403 <- 2.15 -> DA xxx E0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0404 <- 4.22 -> DT xxx E0037 : score x.xxxxx >5y3r_ABCK:SPOC_domain-like;vWA-like;Protein_kinase-like_PK-like;ARM_repeat;C-terminal_domain_of_Ku80; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN DNA-PK HOLOENZYME organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ B0399 <- 2.71 -> DC O2 E0026 : score 2.99918 : H : ARG NE B0400 <- 2.54 -> DG N3 D0010 : score 1.84639 : H : ARG NH2 B0400 <- 2.48 -> DC N3 E0026 : score 2.43765 : V : ALA CB K0012 <- 3.56 -> DT C7 E0050 : score 5.93491 : x : LEU xxxx A0256 <- 3.10 -> DA xxx E0038 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0278 <- 2.86 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0403 <- 2.15 -> DA xxx E0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0404 <- 4.22 -> DT xxx E0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0397 <- 3.79 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx K0013 <- 3.75 -> DA xxx E0051 : score x.xxxxx >5y3r_B:SPOC_domain-like;vWA-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN DNA-PK HOLOENZYME organism=? : H : LYS NZ B0399 <- 2.71 -> DC O2 E0026 : score 2.99918 : H : ARG NE B0400 <- 2.54 -> DG N3 D0010 : score 1.84639 : H : ARG NH2 B0400 <- 2.48 -> DC N3 E0026 : score 2.43765 : x : TYR xxxx B0397 <- 3.79 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >5y3r_K: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN DNA-PK HOLOENZYME organism=HOMO SAPIENS : V : ALA CB K0012 <- 3.56 -> DT C7 E0050 : score 5.93491 : x : ALA xxxx K0013 <- 3.75 -> DA xxx E0051 : score x.xxxxx >5y7g_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF PAFAN1 BOUND TO 1NT 5'FLAP DNA WITH GAP organism=? : x : ASP xxxx B0528 <- 3.74 -> DA xxx L0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0531 <- 3.89 -> DA xxx L0005 : score x.xxxxx >5y7q_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF PAFAN1 BOUND TO 2NT 5'FLAP DNA WITH GAP organism=? : x : PRO xxxx A0014 <- 3.81 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0021 <- 3.35 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0191 <- 3.96 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0192 <- 3.67 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0195 <- 3.54 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0197 <- 3.80 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0198 <- 4.13 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx >5ybb_DG: title=STRUCTURAL BASIS UNDERLYING COMPLEX ASSEMBLY ANDCONFORMATIONAL TRANSITION OF THE TYPE I R-M SYSTEM organism=? : H : ARG NE D0066 <- 3.04 -> DG N7 H0007 : score 4.20955 : H : ARG NH2 D0066 <- 2.36 -> DG O6 H0007 : score 7.1808 : H : ARG NE G0066 <- 3.09 -> DG N7 I0006 : score 4.16533 : H : ARG NH2 G0066 <- 3.18 -> DG N7 I0006 : score 5.89938 : H : ARG NH2 G0066 <- 2.36 -> DG O6 I0006 : score 7.1808 : H : ARG NH1 G0082 <- 2.80 -> DG N7 I0004 : score 6.05 : x : ARG xxxx D0026 <- 4.17 -> DG xxx I0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0065 <- 4.37 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0082 <- 2.96 -> DG xxx H0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0142 <- 3.45 -> DC xxx I0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0026 <- 4.21 -> DA xxx H0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0065 <- 4.37 -> DA xxx I0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0081 <- 4.07 -> DT xxx I0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0142 <- 3.47 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >5ybb_G:DNA_methylase_specificity_domain; title=STRUCTURAL BASIS UNDERLYING COMPLEX ASSEMBLY ANDCONFORMATIONAL TRANSITION OF THE TYPE I R-M SYSTEM organism=? : H : ARG NE G0066 <- 3.09 -> DG N7 I0006 : score 4.16533 : H : ARG NH2 G0066 <- 3.18 -> DG N7 I0006 : score 5.89938 : H : ARG NH2 G0066 <- 2.36 -> DG O6 I0006 : score 7.1808 : H : ARG NH1 G0082 <- 2.80 -> DG N7 I0004 : score 6.05 : x : ARG xxxx G0026 <- 4.21 -> DA xxx H0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0065 <- 4.37 -> DA xxx I0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0081 <- 4.07 -> DT xxx I0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0142 <- 3.47 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >5ybd_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=X-RAY STRUCTURE OF ETS DOMAIN OF ERGP55 IN COMPLEX WITH E74DNA organism=Homo sapiens : H : ASP OD2 A0363 <- 3.42 -> DC N4 C0020 : score 5.4312 : H : ARG NE A0367 <- 2.94 -> DG O6 B0006 : score 3.83068 : H : ARG NH2 A0367 <- 2.73 -> DG N7 B0006 : score 6.474 : H : ARG NH1 A0370 <- 3.24 -> DG N7 B0005 : score 5.5176 : H : ARG NH1 A0370 <- 2.77 -> DG O6 B0005 : score 6.11983 : H : TYR OH A0371 <- 3.09 -> DA N6 B0007 : score 4.39962 : x : LYS xxxx A0364 <- 3.91 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx >5yef_J:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CTCF ZFS2-8-HS5-1AE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 J0339 <- 3.34 -> DG O6 L0020 : score 5.42633 : H : ARG NH2 J0339 <- 3.19 -> DG N7 L0020 : score 5.88662 : H : GLU OE2 J0362 <- 2.86 -> DC N4 L0019 : score 5.2022 : H : LYS NZ J0365 <- 2.93 -> DG O6 L0018 : score 5.63047 : H : ARG NH2 J0368 <- 3.20 -> DG N7 L0017 : score 5.87385 : H : ARG NH2 J0368 <- 2.75 -> DG O6 L0017 : score 6.666 : H : ARG NH1 J0396 <- 3.05 -> DG O6 L0014 : score 5.77917 : H : ARG NH2 J0396 <- 3.09 -> DG N7 L0014 : score 6.01431 : H : GLN OE1 J0418 <- 3.05 -> DA N6 L0013 : score 5.74994 : H : GLN NE2 J0418 <- 3.15 -> DA N7 L0013 : score 5.66346 : H : THR OG1 J0421 <- 3.04 -> DC N4 L0012 : score 3.83973 : H : ASP OD1 J0451 <- 3.14 -> DC N4 L0009 : score 4.98142 : V : VAL CG1 J0454 <- 3.55 -> DT C7 K0020 : score 6.43929 : x : TYR xxxx J0343 <- 3.59 -> DG xxx L0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0364 <- 4.11 -> DC xxx K0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0391 <- 4.48 -> DC xxx K0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0392 <- 3.14 -> DC xxx K0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0393 <- 3.75 -> DA xxx L0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0419 <- 4.31 -> DT xxx K0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0448 <- 3.84 -> DC xxx L0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0450 <- 3.61 -> DC xxx K0019 : score x.xxxxx >5yeg_B:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CTCF ZFS4-8-HS5-1A COMPLEX organism=? : H : GLU OE2 B0362 <- 3.21 -> DC N4 F0019 : score 4.83362 : H : LYS NZ B0365 <- 2.76 -> DG O6 F0018 : score 5.82702 : H : LYS NZ B0365 <- 2.77 -> DG O6 E0003 : score 5.81545 : H : ARG NH1 B0368 <- 2.89 -> DG O6 F0017 : score 5.97383 : H : ARG NH2 B0368 <- 2.95 -> DG N7 F0017 : score 6.19308 : w : ASP OD2 B0390 <- 5.74 -> DG O6 F0016 : score 3.228 : w : ASP OD2 B0390 <- 5.88 -> DG N7 F0016 : score 2.718 : w : ASP OD2 B0390 <- 6.11 -> DC N4 E0005 : score 3.623 : w : THR OG1 B0391 <- 6.23 -> DC N4 E0005 : score 2.558 : w : TYR OH B0392 <- 6.14 -> DT O4 E0007 : score 2.914 : H : LYS NZ B0393 <- 2.97 -> DA N7 F0015 : score 2.83732 : H : ARG NH1 B0396 <- 2.74 -> DG O6 F0014 : score 6.15633 : H : ARG NH2 B0396 <- 2.87 -> DG N7 F0014 : score 6.29523 : w : ARG NH1 B0396 <- 6.58 -> DT O4 E0007 : score 1.768 : H : GLN OE1 B0418 <- 2.92 -> DA N6 F0013 : score 5.9073 : H : GLN NE2 B0418 <- 3.18 -> DA N7 F0013 : score 5.62692 : H : THR OG1 B0421 <- 3.11 -> DC N4 F0012 : score 3.78327 : w : ARG NH2 B0448 <- 6.37 -> DA N6 F0010 : score 1.997 : w : SER OG B0450 <- 5.61 -> DT O4 E0012 : score 2.338 : w : SER OG B0450 <- 5.74 -> DC N4 E0011 : score 2.105 : H : ASP OD1 B0451 <- 2.89 -> DC N4 F0009 : score 5.24866 : w : ASP OD1 B0451 <- 5.40 -> DC N4 F0008 : score 2.835 : w : ASP OD1 B0451 <- 5.46 -> DT O4 E0012 : score 2.616 : V : VAL CG2 B0454 <- 3.72 -> DT C7 E0012 : score 6.24554 : x : SER xxxx B0364 <- 4.14 -> DC xxx E0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0417 <- 4.50 -> DC xxx F0012 : score x.xxxxx >5yeh_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CTCF ZFS4-8-ECBS organism=Homo sapiens : H : GLU OE2 A0362 <- 3.05 -> DC N4 C0019 : score 5.00212 : H : ARG NH1 A0368 <- 2.66 -> DG O6 C0017 : score 6.25367 : H : ARG NH2 A0368 <- 2.72 -> DG N7 C0017 : score 6.48677 : H : LYS NZ A0393 <- 2.42 -> DA N7 C0015 : score 3.16041 : H : ARG NH1 A0396 <- 2.80 -> DG O6 C0014 : score 6.08333 : H : ARG NH2 A0396 <- 2.95 -> DG N7 C0014 : score 6.19308 : H : GLN OE1 A0418 <- 2.90 -> DA N6 C0013 : score 5.93151 : H : GLN NE2 A0418 <- 3.00 -> DA N7 C0013 : score 5.84615 : H : ASP OD2 A0451 <- 2.88 -> DC N4 C0009 : score 6.1008 : w : ASP OD2 A0451 <- 5.08 -> DC N4 D0012 : score 3.623 : w : ASP OD2 A0451 <- 6.26 -> DC N4 C0008 : score 3.623 : x : ARG xxxx A0389 <- 3.32 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0390 <- 4.47 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0392 <- 3.40 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0417 <- 3.97 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0421 <- 3.82 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.64 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0450 <- 3.03 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx >5yej_B:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BIOQ WITH ITS NATUREL DOUBLE-STRANDED DNA OPERATOR organism=Mycobacterium smegmatis : H : ARG NH2 B0027 <- 2.26 -> DG N7 D0013 : score 7.07415 : H : ARG NH2 B0027 <- 3.08 -> DG O6 D0013 : score 6.2304 : x : MET xxxx B0026 <- 4.10 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0036 <- 3.50 -> DG xxx F0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0037 <- 4.18 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0039 <- 3.90 -> DT xxx F0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0041 <- 3.50 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0042 <- 3.52 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx >5yej_BC:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BIOQ WITH ITS NATUREL DOUBLE-STRANDED DNA OPERATOR organism=Mycobacterium smegmatis : H : ARG NH2 B0027 <- 2.26 -> DG N7 D0013 : score 7.07415 : H : ARG NH2 B0027 <- 3.08 -> DG O6 D0013 : score 6.2304 : H : ARG NE C0027 <- 3.29 -> DG N7 F0029 : score 3.98846 : H : ARG NH2 C0027 <- 3.02 -> DG O6 F0029 : score 6.3096 : x : MET xxxx B0026 <- 4.10 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0036 <- 3.50 -> DG xxx F0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0037 <- 4.18 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0039 <- 3.90 -> DT xxx F0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0041 <- 3.50 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0042 <- 3.52 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0036 <- 3.61 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0037 <- 4.21 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0041 <- 3.49 -> DT xxx F0031 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0042 <- 3.60 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx >5yel_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CTCF ZFS6-11-GB7CSE organism=Homo sapiens : H : ASP OD2 A0451 <- 3.06 -> DC N4 F0021 : score 5.8776 : H : ARG NH1 A0508 <- 2.68 -> DG N7 E0018 : score 6.1952 : H : ARG NH2 A0508 <- 2.50 -> DG O6 E0018 : score 6.996 : H : ARG NH1 A0566 <- 2.87 -> DG N7 F0004 : score 5.9653 : H : ARG NH2 A0566 <- 2.74 -> DG O6 F0004 : score 6.6792 : H : ARG NH2 A0566 <- 2.81 -> DG O6 E0023 : score 6.5868 >5yi2_EF:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF LACTOCOCCUS LACTIS ZITR, WILD TYPE IN COMPLEX WITH DNA organism=Lactococcus lactis subsp. lactis : H : LYS NZ E0070 <- 3.34 -> DG N7 G0010 : score 4.80422 : H : LYS NZ F0070 <- 3.04 -> DG O6 H0010 : score 5.50329 : V : PRO CB E0065 <- 3.86 -> DT C7 H0003 : score 5.71906 : V : PRO CB F0065 <- 3.66 -> DT C7 G0003 : score 6.00937 : V : ALA CB E0067 <- 3.90 -> DT C7 G0011 : score 5.459 : x : SER xxxx E0064 <- 3.46 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0066 <- 3.26 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0069 <- 3.40 -> DT xxx H0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0064 <- 3.47 -> DT xxx H0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0066 <- 3.37 -> DT xxx H0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0067 <- 3.96 -> DT xxx H0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0069 <- 3.55 -> DT xxx G0003 : score x.xxxxx >5yi2_J:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF LACTOCOCCUS LACTIS ZITR, WILD TYPE IN COMPLEX WITH DNA organism=Lactococcus lactis subsp. lactis : H : LYS NZ J0070 <- 3.36 -> DA N7 L0009 : score 2.60822 : H : LYS NZ J0070 <- 2.92 -> DG N7 L0010 : score 5.25664 : H : LYS NZ J0070 <- 2.94 -> DG O6 L0010 : score 5.61891 : V : PRO CB J0065 <- 3.88 -> DT C7 K0003 : score 5.69003 : V : ALA CB J0067 <- 3.75 -> DT C7 L0011 : score 5.66896 : x : SER xxxx J0064 <- 3.52 -> DT xxx L0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0066 <- 3.25 -> DT xxx L0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0069 <- 3.57 -> DT xxx K0003 : score x.xxxxx >5yi3_I:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF LACTOCOCCUS LACTIS ZITR, C30S MUTANT IN COMPLEX WITH DNA organism=Lactococcus lactis subsp. lactis (strain IL1403) / Lactococcus lactis subsp. lactis (strain IL1403) : V : PRO CB I0065 <- 3.51 -> DT C7 L0003 : score 6.2271 : x : SER xxxx I0064 <- 3.35 -> DT xxx K0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0066 <- 2.95 -> DT xxx K0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0067 <- 3.91 -> DT xxx K0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0069 <- 3.57 -> DT xxx L0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0070 <- 3.30 -> DG xxx K0010 : score x.xxxxx >5yi3_IJ:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF LACTOCOCCUS LACTIS ZITR, C30S MUTANT IN COMPLEX WITH DNA organism=Lactococcus lactis subsp. lactis (strain IL1403) / Lactococcus lactis subsp. lactis (strain IL1403) / Lactococcus lactis subsp. lactis (strain IL1403) / Lactococcus lactis subsp. lactis (strain IL1403) : H : LYS NZ J0070 <- 3.26 -> DG N7 L0010 : score 4.89039 : V : PRO CB I0065 <- 3.51 -> DT C7 L0003 : score 6.2271 : V : PRO CB J0065 <- 3.83 -> DT C7 K0003 : score 5.76261 : x : SER xxxx I0064 <- 3.35 -> DT xxx K0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0066 <- 2.95 -> DT xxx K0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0067 <- 3.91 -> DT xxx K0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0069 <- 3.57 -> DT xxx L0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0070 <- 3.30 -> DG xxx K0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0064 <- 3.29 -> DT xxx L0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0066 <- 3.34 -> DT xxx K0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0067 <- 3.94 -> DT xxx L0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0069 <- 3.60 -> DT xxx K0003 : score x.xxxxx >5yiv_C:post-AAA+_oligomerization_domain-like; title=CAULOBACTER CRESCENTUS GCRA DNA-BINDING DOMAIN(DBD) IN COMPLEX WITH METHYLATED DSDNA(CRYSTAL FORM 1) organism=Caulobacter crescentus (strain NA1000 / CB15N) / Caulobacter crescentus (strain NA1000 / CB15N) : H : ARG NH2 C0042 <- 3.02 -> DG N7 J-008 : score 6.10369 : V : HIS CG C0041 <- 3.63 -> DT C7 I0006 : score 3.12643 : x : ARG xxxx C0033 <- 3.61 -> DG xxx I0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0034 <- 3.20 -> DA xxx J-006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0037 <- 3.36 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx >5yiw_A:post-AAA+_oligomerization_domain-like; title=CAULOBACTER CRESCENTUS GCRA DNA-BINDING DOMAIN (DBD) IN COMPLEX WITH METHYLATED DSDNA (CRYSTAL FORM 2) organism=Caulobacter crescentus (strain NA1000 / CB15N) / Caulobacter crescentus (strain NA1000 / CB15N) : H : ARG NH1 A0033 <- 2.92 -> DG N7 D0005 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0033 <- 2.92 -> DG O6 D0005 : score 6.4416 : w : ARG NH2 A0033 <- 5.80 -> DT O4 E-006 : score 2.366 : H : ASN OD1 A0034 <- 3.12 -> DA N6 E-007 : score 5.6364 : w : ASN OD1 A0034 <- 5.46 -> DT O4 E-006 : score 3.132 : H : ARG NH2 A0042 <- 3.12 -> DG N7 E-009 : score 5.976 : V : ILE CG2 A0037 <- 3.85 -> DT C7 D0007 : score 7.00264 : x : HIS xxxx A0041 <- 4.06 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >5yiw_AC:post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like; title=CAULOBACTER CRESCENTUS GCRA DNA-BINDING DOMAIN (DBD) IN COMPLEX WITH METHYLATED DSDNA (CRYSTAL FORM 2) organism=Caulobacter crescentus (strain NA1000 / CB15N) / Caulobacter crescentus (strain NA1000 / CB15N) / Caulobacter crescentus (strain NA1000 / CB15N) / Caulobacter crescentus (strain NA1000 / CB15N) : H : ARG NH1 A0033 <- 2.92 -> DG N7 D0005 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0033 <- 2.92 -> DG O6 D0005 : score 6.4416 : w : ARG NH2 A0033 <- 5.80 -> DT O4 E-006 : score 2.366 : H : ASN OD1 A0034 <- 3.12 -> DA N6 E-007 : score 5.6364 : w : ASN OD1 A0034 <- 5.46 -> DT O4 E-006 : score 3.132 : H : ARG NH2 A0042 <- 3.12 -> DG N7 E-009 : score 5.976 : H : LYS NZ C0026 <- 3.05 -> DA N3 E-004 : score 2.63808 : V : ILE CG2 A0037 <- 3.85 -> DT C7 D0007 : score 7.00264 : x : HIS xxxx A0041 <- 4.06 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >5yj3_CD:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TZAP AND TELOMERIC DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 C0595 <- 2.91 -> DG O6 B0018 : score 5.9495 : H : ARG NH2 C0595 <- 3.19 -> DG N7 B0018 : score 5.88662 : H : ARG NH1 C0611 <- 2.74 -> DT O2 B0016 : score 4.35809 : H : ARG NH2 C0611 <- 3.19 -> DT O2 B0016 : score 3.90313 : H : ARG NH1 C0614 <- 3.06 -> DT O2 A0003 : score 4.08248 : H : ARG NH2 C0614 <- 3.12 -> DT O2 A0003 : score 3.9624 : H : ARG NH1 D0589 <- 2.77 -> DG O6 B0014 : score 6.11983 : H : ARG NH2 D0589 <- 2.87 -> DG N7 B0014 : score 6.29523 : H : HIS NE2 D0592 <- 2.80 -> DG N7 B0013 : score 6.80256 : H : ARG NH1 D0595 <- 3.02 -> DG O6 B0012 : score 5.81567 : H : ARG NH2 D0595 <- 3.09 -> DG N7 B0012 : score 6.01431 : H : ARG NH1 D0611 <- 2.80 -> DT O2 B0010 : score 4.30641 : H : ARG NH1 D0614 <- 2.85 -> DT O2 A0009 : score 4.26335 : x : HIS xxxx C0592 <- 3.31 -> DG xxx B0018 : score x.xxxxx >5yj3_D:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TZAP AND TELOMERIC DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 D0589 <- 2.77 -> DG O6 B0014 : score 6.11983 : H : ARG NH2 D0589 <- 2.87 -> DG N7 B0014 : score 6.29523 : H : HIS NE2 D0592 <- 2.80 -> DG N7 B0013 : score 6.80256 : H : ARG NH1 D0595 <- 3.02 -> DG O6 B0012 : score 5.81567 : H : ARG NH2 D0595 <- 3.09 -> DG N7 B0012 : score 6.01431 : H : ARG NH1 D0611 <- 2.80 -> DT O2 B0010 : score 4.30641 : H : ARG NH1 D0614 <- 2.85 -> DT O2 A0009 : score 4.26335 >5ytc_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH THE UNNATURAL BASE M-FC PAIR WITH DATP IN THE ACTIVE SITE organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.68 -> DC O2 B0109 : score 3.01686 : w : LYS NZ A0540 <- 5.49 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 6.06 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.63 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.57 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 6.09 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.80 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.78 -> DG N3 C0208 : score 3.377 : w : ASN OD1 A0583 <- 6.47 -> DG N2 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.55 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : GLN xxxx A0754 <- 4.49 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >5ytd_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH THE NATURAL BASE PAIR 5FC:DGTP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.78 -> DC O2 B0109 : score 2.95794 : w : LYS NZ A0540 <- 5.66 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 6.05 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.68 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.75 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.71 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.82 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.75 -> DG N3 C0208 : score 3.377 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.42 -> DC O2 B0111 : score 3.208 >5yte_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH WITH NATURAL DT:DATP BASE PAIR organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.89 -> DC O2 B0109 : score 2.89312 : w : LYS NZ A0540 <- 5.54 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 6.07 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.69 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.74 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.63 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.70 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.74 -> DG N3 C0208 : score 3.377 : w : ASN OD1 A0583 <- 6.48 -> DG N2 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.56 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : GLN xxxx A0754 <- 4.38 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >5ytf_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS HOST-GUEST COMPLEX WITH THE UNNATURAL BASE M-FC PAIR WITH DA organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.80 -> DC O2 B0109 : score 2.94615 : w : LYS NZ A0540 <- 5.71 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.96 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.48 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.72 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.74 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.93 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.70 -> DG N3 C0208 : score 3.377 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.46 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : GLN xxxx A0754 <- 4.39 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >5ytg_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS HOST-GUEST COMPLEX WITH THE UNNATURAL BASE I-FC PAIR WITH DA organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.85 -> DC O2 B0109 : score 2.91669 : w : LYS NZ A0540 <- 5.52 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.92 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.66 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.74 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 6.04 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.73 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.72 -> DG N3 C0208 : score 3.377 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.62 -> DC O2 B0111 : score 3.208 >5yth_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS HOST-GUEST COMPLEX WITH THE UNNATURAL BASE M-FC PAIR WITH DG organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.76 -> DC O2 B0109 : score 2.96972 : x : ARG xxxx A0573 <- 3.68 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0580 <- 4.22 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0583 <- 3.27 -> DG xxx B0110 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0754 <- 4.47 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0784 <- 4.15 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >5yur_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE IV - DNA TERNARY COMPLEX 1 organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : w : GLU OE2 A0246 <- 5.67 -> DG N7 B0842 : score 2.669 : w : LYS NZ A0289 <- 6.10 -> DG N7 B0842 : score 2.519 : w : GLU OE2 A0301 <- 6.33 -> DG N7 C0868 : score 2.669 : x : VAL xxxx A0040 <- 3.28 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 3.62 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0056 <- 3.85 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0285 <- 4.28 -> DT xxx C0866 : score x.xxxxx >5yus_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE IV - DNA TERNARY COMPLEX 2 organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : w : GLU OE2 A0246 <- 5.64 -> DG N7 B0842 : score 2.669 : w : THR OG1 A0299 <- 5.80 -> DG N7 C0868 : score 3.422 : x : VAL xxxx A0040 <- 3.31 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 3.47 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0056 <- 3.66 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0242 <- 4.45 -> DT xxx B0844 : score x.xxxxx >5yut_F:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE IV - DNA TERNARY COMPLEX 3 organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : x : VAL xxxx F0040 <- 3.30 -> DA xxx G0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0042 <- 3.48 -> DA xxx G0840 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0056 <- 3.66 -> DA xxx G0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0242 <- 4.47 -> DT xxx G0844 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0246 <- 4.10 -> DG xxx G0841 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0285 <- 4.47 -> DT xxx H0866 : score x.xxxxx >5yuu_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE IV - DNA TERNARY COMPLEX 4 organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : w : GLU OE2 A0246 <- 5.43 -> DG N7 B0842 : score 2.669 : x : VAL xxxx A0040 <- 3.35 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 3.71 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0056 <- 3.73 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0285 <- 4.12 -> DT xxx C0866 : score x.xxxxx >5yuv_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE IV - DNA TERNARY COMPLEX 5 organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : w : GLU OE2 A0246 <- 5.84 -> DG N7 B0842 : score 2.669 : x : VAL xxxx A0040 <- 3.32 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 3.53 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0056 <- 3.79 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0242 <- 4.46 -> DT xxx B0844 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0285 <- 4.28 -> DT xxx C0866 : score x.xxxxx >5yuw_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE IV - DNA TERNARY COMPLEX 6 organism=Escherichia coli K-12 : w : GLU OE2 A0246 <- 5.51 -> DG N7 B0842 : score 2.669 : w : LYS NZ A0289 <- 6.20 -> DG N7 B0842 : score 2.519 : x : VAL xxxx A0040 <- 3.43 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 3.60 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0056 <- 3.79 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0242 <- 4.44 -> DT xxx B0844 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0285 <- 4.11 -> DT xxx C0866 : score x.xxxxx >5yux_F:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE IV - DNA TERNARY COMPLEX 8 organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : w : GLU OE2 F0246 <- 5.79 -> DG N7 G0842 : score 2.669 : x : VAL xxxx F0040 <- 3.26 -> DA xxx G0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0042 <- 3.50 -> DA xxx G0840 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0056 <- 3.72 -> DA xxx G0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0242 <- 4.41 -> DT xxx G0844 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0285 <- 4.05 -> DT xxx H0866 : score x.xxxxx >5yuy_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE IV - DNA TERNARY COMPLEX 9 organism=Escherichia coli K-12 : w : GLU OE2 A0246 <- 5.50 -> DG N7 B0842 : score 2.669 : w : THR OG1 A0299 <- 6.00 -> DG N7 C0868 : score 3.422 : x : VAL xxxx A0040 <- 3.29 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 3.59 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0056 <- 3.65 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0285 <- 4.17 -> DT xxx C0866 : score x.xxxxx >5yuz_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE IV - DNA TERNARY COMPLEX 11 organism=Escherichia coli K-12 : w : GLU OE2 A0246 <- 5.46 -> DG N7 B0842 : score 2.669 : w : THR OG1 A0299 <- 6.35 -> DG N7 C0868 : score 3.422 : x : VAL xxxx A0040 <- 3.33 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 3.65 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0056 <- 3.59 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0285 <- 4.09 -> DT xxx C0866 : score x.xxxxx >5yv0_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE IV - DNA TERNARY COMPLEX 12 organism=Escherichia coli K-12 : x : VAL xxxx A0040 <- 3.37 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 3.80 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0056 <- 3.75 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0242 <- 4.48 -> DT xxx B0844 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0246 <- 4.19 -> DG xxx B0841 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0285 <- 4.12 -> DT xxx C0866 : score x.xxxxx >5yv1_F:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE IV - DNA TERNARY COMPLEX 13 organism=Escherichia coli K-12 : H : SER OG F0042 <- 2.93 -> DT O2 H0874 : score 3.6013 : w : GLU OE2 F0246 <- 6.02 -> DG N7 G0842 : score 2.669 : w : GLN OE1 F0297 <- 6.51 -> DG N7 H0869 : score 2.87 : V : SER CB F0055 <- 3.79 -> DT C7 H0874 : score 3.13911 : x : PHE xxxx F0013 <- 4.27 -> DT xxx H0874 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0040 <- 3.27 -> DA xxx G0840 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0056 <- 3.65 -> DA xxx G0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0242 <- 4.50 -> DT xxx G0844 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0285 <- 3.97 -> DT xxx H0866 : score x.xxxxx >5yv2_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE IV - DNA TERNARY COMPLEX 14 organism=Escherichia coli K-12 : H : SER OG A0042 <- 3.07 -> DT O2 C0874 : score 3.49777 : w : GLU OE2 A0246 <- 5.70 -> DG N7 B0842 : score 2.669 : V : SER CB A0055 <- 3.83 -> DT C7 C0874 : score 3.1078 : x : PHE xxxx A0013 <- 4.34 -> DT xxx C0874 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0040 <- 3.37 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0056 <- 3.72 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0285 <- 4.37 -> DT xxx C0866 : score x.xxxxx >5yv3_F:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE IV - DNA TERNARY COMPLEX 7 organism=Escherichia coli K-12 : w : GLU OE2 F0246 <- 5.70 -> DG N7 G0842 : score 2.669 : w : LYS NZ F0289 <- 6.57 -> DG N7 G0842 : score 2.519 : x : VAL xxxx F0040 <- 3.22 -> DA xxx G0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0042 <- 3.57 -> DA xxx G0840 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0056 <- 3.70 -> DA xxx G0840 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0285 <- 3.99 -> DT xxx H0866 : score x.xxxxx >5yws_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TREX1 IN COMPLEX WITH A Y STRUCTURED DNA organism=Mus musculus : w : ASN ND2 A0125 <- 5.85 -> DA N3 C0020 : score 2.277 : H : ARG NH1 A0128 <- 3.06 -> DG N3 C0005 : score 2.89383 : w : ARG NH2 A0128 <- 5.32 -> DC O2 C0019 : score 1.669 : w : ARG NH2 A0128 <- 5.53 -> DA N3 C0020 : score 2.092 >5ywt_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TREX1 IN COMPLEX WITH A DUPLEX DNA WITH 3' OVERHANG organism=Mus musculus : w : SER OG A0078 <- 5.20 -> DT O2 C0009 : score 1.55 : w : ASN OD1 A0125 <- 6.15 -> DC O2 C0007 : score 2.172 : x : LEU xxxx A0024 <- 3.38 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0025 <- 3.81 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0081 <- 4.04 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0084 <- 3.77 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 3.24 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0129 <- 3.42 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0157 <- 3.27 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0160 <- 4.02 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0195 <- 4.22 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0218 <- 4.49 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >5ywu_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TREX1 IN COMPLEX WITH A INOSINE CONTAINED DSDNA organism=Mus musculus : H : ASN ND2 A0125 <- 2.29 -> DC O2 C0021 : score 4.93639 : x : LEU xxxx A0024 <- 3.53 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0025 <- 3.42 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0026 <- 3.16 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 3.28 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0129 <- 3.41 -> DI xxx C0022 : score x.xxxxx >5yx2_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNMT3A-DNMT3L IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING TWO CPG SITES organism=HOMO SAPIENS : w : ASN OD1 A0717 <- 5.98 -> DG N2 F0428 : score 2.566 : w : THR OG1 A0834 <- 5.53 -> DG N7 F0428 : score 3.422 : w : ARG NE A0836 <- 5.57 -> DG N7 F0428 : score 1.593 : x : ILE xxxx A0715 <- 3.38 -> DA xxx E0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0716 <- 3.57 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0718 <- 3.62 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0837 <- 3.89 -> DG xxx E0438 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0838 <- 4.08 -> DA xxx E0439 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0883 <- 4.28 -> DA xxx E0437 : score x.xxxxx >5yx2_AD:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNMT3A-DNMT3L IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING TWO CPG SITES organism=HOMO SAPIENS : w : ASN OD1 A0717 <- 5.98 -> DG N2 F0428 : score 2.566 : w : THR OG1 A0834 <- 5.53 -> DG N7 F0428 : score 3.422 : w : ARG NE A0836 <- 5.57 -> DG N7 F0428 : score 1.593 : w : THR OG1 D0834 <- 6.06 -> DG N7 E0428 : score 3.422 : w : ARG NE D0836 <- 6.04 -> DG N7 E0428 : score 1.593 : w : SER OG D0837 <- 6.02 -> DA N7 F0439 : score 2.343 : x : ILE xxxx A0715 <- 3.38 -> DA xxx E0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0716 <- 3.57 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0718 <- 3.62 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0837 <- 3.89 -> DG xxx E0438 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0838 <- 4.08 -> DA xxx E0439 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0883 <- 4.28 -> DA xxx E0437 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0715 <- 3.50 -> DA xxx F0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0716 <- 3.43 -> DG xxx F0442 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0717 <- 4.48 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0718 <- 3.33 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0835 <- 4.32 -> DT xxx E0429 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0838 <- 3.70 -> DA xxx F0439 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0883 <- 3.97 -> DA xxx F0437 : score x.xxxxx >5yyd_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE IV - TERNARY COMPLEX 15 organism=ESCHERICHIA COLI : w : GLU OE2 A0246 <- 6.02 -> DG N7 B0842 : score 2.669 : w : LYS NZ A0289 <- 6.22 -> DG N7 B0842 : score 2.519 : x : SER xxxx A0242 <- 4.44 -> DT xxx B0844 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0285 <- 4.44 -> DT xxx C0866 : score x.xxxxx >5yye_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE IV - TERNARY COMPLEX 16 organism=? : w : GLU OE2 A0246 <- 5.41 -> DG N7 B0842 : score 2.669 : x : ARG xxxx A0285 <- 4.15 -> DT xxx C0866 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0299 <- 4.38 -> DG xxx C0868 : score x.xxxxx >5yzy_C:DNA-binding_pseudobarrel_domain; title=ATVAL1 B3 DOMAIN IN COMPLEX WITH 13BP-DNA organism=Arabidopsis thaliana : H : ARG NH1 C0309 <- 3.33 -> DG O6 A0294 : score 5.4385 : H : ARG NH2 C0309 <- 2.53 -> DG N7 A0294 : score 6.72938 : H : ASN OD1 C0351 <- 2.74 -> DC N4 B0005 : score 4.24391 : x : SER xxxx C0302 <- 3.80 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0307 <- 4.07 -> DT xxx A0293 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0311 <- 4.11 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0349 <- 3.39 -> DC xxx A0295 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0352 <- 3.84 -> DG xxx A0298 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0356 <- 3.32 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx >5yzz_C:DNA-binding_pseudobarrel_domain; title=ATVAL1 B3 DOMAIN IN COMPLEX WITH 13BP-DNA organism=Arabidopsis thaliana : H : ARG NH1 C0309 <- 3.12 -> DG N7 A0006 : score 5.6628 : H : ARG NH2 C0309 <- 3.29 -> DG N7 A0006 : score 5.75892 : H : ARG NH2 C0309 <- 2.99 -> DG O6 A0006 : score 6.3492 : H : ASN OD1 C0351 <- 2.99 -> DC N4 B0005 : score 4.03423 : x : SER xxxx C0302 <- 3.72 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0307 <- 4.22 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0311 <- 4.24 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0349 <- 3.49 -> DC xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0352 <- 3.56 -> DG xxx A0010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0356 <- 3.36 -> DA xxx B0006 : score x.xxxxx >5z00_K:DNA-binding_pseudobarrel_domain; title=ATVAL1 B3 DOMAIN IN COMPLEX WITH 15BP-DNA organism=Arabidopsis thaliana : H : ARG NH1 K0309 <- 3.32 -> DG N7 I0294 : score 5.4208 : H : ASN OD1 K0351 <- 2.92 -> DC N4 J0005 : score 4.09294 : H : ASN ND2 K0351 <- 3.28 -> DT O4 I0297 : score 4.77729 : x : SER xxxx K0302 <- 3.76 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx K0307 <- 4.36 -> DT xxx I0293 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx K0311 <- 4.43 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx K0349 <- 3.50 -> DC xxx I0295 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx K0352 <- 4.17 -> DT xxx I0297 : score x.xxxxx : x : MET xxxx K0356 <- 3.15 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx >5z23_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING A CHIMERIC HISTONE H3/CENP-A CATD organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.48 -> DA N3 J0229 : score 3.44709 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.74 -> DA N3 I0082 : score 3.27862 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.55 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.93 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.79 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.28 -> DG xxx J0268 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.48 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.96 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.41 -> DT xxx I0080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.19 -> DT xxx I0130 : score x.xxxxx >5z23_C:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING A CHIMERIC HISTONE H3/CENP-A CATD organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx C0042 <- 3.79 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx >5z2t_C:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA-BOUND DUX4-HD2 organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 C0055 <- 2.78 -> DA N6 E0010 : score 6.04588 : H : ASN ND2 C0055 <- 3.12 -> DA N7 E0010 : score 5.4948 : x : ILE xxxx C0051 <- 3.38 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0054 <- 4.18 -> DA xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0059 <- 2.93 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx >5z2t_CD:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA-BOUND DUX4-HD2 organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 C0055 <- 2.78 -> DA N6 E0010 : score 6.04588 : H : ASN ND2 C0055 <- 3.12 -> DA N7 E0010 : score 5.4948 : H : ARG NH1 D0059 <- 3.00 -> DA N7 E0004 : score 2.45785 : V : ILE CG1 D0051 <- 3.72 -> DT C7 E0006 : score 5.05815 : x : ILE xxxx C0051 <- 3.38 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0054 <- 4.18 -> DA xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0059 <- 2.93 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0054 <- 4.07 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0055 <- 2.87 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx >5z30_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING A CANCER- ASSOCIATED HISTONE H2A.Z R80C MUTANT organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0040 <- 3.27 -> DA N3 J0229 : score 3.33594 : H : ARG NH1 D0033 <- 3.14 -> DC O2 I0026 : score 3.4018 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.92 -> DA N3 I0082 : score 3.16199 : w : ARG NH1 G0045 <- 6.45 -> DT O2 J0184 : score 1.855 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.77 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.97 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.96 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0019 <- 4.50 -> DA xxx I0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0045 <- 4.03 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.84 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.35 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.17 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 2.53 -> DG xxx I0122 : score x.xxxxx >5z30_E:Histone-fold; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING A CANCER- ASSOCIATED HISTONE H2A.Z R80C MUTANT organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 E0040 <- 2.92 -> DA N3 I0082 : score 3.16199 : x : LEU xxxx E0065 <- 3.84 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.35 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx >5z3l_O:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF SNF2-NUCLEOSOME COMPLEX IN APO STATE organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : GLU xxxx O0874 <- 3.10 -> DG xxx J0055 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx O1049 <- 3.32 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx O1052 <- 3.97 -> DT xxx J0051 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx O1138 <- 4.16 -> DT xxx J0057 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx O1185 <- 4.40 -> DA xxx I0097 : score x.xxxxx >5z3n_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF LARGE FRAGMENT OF DNA POLYMERASE I FROM THERMUS AQUATICUS HOST-GUEST COMPLEX WITH THE UNNATURAL BASE 5FC PAIR WITH DA organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.77 -> DC O2 B0109 : score 2.96383 : w : LYS NZ A0540 <- 5.80 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.73 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.56 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.79 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.84 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.74 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN OD1 A0583 <- 5.88 -> DG N3 C0208 : score 3.377 : w : ASN OD1 A0583 <- 6.85 -> DC O2 C0209 : score 2.172 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.51 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : GLN xxxx A0754 <- 4.34 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >5z3o_D:Histone-fold; title=STRUCTURE OF SNF2-NUCLEOSOME COMPLEX IN ADP STATE organism=? : x : ARG xxxx D0030 <- 4.10 -> DC xxx I0123 : score x.xxxxx >5z3v_E:Histone-fold; title=STRUCTURE OF SNF2-NUCLEOSOME COMPLEX AT SHL-2 IN ADP BEFX STATE organism=? : H : ARG NH2 E0040 <- 3.24 -> DT O2 J0083 : score 3.8608 >5z6w_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF PAFAN1 BOUND TO 2NT 5'FLAP DNA WITH GAP WITH MANGANESE organism=? : x : TYR xxxx A0021 <- 3.30 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0191 <- 3.98 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0192 <- 3.41 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0195 <- 3.54 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0197 <- 3.78 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0198 <- 4.39 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx >5z6z_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DUX4 HOMEODOMAINS BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0020 <- 3.20 -> DA N3 D0007 : score 3.38749 : H : ARG NH1 A0020 <- 2.93 -> DT O2 E0014 : score 4.19444 : H : ARG NH1 A0023 <- 2.96 -> DT O2 D0005 : score 4.16861 : H : ARG NH2 A0023 <- 3.20 -> DT O2 D0005 : score 3.89467 : w : ARG NH1 A0023 <- 5.61 -> DA N3 E0015 : score 2.585 : w : GLN OE1 A0068 <- 5.96 -> DC N4 D0008 : score 3.488 : H : ASN OD1 A0069 <- 2.94 -> DA N6 D0007 : score 5.85318 : H : ASN ND2 A0069 <- 2.98 -> DA N7 D0007 : score 5.65917 : w : ASN OD1 A0069 <- 6.29 -> DG O6 E0012 : score 3.125 : w : ARG NH2 A0071 <- 6.37 -> DA N7 E0010 : score 1.486 : w : SER OG A0072 <- 5.85 -> DG O6 E0012 : score 2.749 : H : ARG NH1 A0095 <- 3.21 -> DC O2 D0014 : score 3.3507 : w : ARG NH1 A0095 <- 6.65 -> DG N2 E0006 : score 1.082 : w : ARG NH2 A0095 <- 5.90 -> DT O2 E0008 : score 2.261 : H : ARG NH1 A0098 <- 3.13 -> DT O2 E0005 : score 4.02219 : w : GLN OE1 A0143 <- 5.93 -> DT O4 E0008 : score 3.068 : H : ASN OD1 A0144 <- 2.79 -> DA N6 E0007 : score 6.03384 : H : ASN ND2 A0144 <- 3.04 -> DA N7 E0007 : score 5.58873 : w : ASN OD1 A0144 <- 6.06 -> DT O4 E0008 : score 3.132 : H : ARG NH2 A0148 <- 3.04 -> DG O6 E0006 : score 6.2832 : x : ILE xxxx A0065 <- 3.82 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0140 <- 3.87 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx >5z7d_C:HIN-2000_domain-like; title=P204HINAB-DSDNA COMPLEX STRUCTURE organism=Mus musculus : x : ARG xxxx C0320 <- 4.07 -> DT xxx L0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0518 <- 3.10 -> DC xxx K0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0522 <- 4.46 -> DC xxx K0002 : score x.xxxxx >5z7i_AC:post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like; title=CAULOBACTER CRESCENTUS GCRA DNA-BINDING DOMAIN(DBD)IN COMPLEX WITH UNMETHYLATED DSDNA organism=Caulobacter crescentus (strain NA1000 / CB15N) / Caulobacter crescentus (strain NA1000 / CB15N) / Caulobacter crescentus (strain NA1000 / CB15N) / Caulobacter crescentus (strain NA1000 / CB15N) : H : ARG NH1 A0033 <- 2.87 -> DG N7 D0005 : score 5.9653 : H : ARG NH2 A0033 <- 2.80 -> DG O6 D0005 : score 6.6 : w : ARG NH2 A0033 <- 5.43 -> DT O4 E0007 : score 2.366 : H : ASN OD1 A0034 <- 3.25 -> DA N6 E0006 : score 5.47983 : H : ARG NH2 A0042 <- 3.15 -> DG N7 E0004 : score 5.93769 : H : LYS NZ C0026 <- 3.13 -> DA N3 E0009 : score 2.59365 : V : ILE CG2 A0037 <- 3.85 -> DT C7 D0007 : score 7.00264 A : x : HIS xxxx A0041 <- 4.18 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >5z7i_C:post-AAA+_oligomerization_domain-like; title=CAULOBACTER CRESCENTUS GCRA DNA-BINDING DOMAIN(DBD)IN COMPLEX WITH UNMETHYLATED DSDNA organism=Caulobacter crescentus (strain NA1000 / CB15N) / Caulobacter crescentus (strain NA1000 / CB15N) : H : LYS NZ C0026 <- 3.13 -> DA N3 E0009 : score 2.59365 : w : LYS NZ C0026 <- 6.01 -> DG N2 D0005 : score 0.846 >5zad_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=HUMAN TOPOISOMERASE II BETA IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0505 <- 3.48 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0779 <- 4.17 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0872 <- 3.45 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0877 <- 4.22 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx >5zbx_A:Histone-fold; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING HISTONE H3.1 CATD(V76Q, K77D) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.78 -> DA N3 J0229 : score 3.2527 : x : LEU xxxx A0065 <- 4.32 -> DT xxx J0237 : score x.xxxxx >5zbx_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING HISTONE H3.1 CATD(V76Q, K77D) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.78 -> DA N3 J0229 : score 3.2527 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.43 -> DA N3 I0082 : score 3.21811 : x : LEU xxxx A0065 <- 4.32 -> DT xxx J0237 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.85 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 3.27 -> DT xxx J0264 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.08 -> DT xxx I0037 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.31 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0035 <- 4.36 -> DG xxx I0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.17 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.83 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >5zcw_B:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=STRUCTURE OF THE METHANOSARCINA MAZEI CLASS II CPD-PHOTOLYASE IN COMPLEX WITH INTACT, PHOSPHODIESTER LINKED, CPD-LESION organism=Methanosarcina mazei : H : ARG NH1 B0450 <- 2.71 -> DG O6 E0011 : score 6.19283 : x : ARG xxxx B0429 <- 3.69 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0431 <- 3.36 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0441 <- 3.98 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx >5zd4_AB:Periplasmic_binding_protein-like_II; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MBP-FUSED BIL1/BZR1 IN COMPLEX WITH DOUBLE- STRANDED DNA organism=ESCHERICHIA COLI O157:H7, ARABIDOPSIS THALIANA : H : ARG NH1 A0041 <- 3.33 -> DG N7 E0004 : score 5.4087 : H : ARG NH2 B0041 <- 2.46 -> DG N7 F0004 : score 6.81877 : x : ASN xxxx A0033 <- 4.13 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0037 <- 3.48 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 4.16 -> DA xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0033 <- 4.25 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0037 <- 3.46 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0040 <- 4.21 -> DA xxx E0000 : score x.xxxxx >5zd4_C:Periplasmic_binding_protein-like_II; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MBP-FUSED BIL1/BZR1 IN COMPLEX WITH DOUBLE- STRANDED DNA organism=ESCHERICHIA COLI O157:H7, ARABIDOPSIS THALIANA : w : ARG NH2 C0023 <- 5.79 -> DT O4 G-002 : score 2.366 : w : GLU OE1 C0037 <- 5.51 -> DA N6 G0002 : score 2.939 : H : ARG NH1 C0041 <- 3.19 -> DG N7 H0004 : score 5.5781 : w : ARG NH1 C0041 <- 5.40 -> DG O6 H0004 : score 2.756 : x : GLU xxxx C0029 <- 3.91 -> DT xxx G-002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0033 <- 4.13 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0036 <- 3.74 -> DC xxx G-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0040 <- 3.75 -> DA xxx G0000 : score x.xxxxx >5zd4_CD:Periplasmic_binding_protein-like_II; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MBP-FUSED BIL1/BZR1 IN COMPLEX WITH DOUBLE- STRANDED DNA organism=ESCHERICHIA COLI O157:H7, ARABIDOPSIS THALIANA : w : ARG NH2 C0023 <- 6.47 -> DG O6 H0008 : score 2.468 : w : GLU OE1 C0037 <- 5.51 -> DA N6 G0002 : score 2.939 : H : ARG NH1 C0041 <- 3.19 -> DG N7 H0004 : score 5.5781 : w : ARG NH1 D0036 <- 5.79 -> DA N7 H0000 : score 0.388 : w : GLU OE1 D0037 <- 5.74 -> DA N6 H0002 : score 2.939 : w : GLU OE2 D0037 <- 5.66 -> DA N7 H0000 : score 1.687 : H : ARG NH1 D0041 <- 3.15 -> DG N7 G0004 : score 5.6265 : w : ARG NH1 D0041 <- 5.37 -> DG O6 G0004 : score 2.756 : x : GLU xxxx C0029 <- 3.91 -> DT xxx G-002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0033 <- 4.13 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0036 <- 3.74 -> DC xxx G-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0040 <- 3.75 -> DA xxx G0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0023 <- 3.89 -> DT xxx H-002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0029 <- 3.81 -> DT xxx H-002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0033 <- 3.98 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0040 <- 3.75 -> DA xxx H0000 : score x.xxxxx >5zdz_C: title=HAIRPIN FORMING COMPLEX, RAG1/2-NICKED 12RSS/23RSS COMPLEX IN CA2+ organism=? : H : ASN OD1 C0443 <- 3.08 -> DG N2 M0042 : score 4.5312 : H : ASN ND2 C0852 <- 2.95 -> DG O6 G0039 : score 5.46931 : w : SER OG C0963 <- 6.48 -> DT O2 G0040 : score 1.55 : H : LYS NZ C0966 <- 3.24 -> DG N3 G0039 : score 1.32591 : x : ASN xxxx C0850 <- 4.23 -> DT xxx G0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0855 <- 3.26 -> DA xxx M0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0959 <- 3.07 -> DA xxx M0018 : score x.xxxxx >5ze0_CN:Galactose_oxidase,_central_domain; title=HAIRPIN FORMING COMPLEX, RAG1/2-NICKED(WITH DIDEOXY) 12RSS/23RSS COMPLEX IN MG2+ organism=MUS MUSCULUS : H : ASN OD1 C0443 <- 3.14 -> DG N2 M0042 : score 4.4736 : w : ASN OD1 C0850 <- 6.18 -> DT O4 G0040 : score 3.132 : H : ASN OD1 C0852 <- 2.99 -> DA N6 M0018 : score 5.79297 : H : ASN ND2 C0852 <- 3.01 -> DG O6 G0039 : score 5.40165 : H : SER OG C0963 <- 3.41 -> DT O2 G0040 : score 3.24635 : w : SER OG C0963 <- 6.14 -> DT O2 G0040 : score 1.55 : w : LYS NZ C0966 <- 5.52 -> DT O2 G0038 : score 0.522 : x : ARG xxxx C0855 <- 3.20 -> DA xxx M0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0959 <- 3.02 -> DA xxx M0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx N0016 <- 4.09 -> DA xxx M0047 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx N0038 <- 2.92 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx N0042 <- 3.43 -> DG xxx M0046 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx N0102 <- 3.80 -> DT xxx G0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx N0103 <- 3.03 -> DA xxx M0034 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx N0122 <- 3.68 -> DA xxx G0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx N0126 <- 3.32 -> DC xxx G0023 : score x.xxxxx >5zen_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TOPOISOMERASE II BETA IN COMPLEX WITH DNA: A NEW QUATERNARY CONFORMATION SHOWING OPENING OF THE PROTEIN-LINKED DNA-GATE organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0505 <- 3.30 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0779 <- 4.05 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0872 <- 3.33 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0877 <- 4.09 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx >5zfw_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DUX4 HOMEODOMAINS BOUND TO A11G DNA MUTANT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0020 <- 3.13 -> DA N3 D0007 : score 3.43904 : H : ARG NH1 A0020 <- 3.10 -> DT O2 E0014 : score 4.04803 : w : ARG NH1 A0020 <- 6.51 -> DA N3 D0006 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0020 <- 6.05 -> DT O2 E0013 : score 2.261 : H : ARG NH1 A0023 <- 2.60 -> DT O2 D0005 : score 4.47867 : H : ARG NH2 A0023 <- 3.08 -> DT O2 D0005 : score 3.99627 : w : ARG NH1 A0023 <- 5.79 -> DA N3 E0015 : score 2.585 : H : ASN OD1 A0069 <- 3.00 -> DA N6 D0007 : score 5.78092 : H : ASN ND2 A0069 <- 3.07 -> DA N7 D0007 : score 5.55351 : w : ASN OD1 A0069 <- 5.51 -> DG O6 E0012 : score 3.125 : H : ARG NH1 A0095 <- 3.14 -> DC O2 D0014 : score 3.4018 : H : ARG NH1 A0095 <- 3.33 -> DA N3 E0007 : score 3.29175 : w : ARG NH2 A0095 <- 5.33 -> DT O2 E0008 : score 2.261 : H : ARG NH1 A0098 <- 3.05 -> DT O2 E0005 : score 4.09109 : H : ARG NH2 A0098 <- 2.99 -> DT O2 E0005 : score 4.07247 : w : GLN OE1 A0143 <- 5.83 -> DT O4 D0010 : score 3.068 : w : GLN OE1 A0143 <- 6.39 -> DT O4 E0008 : score 3.068 : w : ASN ND2 A0144 <- 5.65 -> DA N6 D0012 : score 2.5 : H : ARG NH1 A0148 <- 3.02 -> DG N7 E0006 : score 5.7838 : H : ARG NH2 A0148 <- 3.18 -> DT O4 D0013 : score 3.28375 : H : ARG NH2 A0148 <- 2.63 -> DG O6 E0006 : score 6.8244 : V : GLN CG A0143 <- 3.85 -> DT C7 D0010 : score 3.21469 : x : ILE xxxx A0065 <- 3.82 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0068 <- 4.41 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0072 <- 3.71 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0140 <- 3.80 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx >5zfy_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DUX4 HOMEODOMAINS BOUND TO A12C DNA MUTANT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0020 <- 3.17 -> DA N3 D0007 : score 3.40958 : w : ARG NH1 A0020 <- 6.60 -> DA N3 D0006 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0020 <- 5.77 -> DT O2 E0013 : score 2.261 : H : ARG NH1 A0023 <- 2.67 -> DT O2 D0005 : score 4.41838 : H : ARG NH2 A0023 <- 3.22 -> DT O2 D0005 : score 3.87773 : w : ARG NH1 A0023 <- 5.66 -> DA N3 E0015 : score 2.585 : w : GLN OE1 A0068 <- 6.27 -> DC N4 D0009 : score 3.488 : w : GLN OE1 A0068 <- 6.25 -> DC N4 D0008 : score 3.488 : H : ASN OD1 A0069 <- 3.03 -> DA N6 D0007 : score 5.74479 : H : ASN ND2 A0069 <- 2.96 -> DA N7 D0007 : score 5.68266 : w : ASN OD1 A0069 <- 5.50 -> DG O6 E0012 : score 3.125 : w : ASN OD1 A0069 <- 6.25 -> DG O6 E0011 : score 3.125 : w : ARG NH2 A0071 <- 6.13 -> DA N7 E0010 : score 1.486 : w : SER OG A0072 <- 5.56 -> DG O6 E0012 : score 2.749 : H : ARG NH1 A0095 <- 2.97 -> DC O2 D0014 : score 3.5259 : w : ARG NH2 A0095 <- 5.66 -> DG N3 E0008 : score 0.677 : H : ARG NH1 A0098 <- 2.91 -> DT O2 E0005 : score 4.21167 : H : ARG NH2 A0098 <- 3.12 -> DT O2 E0005 : score 3.9624 : w : GLN OE1 A0143 <- 5.89 -> DA N6 D0011 : score 3.392 : w : GLN OE1 A0143 <- 6.52 -> DT O4 E0009 : score 3.068 : H : ASN OD1 A0144 <- 2.80 -> DA N6 E0007 : score 6.02179 : H : ASN ND2 A0144 <- 2.97 -> DA N7 E0007 : score 5.67092 : w : ASN OD1 A0144 <- 5.71 -> DC N4 D0012 : score 2.732 : w : ASN OD1 A0144 <- 5.75 -> DG O6 E0008 : score 3.125 : H : ARG NH1 A0148 <- 3.12 -> DG N7 E0006 : score 5.6628 : H : ARG NH2 A0148 <- 2.59 -> DG O6 E0006 : score 6.8772 : x : ILE xxxx A0065 <- 3.83 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0140 <- 4.04 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx >5zfz_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DUX4 HOMEODOMAINS BOUND TO A12T DNA MUTANT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0020 <- 3.12 -> DA N3 D0007 : score 3.4464 : H : ARG NH1 A0020 <- 3.07 -> DT O2 E0014 : score 4.07386 : w : ARG NH1 A0020 <- 6.03 -> DA N3 D0006 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0020 <- 5.70 -> DT O2 E0013 : score 2.261 : H : ARG NH1 A0023 <- 2.73 -> DT O2 D0005 : score 4.3667 : H : ARG NH2 A0023 <- 3.15 -> DT O2 D0005 : score 3.937 : w : ARG NH1 A0023 <- 5.62 -> DA N3 E0015 : score 2.585 : w : GLN OE1 A0068 <- 5.90 -> DC N4 D0009 : score 3.488 : w : GLN OE1 A0068 <- 6.09 -> DC N4 D0008 : score 3.488 : H : ASN OD1 A0069 <- 3.08 -> DA N6 D0007 : score 5.68457 : H : ASN ND2 A0069 <- 3.09 -> DA N7 D0007 : score 5.53002 : w : ASN OD1 A0069 <- 6.69 -> DA N6 D0006 : score 2.837 : w : ASN OD1 A0069 <- 5.50 -> DG O6 E0012 : score 3.125 : w : ASN OD1 A0069 <- 6.26 -> DG O6 E0011 : score 3.125 : w : ARG NH2 A0071 <- 5.95 -> DA N7 E0010 : score 1.486 : w : SER OG A0072 <- 5.12 -> DG N7 E0012 : score 2.749 : H : ARG NH1 A0095 <- 3.08 -> DC O2 D0014 : score 3.4456 : w : ARG NH2 A0095 <- 5.97 -> DA N3 E0008 : score 2.092 : H : ARG NH1 A0098 <- 2.93 -> DT O2 E0005 : score 4.19444 : H : ARG NH2 A0098 <- 2.90 -> DT O2 E0005 : score 4.14867 : w : GLN OE1 A0143 <- 5.87 -> DT O4 D0010 : score 3.068 : H : ASN OD1 A0144 <- 2.97 -> DA N6 E0007 : score 5.81705 : H : ASN ND2 A0144 <- 3.03 -> DA N7 E0007 : score 5.60047 : w : ASN OD1 A0144 <- 5.67 -> DT O4 D0012 : score 3.132 : H : ARG NH1 A0148 <- 2.99 -> DG N7 E0006 : score 5.8201 : H : ARG NH2 A0148 <- 2.62 -> DG O6 E0006 : score 6.8376 : w : ARG NE A0148 <- 5.88 -> DT O4 D0013 : score 1.317 : V : ALA CB A0147 <- 3.74 -> DT C7 D0012 : score 5.68296 : x : ILE xxxx A0065 <- 3.85 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0140 <- 4.07 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx >5zg9_A:ssDNA-binding_transcriptional_regulator_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MOSUB1-SSDNA COMPLEX IN PHOSPHATE BUFFER organism=MAGNAPORTHE ORYZAE (STRAIN P131) / MAGNAPORTHE ORYZAE (STRAIN P131) : w : ASP OD2 A0042 <- 5.84 -> DT O4 C0010 : score 2.798 : H : SER OG A0060 <- 2.85 -> DT O2 C0011 : score 3.66046 : w : ASN OD1 A0069 <- 6.38 -> DT N3 C0010 : score 1.666 : w : ARG NE A0071 <- 6.02 -> DT O2 C0010 : score 0.757 : w : ARG NH2 A0071 <- 5.91 -> DT O2 C0010 : score 2.261 : H : LYS NZ A0084 <- 3.12 -> DT O2 C0008 : score 3.3576 : V : PHE CZ A0062 <- 3.59 -> DT C7 C0011 : score 7.4884 : V : PHE CZ A0067 <- 3.68 -> DT C7 C0012 : score 7.32832 : x : LYS xxxx A0063 <- 3.96 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0065 <- 3.30 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0073 <- 3.77 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0074 <- 3.33 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0082 <- 3.86 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >5zg9_AB:ssDNA-binding_transcriptional_regulator_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MOSUB1-SSDNA COMPLEX IN PHOSPHATE BUFFER organism=MAGNAPORTHE ORYZAE (STRAIN P131) / MAGNAPORTHE ORYZAE (STRAIN P131) / MAGNAPORTHE ORYZAE (STRAIN P131) / MAGNAPORTHE ORYZAE (STRAIN P131) : w : ASP OD2 A0042 <- 5.84 -> DT O4 C0010 : score 2.798 : H : SER OG A0060 <- 2.85 -> DT O2 C0011 : score 3.66046 : w : ASN OD1 A0069 <- 6.38 -> DT N3 C0010 : score 1.666 : w : ARG NE A0071 <- 6.02 -> DT O2 C0010 : score 0.757 : w : ARG NH2 A0071 <- 5.91 -> DT O2 C0010 : score 2.261 : H : LYS NZ A0084 <- 3.12 -> DT O2 C0008 : score 3.3576 : V : PHE CZ A0062 <- 3.59 -> DT C7 C0011 : score 7.4884 : V : PHE CZ A0067 <- 3.68 -> DT C7 C0012 : score 7.32832 : x : LYS xxxx A0063 <- 3.96 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0065 <- 3.30 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0073 <- 3.77 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0074 <- 3.33 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0082 <- 3.86 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0062 <- 3.93 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx >5zgn_ABDE:Ribbon-helix-helix; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF KACTA-DNA COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 A0008 <- 3.14 -> DG N7 H0020 : score 5.6386 : H : ARG NH2 A0008 <- 2.87 -> DG O6 H0020 : score 6.5076 : H : ASP OD1 A0010 <- 3.00 -> DC N4 H0018 : score 5.13108 : w : ASP OD2 A0010 <- 5.66 -> DA N7 H0017 : score 2.024 : w : ARG NH1 A0012 <- 6.20 -> DG N7 G0010 : score 2.063 : H : ARG NH1 B0008 <- 2.76 -> DG N7 G0009 : score 6.0984 : H : ARG NH2 B0008 <- 2.94 -> DG O6 G0009 : score 6.4152 : H : ASP OD2 B0010 <- 3.28 -> DC N4 G0008 : score 5.6048 : H : ARG NE B0012 <- 2.83 -> DG N7 G0005 : score 4.39526 : H : ARG NH2 B0012 <- 2.92 -> DG O6 G0005 : score 6.4416 : H : ARG NH1 D0008 <- 3.23 -> DG N7 G0020 : score 5.5297 : H : ARG NH2 D0008 <- 2.97 -> DG O6 G0020 : score 6.3756 : H : ASP OD1 D0010 <- 3.16 -> DC N4 G0018 : score 4.96004 : H : ARG NH1 E0008 <- 2.87 -> DG O6 H0009 : score 5.99817 : H : ARG NH2 E0008 <- 2.66 -> DG N7 H0009 : score 6.56338 : H : ASP OD2 E0010 <- 3.16 -> DC N4 H0008 : score 5.7536 : H : ARG NE E0012 <- 2.83 -> DG N7 H0005 : score 4.39526 : H : ARG NH2 E0012 <- 2.87 -> DG O6 H0005 : score 6.5076 : x : ARG xxxx D0012 <- 3.39 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx >5zgn_E:Ribbon-helix-helix; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF KACTA-DNA COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 E0008 <- 2.87 -> DG O6 H0009 : score 5.99817 : H : ARG NH2 E0008 <- 2.66 -> DG N7 H0009 : score 6.56338 : H : ASP OD2 E0010 <- 3.16 -> DC N4 H0008 : score 5.7536 : H : ARG NE E0012 <- 2.83 -> DG N7 H0005 : score 4.39526 : H : ARG NH2 E0012 <- 2.87 -> DG O6 H0005 : score 6.5076 >5zjq_A:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF ABDB/EXD COMPLEX BOUND TO A 'RED14' DNA SEQUENCE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NE A0023 <- 3.01 -> DA N3 C0008 : score 2.01426 : H : ARG NH2 A0023 <- 3.16 -> DA N3 C0008 : score 3.00648 : w : GLN OE1 A0068 <- 5.64 -> DT O4 D0011 : score 3.068 : w : GLN NE2 A0068 <- 5.71 -> DT O4 C0002 : score 2.257 : H : ASN OD1 A0069 <- 2.91 -> DA N6 D0010 : score 5.88932 : H : ASN ND2 A0069 <- 2.93 -> DA N7 D0010 : score 5.71788 : w : ASN OD1 A0069 <- 5.46 -> DT O4 D0011 : score 3.132 : V : ILE CG2 A0065 <- 3.72 -> DT C7 D0011 : score 7.23311 : x : MET xxxx A0072 <- 3.86 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx >5zjq_AB:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF ABDB/EXD COMPLEX BOUND TO A 'RED14' DNA SEQUENCE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NE A0023 <- 3.01 -> DA N3 C0008 : score 2.01426 : H : ARG NH2 A0023 <- 3.16 -> DA N3 C0008 : score 3.00648 : w : GLN OE1 A0068 <- 5.64 -> DT O4 D0011 : score 3.068 : w : GLN NE2 A0068 <- 5.71 -> DT O4 C0002 : score 2.257 : H : ASN OD1 A0069 <- 2.91 -> DA N6 D0010 : score 5.88932 : H : ASN ND2 A0069 <- 2.93 -> DA N7 D0010 : score 5.71788 : w : ASN OD1 A0069 <- 5.46 -> DT O4 D0011 : score 3.132 : w : ARG NH2 B0004 <- 5.25 -> DT O2 D0007 : score 2.261 : H : ARG NH1 B0006 <- 2.57 -> DT O2 C0012 : score 4.50451 : H : ASN OD1 B0055 <- 3.05 -> DA N6 D0006 : score 5.72071 : H : ASN ND2 B0055 <- 3.28 -> DA N7 D0006 : score 5.30694 : H : ARG NH1 B0059 <- 3.14 -> DG N7 D0005 : score 5.6386 : H : ARG NH2 B0059 <- 2.74 -> DG O6 D0005 : score 6.6792 : V : ASN CG B0051 <- 3.76 -> DT C7 D0007 : score 2.67469 : V : ILE CG2 A0065 <- 3.72 -> DT C7 D0011 : score 7.23311 : x : MET xxxx A0072 <- 3.86 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0058 <- 3.55 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx >5zjr_AB:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF ABDB/EXD COMPLEX BOUND TO A 'MAGENTA14' DNA SEQUENCE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NE A0023 <- 2.89 -> DA N3 C0008 : score 2.06472 : H : ASN OD1 A0069 <- 2.95 -> DA N6 D0010 : score 5.84114 : H : ASN ND2 A0069 <- 2.99 -> DA N7 D0010 : score 5.64743 : H : ASN OD1 B0055 <- 2.52 -> DA N6 D0006 : score 6.35902 : H : ASN ND2 B0055 <- 2.93 -> DA N7 D0006 : score 5.71788 : H : ARG NH1 B0059 <- 2.98 -> DG N7 D0005 : score 5.8322 : H : ARG NH2 B0059 <- 3.12 -> DG N7 D0005 : score 5.976 : H : ARG NH2 B0059 <- 2.49 -> DG O6 D0005 : score 7.0092 : V : ASN CG B0051 <- 3.86 -> DT C7 D0007 : score 2.60848 : V : GLN CG A0068 <- 3.78 -> DT C7 C0002 : score 3.27166 : x : ILE xxxx A0065 <- 3.54 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0071 <- 4.35 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0072 <- 4.22 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0003 <- 3.32 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0006 <- 3.18 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0058 <- 4.14 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx >5zjr_B:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF ABDB/EXD COMPLEX BOUND TO A 'MAGENTA14' DNA SEQUENCE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ASN OD1 B0055 <- 2.52 -> DA N6 D0006 : score 6.35902 : H : ASN ND2 B0055 <- 2.93 -> DA N7 D0006 : score 5.71788 : H : ARG NH1 B0059 <- 2.98 -> DG N7 D0005 : score 5.8322 : H : ARG NH2 B0059 <- 3.12 -> DG N7 D0005 : score 5.976 : H : ARG NH2 B0059 <- 2.49 -> DG O6 D0005 : score 7.0092 : V : ASN CG B0051 <- 3.86 -> DT C7 D0007 : score 2.60848 : x : ARG xxxx B0003 <- 3.32 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0006 <- 3.18 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0058 <- 4.14 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx >5zjs_A:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF ABDB/EXD COMPLEX BOUND TO A 'BLUE14' DNA SEQUENCE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH1 A0023 <- 2.71 -> DA N3 C0008 : score 3.74833 : H : ASN OD1 A0069 <- 3.41 -> DA N6 D0010 : score 5.28714 : H : ASN ND2 A0069 <- 3.15 -> DA N7 D0010 : score 5.45958 : x : ILE xxxx A0065 <- 3.59 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0068 <- 3.41 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0072 <- 4.00 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx >5zjs_AB:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF ABDB/EXD COMPLEX BOUND TO A 'BLUE14' DNA SEQUENCE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH1 A0023 <- 2.71 -> DA N3 C0008 : score 3.74833 : H : ASN OD1 A0069 <- 3.41 -> DA N6 D0010 : score 5.28714 : H : ASN ND2 A0069 <- 3.15 -> DA N7 D0010 : score 5.45958 : H : ARG NH1 B0006 <- 2.28 -> DT O2 C0012 : score 4.75428 : H : ASN OD1 B0055 <- 2.60 -> DA N6 D0006 : score 6.26267 : H : ASN ND2 B0055 <- 3.07 -> DA N7 D0006 : score 5.55351 : H : ARG NH1 B0059 <- 3.17 -> DG N7 D0005 : score 5.6023 : H : ARG NH2 B0059 <- 2.61 -> DG O6 D0005 : score 6.8508 : x : ILE xxxx A0065 <- 3.59 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0068 <- 3.41 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0072 <- 4.00 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0051 <- 3.46 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >5zjt_E:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF ABDB/EXD COMPLEX BOUND TO A 'BLACK14' DNA SEQUENCE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH1 E0023 <- 2.87 -> DA N3 G0008 : score 3.6305 : w : GLN OE1 E0068 <- 5.93 -> DG O6 G0003 : score 2.87 : w : GLN OE1 E0068 <- 6.08 -> DT O4 H0011 : score 3.068 : w : GLN NE2 E0068 <- 5.94 -> DA N7 G0001 : score 1.888 : H : ASN OD1 E0069 <- 2.65 -> DA N6 H0010 : score 6.20245 : H : ASN ND2 E0069 <- 2.98 -> DA N7 H0010 : score 5.65917 : w : ASN OD1 E0069 <- 5.92 -> DA N6 G0004 : score 2.837 : V : ILE CG2 E0065 <- 3.87 -> DT C7 H0011 : score 6.96719 : x : MET xxxx E0072 <- 4.09 -> DG xxx G0003 : score x.xxxxx >5zk1_AC:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE CRTC2(SEMET)-CREB-CRE COMPLEX organism=HOMO SAPIENS / MUS MUSCULUS : x : ASN xxxx A0293 <- 3.53 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0297 <- 3.99 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0301 <- 2.80 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0020 <- 3.43 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx >5zk1_C: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE CRTC2(SEMET)-CREB-CRE COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : x : ARG xxxx C0020 <- 3.43 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx >5zki_B:His-Me_finger_endonucleases; title=HUMAN EXOG-H140A IN COMPLEX WITH DUPLEX DNA organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ B0110 <- 2.73 -> DG O6 E0003 : score 5.8617 : H : SER OG B0172 <- 2.74 -> DG N3 E0002 : score 2.80506 : H : ASN ND2 B0176 <- 2.84 -> DC O2 E0001 : score 4.44365 : H : LYS NZ B0315 <- 2.83 -> DG N7 F0012 : score 5.35358 : x : ARG xxxx B0109 <- 4.12 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0113 <- 4.15 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0180 <- 4.47 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0311 <- 3.19 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0314 <- 3.38 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0320 <- 3.22 -> DC xxx F0009 : score x.xxxxx >5zkj_B:His-Me_finger_endonucleases; title=HUMAN EXOG-H140A IN COMPLEX WITH RNA/DNA HYBRID DUPLEX organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx B0113 <- 4.11 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0172 <- 3.62 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0176 <- 3.28 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0307 <- 4.19 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0311 <- 3.68 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0315 <- 3.39 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx >5zko_ACGH:Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE CRTC2-CREB-CRE COMPLEX organism=MUS MUSCULUS / HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 C0293 <- 3.44 -> DC N4 D0003 : score 3.65681 : H : ARG NH1 G0020 <- 2.81 -> DC O2 B0006 : score 3.6427 : H : ARG NH2 G0020 <- 2.72 -> DC O2 B0006 : score 3.7579 : H : ARG NH2 G0020 <- 2.78 -> DC O2 D-005 : score 3.71351 : H : ARG NH1 H0020 <- 3.07 -> DC O2 D0006 : score 3.4529 : H : ARG NH2 H0020 <- 2.96 -> DC O2 B-005 : score 3.58036 : H : ARG NH2 H0020 <- 3.07 -> DC O2 D0006 : score 3.49899 : V : ALA CB A0297 <- 3.78 -> DT C7 B0002 : score 5.62697 : x : ASN xxxx A0293 <- 3.20 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0300 <- 3.99 -> DT xxx D-004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0301 <- 3.24 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0294 <- 4.09 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0297 <- 3.95 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0300 <- 4.04 -> DT xxx B-004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0301 <- 3.39 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >5zko_G: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE CRTC2-CREB-CRE COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 G0020 <- 2.81 -> DC O2 B0006 : score 3.6427 : H : ARG NH2 G0020 <- 2.78 -> DC O2 D-005 : score 3.71351 : H : ARG NH2 G0020 <- 2.72 -> DC O2 B0006 : score 3.7579 >5zlv_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE IV - DNA TERNARY COMPLEX WITH 50MM MGCL2 organism=Escherichia coli K-12 : H : SER OG A0042 <- 3.03 -> DT O2 C0874 : score 3.52735 : w : GLU OE2 A0246 <- 5.75 -> DG N7 B0842 : score 2.669 : x : PHE xxxx A0013 <- 4.25 -> DT xxx C0874 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0040 <- 3.42 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0055 <- 3.92 -> DT xxx C0874 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0056 <- 3.72 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0285 <- 4.09 -> DT xxx C0866 : score x.xxxxx >5zmc_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS FOR REACTIVATION OF -146C>T MUTANT TERT PROMOTER BY COOPERATIVE BINDING OF P52 AND ETS1/2 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE B0391 <- 2.86 -> DG O6 C0005 : score 3.89373 : H : ARG NH2 B0391 <- 2.98 -> DG N7 C0005 : score 6.15477 : H : ARG NE B0394 <- 2.60 -> DG N7 C0004 : score 4.59867 : H : ARG NH2 B0394 <- 2.78 -> DG O6 C0004 : score 6.6264 : H : TYR OH B0395 <- 3.02 -> DA N6 C0006 : score 4.46501 : x : LYS xxxx B0388 <- 3.72 -> DT xxx D0112 : score x.xxxxx >5zmd_AC:Clavaminate_synthase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FTO IN COMPLEX WITH M6DA MODIFIED SSDNA organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx A0214 <- 2.72 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0088 <- 3.50 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >5zmd_EG:Clavaminate_synthase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FTO IN COMPLEX WITH M6DA MODIFIED SSDNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ E0306 <- 2.86 -> DC O2 H0003 : score 2.9108 : H : LYS NZ G0086 <- 2.75 -> DC O2 H0003 : score 2.97562 >5zmd_G:Clavaminate_synthase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FTO IN COMPLEX WITH M6DA MODIFIED SSDNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ G0086 <- 2.75 -> DC O2 H0003 : score 2.97562 >5zmn_A: title=SULFUR BINDING DOMAIN AND SRA DOMAIN OF SCOMCRA COMPLEXED WITH PHOSPHOROTHIOATED DNA organism=? : H : ARG NH1 A0190 <- 2.92 -> DG O6 C0004 : score 5.93733 : x : ARG xxxx A0109 <- 4.38 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0163 <- 4.28 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0164 <- 3.53 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0186 <- 2.78 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0187 <- 3.78 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0188 <- 3.97 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx >5zmo_A: title=SULFUR BINDING DOMAIN OF SCOMCRA COMPLEXED WITH PHOSPHOROTHIOATED DNA organism=? : w : ASP OD2 A0160 <- 5.95 -> DC N4 B0006 : score 3.623 : H : TYR OH A0164 <- 3.21 -> DC N4 B0005 : score 3.86855 : w : TYR OH A0164 <- 6.27 -> DC N4 B0006 : score 1.343 : H : ARG NE A0190 <- 3.25 -> DG N7 B0003 : score 4.02383 : H : ARG NE A0190 <- 3.01 -> DG O6 B0003 : score 3.7755 : H : ARG NH2 A0190 <- 3.01 -> DG O6 B0003 : score 6.3228 : x : THR xxxx A0186 <- 3.38 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0187 <- 3.52 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0191 <- 3.22 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx >5zoe_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF D181A HFEN1 IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 A0048 <- 3.11 -> DC N4 C0007 : score 4.29917 : w : ARG NH1 A0320 <- 5.38 -> DT O2 C0006 : score 1.855 : x : ALA xxxx A0045 <- 3.98 -> DG xxx B0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0046 <- 3.66 -> DG xxx B0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0053 <- 3.89 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0065 <- 3.46 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx >5zof_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF D181A/R192F HFEN1 IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : x : ALA xxxx A0045 <- 4.07 -> DG xxx B0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0046 <- 3.65 -> DG xxx B0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0048 <- 3.50 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0053 <- 4.15 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0065 <- 3.28 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx >5zog_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF R192F HFEN1 IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : x : ALA xxxx A0045 <- 3.89 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0046 <- 3.84 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0048 <- 4.05 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0053 <- 3.69 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0065 <- 3.36 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx >5zqf_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TOPOISOMERASE II BETA IN COMPLEX WITH 5- IODOURIDINE-CONTAINING-DNA IN SPACE GROUP P3221 organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0503 <- 3.27 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0505 <- 3.63 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0779 <- 3.99 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0872 <- 3.36 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0877 <- 4.22 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx >5zr1_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=SACCHAROMYCES CEREVISIAE ORIGIN RECOGNITION COMPLEX BOUND TO A 72-BP ORIGIN DNA CONTAINING ACS AND B1 ELEMENT organism=? : H : LYS NZ A0362 <- 2.98 -> DT O2 H0062 : score 3.45804 : H : LYS NZ A0362 <- 2.81 -> DT O2 G0012 : score 3.58001 : H : ARG NH1 A0367 <- 2.74 -> DT O2 G0010 : score 4.35809 : H : TYR OH A0372 <- 2.90 -> DA N3 H0065 : score 4.06826 : x : PHE xxxx A0360 <- 3.61 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx >5zr1_ABCDE:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Inhibitor_of_apoptosis_IAP_repeat; title=SACCHAROMYCES CEREVISIAE ORIGIN RECOGNITION COMPLEX BOUND TO A 72-BP ORIGIN DNA CONTAINING ACS AND B1 ELEMENT organism=? : H : LYS NZ A0362 <- 2.98 -> DT O2 H0062 : score 3.45804 : H : LYS NZ A0362 <- 2.81 -> DT O2 G0012 : score 3.58001 : H : ARG NH1 A0367 <- 2.74 -> DT O2 G0010 : score 4.35809 : H : TYR OH A0372 <- 2.90 -> DA N3 H0065 : score 4.06826 : H : TRP NE1 B0396 <- 3.00 -> DT O2 G0014 : score 5.96677 : H : ARG NH2 E0360 <- 3.04 -> DC O2 G0037 : score 3.52118 : H : TYR OH E0363 <- 3.10 -> DA N3 H0038 : score 3.90221 : V : PHE CZ D0485 <- 3.88 -> DT C7 G0016 : score 6.97257 : x : PHE xxxx A0360 <- 3.61 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0255 <- 4.08 -> DT xxx G0031 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0486 <- 3.52 -> DC xxx H0055 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0489 <- 3.48 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0490 <- 3.44 -> DT xxx H0052 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0366 <- 3.32 -> DA xxx H0040 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0439 <- 3.40 -> DG xxx G0018 : score x.xxxxx >5zr1_F:Inhibitor_of_apoptosis_IAP_repeat; title=SACCHAROMYCES CEREVISIAE ORIGIN RECOGNITION COMPLEX BOUND TO A 72-BP ORIGIN DNA CONTAINING ACS AND B1 ELEMENT organism=? : x : TYR xxxx F0277 <- 4.29 -> DC xxx G0039 : score x.xxxxx >5zrf_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TOPOISOMERASE II BETA IN COMPLEX WITH 5- IODOURIDINE-CONTAINING-DNA AND ETOPOSIDE IN SPACE GROUP P21 organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0505 <- 5.62 -> DG N3 C0007 : score 2.232 : w : GLU OE1 A0522 <- 6.27 -> DG N2 F0013 : score 1.283 : w : ASP OD1 A0726 <- 5.46 -> DC O2 F0016 : score 1.919 : w : ASP OD1 A0726 <- 6.05 -> DA N3 C0006 : score 1.331 : w : ARG NH2 A0729 <- 5.57 -> DA N3 C0006 : score 2.092 : w : SER OG A0730 <- 6.41 -> DC O2 F0016 : score 1.768 : w : SER OG A0730 <- 6.18 -> DA N3 C0006 : score 0.958 : w : MET SD A0782 <- 6.16 -> DG N7 C0007 : score 4.257 : w : LYS NZ A0879 <- 6.06 -> DG N3 F0018 : score 2.232 : x : ALA xxxx A0779 <- 4.25 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0872 <- 3.33 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0877 <- 4.10 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx >5zu1_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BZ JUNCTION IN DIVERSE SEQUENCE organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx B0177 <- 3.36 -> DG xxx F0032 : score x.xxxxx >5zu1_BC:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BZ JUNCTION IN DIVERSE SEQUENCE organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx B0177 <- 3.36 -> DG xxx F0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0177 <- 3.47 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx >5zuo_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BZ JUNCTION IN DIVERSE SEQUENCE organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx B0177 <- 3.56 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx >5zuo_BCD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BZ JUNCTION IN DIVERSE SEQUENCE organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx B0177 <- 3.56 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0177 <- 3.42 -> DG xxx F0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0177 <- 3.22 -> DG xxx F0028 : score x.xxxxx >5zup_BCD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BZ JUNCTION IN DIVERSE SEQUENCE organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx B0174 <- 3.52 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0177 <- 3.42 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0177 <- 3.45 -> DG xxx F0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0177 <- 3.27 -> DG xxx F0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0181 <- 4.48 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx >5zup_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BZ JUNCTION IN DIVERSE SEQUENCE organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx D0177 <- 3.27 -> DG xxx F0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0181 <- 4.48 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx >5zux_A: title=SOLUTION STRUCTURE OF THE DNA COMPLEX OF THE C-TERMINAL DOMAIN OF ROK organism=BACILLUS SUBTILIS SUBSP. SUBTILIS STR. 168 : H : ARG NH1 A0108 <- 3.11 -> DG N3 B0018 : score 2.86331 : H : ARG NH2 A0108 <- 2.78 -> DT O2 C0020 : score 4.25027 : H : ASN ND2 A0154 <- 2.87 -> DT O2 B0012 : score 4.67971 : H : ASN ND2 A0154 <- 2.82 -> DT O2 B0013 : score 4.72717 : H : ARG NH2 A0174 <- 2.73 -> DT O2 C0027 : score 4.2926 : H : ARG NH2 A0174 <- 2.92 -> DA N3 C0028 : score 3.16199 : x : ALA xxxx A0111 <- 3.25 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0156 <- 3.19 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0157 <- 3.18 -> DA xxx C0025 : score x.xxxxx >5zx2_CDF: title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH ECF SIGMA FACTOR SIGMA H AND 7NT RNA organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS H37RV : H : GLU OE2 C0285 <- 2.21 -> DG N2 G0031 : score 4.81887 : H : ASP OD2 C0371 <- 3.13 -> DG N2 G0037 : score 5.09868 : H : GLU OE1 C0402 <- 3.17 -> DT N3 G0029 : score 1.61931 : H : LYS NZ D0288 <- 2.73 -> DG N7 H0001 : score 5.4613 : H : ARG NH2 D0291 <- 2.74 -> DT O4 G0046 : score 3.59649 : H : ARG NH2 D0291 <- 3.05 -> DG O6 H0002 : score 6.27 : H : ARG NH2 F0049 <- 2.39 -> DT O4 H0022 : score 3.84526 : H : THR OG1 F0076 <- 2.90 -> DT N3 G0027 : score 2.29797 : H : ASN ND2 F0077 <- 2.71 -> DT O2 G0027 : score 4.83158 : H : ASN ND2 F0088 <- 2.27 -> DT O2 G0026 : score 5.24925 : H : ASN OD1 F0092 <- 2.90 -> DC N4 H0024 : score 4.10972 : H : ASN OD1 F0092 <- 2.90 -> DC N4 H0024 : score 4.10972 : H : SER OG F0182 <- 2.72 -> DG O6 G0003 : score 4.15648 : H : ARG NH1 F0186 <- 2.88 -> DG N7 G0002 : score 5.9532 : H : ARG NH2 F0186 <- 2.87 -> DG O6 G0002 : score 6.5076 : V : ARG CB C0395 <- 3.60 -> DT C7 H0022 : score 1.05538 : V : MET CB F0181 <- 3.53 -> DT C7 H0044 : score 6.19478 : x : PHE xxxx C0099 <- 4.30 -> DG xxx G0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0181 <- 4.16 -> DG xxx G0037 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0211 <- 3.47 -> DC xxx G0035 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0227 <- 3.86 -> DG xxx G0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0228 <- 3.74 -> DC xxx G0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0282 <- 3.07 -> DG xxx G0031 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0370 <- 3.71 -> DG xxx G0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0376 <- 3.47 -> DG xxx G0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0398 <- 2.97 -> DA xxx H0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0405 <- 4.12 -> DG xxx G0028 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0422 <- 3.94 -> DT xxx H0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0463 <- 3.49 -> DG xxx G0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.81 -> DC xxx G0038 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0471 <- 4.27 -> DG xxx G0037 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0472 <- 3.43 -> DG xxx G0037 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0287 <- 3.86 -> DG xxx H0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0389 <- 2.99 -> DG xxx G0032 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0501 <- 3.96 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0502 <- 4.20 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0867 <- 3.73 -> DG xxx H0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0868 <- 3.39 -> DG xxx H0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0038 <- 4.45 -> DG xxx G0031 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0039 <- 3.99 -> DG xxx G0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0045 <- 3.85 -> DG xxx G0032 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0047 <- 4.20 -> DA xxx H0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0051 <- 3.54 -> DG xxx G0032 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0064 <- 3.78 -> DT xxx G0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0072 <- 3.39 -> DT xxx G0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0073 <- 3.15 -> DT xxx G0027 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0079 <- 3.98 -> DG xxx G0030 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0080 <- 3.51 -> DG xxx G0030 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0081 <- 3.84 -> DT xxx G0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0083 <- 3.45 -> DG xxx G0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0084 <- 3.16 -> DT xxx G0029 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0085 <- 3.56 -> DT xxx G0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0087 <- 4.45 -> DG xxx G0030 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0090 <- 3.08 -> DA xxx H0023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0091 <- 3.46 -> DC xxx H0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0094 <- 3.70 -> DA xxx H0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.86 -> DG xxx G0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0110 <- 4.49 -> DG xxx H0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0166 <- 3.80 -> DG xxx H0043 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0179 <- 3.58 -> DG xxx G0003 : score x.xxxxx >5zx2_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH ECF SIGMA FACTOR SIGMA H AND 7NT RNA organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS H37RV : H : LYS NZ D0288 <- 2.73 -> DG N7 H0001 : score 5.4613 : H : ARG NH2 D0291 <- 2.74 -> DT O4 G0046 : score 3.59649 : H : ARG NH2 D0291 <- 3.05 -> DG O6 H0002 : score 6.27 : x : GLN xxxx D0287 <- 3.86 -> DG xxx H0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0389 <- 2.99 -> DG xxx G0032 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0501 <- 3.96 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0502 <- 4.20 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0867 <- 3.73 -> DG xxx H0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0868 <- 3.39 -> DG xxx H0012 : score x.xxxxx >5zyt_AB:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MGME1 WITH 3' OVERHANG DOUBLE STRAND DNA3 organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 B0138 <- 3.15 -> DT O4 F0013 : score 4.82765 : V : LEU CD2 B0149 <- 3.76 -> DT C7 F0015 : score 5.78859 >5zyt_CD:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MGME1 WITH 3' OVERHANG DOUBLE STRAND DNA3 organism=Homo sapiens : x : THR xxxx D0134 <- 4.42 -> DA xxx H0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0138 <- 3.26 -> DC xxx H0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0149 <- 3.62 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0152 <- 3.78 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0165 <- 3.67 -> DG xxx G0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0169 <- 3.72 -> DG xxx G0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0172 <- 4.17 -> DC xxx H0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0173 <- 3.16 -> DC xxx H0005 : score x.xxxxx >5zyt_D:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MGME1 WITH 3' OVERHANG DOUBLE STRAND DNA3 organism=Homo sapiens : x : THR xxxx D0134 <- 4.42 -> DA xxx H0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0138 <- 3.26 -> DC xxx H0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0149 <- 3.62 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0152 <- 3.78 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0165 <- 3.67 -> DG xxx G0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0169 <- 3.72 -> DG xxx G0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0172 <- 4.17 -> DC xxx H0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0173 <- 3.16 -> DC xxx H0005 : score x.xxxxx >5zyu_AB:Restriction_endonuclease-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF HUMANMGME1 WITH SINGLE STRAND DNA2 organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 A0138 <- 3.19 -> DA N6 E0008 : score 5.58046 : w : ASP OD2 A0267 <- 5.90 -> DC N4 E0009 : score 3.623 >5zyu_B:Restriction_endonuclease-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF HUMANMGME1 WITH SINGLE STRAND DNA2 organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 B0138 <- 3.19 -> DA N6 C0008 : score 5.58046 : w : LYS NZ B0177 <- 6.02 -> DC O2 C0006 : score 1.3 >6a2h_A: title=ARCHITECTURAL ROLES OF CREN7 IN FOLDING CRENARCHAEAL CHROMATIN FILAMENT organism=Sulfolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) / Sulfolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) : H : TRP NE1 A0026 <- 3.20 -> DA N3 B0109 : score -8.38262 : H : ARG NH1 A0033 <- 2.34 -> DT O2 B0107 : score 4.7026 : H : ARG NH1 A0051 <- 3.00 -> DT O2 B0111 : score 4.13415 : w : ARG NE A0051 <- 6.00 -> DT O2 B0111 : score 0.757 : w : ARG NH1 A0051 <- 6.46 -> DT O2 B0111 : score 1.855 : x : LEU xxxx A0028 <- 3.40 -> DA xxx B0108 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0030 <- 3.41 -> DT xxx B0107 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0036 <- 3.93 -> DT xxx C0117 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0038 <- 3.67 -> DT xxx C0116 : score x.xxxxx >6a2i_AB: title=ARCHITECTURAL ROLES OF CREN7 IN FOLDING CRENARCHAEAL CHROMATIN FILAMENT organism=Sulfolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) / Sulfolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) / Sulfolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) / Sulfolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) : H : TRP NE1 A0026 <- 2.76 -> DT O2 C0103 : score 6.26511 : H : TRP NE1 B0026 <- 3.03 -> DA N3 C0109 : score -8.69241 : H : ARG NH1 B0033 <- 3.09 -> DG N3 D0131 : score 2.87552 : H : ARG NH2 B0051 <- 2.85 -> DT O2 C0111 : score 4.191 : x : LEU xxxx A0028 <- 3.41 -> DT xxx C0103 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0030 <- 3.28 -> DC xxx C0101 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0033 <- 3.71 -> DG xxx D0136 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0036 <- 3.72 -> DC xxx D0135 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0038 <- 4.25 -> DA xxx D0134 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0051 <- 3.07 -> DG xxx C0105 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0028 <- 3.42 -> DA xxx C0109 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0030 <- 3.24 -> DT xxx C0107 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0036 <- 3.90 -> DT xxx D0129 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0038 <- 4.09 -> DT xxx D0128 : score x.xxxxx >6a2i_B: title=ARCHITECTURAL ROLES OF CREN7 IN FOLDING CRENARCHAEAL CHROMATIN FILAMENT organism=Sulfolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) / Sulfolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) : H : TRP NE1 B0026 <- 3.03 -> DA N3 C0109 : score -8.69241 : H : ARG NH1 B0033 <- 3.09 -> DG N3 D0131 : score 2.87552 : H : ARG NH2 B0051 <- 2.85 -> DT O2 C0111 : score 4.191 : x : LEU xxxx B0028 <- 3.42 -> DA xxx C0109 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0030 <- 3.24 -> DT xxx C0107 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0036 <- 3.90 -> DT xxx D0129 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0038 <- 4.09 -> DT xxx D0128 : score x.xxxxx >6a47_B:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF TREX2 IN COMPLEX WITH A Y STRUCTURED DSDNA organism=Mus musculus : H : ASN ND2 B0118 <- 3.22 -> DC O2 D0021 : score 4.10321 : H : ASP OD2 B0121 <- 3.11 -> DG N2 D0006 : score 5.12052 : w : ASP OD2 B0121 <- 5.41 -> DG N3 D0007 : score 2.312 : w : ARG NH1 B0152 <- 6.06 -> DC O2 D0020 : score 1.381 : w : ARG NH2 B0152 <- 5.75 -> DC O2 D0020 : score 1.669 : x : LEU xxxx B0020 <- 3.77 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0021 <- 3.45 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0022 <- 3.82 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0122 <- 3.52 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx >6a4b_E:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF TREX2 IN COMPLEX WITH A DUPLEX DNA WITH 2 NUCLEOTIDE 3'- OVERHANG organism=Mus musculus : H : ASN ND2 E0118 <- 3.20 -> DC O2 K0016 : score 4.12113 : H : ASP OD2 E0121 <- 3.20 -> DG N2 K0001 : score 5.02226 : x : ARG xxxx E0167 <- 4.14 -> DC xxx K0005 : score x.xxxxx >6a57_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=STRUCTURE OF HISTONE DEMETHYLASE REF6 COMPLEXED WITH DNA organism=Arabidopsis thaliana : w : TYR OH A1282 <- 5.87 -> DG N7 B0009 : score 3.527 : w : GLU OE1 A1315 <- 5.89 -> DT O4 B0006 : score 2.749 : H : SER OG A1341 <- 2.55 -> DG N7 C0031 : score 4.70615 : H : SER OG A1341 <- 2.97 -> DA N6 C0032 : score 3.17789 : H : ASP OD1 A1342 <- 2.85 -> DC N4 B0005 : score 5.29142 : V : PHE CG A1339 <- 3.86 -> DT C7 B0006 : score 5.19878 >6a5l_AB:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME, WITH FOREIGN DNA organism=? : x : ARG xxxx A0351 <- 4.22 -> G xxx P0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0448 <- 4.30 -> G xxx P0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0449 <- 4.13 -> G xxx P0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0487 <- 4.29 -> G xxx P0009 : score x.xxxxx >6a5l_Eabcdef:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME, WITH FOREIGN DNA organism=? : H : ARG NH2 e0040 <- 2.45 -> DG N3 T0009 : score 3.86297 : x : ARG xxxx a0040 <- 4.29 -> DC xxx T-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a0083 <- 4.06 -> DA xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx c0077 <- 4.29 -> DG xxx N0057 : score x.xxxxx >6a5l_e:Histone-fold; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME, WITH FOREIGN DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 e0040 <- 2.45 -> DG N3 T0009 : score 3.86297 >6a5l_gh:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME, WITH FOREIGN DNA organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx g0042 <- 4.31 -> DA xxx 00038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx g0077 <- 4.16 -> DA xxx 00057 : score x.xxxxx >6a5n_A:SET_domain;PUA_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARABIDOPSIS THALIANA SUVH6 IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=Arabidopsis thaliana : H : SER OG A0356 <- 2.57 -> DA N3 D0009 : score 3.14202 : H : SER OG A0356 <- 2.57 -> DA N3 D0009 : score 3.14202 : H : GLN OE1 A0357 <- 2.41 -> DG N2 D0008 : score 6.04509 : w : THR OG1 A0444 <- 5.16 -> DC N4 D0003 : score 2.558 : x : ARG xxxx A0306 <- 3.64 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx >6a5o_f:Histone-fold; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX STALLED AT SHL(-6) OF THE NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx f0045 <- 3.54 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx >6a5r_f:Histone-fold; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX STALLED AT SHL(-2) OF THE NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx f0045 <- 4.50 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx >6a5t_a:Histone-fold; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx a0040 <- 4.29 -> DC xxx T-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a0083 <- 4.06 -> DA xxx N0026 : score x.xxxxx >6a5u_ABEbc:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME, WITH FOREIGN DNA, TILT CONFORMATION organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ B0463 <- 2.74 -> DT O2 N-043 : score 3.63023 : H : LYS NZ B0500 <- 3.15 -> DC O2 T0033 : score 2.73992 : x : LYS xxxx A0318 <- 3.29 -> DG xxx N-044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0351 <- 4.42 -> DC xxx T0036 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0832 <- 2.89 -> DA xxx T0034 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0833 <- 4.00 -> DA xxx T0034 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1104 <- 4.15 -> DT xxx N-032 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0464 <- 4.50 -> DG xxx N-042 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0524 <- 3.66 -> DA xxx T0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx c0077 <- 4.29 -> DG xxx N0057 : score x.xxxxx >6a5u_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME, WITH FOREIGN DNA, TILT CONFORMATION organism=? : H : LYS NZ B0463 <- 2.74 -> DT O2 N-043 : score 3.63023 : H : LYS NZ B0500 <- 3.15 -> DC O2 T0033 : score 2.73992 : x : LYS xxxx B0464 <- 4.50 -> DG xxx N-042 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0524 <- 3.66 -> DA xxx T0034 : score x.xxxxx >6a5u_adef:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME, WITH FOREIGN DNA, TILT CONFORMATION organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 e0040 <- 2.45 -> DG N3 T0009 : score 3.86297 : x : ARG xxxx a0040 <- 4.29 -> DC xxx T-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a0083 <- 4.06 -> DA xxx N0026 : score x.xxxxx >6a5u_gh:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME, WITH FOREIGN DNA, TILT CONFORMATION organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx g0042 <- 4.31 -> DA xxx 00038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx g0077 <- 4.16 -> DA xxx 00057 : score x.xxxxx >6a8r_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DUX4 HD2 DOMAIN ASSOCIATED WITH ERG DNA BINDING SITE organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0002 <- 3.10 -> DA N3 E0008 : score 3.04536 : H : ARG NH1 A0005 <- 2.73 -> DT O2 E0006 : score 4.3667 : H : ARG NH2 A0005 <- 3.09 -> DT O2 E0006 : score 3.9878 : w : GLN OE1 A0050 <- 5.42 -> DG O6 E0010 : score 2.87 : w : GLN OE1 A0050 <- 5.72 -> DT O4 E0009 : score 3.068 : H : ASN OD1 A0051 <- 3.09 -> DA N6 E0008 : score 5.67253 : H : ASN ND2 A0051 <- 3.12 -> DA N7 E0008 : score 5.4948 : w : ASN OD1 A0051 <- 5.72 -> DA N6 F0012 : score 2.837 : w : ASN OD1 A0051 <- 5.55 -> DT O4 E0009 : score 3.132 : H : ARG NH1 A0055 <- 3.00 -> DG N7 E0007 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0055 <- 3.06 -> DT O4 F0013 : score 3.36905 : H : ARG NH2 A0055 <- 2.70 -> DG O6 E0007 : score 6.732 : x : ILE xxxx A0047 <- 3.56 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0054 <- 3.91 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx >6aeb_F: title=CRYSTAL STRUCTURE OF XCAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA (AAG PAM) organism=Streptococcus pyogenes : H : ARG NH1 F1335 <- 3.23 -> DG N7 H0006 : score 5.5297 : H : ARG NH2 F1335 <- 3.01 -> DG O6 H0006 : score 6.3228 : x : LYS xxxx F1107 <- 3.19 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F1333 <- 3.43 -> DA xxx H0005 : score x.xxxxx >6aeg_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF XCAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA (GAT PAM) organism=Streptococcus pyogenes : H : LYS NZ B1107 <- 2.90 -> DT O2 C0007 : score 3.51544 : H : LYS NZ B1107 <- 2.60 -> DC O2 C0008 : score 3.064 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.98 -> DT O4 D0006 : score 3.42591 : x : ARG xxxx B1333 <- 3.83 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >6ai6_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF SPCAS9-NG organism=Streptococcus pyogenes serotype M1 : H : ARG NH1 A1333 <- 3.32 -> DG N7 D0006 : score 5.4208 : H : ARG NH2 A1333 <- 2.60 -> DG O6 D0006 : score 6.864 : H : ARG NE A1337 <- 3.13 -> DT O4 C0004 : score 1.73628 : H : ARG NH2 A1337 <- 3.08 -> DG O6 D0007 : score 6.2304 : x : LYS xxxx A1107 <- 3.39 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1219 <- 3.85 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A1335 <- 4.47 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx >6ako_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FOXC2 DBD BOUND TO DBE2 DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 C0118 <- 2.79 -> DA N6 A0010 : score 6.03384 : H : ASN ND2 C0118 <- 2.75 -> DA N7 A0010 : score 5.92922 : H : HIS NE2 C0122 <- 2.44 -> DT O4 B0008 : score 6.01282 : V : ARG CZ C0121 <- 3.59 -> DT C7 B0004 : score 2.24425 : V : SER CB C0119 <- 3.69 -> DT C7 A0008 : score 3.21739 : x : SER xxxx C0125 <- 3.75 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0126 <- 4.49 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx >6akp_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURAL OF FOXC2 DNA BINDING DOMAIN BOUND TO PC PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE C0121 <- 2.97 -> DG N7 B0021 : score 4.27145 : x : HIS xxxx C0122 <- 3.63 -> DT xxx B0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0125 <- 3.38 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx >6alf_I:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF CROSSLINKED E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ARG xxxx I0151 <- 3.43 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.08 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.51 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 3.96 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0201 <- 4.40 -> DA xxx A0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.84 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0446 <- 4.10 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0451 <- 2.94 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 3.52 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.05 -> DA xxx A0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0547 <- 3.33 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0567 <- 4.15 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx >6alf_IJ: title=CRYOEM STRUCTURE OF CROSSLINKED E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : V : TYR CZ J0046 <- 3.63 -> DT C7 A0005 : score 5.81662 : x : ARG xxxx I0151 <- 3.43 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.08 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.51 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 3.96 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0201 <- 4.40 -> DA xxx A0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.84 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0446 <- 4.10 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0451 <- 2.94 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 3.52 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.05 -> DA xxx A0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0547 <- 3.33 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0567 <- 4.15 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0270 <- 4.36 -> DA xxx A0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 4.24 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.38 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.87 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.34 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx >6alg_IJN: title=CRYOEM STRUCTURE OF HK022 NUN - E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA PHAGE HK022 / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : HIS NE2 N0100 <- 3.31 -> DC O2 B0022 : score 4.74789 : V : MET CE J0298 <- 3.78 -> DT C7 A0009 : score 6.96491 : x : ARG xxxx I0151 <- 3.39 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.18 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.23 -> DA xxx A0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0201 <- 3.29 -> DA xxx A0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx I0370 <- 4.47 -> DA xxx A0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.43 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0451 <- 4.08 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 4.08 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.29 -> DA xxx A0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0547 <- 3.37 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0212 <- 4.44 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0255 <- 4.01 -> DC xxx B0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0259 <- 4.11 -> DT xxx B0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0271 <- 4.26 -> DT xxx A0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0275 <- 3.33 -> DT xxx A0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0281 <- 4.36 -> DC xxx A0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0314 <- 3.48 -> DT xxx A0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J0316 <- 3.54 -> DC xxx A0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0321 <- 4.17 -> DC xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 4.43 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.35 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.81 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.69 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.85 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx N0089 <- 4.00 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx N0093 <- 3.58 -> DA xxx A0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0094 <- 2.93 -> DT xxx B0024 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx N0096 <- 3.22 -> DC xxx B0023 : score x.xxxxx >6alg_J:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF HK022 NUN - E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=? : V : MET CE J0298 <- 3.78 -> DT C7 A0009 : score 6.96491 : x : THR xxxx J0212 <- 4.44 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0255 <- 4.01 -> DC xxx B0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0259 <- 4.11 -> DT xxx B0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0271 <- 4.26 -> DT xxx A0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0275 <- 3.33 -> DT xxx A0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0281 <- 4.36 -> DC xxx A0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0314 <- 3.48 -> DT xxx A0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J0316 <- 3.54 -> DC xxx A0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0321 <- 4.17 -> DC xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 4.43 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.35 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.81 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.69 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.85 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx >6alh_IJ: title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NH1 I0451 <- 2.58 -> DG O6 A0016 : score 6.351 : V : TYR CD2 J0046 <- 3.89 -> DT C7 A0005 : score 3.65735 : x : ARG xxxx I0151 <- 3.46 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.09 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.88 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 4.33 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0201 <- 3.08 -> DA xxx A0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.51 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0446 <- 4.30 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 3.54 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.03 -> DA xxx A0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0547 <- 3.45 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0314 <- 4.29 -> DA xxx A0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.92 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.52 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.72 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx >6alh_J:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : V : TYR CD2 J0046 <- 3.89 -> DT C7 A0005 : score 3.65735 : x : ARG xxxx J0314 <- 4.29 -> DA xxx A0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.92 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.52 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.72 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx >6ama_L:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF S. COELICOLOR/S. VENEZUELAE BLDC-SMEA-SSFA COMPLEX TO 3.09 ANGSTROM organism=Streptomyces venezuelae : H : LYS NZ L0026 <- 3.31 -> DG N7 R0069 : score 4.83654 : H : LYS NZ L0026 <- 2.66 -> DG O6 R0069 : score 5.94263 : H : ARG NH2 L0030 <- 3.09 -> DA N7 N0108 : score 1.57483 : x : ASP xxxx L0024 <- 4.02 -> DC xxx N0109 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0046 <- 3.70 -> DT xxx R0067 : score x.xxxxx >6amk_AB:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF STREPTOMYCES VENEZUELAE BLDC-WHII OPT COMPLEX organism=Streptomyces venezuelae : H : LYS NZ A0026 <- 3.28 -> DG N7 R0016 : score 4.86885 : H : ARG NH2 A0030 <- 2.92 -> DA N7 Z0017 : score 1.63167 : H : LYS NZ B0026 <- 3.24 -> DG N7 R0024 : score 4.91194 : H : LYS NZ B0026 <- 2.97 -> DG N7 R0025 : score 5.20278 : H : LYS NZ B0026 <- 2.97 -> DG O6 R0025 : score 5.58422 : H : ARG NH1 B0030 <- 2.77 -> DG N7 Z0008 : score 6.0863 : H : ARG NH2 B0030 <- 2.96 -> DG O6 Z0008 : score 6.3888 : x : HIS xxxx A0046 <- 3.43 -> DT xxx Z0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0024 <- 3.60 -> DT xxx Z0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0046 <- 3.84 -> DT xxx R0022 : score x.xxxxx >6amk_B:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF STREPTOMYCES VENEZUELAE BLDC-WHII OPT COMPLEX organism=Streptomyces venezuelae : H : LYS NZ B0026 <- 3.24 -> DG N7 R0024 : score 4.91194 : H : LYS NZ B0026 <- 2.97 -> DG N7 R0025 : score 5.20278 : H : LYS NZ B0026 <- 2.97 -> DG O6 R0025 : score 5.58422 : H : ARG NH1 B0030 <- 2.77 -> DG N7 Z0008 : score 6.0863 : H : ARG NH2 B0030 <- 2.96 -> DG O6 Z0008 : score 6.3888 : x : ASP xxxx B0024 <- 3.60 -> DT xxx Z0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0046 <- 3.84 -> DT xxx R0022 : score x.xxxxx >6amo_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 7.0 organism=? : w : GLN NE2 A0161 <- 6.32 -> DG N3 T0707 : score 1.484 : H : TYR OH A0183 <- 2.48 -> DC O2 P0821 : score 3.72127 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.90 -> DC O2 T0723 : score 3.62474 : w : GLN NE2 A0475 <- 6.41 -> DC O2 P0808 : score 2.699 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.57 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx >6amo_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 7.0 organism=? : H : TYR OH C0183 <- 3.03 -> DC O2 F0821 : score 3.33655 : H : ARG NH2 C0448 <- 3.34 -> DC O2 E0723 : score 3.29926 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.48 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.48 -> DC xxx E0711 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.59 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >6an2_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 7.5 organism=? : w : GLN NE2 A0161 <- 6.49 -> DG N3 T0707 : score 1.484 : H : TYR OH A0183 <- 2.69 -> DC O2 P0821 : score 3.57438 : w : GLN NE2 A0475 <- 6.43 -> DC O2 P0808 : score 2.699 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.71 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.42 -> DC xxx T0711 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.00 -> DC xxx T0723 : score x.xxxxx >6an2_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 7.5 organism=? : w : GLN NE2 A0161 <- 6.49 -> DG N3 T0707 : score 1.484 : H : TYR OH A0183 <- 2.69 -> DC O2 P0821 : score 3.57438 : w : GLN NE2 A0475 <- 6.43 -> DC O2 P0808 : score 2.699 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.71 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.42 -> DC xxx T0711 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.00 -> DC xxx T0723 : score x.xxxxx >6an2_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 7.5 organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.81 -> DC O2 F0821 : score 3.49044 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.44 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.47 -> DC xxx E0711 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.41 -> DT xxx F0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.62 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >6an8_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 8.0 organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.63 -> DC O2 P0821 : score 3.61635 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.76 -> DC O2 T0723 : score 3.72831 : w : GLN NE2 A0475 <- 5.66 -> DG N2 T0721 : score 1.484 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.47 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.49 -> DC xxx T0711 : score x.xxxxx >6an8_C:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 8.0 organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.85 -> DC O2 F0821 : score 3.46246 : w : ASN ND2 C0265 <- 5.17 -> DC O2 E0711 : score 1.885 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.45 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.22 -> DT xxx F0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.91 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >6an8_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 8.0 organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.85 -> DC O2 F0821 : score 3.46246 : w : ASN ND2 C0265 <- 5.17 -> DC O2 E0711 : score 1.885 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.45 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.22 -> DT xxx F0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.91 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >6anq_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 8.5 organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.55 -> DC O2 P0821 : score 3.67231 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.83 -> DC O2 T0723 : score 3.67653 : w : GLN NE2 A0475 <- 6.45 -> DC O2 P0808 : score 2.699 : w : GLN NE2 A0475 <- 6.38 -> DC O2 P0807 : score 2.699 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.58 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx >6anq_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 8.5 organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.55 -> DC O2 P0821 : score 3.67231 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.83 -> DC O2 T0723 : score 3.67653 : w : GLN NE2 A0475 <- 6.45 -> DC O2 P0808 : score 2.699 : w : GLN NE2 A0475 <- 6.38 -> DC O2 P0807 : score 2.699 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.58 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx >6anq_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 8.5 organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.77 -> DC O2 F0821 : score 3.51842 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.53 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.33 -> DT xxx F0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 4.01 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >6ar1_A:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURE OF A THERMOSTABLE GROUP II INTRON REVERSE TRANSCRIPTASE WITH TEMPLATE-PRIMER AND ITS FUNCTIONAL AND EVOLUTIONARY IMPLICATIONS (RT/DUPLEX (NAT)) organism=Geobacillus stearothermophilus : H : TYR OH A0221 <- 2.73 -> DA N3 B0010 : score 4.2094 : x : PHE xxxx A0110 <- 3.38 -> DC xxx B0011 : score x.xxxxx >6ar3_D:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURE OF A THERMOSTABLE GROUP II INTRON REVERSE TRANSCRIPTASE WITH TEMPLATE-PRIMER AND ITS FUNCTIONAL AND EVOLUTIONARY IMPLICATIONS (RT/DUPLEX (SE-MET)) organism=Geobacillus stearothermophilus : H : TYR OH D0221 <- 2.71 -> DA N3 E0010 : score 4.22601 : x : PHE xxxx D0110 <- 3.18 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx >6as7_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC CORE OF HUMAN DNA POLYMERASE ALPHA IN TERNARY COMPLEX WITH AN DNA-PRIMED DNA TEMPLATE AND DCTP organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0834 <- 2.63 -> DG O6 C0113 : score 6.29017 : H : ARG NH1 A0834 <- 2.72 -> DG O6 B0008 : score 6.18067 : H : ARG NH2 A0834 <- 2.84 -> DG N7 C0113 : score 6.33354 : H : ARG NH2 A1081 <- 3.03 -> DG N3 B0008 : score 3.44418 : x : TYR xxxx A0957 <- 4.36 -> DG xxx C0111 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1003 <- 4.31 -> DC xxx B0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1053 <- 3.32 -> DG xxx C0113 : score x.xxxxx >6asb_F: title=CXXC AND PHD-TYPE ZINC FINGER REGIONS OF FBXL19 IN COMPLEX WITH DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 F0035 <- 2.79 -> DT O2 E0008 : score 4.31502 : H : ARG NH2 F0035 <- 2.81 -> DT O2 E0008 : score 4.22487 : H : LYS NZ F0069 <- 2.89 -> DG N7 E0007 : score 5.28895 : H : GLN NE2 F0070 <- 2.90 -> DG O6 D0007 : score 5.68903 : x : MET xxxx F0068 <- 4.40 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx >6asd_C: title=ZINC FINGER REGION OF HUMAN TET1 IN COMPLEX WITH CPG DNA organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ C0587 <- 3.08 -> DG N3 A0010 : score 1.37243 : w : LYS NZ C0587 <- 5.50 -> DT O2 A0009 : score 0.522 : w : LYS NZ C0587 <- 5.77 -> DA N3 B0004 : score 1.538 : H : HIS ND1 C0616 <- 2.72 -> DG O6 A0008 : score 6.32265 : x : TYR xxxx C0608 <- 3.25 -> DC xxx A0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0617 <- 3.36 -> DC xxx A0006 : score x.xxxxx >6asw_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.0 organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.71 -> DC O2 P0821 : score 3.56039 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.92 -> DC O2 T0723 : score 3.60995 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.27 -> DT O2 P0806 : score 3.8354 : w : GLN NE2 A0475 <- 6.05 -> DC O2 P0807 : score 2.699 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.56 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx >6asw_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.0 organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.86 -> DC O2 F0821 : score 3.45547 : w : ASN ND2 C0265 <- 5.33 -> DC O2 E0711 : score 1.885 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.52 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.63 -> DT xxx F0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.83 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >6asx_IJ: title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI HIS PAUSE ELONGATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ARG xxxx I0151 <- 3.69 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.02 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.05 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 4.34 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0541 <- 4.03 -> DG xxx A0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.82 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0046 <- 3.27 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.79 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 4.01 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx >6asx_J:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI HIS PAUSE ELONGATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : TYR xxxx J0046 <- 3.27 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.79 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 4.01 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx >6avm_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.5 WITH CROSS- LINKING TO SECOND BASE TEMPLATE OVERHANG organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.64 -> DC O2 P0821 : score 3.60935 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.17 -> DT O2 P0806 : score 3.98774 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.82 -> DC O2 T0723 : score 3.68392 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.10 -> DT O2 P0806 : score 3.97933 : w : GLN NE2 A0475 <- 6.04 -> DC O2 P0807 : score 2.699 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.57 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.49 -> DC xxx T0711 : score x.xxxxx >6avm_C:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.5 WITH CROSS- LINKING TO SECOND BASE TEMPLATE OVERHANG organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.86 -> DC O2 F0821 : score 3.45547 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.45 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.33 -> DC xxx E0711 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.54 -> DC xxx F0807 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 4.02 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >6avm_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.5 WITH CROSS- LINKING TO SECOND BASE TEMPLATE OVERHANG organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.86 -> DC O2 F0821 : score 3.45547 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.45 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.33 -> DC xxx E0711 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.54 -> DC xxx F0807 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 4.02 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >6avt_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.5 WITH CROSS- LINKING TO FIRST BASE TEMPLATE OVERHANG organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.74 -> DC O2 P0821 : score 3.53941 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.71 -> DC O2 T0723 : score 3.76529 : w : GLN NE2 A0475 <- 5.81 -> DG N2 T0721 : score 1.484 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.63 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.47 -> DC xxx T0711 : score x.xxxxx >6avt_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.5 WITH CROSS- LINKING TO FIRST BASE TEMPLATE OVERHANG organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.74 -> DC O2 P0821 : score 3.53941 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.71 -> DC O2 T0723 : score 3.76529 : w : GLN NE2 A0475 <- 6.26 -> DC O2 P0807 : score 2.699 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.63 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.47 -> DC xxx T0711 : score x.xxxxx >6avt_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.5 WITH CROSS- LINKING TO FIRST BASE TEMPLATE OVERHANG organism=? : H : TYR OH C0183 <- 3.04 -> DC O2 F0821 : score 3.32956 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.41 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.29 -> DC xxx E0711 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.33 -> DT xxx F0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 4.05 -> DC xxx F0808 : score x.xxxxx >6b0o_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZINC FINGER DOMAIN OF WT1(-KTS FORM) WITH 12+1MER OLIGONUCLEOTIDE WITH 3' TRIPLET TGT organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0336 <- 5.42 -> DT O4 B0013 : score 1.7 : w : HIS NE2 A0339 <- 5.61 -> DG N7 B0012 : score 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-> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0369 <- 3.29 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0395 <- 3.33 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0400 <- 4.38 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0427 <- 3.94 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >6b1s_A:DNA/RNA_polymerases; title=HYDROGEN BONDING COMPLEMENTARY, NOT SIZE COMPLEMENTARITY IS KEY IN THE FORMATION OF THE DOUBLE HELIX organism=Moloney murine leukemia virus : H : ASP OD2 A0114 <- 3.08 -> DG N2 F0016 : score 5.15327 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.75 -> DT O2 E0002 : score 4.27567 : x : TYR xxxx A0064 <- 4.33 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0099 <- 3.30 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0112 <- 4.24 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx >6b1s_AB:DNA/RNA_polymerases; title=HYDROGEN BONDING COMPLEMENTARY, NOT SIZE COMPLEMENTARITY IS KEY IN THE FORMATION OF THE DOUBLE HELIX organism=Moloney murine leukemia virus : H : ASP OD2 A0114 <- 3.08 -> DG N2 F0016 : score 5.15327 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.75 -> DT O2 E0002 : score 4.27567 : H : ASP OD2 B0114 <- 2.95 -> DG N2 E0016 : score 5.29521 : H : ARG NH2 B0116 <- 2.72 -> DT O2 F0002 : score 4.30107 : x : TYR xxxx A0064 <- 4.33 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0099 <- 3.30 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0112 <- 4.24 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0064 <- 4.42 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0099 <- 3.31 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0100 <- 3.98 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0112 <- 4.26 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx >6b40_A: title=BBRAGL-3'TIR SYNAPTIC COMPLEX WITH NICKED DNA REFINED WITH C2 SYMMETRY organism=BRANCHIOSTOMA BELCHERI : H : ASN ND2 A0953 <- 2.38 -> DG O6 B0043 : score 6.11209 : x : ALA xxxx A0951 <- 4.43 -> DT xxx B0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0956 <- 2.82 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0995 <- 3.21 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1060 <- 3.08 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1063 <- 3.87 -> DT xxx B0044 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A1064 <- 4.09 -> DT xxx B0044 : score x.xxxxx >6b44_ABH: title=CRYO-EM STRUCTURE OF TYPE I-F CRISPR CRRNA-GUIDED CSY SURVEILLANCE COMPLEX WITH BOUND TARGET DSDNA organism=PSEUDOMONAS AERUGINOSA (STRAIN UCBPP-PA14) / PSEUDOMONAS AERUGINOSA (STRAIN UCBPP-PA14) / PSEUDOMONAS AERUGINOSA (STRAIN UCBPP-PA14) / PSEUDOMONAS AERUGINOSA (STRAIN UCBPP-PA14) / PSEUDOMONAS AERUGINOSA (STRAIN UCBPP-PA14) / PSEUDOMONAS AERUGINOSA (STRAIN UCBPP-PA14) : H : GLN NE2 A0249 <- 2.75 -> DC O2 O0017 : score 3.73182 : H : ASN OD1 A0250 <- 3.12 -> DG N2 N0033 : score 4.4928 : H : ASN ND2 A0250 <- 2.97 -> DG N3 N0033 : score 4.72845 : x : LYS xxxx A0247 <- 3.43 -> DG xxx N0033 : score x.xxxxx >6b44_CDEFG: title=CRYO-EM STRUCTURE OF TYPE I-F CRISPR CRRNA-GUIDED CSY SURVEILLANCE COMPLEX WITH BOUND TARGET DSDNA organism=PSEUDOMONAS AERUGINOSA (STRAIN UCBPP-PA14) / PSEUDOMONAS AERUGINOSA (STRAIN UCBPP-PA14) / PSEUDOMONAS AERUGINOSA (STRAIN UCBPP-PA14) / PSEUDOMONAS AERUGINOSA (STRAIN UCBPP-PA14) / PSEUDOMONAS AERUGINOSA (STRAIN UCBPP-PA14) / PSEUDOMONAS AERUGINOSA (STRAIN UCBPP-PA14) / PSEUDOMONAS AERUGINOSA (STRAIN UCBPP-PA14) / PSEUDOMONAS AERUGINOSA (STRAIN UCBPP-PA14) / PSEUDOMONAS AERUGINOSA (STRAIN UCBPP-PA14) / PSEUDOMONAS AERUGINOSA (STRAIN UCBPP-PA14) : H : ASN ND2 F0055 <- 3.19 -> DA N3 N0016 : score 3.51069 : H : SER OG F0243 <- 3.08 -> DA N6 N0016 : score 3.10552 : H : SER OG G0243 <- 2.90 -> DC N4 N0022 : score 3.60213 : x : VAL xxxx C0011 <- 4.13 -> DA xxx N0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0335 <- 3.34 -> DA xxx N0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0011 <- 3.47 -> DG xxx N0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0054 <- 4.18 -> DG xxx N0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0075 <- 3.64 -> DG xxx N0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0076 <- 3.28 -> DG xxx N0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0077 <- 3.24 -> DG xxx N0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0078 <- 4.23 -> DG xxx N0003 : score 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COLI O157:H7 / ESCHERICHIA COLI O45:K1 (STRAIN S88 / EXPEC) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI O45:K1 (STRAIN S88 / EXPEC) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI O45:K1 (STRAIN S88 / EXPEC) : H : ARG NE C0175 <- 2.26 -> DT O4 10077 : score 2.05974 : H : ARG NH2 C0175 <- 3.00 -> DT O4 10077 : score 3.41169 : H : ASP OD2 C0185 <- 3.20 -> DT N3 10077 : score 3.3002 : H : GLU OE1 C0374 <- 2.73 -> DG N2 10071 : score 4.3706 : H : ARG NH2 C0394 <- 2.39 -> DT O2 10072 : score 4.58047 : H : SER OG D0319 <- 2.43 -> DA N6 20021 : score 3.53318 : H : SER OG D0319 <- 3.01 -> DT O4 20022 : score 3.40581 : H : SER OG F0428 <- 2.55 -> DT O4 10068 : score 3.73288 : H : THR OG1 F0432 <- 3.33 -> DA N7 10067 : score 3.05221 : H : ARG NH2 G0185 <- 3.14 -> DG O6 10009 : score 6.1512 : H : ARG NH2 G0185 <- 3.16 -> DT O4 20079 : score 3.29797 : V : ARG CZ G0180 <- 3.61 -> DT C7 10006 : score 2.23359 : V : TRP CD2 F0434 <- 3.70 -> DT C7 10063 : score 5.63382 : V : LEU CD2 F0573 <- 3.55 -> DT C7 20046 : score 6.08949 : V : ARG CZ H0180 <- 3.77 -> DT C7 20068 : score 2.1483 : x : ARG xxxx C0151 <- 4.31 -> DT xxx 10077 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.20 -> DG xxx 10076 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.66 -> DG xxx 10076 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 2.98 -> DT xxx 10077 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.17 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0375 <- 4.23 -> DG xxx 10069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0473 <- 3.11 -> DT xxx 10072 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0508 <- 3.51 -> DG xxx 20020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0541 <- 3.08 -> DG xxx 20011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.12 -> DC xxx 10078 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 4.26 -> DC xxx 10074 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0320 <- 2.28 -> DA xxx 20021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 3.92 -> DC xxx 20013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 4.40 -> DC xxx 20013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 2.89 -> DA xxx 20012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.71 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.18 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.29 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0103 <- 4.10 -> DG xxx 10069 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 3.39 -> DG xxx 10069 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.25 -> DT xxx 10068 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 3.54 -> DT xxx 10068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0385 <- 2.94 -> DG xxx 10069 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 3.60 -> DT xxx 10068 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0396 <- 3.78 -> DT xxx 20023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0397 <- 3.57 -> DT xxx 20023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 3.48 -> DA xxx 10064 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 3.68 -> DA xxx 10064 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 2.88 -> DA xxx 10064 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 4.41 -> DA xxx 10064 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0426 <- 3.77 -> DT xxx 10068 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.24 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.31 -> DA xxx 10064 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.71 -> DT xxx 10063 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0437 <- 2.16 -> DA xxx 20026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 4.48 -> DA xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0441 <- 3.33 -> DT xxx 10060 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0443 <- 3.14 -> DT xxx 20025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0454 <- 4.01 -> DT xxx 10060 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0455 <- 3.11 -> DT xxx 10058 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0458 <- 3.60 -> DG xxx 20027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0461 <- 3.07 -> DT xxx 20025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0502 <- 4.31 -> DT xxx 20022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0503 <- 3.44 -> DT xxx 20022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0511 <- 3.82 -> DG xxx 20020 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0513 <- 2.89 -> DG xxx 20019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0516 <- 3.52 -> DG xxx 20016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0574 <- 4.00 -> DG xxx 20045 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0583 <- 3.66 -> DT xxx 10040 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0585 <- 2.73 -> DT xxx 20046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0586 <- 3.10 -> DC xxx 10038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0588 <- 3.10 -> DC xxx 20047 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0170 <- 3.94 -> DT xxx 10006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0179 <- 4.29 -> DT xxx 20079 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0181 <- 3.17 -> DT xxx 10008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0182 <- 4.18 -> DT xxx 20079 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0170 <- 4.19 -> DT xxx 20068 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0181 <- 2.96 -> DG xxx 20069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0265 <- 3.41 -> DA xxx 10035 : score x.xxxxx >6b6h_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF A BACTERIAL CLASS I TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : SER OG F0428 <- 2.55 -> DT O4 10068 : score 3.73288 : H : THR OG1 F0432 <- 3.33 -> DA N7 10067 : score 3.05221 : V : TRP CD2 F0434 <- 3.70 -> DT C7 10063 : score 5.63382 : V : LEU CD2 F0573 <- 3.55 -> DT C7 20046 : score 6.08949 : x : VAL xxxx F0098 <- 3.71 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.18 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.29 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0103 <- 4.10 -> DG xxx 10069 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 3.39 -> DG xxx 10069 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.25 -> DT xxx 10068 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 3.54 -> DT xxx 10068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0385 <- 2.94 -> DG xxx 10069 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 3.60 -> DT xxx 10068 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0396 <- 3.78 -> DT xxx 20023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0397 <- 3.57 -> DT xxx 20023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 3.48 -> DA xxx 10064 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 3.68 -> DA xxx 10064 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 2.88 -> DA xxx 10064 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 4.41 -> DA xxx 10064 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0426 <- 3.77 -> DT xxx 10068 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.24 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.31 -> DA xxx 10064 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.71 -> DT xxx 10063 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0437 <- 2.16 -> DA xxx 20026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 4.48 -> DA xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0441 <- 3.33 -> DT xxx 10060 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0443 <- 3.14 -> DT xxx 20025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0454 <- 4.01 -> DT xxx 10060 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0455 <- 3.11 -> DT xxx 10058 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0458 <- 3.60 -> DG xxx 20027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0461 <- 3.07 -> DT xxx 20025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0502 <- 4.31 -> DT xxx 20022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0503 <- 3.44 -> DT xxx 20022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0511 <- 3.82 -> DG xxx 20020 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0513 <- 2.89 -> DG xxx 20019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0516 <- 3.52 -> DG xxx 20016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0574 <- 4.00 -> DG xxx 20045 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0583 <- 3.66 -> DT xxx 10040 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0585 <- 2.73 -> DT xxx 20046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0586 <- 3.10 -> DC xxx 10038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0588 <- 3.10 -> DC xxx 20047 : score x.xxxxx >6bce_A:Homing_endonucleases; title=WILD-TYPE I-LTRI BOUND TO COGNATE SUBSTRATE (PRE-CLEAVAGE COMPLEX) organism=Leptographium truncatum : H : ARG NH1 A0049 <- 2.64 -> DG O6 C0006 : score 6.278 : H : ARG NH2 A0049 <- 2.94 -> DG N7 C0006 : score 6.20585 : H : ARG NH1 A0051 <- 2.92 -> DG O6 B0021 : score 5.93733 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.87 -> DG O6 B0021 : score 6.5076 : H : ARG NH2 A0053 <- 2.98 -> DG N7 B0018 : score 6.15477 : H : ARG NH2 A0053 <- 2.67 -> DG N7 B0019 : score 6.55062 : w : ARG NH1 A0053 <- 5.89 -> DT O4 C0008 : score 1.768 : w : ASP OD2 A0081 <- 5.92 -> DT O4 B0016 : score 2.798 : w : ASP OD2 A0081 <- 5.80 -> DA N7 B0017 : score 2.024 : H : ARG NH1 A0083 <- 3.21 -> DG O6 B0019 : score 5.5845 : H : ARG NH2 A0083 <- 2.56 -> DG O6 B0018 : score 6.9168 : H : GLU OE1 A0087 <- 3.00 -> DC N4 C0007 : score 5.53723 : w : GLU OE2 A0087 <- 5.48 -> DT O4 C0008 : score 2.279 : H : TYR OH A0188 <- 3.29 -> DC N4 C0018 : score 3.80112 : w : ARG NH1 A0190 <- 6.36 -> DA N6 B0008 : score 1.486 : w : ASN ND2 A0194 <- 5.69 -> DT O4 C0021 : score 3.275 : w : ASN ND2 A0194 <- 5.58 -> DT O4 C0022 : score 3.275 : H : THR OG1 A0196 <- 3.13 -> DC N4 B0004 : score 3.76713 : H : GLN OE1 A0202 <- 2.90 -> DA N6 B0006 : score 5.93151 : H : GLN NE2 A0202 <- 2.92 -> DA N7 B0006 : score 5.94359 : w : GLN OE1 A0202 <- 5.39 -> DT O4 C0021 : score 3.068 : H : GLN OE1 A0204 <- 3.10 -> DA N6 B0007 : score 5.68941 : H : GLN NE2 A0204 <- 2.75 -> DA N7 B0007 : score 6.15064 : H : GLN NE2 A0208 <- 2.89 -> DA N7 C0017 : score 5.98013 : H : ARG NH1 A0232 <- 3.24 -> DG O6 B0010 : score 5.548 : H : ARG NH2 A0232 <- 2.41 -> DG N7 B0010 : score 6.88262 : H : ARG NH1 A0234 <- 2.65 -> DG O6 C0016 : score 6.26583 : H : ARG NH2 A0234 <- 3.07 -> DG N7 C0016 : score 6.03985 : H : ARG NH2 A0311 <- 2.99 -> DG N3 B0013 : score 3.47307 : w : ARG NH2 A0311 <- 6.17 -> DT O2 B0014 : score 2.261 : V : ASP CB A0081 <- 3.67 -> DT C7 B0016 : score 2.77028 : V : ALA CB A0192 <- 3.55 -> DT C7 C0020 : score 5.94891 : x : MET xxxx A0033 <- 3.90 -> DG xxx B0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0035 <- 3.83 -> DA xxx B0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0037 <- 3.60 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0042 <- 3.09 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 4.00 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0085 <- 3.56 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0186 <- 4.21 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0197 <- 4.00 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0210 <- 3.75 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0246 <- 4.08 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0252 <- 3.91 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx >6bcf_J:Homing_endonucleases; title=I-LTRI G183A BOUND TO COGNATE SUBSTRATE (PRE-CLEAVAGE COMPLEX) organism=Leptographium truncatum : H : ARG NH1 J0049 <- 2.72 -> DG O6 L0006 : score 6.18067 : H : ARG NH2 J0049 <- 3.33 -> DG N7 L0006 : score 5.70785 : H : ARG NH1 J0051 <- 3.04 -> DG O6 K0021 : score 5.79133 : H : ARG NH2 J0051 <- 3.08 -> DG O6 K0021 : score 6.2304 : H : ARG NH1 J0053 <- 2.94 -> DG N7 K0019 : score 5.8806 : H : ARG NH1 J0053 <- 2.76 -> DG O6 K0019 : score 6.132 : H : ARG NH1 J0083 <- 3.13 -> DG O6 K0019 : score 5.68183 : H : ARG NH2 J0083 <- 2.94 -> DG O6 K0018 : score 6.4152 : H : GLN OE1 J0202 <- 2.92 -> DA N6 K0006 : score 5.9073 : H : GLN NE2 J0202 <- 2.76 -> DA N7 K0006 : score 6.13846 : H : GLN NE2 J0208 <- 3.34 -> DA N7 L0017 : score 5.43205 : V : ARG CG J0190 <- 3.78 -> DT C7 L0020 : score 1.01015 : V : ALA CB J0192 <- 3.53 -> DT C7 L0021 : score 5.97691 : V : LEU CD2 J0197 <- 3.82 -> DT C7 K0005 : score 5.70263 : x : MET xxxx J0033 <- 3.81 -> DG xxx K0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0037 <- 4.44 -> DG xxx K0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0042 <- 4.04 -> DA xxx L0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx J0081 <- 3.66 -> DT xxx K0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0085 <- 3.45 -> DC xxx L0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx J0087 <- 3.17 -> DC xxx L0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0188 <- 3.98 -> DC xxx L0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0194 <- 3.36 -> DT xxx L0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0196 <- 3.42 -> DC xxx K0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx J0204 <- 3.13 -> DA xxx K0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0210 <- 4.37 -> DG xxx L0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0232 <- 2.93 -> DC xxx K0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx J0246 <- 4.26 -> DC xxx L0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0252 <- 4.37 -> DA xxx K0007 : score x.xxxxx >6bcg_A:Homing_endonucleases; title=I-LTRI A28G BOUND TO COGNATE SUBSTRATE (PRE-CLEAVAGE COMPLEX) organism=Leptographium truncatum : H : ARG NH1 A0049 <- 3.28 -> DG N7 C0006 : score 5.4692 : H : ARG NH1 A0049 <- 2.80 -> DG O6 C0006 : score 6.08333 : H : ARG NH1 A0051 <- 2.68 -> DG O6 B0021 : score 6.22933 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.44 -> DG O6 B0021 : score 7.0752 : H : ARG NH1 A0053 <- 2.69 -> DG O6 B0019 : score 6.21717 : H : ARG NH2 A0053 <- 3.01 -> DG O6 B0019 : score 6.3228 : H : GLU OE1 A0087 <- 3.36 -> DC N4 C0007 : score 5.12194 : H : GLN OE1 A0202 <- 2.79 -> DA N6 B0006 : score 6.06467 : H : GLN NE2 A0202 <- 2.77 -> DA N7 B0006 : score 6.12628 : H : GLN NE2 A0204 <- 2.86 -> DA N7 B0006 : score 6.01667 : H : GLN NE2 A0204 <- 2.61 -> DA N7 B0007 : score 6.32115 : H : ARG NH1 A0234 <- 2.81 -> DG O6 C0016 : score 6.07117 : H : ARG NH2 A0234 <- 2.93 -> DG N7 C0016 : score 6.21862 : V : ALA CB A0192 <- 3.51 -> DT C7 C0020 : score 6.0049 : x : MET xxxx A0033 <- 3.68 -> DG xxx B0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0035 <- 4.06 -> DA xxx B0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0037 <- 3.90 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0042 <- 3.64 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0081 <- 4.42 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 2.84 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0085 <- 3.21 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0188 <- 4.13 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0190 <- 2.71 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0194 <- 4.13 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0196 <- 3.55 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0197 <- 4.04 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0208 <- 3.21 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0210 <- 3.74 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0252 <- 4.12 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx >6bch_AD:Homing_endonucleases; title=I-LTRI E29D BOUND TO COGNATE SUBSTRATE (NICKED COMPLEX) organism=Leptographium truncatum : H : ARG NH2 A0042 <- 3.49 -> DA N7 C0004 : score 1.44109 : H : ARG NH1 A0049 <- 2.77 -> DG O6 C0006 : score 6.11983 : H : ARG NH2 A0049 <- 3.35 -> DG N7 C0006 : score 5.68231 : H : ARG NH1 A0051 <- 2.97 -> DG O6 X0021 : score 5.8765 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.88 -> DG O6 X0021 : score 6.4944 : H : ARG NH2 A0053 <- 2.83 -> DG N7 X0018 : score 6.34631 : H : ARG NH2 A0053 <- 2.85 -> DG N7 X0019 : score 6.32077 : H : ARG NH1 A0083 <- 3.04 -> DG O6 X0019 : score 5.79133 : H : ARG NH2 A0083 <- 2.39 -> DG O6 X0018 : score 7.1412 : H : GLU OE1 A0087 <- 3.33 -> DC N4 C0007 : score 5.15655 : H : GLN OE1 A0202 <- 2.91 -> DA N6 B0006 : score 5.91941 : H : GLN NE2 A0202 <- 2.67 -> DA N7 B0006 : score 6.24808 : H : GLN NE2 A0204 <- 2.85 -> DA N7 B0007 : score 6.02885 : H : ARG NH1 A0232 <- 2.75 -> DG N7 B0010 : score 6.1105 : H : ARG NH2 A0232 <- 3.14 -> DG N7 B0010 : score 5.95046 : H : ARG NH2 A0232 <- 2.41 -> DT O4 B0011 : score 3.83105 : H : ARG NH2 D0042 <- 3.48 -> DA N7 F0004 : score 1.44443 : H : ARG NH1 D0049 <- 2.67 -> DG O6 F0006 : score 6.2415 : H : ARG NH2 D0049 <- 3.21 -> DG N7 F0006 : score 5.86108 : H : ARG NH1 D0051 <- 3.00 -> DG O6 G0021 : score 5.84 : H : ARG NH2 D0051 <- 2.95 -> DG O6 G0021 : score 6.402 : H : ARG NH2 D0053 <- 2.87 -> DG N7 G0018 : score 6.29523 : H : ARG NH2 D0053 <- 2.83 -> DG N7 G0019 : score 6.34631 : H : ARG NH1 D0083 <- 3.00 -> DG O6 G0019 : score 5.84 : H : ARG NH2 D0083 <- 2.37 -> DG O6 G0018 : score 7.1676 : H : GLU OE1 D0087 <- 3.34 -> DC N4 F0007 : score 5.14501 : H : GLN OE1 D0202 <- 2.94 -> DA N6 E0006 : score 5.88309 : H : GLN NE2 D0202 <- 2.69 -> DA N7 E0006 : score 6.22372 : H : GLN OE1 D0204 <- 3.46 -> DA N6 E0007 : score 5.25363 : H : GLN NE2 D0204 <- 2.85 -> DA N7 E0007 : score 6.02885 : H : ARG NH1 D0232 <- 2.73 -> DG N7 E0010 : score 6.1347 : H : ARG NH2 D0232 <- 3.10 -> DG N7 E0010 : score 6.00154 : H : ARG NH2 D0232 <- 2.41 -> DT O4 E0011 : score 3.83105 : V : ALA CB A0192 <- 3.52 -> DT C7 C0020 : score 5.9909 : V : ALA CB D0192 <- 3.52 -> DT C7 F0020 : score 5.9909 : x : MET xxxx A0033 <- 3.75 -> DG xxx X0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0035 <- 4.19 -> DA xxx X0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0037 <- 4.00 -> DG xxx X0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0081 <- 4.24 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0085 <- 3.51 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0188 <- 3.72 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0190 <- 3.30 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0194 <- 3.89 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0196 <- 3.89 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0197 <- 4.06 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0208 <- 3.18 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0210 <- 3.54 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0234 <- 4.03 -> DT xxx B0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0246 <- 4.43 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0252 <- 4.28 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0033 <- 3.80 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0035 <- 4.17 -> DA xxx G0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0037 <- 3.98 -> DG xxx G0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0081 <- 4.38 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0085 <- 3.51 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0188 <- 3.66 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0190 <- 3.26 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0194 <- 3.92 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0196 <- 3.83 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0197 <- 4.00 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0208 <- 3.12 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0210 <- 3.57 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0234 <- 4.11 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0246 <- 4.45 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0252 <- 4.24 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx >6bch_H:Homing_endonucleases; title=I-LTRI E29D BOUND TO COGNATE SUBSTRATE (NICKED COMPLEX) organism=Leptographium truncatum : H : ARG NH2 H0042 <- 3.46 -> DA N7 J0004 : score 1.45112 : H : ARG NH1 H0049 <- 2.64 -> DG O6 J0006 : score 6.278 : H : ARG NH2 H0049 <- 3.26 -> DG N7 J0006 : score 5.79723 : H : ARG NH1 H0051 <- 2.98 -> DG O6 K0021 : score 5.86433 : H : ARG NH2 H0051 <- 2.87 -> DG O6 K0021 : score 6.5076 : H : ARG NH2 H0053 <- 2.89 -> DG N7 K0018 : score 6.26969 : H : ARG NH2 H0053 <- 2.79 -> DG N7 K0019 : score 6.39738 : H : ARG NH1 H0083 <- 3.02 -> DG O6 K0019 : score 5.81567 : H : ARG NH2 H0083 <- 2.38 -> DG O6 K0018 : score 7.1544 : H : GLU OE1 H0087 <- 3.31 -> DC N4 J0007 : score 5.17962 : H : GLN OE1 H0202 <- 2.97 -> DA N6 I0006 : score 5.84678 : H : GLN NE2 H0202 <- 2.69 -> DA N7 I0006 : score 6.22372 : H : GLN NE2 H0204 <- 2.91 -> DA N7 I0007 : score 5.95577 : H : ARG NH1 H0232 <- 2.76 -> DG N7 I0010 : score 6.0984 : H : ARG NH2 H0232 <- 3.07 -> DG N7 I0010 : score 6.03985 : H : ARG NH2 H0232 <- 2.50 -> DT O4 I0011 : score 3.76708 : V : ALA CB H0192 <- 3.56 -> DT C7 J0020 : score 5.93491 : x : MET xxxx H0033 <- 3.82 -> DG xxx K0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0035 <- 4.18 -> DA xxx K0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0037 <- 4.02 -> DG xxx K0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0085 <- 3.49 -> DC xxx J0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0188 <- 3.75 -> DC xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0190 <- 3.27 -> DG xxx J0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0194 <- 3.87 -> DT xxx J0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0196 <- 3.85 -> DC xxx I0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0197 <- 4.01 -> DC xxx I0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0208 <- 3.13 -> DA xxx J0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0210 <- 3.65 -> DG xxx J0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0234 <- 4.12 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx H0246 <- 4.27 -> DC xxx J0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0252 <- 4.26 -> DA xxx I0007 : score x.xxxxx >6bch_HL:Homing_endonucleases; title=I-LTRI E29D BOUND TO COGNATE SUBSTRATE (NICKED COMPLEX) organism=Leptographium truncatum : H : ARG NH2 H0042 <- 3.46 -> DA N7 J0004 : score 1.45112 : H : ARG NH1 H0049 <- 2.64 -> DG O6 J0006 : score 6.278 : H : ARG NH2 H0049 <- 3.26 -> DG N7 J0006 : score 5.79723 : H : ARG NH1 H0051 <- 2.98 -> DG O6 K0021 : score 5.86433 : H : ARG NH2 H0051 <- 2.87 -> DG O6 K0021 : score 6.5076 : H : ARG NH2 H0053 <- 2.89 -> DG N7 K0018 : score 6.26969 : H : ARG NH2 H0053 <- 2.79 -> DG N7 K0019 : score 6.39738 : H : ARG NH1 H0083 <- 3.02 -> DG O6 K0019 : score 5.81567 : H : ARG NH2 H0083 <- 2.38 -> DG O6 K0018 : score 7.1544 : H : GLU OE1 H0087 <- 3.31 -> DC N4 J0007 : score 5.17962 : H : GLN OE1 H0202 <- 2.97 -> DA N6 I0006 : score 5.84678 : H : GLN NE2 H0202 <- 2.69 -> DA N7 I0006 : score 6.22372 : H : GLN NE2 H0204 <- 2.91 -> DA N7 I0007 : score 5.95577 : H : ARG NH1 H0232 <- 2.76 -> DG N7 I0010 : score 6.0984 : H : ARG NH2 H0232 <- 3.07 -> DG N7 I0010 : score 6.03985 : H : ARG NH2 H0232 <- 2.50 -> DT O4 I0011 : score 3.76708 : H : ARG NH2 L0042 <- 3.50 -> DA N7 O0004 : score 1.43774 : H : ARG NH1 L0049 <- 2.71 -> DG O6 O0006 : score 6.19283 : H : ARG NH2 L0049 <- 3.30 -> DG N7 O0006 : score 5.74615 : H : ARG NH1 L0051 <- 2.93 -> DG O6 P0021 : score 5.92517 : H : ARG NH2 L0051 <- 2.78 -> DG O6 P0021 : score 6.6264 : H : ARG NH2 L0053 <- 2.98 -> DG N7 P0018 : score 6.15477 : H : ARG NH2 L0053 <- 3.06 -> DG N7 P0019 : score 6.05262 : H : ARG NH1 L0083 <- 2.98 -> DG O6 P0019 : score 5.86433 : H : ARG NH2 L0083 <- 2.32 -> DG O6 P0018 : score 7.2336 : H : GLU OE1 L0087 <- 3.35 -> DC N4 O0007 : score 5.13347 : H : GLN OE1 L0202 <- 2.94 -> DA N6 N0006 : score 5.88309 : H : GLN NE2 L0202 <- 2.67 -> DA N7 N0006 : score 6.24808 : H : GLN OE1 L0204 <- 3.46 -> DA N6 N0007 : score 5.25363 : H : GLN NE2 L0204 <- 2.84 -> DA N7 N0007 : score 6.04103 : H : ARG NH1 L0232 <- 2.70 -> DG N7 N0010 : score 6.171 : H : ARG NH2 L0232 <- 3.05 -> DG N7 N0010 : score 6.06538 : H : ARG NH2 L0232 <- 2.55 -> DT O4 N0011 : score 3.73154 : V : ALA CB H0192 <- 3.56 -> DT C7 J0020 : score 5.93491 : V : ALA CB L0192 <- 3.51 -> DT C7 O0020 : score 6.0049 : x : MET xxxx H0033 <- 3.82 -> DG xxx K0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0035 <- 4.18 -> DA xxx K0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0037 <- 4.02 -> DG xxx K0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0085 <- 3.49 -> DC xxx J0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0188 <- 3.75 -> DC xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0190 <- 3.27 -> DG xxx J0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0194 <- 3.87 -> DT xxx J0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0196 <- 3.85 -> DC xxx I0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0197 <- 4.01 -> DC xxx I0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0208 <- 3.13 -> DA xxx J0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0210 <- 3.65 -> DG xxx J0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0234 <- 4.12 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx H0246 <- 4.27 -> DC xxx J0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0252 <- 4.26 -> DA xxx I0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0033 <- 3.75 -> DG xxx P0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0035 <- 4.18 -> DA xxx P0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0037 <- 3.99 -> DG xxx P0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0081 <- 4.00 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0085 <- 3.46 -> DC xxx O0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0188 <- 3.66 -> DC xxx O0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0190 <- 3.24 -> DG xxx O0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0194 <- 3.87 -> DT xxx O0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0196 <- 3.82 -> DC xxx N0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0197 <- 4.07 -> DC xxx N0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0208 <- 3.08 -> DA xxx O0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0210 <- 3.69 -> DG xxx O0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0234 <- 4.05 -> DT xxx N0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx L0246 <- 4.50 -> DC xxx O0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0252 <- 4.22 -> DA xxx N0007 : score x.xxxxx >6bci_A:Homing_endonucleases; title=WILD-TYPE I-LTRI BOUND TO NON-COGNATE C4 SUBSTRATE (PRE-CLEAVAGE COMPLEX) organism=LEPTOGRAPHIUM TRUNCATUM : H : ARG NH2 A0042 <- 2.44 -> DA N7 D0004 : score 1.79216 : H : ARG NH1 A0049 <- 3.32 -> DG N7 D0006 : score 5.4208 : H : ARG NH1 A0049 <- 2.58 -> DG O6 D0006 : score 6.351 : H : ARG NH2 A0049 <- 3.31 -> DG N7 D0006 : score 5.73338 : H : ARG NH1 A0051 <- 2.92 -> DG O6 B0021 : score 5.93733 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.76 -> DG O6 B0021 : score 6.6528 : H : ARG NH2 A0053 <- 3.12 -> DG N7 B0018 : score 5.976 : H : ARG NH2 A0053 <- 2.60 -> DG N7 B0019 : score 6.64 : w : ARG NH1 A0053 <- 6.21 -> DT O4 D0008 : score 1.768 : H : ARG NH1 A0083 <- 3.13 -> DG O6 B0019 : score 5.68183 : H : ARG NH2 A0083 <- 2.39 -> DG O6 B0018 : score 7.1412 : H : GLU OE1 A0087 <- 3.27 -> DC N4 D0007 : score 5.22576 : w : GLU OE2 A0087 <- 5.59 -> DT O4 D0008 : score 2.279 : H : TYR OH A0188 <- 3.32 -> DC N4 D0018 : score 3.77584 : H : GLN OE1 A0202 <- 3.22 -> DA N6 B0006 : score 5.54415 : H : GLN NE2 A0202 <- 2.76 -> DA N7 B0006 : score 6.13846 : H : GLN OE1 A0204 <- 2.95 -> DA N6 B0007 : score 5.87099 : H : GLN NE2 A0204 <- 2.93 -> DA N7 B0007 : score 5.93141 : H : GLN NE2 A0208 <- 3.30 -> DA N7 D0017 : score 5.48077 : H : ARG NH1 A0232 <- 3.10 -> DG N7 B0010 : score 5.687 : H : ARG NH2 A0232 <- 3.44 -> DT O4 B0011 : score 3.09895 : H : ARG NH1 A0234 <- 2.61 -> DG O6 D0016 : score 6.3145 : H : ARG NH2 A0234 <- 3.01 -> DG N7 D0016 : score 6.11646 : V : LEU CD2 A0197 <- 3.81 -> DT C7 B0005 : score 5.71695 : V : ASP CB A0081 <- 3.73 -> DT C7 B0016 : score 2.73003 : V : ALA CB A0192 <- 3.66 -> DT C7 D0020 : score 5.79494 : x : MET xxxx A0033 <- 4.04 -> DG xxx B0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0035 <- 3.87 -> DA xxx B0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0037 <- 3.90 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0085 <- 3.70 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0186 <- 4.18 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0190 <- 3.00 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0196 <- 3.50 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0210 <- 3.80 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0246 <- 3.86 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0252 <- 3.92 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx >6bcn_A:Homing_endonucleases; title=I-LTRI E184D BOUND TO COGNATE SUBSTRATE (PRE-CLEAVAGE COMPLEX) organism=Leptographium truncatum : H : ARG NH2 A0042 <- 2.48 -> DA N7 D0004 : score 1.77879 : w : SER OG A0047 <- 5.58 -> DT O4 D0005 : score 2.338 : H : ARG NH1 A0049 <- 2.41 -> DG O6 D0006 : score 6.55783 : H : ARG NH1 A0051 <- 2.73 -> DG O6 B0021 : score 6.1685 : H : ARG NH2 A0051 <- 3.16 -> DG N7 B0021 : score 5.92492 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.63 -> DG O6 B0021 : score 6.8244 : H : ARG NH2 A0053 <- 3.20 -> DG N7 B0018 : score 5.87385 : H : ARG NH2 A0053 <- 2.50 -> DG N7 B0019 : score 6.76769 : H : ARG NH1 A0083 <- 3.02 -> DG O6 B0019 : score 5.81567 : H : ARG NH2 A0083 <- 2.27 -> DG O6 B0018 : score 7.2996 : H : GLU OE1 A0087 <- 3.13 -> DC N4 D0007 : score 5.38726 : H : TYR OH A0188 <- 3.31 -> DC N4 D0018 : score 3.78426 : H : GLN OE1 A0202 <- 2.82 -> DA N6 B0006 : score 6.02835 : H : GLN NE2 A0202 <- 2.72 -> DA N7 B0006 : score 6.18718 : H : GLN OE1 A0204 <- 3.01 -> DA N6 B0007 : score 5.79836 : H : GLN NE2 A0204 <- 3.21 -> DA N7 B0007 : score 5.59038 : H : GLN NE2 A0208 <- 2.79 -> DA N7 D0017 : score 6.10192 : H : ARG NH1 A0232 <- 3.19 -> DG O6 B0010 : score 5.60883 : H : ARG NH2 A0232 <- 2.34 -> DG N7 B0010 : score 6.972 : H : ARG NH2 A0234 <- 3.13 -> DG N7 D0016 : score 5.96323 : H : HIS ND1 A0244 <- 2.88 -> DC N4 D0015 : score 3.17277 : V : ARG CG A0190 <- 3.89 -> DT C7 D0020 : score 0.982513 : V : LEU CD2 A0197 <- 3.86 -> DT C7 B0005 : score 5.64531 : x : SER xxxx A0031 <- 4.35 -> DG xxx B0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0033 <- 3.63 -> DG xxx B0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0035 <- 3.58 -> DA xxx B0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0037 <- 3.37 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0081 <- 3.77 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0085 <- 3.73 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0186 <- 4.30 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0192 <- 3.49 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0194 <- 3.70 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0196 <- 3.78 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0210 <- 3.26 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0246 <- 4.00 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0252 <- 3.75 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx >6bcn_AC:Homing_endonucleases; title=I-LTRI E184D BOUND TO COGNATE SUBSTRATE (PRE-CLEAVAGE COMPLEX) organism=Leptographium truncatum : H : ARG NH2 A0042 <- 2.48 -> DA N7 D0004 : score 1.77879 : w : SER OG A0047 <- 5.58 -> DT O4 D0005 : score 2.338 : H : ARG NH1 A0049 <- 2.41 -> DG O6 D0006 : score 6.55783 : H : ARG NH1 A0051 <- 2.73 -> DG O6 B0021 : score 6.1685 : H : ARG NH2 A0051 <- 3.16 -> DG N7 B0021 : score 5.92492 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.63 -> DG O6 B0021 : score 6.8244 : H : ARG NH2 A0053 <- 3.20 -> DG N7 B0018 : score 5.87385 : H : ARG NH2 A0053 <- 2.50 -> DG N7 B0019 : score 6.76769 : H : ARG NH1 A0083 <- 3.02 -> DG O6 B0019 : score 5.81567 : H : ARG NH2 A0083 <- 2.27 -> DG O6 B0018 : score 7.2996 : H : GLU OE1 A0087 <- 3.13 -> DC N4 D0007 : score 5.38726 : H : TYR OH A0188 <- 3.31 -> DC N4 D0018 : score 3.78426 : H : GLN OE1 A0202 <- 2.82 -> DA N6 B0006 : score 6.02835 : H : GLN NE2 A0202 <- 2.72 -> DA N7 B0006 : score 6.18718 : H : GLN OE1 A0204 <- 3.01 -> DA N6 B0007 : score 5.79836 : H : GLN NE2 A0204 <- 3.21 -> DA N7 B0007 : score 5.59038 : H : GLN NE2 A0208 <- 2.79 -> DA N7 D0017 : score 6.10192 : H : ARG NH1 A0232 <- 3.19 -> DG O6 B0010 : score 5.60883 : H : ARG NH2 A0232 <- 2.34 -> DG N7 B0010 : score 6.972 : H : ARG NH2 A0234 <- 3.13 -> DG N7 D0016 : score 5.96323 : H : HIS ND1 A0244 <- 2.88 -> DC N4 D0015 : score 3.17277 : H : ARG NH2 C0042 <- 2.61 -> DA N7 F0004 : score 1.73532 : H : ARG NH1 C0049 <- 2.43 -> DG O6 F0006 : score 6.5335 : H : ARG NH2 C0049 <- 3.33 -> DG N7 F0006 : score 5.70785 : H : ARG NH1 C0051 <- 2.72 -> DG O6 E0021 : score 6.18067 : H : ARG NH2 C0051 <- 3.17 -> DG N7 E0021 : score 5.91215 : H : ARG NH2 C0051 <- 2.62 -> DG O6 E0021 : score 6.8376 : H : ARG NH2 C0053 <- 3.14 -> DG N7 E0018 : score 5.95046 : H : ARG NH2 C0053 <- 2.59 -> DG N7 E0019 : score 6.65277 : w : ARG NH1 C0053 <- 6.10 -> DT O4 F0008 : score 1.768 : w : ARG NH1 C0053 <- 6.57 -> DA N6 E0020 : score 1.486 : H : ARG NH1 C0083 <- 3.11 -> DG O6 E0019 : score 5.70617 : H : ARG NH2 C0083 <- 2.22 -> DG O6 E0018 : score 7.3656 : H : GLU OE1 C0087 <- 3.01 -> DC N4 F0007 : score 5.52569 : w : GLU OE2 C0087 <- 5.30 -> DT O4 F0008 : score 2.279 : H : TYR OH C0188 <- 3.40 -> DC N4 F0018 : score 3.70841 : H : GLN OE1 C0202 <- 2.96 -> DA N6 E0006 : score 5.85888 : H : GLN NE2 C0202 <- 2.70 -> DA N7 E0006 : score 6.21154 : H : GLN OE1 C0204 <- 3.10 -> DA N6 E0007 : score 5.68941 : H : GLN NE2 C0204 <- 2.87 -> DA N7 E0007 : score 6.00449 : H : GLN NE2 C0208 <- 2.77 -> DA N7 F0017 : score 6.12628 : H : ARG NH2 C0232 <- 2.28 -> DG N7 E0010 : score 7.04862 : H : ARG NH2 C0232 <- 2.77 -> DG O6 E0010 : score 6.6396 : w : ARG NH1 C0232 <- 5.25 -> DC N4 E0009 : score 1.892 : H : ARG NH2 C0234 <- 3.07 -> DG N7 F0016 : score 6.03985 : V : ARG CG A0190 <- 3.89 -> DT C7 D0020 : score 0.982513 : V : ARG CG C0190 <- 3.79 -> DT C7 F0020 : score 1.00764 : V : LEU CD2 A0197 <- 3.86 -> DT C7 B0005 : score 5.64531 : V : ASP CB C0081 <- 3.71 -> DT C7 E0016 : score 2.74345 : x : SER xxxx A0031 <- 4.35 -> DG xxx B0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0033 <- 3.63 -> DG xxx B0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0035 <- 3.58 -> DA xxx B0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0037 <- 3.37 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0081 <- 3.77 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0085 <- 3.73 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0186 <- 4.30 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0192 <- 3.49 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0194 <- 3.70 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0196 <- 3.78 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0210 <- 3.26 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0246 <- 4.00 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0252 <- 3.75 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0031 <- 4.39 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0033 <- 3.68 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0035 <- 3.60 -> DA xxx E0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0037 <- 3.46 -> DG xxx E0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0085 <- 3.60 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0186 <- 4.24 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0192 <- 3.46 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0194 <- 3.67 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0196 <- 4.17 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0197 <- 3.38 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0210 <- 3.41 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0246 <- 3.91 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0252 <- 3.79 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0311 <- 3.89 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx >6bct_A:Homing_endonucleases; title=I-LTRI E184D BOUND TO NON-COGNATE C4 SUBSTRATE (PRE-CLEAVAGE COMPLEX) organism=Leptographium truncatum : H : ARG NH2 A0042 <- 2.78 -> DA N7 D0004 : score 1.67848 : H : ARG NH1 A0049 <- 3.17 -> DG N7 D0006 : score 5.6023 : H : ARG NH1 A0049 <- 2.75 -> DG O6 D0006 : score 6.14417 : H : ARG NH1 A0051 <- 2.99 -> DG O6 B0021 : score 5.85217 : H : ARG NH2 A0051 <- 2.41 -> DG O6 B0021 : score 7.1148 : H : ARG NH2 A0053 <- 2.63 -> DG N7 B0019 : score 6.60169 : H : ARG NH1 A0083 <- 3.04 -> DG O6 B0019 : score 5.79133 : H : ARG NH2 A0083 <- 2.31 -> DG O6 B0018 : score 7.2468 : H : TYR OH A0188 <- 3.05 -> DC N4 D0018 : score 4.0034 : H : GLN OE1 A0204 <- 3.28 -> DA N6 B0007 : score 5.47152 : H : GLN NE2 A0204 <- 3.39 -> DA N7 B0007 : score 5.37115 : H : GLN NE2 A0208 <- 3.09 -> DA N7 D0017 : score 5.73654 : H : ARG NH1 A0232 <- 2.77 -> DG O6 B0010 : score 6.11983 : H : ARG NH2 A0232 <- 2.65 -> DG O6 B0010 : score 6.798 : H : ARG NH1 A0234 <- 2.50 -> DG O6 D0016 : score 6.44833 : H : ARG NH2 A0234 <- 3.09 -> DG N7 D0016 : score 6.01431 : V : GLN CG A0202 <- 3.60 -> DT C7 B0005 : score 3.41815 : V : ALA CB A0192 <- 3.88 -> DT C7 D0020 : score 5.48699 : x : MET xxxx A0033 <- 3.73 -> DG xxx B0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0035 <- 3.79 -> DA xxx B0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0037 <- 3.78 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0081 <- 3.88 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0085 <- 3.76 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0087 <- 3.48 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0186 <- 4.37 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0196 <- 3.38 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0210 <- 3.62 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0246 <- 3.83 -> DC xxx D0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0252 <- 3.92 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx >6bd0_A:Homing_endonucleases; title=I-ONUI K227Y, D236A BOUND TO COGNATE SUBSTRATE (PRE-CLEAVAGE COMPLEX) organism=Ophiostoma novo-ulmi subsp. americana : H : ARG NH1 A0028 <- 2.89 -> DG O6 C0020 : score 5.97383 : H : ARG NH2 A0028 <- 2.82 -> DG N7 C0020 : score 6.35908 : H : ARG NH1 A0030 <- 2.75 -> DG O6 C0021 : score 6.14417 : H : ARG NH2 A0030 <- 2.93 -> DG N7 C0021 : score 6.21862 : w : ARG NH1 A0030 <- 5.67 -> DT O4 B0004 : score 1.768 : w : ASN ND2 A0032 <- 5.62 -> DT O4 B0003 : score 3.275 : H : GLU OE1 A0042 <- 3.07 -> DC N4 B0005 : score 5.45648 : w : GLU OE1 A0042 <- 5.55 -> DT O4 B0004 : score 2.749 : w : GLU OE2 A0042 <- 5.80 -> DC N4 B0006 : score 3.597 : H : GLN NE2 A0046 <- 3.20 -> DG N7 C0018 : score 3.86282 : w : THR OG1 A0048 <- 5.54 -> DA N7 C0017 : score 2.152 : H : SER OG A0072 <- 2.76 -> DT O4 B0009 : score 3.58357 : w : SER OG A0072 <- 5.78 -> DT O4 B0010 : score 2.338 : w : SER OG A0078 <- 5.65 -> DC N4 B0008 : score 2.105 : H : LYS NZ A0080 <- 2.87 -> DG O6 C0018 : score 5.69984 : w : LYS NZ A0080 <- 5.55 -> DT O4 C0019 : score 1.7 : H : ASN ND2 A0184 <- 3.02 -> DT O4 B0019 : score 5.05209 : w : SER OG A0188 <- 5.73 -> DA N6 C0004 : score 2.209 : w : SER OG A0188 <- 5.87 -> DA N7 C0004 : score 2.343 : H : GLN OE1 A0195 <- 3.02 -> DA N6 C0005 : score 5.78625 : H : GLN NE2 A0195 <- 2.96 -> DA N7 C0005 : score 5.89487 : w : GLN OE1 A0195 <- 5.84 -> DA N6 C0004 : score 3.392 : H : GLN NE2 A0197 <- 3.02 -> DA N7 C0006 : score 5.82179 : w : GLN OE1 A0197 <- 5.78 -> DA N6 C0007 : score 3.392 : w : SER OG A0201 <- 5.51 -> DA N7 B0016 : score 2.343 : w : TYR OH A0223 <- 5.90 -> DA N7 C0007 : score 3.238 : H : LYS NZ A0225 <- 2.91 -> DG N7 C0008 : score 5.26741 : w : LYS NZ A0225 <- 6.26 -> DA N7 C0007 : score 1.655 : H : TYR OH A0227 <- 2.88 -> DG O6 C0009 : score 3.5752 : w : TYR OH A0227 <- 5.83 -> DA N6 B0016 : score 2.545 : H : LYS NZ A0229 <- 2.82 -> DG O6 C0012 : score 5.75765 : w : LYS NZ A0229 <- 6.04 -> DT O4 B0013 : score 1.7 : w : TRP NE1 A0234 <- 6.00 -> DA N6 B0015 : score 4.074 : w : LYS NZ A0299 <- 5.19 -> DA N3 B0015 : score 1.538 : V : ALA CB A0076 <- 3.73 -> DT C7 C0015 : score 5.69696 : V : LYS CB A0034 <- 3.90 -> DT C7 B0002 : score 2.248 : V : SER CB A0040 <- 3.75 -> DT C7 B0003 : score 3.17042 : V : PHE CB A0232 <- 3.54 -> DT C7 B0013 : score 6.17809 : V : ILE CG2 A0186 <- 3.77 -> DT C7 B0020 : score 7.14447 : x : SER xxxx A0024 <- 4.34 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0035 <- 3.79 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0180 <- 3.88 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0182 <- 3.57 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0189 <- 4.26 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0203 <- 3.41 -> DA xxx B0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 4.01 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx >6bda_A:Homing_endonucleases; title=WILD-TYPE I-ONUI BOUND TO A3G SUBSTRATE (POST-CLEAVAGE COMPLEX) organism=Ophiostoma novo-ulmi subsp. americana : H : ARG NH1 A0028 <- 2.93 -> DG O6 E0020 : score 5.92517 : H : ARG NH2 A0028 <- 2.96 -> DG N7 E0020 : score 6.18031 : H : ARG NH1 A0030 <- 2.84 -> DG O6 E0021 : score 6.03467 : H : ARG NH2 A0030 <- 2.98 -> DG N7 E0021 : score 6.15477 : w : ARG NH1 A0030 <- 5.74 -> DT O4 B0004 : score 1.768 : w : ASN ND2 A0032 <- 5.65 -> DT O4 B0003 : score 3.275 : H : GLU OE1 A0042 <- 3.10 -> DC N4 B0005 : score 5.42187 : w : GLU OE1 A0042 <- 5.43 -> DT O4 B0004 : score 2.749 : w : GLU OE2 A0042 <- 6.50 -> DC N4 B0006 : score 3.597 : w : THR OG1 A0048 <- 6.03 -> DA N6 E0017 : score 3.251 : w : SER OG A0072 <- 5.31 -> DT O4 B0009 : score 2.338 : w : SER OG A0072 <- 6.01 -> DA N6 E0017 : score 2.209 : w : SER OG A0078 <- 5.79 -> DC N4 B0008 : score 2.105 : w : LYS NZ A0080 <- 6.22 -> DA N6 E0017 : score 2.097 : H : ASN ND2 A0184 <- 2.99 -> DT O4 C0019 : score 5.0838 : w : SER OG A0188 <- 6.00 -> DA N6 D0004 : score 2.209 : w : SER OG A0188 <- 5.84 -> DA N7 D0004 : score 2.343 : H : GLN OE1 A0195 <- 3.07 -> DA N6 D0005 : score 5.72573 : H : GLN NE2 A0195 <- 2.84 -> DA N7 D0005 : score 6.04103 : w : GLN OE1 A0195 <- 5.69 -> DA N6 D0004 : score 3.392 : H : GLN NE2 A0197 <- 3.06 -> DA N7 D0006 : score 5.77308 : w : GLN OE1 A0197 <- 5.90 -> DA N6 D0007 : score 3.392 : w : TYR OH A0223 <- 5.67 -> DA N7 D0007 : score 3.238 : H : LYS NZ A0225 <- 3.02 -> DG N7 D0008 : score 5.14892 : w : LYS NZ A0225 <- 5.87 -> DA N7 D0007 : score 1.655 : H : LYS NZ A0227 <- 2.77 -> DG O6 D0009 : score 5.81545 : w : LYS NZ A0227 <- 5.87 -> DG O6 C0015 : score 3.005 : H : LYS NZ A0229 <- 2.76 -> DG O6 D0012 : score 5.82702 : w : TRP NE1 A0234 <- 5.74 -> DG O6 C0015 : score 4.362 : w : ASP OD2 A0236 <- 6.36 -> DA N6 C0016 : score 3.409 : w : LYS NZ A0299 <- 5.55 -> DA N3 C0016 : score 1.538 : V : ALA CB A0076 <- 3.84 -> DT C7 D0015 : score 5.54298 : V : LYS CE A0034 <- 3.84 -> DT C7 B0002 : score 2.57502 : V : PHE CB A0232 <- 3.60 -> DT C7 B0013 : score 6.09108 : V : ILE CG2 A0186 <- 3.67 -> DT C7 C0020 : score 7.32175 : x : SER xxxx A0035 <- 4.22 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0040 <- 3.93 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0046 <- 3.75 -> DA xxx E0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0082 <- 4.46 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0180 <- 3.72 -> DA xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0182 <- 3.54 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0189 <- 4.43 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0190 <- 4.41 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0203 <- 3.43 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 4.02 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx >6bdb_A:Homing_endonucleases; title=I-ONUI K227Y, D236A BOUND TO A3G SUBSTRATE (PRE-CLEAVAGE COMPLEX) organism=Ophiostoma novo-ulmi subsp. americana : H : ARG NH1 A0028 <- 2.82 -> DG O6 C0020 : score 6.059 : H : ARG NH2 A0028 <- 2.84 -> DG N7 C0020 : score 6.33354 : H : ARG NH1 A0030 <- 2.84 -> DG O6 C0021 : score 6.03467 : H : ARG NH2 A0030 <- 2.85 -> DG N7 C0021 : score 6.32077 : w : ARG NH1 A0030 <- 5.50 -> DT O4 B0004 : score 1.768 : w : ASN ND2 A0032 <- 5.68 -> DT O4 B0003 : score 3.275 : H : GLU OE1 A0042 <- 3.08 -> DC N4 B0005 : score 5.44494 : w : GLU OE1 A0042 <- 5.47 -> DT O4 B0004 : score 2.749 : w : GLU OE2 A0042 <- 5.69 -> DC N4 B0006 : score 3.597 : H : GLN NE2 A0046 <- 3.18 -> DG N7 C0018 : score 3.87962 : w : THR OG1 A0048 <- 5.56 -> DA N7 C0017 : score 2.152 : H : SER OG A0072 <- 2.83 -> DT O4 B0009 : score 3.5338 : w : SER OG A0078 <- 5.71 -> DC N4 B0008 : score 2.105 : H : LYS NZ A0080 <- 2.91 -> DG O6 C0018 : score 5.65359 : w : LYS NZ A0080 <- 5.55 -> DT O4 C0019 : score 1.7 : H : ASN ND2 A0184 <- 2.98 -> DT O4 B0019 : score 5.09437 : H : GLN OE1 A0195 <- 3.13 -> DA N6 C0005 : score 5.65309 : H : GLN NE2 A0195 <- 2.87 -> DA N7 C0005 : score 6.00449 : H : GLN NE2 A0197 <- 3.02 -> DA N7 C0006 : score 5.82179 : w : GLN OE1 A0197 <- 5.93 -> DA N6 C0007 : score 3.392 : w : SER OG A0201 <- 5.64 -> DA N7 B0016 : score 2.343 : w : TYR OH A0223 <- 5.63 -> DA N7 C0007 : score 3.238 : H : LYS NZ A0225 <- 2.95 -> DG N7 C0008 : score 5.22432 : H : LYS NZ A0225 <- 3.05 -> DG O6 C0009 : score 5.49173 : H : TYR OH A0227 <- 2.99 -> DG O6 C0009 : score 3.49527 : w : TYR OH A0227 <- 6.13 -> DA N6 B0016 : score 2.545 : H : GLU OE2 A0231 <- 3.15 -> DC N4 B0014 : score 4.89681 : w : GLU OE2 A0231 <- 5.90 -> DC N4 C0011 : score 3.597 : w : TRP NE1 A0234 <- 5.90 -> DG O6 B0015 : score 4.362 : w : LYS NZ A0299 <- 5.83 -> DA N3 B0016 : score 1.538 : V : LYS CB A0034 <- 3.88 -> DT C7 B0002 : score 2.25953 : V : SER CB A0040 <- 3.80 -> DT C7 B0003 : score 3.13128 : V : ALA CB A0076 <- 3.67 -> DT C7 C0015 : score 5.78094 : x : SER xxxx A0024 <- 3.87 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0180 <- 3.99 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0182 <- 3.56 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0186 <- 3.49 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0203 <- 3.63 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0229 <- 4.42 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0232 <- 3.95 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 3.81 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx >6bek_A:S13-like_H2TH_domain; title=STRUCTURE OF SIHF BOUND TO AN 8BP PALINDROMIC DNA organism=? : w : ARG NH1 A0085 <- 5.75 -> DG N3 C0004 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0085 <- 6.43 -> DG N2 C0004 : score 1.593 >6bel_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH R- ISOMER OF BETA-GAMMA-CHF-DCTP organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.36 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.96 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.52 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6bem_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH S- ISOMER OF BETA-GAMMA-CHCL-DCTP organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.46 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.02 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.55 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6bhx_ABC:Nucleic_acid-binding_proteins; title=B. SUBTILIS SSBA WITH DNA organism=Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) : w : ASN OD1 B0050 <- 6.53 -> DT O4 E0002 : score 3.132 : V : PHE CD1 C0091 <- 3.68 -> DT C7 E0001 : score 4.27529 : V : THR CG2 B0030 <- 3.74 -> DT C7 E0002 : score 4.30048 : V : PHE CZ B0048 <- 3.84 -> DT C7 E0003 : score 7.04372 : x : GLN xxxx A0057 <- 3.00 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0060 <- 3.72 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0101 <- 3.95 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0102 <- 3.28 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0010 <- 3.74 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0012 <- 3.98 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0013 <- 3.64 -> DT xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0032 <- 3.28 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0034 <- 3.08 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0036 <- 3.28 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0037 <- 3.56 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0046 <- 3.83 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0000 <- 3.13 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx >6bhx_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=B. SUBTILIS SSBA WITH DNA organism=Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) : w : ASN OD1 B0050 <- 6.53 -> DT O4 E0002 : score 3.132 : V : THR CG2 B0030 <- 3.74 -> DT C7 E0002 : score 4.30048 : V : PHE CZ B0048 <- 3.84 -> DT C7 E0003 : score 7.04372 : x : ARG xxxx B0010 <- 3.74 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0012 <- 3.98 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0013 <- 3.64 -> DT xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0032 <- 3.28 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0034 <- 3.08 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0036 <- 3.28 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0037 <- 3.56 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0046 <- 3.83 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx >6bjs_IJ: title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI HIS PAUSE ELONGATION COMPLEX WITHOUT PAUSE HAIRPIN organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NE I0542 <- 2.52 -> DG O6 A0018 : score 4.16172 : H : ARG NH2 I0542 <- 3.02 -> DG O6 A0018 : score 6.3096 : x : ARG xxxx I0151 <- 3.36 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.08 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.34 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 4.29 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0046 <- 4.19 -> DC xxx A0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0270 <- 3.64 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0274 <- 3.76 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.96 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx >6bjs_J:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI HIS PAUSE ELONGATION COMPLEX WITHOUT PAUSE HAIRPIN organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : TYR xxxx J0046 <- 4.19 -> DC xxx A0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0270 <- 3.64 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0274 <- 3.76 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.96 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx >6bkf_A:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain; title=LYSYL-ADENYLATE FORM OF HUMAN LIGIV CATALYTIC DOMAIN WITH BOUND DNA SUBSTRATE IN OPEN CONFORMATION organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0443 <- 4.41 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx >6bkg_A:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain; title=HUMAN LIGIV CATALYTIC DOMAIN WITH BOUND DNA-ADENYLATE INTERMEDIATE IN CLOSED CONFORMATION organism=Homo sapiens : w : GLU OE2 A0277 <- 6.28 -> DG N2 P0009 : score 1.976 : H : LYS NZ A0345 <- 2.58 -> DT O2 P0010 : score 3.74502 : w : ASP OD1 A0350 <- 6.13 -> DG N2 P0009 : score 2.312 : w : ARG NH1 A0476 <- 5.42 -> DA N3 T0006 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0577 <- 6.01 -> DC O2 P0011 : score 1.669 : x : SER xxxx A0508 <- 4.28 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0578 <- 3.17 -> DG xxx T0008 : score x.xxxxx >6blo_AB: title=POL II ELONGATION COMPLEX WITH AN ABASIC LESION AT I+1 POSITION organism=? : x : ARG xxxx A0350 <- 4.28 -> DT xxx T0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 4.45 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx >6blp_AB: title=POL II ELONGATION COMPLEX WITH AN ABASIC LESION AT I+1 POSITION, SOAKING AMPCPP organism=? : x : GLN xxxx A0447 <- 4.32 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 4.23 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0836 <- 3.26 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx >6blw_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZINC FINGER DOMAIN OF WT1(+KTS FORM) WITH M342R MUTATION AND 17+1MER OLIGONUCLEOTIDE WITH TRIPLET GGT organism=Homo sapiens : H : SER OG A0338 <- 2.73 -> DA N7 C0003 : score 4.5266 : H : HIS NE2 A0339 <- 3.03 -> DG N7 B0015 : score 6.48965 : H : ARG NH1 A0342 <- 2.79 -> DG O6 B0014 : score 6.0955 : H : ARG NH2 A0342 <- 2.91 -> DG N7 B0014 : score 6.24415 : w : ARG NH1 A0342 <- 5.72 -> DC N4 C0005 : score 1.892 : H : ARG NH1 A0366 <- 3.20 -> DG N7 B0013 : score 5.566 : H : ARG NH2 A0366 <- 2.78 -> DG O6 B0013 : score 6.6264 : H : ASP OD2 A0368 <- 2.88 -> DC N4 C0006 : score 6.1008 : w : ASP OD2 A0368 <- 5.90 -> DC N4 C0005 : score 3.623 : w : GLN NE2 A0369 <- 5.43 -> DA N7 B0012 : score 1.888 : H : ARG NH1 A0372 <- 3.02 -> DG O6 B0011 : score 5.81567 : H : ARG NH2 A0372 <- 2.74 -> DG N7 B0011 : score 6.46123 : w : ARG NH1 A0372 <- 5.32 -> DT O4 C0008 : score 1.768 : H : ARG NH1 A0394 <- 2.90 -> DG N7 B0010 : score 5.929 : H : ARG NH2 A0394 <- 2.93 -> DG O6 B0010 : score 6.4284 : H : ASP OD2 A0396 <- 3.07 -> DC N4 C0009 : score 5.8652 : w : ASP OD2 A0396 <- 5.71 -> DG O6 B0009 : score 3.228 : w : ASP OD2 A0396 <- 5.78 -> DC N4 C0010 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0397 <- 2.84 -> DG N7 B0009 : score 6.74814 >6bm2_AB: title=POL II ELONGATION COMPLEX WITH AN ABASIC LESION AT I-1 POSITION organism=? : x : ALA xxxx A0832 <- 3.52 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0531 <- 3.31 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx >6bm2_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=POL II ELONGATION COMPLEX WITH AN ABASIC LESION AT I-1 POSITION organism=? : x : GLN xxxx B0531 <- 3.31 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx >6bm4_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=POL II ELONGATION COMPLEX WITH AN ABASIC LESION AT I-1 POSITION,SOAKING UMPNPP organism=? : x : ALA xxxx A0832 <- 4.00 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0833 <- 4.02 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0836 <- 3.56 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx >6bm4_AB: title=POL II ELONGATION COMPLEX WITH AN ABASIC LESION AT I-1 POSITION,SOAKING UMPNPP organism=? : x : ALA xxxx A0832 <- 4.00 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0833 <- 4.02 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0836 <- 3.56 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx >6boq_A:DNase_I-like; title=HUMAN APE1 SUBSTRATE COMPLEX WITH AN A/A MISMATCH ADJACENT THE THF organism=Homo sapiens : w : ASP OD1 A0070 <- 5.77 -> DC O2 V0013 : score 1.919 : w : ASN OD1 A0226 <- 5.64 -> DG N7 D0013 : score 1.873 : x : LYS xxxx A0098 <- 3.89 -> DG xxx V0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0177 <- 3.50 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0229 <- 3.24 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0269 <- 4.01 -> DA xxx V0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 3.34 -> DA xxx V0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0271 <- 3.23 -> DG xxx V0010 : score x.xxxxx >6bor_A:DNase_I-like; title=HUMAN APE1 SUBSTRATE COMPLEX WITH AN G/G MISMATCH ADJACENT THE THF organism=Homo sapiens : w : ASP OD1 A0070 <- 5.89 -> DC O2 V0013 : score 1.919 : w : ASP OD2 A0070 <- 5.45 -> DC O2 V0013 : score 1.919 : w : GLN NE2 A0096 <- 6.36 -> DG N3 P0010 : score 1.484 : H : LYS NZ A0098 <- 3.12 -> DG N3 V0014 : score 1.3608 : w : LYS NZ A0098 <- 5.85 -> DC O2 V0013 : score 1.3 : w : LYS NZ A0098 <- 6.19 -> DC O2 V0015 : score 1.3 : w : LYS NZ A0098 <- 5.94 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : TYR OH A0128 <- 2.61 -> DC O2 P0008 : score 3.63034 : x : ASN xxxx A0229 <- 3.96 -> DC xxx P0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0269 <- 3.80 -> DG xxx V0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 3.40 -> DG xxx V0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0271 <- 3.58 -> DC xxx P0012 : score x.xxxxx >6bos_A:DNase_I-like; title=HUMAN APE1 SUBSTRATE COMPLEX WITH AN A/C MISMATCH ADJACENT THE THF organism=Homo sapiens : w : ASP OD1 A0070 <- 5.32 -> DC O2 V0013 : score 1.919 : x : LYS xxxx A0098 <- 3.70 -> DG xxx V0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0177 <- 3.13 -> DC xxx P0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0226 <- 4.07 -> DG xxx P0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0229 <- 3.03 -> DC xxx P0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0269 <- 3.80 -> DA xxx V0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 2.91 -> DA xxx V0011 : score x.xxxxx >6bot_A:DNase_I-like; title=HUMAN APE1 SUBSTRATE COMPLEX WITH AN C/C MISMATCH ADJACENT THE THF organism=Homo sapiens : w : ASP OD1 A0070 <- 5.17 -> DC O2 V0013 : score 1.919 : w : ASN OD1 A0226 <- 6.08 -> DG N7 P0013 : score 1.873 : x : LYS xxxx A0098 <- 3.75 -> DG xxx V0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0177 <- 3.19 -> DA xxx V0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0229 <- 3.10 -> DC xxx P0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0269 <- 3.52 -> DC xxx V0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 3.32 -> DA xxx V0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0271 <- 3.23 -> DG xxx V0010 : score x.xxxxx >6bou_A:DNase_I-like; title=HUMAN APE1 SUBSTRATE COMPLEX WITH AN T/C MISMATCH ADJACENT THE THF organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0098 <- 3.68 -> DG xxx V0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0177 <- 3.44 -> DC xxx P0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0224 <- 2.83 -> DC xxx V0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0229 <- 2.99 -> DC xxx P0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0269 <- 3.64 -> DT xxx V0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 3.83 -> DA xxx V0011 : score x.xxxxx >6bov_A:DNase_I-like; title=HUMAN APE1 SUBSTRATE COMPLEX WITH AN A/G MISMATCH ADJACENT THE THF organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 A0181 <- 5.69 -> DG N2 P0010 : score 1.593 : w : ASN OD1 A0226 <- 5.42 -> DG N7 P0013 : score 1.873 : x : LYS xxxx A0098 <- 3.72 -> DG xxx V0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0177 <- 3.32 -> DC xxx P0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0229 <- 3.03 -> DC xxx P0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0269 <- 3.98 -> DA xxx V0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 3.68 -> DA xxx V0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0271 <- 3.18 -> DG xxx P0013 : score x.xxxxx >6bow_A:DNase_I-like; title=HUMAN APE1 SUBSTRATE COMPLEX WITH AN T/T MISMATCH ADJACENT THE THF organism=Homo sapiens : w : ASP OD1 A0070 <- 6.56 -> DG N2 P0009 : score 2.312 : w : LYS NZ A0098 <- 6.30 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : ASN OD1 A0226 <- 5.52 -> DG N7 P0013 : score 1.873 : x : ARG xxxx A0177 <- 3.43 -> DT xxx P0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0229 <- 3.01 -> DC xxx P0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0269 <- 3.55 -> DT xxx V0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 3.66 -> DA xxx V0011 : score x.xxxxx >6bqf_AB: title=POL II ELONGATION COMPLEX WITH 'DT-AP' AT I+1, I-1 POSITION organism=? : x : TYR xxxx A0836 <- 3.17 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx >6brr_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNMT3A (R836A)-DNMT3L IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING TWO CPG SITES organism=HOMO SAPIENS : x : ILE xxxx A0715 <- 3.51 -> DA xxx E0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0716 <- 3.50 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0717 <- 4.46 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0718 <- 3.61 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0834 <- 4.32 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0835 <- 4.33 -> DT xxx F0429 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0836 <- 4.18 -> DT xxx F0429 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0837 <- 3.63 -> DG xxx E0438 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0838 <- 3.96 -> DA xxx E0439 : score x.xxxxx >6brr_AD:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNMT3A (R836A)-DNMT3L IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING TWO CPG SITES organism=HOMO SAPIENS : x : ILE xxxx A0715 <- 3.51 -> DA xxx E0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0716 <- 3.50 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0717 <- 4.46 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0718 <- 3.61 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0834 <- 4.32 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0835 <- 4.33 -> DT xxx F0429 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0836 <- 4.18 -> DT xxx F0429 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0837 <- 3.63 -> DG xxx E0438 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0838 <- 3.96 -> DA xxx E0439 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0715 <- 3.33 -> DA xxx F0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0716 <- 3.49 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0717 <- 4.19 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0718 <- 3.31 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0834 <- 4.43 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0835 <- 4.01 -> DT xxx E0429 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0836 <- 3.77 -> DT xxx E0429 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0837 <- 2.81 -> DG xxx F0438 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0838 <- 3.73 -> DA xxx F0439 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0883 <- 3.80 -> DA xxx F0437 : score x.xxxxx >6brx_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE KAPPA IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING THE MAJOR CISPLATIN LESION organism=Homo sapiens : x : SER xxxx B0415 <- 4.10 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0419 <- 3.47 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0512 <- 4.33 -> DG xxx T0008 : score x.xxxxx >6bs1_B:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE KAPPA IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING THE MAJOR CISPLATIN LESION organism=Homo sapiens : x : SER xxxx B0417 <- 4.40 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0419 <- 4.17 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0469 <- 3.90 -> DC xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0512 <- 4.30 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx >6bse_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR BOUND TO HIGH COOPERATIVITY MONOMER SEQUENCE organism=Saguinus oedipus : H : LYS NZ A0442 <- 2.99 -> DG N7 C0007 : score 5.18123 : H : ARG NH1 A0447 <- 3.19 -> DG N7 D0008 : score 5.5781 : H : ARG NH2 A0447 <- 2.78 -> DG O6 D0008 : score 6.6264 : x : VAL xxxx A0443 <- 3.91 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0446 <- 3.79 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >6bse_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR BOUND TO HIGH COOPERATIVITY MONOMER SEQUENCE organism=Saguinus oedipus : H : LYS NZ A0442 <- 2.99 -> DG N7 C0007 : score 5.18123 : H : ARG NH1 A0447 <- 3.19 -> DG N7 D0008 : score 5.5781 : H : ARG NH2 A0447 <- 2.78 -> DG O6 D0008 : score 6.6264 : H : ARG NH1 B0447 <- 3.24 -> DG N7 C0016 : score 5.5176 : H : ARG NH2 B0447 <- 3.08 -> DG O6 C0016 : score 6.2304 : x : VAL xxxx A0443 <- 3.91 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0446 <- 3.79 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0443 <- 4.44 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx >6bsg_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 RT COMPLEXED WITH RNA/DNA HYBRID IN AN RNA HYDROLYSIS-OFF MODE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : x : MET xxxx A0230 <- 3.87 -> DG xxx D0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.66 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0474 <- 3.42 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.34 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0501 <- 4.00 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0418 <- 3.12 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx >6bsg_B:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURE OF HIV-1 RT COMPLEXED WITH RNA/DNA HYBRID IN AN RNA HYDROLYSIS-OFF MODE organism=? : x : ASN xxxx B0418 <- 3.12 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx >6bsh_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 RT COMPLEXED WITH RNA/DNA HYBRID IN THE RNA HYDROLYSIS MODE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : w : ASN ND2 A0265 <- 6.24 -> DT O2 D0019 : score 1.666 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.04 -> DT O2 D0004 : score 4.03013 : H : ASN ND2 A0474 <- 3.31 -> DC O2 D0006 : score 4.02258 : H : ASN ND2 B0418 <- 2.60 -> DC O2 D0009 : score 4.65867 >6bsh_B:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURE OF HIV-1 RT COMPLEXED WITH RNA/DNA HYBRID IN THE RNA HYDROLYSIS MODE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : ASN ND2 B0418 <- 2.60 -> DC O2 D0009 : score 4.65867 >6bsi_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 RT COMPLEXED WITH AN RNA/DNA HYBRID CONTAINING THE POLYPURINE-TRACT SEQUENCE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : V : ILE CG1 A0505 <- 3.79 -> DT C7 D0010 : score 4.97137 : x : MET xxxx A0230 <- 3.84 -> DG xxx D0021 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0361 <- 3.87 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0406 <- 3.92 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >6bsi_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 RT COMPLEXED WITH AN RNA/DNA HYBRID CONTAINING THE POLYPURINE-TRACT SEQUENCE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : V : ILE CG1 A0505 <- 3.79 -> DT C7 D0010 : score 4.97137 : x : MET xxxx A0230 <- 3.84 -> DG xxx D0021 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0361 <- 3.87 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0406 <- 3.92 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0418 <- 3.05 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >6bsj_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 RT COMPLEXED WITH AN RNA/DNA HYBRID SEQUENCE NON- PREFERRED FOR RNA HYDROLYSIS organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.34 -> DG N3 D0006 : score 2.72289 : x : LYS xxxx A0073 <- 4.12 -> DC xxx D0024 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0230 <- 4.12 -> DG xxx D0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.16 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0418 <- 3.88 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx >6bsj_B:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURE OF HIV-1 RT COMPLEXED WITH AN RNA/DNA HYBRID SEQUENCE NON- PREFERRED FOR RNA HYDROLYSIS organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : x : ASN xxxx B0418 <- 3.88 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx >6bte_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA I260Q BINARY COMPLEX organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.33 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.92 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.63 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6buz_A:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF CENP-A NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH KINETOCHORE PROTEIN CENP-N organism=HOMO SAPIENS : x : LEU xxxx A0065 <- 4.42 -> DA xxx J0017 : score x.xxxxx >6buz_H:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF CENP-A NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH KINETOCHORE PROTEIN CENP-N organism=? : x : ARG xxxx H0034 <- 3.45 -> DC xxx J-047 : score x.xxxxx >6bwy_A:Nucleic_acid-binding_proteins;Cytidine_deaminase-like; title=DNA SUBSTRATE SELECTION BY APOBEC3G organism=? : H : THR OG1 A0131 <- 2.31 -> DG O6 a0003 : score 4.62849 : H : LYS NZ A0144 <- 2.93 -> DG N7 a0002 : score 5.24586 : H : LYS NZ A0144 <- 3.09 -> DG O6 a0002 : score 5.44548 >6byy_AB:SRF-like; title=MEF2 CHIMERA/DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0003 <- 2.76 -> DT O2 K0005 : score 2.59754 : H : ARG NH2 A0003 <- 3.08 -> DT O2 K0005 : score 3.99627 : H : LYS NZ A0023 <- 2.87 -> DA N7 L0012 : score 2.89606 : w : LYS NZ A0023 <- 5.14 -> DG O6 L0013 : score 3.005 : w : LYS NZ A0023 <- 6.06 -> DG N7 L0013 : score 2.519 : H : ARG NE B0003 <- 2.74 -> DT O2 L0005 : score 2.60785 : H : ARG NH2 B0003 <- 3.21 -> DT O2 L0005 : score 3.8862 : H : LYS NZ B0023 <- 2.78 -> DA N7 K0012 : score 2.94893 : w : LYS NZ B0023 <- 5.60 -> DA N7 K0013 : score 1.655 >6byy_C:SRF-like; title=MEF2 CHIMERA/DNA COMPLEX organism=? : H : ARG NE C0003 <- 2.94 -> DA N3 E0013 : score 2.04369 : x : LYS xxxx C0023 <- 4.07 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx >6byy_CD:SRF-like; title=MEF2 CHIMERA/DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE C0003 <- 2.94 -> DA N3 E0013 : score 2.04369 : H : LYS NZ D0023 <- 2.72 -> DA N7 F0012 : score 2.98417 : x : LYS xxxx C0023 <- 4.07 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0003 <- 3.49 -> DA xxx F0012 : score x.xxxxx >6bz1_AB:SRF-like; title=MEF2 CHIMERA D83V MUTANT/DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0003 <- 2.69 -> DT O2 F0005 : score 2.63362 : H : ARG NE A0003 <- 3.17 -> DT O2 F0006 : score 2.38623 : H : ARG NH2 A0003 <- 2.74 -> DT O2 F0005 : score 4.28413 : x : LYS xxxx A0023 <- 4.08 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0003 <- 2.68 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0023 <- 3.11 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx >6bz1_CD:SRF-like; title=MEF2 CHIMERA D83V MUTANT/DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 C0003 <- 2.67 -> DT O2 H0005 : score 4.41838 : H : LYS NZ C0023 <- 2.83 -> DA N7 G0012 : score 2.91956 : H : LYS NZ D0023 <- 2.81 -> DA N7 H0012 : score 2.93131 : x : VAL xxxx C0019 <- 4.46 -> DT xxx H0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0003 <- 3.36 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx >6bz1_D:SRF-like; title=MEF2 CHIMERA D83V MUTANT/DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ D0023 <- 2.81 -> DA N7 H0012 : score 2.93131 : x : ARG xxxx D0003 <- 3.36 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx >6bzo_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=MTB RNAP HOLO/RBPA/FIDAXOMICIN/UPSTREAM FORK DNA organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : H : ARG NH2 F0357 <- 3.20 -> DG N7 O0024 : score 5.87385 : H : ARG NH2 F0357 <- 2.78 -> DG O6 O0024 : score 6.6264 : H : GLU OE1 F0501 <- 3.07 -> DC N4 P0022 : score 5.45648 : V : ARG CG F0500 <- 3.81 -> DT C7 P0021 : score 1.00262 : x : TRP xxxx F0349 <- 3.80 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0350 <- 4.00 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0353 <- 2.98 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0370 <- 3.42 -> DT xxx O0023 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0371 <- 3.39 -> DT xxx O0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0374 <- 3.48 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0489 <- 4.05 -> DG xxx P0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0499 <- 3.97 -> DT xxx O0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0502 <- 4.04 -> DC xxx O0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0504 <- 4.03 -> DC xxx P0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0505 <- 3.66 -> DC xxx O0002 : score x.xxxxx >6c04_CD: title=MTB RNAP HOLO/RBPA/DOUBLE FORK DNA -CLOSED CLAMP organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : x : ARG xxxx C0467 <- 3.26 -> DA xxx G0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0287 <- 4.47 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx >6c1a_AB:DNA-binding_domain; title=MBD2 IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0166 <- 2.80 -> DG N7 C0007 : score 6.05 : H : ARG NH2 A0166 <- 2.79 -> DG O6 C0007 : score 6.6132 : w : ASP OD2 A0176 <- 5.75 -> DA N6 D0005 : score 3.409 : w : TYR 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TYR OH D0178 <- 5.85 -> DC N4 C0001 : score 1.343 : H : ARG NH1 D0188 <- 2.71 -> DG O6 B0012 : score 6.19283 : H : ARG NH2 D0188 <- 2.95 -> DG N7 B0012 : score 6.19308 : w : ARG NH1 D0188 <- 5.97 -> DC N4 C0001 : score 1.892 >6c1u_A:DNA-binding_domain; title=MBD2 IN COMPLEX WITH A DEOXY-OLIGONUCLEOTIDE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0166 <- 2.69 -> DG N7 C0007 : score 6.1831 : H : ARG NH2 A0166 <- 2.93 -> DG O6 C0007 : score 6.4284 : w : TYR OH A0178 <- 5.49 -> DT O4 C0006 : score 2.914 : H : ARG NH1 A0188 <- 2.62 -> DG O6 C0005 : score 6.30233 : H : ARG NH2 A0188 <- 3.14 -> DA N7 C0004 : score 1.55811 : V : ASP CG A0176 <- 3.83 -> DT C7 C0006 : score 2.66295 : x : LYS xxxx A0186 <- 4.44 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx >6c1u_AB:DNA-binding_domain; title=MBD2 IN COMPLEX WITH A DEOXY-OLIGONUCLEOTIDE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0166 <- 2.69 -> DG N7 C0007 : score 6.1831 : H : ARG NH2 A0166 <- 2.93 -> DG O6 C0007 : score 6.4284 : w : TYR OH A0178 <- 5.49 -> DT O4 C0006 : score 2.914 : H : ARG NH1 A0188 <- 2.62 -> DG O6 C0005 : score 6.30233 : H : ARG NH2 A0188 <- 3.14 -> DA N7 C0004 : score 1.55811 : H : ARG NH1 B0166 <- 2.86 -> DG N7 C0002 : score 5.9774 : H : ARG NH2 B0166 <- 2.75 -> DG O6 C0002 : score 6.666 : H : ARG NH1 B0188 <- 2.82 -> DG O6 D0012 : score 6.059 : H : ARG NH2 B0188 <- 2.89 -> DG N7 D0012 : score 6.26969 : V : ASP CG A0176 <- 3.83 -> DT C7 C0006 : score 2.66295 : x : LYS xxxx A0186 <- 4.44 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0176 <- 3.74 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx >6c1u_EF:DNA-binding_domain; title=MBD2 IN COMPLEX WITH A DEOXY-OLIGONUCLEOTIDE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 E0166 <- 2.64 -> DG N7 G0007 : score 6.2436 : H : ARG NH2 E0166 <- 2.87 -> DG O6 G0007 : score 6.5076 : w : TYR OH E0178 <- 5.53 -> DT O4 G0006 : score 2.914 : H : ARG NH1 E0188 <- 2.86 -> DG O6 G0005 : score 6.01033 : H : ARG NH2 E0188 <- 3.15 -> DA N7 G0004 : score 1.55477 : w : ARG NH1 E0188 <- 5.94 -> DT O4 G0006 : score 1.768 : H : ARG NH1 F0166 <- 2.75 -> DG N7 G0002 : score 6.1105 : H : ARG NH2 F0166 <- 2.76 -> DG O6 G0002 : score 6.6528 : w : ASP OD1 F0176 <- 5.80 -> DC N4 H0010 : score 2.835 : H : ARG NH1 F0188 <- 2.82 -> DG O6 H0012 : score 6.059 : H : ARG NH2 F0188 <- 3.00 -> DG N7 H0012 : score 6.12923 : x : ASP xxxx E0176 <- 3.41 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0186 <- 4.42 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0178 <- 4.24 -> DC xxx G0001 : score x.xxxxx >6c1v_A:DNA-binding_domain; title=MBD2 IN COMPLEX WITH DOUBLE-STRANDED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0166 <- 2.89 -> DG N7 C0007 : score 5.9411 : H : ARG NH2 A0166 <- 2.96 -> DG O6 C0007 : score 6.3888 : w : ASP OD2 A0176 <- 5.83 -> DC N4 D0006 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0188 <- 2.52 -> DG O6 C0005 : score 6.424 : V : ASP CG A0176 <- 3.86 -> DT C7 C0006 : score 2.64283 : x : TYR xxxx A0178 <- 3.63 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0186 <- 4.48 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx >6c1v_AB:DNA-binding_domain; title=MBD2 IN COMPLEX WITH DOUBLE-STRANDED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0166 <- 2.89 -> DG N7 C0007 : score 5.9411 : H : ARG NH2 A0166 <- 2.96 -> DG O6 C0007 : score 6.3888 : w : ASP OD2 A0176 <- 5.83 -> DC N4 D0006 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0188 <- 2.52 -> DG O6 C0005 : score 6.424 : H : ARG NH1 B0166 <- 2.75 -> DG N7 C0002 : score 6.1105 : H : ARG NH2 B0166 <- 2.85 -> DG O6 C0002 : score 6.534 : w : ASP OD1 B0176 <- 5.67 -> DC N4 D0011 : score 2.835 : w : TYR OH B0178 <- 5.80 -> DC N4 C0001 : score 1.343 : H : ARG NH1 B0188 <- 2.74 -> DG O6 D0012 : score 6.15633 : H : ARG NH2 B0188 <- 2.99 -> DG N7 D0012 : score 6.142 : w : ARG NH1 B0188 <- 6.12 -> DC N4 C0001 : score 1.892 : V : ASP CG A0176 <- 3.86 -> DT C7 C0006 : score 2.64283 : x : TYR xxxx A0178 <- 3.63 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0186 <- 4.48 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx >6c1v_EF:DNA-binding_domain; title=MBD2 IN COMPLEX WITH DOUBLE-STRANDED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 E0166 <- 2.84 -> DG N7 G0007 : score 6.0016 : H : ARG NH2 E0166 <- 3.02 -> DG O6 G0007 : score 6.3096 : w : TYR OH E0178 <- 5.28 -> DT O4 G0006 : score 2.914 : H : ARG NH1 E0188 <- 2.74 -> DG O6 G0005 : score 6.15633 : w : ARG NH1 E0188 <- 5.75 -> DT O4 G0006 : score 1.768 : H : ARG NH1 F0166 <- 2.72 -> DG N7 G0002 : score 6.1468 : H : ARG NH2 F0166 <- 2.87 -> DG O6 G0002 : score 6.5076 : w : ASP OD1 F0176 <- 5.60 -> DC N4 H0011 : score 2.835 : w : ASP OD1 F0176 <- 5.32 -> DC N4 H0010 : score 2.835 : H : ARG NH1 F0188 <- 2.69 -> DG O6 H0012 : score 6.21717 : H : ARG NH2 F0188 <- 3.01 -> DG N7 H0012 : score 6.11646 : V : ASP CG E0176 <- 3.90 -> DT C7 G0006 : score 2.616 >6c1y_B:DNA-binding_domain; title=MBD OF HUMAN MECP2 IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 B0111 <- 2.68 -> DG N7 E0007 : score 6.1952 : H : ARG NH2 B0111 <- 2.75 -> DG O6 E0007 : score 6.666 : H : ARG NH1 B0133 <- 2.95 -> DG N7 F0007 : score 5.8685 : H : ARG NH2 B0133 <- 2.62 -> DG O6 F0007 : score 6.8376 >6c2f_J:DNA-binding_domain; title=MBD2 IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 J0166 <- 3.21 -> DG N7 L0007 : score 5.5539 : H : ARG NH2 J0166 <- 3.28 -> DG O6 L0007 : score 5.9664 : H : ARG NH1 J0188 <- 2.96 -> DG N7 K0007 : score 5.8564 : H : ARG NH2 J0188 <- 2.85 -> DG O6 K0007 : score 6.534 : x : ASP xxxx J0176 <- 4.02 -> DC xxx L0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0178 <- 4.40 -> DC xxx L0005 : score x.xxxxx >6c2s_AD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR, COUR, BOUND TO A 23-MER DNA DUPLEX organism=Rhodopseudomonas palustris (strain ATCC BAA-98 / CGA009) / Rhodopseudomonas palustris (strain ATCC BAA-98 / CGA009) / Rhodopseudomonas palustris (strain ATCC BAA-98 / CGA009) / Rhodopseudomonas palustris (strain ATCC BAA-98 / CGA009) : H : ASN OD1 A0107 <- 2.60 -> DA N6 V0015 : score 6.26267 : H : ASN ND2 A0107 <- 3.05 -> DA N7 V0015 : score 5.57699 : H : ARG NH1 A0131 <- 3.12 -> DT O2 U0003 : score 4.0308 : H : ASN OD1 D0107 <- 2.96 -> DA N6 U0015 : score 5.8291 : H : ASN ND2 D0107 <- 3.19 -> DA N7 U0015 : score 5.41261 : H : ARG NH1 D0131 <- 3.23 -> DT O2 V0003 : score 3.93606 : V : VAL CG2 D0109 <- 3.62 -> DT C7 V0007 : score 6.39862 : V : ARG CB A0105 <- 3.88 -> DT C7 U0006 : score 0.985026 : x : LEU xxxx A0104 <- 3.42 -> DT xxx V0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0106 <- 3.14 -> DT xxx U0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0109 <- 3.95 -> DT xxx U0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0104 <- 3.50 -> DT xxx U0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0105 <- 4.34 -> DT xxx V0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0106 <- 2.87 -> DT xxx V0007 : score x.xxxxx >6c2s_BC:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR, COUR, BOUND TO A 23-MER DNA DUPLEX organism=Rhodopseudomonas palustris (strain ATCC BAA-98 / CGA009) / Rhodopseudomonas palustris (strain ATCC BAA-98 / CGA009) / Rhodopseudomonas palustris (strain ATCC BAA-98 / CGA009) / Rhodopseudomonas palustris (strain ATCC BAA-98 / CGA009) 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CGA009) / Rhodopseudomonas palustris (strain ATCC BAA-98 / CGA009) : H : ASN OD1 C0107 <- 2.94 -> DA N6 Y0015 : score 5.85318 : H : ASN ND2 C0107 <- 3.14 -> DA N7 Y0015 : score 5.47132 : H : ARG NH1 C0131 <- 3.18 -> DT O2 X0003 : score 3.97912 : V : VAL CG2 C0109 <- 3.90 -> DT C7 X0006 : score 5.97 : x : LEU xxxx C0104 <- 3.47 -> DT xxx Y0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0105 <- 3.93 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0106 <- 3.06 -> DT xxx X0007 : score x.xxxxx >6c31_A:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TETR FAMILY PROTEIN RV0078 IN COMPLEX WITH DNA organism=Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) : H : ARG NH1 A0048 <- 2.81 -> DG N7 K0015 : score 6.0379 : H : ARG NH2 A0048 <- 2.93 -> DG O6 K0015 : score 6.4284 : x : GLN xxxx A0008 <- 3.25 -> DT xxx L0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0038 <- 4.33 -> DT xxx K0014 : score x.xxxxx : x : THR 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>6c31_EFGH:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TETR FAMILY PROTEIN RV0078 IN COMPLEX WITH DNA organism=Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) : H : ARG NH1 E0048 <- 3.00 -> DG N7 I0015 : score 5.808 : H : ARG NH2 E0048 <- 3.10 -> DG O6 I0015 : score 6.204 : H : ARG NH1 F0048 <- 2.76 -> DG N7 J0011 : score 6.0984 : H : ARG NH2 F0048 <- 2.94 -> DG O6 J0011 : score 6.4152 : H : ARG NH1 G0048 <- 2.55 -> DG N7 I0019 : score 6.3525 : H : ARG NH2 G0048 <- 3.11 -> DG O6 I0019 : score 6.1908 : H : ARG NH1 H0048 <- 2.40 -> DG N7 J0015 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x.xxxxx >6ca0_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI RNAP SIGMA70 OPEN COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : GLN OE1 F0437 <- 2.72 -> DA N6 G0035 : score 6.14941 : H : GLN OE1 F0437 <- 2.89 -> DA N6 H0027 : score 5.94362 : H : GLN NE2 F0589 <- 2.60 -> DT O4 G0014 : score 5.39867 : H : GLN NE2 F0589 <- 2.70 -> DG O6 G0015 : score 5.92123 : x : TRP xxxx F0433 <- 3.47 -> DT xxx G0036 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0434 <- 3.58 -> DT xxx G0036 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0455 <- 4.31 -> DC xxx G0031 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0458 <- 4.04 -> DT xxx H0028 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0574 <- 3.33 -> DT xxx H0045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0585 <- 3.11 -> DC xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0586 <- 4.07 -> DT xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0588 <- 3.03 -> DC xxx H0046 : score x.xxxxx >6cc8_A:DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE MBD3 MBD DOMAIN IN COMPLEX WITH METHYLATED CPG DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0022 <- 2.73 -> DG N7 C0007 : score 6.1347 : H : ARG NH2 A0022 <- 2.85 -> DG O6 C0007 : score 6.534 : H : ARG NH1 A0044 <- 2.72 -> DG O6 D0007 : score 6.18067 : H : ARG NH2 A0044 <- 2.92 -> DG N7 D0007 : score 6.23138 >6cce_CFJ: title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MYCOBACTERIUM SMEGMATIS RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH INHIBITOR KANGLEMYCIN A organism=? : H : GLN OE1 F0291 <- 2.87 -> DC N4 O0025 : score 4.51917 : H : ARG NH1 F0295 <- 3.04 -> DG N7 O0024 : score 5.7596 : H : ARG NH2 F0295 <- 2.30 -> DG O6 O0024 : score 7.26 : H : ARG NH1 F0438 <- 2.33 -> DG N7 O0051 : score 6.6187 : H : ARG NH2 F0438 <- 2.94 -> DG O6 O0051 : score 6.4152 : H : GLU OE1 F0439 <- 2.29 -> DC N4 O0053 : score 6.35628 : H : GLN NE2 F0443 <- 2.68 -> DT O4 O0003 : score 5.31561 : V : HIS CG F0309 <- 3.70 -> DT C7 O0021 : score 3.07395 : V : VAL CG1 F0308 <- 3.76 -> DT C7 O0023 : score 6.12112 : V : TRP CD2 F0288 <- 3.81 -> DT C7 O0026 : score 5.48267 : x : TRP xxxx F0287 <- 3.50 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0312 <- 3.31 -> DG xxx O0033 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0437 <- 3.79 -> DT xxx O0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0440 <- 3.47 -> DC xxx O0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0442 <- 3.94 -> DT xxx O0052 : score x.xxxxx >6ccg_A:DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE MBD3 MBD DOMAIN IN COMPLEX WITH METHYLATED CPG DNA organism=? : H : ARG NH1 A0022 <- 2.85 -> DG N7 C0007 : score 5.9895 : H : ARG NH2 A0022 <- 2.99 -> DG O6 C0007 : score 6.3492 : H : ARG NH1 A0044 <- 2.66 -> DG O6 D0007 : score 6.25367 : H : ARG NH2 A0044 <- 3.06 -> DG N7 D0007 : score 6.05262 >6ccv_FT:C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MYCOBACTERIUM SMEGMATIS RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH INHIBITOR RIFAMPICIN organism=? : H : GLN OE1 F0291 <- 2.82 -> DC N4 O0025 : score 4.565 : H : ARG NH2 F0295 <- 2.51 -> DG O6 O0024 : score 6.9828 : H : GLU OE1 F0439 <- 2.79 -> DC N4 P0022 : score 5.77948 : H : GLN NE2 F0443 <- 3.16 -> DT O4 O0003 : score 4.81727 : V : VAL CG1 F0308 <- 3.58 -> DT C7 O0023 : score 6.39384 : V : TRP CD2 F0288 <- 3.70 -> DT C7 O0026 : score 5.63382 : x : TRP xxxx F0287 <- 3.19 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0294 <- 4.40 -> DA xxx P0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0309 <- 3.29 -> DT xxx O0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0312 <- 3.45 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0437 <- 3.93 -> DT xxx O0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0438 <- 2.19 -> DG xxx P0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0440 <- 3.44 -> DC xxx O0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0442 <- 3.80 -> DT xxx P0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx T0259 <- 3.63 -> DG xxx O0012 : score x.xxxxx >6ceu_B:DNA-binding_domain; title=MBD3 MBD IN COMPLEX WITH METHYLATED, NON-PALINDROMIC CPG DNA: ALTERNATIVE INTERPRETATION OF CRYSTALLOGRAPHIC DATA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0022 <- 2.82 -> DG N7 E0007 : score 6.0258 : H : ARG NH2 B0022 <- 2.82 -> DG O6 E0007 : score 6.5736 : H : ARG NH1 B0044 <- 2.77 -> DG O6 F0007 : score 6.11983 : H : ARG NH2 B0044 <- 3.01 -> DG N7 F0007 : score 6.11646 >6cfi_A:Cysteine_proteinases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RAD4-RAD23 BOUND TO A 6-4 PHOTOPRODUCT UV LESION organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C : H : HIS NE2 A0472 <- 3.10 -> DT O2 W0002 : score 4.92536 : x : PHE xxxx A0599 <- 3.16 -> DA xxx W0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0604 <- 3.28 -> DG xxx W0018 : score x.xxxxx >6cg0_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE RAG1/2 HFC COMPLEX (3.17 A) organism=MUS MUSCULUS : H : ASN OD1 A0852 <- 3.19 -> DA N6 L0018 : score 5.55209 : H : ASN ND2 A0852 <- 3.16 -> DG O6 F0028 : score 5.23249 : H : LYS NZ A0966 <- 2.90 -> DG N3 F0028 : score 1.42477 : x : ASN xxxx A0443 <- 4.47 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0850 <- 3.23 -> DT xxx F0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0855 <- 3.04 -> DA xxx L0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0959 <- 3.84 -> DA xxx L0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0963 <- 3.83 -> DT xxx F0029 : score x.xxxxx >6cg8_E: title=STRUCTURE OF C. CRESCENTUS GAPR-DNA organism=Caulobacter vibrioides : x : LYS xxxx E0042 <- 4.39 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx >6chv_AC:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PROTEUS VULGARIS HIGA ANTITOXIN BOUND TO DNA organism=Proteus vulgaris : H : ARG NH1 A0040 <- 2.94 -> DG O6 J0015 : score 5.913 : H : ARG NH2 A0040 <- 3.30 -> DG N7 J0015 : score 5.74615 : H : ARG NH1 C0040 <- 2.68 -> DG O6 I0015 : score 6.22933 : H : ARG NH2 C0040 <- 3.18 -> DG N7 I0015 : score 5.89938 : V : THR CG2 A0046 <- 3.67 -> DT C7 J0014 : score 4.37462 : V : ALA CB A0036 <- 3.80 -> DT C7 J0016 : score 5.59897 : V : ALA CB C0036 <- 3.67 -> DT C7 I0016 : score 5.78094 : x : ARG xxxx A0025 <- 3.68 -> DT xxx I0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0034 <- 3.76 -> DT xxx J0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0039 <- 3.85 -> DT xxx I0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0025 <- 3.76 -> DT xxx J0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0034 <- 3.68 -> DT xxx I0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0035 <- 4.47 -> DT xxx J0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0039 <- 3.84 -> DT xxx J0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0046 <- 3.99 -> DT xxx I0014 : score x.xxxxx >6chv_BD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PROTEUS VULGARIS HIGA ANTITOXIN BOUND TO DNA organism=Proteus vulgaris : H : ARG NH1 B0040 <- 2.90 -> DG O6 F0015 : score 5.96167 : H : ARG NH2 B0040 <- 2.88 -> DG N7 F0015 : score 6.28246 : H : ARG NH1 D0040 <- 2.99 -> DG O6 E0015 : score 5.85217 : H : ARG NH2 D0040 <- 3.16 -> DG N7 E0015 : score 5.92492 : V : THR CG2 D0046 <- 3.69 -> DT C7 E0014 : score 4.35344 : V : ALA CB D0036 <- 3.78 -> DT C7 E0016 : score 5.62697 : V : THR CG2 B0046 <- 3.76 -> DT C7 F0014 : score 4.27929 : V : ALA CB B0036 <- 3.70 -> DT C7 F0016 : score 5.73895 : x : ARG xxxx B0025 <- 3.12 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0034 <- 3.73 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0039 <- 3.77 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0025 <- 3.38 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0034 <- 3.82 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0039 <- 4.08 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx >6chv_D:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PROTEUS VULGARIS HIGA ANTITOXIN BOUND TO DNA organism=Proteus vulgaris : H : ARG NH1 D0040 <- 2.99 -> DG O6 E0015 : score 5.85217 : H : ARG NH2 D0040 <- 3.16 -> DG N7 E0015 : score 5.92492 : V : THR CG2 D0046 <- 3.69 -> DT C7 E0014 : score 4.35344 : V : ALA CB D0036 <- 3.78 -> DT C7 E0016 : score 5.62697 : x : ARG xxxx D0025 <- 3.38 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0034 <- 3.82 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0039 <- 4.08 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx >6chv_GH:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PROTEUS VULGARIS HIGA ANTITOXIN BOUND TO DNA organism=Proteus vulgaris : H : ARG NH1 G0040 <- 2.69 -> DG O6 L0015 : score 6.21717 : H : ARG NH2 G0040 <- 2.53 -> DG N7 L0015 : score 6.72938 : H : ARG NH1 H0040 <- 2.80 -> DG O6 K0015 : score 6.08333 : H : ARG NH2 H0040 <- 2.71 -> DG N7 K0015 : score 6.49954 : V : ALA CB G0036 <- 3.78 -> DT C7 L0016 : score 5.62697 : x : ARG xxxx G0025 <- 3.49 -> DT xxx K0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0034 <- 3.65 -> DT xxx L0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0039 <- 3.94 -> DT xxx K0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0046 <- 3.91 -> DT xxx L0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0025 <- 3.82 -> DT xxx L0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0034 <- 3.84 -> DT xxx K0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0036 <- 3.20 -> DT xxx L0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0039 <- 3.58 -> DT xxx L0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0046 <- 3.94 -> DT xxx K0014 : score x.xxxxx >6cil_DN:Galactose_oxidase,_central_domain; title=PRE-REACTION COMPLEX, RAG1(E962Q)/2-INTACT/INTACT 12/23RSS COMPLEX IN MN2+ organism=MUS MUSCULUS / HOMO SAPIENS : x : SER xxxx N0100 <- 4.09 -> DT xxx G0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx N0102 <- 4.13 -> DT xxx G0025 : score x.xxxxx >6cim_DN:Galactose_oxidase,_central_domain; title=PRE-REACTION COMPLEX, RAG1(E962Q)/2-NICKED/INTACT 12/23RSS COMPLEX IN MN2+ organism=HOMO SAPIENS / MUS MUSCULUS : x : PHE xxxx N0038 <- 4.29 -> DC xxx G0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx N0042 <- 3.14 -> DA xxx J0047 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx N0102 <- 3.96 -> DT xxx G0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx N0103 <- 3.14 -> DA xxx J0034 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx N0122 <- 2.77 -> DT xxx J0036 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx N0126 <- 3.39 -> DG xxx J0035 : score x.xxxxx >6cly_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH 8-CLG AS THE TEMPLATE BASE IN A 1-NUCLEOTIDE GAPPED DNA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.34 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.86 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.56 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6cnb_ABEPRS:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;NTF2-like;TATA-box_binding_protein-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;Homeodomain-like; title=YEAST RNA POLYMERASE III INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX organism=? : H : LYS NZ B0482 <- 3.32 -> DT O2 Y0021 : score 3.21411 : H : ASN ND2 R0395 <- 2.40 -> DT O2 Y0054 : score 5.12585 : H : GLN NE2 R0484 <- 2.68 -> DA N3 X0016 : score 4.12357 : H : GLN NE2 R0484 <- 3.13 -> DG N3 X0017 : score 4.64725 : H : THR OG1 R0541 <- 3.19 -> DT O2 X0015 : score 2.5024 : x : SER xxxx A0340 <- 3.98 -> DA xxx Y0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0360 <- 3.29 -> DT xxx Y0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0378 <- 3.23 -> DC xxx Y0024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0478 <- 3.07 -> DT xxx Y0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0516 <- 4.39 -> DC xxx Y0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0879 <- 3.04 -> DA xxx Y0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0880 <- 3.26 -> DA xxx Y0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1373 <- 2.68 -> DT xxx Y0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0481 <- 3.04 -> DT xxx Y0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1052 <- 4.36 -> DT xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1056 <- 3.77 -> DT xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0073 <- 3.13 -> DA xxx Y0038 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0075 <- 3.57 -> DT xxx X0028 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0253 <- 3.77 -> DG xxx Y0062 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0397 <- 3.46 -> DA xxx X0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0425 <- 3.66 -> DA xxx X0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0440 <- 4.45 -> DA xxx Y0052 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0442 <- 4.06 -> DT xxx X0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0450 <- 3.99 -> DC xxx Y0053 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0485 <- 3.24 -> DT xxx X0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0487 <- 4.04 -> DA xxx Y0055 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0516 <- 3.19 -> DA xxx X0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx R0517 <- 3.39 -> DA xxx Y0058 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0531 <- 3.39 -> DA xxx X0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0533 <- 3.51 -> DT xxx Y0057 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0539 <- 3.92 -> DT xxx Y0057 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx S0416 <- 4.18 -> DT xxx Y0063 : score x.xxxxx >6cnb_R:TATA-box_binding_protein-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=YEAST RNA POLYMERASE III INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX organism=? : H : ASN ND2 R0395 <- 2.40 -> DT O2 Y0054 : score 5.12585 : H : GLN NE2 R0484 <- 2.68 -> DA N3 X0016 : score 4.12357 : H : GLN NE2 R0484 <- 3.13 -> DG N3 X0017 : score 4.64725 : H : THR OG1 R0541 <- 3.19 -> DT O2 X0015 : score 2.5024 : x : SER xxxx R0075 <- 3.57 -> DT xxx X0028 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0253 <- 3.77 -> DG xxx Y0062 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0397 <- 3.46 -> DA xxx X0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0425 <- 3.66 -> DA xxx X0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0440 <- 4.45 -> DA xxx Y0052 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0442 <- 4.06 -> DT xxx X0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0450 <- 3.99 -> DC xxx Y0053 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0485 <- 3.24 -> DT xxx X0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0487 <- 4.04 -> DA xxx Y0055 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0516 <- 3.19 -> DA xxx X0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx R0517 <- 3.39 -> DA xxx Y0058 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0531 <- 3.39 -> DA xxx X0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0533 <- 3.51 -> DT xxx Y0057 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0539 <- 3.92 -> DT xxx Y0057 : score x.xxxxx >6cnb_S:Homeodomain-like; title=YEAST RNA POLYMERASE III INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX organism=? : x : TYR xxxx S0416 <- 4.18 -> DT xxx Y0063 : score x.xxxxx >6cnc_ABEOPRS:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;NTF2-like;TATA-box_binding_protein-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;Homeodomain-like; title=YEAST RNA POLYMERASE III OPEN COMPLEX organism=? : H : ASN ND2 R0395 <- 2.70 -> DT O2 Y0048 : score 4.84108 : H : ASN ND2 R0485 <- 2.77 -> DT O2 X0015 : score 4.77463 : x : HIS xxxx A0315 <- 4.28 -> DA xxx Y0032 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0478 <- 3.09 -> DG xxx Y0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0879 <- 3.25 -> DT xxx Y0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0880 <- 3.97 -> DT xxx Y0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1373 <- 3.61 -> DT xxx Y0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0480 <- 3.88 -> DA xxx X0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0481 <- 3.01 -> DG xxx Y0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1056 <- 3.60 -> DT xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0073 <- 3.27 -> DA xxx Y0032 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0075 <- 3.34 -> DT xxx X0028 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0253 <- 2.83 -> DG xxx Y0056 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0254 <- 4.38 -> DT xxx Y0055 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx R0257 <- 3.79 -> DT xxx Y0055 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0397 <- 3.70 -> DA xxx X0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0425 <- 4.17 -> DA xxx Y0046 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0440 <- 4.07 -> DA xxx Y0046 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0442 <- 3.05 -> DT xxx X0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0448 <- 3.56 -> DG xxx X0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0450 <- 3.93 -> DT xxx Y0048 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx R0484 <- 4.32 -> DG xxx X0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0487 <- 3.61 -> DA xxx Y0049 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0516 <- 3.27 -> DA xxx X0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx R0517 <- 3.79 -> DA xxx Y0052 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0531 <- 4.40 -> DA xxx X0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0533 <- 3.40 -> DT xxx Y0051 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0539 <- 3.72 -> DA xxx Y0050 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0541 <- 3.03 -> DT xxx X0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx S0416 <- 4.05 -> DT xxx Y0057 : score x.xxxxx >6cnd_ABEPRS:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;NTF2-like;TATA-box_binding_protein-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;Homeodomain-like; title=YEAST RNA POLYMERASE III NATURAL OPEN COMPLEX (NOC) organism=? : H : ASN ND2 R0395 <- 3.02 -> DT O2 Y0048 : score 4.53732 : H : ASN ND2 R0485 <- 2.82 -> DT O2 X0015 : score 4.72717 : x : ASN xxxx A0342 <- 3.92 -> DA xxx Y0032 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0880 <- 3.37 -> DT xxx Y0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1373 <- 4.00 -> DT xxx Y0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0480 <- 3.35 -> DA xxx X0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0481 <- 3.91 -> DG xxx Y0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1056 <- 3.27 -> DT xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0041 <- 4.05 -> DT xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0073 <- 3.16 -> DA xxx Y0032 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0075 <- 3.90 -> DT xxx X0028 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0253 <- 3.35 -> DT xxx Y0057 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0397 <- 3.68 -> DA xxx X0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0425 <- 3.58 -> DA xxx Y0046 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0440 <- 4.06 -> DG xxx X0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0442 <- 3.64 -> DT xxx X0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0448 <- 3.74 -> DG xxx X0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx R0484 <- 4.07 -> DG xxx X0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0487 <- 4.17 -> DA xxx Y0049 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0516 <- 3.39 -> DA xxx X0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx R0517 <- 3.96 -> DA xxx Y0052 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0531 <- 4.18 -> DA xxx X0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0533 <- 4.24 -> DT xxx Y0051 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0539 <- 3.49 -> DT xxx Y0051 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0541 <- 3.45 -> DT xxx X0014 : score x.xxxxx >6cnd_R:TATA-box_binding_protein-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=YEAST RNA POLYMERASE III NATURAL OPEN COMPLEX (NOC) organism=? : H : ASN ND2 R0395 <- 3.02 -> DT O2 Y0048 : score 4.53732 : H : ASN ND2 R0485 <- 2.82 -> DT O2 X0015 : score 4.72717 : x : VAL xxxx R0041 <- 4.05 -> DT xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0073 <- 3.16 -> DA xxx Y0032 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0075 <- 3.90 -> DT xxx X0028 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0253 <- 3.35 -> DT xxx Y0057 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0397 <- 3.68 -> DA xxx X0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0425 <- 3.58 -> DA xxx Y0046 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0440 <- 4.06 -> DG xxx X0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0442 <- 3.64 -> DT xxx X0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0448 <- 3.74 -> DG xxx X0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx R0484 <- 4.07 -> DG xxx X0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0487 <- 4.17 -> DA xxx Y0049 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0516 <- 3.39 -> DA xxx X0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx R0517 <- 3.96 -> DA xxx Y0052 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0531 <- 4.18 -> DA xxx X0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0533 <- 4.24 -> DT xxx Y0051 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0539 <- 3.49 -> DT xxx Y0051 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0541 <- 3.45 -> DT xxx X0014 : score x.xxxxx >6cnf_ABEPRS:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;NTF2-like;TATA-box_binding_protein-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;Homeodomain-like; title=YEAST RNA POLYMERASE III ELONGATION COMPLEX organism=? : H : ASN ND2 R0395 <- 2.92 -> DT O2 Y0066 : score 4.63225 : H : ASN ND2 R0485 <- 2.85 -> DT O2 X0013 : score 4.69869 : x : ARG xxxx A1373 <- 3.89 -> DG xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0480 <- 4.13 -> DC xxx X0062 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0075 <- 3.13 -> DT xxx X0025 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0253 <- 3.86 -> DA xxx X0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0254 <- 4.29 -> DT xxx Y0073 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx R0257 <- 4.17 -> DT xxx Y0073 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0397 <- 3.29 -> DA xxx X0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0425 <- 3.30 -> DA xxx X0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0440 <- 4.43 -> DA xxx Y0064 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0442 <- 3.48 -> DT xxx X0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0448 <- 4.21 -> DG xxx X0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0450 <- 3.68 -> DC xxx Y0065 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0487 <- 4.26 -> DA xxx Y0067 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0516 <- 3.85 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx R0517 <- 3.45 -> DA xxx Y0070 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0531 <- 3.56 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0533 <- 4.48 -> DT xxx Y0069 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0539 <- 4.11 -> DA xxx Y0068 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0541 <- 3.48 -> DT xxx X0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx S0416 <- 4.37 -> DT xxx Y0075 : score x.xxxxx >6cnf_R:TATA-box_binding_protein-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=YEAST RNA POLYMERASE III ELONGATION COMPLEX organism=? : H : ASN ND2 R0395 <- 2.92 -> DT O2 Y0066 : score 4.63225 : H : ASN ND2 R0485 <- 2.85 -> DT O2 X0013 : score 4.69869 : x : VAL xxxx R0041 <- 3.91 -> DT xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx R0072 <- 3.95 -> DA xxx Y0050 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0073 <- 3.22 -> DA xxx Y0050 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0075 <- 3.13 -> DT xxx X0025 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0253 <- 3.86 -> DA xxx X0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0254 <- 4.29 -> DT xxx Y0073 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx R0257 <- 4.17 -> DT xxx Y0073 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0397 <- 3.29 -> DA xxx X0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0425 <- 3.30 -> DA xxx X0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0440 <- 4.43 -> DA xxx Y0064 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0442 <- 3.48 -> DT xxx X0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0448 <- 4.21 -> DG xxx X0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0450 <- 3.68 -> DC xxx Y0065 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0487 <- 4.26 -> DA xxx Y0067 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0516 <- 3.85 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx R0517 <- 3.45 -> DA xxx Y0070 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0531 <- 3.56 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx R0533 <- 4.48 -> DT xxx Y0069 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0539 <- 4.11 -> DA xxx Y0068 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0541 <- 3.48 -> DT xxx X0012 : score x.xxxxx >6cnp_A:DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MBD2 COMPLEX WITH METHYLATED CPG ISLAND organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0166 <- 2.64 -> DG N7 C0007 : score 6.2436 : H : ARG NH2 A0166 <- 2.73 -> DG O6 C0007 : score 6.6924 : w : ASP OD1 A0176 <- 6.03 -> DC N4 D0005 : score 2.835 : H : ARG NH1 A0188 <- 2.68 -> DG O6 D0007 : score 6.22933 : H : ARG NH2 A0188 <- 3.12 -> DG N7 D0007 : score 5.976 : x : TYR xxxx A0178 <- 4.19 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0186 <- 4.31 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx >6cnq_B:DNA-binding_domain; title=MBD2 IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 B0166 <- 2.82 -> DG N7 F0007 : score 6.0258 : H : ARG NH2 B0166 <- 2.91 -> DG O6 F0007 : score 6.4548 : H : ARG NH1 B0188 <- 2.74 -> DG O6 E0007 : score 6.15633 : H : ARG NH2 B0188 <- 3.19 -> DG N7 E0007 : score 5.88662 : x : TYR xxxx B0178 <- 4.28 -> DA xxx F0005 : score x.xxxxx >6cpq_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH 8-CLG IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE CTP organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 2.96 -> DG N3 T0009 : score 1.40732 : w : LYS NZ A0234 <- 5.40 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : TYR OH A0271 <- 3.02 -> DA N3 P0010 : score 3.96863 : w : TYR OH A0271 <- 6.26 -> DC O2 T0008 : score 1.343 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.95 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : ARG xxxx A0283 <- 3.26 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >6cq2_A:Prokaryotic_type_I_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TOPOISOMERASE I IN COMPLEX WITH OLIGONUCLEOTIDE MTS2-12 AND MAGNESIUM organism=Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) : H : LYS NZ A0089 <- 3.45 -> DT O2 B0007 : score 3.12085 : H : ARG NH1 A0167 <- 2.54 -> DC O2 B0004 : score 3.8398 : H : ARG NH1 A0168 <- 2.97 -> DC O2 B0003 : score 3.5259 : H : ARG NH2 A0172 <- 3.16 -> DC O2 B0003 : score 3.43241 : V : ALA CB A0055 <- 3.87 -> DT C7 B0002 : score 5.50099 : x : HIS xxxx A0048 <- 3.58 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0051 <- 3.54 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0054 <- 3.37 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0176 <- 3.19 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0179 <- 4.13 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0180 <- 4.29 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 3.28 -> DT xxx B0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0188 <- 3.82 -> DT xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0189 <- 3.90 -> DT xxx B0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0344 <- 3.75 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0535 <- 3.74 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0536 <- 4.36 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx >6cqi_A:Prokaryotic_type_I_DNA_topoisomerase; title=2.42A CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TOPOISOMERASE I IN COMPLEX WITH AN OLIGONUCLEOTIDE MTS2-11 organism=Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) : H : ASP OD2 A0051 <- 3.34 -> DC N4 B0005 : score 5.5304 : H : ARG NH2 A0167 <- 3.03 -> DC O2 B0005 : score 3.52858 : H : ARG NH1 A0168 <- 3.05 -> DC O2 B0004 : score 3.4675 : H : ARG NH2 A0168 <- 2.98 -> DC N3 B0004 : score 2.20855 : H : ARG NE A0172 <- 3.04 -> DC O2 B0004 : score 2.53134 : H : ARG NH1 A0172 <- 2.91 -> DC N3 B0004 : score 1.50336 : V : ALA CB A0055 <- 3.67 -> DT C7 B0003 : score 5.78094 : x : HIS xxxx A0048 <- 3.59 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0054 <- 3.87 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0089 <- 3.58 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0176 <- 3.30 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0179 <- 3.69 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0180 <- 3.70 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 3.31 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0188 <- 3.57 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0189 <- 3.59 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0332 <- 3.43 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0344 <- 3.80 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0535 <- 3.75 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0536 <- 3.91 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx >6cr3_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CBR2, BETA, GAMMA DATP ANALOGUE organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.39 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.87 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.60 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6cr4_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH DATP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.28 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.93 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.59 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6cr5_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CH2-BETA, GAMMA DATP ANALOGUE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.15 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.92 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.62 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6cr6_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CH-CH3, BETA, GAMMA DATP ANALOGUE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.27 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.64 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.47 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6cr7_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CHF, BETA, GAMMA DATP ANALOGUE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.28 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.00 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.64 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6cr8_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CHCL (R & S ISOMERS), BETA, GAMMA DATP ANALOGUE organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0034 <- 6.09 -> DC N4 T0005 : score 3.208 : x : LYS xxxx A0035 <- 4.04 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.65 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6cr9_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CFCL, BETA, GAMMA DATP ANALOGUE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.95 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.58 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6crb_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CF2, BETA, GAMMA DATP ANALOGUE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.50 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.77 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.48 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6crc_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CCL2, BETA, GAMMA DATP ANALOGUE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.91 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.54 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6crh_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH 8-CLG IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE GTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.26 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.85 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.48 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6crm_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RECQ CATALYTIC CORE FROM C. SAKAZAKII BOUND TO AN UNFOLDED G-QUADRUPLEX organism=CRONOBACTER SAKAZAKII (STRAIN ATCC BAA-894) / CRONOBACTER SAKAZAKII (STRAIN ATCC BAA-894) : H : GLU OE1 A0124 <- 3.19 -> DG N2 B0027 : score 3.97406 : H : TRP NE1 A0154 <- 2.64 -> DT O2 B0026 : score 6.41428 : H : ASN ND2 A0244 <- 2.70 -> DC O2 B0023 : score 4.56908 : H : SER OG A0245 <- 2.72 -> DG N7 B0021 : score 4.55376 : H : SER OG A0245 <- 3.16 -> DG O6 B0021 : score 3.79647 : H : ASP OD1 A0312 <- 2.51 -> DG N2 B0021 : score 5.4487 : H : ARG NH2 A0315 <- 3.16 -> DG O6 B0024 : score 6.1248 : H : ASP OD1 A0344 <- 2.69 -> DC N4 B0023 : score 5.46246 : H : LYS NZ A0355 <- 2.74 -> DG O6 B0024 : score 5.85014 : V : PHE CD1 A0158 <- 3.66 -> DT C7 B0026 : score 4.29605 : x : ARG xxxx A0101 <- 4.48 -> DT xxx B0031 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0104 <- 4.31 -> DT xxx B0031 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0153 <- 3.80 -> DT xxx B0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0159 <- 3.57 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0220 <- 3.77 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0243 <- 4.33 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0248 <- 3.24 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0347 <- 3.61 -> DC xxx B0023 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0351 <- 3.79 -> DG xxx B0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0354 <- 3.68 -> DG xxx B0024 : score x.xxxxx >6cro_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LAMBDA-CRO BOUND TO A CONSENSUS OPERATOR AT 3.0 ANGSTROM RESOLUTION organism=Enterobacteria phage lambda : H : GLN OE1 A0027 <- 3.00 -> DA N6 U0004 : score 5.81046 : H : GLN OE1 A0027 <- 3.00 -> DA N6 R0004 : score 5.81046 : H : GLN NE2 A0027 <- 3.39 -> DA N7 U0004 : score 5.37115 : H : GLN NE2 A0027 <- 3.39 -> DA N7 R0004 : score 5.37115 : H : SER OG A0028 <- 3.34 -> DG N7 U0016 : score 3.99799 : H : SER OG A0028 <- 3.34 -> DG N7 R0016 : score 3.99799 : H : LYS NZ A0032 <- 2.68 -> DG N7 U0013 : score 5.51516 : H : LYS NZ A0032 <- 2.68 -> DG N7 U0014 : score 5.51516 : H : LYS NZ A0032 <- 2.72 -> DG O6 U0014 : score 5.87326 : H : LYS NZ A0032 <- 2.68 -> DG N7 R0013 : score 5.51516 : H : LYS NZ A0032 <- 2.68 -> DG N7 R0014 : score 5.51516 : H : LYS NZ A0032 <- 2.72 -> DG O6 R0014 : score 5.87326 : x : THR xxxx A0017 <- 3.44 -> DT xxx R0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0026 <- 3.17 -> DG xxx U0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0029 <- 4.32 -> DT xxx U0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0031 <- 3.77 -> DT xxx R0005 : score x.xxxxx >6cst_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE KAPPA WITH DNA organism=HOMO SAPIENS : w : GLU OE2 A0419 <- 5.70 -> DG N7 D0007 : score 2.669 : x : SER xxxx A0417 <- 3.85 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0469 <- 3.90 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0512 <- 3.97 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >6ct9_A: title=STRUCTURE OF THE HUMAN CGAS-DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0176 <- 2.83 -> DA N3 C0013 : score 3.65996 >6cta_A: title=STRUCTURE OF THE HUMAN CGAS-DNA COMPLEX WITH ATP organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0176 <- 2.96 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx >6cti_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CCL2, BETA, GAMMA DTTP ANALOGUE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.16 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.93 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.53 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6ctj_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CHCH3, BETA, GAMMA DTTP ANALOGUE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.99 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 4.08 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6ctk_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CHF-R/S ISOMERS, BETA, GAMMA DTTP ANALOGUE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.21 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.06 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.54 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6ctl_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CHCL-R/S ISOMERS, BETA, GAMMA DTTP ANALOGUE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.23 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.92 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.57 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6ctm_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CHCL(R-ISOMER), BETA, GAMMA DTTP ANALOGUE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.24 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.73 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.96 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6ctn_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CFCL,BETA-GAMMA DTTP ANALOGUE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.24 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.91 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.50 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6cto_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CF2, BETA, GAMMA DTTP ANALOGUE organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0034 <- 6.17 -> DC N4 T0005 : score 3.208 : x : LYS xxxx A0035 <- 4.08 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.58 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6ctq_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH DCTP organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.44 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.86 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.54 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6ctr_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CHF (R & S ISOMERS), BETA, GAMMA DCTP ANALOGUE organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.41 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.90 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.52 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6ctt_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CHCL (R & S ISOMERS, BETA, GAMMA DCTP ANALOGUE organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.41 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.99 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.60 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6ctu_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CFCL, BETA, GAMMA DCTP ANALOGUE organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.34 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.86 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.57 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6ctv_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CF2, BETA, GAMMA DCTP ANALOGUE organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.29 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.83 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.60 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6ctw_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CCL2, BETA, GAMMA DCTP ANALOGUE organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.32 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.95 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.58 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6ctx_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CBR2, BETA, GAMMA DCTP ANALOGUE organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.39 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.08 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.71 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6cu9_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH 8-CLG IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE CTP AND MANGANESE organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 3.16 -> DG N3 T0009 : score 1.34917 : H : TYR OH A0271 <- 2.96 -> DA N3 P0010 : score 4.01844 : H : ARG NH1 A0283 <- 3.05 -> DT O2 T0007 : score 4.09109 >6cua_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH 8-CLG IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE GTP AND MANGANESE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.29 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.75 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.47 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6cub_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH 8-CLG IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE ATP AND MANGANESE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.28 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.65 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.54 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6cuu_CDF: title=THERMUS THERMOPHILES RNA POLYMERASE IN COMPLEX WITH PROMOTER DNA AND ANTIBIOTIC KANGLEMYCIN A organism=? : x : ARG xxxx C0422 <- 3.03 -> DC xxx H0016 : score x.xxxxx >6d0m_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=POLYMERASE ETA POST-INSERTION BINARY COMPLEX WITH CYTARABINE (ARAC) organism=Homo sapiens : w : GLN OE1 A0038 <- 5.37 -> DG N2 T0004 : score 2.177 : x : ILE xxxx A0048 <- 3.63 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.71 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >6d0z_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=POLYMERASE ETA CYTARABINE (ARAC) EXTENSION TERNARY COMPLEX organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0382 <- 3.25 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >6d1t_A:DNA-binding_domain; title=COMPLEX OF MBD1-MBD AND METHYLATED DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0022 <- 2.64 -> DG N7 B0007 : score 6.2436 : H : ARG NH2 A0022 <- 2.79 -> DG O6 B0007 : score 6.6132 : H : ARG NH1 A0030 <- 2.76 -> DT O4 B0008 : score 3.29409 : H : ARG NH1 A0044 <- 2.78 -> DG O6 C0007 : score 6.10767 : H : ARG NH2 A0044 <- 2.85 -> DG N7 C0007 : score 6.32077 : x : THR xxxx A0027 <- 3.98 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0034 <- 4.38 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx >6d5f_C: title=CRYO-EM RECONSTRUCTION OF MEMBRANE-ENVELOPED FILAMENTOUS VIRUS SFV1 (SULFOLOBUS FILAMENTOUS VIRUS 1) organism=SULFOLOBUS FILAMENTOUS VIRUS 1 : H : TYR OH C0018 <- 2.40 -> DT O2 10185 : score 3.474 : x : MET xxxx C0001 <- 4.16 -> DT xxx 10177 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0004 <- 4.40 -> DT xxx 20159 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0025 <- 3.16 -> DT xxx 20151 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0029 <- 2.17 -> DT xxx 10187 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0036 <- 4.30 -> DT xxx 20149 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0040 <- 3.57 -> DA xxx 20148 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0044 <- 3.78 -> DT xxx 10189 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0047 <- 3.18 -> DT xxx 20147 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0080 <- 4.36 -> DA xxx 10192 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0083 <- 3.27 -> DT xxx 10191 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0086 <- 4.18 -> DT xxx 10191 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0087 <- 3.18 -> DT xxx 20145 : score x.xxxxx >6d5f_d: title=CRYO-EM RECONSTRUCTION OF MEMBRANE-ENVELOPED FILAMENTOUS VIRUS SFV1 (SULFOLOBUS FILAMENTOUS VIRUS 1) organism=SULFOLOBUS FILAMENTOUS VIRUS 1 : H : TYR OH d0017 <- 2.66 -> DT O2 20185 : score 3.30673 : H : TYR OH d0028 <- 2.37 -> DT O2 20187 : score 3.4933 : H : TYR OH d0046 <- 2.77 -> DT O2 10147 : score 3.23597 : H : GLN NE2 d0072 <- 3.18 -> DT O2 10145 : score 3.6344 : x : THR xxxx d0006 <- 3.45 -> DA xxx 10156 : score x.xxxxx : x : MET xxxx d0035 <- 3.20 -> DT xxx 10149 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx d0042 <- 3.31 -> DA xxx 10148 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx d0045 <- 4.31 -> DT xxx 10147 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx d0065 <- 3.67 -> DA xxx 20192 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx d0068 <- 3.19 -> DA xxx 20192 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx d0071 <- 4.10 -> DT xxx 20191 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx d0075 <- 3.98 -> DA xxx 10146 : score x.xxxxx >6d6v_A: title=CRYOEM STRUCTURE OF TETRAHYMENA TELOMERASE WITH TELOMERIC DNA AT 4.8 ANGSTROM RESOLUTION organism=TETRAHYMENA THERMOPHILA : H : GLN NE2 A0228 <- 2.76 -> DG O6 C0007 : score 5.85157 : x : SER xxxx A0227 <- 4.07 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0414 <- 3.09 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0482 <- 3.29 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0545 <- 3.41 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0555 <- 3.96 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0590 <- 3.32 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0623 <- 4.48 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0773 <- 4.01 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0904 <- 4.09 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0924 <- 3.04 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0925 <- 3.49 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx >6d6v_AD:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYOEM STRUCTURE OF TETRAHYMENA TELOMERASE WITH TELOMERIC DNA AT 4.8 ANGSTROM RESOLUTION organism=TETRAHYMENA THERMOPHILA : H : GLN NE2 A0228 <- 2.76 -> DG O6 C0007 : score 5.85157 : H : LYS NZ D0564 <- 2.61 -> DG N3 C0006 : score 1.50909 : H : ARG NH2 D0588 <- 2.51 -> DT O2 C0003 : score 4.47887 : H : LYS NZ D0660 <- 2.45 -> DT O4 C0003 : score 3.83828 : H : LYS NZ D0660 <- 2.42 -> DG O6 C0004 : score 6.22011 : V : PHE CZ D0603 <- 3.53 -> DT C7 C0002 : score 7.59513 : x : SER xxxx A0227 <- 4.07 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0414 <- 3.09 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0482 <- 3.29 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0545 <- 3.41 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0555 <- 3.96 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0590 <- 3.32 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0623 <- 4.48 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0773 <- 4.01 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0904 <- 4.09 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0924 <- 3.04 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0925 <- 3.49 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0532 <- 3.90 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0552 <- 4.25 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0553 <- 3.68 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0554 <- 3.26 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0560 <- 3.35 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0561 <- 2.96 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0563 <- 4.11 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0566 <- 3.10 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0569 <- 3.05 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0573 <- 2.85 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0601 <- 3.28 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx >6d6v_D:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYOEM STRUCTURE OF TETRAHYMENA TELOMERASE WITH TELOMERIC DNA AT 4.8 ANGSTROM RESOLUTION organism=TETRAHYMENA THERMOPHILA : H : LYS NZ D0564 <- 2.61 -> DG N3 C0006 : score 1.50909 : H : ARG NH2 D0588 <- 2.51 -> DT O2 C0003 : score 4.47887 : H : LYS NZ D0660 <- 2.45 -> DT O4 C0003 : score 3.83828 : H : LYS NZ D0660 <- 2.42 -> DG O6 C0004 : score 6.22011 : V : PHE CZ D0603 <- 3.53 -> DT C7 C0002 : score 7.59513 : x : LYS xxxx D0532 <- 3.90 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0552 <- 4.25 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0553 <- 3.68 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0554 <- 3.26 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0560 <- 3.35 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0561 <- 2.96 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0563 <- 4.11 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0566 <- 3.10 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0569 <- 3.05 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0573 <- 2.85 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0601 <- 3.28 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx >6d8a_A:Ribonuclease_H-like; title=RSAGO TERNARY COMPLEX WITH GUIDE RNA AND TARGET DNA CONTAINING A-A BULGE WITHIN THE SEED SEGMENT OF THE TARGET STRAND organism=Rhodobacter sphaeroides (strain ATCC 17025 / ATH 2.4.3) / Rhodobacter sphaeroides (strain ATCC 17025 / ATH 2.4.3) : H : TYR OH A0329 <- 2.82 -> DA N6 G0006 : score 4.65183 : w : TYR OH A0329 <- 5.92 -> DA N7 G0006 : score 3.238 : w : ASP OD2 A0640 <- 5.40 -> DC N4 G-006 : score 3.623 : w : LYS NZ A0692 <- 5.51 -> DT O2 G0004 : score 0.522 : x : PRO xxxx A0045 <- 3.49 -> DC xxx G-012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0063 <- 3.94 -> DG xxx G-011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0245 <- 3.72 -> DG xxx G-002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0341 <- 3.63 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0491 <- 4.18 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0494 <- 3.43 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0495 <- 4.18 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0498 <- 3.75 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0606 <- 3.46 -> DC xxx G-007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0656 <- 3.14 -> DA xxx G0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0661 <- 3.44 -> DA xxx G0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0670 <- 3.76 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0687 <- 4.39 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0689 <- 3.58 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0690 <- 3.49 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0694 <- 3.77 -> DA xxx G0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0727 <- 4.38 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0734 <- 3.47 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0735 <- 4.04 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx >6d8f_A:Ribonuclease_H-like; title=RSAGO TERNARY COMPLEX WITH GUIDE RNA AND TARGET DNA CONTAINING T-T BULGE WITHIN THE SEED SEGMENT organism=Rhodobacter sphaeroides (strain ATCC 17025 / ATH 2.4.3) / Rhodobacter sphaeroides (strain ATCC 17025 / ATH 2.4.3) : H : TYR OH A0329 <- 3.00 -> DA N6 G0006 : score 4.48369 : H : ARG NH2 A0541 <- 3.26 -> DT O2 G-005 : score 3.84387 : w : ARG NH1 A0606 <- 5.41 -> DA N3 G-008 : score 2.585 : w : LYS NZ A0692 <- 5.31 -> DT O2 G0004 : score 0.522 : x : PRO xxxx A0045 <- 3.24 -> DC xxx G-012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0063 <- 3.87 -> DG xxx G-011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0245 <- 3.66 -> DG xxx G-002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0341 <- 3.58 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0491 <- 4.48 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0494 <- 3.44 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0495 <- 3.96 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0498 <- 3.47 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0640 <- 3.90 -> DC xxx G-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0670 <- 3.77 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0687 <- 4.32 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0689 <- 3.29 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0690 <- 3.51 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0727 <- 4.17 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0734 <- 3.36 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0735 <- 3.94 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx >6d8p_B:Ribonuclease_H-like; title=TERNARY RSAGO COMPLEX CONTAINING GUIDE RNA PAIRED WITH TARGET DNA organism=Rhodobacter sphaeroides (strain ATCC 17025 / ATH 2.4.3) / Rhodobacter sphaeroides (strain ATCC 17025 / ATH 2.4.3) : H : TYR OH B0329 <- 2.91 -> DA N6 G0004 : score 4.56776 : H : ARG NH2 B0606 <- 2.78 -> DC O2 G-007 : score 3.71351 : x : PRO xxxx B0045 <- 3.39 -> DC xxx G-012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0063 <- 4.02 -> DG xxx G-011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0245 <- 3.57 -> DG xxx G-002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0341 <- 3.37 -> DC xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0344 <- 4.38 -> DC xxx G0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0491 <- 4.48 -> DA xxx G0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0494 <- 3.33 -> DA xxx G0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0495 <- 4.10 -> DA xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0498 <- 3.82 -> DA xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0640 <- 4.09 -> DC xxx G-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0670 <- 3.72 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0687 <- 4.21 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0689 <- 3.19 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0690 <- 3.37 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0692 <- 3.83 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0727 <- 4.05 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0734 <- 3.79 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0735 <- 4.22 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx >6d92_F:Ribonuclease_H-like; title=TERNARY RSAGO COMPLEX WITH GUIDE RNA AND TARGET DNA CONTAINING A-A NON-CANONICAL PAIR AT POSITION 3 organism=Rhodobacter sphaeroides (strain ATCC 17025 / ATH 2.4.3) / Rhodobacter sphaeroides (strain ATCC 17025 / ATH 2.4.3) : H : TYR OH F0329 <- 2.88 -> DA N6 J0004 : score 4.59578 : w : TYR OH F0329 <- 5.94 -> DA N7 J0004 : score 3.238 : w : ARG NH1 F0606 <- 5.05 -> DA N3 J-008 : score 2.585 : w : ARG NE F0670 <- 5.78 -> DA N6 J0004 : score 1.081 : w : ARG NH2 F0670 <- 5.94 -> DA N6 J0004 : score 1.997 : w : SER OG F0727 <- 5.46 -> DA N6 J0004 : score 2.209 : x : PRO xxxx F0045 <- 3.41 -> DC xxx 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GUIDE RNA PAIRED AND TARGET DNA CONTAINING A8-A8' NON-CANONICAL PAIR organism=Rhodobacter sphaeroides (strain ATCC 17025 / ATH 2.4.3) / Rhodobacter sphaeroides (strain ATCC 17025 / ATH 2.4.3) : H : TYR OH A0329 <- 2.91 -> DA N6 C0004 : score 4.56776 : w : TYR OH A0329 <- 6.12 -> DA N7 C0004 : score 3.238 : w : SER OG A0491 <- 6.27 -> DA N6 C0003 : score 2.209 : w : GLU OE2 A0532 <- 5.81 -> DC O2 C-006 : score 1.988 : w : ARG NH2 A0606 <- 5.75 -> DC O2 C-006 : score 1.669 : w : ASP OD2 A0640 <- 5.69 -> DT O4 C-005 : score 2.798 : w : ARG NE A0670 <- 5.75 -> DA N6 C0004 : score 1.081 : w : ARG NH2 A0670 <- 5.99 -> DA N6 C0004 : score 1.997 : w : LYS NZ A0692 <- 5.70 -> DT O2 C0002 : score 0.522 : w : SER OG A0727 <- 5.49 -> DA N6 C0004 : score 2.209 : x : PRO xxxx A0045 <- 3.48 -> DC xxx C-012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0063 <- 4.09 -> DG xxx C-011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0245 <- 3.53 -> DG xxx C-002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0341 <- 3.51 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0494 <- 3.48 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0495 <- 4.27 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0498 <- 3.80 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0687 <- 4.33 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0689 <- 3.12 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0690 <- 3.32 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0734 <- 3.90 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0735 <- 3.99 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx >6d9k_F:Ribonuclease_H-like; title=TERNARY RSAGO COMPLEX WITH GUIDE RNA AND TARGET DNA CONTAINING A-G NON-CANONICAL PAIR organism=Rhodobacter sphaeroides (strain ATCC 17025 / ATH 2.4.3) / Rhodobacter sphaeroides (strain ATCC 17025 / ATH 2.4.3) : H : TYR OH F0329 <- 2.83 -> DA N6 J0004 : score 4.64249 : H : ARG NH2 F0606 <- 3.10 -> DC O2 J-007 : score 3.47679 : w : ARG NH1 F0606 <- 5.08 -> DA N3 J-008 : score 2.585 : x : PRO xxxx F0045 <- 3.33 -> DC xxx J-012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0063 <- 4.06 -> DG xxx J-011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0245 <- 3.58 -> DG xxx J-002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0341 <- 3.59 -> DA xxx J0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0344 <- 4.04 -> DC xxx J0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0491 <- 4.20 -> DA xxx J0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0494 <- 3.37 -> DA xxx J0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0495 <- 4.17 -> DA xxx J0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0498 <- 3.65 -> DA xxx J0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0640 <- 3.59 -> DC xxx J-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0670 <- 3.76 -> DA xxx J0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0687 <- 4.34 -> DA xxx J0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0689 <- 3.43 -> DA xxx J0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0690 <- 3.44 -> DA xxx J0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0692 <- 3.75 -> DG xxx J0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0727 <- 3.88 -> DA xxx J0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0734 <- 3.79 -> DA xxx J0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0735 <- 4.09 -> DA xxx J0004 : score x.xxxxx >6d9l_A:Ribonuclease_H-like; title=TERNARY RSAGO COMPLEX WITH GUIDE RNA AND TARGET DNA CONTAINING G-A NON-CANONICAL PAIR organism=Rhodobacter sphaeroides (strain ATCC 17025 / ATH 2.4.3) / Rhodobacter sphaeroides (strain ATCC 17025 / ATH 2.4.3) : H : TYR OH A0329 <- 3.16 -> DA N6 G0004 : score 4.33424 : w : SER OG A0491 <- 6.00 -> DA N7 G0003 : score 2.343 : H : ARG NH2 A0606 <- 3.12 -> DC O2 G-007 : score 3.462 : x : PRO xxxx A0045 <- 3.49 -> DC xxx G-012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0063 <- 3.77 -> DG xxx G-011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0245 <- 3.79 -> DG xxx G-002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0340 <- 4.27 -> DC xxx G0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0341 <- 3.40 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0344 <- 4.11 -> DC xxx G0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0494 <- 3.42 -> DA xxx G0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0495 <- 3.92 -> DA xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0498 <- 3.65 -> DA xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0541 <- 3.57 -> DT xxx G-005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0640 <- 4.17 -> DC xxx G-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0670 <- 3.58 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0687 <- 4.05 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0689 <- 3.22 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0690 <- 3.58 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0692 <- 3.86 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0727 <- 4.10 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0734 <- 3.32 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0735 <- 3.96 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx >6dbi_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF RAG IN COMPLEX WITH 12-RSS AND 23-RSS NICKED DNA INTERMEDIATES organism=ESCHERICHIA COLI, DANIO RERIO : x : GLU xxxx A0671 <- 4.30 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0872 <- 4.13 -> DT xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0874 <- 3.79 -> DG xxx F0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0877 <- 3.94 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0981 <- 2.94 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0985 <- 3.94 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0988 <- 3.87 -> DG xxx F0032 : score x.xxxxx >6dbj_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF RAG IN COMPLEX WITH 12-RSS AND 23-RSS NICKED DNA INTERMEDIATES organism=ESCHERICHIA COLI, DANIO RERIO : H : ASN OD1 A0874 <- 3.20 -> DA N6 H0002 : score 5.54005 : H : ASN ND2 A0874 <- 2.92 -> DG O6 G0013 : score 5.50314 : H : LYS NZ A0988 <- 3.30 -> DG N3 G0013 : score 1.30846 : x : ASN xxxx A0872 <- 3.94 -> DT xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0877 <- 3.18 -> DA xxx H0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0981 <- 3.83 -> DA xxx H0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0985 <- 3.81 -> DA xxx H0002 : score x.xxxxx >6dbj_D:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RAG IN COMPLEX WITH 12-RSS AND 23-RSS NICKED DNA INTERMEDIATES organism=DANIO RERIO : x : ASN xxxx D0117 <- 3.91 -> DT xxx J0005 : score x.xxxxx >6dbl_B:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RAG IN COMPLEX WITH 12-RSS AND 23-RSS SUBSTRATE DNAS organism=DANIO RERIO : x : ASN xxxx B0117 <- 3.15 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx >6dbo_CD:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RAG IN COMPLEX WITH 12-RSS AND 23-RSS SUBSTRATE DNAS organism=? : H : LYS NZ C0866 <- 2.20 -> DT O4 H0015 : score 4.01764 : H : LYS NZ C0866 <- 2.20 -> DT O4 H0015 : score 4.01764 : H : MET SD C0869 <- 2.80 -> DC N4 G0019 : score -9.11154 : H : ARG NE C0870 <- 2.97 -> DA N7 G0018 : score -8.80175 : x : PRO xxxx C0867 <- 3.35 -> DT xxx H0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0872 <- 3.87 -> DA xxx G0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0117 <- 3.25 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx >6dbo_D:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RAG IN COMPLEX WITH 12-RSS AND 23-RSS SUBSTRATE DNAS organism=DANIO RERIO : x : ASN xxxx D0117 <- 3.25 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx >6dbq_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF RAG IN COMPLEX WITH 12-RSS AND 23-RSS SUBSTRATE DNAS organism=ESCHERICHIA 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score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0523 <- 4.35 -> DT xxx G0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1000 <- 4.16 -> DT xxx H0042 : score x.xxxxx >6dbt_BC:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RAG IN COMPLEX WITH 12-RSS AND 23-RSS SUBSTRATE DNAS organism=ESCHERICHIA COLI, DANIO RERIO : H : ARG NE C0421 <- 2.91 -> DG O6 F0014 : score 3.85432 : H : ARG NH2 C0421 <- 2.33 -> DG O6 F0014 : score 7.2204 : x : ARG xxxx C0410 <- 2.59 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0523 <- 4.31 -> DT xxx E0025 : score x.xxxxx >6dbu_AD:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RAG IN COMPLEX WITH 12-RSS AND 23-RSS SUBSTRATE DNAS organism=DANIO RERIO / ESCHERICHIA COLI, DANIO RERIO : x : HIS xxxx A0501 <- 3.99 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0520 <- 3.47 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0523 <- 3.28 -> DT xxx E0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1000 <- 4.00 -> DC xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0117 <- 4.19 -> DT xxx 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12-RSS AND 23-RSS SUBSTRATE DNAS organism=DANIO RERIO / ESCHERICHIA COLI, DANIO RERIO : H : ARG NH2 C0421 <- 2.29 -> DG O6 F0014 : score 7.2732 : H : HIS NE2 C0629 <- 3.28 -> DC O2 E0019 : score 4.77961 : x : ASN xxxx B0117 <- 3.77 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0410 <- 2.93 -> DA xxx E0041 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0422 <- 3.99 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0425 <- 3.81 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0999 <- 4.13 -> DG xxx E0023 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C1000 <- 2.64 -> DT xxx F0031 : score x.xxxxx >6dbv_C: title=CRYO-EM STRUCTURE OF RAG IN COMPLEX WITH 12-RSS AND 23-RSS SUBSTRATE DNAS organism=ESCHERICHIA COLI, DANIO RERIO : H : ARG NH2 C0421 <- 2.29 -> DG O6 F0014 : score 7.2732 : H : HIS NE2 C0629 <- 3.28 -> DC O2 E0019 : score 4.77961 : H : GLN NE2 C1000 <- 2.64 -> DT O2 F0031 : score 4.0592 : x : ARG xxxx C0410 <- 2.93 -> DA xxx E0041 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0422 <- 3.99 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : 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x.xxxxx >6dbw_B:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RAG IN COMPLEX WITH 12-RSS SUBSTRATE DNA organism=? : x : ASN xxxx B0117 <- 4.09 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx >6dbx_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF RAG IN COMPLEX WITH 12-RSS SUBSTRATE DNA organism=ESCHERICHIA COLI, DANIO RERIO : x : ASN xxxx A0462 <- 2.96 -> DG xxx F0020 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0869 <- 4.43 -> DA xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0870 <- 4.04 -> DT xxx F0035 : score x.xxxxx >6dbx_ABC:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RAG IN COMPLEX WITH 12-RSS SUBSTRATE DNA organism=ESCHERICHIA COLI, DANIO RERIO : H : ARG NE C0421 <- 2.56 -> DT O4 F0015 : score 1.94821 : H : ARG NH2 C0421 <- 2.26 -> DG O6 F0014 : score 7.3128 : x : ASN xxxx A0462 <- 2.96 -> DG xxx F0020 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0869 <- 4.43 -> DA xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0870 <- 4.04 -> DT xxx F0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0410 <- 3.09 -> DT xxx F0010 : score 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sapiens : w : THR OG1 A0507 <- 5.64 -> DC N4 D0010 : score 2.558 : w : THR OG1 A0507 <- 6.07 -> DC N4 D0011 : score 2.558 : w : SER OG A0508 <- 5.84 -> DC N4 D0010 : score 2.105 : H : ARG NH1 A0511 <- 2.71 -> DG O6 E0027 : score 6.19283 : H : ARG NH1 A0511 <- 3.01 -> DG O6 D0009 : score 5.82783 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.17 -> DG N7 D0009 : score 5.91215 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.27 -> DG O6 D0009 : score 5.9796 : H : GLN NE2 A0563 <- 2.89 -> DG O6 E0031 : score 5.70064 : w : GLN NE2 A0563 <- 5.76 -> DG O6 E0030 : score 2.87 : H : ARG NH1 A0595 <- 2.98 -> DT O2 E0025 : score 4.15138 : H : ARG NH2 A0595 <- 2.69 -> DG N3 E0026 : score 3.68968 : w : ARG NH1 A0595 <- 5.63 -> DA N3 D0013 : score 2.585 : w : TYR OH A0597 <- 5.93 -> DC O2 D0011 : score 1.343 : V : LEU CD2 A0533 <- 3.61 -> DT C7 D0008 : score 6.00352 : x : ALA xxxx A0535 <- 4.33 -> DG xxx E0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0536 <- 3.61 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0561 <- 3.80 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0562 <- 3.52 -> DG xxx E0030 : score x.xxxxx >6dfb_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=KAISO (ZBTB33) K539A ZINC FINGER DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH THE SPECIFIC KAISO BINDING SEQUENCE (KBS) organism=Homo sapiens : w : THR OG1 A0507 <- 5.69 -> DC N4 D0010 : score 2.558 : w : THR OG1 A0507 <- 6.05 -> DC N4 D0011 : score 2.558 : w : SER OG A0508 <- 5.81 -> DC N4 D0010 : score 2.105 : H : ARG NH1 A0511 <- 2.76 -> DG O6 E0027 : score 6.132 : H : ARG NH1 A0511 <- 3.00 -> DG O6 D0009 : score 5.84 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.09 -> DG N7 D0009 : score 6.01431 : H : ARG NH2 A0511 <- 2.99 -> DG O6 D0009 : score 6.3492 : H : GLU OE1 A0535 <- 2.81 -> DC N4 E0028 : score 5.75641 : H : GLN NE2 A0563 <- 2.89 -> DG O6 E0031 : score 5.70064 : w : GLN OE1 A0563 <- 5.66 -> DC N4 D0006 : score 3.488 : w : GLN NE2 A0563 <- 5.86 -> DG O6 E0030 : score 2.87 : H : ARG NH1 A0595 <- 2.89 -> DT O2 E0025 : score 4.22889 : H : ARG NH2 A0595 <- 2.73 -> DG N3 E0026 : score 3.6608 : w : ARG NH1 A0595 <- 5.52 -> DA N3 D0013 : score 2.585 : V : LEU CD2 A0533 <- 3.62 -> DT C7 D0008 : score 5.98919 : x : TYR xxxx A0536 <- 3.72 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0561 <- 3.88 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0562 <- 3.48 -> DG xxx E0030 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0597 <- 3.93 -> DG xxx E0027 : score x.xxxxx >6dfc_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=KAISO (ZBTB33) ZINC FINGER DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH THE SPECIFIC KAISO BINDING SEQUENCE (KBS) WITH A T-TO-U SUBSTITUTION organism=Homo sapiens : w : THR OG1 A0507 <- 5.59 -> DC N4 D0010 : score 2.558 : w : THR OG1 A0507 <- 5.95 -> DC N4 D0011 : score 2.558 : w : SER OG A0508 <- 5.82 -> DC N4 D0010 : score 2.105 : H : ARG NH1 A0511 <- 2.95 -> DG O6 D0009 : score 5.90083 : H : ARG NH1 A0511 <- 2.72 -> DG O6 E0027 : score 6.18067 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.05 -> DG N7 D0009 : score 6.06538 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.23 -> DG O6 D0009 : score 6.0324 : w : GLU OE1 A0535 <- 5.73 -> DC N4 E0028 : score 3.528 : w : GLU OE2 A0535 <- 5.84 -> DA N6 E0029 : score 2.785 : w : LYS NZ A0539 <- 5.83 -> DA N6 E0029 : score 2.097 : H : GLN NE2 A0563 <- 3.05 -> DG O6 E0031 : score 5.51487 : w : GLN NE2 A0563 <- 5.86 -> DA N6 E0030 : score 2.804 : H : ARG NH1 A0595 <- 2.75 -> DT O2 E0025 : score 4.34947 : H : ARG NH2 A0595 <- 2.59 -> DG N3 E0026 : score 3.76189 : V : LEU CD2 A0533 <- 3.56 -> DT C7 D0008 : score 6.07516 : V : THR CG2 A0507 <- 3.82 -> DT C7 E0025 : score 4.21574 : x : CYS xxxx A0505 <- 4.48 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0536 <- 3.56 -> DU xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0561 <- 4.10 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0562 <- 3.52 -> DA xxx E0030 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0597 <- 3.92 -> DG xxx E0027 : score x.xxxxx >6dfy_C:Homeodomain-like; title=REMODELED CRYSTAL STRUCTURE OF DNA-BOUND DUX4-HD2 organism=HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 C0055 <- 2.95 -> DA N6 E0010 : score 5.84114 : H : ASN ND2 C0055 <- 2.87 -> DA N7 E0010 : score 5.78833 : H : ARG NH1 C0059 <- 3.29 -> DG N7 E0009 : score 5.4571 : H : ARG NH2 C0059 <- 2.87 -> DG O6 E0009 : score 6.5076 : V : GLN CG C0054 <- 3.76 -> DT C7 F0015 : score 3.28794 : x : ILE xxxx C0051 <- 3.11 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx >6dfy_CD:Homeodomain-like; title=REMODELED CRYSTAL STRUCTURE OF DNA-BOUND DUX4-HD2 organism=HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 C0055 <- 2.95 -> DA N6 E0010 : score 5.84114 : H : ASN ND2 C0055 <- 2.87 -> DA N7 E0010 : score 5.78833 : H : ARG NH1 C0059 <- 3.29 -> DG N7 E0009 : score 5.4571 : H : ARG NH2 C0059 <- 2.87 -> DG O6 E0009 : score 6.5076 : H : ASN OD1 D0055 <- 2.81 -> DA N6 E0005 : score 6.00975 : H : ASN ND2 D0055 <- 2.82 -> DA N7 E0005 : score 5.84703 : H : ARG NH1 D0059 <- 3.07 -> DG N7 E0004 : score 5.7233 : H : ARG NH2 D0059 <- 3.03 -> DG N7 E0004 : score 6.09092 : H : ARG NH2 D0059 <- 2.90 -> DG O6 E0004 : score 6.468 : V : GLN CG C0054 <- 3.76 -> DT C7 F0015 : score 3.28794 : x : ILE xxxx C0051 <- 3.11 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0051 <- 3.48 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0054 <- 3.87 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx >6dg0_A:RNA-binding_domain,_RBD; title=MEC-8 C-TERMINAL RRM DOMAIN BOUND TO AGCACA organism=Caenorhabditis elegans : H : ARG NE A0092 <- 2.96 -> DG O6 D0001 : score 3.81491 : H : ARG NH2 A0092 <- 2.95 -> DG N7 D0001 : score 6.19308 : H : GLU OE1 A0094 <- 2.77 -> DC N4 D0002 : score 5.80256 : x : THR xxxx A0022 <- 3.86 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0024 <- 3.44 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0026 <- 3.48 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0051 <- 3.34 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0062 <- 3.41 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0087 <- 3.54 -> DA xxx D0000 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0096 <- 4.07 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0097 <- 3.43 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0098 <- 4.05 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0100 <- 3.71 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0101 <- 3.53 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx >6dgd_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=PRIA HELICASE BOUND TO DSDNA OF A DNA REPLICATION FORK organism=KLEBSIELLA PNEUMONIAE : x : VAL xxxx B0010 <- 3.29 -> DA xxx Y0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0011 <- 3.93 -> DA xxx Y0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0012 <- 3.97 -> DT xxx Z0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0014 <- 3.25 -> DT xxx Z0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0036 <- 3.53 -> DT xxx Z0012 : score x.xxxxx >6dia_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA SUBSTRATE COMPLEX WITH TEMPLATING CYTOSINE AND INCOMING FAPY-DGTP ANALOG organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.31 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.58 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.61 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6dic_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=D276G DNA POLYMERASE BETA SUBSTRATE COMPLEX WITH TEMPLATING CYTOSINE AND INCOMING FAPY-DGTP ANALOG organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.27 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.87 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.69 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6dks_C:DNA-binding_protein_LAG-1_CSL;p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=STRUCTURE OF THE RBPJ-SHARP-DNA REPRESSOR COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 C0091 <- 3.10 -> DG N7 B0008 : score 5.687 : H : ARG NH2 C0091 <- 3.06 -> DG O6 B0008 : score 6.2568 : H : ARG NH1 C0220 <- 2.81 -> DT O2 B0007 : score 4.2978 : H : ARG NH1 C0220 <- 2.81 -> DC O2 A0012 : score 3.6427 : x : TYR xxxx C0086 <- 3.55 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0089 <- 3.75 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0191 <- 3.65 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0192 <- 4.41 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx >6dmn_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS HALODURANS RIBONUCLEASE H1 IN COMPLEX WITH AN RNA/DNA HYBRID: SOAKED IN 2 MM CA2+ AND 200 MM K+ AT 21 C organism=BACILLUS HALODURANS : H : ASN ND2 A0077 <- 3.05 -> DA N3 C0003 : score 3.61731 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.32 -> DT O2 C0004 : score 4.25255 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.02 -> DT O2 C0004 : score 4.53732 : w : GLN OE1 A0134 <- 6.06 -> DG N2 C0005 : score 2.177 : w : THR OG1 A0135 <- 5.96 -> DG N2 C0005 : score 2.036 >6dmv_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS HALODURANS RIBONUCLEASE H1 IN COMPLEX WITH AN RNA/DNA HYBRID: SOAKED FOR 40 S IN 2 MM MG2+ AND 200 MM K+ AT 21 C organism=BACILLUS HALODURANS : H : ASN ND2 A0077 <- 3.03 -> DA N3 C0003 : score 3.63254 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.23 -> DT O2 C0004 : score 4.33798 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.08 -> DT O2 C0004 : score 4.48037 : w : GLN OE1 A0134 <- 5.83 -> DT O2 C0006 : score 2.481 : w : GLN OE1 A0134 <- 6.04 -> DG N2 C0005 : score 2.177 : w : THR OG1 A0135 <- 5.81 -> DG N2 C0005 : score 2.036 >6dnw_A: title=SEQUENCE REQUIREMENTS OF THE LISTERIA INNOCUA PROPHAGE ATTP SITE organism=Listeria innocua serovar 6a (strain ATCC BAA-680 / CLIP 11262) / Listeria innocua serovar 6a (strain ATCC BAA-680 / CLIP 11262) : H : LYS NZ A0140 <- 2.92 -> DC O2 C0005 : score 2.87545 : H : ARG NH2 A0156 <- 2.88 -> DT O2 B0021 : score 4.1656 : H : ASN ND2 A0208 <- 3.09 -> DT O4 B0016 : score 4.97811 : H : ASN OD1 A0259 <- 2.74 -> DG N2 C0016 : score 4.8576 : H : ASN ND2 A0259 <- 3.09 -> DG N3 C0016 : score 4.61097 : H : LYS NZ A0286 <- 2.46 -> DG N7 B0006 : score 5.75214 : H : THR OG1 A0288 <- 2.93 -> DT O4 C0023 : score 3.78611 : H : SER OG A0290 <- 3.31 -> DT O4 B0002 : score 3.19251 : H : LYS NZ A0306 <- 2.82 -> DG N7 C0018 : score 5.36435 : V : TYR CD1 A0207 <- 3.55 -> DT C7 B0015 : score 4.97359 : x : MET xxxx A0136 <- 4.04 -> DG xxx B0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0262 <- 3.25 -> DT xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0284 <- 4.08 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0287 <- 3.53 -> DA xxx C0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0295 <- 3.29 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0297 <- 3.17 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0299 <- 3.43 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx >6do8_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS HALODURANS RIBONUCLEASE H1 IN COMPLEX WITH AN RNA/DNA HYBRID: REACTION IN 2 MM MG2+ AND 200 MM K+ FOR 80 S AT 21 C organism=BACILLUS HALODURANS : H : ASN ND2 A0077 <- 3.07 -> DA N3 C0003 : score 3.60208 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.25 -> DT O2 C0004 : score 4.319 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.03 -> DT O2 C0004 : score 4.52783 : w : GLN OE1 A0134 <- 5.39 -> DT O2 C0006 : score 2.481 : w : GLN OE1 A0134 <- 5.88 -> DG N2 C0005 : score 2.177 : w : THR OG1 A0135 <- 5.96 -> DG N2 C0005 : score 2.036 >6do9_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS HALODURANS RIBONUCLEASE H1 IN COMPLEX WITH AN RNA/DNA HYBRID: REACTION IN 2 MM MG2+ AND 200 MM K+ FOR 120 S AT 21 C organism=? : H : ASN ND2 A0077 <- 3.05 -> DA N3 C0003 : score 3.61731 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.27 -> DT O2 C0004 : score 4.30002 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.04 -> DT O2 C0004 : score 4.51834 : w : GLN OE1 A0134 <- 6.32 -> DG N3 C0005 : score 1.484 : w : GLN OE1 A0134 <- 5.81 -> DT O2 C0006 : score 2.481 : w : THR OG1 A0135 <- 6.34 -> DG N3 C0005 : score 2.036 >6doh_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS HALODURANS RIBONUCLEASE H1 IN COMPLEX WITH AN RNA/DNA HYBRID: SOAK IN 0.5 MM EGTA AND 200 MM K+ AT 21 C organism=? : H : ASN ND2 A0077 <- 3.01 -> DA N3 C0003 : score 3.64777 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.21 -> DT O2 C0004 : score 4.35697 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.02 -> DT O2 C0004 : score 4.53732 : w : GLN OE1 A0134 <- 6.32 -> DT O2 C0006 : score 2.481 : w : GLN OE1 A0134 <- 6.42 -> DG N3 C0005 : score 1.484 : w : THR OG1 A0135 <- 6.38 -> DG N3 C0005 : score 2.036 >6doi_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS HALODURANS RIBONUCLEASE H1 IN COMPLEX WITH AN RNA/DNA HYBRID (1.54 ANGSTROM WAVELENGTH): SOAK IN 0.5 MM EGTA AND 200 MM K+ AT 21 C organism=BACILLUS HALODURANS C-125 : H : ASN ND2 A0077 <- 3.05 -> DA N3 C0003 : score 3.61731 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.28 -> DT O2 C0004 : score 4.29052 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.06 -> DT O2 C0004 : score 4.49935 : w : GLN OE1 A0134 <- 6.27 -> DT O2 C0006 : score 2.481 : w : GLN OE1 A0134 <- 6.33 -> DG N3 C0005 : score 1.484 : w : THR OG1 A0135 <- 6.25 -> DG N3 C0005 : score 2.036 >6doj_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS HALODURANS RIBONUCLEASE H1 IN COMPLEX WITH AN RNA/DNA HYBRID: REACTION IN 2 MM MG2+ AND 5 MM K+ FOR 120 S AT 21 C organism=BACILLUS HALODURANS : H : ASN ND2 A0077 <- 3.03 -> DA N3 C0003 : score 3.63254 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.29 -> DT O2 C0004 : score 4.28103 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.03 -> DT O2 C0004 : score 4.52783 : w : GLN OE1 A0134 <- 5.88 -> DT O2 C0006 : score 2.481 : w : GLN OE1 A0134 <- 6.02 -> DG 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OF BACILLUS HALODURANS RIBONUCLEASE H1 K196A IN COMPLEX WITH AN RNA/DNA HYBRID: REACTION IN 10 MM MG2+ AND 200 MM RB+ FOR 40 S AT 21 C organism=BACILLUS HALODURANS : H : ASN ND2 A0077 <- 3.01 -> DA N3 C0003 : score 3.64777 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.26 -> DT O2 C0004 : score 4.30951 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.05 -> DT O2 C0004 : score 4.50885 : w : GLN OE1 A0134 <- 5.32 -> DT O2 C0006 : score 2.481 : w : GLN OE1 A0134 <- 6.07 -> DG N2 C0005 : score 2.177 : w : THR OG1 A0135 <- 5.96 -> DG N2 C0005 : score 2.036 >6dpj_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS HALODURANS RIBONUCLEASE H1 K196A IN COMPLEX WITH AN RNA/DNA HYBRID: REACTION IN 4 MM MN2+ AND 200 MM K+ FOR 80 S AT 21 C organism=BACILLUS HALODURANS : H : ASN ND2 A0077 <- 3.02 -> DA N3 C0003 : score 3.64015 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.20 -> DT O2 C0004 : score 4.36646 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.05 -> DT O2 C0004 : score 4.50885 : w : GLN OE1 A0134 <- 5.84 -> DT O2 C0006 : score 2.481 : w : GLN OE1 A0134 <- 6.23 -> DG N2 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3.04 -> DT O2 C0004 : score 4.51834 : w : GLN OE1 A0134 <- 5.95 -> DG N2 C0005 : score 2.177 : w : GLN OE1 A0134 <- 6.15 -> DT O2 C0006 : score 2.481 : w : THR OG1 A0135 <- 5.93 -> DG N2 C0005 : score 2.036 >6dpm_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS HALODURANS RIBONUCLEASE H1 K196A IN COMPLEX WITH AN RNA/DNA HYBRID: REACTION IN 10 MM MG2+ AND 200 MM RB+ FOR 1800 S AT 21 C organism=BACILLUS HALODURANS : H : ASN ND2 A0077 <- 3.14 -> DA N3 C0003 : score 3.54877 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.19 -> DT O2 C0004 : score 4.37595 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.11 -> DT O2 C0004 : score 4.45189 : w : GLN OE1 A0134 <- 6.07 -> DG N2 C0005 : score 2.177 : w : GLN OE1 A0134 <- 6.37 -> DT O2 C0006 : score 2.481 : w : THR OG1 A0135 <- 5.94 -> DG N2 C0005 : score 2.036 >6dpn_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS HALODURANS RIBONUCLEASE H1 E188A IN COMPLEX WITH AN RNA/DNA HYBRID: REACTION IN 2 MM MG2+ AND 200 MM K+ FOR 200 S AT 21 C organism=BACILLUS HALODURANS : H : ASN ND2 A0077 <- 3.05 -> DA N3 C0003 : score 3.61731 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.25 -> DT O2 C0004 : score 4.319 : H : ASN ND2 A0106 <- 3.01 -> DT O2 C0004 : score 4.54682 : w : GLN OE1 A0134 <- 5.94 -> DT O2 C0006 : score 2.481 : w : GLN OE1 A0134 <- 6.52 -> DG N3 C0005 : score 1.484 : w : THR OG1 A0135 <- 6.28 -> DG N3 C0005 : score 2.036 >6dpo_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS HALODURANS RIBONUCLEASE H1 E188A IN COMPLEX WITH AN RNA/DNA HYBRID: REACTION IN 2 MM MG2+ AND 200 MM K+ FOR 360 S AT 21 C organism=BACILLUS HALODURANS : H : ASN ND2 A0077 <- 3.01 -> DA N3 C0003 : score 3.64777 : H : ASN ND2 A0105 <- 3.24 -> DT O2 C0004 : score 4.32849 : H : ASN ND2 A0106 <- 2.98 -> DT O2 C0004 : score 4.57529 : w : GLN OE1 A0134 <- 6.05 -> DT O2 C0006 : score 2.481 : w : GLN OE1 A0134 <- 6.53 -> DG N3 C0005 : score 1.484 : w : THR OG1 A0135 <- 6.29 -> DG N3 C0005 : score 2.036 >6dsu_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I PRE-INSERTION COMPLEX STRUCTURE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 3.01 -> DA N3 P0007 : score 2.66029 : w : LYS NZ A0582 <- 5.38 -> DC O2 P0006 : score 1.3 : w : ASN ND2 A0622 <- 6.37 -> DG N3 T0006 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.11 -> DC O2 P0008 : score 4.20176 : x : PHE xxxx A0710 <- 3.50 -> DT xxx P0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.43 -> DT xxx P0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 4.18 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx >6dsv_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I POST-CHEMISTRY (N+2) STRUCTURE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.71 -> DC O2 P0008 : score 2.99918 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.95 -> DC O2 T0006 : score 1.885 : w : ASN OD1 A0793 <- 6.19 -> DT O2 T0004 : score 1.953 : x : ASN xxxx A0625 <- 3.52 -> DG xxx P0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0710 <- 3.03 -> DA xxx P0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.87 -> DA xxx P0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 3.84 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx >6dsw_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I PRE-CHEMISTRY (N) STRUCTURE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.65 -> DC O2 P0006 : score 3.03454 : w : LYS NZ A0582 <- 5.49 -> DT O2 P0005 : score 0.522 : w : LYS NZ A0582 <- 5.70 -> DA N3 T0011 : score 1.538 : w : THR OG1 A0586 <- 5.51 -> DA N3 T0011 : score 2.845 : w : TYR OH A0587 <- 5.80 -> DG N2 T0010 : score 2.834 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.95 -> DG N3 P0009 : score 2.96099 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.20 -> DG N3 P0009 : score 3.32144 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.84 -> DG N3 T0008 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.79 -> DT O2 T0009 : score 1.666 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.06 -> DA N3 P0007 : score 3.60969 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.55 -> DG N3 T0010 : score 2.566 : H : ARG NH2 A0629 <- 2.91 -> DG N7 P0009 : score 6.24415 : w : GLU OE1 A0658 <- 6.18 -> DC O2 T0007 : score 2.68 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.26 -> DC O2 T0007 : score 1.885 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.21 -> DC O2 T0007 : score 2.699 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.61 -> DC O2 P0008 : score 3.208 : x : TYR xxxx A0714 <- 3.25 -> DC xxx T0007 : score x.xxxxx >6dsx_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I POST-CHEMISTRY (N+1 WITH DATP SOAK) STRUCTURE organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.87 -> DC O2 P0007 : score 2.90491 : w : LYS NZ A0582 <- 5.74 -> DA N3 P0006 : score 1.538 : w : ARG NH1 A0615 <- 6.12 -> DA N3 T0006 : score 2.585 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.87 -> DC O2 T0007 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.93 -> DG N3 P0008 : score 4.7676 : w : HIS NE2 A0829 <- 5.80 -> DT O2 P0009 : score 3.682 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.46 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.22 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx >6dsy_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I POST-CHEMISTRY (N+1) STRUCTURE organism=Geobacillus stearothermophilus : w : LYS NZ A0582 <- 6.23 -> DT O2 T0009 : score 0.522 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.77 -> DC O2 P0008 : score 4.50636 : w : ASN OD1 A0625 <- 5.89 -> DT O2 T0009 : score 1.953 : x : PHE xxxx A0710 <- 3.98 -> DT xxx P0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.91 -> DT xxx P0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 3.23 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx >6dt1_A:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE LIGASE FROM BACTERIOPHAGE T4 COMPLEXED WITH DNA INTERMEDIATE organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T4 : H : SER OG A0407 <- 2.62 -> DT O2 C0013 : score 3.83054 : x : PHE xxxx A0457 <- 3.18 -> DG xxx D0032 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0458 <- 3.71 -> DG xxx D0032 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0460 <- 4.38 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >6dt8_A:DNA/RNA_polymerases; title=BACTERIOPHAGE N4 RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX 1 organism=ENTEROBACTERIA PHAGE N4 : x : HIS xxxx A0059 <- 3.39 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0060 <- 3.96 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 4.09 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0104 <- 4.10 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0105 <- 4.40 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0238 <- 4.36 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0242 <- 4.03 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx >6dt8_AB:DNA/RNA_polymerases; title=BACTERIOPHAGE N4 RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX 1 organism=ENTEROBACTERIA PHAGE N4 : x : HIS xxxx A0059 <- 3.39 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0060 <- 3.96 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 4.09 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0104 <- 4.10 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0105 <- 4.40 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0238 <- 4.36 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0242 <- 4.03 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0143 <- 3.21 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0148 <- 4.47 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0235 <- 3.52 -> DA xxx C-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0237 <- 4.23 -> DA xxx C-001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0245 <- 3.81 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx >6dta_A:DNA/RNA_polymerases; title=BACTERIOPHAGE N4 RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX 2 organism=ENTEROBACTERIA PHAGE N4 : x : LEU xxxx A0058 <- 4.02 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0059 <- 3.71 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0060 <- 3.69 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.71 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0104 <- 3.58 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0105 <- 3.96 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0238 <- 4.20 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0242 <- 4.09 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx >6dta_AB:DNA/RNA_polymerases; title=BACTERIOPHAGE N4 RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX 2 organism=ENTEROBACTERIA PHAGE N4 : x : LEU xxxx A0058 <- 4.02 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0059 <- 3.71 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0060 <- 3.69 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.71 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0104 <- 3.58 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0105 <- 3.96 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0238 <- 4.20 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0242 <- 4.09 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0143 <- 3.55 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0146 <- 3.58 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0148 <- 3.94 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0245 <- 3.44 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx >6dta_B:DNA/RNA_polymerases; title=BACTERIOPHAGE N4 RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX 2 organism=ENTEROBACTERIA PHAGE N4 : x : THR xxxx B0143 <- 3.55 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0146 <- 3.58 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0148 <- 3.94 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0245 <- 3.44 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx >6dv9_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX(ECF SIGMA FACTOR L) CONTAINING 5NT RNA WITH 4NT SPACER organism=? : H : ARG NH2 D0291 <- 2.36 -> DG O6 H0024 : score 7.1808 : x : ARG xxxx C0467 <- 3.33 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0287 <- 3.39 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx >6dvb_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX(ECF SIGMA FACTOR L) CONTAINING 5NT RNA WITH 5NT SPACER organism=? : x : ARG xxxx C0467 <- 4.33 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx >6dvb_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX(ECF SIGMA FACTOR L) CONTAINING 5NT RNA WITH 5NT SPACER organism=? : H : ARG NH2 D0291 <- 2.37 -> DG O6 H0024 : score 7.1676 : x : ARG xxxx C0467 <- 4.33 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0287 <- 3.23 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx >6dvc_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX(ECF SIGMA FACTOR L) CONTAINING 5NT RNA WITH 6NT SPACER organism=? : H : ARG NH2 D0291 <- 2.33 -> DG O6 H0024 : score 7.2204 : x : ARG xxxx C0467 <- 3.45 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0287 <- 3.19 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx >6dvd_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX(ECF SIGMA FACTOR L) WITH 6 NT SPACER AND BROMINE LABELLED IN POSITION "-11 organism=? : x : ARG xxxx C0467 <- 3.29 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx >6dvd_CD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX(ECF SIGMA FACTOR L) WITH 6 NT SPACER AND BROMINE LABELLED IN POSITION "-11 organism=? : H : ARG NH2 D0291 <- 2.44 -> DG O6 H0024 : score 7.0752 : x : ARG xxxx C0467 <- 3.29 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0287 <- 3.41 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx >6dve_CD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX(ECF SELENOMETHIONINE-LABELLED SIGMA FACTOR L) WITH 6 NT SPACER organism=? : H : ARG NH2 D0291 <- 2.33 -> DG O6 H0024 : score 7.2204 : V : ARG CZ C0467 <- 3.69 -> DT C7 H0016 : score 2.19095 : x : GLU xxxx C0466 <- 4.48 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0287 <- 3.13 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx >6dve_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX(ECF SELENOMETHIONINE-LABELLED SIGMA FACTOR L) WITH 6 NT SPACER organism=? : H : ARG NH1 F0050 <- 2.33 -> DT O4 H0004 : score 3.57514 : H : ASN ND2 F0075 <- 2.72 -> DT O2 H0004 : score 4.82209 : x : VAL xxxx F0025 <- 3.91 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0028 <- 2.97 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0031 <- 3.34 -> DT xxx H0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0054 <- 3.28 -> DT xxx H0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0056 <- 3.39 -> DG xxx H0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0057 <- 3.38 -> DG xxx H0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0060 <- 2.91 -> DG xxx H0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0063 <- 3.33 -> DG xxx H0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0065 <- 3.88 -> DG xxx H0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0067 <- 3.19 -> DA xxx H0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0068 <- 3.98 -> DT xxx H0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0070 <- 3.22 -> DA xxx H0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0071 <- 3.93 -> DT xxx H0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0072 <- 3.42 -> DT xxx H0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0079 <- 3.59 -> DC xxx H0002 : score x.xxxxx >6dww_A:Ribonuclease_H-like;Hermes_dimerisation_domain; title=HERMES TRANSPOSASE DELETION DIMER COMPLEX WITH (A/T) DNA AND MN2+ organism=Musca domestica : H : LYS NZ A0372 <- 2.48 -> DA N7 B0001 : score 3.12516 : H : ARG NE A0573 <- 3.05 -> DA N3 B0001 : score 1.99744 : H : SER OG A0576 <- 2.34 -> DC O2 C0015 : score 2.7314 : x : ARG xxxx A0318 <- 3.34 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0375 <- 3.54 -> DA xxx B0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0572 <- 3.65 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx >6dwy_A:Ribonuclease_H-like;Hermes_dimerisation_domain; title=HERMES TRANSPOSASE DELETION DIMER COMPLEX WITH (C/G) DNA AND CA2+ organism=Musca domestica : H : LYS NZ A0372 <- 2.43 -> DA N7 B0001 : score 3.15453 : H : ARG NE A0573 <- 3.25 -> DA N3 B0001 : score 1.91333 : H : SER OG A0576 <- 2.30 -> DC O2 C0015 : score 2.75141 : x : ARG xxxx A0318 <- 3.58 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0375 <- 3.60 -> DA xxx B0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0572 <- 4.21 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx >6dwz_E:Ribonuclease_H-like;Hermes_dimerisation_domain; title=HERMES TRANSPOSASE DELETION DIMER COMPLEX WITH (C/G) DNA organism=Musca domestica : x : LYS xxxx E0312 <- 3.81 -> DT xxx G0014 : score x.xxxxx >6dx0_A:Ribonuclease_H-like;Hermes_dimerisation_domain; title=HERMES TRANSPOSASE DELETION DIMER COMPLEX WITH (A/T) DNA organism=Musca domestica : H : LYS NZ A0372 <- 2.29 -> DA N7 B0001 : score 3.23677 : H : ARG NE A0573 <- 3.14 -> DA N3 B0001 : score 1.95959 : H : SER OG A0576 <- 2.63 -> DC O2 C0015 : score 2.58633 : x : ARG xxxx A0318 <- 3.52 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0375 <- 3.69 -> DA xxx B0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0572 <- 3.27 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx >6dzt_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH A SINGLE CHAIN ANTIBODY FRAGMENT organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH2 A0040 <- 2.49 -> DG N3 J0083 : score 3.83409 : H : ARG NH1 H0030 <- 3.18 -> DT O2 J0027 : score 3.97912 : x : ARG xxxx A0083 <- 3.46 -> DT xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.27 -> DT xxx J0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.35 -> DG xxx J0122 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.49 -> DG xxx I0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 2.88 -> DT xxx I0083 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.32 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx >6dzt_C:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH A SINGLE CHAIN ANTIBODY FRAGMENT organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : ARG xxxx C0042 <- 3.27 -> DT xxx J0112 : score x.xxxxx >6e0c_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE CENP-A NUCLEOSOME (W601) IN COMPLEX WITH A SINGLE CHAIN ANTIBODY FRAGMENT organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0043 <- 2.50 -> DT O2 I0083 : score 4.5648 : H : ARG NH2 C0011 <- 2.96 -> DT O2 I0118 : score 4.09787 : H : ARG NH1 E0043 <- 2.69 -> DC O2 J0082 : score 3.7303 : H : ARG NH1 G0011 <- 3.05 -> DT O2 J0117 : score 4.09109 : H : ARG NH2 G0011 <- 3.37 -> DC O2 J0118 : score 3.27706 : x : ARG xxxx B0045 <- 4.30 -> DC xxx I0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.25 -> DG xxx J0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.07 -> DC xxx J0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.00 -> DT xxx J0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.60 -> DG xxx J0122 : score x.xxxxx >6e0p_A:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE CENTROMERIC NUCLEOSOME (NATIVE ALPHA SATELLITE DNA) IN COMPLEX WITH A SINGLE CHAIN ANTIBODY FRAGMENT organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0043 <- 3.47 -> DT xxx J0066 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.93 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx >6e0p_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE CENTROMERIC NUCLEOSOME (NATIVE ALPHA SATELLITE DNA) IN COMPLEX WITH A SINGLE CHAIN ANTIBODY FRAGMENT organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 C0011 <- 2.88 -> DC O2 I0117 : score 3.63954 : x : ARG xxxx A0043 <- 3.47 -> DT xxx J0066 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.93 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.69 -> DT xxx I0121 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0043 <- 3.64 -> DC xxx I0066 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.73 -> DT xxx J0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0011 <- 3.33 -> DA xxx I0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.22 -> DT xxx J0111 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.98 -> DG xxx J0121 : score x.xxxxx >6e33_A:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PHO7-DNA COMPLEX organism=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) / Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) : H : ARG NH1 A0284 <- 2.82 -> DT O2 B0011 : score 4.28918 : H : ARG NH2 A0284 <- 2.98 -> DC O2 B0012 : score 3.56556 : w : ARG NH1 A0284 <- 5.63 -> DC O2 C0010 : score 1.381 : H : GLN OE1 A0287 <- 2.99 -> DG N2 B0010 : score 5.3946 : w : GLN OE1 A0287 <- 5.51 -> DC O2 C0010 : score 1.091 : w : GLN NE2 A0287 <- 6.07 -> DA N3 C0011 : score 1.888 : H : ASN ND2 A0299 <- 2.88 -> DG O6 C0007 : score 5.54825 : w : ASN ND2 A0299 <- 6.25 -> DG O6 C0008 : score 2.971 : H : LYS NZ A0300 <- 2.75 -> DG O6 B0014 : score 5.83858 : w : LYS NZ A0300 <- 5.51 -> DT O4 C0004 : score 1.7 : H : ARG NH1 A0326 <- 2.90 -> DC O2 C0014 : score 3.577 : H : ARG NH2 A0326 <- 2.88 -> DT O2 C0013 : score 4.1656 : H : ARG NH2 A0326 <- 3.27 -> DC O2 C0014 : score 3.35104 : H : ARG NH1 A0332 <- 3.08 -> DT O2 B0005 : score 4.06525 : H : ARG NH2 A0332 <- 3.24 -> DG N3 B0006 : score 3.29255 : H : TYR OH A0335 <- 2.81 -> DA N3 C0016 : score 4.14298 : x : ASP xxxx A0298 <- 4.18 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >6e3r_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH 8OA AS THE TEMPLATE BASE IN A 1-NUCLEOTIDE GAPPED DNA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.26 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.66 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.63 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6e3v_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH 8OA IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE TTP organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0037 <- 6.43 -> DT O4 T0007 : score 3.275 : H : LYS NZ A0234 <- 3.14 -> DG N3 T0009 : score 1.35498 : x : TYR xxxx A0271 <- 4.40 -> DA xxx P0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0283 <- 3.70 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >6e3w_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH 8OA IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE GTP organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0258 <- 6.74 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : w : TYR OH A0271 <- 5.13 -> DA N3 P0010 : score 1.448 : w : GLU OE2 A0295 <- 6.19 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : LYS xxxx A0234 <- 3.59 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0283 <- 3.90 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >6e3x_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH 8OA IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE ATP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.32 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.71 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.55 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6e8c_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DOUBLE HOMEODOMAIN OF DUX4 IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0020 <- 2.96 -> DT O2 C0013 : score 4.09787 : H : ARG NH2 A0020 <- 3.14 -> DA N3 B0006 : score 3.01944 : H : ARG NH2 A0023 <- 2.87 -> DT O2 B0004 : score 4.17407 : H : ASN OD1 A0069 <- 3.05 -> DA N6 B0006 : score 5.72071 : H : ASN ND2 A0069 <- 2.91 -> DA N7 B0006 : score 5.74136 : H : ARG NH1 A0095 <- 3.11 -> DC O2 B0013 : score 3.4237 : H : ARG NH1 A0098 <- 3.01 -> DT O2 C0004 : score 4.12554 : H : ARG NH2 A0098 <- 3.09 -> DT O2 C0004 : score 3.9878 : H : ASN OD1 A0144 <- 2.88 -> DA N6 C0006 : score 5.92545 : H : ASN ND2 A0144 <- 3.06 -> DA N7 C0006 : score 5.56525 : H : ARG NH1 A0148 <- 3.05 -> DG N7 C0005 : score 5.7475 : H : ARG NH2 A0148 <- 2.81 -> DG O6 C0005 : score 6.5868 : V : ILE CG2 A0140 <- 3.83 -> DT C7 C0007 : score 7.0381 : V : ILE CG2 A0065 <- 3.60 -> DT C7 B0007 : score 7.44585 : V : GLN CG A0143 <- 3.71 -> DT C7 B0009 : score 3.32863 : x : GLN xxxx A0068 <- 3.48 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0072 <- 3.28 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx >6e93_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZBTB38 C-TERMINAL ZINC FINGERS 6-9 IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 A1052 <- 2.98 -> DA N6 C0029 : score 5.80501 : H : ASN ND2 A1052 <- 2.95 -> DA N7 C0029 : score 5.6944 : w : ASN OD1 A1052 <- 5.72 -> DG O6 C0028 : score 3.125 : w : ASN OD1 A1052 <- 5.86 -> DA N6 D0007 : score 2.837 : H : LYS NZ A1055 <- 2.60 -> DT O4 D0008 : score 3.73067 : w : LYS NZ A1055 <- 5.37 -> DG O6 C0028 : score 3.005 : w : THR OG1 A1080 <- 5.78 -> DC N4 C0026 : score 2.558 : V : VAL CG2 A1049 <- 3.88 -> DT C7 C0030 : score 6.00062 : x : SER xxxx A1023 <- 3.82 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1027 <- 4.07 -> DT xxx C0030 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1079 <- 3.62 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1105 <- 3.78 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1107 <- 3.64 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx >6e94_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZBTB38 C-TERMINAL ZINC FINGERS 6-9 K1055R IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 A1052 <- 3.03 -> DA N6 C0029 : score 5.74479 : H : ASN ND2 A1052 <- 2.95 -> DA N7 C0029 : score 5.6944 : H : ARG NH1 A1055 <- 2.90 -> DT O4 D0008 : score 3.20259 : H : ARG NH2 A1055 <- 2.78 -> DG O6 C0028 : score 6.6264 : w : ARG NH2 A1055 <- 5.87 -> DG N7 C0028 : score 2.18 : w : THR OG1 A1080 <- 5.73 -> DC N4 C0026 : score 2.558 : x : SER xxxx A1023 <- 3.80 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1027 <- 4.16 -> DT xxx C0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A1049 <- 4.02 -> DT xxx C0030 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1079 <- 3.70 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1105 <- 3.77 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1107 <- 3.66 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx >6edb_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF SRY.HCGAS-21BP DSDNA COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 A0176 <- 2.90 -> DC O2 D0016 : score 3.62474 >6edb_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF SRY.HCGAS-21BP DSDNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0176 <- 2.90 -> DC O2 D0016 : score 3.62474 : H : ASN ND2 B0032 <- 2.61 -> DT O2 C0020 : score 4.92651 : H : SER OG B0036 <- 2.93 -> DA N3 D0004 : score 2.92575 : x : ARG xxxx B0007 <- 3.98 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0010 <- 3.53 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0012 <- 3.31 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0013 <- 3.49 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0020 <- 3.29 -> DA xxx C0019 : score x.xxxxx >6edc_A: title=HCGAS-16BP DSDNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0176 <- 2.90 -> DA N3 B0013 : score 3.17495 >6edt_CDFJM: title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RNAP OPEN PROMOTER COMPLEX WITH RBPA/CARD AND AP3 PROMOTER organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : H : ASN OD1 F0299 <- 3.12 -> DT N3 O0054 : score 3.558 : H : ASP OD2 F0432 <- 3.35 -> DG N2 P0098 : score 4.85849 : H : ARG NH1 F0500 <- 2.46 -> DG O6 P0126 : score 6.497 : H : ARG NH1 F0500 <- 3.06 -> DT O4 P0127 : score 3.09802 : H : GLU OE1 F0501 <- 2.61 -> DC N4 P0128 : score 5.98713 : H : LYS NZ M0090 <- 2.41 -> DT O4 P0105 : score 3.86698 : V : GLN CG F0353 <- 3.86 -> DT C7 O0048 : score 3.20655 : V : ARG CZ C0467 <- 3.52 -> DT C7 O0063 : score 2.28157 : x : ARG xxxx C0181 <- 2.12 -> DT xxx O0062 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0211 <- 3.23 -> DG xxx O0061 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0228 <- 3.66 -> DG xxx O0061 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0282 <- 3.98 -> DA xxx O0058 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0305 <- 2.51 -> DA xxx O0058 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0421 <- 3.81 -> DT xxx P0103 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0463 <- 4.39 -> DT xxx O0062 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C1062 <- 4.10 -> DC xxx P0099 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0330 <- 3.39 -> DC xxx P0100 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0331 <- 4.00 -> DC xxx P0100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0334 <- 3.38 -> DC xxx P0100 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0394 <- 3.38 -> DA xxx P0101 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0397 <- 2.46 -> DA xxx P0101 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0502 <- 4.11 -> DC xxx P0094 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0867 <- 2.86 -> DA xxx P0093 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0868 <- 4.29 -> DA xxx P0093 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0226 <- 2.94 -> DG xxx O0056 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0228 <- 3.73 -> DG xxx O0056 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0229 <- 3.27 -> DG xxx O0056 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0232 <- 3.32 -> DG xxx O0056 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0240 <- 3.49 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0246 <- 4.34 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0301 <- 3.27 -> DG xxx O0055 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0302 <- 3.36 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0313 <- 3.98 -> DC xxx P0104 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0335 <- 3.94 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0336 <- 3.68 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0339 <- 3.40 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0341 <- 3.62 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0344 <- 4.08 -> DC xxx O0053 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0345 <- 3.16 -> DA xxx O0052 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0346 <- 3.37 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0348 <- 3.59 -> DC xxx O0053 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0349 <- 3.90 -> DT xxx O0049 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0350 <- 4.27 -> DT xxx O0049 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0370 <- 4.01 -> DT xxx O0046 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0371 <- 3.67 -> DT xxx O0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0374 <- 3.58 -> DA xxx P0107 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0381 <- 3.75 -> DC xxx P0104 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0384 <- 2.51 -> DC xxx P0104 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0385 <- 4.34 -> DC xxx P0104 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0419 <- 4.01 -> DG xxx P0102 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0421 <- 3.34 -> DA xxx P0101 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0422 <- 3.46 -> DA xxx P0101 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0425 <- 3.76 -> DA xxx P0101 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0427 <- 3.71 -> DC xxx P0099 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0430 <- 3.44 -> DG xxx P0098 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0433 <- 4.09 -> DG xxx P0098 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0438 <- 3.48 -> DG xxx P0098 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0499 <- 3.77 -> DT xxx O0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0502 <- 3.77 -> DT xxx O0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0504 <- 3.32 -> DC xxx P0128 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0505 <- 3.32 -> DT xxx O0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0006 <- 3.34 -> DC xxx P0100 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx M0085 <- 3.67 -> DA xxx P0106 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0086 <- 4.05 -> DT xxx O0049 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx M0089 <- 4.02 -> DT xxx P0105 : score x.xxxxx >6edt_J: title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RNAP OPEN PROMOTER COMPLEX WITH RBPA/CARD AND AP3 PROMOTER organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : x : LEU xxxx J0006 <- 3.34 -> DC xxx P0100 : score x.xxxxx >6ee8_CDFM: title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RNAP PROMOTER UNWINDING INTERMEDIATE COMPLEX WITH RBPA/CARD AND AP3 PROMOTER organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : H : ASN OD1 F0299 <- 2.64 -> DT N3 O0054 : score 3.92292 : H : ARG NH1 F0500 <- 2.82 -> DG O6 P0126 : score 6.059 : H : ARG NH2 F0500 <- 2.47 -> DG N7 P0126 : score 6.806 : H : GLU OE2 F0501 <- 2.66 -> DC N4 P0128 : score 5.41282 : V : LYS CE M0090 <- 3.83 -> DT C7 P0105 : score 2.58152 : V : THR CG2 F0499 <- 3.88 -> DT C7 O0026 : score 4.15218 : x : ARG xxxx C0395 <- 3.96 -> DC xxx P0099 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.43 -> DC xxx P0094 : score x.xxxxx : x : 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GLN OE1 A0247 <- 5.42 -> DC N4 E0003 : score 3.488 : x : ARG xxxx A0100 <- 3.40 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0108 <- 3.84 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0193 <- 3.98 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0239 <- 3.99 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0257 <- 3.60 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx >6eko_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF TYPE IIP RESTRICTION ENDONUCLEASE PFOI WITH COGNATE DNA organism=Pseudomonas fluorescens : H : GLN OE1 A0105 <- 2.87 -> DG N2 E0008 : score 5.52918 : H : GLN NE2 A0105 <- 3.09 -> DG N3 E0008 : score 4.68705 : H : LYS NZ A0109 <- 3.28 -> DT O2 F0004 : score 3.24281 : w : LYS NZ A0109 <- 6.29 -> DC O2 E0012 : score 1.3 : H : ARG NE A0189 <- 2.78 -> DG O6 F0008 : score 3.95679 : H : GLU OE1 A0192 <- 2.85 -> DC N4 E0005 : score 5.71027 : H : GLU OE2 A0192 <- 2.79 -> DC N4 E0006 : score 5.27592 : H : GLN OE1 A0247 <- 3.09 -> DA N6 F0010 : score 5.70152 : H : GLN NE2 A0247 <- 2.88 -> DA N7 F0010 : score 5.99231 : w : GLN OE1 A0247 <- 5.42 -> DC N4 E0003 : score 3.488 : H : GLN OE1 B0105 <- 3.11 -> DG N2 F0008 : score 5.26002 : H : LYS NZ B0109 <- 3.39 -> DT O2 E0004 : score 3.16389 : w : LYS NZ B0109 <- 6.42 -> DC O2 F0012 : score 1.3 : H : ARG NE B0189 <- 3.12 -> DG O6 E0008 : score 3.6888 : H : LYS NZ B0191 <- 2.83 -> DG O6 E0009 : score 5.74608 : H : GLU OE1 B0192 <- 3.12 -> DC N4 F0005 : score 5.3988 : H : GLU OE2 B0192 <- 2.96 -> DC N4 F0006 : score 5.09689 : H : GLN OE1 B0247 <- 2.63 -> DA N6 E0010 : score 6.25835 : H : GLN NE2 B0247 <- 2.80 -> DA N7 E0010 : score 6.08974 : w : GLN OE1 B0247 <- 5.86 -> DC N4 F0003 : score 3.488 : x : ARG xxxx A0100 <- 3.40 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0108 <- 3.84 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0191 <- 3.15 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0193 <- 3.98 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0239 <- 3.99 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0257 <- 3.60 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0100 <- 3.48 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0108 <- 3.78 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0193 <- 3.84 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0239 <- 4.13 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0257 <- 3.50 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx >6el8_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE FORKHEAD DOMAIN OF HUMAN FOXN1 IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 A0317 <- 2.83 -> DG O6 C0008 : score 5.60463 : w : ASN ND2 A0317 <- 6.28 -> DG O6 B0007 : score 2.971 : w : ASN ND2 A0317 <- 6.04 -> DC N4 C0009 : score 2.395 : w : SER OG A0318 <- 6.17 -> DA N6 C0006 : score 2.209 : H : ARG NE A0320 <- 2.84 -> DG N7 B0008 : score 4.38642 : H : ARG NH2 A0320 <- 3.02 -> DG O6 B0008 : score 6.3096 : w : ARG NH2 A0320 <- 6.06 -> DG O6 B0007 : score 2.468 : H : HIS ND1 A0321 <- 3.10 -> DG N7 B0010 : score 5.84969 : w : HIS NE2 A0321 <- 5.61 -> DG N7 C0005 : score 3.601 : x : SER xxxx A0324 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-> DT xxx E-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0153 <- 3.22 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0154 <- 4.23 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0160 <- 3.52 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0254 <- 3.31 -> DT xxx E-007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0315 <- 4.04 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0317 <- 3.83 -> DT xxx E-009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0324 <- 3.52 -> DC xxx E-011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0372 <- 3.45 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx >6emz_B:DNA_breaking-rejoining_enzymes; title=STRUCTURE OF THE TN1549 TRANSPOSON INTEGRASE (AA 82-397, R225K) IN COMPLEX WITH CIRCULAR INTERMEDIATE DNA (CI5-DNA) organism=Enterococcus faecalis : H : ASN OD1 B0150 <- 2.41 -> DA N6 C0005 : score 6.49149 : H : ASN ND2 B0150 <- 3.01 -> DT O4 E-003 : score 5.06266 : V : ARG CZ B0108 <- 3.66 -> DT C7 E-004 : score 2.20694 : V : VAL CG1 B0316 <- 3.75 -> DT C7 E-009 : score 6.13627 : x : ASN xxxx B0101 <- 3.43 -> DA xxx C0008 : score 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title=STRUCTURE OF THE TN1549 TRANSPOSON INTEGRASE (AA 82-397) IN COMPLEX WITH CIRCULAR INTERMEDIATE DNA (CI5-DNA) organism=Enterococcus faecalis : H : ARG NE A0108 <- 3.45 -> DA N7 C-005 : score -7.92704 : H : ARG NH2 A0108 <- 3.08 -> DT O4 C-004 : score 3.35483 : H : ASN OD1 A0150 <- 3.29 -> DA N6 E0005 : score 5.43166 : H : ASN ND2 A0150 <- 2.85 -> DT O4 C-003 : score 5.23177 : w : ASN OD1 B0101 <- 5.68 -> DT O4 C0009 : score 3.132 : H : ASN OD1 B0150 <- 2.43 -> DA N6 C0005 : score 6.46741 : H : ASN OD1 B0150 <- 2.43 -> DA N6 C0005 : score 6.46741 : H : ASN ND2 B0150 <- 2.82 -> DT O4 E-003 : score 5.26348 : H : ASN ND2 B0150 <- 2.97 -> DT O4 E-002 : score 5.10494 : H : ARG NH1 B0153 <- 2.65 -> DG O6 E0000 : score 6.26583 : H : ARG NH2 B0153 <- 2.71 -> DG N7 E0000 : score 6.49954 : H : TYR OH B0160 <- 2.61 -> DT O4 E0004 : score 3.63566 : V : VAL CG1 A0316 <- 3.67 -> DT C7 C-009 : score 6.25748 : V : ALA CB B0315 <- 3.78 -> DT C7 C0010 : score 5.62697 : x : ASN xxxx A0101 <- 3.69 -> 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ASN ND2 A0150 <- 3.27 -> DT O4 C-002 : score 4.78786 : H : ARG NH1 A0153 <- 3.08 -> DC N3 C0000 : score 1.4511 : H : ARG NH2 A0153 <- 3.27 -> DC O2 C0000 : score 3.35104 : w : ASN OD1 B0101 <- 5.27 -> DT O4 C0010 : score 3.132 : w : ARG NE B0108 <- 6.03 -> DT O4 D-004 : score 1.317 : H : ASN OD1 B0150 <- 3.03 -> DA N6 C0006 : score 5.74479 : H : ASN ND2 B0150 <- 3.05 -> DT O4 D-003 : score 5.02038 : V : LYS CB A0146 <- 3.87 -> DT C7 C-003 : score 2.26529 : V : TYR CG B0160 <- 3.82 -> DT C7 C0005 : score 3.72283 : V : ALA CB B0315 <- 3.86 -> DT C7 C0011 : score 5.51499 : V : VAL CG2 A0316 <- 3.83 -> DT C7 D0011 : score 6.07715 : x : THR xxxx A0102 <- 3.55 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0108 <- 3.81 -> DT xxx C-004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0147 <- 3.84 -> DT xxx C-004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0154 <- 4.42 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0254 <- 3.88 -> DA xxx C-008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0315 <- 3.93 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0317 <- 4.28 -> DT xxx C-009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0324 <- 3.59 -> DC xxx C-011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0102 <- 3.55 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0146 <- 3.85 -> DT xxx D-002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0147 <- 3.69 -> DT xxx D-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0153 <- 2.46 -> DA xxx D0000 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0154 <- 4.36 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0156 <- 4.35 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0254 <- 3.56 -> DT xxx D-007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0316 <- 3.45 -> DT xxx D-009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0317 <- 4.05 -> DT xxx D-009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0324 <- 3.64 -> DC xxx D-011 : score x.xxxxx >6en8_ABE:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=SAFADR IN COMPLEX WITH DSDNA organism=Sulfolobus acidocaldarius : H : TYR OH A0047 <- 2.80 -> DA N7 Y0013 : score 4.15128 : H : TYR OH B0047 <- 2.77 -> DG N7 X0016 : score 4.3129 : V : PHE 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>6eo6_H:Trypsin-like_serine_proteases; title=X-RAY STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN HUMAN ALPHA-THROMBIN AND MODIFIED 15-MER DNA APTAMER CONTAINING 5-(3-(2-(1H-INDOL-3- YL)ACETAMIDE-N-YL)-1-PROPEN-1-YL)-2'-DEOXYURIDINE RESIDUE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 H0433 <- 2.82 -> DT O4 D0413 : score 3.25488 : H : ARG NH2 H0433 <- 3.17 -> DT O4 D0412 : score 3.29086 : H : ARG NH2 H0433 <- 2.90 -> DT O4 D0413 : score 3.48277 : H : GLU OE2 H0435 <- 2.74 -> DT N3 D0412 : score 2.66753 : H : ARG NH1 H0436 <- 3.04 -> DT O2 D0413 : score 4.0997 : x : ILE xxxx H0372 <- 3.50 -> DT xxx D0412 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0382 <- 3.63 -> DT xxx D0403 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0387 <- 2.95 -> DT xxx D0403 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0423 <- 3.67 -> DT xxx D0403 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0429 <- 3.97 -> DT xxx D0412 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0438 <- 3.38 -> DT xxx D0412 : score x.xxxxx >6eo7_H:Trypsin-like_serine_proteases; title=X-RAY STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN HUMAN ALPHA-THROMBIN AND MODIFIED 15-MER DNA APTAMER CONTAINING 5-(3-(ACETAMIDE-N-YL)-1- PROPEN-1-YL)-2'-DEOXYURIDINE RESIDUE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 H0433 <- 2.76 -> DT O4 D0413 : score 3.29409 : H : ARG NH2 H0433 <- 2.83 -> DT O4 D0413 : score 3.53252 : H : GLU OE2 H0435 <- 2.78 -> DT N3 D0412 : score 2.64644 : H : ARG NH1 H0436 <- 3.04 -> DT O2 D0413 : score 4.0997 : V : TYR CZ H0434 <- 3.55 -> DT C7 D0403 : score 5.92821 : x : ILE xxxx H0372 <- 3.61 -> DT xxx D0412 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0429 <- 3.92 -> DT xxx D0412 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0438 <- 3.53 -> DT xxx D0412 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0441 <- 3.51 -> DT xxx D0403 : score x.xxxxx >6erf_GH:SPOC_domain-like;vWA-like;C-terminal_domain_of_Ku80; title=COMPLEX OF APLF FACTOR AND KU HETERODIMER BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx H0271 <- 4.09 -> DG xxx O0008 : score x.xxxxx >6erg_AB:SPOC_domain-like;vWA-like;C-terminal_domain_of_Ku80; title=COMPLEX OF XLF AND HETERODIMER KU BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 B0003 <- 3.17 -> DT O2 R0020 : score 3.98774 : x : ASN xxxx B-004 <- 3.43 -> DT xxx H0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B-002 <- 3.34 -> DC xxx R0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B-001 <- 3.19 -> DT xxx R0020 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0245 <- 4.19 -> DA xxx R0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0271 <- 3.47 -> DT xxx H0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0273 <- 3.28 -> DT xxx R0023 : score x.xxxxx >6erg_DE:SPOC_domain-like;vWA-like;C-terminal_domain_of_Ku80; title=COMPLEX OF XLF AND HETERODIMER KU BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 E0003 <- 3.12 -> DT O2 M0020 : score 4.0308 : V : ARG CZ E0271 <- 3.89 -> DT C7 K0010 : score 2.08433 : x : ASN xxxx E-004 <- 3.37 -> DT xxx K0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E-002 <- 3.29 -> DC xxx M0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E-001 <- 3.27 -> DT xxx M0020 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E0245 <- 4.18 -> DA xxx M0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0273 <- 3.50 -> DT xxx M0023 : score x.xxxxx >6erh_A:SPOC_domain-like;vWA-like; title=COMPLEX OF XLF AND HETERODIMER KU BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0254 <- 3.46 -> DA xxx F0033 : score x.xxxxx >6erh_AB:SPOC_domain-like;vWA-like;C-terminal_domain_of_Ku80; title=COMPLEX OF XLF AND HETERODIMER KU BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : TYR OH B-002 <- 2.85 -> DC N4 F0019 : score 4.17196 : x : ARG xxxx A0254 <- 3.46 -> DA xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B-004 <- 3.42 -> DT xxx K0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B-001 <- 3.32 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0003 <- 3.24 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0271 <- 3.44 -> DT xxx K0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0273 <- 4.11 -> DA xxx F0022 : score x.xxxxx >6erh_CD:SPOC_domain-like;vWA-like;C-terminal_domain_of_Ku80; title=COMPLEX OF XLF AND HETERODIMER KU BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : TYR OH D-002 <- 2.80 -> DC N4 O0019 : score 4.2141 : H : ARG NH1 D0003 <- 3.32 -> DT O2 O0020 : score 3.85854 : H : ARG NH2 D0400 <- 3.19 -> DA N3 O0024 : score 2.98704 : x : ARG xxxx C0254 <- 3.72 -> DA xxx O0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D-004 <- 3.37 -> DT xxx R0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D-001 <- 3.34 -> DC xxx O0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 3.43 -> DT xxx R0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0273 <- 4.21 -> DA xxx O0022 : score x.xxxxx >6erp_ACF:HMG-box;DNA/RNA_polymerases;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF THE HUMAN MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX AT THE LSP PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ C0052 <- 2.69 -> DA N3 E0029 : score 2.83802 : H : TYR OH C0057 <- 3.02 -> DG N3 D0020 : score 2.97708 : H : THR OG1 C0077 <- 3.24 -> DG N3 E0033 : score 1.57145 : H : ARG NH1 C0157 <- 2.98 -> DT O2 E0046 : score 4.15138 : H : ARG NH2 C0157 <- 3.17 -> DT O2 E0046 : score 3.92007 : H : GLN NE2 C0179 <- 3.10 -> DC O2 E0041 : score 3.47318 : V : ARG CG F0202 <- 3.76 -> DT C7 D0038 : score 1.01518 : V : THR CB A1099 <- 3.57 -> DT C7 E0018 : score 3.72891 : x : SER xxxx C0055 <- 3.75 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0058 <- 3.02 -> DA xxx E0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0061 <- 3.98 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0078 <- 4.24 -> DC xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0081 <- 3.38 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0162 <- 3.79 -> DA xxx E0044 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0163 <- 3.33 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0166 <- 3.95 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0170 <- 4.24 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0178 <- 3.69 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0182 <- 3.13 -> DC xxx E0042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0502 <- 3.12 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0616 <- 3.03 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1103 <- 4.13 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1113 <- 4.42 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx >6erp_BGJ:HMG-box;DNA/RNA_polymerases;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF THE HUMAN MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX AT THE LSP PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 B1113 <- 3.42 -> DC O2 I0008 : score 3.24008 : H : ARG NH2 B1113 <- 3.42 -> DC O2 I0008 : score 3.24008 : H : TYR OH G0057 <- 2.91 -> DG N3 H0020 : score 3.04559 : H : ARG NH1 G0157 <- 3.12 -> DT O2 I0046 : score 4.0308 : H : ARG NH2 G0157 <- 3.20 -> DT O2 I0046 : score 3.89467 : H : GLN NE2 G0179 <- 3.20 -> DC O2 I0041 : score 3.39928 : V : ARG CZ J0202 <- 3.52 -> DT C7 H0038 : score 2.28157 : x : LYS xxxx G0052 <- 3.19 -> DA xxx I0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0055 <- 3.85 -> DT xxx H0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0058 <- 2.99 -> DA xxx I0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0061 <- 3.79 -> DG xxx H0020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0065 <- 3.97 -> DA xxx I0032 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0077 <- 3.00 -> DG xxx I0033 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0078 <- 3.24 -> DC xxx H0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0081 <- 3.31 -> DT xxx H0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0162 <- 3.40 -> DA xxx I0043 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0163 <- 3.24 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0166 <- 3.98 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0170 <- 4.02 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0178 <- 3.21 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0182 <- 2.93 -> DC xxx I0042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0502 <- 3.18 -> DG xxx I0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0616 <- 3.23 -> DG xxx I0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B1085 <- 3.72 -> DC xxx I0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B1099 <- 4.43 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B1101 <- 4.13 -> DG xxx I0014 : score x.xxxxx >6erp_J:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF THE HUMAN MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX AT THE LSP PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : V : ARG CZ J0202 <- 3.52 -> DT C7 H0038 : score 2.28157 >6erq_ACF:HMG-box;DNA/RNA_polymerases;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF THE HUMAN MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX AT THE HSP PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : SER OG C0055 <- 3.22 -> DG N2 E0030 : score 3.09091 : H : TYR OH C0057 <- 2.60 -> DC O2 D0020 : score 3.63733 : H : ARG NH1 C0157 <- 3.31 -> DC O2 E0046 : score 3.2777 : H : ASN ND2 C0163 <- 2.99 -> DT O2 D0007 : score 4.5658 : V : ARG CG F0202 <- 3.57 -> DT C7 D0037 : score 1.06292 : x : LYS xxxx C0052 <- 3.55 -> DG xxx E0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0058 <- 3.05 -> DG xxx E0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0061 <- 4.26 -> DG xxx E0031 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0077 <- 3.50 -> DA xxx E0033 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0078 <- 3.53 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0081 <- 3.36 -> DA xxx D0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0162 <- 3.36 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0166 <- 4.40 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0178 <- 3.50 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0179 <- 3.20 -> DA xxx E0041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0182 <- 3.39 -> DC xxx E0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0502 <- 3.27 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0615 <- 4.34 -> DA xxx D0035 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0616 <- 2.90 -> DA xxx D0035 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0674 <- 4.30 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1099 <- 3.12 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1101 <- 3.37 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1103 <- 4.04 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1113 <- 4.28 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx >6erq_B:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURE OF THE HUMAN MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX AT THE HSP PROMOTER organism=? : H : ARG NH2 B1113 <- 3.05 -> DC O2 I0008 : score 3.51378 : H : ARG NH2 B1113 <- 3.05 -> DC O2 I0008 : score 3.51378 : x : ARG xxxx B0502 <- 3.33 -> DG xxx I0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0615 <- 4.43 -> DA xxx H0035 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0616 <- 2.94 -> DT xxx I0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B1085 <- 2.62 -> DG xxx I0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B1099 <- 4.05 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B1101 <- 4.23 -> DT xxx I0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B1102 <- 4.26 -> DG xxx I0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B1103 <- 4.43 -> DG xxx I0014 : score x.xxxxx >6erq_BGJ:HMG-box;DNA/RNA_polymerases;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF THE HUMAN MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX AT THE HSP PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 B1113 <- 3.05 -> DC O2 I0008 : score 3.51378 : H : SER OG G0055 <- 2.83 -> DG N2 I0030 : score 3.35411 : H : TYR OH G0057 <- 2.95 -> DC O2 H0020 : score 3.39251 : H : THR OG1 G0078 <- 3.39 -> DT O2 H0018 : score 2.39384 : H : ARG NH1 G0157 <- 3.32 -> DC O2 I0046 : score 3.2704 : H : ASN ND2 G0163 <- 2.98 -> DG N3 H0008 : score 4.71866 : H : ARG NH2 J0202 <- 2.98 -> DA N7 H0038 : score 1.61161 : x : LYS xxxx G0052 <- 3.12 -> DG xxx I0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0058 <- 2.89 -> DG xxx I0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0061 <- 3.44 -> DG xxx I0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0065 <- 3.56 -> DT xxx I0032 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0077 <- 3.01 -> DA xxx I0033 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0081 <- 3.22 -> DA xxx H0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0162 <- 2.98 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0166 <- 3.98 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0170 <- 3.98 -> DC xxx H0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0178 <- 2.84 -> DT xxx H0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0179 <- 3.59 -> DA xxx I0041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0182 <- 2.91 -> DG xxx I0042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0502 <- 3.33 -> DG xxx I0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0615 <- 4.43 -> DA xxx H0035 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0616 <- 2.94 -> DT xxx I0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B1085 <- 2.62 -> DG xxx I0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B1099 <- 4.05 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B1101 <- 4.23 -> DT xxx I0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B1102 <- 4.26 -> DG xxx I0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B1103 <- 4.43 -> DG xxx I0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0201 <- 3.46 -> DT xxx H0037 : score x.xxxxx >6es2_K:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF CDX2-DNA(CAA) organism=Homo sapiens : H : TYR OH K0189 <- 2.66 -> DA N3 D0028 : score 4.26752 : H : ARG NE K0190 <- 3.17 -> DA N3 D0030 : score 1.94697 : H : ASN ND2 K0236 <- 3.25 -> DA N7 A0010 : score 5.34217 : V : ILE CG2 K0232 <- 3.58 -> DT C7 A0011 : score 7.4813 : x : GLN xxxx K0235 <- 3.44 -> DC xxx D0024 : score x.xxxxx >6es3_K:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF CDX2-DNA(TCG) organism=Homo sapiens : H : TYR OH K0189 <- 2.53 -> DA N3 F0028 : score 4.37545 : H : ARG NH2 K0190 <- 2.72 -> DA N3 F0030 : score 3.29158 : w : GLN OE1 K0235 <- 6.06 -> DC N4 A0011 : score 3.488 : w : GLN NE2 K0235 <- 6.20 -> DG N7 F0023 : score 2.582 : H : ASN OD1 K0236 <- 3.22 -> DA N6 A0010 : score 5.51596 : H : ASN ND2 K0236 <- 2.99 -> DA N7 A0010 : score 5.64743 : w : ASN OD1 K0236 <- 5.62 -> DG O6 F0026 : score 3.125 : x : ILE xxxx K0232 <- 3.81 -> DA xxx A0010 : score x.xxxxx >6esf_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME : CLASS 1 organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 E0040 <- 3.29 -> DT O2 I0009 : score 3.88438 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.51 -> DG xxx I-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.07 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.18 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.06 -> DT xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.44 -> DA xxx J0057 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.43 -> DA xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.13 -> DG xxx J-037 : score x.xxxxx >6esf_G:Histone-fold; title=NUCLEOSOME : CLASS 1 organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx G0042 <- 4.13 -> DG xxx J-037 : score x.xxxxx >6esg_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME BREATHING : CLASS 2 organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 G0042 <- 2.69 -> DC O2 I0037 : score 3.78009 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.95 -> DG xxx J0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.34 -> DC xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.12 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 4.30 -> DC xxx J0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.56 -> DT xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.59 -> DC xxx J-004 : score x.xxxxx >6esg_G:Histone-fold; title=NUCLEOSOME BREATHING : CLASS 2 organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 G0042 <- 2.69 -> DC O2 I0037 : score 3.78009 >6esh_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME BREATHING : CLASS 3 organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.95 -> DG N3 J0009 : score 3.50195 : x : ARG xxxx A0083 <- 3.92 -> DG xxx J0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.30 -> DT xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.75 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.89 -> DA xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.62 -> DG xxx I0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0119 <- 4.48 -> DT xxx I0069 : score x.xxxxx >6esi_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME BREATHING : CLASS 4 organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 F0045 <- 3.00 -> DT O2 I0005 : score 4.064 : H : GLU OE2 G0041 <- 2.90 -> DG N2 J-037 : score 4.22405 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.83 -> DG xxx I-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0042 <- 3.17 -> DC xxx I0071 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0077 <- 4.42 -> DT xxx I-032 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0074 <- 3.33 -> DC xxx J-062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.67 -> DG xxx I0050 : score x.xxxxx >6eu0_ABEPVYZ:TATA-box_binding_protein-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;NTF2-like;Homeodomain-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=RNA POLYMERASE III OPEN PRE-INITIATION COMPLEX (OC-PIC) organism=? : H : THR OG1 A0879 <- 2.58 -> DA N6 S0019 : score 2.88037 : H : THR OG1 Y0124 <- 2.46 -> DT O2 S0045 : score 2.89866 : H : THR OG1 Y0215 <- 2.95 -> DA N3 R0024 : score 1.31323 : x : ARG xxxx A0184 <- 4.45 -> DT xxx R0061 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0880 <- 3.53 -> DA xxx S0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0482 <- 4.39 -> DT xxx R0053 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Y0069 <- 4.17 -> DT xxx S0046 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx Y0071 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LYS xxxx B0479 <- 3.51 -> DT xxx R0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0481 <- 3.15 -> DT xxx R0053 : score x.xxxxx >6eu1_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE III - OPEN DNA COMPLEX (OC-POL3). organism=? : x : LYS xxxx B0479 <- 3.51 -> DT xxx R0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0481 <- 3.15 -> DT xxx R0053 : score x.xxxxx >6evv_HL:Trypsin-like_serine_proteases; title=X-RAY STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN HUMAN ALPHA THROMBIN AND NU172, A DUPLEX/QUADRUPLEX 26-MER DNA APTAMER, IN THE PRESENCE OF POTASSIUM IONS. organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE H0075 <- 3.20 -> DT O2 E0010 : score 2.37077 : H : ARG NH1 H0075 <- 2.40 -> DG O6 E0013 : score 6.57 : H : ARG NH2 H0075 <- 3.32 -> DT O2 E0010 : score 3.79307 : H : ARG NH2 H0075 <- 2.56 -> DT O4 E0019 : score 3.72443 : H : ARG NH1 H0077 <- 3.12 -> DT O4 E0010 : score 3.0588 A : x : ILE xxxx H0024 <- 3.96 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0071 <- 3.57 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0076 <- 3.19 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0078 <- 3.69 -> DT xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0079 <- 3.27 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0082 <- 3.68 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx >6exv_ABE: title=STRUCTURE OF MAMMALIAN RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX INHIBITED BY ALPHA-AMANITIN organism=SUS SCROFA : x : PRO xxxx A0462 <- 3.73 -> DG xxx T0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.66 -> DA xxx T0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 4.20 -> DA xxx T0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1416 <- 4.15 -> DT xxx T0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0457 <- 4.43 -> DA xxx N0013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0492 <- 3.62 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx >6f1k_A:WGR_domain-like; title=STRUCTURE OF ARTD2/PARP2 WGR DOMAIN BOUND TO DOUBLE STRAND DNA WITHOUT 5'PHOSPHATE organism=Homo sapiens : w : GLN OE1 A0159 <- 5.54 -> DG N3 C0001 : score 1.484 >6f40_ABEOPUVW:TATA-box_binding_protein-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;NTF2-like;Homeodomain-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=RNA POLYMERASE III OPEN COMPLEX organism=? : H : THR OG1 U0215 <- 2.39 -> DA N3 X0024 : score 1.46486 : x : ARG xxxx A1373 <- 3.85 -> DA xxx Y0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0481 <- 3.28 -> DG xxx X0060 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0482 <- 4.20 -> DG xxx X0060 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx U0069 <- 3.49 -> DT xxx Y0057 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx U0071 <- 3.74 -> DA xxx X0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0099 <- 3.63 -> DA xxx Y0055 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx U0114 <- 4.38 -> DT xxx Y0056 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0116 <- 3.37 -> DT xxx X0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx U0124 <- 3.95 -> DT xxx Y0057 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx U0159 <- 3.17 -> DA xxx X0025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx U0161 <- 3.42 -> DT xxx Y0058 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0190 <- 3.33 -> DA xxx X0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx U0191 <- 3.36 -> DA xxx Y0061 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx U0205 <- 3.71 -> DT xxx X0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0207 <- 3.28 -> DT xxx Y0060 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx U0213 <- 3.93 -> DT xxx Y0060 : score x.xxxxx : x : SER xxxx V0075 <- 3.64 -> DT xxx X0037 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx V0118 <- 4.12 -> DT xxx X0034 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx V0253 <- 3.96 -> DG xxx Y0065 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx W0413 <- 3.28 -> DA xxx X0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx W0416 <- 4.07 -> DC xxx Y0066 : score x.xxxxx >6f41_ABEPUVW:TATA-box_binding_protein-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;NTF2-like;Homeodomain-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=RNA POLYMERASE III INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX organism=? : H : THR OG1 A0879 <- 2.75 -> DT O4 Y0024 : score 3.92605 : H : ARG NH1 B0481 <- 2.73 -> DT O2 Y0023 : score 4.3667 : H : THR OG1 U0215 <- 2.94 -> DA N3 X0024 : score 1.31594 : x : PRO xxxx A0478 <- 4.04 -> DC xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0880 <- 4.10 -> DT xxx Y0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0313 <- 4.15 -> DA xxx X0043 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx P0106 <- 3.55 -> DC xxx X0042 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx U0069 <- 3.72 -> DT xxx Y0057 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx U0071 <- 3.84 -> DA xxx X0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0099 <- 3.44 -> DA xxx Y0055 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0116 <- 3.17 -> DT xxx X0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx U0124 <- 3.52 -> DT xxx Y0057 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx U0159 <- 3.76 -> DA xxx X0024 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx U0161 <- 4.34 -> DA xxx Y0059 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0190 <- 3.67 -> DA xxx X0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx U0191 <- 3.68 -> DA xxx Y0061 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0207 <- 3.56 -> DT xxx Y0060 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx U0213 <- 4.20 -> DT xxx Y0060 : score x.xxxxx : x : SER xxxx V0075 <- 3.69 -> DT xxx X0037 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx V0118 <- 3.75 -> DT xxx X0034 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx W0416 <- 3.58 -> DC xxx Y0066 : score x.xxxxx >6f42_U:TATA-box_binding_protein-like; title=RNA POLYMERASE III CLOSED COMPLEX CC1. organism=? : H : ASN ND2 U0069 <- 2.70 -> DT O2 Y0057 : score 4.84108 : H : ASN ND2 U0069 <- 3.13 -> DT O2 Y0058 : score 4.43291 : H : ASN ND2 U0069 <- 3.13 -> DT O2 Y0058 : score 4.43291 : H : THR OG1 U0215 <- 2.93 -> DA N3 X0024 : score 1.31865 : H : THR OG1 U0215 <- 2.93 -> DA N3 X0024 : score 1.31865 : x : VAL xxxx U0071 <- 3.71 -> DA xxx X0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0099 <- 3.47 -> DA xxx X0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx U0124 <- 3.36 -> DT xxx Y0057 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx U0159 <- 2.90 -> DA xxx X0024 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx U0161 <- 3.67 -> DT xxx Y0058 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0190 <- 3.30 -> DA xxx X0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx U0191 <- 3.66 -> DA xxx Y0061 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx U0205 <- 3.53 -> DT xxx X0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0207 <- 3.23 -> DT xxx Y0060 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx U0213 <- 3.79 -> DA xxx Y0059 : score x.xxxxx >6f42_UVW:TATA-box_binding_protein-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Homeodomain-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=RNA POLYMERASE III CLOSED COMPLEX CC1. organism=? : H : ASN ND2 U0069 <- 2.70 -> DT O2 Y0057 : score 4.84108 : H : ASN ND2 U0069 <- 3.13 -> DT O2 Y0058 : score 4.43291 : H : THR OG1 U0215 <- 2.93 -> DA N3 X0024 : score 1.31865 : x : VAL xxxx U0071 <- 3.71 -> DA xxx X0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0099 <- 3.47 -> DA xxx X0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx U0124 <- 3.36 -> DT xxx Y0057 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx U0159 <- 2.90 -> DA xxx X0024 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx U0161 <- 3.67 -> DT xxx Y0058 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0190 <- 3.30 -> DA xxx X0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx U0191 <- 3.66 -> DA xxx Y0061 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx U0205 <- 3.53 -> DT xxx X0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0207 <- 3.23 -> DT xxx Y0060 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx U0213 <- 3.79 -> DA xxx Y0059 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx V0118 <- 4.38 -> DT xxx X0034 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx V0155 <- 3.70 -> DT xxx X0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx V0253 <- 3.98 -> DG xxx Y0065 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx W0307 <- 4.21 -> DC xxx Y0066 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx W0416 <- 3.24 -> DG xxx Y0065 : score x.xxxxx >6f44_BMOUVW:TATA-box_binding_protein-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Homeodomain-like;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=RNA POLYMERASE III CLOSED COMPLEX CC2. organism=? : H : THR OG1 U0215 <- 2.44 -> DA N3 X0024 : score 1.45132 : x : ASN xxxx U0069 <- 3.28 -> DT xxx Y0056 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx U0071 <- 4.28 -> DA xxx X0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0099 <- 3.29 -> DT xxx Y0054 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0116 <- 3.73 -> DA xxx X0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx U0124 <- 3.79 -> DT xxx Y0056 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx U0159 <- 2.93 -> DA xxx X0025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx U0161 <- 3.68 -> DT xxx Y0057 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0190 <- 3.63 -> DA xxx X0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx U0191 <- 3.45 -> DA xxx Y0061 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0207 <- 3.18 -> DT xxx Y0060 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx U0213 <- 3.88 -> DA xxx Y0059 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx V0118 <- 3.78 -> DT xxx X0035 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx V0253 <- 3.69 -> DG xxx Y0065 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx W0307 <- 4.48 -> DC xxx Y0066 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx W0416 <- 4.49 -> DG xxx Y0065 : score x.xxxxx >6f57_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNMT3A-DNMT3L IN COMPLEX WITH SINGLE CPG- CONTAINING DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0836 <- 2.59 -> DG N7 E0406 : score 6.3041 : H : ARG NH1 A0836 <- 3.10 -> DG O6 E0406 : score 5.71833 : x : ILE xxxx A0715 <- 3.50 -> DA xxx E0410 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0716 <- 3.60 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0717 <- 4.28 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0718 <- 3.27 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0834 <- 4.20 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0837 <- 3.94 -> DG xxx E0404 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0838 <- 3.32 -> DA xxx E0405 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0883 <- 3.48 -> DA xxx E0403 : score x.xxxxx >6f58_A:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN BRACHYURY (T) IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0069 <- 2.87 -> DG N7 D0017 : score 6.29523 : x : THR xxxx A0196 <- 3.68 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0197 <- 4.11 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0213 <- 3.56 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0217 <- 3.49 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx >6f58_AB:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN BRACHYURY (T) IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0069 <- 2.87 -> DG N7 D0017 : score 6.29523 : H : ARG NH2 B0069 <- 2.80 -> DG N7 C0017 : score 6.38462 : x : THR xxxx A0196 <- 3.68 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0197 <- 4.11 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0213 <- 3.56 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0217 <- 3.49 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0196 <- 3.61 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0197 <- 4.05 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0213 <- 3.86 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0217 <- 3.40 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx >6f59_AB:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN BRACHYURY (T) G177D VARIANT IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0069 <- 2.99 -> DG N7 D0018 : score 6.142 : H : ARG NH2 B0069 <- 2.87 -> DG N7 C0018 : score 6.29523 : x : THR xxxx A0196 <- 3.63 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0197 <- 4.18 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0213 <- 3.89 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0217 <- 3.25 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0196 <- 3.60 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0197 <- 4.00 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0213 <- 3.73 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0216 <- 4.50 -> DC xxx D0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0217 <- 3.35 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx >6f59_B:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN BRACHYURY (T) G177D VARIANT IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 B0069 <- 2.87 -> DG N7 C0018 : score 6.29523 : x : THR xxxx B0196 <- 3.60 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0197 <- 4.00 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0213 <- 3.73 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0216 <- 4.50 -> DC xxx D0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0217 <- 3.35 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx >6f5b_A:WGR_domain-like; title=STRUCTURE OF ARTD2/PARP2 WGR DOMAIN BOUND TO DOUBLE STRANDED DNA WITH 5'PHOSPHATE organism=HOMO SAPIENS : H : GLN OE1 A0159 <- 2.96 -> DG N2 C0001 : score 5.42825 >6f5b_AB: title=STRUCTURE OF ARTD2/PARP2 WGR DOMAIN BOUND TO DOUBLE STRANDED DNA WITH 5'PHOSPHATE organism=HOMO SAPIENS : H : GLN OE1 A0159 <- 2.96 -> DG N2 C0001 : score 5.42825 : H : GLN OE1 B0159 <- 3.05 -> DG N2 F0001 : score 5.32731 >6fas_B:DNA-binding_pseudobarrel_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF VAL1 B3 DOMAIN IN COMPLEX WITH COGNATE DNA organism=Arabidopsis thaliana : H : ARG NH1 B0309 <- 2.71 -> DG N7 F0005 : score 6.1589 : H : ARG NH2 B0309 <- 2.83 -> DG O6 F0005 : score 6.5604 : w : ARG NH2 B0309 <- 5.59 -> DG O6 E0007 : score 2.468 : H : ASN OD1 B0351 <- 2.82 -> DC N4 E0004 : score 4.17682 : H : ASN ND2 B0351 <- 2.90 -> DT O4 F0008 : score 5.17892 : w : ASN ND2 B0351 <- 6.04 -> DA N6 F0007 : score 2.5 : w : ASN ND2 B0352 <- 5.92 -> DG O6 F0009 : score 2.971 : V : VAL CG2 B0311 <- 3.81 -> DT C7 E0006 : score 6.10777 : x : SER xxxx B0302 <- 3.89 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0307 <- 4.35 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0349 <- 3.31 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0356 <- 3.33 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx >6fb0_A:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TAILORED I-CREI HOMING ENDONUCLEASE PROTEIN (3115 VARIANT) IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA (HAEMOGLOBIN BETA SUBUNIT GENE) IN THE PRESENCE OF CALCIUM organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : w : GLN NE2 A0026 <- 5.64 -> DA N6 D0518 : score 2.804 : H : LYS NZ A0028 <- 2.77 -> DG N7 D0519 : score 5.41821 : w : LYS NZ A0028 <- 5.94 -> DA N6 D0518 : score 2.097 : H : ARG NH1 A0038 <- 2.66 -> DG O6 F0604 : score 6.25367 : H : ARG NH2 A0038 <- 2.92 -> DG N7 F0604 : score 6.23138 : H : LYS NZ A0075 <- 3.07 -> DG N7 D0516 : score 5.09506 : H : ARG NH2 A0077 <- 3.06 -> DG O6 D0517 : score 6.2568 : w : LYS NZ A0139 <- 6.42 -> DA N3 D0515 : score 1.538 : w : THR OG1 A0140 <- 5.75 -> DG N3 D0517 : score 2.036 : x : SER xxxx A0022 <- 4.25 -> DG xxx D0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.71 -> DG xxx D0516 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0030 <- 4.38 -> DC xxx F0602 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0032 <- 3.50 -> DC xxx F0602 : score 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DNA (HAEMOGLOBIN BETA SUBUNIT GENE) IN THE PRESENCE OF MANGANESE organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : H : LYS NZ A0028 <- 3.08 -> DG N7 E0519 : score 5.08429 : H : LYS NZ A0028 <- 2.64 -> DG O6 E0519 : score 5.96575 : w : LYS NZ A0028 <- 5.64 -> DA N6 E0518 : score 2.097 : H : ARG NH1 A0038 <- 3.01 -> DG O6 F0604 : score 5.82783 : H : ARG NH2 A0038 <- 3.15 -> DG N7 F0604 : score 5.93769 : H : LYS NZ A0075 <- 3.26 -> DG N7 E0516 : score 4.89039 : H : ARG NH2 A0077 <- 2.50 -> DG O6 E0517 : score 6.996 : H : GLN NE2 B0026 <- 2.90 -> DA N7 G0618 : score 5.96795 : H : LYS NZ B0028 <- 2.60 -> DG N7 G0619 : score 5.60133 : H : LYS NZ B0038 <- 3.10 -> DG N7 D0504 : score 5.06274 : H : LYS NZ B0038 <- 2.82 -> DG O6 D0504 : score 5.75765 : H : LYS NZ B0044 <- 2.84 -> DG N7 G0616 : score 5.34281 : H : SER OG B0070 <- 3.15 -> DC N4 D0509 : score 3.41835 : H : TYR OH B0077 <- 3.18 -> DA N6 G0617 : score 4.31555 : H : LYS NZ B0139 <- 3.01 -> DC O2 D0511 : score 2.82242 : x : ILE xxxx A0024 <- 3.71 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x.xxxxx : x : VAL xxxx B0073 <- 3.56 -> DG xxx F0614 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0140 <- 3.46 -> DG xxx G0616 : score x.xxxxx >6fb2_B:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TAILORED I-CREI HOMING ENDONUCLEASE PROTEIN (3115 VARIANT) IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA (HAEMOGLOBIN BETA SUBUNIT GENE) IN THE PRESENCE OF MANGANESE organism=? : H : GLN NE2 B0026 <- 2.90 -> DA N7 G0618 : score 5.96795 : H : LYS NZ B0028 <- 2.60 -> DG N7 G0619 : score 5.60133 : H : LYS NZ B0038 <- 3.10 -> DG N7 D0504 : score 5.06274 : H : LYS NZ B0038 <- 2.82 -> DG O6 D0504 : score 5.75765 : H : LYS NZ B0044 <- 2.84 -> DG N7 G0616 : score 5.34281 : H : SER OG B0070 <- 3.15 -> DC N4 D0509 : score 3.41835 : H : TYR OH B0077 <- 3.18 -> DA N6 G0617 : score 4.31555 : H : LYS NZ B0139 <- 3.01 -> DC O2 D0511 : score 2.82242 : x : SER xxxx B0022 <- 4.31 -> DG xxx G0616 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0024 <- 3.90 -> DG xxx G0616 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0032 <- 3.91 -> DT xxx D0501 : score x.xxxxx : 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<- 2.63 -> DA N7 D0604 : score 6.29679 : w : GLN OE1 B0238 <- 6.00 -> DA N6 D0605 : score 3.392 : w : SER OG B0240 <- 6.04 -> DA N6 D0605 : score 2.209 : H : GLN NE2 B0244 <- 3.25 -> DA N7 C0516 : score 5.54167 : w : GLN OE1 B0244 <- 5.71 -> DC N4 C0517 : score 3.488 : w : ASN ND2 B0275 <- 5.99 -> DG N7 C0515 : score 3.259 : V : SER CB B0232 <- 3.77 -> DT C7 D0601 : score 3.15477 : V : SER CB A0032 <- 3.54 -> DT C7 C0501 : score 3.33482 : x : SER xxxx A0022 <- 4.44 -> DC xxx D0616 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0024 <- 3.81 -> DC xxx D0616 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0044 <- 3.36 -> DC xxx D0616 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.61 -> DG xxx D0615 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0070 <- 2.18 -> DG xxx C0509 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 3.81 -> DC xxx D0614 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 4.24 -> DG xxx C0511 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0222 <- 4.27 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0224 <- 3.61 -> DA xxx C0516 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0246 <- 3.72 -> DG xxx C0515 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0268 <- 3.62 -> DA xxx D0606 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0270 <- 3.62 -> DG xxx D0608 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0273 <- 4.00 -> DC xxx C0514 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0339 <- 4.22 -> DG xxx D0611 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0340 <- 4.39 -> DC xxx C0517 : score x.xxxxx >6fb9_A:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE I-CREI HOMING ENDONUCLEASE D75N VARIANT IN COMPLEX WITH AN ALTERED VERSION OF ITS TARGET DNA AT 5NNN REGION IN THE PRESENCE OF MANGANESE organism=Chlamydomonas reinhardtii : H : LYS NZ A0028 <- 2.73 -> DT O4 F0619 : score 3.6374 : H : SER OG A0032 <- 3.24 -> DC N4 C0502 : score 3.35218 : H : TYR OH A0033 <- 2.46 -> DA N7 C0503 : score 4.43357 : H : TYR OH A0033 <- 3.03 -> DA N6 C0503 : score 4.45567 : H : GLN OE1 A0038 <- 2.90 -> DA N6 C0504 : score 5.93151 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.96 -> DA N7 C0504 : score 5.89487 : x : ILE xxxx A0024 <- 4.06 -> DC xxx F0616 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0026 <- 3.09 -> DG xxx F0618 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0030 <- 3.22 -> DT xxx F0621 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0044 <- 3.70 -> DC xxx F0616 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.64 -> DG xxx F0615 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0068 <- 3.99 -> DA xxx C0506 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0070 <- 2.14 -> DG xxx C0509 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 4.14 -> DC xxx E0614 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 4.28 -> DG xxx C0511 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0140 <- 3.62 -> DG xxx C0509 : score x.xxxxx >6fb9_AB:Homing_endonucleases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE I-CREI HOMING ENDONUCLEASE D75N VARIANT IN COMPLEX WITH AN ALTERED VERSION OF ITS TARGET DNA AT 5NNN REGION IN THE PRESENCE OF MANGANESE organism=Chlamydomonas reinhardtii : H : LYS NZ A0028 <- 2.73 -> DT O4 F0619 : score 3.6374 : H : SER OG A0032 <- 3.24 -> DC N4 C0502 : score 3.35218 : H : TYR OH A0033 <- 2.46 -> DA N7 C0503 : score 4.43357 : H : TYR OH A0033 <- 3.03 -> DA N6 C0503 : score 4.45567 : H : GLN OE1 A0038 <- 2.90 -> DA N6 C0504 : score 5.93151 : H : GLN NE2 A0038 <- 2.96 -> DA N7 C0504 : score 5.89487 : H : LYS NZ B0228 <- 2.91 -> DT O4 D0519 : score 3.50826 : w : ASN ND2 B0230 <- 5.84 -> DT O4 D0520 : score 3.275 : H : TYR OH B0233 <- 2.39 -> DA N7 E0603 : score 4.49169 : H : TYR OH B0233 <- 2.76 -> DA N6 E0603 : score 4.70788 : H : GLN OE1 B0238 <- 2.81 -> DA N6 E0604 : score 6.04046 : H : GLN NE2 B0238 <- 2.70 -> DA N7 E0604 : score 6.21154 : V : SER CB B0232 <- 3.78 -> DT C7 E0601 : score 3.14694 : x : ILE xxxx A0024 <- 4.06 -> DC xxx F0616 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0026 <- 3.09 -> DG xxx F0618 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0030 <- 3.22 -> DT xxx F0621 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0044 <- 3.70 -> DC xxx F0616 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.64 -> DG xxx F0615 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0068 <- 3.99 -> DA xxx C0506 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0070 <- 2.14 -> DG xxx C0509 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0073 <- 4.14 -> DC xxx E0614 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0139 <- 4.28 -> DG xxx C0511 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0140 <- 3.62 -> DG xxx C0509 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0222 <- 4.25 -> DA xxx D0516 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0224 <- 3.61 -> DA xxx D0516 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0226 <- 3.19 -> DG xxx D0518 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0244 <- 3.25 -> DA xxx D0516 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0246 <- 3.64 -> DG xxx D0515 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0268 <- 4.08 -> DA xxx E0606 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0270 <- 3.43 -> DG xxx E0608 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0273 <- 4.22 -> DC xxx C0514 : score x.xxxxx >6fbc_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=KLENTAQ DNA POLYMERASE PROCESSING A MODIFIED PRIMER - BEARING THE MODIFICATION AT THE 3'-TERMINUS OF THE PRIMER. organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.79 -> DC O2 B0109 : score 2.95205 : w : LYS NZ A0540 <- 5.46 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.81 -> DG N2 B0108 : score 0.846 : w : THR OG1 A0544 <- 5.63 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.49 -> DT O2 C0206 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.90 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.79 -> DG N3 C0207 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 2.89 -> DC O2 B0110 : score 4.39886 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.54 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.86 -> DA N3 B0111 : score 2.619 >6fbd_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=KLENTAQ DNA POLYMERASE PROCESSING A MODIFIED PRIMER - BEARING THE MODIFICATION UPSTREAM AT THE SECOND PRIMER NUCLEOTIDE. organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.82 -> DC O2 B0109 : score 2.93437 : w : LYS NZ A0540 <- 5.58 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 5.64 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : H : ARG NH1 A0573 <- 2.68 -> DC O2 B0112 : score 3.7376 : H : ARG NH2 A0573 <- 3.08 -> DC O2 B0112 : score 3.49159 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.68 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.57 -> DT O2 C0207 : score 1.666 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.09 -> DA N3 B0110 : score 3.58685 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.73 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : x : LYS xxxx A0663 <- 4.13 -> DC xxx B0112 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0784 <- 3.99 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >6fbe_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=KLENTAQ DNA POLYMERASE PROCESSING A MODIFIED PRIMER - BEARING THE MODIFICATION UPSTREAM AT THE THIRD PRIMER NUCLEOTIDE. organism=Thermus aquaticus : w : LYS NZ A0540 <- 6.38 -> DC O2 C0210 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 5.97 -> DT O2 C0208 : score 0.522 : w : THR OG1 A0544 <- 6.53 -> DC O2 C0210 : score 2.048 : H : ARG NH1 A0573 <- 2.80 -> DC O2 B0112 : score 3.65 : H : ARG NH2 A0573 <- 3.06 -> DC O2 B0112 : score 3.50638 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.74 -> DG N3 C0206 : score 1.593 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.85 -> DG N3 C0207 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0583 <- 6.10 -> DT O2 C0208 : score 1.666 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.63 -> DC O2 B0111 : score 3.208 : x : LYS xxxx A0663 <- 3.83 -> DC xxx B0112 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0754 <- 4.46 -> DG xxx C0206 : score x.xxxxx >6fbf_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=KLENTAQ DNA POLYMERASE PROCESSING A MODIFIED PRIMER - BEARING THE MODIFICATION UPSTREAM AT THE FOURTH PRIMER NUCLEOTIDE. organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 3.00 -> DT O2 C0209 : score 3.44369 : w : TYR OH A0545 <- 6.08 -> DG N2 C0208 : score 2.834 : H : ARG NH1 A0573 <- 2.89 -> DC O2 B0112 : score 3.5843 : H : ARG NH2 A0573 <- 3.13 -> DC O2 B0112 : score 3.4546 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.60 -> DC O2 C0206 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.75 -> DG N3 C0207 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 2.88 -> DC O2 B0110 : score 4.40782 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.91 -> DG N2 B0111 : score 2.908 : x : ARG xxxx A0660 <- 3.39 -> DC xxx B0112 : score x.xxxxx >6fbg_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=KLENTAQ DNA POLYMERASE PROCESSING A MODIFIED PRIMER - BEARING THE MODIFICATION UPSTREAM AT THE FIFTH PRIMER NUCLEOTIDE. organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 3.06 -> DC O2 B0109 : score 2.79295 : w : LYS NZ A0540 <- 5.50 -> DG N3 C0209 : score 2.232 : w : LYS NZ A0540 <- 6.43 -> DT O2 C0210 : score 0.522 : w : THR OG1 A0544 <- 5.77 -> DG N3 C0209 : score 2.036 : H : ARG NH1 A0573 <- 2.82 -> DC O2 B0112 : score 3.6354 : H : ARG NH2 A0573 <- 2.96 -> DC O2 B0112 : score 3.58036 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.53 -> DC O2 C0206 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.64 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.74 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.05 -> DG N3 B0110 : score 4.65013 : x : LYS xxxx A0663 <- 3.72 -> DC xxx B0112 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0784 <- 4.24 -> DG xxx B0111 : score x.xxxxx >6fbh_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=KLENTAQ DNA POLYMERASE PROCESSING A MODIFIED PRIMER - BEARING THE MODIFICATION UPSTREAM AT THE SIXTH PRIMER NUCLEOTIDE. organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.99 -> DG N3 B0109 : score 1.3986 : w : LYS NZ A0540 <- 6.02 -> DG N3 C0209 : score 2.232 : w : LYS NZ A0540 <- 5.75 -> DC O2 B0108 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 6.10 -> DG N3 C0209 : score 2.036 : H : ARG NH1 A0573 <- 2.90 -> DC O2 B0112 : score 3.577 : H : ARG NH2 A0573 <- 3.20 -> DC O2 B0112 : score 3.40282 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.70 -> DT O2 C0206 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.77 -> DC O2 C0207 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.07 -> DG N3 B0110 : score 4.63055 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.87 -> DA N3 B0111 : score 2.619 : x : ARG xxxx A0660 <- 3.65 -> DC xxx B0112 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0754 <- 3.55 -> DG xxx C0205 : score x.xxxxx >6fbi_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=KLENTAQ DNA POLYMERASE IN A CLOSED, TERNARY COMPLEX WITH DGPNHPP BOUND IN THE ACTIVE SITE organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.72 -> DC O2 B0109 : score 2.99329 : w : LYS NZ A0540 <- 5.49 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 6.20 -> DG N2 B0108 : score 0.846 : w : THR OG1 A0544 <- 5.63 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : H : ARG NH1 A0573 <- 2.86 -> DC O2 B0112 : score 3.6062 : H : ARG NH2 A0573 <- 3.10 -> DC O2 B0112 : score 3.47679 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.64 -> DT O2 C0206 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0580 <- 6.03 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.80 -> DG N3 C0207 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 2.94 -> DC O2 B0110 : score 4.35406 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.24 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.76 -> DA N3 B0111 : score 2.619 : x : TYR xxxx A0545 <- 4.42 -> DC xxx B0110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0660 <- 3.57 -> DC xxx B0112 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0754 <- 3.50 -> DG xxx C0205 : score x.xxxxx >6fbq_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN RETINOID X RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO THE HUMAN MEP DR1 RESPONSE ELEMENT, PH 7.0 organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0153 <- 2.77 -> DC N4 D0013 : score 5.80256 : w : GLU OE1 A0153 <- 6.19 -> DA N6 D0012 : score 2.939 : H : LYS NZ A0156 <- 2.75 -> DG O6 C0004 : score 5.83858 A : w : LYS NZ A0156 <- 6.27 -> DG O6 C0003 : score 3.005 A : w : LYS NZ A0160 <- 6.28 -> DG O6 C0005 : score 3.005 : w : LYS NZ A0160 <- 5.42 -> DT O4 C0006 : score 1.7 : H : ARG NH1 A0161 <- 2.95 -> DG N7 D0011 : score 5.8685 : w : ARG NH1 A0209 <- 5.54 -> DG N2 C0003 : score 1.082 : w : ARG NH2 A0209 <- 5.52 -> DG N3 C0003 : score 0.677 : w : ARG NH2 A0209 <- 5.89 -> DG N2 C0003 : score 1.593 : V : SER CB A0143 <- 3.77 -> DT C7 C0002 : score 3.15477 A >6fbq_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN RETINOID X RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO THE HUMAN MEP DR1 RESPONSE ELEMENT, PH 7.0 organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0153 <- 2.77 -> DC N4 D0013 : score 5.80256 : w : GLU OE1 A0153 <- 6.19 -> DA N6 D0012 : score 2.939 : H : LYS NZ A0156 <- 2.75 -> DG O6 C0004 : score 5.83858 A : w : LYS NZ A0156 <- 6.27 -> DG O6 C0003 : score 3.005 A : w : LYS NZ A0160 <- 6.28 -> DG O6 C0005 : score 3.005 : w : LYS NZ A0160 <- 5.42 -> DT O4 C0006 : score 1.7 : H : ARG NH1 A0161 <- 2.95 -> DG N7 D0011 : score 5.8685 : w : ARG NH1 A0209 <- 5.54 -> DG N2 C0003 : score 1.082 : w : ARG NH2 A0209 <- 5.52 -> DG N3 C0003 : score 0.677 : w : ARG NH2 A0209 <- 5.89 -> DG N2 C0003 : score 1.593 : H : GLU OE1 B0153 <- 2.95 -> DA N6 D0006 : score 2.60159 : w : GLU OE1 B0153 <- 5.71 -> DA N6 D0005 : score 2.939 : w : GLU OE2 B0153 <- 6.02 -> DC N4 D0007 : score 3.597 : H : LYS NZ B0156 <- 2.75 -> DG O6 C0011 : score 5.83858 : w : LYS NZ B0156 <- 6.17 -> DA N6 C0010 : score 2.097 : H : ARG NH1 B0161 <- 3.19 -> DG N7 D0004 : score 5.5781 : w : ARG NH1 B0209 <- 5.84 -> DT O2 D0009 : score 1.855 : w : ARG NH2 B0209 <- 6.09 -> DT O2 D0009 : score 2.261 : V : SER CB A0143 <- 3.77 -> DT C7 C0002 : score 3.15477 A : x : LYS xxxx B0160 <- 3.98 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx >6fbr_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN RETINOID X RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO THE HUMAN MEP DR1 RESPONSE ELEMENT, PH 4.2 organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0153 <- 2.75 -> DC N4 D0013 : score 5.82563 : w : GLU OE1 A0153 <- 5.91 -> DA N6 D0012 : score 2.939 : H : LYS NZ A0156 <- 3.11 -> DG N7 C0004 : score 5.05197 : H : ARG NH1 A0161 <- 2.85 -> DG N7 D0011 : score 5.9895 : H : GLU OE1 B0153 <- 2.74 -> DA N6 D0006 : score 2.71424 : w : GLU OE1 B0153 <- 6.08 -> DA N6 D0005 : score 2.939 : H : LYS NZ B0156 <- 2.71 -> DG O6 C0011 : score 5.88482 : w : LYS NZ B0156 <- 5.68 -> DA N7 C0010 : score 1.655 : w : LYS NZ B0160 <- 5.60 -> DT O4 C0013 : score 1.7 : H : ARG NH1 B0161 <- 3.01 -> DG N7 D0004 : score 5.7959 : w : ARG NH1 B0161 <- 5.52 -> DG O6 D0004 : score 2.756 : w : ARG NH1 B0209 <- 5.79 -> DT O2 D0009 : score 1.855 : x : LYS xxxx A0160 <- 3.39 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0129 <- 3.72 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx >6fbr_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN RETINOID X RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO THE HUMAN MEP DR1 RESPONSE ELEMENT, PH 4.2 organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 B0153 <- 2.74 -> DA N6 D0006 : score 2.71424 : w : GLU OE1 B0153 <- 6.08 -> DA N6 D0005 : score 2.939 : H : LYS NZ B0156 <- 2.71 -> DG O6 C0011 : score 5.88482 : w : LYS NZ B0156 <- 5.68 -> DA N7 C0010 : score 1.655 : w : LYS NZ B0160 <- 5.60 -> DT O4 C0013 : score 1.7 : H : ARG NH1 B0161 <- 3.01 -> DG N7 D0004 : score 5.7959 : w : ARG NH1 B0161 <- 5.52 -> DG O6 D0004 : score 2.756 : w : ARG NH1 B0209 <- 5.79 -> DT O2 D0009 : score 1.855 : x : MET xxxx B0129 <- 3.72 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx >6fbu_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA REPAIR ENZYME ENDONUCLEASE-VIII (NEI) FROM E. COLI (E2Q) IN COMPLEX WITH AP-SITE CONTAINING DNA SUBSTRATE organism=Escherichia coli : x : GLN xxxx A0069 <- 3.32 -> DG xxx C0428 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0070 <- 3.67 -> DG xxx C0428 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0071 <- 3.20 -> DT xxx B0408 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0252 <- 3.89 -> DG xxx C0428 : score x.xxxxx >6fix_ABDE:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=ANTITOXIN GRAA IN COMPLEX WITH ITS OPERATOR organism=Pseudomonas putida : V : PRO CG D0039 <- 3.66 -> DT C7 C0018 : score 6.58154 : V : PRO CB B0039 <- 3.61 -> DT C7 C0024 : score 6.08195 : V : THR CG2 D0038 <- 3.55 -> DT C7 F0015 : score 4.50173 : V : PRO CG A0039 <- 3.62 -> DT C7 F0021 : score 6.64513 : x : ALA xxxx A0028 <- 4.39 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0037 <- 3.60 -> DT xxx F0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0038 <- 3.94 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0040 <- 4.06 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0042 <- 4.14 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0038 <- 3.91 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0040 <- 3.90 -> DA xxx C0023 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0042 <- 3.43 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0028 <- 3.61 -> DT xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0037 <- 3.83 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0040 <- 3.37 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0042 <- 3.36 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0038 <- 4.21 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0039 <- 3.59 -> DT xxx F0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0040 <- 3.78 -> DC xxx F0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0042 <- 3.71 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx >6fix_D:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=ANTITOXIN GRAA IN COMPLEX WITH ITS OPERATOR organism=Pseudomonas putida : V : THR CG2 D0038 <- 3.55 -> DT C7 F0015 : score 4.50173 : V : ASN CB D0042 <- 3.77 -> DT C7 F0016 : score 1.95197 : V : PRO CG D0039 <- 3.66 -> DT C7 C0018 : score 6.58154 : x : ALA xxxx D0028 <- 3.61 -> DT xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0037 <- 3.83 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0040 <- 3.37 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx >6fj5_ABCD: title=NEW INSIGHTS INTO THE ROLE OF DNA SHAPE ON ITS RECOGNITION BY P53 PROTEINS (COMPLEX P53DBD-AGG-HG) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 2.52 -> DG N7 G0012 : score 5.68751 : H : LYS NZ A0120 <- 2.83 -> DG O6 G0013 : score 5.74608 : H : CYS SG A0277 <- 3.36 -> DC N4 F0008 : score -3.08295 : H : ARG NH1 A0280 <- 3.11 -> DG N7 F0007 : score 5.6749 : H : ARG NH2 A0280 <- 2.87 -> DG O6 F0007 : score 6.5076 : H : LYS NZ B0120 <- 2.71 -> DG N7 G0002 : score 5.48284 : H : LYS NZ B0120 <- 2.56 -> DG O6 G0003 : score 6.05825 : H : CYS SG B0277 <- 3.32 -> DC N4 F0018 : score -3.11073 : H : ARG NH1 B0280 <- 3.03 -> DG O6 F0017 : score 5.8035 : H : ARG NH2 B0280 <- 3.08 -> DG N7 F0017 : score 6.02708 : H : LYS NZ C0120 <- 2.79 -> DG N7 F0012 : score 5.39667 : H : LYS NZ C0120 <- 2.96 -> DG O6 F0013 : score 5.59578 : H : CYS SG C0277 <- 3.45 -> DC N4 G0008 : score -3.02046 : H : ARG NH1 C0280 <- 2.84 -> DG O6 G0007 : score 6.03467 : H : ARG NH2 C0280 <- 2.96 -> DG N7 G0007 : score 6.18031 : H : LYS NZ D0120 <- 2.80 -> DG N7 F0002 : score 5.3859 : H : LYS NZ D0120 <- 2.68 -> DG O6 F0003 : score 5.91951 : H : CYS SG D0277 <- 3.43 -> DC N4 G0018 : score -3.03435 : H : ARG NH1 D0280 <- 2.96 -> DG O6 G0017 : score 5.88867 : H : ARG NH2 D0280 <- 3.02 -> DG N7 G0017 : score 6.10369 : x : ALA xxxx A0276 <- 3.87 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 3.91 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0276 <- 3.80 -> DG xxx G0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0276 <- 3.88 -> DG xxx G0017 : score x.xxxxx >6fj5_C:p53-like_transcription_factors; title=NEW INSIGHTS INTO THE ROLE OF DNA SHAPE ON ITS RECOGNITION BY P53 PROTEINS (COMPLEX P53DBD-AGG-HG) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ C0120 <- 2.79 -> DG N7 F0012 : score 5.39667 : H : LYS NZ C0120 <- 2.96 -> DG O6 F0013 : score 5.59578 : H : CYS SG C0277 <- 3.45 -> DC N4 G0008 : score -3.02046 : H : ARG NH1 C0280 <- 2.84 -> DG O6 G0007 : score 6.03467 : H : ARG NH2 C0280 <- 2.96 -> DG N7 G0007 : score 6.18031 : x : ALA xxxx C0276 <- 3.80 -> DG xxx G0007 : score x.xxxxx >6fk4_A:DNase_I-like; title=STRUCTURE OF 3' PHOSPHATASE NEXO (WT) FROM NEISSERIA BOUND TO DNA SUBSTRATE organism=Neisseria meningitidis serogroup B (strain MC58) / Neisseria meningitidis serogroup B (strain MC58) : x : TYR xxxx A0062 <- 4.28 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0203 <- 3.38 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0204 <- 3.39 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >6fk5_A:DNase_I-like; title=STRUCTURE OF 3' PHOSPHATASE NEXO (D146N) FROM NEISSERIA BOUND TO DNA SUBSTRATE IN PRESENCE OF MAGNESIUM ION organism=NEISSERIA MENINGITIDIS MC58 : w : LYS NZ A0036 <- 5.23 -> DA N3 B0007 : score 1.538 : w : LYS NZ A0036 <- 5.75 -> DA N3 B0016 : score 1.538 : w : ASP OD2 A0246 <- 5.84 -> DG N3 B0017 : score 2.312 : x : TYR xxxx A0062 <- 4.12 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0203 <- 3.53 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0204 <- 3.48 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >6fke_A:DNase_I-like; title=STRUCTURE OF 3' PHOSPHATASE NEXO (D146N) FROM NEISSERIA BOUND TO PRODUCT DNA HAIRPIN organism=Neisseria meningitidis MC58 : w : LYS NZ A0036 <- 5.95 -> DT O2 B0014 : score 0.522 : H : TYR OH A0062 <- 3.27 -> DC O2 B0013 : score 3.16868 : w : ASP OD1 A0202 <- 5.75 -> DT O2 B0005 : score 2.105 : x : TYR xxxx A0203 <- 3.52 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0204 <- 3.53 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx >6fl1_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN THE LACTOCOCCUS LACTIS FPG MUTANT T221P AND A FAPY-DG CONTAINING DNA organism=Lactococcus lactis subsp. cremoris : H : ARG NH1 A0074 <- 2.86 -> DT O2 B0008 : score 4.25473 : w : ARG NH1 A0074 <- 6.21 -> DT O2 B0009 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0074 <- 6.10 -> DT O2 B0009 : score 2.261 : w : GLU OE2 A0076 <- 6.09 -> DT O2 B0006 : score 2.279 : H : ARG NE A0109 <- 2.70 -> DC O2 C0023 : score 2.71215 : H : ARG NH2 A0109 <- 2.98 -> DC N3 C0023 : score 2.20855 : w : ARG NH1 A0109 <- 6.33 -> DT O2 B0006 : score 1.855 : x : MET xxxx A0075 <- 3.41 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.36 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.35 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >6flp_CD: title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE PAUSED ELONGATION COMPLEX WITHOUT RNA HAIRPIN BOUND TO NUSA organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ARG xxxx C0151 <- 3.38 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 3.80 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0451 <- 4.41 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.30 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.58 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0120 <- 4.23 -> DG xxx N0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0255 <- 3.98 -> DC xxx T0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0261 <- 3.25 -> DC xxx T0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0267 <- 4.01 -> DG xxx N0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 4.45 -> DG xxx T0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0274 <- 4.05 -> DC xxx N0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0317 <- 4.40 -> DG xxx N0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.49 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 4.12 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx >6flp_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE PAUSED ELONGATION COMPLEX WITHOUT RNA HAIRPIN BOUND TO NUSA organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : LEU xxxx D0120 <- 4.23 -> DG xxx N0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0255 <- 3.98 -> DC xxx T0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0261 <- 3.25 -> DC xxx T0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0267 <- 4.01 -> DG xxx N0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 4.45 -> DG xxx T0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0274 <- 4.05 -> DC xxx N0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0317 <- 4.40 -> DG xxx N0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.49 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 4.12 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx >6flq_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE PAUSED ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSA organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ARG xxxx C0151 <- 3.78 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0451 <- 3.63 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.65 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.34 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.63 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx >6flq_CD: title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE PAUSED ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSA organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ARG xxxx C0151 <- 3.78 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0451 <- 3.63 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.65 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.34 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.63 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0255 <- 4.08 -> DC xxx T0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0261 <- 3.33 -> DC xxx T0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0275 <- 4.43 -> DG xxx N0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.55 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx >6fm4_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS GYRASE COMPLEX WITH ID-130 AND DNA organism=? : x : ARG xxxx B0458 <- 3.87 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0460 <- 3.30 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1085 <- 3.21 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1092 <- 3.99 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1175 <- 3.11 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx >6fm4_BD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS GYRASE COMPLEX WITH ID-130 AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : x : ARG xxxx B0458 <- 3.87 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0460 <- 3.30 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1085 <- 3.21 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1092 <- 3.99 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1175 <- 3.11 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0460 <- 3.38 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D1085 <- 3.64 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1122 <- 4.23 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D1175 <- 3.11 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx >6fn0_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=THE ANIMAL-LIKE CRYPTOCHROME FROM CHLAMYDOMONAS REINHARDTII IN COMPLEX WITH 6-4 DNA organism=CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : w : SER OG A0409 <- 5.72 -> DC O2 D0009 : score 1.768 : x : GLN xxxx A0410 <- 3.19 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0412 <- 3.62 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0413 <- 3.50 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx >6fq5_ABCDEFGH:Histone-fold; title=CLASS 1 : CANONICAL NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 A0040 <- 2.93 -> DG N3 J0009 : score 2.9732 : H : ARG NH2 A0040 <- 2.57 -> DG N3 J0009 : score 3.77633 : H : ARG NH2 C0011 <- 2.53 -> DT O2 J0043 : score 4.46193 : H : ARG NH2 D0027 <- 3.04 -> DC O2 J0049 : score 3.52118 : H : ARG NH1 E0040 <- 2.96 -> DT O2 I0009 : score 4.16861 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.43 -> DT O2 I0009 : score 4.5466 : H : ARG NH1 G0011 <- 2.41 -> DT O2 J-042 : score 4.64231 : x : ARG xxxx A0083 <- 4.22 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.01 -> DT xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.84 -> DC xxx I0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.59 -> DT xxx J-047 : score x.xxxxx >6fq5_D:Histone-fold; title=CLASS 1 : CANONICAL NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 D0027 <- 3.04 -> DC O2 J0049 : score 3.52118 >6fq6_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CLASS 2 : DISTORTED NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 A0040 <- 2.98 -> DG N3 J0009 : score 2.94267 : H : ARG NH2 A0040 <- 2.45 -> DG N3 J0009 : score 3.86297 : H : ARG NH1 C0011 <- 3.25 -> DC O2 J0042 : score 3.3215 : H : ARG NH1 C0011 <- 2.94 -> DT O2 J0043 : score 4.18583 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.39 -> DT O2 I0009 : score 4.58047 : x : ARG xxxx C0042 <- 3.37 -> DC xxx J0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0042 <- 3.63 -> DT xxx J0071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0011 <- 3.23 -> DA xxx I0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.29 -> DC xxx I0037 : score x.xxxxx >6fq8_A:Histone-fold; title=CLASS 3 : TRANSLOCATED NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH1 A0040 <- 3.32 -> DG N3 J0009 : score 2.7351 >6fq8_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CLASS 3 : TRANSLOCATED NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 A0040 <- 3.32 -> DG N3 J0009 : score 2.7351 : H : ARG NH2 C0042 <- 3.13 -> DC O2 J0037 : score 3.4546 : H : ARG NH2 G0042 <- 3.05 -> DC O2 I0037 : score 3.51378 : x : ARG xxxx A0042 <- 3.21 -> DC xxx I0071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0042 <- 4.02 -> DT xxx J0071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0017 <- 3.20 -> DT xxx J-043 : score x.xxxxx >6fqm_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=3.06A COMPLEX OF S.AUREUS GYRASE WITH IMIDAZOPYRAZINONE T1 AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS SUBSP. AUREUS N315 : x : LYS xxxx B0460 <- 3.47 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0084 <- 4.10 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0085 <- 3.34 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0122 <- 3.46 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0175 <- 3.27 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0460 <- 3.62 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0084 <- 4.22 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0085 <- 3.46 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0088 <- 3.61 -> DT xxx E-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0122 <- 3.71 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0175 <- 3.26 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx >6fqm_D:Type_II_DNA_topoisomerase; title=3.06A COMPLEX OF S.AUREUS GYRASE WITH IMIDAZOPYRAZINONE T1 AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS SUBSP. AUREUS N315 : x : LYS xxxx D0460 <- 3.62 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx >6fqm_abcd:Type_II_DNA_topoisomerase; title=3.06A COMPLEX OF S.AUREUS GYRASE WITH IMIDAZOPYRAZINONE T1 AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS SUBSP. AUREUS N315 : x : LYS xxxx b0460 <- 3.48 -> DT xxx e0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx a0084 <- 4.19 -> DT xxx f-001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx a0085 <- 3.57 -> DT xxx f-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a0122 <- 4.19 -> DG xxx e0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx a0175 <- 3.33 -> DC xxx e0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx d0460 <- 3.41 -> DT xxx f0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx c0084 <- 4.40 -> DT xxx e-001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx c0085 <- 4.42 -> DA xxx e-002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx c0088 <- 3.75 -> DT xxx e-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx c0122 <- 3.85 -> DG xxx f0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx c0175 <- 3.18 -> DC xxx f0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx c0180 <- 4.44 -> DT xxx f0009 : score x.xxxxx >6fqp_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TALE HOMEOBOX DOMAIN TRANSCRIPTION FACTOR TGIF1 WITH ITS CONSENSUS DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0168 <- 3.03 -> DT O2 L0003 : score 4.0386 : w : ASN OD1 A0213 <- 5.87 -> DC N4 L0006 : score 2.732 : H : ASN OD1 A0217 <- 3.07 -> DA N6 L0005 : score 5.69662 : H : ASN ND2 A0217 <- 3.25 -> DA N7 L0005 : score 5.34217 : H : ARG NH1 A0220 <- 2.73 -> DG N7 M0011 : score 6.1347 : H : ARG NH2 A0220 <- 2.83 -> DG O6 M0011 : score 6.5604 : H : ARG NH1 A0221 <- 2.98 -> DG N7 L0004 : score 5.8322 : H : ARG NH2 A0221 <- 3.07 -> DG O6 L0004 : score 6.2436 : H : ARG NH1 B0167 <- 3.01 -> DT O2 M0003 : score 4.12554 : H : ARG NH2 B0167 <- 3.00 -> DT O2 M0003 : score 4.064 : w : ASN OD1 B0213 <- 5.64 -> DC N4 M0006 : score 2.732 : H : ASN OD1 B0217 <- 2.96 -> DA N6 M0005 : score 5.8291 : H : ASN ND2 B0217 <- 3.04 -> DA N7 M0005 : score 5.58873 : H : ARG NH1 B0220 <- 2.64 -> DG N7 L0011 : score 6.2436 : H : ARG NH2 B0220 <- 2.95 -> DG O6 L0011 : score 6.402 : H : ARG NH1 B0221 <- 2.95 -> DG N7 M0004 : score 5.8685 : H : ARG NH2 B0221 <- 2.93 -> DG O6 M0004 : score 6.4284 : V : ILE CG2 A0216 <- 3.60 -> DT C7 M0010 : score 7.44585 : x : ARG xxxx B0165 <- 3.14 -> DC xxx M0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0216 <- 3.49 -> DT xxx L0010 : score x.xxxxx >6fqp_B:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TALE HOMEOBOX DOMAIN TRANSCRIPTION FACTOR TGIF1 WITH ITS CONSENSUS DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0167 <- 3.01 -> DT O2 M0003 : score 4.12554 : H : ARG NH2 B0167 <- 3.00 -> DT O2 M0003 : score 4.064 : w : ASN OD1 B0213 <- 5.64 -> DC N4 M0006 : score 2.732 : H : ASN OD1 B0217 <- 2.96 -> DA N6 M0005 : score 5.8291 : H : ASN ND2 B0217 <- 3.04 -> DA N7 M0005 : score 5.58873 : H : ARG NH1 B0220 <- 2.64 -> DG N7 L0011 : score 6.2436 : H : ARG NH2 B0220 <- 2.95 -> DG O6 L0011 : score 6.402 : H : ARG NH1 B0221 <- 2.95 -> DG N7 M0004 : score 5.8685 : H : ARG NH2 B0221 <- 2.93 -> DG O6 M0004 : score 6.4284 : x : ARG xxxx B0165 <- 3.14 -> DC xxx M0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0216 <- 3.49 -> DT xxx L0010 : score x.xxxxx >6fqq_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TALE HOMEOBOX DOMAIN TRANSCRIPTION FACTOR TGIF1 DOUBLE ALANINE MUTANT BOUND TO ITS CONSENSUS DNA organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 A0217 <- 2.88 -> DA N6 L0005 : score 5.92545 : H : ASN ND2 A0217 <- 3.03 -> DA N7 L0005 : score 5.60047 : H : ARG NH1 A0220 <- 3.05 -> DG N7 M0011 : score 5.7475 : H : ARG NH1 A0221 <- 2.60 -> DG N7 L0004 : score 6.292 : H : ARG NH2 A0221 <- 2.69 -> DT O4 M0012 : score 3.63203 : H : ARG NH2 A0221 <- 2.64 -> DG O6 L0004 : score 6.8112 : H : ASN OD1 B0217 <- 2.94 -> DA N6 M0005 : score 5.85318 : H : ASN ND2 B0217 <- 3.11 -> DA N7 M0005 : score 5.50654 : H : ARG NH1 B0220 <- 2.92 -> DG N7 L0011 : score 5.9048 : H : ARG NH1 B0220 <- 2.97 -> DG O6 L0011 : score 5.8765 : H : ARG NH2 B0220 <- 2.95 -> DG O6 L0011 : score 6.402 : H : ARG NH1 B0221 <- 3.23 -> DG N7 M0004 : score 5.5297 : H : ARG NH2 B0221 <- 2.39 -> DG O6 M0004 : score 7.1412 : V : ILE CG2 A0216 <- 3.78 -> DT C7 M0010 : score 7.12674 : x : ASN xxxx A0213 <- 3.16 -> DC xxx L0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0213 <- 3.31 -> DC xxx M0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0216 <- 3.92 -> DT xxx L0010 : score x.xxxxx >6fqq_DE:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TALE HOMEOBOX DOMAIN TRANSCRIPTION FACTOR TGIF1 DOUBLE ALANINE MUTANT BOUND TO ITS CONSENSUS DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 D0221 <- 3.11 -> DG N7 G0004 : score 5.6749 : H : ARG NH2 D0221 <- 3.24 -> DT O4 H0012 : score 3.24111 : H : ARG NH2 D0221 <- 3.06 -> DG O6 G0004 : score 6.2568 : H : ASN OD1 E0217 <- 2.89 -> DA N6 H0005 : score 5.9134 : H : ASN ND2 E0217 <- 3.01 -> DA N7 H0005 : score 5.62395 : H : ARG NH1 E0220 <- 2.98 -> DG O6 G0011 : score 5.86433 : H : ARG NH2 E0220 <- 2.31 -> DG N7 G0011 : score 7.01031 : H : ARG NH1 E0221 <- 3.09 -> DG N7 H0004 : score 5.6991 : H : ARG NH2 E0221 <- 2.90 -> DG O6 H0004 : score 6.468 : V : ILE CG2 D0216 <- 3.65 -> DT C7 H0010 : score 7.3572 : V : ILE CG2 E0216 <- 3.66 -> DT C7 G0010 : score 7.33948 : x : ASN xxxx D0213 <- 3.34 -> DC xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0217 <- 3.41 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0220 <- 3.39 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0213 <- 3.04 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx >6fqq_E:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TALE HOMEOBOX DOMAIN TRANSCRIPTION FACTOR TGIF1 DOUBLE ALANINE MUTANT BOUND TO ITS CONSENSUS DNA organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 E0217 <- 2.89 -> DA N6 H0005 : score 5.9134 : H : ASN ND2 E0217 <- 3.01 -> DA N7 H0005 : score 5.62395 : H : ARG NH1 E0220 <- 2.98 -> DG O6 G0011 : score 5.86433 : H : ARG NH2 E0220 <- 2.31 -> DG N7 G0011 : score 7.01031 : H : ARG NH1 E0221 <- 3.09 -> DG N7 H0004 : score 5.6991 : H : ARG NH2 E0221 <- 2.90 -> DG O6 H0004 : score 6.468 : V : ILE CG2 E0216 <- 3.66 -> DT C7 G0010 : score 7.33948 : x : ASN xxxx E0213 <- 3.04 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx >6fqs_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=3.11A COMPLEX OF S.AUREUS GYRASE WITH IMIDAZOPYRAZINONE T3 AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : x : ARG xxxx A0033 <- 4.43 -> DT xxx E-003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0084 <- 4.46 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0085 <- 3.78 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0088 <- 3.97 -> DT xxx E-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0092 <- 4.14 -> DT xxx E-003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0175 <- 3.01 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx >6fqs_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=3.11A COMPLEX OF S.AUREUS GYRASE WITH IMIDAZOPYRAZINONE T3 AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : w : SER OG C0330 <- 5.31 -> DT O2 E0011 : score 1.55 : V : ARG CZ C0232 <- 3.85 -> DT C7 E0012 : score 2.10565 : x : LYS xxxx B0460 <- 3.46 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0033 <- 4.43 -> DT xxx E-003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0084 <- 4.46 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0085 <- 3.78 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0088 <- 3.97 -> DT xxx E-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0092 <- 4.14 -> DT xxx E-003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0175 <- 3.01 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0460 <- 3.49 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0033 <- 4.38 -> DT xxx F-003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0084 <- 4.26 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0085 <- 4.16 -> DA xxx F-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0122 <- 3.49 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0175 <- 3.30 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx >6fqv_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.60A BINARY COMPLEX OF S.AUREUS GYRASE WITH UNCLEAVED DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : w : TYR OH A0025 <- 5.47 -> DA N3 F0015 : score 1.448 : x : ARG xxxx A0033 <- 4.47 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0085 <- 4.46 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0175 <- 3.47 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0460 <- 3.93 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0033 <- 4.26 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0175 <- 3.49 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0460 <- 4.21 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx >6fqv_RSTU:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.60A BINARY COMPLEX OF S.AUREUS GYRASE WITH UNCLEAVED DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : w : ARG NH1 R0033 <- 5.70 -> DT O2 V0006 : score 1.855 : w : TYR OH T0025 <- 5.82 -> DA N3 V0015 : score 1.448 : w : ARG NH1 T0033 <- 5.85 -> DT O2 W0006 : score 1.855 : x : ILE xxxx R0175 <- 3.40 -> DC xxx W0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx S0460 <- 3.75 -> DA xxx W0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx T0175 <- 3.49 -> DG xxx V0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx U0460 <- 3.47 -> DA xxx V0015 : score x.xxxxx >6fqv_T:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.60A BINARY COMPLEX OF S.AUREUS GYRASE WITH UNCLEAVED DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : w : TYR OH T0025 <- 5.82 -> DA N3 V0015 : score 1.448 : w : ARG NH1 T0033 <- 5.85 -> DT O2 W0006 : score 1.855 : x : ILE xxxx T0175 <- 3.49 -> DG xxx V0017 : score x.xxxxx >6fwk_B:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF POL2CORE-M644G IN COMPLEX WITH DNA AND AN INCOMING NUCLEOTIDE organism=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) : H : LYS NZ B0967 <- 3.01 -> DA N3 D0008 : score 2.66029 : H : ARG NH2 B0988 <- 3.40 -> DC O2 C0007 : score 3.25487 >6fwr_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF DING IN COMPLEX WITH SSDNA organism=Escherichia coli : V : TYR CD1 A0636 <- 3.57 -> DT C7 B0001 : score 4.95018 : x : ALA xxxx A0225 <- 3.94 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0259 <- 3.81 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0592 <- 4.34 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0617 <- 3.52 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0618 <- 3.24 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0619 <- 3.29 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0620 <- 4.36 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0638 <- 3.30 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0642 <- 4.07 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx >6fws_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF DING IN COMPLEX WITH SSDNA AND ADPBEF organism=Escherichia coli : H : SER OG A0642 <- 3.40 -> DT O2 C0003 : score 3.25374 : V : TYR CD1 A0636 <- 3.63 -> DT C7 C0001 : score 4.87997 : x : ALA xxxx A0225 <- 4.10 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0259 <- 4.49 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0545 <- 4.07 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0617 <- 3.59 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0618 <- 3.79 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0619 <- 3.17 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0638 <- 3.41 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0639 <- 3.15 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx >6fzs_A:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD5-MH1 BOUND TO THE GGCGC SITE. organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0075 <- 2.92 -> DG N7 D0005 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0075 <- 2.92 -> DG O6 D0005 : score 6.4416 : H : GLN OE1 A0077 <- 2.88 -> DC N4 C0009 : score 4.51 : w : GLN NE2 A0077 <- 6.07 -> DG O6 D0008 : score 2.87 : H : LYS NZ A0082 <- 2.69 -> DG O6 C0010 : score 5.90795 : x : ASP xxxx A0073 <- 4.15 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >6fzs_AB:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD5-MH1 BOUND TO THE GGCGC SITE. organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0075 <- 2.92 -> DG N7 D0005 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0075 <- 2.92 -> DG O6 D0005 : score 6.4416 : H : GLN OE1 A0077 <- 2.88 -> DC N4 C0009 : score 4.51 : w : GLN NE2 A0077 <- 6.07 -> DG O6 D0008 : score 2.87 : H : LYS NZ A0082 <- 2.69 -> DG O6 C0010 : score 5.90795 : H : ARG NH1 B0075 <- 2.90 -> DG N7 C0005 : score 5.929 : H : ARG NH2 B0075 <- 2.95 -> DG O6 C0005 : score 6.402 : H : GLN OE1 B0077 <- 2.87 -> DC N4 D0009 : score 4.51917 : w : GLN OE1 B0077 <- 6.06 -> DC N4 C0007 : score 3.488 : w : GLN NE2 B0077 <- 6.03 -> DG O6 C0008 : score 2.87 : H : LYS NZ B0082 <- 2.88 -> DG O6 D0010 : score 5.68828 : H : LYS NZ B0082 <- 2.68 -> DG O6 C0006 : score 5.91951 : x : ASP xxxx A0073 <- 4.15 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0073 <- 4.46 -> DC xxx D0011 : score x.xxxxx >6fzt_AB:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD8_9-MH1 BOUND TO THE GGCGC SITE. organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0075 <- 2.93 -> DG N7 D0005 : score 5.8927 : H : ARG NH2 A0075 <- 3.00 -> DG O6 D0005 : score 6.336 : H : GLN OE1 A0077 <- 2.98 -> DC N4 C0009 : score 4.41833 : H : LYS NZ A0082 <- 2.77 -> DG O6 D0006 : score 5.81545 : H : LYS NZ A0082 <- 2.75 -> DG O6 C0010 : score 5.83858 : H : ARG NH1 B0075 <- 3.00 -> DG N7 C0005 : score 5.808 : H : ARG NH2 B0075 <- 3.15 -> DG O6 C0005 : score 6.138 : H : GLN OE1 B0077 <- 3.00 -> DC N4 D0009 : score 4.4 : H : LYS NZ B0082 <- 2.80 -> DG O6 D0010 : score 5.78077 : H : LYS NZ B0082 <- 2.83 -> DG O6 C0006 : score 5.74608 : x : ASP xxxx A0073 <- 4.39 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >6fzt_B:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD8_9-MH1 BOUND TO THE GGCGC SITE. organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0075 <- 3.00 -> DG N7 C0005 : score 5.808 : H : ARG NH2 B0075 <- 3.15 -> DG O6 C0005 : score 6.138 : H : GLN OE1 B0077 <- 3.00 -> DC N4 D0009 : score 4.4 : H : LYS NZ B0082 <- 2.80 -> DG O6 D0010 : score 5.78077 : H : LYS NZ B0082 <- 2.83 -> DG O6 C0006 : score 5.74608 >6g0a_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE POL2 CATALYTIC DOMAIN OF DNA POLYMERASE EPSILON CARRYING A P301R SUBSTITUTION. organism=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) : H : LYS NZ A0967 <- 3.13 -> DT O2 P0010 : score 3.35043 : H : ARG NH1 A0988 <- 3.05 -> DG N3 P0008 : score 2.89994 : H : ARG NH2 A0988 <- 3.05 -> DC O2 P0007 : score 3.51378 >6g0l_M:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF TWO MOLECULES OF THE CHROMATIN REMODELLING ENZYME CHD1 BOUND TO A NUCLEOSOME organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C : x : GLU xxxx M0493 <- 3.70 -> DC xxx I-018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0517 <- 4.29 -> DG xxx J0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M1115 <- 3.45 -> DA xxx I0078 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M1255 <- 3.46 -> DT xxx J-078 : score x.xxxxx >6g1l_A:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=MITF/CLEARBOX STRUCTURE organism=Mus musculus : H : HIS NE2 A0209 <- 2.44 -> DG O6 B0011 : score 8.52652 : x : ASN xxxx A0210 <- 3.26 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0213 <- 3.46 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0217 <- 3.59 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx >6g1t_A: title=TRAN, A REPRESSOR OF AN ENTEROCOCCUS CONJUGATIVE TYPE IV SECRETION SYSTEM organism=ENTEROCOCCUS FAECALIS : H : ARG NH1 A0023 <- 3.23 -> DG O6 E0016 : score 5.56017 : H : ARG NH2 A0023 <- 2.70 -> DG N7 E0016 : score 6.51231 : H : ASN OD1 A0024 <- 2.97 -> DC N4 D0019 : score 4.05101 : H : ASN ND2 A0024 <- 3.09 -> DA N7 D0018 : score 5.53002 : H : GLN OE1 A0028 <- 3.02 -> DA N6 E0014 : score 5.78625 : w : ARG NH2 A0031 <- 5.61 -> DA N6 D0020 : score 1.997 : H : GLU OE1 A0078 <- 2.94 -> DC N4 D0010 : score 5.60645 : H : HIS NE2 A0082 <- 2.62 -> DG O6 E0025 : score 8.24018 : H : ARG NH1 A0086 <- 2.90 -> DG O6 D0008 : score 5.96167 : H : ARG NH2 A0086 <- 2.83 -> DT O4 D0007 : score 3.53252 : w : ARG NH1 A0086 <- 5.62 -> DA N6 E0026 : score 1.486 : H : LYS NZ A0101 <- 3.07 -> DA N3 D0016 : score 2.62697 : w : LYS NZ A0101 <- 5.41 -> DA N3 E0020 : score 1.538 : x : ASN xxxx A0022 <- 3.25 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0027 <- 3.89 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0076 <- 3.44 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0081 <- 3.93 -> DT xxx E0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0087 <- 3.67 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >6g2q_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CHCL (S-ISOMER), BETA, GAMMA DTTP ANALOGUE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.45 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.85 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 4.02 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6g3b_A: title=AVAII RESTRICTION ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH AN RNA/DNA HYBRID organism=Nostoc sp. PCC 7120 : x : GLU xxxx A0169 <- 4.16 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >6g3b_AB: title=AVAII RESTRICTION ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH AN RNA/DNA HYBRID organism=Nostoc sp. PCC 7120 : w : GLU OE1 B0115 <- 6.30 -> DT O2 D0007 : score 2.462 : x : GLU xxxx A0169 <- 4.16 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0167 <- 4.31 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx >6gat_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE L22V MUTANT DNA BINDING DOMAIN OF AREA COMPLEXED TO A 13 BP DNA CONTAINING A TGATA SITE, REGULARIZED MEAN STRUCTURE organism=EMERICELLA NIDULANS : H : ARG NH1 A0024 <- 2.90 -> DG N7 B0105 : score 5.929 : H : ARG NH2 A0024 <- 3.23 -> DG N7 B0105 : score 5.83554 : H : ARG NH2 A0024 <- 2.78 -> DG O6 B0105 : score 6.6264 : V : VAL CG2 A0022 <- 3.82 -> DT C7 B0104 : score 6.09246 : x : ASN xxxx A0034 <- 4.46 -> DA xxx C0120 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0038 <- 3.14 -> DA xxx C0120 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0039 <- 4.32 -> DT xxx C0119 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0059 <- 3.61 -> DG xxx B0109 : score x.xxxxx >6gcd_AB: title=DNA BINDING DOMAIN OF RESTRICTION ENDONUCLEASE MCRBC IN COMPLEX WITH 5-HYDROXYMETHYLCYTOSINE DNA organism=Escherichia coli : w : GLN OE1 A0021 <- 6.23 -> DT O2 C0010 : score 2.481 : w : ASN OD1 A0043 <- 6.23 -> DG N3 C0008 : score 3.377 : w : ASN ND2 A0043 <- 6.00 -> DG N3 D0008 : score 2.566 : w : GLN OE1 B0021 <- 6.22 -> DT O2 D0010 : score 2.481 : w : ASN OD1 B0043 <- 6.50 -> DG N3 D0008 : score 3.377 : w : ASN ND2 B0043 <- 5.47 -> DG N3 C0008 : score 2.566 : x : TYR xxxx A0041 <- 3.20 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0041 <- 3.09 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >6gcd_B: title=DNA BINDING DOMAIN OF RESTRICTION ENDONUCLEASE MCRBC IN COMPLEX WITH 5-HYDROXYMETHYLCYTOSINE DNA organism=Escherichia coli : w : GLN OE1 B0021 <- 6.22 -> DT O2 D0010 : score 2.481 : w : ASN OD1 B0043 <- 6.50 -> DG N3 D0008 : score 3.377 : w : ASN ND2 B0043 <- 5.47 -> DG N3 C0008 : score 2.566 : x : TYR xxxx B0041 <- 3.09 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >6gce_AB: title=DNA BINDING DOMAIN OF RESTRICTION ENDONUCLEASE MCRBC IN COMPLEX WITH 5-FORMYLCYTOSINE DNA organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 A0043 <- 3.29 -> DG N2 C0008 : score 4.3296 A : w : GLN OE1 B0021 <- 6.20 -> DT O2 D0010 : score 2.481 : H : ASN OD1 B0043 <- 3.24 -> DG N2 D0008 : score 4.3776 A : H : THR OG1 B0085 <- 2.89 -> DC O2 C0006 : score 2.57838 : x : GLN xxxx A0021 <- 3.92 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.23 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0041 <- 3.27 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0049 <- 4.20 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0060 <- 4.25 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0064 <- 2.80 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0083 <- 3.98 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0084 <- 4.02 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0117 <- 3.25 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >6gce_B: title=DNA BINDING DOMAIN OF RESTRICTION ENDONUCLEASE MCRBC IN COMPLEX WITH 5-FORMYLCYTOSINE DNA organism=Escherichia coli : w : GLN OE1 B0021 <- 6.20 -> DT O2 D0010 : score 2.481 : H : ASN OD1 B0043 <- 3.24 -> DG N2 D0008 : score 4.3776 A : H : THR OG1 B0085 <- 2.89 -> DC O2 C0006 : score 2.57838 : x : TYR xxxx B0041 <- 3.27 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0049 <- 4.20 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0060 <- 4.25 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0064 <- 2.80 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0083 <- 3.98 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0084 <- 4.02 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0117 <- 3.25 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >6gcf_AB: title=DNA BINDING DOMAIN OF RESTRICTION ENDONUCLEASE MCRBC IN COMPLEX WITH N4-METHYLCYTOSINE DNA organism=Escherichia coli : H : ASN OD1 A0043 <- 3.24 -> DG N2 C0008 : score 4.3776 A : w : GLN OE1 B0021 <- 6.33 -> DT O2 D0010 : score 2.481 : w : ASN OD1 B0043 <- 6.52 -> DG N3 D0008 : score 3.377 : H : THR OG1 B0085 <- 2.62 -> DC O2 C0006 : score 2.72016 : x : GLN xxxx A0021 <- 3.83 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.29 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0041 <- 3.25 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0049 <- 3.98 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0059 <- 4.31 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0064 <- 2.90 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0083 <- 4.20 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0084 <- 3.68 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0117 <- 3.28 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >6gcf_B: title=DNA BINDING DOMAIN OF RESTRICTION ENDONUCLEASE MCRBC IN COMPLEX WITH N4-METHYLCYTOSINE DNA organism=Escherichia coli : w : GLN OE1 B0021 <- 6.33 -> DT O2 D0010 : score 2.481 : w : ASN OD1 B0043 <- 6.52 -> DG N3 D0008 : score 3.377 : w : ASN ND2 B0043 <- 5.78 -> DG N3 C0008 : score 2.566 : H : THR OG1 B0085 <- 2.62 -> DC O2 C0006 : score 2.72016 : x : TYR xxxx B0041 <- 3.25 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0049 <- 3.98 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0059 <- 4.31 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0064 <- 2.90 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0083 <- 4.20 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0084 <- 3.68 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0117 <- 3.28 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >6gdr_A:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=DNA BINDING WITH A MINIMAL SCAFFOLD: STRUCTURE-FUNCTION ANALYSIS OF LIG E DNA LIGASES organism=ALTEROMONAS MEDITERRANEA : w : THR OG1 A0251 <- 5.60 -> DT O2 B0010 : score 2.522 : x : PHE xxxx A0081 <- 4.15 -> DG xxx B0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0229 <- 3.78 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0283 <- 3.29 -> DC xxx C0031 : score x.xxxxx >6ged_A:V-region_of_surface_antigen_I/II_SA_I/II,_PAC; title=ADHESIN DOMAIN OF PRGB FROM ENTEROCOCCUS FAECALIS BOUND TO DNA organism=ENTEROCOCCUS FAECALIS : x : LYS xxxx A0282 <- 3.29 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0283 <- 3.98 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx >6gfw_CDM: title=CRYO-EM STRUCTURE OF BACTERIAL RNA POLYMERASE-SIGMA54 HOLOENZYME INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI K-12 / KLEBSIELLA PNEUMONIAE : H : ARG NH1 D0270 <- 3.06 -> DT O4 F0009 : score 3.09802 : V : THR CB M0380 <- 3.59 -> DT C7 F0012 : score 3.71128 : V : LEU CD1 M0367 <- 3.78 -> DT C7 G-016 : score 5.75994 : x : TRP xxxx C0183 <- 2.77 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.52 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.52 -> DA xxx G-003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0384 <- 4.08 -> DA xxx G-003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0387 <- 4.00 -> DA xxx G-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0394 <- 3.71 -> DA xxx G-003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0539 <- 4.44 -> DG xxx G0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 4.19 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0267 <- 3.60 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 4.38 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0317 <- 3.70 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0319 <- 3.85 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 4.18 -> DC xxx F-001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.76 -> DC xxx F-002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.76 -> DG xxx F-003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.83 -> DG xxx F-003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx M0104 <- 3.01 -> DG xxx F0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx M0105 <- 3.57 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx M0109 <- 2.24 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx M0110 <- 4.12 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx M0111 <- 2.94 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx M0310 <- 2.92 -> DA xxx G-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0327 <- 3.80 -> DC xxx G-006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx M0328 <- 3.79 -> DG xxx G-008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0331 <- 3.93 -> DG xxx G-008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0332 <- 4.19 -> DG xxx G-008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx M0333 <- 3.30 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx M0377 <- 2.93 -> DC xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0379 <- 2.26 -> DT xxx G-015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0382 <- 4.34 -> DT xxx G-016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0383 <- 4.47 -> DT xxx G-015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx M0454 <- 4.49 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0456 <- 3.93 -> DC xxx F0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0457 <- 2.51 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >6gfw_M: title=CRYO-EM STRUCTURE OF BACTERIAL RNA POLYMERASE-SIGMA54 HOLOENZYME INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX organism=? : V : THR CB M0380 <- 3.59 -> DT C7 F0012 : score 3.71128 : V : LEU CD1 M0367 <- 3.78 -> DT C7 G-016 : score 5.75994 : x : TYR xxxx M0104 <- 3.01 -> DG xxx F0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx M0105 <- 3.57 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx M0109 <- 2.24 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx M0110 <- 4.12 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx M0111 <- 2.94 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx M0310 <- 2.92 -> DA xxx G-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0327 <- 3.80 -> DC xxx G-006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx M0328 <- 3.79 -> DG xxx G-008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0331 <- 3.93 -> DG xxx G-008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0332 <- 4.19 -> DG xxx G-008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx M0333 <- 3.30 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx M0377 <- 2.93 -> DC xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0379 <- 2.26 -> DT xxx G-015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0382 <- 4.34 -> DT xxx G-016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0383 <- 4.47 -> DT xxx G-015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx M0454 <- 4.49 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0456 <- 3.93 -> DC xxx F0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0457 <- 2.51 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >6gh5_CDM: title=CRYO-EM STRUCTURE OF BACTERIAL RNA POLYMERASE-SIGMA54 HOLOENZYME TRANSCRIPTION OPEN COMPLEX organism=KLEBSIELLA PNEUMONIAE / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : V : THR CG2 M0380 <- 3.77 -> DT C7 F0012 : score 4.2687 : V : ARG CZ D0281 <- 3.82 -> DT C7 G-010 : score 2.12165 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.51 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.22 -> DG xxx G0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 4.07 -> DG xxx G0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 3.43 -> DG xxx G0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 3.96 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0446 <- 4.48 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0451 <- 3.38 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 4.03 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0541 <- 2.84 -> DC xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.17 -> DG xxx G0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0546 <- 3.44 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.02 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0253 <- 3.96 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0261 <- 2.58 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0262 <- 3.73 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0267 <- 4.19 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 4.33 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0319 <- 3.86 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0320 <- 3.28 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0322 <- 3.32 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0334 <- 3.52 -> DC xxx F-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx M0108 <- 4.33 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx M0109 <- 2.38 -> DG xxx F0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx M0110 <- 3.82 -> DG xxx F0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx M0328 <- 4.14 -> DA xxx G-007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0379 <- 3.99 -> DT xxx G-015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0388 <- 4.27 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0456 <- 3.40 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0457 <- 3.21 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >6gh5_M: title=CRYO-EM STRUCTURE OF BACTERIAL RNA POLYMERASE-SIGMA54 HOLOENZYME TRANSCRIPTION OPEN COMPLEX organism=KLEBSIELLA PNEUMONIAE : V : THR CG2 M0380 <- 3.77 -> DT C7 F0012 : score 4.2687 : x : GLU xxxx M0108 <- 4.33 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx M0109 <- 2.38 -> DG xxx F0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx M0110 <- 3.82 -> DG xxx F0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx M0328 <- 4.14 -> DA xxx G-007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0379 <- 3.99 -> DT xxx G-015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0388 <- 4.27 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0456 <- 3.40 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0457 <- 3.21 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >6gh6_DM: title=CRYO-EM STRUCTURE OF BACTERIAL RNA POLYMERASE-SIGMA54 HOLOENZYME INTERMEDIATE PARTIALLY LOADED COMPLEX organism=KLEBSIELLA PNEUMONIAE / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : V : THR CG2 M0380 <- 3.67 -> DT C7 T0012 : score 4.37462 : V : SER CB M0379 <- 3.77 -> DT C7 N-015 : score 3.15477 : x : ALA xxxx M0336 <- 3.44 -> DA xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0456 <- 4.29 -> DT xxx T0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0457 <- 4.41 -> DT xxx T0023 : score x.xxxxx >6gh6_M: title=CRYO-EM STRUCTURE OF BACTERIAL RNA POLYMERASE-SIGMA54 HOLOENZYME INTERMEDIATE PARTIALLY LOADED COMPLEX organism=KLEBSIELLA PNEUMONIAE : V : THR CG2 M0380 <- 3.67 -> DT C7 T0012 : score 4.37462 : V : SER CB M0379 <- 3.77 -> DT C7 N-015 : score 3.15477 : x : ALA xxxx M0336 <- 3.44 -> DA xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0456 <- 4.29 -> DT xxx T0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0457 <- 4.41 -> DT xxx T0023 : score x.xxxxx >6gmh_ABEUZ:Translation_proteins_SH3-like_domain; title=STRUCTURE OF ACTIVATED TRANSCRIPTION COMPLEX POL II-DSIF-PAF-SPT6 organism=SUS SCROFA / HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A1416 <- 2.55 -> DT O2 T0021 : score 4.445 : x : GLN xxxx A0267 <- 3.16 -> DT xxx T0034 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0331 <- 3.32 -> DG xxx T0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0364 <- 4.22 -> DG xxx T0026 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 3.98 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.47 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 3.84 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx >6gml_ABEZ:Translation_proteins_SH3-like_domain; title=STRUCTURE OF PAUSED TRANSCRIPTION COMPLEX POL II-DSIF-NELF organism=SUS SCROFA / HOMO SAPIENS : x : LYS xxxx A0149 <- 4.41 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.59 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 3.58 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1416 <- 4.32 -> DA xxx T0021 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1417 <- 3.91 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0492 <- 3.46 -> DA xxx N0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0494 <- 3.82 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx >6gn7_HL:Trypsin-like_serine_proteases; title=X-RAY STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN HUMAN ALPHA THROMBIN AND NU172, A DUPLEX/QUADRUPLEX 26-MER DNA APTAMER, IN THE PRESENCE OF SODIUM IONS. organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx H0075 <- 3.73 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0077 <- 3.18 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx >6go5_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TDT CHIMERA (LOOP1 OF POL MU) - TERNARY COMPLEX WITH 1-NT GAPPED DNA SUBSTRATE organism=? : w : ARG NH1 A0193 <- 6.36 -> DT O2 H0004 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0193 <- 6.42 -> DT O2 H0004 : score 2.261 : H : ARG NE A0455 <- 3.01 -> DG O6 H0006 : score 3.7755 : x : SER xxxx A0187 <- 3.46 -> DC xxx G0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0189 <- 3.81 -> DG xxx H0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0190 <- 3.36 -> DC xxx G0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0458 <- 3.52 -> DG xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0459 <- 3.57 -> DG xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0462 <- 3.79 -> DG xxx H0006 : score x.xxxxx >6go6_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TDT CHIMERA (LOOP1 OF POL MU) - TERNARY COMPLEX WITH DOWNSTREAM DSDNA organism=MUS MUSCULUS : w : ARG NH2 A0193 <- 6.19 -> DA N3 E0002 : score 2.092 : x : SER xxxx A0187 <- 4.22 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0189 <- 4.10 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0190 <- 3.56 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx >6go7_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TDT CHIMERA (LOOP1 OF POL MU) - FULL DNA SYNAPSIS COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : x : LEU xxxx A0189 <- 4.24 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0190 <- 3.44 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0193 <- 3.62 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx >6gov_GXY: title=STRUCTURE OF THE RNA POLYMERASE LAMBDA-BASED ANTITERMINATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI O157:H7 : V : LEU CD2 X0538 <- 3.74 -> DT C7 K-002 : score 5.81725 : x : ARG xxxx X0151 <- 3.72 -> DT xxx K-002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx X0183 <- 3.03 -> DT xxx K-003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx X0199 <- 3.86 -> DT xxx K-003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx X0445 <- 3.48 -> DT xxx K-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0451 <- 4.37 -> DT xxx K-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0542 <- 3.05 -> DA xxx K-001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx X0547 <- 3.34 -> DT xxx K-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0259 <- 4.43 -> DA xxx K-011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0270 <- 4.20 -> DT xxx K-010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Y0321 <- 3.55 -> DA xxx K-008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx Y0427 <- 3.86 -> DG xxx L0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Y0790 <- 3.44 -> DT xxx L0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0791 <- 4.07 -> DT xxx L0019 : score x.xxxxx >6grc_A:PIN_domain-like;5'_to_3'_exonuclease,_C-terminal_subdomain; title=EUKARYOTIC JUNCTION-RESOLVING ENZYME GEN-1 BINDING WITH SODIUM organism=Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719) / Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719) : x : ARG xxxx A0256 <- 4.46 -> DC xxx R0006 : score x.xxxxx >6gtc_A: title=TRANSITION STATE STRUCTURE OF CPF1(CAS12A) I1 CONFORMATION organism=FRANCISELLA TULARENSIS SUBSP. NOVICIDA U112 : H : ASN ND2 A0666 <- 2.46 -> DA N7 D0001 : score 6.26971 : H : LYS NZ A0671 <- 2.85 -> DT O2 D-002 : score 3.55131 : H : LYS NZ A0671 <- 2.92 -> DA N3 C0003 : score 2.71028 : x : LYS xxxx A0180 <- 3.39 -> DT xxx C-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0184 <- 2.95 -> DC xxx C-002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0185 <- 3.28 -> DT xxx C-004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0188 <- 3.62 -> DT xxx C-004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0613 <- 3.15 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0663 <- 3.96 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0667 <- 3.43 -> DA xxx D-001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0668 <- 3.43 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0677 <- 3.70 -> DG xxx D-008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0751 <- 2.98 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0754 <- 3.45 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0883 <- 4.14 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0895 <- 3.90 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx >6gte_A: title=TRANSIENT STATE STRUCTURE OF CRISPR-CPF1 (CAS12A) I3 CONFORMATION organism=? : H : ASN ND2 A0185 <- 2.35 -> DC O2 C-002 : score 4.88264 : H : ASN ND2 A0666 <- 2.44 -> DA N7 D0001 : score 6.29319 : H : LYS NZ A0671 <- 2.97 -> DT O2 D-002 : score 3.46522 : H : LYS NZ A0677 <- 3.23 -> DG N7 C0005 : score 4.92271 : x : SER xxxx A0014 <- 3.50 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0177 <- 4.14 -> DT xxx D-003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0184 <- 3.78 -> DC xxx C-002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0197 <- 3.70 -> DT xxx C-003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0613 <- 3.80 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0616 <- 4.00 -> DC xxx D-005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0663 <- 4.28 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0667 <- 3.39 -> DA xxx D-001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0668 <- 3.40 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0754 <- 3.48 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0758 <- 4.47 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0825 <- 4.41 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0827 <- 3.77 -> DT xxx C-001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0894 <- 4.43 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx >6gtf_A: title=TRANSIENT STATE STRUCTURE OF CRISPR-CPF1 (CAS12A) I5 CONFORMATION organism=FRANCISELLA TULARENSIS SUBSP. NOVICIDA U112 : H : ASN ND2 A0185 <- 2.41 -> DC O2 C-002 : score 4.82889 : H : LYS NZ A0613 <- 2.70 -> DA N7 C0002 : score 2.99592 : H : ASN ND2 A0666 <- 2.59 -> DA N7 D0001 : score 6.11707 : H : LYS NZ A0671 <- 3.19 -> DT O2 D-002 : score 3.30738 : H : LYS NZ A0677 <- 2.75 -> DG N7 C0005 : score 5.43976 : x : SER xxxx A0014 <- 3.54 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0177 <- 4.03 -> DG xxx D-004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0196 <- 4.40 -> DT xxx C-004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0197 <- 3.56 -> DT xxx C-003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0663 <- 3.34 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0667 <- 3.37 -> DA xxx D-001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0668 <- 3.32 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0750 <- 4.50 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0751 <- 3.67 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0754 <- 3.66 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0758 <- 4.05 -> DA xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0825 <- 4.48 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0894 <- 4.15 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx >6gtg_A: title=TRANSITION STATE STRUCTURE OF CPF1(CAS12A) I4 CONFORMATION organism=FRANCISELLA TULARENSIS SUBSP. NOVICIDA U112 : x : THR xxxx A0177 <- 3.58 -> DT xxx D-003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0180 <- 4.24 -> DT xxx D-003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0613 <- 3.95 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0616 <- 4.25 -> DC xxx D-005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0663 <- 3.75 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0667 <- 3.35 -> DA xxx D-001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0668 <- 3.35 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0671 <- 3.87 -> DA xxx D-001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0677 <- 3.83 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0827 <- 4.00 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx >6gts_BC:Ribbon-helix-helix; title=STRUCTURE OF THE ATAT-ATAR COMPLEX BOUND DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 C0008 <- 2.79 -> DG N7 D0007 : score 6.39738 : x : LYS xxxx B0006 <- 3.10 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0008 <- 4.24 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0012 <- 4.25 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0010 <- 3.58 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx >6gts_C:Ribbon-helix-helix; title=STRUCTURE OF THE ATAT-ATAR COMPLEX BOUND DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 C0008 <- 2.79 -> DG N7 D0007 : score 6.39738 : x : ASP xxxx C0010 <- 3.58 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx >6gy3_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C. GLUTAMICUM AMTR BOUND TO GLNA OPERATOR DNA organism=Corynebacterium glutamicum : H : GLN OE1 A0053 <- 2.65 -> DA N6 C0013 : score 6.23414 : H : GLN NE2 A0053 <- 2.57 -> DA N7 C0013 : score 6.36987 : x : THR xxxx A0042 <- 4.28 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0052 <- 3.95 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0054 <- 3.18 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0055 <- 3.36 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0057 <- 3.54 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0058 <- 3.66 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6gy3_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C. GLUTAMICUM AMTR BOUND TO GLNA OPERATOR DNA organism=Corynebacterium glutamicum : H : GLN OE1 A0053 <- 2.65 -> DA N6 C0013 : score 6.23414 : H : GLN NE2 A0053 <- 2.57 -> DA N7 C0013 : score 6.36987 : H : GLN OE1 B0053 <- 3.10 -> DA N6 D0013 : score 5.68941 : H : GLN NE2 B0053 <- 2.88 -> DA N7 D0013 : score 5.99231 : x : THR xxxx A0042 <- 4.28 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0052 <- 3.95 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0054 <- 3.18 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0055 <- 3.36 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0057 <- 3.54 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0058 <- 3.66 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0042 <- 4.44 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0052 <- 4.43 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0054 <- 3.18 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0055 <- 3.59 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0057 <- 3.82 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0058 <- 3.72 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx >6gyk_MOU:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;TATA-box_binding_protein-like;Rap30/74_interaction_domains;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain; title=STRUCTURE OF A YEAST CLOSED COMPLEX (CORE CC1) organism=? : x : ASN xxxx O0069 <- 3.54 -> DT xxx T0061 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0099 <- 3.62 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0114 <- 3.54 -> DT xxx T0059 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0116 <- 3.82 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx O0159 <- 4.21 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0161 <- 4.48 -> DA xxx T0062 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0190 <- 3.88 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0205 <- 3.82 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0207 <- 3.91 -> DT xxx T0063 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0215 <- 4.04 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx >6gyl_MOQRUW:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;TATA-box_binding_protein-like;Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain; title=STRUCTURE OF A YEAST CLOSED COMPLEX WITH DISTORTED DNA (CORE CCDIST) organism=? : H : THR OG1 O0124 <- 3.21 -> DA N3 T0060 : score 1.24283 : x : ASN xxxx O0069 <- 3.95 -> DA xxx T0060 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0071 <- 3.72 -> DA xxx T0060 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0099 <- 1.95 -> DA xxx T0058 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0114 <- 3.47 -> DA xxx T0058 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0116 <- 4.43 -> DA xxx T0058 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0122 <- 4.01 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx O0159 <- 4.19 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0161 <- 3.66 -> DT xxx T0061 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0191 <- 4.30 -> DA xxx T0064 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0205 <- 4.36 -> DA xxx T0062 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0213 <- 3.73 -> DA xxx T0062 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0215 <- 3.36 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx >6gym_7MOQRW:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;TATA-box_binding_protein-like;Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=STRUCTURE OF A YEAST CLOSED COMPLEX WITH DISTORTED DNA (CCDIST) organism=? : x : ASN xxxx O0069 <- 3.48 -> DT xxx T0061 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0071 <- 4.15 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0099 <- 3.24 -> DT xxx T0058 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0114 <- 4.19 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0124 <- 3.85 -> DA xxx T0060 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0161 <- 3.88 -> DT xxx T0061 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0190 <- 4.29 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0191 <- 4.15 -> DC xxx T0065 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0205 <- 3.64 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0207 <- 4.17 -> DT xxx T0063 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0215 <- 4.35 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx >6gys_ACEHJL:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE CBF3-CEN3 COMPLEX OF THE BUDDING YEAST KINETOCHORE organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : V : HIS CB C0322 <- 3.65 -> DT C7 F0017 : score 4.27982 : V : ARG CZ J0036 <- 3.55 -> DT C7 F0048 : score 2.26558 : x : LYS xxxx C0021 <- 3.52 -> DC xxx F0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0321 <- 4.27 -> DT xxx G0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0325 <- 3.38 -> DC xxx G0039 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0368 <- 4.36 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0334 <- 3.48 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0336 <- 4.06 -> DT xxx G0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0023 <- 3.71 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0032 <- 4.26 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0334 <- 3.17 -> DA xxx F0034 : score x.xxxxx >6gys_C:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE CBF3-CEN3 COMPLEX OF THE BUDDING YEAST KINETOCHORE organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : V : HIS CB C0322 <- 3.65 -> DT C7 F0017 : score 4.27982 : x : LYS xxxx C0021 <- 3.52 -> DC xxx F0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0321 <- 4.27 -> DT xxx G0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0325 <- 3.38 -> DC xxx G0039 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0368 <- 4.36 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx >6h0s_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN THE LACTOCOCCUS LACTIS FPG MUTANT G226P AND A FAPY-DG CONTAINING DNA organism=Lactococcus lactis subsp. cremoris : H : ARG NH1 A0074 <- 2.91 -> DT O2 B0008 : score 4.21167 : w : ARG NH1 A0074 <- 6.10 -> DT O2 B0009 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0074 <- 6.00 -> DT O2 B0009 : score 2.261 : w : GLU OE2 A0076 <- 6.00 -> DT O2 B0006 : score 2.279 : H : ARG NE A0109 <- 2.71 -> DC O2 C0023 : score 2.70684 : H : ARG NH2 A0109 <- 2.99 -> DC N3 C0023 : score 2.20397 : w : ARG NH1 A0109 <- 6.30 -> DT O2 B0006 : score 1.855 : x : MET xxxx A0075 <- 3.44 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.40 -> DC xxx C0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.38 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >6h1v_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF POL2CORE IN COMPLEX WITH DNA AND AN INCOMING NUCLEOTIDE, CARRYING AN FE-S CLUSTER organism=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) : H : LYS NZ A0967 <- 2.98 -> DA N3 T0008 : score 2.67695 : H : LYS NZ A0967 <- 3.30 -> DT O2 P0010 : score 3.22846 : H : ARG NH2 A0988 <- 3.14 -> DC O2 P0007 : score 3.44721 >6h3r_A:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD2 WITHOUT EXON -MH1 BOUND TO THE CAGAC SITE. organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0084 <- 2.95 -> DG N7 D0005 : score 5.8685 : H : ARG NH2 A0084 <- 2.93 -> DG O6 D0005 : score 6.4284 : H : GLN OE1 A0086 <- 2.99 -> DA N6 C0011 : score 5.82257 : H : LYS NZ A0091 <- 3.11 -> DA N7 C0011 : score 2.75507 >6h67_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=YEAST RNA POLYMERASE I ELONGATION COMPLEX STALLED BY CYCLOBUTANE PYRIMIDINE DIMER (CPD) organism=? : x : ARG xxxx A1600 <- 4.14 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx >6h67_AB: title=YEAST RNA POLYMERASE I ELONGATION COMPLEX STALLED BY CYCLOBUTANE PYRIMIDINE DIMER (CPD) organism=? : x : ARG xxxx A1600 <- 4.14 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx >6h68_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=YEAST RNA POLYMERASE I ELONGATION COMPLEX STALLED BY CYCLOBUTANE PYRIMIDINE DIMER (CPD) WITH FULLY-ORDERED A49 organism=? : V : SER CB A1014 <- 3.80 -> DT C7 T0019 : score 3.13128 : x : HIS xxxx A0378 <- 3.94 -> DA xxx T0027 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0593 <- 3.98 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0632 <- 4.45 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1013 <- 3.60 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1600 <- 3.62 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx >6h68_AB: title=YEAST RNA POLYMERASE I ELONGATION COMPLEX STALLED BY CYCLOBUTANE PYRIMIDINE DIMER (CPD) WITH FULLY-ORDERED A49 organism=? : V : SER CB A1014 <- 3.80 -> DT C7 T0019 : score 3.13128 : x : HIS xxxx A0378 <- 3.94 -> DA xxx T0027 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0593 <- 3.98 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0632 <- 4.45 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1013 <- 3.60 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1600 <- 3.62 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0451 <- 3.80 -> DC xxx U0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0508 <- 3.54 -> DC xxx U0034 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0512 <- 4.04 -> DC xxx U0034 : score x.xxxxx >6h8q_A:ARM_repeat; title=STRUCTURAL BASIS FOR SCC3-DEPENDENT COHESIN RECRUITMENT TO CHROMATIN organism=? : x : LYS xxxx A0225 <- 4.39 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx >6hb4_ADGJ:HMG-box; title=TFAM IN COMPLEX WITH SITE-Y organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0057 <- 2.99 -> DC O2 c0020 : score 3.36453 : H : ASN ND2 A0163 <- 3.17 -> DT O2 c0007 : score 4.39494 : H : TYR OH D0057 <- 2.89 -> DC O2 c0042 : score 3.43448 : H : ASN ND2 D0163 <- 3.22 -> DT O2 c0029 : score 4.34748 : H : ASN ND2 D0163 <- 3.08 -> DT O2 c0030 : score 4.48037 : H : TYR OH G0057 <- 2.89 -> DC O2 c0064 : score 3.43448 : H : ASN ND2 G0163 <- 3.23 -> DT O2 c0051 : score 4.33798 : H : TYR OH J0057 <- 2.87 -> DC O2 c0086 : score 3.44847 : H : ASN ND2 J0163 <- 3.26 -> DT O2 c0073 : score 4.30951 >6hb4_J:HMG-box; title=TFAM IN COMPLEX WITH SITE-Y organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 J0157 <- 2.56 -> DT O2 b0084 : score 4.43653 : H : TYR OH J0162 <- 2.90 -> DA N3 b0081 : score 4.06826 >6hc3_ADGJ:HMG-box; title=TFAM BOUND TO SITE-X organism=Homo sapiens : H : TYR OH D0057 <- 2.80 -> DG N3 c0018 : score 3.1141 : H : SER OG D0061 <- 3.00 -> DG N2 c0018 : score 3.23938 : H : ASN ND2 D0163 <- 3.28 -> DG N3 c0005 : score 4.42496 : H : TYR OH J0057 <- 2.70 -> DG N3 c0040 : score 3.17638 : H : SER OG J0061 <- 3.09 -> DG N2 c0040 : score 3.17865 : H : ASN ND2 J0163 <- 3.26 -> DG N3 c0027 : score 4.44454 >6hko_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=YEAST RNA POLYMERASE I ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUCLEOTIDE ANALOG GMPCPP organism=? : x : LEU xxxx A0373 <- 3.77 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0376 <- 3.92 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0481 <- 3.93 -> DC xxx T0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0592 <- 4.03 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0593 <- 3.44 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1013 <- 3.27 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1014 <- 3.89 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1600 <- 3.50 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx >6hko_AB: title=YEAST RNA POLYMERASE I ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUCLEOTIDE ANALOG GMPCPP organism=? : H : GLN NE2 B0479 <- 3.27 -> DA N7 S0025 : score 5.51731 : x : LEU xxxx A0373 <- 3.77 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0376 <- 3.92 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0481 <- 3.93 -> DC xxx T0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0592 <- 4.03 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0593 <- 3.44 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1013 <- 3.27 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1014 <- 3.89 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1600 <- 3.50 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0219 <- 3.11 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0394 <- 4.03 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0395 <- 3.60 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0505 <- 3.91 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0508 <- 3.32 -> DG xxx S0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0509 <- 3.89 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx >6hkt_w:Histone-fold; title=STRUCTURE OF AN H1-BOUND 6-NUCLEOSOME ARRAY organism=? : x : ARG xxxx w0042 <- 4.44 -> DG xxx I0993 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx w0077 <- 3.47 -> DG xxx J0150 : score x.xxxxx >6hlq_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=YEAST RNA POLYMERASE I* ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUCLEOTIDE ANALOG GMPCPP organism=? : x : LEU xxxx A0373 <- 3.77 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0376 <- 3.71 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0481 <- 4.32 -> DC xxx T0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0592 <- 3.69 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0593 <- 3.63 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1013 <- 4.31 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1014 <- 3.61 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1600 <- 4.24 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx >6hlq_AB: title=YEAST RNA POLYMERASE I* ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUCLEOTIDE ANALOG GMPCPP organism=? : x : LEU xxxx A0373 <- 3.77 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0376 <- 3.71 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0481 <- 4.32 -> DC xxx T0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0592 <- 3.69 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0593 <- 3.63 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1013 <- 4.31 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1014 <- 3.61 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1600 <- 4.24 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0219 <- 3.23 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0394 <- 4.45 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0395 <- 3.77 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0479 <- 4.12 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0505 <- 4.15 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0508 <- 3.84 -> DG xxx S0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0509 <- 3.85 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0513 <- 3.47 -> DA xxx T0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B1061 <- 4.31 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx >6hlr_AB: title=YEAST RNA POLYMERASE I ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUCLEOTIDE ANALOG GMPCPP (CORE FOCUSED) organism=? : x : LEU xxxx A0373 <- 3.94 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0376 <- 3.78 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0481 <- 4.26 -> DC xxx T0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0592 <- 3.89 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0593 <- 3.64 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1013 <- 3.67 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1014 <- 3.77 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1600 <- 4.18 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0219 <- 3.56 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0394 <- 4.02 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0395 <- 3.54 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0479 <- 3.63 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0505 <- 3.86 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0508 <- 3.23 -> DG xxx S0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0509 <- 3.86 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B1061 <- 4.39 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx >6hlr_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=YEAST RNA POLYMERASE I ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUCLEOTIDE ANALOG GMPCPP (CORE FOCUSED) organism=? : x : ARG xxxx B0219 <- 3.56 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0394 <- 4.02 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0395 <- 3.54 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0479 <- 3.63 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0505 <- 3.86 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0508 <- 3.23 -> DG xxx S0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0509 <- 3.86 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B1061 <- 4.39 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx >6hp7_A:HCP-like; title=ARBITRIUM PEPTIDE RECEPTOR FROM SPBETA PHAGE IN COMPLEX WITH 43 MER DNA organism=Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) : H : ASN ND2 A0030 <- 3.09 -> DG N7 D0036 : score 4.31992 : w : ASP OD2 A0036 <- 6.57 -> DA N6 D0035 : score 3.409 : x : ASN xxxx A0032 <- 2.90 -> DG xxx D0036 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0033 <- 3.99 -> DA xxx D0035 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0035 <- 3.75 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >6hp7_AB:HCP-like; title=ARBITRIUM PEPTIDE RECEPTOR FROM SPBETA PHAGE IN COMPLEX WITH 43 MER DNA organism=Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) : H : ASN ND2 A0030 <- 3.09 -> DG N7 D0036 : score 4.31992 : w : ASP OD2 A0036 <- 6.57 -> DA N6 D0035 : score 3.409 : H : ASN ND2 B0032 <- 2.47 -> DG O6 C0036 : score 6.0106 : H : ASN ND2 B0032 <- 2.91 -> DT O4 C0037 : score 5.16835 : x : ASN xxxx A0032 <- 2.90 -> DG xxx D0036 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0033 <- 3.99 -> DA xxx D0035 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0035 <- 3.75 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0030 <- 3.05 -> DG xxx C0036 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0033 <- 3.84 -> DA xxx C0035 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0035 <- 3.73 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx >6ht5_D:HMG-box; title=OCT4/SOX2:UTF1 STRUCTURE organism=? : H : ARG NH1 D0048 <- 2.95 -> DT O2 A0007 : score 4.17722 : H : ARG NH2 D0048 <- 3.14 -> DT O2 A0007 : score 3.94547 : x : ASN xxxx D0051 <- 3.24 -> DG xxx A0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0053 <- 3.62 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0054 <- 3.35 -> DA xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0061 <- 3.47 -> DA xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0073 <- 2.93 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0077 <- 3.03 -> DA xxx A0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0115 <- 2.37 -> DA xxx B0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0119 <- 3.76 -> DT xxx A0010 : score x.xxxxx >6ht5_DE:HMG-box;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=OCT4/SOX2:UTF1 STRUCTURE organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 D0048 <- 2.95 -> DT O2 A0007 : score 4.17722 : H : ARG NH2 D0048 <- 3.14 -> DT O2 A0007 : score 3.94547 : H : GLN OE1 E0176 <- 3.34 -> DA N6 A0009 : score 5.39889 : H : GLN NE2 E0176 <- 3.35 -> DA N7 A0009 : score 5.41987 : H : THR OG1 E0177 <- 3.31 -> DT O4 A0010 : score 3.49069 : H : THR OG1 E0177 <- 3.30 -> DC N4 B0008 : score 3.63 : H : ARG NH2 E0181 <- 3.28 -> DG N7 B0007 : score 5.77169 : H : ARG NH2 E0181 <- 2.89 -> DG O6 B0007 : score 6.4812 : x : ASN xxxx D0051 <- 3.24 -> DG xxx A0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0053 <- 3.62 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0054 <- 3.35 -> DA xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0061 <- 3.47 -> DA xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0073 <- 2.93 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0077 <- 3.03 -> DA xxx A0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0115 <- 2.37 -> DA xxx B0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0119 <- 3.76 -> DT xxx A0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0180 <- 3.85 -> DT xxx A0010 : score x.xxxxx >6hts_M:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN INO80 COMPLEX BOUND TO NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH2 M0040 <- 3.42 -> DG N3 Y0009 : score 3.16258 >6i1k_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CATALYTICALLY INACTIVE FNCAS12A IN COMPLEX WITH A CRRNA GUIDE AND A DSDNA TARGET organism=Francisella tularensis subsp. novicida (strain U112) / Francisella tularensis subsp. novicida (strain U112) : H : ASN OD1 A0305 <- 2.89 -> DG N2 a-017 : score 4.7136 : H : LYS NZ A0613 <- 3.19 -> DA N7 a0002 : score 2.70808 : H : LYS NZ A0671 <- 2.38 -> DA N3 a0002 : score 3.01018 >6i1l_D: title=CRYSTAL STRUCTURE OF FNCAS12A IN COMPLEX WITH A CRRNA GUIDE AND SSDNA TARGET organism=Francisella tularensis subsp. novicida (strain U112) / Francisella tularensis subsp. novicida (strain U112) : H : ASN ND2 D0305 <- 2.96 -> DG N3 F-017 : score 4.73824 : V : LYS CE D0397 <- 3.84 -> DT C7 F-019 : score 2.57502 : x : SER xxxx D0014 <- 4.00 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0185 <- 3.89 -> DT xxx F-003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0289 <- 4.18 -> DT xxx F-014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0296 <- 4.06 -> DA xxx F-015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0302 <- 3.98 -> DA xxx F-016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0306 <- 4.01 -> DG xxx F-017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0309 <- 3.42 -> DG xxx F-017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0400 <- 3.83 -> DA xxx F-020 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0401 <- 4.47 -> DA xxx F-020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0404 <- 3.85 -> DA xxx F-020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0410 <- 3.34 -> DA xxx F-020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0583 <- 4.45 -> DA xxx F-012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0584 <- 4.35 -> DA xxx F-012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0883 <- 3.73 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0968 <- 3.92 -> DC xxx F-010 : score x.xxxxx >6i52_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=YEAST RPA BOUND TO SSDNA organism=? : x : THR xxxx B0032 <- 3.30 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0033 <- 3.42 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0141 <- 4.31 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0143 <- 3.23 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0148 <- 3.18 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0150 <- 2.86 -> DT xxx D0021 : score x.xxxxx >6i52_BC:Nucleic_acid-binding_proteins; title=YEAST RPA BOUND TO SSDNA organism=? : H : LYS NZ C0477 <- 2.42 -> DT O2 D0018 : score 3.85981 : H : ARG NE C0518 <- 3.12 -> DT O2 D0013 : score 2.412 : H : ARG NH2 C0518 <- 2.41 -> DT O2 D0013 : score 4.56353 : V : TYR CB C0586 <- 3.76 -> DT C7 D0016 : score 4.91741 : V : MET CE C0572 <- 3.73 -> DT C7 D0021 : score 7.05154 : x : THR xxxx B0032 <- 3.30 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0033 <- 3.42 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0141 <- 4.31 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0143 <- 3.23 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0148 <- 3.18 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0150 <- 2.86 -> DT xxx D0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0492 <- 3.60 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0520 <- 3.38 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0533 <- 3.26 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0535 <- 3.45 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0537 <- 3.57 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0580 <- 3.52 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0582 <- 3.76 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0584 <- 3.41 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0591 <- 4.30 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0593 <- 3.21 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx >6i52_C:Nucleic_acid-binding_proteins; title=YEAST RPA BOUND TO SSDNA organism=? : H : LYS NZ C0477 <- 2.42 -> DT O2 D0018 : score 3.85981 : H : ARG NE C0518 <- 3.12 -> DT O2 D0013 : score 2.412 : H : ARG NH2 C0518 <- 2.41 -> DT O2 D0013 : score 4.56353 : V : TYR CB C0586 <- 3.76 -> DT C7 D0016 : score 4.91741 : V : MET CE C0572 <- 3.73 -> DT C7 D0021 : score 7.05154 : x : ASN xxxx C0492 <- 3.60 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0520 <- 3.38 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0533 <- 3.26 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0535 <- 3.45 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0537 <- 3.57 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0580 <- 3.52 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0582 <- 3.76 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0584 <- 3.41 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0591 <- 4.30 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0593 <- 3.21 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx >6i84_U:Histone-fold; title=STRUCTURE OF TRANSCRIBING RNA POLYMERASE II-NUCLEOSOME COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 U0045 <- 2.40 -> DC O2 T0134 : score 3.99462 : H : ARG NH2 U0045 <- 2.94 -> DC O2 T0135 : score 3.59515 >6i8a_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE POL2 CATALYTIC DOMAIN OF DNA POLYMERASE EPSILON CARRYING A P301R SUBSTITUTION. organism=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) : H : LYS NZ A0967 <- 2.99 -> DT O2 P0010 : score 3.45087 : H : ARG NH2 A0988 <- 3.32 -> DC O2 P0007 : score 3.31405 >6ide_A:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators;PYP-like_sensor_domain_PAS_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE VIBRIO CHOLERA VQMA-LIGAND-DNA COMPLEX PROVIDES MOLECULAR MECHANISMS FOR DRUG DESIGN organism=Vibrio cholerae : H : LYS NZ A0185 <- 2.64 -> DG O6 D0005 : score 5.96575 : H : LYS NZ A0185 <- 2.89 -> DG O6 D0006 : score 5.67672 : H : GLU OE1 A0188 <- 2.47 -> DC N4 C0013 : score 6.14863 : x : THR xxxx A0186 <- 3.59 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx >6ide_AB:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators;PYP-like_sensor_domain_PAS_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE VIBRIO CHOLERA VQMA-LIGAND-DNA COMPLEX PROVIDES MOLECULAR MECHANISMS FOR DRUG DESIGN organism=Vibrio cholerae : H : LYS NZ A0185 <- 2.64 -> DG O6 D0005 : score 5.96575 : H : LYS NZ A0185 <- 2.89 -> DG O6 D0006 : score 5.67672 : H : GLU OE1 A0188 <- 2.47 -> DC N4 C0013 : score 6.14863 : H : LYS NZ B0185 <- 2.85 -> DG O6 C0005 : score 5.72296 : x : THR xxxx A0186 <- 3.59 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0186 <- 3.90 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0188 <- 2.72 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx >6ido_B:Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF KLEBSIELLA PNEUMONIAE SIGMA4 OF SIGMAS FUSING WITH THE RNA POLYMERASE BETA-FLAP-TIP-HELIX IN COMPLEX WITH -35 ELEMENT DNA organism=ESCHERICHIA COLI, KLEBSIELLA PNEUMONIAE : H : ARG NH1 B0059 <- 2.35 -> DG N7 E0006 : score 6.5945 : V : GLU CB B0060 <- 3.51 -> DT C7 F0006 : score 1.7457 : x : LEU xxxx B0048 <- 3.92 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0058 <- 3.73 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0061 <- 3.47 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0063 <- 3.05 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0064 <- 3.29 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx >6ifm_B:AbrB/MazE/MraZ-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA BOUND VAPBC FROM SALMONELLA TYPHIMURIUM organism=? : H : ASN ND2 B0009 <- 2.20 -> DG O6 N0010 : score 6.31508 : H : ARG NE B0010 <- 3.12 -> DG N7 M0016 : score 4.1388 : H : ARG NH2 B0010 <- 2.86 -> DG N7 M0016 : score 6.308 : H : ARG NH2 B0010 <- 2.51 -> DG O6 M0016 : score 6.9828 : x : PHE xxxx B0006 <- 3.94 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0008 <- 3.37 -> DA xxx M0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0011 <- 3.56 -> DA xxx M0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0015 <- 3.57 -> DA xxx N0006 : score x.xxxxx >6ifm_BDFH:AbrB/MazE/MraZ-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA BOUND VAPBC FROM SALMONELLA TYPHIMURIUM organism=? : H : ASN ND2 B0009 <- 2.20 -> DG O6 N0010 : score 6.31508 : H : ARG NE B0010 <- 3.12 -> DG N7 M0016 : score 4.1388 : H : ARG NH2 B0010 <- 2.86 -> DG N7 M0016 : score 6.308 : H : ARG NH2 B0010 <- 2.51 -> DG O6 M0016 : score 6.9828 : H : ASN ND2 D0009 <- 2.71 -> DT O4 M0005 : score 5.37974 : H : ARG NH2 D0015 <- 3.04 -> DA N7 N0019 : score 1.59155 : H : SER OG F0008 <- 2.92 -> DA N6 N0019 : score 3.21079 : H : ARG NH2 F0010 <- 2.37 -> DG N7 N0016 : score 6.93369 : H : ARG NH2 F0010 <- 2.73 -> DG O6 N0016 : score 6.6924 : x : PHE xxxx B0006 <- 3.94 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0008 <- 3.37 -> DA xxx M0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0011 <- 3.56 -> DA xxx M0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0015 <- 3.57 -> DA xxx N0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0006 <- 3.99 -> DT xxx M0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0009 <- 3.04 -> DT xxx M0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0011 <- 3.45 -> DA xxx N0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0015 <- 3.65 -> DA xxx M0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0006 <- 4.47 -> DT xxx M0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0008 <- 3.68 -> DT xxx N0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0009 <- 2.79 -> DT xxx M0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0010 <- 3.21 -> DT xxx N0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0011 <- 3.30 -> DT xxx N0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0015 <- 3.78 -> DC xxx M0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0006 <- 4.22 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0008 <- 3.99 -> DA xxx M0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0011 <- 3.74 -> DG xxx M0004 : score x.xxxxx >6ig1_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=DNA POLYMERASE IV - DNA TERNARY COMPLEX 10 organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : w : GLU OE2 A0246 <- 5.66 -> DG N7 B0842 : score 2.669 : w : LYS NZ A0289 <- 6.24 -> DG N7 B0842 : score 2.519 : w : GLU OE2 A0301 <- 6.16 -> DA N7 C0867 : score 1.687 : x : VAL xxxx A0040 <- 3.35 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 3.68 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0056 <- 3.72 -> DA xxx B0840 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0285 <- 4.20 -> DT xxx C0866 : score x.xxxxx >6iid_B:His-Me_finger_endonucleases; title=HUMAN EXOG-H140A IN COMPLEX WITH RNA-DNA CHIMERIC DUPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0315 <- 2.91 -> DG O6 H0012 : score 5.65359 : x : PHE xxxx B0168 <- 3.60 -> DC xxx H0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0172 <- 3.46 -> DG xxx H0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0176 <- 3.38 -> DG xxx H0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0307 <- 4.06 -> DG xxx H0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0311 <- 3.69 -> DG xxx H0012 : score x.xxxxx >6iis_A:Tudor/PWWP/MBT; title=COMPLEX STRUCTURE OF THE HRP3 PWWP DOMAIN WITH BOTH A 16-BP TA-RICH DNA AND AN H3K36ME3-CONTAINING HISTONE PEPTIDE organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0077 <- 3.10 -> DT O2 D0001 : score 3.37195 >6iis_AB:Tudor/PWWP/MBT; title=COMPLEX STRUCTURE OF THE HRP3 PWWP DOMAIN WITH BOTH A 16-BP TA-RICH DNA AND AN H3K36ME3-CONTAINING HISTONE PEPTIDE organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0077 <- 3.10 -> DT O2 D0001 : score 3.37195 : x : LYS xxxx B0077 <- 3.51 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx >6iit_AB:Tudor/PWWP/MBT; title=COMPLEX STRUCTURE OF THE HRP3 PWWP DOMAIN WITH BOTH A 16-BP TA-RICH DNA AND AN H3K36ME2-CONTAINING HISTONE PEPTIDE organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx B0077 <- 3.45 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx >6iit_B:Tudor/PWWP/MBT; title=COMPLEX STRUCTURE OF THE HRP3 PWWP DOMAIN WITH BOTH A 16-BP TA-RICH DNA AND AN H3K36ME2-CONTAINING HISTONE PEPTIDE organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx B0077 <- 3.45 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx >6ik9_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH Q151M/G112S/D113A/Y115F/F116Y/F160L/I159L:DNA:DGTP TERNARY COMPLEX organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH A0183 <- 3.04 -> DG N2 E0032 : score 4.65504 : H : TYR OH A0183 <- 2.64 -> DG N3 E0032 : score 3.21375 : V : TRP CD1 A0024 <- 3.62 -> DT C7 E-001 : score 7.66333 : x : PHE xxxx A0061 <- 3.61 -> DC xxx E0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.35 -> DC xxx E0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0078 <- 4.05 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.26 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.99 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.72 -> DC xxx E0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.35 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.65 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0266 <- 3.74 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0269 <- 2.89 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0346 <- 4.48 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx >6ik9_C:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH Q151M/G112S/D113A/Y115F/F116Y/F160L/I159L:DNA:DGTP TERNARY COMPLEX organism=? : H : TYR OH C0183 <- 3.06 -> DG N2 F0032 : score 4.63548 : H : TYR OH C0183 <- 2.64 -> DG N3 F0032 : score 3.21375 : w : ASN ND2 C0265 <- 5.62 -> DC O2 F0006 : score 1.885 : x : TRP xxxx C0024 <- 3.22 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0061 <- 3.81 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0074 <- 3.39 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0076 <- 3.81 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0078 <- 3.41 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0094 <- 3.30 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.13 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.45 -> DC xxx F0033 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.84 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0501 <- 3.77 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx >6ik9_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH Q151M/G112S/D113A/Y115F/F116Y/F160L/I159L:DNA:DGTP TERNARY COMPLEX organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH C0183 <- 3.06 -> DG N2 F0032 : score 4.63548 : H : TYR OH C0183 <- 2.64 -> DG N3 F0032 : score 3.21375 : w : ASN ND2 C0265 <- 5.62 -> DC O2 F0006 : score 1.885 : x : TRP xxxx C0024 <- 3.22 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0061 <- 3.81 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0074 <- 3.39 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0076 <- 3.81 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0078 <- 3.41 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0094 <- 3.30 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.13 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.45 -> DC xxx F0033 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.84 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0501 <- 3.77 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx >6ika_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH Q151M/G112S/D113A/Y115F/F116Y/F160L/I159L:DNA:ENTECAVIR-TRIPHOSPHATE TERNARY COMPLEX organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 / HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 3.03 -> DG N2 E0032 : score 4.66482 : H : TYR OH A0183 <- 2.72 -> DG N3 E0032 : score 3.16393 : x : TRP xxxx A0024 <- 3.49 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0061 <- 3.58 -> DC xxx E0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.43 -> DC xxx E0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0076 <- 4.49 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0078 <- 3.38 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.38 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.04 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.08 -> DC xxx E0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.45 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.48 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0266 <- 3.02 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0269 <- 3.34 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0346 <- 3.99 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx >6ika_B:DNA/RNA_polymerases; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH Q151M/G112S/D113A/Y115F/F116Y/F160L/I159L:DNA:ENTECAVIR-TRIPHOSPHATE TERNARY COMPLEX organism=? : x : TRP xxxx B0266 <- 3.02 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0269 <- 3.34 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0346 <- 3.99 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx >6ika_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH Q151M/G112S/D113A/Y115F/F116Y/F160L/I159L:DNA:ENTECAVIR-TRIPHOSPHATE TERNARY COMPLEX organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 / HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH C0183 <- 3.08 -> DG N2 F0032 : score 4.61592 : H : TYR OH C0183 <- 2.80 -> DG N3 F0032 : score 3.1141 : V : TRP CD1 C0024 <- 3.78 -> DT C7 F-001 : score 7.37 : x : PHE xxxx C0061 <- 3.64 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0074 <- 3.30 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0076 <- 3.93 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0078 <- 3.38 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0094 <- 3.40 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.29 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.71 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.41 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.97 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0501 <- 3.89 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx >6imj_A:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF SE-ASFVLIG:DNA COMPLEX organism=African swine fever virus : H : ARG NH1 A0109 <- 3.36 -> DG N7 D0008 : score 5.3724 : H : ARG NH2 A0109 <- 3.00 -> DG O6 D0008 : score 6.336 : x : LYS xxxx A0089 <- 4.29 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx >6imj_AB:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF SE-ASFVLIG:DNA COMPLEX organism=African swine fever virus : H : ARG NH1 A0109 <- 3.36 -> DG N7 D0008 : score 5.3724 : H : ARG NH2 A0109 <- 3.00 -> DG O6 D0008 : score 6.336 : H : ARG NH1 B0109 <- 3.33 -> DG N7 C0006 : score 5.4087 : H : ARG NH2 B0109 <- 3.04 -> DG O6 C0006 : score 6.2832 : x : LYS xxxx A0089 <- 4.29 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0089 <- 3.89 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0113 <- 4.45 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx >6imk_A:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVLIG:CG COMPLEX organism=African swine fever virus : w : ARG NH1 A0074 <- 6.38 -> DT O2 C0005 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0074 <- 6.03 -> DT O2 C0005 : score 2.261 : w : ASN ND2 A0219 <- 6.21 -> DC O2 C0014 : score 1.885 : H : LYS NZ A0337 <- 3.07 -> DG N3 C0008 : score 1.37534 : x : GLN xxxx A0403 <- 4.17 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx >6iml_A:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVLIG:CT1 COMPLEX organism=African swine fever virus : w : ASN OD1 A0086 <- 5.55 -> DG N3 D0006 : score 3.377 : w : ASN OD1 A0308 <- 5.92 -> DG O6 C0008 : score 3.125 : H : LYS NZ A0337 <- 3.15 -> DG N3 C0008 : score 1.35208 : w : LYS NZ A0337 <- 5.71 -> DG N3 E0016 : score 2.232 : x : ASN xxxx A0219 <- 3.59 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0403 <- 3.61 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx >6imn_B:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVLIG:CT2 COMPLEX organism=African swine fever virus : H : LYS NZ B0337 <- 2.83 -> DG N3 C0008 : score 1.44512 : H : GLN NE2 B0403 <- 3.12 -> DT O2 D0012 : score 3.6816 : x : ARG xxxx B0172 <- 3.97 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0219 <- 4.34 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx >6inq_ABEbcdef:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME, WITH FOREIGN DNA (+1 POSITION) organism=HOMO SAPIENS : H : THR OG1 A0832 <- 2.99 -> DC O2 T0033 : score 2.52587 : H : LYS NZ B0500 <- 3.29 -> DA N3 T0032 : score 2.50478 : H : ARG NH2 e0040 <- 2.45 -> DG N3 T0009 : score 3.86297 : V : LYS CG A0318 <- 3.55 -> DT C7 N-043 : score 2.25141 : x : ARG xxxx A0351 <- 4.42 -> DC xxx T0035 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0833 <- 3.68 -> DC xxx T0033 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0463 <- 3.85 -> DG xxx N-042 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0498 <- 3.14 -> DA xxx T0032 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0524 <- 2.70 -> DC xxx T0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx c0077 <- 4.29 -> DG xxx N0057 : score x.xxxxx >6inq_gh:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME, WITH FOREIGN DNA (+1 POSITION) organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx g0042 <- 4.31 -> DA xxx 00038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx g0077 <- 4.16 -> DA xxx 00057 : score x.xxxxx >6iod_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=THE STRUCTURE OF UDGX IN COMPLEX WITH SINGLE-STRANDED DNA organism=Mycobacterium smegmatis MC2 155 : w : THR OG1 A0111 <- 5.91 -> DG N7 C0010 : score 3.422 >6iod_AB:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=THE STRUCTURE OF UDGX IN COMPLEX WITH SINGLE-STRANDED DNA organism=Mycobacterium smegmatis MC2 155 : w : THR OG1 A0111 <- 5.91 -> DG N7 C0010 : score 3.422 >6ipu_A:Histone-fold; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING 145 BP OF DNA organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.92 -> DA N3 J0009 : score 3.16199 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.19 -> DT xxx J-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.68 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.77 -> DA xxx J0025 : score x.xxxxx >6ipu_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING 145 BP OF DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.92 -> DA N3 J0009 : score 3.16199 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.19 -> DA N3 I0009 : score 2.98704 : H : ARG NH2 G0042 <- 3.18 -> DT O2 I0038 : score 3.9116 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.19 -> DT xxx J-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.68 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.77 -> DA xxx J0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.13 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.23 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.98 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.76 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.77 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.27 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0036 <- 3.75 -> DT xxx I0049 : score x.xxxxx >6iq4_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE CROSS-LINKED WITH A HETERO-BINUCLEAR MOLECULE POSSESSING RAPTA AND GOLD(I) 4-(DIPHENYLPHOSPHINO)BENZOIC ACID GROUPS. organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.00 -> DA N3 J0009 : score 3.11015 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.22 -> DA N3 I0009 : score 3.37276 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.31 -> DA N3 I0009 : score 2.90929 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.95 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.87 -> DA xxx J0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.27 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.45 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.89 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.84 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.91 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.35 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.39 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0036 <- 3.54 -> DT xxx I0049 : score x.xxxxx >6iq4_G:Histone-fold; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE CROSS-LINKED WITH A HETERO-BINUCLEAR MOLECULE POSSESSING RAPTA AND GOLD(I) 4-(DIPHENYLPHOSPHINO)BENZOIC ACID GROUPS. organism=? : x : ARG xxxx G0042 <- 3.35 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx >6ir8_A:WRKY_DNA-binding_domain; title=RICE WRKY/DNA COMPLEX organism=ORYZA SATIVA JAPONICA GROUP : H : LYS NZ A0129 <- 2.82 -> DG O6 C0005 : score 5.75765 : w : LYS NZ A0129 <- 5.84 -> DA N6 B0009 : score 2.097 : V : GLN CB A0128 <- 3.71 -> DT C7 B0007 : score 1.87511 : x : ARG xxxx A0124 <- 3.49 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0125 <- 4.16 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0126 <- 4.31 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0140 <- 3.73 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx >6ir9_e:Histone-fold; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH ELF1 AND SPT4/5, STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH2 e0040 <- 2.45 -> DG N3 T0009 : score 3.86297 >6iro_A:Histone-fold; title=THE CROSSLINKED COMPLEX OF ISWI-NUCLEOSOME IN THE ADP-BOUND STATE organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.41 -> DG N3 I0083 : score 3.16981 : x : ARG xxxx A0083 <- 4.19 -> DC xxx J0049 : score x.xxxxx >6irq_A:Nucleic_acid-binding_proteins; title=COMPLEXED CRYSTAL STRUCTURE OF PASSB WITH SSDNA DT25 AT 1.91 ANGSTROM RESOLUTION organism=Pseudomonas aeruginosa PAO1 : H : THR OG1 A0033 <- 2.90 -> DT N3 E0007 : score 2.29797 : H : THR OG1 A0052 <- 3.41 -> DT O4 E0008 : score 3.41294 : H : ARG NH2 A0086 <- 2.65 -> DT O4 E0004 : score 3.66046 : V : TRP CD1 A0054 <- 3.50 -> DT C7 E0007 : score 7.88333 >6irq_ABCD:Nucleic_acid-binding_proteins; title=COMPLEXED CRYSTAL STRUCTURE OF PASSB WITH SSDNA DT25 AT 1.91 ANGSTROM RESOLUTION organism=Pseudomonas aeruginosa PAO1 : H : GLU OE2 A0080 <- 2.91 -> DT N3 F0016 : score 2.57791 : H : THR OG1 B0052 <- 3.50 -> DT O4 F0008 : score 3.34297 : V : THR CG2 B0033 <- 3.66 -> DT C7 F0007 : score 4.38522 : V : ASN CB A0106 <- 3.75 -> DT C7 F0016 : score 1.96165 >6is7_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF 9N-I DNA POLYMERASE INCORPORATION WITH DA IN THE ACTIVE SITE organism=THERMOCOCCUS SP. 9ON-7 : H : LYS NZ A0592 <- 3.10 -> DC O2 C0001 : score 2.76938 : H : ARG NH1 A0612 <- 3.12 -> DA N3 C-001 : score 3.4464 : x : TYR xxxx A0494 <- 3.75 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx >6is8_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZMMOC1 D115N MUTANT IN COMPLEX WITH HOLLIDAY JUNCTION organism=Zea mays : H : ASP OD1 A0182 <- 2.86 -> DC N4 D0025 : score 5.28073 : H : GLN NE2 A0214 <- 3.08 -> DA N3 D0023 : score 3.80142 : w : GLN NE2 A0214 <- 6.13 -> DC O2 D0024 : score 2.699 : w : GLU OE2 B0145 <- 5.32 -> DC N4 D0019 : score 3.597 : H : ASP OD1 B0182 <- 2.92 -> DC N4 C0025 : score 5.21659 : w : ASP OD2 B0182 <- 5.48 -> DC O2 C0026 : score 1.919 : w : GLN NE2 B0214 <- 6.00 -> DC O2 C0024 : score 2.699 : x : SER xxxx A0144 <- 3.63 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0177 <- 4.03 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0178 <- 4.38 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0179 <- 3.47 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0180 <- 3.31 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0184 <- 3.93 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0185 <- 3.18 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0144 <- 3.68 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0177 <- 3.90 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0178 <- 4.39 -> DC xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0179 <- 3.46 -> DC xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0180 <- 3.49 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0184 <- 3.99 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0185 <- 3.19 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >6is8_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZMMOC1 D115N MUTANT IN COMPLEX WITH HOLLIDAY JUNCTION organism=Zea mays : w : GLU OE2 B0145 <- 5.32 -> DC N4 D0019 : score 3.597 : H : ASP OD1 B0182 <- 2.92 -> DC N4 C0025 : score 5.21659 : w : ASP OD2 B0182 <- 5.48 -> DC O2 C0026 : score 1.919 : w : GLN NE2 B0214 <- 6.00 -> DC O2 C0024 : score 2.699 : x : SER xxxx B0144 <- 3.68 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0177 <- 3.90 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0178 <- 4.39 -> DC xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0179 <- 3.46 -> DC xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0180 <- 3.49 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0184 <- 3.99 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0185 <- 3.19 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >6isf_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF 9N-I DNA POLYMERASE INCORPORATION WITH DT IN THE ACTIVE SITE organism=Thermococcus sp. 9oN-7 : H : LYS NZ A0592 <- 2.74 -> DC O2 C0001 : score 2.98151 : H : ARG NH1 A0612 <- 2.96 -> DA N3 C-001 : score 3.56423 : H : ARG NH2 A0612 <- 2.84 -> DT O2 C-002 : score 4.19947 : x : TYR xxxx A0494 <- 4.00 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0614 <- 4.30 -> DT xxx C-002 : score x.xxxxx >6isg_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF 9N-I DNA POLYMERASE INCORPORATION WITH DG IN THE ACTIVE SITE organism=Thermococcus sp. 9oN-7 : H : LYS NZ A0592 <- 2.69 -> DC O2 C0001 : score 3.01097 : x : TYR xxxx A0494 <- 4.07 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0612 <- 4.22 -> DT xxx C-002 : score x.xxxxx >6ish_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF 9N-I DNA POLYMERASE INCORPORATION WITH 3'-AL IN THE ACTIVE SITE organism=Thermococcus sp. 9oN-7 : H : ARG NH2 A0612 <- 3.26 -> DA N3 C-001 : score 2.94169 : x : LYS xxxx A0592 <- 3.34 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx >6isi_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF 9N-I DNA POLYMERASE INCORPORATION WITH 3'-CL IN THE ACTIVE SITE organism=Thermococcus sp. 9oN-7 : x : TYR xxxx A0494 <- 4.40 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0592 <- 3.21 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0612 <- 3.48 -> DT xxx C-002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0614 <- 4.20 -> DT xxx C-002 : score x.xxxxx >6iy2_A:Histone-fold; title=STRUCTURE OF SNF2-MMTV-A NUCLEOSOME COMPLEX AT SHL2 IN ADP STATE organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 3.29 -> DG N3 I0083 : score 3.25645 >6iy2_G:Histone-fold; title=STRUCTURE OF SNF2-MMTV-A NUCLEOSOME COMPLEX AT SHL2 IN ADP STATE organism=? : H : LYS NZ G0013 <- 3.40 -> DT O2 J0117 : score 3.15672 : H : LYS NZ G0013 <- 2.56 -> DC O2 J0118 : score 3.08757 >6iy3_D:Histone-fold; title=STRUCTURE OF SNF2-MMTV-A NUCLEOSOME COMPLEX AT SHL-2 IN ADP STATE organism=? : H : ARG NH2 D0033 <- 3.34 -> DC O2 J0027 : score 3.29926 >6j4e_B:WRKY_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ATWRKY1 DOMAIN organism=Arabidopsis thaliana : x : ARG xxxx B0117 <- 3.81 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0118 <- 4.00 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0121 <- 4.05 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0122 <- 2.88 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0133 <- 3.82 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >6j4f_F:WRKY_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ATWRKY2 DOMAIN organism=Arabidopsis thaliana : H : LYS NZ F0284 <- 3.09 -> DG N7 H0006 : score 5.07352 : H : LYS NZ F0284 <- 3.27 -> DG N7 H0007 : score 4.87962 : H : LYS NZ F0284 <- 2.44 -> DG O6 H0007 : score 6.19698 : V : ARG CG F0279 <- 3.59 -> DT C7 G0005 : score 1.0579 : x : LYS xxxx F0280 <- 3.72 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0281 <- 4.45 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0283 <- 3.94 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0295 <- 3.81 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx >6j4g_B:WRKY_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ATWRKY33 DOMAIN organism=Arabidopsis thaliana : H : LYS NZ B0195 <- 2.68 -> DG O6 D0007 : score 5.91951 : V : ARG CG B0190 <- 3.79 -> DT C7 C0005 : score 1.00764 : x : LYS xxxx B0191 <- 4.05 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0194 <- 4.22 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0206 <- 3.67 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >6j4r_AD:Homeodomain-like; title=STRUCTURAL BASIS FOR THE TARGET DNA RECOGNITION AND BINDING BY THE MYB DOMAIN OF PHOSPHATE STARVATION RESPONSE REGULATOR 1 organism=Arabidopsis thaliana : H : ARG NH1 A0227 <- 3.17 -> DT O2 F0008 : score 3.98774 : w : LYS NZ A0271 <- 6.54 -> DC N4 F0002 : score 0.048 : H : SER OG A0272 <- 2.99 -> DA N7 E0006 : score 4.29447 : H : SER OG D0272 <- 3.00 -> DA N7 F0007 : score 4.28554 : V : LYS CG D0271 <- 3.72 -> DT C7 E0002 : score 2.16135 : x : GLN xxxx A0275 <- 3.05 -> DA xxx F0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0276 <- 4.35 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0227 <- 3.64 -> DA xxx F0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0275 <- 3.04 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx >6j4r_BC:Homeodomain-like; title=STRUCTURAL BASIS FOR THE TARGET DNA RECOGNITION AND BINDING BY THE MYB DOMAIN OF PHOSPHATE STARVATION RESPONSE REGULATOR 1 organism=Arabidopsis thaliana : H : LYS NZ B0271 <- 2.74 -> DG O6 X0002 : score 5.85014 : H : SER OG B0272 <- 3.05 -> DA N7 Y0007 : score 4.2409 : H : LYS NZ C0271 <- 2.56 -> DG O6 Y0003 : score 6.05825 : H : SER OG C0272 <- 2.94 -> DA N7 X0006 : score 4.33911 : H : GLN OE1 C0275 <- 3.02 -> DA N6 Y0005 : score 5.78625 : H : GLN NE2 C0275 <- 2.89 -> DA N7 Y0005 : score 5.98013 : x : ARG xxxx B0227 <- 3.26 -> DT xxx Y0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0268 <- 4.27 -> DT xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0275 <- 2.99 -> DA xxx X0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0276 <- 4.24 -> DT xxx Y0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0227 <- 3.56 -> DA xxx Y0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0276 <- 3.84 -> DT xxx X0005 : score x.xxxxx >6j4r_D:Homeodomain-like; title=STRUCTURAL BASIS FOR THE TARGET DNA RECOGNITION AND BINDING BY THE MYB DOMAIN OF PHOSPHATE STARVATION RESPONSE REGULATOR 1 organism=Arabidopsis thaliana : H : SER OG D0272 <- 3.00 -> DA N7 F0007 : score 4.28554 : V : LYS CG D0271 <- 3.72 -> DT C7 E0002 : score 2.16135 : x : ARG xxxx D0227 <- 3.64 -> DA xxx F0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0275 <- 3.04 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx >6j4w_e:Histone-fold; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH ELF1 AND SPT4/5, STALLED AT SHL(-5) OF THE NUCLEOSOME organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx e0040 <- 3.09 -> DG xxx N-008 : score x.xxxxx >6j4x_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH ELF1 AND SPT4/5, STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME (+1A) organism=? : H : LYS NZ A0318 <- 2.56 -> DG O6 N-042 : score 6.05825 : H : LYS NZ A0318 <- 2.56 -> DG O6 N-042 : score 6.05825 : H : LYS NZ A0318 <- 3.00 -> DC N3 T0042 : score 0.557538 : H : LYS NZ A0318 <- 3.00 -> DC N3 T0042 : score 0.557538 : x : ARG xxxx A1389 <- 3.56 -> DG xxx T0028 : score x.xxxxx >6j4z_EWabcdef:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH SPT4/5 AND FOREIGN DNA, STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH2 e0040 <- 2.45 -> DG N3 T0009 : score 3.86297 : x : ARG xxxx a0040 <- 4.29 -> DC xxx T-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a0083 <- 4.06 -> DA xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx c0077 <- 4.29 -> DG xxx N0057 : score x.xxxxx >6j4z_gh:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH SPT4/5 AND FOREIGN DNA, STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx g0042 <- 4.31 -> DA xxx 00038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx g0077 <- 4.16 -> DA xxx 00057 : score x.xxxxx >6j50_BEbc:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH SPT4/5 AND FOREIGN DNA, STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME (TILTED CONFORMATION) organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0419 <- 2.60 -> DC xxx N-040 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0463 <- 3.85 -> DT xxx N-041 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0464 <- 4.45 -> DT xxx N-038 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0498 <- 3.70 -> DA xxx T0032 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0500 <- 3.51 -> DA xxx N-031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx c0077 <- 4.29 -> DG xxx N0057 : score x.xxxxx >6j50_adef:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH SPT4/5 AND FOREIGN DNA, STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME (TILTED CONFORMATION) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 e0040 <- 2.45 -> DG N3 T0009 : score 3.86297 : x : ARG xxxx a0040 <- 4.29 -> DC xxx T-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a0083 <- 4.06 -> DA xxx N0026 : score x.xxxxx >6j50_gh:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH SPT4/5 AND FOREIGN DNA, STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME (TILTED CONFORMATION) organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx g0042 <- 4.31 -> DA xxx 00038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx g0077 <- 4.16 -> DA xxx 00057 : score x.xxxxx >6j51_g:Histone-fold; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH SPT4/5 AND FOREIGN DNA, STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME, WEAK ELF1 (+1 POSITION) organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx g0042 <- 4.31 -> DA xxx 00038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx g0077 <- 4.16 -> DA xxx 00057 : score x.xxxxx >6j51_gh:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH SPT4/5 AND FOREIGN DNA, STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME, WEAK ELF1 (+1 POSITION) organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx g0042 <- 4.31 -> DA xxx 00038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx g0077 <- 4.16 -> DA xxx 00057 : score x.xxxxx >6j5b_AD:Homeodomain-like; title=STRUCTURAL BASIS FOR THE TARGET DNA RECOGNITION AND BINDING BY THE MYB DOMAIN OF PHOSPHATE STARVATION RESPONSE REGULATOR 1 organism=Arabidopsis thaliana : H : LYS NZ A0271 <- 3.07 -> DG N7 U0007 : score 5.09506 : H : LYS NZ A0271 <- 2.69 -> DG O6 U0007 : score 5.90795 : H : SER OG A0272 <- 2.94 -> DA N7 B0011 : score 4.33911 : H : LYS NZ D0271 <- 3.00 -> DG N7 B0007 : score 5.17046 : H : LYS NZ D0271 <- 2.80 -> DG O6 B0007 : score 5.78077 : H : SER OG D0272 <- 3.05 -> DA N7 U0011 : score 4.2409 : V : GLN CG D0275 <- 3.87 -> DT C7 B0008 : score 3.19842 : x : ARG xxxx A0227 <- 3.51 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0275 <- 2.99 -> DA xxx U0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0276 <- 4.08 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0227 <- 3.60 -> DT xxx U0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0276 <- 4.03 -> DT xxx U0010 : score x.xxxxx >6j5b_C:Homeodomain-like; title=STRUCTURAL BASIS FOR THE TARGET DNA RECOGNITION AND BINDING BY THE MYB DOMAIN OF PHOSPHATE STARVATION RESPONSE REGULATOR 1 organism=Arabidopsis thaliana : H : LYS NZ C0271 <- 3.23 -> DG N7 G0007 : score 4.92271 : H : LYS NZ C0271 <- 2.69 -> DG O6 G0007 : score 5.90795 : H : SER OG C0272 <- 2.94 -> DA N7 E0011 : score 4.33911 : x : ARG xxxx C0227 <- 3.37 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0275 <- 2.91 -> DA xxx G0009 : score x.xxxxx >6j5b_CF:Homeodomain-like; title=STRUCTURAL BASIS FOR THE TARGET DNA RECOGNITION AND BINDING BY THE MYB DOMAIN OF PHOSPHATE STARVATION RESPONSE REGULATOR 1 organism=Arabidopsis thaliana : H : LYS NZ C0271 <- 3.23 -> DG N7 G0007 : score 4.92271 : H : LYS NZ C0271 <- 2.69 -> DG O6 G0007 : score 5.90795 : H : SER OG C0272 <- 2.94 -> DA N7 E0011 : score 4.33911 : H : LYS NZ F0271 <- 2.62 -> DG O6 E0007 : score 5.98888 : H : SER OG F0272 <- 3.13 -> DA N7 G0011 : score 4.16947 : V : GLN CG F0275 <- 3.66 -> DT C7 E0008 : score 3.36932 : x : ARG xxxx C0227 <- 3.37 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0275 <- 2.91 -> DA xxx G0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0227 <- 3.43 -> DT xxx G0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0276 <- 4.23 -> DT xxx G0010 : score x.xxxxx >6j5b_HJ:Homeodomain-like; title=STRUCTURAL BASIS FOR THE TARGET DNA RECOGNITION AND BINDING BY THE MYB DOMAIN OF PHOSPHATE STARVATION RESPONSE REGULATOR 1 organism=Arabidopsis thaliana : H : LYS NZ H0271 <- 3.31 -> DG N7 K0007 : score 4.83654 : H : LYS NZ H0271 <- 2.67 -> DG O6 K0007 : score 5.93107 : H : SER OG H0272 <- 2.93 -> DA N7 I0011 : score 4.34804 : H : LYS NZ J0271 <- 2.66 -> DG O6 I0007 : score 5.94263 : H : SER OG J0272 <- 3.15 -> DA N7 K0011 : score 4.15162 : V : GLN CG J0275 <- 3.70 -> DT C7 I0008 : score 3.33677 : x : ARG xxxx H0227 <- 3.31 -> DT xxx K0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0275 <- 2.90 -> DA xxx K0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0276 <- 4.20 -> DT xxx I0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0227 <- 3.50 -> DT xxx K0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0276 <- 4.03 -> DT xxx K0010 : score x.xxxxx >6j99_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN DOT1L IN COMPLEX WITH AN H2B- MONOUBIQUITINATED NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 A0040 <- 2.55 -> DT O2 J0083 : score 4.52173 : H : ARG NH1 D0030 <- 3.26 -> DC O2 J0123 : score 3.3142 : H : ARG NH2 D0030 <- 3.12 -> DG N3 J0122 : score 3.3792 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.36 -> DC O2 I0084 : score 3.2412 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.44 -> DC xxx I0143 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.11 -> DG xxx J0092 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.09 -> DG xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.27 -> DA xxx J0080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.33 -> DG xxx J0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 3.74 -> DG xxx J0131 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.15 -> DC xxx I0092 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.65 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.75 -> DC xxx I0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.84 -> DG xxx J0037 : score x.xxxxx >6j99_D:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN DOT1L IN COMPLEX WITH AN H2B- MONOUBIQUITINATED NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH1 D0030 <- 3.26 -> DC O2 J0123 : score 3.3142 : H : ARG NH2 D0030 <- 3.12 -> DG N3 J0122 : score 3.3792 >6j9a_A:DNA-binding_pseudobarrel_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARABIDOPSIS THALIANA VAL1 IN COMPLEX WITH FLC DNA FRAGMENT organism=Arabidopsis thaliana : H : ARG NH1 A0309 <- 2.70 -> DG N7 B0006 : score 6.171 : H : ARG NH2 A0309 <- 2.72 -> DG O6 B0006 : score 6.7056 : H : ASN OD1 A0351 <- 2.39 -> DC N4 C0005 : score 4.53746 : H : ASN ND2 A0351 <- 3.04 -> DT O4 B0009 : score 5.03095 : x : SER xxxx A0302 <- 3.58 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0311 <- 4.11 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0349 <- 3.43 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0352 <- 3.71 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0356 <- 3.15 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx >6j9b_A:DNA-binding_pseudobarrel_domain; title=ARABIDOPSIS FUS3-DNA COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : H : ARG NH1 A0106 <- 2.72 -> DG N7 B0006 : score 6.1468 : H : ARG NH2 A0106 <- 3.04 -> DG O6 B0006 : score 6.2832 : w : ARG NH2 A0106 <- 5.16 -> DG O6 C0008 : score 2.468 : H : ASN ND2 A0149 <- 2.82 -> DT O4 B0009 : score 5.26348 : H : MET SD A0154 <- 3.03 -> DA N6 C0006 : score 5.70076 : w : MET SD A0154 <- 6.43 -> DA N6 B0008 : score 3.968 : V : LEU CD2 A0104 <- 3.70 -> DT C7 B0005 : score 5.87456 : V : ILE CG1 A0108 <- 3.85 -> DT C7 C0007 : score 4.89699 : x : LYS xxxx A0097 <- 2.95 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0099 <- 4.09 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0147 <- 3.07 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0150 <- 4.18 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx >6j9c_D:DNA-binding_pseudobarrel_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARABIDOPSIS THALIANA TRANSCRIPTION FACTOR LEC2- DNA COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : H : ARG NH1 D0185 <- 2.51 -> DG O6 E0007 : score 6.43617 : H : ARG NH2 D0185 <- 2.82 -> DG N7 E0007 : score 6.35908 : H : ASN OD1 D0228 <- 2.72 -> DC N4 F0006 : score 4.26069 : H : ASN ND2 D0228 <- 3.19 -> DA N7 E0009 : score 5.41261 : H : ASN ND2 D0228 <- 3.23 -> DT O4 E0010 : score 4.83014 : x : SER xxxx D0178 <- 4.41 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0226 <- 3.15 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0233 <- 3.15 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx >6j9e_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF XANTHOMONOS ORYZAE TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX WITH NUSA AND THE BACTERIOPHAGE PROTEIN P7 organism=XANTHOMONAS ORYZAE PV. ORYZAE PXO99A : H : ARG NE C0479 <- 2.99 -> DG O6 H0016 : score 3.79127 : x : ARG xxxx C0156 <- 3.51 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0188 <- 3.13 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0204 <- 3.52 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0473 <- 3.46 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0566 <- 4.12 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0570 <- 4.09 -> DA xxx H0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0575 <- 3.44 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx >6j9e_CD: title=CRYO-EM STRUCTURE OF XANTHOMONOS ORYZAE TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX WITH NUSA AND THE BACTERIOPHAGE PROTEIN P7 organism=XANTHOMONAS ORYZAE PV. ORYZAE PXO99A : H : ARG NE C0479 <- 2.99 -> DG O6 H0016 : score 3.79127 : V : TYR CD2 D0046 <- 3.81 -> DT C7 H0005 : score 3.73218 : x : ARG xxxx C0156 <- 3.51 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0188 <- 3.13 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0204 <- 3.52 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0473 <- 3.46 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0566 <- 4.12 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0570 <- 4.09 -> DA xxx H0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0575 <- 3.44 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0120 <- 3.58 -> DG xxx H0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 3.58 -> DA xxx H0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 4.35 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0791 <- 3.59 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0792 <- 4.16 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx >6j9f_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF XANTHOMONOS ORYZAE TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX WITH THE BACTERIOPHAGE PROTEIN P7 organism=XANTHOMONAS ORYZAE PV. ORYZAE MAFF 311018 : H : ARG NE C0479 <- 2.81 -> DG O6 H0016 : score 3.93314 : x : ARG xxxx C0156 <- 3.86 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0188 <- 3.23 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0204 <- 4.02 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0205 <- 4.14 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0473 <- 3.54 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0566 <- 3.92 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0570 <- 4.10 -> DA xxx H0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0575 <- 3.46 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx >6j9f_CD: title=CRYO-EM STRUCTURE OF XANTHOMONOS ORYZAE TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX WITH THE BACTERIOPHAGE PROTEIN P7 organism=XANTHOMONAS ORYZAE PV. ORYZAE MAFF 311018 / XANTHOMONAS ORYZAE PV. ORYZAE PXO99A : H : ARG NE C0479 <- 2.81 -> DG O6 H0016 : score 3.93314 : V : TYR CG D0046 <- 3.56 -> DT C7 H0005 : score 3.96603 : x : ARG xxxx C0156 <- 3.86 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0188 <- 3.23 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0204 <- 4.02 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0205 <- 4.14 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0473 <- 3.54 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0566 <- 3.92 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0570 <- 4.10 -> DA xxx H0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0575 <- 3.46 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0120 <- 4.15 -> DG xxx H0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 4.29 -> DA xxx H0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.64 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0791 <- 3.44 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0792 <- 4.06 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx >6jbq_CDF: title=CRYOEM STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI SIGMAE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING 5NT OF RNA organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ASP OD2 C0199 <- 3.24 -> DT N3 H0035 : score 3.27151 : H : ASN ND2 D0320 <- 2.53 -> DT O4 G0021 : score 5.56998 : H : SER OG F0035 <- 2.51 -> DC O2 H0031 : score 2.64636 : H : THR OG1 F0072 <- 3.09 -> DA N7 H0029 : score 3.21608 : H : THR OG1 F0072 <- 3.10 -> DA N6 H0029 : score 2.59344 : H : ASN ND2 F0080 <- 2.38 -> DT O2 H0025 : score 5.14483 : H : ARG NH2 F0091 <- 3.37 -> DA N7 H0021 : score 1.48121 : H : GLU OE1 F0102 <- 2.85 -> DG N2 G0020 : score 4.26715 : H : SER OG F0172 <- 3.28 -> DG O6 H0003 : score 3.69829 : V : VAL CG2 F0087 <- 3.88 -> DT C7 G0024 : score 6.00062 : V : ARG CB F0171 <- 3.87 -> DT C7 G0044 : score 0.987539 : V : ALA CB F0060 <- 3.88 -> DT C7 H0025 : score 5.48699 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.22 -> DG xxx H0036 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.81 -> DT xxx H0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0201 <- 4.28 -> DT xxx H0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.09 -> DC xxx H0031 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 3.74 -> DC xxx H0031 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 3.44 -> DG xxx H0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0451 <- 3.08 -> DG xxx H0036 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0480 <- 4.14 -> DA xxx H0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0481 <- 4.36 -> DA xxx H0028 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0504 <- 3.58 -> DT xxx G0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0508 <- 2.78 -> DT xxx G0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0514 <- 4.10 -> DG xxx G0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.71 -> DG xxx H0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.30 -> DT xxx H0037 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.72 -> DG xxx H0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 3.47 -> DA xxx H0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0352 <- 3.75 -> DC xxx G0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.45 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.59 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0042 <- 4.38 -> DT xxx G0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0043 <- 4.49 -> DC xxx H0032 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0056 <- 4.30 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0063 <- 3.23 -> DC xxx H0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0064 <- 3.31 -> DC xxx H0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0065 <- 3.47 -> DC xxx H0026 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0067 <- 4.43 -> DC xxx H0026 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0073 <- 3.62 -> DT xxx H0025 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0075 <- 3.40 -> DA xxx H0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0076 <- 3.91 -> DT xxx H0025 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0077 <- 3.57 -> DT xxx H0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0083 <- 3.60 -> DC xxx G0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0084 <- 3.16 -> DC xxx G0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0106 <- 3.24 -> DG xxx G0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0156 <- 4.40 -> DA xxx G0042 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0169 <- 4.16 -> DG xxx H0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0175 <- 3.70 -> DT xxx G0045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0176 <- 3.31 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx >6jbq_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYOEM STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI SIGMAE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING 5NT OF RNA organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : SER OG F0035 <- 2.51 -> DC O2 H0031 : score 2.64636 : H : THR OG1 F0072 <- 3.09 -> DA N7 H0029 : score 3.21608 : H : THR OG1 F0072 <- 3.10 -> DA N6 H0029 : score 2.59344 : H : ASN ND2 F0080 <- 2.38 -> DT O2 H0025 : score 5.14483 : H : ASN OD1 F0084 <- 3.16 -> DC N4 G0025 : score 3.89165 : H : ARG NH2 F0091 <- 3.37 -> DA N7 H0021 : score 1.48121 : H : GLU OE1 F0102 <- 2.85 -> DG N2 G0020 : score 4.26715 : H : SER OG F0172 <- 3.28 -> DG O6 H0003 : score 3.69829 : V : ALA CB F0060 <- 3.88 -> DT C7 H0025 : score 5.48699 : V : VAL CG2 F0087 <- 3.88 -> DT C7 G0024 : score 6.00062 : V : ARG CB F0171 <- 3.87 -> DT C7 G0044 : score 0.987539 : V : PHE CD2 F0175 <- 3.70 -> DT C7 G0045 : score 6.67459 : x : PRO xxxx F0042 <- 4.38 -> DT xxx G0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0043 <- 4.49 -> DC xxx H0032 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0056 <- 4.30 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0063 <- 3.23 -> DC xxx H0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0064 <- 3.31 -> DC xxx H0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0065 <- 3.47 -> DC xxx H0026 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0067 <- 4.43 -> DC xxx H0026 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0073 <- 3.62 -> DT xxx H0025 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0075 <- 3.40 -> DA xxx H0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0076 <- 3.91 -> DT xxx H0025 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0077 <- 3.57 -> DT xxx H0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0083 <- 3.60 -> DC xxx G0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0106 <- 3.24 -> DG xxx G0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0156 <- 4.40 -> DA xxx G0042 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0169 <- 4.16 -> DG xxx H0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0176 <- 3.31 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx >6jbx_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE FABT IN COMPLEX WITH DNA organism=Streptococcus pneumoniae : H : ARG NH1 A0088 <- 3.11 -> DT O2 D0003 : score 4.03941 : V : LEU CG A0062 <- 3.62 -> DT C7 D0006 : score 4.59693 : x : THR xxxx A0061 <- 3.84 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0064 <- 3.27 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0066 <- 3.66 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0067 <- 3.92 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx >6jbx_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE FABT IN COMPLEX WITH DNA organism=Streptococcus pneumoniae : H : ARG NH1 A0088 <- 3.11 -> DT O2 D0003 : score 4.03941 : w : THR OG1 B0061 <- 5.57 -> DA N6 D0016 : score 3.251 : w : THR OG1 B0067 <- 5.58 -> DT O4 C0008 : score 2.809 : w : ARG NH1 B0082 <- 6.23 -> DA N3 C0004 : score 2.585 : H : ARG NH1 B0088 <- 3.14 -> DT O2 C0003 : score 4.01357 : w : ARG NH1 B0088 <- 6.30 -> DA N3 C0002 : score 2.585 : V : LEU CG A0062 <- 3.62 -> DT C7 D0006 : score 4.59693 : V : LEU CD1 B0062 <- 3.70 -> DT C7 C0006 : score 5.87456 : x : THR xxxx A0061 <- 3.84 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0064 <- 3.27 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0066 <- 3.66 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0067 <- 3.92 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0064 <- 3.35 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0066 <- 3.68 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >6jcx_CDF: title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH ECF SIGMA FACTOR SIGMA H AND 6NT RNA organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS H37RV : x : GLU xxxx C0466 <- 3.93 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.25 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0291 <- 3.38 -> DC xxx H0005 : score x.xxxxx >6jcx_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH ECF SIGMA FACTOR SIGMA H AND 6NT RNA organism=? : x : ARG xxxx D0291 <- 3.38 -> DC xxx H0005 : score x.xxxxx >6jcy_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION OPEN COMPLEX WITH A CHIMERIC ECF SIGMA FACTOR SIGH/E organism=? : V : ARG CZ C0467 <- 3.75 -> DT C7 G0015 : score 2.15896 : x : GLU xxxx C0466 <- 4.37 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx >6jcy_CDF: title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION OPEN COMPLEX WITH A CHIMERIC ECF SIGMA FACTOR SIGH/E organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS H37RV : V : ARG CZ C0467 <- 3.75 -> DT C7 G0015 : score 2.15896 : x : GLU xxxx C0466 <- 4.37 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0291 <- 3.20 -> DG xxx G0023 : score x.xxxxx >6jdg_AB:Nucleic_acid-binding_proteins; title=COMPLEXED CRYSTAL STRUCTURE OF PASSB WITH SSDNA DT20 AT 2.39 ANGSTROM RESOLUTION organism=Pseudomonas aeruginosa PAO1 : H : THR OG1 A0033 <- 2.79 -> DT N3 F0007 : score 2.34956 : H : THR OG1 A0052 <- 3.10 -> DT O4 F0008 : score 3.65395 : H : ARG NH1 A0086 <- 2.47 -> DT O4 F0004 : score 3.48363 : H : LYS NZ B0007 <- 2.76 -> DT O4 F0016 : score 3.61588 : V : TRP CG A0088 <- 3.75 -> DT C7 F0004 : score 5.56512 : V : TRP CG A0054 <- 3.61 -> DT C7 F0007 : score 5.75749 >6jdg_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=COMPLEXED CRYSTAL STRUCTURE OF PASSB WITH SSDNA DT20 AT 2.39 ANGSTROM RESOLUTION organism=Pseudomonas aeruginosa PAO1 : H : LYS NZ B0007 <- 2.76 -> DT O4 F0016 : score 3.61588 >6jdv_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NME1CAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA (ATATGATT PAM) IN CATALYTIC STATE organism=Neisseria meningitidis serogroup C (strain 8013) / Neisseria meningitidis serogroup C (strain 8013) : H : GLN OE1 A0981 <- 2.83 -> DA N6 C0004 : score 6.01625 : H : GLN NE2 A0981 <- 3.21 -> DA N7 C0004 : score 5.59038 : H : HIS NE2 A1024 <- 2.60 -> DG O6 D0005 : score 8.272 : w : THR OG1 A1027 <- 5.67 -> DT O4 C0006 : score 2.809 : x : ASN xxxx A1029 <- 3.34 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx >6je3_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF NME2CAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA (AGGCCC PAM) WITH 5 NT OVERHANG organism=Neisseria meningitidis : H : ASP OD2 A1028 <- 3.23 -> DC N4 D0010 : score 5.6668 : H : ARG NH1 A1033 <- 3.17 -> DG N7 C0006 : score 5.6023 : H : ARG NH1 A1033 <- 2.70 -> DG O6 C0006 : score 6.205 : x : LYS xxxx A0843 <- 3.59 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1030 <- 3.90 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1031 <- 3.44 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1035 <- 4.04 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1044 <- 4.49 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx >6je4_K: title=CRYSTAL STRUCTURE OF NME1CAS9-SGRNA-DSDNA DIMER MEDIATED BY DOUBLE PROTEIN INHIBITOR ACRIIC3 MONOMERS organism=NEISSERIA MENINGITIDIS 8013 : H : GLN OE1 K0981 <- 2.81 -> DA N6 M0004 : score 6.04046 : H : GLN NE2 K0981 <- 3.23 -> DA N7 M0004 : score 5.56603 : H : HIS NE2 K1024 <- 2.79 -> DG O6 N0029 : score 7.96975 : H : ASN ND2 K1029 <- 2.90 -> DA N7 M0005 : score 5.7531 : x : THR xxxx K1027 <- 3.12 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx K1043 <- 4.37 -> DT xxx M0006 : score x.xxxxx >6jfu_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF NME2CAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA (AGGCCC PAM) organism=Neisseria meningitidis : H : ASP OD2 A1028 <- 3.15 -> DC N4 D0005 : score 5.766 : H : ARG NH1 A1033 <- 2.82 -> DG N7 C0006 : score 6.0258 : x : LYS xxxx A0843 <- 4.09 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1030 <- 3.10 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1031 <- 4.15 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1035 <- 3.80 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1052 <- 4.29 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >6jg8_A:HCP-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AIMR IN COMPLEX WITH DNA organism=Bacillus phage SPbeta : w : ASP OD1 A0036 <- 5.52 -> DT O4 C0002 : score 2.616 : x : ASN xxxx A0030 <- 3.32 -> DA xxx D0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0032 <- 3.10 -> DA xxx D0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0033 <- 3.56 -> DA xxx D0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0043 <- 4.33 -> DT xxx D0027 : score x.xxxxx >6jg8_AB:HCP-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AIMR IN COMPLEX WITH DNA organism=Bacillus phage SPbeta : w : ASP OD1 A0036 <- 5.52 -> DT O4 C0002 : score 2.616 : H : ASN ND2 B0032 <- 2.91 -> DT O4 C0030 : score 5.16835 : x : ASN xxxx A0030 <- 3.32 -> DA xxx D0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0032 <- 3.10 -> DA xxx D0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0033 <- 3.56 -> DA xxx D0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0043 <- 4.33 -> DT xxx D0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0030 <- 2.97 -> DT xxx C0030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0033 <- 3.37 -> DG xxx C0029 : score x.xxxxx >6jgw_AB:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CADR FROM P. PUTIDA IN COMPLEX WITH DNA organism=PSEUDOMONAS PUTIDA : H : TYR OH A0036 <- 2.75 -> DG N2 C0023 : score 4.93864 : H : TYR OH B0036 <- 2.91 -> DG N2 D0023 : score 4.78217 : x : GLU xxxx B0015 <- 3.94 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0018 <- 3.57 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0019 <- 3.71 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0022 <- 4.43 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0015 <- 3.92 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0018 <- 3.72 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0019 <- 3.69 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx >6jgw_B:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CADR FROM P. PUTIDA IN COMPLEX WITH DNA organism=PSEUDOMONAS PUTIDA : H : TYR OH B0036 <- 2.91 -> DG N2 D0023 : score 4.78217 : x : GLU xxxx B0015 <- 3.94 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0018 <- 3.57 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0019 <- 3.71 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0022 <- 4.43 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >6jgx_AB:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CADR FROM P. PUTIDA IN COMPLEX WITH CADMIUM(II) AND DNA organism=PSEUDOMONAS PUTIDA : H : TYR OH A0036 <- 3.04 -> DG N2 C0021 : score 4.65504 : H : TYR OH B0036 <- 3.03 -> DG N2 D0021 : score 4.66482 : x : GLU xxxx A0015 <- 4.06 -> DA xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0018 <- 3.52 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0019 <- 3.28 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0015 <- 4.05 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0018 <- 3.60 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0019 <- 3.41 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0022 <- 4.47 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx >6jgx_B:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CADR FROM P. PUTIDA IN COMPLEX WITH CADMIUM(II) AND DNA organism=PSEUDOMONAS PUTIDA : H : TYR OH B0036 <- 3.03 -> DG N2 D0021 : score 4.66482 : x : GLU xxxx B0015 <- 4.05 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0018 <- 3.60 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0019 <- 3.41 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0022 <- 4.47 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx >6jhe_A:Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS SUBTILIS SIGW DOMAIN 4 IN COMPLEXED WITH -35 ELEMENT DNA organism=Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) : H : LYS NZ A0170 <- 2.50 -> DG O6 C0006 : score 6.12762 : H : THR OG1 A0171 <- 3.15 -> DA N7 B0005 : score 3.17512 : H : ARG NH1 A0175 <- 3.41 -> DG N7 B0004 : score 5.3119 : H : ARG NH2 A0175 <- 3.13 -> DG O6 B0004 : score 6.1644 : V : HIS CB A0174 <- 3.86 -> DT C7 C0007 : score 4.06325 : x : LEU xxxx A0155 <- 4.02 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0168 <- 4.13 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx >6jm9_A:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF DOT1L BOUND TO UNMODIFIED NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.56 -> DA N3 J0009 : score 3.39525 : H : ARG NH1 A0083 <- 3.19 -> DA N3 J0025 : score 3.39485 : H : ARG NH2 A0083 <- 2.91 -> DC O2 I-023 : score 3.61735 >6jm9_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF DOT1L BOUND TO UNMODIFIED NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.56 -> DA N3 J0009 : score 3.39525 : H : ARG NH1 A0083 <- 3.19 -> DA N3 J0025 : score 3.39485 : H : ARG NH2 A0083 <- 2.91 -> DC O2 I-023 : score 3.61735 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.61 -> DA N3 I0009 : score 3.36285 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.65 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.14 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.38 -> DG xxx J0047 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.94 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.76 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0032 <- 4.35 -> DT xxx J-012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.05 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.47 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >6jma_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF DOT1L BOUND TO H2B UBIQUITINATED NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.56 -> DA N3 J0009 : score 3.39525 : H : ARG NH1 A0083 <- 3.19 -> DA N3 J0025 : score 3.39485 : H : ARG NH2 A0083 <- 2.91 -> DC O2 I-023 : score 3.61735 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.61 -> DA N3 I0009 : score 3.36285 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.65 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.14 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.38 -> DG xxx J0047 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.95 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.76 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0032 <- 4.35 -> DT xxx J-012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.05 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.47 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >6jni_CD:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CADR FROM P. PUTIDA IN COMPLEX WITH ZINC(II) AND DNA organism=PSEUDOMONAS PUTIDA : H : GLU OE2 C0015 <- 3.27 -> DA N6 L0017 : score 2.76446 : H : TYR OH C0036 <- 2.77 -> DG N2 L0022 : score 4.91908 : H : GLU OE2 D0015 <- 2.78 -> DA N6 K0017 : score 3.06349 : H : TYR OH D0036 <- 2.87 -> DG N2 K0022 : score 4.82129 : x : ARG xxxx C0018 <- 3.42 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0019 <- 3.37 -> DA xxx L0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0018 <- 3.42 -> DT xxx L0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0019 <- 3.38 -> DG xxx K0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0022 <- 4.35 -> DT xxx K0016 : score x.xxxxx >6jni_E:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CADR FROM P. PUTIDA IN COMPLEX WITH ZINC(II) AND DNA organism=PSEUDOMONAS PUTIDA : H : GLU OE2 E0015 <- 3.09 -> DA N6 N0017 : score 2.87431 : H : TYR OH E0036 <- 2.70 -> DG N2 N0022 : score 4.98754 : x : ARG xxxx E0018 <- 3.28 -> DT xxx M0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0019 <- 3.30 -> DA xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0022 <- 4.34 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx >6jni_EF:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CADR FROM P. PUTIDA IN COMPLEX WITH ZINC(II) AND DNA organism=PSEUDOMONAS PUTIDA : H : GLU OE2 E0015 <- 3.09 -> DA N6 N0017 : score 2.87431 : H : TYR OH E0036 <- 2.70 -> DG N2 N0022 : score 4.98754 : H : GLU OE2 F0015 <- 2.79 -> DA N6 M0017 : score 3.05738 : H : TYR OH F0036 <- 2.99 -> DG N2 M0022 : score 4.70393 : x : ARG xxxx E0018 <- 3.28 -> DT xxx M0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0019 <- 3.30 -> DA xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0022 <- 4.34 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0018 <- 3.51 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0019 <- 3.35 -> DG xxx M0014 : score x.xxxxx >6jnl_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=REF6 ZNF2-4-NAC004 COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : w : GLU OE2 A1315 <- 5.92 -> DT O4 D0004 : score 2.279 : w : GLU OE2 A1315 <- 5.90 -> DC N4 D0005 : score 3.597 : H : SER OG A1341 <- 2.54 -> DG N7 C0008 : score 4.71512 : H : SER OG A1341 <- 2.95 -> DA N6 C0009 : score 3.19105 : H : ASP OD1 A1342 <- 2.99 -> DC N4 D0003 : score 5.14177 : V : PHE CG A1339 <- 3.81 -> DT C7 D0004 : score 5.26475 : x : PHE xxxx A1278 <- 3.55 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1282 <- 3.32 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A1309 <- 3.55 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A1311 <- 3.35 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1312 <- 3.45 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A1340 <- 3.45 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1344 <- 3.60 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1345 <- 3.53 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx >6jnm_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=REF6 ZNF2-4-NAC004-MC3 COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : w : GLU OE2 A1315 <- 5.53 -> DT O4 D0004 : score 2.279 : H : SER OG A1341 <- 2.47 -> DG N7 C0008 : score 4.77787 : H : SER OG A1341 <- 3.06 -> DA N6 C0009 : score 3.11868 : H : ASP OD1 A1342 <- 2.94 -> DC N4 D0003 : score 5.19522 >6jnn_AN:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=REF6 ZNF2-4-NAC004-MC1 COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : H : SER OG A1341 <- 2.91 -> DG N7 C0008 : score 4.38345 : H : SER OG A1341 <- 2.47 -> DA N6 C0009 : score 3.50687 : H : SER OG N1341 <- 2.75 -> DG N7 H0008 : score 4.52687 : H : SER OG N1341 <- 3.13 -> DA N6 H0009 : score 3.07262 : V : PHE CG N1339 <- 3.75 -> DT C7 I0004 : score 5.34392 : V : PHE CG A1339 <- 3.80 -> DT C7 D0004 : score 5.27795 : x : PHE xxxx A1278 <- 3.41 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1282 <- 3.13 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A1309 <- 3.54 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A1311 <- 3.21 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1312 <- 3.32 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1315 <- 3.67 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A1340 <- 3.39 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A1342 <- 4.23 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1344 <- 3.68 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx N1278 <- 3.36 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx N1282 <- 3.21 -> DG xxx I0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx N1311 <- 3.58 -> DA xxx H0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx N1312 <- 4.49 -> DC xxx I0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx N1315 <- 3.31 -> DT xxx I0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx N1340 <- 3.68 -> DA xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx N1342 <- 4.07 -> DT xxx I0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N1345 <- 4.22 -> DT xxx I0001 : score x.xxxxx >6jnn_G:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=REF6 ZNF2-4-NAC004-MC1 COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : H : SER OG G1341 <- 2.90 -> DG N7 K0008 : score 4.39241 : H : SER OG G1341 <- 3.26 -> DA N6 K0009 : score 2.98709 : V : PHE CD2 G1339 <- 3.52 -> DT C7 L0004 : score 6.96762 : x : TYR xxxx G1282 <- 2.93 -> DG xxx L0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx G1309 <- 3.86 -> DT xxx L0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx G1311 <- 3.45 -> DA xxx K0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G1312 <- 4.33 -> DC xxx L0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G1315 <- 3.84 -> DT xxx L0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G1340 <- 3.25 -> DA xxx K0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx G1342 <- 4.17 -> DT xxx L0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G1345 <- 3.98 -> DT xxx L0002 : score x.xxxxx >6jnx_CDFPQ:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYO-EM STRUCTURE OF A Q-ENGAGED ARRESTED COMPLEX organism=ENTEROBACTERIA PHAGE SFI / ESCHERICHIA COLI K-12 : H : ARG NH2 C0542 <- 2.71 -> DT O4 N0049 : score 3.61782 : H : ARG NH2 C0542 <- 2.71 -> DT O4 N0049 : score 3.61782 : H : ARG NE F0099 <- 2.91 -> DG O6 N0042 : score 3.85432 : H : ARG NE F0099 <- 3.10 -> DG O6 N0043 : score 3.70456 : H : ARG NH2 F0099 <- 2.50 -> DG O6 N0043 : score 6.996 : H : ARG NH2 F0385 <- 2.71 -> DG O6 N0041 : score 6.7188 : H : ARG NE P0113 <- 2.96 -> DT O2 N0008 : score 2.49446 : H : ARG NE P0113 <- 2.81 -> DT O2 N0009 : score 2.57177 : H : ARG NH1 P0113 <- 2.80 -> DT O2 N0009 : score 4.30641 : H : ARG NH1 P0127 <- 3.23 -> DG O6 T0049 : score 5.56017 : H : ARG NH2 P0128 <- 3.07 -> DG N7 N0010 : score 6.03985 : H : ARG NH2 Q0128 <- 2.67 -> DG N7 N0018 : score 6.55062 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.21 -> DG xxx N0048 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.07 -> DA xxx N0047 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.53 -> DA xxx N0047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0201 <- 4.48 -> DG xxx N0045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.15 -> DG xxx N0043 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 3.37 -> DG xxx N0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0451 <- 4.07 -> DG xxx N0048 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0481 <- 3.47 -> DG xxx N0039 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.40 -> DG xxx N0048 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.40 -> DG xxx N0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0259 <- 3.96 -> DC xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 3.87 -> DG xxx N0043 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.51 -> DC xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 4.44 -> DC xxx T0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D1170 <- 3.95 -> DT xxx N0061 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0096 <- 2.96 -> DG xxx N0042 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.34 -> DG xxx N0042 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.40 -> DG xxx N0041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.32 -> DT xxx N0040 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 4.21 -> DT xxx N0040 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 3.36 -> DT xxx N0040 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 3.80 -> DA xxx N0036 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 2.63 -> DA xxx N0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 3.96 -> DA xxx N0036 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 3.46 -> DA xxx N0036 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0426 <- 3.59 -> DT xxx N0040 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 4.41 -> DT xxx N0040 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.85 -> DG xxx N0039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.38 -> DA xxx N0036 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0432 <- 4.20 -> DG xxx N0039 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.33 -> DT xxx N0035 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0434 <- 4.01 -> DT xxx N0035 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0437 <- 2.90 -> DT xxx N0035 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx P0095 <- 4.48 -> DT xxx T0048 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx P0124 <- 3.59 -> DA xxx N0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx Q0095 <- 3.36 -> DT xxx T0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0113 <- 3.28 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Q0122 <- 4.37 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Q0124 <- 4.00 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0127 <- 3.08 -> DC xxx T0042 : score x.xxxxx >6jnx_P: title=CRYO-EM STRUCTURE OF A Q-ENGAGED ARRESTED COMPLEX organism=ENTEROBACTERIA PHAGE SFI : H : ARG NE P0113 <- 2.96 -> DT O2 N0008 : score 2.49446 : H : ARG NE P0113 <- 2.81 -> DT O2 N0009 : score 2.57177 : H : ARG NH1 P0113 <- 2.80 -> DT O2 N0009 : score 4.30641 : H : ARG NH1 P0127 <- 3.23 -> DG O6 T0049 : score 5.56017 : H : ARG NH2 P0128 <- 3.07 -> DG N7 N0010 : score 6.03985 : x : HIS xxxx P0095 <- 4.48 -> DT xxx T0048 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx P0124 <- 3.59 -> DA xxx N0011 : score x.xxxxx >6joo_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CORYNEBACTERIUM DIPHTHERIAE CAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA organism=? : H : ARG NH2 A1017 <- 2.78 -> DG N7 D0007 : score 6.41015 : H : ARG NH1 A1042 <- 3.08 -> DG N7 D0006 : score 5.7112 : H : ARG NH2 A1042 <- 2.32 -> DG O6 D0006 : score 7.2336 : V : LYS CE A1015 <- 3.64 -> DT C7 C0003 : score 2.70507 : V : PHE CZ A1011 <- 3.58 -> DT C7 D0008 : score 7.50619 : x : ILE xxxx A0047 <- 3.82 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0818 <- 4.21 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1043 <- 4.46 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A1046 <- 3.94 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx >6jou_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME CONTAINING H2A.Z.1 S42R organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0040 <- 3.04 -> DA N3 J0229 : score 3.50531 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.46 -> DA N3 I0082 : score 3.19602 : w : ARG NH1 G0045 <- 5.67 -> DA N3 I0110 : score 2.585 : H : ARG NH1 H0033 <- 3.27 -> DG N3 I0121 : score 2.76562 : H : ARG NH2 H0033 <- 2.85 -> DG N3 I0121 : score 3.57415 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.71 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.15 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.29 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0045 <- 3.76 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.43 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.57 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.99 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.19 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx >6jou_G:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME CONTAINING H2A.Z.1 S42R organism=? : w : ARG NH1 G0045 <- 6.01 -> DT O2 J0184 : score 1.855 >6jpi_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PA4674 IN COMPLEX WITH ITS OPERATOR DNA (28BP) FROM PSEUDOMONAS AERUGINOSA organism=? : V : PRO CG A0039 <- 3.87 -> DT C7 E0023 : score 6.24769 : x : ALA xxxx A0028 <- 4.28 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0037 <- 3.65 -> DG xxx E0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.92 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0042 <- 4.32 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0049 <- 3.44 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx >6jpi_ABCD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PA4674 IN COMPLEX WITH ITS OPERATOR DNA (28BP) FROM PSEUDOMONAS AERUGINOSA organism=? : V : PRO CB B0039 <- 3.80 -> DT C7 E0011 : score 5.80615 : V : PRO CG A0039 <- 3.87 -> DT C7 E0023 : score 6.24769 : x : ALA xxxx A0028 <- 4.28 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0037 <- 3.65 -> DG xxx E0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.92 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0042 <- 4.32 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0049 <- 3.44 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0028 <- 4.30 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0037 <- 3.14 -> DG xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0038 <- 3.50 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0042 <- 3.30 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0049 <- 3.24 -> DC xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0028 <- 4.31 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0037 <- 3.18 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0038 <- 3.89 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0039 <- 3.25 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0042 <- 3.36 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0049 <- 2.90 -> DC xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0028 <- 4.34 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0037 <- 3.51 -> DG xxx F0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0038 <- 4.45 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0039 <- 3.48 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0042 <- 3.81 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0046 <- 4.27 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0049 <- 3.51 -> DG xxx F0021 : score x.xxxxx >6jr0_A:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME PHASED WITH 12 SELENIUM ATOMS organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0040 <- 2.93 -> DA N3 J0229 : score 3.58632 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.31 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.74 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.06 -> DT xxx I0048 : score x.xxxxx >6jr0_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME PHASED WITH 12 SELENIUM ATOMS organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0040 <- 2.93 -> DA N3 J0229 : score 3.58632 : w : ARG NH1 D0033 <- 5.02 -> DG N3 I0121 : score 1.593 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.34 -> DA N3 I0082 : score 3.28439 : w : ARG NH2 E0083 <- 5.71 -> DG N3 I0098 : score 0.677 : w : ARG NH2 G0042 <- 5.74 -> DT O2 I0037 : score 2.261 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.31 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.74 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.06 -> DT xxx I0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.03 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.29 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.75 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0017 <- 3.82 -> DT xxx I0096 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0032 <- 4.38 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.30 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0039 <- 4.45 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx >6jr1_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME PHASED WITH 16 SELENIUM ATOMS organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.98 -> DA N3 J0229 : score 3.12311 : H : ARG NH2 C0011 <- 3.19 -> DT O2 J0263 : score 3.90313 : w : ARG NH2 C0042 <- 5.95 -> DT O2 I0037 : score 2.261 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.15 -> DA N3 I0082 : score 3.01296 : w : ARG NH1 G0077 <- 5.77 -> DA N3 J0165 : score 2.585 : w : ARG NH1 H0033 <- 5.36 -> DG N3 I0121 : score 1.593 : x : LEU xxxx A0065 <- 4.06 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.73 -> DT xxx I0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.06 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.48 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.70 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.55 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0017 <- 4.20 -> DT xxx J0198 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0032 <- 4.38 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.28 -> DG xxx J0214 : score x.xxxxx >6jr1_F:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME PHASED WITH 16 SELENIUM ATOMS organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx F0017 <- 4.20 -> DT xxx J0198 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0032 <- 4.38 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.28 -> DG xxx J0214 : score x.xxxxx >6jrf_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZMMOC1-HOLLIDAY JUNCTION COMPLEX IN THE PRESENCE OF CALCIUM organism=Zea mays : H : SER OG A0177 <- 3.04 -> DG N2 D0010 : score 3.21239 : H : ASP OD1 A0182 <- 2.95 -> DC N4 D0025 : score 5.18453 : H : GLU OE1 B0145 <- 2.96 -> DC N4 D0020 : score 5.58337 : H : SER OG B0177 <- 3.20 -> DG N2 C0010 : score 3.10441 : H : ASP OD1 B0182 <- 2.90 -> DC N4 C0025 : score 5.23797 : H : GLN NE2 B0214 <- 2.77 -> DT O2 C0023 : score 3.95693 : x : SER xxxx A0144 <- 3.34 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0178 <- 4.11 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0179 <- 3.36 -> DC xxx D0024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0180 <- 3.23 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0184 <- 3.84 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0185 <- 2.93 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0214 <- 3.00 -> DA xxx D0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0178 <- 4.29 -> DC xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0179 <- 3.36 -> DC xxx C0024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0180 <- 3.44 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0184 <- 4.11 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0185 <- 3.44 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >6jrf_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZMMOC1-HOLLIDAY JUNCTION COMPLEX IN THE PRESENCE OF CALCIUM organism=Zea mays : H : GLU OE1 B0145 <- 2.96 -> DC N4 D0020 : score 5.58337 : H : SER OG B0177 <- 3.20 -> DG N2 C0010 : score 3.10441 : H : ASP OD1 B0182 <- 2.90 -> DC N4 C0025 : score 5.23797 : H : GLN NE2 B0214 <- 2.77 -> DT O2 C0023 : score 3.95693 : x : PRO xxxx B0178 <- 4.29 -> DC xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0179 <- 3.36 -> DC xxx C0024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0180 <- 3.44 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0184 <- 4.11 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0185 <- 3.44 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >6jrg_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZMMOC1 H253A MUTANT IN COMPLEX WITH HOLLIDAY JUNCTION organism=Zea mays : H : ASP OD1 A0182 <- 2.86 -> DC N4 D0025 : score 5.28073 : H : GLN NE2 A0214 <- 3.16 -> DA N3 D0023 : score 3.73698 : w : GLN NE2 A0214 <- 6.14 -> DC O2 D0024 : score 2.699 : H : ASP OD1 B0182 <- 2.92 -> DC N4 C0025 : score 5.21659 : H : GLN NE2 B0214 <- 2.78 -> DT O2 C0023 : score 3.94907 : w : GLN NE2 B0214 <- 6.05 -> DC O2 C0024 : score 2.699 : x : SER xxxx A0177 <- 3.95 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0178 <- 4.37 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0179 <- 3.43 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0180 <- 3.25 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0184 <- 4.07 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0185 <- 3.36 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0144 <- 3.68 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0145 <- 3.40 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0177 <- 3.84 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0178 <- 4.48 -> DC xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0179 <- 3.42 -> DC xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0180 <- 3.41 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0184 <- 4.19 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0185 <- 3.30 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >6jrg_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZMMOC1 H253A MUTANT IN COMPLEX WITH HOLLIDAY JUNCTION organism=Zea mays : H : ASP OD1 B0182 <- 2.92 -> DC N4 C0025 : score 5.21659 : H : GLN NE2 B0214 <- 2.78 -> DT O2 C0023 : score 3.94907 : w : GLN NE2 B0214 <- 6.05 -> DC O2 C0024 : score 2.699 : x : SER xxxx B0144 <- 3.68 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0145 <- 3.40 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0177 <- 3.84 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0178 <- 4.48 -> DC xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0179 <- 3.42 -> DC xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0180 <- 3.41 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0184 <- 4.19 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0185 <- 3.30 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >6jrp_AD:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CIC-HMG-ETV5-DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0202 <- 3.08 -> DT O2 C0002 : score 4.06525 : H : ARG NH1 A0202 <- 2.93 -> DT O2 C0003 : score 4.19444 : H : ARG NH2 A0202 <- 3.23 -> DT O2 C0002 : score 3.86927 : H : ASN ND2 A0205 <- 3.01 -> DA N3 B0008 : score 3.64777 : H : ASN ND2 A0227 <- 3.00 -> DT O2 C0007 : score 4.55631 : H : ARG NE A0228 <- 3.24 -> DA N3 B0005 : score 1.91754 : H : SER OG A0231 <- 2.48 -> DT O2 B0006 : score 3.93407 : H : ARG NH2 D0202 <- 3.40 -> DT O2 F0002 : score 3.72533 : H : ASN ND2 D0205 <- 2.86 -> DA N3 E0008 : score 3.762 : H : ARG NH1 D0215 <- 2.75 -> DC O2 F0005 : score 3.6865 : H : ASN ND2 D0227 <- 3.13 -> DT O2 F0007 : score 4.43291 : H : ARG NH1 D0228 <- 2.39 -> DA N3 E0005 : score 3.98398 : H : SER OG D0231 <- 2.56 -> DT O2 E0006 : score 3.87491 : x : PHE xxxx A0207 <- 4.05 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0208 <- 3.21 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0215 <- 3.74 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0226 <- 4.09 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0271 <- 3.45 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0207 <- 4.11 -> DA xxx E0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0208 <- 3.23 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0226 <- 3.78 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0271 <- 3.71 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx >6jrp_D:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CIC-HMG-ETV5-DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 D0202 <- 3.40 -> DT O2 F0002 : score 3.72533 : H : ASN ND2 D0205 <- 2.86 -> DA N3 E0008 : score 3.762 : H : ARG NH1 D0215 <- 2.75 -> DC O2 F0005 : score 3.6865 : H : ASN ND2 D0227 <- 3.13 -> DT O2 F0007 : score 4.43291 : H : ARG NH1 D0228 <- 2.39 -> DA N3 E0005 : score 3.98398 : H : SER OG D0231 <- 2.56 -> DT O2 E0006 : score 3.87491 : x : PHE xxxx D0207 <- 4.11 -> DA xxx E0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0208 <- 3.23 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0226 <- 3.78 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0271 <- 3.71 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx >6jrp_GJ:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CIC-HMG-ETV5-DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 G0202 <- 3.19 -> DT O2 I0002 : score 3.97051 : H : ARG NH1 G0202 <- 2.89 -> DT O2 I0003 : score 4.22889 : H : ARG NH2 G0202 <- 3.10 -> DT O2 I0002 : score 3.97933 : H : ASN ND2 G0205 <- 3.13 -> DA N3 H0008 : score 3.55638 : H : ASN ND2 G0227 <- 3.03 -> DT O2 I0007 : score 4.52783 : H : SER OG G0231 <- 2.59 -> DT O2 H0006 : score 3.85273 : H : ASN ND2 J0205 <- 3.24 -> DA N3 K0009 : score 3.47262 : H : ARG NH1 J0215 <- 3.06 -> DC O2 L0005 : score 3.4602 : H : ASN ND2 J0227 <- 2.70 -> DT O2 L0007 : score 4.84108 : H : SER OG J0231 <- 2.51 -> DT O2 K0006 : score 3.91189 : x : PHE xxxx G0207 <- 4.24 -> DG xxx H0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0208 <- 3.57 -> DT xxx I0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0215 <- 4.19 -> DC xxx I0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx G0226 <- 3.53 -> DT xxx I0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0228 <- 3.76 -> DA xxx H0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0271 <- 3.45 -> DT xxx I0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0202 <- 3.12 -> DT xxx L0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx J0207 <- 3.83 -> DA xxx K0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx J0208 <- 3.27 -> DT xxx L0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0211 <- 4.34 -> DC xxx L0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx J0226 <- 4.06 -> DT xxx L0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0228 <- 3.74 -> DA xxx K0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx J0269 <- 3.74 -> DA xxx K0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0271 <- 3.78 -> DT xxx L0002 : score x.xxxxx >6jtq_B:Thiolase-like; title=RVD HA SPECIFICALLY CONTACTS 5MC THROUGH VAN DER WAALS INTERACTIONS organism=? : H : ARG NH2 B0266 <- 3.22 -> DG O6 D-003 : score 6.0456 : H : ASP OD2 B0301 <- 2.70 -> DC N4 C0001 : score 6.324 : H : ASP OD2 B0335 <- 3.07 -> DC N4 C0002 : score 5.8652 : H : ASP OD2 B0369 <- 2.82 -> DC N4 C0003 : score 6.1752 : H : ASN ND2 B0505 <- 2.85 -> DG N7 C0007 : score 4.54004 : H : ASP OD2 B0539 <- 2.85 -> DC N4 C0008 : score 6.138 : H : ASN ND2 B0573 <- 2.90 -> DG N7 C0009 : score 4.49418 : H : ASP OD2 B0641 <- 3.18 -> DC N4 C0011 : score 5.7288 : x : TRP xxxx B0232 <- 4.24 -> DT xxx C0000 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0471 <- 4.21 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >6jul_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=MSDPO4-DNA COMPLEX 1 organism=? : x : ARG xxxx A0287 <- 3.71 -> DT xxx C0866 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0339 <- 4.46 -> DT xxx B0844 : score x.xxxxx >6jum_F:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=MSDPO4-DNA COMPLEX 2 organism=? : x : ARG xxxx F0287 <- 4.26 -> DT xxx H0866 : score x.xxxxx >6jun_F:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=MSDPO4-DNA COMPLEX 3 organism=? : x : ARG xxxx F0287 <- 3.96 -> DT xxx H0866 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0339 <- 3.84 -> DG xxx G0843 : score x.xxxxx >6juo_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=MSDPO4-DNA COMPLEX 4 organism=? : x : ARG xxxx A0287 <- 3.85 -> DT xxx C0866 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0339 <- 3.52 -> DT xxx B0844 : score x.xxxxx >6jup_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=MUTANT POLIV-DNA INCOMING NUCLEOTIDE COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : x : GLU xxxx A0246 <- 3.99 -> DG xxx B0841 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0285 <- 3.46 -> DT xxx C0866 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0299 <- 4.46 -> DG xxx C0868 : score x.xxxxx >6juq_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=MUTANT POLIV-DNA INCOMING NUCLEOTIDE COMPLEX 2 organism=ESCHERICHIA COLI : x : THR xxxx A0299 <- 4.24 -> DA xxx C0867 : score x.xxxxx >6jur_F:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=MSDPO4-DNA COMPLEX 5 organism=? : V : ARG CZ F0339 <- 3.69 -> DT C7 G0844 : score 2.19095 : x : ARG xxxx F0287 <- 3.62 -> DT xxx H0866 : score x.xxxxx >6jus_F:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=MSDPO4-DNA COMPLEX 6 organism=? : x : ARG xxxx F0287 <- 3.68 -> DT xxx H0866 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0339 <- 4.18 -> DT xxx G0844 : score x.xxxxx >6jvz_A:Thiolase-like; title=RVD HA SPECIFICALLY CONTACTS 5MC THROUGH VAN DER WAALS INTERACTIONS organism=Xanthomonas campestris pv. armoraciae : H : ARG NH1 A0266 <- 3.07 -> DG N7 J-003 : score 5.7233 : H : ARG NH2 A0266 <- 2.97 -> DG O6 J-003 : score 6.3756 : H : ASP OD2 A0301 <- 3.07 -> DC N4 I0001 : score 5.8652 : H : ASP OD2 A0335 <- 2.86 -> DC N4 I0002 : score 6.1256 : H : ASP OD2 A0369 <- 3.00 -> DC N4 I0003 : score 5.952 : H : ASN ND2 A0505 <- 3.01 -> DG N7 I0007 : score 4.39329 : H : ASP OD2 A0539 <- 2.65 -> DC N4 I0008 : score 6.386 : H : ASN ND2 A0573 <- 3.14 -> DG N7 I0009 : score 4.27406 : H : ASN ND2 A0573 <- 2.98 -> DG O6 I0009 : score 5.43548 : H : ASP OD2 A0641 <- 2.98 -> DC N4 I0011 : score 5.9768 : x : ALA xxxx A0471 <- 4.26 -> DT xxx I0005 : score x.xxxxx >6jw0_A:Thiolase-like; title=UNIVERSAL RVD R* ACCOMMODATES CYTOSINE VIA WATER-MEDIATED INTERACTIONS organism=Xanthomonas campestris pv. armoraciae : H : ARG NH1 A0266 <- 2.96 -> DG N7 J-003 : score 5.8564 : H : ARG NH2 A0266 <- 3.02 -> DG O6 J-003 : score 6.3096 : H : ASP OD2 A0301 <- 2.96 -> DC N4 I0001 : score 6.0016 : H : ASP OD2 A0335 <- 2.86 -> DC N4 I0002 : score 6.1256 : H : ASP OD2 A0369 <- 2.88 -> DC N4 I0003 : score 6.1008 : H : ASN ND2 A0504 <- 3.05 -> DG N7 I0007 : score 4.3566 : H : ASP OD2 A0538 <- 2.79 -> DC N4 I0008 : score 6.2124 : H : ASN ND2 A0572 <- 3.12 -> DG N7 I0009 : score 4.2924 : H : ASP OD2 A0640 <- 2.91 -> DC N4 I0011 : score 6.0636 : x : ARG xxxx A0470 <- 4.50 -> DG xxx J-011 : score x.xxxxx >6jw1_B:Thiolase-like; title=UNIVERSAL RVD R* ACCOMMODATES 5MC VIA WATER-MEDIATED INTERACTIONS organism=Xanthomonas campestris pv. armoraciae : H : ARG NH1 B0266 <- 2.77 -> DG N7 D-003 : score 6.0863 : H : ARG NH2 B0266 <- 2.72 -> DG O6 D-003 : score 6.7056 : H : ASP OD2 B0301 <- 3.03 -> DC N4 C0001 : score 5.9148 : H : ASP OD2 B0335 <- 3.03 -> DC N4 C0002 : score 5.9148 : H : ASP OD2 B0369 <- 3.02 -> DC N4 C0003 : score 5.9272 : H : ASN ND2 B0504 <- 3.06 -> DG N7 C0007 : score 4.34743 : H : ASP OD2 B0538 <- 2.77 -> DC N4 C0008 : score 6.2372 : H : ASN ND2 B0572 <- 3.12 -> DG N7 C0009 : score 4.2924 : H : ASP OD2 B0640 <- 2.76 -> DC N4 C0011 : score 6.2496 >6jw2_A:Thiolase-like; title=UNIVERSAL RVD R* ACCOMMODATES 5HMC VIA WATER-MEDIATED INTERACTIONS organism=Xanthomonas campestris pv. armoraciae : H : ARG NH1 A0266 <- 3.27 -> DG N7 J-003 : score 5.4813 : H : ARG NH2 A0266 <- 3.17 -> DG O6 J-003 : score 6.1116 : H : ASP OD2 A0301 <- 2.98 -> DC N4 I0001 : score 5.9768 : H : ASP OD2 A0335 <- 3.10 -> DC N4 I0002 : score 5.828 : H : ASP OD2 A0369 <- 3.04 -> DC N4 I0003 : score 5.9024 : H : ASN ND2 A0504 <- 3.09 -> DG N7 I0007 : score 4.31992 : H : ASP OD2 A0538 <- 3.15 -> DC N4 I0008 : score 5.766 : H : ASN ND2 A0572 <- 3.16 -> DG N7 I0009 : score 4.25571 : H : ASP OD2 A0640 <- 3.12 -> DC N4 I0011 : score 5.8032 >6jw3_B:Thiolase-like; title=DEGENERATE RVD RG FORMS A DISTINCT LOOP CONFORMATION organism=Xanthomonas campestris pv. armoraciae : H : ARG NH1 B0266 <- 3.22 -> DG N7 D-003 : score 5.5418 : H : ARG NH2 B0266 <- 3.11 -> DG O6 D-003 : score 6.1908 : H : ASP OD2 B0301 <- 3.11 -> DC N4 C0001 : score 5.8156 : H : ASP OD2 B0335 <- 2.95 -> DC N4 C0002 : score 6.014 : H : ASP OD2 B0369 <- 2.92 -> DC N4 C0003 : score 6.0512 : H : ASN ND2 B0505 <- 3.12 -> DG N7 C0007 : score 4.2924 : H : ASP OD2 B0539 <- 3.07 -> DC N4 C0008 : score 5.8652 : H : ASN ND2 B0573 <- 3.10 -> DG N7 C0009 : score 4.31074 : H : ASP OD2 B0641 <- 3.35 -> DC N4 C0011 : score 5.518 >6jw4_E:Thiolase-like; title=DEGENERATE RVD RG FORMS A DISTINCT LOOP CONFORMATION organism=Xanthomonas campestris pv. armoraciae : H : ARG NH1 E0266 <- 3.41 -> DG N7 G-003 : score 5.3119 : H : ARG NH2 E0266 <- 3.44 -> DG O6 G-003 : score 5.7552 : H : ASP OD2 E0301 <- 3.17 -> DC N4 F0001 : score 5.7412 : H : ASP OD2 E0335 <- 3.13 -> DC N4 F0002 : score 5.7908 : H : ASP OD2 E0369 <- 3.05 -> DC N4 F0003 : score 5.89 : H : ASN ND2 E0505 <- 3.26 -> DG N7 F0007 : score 4.16399 : H : ASP OD2 E0539 <- 3.08 -> DC N4 F0008 : score 5.8528 : H : ASN ND2 E0573 <- 3.02 -> DG N7 F0009 : score 4.38412 : H : ASP OD2 E0641 <- 3.35 -> DC N4 F0011 : score 5.518 >6jw5_E:Thiolase-like; title=RVD Q* RECOGNIZES 5HMC THROUGH WATER-MEDIATED H BONDS organism=Xanthomonas campestris pv. armoraciae : H : ARG NH1 E0266 <- 2.86 -> DG N7 G-003 : score 5.9774 : H : ARG NH2 E0266 <- 2.90 -> DG O6 G-003 : score 6.468 : H : ASP OD2 E0301 <- 3.07 -> DC N4 F0001 : score 5.8652 : H : ASP OD2 E0335 <- 2.87 -> DC N4 F0002 : score 6.1132 : H : ASP OD2 E0369 <- 3.00 -> DC N4 F0003 : score 5.952 : H : ASN ND2 E0504 <- 2.95 -> DG N7 F0007 : score 4.44832 : H : ASP OD2 E0538 <- 2.86 -> DC N4 F0008 : score 6.1256 : H : ASN ND2 E0572 <- 2.98 -> DG N7 F0009 : score 4.4208 : H : ASP OD2 E0640 <- 2.95 -> DC N4 F0011 : score 6.014 >6jxd_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH COHESIVE END DNA TERMINI organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0040 <- 2.83 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.69 -> DG xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.31 -> DA xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.45 -> DC xxx J0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.36 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.51 -> DG xxx I0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.29 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0017 <- 3.92 -> DA xxx J-043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.49 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx >6jxd_G:Histone-fold; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH COHESIVE END DNA TERMINI organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx G0017 <- 3.92 -> DA xxx J-043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.49 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx >6jyl_E:Histone-fold; title=THE CROSSLINKED COMPLEX OF ISWI-NUCLEOSOME IN THE ADP.BEF-BOUND STATE organism=? : H : ARG NH2 E0040 <- 3.35 -> DT O2 J0083 : score 3.76767 >6jyw_AB:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRANSCRIPTION REGULATOR CADR N81M MUTANT FROM P. PUTIDA IN COMPLEX WITH CADMIUM(II) AND DNA organism=PSEUDOMONAS PUTIDA : H : TYR OH A0036 <- 2.83 -> DG N2 D0021 : score 4.8604 : H : TYR OH B0036 <- 2.78 -> DG N2 C0021 : score 4.9093 : x : GLU xxxx A0015 <- 4.24 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0018 <- 3.55 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0019 <- 3.14 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0015 <- 4.31 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0018 <- 3.45 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0019 <- 3.18 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >6jyw_B:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRANSCRIPTION REGULATOR CADR N81M MUTANT FROM P. PUTIDA IN COMPLEX WITH CADMIUM(II) AND DNA organism=? : H : TYR OH B0036 <- 2.78 -> DG N2 C0021 : score 4.9093 : x : GLU xxxx B0015 <- 4.31 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0018 <- 3.45 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0019 <- 3.18 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >6k1i_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH GAMMAH2A.X VARIANT organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 E0040 <- 3.33 -> DG N3 I0009 : score 2.72899 : x : ARG xxxx A0040 <- 2.26 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.87 -> DG xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.27 -> DA xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.26 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.45 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.48 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.38 -> DA xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0017 <- 4.33 -> DA xxx J-043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.17 -> DG xxx J-037 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0027 <- 3.48 -> DT xxx I-028 : score x.xxxxx >6k1i_G:Histone-fold; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH GAMMAH2A.X VARIANT organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx G0017 <- 4.33 -> DA xxx J-043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.17 -> DG xxx J-037 : score x.xxxxx >6k1j_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH H2A.X VARIANT organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.93 -> DA N3 J0009 : score 3.15551 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.10 -> DA N3 I0009 : score 3.04536 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.25 -> DT xxx J-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.04 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.99 -> DA xxx J0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.35 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.33 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.23 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.96 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.80 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.32 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.30 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0036 <- 4.01 -> DT xxx I0049 : score x.xxxxx >6k1k_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH H2A.X S139E VARIANT organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.15 -> DT O2 J0009 : score 3.937 : H : ARG NH2 G0011 <- 3.41 -> DT O2 J-042 : score 3.71687 : x : ARG xxxx B0045 <- 4.25 -> DA xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.86 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0124 <- 3.69 -> DA xxx I-072 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.51 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0063 <- 4.47 -> DA xxx I0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.23 -> DA xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.30 -> DG xxx J-037 : score x.xxxxx >6k1k_C:Histone-fold; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH H2A.X S139E VARIANT organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx C0042 <- 3.86 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0124 <- 3.69 -> DA xxx I-072 : score x.xxxxx >6k1p_D:Histone-fold; title=THE COMPLEX OF ISWI-NUCLEOSOME IN THE ADP.BEF-BOUND STATE organism=? : x : ARG xxxx D0030 <- 3.48 -> DG xxx I0122 : score x.xxxxx >6k3z_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF DCAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND DNA (TGA PAM) organism=Streptococcus pyogenes serotype M1 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.26 -> DG N7 D0006 : score 5.4934 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.78 -> DG N7 D0006 : score 6.41015 : H : ARG NH1 B1335 <- 2.90 -> DT O4 D0008 : score 3.20259 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.88 -> DA N7 D0007 : score 1.64505 : x : LYS xxxx B1107 <- 2.95 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1219 <- 4.08 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx >6k4p_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF XCAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND DNA (TGG PAM) organism=Streptococcus pyogenes serotype M1 : H : LYS NZ B1107 <- 3.00 -> DC O2 C0007 : score 2.82831 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.07 -> DG N7 D0006 : score 5.7233 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.79 -> DG O6 D0006 : score 6.6132 : H : ARG NH1 B1335 <- 3.08 -> DG O6 D0007 : score 5.74267 : H : ARG NH2 B1335 <- 3.37 -> DG N7 D0007 : score 5.65677 >6k4q_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF XCAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND DNA (CGG PAM) organism=Streptococcus pyogenes serotype M1 : H : LYS NZ B1107 <- 3.04 -> DC O2 C0007 : score 2.80474 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.25 -> DG N7 D0006 : score 5.5055 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.77 -> DG O6 D0006 : score 6.6396 : H : ARG NH1 B1335 <- 2.87 -> DG O6 D0007 : score 5.99817 : H : ARG NH2 B1335 <- 3.10 -> DG N7 D0007 : score 6.00154 >6k4s_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF XCAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND DNA (TGC PAM) organism=Streptococcus pyogenes serotype M1 : H : LYS NZ B1107 <- 2.94 -> DA N3 C0008 : score 2.69917 : H : ARG NH2 B1333 <- 3.02 -> DG O6 D0006 : score 6.3096 : V : ARG CZ B1335 <- 3.85 -> DT C7 C0004 : score 2.10565 >6k4u_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF XCAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND DNA (TGA PAM) organism=Streptococcus pyogenes serotype M1 : H : LYS NZ B1107 <- 3.10 -> DC O2 C0007 : score 2.76938 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.98 -> DG O6 D0006 : score 6.3624 : V : ARG CZ B1335 <- 3.68 -> DT C7 C0004 : score 2.19628 >6k4y_CDFIM: title=CRYOEM STRUCTURE OF SIGMA APPROPRIATION COMPLEX organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T4 / ESCHERICHIA COLI K-12 : H : ASP OD2 F0096 <- 3.01 -> DG N2 N0042 : score 5.2297 : H : ARG NH2 F0099 <- 2.79 -> DG O6 N0043 : score 6.6132 : H : ARG NH2 M0101 <- 2.45 -> DG N3 T0050 : score 3.86297 : H : ARG NH2 M0135 <- 3.11 -> DG O6 N0016 : score 6.1908 : V : ARG CZ M0150 <- 3.51 -> DT C7 T0042 : score 2.2869 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.35 -> DG xxx N0048 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.12 -> DT xxx N0047 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.37 -> DT xxx N0047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0201 <- 4.05 -> DG xxx N0045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 4.21 -> DG xxx N0043 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 4.04 -> DG xxx N0042 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 3.90 -> DG xxx N0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0451 <- 4.32 -> DG xxx N0048 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.53 -> DG xxx N0048 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.40 -> DG xxx N0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 3.30 -> DG xxx N0043 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.34 -> DG xxx N0042 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.43 -> DG xxx N0041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.26 -> DT xxx N0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0385 <- 2.94 -> DG xxx N0041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 3.42 -> DT xxx N0040 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0401 <- 4.24 -> DG xxx N0042 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 3.87 -> DA xxx N0036 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 3.20 -> DA xxx N0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 3.05 -> DA xxx N0036 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 4.08 -> DA xxx N0036 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0426 <- 3.88 -> DT xxx N0040 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 3.25 -> DT xxx N0040 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.14 -> DA xxx N0038 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.33 -> DA xxx N0036 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0432 <- 3.49 -> DA xxx N0039 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.33 -> DT xxx N0035 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0434 <- 4.06 -> DT xxx N0035 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0437 <- 2.92 -> DT xxx N0034 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 4.19 -> DA xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0441 <- 4.18 -> DT xxx N0031 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0454 <- 3.94 -> DT xxx N0031 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0455 <- 3.85 -> DT xxx N0029 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0458 <- 4.15 -> DC xxx T0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0052 <- 4.03 -> DC xxx N0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0055 <- 4.22 -> DA xxx T0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0098 <- 3.99 -> DG xxx N0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx M0165 <- 3.27 -> DA xxx T0040 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx M0187 <- 3.67 -> DT xxx N0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx M0189 <- 3.79 -> DT xxx N0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx M0191 <- 3.64 -> DT xxx N0018 : score x.xxxxx >6k4y_I:Anti-sigma_factor_AsiA; title=CRYOEM STRUCTURE OF SIGMA APPROPRIATION COMPLEX organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T4 : x : ASN xxxx I0052 <- 4.03 -> DC xxx N0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0055 <- 4.22 -> DA xxx T0048 : score x.xxxxx >6k57_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF DCAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND DNA (CGA PAM) organism=Streptococcus pyogenes serotype M1 : H : LYS NZ B1107 <- 3.08 -> DC O2 C0007 : score 2.78117 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.25 -> DG N7 D0006 : score 5.5055 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.72 -> DG O6 D0006 : score 6.7056 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.91 -> DA N7 D0007 : score 1.63502 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.16 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx >6kbz_B:BB1717-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF YEDK WITH SSDNA CONTAINING A TETRAHYDROFURAN ABASIC SITE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 B0004 <- 3.25 -> DG N3 A0003 : score 2.77783 : x : ALA xxxx B0039 <- 4.15 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0040 <- 3.56 -> DG xxx A0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0074 <- 3.66 -> DG xxx A0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0211 <- 3.18 -> DG xxx A0003 : score x.xxxxx >6kbz_BF:BB1717-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF YEDK WITH SSDNA CONTAINING A TETRAHYDROFURAN ABASIC SITE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 B0004 <- 3.25 -> DG N3 A0003 : score 2.77783 : H : ARG NH1 F0004 <- 3.11 -> DG N3 E0003 : score 2.86331 : x : ALA xxxx B0039 <- 4.15 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0040 <- 3.56 -> DG xxx A0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0074 <- 3.66 -> DG xxx A0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0211 <- 3.18 -> DG xxx A0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0039 <- 4.10 -> DC xxx A0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0040 <- 3.63 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0074 <- 3.80 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0211 <- 3.22 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx >6kbz_DH:BB1717-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF YEDK WITH SSDNA CONTAINING A TETRAHYDROFURAN ABASIC SITE organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 D0004 <- 3.06 -> DG N3 C0003 : score 2.89383 : H : ARG NH1 H0004 <- 3.07 -> DG N3 G0003 : score 2.88773 : x : ALA xxxx D0039 <- 4.07 -> DC xxx G0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0040 <- 3.65 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0074 <- 3.71 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0211 <- 3.20 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0039 <- 4.02 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0040 <- 3.66 -> DG xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0074 <- 3.73 -> DG xxx G0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx H0211 <- 3.25 -> DG xxx G0003 : score x.xxxxx >6kc7_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NME1CAS9 IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA (ATATGATT PAM) IN SEED-BASE PARING STATE organism=Neisseria meningitidis 8013 : H : GLN OE1 A0981 <- 2.76 -> DA N6 C0004 : score 6.10098 : H : GLN NE2 A0981 <- 2.98 -> DA N7 C0004 : score 5.87051 : H : HIS NE2 A1024 <- 2.82 -> DG O6 D0005 : score 7.92203 : x : MET xxxx A0844 <- 4.17 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1027 <- 3.17 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1029 <- 3.59 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx >6kco_KL: title=SHUGUO PWWP IN COMPLEX WITH SSDNA organism=? : H : THR OG1 L0046 <- 2.47 -> DT O4 L0165 : score 4.14373 : H : GLU OE1 L0048 <- 3.05 -> DT N3 L0165 : score 1.66128 >6kcs_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIRAN DOMAIN OF HLTF IN COMPLEX WITH DUPLEX DNA organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0073 <- 2.77 -> DG N7 B0013 : score 4.3129 : H : ASN ND2 A0091 <- 2.83 -> DT O2 B0014 : score 4.71768 : V : TYR CD1 A0093 <- 3.86 -> DT C7 B0014 : score 4.61081 : x : TYR xxxx A0072 <- 3.06 -> DG xxx B0013 : score x.xxxxx : x : 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REVERSE TRANSCRIPTASE WITH Q151M/Y115F/F116Y:DNA:DCTP TERNARY COMPLEX organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 / HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH C0183 <- 2.92 -> DG N2 F0032 : score 4.77239 : H : TYR OH C0183 <- 2.68 -> DG N3 F0032 : score 3.18884 : V : TRP CD1 C0024 <- 3.81 -> DT C7 F-001 : score 7.315 : x : PHE xxxx C0061 <- 3.80 -> DG xxx F0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0074 <- 3.61 -> DG xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0076 <- 3.88 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0078 <- 3.27 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0094 <- 3.34 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0151 <- 3.91 -> DG xxx F0000 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 3.77 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.37 -> DG xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.49 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.44 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0501 <- 3.81 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx 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xxx E0016 : score x.xxxxx >6kdn_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH Q151M/Y115F/F116Y:DNA:DGTP TERNARY COMPLEX organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 / HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH C0183 <- 3.10 -> DG N2 F0032 : score 4.59636 : H : TYR OH C0183 <- 2.69 -> DG N3 F0032 : score 3.18261 : w : ASN ND2 C0265 <- 6.52 -> DG N3 F0029 : score 2.566 : H : ARG NH2 C0448 <- 2.72 -> DT O2 F0018 : score 4.30107 : V : TRP CD1 C0024 <- 3.78 -> DT C7 F-001 : score 7.37 : x : PHE xxxx C0061 <- 3.67 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0063 <- 3.98 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0074 <- 3.50 -> DC xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0076 <- 3.82 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0078 <- 3.49 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0094 <- 3.36 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.15 -> DG xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.40 -> DC xxx F0033 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.81 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0501 <- 3.80 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx >6kdo_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH Q151M/Y115F/F116Y/M184V/F160M:DNA:LAMIVUDINE 5'-TRIPHOSPHATE TERNARY COMPLEX organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 / HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.87 -> DG N2 E0032 : score 4.82129 : H : TYR OH A0183 <- 2.57 -> DG N3 E0032 : score 3.25735 : V : PHE CD1 A0061 <- 3.56 -> DT C7 E-001 : score 4.39982 : x : TRP xxxx A0024 <- 3.27 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.95 -> DG xxx E0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0078 <- 3.97 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.23 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0151 <- 3.91 -> DG xxx E0000 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.75 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 2.99 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx 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C0076 <- 3.74 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0094 <- 3.33 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0151 <- 3.84 -> DG xxx F0000 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 3.70 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.46 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.54 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0501 <- 3.89 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx >6kdv_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF TTCAS1-DNA COMPLEX organism=Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) / Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) : x : HIS xxxx A0027 <- 3.02 -> DC xxx H0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0060 <- 4.19 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0084 <- 3.41 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx >6kdv_CD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF TTCAS1-DNA COMPLEX organism=Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) / Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) / Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) / Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) : x : HIS xxxx C0027 <- 3.54 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0060 <- 4.34 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0084 <- 3.21 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx >6ke9_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE HUMAN TELOMERIC NUCLEOSOME DISPLAYS DISTINCT STRUCTURAL AND DYNAMIC PROPERTIES organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.88 -> DA N3 J0009 : score 3.18791 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.89 -> DC O2 J-008 : score 3.63214 : x : TYR xxxx A0041 <- 3.76 -> DC xxx J-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.11 -> DG xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.28 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.63 -> DT xxx J0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 3.93 -> DA xxx J0057 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.58 -> DG xxx I-047 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0036 <- 4.46 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>6khy_A:Xylose_isomerase-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVAP:AG organism=African swine fever virus (isolate Tick/South Africa/Pretoriuskop Pr4/1996) / African swine fever virus (isolate Tick/South Africa/Pretoriuskop Pr4/1996) : x : ARG xxxx A0050 <- 3.33 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0081 <- 3.26 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0082 <- 3.41 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx >6khy_AB:Xylose_isomerase-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVAP:AG organism=African swine fever virus (isolate Tick/South Africa/Pretoriuskop Pr4/1996) / African swine fever virus (isolate Tick/South Africa/Pretoriuskop Pr4/1996) / African swine fever virus (isolate Tick/South Africa/Pretoriuskop Pr4/1996) / African swine fever virus (isolate Tick/South Africa/Pretoriuskop Pr4/1996) : x : ARG xxxx A0050 <- 3.33 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0081 <- 3.26 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0082 <- 3.41 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx >6ki3_B:Xylose_isomerase-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVAP:DF COMMPLEX organism=African swine fever virus (isolate Tick/South Africa/Pretoriuskop Pr4/1996) / African swine fever virus (isolate Tick/South Africa/Pretoriuskop Pr4/1996) : x : PRO xxxx B0049 <- 3.94 -> DC xxx G0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0050 <- 3.22 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0051 <- 3.77 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx >6ki6_B:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BCL11A IN COMPLEX WITH GAMMA-GLOBIN -115 HPFH REGION organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 B0756 <- 2.74 -> DA N6 F0010 : score 6.09406 : H : ASN ND2 B0756 <- 2.94 -> DA N7 F0010 : score 5.70614 : H : GLN NE2 B0781 <- 2.71 -> DG O6 E0006 : score 5.90962 : H : GLN NE2 B0781 <- 3.11 -> DT O4 F0008 : score 4.86918 : H : SER OG B0783 <- 3.12 -> DG N7 E0006 : score 4.1952 : H : LYS NZ B0784 <- 2.99 -> DG N7 F0007 : score 5.18123 : H : LYS NZ B0784 <- 2.54 -> DG O6 F0007 : score 6.08137 : H : LYS NZ B0784 <- 2.93 -> DT O4 F0008 : score 3.49391 : H : ARG NH1 B0787 <- 2.71 -> DG N7 F0006 : score 6.1589 : H : ARG NH2 B0787 <- 2.63 -> DG O6 F0006 : score 6.8244 : V : SER CB B0755 <- 3.71 -> DT C7 E0004 : score 3.20174 : x : ASN xxxx B0753 <- 3.23 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0759 <- 4.04 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0782 <- 3.98 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx >6kiu_ABCDEFGH: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN MLL1-UBNCP COMPLEX (3.2 ANGSTROM) organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 D0030 <- 3.43 -> DT O2 I0027 : score 3.69993 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.21 -> DG xxx J0082 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.52 -> DG xxx I0083 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.95 -> DG xxx I0122 : score x.xxxxx >6kiu_D:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN MLL1-UBNCP COMPLEX (3.2 ANGSTROM) organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 D0030 <- 3.43 -> DT O2 I0027 : score 3.69993 >6kiv_ABCDEFGH: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN MLL1-UBNCP COMPLEX (4.0 ANGSTROM) organism=XENOPUS LAEVIS : V : SER CB C0122 <- 3.69 -> DT C7 I0002 : score 3.21739 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.24 -> DT xxx J0083 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.81 -> DC xxx J0123 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 2.77 -> DG xxx I0083 : score x.xxxxx >6kiv_D:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN MLL1-UBNCP COMPLEX (4.0 ANGSTROM) organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx D0030 <- 3.81 -> DC xxx J0123 : score x.xxxxx >6kiw_ABCDEFGH: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN MLL3-UBNCP COMPLEX (4.0 ANGSTROM) organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 A0040 <- 3.19 -> DT O2 J0083 : score 3.97051 : x : ARG xxxx D0030 <- 3.43 -> DC xxx J0123 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.49 -> DG xxx I0083 : score x.xxxxx >6kiw_D:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN MLL3-UBNCP COMPLEX (4.0 ANGSTROM) organism=? : x : ARG xxxx D0030 <- 3.43 -> DC xxx J0123 : score x.xxxxx >6kix_ABCDEFGH: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN MLL1-NCP COMPLEX, BINDING MODE1 organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.36 -> DT O2 J0083 : score 4.60587 : x : ARG xxxx D0030 <- 3.53 -> DT xxx I0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.00 -> DG xxx I0083 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.43 -> DC xxx I0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.26 -> DC xxx I0123 : score x.xxxxx >6kix_D:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN MLL1-NCP COMPLEX, BINDING MODE1 organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx D0030 <- 3.53 -> DT xxx I0027 : score x.xxxxx >6kj6_CDF: title=CRYO-EM STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI CRL TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI K-12 / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NH1 C0371 <- 2.81 -> DG O6 H0044 : score 6.07117 : H : SER OG C0508 <- 3.42 -> DT O2 G0021 : score 3.23895 : H : SER OG F0143 <- 2.91 -> DT O4 H0041 : score 3.47692 : H : ARG NH2 F0156 <- 2.65 -> DG O6 H0034 : score 6.798 : H : LYS NZ F0173 <- 2.72 -> DG N7 G0027 : score 5.47207 : V : HIS CG F0170 <- 3.57 -> DT C7 H0031 : score 3.17142 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.59 -> DG xxx H0049 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.17 -> DT xxx H0048 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 4.48 -> DT xxx H0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 4.16 -> DT xxx H0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0201 <- 3.26 -> DC xxx H0047 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 3.41 -> DG xxx H0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0451 <- 3.53 -> DG xxx H0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0478 <- 4.20 -> DA xxx G0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0496 <- 3.93 -> DT xxx G0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 4.09 -> DG xxx H0050 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.77 -> DG xxx H0049 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.80 -> DT xxx G0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.29 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 4.18 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0058 <- 3.99 -> DG xxx H0043 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0059 <- 3.10 -> DG xxx H0043 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0062 <- 4.08 -> DG xxx H0043 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0065 <- 3.57 -> DG xxx H0042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0070 <- 3.36 -> DT xxx H0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0100 <- 2.97 -> DG xxx H0042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0101 <- 3.67 -> DT xxx H0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0108 <- 3.96 -> DA xxx G0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0134 <- 4.18 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0135 <- 3.92 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0138 <- 3.81 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0140 <- 3.83 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0141 <- 4.10 -> DT xxx H0041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0144 <- 3.59 -> DA xxx H0039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0145 <- 3.80 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0147 <- 4.44 -> DA xxx H0040 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0148 <- 3.53 -> DT xxx H0036 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0149 <- 3.69 -> DT xxx H0036 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0152 <- 3.66 -> DC xxx H0035 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0169 <- 4.29 -> DT xxx H0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0183 <- 4.35 -> DA xxx G0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0216 <- 3.54 -> DT xxx G0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0218 <- 3.11 -> DA xxx G0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0226 <- 3.48 -> DG xxx G0020 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0237 <- 4.28 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0300 <- 2.91 -> DT xxx G0046 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0304 <- 3.53 -> DT xxx G0046 : score x.xxxxx >6kj6_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI CRL TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX organism=? : H : SER OG F0143 <- 2.91 -> DT O4 H0041 : score 3.47692 : H : ARG NH2 F0156 <- 2.65 -> DG O6 H0034 : score 6.798 : H : LYS NZ F0173 <- 2.72 -> DG N7 G0027 : score 5.47207 : V : HIS CG F0170 <- 3.57 -> DT C7 H0031 : score 3.17142 : x : THR xxxx F0058 <- 3.99 -> DG xxx H0043 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0059 <- 3.10 -> DG xxx H0043 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0062 <- 4.08 -> DG xxx H0043 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0065 <- 3.57 -> DG xxx H0042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0070 <- 3.36 -> DT xxx H0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0100 <- 2.97 -> DG xxx H0042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0101 <- 3.67 -> DT xxx H0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0108 <- 3.96 -> DA xxx G0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0134 <- 4.18 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0135 <- 3.92 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0138 <- 3.81 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0140 <- 3.83 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0141 <- 4.10 -> DT xxx H0041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0144 <- 3.59 -> DA xxx H0039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0145 <- 3.80 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0147 <- 4.44 -> DA xxx H0040 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0148 <- 3.53 -> DT xxx H0036 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0149 <- 3.69 -> DT xxx H0036 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0152 <- 3.66 -> DC xxx H0035 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0169 <- 4.29 -> DT xxx H0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0183 <- 4.35 -> DA xxx G0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0216 <- 3.54 -> DT xxx G0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0218 <- 3.11 -> DA xxx G0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0226 <- 3.48 -> DG xxx G0020 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0237 <- 4.28 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0300 <- 2.91 -> DT xxx G0046 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0304 <- 3.53 -> DT xxx G0046 : score x.xxxxx >6kks_A:Homeodomain-like; title=STRUCTURAL INSIGHTS INTO TARGET DNA RECOGNITION BY R2R3-TYPE MYB TRANSCRIPTION FACTOR organism=Arabidopsis thaliana : H : LYS NZ A0055 <- 2.73 -> DG O6 B0014 : score 5.8617 : w : LYS NZ A0055 <- 6.43 -> DG O6 C0008 : score 3.005 : H : ASN OD1 A0106 <- 2.96 -> DA N6 B0011 : score 5.8291 : H : ASN ND2 A0106 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TRANSCRIPTION COMPLEX COMPRISING SIGMA H AND 5'-OH RNA OF 9 NT organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS H37RV : H : GLN OE1 D0287 <- 3.22 -> DC N4 H0003 : score 4.19833 : H : ARG NH2 D0291 <- 3.36 -> DG O6 G0021 : score 5.8608 : x : GLU xxxx C0460 <- 4.04 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0461 <- 3.29 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx >6kop_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS INITIAL TRANSCRIPTION COMPLEX COMPRISING SIGMA H AND 5'-OH RNA OF 9 NT organism=? : H : THR OG1 F0076 <- 2.97 -> DT N3 G0002 : score 2.26515 : H : ASN ND2 F0088 <- 3.02 -> DT O2 G0001 : score 4.53732 : x : ASP xxxx F0038 <- 3.93 -> DG xxx G0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0039 <- 3.79 -> DG xxx G0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0041 <- 4.38 -> DG xxx G0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0045 <- 3.95 -> DG xxx G0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0051 <- 4.37 -> DG xxx G0007 : score x.xxxxx : x : 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TRANSCRIPTION COMPLEX COMPRISING SIGMA H AND 5'-OH RNA OF 10 NT organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS H37RV : V : ARG CZ C0461 <- 3.85 -> DT C7 G0013 : score 2.10565 : x : GLU xxxx C0460 <- 3.97 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0287 <- 3.37 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0291 <- 4.01 -> DT xxx G0020 : score x.xxxxx >6kqd_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=THERMUS THERMOPHILUS INITIAL TRANSCRIPTION COMPLEX COMPRISING SIGMA A AND 5'-OH RNA OF 3 NT organism=? : x : GLU xxxx C0421 <- 3.80 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >6kqd_CDF: title=THERMUS THERMOPHILUS INITIAL TRANSCRIPTION COMPLEX COMPRISING SIGMA A AND 5'-OH RNA OF 3 NT organism=? : x : GLU xxxx C0421 <- 3.80 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >6kqd_MNP: title=THERMUS THERMOPHILUS INITIAL TRANSCRIPTION COMPLEX COMPRISING SIGMA A AND 5'-OH RNA OF 3 NT organism=? : x : GLU xxxx M0421 <- 3.71 -> DA xxx Q0013 : score x.xxxxx >6kqe_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=THERMUS THERMOPHILUS INITIAL TRANSCRIPTION COMPLEX COMPRISING SIGMA A AND 5'-OH RNA OF 4 NT organism=? : x : GLU xxxx C0421 <- 4.19 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx >6kqe_CDF: title=THERMUS THERMOPHILUS INITIAL TRANSCRIPTION COMPLEX COMPRISING SIGMA A AND 5'-OH RNA OF 4 NT organism=? : x : GLU xxxx C0421 <- 4.19 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx >6kqf_CDF: title=THERMUS THERMOPHILUS INITIAL TRANSCRIPTION COMPLEX COMPRISING SIGMA A AND 5'-OH RNA OF 5 NT organism=? : x : GLU xxxx C0421 <- 3.91 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 3.12 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx >6kqg_CDF: title=THERMUS THERMOPHILUS INITIAL TRANSCRIPTION COMPLEX COMPRISING SIGMA A AND 5'-OH RNA OF 6 NT organism=? : x : GLU xxxx C0421 <- 3.83 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 3.79 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >6kqh_CDF: title=THERMUS THERMOPHILUS INITIAL TRANSCRIPTION COMPLEX COMPRISING SIGMA A AND 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1.855 : w : ARG NH2 G0042 <- 5.47 -> DT O2 J0183 : score 2.261 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.94 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.30 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.14 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.46 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.46 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.05 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.74 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0032 <- 4.35 -> DT xxx J0208 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.15 -> DG xxx J0214 : score x.xxxxx >6kvd_D:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NUCLEOSOME CONTAINING H2A.J organism=HOMO SAPIENS : x : ILE xxxx D0039 <- 4.46 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx >6kvo_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CHLOROPLAST RESOLVASE IN COMPLEX WITH HOLLIDAY JUNCTION organism=NICOTIANA TABACUM : w : ASP OD2 A0183 <- 6.46 -> DA N3 F0010 : score 1.331 : x : GLN xxxx A0182 <- 4.14 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >6kw3_S:Histone-fold; title=THE CLASSA RSC-NUCLEOSOME COMPLEX organism=? : x : ALA xxxx S0012 <- 4.26 -> DT xxx V0118 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx S0042 <- 4.36 -> DA xxx U0039 : score x.xxxxx >6kw4_Y:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=THE CLASSB RSC-NUCLEOSOME COMPLEX organism=? : H : GLU OE2 Y0577 <- 3.22 -> DG N2 U0055 : score 3.94819 : H : ARG NH1 Y0868 <- 2.88 -> DG N3 W0115 : score 3.00372 : x : SER xxxx Y0840 <- 3.13 -> DC xxx U0056 : score x.xxxxx >6kxv_A:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A NUCLEOSOME CONTAINING LEISHMANIA HISTONE H3 organism=LEISHMANIA MAJOR : x : ARG xxxx A0034 <- 3.64 -> DA xxx J0229 : score x.xxxxx >6kxv_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A NUCLEOSOME CONTAINING LEISHMANIA HISTONE H3 organism=HOMO SAPIENS / LEISHMANIA MAJOR : x : ARG xxxx A0034 <- 3.64 -> DA xxx J0229 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.12 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.34 -> DT xxx I0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0034 <- 3.45 -> DG xxx I0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.33 -> DG xxx J0214 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.88 -> DT xxx J0184 : score x.xxxxx >6l2n_A:Transglycosidases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE R.PABI(Y68F-K154A)-DSDNA(GTAC-3BP-GTAC) COMPLEX organism=Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) : H : THR OG1 A0028 <- 3.29 -> DG N2 C-005 : score 3.62419 >6l2n_AB:Transglycosidases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE R.PABI(Y68F-K154A)-DSDNA(GTAC-3BP-GTAC) COMPLEX organism=Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) : H : THR OG1 A0028 <- 3.29 -> DG N2 C-005 : score 3.62419 : x : THR xxxx B0028 <- 3.67 -> DC xxx C-002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0048 <- 3.79 -> DA xxx C0000 : score x.xxxxx >6l2o_A:Transglycosidases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE R.PABI(Y68F-K154A)-DSDNA(GTAC-5BP-GTAC) COMPLEX organism=Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) : H : THR OG1 A0028 <- 2.72 -> DT O2 C-005 : score 2.75753 >6l2o_AB:Transglycosidases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE R.PABI(Y68F-K154A)-DSDNA(GTAC-5BP-GTAC) COMPLEX organism=Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) : H : THR OG1 A0028 <- 2.72 -> DT O2 C-005 : score 2.75753 : x : THR xxxx B0028 <- 3.78 -> DT xxx C-002 : score x.xxxxx >6l3g_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURAL BASIS FOR DNA UNWINDING AT FORKED DSDNA BY TWO COORDINATING PIF1 HELICASES organism=Bacteroides sp. AF32-8BH : H : HIS NE2 A0377 <- 2.93 -> DT O2 D0004 : score 5.10351 : V : PHE CD1 A0075 <- 3.60 -> DT C7 D0008 : score 4.35831 : x : HIS xxxx A0068 <- 3.33 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0074 <- 3.66 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0091 <- 3.15 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0111 <- 4.13 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0149 <- 3.60 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0151 <- 3.40 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0154 <- 4.03 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0236 <- 3.49 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0290 <- 3.77 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0361 <- 4.05 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0379 <- 3.84 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0380 <- 3.56 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0068 <- 3.27 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0074 <- 3.22 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0075 <- 3.15 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0149 <- 3.51 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0151 <- 3.53 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0236 <- 4.13 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0377 <- 4.11 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0379 <- 3.34 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0380 <- 4.12 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx >6l3g_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURAL BASIS FOR DNA UNWINDING AT FORKED DSDNA BY TWO COORDINATING PIF1 HELICASES organism=Bacteroides sp. AF32-8BH : x : HIS xxxx B0068 <- 3.27 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0074 <- 3.22 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0075 <- 3.15 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0149 <- 3.51 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0151 <- 3.53 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0236 <- 4.13 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0377 <- 4.11 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0379 <- 3.34 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0380 <- 4.12 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx >6l49_D:Histone-fold; title=H3-CA-H3 TRI-NUCLEOSOME WITH THE 22 BASE-PAIR LINKER DNA organism=HOMO SAPIENS : x : TYR xxxx D0042 <- 4.46 -> DG xxx I-053 : score x.xxxxx >6l6l_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS OF NR4A2 HOMODIMERS BINDING TO SELECTIVE NUR- RESPONSIVE ELEMENTS organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE2 A0281 <- 2.28 -> DC N4 D0018 : score 5.81298 : H : LYS NZ A0284 <- 3.15 -> DG O6 C0004 : score 5.37612 : w : LYS NZ A0288 <- 5.88 -> DG O6 C0005 : score 3.005 : H : ARG NH1 A0289 <- 3.02 -> DG N7 D0016 : score 5.7838 : x : CYS xxxx A0272 <- 3.89 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0342 <- 3.90 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx >6l6l_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS OF NR4A2 HOMODIMERS BINDING TO SELECTIVE NUR- RESPONSIVE ELEMENTS organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE2 A0281 <- 2.28 -> DC N4 D0018 : score 5.81298 : H : LYS NZ A0284 <- 3.15 -> DG O6 C0004 : score 5.37612 : w : LYS NZ A0288 <- 5.88 -> DG O6 C0005 : score 3.005 : H : ARG NH1 A0289 <- 3.02 -> DG N7 D0016 : score 5.7838 : H : GLU OE2 B0281 <- 2.46 -> DC N4 C0017 : score 5.62343 : w : GLU OE2 B0281 <- 6.30 -> DA N6 C0016 : score 2.785 : H : LYS NZ B0284 <- 2.64 -> DG O6 D0005 : score 5.96575 : H : ARG NH1 B0289 <- 3.05 -> DG N7 C0015 : score 5.7475 : H : ARG NH1 B0342 <- 2.54 -> DT O2 C0019 : score 4.53034 : x : CYS xxxx A0272 <- 3.89 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0342 <- 3.90 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0272 <- 3.60 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0288 <- 3.58 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0344 <- 3.86 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx >6l6q_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS OF NR4A2 HOMODIMERS BINDING TO SELECTIVE NUR- RESPONSIVE ELEMENTS organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE2 A0281 <- 2.51 -> DC N4 F0006 : score 5.57078 : H : ARG NH1 B0289 <- 2.64 -> DG N7 C0004 : score 6.2436 : H : ARG NH1 B0342 <- 2.58 -> DT O2 C0008 : score 4.49589 : H : ARG NH2 B0344 <- 2.32 -> DA N3 C0011 : score 3.55076 : x : CYS xxxx A0272 <- 3.82 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0284 <- 3.30 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0288 <- 4.11 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0289 <- 3.65 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0342 <- 3.88 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0344 <- 3.70 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0272 <- 3.84 -> DA xxx F0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0281 <- 2.90 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0284 <- 3.13 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0288 <- 3.46 -> DG xxx F0015 : score x.xxxxx >6l6q_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS OF NR4A2 HOMODIMERS BINDING TO SELECTIVE NUR- RESPONSIVE ELEMENTS organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 B0289 <- 2.64 -> DG N7 C0004 : score 6.2436 : H : ARG NH1 B0342 <- 2.58 -> DT O2 C0008 : score 4.49589 : H : ARG NH2 B0344 <- 2.32 -> DA N3 C0011 : score 3.55076 : x : CYS xxxx B0272 <- 3.84 -> DA xxx F0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0281 <- 2.90 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0284 <- 3.13 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0288 <- 3.46 -> DG xxx F0015 : score x.xxxxx >6l6s_AB:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=THE STRUCTURE OF THE UDGX MUTANT H109E CROSSLINKED TO SINGLE-STRANDED DNA organism=MYCOLICIBACTERIUM SMEGMATIS MC2 155 : w : THR OG1 A0111 <- 6.49 -> DG N7 C0010 : score 3.422 : w : ARG NH1 A0190 <- 6.06 -> DG N2 C0007 : score 1.082 : w : ARG NH2 A0190 <- 5.38 -> DG O6 C0007 : score 2.468 >6l6y_F:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PLURIPOTENCY REPROGRAMMING FACTOR SOX17 MUTANT (SOX17EK) HMG DOMAIN BOUND TO DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 F0070 <- 2.92 -> DT O2 C0011 : score 4.20306 : H : ARG NH1 F0070 <- 2.80 -> DC O2 E0007 : score 3.65 : H : ARG NH2 F0070 <- 2.80 -> DT O2 C0011 : score 4.23333 : H : ASN ND2 F0073 <- 2.81 -> DT O2 C0009 : score 4.73666 : H : ASN ND2 F0073 <- 3.16 -> DG N3 C0010 : score 4.54244 : H : SER OG F0099 <- 2.85 -> DA N3 C0007 : score 2.97381 : H : TYR OH F0137 <- 2.78 -> DA N3 E0006 : score 4.16789 : x : PHE xxxx F0075 <- 3.52 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0076 <- 3.21 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0083 <- 3.51 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0094 <- 3.89 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0095 <- 2.92 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0096 <- 3.75 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx >6l74_CDF: title=THERMUS THERMOPHILUS INITIAL TRANSCRIPTION COMPLEX COMPRISING SIGMA A AND 5'-TRIPHOSPHATE RNA OF 2 NT organism=? : x : ARG xxxx C0422 <- 3.66 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >6l74_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=THERMUS THERMOPHILUS INITIAL TRANSCRIPTION COMPLEX COMPRISING SIGMA A AND 5'-TRIPHOSPHATE RNA OF 2 NT organism=? : x : ARG xxxx D0628 <- 4.47 -> DC xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0705 <- 3.73 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 4.00 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.47 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 3.56 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx >6l84_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=COMPLEX OF DNA POLYMERASE IV AND D-DNA DUPLEX organism=Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) / Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) : w : TYR OH A0012 <- 5.59 -> DC O2 P0014 : score 1.343 : x : VAL xxxx A0032 <- 4.37 -> DG xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.66 -> DG xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0044 <- 3.98 -> DG xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0057 <- 3.96 -> DC xxx P0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0189 <- 4.47 -> DT xxx P0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0244 <- 3.95 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0285 <- 4.32 -> DG xxx P0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0332 <- 4.42 -> DG xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.87 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >6l8e_ABCD:YefM-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HETEROHEXAMERIC YOEB-YEFM COMPLEX BOUND TO 26BP- DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS SUBSP. AUREUS NCTC 8325 : H : ARG NH1 A0010 <- 2.96 -> DG N7 G0006 : score 5.8564 : H : ARG NH2 A0010 <- 2.86 -> DG O6 G0006 : score 6.5208 : H : GLN NE2 A0011 <- 3.35 -> DA N7 H0020 : score 5.41987 : H : ARG NH1 B0010 <- 2.49 -> DG N7 H0018 : score 6.4251 : H : ARG NH1 C0010 <- 2.83 -> DG O6 H0006 : score 6.04683 : H : ARG NH2 C0010 <- 2.91 -> DG N7 H0006 : score 6.24415 : H : GLN OE1 C0011 <- 3.17 -> DA N6 G0020 : score 5.60467 : H : GLN NE2 C0011 <- 2.99 -> DA N7 G0020 : score 5.85833 : w : GLN OE1 C0011 <- 5.42 -> DT O4 G0019 : score 3.068 : H : ARG NH1 D0010 <- 2.95 -> DG O6 G0018 : score 5.90083 : H : ARG NH2 D0010 <- 2.74 -> DG N7 G0018 : score 6.46123 : x : TYR xxxx A0006 <- 3.27 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0007 <- 3.30 -> DT xxx G0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0006 <- 3.53 -> DT xxx H0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0007 <- 3.30 -> DC xxx H0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0011 <- 3.55 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0006 <- 3.50 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0007 <- 3.32 -> DT xxx H0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0006 <- 3.47 -> DT xxx G0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0007 <- 3.58 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0011 <- 3.63 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx >6l8e_C:YefM-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HETEROHEXAMERIC YOEB-YEFM COMPLEX BOUND TO 26BP- DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS SUBSP. AUREUS NCTC 8325 : H : ARG NH1 C0010 <- 2.83 -> DG O6 H0006 : score 6.04683 : H : ARG NH2 C0010 <- 2.91 -> DG N7 H0006 : score 6.24415 : H : GLN OE1 C0011 <- 3.17 -> DA N6 G0020 : score 5.60467 : H : GLN NE2 C0011 <- 2.99 -> DA N7 G0020 : score 5.85833 : w : GLN OE1 C0011 <- 5.42 -> DT O4 G0019 : score 3.068 : x : TYR xxxx C0006 <- 3.50 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0007 <- 3.32 -> DT xxx H0004 : score x.xxxxx >6l8e_IJKL:YefM-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HETEROHEXAMERIC YOEB-YEFM COMPLEX BOUND TO 26BP- DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS SUBSP. AUREUS NCTC 8325 : H : ARG NH1 I0010 <- 2.93 -> DG O6 P0006 : score 5.92517 : H : ARG NH2 I0010 <- 2.96 -> DG N7 P0006 : score 6.18031 : H : GLN OE1 I0011 <- 3.14 -> DA N6 O0020 : score 5.64099 : H : GLN NE2 I0011 <- 3.04 -> DA N7 O0020 : score 5.79744 : w : GLN OE1 I0011 <- 5.77 -> DT O4 O0019 : score 3.068 : H : ARG NH1 J0010 <- 2.79 -> DG O6 O0018 : score 6.0955 : H : ARG NH2 J0010 <- 2.70 -> DG N7 O0018 : score 6.51231 : w : ARG NH1 J0010 <- 6.35 -> DA N6 P0008 : score 1.486 : w : GLN OE1 J0011 <- 5.73 -> DA N6 P0008 : score 3.392 : H : ARG NH1 K0010 <- 3.17 -> DG O6 O0006 : score 5.63317 : H : ARG NH2 K0010 <- 3.00 -> DG N7 O0006 : score 6.12923 : H : GLN NE2 K0011 <- 3.49 -> DA N7 P0020 : score 5.24936 : H : ARG NH1 L0010 <- 3.41 -> DG O6 P0018 : score 5.34117 : H : ARG NH2 L0010 <- 2.87 -> DG N7 P0018 : score 6.29523 : x : TYR xxxx I0006 <- 3.30 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0007 <- 3.36 -> DT xxx P0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0006 <- 3.42 -> DT xxx O0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0007 <- 3.56 -> DT xxx O0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx K0006 <- 3.44 -> DT xxx O0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0007 <- 3.40 -> DT xxx O0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0006 <- 3.69 -> DT xxx P0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0007 <- 3.24 -> DC xxx P0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0011 <- 3.54 -> DT xxx O0007 : score x.xxxxx >6l9h_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE HUMAN TELOMERIC NUCLEOSOME DISPLAYS DISTINCT STRUCTURAL AND DYNAMIC PROPERTIES organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.82 -> DA N3 J0009 : score 3.22678 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.72 -> DT O2 I0009 : score 4.30107 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.20 -> DC O2 J-008 : score 3.40282 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.47 -> DC xxx J-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.12 -> DG xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.00 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.75 -> DT xxx J0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.40 -> DG xxx I-047 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0039 <- 3.53 -> DG xxx I-053 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0043 <- 4.29 -> DC xxx J-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.13 -> DG xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.20 -> DG xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.36 -> DC xxx J-055 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.48 -> DG xxx I0049 : score x.xxxxx >6l9h_B:Histone-fold; title=THE HUMAN TELOMERIC NUCLEOSOME DISPLAYS DISTINCT STRUCTURAL AND DYNAMIC PROPERTIES organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0045 <- 4.00 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx >6l9z_C:Histone-fold; title=338 BP DI-NUCLEOSOME ASSEMBLED WITH LINKER HISTONE H1.X organism=? : x : ARG xxxx C0011 <- 3.43 -> DT xxx I0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.03 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >6la2_g:Histone-fold; title=343 BP DI-NUCLEOSOME HARBORING COHESIVE DNA TERMINI ASSEMBLED WITH LINKER HISTONE H1.0 organism=? : x : ARG xxxx g0011 <- 3.27 -> DG xxx d0215 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx g0042 <- 3.48 -> DT xxx c0121 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx g0077 <- 4.15 -> DA xxx c0140 : score x.xxxxx >6la8_R:Histone-fold; title=349 BP DI-NUCLEOSOME HARBORING COHESIVE DNA TERMINI ASSEMBLED WITH LINKER HISTONE H1.0 organism=? : x : LYS xxxx R0030 <- 3.92 -> DT xxx I0232 : score x.xxxxx >6la9_A:Histone-fold; title=349 BP DI-NUCLEOSOME HARBORING COHESIVE DNA TERMINI ASSEMBLED WITH LINKER HISTONE H1.0 (HIGH CRYOPROTECTANT) organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 3.24 -> DT O2 J0269 : score 3.8608 >6lab_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=169 BP NUCLEOSOME, HARBORING COHESIVE DNA TERMINI, ASSEMBLED WITH LINKER HISTONE H1.0 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.12 -> DT O2 J0009 : score 3.9624 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.68 -> DT O2 I0009 : score 4.33493 : x : ARG xxxx A0042 <- 3.95 -> DA xxx I0071 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0043 <- 4.09 -> DT xxx I-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.69 -> DA xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.22 -> DG xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0063 <- 4.17 -> DA xxx I0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0035 <- 4.26 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.20 -> DA xxx I0006 : score x.xxxxx >6lab_KLMNOPQR:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=169 BP NUCLEOSOME, HARBORING COHESIVE DNA TERMINI, ASSEMBLED WITH LINKER HISTONE H1.0 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 O0040 <- 2.91 -> DT O2 S0009 : score 4.21167 : x : ARG xxxx K0040 <- 3.60 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx K0043 <- 4.12 -> DT xxx S-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0045 <- 4.09 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0042 <- 3.76 -> DG xxx S-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0042 <- 3.52 -> DG xxx S0038 : score x.xxxxx >6lab_M:Histone-fold; title=169 BP NUCLEOSOME, HARBORING COHESIVE DNA TERMINI, ASSEMBLED WITH LINKER HISTONE H1.0 organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx M0042 <- 3.76 -> DG xxx S-037 : score x.xxxxx >6lab_UV:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=169 BP NUCLEOSOME, HARBORING COHESIVE DNA TERMINI, ASSEMBLED WITH LINKER HISTONE H1.0 organism=HOMO SAPIENS : x : PRO xxxx U0101 <- 3.98 -> DG xxx i0339 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx V0040 <- 3.05 -> DA xxx i0338 : score x.xxxxx >6lae_A:Putative_DNA-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA-BINDING DOMAIN OF HUMAN XPA IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : x : THR xxxx A0142 <- 3.85 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0169 <- 3.92 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0175 <- 3.01 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx >6lae_AB:Putative_DNA-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA-BINDING DOMAIN OF HUMAN XPA IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : x : THR xxxx A0142 <- 3.85 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0169 <- 3.92 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0175 <- 3.01 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0142 <- 3.21 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0175 <- 3.20 -> DC xxx D0011 : score x.xxxxx >6lb3_ABGH:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PA4674 IN COMPLEX WITH ITS OPERATOR DNA (18BP) FROM PSEUDOMONAS AERUGINOSA organism=? : w : THR OG1 B0040 <- 5.73 -> DG N7 J0010 : score 3.422 : w : ARG NH2 B0049 <- 5.46 -> DG N7 J0010 : score 2.18 : V : ALA CB B0038 <- 3.85 -> DT C7 I0006 : score 5.52899 : V : PRO CG G0039 <- 3.83 -> DT C7 I0011 : score 6.31128 : V : ALA CB G0038 <- 3.84 -> DT C7 J0006 : score 5.54298 : V : PRO CG B0039 <- 3.80 -> DT C7 J0011 : score 6.35897 : x : ARG xxxx A0049 <- 3.63 -> DG xxx I0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0037 <- 3.37 -> DG xxx J0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0042 <- 3.76 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0028 <- 4.34 -> DT xxx J0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0037 <- 3.31 -> DG xxx I0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0042 <- 4.01 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0049 <- 3.31 -> DC xxx I0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0037 <- 3.49 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0039 <- 3.52 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0049 <- 3.26 -> DC xxx J0016 : score x.xxxxx >6lb3_D:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PA4674 IN COMPLEX WITH ITS OPERATOR DNA (18BP) FROM PSEUDOMONAS AERUGINOSA organism=? : V : PRO CG D0039 <- 3.84 -> DT C7 L0011 : score 6.29538 : x : ALA xxxx D0028 <- 4.33 -> DT xxx K0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0037 <- 3.35 -> DG xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0038 <- 3.97 -> DT xxx K0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0042 <- 3.92 -> DT xxx K0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0049 <- 3.58 -> DC xxx L0009 : score x.xxxxx >6lb3_DEF:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PA4674 IN COMPLEX WITH ITS OPERATOR DNA (18BP) FROM PSEUDOMONAS AERUGINOSA organism=? : V : ALA CB E0038 <- 3.63 -> DT C7 L0006 : score 5.83693 : V : PRO CG D0039 <- 3.84 -> DT C7 L0011 : score 6.29538 : V : PRO CG E0039 <- 3.85 -> DT C7 K0011 : score 6.27949 : x : ALA xxxx D0028 <- 4.33 -> DT xxx K0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0037 <- 3.35 -> DG xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0038 <- 3.97 -> DT xxx K0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0042 <- 3.92 -> DT xxx K0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0049 <- 3.58 -> DC xxx L0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0037 <- 3.44 -> DT xxx K0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0042 <- 3.90 -> DT xxx L0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0049 <- 3.39 -> DC xxx K0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0049 <- 3.72 -> DC xxx L0016 : score x.xxxxx >6lbi_CD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FOXO1-DBD HOMODIMER BOUND TO A PALINDROMIC DNA SEQUENCE organism=HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 C0211 <- 3.25 -> DA N6 B0007 : score 5.47983 : H : HIS NE2 D0215 <- 2.86 -> DT O4 B0015 : score 5.54167 : V : ARG CB D0214 <- 3.82 -> DT C7 B0013 : score 1.0001 : x : SER xxxx C0212 <- 3.58 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0214 <- 3.86 -> DG xxx A0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0215 <- 3.22 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0218 <- 3.65 -> DT xxx A0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0206 <- 4.10 -> DT xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0211 <- 3.39 -> DA xxx A0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0212 <- 3.75 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0218 <- 3.44 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx >6lbi_G:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FOXO1-DBD HOMODIMER BOUND TO A PALINDROMIC DNA SEQUENCE organism=? : H : ASN OD1 G0211 <- 3.24 -> DA N6 F0007 : score 5.49188 : V : ARG CZ G0214 <- 3.86 -> DT C7 E0011 : score 2.10032 : V : SER CB G0212 <- 3.86 -> DT C7 F0005 : score 3.08431 : x : HIS xxxx G0215 <- 3.03 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0218 <- 3.92 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx >6lbi_GH:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FOXO1-DBD HOMODIMER BOUND TO A PALINDROMIC DNA SEQUENCE organism=HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 G0211 <- 3.24 -> DA N6 F0007 : score 5.49188 : H : ASN OD1 H0211 <- 3.21 -> DA N6 E0007 : score 5.52801 : H : ASN ND2 H0211 <- 2.86 -> DA N7 E0007 : score 5.80007 : H : HIS ND1 H0215 <- 3.17 -> DT O4 F0014 : score 4.37119 : V : ARG CZ G0214 <- 3.86 -> DT C7 E0011 : score 2.10032 : V : SER CB G0212 <- 3.86 -> DT C7 F0005 : score 3.08431 : V : ARG CB H0214 <- 3.74 -> DT C7 F0013 : score 1.02021 : x : HIS xxxx G0215 <- 3.03 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0218 <- 3.92 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0212 <- 3.47 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0218 <- 3.67 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0219 <- 3.94 -> DT xxx F0015 : score x.xxxxx >6lbi_KL:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FOXO1-DBD HOMODIMER BOUND TO A PALINDROMIC DNA SEQUENCE organism=? : H : ASN OD1 L0211 <- 3.00 -> DA N6 I0007 : score 5.78092 : H : ASN ND2 L0211 <- 3.13 -> DA N7 I0006 : score 5.48306 : H : ARG NE L0214 <- 3.26 -> DG N7 J0012 : score 4.01499 : V : SER CB L0212 <- 3.87 -> DT C7 I0005 : score 3.07648 : x : SER xxxx K0205 <- 3.20 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx K0211 <- 3.49 -> DA xxx J0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0212 <- 3.29 -> DT xxx J0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0214 <- 3.31 -> DG xxx I0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx K0215 <- 3.06 -> DT xxx I0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0218 <- 3.82 -> DT xxx I0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0215 <- 3.11 -> DT xxx I0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0218 <- 4.08 -> DT xxx J0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0219 <- 4.49 -> DT xxx J0014 : score x.xxxxx >6lbm_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FOXC2-DBD BOUND TO A PALINDROMIC DNA SEQUENCE organism=HOMO SAPIENS : x : ASN xxxx C0118 <- 3.36 -> DA xxx A0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0119 <- 3.66 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0121 <- 3.63 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0122 <- 2.93 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0125 <- 3.66 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx >6lbr_A:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF YEAST CDC13 AND SSDNA organism=KLUYVEROMYCES LACTIS : H : ASN OD1 A0570 <- 3.01 -> DT N3 C0012 : score 3.64163 : H : ASP OD1 A0574 <- 2.86 -> DG N2 C0014 : score 5.0882 : H : ARG NH1 A0583 <- 3.00 -> DG N7 C0014 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0583 <- 2.87 -> DG O6 C0014 : score 6.5076 : H : ASN OD1 A0597 <- 2.60 -> DT N3 C0007 : score 3.95333 : H : ASN ND2 A0597 <- 3.25 -> DT O4 C0007 : score 4.809 : H : ARG NE A0598 <- 2.46 -> DT O4 C0007 : score 1.98538 : H : ARG NH1 A0598 <- 3.13 -> DT O4 C0007 : score 3.05226 : H : MET SD A0612 <- 3.21 -> DT N3 C0020 : score 4.28988 : H : LYS NZ A0620 <- 3.03 -> DT O2 C0016 : score 3.42217 : H : ARG NH2 A0628 <- 2.80 -> DG N7 C0019 : score 6.38462 : H : ARG NH2 A0628 <- 2.64 -> DG O6 C0019 : score 6.8112 : H : LYS NZ A0637 <- 2.54 -> DT O4 C0008 : score 3.77371 : H : GLN OE1 A0639 <- 3.10 -> DG N2 C0009 : score 5.27123 : H : ASN OD1 A0646 <- 3.00 -> DT N3 C0008 : score 3.64923 : H : ASN ND2 A0646 <- 2.71 -> DT O2 C0008 : score 4.83158 >6lc1_AD:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS OF NR4A1 BOUND TO THE HUMAN PITUITARY PROOPIOMELANOCORTIN GENE PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : GLU OE1 A0285 <- 3.27 -> DC N4 C0007 : score 5.22576 : H : LYS NZ A0288 <- 2.48 -> DT O4 F0020 : score 3.81676 : H : ARG NH1 A0293 <- 2.99 -> DG N7 C0005 : score 5.8201 : H : ARG NH1 A0346 <- 2.80 -> DT O2 C0009 : score 4.30641 : H : LYS NZ D0288 <- 3.14 -> DT O4 F0006 : score 3.34325 : H : LYS NZ D0288 <- 3.18 -> DT O4 C0021 : score 3.31455 : H : ARG NH1 D0293 <- 2.89 -> DG N7 F0004 : score 5.9411 : H : ARG NH1 D0346 <- 3.05 -> DT O2 F0008 : score 4.09109 : x : CYS xxxx A0276 <- 4.09 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0279 <- 4.50 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0292 <- 3.58 -> DG xxx F0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0348 <- 2.45 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0276 <- 4.20 -> DA xxx C0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0279 <- 3.90 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0285 <- 3.26 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0292 <- 3.62 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0348 <- 3.44 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx >6lc1_D:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS OF NR4A1 BOUND TO THE HUMAN PITUITARY PROOPIOMELANOCORTIN GENE PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ D0288 <- 3.18 -> DT O4 C0021 : score 3.31455 : H : LYS NZ D0288 <- 3.14 -> DT O4 F0006 : score 3.34325 : H : ARG NH1 D0293 <- 2.89 -> DG N7 F0004 : score 5.9411 : H : ARG NH1 D0346 <- 3.05 -> DT O2 F0008 : score 4.09109 : x : CYS xxxx D0276 <- 4.20 -> DA xxx C0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0279 <- 3.90 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0285 <- 3.26 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0292 <- 3.62 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0348 <- 3.44 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx >6lct_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CATALYTIC INACTIVE CHLOROPLAST RESOLVASE NTMOC1 IN COMPLEX WITH HOLLIDAY JUNCTION organism=NICOTIANA TABACUM : x : ASP xxxx B0183 <- 3.01 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >6ldi_CDFGH:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI CUER TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ASN OD1 D0320 <- 2.69 -> DA N6 20021 : score 6.15427 : H : THR OG1 F0432 <- 3.43 -> DA N7 10069 : score 2.98393 : H : HIS NE2 F0455 <- 3.09 -> DG N7 10061 : score 6.40802 : H : ARG NH1 F0584 <- 2.55 -> DG N7 20046 : score 6.3525 : H : GLU OE1 F0585 <- 2.77 -> DC N4 20048 : score 5.80256 : H : GLN NE2 F0589 <- 3.09 -> DT O4 10040 : score 4.88995 : H : LYS NZ G0015 <- 2.73 -> DG N7 10057 : score 5.4613 : H : LYS NZ G0015 <- 2.62 -> DG N7 10058 : score 5.57979 : H : LYS NZ G0015 <- 3.14 -> DG O6 10058 : score 5.38768 : V : LEU CD1 F0519 <- 3.63 -> DT C7 20020 : score 5.97486 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.85 -> DG xxx 10078 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.27 -> DT xxx 10077 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 2.99 -> DT xxx 10077 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 3.54 -> DT xxx 10077 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0201 <- 3.70 -> DG xxx 10075 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.32 -> DG xxx 10073 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 3.54 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 3.41 -> DG xxx 10078 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0446 <- 4.40 -> DG xxx 10078 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0451 <- 4.10 -> DG xxx 10078 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0496 <- 3.88 -> DT xxx 20023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.55 -> DG xxx 10078 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 4.36 -> DT xxx 10079 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.42 -> DG xxx 10078 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0319 <- 4.31 -> DA xxx 20022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.97 -> DT xxx 20013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.92 -> DG xxx 20012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 4.15 -> DG xxx 20012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0096 <- 3.55 -> DG xxx 10072 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.49 -> DG xxx 10072 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.06 -> DG xxx 10072 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.49 -> DG xxx 10072 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 4.36 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 4.10 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0116 <- 3.78 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 3.15 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0385 <- 3.48 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 4.43 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0396 <- 3.31 -> DA xxx 20024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 3.83 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 3.80 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 3.93 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 3.67 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 3.25 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.87 -> DA xxx 10068 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.49 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.35 -> DT xxx 10065 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0434 <- 4.13 -> DT xxx 10065 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0437 <- 3.72 -> DT xxx 10064 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 4.18 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0441 <- 3.68 -> DT xxx 10063 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0468 <- 4.31 -> DA xxx 20024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0505 <- 4.01 -> DA xxx 20021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0509 <- 3.91 -> DA xxx 20021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0511 <- 3.40 -> DG xxx 20019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0522 <- 3.74 -> DG xxx 20018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0573 <- 4.39 -> DT xxx 20047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0586 <- 3.68 -> DC xxx 10039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0018 <- 4.01 -> DT xxx 20030 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0019 <- 3.51 -> DC xxx 10055 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0036 <- 3.89 -> DG xxx 10062 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0015 <- 4.40 -> DG xxx 20040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0018 <- 3.42 -> DT xxx 10047 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0019 <- 3.72 -> DA xxx 20038 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0036 <- 3.46 -> DG xxx 20046 : score x.xxxxx >6ldi_G:Putative_DNA-binding_domain; title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI CUER TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : LYS NZ G0015 <- 2.73 -> DG N7 10057 : score 5.4613 : H : LYS NZ G0015 <- 2.62 -> DG N7 10058 : score 5.57979 : H : LYS NZ G0015 <- 3.14 -> DG O6 10058 : score 5.38768 : x : ARG xxxx G0018 <- 4.01 -> DT xxx 20030 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0019 <- 3.51 -> DC xxx 10055 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0036 <- 3.89 -> DG xxx 10062 : score x.xxxxx >6ldm_A:Homeodomain-like; title=STRUCTURAL BASIS OF G-QUADRUPLEX DNA RECOGNITION BY THE YEAST TELOMERIC PROTEIN RAP1 organism=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) : w : ARG NH1 A0406 <- 5.54 -> DG N3 B0009 : score 1.593 >6le9_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE HUMAN TELOMERIC NUCLEOSOME DISPLAYS DISTINCT STRUCTURAL AND DYNAMIC PROPERTIES organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.66 -> DT O2 J0009 : score 4.35187 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.96 -> DT O2 J-008 : score 4.09787 : H : ARG NH2 H0030 <- 3.05 -> DT O2 I0049 : score 4.02167 : x : PRO xxxx A0043 <- 4.38 -> DG xxx J0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.98 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 3.59 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.64 -> DG xxx J0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.28 -> DT xxx J0057 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.40 -> DG xxx J0049 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0039 <- 3.96 -> DT xxx I-053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.32 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.32 -> DA xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.42 -> DA xxx I0057 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0039 <- 3.96 -> DG xxx J-053 : score x.xxxxx >6le9_D:Histone-fold; title=THE HUMAN TELOMERIC NUCLEOSOME DISPLAYS DISTINCT STRUCTURAL AND DYNAMIC PROPERTIES organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx D0030 <- 4.40 -> DG xxx J0049 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0039 <- 3.96 -> DT xxx I-053 : score x.xxxxx >6ler_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=169 BP NUCLEOSOME HARBORING NON-IDENTICAL COHESIVE DNA TERMINI. organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0040 <- 3.18 -> DT O2 J0009 : score 3.97912 : H : ARG NH2 A0040 <- 3.07 -> DT O2 J0009 : score 4.00473 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.14 -> DG N3 I0009 : score 2.84499 : H : LYS NZ H0030 <- 2.46 -> DT O2 I-028 : score 3.83111 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.11 -> DG xxx I0069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.03 -> DT xxx J-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.42 -> DG xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.50 -> DA xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.91 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0042 <- 3.87 -> DT xxx J0071 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.38 -> DC xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.48 -> DG xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.37 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx >6ler_KLMNOPQR:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=169 BP NUCLEOSOME HARBORING NON-IDENTICAL COHESIVE DNA TERMINI. organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 K0040 <- 3.19 -> DG N3 T0009 : score 3.32866 : H : ARG NH1 O0040 <- 3.18 -> DT O2 S0009 : score 3.97912 : H : LYS NZ R0030 <- 2.62 -> DT O2 S-028 : score 3.71632 : x : TYR xxxx K0041 <- 3.68 -> DC xxx T-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0045 <- 4.40 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0042 <- 3.98 -> DG xxx S-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0045 <- 4.35 -> DA xxx S0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0042 <- 3.76 -> DG xxx S0038 : score x.xxxxx >6lew_A:Thiolase-like; title=RVD HA SPECIFICALLY CONTACTS 5MC THROUGH VAN DER WAALS INTERACTIONS organism=Xanthomonas campestris pv. armoraciae : H : ARG NH1 A0266 <- 3.13 -> DG N7 J-003 : score 5.6507 : H : ARG NH2 A0266 <- 2.98 -> DG O6 J-003 : score 6.3624 : H : ASP OD2 A0301 <- 3.16 -> DC N4 I0001 : score 5.7536 : H : ASP OD2 A0335 <- 2.90 -> DC N4 I0002 : score 6.076 : H : ASP OD2 A0369 <- 3.04 -> DC N4 I0003 : score 5.9024 : H : ASN ND2 A0505 <- 2.99 -> DG N7 I0007 : score 4.41163 : H : ASP OD2 A0539 <- 2.64 -> DC N4 I0008 : score 6.3984 : H : ASN ND2 A0573 <- 3.01 -> DG N7 I0009 : score 4.39329 : H : ASP OD2 A0641 <- 2.93 -> DC N4 I0011 : score 6.0388 : x : ALA xxxx A0471 <- 4.25 -> DT xxx I0005 : score x.xxxxx >6lff_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=TRANSCRIPTION FACTOR SATB1 CUTR1 DOMAIN IN COMPLEX WITH A PHOSPHOROTHIOATE DNA organism=Homo sapiens : w : THR OG1 A0401 <- 5.64 -> DA N6 C0004 : score 3.251 : w : GLN OE1 A0402 <- 5.60 -> DA N6 C0005 : score 3.392 : x : GLU xxxx A0407 <- 3.54 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx >6lff_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=TRANSCRIPTION FACTOR SATB1 CUTR1 DOMAIN IN COMPLEX WITH A PHOSPHOROTHIOATE DNA organism=Homo sapiens : w : GLN OE1 A0402 <- 5.60 -> DA N6 C0005 : score 3.392 : w : THR OG1 B0401 <- 5.58 -> DT O4 D0004 : score 2.809 : H : GLN OE1 B0402 <- 3.09 -> DA N6 C0007 : score 5.70152 : H : GLN NE2 B0402 <- 2.89 -> DA N7 C0007 : score 5.98013 : x : GLU xxxx A0407 <- 3.54 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0406 <- 3.47 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0407 <- 3.57 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >6lnb_B: title=CRYOEM STRUCTURE OF CASCADE-TNIQ-DSDNA COMPLEX organism=? : x : MET xxxx B0346 <- 4.47 -> DT xxx N0014 : score x.xxxxx >6lnb_BCDEFG: title=CRYOEM STRUCTURE OF CASCADE-TNIQ-DSDNA COMPLEX organism=VIBRIO CHOLERAE : H : ASN OD1 C0006 <- 3.40 -> DG N2 N0021 : score 4.224 : H : GLN NE2 F0348 <- 2.56 -> DG N3 N0039 : score 5.21447 : x : ASN xxxx G0069 <- 4.21 -> DG xxx N0037 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0070 <- 3.46 -> DC xxx N0036 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0071 <- 3.32 -> DG xxx N0037 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0227 <- 3.26 -> DA xxx N0041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0240 <- 3.25 -> DC xxx N0036 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0243 <- 3.82 -> DG xxx N0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0006 <- 3.74 -> DG xxx N0039 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0069 <- 3.77 -> DC xxx N0031 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0070 <- 3.56 -> DG xxx N0030 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0071 <- 3.17 -> DC xxx N0031 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0102 <- 3.53 -> DG xxx N0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0227 <- 3.97 -> DC xxx N0035 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0241 <- 4.21 -> DC xxx N0031 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0243 <- 3.76 -> DC xxx N0031 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0346 <- 3.80 -> DT xxx N0038 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0067 <- 3.39 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0070 <- 3.59 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0071 <- 3.30 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0227 <- 3.82 -> DA xxx N0029 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0229 <- 3.50 -> DG xxx N0030 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0230 <- 4.07 -> DA xxx N0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0243 <- 4.14 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0346 <- 3.67 -> DC xxx N0032 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0069 <- 3.18 -> DG xxx N0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0070 <- 3.28 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0071 <- 3.18 -> DG xxx N0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0227 <- 3.45 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0243 <- 4.23 -> DG xxx N0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0346 <- 3.39 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0348 <- 3.80 -> DC xxx N0027 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0102 <- 4.30 -> DG xxx N0022 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0227 <- 3.82 -> DA xxx N0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0346 <- 3.44 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0348 <- 4.08 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0346 <- 4.47 -> DT xxx N0014 : score x.xxxxx >6lqf_A:ARID-like;FYVE/PHD_zinc_finger; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARABIDOPSIS ARID5 ARID-PHD CASSETTE IN COMPLEX WITH H3K4ME3 PEPTIDE AND DNA organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : THR OG1 A0648 <- 2.67 -> DA N7 B0006 : score 3.50287 : H : THR OG1 A0648 <- 2.96 -> DA N6 B0006 : score 2.67069 : x : ARG xxxx A0646 <- 4.31 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0652 <- 3.40 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0656 <- 4.39 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0712 <- 4.46 -> DA xxx B0012 : score x.xxxxx >6ltj_A:Histone-fold; title=STRUCTURE OF NUCLEOSOME-BOUND HUMAN BAF COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx A0080 <- 3.74 -> DT xxx Y0053 : score x.xxxxx >6ltj_ABCDEFGH: title=STRUCTURE OF NUCLEOSOME-BOUND HUMAN BAF COMPLEX organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx A0080 <- 3.74 -> DT xxx Y0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.83 -> DT xxx X0115 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.89 -> DG xxx X0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0035 <- 4.27 -> DA xxx Y0116 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.20 -> DC xxx Y0114 : score x.xxxxx >6lts_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX COMPRISING A TRUNCATED SIGMA FINGER organism=THERMUS THERMOPHILUS HB8 : x : GLU xxxx C0421 <- 3.48 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx >6lts_CD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX COMPRISING A TRUNCATED SIGMA FINGER organism=THERMUS THERMOPHILUS HB8 : x : GLU xxxx C0421 <- 3.48 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0491 <- 3.96 -> DT xxx H0022 : score x.xxxxx >6lty_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=DNA BOUND ANTITOXIN HIGA3 organism=Mycobacterium tuberculosis H37Rv : x : GLN xxxx A0053 <- 3.67 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0063 <- 4.46 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0065 <- 3.35 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0066 <- 3.99 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0068 <- 3.95 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0069 <- 3.74 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0063 <- 3.96 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0064 <- 3.49 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0065 <- 3.42 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0066 <- 3.18 -> DC xxx D0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0068 <- 4.45 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0069 <- 3.41 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx >6lty_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=DNA BOUND ANTITOXIN HIGA3 organism=Mycobacterium tuberculosis H37Rv : x : SER xxxx B0063 <- 3.96 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0064 <- 3.49 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0065 <- 3.42 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0066 <- 3.18 -> DC xxx D0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0068 <- 4.45 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0069 <- 3.41 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx >6lu0_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CAS12I2 TERNARY COMPLEX WITH 12 NT SPACER organism=UNIDENTIFIED : x : GLN xxxx A0163 <- 3.33 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0164 <- 3.03 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0166 <- 3.85 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0169 <- 3.66 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0232 <- 3.21 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0289 <- 3.98 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >6lui_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE SAMD1 WH DOMAIN AND DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : w : ARG NH1 A0043 <- 6.49 -> DG O6 C0006 : score 2.756 : w : ARG NH2 A0043 <- 6.30 -> DG O6 C0006 : score 2.468 : w : ARG NH1 A0045 <- 5.62 -> DG O6 B0005 : score 2.756 : w : LYS NZ A0046 <- 6.29 -> DC N4 B0008 : score 0.048 : H : TYR OH A0087 <- 2.82 -> DG N2 C0004 : score 4.87018 : w : TYR OH A0087 <- 5.33 -> DC O2 B0011 : score 1.343 : H : LYS NZ A0088 <- 2.71 -> DC O2 B0010 : score 2.99918 >6lwa_G:S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain;N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1(P2G, E3Q, K242) BOUND TO DUPLEX DNA CONTAINING 5-HYDROXYURACIL (5-OHU) organism=Homo sapiens : H : ARG NE G0118 <- 2.78 -> DC O2 I0006 : score 2.66961 : H : ARG NH2 G0118 <- 3.12 -> DC N3 I0006 : score 2.1444 : x : MET xxxx G0081 <- 3.65 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0117 <- 4.30 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0120 <- 3.33 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0277 <- 4.02 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx >6lwb_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1(P2G, E3Q, R242) BOUND TO DUPLEX DNA CONTAINING 5-HYDROXYURACIL (5-OHU) organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0118 <- 2.69 -> DC O2 c0006 : score 2.71747 : H : ARG NH2 A0118 <- 3.25 -> DC N3 c0006 : score 2.08483 >6lwc_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1(P2G, E3Q, K242) BOUND TO DUPLEX DNA CONTAINING SPIROIMINODIHYDANTOIN (SP) organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0118 <- 2.62 -> DC O2 C0006 : score 2.7547 : H : ARG NH2 A0118 <- 2.64 -> DC N3 C0006 : score 2.36434 : x : MET xxxx A0081 <- 3.22 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0120 <- 3.41 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0277 <- 3.80 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx >6lwd_D:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1(P2G, E3Q, R242) BOUND TO DUPLEX DNA CONTAINING SPIROIMINODIHYDANTOIN (SP) organism=Homo sapiens : H : ARG NE D0118 <- 2.68 -> DC O2 F0006 : score 2.72279 : H : ARG NH2 D0118 <- 2.99 -> DC N3 F0006 : score 2.20397 : w : ARG NH1 D0118 <- 6.38 -> DA N3 E0006 : score 2.585 : w : ARG NH2 D0118 <- 6.55 -> DA N7 E0006 : score 1.486 : x : MET xxxx D0081 <- 3.55 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0120 <- 3.33 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0277 <- 4.08 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx >6lwf_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1(P2G, E3Q, K242) BOUND TO DUPLEX DNA CONTAINING GUANIDINOHYDANTOIN (GH) organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0118 <- 2.65 -> DC O2 C0006 : score 2.73874 : H : ARG NH2 A0118 <- 2.88 -> DC N3 C0006 : score 2.25437 : x : MET xxxx A0081 <- 3.17 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0117 <- 4.39 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0120 <- 3.38 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0277 <- 3.95 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx >6lwg_D:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1(P2G, E3Q, R242) BOUND TO DUPLEX DNA CONTAINING GUANIDINOHYDANTOIN (GH) organism=Homo sapiens : H : ARG NE D0118 <- 2.63 -> DC O2 F0006 : score 2.74938 : H : ARG NH2 D0118 <- 2.98 -> DC N3 F0006 : score 2.20855 : w : ARG NH1 D0118 <- 6.06 -> DA N7 E0006 : score 0.388 : w : ARG NH1 D0118 <- 6.15 -> DA N3 E0006 : score 2.585 : w : ARG NH2 D0118 <- 6.41 -> DA N7 E0006 : score 1.486 : x : MET xxxx D0081 <- 3.48 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0120 <- 3.36 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0277 <- 3.96 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx >6lwi_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1(P2G, E3Q, R242) BOUND TO DUPLEX DNA CONTAINING DIHYDROTHYMINE (DHT) organism=Homo sapiens : w : ARG NE A0277 <- 6.14 -> DG N7 b0007 : score 1.593 >6lwj_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1(P2G, E3Q, K242) BOUND TO DUPLEX DNA CONTAINING DIHYDROURACIL (DHU) organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0118 <- 2.58 -> DC O2 C0006 : score 2.77597 : H : ARG NH2 A0118 <- 2.87 -> DC N3 C0006 : score 2.25895 : w : ARG NE A0277 <- 6.31 -> DG N7 B0008 : score 1.593 : x : MET xxxx A0081 <- 3.87 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0120 <- 3.41 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >6lwk_G:S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain;N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1(P2G, E3Q, R242) BOUND TO DUPLEX DNA CONTAINING DIHYDROURACIL (DHU) organism=Homo sapiens : H : ARG NE G0118 <- 2.75 -> DC O2 I0006 : score 2.68556 : H : ARG NH2 G0118 <- 3.18 -> DC N3 I0006 : score 2.11691 : x : MET xxxx G0081 <- 3.28 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0117 <- 4.26 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0120 <- 3.37 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0277 <- 3.53 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx >6lwl_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1(R242) BOUND TO DUPLEX DNA CONTAINING 2'-FLUORO-2'-DEOXY-5,6-DIHYDROURIDINE organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0118 <- 2.93 -> DC O2 c0006 : score 2.58984 : w : ARG NH2 A0122 <- 6.76 -> DC O2 c0005 : score 1.669 >6lwm_D:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1(K242) BOUND TO DUPLEX DNA CONTAINING 2'-FLUORO-2'-DEOXY-5,6-DIHYDROURIDINE organism=Homo sapiens : H : ARG NE D0118 <- 2.62 -> DC O2 F0006 : score 2.7547 : H : ARG NH2 D0118 <- 3.07 -> DC N3 F0006 : score 2.16731 : w : ARG NE D0277 <- 5.92 -> DG N7 E0008 : score 1.593 : x : MET xxxx D0081 <- 3.08 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0120 <- 3.24 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx >6lwn_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1(R242, G249P) BOUND TO DUPLEX DNA CONTAINING 2'-FLUORO-2'-DEOXY-5,6-DIHYDROURIDINE organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0118 <- 2.83 -> DC O2 c0006 : score 2.64302 : H : ARG NH2 A0118 <- 3.45 -> DC N3 c0006 : score 1.99319 >6lwo_G:S13-like_H2TH_domain;N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1(R242, Y244H) BOUND TO DUPLEX DNA CONTAINING 2'-FLUORO-2'-DEOXY-5,6-DIHYDROURIDINE organism=Homo sapiens : H : ARG NE G0118 <- 2.76 -> DC O2 I0006 : score 2.68025 : H : ARG NH2 G0118 <- 3.07 -> DC N3 I0006 : score 2.16731 : x : MET xxxx G0081 <- 3.61 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0117 <- 4.25 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0120 <- 3.29 -> DC xxx I0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0277 <- 3.81 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx >6lwp_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1(R242, Y244R) BOUND TO DUPLEX DNA CONTAINING 2'-FLUORO-2'-DEOXY-5,6-DIHYDROURIDINE organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0118 <- 2.79 -> DC O2 c0006 : score 2.66429 : H : ARG NH2 A0118 <- 3.43 -> DC N3 c0006 : score 2.00236 >6lwq_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1(R242) BOUND TO DUPLEX DNA CONTAINING A C:T MISMATCH organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0118 <- 2.80 -> DC O2 C0006 : score 2.65897 : H : ARG NH2 A0118 <- 3.42 -> DC N3 C0006 : score 2.00694 : w : ARG NH1 A0118 <- 6.22 -> DA N7 B0006 : score 0.388 : w : ARG NH2 A0118 <- 5.97 -> DA N7 B0006 : score 1.486 : x : PRO xxxx A0002 <- 4.36 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0006 <- 3.78 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0081 <- 3.40 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0120 <- 3.41 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0177 <- 4.29 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0244 <- 3.30 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0274 <- 3.51 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0275 <- 3.97 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0277 <- 3.74 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx >6lwr_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1(K242) BOUND TO DUPLEX DNA CONTAINING A CLEAVED C:T MISMATCH organism=Homo sapiens : x : MET xxxx A0081 <- 3.84 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0120 <- 3.49 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0275 <- 3.71 -> DA xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0277 <- 3.81 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx >6lxn_A:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C-TERMINAL DNA-BINDING DOMAIN OF ESCHERICHIA COLI OMPR IN COMPLEX WITH F1-DNA organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0065 <- 2.93 -> DG O6 D0008 : score 5.92517 : H : ARG NH2 A0065 <- 2.68 -> DG N7 D0008 : score 6.53785 : H : ARG NH1 A0073 <- 3.46 -> DG N7 C0015 : score 5.2514 : H : ARG NH2 A0073 <- 2.60 -> DG O6 C0015 : score 6.864 : V : VAL CG2 A0069 <- 3.71 -> DT C7 C0016 : score 6.26085 : x : ASP xxxx A0068 <- 3.92 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0072 <- 4.32 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0092 <- 4.43 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx >6lxn_AB:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C-TERMINAL DNA-BINDING DOMAIN OF ESCHERICHIA COLI OMPR IN COMPLEX WITH F1-DNA organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0065 <- 2.93 -> DG O6 D0008 : score 5.92517 : H : ARG NH2 A0065 <- 2.68 -> DG N7 D0008 : score 6.53785 : H : ARG NH1 A0073 <- 3.46 -> DG N7 C0015 : score 5.2514 : H : ARG NH2 A0073 <- 2.60 -> DG O6 C0015 : score 6.864 : H : ARG NH1 B0065 <- 3.26 -> DG O6 D0018 : score 5.52367 : H : ARG NH2 B0065 <- 2.39 -> DG N7 D0018 : score 6.90815 : H : ARG NH2 B0065 <- 3.00 -> DG O6 D0018 : score 6.336 : V : VAL CG2 B0069 <- 3.51 -> DT C7 C0006 : score 6.567 : V : VAL CG2 A0069 <- 3.71 -> DT C7 C0016 : score 6.26085 : V : ASP CB B0068 <- 3.55 -> DT C7 D0019 : score 2.85077 : x : ASP xxxx A0068 <- 3.92 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0072 <- 4.32 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0092 <- 4.43 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0066 <- 4.06 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0070 <- 4.35 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0092 <- 4.02 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >6m0v_A: title=CRSYTAL STRUCTURE OF STREPTOCOCCUS THERMOPHILUS CAS9 IN COMPLEX WITH THE GGAA PAM organism=Streptococcus thermophilus LMD-9 : H : GLN OE1 A1084 <- 2.52 -> DC N4 C0005 : score 4.84 : H : GLN NE2 A1084 <- 3.22 -> DG O6 D0003 : score 5.3175 : H : LYS NZ A1086 <- 2.84 -> DG N7 D0004 : score 5.34281 : H : LYS NZ A1086 <- 2.45 -> DG O6 D0004 : score 6.18542 : V : MET CE A1049 <- 3.86 -> DT C7 C0003 : score 6.8263 : V : ALA CB A1080 <- 3.85 -> DT C7 C0004 : score 5.52899 : x : PHE xxxx A0673 <- 3.45 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0961 <- 3.98 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1052 <- 3.37 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1055 <- 3.35 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1082 <- 4.14 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >6m0w_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTOCOCCUS THERMOPHILUS CAS9 IN COMPLEX WITH THE AGAA PAM organism=Streptococcus thermophilus LMD-9 : w : ASP OD2 A0824 <- 6.30 -> DT O2 C0008 : score 1.008 : H : GLN OE1 A1084 <- 2.98 -> DA N6 D0003 : score 5.83467 : H : GLN NE2 A1084 <- 2.99 -> DA N7 D0003 : score 5.85833 : H : LYS NZ A1086 <- 2.82 -> DG N7 D0004 : score 5.36435 : H : LYS NZ A1086 <- 2.44 -> DG O6 D0004 : score 6.19698 : x : PHE xxxx A0673 <- 3.48 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1048 <- 3.70 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1049 <- 3.55 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1052 <- 3.49 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1055 <- 3.33 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A1080 <- 3.96 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1082 <- 3.48 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx >6m0x_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTOCOCCUS THERMOPHILUS CAS9 IN COMPLEX WITH AGGA PAM organism=Streptococcus thermophilus LMD-9 : w : ASP OD2 A0824 <- 6.16 -> DT O2 C0008 : score 1.008 : w : SER OG A0961 <- 6.01 -> DA N3 D0002 : score 0.958 : H : GLN OE1 A1084 <- 2.89 -> DA N6 D0003 : score 5.94362 : H : GLN NE2 A1084 <- 3.13 -> DA N7 D0003 : score 5.68782 : H : LYS NZ A1086 <- 2.91 -> DG N7 D0004 : score 5.26741 : H : LYS NZ A1086 <- 2.66 -> DG O6 D0004 : score 5.94263 : V : MET CE A1049 <- 3.80 -> DT C7 C0003 : score 6.93026 : x : PHE xxxx A0673 <- 3.22 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1048 <- 4.28 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1052 <- 3.60 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1055 <- 3.71 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1082 <- 3.57 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx >6m2v_AB:PUA_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UHRF1 SRA COMPLEXED WITH FULLY-MCHG DNA. organism=Mus musculus : x : VAL xxxx B0451 <- 3.05 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0450 <- 4.09 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0451 <- 3.41 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx >6m2v_B:PUA_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UHRF1 SRA COMPLEXED WITH FULLY-MCHG DNA. organism=Mus musculus : x : VAL xxxx B0451 <- 3.05 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx >6m3d_C:Homeodomain-like; title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF TANDEMLY CONNECTED ENGRAILED HOMEODOMAINS (EHD) WITH R53A MUTATIONS AND DNA COMPLEX organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH2 C0090 <- 2.97 -> DT O2 B0005 : score 4.0894 A : H : ARG NH1 C0092 <- 2.71 -> DT O2 A0007 : score 4.38393 A : H : LYS NZ C0137 <- 3.01 -> DG N7 B0002 : score 5.15969 : H : LYS NZ C0137 <- 2.91 -> DG O6 B0002 : score 5.65359 : w : LYS NZ C0137 <- 5.67 -> DT O4 A0010 : score 1.7 : H : ASN ND2 C0138 <- 3.06 -> DA N7 A0009 : score 5.56525 : w : ASN OD1 C0138 <- 5.72 -> DT O4 A0010 : score 3.132 : x : ILE xxxx C0134 <- 3.60 -> DA xxx A0009 : score x.xxxxx >6m3l_A:Transglycosidases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE R.PABI(Y68F-K154A)-DSDNA(NONSPECIFIC) COMPLEX organism=Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) : x : THR xxxx A0028 <- 3.68 -> DG xxx C-005 : score x.xxxxx >6m3l_AB:Transglycosidases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE R.PABI(Y68F-K154A)-DSDNA(NONSPECIFIC) COMPLEX organism=Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) : x : THR xxxx A0028 <- 3.68 -> DG xxx C-005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0028 <- 3.88 -> DT xxx C-002 : score x.xxxxx >6m3v_O:Histone-fold; title=355 BP DI-NUCLEOSOME HARBORING COHESIVE DNA TERMINI organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx O0039 <- 3.40 -> DG xxx J0333 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0040 <- 3.48 -> DG xxx I0097 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx O0041 <- 3.99 -> DG xxx I0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0083 <- 4.40 -> DG xxx J0240 : score x.xxxxx >6m44_O:Histone-fold; title=355 BP DI-NUCLEOSOME HARBORING COHESIVE DNA TERMINI (HIGH CRYOPROTECTANT) organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx O0039 <- 4.36 -> DG xxx J0333 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0040 <- 3.51 -> DG xxx J0256 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx O0041 <- 4.47 -> DG xxx I0020 : score x.xxxxx >6m4d_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL MECHANISM OF NUCLEOSOME DYNAMICS GOVERNED BY HUMAN HISTONE VARIANTS H2A.B AND H2A.Z.2.2 organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0083 <- 4.10 -> DG xxx I0099 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 3.99 -> DC xxx I0082 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0045 <- 3.60 -> DT xxx I0112 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.48 -> DG xxx J0092 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.57 -> DG xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0035 <- 3.49 -> DG xxx J0082 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0045 <- 3.89 -> DG xxx J0112 : score x.xxxxx >6m4d_C:Histone-fold; title=STRUCTURAL MECHANISM OF NUCLEOSOME DYNAMICS GOVERNED BY HUMAN HISTONE VARIANTS H2A.B AND H2A.Z.2.2 organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx C0045 <- 3.60 -> DT xxx I0112 : score x.xxxxx >6m4g_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL MECHANISM OF NUCLEOSOME DYNAMICS GOVERNED BY HUMAN HISTONE VARIANTS H2A.B AND H2A.Z.2.2 organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0045 <- 4.47 -> DC xxx I0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0046 <- 4.48 -> DT xxx J0112 : score x.xxxxx >6m4g_G:Histone-fold; title=STRUCTURAL MECHANISM OF NUCLEOSOME DYNAMICS GOVERNED BY HUMAN HISTONE VARIANTS H2A.B AND H2A.Z.2.2 organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx G0046 <- 4.48 -> DT xxx J0112 : score x.xxxxx >6m4h_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL MECHANISM OF NUCLEOSOME DYNAMICS GOVERNED BY HUMAN HISTONE VARIANTS H2A.B AND H2A.Z.2.2 organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx C0049 <- 4.10 -> DG xxx I0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0086 <- 4.25 -> DG xxx J0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.40 -> DC xxx J0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0086 <- 3.89 -> DA xxx I0040 : score x.xxxxx >6m6a_CM: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS MFD IN COMPLEX WITH RNA POLYMERASE organism=? : x : ARG xxxx M0732 <- 4.11 -> DC xxx N0014 : score x.xxxxx >6m6b_CDM: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS MFD IN COMPLEX WITH RNA POLYMERASE AND ATP-GAMMA-S organism=? : x : ARG xxxx D0486 <- 2.99 -> DG xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0527 <- 3.92 -> DC xxx T0032 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx M0553 <- 4.11 -> DC xxx T0032 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx M0580 <- 3.44 -> DT xxx N0010 : score x.xxxxx >6m6c_CD: title=CRYOEM STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 C0331 <- 2.42 -> DG O6 N0016 : score 7.1016 : H : GLU OE1 C0421 <- 3.41 -> DA N6 N0017 : score 2.35484 : x : ARG xxxx C0142 <- 3.60 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0325 <- 3.50 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0326 <- 3.79 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0418 <- 3.37 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 3.35 -> DA xxx N0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0426 <- 3.26 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0427 <- 4.20 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0594 <- 4.09 -> DA xxx N0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 3.69 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.72 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 4.00 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx >6m6c_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=? : x : PRO xxxx D0594 <- 4.09 -> DA xxx N0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 3.69 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.72 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 4.00 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx >6m7o_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA TERNARY COMPLEX WITH MN2+ AND DTMPNPP OPPOSITING CDA organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 3.87 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.53 -> DG xxx P0003 : score x.xxxxx >6m7p_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA EXTENSION COMPLEX WITH CDA AT THE -2 POSITION organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 3.10 -> DT O2 T0005 : score 3.69733 : w : GLN OE1 A0038 <- 6.03 -> DC O2 T0006 : score 1.091 >6m7t_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA IN A NON-PRODUCTIVE TERNARY COMPLEX WITH CA2+ AND DTTP OPPOSITING CDA organism=Homo sapiens : V : ARG CZ A0382 <- 3.86 -> DT C7 P0003 : score 2.10032 : x : LEU xxxx A0378 <- 4.41 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx >6m7u_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA IN A NON-PRODUCTIVE TERNARY COMPLEX WITH MG2+ AND DTMPNPP OPPOSITING CDA organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.36 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.23 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx >6m7v_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA EXTENSION COMPLEX WITH CDA AT THE -1 POSITION organism=Homo sapiens : x : LEU xxxx A0378 <- 3.97 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 4.20 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx >6me0_C:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURE OF A GROUP II INTRON RETROELEMENT PRIOR TO DNA INTEGRATION organism=THERMOSYNECHOCOCCUS ELONGATUS (STRAIN BP-1) / THERMOSYNECHOCOCCUS ELONGATUS (STRAIN BP-1) : H : ASN ND2 C0389 <- 2.69 -> DT O4 B0004 : score 5.40088 : H : ASP OD1 C0393 <- 2.89 -> DG N2 B0007 : score 5.0573 : x : LYS xxxx C0332 <- 3.88 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0334 <- 3.44 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0336 <- 3.57 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0383 <- 4.00 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0385 <- 4.15 -> DG xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0386 <- 4.42 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0396 <- 2.62 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0405 <- 4.13 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0408 <- 4.27 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0409 <- 3.42 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0413 <- 3.77 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0416 <- 3.38 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0428 <- 3.72 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx >6mec_C:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURE OF A GROUP II INTRON RETROELEMENT AFTER DNA INTEGRATION organism=THERMOSYNECHOCOCCUS ELONGATUS (STRAIN BP-1) / THERMOSYNECHOCOCCUS ELONGATUS (STRAIN BP-1) : H : ASP OD1 C0393 <- 2.60 -> DG N2 B0007 : score 5.356 : x : LYS xxxx C0332 <- 4.26 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0334 <- 3.17 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0336 <- 3.37 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0383 <- 3.73 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0385 <- 4.21 -> DG xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0386 <- 4.11 -> DG xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0389 <- 3.15 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0396 <- 2.34 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0409 <- 3.50 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0413 <- 3.81 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0416 <- 3.31 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0428 <- 3.19 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx >6mg1_AB:Leucine_zipper_domain; title=C-TERMINAL BZIP DOMAIN OF HUMAN C/EBPBETA WITH 16BP METHYLATED OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING CONSENSUS RECOGNITION SEQUENCE-C2 CRYSTAL FORM organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0278 <- 3.13 -> DA N7 C0011 : score 2.39128 : H : ASN OD1 A0281 <- 2.93 -> DA N6 C0011 : score 5.86523 : H : ASN ND2 A0281 <- 2.97 -> DT O4 D0105 : score 5.10494 : w : ASN ND2 A0281 <- 6.06 -> DA N6 D0104 : score 2.5 : H : ARG NH1 A0289 <- 2.72 -> DG O6 C0009 : score 6.18067 : H : ARG NH2 A0289 <- 3.09 -> DG N7 C0009 : score 6.01431 : w : ARG NH1 A0289 <- 6.21 -> DG O6 D0107 : score 2.756 : H : ARG NH1 B0278 <- 3.07 -> DA N7 D0111 : score 2.422 : H : ASN OD1 B0281 <- 2.96 -> DA N6 D0111 : score 5.8291 : H : ASN ND2 B0281 <- 2.93 -> DT O4 C0005 : score 5.14722 : w : ASN ND2 B0281 <- 6.01 -> DA N6 C0004 : score 2.5 : H : ARG NH1 B0289 <- 3.07 -> DG N7 D0109 : score 5.7233 : H : ARG NH2 B0289 <- 2.75 -> DG O6 D0109 : score 6.666 : w : ARG NH2 B0289 <- 6.06 -> DG O6 C0007 : score 2.468 : x : ALA xxxx A0284 <- 3.94 -> DT xxx D0105 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0285 <- 3.24 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 4.17 -> DT xxx D0105 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0284 <- 3.91 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0285 <- 3.22 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 4.17 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >6mg1_B:Leucine_zipper_domain; title=C-TERMINAL BZIP DOMAIN OF HUMAN C/EBPBETA WITH 16BP METHYLATED OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING CONSENSUS RECOGNITION SEQUENCE-C2 CRYSTAL FORM organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0278 <- 3.07 -> DA N7 D0111 : score 2.422 : H : ASN OD1 B0281 <- 2.96 -> DA N6 D0111 : score 5.8291 : H : ASN ND2 B0281 <- 2.93 -> DT O4 C0005 : score 5.14722 : w : ASN ND2 B0281 <- 6.01 -> DA N6 C0004 : score 2.5 : H : ARG NH1 B0289 <- 3.07 -> DG N7 D0109 : score 5.7233 : H : ARG NH2 B0289 <- 2.75 -> DG O6 D0109 : score 6.666 : w : ARG NH2 B0289 <- 6.06 -> DG O6 C0007 : score 2.468 : x : ALA xxxx B0284 <- 3.91 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0285 <- 3.22 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 4.17 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >6mg2_AB:Leucine_zipper_domain; title=C-TERMINAL BZIP DOMAIN OF HUMAN C/EBPBETA WITH 16BP METHYLATED OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING CONSENSUS RECOGNITION SEQUENCE-C2221 CRYSTAL FORM organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0278 <- 3.12 -> DA N7 C0011 : score 2.3964 : H : ASN OD1 A0281 <- 2.97 -> DA N6 C0011 : score 5.81705 : H : ASN ND2 A0281 <- 3.00 -> DT O4 D0105 : score 5.07323 : w : ASN ND2 A0281 <- 6.17 -> DA N6 D0104 : score 2.5 : H : ARG NH1 A0289 <- 2.61 -> DG O6 C0009 : score 6.3145 : H : ARG NH2 A0289 <- 3.10 -> DG N7 C0009 : score 6.00154 : w : ARG NH1 A0289 <- 6.72 -> DG O6 D0107 : score 2.756 : H : ARG NH1 B0278 <- 3.09 -> DA N7 D0111 : score 2.41176 : H : ASN OD1 B0281 <- 2.97 -> DA N6 D0111 : score 5.81705 : H : ASN ND2 B0281 <- 3.06 -> DT O4 C0005 : score 5.00982 : w : ASN ND2 B0281 <- 6.20 -> DA N6 C0004 : score 2.5 : H : ARG NH1 B0289 <- 2.91 -> DG O6 D0109 : score 5.9495 : H : ARG NH2 B0289 <- 2.67 -> DG O6 C0007 : score 6.7716 : H : ARG NH2 B0289 <- 3.06 -> DG O6 D0109 : score 6.2568 : x : ALA xxxx A0284 <- 4.07 -> DT xxx D0105 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0285 <- 3.18 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 4.17 -> DT xxx D0105 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0284 <- 4.01 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0285 <- 3.43 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 4.08 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >6mg2_B:Leucine_zipper_domain; title=C-TERMINAL BZIP DOMAIN OF HUMAN C/EBPBETA WITH 16BP METHYLATED OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING CONSENSUS RECOGNITION SEQUENCE-C2221 CRYSTAL FORM organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0278 <- 3.09 -> DA N7 D0111 : score 2.41176 : H : ASN OD1 B0281 <- 2.97 -> DA N6 D0111 : score 5.81705 : H : ASN ND2 B0281 <- 3.06 -> DT O4 C0005 : score 5.00982 : w : ASN ND2 B0281 <- 6.20 -> DA N6 C0004 : score 2.5 : H : ARG NH1 B0289 <- 2.91 -> DG O6 D0109 : score 5.9495 : H : ARG NH2 B0289 <- 3.06 -> DG O6 D0109 : score 6.2568 : H : ARG NH2 B0289 <- 2.67 -> DG O6 C0007 : score 6.7716 : w : ARG NH2 B0289 <- 5.55 -> DG N7 C0007 : score 2.18 : x : ALA xxxx B0284 <- 4.01 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0285 <- 3.43 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 4.08 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >6mg3_A:Leucine_zipper_domain; title=V285A MUTANT OF THE C-TERMINAL BZIP DOMAIN OF HUMAN C/EBPBETA WITH 16BP METHYLATED OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING CONSENSUS RECOGNITION SEQUENCE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0278 <- 3.10 -> DA N7 C0011 : score 2.40664 : H : ASN OD1 A0281 <- 2.79 -> DA N6 C0011 : score 6.03384 : H : ASN ND2 A0281 <- 3.04 -> DT O4 D0105 : score 5.03095 : w : ASN ND2 A0281 <- 6.08 -> DA N6 D0104 : score 2.5 : H : ARG NH1 A0289 <- 3.16 -> DG N7 C0009 : score 5.6144 A : H : ARG NH2 A0289 <- 2.62 -> DG O6 C0009 : score 6.8376 A : x : ALA xxxx A0284 <- 3.97 -> DT xxx D0105 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0285 <- 3.30 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 3.95 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx >6mg3_AB:Leucine_zipper_domain; title=V285A MUTANT OF THE C-TERMINAL BZIP DOMAIN OF HUMAN C/EBPBETA WITH 16BP METHYLATED OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING CONSENSUS RECOGNITION SEQUENCE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0278 <- 3.10 -> DA N7 C0011 : score 2.40664 : H : ASN OD1 A0281 <- 2.79 -> DA N6 C0011 : score 6.03384 : H : ASN ND2 A0281 <- 3.04 -> DT O4 D0105 : score 5.03095 : w : ASN ND2 A0281 <- 6.08 -> DA N6 D0104 : score 2.5 : H : ARG NH1 A0289 <- 3.16 -> DG N7 C0009 : score 5.6144 A : H : ARG NH2 A0289 <- 2.62 -> DG O6 C0009 : score 6.8376 A : H : ARG NH1 B0278 <- 3.20 -> DA N7 D0111 : score 2.35544 : H : ASN OD1 B0281 <- 2.64 -> DA N6 D0111 : score 6.21449 : H : ASN ND2 B0281 <- 3.13 -> DT O4 C0005 : score 4.93583 : w : ASN ND2 B0281 <- 6.32 -> DA N6 C0004 : score 2.5 : H : ARG NH2 B0289 <- 3.11 -> DG N7 C0007 : score 5.98877 : H : ARG NH2 B0289 <- 2.84 -> DG O6 C0007 : score 6.5472 : w : ARG NE B0289 <- 5.26 -> DG O6 D0109 : score 1.369 : x : ALA xxxx A0284 <- 3.97 -> DT xxx D0105 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0285 <- 3.30 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 3.95 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0284 <- 4.07 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0285 <- 3.59 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 3.61 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx >6mht_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=TERNARY STRUCTURE OF HHAI METHYLTRANSFERASE WITH ADOHCY AND DNA CONTAINING 4'-THIO-2'DEOXYCYTIDINE AT THE TARGET organism=HAEMOPHILUS HAEMOLYTICUS : H : GLN OE1 A0237 <- 3.01 -> DG N2 C0408 : 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ARG NH2 A0477 <- 5.86 -> DA N7 F0011 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0478 <- 2.76 -> DG O6 E0007 : score 6.132 : H : ARG NH2 A0478 <- 2.83 -> DG N7 E0007 : score 6.34631 : w : ARG NH1 A0478 <- 6.07 -> DA N6 F0014 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0500 <- 3.18 -> DG N7 E0006 : score 5.5902 : H : ARG NH2 A0500 <- 2.75 -> DG O6 E0006 : score 6.666 : H : ASP OD1 A0502 <- 2.86 -> DC N4 F0015 : score 5.28073 : w : ASP OD1 A0502 <- 5.54 -> DA N7 F0014 : score 2.429 : w : ASP OD1 A0502 <- 5.91 -> DA N6 F0014 : score 3.122 : H : ASN ND2 A0503 <- 3.27 -> DA N7 E0005 : score 5.31868 : V : ALA CB A0475 <- 3.69 -> DT C7 E0008 : score 5.75295 : x : SER xxxx A0418 <- 3.44 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0443 <- 3.83 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0444 <- 4.08 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx >6ml5_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZBTB24 ZINC FINGERS 4-8 WITH 19+1MER DNA OLIGONUCLEOTIDE (SEQUENCE 4) organism=Mus musculus : H : ASP OD2 A0416 <- 3.26 -> DC N4 F0006 : score 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score 6.1628 : H : ASN OD1 A0503 <- 2.94 -> DA N6 E0005 : score 5.85318 : H : ASN ND2 A0503 <- 2.90 -> DA N7 E0005 : score 5.7531 : w : ASN OD1 A0503 <- 5.97 -> DC N4 F0016 : score 2.732 : V : ALA CB A0475 <- 3.65 -> DT C7 E0008 : score 5.80894 : x : SER xxxx A0418 <- 3.47 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0443 <- 3.88 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0444 <- 3.93 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx >6ml7_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZBTB24 ZINC FINGERS 4-8 WITH 19+1MER DNA OLIGONUCLEOTIDE (SEQUENCE 4 WITH A CPG 5MC MODIFICATION) organism=Mus musculus : H : ASP OD2 A0416 <- 3.08 -> DC N4 F0006 : score 5.8528 : H : GLN NE2 A0419 <- 2.89 -> DG O6 F0007 : score 5.70064 : w : GLN OE1 A0419 <- 5.66 -> DG N7 E0013 : score 2.87 : H : LYS NZ A0422 <- 2.70 -> DT O4 F0008 : score 3.65892 : w : LYS NZ A0422 <- 5.87 -> DG N7 E0013 : score 2.519 : w : LYS NZ A0422 <- 5.86 -> DG O6 E0012 : score 3.005 : H : SER OG A0446 <- 3.15 -> DC N4 F0010 : score 3.41835 : w : SER OG A0447 <- 5.32 -> DT O4 E0011 : score 2.338 : H : ASP OD1 A0472 <- 2.96 -> DC N4 E0009 : score 5.17384 : w : SER OG A0473 <- 5.30 -> DA N7 F0011 : score 2.343 : H : SER OG A0474 <- 2.94 -> DG N7 F0012 : score 4.35655 : H : SER OG A0474 <- 3.26 -> DG O6 F0012 : score 3.71465 : w : SER OG A0474 <- 6.09 -> DA N7 F0011 : score 2.343 : w : ARG NH2 A0477 <- 5.42 -> DA N7 F0011 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0478 <- 2.84 -> DG O6 E0007 : score 6.03467 : H : ARG NH2 A0478 <- 2.84 -> DG N7 E0007 : score 6.33354 : w : ARG NH1 A0478 <- 6.09 -> DA N6 F0014 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0500 <- 3.13 -> DG N7 E0006 : score 5.6507 : H : ARG NH2 A0500 <- 2.82 -> DG O6 E0006 : score 6.5736 : H : ASP OD2 A0502 <- 2.61 -> DC N4 F0015 : score 6.4356 : w : ASP OD1 A0502 <- 5.99 -> DA N7 F0014 : score 2.429 : w : ASP OD2 A0502 <- 6.07 -> DA N6 F0014 : score 3.409 : H : ASN ND2 A0503 <- 3.16 -> DA N7 E0005 : score 5.44784 : V : ALA CB A0475 <- 3.62 -> DT C7 E0008 : score 5.85093 : x : SER xxxx A0418 <- 3.48 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0443 <- 3.94 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0444 <- 4.13 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx >6mp3_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=BINARY STRUCTURE OF DNA POLYMERASE ETA IN COMPLEX WITH TEMPLATING HYPOXANTHINE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 2.98 -> DG O6 P0004 : score 5.86433 : H : ARG NH2 A0382 <- 2.84 -> DG N7 P0004 : score 6.33354 : x : SER xxxx A0322 <- 3.79 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.49 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.12 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >6mq8_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=BINARY STRUCTURE OF DNA POLYMERASE ETA IN COMPLEX WITH TEMPLATING HYPOXANTHINE organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0382 <- 2.94 -> DG O6 P0004 : score 6.4152 : x : SER xxxx A0322 <- 4.14 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.52 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >6mr7_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA SUBSTRATE COMPLEX WITH TEMPLATING ADENINE AND INCOMING FAPY-DGTP ANALOG organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.34 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.79 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.55 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6mr8_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=D276G DNA POLYMERASE BETA SUBSTRATE COMPLEX WITH TEMPLATING ADENINE AND INCOMING FAPY-DGTP ANALOG organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.25 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.77 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.55 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6mrj_ABCD:ACT-like;Ribbon-helix-helix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF H.PYLORI NIKR IN COMPLEX WITH DNA organism=Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) / Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) / Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) / Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) / Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) / Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) / Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) / Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) : H : ARG NH1 A0012 <- 3.05 -> DA N7 M0006 : score 2.43224 : H : ARG NH1 A0012 <- 2.82 -> DT O4 M0007 : score 3.25488 : H : SER OG A0014 <- 2.87 -> DG O6 L0026 : score 4.03375 : H : ARG NH1 B0012 <- 3.10 -> DG N7 L0024 : score 5.687 : H : SER OG B0014 <- 3.22 -> DA N6 M0008 : score 3.01341 : H : ARG NE C0012 <- 3.29 -> DT O4 M0027 : score 1.67679 : H : ARG NH1 C0012 <- 3.00 -> DA N7 M0026 : score 2.45785 : H : ARG NE D0012 <- 3.47 -> DT O4 L0004 : score 1.60987 : H : SER OG D0014 <- 2.70 -> DA N7 M0028 : score 4.55338 : x : SER xxxx A0016 <- 3.39 -> DG xxx L0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0016 <- 3.67 -> DT xxx M0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0038 <- 4.46 -> DT xxx L0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0014 <- 3.25 -> DA xxx M0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0016 <- 3.99 -> DT xxx L0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0016 <- 3.23 -> DA xxx M0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0077 <- 4.18 -> DA xxx L0015 : score x.xxxxx >6mrj_D:ACT-like;Ribbon-helix-helix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF H.PYLORI NIKR IN COMPLEX WITH DNA organism=Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) / Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) : H : ARG NE D0012 <- 3.47 -> DT O4 L0004 : score 1.60987 : H : SER OG D0014 <- 2.70 -> DA N7 M0028 : score 4.55338 : x : SER xxxx D0016 <- 3.23 -> DA xxx M0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0077 <- 4.18 -> DA xxx L0015 : score x.xxxxx >6mu4_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I FANA/DNA BINARY COMPLEX organism=Geobacillus stearothermophilus : w : LYS NZ A0582 <- 5.43 -> DA N3 P0007 : score 1.538 : H : ASN OD1 A0625 <- 2.59 -> DG N2 P0009 : score 5.0016 : x : PHE xxxx A0710 <- 4.08 -> DT xxx P0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 4.18 -> DT xxx P0011 : score x.xxxxx >6mu5_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I TNA/DNA BINARY COMPLEX organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.92 -> DA N3 P0007 : score 2.71028 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.85 -> DT O2 P0010 : score 4.26335 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.83 -> DC O2 P0008 : score 4.45261 : x : PHE xxxx A0710 <- 3.48 -> DT xxx P0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.02 -> DT xxx P0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.37 -> DG xxx P0009 : score x.xxxxx >6mup_E:Histone-fold; title=CENP-A NUCLEOSOME BOUND BY TWO COPIES OF CENP-C(CD) AND TWO COPIES CENP-N(NT) organism=HOMO SAPIENS : x : LEU xxxx E0065 <- 4.06 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx >6mup_M: title=CENP-A NUCLEOSOME BOUND BY TWO COPIES OF CENP-C(CD) AND TWO COPIES CENP-N(NT) organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx M0044 <- 4.22 -> DA xxx J0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0169 <- 4.22 -> DT xxx I-021 : score x.xxxxx >6mxo_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF HPOLETA INCORPORATING DCTP OPPOSITE THE 3-PRIME PT(DACH)- GG organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 3.83 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.44 -> DT xxx P0004 : score x.xxxxx >6mzm_ABTW:TATA-box_binding_protein-like;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain; title=HUMAN TFIID BOUND TO PROMOTER DNA AND TFIIA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0854 <- 2.65 -> DA N3 V0069 : score 3.33694 : H : ASN ND2 T0167 <- 3.04 -> DT O2 U0148 : score 4.51834 : H : ASN ND2 T0167 <- 2.92 -> DT O2 U0149 : score 4.63225 : H : ASN ND2 T0257 <- 2.43 -> DA N3 V0012 : score 4.08946 : x : ARG xxxx A0843 <- 4.03 -> DG xxx U0095 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0844 <- 3.40 -> DC xxx V0062 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx T0169 <- 3.57 -> DT xxx U0148 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx T0197 <- 3.15 -> DT xxx U0146 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx T0212 <- 3.44 -> DT xxx U0146 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx T0214 <- 3.57 -> DA xxx V0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx T0220 <- 3.54 -> DA xxx V0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx T0222 <- 3.78 -> DT xxx U0147 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx T0259 <- 3.34 -> DT xxx U0149 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx T0288 <- 3.30 -> DA xxx V0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx T0289 <- 3.41 -> DA xxx U0152 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx T0303 <- 3.67 -> DA xxx V0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx T0305 <- 3.12 -> DT xxx U0151 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx T0311 <- 3.31 -> DA xxx U0150 : score x.xxxxx : x : THR xxxx T0313 <- 3.31 -> DA xxx V0012 : score x.xxxxx >6n1p_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=DIHEDRAL OLIGOMERIC COMPLEX OF GYRA N-TERMINAL FRAGMENT WITH DNA, SOLVED BY CRYOEM IN C2 SYMMETRY organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE G54 : H : LYS NZ A0436 <- 3.10 -> DC N3 J0002 : score 0.545923 : x : LEU xxxx A0432 <- 2.52 -> DA xxx I0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0433 <- 1.21 -> DC xxx J0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0435 <- 3.96 -> DA xxx I0044 : score x.xxxxx >6n1p_ABDFGH:Type_II_DNA_topoisomerase; title=DIHEDRAL OLIGOMERIC COMPLEX OF GYRA N-TERMINAL FRAGMENT WITH DNA, SOLVED BY CRYOEM IN C2 SYMMETRY organism=STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE G54 : H : LYS NZ A0436 <- 3.10 -> DC N3 J0002 : score 0.545923 : x : LEU xxxx A0432 <- 2.52 -> DA xxx I0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0433 <- 1.21 -> DC xxx J0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0435 <- 3.96 -> DA xxx I0044 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0120 <- 2.97 -> DC xxx I0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0120 <- 2.91 -> DT xxx J0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0432 <- 4.13 -> DG xxx I0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0433 <- 2.39 -> DA xxx I0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0436 <- 2.37 -> DG xxx I0001 : score x.xxxxx >6n2r_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=BINARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH 5- CARBOXY-DC (5-CAC) AT THE TEMPLATING POSITION organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.21 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.90 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.59 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6n2s_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH 5- CARBOXY-DC (5-CAC) AT THE TEMPLATING POSITION organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0280 <- 6.17 -> DC O2 T0005 : score 1.3 : x : HIS xxxx A0034 <- 3.22 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.09 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.36 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6n2t_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH 5- HYDROXYMETHYL-DC (5-HMC) AT THE TEMPLATING POSITION organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.21 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.87 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.59 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6n7i_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF BACTERIOPHAGE T7 E343Q MUTANT GP4 HELICASE-PRIMASE IN COMPLEX WITH SSDNA, DTTP, AC DINUCLEOTIDE AND CTP (GP4(5)-DNA) organism=? : x : ASP xxxx A0437 <- 3.59 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0439 <- 4.04 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx >6n7i_ABCDE:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;DNA_primase_core;Zinc_beta-ribbon; title=STRUCTURE OF BACTERIOPHAGE T7 E343Q MUTANT GP4 HELICASE-PRIMASE IN COMPLEX WITH SSDNA, DTTP, AC DINUCLEOTIDE AND CTP (GP4(5)-DNA) organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : ARG NE E0439 <- 2.98 -> DT O2 T0007 : score 2.48415 : x : ASP xxxx A0437 <- 3.59 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0439 <- 4.04 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0437 <- 4.32 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0439 <- 4.17 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0439 <- 4.35 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0439 <- 3.34 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx >6n7n_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;DNA_primase_core;Zinc_beta-ribbon; title=STRUCTURE OF BACTERIOPHAGE T7 E343Q MUTANT GP4 HELICASE-PRIMASE IN COMPLEX WITH SSDNA, DTTP, AC DINUCLEOTIDE AND CTP (FORM I) organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : ARG NH2 B0439 <- 3.29 -> DT O2 T0013 : score 3.81847 : H : ARG NE E0439 <- 2.80 -> DT O2 T0007 : score 2.57692 : x : ASP xxxx A0437 <- 3.84 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0439 <- 3.97 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0439 <- 3.08 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx >6n7n_D:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF BACTERIOPHAGE T7 E343Q MUTANT GP4 HELICASE-PRIMASE IN COMPLEX WITH SSDNA, DTTP, AC DINUCLEOTIDE AND CTP (FORM I) organism=? : x : ARG xxxx D0439 <- 3.08 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx >6n7s_ABCDE:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;DNA_primase_core;Zinc_beta-ribbon; title=STRUCTURE OF BACTERIOPHAGE T7 E343Q MUTANT GP4 HELICASE-PRIMASE IN COMPLEX WITH SSDNA, DTTP, AC DINUCLEOTIDE AND CTP (FORM II) organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : ARG NH2 D0439 <- 2.65 -> DT O2 T0008 : score 4.36033 : H : ARG NE E0439 <- 3.40 -> DT O2 T0006 : score 2.26769 : V : ASP CB E0470 <- 3.81 -> DT C7 T0011 : score 2.67637 : x : ASP xxxx A0437 <- 3.62 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0439 <- 3.56 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0470 <- 3.83 -> DT xxx T0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0439 <- 3.45 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0470 <- 4.11 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx >6n7s_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF BACTERIOPHAGE T7 E343Q MUTANT GP4 HELICASE-PRIMASE IN COMPLEX WITH SSDNA, DTTP, AC DINUCLEOTIDE AND CTP (FORM II) organism=? : x : ARG xxxx B0439 <- 3.45 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx >6n7t_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;DNA_primase_core;Zinc_beta-ribbon; title=STRUCTURE OF BACTERIOPHAGE T7 E343Q MUTANT GP4 HELICASE-PRIMASE IN COMPLEX WITH SSDNA, DTTP, AC DINUCLEOTIDE AND CTP (FORM III) organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : ARG NE D0439 <- 3.26 -> DT O2 T0009 : score 2.33985 : H : ARG NE E0439 <- 3.22 -> DT O2 T0007 : score 2.36046 : x : ARG xxxx A0439 <- 3.47 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0437 <- 3.77 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0439 <- 4.35 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0437 <- 4.47 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0439 <- 4.48 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0439 <- 4.49 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >6n7t_D:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF BACTERIOPHAGE T7 E343Q MUTANT GP4 HELICASE-PRIMASE IN COMPLEX WITH SSDNA, DTTP, AC DINUCLEOTIDE AND CTP (FORM III) organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : ARG NE D0439 <- 3.26 -> DT O2 T0009 : score 2.33985 >6n7v_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF BACTERIOPHAGE T7 GP4 (HELICASE-PRIMASE, E343Q MUTANT) IN COMPLEX WITH SSDNA, DTTP, AC DINUCLEOTIDE, AND CTP (FROM MULTIPLE LEAD COMPLEXES) organism=? : x : ARG xxxx A0439 <- 3.51 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx >6n7v_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;DNA_primase_core;Zinc_beta-ribbon; title=STRUCTURE OF BACTERIOPHAGE T7 GP4 (HELICASE-PRIMASE, E343Q MUTANT) IN COMPLEX WITH SSDNA, DTTP, AC DINUCLEOTIDE, AND CTP (FROM MULTIPLE LEAD COMPLEXES) organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : ARG NE E0439 <- 3.30 -> DT O2 T0007 : score 2.31923 : x : ARG xxxx A0439 <- 3.51 -> DT xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0439 <- 4.08 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0439 <- 4.20 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0439 <- 3.06 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0439 <- 4.18 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx >6n7w_H:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF BACTERIOPHAGE T7 LEADING-STRAND DNA POLYMERASE (D5A/E7A)/TRX IN COMPLEX WITH A DNA FORK AND INCOMING DTTP (FROM MULTIPLE LEAD COMPLEXES) organism=ENTEROBACTERIA PHAGE T7 : H : GLN OE1 H0439 <- 2.69 -> DG N2 P0022 : score 5.73106 : H : GLN NE2 H0439 <- 2.70 -> DC O2 T0056 : score 3.76877 : x : LYS xxxx H0394 <- 4.24 -> DG xxx T0057 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0429 <- 3.33 -> DC xxx T0054 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0436 <- 4.44 -> DC xxx T0056 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0615 <- 3.83 -> DC xxx T0054 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0653 <- 4.25 -> DG xxx P0024 : score x.xxxxx >6nce_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN FOXN3 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A FORKHEAD DNA SEQUENCE organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 A0160 <- 3.29 -> DA N6 C0010 : score 5.43166 : H : ASN ND2 A0160 <- 3.24 -> DA N7 C0010 : score 5.35391 : H : HIS ND1 A0164 <- 3.17 -> DT O4 D0008 : score 4.37119 : V : ARG CZ A0163 <- 3.58 -> DT C7 D0005 : score 2.24958 : x : SER xxxx A0161 <- 3.88 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0167 <- 3.36 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >6ncm_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN FOXN3 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A FORKHEAD-LIKE (FHL) DNA SEQUENCE organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 A0160 <- 2.83 -> DG O6 D0013 : score 5.60463 : w : ASN ND2 A0160 <- 6.46 -> DC N4 D0014 : score 2.395 : H : ARG NE A0163 <- 2.75 -> DG N7 C0004 : score 4.46601 : H : ARG NH2 A0163 <- 3.20 -> DG O6 C0004 : score 6.072 : x : SER xxxx A0161 <- 3.41 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0164 <- 3.28 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0167 <- 3.67 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >6ncm_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN FOXN3 DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A FORKHEAD-LIKE (FHL) DNA SEQUENCE organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 A0160 <- 2.83 -> DG O6 D0013 : score 5.60463 : w : ASN ND2 A0160 <- 6.46 -> DC N4 D0014 : score 2.395 : H : ARG NE A0163 <- 2.75 -> DG N7 C0004 : score 4.46601 : H : ARG NH2 A0163 <- 3.20 -> DG O6 C0004 : score 6.072 : H : HIS NE2 B0164 <- 2.71 -> DT O4 C0002 : score 5.70994 : V : LEU CD2 B0168 <- 3.63 -> DT C7 C0002 : score 5.97486 : x : SER xxxx A0161 <- 3.41 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0164 <- 3.28 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0167 <- 3.67 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0161 <- 3.98 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx >6ne0_AH: title=STRUCTURE OF DOUBLE-STRANDED TARGET DNA ENGAGED CSY COMPLEX FROM PSEUDOMONAS AERUGINOSA (PA-14) organism=PSEUDOMONAS AERUGINOSA UCBPP-PA14 : H : ASN OD1 A0111 <- 3.22 -> DG N2 N0034 : score 4.3968 : H : ASN OD1 A0250 <- 2.65 -> DG N2 N0033 : score 4.944 : H : ASN ND2 A0250 <- 2.97 -> DG N3 N0033 : score 4.72845 : x : ALA xxxx A0112 <- 3.96 -> DC xxx O0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0113 <- 3.40 -> DC xxx O0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0247 <- 3.54 -> DG xxx N0033 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0249 <- 3.74 -> DC xxx O0012 : score x.xxxxx >6ne0_BCDEFG: title=STRUCTURE OF DOUBLE-STRANDED TARGET DNA ENGAGED CSY COMPLEX FROM PSEUDOMONAS AERUGINOSA (PA-14) organism=PSEUDOMONAS AERUGINOSA UCBPP-PA14 : H : SER OG G0262 <- 3.12 -> DC N4 N0022 : score 3.4404 : V : VAL CG2 E0354 <- 3.53 -> DT C7 N0017 : score 6.53638 : V : VAL CB G0354 <- 3.81 -> DT C7 N0029 : score 3.91838 : x : ARG xxxx B0085 <- 3.74 -> DA xxx N0031 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0094 <- 3.48 -> DA xxx N0032 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0030 <- 3.40 -> DA xxx N0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0354 <- 3.56 -> DA xxx N0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0030 <- 3.45 -> DG xxx N0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0032 <- 4.49 -> DG xxx N0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0073 <- 4.21 -> DG xxx N0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0074 <- 3.77 -> DT xxx 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x : LEU xxxx E0252 <- 2.90 -> DC xxx N0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0030 <- 3.37 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0069 <- 4.28 -> DG xxx N0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0093 <- 3.56 -> DA xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0094 <- 3.83 -> DA xxx N0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0095 <- 2.72 -> DC xxx N0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0096 <- 3.50 -> DA xxx N0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 4.50 -> DA xxx N0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0252 <- 3.44 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0262 <- 3.65 -> DA xxx N0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0354 <- 3.42 -> DC xxx N0023 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0030 <- 3.40 -> DG xxx N0030 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0032 <- 3.97 -> DG xxx N0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0069 <- 4.34 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0074 <- 4.05 -> DC xxx N0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0093 <- 3.44 -> DA xxx N0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0094 <- 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F0354 <- 3.42 -> DC xxx N0023 : score x.xxxxx >6nj9_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=ACTIVE STATE DOT1L BOUND TO THE H2B-UBIQUITINATED NUCLEOSOME, 2-TO-1 COMPLEX organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 E0040 <- 2.95 -> DT O2 J0083 : score 4.10633 : H : ARG NH1 G0011 <- 3.22 -> DT O2 I0031 : score 3.94467 : H : ARG NH1 H0033 <- 3.35 -> DT O2 I0027 : score 3.83271 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.51 -> DG xxx I0083 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.70 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 3.54 -> DA xxx J0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.32 -> DT xxx I0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.67 -> DG xxx I0122 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.24 -> DG xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.46 -> DC xxx J0111 : score x.xxxxx >6nj9_H:Histone-fold; title=ACTIVE STATE DOT1L BOUND TO THE H2B-UBIQUITINATED NUCLEOSOME, 2-TO-1 COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 H0033 <- 3.35 -> DT O2 I0027 : score 3.83271 >6njq_B:TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURE OF TBP-HOOGSTEEN CONTAINING DNA COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : H : ASN ND2 B0027 <- 3.06 -> DT O2 F0222 : score 4.49935 : H : ASN ND2 B0117 <- 3.23 -> DA N3 E0207 : score 3.48023 : H : THR OG1 B0173 <- 2.66 -> DA N3 E0206 : score 1.39175 : x : VAL xxxx B0029 <- 3.53 -> DT xxx F0222 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0057 <- 3.32 -> DG xxx F0220 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0072 <- 4.17 -> DT xxx F0221 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0074 <- 3.91 -> DC xxx E0209 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0080 <- 3.71 -> DA xxx E0208 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0082 <- 3.61 -> DT xxx F0221 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0119 <- 3.34 -> DT xxx F0223 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0148 <- 3.32 -> DA xxx E0204 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0149 <- 3.29 -> DA 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D0001 : score x.xxxxx >6nkt_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF K289M VARIANT OF DNA POLYMERASE BETA WITH BETA-GAMMA DIFLUORO ANALOGUE OF DGTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.16 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.74 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.75 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6nku_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH "HOT- SPOT SEQUENCE" WITH DGTP organism=Homo sapiens : V : LYS CE A0035 <- 3.83 -> DT C7 D0001 : score 2.58152 : x : HIS xxxx A0034 <- 3.19 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.67 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx >6nkv_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH "HOT- SPOT SEQUENCE" WITH BETA-GAMMA CHF ANALOGUE OF DGTP organism=Homo sapiens : V : LYS CE A0035 <- 3.78 -> DT C7 D0001 : score 2.61403 : x : HIS xxxx A0034 <- 3.15 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.75 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx >6nkw_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH "HOT- SPOT SEQUENCE" WITH BETA-GAMMA-METHYLENE DGTP organism=Homo sapiens : V : LYS CE A0035 <- 3.83 -> DT C7 D0001 : score 2.58152 : x : HIS xxxx A0034 <- 3.09 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.64 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx >6nkx_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF K289M VARIANT OF DNA POLYMERASE BETA WITH "HOT-SPOT SEQUENCE" WITH DGTP organism=Homo sapiens : V : LYS CE A0035 <- 3.85 -> DT C7 D0001 : score 2.56851 : x : HIS xxxx A0034 <- 3.17 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.64 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx >6nky_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF K289M VARIANT OF DNA POLYMERASE BETA WITH "HOT-SPOT SEQUENCE" WITH BETA-GAMMA CHF ANALOGUE OF DGTP organism=Homo sapiens : V : LYS CE A0035 <- 3.72 -> DT C7 D0001 : score 2.65305 : x : HIS xxxx A0034 <- 3.15 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.75 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx >6nkz_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF K289M VARIANT OF DNA POLYMERASE BETA WITH "HOT-SPOT SEQUENCE" WITH BETA-GAMMA METHYLENE DGTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.19 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.97 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.67 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx >6nl0_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF K289M VARIANT OF DNA POLYMERASE BETA WITH "HOT-SPOT SEQUENCE" WITH BETA-GAMMA CF2 ANALOGUE OF DGTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.16 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.92 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.73 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx >6nn6_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF DOT1L-H2BK120UB NUCLEOSOME COMPLEX organism=XENOPUS LAEVIS : x : HIS xxxx A0039 <- 4.49 -> DG xxx I0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 3.58 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.99 -> DA xxx J0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.70 -> DG xxx J-008 : score x.xxxxx >6nog_A:Histone-fold; title=POISED-STATE DOT1L BOUND TO THE H2B-UBIQUITINATED NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx A0040 <- 3.39 -> DG xxx J0066 : score x.xxxxx >6nog_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=POISED-STATE DOT1L BOUND TO THE H2B-UBIQUITINATED NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx A0040 <- 3.39 -> DG xxx J0066 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 4.48 -> DT xxx J0083 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.34 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx >6nqa_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=ACTIVE STATE DOT1L BOUND TO THE H2B-UBIQUITINATED NUCLEOSOME, 1-TO-1 COMPLEX organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx G0011 <- 3.84 -> DA xxx J0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.24 -> DC xxx I0111 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 4.05 -> DG xxx I0122 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.98 -> DG xxx J0066 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0039 <- 4.27 -> DG xxx J0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 3.57 -> DT xxx J0083 : score x.xxxxx >6nsm_A:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=TETR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CIFR C99T-C107S-C181R CYSTEINES MUTANT COMPLEXED WITH 26BP DOUBLE-STRAND OPERATOR DNA organism=Pseudomonas aeruginosa : H : ARG NH1 A0004 <- 2.59 -> DT O2 C0002 : score 4.48728 : V : PRO CB A0044 <- 3.78 -> DT C7 D0018 : score 5.83518 : x : ARG xxxx A0006 <- 3.20 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0033 <- 4.46 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0043 <- 3.95 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0045 <- 3.52 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0046 <- 4.32 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0048 <- 3.19 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx >6nsm_AB:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=TETR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CIFR C99T-C107S-C181R CYSTEINES MUTANT COMPLEXED WITH 26BP DOUBLE-STRAND OPERATOR DNA organism=Pseudomonas aeruginosa : H : ARG NH1 A0004 <- 2.59 -> DT O2 C0002 : score 4.48728 : H : ARG NE B0006 <- 3.31 -> DA N3 C0023 : score 1.8881 : V : PRO CB B0044 <- 3.63 -> DT C7 C0018 : score 6.05292 : V : PRO CB A0044 <- 3.78 -> DT C7 D0018 : score 5.83518 : x : ARG xxxx A0006 <- 3.20 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0033 <- 4.46 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0043 <- 3.95 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0045 <- 3.52 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0046 <- 4.32 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0048 <- 3.19 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0033 <- 3.74 -> DA xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 3.94 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0045 <- 3.18 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0048 <- 3.34 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx >6nsn_AB:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=TETR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CIFR C99T-C181R CYSTEINES MUTANT COMPLEXED WITH 26BP DOUBLE-STRAND OPERATOR DNA organism=Pseudomonas aeruginosa : H : ARG NH2 A0004 <- 2.97 -> DA N3 D0026 : score 3.12959 : H : ARG NH2 A0004 <- 2.67 -> DT O2 C0002 : score 4.3434 : V : PRO CB A0044 <- 3.87 -> DT C7 D0018 : score 5.70455 : V : PRO CB B0044 <- 3.76 -> DT C7 C0018 : score 5.86422 : x : ARG xxxx A0006 <- 3.27 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0033 <- 4.43 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0043 <- 4.00 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0045 <- 3.40 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0048 <- 3.20 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0006 <- 3.08 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0033 <- 3.50 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 4.01 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0045 <- 3.03 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0046 <- 4.06 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0048 <- 3.32 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx >6nsn_B:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=TETR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CIFR C99T-C181R CYSTEINES MUTANT COMPLEXED WITH 26BP DOUBLE-STRAND OPERATOR DNA organism=Pseudomonas aeruginosa : V : PRO CB B0044 <- 3.76 -> DT C7 C0018 : score 5.86422 : x : ARG xxxx B0006 <- 3.08 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0033 <- 3.50 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 4.01 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0045 <- 3.03 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0046 <- 4.06 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0048 <- 3.32 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx >6nsr_AB:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=TETR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CIFR C99T-C181R CYSTEINE MUTANT COMPLEXED WITH 26BP DOUBLE-STRAND OPERATOR DNA AND APO-CIFR C99T- C181R organism=Pseudomonas aeruginosa : H : ARG NH1 A0006 <- 3.15 -> DT O2 C0005 : score 4.00496 : H : ARG NH2 B0006 <- 3.22 -> DA N3 C0023 : score 2.96761 : V : PRO CB A0044 <- 3.71 -> DT C7 D0018 : score 5.93679 : x : LEU xxxx A0033 <- 4.27 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0043 <- 4.13 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0045 <- 3.33 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0046 <- 4.29 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0048 <- 3.05 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0033 <- 3.47 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0044 <- 3.27 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0045 <- 3.36 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0046 <- 4.18 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0048 <- 3.57 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx >6nua_AB:BB1717-like; title=DNA-PROTEIN CROSSLINK BETWEEN E. COLI YEDK AND SSDNA CONTAINING AN ABASIC SITE organism=Escherichia coli : w : ARG NE B0004 <- 5.73 -> DG N3 C0005 : score 1.082 : w : ARG NH2 B0004 <- 5.87 -> DG N3 C0005 : score 0.677 >6nua_B:BB1717-like; title=DNA-PROTEIN CROSSLINK BETWEEN E. COLI YEDK AND SSDNA CONTAINING AN ABASIC SITE organism=Escherichia coli : w : ARG NE B0004 <- 5.73 -> DG N3 C0005 : score 1.082 : w : ARG NH2 B0004 <- 5.87 -> DG N3 C0005 : score 0.677 >6ny1_Y: title=CASX-GRNA-DNA(30BP) STATE II organism=DELTAPROTEOBACTERIA BACTERIUM : H : ARG NH1 Y0191 <- 2.61 -> DT O4 D0011 : score 3.39213 : H : LYS NZ Y0226 <- 2.82 -> DG O6 C0022 : score 5.75765 : H : LYS NZ Y0226 <- 3.00 -> DT O4 D0008 : score 3.44369 : H : SER OG Y0238 <- 2.76 -> DA N3 C0017 : score 3.02788 : V : ALA CB Y0135 <- 3.71 -> DT C7 D0014 : score 5.72495 : x : ARG xxxx Y0023 <- 3.34 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx Y0027 <- 3.32 -> DA xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0130 <- 3.39 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0134 <- 3.87 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Y0196 <- 3.56 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx Y0230 <- 3.98 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Y0242 <- 3.57 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Y0521 <- 4.29 -> DA xxx C0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Y0527 <- 4.05 -> DA xxx C0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Y0528 <- 3.61 -> DG xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0628 <- 4.02 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx >6ny2_Y: title=CASX-GRNA-DNA(45BP) STATE I organism=DELTAPROTEOBACTERIA BACTERIUM : H : LYS NZ Y0226 <- 3.32 -> DT O4 D0008 : score 3.21411 : H : LYS NZ Y0226 <- 2.86 -> DG O6 C0022 : score 5.7114 : H : SER OG Y0238 <- 2.56 -> DA N3 C0017 : score 3.14803 : H : LYS NZ Y0242 <- 3.17 -> DC O2 C0016 : score 2.72814 : H : ASN ND2 Y0305 <- 3.43 -> DG N3 C0004 : score 4.27812 : H : TYR OH Y0528 <- 2.93 -> DG N7 C0022 : score 4.17571 : H : THR OG1 Y0651 <- 3.45 -> DA N3 C0020 : score 1.17785 : V : TYR CG Y0196 <- 3.56 -> DT C7 D0008 : score 3.96603 : V : ALA CB Y0131 <- 3.78 -> DT C7 D0014 : score 5.62697 : x : MET xxxx Y0027 <- 4.07 -> DA xxx C0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Y0029 <- 4.47 -> DA xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0135 <- 3.91 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Y0187 <- 4.47 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0191 <- 3.51 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Y0306 <- 4.34 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Y0310 <- 3.47 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Y0492 <- 4.10 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Y0521 <- 3.99 -> DA xxx C0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Y0527 <- 3.38 -> DA xxx C0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0628 <- 3.37 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Y0771 <- 3.73 -> DT xxx D0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Y0775 <- 3.37 -> DC xxx D0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0777 <- 3.23 -> DC xxx D0023 : score x.xxxxx : x : MET xxxx Y0784 <- 3.52 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Y0789 <- 3.87 -> DC xxx D0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0816 <- 4.35 -> DT xxx D0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Y0817 <- 4.37 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0876 <- 3.37 -> DC xxx D0028 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0881 <- 4.07 -> DC xxx D0028 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0908 <- 3.74 -> DG xxx D0026 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Y0920 <- 3.38 -> DC xxx D0024 : score x.xxxxx >6ny3_Y: title=CASX TERNARY COMPLEX WITH 30BP TARGET DNA organism=DELTAPROTEOBACTERIA BACTERIUM : H : LYS NZ Y0226 <- 3.02 -> DT O4 D0008 : score 3.42934 : H : SER OG Y0238 <- 2.71 -> DA N3 C0017 : score 3.05792 : H : LYS NZ Y0242 <- 2.81 -> DC O2 C0016 : score 2.94026 : H : TYR OH Y0528 <- 3.16 -> DG N7 C0022 : score 3.9785 : H : GLN NE2 Y0817 <- 2.86 -> DC O2 D0019 : score 3.65053 : V : TYR CD2 Y0196 <- 3.56 -> DT C7 D0008 : score 3.96603 : V : ALA CB Y0131 <- 3.76 -> DT C7 D0014 : score 5.65496 : x : ARG xxxx Y0023 <- 3.32 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx Y0027 <- 3.50 -> DA xxx C0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Y0100 <- 3.61 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Y0103 <- 3.72 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0135 <- 4.30 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0191 <- 3.53 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx Y0230 <- 4.22 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Y0492 <- 3.64 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Y0515 <- 3.43 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Y0521 <- 3.50 -> DA xxx C0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Y0527 <- 3.17 -> DA xxx C0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0628 <- 3.41 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Y0651 <- 3.79 -> DA xxx C0020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Y0771 <- 3.66 -> DT xxx D0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Y0775 <- 3.38 -> DC xxx D0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0777 <- 3.84 -> DC xxx D0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx Y0784 <- 3.35 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Y0789 <- 4.26 -> DC xxx D0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Y0920 <- 3.25 -> DC xxx D0023 : score x.xxxxx >6nzo_C:Histone-fold; title=SET2 BOUND TO NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx C0042 <- 4.24 -> DG xxx J0037 : score x.xxxxx >6o0z_A: title=CONFORMATIONAL STATES OF CAS9-SGRNA-DNA TERNARY COMPLEX IN THE PRESENCE OF MAGNESIUM organism=STREPTOCOCCUS PYOGENES : H : LYS NZ A1107 <- 3.19 -> DC O2 C0009 : score 2.71635 : H : ARG NH2 A1333 <- 3.21 -> DG O6 D0032 : score 6.0588 : H : ARG NH1 A1335 <- 3.14 -> DG O6 D0033 : score 5.66967 : H : ARG NH2 A1335 <- 3.16 -> DG N7 D0033 : score 5.92492 >6o19_A:Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PHO7 COMPLEX WITH PHO1 PROMOTER SITE 2 organism=Schizosaccharomyces pombe : w : ARG NH2 A0284 <- 5.74 -> DC O2 B0012 : score 1.669 : w : ARG NH2 A0284 <- 6.18 -> DT O2 B0011 : score 2.261 : w : ARG NH2 A0284 <- 5.76 -> DA N3 C0009 : score 2.092 : w : ARG NH2 A0284 <- 5.63 -> DT O2 B0011 : score 2.261 : w : GLN OE1 A0287 <- 5.82 -> DT O2 B0010 : score 2.481 : w : GLN NE2 A0287 <- 5.99 -> DT O2 B0011 : score 1.565 : H : ASN ND2 A0299 <- 2.92 -> DG O6 C0007 : score 5.50314 : w : ASN OD1 A0299 <- 6.06 -> DC N4 B0012 : score 2.732 : w : ASN ND2 A0299 <- 6.26 -> DG O6 C0008 : score 2.971 : H : LYS NZ A0300 <- 2.70 -> DG O6 B0014 : score 5.89638 : w : LYS NZ A0300 <- 5.57 -> DT O4 C0004 : score 1.7 : H : ARG NH2 A0326 <- 2.96 -> DA N3 C0014 : score 3.13607 : w : ARG NE A0326 <- 5.64 -> DT O2 C0013 : score 0.757 : w : ARG NH1 A0326 <- 5.77 -> DA N3 C0015 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0326 <- 5.97 -> DA N3 C0015 : score 2.092 : H : ARG NH1 A0332 <- 3.03 -> DT O2 B0005 : score 4.10832 : w : ARG NH2 A0332 <- 6.28 -> DA N3 B0007 : score 2.092 : H : TYR OH A0335 <- 2.76 -> DA N3 C0016 : score 4.18449 : x : ASP xxxx A0298 <- 4.37 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >6o1d_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE CENTROMERIC NUCLEOSOME WITH NATIVE ALPHA SATELLITE DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 C0011 <- 3.19 -> DT O2 I0116 : score 3.90313 : H : ARG NH1 G0011 <- 3.21 -> DT O2 J0116 : score 3.95328 : H : ARG NH2 G0011 <- 2.66 -> DT O2 J0116 : score 4.35187 : x : ARG xxxx A0043 <- 3.09 -> DT xxx J0066 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.44 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.59 -> DT xxx I0121 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0043 <- 3.78 -> DC xxx I0066 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.95 -> DT xxx J0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.84 -> DT xxx I0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 4.35 -> DG xxx J0121 : score x.xxxxx >6o3t_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS OF FOXC2 AND DNA INTERACTIONS organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 A0118 <- 3.16 -> DA N6 D0016 : score 5.58823 : H : ASN ND2 A0118 <- 2.89 -> DA N7 D0016 : score 5.76484 : H : ARG NE A0121 <- 3.33 -> DG N7 C0006 : score 3.95308 : H : ARG NH2 A0121 <- 3.39 -> DG N7 C0006 : score 5.63123 : H : ARG NH2 A0121 <- 3.00 -> DG O6 C0006 : score 6.336 : H : HIS ND1 A0122 <- 2.73 -> DT O4 C0008 : score 4.7866 : H : ASN OD1 B0118 <- 3.10 -> DA N6 C0013 : score 5.66049 : H : ASN ND2 B0118 <- 2.73 -> DA N7 C0013 : score 5.9527 : H : ARG NE B0121 <- 3.39 -> DG N7 D0009 : score 3.90002 : H : ARG NH2 B0121 <- 3.28 -> DG O6 D0009 : score 5.9664 : H : HIS NE2 B0122 <- 2.90 -> DT O4 D0012 : score 5.49679 : V : SER CB A0125 <- 3.61 -> DT C7 C0008 : score 3.28002 : V : SER CB B0119 <- 3.76 -> DT C7 C0011 : score 3.16259 : V : SER CB B0125 <- 3.88 -> DT C7 D0010 : score 3.06866 : x : SER xxxx A0119 <- 3.38 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0142 <- 4.23 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0126 <- 4.20 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx >6o3t_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS OF FOXC2 AND DNA INTERACTIONS organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 B0118 <- 3.10 -> DA N6 C0013 : score 5.66049 : H : ASN ND2 B0118 <- 2.73 -> DA N7 C0013 : score 5.9527 : H : ARG NE B0121 <- 3.39 -> DG N7 D0009 : score 3.90002 : H : ARG NH2 B0121 <- 3.28 -> DG O6 D0009 : score 5.9664 : H : HIS NE2 B0122 <- 2.90 -> DT O4 D0012 : score 5.49679 : V : SER CB B0119 <- 3.76 -> DT C7 C0011 : score 3.16259 : V : SER CB B0125 <- 3.88 -> DT C7 D0010 : score 3.06866 : x : LEU xxxx B0126 <- 4.20 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx >6o6c_ABD: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX ARRESTED AT A CPD LESION organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A1386 <- 3.99 -> DC xxx M0017 : score x.xxxxx >6o6p_AB:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF THE REGULATOR FASR FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN COMPLEX WITH DNA organism=Mycobacterium tuberculosis : H : LYS NZ B0073 <- 2.40 -> DG N7 D0017 : score 5.81677 : x : SER xxxx A0072 <- 4.20 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0073 <- 2.76 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0074 <- 3.87 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0077 <- 4.02 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0072 <- 3.82 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0074 <- 3.30 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0077 <- 3.39 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx >6o6p_B:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF THE REGULATOR FASR FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN COMPLEX WITH DNA organism=Mycobacterium tuberculosis : H : LYS NZ B0073 <- 2.40 -> DG N7 D0017 : score 5.81677 : x : SER xxxx B0072 <- 3.82 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0074 <- 3.30 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0077 <- 3.39 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx >6o8e_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UVRB BOUND TO DUPLEX DNA WITH ADP organism=Bacillus caldotenax : V : TYR CG A0096 <- 3.83 -> DT C7 C0012 : score 3.71348 : x : SER xxxx A0091 <- 3.84 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0093 <- 3.89 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0095 <- 3.25 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0097 <- 2.84 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0098 <- 3.34 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0109 <- 3.85 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0112 <- 3.92 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0114 <- 3.45 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0115 <- 4.40 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0146 <- 3.49 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0249 <- 3.53 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0251 <- 3.74 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0302 <- 3.46 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0306 <- 4.05 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0307 <- 4.04 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0310 <- 3.90 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0346 <- 3.46 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0350 <- 3.26 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0357 <- 3.43 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0527 <- 3.14 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx >6o8f_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UVRB BOUND TO DUPLEX DNA organism=Bacillus caldotenax : H : CYS SG A0251 <- 3.29 -> DC N4 C0013 : score -3.13156 : H : GLN NE2 A0346 <- 2.99 -> DT O2 C0009 : score 3.78387 : V : TYR CB A0096 <- 3.64 -> DT C7 C0012 : score 5.06347 : x : SER xxxx A0091 <- 3.47 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0093 <- 3.58 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0095 <- 3.47 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0097 <- 3.24 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0098 <- 3.31 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0109 <- 3.63 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0112 <- 3.79 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0114 <- 3.61 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0115 <- 4.13 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0146 <- 3.90 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0249 <- 3.48 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0302 <- 3.75 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0306 <- 3.92 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0307 <- 4.02 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0310 <- 3.76 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0350 <- 3.20 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0357 <- 3.27 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0480 <- 3.95 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0527 <- 3.54 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx >6o8g_C:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UVRB BOUND TO FULLY DUPLEX DNA organism=Bacillus caldotenax : x : GLN xxxx C0346 <- 3.93 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0350 <- 3.18 -> DG xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0357 <- 3.28 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0503 <- 4.12 -> DC xxx H0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0527 <- 3.26 -> DG xxx I0013 : score x.xxxxx >6o8h_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF UVRB MUTANT BOUND TO DUPLEX DNA organism=Bacillus caldotenax : x : ARG xxxx A0357 <- 3.74 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0527 <- 3.68 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >6o96_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=DOT1L BOUND TO THE H2BK120 UBIQUITINATED NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.75 -> DG N3 I0083 : score 3.64636 : H : ARG NH2 D0033 <- 2.96 -> DC O2 J0027 : score 3.58036 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.21 -> DT O2 J0083 : score 4.73287 : H : ARG NH2 H0033 <- 3.42 -> DC O2 J0123 : score 3.24008 : x : ARG xxxx A0083 <- 4.00 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.41 -> DC xxx I0080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.98 -> DG xxx J0037 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.35 -> DG xxx J0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.86 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.11 -> DG xxx I0050 : score x.xxxxx >6o96_D:Histone-fold; title=DOT1L BOUND TO THE H2BK120 UBIQUITINATED NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 D0033 <- 2.96 -> DC O2 J0027 : score 3.58036 >6o9e_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA AND INDOPY-1 organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 3.11 -> DG N2 E0032 : score 4.58658 : H : TYR OH A0183 <- 2.57 -> DG N3 E0032 : score 3.25735 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.43 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.42 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.84 -> DT xxx E0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.28 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.70 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx >6o9e_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA AND INDOPY-1 organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH C0183 <- 3.03 -> DG N3 F0032 : score 2.97085 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.33 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 4.11 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.16 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.34 -> DT xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.32 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.88 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx >6o9l_7AMNPT:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain;TATA-box_binding_protein-like;Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HUMAN HOLO-PIC IN THE CLOSED STATE organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ 70528 <- 2.63 -> DG N3 Y0035 : score 1.50328 : H : ASN ND2 P0167 <- 2.44 -> DT O2 Y0079 : score 5.08788 : H : THR OG1 P0313 <- 3.24 -> DA N3 X0014 : score 1.23471 : H : HIS NE2 T0229 <- 3.10 -> DG N2 X0028 : score 3.50451 : x : ALA xxxx M0281 <- 4.12 -> DC xxx Y0086 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx M0283 <- 3.60 -> DC xxx Y0086 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0284 <- 3.36 -> DC xxx Y0086 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0286 <- 4.29 -> DG xxx X0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 3.32 -> DG xxx X0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.90 -> DT xxx Y0077 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0222 <- 3.60 -> DT xxx Y0078 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0257 <- 3.73 -> DA xxx X0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 4.28 -> DA xxx X0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.51 -> DA xxx X0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 3.85 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 3.31 -> DT xxx Y0082 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 3.91 -> DA xxx Y0081 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx T0174 <- 4.09 -> DG xxx X0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx 70727 <- 3.00 -> DA xxx X0054 : score x.xxxxx >6o9l_T:Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN HOLO-PIC IN THE CLOSED STATE organism=? : H : HIS NE2 T0229 <- 3.10 -> DG N2 X0028 : score 3.50451 : x : LYS xxxx T0174 <- 4.09 -> DG xxx X0019 : score x.xxxxx >6obj_A:Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURE OF A DNA-BOUND DIMER EXTRACTED FROM FILAMENTOUS SGRAI ENDONUCLEASE IN ITS ACTIVATED FORM organism=? : H : ASN ND2 A0092 <- 3.17 -> DG N3 D0014 : score 4.53265 : H : ARG NH1 A0152 <- 2.74 -> DA N3 C0011 : score 3.72624 : H : ARG NE A0246 <- 2.59 -> DG O6 C0015 : score 4.10655 : H : ARG NH2 A0246 <- 2.46 -> DG N7 C0015 : score 6.81877 : x : ARG xxxx A0031 <- 3.38 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0095 <- 4.07 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0096 <- 3.07 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0242 <- 4.49 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0247 <- 3.38 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0248 <- 3.13 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0249 <- 3.20 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx >6obj_AB:Restriction_endonuclease-like; title=STRUCTURE OF A DNA-BOUND DIMER EXTRACTED FROM FILAMENTOUS SGRAI ENDONUCLEASE IN ITS ACTIVATED FORM organism=STREPTOMYCES GRISEUS : H : ASN ND2 A0092 <- 3.17 -> DG N3 D0014 : score 4.53265 : H : ARG NH1 A0152 <- 2.74 -> DA N3 C0011 : score 3.72624 : H : ARG NE A0246 <- 2.59 -> DG O6 C0015 : score 4.10655 : H : ARG NH2 A0246 <- 2.46 -> DG N7 C0015 : score 6.81877 : H : ASN ND2 B0092 <- 3.15 -> DG N3 C0014 : score 4.55223 : H : ARG NH1 B0152 <- 2.74 -> DA N3 D0011 : score 3.72624 : H : ARG NE B0246 <- 2.59 -> DG O6 D0015 : score 4.10655 : H : ARG NH2 B0246 <- 2.46 -> DG N7 D0015 : score 6.81877 : x : ARG xxxx A0031 <- 3.38 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0095 <- 4.07 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0096 <- 3.07 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0242 <- 4.49 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0247 <- 3.38 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0248 <- 3.13 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0249 <- 3.20 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0031 <- 3.38 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0095 <- 4.07 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0096 <- 3.04 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0242 <- 4.49 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0247 <- 3.40 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0248 <- 3.15 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0249 <- 3.20 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx >6od3_ABH:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=HUMAN TCF4 C-TERMINAL BHLH DOMAIN IN COMPLEX WITH 13-BP OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING E-BOX SEQUENCE organism=Homo sapiens : H : GLU OE2 A0577 <- 3.04 -> DA N6 X0006 : score 2.90482 : w : GLU OE2 A0577 <- 5.51 -> DG O6 W0008 : score 2.892 : w : ARG NH2 A0578 <- 5.59 -> DG O6 W0008 : score 2.468 : H : GLU OE2 B0577 <- 3.14 -> DA N6 W0006 : score 2.84379 : w : GLU OE2 B0577 <- 5.50 -> DG O6 X0008 : score 2.892 : w : ARG NH2 B0578 <- 5.64 -> DG O6 X0008 : score 2.468 : H : ARG NH1 H0576 <- 2.69 -> DT O2 W0009 : score 4.40115 : H : ARG NH2 H0576 <- 3.15 -> DT O2 W0009 : score 3.937 : x : ASN xxxx A0573 <- 3.79 -> DT xxx X0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0574 <- 3.51 -> DG xxx W0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0580 <- 3.54 -> DC xxx X0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0573 <- 3.85 -> DT xxx W0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0574 <- 3.46 -> DG xxx X0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0576 <- 4.01 -> DT xxx W0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0580 <- 3.50 -> DC xxx W0005 : score x.xxxxx >6od3_EF:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=HUMAN TCF4 C-TERMINAL BHLH DOMAIN IN COMPLEX WITH 13-BP OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING E-BOX SEQUENCE organism=Homo sapiens : H : GLU OE2 E0577 <- 3.09 -> DA N6 Y0006 : score 2.87431 : w : GLU OE1 E0577 <- 5.64 -> DC N4 Y0005 : score 3.528 : w : GLU OE2 E0577 <- 5.44 -> DG O6 Z0008 : score 2.892 : w : ARG NH2 E0578 <- 5.56 -> DG O6 Z0008 : score 2.468 : w : ARG NH2 F0576 <- 5.51 -> DA N6 Z0004 : score 1.997 : H : GLU OE2 F0577 <- 3.20 -> DA N6 Z0006 : score 2.80718 : w : GLU OE2 F0577 <- 5.35 -> DG O6 Y0008 : score 2.892 : w : ARG NH2 F0578 <- 5.56 -> DG O6 Y0008 : score 2.468 : w : ARG NH2 F0580 <- 5.88 -> DA N7 Z0006 : score 1.486 : x : ASN xxxx E0573 <- 4.43 -> DT xxx Z0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0574 <- 3.55 -> DG xxx Z0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0580 <- 3.45 -> DC xxx Y0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0573 <- 3.54 -> DT xxx Z0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0574 <- 3.61 -> DG xxx Y0008 : score x.xxxxx >6od3_F:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=HUMAN TCF4 C-TERMINAL BHLH DOMAIN IN COMPLEX WITH 13-BP OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING E-BOX SEQUENCE organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 F0576 <- 5.51 -> DA N6 Z0004 : score 1.997 : H : GLU OE2 F0577 <- 3.20 -> DA N6 Z0006 : score 2.80718 : w : GLU OE2 F0577 <- 5.35 -> DG O6 Y0008 : score 2.892 : w : ARG NH2 F0578 <- 5.56 -> DG O6 Y0008 : score 2.468 : w : ARG NH2 F0580 <- 5.88 -> DA N7 Z0006 : score 1.486 : x : ASN xxxx F0573 <- 3.54 -> DT xxx Z0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0574 <- 3.61 -> DG xxx Y0008 : score x.xxxxx >6od4_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=HUMAN TCF4 C-TERMINAL BHLH DOMAIN IN COMPLEX WITH 11-BP OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING E-BOX SEQUENCE organism=Homo sapiens : w : GLU OE2 A0577 <- 5.60 -> DG O6 W0007 : score 2.892 : w : ARG NH2 A0578 <- 5.63 -> DG O6 W0007 : score 2.468 : w : ARG NH2 A0580 <- 5.71 -> DA N7 X0005 : score 1.486 : w : GLU OE2 B0577 <- 5.51 -> DG O6 X0007 : score 2.892 : H : ARG NH1 B0578 <- 3.12 -> DG N7 X0007 : score 5.6628 : w : ARG NH2 B0578 <- 5.51 -> DG O6 X0007 : score 2.468 : w : ARG NH2 B0580 <- 5.54 -> DA N7 W0005 : score 1.486 : x : ASN xxxx A0574 <- 3.51 -> DG xxx W0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0574 <- 3.39 -> DG xxx X0007 : score x.xxxxx >6od5_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=HUMAN TCF4 C-TERMINAL BHLH DOMAIN IN COMPLEX WITH 12-BP OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING E-BOX SEQUENCE WITH 5-CARBOXYLCYTOSINES organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 A0573 <- 3.00 -> DG O6 Y0009 : score 5.41292 : w : ASN OD1 A0573 <- 5.70 -> DG O6 X0003 : score 3.125 : H : GLU OE2 A0577 <- 2.46 -> DC N4 X0004 : score 5.62343 : w : GLU OE1 A0577 <- 5.60 -> DG O6 Y0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0577 <- 5.77 -> DG N7 X0003 : score 2.669 : w : ARG NH2 A0578 <- 5.50 -> DG O6 Y0007 : score 2.468 : w : ARG NH2 A0580 <- 5.67 -> DA N7 X0005 : score 1.486 : H : ASN ND2 B0573 <- 3.31 -> DG O6 X0009 : score 5.06334 : w : ASN OD1 B0573 <- 5.54 -> DC N4 Y0004 : score 2.732 : H : GLU OE1 B0577 <- 3.10 -> DA N6 Y0005 : score 2.52113 : w : GLU OE1 B0577 <- 5.24 -> DG O6 X0007 : score 2.669 : w : ARG NH2 B0578 <- 5.70 -> DG O6 X0007 : score 2.468 : w : ARG NH2 B0580 <- 5.69 -> DA N7 Y0005 : score 1.486 : x : ASN xxxx A0574 <- 3.54 -> DG xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0574 <- 3.59 -> DG xxx X0007 : score x.xxxxx >6od5_C:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=HUMAN TCF4 C-TERMINAL BHLH DOMAIN IN COMPLEX WITH 12-BP OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING E-BOX SEQUENCE WITH 5-CARBOXYLCYTOSINES organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 C0573 <- 3.19 -> DG O6 F0009 : score 5.19866 : w : ASN OD1 C0573 <- 5.28 -> DC N4 E0004 : score 2.732 : w : ASN OD1 C0573 <- 6.36 -> DG N7 E0003 : score 1.873 : H : GLU OE2 C0577 <- 3.01 -> DA N6 E0005 : score 2.92313 : w : GLU OE1 C0577 <- 6.13 -> DC N4 E0004 : score 3.528 : w : GLU OE2 C0577 <- 5.34 -> DG O6 F0007 : score 2.892 : w : ARG NH2 C0578 <- 5.66 -> DG O6 F0007 : score 2.468 : x : ASN xxxx C0574 <- 3.54 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0580 <- 3.68 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx >6oe7_A:BB1717-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HMCES CROSS-LINKED TO DNA ABASIC SITE organism=Homo sapiens : x : TRP xxxx A0081 <- 3.30 -> DC xxx B0106 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0083 <- 3.56 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0092 <- 4.26 -> DC xxx B0106 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0106 <- 2.99 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx >6oea_A:BB1717-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HMCES SRAP DOMAIN IN COMPLEX WITH LONGER 3' OVERHANG DNA organism=Homo sapiens : x : TRP xxxx A0081 <- 3.26 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0083 <- 3.56 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0092 <- 4.22 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0106 <- 3.11 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx >6oeb_A:BB1717-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HMCES SRAP DOMAIN IN COMPLEX WITH 3' OVERHANG DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0106 <- 3.27 -> DC O2 B0006 : score 2.40903 : x : TRP xxxx A0081 <- 3.24 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0083 <- 3.58 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0092 <- 4.17 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx >6oem_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE RAG1/2 PRC COMPLEX (DNA0) organism=? : V : HIS CG A0501 <- 3.79 -> DT C7 G0030 : score 3.00647 : x : ARG xxxx A0402 <- 3.78 -> DG xxx G0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0406 <- 4.41 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0504 <- 4.10 -> DT xxx J0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0977 <- 3.61 -> DT xxx J0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0978 <- 2.78 -> DG xxx J0021 : score x.xxxxx >6oem_BH:Galactose_oxidase,_central_domain;HMG-box; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE RAG1/2 PRC COMPLEX (DNA0) organism=HOMO SAPIENS / MUS MUSCULUS : H : CYS SG H0106 <- 3.51 -> DA N3 F0013 : score 4.9236 : x : PHE xxxx H0103 <- 3.19 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0122 <- 3.35 -> DG xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0126 <- 3.74 -> DT xxx I0033 : score x.xxxxx >6oem_DN:Galactose_oxidase,_central_domain;HMG-box; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE RAG1/2 PRC COMPLEX (DNA0) organism=MUS MUSCULUS / HOMO SAPIENS : x : PHE xxxx N0102 <- 3.45 -> DT xxx G0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx N0103 <- 4.42 -> DA xxx J0034 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx N0106 <- 4.11 -> DG xxx J0035 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx N0122 <- 4.16 -> DT xxx J0036 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx N0126 <- 3.47 -> DG xxx J0035 : score x.xxxxx >6oen_ADN:Galactose_oxidase,_central_domain;HMG-box; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE RAG1/2 PRC COMPLEX (DNA1) organism=MUS MUSCULUS / HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0402 <- 2.92 -> DG N7 G0010 : score 4.31567 : H : ARG NH2 A0402 <- 2.40 -> DG O6 G0010 : score 7.128 : x : HIS xxxx A0406 <- 4.06 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0478 <- 4.23 -> DG xxx J0023 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0501 <- 3.33 -> DT xxx G0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0504 <- 4.30 -> DT xxx J0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0978 <- 4.09 -> DG xxx J0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx N0102 <- 3.26 -> DT xxx G0024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx N0122 <- 3.80 -> DT xxx J0036 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx N0126 <- 3.47 -> DG xxx J0035 : score x.xxxxx >6oen_BCH:Galactose_oxidase,_central_domain;HMG-box; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE RAG1/2 PRC COMPLEX (DNA1) organism=MUS MUSCULUS / HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 C0402 <- 2.56 -> DG N7 F0010 : score 6.3404 : H : ARG NH2 C0402 <- 2.74 -> DG O6 F0010 : score 6.6792 : H : GLN OE1 C0978 <- 2.98 -> DG N2 I0021 : score 5.40582 : x : CYS xxxx C0478 <- 4.18 -> DG xxx I0023 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0482 <- 4.15 -> DT xxx F0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0504 <- 4.09 -> DT xxx I0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0977 <- 3.54 -> DT xxx I0022 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0103 <- 3.56 -> DA xxx I0035 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx H0106 <- 4.44 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0107 <- 4.25 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0122 <- 3.34 -> DG xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0126 <- 3.31 -> DT xxx I0033 : score x.xxxxx >6oen_H:HMG-box; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE RAG1/2 PRC COMPLEX (DNA1) organism=HOMO SAPIENS : x : PHE xxxx H0103 <- 3.56 -> DA xxx I0035 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx H0106 <- 4.44 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0107 <- 4.25 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0122 <- 3.34 -> DG xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0126 <- 3.31 -> DT xxx I0033 : score x.xxxxx >6oeo_AB:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE RAG1/2 NFC COMPLEX (DNA1) organism=? : x : ASN xxxx A0443 <- 3.93 -> DC xxx I0031 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0721 <- 4.10 -> DT xxx I0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0846 <- 3.32 -> DG xxx F0028 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0847 <- 4.05 -> DG xxx F0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0848 <- 2.82 -> DT xxx F0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0850 <- 2.89 -> DA xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0852 <- 4.42 -> DA xxx I0020 : score x.xxxxx >6oeo_C: title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE RAG1/2 NFC COMPLEX (DNA1) organism=MUS MUSCULUS : H : LYS NZ C0844 <- 2.80 -> DG O6 G0039 : score 5.78077 : V : MET CE C0847 <- 3.56 -> DT C7 G0040 : score 7.34607 : x : ASN xxxx C0443 <- 3.13 -> DT xxx G0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0721 <- 4.35 -> DT xxx J0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0846 <- 3.49 -> DG xxx G0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0848 <- 3.15 -> DT xxx G0040 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0850 <- 3.60 -> DG xxx G0039 : score x.xxxxx >6oeo_CD:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE RAG1/2 NFC COMPLEX (DNA1) organism=MUS MUSCULUS : H : LYS NZ C0844 <- 2.80 -> DG O6 G0039 : score 5.78077 : V : MET CE C0847 <- 3.56 -> DT C7 G0040 : score 7.34607 : x : ASN xxxx C0443 <- 3.13 -> DT xxx G0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0721 <- 4.35 -> DT xxx J0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0846 <- 3.49 -> DG xxx G0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0848 <- 3.15 -> DT xxx G0040 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0850 <- 3.60 -> DG xxx G0039 : score x.xxxxx >6oep_AC:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE RAG1/2 12RSS-NFC/23RSS-PRC COMPLEX (DNA1) organism=MUS MUSCULUS : V : HIS CG C0406 <- 3.78 -> DT C7 F0009 : score 3.01397 : V : MET CB A0847 <- 3.76 -> DT C7 F0029 : score 5.86111 : x : ASN xxxx A0443 <- 4.30 -> DC xxx I0031 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0721 <- 4.18 -> DT xxx I0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0846 <- 3.94 -> DG xxx F0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0848 <- 3.21 -> DA xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0850 <- 4.07 -> DG xxx F0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0402 <- 2.90 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0482 <- 3.80 -> DT xxx F0021 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0501 <- 4.36 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0504 <- 3.46 -> DT xxx I0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0611 <- 4.29 -> DT xxx F0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0977 <- 3.73 -> DT xxx I0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0978 <- 3.70 -> DG xxx I0021 : score x.xxxxx >6oeq_AC:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE RAG1/2 12RSS-PRC/23RSS-NFC COMPLEX (DNA1) organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0402 <- 2.50 -> DT O4 G0011 : score 3.46403 : H : HIS NE2 A0609 <- 2.65 -> DA N3 J0018 : score 4.37354 : H : ASN ND2 C0850 <- 2.87 -> DG O6 G0039 : score 5.55952 : V : HIS CB A0406 <- 3.71 -> DT C7 G0008 : score 4.21794 : V : MET CE C0847 <- 3.75 -> DT C7 G0040 : score 7.01688 : x : CYS xxxx A0478 <- 4.30 -> DG xxx J0023 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0501 <- 3.40 -> DT xxx G0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0504 <- 3.86 -> DT xxx J0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0977 <- 3.60 -> DT xxx J0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0978 <- 3.63 -> DC xxx G0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0443 <- 3.53 -> DT xxx G0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0844 <- 3.71 -> DC xxx J0019 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0846 <- 3.86 -> DG xxx G0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0848 <- 3.22 -> DT xxx G0040 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0852 <- 3.84 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx >6oer_AB:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE RAG1/2 NFC COMPLEX (DNA2) organism=MUS MUSCULUS : H : ASN ND2 A0850 <- 2.57 -> DG O6 F0028 : score 5.89783 : x : ASN xxxx A0443 <- 4.10 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0721 <- 3.83 -> DT xxx I0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0844 <- 4.45 -> DT xxx F0027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0846 <- 4.02 -> DG xxx F0028 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0847 <- 3.50 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0848 <- 3.01 -> DA xxx I0018 : score x.xxxxx >6oer_C: title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE RAG1/2 NFC COMPLEX (DNA2) organism=MUS MUSCULUS : H : ASN ND2 C0850 <- 2.61 -> DG O6 G0039 : score 5.85272 : x : ASN xxxx C0443 <- 4.20 -> DT xxx G0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0848 <- 3.18 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx >6oer_CDH:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE RAG1/2 NFC COMPLEX (DNA2) organism=MUS MUSCULUS / EQUUS CABALLUS : H : ASN ND2 C0850 <- 2.61 -> DG O6 G0039 : score 5.85272 : x : ASN xxxx C0443 <- 4.20 -> DT xxx G0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0848 <- 3.18 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0102 <- 3.61 -> DT xxx G0024 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx H0106 <- 4.15 -> DG xxx J0035 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0122 <- 3.24 -> DT xxx J0036 : score x.xxxxx >6oes_ABCD:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE RAG1/2 STC COMPLEX (WITHOUT NBD DOMAIN) organism=MUS MUSCULUS : H : ARG NH1 A0848 <- 2.75 -> DG O6 F0032 : score 6.14417 : x : LYS xxxx A0710 <- 4.19 -> DT xxx J0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0721 <- 3.69 -> DC xxx J0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0847 <- 3.58 -> DG xxx G0046 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0721 <- 3.42 -> DC xxx I0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0847 <- 3.86 -> DC xxx F0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0848 <- 3.03 -> DG xxx G0043 : score x.xxxxx >6oet_AB:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE RAG1/2 STC COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : V : ALA CB A0403 <- 3.83 -> DT C7 g0007 : score 5.55698 : V : ARG CZ A0402 <- 3.55 -> DT C7 g0009 : score 2.26558 >6oet_CD:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE RAG1/2 STC COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : x : SER xxxx C0721 <- 3.56 -> DC xxx J0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0847 <- 3.85 -> DC xxx F0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0848 <- 2.86 -> DG xxx G0043 : score x.xxxxx >6ogj_A:DNA-binding_domain; title=MECP2 MBD IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0111 <- 2.72 -> DG N7 D0007 : score 6.1468 : H : ARG NH2 A0111 <- 2.85 -> DG O6 D0007 : score 6.534 : w : ASP OD1 A0121 <- 6.04 -> DC N4 C0006 : score 2.835 : H : ARG NH1 A0133 <- 2.95 -> DT O4 D0006 : score 3.16991 : H : ARG NH2 A0133 <- 2.98 -> DG O6 D0005 : score 6.3624 : H : ARG NH2 A0133 <- 2.96 -> DT O4 D0006 : score 3.44012 : w : ARG NH1 A0133 <- 6.11 -> DC N4 C0006 : score 1.892 : x : SER xxxx A0116 <- 4.08 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >6ogj_AB:DNA-binding_domain; title=MECP2 MBD IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0111 <- 2.72 -> DG N7 D0007 : score 6.1468 : H : ARG NH2 A0111 <- 2.85 -> DG O6 D0007 : score 6.534 : w : ASP OD1 A0121 <- 6.04 -> DC N4 C0006 : score 2.835 : H : ARG NH1 A0133 <- 2.95 -> DT O4 D0006 : score 3.16991 : H : ARG NH2 A0133 <- 2.98 -> DG O6 D0005 : score 6.3624 : H : ARG NH2 A0133 <- 2.96 -> DT O4 D0006 : score 3.44012 : w : ARG NH1 A0133 <- 6.11 -> DC N4 C0006 : score 1.892 : H : ARG NH1 B0111 <- 2.73 -> DG N7 D0002 : score 6.1347 : H : ARG NH2 B0111 <- 3.00 -> DG O6 D0002 : score 6.336 : w : SER OG B0134 <- 5.59 -> DG N7 C0012 : score 2.749 : x : SER xxxx A0116 <- 4.08 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0121 <- 4.22 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx >6ogk_A:DNA-binding_domain; title=MECP2 MBD IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0111 <- 2.76 -> DG N7 C0007 : score 6.0984 : H : ARG NH2 A0111 <- 2.87 -> DG O6 C0007 : score 6.5076 : H : ARG NH1 A0133 <- 2.84 -> DT O4 C0006 : score 3.24181 : H : ARG NH2 A0133 <- 3.09 -> DG O6 C0005 : score 6.2172 : H : ARG NH2 A0133 <- 3.02 -> DT O4 C0006 : score 3.39748 : x : ASP xxxx A0121 <- 3.46 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0123 <- 4.24 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx >6om3_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;BAH_domain;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ORC1 BAH DOMAIN IN COMPLEX WITH A NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.33 -> DG N3 I0083 : score 3.22757 : H : ARG NH1 D0033 <- 3.19 -> DC O2 J0027 : score 3.3653 : H : ARG NH2 D0033 <- 3.25 -> DC O2 J0027 : score 3.36583 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.99 -> DT O2 J0083 : score 4.07247 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.56 -> DG xxx I0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.19 -> DG xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.27 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.01 -> DC xxx I0080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.74 -> DC xxx I0111 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.36 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.46 -> DA xxx J0080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.00 -> DG xxx I0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.40 -> DG xxx J0122 : score x.xxxxx >6omf_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF SIGMAS-TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH ACTIVATOR CRL organism=? : V : ARG CZ C0542 <- 3.50 -> DT C7 N0040 : score 2.29223 : x : ASP xxxx C0199 <- 2.93 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.13 -> DA xxx N0034 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 4.39 -> DA xxx N0033 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.35 -> DG xxx N0039 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0539 <- 3.28 -> DG xxx N0039 : score x.xxxxx >6omf_CDF: title=CRYOEM STRUCTURE OF SIGMAS-TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH ACTIVATOR CRL organism=ESCHERICHIA COLI / SALMONELLA TYPHIMURIUM : H : THR OG1 D0790 <- 2.69 -> DC N4 T0014 : score 4.12207 : H : ARG NH2 F0156 <- 2.55 -> DG O6 N0024 : score 6.93 : V : TRP CD2 F0149 <- 3.83 -> DT C7 N0026 : score 5.45519 : V : ARG CZ C0542 <- 3.50 -> DT C7 N0040 : score 2.29223 : x : ASP xxxx C0199 <- 2.93 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.13 -> DA xxx N0034 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 4.39 -> DA xxx N0033 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.35 -> DG xxx N0039 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0539 <- 3.28 -> DG xxx N0039 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 3.51 -> DG xxx T0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 4.05 -> DG xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 4.09 -> DC xxx T0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0058 <- 4.16 -> DA xxx N0033 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0059 <- 3.16 -> DA xxx N0033 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0062 <- 3.45 -> DA xxx N0033 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0065 <- 3.55 -> DT xxx N0032 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0070 <- 4.04 -> DT xxx N0031 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0076 <- 3.50 -> DT xxx N0031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0098 <- 4.26 -> DT xxx N0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0100 <- 3.34 -> DT xxx N0032 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0101 <- 3.28 -> DT xxx N0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0116 <- 4.24 -> DA xxx N0033 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0134 <- 4.05 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0135 <- 3.73 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0138 <- 3.18 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0141 <- 4.23 -> DT xxx N0031 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0143 <- 3.15 -> DC xxx N0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0144 <- 3.49 -> DA xxx N0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0145 <- 3.38 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0147 <- 3.61 -> DC xxx N0030 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0148 <- 3.21 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0152 <- 3.14 -> DC xxx N0025 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0155 <- 2.95 -> DA xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0169 <- 4.16 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0170 <- 3.52 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0173 <- 3.64 -> DC xxx T0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0299 <- 2.98 -> DG xxx T0046 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0300 <- 3.27 -> DT xxx T0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0303 <- 3.25 -> DC xxx T0047 : score x.xxxxx >6omv_B: title=CRYOEM STRUCTURE OF THE LBCAS12A-CRRNA-ACRVA4-DNA COMPLEX organism=LACHNOSPIRACEAE BACTERIUM ND2006 : H : LYS NZ B0595 <- 2.44 -> DA N3 E0003 : score 2.97686 : V : GLN CG B0529 <- 3.81 -> DT C7 F-004 : score 3.24725 : x : THR xxxx B0149 <- 3.78 -> DT xxx F-004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0538 <- 3.74 -> DA xxx E0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0542 <- 3.01 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0592 <- 3.35 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx >6on0_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF N15 CRO COMPLEXED WITH CONSENSUS OPERATOR DNA organism=ESCHERICHIA PHAGE N15 : w : THR OG1 A0023 <- 6.05 -> DA N6 C0014 : score 3.251 : H : GLN NE2 A0029 <- 2.92 -> DT O4 N0005 : score 5.06644 : H : GLN NE2 A0029 <- 2.80 -> DT O4 C0013 : score 5.19103 : w : THR OG1 B0023 <- 5.98 -> DA N6 N0014 : score 3.251 : H : GLN NE2 B0029 <- 2.81 -> DT O4 N0013 : score 5.18064 : H : GLN NE2 B0029 <- 2.82 -> DT O4 C0005 : score 5.17026 : w : GLN OE1 B0032 <- 5.84 -> DA N7 C0004 : score 1.196 : x : ALA xxxx A0026 <- 3.93 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0028 <- 3.31 -> DT xxx N0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0026 <- 4.04 -> DT xxx N0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0028 <- 3.24 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx >6on0_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF N15 CRO COMPLEXED WITH CONSENSUS OPERATOR DNA organism=ESCHERICHIA PHAGE N15 : w : THR OG1 B0023 <- 5.98 -> DA N6 N0014 : score 3.251 : H : GLN NE2 B0029 <- 2.82 -> DT O4 C0005 : score 5.17026 : H : GLN NE2 B0029 <- 2.81 -> DT O4 N0013 : score 5.18064 : w : GLN OE1 B0032 <- 5.84 -> DA N7 C0004 : score 1.196 : V : TYR CB B0028 <- 3.71 -> DT C7 C0003 : score 4.97826 : x : ALA xxxx B0026 <- 4.04 -> DT xxx N0013 : score x.xxxxx >6oov_A:BB1717-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HMCES SRAP DOMAIN IN COMPLEX WITH PALINDROMIC 3' OVERHANG DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0106 <- 2.58 -> DT O2 C0006 : score 4.49589 : x : TRP xxxx A0081 <- 3.22 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0092 <- 3.98 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >6opm_ABCD: title=CASPOSASE BOUND TO INTEGRATION PRODUCT organism=METHANOSARCINA MAZEI : H : ARG NH1 B0156 <- 3.00 -> DC O2 F0009 : score 3.504 : H : ARG NH2 B0156 <- 2.79 -> DC O2 F0009 : score 3.70612 : H : ARG NH2 B0192 <- 2.76 -> DG N7 E0020 : score 6.43569 : H : ARG NH2 B0192 <- 2.72 -> DG O6 E0020 : score 6.7056 : H : ARG NH1 D0156 <- 2.89 -> DC O2 E0009 : score 3.5843 : H : ARG NH2 D0156 <- 2.79 -> DC O2 E0009 : score 3.70612 : H : ARG NE D0191 <- 3.08 -> DG O6 F0022 : score 3.72033 : H : ARG NH2 D0192 <- 2.81 -> DG N7 F0020 : score 6.37185 : H : ARG NH2 D0192 <- 2.68 -> DG O6 F0020 : score 6.7584 : V : MET CE D0194 <- 3.65 -> DT C7 F0019 : score 7.19014 : x : LYS xxxx A0306 <- 3.79 -> DC xxx F0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0312 <- 3.55 -> DG xxx F0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0190 <- 3.99 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0191 <- 3.67 -> DG xxx E0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0194 <- 3.97 -> DT xxx E0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0237 <- 3.21 -> DA xxx E0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0306 <- 4.18 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0312 <- 3.66 -> DG xxx E0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0190 <- 3.87 -> DC xxx F0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0237 <- 3.35 -> DA xxx F0016 : score x.xxxxx >6opm_B: title=CASPOSASE BOUND TO INTEGRATION PRODUCT organism=METHANOSARCINA MAZEI : H : ARG NH1 B0156 <- 3.00 -> DC O2 F0009 : score 3.504 : H : ARG NH2 B0156 <- 2.79 -> DC O2 F0009 : score 3.70612 : H : ARG NH2 B0192 <- 2.76 -> DG N7 E0020 : score 6.43569 : H : ARG NH2 B0192 <- 2.72 -> DG O6 E0020 : score 6.7056 : x : PHE xxxx B0190 <- 3.99 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0191 <- 3.67 -> DG xxx E0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0194 <- 3.97 -> DT xxx E0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0237 <- 3.21 -> DA xxx E0016 : score x.xxxxx >6or7_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH DNA AND (-)FTC-TP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.74 -> DC O2 P0821 : score 3.53941 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.48 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.84 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >6otz_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH DSDNA AND (+)FTC-TP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.71 -> DC O2 P0821 : score 3.56039 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.27 -> DC O2 T0723 : score 3.3069 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.60 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.94 -> DG xxx T0721 : score x.xxxxx >6otz_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH DSDNA AND (+)FTC-TP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.71 -> DC O2 P0821 : score 3.56039 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.27 -> DC O2 T0723 : score 3.3069 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.60 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.94 -> DG xxx T0721 : score x.xxxxx >6oul_IJLR:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI RNAP POLYMERASE BOUND TO RPSTP2 PROMOTER DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 I0371 <- 2.37 -> DT O4 P0057 : score 3.54899 : H : GLU OE1 L0585 <- 2.49 -> DC N4 Q0068 : score 6.12556 : H : ARG NH1 L0586 <- 2.70 -> DA N7 P0025 : score 2.61146 : V : THR CG2 L0583 <- 3.82 -> DT C7 P0027 : score 4.21574 : x : ARG xxxx I0542 <- 3.97 -> DT xxx P0063 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0567 <- 4.49 -> DG xxx Q0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 4.47 -> DC xxx Q0036 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.47 -> DG xxx Q0034 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.33 -> DG xxx Q0034 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0096 <- 4.39 -> DC xxx P0056 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx L0098 <- 4.03 -> DC xxx P0056 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0099 <- 3.31 -> DC xxx P0056 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0102 <- 3.71 -> DC xxx P0056 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0105 <- 3.13 -> DC xxx P0055 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0385 <- 2.95 -> DC xxx P0055 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0433 <- 3.15 -> DC xxx P0049 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0434 <- 4.37 -> DG xxx P0048 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0437 <- 3.03 -> DC xxx P0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0441 <- 3.84 -> DG xxx P0047 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0455 <- 3.72 -> DA xxx P0044 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0573 <- 4.12 -> DG xxx Q0066 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0584 <- 3.99 -> DG xxx Q0066 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0588 <- 3.40 -> DT xxx Q0067 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0589 <- 3.94 -> DA xxx Q0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0265 <- 4.34 -> DT xxx Q0076 : score x.xxxxx >6oul_L:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI RNAP POLYMERASE BOUND TO RPSTP2 PROMOTER DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : SER OG L0428 <- 2.85 -> DT O4 P0054 : score 3.51958 : H : GLU OE1 L0585 <- 2.49 -> DC N4 Q0068 : score 6.12556 : H : ARG NH1 L0586 <- 2.70 -> DA N7 P0025 : score 2.61146 : V : THR CG2 L0583 <- 3.82 -> DT C7 P0027 : score 4.21574 : x : MET xxxx L0102 <- 3.94 -> DC xxx P0055 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0105 <- 3.13 -> DC xxx P0055 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0110 <- 3.10 -> DT xxx P0054 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0383 <- 3.80 -> DT xxx P0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0385 <- 2.95 -> DC xxx P0055 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0386 <- 4.14 -> DT xxx P0054 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0393 <- 3.96 -> DT xxx P0053 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0419 <- 3.99 -> DA xxx P0050 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0420 <- 3.37 -> DA xxx P0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0423 <- 3.10 -> DA xxx P0050 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0425 <- 3.77 -> DA xxx P0050 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0426 <- 4.01 -> DT xxx P0054 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0429 <- 3.64 -> DT xxx P0053 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0430 <- 3.34 -> DA xxx P0050 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0432 <- 3.42 -> DT xxx P0053 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0433 <- 3.15 -> DC xxx P0049 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0434 <- 4.37 -> DG xxx P0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0436 <- 3.23 -> DT xxx P0053 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0437 <- 3.03 -> DC xxx P0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0441 <- 3.84 -> DG xxx P0047 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0455 <- 3.72 -> DA xxx P0044 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0573 <- 4.12 -> DG xxx Q0066 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0584 <- 3.99 -> DG xxx Q0066 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0588 <- 3.40 -> DT xxx Q0067 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0589 <- 3.94 -> DA xxx Q0070 : score x.xxxxx >6oun_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH DSDNA AND (-)3TC-TP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 3.01 -> DC O2 P0821 : score 3.35054 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.22 -> DT O2 P0806 : score 3.87773 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.57 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.30 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.97 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >6oun_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH DSDNA AND (-)3TC-TP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 3.01 -> DC O2 P0821 : score 3.35054 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.22 -> DT O2 P0806 : score 3.87773 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.57 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.30 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.97 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >6ow3_CDF: title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF A BACTERIAL REITERATIVE TRANSCRIPTION COMPLEX OF PYRG PROMOTER VARIANT -1T organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : GLU xxxx C0421 <- 3.71 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 4.04 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >6oy5_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF A BACTERIAL REITERATIVE TRANSCRIPTION COMPLEX OF PYRG PROMOTER AT 3 MIN organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : ASN xxxx C0187 <- 4.19 -> DC xxx H0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0243 <- 2.56 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0247 <- 4.23 -> DG xxx H0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0256 <- 4.39 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0394 <- 4.28 -> DA xxx G0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 3.62 -> DC xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0630 <- 3.22 -> DA xxx G0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0706 <- 4.09 -> DA xxx G0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0998 <- 4.22 -> DA xxx G0020 : score x.xxxxx >6oy5_CDF: title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF A BACTERIAL REITERATIVE TRANSCRIPTION COMPLEX OF PYRG PROMOTER AT 3 MIN organism=THERMUS THERMOPHILUS : V : THR CG2 F0240 <- 3.85 -> DT C7 H0005 : score 4.18396 : x : ASN xxxx C0187 <- 4.19 -> DC xxx H0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0243 <- 2.56 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0247 <- 4.23 -> DG xxx H0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0256 <- 4.39 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0394 <- 4.28 -> DA xxx G0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 3.62 -> DC xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0630 <- 3.22 -> DA xxx G0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0706 <- 4.09 -> DA xxx G0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0998 <- 4.22 -> DA xxx G0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0705 <- 3.84 -> DC xxx G0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 3.68 -> DC xxx G0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.42 -> DC xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 4.01 -> DC xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0079 <- 2.53 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0081 <- 3.45 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0082 <- 3.14 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0085 <- 3.44 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0086 <- 4.15 -> DG xxx H0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0093 <- 3.58 -> DG xxx H0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0099 <- 3.82 -> DG xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0191 <- 2.48 -> DG xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0193 <- 2.77 -> DG xxx H0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0194 <- 3.07 -> DG xxx H0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0236 <- 4.15 -> DG xxx H0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0237 <- 2.86 -> DA xxx H0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0244 <- 4.22 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0324 <- 3.50 -> DA xxx G0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0326 <- 3.12 -> DA xxx G0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0327 <- 3.77 -> DA xxx G0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0332 <- 4.41 -> DA xxx G0019 : score x.xxxxx >6oy6_CDF: title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF A BACTERIAL REITERATIVE TRANSCRIPTION COMPLEX OF PYRG PROMOTER AT 5 MIN organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : GLU xxxx C0421 <- 3.79 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 3.76 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx >6oy7_CDF: title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF A BACTERIAL REITERATIVE TRANSCRIPTION COMPLEX OF PYRG PROMOTER AT 7 MIN organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : GLU xxxx C0421 <- 3.10 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx >6p09_A:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=HUMAN DNA LIGASE 1 BOUND TO AN ADENYLATED, DIDEOXY TERMINATED DNA NICK WITH 200 MM MG2+ organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0305 <- 3.27 -> DT O2 D0010 : score 3.8354 : w : ARG NH1 A0305 <- 5.31 -> DC O2 D0011 : score 1.381 : H : ARG NH2 A0643 <- 2.73 -> DC O2 D0020 : score 3.7505 : w : ARG NH1 A0643 <- 5.75 -> DC O2 B0010 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0643 <- 5.82 -> DC O2 B0010 : score 1.669 : w : LYS NZ A0770 <- 5.97 -> DG N2 C0004 : score 0.846 : w : LYS NZ A0770 <- 5.79 -> DC O2 D0012 : score 1.3 : w : ARG NH2 A0771 <- 5.86 -> DA N3 D0014 : score 2.092 : H : THR OG1 A0798 <- 3.02 -> DT O2 C0002 : score 2.59468 : x : HIS xxxx A0546 <- 4.49 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0635 <- 3.98 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0872 <- 3.50 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx >6p0a_A:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=HUMAN DNA LIGASE 1 BOUND TO AN ADENYLATED, DIDEOXY TERMINATED DNA NICK WITH 2 MM MG2+ organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0643 <- 2.95 -> DC O2 D0020 : score 3.58776 : w : ARG NH1 A0643 <- 5.94 -> DC O2 B0010 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0643 <- 5.67 -> DC O2 B0010 : score 1.669 : w : LYS NZ A0770 <- 5.73 -> DC O2 D0012 : score 1.3 : w : ARG NH2 A0771 <- 5.92 -> DA N3 D0014 : score 2.092 : H : THR OG1 A0798 <- 2.90 -> DT O2 C0002 : score 2.65982 : x : HIS xxxx A0546 <- 4.17 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0635 <- 4.05 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0872 <- 3.38 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx >6p0b_A:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=HUMAN DNA LIGASE 1 (E346A/E592A) BOUND TO AN ADENYLATED, DIDEOXY TERMINATED DNA NICK WITH 200 MM MG2+ organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0305 <- 5.57 -> DC O2 D0011 : score 1.381 : H : ARG NH2 A0643 <- 2.88 -> DC O2 D0020 : score 3.63954 : w : ARG NH1 A0643 <- 5.67 -> DG N3 B0011 : score 1.593 : H : LYS NZ A0770 <- 3.22 -> DG N3 D0013 : score 1.33172 : w : LYS NZ A0770 <- 6.23 -> DG N2 C0004 : score 0.846 : w : LYS NZ A0770 <- 5.87 -> DC O2 D0012 : score 1.3 : w : ARG NH2 A0771 <- 5.94 -> DA N3 D0014 : score 2.092 : H : THR OG1 A0798 <- 3.14 -> DT O2 C0002 : score 2.52954 : w : THR OG1 A0798 <- 6.07 -> DC O2 C0003 : score 2.048 : w : ARG NH2 A0871 <- 6.04 -> DC O2 B0013 : score 1.669 : x : HIS xxxx A0546 <- 4.14 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0635 <- 3.91 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0872 <- 3.38 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx >6p0c_A:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=HUMAN DNA LIGASE 1 BOUND TO AN ADENYLATED, HYDROXYL TERMINATED DNA NICK IN EDTA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0305 <- 3.08 -> DT O2 D0010 : score 4.06525 : w : ARG NH1 A0305 <- 5.84 -> DC O2 D0011 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0305 <- 6.04 -> DG N2 D0009 : score 1.593 : w : ARG NH1 A0643 <- 5.63 -> DC O2 B0010 : score 1.381 : H : LYS NZ A0770 <- 3.05 -> DG N3 D0013 : score 1.38115 : w : LYS NZ A0770 <- 6.06 -> DG N2 C0004 : score 0.846 : w : LYS NZ A0770 <- 5.70 -> DC O2 D0012 : score 1.3 : w : ARG NH2 A0771 <- 5.92 -> DA N3 D0014 : score 2.092 : H : THR OG1 A0798 <- 2.93 -> DT O2 C0002 : score 2.64354 : w : ARG NH2 A0871 <- 5.96 -> DC O2 B0013 : score 1.669 : x : HIS xxxx A0546 <- 4.15 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0635 <- 3.92 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0872 <- 3.42 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx >6p0d_A:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=HUMAN DNA LIGASE 1 (E346A/E592A) BOUND TO AN ADENYLATED, HYDROXYL TERMINATED DNA NICK organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0643 <- 3.04 -> DG N3 B0011 : score 2.90604 : w : ARG NH2 A0643 <- 5.46 -> DC O2 D0020 : score 1.669 : H : LYS NZ A0770 <- 3.11 -> DG N3 D0013 : score 1.36371 : w : LYS NZ A0770 <- 6.10 -> DG N2 C0004 : score 0.846 : w : LYS NZ A0770 <- 5.56 -> DC O2 D0012 : score 1.3 : w : ARG NH2 A0771 <- 5.84 -> DA N3 D0014 : score 2.092 : H : THR OG1 A0798 <- 2.92 -> DT O2 C0002 : score 2.64896 : w : ARG NH2 A0871 <- 5.94 -> DC O2 B0013 : score 1.669 : x : PHE xxxx A0635 <- 3.90 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0872 <- 3.31 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx >6p0e_A:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=HUMAN DNA LIGASE 1 (E346A,E592A) BOUND TO ADENYLATED DNA CONTAINING AN 8-OXO GUANINE:ADENINE BASE-PAIR organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0770 <- 3.08 -> DG N3 D0013 : score 1.37243 : w : LYS NZ A0770 <- 5.93 -> DG N2 C0004 : score 0.846 : w : LYS NZ A0770 <- 5.59 -> DC O2 D0012 : score 1.3 : w : ARG NH2 A0771 <- 5.81 -> DA N3 D0014 : score 2.092 : H : THR OG1 A0798 <- 2.89 -> DT O2 C0002 : score 2.66525 : x : HIS xxxx A0546 <- 4.25 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0872 <- 3.94 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx >6p0g_A: title=N-TERMINAL DOMAIN OF THERMOCOCCUS GAMMATOLERANS MCRB BOUND TO M5C DNA organism=Thermococcus gammatolerans (strain DSM 15229 / JCM 11827 / EJ3) / Thermococcus gammatolerans (strain DSM 15229 / JCM 11827 / EJ3) : H : ASN ND2 A0082 <- 3.32 -> DG N7 C0005 : score 4.10896 : x : TYR xxxx A0061 <- 3.40 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0081 <- 3.45 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0151 <- 4.12 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0154 <- 3.62 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx >6p0s_ABE:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY DNA COMPLEX "FX2" CONTAINING E. COLI FIS AND PHAGE LAMBDA XIS organism=ESCHERICHIA COLI / ESCHERICHIA PHAGE LAMBDA : w : ASN OD1 A0084 <- 5.83 -> DA N6 C0018 : score 2.837 : H : ARG NH1 A0085 <- 2.86 -> DG O6 D0007 : score 6.01033 : H : ARG NH2 A0085 <- 2.99 -> DG N7 D0007 : score 6.142 : w : ARG NH1 A0085 <- 5.81 -> DA N6 C0020 : score 1.486 : H : ASN ND2 B0084 <- 2.96 -> DA N7 D0018 : score 5.68266 : H : ARG NH1 B0085 <- 3.14 -> DG O6 C0007 : score 5.66967 : H : ARG NH2 B0085 <- 2.84 -> DG N7 C0007 : score 6.33354 : H : GLU OE1 E0019 <- 2.75 -> DC N4 C0021 : score 5.82563 : w : GLU OE2 E0019 <- 5.48 -> DA N6 C0020 : score 2.785 : H : ARG NH1 E0039 <- 3.06 -> DT O2 D0012 : score 4.08248 : H : ARG NH1 E0039 <- 2.99 -> DT O2 D0013 : score 4.14277 : w : ARG NH1 E0039 <- 5.94 -> DA N3 C0016 : score 2.585 : x : THR xxxx A0087 <- 4.48 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 3.46 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 3.59 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.57 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.83 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0017 <- 3.99 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0020 <- 4.36 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0022 <- 3.63 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0023 <- 3.53 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0026 <- 4.11 -> DA xxx C0020 : score x.xxxxx >6p0s_E:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY DNA COMPLEX "FX2" CONTAINING E. COLI FIS AND PHAGE LAMBDA XIS organism=ESCHERICHIA PHAGE LAMBDA : H : GLU OE1 E0019 <- 2.75 -> DC N4 C0021 : score 5.82563 : w : GLU OE2 E0019 <- 5.48 -> DA N6 C0020 : score 2.785 : H : ARG NH1 E0039 <- 3.06 -> DT O2 D0012 : score 4.08248 : H : ARG NH1 E0039 <- 2.99 -> DT O2 D0013 : score 4.14277 : w : ARG NH1 E0039 <- 5.94 -> DA N3 C0016 : score 2.585 : x : SER xxxx E0017 <- 3.99 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0020 <- 4.36 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0022 <- 3.63 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0023 <- 3.53 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0026 <- 4.11 -> DA xxx C0020 : score x.xxxxx >6p0t_ABE:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY DNA COMPLEX "FX(1-2)-1XIS" CONTAINING E. COLI FIS AND PHAGE LAMBDA XIS organism=ESCHERICHIA COLI / ESCHERICHIA PHAGE LAMBDA : H : ARG NH1 A0085 <- 3.07 -> DG O6 D0007 : score 5.75483 : H : ARG NH2 A0085 <- 3.18 -> DG N7 D0007 : score 5.89938 : H : ARG NH1 E0039 <- 3.41 -> DT O2 D0012 : score 3.78103 : V : GLU CB E0019 <- 3.57 -> DT C7 D0005 : score 1.72128 : x : THR xxxx B0075 <- 3.78 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.34 -> DA xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0085 <- 3.11 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.31 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 3.25 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.49 -> DA xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 3.35 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0017 <- 4.31 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0020 <- 4.30 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0022 <- 3.64 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0023 <- 3.67 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0026 <- 3.92 -> DC xxx C0021 : score x.xxxxx >6p0t_E:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY DNA COMPLEX "FX(1-2)-1XIS" CONTAINING E. COLI FIS AND PHAGE LAMBDA XIS organism=ESCHERICHIA PHAGE LAMBDA : H : ARG NH1 E0039 <- 3.41 -> DT O2 D0012 : score 3.78103 : V : GLU CB E0019 <- 3.57 -> DT C7 D0005 : score 1.72128 : x : SER xxxx E0017 <- 4.31 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0020 <- 4.30 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0022 <- 3.64 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0023 <- 3.67 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0026 <- 3.92 -> DC xxx C0021 : score x.xxxxx >6p0u_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY DNA COMPLEX " FX(1-2)-2XIS" CONTAINING E. COLI FIS AND PHAGE LAMBDA XIS organism=? : H : ARG NH1 A0085 <- 2.95 -> DG N7 D0007 : score 5.8685 : H : ARG NH2 A0085 <- 3.02 -> DG O6 D0007 : score 6.3096 : x : ASN xxxx A0084 <- 3.52 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 3.41 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >6p0u_ABEF:Putative_DNA-binding_domain;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY DNA COMPLEX " FX(1-2)-2XIS" CONTAINING E. COLI FIS AND PHAGE LAMBDA XIS organism=ESCHERICHIA COLI / ESCHERICHIA PHAGE LAMBDA : H : ARG NH1 A0085 <- 2.95 -> DG N7 D0007 : score 5.8685 : H : ARG NH2 A0085 <- 3.02 -> DG O6 D0007 : score 6.3096 : H : ARG NH1 B0085 <- 3.14 -> DG N7 C0007 : score 5.6386 : H : ARG NH2 B0085 <- 3.30 -> DG N7 C0007 : score 5.74615 : H : ARG NH2 B0085 <- 3.08 -> DG O6 C0007 : score 6.2304 : H : ARG NE E0039 <- 3.06 -> DT O2 D0012 : score 2.44292 : x : ASN xxxx A0084 <- 3.52 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0089 <- 3.41 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0075 <- 4.03 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0084 <- 3.64 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0089 <- 3.48 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0017 <- 3.88 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0019 <- 3.33 -> DC xxx C0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0020 <- 3.67 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0022 <- 3.31 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 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(STRAIN K12) / PHAGE 21 / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NH1 C0371 <- 2.52 -> DG O6 10044 : score 6.424 : H : GLU OE1 C0374 <- 2.51 -> DG N2 10042 : score 4.56025 : H : ARG NE C0451 <- 3.00 -> DG O6 10049 : score 3.78338 : H : ARG NH2 C0451 <- 3.10 -> DG O6 10049 : score 6.204 : H : ARG NE F0099 <- 3.13 -> DG O6 10043 : score 3.68092 : H : ASN OD1 F0383 <- 2.83 -> DT N3 10041 : score 3.77847 : H : ARG NE F0385 <- 3.17 -> DG N7 10042 : score 4.09458 : H : THR OG1 F0432 <- 3.43 -> DA N7 10040 : score 2.98393 : H : ARG NH1 P0127 <- 3.21 -> DG O6 20046 : score 5.5845 : H : ARG NH2 P0127 <- 2.92 -> DG N7 20046 : score 6.23138 : H : ARG NH2 P0128 <- 2.54 -> DG O6 10019 : score 6.9432 : H : ARG NH1 Q0127 <- 3.34 -> DG O6 20054 : score 5.42633 : H : ARG NH2 Q0127 <- 3.00 -> DG N7 20054 : score 6.12923 : H : ARG NH2 Q0127 <- 3.24 -> DG O6 20054 : score 6.0192 : V : ALA CB D0791 <- 3.77 -> DT C7 20019 : score 5.64097 : V : HIS CG F0455 <- 3.86 -> DT C7 10031 : score 2.95399 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.48 -> DG xxx 10049 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.58 -> DA xxx 10048 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.03 -> DA xxx 10048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 3.99 -> DA xxx 10048 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 3.52 -> DG xxx 10049 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0446 <- 3.86 -> DG xxx 10049 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0481 <- 3.46 -> DA xxx 10040 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.49 -> DG xxx 10049 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0541 <- 3.15 -> DA xxx 20018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.89 -> DT xxx 10050 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0546 <- 3.78 -> DG xxx 10049 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.38 -> DG xxx 10049 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0255 <- 3.85 -> DC xxx 20028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0259 <- 3.75 -> DT xxx 20030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0352 <- 4.26 -> DA xxx 20021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 4.44 -> DT xxx 20020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.64 -> DT xxx 20020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.90 -> DT xxx 20019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0096 <- 3.92 -> DG xxx 10044 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.39 -> DG xxx 10043 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.57 -> DG xxx 10043 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 3.58 -> DG xxx 10042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.57 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 3.34 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 4.00 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 4.19 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 3.61 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 3.48 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 3.14 -> DA xxx 10040 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.56 -> DA xxx 10039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.47 -> DA xxx 10037 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 4.06 -> DT xxx 10036 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0434 <- 4.11 -> DT xxx 10036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0436 <- 4.00 -> DA xxx 10040 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0437 <- 3.31 -> DT xxx 10036 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 3.76 -> DA xxx 20032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0448 <- 3.42 -> DA xxx 20029 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0454 <- 3.93 -> DT xxx 20033 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0457 <- 4.01 -> DA xxx 20031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0461 <- 3.32 -> DA xxx 20031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0465 <- 4.10 -> DA xxx 20031 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx P0095 <- 3.43 -> DT xxx 20045 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx P0112 <- 3.38 -> DT xxx 20052 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0113 <- 3.46 -> DT xxx 20051 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx P0124 <- 3.55 -> DA xxx 10020 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx Q0095 <- 3.71 -> DT xxx 20053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0113 <- 3.06 -> DT xxx 10010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Q0124 <- 3.51 -> DA xxx 10012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0128 <- 3.39 -> DT xxx 10010 : score x.xxxxx >6p18_P: title=Q21 TRANSCRIPTION ANTITERMINATION COMPLEX: LOADING COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 P0127 <- 3.21 -> DG O6 20046 : score 5.5845 : H : ARG NH2 P0127 <- 2.92 -> DG N7 20046 : score 6.23138 : H : ARG NH2 P0128 <- 2.54 -> DG O6 10019 : score 6.9432 : x : HIS xxxx P0095 <- 3.43 -> DT xxx 20045 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx P0112 <- 3.38 -> DT xxx 20052 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0113 <- 3.46 -> DT xxx 20051 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx P0124 <- 3.55 -> DA xxx 10020 : score x.xxxxx >6p19_CD: title=Q21 TRANSCRIPTION ANTITERMINATION COMPLEX: LOADED COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NH1 C0151 <- 2.41 -> DC O2 10110 : score 3.9347 : H : SER OG C0182 <- 2.30 -> DT O4 10108 : score 3.91064 : V : ASP CB C0199 <- 3.67 -> DT C7 10108 : score 2.77028 : x : ILE xxxx C0177 <- 4.18 -> DC xxx 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>6p19_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=Q21 TRANSCRIPTION ANTITERMINATION COMPLEX: LOADED COMPLEX organism=? : x : GLU xxxx D0042 <- 4.28 -> DG xxx 10098 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0046 <- 4.20 -> DT xxx 10097 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0255 <- 3.39 -> DC xxx 20023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 3.17 -> DA xxx 20024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 3.72 -> DG xxx 10101 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0275 <- 4.25 -> DG xxx 10101 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0319 <- 4.41 -> DA xxx 20024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0352 <- 4.01 -> DA xxx 20016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.62 -> DT xxx 20015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.00 -> DG xxx 20014 : score x.xxxxx >6p1a_B: title=TRANSCRIPTION ANTITERMINATION FACTOR Q21 IN COMPLEX WITH Q21-BINDING- ELEMENT DNA organism=Phage 21 : H : ARG NH1 B0127 <- 3.18 -> DG O6 E0012 : score 5.621 : H : ARG NH2 B0127 <- 2.78 -> DG N7 E0012 : score 6.41015 : H : ARG NH2 B0127 <- 3.30 -> DG O6 E0012 : score 5.94 : H : ARG NH2 B0128 <- 3.01 -> DG O6 D0007 : score 6.3228 : x : HIS xxxx B0095 <- 3.45 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0112 <- 3.77 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0113 <- 3.03 -> DA xxx E0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0122 <- 4.06 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0124 <- 3.52 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx >6p1h_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF DNA POLYMERASE DELTA HOLOENZYME organism=? : w : TYR OH A0613 <- 5.97 -> DG N2 T0006 : score 2.834 : x : LYS xxxx A0444 <- 3.82 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0708 <- 4.22 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0814 <- 3.36 -> DA xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0815 <- 4.01 -> DG xxx T0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0839 <- 3.43 -> DG xxx T0010 : score x.xxxxx >6p1i_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH DSDNA AND DCTP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.63 -> DC O2 P0821 : score 3.61635 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.69 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.14 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.32 -> DT xxx P0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.95 -> DG xxx T0721 : score x.xxxxx >6p1s_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=POST-CATALYTIC NICKED COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE MU WITH 1-NT GAPPED SUBSTRATE CONTAINING TEMPLATE 8OG AND NEWLY INCORPORATED AMP organism=HOMO SAPIENS : H : THR OG1 A0178 <- 3.10 -> DG N2 D0001 : score 3.77687 : H : THR OG1 A0178 <- 2.61 -> DG N3 D0001 : score 1.78855 : w : ARG NH1 A0181 <- 5.73 -> DC O2 T0004 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0181 <- 5.67 -> DC O2 T0004 : score 1.669 : x : ARG xxxx A0175 <- 3.98 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0177 <- 4.00 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx >6p1u_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=POST-CATALYTIC NICKED COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE MU WITH 1-NT GAPPED SUBSTRATE CONTAINING TEMPLATE 8OG AND NEWLY INCORPORATED CMP organism=HOMO SAPIENS : H : THR OG1 A0178 <- 3.08 -> DG N2 D0001 : score 3.79294 : H : THR OG1 A0178 <- 2.62 -> DG N3 D0001 : score 1.78511 : w : ARG NH1 A0181 <- 5.69 -> DC O2 T0004 : score 1.381 : w : ARG NH2 A0181 <- 5.63 -> DC O2 T0004 : score 1.669 : x : ARG xxxx A0175 <- 3.92 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0177 <- 4.07 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx >6p1x_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH DSDNA AND L-DDCTP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.61 -> DC O2 P0821 : score 3.63034 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.98 -> DT O2 P0806 : score 4.15138 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.21 -> DT O2 P0806 : score 3.8862 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.61 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.00 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.62 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >6p1x_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH DSDNA AND L-DDCTP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.61 -> DC O2 P0821 : score 3.63034 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.98 -> DT O2 P0806 : score 4.15138 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.21 -> DT O2 P0806 : score 3.8862 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.61 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.00 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.62 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >6p2g_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH DSDNA AND D-DDCTP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.71 -> DC O2 P0821 : score 3.56039 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.93 -> DT O2 P0806 : score 4.19444 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.44 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.16 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.64 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >6p2g_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH DSDNA AND D-DDCTP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.71 -> DC O2 P0821 : score 3.56039 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.93 -> DT O2 P0806 : score 4.19444 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.44 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.16 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.64 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >6p4f_C:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE XPB-BAX1-FORKED DNA TERNARY COMPLEX organism=? : V : TYR CD2 C0351 <- 3.64 -> DT C7 H0017 : score 3.8912 : x : ASP xxxx C0155 <- 4.30 -> DG xxx H0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0278 <- 3.37 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0279 <- 3.80 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0282 <- 3.44 -> DC xxx H0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0295 <- 3.35 -> DC xxx H0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0397 <- 4.26 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx >6p4f_CD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE XPB-BAX1-FORKED DNA TERNARY COMPLEX organism=? : V : TYR CD2 C0351 <- 3.64 -> DT C7 H0017 : score 3.8912 : x : ASP xxxx C0155 <- 4.30 -> DG xxx H0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0278 <- 3.37 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0279 <- 3.80 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0282 <- 3.44 -> DC xxx H0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0295 <- 3.35 -> DC xxx H0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0397 <- 4.26 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx >6p5c_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BACILLUS FRAGMENT DNA POLYMERASE MUTANT I716M organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.68 -> DA N3 B0026 : score 2.84357 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.69 -> DC O2 B0029 : score 3.7303 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.05 -> DC O2 B0029 : score 3.51378 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.71 -> DC O2 C0007 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.79 -> DG N3 C0008 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.99 -> DC O2 B0027 : score 4.30927 : w : GLU OE1 A0658 <- 5.89 -> DG N3 C0006 : score 2.669 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.45 -> DG N3 C0006 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.30 -> DG N3 C0006 : score 1.484 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.41 -> DC xxx B0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0629 <- 3.37 -> DC xxx B0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.41 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.28 -> DG xxx B0028 : score x.xxxxx >6p71_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF A BACTERIAL REITERATIVE TRANSCRIPTION COMPLEX OF PYRBI PROMOTER organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : ARG xxxx C0243 <- 3.05 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx >6p71_CDF: title=X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF A BACTERIAL REITERATIVE TRANSCRIPTION COMPLEX OF PYRBI PROMOTER organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ARG NE F0082 <- 2.91 -> DG O6 H0008 : score 3.85432 : H : ASN OD1 F0191 <- 2.91 -> DT N3 H0006 : score 3.71765 : x : ARG xxxx C0243 <- 3.05 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0705 <- 4.10 -> DA xxx G0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 3.85 -> DA xxx G0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.09 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 4.12 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D1238 <- 3.60 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0079 <- 2.45 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0081 <- 3.46 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0085 <- 3.80 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0093 <- 3.40 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0099 <- 4.08 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0193 <- 2.79 -> DC xxx H0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0194 <- 3.02 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0236 <- 3.73 -> DA xxx H0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0237 <- 3.11 -> DA xxx H0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx 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POLYMERASE BOUND TO A PRIMER/TEMPLATE DNA AND A PEPTIDE THAT MIMICS THE C-TERMINAL TAIL OF THE PRIMASE-HELICASE organism=? : H : ARG NH1 C0429 <- 3.07 -> DA N3 M0822 : score 3.48322 : x : LYS xxxx C0394 <- 3.81 -> DG xxx M0819 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0439 <- 3.08 -> DC xxx N0858 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0523 <- 3.34 -> DA xxx N0854 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0526 <- 3.94 -> DA xxx N0854 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0530 <- 3.62 -> DA xxx N0854 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0532 <- 4.18 -> DA xxx N0854 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0540 <- 3.95 -> DA xxx N0854 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0611 <- 4.00 -> DT xxx N0855 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0615 <- 3.14 -> DT xxx N0855 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0653 <- 3.96 -> DG xxx M0821 : score x.xxxxx >6p93_A:DNase_I-like; title=HUMAN APE1 K98A AP-ENDONUCLEASE PRODUCT COMPLEX organism=Homo sapiens : w : ASN OD1 A0226 <- 6.09 -> DG N7 D0003 : score 1.873 : x : ARG xxxx A0177 <- 3.26 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0229 <- 3.62 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 3.83 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0271 <- 3.39 -> DG xxx V0010 : score x.xxxxx >6p94_A:DNase_I-like; title=HUMAN APE1 C65A AP-ENDONUCLEASE PRODUCT COMPLEX organism=Homo sapiens : w : ASN OD1 A0229 <- 6.19 -> DG O6 D0003 : score 3.125 : x : ARG xxxx A0177 <- 3.38 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 3.98 -> DG xxx V0010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0271 <- 3.21 -> DG xxx V0010 : score x.xxxxx >6pa7_K:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN DNMT3A2-DNMT3B3 COMPLEX BOUND TO NUCLEOSOME. organism=HOMO SAPIENS : x : ASN xxxx K0711 <- 4.45 -> DC xxx I0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx K0883 <- 4.42 -> DG xxx J0162 : score x.xxxxx >6pax_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN PAX-6 PAIRED DOMAIN-DNA COMPLEX REVEALS A GENERAL MODEL FOR PAX PROTEIN-DNA INTERACTIONS organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 A0014 <- 2.79 -> DG N2 B1013 : score 4.8096 : w : ASN OD1 A0014 <- 6.14 -> DC O2 C2016 : score 2.172 : w : ASN OD1 A0014 <- 5.84 -> DG N3 C2017 : score 3.377 : w : ARG NH1 A0016 <- 5.96 -> DA N3 B1015 : score 2.585 : w : LYS NZ A0052 <- 5.69 -> DG N7 C2017 : score 2.519 : H : SER OG A0071 <- 2.83 -> DA N3 B1018 : score 2.98582 : H : ARG NH2 A0074 <- 3.32 -> DG N3 B1019 : score 3.23479 : H : SER OG A0118 <- 3.48 -> DC N4 B1022 : score 3.17575 : w : SER OG A0118 <- 6.04 -> DG N7 B1021 : score 2.749 : w : ASN ND2 A0121 <- 6.25 -> DG N7 C2005 : score 3.259 : w : ARG NE A0122 <- 5.45 -> DG N7 B1021 : score 1.593 : V : CYS CB A0049 <- 3.83 -> DT C7 C2018 : score 5.15896 : x : SER xxxx A0046 <- 3.37 -> DT xxx C2018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0047 <- 4.11 -> DT xxx B1007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0051 <- 3.78 -> DT xxx B1009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0068 <- 3.69 -> DT xxx C2014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0116 <- 3.93 -> DG xxx B1021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0117 <- 4.32 -> DT xxx C2004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0119 <- 3.86 -> DG xxx B1021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0125 <- 3.67 -> DT xxx C2006 : score x.xxxxx >6pb4_CDFGH:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=THE E. COLI CLASS-II CAP-DEPENDENT TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX WITH DE NOVO RNA TRANSCRIPT AT THE STATE 2 organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NE C0175 <- 3.07 -> DT O4 10079 : score 1.75859 : H : ARG NH2 C0175 <- 2.86 -> DT O4 10079 : score 3.5112 : H : LYS NZ F0426 <- 2.75 -> DT O4 10070 : score 3.62305 : H : ARG NH1 G0180 <- 3.30 -> DG N7 20049 : score 5.445 : H : ARG NH2 G0185 <- 2.43 -> DG N7 20051 : score 6.85708 : V : MET CE F0102 <- 3.57 -> DT C7 10072 : score 7.32875 : x : ARG xxxx C0151 <- 4.42 -> DT xxx 10079 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.27 -> DG xxx 10078 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0185 <- 3.43 -> DT xxx 10079 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 4.25 -> DG xxx 10078 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 3.54 -> DT xxx 10079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 2.94 -> DG xxx 10073 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0375 <- 4.26 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0541 <- 3.72 -> DC xxx 10080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.21 -> DC xxx 10080 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0319 <- 3.33 -> DT xxx 20022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0320 <- 4.28 -> DA xxx 20021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0322 <- 3.32 -> DA xxx 20021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 4.00 -> DC xxx 20013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.86 -> DC xxx 20013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 2.70 -> DA xxx 20012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 4.05 -> DA xxx 20012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.97 -> DT xxx 10072 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.85 -> DT xxx 10072 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 3.28 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.27 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 4.05 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0385 <- 3.63 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 3.75 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0396 <- 3.70 -> DT xxx 20025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0397 <- 3.63 -> DT xxx 10074 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 3.27 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 3.46 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 2.99 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 4.02 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 3.36 -> DA xxx 10069 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.53 -> DA xxx 10068 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.21 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0432 <- 3.86 -> DA xxx 10069 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.90 -> DT xxx 10065 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0434 <- 3.82 -> DT xxx 10065 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0436 <- 3.33 -> DA xxx 20026 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0437 <- 2.11 -> DA xxx 20026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 4.34 -> DA xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0441 <- 4.50 -> DC xxx 10064 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0443 <- 4.43 -> DT xxx 20025 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0455 <- 3.02 -> DT xxx 10060 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0464 <- 4.25 -> DT xxx 20025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0502 <- 3.27 -> DT xxx 20022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0505 <- 4.49 -> DA xxx 20021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0511 <- 3.21 -> DG xxx 20019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0513 <- 2.77 -> DG xxx 20019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0516 <- 3.15 -> DG xxx 20016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0181 <- 3.01 -> DC xxx 10040 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0182 <- 3.38 -> DA xxx 10038 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0181 <- 3.29 -> DT xxx 10028 : score x.xxxxx >6pb4_H:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE E. COLI CLASS-II CAP-DEPENDENT TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX WITH DE NOVO RNA TRANSCRIPT AT THE STATE 2 organism=ESCHERICHIA COLI O157:H7 : x : GLU xxxx H0181 <- 3.29 -> DT xxx 10028 : score x.xxxxx >6pb5_CFGH:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=THE E. COLI CLASS-II CAP-DEPENDENT TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX AT THE STATE 1 ARCHITECTURE organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 C0180 <- 3.10 -> DG O6 10078 : score 5.71833 : H : TRP NE1 C0183 <- 2.68 -> DT O4 10079 : score 4.92308 : H : ARG NH2 F0385 <- 2.58 -> DG N7 10071 : score 6.66554 : H : SER OG F0428 <- 2.33 -> DT O4 10070 : score 3.88931 : H : THR OG1 F0432 <- 3.04 -> DA N7 10069 : score 3.25023 : H : ARG NH1 F0441 <- 2.63 -> DG N7 10063 : score 6.2557 : H : ARG NH2 G0180 <- 2.71 -> DG N7 20049 : score 6.49954 : H : GLU OE2 G0181 <- 2.27 -> DC N4 10040 : score 5.82352 : H : ARG NH2 G0185 <- 2.69 -> DG N7 20051 : score 6.52508 : V : HIS CB F0455 <- 3.86 -> DT C7 10060 : score 4.06325 : V : TRP CB F0433 <- 3.63 -> DT C7 10065 : score 5.73001 : V : MET CE F0102 <- 3.87 -> DT C7 10072 : score 6.80898 : V : ASN CB F0464 <- 3.84 -> DT C7 20025 : score 1.91806 : x : ARG xxxx C0151 <- 4.07 -> DG xxx 10078 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0177 <- 3.13 -> DT xxx 10079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 4.32 -> DG xxx 20007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.06 -> DG xxx 10073 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 3.36 -> DT xxx 10072 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0375 <- 3.69 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0393 <- 3.43 -> DG xxx 10075 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0394 <- 3.02 -> DG xxx 10075 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0396 <- 3.44 -> DG xxx 10075 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0513 <- 3.82 -> DG xxx 20019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0541 <- 3.26 -> DG xxx 20011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.08 -> DC xxx 10080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.04 -> DT xxx 10072 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0103 <- 3.78 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 3.23 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.17 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 3.41 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 3.40 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 3.26 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 3.44 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 3.29 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 3.79 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.19 -> DA xxx 10068 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.18 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0434 <- 3.88 -> DT xxx 10065 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0436 <- 4.25 -> DA xxx 20026 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0437 <- 3.00 -> DA xxx 20026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 3.59 -> DA xxx 20026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0454 <- 4.21 -> DC xxx 20028 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0458 <- 2.84 -> DG xxx 20027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0461 <- 3.78 -> DT xxx 20025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0514 <- 3.81 -> DG xxx 20016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0516 <- 3.11 -> DG xxx 20016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0181 <- 2.84 -> DG xxx 10029 : score x.xxxxx >6pb5_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=THE E. COLI CLASS-II CAP-DEPENDENT TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX AT THE STATE 1 ARCHITECTURE organism=ESCHERICHIA COLI : x : THR xxxx D0790 <- 3.66 -> DA xxx 20012 : score x.xxxxx >6pb6_CDFGH:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=THE E. COLI CLASS-II CAP-DEPENDENT TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX AT THE STATE 2 organism=ESCHERICHIA COLI : H : ASN ND2 F0396 <- 3.20 -> DA N3 20024 : score 3.50308 : H : ARG NH1 F0423 <- 2.68 -> DA N7 10066 : score 2.6217 : H : SER OG F0428 <- 3.02 -> DT O4 10070 : score 3.3987 : H : ARG NH1 G0180 <- 2.89 -> DG N7 20049 : score 5.9411 : H : ARG NH2 G0185 <- 2.23 -> DG N7 20051 : score 7.11246 : H : ARG NH2 H0185 <- 2.81 -> DT O4 20059 : score 3.54674 : V : TRP CB F0433 <- 3.66 -> DT C7 10065 : score 5.68878 : V : MET CE F0102 <- 3.65 -> DT C7 10072 : score 7.19014 : x : TRP xxxx C0183 <- 3.07 -> DG xxx 10078 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 3.09 -> DT xxx 10079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 4.01 -> DG xxx 10073 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 3.29 -> DG xxx 10073 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0375 <- 4.46 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0473 <- 4.02 -> DT xxx 10074 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0508 <- 3.54 -> DG xxx 20020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.09 -> DC xxx 10080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 4.36 -> DC xxx 10076 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0319 <- 3.25 -> DA xxx 20021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0320 <- 4.19 -> DA xxx 20021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 2.92 -> DT xxx 20014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.24 -> DC xxx 20013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 2.80 -> DA xxx 20012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.69 -> DA xxx 20012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.57 -> DT xxx 10072 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.70 -> DT xxx 10072 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0103 <- 4.19 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 3.31 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.26 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 3.31 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0385 <- 2.60 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 3.41 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0394 <- 4.11 -> DT xxx 20025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0397 <- 3.61 -> DT xxx 20023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 3.24 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 3.43 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.83 -> DA xxx 10069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.35 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0432 <- 3.53 -> DA xxx 10069 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0434 <- 3.36 -> DT xxx 10065 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0436 <- 3.85 -> DA xxx 20026 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0437 <- 2.17 -> DA xxx 20026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 4.24 -> DA xxx 20026 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0455 <- 3.14 -> DT xxx 10060 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0461 <- 3.46 -> DT xxx 20025 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0511 <- 3.51 -> DG xxx 20020 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0513 <- 2.95 -> DA xxx 20018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0516 <- 3.63 -> DG xxx 20016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0585 <- 4.06 -> DC xxx 10042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0586 <- 3.80 -> DC xxx 10042 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0181 <- 3.14 -> DG xxx 20049 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0181 <- 2.97 -> DG xxx 10029 : score x.xxxxx >6pb6_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=THE E. COLI CLASS-II CAP-DEPENDENT TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX AT THE STATE 2 organism=ESCHERICHIA COLI : x : ARG xxxx D0314 <- 4.36 -> DC xxx 10076 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0319 <- 3.25 -> DA xxx 20021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0320 <- 4.19 -> DA xxx 20021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 2.92 -> DT xxx 20014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.24 -> DC xxx 20013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 2.80 -> DA xxx 20012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.69 -> DA xxx 20012 : score x.xxxxx >6pbd_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=DNA N6-ADENINE METHYLTRANSFERASE CCRM IN COMPLEX WITH DOUBLE-STRANDED DNA OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING ITS RECOGNITION SEQUENCE GAATC organism=Caulobacter vibrioides : H : ASP OD2 A0031 <- 2.89 -> DA N6 X0011 : score 3.93052 : H : ARG NH1 A0044 <- 2.31 -> DG O6 X0010 : score 6.6795 : H : ARG NH2 A0044 <- 2.99 -> DG N7 X0010 : score 6.142 : H : LYS NZ A0126 <- 2.77 -> DT O2 Y0009 : score 3.6087 : H : ARG NH1 A0129 <- 2.70 -> DT O2 X0013 : score 4.39254 : H : ARG NH2 A0129 <- 2.83 -> DT O2 X0013 : score 4.20793 : H : LYS NZ A0193 <- 2.91 -> DA N7 X0011 : score 2.87256 : x : TYR xxxx A0034 <- 3.19 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0036 <- 3.54 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0037 <- 3.59 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0038 <- 3.57 -> DA xxx X0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0042 <- 3.34 -> DA xxx X0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0045 <- 3.69 -> DT xxx Y0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0046 <- 3.99 -> DT xxx Y0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0050 <- 4.06 -> DA xxx X0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0052 <- 3.37 -> DA xxx X0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0053 <- 4.16 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0057 <- 4.01 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0058 <- 3.50 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0063 <- 4.19 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0093 <- 3.49 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0094 <- 3.38 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0122 <- 3.18 -> DC xxx X0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0123 <- 3.68 -> DC xxx Y0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0124 <- 3.60 -> DC xxx X0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0125 <- 3.61 -> DT xxx Y0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0128 <- 4.09 -> DC xxx X0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0135 <- 3.68 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0173 <- 4.38 -> DG xxx X0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0191 <- 3.44 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx >6pbd_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=DNA N6-ADENINE METHYLTRANSFERASE CCRM IN COMPLEX WITH DOUBLE-STRANDED DNA OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING ITS RECOGNITION SEQUENCE GAATC organism=Caulobacter vibrioides : H : ASP OD2 A0031 <- 2.89 -> DA N6 X0011 : score 3.93052 : H : ARG NH1 A0044 <- 2.31 -> DG O6 X0010 : score 6.6795 : H : ARG NH2 A0044 <- 2.99 -> DG N7 X0010 : score 6.142 : H : LYS NZ A0126 <- 2.77 -> DT O2 Y0009 : score 3.6087 : H : ARG NH1 A0129 <- 2.70 -> DT O2 X0013 : score 4.39254 : H : ARG NH2 A0129 <- 2.83 -> DT O2 X0013 : score 4.20793 : H : LYS NZ A0193 <- 2.91 -> DA N7 X0011 : score 2.87256 : x : TYR xxxx A0034 <- 3.19 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0036 <- 3.54 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0037 <- 3.59 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0038 <- 3.57 -> DA xxx X0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0042 <- 3.34 -> DA xxx X0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0045 <- 3.69 -> DT xxx Y0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0046 <- 3.99 -> DT xxx Y0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0050 <- 4.06 -> DA xxx X0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0052 <- 3.37 -> DA xxx X0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0053 <- 4.16 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0057 <- 4.01 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0058 <- 3.50 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0063 <- 4.19 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0093 <- 3.49 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0094 <- 3.38 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0122 <- 3.18 -> DC xxx X0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0123 <- 3.68 -> DC xxx Y0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0124 <- 3.60 -> DC xxx X0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0125 <- 3.61 -> DT xxx Y0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0128 <- 4.09 -> DC xxx X0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0135 <- 3.68 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0173 <- 4.38 -> DG xxx X0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0191 <- 3.44 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0104 <- 4.17 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0109 <- 3.27 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0110 <- 3.64 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0268 <- 4.05 -> DA xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0272 <- 4.07 -> DG xxx Y0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0317 <- 3.59 -> DG xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0328 <- 3.74 -> DA xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0330 <- 4.04 -> DA xxx Y0008 : score x.xxxxx >6ph5_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=BINARY PRODUCT COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH AN EXTRA-HELICAL TEMPLATE BASE organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 3.29 -> DG N3 T0010 : score 1.31137 : x : MET xxxx A0236 <- 4.39 -> DG xxx P0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0271 <- 3.35 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0272 <- 3.69 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx >6ph6_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH 2NT-GAP WITH DCTP BOUND DOWNSTREAM organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.79 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.90 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.77 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6pij_AG: title=TARGET DNA-BOUND V. CHOLERAE TNIQ-CASCADE COMPLEX, CLOSED CONFORMATION organism=VIBRIO CHOLERAE : H : LYS NZ G0131 <- 3.14 -> DG N3 20056 : score 1.35498 : H : ASN OD1 G0249 <- 2.94 -> DG N2 20053 : score 4.6656 : x : SER xxxx G0130 <- 3.26 -> DC xxx 30005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0246 <- 3.41 -> DG xxx 20053 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0248 <- 3.73 -> DC xxx 30005 : score x.xxxxx >6pij_BCDE: title=TARGET DNA-BOUND V. CHOLERAE TNIQ-CASCADE COMPLEX, CLOSED CONFORMATION organism=VIBRIO CHOLERAE : H : SER OG C0243 <- 3.19 -> DG O6 20036 : score 3.77193 : x : ASN xxxx B0006 <- 3.01 -> DT xxx 20050 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0040 <- 4.04 -> DA xxx 20040 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0069 <- 3.53 -> DG xxx 20042 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0070 <- 3.28 -> DG xxx 20041 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0071 <- 3.12 -> DG xxx 20042 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0102 <- 4.14 -> DA xxx 20051 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0227 <- 3.73 -> DC xxx 20046 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0243 <- 3.75 -> DG xxx 20042 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0346 <- 3.34 -> DG xxx 20049 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0348 <- 4.09 -> DT xxx 20050 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0006 <- 3.97 -> DG xxx 20044 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0069 <- 3.36 -> DG xxx 20036 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0070 <- 3.42 -> DA xxx 20035 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0071 <- 3.17 -> DG xxx 20036 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0102 <- 4.01 -> DG xxx 20044 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0227 <- 3.61 -> DA xxx 20040 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0230 <- 3.90 -> DA xxx 20040 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0241 <- 3.76 -> DA xxx 20035 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0346 <- 3.27 -> DC xxx 20043 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0348 <- 4.19 -> DG xxx 20044 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0006 <- 4.03 -> DC xxx 20038 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0071 <- 3.67 -> DA xxx 20031 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0227 <- 3.29 -> DA xxx 20034 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0346 <- 3.36 -> DC xxx 20037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0006 <- 4.44 -> DT xxx 20032 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0102 <- 4.22 -> DG xxx 20033 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0346 <- 3.53 -> DA xxx 20031 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0348 <- 4.47 -> DT xxx 20032 : score x.xxxxx >6pij_C: title=TARGET DNA-BOUND V. CHOLERAE TNIQ-CASCADE COMPLEX, CLOSED CONFORMATION organism=VIBRIO CHOLERAE : H : SER OG C0243 <- 3.19 -> DG O6 20036 : score 3.77193 : x : ASN xxxx C0006 <- 3.97 -> DG xxx 20044 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0069 <- 3.36 -> DG xxx 20036 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0070 <- 3.42 -> DA xxx 20035 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0071 <- 3.17 -> DG xxx 20036 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0102 <- 4.01 -> DG xxx 20044 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0227 <- 3.61 -> DA xxx 20040 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0230 <- 3.90 -> DA xxx 20040 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0241 <- 3.76 -> DA xxx 20035 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0346 <- 3.27 -> DC xxx 20043 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0348 <- 4.19 -> DG xxx 20044 : score x.xxxxx >6pkz_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA N279A COMPLEXED WITH 8OA IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE GTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.34 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.67 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.61 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6pl7_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA COMPLEXED WITH A IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE TTP organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.00 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.75 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >6pl8_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA COMPLEXED WITH 8OA IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE TTP organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.12 -> DG O6 P0004 : score 5.694 : H : ARG NH2 A0382 <- 2.98 -> DG N7 P0004 : score 6.15477 : x : SER xxxx A0322 <- 3.90 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.43 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx >6plc_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA COMPLEXED WITH 8OA IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE GTP organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.23 -> DG N7 P0004 : score 5.5297 : x : SER xxxx A0322 <- 3.68 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.38 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >6pmi_CDF: title=SIGM28-TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH SPECIFIC PROMOTER AT THE STATE 1 organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI O45:K1 (STRAIN S88 / EXPEC) / ESCHERICHIA COLI O157:H7 / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI O45:K1 (STRAIN S88 / EXPEC) : H : ARG NE C0175 <- 2.32 -> DT O4 10077 : score 2.03744 : H : ARG NH1 C0200 <- 2.68 -> DC N3 10076 : score 1.57407 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.67 -> DA N3 10075 : score 3.32398 : H : GLU OE2 C0374 <- 3.20 -> DA N6 10071 : score 2.80718 : H : TRP NE1 F0149 <- 2.88 -> DA N7 20018 : score -8.96575 : H : GLU OE2 F0151 <- 2.39 -> DT N3 20017 : score 2.85204 : x : ARG xxxx C0143 <- 4.45 -> DG xxx 20019 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.06 -> DC xxx 10076 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0185 <- 3.92 -> DT xxx 10077 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 4.08 -> DA xxx 10075 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.10 -> DA xxx 10071 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0375 <- 3.02 -> DA xxx 10069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0394 <- 3.13 -> DT xxx 10072 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0470 <- 2.59 -> DT xxx 20023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0473 <- 3.88 -> DT xxx 20023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0514 <- 3.21 -> DG xxx 20019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0541 <- 2.94 -> DT xxx 10078 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.11 -> DT xxx 10078 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0319 <- 3.51 -> DC xxx 20022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0320 <- 2.91 -> DG xxx 20021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 4.41 -> DG xxx 20013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.69 -> DA xxx 20012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0022 <- 4.11 -> DG xxx 10068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0025 <- 3.14 -> DA xxx 10069 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0026 <- 3.05 -> DC xxx 10067 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0033 <- 3.54 -> DT xxx 20023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0034 <- 3.33 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0035 <- 2.99 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0063 <- 2.80 -> DA xxx 10063 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0065 <- 3.69 -> DA xxx 10063 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0070 <- 3.37 -> DA xxx 10063 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0073 <- 3.00 -> DG xxx 10062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0074 <- 4.30 -> DG xxx 10062 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0080 <- 3.31 -> DC xxx 20027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0083 <- 2.80 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0087 <- 4.07 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0091 <- 3.26 -> DT xxx 10058 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0094 <- 2.94 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0143 <- 3.39 -> DG xxx 20021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0150 <- 3.10 -> DG xxx 20019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0155 <- 3.59 -> DA xxx 20018 : score x.xxxxx >6pmi_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=SIGM28-TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH SPECIFIC PROMOTER AT THE STATE 1 organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : TRP NE1 F0149 <- 2.88 -> DA N7 20018 : score -8.96575 : H : GLU OE2 F0151 <- 2.39 -> DT N3 20017 : score 2.85204 : x : PRO xxxx F0022 <- 4.11 -> DG xxx 10068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0025 <- 3.14 -> DA xxx 10069 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0026 <- 3.05 -> DC xxx 10067 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0033 <- 3.54 -> DT xxx 20023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0034 <- 3.33 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0035 <- 2.99 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0063 <- 2.80 -> DA xxx 10063 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0065 <- 3.69 -> DA xxx 10063 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0070 <- 3.37 -> DA xxx 10063 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0073 <- 3.00 -> DG xxx 10062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0074 <- 4.30 -> DG xxx 10062 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0080 <- 3.31 -> DC xxx 20027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0083 <- 2.80 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0087 <- 4.07 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0091 <- 3.26 -> DT xxx 10058 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0094 <- 2.94 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0143 <- 3.39 -> DG xxx 20021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0150 <- 3.10 -> DG xxx 20019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0155 <- 3.59 -> DA xxx 20018 : score x.xxxxx >6pmj_CDF: title=SIGM28-TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH SPECIFIC PROMOTER AT THE STATE 2 organism=ESCHERICHIA COLI O45:K1 (STRAIN S88 / EXPEC) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI O157:H7 / ESCHERICHIA COLI O45:K1 (STRAIN S88 / EXPEC) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NE C0175 <- 2.36 -> DT O4 10077 : score 2.02256 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.67 -> DA N3 10075 : score 3.32398 : H : GLU OE2 C0374 <- 3.25 -> DA N6 10071 : score 2.77667 : H : ASP OD2 F0087 <- 2.83 -> DT N3 20026 : score 3.56566 : H : ARG NH1 F0094 <- 2.81 -> DT O4 20026 : score 3.26141 : H : GLU OE1 F0151 <- 2.69 -> DT N3 20017 : score 1.78719 : x : ARG xxxx C0180 <- 4.28 -> DA xxx 10075 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.11 -> DC xxx 10076 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0185 <- 3.92 -> DT xxx 10077 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 4.34 -> DA xxx 10075 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.06 -> DA xxx 10071 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0375 <- 3.07 -> DA xxx 10069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0394 <- 3.08 -> DT xxx 10072 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0470 <- 2.63 -> DT xxx 20023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0473 <- 4.13 -> DT xxx 10072 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0504 <- 4.24 -> DG xxx 20021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0514 <- 3.13 -> DG xxx 20019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0541 <- 3.18 -> DA xxx 20011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.02 -> DT xxx 10078 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0319 <- 3.56 -> DC xxx 20022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0320 <- 2.83 -> DG xxx 20021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 4.42 -> DG xxx 20013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.79 -> DA xxx 20012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0022 <- 3.97 -> DG xxx 10068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0025 <- 4.09 -> DA xxx 10069 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0026 <- 3.11 -> DG xxx 10068 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0033 <- 3.64 -> DT xxx 20023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0034 <- 3.33 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0035 <- 3.37 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0063 <- 2.83 -> DA xxx 10063 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0065 <- 3.64 -> DA xxx 10063 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0070 <- 3.66 -> DA xxx 10063 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0073 <- 3.57 -> DG xxx 10062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0074 <- 4.38 -> DG xxx 10062 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0080 <- 3.32 -> DC xxx 20027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0083 <- 3.38 -> DT xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0091 <- 3.25 -> DT xxx 10058 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0143 <- 3.53 -> DG xxx 20021 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0149 <- 2.91 -> DA xxx 20018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0150 <- 3.09 -> DA xxx 20020 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0155 <- 4.07 -> DA xxx 20018 : score x.xxxxx >6pmj_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=SIGM28-TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH SPECIFIC PROMOTER AT THE STATE 2 organism=ESCHERICHIA COLI O157:H7 : x : SER xxxx D0319 <- 3.56 -> DC xxx 20022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0320 <- 2.83 -> DG xxx 20021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 4.42 -> DG xxx 20013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.79 -> DA xxx 20012 : score x.xxxxx >6ppr_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ADNA(D934A)-ADNB(D1014A) IN COMPLEX WITH AMPPNP AND DNA organism=MYCOBACTERIUM SMEGMATIS : x : SER xxxx A0799 <- 3.34 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0800 <- 4.07 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0815 <- 3.33 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0826 <- 4.50 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0918 <- 3.26 -> DT xxx X0000 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0940 <- 2.83 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0941 <- 4.43 -> DT xxx X0048 : score x.xxxxx >6ppr_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ADNA(D934A)-ADNB(D1014A) IN COMPLEX WITH AMPPNP AND DNA organism=MYCOBACTERIUM SMEGMATIS : H : HIS NE2 B0665 <- 2.52 -> DT O2 X0054 : score 5.53317 : H : SER OG B0687 <- 2.54 -> DT O2 X0053 : score 3.8897 : x : PHE xxxx B0079 <- 3.56 -> DG xxx X0056 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0081 <- 4.39 -> DT xxx X0058 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0120 <- 3.53 -> DG xxx X0056 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0142 <- 3.73 -> DT xxx X0058 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0254 <- 3.31 -> DT xxx X0057 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0325 <- 3.23 -> DT xxx X0055 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0326 <- 3.33 -> DG xxx X0056 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0436 <- 3.48 -> DT xxx X0053 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0799 <- 3.34 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0800 <- 4.07 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0815 <- 3.33 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0826 <- 4.50 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0918 <- 3.26 -> DT xxx X0000 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0940 <- 2.83 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0941 <- 4.43 -> DT xxx X0048 : score x.xxxxx >6ppr_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ADNA(D934A)-ADNB(D1014A) IN COMPLEX WITH AMPPNP AND DNA organism=MYCOBACTERIUM SMEGMATIS : H : HIS NE2 B0665 <- 2.52 -> DT O2 X0054 : score 5.53317 : H : SER OG B0687 <- 2.54 -> DT O2 X0053 : score 3.8897 : x : PHE xxxx B0079 <- 3.56 -> DG xxx X0056 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0081 <- 4.39 -> DT xxx X0058 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0120 <- 3.53 -> DG xxx X0056 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0142 <- 3.73 -> DT xxx X0058 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0254 <- 3.31 -> DT xxx X0057 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0325 <- 3.23 -> DT xxx X0055 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0326 <- 3.33 -> DG xxx X0056 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0436 <- 3.48 -> DT xxx X0053 : score x.xxxxx >6ppu_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ADNAB-AMPPNP-DNA COMPLEX organism=? : x : SER xxxx A0940 <- 3.27 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx >6ppu_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ADNAB-AMPPNP-DNA COMPLEX organism=? : x : SER xxxx A0940 <- 3.27 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx >6pqr_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HZTRANSIB/INTACT TIR SUBSTRATE DNA PRE-REACTION COMPLEX (PRC) organism=? : H : LYS NZ A0040 <- 3.41 -> DG N7 E0024 : score 4.72882 : x : TYR xxxx A0063 <- 3.78 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0066 <- 3.91 -> DG xxx E0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0450 <- 3.84 -> DG xxx E0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0451 <- 3.23 -> DC xxx F0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0452 <- 3.44 -> DC xxx F0010 : score x.xxxxx >6pqu_E: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HZTRANSIB/NICKED TIR SUBSTRATE DNA PRE-REACTION COMPLEX (PRC) organism=? : H : LYS NZ E0040 <- 3.10 -> DG O6 C0024 : score 5.43392 : V : TYR CZ E0063 <- 3.83 -> DT C7 D0004 : score 5.53764 : x : ARG xxxx E0450 <- 3.39 -> DG xxx C0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0451 <- 3.07 -> DG xxx C0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0452 <- 3.20 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx >6pqx_E: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HZTRANSIB/NICKED TIR SUBSTRATE DNA HAIRPIN FORMING COMPLEX (HFC) organism=? : H : ASN ND2 E0339 <- 3.20 -> DG N7 H0014 : score 4.21903 : H : LYS NZ E0439 <- 2.61 -> DG N3 H0014 : score 1.50909 : V : ASP CB E0337 <- 3.64 -> DT C7 H0015 : score 2.7904 : x : ARG xxxx E0342 <- 3.82 -> DA xxx G0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0432 <- 3.66 -> DA xxx G0018 : score x.xxxxx >6pqy_D: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HZTRANSIB/TIR DNA TRANSPOSON END COMPLEX (TEC) organism=HELICOVERPA ZEA : H : ARG NH1 D0450 <- 2.88 -> DG N3 B0023 : score 3.00372 : x : LYS xxxx D0040 <- 3.55 -> DG xxx B0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0063 <- 3.61 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0451 <- 3.29 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0452 <- 3.75 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx >6pr5_E: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HZTRANSIB STRAND TRANSFER COMPLEX (STC) organism=HELICOVERPA ZEA : H : GLN NE2 E0330 <- 3.24 -> DG O6 d0019 : score 5.29428 >6psq_ILM:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE CLOSED COMPLEX (TRPC) WITH TRAR AND RPST P2 PROMOTER organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 L0584 <- 2.51 -> DG N7 P0056 : score 6.4009 : H : ARG NH1 L0584 <- 2.83 -> DG O6 P0056 : score 6.04683 : H : ARG NH2 L0584 <- 3.15 -> DG O6 P0056 : score 6.138 : H : GLU OE2 L0585 <- 2.94 -> DC N4 P0058 : score 5.11795 : H : GLN NE2 L0589 <- 2.73 -> DT O4 O0026 : score 5.2637 : x : HIS xxxx L0455 <- 4.15 -> DA xxx O0044 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0573 <- 4.32 -> DG xxx P0056 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0583 <- 3.99 -> DT xxx O0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0586 <- 3.94 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0588 <- 4.00 -> DT xxx P0057 : score x.xxxxx >6psr_JLM:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE PROMOTER UNWINDING INTERMEDIATE (TRPI1) WITH TRAR AND RPST P2 PROMOTER organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 L0584 <- 2.40 -> DG N7 P0056 : score 6.89538 : x : TRP xxxx L0433 <- 4.35 -> DG xxx O0048 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0437 <- 4.49 -> DG xxx O0048 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0573 <- 4.29 -> DG xxx P0056 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0585 <- 2.64 -> DT xxx P0057 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0586 <- 3.50 -> DA xxx O0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0588 <- 4.37 -> DC xxx P0058 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0589 <- 3.38 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0265 <- 4.18 -> DT xxx P0067 : score x.xxxxx >6pss_ILM:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE PROMOTER UNWINDING INTERMEDIATE (TRPI1.5A) WITH TRAR AND MUTANT RPST P2 PROMOTER organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 L0441 <- 2.90 -> DG O6 O0047 : score 6.468 : H : ARG NH2 L0584 <- 2.51 -> DG N7 P0056 : score 6.75492 : H : GLU OE1 L0585 <- 2.77 -> DC N4 P0058 : score 5.80256 : V : TYR CD1 L0425 <- 3.55 -> DT C7 O0051 : score 4.97359 : x : GLU xxxx L0420 <- 2.85 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0423 <- 3.47 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0426 <- 3.73 -> DT xxx O0051 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0429 <- 3.38 -> DG xxx P0035 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0430 <- 3.46 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0433 <- 3.94 -> DG xxx P0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0436 <- 3.73 -> DC xxx P0036 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0437 <- 2.86 -> DG xxx O0048 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0455 <- 3.33 -> DA xxx O0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0458 <- 4.32 -> DC xxx P0038 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0573 <- 4.05 -> DT xxx P0057 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0583 <- 3.42 -> DT xxx O0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0586 <- 3.73 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0588 <- 3.93 -> DT xxx P0057 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0589 <- 3.78 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0265 <- 4.03 -> DT xxx P0066 : score x.xxxxx >6pss_M:C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit; title=ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE PROMOTER UNWINDING INTERMEDIATE (TRPI1.5A) WITH TRAR AND MUTANT RPST P2 PROMOTER organism=ESCHERICHIA COLI : x : ARG xxxx M0265 <- 4.03 -> DT xxx P0066 : score x.xxxxx >6pst_ILM:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE PROMOTER UNWINDING INTERMEDIATE (TRPI1.5B) WITH TRAR AND MUTANT RPST P2 PROMOTER organism=ESCHERICHIA COLI : H : ASN ND2 L0396 <- 2.43 -> DA N7 P0033 : score 6.30493 : H : ARG NH2 L0397 <- 3.25 -> DG N3 P0035 : score 3.28533 : H : ARG NH2 L0441 <- 2.90 -> DG N7 O0047 : score 6.25692 : H : ARG NH2 L0441 <- 3.07 -> DG O6 O0047 : score 6.2436 : H : ARG NH1 L0584 <- 2.82 -> DG N7 P0056 : score 6.0258 : H : ARG NH1 L0584 <- 2.75 -> DG O6 P0056 : score 6.14417 : H : GLU OE1 L0585 <- 2.81 -> DC N4 P0058 : score 5.75641 : V : VAL CG2 I0471 <- 3.88 -> DT C7 P0034 : score 6.00062 : x : ARG xxxx M0265 <- 4.26 -> DA xxx O0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0379 <- 4.34 -> DG xxx P0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0470 <- 4.41 -> DT xxx P0034 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0474 <- 3.13 -> DT xxx P0034 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0493 <- 3.79 -> DT xxx P0034 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0494 <- 3.13 -> DT xxx P0034 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0497 <- 3.27 -> DT xxx P0034 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0498 <- 3.61 -> DT xxx P0034 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0392 <- 4.05 -> DG xxx P0031 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0395 <- 2.92 -> DA xxx P0033 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0419 <- 4.43 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0420 <- 3.13 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0423 <- 3.10 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0425 <- 4.33 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0429 <- 3.32 -> DA xxx O0052 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0430 <- 3.31 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0433 <- 3.56 -> DG xxx P0037 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0434 <- 4.02 -> DG xxx O0048 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0437 <- 2.26 -> DC xxx O0049 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0455 <- 3.29 -> DA xxx O0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0458 <- 4.13 -> DC xxx P0038 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0461 <- 4.12 -> DC xxx P0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0468 <- 4.10 -> DC xxx P0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0586 <- 3.29 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0588 <- 4.01 -> DC xxx P0058 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0589 <- 3.39 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx >6pst_M:C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit; title=ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE PROMOTER UNWINDING INTERMEDIATE (TRPI1.5B) WITH TRAR AND MUTANT RPST P2 PROMOTER organism=ESCHERICHIA COLI : x : ARG xxxx M0265 <- 4.26 -> DA xxx O0021 : score x.xxxxx >6psu_IJLM:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE PROMOTER UNWINDING INTERMEDIATE (TRPI2) WITH TRAR AND RPST P2 PROMOTER organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 L0584 <- 2.94 -> DT O4 P0057 : score 3.45434 : H : GLU OE1 L0585 <- 2.32 -> DC N4 P0058 : score 6.32167 : H : ARG NH1 M0265 <- 2.42 -> DA N3 O0021 : score 3.96189 : V : ARG CB L0586 <- 3.59 -> DT C7 O0026 : score 1.0579 : x : TRP xxxx L0433 <- 3.12 -> DC xxx O0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0436 <- 3.68 -> DG xxx P0037 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0437 <- 2.90 -> DG xxx P0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0441 <- 3.41 -> DG xxx O0047 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0455 <- 4.15 -> DA xxx O0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0588 <- 3.37 -> DT xxx P0057 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0589 <- 4.41 -> DC xxx O0024 : score x.xxxxx >6psu_M:C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit; title=ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE PROMOTER UNWINDING INTERMEDIATE (TRPI2) WITH TRAR AND RPST P2 PROMOTER organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 M0265 <- 2.42 -> DA N3 O0021 : score 3.96189 >6psv_I:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE PROMOTER UNWINDING INTERMEDIATE (TPRERPO) WITH TRAR AND RPST P2 PROMOTER organism=ESCHERICHIA COLI : x : ARG xxxx I0470 <- 3.02 -> DT xxx P0034 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0497 <- 3.18 -> DT xxx P0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.86 -> DT xxx O0063 : score x.xxxxx >6psv_IJLM:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE PROMOTER UNWINDING INTERMEDIATE (TPRERPO) WITH TRAR AND RPST P2 PROMOTER organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 L0468 <- 2.63 -> DT O2 P0036 : score 4.37727 : V : THR CB L0432 <- 3.80 -> DT C7 O0053 : score 3.52615 : x : ARG xxxx I0470 <- 3.02 -> DT xxx P0034 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0497 <- 3.18 -> DT xxx P0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.86 -> DT xxx O0063 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx L0098 <- 4.13 -> DC xxx O0056 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0099 <- 3.82 -> DC xxx O0056 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0102 <- 4.05 -> DC xxx O0055 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0105 <- 3.21 -> DC xxx O0055 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0111 <- 3.27 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0383 <- 3.48 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0385 <- 3.23 -> DC xxx O0055 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0386 <- 3.48 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0396 <- 3.48 -> DA xxx P0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0397 <- 3.24 -> DT xxx P0036 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0419 <- 3.96 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0420 <- 3.97 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0423 <- 4.22 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0425 <- 3.11 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0426 <- 3.53 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0428 <- 3.11 -> DT xxx O0053 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0429 <- 3.48 -> DA xxx O0052 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0430 <- 3.31 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0433 <- 3.22 -> DC xxx O0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0436 <- 4.27 -> DG xxx P0037 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0437 <- 3.19 -> DC xxx O0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0441 <- 3.99 -> DG xxx O0047 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx L0454 <- 4.48 -> DA xxx O0045 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0455 <- 3.39 -> DA xxx O0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0458 <- 3.36 -> DC xxx P0038 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0573 <- 3.59 -> DG xxx P0056 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0574 <- 4.13 -> DT xxx P0055 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0583 <- 3.44 -> DT xxx O0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0584 <- 3.51 -> DG xxx P0056 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0585 <- 2.99 -> DT xxx O0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0586 <- 3.91 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0588 <- 3.64 -> DT xxx P0057 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0589 <- 3.02 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0265 <- 4.37 -> DT xxx P0067 : score x.xxxxx >6psw_IJLM:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE PROMOTER UNWINDING INTERMEDIATE (TRPO) WITH TRAR AND RPST P2 PROMOTER organism=ESCHERICHIA COLI : H : SER OG I0182 <- 3.18 -> DG O6 O0060 : score 3.78011 : H : SER OG I0508 <- 3.21 -> DA N6 P0033 : score 3.01998 : V : ARG CB L0586 <- 3.74 -> DT C7 O0026 : score 1.02021 : x : ASN xxxx I0139 <- 4.03 -> DA xxx P0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0151 <- 3.15 -> DC xxx O0062 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.21 -> DC xxx O0061 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 2.63 -> DG xxx O0060 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 4.44 -> DC xxx O0061 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0201 <- 3.35 -> DG xxx O0059 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0371 <- 2.72 -> DT xxx O0057 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0374 <- 3.71 -> DC xxx O0056 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0470 <- 2.45 -> DT xxx P0034 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0497 <- 4.23 -> DT xxx P0034 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0503 <- 3.12 -> DA xxx P0033 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0504 <- 3.56 -> DA xxx P0033 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0514 <- 3.38 -> DG xxx P0030 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 3.29 -> DC xxx O0062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.21 -> DC xxx O0062 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0567 <- 4.17 -> DG xxx P0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I1264 <- 4.38 -> DA xxx P0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0259 <- 3.11 -> DG xxx P0031 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0321 <- 3.60 -> DT xxx P0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 4.47 -> DC xxx P0026 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 3.77 -> DG xxx P0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 4.06 -> DG xxx P0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 2.77 -> DG xxx P0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.52 -> DG xxx P0024 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx L0098 <- 4.47 -> DC xxx O0056 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0102 <- 3.29 -> DC xxx O0056 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0105 <- 3.10 -> DC xxx O0055 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0110 <- 3.10 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0111 <- 4.45 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0383 <- 3.40 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0385 <- 3.29 -> DC xxx O0055 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0386 <- 3.71 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0396 <- 3.13 -> DA xxx P0035 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0419 <- 3.73 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0420 <- 3.25 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0423 <- 3.49 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0425 <- 3.19 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0428 <- 3.39 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0429 <- 3.01 -> DT xxx O0053 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0430 <- 3.48 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0432 <- 4.21 -> DT xxx O0053 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0433 <- 3.23 -> DC xxx O0049 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0437 <- 3.10 -> DC xxx O0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0465 <- 4.24 -> DT xxx P0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0468 <- 4.35 -> DT xxx P0036 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0505 <- 3.36 -> DG xxx P0031 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0515 <- 2.86 -> DG xxx P0028 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0517 <- 3.71 -> DA xxx P0029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0522 <- 4.37 -> DA xxx P0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0583 <- 3.31 -> DT xxx O0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0584 <- 3.57 -> DG xxx P0056 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0585 <- 2.65 -> DT xxx P0057 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0589 <- 4.39 -> DA xxx O0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0265 <- 4.46 -> DT xxx P0066 : score x.xxxxx >6psw_J:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE PROMOTER UNWINDING INTERMEDIATE (TRPO) WITH TRAR AND RPST P2 PROMOTER organism=? : x : ARG xxxx J0259 <- 3.11 -> DG xxx P0031 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0321 <- 3.60 -> DT xxx P0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 4.47 -> DC xxx P0026 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 3.77 -> DG xxx P0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 4.06 -> DG xxx P0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 2.77 -> DG xxx P0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.52 -> DG xxx P0024 : score x.xxxxx >6put_ACD:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF HIV CLEAVED SYNAPTIC COMPLEX (CSC) INTASOME BOUND WITH CALCIUM organism=? : H : SER OG A0153 <- 2.28 -> DC O2 E0019 : score 2.76142 : x : HIS xxxx A0051 <- 3.38 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.62 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.57 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0156 <- 3.46 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx >6puw_AC:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF HIV CLEAVED SYNAPTIC COMPLEX (CSC) INTASOME BOUND WITH MAGNESIUM AND BICTEGRAVIR (BIC) organism=? : x : HIS xxxx A0051 <- 3.37 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.74 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.89 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0153 <- 3.10 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0156 <- 3.24 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx >6puw_D:DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF HIV CLEAVED SYNAPTIC COMPLEX (CSC) INTASOME BOUND WITH MAGNESIUM AND BICTEGRAVIR (BIC) organism=? : H : GLU OE2 D0246 <- 2.78 -> DT N3 E0017 : score 2.64644 : x : LEU xxxx D0242 <- 3.84 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0243 <- 3.34 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0248 <- 3.50 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0250 <- 3.82 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx >6puy_A:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF HIV CLEAVED SYNAPTIC COMPLEX (CSC) INTASOME BOUND WITH MAGNESIUM AND INSTI XZ426 (COMPOUND 4D) organism=? : H : LYS NZ A0156 <- 2.80 -> DT O2 E0020 : score 3.58718 : x : HIS xxxx A0051 <- 3.36 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.68 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.83 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0153 <- 3.24 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx >6puy_ABC:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF HIV CLEAVED SYNAPTIC COMPLEX (CSC) INTASOME BOUND WITH MAGNESIUM AND INSTI XZ426 (COMPOUND 4D) organism=? : H : LYS NZ A0156 <- 2.80 -> DT O2 E0020 : score 3.58718 : x : HIS xxxx A0051 <- 3.36 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.68 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.83 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0153 <- 3.24 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0262 <- 3.52 -> DC xxx E0032 : score x.xxxxx >6puz_A:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF HIV CLEAVED SYNAPTIC COMPLEX (CSC) INTASOME BOUND WITH MAGNESIUM AND INSTI XZ446 (COMPOUND 4F) organism=? : x : HIS xxxx A0051 <- 3.32 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.72 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.99 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0153 <- 3.24 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0156 <- 3.33 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx >6puz_ABC:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF HIV CLEAVED SYNAPTIC COMPLEX (CSC) INTASOME BOUND WITH MAGNESIUM AND INSTI XZ446 (COMPOUND 4F) organism=? : x : HIS xxxx A0051 <- 3.32 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.72 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.99 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0153 <- 3.24 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0156 <- 3.33 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0263 <- 4.10 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx >6pw2_ABCD:Viral_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS FOR COOPERATIVE BINDING OF EBNA1 TO THE EPSTEIN-BARR VIRUS DYAD SYMMETRY MINIMAL ORIGIN OF REPLICATION organism=Epstein-Barr virus (strain B95-8) / Epstein-Barr virus (strain B95-8) / Epstein-Barr virus (strain B95-8) / Epstein-Barr virus (strain B95-8) / Epstein-Barr virus (strain B95-8) / Epstein-Barr virus (strain B95-8) / Epstein-Barr virus (strain B95-8) / Epstein-Barr virus (strain B95-8) : H : LYS NZ A0477 <- 2.57 -> DG N7 F0034 : score 5.63365 : H : LYS NZ A0477 <- 2.88 -> DG O6 F0034 : score 5.68828 : H : LYS NZ B0477 <- 2.95 -> DG N7 E0013 : score 5.22432 : H : LYS NZ C0477 <- 2.75 -> DG N7 E0034 : score 5.43976 : H : LYS NZ C0477 <- 2.93 -> DG O6 E0034 : score 5.63047 : V : THR CG2 B0515 <- 3.64 -> DT C7 E0015 : score 4.4064 : x : LYS xxxx A0461 <- 3.83 -> DT xxx E0026 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0464 <- 3.33 -> DG xxx E0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0465 <- 3.73 -> DT xxx E0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0469 <- 4.05 -> DA xxx F0042 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0514 <- 3.90 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0515 <- 3.49 -> DG xxx F0035 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0518 <- 3.60 -> DT xxx E0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0519 <- 3.74 -> DG xxx F0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0522 <- 4.47 -> DT xxx E0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0461 <- 3.01 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0464 <- 3.38 -> DG xxx F0044 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0465 <- 3.10 -> DT xxx F0046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0469 <- 3.75 -> DT xxx F0043 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0514 <- 3.89 -> DT xxx F0043 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0518 <- 3.38 -> DC xxx F0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0519 <- 3.99 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0464 <- 3.73 -> DG xxx F0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0465 <- 3.73 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0469 <- 4.03 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0514 <- 3.69 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0515 <- 3.46 -> DT xxx E0036 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0518 <- 3.39 -> DT xxx F0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0519 <- 3.63 -> DG xxx E0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0522 <- 4.38 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0461 <- 3.29 -> DT xxx E0048 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0464 <- 3.47 -> DC xxx F0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0465 <- 3.01 -> DT xxx E0046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0469 <- 3.63 -> DT xxx E0043 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0477 <- 3.76 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0514 <- 3.98 -> DT xxx E0043 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0515 <- 3.58 -> DT xxx F0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0518 <- 3.48 -> DC xxx E0045 : score x.xxxxx >6pw2_C:Viral_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS FOR COOPERATIVE BINDING OF EBNA1 TO THE EPSTEIN-BARR VIRUS DYAD SYMMETRY MINIMAL ORIGIN OF REPLICATION organism=Epstein-Barr virus (strain B95-8) / Epstein-Barr virus (strain B95-8) : H : LYS NZ C0477 <- 2.75 -> DG N7 E0034 : score 5.43976 : H : LYS NZ C0477 <- 2.93 -> DG O6 E0034 : score 5.63047 : x : TRP xxxx C0464 <- 3.73 -> DG xxx F0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0465 <- 3.73 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0469 <- 4.03 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0514 <- 3.69 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0515 <- 3.46 -> DT xxx E0036 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0518 <- 3.39 -> DT xxx F0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0519 <- 3.63 -> DG xxx E0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0522 <- 4.38 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx >6pw2_IKL:Viral_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS FOR COOPERATIVE BINDING OF EBNA1 TO THE EPSTEIN-BARR VIRUS DYAD SYMMETRY MINIMAL ORIGIN OF REPLICATION organism=Epstein-Barr virus (strain B95-8) / Epstein-Barr virus (strain B95-8) / Epstein-Barr virus (strain B95-8) / Epstein-Barr virus (strain B95-8) / Epstein-Barr virus (strain B95-8) / Epstein-Barr virus (strain B95-8) : H : LYS NZ I0461 <- 2.26 -> DT O2 G0026 : score 3.97459 : H : LYS NZ I0477 <- 3.12 -> DG N7 H0034 : score 5.0412 : H : LYS NZ I0477 <- 2.53 -> DG O6 H0034 : score 6.09293 : H : LYS NZ K0461 <- 2.66 -> DT O2 G0036 : score 3.68762 : H : LYS NZ K0477 <- 2.95 -> DG N7 G0034 : score 5.22432 : H : LYS NZ K0477 <- 2.88 -> DG O6 G0034 : score 5.68828 : H : LYS NZ L0461 <- 3.17 -> DT O2 H0015 : score 3.32173 : H : ARG NH2 L0469 <- 3.08 -> DT O2 H0020 : score 3.99627 : V : THR CG2 L0515 <- 3.73 -> DT C7 H0015 : score 4.31107 : V : ASN CG I0475 <- 3.73 -> DT C7 G0026 : score 2.69455 : x : TRP xxxx I0464 <- 3.40 -> DC xxx H0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0465 <- 2.98 -> DC xxx G0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0469 <- 3.72 -> DT xxx G0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0514 <- 3.84 -> DT xxx G0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0515 <- 3.57 -> DG xxx H0035 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx I0518 <- 3.78 -> DC xxx G0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0519 <- 3.75 -> DG xxx H0034 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx K0464 <- 3.38 -> DC xxx G0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx K0465 <- 3.70 -> DT xxx H0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx K0514 <- 3.58 -> DT xxx H0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx K0515 <- 3.42 -> DT xxx G0036 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx K0518 <- 3.32 -> DT xxx H0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx K0519 <- 3.90 -> DG xxx G0034 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0464 <- 3.56 -> DG xxx G0044 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0465 <- 3.39 -> DT xxx G0046 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0477 <- 3.13 -> DA xxx H0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0514 <- 3.84 -> DT xxx G0043 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0518 <- 3.60 -> DC xxx G0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0519 <- 3.96 -> DA xxx H0013 : score x.xxxxx >6pwe_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : ARG xxxx A0040 <- 3.04 -> DG xxx I-008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0043 <- 4.27 -> DC xxx J0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0041 <- 4.46 -> DC xxx J0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.62 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 2.98 -> DG xxx I0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0016 <- 4.49 -> DT xxx J-042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0041 <- 4.29 -> DC xxx I0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.04 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >6pwe_G:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=? : x : ARG xxxx G0016 <- 4.49 -> DT xxx J-042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0041 <- 4.29 -> DC xxx I0037 : score x.xxxxx >6pwe_H:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=? : x : ARG xxxx H0030 <- 3.04 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >6pwf_C:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE ATPASE DOMAIN OF CHROMATIN REMODELING FACTOR ISWI BOUND TO THE NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx C0041 <- 4.38 -> DT xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0076 <- 4.35 -> DG xxx I-056 : score x.xxxxx >6pwv_G:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MLL1 CORE COMPLEX BOUND TO THE NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 G0040 <- 2.96 -> DG N3 O0083 : score 2.95488 : x : TYR xxxx G0041 <- 4.43 -> DG xxx O0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.41 -> DC xxx P0144 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0065 <- 4.13 -> DC xxx O0092 : score x.xxxxx >6pww_K:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MLL1 IN COMPLEX WITH RBBP5 AND WDR5 BOUND TO THE NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 K0040 <- 3.04 -> DT O2 P0083 : score 4.0997 : x : ARG xxxx K0042 <- 4.43 -> DG xxx O0145 : score x.xxxxx >6pwx_M:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RBBP5 BOUND TO THE NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx M0042 <- 3.94 -> DC xxx P0111 : score x.xxxxx >6px1_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=SET2 BOUND TO NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.64 -> DG N3 I0083 : score 3.72578 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.77 -> DT O2 J0083 : score 4.25873 : x : ARG xxxx A0083 <- 3.55 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.45 -> DG xxx J0068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.40 -> DT xxx I0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0027 <- 4.22 -> DA xxx I0124 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.89 -> DG xxx I0122 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.40 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0027 <- 3.73 -> DG xxx I0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.12 -> DT xxx I0027 : score x.xxxxx >6px1_C:Histone-fold; title=SET2 BOUND TO NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx C0042 <- 3.40 -> DT xxx I0112 : score x.xxxxx >6px3_G:Histone-fold; title=SET2 BOUND TO NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx G0042 <- 3.81 -> DG xxx I0037 : score x.xxxxx >6py8_C:p53-like_transcription_factors;DNA-binding_protein_LAG-1_CSL;E_set_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE RBPJ-NOTCH1-NRARP TERNARY COMPLEX BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ C0152 <- 2.45 -> DG O6 X0011 : score 6.18542 : H : LYS NZ C0152 <- 2.43 -> DT O4 Y0107 : score 3.85263 : H : SER OG C0181 <- 2.64 -> DT O2 X0008 : score 3.81575 : H : GLN NE2 C0182 <- 3.18 -> DA N3 Y0113 : score 3.72088 : x : TYR xxxx C0046 <- 3.30 -> DT xxx Y0107 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0049 <- 4.07 -> DC xxx Y0109 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0051 <- 3.53 -> DG xxx X0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0151 <- 3.73 -> DT xxx Y0106 : score x.xxxxx >6pz3_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=POLYMERASE ETA-CATALYZED INSERTION OF CORRECT G OPPOSITE TEMPLATE CYTARABINE (ARAC) RESIDUE organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0382 <- 3.37 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >6q02_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=POLYMERASE ETA-CATALYZED INSERTION OF THE MISMATCHED A OPPOSITE TEMPLATE CYTARABINE (ARAC) RESIDUE organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0382 <- 3.58 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >6q0c_A:DNA-glycosylase;Nudix; title=MUTY ADENINE GLYCOSYLASE BOUND TO DNA CONTAINING A TRANSITION STATE ANALOG (1N) PAIRED WITH UNDAMAGED DG organism=Geobacillus stearothermophilus : w : GLN OE1 A0047 <- 5.62 -> DG N3 C0019 : score 1.484 : w : GLN OE1 A0048 <- 5.27 -> DA N7 C0017 : score 1.196 : H : THR OG1 A0049 <- 2.85 -> DG N2 B0006 : score 3.97777 : w : ARG NH1 A0050 <- 5.31 -> DC O2 C0016 : score 1.381 : x : TYR xxxx A0088 <- 3.23 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0091 <- 3.80 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0308 <- 3.07 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0309 <- 3.63 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >6q1v_A:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=HUMAN DNA LIGASE 1 (E592R) BOUND TO AN ADENYLATED, HYDROXYL TERMINATED DNA NICK organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0643 <- 5.12 -> DC O2 B0010 : score 1.381 : w : ARG NH1 A0643 <- 5.89 -> DG N3 B0011 : score 1.593 : H : LYS NZ A0770 <- 3.14 -> DG N3 D0013 : score 1.35498 : w : LYS NZ A0770 <- 6.05 -> DG N2 C0004 : score 0.846 : w : LYS NZ A0770 <- 5.64 -> DC O2 D0012 : score 1.3 : w : ARG NH2 A0771 <- 5.88 -> DA N3 D0014 : score 2.092 : H : THR OG1 A0798 <- 2.96 -> DT O2 C0002 : score 2.62725 : w : ARG NH2 A0871 <- 5.87 -> DC O2 B0013 : score 1.669 : x : HIS xxxx A0546 <- 4.10 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0635 <- 3.97 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0872 <- 3.29 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx >6q2b_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PUTATIVE MARR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR FROM LISTERIA MONOCYTOGENES COMPLEXED WITH 26MER DNA organism=Listeria monocytogenes : H : ARG NH2 A0063 <- 2.92 -> DG O6 D0016 : score 6.4416 : H : LYS NZ A0084 <- 2.72 -> DT O2 C0005 : score 3.64457 : H : ARG NH2 B0063 <- 2.55 -> DG N7 D0010 : score 6.70385 : H : LYS NZ B0084 <- 2.79 -> DT O2 C0023 : score 3.59435 : H : LYS NZ B0084 <- 2.32 -> DT O2 D0005 : score 3.93155 : x : GLU xxxx A0048 <- 4.18 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0058 <- 3.39 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0059 <- 3.22 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0060 <- 3.86 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0048 <- 4.00 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0058 <- 3.42 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0059 <- 3.22 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0060 <- 3.37 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0062 <- 3.89 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx >6q2b_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PUTATIVE MARR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR FROM LISTERIA MONOCYTOGENES COMPLEXED WITH 26MER DNA organism=Listeria monocytogenes : H : ARG NH2 B0063 <- 2.55 -> DG N7 D0010 : score 6.70385 : H : LYS NZ B0084 <- 2.79 -> DT O2 C0023 : score 3.59435 : H : LYS NZ B0084 <- 2.32 -> DT O2 D0005 : score 3.93155 : x : GLU xxxx B0048 <- 4.00 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0058 <- 3.42 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0059 <- 3.22 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0060 <- 3.37 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0062 <- 3.89 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx >6q4t_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=KOD DNA POL IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH 7-DEAZA-7-(2-(2- HYDROXYETHOXY)-N-(PROP-2-YN-1-YL)ACETAMIDE)-2-DATP organism=? : w : TYR OH A0409 <- 6.13 -> DG N2 T0005 : score 2.834 : w : TYR OH A0494 <- 5.32 -> DG N3 T0005 : score 3.344 : H : LYS NZ A0592 <- 3.00 -> DA N3 P0011 : score 2.66585 : H : ARG NH1 A0612 <- 3.10 -> DC O2 P0009 : score 3.431 >6q4u_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=KLENTAQ DNA POL IN A CLOSED TERNARY COMPLEX WITH 7-DEAZA-7-(2-(2- HYDROXYETHOXY)-N-(PROP-2-YN-1-YL)ACETAMIDE)-2-DATP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 3.01 -> DC O2 B0109 : score 2.82242 : w : LYS NZ A0540 <- 5.35 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 6.72 -> DC O2 C0210 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 5.66 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.61 -> DT O2 C0206 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0580 <- 6.09 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.75 -> DG N3 C0207 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 2.88 -> DC O2 B0110 : score 4.40782 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.55 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : GLU OE1 A0615 <- 6.21 -> DG N3 C0205 : score 2.669 : w : ASN ND2 A0750 <- 6.58 -> DG N3 C0205 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0754 <- 6.54 -> DG N3 C0205 : score 1.484 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.70 -> DA N3 B0111 : score 2.619 : x : TYR xxxx A0545 <- 4.45 -> DC xxx B0110 : score x.xxxxx >6q4v_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=KLENTAQ DNA POLYMERASE IN COMPLEX WITH DATP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.99 -> DC O2 B0109 : score 2.8342 : w : LYS NZ A0540 <- 5.46 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : LYS NZ A0540 <- 6.53 -> DG N3 B0108 : score 2.232 : w : THR OG1 A0544 <- 5.58 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.75 -> DT O2 C0206 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.74 -> DG N3 C0207 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 3.08 -> DC O2 B0110 : score 4.22864 : w : ASN ND2 A0583 <- 5.56 -> DG N3 C0208 : score 2.566 : w : HIS NE2 A0784 <- 5.76 -> DA N3 B0111 : score 2.619 >6q6r_F: title=RECOGNITION OF DIFFERENT BASE TETRADS BY RHAU: X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF G4 RECOGNITION MOTIF BOUND TO THE 3-END TETRAD OF A DNA G-QUADRUPLEX organism=HOMO SAPIENS : w : ARG NH2 F0008 <- 5.87 -> DG N3 B0003 : score 0.677 : x : HIS xxxx F0001 <- 3.84 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0010 <- 3.72 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0012 <- 3.60 -> DG xxx B0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0014 <- 3.34 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0015 <- 3.81 -> DG xxx B0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0017 <- 3.39 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx >6qec_A:Homeodomain-like; title=DNA BINDING DOMAIN OF LUX ARRYTHMO IN COMPLEX WITH DNA organism=Arabidopsis thaliana : w : ARG NH1 A0146 <- 5.18 -> DA N3 B0038 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0146 <- 5.77 -> DT O2 B0039 : score 2.261 : w : ARG NH2 A0146 <- 5.83 -> DA N3 B0038 : score 2.092 : w : ARG NH1 A0185 <- 5.63 -> DG N7 U0022 : score 2.063 : w : GLU OE2 A0186 <- 6.19 -> DG N7 U0022 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0186 <- 5.40 -> DT O4 B0042 : score 2.279 : H : SER OG A0190 <- 2.80 -> DA N7 B0040 : score 4.4641 : H : GLN OE1 A0193 <- 2.90 -> DA N6 U0024 : score 5.93151 : H : GLN NE2 A0193 <- 3.06 -> DA N7 U0024 : score 5.77308 : w : GLN OE1 A0193 <- 6.19 -> DA N6 U0023 : score 3.392 : x : LYS xxxx A0194 <- 3.45 -> DT xxx B0039 : score x.xxxxx >6qem_L:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=E. COLI DNABC COMPLEX BOUND TO SSDNA organism=ESCHERICHIA COLI : x : LYS xxxx L0143 <- 3.37 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0146 <- 3.12 -> DT xxx M0025 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0179 <- 4.43 -> DT xxx M0025 : score x.xxxxx >6qfd_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE COMPLEX STRUCTURE OF HSROSR-S4 (VNG0258/ROSR-S4) organism=Halobacterium salinarum NRC-1 : H : HIS NE2 A0050 <- 2.85 -> DG O6 F0008 : score 7.87431 : H : ARG NH2 A0074 <- 3.27 -> DT O2 E0025 : score 3.8354 : H : HIS NE2 B0050 <- 2.80 -> DG O6 E0008 : score 7.95385 : H : ARG NH1 B0074 <- 3.03 -> DC O2 E0005 : score 3.4821 : H : ARG NH1 B0074 <- 2.91 -> DT O2 F0025 : score 4.21167 : x : LEU xxxx A0034 <- 3.82 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0049 <- 3.27 -> DT xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0052 <- 3.69 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0054 <- 3.37 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0055 <- 3.82 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0034 <- 3.92 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0049 <- 4.28 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0052 <- 3.71 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0054 <- 3.34 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0055 <- 3.95 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx >6qfd_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE COMPLEX STRUCTURE OF HSROSR-S4 (VNG0258/ROSR-S4) organism=Halobacterium salinarum NRC-1 : H : HIS NE2 B0050 <- 2.80 -> DG O6 E0008 : score 7.95385 : H : ARG NH1 B0074 <- 2.91 -> DT O2 F0025 : score 4.21167 : H : ARG NH1 B0074 <- 3.03 -> DC O2 E0005 : score 3.4821 : x : LEU xxxx B0034 <- 3.92 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0049 <- 4.28 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0052 <- 3.71 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0054 <- 3.34 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0055 <- 3.95 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx >6qh0_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE COMPLEX STRUCTURE OF HSROSR-S5 (VNG0258H/ROSR-S5) organism=Halobacterium salinarum NRC-1 : H : HIS NE2 A0050 <- 2.91 -> DG O6 H0008 : score 7.77886 : H : ARG NH1 A0074 <- 3.21 -> DT O2 G0025 : score 3.95328 : H : ARG NH1 A0074 <- 3.11 -> DC O2 G0026 : score 3.4237 : w : ARG NH1 A0074 <- 5.86 -> DA N3 H0004 : score 2.585 : x : LEU xxxx A0034 <- 3.67 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0049 <- 4.02 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0052 <- 3.65 -> DT xxx G0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0054 <- 3.57 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0055 <- 4.10 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx >6qh0_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE COMPLEX STRUCTURE OF HSROSR-S5 (VNG0258H/ROSR-S5) organism=Halobacterium salinarum NRC-1 : H : HIS NE2 A0050 <- 2.91 -> DG O6 H0008 : score 7.77886 : H : ARG NH1 A0074 <- 3.21 -> DT O2 G0025 : score 3.95328 : H : ARG NH1 A0074 <- 3.11 -> DC O2 G0026 : score 3.4237 : H : HIS NE2 B0050 <- 2.62 -> DG O6 G0008 : score 8.24018 : x : LEU xxxx A0034 <- 3.67 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0049 <- 4.02 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0052 <- 3.65 -> DT xxx G0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0054 <- 3.57 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0055 <- 4.10 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0034 <- 4.12 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0049 <- 3.42 -> DT xxx H0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0052 <- 3.70 -> DT xxx H0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0054 <- 3.60 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0055 <- 4.00 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0074 <- 3.44 -> DC xxx G0005 : score x.xxxxx >6qh0_CD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE COMPLEX STRUCTURE OF HSROSR-S5 (VNG0258H/ROSR-S5) organism=Halobacterium salinarum NRC-1 : H : HIS NE2 C0050 <- 2.59 -> DG O6 E0008 : score 8.28791 : H : ARG NH1 C0074 <- 3.20 -> DC O2 E0005 : score 3.358 : H : HIS NE2 D0050 <- 2.69 -> DG O6 F0008 : score 8.12883 : V : ASN CG C0049 <- 3.62 -> DT C7 F0019 : score 2.76737 : x : LEU xxxx C0034 <- 3.68 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0052 <- 3.92 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0054 <- 3.41 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0055 <- 3.73 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0034 <- 3.63 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0049 <- 3.74 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0052 <- 3.68 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0054 <- 3.62 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0055 <- 3.75 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0074 <- 3.34 -> DA xxx F0005 : score x.xxxxx >6qhd_A:p53-like_transcription_factors;STAT;SH2_domain; title=LYSINE ACETYLATED AND TYROSINE PHOSPHORYLATED STAT3 IN A COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0340 <- 6.34 -> DG O6 C1011 : score 3.005 : w : LYS NZ A0340 <- 6.42 -> DG O6 C1011 : score 3.005 : H : ASN ND2 A0466 <- 2.47 -> DT O4 D1007 : score 5.6334 : H : ASN ND2 A0466 <- 2.41 -> DG O6 C1012 : score 6.07826 : x : SER xxxx A0465 <- 3.45 -> DT xxx D1006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0467 <- 3.98 -> DG xxx C1011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0469 <- 3.74 -> DT xxx D1006 : score x.xxxxx >6qhd_AB:p53-like_transcription_factors;STAT;SH2_domain; title=LYSINE ACETYLATED AND TYROSINE PHOSPHORYLATED STAT3 IN A COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0340 <- 6.34 -> DG O6 C1011 : score 3.005 : w : LYS NZ A0340 <- 6.42 -> DG O6 C1011 : score 3.005 : H : ASN ND2 A0466 <- 2.47 -> DT O4 D1007 : score 5.6334 : H : ASN ND2 A0466 <- 2.41 -> DG O6 C1012 : score 6.07826 : w : LYS NZ B0340 <- 5.71 -> DG N7 D1011 : score 2.519 : w : LYS NZ B0340 <- 6.20 -> DC N4 D1010 : score 0.048 : H : ASN ND2 B0466 <- 2.61 -> DT O4 D1012 : score 5.48543 : H : ASN ND2 B0466 <- 2.44 -> DT O4 C1007 : score 5.66511 : x : SER xxxx A0465 <- 3.45 -> DT xxx D1006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0467 <- 3.98 -> DG xxx C1011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0469 <- 3.74 -> DT xxx D1006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0465 <- 3.44 -> DT xxx C1006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0467 <- 3.98 -> DG xxx D1011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0468 <- 4.11 -> DT xxx D1012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0469 <- 3.95 -> DT xxx C1006 : score x.xxxxx >6qib_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF POL2CORE IN COMPLEX WITH DNA AND AN INCOMING NUCLEOTIDE, CARRYING AN FE-S CLUSTER organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0967 <- 2.52 -> DT O2 P0010 : score 3.78806 : H : ARG NH2 A0988 <- 3.04 -> DC O2 P0007 : score 3.52118 : x : GLN xxxx A0434 <- 3.91 -> DT xxx P0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1050 <- 4.46 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >6qil_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE COMPLEX STRUCTURE OF HSROSR-S1 (VNG0258H/ROSR-S1) organism=Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) / Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) : H : HIS NE2 A0050 <- 2.53 -> DG O6 E0008 : score 8.38335 : H : ARG NH2 A0074 <- 3.14 -> DT O2 F0025 : score 3.94547 : x : LEU xxxx A0034 <- 3.94 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0049 <- 3.15 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0052 <- 3.73 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0054 <- 3.59 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0055 <- 3.65 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx >6qil_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE COMPLEX STRUCTURE OF HSROSR-S1 (VNG0258H/ROSR-S1) organism=Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) / Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) / Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) / Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) : H : HIS NE2 A0050 <- 2.53 -> DG O6 E0008 : score 8.38335 : H : ARG NH2 A0074 <- 3.14 -> DT O2 F0025 : score 3.94547 : H : HIS NE2 B0050 <- 2.65 -> DG O6 F0008 : score 8.19246 : H : ARG NH1 B0074 <- 2.94 -> DT O2 E0025 : score 4.18583 : x : LEU xxxx A0034 <- 3.94 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0049 <- 3.15 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0052 <- 3.73 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0054 <- 3.59 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0055 <- 3.65 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0034 <- 4.19 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0049 <- 4.42 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0052 <- 3.88 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0054 <- 3.28 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0055 <- 3.93 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx >6qil_CD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE COMPLEX STRUCTURE OF HSROSR-S1 (VNG0258H/ROSR-S1) organism=Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) / Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) / Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) / Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) : H : HIS NE2 C0050 <- 2.57 -> DG O6 H0008 : score 8.31972 : H : ARG NH2 C0074 <- 3.12 -> DC O2 H0005 : score 3.462 : H : HIS NE2 D0050 <- 2.54 -> DG O6 G0008 : score 8.36745 : H : ARG NH1 D0074 <- 3.08 -> DT O2 H0025 : score 4.06525 : V : PRO CG C0055 <- 3.86 -> DT C7 H0009 : score 6.26359 : x : LEU xxxx C0034 <- 3.87 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0049 <- 4.29 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0052 <- 3.84 -> DT xxx G0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0054 <- 3.49 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0034 <- 4.02 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0049 <- 3.27 -> DT xxx H0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0052 <- 3.72 -> DT xxx H0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0054 <- 3.57 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0055 <- 3.66 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx >6qld_abdefghi:Histone-fold; title=STRUCTURE OF INNER KINETOCHORE CCAN-CENP-A COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 a0177 <- 3.10 -> DA N3 G0049 : score 3.04536 : H : ARG NH2 e0177 <- 3.27 -> DG N3 G0100 : score 3.27089 : x : ARG xxxx b0046 <- 4.44 -> DC xxx J-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx d0037 <- 3.02 -> DG xxx J-026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx f0046 <- 3.91 -> DC xxx G0080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx g0044 <- 3.03 -> DC xxx G0111 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx i0044 <- 3.63 -> DG xxx J-036 : score x.xxxxx >6qld_f:Histone-fold; title=STRUCTURE OF INNER KINETOCHORE CCAN-CENP-A COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx f0046 <- 3.91 -> DC xxx G0080 : score x.xxxxx >6qtk_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.31A STRUCTURE OF GEPOTIDACIN WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DOUBLY NICKED DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : w : TYR OH A0025 <- 5.54 -> DA N3 F2015 : score 1.448 : w : TYR OH A0025 <- 5.97 -> DA N3 E0007 : score 1.448 : w : SER OG A0085 <- 6.54 -> DA N7 E0007 : score 2.343 : w : ARG NH1 B0458 <- 5.81 -> DT O2 E2010 : score 1.855 : w : LYS NZ B0460 <- 5.51 -> DA N3 E0007 : score 1.538 : w : TYR OH C0025 <- 6.13 -> DA N3 F0007 : score 1.448 : w : TYR OH C0025 <- 5.42 -> DA N3 E2015 : score 1.448 : w : SER OG C0084 <- 5.52 -> DG O6 F2009 : score 2.749 : w : SER OG C0084 <- 6.39 -> DG N7 F2009 : score 2.749 : w : SER OG C0085 <- 5.96 -> DA N7 F0007 : score 2.343 : w : LYS NZ D0460 <- 5.66 -> DA N3 F0007 : score 1.538 : x : ARG xxxx A0033 <- 4.49 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0175 <- 3.38 -> DC xxx F2016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0458 <- 3.78 -> DT xxx F2010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0175 <- 3.30 -> DC xxx E2016 : score x.xxxxx >6qtk_D:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.31A STRUCTURE OF GEPOTIDACIN WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DOUBLY NICKED DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) / STAPHYLOCOCCUS AUREUS (STRAIN N315) : w : LYS NZ D0460 <- 5.66 -> DA N3 F0007 : score 1.538 : x : ARG xxxx D0458 <- 3.78 -> DT xxx F2010 : score x.xxxxx >6qtp_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.37A STRUCTURE OF GEPOTIDACIN WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND UNCLEAVED DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : w : SER OG A0084 <- 5.89 -> DC N4 E0008 : score 2.105 : w : SER OG A0084 <- 6.53 -> DA N7 E0009 : score 2.343 : w : TYR OH C0025 <- 6.10 -> DA N3 E0015 : score 1.448 : w : TYR OH C0025 <- 5.84 -> DA N3 E0015 : score 1.448 : w : LYS NZ D0460 <- 5.78 -> DA N3 E0015 : score 1.538 : x : ARG xxxx B0458 <- 3.66 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0460 <- 3.56 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0085 <- 3.41 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0175 <- 3.23 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0085 <- 3.42 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0088 <- 4.14 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0175 <- 3.14 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx >6qtp_D:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.37A STRUCTURE OF GEPOTIDACIN WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND UNCLEAVED DNA organism=? : w : LYS NZ D0460 <- 5.67 -> DA N3 F0007 : score 1.538 >6qua_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE COMPLEX STRUCTURE OF HSROSR-SG (VNG0258/ROSR-SG) organism=Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) / Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) / Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) / Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) : H : HIS NE2 A0050 <- 2.86 -> DG O6 F0008 : score 7.8584 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.86 -> DC O2 F0005 : score 3.65433 : H : HIS NE2 B0050 <- 3.24 -> DG O6 E0008 : score 7.25391 : V : ASN CG A0049 <- 3.88 -> DT C7 E0019 : score 2.59524 : x : LEU xxxx A0034 <- 3.64 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0054 <- 3.53 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0055 <- 3.99 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0034 <- 4.01 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0052 <- 4.26 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0054 <- 3.37 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0055 <- 3.97 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0074 <- 3.28 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx >6qua_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE COMPLEX STRUCTURE OF HSROSR-SG (VNG0258/ROSR-SG) organism=Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) / Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) : H : HIS NE2 C0050 <- 2.60 -> DG O6 G0008 : score 8.272 : H : ARG NH2 C0074 <- 3.37 -> DA N3 H0025 : score 2.87041 : x : LEU xxxx C0034 <- 4.05 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0049 <- 4.42 -> DG xxx H0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0052 <- 4.21 -> DT xxx H0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0054 <- 3.60 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0055 <- 3.78 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx >6qua_CD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE COMPLEX STRUCTURE OF HSROSR-SG (VNG0258/ROSR-SG) organism=Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) / Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) / Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) / Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) : H : HIS NE2 C0050 <- 2.60 -> DG O6 G0008 : score 8.272 : H : ARG NH2 C0074 <- 3.37 -> DA N3 H0025 : score 2.87041 : H : HIS NE2 D0050 <- 3.21 -> DG O6 H0008 : score 7.30163 : H : ARG NH2 D0074 <- 3.13 -> DT O2 G0025 : score 3.95393 : x : LEU xxxx C0034 <- 4.05 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0049 <- 4.42 -> DG xxx H0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0052 <- 4.21 -> DT xxx H0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0054 <- 3.60 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0055 <- 3.78 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0034 <- 3.71 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0049 <- 3.10 -> DT xxx G0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0054 <- 3.74 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0055 <- 4.04 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx >6qwf_AB:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PRFA-A94V MUTANT FROM LISTERIA MONOCYTOGENES IN COMPLEX WITH A 30-BP OPERATOR PRFA-BOX MOTIF organism=Listeria monocytogenes : H : SER OG A0184 <- 2.63 -> DT O4 D0020 : score 3.676 : H : SER OG B0184 <- 2.60 -> DT O4 C0020 : score 3.69733 : H : ARG NH1 B0188 <- 2.75 -> DG O6 C0018 : score 6.14417 : H : ARG NH2 B0188 <- 2.80 -> DG N7 C0018 : score 6.38462 : V : ALA CB A0185 <- 3.90 -> DT C7 D0019 : score 5.459 : x : HIS xxxx A0182 <- 4.02 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0187 <- 3.75 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0188 <- 3.15 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0182 <- 3.94 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0185 <- 4.10 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0187 <- 3.60 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >6qwf_B:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PRFA-A94V MUTANT FROM LISTERIA MONOCYTOGENES IN COMPLEX WITH A 30-BP OPERATOR PRFA-BOX MOTIF organism=Listeria monocytogenes : H : SER OG B0184 <- 2.60 -> DT O4 C0020 : score 3.69733 : H : ARG NH1 B0188 <- 2.75 -> DG O6 C0018 : score 6.14417 : H : ARG NH2 B0188 <- 2.80 -> DG N7 C0018 : score 6.38462 : x : HIS xxxx B0182 <- 3.94 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0185 <- 4.10 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0187 <- 3.60 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >6qwh_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PRFA-L140H MUTANT FROM LISTERIA MONOCYTOGENES IN COMPLEX WITH A 30-BP OPERATOR PRFA-BOX MOTIF organism=Listeria monocytogenes : H : SER OG A0184 <- 2.54 -> DT O4 D0020 : score 3.74 : H : ARG NH2 A0188 <- 3.28 -> DG N7 D0018 : score 5.77169 : V : ALA CB A0185 <- 3.86 -> DT C7 D0019 : score 5.51499 : V : SER CB A0187 <- 3.78 -> DT C7 C0009 : score 3.14694 : x : HIS xxxx A0182 <- 3.75 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx >6qwh_AB:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PRFA-L140H MUTANT FROM LISTERIA MONOCYTOGENES IN COMPLEX WITH A 30-BP OPERATOR PRFA-BOX MOTIF organism=Listeria monocytogenes : H : SER OG A0184 <- 2.54 -> DT O4 D0020 : score 3.74 : H : ARG NH2 A0188 <- 3.28 -> DG N7 D0018 : score 5.77169 : H : SER OG B0184 <- 2.57 -> DT O4 C0020 : score 3.71866 : H : ARG NH1 B0188 <- 2.86 -> DG O6 C0018 : score 6.01033 : H : ARG NH2 B0188 <- 2.98 -> DG N7 C0018 : score 6.15477 : V : ALA CB A0185 <- 3.86 -> DT C7 D0019 : score 5.51499 : x : HIS xxxx A0182 <- 3.75 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0187 <- 3.78 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0182 <- 3.54 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0185 <- 3.90 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0187 <- 4.07 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx >6qwk_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PRFA-L140F MUTANT FROM LISTERIA MONOCYTOGENES IN COMPLEX WITH A 30-BP OPERATOR PRFA-BOX MOTIF organism=Listeria monocytogenes : H : SER OG A0184 <- 2.54 -> DT O4 D0020 : score 3.74 : H : ARG NH2 A0188 <- 3.33 -> DG N7 D0018 : score 5.70785 : V : ALA CB A0185 <- 3.69 -> DT C7 D0019 : score 5.75295 : x : HIS xxxx A0182 <- 3.60 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0187 <- 3.91 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >6qwk_AB:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PRFA-L140F MUTANT FROM LISTERIA MONOCYTOGENES IN COMPLEX WITH A 30-BP OPERATOR PRFA-BOX MOTIF organism=Listeria monocytogenes : H : SER OG A0184 <- 2.54 -> DT O4 D0020 : score 3.74 : H : ARG NH2 A0188 <- 3.33 -> DG N7 D0018 : score 5.70785 : H : SER OG B0184 <- 2.55 -> DT O4 C0020 : score 3.73288 : H : ARG NH1 B0188 <- 2.99 -> DG O6 C0018 : score 5.85217 : H : ARG NH2 B0188 <- 2.98 -> DG N7 C0018 : score 6.15477 : V : ALA CB A0185 <- 3.69 -> DT C7 D0019 : score 5.75295 : x : HIS xxxx A0182 <- 3.60 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0187 <- 3.91 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0182 <- 3.73 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0185 <- 4.01 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0187 <- 3.80 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >6qwm_AB:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PRFA-A218G MUTANT FROM LISTERIA MONOCYTOGENES IN COMPLEX WITH A 30-BP OPERATOR PRFA-BOX MOTIF organism=Listeria monocytogenes : H : SER OG A0184 <- 2.69 -> DT O4 D0020 : score 3.63334 : H : SER OG B0184 <- 2.69 -> DT O4 C0020 : score 3.63334 : H : ARG NH1 B0188 <- 2.79 -> DG O6 C0018 : score 6.0955 : H : ARG NH2 B0188 <- 2.86 -> DG N7 C0018 : score 6.308 : V : ALA CB A0185 <- 3.89 -> DT C7 D0019 : score 5.473 : x : HIS xxxx A0182 <- 4.05 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0187 <- 3.59 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0188 <- 3.41 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0182 <- 3.96 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0185 <- 3.91 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0187 <- 3.94 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >6qwm_B:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PRFA-A218G MUTANT FROM LISTERIA MONOCYTOGENES IN COMPLEX WITH A 30-BP OPERATOR PRFA-BOX MOTIF organism=Listeria monocytogenes : H : SER OG B0184 <- 2.69 -> DT O4 C0020 : score 3.63334 : H : ARG NH1 B0188 <- 2.79 -> DG O6 C0018 : score 6.0955 : H : ARG NH2 B0188 <- 2.86 -> DG N7 C0018 : score 6.308 : x : HIS xxxx B0182 <- 3.96 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0185 <- 3.91 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0187 <- 3.94 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >6qx1_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.7A STRUCTURE OF BENZOISOXAZOLE 3 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA. organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : w : TYR OH A0025 <- 6.37 -> DA N3 E0007 : score 1.448 : w : TYR OH A0025 <- 5.59 -> DA N3 F2015 : score 1.448 : x : ARG xxxx A0033 <- 4.36 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0085 <- 3.45 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0088 <- 4.30 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0175 <- 2.97 -> DC xxx F2016 : score x.xxxxx >6qx1_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=2.7A STRUCTURE OF BENZOISOXAZOLE 3 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA. organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : w : TYR OH A0025 <- 6.37 -> DA N3 E0007 : score 1.448 : w : TYR OH A0025 <- 5.59 -> DA N3 F2015 : score 1.448 : w : LYS NZ B0460 <- 5.62 -> DA N3 E0007 : score 1.538 : w : TYR OH C0025 <- 6.15 -> DA N3 F0007 : score 1.448 : w : TYR OH C0025 <- 5.65 -> DA N3 E2015 : score 1.448 : w : LYS NZ D0460 <- 5.96 -> DA N3 F0007 : score 1.538 : x : ARG xxxx B0458 <- 3.49 -> DG xxx E2009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0033 <- 4.36 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0085 <- 3.45 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0088 <- 4.30 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0175 <- 2.97 -> DC xxx F2016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0085 <- 3.55 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0175 <- 3.49 -> DG xxx E2017 : score x.xxxxx >6qx2_BCD: title=3.4A STRUCTURE OF BENZOISOXAZOLE 3 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : x : ARG xxxx B0458 <- 4.09 -> DG xxx F2013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0460 <- 3.62 -> DT xxx F2014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0460 <- 3.42 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0025 <- 4.47 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0085 <- 3.48 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0088 <- 3.85 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0175 <- 3.04 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx >6qx2_JKLM: title=3.4A STRUCTURE OF BENZOISOXAZOLE 3 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : x : LYS xxxx K0460 <- 3.47 -> DT xxx O0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0085 <- 3.70 -> DA xxx N0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx J0088 <- 4.35 -> DT xxx N0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J0175 <- 3.19 -> DG xxx O0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0460 <- 3.49 -> DT xxx N2014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0085 <- 3.57 -> DA xxx O0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0088 <- 4.13 -> DT xxx O0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0175 <- 3.11 -> DG xxx N2017 : score x.xxxxx >6qx2_RSTU: title=3.4A STRUCTURE OF BENZOISOXAZOLE 3 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : H : ARG NH1 S0458 <- 3.21 -> DG N3 W2013 : score 2.80225 : x : LYS xxxx S0460 <- 3.32 -> DT xxx W2014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx R0085 <- 3.63 -> DA xxx V0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0088 <- 4.06 -> DT xxx V0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0175 <- 3.09 -> DC xxx W2016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx U0460 <- 3.24 -> DT xxx V2014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx T0085 <- 3.84 -> DA xxx W0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx T0088 <- 4.01 -> DT xxx W0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx T0175 <- 3.13 -> DC xxx V2016 : score x.xxxxx >6qx2_a:Type_II_DNA_topoisomerase; title=3.4A STRUCTURE OF BENZOISOXAZOLE 3 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=? : x : SER xxxx a0085 <- 3.67 -> DA xxx e0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx a0088 <- 4.35 -> DT xxx e0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx a0175 <- 3.42 -> DC xxx f0016 : score x.xxxxx >6qx2_abcd: title=3.4A STRUCTURE OF BENZOISOXAZOLE 3 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : x : LYS xxxx b0460 <- 3.61 -> DT xxx f0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx a0085 <- 3.67 -> DA xxx e0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx a0088 <- 4.35 -> DT xxx e0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx a0175 <- 3.42 -> DC xxx f0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx d0460 <- 3.49 -> DT xxx e0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx c0085 <- 3.51 -> DA xxx f0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx c0088 <- 3.71 -> DT xxx f0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx c0122 <- 4.42 -> DG xxx e0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx c0175 <- 3.07 -> DC xxx e0016 : score x.xxxxx >6qx2_jklm: title=3.4A STRUCTURE OF BENZOISOXAZOLE 3 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : x : ARG xxxx k0458 <- 3.84 -> DG xxx n2009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx k0460 <- 3.49 -> DT xxx o2014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx j0085 <- 3.46 -> DA xxx n0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx j0088 <- 4.05 -> DT xxx n0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx j0122 <- 4.40 -> DG xxx o2009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx j0175 <- 3.14 -> DG xxx o2017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx m0460 <- 3.37 -> DT xxx n2014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx l0085 <- 3.53 -> DA xxx o0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx l0088 <- 4.11 -> DT xxx o0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx l0122 <- 3.81 -> DG xxx n2009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx l0175 <- 3.22 -> DC xxx n2016 : score x.xxxxx >6qx2_rsu: title=3.4A STRUCTURE OF BENZOISOXAZOLE 3 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : x : ARG xxxx s0458 <- 3.57 -> DG xxx w2013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx s0460 <- 3.30 -> DT xxx w2014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx r0025 <- 4.14 -> DA xxx w2015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx r0033 <- 4.47 -> DT xxx v0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx r0085 <- 3.77 -> DA xxx v0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx r0088 <- 4.17 -> DT xxx v0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx r0175 <- 3.22 -> DG xxx w2017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx u0460 <- 3.35 -> DT xxx v2014 : score x.xxxxx >6qxt_FHWXhwx: title=CAS1-CAS2-CSN2-DNA DIMER COMPLEX FROM THE TYPE II-A CRISPR-CAS SYSTEM organism=STREPTOCOCCUS THERMOPHILUS : V : ALA CB x0019 <- 3.69 -> DT C7 10027 : score 5.75295 : x : LYS xxxx x0023 <- 4.02 -> DT xxx 10026 : score x.xxxxx >6qzk_A:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF CLOSTRIDIUM BUTYRICUM ARGONAUTE BOUND TO A GUIDE DNA (5' DEOXYCYTIDINE) AND A 19-MER TARGET DNA organism=Clostridium butyricum : H : ASN ND2 A0511 <- 2.70 -> DG N3 B0002 : score 4.99277 : H : GLU OE2 A0577 <- 3.20 -> DG N2 B0012 : score 3.96544 : H : LYS NZ A0715 <- 3.18 -> DT O2 C-003 : score 3.31455 : x : ASN xxxx A0033 <- 3.01 -> DA xxx C-016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0035 <- 3.08 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0036 <- 3.92 -> DA xxx C-016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0278 <- 3.74 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0279 <- 3.67 -> DA xxx C-006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0298 <- 3.05 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0493 <- 4.01 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0507 <- 3.75 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0508 <- 2.75 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0615 <- 4.28 -> DA xxx C-013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0640 <- 3.33 -> DT xxx C-010 : score x.xxxxx >6r0c_A:Histone-fold; title=HUMAN-D02 NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH BIOTIN-STREPTAVIDIN LABEL organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0040 <- 3.25 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx >6r0c_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=HUMAN-D02 NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH BIOTIN-STREPTAVIDIN LABEL organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0040 <- 3.25 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.50 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.37 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.47 -> DA xxx J-054 : score x.xxxxx >6r1t_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF LSD2/NPAC-LINKER/NUCLEOSOME CORE PARTICLE COMPLEX: CLASS 1, FREE NUCLESOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 E0040 <- 3.29 -> DT O2 I0009 : score 3.88438 : x : ARG xxxx A0083 <- 4.07 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.18 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.06 -> DT xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.44 -> DA xxx J0057 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0018 <- 2.86 -> DC xxx J-018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.43 -> DA xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.13 -> DG xxx J-037 : score x.xxxxx >6r1u_E:Histone-fold; title=STRUCTURE OF LSD2/NPAC-LINKER/NUCLEOSOME CORE PARTICLE COMPLEX: CLASS 2 organism=? : H : ARG NH1 E0040 <- 3.29 -> DT O2 I0009 : score 3.88438 >6r25_E:Histone-fold; title=STRUCTURE OF LSD2/NPAC-LINKER/NUCLEOSOME CORE PARTICLE COMPLEX: CLASS 3 organism=? : H : ARG NH1 E0040 <- 3.29 -> DT O2 I0009 : score 3.88438 >6r2v_A: title=ARABIDOPSIS NF-Y/CCAAT-BOX COMPLEX organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ARG NH2 A0211 <- 2.49 -> DC O2 I0013 : score 3.92804 : H : HIS NE2 A0214 <- 3.23 -> DA N3 I0011 : score 3.88098 : w : ARG NH1 A0218 <- 5.71 -> DT O2 J-010 : score 1.855 : H : ARG NH1 A0220 <- 3.02 -> DG N3 J-009 : score 2.91825 : x : ARG xxxx A0225 <- 3.30 -> DC xxx I0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0226 <- 3.31 -> DC xxx I0009 : score x.xxxxx >6r2v_ABC:Histone-fold; title=ARABIDOPSIS NF-Y/CCAAT-BOX COMPLEX organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ARG NH2 A0211 <- 2.49 -> DC O2 I0013 : score 3.92804 : H : HIS NE2 A0214 <- 3.23 -> DA N3 I0011 : score 3.88098 : w : ARG NH1 A0218 <- 5.71 -> DT O2 J-010 : score 1.855 : H : ARG NH1 A0220 <- 3.02 -> DG N3 J-009 : score 2.91825 : x : ARG xxxx A0225 <- 3.30 -> DC xxx I0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0226 <- 3.31 -> DC xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0035 <- 3.91 -> DT xxx J-011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0074 <- 4.42 -> DT xxx I0017 : score x.xxxxx >6r2v_B:Histone-fold; title=ARABIDOPSIS NF-Y/CCAAT-BOX COMPLEX organism=ARABIDOPSIS THALIANA : x : ALA xxxx B0035 <- 3.91 -> DT xxx J-011 : score x.xxxxx >6r64_A: title=N-TERMINAL DOMAIN OF MODIFICATION DEPENDENT ECOKMCRA RESTRICTION ENDONUCLEASE (NECO) IN COMPLEX WITH C5MCGG TARGET SEQUENCE organism=Escherichia coli K12 : H : ARG NH2 A0109 <- 2.72 -> DC O2 C0004 : score 3.7579 : H : ASN ND2 A0119 <- 2.99 -> DG O6 C0006 : score 5.4242 : x : TRP xxxx A0031 <- 3.61 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0033 <- 3.27 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0120 <- 4.19 -> DA xxx D0002 : score x.xxxxx >6r8y_H:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NCP-6-4PP(-1)-UV-DDB organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx H0034 <- 3.94 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >6r8z_G:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NCP_THF2(-1)-UV-DDB organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx G0012 <- 3.36 -> DT xxx I0117 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0043 <- 4.31 -> DT xxx I0111 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0124 <- 3.37 -> DA xxx J0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0126 <- 2.92 -> DA xxx J0001 : score x.xxxxx >6r90_L:WD40_repeat-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NCP-THF2(+1)-UV-DDB CLASS A organism=HOMO SAPIENS : H : GLN OE1 L0335 <- 3.26 -> DT N3 I0052 : score 3.10001 : x : HIS xxxx L0333 <- 4.37 -> DT xxx J0095 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0334 <- 2.95 -> DT xxx I0052 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0336 <- 3.11 -> DT xxx J0092 : score x.xxxxx >6r91_C:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NCP_THF2(-3)-UV-DDB organism=? : H : ARG NH2 C0012 <- 3.05 -> DT O2 J0119 : score 4.02167 : x : ARG xxxx C0043 <- 4.49 -> DG xxx I0033 : score x.xxxxx >6r92_C:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NCP-THF2(+1)-UV-DDB CLASS B organism=? : H : SER OG C0123 <- 2.31 -> DC N4 I0003 : score 4.03585 : x : ARG xxxx C0012 <- 2.89 -> DT xxx J0116 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0124 <- 3.59 -> DT xxx J0141 : score x.xxxxx >6r93_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NCP-6-4PP organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 G0012 <- 2.89 -> DT O2 I0117 : score 4.15713 : x : ARG xxxx A0041 <- 4.39 -> DA xxx J0082 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0042 <- 3.94 -> DT xxx I0141 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0066 <- 3.77 -> DT xxx J0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0084 <- 3.68 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0012 <- 3.26 -> DT xxx J0117 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0034 <- 3.32 -> DG xxx J0121 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0087 <- 4.24 -> DG xxx I0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0041 <- 4.43 -> DA xxx I0082 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0084 <- 3.79 -> DC xxx J0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0117 <- 4.11 -> DG xxx J0071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0046 <- 4.46 -> DT xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0034 <- 3.54 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0040 <- 4.36 -> DT xxx I0122 : score x.xxxxx >6r93_G:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NCP-6-4PP organism=? : H : ARG NH2 G0012 <- 2.89 -> DT O2 I0117 : score 4.15713 >6r94_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NCP_THF2(-3) organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0040 <- 4.49 -> DT xxx I0142 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0041 <- 3.45 -> DT xxx I0065 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0042 <- 4.14 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0084 <- 3.67 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0046 <- 3.53 -> DT xxx J0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0012 <- 3.73 -> DG xxx I0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 3.62 -> DT xxx I0037 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0040 <- 3.99 -> DT xxx J0142 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0041 <- 3.41 -> DA xxx I0082 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0046 <- 4.42 -> DT xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0012 <- 2.70 -> DT xxx I0117 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0126 <- 3.71 -> DT xxx I0145 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0034 <- 4.38 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >6r94_E:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NCP_THF2(-3) organism=? : x : HIS xxxx E0040 <- 3.99 -> DT xxx J0142 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0041 <- 3.41 -> DA xxx I0082 : score x.xxxxx >6rar_I:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=PMAR-LIG_PRES3-MN organism=Prochlorococcus marinus str. MIT 9302 : H : SER OG I0385 <- 2.93 -> DA N3 D0033 : score 2.92575 : x : MET xxxx I0230 <- 3.30 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0427 <- 3.52 -> DC xxx C0031 : score x.xxxxx >6ras_I:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=PMAR-LIG_PRE. organism=Prochlorococcus marinus str. MIT 9302 : H : SER OG I0385 <- 3.02 -> DA N3 D0033 : score 2.87168 : x : MET xxxx I0230 <- 3.29 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0427 <- 3.34 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx >6rau_I:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=POSTS3_PMAR_LIG4_WT organism=Prochlorococcus marinus : H : SER OG I0385 <- 3.16 -> DA N3 C0033 : score 2.78757 : x : ARG xxxx I0187 <- 4.32 -> DC xxx C0031 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0226 <- 3.91 -> DC xxx C0030 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0427 <- 3.38 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx >6raw_2356: title=D. MELANOGASTER CMG-DNA, STATE 1A organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH2 50422 <- 2.57 -> DT O2 F0005 : score 4.42807 : x : ARG xxxx 20546 <- 4.06 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx 30377 <- 4.27 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 50417 <- 4.20 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 60427 <- 4.20 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx >6raw_6:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=D. MELANOGASTER CMG-DNA, STATE 1A organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : ARG xxxx 60427 <- 4.20 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx >6rax_2357: title=D. MELANOGASTER CMG-DNA, STATE 1B organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : LYS NZ 50417 <- 2.81 -> DT O2 X0008 : score 3.58001 : H : ARG NH1 50422 <- 2.20 -> DT O2 X0006 : score 4.82318 : H : ARG NH2 50422 <- 2.84 -> DT O2 X0005 : score 4.19947 : x : ARG xxxx 20546 <- 3.18 -> DT xxx X0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx 30377 <- 3.66 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx 30379 <- 2.91 -> DT xxx X0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx 30380 <- 3.67 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 50448 <- 4.19 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx 70285 <- 2.95 -> DT xxx X0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx 70287 <- 3.32 -> DT xxx X0003 : score x.xxxxx >6rax_2:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=D. MELANOGASTER CMG-DNA, STATE 1B organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : ARG xxxx 20546 <- 3.18 -> DT xxx X0010 : score x.xxxxx >6ray_234567:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=D. MELANOGASTER CMG-DNA, STATE 2A organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : TYR xxxx 40548 <- 2.17 -> DT xxx X0033 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx 70421 <- 2.66 -> DT xxx X0035 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 70471 <- 3.90 -> DT xxx X0036 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx 20553 <- 3.46 -> DT xxx X0029 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx 20554 <- 2.96 -> DT xxx X0028 : score x.xxxxx >6ray_2:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=D. MELANOGASTER CMG-DNA, STATE 2A organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : GLU xxxx 20553 <- 3.46 -> DT xxx X0029 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx 20554 <- 2.96 -> DT xxx X0028 : score x.xxxxx >6raz_234567:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=D. MELANOGASTER CMG-DNA, STATE 2B organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : H : ARG NH2 40556 <- 2.24 -> DT O2 X0026 : score 4.70747 : x : LEU xxxx 50204 <- 3.30 -> DT xxx X0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 60427 <- 4.50 -> DT xxx X0025 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx 30382 <- 2.65 -> DT xxx X0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx 70285 <- 4.43 -> DT xxx X0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx 70286 <- 3.90 -> DT xxx X0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx 70287 <- 3.43 -> DA xxx X0021 : score x.xxxxx >6raz_3:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=D. MELANOGASTER CMG-DNA, STATE 2B organism=? : x : GLU xxxx 30382 <- 2.65 -> DT xxx X0025 : score x.xxxxx >6raz_4:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=D. MELANOGASTER CMG-DNA, STATE 2B organism=? : H : ARG NH2 40556 <- 2.24 -> DT O2 X0026 : score 4.70747 >6raz_6:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=D. MELANOGASTER CMG-DNA, STATE 2B organism=? : x : ARG xxxx 60427 <- 4.50 -> DT xxx X0025 : score x.xxxxx >6raz_7:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=D. MELANOGASTER CMG-DNA, STATE 2B organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : PHE xxxx 70285 <- 4.43 -> DT xxx X0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx 70286 <- 3.90 -> DT xxx X0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx 70287 <- 3.43 -> DA xxx X0021 : score x.xxxxx >6rce_I:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=PMAR-LIG_PRES3 organism=Prochlorococcus marinus : H : SER OG I0385 <- 3.01 -> DA N3 D0033 : score 2.87768 : w : SER OG I0385 <- 6.39 -> DC O2 D0034 : score 1.768 : x : MET xxxx I0230 <- 3.23 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0427 <- 3.29 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx >6rh3_CD: title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO CTP SUBSTRATE organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : x : TYR xxxx D0046 <- 4.41 -> DT xxx N0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 4.06 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.35 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 4.09 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0932 <- 3.57 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx >6ri7_CD:GreA_transcript_cleavage_protein,_N-terminal_domain;FKBP-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO GREB TRANSCRIPTION FACTOR organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : TYR xxxx D0046 <- 4.32 -> DT xxx N0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 2.93 -> DC xxx N0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 4.21 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.49 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 4.01 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx >6ri9_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI RNA POLYMERASE BACKTRACKED ELONGATION COMPLEX IN NON-SWIVELED STATE organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ARG xxxx C0151 <- 3.33 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.11 -> DA xxx N0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.25 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.43 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx >6ri9_CD: title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI RNA POLYMERASE BACKTRACKED ELONGATION COMPLEX IN NON-SWIVELED STATE organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ARG xxxx C0151 <- 3.33 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.11 -> DA xxx N0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.25 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.43 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0046 <- 3.37 -> DT xxx N0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 2.97 -> DC xxx N0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 4.47 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.63 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.94 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx >6rin_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI RNA POLYMERASE BACKTRACKED ELONGATION COMPLEX BOUND TO GREB TRANSCRIPTION FACTOR organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ARG xxxx C0151 <- 3.33 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 2.91 -> DA xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 3.86 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 4.06 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.38 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx >6rin_CD: title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI RNA POLYMERASE BACKTRACKED ELONGATION COMPLEX BOUND TO GREB TRANSCRIPTION FACTOR organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ARG xxxx C0151 <- 3.33 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 2.91 -> DA xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 3.86 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 4.06 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.38 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.01 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx >6rip_CD: title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI RNA POLYMERASE BACKTRACKED ELONGATION COMPLEX IN SWIVELED STATE organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ARG xxxx C0151 <- 3.43 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.17 -> DA xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 4.23 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0451 <- 3.96 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.44 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 2.73 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 4.15 -> DC xxx N0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.06 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.74 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx >6rip_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI RNA POLYMERASE BACKTRACKED ELONGATION COMPLEX IN SWIVELED STATE organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ARG xxxx D0270 <- 4.15 -> DC xxx N0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.06 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.74 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx >6rj9_C: title=CRYO-EM STRUCTURE OF ST1CAS9-SGRNA-TDNA20-ACRIIA6 MONOMERIC ASSEMBLY. organism=STREPTOCOCCUS THERMOPHILUS : x : TYR xxxx C0225 <- 4.06 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0252 <- 3.65 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0286 <- 4.47 -> DA xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0338 <- 3.87 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0341 <- 4.39 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0445 <- 3.27 -> DA xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0446 <- 4.00 -> DA xxx E0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0447 <- 3.31 -> DA xxx E0019 : score x.xxxxx >6rja_F: title=CRYO-EM STRUCTURE OF ST1CAS9-SGRNA-TDNA20-ACRIIA6 DIMERIC ASSEMBLY. organism=? : x : THR xxxx F0056 <- 4.48 -> DA xxx H0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0225 <- 4.06 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0252 <- 3.32 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0338 <- 4.39 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0445 <- 3.94 -> DA xxx H0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0447 <- 3.47 -> DA xxx H0019 : score x.xxxxx >6rjd_C: title=CRYO-EM STRUCTURE OF ST1CAS9-SGRNA-TDNA59-NTPAM COMPLEX. organism=STREPTOCOCCUS THERMOPHILUS DGCC 7710 : V : LYS CG C1086 <- 3.70 -> DT C7 E0018 : score 2.17195 : x : MET xxxx C1049 <- 3.32 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C1052 <- 3.33 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C1055 <- 4.40 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C1082 <- 3.85 -> DT xxx E0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C1084 <- 3.57 -> DC xxx G0002 : score x.xxxxx >6rjg_C: title=CRYO-EM STRUCTURE OF ST1CAS9-SGRNA-ACRIIA6-TDNA59-NTPAM COMPLEX. organism=STREPTOCOCCUS THERMOPHILUS DGCC 7710 : x : MET xxxx C1049 <- 3.49 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C1052 <- 3.61 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C1055 <- 3.37 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C1082 <- 4.36 -> DC xxx E0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C1084 <- 3.39 -> DC xxx G0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C1086 <- 3.06 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx >6rks_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=E. COLI DNA GYRASE - DNA BINDING AND CLEAVAGE DOMAIN IN STATE 1 WITHOUT TOPRIM INSERTION organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : x : ILE xxxx A0174 <- 3.35 -> DC xxx G0022 : score x.xxxxx >6rks_AB:Type_II_DNA_topoisomerase;GyrA/ParC_C-terminal_domain-like; title=E. COLI DNA GYRASE - DNA BINDING AND CLEAVAGE DOMAIN IN STATE 1 WITHOUT TOPRIM INSERTION organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : x : ILE xxxx A0174 <- 3.35 -> DC xxx G0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0449 <- 4.49 -> DT xxx G0020 : score x.xxxxx >6rks_CD:Type_II_DNA_topoisomerase;GyrA/ParC_C-terminal_domain-like; title=E. COLI DNA GYRASE - DNA BINDING AND CLEAVAGE DOMAIN IN STATE 1 WITHOUT TOPRIM INSERTION organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : x : ILE xxxx C0174 <- 3.23 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0449 <- 4.26 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0455 <- 4.35 -> DC xxx H0022 : score x.xxxxx >6rks_D:Type_II_DNA_topoisomerase; title=E. COLI DNA GYRASE - DNA BINDING AND CLEAVAGE DOMAIN IN STATE 1 WITHOUT TOPRIM INSERTION organism=? : x : LYS xxxx D0449 <- 4.26 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0455 <- 4.35 -> DC xxx H0022 : score x.xxxxx >6rku_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=E. COLI DNA GYRASE - DNA BINDING AND CLEAVAGE DOMAIN IN STATE 1 organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ILE xxxx A0174 <- 3.30 -> DG xxx G0023 : score x.xxxxx >6rku_AB:Type_II_DNA_topoisomerase;GyrA/ParC_C-terminal_domain-like; title=E. COLI DNA GYRASE - DNA BINDING AND CLEAVAGE DOMAIN IN STATE 1 organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ILE xxxx A0174 <- 3.30 -> DG xxx G0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0449 <- 4.26 -> DA xxx G0021 : score x.xxxxx >6rku_CD:Type_II_DNA_topoisomerase;GyrA/ParC_C-terminal_domain-like; title=E. COLI DNA GYRASE - DNA BINDING AND CLEAVAGE DOMAIN IN STATE 1 organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ILE xxxx C0174 <- 3.19 -> DC xxx H0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0449 <- 4.27 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0455 <- 4.33 -> DC xxx H0022 : score x.xxxxx >6rkv_AB:Type_II_DNA_topoisomerase;GyrA/ParC_C-terminal_domain-like; title=E. COLI DNA GYRASE - DNA BINDING AND CLEAVAGE DOMAIN IN STATE 2 organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ARG xxxx A0032 <- 4.34 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0174 <- 3.28 -> DG xxx G0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0449 <- 3.69 -> DT xxx G0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0455 <- 3.43 -> DC xxx G0022 : score x.xxxxx >6rkv_CD:Type_II_DNA_topoisomerase;GyrA/ParC_C-terminal_domain-like; title=E. COLI DNA GYRASE - DNA BINDING AND CLEAVAGE DOMAIN IN STATE 2 organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ILE xxxx C0174 <- 3.24 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0449 <- 3.85 -> DT xxx H0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0455 <- 3.65 -> DC xxx H0022 : score x.xxxxx >6rkv_D:Type_II_DNA_topoisomerase; title=E. COLI DNA GYRASE - DNA BINDING AND CLEAVAGE DOMAIN IN STATE 2 organism=? : x : LYS xxxx D0449 <- 3.85 -> DT xxx H0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0455 <- 3.65 -> DC xxx H0022 : score x.xxxxx >6rkw_A:Type_II_DNA_topoisomerase;GyrA/ParC_C-terminal_domain-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF THE COMPLETE E. COLI DNA GYRASE COMPLEX BOUND TO A 130 BP DNA DUPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ILE xxxx A0174 <- 3.27 -> DC xxx g0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0712 <- 4.09 -> DC xxx e0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0725 <- 3.20 -> DC xxx g0034 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0769 <- 3.05 -> DC xxx e0027 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0775 <- 3.06 -> DG xxx g0042 : score x.xxxxx >6rkw_AB:Type_II_DNA_topoisomerase;GyrA/ParC_C-terminal_domain-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF THE COMPLETE E. COLI DNA GYRASE COMPLEX BOUND TO A 130 BP DNA DUPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ILE xxxx A0174 <- 3.27 -> DC xxx g0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0712 <- 4.09 -> DC xxx e0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0725 <- 3.20 -> DC xxx g0034 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0769 <- 3.05 -> DC xxx e0027 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0775 <- 3.06 -> DG xxx g0042 : score x.xxxxx >6rkw_CD:Type_II_DNA_topoisomerase;GyrA/ParC_C-terminal_domain-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF THE COMPLETE E. COLI DNA GYRASE COMPLEX BOUND TO A 130 BP DNA DUPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : V : ASN CB C0717 <- 3.68 -> DT C7 h0024 : score 1.99556 : x : ILE xxxx C0174 <- 3.25 -> DG xxx f0055 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0725 <- 3.82 -> DG xxx h0033 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0769 <- 3.38 -> DC xxx f0027 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0775 <- 3.17 -> DG xxx h0042 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0449 <- 4.25 -> DG xxx f0058 : score x.xxxxx >6rnm_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THE LLFPG PROTEIN, A THF-DNA AND AN INHIBITOR organism=Lactococcus lactis subsp. cremoris : H : ARG NH1 A0074 <- 2.88 -> DT O2 D0008 : score 4.23751 : w : ARG NH1 A0074 <- 6.08 -> DT O2 D0009 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0074 <- 5.92 -> DT O2 D0009 : score 2.261 : w : GLU OE2 A0076 <- 6.24 -> DT O2 D0006 : score 2.279 : H : ARG NE A0109 <- 2.74 -> DC O2 E0023 : score 2.69088 : H : ARG NH2 A0109 <- 3.03 -> DC N3 E0023 : score 2.18564 : w : ARG NH1 A0109 <- 6.29 -> DT O2 D0006 : score 1.855 : x : MET xxxx A0075 <- 3.42 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.42 -> DA xxx E0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.37 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >6rno_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THE LLFPG PROTEIN, A THF-DNA AND AN INHIBITOR organism=Lactococcus lactis subsp. cremoris : H : ARG NH1 A0074 <- 2.66 -> DT O2 D0008 : score 4.42699 : w : GLU OE2 A0076 <- 5.93 -> DT O2 D0006 : score 2.279 : H : ARG NE A0109 <- 2.64 -> DC O2 E0023 : score 2.74406 : H : ARG NH2 A0109 <- 2.97 -> DC N3 E0023 : score 2.21313 : w : ARG NH1 A0109 <- 6.29 -> DT O2 D0006 : score 1.855 : x : MET xxxx A0075 <- 3.45 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.39 -> DC xxx E0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.46 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >6rnr_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THE LLFPG PROTEIN, A THF- DNA AND AN INHIBITOR organism=Lactococcus lactis subsp. cremoris : H : ARG NH1 A0074 <- 2.85 -> DT O2 D0008 : score 4.26335 : H : ARG NH1 A0074 <- 2.85 -> DT O2 D0008 : score 4.26335 : w : ARG NH1 A0074 <- 6.20 -> DT O2 D0009 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0074 <- 6.16 -> DT O2 D0009 : score 2.261 : w : GLU OE2 A0076 <- 6.05 -> DT O2 D0006 : score 2.279 : H : ARG NE A0109 <- 2.65 -> DC O2 E0023 : score 2.73874 : H : ARG NH2 A0109 <- 2.89 -> DC N3 E0023 : score 2.24979 : w : ARG NH1 A0109 <- 6.35 -> DT O2 D0006 : score 1.855 : x : MET xxxx A0075 <- 3.41 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.41 -> DC xxx E0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.46 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >6rny_ABFGH: title=PFV INTASOME - NUCLEOSOME STRAND TRANSFER COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 G0011 <- 2.97 -> DT O2 I0044 : score 4.0894 : x : ARG xxxx A0040 <- 4.13 -> DG xxx I-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.11 -> DT xxx U0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 3.89 -> DT xxx U0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.32 -> DG xxx U0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0031 <- 4.24 -> DA xxx U-012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.10 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.89 -> DC xxx I0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.49 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >6rny_C:Histone-fold; title=PFV INTASOME - NUCLEOSOME STRAND TRANSFER COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 C0011 <- 3.03 -> DT O2 J0046 : score 4.0386 : x : ARG xxxx C0077 <- 3.83 -> DT xxx T-057 : score x.xxxxx >6rny_CDEKO: title=PFV INTASOME - NUCLEOSOME STRAND TRANSFER COMPLEX organism=HOMO SAPIENS / HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NH2 C0011 <- 3.03 -> DT O2 J0046 : score 4.0386 : H : ARG NH1 E0083 <- 3.14 -> DG N3 I0026 : score 2.84499 : x : ARG xxxx C0077 <- 3.83 -> DT xxx T-057 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.52 -> DA xxx T-049 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0036 <- 4.14 -> DT xxx J0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.78 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.74 -> DG xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx K0188 <- 3.17 -> DT xxx I-034 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx K0212 <- 3.56 -> DA xxx U0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0329 <- 2.76 -> DC xxx I-037 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx O0188 <- 3.94 -> DA xxx J0043 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx O0212 <- 2.96 -> DA xxx T-042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0329 <- 3.04 -> DG xxx J0040 : score x.xxxxx >6ro2_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THE LLFPG PROTEIN, A THF- DNA AND AN INHIBITOR organism=Lactococcus lactis subsp. cremoris : H : ARG NH1 A0074 <- 2.82 -> DT O2 B0008 : score 4.28918 : w : ARG NH1 A0074 <- 6.12 -> DA N3 C0022 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0074 <- 6.32 -> DT O2 B0009 : score 2.261 : H : ARG NE A0109 <- 2.67 -> DC O2 C0023 : score 2.72811 : H : ARG NH2 A0109 <- 3.05 -> DC N3 C0023 : score 2.17647 : x : MET xxxx A0075 <- 3.42 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0076 <- 4.41 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.38 -> DC xxx C0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.47 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >6ro4_ABG:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE CORE TFIIH-XPA-DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ A0609 <- 2.94 -> DC O2 K0020 : score 2.86366 : x : HIS xxxx A0415 <- 4.33 -> DG xxx K0023 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0629 <- 3.69 -> DA xxx J0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0686 <- 4.43 -> DC xxx J0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0146 <- 4.22 -> DA xxx K0030 : score x.xxxxx >6ro4_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF THE CORE TFIIH-XPA-DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0686 <- 4.43 -> DC xxx J0020 : score x.xxxxx >6rok_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THE LLFPG PROTEIN, A THF- DNA AND AN INHIBITOR organism=Lactococcus lactis subsp. cremoris : H : ARG NH1 A0074 <- 2.81 -> DT O2 D0008 : score 4.2978 : w : ARG NH2 A0074 <- 6.26 -> DT O2 D0009 : score 2.261 : w : GLU OE2 A0076 <- 6.09 -> DT O2 D0006 : score 2.279 : H : ARG NE A0109 <- 2.70 -> DC O2 E0023 : score 2.71215 : H : ARG NH2 A0109 <- 2.96 -> DC N3 E0023 : score 2.21771 : w : ARG NH1 A0109 <- 6.30 -> DT O2 D0006 : score 1.855 : x : MET xxxx A0075 <- 3.38 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.38 -> DC xxx E0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.43 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >6rp0_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THE LLFPG PROTEIN, A THF- DNA AND AN INHIBITOR organism=LACTOCOCCUS LACTIS SUBSP. CREMORIS : H : ARG NH1 A0074 <- 2.81 -> DT O2 b0007 : score 4.2978 : w : GLU OE2 A0076 <- 6.24 -> DT O2 b0006 : score 2.279 : H : ARG NE A0109 <- 2.75 -> DC O2 c0009 : score 2.68556 : H : ARG NH2 A0109 <- 2.99 -> DC N3 c0009 : score 2.20397 : w : ARG NH1 A0109 <- 6.16 -> DT O2 b0006 : score 1.855 : x : MET xxxx A0075 <- 3.39 -> DT xxx b0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.39 -> DA xxx c0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.45 -> DT xxx b0007 : score x.xxxxx >6rp7_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THE LLFPG PROTEIN, A THF- DNA AND AN INHIBITOR organism=Lactococcus lactis subsp. cremoris : H : ARG NH1 A0074 <- 2.87 -> DT O2 D0008 : score 4.24612 : w : ARG NH1 A0074 <- 6.14 -> DT O2 D0009 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0074 <- 6.02 -> DT O2 D0009 : score 2.261 : w : GLU OE1 A0076 <- 6.27 -> DT O2 D0006 : score 2.462 : H : ARG NE A0109 <- 2.69 -> DC O2 E0023 : score 2.71747 : H : ARG NH2 A0109 <- 3.00 -> DC N3 E0023 : score 2.19938 : w : ARG NH1 A0109 <- 6.41 -> DT O2 D0006 : score 1.855 : x : MET xxxx A0075 <- 3.42 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0111 <- 3.41 -> DC xxx E0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0260 <- 3.47 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >6rqh_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE I CLOSED CONFORMATION 1 (CC1) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : GLN xxxx B0427 <- 3.49 -> DC xxx T0027 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0430 <- 3.42 -> DC xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0431 <- 4.19 -> DC xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0434 <- 3.25 -> DC xxx T0027 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0451 <- 3.57 -> DA xxx U0042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0452 <- 3.79 -> DC xxx T0027 : score x.xxxxx >6rqh_BQR: title=RNA POLYMERASE I CLOSED CONFORMATION 1 (CC1) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 Q0293 <- 2.46 -> DT O4 U0024 : score 3.49017 : H : HIS ND1 Q0294 <- 3.32 -> DC N4 T0048 : score 2.88903 : H : ARG NH1 R0011 <- 2.71 -> DG O6 U0028 : score 6.19283 : H : ARG NH2 R0011 <- 3.03 -> DT O4 T0042 : score 3.39037 : x : GLN xxxx Q0155 <- 3.99 -> DT xxx T0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Q0209 <- 3.35 -> DA xxx U0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Q0210 <- 3.44 -> DT xxx T0042 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx Q0212 <- 3.65 -> DA xxx U0031 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Q0213 <- 3.15 -> DA xxx U0029 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Q0292 <- 3.78 -> DT xxx U0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0297 <- 3.48 -> DC xxx T0048 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0009 <- 3.76 -> DC xxx T0038 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0288 <- 3.73 -> DG xxx U0036 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0427 <- 3.49 -> DC xxx T0027 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0430 <- 3.42 -> DC xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0431 <- 4.19 -> DC xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0434 <- 3.25 -> DC xxx T0027 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0451 <- 3.57 -> DA xxx U0042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0452 <- 3.79 -> DC xxx T0027 : score x.xxxxx >6rql_BQR: title=RNA POLYMERASE I CLOSED CONFORMATION 2 (CC2) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 R0011 <- 2.59 -> DT O4 T0040 : score 3.4052 : H : ARG NH2 R0011 <- 2.73 -> DT O4 T0040 : score 3.6036 : x : ASN xxxx Q0209 <- 3.48 -> DA xxx U0031 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Q0210 <- 3.33 -> DT xxx T0042 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Q0292 <- 3.63 -> DT xxx U0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0293 <- 3.03 -> DG xxx U0025 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx Q0294 <- 3.33 -> DT xxx U0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0297 <- 2.88 -> DT xxx U0022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx R0288 <- 4.21 -> DT xxx T0036 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0430 <- 3.56 -> DC xxx T0027 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0451 <- 4.46 -> DG xxx U0040 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0454 <- 3.52 -> DG xxx U0043 : score x.xxxxx >6rqt_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE I-TWH-RRN3-DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : GLU xxxx A0464 <- 3.53 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0481 <- 3.80 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0592 <- 4.38 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1013 <- 3.85 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1600 <- 3.01 -> DG xxx U0059 : score x.xxxxx >6rqt_AB: title=RNA POLYMERASE I-TWH-RRN3-DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : LYS NZ B0513 <- 2.49 -> DA N3 U0056 : score 2.94909 : x : GLU xxxx A0464 <- 3.53 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0481 <- 3.80 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0592 <- 4.38 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1013 <- 3.85 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1600 <- 3.01 -> DG xxx U0059 : score x.xxxxx >6rrd_ABQR:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE I PRE-INITIATION COMPLEX DNA OPENING INTERMEDIATE 1 organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : V : HIS CG Q0294 <- 3.72 -> DT C7 U0022 : score 3.05895 : x : GLN xxxx Q0155 <- 4.45 -> DT xxx T0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Q0209 <- 3.30 -> DA xxx U0031 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Q0210 <- 3.64 -> DT xxx T0042 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Q0292 <- 4.32 -> DT xxx U0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0293 <- 3.05 -> DG xxx U0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0297 <- 3.78 -> DT xxx U0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0011 <- 3.04 -> DA xxx U0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0450 <- 4.13 -> DG xxx U0055 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1223 <- 4.07 -> DG xxx U0059 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0456 <- 4.31 -> DA xxx U0042 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0511 <- 3.97 -> DA xxx U0056 : score x.xxxxx >6rrd_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE I PRE-INITIATION COMPLEX DNA OPENING INTERMEDIATE 1 organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ASN xxxx B0456 <- 4.31 -> DA xxx U0042 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0511 <- 3.97 -> DA xxx U0056 : score x.xxxxx >6rui_ABQR: title=RNA POLYMERASE I PRE-INITIATION COMPLEX DNA OPENING INTERMEDIATE 2 organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : SER OG A1014 <- 3.24 -> DT O2 T0014 : score 3.37206 : H : ASN ND2 Q0209 <- 2.80 -> DA N3 U0031 : score 3.80769 : H : ARG NH2 R0011 <- 2.45 -> DT O4 T0040 : score 3.80262 : x : MET xxxx B0451 <- 3.42 -> DG xxx U0040 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0507 <- 4.43 -> DC xxx U0054 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0508 <- 3.42 -> DA xxx U0056 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Q0155 <- 4.24 -> DT xxx T0045 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Q0210 <- 3.27 -> DT xxx T0041 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Q0213 <- 4.37 -> DA xxx U0030 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Q0214 <- 4.20 -> DC xxx T0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0293 <- 2.42 -> DA xxx T0047 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx Q0294 <- 3.01 -> DA xxx T0047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0297 <- 3.76 -> DC xxx T0048 : score x.xxxxx >6rui_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE I PRE-INITIATION COMPLEX DNA OPENING INTERMEDIATE 2 organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : MET xxxx B0451 <- 3.42 -> DG xxx U0040 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0507 <- 4.43 -> DC xxx U0054 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0508 <- 3.42 -> DA xxx U0056 : score x.xxxxx >6ruo_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE I OPEN COMPLEX CONFORMATION 1 organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : GLN xxxx A0592 <- 3.94 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0593 <- 4.39 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0632 <- 4.47 -> DT xxx T0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1013 <- 3.21 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1014 <- 4.15 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1600 <- 4.21 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx >6ruo_ABQR: title=RNA POLYMERASE I OPEN COMPLEX CONFORMATION 1 organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 B0817 <- 2.71 -> DC O2 T0031 : score 3.7157 : H : ASP OD2 Q0046 <- 2.39 -> DA N6 T0023 : score 4.33077 : H : ARG NH1 Q0293 <- 2.32 -> DT O4 U0024 : score 3.58167 : H : ARG NH2 Q0297 <- 3.03 -> DT O4 U0022 : score 3.39037 : V : HIS CB Q0294 <- 3.71 -> DT C7 U0022 : score 4.21794 : x : GLN xxxx Q0155 <- 4.04 -> DT xxx T0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Q0209 <- 3.03 -> DT xxx T0041 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Q0210 <- 3.22 -> DT xxx T0041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Q0292 <- 4.39 -> DT xxx U0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Q0295 <- 3.42 -> DA xxx T0047 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0592 <- 3.94 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0593 <- 4.39 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0632 <- 4.47 -> DT xxx T0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1013 <- 3.21 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1014 <- 4.15 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1600 <- 4.21 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0511 <- 3.65 -> DA xxx U0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0011 <- 2.95 -> DG xxx U0028 : score x.xxxxx >6rwe_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE I OPEN COMPLEX CONFORMATION 2 organism=? : x : GLN xxxx A0592 <- 3.74 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0593 <- 3.91 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1013 <- 3.18 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1014 <- 3.34 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1600 <- 3.75 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx >6rwe_ABMQR: title=RNA POLYMERASE I OPEN COMPLEX CONFORMATION 2 organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : LYS NZ B0513 <- 3.05 -> DG N3 U0054 : score 1.38115 : H : ARG NH1 B0817 <- 2.53 -> DC O2 T0032 : score 3.8471 : H : ARG NH1 R0011 <- 3.27 -> DA N7 U0029 : score 2.31959 : H : ARG NH2 R0011 <- 3.35 -> DA N7 U0029 : score 1.4879 : x : SER xxxx M0387 <- 2.61 -> DA xxx U0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0391 <- 3.33 -> DT xxx T0041 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0592 <- 3.74 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0593 <- 3.91 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1013 <- 3.18 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1014 <- 3.34 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1600 <- 3.75 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0219 <- 3.32 -> DA xxx U0052 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0394 <- 4.03 -> DA xxx U0052 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0395 <- 3.51 -> DA xxx U0052 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0454 <- 4.18 -> DC xxx T0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0505 <- 3.35 -> DA xxx U0052 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0508 <- 3.51 -> DG xxx U0051 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0509 <- 3.83 -> DA xxx U0052 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0511 <- 2.97 -> DA xxx U0053 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx Q0046 <- 3.39 -> DA xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Q0209 <- 2.83 -> DA xxx U0031 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Q0210 <- 3.16 -> DT xxx T0042 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Q0213 <- 4.40 -> DA xxx U0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0293 <- 2.53 -> DG xxx U0025 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx Q0294 <- 3.26 -> DA xxx T0047 : score x.xxxxx >6rwl_ADFM:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=SIVRCM INTASOME organism=SIMIAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS : x : HIS xxxx A0051 <- 3.67 -> DG xxx S0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.86 -> DG xxx S0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.39 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0153 <- 3.51 -> DG xxx S0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0156 <- 4.24 -> DC xxx T0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0157 <- 3.81 -> DT xxx S0007 : score x.xxxxx >6rwl_EILN:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=SIVRCM INTASOME organism=SIMIAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS : x : HIS xxxx I0051 <- 3.85 -> DG xxx Q0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0146 <- 3.82 -> DG xxx Q0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0152 <- 3.22 -> DC xxx W0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0153 <- 3.27 -> DG xxx Q0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx I0156 <- 4.22 -> DC xxx W0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0157 <- 3.68 -> DT xxx Q0007 : score x.xxxxx >6rwm_ADFM:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=SIVRCM INTASOME IN COMPLEX WITH BICTEGRAVIR organism=SIMIAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS : w : ASP OD1 A0064 <- 6.25 -> DA N7 T0021 : score 2.429 : H : SER OG A0153 <- 3.38 -> DG N2 S0006 : score 2.98293 : H : SER OG A0153 <- 3.40 -> DG N3 S0006 : score 2.43918 : x : HIS xxxx A0051 <- 3.69 -> DG xxx S0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0055 <- 4.44 -> DT xxx S0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.79 -> DG xxx S0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.70 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0156 <- 3.91 -> DC xxx T0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0157 <- 3.84 -> DT xxx S0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0234 <- 4.26 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0263 <- 3.24 -> DT xxx S0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0246 <- 3.96 -> DT xxx S0004 : score x.xxxxx >6rwm_EL:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=SIVRCM INTASOME IN COMPLEX WITH BICTEGRAVIR organism=SIMIAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS : x : GLN xxxx L0234 <- 4.25 -> DT xxx W0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0263 <- 3.23 -> DT xxx Q0004 : score x.xxxxx >6rwm_I:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=SIVRCM INTASOME IN COMPLEX WITH BICTEGRAVIR organism=? : H : SER OG I0153 <- 3.37 -> DG N2 Q0006 : score 2.98968 : H : SER OG I0153 <- 3.39 -> DG N3 Q0006 : score 2.44472 : x : HIS xxxx I0051 <- 3.70 -> DG xxx Q0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0146 <- 3.79 -> DG xxx Q0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0152 <- 3.68 -> DC xxx W0020 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx I0156 <- 3.91 -> DC xxx W0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0157 <- 3.83 -> DT xxx Q0007 : score x.xxxxx >6rwm_IN:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=SIVRCM INTASOME IN COMPLEX WITH BICTEGRAVIR organism=SIMIAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS : w : ASP OD1 I0064 <- 6.25 -> DA N7 W0021 : score 2.429 : H : SER OG I0153 <- 3.37 -> DG N2 Q0006 : score 2.98968 : H : SER OG I0153 <- 3.39 -> DG N3 Q0006 : score 2.44472 : x : HIS xxxx I0051 <- 3.70 -> DG xxx Q0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0055 <- 4.44 -> DT xxx Q0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0146 <- 3.79 -> DG xxx Q0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0152 <- 3.68 -> DC xxx W0020 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx I0156 <- 3.91 -> DC xxx W0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0157 <- 3.83 -> DT xxx Q0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx N0246 <- 3.96 -> DT xxx Q0004 : score x.xxxxx >6rwn_AF:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=SIVRCM INTASOME IN COMPLEX WITH DOLUTEGRAVIR organism=SIMIAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS : w : ASP OD1 A0064 <- 6.52 -> DA N7 T0021 : score 2.429 : x : HIS xxxx A0051 <- 3.80 -> DG xxx S0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0067 <- 4.49 -> DA xxx T0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.82 -> DG xxx S0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.54 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0153 <- 3.73 -> DG xxx S0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0156 <- 4.07 -> DC xxx T0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0157 <- 3.80 -> DT xxx S0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0246 <- 3.56 -> DT xxx S0004 : score x.xxxxx >6rwn_DM:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=SIVRCM INTASOME IN COMPLEX WITH DOLUTEGRAVIR organism=SIMIAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS : H : ARG NE D0263 <- 3.09 -> DT O4 S0004 : score 1.75115 >6rwn_EL:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=SIVRCM INTASOME IN COMPLEX WITH DOLUTEGRAVIR organism=SIMIAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS : H : ARG NE L0263 <- 3.08 -> DT O4 Q0004 : score 1.75487 >6rwn_I:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=SIVRCM INTASOME IN COMPLEX WITH DOLUTEGRAVIR organism=? : x : HIS xxxx I0051 <- 3.80 -> DG xxx Q0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0146 <- 3.83 -> DG xxx Q0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0152 <- 3.53 -> DC xxx W0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0153 <- 3.72 -> DG xxx Q0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx I0156 <- 4.07 -> DC xxx W0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0157 <- 3.80 -> DT xxx Q0007 : score x.xxxxx >6rwn_IN:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=SIVRCM INTASOME IN COMPLEX WITH DOLUTEGRAVIR organism=SIMIAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS : w : ASP OD1 I0064 <- 6.52 -> DA N7 W0021 : score 2.429 : x : GLU xxxx N0246 <- 3.56 -> DT xxx Q0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx I0051 <- 3.80 -> DG xxx Q0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx I0067 <- 4.49 -> DA xxx W0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0092 <- 4.50 -> DA xxx W0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0146 <- 3.83 -> DG xxx Q0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0152 <- 3.53 -> DC xxx W0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0153 <- 3.72 -> DG xxx Q0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx I0156 <- 4.07 -> DC xxx W0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0157 <- 3.80 -> DT xxx Q0007 : score x.xxxxx >6rwo_AF:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=SIVRCM INTASOME (Q148H/G140S) IN COMPLEX WITH BICTEGRAVIR organism=SIMIAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS : w : ASP OD1 A0064 <- 6.49 -> DA N7 T0021 : score 2.429 : x : HIS xxxx A0051 <- 3.82 -> DG xxx S0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0067 <- 4.14 -> DA xxx T0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.75 -> DG xxx S0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.73 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0153 <- 3.51 -> DG xxx S0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0156 <- 3.99 -> DC xxx T0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0157 <- 3.70 -> DT xxx S0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0246 <- 4.41 -> DT xxx S0004 : score x.xxxxx >6rwo_DM:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=SIVRCM INTASOME (Q148H/G140S) IN COMPLEX WITH BICTEGRAVIR organism=SIMIAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS : H : ARG NE D0263 <- 2.98 -> DT O4 S0004 : score 1.79205 : x : GLN xxxx D0234 <- 3.93 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx >6rwo_EL:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=SIVRCM INTASOME (Q148H/G140S) IN COMPLEX WITH BICTEGRAVIR organism=SIMIAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS : x : GLN xxxx L0234 <- 3.92 -> DT xxx W0015 : score x.xxxxx >6rwo_IN:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=SIVRCM INTASOME (Q148H/G140S) IN COMPLEX WITH BICTEGRAVIR organism=SIMIAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS : x : HIS xxxx I0051 <- 3.82 -> DG xxx Q0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0146 <- 3.76 -> DG xxx Q0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0152 <- 3.72 -> DC xxx W0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0153 <- 3.50 -> DG xxx Q0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx I0156 <- 3.99 -> DC xxx W0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0157 <- 3.69 -> DT xxx Q0007 : score x.xxxxx >6ryd_EF:Homeodomain-like; title=WUS-HD BOUND TO TGAA DNA organism=Arabidopsis thaliana : H : ARG NH1 E0038 <- 2.88 -> DT O2 G0011 : score 4.23751 : w : GLN OE1 E0089 <- 6.24 -> DC N4 G0015 : score 3.488 : w : GLN OE1 E0089 <- 5.89 -> DA N6 G0014 : score 3.392 : H : ASN OD1 E0090 <- 2.88 -> DA N6 G0013 : score 5.92545 : H : ASN ND2 E0090 <- 2.97 -> DA N7 G0013 : score 5.67092 : w : ASN OD1 E0090 <- 6.07 -> DA N6 G0014 : score 2.837 : w : ASN OD1 E0090 <- 5.50 -> DT O4 H0003 : score 3.132 : H : ARG NH1 E0094 <- 3.05 -> DG N7 G0012 : score 5.7475 : H : ARG NH2 E0094 <- 2.64 -> DG O6 G0012 : score 6.8112 : H : ARG NH1 F0038 <- 2.89 -> DT O2 H0011 : score 4.22889 : w : GLN OE1 F0089 <- 6.08 -> DA N6 G0010 : score 3.392 : H : ASN OD1 F0090 <- 2.83 -> DA N6 G0009 : score 5.98566 : H : ASN ND2 F0090 <- 2.88 -> DA N7 G0009 : score 5.77658 : w : ASN OD1 F0090 <- 6.27 -> DA N6 G0010 : score 2.837 : w : ASN OD1 F0090 <- 5.83 -> DT O4 H0007 : score 3.132 : H : ARG NH1 F0094 <- 3.01 -> DG N7 G0008 : score 5.7959 : H : ARG NH2 F0094 <- 2.59 -> DG O6 G0008 : score 6.8772 : w : ARG NE F0094 <- 5.38 -> DT O4 H0008 : score 1.317 : w : ARG NH2 F0094 <- 5.17 -> DT O4 H0008 : score 2.366 : x : TYR xxxx E0086 <- 3.51 -> DA xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0093 <- 3.91 -> DT xxx H0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0085 <- 4.47 -> DT xxx H0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0086 <- 3.60 -> DA xxx G0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0093 <- 4.19 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx >6ryd_F:Homeodomain-like; title=WUS-HD BOUND TO TGAA DNA organism=Arabidopsis thaliana : H : ARG NH1 F0038 <- 2.89 -> DT O2 H0011 : score 4.22889 : w : GLN OE1 F0089 <- 6.08 -> DA N6 G0010 : score 3.392 : w : GLN NE2 F0089 <- 6.13 -> DT O4 G0011 : score 2.257 : H : ASN OD1 F0090 <- 2.83 -> DA N6 G0009 : score 5.98566 : H : ASN ND2 F0090 <- 2.88 -> DA N7 G0009 : score 5.77658 : w : ASN OD1 F0090 <- 6.27 -> DA N6 G0010 : score 2.837 : w : ASN OD1 F0090 <- 5.83 -> DT O4 H0007 : score 3.132 : H : ARG NH1 F0094 <- 3.01 -> DG N7 G0008 : score 5.7959 : H : ARG NH2 F0094 <- 2.59 -> DG O6 G0008 : score 6.8772 : w : ARG NE F0094 <- 5.38 -> DT O4 H0008 : score 1.317 : w : ARG NH2 F0094 <- 5.17 -> DT O4 H0008 : score 2.366 : x : PHE xxxx F0085 <- 4.47 -> DT xxx H0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0086 <- 3.60 -> DA xxx G0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0093 <- 4.19 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx >6ryi_AB:Homeodomain-like; title=WUS-HD BOUND TO G-BOX DNA organism=Arabidopsis thaliana : H : ASN OD1 A0090 <- 3.39 -> DA N6 G0012 : score 5.31122 : H : ASN ND2 A0090 <- 3.19 -> DA N7 G0012 : score 5.41261 : H : ARG NH1 A0094 <- 3.27 -> DG N7 G0011 : score 5.4813 : H : ARG NH2 A0094 <- 2.76 -> DG O6 G0011 : score 6.6528 : H : ASN OD1 B0090 <- 2.89 -> DA N6 F0012 : score 5.9134 : H : ASN ND2 B0090 <- 2.75 -> DA N7 F0012 : score 5.92922 : H : ARG NH1 B0094 <- 3.43 -> DG N7 F0011 : score 5.2877 : H : ARG NH2 B0094 <- 3.00 -> DG O6 F0011 : score 6.336 : V : GLN CG A0089 <- 3.74 -> DT C7 F0002 : score 3.30422 : x : ARG xxxx A0038 <- 2.98 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0086 <- 3.80 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0038 <- 3.53 -> DA xxx G0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0086 <- 3.34 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0089 <- 3.26 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx >6ryi_D:Homeodomain-like; title=WUS-HD BOUND TO G-BOX DNA organism=Arabidopsis thaliana : H : ASN OD1 D0090 <- 3.06 -> DA N6 I0012 : score 5.70866 : H : ASN ND2 D0090 <- 3.06 -> DA N7 I0012 : score 5.56525 : H : ARG NH1 D0094 <- 3.18 -> DG N7 I0011 : score 5.5902 : H : ARG NH2 D0094 <- 2.87 -> DG O6 I0011 : score 6.5076 : H : ARG NH2 D0094 <- 3.16 -> DT O4 H0005 : score 3.29797 : x : ARG xxxx D0038 <- 2.19 -> DC xxx H0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0086 <- 4.30 -> DC xxx I0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0089 <- 3.54 -> DT xxx H0002 : score x.xxxxx >6ryi_DE:Homeodomain-like; title=WUS-HD BOUND TO G-BOX DNA organism=Arabidopsis thaliana : H : ASN OD1 D0090 <- 3.06 -> DA N6 I0012 : score 5.70866 : H : ASN ND2 D0090 <- 3.06 -> DA N7 I0012 : score 5.56525 : H : ARG NH1 D0094 <- 3.18 -> DG N7 I0011 : score 5.5902 : H : ARG NH2 D0094 <- 3.16 -> DT O4 H0005 : score 3.29797 : H : ARG NH2 D0094 <- 2.87 -> DG O6 I0011 : score 6.5076 : H : ARG NH2 E0038 <- 2.27 -> DT O2 H0010 : score 4.68207 : H : ASN OD1 E0090 <- 3.13 -> DA N6 H0012 : score 5.62436 : H : ASN ND2 E0090 <- 3.02 -> DA N7 H0012 : score 5.61221 : H : ARG NH1 E0094 <- 3.07 -> DG N7 H0011 : score 5.7233 : H : ARG NH2 E0094 <- 2.77 -> DG O6 H0011 : score 6.6396 : V : TYR CD1 E0086 <- 3.51 -> DT C7 H0013 : score 5.0204 : x : ARG xxxx D0038 <- 2.19 -> DC xxx H0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0086 <- 4.30 -> DC xxx I0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0089 <- 3.54 -> DT xxx H0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0089 <- 3.09 -> DC xxx I0003 : score x.xxxxx >6ryl_A:Homeodomain-like; title=WUS-HD BOUND TO TAAT DNA organism=Arabidopsis thaliana : H : ASN OD1 A0090 <- 3.31 -> DA N6 F0005 : score 5.40757 : H : ASN ND2 A0090 <- 3.07 -> DA N7 F0005 : score 5.55351 : x : TYR xxxx A0086 <- 4.06 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0089 <- 3.17 -> DG xxx G0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0094 <- 2.99 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx >6ryl_ABC:Homeodomain-like; title=WUS-HD BOUND TO TAAT DNA organism=Arabidopsis thaliana : H : ASN OD1 A0090 <- 3.31 -> DA N6 F0005 : score 5.40757 : H : ASN ND2 A0090 <- 3.07 -> DA N7 F0005 : score 5.55351 : H : ARG NH1 B0038 <- 2.99 -> DT O2 G0004 : score 4.14277 : H : ASN OD1 B0090 <- 2.55 -> DA N6 G0006 : score 6.32288 : H : ASN ND2 B0090 <- 2.92 -> DA N7 G0006 : score 5.72962 : H : ASN OD1 C0090 <- 2.78 -> DA N6 F0013 : score 6.04588 : H : ASN ND2 C0090 <- 2.93 -> DA N7 F0013 : score 5.71788 : x : TYR xxxx A0086 <- 4.06 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0089 <- 3.17 -> DG xxx G0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0094 <- 2.99 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0086 <- 3.71 -> DA xxx G0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0093 <- 4.35 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0094 <- 4.36 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0096 <- 4.19 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0038 <- 3.39 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0086 <- 3.87 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0089 <- 4.19 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx >6ryl_DE:Homeodomain-like; title=WUS-HD BOUND TO TAAT DNA organism=Arabidopsis thaliana : H : ARG NH1 D0038 <- 2.65 -> DT O2 I0015 : score 4.4356 : H : ASN OD1 D0090 <- 3.09 -> DA N6 H0005 : score 5.67253 : H : ASN ND2 D0090 <- 2.85 -> DA N7 H0005 : score 5.81181 : H : ARG NH1 E0038 <- 2.65 -> DT O2 I0005 : score 4.4356 : H : ASN OD1 E0090 <- 3.20 -> DA N6 I0007 : score 5.54005 : H : ASN ND2 E0090 <- 2.94 -> DA N7 I0007 : score 5.70614 : x : TYR xxxx D0086 <- 3.63 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0089 <- 3.18 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0086 <- 3.52 -> DT xxx I0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0089 <- 3.10 -> DC xxx H0008 : score x.xxxxx >6ryu_V:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like; title=NUCLEOSOME-CHD4 COMPLEX STRUCTURE (TWO CHD4 COPIES) organism=? : x : ARG xxxx V1127 <- 3.30 -> DC xxx J-020 : score x.xxxxx >6s01_E:Histone-fold; title=STRUCTURE OF LEDGF PWWP DOMAIN BOUND H3K36 METHYLATED NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH1 E0040 <- 3.06 -> DG N3 I0009 : score 2.89383 : x : ARG xxxx E0042 <- 4.40 -> DG xxx J0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.23 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx >6s16_B:Ribonuclease_H-like; title=T. THERMOPHILUS RUVC IN COMPLEX WITH HOLLIDAY JUNCTION SUBSTRATE organism=? : H : ARG NH2 B0076 <- 3.44 -> DA N7 F0024 : score 1.45781 : H : GLN NE2 B0077 <- 3.21 -> DT O2 C0009 : score 3.6108 : x : PHE xxxx B0074 <- 3.24 -> DA xxx F0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0080 <- 3.62 -> DG xxx F0026 : score x.xxxxx >6s1n_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HUMAN POLYMERASE DELTA HOLOENZYME CONFORMER 2 organism=HOMO SAPIENS : H : GLN NE2 A0440 <- 3.34 -> DG O6 T0001 : score 5.17817 : x : GLN xxxx A0551 <- 4.45 -> DA xxx T0000 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0695 <- 4.24 -> DA xxx T0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0698 <- 4.38 -> DA xxx T0000 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0699 <- 4.09 -> DA xxx T0000 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0807 <- 3.67 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0808 <- 4.12 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0833 <- 3.73 -> DT xxx P0022 : score x.xxxxx >6s1o_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HUMAN POLYMERASE DELTA HOLOENZYME CONFORMER 3 organism=HOMO SAPIENS : H : GLN NE2 A0440 <- 3.05 -> DG O6 T0001 : score 5.51487 : x : GLN xxxx A0551 <- 3.71 -> DA xxx T0000 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0699 <- 4.40 -> DA xxx T0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0833 <- 3.99 -> DA xxx P0021 : score x.xxxxx >6s3h_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HELICASE PIF1 FROM THERMUS OSHIMAI IN COMPLEX WITH ADP-ALF4 AND (DT)7DS11BP organism=Thermus oshimai JL-2 : w : HIS NE2 A0131 <- 5.72 -> DT O2 D0006 : score 3.682 : w : ARG NH1 A0177 <- 6.51 -> DT O4 D0005 : score 1.768 : w : GLU OE2 A0214 <- 6.74 -> DT O2 D0004 : score 2.279 : w : GLU OE1 A0222 <- 5.96 -> DT O4 D0005 : score 2.749 : H : ARG NE A0302 <- 3.05 -> DT O2 D0003 : score 2.44808 : H : ARG NH2 A0302 <- 2.79 -> DT O2 D0003 : score 4.2418 : V : TRP CD1 A0396 <- 3.61 -> DT C7 D0008 : score 7.68167 : x : ALA xxxx A0138 <- 3.41 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0216 <- 3.39 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0218 <- 3.68 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0332 <- 3.29 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0338 <- 3.70 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0398 <- 3.45 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0451 <- 3.33 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >6s3n_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HELICASE PIF1 FROM THERMUS OSHIMAI IN COMPLEX WITH SSDNA (DT)18 AND ADP-VO4 organism=Thermus oshimai : H : ARG NH2 A0392 <- 2.59 -> DT O4 D0003 : score 3.70311 >6s48_A: title=AVAII RESTRICTION ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH PARTIALLY CLEAVED DSDNA organism=NOSTOC SP. PCC 7120 = FACHB-418 : H : LYS NZ A0046 <- 3.24 -> DT O2 E0010 : score 3.27151 : w : LYS NZ A0046 <- 5.55 -> DT O2 C0003 : score 0.522 : H : ASN OD1 A0116 <- 2.93 -> DG N2 C0005 : score 4.6752 A : w : SER OG A0141 <- 5.80 -> DT O2 C0003 : score 1.55 : H : ASN ND2 A0170 <- 2.98 -> DG O6 E0005 : score 5.43548 : w : SER OG A0173 <- 5.38 -> DT O4 C0006 : score 2.338 : x : ASN xxxx A0167 <- 3.49 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0168 <- 3.66 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0171 <- 3.20 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >6s48_AB: title=AVAII RESTRICTION ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH PARTIALLY CLEAVED DSDNA organism=NOSTOC SP. PCC 7120 = FACHB-418 : H : LYS NZ A0046 <- 3.24 -> DT O2 E0010 : score 3.27151 : w : LYS NZ A0046 <- 5.55 -> DT O2 C0003 : score 0.522 : H : ASN OD1 A0116 <- 2.93 -> DG N2 C0005 : score 4.6752 A : w : SER OG A0141 <- 5.80 -> DT O2 C0003 : score 1.55 : H : ASN ND2 A0170 <- 2.98 -> DG O6 E0005 : score 5.43548 : w : SER OG A0173 <- 5.38 -> DT O4 C0006 : score 2.338 : H : ASN OD1 B0116 <- 3.05 -> DG N2 E0005 : score 4.56 A : H : ASN ND2 B0170 <- 2.81 -> DG O6 C0005 : score 5.62718 : w : ASN ND2 B0170 <- 6.11 -> DT O4 C0006 : score 3.275 : x : ASN xxxx A0167 <- 3.49 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0168 <- 3.66 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0171 <- 3.20 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0046 <- 3.64 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0167 <- 3.31 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0168 <- 3.90 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0171 <- 3.30 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0191 <- 4.22 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx >6s6h_A:KorB_DNA-binding_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF THE CHROMOSOME- PARTITIONING PROTEIN PARB COMPLEXED TO THE CENTROMERIC PARS SITE organism=Caulobacter vibrioides NA1000 : H : ARG NH1 A0173 <- 3.00 -> DG N7 C0004 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0173 <- 2.73 -> DG O6 C0004 : score 6.6924 : w : SER OG A0174 <- 6.00 -> DA N7 D0015 : score 2.343 : H : ASN ND2 A0178 <- 2.91 -> DT O4 C0006 : score 5.16835 : w : ASN ND2 A0178 <- 5.95 -> DA N6 D0014 : score 2.5 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.99 -> DG N7 D0013 : score 5.8201 : H : ARG NH2 A0204 <- 2.79 -> DG O6 D0013 : score 6.6132 : H : ARG NH1 A0227 <- 2.98 -> DG N7 D0011 : score 5.8322 : H : ARG NH2 A0227 <- 2.94 -> DT O4 D0012 : score 3.45434 : H : GLU OE2 A0230 <- 2.95 -> DC N4 C0008 : score 5.10742 : V : ALA CB A0177 <- 3.71 -> DT C7 C0005 : score 5.72495 : x : GLN xxxx A0162 <- 4.35 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0172 <- 3.66 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0181 <- 3.78 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0226 <- 3.75 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx >6s6h_AB:KorB_DNA-binding_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF THE CHROMOSOME- PARTITIONING PROTEIN PARB COMPLEXED TO THE CENTROMERIC PARS SITE organism=Caulobacter vibrioides NA1000 : H : ARG NH1 A0173 <- 3.00 -> DG N7 C0004 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0173 <- 2.73 -> DG O6 C0004 : score 6.6924 : w : SER OG A0174 <- 6.00 -> DA N7 D0015 : score 2.343 : H : ASN ND2 A0178 <- 2.91 -> DT O4 C0006 : score 5.16835 : w : ASN ND2 A0178 <- 5.95 -> DA N6 D0014 : score 2.5 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.99 -> DG N7 D0013 : score 5.8201 : H : ARG NH2 A0204 <- 2.79 -> DG O6 D0013 : score 6.6132 : H : ARG NH1 A0227 <- 2.98 -> DG N7 D0011 : score 5.8322 : H : ARG NH2 A0227 <- 2.94 -> DT O4 D0012 : score 3.45434 : H : GLU OE2 A0230 <- 2.95 -> DC N4 C0008 : score 5.10742 : H : ARG NH1 B0173 <- 2.97 -> DG N7 D0004 : score 5.8443 : H : ARG NH2 B0173 <- 2.74 -> DG O6 D0004 : score 6.6792 : H : ASN ND2 B0178 <- 2.88 -> DT O4 D0006 : score 5.20006 : w : ASN ND2 B0178 <- 6.07 -> DA N6 C0014 : score 2.5 : H : ARG NH1 B0204 <- 2.95 -> DG N7 C0013 : score 5.8685 : H : ARG NH2 B0204 <- 2.79 -> DG O6 C0013 : score 6.6132 : H : ARG NH1 B0227 <- 2.92 -> DG N7 C0011 : score 5.9048 : H : ARG NH1 B0227 <- 3.20 -> DT O4 C0012 : score 3.00651 : H : ARG NH2 B0227 <- 2.91 -> DT O4 C0012 : score 3.47566 : H : GLU OE2 B0230 <- 2.93 -> DC N4 D0008 : score 5.12848 : V : ALA CB B0177 <- 3.67 -> DT C7 D0005 : score 5.78094 : V : ALA CB A0177 <- 3.71 -> DT C7 C0005 : score 5.72495 : x : GLN xxxx A0162 <- 4.35 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0172 <- 3.66 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0181 <- 3.78 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0226 <- 3.75 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0162 <- 4.37 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0172 <- 3.67 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0174 <- 3.23 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0181 <- 3.74 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0226 <- 3.71 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx >6s85_AD:Metallo-dependent_phosphatases;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CUTTING STATE OF THE E. COLI MRE11-RAD50 (SBCCD) HEAD COMPLEX BOUND TO ADP AND DSDNA. organism=ESCHERICHIA COLI : x : GLN xxxx D0066 <- 4.16 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0110 <- 3.45 -> DT xxx F0054 : score x.xxxxx >6s85_C:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CUTTING STATE OF THE E. COLI MRE11-RAD50 (SBCCD) HEAD COMPLEX BOUND TO ADP AND DSDNA. organism=ESCHERICHIA COLI : x : LYS xxxx C0890 <- 4.16 -> DT xxx F0066 : score x.xxxxx >6sa1_A: title=POST CATALYTIC COMPLEX OF PRIM-POLC FROM MYCOBACTERIUM SMEGMATIS WITH GAPPED DNA AND 3'-DUTP organism=? : H : ARG NH2 A0063 <- 2.99 -> DG N3 B0001 : score 3.47307 : H : GLU OE2 A0071 <- 3.12 -> DC N4 C0007 : score 4.9284 : x : PRO xxxx A0065 <- 3.57 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0073 <- 3.45 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0075 <- 4.45 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx >6sdg_AB:DNA-binding_pseudobarrel_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF M. POLYMORPHA AUXIN RESPONSE FACTOR 2 (MPARF2) IN COMPLEX WITH HIGH AFFINITY DNA organism=Marchantia polymorpha : H : HIS NE2 A0141 <- 3.00 -> DG O6 C0006 : score 7.63569 : H : HIS NE2 A0141 <- 2.83 -> DG O6 D0013 : score 7.90612 : H : ARG NH1 B0191 <- 2.81 -> DT O4 D0003 : score 3.26141 : H : ARG NH2 B0191 <- 2.64 -> DG N7 D0002 : score 6.58892 : V : PRO CG B0189 <- 3.69 -> DT C7 D0000 : score 6.53385 : x : SER xxxx A0136 <- 4.06 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0186 <- 3.83 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0189 <- 3.25 -> DT xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0191 <- 2.52 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0136 <- 3.49 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0141 <- 2.17 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0145 <- 4.27 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0186 <- 3.39 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx >6sdg_B:DNA-binding_pseudobarrel_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF M. POLYMORPHA AUXIN RESPONSE FACTOR 2 (MPARF2) IN COMPLEX WITH HIGH AFFINITY DNA organism=Marchantia polymorpha : H : ARG NH1 B0191 <- 2.81 -> DT O4 D0003 : score 3.26141 : H : ARG NH2 B0191 <- 2.64 -> DG N7 D0002 : score 6.58892 : V : PRO CG B0189 <- 3.69 -> DT C7 D0000 : score 6.53385 : x : SER xxxx B0136 <- 3.49 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0141 <- 2.17 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0145 <- 4.27 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0186 <- 3.39 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx >6se0_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CLASS 1 : CENP-A NUCLEOSOME organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 G0011 <- 2.90 -> DC O2 I0044 : score 3.62474 : x : ARG xxxx C0011 <- 3.63 -> DT xxx J0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.81 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.18 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.38 -> DC xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.84 -> DG xxx J-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 4.38 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx >6se6_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CLASS2 : CENP-A NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH CENP-C CENTRAL REGION organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx D0033 <- 3.47 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0011 <- 3.97 -> DT xxx I0043 : score x.xxxxx >6see_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CLASS2A : CENP-A NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH CENP-C CENTRAL REGION organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0045 <- 4.24 -> DC xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.53 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >6sef_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CLASS2C : CENP-A NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH CENP-C CENTRAL REGION organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx D0033 <- 3.47 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0011 <- 4.16 -> DC xxx I0044 : score x.xxxxx >6seg_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CLASS1: CENP-A NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH CENP-C CENTRAL REGION organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0035 <- 3.91 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.98 -> DC xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.18 -> DC xxx J0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.62 -> DT xxx I-047 : score x.xxxxx >6seg_B:Histone-fold; title=CLASS1: CENP-A NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH CENP-C CENTRAL REGION organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0035 <- 3.91 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.98 -> DC xxx J0007 : score x.xxxxx >6sei_AC:RING/U-box;GIY-YIG_endonuclease; title=RECOGNITION AND PROCESSING OF BRANCHED DNA SUBSTRATES BY SLX1-SLX4 NUCLEASE organism=THIELAVIA TERRESTRIS : H : ARG NH1 A0022 <- 2.63 -> DA N3 E0030 : score 3.80724 : H : ARG NH1 C0022 <- 3.12 -> DT O2 E0011 : score 4.0308 : w : ARG NE C0022 <- 6.58 -> DG N3 E0012 : score 1.082 >6sei_C:RING/U-box;GIY-YIG_endonuclease; title=RECOGNITION AND PROCESSING OF BRANCHED DNA SUBSTRATES BY SLX1-SLX4 NUCLEASE organism=THIELAVIA TERRESTRIS : H : ARG NH1 C0022 <- 3.12 -> DT O2 E0011 : score 4.0308 : w : ARG NE C0022 <- 6.58 -> DG N3 E0012 : score 1.082 >6sjb_BCD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE RECBCD CHI RECOGNISED COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NE B0559 <- 2.63 -> DT O2 X0071 : score 2.66454 : H : LYS NZ C0088 <- 2.79 -> DG O6 X0079 : score 5.79233 : H : ASP OD2 C0136 <- 2.53 -> DG N2 X0083 : score 5.75376 : H : THR OG1 C0663 <- 2.67 -> DC O2 X0080 : score 2.69391 : H : ARG NH1 C0706 <- 3.05 -> DG O6 X0083 : score 5.77917 : H : ARG NH2 C0706 <- 3.02 -> DG N7 X0083 : score 6.10369 : V : PHE CD2 B0422 <- 3.84 -> DT C7 X0072 : score 6.44668 : V : GLN CG B0134 <- 3.78 -> DT C7 X0077 : score 3.27166 : V : ARG CZ C0653 <- 3.79 -> DT C7 X0087 : score 2.13764 : V : SER CB B0907 <- 3.89 -> DT C7 X0090 : score 3.06083 : x : PHE xxxx B0064 <- 4.00 -> DT xxx X0074 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0130 <- 3.71 -> DT xxx X0075 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0138 <- 3.52 -> DT xxx X0077 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0150 <- 3.41 -> DT xxx X0077 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0152 <- 3.59 -> DT xxx X0076 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0154 <- 3.95 -> DT xxx X0075 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0252 <- 3.91 -> DG xxx X0059 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0351 <- 3.60 -> DT xxx X0075 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0354 <- 3.94 -> DT xxx X0077 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0423 <- 3.34 -> DT xxx X0074 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0560 <- 4.02 -> DT xxx X0071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0584 <- 3.46 -> DT xxx X0073 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0742 <- 3.66 -> DT xxx X0072 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0761 <- 3.18 -> DT xxx X0071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0824 <- 3.49 -> DG xxx X0067 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0953 <- 3.75 -> DT xxx X0090 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0037 <- 4.10 -> DG xxx X0086 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0039 <- 4.11 -> DT xxx X0081 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0040 <- 3.82 -> DG xxx X0086 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0043 <- 4.34 -> DG xxx X0086 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0062 <- 4.05 -> DG xxx X0086 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0064 <- 3.45 -> DG xxx X0085 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0065 <- 3.30 -> DG xxx X0085 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0066 <- 3.32 -> DG xxx X0085 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0067 <- 4.04 -> DG xxx X0086 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0070 <- 3.25 -> DT xxx X0084 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0084 <- 3.34 -> DT xxx X0084 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0133 <- 2.92 -> DG xxx X0079 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0137 <- 3.23 -> DG xxx X0082 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0140 <- 3.51 -> DG xxx X0083 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0141 <- 3.30 -> DG xxx X0083 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0186 <- 3.57 -> DT xxx X0084 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0443 <- 3.94 -> DT xxx X0087 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0492 <- 3.98 -> DT xxx X0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0556 <- 4.10 -> DT xxx X0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0649 <- 4.47 -> DG xxx X0085 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0650 <- 3.67 -> DT xxx X0081 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0651 <- 3.64 -> DT xxx X0087 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0652 <- 3.19 -> DT xxx X0081 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0665 <- 3.31 -> DT xxx X0081 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0666 <- 2.92 -> DT xxx X0081 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0685 <- 3.48 -> DC xxx X0080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0708 <- 3.65 -> DC xxx X0080 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0712 <- 2.86 -> DC xxx X0080 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0715 <- 4.30 -> DC xxx X0080 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0875 <- 3.70 -> DT xxx X0014 : score x.xxxxx : x : TYR 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DT xxx X0004 : score x.xxxxx >6sje_BCD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE RECBCD CHI PARTIALLY-RECOGNISED COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NE B0559 <- 2.62 -> DT O2 X0071 : score 2.66969 : H : LYS NZ C0088 <- 2.92 -> DG O6 X0079 : score 5.64203 : H : ASP OD2 C0136 <- 2.46 -> DG N2 X0083 : score 5.83018 : H : THR OG1 C0663 <- 2.37 -> DC O2 X0080 : score 2.85145 : H : ARG NH1 C0706 <- 3.21 -> DG O6 X0083 : score 5.5845 : H : ARG NH2 C0706 <- 3.15 -> DG N7 X0083 : score 5.93769 : V : LEU CD1 C0875 <- 3.80 -> DT C7 X0013 : score 5.73128 : V : ARG CZ B0584 <- 3.73 -> DT C7 X0073 : score 2.16962 : V : PHE CZ B0351 <- 3.81 -> DT C7 X0075 : score 7.09708 : V : GLN CG B0134 <- 3.83 -> DT C7 X0077 : score 3.23097 : V : ARG CZ C0653 <- 3.66 -> DT C7 X0087 : score 2.20694 : x : PHE xxxx B0064 <- 4.18 -> DT xxx X0074 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0130 <- 3.70 -> DT xxx X0075 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx 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>6sje_C:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE RECBCD CHI PARTIALLY-RECOGNISED COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : LYS NZ C0088 <- 2.92 -> DG O6 X0079 : score 5.64203 : H : ASP OD2 C0136 <- 2.46 -> DG N2 X0083 : score 5.83018 : H : THR OG1 C0663 <- 2.37 -> DC O2 X0080 : score 2.85145 : H : ARG NH1 C0706 <- 3.21 -> DG O6 X0083 : score 5.5845 : H : ARG NH2 C0706 <- 3.15 -> DG N7 X0083 : score 5.93769 : V : LEU CD1 C0875 <- 3.80 -> DT C7 X0013 : score 5.73128 : V : ARG CZ C0653 <- 3.66 -> DT C7 X0087 : score 2.20694 : x : VAL xxxx C0037 <- 4.23 -> DG xxx X0086 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0039 <- 3.79 -> DT xxx X0081 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0040 <- 3.87 -> DG xxx X0086 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0043 <- 3.96 -> DG xxx X0086 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0062 <- 3.62 -> DG xxx X0086 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0063 <- 4.28 -> DG xxx X0086 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0064 <- 3.46 -> DG 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>6sjf_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE RECBCD CHI UNRECOGNISED COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : x : ILE xxxx B0252 <- 4.19 -> DG xxx X0059 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0824 <- 3.78 -> DG xxx X0067 : score x.xxxxx >6sjf_BCD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE RECBCD CHI UNRECOGNISED COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : x : ILE xxxx B0252 <- 4.19 -> DG xxx X0059 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0824 <- 3.78 -> DG xxx X0067 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C1073 <- 4.32 -> DT xxx X0069 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C1078 <- 3.11 -> DC xxx X0070 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1079 <- 3.81 -> DC xxx X0070 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1080 <- 3.50 -> DG xxx X0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C1081 <- 3.42 -> DG xxx X0016 : score x.xxxxx >6sjf_C:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE RECBCD CHI UNRECOGNISED COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : x : GLN xxxx C1073 <- 4.32 -> DT xxx X0069 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C1078 <- 3.11 -> DC xxx X0070 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1079 <- 3.81 -> DC xxx X0070 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1080 <- 3.50 -> DG xxx X0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C1081 <- 3.42 -> DG xxx X0016 : score x.xxxxx >6sjg_BCD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE RECBCD NO CHI NEGATIVE CONTROL COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NE B0559 <- 2.79 -> DT O2 X0071 : score 2.58208 : H : GLU OE2 D0305 <- 3.22 -> DT N3 X0007 : score 2.41448 : V : LEU CD1 C0875 <- 3.83 -> DT C7 X0013 : score 5.6883 : V : PHE CD2 B0422 <- 3.85 -> DT C7 X0072 : score 6.4304 : V : ARG CZ B0584 <- 3.76 -> DT C7 X0073 : score 2.15363 : V : PHE CZ B0351 <- 3.73 -> DT 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>6sjg_C:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE RECBCD NO CHI NEGATIVE CONTROL COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : V : LEU CD1 C0875 <- 3.83 -> DT C7 X0013 : score 5.6883 : x : TYR xxxx C0492 <- 3.73 -> DT xxx X0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0858 <- 4.48 -> DT xxx X0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0878 <- 3.26 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0879 <- 4.21 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C1073 <- 4.27 -> DT xxx X0069 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C1078 <- 3.17 -> DC xxx X0070 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1079 <- 3.87 -> DC xxx X0070 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1080 <- 3.75 -> DG xxx X0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C1081 <- 3.41 -> DG xxx X0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C1082 <- 3.35 -> DT xxx X0015 : score x.xxxxx >6skl_34567XY: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE CMG FORK PROTECTION COMPLEX AT A REPLICATION FORK - CONFORMATION 1 organism=? : H : ARG NH1 Y0048 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HALF-SITES organism=? : H : ARG NH1 B0019 <- 3.40 -> DG O6 E0004 : score 5.35333 : H : LYS NZ B0039 <- 2.55 -> DG N7 H0014 : score 5.65519 : H : LYS NZ B0039 <- 2.56 -> DG O6 H0014 : score 6.05825 : H : LYS NZ B0040 <- 2.47 -> DG N7 H0011 : score 5.74137 : H : LYS NZ B0115 <- 2.77 -> DG O6 E0014 : score 5.81545 : H : LYS NZ B0115 <- 3.12 -> DG N7 H0004 : score 5.0412 : x : SER xxxx B0037 <- 3.76 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0095 <- 4.36 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx >6t1f_AB:KorB_DNA-binding_domain-like;ParB/Sulfiredoxin; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE C-TERMINALLY TRUNCATED CHROMOSOME- PARTITIONING PROTEIN PARB FROM CAULOBACTER CRESCENTUS COMPLEXED TO THE CENTROMERIC PARS SITE organism=Caulobacter vibrioides (strain NA1000 / CB15N) / Caulobacter vibrioides (strain NA1000 / CB15N) / Caulobacter vibrioides (strain NA1000 / CB15N) / Caulobacter vibrioides (strain NA1000 / CB15N) : H : ARG NH1 A0173 <- 3.32 -> DG N7 E0005 : score 5.4208 : H : ARG NH2 A0173 <- 3.33 -> DG N7 E0005 : score 5.70785 : H : ARG NH2 A0173 <- 2.44 -> DG O6 E0005 : score 7.0752 : H : SER OG A0174 <- 3.01 -> DA N7 F0016 : score 4.27661 : H : ASN ND2 A0178 <- 3.10 -> DT O4 E0007 : score 4.96754 : H : ARG NH1 A0204 <- 2.83 -> DG N7 F0014 : score 6.0137 : H : ARG NH2 A0204 <- 3.28 -> DG N7 F0014 : score 5.77169 : H : ARG NH2 A0204 <- 2.49 -> DG O6 F0014 : score 7.0092 : H : ARG NH1 A0227 <- 3.18 -> DT O4 F0013 : score 3.01958 : H : ARG NH2 A0227 <- 2.94 -> DT O4 F0013 : score 3.45434 : H : GLU OE2 A0230 <- 3.00 -> DC N4 E0009 : score 5.05477 : H : ARG NH2 B0173 <- 3.17 -> DG N7 F0005 : score 5.91215 : H : ARG NH2 B0173 <- 2.42 -> DG O6 F0005 : score 7.1016 : H : SER OG B0174 <- 2.81 -> DA N7 E0016 : score 4.45517 : H : ASN ND2 B0178 <- 3.02 -> DT O4 F0007 : score 5.05209 : H : ARG NH1 B0204 <- 2.69 -> DG N7 E0014 : score 6.1831 : H : ARG NH2 B0204 <- 2.59 -> DG O6 E0014 : score 6.8772 : H : ARG NH1 B0227 <- 2.80 -> DT O4 E0013 : score 3.26795 : H : ARG NH2 B0227 <- 2.85 -> DT O4 E0013 : score 3.51831 : H : GLU OE2 B0230 <- 2.69 -> DC N4 F0009 : score 5.38122 : V : ALA CB B0177 <- 3.55 -> DT C7 F0006 : score 5.94891 : V : ALA CB A0177 <- 3.60 -> DT C7 E0006 : score 5.87892 : x : GLN xxxx A0162 <- 4.05 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0172 <- 3.80 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0181 <- 3.94 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0226 <- 3.81 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0162 <- 4.24 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0172 <- 3.66 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0181 <- 3.84 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0226 <- 3.65 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx >6t1f_B:KorB_DNA-binding_domain-like;ParB/Sulfiredoxin; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE C-TERMINALLY TRUNCATED CHROMOSOME- PARTITIONING PROTEIN PARB FROM CAULOBACTER CRESCENTUS COMPLEXED TO THE CENTROMERIC PARS SITE organism=Caulobacter vibrioides (strain NA1000 / CB15N) / Caulobacter vibrioides (strain NA1000 / CB15N) : H : ARG NH2 B0173 <- 3.17 -> DG N7 F0005 : score 5.91215 : H : ARG NH2 B0173 <- 2.42 -> DG O6 F0005 : score 7.1016 : H : SER OG B0174 <- 2.81 -> DA N7 E0016 : score 4.45517 : H : ASN ND2 B0178 <- 3.02 -> DT O4 F0007 : score 5.05209 : H : ARG NH1 B0204 <- 2.69 -> DG N7 E0014 : score 6.1831 : H : ARG NH2 B0204 <- 2.59 -> DG O6 E0014 : score 6.8772 : H : ARG NH1 B0227 <- 2.80 -> DT O4 E0013 : score 3.26795 : H : ARG NH2 B0227 <- 2.85 -> DT O4 E0013 : score 3.51831 : H : GLU OE2 B0230 <- 2.69 -> DC N4 F0009 : score 5.38122 : V : ALA CB B0177 <- 3.55 -> DT C7 F0006 : score 5.94891 : x : GLN xxxx B0162 <- 4.24 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0172 <- 3.66 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0181 <- 3.84 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0226 <- 3.65 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx >6t1f_CD:KorB_DNA-binding_domain-like;ParB/Sulfiredoxin; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE C-TERMINALLY TRUNCATED CHROMOSOME- PARTITIONING PROTEIN PARB FROM CAULOBACTER CRESCENTUS COMPLEXED TO THE CENTROMERIC PARS SITE organism=Caulobacter vibrioides (strain NA1000 / CB15N) / Caulobacter vibrioides (strain NA1000 / CB15N) / Caulobacter vibrioides (strain NA1000 / CB15N) / Caulobacter vibrioides (strain NA1000 / CB15N) : H : ARG NH1 C0173 <- 3.24 -> DG N7 G0005 : score 5.5176 : H : ARG NH2 C0173 <- 2.31 -> DG O6 G0005 : score 7.2468 : H : SER OG C0174 <- 3.05 -> DA N7 H0016 : score 4.2409 : H : ASN ND2 C0178 <- 3.09 -> DT O4 G0007 : score 4.97811 : H : ARG NH1 C0204 <- 3.01 -> DG N7 H0014 : score 5.7959 : H : ARG NH2 C0204 <- 3.28 -> DG N7 H0014 : score 5.77169 : H : ARG NH2 C0204 <- 2.72 -> DG O6 H0014 : score 6.7056 : H : ARG NH1 C0227 <- 3.11 -> DG N7 H0012 : score 5.6749 : H : ARG NH1 C0227 <- 3.12 -> DT O4 H0013 : score 3.0588 : H : ARG NH2 C0227 <- 3.05 -> DT O4 H0013 : score 3.37615 : H : GLU OE2 C0230 <- 3.00 -> DC N4 G0009 : score 5.05477 : H : ARG NH1 D0173 <- 3.32 -> DG N7 H0005 : score 5.4208 : H : ARG NH2 D0173 <- 3.24 -> DG N7 H0005 : score 5.82277 : H : ARG NH2 D0173 <- 2.36 -> DG O6 H0005 : score 7.1808 : H : SER OG D0174 <- 2.84 -> DA N7 G0016 : score 4.42839 : H : ASN ND2 D0178 <- 2.96 -> DT O4 H0007 : score 5.11551 : H : ARG NH1 D0204 <- 2.83 -> DG N7 G0014 : score 6.0137 : H : ARG NH2 D0204 <- 3.16 -> DG N7 G0014 : score 5.92492 : H : ARG NH2 D0204 <- 2.61 -> DG O6 G0014 : score 6.8508 : H : ARG NH1 D0227 <- 3.16 -> DT O4 G0013 : score 3.03266 : H : ARG NH2 D0227 <- 2.81 -> DT O4 G0013 : score 3.54674 : H : GLU OE2 D0230 <- 2.90 -> DC N4 H0009 : score 5.16008 : V : ALA CB D0177 <- 3.52 -> DT C7 H0006 : score 5.9909 : V : ALA CB C0177 <- 3.54 -> DT C7 G0006 : score 5.96291 : x : GLN xxxx C0162 <- 4.10 -> DT xxx G0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0172 <- 3.76 -> DA xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0181 <- 4.05 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0226 <- 3.82 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0162 <- 4.09 -> DT xxx H0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0172 <- 3.59 -> DA xxx G0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0181 <- 3.75 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0226 <- 3.74 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx >6t21_B: title=N-TERMINAL DOMAIN OF ECOKMCRA RESTRICTION ENDONUCLEASE (NECO) IN COMPLEX WITH T5MCGA TARGET SEQUENCE organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NH2 B0109 <- 3.08 -> DT O2 E0004 : score 3.99627 : H : ASN ND2 B0119 <- 3.02 -> DG O6 E0006 : score 5.39037 : V : THR CG2 B0121 <- 3.67 -> DT C7 F0004 : score 4.37462 : x : SER xxxx B0030 <- 3.90 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0031 <- 3.59 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0033 <- 3.40 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0036 <- 3.92 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0120 <- 3.80 -> DA xxx F0002 : score x.xxxxx >6t22_A: title=N-TERMINAL DOMAIN OF ECOKMCRA RESTRICTION ENDONUCLEASE (NECO) IN COMPLEX WITH T5HMCGA TARGET SEQUENCE organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : H : ARG NH2 A0109 <- 2.98 -> DT O2 C0004 : score 4.08093 : H : ASN ND2 A0119 <- 3.24 -> DG O6 C0006 : score 5.14228 : V : THR CG2 A0121 <- 3.69 -> DT C7 D0004 : score 4.35344 : x : SER xxxx A0030 <- 3.93 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0031 <- 3.68 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0033 <- 3.37 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0036 <- 3.80 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0120 <- 4.29 -> DA xxx D0002 : score x.xxxxx >6t2u_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE RECBCD IN COMPLEX WITH CHI-MINUS2 SUBSTRATE organism=? : H : ARG NE B0559 <- 3.02 -> DT O2 X0071 : score 2.46354 : V : ARG CZ B0584 <- 3.52 -> DT C7 X0073 : score 2.28157 : x : LEU xxxx B0152 <- 3.82 -> DT xxx X0076 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0252 <- 4.39 -> DG xxx X0059 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0351 <- 4.00 -> DT xxx X0075 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0422 <- 3.76 -> DT xxx X0073 : score x.xxxxx : x : ARG 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-> DT xxx X0071 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0742 <- 3.42 -> DT xxx X0072 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0761 <- 3.48 -> DT xxx X0071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0824 <- 4.25 -> DG xxx X0067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0858 <- 4.23 -> DT xxx X0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0878 <- 3.98 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0879 <- 3.94 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C1078 <- 3.81 -> DG xxx X0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1079 <- 3.73 -> DC xxx X0070 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1080 <- 3.39 -> DG xxx X0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C1081 <- 3.95 -> DG xxx X0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C1082 <- 3.26 -> DT xxx X0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0012 <- 3.72 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0048 <- 3.86 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0241 <- 3.83 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0247 <- 3.53 -> DT xxx X0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0248 <- 3.38 -> DT xxx X0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0254 <- 4.37 -> DT xxx X0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0304 <- 3.34 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0305 <- 3.54 -> DT xxx X0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0445 <- 4.13 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0486 <- 3.32 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0539 <- 3.71 -> DT xxx X0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0559 <- 4.39 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0560 <- 3.49 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx >6t2v_BCD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE RECBCD IN COMPLEX WITH CHI-PLUS2 SUBSTRATE organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NE B0559 <- 2.95 -> DT O2 X0071 : score 2.49962 : H : GLU OE2 D0305 <- 3.37 -> DT N3 X0007 : score 2.33541 : V : LEU CD1 C0875 <- 3.72 -> DT C7 X0013 : score 5.84591 : V : ARG CZ B0584 <- 3.69 -> DT C7 X0073 : score 2.19095 : x : LEU xxxx B0152 <- 3.58 -> DT xxx X0076 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0252 <- 4.06 -> DG xxx X0059 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0351 <- 3.68 -> DT xxx X0075 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0422 <- 3.62 -> DT xxx X0073 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0423 <- 3.54 -> DT xxx X0074 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0560 <- 4.28 -> DT xxx X0071 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0742 <- 3.32 -> DT xxx X0072 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0761 <- 3.55 -> DT xxx X0071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0858 <- 3.59 -> DT xxx X0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0878 <- 3.49 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0879 <- 3.96 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C1078 <- 3.85 -> DG xxx X0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1079 <- 3.73 -> DC xxx X0070 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1080 <- 3.25 -> DG xxx X0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C1081 <- 3.66 -> DG xxx X0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C1082 <- 3.91 -> DT xxx X0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0012 <- 3.60 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0048 <- 4.32 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0241 <- 3.61 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0247 <- 3.16 -> DT xxx X0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0248 <- 3.44 -> DT xxx X0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0254 <- 4.15 -> DT xxx X0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0304 <- 3.22 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0486 <- 3.65 -> DT xxx X0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0539 <- 3.12 -> DT xxx X0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0560 <- 3.34 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx >6t2v_C:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE RECBCD IN COMPLEX WITH CHI-PLUS2 SUBSTRATE organism=ESCHERICHIA COLI : V : LEU CD1 C0875 <- 3.72 -> DT C7 X0013 : score 5.84591 : x : ARG xxxx C0858 <- 3.59 -> DT xxx X0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0878 <- 3.49 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0879 <- 3.96 -> DT xxx X0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C1078 <- 3.85 -> DG xxx X0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1079 <- 3.73 -> DC xxx X0070 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1080 <- 3.25 -> DG xxx X0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C1081 <- 3.66 -> DG xxx X0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C1082 <- 3.91 -> DT xxx X0015 : score x.xxxxx >6t5t_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS ARGONAUTE PROTEIN WITH COGNATE DNA OLIGODUPLEX 5'-PATTGTGGCCACAAT organism=? : H : ARG NE A0147 <- 2.99 -> DT O4 R0002 : score 1.78833 : H : ARG NE A0147 <- 3.20 -> DT O4 R0003 : score 1.71026 : H : ARG NH2 A0147 <- 2.90 -> DT O4 R0003 : score 3.48277 : H : ARG NH1 A0383 <- 2.95 -> DA N3 S0013 : score 3.57159 : x : ILE xxxx A0143 <- 3.33 -> DT xxx R0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0151 <- 3.22 -> DA xxx S0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0152 <- 3.51 -> DT xxx R0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0155 <- 3.05 -> DT xxx R0002 : score x.xxxxx >6t78_A:HMG-box; title=STRUCTURE OF HUMAN SOX11 TRANSCRIPTION FACTOR IN COMPLEX WITH A SHORT DNA FRAGMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0051 <- 2.33 -> DT O2 F0006 : score 4.71121 : H : ASN ND2 A0054 <- 3.04 -> DT O2 F0004 : score 4.51834 : H : ASN ND2 A0054 <- 2.95 -> DG N3 F0005 : score 4.74803 : H : ASN ND2 A0076 <- 2.77 -> DT O2 G0015 : score 4.77463 : H : ASN ND2 A0076 <- 3.14 -> DT O4 C0001 : score 4.92526 : H : SER OG A0080 <- 2.71 -> DA N3 F0002 : score 3.05792 : H : TYR OH A0118 <- 2.58 -> DA N3 G0011 : score 4.33394 : V : ALA CB A0077 <- 3.59 -> DT C7 C0001 : score 5.89292 : x : PHE xxxx A0056 <- 3.58 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0057 <- 3.23 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0064 <- 3.34 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0120 <- 4.28 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx >6t78_AB: title=STRUCTURE OF HUMAN SOX11 TRANSCRIPTION FACTOR IN COMPLEX WITH A SHORT DNA FRAGMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0051 <- 2.33 -> DT O2 F0006 : score 4.71121 : H : ASN ND2 A0054 <- 3.04 -> DT O2 F0004 : score 4.51834 : H : ASN ND2 A0054 <- 2.95 -> DG N3 F0005 : score 4.74803 : H : ASN ND2 A0076 <- 2.77 -> DT O2 G0015 : score 4.77463 : H : ASN ND2 A0076 <- 3.14 -> DT O4 C0001 : score 4.92526 : H : SER OG A0080 <- 2.71 -> DA N3 F0002 : score 3.05792 : H : TYR OH A0118 <- 2.58 -> DA N3 G0011 : score 4.33394 : H : ARG NH1 B0051 <- 2.37 -> DT O2 C0006 : score 4.67676 : H : ASN ND2 B0054 <- 3.16 -> DT O2 C0004 : score 4.40443 : H : ASN ND2 B0054 <- 2.87 -> DG N3 C0005 : score 4.82634 : H : ASN ND2 B0076 <- 2.86 -> DT O2 D0015 : score 4.6892 : H : ASN ND2 B0076 <- 3.20 -> DT O4 F0001 : score 4.86185 : H : SER OG B0080 <- 2.79 -> DA N3 C0002 : score 3.00985 : H : TYR OH B0118 <- 2.81 -> DA N3 D0011 : score 4.14298 : V : ALA CB A0077 <- 3.59 -> DT C7 C0001 : score 5.89292 : V : ALA CB B0077 <- 3.66 -> DT C7 F0001 : score 5.79494 : x : PHE xxxx A0056 <- 3.58 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0057 <- 3.23 -> DA xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0064 <- 3.34 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0120 <- 4.28 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0056 <- 3.58 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0057 <- 3.28 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0064 <- 3.36 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx >6t79_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF A HUMAN NUCLEOSOME AT 3.2 A RESOLUTION organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0040 <- 3.19 -> DC O2 J0083 : score 3.3653 : H : ARG NH2 A0040 <- 2.96 -> DC O2 J0083 : score 3.58036 : H : ARG NH1 C0011 <- 2.81 -> DA N3 I0030 : score 3.67469 : H : ARG NH2 C0011 <- 2.51 -> DA N3 J0117 : score 3.42765 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.17 -> DA N3 I0081 : score 3 : H : ARG NH1 G0011 <- 2.90 -> DT O2 J0032 : score 4.22028 : H : ARG NH2 G0011 <- 2.59 -> DA N3 I0115 : score 3.37581 : x : ARG xxxx A0083 <- 3.79 -> DC xxx I0048 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0032 <- 4.38 -> DT xxx I0060 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.22 -> DA xxx J0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.61 -> DT xxx I0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.03 -> DG xxx I0110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.69 -> DT xxx J0026 : score x.xxxxx >6t79_G:Histone-fold; title=STRUCTURE OF A HUMAN NUCLEOSOME AT 3.2 A RESOLUTION organism=? : H : ARG NH1 G0011 <- 2.90 -> DT O2 J0032 : score 4.22028 : H : ARG NH2 G0011 <- 2.59 -> DA N3 I0115 : score 3.37581 : x : ARG xxxx G0042 <- 4.03 -> DG xxx I0110 : score x.xxxxx >6t7a_C:Histone-fold; title=STRUCTURE OF HUMAN SOX11 TRANSCRIPTION FACTOR IN COMPLEX WITH A NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx C0042 <- 3.58 -> DA xxx J0112 : score x.xxxxx >6t7c_G:Histone-fold; title=STRUCTURE OF TWO COPIES OF HUMAN SOX11 TRANSCRIPTION FACTOR IN COMPLEX WITH A NUCLEOSOME organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx G0042 <- 3.82 -> DG xxx I0110 : score x.xxxxx >6t8g_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STALLED FTSK MOTOR DOMAIN BOUND TO DSDNA organism=PSEUDOMONAS AERUGINOSA PAO1 : x : LYS xxxx A0606 <- 3.69 -> DT xxx H0002 : score x.xxxxx >6t8g_ABEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STALLED FTSK MOTOR DOMAIN BOUND TO DSDNA organism=PSEUDOMONAS AERUGINOSA PAO1 : x : LYS xxxx A0606 <- 3.69 -> DT xxx H0002 : score x.xxxxx >6t90_L:HMG-box; title=OCT4-SOX2-BOUND NUCLEOSOME - SHL-6 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 L0043 <- 2.78 -> DC O2 J0136 : score 3.6646 : H : ARG NH2 L0043 <- 2.78 -> DT O2 I0013 : score 4.25027 : H : ASN ND2 L0068 <- 2.85 -> DG N3 J0140 : score 4.84592 : H : SER OG L0072 <- 2.72 -> DT O2 I0009 : score 3.75659 : H : TYR OH L0110 <- 2.78 -> DA N3 J0135 : score 4.16789 : x : ASN xxxx L0046 <- 3.31 -> DG xxx I0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0048 <- 3.42 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0049 <- 3.52 -> DA xxx J0137 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0056 <- 3.25 -> DT xxx I0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0067 <- 3.68 -> DT xxx J0141 : score x.xxxxx >6t93_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME WITH OCT4-SOX2 MOTIF AT SHL-6 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0041 <- 3.07 -> DT O2 J0083 : score 4.00473 : H : ARG NH1 C0012 <- 3.45 -> DT O2 I0032 : score 3.74658 : H : ARG NH1 D0034 <- 3.07 -> DT O2 I0027 : score 4.07386 : x : TYR xxxx A0042 <- 4.42 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 4.50 -> DG xxx J0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0041 <- 3.95 -> DG xxx I0083 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0084 <- 4.36 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0012 <- 4.01 -> DG xxx J0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0034 <- 4.28 -> DT xxx J0028 : score x.xxxxx >6t93_H:Histone-fold; title=NUCLEOSOME WITH OCT4-SOX2 MOTIF AT SHL-6 organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx H0034 <- 4.28 -> DT xxx J0028 : score x.xxxxx >6t9l_ABCDEFGH: title=SAGA DUB MODULE BOUND TO A UBIQITINATED NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 E0040 <- 2.47 -> DG N3 I0009 : score 3.84853 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.91 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.94 -> DG xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.40 -> DG xxx J0057 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.16 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx >6t9l_E:Histone-fold; title=SAGA DUB MODULE BOUND TO A UBIQITINATED NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH2 E0040 <- 2.47 -> DG N3 I0009 : score 3.84853 >6tbz_A:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MH1 DOMAIN OF SMAD5-SMAD3 CHIMERA CONSTRUCT BOUND TO THE GGCGC SITE organism=HOMO SAPIENS : w : ASP OD1 A0073 <- 6.44 -> DA N6 C0004 : score 3.122 : H : ARG NH1 A0075 <- 2.93 -> DG N7 C0005 : score 5.8927 : H : ARG NH2 A0075 <- 2.88 -> DG O6 C0005 : score 6.4944 : H : GLN OE1 A0077 <- 2.87 -> DC N4 B0009 : score 4.51917 : H : LYS NZ A0082 <- 2.76 -> DG O6 B0010 : score 5.82702 : w : LYS NZ A0082 <- 6.07 -> DG N7 C0006 : score 2.519 >6tc9_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MUTM FROM NEISSERIA MENINGITIDIS organism=Neisseria meningitidis alpha522 : H : ARG NH1 A0034 <- 2.35 -> DT O2 D0009 : score 4.69399 : H : ARG NE A0114 <- 2.78 -> DC O2 B0009 : score 2.66961 : H : ARG NH1 A0114 <- 3.01 -> DC N3 B0009 : score 1.47262 : x : MET xxxx A0075 <- 3.39 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0116 <- 3.41 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0265 <- 3.83 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx >6tce_A:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE GGCT SITE-BOUND MH1 DOMAIN OF SMAD5 CONTAINING A GGGS INSERTION IN THE LOOP1 organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 A0077 <- 3.09 -> DA N6 B0009 : score 5.70152 : H : LYS NZ A0082 <- 2.83 -> DG O6 B0010 : score 5.74608 : x : ASP xxxx A0073 <- 4.38 -> DC xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0075 <- 3.72 -> DC xxx B0011 : score x.xxxxx >6ted_ABEZ:Translation_proteins_SH3-like_domain; title=STRUCTURE OF COMPLETE, ACTIVATED TRANSCRIPTION COMPLEX POL II-DSIF- PAF-SPT6 UNCOVERS ALLOSTERIC ELONGATION ACTIVATION BY RTF1 organism=HOMO SAPIENS / SUS SCROFA : H : ASP OD2 B0492 <- 3.30 -> DG N2 N0026 : score 4.91308 : x : ASN xxxx A0272 <- 2.19 -> DT xxx T0034 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0331 <- 3.25 -> DG xxx T0035 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 4.27 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.88 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 3.60 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1416 <- 2.91 -> DT xxx T0021 : score x.xxxxx >6tem_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CENP-A NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH 145 BASE PAIRS OF THE WIDOM 601 SEQUENCE BY CRYO-EM organism=XENOPUS LAEVIS / HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0035 <- 4.03 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.91 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.80 -> DT xxx I-047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.75 -> DG xxx J-037 : score x.xxxxx >6tem_D:Histone-fold; title=CENP-A NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH 145 BASE PAIRS OF THE WIDOM 601 SEQUENCE BY CRYO-EM organism=? : x : ARG xxxx D0030 <- 3.80 -> DT xxx I-047 : score x.xxxxx >6tnz_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HUMAN POLYMERASE DELTA-FEN1-PCNA TOOLBELT organism=HOMO SAPIENS : x : GLN xxxx A0440 <- 3.64 -> DA xxx T0000 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0551 <- 4.25 -> DA xxx T0000 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0699 <- 3.87 -> DA xxx T0000 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0807 <- 3.56 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0833 <- 3.69 -> DT xxx P0022 : score x.xxxxx >6tps_BQR: title=EARLY INTERMEDIATE RNA POLYMERASE I PRE-INITIATION COMPLEX - EIPIC organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : V : HIS CB Q0294 <- 3.87 -> DT C7 T0048 : score 4.05294 : x : GLN xxxx Q0155 <- 3.41 -> DT xxx T0046 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Q0210 <- 3.46 -> DT xxx T0043 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Q0292 <- 4.41 -> DA xxx S0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0293 <- 3.90 -> DT xxx T0047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0297 <- 3.38 -> DT xxx T0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0011 <- 3.72 -> DA xxx S0011 : score x.xxxxx >6tps_Q: title=EARLY INTERMEDIATE RNA POLYMERASE I PRE-INITIATION COMPLEX - EIPIC organism=? : V : HIS CB Q0294 <- 3.87 -> DT C7 T0048 : score 4.05294 : x : GLN xxxx Q0155 <- 3.41 -> DT xxx T0046 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Q0210 <- 3.46 -> DT xxx T0043 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Q0292 <- 4.41 -> DA xxx S0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0293 <- 3.90 -> DT xxx T0047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0297 <- 3.38 -> DT xxx T0049 : score x.xxxxx >6tqn_GXY: title=RRN ANTI-TERMINATION COMPLEX WITHOUT S4 organism=ESCHERICHIA COLI : x : PHE xxxx G0015 <- 3.53 -> DA xxx K-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0057 <- 3.29 -> DG xxx L0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx X0163 <- 3.14 -> DT xxx K0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx X0173 <- 2.99 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0175 <- 2.98 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx X0183 <- 4.37 -> DT xxx K-003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx X0185 <- 4.01 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx X0199 <- 3.42 -> DT xxx K-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0371 <- 4.50 -> DA xxx K-005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0470 <- 3.45 -> DT xxx K-009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx X0541 <- 4.32 -> DA xxx L0000 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0261 <- 4.41 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0270 <- 4.20 -> DG xxx K-012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0271 <- 4.49 -> DC xxx K-011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Y0319 <- 3.59 -> DT xxx K-009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Y0321 <- 3.66 -> DT xxx K-009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0426 <- 4.05 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx >6tqn_X:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RRN ANTI-TERMINATION COMPLEX WITHOUT S4 organism=ESCHERICHIA COLI : x : LYS xxxx X0163 <- 3.14 -> DT xxx K0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx X0173 <- 2.99 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0175 <- 2.98 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx X0183 <- 4.37 -> DT xxx K-003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx X0185 <- 4.01 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx X0199 <- 3.42 -> DT xxx K-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0371 <- 4.50 -> DA xxx K-005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0470 <- 3.45 -> DT xxx K-009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx X0541 <- 4.32 -> DA xxx L0000 : score x.xxxxx >6tqo_G:N-utilization_substance_G_protein_NusG,_N-terminal_domain;Translation_proteins_SH3-like_domain; title=RRN ANTI-TERMINATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 G0057 <- 2.63 -> DG O6 L0019 : score 6.29017 : x : MET xxxx G0090 <- 3.94 -> DA xxx K-010 : score x.xxxxx >6tqo_GXY: title=RRN ANTI-TERMINATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 X0473 <- 2.31 -> DC O2 K-006 : score 4.06119 : x : MET xxxx G0090 <- 3.94 -> DA xxx K-010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx X0173 <- 3.16 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0175 <- 2.53 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx X0183 <- 3.00 -> DT xxx K-003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx X0199 <- 2.88 -> DT xxx K-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0371 <- 4.49 -> DA xxx K-005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx X0541 <- 3.09 -> DA xxx L0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0542 <- 3.18 -> DT xxx K0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0270 <- 3.59 -> DG xxx K-012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0271 <- 3.24 -> DC xxx K-011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Y0274 <- 4.41 -> DG xxx K-012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Y0316 <- 4.47 -> DT xxx K-009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Y0321 <- 4.14 -> DT xxx K-009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0426 <- 3.98 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx Y0427 <- 4.31 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Y0790 <- 3.70 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0791 <- 3.48 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx >6tuo_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS ARGONAUTE PROTEIN WITH COGNATE DNA OLIGODUPLEX 5'-PATTGTACGTACAAT organism=? : H : ARG NE A0147 <- 3.05 -> DT O4 R0002 : score 1.76603 : H : ARG NH2 A0147 <- 3.27 -> DT O4 R0003 : score 3.21978 : H : ARG NH2 A0383 <- 2.62 -> DT O2 R0003 : score 4.38573 : x : ILE xxxx A0143 <- 3.50 -> DT xxx R0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0151 <- 3.31 -> DA xxx S0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0152 <- 3.49 -> DT xxx R0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0155 <- 3.10 -> DT xxx R0002 : score x.xxxxx >6tye_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MTB SIGMA L TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH 5 NT LONG RNA PRIMER organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : H : ARG NH2 D0291 <- 2.71 -> DG O6 H0024 : score 6.7188 : x : GLU xxxx C0466 <- 4.08 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.37 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0287 <- 3.35 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx >6tyf_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MTB SIGMA L TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH 6 NT LONG RNA PRIMER organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : H : ARG NH2 D0291 <- 3.24 -> DG O6 G0004 : score 6.0192 : H : ARG NH2 D0291 <- 2.50 -> DG O6 H0024 : score 6.996 : x : GLU xxxx C0466 <- 4.22 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.93 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0287 <- 3.28 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx >6tyg_CDF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF MTB SIGMA L TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH 9 NT LONG RNA PRIMER organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : H : ARG NH2 D0291 <- 2.48 -> DG O6 H0024 : score 7.0224 : x : GLU xxxx C0466 <- 4.27 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.93 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0287 <- 2.91 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx >6tyg_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MTB SIGMA L TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH 9 NT LONG RNA PRIMER organism=? : H : ARG NH2 D0291 <- 2.48 -> DG O6 H0024 : score 7.0224 : x : GLN xxxx D0287 <- 2.91 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx >6u0m_25:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF THE S. CEREVISIAE REPLICATIVE HELICASE CMG IN COMPLEX WITH A FORKED DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : TRP xxxx 20589 <- 4.41 -> DT xxx F0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 50455 <- 3.19 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx >6u15_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=HUMAN THYMINE DNA GLYCOSYLASE N140A MUTANT BOUND TO DNA WITH 2'-F-5- CARBOXYL-DC SUBSTRATE ANALOG organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0158 <- 6.54 -> DT O2 C0013 : score 3.682 : H : GLN OE1 A0278 <- 2.85 -> DG N2 D0018 : score 5.55162 : H : GLN NE2 A0278 <- 2.83 -> DT O2 D0019 : score 3.90973 : x : SER xxxx A0200 <- 4.03 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0201 <- 3.61 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0274 <- 3.31 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.58 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 3.48 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >6u16_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=HUMAN THYMINE DNA GLYCOSYLASE N140A MUTANT BOUND TO DNA WITH 5- CARBOXYL-DC SUBSTRATE organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0201 <- 3.07 -> DG O6 D0018 : score 5.46861 : w : LYS NZ A0201 <- 5.78 -> DA N6 C0010 : score 2.097 : H : GLN OE1 A0278 <- 2.93 -> DG N2 D0018 : score 5.46189 : H : GLN NE2 A0278 <- 2.80 -> DT O2 D0019 : score 3.93333 : x : SER xxxx A0200 <- 3.67 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0274 <- 3.42 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.38 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 3.55 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >6u17_A:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=HUMAN THYMINE DNA GLYCOSYLASE BOUND TO DNA WITH 2'-F-5-CARBOXYL-DC SUBSTRATE ANALOG organism=Homo sapiens : w : HIS NE2 A0158 <- 6.31 -> DT O2 C0013 : score 3.682 : H : GLN OE1 A0278 <- 2.99 -> DG N2 D0018 : score 5.3946 : H : GLN NE2 A0278 <- 2.80 -> DT O2 D0019 : score 3.93333 : x : SER xxxx A0200 <- 3.63 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0201 <- 3.69 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0274 <- 3.47 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0275 <- 3.47 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 3.48 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >6u2o_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA MISINSERTING DAMPNPP OPPOSITE THE 5'G OF THE CISPLATIN PT-GG INTRASTRAND CROSSLINK organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.25 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.77 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.53 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6u6b_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA MISINSERTING DAMPNPP OPPOSITE THE 5'G OF THE CISPLATIN PT-GG INTRASTRAND CROSSLINK WITH MANGANESE IN THE ACTIVE SITE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.21 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.34 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.63 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6u7t_A:DNA-glycosylase;Nudix; title=MUTY ADENINE GLYCOSYLASE BOUND TO DNA CONTAINING A TRANSITION STATE ANALOG (1N) PAIRED WITH D(8-OXO-G) organism=Geobacillus stearothermophilus : w : GLN OE1 A0047 <- 5.65 -> DG N3 C0019 : score 1.484 : w : GLN OE1 A0048 <- 5.66 -> DA N7 C0017 : score 1.196 : x : ARG xxxx A0050 <- 3.42 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0088 <- 3.17 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0308 <- 3.73 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0309 <- 3.79 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >6u81_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DOUBLE HOMEODOMAIN OF DUX4 IN COMPLEX WITH A DNA APTAMER organism=Homo sapiens : H : SER OG A0072 <- 3.24 -> DG N7 C0010 : score 4.08763 : H : ARG NH1 A0095 <- 3.36 -> DA N3 C0006 : score 3.26966 : H : ARG NH1 A0098 <- 2.78 -> DT O2 C0004 : score 4.32364 : H : ARG NH2 A0098 <- 2.96 -> DT O2 C0004 : score 4.09787 : H : ASN OD1 A0144 <- 2.63 -> DA N6 C0006 : score 6.22654 : H : ASN ND2 A0144 <- 3.12 -> DA N7 C0006 : score 5.4948 : w : ASN OD1 A0144 <- 6.07 -> DA N6 B0011 : score 2.837 : H : ARG NH1 A0148 <- 3.07 -> DG N7 C0005 : score 5.7233 : H : ARG NH2 A0148 <- 2.68 -> DG O6 C0005 : score 6.7584 : H : ARG NH2 A0148 <- 3.12 -> DT O4 B0012 : score 3.3264 : V : ILE CG2 A0140 <- 3.85 -> DT C7 C0007 : score 7.00264 : x : GLN xxxx A0068 <- 3.46 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0143 <- 3.52 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx >6u82_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DOUBLE HOMEODOMAIN OF DUX4 IN COMPLEX WITH A DNA APTAMER CONTAINING BULGE AND LOOP organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0023 <- 2.90 -> DT O2 B0003 : score 4.14867 : H : GLN NE2 A0068 <- 3.12 -> DA N7 B0028 : score 5.7 : H : ASN ND2 A0144 <- 3.21 -> DA N7 B0025 : score 5.38913 : H : ARG NH2 A0148 <- 3.03 -> DG O6 B0024 : score 6.2964 : V : ILE CG2 A0065 <- 3.78 -> DT C7 B0006 : score 7.12674 : x : ARG xxxx A0020 <- 3.25 -> DT xxx B0035 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0069 <- 3.41 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0072 <- 4.34 -> DG xxx B0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0095 <- 3.41 -> DC xxx B0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0098 <- 4.24 -> DA xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0140 <- 3.95 -> DT xxx B0026 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0143 <- 3.33 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >6u8p_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNMT3B-DNMT3L IN COMPLEX WITH CPGPA DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 A0779 <- 3.21 -> DG O6 F0428 : score 5.17611 : H : ASN ND2 A0779 <- 2.78 -> DT O4 E0440 : score 5.30575 : x : ASN xxxx A0656 <- 3.70 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0657 <- 3.42 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0658 <- 4.42 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0659 <- 3.48 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0775 <- 4.38 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0777 <- 3.32 -> DA xxx F0429 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0778 <- 3.85 -> DG xxx E0438 : score x.xxxxx >6u8p_AD:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNMT3B-DNMT3L IN COMPLEX WITH CPGPA DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 A0779 <- 3.21 -> DG O6 F0428 : score 5.17611 : H : ASN ND2 A0779 <- 2.78 -> DT O4 E0440 : score 5.30575 : H : ASN ND2 D0779 <- 2.77 -> DT O4 F0440 : score 5.31632 : w : ASN OD1 D0779 <- 5.55 -> DG N7 E0428 : score 1.873 : x : ASN xxxx A0656 <- 3.70 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0657 <- 3.42 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0658 <- 4.42 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0659 <- 3.48 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0775 <- 4.38 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0777 <- 3.32 -> DA xxx F0429 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0778 <- 3.85 -> DG xxx E0438 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0656 <- 3.56 -> DA xxx F0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0657 <- 3.35 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0659 <- 3.63 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0775 <- 4.35 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0777 <- 3.37 -> DA xxx E0429 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0778 <- 3.72 -> DG xxx F0438 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0787 <- 3.62 -> DT xxx F0440 : score x.xxxxx >6u8q_AJP:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=CRYOEM STRUCTURE OF HIV-1 CLEAVED SYNAPTIC COMPLEX (CSC) INTASOME organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : x : HIS xxxx A0051 <- 3.32 -> DG xxx G0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.97 -> DG xxx G0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.60 -> DC xxx H0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0153 <- 3.80 -> DG xxx H0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0156 <- 4.03 -> DG xxx H0019 : score x.xxxxx >6u8q_CIM:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=CRYOEM STRUCTURE OF HIV-1 CLEAVED SYNAPTIC COMPLEX (CSC) INTASOME organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : x : HIS xxxx C0051 <- 3.98 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0146 <- 3.77 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0152 <- 3.32 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0153 <- 3.43 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0156 <- 4.07 -> DT xxx E0020 : score x.xxxxx >6u8v_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNMT3B-DNMT3L IN COMPLEX WITH CPGPT DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 A0779 <- 2.94 -> DG O6 F0428 : score 5.48058 : V : LYS CG A0777 <- 3.52 -> DT C7 F0429 : score 2.2673 : x : ASN xxxx A0656 <- 3.68 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0657 <- 3.63 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0659 <- 3.69 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0775 <- 4.48 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0778 <- 4.06 -> DG xxx E0438 : score x.xxxxx >6u8v_AD:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNMT3B-DNMT3L IN COMPLEX WITH CPGPT DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 A0779 <- 2.94 -> DG O6 F0428 : score 5.48058 : H : ASN ND2 D0779 <- 3.04 -> DG O6 E0428 : score 5.36782 : V : LYS CG A0777 <- 3.52 -> DT C7 F0429 : score 2.2673 : V : LYS CG D0777 <- 3.52 -> DT C7 E0429 : score 2.2673 : x : ASN xxxx A0656 <- 3.68 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0657 <- 3.63 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0659 <- 3.69 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0775 <- 4.48 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0778 <- 4.06 -> DG xxx E0438 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0656 <- 3.62 -> DG xxx E0426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0657 <- 3.51 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0659 <- 3.40 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0778 <- 3.89 -> DG xxx F0438 : score x.xxxxx >6u8w_AD:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNMT3B(K777A)-DNMT3L IN COMPLEX WITH CPGPT DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 A0779 <- 3.14 -> DG O6 F0428 : score 5.25505 : H : ASN ND2 D0656 <- 3.23 -> DA N3 F0444 : score 3.48023 : H : ASN ND2 D0779 <- 3.18 -> DG O6 E0428 : score 5.20994 : x : ASN xxxx A0656 <- 3.58 -> DA xxx E0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0657 <- 3.53 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0659 <- 3.98 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0775 <- 4.22 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0777 <- 4.05 -> DT xxx F0429 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0778 <- 3.45 -> DG xxx E0438 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0657 <- 3.53 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0659 <- 4.09 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0775 <- 4.12 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0777 <- 3.94 -> DT xxx E0429 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0778 <- 3.82 -> DG xxx F0438 : score x.xxxxx >6u8w_D:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNMT3B(K777A)-DNMT3L IN COMPLEX WITH CPGPT DNA organism=? : H : ASN ND2 D0656 <- 3.23 -> DA N3 F0444 : score 3.48023 : H : ASN ND2 D0779 <- 3.18 -> DG O6 E0428 : score 5.20994 : x : VAL xxxx D0657 <- 3.53 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0659 <- 4.09 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0775 <- 4.12 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0777 <- 3.94 -> DT xxx E0429 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0778 <- 3.82 -> DG xxx F0438 : score x.xxxxx >6u8x_AD:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNMT3B-DNMT3L IN COMPLEX WITH CPAPG DNA organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ A0777 <- 3.50 -> DT O4 F0430 : score 3.08497 : x : ASN xxxx A0656 <- 4.41 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0657 <- 3.54 -> DA xxx F0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0659 <- 3.85 -> DA xxx F0428 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0778 <- 4.37 -> DG xxx E0438 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0779 <- 3.91 -> DA xxx E0439 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0656 <- 4.37 -> DG xxx E0426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0657 <- 3.34 -> DA xxx E0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0659 <- 4.05 -> DA xxx E0428 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0777 <- 3.05 -> DG xxx E0429 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0778 <- 4.01 -> DG xxx F0438 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0779 <- 3.50 -> DA xxx F0439 : score x.xxxxx >6u8x_D:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNMT3B-DNMT3L IN COMPLEX WITH CPAPG DNA organism=HOMO SAPIENS : x : ASN xxxx D0656 <- 4.37 -> DG xxx E0426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0657 <- 3.34 -> DA xxx E0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0659 <- 4.05 -> DA xxx E0428 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0777 <- 3.05 -> DG xxx E0429 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0778 <- 4.01 -> DG xxx F0438 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0779 <- 3.50 -> DA xxx F0439 : score x.xxxxx >6u90_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNMT3B(N779A)-DNMT3L IN COMPLEX WITH CPGPT DNA organism=HOMO SAPIENS : V : LYS CE A0777 <- 3.61 -> DT C7 F0429 : score 2.72457 : x : ASN xxxx A0656 <- 3.61 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0657 <- 3.54 -> DG xxx E0442 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0658 <- 4.23 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0659 <- 3.56 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx >6u90_AD:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNMT3B(N779A)-DNMT3L IN COMPLEX WITH CPGPT DNA organism=HOMO SAPIENS : V : LYS CE A0777 <- 3.61 -> DT C7 F0429 : score 2.72457 : V : LYS CE D0777 <- 3.70 -> DT C7 E0429 : score 2.66605 : x : ASN xxxx A0656 <- 3.61 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0657 <- 3.54 -> DG xxx E0442 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0658 <- 4.23 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0659 <- 3.56 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0656 <- 3.47 -> DG xxx E0426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0657 <- 3.23 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0658 <- 4.47 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0659 <- 3.69 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0775 <- 4.47 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx >6u91_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNMT3B(Q772R)-DNMT3L IN COMPLEX WITH CPGPT DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 A0779 <- 2.95 -> DG O6 F0428 : score 5.46931 : V : LYS CG A0777 <- 3.53 -> DT C7 F0429 : score 2.26201 : x : ASN xxxx A0656 <- 3.35 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0657 <- 3.58 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0659 <- 3.67 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0775 <- 4.45 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0778 <- 3.83 -> DG xxx E0438 : score x.xxxxx >6u91_AD:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNMT3B(Q772R)-DNMT3L IN COMPLEX WITH CPGPT DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 A0779 <- 2.95 -> DG O6 F0428 : score 5.46931 : H : ASN ND2 D0779 <- 2.84 -> DG O6 E0428 : score 5.59335 : V : LYS CG D0777 <- 3.54 -> DT C7 E0429 : score 2.25671 : V : LYS CG A0777 <- 3.53 -> DT C7 F0429 : score 2.26201 : x : ASN xxxx A0656 <- 3.35 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0657 <- 3.58 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0659 <- 3.67 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0775 <- 4.45 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0778 <- 3.83 -> DG xxx E0438 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0656 <- 3.82 -> DG xxx E0426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0657 <- 3.57 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0659 <- 3.66 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0775 <- 4.39 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0778 <- 3.99 -> DG xxx F0438 : score x.xxxxx >6u9q_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF DNA-BCL11A ZNF DOMAIN COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ASN ND2 A0753 <- 3.29 -> DT O4 C0003 : score 4.76672 : w : ASN ND2 A0753 <- 6.42 -> DA N6 B0010 : score 2.5 : H : ASN OD1 A0756 <- 2.86 -> DA N6 B0009 : score 5.94953 : H : ASN ND2 A0756 <- 2.92 -> DA N7 B0009 : score 5.72962 : w : ASN OD1 A0756 <- 5.72 -> DC N4 B0008 : score 2.732 : H : GLN NE2 A0781 <- 2.65 -> DT O4 B0007 : score 5.34676 : w : GLN NE2 A0781 <- 5.92 -> DT O4 C0004 : score 2.257 : H : SER OG A0783 <- 2.75 -> DG N7 C0005 : score 4.52687 : w : SER OG A0783 <- 5.97 -> DA N6 C0006 : score 2.209 : H : LYS NZ A0784 <- 3.14 -> DG N7 B0006 : score 5.01966 : H : LYS NZ A0784 <- 2.85 -> DG O6 B0006 : score 5.72296 : w : LYS NZ A0784 <- 6.07 -> DA N6 C0006 : score 2.097 : H : ARG NH1 A0787 <- 2.88 -> DG O6 B0005 : score 5.986 : H : ARG NH2 A0787 <- 2.85 -> DG N7 B0005 : score 6.32077 : w : ARG NH1 A0787 <- 5.75 -> DC N4 C0007 : score 1.892 : V : VAL CG1 A0759 <- 3.88 -> DT C7 B0007 : score 5.9393 >6ubf_A:Cysteine_proteinases; title=ROLE OF BETA-HAIRPIN MOTIFS IN THE DNA DUPLEX OPENING BY THE RAD4/XPC NUCLEOTIDE EXCISION REPAIR COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx A0137 <- 4.44 -> DT xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0472 <- 3.22 -> DT xxx W0002 : score x.xxxxx >6ueo_D:TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURE OF A. THALIANA TBP-AC MISMATCH DNA SITE organism=Arabidopsis thaliana : H : ASN ND2 D0027 <- 2.80 -> DT O2 F0222 : score 4.74615 : H : ASN ND2 D0027 <- 3.14 -> DT O2 F0223 : score 4.42342 : H : ASN ND2 D0117 <- 3.34 -> DA N3 E0206 : score 3.39646 : H : ASN ND2 D0117 <- 3.34 -> DA N3 E0207 : score 3.39646 : H : THR OG1 D0173 <- 2.76 -> DA N3 E0206 : score 1.36468 : x : VAL xxxx D0029 <- 3.55 -> DA xxx E0207 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0057 <- 3.63 -> DC xxx F0219 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0072 <- 3.94 -> DT xxx F0221 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0074 <- 3.94 -> DA xxx E0209 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0080 <- 3.62 -> DA xxx E0208 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0082 <- 3.60 -> DT xxx F0221 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0119 <- 3.55 -> DT xxx F0223 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0148 <- 3.19 -> DA xxx E0204 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0149 <- 3.32 -> DA xxx F0226 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0163 <- 3.59 -> DT xxx E0205 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0165 <- 3.18 -> DT xxx F0225 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0171 <- 3.61 -> DA xxx F0224 : score x.xxxxx >6uep_B:TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURE OF A. THALIANA TBP BOUND TO A DNA SITE WITH A C-C MISMATCH organism=Arabidopsis thaliana : H : ASN ND2 B0117 <- 3.26 -> DA N3 E0206 : score 3.45738 : H : ASN ND2 B0117 <- 3.30 -> DA N3 E0207 : score 3.42692 : H : THR OG1 B0173 <- 2.74 -> DA N3 E0206 : score 1.37009 : x : ASN xxxx B0027 <- 2.83 -> DT xxx F0222 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0029 <- 3.56 -> DA xxx E0208 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0057 <- 3.26 -> DC xxx E0209 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0072 <- 4.18 -> DT xxx F0221 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0074 <- 3.14 -> DC xxx E0209 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0080 <- 3.62 -> DA xxx E0208 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0082 <- 3.57 -> DT xxx F0221 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0119 <- 3.47 -> DT xxx F0223 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0148 <- 3.14 -> DA xxx E0204 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0149 <- 3.45 -> DA xxx F0226 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0163 <- 3.53 -> DA xxx E0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0165 <- 3.36 -> DT xxx F0225 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0171 <- 3.51 -> DA xxx F0224 : score x.xxxxx >6ueq_B:TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURE OF TBP BOUND TO C-C MISMATCH CONTAINING TATA SITE organism=Arabidopsis thaliana : H : ASN ND2 B0027 <- 2.78 -> DT O2 D0222 : score 4.76514 : H : ASN ND2 B0027 <- 3.15 -> DT O2 D0223 : score 4.41392 : H : ASN ND2 B0117 <- 3.31 -> DA N3 C0206 : score 3.41931 : H : ASN ND2 B0117 <- 3.28 -> DA N3 C0207 : score 3.44215 : H : THR OG1 B0173 <- 2.67 -> DA N3 C0206 : score 1.38905 : x : VAL xxxx B0029 <- 3.47 -> DA xxx C0207 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0057 <- 3.33 -> DC xxx D0219 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0058 <- 4.18 -> DC xxx C0210 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0072 <- 3.61 -> DT xxx D0220 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0074 <- 3.71 -> DA xxx C0209 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0080 <- 3.71 -> DA xxx C0208 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0082 <- 3.65 -> DT xxx D0221 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0119 <- 3.26 -> DT xxx D0223 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0148 <- 3.28 -> DA xxx C0204 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0149 <- 3.51 -> DA xxx D0226 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0163 <- 3.67 -> DA xxx C0204 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0165 <- 3.32 -> DT xxx D0225 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0171 <- 3.46 -> DA xxx D0224 : score x.xxxxx >6uer_A:TATA-box_binding_protein-like; title=CRYSTAL FORM 2: STRUCTURE OF TBP BOUND TO C-C MISMATCH AT PH 7 organism=Arabidopsis thaliana : H : ASN ND2 A0027 <- 2.89 -> DT O2 D0222 : score 4.66072 : H : ASN ND2 A0117 <- 3.20 -> DA N3 C0207 : score 3.50308 : H : THR OG1 A0173 <- 2.78 -> DA N3 C0206 : score 1.35926 : x : VAL xxxx A0029 <- 3.53 -> DA xxx C0207 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0057 <- 3.36 -> DC xxx C0209 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0072 <- 4.38 -> DT xxx D0221 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0074 <- 3.20 -> DC xxx C0209 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0080 <- 3.96 -> DA xxx C0208 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0082 <- 3.62 -> DT xxx D0222 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0119 <- 3.43 -> DT xxx D0223 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0148 <- 3.17 -> DA xxx C0204 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0149 <- 3.33 -> DA xxx D0226 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0163 <- 3.58 -> DT xxx C0205 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0165 <- 3.24 -> DT xxx D0225 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0171 <- 3.54 -> DA xxx D0224 : score x.xxxxx >6ueu_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BF DNA POLYMERASE F710Y MUTANT BOUND TO TETRAHYDROFURAN AND DATP organism=Geobacillus stearothermophilus : w : LYS NZ A0582 <- 5.92 -> DT O2 C0007 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 5.84 -> DG N2 C0008 : score 2.036 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.76 -> DC O2 C0005 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.82 -> DG N3 C0006 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.05 -> DC O2 B0027 : score 4.25551 : w : ASN ND2 A0625 <- 6.11 -> DT O2 C0007 : score 1.666 : x : GLN xxxx A0797 <- 4.44 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.15 -> DG xxx B0028 : score x.xxxxx >6ug1_A:Cysteine_proteinases; title=SEQUENCE IMPACT IN DNA DUPLEX OPENING BY THE RAD4/XPC NUCLEOTIDE EXCISION REPAIR COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 A0129 <- 3.04 -> DC O2 Y0017 : score 3.4748 >6ugm_ABCDEFGH: title=STRUCTURAL BASIS OF COMPASS ECM RECOGNITION OF AN UNMODIFIED NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 E0040 <- 2.75 -> DT O2 J0083 : score 4.34947 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.32 -> DG xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 4.48 -> DG xxx I0083 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.39 -> DC xxx J0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.41 -> DT xxx I0027 : score x.xxxxx >6ugm_H:Histone-fold; title=STRUCTURAL BASIS OF COMPASS ECM RECOGNITION OF AN UNMODIFIED NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx H0030 <- 3.41 -> DT xxx I0027 : score x.xxxxx >6uh5_H:Histone-fold; title=STRUCTURAL BASIS OF COMPASS ECM RECOGNITION OF THE H2BUB NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx H0030 <- 3.87 -> DC xxx J0123 : score x.xxxxx >6ui2_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA COMPLEXED WITH N7MG IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE CTP organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.26 -> DG O6 P0004 : score 5.52367 : H : ARG NH2 A0382 <- 2.92 -> DG N7 P0004 : score 6.23138 : x : SER xxxx A0322 <- 3.93 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.58 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx >6uin_A:Cysteine_proteinases; title=ROLE OF BETA-HAIRPIN MOTIFS IN THE DNA DUPLEX OPENING BY THE RAD4/XPC NUCLEOTIDE EXCISION REPAIR COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : PHE xxxx A0599 <- 2.98 -> DC xxx W0014 : score x.xxxxx >6uir_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 M184V REVERSE TRANSCRIPTASE-DNA COMPLEX WITH (-)-FTC-TP organism=? : w : GLN NE2 A0161 <- 5.69 -> DG N3 T0707 : score 1.484 : H : TYR OH A0183 <- 2.67 -> DC O2 P0821 : score 3.58837 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.96 -> DT O2 P0806 : score 4.16861 : w : GLN NE2 A0475 <- 5.97 -> DC O2 P0808 : score 2.699 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.58 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.87 -> DG xxx T0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.16 -> DG xxx T0706 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.23 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx >6uis_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 M184V REVERSE TRANSCRIPTASE-DNA COMPLEX WITH DCTP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.61 -> DC O2 P0821 : score 3.63034 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.73 -> DT O2 P0806 : score 4.3667 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.55 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.43 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.11 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.64 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >6uis_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 M184V REVERSE TRANSCRIPTASE-DNA COMPLEX WITH DCTP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.61 -> DC O2 P0821 : score 3.63034 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.73 -> DT O2 P0806 : score 4.3667 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.55 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.43 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.11 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.64 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >6uit_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 WILD-TYPE REVERSE TRANSCRIPTASE-DNA COMPLEX WITH DCTP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.48 -> DC O2 P0821 : score 3.72127 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.57 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.28 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.10 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0258 <- 4.40 -> DG xxx P0817 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 3.98 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.37 -> DC xxx T0723 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.69 -> DG xxx T0721 : score x.xxxxx >6ujx_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 WILD-TYPE REVERSE TRANSCRIPTASE-DNA COMPLEX WITH (-)-FTC-TP organism=? : w : TYR OH A0115 <- 5.82 -> DG N3 T0706 : score 3.344 : w : GLN OE1 A0161 <- 5.81 -> DG N3 T0707 : score 1.484 : H : TYR OH A0183 <- 2.56 -> DC O2 P0821 : score 3.66531 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.71 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.27 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.97 -> DG xxx T0706 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0258 <- 4.32 -> DG xxx P0817 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 2.92 -> DT xxx P0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.84 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >6ujy_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 WILD-TYPE REVERSE TRANSCRIPTASE-DNA COMPLEX WITH (-)-3TC-TP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.60 -> DC O2 P0821 : score 3.63733 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.25 -> DC O2 T0723 : score 3.36583 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.64 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.28 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.11 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.03 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.61 -> DG xxx T0721 : score x.xxxxx >6ujz_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 WILD-TYPE REVERSE TRANSCRIPTASE-DNA COMPLEX WITH (+)-FTC-TP organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.55 -> DC O2 P0821 : score 3.67231 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.59 -> DT O2 P0806 : score 4.48728 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.51 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 4.03 -> DG xxx T0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.19 -> DG xxx T0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.86 -> DG xxx T0706 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.73 -> DG xxx T0721 : score x.xxxxx >6uk0_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 M184V REVERSE TRANSCRIPTASE-DNA COMPLEX organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.76 -> DC O2 P0821 : score 3.52542 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.06 -> DT O2 P0806 : score 4.08248 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.56 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.65 -> DG xxx T0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.09 -> DG xxx T0706 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0258 <- 4.27 -> DG xxx P0817 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.61 -> DG xxx T0721 : score x.xxxxx >6uke_X: title=HHAI ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH IODINE-LABELLED DNA organism=Haemophilus parahaemolyticus : H : GLN NE2 X0053 <- 3.15 -> DG O6 B0005 : score 5.39877 : w : GLN OE1 X0056 <- 5.67 -> DC N4 A0009 : score 3.488 : H : ARG NH1 X0155 <- 3.07 -> DG N7 B0005 : score 5.7233 : H : ARG NH2 X0155 <- 2.74 -> DG O6 B0005 : score 6.6792 : H : LYS NZ X0157 <- 2.79 -> DG O6 A0008 : score 5.79233 : w : LYS NZ X0157 <- 5.81 -> DC N4 A0007 : score 0.048 : H : SER OG X0159 <- 2.79 -> DG N7 A0006 : score 4.49102 : w : SER OG X0223 <- 5.39 -> DA N7 A0005 : score 2.343 : w : SER OG X0233 <- 5.55 -> DA N6 A0010 : score 2.209 : x : SER xxxx X0161 <- 3.58 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0162 <- 4.31 -> DC xxx A0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx X0225 <- 4.20 -> DA xxx A0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx X0231 <- 3.94 -> DC xxx A0009 : score x.xxxxx >6ukf_X: title=HHAI ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH DNA AT 1 ANGSTROM RESOLUTION organism=Haemophilus parahaemolyticus : H : GLN NE2 X0053 <- 3.10 -> DG O6 B0005 : score 5.45682 : w : GLN OE1 X0056 <- 5.67 -> DC N4 A0009 : score 3.488 : H : ARG NH1 X0155 <- 3.11 -> DG N7 B0005 : score 5.6749 : H : ARG NH2 X0155 <- 2.78 -> DG O6 B0005 : score 6.6264 : H : LYS NZ X0157 <- 2.83 -> DG O6 A0008 : score 5.74608 : w : LYS NZ X0157 <- 5.84 -> DC N4 A0007 : score 0.048 : H : SER OG X0159 <- 2.83 -> DG N7 A0006 : score 4.45516 : w : SER OG X0223 <- 5.60 -> DA N7 A0005 : score 2.343 : w : SER OG X0233 <- 5.59 -> DA N6 A0010 : score 2.209 : x : SER xxxx X0161 <- 3.48 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0162 <- 4.29 -> DC xxx A0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx X0225 <- 4.15 -> DA xxx A0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx X0231 <- 4.03 -> DC xxx A0009 : score x.xxxxx >6ukg_X: title=HHAI ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH DNA IN SPACE GROUP P21 (PH 4.2) organism=Haemophilus parahaemolyticus : H : SER OG X0030 <- 3.30 -> DG N2 A0006 : score 3.03692 : w : SER OG X0030 <- 5.45 -> DC O2 B0009 : score 1.768 : H : GLN NE2 X0053 <- 3.10 -> DG O6 B0006 : score 5.45682 : w : GLN OE1 X0056 <- 5.67 -> DC N4 A0009 : score 3.488 : w : LYS NZ X0075 <- 5.51 -> DA N3 B0011 : score 1.538 : H : ARG NH1 X0155 <- 3.05 -> DG N7 B0006 : score 5.7475 : H : ARG NH2 X0155 <- 2.83 -> DG O6 B0006 : score 6.5604 : H : LYS NZ X0157 <- 2.84 -> DG O6 A0008 : score 5.73452 : w : LYS NZ X0157 <- 5.90 -> DC N4 A0007 : score 0.048 : H : SER OG X0159 <- 2.80 -> DG N7 A0006 : score 4.48205 : w : SER OG X0233 <- 5.28 -> DT O4 A0010 : score 2.338 : x : SER xxxx X0028 <- 3.70 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx X0051 <- 4.49 -> DT xxx A0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx X0161 <- 3.43 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0162 <- 3.44 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx X0223 <- 3.27 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx X0225 <- 3.91 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx X0231 <- 4.03 -> DC xxx A0009 : score x.xxxxx >6ukh_X: title=HHAI ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH DNA IN SPACE GROUP P41212 (PH 6.0) organism=Haemophilus parahaemolyticus : H : GLN NE2 X0053 <- 3.38 -> DG O6 B0006 : score 5.13173 : H : ARG NH1 X0155 <- 3.15 -> DG N7 B0006 : score 5.6265 : H : ARG NH2 X0155 <- 2.77 -> DG O6 B0006 : score 6.6396 : H : LYS NZ X0157 <- 2.78 -> DG O6 A0008 : score 5.80389 : H : SER OG X0159 <- 3.17 -> DG N7 A0006 : score 4.15038 : x : SER xxxx X0028 <- 3.78 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx X0030 <- 4.34 -> DC xxx A0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx X0056 <- 3.61 -> DC xxx A0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx X0161 <- 3.71 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0162 <- 3.73 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx X0223 <- 3.61 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx X0225 <- 3.93 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx X0231 <- 3.96 -> DC xxx A0009 : score x.xxxxx >6uki_Y: title=HHAI ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH DNA IN SPACE GROUP P212121 (PH 6.0) organism=Haemophilus parahaemolyticus : H : ARG NH1 Y0155 <- 3.35 -> DG N7 E0006 : score 5.3845 : H : ARG NH2 Y0155 <- 2.75 -> DG O6 E0006 : score 6.666 : H : LYS NZ Y0157 <- 3.03 -> DG O6 D0008 : score 5.51485 : H : SER OG Y0159 <- 2.58 -> DG N7 D0006 : score 4.67926 : x : SER xxxx Y0028 <- 4.38 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Y0030 <- 3.73 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx Y0051 <- 4.30 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Y0053 <- 3.50 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Y0056 <- 3.61 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Y0161 <- 3.65 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0162 <- 3.59 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Y0223 <- 3.76 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Y0225 <- 3.99 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Y0231 <- 3.89 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Y0233 <- 4.27 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >6uok_F:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=Y271G DNA POLYMERASE BETA SUBSTRATE COMPLEX WITH TEMPLATING CYTOSINE AND INCOMING R8-OXO-GTP organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx F0034 <- 3.31 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0035 <- 3.89 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0038 <- 3.43 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx >6uol_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=Y271G DNA POLYMERASE BETA SUBSTRATE COMPLEX WITH A TEMPLATING CYTOSINE AND INCOMING RGTP organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.45 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.83 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.53 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6uom_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=Y271G DNA POLYMERASE BETA TERNARY COMPLEX WITH TEMPLATING ADENINE AND INCOMING R8-OXO-GTP organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.32 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.87 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.52 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >6uph_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF A YEAST CENTROMERIC NUCLEOSOME AT 2.7 ANGSTROM RESOLUTION organism=? : x : ILE xxxx A0156 <- 4.45 -> DG xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0046 <- 4.43 -> DC xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0038 <- 3.89 -> DC xxx J0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0177 <- 3.66 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0038 <- 3.45 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >6upk_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF FACT_SUBNUCLEOSOME COMPLEX 1 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 B0045 <- 3.13 -> DC O2 J0007 : score 3.4546 : x : ARG xxxx A0083 <- 4.39 -> DA xxx I-025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.16 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 1.73 -> DG xxx J-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.40 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0211 <- 3.40 -> DC xxx J-002 : score x.xxxxx >6upk_H:PH_domain-like; title=STRUCTURE OF FACT_SUBNUCLEOSOME COMPLEX 1 organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx H0211 <- 3.40 -> DC xxx J-002 : score x.xxxxx >6upx_AE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX WITH 5-GUANIDINOHYDANTOIN LESION IN STATE 1 organism=? : x : ARG xxxx A1386 <- 3.02 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >6upy_AE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX WITH 5-GUANIDINOHYDANTOIN LESION IN STATE 2E organism=? : x : ARG xxxx A1386 <- 3.89 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx >6upz_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX WITH 5-GUANIDINOHYDANTOIN LESION IN STATE 3 organism=? : x : ARG xxxx A1386 <- 3.61 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx >6upz_AE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX WITH 5-GUANIDINOHYDANTOIN LESION IN STATE 3 organism=? : x : ARG xxxx A1386 <- 3.61 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx >6uq0_ABE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX WITH 5-GUANIDINOHYDANTOIN LESION IN STATE 4 organism=? : H : ARG NH2 A1386 <- 2.20 -> DT O2 T0016 : score 4.74133 : x : LYS xxxx A0143 <- 3.62 -> DA xxx N0009 : score x.xxxxx >6uq1_ABE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX WITH 5-GUANIDINOHYDANTOIN LESION IN STATE 6 organism=? : H : ARG NH2 A1386 <- 2.43 -> DT O2 T0016 : score 4.5466 >6uq2_AE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX WITH DG IN STATE 1 organism=? : x : ARG xxxx A1386 <- 3.05 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >6uq3_ABE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX WITH 5-GUANIDINOHYDANTOIN LESION IN STATE 5 organism=? : x : ARG xxxx A1386 <- 2.65 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >6uqi_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF Q38A HUMAN DNA POLYMERASE ETA BOUND WITH 8- OXOADENINE (OXOA) AND NON-HYDROLYZABLE DGTP ANALOG (DGTP*) organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.04 -> DG N7 P0004 : score 5.7596 : x : ARG xxxx A0061 <- 3.71 -> DT xxx P0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.62 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.59 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx >6ur4_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS WITH DNA TEMPLATE AND 3'-AMINO PRIMER organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.65 -> DC O2 B0010 : score 3.03454 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.60 -> DC O2 C0006 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.92 -> DT O2 C0007 : score 1.666 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.09 -> DA N3 B0011 : score 3.58685 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.38 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 4.41 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.18 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx >6ur9_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS WITH DNA TEMPLATE, DIDEOXY PRIMER, 3'-AMINO-DDGTP (NGTP), AND CA2+ organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.88 -> DC O2 b0006 : score 2.89902 : w : LYS NZ A0582 <- 5.95 -> DT O2 b0005 : score 0.522 : w : LYS NZ A0582 <- 5.61 -> DA N3 c0008 : score 1.538 : w : THR OG1 A0586 <- 5.61 -> DA N3 c0008 : score 2.845 : w : TYR OH A0587 <- 5.91 -> DG N2 c0007 : score 2.834 : w : ARG NH2 A0615 <- 5.33 -> DC O2 c0005 : score 1.669 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.71 -> DT O2 c0006 : score 1.666 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.33 -> DA N3 b0007 : score 3.40408 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.74 -> DG N3 c0007 : score 2.566 : w : GLU OE1 A0658 <- 6.13 -> DG N3 c0004 : score 2.669 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.30 -> DG N3 c0004 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.33 -> DG N3 c0004 : score 1.484 : x : ALA xxxx A0707 <- 4.13 -> DC xxx c0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.29 -> DC xxx c0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 4.28 -> DC xxx c0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0717 <- 4.24 -> DA xxx c0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0719 <- 3.63 -> DA xxx c0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0729 <- 4.43 -> DA xxx c0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 3.95 -> DG xxx b0008 : score x.xxxxx >6ur9_AD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS WITH DNA TEMPLATE, DIDEOXY PRIMER, 3'-AMINO-DDGTP (NGTP), AND CA2+ organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.88 -> DC O2 b0006 : score 2.89902 : w : LYS NZ A0582 <- 5.95 -> DT O2 b0005 : score 0.522 : w : LYS NZ A0582 <- 5.61 -> DA N3 c0008 : score 1.538 : w : THR OG1 A0586 <- 5.61 -> DA N3 c0008 : score 2.845 : w : TYR OH A0587 <- 5.91 -> DG N2 c0007 : score 2.834 : w : ARG NH2 A0615 <- 5.33 -> DC O2 c0005 : score 1.669 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.71 -> DT O2 c0006 : score 1.666 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.33 -> DA N3 b0007 : score 3.40408 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.74 -> DG N3 c0007 : score 2.566 : w : GLU OE1 A0658 <- 6.13 -> DG N3 c0004 : score 2.669 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.30 -> DG N3 c0004 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.33 -> DG N3 c0004 : score 1.484 : w : ASN ND2 D0793 <- 6.30 -> DG N3 b0012 : score 2.566 : w : GLN NE2 D0797 <- 6.08 -> DG N3 b0012 : score 1.484 : x : ALA xxxx A0707 <- 4.13 -> DC xxx c0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.29 -> DC xxx c0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 4.28 -> DC xxx c0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0717 <- 4.24 -> DA xxx c0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0719 <- 3.63 -> DA xxx c0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0729 <- 4.43 -> DA xxx c0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 3.95 -> DG xxx b0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0615 <- 3.36 -> DG xxx b0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.10 -> DC xxx b0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0716 <- 3.81 -> DC xxx b0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0719 <- 3.44 -> DA xxx b0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0724 <- 3.84 -> DC xxx b0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0729 <- 3.34 -> DA xxx b0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0781 <- 4.06 -> DC xxx b0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0782 <- 3.40 -> DC xxx b0009 : score x.xxxxx >6us5_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS WITH DNA TEMPLATE, 3'-AMINO PRIMER, DGPNHPP ANALOG, AND MN2+ organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.97 -> DC O2 b0006 : score 2.84598 : w : LYS NZ A0582 <- 5.96 -> DA N3 c0008 : score 1.538 : w : THR OG1 A0586 <- 5.67 -> DA N3 c0008 : score 2.845 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.44 -> DC O2 c0005 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.70 -> DT O2 c0006 : score 1.666 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.39 -> DA N3 b0007 : score 3.35838 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.56 -> DG N3 c0007 : score 2.566 : w : GLU OE1 A0658 <- 6.31 -> DG N3 c0004 : score 2.669 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.39 -> DG N3 c0004 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.09 -> DG N3 c0004 : score 1.484 : x : ALA xxxx A0707 <- 3.80 -> DC xxx c0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0710 <- 4.33 -> DC xxx c0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.38 -> DC xxx c0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 4.29 -> DC xxx c0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0717 <- 3.76 -> DA xxx c0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0719 <- 3.45 -> DA xxx c0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0729 <- 4.32 -> DA xxx c0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0781 <- 3.96 -> DA xxx c0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.02 -> DG xxx b0008 : score x.xxxxx >6us5_AD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS WITH DNA TEMPLATE, 3'-AMINO PRIMER, DGPNHPP ANALOG, AND MN2+ organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.97 -> DC O2 b0006 : score 2.84598 : w : LYS NZ A0582 <- 5.96 -> DA N3 c0008 : score 1.538 : w : THR OG1 A0586 <- 5.67 -> DA N3 c0008 : score 2.845 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.44 -> DC O2 c0005 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.70 -> DT O2 c0006 : score 1.666 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.39 -> DA N3 b0007 : score 3.35838 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.56 -> DG N3 c0007 : score 2.566 : w : GLU OE1 A0658 <- 6.31 -> DG N3 c0004 : score 2.669 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.39 -> DG N3 c0004 : score 2.566 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.09 -> DG N3 c0004 : score 1.484 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.14 -> DG N3 b0012 : score 2.669 : w : ASN ND2 D0793 <- 6.37 -> DG N3 b0012 : score 2.566 : w : GLN NE2 D0797 <- 6.17 -> DG N3 b0012 : score 1.484 : x : ALA xxxx A0707 <- 3.80 -> DC xxx c0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0710 <- 4.33 -> DC xxx c0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.38 -> DC xxx c0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 4.29 -> DC xxx c0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0717 <- 3.76 -> DA xxx c0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0719 <- 3.45 -> DA xxx c0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0729 <- 4.32 -> DA xxx c0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0781 <- 3.96 -> DA xxx c0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.02 -> DG xxx b0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0615 <- 3.28 -> DG xxx b0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0707 <- 4.10 -> DC xxx b0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.12 -> DC xxx b0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0716 <- 4.19 -> DC xxx b0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0719 <- 3.68 -> DA xxx b0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0729 <- 3.39 -> DA xxx b0010 : score x.xxxxx >6usj_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF TWO NUCLEOSOMES BRIDGED BY HUMAN PARP2 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.83 -> DC O2 J0008 : score 3.67653 : H : ARG NH2 A0040 <- 2.92 -> DG N3 J0009 : score 3.52361 : H : ARG NH1 C0011 <- 2.79 -> DT O2 J0043 : score 4.31502 : H : ARG NH2 C0011 <- 2.90 -> DC O2 J0044 : score 3.62474 : H : ARG NH2 C0042 <- 2.84 -> DT O2 J0038 : score 4.19947 : H : ARG NH1 E0040 <- 2.87 -> DT O2 I0009 : score 4.24612 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.81 -> DT O2 I0009 : score 4.22487 : H : ARG NH1 G0042 <- 2.99 -> DG N3 I0038 : score 2.93657 : x : ARG xxxx A0083 <- 3.48 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.28 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.39 -> DC xxx J0069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.49 -> DG xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0035 <- 3.86 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.54 -> DA xxx I0006 : score x.xxxxx >6usj_E:Histone-fold; title=STRUCTURE OF TWO NUCLEOSOMES BRIDGED BY HUMAN PARP2 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 E0040 <- 2.87 -> DT O2 I0009 : score 4.24612 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.81 -> DT O2 I0009 : score 4.22487 : x : HIS xxxx E0039 <- 4.39 -> DC xxx J0069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.49 -> DG xxx J-024 : score x.xxxxx >6usj_KLMNOPQR:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF TWO NUCLEOSOMES BRIDGED BY HUMAN PARP2 organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 K0040 <- 2.84 -> DC O2 T0008 : score 3.66913 : H : ARG NH2 K0040 <- 2.92 -> DG N3 T0009 : score 3.52361 : H : ARG NH1 M0011 <- 2.79 -> DT O2 T0043 : score 4.31502 : H : ARG NH2 M0011 <- 2.90 -> DC O2 T0044 : score 3.62474 : H : ARG NH2 M0042 <- 2.84 -> DT O2 T0038 : score 4.19947 : H : ARG NH1 O0040 <- 2.87 -> DT O2 S0009 : score 4.24612 : H : ARG NH2 O0040 <- 2.80 -> DT O2 S0009 : score 4.23333 : H : ARG NH1 Q0042 <- 2.99 -> DG N3 S0038 : score 2.93657 : x : ARG xxxx K0083 <- 3.49 -> DT xxx S-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0045 <- 3.26 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx O0039 <- 4.40 -> DC xxx T0069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0083 <- 3.49 -> DG xxx T-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0035 <- 3.85 -> DT xxx S0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0045 <- 3.52 -> DA xxx S0006 : score x.xxxxx >6usj_UV:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF TWO NUCLEOSOMES BRIDGED BY HUMAN PARP2 organism=HOMO SAPIENS : x : GLN xxxx U0146 <- 3.86 -> DC xxx I-081 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx V0146 <- 4.04 -> DG xxx J0081 : score x.xxxxx >6uso_A:DNA/RNA_polymerases; title=TELOMERASE REVERSE TRANSCRIPTASE PRENUCLEOTIDE BINARY COMPLEX, TERT:DNA organism=Tribolium castaneum : H : ASN OD1 A0446 <- 3.16 -> DG N2 E0012 : score 4.4544 : H : ASN ND2 A0446 <- 3.35 -> DG N3 E0012 : score 4.35644 : x : PRO xxxx A0442 <- 4.02 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0445 <- 3.47 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx >6usp_A:DNA/RNA_polymerases; title=TELOMERASE REVERSE TRANSCRIPTASE PRODUCT COMPLEX, TERT:DNA organism=Tribolium castaneum : H : ASN OD1 A0446 <- 2.50 -> DG N2 E0012 : score 5.088 : H : ASN ND2 A0446 <- 3.20 -> DG N3 E0012 : score 4.50328 : x : ARG xxxx A0194 <- 3.15 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0442 <- 3.40 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0445 <- 3.21 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx >6usq_A:DNA/RNA_polymerases; title=TELOMERASE REVERSE TRANSCRIPTASE BINARY COMPLEX WITH Y256A MUTATION, TERT:DNA organism=Tribolium castaneum : H : ASN OD1 A0446 <- 2.99 -> DG N2 E0012 : score 4.6176 : x : PRO xxxx A0442 <- 4.18 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0445 <- 3.64 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx >6usr_A:DNA/RNA_polymerases; title=TELOMERASE REVERSE TRANSCRIPTASE TERNARY COMPLEX, TERT:DNA:DGPCPP organism=Tribolium castaneum : H : ASN OD1 A0446 <- 2.76 -> DG N2 E0012 : score 4.8384 : H : ASN ND2 A0446 <- 2.80 -> DG N3 E0012 : score 4.89487 : x : PRO xxxx A0442 <- 3.75 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0445 <- 3.30 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx >6uvw_D:Homing_endonucleases; title=ENGINEERED VARIANT OF I-ONUI MEGANUCLEASE WITH IMPROVED THERMOSTABILITY organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : ARG NH1 D0028 <- 3.09 -> DG O6 F0020 : score 5.7305 : H : ARG NH2 D0028 <- 2.84 -> DG N7 F0020 : score 6.33354 : H : ARG NH1 D0030 <- 2.79 -> DG O6 F0021 : score 6.0955 : H : ARG NH2 D0030 <- 3.08 -> DG N7 F0021 : score 6.02708 : H : GLN NE2 D0046 <- 3.31 -> DG N7 F0018 : score 3.77045 : H : LYS NZ D0080 <- 2.54 -> DG O6 F0018 : score 6.08137 : H : ASN ND2 D0184 <- 2.92 -> DT O4 E0019 : score 5.15778 : H : GLN OE1 D0195 <- 2.87 -> DA N6 F0005 : score 5.96783 : H : GLN NE2 D0195 <- 2.77 -> DA N7 F0005 : score 6.12628 : H : GLN NE2 D0197 <- 2.91 -> DA N7 F0006 : score 5.95577 : H : LYS NZ D0225 <- 2.75 -> DG N7 F0008 : score 5.43976 : V : LYS CB D0034 <- 3.56 -> DT C7 E0002 : score 2.44398 : V : SER CB D0040 <- 3.78 -> DT C7 E0003 : score 3.14694 : V : PHE CB D0232 <- 3.69 -> DT C7 E0013 : score 5.96055 : V : ALA CB D0076 <- 3.55 -> DT C7 F0015 : score 5.94891 : x : SER xxxx D0024 <- 4.27 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0032 <- 3.85 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0042 <- 3.04 -> DC xxx E0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0048 <- 3.76 -> DA xxx F0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0072 <- 3.02 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0180 <- 4.02 -> DA xxx E0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0182 <- 3.57 -> DC xxx E0017 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0186 <- 3.62 -> DT xxx E0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0203 <- 3.32 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0223 <- 4.14 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0227 <- 3.20 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0229 <- 3.97 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0234 <- 3.22 -> DC xxx E0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0240 <- 4.10 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx >6uw0_B:Homing_endonucleases; title=ENGINEERED VARIANT OF I-ONUI MEGANUCLEASE WITH IMPROVED THERMOSTABILITY AND FULLY ALTERED SPECIFICITY TARGETING CHOLERA TOXIN A SUBUNIT organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : ARG NH1 B0028 <- 3.26 -> DA N7 D0020 : score 2.32471 : H : ARG NH2 B0030 <- 2.79 -> DG N7 D0021 : score 6.39738 : H : ARG NH2 B0030 <- 2.75 -> DG O6 D0021 : score 6.666 : H : ARG NH1 B0032 <- 3.32 -> DG N7 C0003 : score 5.4208 : H : ARG NH2 B0032 <- 2.78 -> DG O6 C0003 : score 6.6264 : H : GLU OE2 B0042 <- 3.11 -> DC N4 C0005 : score 4.93893 : H : GLU OE1 B0046 <- 3.07 -> DC N4 D0018 : score 5.45648 : H : LYS NZ B0048 <- 2.80 -> DT O4 C0009 : score 3.58718 : H : LYS NZ B0048 <- 2.57 -> DG O6 D0016 : score 6.04668 : H : SER OG B0072 <- 3.01 -> DT O4 C0009 : score 3.40581 : H : ARG NH1 B0078 <- 3.17 -> DG N7 C0007 : score 5.6023 : H : ARG NH1 B0080 <- 2.52 -> DG O6 C0007 : score 6.424 : H : ARG NH2 B0080 <- 3.10 -> DG O6 C0008 : score 6.204 : H : ASN ND2 B0184 <- 2.90 -> DT O4 C0019 : score 5.17892 : H : GLN OE1 B0195 <- 3.19 -> DA N6 D0005 : score 5.58046 : H : LYS NZ B0227 <- 3.00 -> DA N7 D0008 : score 2.81969 : H : LYS NZ B0227 <- 2.91 -> DG N7 D0009 : score 5.26741 : H : LYS NZ B0227 <- 2.88 -> DG O6 D0009 : score 5.68828 : V : PHE CG B0232 <- 3.88 -> DT C7 C0013 : score 5.17239 : V : TRP CD1 B0234 <- 3.83 -> DT C7 C0015 : score 7.27833 : V : PHE CZ B0182 <- 3.89 -> DT C7 C0018 : score 6.95479 : x : SER xxxx B0024 <- 4.31 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0034 <- 4.11 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0076 <- 4.01 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0140 <- 3.91 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0180 <- 3.99 -> DA xxx C0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0186 <- 3.32 -> DA xxx C0020 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0197 <- 4.13 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0201 <- 4.43 -> DA xxx C0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0223 <- 4.04 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0225 <- 4.17 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0236 <- 2.91 -> DA xxx C0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0240 <- 3.51 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx >6uwg_A:Homing_endonucleases; title=ENGINEERED VARIANT OF I-ONUI MEGANUCLEASE WITH IMPROVED THERMOSTABILITY AND E178D MUTATION AT CATALYTIC SITE organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : ARG NH1 A0028 <- 2.98 -> DG O6 C0020 : score 5.86433 : H : ARG NH2 A0028 <- 2.90 -> DG N7 C0020 : score 6.25692 : H : ARG NH1 A0030 <- 2.87 -> DG O6 C0021 : score 5.99817 : H : ARG NH2 A0030 <- 3.20 -> DG N7 C0021 : score 5.87385 : w : ARG NH1 A0030 <- 5.71 -> DT O4 B0004 : score 1.768 : w : ASN ND2 A0032 <- 5.61 -> DT O4 B0003 : score 3.275 : H : GLU OE2 A0042 <- 2.92 -> DC N4 B0005 : score 5.13902 : w : GLU OE2 A0042 <- 5.68 -> DT O4 B0004 : score 2.279 : H : GLN NE2 A0046 <- 3.14 -> DG N7 C0018 : score 3.91321 : w : GLN NE2 A0046 <- 5.58 -> DA N7 C0017 : score 1.888 : w : THR OG1 A0048 <- 5.59 -> DA N7 C0017 : score 2.152 : w : SER OG A0072 <- 6.16 -> DT O4 B0009 : score 2.338 : w : SER OG A0078 <- 5.62 -> DC N4 B0008 : score 2.105 : H : LYS NZ A0080 <- 2.84 -> DG O6 C0018 : score 5.73452 : H : ASN ND2 A0184 <- 3.03 -> DT O4 B0019 : score 5.04152 : w : SER OG A0188 <- 5.63 -> DT O4 B0021 : score 2.338 : H : GLN OE1 A0195 <- 3.00 -> DA N6 C0005 : score 5.81046 : H : GLN NE2 A0195 <- 2.76 -> DA N7 C0005 : score 6.13846 : H : GLN NE2 A0197 <- 3.02 -> DA N7 C0006 : score 5.82179 : w : GLN OE1 A0197 <- 5.76 -> DA N6 C0007 : score 3.392 : w : TYR OH A0223 <- 5.67 -> DA N7 C0007 : score 3.238 : H : LYS NZ A0225 <- 3.05 -> DG N7 C0008 : score 5.1166 : w : LYS NZ A0225 <- 5.83 -> DA N7 C0007 : score 1.655 : H : LYS NZ A0227 <- 2.60 -> DG N7 C0009 : score 5.60133 : H : LYS NZ A0229 <- 2.49 -> DT O4 B0013 : score 3.80958 : H : LYS NZ A0229 <- 3.07 -> DG O6 C0012 : score 5.46861 : w : TRP NE1 A0234 <- 5.92 -> DA N6 B0015 : score 4.074 : w : ASP OD2 A0236 <- 5.68 -> DA N6 B0015 : score 3.409 : V : LYS CB A0034 <- 3.62 -> DT C7 B0002 : score 2.40939 : V : SER CB A0040 <- 3.81 -> DT C7 B0003 : score 3.12345 : V : PHE CB A0232 <- 3.62 -> DT C7 B0013 : score 6.06207 : V : ILE CG2 A0186 <- 3.64 -> DT C7 B0020 : score 7.37493 : x : SER xxxx A0024 <- 4.38 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0050 <- 3.23 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0052 <- 3.00 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0082 <- 4.41 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0140 <- 4.05 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0180 <- 4.16 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0182 <- 3.45 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0190 <- 4.49 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0203 <- 3.21 -> DA xxx B0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 4.21 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0299 <- 3.38 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx >6uwh_A:Homing_endonucleases; title=INTERMEDIATE ENGINEERED VARIANT OF I-ONUI MEGANUCLEASE WITH IMPROVED THERMOSTABILITY AND PARTIALLY ALTERED SPECIFICITY organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : ARG NH1 A0028 <- 2.95 -> DG O6 C0020 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0028 <- 2.80 -> DG N7 C0020 : score 6.38462 : H : ARG NH1 A0030 <- 2.77 -> DG O6 C0021 : score 6.11983 : H : ARG NH2 A0030 <- 2.99 -> DG N7 C0021 : score 6.142 : H : GLU OE1 A0042 <- 3.15 -> DC N4 B0005 : score 5.36419 : w : GLU OE2 A0042 <- 5.41 -> DC N4 B0006 : score 3.597 : H : GLN NE2 A0046 <- 3.17 -> DG N7 C0018 : score 3.88801 : w : THR OG1 A0048 <- 5.86 -> DA N7 C0017 : score 2.152 : w : SER OG A0072 <- 5.93 -> DT O4 B0009 : score 2.338 : w : SER OG A0078 <- 5.52 -> DC N4 B0008 : score 2.105 : H : LYS NZ A0080 <- 2.79 -> DG O6 C0018 : score 5.79233 : H : ASN ND2 A0184 <- 2.95 -> DT O4 B0019 : score 5.12608 : H : GLN OE1 A0195 <- 2.96 -> DA N6 C0005 : score 5.85888 : H : GLN NE2 A0195 <- 2.96 -> DA N7 C0005 : score 5.89487 : H : GLN NE2 A0197 <- 3.15 -> DA N7 C0006 : score 5.66346 : w : GLN OE1 A0197 <- 5.91 -> DA N6 C0007 : score 3.392 : w : SER OG A0203 <- 5.72 -> DG N7 B0015 : score 2.749 : w : TYR OH A0223 <- 5.61 -> DA N7 C0007 : score 3.238 : H : LYS NZ A0225 <- 3.17 -> DG N7 C0008 : score 4.98734 : w : LYS NZ A0225 <- 5.72 -> DA N7 C0007 : score 1.655 : w : GLU OE1 A0236 <- 5.24 -> DG N7 B0015 : score 1.976 : V : LYS CB A0034 <- 3.79 -> DT C7 B0002 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NH1 A0028 <- 2.95 -> DG O6 C0020 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0028 <- 2.83 -> DG N7 C0020 : score 6.34631 : H : ARG NH1 A0030 <- 2.85 -> DG O6 C0021 : score 6.0225 : H : ARG NH2 A0030 <- 2.90 -> DG N7 C0021 : score 6.25692 : w : ARG NH1 A0030 <- 5.55 -> DT O4 B0004 : score 1.768 : w : ASN ND2 A0032 <- 5.70 -> DT O4 B0003 : score 3.275 : H : GLU OE1 A0042 <- 3.04 -> DC N4 B0005 : score 5.49109 : w : GLU OE1 A0042 <- 5.49 -> DT O4 B0004 : score 2.749 : w : GLU OE2 A0042 <- 5.91 -> DC N4 B0006 : score 3.597 : H : GLN NE2 A0046 <- 3.03 -> DG N7 C0018 : score 4.00558 : w : GLN NE2 A0046 <- 5.75 -> DA N7 C0017 : score 1.888 : w : THR OG1 A0048 <- 5.50 -> DA N7 C0017 : score 2.152 : w : SER OG A0072 <- 5.44 -> DT O4 B0009 : score 2.338 : w : SER OG A0078 <- 5.57 -> DC N4 B0008 : score 2.105 : H : LYS NZ A0080 <- 2.93 -> DG O6 C0018 : score 5.63047 : w : LYS NZ A0080 <- 5.62 -> DT O4 C0019 : score 1.7 : H : ASN ND2 A0184 <- 2.98 -> DT O4 B0019 : score 5.09437 : w : ASN ND2 A0184 <- 6.16 -> DC N4 B0018 : score 2.395 : H : SER OG A0186 <- 3.06 -> DC N4 B0020 : score 3.48451 : H : LYS NZ A0188 <- 2.52 -> DG O6 C0004 : score 6.10449 : H : GLN OE1 A0195 <- 2.93 -> DA N6 C0005 : score 5.8952 : H : GLN NE2 A0195 <- 2.93 -> DA N7 C0005 : score 5.93141 : H : LYS NZ A0197 <- 3.10 -> DG N7 C0006 : score 5.06274 : H : LYS NZ A0197 <- 2.96 -> DG O6 C0006 : score 5.59578 : w : LYS NZ A0197 <- 6.26 -> DA N6 C0007 : score 2.097 : w : SER OG A0203 <- 5.68 -> DG N7 B0015 : score 2.749 : w : TYR OH A0223 <- 5.49 -> DA N7 C0007 : score 3.238 : H : LYS NZ A0225 <- 2.76 -> DG N7 C0008 : score 5.42898 : w : LYS NZ A0225 <- 5.61 -> DA N7 C0007 : score 1.655 : H : LYS NZ A0227 <- 2.85 -> DG N7 C0009 : score 5.33204 : w : TRP NE1 A0234 <- 5.56 -> DG N7 B0015 : score 4.362 : H : GLU OE2 A0236 <- 3.25 -> DA N6 B0016 : score 2.77667 : w : GLU OE2 A0236 <- 5.43 -> DG N7 B0015 : score 2.669 : V : LYS CB A0034 <- 3.54 -> DT C7 B0002 : score 2.45551 : V : SER CB A0040 <- 3.68 -> DT C7 B0003 : score 3.22522 : V : THR CG2 A0190 <- 3.86 -> DT C7 C0003 : score 4.17337 : x : SER xxxx A0024 <- 4.35 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0026 <- 4.05 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0050 <- 3.10 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0052 <- 2.89 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0082 <- 4.46 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0140 <- 3.78 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0180 <- 3.95 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0182 <- 3.52 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0229 <- 3.42 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0232 <- 3.48 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 3.97 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0299 <- 4.21 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx >6uwk_A:Homing_endonucleases; title=ENGINEERED VARIANT OF I-ONUI MEGANUCLEASE WITH IMPROVED STABILITY AND FULLY ALTERED SPECIFICITY TARGETING HUMAN CHROMOSOME 11 TRANS INTEGRATION SITE organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : ARG NH1 A0028 <- 2.73 -> DG O6 C0020 : score 6.1685 : H : ARG NH2 A0028 <- 2.66 -> DG N7 C0020 : score 6.56338 : H : ARG NH1 A0030 <- 3.07 -> DG N7 C0021 : score 5.7233 : H : ARG NH2 A0030 <- 3.06 -> DG O6 C0021 : score 6.2568 : w : ARG NH2 A0030 <- 5.94 -> DT O4 B0004 : score 2.366 : H : TYR OH A0032 <- 3.13 -> DC N4 B0003 : score 3.93597 : H : GLN OE1 A0034 <- 2.48 -> DC N4 B0002 : score 4.87667 : H : GLU OE1 A0042 <- 2.99 -> DC N4 B0005 : score 5.54877 : w : GLU OE1 A0042 <- 5.26 -> DT O4 B0004 : score 2.749 : w : GLU OE2 A0042 <- 6.35 -> DC N4 B0006 : score 3.597 : H : GLN NE2 A0046 <- 3.29 -> DG N7 C0018 : score 3.78724 : H : LYS NZ A0080 <- 3.09 -> DG O6 C0018 : score 5.44548 : H : ASN ND2 A0184 <- 2.92 -> DT O4 B0019 : score 5.15778 : w : ASN ND2 A0184 <- 6.03 -> DC N4 B0018 : score 2.395 : H : SER OG A0186 <- 2.49 -> DC N4 B0020 : score 3.90353 : H : GLN OE1 A0195 <- 2.81 -> DA N6 C0005 : score 6.04046 : H : GLN NE2 A0195 <- 2.98 -> DA N7 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<- 3.19 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0232 <- 3.47 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0234 <- 3.06 -> DC xxx B0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0240 <- 4.14 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx >6v0v_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE WT RAG1/2 NFC COMPLEX (DNA0) organism=MUS MUSCULUS : V : LYS CE A0844 <- 3.69 -> DT C7 F0027 : score 2.67255 : x : ILE xxxx A0846 <- 3.25 -> DG xxx F0028 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0847 <- 2.97 -> DT xxx F0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0848 <- 3.01 -> DA xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0850 <- 3.50 -> DG xxx F0028 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0852 <- 3.66 -> DA xxx I0020 : score x.xxxxx >6v0v_AB:Galactose_oxidase,_central_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MOUSE WT RAG1/2 NFC COMPLEX (DNA0) organism=MUS MUSCULUS : V : LYS CE A0844 <- 3.69 -> DT C7 F0027 : score 2.67255 : x : ILE xxxx A0846 <- 3.25 -> DG xxx F0028 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0847 <- 2.97 -> DT xxx F0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0848 <- 3.01 -> DA xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0850 <- 3.50 -> DG xxx F0028 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0852 <- 3.66 -> DA xxx I0020 : score x.xxxxx >6v2k_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE NUCLEOSOME STRUCTURE AFTER H2A-H2B EXCHANGE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.79 -> DA N3 J0229 : score 3.24622 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.45 -> DA xxx J0153 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 3.69 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.13 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.07 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.57 -> DT xxx J0258 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.36 -> DT xxx J0269 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.45 -> DA xxx I0082 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.95 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.01 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.80 -> DC xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.20 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx >6v2k_B:Histone-fold; title=THE NUCLEOSOME STRUCTURE AFTER H2A-H2B EXCHANGE organism=? : x : ARG xxxx B0045 <- 4.07 -> DT xxx J0226 : score x.xxxxx >6v3k_A:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF HIV CLEAVED SYNAPTIC COMPLEX (CSC) INTASOME BOUND WITH MAGNESIUM AND INSTI XZ419 (COMPOUND 4C) organism=? : H : LYS NZ A0156 <- 3.09 -> DT O2 E0020 : score 3.37912 : x : HIS xxxx A0051 <- 3.36 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.85 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.99 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0153 <- 3.14 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx >6v3k_ABC:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF HIV CLEAVED SYNAPTIC COMPLEX (CSC) INTASOME BOUND WITH MAGNESIUM AND INSTI XZ419 (COMPOUND 4C) organism=? : H : LYS NZ A0156 <- 3.09 -> DT O2 E0020 : score 3.37912 : x : HIS xxxx A0051 <- 3.36 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.85 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.99 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0153 <- 3.14 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx >6v5k_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA COMPLEXED WITH N7- NITROGEN HALF-MUSTARD GUANINE (NHMG) AND DCTP* organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.49 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.28 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx >6v7b_I: title=CRYO-EM RECONSTRUCTION OF PYROBACULUM FILAMENTOUS VIRUS 2 (PFV2) organism=PYROBACULUM FILAMENTOUS VIRUS 1 : H : TRP NE1 I0031 <- 2.74 -> DT O2 20318 : score 6.28997 : x : HIS xxxx I0018 <- 3.08 -> DT xxx 20320 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0035 <- 4.43 -> DT xxx 10188 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0045 <- 3.33 -> DT xxx 10190 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0048 <- 3.49 -> DA xxx 20315 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0072 <- 4.26 -> DA xxx 10193 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0075 <- 3.65 -> DT xxx 10192 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0079 <- 3.73 -> DT xxx 20314 : score x.xxxxx >6v7b_p: title=CRYO-EM RECONSTRUCTION OF PYROBACULUM FILAMENTOUS VIRUS 2 (PFV2) organism=PYROBACULUM FILAMENTOUS VIRUS 1 : H : TYR OH p0006 <- 2.83 -> DA N3 20473 : score 4.12637 : H : TYR OH p0015 <- 3.05 -> DA N3 20475 : score 3.94372 : H : TRP NE1 p0039 <- 2.70 -> DA N3 10041 : score -9.29377 : H : TRP NE1 p0043 <- 2.94 -> DT O2 10040 : score 6.04135 : x : ALA xxxx p0062 <- 3.26 -> DT xxx 20468 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx p0065 <- 3.58 -> DA xxx 20467 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx p0066 <- 3.47 -> DT xxx 10038 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx p0069 <- 3.15 -> DA xxx 10039 : score x.xxxxx >6v8u_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=KAISO (ZBTB33) ZINC FINGER DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH A MODIFIED KAISO BINDING SEQUENCE (KBS) organism=Homo sapiens : w : THR OG1 A0507 <- 5.76 -> DC N4 D0010 : score 2.558 : w : SER OG A0508 <- 5.75 -> DC N4 D0010 : score 2.105 : H : ARG NH1 A0511 <- 2.88 -> DG O6 E0027 : score 5.986 : H : ARG NH1 A0511 <- 2.94 -> DG O6 D0009 : score 5.913 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.00 -> DG N7 D0009 : score 6.12923 : H : ARG NH2 A0511 <- 3.23 -> DG O6 D0009 : score 6.0324 : H : GLU OE2 A0535 <- 2.90 -> DC N4 E0028 : score 5.16008 : H : LYS NZ A0539 <- 2.97 -> DG O6 D0007 : score 5.58422 : w : LYS NZ A0539 <- 5.76 -> DC N4 D0006 : score 0.048 : w : LYS NZ A0539 <- 6.04 -> DA N6 E0029 : score 2.097 : H : GLN NE2 A0563 <- 2.74 -> DG O6 E0031 : score 5.87479 : w : GLN OE1 A0563 <- 5.63 -> DC N4 E0030 : score 3.488 : H : ARG NH1 A0595 <- 2.86 -> DT O2 E0025 : score 4.25473 : H : ARG NH2 A0595 <- 2.91 -> DG N3 E0026 : score 3.53083 : w : ARG NH1 A0595 <- 5.46 -> DA N3 D0013 : score 2.585 : H : TYR OH A0597 <- 3.44 -> DG N2 E0026 : score 4.26386 : w : TYR OH A0597 <- 5.96 -> DC O2 D0011 : score 1.343 : V : THR CG2 A0507 <- 3.85 -> DT C7 E0025 : score 4.18396 : V : LEU CD2 A0533 <- 3.60 -> DT C7 D0008 : score 6.01785 : x : TYR xxxx A0536 <- 3.69 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0561 <- 3.96 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0562 <- 3.56 -> DC xxx E0030 : score x.xxxxx >6v92_abcdefgh: title=RSC-NCP organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 a0040 <- 2.95 -> DA N3 j0229 : score 3.14255 : H : ARG NH1 c0011 <- 3.46 -> DT O2 j0263 : score 3.73796 : H : ARG NH2 c0011 <- 2.83 -> DT O2 j0264 : score 4.20793 : H : ARG NH2 e0040 <- 2.84 -> DA N3 i0082 : score 3.21383 : x : TYR xxxx a0041 <- 4.48 -> DA xxx j0153 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx a0065 <- 4.35 -> DT xxx j0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a0083 <- 4.02 -> DC xxx i0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx b0045 <- 3.77 -> DT xxx j0226 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx d0036 <- 4.10 -> DT xxx j0269 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx e0039 <- 4.33 -> DT xxx j0289 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx e0041 <- 4.18 -> DT xxx i0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx e0065 <- 4.02 -> DT xxx i0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx e0083 <- 3.64 -> DA xxx i0099 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx f0045 <- 3.97 -> DC xxx i0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx g0077 <- 4.22 -> DA xxx j0165 : score x.xxxxx >6v92_d:Histone-fold; title=RSC-NCP organism=? : x : VAL xxxx d0036 <- 4.10 -> DT xxx j0269 : score x.xxxxx >6v93_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF DNA POLYMERASE ZETA/DNA/DNTP TERNARY COMPLEX organism=? : H : LYS NZ A1194 <- 3.29 -> DA N3 P0114 : score 2.50478 : H : ARG NH1 A1220 <- 3.21 -> DC O2 P0112 : score 3.3507 : x : ARG xxxx A1195 <- 3.88 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A1222 <- 4.32 -> DC xxx P0111 : score x.xxxxx >6vaa_A:ARM_repeat; title=STRUCTURE OF THE FANCONI ANEMIA ID COMPLEX BOUND TO ICL DNA organism=HOMO SAPIENS : V : LYS CE A0793 <- 3.86 -> DT C7 X0004 : score 2.56201 >6vae_A:ARM_repeat; title=MONO-UBIQUITINATED FANCONI ANEMIA ID COMPLEX BOUND TO ICL DNA organism=HOMO SAPIENS : x : LYS xxxx A0793 <- 4.45 -> DA xxx S0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1245 <- 4.42 -> DT xxx S0010 : score x.xxxxx >6vbw_BCDEFG: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CASCADE-TNIQ-DSDNA TERNARY COMPLEX organism=VIBRIO CHOLERAE : H : SER OG D0243 <- 3.29 -> DG O6 L0072 : score 3.69011 : x : ALA xxxx B0045 <- 4.38 -> DG xxx L0085 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0069 <- 3.42 -> DT xxx L0084 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0070 <- 3.78 -> DC xxx L0083 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0071 <- 3.52 -> DT xxx L0084 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0227 <- 3.63 -> DA xxx L0088 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0243 <- 3.56 -> DT xxx L0084 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0006 <- 3.16 -> DT xxx L0086 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0040 <- 3.83 -> DA xxx L0076 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0069 <- 3.33 -> DG xxx L0078 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0070 <- 3.49 -> DA xxx L0077 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0071 <- 3.29 -> DG xxx L0078 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0229 <- 2.74 -> DC xxx L0083 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0243 <- 3.60 -> DG xxx L0078 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0346 <- 3.38 -> DG xxx L0085 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0348 <- 3.37 -> DT xxx L0086 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0006 <- 3.13 -> DG xxx L0080 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0040 <- 3.79 -> DA xxx L0070 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0044 <- 4.23 -> DG xxx L0072 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0069 <- 3.18 -> DG xxx L0072 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0070 <- 3.54 -> DA xxx L0071 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0071 <- 3.36 -> DG xxx L0072 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0102 <- 4.38 -> DG xxx L0080 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0227 <- 3.99 -> DA xxx L0077 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0229 <- 3.31 -> DA xxx L0077 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0239 <- 3.84 -> DA xxx L0071 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0240 <- 3.09 -> DA xxx L0071 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0346 <- 3.35 -> DC xxx L0079 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0348 <- 3.48 -> DG xxx L0080 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0006 <- 3.64 -> DT xxx L0068 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0069 <- 3.84 -> DA xxx L0060 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0070 <- 3.54 -> DG xxx L0059 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0071 <- 3.33 -> DA xxx L0060 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0227 <- 3.66 -> DG xxx L0064 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0229 <- 3.22 -> DC xxx L0065 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0239 <- 3.73 -> DG xxx L0059 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0240 <- 4.45 -> DG xxx L0059 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0243 <- 3.42 -> DA xxx L0060 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0346 <- 3.28 -> DA xxx L0067 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0348 <- 3.59 -> DT xxx L0068 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0006 <- 4.06 -> DC xxx L0074 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0040 <- 3.40 -> DG xxx L0064 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0069 <- 4.15 -> DA xxx L0066 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0070 <- 3.72 -> DC xxx L0065 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0071 <- 3.40 -> DA xxx L0066 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0227 <- 3.81 -> DA xxx L0071 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0229 <- 3.70 -> DA xxx L0071 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0240 <- 2.50 -> DC xxx L0065 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0243 <- 3.22 -> DA xxx L0066 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0346 <- 3.44 -> DC xxx L0073 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0006 <- 3.90 -> DA xxx L0062 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0227 <- 3.94 -> DG xxx L0059 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0229 <- 4.21 -> DG xxx L0059 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0230 <- 3.73 -> DC xxx L0057 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0346 <- 3.40 -> DA xxx L0061 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0348 <- 3.66 -> DA xxx L0062 : score x.xxxxx >6vbw_D: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CASCADE-TNIQ-DSDNA TERNARY COMPLEX organism=? : H : SER OG D0243 <- 3.29 -> DG O6 L0072 : score 3.69011 : x : ASN xxxx D0006 <- 3.13 -> DG xxx L0080 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0040 <- 3.79 -> DA xxx L0070 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0044 <- 4.23 -> DG xxx L0072 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0069 <- 3.18 -> DG xxx L0072 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0070 <- 3.54 -> DA xxx L0071 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0071 <- 3.36 -> DG xxx L0072 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0102 <- 4.38 -> DG xxx L0080 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0227 <- 3.99 -> DA xxx L0077 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0229 <- 3.31 -> DA xxx L0077 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0239 <- 3.84 -> DA xxx L0071 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0240 <- 3.09 -> DA xxx L0071 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0346 <- 3.35 -> DC xxx L0079 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0348 <- 3.48 -> DG xxx L0080 : score x.xxxxx >6vcs_A:PUA_domain-like; title=SRA DOMAIN OF UHRF1 IN COMPLEX WITH DNA organism=HOMO SAPIENS : H : SER OG A0415 <- 2.75 -> DG N7 C0010 : score 4.52687 : w : SER OG A0437 <- 5.85 -> DC O2 D0002 : score 1.768 : w : ARG NH1 A0443 <- 5.76 -> DC O2 D0002 : score 1.381 : x : PRO xxxx A0414 <- 4.05 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0450 <- 3.88 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0452 <- 4.15 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx >6vcs_ABE:PUA_domain-like; title=SRA DOMAIN OF UHRF1 IN COMPLEX WITH DNA organism=HOMO SAPIENS : H : SER OG A0415 <- 2.75 -> DG N7 C0010 : score 4.52687 : w : SER OG A0437 <- 5.85 -> DC O2 D0002 : score 1.768 : w : ARG NH1 A0443 <- 5.76 -> DC O2 D0002 : score 1.381 : H : SER OG B0415 <- 2.94 -> DG N7 D0010 : score 4.35655 : w : SER OG B0437 <- 6.01 -> DC O2 C0002 : score 1.768 : w : ARG NH1 B0443 <- 5.67 -> DC O2 C0002 : score 1.381 : x : PRO xxxx A0414 <- 4.05 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0450 <- 3.88 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0452 <- 4.15 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0414 <- 4.11 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0450 <- 3.92 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0452 <- 4.16 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx >6vdd_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=POL DOMAIN OF POL1 FROM M. SMEGMATIS COMPLEX WITH DNA PRIMER-TEMPLATE AND DNTP organism=Mycolicibacterium smegmatis : H : ARG NH1 A0646 <- 2.95 -> DA N3 B0011 : score 3.57159 : H : ARG NH2 A0646 <- 3.21 -> DA N3 B0011 : score 2.97408 : w : ARG NH1 A0646 <- 5.70 -> DA N3 C0010 : score 2.585 : w : ASN ND2 A0653 <- 5.73 -> DC O2 C0011 : score 1.885 : H : ASN OD1 A0656 <- 3.22 -> DG N2 B0009 : score 4.3968 : w : ASN OD1 A0656 <- 6.20 -> DG N3 C0012 : score 3.377 : w : HIS NE2 A0860 <- 5.61 -> DT O2 B0010 : score 3.682 : x : ARG xxxx A0615 <- 2.07 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0660 <- 3.54 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0745 <- 3.11 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0824 <- 4.15 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0828 <- 3.45 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >6vdk_A:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=CRYOEM STRUCTURE OF HIV-1 CONSERVED INTASOME CORE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : x : HIS xxxx A0051 <- 4.18 -> DG xxx G0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.82 -> DG xxx G0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.37 -> DC xxx H0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0153 <- 3.64 -> DC xxx G0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0156 <- 4.28 -> DG xxx H0019 : score x.xxxxx >6vdk_AJP:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=CRYOEM STRUCTURE OF HIV-1 CONSERVED INTASOME CORE organism=? : x : HIS xxxx A0051 <- 4.18 -> DG xxx G0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.82 -> DG xxx G0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.37 -> DC xxx H0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0153 <- 3.64 -> DC xxx G0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0156 <- 4.28 -> DG xxx H0019 : score x.xxxxx >6vdk_CIM:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=CRYOEM STRUCTURE OF HIV-1 CONSERVED INTASOME CORE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : x : HIS xxxx C0051 <- 3.56 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0146 <- 4.19 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0152 <- 3.55 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0153 <- 3.80 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0156 <- 3.66 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx >6ven_ABCDEFGH: title=YEAST COMPASS IN COMPLEX WITH A UBIQUITINATED NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 E0040 <- 2.43 -> DT O2 J0083 : score 4.5466 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.57 -> DG xxx J0066 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.86 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.21 -> DG xxx I0122 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.45 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.47 -> DA xxx J0100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.40 -> DC xxx J0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.80 -> DG xxx J0122 : score x.xxxxx >6vg2_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF HUMAN TRANSCRIPTION FACTOR FLI1 IN COMPLEX WITH 16-MER DNA CAGAGGATGTGGCTTC organism=Homo sapiens : H : ARG NE D0337 <- 2.83 -> DG O6 E0006 : score 3.91738 : H : ARG NH2 D0337 <- 2.80 -> DG N7 E0006 : score 6.38462 : H : ARG NH2 D0340 <- 2.81 -> DG N7 E0005 : score 6.37185 : H : ARG NH2 D0340 <- 2.82 -> DG O6 E0005 : score 6.5736 : H : TYR OH D0341 <- 3.12 -> DA N6 F0017 : score 4.3716 : H : TYR OH D0341 <- 3.04 -> DA N6 E0007 : score 4.44633 : x : LYS xxxx D0334 <- 4.19 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx >6vg6_D:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DPO4 WITH 8-OXOADENINE (OXOA) AND DGTP* organism=Saccharolobus solfataricus : x : ARG xxxx D0332 <- 3.22 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0336 <- 3.99 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx >6vg8_AD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAINS OF HUMAN FLI1 AND RUNX2 IN COMPLEX WITH 16-MER DNA CAGAGGATGTGGCTTC organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0337 <- 3.04 -> DG O6 B0006 : score 3.75186 : H : TYR OH A0341 <- 2.80 -> DA N6 C0010 : score 4.67051 : H : ARG NH1 D0131 <- 3.07 -> DG N7 B0009 : score 5.7233 : H : ARG NH1 D0193 <- 2.96 -> DA N3 C0004 : score 3.56423 : H : ARG NH1 D0228 <- 2.82 -> DG N7 B0012 : score 6.0258 : H : ARG NH2 D0228 <- 2.68 -> DG O6 B0012 : score 6.7584 : x : LYS xxxx A0334 <- 4.17 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0340 <- 3.41 -> DA xxx B0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0221 <- 3.02 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0222 <- 3.38 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0225 <- 2.59 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx >6vg8_D:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAINS OF HUMAN FLI1 AND RUNX2 IN COMPLEX WITH 16-MER DNA CAGAGGATGTGGCTTC organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 D0131 <- 3.07 -> DG N7 B0009 : score 5.7233 : H : ARG NH1 D0193 <- 2.96 -> DA N3 C0004 : score 3.56423 : H : ARG NH1 D0228 <- 2.82 -> DG N7 B0012 : score 6.0258 : H : ARG NH2 D0228 <- 2.68 -> DG O6 B0012 : score 6.7584 : x : VAL xxxx D0221 <- 3.02 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0222 <- 3.38 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0225 <- 2.59 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx >6vgd_AD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN (DBD) OF HUMAN FLI1 AND THE COMPLEX OF THE DBD OF HUMAN RUNX2 WITH CORE BINDING FACTOR BETA (CBFB), IN COMPLEX WITH 16MER DNA CAGAGGATGTGGCTTC organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0337 <- 3.07 -> DG O6 B0006 : score 3.72821 : H : TYR OH A0341 <- 2.67 -> DA N6 C0010 : score 4.79195 : H : ARG NH1 D0131 <- 2.99 -> DG N7 B0009 : score 5.8201 : H : ARG NH2 D0131 <- 3.01 -> DG O6 B0009 : score 6.3228 : H : ARG NH2 D0131 <- 3.37 -> DT O4 B0010 : score 3.14871 : H : ARG NH1 D0193 <- 3.17 -> DA N3 C0004 : score 3.40958 : V : ARG CZ D0225 <- 3.51 -> DT C7 B0010 : score 2.2869 : x : ARG xxxx A0340 <- 3.18 -> DA xxx B0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0221 <- 3.36 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0222 <- 3.08 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >6vgd_D:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN (DBD) OF HUMAN FLI1 AND THE COMPLEX OF THE DBD OF HUMAN RUNX2 WITH CORE BINDING FACTOR BETA (CBFB), IN COMPLEX WITH 16MER DNA CAGAGGATGTGGCTTC organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 D0131 <- 2.99 -> DG N7 B0009 : score 5.8201 : H : ARG NH2 D0131 <- 3.01 -> DG O6 B0009 : score 6.3228 : H : ARG NH2 D0131 <- 3.37 -> DT O4 B0010 : score 3.14871 : H : ARG NH1 D0193 <- 3.17 -> DA N3 C0004 : score 3.40958 : V : ARG CZ D0225 <- 3.51 -> DT C7 B0010 : score 2.2869 : x : VAL xxxx D0221 <- 3.36 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0222 <- 3.08 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >6vge_AD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAINS OF HUMAN TRANSCRIPTION FACTOR ERG, HUMAN RUNX2 BOUND TO CORE BINDING FACTOR BETA (CBFB), IN COMPLEX WITH 16MER DNA CAGAGGATGTGGCTTC organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0367 <- 3.05 -> DG O6 B0006 : score 3.74397 : H : TYR OH A0371 <- 2.71 -> DA N6 C0010 : score 4.75458 : H : ARG NH1 D0131 <- 2.99 -> DG N7 B0009 : score 5.8201 : H : ARG NH2 D0131 <- 3.06 -> DG O6 B0009 : score 6.2568 : H : ARG NH2 D0131 <- 3.38 -> DT O4 B0010 : score 3.1416 : H : ARG NH1 D0193 <- 3.05 -> DA N3 C0004 : score 3.49795 : V : ARG CZ D0225 <- 3.66 -> DT C7 B0010 : score 2.20694 : x : LYS xxxx A0364 <- 3.30 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0370 <- 3.19 -> DA xxx B0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0221 <- 3.35 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0222 <- 3.13 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >6vge_D:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAINS OF HUMAN TRANSCRIPTION FACTOR ERG, HUMAN RUNX2 BOUND TO CORE BINDING FACTOR BETA (CBFB), IN COMPLEX WITH 16MER DNA CAGAGGATGTGGCTTC organism=? : H : ARG NH1 D0131 <- 2.99 -> DG N7 B0009 : score 5.8201 : H : ARG NH2 D0131 <- 3.06 -> DG O6 B0009 : score 6.2568 : H : ARG NH2 D0131 <- 3.38 -> DT O4 B0010 : score 3.1416 : H : ARG NH1 D0193 <- 3.05 -> DA N3 C0004 : score 3.49795 : V : ARG CZ D0225 <- 3.66 -> DT C7 B0010 : score 2.20694 : x : VAL xxxx D0221 <- 3.35 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0222 <- 3.13 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >6vgg_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAINS OF HUMAN TRANSCRIPTION FACTOR ERG, HUMAN RUNX2 BOUND TO CORE BINDING FACTOR BETA (CBFB), AND MITHRAMYCIN, IN COMPLEX WITH 16MER DNA CAGAGGATGTGGCTTC organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0367 <- 3.02 -> DG O6 B0006 : score 3.76762 : H : TYR OH A0371 <- 2.85 -> DA N6 B0007 : score 4.62381 : H : TYR OH A0371 <- 2.73 -> DA N6 C0010 : score 4.7359 : x : LYS xxxx A0364 <- 3.75 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0370 <- 3.27 -> DA xxx B0004 : score x.xxxxx >6vgg_AD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAINS OF HUMAN TRANSCRIPTION FACTOR ERG, HUMAN RUNX2 BOUND TO CORE BINDING FACTOR BETA (CBFB), AND MITHRAMYCIN, IN COMPLEX WITH 16MER DNA CAGAGGATGTGGCTTC organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0367 <- 3.02 -> DG O6 B0006 : score 3.76762 : H : TYR OH A0371 <- 2.73 -> DA N6 C0010 : score 4.7359 : H : TYR OH A0371 <- 2.85 -> DA N6 B0007 : score 4.62381 : H : ARG NH2 D0131 <- 2.96 -> DG O6 B0009 : score 6.3888 : H : ARG NH1 D0193 <- 3.15 -> DA N3 C0004 : score 3.42431 : H : ASP OD1 D0222 <- 3.33 -> DC N4 C0006 : score 4.77832 : V : ARG CZ D0225 <- 3.85 -> DT C7 B0010 : score 2.10565 : x : LYS xxxx A0364 <- 3.75 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0370 <- 3.27 -> DA xxx B0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0221 <- 3.27 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >6vgm_D:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DPO4 WITH 8-OXOADENINE (OXOA) AND DTTP* organism=Saccharolobus solfataricus : x : SER xxxx D0244 <- 4.50 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0336 <- 3.64 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx >6vjw_A:DNA-glycosylase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF WT HMBD4 COMPLEXED WITH T:G MISMATCH DNA organism=Homo sapiens : w : ASN OD1 A0467 <- 5.44 -> DG N3 C0008 : score 3.377 : w : SER OG A0470 <- 5.95 -> DG N2 C0006 : score 1.651 : x : ARG xxxx A0468 <- 3.29 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0469 <- 3.59 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0508 <- 3.51 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0511 <- 3.50 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx >6vkp_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DPO4 EXTENSION PAST 8-OXOADENINE (OXOA) AND DG organism=Saccharolobus solfataricus : x : VAL xxxx A0032 <- 3.68 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0042 <- 3.56 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0184 <- 4.43 -> DG xxx P0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.93 -> DA xxx T0008 : score x.xxxxx >6vnp_D:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DPO4 EXTENSION PAST 8-OXOADENINE (OXOA) AND DT organism=Saccharolobus solfataricus : x : VAL xxxx D0032 <- 3.62 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0042 <- 3.34 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >6voy_AD:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HTLV-1 INSTASOME organism=? : x : GLN xxxx A0156 <- 4.20 -> DC xxx L0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0157 <- 2.97 -> DG xxx M0006 : score x.xxxxx >6voy_BC:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HTLV-1 INSTASOME organism=? : x : GLN xxxx C0156 <- 3.76 -> DC xxx I0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0157 <- 3.01 -> DG xxx J0006 : score x.xxxxx >6voy_C:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HTLV-1 INSTASOME organism=? : x : ILE xxxx C0050 <- 3.23 -> DT xxx J0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0052 <- 3.72 -> DT xxx J0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0149 <- 3.56 -> DA xxx I0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0150 <- 3.88 -> DA xxx I0023 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0156 <- 3.76 -> DC xxx I0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0157 <- 3.01 -> DG xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0218 <- 4.36 -> DA xxx J0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0220 <- 3.18 -> DA xxx J0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0223 <- 4.32 -> DA xxx J0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0265 <- 3.68 -> DA xxx J0001 : score x.xxxxx >6vpc_F:Cytidine_deaminase-like; title=STRUCTURE OF THE SPCAS9 DNA ADENINE BASE EDITOR - ABE8E organism=ESCHERICHIA COLI : x : ASN xxxx F0108 <- 2.92 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0110 <- 3.66 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0148 <- 3.72 -> DC xxx D0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0149 <- 3.25 -> DC xxx D0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0153 <- 4.27 -> DC xxx D0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0154 <- 3.04 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx >6vtx_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN KLF4 ZINC FINGER DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH NANOG DNA organism=Homo sapiens : H : HIS NE2 A0446 <- 2.99 -> DG O6 B0010 : score 7.6516 : H : ARG NH1 A0473 <- 2.56 -> DG N7 B0008 : score 6.3404 : H : ARG NH2 A0473 <- 2.74 -> DG O6 B0008 : score 6.6792 : H : ARG NH1 A0479 <- 2.82 -> DG O6 B0006 : score 6.059 : H : ARG NH2 A0479 <- 2.95 -> DG N7 B0006 : score 6.19308 : H : ARG NH1 A0501 <- 2.97 -> DG N7 B0005 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0501 <- 2.77 -> DG O6 B0005 : score 6.6396 : H : ASP OD2 A0503 <- 3.18 -> DC N4 C0007 : score 5.7288 : w : ASP OD1 A0503 <- 6.63 -> DA N6 C0006 : score 3.122 : w : ASP OD2 A0503 <- 5.36 -> DC N4 C0008 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0504 <- 2.98 -> DG N7 B0004 : score 6.55767 : x : SER xxxx A0445 <- 3.38 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0475 <- 3.64 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0476 <- 3.63 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx >6vu3_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI TRANSCRIPTION-TRANSLATION COMPLEX A (TTC-A) CONTAINING MRNA WITH A 12 NT LONG SPACER organism=? : V : ASP CG A0199 <- 3.86 -> DT C7 50108 : score 2.64283 : x : ARG xxxx A0151 <- 3.54 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0175 <- 4.09 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 2.43 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.45 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0542 <- 4.19 -> DC xxx 50111 : score x.xxxxx >6vu3_ABE:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI TRANSCRIPTION-TRANSLATION COMPLEX A (TTC-A) CONTAINING MRNA WITH A 12 NT LONG SPACER organism=? : H : LYS NZ E1170 <- 2.93 -> DG N3 50122 : score 1.41605 : V : ASP CG A0199 <- 3.86 -> DT C7 50108 : score 2.64283 : x : ARG xxxx A0151 <- 3.54 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0175 <- 4.09 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 2.43 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.45 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0542 <- 4.19 -> DC xxx 50111 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0015 <- 4.08 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0046 <- 3.08 -> DC xxx 50097 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0255 <- 3.61 -> DC xxx 60023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0271 <- 2.92 -> DT xxx 50101 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0274 <- 4.21 -> DA xxx 50100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0314 <- 3.62 -> DA xxx 50103 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0317 <- 4.50 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0352 <- 4.09 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0426 <- 4.03 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0427 <- 3.76 -> DC xxx 60015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0790 <- 3.45 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0791 <- 3.75 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx >6vug_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DIABODY BOUND TO A REVERSE TRANSCRIPTASE APTAMER COMPLEX organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 / HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 3.16 -> DG N2 E0032 : score 4.53768 : H : TYR OH A0183 <- 2.64 -> DG N3 E0032 : score 3.21375 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.38 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.43 -> DG xxx E0033 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.93 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.61 -> DG xxx E0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.17 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.97 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx >6vvs_FT:C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MYCOBACTERIUM SMEGMATIS RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH ANTIBIOTIC SORANGICIN organism=? : H : GLN OE1 F0291 <- 2.77 -> DC N4 O0025 : score 4.61083 : H : ARG NH2 F0295 <- 2.50 -> DG O6 O0024 : score 6.996 : H : ARG NH2 F0295 <- 3.31 -> DG O6 P0002 : score 5.9268 : H : ARG NH1 F0438 <- 2.25 -> DG N7 P0020 : score 6.7155 : H : ARG NH1 F0438 <- 2.52 -> DG O6 P0020 : score 6.424 : H : ARG NH2 F0438 <- 3.05 -> DG O6 P0020 : score 6.27 : H : GLU OE1 F0439 <- 2.70 -> DC N4 P0022 : score 5.88331 : H : GLN NE2 F0443 <- 3.10 -> DT O4 O0003 : score 4.87956 : V : VAL CG1 F0308 <- 3.52 -> DT C7 O0023 : score 6.48475 : V : TRP CD2 F0288 <- 3.77 -> DT C7 O0026 : score 5.53763 : x : TRP xxxx F0287 <- 3.12 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0294 <- 4.42 -> DA xxx P0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0309 <- 3.24 -> DT xxx O0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0312 <- 3.51 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0437 <- 3.90 -> DT xxx O0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0440 <- 3.26 -> DC xxx O0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0442 <- 3.66 -> DT xxx P0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx T0259 <- 3.56 -> DG xxx O0012 : score x.xxxxx >6vvv_FT:C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MYCOBACTERIUM SMEGMATIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH RIFAMPICIN-RESISTANT RNA POLYMERASE organism=? : H : GLN OE1 F0291 <- 2.53 -> DC N4 O0025 : score 4.83083 : H : ARG NH1 F0295 <- 3.18 -> DG N7 O0024 : score 5.5902 : H : ARG NH2 F0295 <- 3.17 -> DG O6 P0002 : score 6.1116 : H : ARG NH2 F0295 <- 2.36 -> DG O6 O0024 : score 7.1808 : H : ARG NH1 F0438 <- 2.26 -> DG N7 P0020 : score 6.7034 : H : ARG NH2 F0438 <- 2.32 -> DG O6 P0020 : score 7.2336 : H : GLU OE1 F0439 <- 2.46 -> DC N4 P0022 : score 6.16017 : H : GLN NE2 F0443 <- 2.98 -> DT O4 O0003 : score 5.00415 : x : TRP xxxx F0287 <- 3.26 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0288 <- 3.65 -> DC xxx O0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0294 <- 4.48 -> DA xxx P0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0308 <- 3.21 -> DT xxx O0023 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0309 <- 3.41 -> DT xxx O0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0312 <- 3.59 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0427 <- 4.40 -> DG xxx P0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0437 <- 3.98 -> DT xxx O0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 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title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RNAP S456L MUTANT TRANSCRIPTION INITIATION INTERMEDIATE STRUCTURE WITH SORANGICIN organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : x : ASN xxxx D0396 <- 3.39 -> DG xxx P0098 : score x.xxxxx >6vw0_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RNAP S456L MUTANT OPEN PROMOTER COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 C0181 <- 2.38 -> DT O2 O0062 : score 4.58893 : x : TRP xxxx C0211 <- 3.20 -> DT xxx O0062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0228 <- 3.45 -> DG xxx O0061 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0305 <- 3.94 -> DA xxx O0058 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0403 <- 4.37 -> DC xxx P0104 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0421 <- 3.29 -> DC xxx P0104 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0463 <- 3.71 -> DT xxx O0062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 4.13 -> DT xxx O0062 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C1062 <- 4.08 -> DC xxx P0099 : score x.xxxxx >6vw0_CDFJM: title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RNAP S456L MUTANT OPEN PROMOTER COMPLEX 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score 3.122 : x : HIS xxxx A0034 <- 3.27 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 2.97 -> DA xxx P0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0275 <- 3.99 -> DA xxx P0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0279 <- 3.64 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.16 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0283 <- 3.15 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0335 <- 4.38 -> DA xxx P0010 : score x.xxxxx >6w2p_A:DNase_I-like; title=APE1 ENDONUCLEASE PRODUCT COMPLEX L104R organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0177 <- 6.31 -> DC O2 D0002 : score 1.381 : w : ASN OD1 A0226 <- 6.30 -> DG N7 D0003 : score 1.873 : w : THR OG1 A0268 <- 6.45 -> DC O2 D0002 : score 2.048 : x : ASN xxxx A0229 <- 3.51 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 4.07 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx >6w3l_B:DNase_I-like; title=APE1 EXONUCLEASE SUBSTRATE COMPLEX WILD-TYPE organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx B0098 <- 3.75 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0177 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B0270 <- 3.78 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx >6w43_A:DNase_I-like; title=APE1 AP-ENDONUCLEASE PRODUCT COMPLEX R237C organism=Homo sapiens : w : ASN OD1 A0226 <- 5.77 -> DG N7 D0003 : score 1.873 : w : ASN OD1 A0229 <- 5.48 -> DG O6 D0003 : score 3.125 : w : ASN OD1 A0229 <- 5.55 -> DG N7 D0003 : score 1.873 : x : ARG xxxx A0177 <- 3.27 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 3.79 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0271 <- 3.13 -> DG xxx V0010 : score x.xxxxx >6w4i_B:DNase_I-like; title=APE1 Y269A PRODUCT COMPLEX WITH ABASIC DNA organism=Homo sapiens : w : ASN OD1 B0226 <- 5.85 -> DG N7 C0003 : score 1.873 : x : ARG xxxx B0177 <- 3.22 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0229 <- 2.88 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx >6w4t_B:DNase_I-like; title=APE1 Y269A PHOSPHOROTHIOATE SUBSTRATE COMPLEX WITH ABASIC DNA organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx B0098 <- 3.67 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0177 <- 2.83 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0226 <- 4.42 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0229 <- 3.22 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0269 <- 4.03 -> DA xxx F0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0270 <- 3.58 -> DG xxx F0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0271 <- 3.23 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >6w5i_GHIJKLMN: title=CRYO-EM STRUCTURE OF MLL1 IN COMPLEX WITH RBBP5, WDR5, SET1, AND ASH2L BOUND TO THE NUCLEOSOME (CLASS01) organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 K0040 <- 3.11 -> DT O2 P0083 : score 4.03941 : x : ARG xxxx G0040 <- 2.73 -> DG xxx P0066 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0041 <- 4.10 -> DG xxx O0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0065 <- 4.00 -> DA xxx O0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0042 <- 3.96 -> DG xxx P0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0077 <- 4.13 -> DA xxx O0131 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0083 <- 4.18 -> DG xxx P0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0042 <- 4.15 -> DC xxx O0144 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0042 <- 3.14 -> DG xxx P0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0077 <- 4.28 -> DG xxx P0131 : score x.xxxxx >6w5m_G:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MLL1 IN COMPLEX WITH RBBP5, WDR5, SET1, AND ASH2L BOUND TO THE NUCLEOSOME (CLASS02) organism=? : H : ARG NH1 G0040 <- 3.18 -> DG N3 O0083 : score 2.82057 : x : TYR xxxx G0041 <- 4.19 -> DG xxx O0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0065 <- 4.25 -> DA xxx O0091 : score x.xxxxx >6w5m_GHIJKLMN: title=CRYO-EM STRUCTURE OF MLL1 IN COMPLEX WITH RBBP5, WDR5, SET1, AND ASH2L BOUND TO THE NUCLEOSOME (CLASS02) organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 G0040 <- 3.18 -> DG N3 O0083 : score 2.82057 : H : ARG NH1 K0040 <- 2.92 -> DT O2 P0083 : score 4.20306 : x : TYR xxxx G0041 <- 4.19 -> DG xxx O0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0065 <- 4.25 -> DA xxx O0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0042 <- 3.75 -> DG xxx P0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0077 <- 3.99 -> DA xxx O0131 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0042 <- 4.22 -> DC xxx O0144 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0042 <- 3.55 -> DG xxx P0112 : score x.xxxxx >6w5n_L:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MLL1 IN COMPLEX WITH RBBP5, WDR5, SET1, AND ASH2L BOUND TO THE NUCLEOSOME (CLASS05) organism=? : x : ARG xxxx L0045 <- 4.42 -> DA xxx P0080 : score x.xxxxx >6w5x_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN POLYMERASE ETA COMPLEXED WITH N7- BENZYLGUANINE AND DCTP* organism=Homo sapiens : x : LEU xxxx A0378 <- 4.27 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.28 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx >6w64_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CAS12I-CRRNA-DSDNA COMPLEX IN I1 STATE organism=LACHNOSPIRACEAE BACTERIUM ND2006 : x : ARG xxxx A0012 <- 3.20 -> DC xxx C0026 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0306 <- 4.48 -> DG xxx C0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0310 <- 4.24 -> DA xxx C0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0318 <- 2.91 -> DG xxx C0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0477 <- 3.33 -> DG xxx C0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0481 <- 3.95 -> DA xxx C0028 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0482 <- 4.44 -> DA xxx C0028 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0629 <- 3.55 -> DC xxx C0026 : score x.xxxxx >6w89_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF DNMT3A (R882H) IN COMPLEX WITH CGA DNA organism=? : w : THR OG1 A0834 <- 5.43 -> DG N7 F0428 : score 3.422 : H : ARG NH2 A0836 <- 3.06 -> DG O6 E0438 : score 6.2568 : w : ASN OD1 A0838 <- 6.10 -> DG N7 F0428 : score 1.873 : x : ILE xxxx A0715 <- 3.33 -> DA xxx E0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0716 <- 3.42 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0718 <- 3.61 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0831 <- 4.39 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0837 <- 4.25 -> DG xxx E0438 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0846 <- 3.76 -> DT xxx E0440 : score x.xxxxx >6w89_AD:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF DNMT3A (R882H) IN COMPLEX WITH CGA DNA organism=HOMO SAPIENS : w : THR OG1 A0834 <- 5.43 -> DG N7 F0428 : score 3.422 : H : ARG NH2 A0836 <- 3.06 -> DG O6 E0438 : score 6.2568 : w : ASN OD1 A0838 <- 6.10 -> DG N7 F0428 : score 1.873 : H : ARG NH2 D0836 <- 3.23 -> DG O6 F0438 : score 6.0324 : w : ASN OD1 D0838 <- 6.21 -> DA N6 F0439 : score 2.837 : x : ILE xxxx A0715 <- 3.33 -> DA xxx E0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0716 <- 3.42 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0718 <- 3.61 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0831 <- 4.39 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0837 <- 4.25 -> DG xxx E0438 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0846 <- 3.76 -> DT xxx E0440 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0715 <- 3.40 -> DA xxx F0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0716 <- 3.60 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0718 <- 3.74 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0846 <- 4.48 -> DT xxx F0440 : score x.xxxxx >6w89_GJ:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF DNMT3A (R882H) IN COMPLEX WITH CGA DNA organism=HOMO SAPIENS : w : THR OG1 G0834 <- 5.50 -> DG N7 L0428 : score 3.422 : w : THR OG1 J0834 <- 5.33 -> DG N7 K0428 : score 3.422 : w : ASN OD1 J0838 <- 6.44 -> DA N6 L0439 : score 2.837 : w : ASN OD1 J0838 <- 5.72 -> DG N7 K0428 : score 1.873 : w : ASN ND2 J0838 <- 5.55 -> DG O6 K0428 : score 2.971 : x : ILE xxxx G0715 <- 3.29 -> DA xxx K0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0716 <- 3.45 -> DG xxx L0426 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0718 <- 3.49 -> DG xxx L0428 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0836 <- 2.86 -> DT xxx L0430 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0837 <- 4.13 -> DG xxx K0438 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0838 <- 3.38 -> DT xxx K0440 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0846 <- 3.81 -> DT xxx K0440 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J0715 <- 3.39 -> DA xxx L0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx J0716 <- 3.56 -> DG xxx K0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0718 <- 3.59 -> DG xxx K0428 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0836 <- 3.09 -> DA xxx L0439 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0844 <- 4.43 -> DT xxx K0425 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx J0846 <- 4.08 -> DT xxx L0440 : score x.xxxxx >6w8b_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF DNMT3A IN COMPLEX WITH CGA DNA organism=HOMO SAPIENS : w : THR OG1 A0834 <- 6.41 -> DG N7 F0428 : score 3.422 : H : ARG NH2 A0836 <- 3.21 -> DT O4 F0430 : score 3.26243 : w : ASN OD1 A0838 <- 6.70 -> DG N7 F0428 : score 1.873 : x : ILE xxxx A0715 <- 3.33 -> DA xxx E0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0716 <- 3.58 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0718 <- 3.52 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0837 <- 4.41 -> DG xxx E0438 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0846 <- 3.84 -> DT xxx E0440 : score x.xxxxx >6w8b_AD:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF DNMT3A IN COMPLEX WITH CGA DNA organism=HOMO SAPIENS : w : THR OG1 A0834 <- 6.41 -> DG N7 F0428 : score 3.422 : H : ARG NH2 A0836 <- 3.21 -> DT O4 F0430 : score 3.26243 : w : ASN OD1 A0838 <- 6.70 -> DG N7 F0428 : score 1.873 : w : THR OG1 D0834 <- 5.45 -> DG N7 E0428 : score 3.422 : H : ARG NE D0836 <- 3.15 -> DA N7 E0429 : score -8.47373 : H : ARG NH2 D0836 <- 2.85 -> DT O4 E0430 : score 3.51831 : w : ASN OD1 D0838 <- 5.84 -> DG N7 E0428 : score 1.873 : x : ILE xxxx A0715 <- 3.33 -> DA xxx E0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0716 <- 3.58 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0718 <- 3.52 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0837 <- 4.41 -> DG xxx E0438 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0846 <- 3.84 -> DT xxx E0440 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0715 <- 3.38 -> DA xxx F0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0716 <- 3.62 -> DG xxx E0426 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0718 <- 3.78 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0837 <- 3.84 -> DG xxx F0438 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0846 <- 4.27 -> DT xxx F0440 : score x.xxxxx >6w8b_HK:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF DNMT3A IN COMPLEX WITH CGA DNA organism=HOMO SAPIENS : w : THR OG1 H0834 <- 6.04 -> DG N7 M0428 : score 3.422 : H : ARG NH2 H0836 <- 3.07 -> DT O4 M0430 : score 3.36194 : w : ASN OD1 H0838 <- 6.43 -> DG N7 M0428 : score 1.873 : H : ARG NH2 K0836 <- 2.69 -> DG O6 M0438 : score 6.7452 : x : ILE xxxx H0715 <- 3.37 -> DA xxx L0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx H0716 <- 3.53 -> DG xxx M0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0718 <- 3.61 -> DG xxx M0428 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0831 <- 4.42 -> DG xxx M0426 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0837 <- 4.11 -> DG xxx L0438 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0846 <- 3.85 -> DT xxx L0440 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx K0715 <- 3.37 -> DA xxx M0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx K0716 <- 3.47 -> DG xxx L0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx K0718 <- 3.78 -> DG xxx L0428 : score x.xxxxx : x : THR xxxx K0834 <- 4.44 -> DG xxx L0428 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0837 <- 4.39 -> DG xxx M0438 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx K0838 <- 3.40 -> DG xxx L0428 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx K0846 <- 4.16 -> DT xxx M0440 : score x.xxxxx >6w8d_AD:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF DNMT3A (R882H) IN COMPLEX WITH CGT DNA organism=HOMO SAPIENS : x : ILE xxxx A0715 <- 3.10 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0716 <- 3.59 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0717 <- 4.21 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0718 <- 3.30 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0836 <- 3.21 -> DG xxx F0428 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0838 <- 3.88 -> DA xxx E0439 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0715 <- 3.25 -> DA xxx F0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0716 <- 3.42 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0718 <- 3.88 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0836 <- 3.37 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx >6w8d_D:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF DNMT3A (R882H) IN COMPLEX WITH CGT DNA organism=HOMO SAPIENS : x : ILE xxxx D0715 <- 3.25 -> DA xxx F0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0716 <- 3.42 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0718 <- 3.88 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0836 <- 3.37 -> DG xxx E0428 : score x.xxxxx >6w8j_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF DNMT3A (R882H) IN COMPLEX WITH CAG DNA organism=HOMO SAPIENS : w : THR OG1 A0834 <- 5.75 -> DA N7 F0428 : score 2.152 : H : ARG NE A0836 <- 2.84 -> DG N7 F0429 : score 4.38642 A : x : ILE xxxx A0715 <- 3.85 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0716 <- 3.43 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0718 <- 3.66 -> DA xxx F0428 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0838 <- 3.57 -> DC xxx E0440 : score x.xxxxx >6w8j_AD:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=STRUCTURE OF DNMT3A (R882H) IN COMPLEX WITH CAG DNA organism=HOMO SAPIENS : w : THR OG1 A0834 <- 5.75 -> DA N7 F0428 : score 2.152 : H : ARG NE A0836 <- 2.84 -> DG N7 F0429 : score 4.38642 A : x : ILE xxxx A0715 <- 3.85 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0716 <- 3.43 -> DG xxx F0426 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0718 <- 3.66 -> DA xxx F0428 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0838 <- 3.57 -> DC xxx E0440 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0715 <- 3.35 -> DA xxx F0444 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0716 <- 3.78 -> DG xxx E0426 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0718 <- 4.12 -> DA xxx E0428 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0836 <- 3.03 -> DG xxx E0429 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0837 <- 4.44 -> DG xxx F0438 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0838 <- 4.24 -> DC xxx F0440 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0883 <- 4.38 -> DA xxx F0437 : score x.xxxxx >6w8v_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MOUSE DNMT1 IN COMPLEX WITH ACG DNA organism=Mus musculus : V : ASN CG B1510 <- 3.51 -> DT C7 F0015 : score 2.8402 : x : LYS xxxx B0985 <- 3.44 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B1235 <- 3.46 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1237 <- 3.39 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx 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PNEUMONIAE TOPOISOMERASE IV (PARE-PARC) IN COMPLEX WITH DNA AND COMPOUND 34 (7-[(1S,5R)-1-AMINO-3-AZABICYCLO[3.1.0]HEXAN-3-YL]-4- (AMINOMETHYL)-1-CYCLOPROPYL-3,6-DIFLUORO-8-METHYLQUINOLIN-2(1H)-ONE) organism=KLEBSIELLA PNEUMONIAE 342 : x : LYS xxxx B0444 <- 3.70 -> DA xxx I0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1029 <- 4.32 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1080 <- 4.12 -> DG xxx K0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B1081 <- 3.74 -> DA xxx I0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1084 <- 3.60 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1172 <- 3.14 -> DC xxx J0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1326 <- 3.67 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0444 <- 3.84 -> DT xxx L0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0610 <- 3.33 -> DA xxx K0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D1021 <- 4.27 -> DA xxx K0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D1080 <- 4.14 -> DG xxx J0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1081 <- 3.81 -> DA xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D1172 <- 3.07 -> DC xxx K0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1326 <- 3.42 -> DA xxx K0020 : score x.xxxxx >6waa_D:Type_II_DNA_topoisomerase; title=K. PNEUMONIAE TOPOISOMERASE IV (PARE-PARC) IN COMPLEX WITH DNA AND COMPOUND 34 (7-[(1S,5R)-1-AMINO-3-AZABICYCLO[3.1.0]HEXAN-3-YL]-4- (AMINOMETHYL)-1-CYCLOPROPYL-3,6-DIFLUORO-8-METHYLQUINOLIN-2(1H)-ONE) organism=KLEBSIELLA PNEUMONIAE 342 : x : LYS xxxx D0444 <- 3.84 -> DT xxx L0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0610 <- 3.33 -> DA xxx K0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D1021 <- 4.27 -> DA xxx K0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D1080 <- 4.14 -> DG xxx J0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1081 <- 3.81 -> DA xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D1172 <- 3.07 -> DC xxx K0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1326 <- 3.42 -> DA xxx K0020 : score x.xxxxx >6waa_FH:Type_II_DNA_topoisomerase; title=K. PNEUMONIAE TOPOISOMERASE IV (PARE-PARC) IN COMPLEX WITH DNA AND COMPOUND 34 (7-[(1S,5R)-1-AMINO-3-AZABICYCLO[3.1.0]HEXAN-3-YL]-4- (AMINOMETHYL)-1-CYCLOPROPYL-3,6-DIFLUORO-8-METHYLQUINOLIN-2(1H)-ONE) organism=KLEBSIELLA PNEUMONIAE 342 : H : ARG NH2 F1326 <- 3.08 -> DT O2 M0007 : score 3.99627 : H : LYS NZ H0444 <- 2.91 -> DA N3 P0010 : score 2.71583 : H : ARG NH2 H1326 <- 2.63 -> DA N3 O0021 : score 3.34989 : x : LYS xxxx F0444 <- 3.71 -> DA xxx N0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F1021 <- 4.46 -> DA xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F1029 <- 4.29 -> DT xxx M0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F1080 <- 4.14 -> DG xxx O0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F1081 <- 3.69 -> DA xxx M0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F1084 <- 4.08 -> DT xxx M0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F1172 <- 3.21 -> DC xxx N0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0610 <- 4.39 -> DA xxx O0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H1080 <- 4.17 -> DG xxx N0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H1081 <- 3.78 -> DA xxx P0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H1084 <- 3.38 -> DT xxx P0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H1119 <- 3.99 -> DG xxx O0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H1172 <- 3.18 -> DC xxx O0019 : score x.xxxxx >6wbr_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF ACECAS9 BOUND WITH GUIDE RNA AND DNA WITH 5'- NNNCC-3' PAM organism=? : H : GLU OE2 A1044 <- 3.13 -> DC N4 D0004 : score 4.91787 : H : ARG NH1 A1091 <- 3.36 -> DG N7 C-005 : score 5.3724 : H : ARG NH2 A1091 <- 2.95 -> DG O6 C-005 : score 6.402 : x : ARG xxxx A0055 <- 3.31 -> DT xxx C-001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1047 <- 3.98 -> DG xxx C-009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1048 <- 3.51 -> DA xxx C-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1088 <- 3.25 -> DG xxx C-004 : score x.xxxxx >6wc0_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF ACECAS9 BOUND WITH GUIDE RNA AND DNA WITH 5'- NNNTC-3' PAM organism=? : H : ARG NH2 A1088 <- 2.39 -> DG N7 C-005 : score 6.90815 : H : ARG NH2 A1088 <- 2.60 -> DG O6 C-005 : score 6.864 : H : ARG NH2 A1091 <- 2.89 -> DA N7 C-006 : score 1.6417 : x : ARG xxxx A0055 <- 3.38 -> DT xxx C-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1044 <- 3.47 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >6wc2_ABO:SRF-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY MEF2 CHIMERA/NKX2-5/MYOCARDIN ENHANCER DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE A0003 <- 2.96 -> DT O2 L0004 : score 2.49446 : H : ARG NH2 A0003 <- 3.06 -> DT O2 L0004 : score 4.0132 : H : LYS NZ A0023 <- 2.95 -> DG O6 K0019 : score 5.60735 : H : LYS NZ B0023 <- 3.08 -> DA N7 L0011 : score 2.7727 : H : LYS NZ B0023 <- 3.08 -> DG O6 L0012 : score 5.45705 : w : GLN OE1 O0187 <- 5.83 -> DA N6 K0005 : score 3.392 : w : GLN NE2 O0187 <- 5.47 -> DG N7 K0003 : score 2.582 : H : ASN OD1 O0188 <- 3.18 -> DA N6 L0015 : score 5.56414 : H : ASN ND2 O0188 <- 2.97 -> DA N7 L0015 : score 5.67092 : w : ASN OD1 O0188 <- 5.48 -> DG O6 L0016 : score 3.125 : w : ASN OD1 O0188 <- 5.52 -> DC N4 K0006 : score 2.732 : x : ILE xxxx O0184 <- 3.93 -> DA xxx L0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx O0191 <- 3.47 -> DC xxx K0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx O0192 <- 4.34 -> DA xxx L0013 : score x.xxxxx >6wc2_DM:SRF-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY MEF2 CHIMERA/NKX2-5/MYOCARDIN ENHANCER DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE D0003 <- 2.85 -> DT O2 H0004 : score 2.55115 : H : ARG NH2 D0003 <- 3.02 -> DT O2 H0004 : score 4.04707 : H : LYS NZ D0023 <- 2.81 -> DG O6 G0019 : score 5.76921 : H : ARG NH1 M0142 <- 2.75 -> DT O2 G0009 : score 4.34947 : w : GLN OE1 M0187 <- 5.75 -> DA N6 G0005 : score 3.392 : w : GLN NE2 M0187 <- 5.78 -> DG N7 G0003 : score 2.582 : H : ASN OD1 M0188 <- 3.14 -> DA N6 H0015 : score 5.61231 : H : ASN ND2 M0188 <- 3.00 -> DA N7 H0015 : score 5.63569 : w : ASN OD1 M0188 <- 5.67 -> DG O6 H0016 : score 3.125 : w : ASN OD1 M0188 <- 5.52 -> DC N4 G0006 : score 2.732 : x : ARG xxxx D0015 <- 3.78 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0019 <- 4.43 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx M0184 <- 3.94 -> DA xxx H0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx M0191 <- 3.55 -> DC xxx G0006 : score x.xxxxx >6wc2_IJN:SRF-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY MEF2 CHIMERA/NKX2-5/MYOCARDIN ENHANCER DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE I0003 <- 2.84 -> DT O2 F0004 : score 2.55631 : H : ARG NH2 I0003 <- 3.04 -> DT O2 F0004 : score 4.03013 : H : LYS NZ J0023 <- 2.77 -> DT O4 E0009 : score 3.6087 : H : LYS NZ J0023 <- 2.85 -> DG O6 F0012 : score 5.72296 : H : ARG NH2 N0142 <- 2.96 -> DT O2 E0009 : score 4.09787 : w : LYS NZ N0183 <- 5.82 -> DG N7 E0003 : score 2.519 : w : GLN OE1 N0187 <- 5.66 -> DA N6 E0005 : score 3.392 : w : GLN NE2 N0187 <- 5.75 -> DG N7 E0003 : score 2.582 : H : ASN OD1 N0188 <- 3.07 -> DA N6 F0015 : score 5.69662 : H : ASN ND2 N0188 <- 2.97 -> DA N7 F0015 : score 5.67092 : w : ASN OD1 N0188 <- 5.48 -> DG O6 F0016 : score 3.125 : w : ASN OD1 N0188 <- 5.61 -> DC N4 E0006 : score 2.732 : x : ARG xxxx J0003 <- 3.58 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx J0019 <- 4.20 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx N0184 <- 3.92 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx N0191 <- 3.53 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx >6wc2_N:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY MEF2 CHIMERA/NKX2-5/MYOCARDIN ENHANCER DNA COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 N0142 <- 2.96 -> DT O2 E0009 : score 4.09787 : w : LYS NZ N0183 <- 5.82 -> DG N7 E0003 : score 2.519 : w : GLN OE1 N0187 <- 5.66 -> DA N6 E0005 : score 3.392 : w : GLN NE2 N0187 <- 5.75 -> DG N7 E0003 : score 2.582 : H : ASN OD1 N0188 <- 3.07 -> DA N6 F0015 : score 5.69662 : H : ASN ND2 N0188 <- 2.97 -> DA N7 F0015 : score 5.67092 : w : ASN OD1 N0188 <- 5.48 -> DG O6 F0016 : score 3.125 : w : ASN OD1 N0188 <- 5.61 -> DC N4 E0006 : score 2.732 : x : ILE xxxx N0184 <- 3.92 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx N0191 <- 3.53 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx >6wc5_ABI:SRF-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY MEF2B/NKX2-5/MYOCARDIN ENHANCER DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ A0023 <- 2.84 -> DA N7 E0018 : score 2.91368 : H : LYS NZ A0023 <- 3.07 -> DG O6 E0019 : score 5.46861 : H : ARG NH2 B0003 <- 2.95 -> DT O2 E0011 : score 4.10633 : H : ASN OD1 I0188 <- 3.35 -> DA N6 F0015 : score 5.3594 : H : ASN ND2 I0188 <- 3.24 -> DA N7 F0015 : score 5.35391 : x : ARG xxxx A0003 <- 3.10 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0023 <- 3.62 -> DG xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0184 <- 4.03 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0187 <- 3.49 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx I0191 <- 3.62 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0192 <- 3.94 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0195 <- 4.13 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx >6wc5_CDN:SRF-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY MEF2B/NKX2-5/MYOCARDIN ENHANCER DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE C0003 <- 2.90 -> DT O2 H0004 : score 2.52538 : H : ARG NH2 C0003 <- 3.03 -> DT O2 H0004 : score 4.0386 : H : LYS NZ C0023 <- 2.73 -> DA N7 G0018 : score 2.9783 : H : LYS NZ C0023 <- 3.07 -> DG O6 G0019 : score 5.46861 : H : LYS NZ D0023 <- 2.98 -> DA N7 H0011 : score 2.83144 : H : LYS NZ D0023 <- 2.78 -> DG O6 H0012 : score 5.80389 : H : ARG NH1 N0142 <- 3.05 -> DT O2 G0009 : score 4.09109 : H : ARG NH2 N0142 <- 2.85 -> DT O2 G0009 : score 4.191 : H : ASN OD1 N0188 <- 3.29 -> DA N6 H0015 : score 5.43166 : H : ASN ND2 N0188 <- 3.38 -> DA N7 H0015 : score 5.18953 : x : ARG xxxx C0015 <- 3.52 -> DC xxx H0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0003 <- 4.11 -> DA xxx H0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0019 <- 4.43 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx N0183 <- 4.12 -> DA xxx G0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx N0184 <- 4.40 -> DA xxx H0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx N0187 <- 3.34 -> DC xxx G0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx N0191 <- 3.94 -> DC xxx G0006 : score x.xxxxx >6wc5_I:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY MEF2B/NKX2-5/MYOCARDIN ENHANCER DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ASN OD1 I0188 <- 3.35 -> DA N6 F0015 : score 5.3594 : H : ASN ND2 I0188 <- 3.24 -> DA N7 F0015 : score 5.35391 : x : ILE xxxx I0184 <- 4.03 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0187 <- 3.49 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx I0191 <- 3.62 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0192 <- 3.94 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0195 <- 4.13 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx >6wdz_A: title=PORCINE CIRCOVIRUS 2 REP DOMAIN COMPLEXED WITH A SINGLE-STRANDED DNA 10-MER COMPRISING THE CLEAVAGE SITE organism=? : H : THR OG1 A0020 <- 2.90 -> DA N3 C0306 : score 1.32677 : H : ASN ND2 A0022 <- 3.13 -> DT O2 C0302 : score 4.43291 : H : ASN ND2 A0022 <- 2.87 -> DT O2 C0305 : score 4.67971 : x : HIS xxxx A0082 <- 3.30 -> DA xxx C0306 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0084 <- 3.37 -> DA xxx C0306 : score x.xxxxx >6we1_AD:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=WHEAT DWARF VIRUS REP DOMAIN COMPLEXED WITH A SINGLE-STRANDED DNA 8- MER COMPRISING THE CLEAVAGE SITE organism=Wheat dwarf virus : H : HIS NE2 D0091 <- 3.17 -> DA N3 F0300 : score 3.93194 : x : THR xxxx A0019 <- 3.51 -> DA xxx C0306 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0021 <- 3.05 -> DT xxx C0302 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0091 <- 3.46 -> DA xxx C0301 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0093 <- 2.93 -> DA xxx C0301 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0095 <- 3.88 -> DA xxx C0306 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0009 <- 3.47 -> DA xxx F0300 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0075 <- 3.69 -> DA xxx F0300 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0093 <- 3.16 -> DA xxx F0300 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0094 <- 4.01 -> DA xxx F0300 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0095 <- 3.75 -> DT xxx C0305 : score x.xxxxx >6we1_D:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=WHEAT DWARF VIRUS REP DOMAIN COMPLEXED WITH A SINGLE-STRANDED DNA 8- MER COMPRISING THE CLEAVAGE SITE organism=Wheat dwarf virus : H : HIS NE2 D0091 <- 3.17 -> DA N3 F0300 : score 3.93194 : x : PHE xxxx D0009 <- 3.47 -> DA xxx F0300 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0075 <- 3.69 -> DA xxx F0300 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0093 <- 3.16 -> DA xxx F0300 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0094 <- 4.01 -> DA xxx F0300 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0095 <- 3.75 -> DT xxx C0305 : score x.xxxxx >6we9_A: title=YTH DOMAIN OF HUMAN YTHDC1 WITH 11MER SSDNA CONTAINING N6MA organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0466 <- 5.82 -> DC O2 B0007 : score 1.885 : w : LYS NZ A0469 <- 5.98 -> DT O2 B0008 : score 0.522 : x : LEU xxxx A0380 <- 3.84 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0381 <- 3.27 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0438 <- 3.90 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0472 <- 3.65 -> DC xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0473 <- 3.45 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0475 <- 3.36 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx >6wea_A: title=YTH DOMAIN OF HUMAN YTHDC1 WITH A 10MER OLIGO CONTAINING N6MA organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0466 <- 5.87 -> DC O2 E0007 : score 1.885 : w : LYS NZ A0469 <- 5.97 -> DT O2 E0008 : score 0.522 : x : LEU xxxx A0380 <- 4.04 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0381 <- 3.29 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0438 <- 3.62 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0473 <- 3.50 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0475 <- 3.17 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx >6wfq_CD:GntR_ligand-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=NANR DIMER-DNA HETERO-COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : x : ARG xxxx C0069 <- 4.32 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0073 <- 4.40 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0069 <- 4.32 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx >6wfq_D:GntR_ligand-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=NANR DIMER-DNA HETERO-COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx D0069 <- 4.32 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx >6wg3_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Smc_hinge_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN COHESIN-NIPBL-DNA COMPLEX organism=? : V : SER CB A0102 <- 3.87 -> DT C7 G0043 : score 3.07648 >6wg3_ABDE:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Smc_hinge_domain;ARM_repeat; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN COHESIN-NIPBL-DNA COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : V : SER CB A0102 <- 3.87 -> DT C7 G0043 : score 3.07648 >6wg7_CDEFGH:GntR_ligand-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=COORDINATES OF NANR DIMER FITTED IN HEXAMERIC NANR-DNA HETERO-COMPLEX CRYO-EM MAP organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 C0069 <- 2.52 -> DT O4 B0023 : score 3.45095 : H : ARG NH2 C0069 <- 2.62 -> DT O4 B0022 : score 3.68178 : H : ARG NH2 C0069 <- 2.35 -> DT O4 B0023 : score 3.87369 : V : PRO CG C0070 <- 3.74 -> DT C7 A0010 : score 6.45436 : V : MET CG G0062 <- 3.66 -> DT C7 A0027 : score 6.00618 : V : VAL CB G0072 <- 3.81 -> DT C7 B0008 : score 3.91838 : x : SER xxxx C0057 <- 4.19 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0058 <- 1.49 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0059 <- 3.38 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0073 <- 0.62 -> DT xxx B0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0074 <- 3.57 -> DT xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0089 <- 3.46 -> DA xxx A0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0058 <- 3.86 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0059 <- 3.71 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0069 <- 2.46 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0070 <- 1.25 -> DT xxx B0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0071 <- 4.45 -> DT xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0073 <- 2.87 -> DG xxx A0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0058 <- 2.29 -> DA xxx A0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0059 <- 2.55 -> DT xxx A0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0069 <- 1.80 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0070 <- 2.33 -> DC xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0073 <- 1.30 -> DA xxx A0023 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0089 <- 2.67 -> DA xxx B0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0057 <- 3.17 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0058 <- 1.61 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0059 <- 0.57 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0069 <- 0.50 -> DT xxx A0027 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0070 <- 0.89 -> DG xxx A0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0071 <- 4.04 -> DG xxx A0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0073 <- 3.00 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0057 <- 3.74 -> DA xxx A0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0058 <- 1.64 -> DA xxx A0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0059 <- 2.11 -> DA xxx A0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0069 <- 0.79 -> DC xxx A0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0070 <- 1.69 -> DC xxx B0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0073 <- 1.28 -> DA xxx A0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0058 <- 4.41 -> DT xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0059 <- 3.57 -> DT xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0069 <- 1.61 -> DT xxx A0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0070 <- 1.81 -> DG xxx A0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0073 <- 2.48 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx >6wg7_G:GntR_ligand-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=COORDINATES OF NANR DIMER FITTED IN HEXAMERIC NANR-DNA HETERO-COMPLEX CRYO-EM MAP organism=? : V : MET CG G0062 <- 3.66 -> DT C7 A0027 : score 6.00618 : V : VAL CB G0072 <- 3.81 -> DT C7 B0008 : score 3.91838 : x : SER xxxx G0057 <- 3.17 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0058 <- 1.61 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0059 <- 0.57 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0069 <- 0.50 -> DT xxx A0027 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0070 <- 0.89 -> DG xxx A0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0071 <- 4.04 -> DG xxx A0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0073 <- 3.00 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx >6wgc_9ABCDE: title=ATOMIC MODEL OF SEMI-ATTACHED MUTANT OCCM-DNA COMPLEX (ORC-CDC6-CDT1- MCM2-7 WITH MCM6 WHD TRUNCATION) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : V : PHE CZ D0485 <- 3.74 -> DT C7 G0016 : score 7.22159 : V : ASN CB D0489 <- 3.64 -> DT C7 G0017 : score 2.01493 : x : ARG xxxx E0344 <- 3.81 -> DT xxx H0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0486 <- 2.91 -> DC xxx H0024 : score x.xxxxx >6wgc_D:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=ATOMIC MODEL OF SEMI-ATTACHED MUTANT OCCM-DNA COMPLEX (ORC-CDC6-CDT1- MCM2-7 WITH MCM6 WHD TRUNCATION) organism=? : V : PHE CZ D0485 <- 3.74 -> DT C7 G0016 : score 7.22159 : V : ASN CB D0489 <- 3.64 -> DT C7 G0017 : score 2.01493 : x : TYR xxxx D0486 <- 2.91 -> DC xxx H0024 : score x.xxxxx >6wge_ABE:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Smc_hinge_domain;ARM_repeat; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN COHESIN-NIPBL-DNA COMPLEX WITHOUT STAG1 organism=HOMO SAPIENS : x : SER xxxx A0102 <- 4.28 -> DT xxx G0035 : score x.xxxxx >6wgg_49ABCDE:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=ATOMIC MODEL OF PRE-INSERTION MUTANT OCCM-DNA COMPLEX(ORC-CDC6-CDT1- MCM2-7 WITH MCM6 WHD TRUNCATION) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : V : PHE CZ D0485 <- 3.74 -> DT C7 G0016 : score 7.22159 : V : ASN CB D0489 <- 3.64 -> DT C7 G0017 : score 2.01493 : x : ARG xxxx E0344 <- 3.81 -> DT xxx H0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0486 <- 2.91 -> DC xxx H0024 : score x.xxxxx >6wgi_79BCDE:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=ATOMIC MODEL OF THE MUTANT OCCM (ORC-CDC6-CDT1-MCM2-7 WITH MCM6 WHD TRUNCATION) LOADED ON DNA AT 10.5 A RESOLUTION organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 B0390 <- 3.02 -> DT O4 G0001 : score 3.12416 : x : TYR xxxx D0486 <- 4.43 -> DT xxx H0033 : score x.xxxxx >6whi_AJ: title=CRYO-ELECTRON MICROSCOPY STRUCTURE OF THE TYPE I-F CRISPR RNA-GUIDED SURVEILLANCE COMPLEX BOUND TO THE ANTI-CRISPR ACRIF9 organism=PROTEUS PENNERI / PSEUDOMONAS AERUGINOSA : x : ARG xxxx J0032 <- 3.95 -> DA xxx N0009 : score x.xxxxx >6whi_J: title=CRYO-ELECTRON MICROSCOPY STRUCTURE OF THE TYPE I-F CRISPR RNA-GUIDED SURVEILLANCE COMPLEX BOUND TO THE ANTI-CRISPR ACRIF9 organism=PROTEUS PENNERI : x : ARG xxxx J0032 <- 3.95 -> DA xxx N0009 : score x.xxxxx >6wie_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=POST-CATALYTIC NICKED COMPLEX OF HUMAN POLYMERASE MU ON A COMPLEMENTARY DNA DOUBLE-STRAND BREAK SUBSTRATE organism=HOMO SAPIENS : w : GLN NE2 A0275 <- 5.93 -> DG N3 P0002 : score 1.484 : H : ARG NH1 A0387 <- 3.02 -> DA N3 U0001 : score 3.52004 : w : ARG NH1 A0387 <- 5.65 -> DC O2 U0002 : score 1.381 : H : ARG NH1 A0445 <- 2.97 -> DT O2 T0006 : score 4.15999 : w : ARG NH2 A0445 <- 6.39 -> DT O2 P0005 : score 2.261 : x : PHE xxxx A0389 <- 3.71 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0438 <- 3.42 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0441 <- 4.22 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.61 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >6wig_A:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF STENOFOLIA PROTEIN HD DOMAIN BOUND WITH DNA organism=MEDICAGO TRUNCATULA : H : ARG NH2 A0096 <- 2.92 -> DA N3 C0020 : score 3.16199 : w : GLN NE2 A0146 <- 5.21 -> DT O4 C0015 : score 2.257 : H : ASN OD1 A0147 <- 2.90 -> DA N6 D0005 : score 5.90136 : H : ASN ND2 A0147 <- 2.94 -> DA N7 D0005 : score 5.70614 : H : ARG NH1 A0151 <- 2.97 -> DG N7 D0004 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0151 <- 2.89 -> DG O6 D0004 : score 6.4812 : x : TYR xxxx A0143 <- 3.65 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0150 <- 4.22 -> DA xxx C0016 : score x.xxxxx >6wig_AB:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF STENOFOLIA PROTEIN HD DOMAIN BOUND WITH DNA organism=MEDICAGO TRUNCATULA : H : ARG NH2 A0096 <- 2.92 -> DA N3 C0020 : score 3.16199 : w : GLN NE2 A0146 <- 5.21 -> DT O4 C0015 : score 2.257 : H : ASN OD1 A0147 <- 2.90 -> DA N6 D0005 : score 5.90136 : H : ASN ND2 A0147 <- 2.94 -> DA N7 D0005 : score 5.70614 : H : ARG NH1 A0151 <- 2.97 -> DG N7 D0004 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0151 <- 2.89 -> DG O6 D0004 : score 6.4812 : H : ARG NH1 B0096 <- 2.80 -> DT O2 C0010 : score 4.30641 : H : ASN OD1 B0147 <- 2.84 -> DA N6 C0012 : score 5.97362 : H : ASN ND2 B0147 <- 2.89 -> DA N7 C0012 : score 5.76484 : w : ASN OD1 B0147 <- 5.83 -> DA N6 D0010 : score 2.837 : H : ARG NH1 B0151 <- 2.49 -> DG O6 C0011 : score 6.4605 : H : ARG NH2 B0151 <- 3.02 -> DG N7 C0011 : score 6.10369 : x : TYR xxxx A0143 <- 3.65 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0150 <- 4.22 -> DA xxx C0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0143 <- 3.34 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0146 <- 3.27 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx >6wk6_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN POLYMERASE ETA COMPLEXED WITH XANTHINE CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : x : LEU xxxx A0378 <- 3.54 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.33 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx >6wmi_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZNF410 ZINC FINGERS 1-5 WITH 17 MER BLUNT DNA OLIGONUCLEOTIDE organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 A0264 <- 2.88 -> DA N6 F0005 : score 5.95572 : H : GLN NE2 A0264 <- 2.83 -> DA N7 F0005 : score 6.05321 : w : GLN OE1 A0264 <- 5.52 -> DA N6 E0012 : score 3.392 : w : ARG NE A0265 <- 5.78 -> DA N6 E0012 : score 1.081 : w : ARG NH2 A0265 <- 5.66 -> DT O4 F0006 : score 2.366 : w : THR OG1 A0292 <- 5.55 -> DT O4 E0010 : score 2.809 : H : ASN OD1 A0295 <- 3.32 -> DA N6 E0009 : score 5.39553 : H : ASN ND2 A0295 <- 3.17 -> DA N7 E0009 : score 5.43609 : w : ASN ND2 A0298 <- 6.04 -> DC N4 E0008 : score 2.395 : w : ASN ND2 A0298 <- 5.95 -> DT O4 F0009 : score 3.275 : H : GLU OE1 A0322 <- 2.84 -> DC N4 E0007 : score 5.72181 : w : GLU OE2 A0322 <- 5.87 -> DC N4 E0008 : score 3.597 : H : SER OG A0324 <- 2.47 -> DG N7 F0010 : score 4.77787 : H : LYS NZ A0328 <- 2.89 -> DG O6 F0012 : score 5.67672 : H : LYS NZ A0328 <- 3.29 -> DT O4 E0005 : score 3.23564 : H : GLN OE1 A0350 <- 2.94 -> DA N6 E0004 : score 5.88309 : H : GLN NE2 A0350 <- 3.14 -> DA N7 E0004 : score 5.67564 : V : SER CB A0325 <- 3.78 -> DT C7 E0005 : score 3.14694 : x : TRP xxxx A0232 <- 3.56 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0234 <- 3.88 -> DA xxx F0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0235 <- 4.34 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0238 <- 3.64 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0268 <- 4.29 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0323 <- 3.74 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0353 <- 3.70 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx >6wmp_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=F. TULARENSIS RNAPS70-IGLA DNA COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx C0545 <- 3.38 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx >6wmp_CD:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=F. TULARENSIS RNAPS70-IGLA DNA COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx C0545 <- 3.38 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0214 <- 3.84 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx >6wmp_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=F. TULARENSIS RNAPS70-IGLA DNA COMPLEX organism=? : x : LYS xxxx D0214 <- 3.84 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx >6wmr_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=F. TULARENSIS RNAPS70-(MGLA-SSPA)-IGLA DNA COMPLEX organism=? : x : ALA xxxx D0210 <- 4.07 -> DG xxx J0003 : score x.xxxxx >6wmt_CKLZ: title=F. TULARENSIS RNAPS70-(MGLA-SSPA)-PPGPP-PIGR-IGLA DNA COMPLEX organism=FRANCISELLA TULARENSIS SUBSP. HOLARCTICA LVS : H : ARG NH2 Z0405 <- 2.66 -> DG O6 G0040 : score 6.7848 : V : GLU CB Z0551 <- 3.58 -> DT C7 G0019 : score 1.71722 : V : ASN CB Z0425 <- 3.88 -> DT C7 H0001 : score 1.89869 : x : ALA xxxx K0296 <- 4.04 -> DA xxx H0033 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx K0297 <- 3.02 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0361 <- 3.29 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Z0383 <- 3.63 -> DA xxx G0042 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Z0394 <- 3.07 -> DA xxx G0042 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx Z0397 <- 3.62 -> DT xxx G0041 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx Z0398 <- 3.02 -> DT xxx G0041 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Z0401 <- 2.56 -> DA xxx H0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Z0404 <- 3.37 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx Z0419 <- 4.17 -> DT xxx G0036 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Z0422 <- 4.06 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0429 <- 3.92 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0552 <- 3.57 -> DT xxx G0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0554 <- 2.91 -> DC xxx H0023 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Z0555 <- 2.84 -> DT xxx G0018 : score x.xxxxx >6wox_CDF: title=THERMUS THERMOPHILUS RNA POLYMERASE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX WITH 2'DCTP organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : TYR OH C0256 <- 3.28 -> DG N2 H0011 : score 4.42033 : H : ASP OD1 C0326 <- 3.24 -> DG N2 H0014 : score 4.6968 : H : GLU OE2 F0324 <- 2.54 -> DG N2 G0019 : score 4.53439 : H : ASP OD1 F0326 <- 2.91 -> DG N2 G0019 : score 5.0367 : x : ARG xxxx C0142 <- 3.93 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0167 <- 3.16 -> DC xxx H0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0170 <- 4.24 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0171 <- 3.51 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0187 <- 3.41 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0243 <- 2.52 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0260 <- 3.53 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0266 <- 4.00 -> DA xxx H0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0325 <- 3.32 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0331 <- 3.39 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0418 <- 3.51 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0421 <- 3.08 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 3.96 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0426 <- 3.91 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0427 <- 3.32 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0628 <- 3.99 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0705 <- 4.42 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 3.21 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.05 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 4.14 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0079 <- 4.15 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0082 <- 3.64 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0327 <- 3.78 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0332 <- 4.31 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx >6wox_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=THERMUS THERMOPHILUS RNA POLYMERASE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX WITH 2'DCTP organism=THERMUS THERMOPHILUS : x : ARG xxxx D0628 <- 3.99 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0705 <- 4.42 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 3.21 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.05 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 4.14 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx >6woy_CDF: title=THERMUS THERMOPHILUS RNA POLYMERASE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX WITH 3'DCTP organism=THERMUS THERMOPHILUS : H : ARG NH2 C0243 <- 2.77 -> DG O6 H0009 : score 6.6396 : H : TYR OH C0256 <- 3.31 -> DG N2 H0011 : score 4.39099 : H : ASP OD1 C0326 <- 3.28 -> DG N2 H0014 : score 4.6556 : H : GLU OE2 F0324 <- 2.50 -> DG N2 G0019 : score 4.56887 : x : ARG xxxx C0142 <- 4.42 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0167 <- 3.11 -> DC xxx H0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0170 <- 4.48 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0171 <- 3.54 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0187 <- 3.46 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0260 <- 3.61 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0266 <- 3.79 -> DA xxx H0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0325 <- 3.71 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0331 <- 3.24 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0418 <- 3.39 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0421 <- 3.81 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 4.21 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0426 <- 4.14 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0427 <- 2.97 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0628 <- 4.05 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 3.46 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.04 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 4.32 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0079 <- 3.95 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0082 <- 3.60 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0326 <- 2.76 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0327 <- 3.72 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0332 <- 4.08 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx >6woy_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=THERMUS THERMOPHILUS RNA POLYMERASE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX WITH 3'DCTP organism=? : x : ARG xxxx D0628 <- 4.05 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 3.46 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.04 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 4.32 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx >6wpa_A:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF AVAR1 BOUND TO DNA HALF-SITE organism=STREPTOMYCES AVERMITILIS : x : ARG xxxx A0007 <- 4.46 -> DT xxx M0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0044 <- 3.01 -> DG xxx M0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0048 <- 3.60 -> DT xxx M0017 : score x.xxxxx >6wpa_AD:Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF AVAR1 BOUND TO DNA HALF-SITE organism=STREPTOMYCES AVERMITILIS : x : ARG xxxx A0007 <- 4.46 -> DT xxx M0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0044 <- 3.01 -> DG xxx M0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0048 <- 3.60 -> DT xxx M0017 : score x.xxxxx >6wpf_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH DSDNA AND D4T organism=? : w : GLN NE2 A0161 <- 5.79 -> DG N3 T0707 : score 1.484 : H : TYR OH A0183 <- 2.60 -> DC O2 P0821 : score 3.63733 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.54 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.84 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.32 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.49 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.38 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.60 -> DC xxx T0723 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.96 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >6wph_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH DSDNA AND (-)-FTC organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.44 -> DC O2 P0821 : score 3.74925 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.22 -> DT O2 P0806 : score 3.87773 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.54 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.96 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.20 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.69 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.41 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.47 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >6wph_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH DSDNA AND (-)-FTC organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.44 -> DC O2 P0821 : score 3.74925 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.22 -> DT O2 P0806 : score 3.87773 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.54 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.96 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.20 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.69 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.41 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.47 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >6wpj_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH DSDNA AND D4T organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.62 -> DC O2 P0821 : score 3.62334 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.70 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.29 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.42 -> DT xxx P0806 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.81 -> DG xxx T0721 : score x.xxxxx >6wq0_l: title=CRYO-EM OF THE S. SOLFATARICUS ROD-SHAPED VIRUS, SSRV1 organism=? : H : TRP NE1 l0017 <- 3.43 -> DA N3 70219 : score -7.96348 : x : ALA xxxx l0002 <- 4.24 -> DT xxx 70208 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx l0003 <- 3.92 -> DT xxx 70210 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx l0005 <- 4.30 -> DT xxx 70206 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx l0045 <- 4.19 -> DA xxx 80127 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx l0071 <- 3.65 -> DT xxx 70226 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx l0074 <- 3.21 -> DT xxx 70226 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx l0077 <- 4.49 -> DA xxx 70225 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx l0081 <- 3.71 -> DA xxx 80125 : score x.xxxxx >6wq2_J: title=CRYO-EM OF THE S. ISLANDICUS FILAMENTOUS VIRUS, SIFV organism=SULFOLOBUS ISLANDICUS FILAMENTOUS VIRUS : H : TYR OH J0016 <- 2.84 -> DA N3 10149 : score 4.11807 : H : TRP NE1 J0057 <- 2.61 -> DT O2 10148 : score 6.45157 : H : LYS NZ J0068 <- 2.96 -> DA N3 20359 : score 2.68806 : V : ASN CB J0005 <- 3.54 -> DT C7 20362 : score 2.06337 : x : ARG xxxx J0020 <- 3.21 -> DT xxx 20356 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0061 <- 4.20 -> DA xxx 20359 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0087 <- 4.12 -> DA xxx 10145 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0090 <- 4.34 -> DT xxx 10146 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx J0093 <- 4.27 -> DA xxx 10147 : score x.xxxxx >6wq2_b:Transglycosidases; title=CRYO-EM OF THE S. ISLANDICUS FILAMENTOUS VIRUS, SIFV organism=SULFOLOBUS ISLANDICUS FILAMENTOUS VIRUS : H : TYR OH b0020 <- 3.00 -> DA N3 20401 : score 3.98523 : H : TYR OH b0048 <- 3.05 -> DT O2 10106 : score 3.05583 : H : GLN NE2 b0081 <- 3.40 -> DA N3 20397 : score 3.54369 : V : ILE CG2 b0010 <- 3.62 -> DT C7 10108 : score 7.41039 : x : GLN xxxx b0005 <- 4.12 -> DT xxx 10114 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx b0024 <- 4.37 -> DT xxx 10104 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx b0052 <- 3.51 -> DA xxx 20399 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx b0077 <- 3.02 -> DA xxx 20397 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx b0080 <- 4.18 -> DT xxx 10108 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx b0084 <- 3.50 -> DT xxx 20398 : score x.xxxxx >6wqu_C:p53-like_transcription_factors;DNA-binding_protein_LAG-1_CSL;E_set_domains; title=CSL (RBPJ) BOUND TO NOTCH3 RAM AND DNA organism=MUS MUSCULUS : w : GLU OE1 C0089 <- 5.51 -> DC N4 A0009 : score 3.528 : w : GLU OE2 C0089 <- 5.68 -> DC N4 A0009 : score 3.597 : H : ARG NH1 C0091 <- 2.96 -> DG N7 B0023 : score 5.8564 : H : ARG NH2 C0091 <- 2.92 -> DG O6 B0023 : score 6.4416 : H : LYS NZ C0192 <- 2.69 -> DG O6 B0025 : score 5.90795 : w : LYS NZ C0192 <- 5.58 -> DG N7 B0024 : score 2.519 : x : TYR xxxx C0086 <- 3.69 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0191 <- 3.96 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0195 <- 4.30 -> DG xxx B0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0221 <- 4.01 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0222 <- 2.99 -> DG xxx A0013 : score x.xxxxx >6wvj_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF BACILLUS SUBTILIS RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=BACILLUS SUBTILIS : x : GLU xxxx C0497 <- 4.34 -> DA xxx N0003 : score x.xxxxx >6wvj_CD: title=CRYO-EM STRUCTURE OF BACILLUS SUBTILIS RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=BACILLUS SUBTILIS : x : GLU xxxx C0497 <- 4.34 -> DA xxx N0003 : score x.xxxxx >6wya_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RTX (REVERSE TRANSCRIPTION XENOPOLYMERASE) IN COMPLEX WITH A DNA DUPLEX AND DAMPNPP organism=Thermococcus kodakarensis (strain ATCC BAA-918 / JCM 12380 / KOD1) / Thermococcus kodakarensis (strain ATCC BAA-918 / JCM 12380 / KOD1) : w : TYR OH A0494 <- 5.74 -> DA N3 B0004 : score 1.448 : w : THR OG1 A0541 <- 5.61 -> DT O2 C0020 : score 2.522 : H : LYS NZ A0592 <- 3.05 -> DC O2 C0019 : score 2.79885 : w : LYS NZ A0592 <- 5.54 -> DG N2 B0005 : score 0.846 : w : LYS NZ A0593 <- 5.74 -> DA N3 B0008 : score 1.538 A : H : ARG NH1 A0612 <- 3.14 -> DG N3 C0017 : score 2.84499 : H : ARG NH2 A0612 <- 3.19 -> DT O2 C0016 : score 3.90313 >6wyb_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=RTX (REVERSE TRANSCRIPTION XENOPOLYMERASE) IN COMPLEX WITH AN RNA/DNA HYBRID organism=Thermococcus kodakarensis (strain ATCC BAA-918 / JCM 12380 / KOD1) / Thermococcus kodakarensis (strain ATCC BAA-918 / JCM 12380 / KOD1) : H : LYS NZ A0592 <- 2.88 -> DC O2 C0011 : score 2.89902 : x : ARG xxxx A0612 <- 3.40 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx >6wz5_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=BRIDGING OF DOUBLE-STRAND DNA BREAK ACTIVATES PARP2/HPF1 TO MODIFY CHROMATIN organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.95 -> DG N3 J0009 : score 3.50195 : H : ARG NH2 C0011 <- 2.74 -> DT O2 J0043 : score 4.28413 : H : ARG NH1 D0027 <- 2.97 -> DA N3 J0050 : score 3.55686 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.22 -> DT O2 I0009 : score 3.94467 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.89 -> DT O2 I0009 : score 4.15713 : H : ARG NH2 G0011 <- 3.20 -> DT O2 I0044 : score 3.89467 : H : ARG NH2 H0027 <- 2.90 -> DG N3 I0050 : score 3.53805 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.40 -> DA xxx J-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.46 -> DC xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.04 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.81 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.24 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.90 -> DG xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.19 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >6wz5_G:Histone-fold; title=BRIDGING OF DOUBLE-STRAND DNA BREAK ACTIVATES PARP2/HPF1 TO MODIFY CHROMATIN organism=? : H : ARG NH2 G0011 <- 3.20 -> DT O2 I0044 : score 3.89467 >6wz9_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=BRIDGING OF DOUBLE-STRAND DNA BREAK ACTIVATES PARP2/HPF1 TO MODIFY CHROMATIN organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.47 -> DG N3 J0009 : score 3.84853 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.12 -> DT O2 I0009 : score 4.0308 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.85 -> DT O2 I0009 : score 4.191 : H : ARG NH2 G0011 <- 2.58 -> DA N3 I0043 : score 3.38229 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.49 -> DA xxx J-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.00 -> DC xxx J0049 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.31 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.23 -> DG xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.12 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >6wz9_H:Histone-fold; title=BRIDGING OF DOUBLE-STRAND DNA BREAK ACTIVATES PARP2/HPF1 TO MODIFY CHROMATIN organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx H0030 <- 4.12 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >6x0l_PR:WGR_domain-like; title=BRIDGING OF DOUBLE-STRAND DNA BREAK ACTIVATES PARP2/HPF1 TO MODIFY CHROMATIN organism=HOMO SAPIENS : H : GLN OE1 P0146 <- 2.45 -> DG N2 J0083 : score 6.00023 : x : GLN xxxx R0146 <- 4.22 -> DC xxx I-083 : score x.xxxxx >6x0l_R:WGR_domain-like; title=BRIDGING OF DOUBLE-STRAND DNA BREAK ACTIVATES PARP2/HPF1 TO MODIFY CHROMATIN organism=HOMO SAPIENS : x : GLN xxxx R0146 <- 4.22 -> DC xxx I-083 : score x.xxxxx >6x0m_P:ADP-ribosylation;Domain_of_polyADP-ribose_polymerase;WGR_domain-like; title=BRIDGING OF DOUBLE-STRAND DNA BREAK ACTIVATES PARP2/HPF1 TO MODIFY CHROMATIN organism=HOMO SAPIENS : x : GLN xxxx P0146 <- 3.93 -> DA xxx I-082 : score x.xxxxx >6x0m_Pp: title=BRIDGING OF DOUBLE-STRAND DNA BREAK ACTIVATES PARP2/HPF1 TO MODIFY CHROMATIN organism=HOMO SAPIENS : x : GLN xxxx P0146 <- 3.93 -> DA xxx I-082 : score x.xxxxx >6x0n_G:Histone-fold; title=BRIDGING OF DOUBLE-STRAND DNA BREAK ACTIVATES PARP2/HPF1 TO MODIFY CHROMATIN organism=? : H : ARG NH2 G0011 <- 2.58 -> DT O2 I0044 : score 4.4196 >6x0n_PR:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;WGR_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=BRIDGING OF DOUBLE-STRAND DNA BREAK ACTIVATES PARP2/HPF1 TO MODIFY CHROMATIN organism=HOMO SAPIENS : H : GLN OE1 P0146 <- 3.01 -> DG N2 J0083 : score 5.37217 : x : TRP xxxx R0138 <- 4.47 -> DC xxx I-083 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx R0146 <- 4.08 -> DC xxx I-083 : score x.xxxxx >6x0n_abcdefgh:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;WGR_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=BRIDGING OF DOUBLE-STRAND DNA BREAK ACTIVATES PARP2/HPF1 TO MODIFY CHROMATIN organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 a0040 <- 2.25 -> DG N3 j0009 : score 4.00738 : H : ARG NH1 e0040 <- 3.05 -> DT O2 i0009 : score 4.09109 : H : ARG NH2 e0040 <- 2.21 -> DT O2 i0009 : score 4.73287 : H : ARG NH1 g0011 <- 2.60 -> DT O2 j-043 : score 4.47867 : H : ARG NH2 g0011 <- 2.51 -> DA N3 i0043 : score 3.42765 : H : ARG NH1 h0030 <- 3.18 -> DT O2 j-047 : score 3.97912 : H : ARG NH2 h0030 <- 2.85 -> DT O2 j-047 : score 4.191 : x : HIS xxxx a0039 <- 3.44 -> DT xxx i0069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx a0041 <- 3.81 -> DA xxx j-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx b0045 <- 3.61 -> DC xxx j0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx d0030 <- 3.38 -> DC xxx i-047 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx e0039 <- 3.80 -> DG xxx i-069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx e0041 <- 3.04 -> DT xxx i-067 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx e0043 <- 4.41 -> DG xxx j-007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx g0042 <- 4.36 -> DG xxx j-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx g0077 <- 4.31 -> DG xxx i0057 : score x.xxxxx >6x1j_A:Homing_endonucleases; title=THE HOMING ENDONUCLEASE I-WCAI BOUND TO ITS DNA RECOGNITION SEQUENCE organism=Wickerhamomyces canadensis : H : ASN ND2 A0018 <- 2.76 -> DT O2 D0005 : score 4.78412 : H : LYS NZ A0051 <- 3.05 -> DG N7 C0018 : score 5.1166 : H : GLN NE2 A0062 <- 3.31 -> DG O6 C0017 : score 5.21301 : w : GLN NE2 A0062 <- 5.85 -> DA N7 C0016 : score 1.888 : H : GLU OE1 A0064 <- 2.97 -> DC N4 C0015 : score 5.57184 : w : GLU OE1 A0064 <- 5.89 -> DA N6 C0016 : score 2.939 : w : GLU OE2 A0064 <- 5.65 -> DA N6 C0014 : score 2.785 : H : ARG NH1 A0091 <- 3.18 -> DG O6 D0012 : score 5.621 : H : ARG NH2 A0091 <- 3.07 -> DG N7 D0012 : score 6.03985 : w : ARG NH1 A0091 <- 5.97 -> DA N6 C0014 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0103 <- 2.79 -> DT O4 D0011 : score 3.27448 : H : ARG NH2 A0103 <- 2.90 -> DT O4 D0011 : score 3.48277 : w : ARG NH2 A0103 <- 6.10 -> DA N6 C0014 : score 1.997 : w : ASP OD1 A0153 <- 5.50 -> DT O4 C0006 : score 2.616 : H : ASN OD1 A0195 <- 2.90 -> DC N4 D0017 : score 4.10972 : H : ASN ND2 A0195 <- 2.80 -> DG O6 C0009 : score 5.63846 : w : ASN ND2 A0195 <- 5.49 -> DG N7 C0008 : score 3.259 : H : LYS NZ A0196 <- 2.87 -> DT O4 D0016 : score 3.53696 : H : LYS NZ A0196 <- 2.90 -> DG N7 C0010 : score 5.27818 : V : ASP CG A0153 <- 3.77 -> DT C7 C0006 : score 2.7032 : x : PRO xxxx A0017 <- 3.18 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0049 <- 3.18 -> DA xxx C0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0053 <- 3.92 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0055 <- 4.48 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0089 <- 3.82 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0093 <- 3.92 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0094 <- 4.08 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0099 <- 3.97 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0101 <- 4.04 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0105 <- 4.31 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0154 <- 3.47 -> DC xxx D0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0166 <- 3.29 -> DC xxx D0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0168 <- 3.86 -> DC xxx D0017 : score x.xxxxx >6x26_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;TRCF_domain-like;CarD-like; title=MFD-BOUND E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX - L1 STATE organism=? : x : LYS xxxx A0690 <- 3.73 -> DG xxx Q0213 : score x.xxxxx >6x26_AIJ: title=MFD-BOUND E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX - L1 STATE organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 I0451 <- 2.51 -> DG O6 Q0251 : score 6.43617 : H : ARG NE I0542 <- 2.89 -> DC N3 P0113 : score -8.94753 : H : ARG NE I0542 <- 2.89 -> DC N3 P0113 : score -8.94753 : H : ARG NH2 I0542 <- 3.06 -> DC N3 P0113 : score 2.17189 : x : LYS xxxx A0690 <- 3.73 -> DG xxx Q0213 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0151 <- 4.12 -> DG xxx Q0251 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.17 -> DT xxx Q0250 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.23 -> DT xxx Q0250 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.48 -> DG xxx Q0251 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0473 <- 3.40 -> DT xxx Q0248 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0496 <- 3.62 -> DG xxx P0126 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 3.82 -> DG xxx Q0251 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0547 <- 4.24 -> DG xxx Q0251 : score x.xxxxx >6x2f_AIJ: title=MFD-BOUND E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX - L2 STATE organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NE I0451 <- 3.24 -> DG O6 Q0051 : score 3.59422 : H : ARG NH2 I0451 <- 3.17 -> DG O6 Q0051 : score 6.1116 : H : ARG NE I0542 <- 2.89 -> DG N7 Q0052 : score 4.3422 : x : ARG xxxx A0685 <- 4.03 -> DT xxx P0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0151 <- 3.43 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.15 -> DT xxx Q0050 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 2.99 -> DT xxx Q0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0201 <- 4.12 -> DA xxx Q0049 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.98 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0446 <- 4.16 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0496 <- 4.43 -> DA xxx P0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 4.48 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0541 <- 3.80 -> DC xxx P0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0547 <- 3.72 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0255 <- 4.01 -> DC xxx P0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0259 <- 3.29 -> DT xxx P0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0314 <- 4.50 -> DT xxx Q0048 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0321 <- 4.45 -> DT xxx Q0048 : score x.xxxxx >6x2f_J:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=MFD-BOUND E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX - L2 STATE organism=? : x : LEU xxxx J0255 <- 4.01 -> DC xxx P0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0259 <- 3.29 -> DT xxx P0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0314 <- 4.50 -> DT xxx Q0048 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0321 <- 4.45 -> DT xxx Q0048 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.39 -> DA xxx P0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.49 -> DT xxx P0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.56 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.74 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx >6x2n_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;TRCF_domain-like;CarD-like; title=MFD-BOUND E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX - I STATE organism=? : x : ARG xxxx A0685 <- 3.81 -> DT xxx P0037 : score x.xxxxx >6x2n_AIJ: title=MFD-BOUND E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX - I STATE organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 I0451 <- 2.57 -> DG O6 Q0051 : score 6.36317 : V : TRP CD1 I0183 <- 3.90 -> DT C7 Q0050 : score 7.15 : x : ARG xxxx A0685 <- 3.81 -> DT xxx P0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0151 <- 3.35 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.38 -> DT xxx Q0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0201 <- 3.50 -> DA xxx Q0049 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.57 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0446 <- 4.36 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 4.38 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 2.99 -> DC xxx P0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0547 <- 4.18 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0046 <- 3.94 -> DA xxx Q0041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0255 <- 3.84 -> DC xxx P0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0259 <- 3.19 -> DA xxx Q0041 : score x.xxxxx >6x43_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;TRCF_domain-like;CarD-like; title=MFD-BOUND E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX - II STATE organism=? : x : ARG xxxx A0733 <- 4.04 -> DG xxx P0034 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0844 <- 4.37 -> DT xxx P0035 : score x.xxxxx >6x43_AIJ: title=MFD-BOUND E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX - II STATE organism=ESCHERICHIA COLI : H : ASP OD1 I0199 <- 3.22 -> DT N3 Q0050 : score 1.18375 : H : ARG NE I0451 <- 3.08 -> DG O6 Q0051 : score 3.72033 : H : ASP OD1 I1041 <- 2.49 -> DC N4 Q0039 : score 5.67625 : x : ARG xxxx A0733 <- 4.04 -> DG xxx P0034 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0844 <- 4.37 -> DT xxx P0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0151 <- 3.61 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.91 -> DT xxx Q0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 4.08 -> DT xxx Q0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0201 <- 3.62 -> DT xxx Q0048 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.35 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0446 <- 3.58 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 3.94 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.51 -> DG xxx Q0052 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0547 <- 4.01 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I1044 <- 3.76 -> DC xxx Q0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0259 <- 3.74 -> DT xxx P0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0319 <- 3.30 -> DA xxx Q0041 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0320 <- 3.99 -> DA xxx Q0041 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0321 <- 4.50 -> DT xxx Q0048 : score x.xxxxx >6x4w_AIJ: title=MFD-BOUND E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX - III STATE organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 I0542 <- 2.71 -> DC N3 P0013 : score 2.33226 : H : ARG NH2 I0542 <- 2.71 -> DC N3 P0013 : score 2.33226 : V : THR CG2 J0790 <- 3.64 -> DT C7 P0015 : score 4.4064 : x : ARG xxxx I0151 <- 2.96 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.21 -> DT xxx Q0050 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.41 -> DT xxx Q0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 4.13 -> DT xxx Q0050 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.36 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0446 <- 3.94 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0451 <- 3.55 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 3.79 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0547 <- 3.88 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I1044 <- 3.49 -> DA xxx Q0041 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0334 <- 4.32 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.24 -> DA xxx P0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 4.18 -> DT xxx P0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0795 <- 3.31 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx >6x4w_I:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=MFD-BOUND E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX - III STATE organism=? : H : ARG NH2 I0542 <- 2.71 -> DC N3 P0013 : score 2.33226 : H : ARG NH2 I0542 <- 2.71 -> DC N3 P0013 : score 2.33226 : x : ARG xxxx I0151 <- 2.96 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.21 -> DT xxx Q0050 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.41 -> DT xxx Q0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 4.13 -> DT xxx Q0050 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.36 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0446 <- 3.94 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0451 <- 3.55 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 3.79 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0547 <- 3.88 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I1044 <- 3.49 -> DA xxx Q0041 : score x.xxxxx >6x4y_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;TRCF_domain-like;CarD-like; title=MFD-BOUND E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX - IV STATE organism=ESCHERICHIA COLI : x : GLN xxxx A0895 <- 4.42 -> DT xxx Q0033 : score x.xxxxx >6x4y_AIJ: title=MFD-BOUND E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX - IV STATE organism=ESCHERICHIA COLI : H : ASP OD2 I0199 <- 2.94 -> DA N6 Q0049 : score 3.89049 : H : ARG NE I0451 <- 3.22 -> DG O6 Q0051 : score 3.60998 : x : GLN xxxx A0895 <- 4.42 -> DT xxx Q0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0151 <- 3.38 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.02 -> DT xxx Q0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 3.24 -> DT xxx Q0050 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.31 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 3.89 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.72 -> DG xxx Q0052 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0547 <- 3.30 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 3.94 -> DA xxx P0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 3.92 -> DT xxx P0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.95 -> DT xxx P0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.67 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.51 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx >6x50_AIJ: title=MFD-BOUND E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX - V STATE organism=ESCHERICHIA COLI : H : ASP OD1 I0199 <- 3.21 -> DT N3 Q0050 : score 1.18634 : V : ARG CZ J0259 <- 3.78 -> DT C7 P0024 : score 2.14297 : x : ARG xxxx A0685 <- 3.41 -> DT xxx P0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0733 <- 3.38 -> DT xxx Q0032 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0844 <- 3.47 -> DT xxx P0035 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0895 <- 4.40 -> DT xxx Q0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0151 <- 3.55 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.81 -> DT xxx Q0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 4.26 -> DT xxx Q0050 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.41 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0451 <- 3.88 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 4.31 -> DG xxx Q0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.42 -> DG xxx Q0052 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0046 <- 3.77 -> DG xxx Q0042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0255 <- 4.08 -> DC xxx P0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 3.79 -> DA xxx P0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.04 -> DA xxx P0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 4.07 -> DT xxx P0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.49 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.45 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx >6x50_J:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=MFD-BOUND E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX - V STATE organism=? : V : ARG CZ J0259 <- 3.78 -> DT C7 P0024 : score 2.14297 : x : TYR xxxx J0046 <- 3.77 -> DG xxx Q0042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0255 <- 4.08 -> DC xxx P0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 3.79 -> DA xxx P0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.04 -> DA xxx P0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 4.07 -> DT xxx P0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.49 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.45 -> DG xxx P0014 : score x.xxxxx >6x59_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE MOUSE CGAS CATALYTIC DOMAIN BINDING TO HUMAN ASSEMBLED NUCLEOSOME organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 E0040 <- 2.46 -> DG N3 I0082 : score 3.85575 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.09 -> DG xxx J0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 2.26 -> DT xxx J0082 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.30 -> DG xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 3.41 -> DA xxx J0116 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.37 -> DG xxx I0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.92 -> DG xxx J0121 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.24 -> DG xxx I0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.92 -> DT xxx J0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0011 <- 3.92 -> DA xxx J0030 : score x.xxxxx >6x5a_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE MOUSE CGAS CATALYTIC DOMAIN BINDING TO HUMAN NUCLEOSOME THAT PURIFIED FROM HEK293T CELLS organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0040 <- 3.24 -> DT O2 J0082 : score 3.92745 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.07 -> DG N3 I0082 : score 2.88773 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.83 -> DA xxx J0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.32 -> DG xxx J0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.89 -> DG xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 3.42 -> DT xxx I0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.18 -> DG xxx I0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.70 -> DG xxx J0121 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.28 -> DG xxx I0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.00 -> DT xxx J0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.99 -> DC xxx I0080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.19 -> DG xxx J0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 3.93 -> DA xxx I0130 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 4.34 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >6x5a_G:Histone-fold; title=THE MOUSE CGAS CATALYTIC DOMAIN BINDING TO HUMAN NUCLEOSOME THAT PURIFIED FROM HEK293T CELLS organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx G0042 <- 4.19 -> DG xxx J0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 3.93 -> DA xxx I0130 : score x.xxxxx >6x68_CD:AN1-like_Zinc_finger; title=CRYO-EM STRUCTURE OF PIGGYBAC TRANSPOSASE SYNAPTIC COMPLEX WITH HAIRPIN DNA (SNHP) organism=TRICHOPLUSIA NI : H : ARG NH1 C0275 <- 2.69 -> DG N7 A-006 : score 6.1831 : H : LYS NZ C0290 <- 2.89 -> DG O6 A-004 : score 5.67672 : H : TYR OH C0291 <- 3.03 -> DC N4 A0001 : score 4.02025 : H : LYS NZ C0525 <- 3.34 -> DT O2 A0015 : score 3.19976 : H : TYR OH C0558 <- 3.03 -> DG N7 A0018 : score 4.08997 : H : TYR OH C0558 <- 3.14 -> DC N4 A0019 : score 3.92754 : H : ARG NE C0567 <- 3.20 -> DG O6 A-022 : score 3.62574 : H : ARG NH2 C0567 <- 3.19 -> DG N7 A-022 : score 5.88662 : H : LYS NZ C0569 <- 3.12 -> DG N7 A0020 : score 5.0412 : H : GLN OE1 D0451 <- 2.98 -> DG N2 A-006 : score 5.40582 : H : GLN NE2 D0451 <- 2.92 -> DT O2 A0004 : score 3.83893 : H : ARG NH1 D0556 <- 2.93 -> DG N7 A-033 : score 5.8927 : H : ARG NH2 D0556 <- 3.04 -> DG O6 A-033 : score 6.2832 : H : TYR OH D0558 <- 2.73 -> DG O6 A-035 : score 3.6842 : H : TYR OH D0558 <- 3.25 -> DC N4 A-034 : score 3.83483 : H : LYS NZ D0569 <- 3.07 -> DG O6 A0028 : score 5.46861 : V : VAL CG1 D0414 <- 3.84 -> DT C7 A-002 : score 5.99991 : V : ASP CG C0215 <- 3.53 -> DT C7 A-016 : score 2.86418 >6x68_D:AN1-like_Zinc_finger; title=CRYO-EM STRUCTURE OF PIGGYBAC TRANSPOSASE SYNAPTIC COMPLEX WITH HAIRPIN DNA (SNHP) organism=TRICHOPLUSIA NI : H : LYS NZ D0290 <- 3.08 -> DG O6 B-004 : score 5.45705 : H : LYS NZ D0290 <- 2.95 -> DT O4 B-003 : score 3.47956 : H : TYR OH D0291 <- 3.30 -> DC N4 B0001 : score 3.79269 : H : LYS NZ D0461 <- 2.93 -> DA N3 B0007 : score 2.70472 : H : LYS NZ D0525 <- 3.02 -> DT O2 B0015 : score 3.42934 >6x6d_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH UNMODIFIED PRECURSOR FOR A MODERN RECOGNITION ELEMENT (PRE-GBS) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0442 <- 2.63 -> DG N7 C0004 : score 5.56902 : H : LYS NZ A0442 <- 3.31 -> DG O6 C0004 : score 5.19113 : H : ARG NH1 A0447 <- 2.91 -> DG N7 D0013 : score 5.9169 : H : ARG NH2 A0447 <- 2.50 -> DG O6 D0013 : score 6.996 : H : LYS NZ B0442 <- 2.61 -> DG N7 D0004 : score 5.59056 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.75 -> DG N7 C0013 : score 6.44846 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.77 -> DG O6 C0013 : score 6.6396 : x : VAL xxxx A0443 <- 3.85 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0443 <- 3.92 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >6x6d_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH UNMODIFIED PRECURSOR FOR A MODERN RECOGNITION ELEMENT (PRE-GBS) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0442 <- 2.61 -> DG N7 D0004 : score 5.59056 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.75 -> DG N7 C0013 : score 6.44846 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.77 -> DG O6 C0013 : score 6.6396 : x : VAL xxxx B0443 <- 3.92 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >6x6e_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH METHYLATED PRECURSOR FOR A MODERN RECOGNITION ELEMENT (METHYLATED PRE-GBS) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0442 <- 2.65 -> DG N7 C0004 : score 5.54747 : H : ARG NH1 A0447 <- 3.02 -> DG N7 D0031 : score 5.7838 : H : ARG NH2 A0447 <- 2.80 -> DG O6 D0031 : score 6.6 : H : LYS NZ B0442 <- 3.00 -> DG N7 D0022 : score 5.17046 : H : LYS NZ B0442 <- 3.01 -> DG O6 D0022 : score 5.53798 : H : ARG NH1 B0447 <- 3.14 -> DG N7 C0013 : score 5.6386 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.97 -> DG O6 C0013 : score 6.3756 : x : VAL xxxx A0443 <- 3.72 -> DT xxx D0032 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0443 <- 4.05 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx >6x6e_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=GLUCOCORTICOID RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH METHYLATED PRECURSOR FOR A MODERN RECOGNITION ELEMENT (METHYLATED PRE-GBS) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0442 <- 3.00 -> DG N7 D0022 : score 5.17046 : H : LYS NZ B0442 <- 3.01 -> DG O6 D0022 : score 5.53798 : H : ARG NH1 B0447 <- 3.14 -> DG N7 C0013 : score 5.6386 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.97 -> DG O6 C0013 : score 6.3756 : x : VAL xxxx B0443 <- 4.05 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx >6x6t_ABE:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators;Translation_proteins_SH3-like_domain;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=CRYO-EM STRUCTURE OF AN ESCHERICHIA COLI COUPLED TRANSCRIPTION- TRANSLATION COMPLEX B1 (TTC-B1) CONTAINING AN MRNA WITH A 24 NT LONG SPACER, TRANSCRIPTION FACTORS NUSA AND NUSG, AND FMET-TRNAS AT P- SITE AND E-SITE organism=? : H : LYS NZ E1170 <- 2.93 -> DG N3 50122 : score 1.41605 : V : ASP CG A0199 <- 3.85 -> DT C7 50108 : score 2.64954 : x : HIS xxxx A0150 <- 4.28 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0151 <- 3.23 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0175 <- 3.95 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0182 <- 4.15 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 2.69 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.74 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0542 <- 3.53 -> DC xxx 50111 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0015 <- 4.18 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0046 <- 3.08 -> DC xxx 50097 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0255 <- 3.61 -> DC xxx 60023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0271 <- 2.92 -> DT xxx 50101 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0274 <- 4.21 -> DA xxx 50100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0314 <- 3.62 -> DA xxx 50103 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0317 <- 4.50 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0352 <- 4.09 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0426 <- 4.03 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0427 <- 3.76 -> DC xxx 60015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0790 <- 3.45 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0791 <- 3.75 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx >6x6t_E:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Ribosomal_protein_S20; title=CRYO-EM STRUCTURE OF AN ESCHERICHIA COLI COUPLED TRANSCRIPTION- TRANSLATION COMPLEX B1 (TTC-B1) CONTAINING AN MRNA WITH A 24 NT LONG SPACER, TRANSCRIPTION FACTORS NUSA AND NUSG, AND FMET-TRNAS AT P- SITE AND E-SITE organism=? : H : LYS NZ E1170 <- 2.93 -> DG N3 50122 : score 1.41605 : x : TYR xxxx E0046 <- 3.08 -> DC xxx 50097 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0255 <- 3.61 -> DC xxx 60023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0271 <- 2.92 -> DT xxx 50101 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0274 <- 4.21 -> DA xxx 50100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0314 <- 3.62 -> DA xxx 50103 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0317 <- 4.50 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0352 <- 4.09 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0426 <- 4.03 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0427 <- 3.76 -> DC xxx 60015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0790 <- 3.45 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0791 <- 3.75 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx >6x6z_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=REV1 TERNARY COMPLEX WITH DCTP AND CA2+ organism=Saccharomyces cerevisiae : w : SER OG A0329 <- 5.06 -> DT O2 T0007 : score 1.55 : w : LYS NZ A0332 <- 5.56 -> DG N3 P0012 : score 2.232 : x : LEU xxxx A0325 <- 3.71 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0328 <- 4.20 -> DG xxx P0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0626 <- 3.57 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >6x70_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=REV1-DNA BINARY COMPLEX organism=Saccharomyces cerevisiae : w : SER OG A0329 <- 5.46 -> DC O2 T0006 : score 1.768 : w : SER OG A0329 <- 6.15 -> DT O2 T0007 : score 1.55 : w : LYS NZ A0332 <- 6.11 -> DG N3 P0012 : score 2.232 : w : LYS NZ A0332 <- 5.88 -> DT O2 T0007 : score 0.522 : x : LEU xxxx A0325 <- 3.88 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0626 <- 3.68 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0692 <- 3.92 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx >6x71_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=REV1 MG2+-FACILITATED INTERMEDIATE COMPLEX WITH REACTANT DCTP AND PRODUCT DCMP organism=Saccharomyces cerevisiae : H : SER OG A0329 <- 2.76 -> DC O2 T0006 : score 2.52129 : w : SER OG A0329 <- 5.60 -> DT O2 T0007 : score 1.55 : w : LYS NZ A0332 <- 6.02 -> DT O2 T0007 : score 0.522 : x : LEU xxxx A0325 <- 3.69 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0328 <- 4.11 -> DG xxx P0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0626 <- 3.46 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0667 <- 3.20 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0692 <- 4.35 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx >6x72_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=REV1 MG2+-FACILITATED PRODUCT COMPLEX WITH TWO MONOPHOSPHATES organism=Saccharomyces cerevisiae : H : SER OG A0329 <- 2.97 -> DC O2 T0006 : score 2.41624 : x : LEU xxxx A0325 <- 3.55 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0328 <- 4.28 -> DG xxx P0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0332 <- 3.72 -> DG xxx P0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0626 <- 3.50 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0692 <- 4.30 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx >6x73_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=REV1 MG2+-FACILITATED PRODUCT COMPLEX WITH ONE MONOPHOSPHATE organism=Saccharomyces cerevisiae : H : SER OG A0329 <- 2.49 -> DC O2 T0006 : score 2.65636 : x : LEU xxxx A0325 <- 3.56 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0328 <- 4.20 -> DG xxx P0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0626 <- 3.49 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0692 <- 4.21 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx >6x74_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=REV1 MG2+-FACILITATED PRODUCT COMPLEX WITH NO MONOPHOSPHATES organism=Saccharomyces cerevisiae : H : SER OG A0329 <- 2.63 -> DC O2 T0006 : score 2.58633 : w : SER OG A0329 <- 6.01 -> DT O2 T0007 : score 1.55 : x : LEU xxxx A0325 <- 3.76 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0328 <- 4.02 -> DG xxx P0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0626 <- 3.54 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0692 <- 3.79 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx >6x75_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=REV1 MN2+-FACILITATED PRODUCT COMPLEX WITH SECOND DCTP BOUND organism=Saccharomyces cerevisiae : H : SER OG A0329 <- 2.64 -> DG N2 P0012 : score 3.48234 : H : SER OG A0329 <- 2.66 -> DC O2 T0006 : score 2.57132 : w : LYS NZ A0667 <- 6.52 -> DG N7 P0008 : score 2.519 : x : LEU xxxx A0325 <- 3.73 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0417 <- 3.77 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0626 <- 3.72 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0629 <- 4.10 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0681 <- 3.95 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0685 <- 3.36 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0692 <- 3.91 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx >6x76_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=REV1 L325G MN2+-FACILITATED PRODUCT COMPLEX WITH SECOND DCTP BOUND organism=Saccharomyces cerevisiae : H : SER OG A0329 <- 2.83 -> DC O2 T0006 : score 2.48627 : x : ARG xxxx A0324 <- 4.00 -> DC xxx P0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0328 <- 4.25 -> DC xxx P0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0332 <- 3.47 -> DG xxx P0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0417 <- 4.04 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0626 <- 3.79 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0629 <- 4.09 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0667 <- 3.69 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0679 <- 4.44 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0681 <- 3.72 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0685 <- 3.35 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0692 <- 4.19 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx >6x77_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=REV1 R518A TERNARY COMPLEX WITH DCTP AND CA2+ organism=Saccharomyces cerevisiae : H : SER OG A0329 <- 2.95 -> DC O2 T0006 : score 2.42624 : w : SER OG A0329 <- 6.46 -> DT O2 T0007 : score 1.55 : x : LEU xxxx A0325 <- 3.70 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0328 <- 4.14 -> DG xxx P0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0626 <- 3.58 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >6x7f_ABE:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators;Translation_proteins_SH3-like_domain;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=CRYO-EM STRUCTURE OF AN ESCHERICHIA COLI COUPLED TRANSCRIPTION- TRANSLATION COMPLEX B2 (TTC-B2) CONTAINING AN MRNA WITH A 24 NT LONG SPACER, TRANSCRIPTION FACTORS NUSA AND NUSG, AND FMET-TRNAS AT P- SITE AND E-SITE organism=? : H : LYS NZ E1170 <- 2.93 -> DG N3 50122 : score 1.41605 : V : ASP CG A0199 <- 3.86 -> DT C7 50108 : score 2.64283 : x : HIS xxxx A0150 <- 4.28 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0151 <- 3.24 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0175 <- 3.94 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0182 <- 4.15 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 2.69 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.73 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0542 <- 3.54 -> DC xxx 50111 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0015 <- 4.21 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0046 <- 3.08 -> DC xxx 50097 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0255 <- 3.61 -> DC xxx 60023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0271 <- 2.92 -> DT xxx 50101 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0274 <- 4.21 -> DA xxx 50100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0314 <- 3.62 -> DA xxx 50103 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0317 <- 4.50 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0352 <- 4.09 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0426 <- 4.03 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0427 <- 3.76 -> DC xxx 60015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0790 <- 3.45 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0791 <- 3.75 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx >6x7f_E:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Ribosomal_protein_S20; title=CRYO-EM STRUCTURE OF AN ESCHERICHIA COLI COUPLED TRANSCRIPTION- TRANSLATION COMPLEX B2 (TTC-B2) CONTAINING AN MRNA WITH A 24 NT LONG SPACER, TRANSCRIPTION FACTORS NUSA AND NUSG, AND FMET-TRNAS AT P- SITE AND E-SITE organism=? : H : LYS NZ E1170 <- 2.93 -> DG N3 50122 : score 1.41605 : x : TYR xxxx E0046 <- 3.08 -> DC xxx 50097 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0255 <- 3.61 -> DC xxx 60023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0271 <- 2.92 -> DT xxx 50101 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0274 <- 4.21 -> DA xxx 50100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0314 <- 3.62 -> DA xxx 50103 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0317 <- 4.50 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0352 <- 4.09 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0426 <- 4.03 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0427 <- 3.76 -> DC xxx 60015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0790 <- 3.45 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0791 <- 3.75 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx >6x7k_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF AN ESCHERICHIA COLI COUPLED TRANSCRIPTION- TRANSLATION COMPLEX B3 (TTC-B3) CONTAINING AN MRNA WITH A 24 NT LONG SPACER, TRANSCRIPTION FACTORS NUSA AND NUSG, AND FMET-TRNAS AT P- SITE AND E-SITE organism=? : V : ASP CG A0199 <- 3.88 -> DT C7 50108 : score 2.62942 : x : HIS xxxx A0150 <- 4.29 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0151 <- 3.24 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0175 <- 3.97 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0182 <- 4.20 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 2.75 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.76 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0542 <- 3.54 -> DC xxx 50111 : score x.xxxxx >6x7k_ABE:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators;Translation_proteins_SH3-like_domain;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=CRYO-EM STRUCTURE OF AN ESCHERICHIA COLI COUPLED TRANSCRIPTION- TRANSLATION COMPLEX B3 (TTC-B3) CONTAINING AN MRNA WITH A 24 NT LONG SPACER, TRANSCRIPTION FACTORS NUSA AND NUSG, AND FMET-TRNAS AT P- SITE AND E-SITE organism=? : H : LYS NZ E1170 <- 2.93 -> DG N3 50122 : score 1.41605 : V : ASP CG A0199 <- 3.88 -> DT C7 50108 : score 2.62942 : x : HIS xxxx A0150 <- 4.29 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0151 <- 3.24 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0175 <- 3.97 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0182 <- 4.20 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 2.75 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.76 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0542 <- 3.54 -> DC xxx 50111 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0015 <- 4.21 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0046 <- 3.08 -> DC xxx 50097 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0255 <- 3.61 -> DC xxx 60023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0271 <- 2.92 -> DT xxx 50101 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0274 <- 4.21 -> DA xxx 50100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0314 <- 3.62 -> DA xxx 50103 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0317 <- 4.50 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0352 <- 4.09 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0426 <- 4.03 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0427 <- 3.76 -> DC xxx 60015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0790 <- 3.45 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0791 <- 3.75 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx >6x9i_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=HUMAN DNMT1(729-1600) BOUND TO ZEBULARINE-CONTAINING 12MER DSDNA organism=Homo sapiens : w : GLU OE2 A1531 <- 6.31 -> DG N7 D0020 : score 2.669 : H : LYS NZ A1535 <- 3.16 -> DG O6 D0017 : score 5.36455 : x : MET xxxx A1232 <- 3.62 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1234 <- 3.66 -> DG xxx D0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1235 <- 3.60 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1236 <- 4.46 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A1499 <- 4.42 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1507 <- 4.00 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1508 <- 4.32 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1533 <- 3.35 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >6x9j_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=HUMAN DNMT1(729-1600) BOUND TO ZEBULARINE-CONTAINING 12MER DSDNA AND INHIBITOR GSK3830052 organism=Homo sapiens : x : CYS xxxx A1499 <- 4.16 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1507 <- 3.14 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1508 <- 4.22 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1533 <- 3.99 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1535 <- 3.72 -> DG xxx D0019 : score x.xxxxx >6x9k_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=HUMAN DNMT1(729-1600) BOUND TO ZEBULARINE-CONTAINING 12MER DSDNA AND INHIBITOR GSK3685032A organism=Homo sapiens : w : HIS ND1 A1507 <- 6.34 -> DG O6 C0007 : score 4.006 : x : CYS xxxx A1499 <- 4.39 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1508 <- 4.40 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1533 <- 3.51 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1535 <- 4.22 -> DG xxx D0019 : score x.xxxxx >6x9q_ABE:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators;Translation_proteins_SH3-like_domain;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=CRYO-EM STRUCTURE OF AN ESCHERICHIA COLI COUPLED TRANSCRIPTION- TRANSLATION COMPLEX B3 (TTC-B3) CONTAINING AN MRNA WITH A 27 NT LONG SPACER, TRANSCRIPTION FACTORS NUSA AND NUSG, AND FMET-TRNAS AT P- SITE AND E-SITE organism=? : H : LYS NZ E1170 <- 2.93 -> DG N3 50122 : score 1.41605 : V : ASP CG A0199 <- 3.88 -> DT C7 50108 : score 2.62942 : x : HIS xxxx A0150 <- 4.29 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0151 <- 3.24 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0175 <- 3.97 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0182 <- 4.20 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 2.75 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.76 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0542 <- 3.54 -> DC xxx 50111 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0015 <- 4.21 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0046 <- 3.08 -> DC xxx 50097 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0255 <- 3.62 -> DC xxx 60023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0271 <- 2.92 -> DT xxx 50101 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0274 <- 4.21 -> DA xxx 50100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0314 <- 3.62 -> DA xxx 50103 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0317 <- 4.50 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0352 <- 4.09 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0426 <- 4.03 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0427 <- 3.77 -> DC xxx 60015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0790 <- 3.45 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0791 <- 3.75 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx >6x9q_B:N-utilization_substance_G_protein_NusG,_N-terminal_domain;Translation_proteins_SH3-like_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF AN ESCHERICHIA COLI COUPLED TRANSCRIPTION- TRANSLATION COMPLEX B3 (TTC-B3) CONTAINING AN MRNA WITH A 27 NT LONG SPACER, TRANSCRIPTION FACTORS NUSA AND NUSG, AND FMET-TRNAS AT P- SITE AND E-SITE organism=? : x : PHE xxxx B0015 <- 4.21 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx >6xas_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF E. COLI RHO-DEPENDENT TRANSCRIPTION PRE- TERMINATION COMPLEX organism=? : x : ASP xxxx B0060 <- 3.38 -> DG xxx N0001 : score x.xxxxx >6xas_BIJ:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators;Translation_proteins_SH3-like_domain;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=CRYOEM STRUCTURE OF E. COLI RHO-DEPENDENT TRANSCRIPTION PRE- TERMINATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : GLU xxxx I0541 <- 3.54 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.31 -> DA xxx N0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0270 <- 3.73 -> DT xxx N0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0314 <- 3.52 -> DT xxx N0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0322 <- 3.87 -> DC xxx T0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 3.89 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.37 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 4.10 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.51 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0795 <- 3.07 -> DG xxx T0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0060 <- 3.38 -> DG xxx N0001 : score x.xxxxx >6xav_BIJL: title=CRYOEM STRUCTURE OF E. COLI RHO-DEPENDENT TRANSCRIPTION PRE- TERMINATION COMPLEX BOUND WITH NUSG organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : H : ARG NH2 J0314 <- 2.72 -> DT O2 N0011 : score 4.30107 : V : PHE CD1 L0015 <- 3.59 -> DT C7 N0009 : score 4.36868 : x : PRO xxxx I0372 <- 3.55 -> DC xxx N0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0270 <- 3.74 -> DT xxx N0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0312 <- 3.43 -> DT xxx N0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 3.81 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.26 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.80 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0795 <- 4.08 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx >6xbu_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=POLYMERASE DOMAIN OF POLYMERASE-THETA organism=HOMO SAPIENS : x : LYS xxxx A2209 <- 3.64 -> DA xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A2251 <- 3.56 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A2474 <- 3.63 -> DG xxx F0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A2539 <- 4.35 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx >6xdq_ABE:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators;Translation_proteins_SH3-like_domain;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=CRYO-EM STRUCTURE OF AN ESCHERICHIA COLI COUPLED TRANSCRIPTION- TRANSLATION COMPLEX B3 (TTC-B3) CONTAINING AN MRNA WITH A 30 NT LONG SPACER, TRANSCRIPTION FACTORS NUSA AND NUSG, AND FMET-TRNAS AT P- SITE AND E-SITE organism=? : H : LYS NZ E1170 <- 2.93 -> DG N3 50122 : score 1.41605 : V : ASP CG A0199 <- 3.88 -> DT C7 50108 : score 2.62942 : x : HIS xxxx A0150 <- 4.29 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0151 <- 3.24 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0175 <- 3.97 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0182 <- 4.20 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 2.75 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.76 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0542 <- 3.54 -> DC xxx 50111 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0015 <- 4.21 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0046 <- 3.08 -> DC xxx 50097 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0255 <- 3.61 -> DC xxx 60023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0271 <- 2.92 -> DT xxx 50101 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0274 <- 4.21 -> DA xxx 50100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0314 <- 3.62 -> DA xxx 50103 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0317 <- 4.50 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0352 <- 4.09 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0426 <- 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>6xdr_ABE:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators;Translation_proteins_SH3-like_domain;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=ESCHERICHIA COLI TRANSCRIPTION-TRANSLATION COMPLEX B (TTC-B) CONTAINING AN 27 NT LONG MRNA SPACER, NUSG, AND FMET-TRNAS AT E-SITE AND P-SITE organism=? : V : ASP CG A0199 <- 3.85 -> DT C7 50108 : score 2.64954 : x : HIS xxxx A0150 <- 4.28 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0151 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>6xgf_ABE:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators;Translation_proteins_SH3-like_domain;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=ESCHERICHIA COLI TRANSCRIPTION-TRANSLATION COMPLEX B (TTC-B) CONTAINING AN 30 NT LONG MRNA SPACER, NUSG, AND FMET-TRNAS AT E-SITE AND P-SITE organism=? : V : ASP CG A0199 <- 3.85 -> DT C7 50108 : score 2.64954 : x : HIS xxxx A0150 <- 4.28 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0151 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>6xgw_A:Ribonuclease_H-like; title=ISCTH4 TRANSPOSASE, PRE-REACTION COMPLEX, PRC organism=? : H : TYR OH A0059 <- 2.42 -> DA N3 E0031 : score 4.46678 : H : ARG NH1 A0091 <- 2.99 -> DT O4 E0026 : score 3.14377 : H : ARG NH1 A0093 <- 2.85 -> DG O6 E0027 : score 6.0225 : H : ARG NH1 A0127 <- 3.28 -> DG N7 E0013 : score 5.4692 : H : ARG NH1 A0127 <- 3.10 -> DG O6 E0013 : score 5.71833 : V : ALA CB A0143 <- 3.70 -> DT C7 E0014 : score 5.73895 : V : TYR CB A0069 <- 3.58 -> DT C7 D0004 : score 5.1365 : V : GLU CB A0144 <- 3.88 -> DT C7 D0016 : score 1.59514 : x : ASN xxxx A0071 <- 3.13 -> DT xxx E0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0074 <- 3.44 -> DT xxx E0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0105 <- 3.47 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0107 <- 3.99 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0126 <- 3.64 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0142 <- 4.02 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0147 <- 4.02 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx 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>6xh8_CDFGH:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CUER-TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX WITH RNA TRANSCRIPT organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NE C0175 <- 2.68 -> DT O4 10077 : score 1.90359 : H : ARG NH2 C0175 <- 2.41 -> DT O4 10077 : score 3.83105 : H : ARG NH1 C0394 <- 2.74 -> DG O6 10073 : score 6.15633 : H : THR OG1 D0790 <- 2.85 -> DA N7 20012 : score 3.37996 : H : GLN NE2 F0437 <- 2.52 -> DA N7 20026 : score 6.43077 : H : HIS NE2 F0455 <- 3.02 -> 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>6xij_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=ESCHERICHIA COLI TRANSCRIPTION-TRANSLATION COMPLEX A (TTC-A) CONTAINING AN 24 NT LONG MRNA SPACER, NUSG, AND FMET-TRNAS AT E-SITE AND P-SITE organism=? : V : ASP CG A0199 <- 3.86 -> DT C7 50108 : score 2.64283 : x : ARG xxxx A0151 <- 3.54 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0175 <- 4.09 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 2.43 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.45 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0542 <- 4.19 -> DC xxx 50111 : score x.xxxxx 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3.54 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0175 <- 4.09 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 2.43 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.45 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0542 <- 4.19 -> DC xxx 50111 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0015 <- 4.08 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0046 <- 3.08 -> DC xxx 50097 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0255 <- 3.61 -> DC xxx 60023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0271 <- 2.92 -> DT xxx 50101 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0274 <- 4.21 -> DA xxx 50100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0314 <- 3.62 -> DA xxx 50103 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0317 <- 4.50 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0352 <- 4.09 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0426 <- 4.03 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0427 <- 3.77 -> DC xxx 60015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0790 <- 3.45 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0791 <- 3.75 -> DT xxx 60014 : 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>6xl9_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ECMRR-RNAP-PROMOTER INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX WITH 3-NT RNA TRANSCRIPT (ECMRR-RPITC-3NT) organism=? : H : ARG NE F0584 <- 2.94 -> DG N7 T0047 : score 4.29798 : H : ARG NH2 F0584 <- 2.77 -> DG N7 T0047 : score 6.42292 : V : THR CG2 F0583 <- 3.76 -> DT C7 N0038 : score 4.27929 : x : VAL xxxx F0098 <- 4.04 -> DT xxx N0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.94 -> DT xxx N0070 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.72 -> DT xxx N0070 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 4.19 -> DT xxx N0068 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 3.25 -> DT xxx N0068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0385 <- 3.41 -> DT xxx N0068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 4.06 -> DT xxx N0068 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0396 <- 4.13 -> DC xxx T0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0401 <- 4.09 -> DT xxx N0070 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 4.03 -> 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>6xlj_CDFGH:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ECMRR-RNAP-PROMOTER INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX WITH 4-NT RNA TRANSCRIPT (ECMRR-RPITC-4NT) organism=ESCHERICHIA COLI O157:H7 : H : ARG NE C0465 <- 2.75 -> DG O6 N0073 : score 3.98044 : H : SER OG C0508 <- 2.51 -> DA N6 T0022 : score 3.48055 : H : ARG NH1 D0259 <- 2.31 -> DC O2 T0020 : score 4.0077 : H : ARG NH1 F0584 <- 2.78 -> DG N7 T0047 : score 6.0742 : H : TYR OH G0038 <- 2.97 -> 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organism=? : H : TYR OH G0038 <- 2.97 -> DG N2 N0060 : score 4.72349 : x : LYS xxxx G0016 <- 3.34 -> DG xxx N0055 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0019 <- 3.48 -> DT xxx T0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0020 <- 3.41 -> DA xxx N0052 : score x.xxxxx >6xlk_G:Putative_DNA-binding_domain;Probable_bacterial_effector-binding_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ECMRR-DNA COMPLEX IN ECMRR-RPITC-4NT organism=ESCHERICHIA COLI : H : TYR OH G0038 <- 2.84 -> DG N2 N0060 : score 4.85063 : x : LYS xxxx G0016 <- 3.28 -> DG xxx N0056 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0019 <- 3.42 -> DT xxx T0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0020 <- 3.34 -> DA xxx N0052 : score x.xxxxx >6xlk_GH: title=CRYO-EM STRUCTURE OF ECMRR-DNA COMPLEX IN ECMRR-RPITC-4NT organism=ESCHERICHIA COLI : H : TYR OH G0038 <- 2.84 -> DG N2 N0060 : score 4.85063 : H : LYS NZ H0016 <- 3.13 -> DG O6 T0043 : score 5.39924 : x : LYS xxxx G0016 <- 3.28 -> DG xxx N0056 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0019 <- 3.42 -> DT xxx T0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0020 <- 3.34 -> DA xxx N0052 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0019 <- 3.56 -> DT xxx N0045 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0020 <- 3.34 -> DA xxx T0039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0038 <- 3.32 -> DG xxx T0047 : score x.xxxxx >6xll_CDF: title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI RNAP-PROMOTER INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX WITH 5-NT RNA TRANSCRIPT (RPITC-5NT) organism=ESCHERICHIA COLI O157:H7 : H : ASP OD2 C0199 <- 2.82 -> DG N2 N0076 : score 5.43714 : H : GLN NE2 F0589 <- 3.35 -> DG N7 N0040 : score 3.73686 : V : GLN CG F0437 <- 3.80 -> DT C7 N0062 : score 3.25538 : V : TRP CD2 F0434 <- 3.51 -> DT C7 N0063 : score 5.8949 : V : ARG CZ C0542 <- 3.88 -> DT C7 N0079 : score 2.08966 : x : SER xxxx C0182 <- 4.17 -> DG xxx N0076 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.72 -> DT xxx N0077 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.31 -> DG xxx N0071 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 3.40 -> DG xxx N0069 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0375 <- 4.30 -> DG xxx N0069 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0539 <- 4.01 -> DC xxx N0078 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0255 <- 4.38 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0256 <- 3.82 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0259 <- 4.10 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0352 <- 3.93 -> DC xxx T0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.45 -> DG xxx T0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.29 -> DG xxx T0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.55 -> DG xxx T0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0096 <- 4.02 -> DT xxx N0070 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.69 -> DT xxx N0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.69 -> DG xxx N0071 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.81 -> DG xxx N0069 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 4.08 -> DG xxx N0069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0385 <- 3.70 -> DG xxx N0069 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0401 <- 4.32 -> DT xxx N0070 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 3.87 -> DA xxx N0064 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 2.63 -> DA xxx N0064 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 3.72 -> DA xxx N0064 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.49 -> DA xxx N0066 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.85 -> DA xxx N0064 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.17 -> DT xxx N0063 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 4.24 -> DA xxx T0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0441 <- 3.38 -> DT xxx N0061 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0455 <- 3.71 -> DG xxx N0058 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0458 <- 3.81 -> DA xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0505 <- 3.33 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0511 <- 3.25 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0514 <- 3.81 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0519 <- 4.17 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0522 <- 4.34 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0584 <- 3.13 -> DG xxx T0045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0585 <- 2.94 -> DC xxx N0042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0586 <- 3.48 -> DT xxx N0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0588 <- 3.14 -> DG xxx T0046 : score x.xxxxx >6xll_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI RNAP-PROMOTER INITIAL TRANSCRIBING COMPLEX WITH 5-NT RNA TRANSCRIPT (RPITC-5NT) organism=? : x : LEU xxxx D0255 <- 4.38 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0256 <- 3.82 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0259 <- 4.10 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0352 <- 3.93 -> DC xxx T0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.45 -> DG xxx T0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.29 -> DG xxx T0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.55 -> DG xxx T0011 : score x.xxxxx >6xlm_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF E.COLI RNAP-DNA ELONGATION COMPLEX 1 (RDE1) IN ECMRR-DEPENDENT TRANSCRIPTION organism=? : x : GLU xxxx C0541 <- 3.63 -> DG xxx N0083 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.29 -> DG xxx N0083 : score x.xxxxx >6xlm_CD: title=CRYO-EM STRUCTURE OF E.COLI RNAP-DNA ELONGATION COMPLEX 1 (RDE1) IN ECMRR-DEPENDENT TRANSCRIPTION organism=ESCHERICHIA COLI O157:H7 : x : GLU xxxx C0541 <- 3.63 -> DG xxx N0083 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.29 -> DG xxx N0083 : score x.xxxxx >6xln_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI RNAP-DNA ELONGATION COMPLEX 2 (RDE2) IN ECMRR-DEPENDENT TRANSCRIPTION organism=? : x : ARG xxxx C0542 <- 3.68 -> DG xxx N0083 : score x.xxxxx >6xln_CD: title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI RNAP-DNA ELONGATION COMPLEX 2 (RDE2) IN ECMRR-DEPENDENT TRANSCRIPTION organism=ESCHERICHIA COLI O157:H7 : x : ARG xxxx C0542 <- 3.68 -> DG xxx N0083 : score x.xxxxx >6xnx_B:Galactose_oxidase,_central_domain; title=STRUCTURE OF RAG1 (R848M/E649V)-RAG2-DNA STRAND TRANSFER COMPLEX (DYNAMIC-FORM) organism=MUS MUSCULUS : x : LYS xxxx B0118 <- 3.86 -> DG xxx I0006 : score x.xxxxx >6xnz_A: title=STRUCTURE OF RAG1 (R848M/E649V)-RAG2-DNA TARGET CAPTURE COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : H : ASP OD1 A0600 <- 2.35 -> DC N4 J0017 : score 5.82591 : H : ASP OD2 A0708 <- 2.62 -> DC N4 J0017 : score 6.4232 : H : HIS NE2 A0795 <- 3.02 -> DC N3 J0017 : score -5.78257 : x : ASP xxxx A0604 <- 4.32 -> DG xxx J0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0662 <- 3.87 -> DC xxx J0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0721 <- 4.13 -> DA xxx J0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0806 <- 3.67 -> DT xxx J0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0847 <- 3.30 -> DC xxx I0020 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0848 <- 3.11 -> DC xxx J0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0962 <- 3.36 -> DC xxx J0017 : score x.xxxxx >6xnz_AC:Galactose_oxidase,_central_domain; title=STRUCTURE OF RAG1 (R848M/E649V)-RAG2-DNA TARGET CAPTURE COMPLEX organism=? : H : ASP OD1 A0600 <- 2.35 -> DC N4 J0017 : score 5.82591 : H : ASP OD2 A0708 <- 2.62 -> DC N4 J0017 : score 6.4232 : H : HIS NE2 A0795 <- 3.02 -> DC N3 J0017 : score -5.78257 : H : ASP OD1 C0600 <- 2.20 -> DC N4 I0017 : score 5.98626 : H : MET SD C0847 <- 3.05 -> DC N4 J0020 : score -8.65596 : x : ASP xxxx A0604 <- 4.32 -> DG xxx J0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0662 <- 3.87 -> DC xxx J0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0721 <- 4.13 -> DA xxx J0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0806 <- 3.67 -> DT xxx J0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0847 <- 3.30 -> DC xxx I0020 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0848 <- 3.11 -> DC xxx J0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0962 <- 3.36 -> DC xxx J0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0708 <- 3.05 -> DC xxx I0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0721 <- 4.04 -> DT xxx I0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0795 <- 3.10 -> DC xxx I0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0848 <- 2.95 -> DC xxx I0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0962 <- 3.27 -> DC xxx I0017 : score x.xxxxx >6xnz_BD:Galactose_oxidase,_central_domain; title=STRUCTURE OF RAG1 (R848M/E649V)-RAG2-DNA TARGET CAPTURE COMPLEX organism=MUS MUSCULUS : x : SER xxxx B0040 <- 4.22 -> DC xxx I0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0336 <- 3.85 -> DC xxx J0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0337 <- 3.06 -> DC xxx J0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0340 <- 4.43 -> DC xxx J0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0336 <- 3.31 -> DG xxx I0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0338 <- 3.77 -> DC xxx I0020 : score x.xxxxx >6xtx_234567: title=CRYOEM STRUCTURE OF HUMAN CMG BOUND TO ATPGAMMAS AND DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 50420 <- 2.76 -> DT O2 M0010 : score 4.2672 : H : ARG NH1 70420 <- 2.44 -> DT O2 M0006 : score 4.61647 : H : ARG NH2 70420 <- 2.93 -> DT O2 M0006 : score 4.12327 : x : ARG xxxx 20562 <- 3.28 -> DT xxx M0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx 20569 <- 3.79 -> DT xxx M0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx 40556 <- 4.15 -> DT xxx M0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 60435 <- 3.57 -> DT xxx M0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx 60442 <- 3.80 -> DT xxx M0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx 60487 <- 4.17 -> DT xxx M0002 : score x.xxxxx >6xu0_A:Ribonuclease_H-like; title=ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS ARGONAUTE PROTEIN WITH DNA OLIGODUPLEX 5'- PATCGTGGCCACGAT organism=? : w : ARG NH2 A0383 <- 6.26 -> DA N3 S0013 : score 2.092 : V : ILE CG1 A0143 <- 3.79 -> DT C7 R0002 : score 4.97137 : x : ASN xxxx A0148 <- 3.61 -> DA xxx S0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0151 <- 3.69 -> DA xxx S0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0152 <- 3.23 -> DT xxx R0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0155 <- 3.20 -> DT xxx R0002 : score x.xxxxx >6xup_A:Ribonuclease_H-like; title=ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS ARGONAUTE PROTEIN WITH DNA OLIGODUPLEX 5'- PATCGTGGCCACGAT organism=ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS : w : ASN ND2 A0148 <- 5.97 -> DT O4 R0002 : score 3.275 A : w : ARG NH1 A0383 <- 5.90 -> DA N3 S0013 : score 2.585 : V : ILE CG2 A0143 <- 3.65 -> DT C7 R0002 : score 7.3572 : x : PHE xxxx A0151 <- 3.68 -> DA xxx S0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0152 <- 3.19 -> DT xxx R0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0155 <- 3.20 -> DT xxx R0002 : score x.xxxxx >6xwg_C:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN RXR/RAR DNA-BINDING DOMAIN HETERODIMER BOUND TO THE HUMAN RARB2 DR5 RESPONSE ELEMENT organism=? : H : LYS NZ C0156 <- 2.96 -> DG O6 A0004 : score 5.59578 : H : ARG NH1 C0161 <- 3.04 -> DG N7 B0015 : score 5.7596 : x : GLU xxxx C0153 <- 3.42 -> DA xxx B0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0160 <- 3.46 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx >6xwg_CD:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN RXR/RAR DNA-BINDING DOMAIN HETERODIMER BOUND TO THE HUMAN RARB2 DR5 RESPONSE ELEMENT organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ C0156 <- 2.96 -> DG O6 A0004 : score 5.59578 : H : ARG NH1 C0161 <- 3.04 -> DG N7 B0015 : score 5.7596 : H : GLU OE1 D0106 <- 3.28 -> DA N6 B0006 : score 2.42457 : H : LYS NZ D0109 <- 2.80 -> DG O6 A0015 : score 5.78077 : x : GLU xxxx C0153 <- 3.42 -> DA xxx B0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0160 <- 3.46 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0113 <- 3.75 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0114 <- 3.40 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx >6xwh_C:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN RXR DNA-BINDING DOMAIN HOMODIMER BOUND TO THE HUMAN HOXB13 DR0 RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 C0153 <- 3.01 -> DC N4 B0012 : score 5.52569 : w : GLU OE1 C0153 <- 5.50 -> DA N6 B0011 : score 2.939 : H : LYS NZ C0156 <- 2.78 -> DG O6 A0004 : score 5.80389 : H : LYS NZ C0160 <- 3.24 -> DG N7 A0005 : score 4.91194 : H : ARG NH1 C0161 <- 2.95 -> DG N7 B0010 : score 5.8685 : w : ARG NH1 C0161 <- 5.50 -> DG O6 B0010 : score 2.756 : w : ARG NH1 C0209 <- 6.07 -> DT O2 B0014 : score 1.855 >6xwh_CD:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN RXR DNA-BINDING DOMAIN HOMODIMER BOUND TO THE HUMAN HOXB13 DR0 RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 C0153 <- 3.01 -> DC N4 B0012 : score 5.52569 : w : GLU OE1 C0153 <- 5.50 -> DA N6 B0011 : score 2.939 : H : LYS NZ C0156 <- 2.78 -> DG O6 A0004 : score 5.80389 : H : LYS NZ C0160 <- 3.24 -> DG N7 A0005 : score 4.91194 : H : ARG NH1 C0161 <- 2.95 -> DG N7 B0010 : score 5.8685 : w : ARG NH1 C0209 <- 6.07 -> DT O2 B0014 : score 1.855 : H : GLU OE1 D0153 <- 2.88 -> DC N4 B0006 : score 5.67566 : H : ARG NH1 D0161 <- 2.80 -> DG N7 B0004 : score 6.05 : x : LYS xxxx D0156 <- 3.97 -> DG xxx A0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0160 <- 3.72 -> DG xxx A0011 : score x.xxxxx >6y35_A: title=CCAAT-BINDING COMPLEX FROM ASPERGILLUS FUMIGATUS WITH CYCA DNA organism=? : H : ARG NH1 A0272 <- 2.95 -> DC O2 E0013 : score 3.5405 : H : ARG NH2 A0272 <- 3.02 -> DC O2 E0013 : score 3.53597 : H : HIS NE2 A0275 <- 2.77 -> DA N3 E0011 : score 4.27163 : H : ARG NH1 A0279 <- 2.80 -> DA N3 E0010 : score 3.68205 : H : ARG NH1 A0281 <- 3.11 -> DG N3 D0019 : score 2.86331 : x : ARG xxxx A0286 <- 3.76 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0287 <- 3.25 -> DG xxx D0019 : score x.xxxxx >6y35_ABC:Histone-fold;Leucine_zipper_domain; title=CCAAT-BINDING COMPLEX FROM ASPERGILLUS FUMIGATUS WITH CYCA DNA organism=ASPERGILLUS FUMIGATUS A1163 : H : ARG NH1 A0272 <- 2.95 -> DC O2 E0013 : score 3.5405 : H : ARG NH2 A0272 <- 3.02 -> DC O2 E0013 : score 3.53597 : H : HIS NE2 A0275 <- 2.77 -> DA N3 E0011 : score 4.27163 : H : ARG NH1 A0279 <- 2.80 -> DA N3 E0010 : score 3.68205 : H : ARG NH1 A0281 <- 3.11 -> DG N3 D0019 : score 2.86331 : x : ARG xxxx A0286 <- 3.76 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0287 <- 3.25 -> DG xxx D0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0049 <- 4.19 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0090 <- 4.35 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx >6y36_A: title=CCAAT-BINDING COMPLEX FROM ASPERGILLUS FUMIGATUS WITH CCCA DNA organism=? : H : ARG NH1 A0272 <- 2.88 -> DC O2 E0013 : score 3.5916 : H : ARG NH2 A0272 <- 2.61 -> DC O2 E0013 : score 3.83927 : H : HIS NE2 A0275 <- 3.16 -> DA N3 E0011 : score 3.94043 : H : ARG NH1 A0279 <- 3.01 -> DA N3 E0010 : score 3.52741 : H : ARG NH1 A0281 <- 3.20 -> DG N3 D0019 : score 2.80836 : x : ALA xxxx A0276 <- 4.19 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0286 <- 3.77 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0287 <- 3.27 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx >6y36_ABC:Histone-fold;Leucine_zipper_domain; title=CCAAT-BINDING COMPLEX FROM ASPERGILLUS FUMIGATUS WITH CCCA DNA organism=ASPERGILLUS FUMIGATUS A1163 : H : ARG NH1 A0272 <- 2.88 -> DC O2 E0013 : score 3.5916 : H : ARG NH2 A0272 <- 2.61 -> DC O2 E0013 : score 3.83927 : H : HIS NE2 A0275 <- 3.16 -> DA N3 E0011 : score 3.94043 : H : ARG NH1 A0279 <- 3.01 -> DA N3 E0010 : score 3.52741 : H : ARG NH1 A0281 <- 3.20 -> DG N3 D0019 : score 2.80836 : x : ALA xxxx A0276 <- 4.19 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0286 <- 3.77 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0287 <- 3.27 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0049 <- 4.13 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx >6y37_ABC:Histone-fold;Leucine_zipper_domain; title=CCAAT-BINDING COMPLEX FROM ASPERGILLUS NIDULANS WITH CCCA DNA organism=ASPERGILLUS NIDULANS FGSC A4 : H : ARG NH1 A0273 <- 2.94 -> DC O2 E0013 : score 3.5478 : H : ARG NH2 A0273 <- 2.78 -> DC O2 E0013 : score 3.71351 : H : HIS NE2 A0276 <- 3.20 -> DA N3 E0011 : score 3.90646 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.91 -> DA N3 E0010 : score 3.60105 : w : ARG NH1 A0280 <- 6.18 -> DT O2 D0018 : score 1.855 : H : ARG NH1 A0282 <- 2.82 -> DG N3 D0019 : score 3.04035 : x : ALA xxxx A0277 <- 4.44 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0287 <- 3.59 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0288 <- 3.19 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0051 <- 4.06 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx >6y37_B:Histone-fold; title=CCAAT-BINDING COMPLEX FROM ASPERGILLUS NIDULANS WITH CCCA DNA organism=? : x : ALA xxxx B0051 <- 4.06 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx >6y39_BCEFHI:Histone-fold; title=HAPE-P88L MUTANT CCAAT-BINDING COMPLEX FROM ASPERGILLUS NIDULANS WITH CYCA DNA organism=ASPERGILLUS NIDULANS FGSC A4 : x : LYS xxxx H0066 <- 3.31 -> DT xxx K0019 : score x.xxxxx >6y42_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RSRR COMPLEXED TO A 39 BASEPAIR DNA FRAGMENT OF THE RSRR PROMOTER organism=? : H : SER OG A0038 <- 2.57 -> DC N4 F0026 : score 3.84472 : H : SER OG B0038 <- 2.81 -> DC N4 E0026 : score 3.66829 : x : TYR xxxx A0039 <- 3.28 -> DA xxx F0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0042 <- 4.21 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0045 <- 3.37 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0057 <- 3.26 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0059 <- 3.47 -> DA xxx F0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0039 <- 3.38 -> DG xxx E0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0042 <- 3.72 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0045 <- 2.80 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0049 <- 4.36 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0057 <- 3.45 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx >6y42_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RSRR COMPLEXED TO A 39 BASEPAIR DNA FRAGMENT OF THE RSRR PROMOTER organism=? : H : SER OG B0038 <- 2.81 -> DC N4 E0026 : score 3.66829 : V : TYR CB B0039 <- 3.68 -> DT C7 E0025 : score 5.01478 : x : LYS xxxx B0042 <- 3.72 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0045 <- 2.80 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0049 <- 4.36 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0057 <- 3.45 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx >6y5d_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF HUMAN CGAS (K394E) BOUND TO THE NUCLEOSOME organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0041 <- 2.85 -> DT O2 J0086 : score 4.191 : H : ARG NH1 C0012 <- 2.80 -> DT O2 I0035 : score 4.30641 : H : ARG NH2 E0041 <- 3.13 -> DG N3 I0086 : score 3.37198 : H : ARG NH1 G0012 <- 2.88 -> DT O2 I0120 : score 4.23751 : H : ARG NH2 G0012 <- 3.23 -> DC O2 I0121 : score 3.38063 : x : TYR xxxx A0042 <- 3.55 -> DT xxx J0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 3.80 -> DG xxx J0115 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0034 <- 3.52 -> DC xxx J0126 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0040 <- 3.89 -> DT xxx J0146 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0042 <- 4.19 -> DG xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0084 <- 3.98 -> DT xxx J0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0034 <- 4.26 -> DG xxx I0125 : score x.xxxxx >6y5d_H:Histone-fold; title=STRUCTURE OF HUMAN CGAS (K394E) BOUND TO THE NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx H0034 <- 4.26 -> DG xxx I0125 : score x.xxxxx >6y5d_Q:Histone-fold; title=STRUCTURE OF HUMAN CGAS (K394E) BOUND TO THE NUCLEOSOME organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 Q0041 <- 3.22 -> DG N3 U0086 : score 2.79615 : H : ARG NH2 Q0041 <- 3.09 -> DG N3 U0086 : score 3.40086 >6y5e_A:Histone-fold; title=STRUCTURE OF HUMAN CGAS (K394E) BOUND TO THE NUCLEOSOME (FOCUSED REFINEMENT OF CGAS-NCP SUBCOMPLEX) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0041 <- 2.84 -> DT O2 J0086 : score 4.19947 : x : HIS xxxx A0040 <- 4.45 -> DG xxx J0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0042 <- 4.13 -> DT xxx J0010 : score x.xxxxx >6y5e_ABCDEFGH: title=STRUCTURE OF HUMAN CGAS (K394E) BOUND TO THE NUCLEOSOME (FOCUSED REFINEMENT OF CGAS-NCP SUBCOMPLEX) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0041 <- 2.84 -> DT O2 J0086 : score 4.19947 : H : ARG NH1 C0012 <- 3.15 -> DT O2 I0035 : score 4.00496 : H : ARG NH2 E0041 <- 3.22 -> DG N3 I0086 : score 3.30699 : H : ARG NH1 G0012 <- 2.70 -> DT O2 I0120 : score 4.39254 : H : ARG NH2 G0012 <- 3.25 -> DC O2 I0121 : score 3.36583 : x : HIS xxxx A0040 <- 4.45 -> DG xxx J0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0042 <- 4.13 -> DT xxx J0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0042 <- 4.11 -> DG xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0084 <- 3.94 -> DT xxx J0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0034 <- 3.52 -> DC xxx J0030 : score x.xxxxx >6y93_AB:KorB_DNA-binding_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA-BINDING DOMAIN OF THE NUCLEOID OCCLUSION FACTOR (NOC) COMPLEXED TO THE NOC-BINDING SITE (NBS) organism=Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) : H : GLN OE1 A0158 <- 2.95 -> DA N6 C0005 : score 5.87099 : H : GLN NE2 A0158 <- 2.71 -> DA N7 C0005 : score 6.19936 : H : SER OG A0159 <- 2.53 -> DA N6 D0016 : score 3.46739 : H : ASN ND2 A0163 <- 3.11 -> DT O4 C0007 : score 4.95697 : H : ARG NE A0186 <- 2.85 -> DG N7 D0013 : score 4.37758 : H : ARG NH1 A0186 <- 3.33 -> DG O6 D0013 : score 5.4385 : H : ARG NH1 A0189 <- 3.19 -> DG N7 D0014 : score 5.5781 : H : ARG NH2 A0189 <- 2.88 -> DT O4 C0008 : score 3.49698 : H : GLN OE1 B0158 <- 3.05 -> DA N6 D0005 : score 5.74994 : H : GLN NE2 B0158 <- 2.83 -> DA N7 D0005 : score 6.05321 : H : SER OG B0159 <- 2.55 -> DA N6 C0016 : score 3.45423 : H : ASN ND2 B0163 <- 3.12 -> DT O4 D0007 : score 4.9464 : H : ARG NE B0186 <- 2.72 -> DG N7 C0013 : score 4.49254 : H : ARG NH1 B0189 <- 2.97 -> DG N7 C0014 : score 5.8443 : H : ARG NH2 B0189 <- 3.30 -> DG O6 C0014 : score 5.94 : V : ALA CB B0162 <- 3.51 -> DT C7 D0006 : score 6.0049 : x : THR xxxx A0160 <- 3.45 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0162 <- 3.44 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0166 <- 3.28 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0218 <- 4.49 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0160 <- 3.36 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0166 <- 3.30 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >6y93_B:KorB_DNA-binding_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA-BINDING DOMAIN OF THE NUCLEOID OCCLUSION FACTOR (NOC) COMPLEXED TO THE NOC-BINDING SITE (NBS) organism=Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) : H : GLN OE1 B0158 <- 3.05 -> DA N6 D0005 : score 5.74994 : H : GLN NE2 B0158 <- 2.83 -> DA N7 D0005 : score 6.05321 : H : SER OG B0159 <- 2.55 -> DA N6 C0016 : score 3.45423 : H : ASN ND2 B0163 <- 3.12 -> DT O4 D0007 : score 4.9464 : H : ARG NE B0186 <- 2.72 -> DG N7 C0013 : score 4.49254 : H : ARG NH1 B0189 <- 2.97 -> DG N7 C0014 : score 5.8443 : H : ARG NH2 B0189 <- 3.30 -> DG O6 C0014 : score 5.94 : V : ALA CB B0162 <- 3.51 -> DT C7 D0006 : score 6.0049 : x : THR xxxx B0160 <- 3.36 -> DA xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0166 <- 3.30 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >6ycq_A:DNA-binding_pseudobarrel_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF ARABIDOPSIS THALIANA AUXIN RESPONSE FACTOR 1 (ATARF1) IN COMPLEX WITH HIGH AFFINITY DNA organism=Arabidopsis thaliana : H : HIS NE2 A0136 <- 2.53 -> DG O6 D0006 : score 8.38335 A : w : HIS ND1 A0136 <- 6.35 -> DG O6 C0014 : score 4.006 A : H : ARG NH1 A0181 <- 3.17 -> DG N7 C0017 : score 5.6023 : H : ARG NH1 A0186 <- 3.29 -> DG O6 D0003 : score 5.48717 : H : ARG NH2 A0186 <- 2.87 -> DG O6 D0003 : score 6.5076 : V : PRO CG A0184 <- 3.85 -> DT C7 D0001 : score 6.27949 : x : SER xxxx A0131 <- 3.54 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >6ycq_AB:DNA-binding_pseudobarrel_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF ARABIDOPSIS THALIANA AUXIN RESPONSE FACTOR 1 (ATARF1) IN COMPLEX WITH HIGH AFFINITY DNA organism=Arabidopsis thaliana : H : HIS NE2 A0136 <- 2.53 -> DG O6 D0006 : score 8.38335 A : w : HIS ND1 A0136 <- 6.35 -> DG O6 C0014 : score 4.006 A : H : ARG NH1 A0181 <- 3.17 -> DG N7 C0017 : score 5.6023 : H : ARG NH1 A0186 <- 3.29 -> DG O6 D0003 : score 5.48717 : H : ARG NH2 A0186 <- 2.87 -> DG O6 D0003 : score 6.5076 : H : HIS NE2 B0136 <- 2.70 -> DG O6 C0006 : score 8.11292 : H : ARG NH2 B0181 <- 3.10 -> DG N7 D0017 : score 6.00154 : H : ARG NH1 B0186 <- 2.86 -> DG O6 C0003 : score 6.01033 : V : PRO CG A0184 <- 3.85 -> DT C7 D0001 : score 6.27949 : x : SER xxxx A0131 <- 3.54 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0131 <- 3.51 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0184 <- 3.14 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx >6yl2_A:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURAL AND DNA BINDING STUDIES OF THE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR RV2506 (BKAR) FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS SUPPORTS A ROLE IN L- LEUCINE CATABOLISM organism=Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) : H : ARG NE A0064 <- 2.68 -> DG N7 H0003 : score 4.52792 : H : ARG NH2 A0064 <- 2.74 -> DG O6 H0003 : score 6.6792 : x : PRO xxxx A0060 <- 3.10 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0063 <- 3.27 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx >6yl2_AB:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURAL AND DNA BINDING STUDIES OF THE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR RV2506 (BKAR) FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS SUPPORTS A ROLE IN L- LEUCINE CATABOLISM organism=Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) / Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) : H : ARG NE A0064 <- 2.68 -> DG N7 H0003 : score 4.52792 : H : ARG NH2 A0064 <- 2.74 -> DG O6 H0003 : score 6.6792 : H : ARG NE B0064 <- 3.16 -> DG N7 G0003 : score 4.10343 : H : ARG NH2 B0064 <- 2.80 -> DG O6 G0003 : score 6.6 : x : LEU xxxx B0048 <- 4.04 -> DT xxx H0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0060 <- 3.52 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0061 <- 4.46 -> DT xxx G0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0063 <- 3.47 -> DT xxx H0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0060 <- 3.10 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0063 <- 3.27 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx >6ymg_A: title=VCAM4I RESTRICTION ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH 5MC-MODIFIED DSDNA organism=VIBRIO CAMPBELLII : x : LYS xxxx A0009 <- 3.40 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0128 <- 3.18 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx >6ymv_A:DNA/RNA_polymerases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF YEAST MITOCHONDRIAL RNA POLYMERASE PARTIALLY- MELTED TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX (PMIC) organism=? : V : GLN CG A1129 <- 3.68 -> DT C7 T0026 : score 3.35305 : x : TYR xxxx A0640 <- 3.54 -> DT xxx N0117 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0641 <- 4.28 -> DA xxx T0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0644 <- 3.39 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0645 <- 2.98 -> DT xxx T0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1138 <- 3.44 -> DT xxx T0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1151 <- 2.78 -> DG xxx T0021 : score x.xxxxx >6ymv_AB:DNA/RNA_polymerases;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF YEAST MITOCHONDRIAL RNA POLYMERASE PARTIALLY- MELTED TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX (PMIC) organism=? : H : GLU OE1 B0144 <- 2.52 -> DA N6 N0119 : score 2.83225 : H : GLN OE1 B0149 <- 2.92 -> DG N2 N0120 : score 5.47311 : V : GLN CG A1129 <- 3.68 -> DT C7 T0026 : score 3.35305 : x : TYR xxxx B0018 <- 3.65 -> DT xxx T0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0103 <- 3.22 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0104 <- 3.73 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0105 <- 3.30 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0143 <- 3.38 -> DT xxx N0121 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0146 <- 3.48 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0148 <- 3.24 -> DA xxx N0119 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0334 <- 3.51 -> DA xxx T0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0640 <- 3.54 -> DT xxx N0117 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0641 <- 4.28 -> DA xxx T0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0644 <- 3.39 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0645 <- 2.98 -> DT xxx T0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1138 <- 3.44 -> DT xxx T0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1151 <- 2.78 -> DG xxx T0021 : score x.xxxxx >6ymv_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF YEAST MITOCHONDRIAL RNA POLYMERASE PARTIALLY- MELTED TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX (PMIC) organism=? : H : GLU OE1 B0144 <- 2.52 -> DA N6 N0119 : score 2.83225 : H : GLN OE1 B0149 <- 2.92 -> DG N2 N0120 : score 5.47311 : x : TYR xxxx B0018 <- 3.65 -> DT xxx T0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0103 <- 3.22 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0104 <- 3.73 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0105 <- 3.30 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0143 <- 3.38 -> DT xxx N0121 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0146 <- 3.48 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0148 <- 3.24 -> DA xxx N0119 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0334 <- 3.51 -> DA xxx T0022 : score x.xxxxx >6ymw_AB:DNA/RNA_polymerases;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF YEAST MITOCHONDRIAL RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX organism=? : H : LYS NZ A0645 <- 3.11 -> DT O2 T0026 : score 3.36477 : H : ARG NH1 A1151 <- 3.26 -> DT O2 T0015 : score 3.91022 : H : GLU OE2 B0144 <- 2.79 -> DA N6 N0119 : score 3.05738 : H : GLN OE1 B0149 <- 2.80 -> DG N2 N0120 : score 5.60769 : x : TYR xxxx B0103 <- 3.24 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0104 <- 3.85 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0105 <- 3.07 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0146 <- 3.82 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0148 <- 3.25 -> DA xxx N0119 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0179 <- 4.02 -> DA xxx N0119 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0335 <- 3.67 -> DA xxx N0123 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0339 <- 3.83 -> DC xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0533 <- 3.35 -> DC xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0536 <- 3.58 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0594 <- 3.87 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0640 <- 3.86 -> DT xxx N0117 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0641 <- 3.80 -> DA xxx N0122 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0642 <- 3.27 -> DA xxx N0122 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0644 <- 3.54 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0831 <- 3.43 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1015 <- 3.08 -> DA xxx T0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1019 <- 3.32 -> DA xxx T0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1022 <- 3.89 -> DA xxx T0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A1024 <- 3.88 -> DA xxx T0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A1027 <- 3.04 -> DT xxx T0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1031 <- 4.44 -> DA xxx N0123 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1032 <- 3.83 -> DA xxx T0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1129 <- 3.48 -> DA xxx T0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1138 <- 3.38 -> DT xxx T0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1139 <- 4.32 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1140 <- 4.30 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1159 <- 4.42 -> DA xxx T0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1163 <- 3.33 -> DC xxx T0019 : score x.xxxxx >6ymw_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF YEAST MITOCHONDRIAL RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX organism=? : H : GLU OE2 B0144 <- 2.79 -> DA N6 N0119 : score 3.05738 : H : GLN OE1 B0149 <- 2.80 -> DG N2 N0120 : score 5.60769 : x : TYR xxxx B0103 <- 3.24 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0104 <- 3.85 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0105 <- 3.07 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0146 <- 3.82 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0148 <- 3.25 -> DA xxx N0119 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0179 <- 4.02 -> DA xxx N0119 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0335 <- 3.67 -> DA xxx N0123 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0339 <- 3.83 -> DC xxx T0023 : score x.xxxxx >6yov_C:Histone-fold; title=OCT4-SOX2-BOUND NUCLEOSOME - SHL+6 organism=? : x : ARG xxxx C0043 <- 3.30 -> DG xxx J0113 : score x.xxxxx >6yuf_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=COHESIN COMPLEX WITH LOADER GRIPPING DNA organism=? : x : ALA xxxx A0112 <- 4.09 -> DT xxx Y0035 : score x.xxxxx >6yuf_ACD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;ARM_repeat; title=COHESIN COMPLEX WITH LOADER GRIPPING DNA organism=? : x : ALA xxxx A0112 <- 4.09 -> DT xxx Y0035 : score x.xxxxx >6yww_A:DNA-binding_domain; title=MECP2 IS A MICROSATELLITE BINDING PROTEIN THAT PROTECTS CA REPEATS FROM NUCLEOSOME INVASION organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0133 <- 2.68 -> DT O4 C0032 : score 3.63914 : V : ARG CZ A0111 <- 3.79 -> DT C7 C0032 : score 2.13764 : x : LYS xxxx A0119 <- 3.38 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0121 <- 3.44 -> DT xxx C0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0123 <- 4.10 -> DT xxx C0032 : score x.xxxxx >6z1a_B:Type_II_DNA_topoisomerase; title=TERNARY COMPLEX OF STAPHYLOCOCCUS AUREUS DNA GYRASE WITH AMK12 AND DNA organism=? : w : LYS NZ B0460 <- 5.49 -> DA N3 e0007 : score 1.538 : w : TYR OH B1025 <- 5.51 -> DA N3 h0007 : score 1.448 : w : TYR OH B1025 <- 5.82 -> DA N3 e0007 : score 1.448 : w : SER OG B1085 <- 5.93 -> DA N7 e0007 : score 2.343 : x : ARG xxxx B0458 <- 3.21 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1092 <- 4.47 -> DT xxx e0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1175 <- 3.40 -> DG xxx h0009 : score x.xxxxx >6z8v_H:Trypsin-like_serine_proteases; title=X-RAY STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN HUMAN ALPHA THROMBIN AND A THROMBIN BINDING APTAMER VARIANT (TBA-3L), WHICH CONTAINS 1-BETA-D- LACTOPYRANOSYL RESIDUE IN THE SIDE CHAIN OF THY3 AT N3. organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 H0075 <- 2.99 -> DT O2 A0004 : score 4.14277 : H : ARG NH1 H0075 <- 2.68 -> DT O4 A0013 : score 3.34638 : H : ARG NH2 H0075 <- 3.08 -> DT O4 A0012 : score 3.35483 : H : ARG NH2 H0075 <- 2.85 -> DT O4 A0013 : score 3.51831 : H : GLU OE2 H0077 <- 2.74 -> DT N3 A0012 : score 2.66753 : H : ARG NH1 H0077 <- 2.93 -> DT O2 A0013 : score 4.19444 : x : ILE xxxx H0024 <- 3.46 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0071 <- 4.06 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0076 <- 3.74 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0079 <- 3.16 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx >6z8w_H:Trypsin-like_serine_proteases; title=X-RAY STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN HUMAN ALPHA THROMBIN AND A THROMBIN BINDING APTAMER VARIANT (TBA-3G), WHICH CONTAINS 1-BETA-D- GLUCOPYRANOSYL RESIDUE IN THE SIDE CHAIN OF THY3 AT N3. organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 H0075 <- 2.92 -> DT O2 A0004 : score 4.20306 : H : ARG NH1 H0075 <- 2.77 -> DT O4 A0013 : score 3.28756 : H : ARG NH2 H0075 <- 3.12 -> DT O4 A0012 : score 3.3264 : H : ARG NH2 H0075 <- 2.78 -> DT O4 A0013 : score 3.56806 : H : GLU OE2 H0077 <- 2.70 -> DT N3 A0012 : score 2.68862 : H : ARG NH1 H0077 <- 2.90 -> DT O2 A0013 : score 4.22028 : x : ILE xxxx H0024 <- 3.47 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0071 <- 4.00 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0076 <- 3.77 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0079 <- 3.31 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx >6z8x_H:Trypsin-like_serine_proteases; title=X-RAY STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN HUMAN ALPHA THROMBIN AND A THROMBIN BINDING APTAMER VARIANT (TBA-3LEU), WHICH CONTAINS LEUCYL AMIDE IN THE SIDE CHAIN OF THY3 AT N3. organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 H0075 <- 2.72 -> DT O2 B0004 : score 4.37531 : H : ARG NH2 H0075 <- 2.39 -> DT O4 B0013 : score 3.84526 : H : ARG NH1 H0077 <- 2.86 -> DT O2 B0013 : score 4.25473 : x : ILE xxxx H0024 <- 4.28 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0071 <- 3.49 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0076 <- 3.56 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0079 <- 3.36 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0117 <- 3.55 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx >6z9p_GXYa: title=TRANSCRIPTION TERMINATION INTERMEDIATE COMPLEX 1 organism=ESCHERICHIA COLI : V : ALA CB Y0791 <- 3.62 -> DT C7 L0001 : score 5.85093 : x : ARG xxxx G0057 <- 3.16 -> DC xxx K-018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0059 <- 4.26 -> DC xxx K-018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0061 <- 4.33 -> DC xxx K-018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0151 <- 3.17 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx X0183 <- 3.17 -> DA xxx K-002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx X0199 <- 3.52 -> DA xxx K-002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx X0445 <- 3.19 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0470 <- 3.16 -> DC xxx K-011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx X0514 <- 4.32 -> DA xxx L0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx X0538 <- 4.25 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx X0541 <- 3.94 -> DA xxx L0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0542 <- 3.02 -> DT xxx K0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Y0255 <- 4.11 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0259 <- 3.29 -> DG xxx L0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Y0319 <- 3.79 -> DG xxx L0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0426 <- 4.45 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx Y0427 <- 4.12 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Y0790 <- 3.29 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx >6z9q_GXYa: title=TRANSCRIPTION TERMINATION INTERMEDIATE COMPLEX 2 organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 G0021 <- 2.96 -> DG N3 L0014 : score 3.49473 : H : LYS NZ Y0074 <- 3.34 -> DA N7 L0025 : score 2.61996 : V : ARG CZ X0542 <- 3.62 -> DT C7 K0000 : score 2.22826 : V : THR CG2 Y0790 <- 3.57 -> DT C7 L0001 : score 4.48055 : x : PHE xxxx G0018 <- 3.68 -> DG xxx K-012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0052 <- 3.07 -> DC xxx K-018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0061 <- 3.32 -> DT xxx L0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0063 <- 4.46 -> DT xxx L0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0064 <- 4.20 -> DC xxx L0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx a0058 <- 4.26 -> DC xxx L0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx a0062 <- 3.90 -> DC xxx L0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx a0064 <- 3.67 -> DC xxx L0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a0066 <- 2.98 -> DC xxx L0021 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx a0073 <- 3.96 -> DG xxx L0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx a0074 <- 3.05 -> DC xxx L0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx a0110 <- 4.01 -> DC xxx L0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx a0241 <- 4.47 -> DG xxx L0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0151 <- 3.24 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx X0183 <- 3.20 -> DA xxx K-002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx X0199 <- 3.09 -> DA xxx K-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0200 <- 4.36 -> DA xxx K-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0451 <- 3.64 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx X0538 <- 4.08 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx X0547 <- 3.48 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Y0046 <- 3.28 -> DG xxx K-015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Y0076 <- 4.03 -> DT xxx L0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0077 <- 3.52 -> DG xxx K-030 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Y0086 <- 3.34 -> DT xxx L0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Y0255 <- 3.19 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx Y0427 <- 3.81 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0791 <- 3.70 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx >6z9q_X:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=TRANSCRIPTION TERMINATION INTERMEDIATE COMPLEX 2 organism=? : V : ARG CZ X0542 <- 3.62 -> DT C7 K0000 : score 2.22826 : x : ARG xxxx X0151 <- 3.24 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx X0183 <- 3.20 -> DA xxx K-002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx X0199 <- 3.09 -> DA xxx K-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0200 <- 4.36 -> DA xxx K-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0451 <- 3.64 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx X0538 <- 4.08 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx X0547 <- 3.48 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx >6z9r_GXYa: title=TRANSCRIPTION TERMINATION INTERMEDIATE COMPLEX 3 organism=ESCHERICHIA COLI : V : THR CG2 Y0790 <- 3.53 -> DT C7 L0001 : score 4.52292 : x : ARG xxxx X0151 <- 3.10 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx X0183 <- 3.80 -> DA xxx K-002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx X0199 <- 4.13 -> DA xxx K-002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx X0445 <- 2.86 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0451 <- 3.49 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx X0496 <- 3.78 -> DG xxx L0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx X0538 <- 4.37 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx X0541 <- 3.14 -> DA xxx L0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0542 <- 3.27 -> DT xxx K0000 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx X0547 <- 3.79 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Y0212 <- 4.24 -> DT xxx L-010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Y0255 <- 3.15 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0259 <- 4.13 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Y0320 <- 4.09 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0322 <- 3.78 -> DG xxx L0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx Y0427 <- 4.38 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0791 <- 3.84 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx >6z9s_XYab: title=TRANSCRIPTION TERMINATION INTERMEDIATE COMPLEX 4 organism=ESCHERICHIA COLI : V : ARG CZ X0542 <- 3.80 -> DT C7 K0000 : score 2.13231 : x : ARG xxxx X0470 <- 4.19 -> DG xxx L0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx X0504 <- 4.31 -> DG xxx L0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0540 <- 4.04 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx X0541 <- 4.19 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx X0567 <- 3.64 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0259 <- 3.91 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0278 <- 4.14 -> DG xxx K-017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0314 <- 3.01 -> DT xxx K-009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Y0319 <- 3.43 -> DG xxx L0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx Y0427 <- 4.13 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Y0790 <- 4.39 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0791 <- 4.09 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx >6z9s_Y:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=TRANSCRIPTION TERMINATION INTERMEDIATE COMPLEX 4 organism=? : x : ARG xxxx Y0259 <- 3.91 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0278 <- 4.14 -> DG xxx K-017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0314 <- 3.01 -> DT xxx K-009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Y0319 <- 3.43 -> DG xxx L0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx Y0427 <- 4.13 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Y0790 <- 4.39 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0791 <- 4.09 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx >6z9t_XYab: title=TRANSCRIPTION TERMINATION INTERMEDIATE COMPLEX 5 organism=ESCHERICHIA COLI : x : ARG xxxx X0470 <- 3.49 -> DC xxx K-011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx X0541 <- 4.28 -> DC xxx L0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0542 <- 4.39 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Y0320 <- 3.19 -> DC xxx K-014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Y0795 <- 2.92 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0798 <- 4.15 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Y1326 <- 4.01 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Y1327 <- 4.39 -> DA xxx L0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y1330 <- 2.98 -> DG xxx K0002 : score x.xxxxx >6za3_AB:GntR_ligand-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR ATU1419 (VANR) FROM AGROBACTERIUM FABRUM IN COMPLEX A PALINDROMIC DNA (C2221 SPACE GROUP) organism=AGROBACTERIUM FABRUM STR. C58 : H : ARG NH1 A0045 <- 2.73 -> DG O6 E0003 : score 6.1685 : H : ARG NH2 A0045 <- 2.81 -> DG N7 E0003 : score 6.37185 : H : THR OG1 A0046 <- 2.92 -> DA N7 F0005 : score 3.33216 : w : ARG NH1 A0049 <- 5.43 -> DT O4 F0006 : score 1.768 : H : ARG NH1 B0045 <- 2.97 -> DG O6 F0003 : score 5.8765 : H : ARG NH2 B0045 <- 2.95 -> DG N7 F0003 : score 6.19308 : H : THR OG1 B0046 <- 2.63 -> DA N7 E0005 : score 3.53018 : V : VAL CG2 A0035 <- 3.70 -> DT C7 E0002 : score 6.27615 : V : VAL CG2 B0035 <- 3.69 -> DT C7 F0002 : score 6.29146 : x : SER xxxx A0044 <- 3.23 -> DA xxx F0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0044 <- 3.27 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0049 <- 3.46 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx >6za3_B:GntR_ligand-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR ATU1419 (VANR) FROM AGROBACTERIUM FABRUM IN COMPLEX A PALINDROMIC DNA (C2221 SPACE GROUP) organism=AGROBACTERIUM FABRUM STR. C58 : H : ARG NH1 B0045 <- 2.97 -> DG O6 F0003 : score 5.8765 : H : ARG NH2 B0045 <- 2.95 -> DG N7 F0003 : score 6.19308 : H : THR OG1 B0046 <- 2.63 -> DA N7 E0005 : score 3.53018 : V : VAL CG2 B0035 <- 3.69 -> DT C7 F0002 : score 6.29146 : x : SER xxxx B0044 <- 3.27 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0049 <- 3.46 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx >6zh8_A:Protein_kinase-like_PK-like;ARM_repeat; title=CRYO-EM STRUCTURE OF DNA-PKCS:DNA organism=HOMO SAPIENS : x : LYS xxxx A0263 <- 4.05 -> DA xxx C0032 : score x.xxxxx >6zha_ABC:SPOC_domain-like;vWA-like;Protein_kinase-like_PK-like;ARM_repeat;C-terminal_domain_of_Ku80; title=CRYO-EM STRUCTURE OF DNA-PK MONOMER organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0254 <- 4.17 -> DT xxx E0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0403 <- 3.95 -> DA xxx D0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0271 <- 3.22 -> DT xxx E0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0400 <- 3.30 -> DA xxx D0024 : score x.xxxxx >6zha_B:SPOC_domain-like;vWA-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF DNA-PK MONOMER organism=? : x : ARG xxxx B0254 <- 4.17 -> DT xxx E0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0403 <- 3.95 -> DA xxx D0031 : score x.xxxxx >6zhe_C:SPOC_domain-like;vWA-like;C-terminal_domain_of_Ku80; title=CRYO-EM STRUCTURE OF DNA-PK DIMER organism=? : x : ARG xxxx C0271 <- 3.85 -> DT xxx D0030 : score x.xxxxx >6zhx_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE REGULATORY LINKER OF ALC1 BOUND TO THE NUCLEOSOME'S ACIDIC PATCH: NUCLEOSOME CLASS. organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 A0040 <- 3.16 -> DT O2 J0009 : score 3.99635 : H : ARG NH2 A0040 <- 2.71 -> DT O2 J0009 : score 4.30953 : H : ARG NH1 C0011 <- 3.12 -> DA N3 J0043 : score 3.4464 : H : ARG NH2 C0011 <- 2.75 -> DT O2 J0044 : score 4.27567 : H : ARG NH1 D0030 <- 3.31 -> DT O2 I-047 : score 3.86716 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.82 -> DG N3 I0009 : score 3.59582 : H : ARG NH1 G0011 <- 3.17 -> DT O2 I0043 : score 3.98774 : H : ARG NH2 G0011 <- 2.79 -> DT O2 I0043 : score 4.2418 : H : ARG NH1 H0030 <- 3.37 -> DC O2 J-047 : score 3.2339 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.38 -> DT xxx J-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.40 -> DG xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.28 -> DA xxx J0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.42 -> DC xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.98 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.24 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.40 -> DC xxx I0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0027 <- 3.45 -> DA xxx I0050 : score x.xxxxx >6zhx_C:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE REGULATORY LINKER OF ALC1 BOUND TO THE NUCLEOSOME'S ACIDIC PATCH: NUCLEOSOME CLASS. organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 C0011 <- 3.12 -> DA N3 J0043 : score 3.4464 : H : ARG NH2 C0011 <- 2.75 -> DT O2 J0044 : score 4.27567 >6zhy_ABCDEF:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE REGULATORY LINKER OF ALC1 BOUND TO THE NUCLEOSOME'S ACIDIC PATCH: HEXASOME CLASS. organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.69 -> DT O2 J0009 : score 4.32647 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.99 -> DG N3 I0009 : score 3.47307 : x : ARG xxxx B0045 <- 4.38 -> DC xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.16 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx >6zix_AB:CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=STRUCTURE OF RCSB FROM SALMONELLA ENTERICA SEROVAR TYPHIMURIUM BOUND TO PROMOTER P1FLHDC IN THE PRESENCE OF PHOSPHOMIMETIC BEF3- organism=? : H : SER OG A0184 <- 3.38 -> DA N6 F0022 : score 2.90813 : V : ILE CG2 B0179 <- 3.89 -> DT C7 F0029 : score 6.93173 : x : LYS xxxx B0180 <- 3.45 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0181 <- 3.56 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.29 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0184 <- 3.13 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0185 <- 3.99 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0179 <- 4.29 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0180 <- 3.36 -> DA xxx F0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0181 <- 3.59 -> DA xxx F0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.09 -> DT xxx E0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0185 <- 4.34 -> DT xxx F0021 : score x.xxxxx >6zix_B:CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=STRUCTURE OF RCSB FROM SALMONELLA ENTERICA SEROVAR TYPHIMURIUM BOUND TO PROMOTER P1FLHDC IN THE PRESENCE OF PHOSPHOMIMETIC BEF3- organism=? : V : ILE CG2 B0179 <- 3.89 -> DT C7 F0029 : score 6.93173 : x : LYS xxxx B0180 <- 3.45 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0181 <- 3.56 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.29 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0184 <- 3.13 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0185 <- 3.99 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx >6zj2_AB:CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=STRUCTURE OF RCSB FROM SALMONELLA ENTERICA SEROVAR TYPHIMURIUM BOUND TO PROMOTER RPRA IN THE PRESENCE OF PHOSPHOMIMETIC BEF3- organism=? : H : LYS NZ A0180 <- 3.02 -> DA N7 I0023 : score 2.80794 : H : LYS NZ B0180 <- 2.78 -> DG N7 G0009 : score 5.40744 : H : LYS NZ B0180 <- 2.77 -> DG O6 G0009 : score 5.81545 : V : SER CB A0184 <- 3.82 -> DT C7 I0021 : score 3.11563 : V : ILE CG2 B0179 <- 3.85 -> DT C7 I0030 : score 7.00264 : x : THR xxxx B0181 <- 3.94 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0183 <- 3.22 -> DT xxx I0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0184 <- 3.91 -> DG xxx G0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0181 <- 3.28 -> DC xxx I0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0183 <- 3.91 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx >6zmn_B:SMAD_MH1_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMAD3-SMAD5 MH1 DOMAIN CHIMERA BOUND TO THE GGCGC SITE organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0071 <- 2.96 -> DG N7 D0005 : score 5.8564 : H : ARG NH2 B0071 <- 2.92 -> DG O6 D0005 : score 6.4416 : H : GLN OE1 B0073 <- 2.96 -> DC N4 C0009 : score 4.43667 : H : LYS NZ B0078 <- 3.11 -> DG O6 D0006 : score 5.42236 : H : LYS NZ B0078 <- 2.76 -> DG O6 C0010 : score 5.82702 : x : ASP xxxx B0069 <- 4.43 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >6znc_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL BASIS OF REACTIVATION OF ONCOGENIC P53 MUTANTS BY A SMALL MOLECULE: METHYLENE QUINUCLIDINONE (MQ). HUMAN WILD-TYPE P53DBD BOUND TO DNA AND MQ: WT-DNA-MQ (I) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 2.77 -> DG N7 B0003 : score 5.41821 A : H : LYS NZ A0120 <- 2.66 -> DG O6 B0004 : score 5.94263 A : H : SER OG A0166 <- 2.97 -> DG O6 B0012 : score 3.95193 : H : GLN NE2 A0167 <- 3.08 -> DC O2 B0011 : score 3.48796 : x : GLN xxxx A0165 <- 3.56 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0280 <- 3.38 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx >6ztj_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=E. COLI 70S-RNAP EXPRESSOME COMPLEX IN NUSG-COUPLED STATE (38 NT INTERVENING MRNA) organism=? : H : ARG NH2 C0394 <- 2.65 -> DC O2 N0021 : score 3.80968 : H : ARG NH1 C0451 <- 3.12 -> DG O6 N0025 : score 5.694 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.11 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.69 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 4.02 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 4.15 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.10 -> DC xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 4.41 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0446 <- 3.25 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 4.49 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.48 -> DG xxx N0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.19 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx >6ztj_CDF:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=E. COLI 70S-RNAP EXPRESSOME COMPLEX IN NUSG-COUPLED STATE (38 NT INTERVENING MRNA) organism=? : H : ARG NH2 C0394 <- 2.65 -> DC O2 N0021 : score 3.80968 : H : ARG NH1 C0451 <- 3.12 -> DG O6 N0025 : score 5.694 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.11 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.69 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 4.02 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 4.15 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.10 -> DC xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 4.41 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0446 <- 3.25 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 4.49 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.48 -> DG xxx N0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.19 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0212 <- 3.30 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 3.87 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0275 <- 4.04 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 4.20 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.87 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.26 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0012 <- 4.34 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0013 <- 1.76 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0014 <- 3.25 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0015 <- 4.01 -> DC xxx N0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0016 <- 3.59 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0025 <- 3.00 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0026 <- 4.20 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0029 <- 3.26 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0068 <- 3.57 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0069 <- 3.48 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0085 <- 4.27 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0086 <- 0.90 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0087 <- 2.41 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0088 <- 4.05 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0089 <- 3.74 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0090 <- 3.54 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx >6ztl_CDF:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=E. COLI 70S-RNAP EXPRESSOME COMPLEX IN COLLIDED STATE BOUND TO NUSG organism=? : H : ARG NH2 C0394 <- 2.65 -> DC O2 N0021 : score 3.80968 : H : ARG NH1 C0451 <- 3.13 -> DG O6 N0025 : score 5.68183 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.11 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.69 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 4.02 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 4.15 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.10 -> DC xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 4.41 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0446 <- 3.25 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 4.50 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.48 -> DG xxx N0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.19 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0212 <- 3.30 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 3.87 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0275 <- 4.04 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 4.20 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.87 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.26 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0012 <- 4.19 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0013 <- 1.33 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0014 <- 3.50 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0016 <- 3.51 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0025 <- 4.04 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0029 <- 4.10 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0068 <- 3.62 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0069 <- 4.40 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0085 <- 3.78 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0086 <- 1.30 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0087 <- 2.45 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0088 <- 3.94 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0089 <- 3.82 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0090 <- 2.55 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx >6ztl_F:RL5-like;Ribosomal_protein_S6;N-utilization_substance_G_protein_NusG,_N-terminal_domain; title=E. COLI 70S-RNAP EXPRESSOME COMPLEX IN COLLIDED STATE BOUND TO NUSG organism=? : x : VAL xxxx F0089 <- 3.82 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0090 <- 2.55 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0012 <- 4.19 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0013 <- 1.33 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0014 <- 3.50 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0016 <- 3.51 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0025 <- 4.04 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0029 <- 4.10 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0068 <- 3.62 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0069 <- 4.40 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0085 <- 3.78 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0086 <- 1.30 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0087 <- 2.45 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0088 <- 3.94 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx >6ztm_CD:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=E. COLI 70S-RNAP EXPRESSOME COMPLEX IN COLLIDED STATE WITHOUT NUSG organism=? : H : ARG NH2 C0394 <- 2.66 -> DC O2 N0021 : score 3.80228 : H : ARG NH1 C0451 <- 3.12 -> DG O6 N0025 : score 5.694 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.11 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.69 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 4.02 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 4.15 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.10 -> DC xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 4.41 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0446 <- 3.25 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 4.50 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.48 -> DG xxx N0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.19 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0212 <- 3.30 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 3.87 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0275 <- 4.04 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 4.20 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.87 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.26 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx >6ztm_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins;Alpha-L_RNA-binding_motif; title=E. COLI 70S-RNAP EXPRESSOME COMPLEX IN COLLIDED STATE WITHOUT NUSG organism=? : x : THR xxxx D0212 <- 3.30 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 3.87 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0275 <- 4.04 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 4.20 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.87 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.26 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx >6ztn_CDF:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=E. COLI 70S-RNAP EXPRESSOME COMPLEX IN NUSG-COUPLED STATE (42 NT INTERVENING MRNA) organism=? : H : ARG NH2 C0394 <- 2.64 -> DC O2 N0021 : score 3.81708 : H : ARG NH1 C0451 <- 2.98 -> DG O6 N0025 : score 5.86433 : V : PHE CD2 D0260 <- 3.82 -> DT C7 T0025 : score 6.47924 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.23 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.63 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 4.02 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 3.93 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.04 -> DC xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 4.27 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0446 <- 3.21 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.42 -> DG xxx N0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.14 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0212 <- 3.00 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0255 <- 4.05 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 4.11 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0275 <- 4.15 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 4.03 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.80 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.25 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0013 <- 0.16 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0068 <- 3.73 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0084 <- 3.90 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0085 <- 3.05 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0086 <- 2.95 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0087 <- 3.57 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0089 <- 3.70 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0090 <- 1.72 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0093 <- 3.88 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx >6ztn_F:RL5-like;Ribosomal_protein_S6;N-utilization_substance_G_protein_NusG,_N-terminal_domain; title=E. COLI 70S-RNAP EXPRESSOME COMPLEX IN NUSG-COUPLED STATE (42 NT INTERVENING MRNA) organism=? : x : VAL xxxx F0089 <- 3.70 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0090 <- 1.72 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0013 <- 0.16 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0068 <- 3.73 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0084 <- 3.90 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0085 <- 3.05 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0086 <- 2.95 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0087 <- 3.57 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0093 <- 3.88 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx >6zto_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=E. 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COLI 70S-RNAP EXPRESSOME COMPLEX IN UNCOUPLED STATE 1 organism=? : H : ARG NH2 C0394 <- 2.65 -> DC O2 N0021 : score 3.80968 : H : ARG NH1 C0451 <- 3.13 -> DG O6 N0025 : score 5.68183 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.11 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.69 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 4.02 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 4.15 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.10 -> DC xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 4.41 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0446 <- 3.25 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 4.49 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.48 -> DG xxx N0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.19 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0212 <- 3.30 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 3.87 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0275 <- 4.04 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 4.20 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.87 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.26 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx >6ztp_CDJ:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=E. COLI 70S-RNAP EXPRESSOME COMPLEX IN UNCOUPLED STATE 6 organism=? : H : ARG NH2 C0394 <- 2.65 -> DC O2 N0021 : score 3.80968 : H : ARG NH1 C0451 <- 3.13 -> DG O6 N0025 : score 5.68183 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.11 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.69 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 4.02 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 4.15 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.10 -> DC xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 4.41 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0446 <- 3.25 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 4.50 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.48 -> DG xxx N0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.19 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0212 <- 3.30 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 3.87 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0275 <- 4.04 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 4.20 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.87 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.26 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx >6zu1_CD:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=E. COLI 70S-RNAP EXPRESSOME COMPLEX IN UNCOUPLED STATE 2 organism=? : H : ARG NH2 C0394 <- 2.65 -> DC O2 N0021 : score 3.80968 : H : ARG NH1 C0451 <- 3.13 -> DG O6 N0025 : score 5.68183 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.11 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.69 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 4.02 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 4.15 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.10 -> DC xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 4.41 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0446 <- 3.25 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 4.49 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.48 -> DG xxx N0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.19 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0212 <- 3.30 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 3.87 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0275 <- 4.04 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 4.20 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.87 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.26 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx >6zu1_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins;Alpha-L_RNA-binding_motif; title=E. COLI 70S-RNAP EXPRESSOME COMPLEX IN UNCOUPLED STATE 2 organism=? : x : THR xxxx D0212 <- 3.30 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 3.87 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0275 <- 4.04 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 4.20 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.87 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.26 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx >6zy5_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN TOPOISOMERASE II ALPHA DNA- BINDING/CLEAVAGE DOMAIN IN STATE 1 organism=? : x : LYS xxxx A0489 <- 3.46 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0762 <- 3.65 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0763 <- 3.99 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0766 <- 4.37 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0856 <- 3.87 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx >6zy5_AB:Type_II_DNA_topoisomerase;ATPase_domain_of_HSP90_chaperone/DNA_topoisomerase_II/histidine_kinase;Ribosomal_protein_S5_domain_2-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN TOPOISOMERASE II ALPHA DNA- BINDING/CLEAVAGE DOMAIN IN STATE 1 organism=? : x : LYS xxxx B0489 <- 3.90 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0762 <- 3.21 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0763 <- 3.98 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0766 <- 4.17 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0854 <- 4.00 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0856 <- 3.79 -> DC xxx F0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0861 <- 4.42 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0489 <- 3.46 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0762 <- 3.65 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0763 <- 3.99 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0766 <- 4.37 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0856 <- 3.87 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx >6zy6_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN TOPOISOMERASE II ALPHA DNA- BINDING/CLEAVAGE DOMAIN IN STATE 2 organism=? : x : LYS xxxx A0489 <- 3.65 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0763 <- 4.48 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0766 <- 3.59 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0856 <- 3.41 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx >6zy7_AB:Type_II_DNA_topoisomerase;ATPase_domain_of_HSP90_chaperone/DNA_topoisomerase_II/histidine_kinase;Ribosomal_protein_S5_domain_2-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE ENTIRE HUMAN TOPOISOMERASE II ALPHA IN STATE 1 organism=? : x : LYS xxxx B0489 <- 3.90 -> DG xxx d0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0763 <- 3.98 -> DT xxx d0029 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0766 <- 4.17 -> DT xxx d0029 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0854 <- 4.00 -> DC xxx d0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0856 <- 3.79 -> DC xxx c0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0861 <- 4.32 -> DG xxx c0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0489 <- 3.46 -> DG xxx c0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0763 <- 3.99 -> DT xxx c0029 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0766 <- 4.37 -> DT xxx c0029 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0854 <- 4.03 -> DC xxx c0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0856 <- 3.61 -> DG xxx d0009 : score x.xxxxx >6zy7_B:Type_II_DNA_topoisomerase;ATPase_domain_of_HSP90_chaperone/DNA_topoisomerase_II/histidine_kinase;Ribosomal_protein_S5_domain_2-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE ENTIRE HUMAN TOPOISOMERASE II ALPHA IN STATE 1 organism=? : x : LYS xxxx B0489 <- 3.90 -> DG xxx d0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0763 <- 3.98 -> DT xxx d0029 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0766 <- 4.17 -> DT xxx d0029 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0854 <- 4.00 -> DC xxx d0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0856 <- 3.79 -> DC xxx c0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0861 <- 4.32 -> DG xxx c0009 : score x.xxxxx >6zy8_B:Type_II_DNA_topoisomerase;ATPase_domain_of_HSP90_chaperone/DNA_topoisomerase_II/histidine_kinase;Ribosomal_protein_S5_domain_2-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE ENTIRE HUMAN TOPOISOMERASE II ALPHA IN STATE 2 organism=? : x : ARG xxxx B0487 <- 4.35 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0489 <- 3.19 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0763 <- 4.39 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0766 <- 3.67 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0856 <- 3.38 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx >6zz6_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF S.CEREVISIAE COHESIN-SCC2-DNA COMPLEX organism=? : x : ASP xxxx A0116 <- 3.75 -> DT xxx G0030 : score x.xxxxx >6zz6_ABD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;ARM_repeat; title=CRYO-EM STRUCTURE OF S.CEREVISIAE COHESIN-SCC2-DNA COMPLEX organism=? : x : ASP xxxx A0116 <- 3.75 -> DT xxx G0030 : score x.xxxxx >7a08_bcdefghi:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYOEM STRUCTURE OF CGAS NUCLEOSOME COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 d0040 <- 2.30 -> DG N3 I0009 : score 3.35782 : x : ARG xxxx c0033 <- 4.09 -> DT xxx I-047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx d0083 <- 3.80 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx e0045 <- 4.06 -> DA xxx I-005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx f0042 <- 3.34 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx h0065 <- 4.24 -> DG xxx J0018 : score x.xxxxx >7abs_A:Metallo-hydrolase/oxidoreductase; title=STRUCTURE OF HUMAN DCLRE1C/ARTEMIS IN COMPLEX WITH DNA - RE- EVALUATION OF 6WO0 organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0207 <- 3.63 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx >7ad8_ABG: title=CORE TFIIH-XPA-DNA COMPLEX WITH MODELLED P62 SUBUNIT organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ A0609 <- 2.78 -> DC O2 K0020 : score 2.95794 : x : HIS xxxx A0629 <- 4.00 -> DA xxx J0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0686 <- 4.07 -> DC xxx J0020 : score x.xxxxx >7adb_X:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=TRANSCRIPTION TERMINATION INTERMEDIATE COMPLEX 1 DELTA NUSG organism=? : x : ARG xxxx X0175 <- 3.41 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0470 <- 3.74 -> DC xxx K-011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx X0538 <- 4.00 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx X0541 <- 4.47 -> DA xxx L0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0542 <- 3.39 -> DT xxx K0000 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx X0547 <- 4.38 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx >7adb_XYa: title=TRANSCRIPTION TERMINATION INTERMEDIATE COMPLEX 1 DELTA NUSG organism=ESCHERICHIA COLI : V : ALA CB Y0791 <- 3.64 -> DT C7 L0001 : score 5.82293 : x : ARG xxxx X0175 <- 3.41 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0470 <- 3.74 -> DC xxx K-011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx X0538 <- 4.00 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx X0541 <- 4.47 -> DA xxx L0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0542 <- 3.39 -> DT xxx K0000 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx X0547 <- 4.38 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Y0255 <- 4.21 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0261 <- 3.75 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0426 <- 4.01 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx Y0427 <- 4.41 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Y0790 <- 3.44 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx >7adc_XYab: title=TRANSCRIPTION TERMINATION INTERMEDIATE COMPLEX 3 DELTA NUSG organism=ESCHERICHIA COLI : V : ARG CZ X0542 <- 3.75 -> DT C7 K0000 : score 2.15896 : V : THR CG2 Y0790 <- 3.63 -> DT C7 L0001 : score 4.41699 : x : GLN xxxx a0059 <- 4.18 -> DC xxx K-019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0151 <- 3.49 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx X0199 <- 4.14 -> DA xxx K-002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx X0445 <- 3.65 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0451 <- 3.53 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx X0538 <- 3.41 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx X0541 <- 3.15 -> DA xxx L0000 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx X0547 <- 3.83 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Y0212 <- 3.73 -> DT xxx L-010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Y0255 <- 3.23 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0259 <- 4.48 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0322 <- 2.98 -> DG xxx L0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0426 <- 4.50 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0791 <- 4.25 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx >7adc_Y:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=TRANSCRIPTION TERMINATION INTERMEDIATE COMPLEX 3 DELTA NUSG organism=ESCHERICHIA COLI : V : THR CG2 Y0790 <- 3.63 -> DT C7 L0001 : score 4.41699 : x : THR xxxx Y0212 <- 3.73 -> DT xxx L-010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Y0255 <- 3.23 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0259 <- 4.48 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0322 <- 2.98 -> DG xxx L0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0426 <- 4.50 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Y0791 <- 4.25 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx >7add_X:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=TRANSCRIPTION TERMINATION INTERMEDIATE COMPLEX IIIA organism=ESCHERICHIA COLI : x : ARG xxxx X0200 <- 4.45 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx X0504 <- 3.68 -> DG xxx L0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx X0514 <- 4.48 -> DA xxx L0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0542 <- 4.07 -> DT xxx K0000 : score x.xxxxx : x : MET xxxx X1273 <- 4.35 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx >7add_XYab: title=TRANSCRIPTION TERMINATION INTERMEDIATE COMPLEX IIIA organism=ESCHERICHIA COLI : V : ALA CB Y0791 <- 3.63 -> DT C7 L0001 : score 5.83693 : x : ARG xxxx X0200 <- 4.45 -> DC xxx K-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx X0504 <- 3.68 -> DG xxx L0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx X0514 <- 4.48 -> DA xxx L0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0542 <- 4.07 -> DT xxx K0000 : score x.xxxxx : x : MET xxxx X1273 <- 4.35 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0259 <- 3.17 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0278 <- 3.71 -> DG xxx K-017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0314 <- 4.27 -> DT xxx K-009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Y0319 <- 4.34 -> DG xxx L0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0352 <- 3.77 -> DC xxx L0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Y0790 <- 3.38 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Y1326 <- 3.72 -> DC xxx L-002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Y1327 <- 4.45 -> DC xxx L-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y1330 <- 4.43 -> DA xxx L-003 : score x.xxxxx >7ade_XYa: title=TRANSCRIPTION TERMINATION COMPLEX IVA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 Y0278 <- 2.87 -> DC O2 K-022 : score 3.64694 : x : GLU xxxx X0541 <- 2.87 -> DC xxx L0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0259 <- 4.27 -> DC xxx L0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Y0795 <- 3.37 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y1330 <- 4.33 -> DT xxx K0003 : score x.xxxxx >7ade_bf: title=TRANSCRIPTION TERMINATION COMPLEX IVA organism=ESCHERICHIA COLI : x : ARG xxxx f0087 <- 3.38 -> DA xxx L0031 : score x.xxxxx >7adu_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND THE INSTI XZ440 (COMPOUND 5J) organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.86 -> DC O2 C0006 : score 2.62707 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.89 -> DC O2 C0006 : score 3.63214 : V : PRO CG A0259 <- 3.86 -> DT C7 C0008 : score 6.26359 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.62 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.96 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.92 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.92 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >7adv_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTOTYPE FOAMY VIRUS (PFV) INTASOME IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND THE INSTI XZ447 (COMPOUND 6V) organism=HUMAN SPUMARETROVIRUS : H : ARG NE A0222 <- 2.77 -> DC O2 C0006 : score 2.67493 : H : ARG NH2 A0222 <- 2.98 -> DC O2 C0006 : score 3.56556 : V : PRO CG A0259 <- 3.70 -> DT C7 C0008 : score 6.51795 : x : ILE xxxx A0112 <- 3.61 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.88 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0215 <- 3.91 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0221 <- 3.94 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >7ae1_ABE: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN RNA POLYMERASE III ELONGATION COMPLEX 1 organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A1305 <- 4.27 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0195 <- 4.13 -> DC xxx S0030 : score x.xxxxx >7ae1_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN RNA POLYMERASE III ELONGATION COMPLEX 1 organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0195 <- 4.13 -> DC xxx S0030 : score x.xxxxx >7aea_ABE: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN RNA POLYMERASE III ELONGATION COMPLEX 2 organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A1305 <- 4.23 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx >7ahx_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND D-ASPARTATE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH A0183 <- 2.64 -> DC O2 P0821 : score 3.60935 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.75 -> DT O2 P0806 : score 4.34947 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.93 -> DT O2 P0806 : score 4.12327 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.27 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.09 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.43 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >7ahx_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND D-ASPARTATE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH A0183 <- 2.64 -> DC O2 P0821 : score 3.60935 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.75 -> DT O2 P0806 : score 4.34947 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.93 -> DT O2 P0806 : score 4.12327 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.27 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.09 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.43 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >7ahx_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND D-ASPARTATE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH C0183 <- 2.60 -> DC O2 F0821 : score 3.63733 : H : ARG NH2 C0448 <- 3.17 -> DT O2 F0806 : score 3.92007 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.26 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 4.20 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.35 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx >7ai5_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MUTS IN SCANNING STATE organism=Escherichia coli : H : LYS NZ B0496 <- 3.08 -> DG N7 C0021 : score 5.08429 >7ai5_B:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MUTS IN SCANNING STATE organism=Escherichia coli : H : LYS NZ B0496 <- 3.08 -> DG N7 C0021 : score 5.08429 >7ai6_A:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MUTS IN MISMATCH BOUND STATE organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : GLU OE2 A0038 <- 3.30 -> DT N3 D0031 : score 2.37231 : H : GLU OE2 A0038 <- 3.30 -> DT N3 D0031 : score 2.37231 : H : ARG NH1 A0058 <- 3.36 -> DT O2 D0030 : score 3.82409 : V : PHE CZ A0036 <- 3.66 -> DT C7 D0031 : score 7.36389 : x : MET xxxx A0033 <- 4.39 -> DA xxx C0032 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0035 <- 4.02 -> DC xxx C0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0056 <- 4.44 -> DT xxx D0031 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 4.07 -> DT xxx D0031 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.72 -> DG xxx D0032 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0074 <- 3.28 -> DG xxx D0032 : score x.xxxxx >7ai6_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MUTS IN MISMATCH BOUND STATE organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : GLU OE2 A0038 <- 3.30 -> DT N3 D0031 : score 2.37231 : H : GLU OE2 A0038 <- 3.30 -> DT N3 D0031 : score 2.37231 : H : ARG NH1 A0058 <- 3.36 -> DT O2 D0030 : score 3.82409 : V : PHE CZ A0036 <- 3.66 -> DT C7 D0031 : score 7.36389 : x : MET xxxx A0033 <- 4.39 -> DA xxx C0032 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0035 <- 4.02 -> DC xxx C0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0056 <- 4.44 -> DT xxx D0031 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 4.07 -> DT xxx D0031 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.72 -> DG xxx D0032 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0074 <- 3.28 -> DG xxx D0032 : score x.xxxxx >7ai7_A:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MUTS IN INTERMEDIATE STATE organism=? : H : ARG NH2 A0058 <- 2.81 -> DG N3 D0010 : score 3.60304 : x : MET xxxx A0033 <- 3.89 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0035 <- 3.67 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0036 <- 3.26 -> DA xxx C0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0038 <- 2.87 -> DA xxx C0043 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 3.82 -> DA xxx C0043 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.58 -> DA xxx C0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0361 <- 2.81 -> DA xxx C0049 : score x.xxxxx >7ai7_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MUTS IN INTERMEDIATE STATE organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NH2 A0058 <- 2.81 -> DG N3 D0010 : score 3.60304 : x : MET xxxx A0033 <- 3.89 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0035 <- 3.67 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0036 <- 3.26 -> DA xxx C0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0038 <- 2.87 -> DA xxx C0043 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0068 <- 3.82 -> DA xxx C0043 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0072 <- 3.58 -> DA xxx C0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0361 <- 2.81 -> DA xxx C0049 : score x.xxxxx >7aib_ABC:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MUTS-MUTL IN CLAMP STATE organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ARG xxxx B0363 <- 4.20 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0165 <- 3.79 -> DC xxx E0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0166 <- 4.11 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx >7aib_B:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MUTS-MUTL IN CLAMP STATE organism=? : x : ARG xxxx B0363 <- 4.20 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx >7aic_ABC:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MUTS-MUTL IN CLAMP STATE (KINKED CLAMP DOMAIN) organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ARG xxxx B0361 <- 3.75 -> DT xxx D0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0363 <- 3.37 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0367 <- 4.49 -> DG xxx E0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0165 <- 3.59 -> DC xxx E0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0166 <- 4.18 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx >7aic_C:ATPase_domain_of_HSP90_chaperone/DNA_topoisomerase_II/histidine_kinase;Ribosomal_protein_S5_domain_2-like; title=MUTS-MUTL IN CLAMP STATE (KINKED CLAMP DOMAIN) organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : LYS xxxx C0165 <- 3.59 -> DC xxx E0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0166 <- 4.18 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx >7aid_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND D-ASPARTATE TENOFOVIR organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH A0183 <- 2.88 -> DC O2 P0821 : score 3.44148 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.15 -> DT O2 P0806 : score 4.00496 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.32 -> DT O2 P0806 : score 3.79307 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.27 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 4.20 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.40 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.27 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.39 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >7aid_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND D-ASPARTATE TENOFOVIR organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH C0183 <- 2.65 -> DC O2 F0821 : score 3.60236 : H : ARG NH1 C0448 <- 3.11 -> DT O2 F0806 : score 4.03941 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.31 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 3.96 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx >7aif_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-GLUTAMATE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : w : GLN NE2 A0161 <- 5.82 -> DG N3 T0707 : score 1.484 : H : TYR OH A0183 <- 2.45 -> DC O2 P0821 : score 3.74226 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.86 -> DT O2 P0806 : score 4.25473 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.77 -> DT O2 P0806 : score 4.25873 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.28 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 4.44 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.27 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 3.89 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.41 -> DG xxx T0721 : score x.xxxxx >7aif_C:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-GLUTAMATE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.66 -> DC O2 F0821 : score 3.59536 : H : ARG NH1 C0448 <- 3.20 -> DT O2 F0806 : score 3.9619 : H : ARG NH2 C0448 <- 2.91 -> DT O2 F0806 : score 4.1402 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.29 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 4.38 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.45 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 3.81 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx >7aif_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-GLUTAMATE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH C0183 <- 2.66 -> DC O2 F0821 : score 3.59536 : H : ARG NH1 C0448 <- 3.20 -> DT O2 F0806 : score 3.9619 : H : ARG NH2 C0448 <- 2.91 -> DT O2 F0806 : score 4.1402 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.29 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 4.38 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.45 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 3.81 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx >7aig_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-GLUTAMATE TENOFOVIR organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH A0183 <- 2.85 -> DC O2 P0821 : score 3.46246 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.05 -> DT O2 P0806 : score 4.09109 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.31 -> DT O2 P0806 : score 3.80153 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.27 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 4.31 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.48 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.10 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx >7aig_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-GLUTAMATE TENOFOVIR organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH C0183 <- 2.85 -> DC O2 F0821 : score 3.46246 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.31 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 4.46 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.43 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 4.06 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.63 -> DC xxx F0807 : score x.xxxxx >7aii_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-METHIONINE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH A0183 <- 2.46 -> DC O2 P0821 : score 3.73526 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.76 -> DT O2 P0806 : score 4.34086 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.90 -> DT O2 P0806 : score 4.14867 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.84 -> DC O2 P0807 : score 3.66913 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.26 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 4.49 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.44 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.43 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 3.90 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx >7aii_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-METHIONINE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH C0183 <- 2.58 -> DC O2 F0821 : score 3.65132 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.28 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 4.31 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.28 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 4.43 -> DG xxx E0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 4.08 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.14 -> DT xxx F0806 : score x.xxxxx >7aij_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-METHIONINE TENOFOVIR organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH A0183 <- 2.66 -> DC O2 P0821 : score 3.59536 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.85 -> DT O2 P0806 : score 4.26335 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.26 -> DT O2 P0806 : score 3.84387 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.28 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 4.35 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.38 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.09 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 3.95 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx >7aij_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-METHIONINE TENOFOVIR organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH A0183 <- 2.66 -> DC O2 P0821 : score 3.59536 : H : ARG NH1 A0448 <- 2.85 -> DT O2 P0806 : score 4.26335 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.26 -> DT O2 P0806 : score 3.84387 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.28 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 4.35 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.38 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.09 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 3.95 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx >7aij_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-METHIONINE TENOFOVIR organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH C0183 <- 2.70 -> DC O2 F0821 : score 3.56738 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.28 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 4.46 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.40 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 4.47 -> DG xxx E0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 3.96 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.25 -> DT xxx F0806 : score x.xxxxx >7amn_A:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF LUXR WITH DNA (REPRESSION) organism=Vibrio alginolyticus : H : ARG NH2 A0009 <- 3.26 -> DT O2 E0019 : score 3.84387 : H : ARG NH1 A0011 <- 2.95 -> DT O2 F0002 : score 4.17722 : H : ARG NH2 A0011 <- 3.27 -> DT O2 F0002 : score 3.8354 : V : ASN CG A0055 <- 3.83 -> DT C7 F0004 : score 2.62834 : V : ALA CB A0051 <- 3.69 -> DT C7 F0005 : score 5.75295 : x : SER xxxx A0049 <- 3.85 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0050 <- 4.35 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0052 <- 3.61 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0054 <- 3.51 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx >7amn_AB:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF LUXR WITH DNA (REPRESSION) organism=Vibrio alginolyticus : H : ARG NH2 A0009 <- 3.26 -> DT O2 E0019 : score 3.84387 : H : ARG NH1 A0011 <- 2.95 -> DT O2 F0002 : score 4.17722 : H : ARG NH2 A0011 <- 3.27 -> DT O2 F0002 : score 3.8354 : H : ARG NH1 B0011 <- 2.90 -> DT O2 E0001 : score 4.22028 : V : ASN CG B0055 <- 3.85 -> DT C7 E0003 : score 2.6151 : V : ALA CB B0051 <- 3.73 -> DT C7 E0004 : score 5.69696 : V : ASN CG A0055 <- 3.83 -> DT C7 F0004 : score 2.62834 : V : ALA CB A0051 <- 3.69 -> DT C7 F0005 : score 5.75295 : V : PHE CB B0054 <- 3.86 -> DT C7 F0016 : score 5.71401 : x : ARG xxxx B0009 <- 3.62 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0049 <- 3.72 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0052 <- 3.62 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0049 <- 3.85 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0050 <- 4.35 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0052 <- 3.61 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0054 <- 3.51 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx >7amt_A:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF LUXR WITH DNA (ACTIVATION) organism=Vibrio alginolyticus : H : ARG NH1 A0011 <- 2.66 -> DT O2 F0002 : score 4.42699 : H : ARG NH2 A0011 <- 2.68 -> DT O2 F0002 : score 4.33493 : V : ALA CB A0051 <- 3.62 -> DT C7 F0005 : score 5.85093 : x : SER xxxx A0049 <- 4.10 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0052 <- 3.91 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0054 <- 3.74 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx >7amt_AB:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF LUXR WITH DNA (ACTIVATION) organism=Vibrio alginolyticus : H : ARG NH1 A0011 <- 2.66 -> DT O2 F0002 : score 4.42699 : H : ARG NH2 A0011 <- 2.68 -> DT O2 F0002 : score 4.33493 : V : ASN CG B0055 <- 3.87 -> DT C7 E0003 : score 2.60186 : V : ALA CB B0051 <- 3.60 -> DT C7 E0005 : score 5.87892 : V : ALA CB A0051 <- 3.62 -> DT C7 F0005 : score 5.85093 : V : PHE CZ B0054 <- 3.69 -> DT C7 F0014 : score 7.31053 : x : SER xxxx B0049 <- 3.78 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0049 <- 4.10 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0052 <- 3.91 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0054 <- 3.74 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx >7amv_BKW:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=ATOMIC STRUCTURE OF THE POXVIRUS TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX IN THE INITIALLY MELTED STATE organism=VACCINIA VIRUS GLV-1H68 : H : THR OG1 K0303 <- 2.92 -> DA N7 T0035 : score 3.33216 : H : THR OG1 K0303 <- 2.92 -> DA N7 T0035 : score 3.33216 : H : ASN OD1 K0307 <- 2.89 -> DA N6 N0025 : score 5.9134 : H : ASN ND2 K0307 <- 3.36 -> DA N7 N0025 : score 5.21302 : H : ARG NH2 K0370 <- 2.65 -> DG N7 N0017 : score 6.57615 : H : GLN NE2 K0373 <- 2.97 -> DT O4 N0016 : score 5.01453 : V : LYS CE K0328 <- 3.51 -> DT C7 N0026 : score 2.7896 : V : TYR CG K0367 <- 3.57 -> DT C7 T0042 : score 3.95668 : x : LYS xxxx B0390 <- 3.67 -> DT xxx T0036 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0288 <- 4.20 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx K0304 <- 4.20 -> DA xxx T0035 : score x.xxxxx : x : THR xxxx K0305 <- 3.18 -> DT xxx T0036 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx K0308 <- 3.46 -> DA xxx T0035 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0317 <- 3.60 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx K0319 <- 3.49 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0369 <- 3.69 -> DT xxx T0042 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx K0378 <- 4.30 -> DA xxx N0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx K0473 <- 3.76 -> DT xxx T0050 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx W0197 <- 3.57 -> DG xxx N0058 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx W0271 <- 3.24 -> DC xxx N0054 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx W0273 <- 3.37 -> DG xxx T0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx W0391 <- 3.95 -> DG xxx T0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx W0394 <- 4.08 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx >7amv_W:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=ATOMIC STRUCTURE OF THE POXVIRUS TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX IN THE INITIALLY MELTED STATE organism=VACCINIA VIRUS GLV-1H68 : x : LYS xxxx W0197 <- 3.57 -> DG xxx N0058 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx W0271 <- 3.24 -> DC xxx N0054 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx W0273 <- 3.37 -> DG xxx T0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx W0391 <- 3.95 -> DG xxx T0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx W0394 <- 4.08 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx >7aoh_ABY:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=ATOMIC STRUCTURE OF THE POXVIRUS LATE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX organism=VACCINIA VIRUS GLV-1H68 : V : LYS CE Y0153 <- 3.88 -> DT C7 N0016 : score 2.54901 : x : GLN xxxx A0381 <- 3.59 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0382 <- 3.91 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0749 <- 3.16 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0750 <- 3.88 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Y0154 <- 2.78 -> DG xxx N0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Y0286 <- 3.06 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Y0288 <- 3.25 -> DA xxx T0045 : score x.xxxxx >7aoh_Y:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=ATOMIC STRUCTURE OF THE POXVIRUS LATE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX organism=VACCINIA VIRUS GLV-1H68 : V : LYS CE Y0153 <- 3.88 -> DT C7 N0016 : score 2.54901 : x : GLU xxxx Y0154 <- 2.78 -> DG xxx N0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx Y0286 <- 3.06 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Y0288 <- 3.25 -> DA xxx T0045 : score x.xxxxx >7ap9_AB: title=ATOMIC STRUCTURE OF THE POXVIRUS INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX IN CONFORMATION 3 organism=VACCINIA VIRUS GLV-1H68 : x : TRP xxxx A0209 <- 4.43 -> DG xxx T0025 : score x.xxxxx >7apd_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=BOVINE PAPILLOMAVIRUS E1 DNA HELICASE-REPLICATION FORK COMPLEX organism=BOVINE PAPILLOMAVIRUS : x : LYS xxxx A0356 <- 2.69 -> DG xxx P0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0359 <- 4.21 -> DG xxx P0026 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0507 <- 3.46 -> DT xxx P0032 : score x.xxxxx >7apd_ABF:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=BOVINE PAPILLOMAVIRUS E1 DNA HELICASE-REPLICATION FORK COMPLEX organism=BOVINE PAPILLOMAVIRUS : x : SER xxxx B0462 <- 4.35 -> DT xxx P0030 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0356 <- 1.92 -> DG xxx P0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0462 <- 3.23 -> DT xxx P0034 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0507 <- 2.87 -> DT xxx P0030 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0356 <- 2.69 -> DG xxx P0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0359 <- 4.21 -> DG xxx P0026 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0507 <- 3.46 -> DT xxx P0032 : score x.xxxxx >7at8_D:Histone-fold; title=HISTONE H3 RECOGNITION BY NUCLEOSOME-BOUND PRC2 SUBUNIT EZH2. organism=? : x : ARG xxxx D0040 <- 3.76 -> DT xxx U0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0083 <- 3.63 -> DG xxx T-024 : score x.xxxxx >7aud_E:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;HRDC-like; title=STRUCTURE OF AN ENGINEERED HELICASE DOMAIN CONSTRUCT FOR HUMAN BLOOM SYNDROME PROTEIN (BLM) organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx E0996 <- 3.47 -> DT xxx M0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0999 <- 4.12 -> DG xxx M0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E1003 <- 3.11 -> DC xxx Q0005 : score x.xxxxx >7aw7_ABCDE:Histone-fold;Leucine_zipper_domain; title=CCAAT-BINDING COMPLEX AND HAPX BOUND TO ASPERGILLUS NIDULANS CCCA DNA organism=ASPERGILLUS NIDULANS FGSC A4 : H : ARG NH1 A0273 <- 3.05 -> DT O2 G0012 : score 4.09109 : H : ARG NH1 A0273 <- 2.78 -> DC O2 G0013 : score 3.6646 : H : ARG NH2 A0273 <- 3.12 -> DC O2 G0013 : score 3.462 : H : HIS NE2 A0276 <- 3.17 -> DA N3 G0011 : score 3.93194 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.85 -> DA N3 G0010 : score 3.64523 : H : ARG NH1 D0053 <- 2.99 -> DA N3 G0028 : score 3.54213 : H : GLN OE1 D0072 <- 3.01 -> DC N4 G0030 : score 4.39083 : H : GLN NE2 D0072 <- 3.27 -> DT O4 F0009 : score 4.70307 : H : GLN NE2 E0072 <- 3.07 -> DT O4 G0027 : score 4.91071 : H : ARG NH1 E0076 <- 3.40 -> DG N7 F0010 : score 5.324 : V : PHE CZ E0075 <- 3.81 -> DT C7 G0027 : score 7.09708 : V : PHE CZ D0075 <- 3.69 -> DT C7 F0009 : score 7.31053 : x : ARG xxxx A0282 <- 3.82 -> DG xxx F0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0287 <- 3.59 -> DC xxx G0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0288 <- 3.16 -> DG xxx F0031 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0051 <- 4.47 -> DT xxx F0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0051 <- 4.32 -> DT xxx F0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0067 <- 4.19 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0076 <- 3.98 -> DC xxx G0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0064 <- 3.39 -> DG xxx G0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0068 <- 3.82 -> DA xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0069 <- 4.46 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx >7aw7_D:Leucine_zipper_domain; title=CCAAT-BINDING COMPLEX AND HAPX BOUND TO ASPERGILLUS NIDULANS CCCA DNA organism=? : H : ARG NH1 D0053 <- 2.99 -> DA N3 G0028 : score 3.54213 : H : GLN OE1 D0072 <- 3.01 -> DC N4 G0030 : score 4.39083 : H : GLN NE2 D0072 <- 3.27 -> DT O4 F0009 : score 4.70307 : V : PHE CZ D0075 <- 3.69 -> DT C7 F0009 : score 7.31053 : x : PRO xxxx D0051 <- 4.32 -> DT xxx F0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0067 <- 4.19 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0076 <- 3.98 -> DC xxx G0029 : score x.xxxxx >7aw9_ABCDE:Histone-fold;Leucine_zipper_domain; title=CCAAT-BINDING COMPLEX AND HAPX BOUND TO ASPERGILLUS FUMIGATUS CCCA DNA organism=ASPERGILLUS NIDULANS FGSC A4 : H : ARG NH1 A0273 <- 2.68 -> DC O2 G0013 : score 3.7376 : H : ARG NH2 A0273 <- 2.85 -> DC O2 G0013 : score 3.66173 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.64 -> DA N3 G0010 : score 3.79988 : H : ARG NH1 A0282 <- 3.35 -> DG N3 F0031 : score 2.71678 : H : GLN OE1 E0072 <- 3.00 -> DA N6 F0012 : score 5.81046 : V : PHE CZ E0075 <- 3.66 -> DT C7 G0027 : score 7.36389 : x : HIS xxxx A0276 <- 3.24 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0277 <- 4.46 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0287 <- 4.06 -> DC xxx G0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0288 <- 3.53 -> DC xxx G0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0051 <- 4.02 -> DT xxx F0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0051 <- 3.78 -> DG xxx G0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0053 <- 3.00 -> DT xxx G0028 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0072 <- 2.84 -> DC xxx G0031 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0075 <- 4.14 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0076 <- 3.95 -> DT xxx G0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0064 <- 3.64 -> DT xxx G0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0076 <- 4.48 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx >7b0c_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=[4FE-4S]-NSRR COMPLEXED TO 23-BP HMPA1 OPERATOR FRAGMENT organism=Streptomyces coelicolor A3(2) / Streptomyces coelicolor A3(2) : H : ARG NH2 A0060 <- 2.82 -> DC O2 C0003 : score 3.68392 : x : THR xxxx A0041 <- 3.57 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0042 <- 3.62 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0045 <- 3.21 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx >7b0c_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=[4FE-4S]-NSRR COMPLEXED TO 23-BP HMPA1 OPERATOR FRAGMENT organism=Streptomyces coelicolor A3(2) / Streptomyces coelicolor A3(2) / Streptomyces coelicolor A3(2) / Streptomyces coelicolor A3(2) : H : ARG NH2 A0060 <- 2.82 -> DC O2 C0003 : score 3.68392 : H : LYS NZ B0045 <- 3.29 -> DG O6 D0006 : score 5.21425 : H : ARG NH2 B0060 <- 2.79 -> DT O2 D0003 : score 4.2418 : x : THR xxxx A0041 <- 3.57 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0042 <- 3.62 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0045 <- 3.21 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0040 <- 3.72 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0041 <- 3.56 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0042 <- 3.54 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx >7b0f_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TGOT_6G12 BINARY COMPLEX organism=Thermococcus gorgonarius : H : LYS NZ A0592 <- 2.75 -> DT O2 B0011 : score 3.62305 : x : TYR xxxx A0494 <- 4.15 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0541 <- 4.48 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx >7b0g_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TGOT_6G12 BINARY WITH 2 HCTPS organism=Thermococcus gorgonarius : H : LYS NZ A0592 <- 2.81 -> DA N3 P0011 : score 2.77137 : x : THR xxxx A0349 <- 3.95 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0494 <- 3.89 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx >7b0h_E:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TGOT_6G12 TERNARY COMPLEX organism=Thermococcus gorgonarius : H : LYS NZ E0592 <- 2.77 -> DT O2 G0011 : score 3.6087 : x : THR xxxx E0349 <- 4.29 -> DA xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E0488 <- 3.56 -> DA xxx A0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0492 <- 3.37 -> DA xxx A0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0494 <- 4.01 -> DA xxx A0005 : score x.xxxxx >7b0y_ABE: title=STRUCTURE OF A TRANSCRIBING RNA POLYMERASE II-U1 SNRNP COMPLEX organism=SUS SCROFA DOMESTICUS : H : LYS NZ A0331 <- 2.51 -> DG N7 T0035 : score 5.69828 : H : LYS NZ A0331 <- 2.51 -> DG N7 T0035 : score 5.69828 : H : ARG NH2 A1416 <- 2.60 -> DT O2 T0021 : score 4.40267 : H : LYS NZ B0327 <- 3.17 -> DG O6 N0021 : score 5.35299 : H : ASN OD1 B0410 <- 2.90 -> DT N3 N0017 : score 3.72526 : H : HIS ND1 B0460 <- 2.54 -> DC O2 N0024 : score 3.39203 : x : MET xxxx A0266 <- 4.36 -> DT xxx T0034 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0272 <- 3.58 -> DT xxx T0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0327 <- 3.55 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0329 <- 3.99 -> DC xxx N0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 4.19 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.40 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 4.09 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1417 <- 4.36 -> DG xxx N0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0222 <- 4.38 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0230 <- 4.19 -> DT xxx N0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0231 <- 3.19 -> DT xxx N0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0233 <- 4.36 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0234 <- 3.99 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0262 <- 3.36 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0264 <- 3.46 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0338 <- 3.34 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0409 <- 3.36 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0455 <- 2.89 -> DC xxx N0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0457 <- 3.28 -> DC xxx N0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0458 <- 3.06 -> DC xxx N0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0461 <- 3.24 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0492 <- 2.72 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0494 <- 4.38 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx >7b0y_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=STRUCTURE OF A TRANSCRIBING RNA POLYMERASE II-U1 SNRNP COMPLEX organism=SUS SCROFA DOMESTICUS : H : LYS NZ B0327 <- 3.17 -> DG O6 N0021 : score 5.35299 : H : ASN OD1 B0410 <- 2.90 -> DT N3 N0017 : score 3.72526 : H : HIS ND1 B0460 <- 2.54 -> DC O2 N0024 : score 3.39203 : x : ARG xxxx B0222 <- 4.38 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0230 <- 4.19 -> DT xxx N0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0231 <- 3.19 -> DT xxx N0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0233 <- 4.36 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0234 <- 3.99 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0262 <- 3.36 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0264 <- 3.46 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0338 <- 3.34 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0409 <- 3.36 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0455 <- 2.89 -> DC xxx N0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0457 <- 3.28 -> DC xxx N0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0458 <- 3.06 -> DC xxx N0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0461 <- 3.24 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0492 <- 2.72 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0494 <- 4.38 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx >7b1y_ABCD:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;C-terminal_domain_of_transcriptional_repressors;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=DTXR-LIKE IRON-DEPENDENT REGULATOR IDER COMPLEXED WITH COBALT AND ITS CONSENSUS DNA-BINDING SEQUENCE organism=? : H : GLN OE1 A0043 <- 2.76 -> DC N4 F0020 : score 4.62 : H : GLN OE1 B0043 <- 3.09 -> DC N4 E0015 : score 4.3175 : w : GLN OE1 B0043 <- 5.63 -> DC N4 E0016 : score 3.488 : H : GLN OE1 D0043 <- 2.81 -> DC N4 E0020 : score 4.57417 : w : GLN OE1 D0043 <- 5.67 -> DC N4 E0021 : score 3.488 : x : SER xxxx A0037 <- 3.20 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0039 <- 3.42 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0040 <- 3.24 -> DC xxx F0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 4.10 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0047 <- 3.68 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0037 <- 3.27 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0039 <- 3.41 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0040 <- 3.21 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0042 <- 4.31 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0047 <- 3.89 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0037 <- 3.29 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0039 <- 3.40 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0040 <- 3.21 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0042 <- 4.38 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0043 <- 3.33 -> DG xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0047 <- 3.87 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0060 <- 4.40 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0037 <- 3.15 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0039 <- 3.35 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0040 <- 3.29 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 4.12 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0047 <- 3.94 -> DA xxx E0019 : score x.xxxxx >7b1y_D:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=DTXR-LIKE IRON-DEPENDENT REGULATOR IDER COMPLEXED WITH COBALT AND ITS CONSENSUS DNA-BINDING SEQUENCE organism=? : H : GLN OE1 D0043 <- 2.81 -> DC N4 E0020 : score 4.57417 : w : GLN OE1 D0043 <- 5.67 -> DC N4 E0021 : score 3.488 : x : SER xxxx D0037 <- 3.15 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0039 <- 3.35 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0040 <- 3.29 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 4.12 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0047 <- 3.94 -> DA xxx E0019 : score x.xxxxx >7b20_ABCD:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;C-terminal_domain_of_transcriptional_repressors;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=DTXR-LIKE IRON-DEPENDENT REGULATOR IDER COMPLEXED WITH IRON AND ITS CONSENSUS DNA-BINDING SEQUENCE organism=? : H : GLN OE1 A0043 <- 2.81 -> DC N4 F0020 : score 4.57417 : w : GLN OE1 A0043 <- 5.67 -> DC N4 F0021 : score 3.488 : H : GLN OE1 B0043 <- 3.19 -> DC N4 E0015 : score 4.22583 : w : GLN OE1 B0043 <- 5.71 -> DC N4 E0016 : score 3.488 : H : GLN OE1 D0043 <- 2.84 -> DC N4 E0020 : score 4.54667 : w : GLN OE1 D0043 <- 5.79 -> DC N4 E0021 : score 3.488 : V : PRO CG A0039 <- 3.71 -> DT C7 F0022 : score 6.50205 : V : PRO CG D0039 <- 3.69 -> DT C7 E0022 : score 6.53385 : x : SER xxxx A0037 <- 3.19 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0040 <- 3.31 -> DC xxx F0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 4.14 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0047 <- 3.42 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0037 <- 3.33 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0039 <- 3.39 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0040 <- 3.33 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0042 <- 4.32 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0047 <- 3.60 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0037 <- 3.32 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0039 <- 3.40 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0040 <- 3.31 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0042 <- 4.23 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0043 <- 3.47 -> DG xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0047 <- 4.06 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0037 <- 3.20 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0040 <- 3.38 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 4.21 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0047 <- 3.46 -> DA xxx E0019 : score x.xxxxx >7b20_D:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=DTXR-LIKE IRON-DEPENDENT REGULATOR IDER COMPLEXED WITH IRON AND ITS CONSENSUS DNA-BINDING SEQUENCE organism=? : H : GLN OE1 D0043 <- 2.84 -> DC N4 E0020 : score 4.54667 : w : GLN OE1 D0043 <- 5.79 -> DC N4 E0021 : score 3.488 : V : PRO CG D0039 <- 3.69 -> DT C7 E0022 : score 6.53385 : x : SER xxxx D0037 <- 3.20 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0040 <- 3.38 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 4.21 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0047 <- 3.46 -> DA xxx E0019 : score x.xxxxx >7b23_ABCD:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;C-terminal_domain_of_transcriptional_repressors;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=DTXR-LIKE IRON-DEPENDENT REGULATOR IDER COMPLEXED WITH COBALT AND THE SACE_2689 PROMOTER DNA-BINDING SEQUENCE organism=? : H : GLN OE1 A0043 <- 2.81 -> DC N4 F0021 : score 4.57417 : w : GLN OE1 A0043 <- 5.88 -> DC N4 F0022 : score 3.488 : H : GLN OE1 B0043 <- 3.21 -> DC N4 E0016 : score 4.2075 : H : GLN OE1 D0043 <- 2.83 -> DC N4 E0021 : score 4.55583 : x : SER xxxx A0037 <- 3.15 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0039 <- 3.38 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0040 <- 3.20 -> DC xxx F0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 4.00 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0047 <- 3.42 -> DA xxx F0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0037 <- 3.46 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0039 <- 3.47 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0040 <- 2.75 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0042 <- 4.24 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0047 <- 3.48 -> DG xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0037 <- 3.52 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0039 <- 3.51 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0040 <- 3.37 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0042 <- 4.19 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0043 <- 3.43 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0047 <- 3.60 -> DA xxx F0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0037 <- 3.91 -> DC xxx E0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0039 <- 3.31 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0040 <- 3.25 -> DC xxx E0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 4.15 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0047 <- 3.46 -> DA xxx E0020 : score x.xxxxx >7b23_D:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=DTXR-LIKE IRON-DEPENDENT REGULATOR IDER COMPLEXED WITH COBALT AND THE SACE_2689 PROMOTER DNA-BINDING SEQUENCE organism=? : H : GLN OE1 D0043 <- 2.83 -> DC N4 E0021 : score 4.55583 : x : SER xxxx D0037 <- 3.91 -> DC xxx E0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0039 <- 3.31 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0040 <- 3.25 -> DC xxx E0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 4.15 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0047 <- 3.46 -> DA xxx E0020 : score x.xxxxx >7b24_ABCD:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;C-terminal_domain_of_transcriptional_repressors;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=DTXR-LIKE IRON-DEPENDENT REGULATOR IDER (P39G VARIANT) COMPLEXED WITH COBALT AND ITS CONSENSUS DNA-BINDING SEQUENCE organism=? : H : GLN OE1 A0043 <- 2.86 -> DC N4 F0020 : score 4.52833 : w : GLN OE1 A0043 <- 5.69 -> DC N4 F0021 : score 3.488 : H : GLN OE1 B0043 <- 3.24 -> DC N4 E0016 : score 4.18 : w : GLN OE1 B0043 <- 5.63 -> DC N4 E0017 : score 3.488 : w : GLN OE1 C0043 <- 5.52 -> DC N4 F0016 : score 3.488 : H : GLN OE1 D0043 <- 2.87 -> DC N4 E0021 : score 4.51917 : w : GLN OE1 D0043 <- 5.85 -> DC N4 E0022 : score 3.488 : x : SER xxxx A0037 <- 3.34 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0040 <- 3.50 -> DC xxx F0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 4.18 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0047 <- 4.03 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0037 <- 3.48 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0040 <- 3.52 -> DC xxx E0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0047 <- 4.13 -> DG xxx E0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0037 <- 3.46 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0040 <- 3.51 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0047 <- 4.09 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0037 <- 3.31 -> DT xxx E0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0040 <- 3.56 -> DC xxx E0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 3.95 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0047 <- 4.22 -> DA xxx E0020 : score x.xxxxx >7b24_C:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;C-terminal_domain_of_transcriptional_repressors;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=DTXR-LIKE IRON-DEPENDENT REGULATOR IDER (P39G VARIANT) COMPLEXED WITH COBALT AND ITS CONSENSUS DNA-BINDING SEQUENCE organism=? : w : GLN OE1 C0043 <- 5.52 -> DC N4 F0016 : score 3.488 : x : SER xxxx C0037 <- 3.46 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0040 <- 3.51 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0047 <- 4.09 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx >7b25_ABCD:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;C-terminal_domain_of_transcriptional_repressors;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=DTXR-LIKE IRON-DEPENDENT REGULATOR IDER (Q43A VARIANT) COMPLEXED WITH COBALT AND ITS CONSENSUS DNA-BINDING SEQUENCE organism=? : V : PRO CG A0039 <- 3.70 -> DT C7 F0022 : score 6.51795 : V : PRO CG D0039 <- 3.74 -> DT C7 E0022 : score 6.45436 : x : SER xxxx A0037 <- 3.16 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0040 <- 3.30 -> DC xxx F0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 4.24 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0047 <- 3.37 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0037 <- 3.23 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0039 <- 3.42 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0040 <- 3.37 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0042 <- 4.15 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0047 <- 3.65 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0060 <- 4.44 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0037 <- 3.23 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0039 <- 3.40 -> DT xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0040 <- 3.31 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0042 <- 4.13 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0047 <- 4.16 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0037 <- 3.06 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0040 <- 3.17 -> DC xxx E0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0042 <- 4.06 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0047 <- 3.30 -> DA xxx E0019 : score x.xxxxx >7b25_B:Iron-dependent_repressor_protein,_dimerization_domain;C-terminal_domain_of_transcriptional_repressors;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=DTXR-LIKE IRON-DEPENDENT REGULATOR IDER (Q43A VARIANT) COMPLEXED WITH COBALT AND ITS CONSENSUS DNA-BINDING SEQUENCE organism=? : x : SER xxxx B0037 <- 3.23 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0039 <- 3.42 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0040 <- 3.37 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0042 <- 4.15 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0047 <- 3.65 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0060 <- 4.44 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx >7b46_AC: title=STRUCTURAL BASIS OF REACTIVATION OF ONCOGENIC P53 MUTANTS BY A SMALL MOLECULE: METHYLENE QUINUCLIDINONE (MQ). HUMAN WILD-TYPE P53DBD BOUND TO DNA AND MQ: WT-DNA-MQ (P1) organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 C0280 <- 2.90 -> DG O6 e0019 : score 5.96167 : H : ARG NH2 C0280 <- 2.93 -> DG N7 e0019 : score 6.21862 >7b46_B:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL BASIS OF REACTIVATION OF ONCOGENIC P53 MUTANTS BY A SMALL MOLECULE: METHYLENE QUINUCLIDINONE (MQ). HUMAN WILD-TYPE P53DBD BOUND TO DNA AND MQ: WT-DNA-MQ (P1) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ B0120 <- 3.37 -> DG N7 F0003 : score 4.77191 : H : LYS NZ B0120 <- 2.73 -> DG O6 F0004 : score 5.8617 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.97 -> DG O6 E0008 : score 5.8765 : H : ARG NH2 B0280 <- 2.98 -> DG N7 E0008 : score 6.15477 : x : ALA xxxx B0276 <- 4.42 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0277 <- 3.56 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx >7b49_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL BASIS OF REACTIVATION OF ONCOGENIC P53 MUTANTS BY A SMALL MOLECULE: METHYLENE QUINUCLIDINONE (MQ). HUMAN P53DBD-R273H MUTANT BOUND TO DNA AND MQ: R273H-DNA-MQ organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 3.02 -> DG N7 C0003 : score 5.14892 : H : LYS NZ A0120 <- 2.92 -> DG O6 C0003 : score 5.64203 : H : LYS NZ A0120 <- 2.80 -> DG O6 C0004 : score 5.78077 : w : ARG NH1 A0280 <- 6.20 -> DG O6 C0004 : score 2.756 : x : ARG xxxx A0248 <- 3.49 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx >7b49_AB: title=STRUCTURAL BASIS OF REACTIVATION OF ONCOGENIC P53 MUTANTS BY A SMALL MOLECULE: METHYLENE QUINUCLIDINONE (MQ). HUMAN P53DBD-R273H MUTANT BOUND TO DNA AND MQ: R273H-DNA-MQ organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 3.02 -> DG N7 C0003 : score 5.14892 : H : LYS NZ A0120 <- 2.92 -> DG O6 C0003 : score 5.64203 : H : LYS NZ A0120 <- 2.80 -> DG O6 C0004 : score 5.78077 : H : LYS NZ B0120 <- 2.91 -> DG N7 C0013 : score 5.26741 : H : LYS NZ B0120 <- 3.01 -> DG O6 C0013 : score 5.53798 : H : LYS NZ B0120 <- 2.79 -> DG O6 C0014 : score 5.79233 >7b4a_AB: title=STRUCTURAL BASIS OF REACTIVATION OF ONCOGENIC P53 MUTANTS BY A SMALL MOLECULE: METHYLENE QUINUCLIDINONE (MQ). HUMAN P53DBD-R273H MUTANT BOUND TO DNA: R273H-DNA organism=Homo sapiens : H : CYS SG A0277 <- 3.44 -> DC N4 C0018 : score -3.02741 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.99 -> DG O6 C0017 : score 5.85217 : H : ARG NH2 A0280 <- 3.02 -> DG N7 C0017 : score 6.10369 : H : CYS SG B0277 <- 3.37 -> DC N4 C0008 : score -3.07601 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.91 -> DG O6 C0007 : score 5.9495 : H : ARG NH2 B0280 <- 3.05 -> DG N7 C0007 : score 6.06538 : x : LYS xxxx A0120 <- 3.97 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 4.13 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0120 <- 3.95 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 4.15 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >7b4a_B:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL BASIS OF REACTIVATION OF ONCOGENIC P53 MUTANTS BY A SMALL MOLECULE: METHYLENE QUINUCLIDINONE (MQ). HUMAN P53DBD-R273H MUTANT BOUND TO DNA: R273H-DNA organism=Homo sapiens : H : CYS SG B0277 <- 3.37 -> DC N4 C0008 : score -3.07601 : H : ARG NH1 B0280 <- 2.91 -> DG O6 C0007 : score 5.9495 : H : ARG NH2 B0280 <- 3.05 -> DG N7 C0007 : score 6.06538 : x : LYS xxxx B0120 <- 3.95 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 4.15 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >7b4d_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL BASIS OF REACTIVATION OF ONCOGENIC P53 MUTANTS BY A SMALL MOLECULE: METHYLENE QUINUCLIDINONE (MQ). HUMAN P53DBD-R273C/S240R DOUBLE MUTANT BOUND TO DNA AND MQ: R273C/S240R-DNA-MQ organism=Homo sapiens : H : CYS SG A0277 <- 3.37 -> DC N4 C0009 : score -3.07601 : H : ARG NH1 A0280 <- 2.84 -> DG O6 C0008 : score 6.03467 : H : ARG NH2 A0280 <- 2.91 -> DG N7 C0008 : score 6.24415 : x : LYS xxxx A0120 <- 4.23 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0276 <- 4.24 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx >7b4e_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL BASIS OF REACTIVATION OF ONCOGENIC P53 MUTANTS BY A SMALL MOLECULE: METHYLENE QUINUCLIDINONE (MQ). HUMAN P53DBD-R282W MUTANT BOUND TO DNA AND MQ: R282W-DNA-MQ organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0280 <- 5.57 -> DG O6 B0004 : score 2.756 >7b4f_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL BASIS OF REACTIVATION OF ONCOGENIC P53 MUTANTS BY A SMALL MOLECULE: METHYLENE QUINUCLIDINONE (MQ). HUMAN P53DBD-R282W MUTANT BOUND TO DNA: R282W-MQ (I) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 2.87 -> DG N7 B0003 : score 5.31049 : H : LYS NZ A0120 <- 3.24 -> DG O6 B0003 : score 5.27206 : H : LYS NZ A0120 <- 2.61 -> DG O6 B0004 : score 6.00044 : w : SER OG A0121 <- 5.58 -> DG N7 B0002 : score 2.749 : w : ARG NH1 A0280 <- 5.86 -> DG N7 B0004 : score 2.063 >7b4g_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL BASIS OF REACTIVATION OF ONCOGENIC P53 MUTANTS BY A SMALL MOLECULE: METHYLENE QUINUCLIDINONE (MQ). HUMAN P53DBD-R282W MUTANT BOUND TO DNA: R282W-MQ (II) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 2.91 -> DG N7 B0003 : score 5.26741 : H : LYS NZ A0120 <- 2.97 -> DG O6 B0003 : score 5.58422 : H : LYS NZ A0120 <- 2.66 -> DG O6 B0004 : score 5.94263 : w : SER OG A0121 <- 5.41 -> DG N7 B0002 : score 2.749 : x : ARG xxxx A0280 <- 3.36 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx >7b4h_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL BASIS OF REACTIVATION OF ONCOGENIC P53 MUTANTS BY A SMALL MOLECULE: METHYLENE QUINUCLIDINONE (MQ). HUMAN WILD-TYPE P53DBD BOUND TO DNA AND MQ: WT-DNA-MQ (III) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 3.10 -> DG N7 B0003 : score 5.06274 A : H : LYS NZ A0120 <- 3.15 -> DG O6 B0004 : score 5.37612 A : w : ARG NH1 A0280 <- 6.17 -> DG O6 B0004 : score 2.756 >7b4n_A:p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURAL BASIS OF REACTIVATION OF ONCOGENIC P53 MUTANTS BY A SMALL MOLECULE: METHYLENE QUINUCLIDINONE (MQ). HUMAN WILD-TYPE P53DBD BOUND TO DNA AND MQ: WT-DNA-MQ (II) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0120 <- 2.80 -> DG N7 B0003 : score 5.3859 A : H : LYS NZ A0120 <- 2.65 -> DG O6 B0004 : score 5.95419 A : w : ARG NH1 A0280 <- 6.24 -> DG O6 B0004 : score 2.756 >7b5y_ABCD:TrkA_C-terminal_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=S. AGALACTIAE BUSR IN COMPLEX WITH ITS BUSAB-PROMOTOR DNA organism=STREPTOCOCCUS AGALACTIAE : H : TYR OH B0013 <- 2.57 -> DA N7 F0032 : score 4.34224 : H : LYS NZ B0054 <- 2.95 -> DT O4 E0014 : score 3.47956 : x : SER xxxx C0048 <- 3.86 -> DG xxx E0030 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0013 <- 2.85 -> DG xxx E0032 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0050 <- 3.13 -> DA xxx E0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0053 <- 3.78 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0069 <- 2.74 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0038 <- 2.66 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0048 <- 4.23 -> DA xxx F0033 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0050 <- 2.86 -> DC xxx F0034 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0051 <- 4.07 -> DA xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0053 <- 3.78 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0069 <- 4.30 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0039 <- 4.16 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0043 <- 3.98 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0048 <- 3.30 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx >7b5y_B:TrkA_C-terminal_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=S. AGALACTIAE BUSR IN COMPLEX WITH ITS BUSAB-PROMOTOR DNA organism=? : H : TYR OH B0013 <- 2.57 -> DA N7 F0032 : score 4.34224 : H : LYS NZ B0054 <- 2.95 -> DT O4 E0014 : score 3.47956 : x : ARG xxxx B0038 <- 2.66 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0048 <- 4.23 -> DA xxx F0033 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0050 <- 2.86 -> DC xxx F0034 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0051 <- 4.07 -> DA xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0053 <- 3.78 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0069 <- 4.30 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx >7bca_AB:Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HTH DNA BINDING PROTEIN ARDK FROM R388 PLASMID BOUND TO A DIRECT-REPEAT DNA ELEMENT organism=Escherichia coli K-12 : H : ARG NE A0045 <- 2.72 -> DG N7 C0012 : score 4.49254 : H : ARG NH2 A0045 <- 2.36 -> DG O6 C0012 : score 7.1808 : H : GLN NE2 A0046 <- 3.03 -> DG O6 D0006 : score 5.53809 : H : ARG NH2 B0045 <- 3.16 -> DG O6 C0002 : score 6.1248 : H : GLN NE2 B0046 <- 2.45 -> DG O6 D0016 : score 6.21149 : x : SER xxxx A0044 <- 3.56 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0047 <- 3.49 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0049 <- 3.96 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0044 <- 3.15 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0047 <- 3.43 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0049 <- 3.76 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx >7bca_B:Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HTH DNA BINDING PROTEIN ARDK FROM R388 PLASMID BOUND TO A DIRECT-REPEAT DNA ELEMENT organism=Escherichia coli K-12 : H : ARG NH2 B0045 <- 3.16 -> DG O6 C0002 : score 6.1248 : H : GLN NE2 B0046 <- 2.45 -> DG O6 D0016 : score 6.21149 : V : SER CB B0044 <- 3.63 -> DT C7 D0015 : score 3.26436 : x : ARG xxxx B0047 <- 3.43 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0049 <- 3.76 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx >7bcb_A:Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HTH DNA BINDING PROTEIN ARDK FROM R388 PLASMID BOUND TO IR3 DNA organism=Escherichia coli K-12 : H : ARG NE A0045 <- 2.68 -> DG N7 C0015 : score 4.52792 : H : ARG NH2 A0045 <- 2.59 -> DG O6 C0015 : score 6.8772 : H : ARG NH2 A0045 <- 2.77 -> DT O4 D0003 : score 3.57517 : H : GLN NE2 A0046 <- 2.50 -> DG O6 D0002 : score 6.15344 : V : SER CB A0044 <- 3.78 -> DT C7 D0001 : score 3.14694 >7bcb_AB:Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HTH DNA BINDING PROTEIN ARDK FROM R388 PLASMID BOUND TO IR3 DNA organism=Escherichia coli K-12 : H : ARG NE A0045 <- 2.68 -> DG N7 C0015 : score 4.52792 : H : ARG NH2 A0045 <- 2.59 -> DG O6 C0015 : score 6.8772 : H : ARG NH2 A0045 <- 2.77 -> DT O4 D0003 : score 3.57517 : H : GLN NE2 A0046 <- 2.50 -> DG O6 D0002 : score 6.15344 : H : ARG NE B0045 <- 2.71 -> DG N7 C0005 : score 4.50139 : H : ARG NH2 B0045 <- 2.66 -> DG O6 C0005 : score 6.7848 : H : GLN NE2 B0046 <- 2.49 -> DG O6 D0012 : score 6.16505 : x : SER xxxx A0044 <- 3.78 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0044 <- 3.48 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0047 <- 3.16 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0049 <- 3.61 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx >7bef_ACDFG:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=STRUCTURES OF CLASS II BACTERIAL TRANSCRIPTION COMPLEXES organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / KLEBSIELLA PNEUMONIAE / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : TYR OH C0367 <- 2.91 -> DA N6 N-007 : score 4.56776 : H : GLU OE2 F0116 <- 2.51 -> DA N6 N-009 : score 3.22826 : H : THR OG1 F0429 <- 3.40 -> DA N7 N-010 : score 3.00441 : H : GLN OE1 F0437 <- 3.21 -> DC N4 N-014 : score 4.2075 : H : TRP NE1 G0037 <- 2.25 -> DG N7 N-048 : score -10.1138 : H : GLN OE1 G0087 <- 2.65 -> DA N6 N-038 : score 6.23414 : H : ARG NH2 G0091 <- 2.29 -> DT O4 T0038 : score 3.91634 : V : HIS CG F0455 <- 3.77 -> DT C7 N-019 : score 3.02147 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.56 -> DC xxx N0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0175 <- 3.14 -> DC xxx N0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0177 <- 2.68 -> DG xxx N0000 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0182 <- 3.63 -> DG xxx N-002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 2.60 -> DG xxx N0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.02 -> DG xxx N-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 2.27 -> DG xxx N0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.50 -> DA xxx N-007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0394 <- 2.92 -> DT xxx N-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0473 <- 3.40 -> DC xxx N-004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0504 <- 3.19 -> DA xxx T0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0514 <- 3.07 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0541 <- 2.88 -> DT xxx N0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 2.98 -> DC xxx N0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0259 <- 3.17 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0320 <- 3.00 -> DA xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 3.75 -> DC xxx T0000 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.71 -> DC xxx T0000 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.18 -> DG xxx T-001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.83 -> DG xxx T-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.55 -> DA xxx N-005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.45 -> DA xxx N-007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 3.57 -> DT xxx N-008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.54 -> DA xxx N-009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 2.51 -> DA xxx N-009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0385 <- 2.67 -> DT xxx N-008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 3.34 -> DA xxx N-009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0392 <- 3.04 -> DA xxx N-007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0393 <- 3.40 -> DA xxx N-010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0394 <- 4.43 -> DA xxx T0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0396 <- 3.23 -> DC xxx T0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0397 <- 2.86 -> DC xxx T0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 3.86 -> DT xxx N-013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 4.08 -> DT xxx N-013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 3.99 -> DA xxx N-009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.60 -> DT xxx N-013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0432 <- 4.16 -> DA xxx N-010 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.76 -> DC xxx N-014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0441 <- 3.73 -> DG xxx N-016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0443 <- 4.02 -> DA xxx T0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0458 <- 2.57 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0461 <- 3.04 -> DA xxx T0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0464 <- 3.93 -> DA xxx T0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0468 <- 3.23 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0502 <- 4.05 -> DT xxx T0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0503 <- 3.71 -> DT xxx T0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0505 <- 3.66 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0509 <- 4.03 -> DA xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0511 <- 3.47 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0516 <- 3.67 -> DG xxx T0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0517 <- 4.06 -> DA xxx T0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0522 <- 4.02 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0584 <- 3.06 -> DT xxx T0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0588 <- 4.24 -> DT xxx T0033 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0036 <- 3.61 -> DG xxx N-048 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0040 <- 4.34 -> DT xxx T0046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0041 <- 3.09 -> DT xxx N-050 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0086 <- 3.41 -> DT xxx T0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0095 <- 3.53 -> DA xxx N-041 : score x.xxxxx >7bef_G:Homeodomain-like; title=STRUCTURES OF CLASS II BACTERIAL TRANSCRIPTION COMPLEXES organism=KLEBSIELLA PNEUMONIAE : H : TRP NE1 G0037 <- 2.25 -> DG N7 N-048 : score -10.1138 : H : GLN OE1 G0087 <- 2.65 -> DA N6 N-038 : score 6.23414 : H : ARG NH2 G0091 <- 2.29 -> DT O4 T0038 : score 3.91634 : x : LYS xxxx G0036 <- 3.61 -> DG xxx N-048 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0040 <- 4.34 -> DT xxx T0046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0041 <- 3.09 -> DT xxx N-050 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0086 <- 3.41 -> DT xxx T0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0095 <- 3.53 -> DA xxx N-041 : score x.xxxxx >7beg_BCDFG:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=STRUCTURES OF CLASS I BACTERIAL TRANSCRIPTION COMPLEXES organism=ESCHERICHIA COLI / KLEBSIELLA PNEUMONIAE : H : ARG NH2 C0470 <- 2.81 -> DG O6 T0009 : score 6.5868 : H : ARG NH2 F0099 <- 2.34 -> DA N3 N-005 : score 3.5378 : H : ASN ND2 F0396 <- 2.46 -> DT O2 T0011 : score 5.06889 : H : ARG NH1 F0423 <- 2.85 -> DA N3 N-011 : score 3.64523 : H : HIS NE2 F0455 <- 2.50 -> DT O4 N-016 : score 5.94551 : H : SER OG F0517 <- 3.19 -> DG O6 T0004 : score 3.77193 : V : TRP CD2 F0434 <- 3.70 -> DT C7 N-012 : score 5.63382 : x : ARG xxxx C0143 <- 3.32 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.24 -> DC xxx N0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 4.03 -> DC xxx N0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0367 <- 4.28 -> DA xxx N-004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.11 -> DG xxx N-002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 2.88 -> DA xxx N-005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0375 <- 4.06 -> DG xxx N-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0394 <- 4.10 -> DG xxx N-002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0497 <- 4.40 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0504 <- 3.69 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0514 <- 4.26 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0541 <- 3.35 -> DA xxx N0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1273 <- 3.44 -> DG xxx T-001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0320 <- 2.93 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0321 <- 4.23 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 4.21 -> DG xxx T-001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.33 -> DG xxx T-002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 2.87 -> DA xxx N-005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 3.57 -> DG xxx N-006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 4.46 -> DT xxx N-007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 3.69 -> DT xxx N-007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0385 <- 3.38 -> DT xxx N-007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 3.36 -> DT xxx N-007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0397 <- 4.17 -> DG xxx T0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 3.04 -> DA xxx N-011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0427 <- 3.30 -> DT xxx N-007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 4.10 -> DA xxx N-008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.56 -> DA xxx N-008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.38 -> DA xxx N-011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0432 <- 3.65 -> DA xxx N-008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.78 -> DA xxx T0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0437 <- 2.45 -> DA xxx T0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 4.01 -> DA xxx T0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0443 <- 4.29 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0454 <- 4.23 -> DT xxx N-016 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0461 <- 3.37 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0503 <- 3.63 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0505 <- 3.58 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0511 <- 2.60 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0514 <- 4.32 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0516 <- 3.07 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0583 <- 3.22 -> DT xxx N-034 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0585 <- 3.09 -> DT xxx N-034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0586 <- 3.96 -> DT xxx N-035 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0094 <- 2.34 -> DT xxx N-075 : score x.xxxxx >7bg9_A:DNA/RNA_polymerases; title=THE CATALYTIC CORE LOBE OF HUMAN TELOMERASE IN COMPLEX WITH A TELOMERIC DNA SUBSTRATE organism=HOMO SAPIENS : V : HIS CB A0752 <- 3.73 -> DT C7 N0013 : score 4.19732 : x : LYS xxxx A0749 <- 3.75 -> DT xxx N0013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0977 <- 4.13 -> DT xxx N0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0980 <- 3.38 -> DT xxx N0014 : score x.xxxxx >7bhy_A:Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=DNA-BINDING DOMAIN OF DEOR IN COMPLEX WITH THE DNA OPERATOR organism=Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 : H : ARG NH1 A0034 <- 3.40 -> DG N7 E0010 : score 5.324 : H : ARG NH2 A0034 <- 2.88 -> DG O6 E0010 : score 6.4944 : H : ARG NH1 A0039 <- 3.03 -> DG N7 G0003 : score 5.7717 : H : ARG NH2 A0039 <- 2.87 -> DG O6 G0003 : score 6.5076 : x : SER xxxx A0033 <- 3.61 -> DG xxx G0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0035 <- 3.63 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0038 <- 3.90 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx >7bhy_AB:Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=DNA-BINDING DOMAIN OF DEOR IN COMPLEX WITH THE DNA OPERATOR organism=Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 : H : ARG NH1 A0034 <- 3.40 -> DG N7 E0010 : score 5.324 : H : ARG NH2 A0034 <- 2.88 -> DG O6 E0010 : score 6.4944 : H : ARG NH1 A0039 <- 3.03 -> DG N7 G0003 : score 5.7717 : H : ARG NH2 A0039 <- 2.87 -> DG O6 G0003 : score 6.5076 : H : ARG NH2 B0034 <- 2.89 -> DA N7 G0010 : score 1.6417 : V : PRO CB B0035 <- 3.77 -> DT C7 E0002 : score 5.8497 : x : SER xxxx A0033 <- 3.61 -> DG xxx G0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0035 <- 3.63 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0038 <- 3.90 -> DG xxx E0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0023 <- 4.29 -> DT xxx G0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0033 <- 4.18 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0036 <- 3.56 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0038 <- 4.15 -> DT xxx G0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0039 <- 4.36 -> DT xxx E0001 : score x.xxxxx >7bil_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HELICASE PIF1 FROM THERMUS OSHIMAI IN COMPLEX WITH OLIGO GGTTTGGTTTGGTT organism=Thermus oshimai JL-2 : H : ARG NH2 A0355 <- 2.46 -> DG N7 C0007 : score 6.81877 : V : PHE CD1 A0394 <- 3.54 -> DT C7 C0008 : score 4.42057 : V : PHE CB B0451 <- 3.74 -> DT C7 C0009 : score 5.88804 : V : TRP CD1 B0396 <- 3.54 -> DT C7 C0013 : score 7.81 : x : HIS xxxx A0131 <- 4.14 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0138 <- 3.55 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0216 <- 3.62 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0218 <- 3.71 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0302 <- 3.63 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0303 <- 4.30 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0358 <- 3.90 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0359 <- 3.94 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0362 <- 3.83 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0392 <- 3.17 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0395 <- 3.57 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0396 <- 2.97 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0397 <- 3.57 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0432 <- 4.44 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0451 <- 3.28 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0131 <- 4.24 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0137 <- 3.21 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0138 <- 3.73 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0177 <- 3.14 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0216 <- 3.46 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0218 <- 3.57 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0302 <- 3.88 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0355 <- 4.27 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0432 <- 4.28 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >7bil_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HELICASE PIF1 FROM THERMUS OSHIMAI IN COMPLEX WITH OLIGO GGTTTGGTTTGGTT organism=Thermus oshimai JL-2 : V : PHE CB B0451 <- 3.74 -> DT C7 C0009 : score 5.88804 : V : TRP CD1 B0396 <- 3.54 -> DT C7 C0013 : score 7.81 : x : HIS xxxx B0131 <- 4.24 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0137 <- 3.21 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0138 <- 3.73 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0177 <- 3.14 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0216 <- 3.46 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0218 <- 3.57 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0302 <- 3.88 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0355 <- 4.27 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0432 <- 4.28 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >7bjq_A:DHH_phosphoesterases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF RECJCDC45 FROM METHANOTHERMOBACTER THERMOAUTOTROFICUS IN COMPLEX WITH SSDNA organism=? : H : ARG NH1 A0073 <- 2.58 -> DG O6 G0005 : score 6.351 : x : SER xxxx A0072 <- 3.71 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx >7bjq_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF RECJCDC45 FROM METHANOTHERMOBACTER THERMOAUTOTROFICUS IN COMPLEX WITH SSDNA organism=? : H : ARG NH1 A0073 <- 2.58 -> DG O6 G0005 : score 6.351 : x : SER xxxx A0072 <- 3.71 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0073 <- 3.37 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0423 <- 3.53 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx >7btq_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=ECOR124I-DNA IN THE RESTRICTION-ALLEVIATION STATE organism=ESCHERICHIA COLI : x : PHE xxxx A0199 <- 3.35 -> DA xxx B0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0302 <- 3.99 -> DA xxx B0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0305 <- 3.17 -> DA xxx B0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0395 <- 4.46 -> DA xxx B0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0396 <- 3.98 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0397 <- 4.35 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx >7btq_ADE:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=ECOR124I-DNA IN THE RESTRICTION-ALLEVIATION STATE organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 E0274 <- 2.42 -> DG O6 C0002 : score 7.1016 : H : ARG NH2 E0274 <- 2.42 -> DG O6 C0002 : score 7.1016 : H : ASP OD1 E0296 <- 2.89 -> DC N4 B0011 : score 5.24866 : H : ASP OD1 E0296 <- 2.89 -> DC N4 B0011 : score 5.24866 : V : GLN CB E0295 <- 3.70 -> DT C7 C0000 : score 1.87969 : x : PHE xxxx A0199 <- 3.35 -> DA xxx B0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0302 <- 3.99 -> DA xxx B0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0305 <- 3.17 -> DA xxx B0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0395 <- 4.46 -> DA xxx B0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0396 <- 3.98 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0397 <- 4.35 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0199 <- 4.15 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0304 <- 4.36 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0305 <- 3.27 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0395 <- 4.12 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0397 <- 4.49 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0029 <- 3.29 -> DT xxx B-002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0033 <- 4.17 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx E0079 <- 3.85 -> DA xxx B0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0080 <- 2.35 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0081 <- 4.40 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0099 <- 4.46 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0131 <- 4.11 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0260 <- 3.85 -> DT xxx C-002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0275 <- 3.36 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0333 <- 3.37 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0334 <- 4.41 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx >7bwd_L:Ubiquitin-like; title=STRUCTURE OF DOT1L-H2BK34UB NUCLEOSOME COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx L0072 <- 4.21 -> DG xxx J0125 : score x.xxxxx >7by0_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF CENP-A NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH THE PHOSPHORYLATED CENP-C organism=GALLUS GALLUS / HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 D0033 <- 2.43 -> DG N3 J0266 : score 3.87742 : H : ARG NH2 G0011 <- 2.46 -> DT O2 I0116 : score 4.5212 : x : GLN xxxx A0066 <- 4.39 -> DG xxx J0236 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0086 <- 3.61 -> DA xxx I0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 3.87 -> DT xxx J0262 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.24 -> DA xxx J0257 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0039 <- 4.36 -> DG xxx J0266 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.45 -> DC xxx J0164 : score x.xxxxx >7by0_C:Histone-fold; title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF CENP-A NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH THE PHOSPHORYLATED CENP-C organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx C0011 <- 3.87 -> DT xxx J0262 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.24 -> DA xxx J0257 : score x.xxxxx >7bzg_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF BACILLUS SUBTILIS HXLR, WILD TYPE IN COMPLEX WITH FORMALDEHYDE AND DNA organism=Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) : H : LYS NZ A0053 <- 3.06 -> DG N7 D0014 : score 5.10583 : H : LYS NZ A0053 <- 2.63 -> DG O6 D0014 : score 5.97732 : w : LYS NZ A0053 <- 6.21 -> DG O6 D0013 : score 3.005 : w : THR OG1 B0051 <- 6.26 -> DA N6 C0015 : score 3.251 : H : GLN NE2 B0052 <- 2.92 -> DG O6 D0003 : score 5.6658 : H : LYS NZ B0053 <- 2.94 -> DG O6 C0014 : score 5.61891 : w : LYS NZ B0053 <- 5.85 -> DG O6 C0014 : score 3.005 : w : LYS NZ B0053 <- 6.01 -> DG O6 C0014 : score 3.005 : x : PHE xxxx A0040 <- 4.36 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0041 <- 4.14 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0052 <- 2.83 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0054 <- 3.63 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0056 <- 4.17 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0078 <- 3.21 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0040 <- 4.22 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0041 <- 3.82 -> DA xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0054 <- 3.82 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0056 <- 4.46 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0078 <- 3.22 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx >7bzg_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF BACILLUS SUBTILIS HXLR, WILD TYPE IN COMPLEX WITH FORMALDEHYDE AND DNA organism=Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) : w : THR OG1 B0051 <- 6.26 -> DA N6 C0015 : score 3.251 : H : GLN NE2 B0052 <- 2.92 -> DG O6 D0003 : score 5.6658 : H : LYS NZ B0053 <- 2.94 -> DG O6 C0014 : score 5.61891 : w : LYS NZ B0053 <- 5.85 -> DG O6 C0014 : score 3.005 : w : LYS NZ B0053 <- 6.01 -> DG O6 C0014 : score 3.005 : x : PHE xxxx B0040 <- 4.22 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0041 <- 3.82 -> DA xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0054 <- 3.82 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0056 <- 4.46 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0078 <- 3.22 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx >7bzg_EF:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF BACILLUS SUBTILIS HXLR, WILD TYPE IN COMPLEX WITH FORMALDEHYDE AND DNA organism=Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) : H : LYS NZ E0053 <- 2.57 -> DT O4 G0006 : score 3.75219 : w : ASN ND2 F0041 <- 6.29 -> DA N7 H0002 : score 1.989 : H : GLN NE2 F0052 <- 3.18 -> DG O6 H0003 : score 5.36394 : w : GLN NE2 F0052 <- 6.59 -> DA N6 G0017 : score 2.804 : H : LYS NZ F0053 <- 2.46 -> DG O6 G0014 : score 6.17386 : w : LYS NZ F0053 <- 5.09 -> DG N7 G0014 : score 2.519 : x : PHE xxxx E0040 <- 4.34 -> DA xxx G0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0041 <- 4.08 -> DA xxx G0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0052 <- 2.72 -> DG xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E0054 <- 3.90 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0056 <- 4.40 -> DT xxx G0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0078 <- 3.37 -> DC xxx G0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0040 <- 4.38 -> DA xxx H0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0051 <- 4.20 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0054 <- 3.81 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0078 <- 3.16 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx >7bzg_IJ:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF BACILLUS SUBTILIS HXLR, WILD TYPE IN COMPLEX WITH FORMALDEHYDE AND DNA organism=Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) : H : LYS NZ I0053 <- 2.99 -> DG O6 L0014 : score 5.5611 : H : LYS NZ J0053 <- 2.90 -> DG O6 K0014 : score 5.66515 : w : LYS NZ J0053 <- 5.29 -> DG N7 K0014 : score 2.519 : x : PHE xxxx I0040 <- 4.39 -> DA xxx K0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0041 <- 4.04 -> DA xxx K0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0051 <- 4.33 -> DT xxx L0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0052 <- 3.22 -> DG xxx K0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0054 <- 3.87 -> DG xxx L0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0056 <- 4.07 -> DT xxx K0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0078 <- 3.11 -> DC xxx K0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0041 <- 3.67 -> DA xxx L0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0051 <- 3.93 -> DT xxx K0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx J0052 <- 2.94 -> DA xxx K0017 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J0054 <- 4.09 -> DG xxx K0014 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0078 <- 3.19 -> DC xxx L0001 : score x.xxxxx >7c0g_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=ACA1 IN COMPLEX WITH 14BP PALINDROMIC DNA TARGET organism=PSEUDOMONAS PHAGE JBD30 : w : SER OG B0042 <- 6.16 -> DG N7 D0012 : score 2.749 : H : ARG NE B0044 <- 2.82 -> DG O6 C0002 : score 3.92526 : H : ARG NH2 B0044 <- 3.13 -> DG N7 C0002 : score 5.96323 : H : ARG NE B0047 <- 2.74 -> DG N7 C0001 : score 4.47486 : H : ARG NH2 B0047 <- 2.73 -> DG O6 C0001 : score 6.6924 : H : TYR OH B0048 <- 3.00 -> DC N4 C0003 : score 4.04554 : H : ARG NH1 B0059 <- 2.57 -> DG N7 D0010 : score 6.3283 : H : ARG NH2 B0059 <- 2.68 -> DG O6 D0010 : score 6.7584 : V : VAL CG2 B0045 <- 3.88 -> DT C7 D0011 : score 6.00062 >7c0j_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CHIMERIC MUTANT OF GH5 IN COMPLEX WITH Z-DNA organism=GALLUS GALLUS, HOMO SAPIENS : x : TYR xxxx A1177 <- 3.44 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0088 <- 4.36 -> DG xxx D0002 : score x.xxxxx >7c0m_a:Histone-fold; title=HUMAN CGAS-NUCLEOSOME COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx a0040 <- 3.56 -> DG xxx j0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a0083 <- 3.83 -> DG xxx i0049 : score x.xxxxx >7c0m_abcdefgh:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=HUMAN CGAS-NUCLEOSOME COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 h0033 <- 2.70 -> DC O2 j0026 : score 3.77269 : x : ARG xxxx a0040 <- 3.56 -> DG xxx j0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a0083 <- 3.83 -> DG xxx i0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx c0042 <- 3.90 -> DG xxx i0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx d0033 <- 2.85 -> DG xxx j0121 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx e0040 <- 3.09 -> DG xxx j0065 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx e0083 <- 4.15 -> DT xxx j0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx f0045 <- 4.34 -> DC xxx i0080 : score x.xxxxx >7c17_ACDFGH:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators;Translation_proteins_SH3-like_domain;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI CUER TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX WITH FULLY DUPLEX PROMOTER DNA organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NH1 C0201 <- 2.94 -> DG O6 10075 : score 5.913 : H : ARG NH2 C0371 <- 2.94 -> DG O6 10073 : score 6.4152 : H : THR OG1 D0790 <- 2.94 -> DC N3 20012 : score 1.18509 : H : THR OG1 F0432 <- 3.43 -> DA N7 10069 : score 2.98393 : H : ARG NH1 F0584 <- 2.40 -> DG O6 20046 : score 6.57 : H : ARG NH2 F0584 <- 2.51 -> DG N7 20046 : score 6.75492 : H : GLU OE2 F0585 <- 2.41 -> DA N6 10043 : score 3.28928 : H : LYS NZ G0015 <- 2.96 -> DG N7 10058 : score 5.21355 : H : LYS NZ G0015 <- 2.80 -> DG O6 10058 : score 5.78077 : H : LYS NZ H0015 <- 2.66 -> DG N7 20040 : score 5.5367 : H : LYS NZ H0015 <- 2.80 -> DG O6 20040 : score 5.78077 : H : LYS NZ H0015 <- 2.97 -> DG O6 20041 : score 5.58422 : V : GLN CG F0589 <- 3.76 -> DT C7 10040 : score 3.28794 : V : GLN CG F0437 <- 3.71 -> DT C7 10064 : score 3.32863 : V : TRP CD1 F0434 <- 3.59 -> DT C7 10065 : score 7.71833 : x : ASP xxxx C0199 <- 4.48 -> DC xxx 10076 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 3.42 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0481 <- 3.82 -> DA xxx 10069 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0541 <- 4.42 -> DA xxx 20011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 4.26 -> DA xxx 20011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0212 <- 4.30 -> DG xxx 20002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 2.97 -> DG xxx 10075 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.32 -> DC xxx 20012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0096 <- 4.17 -> DG xxx 10073 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.30 -> DG xxx 10072 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 2.69 -> DA xxx 10074 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.31 -> DG xxx 10072 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 3.87 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 4.09 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0111 <- 4.23 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0116 <- 4.39 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 3.58 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0385 <- 3.36 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 3.51 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0388 <- 4.43 -> DG xxx 10072 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0401 <- 3.23 -> DG xxx 10072 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 4.34 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 4.12 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 3.45 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 4.12 -> DA xxx 10069 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.46 -> DA xxx 10068 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.42 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.51 -> DT xxx 10065 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0436 <- 3.47 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 3.49 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0441 <- 4.38 -> DT xxx 10063 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0455 <- 3.25 -> DA xxx 10060 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0458 <- 4.14 -> DA xxx 20026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0586 <- 4.27 -> DT xxx 10041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0588 <- 3.69 -> DT xxx 20047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0018 <- 3.66 -> DT xxx 20030 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0019 <- 3.55 -> DC xxx 10055 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0036 <- 4.23 -> DG xxx 10062 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0014 <- 3.77 -> DT xxx 10047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0018 <- 3.09 -> DC xxx 10049 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0019 <- 3.52 -> DA xxx 20038 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0036 <- 3.39 -> DG xxx 20046 : score x.xxxxx >7c4p_B:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DBD PLASMA TREATED ZEBRAFISH TRF2 MYB-DOMAIN COMPLEXED WITH DNA organism=? : H : ARG NH1 B0522 <- 2.96 -> DT O2 E0008 : score 4.16861 : H : LYS NZ B0563 <- 3.15 -> DG N7 E0004 : score 5.00888 : H : LYS NZ B0563 <- 2.87 -> DG O6 E0004 : score 5.69984 : H : ASP OD2 B0564 <- 2.87 -> DC N4 F0008 : score 6.1132 : H : ARG NH1 B0567 <- 2.89 -> DG N7 E0005 : score 5.9411 : H : ARG NH2 B0567 <- 2.84 -> DG O6 E0005 : score 6.5472 : V : VAL CG1 B0560 <- 3.71 -> DT C7 E0002 : score 6.19687 : x : THR xxxx B0568 <- 4.43 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx >7c4q_B:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DBD PLASMA TREATED ZEBRAFISH TRF2 MYB-DOMAIN COMPLEXED WITH DNA organism=? : H : ARG NH1 B0522 <- 2.89 -> DT O2 E0008 : score 4.22889 : H : LYS NZ B0563 <- 2.97 -> DG N7 E0004 : score 5.20278 : H : LYS NZ B0563 <- 2.62 -> DG O6 E0004 : score 5.98888 : H : ASP OD2 B0564 <- 2.88 -> DC N4 F0008 : score 6.1008 : H : ARG NH1 B0567 <- 2.99 -> DG N7 E0005 : score 5.8201 : H : ARG NH2 B0567 <- 2.93 -> DG O6 E0005 : score 6.4284 : V : VAL CG2 B0560 <- 3.84 -> DT C7 E0002 : score 6.06185 >7c4r_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HYDROGEN PEROXIDE TREATED ZEBRAFISH TRF2 COMPLEXED WITH DNA organism=Danio rerio : H : ARG NH1 A0522 <- 2.65 -> DA N3 C0009 : score 3.79251 : H : ARG NH2 A0522 <- 2.78 -> DA N3 D0005 : score 3.2527 : H : LYS NZ A0563 <- 3.02 -> DG N7 C0004 : score 5.14892 : H : LYS NZ A0563 <- 2.49 -> DG O6 C0004 : score 6.13918 : H : ARG NH1 A0567 <- 2.96 -> DG N7 C0005 : score 5.8564 : H : ARG NH2 A0567 <- 2.65 -> DG O6 C0005 : score 6.798 : V : VAL CG2 A0560 <- 3.81 -> DT C7 C0002 : score 6.10777 : x : ASP xxxx A0564 <- 2.92 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0568 <- 4.43 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx >7c7l_AB: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE CAS12F1-SGRNA-TARGET DNA COMPLEX organism=uncultured archaeon : H : SER OG A0142 <- 2.51 -> DG N7 E0006 : score 4.74201 : H : GLN OE1 A0197 <- 3.15 -> DA N6 D0023 : score 5.62888 : H : GLN NE2 A0197 <- 2.80 -> DA N7 D0023 : score 6.08974 : H : TYR OH A0202 <- 2.68 -> DA N6 D0024 : score 4.78261 : x : TYR xxxx A0146 <- 3.39 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0156 <- 3.68 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0160 <- 4.04 -> DC xxx D0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0163 <- 2.94 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0164 <- 4.48 -> DC xxx D0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0244 <- 3.82 -> DA xxx E0002 : score x.xxxxx >7c97_CDFK:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=CRYO-EM STRUCTURE OF AN ESCHERICHIA COLI RNAP-PROMOTER OPEN COMPLEX (RPO) WITH SSPA organism=ESCHERICHIA COLI / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NH1 C0371 <- 2.92 -> DG O6 H0043 : score 5.93733 : H : TYR OH F0394 <- 3.31 -> DT O2 G0026 : score 2.88857 : H : ARG NH1 F0397 <- 2.66 -> DT O4 G0026 : score 3.35945 : H : ARG NH2 F0397 <- 2.45 -> DT O4 G0026 : score 3.80262 : H : THR OG1 F0432 <- 2.68 -> DA N7 H0040 : score 3.49604 : H : GLU OE2 F0585 <- 2.90 -> DA N6 H0016 : score 2.99026 : V : HIS CG F0455 <- 3.64 -> DT C7 H0031 : score 3.11893 : V : ARG CZ F0465 <- 3.73 -> DT C7 G0026 : score 2.16962 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.18 -> DG xxx H0049 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0182 <- 4.05 -> DC xxx H0047 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.02 -> DT xxx H0048 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 2.72 -> DC xxx H0047 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0367 <- 3.26 -> DG xxx H0043 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 2.74 -> DG xxx H0043 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 4.33 -> DG xxx H0049 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.31 -> DG xxx H0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 4.01 -> DT xxx H0050 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0546 <- 4.45 -> DG xxx H0049 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.27 -> DG xxx H0049 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.47 -> DG xxx H0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.81 -> DA xxx H0045 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.74 -> DG xxx H0043 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 3.57 -> DG xxx H0042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.30 -> DT xxx H0041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0116 <- 3.20 -> DT xxx H0041 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 3.74 -> DT xxx H0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0385 <- 3.22 -> DG xxx H0042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 3.78 -> DT xxx H0041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 3.16 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 3.13 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 3.12 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 2.94 -> DT xxx H0041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.36 -> DA xxx H0040 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.34 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.14 -> DT xxx H0036 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0434 <- 3.28 -> DT xxx H0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0436 <- 4.03 -> DT xxx G0026 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0437 <- 2.59 -> DC xxx H0035 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 4.41 -> DT xxx G0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0441 <- 3.11 -> DT xxx H0033 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0454 <- 4.39 -> DT xxx H0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0588 <- 4.13 -> DT xxx G0045 : score x.xxxxx >7c98_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Rad51_N-terminal_domain-like; title=HUMAN DMC1 POST-SYNAPTIC COMPLEXES organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0236 <- 3.65 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0239 <- 3.94 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0273 <- 4.49 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0274 <- 3.55 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx >7c98_ABC:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Rad51_N-terminal_domain-like; title=HUMAN DMC1 POST-SYNAPTIC COMPLEXES organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0236 <- 3.65 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0239 <- 3.94 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0273 <- 4.49 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0274 <- 3.55 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0236 <- 3.47 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0239 <- 3.84 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0240 <- 3.35 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0272 <- 4.41 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0274 <- 3.51 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0286 <- 4.50 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0236 <- 3.29 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0239 <- 3.77 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0240 <- 3.24 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0274 <- 3.54 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0286 <- 4.48 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >7c99_ABC:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Rad51_N-terminal_domain-like; title=HUMAN DMC1 POST-SYNAPTIC COMPLEXES WITH MISMATCHED DSDNA organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0236 <- 3.58 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0239 <- 3.82 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0271 <- 4.18 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0272 <- 4.32 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0274 <- 3.48 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0236 <- 3.52 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0239 <- 3.76 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0240 <- 3.47 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0271 <- 4.08 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0272 <- 4.47 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0274 <- 3.52 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0236 <- 3.35 -> DA xxx E0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0239 <- 3.41 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0240 <- 3.36 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0244 <- 4.40 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0271 <- 4.02 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0274 <- 3.65 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx >7c99_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Rad51_N-terminal_domain-like; title=HUMAN DMC1 POST-SYNAPTIC COMPLEXES WITH MISMATCHED DSDNA organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0236 <- 3.52 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0239 <- 3.76 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0240 <- 3.47 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0271 <- 4.08 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0272 <- 4.47 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0274 <- 3.52 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx >7c9a_ABC:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Rad51_N-terminal_domain-like; title=HUMAN RAD51 POST-SYNAPTIC COMPLEXES MUTANT (V273P, D274G) organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0235 <- 3.28 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0238 <- 3.82 -> DT xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0271 <- 4.21 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0273 <- 3.47 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0235 <- 3.21 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0238 <- 3.91 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0239 <- 3.39 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0271 <- 4.01 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0273 <- 3.46 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0235 <- 3.18 -> DA xxx E0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0238 <- 3.84 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0239 <- 3.58 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0273 <- 3.56 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx >7c9a_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Rad51_N-terminal_domain-like; title=HUMAN RAD51 POST-SYNAPTIC COMPLEXES MUTANT (V273P, D274G) organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0235 <- 3.21 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0238 <- 3.91 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0239 <- 3.39 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0271 <- 4.01 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0273 <- 3.46 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >7c9o_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA-BOUND CCT/NF-YB/YC COMPLEX (HD1CCT/GHD8/OSNF- YC2) organism=ORYZA SATIVA JAPONICA GROUP : H : ARG NH1 A0363 <- 2.94 -> DT O2 E0010 : score 4.18583 : x : ALA xxxx A0367 <- 3.60 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0370 <- 3.50 -> DC xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0372 <- 3.35 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0376 <- 3.40 -> DC xxx D0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0377 <- 3.14 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx >7c9o_ABC:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA-BOUND CCT/NF-YB/YC COMPLEX (HD1CCT/GHD8/OSNF- YC2) organism=ORYZA SATIVA JAPONICA GROUP : H : ARG NH1 A0363 <- 2.94 -> DT O2 E0010 : score 4.18583 : x : ALA xxxx A0367 <- 3.60 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0370 <- 3.50 -> DC xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0372 <- 3.35 -> DG xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0376 <- 3.40 -> DC xxx D0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0377 <- 3.14 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx >7cby_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF FOXG1 DNA BINDING DOMAIN BOUND TO DBE2 DNA SITE organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 C0227 <- 3.04 -> DA N6 B0010 : score 5.73275 : H : ASN ND2 C0227 <- 2.80 -> DA N7 B0010 : score 5.87051 : w : ASN OD1 C0227 <- 5.53 -> DT O4 A0006 : score 3.132 : w : ARG NE C0230 <- 5.83 -> DT O4 A0006 : score 1.317 : w : ARG NH1 C0230 <- 5.49 -> DG O6 A0005 : score 2.756 : H : HIS ND1 C0231 <- 3.04 -> DT O4 A0007 : score 4.49393 : H : HIS ND1 C0231 <- 2.94 -> DT O4 A0008 : score 4.58834 : w : HIS NE2 C0231 <- 5.77 -> DG N7 B0007 : score 3.601 : V : ARG CZ C0230 <- 3.64 -> DT C7 A0004 : score 2.2176 : V : SER CB C0228 <- 3.69 -> DT C7 B0008 : score 3.21739 : x : SER xxxx C0234 <- 3.47 -> DT xxx A0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0235 <- 4.00 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx >7cc9_A: title=SULFUR BINDING DOMAIN OF SPRMCRA COMPLEXED WITH PHOSPHOROTHIOATED DNA organism=Streptomyces pristinaespiralis : H : LYS NZ A0020 <- 2.93 -> DC O2 E0007 : score 2.86955 : w : LYS NZ A0020 <- 5.56 -> DC O2 D0003 : score 1.3 : w : LYS NZ A0020 <- 6.41 -> DG N2 E0006 : score 0.846 : H : HIS ND1 A0102 <- 2.93 -> DG N7 D0004 : score 6.06128 : H : HIS ND1 A0102 <- 2.98 -> DG O6 D0004 : score 5.99905 : H : ASP OD2 A0104 <- 2.72 -> DC N4 D0007 : score 6.2992 : w : ASP OD2 A0104 <- 5.84 -> DC N4 D0008 : score 3.623 : H : SER OG A0105 <- 2.67 -> DG N7 E0001 : score 4.59858 : w : SER OG A0105 <- 5.77 -> DG O6 E0002 : score 2.749 : w : SER OG A0105 <- 5.90 -> DG N7 E0002 : score 2.749 : x : ALA xxxx A0022 <- 3.99 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0073 <- 3.63 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0078 <- 3.57 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx >7ccd_A: title=SULFUR BINDING DOMAIN OF SPRMCRA COMPLEXED WITH PHOSPHOROTHIOATED DNA organism=Streptomyces pristinaespiralis : H : HIS ND1 A0102 <- 3.00 -> DG N7 F0004 : score 5.97415 : H : HIS ND1 A0102 <- 2.95 -> DG O6 F0004 : score 6.03638 : H : ASP OD2 A0104 <- 2.37 -> DC N4 F0007 : score 6.7332 : x : LYS xxxx A0020 <- 3.14 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0022 <- 3.93 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0073 <- 3.49 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0078 <- 3.50 -> DA xxx F0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0105 <- 3.22 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx >7ccj_AB: title=SULFUR BINDING DOMAIN OF SPRMCRA COMPLEXED WITH PHOSPHOROTHIOATED DNA organism=Streptomyces pristinaespiralis : H : HIS ND1 A0102 <- 2.97 -> DG O6 F0004 : score 6.01149 : H : ASP OD2 A0104 <- 2.68 -> DC N4 F0007 : score 6.3488 : H : SER OG A0105 <- 3.01 -> DG N7 E0001 : score 4.29381 : H : LYS NZ B0020 <- 2.58 -> DT O2 D0003 : score 3.74502 : H : HIS ND1 B0102 <- 2.93 -> DG O6 D0004 : score 6.06128 : H : ASP OD2 B0104 <- 2.33 -> DC N4 D0007 : score 6.7828 : x : LYS xxxx A0020 <- 3.21 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0022 <- 4.08 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0073 <- 3.49 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0078 <- 3.30 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0022 <- 4.10 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0073 <- 3.90 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0078 <- 3.22 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx >7ccj_B: title=SULFUR BINDING DOMAIN OF SPRMCRA COMPLEXED WITH PHOSPHOROTHIOATED DNA organism=Streptomyces pristinaespiralis : H : LYS NZ B0020 <- 2.58 -> DT O2 D0003 : score 3.74502 : H : HIS ND1 B0102 <- 2.93 -> DG O6 D0004 : score 6.06128 : H : ASP OD2 B0104 <- 2.33 -> DC N4 D0007 : score 6.7828 : x : ALA xxxx B0022 <- 4.10 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0073 <- 3.90 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0078 <- 3.22 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx >7ccq_A:Histone-fold; title=STRUCTURE OF THE 1:1 CGAS-NUCLEOSOME COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0040 <- 3.04 -> DG xxx I-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0063 <- 4.39 -> DA xxx I-014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.78 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx >7ccq_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like; title=STRUCTURE OF THE 1:1 CGAS-NUCLEOSOME COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 E0040 <- 3.08 -> DT O2 I0009 : score 4.06525 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.68 -> DT O2 I0009 : score 4.33493 : H : ARG NH2 E0083 <- 3.04 -> DG N3 J-024 : score 3.43696 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.04 -> DG xxx I-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0063 <- 4.39 -> DA xxx I-014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.78 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.69 -> DC xxx J0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.39 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.30 -> DG xxx I0038 : score x.xxxxx >7ccr_A:Histone-fold; title=STRUCTURE OF THE 2:2 CGAS-NUCLEOSOME COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 A0040 <- 3.37 -> DG N3 J0009 : score 2.70457 : H : ARG NH2 A0040 <- 2.94 -> DC O2 J0008 : score 3.59515 >7ccr_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like; title=STRUCTURE OF THE 2:2 CGAS-NUCLEOSOME COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0040 <- 3.37 -> DG N3 J0009 : score 2.70457 : H : ARG NH2 A0040 <- 2.94 -> DC O2 J0008 : score 3.59515 : H : ARG NH1 E0040 <- 2.68 -> DT O2 I0009 : score 4.40976 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.76 -> DT O2 I0009 : score 4.2672 : H : ARG NH2 E0083 <- 2.87 -> DG N3 J-024 : score 3.55971 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.24 -> DA xxx J-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.55 -> DG xxx J0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.71 -> DC xxx J0037 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.29 -> DG xxx I-069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.48 -> DA xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.94 -> DG xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 4.28 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >7ccr_LMNOPQRS:Histone-fold;PH_domain-like; title=STRUCTURE OF THE 2:2 CGAS-NUCLEOSOME COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 L0040 <- 3.37 -> DG N3 U0009 : score 2.70457 : H : ARG NH2 L0040 <- 2.94 -> DC O2 U0008 : score 3.59515 : H : ARG NH1 P0040 <- 2.68 -> DT O2 T0009 : score 4.40976 : H : ARG NH2 P0040 <- 2.76 -> DT O2 T0009 : score 4.2672 : H : ARG NH2 P0083 <- 2.87 -> DG N3 U-024 : score 3.55971 : x : TYR xxxx L0041 <- 4.24 -> DA xxx U-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0083 <- 3.55 -> DG xxx U0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0042 <- 3.71 -> DC xxx U0037 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx P0039 <- 4.29 -> DG xxx T-069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0045 <- 4.48 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0042 <- 3.94 -> DG xxx T0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx S0033 <- 4.28 -> DG xxx T0048 : score x.xxxxx >7ce1_CD:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=COMPLEX STRUCTURE OF TRANSCRIPTION FACTOR SGHR WITH ITS COGNATE DNA organism=AGROBACTERIUM TUMEFACIENS A6 : H : THR OG1 C0034 <- 2.73 -> DG O6 d0006 : score 4.2744 : H : ARG NE C0073 <- 2.85 -> DT O2 c0013 : score 2.55115 : H : ARG NH2 C0073 <- 2.92 -> DT O2 c0013 : score 4.13173 : V : ILE CG2 D0033 <- 3.82 -> DT C7 d0013 : score 7.05583 : x : LEU xxxx C0022 <- 3.72 -> DT xxx c0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0033 <- 4.09 -> DT xxx c0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0035 <- 3.50 -> DT xxx d0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0037 <- 3.76 -> DT xxx c0013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0045 <- 3.62 -> DC xxx d0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0046 <- 4.28 -> DC xxx d0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0072 <- 3.50 -> DC xxx d0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0022 <- 4.26 -> DT xxx d0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0034 <- 3.22 -> DG xxx c0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0035 <- 2.95 -> DT xxx c0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0037 <- 3.71 -> DT xxx d0013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0045 <- 4.07 -> DC xxx c0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0046 <- 4.32 -> DT xxx c0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0072 <- 3.53 -> DC xxx c0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0073 <- 3.05 -> DT xxx d0013 : score x.xxxxx >7ce1_D:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=COMPLEX STRUCTURE OF TRANSCRIPTION FACTOR SGHR WITH ITS COGNATE DNA organism=AGROBACTERIUM TUMEFACIENS A6 : V : ILE CG2 D0033 <- 3.82 -> DT C7 d0013 : score 7.05583 : V : THR CG2 D0034 <- 3.79 -> DT C7 c0005 : score 4.24752 : x : LEU xxxx D0022 <- 4.26 -> DT xxx d0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0035 <- 2.95 -> DT xxx c0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0037 <- 3.71 -> DT xxx d0013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0045 <- 4.07 -> DC xxx c0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0046 <- 4.32 -> DT xxx c0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0072 <- 3.53 -> DC xxx c0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0073 <- 3.05 -> DT xxx d0013 : score x.xxxxx >7ce1_OP:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=COMPLEX STRUCTURE OF TRANSCRIPTION FACTOR SGHR WITH ITS COGNATE DNA organism=AGROBACTERIUM TUMEFACIENS A6 : H : THR OG1 O0034 <- 3.43 -> DG O6 o0014 : score 3.68425 : H : THR OG1 O0034 <- 3.34 -> DG N7 p0006 : score 3.12086 : H : THR OG1 O0034 <- 2.70 -> DG O6 p0006 : score 4.29969 : H : ASP OD2 O0045 <- 2.53 -> DC N4 p0004 : score 6.5348 : H : ASP OD2 P0045 <- 2.87 -> DC N4 o0004 : score 6.1132 : x : LEU xxxx O0022 <- 3.60 -> DT xxx o0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx O0033 <- 4.15 -> DT xxx o0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0035 <- 3.34 -> DT xxx p0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx O0037 <- 3.84 -> DT xxx o0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0038 <- 4.48 -> DT xxx p0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0072 <- 3.65 -> DC xxx p0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0073 <- 3.51 -> DC xxx p0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0022 <- 3.79 -> DT xxx p0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0034 <- 3.14 -> DT xxx o0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0035 <- 3.37 -> DT xxx o0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx P0037 <- 4.23 -> DT xxx p0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx P0046 <- 4.23 -> DC xxx o0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0072 <- 3.65 -> DG xxx o0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0073 <- 3.09 -> DT xxx p0013 : score x.xxxxx >7ce1_ST:Periplasmic_binding_protein-like_I;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=COMPLEX STRUCTURE OF TRANSCRIPTION FACTOR SGHR WITH ITS COGNATE DNA organism=AGROBACTERIUM TUMEFACIENS A6 : H : THR OG1 S0034 <- 3.46 -> DG O6 s0014 : score 3.65895 : H : THR OG1 S0034 <- 3.27 -> DG N7 t0006 : score 3.16984 : H : ARG NE S0073 <- 2.57 -> DT O2 s0013 : score 2.69546 : H : ARG NH1 S0073 <- 3.04 -> DT O2 s0013 : score 4.0997 : H : THR OG1 T0034 <- 2.28 -> DG N2 s0006 : score 4.43582 : x : LEU xxxx S0022 <- 3.75 -> DT xxx s0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx S0033 <- 4.20 -> DT xxx s0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx S0035 <- 3.03 -> DT xxx t0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx S0037 <- 3.73 -> DT xxx s0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx S0046 <- 3.99 -> DT xxx t0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx S0072 <- 3.16 -> DC xxx t0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx T0022 <- 3.87 -> DT xxx t0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx T0033 <- 3.99 -> DT xxx t0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx T0037 <- 3.74 -> DT xxx t0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx T0072 <- 3.20 -> DC xxx s0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx T0073 <- 3.29 -> DT xxx t0013 : score x.xxxxx >7chw_CDFK:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=CRYO-EM STRUCTURE OF AN ESCHERICHIA COLI RNAP-PROMOTER OPEN COMPLEX (RPO) organism=ESCHERICHIA COLI / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NH1 C0371 <- 2.46 -> DG O6 H0043 : score 6.497 : H : GLU OE1 C0374 <- 2.65 -> DG N2 H0043 : score 4.43956 : H : ARG NH1 F0397 <- 2.26 -> DT O4 G0026 : score 3.62089 : H : THR OG1 F0432 <- 3.06 -> DA N7 H0040 : score 3.23657 : H : THR OG1 F0440 <- 3.49 -> DT O2 G0026 : score 2.33956 : H : GLU OE1 F0585 <- 2.66 -> DC N4 G0048 : score 5.92945 : H : GLU OE2 F0585 <- 3.17 -> DA N6 H0016 : score 2.82549 : V : ARG CZ F0588 <- 3.76 -> DT C7 G0045 : score 2.15363 : V : HIS CG F0455 <- 3.79 -> DT C7 H0031 : score 3.00647 : V : SER CB F0428 <- 3.88 -> DT C7 H0041 : score 3.06866 : x : ARG xxxx K0265 <- 3.78 -> DT xxx G0055 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx K0298 <- 3.47 -> DT xxx G0055 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0151 <- 3.03 -> DG xxx H0049 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.73 -> DT xxx H0048 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 2.94 -> DT xxx H0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 4.44 -> DT xxx H0048 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0367 <- 3.44 -> DG xxx H0043 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0375 <- 3.40 -> DG xxx H0042 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 3.80 -> DG xxx H0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0451 <- 4.44 -> DG xxx H0049 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.38 -> DG xxx H0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 4.09 -> DT xxx H0050 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.42 -> DG xxx H0049 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0212 <- 4.40 -> DT xxx G0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 4.26 -> DG xxx H0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.85 -> DG xxx H0044 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.10 -> DG xxx H0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0103 <- 3.88 -> DG xxx H0042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.17 -> DT xxx H0041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0116 <- 4.05 -> DT xxx H0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0385 <- 3.54 -> DG xxx H0042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 4.30 -> DT xxx H0041 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0394 <- 3.81 -> DT xxx G0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 3.81 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 3.70 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 3.47 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 3.36 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 4.30 -> DA xxx H0040 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.65 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.13 -> DT xxx H0036 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0434 <- 3.29 -> DT xxx H0036 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0437 <- 2.97 -> DT xxx H0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0465 <- 4.09 -> DT xxx G0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0573 <- 4.32 -> DT xxx G0045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0574 <- 4.41 -> DT xxx G0045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0584 <- 4.06 -> DT xxx H0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0589 <- 3.65 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx >7chw_K:C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit; title=CRYO-EM STRUCTURE OF AN ESCHERICHIA COLI RNAP-PROMOTER OPEN COMPLEX (RPO) organism=? : x : ARG xxxx K0265 <- 3.78 -> DT xxx G0055 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx K0298 <- 3.47 -> DT xxx G0055 : score x.xxxxx >7ckq_CDFGI:Probable_bacterial_effector-binding_domain;Putative_DNA-binding_domain; title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF B. SUBTILIS BMRR TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX organism=BACILLUS SUBTILIS (STRAIN 168) / BACILLUS SUBTILIS (STRAIN 168) / BACILLUS SUBTILIS (STRAIN 168) / BACILLUS SUBTILIS (STRAIN 168) / BACILLUS SUBTILIS (STRAIN 168) / BACILLUS SUBTILIS (STRAIN 168) / BACILLUS SUBTILIS (STRAIN 168) / BACILLUS SUBTILIS (STRAIN 168) / BACILLUS SUBTILIS (STRAIN 168) / BACILLUS SUBTILIS (STRAIN 168) : H : ARG NH1 C0241 <- 2.46 -> DG O6 10073 : score 6.497 : H : ARG NH1 F0181 <- 3.26 -> DA N7 10066 : score 2.32471 : H : HIS NE2 F0214 <- 2.47 -> DG O6 10061 : score 8.4788 : H : GLU OE1 F0344 <- 2.75 -> DC N4 20048 : score 5.82563 : H : GLU OE1 F0344 <- 2.66 -> DA N6 20049 : score 2.75715 : H : GLN NE2 F0348 <- 2.92 -> DT O4 10040 : score 5.06644 : H : LYS NZ G0020 <- 2.66 -> DG O6 10057 : score 5.94263 : H : LYS NZ I0020 <- 3.05 -> DG O6 20041 : score 5.49173 : V : ARG CG F0347 <- 3.69 -> DT C7 20047 : score 1.03277 : V : ARG CZ I0023 <- 3.81 -> DT C7 10047 : score 2.12698 : V : GLN CG F0196 <- 3.75 -> DT C7 10064 : score 3.29608 : V : TRP CD1 F0193 <- 3.59 -> DT C7 10065 : score 7.71833 : x : GLU xxxx C0244 <- 3.45 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0245 <- 3.97 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0437 <- 4.11 -> DA xxx 10068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0303 <- 3.21 -> DG xxx 10075 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0102 <- 3.43 -> DG xxx 10072 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0106 <- 3.34 -> DG xxx 10072 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0115 <- 3.43 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0120 <- 3.35 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0141 <- 4.42 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0144 <- 3.31 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0145 <- 3.47 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0149 <- 4.36 -> DA xxx 10069 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0178 <- 3.36 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0185 <- 4.48 -> DT xxx 10070 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0186 <- 4.10 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0188 <- 3.91 -> DA xxx 10068 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0189 <- 3.43 -> DA xxx 10066 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0191 <- 3.48 -> DA xxx 10069 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0192 <- 3.48 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0195 <- 3.40 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0199 <- 3.40 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0200 <- 3.46 -> DT xxx 10062 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0213 <- 4.03 -> DT xxx 10062 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0333 <- 3.98 -> DA xxx 20045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0345 <- 3.85 -> DT xxx 10040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0023 <- 3.82 -> DT xxx 20031 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0024 <- 4.06 -> DG xxx 10055 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0042 <- 3.72 -> DC xxx 20029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0043 <- 4.05 -> DT xxx 20031 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx I0024 <- 4.12 -> DA xxx 20038 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx I0042 <- 4.20 -> DG xxx 20046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0043 <- 4.34 -> DT xxx 10047 : score x.xxxxx >7ckq_G:Probable_bacterial_effector-binding_domain;Putative_DNA-binding_domain; title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF B. SUBTILIS BMRR TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX organism=? : H : LYS NZ G0020 <- 2.66 -> DG O6 10057 : score 5.94263 : x : ARG xxxx G0023 <- 3.82 -> DT xxx 20031 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0024 <- 4.06 -> DG xxx 10055 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0042 <- 3.72 -> DC xxx 20029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0043 <- 4.05 -> DT xxx 20031 : score x.xxxxx >7cli_AB:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=STRUCTURE OF NF-KB P52 HOMODIMER BOUND TO P-SELECTIN KB DNA FRAGMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0052 <- 2.76 -> DG O6 D0007 : score 6.132 : H : ARG NH2 A0052 <- 3.26 -> DG N7 D0007 : score 5.79723 : H : ARG NH1 A0054 <- 3.19 -> DG O6 D0006 : score 5.60883 : H : ARG NH2 A0054 <- 3.22 -> DG N7 D0006 : score 5.84831 : H : GLU OE1 A0058 <- 3.23 -> DC N4 C0012 : score 5.2719 : H : HIS ND1 A0062 <- 2.80 -> DG N7 D0005 : score 6.22308 : H : ARG NH1 B0052 <- 3.24 -> DG N7 C0006 : score 5.5176 : H : ARG NH2 B0052 <- 3.19 -> DG O6 C0006 : score 6.0852 : H : ARG NH1 B0054 <- 3.08 -> DG O6 C0005 : score 5.74267 : H : ARG NH2 B0054 <- 3.27 -> DG N7 C0005 : score 5.78446 : H : GLU OE1 B0058 <- 3.04 -> DC N4 D0013 : score 5.49109 : H : HIS ND1 B0062 <- 2.93 -> DG N7 C0004 : score 6.06128 : H : LYS NZ B0221 <- 2.63 -> DG O6 C0007 : score 5.97732 : x : TYR xxxx A0055 <- 3.66 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0057 <- 3.95 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0061 <- 4.03 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0221 <- 4.27 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0055 <- 3.74 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0057 <- 3.91 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0061 <- 3.34 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx >7cli_B:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=STRUCTURE OF NF-KB P52 HOMODIMER BOUND TO P-SELECTIN KB DNA FRAGMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0052 <- 3.24 -> DG N7 C0006 : score 5.5176 : H : ARG NH2 B0052 <- 3.19 -> DG O6 C0006 : score 6.0852 : H : ARG NH1 B0054 <- 3.08 -> DG O6 C0005 : score 5.74267 : H : ARG NH2 B0054 <- 3.27 -> DG N7 C0005 : score 5.78446 : H : GLU OE1 B0058 <- 3.04 -> DC N4 D0013 : score 5.49109 : H : HIS ND1 B0062 <- 2.93 -> DG N7 C0004 : score 6.06128 : H : LYS NZ B0221 <- 2.63 -> DG O6 C0007 : score 5.97732 : x : TYR xxxx B0055 <- 3.74 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0057 <- 3.91 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0061 <- 3.34 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx >7cow_C:Histone-fold; title=353 BP DI-NUCLEOSOME HARBORING COHESIVE DNA TERMINI WITH LINKER HISTONE H1.0 organism=? : x : ARG xxxx C0042 <- 3.37 -> DT xxx I0301 : score x.xxxxx >7cpw_B:Nucleotidyltransferase; title=COMPLEX STRUCTURE OF DNA WITH SELF-CATALYZED DEPURINATION ACTIVITY organism=African swine fever virus : H : ARG NH1 B0127 <- 2.95 -> DC O2 b0001 : score 3.5405 : x : LYS xxxx B0085 <- 4.22 -> DG xxx b0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0115 <- 3.93 -> DG xxx b0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0120 <- 4.19 -> DC xxx b0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0124 <- 4.06 -> DC xxx b0001 : score x.xxxxx >7cq4_A:GIY-YIG_endonuclease; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SLX1-SLX4 IN COMPLEX WITH 5'FLAP DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE (STRAIN YJM789) / SACCHAROMYCES CEREVISIAE (STRAIN YJM789) : x : LYS xxxx A0075 <- 4.26 -> DT xxx L0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0083 <- 4.40 -> DC xxx L0014 : score x.xxxxx >7cq4_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF SLX1-SLX4 IN COMPLEX WITH 5'FLAP DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 B0646 <- 2.43 -> DT O2 L0023 : score 4.5466 >7cr6_ABCDEF: title=SYNECHOCYSTIS CAS1-CAS2/PRESPACER BINARY COMPLEX organism=SYNECHOCYSTIS SP. (STRAIN PCC 6803 / KAZUSA) / SYNECHOCYSTIS SP. (STRAIN PCC 6803 / KAZUSA) / SYNECHOCYSTIS SP. (STRAIN PCC 6803 / KAZUSA) / SYNECHOCYSTIS SP. (STRAIN PCC 6803 / KAZUSA) / SYNECHOCYSTIS SP. (STRAIN PCC 6803 / KAZUSA) / SYNECHOCYSTIS SP. (STRAIN PCC 6803 / KAZUSA) / SYNECHOCYSTIS SP. (STRAIN PCC 6803 / KAZUSA) / SYNECHOCYSTIS SP. (STRAIN PCC 6803 / KAZUSA) / SYNECHOCYSTIS SP. (STRAIN PCC 6803 / KAZUSA) / SYNECHOCYSTIS SP. (STRAIN PCC 6803 / KAZUSA) / SYNECHOCYSTIS SP. (STRAIN PCC 6803 / KAZUSA) / SYNECHOCYSTIS SP. (STRAIN PCC 6803 / KAZUSA) : V : THR CG2 E0020 <- 3.76 -> DT C7 G0022 : score 4.27929 : x : GLU xxxx A0055 <- 4.20 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0009 <- 4.08 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0010 <- 3.02 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0026 <- 4.26 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0010 <- 4.26 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0012 <- 4.21 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0051 <- 3.79 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0011 <- 3.34 -> DC xxx G0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0013 <- 4.44 -> DA xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0016 <- 4.11 -> DG xxx G0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0019 <- 4.20 -> DG xxx G0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0035 <- 4.24 -> DG xxx G0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0019 <- 3.52 -> DC xxx H0020 : score x.xxxxx >7cr6_F:TTP0101/SSO1404-like; title=SYNECHOCYSTIS CAS1-CAS2/PRESPACER BINARY COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx F0019 <- 3.52 -> DC xxx H0020 : score x.xxxxx >7cr8_AC: title=SYNECHOCYSTIS CAS1-CAS2-PRESPACERL COMPLEX organism=? : x : GLU xxxx A0055 <- 3.54 -> DA xxx H0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0055 <- 4.47 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx >7cr8_BDEF: title=SYNECHOCYSTIS CAS1-CAS2-PRESPACERL COMPLEX organism=? : x : PRO xxxx B0009 <- 3.48 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0010 <- 3.06 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0010 <- 2.59 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0051 <- 4.39 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0011 <- 4.42 -> DC xxx G0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0019 <- 4.31 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0020 <- 4.13 -> DT xxx G0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0019 <- 3.15 -> DC xxx H0021 : score x.xxxxx >7cr8_IJKLMN: title=SYNECHOCYSTIS CAS1-CAS2-PRESPACERL COMPLEX organism=? : x : GLU xxxx I0055 <- 3.81 -> DA xxx P0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0009 <- 3.51 -> DG xxx P0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx J0010 <- 3.23 -> DG xxx P0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx K0055 <- 4.30 -> DT xxx O0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0010 <- 2.86 -> DT xxx O0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx M0016 <- 4.43 -> DG xxx O0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0019 <- 4.25 -> DG xxx O0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0020 <- 4.03 -> DT xxx O0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0019 <- 3.45 -> DC xxx P0021 : score x.xxxxx >7cr8_QRSTUVac: title=SYNECHOCYSTIS CAS1-CAS2-PRESPACERL COMPLEX organism=? : x : LYS xxxx Q0016 <- 4.45 -> DA xxx X0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Q0055 <- 3.83 -> DA xxx X0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx R0009 <- 3.33 -> DG xxx X0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx R0010 <- 2.87 -> DG xxx X0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx T0010 <- 2.60 -> DT xxx W0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx T0025 <- 4.47 -> DT xxx W0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx T0051 <- 4.31 -> DT xxx W0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx U0019 <- 4.18 -> DG xxx W0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx U0020 <- 4.22 -> DT xxx W0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx V0019 <- 3.54 -> DC xxx X0021 : score x.xxxxx >7cr8_bdef: title=SYNECHOCYSTIS CAS1-CAS2-PRESPACERL COMPLEX organism=? : V : THR CG2 e0020 <- 3.58 -> DT C7 g0021 : score 4.46995 : x : PRO xxxx b0009 <- 3.48 -> DG xxx h0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx b0010 <- 3.10 -> DG xxx h0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx d0010 <- 2.61 -> DT xxx g0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx d0051 <- 4.30 -> DT xxx g0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx e0011 <- 4.25 -> DC xxx g0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx e0016 <- 4.01 -> DG xxx g0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx e0019 <- 3.64 -> DG xxx g0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx f0019 <- 3.49 -> DC xxx h0021 : score x.xxxxx >7cr8_jlmn: title=SYNECHOCYSTIS CAS1-CAS2-PRESPACERL COMPLEX organism=? : V : THR CG2 m0020 <- 3.54 -> DT C7 o0021 : score 4.51232 : x : PRO xxxx j0009 <- 3.48 -> DG xxx p0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx j0010 <- 3.13 -> DG xxx p0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx l0010 <- 2.55 -> DT xxx o0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx l0051 <- 4.12 -> DT xxx o0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx m0011 <- 4.33 -> DC xxx o0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx m0016 <- 4.14 -> DG xxx o0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx m0019 <- 4.04 -> DG xxx o0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx n0019 <- 3.23 -> DC xxx p0021 : score x.xxxxx >7cr8_r: title=SYNECHOCYSTIS CAS1-CAS2-PRESPACERL COMPLEX organism=? : x : PRO xxxx r0009 <- 3.38 -> DG xxx x0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx r0010 <- 2.92 -> DG xxx x0009 : score x.xxxxx >7cr8_rtuv: title=SYNECHOCYSTIS CAS1-CAS2-PRESPACERL COMPLEX organism=? : x : PRO xxxx r0009 <- 3.38 -> DG xxx x0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx r0010 <- 2.92 -> DG xxx x0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx t0010 <- 2.59 -> DT xxx w0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx t0025 <- 4.47 -> DT xxx w0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx t0051 <- 4.24 -> DT xxx w0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx u0019 <- 4.37 -> DG xxx w0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx u0020 <- 4.32 -> DT xxx w0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx v0019 <- 3.78 -> DC xxx x0021 : score x.xxxxx >7cro_BCDEFGHM:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NSD2 BEARING E1099K/T1150A DUAL MUTATION IN COMPLEX WITH 187-BP NCP organism=XENOPUS LAEVIS / XENOPUS TROPICALIS : x : ARG xxxx M0040 <- 3.74 -> DG xxx K0086 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0083 <- 3.93 -> DT xxx K0070 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 3.94 -> DG xxx K0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 4.20 -> DT xxx K0103 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0010 <- 3.05 -> DT xxx A0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0027 <- 4.35 -> DG xxx A0045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.63 -> DC xxx K0143 : score x.xxxxx >7crp_BCDEFGHM:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NSD3 BEARING E1181K/T1232A DUAL MUTATION IN COMPLEX WITH 187-BP NCP (1:1 BINDING MODE) organism=XENOPUS LAEVIS / XENOPUS TROPICALIS : H : ARG NH1 E0040 <- 3.10 -> DT O2 K0103 : score 4.04803 : x : ARG xxxx M0040 <- 3.72 -> DG xxx K0086 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0083 <- 3.83 -> DT xxx K0070 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0010 <- 3.61 -> DT xxx A0137 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0010 <- 3.16 -> DT xxx A0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0027 <- 4.29 -> DG xxx K0144 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.82 -> DG xxx K0142 : score x.xxxxx >7crp_C:Histone-fold; title=NSD3 BEARING E1181K/T1232A DUAL MUTATION IN COMPLEX WITH 187-BP NCP (1:1 BINDING MODE) organism=? : x : THR xxxx C0010 <- 3.61 -> DT xxx A0137 : score x.xxxxx >7crr_BCDEFGHM:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NATIVE NSD3 BOUND TO 187-BP NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS / XENOPUS TROPICALIS : x : ARG xxxx M0083 <- 4.15 -> DT xxx K0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.42 -> DT xxx A0132 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.08 -> DG xxx K0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.93 -> DT xxx K0103 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0010 <- 3.87 -> DT xxx A0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0027 <- 3.87 -> DG xxx K0144 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.31 -> DG xxx K0142 : score x.xxxxx >7csw_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PSEUDOMONAS AERUGINOSA ANTITOXIN HIGA WITH PA2440 PROMOTER organism=PSEUDOMONAS AERUGINOSA PAO1 : w : SER OG B0037 <- 5.56 -> DG N7 C0006 : score 2.749 : w : THR OG1 B0040 <- 5.40 -> DG N7 C0006 : score 3.422 : w : ARG NH1 B0049 <- 5.46 -> DG N7 C0006 : score 2.063 : x : PRO xxxx B0039 <- 4.13 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx >7csy_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PSEUDOMONAS AERUGINOSA ANTITOXIN HIGA WITH HIGBA PROMOTER organism=PSEUDOMONAS AERUGINOSA PAO1 : V : PRO CG A0039 <- 3.75 -> DT C7 F0017 : score 6.43846 : x : SER xxxx A0037 <- 3.34 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.91 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0042 <- 3.91 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0049 <- 3.30 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx >7csy_ABCD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PSEUDOMONAS AERUGINOSA ANTITOXIN HIGA WITH HIGBA PROMOTER organism=PSEUDOMONAS AERUGINOSA PAO1 : w : SER OG B0037 <- 6.17 -> DG N7 E0024 : score 2.749 : w : THR OG1 B0040 <- 5.80 -> DG N7 E0024 : score 3.422 : w : ARG NH1 B0049 <- 5.62 -> DG N7 E0024 : score 2.063 : w : SER OG C0037 <- 6.24 -> DG N7 E0017 : score 2.749 : w : THR OG1 C0040 <- 5.92 -> DG N7 E0017 : score 3.422 : w : ASP OD2 C0043 <- 6.46 -> DA N6 F0014 : score 3.409 : w : ARG NH1 C0049 <- 5.62 -> DG N7 E0017 : score 2.063 : w : ARG NH2 C0049 <- 6.05 -> DG N7 E0017 : score 2.18 : V : PRO CG C0039 <- 3.84 -> DT C7 E0018 : score 6.29538 : V : PRO CG B0039 <- 3.60 -> DT C7 E0025 : score 6.67692 : V : ALA CB C0038 <- 3.72 -> DT C7 F0012 : score 5.71095 : V : PRO CG A0039 <- 3.75 -> DT C7 F0017 : score 6.43846 : V : PRO CG D0039 <- 3.63 -> DT C7 F0024 : score 6.62923 : x : SER xxxx A0037 <- 3.34 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.91 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0042 <- 3.91 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0049 <- 3.30 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0038 <- 3.95 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0042 <- 4.12 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0028 <- 4.33 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0042 <- 3.87 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0028 <- 4.37 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0037 <- 3.61 -> DG xxx F0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0038 <- 4.22 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0042 <- 3.82 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0049 <- 3.50 -> DC xxx F0022 : score x.xxxxx >7csz_A:RNA-binding_domain,_RBD; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE N-TERMINAL TANDEM RRM DOMAINS OF RBM45 IN COMPLEX WITH SINGLE-STRANDED DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0027 <- 3.05 -> DC O2 B0004 : score 3.4675 : H : ARG NH2 A0027 <- 3.17 -> DC N3 B0004 : score 2.12149 : H : ASP OD1 A0053 <- 3.21 -> DG N2 B0005 : score 4.7277 : H : ASP OD1 A0114 <- 2.63 -> DG N2 B0002 : score 5.3251 : H : ASP OD1 A0114 <- 2.99 -> DA N6 B0003 : score 3.34973 >7cuh_A:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FISSION YEAST POT1 AND SSDNA organism=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) / Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) : H : SER OG A0058 <- 2.38 -> DT O2 B0004 : score 4.00802 : H : THR OG1 A0062 <- 3.04 -> DT N3 B0003 : score 2.23232 : H : THR OG1 A0062 <- 2.77 -> DT O4 B0003 : score 3.9105 : H : HIS NE2 A0086 <- 2.47 -> DC O2 B0006 : score 5.63613 : H : LYS NZ A0090 <- 3.35 -> DT O4 B0003 : score 3.19259 : H : GLN NE2 A0120 <- 2.51 -> DC O2 B0006 : score 3.90917 : H : LYS NZ A0221 <- 2.77 -> DG N7 B0016 : score 5.41821 : H : TYR OH A0232 <- 3.08 -> DG O6 B0016 : score 3.42987 : H : ARG NH1 A0264 <- 2.84 -> DT O4 B0012 : score 3.24181 : H : ASP OD1 A0269 <- 2.64 -> DG N2 B0010 : score 5.3148 : H : GLU OE2 A0301 <- 3.01 -> DG N2 B0011 : score 4.12923 : H : HIS ND1 A0305 <- 2.72 -> DG O6 B0010 : score 6.32265 : H : SER OG A0308 <- 2.34 -> DG N2 B0008 : score 3.6848 : x : ASP xxxx A0064 <- 3.26 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0084 <- 3.08 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0088 <- 3.65 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0111 <- 2.98 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0113 <- 3.98 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.23 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0122 <- 4.29 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0124 <- 3.16 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0125 <- 3.04 -> DG xxx B0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0223 <- 3.31 -> DT xxx B0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0224 <- 3.10 -> DT xxx B0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0227 <- 4.40 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0228 <- 4.34 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0243 <- 3.41 -> DA xxx B0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0245 <- 4.25 -> DA xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0253 <- 3.98 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0266 <- 2.95 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0268 <- 3.29 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0293 <- 3.44 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0295 <- 3.43 -> DA xxx B0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0297 <- 3.29 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0299 <- 4.05 -> DA xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0303 <- 3.59 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0307 <- 3.27 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0309 <- 4.16 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0311 <- 3.54 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0312 <- 3.04 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx >7cvo_A:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARABIDOPSIS CO CCT DOMAIN IN COMPLEX WITH NF- YB3/YC4 AND FT CORE2 DNA organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ARG NH1 A0331 <- 2.74 -> DT O2 D0010 : score 4.35809 : H : ARG NH1 A0331 <- 3.12 -> DG N3 D0011 : score 2.8572 : H : ARG NH2 A0331 <- 2.78 -> DA N3 E0018 : score 3.2527 : H : ARG NH2 A0340 <- 2.97 -> DG N3 D0013 : score 3.48751 : x : LYS xxxx A0085 <- 4.42 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0335 <- 4.07 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0338 <- 3.22 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0344 <- 3.41 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0345 <- 3.29 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx >7cvo_AB:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARABIDOPSIS CO CCT DOMAIN IN COMPLEX WITH NF- YB3/YC4 AND FT CORE2 DNA organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ARG NH1 A0331 <- 2.74 -> DT O2 D0010 : score 4.35809 : H : ARG NH1 A0331 <- 3.12 -> DG N3 D0011 : score 2.8572 : H : ARG NH2 A0331 <- 2.78 -> DA N3 E0018 : score 3.2527 : H : ARG NH2 A0340 <- 2.97 -> DG N3 D0013 : score 3.48751 : x : LYS xxxx A0085 <- 4.42 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0335 <- 4.07 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0338 <- 3.22 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0344 <- 3.41 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0345 <- 3.29 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0047 <- 4.29 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx >7cvo_B:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARABIDOPSIS CO CCT DOMAIN IN COMPLEX WITH NF- YB3/YC4 AND FT CORE2 DNA organism=ARABIDOPSIS THALIANA : x : LYS xxxx B0047 <- 4.29 -> DG xxx E0002 : score x.xxxxx >7cvq_AB:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARABIDOPSIS CO CCT DOMAIN IN COMPLEX WITH NF- YB2/YC3 AND FT CORE1 DNA organism=? : H : ARG NH1 A0338 <- 2.38 -> DA N3 E0016 : score 3.99134 : H : ARG NH2 A0338 <- 2.67 -> DC O2 E0017 : score 3.79488 : x : ARG xxxx A0331 <- 3.27 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0335 <- 3.07 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0340 <- 3.53 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0344 <- 2.97 -> DT xxx E0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0345 <- 3.07 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx >7cvq_F:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARABIDOPSIS CO CCT DOMAIN IN COMPLEX WITH NF- YB2/YC3 AND FT CORE1 DNA organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ARG NH1 F0331 <- 2.21 -> DT O2 I0009 : score 4.81457 : H : ARG NH1 F0338 <- 2.61 -> DA N3 J0016 : score 3.82197 : H : ARG NH2 F0338 <- 2.53 -> DC O2 J0017 : score 3.89845 : x : LYS xxxx F0324 <- 4.13 -> DG xxx I0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0335 <- 3.19 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0340 <- 3.71 -> DG xxx I0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0344 <- 3.55 -> DT xxx J0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0345 <- 3.09 -> DC xxx J0015 : score x.xxxxx >7cvq_KL:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARABIDOPSIS CO CCT DOMAIN IN COMPLEX WITH NF- YB2/YC3 AND FT CORE1 DNA organism=ARABIDOPSIS THALIANA : x : ARG xxxx K0331 <- 3.44 -> DT xxx N0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx K0335 <- 3.70 -> DT xxx N0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0338 <- 2.94 -> DA xxx O0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx L0035 <- 4.29 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx >7cvq_PQ:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARABIDOPSIS CO CCT DOMAIN IN COMPLEX WITH NF- YB2/YC3 AND FT CORE1 DNA organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ARG NH2 P0340 <- 2.79 -> DG N3 T0012 : score 3.61748 : x : ARG xxxx P0331 <- 3.77 -> DG xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx P0335 <- 3.21 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0338 <- 3.23 -> DC xxx U0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0344 <- 3.39 -> DT xxx U0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0345 <- 3.17 -> DC xxx U0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Q0035 <- 4.05 -> DT xxx T0020 : score x.xxxxx >7cy6_A:Periplasmic_binding_protein-like_II; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CMD1 IN COMPLEX WITH 5MC-DNA organism=ESCHERICHIA COLI, CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : x : ASN xxxx A0261 <- 3.36 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx >7cy7_A:Periplasmic_binding_protein-like_II; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CMD1 IN COMPLEX WITH DNA organism=ESCHERICHIA COLI, CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : x : ASN xxxx A0261 <- 3.35 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx >7cy8_A:Periplasmic_binding_protein-like_II; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CMD1 IN COMPLEX WITH 5MC-DNA AND VITAMIN C organism=ESCHERICHIA COLI, CHLAMYDOMONAS REINHARDTII : x : ASN xxxx A0261 <- 3.22 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx >7d1z_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF SET8-NUCLEOSOME COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.48 -> DT O2 J0009 : score 3.6576 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.84 -> DG xxx I0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.12 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.77 -> DG xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.45 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0010 <- 4.00 -> DT xxx I0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.71 -> DG xxx J-037 : score x.xxxxx >7d20_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF SET8-CENP-A-NUCLEOSOME COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0045 <- 4.08 -> DC xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.31 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.83 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0010 <- 4.39 -> DT xxx I0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.90 -> DG xxx J-037 : score x.xxxxx >7d20_G:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF SET8-CENP-A-NUCLEOSOME COMPLEX organism=? : x : ALA xxxx G0010 <- 4.39 -> DT xxx I0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.90 -> DG xxx J-037 : score x.xxxxx >7d2l_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE CAS12I1 R-LOOP COMPLEX BEFORE TARGET DNA CLEAVAGE organism=LACHNOSPIRACEAE BACTERIUM ND2006 : H : THR OG1 A0168 <- 2.61 -> DG O6 C0022 : score 4.37557 : H : HIS NE2 A0170 <- 2.79 -> DT O4 D0007 : score 5.62019 : H : LYS NZ A0234 <- 3.15 -> DT O2 C0026 : score 3.33608 : H : ASN OD1 A0481 <- 3.24 -> DA N6 C0024 : score 5.49188 : H : ASN ND2 A0481 <- 2.73 -> DA N7 C0024 : score 5.9527 : H : SER OG A0482 <- 2.99 -> DA N7 C0023 : score 4.29447 : H : SER OG A0482 <- 3.00 -> DA N6 C0023 : score 3.15815 : H : ASN OD1 A0940 <- 2.83 -> DG N2 D0023 : score 4.7712 : V : TYR CD1 A0171 <- 3.59 -> DT C7 D0008 : score 4.92678 : x : ARG xxxx A0012 <- 3.68 -> DA xxx C0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0167 <- 4.31 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0174 <- 3.47 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0236 <- 3.39 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0298 <- 3.48 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0315 <- 4.14 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0318 <- 3.60 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0629 <- 4.16 -> DA xxx C0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0650 <- 4.46 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0759 <- 4.01 -> DT xxx D0028 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0896 <- 3.59 -> DG xxx D0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0897 <- 4.29 -> DG xxx D0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0904 <- 4.20 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0908 <- 3.96 -> DG xxx D0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0911 <- 3.46 -> DG xxx D0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0912 <- 3.99 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0915 <- 3.80 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0941 <- 3.60 -> DG xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0942 <- 3.54 -> DA xxx D0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0974 <- 3.34 -> DG xxx D0029 : score x.xxxxx >7d3j_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE CAS12I1 R-LOOP COMPLEX AFTER TARGET DNA CLEAVAGE organism=LACHNOSPIRACEAE BACTERIUM ND2006 : H : THR OG1 A0168 <- 3.37 -> DG N7 C0020 : score 3.09986 : H : THR OG1 A0168 <- 3.01 -> DG O6 C0020 : score 4.03834 : H : HIS NE2 A0170 <- 2.72 -> DT O4 D0007 : score 5.69872 : H : LYS NZ A0234 <- 2.92 -> DT O2 C0024 : score 3.50109 : H : ASN OD1 A0481 <- 3.32 -> DA N6 C0022 : score 5.39553 : H : ASN ND2 A0481 <- 2.61 -> DA N7 C0022 : score 6.09359 : H : SER OG A0482 <- 2.78 -> DA N7 C0021 : score 4.48196 : H : SER OG A0482 <- 3.10 -> DA N6 C0021 : score 3.09236 : V : TYR CD1 A0171 <- 3.56 -> DT C7 D0008 : score 4.96189 : x : SER xxxx A0174 <- 3.38 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0236 <- 3.41 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0298 <- 3.45 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >7d3t_AB:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF OSPHR2 IN COMPLEX WITH DNA organism=Oryza sativa subsp. indica : H : LYS NZ A0292 <- 2.60 -> DG O6 E0008 : score 6.012 : H : SER OG A0293 <- 2.55 -> DA N7 F0008 : score 4.68731 : H : LYS NZ B0292 <- 2.25 -> DG O6 F0004 : score 6.41665 : H : SER OG B0293 <- 2.71 -> DA N7 E0011 : score 4.54446 : H : GLN OE1 B0296 <- 2.99 -> DA N6 F0006 : score 5.82257 : H : GLN NE2 B0296 <- 3.18 -> DA N7 F0006 : score 5.62692 : x : ARG xxxx A0248 <- 3.41 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0296 <- 3.01 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0297 <- 4.19 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0248 <- 3.57 -> DA xxx E0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0297 <- 4.13 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx >7d3t_CD:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF OSPHR2 IN COMPLEX WITH DNA organism=Oryza sativa subsp. indica : H : LYS NZ C0292 <- 2.62 -> DG N7 H0004 : score 5.57979 : H : LYS NZ C0292 <- 2.56 -> DG O6 H0005 : score 6.05825 : w : LYS NZ C0292 <- 6.28 -> DT O4 G0012 : score 1.7 : H : GLN OE1 C0296 <- 2.88 -> DA N6 H0006 : score 5.95572 : H : GLN NE2 C0296 <- 2.95 -> DA N7 H0006 : score 5.90705 : w : GLN OE1 C0296 <- 6.73 -> DT O4 G0012 : score 3.068 : H : ARG NH1 D0248 <- 3.17 -> DA N3 H0006 : score 3.40958 : H : LYS NZ D0292 <- 2.45 -> DG N7 G0007 : score 5.76291 : x : ARG xxxx C0248 <- 3.52 -> DC xxx H0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0293 <- 3.33 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0297 <- 4.26 -> DT xxx G0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0293 <- 3.07 -> DA xxx H0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0296 <- 2.81 -> DA xxx G0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0297 <- 3.74 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx >7d3t_D:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF OSPHR2 IN COMPLEX WITH DNA organism=Oryza sativa subsp. indica : H : ARG NH1 D0248 <- 3.17 -> DA N3 H0006 : score 3.40958 : H : LYS NZ D0292 <- 2.45 -> DG N7 G0007 : score 5.76291 : x : SER xxxx D0293 <- 3.07 -> DA xxx H0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0296 <- 2.81 -> DA xxx G0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0297 <- 3.74 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx >7d3v_A:Cytidine_deaminase-like; title=NON-SPECIFIC AND SPECIFIC INTERACTIONS WORK COOPERATIVELY TO PROMOTE CYTIDINE DEAMINATION CATALYZED BY APOBEC3A organism=HOMO SAPIENS : H : HIS NE2 A0029 <- 2.58 -> DA N7 D0415 : score 4.43298 : H : LYS NZ A0060 <- 2.73 -> DT O4 D0417 : score 3.6374 : V : LEU CD1 A0062 <- 3.84 -> DT C7 D0418 : score 5.67397 : x : ASN xxxx A0024 <- 4.49 -> DA xxx D0409 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0026 <- 4.14 -> DT xxx D0412 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0058 <- 4.41 -> DA xxx D0416 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0070 <- 2.86 -> DC xxx D0414 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0072 <- 4.38 -> DC xxx D0414 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0098 <- 2.87 -> DC xxx D0414 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0101 <- 3.16 -> DC xxx D0414 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0130 <- 3.42 -> DC xxx D0414 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0131 <- 2.42 -> DT xxx D0413 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0132 <- 3.42 -> DT xxx D0413 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0181 <- 2.41 -> DA xxx D0409 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0182 <- 2.85 -> DA xxx D0409 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0185 <- 2.93 -> DT xxx D0410 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0186 <- 4.30 -> DT xxx D0410 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0189 <- 3.50 -> DT xxx D0412 : score x.xxxxx >7d58_ABE: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN RNA POLYMERASE III IN ELONGATING STATE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A1305 <- 2.47 -> DT O2 S0015 : score 4.51273 >7d69_ABCDEFGH:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING GIARDIA HISTONES organism=GIARDIA INTESTINALIS : x : ARG xxxx A0086 <- 4.26 -> DG xxx I0042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0031 <- 4.50 -> DT xxx J0069 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0044 <- 3.13 -> DG xxx J0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0086 <- 4.44 -> DG xxx J0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0039 <- 4.27 -> DG xxx I0104 : score x.xxxxx >7d69_B:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING GIARDIA HISTONES organism=GIARDIA INTESTINALIS : x : ARG xxxx B0031 <- 4.50 -> DT xxx J0069 : score x.xxxxx >7d69_E:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING GIARDIA HISTONES organism=GIARDIA INTESTINALIS : x : GLN xxxx E0044 <- 3.13 -> DG xxx J0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0086 <- 4.44 -> DG xxx J0036 : score x.xxxxx >7d69_G:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING GIARDIA HISTONES organism=GIARDIA INTESTINALIS : x : ARG xxxx G0039 <- 4.27 -> DG xxx I0104 : score x.xxxxx >7d7c_CDF: title=CRYOEM STRUCTURE OF GP55-DEPENDENT RNA POLYMERASE-PROMOTER OPEN COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI / ESCHERICHIA COLI 1-392-07_S4_C3 : H : SER OG C0182 <- 2.62 -> DG N2 N0038 : score 3.49584 : H : SER OG D0319 <- 2.80 -> DT O2 T0023 : score 3.69744 : H : TYR OH F0010 <- 2.39 -> DA N7 N0031 : score 4.49169 : H : GLN OE1 F0100 <- 2.68 -> DA N6 N0029 : score 6.19783 : V : ARG CZ C0542 <- 3.82 -> DT C7 N0040 : score 2.12165 : V : THR CG2 D0262 <- 3.61 -> DT C7 T0022 : score 4.43818 : V : VAL CG2 F0117 <- 3.65 -> DT C7 T0024 : score 6.35269 : V : VAL CG2 F0107 <- 3.86 -> DT C7 T0026 : score 6.03123 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.42 -> DA xxx N0039 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0178 <- 4.33 -> DG xxx N0038 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 2.81 -> DG xxx N0038 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 2.73 -> DG xxx N0038 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 4.45 -> DA xxx N0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0470 <- 4.07 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0477 <- 4.42 -> DA xxx N0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0481 <- 3.45 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.30 -> DA xxx N0039 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 4.48 -> DA xxx N0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0259 <- 3.03 -> DT xxx T0022 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0260 <- 4.23 -> DT xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0320 <- 2.85 -> DT xxx T0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D1170 <- 3.41 -> DC xxx N0052 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0013 <- 3.93 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0050 <- 3.39 -> DA xxx N0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0054 <- 3.59 -> DA xxx N0031 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0056 <- 4.49 -> DA xxx N0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0057 <- 4.02 -> DA xxx N0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0059 <- 3.71 -> DT xxx T0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0060 <- 3.13 -> DT xxx T0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0063 <- 2.99 -> DT xxx T0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0064 <- 3.90 -> DT xxx T0024 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0067 <- 3.55 -> DT xxx T0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0086 <- 3.80 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0087 <- 3.73 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0090 <- 2.86 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0091 <- 3.21 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0095 <- 2.78 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0097 <- 3.11 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0099 <- 3.23 -> DA xxx N0029 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0101 <- 3.40 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0104 <- 2.81 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0110 <- 3.96 -> DT xxx T0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0121 <- 3.33 -> DT xxx T0023 : score x.xxxxx >7d7c_F: title=CRYOEM STRUCTURE OF GP55-DEPENDENT RNA POLYMERASE-PROMOTER OPEN COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : TYR OH F0010 <- 2.39 -> DA N7 N0031 : score 4.49169 : H : GLN OE1 F0100 <- 2.68 -> DA N6 N0029 : score 6.19783 : V : VAL CG2 F0117 <- 3.65 -> DT C7 T0024 : score 6.35269 : V : VAL CG2 F0107 <- 3.86 -> DT C7 T0026 : score 6.03123 : x : ASN xxxx F0013 <- 3.93 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0050 <- 3.39 -> DA xxx N0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0054 <- 3.59 -> DA xxx N0031 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0056 <- 4.49 -> DA xxx N0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0057 <- 4.02 -> DA xxx N0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0059 <- 3.71 -> DT xxx T0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0060 <- 3.13 -> DT xxx T0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0063 <- 2.99 -> DT xxx T0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0064 <- 3.90 -> DT xxx T0024 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0067 <- 3.55 -> DT xxx T0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0086 <- 3.80 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0087 <- 3.73 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0090 <- 2.86 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0091 <- 3.21 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0095 <- 2.78 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0097 <- 3.11 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0099 <- 3.23 -> DA xxx N0029 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0101 <- 3.40 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0104 <- 2.81 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0110 <- 3.96 -> DT xxx T0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0121 <- 3.33 -> DT xxx T0023 : score x.xxxxx >7d7d_CDF: title=CRYOEM STRUCTURE OF GP45-DEPENDENT TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI / ESCHERICHIA COLI 1-392-07_S4_C3 / ESCHERICHIA VIRUS T4 : H : SER OG C0182 <- 3.03 -> DG N2 N0038 : score 3.21914 : H : ARG NH2 C0470 <- 2.50 -> DA N3 T0025 : score 3.43413 : H : ASN ND2 D0320 <- 2.41 -> DT O2 T0023 : score 5.11635 : H : TYR OH F0010 <- 2.72 -> DA N7 N0031 : score 4.2177 : H : GLN OE1 F0100 <- 3.17 -> DA N6 N0029 : score 5.60467 : H : ASN ND2 F0104 <- 2.44 -> DT O2 N0026 : score 5.08788 : V : PHE CZ D0260 <- 3.66 -> DT C7 T0023 : score 7.36389 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.27 -> DA xxx N0039 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 2.99 -> DG xxx N0038 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 2.70 -> DG xxx N0038 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 3.51 -> DA xxx N0039 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0481 <- 3.46 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.54 -> DA xxx N0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0259 <- 2.80 -> DT xxx T0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0319 <- 4.07 -> DT xxx T0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D1170 <- 4.47 -> DC xxx N0052 : score x.xxxxx : x 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>7d8t_AB:Nucleic_acid-binding_proteins;HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=MITF BHLHLZ COMPLEX WITH M-BOX DNA organism=HOMO SAPIENS, AQUIFEX AEOLICUS VF5 : H : HIS NE2 A0316 <- 2.83 -> DG O6 D0011 : score 7.90612 : H : GLU OE1 A0320 <- 2.33 -> DC N4 C0005 : score 6.31014 : H : HIS NE2 B0316 <- 2.89 -> DG O6 C0010 : score 7.81068 : H : GLU OE1 B0320 <- 2.27 -> DC N4 D0006 : score 6.37935 : x : ASN xxxx A0317 <- 3.93 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0323 <- 3.49 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0324 <- 3.32 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0317 <- 4.02 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0323 <- 3.36 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0324 <- 3.88 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx >7d98_BPQ:Periplasmic_binding_protein-like_II;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FULL-LENGTH CBNR COMPLEXED WITH THE TARGET DNA COMPLEX organism=Cupriavidus necator : V : PRO CB P0030 <- 3.55 -> DT C7 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x.xxxxx >7dbh_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE MOUSE NUCLEOSOME STRUCTURE CONTAINING H3MM18 organism=MUS MUSCULUS : x : ARG xxxx B0045 <- 4.45 -> DC xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.12 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx >7dbm_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE MUTANT Q151M/Y115F/F116Y/M184V:DNA:DGTP TERNARY COMPLEX organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 / HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.98 -> DG N2 E0032 : score 4.71371 : H : TYR OH A0183 <- 2.65 -> DG N3 E0032 : score 3.20753 : w : ASN OD1 A0265 <- 6.55 -> DG N3 E0029 : score 3.377 : V : TRP CD1 A0024 <- 3.55 -> DT C7 E-001 : score 7.79167 : x : PHE xxxx A0061 <- 3.62 -> DC xxx E0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0063 <- 4.14 -> DC xxx E0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.51 -> DC xxx E0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0076 <- 4.31 -> DT xxx 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DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0078 <- 3.40 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0094 <- 3.33 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0151 <- 3.83 -> DG xxx F0000 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 3.74 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.41 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 3.63 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.73 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0501 <- 3.82 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx >7dbn_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE MUTANT Q151M/Y115F/F116Y/M184V/F160M:DNA:DCTP TERNARY COMPLEX organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1 / HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH C0183 <- 2.99 -> DG N2 F0032 : score 4.70393 : H : TYR OH C0183 <- 2.70 -> DG N3 F0032 : score 3.17638 : x : TRP xxxx C0024 <- 3.18 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0061 <- 4.09 -> DG xxx F0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0074 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DG xxx G0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0068 <- 3.55 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0072 <- 3.79 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0074 <- 3.59 -> DG xxx H0004 : score x.xxxxx >7dcs_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HSF1 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH 3-SITE HSE DNA (23 BP) organism=? : H : ARG NE D0071 <- 2.77 -> DG O6 I0010 : score 3.96467 : H : ARG NH2 D0071 <- 2.85 -> DG N7 I0010 : score 6.32077 : w : ASN ND2 D0074 <- 5.99 -> DA N7 I0009 : score 1.989 : x : SER xxxx D0068 <- 3.59 -> DT xxx J0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0070 <- 4.26 -> DT xxx I0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0072 <- 3.72 -> DT xxx J0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0117 <- 3.22 -> DA xxx J0010 : score x.xxxxx >7dcs_DEF:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HSF1 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH 3-SITE HSE DNA (23 BP) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE D0071 <- 2.77 -> DG O6 I0010 : score 3.96467 : H : ARG NH2 D0071 <- 2.85 -> DG N7 I0010 : score 6.32077 : w : ASN ND2 D0074 <- 5.99 -> DA N7 I0009 : score 1.989 : H : ARG NE E0071 <- 2.98 -> DG O6 J0016 : score 3.79915 : H : ARG NH2 E0071 <- 2.78 -> DG N7 J0016 : score 6.41015 : w : ASN OD1 E0074 <- 5.79 -> DA N7 J0015 : score 2.277 : H : ARG NE F0071 <- 2.93 -> DG O6 J0006 : score 3.83856 : H : ARG NH2 F0071 <- 2.99 -> DG N7 J0006 : score 6.142 : x : SER xxxx D0068 <- 3.59 -> DT xxx J0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0070 <- 4.26 -> DT xxx I0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0072 <- 3.72 -> DT xxx J0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0117 <- 3.22 -> DA xxx J0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0068 <- 3.55 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0070 <- 4.24 -> DT xxx J0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0072 <- 3.56 -> DT xxx I0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0075 <- 4.30 -> DA xxx J0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0117 <- 3.42 -> DG xxx I0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0068 <- 3.59 -> DT xxx I0016 : score 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DT xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0117 <- 3.75 -> DA xxx G0015 : score x.xxxxx >7dct_DEF:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HSF1 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH 3-SITE HSE DNA (24 BP) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE D0071 <- 2.65 -> DG O6 I0011 : score 4.05926 : H : ARG NH2 D0071 <- 2.78 -> DG N7 I0011 : score 6.41015 : H : ARG NH2 D0117 <- 3.11 -> DA N7 J0010 : score 1.56814 : H : ARG NE E0071 <- 2.90 -> DG O6 J0016 : score 3.86221 : H : ARG NH2 E0071 <- 2.90 -> DG N7 J0016 : score 6.25692 : w : ASN ND2 E0074 <- 5.80 -> DA N7 J0015 : score 1.989 : H : ARG NE F0071 <- 2.99 -> DG O6 J0006 : score 3.79127 : H : ARG NH2 F0071 <- 3.00 -> DG N7 J0006 : score 6.12923 : x : SER xxxx D0068 <- 3.55 -> DT xxx J0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0070 <- 4.03 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0072 <- 3.76 -> DT xxx J0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0074 <- 3.37 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0068 <- 3.48 -> DT xxx 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score 1.989 : w : ARG NH1 B0109 <- 5.89 -> DG O6 D0003 : score 2.756 : w : ARG NH2 B0109 <- 5.55 -> DT O4 D0004 : score 2.366 : w : SER OG B0112 <- 6.08 -> DG O6 D0003 : score 2.749 : H : ARG NE C0063 <- 2.88 -> DG O6 E0005 : score 3.87797 : H : ARG NH2 C0063 <- 3.01 -> DG N7 E0005 : score 6.11646 : w : ARG NH1 C0109 <- 6.04 -> DA N6 D0013 : score 1.486 : w : ARG NH2 C0109 <- 5.56 -> DT O4 D0014 : score 2.366 : x : SER xxxx A0060 <- 3.52 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0062 <- 4.19 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0064 <- 3.31 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0067 <- 3.91 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0112 <- 3.89 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0060 <- 3.64 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0062 <- 4.18 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0064 <- 3.97 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0060 <- 3.47 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0064 <- 3.90 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx >7dcu_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HSF2 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH 3-SITE HSE DNA (21 BP) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NE C0063 <- 2.88 -> DG O6 E0005 : score 3.87797 : H : ARG NH2 C0063 <- 3.01 -> DG N7 E0005 : score 6.11646 : w : ARG NH1 C0109 <- 6.04 -> DA N6 D0013 : score 1.486 : w : ARG NH2 C0109 <- 5.56 -> DT O4 D0014 : score 2.366 : x : SER xxxx C0060 <- 3.47 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0064 <- 3.90 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx >7dpe_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=RNA METHYLTRANSFERASE METTL4 organism=Arabidopsis thaliana : x : LYS xxxx A0280 <- 3.24 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx >7dta_A: title=SOLUTION STRUCTURE OF THE C-CLAMP DOMAIN FROM HUMAN HDBP1 IN COMPLEX WITH DNA organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ A0379 <- 2.92 -> DG N7 C0017 : score 5.25664 : H : LYS NZ A0380 <- 2.76 -> DG O6 B0007 : score 5.82702 : H : LYS NZ A0380 <- 2.87 -> DG O6 B0008 : score 5.69984 : x : ARG xxxx A0361 <- 3.00 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0378 <- 3.42 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx >7du2_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE III EC COMPLEX IN POST-TRANSLOCATION STATE organism=? : x : ARG xxxx A1305 <- 4.03 -> DG xxx Y0012 : score x.xxxxx >7du2_AE: title=RNA POLYMERASE III EC COMPLEX IN POST-TRANSLOCATION STATE organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A1305 <- 4.03 -> DG xxx Y0012 : score x.xxxxx >7dv2_A: title=STRUCTURE OF SULFOLOBUS SOLFATARICUS SEGB-DNA COMPLEX organism=? : H : LYS NZ A0052 <- 3.19 -> DA N7 E0015 : score 2.70808 : x : TRP xxxx A0056 <- 3.31 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0077 <- 4.35 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx >7dv2_ABCD: title=STRUCTURE OF SULFOLOBUS SOLFATARICUS SEGB-DNA COMPLEX organism=? : H : LYS NZ A0052 <- 3.19 -> DA N7 E0015 : score 2.70808 : H : LYS NZ B0052 <- 2.48 -> DG O6 F0008 : score 6.15074 : H : LYS NZ C0052 <- 3.00 -> DG O6 E0006 : score 5.54954 : H : LYS NZ D0052 <- 2.24 -> DG O6 E0009 : score 6.42822 : x : TRP xxxx A0056 <- 3.31 -> DT xxx E0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0077 <- 4.35 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0056 <- 3.40 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0077 <- 4.20 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0050 <- 4.50 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0056 <- 3.34 -> DC xxx F0010 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0056 <- 3.31 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0077 <- 4.41 -> DC xxx F0012 : score x.xxxxx >7dvv_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HEME SENSOR PROTEIN PEFR FROM STREPTOCOCCUS AGALACTIAE BOUND TO OPERATOR DNA (28-MER) organism=Streptococcus agalactiae serotype III (strain NEM316) / Streptococcus agalactiae serotype III (strain NEM316) : H : LYS NZ A0063 <- 3.13 -> DG N7 M0008 : score 5.03043 : H : SER OG A0064 <- 2.63 -> DT O4 L0018 : score 3.676 : H : ARG NH1 A0089 <- 3.06 -> DT O2 M0006 : score 4.08248 : x : SER xxxx A0062 <- 3.66 -> DT xxx L0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0065 <- 3.55 -> DA xxx L0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0067 <- 3.73 -> DT xxx M0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0068 <- 4.26 -> DT xxx M0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0071 <- 3.90 -> DT xxx M0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0072 <- 4.13 -> DC xxx L0015 : score x.xxxxx >7dvv_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HEME SENSOR PROTEIN PEFR FROM STREPTOCOCCUS AGALACTIAE BOUND TO OPERATOR DNA (28-MER) organism=Streptococcus agalactiae serotype III (strain NEM316) / Streptococcus agalactiae serotype III (strain NEM316) / Streptococcus agalactiae serotype III (strain NEM316) / Streptococcus agalactiae serotype III (strain NEM316) : H : LYS NZ A0063 <- 3.13 -> DG N7 M0008 : score 5.03043 : H : SER OG A0064 <- 2.63 -> DT O4 L0018 : score 3.676 : H : ARG NH1 A0089 <- 3.06 -> DT O2 M0006 : score 4.08248 : H : LYS NZ B0063 <- 3.28 -> DA N7 L0007 : score 2.65521 : H : LYS NZ B0063 <- 2.91 -> DG O6 L0008 : score 5.65359 : H : SER OG B0064 <- 3.12 -> DG O6 M0018 : score 3.8292 : H : ARG NH1 B0089 <- 2.99 -> DT O2 L0006 : score 4.14277 : x : SER xxxx A0062 <- 3.66 -> DT xxx L0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0065 <- 3.55 -> DA xxx L0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0067 <- 3.73 -> DT xxx M0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0068 <- 4.26 -> DT xxx M0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0071 <- 3.90 -> DT xxx M0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0072 <- 4.13 -> DC xxx L0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0062 <- 4.18 -> DA xxx M0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0065 <- 3.51 -> DA xxx M0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0067 <- 3.63 -> DT xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0068 <- 4.26 -> DT xxx L0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0071 <- 4.21 -> DT xxx L0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0072 <- 3.79 -> DT xxx M0015 : score x.xxxxx >7dw5_B:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DUX4 HD1-HD2 DOMAIN COMPLEXED WITH ERG SITES organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 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>7dy6_CDFK:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=A REFINED CRYO-EM STRUCTURE OF AN ESCHERICHIA COLI RNAP-PROMOTER OPEN COMPLEX (RPO) WITH SSPA organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NH1 C0371 <- 2.84 -> DG O6 H0043 : score 6.03467 : H : ARG NH1 F0397 <- 3.03 -> DT O4 G0026 : score 3.11762 : H : ARG NH2 F0397 <- 2.26 -> DT O4 G0026 : score 3.93766 : H : THR OG1 F0432 <- 2.74 -> DA N7 H0040 : score 3.45507 : H : GLN OE1 F0437 <- 2.89 -> DC N4 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: ARG xxxx C0042 <- 3.67 -> DG xxx I0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.16 -> DT xxx I0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.70 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.36 -> DC xxx I0111 : score x.xxxxx >7e9c_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE 1:1 ORC1 BAH DOMAIN IN COMPLEX WITH NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx A0040 <- 3.05 -> DG xxx J0066 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.69 -> DG xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0049 <- 4.34 -> DA xxx I0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0063 <- 4.50 -> DA xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.35 -> DG xxx J0069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0063 <- 4.48 -> DG xxx J0092 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.15 -> DA xxx J0080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0043 <- 4.12 -> DG xxx I0037 : score x.xxxxx >7e9c_G:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE 1:1 ORC1 BAH DOMAIN IN COMPLEX WITH NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx G0043 <- 4.12 -> DG xxx I0037 : score x.xxxxx >7e9f_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE 2:1 ORC1 BAH DOMAIN IN COMPLEX WITH NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx A0083 <- 4.38 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 3.56 -> DT xxx I0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0043 <- 4.35 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0078 <- 4.20 -> DG xxx J0131 : score x.xxxxx >7ea5_ABCDEFGH:Histone-fold; title=YEAST SET2 BOUND TO A NUCLEOSOME CONTAINING ONCOHISTONE MUTATIONS organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 3.09 -> DC O2 I0066 : score 3.48419 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.99 -> DG N3 I0083 : score 3.47307 : x : ARG xxxx C0042 <- 4.40 -> DC xxx J0111 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.41 -> DT xxx J0143 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.43 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.54 -> DC xxx 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score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0097 <- 3.67 -> DA xxx N0032 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0231 <- 3.81 -> DA xxx N0032 : score x.xxxxx >7ecw_H: title=THE CSY-ACRIF14-DSDNA COMPLEX organism=? : x : LEU xxxx H0231 <- 3.81 -> DA xxx N0032 : score x.xxxxx >7edb_A: title=ECOT38I RESTRICTION ENDONUCLEASE COMPLEXED WITH DNA organism=ESCHERICHIA PHAGE P2 : H : ARG NH1 A0082 <- 3.04 -> DG N7 F0004 : score 5.7596 : H : ARG NH2 A0082 <- 2.75 -> DG O6 F0004 : score 6.666 : H : ARG NH1 A0115 <- 3.14 -> DG O6 F0006 : score 5.66967 : H : ARG NH2 A0115 <- 2.93 -> DA N7 F0005 : score 1.62833 : w : ARG NH1 A0126 <- 5.82 -> DG N2 E0005 : score 1.082 : H : ARG NH2 A0127 <- 3.24 -> DC O2 F0012 : score 3.37323 : w : ASP OD1 A0191 <- 6.12 -> DC O2 F0009 : score 1.919 : H : ASN ND2 A0220 <- 3.05 -> DT O2 F0008 : score 4.50885 : w : SER OG A0224 <- 6.14 -> DT O2 E0009 : score 1.55 : V : GLU CB A0107 <- 3.72 -> DT C7 E0009 : score 1.66025 : x : ASP xxxx A0080 <- 3.57 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : SER 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2.94 -> DG N7 E0005 : score 5.8806 : H : ARG NH2 B0082 <- 2.72 -> DG O6 E0005 : score 6.7056 : H : GLU OE2 B0107 <- 2.74 -> DC N4 F0009 : score 5.32857 : H : ARG NH1 B0115 <- 2.97 -> DG O6 E0007 : score 5.8765 : H : ARG NH2 B0115 <- 3.08 -> DA N7 E0006 : score 1.57817 : x : ASP xxxx A0080 <- 3.57 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0083 <- 3.25 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0107 <- 3.11 -> DC xxx E0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0110 <- 3.32 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0111 <- 3.40 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0112 <- 3.71 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0126 <- 3.18 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0222 <- 3.60 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0249 <- 3.93 -> DC xxx F0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0250 <- 3.86 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0110 <- 3.21 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0111 <- 3.33 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0112 <- 4.15 -> DG xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0126 <- 3.16 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx >7eds_A:p53-like_transcription_factors; title=HUMAN P53 CORE DOMAIN WITH GERMLINE HOT SPOT MUTATION M133T IN COMPLEX WITH THE NATURAL PIG3 P53-RESPONSE ELEMENT AND ARSENIC organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0280 <- 2.91 -> DG O6 R0022 : score 5.9495 : H : ARG NH2 A0280 <- 3.06 -> DG N7 R0022 : score 6.05262 : x : ALA xxxx A0276 <- 4.11 -> DG xxx R0022 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0277 <- 3.65 -> DC xxx R0023 : score x.xxxxx >7edx_ABPQR: title=P53-BOUND TFIID-BASED CORE PIC ON HDM2 PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 P0257 <- 2.75 -> DT O2 X-028 : score 4.79362 : V : VAL CB R0283 <- 3.64 -> DT C7 X-037 : score 4.08533 : x : SER xxxx A0840 <- 3.44 -> DC xxx Y-026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0844 <- 3.50 -> DA xxx Y-025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0167 <- 3.48 -> DA xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0169 <- 3.81 -> DA xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 2.94 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.91 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.13 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0220 <- 3.67 -> DA xxx X-026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 3.18 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.31 -> DA xxx X-030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0289 <- 3.57 -> DA xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 4.06 -> DT xxx X-029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 3.40 -> DT xxx Y0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 2.97 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0313 <- 3.34 -> DT xxx X-028 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx R0281 <- 4.31 -> DC xxx Y0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0286 <- 3.36 -> DT xxx X-037 : score x.xxxxx >7edx_P:TATA-box_binding_protein-like; title=P53-BOUND TFIID-BASED CORE PIC ON HDM2 PROMOTER organism=? : H : ASN ND2 P0257 <- 2.75 -> DT O2 X-028 : score 4.79362 : x : ASN xxxx P0167 <- 3.48 -> DA xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0169 <- 3.81 -> DA xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 2.94 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.91 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.13 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0220 <- 3.67 -> DA xxx X-026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 3.18 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.31 -> DA xxx X-030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0289 <- 3.57 -> DA xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 4.06 -> DT xxx X-029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 3.40 -> DT xxx Y0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 2.97 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0313 <- 3.34 -> DT xxx X-028 : score x.xxxxx >7eeu_ABCD: title=HUMAN P53 CORE DOMAIN WITH HOT SPOT MUTATION R282W IN COMPLEX WITH THE NATURAL CDKN1A(P21) P53-RESPONSE ELEMENT AND ARSENIC organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0280 <- 2.81 -> DG O6 I0011 : score 6.07117 : H : ARG NH2 A0280 <- 2.87 -> DG N7 I0011 : score 6.29523 : H : ARG NH1 B0280 <- 3.06 -> DG O6 I0021 : score 5.767 : H : ARG NH2 B0280 <- 3.01 -> DG N7 I0021 : score 6.11646 : H : ARG NH1 C0280 <- 2.73 -> DG O6 J0023 : score 6.1685 : H : ARG NH2 C0280 <- 2.82 -> DG N7 J0023 : score 6.35908 : H : ARG NH1 D0280 <- 2.82 -> DG O6 J0013 : score 6.059 : H : ARG NH2 D0280 <- 2.84 -> DG N7 J0013 : score 6.33354 : x : ALA xxxx A0276 <- 3.89 -> DT xxx I0012 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0277 <- 3.99 -> DT xxx I0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0276 <- 3.87 -> DT xxx I0022 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0277 <- 4.01 -> DT xxx I0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0276 <- 3.97 -> DT xxx J0024 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0277 <- 3.96 -> DT xxx J0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0276 <- 3.81 -> DT xxx J0014 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0277 <- 3.93 -> DT xxx J0014 : score x.xxxxx >7eeu_E:p53-like_transcription_factors; title=HUMAN P53 CORE DOMAIN WITH HOT SPOT MUTATION R282W IN COMPLEX WITH THE NATURAL CDKN1A(P21) P53-RESPONSE ELEMENT AND ARSENIC organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 E0280 <- 2.77 -> DG O6 K0011 : score 6.11983 : H : ARG NH2 E0280 <- 2.77 -> DG N7 K0011 : score 6.42292 : x : ALA xxxx E0276 <- 3.86 -> DT xxx K0012 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx E0277 <- 3.92 -> DT xxx K0012 : score x.xxxxx >7eeu_EFGH: title=HUMAN P53 CORE DOMAIN WITH HOT SPOT MUTATION R282W IN COMPLEX WITH THE NATURAL CDKN1A(P21) P53-RESPONSE ELEMENT AND ARSENIC organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 E0280 <- 2.77 -> DG O6 K0011 : score 6.11983 : H : ARG NH2 E0280 <- 2.77 -> DG N7 K0011 : score 6.42292 : H : ARG NH1 F0280 <- 2.56 -> DG O6 K0021 : score 6.37533 : H : ARG NH2 F0280 <- 2.71 -> DG N7 K0021 : score 6.49954 : H : ARG NH1 G0280 <- 2.71 -> DG O6 L0023 : score 6.19283 : H : ARG NH2 G0280 <- 2.87 -> DG N7 L0023 : score 6.29523 : H : ARG NH1 H0280 <- 2.97 -> DG O6 L0013 : score 5.8765 : H : ARG NH2 H0280 <- 2.99 -> DG N7 L0013 : score 6.142 : x : ALA xxxx E0276 <- 3.86 -> DT xxx K0012 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx E0277 <- 3.92 -> DT xxx K0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0276 <- 3.63 -> DT xxx K0022 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx F0277 <- 3.89 -> DT xxx K0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0276 <- 3.71 -> DT xxx L0024 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx G0277 <- 3.90 -> DT xxx L0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0276 <- 3.68 -> DT xxx L0014 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx H0277 <- 4.15 -> DT xxx L0014 : score x.xxxxx >7ef8_A:DNA-glycosylase;Nudix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MOUSE MUTYH IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING AP SITE ANALOGUE:8-OXOG (FORM I) organism=Mus musculus : x : GLN xxxx A0110 <- 3.35 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0112 <- 3.54 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0150 <- 3.19 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0332 <- 3.99 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0416 <- 4.00 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0417 <- 3.92 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx >7ef9_A:DNA-glycosylase;Nudix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MOUSE MUTYH IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING AP SITE ANALOGUE:8-OXOG (FORM II) organism=Mus musculus : w : GLN OE1 A0109 <- 5.63 -> DG N3 C0009 : score 1.484 : w : GLN NE2 A0112 <- 6.04 -> DG N2 B0011 : score 1.484 : w : GLN NE2 A0112 <- 5.56 -> DC O2 C0006 : score 2.699 : w : THR OG1 A0115 <- 5.76 -> DG N2 B0009 : score 2.036 : w : SER OG A0152 <- 5.94 -> DC O2 B0007 : score 1.768 : w : ARG NH1 A0156 <- 5.71 -> DT O2 C0010 : score 1.855 : w : SER OG A0416 <- 5.31 -> DG O6 B0009 : score 2.749 : x : GLN xxxx A0110 <- 3.38 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0150 <- 3.06 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0332 <- 3.41 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0417 <- 3.87 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx >7eg6_A:Histone-fold; title=SNF5 FINGER HELIX BOUND TO THE NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH1 A0040 <- 3.37 -> DG N3 I0083 : score 2.70457 >7eg6_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=SNF5 FINGER HELIX BOUND TO THE NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 A0040 <- 3.37 -> DG N3 I0083 : score 2.70457 : x : ARG xxxx A0083 <- 4.14 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.48 -> DC xxx I0111 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.56 -> DT xxx J0083 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0042 <- 3.96 -> DT xxx I0145 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.46 -> DG xxx J0122 : score x.xxxxx >7eg7_APQRo: title=TFIID-BASED CORE PIC ON SCP PROMOTER organism=SUS SCROFA / HOMO SAPIENS : x : SER xxxx A0840 <- 3.95 -> DC xxx Y-026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0844 <- 3.93 -> DT xxx Y-025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0996 <- 4.40 -> DG xxx Y0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0167 <- 4.01 -> DT xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 2.87 -> DT xxx Y0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.80 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 4.29 -> DA xxx X-024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.31 -> DA xxx X-029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 3.58 -> DT xxx X-028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 4.00 -> DT xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0313 <- 4.20 -> DA xxx X-027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0286 <- 4.06 -> DG xxx X-036 : score x.xxxxx >7eg8_APQRT: title=TFIID-BASED CORE PIC ON PUMA PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 P0167 <- 2.74 -> DG N3 Y0028 : score 4.95361 : H : ASN ND2 P0257 <- 2.93 -> DC O2 X-028 : score 4.36302 : H : HIS ND1 T0229 <- 2.93 -> DG N2 Y0014 : score -5.89145 : V : VAL CG2 R0283 <- 3.55 -> DT C7 Y0035 : score 6.50577 : x : ARG xxxx A0843 <- 3.45 -> DA xxx Y-035 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0844 <- 2.73 -> DT xxx X0031 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0169 <- 3.56 -> DA xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 3.08 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.57 -> DG xxx Y0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.47 -> DG xxx X-024 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0220 <- 3.97 -> DC xxx X-026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0222 <- 3.79 -> DA xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 2.48 -> DG xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.26 -> DT xxx X-030 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 3.92 -> DA xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 3.14 -> DT xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0313 <- 4.34 -> DT xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx R0281 <- 3.77 -> DT xxx Y0035 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0284 <- 4.33 -> DA xxx Y0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0286 <- 2.98 -> DG xxx X-038 : score x.xxxxx >7eg9_A: title=TFIID-BASED INTERMEDIATE PIC ON SCP PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ A0844 <- 3.25 -> DG O6 X0023 : score 5.2605 : V : ARG CZ A0843 <- 3.73 -> DT C7 Y-027 : score 2.16962 : x : SER xxxx A0840 <- 4.15 -> DA xxx X0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0847 <- 3.74 -> DT xxx Y-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0854 <- 2.89 -> DT xxx Y-027 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A1023 <- 3.78 -> DT xxx X0002 : score x.xxxxx >7eg9_ABPQR: title=TFIID-BASED INTERMEDIATE PIC ON SCP PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ A0844 <- 3.25 -> DG O6 X0023 : score 5.2605 : H : ASN ND2 P0257 <- 2.65 -> DA N3 X-027 : score 3.92192 : H : THR OG1 P0313 <- 2.78 -> DA N3 X-028 : score 1.35926 : V : ARG CZ A0843 <- 3.73 -> DT C7 Y-027 : score 2.16962 : x : SER xxxx A0840 <- 4.15 -> DA xxx X0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0847 <- 3.74 -> DT xxx Y-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0854 <- 2.89 -> DT xxx Y-027 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A1023 <- 3.78 -> DT xxx X0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0167 <- 4.06 -> DT xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0169 <- 3.56 -> DA xxx X-026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 3.26 -> DG xxx X-024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx P0198 <- 3.91 -> DG xxx X-023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.75 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.24 -> DG xxx X-024 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0220 <- 4.17 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0222 <- 4.14 -> DT xxx Y0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 2.75 -> DT xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0287 <- 4.13 -> DG xxx Y0032 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.33 -> DT xxx X-031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 2.41 -> DT xxx X-029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 3.18 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 3.41 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx >7ega_APQRT: title=TFIID-BASED INTERMEDIATE PIC ON PUMA PROMOTER organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 P0257 <- 2.94 -> DC O2 X-028 : score 4.35406 : H : ARG NH2 R0286 <- 2.80 -> DG N7 X-038 : score 6.38462 : V : VAL CG2 R0283 <- 3.58 -> DT C7 Y0035 : score 6.45985 : x : ARG xxxx A0843 <- 3.44 -> DA xxx Y-035 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0844 <- 2.73 -> DT xxx X0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0996 <- 4.26 -> DC xxx X0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0167 <- 2.88 -> DG xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0169 <- 3.66 -> DT xxx X-027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 1.88 -> DG xxx X-024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.52 -> DG xxx Y0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.19 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0220 <- 3.97 -> DC xxx X-026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0222 <- 3.79 -> DA xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 2.49 -> DG xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.40 -> DT xxx X-030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 2.99 -> DT xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0313 <- 4.37 -> DT xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx R0189 <- 3.89 -> DT xxx X-030 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx R0281 <- 3.68 -> DT xxx Y0035 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0284 <- 4.33 -> DA xxx Y0034 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx R0316 <- 4.47 -> DG xxx X-038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx T0174 <- 3.91 -> DG xxx Y0023 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx T0229 <- 2.67 -> DG xxx X0014 : score x.xxxxx >7egb_6PQRT: title=TFIID-BASED HOLO PIC ON SCP PROMOTER organism=? : x : LYS xxxx 60418 <- 3.40 -> DA xxx Y-008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0167 <- 3.56 -> DT xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0169 <- 2.92 -> DA xxx X-027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 2.78 -> DC xxx Y0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx P0198 <- 4.36 -> DG xxx X-024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.29 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.15 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0220 <- 3.43 -> DA xxx X-026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0222 <- 4.06 -> DT xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0257 <- 3.16 -> DA xxx X-028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 3.28 -> DA xxx X-028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.09 -> DA xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0289 <- 4.09 -> DA xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 3.86 -> DA xxx X-030 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 4.01 -> DT xxx Y0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 3.54 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0313 <- 3.38 -> DA xxx X-028 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx R0281 <- 4.10 -> DC xxx Y0034 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0283 <- 4.47 -> DC xxx Y0036 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0284 <- 4.00 -> DC xxx Y0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0286 <- 3.67 -> DG xxx X-038 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx T0229 <- 3.00 -> DG xxx X-014 : score x.xxxxx >7egb_R:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=TFIID-BASED HOLO PIC ON SCP PROMOTER organism=? : x : ALA xxxx R0281 <- 4.10 -> DC xxx Y0034 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0283 <- 4.47 -> DC xxx Y0036 : score x.xxxxx : x : THR xxxx R0284 <- 4.00 -> DC xxx Y0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0286 <- 3.67 -> DG xxx X-038 : score x.xxxxx >7egc_6PQRTs: title=P53-BOUND TFIID-BASED HOLO PIC ON HDM2 PROMOTER organism=? : H : LYS NZ 60528 <- 2.74 -> DC O2 Y-016 : score 2.98151 : H : ASN ND2 P0257 <- 2.65 -> DT O2 X-028 : score 4.88854 : H : ASN ND2 P0257 <- 3.02 -> DT O2 X-027 : score 4.53732 : H : THR OG1 P0313 <- 2.85 -> DT O2 X-028 : score 2.68696 : x : ILE xxxx 60477 <- 4.27 -> DT xxx Y-020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0167 <- 2.63 -> DA xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0169 <- 3.26 -> DA xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 1.97 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 2.71 -> DT xxx Y0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 4.14 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0220 <- 3.44 -> DA xxx X-026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0222 <- 4.02 -> DT xxx Y0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 3.43 -> DA xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 2.92 -> DA xxx X-030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0289 <- 3.83 -> DA xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 2.80 -> DT xxx X-029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 3.18 -> DT xxx Y0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 3.83 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx R0283 <- 4.13 -> DT xxx X-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0286 <- 3.74 -> DT xxx X-037 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx R0287 <- 4.41 -> DG xxx X-036 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx T0229 <- 3.11 -> DA xxx Y0014 : score x.xxxxx >7egd_ABDPd: title=SCP PROMOTER-BOUND TFIID-TFIIA IN INITIAL TBP-LOADING STATE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0854 <- 2.49 -> DT O2 Y-029 : score 4.4958 : H : ARG NH1 A1022 <- 2.79 -> DT O2 Y0000 : score 4.31502 : H : ARG NH2 A1022 <- 2.70 -> DT O2 Y0000 : score 4.318 : H : ARG NH1 D0973 <- 3.12 -> DG N7 X-018 : score 5.6628 : H : ARG NH1 D0973 <- 3.09 -> DG O6 X-018 : score 5.7305 : x : ARG xxxx A0843 <- 3.52 -> DT xxx Y-027 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A1023 <- 3.58 -> DA xxx X0000 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1230 <- 3.70 -> DG xxx X0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A1231 <- 4.15 -> DC xxx Y-031 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1235 <- 3.79 -> DC xxx Y-033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0975 <- 3.76 -> DC xxx Y0016 : score x.xxxxx >7egd_D:Histone-fold; title=SCP PROMOTER-BOUND TFIID-TFIIA IN INITIAL TBP-LOADING STATE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 D0973 <- 3.12 -> DG N7 X-018 : score 5.6628 : H : ARG NH1 D0973 <- 3.09 -> DG O6 X-018 : score 5.7305 : x : ARG xxxx D0975 <- 3.76 -> DC xxx Y0016 : score x.xxxxx >7egh_AB: title=TFIID LOBE C SUBCOMPLEX organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0854 <- 2.49 -> DT O2 Y0017 : score 4.4958 : H : ARG NH2 A1022 <- 2.45 -> DT O2 Y0046 : score 4.52967 : x : ARG xxxx A0843 <- 3.52 -> DT xxx Y0019 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A1023 <- 3.58 -> DG xxx Y0047 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1230 <- 3.70 -> DG xxx X0070 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A1231 <- 4.15 -> DC xxx Y0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1235 <- 3.79 -> DC xxx Y0013 : score x.xxxxx >7egj_ABDPQ: title=SCP PROMOTER-BOUND TFIID-TFIIA IN POST TBP-LOADING STATE organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ Q0346 <- 2.86 -> DA N7 Y0029 : score 2.90193 : H : LYS NZ Q0346 <- 3.06 -> DT O4 Y0030 : score 3.40065 : x : SER xxxx A0840 <- 4.00 -> DG xxx X0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0843 <- 2.84 -> DG xxx Y-026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0844 <- 4.31 -> DG xxx X0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0854 <- 3.64 -> DC xxx Y-028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1022 <- 3.30 -> DT xxx Y0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1227 <- 3.61 -> DT xxx Y-029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A1231 <- 3.08 -> DC xxx Y-031 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1235 <- 3.42 -> DA xxx Y-032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0344 <- 3.56 -> DT xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Q0345 <- 3.62 -> DA xxx X-030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx Q0347 <- 4.19 -> DT xxx X-031 : score x.xxxxx >7egp_S:Histone-fold; title=THE STRUCTURE OF SWI/SNF-NUCLEOSOME COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 S0040 <- 2.93 -> DC O2 W0084 : score 3.5551 : H : ARG NH2 S0040 <- 2.36 -> DG N3 W0083 : score 3.92796 : H : ARG NH2 S0083 <- 2.73 -> DC O2 X0049 : score 3.7505 : H : ARG NH2 S0083 <- 2.63 -> DT O2 X0050 : score 4.37727 : x : PRO xxxx S0043 <- 3.19 -> DG xxx X0068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx S0065 <- 3.48 -> DC xxx W0092 : score x.xxxxx >7eh0_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=THERMUS THERMOPHILUS RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING A TEMPLATE-STRAND PURINE AT POSITION TSS-2, UPA RNA PRIMER AND CMPCPP organism=? : H : ARG NH1 C0243 <- 2.53 -> DG O6 G0009 : score 6.41183 : H : ARG NH1 C0266 <- 2.53 -> DG N7 G0011 : score 6.3767 : H : ARG NH2 C0266 <- 2.63 -> DG O6 G0011 : score 6.8244 : H : ASP OD1 C0326 <- 2.72 -> DG N2 G0014 : score 5.2324 : x : ARG xxxx C0142 <- 3.68 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0167 <- 3.45 -> DC xxx G0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0170 <- 3.57 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0171 <- 3.46 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0187 <- 3.88 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0188 <- 4.42 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0256 <- 4.07 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0260 <- 4.47 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0325 <- 3.80 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0331 <- 3.29 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0418 <- 3.54 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 3.93 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0426 <- 4.04 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0427 <- 3.39 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx >7eh0_CDF: title=THERMUS THERMOPHILUS RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING A TEMPLATE-STRAND PURINE AT POSITION TSS-2, UPA RNA PRIMER AND CMPCPP organism=THERMUS THERMOPHILUS HB8 : H : ARG NH1 C0243 <- 2.53 -> DG O6 G0009 : score 6.41183 : H : ARG NH1 C0266 <- 2.53 -> DG N7 G0011 : score 6.3767 : H : ARG NH2 C0266 <- 2.63 -> DG O6 G0011 : score 6.8244 : H : ASP OD1 C0326 <- 2.72 -> DG N2 G0014 : score 5.2324 : H : ASP OD2 F0326 <- 3.42 -> DA N6 H0018 : score 3.50625 : x : ARG xxxx C0142 <- 3.68 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0167 <- 3.45 -> DC xxx G0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0170 <- 3.57 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0171 <- 3.46 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0187 <- 3.88 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0188 <- 4.42 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0256 <- 4.07 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0260 <- 4.47 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0325 <- 3.80 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0331 <- 3.29 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0418 <- 3.54 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 3.93 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0426 <- 4.04 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0427 <- 3.39 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0705 <- 3.64 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 3.89 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.49 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 3.63 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0079 <- 4.16 -> DG xxx G0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0082 <- 3.47 -> DG xxx G0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0321 <- 4.33 -> DG xxx H0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0324 <- 3.09 -> DA xxx H0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0327 <- 3.59 -> DG xxx H0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0332 <- 3.91 -> DG xxx H0019 : score x.xxxxx >7eh1_CDF: title=THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING A TEMPLATE-STRAND PURINE AT POSITION TSS-2, GPG RNA PRIMER, AND CMPCPP organism=THERMUS THERMOPHILUS HB8 : H : ARG NH1 C0243 <- 2.33 -> DG O6 G0009 : score 6.65517 : H : ARG NH2 C0243 <- 3.05 -> DG O6 G0009 : score 6.27 : H : ASP OD1 C0326 <- 2.85 -> DG N2 G0014 : score 5.0985 : H : ARG NH2 F0082 <- 3.38 -> DG O6 G0009 : score 5.8344 : H : ASP OD1 F0326 <- 3.14 -> DG N2 H0019 : score 4.7998 : x : ARG xxxx C0142 <- 3.78 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0167 <- 3.34 -> DC xxx G0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0170 <- 3.53 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0171 <- 3.36 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0187 <- 3.85 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0188 <- 3.43 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0256 <- 4.06 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0260 <- 4.36 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0266 <- 2.19 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0325 <- 3.68 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0331 <- 3.18 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0418 <- 3.46 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0421 <- 3.95 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0426 <- 4.37 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0427 <- 3.63 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0705 <- 3.61 -> DC xxx H0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 3.72 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.80 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 3.91 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0079 <- 3.99 -> DG xxx G0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0321 <- 4.13 -> DG xxx H0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0324 <- 3.35 -> DG xxx H0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0327 <- 3.73 -> DG xxx H0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0332 <- 4.01 -> DG xxx H0019 : score x.xxxxx >7eh1_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING A TEMPLATE-STRAND PURINE AT POSITION TSS-2, GPG RNA PRIMER, AND CMPCPP organism=? : x : ALA xxxx D0705 <- 3.61 -> DC xxx H0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0706 <- 3.72 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D1088 <- 3.80 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1089 <- 3.91 -> DG xxx H0014 : score x.xxxxx >7eh2_CDF: title=THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING A TEMPLATE-STRAND PYRIMIDINE AT POSITION TSS-2 AND GPG RNA PRIMER organism=THERMUS THERMOPHILUS HB8 : V : ARG CG C0422 <- 3.85 -> DT C7 G0015 : score 0.992564 : x : GLU xxxx C0421 <- 3.85 -> DA xxx H0013 : score x.xxxxx >7eh2_M:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING A TEMPLATE-STRAND PYRIMIDINE AT POSITION TSS-2 AND GPG RNA PRIMER organism=? : x : GLU xxxx M0421 <- 4.21 -> DT xxx J0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0422 <- 3.87 -> DT xxx J0015 : score x.xxxxx >7eh2_MNP: title=THERMUS THERMOPHILUS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX CONTAINING A TEMPLATE-STRAND PYRIMIDINE AT POSITION TSS-2 AND GPG RNA PRIMER organism=THERMUS THERMOPHILUS HB8 : x : GLU xxxx M0421 <- 4.21 -> DT xxx J0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0422 <- 3.87 -> DT xxx J0015 : score x.xxxxx >7ej7_ABC:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Rad51_N-terminal_domain-like; title=YEAST DMC1 POST-SYNAPTIC COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 B0229 <- 2.58 -> DA N7 E0007 : score 2.67291 : V : LYS CE A0280 <- 3.79 -> DT C7 D0003 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xxxx C0232 <- 4.01 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0233 <- 3.45 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0264 <- 3.62 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0266 <- 4.44 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0267 <- 3.28 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0280 <- 3.12 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx >7ej7_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Rad51_N-terminal_domain-like; title=YEAST DMC1 POST-SYNAPTIC COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH1 B0229 <- 2.58 -> DA N7 E0007 : score 2.67291 : V : LYS CE B0280 <- 3.87 -> DT C7 D0006 : score 2.55551 : x : LEU xxxx B0232 <- 4.01 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0233 <- 3.45 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0264 <- 3.60 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0265 <- 2.88 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0266 <- 4.32 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0267 <- 3.19 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0277 <- 4.36 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >7eje_ABC:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Rad51_N-terminal_domain-like; title=HUMAN RAD51 POST-SYNAPTIC COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0235 <- 3.15 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0238 <- 3.09 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0239 <- 3.68 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0272 <- 4.43 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0273 <- 3.95 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0274 <- 2.51 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0283 <- 4.11 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0235 <- 2.89 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0238 <- 3.08 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0239 <- 3.84 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0273 <- 3.81 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0274 <- 2.38 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0235 <- 3.01 -> DA xxx E0001 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PRO xxxx B0063 <- 3.04 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0064 <- 3.76 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0066 <- 3.91 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0071 <- 3.81 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx >7ena_6ABP: title=TFIID-BASED PIC-MEDIATOR HOLO-COMPLEX IN PRE-ASSEMBLED STATE (PRE- HPIC-MED) organism=? : H : ASN ND2 P0167 <- 2.75 -> DT O2 Y0027 : score 4.79362 : H : ASN ND2 P0257 <- 2.66 -> DA N3 X-026 : score 3.91431 : V : ARG CZ A0843 <- 3.71 -> DT C7 Y-025 : score 2.18028 : x : VAL xxxx P0169 <- 2.74 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 3.09 -> DC xxx Y0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.56 -> DT xxx Y0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.95 -> DG xxx X-023 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0220 <- 3.49 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0222 <- 3.89 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx P0256 <- 4.06 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 3.20 -> DA xxx X-027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.10 -> DA xxx X-029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0289 <- 4.29 -> DG xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 3.00 -> DT xxx X-028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 3.42 -> DT xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 3.51 -> DA xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0313 <- 1.89 -> DA xxx X-027 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0281 <- 3.00 -> DC xxx Y0033 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0283 <- 4.39 -> DC xxx Y0033 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0284 <- 3.55 -> DC xxx Y0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0286 <- 3.45 -> DG xxx X-037 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0229 <- 3.43 -> DC xxx Y0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0840 <- 4.36 -> DC xxx X0022 : score x.xxxxx >7enc_6ABP: title=TFIID-BASED PIC-MEDIATOR HOLO-COMPLEX IN FULLY-ASSEMBLED STATE (HPIC- MED) organism=? : H : ASN ND2 P0257 <- 3.18 -> DA N3 X-027 : score 3.51831 : H : ASN ND2 P0257 <- 2.97 -> DA N3 X-026 : score 3.67823 : H : THR OG1 P0313 <- 2.73 -> DA N3 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4.02025 : H : ARG NH1 G0093 <- 3.26 -> DG N7 I0005 : score 5.4934 : H : ARG NH1 G0093 <- 2.92 -> DG O6 I0005 : score 5.93733 : H : GLN OE1 J0078 <- 3.01 -> DC N4 L0003 : score 4.39083 : H : TYR OH J0088 <- 3.01 -> DC N4 K0005 : score 4.03711 : H : ARG NH1 J0093 <- 2.99 -> DG O6 L0005 : score 5.85217 : H : ARG NH2 J0093 <- 2.70 -> DG N7 L0005 : score 6.51231 : V : PRO CG J0079 <- 3.70 -> DT C7 L0002 : score 6.51795 : x : PRO xxxx A0079 <- 3.68 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0091 <- 3.54 -> DG xxx H0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0095 <- 3.84 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0079 <- 3.76 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0091 <- 3.39 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0095 <- 3.75 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0079 <- 4.05 -> DT xxx I0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx G0095 <- 3.48 -> DT xxx I0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx J0086 <- 3.91 -> DC xxx K0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx J0095 <- 3.67 -> DT xxx L0004 : score x.xxxxx >7et4_D:DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARABIDOPSIS TEM1 AP2 DOMAIN organism=Arabidopsis thaliana : H : GLN NE2 D0078 <- 3.31 -> DG N7 F0005 : score 3.77045 : w : GLN OE1 D0086 <- 5.88 -> DA N6 E0010 : score 3.392 : w : GLN NE2 D0086 <- 6.20 -> DA N6 E0010 : score 2.804 : H : TYR OH D0088 <- 2.76 -> DA N7 E0009 : score 4.18449 : H : TYR OH D0088 <- 3.04 -> DA N6 E0009 : score 4.44633 : H : ARG NH1 D0093 <- 2.80 -> DG O6 F0007 : score 6.08333 : H : ARG NH2 D0093 <- 2.66 -> DG N7 F0007 : score 6.56338 : x : PRO xxxx D0079 <- 3.76 -> DT xxx F0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0091 <- 3.39 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0095 <- 3.75 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx >7et6_A:DNA-binding_pseudobarrel_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARABIDOPSIS TEM1 B3-DNA COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : H : ARG NH1 A0209 <- 3.35 -> DG N7 F0008 : score 5.3845 : x : SER xxxx A0202 <- 3.49 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0207 <- 3.60 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0208 <- 4.10 -> DC xxx E0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0211 <- 4.48 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0259 <- 3.29 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0261 <- 3.14 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0262 <- 3.00 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0264 <- 4.45 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx >7et6_AD:DNA-binding_pseudobarrel_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARABIDOPSIS TEM1 B3-DNA COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : H : ARG NH1 A0209 <- 3.35 -> DG N7 F0008 : score 5.3845 : x : SER xxxx A0202 <- 3.49 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0207 <- 3.60 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0208 <- 4.10 -> DC xxx E0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0211 <- 4.48 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0259 <- 3.29 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0261 <- 3.14 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0262 <- 3.00 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0264 <- 4.45 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx >7eu0_ABE: title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF A. THALIANA POL IV-RDR2 BACKTRACKED COMPLEX organism=ARABIDOPSIS THALIANA : x : LYS xxxx A0918 <- 4.50 -> DC xxx N0035 : score x.xxxxx >7eu9_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE SELENOMETHIONINE(SEMET)-DERIVED CAS12I1 R- LOOP COMPLEX BEFORE TARGET DNA CLEAVAGE organism=LACHNOSPIRACEAE BACTERIUM ND2006 : H : THR OG1 A0168 <- 2.89 -> DG O6 C0023 : score 4.13951 : H : ASN OD1 A0481 <- 3.17 -> DA N6 C0025 : score 5.57618 : H : ASN ND2 A0481 <- 2.85 -> DA N7 C0025 : score 5.81181 : H : SER OG A0482 <- 3.09 -> DA N7 C0024 : score 4.20518 : H : SER OG A0482 <- 3.00 -> DA N6 C0024 : score 3.15815 : V : TYR CD1 A0171 <- 3.68 -> DT C7 D0008 : score 4.82146 : x : HIS xxxx A0170 <- 2.84 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0174 <- 3.37 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0234 <- 3.12 -> DT xxx C0027 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0236 <- 3.37 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0298 <- 3.49 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >7eyi_G:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZBTB7A IN COMPLEX WITH GAMMA-GLOBIN -200 SEQUENCE ELEMENT WITH C-194A MUTATION organism=Homo sapiens : H : LYS NZ G0396 <- 2.94 -> DG O6 B0012 : score 5.61891 : H : ARG NH1 G0399 <- 2.83 -> DG O6 B0011 : score 6.04683 : H : ARG NH2 G0399 <- 2.82 -> DG N7 B0011 : score 6.35908 : H : ARG NH1 G0421 <- 2.99 -> DG N7 B0010 : score 5.8201 : H : ARG NH2 G0421 <- 3.04 -> DG O6 B0010 : score 6.2832 : H : ASP OD2 G0423 <- 3.07 -> DC N4 A-202 : score 5.8652 : H : LYS NZ G0424 <- 2.66 -> DG O6 B0009 : score 5.94263 : H : TYR OH G0451 <- 3.31 -> DC N4 A-200 : score 3.78426 : H : ARG NH1 G0477 <- 2.49 -> DG O6 B0005 : score 6.4605 : H : ARG NH2 G0477 <- 2.90 -> DG N7 B0005 : score 6.25692 : H : ASP OD2 G0479 <- 2.95 -> DC N4 A-197 : score 6.014 : H : HIS NE2 G0480 <- 2.67 -> DG N7 B0004 : score 6.97943 : H : ARG NH1 G0483 <- 3.07 -> DT O4 B0003 : score 3.09148 : H : ARG NH2 G0483 <- 2.78 -> DG O6 B0004 : score 6.6264 : x : ALA xxxx G0394 <- 4.28 -> DG xxx A-206 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0478 <- 3.86 -> DT xxx A-198 : score x.xxxxx >7ezj_A:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN COMPLEX BOUND WITH 1 BP AND 2 BP SPACER DNA RESPONSE ELEMENTS. organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0138 <- 2.78 -> DG N7 E0400 : score 5.40744 : H : LYS NZ A0138 <- 3.01 -> DG O6 E0400 : score 5.53798 : H : LYS NZ A0138 <- 2.64 -> DG O6 E0401 : score 5.96575 : H : CYS SG A0297 <- 3.28 -> DC N4 F0418 : score -3.1385 : H : ARG NH1 A0300 <- 3.19 -> DG O6 F0417 : score 5.60883 : H : ARG NH2 A0300 <- 3.25 -> DG N7 F0417 : score 5.81 : x : SER xxxx A0139 <- 4.12 -> DA xxx E0399 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0296 <- 4.40 -> DG xxx F0417 : score x.xxxxx >7ezj_CD:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN COMPLEX BOUND WITH 1 BP AND 2 BP SPACER DNA RESPONSE ELEMENTS. organism=Homo sapiens : H : LYS NZ C0138 <- 2.70 -> DG N7 H0514 : score 5.49362 : H : LYS NZ C0138 <- 3.13 -> DG O6 H0514 : score 5.39924 : H : LYS NZ C0138 <- 3.16 -> DG O6 H0515 : score 5.36455 : H : ARG NH1 C0300 <- 3.47 -> DG O6 G0507 : score 5.26817 : H : ARG NH2 C0300 <- 3.21 -> DG N7 G0507 : score 5.86108 : H : LYS NZ D0138 <- 2.70 -> DG N7 G0502 : score 5.49362 : H : LYS NZ D0138 <- 2.56 -> DG O6 G0503 : score 6.05825 : H : CYS SG D0297 <- 3.10 -> DC N4 H0520 : score -3.26349 : H : ARG NH1 D0300 <- 2.97 -> DG O6 H0519 : score 5.8765 : H : ARG NH2 D0300 <- 3.08 -> DG N7 H0519 : score 6.02708 : x : ALA xxxx C0296 <- 4.39 -> DG xxx G0507 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0297 <- 3.49 -> DC xxx G0508 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0296 <- 4.25 -> DG xxx H0519 : score x.xxxxx >7ezj_IJ:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN COMPLEX BOUND WITH 1 BP AND 2 BP SPACER DNA RESPONSE ELEMENTS. organism=Homo sapiens : H : LYS NZ I0138 <- 2.85 -> DG O6 M0413 : score 5.72296 : H : CYS SG I0297 <- 3.20 -> DC N4 N0406 : score -3.19405 : H : ARG NH1 I0300 <- 3.11 -> DG O6 N0405 : score 5.70617 : H : ARG NH2 I0300 <- 3.25 -> DG N7 N0405 : score 5.81 : H : LYS NZ J0138 <- 2.70 -> DG N7 N0400 : score 5.49362 : H : LYS NZ J0138 <- 3.30 -> DG O6 N0400 : score 5.20269 : H : LYS NZ J0138 <- 3.06 -> DG O6 N0401 : score 5.48017 : H : CYS SG J0297 <- 3.15 -> DC N4 M0418 : score -3.22877 : H : ARG NH1 J0300 <- 2.62 -> DG O6 M0417 : score 6.30233 : H : ARG NH2 J0300 <- 2.92 -> DG N7 M0417 : score 6.23138 : x : SER xxxx I0139 <- 3.69 -> DC xxx M0410 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0296 <- 4.12 -> DC xxx N0406 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0296 <- 4.35 -> DG xxx M0417 : score x.xxxxx >7ezj_cd:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN COMPLEX BOUND WITH 1 BP AND 2 BP SPACER DNA RESPONSE ELEMENTS. organism=Homo sapiens : H : LYS NZ c0138 <- 3.01 -> DG N7 h0514 : score 5.15969 : H : LYS NZ c0138 <- 3.29 -> DG O6 h0515 : score 5.21425 : H : CYS SG c0297 <- 3.41 -> DC N4 g0508 : score -3.04824 : H : ARG NH1 c0300 <- 2.93 -> DG O6 g0507 : score 5.92517 : H : ARG NH2 c0300 <- 3.17 -> DG N7 g0507 : score 5.91215 : H : LYS NZ d0138 <- 3.05 -> DG N7 g0502 : score 5.1166 : H : LYS NZ d0138 <- 2.24 -> DG O6 g0503 : score 6.42822 : H : ARG NH1 d0300 <- 3.15 -> DG O6 h0519 : score 5.6575 : x : ALA xxxx c0296 <- 4.19 -> DC xxx g0508 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx d0296 <- 4.11 -> DG xxx h0519 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx d0297 <- 3.52 -> DC xxx h0520 : score x.xxxxx >7ezj_ij:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF P73 DNA BINDING DOMAIN COMPLEX BOUND WITH 1 BP AND 2 BP SPACER DNA RESPONSE ELEMENTS. organism=Homo sapiens : H : SER OG i0139 <- 3.27 -> DA N7 m0411 : score 4.04448 : H : SER OG i0139 <- 3.16 -> DA N6 m0411 : score 3.05288 : H : CYS SG i0297 <- 3.27 -> DC N4 n0406 : score -3.14545 : H : ARG NH1 i0300 <- 3.12 -> DG O6 n0405 : score 5.694 : H : ARG NH2 i0300 <- 3.23 -> DG N7 n0405 : score 5.83554 : H : LYS NZ j0138 <- 2.66 -> DG N7 n0400 : score 5.5367 : H : LYS NZ j0138 <- 2.90 -> DG O6 n0401 : score 5.66515 : H : CYS SG j0297 <- 3.06 -> DC N4 m0418 : score -3.29126 : H : ARG NH1 j0300 <- 3.02 -> DG O6 m0417 : score 5.81567 : H : ARG NH2 j0300 <- 2.91 -> DG N7 m0417 : score 6.24415 : x : LYS xxxx i0138 <- 3.13 -> DG xxx m0412 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx i0296 <- 3.95 -> DC xxx n0406 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx j0296 <- 4.48 -> DC xxx m0418 : score x.xxxxx >7f0r_CDF: title=CRYO-EM STRUCTURE OF PSEUDOMONAS AERUGINOSA SUTA TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX organism=? : H : GLU OE2 F0305 <- 2.67 -> DC N4 I0057 : score 5.40228 : V : TRP CD1 F0154 <- 3.81 -> DT C7 H0049 : score 7.315 : x : GLU xxxx C0546 <- 4.19 -> DG xxx I0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0547 <- 3.92 -> DC xxx H0064 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0210 <- 4.34 -> DT xxx I0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0211 <- 3.74 -> DT xxx I0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0212 <- 3.52 -> DT xxx I0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0150 <- 3.66 -> DT xxx H0049 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0153 <- 3.43 -> DA xxx I0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0156 <- 3.82 -> DA xxx I0037 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0157 <- 3.67 -> DT xxx H0047 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0160 <- 3.16 -> DA xxx I0037 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0174 <- 3.48 -> DC xxx H0046 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0175 <- 3.66 -> DT xxx H0044 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0178 <- 3.96 -> DA xxx I0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0308 <- 3.52 -> DC xxx I0057 : score x.xxxxx >7f0r_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF PSEUDOMONAS AERUGINOSA SUTA TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX organism=? : H : GLU OE2 F0305 <- 2.67 -> DC N4 I0057 : score 5.40228 : V : TRP CD1 F0154 <- 3.81 -> DT C7 H0049 : score 7.315 : x : TYR xxxx F0150 <- 3.66 -> DT xxx H0049 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0153 <- 3.43 -> DA xxx I0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0156 <- 3.82 -> DA xxx I0037 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0157 <- 3.67 -> DT xxx H0047 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0160 <- 3.16 -> DA xxx I0037 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0174 <- 3.48 -> DC xxx H0046 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0175 <- 3.66 -> DT xxx H0044 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0178 <- 3.96 -> DA xxx I0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0308 <- 3.52 -> DC xxx I0057 : score x.xxxxx >7f2f_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=THE COMPLEX OF DNA WITH THE C-TERMINAL DOMAIN OF TYE7 FROM SACCHAROMYCES CEREVISIAE. organism=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) : H : HIS NE2 A0185 <- 3.07 -> DG N7 E0011 : score 6.43523 : H : HIS NE2 A0185 <- 3.06 -> DG O6 E0011 : score 7.54025 : H : HIS NE2 B0185 <- 3.20 -> DG O6 H0011 : score 7.31754 : H : GLU OE1 B0189 <- 2.46 -> DC N4 E0006 : score 6.16017 : V : ILE CG2 B0188 <- 3.79 -> DT C7 E0005 : score 7.10901 : x : ASN xxxx A0186 <- 3.42 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0189 <- 2.89 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0192 <- 3.84 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0193 <- 3.43 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0186 <- 3.37 -> DT xxx H0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0192 <- 3.72 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0193 <- 4.08 -> DC xxx H0008 : score x.xxxxx >7f2f_B:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=THE COMPLEX OF DNA WITH THE C-TERMINAL DOMAIN OF TYE7 FROM SACCHAROMYCES CEREVISIAE. organism=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) / Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) : H : HIS NE2 B0185 <- 3.20 -> DG O6 H0011 : score 7.31754 : H : GLU OE1 B0189 <- 2.46 -> DC N4 E0006 : score 6.16017 : V : ILE CG2 B0188 <- 3.79 -> DT C7 E0005 : score 7.10901 : x : ASN xxxx B0186 <- 3.37 -> DT xxx H0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0192 <- 3.72 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0193 <- 4.08 -> DC xxx H0008 : score x.xxxxx >7f4y_B:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF REPLISOMAL DIMER OF DNA POLYMERASE FROM BACTERIOPHAGE RB69 WITH DNA DUPLEXES organism=Enterobacteria phage RB69 : w : TYR OH B0567 <- 5.27 -> DG N3 S0005 : score 3.344 : w : THR OG1 B0622 <- 5.50 -> DC O2 Q0115 : score 2.048 : H : LYS NZ B0706 <- 3.03 -> DA N3 Q0114 : score 2.64918 : w : LYS NZ B0734 <- 5.48 -> DG N3 S0009 : score 2.232 : w : LYS NZ B0734 <- 5.81 -> DT O2 Q0112 : score 0.522 : w : LYS NZ B0734 <- 5.69 -> DC O2 S0010 : score 1.3 : H : LYS NZ B0800 <- 2.71 -> DC O2 Q0108 : score 2.99918 : w : LYS NZ B0800 <- 6.53 -> DT O2 S0013 : score 0.522 >7f75_CDFG: title=CRYO-EM STRUCTURE OF SPX-DEPENDENT TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX organism=BACILLUS SUBTILIS : H : ARG NH1 C0241 <- 2.81 -> DG N3 J0045 : score 3.04646 : V : GLN CG F0196 <- 3.71 -> DT C7 J0036 : score 3.32863 : V : SER CB G0012 <- 3.88 -> DT C7 K0056 : score 3.06866 : V : LYS CE G0062 <- 3.72 -> DT C7 K0059 : score 2.65305 : x : TRP xxxx C0169 <- 3.85 -> DG xxx J0050 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0171 <- 3.26 -> DT xxx J0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0186 <- 3.39 -> DT xxx J0051 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0244 <- 3.19 -> DG xxx J0045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0426 <- 3.91 -> DA xxx K0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0459 <- 3.98 -> DA xxx K0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0460 <- 4.14 -> DA xxx K0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0498 <- 4.38 -> DC xxx J0052 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0248 <- 3.37 -> DT xxx K0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0303 <- 3.35 -> DC xxx J0048 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0415 <- 3.33 -> DT xxx K0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0416 <- 3.62 -> DG xxx K0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0794 <- 3.26 -> DA xxx K0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0795 <- 3.44 -> DA xxx K0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0102 <- 3.38 -> DG xxx J0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0103 <- 3.72 -> DG xxx J0044 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0106 <- 3.33 -> DG xxx J0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0120 <- 3.08 -> DT xxx J0042 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0141 <- 4.41 -> DT xxx J0042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0144 <- 4.18 -> DT xxx J0042 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0154 <- 4.36 -> DA xxx K0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0156 <- 3.23 -> DT xxx K0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0181 <- 2.76 -> DA xxx J0038 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0187 <- 3.53 -> DT xxx J0042 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0188 <- 3.74 -> DA xxx J0041 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0189 <- 3.44 -> DA xxx J0038 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0191 <- 3.80 -> DA xxx J0041 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0192 <- 3.91 -> DA xxx K0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0195 <- 4.40 -> DA xxx K0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0199 <- 4.24 -> DA xxx K0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0200 <- 3.58 -> DG xxx J0034 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0202 <- 4.49 -> DA xxx K0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0214 <- 3.49 -> DT xxx J0033 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0217 <- 4.23 -> DA xxx K0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0270 <- 3.89 -> DG xxx K0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0278 <- 3.92 -> DG xxx K0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0281 <- 3.48 -> DG xxx K0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0342 <- 4.19 -> DT xxx J0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0344 <- 3.72 -> DC xxx K0045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0345 <- 4.05 -> DT xxx J0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0348 <- 4.38 -> DT xxx J0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0009 <- 3.30 -> DA xxx J0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0011 <- 2.98 -> DG xxx J0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0092 <- 2.67 -> DG xxx K0057 : score x.xxxxx >7f75_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF SPX-DEPENDENT TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX organism=BACILLUS SUBTILIS : V : GLN CG F0196 <- 3.71 -> DT C7 J0036 : score 3.32863 : x : VAL xxxx F0102 <- 3.38 -> DG xxx J0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0103 <- 3.72 -> DG xxx J0044 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0106 <- 3.33 -> DG xxx J0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0120 <- 3.08 -> DT xxx J0042 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0141 <- 4.41 -> DT xxx J0042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0144 <- 4.18 -> DT xxx J0042 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0154 <- 4.36 -> DA xxx K0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0156 <- 3.23 -> DT xxx K0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0181 <- 2.76 -> DA xxx J0038 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0187 <- 3.53 -> DT xxx J0042 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0188 <- 3.74 -> DA xxx J0041 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0189 <- 3.44 -> DA xxx J0038 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0191 <- 3.80 -> DA xxx J0041 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0192 <- 3.91 -> DA xxx K0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0195 <- 4.40 -> DA xxx K0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0199 <- 4.24 -> DA xxx K0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0200 <- 3.58 -> DG xxx J0034 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0202 <- 4.49 -> DA xxx K0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0214 <- 3.49 -> DT xxx J0033 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0217 <- 4.23 -> DA xxx K0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0270 <- 3.89 -> DG xxx K0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0278 <- 3.92 -> DG xxx K0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0281 <- 3.48 -> DG xxx K0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0342 <- 4.19 -> DT xxx J0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0344 <- 3.72 -> DC xxx K0045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0345 <- 4.05 -> DT xxx J0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0348 <- 4.38 -> DT xxx J0013 : score x.xxxxx >7f9h_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=COMPLEX STRUCTURE OF ENRR-DNA organism=Edwardsiella piscicida : H : ARG NH1 A0047 <- 2.94 -> DG N7 C0014 : score 5.8806 : H : ARG NH2 A0047 <- 2.68 -> DG O6 C0014 : score 6.7584 : w : ARG NE A0047 <- 5.70 -> DT O4 D0008 : score 1.317 : w : ARG NH2 A0047 <- 5.42 -> DT O4 D0008 : score 2.366 : w : ASN ND2 A0051 <- 5.68 -> DT O4 C0012 : score 3.275 : H : ARG NH1 A0055 <- 2.87 -> DT O4 C0010 : score 3.2222 : H : ARG NH2 A0055 <- 3.07 -> DT O4 C0010 : score 3.36194 : H : ARG NH2 A0055 <- 3.14 -> DA N7 C0011 : score 1.55811 : H : ARG NH1 B0047 <- 2.89 -> DG N7 D0014 : score 5.9411 : H : ARG NH2 B0047 <- 2.69 -> DG O6 D0014 : score 6.7452 : w : ARG NE B0047 <- 5.86 -> DT O4 C0008 : score 1.317 : w : ARG NH2 B0047 <- 5.96 -> DT O4 C0008 : score 2.366 : w : ASN ND2 B0051 <- 5.93 -> DT O4 D0012 : score 3.275 : H : ARG NH1 B0055 <- 2.77 -> DT O4 D0010 : score 3.28756 : H : ARG NH2 B0055 <- 2.91 -> DT O4 D0010 : score 3.47566 : H : ARG NH2 B0055 <- 3.09 -> DA N7 D0011 : score 1.57483 : V : ASN CG B0051 <- 3.80 -> DT C7 D0012 : score 2.64821 : V : ASN CG A0051 <- 3.84 -> DT C7 C0012 : score 2.62172 : x : ARG xxxx A0021 <- 4.49 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0054 <- 3.55 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0057 <- 3.32 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0021 <- 4.21 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0054 <- 3.55 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0057 <- 3.41 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx >7f9h_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=COMPLEX STRUCTURE OF ENRR-DNA organism=Edwardsiella piscicida : H : ARG NH1 B0047 <- 2.89 -> DG N7 D0014 : score 5.9411 : H : ARG NH2 B0047 <- 2.69 -> DG O6 D0014 : score 6.7452 : w : ARG NE B0047 <- 5.86 -> DT O4 C0008 : score 1.317 : w : ARG NH2 B0047 <- 5.96 -> DT O4 C0008 : score 2.366 : w : ASN ND2 B0051 <- 5.93 -> DT O4 D0012 : score 3.275 : H : ARG NH1 B0055 <- 2.77 -> DT O4 D0010 : score 3.28756 : H : ARG NH2 B0055 <- 2.91 -> DT O4 D0010 : score 3.47566 : H : ARG NH2 B0055 <- 3.09 -> DA N7 D0011 : score 1.57483 : V : ASN CG B0051 <- 3.80 -> DT C7 D0012 : score 2.64821 : x : ARG xxxx B0021 <- 4.21 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0054 <- 3.55 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0057 <- 3.41 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx >7fef_A:DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ATMBD6 WITH DNA organism=ARABIDOPSIS THALIANA : H : ARG NH1 A0092 <- 2.89 -> DG N7 E0007 : score 5.9411 : H : ARG NH2 A0092 <- 2.99 -> DG O6 E0007 : score 6.3492 : H : ARG NH1 A0115 <- 2.58 -> DG O6 F0007 : score 6.351 : H : ARG NH2 A0115 <- 2.93 -> DG N7 F0007 : score 6.21862 : x : THR xxxx A0097 <- 3.79 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx >7fhj_A:DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BAZ2A WITH DNA organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0595 <- 4.31 -> DG xxx C0002 : score x.xxxxx >7fj2_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF FOXM1 HOMODIMER BOUND TO A PALINDROMIC DNA SITE organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 A0283 <- 3.25 -> DA N7 C0013 : score 5.34217 : H : ARG NE A0286 <- 3.18 -> DG N7 D0018 : score 4.08574 : H : HIS ND1 A0287 <- 2.43 -> DT O4 D0020 : score 5.06983 : H : ASN ND2 B0283 <- 3.13 -> DA N7 D0013 : score 5.48306 : H : ARG NH2 B0286 <- 3.00 -> DG O6 C0018 : score 6.336 : H : HIS ND1 B0287 <- 2.71 -> DT O4 C0020 : score 4.80548 : V : SER CB B0284 <- 3.82 -> DT C7 D0011 : score 3.11563 : x : SER xxxx A0284 <- 3.63 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0290 <- 3.71 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0291 <- 4.35 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0288 <- 4.50 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0290 <- 3.48 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0291 <- 4.38 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx >7fj2_EF:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF FOXM1 HOMODIMER BOUND TO A PALINDROMIC DNA SITE organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 E0283 <- 3.42 -> DA N7 G0013 : score 5.14257 : H : ARG NE E0286 <- 3.18 -> DG N7 H0018 : score 4.08574 : H : HIS ND1 E0287 <- 2.61 -> DT O4 H0020 : score 4.89989 : H : ASN OD1 F0283 <- 3.06 -> DA N6 H0013 : score 5.70866 : H : ASN ND2 F0283 <- 2.66 -> DA N7 H0013 : score 6.03489 : H : HIS ND1 F0287 <- 2.73 -> DT O4 G0020 : score 4.7866 : V : SER CB E0284 <- 3.77 -> DT C7 G0011 : score 3.15477 : V : SER CB F0284 <- 3.65 -> DT C7 H0011 : score 3.24871 : x : SER xxxx E0290 <- 3.83 -> DT xxx H0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0286 <- 3.57 -> DG xxx G0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0290 <- 3.78 -> DT xxx G0020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0291 <- 4.38 -> DT xxx G0021 : score x.xxxxx >7fj2_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF FOXM1 HOMODIMER BOUND TO A PALINDROMIC DNA SITE organism=? : H : ASN OD1 F0283 <- 3.06 -> DA N6 H0013 : score 5.70866 : H : ASN ND2 F0283 <- 2.66 -> DA N7 H0013 : score 6.03489 : H : HIS ND1 F0287 <- 2.73 -> DT O4 G0020 : score 4.7866 : V : SER CB F0284 <- 3.65 -> DT C7 H0011 : score 3.24871 : V : ARG CZ F0286 <- 3.78 -> DT C7 G0017 : score 2.14297 : x : SER xxxx F0290 <- 3.78 -> DT xxx G0020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0291 <- 4.38 -> DT xxx G0021 : score x.xxxxx >7fji_ABE: title=HUMAN POL III ELONGATION COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A1305 <- 4.08 -> DG xxx X0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0195 <- 4.28 -> DC xxx X0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0463 <- 3.31 -> DT xxx X0029 : score x.xxxxx >7fjj_ABE: title=HUMAN POL III PRE-TERMINATION COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0195 <- 3.94 -> DC xxx X0030 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0461 <- 3.78 -> DT xxx X0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0463 <- 3.77 -> DT xxx Y0015 : score x.xxxxx >7fjj_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=HUMAN POL III PRE-TERMINATION COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0195 <- 3.94 -> DC xxx X0030 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0461 <- 3.78 -> DT xxx X0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0463 <- 3.77 -> DT xxx Y0015 : score x.xxxxx >7fvs_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS GYRASE IN COMPLEX WITH 4-[[1-[(1- CHLORO-6,7-DIHYDRO-5H-CYCLOPENTA[C]PYRIDIN-6-YL)METHYL]AZETIDIN-3- YL]METHYLAMINO]-6-FLUOROCHROMEN-2-ONE organism=? : w : LYS NZ A0460 <- 5.11 -> DA N3 D0007 : score 1.538 : w : TYR OH A1025 <- 5.43 -> DA N3 C0015 : score 1.448 : w : SER OG A1084 <- 6.10 -> DA N7 D0007 : score 2.343 : w : SER OG A1084 <- 5.97 -> DG O6 D0009 : score 2.749 : w : SER OG A1085 <- 6.35 -> DA N7 D0007 : score 2.343 : x : ARG xxxx A1033 <- 4.44 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1122 <- 4.07 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1175 <- 3.24 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx >7fvs_AB:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS GYRASE IN COMPLEX WITH 4-[[1-[(1- CHLORO-6,7-DIHYDRO-5H-CYCLOPENTA[C]PYRIDIN-6-YL)METHYL]AZETIDIN-3- YL]METHYLAMINO]-6-FLUOROCHROMEN-2-ONE organism=? : w : LYS NZ A0460 <- 5.11 -> DA N3 D0007 : score 1.538 : w : TYR OH A1025 <- 5.43 -> DA N3 C0015 : score 1.448 : w : SER OG A1084 <- 6.10 -> DA N7 D0007 : score 2.343 : w : SER OG A1084 <- 5.97 -> DG O6 D0009 : score 2.749 : w : SER OG A1085 <- 6.35 -> DA N7 D0007 : score 2.343 : w : ARG NH2 B0458 <- 5.92 -> DG N3 C0010 : score 0.677 : w : TYR OH B1025 <- 5.93 -> DA N3 D0015 : score 1.448 : w : SER OG B1085 <- 5.62 -> DA N7 C0007 : score 2.343 : x : ARG xxxx A1033 <- 4.44 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1122 <- 4.07 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1175 <- 3.24 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0460 <- 3.04 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1088 <- 4.30 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1122 <- 4.12 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1175 <- 3.32 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >7fvt_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS GYRASE IN COMPLEX WITH 6-[5-[2-[(4- CHLORO-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-2-YL)METHYLAMINO]ETHYL]-2-OXO-1,3- OXAZOLIDIN-3-YL]-4H-PYRIDO[3,2-B][1,4]OXAZIN-3-ONE organism=? : w : ARG NH1 A0458 <- 5.42 -> DG N2 D0009 : score 1.082 : w : LYS NZ A0460 <- 6.10 -> DA N3 D0007 : score 1.538 : w : TYR OH A1025 <- 5.44 -> DA N3 C0015 : score 1.448 : w : TYR OH A1025 <- 6.13 -> DA N3 D0007 : score 1.448 : w : SER OG A1084 <- 5.81 -> DG O6 D0009 : score 2.749 : x : SER xxxx A1085 <- 3.40 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1122 <- 4.43 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1175 <- 3.29 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx >7fvt_AB:Type_II_DNA_topoisomerase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS GYRASE IN COMPLEX WITH 6-[5-[2-[(4- CHLORO-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-2-YL)METHYLAMINO]ETHYL]-2-OXO-1,3- OXAZOLIDIN-3-YL]-4H-PYRIDO[3,2-B][1,4]OXAZIN-3-ONE organism=? : w : ARG NH1 A0458 <- 5.42 -> DG N2 D0009 : score 1.082 : w : LYS NZ A0460 <- 6.10 -> DA N3 D0007 : score 1.538 : w : TYR OH A1025 <- 5.44 -> DA N3 C0015 : score 1.448 : w : TYR OH A1025 <- 6.13 -> DA N3 D0007 : score 1.448 : w : SER OG A1084 <- 5.81 -> DG O6 D0009 : score 2.749 : w : LYS NZ B0460 <- 5.36 -> DA N3 C0007 : score 1.538 : w : TYR OH B1025 <- 5.92 -> DA N3 C0007 : score 1.448 : w : TYR OH B1025 <- 5.81 -> DA N3 D0015 : score 1.448 : w : SER OG B1085 <- 6.49 -> DA N7 C0007 : score 2.343 : x : SER xxxx A1085 <- 3.40 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1122 <- 4.43 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1175 <- 3.29 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0458 <- 3.78 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1088 <- 4.10 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1092 <- 3.78 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B1122 <- 4.37 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1175 <- 3.31 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx >7gat_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE L22V MUTANT DNA BINDING DOMAIN OF AREA COMPLEXED TO A 13 BP DNA CONTAINING A TGATA SITE, 34 STRUCTURES organism=EMERICELLA NIDULANS : H : ARG NH1 A0024 <- 3.15 -> DG N7 B0105 : score 5.6265 : H : ARG NH2 A0024 <- 3.30 -> DG N7 B0105 : score 5.74615 : H : ARG NH2 A0024 <- 3.09 -> DG O6 B0105 : score 6.2172 : V : VAL CG2 A0022 <- 3.76 -> DT C7 B0104 : score 6.18431 : x : LEU xxxx A0038 <- 2.97 -> DA xxx C0120 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0042 <- 4.48 -> DT xxx C0119 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0059 <- 3.95 -> DG xxx B0109 : score x.xxxxx >7ice_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX, SOAKED IN THE PRESENCE OF CACL2 organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.34 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >7icf_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SIX BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF CDCL2 (0.1 MILLIMOLAR) (FOUR- DAY SOAK) organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 2.93 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >7icg_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX, SOAKED IN THE PRESENCE OF CDCL2 organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.02 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >7ich_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX, SOAKED IN THE PRESENCE OF COCL2 organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.44 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >7ici_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SIX BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF CRCL3 (0.1 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.29 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >7icj_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SIX BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF CUCL2 (0.1 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.86 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >7ick_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX, SOAKED IN THE PRESENCE OF MGCL2 organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 6.68 -> DA N3 T0003 : score 1.538 >7icl_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SIX BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF MNCL2 (0.1 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.54 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >7icm_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SIX BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF MNCL2 (1.0 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 6.40 -> DA N3 T0003 : score 1.538 >7icn_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX, SOAKED IN THE PRESENCE OF NICL2 organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 2.94 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >7ico_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX, SOAKED IN THE PRESENCE OF ZNCL2 organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.89 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >7icp_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SIX BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF ZNCL2 (0.01 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.18 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >7icq_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX, SOAKED IN THE PRESENCE OF ZNCL2 organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.28 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >7icr_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX, SOAKED IN THE PRESENCE OF ZNCL2 organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.08 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >7ics_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX, SOAKED IN THE PRESENCE OF ZNCL2 organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.15 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >7ict_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX, SOAKED IN THE PRESENCE OF ZNCL2 AND MGCL2 organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.42 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >7icu_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SIX BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF CDCL2 (0.1 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.28 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >7icv_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SIX BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF MNCL2 (0.1 MILLIMOLAR) AND IN THE ABSENCE OF NACL organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.22 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >7jgr_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF DROSOPHILA ORC BOUND TO DNA (84 BP) AND CDC6 organism=? : x : ARG xxxx A0692 <- 3.72 -> DT xxx I0053 : score x.xxxxx >7jgr_ABCDEG:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF DROSOPHILA ORC BOUND TO DNA (84 BP) AND CDC6 organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : ARG xxxx C0711 <- 3.01 -> DA xxx I0045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0692 <- 3.72 -> DT xxx I0053 : score x.xxxxx >7jgr_C: title=STRUCTURE OF DROSOPHILA ORC BOUND TO DNA (84 BP) AND CDC6 organism=? : x : ARG xxxx C0711 <- 3.01 -> DA xxx I0045 : score x.xxxxx >7jgs_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF DROSOPHILA ORC BOUND TO POLY(DA/DT) DNA AND CDC6 (CONFORMATION 2) organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : ARG xxxx A0692 <- 4.36 -> DA xxx I0052 : score x.xxxxx >7jgs_ABCDG:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF DROSOPHILA ORC BOUND TO POLY(DA/DT) DNA AND CDC6 (CONFORMATION 2) organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : ARG xxxx C0711 <- 4.07 -> DA xxx I0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0692 <- 4.36 -> DA xxx I0052 : score x.xxxxx >7jk1_A: title=HUMAN PRIMPOL INSERTING CORRECT DCTP OPPOSITE THE 8-OXOGUANINE LESION organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0288 <- 2.85 -> DG N3 D0014 : score 3.02204 >7jk2_ABDG:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF DROSOPHILA ORC BOUND TO POLY(DA/DT) DNA AND CDC6 (CONFORMATION 1) organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : ARG xxxx A0692 <- 4.13 -> DT xxx H0017 : score x.xxxxx >7jk3_ABCDEG:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF DROSOPHILA ORC BOUND TO GC-RICH DNA AND CDC6 organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : ARG xxxx C0711 <- 3.47 -> DC xxx I0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0692 <- 4.39 -> DT xxx I0052 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0351 <- 4.25 -> DG xxx H0008 : score x.xxxxx >7jk4_ABCDEG:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF DROSOPHILA ORC BOUND TO AT-RICH DNA AND CDC6 organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : ARG xxxx C0711 <- 3.13 -> DA xxx I0045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0692 <- 4.08 -> DT xxx H0017 : score x.xxxxx >7jk5_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF DROSOPHILA ORC BOUND TO DNA organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : ARG xxxx A0692 <- 3.78 -> DC xxx I0054 : score x.xxxxx >7jk5_ACDE:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF DROSOPHILA ORC BOUND TO DNA organism=DROSOPHILA MELANOGASTER : x : ARG xxxx C0711 <- 2.65 -> DG xxx H0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0341 <- 4.19 -> DC xxx I0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0692 <- 3.78 -> DC xxx I0054 : score x.xxxxx >7jl8_B: title=HUMAN PRIMPOL EXTENDING FROM THE CORRECT PRIMER BASE C OPPOSITE THE 8- OXOGUANINE LESION organism=Homo sapiens : w : TYR OH B0078 <- 5.63 -> DT O2 G0003 : score 3.068 : H : ARG NH1 B0288 <- 2.87 -> DC O2 H0014 : score 3.5989 : w : ASN OD1 B0289 <- 6.04 -> DT O2 G0003 : score 1.953 : x : ARG xxxx B0076 <- 3.26 -> DT xxx G0003 : score x.xxxxx >7jlg_A: title=HUMAN PRIMPOL EXTENDING FROM THE ERRONEOUS PRIMER BASE A OPPOSITE THE 8-OXOGUANINE LESION organism=Homo sapiens : x : ASP xxxx A0073 <- 4.50 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0075 <- 4.16 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0076 <- 3.90 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0078 <- 4.15 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0288 <- 3.67 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx >7jm4_G:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=IRF TRANSCRIPTION FACTOR organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 G0098 <- 2.99 -> DG N7 C0006 : score 5.8201 : H : CYS SG G0099 <- 3.57 -> DT O4 F0012 : score 6.0066 : H : LYS NZ G0103 <- 2.94 -> DG N7 F0010 : score 5.23509 : H : LYS NZ G0103 <- 3.18 -> DG O6 F0010 : score 5.34143 : x : THR xxxx G0095 <- 3.98 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx >7jm4_GH:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=IRF TRANSCRIPTION FACTOR organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 G0098 <- 2.99 -> DG N7 C0006 : score 5.8201 : H : CYS SG G0099 <- 3.57 -> DT O4 F0012 : score 6.0066 : H : LYS NZ G0103 <- 2.94 -> DG N7 F0010 : score 5.23509 : H : LYS NZ G0103 <- 3.18 -> DG O6 F0010 : score 5.34143 : H : ARG NH2 H0098 <- 3.23 -> DG N7 C0012 : score 5.83554 : H : LYS NZ H0103 <- 2.81 -> DG O6 C0014 : score 5.76921 : x : THR xxxx G0095 <- 3.98 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0059 <- 3.20 -> DC xxx F0014 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx H0099 <- 3.61 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx >7jn3_E:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ROUS SARCOMA VIRUS CLEAVED SYNAPTIC COMPLEX (CSC) WITH HIV-1 INTEGRASE STRAND TRANSFER INHIBITOR MK-2048 organism=ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN SCHMIDT-RUPPIN A) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN SCHMIDT-RUPPIN A) : H : ARG NH1 E0158 <- 3.30 -> DT O2 K0005 : score 3.87577 : H : ARG NH1 E0158 <- 2.61 -> DT O2 K0006 : score 4.47005 : H : ARG NH2 E0158 <- 2.41 -> DT O2 K0006 : score 4.56353 : H : ARG NH2 E0244 <- 2.32 -> DG N7 K0007 : score 6.99754 : x : GLN xxxx E0151 <- 3.00 -> DG xxx K0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0154 <- 3.22 -> DG xxx K0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0157 <- 4.14 -> DC xxx L0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0161 <- 3.86 -> DC xxx L0035 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0203 <- 2.94 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0246 <- 3.09 -> DT xxx K0005 : score x.xxxxx >7jn3_EF:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ROUS SARCOMA VIRUS CLEAVED SYNAPTIC COMPLEX (CSC) WITH HIV-1 INTEGRASE STRAND TRANSFER INHIBITOR MK-2048 organism=ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN SCHMIDT-RUPPIN A) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN SCHMIDT-RUPPIN A) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN SCHMIDT-RUPPIN A) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN SCHMIDT-RUPPIN A) : H : ARG NH1 E0158 <- 3.30 -> DT O2 K0005 : score 3.87577 : H : ARG NH1 E0158 <- 2.61 -> DT O2 K0006 : score 4.47005 : H : ARG NH2 E0158 <- 2.41 -> DT O2 K0006 : score 4.56353 : H : ARG NH2 E0244 <- 2.32 -> DG N7 K0007 : score 6.99754 : x : ASN xxxx E0051 <- 3.65 -> DT xxx K0003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx E0076 <- 3.79 -> DA xxx L0036 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0151 <- 3.00 -> DG xxx K0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0154 <- 3.22 -> DG xxx K0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0157 <- 4.14 -> DC xxx L0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0161 <- 3.86 -> DC xxx L0035 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0203 <- 2.94 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0246 <- 3.09 -> DT xxx K0005 : score x.xxxxx 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>7jqq_ABCDE:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=THE BACTERIOPHAGE PHI-29 VIRAL GENOME PACKAGING MOTOR ASSEMBLY organism=BACILLUS PHAGE PHI29 : V : TYR CZ D0293 <- 3.68 -> DT C7 F0034 : score 5.74687 : x : LYS xxxx A0056 <- 4.14 -> DA xxx F0048 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0059 <- 3.92 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0126 <- 4.29 -> DA xxx F0044 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0128 <- 4.02 -> DG xxx G0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0055 <- 3.84 -> DC xxx F0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0330 <- 3.90 -> DG xxx G0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0330 <- 3.84 -> DA xxx G0027 : score x.xxxxx >7jqq_D:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=THE BACTERIOPHAGE PHI-29 VIRAL GENOME PACKAGING MOTOR ASSEMBLY organism=BACILLUS PHAGE PHI29 : V : TYR CZ D0293 <- 3.68 -> DT C7 F0034 : score 5.74687 : x : ARG xxxx D0330 <- 3.90 -> DG xxx G0026 : score x.xxxxx >7jsa_J:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF HUMAN TRANSCRIPTION FACTOR ERF IN THE REDUCED FORM, IN COMPLEX WITH DOUBLE-STRANDED DNA ACCGGAAGTG organism=Homo sapiens : H : ARG NE J0083 <- 3.00 -> DG O6 B0006 : score 3.78338 : H : ARG NH2 J0083 <- 3.00 -> DG N7 B0006 : score 6.12923 : H : ARG NH2 J0086 <- 3.33 -> DG N7 B0005 : score 5.70785 : H : TYR OH J0087 <- 3.32 -> DA N6 B0007 : score 4.18478 : x : ASP xxxx J0079 <- 3.76 -> DC xxx C0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0080 <- 4.10 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx >7jsl_L:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF HUMAN TRANSCRIPTION FACTOR ERF IN THE OXIDIZED FORM, IN COMPLEX WITH DOUBLE-STRANDED DNA ACCGGAAGTG organism=Homo sapiens : H : ARG NE L0083 <- 3.29 -> DG O6 I0006 : score 3.55481 : H : ARG NH2 L0083 <- 3.17 -> DG N7 I0006 : score 5.91215 : H : TYR OH L0087 <- 3.15 -> DA N6 I0007 : score 4.34358 : x : ASP xxxx L0079 <- 3.52 -> DC xxx K0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0080 <- 3.92 -> DT xxx 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x : GLN xxxx D0033 <- 4.39 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0034 <- 4.47 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0054 <- 4.00 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx >7jvt_D:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A LAMBDA-186 HYBRID REPRESSOR organism=? : H : GLN OE1 D0044 <- 2.68 -> DA N6 F0024 : score 6.19783 : H : GLN NE2 D0044 <- 3.00 -> DA N7 F0024 : score 5.84615 : H : SER OG D0045 <- 3.07 -> DG N7 E0016 : score 4.24002 : H : ASN ND2 D0055 <- 2.76 -> DG N7 E0014 : score 4.62258 : w : ASN OD1 D0055 <- 6.62 -> DG O6 E0014 : score 3.125 : x : LYS xxxx D0003 <- 3.37 -> DG xxx E0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0033 <- 4.39 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0034 <- 4.47 -> DT xxx F0023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0054 <- 4.00 -> DT xxx F0025 : score x.xxxxx >7jy7_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;RecA_protein,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF A 12 BASE PAIR RECA-D LOOP COMPLEX organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0169 <- 2.64 -> DC O2 S0024 : score 3.7668 : V : ILE CG2 B0199 <- 3.89 -> DT C7 S0025 : score 6.93173 : x : MET xxxx A0164 <- 3.98 -> DG xxx T0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0198 <- 4.29 -> DT xxx S0027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0199 <- 3.63 -> DT xxx S0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0162 <- 4.09 -> DG xxx T0021 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0164 <- 3.42 -> DG xxx T0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0169 <- 3.28 -> DA xxx S0021 : score x.xxxxx >7jy7_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;RecA_protein,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF A 12 BASE PAIR RECA-D LOOP COMPLEX organism=Escherichia coli : V : ILE CG2 B0199 <- 3.89 -> DT C7 S0025 : score 6.93173 : x : SER xxxx B0162 <- 4.09 -> DG xxx T0021 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0164 <- 3.42 -> DG xxx T0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0169 <- 3.28 -> DA xxx S0021 : score x.xxxxx >7jy8_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;RecA_protein,_C-terminal_domain; title=ANALYSIS OF A STRAND EXCHANGE REACTION WITH A MINI FILAMENT OF 9- RECA, 27-MER SSDNA, PARTIALLY-HOMOLOGOUS 67 BP DSDNA AND ATPGAMMAS organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 A0169 <- 2.34 -> DT O2 S0024 : score 4.7026 : H : ARG NH1 B0169 <- 2.41 -> DT O2 S0021 : score 4.64231 : H : ARG NH1 C0169 <- 2.57 -> DT O2 S0018 : score 4.50451 : H : ARG NH1 D0169 <- 2.50 -> DT O2 S0015 : score 4.5648 : H : ARG NH1 E0169 <- 2.69 -> DT O2 S0012 : score 4.40115 : H : ARG NH1 F0169 <- 2.42 -> DT O2 S0009 : score 4.6337 : V : LYS CB D0198 <- 3.64 -> DT C7 S0018 : score 2.39787 : V : LYS CB C0198 <- 3.78 -> DT C7 S0021 : score 2.31717 : V : LYS CB B0198 <- 3.53 -> DT C7 S0024 : score 2.46127 >7jy8_GHI:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;RecA_protein,_C-terminal_domain; title=ANALYSIS OF A STRAND EXCHANGE REACTION WITH A MINI FILAMENT OF 9- RECA, 27-MER SSDNA, PARTIALLY-HOMOLOGOUS 67 BP DSDNA AND ATPGAMMAS organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 G0169 <- 2.48 -> DT O2 S0006 : score 4.58202 : H : ARG NH1 H0169 <- 2.66 -> DT O2 S0003 : score 4.42699 : V : LYS CB I0198 <- 3.80 -> DT C7 S0003 : score 2.30564 : V : LYS CB G0198 <- 3.84 -> DT C7 S0009 : score 2.28258 : x : MET xxxx G0197 <- 4.50 -> DT xxx S0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0199 <- 3.39 -> DT xxx S0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0198 <- 3.26 -> DT xxx S0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0199 <- 3.05 -> DT xxx S0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0199 <- 3.48 -> DT xxx S0003 : score x.xxxxx >7jy8_I:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;RecA_protein,_C-terminal_domain; title=ANALYSIS OF A STRAND EXCHANGE REACTION WITH A MINI FILAMENT OF 9- RECA, 27-MER SSDNA, PARTIALLY-HOMOLOGOUS 67 BP DSDNA AND ATPGAMMAS organism=Escherichia coli : V : LYS CB I0198 <- 3.80 -> DT C7 S0003 : score 2.30564 : x : ILE xxxx I0199 <- 3.48 -> DT xxx S0003 : score x.xxxxx >7jy9_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;RecA_protein,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF A 9 BASE PAIR RECA-D LOOP COMPLEX organism=Escherichia coli : H : SER OG A0162 <- 2.60 -> DT O2 T0018 : score 3.84533 : x : MET xxxx A0164 <- 3.48 -> DT xxx T0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0169 <- 3.12 -> DA xxx S0024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0199 <- 3.61 -> DC xxx S0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0162 <- 3.94 -> DT xxx T0021 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0164 <- 3.32 -> DT xxx T0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0169 <- 3.14 -> DA xxx S0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0198 <- 4.40 -> DA xxx S0024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0199 <- 3.27 -> DA xxx S0025 : score x.xxxxx >7jy9_HI:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;RecA_protein,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF A 9 BASE PAIR RECA-D LOOP COMPLEX organism=Escherichia coli : H : ARG NH1 H0169 <- 2.87 -> DC O2 S0003 : score 3.5989 : x : ILE xxxx H0199 <- 3.65 -> DC xxx S0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0199 <- 3.32 -> DC xxx S0004 : score x.xxxxx >7jy9_I:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;RecA_protein,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF A 9 BASE PAIR RECA-D LOOP COMPLEX organism=Escherichia coli : x : ILE xxxx I0199 <- 3.32 -> DC xxx S0004 : score x.xxxxx >7jzv_N:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE BRCA1-UBCH5C/BARD1 E3-E2 MODULE BOUND TO A NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx N0042 <- 3.05 -> DT xxx Y0108 : score x.xxxxx >7jzv_NOPQnopq:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE BRCA1-UBCH5C/BARD1 E3-E2 MODULE BOUND TO A NUCLEOSOME organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx N0042 <- 3.05 -> DT xxx Y0108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0083 <- 4.09 -> DG xxx Y0096 : score x.xxxxx >7k04_7A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;TFB5-like; title=STRUCTURE OF TFIIH/RAD4-RAD23-RAD33/DNA IN DNA OPENING organism=? : H : HIS NE2 A0472 <- 3.10 -> DT O2 W0002 : score 4.92536 : x : ARG xxxx A0494 <- 4.01 -> DA xxx W0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0495 <- 4.46 -> DA xxx W0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0498 <- 3.29 -> DA xxx W0016 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0554 <- 2.80 -> DA xxx W0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0556 <- 3.60 -> DA xxx W0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0558 <- 3.81 -> DA xxx W0017 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0560 <- 2.92 -> DA xxx W0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0594 <- 3.63 -> DA xxx W0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0597 <- 3.31 -> DA xxx W0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0599 <- 3.22 -> DA xxx W0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0607 <- 3.34 -> DA xxx W0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx 70441 <- 3.28 -> DA xxx Y0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 70464 <- 3.45 -> DG xxx Y0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 70466 <- 4.17 -> DC xxx W0023 : score x.xxxxx >7k0y_ABC: title=CRYO-EM STRUCTURE OF ACTIVATED-FORM DNA-PK (COMPLEX VI) organism=? : H : ARG NH1 C0400 <- 3.05 -> DT O2 F0016 : score 4.09109 : x : ARG xxxx A0264 <- 3.81 -> DA xxx G0032 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0405 <- 4.36 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0254 <- 3.04 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx >7k0y_B:SPOC_domain-like;vWA-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ACTIVATED-FORM DNA-PK (COMPLEX VI) organism=? : x : ARG xxxx B0254 <- 3.04 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx >7k19_A:Protein_kinase-like_PK-like;ARM_repeat; title=CRYOEM STRUCTURE OF DNA-PK CATALYTIC SUBUNIT COMPLEXED WITH DNA (COMPLEX I) organism=HOMO SAPIENS : x : LYS xxxx A0122 <- 3.46 -> DA xxx G0029 : score x.xxxxx >7k1b_A:Protein_kinase-like_PK-like;ARM_repeat; title=CRYOEM STRUCTURE OF DNA-PK CATALYTIC SUBUNIT COMPLEXED WITH DNA (COMPLEX II) organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0264 <- 4.23 -> DA xxx G0032 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0402 <- 4.44 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0405 <- 3.07 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7k1j_A:Protein_kinase-like_PK-like;ARM_repeat; title=CRYOEM STRUCTURE OF INACTIVATED-FORM DNA-PK (COMPLEX III) organism=? : x : LYS xxxx A0164 <- 3.51 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx >7k1j_ABC: title=CRYOEM STRUCTURE OF INACTIVATED-FORM DNA-PK (COMPLEX III) organism=? : x : LYS xxxx A0164 <- 3.51 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0254 <- 4.22 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0271 <- 3.63 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0400 <- 4.38 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx >7k1k_ABC: title=CRYOEM STRUCTURE OF INACTIVATED-FORM DNA-PK (COMPLEX IV) organism=? : x : ARG xxxx A0264 <- 3.72 -> DT xxx G0031 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0405 <- 3.79 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0519 <- 3.48 -> DC xxx G0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0254 <- 3.14 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0400 <- 3.96 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx >7k1k_C:SPOC_domain-like;vWA-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF INACTIVATED-FORM DNA-PK (COMPLEX IV) organism=? : x : ARG xxxx C0400 <- 3.96 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx >7k1n_ABC: title=CRYOEM STRUCTURE OF INACTIVATED-FORM DNA-PK (COMPLEX V) organism=? : H : ARG NH1 C0400 <- 2.58 -> DT O2 F0016 : score 4.49589 : x : LYS xxxx A0518 <- 3.27 -> DC xxx G0040 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0519 <- 3.36 -> DC xxx G0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0254 <- 3.09 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0271 <- 4.22 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx >7k1n_C:SPOC_domain-like;vWA-like;C-terminal_domain_of_Ku80; title=CRYOEM STRUCTURE OF INACTIVATED-FORM DNA-PK (COMPLEX V) organism=? : H : ARG NH1 C0400 <- 2.58 -> DT O2 F0016 : score 4.49589 : x : ARG xxxx C0271 <- 4.22 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx >7k30_A:PHP_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ENDONUCLEASE Q COMPLEX WITH 27-MER DUPLEX SUBSTRATE WITH DU AT THE ACTIVE SITE organism=Pyrococcus furiosus : H : ARG NH2 A0082 <- 2.90 -> DC O2 B0017 : score 3.62474 : x : LYS xxxx A0015 <- 3.37 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0016 <- 3.71 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 3.88 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0139 <- 3.60 -> DU xxx C0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0142 <- 3.87 -> DU xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0170 <- 3.46 -> DU xxx C0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0171 <- 2.99 -> DU xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0243 <- 3.02 -> DU xxx C0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0244 <- 3.94 -> DU xxx C0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0377 <- 4.49 -> DU xxx C0014 : score x.xxxxx >7k31_A:PHP_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ENDONUCLEASE Q COMPLEX WITH 27-MER DUPLEX SUBSTRATE WITH DI AT THE ACTIVE SITE organism=Pyrococcus furiosus : x : LYS xxxx A0015 <- 3.48 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0016 <- 3.49 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0082 <- 3.03 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0114 <- 4.47 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0139 <- 3.48 -> DI xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0170 <- 3.53 -> DI xxx C0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0171 <- 2.71 -> DI xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0193 <- 4.12 -> DI xxx C0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0243 <- 3.69 -> DI xxx C0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0244 <- 3.30 -> DI xxx C0014 : score x.xxxxx >7k32_A:PHP_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ENDONUCLEASE Q COMPLEX WITH 27-MER DUPLEX SUBSTRATE WITH AN ABASIC LESION AT THE ACTIVE SITE organism=Pyrococcus furiosus : x : LYS xxxx A0015 <- 3.44 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0016 <- 3.54 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0082 <- 3.29 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx >7k33_A:PHP_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ENDONUCLEASE Q COMPLEX WITH 27-MER DUPLEX SUBSTRATE WITH AN ABASIC LESION AT THE ACTIVE SITE organism=Pyrococcus furiosus : x : LYS xxxx A0015 <- 3.29 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0016 <- 3.57 -> DC xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0082 <- 3.30 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx >7k5o_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I TIME-RESOLVED STRUCTURE, 1 MIN POST DATP ADDITION organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 3.16 -> DA N3 P0007 : score 2.57698 : w : LYS NZ A0582 <- 5.62 -> DC O2 P0006 : score 1.3 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.35 -> DC O2 T0007 : score 3.29186 A : H : ARG NH2 A0615 <- 2.72 -> DT O2 P0010 : score 4.30107 A : w : ASN ND2 A0622 <- 6.09 -> DG N3 T0008 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.98 -> DC O2 P0008 : score 4.31823 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.29 -> DC xxx P0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.19 -> DT xxx P0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 3.96 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx >7k5p_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I TIME-RESOLVED STRUCTURE, 4 MIN POST DATP ADDITION organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 3.21 -> DA N3 P0007 : score 2.54922 : w : LYS NZ A0582 <- 5.93 -> DC O2 P0006 : score 1.3 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.64 -> DT O2 P0010 : score 4.44422 : H : ARG NH2 A0615 <- 2.95 -> DT O2 P0010 : score 4.10633 : w : ARG NH1 A0615 <- 6.12 -> DC O2 T0007 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.93 -> DG N3 T0008 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.81 -> DC O2 P0008 : score 4.47053 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.77 -> DT O2 T0009 : score 1.666 : w : ASN ND2 A0793 <- 6.29 -> DA N3 T0006 : score 2.277 : w : GLN NE2 A0797 <- 5.96 -> DA N3 T0006 : score 1.888 : x : TYR xxxx A0587 <- 4.47 -> DC xxx P0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.40 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.34 -> DG xxx P0009 : score x.xxxxx >7k5q_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I TIME-RESOLVED STRUCTURE, 8 MIN POST DATP ADDITION organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.75 -> DC O2 P0008 : score 2.97562 : w : LYS NZ A0582 <- 5.69 -> DA N3 P0007 : score 1.538 : w : LYS NZ A0582 <- 5.43 -> DT O2 T0009 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 5.13 -> DT O2 T0009 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title=BST DNA POLYMERASE I TIME-RESOLVED STRUCTURE, 4 HR POST DATP AND DCTP ADDITION organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.54 -> DC O2 P0008 : score 3.09935 : w : LYS NZ A0582 <- 5.14 -> DT O2 T0009 : score 0.522 : w : LYS NZ A0582 <- 5.87 -> DA N3 P0007 : score 1.538 : w : THR OG1 A0586 <- 5.20 -> DT O2 T0009 : score 2.522 : w : TYR OH A0587 <- 5.86 -> DG N2 T0008 : score 2.834 : H : ARG NH1 A0615 <- 2.99 -> DA N3 P0011 : score 3.54213 : H : ARG NH2 A0615 <- 3.24 -> DA N3 P0011 : score 2.95465 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.87 -> DA N3 T0006 : score 2.585 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.80 -> DC O2 T0007 : score 1.885 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.15 -> DG N3 P0009 : score 4.55223 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.56 -> DG N3 T0008 : score 2.566 : H : ARG NH2 A0629 <- 2.89 -> DA N7 P0011 : score 1.6417 : w : GLU OE2 A0658 <- 5.97 -> DT O2 T0005 : score 2.279 : w : ASN ND2 A0793 <- 5.93 -> DT O2 T0005 : score 1.666 : w : GLN NE2 A0797 <- 5.86 -> DT O2 T0005 : score 1.565 : w : HIS NE2 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-> DT O2 T0005 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.76 -> DA N3 T0006 : score 2.277 : H : ASN ND2 A0625 <- 2.89 -> DT O2 P0010 : score 4.66072 : w : ASN ND2 A0625 <- 5.66 -> DC O2 T0007 : score 1.885 : w : HIS NE2 A0829 <- 6.03 -> DA N3 P0011 : score 2.619 : x : TYR xxxx A0714 <- 3.53 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0797 <- 3.55 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx >7k5x_H:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF A CHROMATOSOME CONTAINING HUMAN LINKER HISTONE H1.0 organism=? : x : ARG xxxx H0033 <- 4.06 -> DG xxx J0147 : score x.xxxxx >7k5y_D:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF A CHROMATOSOME CONTAINING HUMAN LINKER HISTONE H1.4 organism=? : x : LYS xxxx D0030 <- 4.47 -> DG xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.28 -> DG xxx I0147 : score x.xxxxx >7k60_H:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF A CHROMATOSOME CONTAINING HUMAN LINKER HISTONE H1.10 organism=? : x : ARG xxxx H0033 <- 4.03 -> DG xxx J0147 : score x.xxxxx >7k61_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF 197BP NUCLEOSOME AIDED BY SCFV organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0040 <- 3.26 -> DG N3 I0108 : score 2.77173 : H : ARG NH2 A0040 <- 3.20 -> DG N3 I0108 : score 3.32144 : H : ARG NH1 C0011 <- 2.98 -> DC O2 I0143 : score 3.5186 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.22 -> DT O2 J0108 : score 3.94467 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.88 -> DT O2 J0108 : score 4.1656 : H : ARG NH1 G0011 <- 3.24 -> DT O2 I0057 : score 3.92745 : H : ARG NH2 G0011 <- 2.86 -> DT O2 I0056 : score 4.18253 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.42 -> DA xxx I0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.44 -> DT xxx J0075 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.57 -> DT xxx I0137 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.42 -> DG xxx J0030 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.26 -> DT xxx J0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.71 -> DG xxx J0137 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.52 -> DG xxx J0147 : score x.xxxxx >7k61_H:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF 197BP NUCLEOSOME AIDED BY SCFV organism=? : x : ARG xxxx H0033 <- 3.52 -> DG xxx J0147 : score x.xxxxx >7k63_H:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF A CHROMATOSOME CONTAINING CHIMERIC LINKER HISTONE GH1.10-NCH1.4 organism=? : x : ARG xxxx H0033 <- 3.99 -> DG xxx J0147 : score x.xxxxx >7k6p_A:Histone-fold; title=ACTIVE STATE DOT1 BOUND TO THE UNACETYLATED H4 NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.21 -> DT O2 J0083 : score 4.73287 >7k6p_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=ACTIVE STATE DOT1 BOUND TO THE UNACETYLATED H4 NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.21 -> DT O2 J0083 : score 4.73287 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.89 -> DG N3 I0083 : score 3.54527 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.51 -> DG xxx J0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.00 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.64 -> DG xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.00 -> DC xxx J0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.32 -> DC xxx J0111 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.12 -> DG xxx J0122 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.18 -> DC xxx I0092 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.61 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.55 -> DC xxx J0027 : score x.xxxxx >7k6q_A:Histone-fold; title=ACTIVE STATE DOT1 BOUND TO THE H4K16AC NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.21 -> DT O2 J0083 : score 4.73287 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.52 -> DG xxx J0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.03 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.76 -> DG xxx I0050 : score x.xxxxx >7k78_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=ANTIBODY AND NUCLEOSOME COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ILE xxxx A0156 <- 3.62 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0177 <- 4.50 -> DA xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0044 <- 4.19 -> DT xxx I0037 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E0156 <- 3.71 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0177 <- 3.60 -> DA xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0046 <- 3.35 -> DT xxx J0215 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0044 <- 4.44 -> DG xxx J0183 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0037 <- 4.36 -> DT xxx J0173 : score x.xxxxx >7k78_E:Histone-fold; title=ANTIBODY AND NUCLEOSOME COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ILE xxxx E0156 <- 3.71 -> DT xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0177 <- 3.60 -> DA xxx J0196 : score x.xxxxx >7k96_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA TERNARY COMPLEX WITH TEMPLATING CYTOSINE AND INCOMING DEOXYGUANOSINE DIPHOSPHATE organism=? : x : HIS xxxx A0034 <- 3.36 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.96 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.65 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7k97_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA DGDP PRODUCT COMPLEX WITH MN2+ organism=? : w : ASN OD1 A0037 <- 6.41 -> DC N4 T0006 : score 2.732 : w : ASN ND2 A0037 <- 6.18 -> DC N4 T0006 : score 2.395 : w : SER OG A0229 <- 6.32 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.71 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : H : TYR OH A0271 <- 3.10 -> DC O2 P0010 : score 3.28759 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.98 -> DG N3 P0011 : score 4.71866 : H : ARG NH1 A0283 <- 3.05 -> DC O2 T0006 : score 3.4675 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.71 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0283 <- 5.99 -> DG N3 T0007 : score 0.677 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.43 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : x : ASP xxxx A0276 <- 3.36 -> DG xxx P0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.31 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx >7k9y_A:DNA/RNA_polymerases; title=GSI-IIC RT TEMPLATE-SWITCHING COMPLEX (TWINNED) organism=GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS : H : TYR OH A0221 <- 2.96 -> DA N3 B0010 : score 4.01844 : x : PHE xxxx A0110 <- 3.66 -> DC xxx B0011 : score x.xxxxx >7kbd_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME IN INTERPHASE CHROMOSOME FORMED IN XENOPUS EGG EXTRACT (OLIGO FRACTION) organism=XENOPUS LAEVIS : H : LYS NZ G0015 <- 2.36 -> DT O2 I0118 : score 3.90285 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.32 -> DG xxx I0066 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.46 -> DA xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.56 -> DT xxx I0050 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0015 <- 2.93 -> DG xxx I0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 3.70 -> DT xxx J0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.03 -> DG xxx J0122 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.49 -> DG xxx I0082 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.83 -> DG xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.05 -> DG xxx I0122 : score x.xxxxx >7kbd_C:Histone-fold; title=NUCLEOSOME IN INTERPHASE CHROMOSOME FORMED IN XENOPUS EGG EXTRACT (OLIGO FRACTION) organism=XENOPUS LAEVIS : x : LYS xxxx C0015 <- 2.93 -> DG xxx I0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 3.70 -> DT xxx J0112 : score x.xxxxx >7kbe_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME ISOLATED FROM METAPHASE CHROMOSOME FORMED IN XENOPUS EGG EXTRACT (OLIGO FRACTION) organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.72 -> DG N3 J0083 : score 3.66802 : H : ARG NH2 D0033 <- 2.97 -> DG N3 J0122 : score 3.48751 : H : LYS NZ G0015 <- 2.66 -> DT O2 I0118 : score 3.68762 : H : LYS NZ G0015 <- 2.54 -> DT O2 J0031 : score 3.77371 : x : ARG xxxx A0083 <- 4.16 -> DG xxx J0100 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0015 <- 3.55 -> DA xxx I0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0043 <- 3.58 -> DT xxx J0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 4.12 -> DT xxx I0083 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.40 -> DG xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.31 -> DT xxx J0027 : score x.xxxxx >7kbe_E:Histone-fold; title=NUCLEOSOME ISOLATED FROM METAPHASE CHROMOSOME FORMED IN XENOPUS EGG EXTRACT (OLIGO FRACTION) organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx E0040 <- 4.12 -> DT xxx I0083 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.40 -> DG xxx J0050 : score x.xxxxx >7kc0_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF THE SACCHAROMYCES CEREVISIAE REPLICATIVE POLYMERASE DELTA IN COMPLEX WITH A PRIMER/TEMPLATE AND THE PCNA CLAMP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : TYR xxxx A0708 <- 3.96 -> DG xxx T0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0814 <- 3.71 -> DG xxx P0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0815 <- 4.46 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0839 <- 3.67 -> DA xxx P0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0899 <- 4.25 -> DG xxx T0008 : score x.xxxxx >7kef_AE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX WITH UNNATURAL BASE DTPT3, RNAM IN SWING STATE organism=? : x : ARG xxxx A1386 <- 3.71 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx >7khb_CDF: title=ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE AND RRNBP1 PROMOTER OPEN COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NH1 C0371 <- 2.50 -> DG O6 X0055 : score 6.44833 : H : GLU OE1 C0374 <- 2.59 -> DC N4 X0054 : score 6.0102 : H : ARG NH1 F0385 <- 2.77 -> DG N7 X0053 : score 6.0863 : H : TYR OH F0394 <- 2.54 -> DA N7 Y0032 : score 4.36715 : H : GLN OE1 F0437 <- 2.45 -> DA N6 Y0034 : score 6.47624 : H : GLU OE1 F0585 <- 2.92 -> DC N4 Y0054 : score 5.62952 : V : ARG CG F0397 <- 3.89 -> DT C7 Y0031 : score 0.982513 : V : GLN CG F0589 <- 3.80 -> DT C7 X0025 : score 3.25538 : V : TRP CD2 F0434 <- 3.61 -> DT C7 X0047 : score 5.75749 : V : SER CB F0428 <- 3.81 -> DT C7 X0052 : score 3.12345 : x : SER xxxx C0182 <- 4.47 -> DC xxx X0057 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.62 -> DA xxx X0058 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.34 -> DA xxx X0058 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0470 <- 2.86 -> DT xxx Y0030 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0481 <- 3.02 -> DT xxx Y0033 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0504 <- 3.58 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0508 <- 4.16 -> DC xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.50 -> DT xxx X0063 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0255 <- 3.52 -> DG xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0256 <- 4.06 -> DG xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.43 -> DC xxx X0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.08 -> DG xxx X0055 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.84 -> DG xxx X0053 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.28 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 4.18 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0395 <- 4.44 -> DT xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0396 <- 3.47 -> DT xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0401 <- 4.49 -> DC xxx X0054 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 4.15 -> DA xxx X0048 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 4.40 -> DA xxx X0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 3.18 -> DA xxx X0048 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0426 <- 4.07 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.39 -> DA xxx X0048 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0432 <- 3.73 -> DA xxx X0051 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 2.74 -> DT xxx X0047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0436 <- 3.28 -> DA xxx Y0032 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 4.00 -> DA xxx Y0032 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0455 <- 4.40 -> DA xxx X0041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0458 <- 3.87 -> DG xxx Y0035 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0505 <- 3.03 -> DC xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0509 <- 3.50 -> DC xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0511 <- 3.31 -> DG xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0514 <- 3.32 -> DG xxx Y0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0517 <- 4.42 -> DG xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0522 <- 4.15 -> DC xxx Y0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0573 <- 4.46 -> DA xxx Y0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0586 <- 4.19 -> DT xxx X0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0588 <- 3.15 -> DC xxx Y0054 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0593 <- 4.14 -> DT xxx X0023 : score x.xxxxx >7khb_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE AND RRNBP1 PROMOTER OPEN COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : LEU xxxx D0255 <- 3.52 -> DG xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0256 <- 4.06 -> DG xxx Y0027 : score x.xxxxx >7khc_ABF:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE AND RRNBP1 PROMOTER CLOSED COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : GLU OE1 F0585 <- 2.50 -> DC N4 Y0054 : score 6.11403 : H : GLU OE2 F0585 <- 2.73 -> DA N6 Y0053 : score 3.094 : V : ARG CG F0584 <- 3.54 -> DT C7 X0026 : score 1.07046 : x : ARG xxxx A0265 <- 3.78 -> DT xxx Y0071 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0294 <- 3.87 -> DT xxx Y0071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0265 <- 4.00 -> DA xxx Y0073 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 4.14 -> DA xxx Y0032 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.74 -> DT xxx Y0033 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0574 <- 4.17 -> DT xxx Y0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0586 <- 3.41 -> DT xxx X0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0588 <- 2.52 -> DA xxx Y0053 : score x.xxxxx >7khc_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE AND RRNBP1 PROMOTER CLOSED COMPLEX organism=? : x : GLU xxxx C0541 <- 2.58 -> DT xxx O0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.96 -> DT xxx O0001 : score x.xxxxx >7khe_CDF: title=ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE AND RRNBP1 PROMOTER PRE-OPEN COMPLEX WITH DKSA/PPGPP organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NH1 F0385 <- 2.63 -> DG N7 X0053 : score 6.2557 : H : THR OG1 F0432 <- 3.39 -> DA N7 X0051 : score 3.01124 : H : GLU OE1 F0585 <- 2.77 -> DC N4 Y0054 : score 5.80256 : V : TRP CD1 F0434 <- 3.60 -> DT C7 X0047 : score 7.7 : V : SER CB F0428 <- 3.51 -> DT C7 X0052 : score 3.3583 : x : GLU xxxx C0374 <- 3.82 -> DG xxx X0055 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.42 -> DG xxx X0055 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 3.63 -> DG xxx X0053 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.78 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 3.32 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 4.21 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 4.17 -> DA xxx X0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 3.00 -> DA xxx X0048 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 3.99 -> DA xxx X0048 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0426 <- 3.64 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.47 -> DA xxx X0051 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.86 -> DA xxx X0048 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.60 -> DT xxx X0047 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0437 <- 2.29 -> DC xxx X0046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0441 <- 3.76 -> DC xxx X0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0458 <- 3.41 -> DG xxx Y0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0588 <- 3.05 -> DA xxx Y0055 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0589 <- 3.40 -> DC xxx X0024 : score x.xxxxx >7kif_CDFMZ: title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS WT RNAP TRANSCRIPTION OPEN PROMOTER COMPLEX WITH WHIB7 TRANSCRIPTION FACTOR organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : H : THR OG1 F0345 <- 2.45 -> DC O2 O0052 : score 2.80944 : H : ARG NH2 Z0083 <- 2.68 -> DT O2 P0136 : score 4.33493 : V : SER CB F0344 <- 3.75 -> DT C7 O0054 : score 3.17042 : x : ARG xxxx C0467 <- 3.73 -> DA xxx O0064 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0226 <- 4.40 -> DA xxx O0057 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0228 <- 4.37 -> DC xxx O0056 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0229 <- 3.72 -> DC xxx O0056 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0232 <- 3.88 -> DC xxx O0056 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0240 <- 3.33 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0246 <- 3.91 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0299 <- 3.75 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0301 <- 3.66 -> DC xxx O0055 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0302 <- 3.93 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0335 <- 4.03 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0336 <- 3.60 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0339 <- 3.62 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0341 <- 4.12 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0346 <- 3.86 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0349 <- 3.26 -> DT xxx O0049 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0350 <- 4.14 -> DT xxx O0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0352 <- 4.42 -> DA xxx P0106 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0353 <- 3.37 -> DT xxx O0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0357 <- 3.41 -> DT xxx O0048 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0371 <- 3.82 -> DC xxx O0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0374 <- 4.26 -> DA xxx P0107 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0499 <- 4.20 -> DT xxx O0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0500 <- 3.32 -> DC xxx P0126 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0501 <- 3.15 -> DC xxx P0128 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0502 <- 4.18 -> DG xxx O0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0086 <- 3.99 -> DT xxx O0049 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0090 <- 3.24 -> DA xxx O0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0085 <- 3.31 -> DT xxx P0138 : score x.xxxxx >7kif_Z: title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS WT RNAP TRANSCRIPTION OPEN PROMOTER COMPLEX WITH WHIB7 TRANSCRIPTION FACTOR organism=? : H : ARG NH2 Z0083 <- 2.68 -> DT O2 P0136 : score 4.33493 : x : ARG xxxx Z0085 <- 3.31 -> DT xxx P0138 : score x.xxxxx >7kij_A: title=MUSCOVY DUCK CIRCOVIRUS REP DOMAIN COMPLEXED WITH A SINGLE-STRANDED DNA 10-MER COMPRISING THE CLEAVAGE SITE organism=Muscovy duck circovirus : w : SER OG A0084 <- 6.01 -> DT O4 D0301 : score 2.338 : H : GLU OE1 A0086 <- 3.10 -> DA N6 D0303 : score 2.52113 : H : ASP OD2 A0087 <- 2.85 -> DA N6 D0300 : score 3.96254 : w : ASP OD2 A0087 <- 5.67 -> DT N3 D0301 : score 2.393 : w : GLU OE1 A0090 <- 6.19 -> DC N4 D0307 : score 3.528 : w : GLU OE2 A0090 <- 6.08 -> DA N6 D0306 : score 2.785 >7kij_AC: title=MUSCOVY DUCK CIRCOVIRUS REP DOMAIN COMPLEXED WITH A SINGLE-STRANDED DNA 10-MER COMPRISING THE CLEAVAGE SITE organism=Muscovy duck circovirus : H : THR OG1 A0015 <- 2.86 -> DA N3 B0306 : score 1.3376 : H : ASN ND2 A0017 <- 2.84 -> DT O2 B0302 : score 4.70818 : H : ASN ND2 A0017 <- 2.94 -> DT O2 B0305 : score 4.61326 : H : SER OG A0079 <- 3.16 -> DT O4 B0299 : score 3.29916 : H : ARG NE A0082 <- 3.05 -> DC O2 B0308 : score 2.52603 : H : ASN ND2 A0088 <- 3.12 -> DC O2 B0307 : score 4.1928 : H : TYR OH C0009 <- 2.96 -> DC N4 B0308 : score 4.07925 >7kim_FMZ: title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS WT RNAP TRANSCRIPTION CLOSED PROMOTER COMPLEX WITH WHIB7 TRANSCRIPTION FACTOR organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : H : GLU OE1 F0501 <- 3.00 -> DC N4 P0128 : score 5.53723 : H : ARG NH1 Z0083 <- 2.46 -> DT O2 P0136 : score 4.59925 : H : ARG NH1 Z0085 <- 3.09 -> DA N3 O0017 : score 3.46849 : x : TRP xxxx F0349 <- 4.35 -> DT xxx O0048 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0499 <- 3.71 -> DT xxx O0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0500 <- 3.10 -> DA xxx P0127 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0502 <- 3.99 -> DG xxx O0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0504 <- 3.29 -> DC xxx P0128 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0505 <- 4.49 -> DG xxx O0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0087 <- 4.14 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0090 <- 3.31 -> DC xxx O0052 : score x.xxxxx >7kim_Z: title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS WT RNAP TRANSCRIPTION CLOSED PROMOTER COMPLEX WITH WHIB7 TRANSCRIPTION FACTOR organism=? : H : ARG NH1 Z0083 <- 2.46 -> DT O2 P0136 : score 4.59925 : H : ARG NH1 Z0085 <- 3.09 -> DA N3 O0017 : score 3.46849 >7kin_CDFM: title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS WT RNAP TRANSCRIPTION OPEN PROMOTER COMPLEX WITH WHIB7 PROMOTER organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : H : ARG NH1 F0357 <- 2.86 -> DG N7 O0047 : score 5.9774 : H : ARG NH2 F0357 <- 2.98 -> DG N7 O0047 : score 6.15477 : H : ARG NH2 F0357 <- 2.62 -> DG O6 O0047 : score 6.8376 : V : ARG CZ F0309 <- 3.70 -> DT C7 P0104 : score 2.18562 : V : TRP CD2 F0350 <- 3.72 -> DT C7 O0049 : score 5.60634 : x : GLU xxxx C0402 <- 2.89 -> DT xxx P0104 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0405 <- 3.62 -> DT xxx P0104 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0406 <- 3.58 -> DT xxx P0104 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.66 -> DA xxx O0064 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0310 <- 4.44 -> DT xxx P0105 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0335 <- 4.02 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0336 <- 3.36 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0339 <- 3.83 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0341 <- 4.26 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0346 <- 3.56 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0349 <- 3.39 -> DT xxx O0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0352 <- 3.62 -> DT xxx P0105 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0353 <- 3.28 -> DT xxx O0048 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0371 <- 3.65 -> DC xxx O0044 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0499 <- 4.33 -> DG xxx O0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0500 <- 3.22 -> DC xxx P0126 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0501 <- 3.76 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0502 <- 4.01 -> DG xxx O0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0504 <- 3.20 -> DA xxx P0127 : score x.xxxxx >7kle_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY STRUCTURE OF DPO4 BOUND TO N7MG IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING DCTP organism=Sulfolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) / Sulfolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) : x : ARG xxxx A0332 <- 3.98 -> DG xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0336 <- 3.89 -> DA xxx T0009 : score x.xxxxx >7klf_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=TERNARY STRUCTURE OF DPO4 BOUND TO G IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING DCTP organism=Sulfolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) / Sulfolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) : x : ARG xxxx A0332 <- 4.15 -> DG xxx T0007 : score x.xxxxx >7kqm_A:DNA/RNA_polymerases; title=BINARY COMPLEX OF TERT (TELOMERASE REVERSE TRANSCRIPTASE) WITH RNA/TELOMERIC DNA HYBRID organism=Tribolium castaneum : w : TYR OH A0256 <- 5.52 -> DG N3 C0015 : score 3.344 : w : ASP OD2 A0440 <- 6.75 -> DC O2 C0010 : score 1.919 : H : ASN ND2 A0446 <- 3.05 -> DC O2 C0012 : score 4.25551 : x : PRO xxxx A0442 <- 3.11 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx >7kqn_AD:DNA/RNA_polymerases; title=TERNARY COMPLEX OF TERT (TELOMERASE REVERSE TRANSCRIPTASE) WITH RNA TEMPLATE, DNA PRIMER, AN INCOMING DGTP AND A DOWNSTREAM HYBRID DUPLEX organism=TRIBOLIUM CASTANEUM : w : TYR OH D0256 <- 5.77 -> DG N2 b0025 : score 2.834 : H : ASN ND2 D0446 <- 2.93 -> DC O2 b0022 : score 4.36302 : x : ASN xxxx A0424 <- 2.94 -> A xxx c0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0437 <- 2.98 -> A xxx c0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0424 <- 3.19 -> A xxx b0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0437 <- 3.40 -> A xxx b0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0442 <- 3.76 -> G xxx c0023 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0445 <- 3.11 -> U xxx c0022 : score x.xxxxx >7kqn_D:DNA/RNA_polymerases; title=TERNARY COMPLEX OF TERT (TELOMERASE REVERSE TRANSCRIPTASE) WITH RNA TEMPLATE, DNA PRIMER, AN INCOMING DGTP AND A DOWNSTREAM HYBRID DUPLEX organism=TRIBOLIUM CASTANEUM : w : TYR OH D0256 <- 5.77 -> DG N2 b0025 : score 2.834 : H : ASN ND2 D0446 <- 2.93 -> DC O2 b0022 : score 4.36302 : x : ASN xxxx D0424 <- 3.19 -> A xxx b0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0437 <- 3.40 -> A xxx b0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0442 <- 3.76 -> G xxx c0023 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0445 <- 3.11 -> U xxx c0022 : score x.xxxxx >7kr3_A:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=HUMAN DNA LIGASE 1(E346A/E592A) BOUND TO A BULGED DNA SUBSTRATE organism=Homo sapiens : H : THR OG1 A0798 <- 2.88 -> DT O2 C0002 : score 2.67068 : x : ARG xxxx A0305 <- 3.09 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0635 <- 4.00 -> DC xxx B0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0643 <- 3.58 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0770 <- 3.72 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0872 <- 3.20 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx >7kr4_A:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=HUMAN DNA LIGASE 1(E346A/E592A) BOUND TO A NICKED DNA SUBSTRATE CONTROL DUPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0305 <- 3.33 -> DA N3 D0011 : score 3.29175 : H : ARG NH2 A0305 <- 2.71 -> DC O2 D0010 : score 3.76529 : H : ARG NH1 A0643 <- 2.91 -> DC O2 D0019 : score 3.5697 : H : ARG NH2 A0643 <- 2.80 -> DC O2 D0019 : score 3.69872 : w : ARG NH2 A0643 <- 5.48 -> DA N3 D0020 : score 2.092 : w : ARG NH1 A0771 <- 5.87 -> DA N3 D0014 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0771 <- 5.96 -> DA N3 D0014 : score 2.092 : H : THR OG1 A0798 <- 2.73 -> DT O2 C0002 : score 2.7521 : w : ARG NH2 A0871 <- 6.11 -> DC O2 B0013 : score 1.669 : x : PHE xxxx A0635 <- 3.86 -> DC xxx B0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0770 <- 4.01 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0872 <- 3.37 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx >7ksp_A:N-terminal_nucleophile_aminohydrolases_Ntn_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HSAMD9_DBD WITH DNA organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0354 <- 4.43 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx >7ksp_AB:N-terminal_nucleophile_aminohydrolases_Ntn_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HSAMD9_DBD WITH DNA organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0354 <- 4.43 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx >7ksu_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE MU, DGTP:CT PRODUCT STATE TERNARY COMPLEX, 10 MM MN2+ (4MIN) organism=HOMO SAPIENS : w : GLU OE2 A0173 <- 5.72 -> DC N4 T0005 : score 3.597 : H : ARG NH1 A0387 <- 3.22 -> DA N3 T0007 : score 3.37276 : w : ARG NH1 A0387 <- 5.51 -> DT O2 P0003 : score 1.855 : H : ARG NH1 A0445 <- 3.02 -> DT O2 T0006 : score 4.11693 : x : PHE xxxx A0389 <- 3.97 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0438 <- 3.35 -> DG xxx P0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0441 <- 4.23 -> DG xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.33 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx >7ksv_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE MU, DGTP:CT PRODUCT STATE TERNARY COMPLEX, 10 MM MN2+ (960MIN) organism=? : w : GLU OE2 A0173 <- 5.78 -> DC N4 T0005 : score 3.597 : H : ARG NH1 A0387 <- 3.20 -> DA N3 T0007 : score 3.38749 : w : ARG NH1 A0387 <- 5.51 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : w : LYS NZ A0438 <- 5.99 -> DG N7 P0005 : score 2.519 : H : ARG NH1 A0445 <- 3.07 -> DT O2 T0006 : score 4.07386 : w : ARG NH1 A0445 <- 6.41 -> DT O2 T0006 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0445 <- 6.29 -> DT O2 T0006 : score 2.261 : x : PHE xxxx A0389 <- 4.01 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0441 <- 4.10 -> DG xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.38 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx >7ksx_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE MU, DGTP:CT PRODUCT STATE TERNARY COMPLEX, 10 MM MG2+ (30MIN) organism=? : w : GLU OE2 A0173 <- 5.68 -> DC N4 T0005 : score 3.597 : H : ARG NH1 A0387 <- 3.19 -> DA N3 T0007 : score 3.39485 : w : ARG NH1 A0387 <- 5.57 -> DT O2 P0003 : score 1.855 : w : LYS NZ A0438 <- 5.24 -> DG O6 P0005 : score 3.005 : H : ARG NH1 A0445 <- 3.02 -> DT O2 T0006 : score 4.11693 : x : PHE xxxx A0389 <- 3.91 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0441 <- 4.12 -> DG xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.44 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx >7ksy_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE MU, DGTP:CT PRODUCT STATE TERNARY COMPLEX, 10 MM MG2+ (960MIN) organism=? : w : GLU OE2 A0173 <- 5.83 -> DC N4 T0005 : score 3.597 : w : GLN NE2 A0275 <- 5.92 -> DG N3 P0002 : score 1.484 : H : ARG NH1 A0387 <- 3.15 -> DA N3 T0007 : score 3.42431 : w : ARG NH1 A0387 <- 5.58 -> DT O2 P0003 : score 1.855 : H : ARG NH1 A0445 <- 2.98 -> DT O2 T0006 : score 4.15138 : x : PHE xxxx A0389 <- 3.86 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0438 <- 3.47 -> DG xxx P0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0441 <- 4.03 -> DG xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.52 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx >7kt2_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE MU, DGTP:AT PRODUCT STATE TERNARY COMPLEX, 50 MM MN2+ (225MIN) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0387 <- 3.22 -> DA N3 T0007 : score 3.37276 : w : ARG NH1 A0387 <- 5.54 -> DT O2 P0003 : score 1.855 : w : LYS NZ A0438 <- 5.98 -> DA N6 T0005 : score 2.097 : w : LYS NZ A0438 <- 6.27 -> DG N7 P0005 : score 2.519 : x : PHE xxxx A0389 <- 3.95 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.31 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0445 <- 3.14 -> DG xxx P0005 : score x.xxxxx >7ktq_ABCDEFGH:Histone-fold; title=NUCLEOSOME FROM A DIMERIC PRC2 BOUND TO A NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 A0040 <- 3.07 -> DT O2 J0093 : score 4.07386 : H : ARG NH1 D0030 <- 3.37 -> DT O2 I0037 : score 3.81548 : H : ARG NH1 E0040 <- 2.97 -> DG N3 I0093 : score 2.94878 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.16 -> DT xxx J0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 4.16 -> DT xxx J0093 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.99 -> DC xxx J0121 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.39 -> DT xxx J0060 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.77 -> DC xxx I0121 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.48 -> DG xxx I0132 : score x.xxxxx >7ktq_D:Histone-fold; title=NUCLEOSOME FROM A DIMERIC PRC2 BOUND TO A NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH1 D0030 <- 3.37 -> DT O2 I0037 : score 3.81548 >7ktq_E:Histone-fold; title=NUCLEOSOME FROM A DIMERIC PRC2 BOUND TO A NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 E0040 <- 2.97 -> DG N3 I0093 : score 2.94878 : x : ARG xxxx E0083 <- 3.39 -> DT xxx J0060 : score x.xxxxx >7ku7_AB:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ROUS SARCOMA VIRUS CLEAVED SYNAPTIC COMPLEX (CSC) WITH HIV-1 INTEGRASE STRAND TRANSFER INHIBITOR MK-2048. CLUSTER IDENTIFIED BY 3-DIMENSIONAL VARIABILITY ANALYSIS IN CRYOSPARC. organism=ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN SCHMIDT-RUPPIN A) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN SCHMIDT-RUPPIN A) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN SCHMIDT-RUPPIN A) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN SCHMIDT-RUPPIN A) : H : ARG NH1 A0158 <- 2.31 -> DT O2 I0006 : score 4.72844 : H : ARG NH2 A0244 <- 2.93 -> DG N7 I0007 : score 6.21862 : x : ASN xxxx A0051 <- 3.39 -> DT xxx I0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0151 <- 2.90 -> DG xxx I0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0154 <- 3.23 -> DG xxx I0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0157 <- 3.99 -> DC xxx J0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0161 <- 3.57 -> DA xxx J0034 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0203 <- 3.15 -> DT xxx I0008 : score x.xxxxx >7kuf_A: title=TRANSCRIPTION ACTIVATION SUBCOMPLEX WITH WHIB7 BOUND TO SIGMAAR4-RNAP BETA FLAP TIP CHIMERA AND DNA organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : H : ARG NH1 A0083 <- 3.43 -> DT O2 D0013 : score 3.7638 : H : ARG NH2 A0083 <- 2.76 -> DT O2 C0008 : score 4.2672 : x : ARG xxxx A0085 <- 3.21 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx >7kuf_AB:Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=TRANSCRIPTION ACTIVATION SUBCOMPLEX WITH WHIB7 BOUND TO SIGMAAR4-RNAP BETA FLAP TIP CHIMERA AND DNA organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : H : ARG NH1 A0083 <- 3.43 -> DT O2 D0013 : score 3.7638 : H : ARG NH2 A0083 <- 2.76 -> DT O2 C0008 : score 4.2672 : H : GLU OE2 B0501 <- 2.98 -> DC N4 D0006 : score 5.07583 : H : GLN NE2 B0505 <- 2.90 -> DT O4 C0012 : score 5.0872 : x : ARG xxxx A0085 <- 3.21 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0499 <- 4.00 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0500 <- 3.41 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0502 <- 3.79 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0504 <- 3.33 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx >7kui_EF:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ROUS SARCOMA VIRUS CLEAVED SYNAPTIC COMPLEX (CSC) WITH HIV-1 INTEGRASE STRAND TRANSFER INHIBITOR MK-2048. CIC REGION OF A CLUSTER IDENTIFIED BY 3-DIMENSIONAL VARIABILITY ANALYSIS IN CRYOSPARC. organism=ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN SCHMIDT-RUPPIN A) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN SCHMIDT-RUPPIN A) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN SCHMIDT-RUPPIN A) / ROUS SARCOMA VIRUS (STRAIN SCHMIDT-RUPPIN A) : H : ARG NH1 E0158 <- 3.32 -> DT O2 K0005 : score 3.85854 : H : ARG NH2 E0158 <- 2.41 -> DT O2 K0006 : score 4.56353 : H : ARG NH2 E0244 <- 2.99 -> DG N7 K0007 : score 6.142 : x : GLN xxxx E0151 <- 2.92 -> DG xxx K0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0154 <- 3.20 -> DG xxx K0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0161 <- 3.73 -> DA xxx L0034 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0203 <- 3.10 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx >7kz0_A:DNA-glycosylase; title=HUMAN MBD4 GLYCOSYLASE DOMAIN BOUND TO DNA CONTAINING SUBSTRATE ANALOG 2'-DEOXY-PSEUDOURIDINE organism=Homo sapiens : w : ASN OD1 A0467 <- 5.99 -> DG N3 C0008 : score 3.377 : x : ARG xxxx A0468 <- 3.42 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0469 <- 3.18 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0508 <- 3.45 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0511 <- 3.17 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0512 <- 4.22 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx >7kz1_A:DNA-glycosylase; title=HUMAN MBD4 GLYCOSYLASE DOMAIN BOUND TO DNA CONTAINING AN ABASIC SITE organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0467 <- 5.77 -> DG N3 C0008 : score 2.566 : w : SER OG A0470 <- 5.85 -> DG N2 C0006 : score 1.651 : x : ARG xxxx A0468 <- 3.27 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0469 <- 3.29 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0473 <- 3.91 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0508 <- 3.50 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0511 <- 3.34 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0512 <- 4.13 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx >7kzg_A:DNA-glycosylase; title=HUMAN MBD4 GLYCOSYLASE DOMAIN BOUND TO DNA CONTAINING OXACARBENIUM- ION ANALOG 1-AZA-2'-DEOXYRIBOSE organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0468 <- 5.62 -> DG N7 C0006 : score 2.063 : w : SER OG A0470 <- 5.98 -> DG N2 C0006 : score 1.651 : x : ASN xxxx A0467 <- 4.11 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0469 <- 3.35 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0508 <- 3.49 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0511 <- 3.19 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0512 <- 4.33 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx >7kzv_U: title=STRUCTURE OF THE HUMAN FANCONI ANAEMIA CORE-UBE2T-ID-DNA COMPLEX IN CLOSED STATE organism=? : x : ARG xxxx U1245 <- 3.78 -> DT xxx Y0010 : score x.xxxxx >7l34_A:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=HUMAN DNA LIGASE 1 - R641L NICKED DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : w : ARG NE A0305 <- 5.70 -> DT O2 D0010 : score 0.757 : H : LYS NZ A0770 <- 3.05 -> DG N3 D0013 : score 1.38115 : w : LYS NZ A0770 <- 5.60 -> DG N2 C0004 : score 0.846 : w : LYS NZ A0770 <- 5.59 -> DC O2 D0012 : score 1.3 : w : ARG NH2 A0771 <- 5.66 -> DA N3 D0014 : score 2.092 : H : THR OG1 A0798 <- 2.90 -> DT O2 C0002 : score 2.65982 : w : ARG NH2 A0871 <- 5.96 -> DC O2 B0013 : score 1.669 : x : HIS xxxx A0546 <- 3.83 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0635 <- 3.93 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0872 <- 3.33 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx >7l35_A:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=HUMAN DNA LIGASE 1 - R771W NICKED DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0305 <- 3.18 -> DT O2 D0010 : score 3.97912 A : H : ARG NH2 A0305 <- 3.27 -> DT O2 D0010 : score 3.8354 A : w : ARG NH1 A0305 <- 5.32 -> DC O2 D0011 : score 1.381 A : w : ARG NH2 A0451 <- 6.18 -> DC N4 D0015 : score 0.976 A : w : ARG NH1 A0643 <- 5.45 -> DC O2 B0010 : score 1.381 : w : ARG NH1 A0643 <- 6.20 -> DG N3 B0011 : score 1.593 : H : THR OG1 A0798 <- 3.01 -> DT O2 C0002 : score 2.60011 : w : ARG NH2 A0871 <- 6.00 -> DC O2 B0013 : score 1.669 : x : HIS xxxx A0546 <- 4.43 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0635 <- 3.87 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0872 <- 3.27 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx >7l4c_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DRM2-CTT DNA COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : H : CYS SG A0397 <- 3.25 -> DT O4 C0012 : score 6.461 : w : ARG NH1 A0598 <- 5.63 -> DA N3 B0010 : score 2.585 : w : ARG NH1 A0598 <- 6.01 -> DT O2 B0011 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0598 <- 5.74 -> DT O2 B0011 : score 2.261 : V : LEU CD1 A0395 <- 3.63 -> DT C7 C0011 : score 5.97486 : x : LYS xxxx A0434 <- 4.00 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0435 <- 3.49 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0472 <- 3.47 -> DA xxx B0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0476 <- 3.97 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0595 <- 3.29 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx >7l4f_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DRM2-CAT DNA COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : H : CYS SG A0397 <- 2.99 -> DT O4 G0012 : score 6.8302 : x : LYS xxxx A0434 <- 4.20 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0435 <- 3.64 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0472 <- 3.46 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0595 <- 2.99 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0598 <- 4.36 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx >7l4h_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DRM2-CTG DNA COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : H : CYS SG A0397 <- 3.69 -> DG O6 C0012 : score -7.48968 : w : ARG NH2 A0598 <- 5.53 -> DT O2 B0011 : score 2.261 : V : LEU CD1 A0395 <- 3.61 -> DT C7 C0011 : score 6.00352 : x : SER xxxx A0400 <- 4.42 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0434 <- 4.44 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0435 <- 3.55 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0472 <- 3.25 -> DA xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0595 <- 3.22 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx >7l4k_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DRM2-CCG DNA COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : w : ASN OD1 A0594 <- 5.51 -> DC O2 C0011 : score 2.172 : H : ARG NH1 A0598 <- 3.45 -> DT O2 B0011 : score 3.74658 : x : LEU xxxx A0316 <- 4.46 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0397 <- 3.79 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0434 <- 3.34 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0435 <- 3.18 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0472 <- 3.37 -> DA xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0595 <- 3.14 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx >7l4m_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DRM2-CCT DNA COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : x : LEU xxxx B0395 <- 4.37 -> DC xxx D0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0397 <- 3.52 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0435 <- 4.14 -> DC xxx D0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0472 <- 4.13 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0595 <- 3.30 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0598 <- 4.24 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx >7l4n_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DRM2 (C397R)-CCG DNA COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : H : ARG NH1 A0598 <- 3.41 -> DT O2 B0011 : score 3.78103 : w : ARG NH1 A0598 <- 5.55 -> DA N3 B0010 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0598 <- 5.73 -> DT O2 B0011 : score 2.261 : x : ARG xxxx A0397 <- 3.22 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0434 <- 3.94 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0435 <- 3.30 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0472 <- 3.49 -> DA xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0595 <- 3.32 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx >7l4v_A:Leucine_zipper_domain; title=C-TERMINAL BZIP DOMAIN OF HUMAN C/EBPBETA BOUND TO DNA WITH CONSENSUS RECOGNITION WITH GT MISMATCH organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0277 <- 3.08 -> DG N7 C0004 : score 5.7112 : H : ARG NH2 A0277 <- 3.08 -> DG O6 C0004 : score 6.2304 : H : ARG NH1 A0278 <- 3.08 -> DA N7 D0111 : score 2.41688 : H : ASN OD1 A0281 <- 2.99 -> DA N6 D0111 : score 5.79297 : H : ASN ND2 A0281 <- 3.05 -> DT O4 C0006 : score 5.02038 : w : ASN ND2 A0281 <- 6.06 -> DA N6 C0005 : score 2.5 : H : ARG NH1 A0289 <- 2.99 -> DG N7 D0109 : score 5.8201 : H : ARG NH2 A0289 <- 2.88 -> DG O6 D0109 : score 6.4944 : w : ARG NH2 A0289 <- 6.65 -> DT O4 C0009 : score 2.366 : x : ALA xxxx A0284 <- 3.98 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0285 <- 3.28 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 4.12 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >7l4v_AB:Leucine_zipper_domain; title=C-TERMINAL BZIP DOMAIN OF HUMAN C/EBPBETA BOUND TO DNA WITH CONSENSUS RECOGNITION WITH GT MISMATCH organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0277 <- 3.08 -> DG N7 C0004 : score 5.7112 : H : ARG NH2 A0277 <- 3.08 -> DG O6 C0004 : score 6.2304 : H : ARG NH1 A0278 <- 3.08 -> DA N7 D0111 : score 2.41688 : H : ASN OD1 A0281 <- 2.99 -> DA N6 D0111 : score 5.79297 : H : ASN ND2 A0281 <- 3.05 -> DT O4 C0006 : score 5.02038 : w : ASN ND2 A0281 <- 6.06 -> DA N6 C0005 : score 2.5 : H : ARG NH1 A0289 <- 2.99 -> DG N7 D0109 : score 5.8201 : H : ARG NH2 A0289 <- 2.88 -> DG O6 D0109 : score 6.4944 : w : ARG NH2 A0289 <- 6.65 -> DT O4 C0009 : score 2.366 : w : ARG NH1 B0278 <- 6.35 -> DA N6 C0013 : score 1.486 : H : ASN OD1 B0281 <- 2.99 -> DA N6 C0012 : score 5.79297 : H : ASN ND2 B0281 <- 3.07 -> DT O4 D0105 : score 4.99925 : w : ASN ND2 B0281 <- 6.13 -> DA N6 D0104 : score 2.5 : w : ASN OD1 B0282 <- 6.05 -> DC N4 C0011 : score 2.732 : H : ARG NH1 B0289 <- 2.81 -> DG O6 C0010 : score 6.07117 A : H : ARG NH2 B0289 <- 2.90 -> DG O6 C0010 : score 6.468 A : H : ARG NH2 B0289 <- 2.70 -> DG O6 D0107 : score 6.732 A : x : ALA xxxx A0284 <- 3.98 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0285 <- 3.28 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 4.12 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0284 <- 4.05 -> DT xxx D0105 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0285 <- 3.37 -> DT xxx D0106 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 4.04 -> DT xxx D0105 : score x.xxxxx >7l4x_B: title=YTH DOMAIN OF HUMAN YTHDC1 WITH DSDNA COMPRISING SINGLE N6MA JOINED BY TWO SIX-BP DNA DUPLEXES IN P3221 CRYSTAL organism=Homo sapiens : x : LEU xxxx B0380 <- 3.74 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0381 <- 4.18 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0438 <- 3.30 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0473 <- 4.31 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0475 <- 3.35 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx >7l4y_B: title=YTH DOMAIN OF HUMAN YTHDC1 WITH DSDNA COMPRISING SINGLE N6MA JOINED BY TWO SIX-BP DNA DUPLEXES IN P212121 CRYSTAL organism=HOMO SAPIENS : x : LEU xxxx B0380 <- 3.48 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0381 <- 3.59 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0382 <- 3.19 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0438 <- 3.22 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx >7l69_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN POLYMERASE ETA COMPLEXED WITH SYN N7- BENZYLGUANINE organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx A0382 <- 3.40 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx >7lbm_AMOPTW:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain;TATA-box_binding_protein-like;Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF THE HUMAN MEDIATOR-BOUND TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX organism=? : H : ASN ND2 P0167 <- 2.82 -> DT O2 V0079 : score 4.72717 : H : THR OG1 P0222 <- 2.33 -> DT O2 V0079 : score 2.96923 : x : LYS xxxx M0346 <- 3.72 -> DT xxx V0080 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0169 <- 3.41 -> DA xxx U0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 3.29 -> DC xxx V0076 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx P0198 <- 4.03 -> DG xxx U0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.60 -> DT xxx V0077 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.68 -> DA xxx U0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0220 <- 4.49 -> DA xxx U0016 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0257 <- 3.55 -> DA xxx U0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 3.28 -> DT xxx V0080 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.80 -> DA xxx V0083 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0289 <- 4.46 -> DG xxx V0084 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 3.99 -> DT xxx U0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 4.01 -> DT xxx V0082 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 3.71 -> DA xxx V0081 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0313 <- 3.89 -> DT xxx U0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx T0174 <- 3.51 -> DC xxx V0075 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx W0528 <- 4.23 -> DG xxx U0060 : score x.xxxxx >7lbw_AB:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TFAM (MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTION FACTOR A) BRIDGING TWO NON-SEQUENCE SPECIFIC DNA SUBSTRATES organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0057 <- 2.98 -> DG N3 c0029 : score 3.00199 : H : LYS NZ A0062 <- 2.88 -> DC O2 e0016 : score 2.89902 : H : ARG NH2 A0157 <- 2.65 -> DT O2 c0010 : score 4.36033 : H : TYR OH A0162 <- 2.94 -> DT O2 c0006 : score 3.1266 : H : ASN ND2 A0163 <- 3.03 -> DA N3 e0038 : score 3.63254 : H : ASN ND2 A0163 <- 2.97 -> DA N3 e0039 : score 3.67823 : H : TYR OH B0057 <- 2.91 -> DG N3 e0029 : score 3.04559 : w : SER OG B0061 <- 6.09 -> DC O2 c0016 : score 1.768 : H : ARG NH2 B0157 <- 2.83 -> DT O2 e0010 : score 4.20793 : H : TYR OH B0162 <- 2.86 -> DT O2 e0006 : score 3.17807 : H : ASN ND2 B0163 <- 2.88 -> DA N3 c0038 : score 3.74677 : H : ASN ND2 B0163 <- 3.18 -> DA N3 c0039 : score 3.51831 : x : SER xxxx A0055 <- 3.41 -> DG xxx e0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0058 <- 3.22 -> DG xxx e0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0061 <- 3.71 -> DG xxx c0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.09 -> DT xxx e0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0077 <- 3.39 -> DT xxx e0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0078 <- 3.29 -> DG xxx c0027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0081 <- 3.24 -> DG xxx c0029 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0143 <- 4.18 -> DG xxx e0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0147 <- 4.01 -> DG xxx e0022 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0166 <- 3.89 -> DA xxx e0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0170 <- 3.75 -> DG xxx e0040 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0178 <- 3.49 -> DG xxx e0041 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0179 <- 3.44 -> DC xxx c0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0182 <- 3.31 -> DC xxx c0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0234 <- 3.74 -> DT xxx c0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0055 <- 3.30 -> DG xxx c0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0058 <- 3.25 -> DG xxx c0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0065 <- 4.15 -> DT xxx c0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0077 <- 3.27 -> DT xxx c0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0078 <- 3.63 -> DG xxx e0027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0081 <- 3.22 -> DG xxx e0029 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0143 <- 3.79 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0147 <- 3.66 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0166 <- 4.29 -> DA xxx c0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0170 <- 4.05 -> DG xxx c0040 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0178 <- 3.72 -> DG xxx c0041 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0179 <- 3.39 -> DC xxx e0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0182 <- 3.72 -> DT xxx e0006 : score x.xxxxx >7lbw_B:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TFAM (MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTION FACTOR A) BRIDGING TWO NON-SEQUENCE SPECIFIC DNA SUBSTRATES organism=Homo sapiens : H : TYR OH B0057 <- 2.91 -> DG N3 e0029 : score 3.04559 : w : SER OG B0061 <- 6.09 -> DC O2 c0016 : score 1.768 : H : ARG NH2 B0157 <- 2.83 -> DT O2 e0010 : score 4.20793 : H : TYR OH B0162 <- 2.86 -> DT O2 e0006 : score 3.17807 : H : ASN ND2 B0163 <- 2.88 -> DA N3 c0038 : score 3.74677 : H : ASN ND2 B0163 <- 3.18 -> DA N3 c0039 : score 3.51831 : x : SER xxxx B0055 <- 3.30 -> DG xxx c0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0058 <- 3.25 -> DG xxx c0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0065 <- 4.15 -> DT xxx c0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0077 <- 3.27 -> DT xxx c0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0078 <- 3.63 -> DG xxx e0027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0081 <- 3.22 -> DG xxx e0029 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0143 <- 3.79 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0147 <- 3.66 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0166 <- 4.29 -> DA xxx c0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0170 <- 4.05 -> DG xxx c0040 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0178 <- 3.72 -> DG xxx c0041 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0179 <- 3.39 -> DC xxx e0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0182 <- 3.72 -> DT xxx e0006 : score x.xxxxx >7lbx_B:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TFAM (MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTION FACTOR A) IN COMPLEX WITH LSP organism=Homo sapiens : H : TYR OH B0057 <- 2.94 -> DG N3 F0018 : score 3.02691 : w : SER OG B0061 <- 5.11 -> DC O2 E0005 : score 1.768 : H : TYR OH B0162 <- 3.38 -> DA N3 E0017 : score 3.66973 : H : ASN ND2 B0163 <- 3.21 -> DT O2 F0005 : score 4.35697 : H : LYS NZ B0186 <- 2.83 -> DA N3 E0017 : score 2.76026 : x : LYS xxxx B0052 <- 3.51 -> DA xxx E0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0055 <- 3.66 -> DT xxx F0020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0058 <- 3.38 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0065 <- 4.22 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0077 <- 3.36 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0078 <- 3.21 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0081 <- 3.28 -> DG xxx F0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0143 <- 3.99 -> DG xxx F0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0147 <- 3.74 -> DG xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0157 <- 3.87 -> DG xxx F0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0166 <- 3.53 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0170 <- 4.31 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0178 <- 3.61 -> DG xxx F0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0179 <- 3.79 -> DC xxx E0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0182 <- 3.40 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx >7lcc_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HELITRON TRANSPOSASE BOUND TO LTS organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : SER OG A0868 <- 3.27 -> DA N7 B0009 : score 4.04448 : H : ARG NH2 A1122 <- 3.03 -> DT O2 B0008 : score 4.0386 : H : SER OG A1403 <- 2.86 -> DT O4 B0006 : score 3.51247 : x : GLN xxxx A0461 <- 3.58 -> DA xxx B0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0493 <- 3.73 -> DA xxx B0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0494 <- 3.56 -> DT xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0502 <- 2.98 -> DT xxx B0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0509 <- 4.43 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0865 <- 3.47 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0866 <- 3.23 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1106 <- 3.99 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1113 <- 3.34 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1146 <- 4.32 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1185 <- 3.91 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1186 <- 3.23 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1286 <- 3.59 -> DC xxx B0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1336 <- 3.66 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1355 <- 3.36 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1356 <- 3.97 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1410 <- 4.18 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1427 <- 4.23 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1446 <- 3.68 -> DC xxx B0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A1447 <- 4.47 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >7lcd_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN POLYMERASE ETA COMPLEXED WITH SYN N7- ACETOPHENONEGUANINE organism=Homo sapiens : x : LEU xxxx A0378 <- 4.07 -> DT xxx P0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.28 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx >7lh9_C:Tudor/PWWP/MBT; title=CRYSTAL STRUCTURE OF BRPF2 PWWP DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=? : x : ASN xxxx C1025 <- 4.00 -> DT xxx I0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C1027 <- 3.41 -> DT xxx I0005 : score x.xxxxx >7lhz_AB:Type_II_DNA_topoisomerase; title=K. PNEUMONIAE TOPOISOMERASE IV (PARE-PARC) IN COMPLEX WITH DNA AND (3S)-10-[(3R)-3-(1-AMINOCYCLOPROPYL)PYRROLIDIN-1-YL]-9-FLUORO-3- METHYL-5-OXO-2,3-DIHYDRO-5H-[1,4]OXAZINO[2,3,4-IJ]QUINOLINE-6- CARBOXYLIC ACID (COMPOUND 25) organism=? : H : SER OG A1080 <- 3.41 -> DG O6 F0112 : score 3.59192 : V : ALA CB A1081 <- 3.87 -> DT C7 E0011 : score 5.50099 : x : LYS xxxx A0444 <- 3.84 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1029 <- 4.07 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A1079 <- 3.66 -> DG xxx F0112 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1172 <- 3.34 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1326 <- 3.36 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0444 <- 3.29 -> DT xxx H0211 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B1079 <- 3.72 -> DG xxx G0312 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B1080 <- 3.68 -> DG xxx G0312 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B1081 <- 4.03 -> DA xxx H0210 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B1172 <- 2.93 -> DC xxx F0119 : score x.xxxxx >7lhz_D:Type_II_DNA_topoisomerase; title=K. PNEUMONIAE TOPOISOMERASE IV (PARE-PARC) IN COMPLEX WITH DNA AND (3S)-10-[(3R)-3-(1-AMINOCYCLOPROPYL)PYRROLIDIN-1-YL]-9-FLUORO-3- METHYL-5-OXO-2,3-DIHYDRO-5H-[1,4]OXAZINO[2,3,4-IJ]QUINOLINE-6- CARBOXYLIC ACID (COMPOUND 25) organism=? : x : LYS xxxx D0444 <- 3.40 -> DT xxx J0611 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D1029 <- 4.36 -> DT xxx J0609 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D1081 <- 4.35 -> DA xxx J0610 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D1084 <- 3.34 -> DT xxx J0609 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D1172 <- 3.04 -> DC xxx K0519 : score x.xxxxx >7lma_A: title=TETRAHYMENA TELOMERASE T3D2 STRUCTURE AT 3.3 ANGSTROM organism=TETRAHYMENA THERMOPHILA : x : PHE xxxx A0414 <- 3.63 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0559 <- 3.62 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0563 <- 3.94 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0926 <- 3.71 -> DT xxx C0027 : score x.xxxxx >7lma_AD:Nucleic_acid-binding_proteins; title=TETRAHYMENA TELOMERASE T3D2 STRUCTURE AT 3.3 ANGSTROM organism=TETRAHYMENA THERMOPHILA : H : LYS NZ D0660 <- 2.58 -> DG O6 C0019 : score 6.03512 : H : GLU OE1 D0667 <- 3.39 -> DG N2 C0019 : score 3.80165 : x : PHE xxxx A0414 <- 3.63 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0559 <- 3.62 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0563 <- 3.94 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0926 <- 3.71 -> DT xxx C0027 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0586 <- 4.46 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0588 <- 3.41 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0601 <- 3.41 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0603 <- 3.40 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0604 <- 4.05 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0656 <- 3.77 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0662 <- 3.41 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0669 <- 4.14 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0671 <- 3.51 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0673 <- 3.15 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx >7lmb_A: title=TETRAHYMENA TELOMERASE T5D5 STRUCTURE AT 3.8 ANGSTROM organism=TETRAHYMENA THERMOPHILA : H : ASN ND2 A0926 <- 2.51 -> DG N3 C0017 : score 5.17877 : x : PHE xxxx A0414 <- 3.77 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0543 <- 3.08 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0623 <- 4.44 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0773 <- 4.09 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0927 <- 4.46 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx >7lmb_AD:Nucleic_acid-binding_proteins; title=TETRAHYMENA TELOMERASE T5D5 STRUCTURE AT 3.8 ANGSTROM organism=TETRAHYMENA THERMOPHILA : H : ASN ND2 A0926 <- 2.51 -> DG N3 C0017 : score 5.17877 : H : LYS NZ D0660 <- 2.97 -> DG O6 C0010 : score 5.58422 : x : PHE xxxx A0414 <- 3.77 -> DG xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0543 <- 3.08 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0623 <- 4.44 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0773 <- 4.09 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0927 <- 4.46 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0586 <- 4.46 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0588 <- 4.05 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0601 <- 3.69 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0603 <- 4.14 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0604 <- 4.23 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0662 <- 3.51 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0667 <- 3.34 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx >7lni_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=SEMET CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.26 -> DA N3 d0006 : score 3.85551 : H : LYS NZ A0172 <- 2.79 -> DT O2 e0009 : score 3.59435 : H : LYS NZ A0172 <- 2.84 -> DT O2 e0010 : score 3.55848 : H : LYS NZ A0193 <- 3.27 -> DG N3 e0013 : score 1.31718 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.17 -> DA N7 d0005 : score 5.6391 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.97 -> DG N7 e0013 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.96 -> DG O6 e0013 : score 6.3888 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.23 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.93 -> DT O4 e0012 : score 4.68269 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.11 -> DA N7 d0004 : score 2.40152 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.08 -> DA N7 d0004 : score 1.57817 : H : SER OG A0514 <- 2.91 -> DA N6 d0007 : score 3.21737 : H : TYR OH A0521 <- 2.88 -> DA N7 d0006 : score 4.08486 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.71 -> DT C7 e0011 : score 7.25084 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.40 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 2.72 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.25 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.25 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.75 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.70 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0255 <- 4.45 -> DG xxx e0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.95 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.38 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.22 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 3.75 -> DT xxx d0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.44 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0455 <- 3.05 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.59 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.17 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0473 <- 3.10 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 4.06 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.11 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.39 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.52 -> DC xxx e0007 : score x.xxxxx >7lni_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=SEMET CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.26 -> DA N3 d0006 : score 3.85551 : H : LYS NZ A0172 <- 2.79 -> DT O2 e0009 : score 3.59435 : H : LYS NZ A0172 <- 2.84 -> DT O2 e0010 : score 3.55848 : H : LYS NZ A0193 <- 3.27 -> DG N3 e0013 : score 1.31718 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.17 -> DA N7 d0005 : score 5.6391 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.97 -> DG N7 e0013 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.96 -> DG O6 e0013 : score 6.3888 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.23 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.93 -> DT O4 e0012 : score 4.68269 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.11 -> DA N7 d0004 : score 2.40152 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.08 -> DA N7 d0004 : score 1.57817 : H : SER OG A0514 <- 2.91 -> DA N6 d0007 : score 3.21737 : H : TYR OH A0521 <- 2.88 -> DA N7 d0006 : score 4.08486 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.71 -> DT C7 e0011 : score 7.25084 : V : ILE CG1 B0431 <- 3.82 -> DT C7 e0015 : score 4.93418 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.40 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 2.72 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.25 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.25 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.75 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.70 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0255 <- 4.45 -> DG xxx e0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.95 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.38 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.22 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 3.75 -> DT xxx d0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.44 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0455 <- 3.05 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.59 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.17 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0473 <- 3.10 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 4.06 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.11 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.39 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.52 -> DC xxx e0007 : score x.xxxxx >7lnj_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.15 -> DA N3 d0006 : score 3.94892 : H : LYS NZ A0172 <- 2.83 -> DT O2 e0008 : score 3.56566 : H : LYS NZ A0172 <- 2.81 -> DT O2 e0009 : score 3.58001 : H : LYS NZ A0193 <- 3.20 -> DG N3 e0012 : score 1.33754 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.24 -> DA N7 d0005 : score 5.55385 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.90 -> DG N7 e0012 : score 5.929 : H : ARG NH2 A0425 <- 3.02 -> DG O6 e0012 : score 6.3096 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.64 -> DT O4 e0011 : score 4.96154 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.06 -> DA N7 d0004 : score 1.58486 : H : SER OG A0514 <- 2.92 -> DA N6 d0007 : score 3.21079 : H : TYR OH A0521 <- 2.99 -> DA N7 d0006 : score 3.99353 : V : TYR CZ A0455 <- 3.86 -> DT C7 e0008 : score 5.4958 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.71 -> DT C7 e0010 : score 7.25084 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.42 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 2.84 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.28 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.47 -> DG xxx e0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.83 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.74 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0255 <- 4.43 -> DG xxx e0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 4.06 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.35 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.08 -> DT xxx e0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0426 <- 4.21 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 4.24 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.31 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.47 -> DT xxx e0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.24 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0473 <- 3.11 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 4.26 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.17 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.58 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.40 -> DC xxx e0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 3.92 -> DT xxx e0014 : score x.xxxxx >7lnj_C:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA organism=Clostridioides difficile : H : LYS NZ C0172 <- 2.94 -> DT O2 g0023 : score 3.48674 : H : ARG NH1 C0425 <- 2.90 -> DG N7 g0027 : score 5.929 : H : ARG NH2 C0425 <- 2.82 -> DG O6 g0027 : score 6.5736 : H : TRP NE1 C0439 <- 2.88 -> DT O4 g0026 : score 4.73077 : V : ILE CG2 C0349 <- 3.75 -> DT C7 g0025 : score 7.17992 >7lo5_D:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYOEM STRUCTURE DRDV-DNA COMPLEX organism=? : H : GLN OE1 D0485 <- 3.28 -> DG N2 L0024 : score 5.06935 : H : LYS NZ D0486 <- 3.28 -> DT O2 L0022 : score 3.24281 : H : ARG NE D0554 <- 3.00 -> DG N7 L0017 : score 4.24492 : H : ARG NE D0554 <- 3.00 -> DG N7 L0017 : score 4.24492 : H : ARG NH2 D0554 <- 3.04 -> DG O6 L0017 : score 6.2832 : H : ARG NH2 D0554 <- 3.04 -> DG O6 L0017 : score 6.2832 : H : LYS NZ D0567 <- 3.05 -> DC O2 K0012 : score 2.79885 : H : LYS NZ D0567 <- 3.05 -> DC O2 K0012 : score 2.79885 : H : ARG NH1 D0721 <- 2.98 -> DG N7 L0023 : score 5.8322 : H : ARG NH2 D0721 <- 3.20 -> DG O6 L0023 : score 6.072 : H : TYR OH D0764 <- 2.73 -> DA N7 K0007 : score 4.2094 : H : TYR OH D0764 <- 3.01 -> DA N6 K0007 : score 4.47435 : H : LYS NZ D0807 <- 3.07 -> DG N7 K0009 : score 5.09506 : V : LEU CD2 D0802 <- 3.61 -> DT C7 K0008 : score 6.00352 : x : PHE xxxx D0304 <- 3.80 -> DA xxx K0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0448 <- 3.05 -> DA xxx K0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0451 <- 3.48 -> DA xxx K0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0454 <- 3.76 -> DA xxx L0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0458 <- 4.25 -> DT xxx L0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0488 <- 3.05 -> DG xxx K0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0547 <- 3.26 -> DG xxx L0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0548 <- 3.26 -> DT xxx L0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0562 <- 3.94 -> DA xxx K0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0566 <- 3.55 -> DA xxx K0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0668 <- 4.01 -> DA xxx K0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0673 <- 3.37 -> DT xxx L0022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0761 <- 3.63 -> DT xxx L0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0762 <- 3.33 -> DC xxx K0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0803 <- 3.44 -> DC xxx L0019 : score x.xxxxx >7lpg_D:DNase_I-like; title=APE1 PRODUCT COMPLEX WITH ABASIC RIBONUCLEOTIDE DNA organism=Homo sapiens : w : ASP OD1 D0070 <- 5.84 -> DC O2 C0013 : score 1.919 : x : LYS xxxx D0098 <- 3.70 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0177 <- 3.60 -> DC xxx E0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0269 <- 4.01 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0270 <- 3.75 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >7lph_D:DNase_I-like; title=APE1 MN-BOUND PRODUCT COMPLEX WITH ABASIC RIBONUCLEOTIDE DNA organism=Homo sapiens : w : ASP OD1 D0070 <- 5.46 -> DC O2 C0013 : score 1.919 : w : ASP OD1 D0070 <- 6.19 -> DC O2 E0010 : score 1.919 : w : ASP OD2 D0070 <- 5.50 -> DC O2 C0013 : score 1.919 : w : ASP OD1 D0308 <- 6.12 -> DC O2 E0010 : score 1.919 : x : LYS xxxx D0098 <- 3.79 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0177 <- 4.36 -> DC xxx E0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0269 <- 3.90 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0270 <- 3.76 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >7lpi_D:DNase_I-like; title=APE1 PHOSPHOROTHIOATE SUBSTRATE COMPLEX WITH ABASIC RIBONUCLEOTIDE DNA organism=Homo sapiens : w : ASP OD2 D0070 <- 5.46 -> DC O2 C0013 : score 1.919 : w : GLU OE2 D0096 <- 6.10 -> DG N2 E0009 : score 1.976 : w : LYS NZ D0098 <- 6.12 -> DG N2 E0009 : score 0.846 : x : ARG xxxx D0177 <- 3.47 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0229 <- 3.13 -> DC xxx E0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0269 <- 4.09 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0270 <- 3.31 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx >7lpj_D:DNase_I-like; title=APE1 MN-BOUND PHOSPHOROTHIOATE SUBSTRATE COMPLEX WITH ABASIC RIBONUCLEOTIDE DNA organism=Homo sapiens : w : ASP OD1 D0070 <- 5.77 -> DC O2 C0013 : score 1.919 : w : ASP OD2 D0070 <- 5.55 -> DC O2 C0013 : score 1.919 : x : ARG xxxx D0177 <- 2.96 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0229 <- 3.22 -> DC xxx E0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0269 <- 4.43 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0270 <- 2.90 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx >7lri_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA, DTTP, AND CA(2+) ION organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 3.14 -> DG N2 E0033 : score 4.55724 : H : TYR OH A0183 <- 2.68 -> DG N3 E0033 : score 3.18884 : x : PHE xxxx A0061 <- 3.50 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0063 <- 4.37 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.44 -> DA xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.21 -> DG xxx E0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.59 -> DG xxx E0034 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.03 -> DC xxx E0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.53 -> DG xxx E0034 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 3.83 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx >7lri_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA, DTTP, AND CA(2+) ION organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH C0183 <- 2.99 -> DG N2 F0033 : score 4.70393 : H : TYR OH C0183 <- 2.74 -> DG N3 F0033 : score 3.15147 : x : PHE xxxx C0061 <- 3.98 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0074 <- 3.66 -> DA xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0094 <- 3.19 -> DG xxx F0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 3.47 -> DG xxx F0034 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.33 -> DC xxx F0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 4.25 -> DG xxx F0034 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 3.70 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx >7lrm_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA, DCTP, AND CA(2+) ION organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.98 -> DG N2 E0032 : score 4.71371 : H : TYR OH A0183 <- 2.69 -> DG N3 E0032 : score 3.18261 : x : PHE xxxx A0061 <- 3.87 -> DG xxx E0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.37 -> DG xxx E0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.34 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.68 -> DG xxx E0033 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0151 <- 3.72 -> DG xxx E0000 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.73 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.69 -> DG xxx E0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 3.96 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.17 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.13 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0501 <- 3.49 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx >7lrm_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA, DCTP, AND CA(2+) ION organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH C0183 <- 2.77 -> DG N3 F0032 : score 3.13279 : w : GLN NE2 C0475 <- 5.58 -> DG N3 F0019 : score 1.484 : x : PHE xxxx C0061 <- 3.52 -> DG xxx F0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0074 <- 3.49 -> DG xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0094 <- 3.43 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 3.02 -> DG xxx F0033 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0151 <- 3.19 -> DG xxx F0000 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 3.55 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.56 -> DG xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.17 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 4.11 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0501 <- 3.34 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx >7lrx_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA, L-DCTP, AND CA(2+) ION organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 3.25 -> DG N2 E0032 : score 4.44967 : H : TYR OH A0183 <- 2.90 -> DG N3 E0032 : score 3.05182 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.33 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.63 -> DG xxx E0033 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.56 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.22 -> DG xxx E0032 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 3.69 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.89 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx >7lrx_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA, L-DCTP, AND CA(2+) ION organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH C0183 <- 2.95 -> DG N3 F0032 : score 3.02068 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.58 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 4.00 -> DG xxx F0033 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 3.77 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 3.89 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 4.16 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx >7lry_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA, (-)FTC- TP, AND CA(2+) ION organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.83 -> DG N2 E0032 : score 4.8604 : H : TYR OH A0183 <- 2.36 -> DG N3 E0032 : score 3.38814 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.18 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 4.00 -> DG xxx E0033 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.53 -> DC xxx E0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.97 -> DG xxx E0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.07 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.97 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx >7lry_C:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA, (-)FTC- TP, AND CA(2+) ION organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH C0183 <- 3.05 -> DG N2 F0032 : score 4.64526 : H : TYR OH C0183 <- 2.66 -> DG N3 F0032 : score 3.2013 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.15 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 3.77 -> DG xxx F0033 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 3.76 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.61 -> DG xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.29 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 4.09 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx >7lry_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA, (-)FTC- TP, AND CA(2+) ION organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH C0183 <- 3.05 -> DG N2 F0032 : score 4.64526 : H : TYR OH C0183 <- 2.66 -> DG N3 F0032 : score 3.2013 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.15 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 3.77 -> DG xxx F0033 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 3.76 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.61 -> DG xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 4.29 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 4.09 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx >7lsk_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA, L-DTTP, AND CA(2+) ION organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH A0183 <- 2.68 -> DG N3 E0033 : score 3.18884 : w : TYR OH A0183 <- 5.24 -> DG N2 E0033 : score 2.834 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.33 -> DG xxx E0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 3.31 -> DG xxx E0034 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.83 -> DC xxx E0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.25 -> DG xxx E0034 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 3.96 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx >7lsk_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DNA, L-DTTP, AND CA(2+) ION organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 : H : TYR OH C0115 <- 3.13 -> DG N2 F0034 : score 4.56702 : H : TYR OH C0183 <- 2.78 -> DG N3 F0033 : score 3.12656 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.21 -> DG xxx F0032 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.09 -> DG xxx F0034 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 4.16 -> DG xxx F0034 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0265 <- 3.87 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx >7lsy_AB: title=NHEJ SHORT-RANGE SYNAPTIC COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0271 <- 3.35 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0400 <- 3.81 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx >7lsy_JY: title=NHEJ SHORT-RANGE SYNAPTIC COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : SER xxxx J0033 <- 2.89 -> DC xxx V0001 : score x.xxxxx >7lsy_K:SPOC_domain-like;vWA-like; title=NHEJ SHORT-RANGE SYNAPTIC COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx K0271 <- 3.40 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx >7lt3_ABC: title=NHEJ LONG-RANGE SYNAPTIC COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0400 <- 3.11 -> DT xxx E0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C2736 <- 2.92 -> DA xxx D0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C2740 <- 4.13 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C2744 <- 3.86 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx >7lt3_JKL: title=NHEJ LONG-RANGE SYNAPTIC COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx K0400 <- 3.11 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L2736 <- 2.93 -> DA xxx M0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L2740 <- 4.13 -> DG xxx N0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx L2744 <- 3.86 -> DG xxx N0001 : score x.xxxxx >7lt5_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND COFACTOR SAH organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.21 -> DA N3 d0006 : score 3.89797 : H : LYS NZ A0172 <- 2.70 -> DT O2 e0009 : score 3.65892 : H : LYS NZ A0193 <- 3.41 -> DG N3 e0012 : score 1.27648 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.06 -> DA N7 d0005 : score 5.77308 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.98 -> DG N7 e0012 : score 5.8322 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.94 -> DG O6 e0012 : score 6.4152 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.87 -> DT O4 e0011 : score 4.74038 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.18 -> DA N7 d0004 : score 2.36568 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.23 -> DA N7 d0004 : score 1.52802 : H : SER OG A0514 <- 2.96 -> DA N6 d0007 : score 3.18447 : H : TYR OH A0521 <- 2.99 -> DA N7 d0006 : score 3.99353 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.72 -> DT C7 e0010 : score 7.23311 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.41 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 2.92 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.20 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.05 -> DG xxx e0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.89 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.67 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0255 <- 4.01 -> DG xxx e0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.87 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.09 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.16 -> DT xxx e0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0426 <- 4.25 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 4.02 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.50 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0455 <- 3.05 -> DT xxx e0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.57 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.28 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0473 <- 3.11 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 4.01 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.23 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.52 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.57 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 3.99 -> DT xxx e0014 : score x.xxxxx >7lt5_C:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND COFACTOR SAH organism=Clostridioides difficile : H : LYS NZ C0172 <- 2.64 -> DT O2 g0023 : score 3.70197 : H : LYS NZ C0172 <- 3.01 -> DT O2 g0024 : score 3.43652 : H : ARG NH1 C0425 <- 3.04 -> DG N7 g0027 : score 5.7596 : H : ARG NH2 C0425 <- 2.88 -> DG O6 g0027 : score 6.4944 : H : TRP NE1 C0439 <- 2.87 -> DT O4 g0026 : score 4.74038 : V : TYR CZ C0455 <- 3.85 -> DT C7 g0023 : score 5.50974 : V : ILE CG2 C0349 <- 3.86 -> DT C7 g0025 : score 6.98491 >7luf_B:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HSV1 POLYMERASE TERNARY COMPLEX WITH DSDNA AND PNU-183792 organism=Human herpesvirus 1 : H : LYS NZ B0939 <- 2.90 -> DA N3 E-007 : score 2.72138 : H : ARG NH1 B0959 <- 2.79 -> DC O2 F-003 : score 3.6573 : H : ARG NH1 B0959 <- 2.48 -> DC O2 F-002 : score 3.8836 : H : ARG NH2 B0959 <- 2.63 -> DC O2 F-003 : score 3.82447 : x : ARG xxxx B0692 <- 3.15 -> DG xxx E-006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0940 <- 4.36 -> DG xxx E-005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B1046 <- 4.03 -> DC xxx F-005 : score x.xxxxx >7lv8_ABCDEFGH:Histone-fold; title=STRUCTURE OF THE MARSEILLEVIRUS NUCLEOSOME organism=MARSEILLEVIRUS MARSEILLEVIRUS : x : ARG xxxx A0114 <- 3.15 -> DA xxx J-015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0136 <- 4.35 -> DG xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0114 <- 3.21 -> DA xxx J0017 : score x.xxxxx >7lv8_C:Histone-fold; title=STRUCTURE OF THE MARSEILLEVIRUS NUCLEOSOME organism=MARSEILLEVIRUS MARSEILLEVIRUS : x : ARG xxxx C0136 <- 4.35 -> DG xxx I0038 : score x.xxxxx >7lv9_A:Histone-fold; title=MARSEILLEVIRUS HETEROTRIMERIC (HEXAMERIC) NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx A0114 <- 3.21 -> DA xxx G0017 : score x.xxxxx >7lv9_ABCDEF:Histone-fold; title=MARSEILLEVIRUS HETEROTRIMERIC (HEXAMERIC) NUCLEOSOME organism=MARSEILLEVIRUS MARSEILLEVIRUS : x : ARG xxxx A0114 <- 3.21 -> DA xxx G0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0114 <- 3.15 -> DA xxx G-015 : score x.xxxxx >7lvv_AC:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYOEM STRUCTURE DRDV-DNA COMPLEX organism=DEINOCOCCUS WULUMUQIENSIS : H : LYS NZ A0488 <- 2.93 -> DT O2 E0008 : score 3.49391 : H : LYS NZ A0488 <- 3.02 -> DG N3 E0009 : score 1.38988 : H : ARG NE A0554 <- 3.09 -> DG N7 F0017 : score 4.16533 : H : ARG NE A0554 <- 3.09 -> DG N7 F0017 : score 4.16533 : H : ARG NH2 A0554 <- 3.43 -> DG O6 F0017 : score 5.7684 : H : ARG NH2 A0554 <- 3.43 -> DG O6 F0017 : score 5.7684 : H : TYR OH A0764 <- 2.74 -> DA N7 E0007 : score 4.2011 : H : ARG NH2 C0062 <- 3.10 -> DG N3 F0007 : score 3.39364 : V : ARG CB A0721 <- 3.65 -> DT C7 F0022 : score 1.04282 : x : PHE xxxx A0304 <- 3.64 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0448 <- 3.37 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0450 <- 4.37 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0451 <- 3.47 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0454 <- 4.41 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0485 <- 3.18 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0486 <- 3.41 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0547 <- 3.69 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0548 <- 3.61 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0560 <- 4.38 -> DC xxx E0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0562 <- 3.57 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0564 <- 2.99 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0566 <- 3.31 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0567 <- 3.55 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0671 <- 3.91 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0673 <- 3.49 -> DA xxx F0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0761 <- 3.45 -> DT xxx F0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0762 <- 2.70 -> DC xxx E0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0802 <- 3.75 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0803 <- 3.35 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx >7lvv_BD:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYOEM STRUCTURE DRDV-DNA COMPLEX organism=DEINOCOCCUS WULUMUQIENSIS : H : GLN OE1 B0485 <- 2.83 -> DG N2 H0024 : score 5.57405 : H : LYS NZ B0486 <- 2.70 -> DT O2 H0022 : score 3.65892 : H : LYS NZ B0488 <- 3.04 -> DT O2 G0008 : score 3.41499 : H : ARG NE B0554 <- 3.14 -> DG N7 H0017 : score 4.12111 : H : ARG NE B0554 <- 3.14 -> DG N7 H0017 : score 4.12111 : H : ARG NH2 B0554 <- 3.28 -> DG O6 H0017 : score 5.9664 : H : ARG NH2 B0554 <- 3.28 -> DG O6 H0017 : score 5.9664 : H : ARG NH1 B0721 <- 3.35 -> DG N7 H0023 : score 5.3845 : H : TYR OH B0764 <- 2.83 -> DA N7 G0007 : score 4.12637 : H : LYS NZ B0807 <- 2.79 -> DG N7 G0009 : score 5.39667 : V : LEU CD2 B0668 <- 3.74 -> DT C7 G0008 : score 5.81725 : x : PHE xxxx B0304 <- 3.68 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0448 <- 3.18 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0450 <- 3.96 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0451 <- 3.52 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0547 <- 3.46 -> DG xxx H0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0548 <- 3.28 -> DT xxx H0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0562 <- 3.57 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0564 <- 3.77 -> DC xxx G0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0566 <- 3.36 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0567 <- 3.55 -> DC xxx G0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0673 <- 4.12 -> DA xxx H0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0720 <- 4.34 -> DT xxx H0022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0761 <- 3.59 -> DT xxx H0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0762 <- 3.55 -> DC xxx G0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0802 <- 3.68 -> DC xxx H0020 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0803 <- 2.73 -> DC xxx H0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0062 <- 3.84 -> DG xxx H0007 : score x.xxxxx >7lvv_C: title=CRYOEM STRUCTURE DRDV-DNA COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 C0062 <- 3.10 -> DG N3 F0007 : score 3.39364 >7lw8_A: title=HUMAN EXONUCLEASE 5 CRYSTAL STRUCTURE IN COMPLEX WITH A SSDNA organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 A0210 <- 2.89 -> DT N3 B0010 : score 3.35265 : H : LYS NZ A0213 <- 2.50 -> DT O4 B0009 : score 3.80241 : w : ARG NE A0344 <- 5.40 -> DT O4 B0012 : score 1.317 : H : THR OG1 A0345 <- 3.42 -> DT O2 B0011 : score 2.37755 : V : LEU CD2 A0078 <- 3.67 -> DT C7 B0004 : score 5.91755 : V : LYS CE A0198 <- 3.71 -> DT C7 B0009 : score 2.65955 : V : MET CE A0204 <- 3.51 -> DT C7 B0011 : score 7.4327 : x : LYS xxxx A0079 <- 4.35 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0080 <- 3.94 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0082 <- 3.17 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0084 <- 4.47 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0091 <- 3.01 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0095 <- 4.22 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0100 <- 4.17 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0202 <- 3.32 -> DT xxx B0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0207 <- 3.10 -> DT xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0214 <- 3.91 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx >7lxh_A:ARM_repeat; title=BACILLUS CEREUS DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO A CC1065-ADENINE NUCLEOBASE ADDUCT AND DNA CONTAINING AN ABASIC SITE organism=Bacillus cereus : H : TYR OH A0027 <- 2.79 -> DG N3 B0007 : score 3.12033 >7lxj_A:ARM_repeat; title=BACILLUS CEREUS DNA GLYCOSYLASE ALKD BOUND TO A DUOCARMYCIN SA- ADENINE NUCLEOBASE ADDUCT AND DNA CONTAINING AN ABASIC SITE organism=Bacillus cereus : H : TYR OH A0027 <- 2.77 -> DG N3 B0007 : score 3.13279 >7lya_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH LINKED HISTONE PROTEINS H2A AND H2B organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.34 -> DT O2 J0009 : score 4.6228 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.75 -> DG N3 I0009 : score 3.64636 : x : ARG xxxx A0083 <- 4.36 -> DG xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0029 <- 4.42 -> DA xxx I0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.89 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.92 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx >7lyb_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE IN COMPLEX WITH BRCA1-BARD1-UBCH5C organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 D0029 <- 2.44 -> DT O2 I0030 : score 4.61647 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.66 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.50 -> DT xxx J-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.24 -> DG xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.21 -> DT xxx I-047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.49 -> DG xxx J-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.02 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.53 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx >7lyb_G:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE IN COMPLEX WITH BRCA1-BARD1-UBCH5C organism=? : x : ARG xxxx G0042 <- 3.53 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx >7lyc_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE UBIQUITYLATED AT HISTONE H2A LYS13 AND LYS15 IN COMPLEX WITH BARD1 (RESIDUES 415- 777) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 A0040 <- 2.21 -> DT O2 J0009 : score 4.73287 : H : ARG NH2 D0029 <- 3.08 -> DT O2 J-029 : score 3.99627 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.45 -> DG N3 I0009 : score 3.86297 : x : ARG xxxx A0083 <- 3.84 -> DG xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 4.35 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.99 -> DT xxx I-047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.62 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 4.25 -> DC xxx J-047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.32 -> DC xxx I0037 : score x.xxxxx >7lyc_G:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE UBIQUITYLATED AT HISTONE H2A LYS13 AND LYS15 IN COMPLEX WITH BARD1 (RESIDUES 415- 777) organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx G0042 <- 4.32 -> DC xxx I0037 : score x.xxxxx >7lys_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CASPHI-2 (CAS12J) BOUND TO CRRNA AND DNA organism=BIGGIEVIRUS MOS11 : H : LYS NZ A0033 <- 3.11 -> DA N3 C0002 : score 2.60475 : H : GLN NE2 A0127 <- 3.02 -> DG N7 D-003 : score 4.01397 : H : GLN OE1 A0202 <- 2.93 -> DA N6 C0002 : score 5.8952 : V : LEU CD2 A0131 <- 3.70 -> DT C7 C0000 : score 5.87456 : x : LYS xxxx A0029 <- 2.94 -> DT xxx C0000 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0104 <- 4.06 -> DT xxx D-001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0126 <- 4.04 -> DT xxx D-002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0130 <- 3.71 -> DT xxx D-001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0203 <- 3.77 -> DA xxx D-004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0342 <- 3.83 -> DT xxx C0000 : score x.xxxxx >7lyt_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CASPHI-2 (CAS12J) BOUND TO CRRNA AND PHOSPHOROTHIOATE-DNA organism=BIGGIEVIRUS MOS11 : H : LYS NZ A0033 <- 3.18 -> DT O2 D-001 : score 3.31455 : H : GLN NE2 A0127 <- 3.25 -> DT O4 D-002 : score 4.72383 : H : GLN OE1 A0202 <- 2.96 -> DA N6 C0002 : score 5.85888 : H : GLN NE2 A0202 <- 2.68 -> DA N7 C0002 : score 6.2359 : x : LYS xxxx A0029 <- 3.46 -> DT xxx C0000 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0104 <- 4.25 -> DT xxx D-001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0126 <- 3.62 -> DT xxx D-002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0131 <- 3.99 -> DT xxx C0000 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0203 <- 3.60 -> DA xxx D-004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0342 <- 3.86 -> DT xxx C0000 : score x.xxxxx >7m08_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=POST-CATALYTIC NICKED COMPLEX OF DNA POLYMERASE LAMBDA WITH BOUND 1- NT GAPPED SSB SUBSTRATE AND INCOMING DUMPNPP organism=HOMO SAPIENS : w : GLN NE2 A0372 <- 5.84 -> DC O2 T0009 : score 2.699 : w : LYS NZ A0472 <- 5.56 -> DA N3 P0005 : score 1.538 : H : TYR OH A0505 <- 2.67 -> DC O2 P0006 : score 3.58837 : H : ASN ND2 A0513 <- 2.96 -> DT O2 P0007 : score 4.59428 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.04 -> DG N3 T0006 : score 2.90604 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.61 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.52 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >7m0a_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=INCOMPLETE IN CRYSTALLO INCORPORATION BY DNA POLYMERASE LAMBDA BOUND TO BLUNT-ENDED DSB SUBSTRATE AND INCOMING DTTP organism=HOMO SAPIENS : w : GLN NE2 A0372 <- 6.36 -> DC O2 U0004 : score 2.699 : H : LYS NZ A0472 <- 2.99 -> DA N3 U0003 : score 2.6714 : w : LYS NZ A0472 <- 6.18 -> DG N2 P0005 : score 0.846 : w : LYS NZ A0472 <- 6.21 -> DC O2 U0002 : score 1.3 : w : LYS NZ A0472 <- 6.18 -> DG N3 P0005 : score 2.232 : H : TYR OH A0505 <- 2.57 -> DC O2 P0006 : score 3.65832 : H : ASN ND2 A0513 <- 3.04 -> DT O2 P0007 : score 4.51834 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.11 -> DA N3 T0005 : score 3.45376 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.07 -> DG N3 U0001 : score 2.88773 : w : ARG NH1 A0517 <- 5.86 -> DG N3 U0001 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0517 <- 5.99 -> DG N3 U0001 : score 0.677 : w : GLU OE1 A0529 <- 5.47 -> DG N3 U0001 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0529 <- 6.17 -> DC O2 U0002 : score 1.988 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.61 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.55 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >7m0b_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=PRE-CATALYTIC QUATERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE LAMBDA WITH BOUND MISMATCHED DSB AND INCOMING DUMPNPP organism=HOMO SAPIENS : w : GLN NE2 A0372 <- 6.10 -> DC O2 t0009 : score 2.699 : H : LYS NZ A0472 <- 3.33 -> DA N3 t0008 : score 2.48257 : w : LYS NZ A0472 <- 5.78 -> DG N2 p0005 : score 0.846 : H : TYR OH A0505 <- 2.66 -> DC O2 p0006 : score 3.59536 : w : TYR OH A0505 <- 6.86 -> DT O2 t0007 : score 3.068 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.00 -> DG N3 t0006 : score 2.93046 : w : ARG NH1 A0517 <- 6.45 -> DG N3 t0006 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0517 <- 6.21 -> DG N3 t0006 : score 0.677 : w : GLU OE1 A0529 <- 5.80 -> DG N3 t0006 : score 2.669 : w : GLU OE1 A0529 <- 6.27 -> DT O2 t0007 : score 2.462 >7m0c_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=POST-CATALYTIC NICKED COMPLEX OF DNA POLYMERASE LAMBDA WITH BOUND MISMATCHED DSB SUBSTRATE organism=HOMO SAPIENS : H : TYR OH A0505 <- 2.53 -> DC O2 P0006 : score 3.6863 : H : ASN ND2 A0513 <- 2.98 -> DT O2 P0007 : score 4.57529 : H : ARG NH1 A0517 <- 2.97 -> DA N3 T0005 : score 3.55686 : H : ARG NH1 A0517 <- 2.95 -> DG N3 T0006 : score 2.96099 : x : LYS xxxx A0472 <- 3.23 -> DA xxx U0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0510 <- 3.60 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.53 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0529 <- 3.79 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >7m0d_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=PRE-CATALYTIC QUATERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE LAMBDA WITH BOUND COMPLEMENTARY DSB SUBSTRATE AND INCOMING DUMPNPP organism=HOMO SAPIENS : w : GLN OE1 A0372 <- 6.49 -> DG N2 f0003 : score 2.177 : w : GLN NE2 A0372 <- 5.84 -> DC O2 e0009 : score 2.699 : w : LYS NZ A0472 <- 5.86 -> DG N2 f0005 : score 0.846 : w : LYS NZ A0472 <- 5.79 -> DA N3 e0008 : score 1.538 : H : TYR OH A0505 <- 2.66 -> DC O2 f0006 : score 3.59536 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.04 -> DG N3 e0006 : score 2.90604 : x : GLU xxxx A0529 <- 3.43 -> DG xxx e0006 : score x.xxxxx >7m1x_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NUCLEOSOME CONTAINING MOUSE HISTONE VARIANT H2A.Z organism=XENOPUS LAEVIS / MUS MUSCULUS : x : ARG xxxx B0045 <- 4.32 -> DC xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0845 <- 3.78 -> DT xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0683 <- 3.93 -> DG xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0245 <- 4.20 -> DC xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G1045 <- 4.04 -> DG xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H1430 <- 4.12 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >7m2u_5A: title=NUCLEOTIDE EXCISION REPAIR COMPLEX TFIIH RAD4-33 organism=? : x : ASN xxxx A0554 <- 2.81 -> DA xxx W0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0556 <- 3.63 -> DA xxx W0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0558 <- 3.81 -> DA xxx W0017 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0560 <- 2.92 -> DA xxx W0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0594 <- 3.62 -> DA xxx W0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0597 <- 3.29 -> DA xxx W0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0599 <- 3.76 -> DA xxx W0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0607 <- 3.33 -> DA xxx W0017 : score x.xxxxx >7m46_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE LAMBDA, TTP:AT MG2+ PRODUCT STATE TERNARY COMPLEX, 5 MIN organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 A0372 <- 6.12 -> DC O2 T0009 : score 2.699 : w : LYS NZ A0472 <- 5.58 -> DT O2 T0007 : score 0.522 : w : LYS NZ A0472 <- 5.75 -> DA N3 P0005 : score 1.538 : w : LYS NZ A0472 <- 6.05 -> DA N3 T0008 : score 1.538 : H : TYR OH A0505 <- 2.66 -> DC O2 P0006 : score 3.59536 : H : ASN ND2 A0513 <- 3.04 -> DT O2 P0007 : score 4.51834 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.04 -> DG N3 T0006 : score 2.90604 : H : GLU OE2 A0529 <- 3.16 -> DG N2 T0006 : score 3.99992 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.63 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.47 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >7m47_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE LAMBDA, TTP:AT MG2+ PRODUCT STATE TERNARY COMPLEX, 60 MIN organism=? : w : GLN NE2 A0372 <- 6.10 -> DC O2 T0009 : score 2.699 : w : LYS NZ A0472 <- 6.17 -> DA N3 T0008 : score 1.538 : w : LYS NZ A0472 <- 5.81 -> DA N3 P0005 : score 1.538 : H : TYR OH A0505 <- 2.69 -> DC O2 P0006 : score 3.57438 : H : ASN ND2 A0513 <- 2.94 -> DT O2 P0007 : score 4.61326 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.03 -> DG N3 T0006 : score 2.91215 : w : ARG NH1 A0517 <- 5.82 -> DG N2 T0006 : score 1.082 : w : ARG NH2 A0517 <- 6.07 -> DG N2 T0006 : score 1.593 : w : GLU OE1 A0529 <- 5.42 -> DG N3 T0006 : score 2.669 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.64 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.44 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >7m48_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE LAMBDA, TTP:AT MG2+ PRODUCT STATE TERNARY COMPLEX, 960 MIN organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 A0372 <- 6.16 -> DC O2 T0009 : score 2.699 : w : LYS NZ A0472 <- 5.79 -> DA N3 T0008 : score 1.538 : w : LYS NZ A0472 <- 5.73 -> DA N3 P0005 : score 1.538 : H : TYR OH A0505 <- 2.58 -> DC O2 P0006 : score 3.65132 : H : ASN ND2 A0513 <- 3.01 -> DT O2 P0007 : score 4.54682 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.19 -> DA N3 T0005 : score 3.39485 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.03 -> DG N3 T0006 : score 2.91215 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.62 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.37 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >7m4a_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE LAMBDA, TTP:AT MN2+ PRODUCT STATE TERNARY COMPLEX, 20 MIN organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 A0372 <- 6.10 -> DC O2 T0009 : score 2.699 : H : TYR OH A0505 <- 2.75 -> DC O2 P0006 : score 3.53241 : H : ASN ND2 A0513 <- 2.96 -> DT O2 P0007 : score 4.59428 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.06 -> DG N3 T0006 : score 2.89383 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.73 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.43 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0529 <- 3.41 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >7m4b_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE LAMBDA, TTP:AT MN2+ PRODUCT STATE TERNARY COMPLEX, 60 MIN organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 A0372 <- 5.91 -> DC O2 T0009 : score 2.699 : w : LYS NZ A0472 <- 5.97 -> DA N3 T0008 : score 1.538 : w : LYS NZ A0472 <- 5.73 -> DA N3 P0005 : score 1.538 : H : TYR OH A0505 <- 2.72 -> DC O2 P0006 : score 3.55339 : H : ASN ND2 A0513 <- 2.94 -> DT O2 P0007 : score 4.61326 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.15 -> DA N3 T0005 : score 3.42431 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.02 -> DG N3 T0006 : score 2.91825 : H : GLU OE2 A0529 <- 3.28 -> DG N2 T0006 : score 3.89647 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.65 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.44 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >7m4c_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE LAMBDA, TTP:AT MN2+ PRODUCT STATE TERNARY COMPLEX, 960 MIN organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 A0372 <- 5.99 -> DC O2 T0009 : score 2.699 : w : LYS NZ A0472 <- 5.67 -> DA N3 P0005 : score 1.538 : H : TYR OH A0505 <- 2.73 -> DC O2 P0006 : score 3.5464 : H : ASN ND2 A0513 <- 2.99 -> DT O2 P0007 : score 4.5658 : H : ARG NH1 A0517 <- 2.95 -> DG N3 T0006 : score 2.96099 : H : GLU OE2 A0529 <- 3.22 -> DG N2 T0006 : score 3.94819 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.69 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 3.49 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >7m4f_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE LAMBDA, DCTP:AT MG2+ PRODUCT STATE TERNARY COMPLEX, 300 MIN organism=Homo sapiens : w : GLN OE1 A0372 <- 6.75 -> DT O2 T0010 : score 2.481 : w : GLN NE2 A0372 <- 6.10 -> DC O2 T0009 : score 2.699 : w : LYS NZ A0472 <- 5.82 -> DA N3 P0005 : score 1.538 : w : LYS NZ A0472 <- 5.64 -> DT O2 T0007 : score 0.522 : H : TYR OH A0505 <- 3.10 -> DC O2 P0006 : score 3.28759 : H : ASN ND2 A0513 <- 3.08 -> DC O2 P0007 : score 4.22864 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.67 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0517 <- 3.46 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0529 <- 3.61 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >7m4g_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE LAMBDA, DCTP:AT MG2+ PRODUCT STATE TERNARY COMPLEX, 960 MIN organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 A0372 <- 6.12 -> DC O2 T0009 : score 2.699 : H : ASN ND2 A0513 <- 3.18 -> DC O2 P0007 : score 4.13905 : H : GLU OE1 A0529 <- 3.36 -> DG N2 T0006 : score 3.82751 A : x : TYR xxxx A0505 <- 2.83 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0510 <- 3.58 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 4.31 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0517 <- 3.36 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx >7m4i_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE LAMBDA, DCTP:AT MN2+ PRODUCT STATE TERNARY COMPLEX, 420 MIN organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0505 <- 3.03 -> DC O2 P0006 : score 3.33655 : H : ASN ND2 A0513 <- 3.03 -> DC O2 P0007 : score 4.27343 : w : ARG NH2 A0514 <- 5.61 -> DA N7 T0005 : score 1.486 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.66 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0517 <- 3.41 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0529 <- 3.55 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >7m4j_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE LAMBDA, DCTP:AT MN2+ PRODUCT STATE TERNARY COMPLEX, 960 MIN organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 A0372 <- 5.87 -> DC O2 T0009 : score 2.699 : H : TYR OH A0505 <- 2.91 -> DC O2 P0006 : score 3.42049 : H : ASN ND2 A0513 <- 2.91 -> DC O2 P0007 : score 4.38094 : x : ALA xxxx A0510 <- 3.73 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0514 <- 4.34 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0517 <- 3.12 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0529 <- 3.83 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >7m5w_A:HMG-box; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HMG-C1 DOMAIN OF HUMAN CAPICUA BOUND TO DNA organism=HOMO SAPIENS : H : ASN ND2 A0039 <- 2.85 -> DT O2 C0011 : score 4.69869 : H : ASN ND2 A0039 <- 2.95 -> DC O2 C0012 : score 4.3451 : H : ASN ND2 A0061 <- 2.86 -> DT O2 B0010 : score 4.6892 : H : ASN ND2 A0061 <- 2.64 -> DG N3 B0011 : score 5.05151 : H : ARG NH1 A0062 <- 2.74 -> DT O2 C0007 : score 4.35809 : H : SER OG A0065 <- 2.82 -> DA N3 C0009 : score 2.99183 : w : TRP NE1 A0103 <- 5.90 -> DT O2 C0014 : score 4.848 : x : ARG xxxx A0036 <- 3.39 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0041 <- 3.51 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0042 <- 3.35 -> DA xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0049 <- 3.04 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0105 <- 3.85 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0168 <- 4.37 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0171 <- 3.47 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0172 <- 4.02 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0175 <- 3.53 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx >7m7l_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA WITH DA-ENDED PRIMER AND DAMPNPP organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 A0256 <- 6.48 -> DG N2 T0008 : score 1.593 A : H : ARG NH1 A0382 <- 3.39 -> DG O6 P0005 : score 5.3655 A : H : ARG NH2 A0382 <- 2.74 -> DG N7 P0005 : score 6.46123 A : x : SER xxxx A0322 <- 4.03 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.33 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0421 <- 4.01 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >7m7m_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA WITH RA-ENDED PRIMER AND DAMPNPP organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 2.98 -> DT O2 T0005 : score 3.79173 : w : GLN OE1 A0038 <- 6.00 -> DT O2 T0005 : score 2.481 : x : TRP xxxx A0042 <- 3.32 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 4.03 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 4.39 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.47 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0326 <- 3.63 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0329 <- 3.55 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx >7m7n_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA WITH 2'-FA-ENDED PRIMER AND DAMPNPP organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.37 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 4.17 -> DC xxx P0004 : score x.xxxxx >7m7o_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA WITH DT-ENDED PRIMER AND 0.1 MM DAMPNPP organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 3.83 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.16 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 4.11 -> DC xxx P0004 : score x.xxxxx >7m7p_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA S113A WITH DA-ENDED PRIMER AND DAMPNPP organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0382 <- 2.80 -> DG N7 P0005 : score 6.38462 : x : SER xxxx A0322 <- 3.93 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.07 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.40 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0421 <- 3.93 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >7m7q_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA S113A WITH DT-ENDED PRIMER AND DAMPNPP organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 A0382 <- 5.42 -> DT O4 P0006 : score 2.366 : x : SER xxxx A0322 <- 3.88 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.47 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >7m7r_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA S113A WITH RA-ENDED PRIMER AND DAMPNPP organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 3.12 -> DT O2 T0005 : score 3.6816 : w : GLN OE1 A0038 <- 5.73 -> DT O2 T0005 : score 2.481 : x : TRP xxxx A0042 <- 3.43 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 4.07 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.82 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0062 <- 3.22 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 4.18 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.04 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0326 <- 3.64 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0329 <- 3.26 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.64 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >7m7s_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA S113A WITH DT-ENDED PRIMER AND 0.1 MM DAMPNPP organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0324 <- 6.13 -> DA N7 T0006 : score 1.989 : H : ARG NH1 A0382 <- 2.99 -> DG O6 P0005 : score 5.85217 : H : ARG NH2 A0382 <- 2.96 -> DG N7 P0005 : score 6.18031 : x : ARG xxxx A0061 <- 3.62 -> DT xxx P0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.93 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.56 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.16 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx >7m7t_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA S113A WITH DT-ENDED PRIMER AND DATP: IN CRYSTALLO REACTION FOR 0 S organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0382 <- 6.19 -> DG N7 P0002 : score 2.063 : w : ARG NH2 A0382 <- 5.80 -> DG N7 P0002 : score 2.18 : x : SER xxxx A0322 <- 4.00 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 4.42 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >7m7u_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA S113A WITH DT-ENDED PRIMER AND DATP: IN CRYSTALLO REACTION FOR 480S organism=Homo sapiens : w : ARG NH1 A0382 <- 5.89 -> DG N7 P0002 : score 2.063 : w : ARG NH2 A0382 <- 6.31 -> DG N7 P0002 : score 2.18 : x : ARG xxxx A0061 <- 3.99 -> DT xxx P0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.93 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 4.43 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >7m7y_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA WITH DA-ENDED PRIMER AND DATP: IN CRYSTALLO REACTION FOR 0 S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.32 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.34 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.48 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >7m7z_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA WITH DA-ENDED PRIMER AND DATP: IN CRYSTALLO REACTION FOR 40 S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.29 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.37 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.80 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >7m80_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA WITH DA-ENDED PRIMER AND DATP: IN CRYSTALLO REACTION FOR 100 S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.22 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.44 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.70 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >7m81_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA WITH DA-ENDED PRIMER AND DATP: IN CRYSTALLO REACTION FOR 100 S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.27 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.35 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 4.22 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >7m82_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA WITH DA-ENDED PRIMER AND DATP: IN CRYSTALLO REACTION FOR 300 S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.20 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.20 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.09 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >7m83_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA S113A WITH DA-ENDED PRIMER AND DATP: IN CRYSTALLO REACTION FOR 0 S organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 2.60 -> DG N7 P0004 : score 6.292 : x : SER xxxx A0322 <- 4.40 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.46 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx >7m84_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA S113A WITH DA-ENDED PRIMER AND DATP: IN CRYSTALLO REACTION FOR 40 S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.36 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 4.41 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >7m85_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA S113A WITH DA-ENDED PRIMER AND DATP: IN CRYSTALLO REACTION FOR 80 S organism=Homo sapiens : w : GLN OE1 A0038 <- 6.47 -> DT O2 T0005 : score 2.481 : x : SER xxxx A0322 <- 4.37 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 4.32 -> DC xxx P0003 : score x.xxxxx >7m86_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA S113A WITH DA-ENDED PRIMER AND DATP: IN CRYSTALLO REACTION FOR 140 S organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 2.95 -> DG N7 P0004 : score 5.8685 : x : SER xxxx A0322 <- 4.24 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.16 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx >7m87_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA S113A WITH DA-ENDED PRIMER AND DATP: IN CRYSTALLO REACTION FOR 230 S organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 2.95 -> DG N7 P0004 : score 5.8685 : x : SER xxxx A0322 <- 4.24 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.16 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx >7m88_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA S113A WITH DA-ENDED PRIMER AND DATP: IN CRYSTALLO REACTION FOR 300 S organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.31 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0421 <- 4.30 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >7m89_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA S113A WITH RA-ENDED PRIMER AND DATP: IN CRYSTALLO REACTION FOR 0 S organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 2.72 -> DT O2 T0004 : score 3.99627 A : V : SER CB A0062 <- 3.67 -> DT C7 T0003 : score 3.23305 : x : TRP xxxx A0042 <- 3.42 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 4.14 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.44 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0064 <- 4.42 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 4.12 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.04 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0326 <- 3.56 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0329 <- 3.70 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx >7m8a_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA S113A WITH RA-ENDED PRIMER AND DATP: IN CRYSTALLO REACTION FOR 40 S organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 2.54 -> DT O2 T0004 : score 4.13787 A : V : SER CB A0062 <- 3.59 -> DT C7 T0003 : score 3.29567 : x : TRP xxxx A0042 <- 3.37 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 4.05 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.03 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0064 <- 4.25 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 4.27 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.26 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0326 <- 3.67 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0329 <- 3.83 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx >7m8b_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA S113A WITH RA-ENDED PRIMER AND DATP: IN CRYSTALLO REACTION FOR 140 S organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 2.51 -> DT O2 T0004 : score 4.16147 A : x : TRP xxxx A0042 <- 3.48 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 4.14 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.04 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0062 <- 3.35 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0064 <- 4.17 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 4.17 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.21 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0326 <- 3.60 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0329 <- 3.80 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx >7m8c_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA S113A WITH RA-ENDED PRIMER AND DATP: IN CRYSTALLO REACTION FOR 230 S organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 2.51 -> DT O2 T0004 : score 4.16147 A : x : TRP xxxx A0042 <- 3.48 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 4.14 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.04 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0062 <- 3.35 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0064 <- 4.17 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 4.17 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.21 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0326 <- 3.60 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0329 <- 3.80 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx >7m8d_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POL ETA S113A WITH RA-ENDED PRIMER AND DATP: IN CRYSTALLO REACTION FOR 300 S organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 2.54 -> DT O2 T0004 : score 4.13787 A : V : SER CB A0062 <- 3.50 -> DT C7 T0003 : score 3.36613 : x : TRP xxxx A0042 <- 3.42 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 3.99 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.00 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0064 <- 4.26 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 4.28 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.30 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0326 <- 3.62 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0329 <- 4.42 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx >7m8e_CD: title=E.COLI RNAP-RAPA ELONGATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : x : GLU xxxx C0541 <- 4.07 -> DC xxx 10078 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.09 -> DC xxx 10078 : score x.xxxxx >7mbm_GHIJKLMN: title=CRYO-EM STRUCTURE OF MLL1-NCP (H3K4M) COMPLEX, MODE01 organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx G0040 <- 2.65 -> DG xxx O0082 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0040 <- 2.81 -> DG xxx O0066 : score x.xxxxx >7mbn_M:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MLL1-NCP (H3K4M) COMPLEX, MODE02 organism=? : x : ARG xxxx M0042 <- 3.35 -> DG xxx P0112 : score x.xxxxx >7mca_ABCDEFI:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Inhibitor_of_apoptosis_IAP_repeat;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE S. CEREVISIAE ORIGIN RECOGNITION COMPLEX BOUND TO THE REPLICATION INITIATOR CDC6 AND THE ARS1 ORIGIN DNA. organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : LYS NZ A0362 <- 3.09 -> DT O2 G0019 : score 3.37912 : H : TYR OH A0372 <- 3.42 -> DA N3 H0071 : score 3.63652 : H : ARG NH2 E0360 <- 2.34 -> DT O2 G0044 : score 4.6228 : V : PHE CZ D0485 <- 3.65 -> DT C7 G0022 : score 7.38168 : V : TYR CB D0486 <- 3.65 -> DT C7 H0060 : score 5.05129 : x : PHE xxxx A0360 <- 3.91 -> DA xxx H0067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0367 <- 3.37 -> DA xxx H0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0254 <- 3.78 -> DT xxx G0038 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0396 <- 3.61 -> DT xxx G0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0489 <- 3.70 -> DT xxx G0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0490 <- 3.19 -> DG xxx H0058 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0344 <- 4.22 -> DC xxx H0047 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0363 <- 3.20 -> DT xxx G0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0366 <- 3.45 -> DG xxx H0046 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0439 <- 3.35 -> DG xxx G0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0276 <- 4.35 -> DA xxx G0046 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0277 <- 4.45 -> DA xxx G0046 : score x.xxxxx >7mcs_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-ELECTRON MICROSCOPY STRUCTURE OF TNSC(1-503)A225V BOUND TO DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 F0207 <- 2.85 -> DC O2 I0014 : score 3.6135 : x : ARG xxxx A0207 <- 3.26 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0207 <- 4.35 -> DC xxx H0005 : score x.xxxxx >7mcs_F:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-ELECTRON MICROSCOPY STRUCTURE OF TNSC(1-503)A225V BOUND TO DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 F0207 <- 2.85 -> DC O2 I0014 : score 3.6135 >7mei_ABabe: title=COMPOSITE STRUCTURE OF EC+EC organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : PHE xxxx a0252 <- 3.31 -> DT xxx O-038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx a0448 <- 4.15 -> DG xxx O-048 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx a0832 <- 3.99 -> DG xxx O-048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a1386 <- 3.58 -> DG xxx N0052 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx b0470 <- 3.65 -> DA xxx N0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0252 <- 3.06 -> DA xxx O-003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0254 <- 3.72 -> DA xxx O-003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0256 <- 4.01 -> DA xxx O-003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.55 -> DT xxx O-012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 3.66 -> DA xxx O-013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 3.62 -> DA xxx O-013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0474 <- 4.35 -> DT xxx N0011 : score x.xxxxx >7mei_a:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=COMPOSITE STRUCTURE OF EC+EC organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : PHE xxxx a0252 <- 3.31 -> DT xxx O-038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx a0448 <- 4.15 -> DG xxx O-048 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx a0832 <- 3.99 -> DG xxx O-048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a1386 <- 3.58 -> DG xxx N0052 : score x.xxxxx >7mga_A:Concanavalin_A-like_lectins/glucanases; title=CONCANAVALIN A BOUND TO A DNA GLYCOCONJUGATE, MAN-AAATTT organism=CANAVALIA ENSIFORMIS : x : HIS xxxx A0205 <- 4.25 -> DA xxx C0001 : score x.xxxxx >7mht_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CYTOSINE-SPECIFIC METHYLTRANSFERASE HHAI/DNA COMPLEX organism=Haemophilus haemolyticus : H : SER OG A0087 <- 3.30 -> DG N3 D0426 : score 2.49462 : H : SER OG A0087 <- 3.30 -> DG N3 D0426 : score 2.49462 : H : GLN OE1 A0237 <- 2.80 -> DG N2 C0408 : score 5.60769 : H : ARG NH1 A0240 <- 3.19 -> DG N7 D0426 : score 5.5781 : H : ARG NH1 A0240 <- 3.19 -> DG N7 D0426 : score 5.5781 : H : ARG NH2 A0240 <- 3.11 -> DG O6 D0426 : score 6.1908 : H : ARG NH2 A0240 <- 3.11 -> DG O6 D0426 : score 6.1908 : x : CYS xxxx A0081 <- 2.94 -> DA xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0086 <- 3.83 -> DA xxx C0410 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0119 <- 2.59 -> DA xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0120 <- 4.17 -> DA xxx D0427 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0121 <- 4.12 -> DA xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0163 <- 3.64 -> DA xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0165 <- 3.42 -> DA xxx D0427 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0228 <- 4.23 -> DT xxx D0425 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0304 <- 3.91 -> DA xxx D0427 : score x.xxxxx >7mi4_ABCDEF: title=SYMMETRICAL PAM-PAM PRESPACER BOUND CAS4/CAS1/CAS2 COMPLEX organism=GEOBACTER SULFURREDUCENS : x : PRO xxxx B0229 <- 4.19 -> DG xxx H0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0230 <- 3.05 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0265 <- 3.67 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0288 <- 4.03 -> DG xxx H0024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0229 <- 4.37 -> DG xxx G0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0230 <- 3.51 -> DG xxx G0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0265 <- 3.11 -> DG xxx G0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0288 <- 4.23 -> DG xxx G0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0014 <- 3.35 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx E0017 <- 3.36 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0018 <- 3.65 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0014 <- 2.80 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0017 <- 3.41 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0018 <- 3.16 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx >7mi5_A: title=ASYMMETRICAL PAM-NON PAM PRESPACER BOUND CAS4/CAS1/CAS2 COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx A0234 <- 4.29 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx >7mi5_ABCDEF: title=ASYMMETRICAL PAM-NON PAM PRESPACER BOUND CAS4/CAS1/CAS2 COMPLEX organism=GEOBACTER SULFURREDUCENS : H : LYS NZ B0230 <- 2.38 -> DC N3 G0003 : score 0.629554 : x : ARG xxxx A0234 <- 4.29 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0245 <- 3.06 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0229 <- 3.76 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0230 <- 2.84 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0265 <- 3.73 -> DC xxx H0003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx E0017 <- 3.45 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0018 <- 3.28 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0014 <- 4.17 -> DA xxx H0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0017 <- 3.59 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0018 <- 3.32 -> DT xxx H0009 : score x.xxxxx >7mi9_ACEF: title=FULL INTEGRATION COMPLEX OF CAS1/CAS2 FROM CAS4-CONTAINING SYSTEM organism=GEOBACTER SULFURREDUCENS : x : ILE xxxx A0214 <- 3.86 -> DC xxx G0058 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0215 <- 3.15 -> DC xxx G0059 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0278 <- 3.35 -> DC xxx G0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0302 <- 4.07 -> DT xxx G0030 : score x.xxxxx >7mi9_BD: title=FULL INTEGRATION COMPLEX OF CAS1/CAS2 FROM CAS4-CONTAINING SYSTEM organism=GEOBACTER SULFURREDUCENS : H : GLU OE2 B0374 <- 2.79 -> DG N2 g0069 : score 4.31888 : H : ARG NE B0469 <- 3.07 -> DT O4 h0028 : score 1.75859 : H : ASN ND2 B0499 <- 2.83 -> DT O4 h0027 : score 5.25291 : H : SER OG D0424 <- 3.05 -> DT O2 g0029 : score 3.51256 : H : ASN OD1 D0499 <- 2.38 -> DT N3 g0029 : score 4.12059 : V : LEU CD1 D0462 <- 3.83 -> DT C7 g0031 : score 5.6883 : x : SER xxxx B0287 <- 2.79 -> DA xxx h0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0288 <- 3.04 -> DG xxx h0023 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0291 <- 3.22 -> DA xxx h0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0377 <- 3.26 -> DG xxx g0069 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0382 <- 3.17 -> DC xxx g0071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0410 <- 3.09 -> DT xxx h0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0412 <- 3.49 -> DT xxx h0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0413 <- 4.40 -> DT xxx h0029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0425 <- 2.72 -> DT xxx h0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0427 <- 2.59 -> DT xxx h0028 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0428 <- 4.45 -> DT xxx h0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0431 <- 3.47 -> DT xxx h0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0454 <- 3.34 -> DA xxx h0032 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0455 <- 3.48 -> DG xxx g0062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0457 <- 3.28 -> DT xxx h0031 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0458 <- 4.35 -> DT xxx h0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0462 <- 3.22 -> DT xxx h0029 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0465 <- 4.05 -> DT xxx h0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0500 <- 4.06 -> DT xxx h0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0505 <- 3.67 -> DT xxx h0027 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0506 <- 3.75 -> DA xxx h0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0230 <- 3.78 -> DG xxx g0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0287 <- 3.02 -> DC xxx g0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0288 <- 3.28 -> DC xxx g0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0291 <- 3.72 -> DT xxx g0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0377 <- 3.00 -> DG xxx h0067 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0415 <- 3.29 -> DT xxx g0029 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0421 <- 4.03 -> DT xxx g0029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0425 <- 3.04 -> DT xxx g0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0454 <- 2.52 -> DC xxx g0033 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0455 <- 3.39 -> DT xxx h0061 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0457 <- 2.49 -> DC xxx g0033 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0458 <- 3.19 -> DT xxx g0031 : score x.xxxxx >7mib_ACDEF: title=HALF INTEGRATION COMPLEX OF CAS4/CAS1/CAS2 WITH CAS4 STILL ON THE NON- PAM SIDE organism=GEOBACTER SULFURREDUCENS : H : ARG NH2 D0505 <- 2.61 -> DT O2 G0027 : score 4.3942 : H : LYS NZ D0506 <- 2.50 -> DT O4 G0027 : score 3.80241 >7mid_ABCD:TTP0101/SSO1404-like; title=SUB-COMPLEX OF CAS4-CAS1-CAS2 BOUND PAM CONTAINING DNA organism=GEOBACTER SULFURREDUCENS : x : PRO xxxx B0229 <- 4.09 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0230 <- 3.81 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0265 <- 3.58 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0288 <- 4.03 -> DG xxx F0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0014 <- 3.35 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0017 <- 3.36 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0018 <- 3.30 -> DT xxx E0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0014 <- 2.80 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0017 <- 3.41 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0018 <- 3.16 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx >7mid_D:TTP0101/SSO1404-like; title=SUB-COMPLEX OF CAS4-CAS1-CAS2 BOUND PAM CONTAINING DNA organism=GEOBACTER SULFURREDUCENS : x : GLN xxxx D0014 <- 2.80 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0017 <- 3.41 -> DT xxx E0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0018 <- 3.16 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx >7mk1_A: title=STRUCTURE OF A PROTEIN-MODIFIED APTAMER COMPLEX organism=Homo sapiens : w : GLU OE2 A0890 <- 5.06 -> DG O6 C0024 : score 2.892 >7mk1_AB: title=STRUCTURE OF A PROTEIN-MODIFIED APTAMER COMPLEX organism=Homo sapiens : w : GLU OE2 B0890 <- 5.21 -> DG O6 D0024 : score 2.892 >7mk9_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=COMPLEX STRUCTURE OF TRAILING EC OF EC+EC (TRAILING EC-FOCUSED) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : PHE xxxx A0252 <- 3.06 -> DA xxx O-003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0254 <- 3.72 -> DA xxx O-003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0256 <- 4.01 -> DA xxx O-003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.55 -> DT xxx O-012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 3.66 -> DA xxx O-013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 3.62 -> DA xxx O-013 : score x.xxxxx >7mk9_AB: title=COMPLEX STRUCTURE OF TRAILING EC OF EC+EC (TRAILING EC-FOCUSED) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : PHE xxxx A0252 <- 3.06 -> DA xxx O-003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0254 <- 3.72 -> DA xxx O-003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0256 <- 4.01 -> DA xxx O-003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0448 <- 3.55 -> DT xxx O-012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0831 <- 3.66 -> DA xxx O-013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0832 <- 3.62 -> DA xxx O-013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0474 <- 4.35 -> DT xxx N0011 : score x.xxxxx >7mka_abe: title=STRUCTURE OF EC+EC (LEADING EC-FOCUSED) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : PHE xxxx a0252 <- 3.31 -> DT xxx O-038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx a0448 <- 4.15 -> DG xxx O-048 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx a0832 <- 3.99 -> DG xxx O-048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a1386 <- 3.58 -> DG xxx N0052 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx b0470 <- 3.65 -> DA xxx N0039 : score x.xxxxx >7mka_b:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=STRUCTURE OF EC+EC (LEADING EC-FOCUSED) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : LYS xxxx b0470 <- 3.65 -> DA xxx N0039 : score x.xxxxx >7mkd_IJLR:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE BOUND TO LAMBDA PR PROMOTER DNA (CLASS 1) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 I0151 <- 2.70 -> DT O2 P0062 : score 4.39254 : H : ARG NH1 I0175 <- 2.80 -> DT O2 P0062 : score 4.30641 : H : ASP OD1 I0199 <- 3.24 -> DA N6 P0061 : score 3.17563 : H : ARG NH1 I0371 <- 2.51 -> DT O4 P0057 : score 3.45749 : H : ARG NH2 I0371 <- 2.98 -> DT O4 P0057 : score 3.42591 : H : SER OG I0508 <- 2.73 -> DT O4 Q0038 : score 3.6049 : H : GLU OE2 I0541 <- 2.84 -> DC N4 Q0028 : score 5.22326 : H : ARG NH1 J0259 <- 3.03 -> DA N3 Q0037 : score 3.51268 : H : ARG NE L0099 <- 2.84 -> DG O6 P0056 : score 3.9095 : H : ASN OD1 L0383 <- 3.15 -> DT N3 P0054 : score 3.53519 : H : ARG NH1 L0385 <- 2.53 -> DG N7 P0055 : score 6.3767 : H : ASN OD1 L0464 <- 3.09 -> DT N3 Q0041 : score 3.58081 : H : ARG NH1 L0584 <- 2.30 -> DG N7 Q0061 : score 6.655 : H : ARG NH2 L0584 <- 2.66 -> DG N7 Q0061 : score 6.56338 : H : ARG NH2 R0265 <- 3.18 -> DT O2 P0020 : score 3.9116 : x : SER xxxx I0182 <- 3.84 -> DC xxx P0060 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.43 -> DA xxx P0061 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 4.03 -> DA xxx P0061 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0374 <- 3.35 -> DG xxx P0055 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0470 <- 3.17 -> DT xxx Q0039 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0497 <- 3.77 -> DT xxx Q0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0514 <- 4.12 -> DC xxx Q0035 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 4.26 -> DT xxx P0062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.29 -> DG xxx P0063 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0314 <- 3.71 -> DT xxx P0057 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.39 -> DT xxx Q0030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.79 -> DT xxx Q0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.52 -> DA xxx Q0029 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 4.02 -> DA xxx Q0029 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0096 <- 3.14 -> DG xxx P0056 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx L0098 <- 3.23 -> DG xxx P0056 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0102 <- 3.23 -> DG xxx P0055 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0110 <- 3.32 -> DT xxx P0054 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0116 <- 3.87 -> DT xxx P0054 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0386 <- 4.01 -> DT xxx P0054 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0396 <- 3.78 -> DA xxx Q0040 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0419 <- 3.97 -> DA xxx P0050 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0420 <- 3.25 -> DA xxx P0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0423 <- 3.08 -> DA xxx P0050 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0425 <- 3.82 -> DA xxx P0050 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0426 <- 4.03 -> DT xxx P0054 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0428 <- 2.96 -> DT xxx P0054 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0429 <- 3.46 -> DA xxx P0052 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0430 <- 3.63 -> DA xxx P0050 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0432 <- 3.30 -> DA xxx P0053 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0433 <- 3.62 -> DG xxx P0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0436 <- 4.18 -> DA xxx P0053 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0437 <- 3.12 -> DG xxx P0049 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0440 <- 3.52 -> DC xxx Q0042 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0455 <- 3.87 -> DG xxx P0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0458 <- 3.63 -> DC xxx Q0044 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0461 <- 3.11 -> DT xxx Q0041 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0505 <- 3.97 -> DC xxx Q0036 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0511 <- 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: H : ASN OD1 L0464 <- 3.09 -> DT N3 Q0041 : score 3.58081 : H : ARG NH1 L0584 <- 2.30 -> DG N7 Q0061 : score 6.655 : H : ARG NH2 L0584 <- 2.66 -> DG N7 Q0061 : score 6.56338 : x : ASP xxxx L0096 <- 3.14 -> DG xxx P0056 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx L0098 <- 3.23 -> DG xxx P0056 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0102 <- 3.23 -> DG xxx P0055 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0110 <- 3.32 -> DT xxx P0054 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0116 <- 3.87 -> DT xxx P0054 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0386 <- 4.01 -> DT xxx P0054 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0396 <- 3.78 -> DA xxx Q0040 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0419 <- 3.97 -> DA xxx P0050 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0420 <- 3.25 -> DA xxx P0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0423 <- 3.08 -> DA xxx P0050 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0425 <- 3.82 -> DA xxx P0050 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0426 <- 4.03 -> DT xxx P0054 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0428 <- 2.96 -> DT xxx P0054 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0429 <- 3.46 -> DA xxx P0052 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0430 <- 3.63 -> DA xxx P0050 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0432 <- 3.30 -> DA xxx P0053 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0433 <- 3.62 -> DG xxx P0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0436 <- 4.18 -> DA xxx P0053 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0437 <- 3.12 -> DG xxx P0049 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0440 <- 3.52 -> DC xxx Q0042 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx L0455 <- 3.87 -> DG xxx P0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0458 <- 3.63 -> DC xxx Q0044 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0461 <- 3.11 -> DT xxx Q0041 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0505 <- 3.97 -> DC xxx Q0036 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx L0511 <- 4.45 -> DA xxx Q0034 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0514 <- 4.33 -> DA xxx Q0034 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L0517 <- 3.41 -> DA xxx Q0034 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0519 <- 4.44 -> DC xxx Q0036 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx L0522 <- 3.59 -> DA xxx Q0034 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0583 <- 3.74 -> DT xxx P0027 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0585 <- 3.18 -> DC xxx Q0063 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0586 <- 3.58 -> DG xxx P0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0588 <- 3.80 -> DT xxx Q0062 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0589 <- 3.49 -> DT xxx P0026 : score x.xxxxx >7mke_IJL: title=CRYO-EM STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE BOUND TO LAMBDA PR PROMOTER DNA (CLASS 2) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 L0423 <- 2.46 -> DA N7 P0050 : score 2.73435 : H : THR OG1 L0440 <- 3.05 -> DC N4 Q0042 : score 3.83167 : H : GLN NE2 L0589 <- 2.45 -> DT O4 P0026 : score 5.5544 : V : LYS CE L0593 <- 3.83 -> DT C7 P0024 : score 2.58152 : V : ARG CB L0586 <- 3.69 -> DT C7 P0026 : score 1.03277 : V : GLU CB L0585 <- 3.71 -> DT C7 P0027 : score 1.66432 : x : ARG xxxx I0371 <- 3.69 -> DG xxx P0056 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.51 -> DG xxx P0063 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0096 <- 4.17 -> DG xxx P0056 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx L0098 <- 4.42 -> DG xxx P0056 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 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>7mkj_IJLR:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE BOUND TO T7A1 PROMOTER DNA organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 I0175 <- 2.76 -> DT O2 P0068 : score 4.34086 : H : ASN OD1 L0383 <- 3.17 -> DT N3 P0059 : score 3.51999 : H : GLU OE1 L0585 <- 2.79 -> DC N4 Q0059 : score 5.77948 : V : ARG CZ L0385 <- 3.74 -> DT C7 P0060 : score 2.16429 : V : LEU CB I0538 <- 3.62 -> DT C7 P0068 : score 4.59693 : V : LYS CB L0393 <- 3.66 -> DT C7 Q0037 : score 2.38634 : x : ARG xxxx I0151 <- 3.68 -> DT xxx P0068 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0182 <- 3.95 -> DC xxx P0066 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.25 -> DT xxx P0068 : score 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(STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : ARG NH1 C0542 <- 3.01 -> DT O2 T0013 : score 4.12554 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.46 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.12 -> DT xxx N0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.06 -> DT xxx N0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 3.65 -> DT xxx N0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0201 <- 3.98 -> DA xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 3.26 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0446 <- 3.84 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0451 <- 3.22 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.90 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 4.33 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0046 <- 3.50 -> DC xxx N0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0212 <- 3.94 -> DT xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0352 <- 3.83 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 3.93 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.81 -> DG xxx 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: ARG NH2 70464 <- 2.45 -> DA N3 N0052 : score 3.46653 : H : ARG NH2 70466 <- 2.78 -> DA N3 T0115 : score 3.2527 : H : THR OG1 O0215 <- 2.87 -> DA N3 N0021 : score 1.33489 : x : ASP xxxx 70441 <- 3.19 -> DC xxx T0116 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx O0069 <- 3.85 -> DA xxx T0144 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0071 <- 3.91 -> DA xxx T0144 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0099 <- 3.28 -> DT xxx T0142 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0114 <- 3.90 -> DA xxx N0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0124 <- 3.72 -> DA xxx T0144 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx O0159 <- 3.63 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0161 <- 4.15 -> DA xxx N0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0190 <- 3.23 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0205 <- 3.13 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0213 <- 4.49 -> DA xxx T0146 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0272 <- 3.29 -> DA xxx T0148 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0273 <- 4.39 -> DT xxx N0018 : score x.xxxxx 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title=CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS REITERATIVE TRANSCRIPTION COMPLEX WITH 4NT OLIGO-G RNA organism=? : x : GLU xxxx C0421 <- 3.94 -> DG xxx G0013 : score x.xxxxx >7mr3_BC:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RECBCD-DNA COMPLEX WITH DOCKED RECBNUC AND STABILIZED RECD organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ASN xxxx C1078 <- 2.91 -> DG xxx X0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1079 <- 3.54 -> DC xxx A0067 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1080 <- 3.85 -> DG xxx X0013 : score x.xxxxx >7mr3_D:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RECBCD-DNA COMPLEX WITH DOCKED RECBNUC AND STABILIZED RECD organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : GLU OE2 D0305 <- 2.42 -> DG N2 X0004 : score 4.63784 : H : ARG NH2 D0486 <- 2.90 -> DA N7 X0006 : score 1.63836 : x : HIS xxxx D0241 <- 3.77 -> DG xxx X0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0247 <- 2.81 -> DC xxx X0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0248 <- 3.47 -> DG xxx X0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0275 <- 4.06 -> DG xxx X0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0304 <- 4.13 -> DT xxx X0003 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0539 <- 3.84 -> DC xxx X0002 : score x.xxxxx >7mr4_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RECBCD-DNA COMPLEX WITH UNDOCKED RECBNUC AND FLEXIBLE RECD organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ILE xxxx B0252 <- 3.88 -> DG xxx A0056 : score x.xxxxx >7mr4_BC:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Restriction_endonuclease-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RECBCD-DNA COMPLEX WITH UNDOCKED RECBNUC AND FLEXIBLE RECD organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : x : ILE xxxx B0252 <- 3.88 -> DG xxx A0056 : score x.xxxxx >7mtl_A:DinB/YfiT-like_putative_metalloenzymes; title=CRYSTAL STRUCTURE OF COLIBACTIN SELF-RESISTANCE PROTEIN CLBS IN COMPLEX WITH A DSDNA organism=Escherichia coli : x : ASN xxxx A0086 <- 3.22 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx >7mtl_AB:DinB/YfiT-like_putative_metalloenzymes; title=CRYSTAL STRUCTURE OF COLIBACTIN SELF-RESISTANCE PROTEIN CLBS IN COMPLEX WITH A DSDNA organism=Escherichia coli : x : ASN xxxx A0086 <- 3.22 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx >7mvs_AB:Type_II_DNA_topoisomerase; title=DNA GYRASE COMPLEXED WITH UNCLEAVED DNA AND COMPOUND 7 TO 2.6A RESOLUTION organism=STAPHYLOCOCCUS AUREUS : w : ARG NH1 A0234 <- 6.39 -> DT O2 C0006 : score 1.855 : w : SER OG A0286 <- 6.76 -> DA N7 C0007 : score 2.343 : w : GLU OE2 A0289 <- 5.81 -> DA N7 C0007 : score 1.687 : w : SER OG A0374 <- 6.18 -> DC O2 C0004 : score 1.768 : x : LYS xxxx A0053 <- 3.39 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0376 <- 3.23 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0053 <- 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score 6.6 >7mz0_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH DZA AS THE TEMPLATE BASE IN A 1-NUCLEOTIDE GAPPED DNA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.31 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.81 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.46 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7mz1_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH DZA IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING NON-HYDROLYZABLE TTP organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0234 <- 2.83 -> DG N3 T0009 : score 1.44512 : H : TYR OH A0271 <- 3.05 -> DA N3 P0010 : score 3.94372 : w : TYR OH A0271 <- 6.46 -> DC O2 T0008 : score 1.343 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.88 -> DT O2 T0007 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0283 <- 5.98 -> DT O2 T0007 : score 2.261 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.63 -> DT O2 T0007 : score 2.462 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.85 -> DC O2 T0008 : score 1.988 >7mz2_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH DZA AT N-1 OF THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING DTTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.31 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.90 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.56 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7mz3_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH 3-DEAZA-3- METHYLADENINE (3DMEA) AS THE TEMPLATE BASE IN A 1-NUCLEOTIDE GAPPED DNA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.38 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.82 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.61 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7mz4_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH 3-DEAZA-3- METHYLADENINE (3DMEA) IN THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING DTTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.19 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.83 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.54 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7mz8_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH 3-DEAZA-3- METHYLADENINE (3DMEA) AT N-1 OF THE TEMPLATE BASE PAIRED WITH INCOMING DTTP organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.28 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.04 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.65 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7n2m_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE ALPHA CATALYTIC CORE IN COMPLEX WITH DCTP AND TEMPLATE/PRIMER HAVING T-C MISMATCH AT THE POST- INSERTION SITE organism=HOMO SAPIENS : w : ARG NE A0784 <- 5.60 -> DG N7 C0110 : score 1.593 : H : ARG NH1 A0834 <- 2.53 -> DG O6 C0113 : score 6.41183 : H : ARG NH2 A0834 <- 2.99 -> DG N7 C0113 : score 6.142 : w : TYR OH A0865 <- 6.88 -> DT O2 C0111 : score 3.068 : w : TYR OH A0957 <- 6.35 -> DT O2 C0111 : score 3.068 : x : LEU xxxx A0951 <- 3.44 -> DG xxx C0110 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0954 <- 4.36 -> DG xxx C0110 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0955 <- 3.52 -> DG xxx C0110 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0962 <- 4.08 -> DA xxx C0109 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0964 <- 3.23 -> DA xxx C0109 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1053 <- 3.36 -> DG xxx C0113 : score x.xxxxx >7n3p_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE CAS12K-SGRNA-DSDNA COMPLEX organism=SCYTONEMA HOFMANNII : H : ARG NH2 A0078 <- 3.09 -> DG N7 D0012 : score 6.01431 : H : ARG NH2 A0078 <- 2.75 -> DG O6 D0012 : score 6.666 : H : THR OG1 A0287 <- 2.83 -> DA N7 C0048 : score 3.39362 : H : THR OG1 A0287 <- 3.41 -> DA N6 C0048 : score 2.42238 : V : MET CE A0081 <- 3.85 -> DT C7 D0013 : score 6.84363 : x : SER xxxx A0077 <- 4.21 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0085 <- 3.51 -> DA xxx C0047 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0286 <- 3.57 -> DA xxx C0047 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0306 <- 3.63 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0418 <- 4.48 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0421 <- 3.34 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx >7n3y_AB:DNase_I-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SACCHAROMYCES CEREVISIAE APN2 CATALYTIC DOMAIN E59Q/D222N MUTANT IN COMPLEX WITH DNA organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ASP OD1 B0286 <- 2.92 -> DC N4 a0002 : score 5.21659 >7n3y_B:DNase_I-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SACCHAROMYCES CEREVISIAE APN2 CATALYTIC DOMAIN E59Q/D222N MUTANT IN COMPLEX WITH DNA organism=Saccharomyces cerevisiae : H : ASP OD1 B0286 <- 2.92 -> DC N4 a0002 : score 5.21659 >7n4e_CDF: title=ESCHERICHIA COLI SIGMA 70-DEPENDENT PAUSED TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 C0371 <- 2.57 -> DG O6 10040 : score 6.36317 : H : ARG NE F0385 <- 2.94 -> DG N7 10038 : score 4.29798 : H : THR OG1 F0432 <- 3.41 -> DA N7 10036 : score 2.99758 : x : TRP xxxx C0183 <- 2.68 -> DA xxx 10044 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 2.66 -> DA xxx 10044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 3.97 -> DA xxx 10044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 3.73 -> DG xxx 10038 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0541 <- 2.74 -> DC xxx 10049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0259 <- 4.28 -> DC xxx 20023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 3.66 -> DT xxx 10042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0352 <- 4.28 -> DA xxx 20016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 4.30 -> DT xxx 20015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 4.06 -> DC xxx 20014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.54 -> DC xxx 20014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 4.24 -> DC xxx 20014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0096 <- 3.80 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.43 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.86 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.57 -> DG xxx 10038 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 4.39 -> DG xxx 10038 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 2.39 -> DT xxx 10037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0396 <- 3.62 -> DT xxx 20028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0397 <- 3.74 -> DT xxx 20028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0401 <- 4.01 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 4.40 -> DA xxx 10033 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 3.88 -> DA xxx 10033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 2.85 -> DA xxx 10033 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 3.68 -> DA xxx 10033 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 3.42 -> DA xxx 10036 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.04 -> DA xxx 10035 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.86 -> DA xxx 10033 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 3.33 -> DT xxx 10032 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0434 <- 4.19 -> DC xxx 10031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0436 <- 2.53 -> DA xxx 20030 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0437 <- 2.98 -> DC xxx 10031 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0455 <- 4.11 -> DG xxx 10027 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0458 <- 3.79 -> DT xxx 20032 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0460 <- 4.22 -> DA xxx 20029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0461 <- 3.25 -> DA xxx 20029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0464 <- 2.56 -> DA xxx 20029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0468 <- 4.20 -> DA xxx 20029 : score x.xxxxx >7n4e_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=ESCHERICHIA COLI SIGMA 70-DEPENDENT PAUSED TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX organism=ESCHERICHIA COLI : x : ARG xxxx D0259 <- 4.28 -> DC xxx 20023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 3.66 -> DT xxx 10042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0352 <- 4.28 -> DA xxx 20016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 4.30 -> DT xxx 20015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 4.06 -> DC xxx 20014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.54 -> DC xxx 20014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 4.24 -> DC xxx 20014 : score x.xxxxx >7n5s_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZBTB7A ZINC FINGER DOMAIN BOUND TO -200 SITE OF FETAL GLOBIN PROMOTER (OLIGO 6) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0396 <- 2.42 -> DG O6 X0012 : score 6.22011 : H : ARG NH1 A0399 <- 3.12 -> DG O6 X0011 : score 5.694 : H : ARG NH2 A0399 <- 2.92 -> DG N7 X0011 : score 6.23138 : H : ARG NH1 A0421 <- 3.01 -> DG N7 X0010 : score 5.7959 : H : ARG NH2 A0421 <- 3.18 -> DG O6 X0010 : score 6.0984 : H : ASP OD2 A0423 <- 2.67 -> DC N4 Y0005 : score 6.3612 : H : LYS NZ A0424 <- 2.99 -> DG O6 X0009 : score 5.5611 : H : ARG NH1 A0477 <- 3.24 -> DG N7 X0005 : score 5.5176 : H : ARG NH2 A0477 <- 2.92 -> DG O6 X0005 : score 6.4416 : H : ASP OD2 A0479 <- 2.90 -> DC N4 Y0010 : score 6.076 : H : HIS NE2 A0480 <- 3.19 -> DG N7 X0004 : score 6.27196 : H : ARG NH1 A0483 <- 3.04 -> DG N7 X0003 : score 5.7596 : H : ARG NH2 A0483 <- 3.00 -> DG O6 X0003 : score 6.336 : x : SER xxxx A0478 <- 3.61 -> DT xxx Y0009 : score x.xxxxx >7n5t_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZBTB7A ZINC FINGER DOMAIN BOUND TO -200 SITE OF FETAL GLOBIN PROMOTER (OLIGO 5) organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0399 <- 2.82 -> DG N7 X0012 : score 6.0258 : H : ARG NH2 A0399 <- 2.68 -> DG O6 X0012 : score 6.7584 : H : ARG NH1 A0421 <- 3.00 -> DG N7 X0011 : score 5.808 : H : ARG NH2 A0421 <- 2.93 -> DG O6 X0011 : score 6.4284 : H : ASP OD2 A0423 <- 2.78 -> DC N4 Y0005 : score 6.2248 : H : LYS NZ A0424 <- 3.22 -> DG O6 X0010 : score 5.29518 : H : ARG NH1 A0477 <- 3.20 -> DG N7 X0006 : score 5.566 : H : ARG NH2 A0477 <- 3.02 -> DG O6 X0006 : score 6.3096 : H : HIS NE2 A0480 <- 2.80 -> DG N7 X0005 : score 6.80256 : H : ARG NH1 A0483 <- 2.94 -> DG N7 X0004 : score 5.8806 : H : ARG NH1 A0483 <- 3.10 -> DG O6 X0004 : score 5.71833 : H : ARG NH2 A0483 <- 2.72 -> DG O6 X0004 : score 6.7056 : x : LYS xxxx A0396 <- 3.17 -> DG xxx X0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0478 <- 3.87 -> DT xxx Y0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0479 <- 3.27 -> DC xxx Y0010 : score x.xxxxx >7n5u_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZBTB7A ZINC FINGER DOMAIN BOUND TO DNA DUPLEX CONTAINING GGACCC (OLIGO 21) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0396 <- 3.13 -> DG O6 Y0003 : score 5.39924 : H : ARG NH1 A0399 <- 3.01 -> DG O6 X0013 : score 5.82783 : H : ARG NH2 A0399 <- 2.42 -> DG N7 X0013 : score 6.86985 : H : ARG NH1 A0421 <- 2.66 -> DG N7 X0012 : score 6.2194 : H : ARG NH2 A0421 <- 2.92 -> DG O6 X0012 : score 6.4416 : H : ASP OD2 A0423 <- 2.75 -> DC N4 Y0005 : score 6.262 : H : LYS NZ A0424 <- 3.36 -> DG O6 X0011 : score 5.13332 : x : TYR xxxx A0451 <- 4.26 -> DC xxx X0008 : score x.xxxxx >7n5v_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZBTB7A ZINC FINGER DOMAIN BOUND TO DNA DUPLEX CONTAINING GGACCC (OLIGO 20) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0396 <- 2.83 -> DG O6 Y0003 : score 5.74608 : H : ARG NH1 A0421 <- 2.92 -> DG N7 X0011 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0421 <- 3.07 -> DG O6 X0011 : score 6.2436 : H : ASP OD2 A0423 <- 3.23 -> DC N4 Y0005 : score 5.6668 : x : ALA xxxx A0394 <- 3.45 -> DG xxx Y0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0399 <- 3.32 -> DG xxx X0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0424 <- 3.80 -> DG xxx X0010 : score x.xxxxx >7n5v_AB:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZBTB7A ZINC FINGER DOMAIN BOUND TO DNA DUPLEX CONTAINING GGACCC (OLIGO 20) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0396 <- 2.83 -> DG O6 Y0003 : score 5.74608 : H : ARG NH1 A0421 <- 2.92 -> DG N7 X0011 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0421 <- 3.07 -> DG O6 X0011 : score 6.2436 : H : ASP OD2 A0423 <- 3.23 -> DC N4 Y0005 : score 5.6668 : H : LYS NZ B0396 <- 2.78 -> DG N7 E0002 : score 5.40744 : H : LYS NZ B0396 <- 2.95 -> DG O6 E0003 : score 5.60735 : H : ARG NH1 B0399 <- 3.37 -> DG O6 D0012 : score 5.38983 : H : ARG NH2 B0399 <- 2.29 -> DG N7 D0012 : score 7.03585 : H : ARG NH1 B0421 <- 2.62 -> DG N7 D0011 : score 6.2678 : H : ARG NH1 B0421 <- 2.91 -> DG O6 D0011 : score 5.9495 : H : ASP OD2 B0423 <- 3.01 -> DC N4 E0005 : score 5.9396 : H : LYS NZ B0424 <- 2.61 -> DA N7 D0009 : score 3.04879 : x : ALA xxxx A0394 <- 3.45 -> DG xxx Y0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0399 <- 3.32 -> DG xxx X0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0424 <- 3.80 -> DG xxx X0010 : score x.xxxxx >7n5w_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZBTB7A ZINC FINGER DOMAIN BOUND TO DNA DUPLEX CONTAINING GGACCC (OLIGO 23) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0396 <- 2.67 -> DG O6 Y0003 : score 5.93107 : H : LYS NZ A0396 <- 3.42 -> DT O4 X0012 : score 3.14237 : H : ARG NH1 A0399 <- 2.99 -> DG O6 X0011 : score 5.85217 : H : ARG NH2 A0399 <- 2.69 -> DG N7 X0011 : score 6.52508 : H : ARG NH1 A0421 <- 2.81 -> DG N7 X0010 : score 6.0379 : H : ARG NH2 A0421 <- 2.99 -> DG O6 X0010 : score 6.3492 : w : ASP OD2 A0423 <- 6.33 -> DC N4 Y0006 : score 3.623 : H : LYS NZ A0424 <- 2.86 -> DG O6 X0009 : score 5.7114 >7n8n_A:Histone-fold; title=MELBOURNEVIRUS NUCLEOSOME LIKE PARTICLE organism=MELBOURNEVIRUS : x : ARG xxxx A0082 <- 3.74 -> DA xxx J0028 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 4.25 -> DA xxx J0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0203 <- 2.80 -> DG xxx I-003 : score x.xxxxx >7n8n_ABCD:Histone-fold; title=MELBOURNEVIRUS NUCLEOSOME LIKE PARTICLE organism=MELBOURNEVIRUS : x : ARG xxxx A0082 <- 3.74 -> DA xxx J0028 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 4.25 -> DA xxx J0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0203 <- 2.80 -> DG xxx I-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0032 <- 3.38 -> DT xxx I-047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0132 <- 3.74 -> DT xxx J0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0082 <- 3.87 -> DG xxx I0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0203 <- 2.96 -> DA xxx J-003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0087 <- 4.16 -> DA xxx J-034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0132 <- 3.30 -> DC xxx I0045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0157 <- 4.48 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx >7n8n_B:Histone-fold; title=MELBOURNEVIRUS NUCLEOSOME LIKE PARTICLE organism=MELBOURNEVIRUS : x : ARG xxxx B0032 <- 3.38 -> DT xxx I-047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0132 <- 3.74 -> DT xxx J0044 : score x.xxxxx >7n8s_A:DNase_I-like; title=LINE-1 ENDONUCLEASE DOMAIN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : x : ASN xxxx A0118 <- 3.38 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0197 <- 3.06 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0198 <- 3.36 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx >7n94_B:DNase_I-like; title=LINE-1 ENDONUCLEASE DOMAIN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : HIS NE2 B0198 <- 2.73 -> DA N3 F0012 : score 4.3056 : x : ASN xxxx B0118 <- 4.32 -> DA xxx F0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0197 <- 2.94 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx >7ne3_A: title=HUMAN TET2 IN COMPLEX WITH FAVOURABLE DNA SUBSTRATE. organism=COLINUS VIRGINIANUS : w : TYR OH A1295 <- 5.72 -> DT O2 B0008 : score 3.068 : H : ARG NH2 A1302 <- 3.07 -> DG N3 B0009 : score 3.4153 : w : ARG NE A1302 <- 6.58 -> DT O2 B0008 : score 0.757 : x : TRP xxxx A1291 <- 3.87 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1293 <- 3.13 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1294 <- 3.29 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx >7ne6_A: title=HUMAN TET2 IN COMPLEX WITH UNFAVOURABLE DNA SUBSTRATE. organism=COLINUS VIRGINIANUS : w : SER OG A1292 <- 6.35 -> DG N3 B0007 : score 2.344 : w : TYR OH A1294 <- 6.28 -> DG N7 B0007 : score 3.527 : w : TYR OH A1295 <- 6.36 -> DG N2 C0005 : score 2.834 : w : ARG NH2 A1302 <- 6.53 -> DC O2 B0009 : score 1.669 : w : ARG NH2 A1302 <- 5.62 -> DG N3 C0005 : score 0.677 : w : ARG NH2 A1302 <- 6.11 -> DG N2 C0005 : score 1.593 : w : LYS NZ A1905 <- 5.75 -> DC O2 C0008 : score 1.3 : x : TRP xxxx A1291 <- 3.69 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1293 <- 3.43 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx >7nfc_ABC:SPOC_domain-like;vWA-like;C-terminal_domain_of_Ku80; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NHEJ SUPER-COMPLEX (DIMER) organism=HOMO SAPIENS : V : THR CG2 B0298 <- 3.66 -> DT C7 E0028 : score 4.38522 : x : LYS xxxx A0124 <- 4.46 -> DG xxx D0022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0125 <- 3.27 -> DG xxx D0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 2.97 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0450 <- 4.12 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0452 <- 3.18 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0835 <- 3.33 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0839 <- 4.28 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A2738 <- 4.48 -> DG xxx E0044 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A2741 <- 3.45 -> DG xxx E0044 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A2742 <- 3.21 -> DG xxx E0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A2745 <- 3.66 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A2746 <- 3.04 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A2749 <- 4.25 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0258 <- 2.70 -> DA xxx E0032 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0281 <- 4.32 -> DT xxx D0027 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0287 <- 2.90 -> DT xxx E0028 : score 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x.xxxxx : x : ARG xxxx C0400 <- 4.15 -> DA xxx E0033 : score x.xxxxx >7nfe_C:SPOC_domain-like;vWA-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NHEJ SUPER-COMPLEX (MONOMER) organism=? : x : ARG xxxx C0400 <- 4.15 -> DA xxx E0033 : score x.xxxxx >7nkx_a:Histone-fold; title=RNA POLYMERASE II-SPT4/5-NUCLEOSOME-CHD1 STRUCTURE organism=? : x : ARG xxxx a0083 <- 3.69 -> DC xxx T-023 : score x.xxxxx >7nkx_f:Histone-fold; title=RNA POLYMERASE II-SPT4/5-NUCLEOSOME-CHD1 STRUCTURE organism=? : x : LYS xxxx f0079 <- 4.30 -> DG xxx T0026 : score x.xxxxx >7nky_e:Histone-fold; title=RNA POLYMERASE II-SPT4/5-NUCLEOSOME-FACT STRUCTURE organism=? : x : HIS xxxx e0039 <- 4.29 -> DT xxx N0069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx e0040 <- 3.52 -> DG xxx N-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx e0042 <- 4.24 -> DA xxx N0071 : score x.xxxxx >7nl0_A:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE LIN28B NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=HOMO SAPIENS : V : LEU CD2 A0065 <- 3.62 -> DT C7 J0018 : score 5.98919 : x : HIS xxxx A0039 <- 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DG xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.25 -> DC xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.04 -> DT xxx I0048 : score x.xxxxx >7npf_ABCDEFGH:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=VIBRIO CHOLERAE PARA2-ATPYS-DNA FILAMENT organism=VIBRIO CHOLERAE : H : ASN ND2 B0078 <- 3.35 -> DA N3 I0023 : score 3.38885 : H : HIS NE2 B0079 <- 2.88 -> DA N3 I0022 : score 4.17822 : H : HIS NE2 C0079 <- 2.84 -> DT O2 J0044 : score 5.19783 : H : HIS NE2 D0079 <- 3.10 -> DA N3 I0030 : score 3.99138 : H : HIS NE2 E0079 <- 2.93 -> DT O2 J0037 : score 5.10351 : H : ASN ND2 F0078 <- 3.48 -> DA N3 I0039 : score 3.28985 : H : HIS NE2 F0079 <- 2.76 -> DT O2 J0015 : score 5.28166 : H : HIS NE2 G0079 <- 2.58 -> DT O2 J0029 : score 5.47029 : H : ASN ND2 H0078 <- 3.42 -> DA N3 I0046 : score 3.33554 : H : HIS NE2 H0079 <- 3.20 -> DT O2 J0007 : score 4.82056 : x : ASN xxxx D0078 <- 3.46 -> DA xxx I0031 : score x.xxxxx >7npf_H:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=VIBRIO CHOLERAE PARA2-ATPYS-DNA FILAMENT organism=VIBRIO CHOLERAE : H : ASN ND2 H0078 <- 3.42 -> DA N3 I0046 : score 3.33554 : H : HIS NE2 H0079 <- 3.20 -> DT O2 J0007 : score 4.82056 >7nqf_A:Prim-pol_domain; title=PRIM-POL DOMAIN OF CRISPR-ASSOCIATED PRIM-POL (CAPP) FROM MARINITOGA SP. 1137 WITH DSDNA organism=? : w : TYR OH A0163 <- 5.67 -> DC O2 C0001 : score 1.343 : w : ASN ND2 A0274 <- 5.83 -> DC O2 D0005 : score 1.885 : w : ASN ND2 A0274 <- 5.93 -> DG N3 D0006 : score 2.566 : x : TYR xxxx A0138 <- 3.38 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0139 <- 4.46 -> DC xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0275 <- 3.46 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx >7nv1_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN POL KAPPA HOLOENZYME WITH UB-PCNA organism=HOMO SAPIENS : x : MET xxxx A0135 <- 2.86 -> DA xxx T0000 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0419 <- 4.45 -> DC xxx T0002 : 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>7nvs_AMORU:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain;TATA-box_binding_protein-like;Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=RNA POLYMERASE II CORE PRE-INITIATION COMPLEX WITH CLOSED PROMOTER DNA IN PROXIMAL POSITION organism=HOMO SAPIENS / SUS SCROFA : H : ASN ND2 O0167 <- 2.94 -> DT O2 T-005 : score 4.61326 : H : ASN ND2 O0257 <- 3.14 -> DA N3 N0004 : score 3.54877 : H : THR OG1 O0313 <- 2.50 -> DA N3 N0004 : score 1.43508 : x : VAL xxxx O0169 <- 3.21 -> DT xxx T-005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0197 <- 2.93 -> DT xxx T-007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx O0198 <- 4.48 -> DG xxx N0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0212 <- 2.92 -> DT xxx T-006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0214 <- 3.55 -> DA xxx N0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0220 <- 3.61 -> DA xxx N0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0222 <- 3.57 -> DT xxx T-005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0259 <- 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2.81652 : x : ARG xxxx A0192 <- 3.69 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0169 <- 3.34 -> DA xxx N0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0197 <- 2.96 -> DT xxx T-007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx O0198 <- 4.21 -> DG xxx N0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0212 <- 3.04 -> DT xxx T-006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0214 <- 3.58 -> DA xxx N0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0220 <- 3.54 -> DA xxx N0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0222 <- 3.55 -> DT xxx T-005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0259 <- 3.26 -> DT xxx T-004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0288 <- 3.14 -> DA xxx N0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0289 <- 3.44 -> DA xxx T-001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0303 <- 3.02 -> DT xxx N0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0305 <- 3.06 -> DT xxx T-002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0311 <- 3.56 -> DA xxx T-003 : score x.xxxxx >7nvv_7:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=XPB-CONTAINING PART OF TFIIH IN A POST-TRANSLOCATED STATE (WITH ADP- BEF3) organism=HOMO SAPIENS : H : HIS NE2 70629 <- 2.94 -> DC O2 N0048 : score 5.13914 : x : HIS xxxx 70415 <- 4.45 -> DG xxx T-043 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 70609 <- 3.20 -> DG xxx N0047 : score x.xxxxx >7nvw_7:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=TFIIH IN A PRE-TRANSLOCATED STATE (WITHOUT ADP-BEF3) organism=HOMO SAPIENS : H : HIS NE2 70629 <- 3.13 -> DG N2 N0047 : score 3.48214 : x : LYS xxxx 70609 <- 3.58 -> DG xxx T-046 : score x.xxxxx >7nvx_7:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=TFIIH IN A POST-TRANSLOCATED STATE (WITH ADP-BEF3) organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx 70415 <- 4.35 -> DG xxx T-055 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 70609 <- 3.49 -> DG xxx N0059 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx 70629 <- 3.25 -> DG xxx N0060 : score x.xxxxx >7nvy_7AMORU:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain;TATA-box_binding_protein-like;Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Eukaryotic_RPB5_N-terminal_domain;RPB5-like_RNA_polymerase_subunit; title=RNA POLYMERASE II PRE-INITIATION COMPLEX WITH CLOSED PROMOTER DNA IN PROXIMAL POSITION organism=HOMO SAPIENS / SUS SCROFA : H : HIS NE2 70629 <- 3.07 -> DG N2 N0047 : score 3.52688 : H : ASN ND2 O0167 <- 3.07 -> DT O2 T-005 : score 4.48986 : H : ASN ND2 O0257 <- 3.19 -> DA N3 N0004 : score 3.51069 : H : THR OG1 O0313 <- 2.52 -> DA N3 N0004 : score 1.42966 : x : LYS xxxx 70609 <- 3.57 -> DG xxx T-046 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0169 <- 3.17 -> DT xxx T-005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0197 <- 2.95 -> DT xxx T-007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx O0198 <- 4.47 -> DG xxx N0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0212 <- 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WITH CLOSED PROMOTER DNA IN DISTAL POSITION organism=HOMO SAPIENS / SUS SCROFA : H : HIS NE2 70629 <- 3.07 -> DG N2 N0047 : score 3.52688 : H : ASN ND2 O0167 <- 3.13 -> DT O2 T-005 : score 4.43291 : H : ASN ND2 O0257 <- 2.95 -> DA N3 N0004 : score 3.69346 : H : THR OG1 O0313 <- 2.55 -> DA N3 N0004 : score 1.42154 : H : LYS NZ R0174 <- 3.00 -> DC O2 T-008 : score 2.82831 : x : SER xxxx 70411 <- 4.31 -> DG xxx T-043 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx 70415 <- 4.48 -> DC xxx T-042 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 70418 <- 4.45 -> DG xxx N0042 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 70609 <- 3.58 -> DG xxx T-046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0192 <- 3.65 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0169 <- 3.37 -> DA xxx N0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0197 <- 2.97 -> DT xxx T-007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx O0198 <- 4.21 -> DG xxx N0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0212 <- 3.02 -> DT xxx T-006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0214 <- 3.58 -> DA xxx N0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx 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>7nyx_ABF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;MukF_C-terminal_domain-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE MUKBEF-MATP-DNA MONOMER (CLOSED CONFORMATION) organism=PHOTORHABDUS THRACENSIS : x : THR xxxx A0056 <- 4.47 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B1327 <- 3.85 -> DT xxx M0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0079 <- 3.54 -> DT xxx M0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0080 <- 4.38 -> DT xxx M0020 : score x.xxxxx >7nyx_IJ:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;MukF_C-terminal_domain-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE MUKBEF-MATP-DNA MONOMER (CLOSED CONFORMATION) organism=PHOTORHABDUS THRACENSIS : H : ARG NH1 I0080 <- 3.20 -> DG N7 K0072 : score 5.566 : H : ARG NH2 I0080 <- 2.84 -> DG O6 K0072 : score 6.5472 : H : SER OG I0093 <- 2.69 -> DA N7 K0069 : score 4.56231 : H : ASP OD2 I0095 <- 2.81 -> DC N4 K0068 : score 6.1876 : H : ARG NE J0075 <- 2.98 -> DG N7 K0064 : score 4.26261 : H : ARG NH1 J0080 <- 2.94 -> DG N7 L0013 : score 5.8806 : H : 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>7nz0_IJ:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;MukF_C-terminal_domain-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE MUKBEF-MATP-DNA MONOMER (OPEN CONFORMATION) organism=PHOTORHABDUS THRACENSIS : H : ARG NE I0075 <- 2.77 -> DG N7 L0005 : score 4.44833 : H : ARG NH2 I0075 <- 2.80 -> DG O6 L0005 : score 6.6 : H : ARG NH1 I0080 <- 3.04 -> DG N7 K0072 : score 5.7596 : H : ARG NH2 I0080 <- 3.28 -> DG N7 K0072 : score 5.77169 : H : ARG NH2 I0080 <- 2.71 -> DG O6 K0072 : score 6.7188 : H : SER OG I0093 <- 2.78 -> DA N7 K0069 : score 4.48196 : H : ASP OD2 I0095 <- 2.76 -> DC N4 K0068 : score 6.2496 : H : ARG NE J0075 <- 2.61 -> DG N7 K0064 : score 4.58982 : H : ARG NH2 J0075 <- 3.09 -> DG O6 K0064 : score 6.2172 : H : ARG NH1 J0080 <- 2.78 -> DG N7 L0013 : score 6.0742 : H : ARG NH2 J0080 <- 3.22 -> DG N7 L0013 : score 5.84831 : H : ARG NH2 J0080 <- 2.48 -> DG O6 L0013 : score 7.0224 : V : ALA CB J0076 <- 3.82 -> DT C7 L0014 : score 5.57098 : x : GLN xxxx I0072 <- 3.76 -> DA xxx K0074 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0073 <- 4.26 -> DT xxx K0073 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0076 <- 4.04 -> DT xxx K0073 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0079 <- 4.26 -> DT xxx L0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx J0072 <- 3.33 -> DA xxx L0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0073 <- 4.28 -> DT xxx L0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0079 <- 4.00 -> DT xxx K0066 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0093 <- 3.81 -> DA xxx L0010 : score x.xxxxx >7nz2_12: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE MUKBEF-MATP-DNA TETRAD organism=? : H : ARG NE 20075 <- 3.04 -> DG N7 20005 : score 4.20955 : H : ARG NE 20075 <- 3.09 -> DG N7 20064 : score 4.16533 : H : ARG NH1 20080 <- 3.34 -> DG N7 20072 : score 5.3966 : H : ARG NH2 20080 <- 3.03 -> DG O6 20072 : score 6.2964 : H : ARG NH1 20080 <- 2.87 -> DG N7 20013 : score 5.9653 : H : ARG NH2 20080 <- 2.44 -> DG O6 20013 : score 7.0752 : H : SER OG 20093 <- 2.75 -> DA N7 20069 : score 4.50874 : H : ASP OD2 20095 <- 2.71 -> DC N4 20068 : score 6.3116 >7nz2_4:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;ACP-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE MUKBEF-MATP-DNA TETRAD organism=? : H : ARG NE 40075 <- 2.61 -> DG N7 a0064 : score 4.58982 : H : ARG NE 40075 <- 2.61 -> DG N7 a0064 : score 4.58982 : H : ARG NE 40075 <- 2.61 -> DG N7 a0064 : score 4.58982 : H : ARG NH2 40075 <- 3.41 -> DG O6 a0064 : score 5.7948 : H : ARG NH2 40075 <- 3.41 -> DG O6 a0064 : score 5.7948 : H : ARG NH2 40075 <- 3.41 -> DG O6 a0064 : score 5.7948 : H : ARG NH1 40080 <- 3.30 -> DG N7 a0072 : score 5.445 : H : ARG NH1 40080 <- 3.30 -> DG N7 a0072 : score 5.445 : H : ARG NH1 40080 <- 3.30 -> DG N7 a0072 : score 5.445 : H : ARG NH2 40080 <- 2.98 -> DG O6 a0072 : score 6.3624 : H : ARG NH2 40080 <- 2.98 -> DG O6 a0072 : score 6.3624 : H : ARG NH2 40080 <- 2.98 -> DG O6 a0072 : score 6.3624 : H : SER OG 40093 <- 2.72 -> DA N7 a0069 : score 4.53553 : H : SER OG 40093 <- 2.72 -> DA N7 a0069 : score 4.53553 : H : SER OG 40093 <- 2.72 -> DA N7 a0069 : score 4.53553 : H : ASP OD2 40095 <- 2.67 -> DC N4 a0068 : score 6.3612 : H : ASP OD2 40095 <- 2.67 -> DC N4 a0068 : score 6.3612 : H : ASP OD2 40095 <- 2.67 -> DC N4 a0068 : score 6.3612 >7nz3_12: title=CRYO-EM STRUCTURE OF APPOSED MUKBEF-MATP MONOMERS ON DNA organism=? : H : ARG NE 10075 <- 2.90 -> DG N7 a0005 : score 4.33336 : H : ARG NE 10075 <- 2.90 -> DG N7 a0005 : score 4.33336 : H : ARG NE 10075 <- 2.90 -> DG N7 a0005 : score 4.33336 : H : ARG NH1 10080 <- 2.82 -> DG N7 a0013 : score 6.0258 : H : ARG NH1 10080 <- 2.82 -> DG N7 a0013 : score 6.0258 : H : ARG NH1 10080 <- 2.82 -> DG N7 a0013 : score 6.0258 : H : ARG NH2 10080 <- 2.38 -> DG O6 a0013 : score 7.1544 : H : ARG NH2 10080 <- 2.38 -> DG O6 a0013 : score 7.1544 : H : ARG NH2 10080 <- 2.38 -> DG O6 a0013 : score 7.1544 >7o0g_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like;Acid_proteases; title=STRUCTURE OF THE FOAMY VIRAL PROTEASE-REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH RNA/DNA HYBRID. organism=WHITE-TUFTED-EAR MARMOSET SIMIAN FOAMY VIRUS : x : ARG xxxx A0212 <- 4.19 -> DG xxx F0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0398 <- 4.06 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx >7o0h_A:DNA/RNA_polymerases;Acid_proteases; title=STRUCTURE OF THE FOAMY VIRAL PROTEASE-REVERSE TRANSCRIPTASE DRH IN COMPLEX WITH DS DNA. organism=WHITE-TUFTED-EAR MARMOSET SIMIAN FOAMY VIRUS : H : SER OG A0234 <- 3.35 -> DG N2 E0005 : score 3.00318 : H : TYR OH A0311 <- 2.52 -> DT O2 F0012 : score 3.3968 : x : GLN xxxx A0232 <- 3.06 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0291 <- 3.89 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0397 <- 3.60 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx >7o0h_AB:DNA/RNA_polymerases;Acid_proteases; title=STRUCTURE OF THE FOAMY VIRAL PROTEASE-REVERSE TRANSCRIPTASE DRH IN COMPLEX WITH DS DNA. organism=WHITE-TUFTED-EAR MARMOSET SIMIAN FOAMY VIRUS : H : SER OG A0234 <- 3.35 -> DG N2 E0005 : score 3.00318 : H : TYR OH A0311 <- 2.52 -> DT O2 F0012 : score 3.3968 : x : GLN xxxx A0232 <- 3.06 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0291 <- 3.89 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0397 <- 3.60 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx >7o24_A:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURE OF THE FOAMY VIRAL PROTEASE-REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DSDNA. organism=WHITE-TUFTED-EAR MARMOSET SIMIAN FOAMY VIRUS : x : PRO xxxx A0291 <- 4.48 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0311 <- 3.23 -> DT xxx F0021 : score x.xxxxx >7o24_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like;Acid_proteases; title=STRUCTURE OF THE FOAMY VIRAL PROTEASE-REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DSDNA. organism=WHITE-TUFTED-EAR MARMOSET SIMIAN FOAMY VIRUS : x : PRO xxxx A0291 <- 4.48 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0311 <- 3.23 -> DT xxx F0021 : score x.xxxxx >7o4i_Q:Rap30/74_interaction_domains; title=YEAST RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH INITIAL TRANSCRIPTION BUBBLE organism=? : x : LYS xxxx Q0415 <- 3.09 -> DC xxx N0054 : score x.xxxxx >7o4i_W:Zinc_beta-ribbon; title=YEAST RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH INITIAL TRANSCRIPTION BUBBLE organism=? : H : LYS NZ W0080 <- 3.17 -> DG N7 T0063 : score 4.98734 : H : LYS NZ W0080 <- 3.02 -> DG O6 T0063 : score 5.52642 >7o4j_7MOQRUWX:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;TATA-box_binding_protein-like;Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=YEAST RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX (CONSENSUS) organism=? : H : THR OG1 O0215 <- 2.64 -> DA N3 N0025 : score 1.39717 : H : LYS NZ W0080 <- 2.86 -> DG N7 T0063 : score 5.32127 : H : LYS NZ W0080 <- 2.95 -> DG O6 T0063 : score 5.60735 : x : LYS xxxx 70656 <- 4.13 -> DG xxx T0038 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx 70676 <- 3.86 -> DA xxx N0070 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx O0069 <- 3.23 -> DA xxx T0081 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0071 <- 3.30 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0099 <- 3.33 -> DT xxx T0079 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0114 <- 3.52 -> DT xxx T0079 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0116 <- 3.19 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0122 <- 3.26 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0124 <- 3.49 -> DA xxx T0081 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx O0159 <- 3.37 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0161 <- 3.37 -> DT xxx T0082 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0190 <- 3.10 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0191 <- 3.35 -> DA xxx T0085 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0205 <- 3.53 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0207 <- 3.03 -> DT xxx T0084 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0213 <- 3.31 -> DA xxx T0083 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx R0290 <- 3.53 -> DT xxx T0077 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx R0326 <- 4.25 -> DT xxx N0033 : score x.xxxxx >7o4l_7:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=YEAST TFIIH IN THE EXPANDED STATE WITHIN THE PRE-INITIATION COMPLEX organism=? : x : LYS xxxx 70656 <- 4.46 -> DT xxx N0069 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx 70676 <- 4.30 -> DC xxx N0070 : score x.xxxxx >7o56_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=X-RAY STRUCTURE OF INTERFERON REGULATORY FACTOR 4 DNA BINDING DOMAIN BOUND TO AN INTERFERON-STIMULATED RESPONSE ELEMENT SOLVED BY PHOSPHORUS AND SULPHUR SAD METHODS organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0098 <- 3.06 -> DG N7 D0008 : score 5.7354 : H : CYS SG A0099 <- 3.50 -> DT O4 E0013 : score 6.106 : H : LYS NZ A0103 <- 2.93 -> DG N7 E0011 : score 5.24586 : x : THR xxxx A0095 <- 4.17 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx >7o56_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=X-RAY STRUCTURE OF INTERFERON REGULATORY FACTOR 4 DNA BINDING DOMAIN BOUND TO AN INTERFERON-STIMULATED RESPONSE ELEMENT SOLVED BY PHOSPHORUS AND SULPHUR SAD METHODS organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0098 <- 3.06 -> DG N7 D0008 : score 5.7354 : H : CYS SG A0099 <- 3.50 -> DT O4 E0013 : score 6.106 : H : LYS NZ A0103 <- 2.93 -> DG N7 E0011 : score 5.24586 : H : ARG NH1 B0098 <- 3.04 -> DG N7 D0014 : score 5.7596 : H : CYS SG B0099 <- 3.52 -> DT O4 E0007 : score 6.0776 : H : LYS NZ B0103 <- 2.73 -> DA N7 D0016 : score 2.9783 : x : THR xxxx A0095 <- 4.17 -> DT xxx E0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0095 <- 4.31 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0096 <- 4.31 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0100 <- 4.42 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx >7oar_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HELICASE PIF1 FROM THERMUS OSHIMAI IN COMPLEX WITH PARALLEL G-QUADRUPLEX organism=Thermus oshimai : H : ARG NH2 A0392 <- 2.55 -> DT O4 C0006 : score 3.73154 : H : TRP NE1 A0396 <- 2.99 -> DT O4 C0005 : score 4.625 : x : HIS xxxx A0131 <- 3.60 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0138 <- 3.38 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0216 <- 3.36 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0218 <- 3.69 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0303 <- 3.83 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0327 <- 4.44 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0355 <- 3.70 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0358 <- 3.27 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0364 <- 3.95 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0394 <- 3.26 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0395 <- 3.36 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0419 <- 3.06 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0432 <- 4.07 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0451 <- 3.55 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx >7oar_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HELICASE PIF1 FROM THERMUS OSHIMAI IN COMPLEX WITH PARALLEL G-QUADRUPLEX organism=Thermus oshimai : H : ARG NH2 A0392 <- 2.55 -> DT O4 C0006 : score 3.73154 : H : TRP NE1 A0396 <- 2.99 -> DT O4 C0005 : score 4.625 : H : ARG NE B0302 <- 2.77 -> DT O2 C0023 : score 2.59238 : H : ARG NH2 B0448 <- 3.00 -> DT O2 C0022 : score 4.064 : x : HIS xxxx A0131 <- 3.60 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0138 <- 3.38 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0216 <- 3.36 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0218 <- 3.69 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0303 <- 3.83 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0327 <- 4.44 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0355 <- 3.70 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0358 <- 3.27 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0364 <- 3.95 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0394 <- 3.26 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0395 <- 3.36 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0419 <- 3.06 -> DG xxx C0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0432 <- 4.07 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0451 <- 3.55 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0131 <- 3.94 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0138 <- 3.54 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0216 <- 3.13 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0218 <- 3.39 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0303 <- 4.36 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0432 <- 4.09 -> DT xxx C0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0451 <- 3.30 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx >7ob9_AB: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN RNA POLYMERASE I IN ELONGATION STATE organism=HOMO SAPIENS : H : ASP OD1 B0367 <- 2.34 -> DA N6 S0026 : score 3.8024 : x : ASP xxxx A0412 <- 3.89 -> DG xxx S0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0442 <- 3.99 -> DT xxx T0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0553 <- 3.95 -> DC xxx T0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0554 <- 3.76 -> DG xxx T0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0982 <- 3.35 -> DG xxx T0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0983 <- 3.64 -> DG xxx T0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1659 <- 3.87 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0195 <- 3.21 -> DA xxx S0026 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0366 <- 3.71 -> DA xxx S0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0474 <- 3.00 -> DA xxx S0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0478 <- 3.87 -> DA xxx S0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0486 <- 3.94 -> DA xxx S0026 : score x.xxxxx >7obb_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN RNA POLYMERASE I OPEN COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A1659 <- 3.67 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx >7obn_A:DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=STRUCTURAL INVESTIGATIONS OF A NEW L3 DNA LIGASE: STRUCTURE-FUNCTION ANALYSIS organism=Burkholderia pseudomallei : x : GLN xxxx A0086 <- 3.53 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0227 <- 4.13 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0271 <- 3.62 -> DA xxx C0033 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0308 <- 3.27 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx >7ogs_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=X-RAY STRUCTURE OF INTERFERON REGULATORY FACTOR 4 DNA BINDING DOMAIN BOUND TO AN INTERFERON-STIMULATED RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : CYS SG A0099 <- 3.16 -> DT O4 C0013 : score 6.5888 : H : LYS NZ A0103 <- 2.99 -> DA N7 D0009 : score 2.82557 : V : THR CG2 A0095 <- 3.90 -> DT C7 C0014 : score 4.131 : x : ARG xxxx A0098 <- 3.35 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0102 <- 4.29 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx >7ogs_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=X-RAY STRUCTURE OF INTERFERON REGULATORY FACTOR 4 DNA BINDING DOMAIN BOUND TO AN INTERFERON-STIMULATED RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : CYS SG A0099 <- 3.16 -> DT O4 C0013 : score 6.5888 : H : LYS NZ A0103 <- 2.99 -> DA N7 D0009 : score 2.82557 : H : CYS SG B0099 <- 3.12 -> DT O4 C0007 : score 6.6456 : H : LYS NZ B0103 <- 2.94 -> DA N7 D0015 : score 2.85494 : V : THR CG2 A0095 <- 3.90 -> DT C7 C0014 : score 4.131 : x : ARG xxxx A0098 <- 3.35 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0102 <- 4.29 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0095 <- 4.21 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0098 <- 3.39 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0102 <- 4.45 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx >7ogs_EF:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=X-RAY STRUCTURE OF INTERFERON REGULATORY FACTOR 4 DNA BINDING DOMAIN BOUND TO AN INTERFERON-STIMULATED RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 E0098 <- 3.18 -> DG N7 H0007 : score 5.89938 : H : CYS SG E0099 <- 3.30 -> DT O4 G0013 : score 6.39 : H : LYS NZ E0103 <- 3.49 -> DA N7 H0009 : score 2.53185 : H : ARG NH2 F0098 <- 3.29 -> DG N7 H0013 : score 5.75892 : H : CYS SG F0099 <- 3.25 -> DT O4 G0007 : score 6.461 : H : LYS NZ F0103 <- 3.11 -> DA N7 H0015 : score 2.75507 : x : THR xxxx E0095 <- 3.43 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0102 <- 4.37 -> DG xxx H0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0095 <- 4.06 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx >7oh9_D:Histone-fold; title=NUCLEOSOME WITH TBP AND TFIIA BOUND AT SHL -6 organism=? : x : ARG xxxx D0026 <- 3.73 -> DT xxx J-029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0027 <- 3.68 -> DG xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.21 -> DC xxx I-048 : score x.xxxxx >7oha_G:Histone-fold; title=NUCLEOSOME WITH TBP AND TFIIA BOUND AT SHL +2 organism=? : x : ARG xxxx G0042 <- 4.45 -> DC xxx I0037 : score x.xxxxx >7ohb_G:Histone-fold; title=TBP-NUCLEOSOME COMPLEX organism=XENOPUS LAEVIS : x : ARG xxxx G0042 <- 4.43 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.05 -> DA xxx I0057 : score x.xxxxx >7ohc_A:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE COMPOSED OF THE WIDOM 601 DNA SEQUENCE organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 A0040 <- 2.99 -> DT O2 J0009 : score 4.14277 >7ohc_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NUCLEOSOME CORE PARTICLE COMPOSED OF THE WIDOM 601 DNA SEQUENCE organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 A0040 <- 2.99 -> DT O2 J0009 : score 4.14277 : H : ARG NH2 C0011 <- 3.01 -> DT O2 I-043 : score 4.05553 : H : ARG NH1 E0040 <- 2.86 -> DG N3 I0009 : score 3.01593 : x : ARG xxxx D0026 <- 3.70 -> DT xxx J-029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0027 <- 3.90 -> DG xxx I-049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 2.92 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.10 -> DA xxx I-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.61 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.21 -> DC xxx I0037 : score x.xxxxx >7okx_ABE: title=STRUCTURE OF ACTIVE TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX POL II-DSIF (SPT5-KOW5)-ELL2-EAF1 (COMPOSITE STRUCTURE) organism=SUS SCROFA : x : ARG xxxx A0364 <- 4.13 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0461 <- 3.95 -> DC xxx T0024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 3.59 -> DG xxx T0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.25 -> DG xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 3.76 -> DG xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1416 <- 3.71 -> DT xxx T0020 : score x.xxxxx >7oky_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=STRUCTURE OF ACTIVE TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX POL II-DSIF-ELL2- EAF1(COMPOSITE STRUCTURE) organism=SUS SCROFA : x : ARG xxxx A0364 <- 4.14 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0461 <- 3.95 -> DC xxx T0024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 3.59 -> DG xxx T0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.25 -> DG xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 3.76 -> DG xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1416 <- 3.71 -> DT xxx T0020 : score x.xxxxx >7oky_ABE: title=STRUCTURE OF ACTIVE TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX POL II-DSIF-ELL2- EAF1(COMPOSITE STRUCTURE) organism=SUS SCROFA : x : ARG xxxx A0364 <- 4.14 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0461 <- 3.95 -> DC xxx T0024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 3.59 -> DG xxx T0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.25 -> DG xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 3.76 -> DG xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1416 <- 3.71 -> DT xxx T0020 : score x.xxxxx >7ol0_ABE: title=STRUCTURE OF ACTIVE TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX POL II-DSIF (SPT5-KOW5) organism=SUS SCROFA : H : ARG NH2 A1416 <- 2.91 -> DT O2 T0020 : score 4.1402 : x : LYS xxxx A0331 <- 3.24 -> DT xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0364 <- 4.23 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0461 <- 4.15 -> DC xxx T0024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 4.13 -> DG xxx T0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 4.02 -> DG xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 4.31 -> DG xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0569 <- 4.41 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0571 <- 4.02 -> DA xxx T0022 : score x.xxxxx >7ol9_AB:KorB_DNA-binding_domain-like;ParB/Sulfiredoxin; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C-TERMINALLY TRUNCATED BACILLUS SUBTILIS NUCLEOID OCCLUSION PROTEIN (NOC) COMPLEXED TO THE NOC-BINDING SITE (NBS) organism=Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) : H : GLN OE1 A0158 <- 3.07 -> DA N6 D0002 : score 5.72573 : H : GLN NE2 A0158 <- 3.16 -> DA N7 D0002 : score 5.65128 : H : SER OG A0159 <- 3.09 -> DA N7 C0013 : score 4.20518 : H : ASN ND2 A0163 <- 2.85 -> DT O4 D0004 : score 5.23177 : H : ARG NE A0186 <- 2.88 -> DG N7 C0010 : score 4.35105 : H : ARG NH1 A0186 <- 3.04 -> DG O6 C0010 : score 5.79133 : H : ARG NH1 A0189 <- 2.92 -> DG N7 C0011 : score 5.9048 : H : ARG NH2 A0189 <- 2.79 -> DG O6 C0011 : score 6.6132 : H : GLN OE1 B0158 <- 2.96 -> DA N6 C0002 : score 5.85888 : H : GLN NE2 B0158 <- 3.19 -> DA N7 C0002 : score 5.61474 : H : SER OG B0159 <- 2.98 -> DA N7 D0013 : score 4.30339 : H : ASN ND2 B0163 <- 2.90 -> DT O4 C0004 : score 5.17892 : H : ARG NE B0186 <- 2.87 -> DG N7 D0010 : score 4.35989 : H : ARG NH1 B0186 <- 2.72 -> DG O6 D0010 : score 6.18067 : H : ARG NH1 B0189 <- 2.93 -> DG N7 D0011 : score 5.8927 : H : ARG NH2 B0189 <- 2.82 -> DG O6 D0011 : score 6.5736 : x : THR xxxx A0160 <- 3.29 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0162 <- 3.36 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0166 <- 3.25 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0214 <- 3.95 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0160 <- 3.17 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0162 <- 3.40 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0166 <- 3.28 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0214 <- 4.05 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >7ol9_B:KorB_DNA-binding_domain-like;ParB/Sulfiredoxin; title=CRYSTAL STRUCTURE OF C-TERMINALLY TRUNCATED BACILLUS SUBTILIS NUCLEOID OCCLUSION PROTEIN (NOC) COMPLEXED TO THE NOC-BINDING SITE (NBS) organism=Bacillus subtilis (strain 168) / Bacillus subtilis (strain 168) : H : GLN OE1 B0158 <- 2.96 -> DA N6 C0002 : score 5.85888 : H : GLN NE2 B0158 <- 3.19 -> DA N7 C0002 : score 5.61474 : H : SER OG B0159 <- 2.98 -> DA N7 D0013 : score 4.30339 : H : ASN ND2 B0163 <- 2.90 -> DT O4 C0004 : score 5.17892 : H : ARG NE B0186 <- 2.87 -> DG N7 D0010 : score 4.35989 : H : ARG NH1 B0186 <- 2.72 -> DG O6 D0010 : score 6.18067 : H : ARG NH1 B0189 <- 2.93 -> DG N7 D0011 : score 5.8927 : H : ARG NH2 B0189 <- 2.82 -> DG O6 D0011 : score 6.5736 : x : THR xxxx B0160 <- 3.17 -> DA xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0162 <- 3.40 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0166 <- 3.28 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0214 <- 4.05 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx >7om3_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF KOD DNA POLYMERASE IN A BINARY COMPLEX WITH HYPOXANTHINE CONTAINING TEMPLATE organism=THERMOCOCCUS KODAKARENSIS KOD1 : w : TYR OH A0409 <- 5.98 -> DG N2 T0010 : score 2.834 : w : TYR OH A0494 <- 5.51 -> DG N3 T0010 : score 3.344 : H : LYS NZ A0592 <- 2.72 -> DA N3 P0011 : score 2.82135 : H : ARG NH1 A0612 <- 3.07 -> DC O2 P0009 : score 3.4529 >7omb_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF KOD DNA POLYMERASE IN A TERNARY COMPLEX WITH A P/T DUPLEX CONTAINING AN EXTENDED 5' SINGLE STRANDED TEMPLATE OVERHANG organism=THERMOCOCCUS KODAKARENSIS KOD1 : H : LYS NZ A0592 <- 3.03 -> DA N3 P0011 : score 2.64918 : w : LYS NZ A0592 <- 6.34 -> DT O2 T0011 : score 0.522 : H : ARG NH1 A0612 <- 3.17 -> DC O2 P0009 : score 3.3799 >7omg_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF KOD DNA POLYMERASE IN A TERNARY COMPLEX WITH AN URACIL CONTAINING TEMPLATE organism=THERMOCOCCUS KODAKARENSIS KOD1 : H : LYS NZ A0592 <- 2.92 -> DA N3 P0011 : score 2.71028 : H : ARG NH1 A0612 <- 3.23 -> DC O2 P0009 : score 3.3361 >7on1_abcdefgh:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CENP-A NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH CENP-C organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : ARG xxxx d0037 <- 4.44 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx e0177 <- 4.08 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx h0037 <- 4.46 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx c0044 <- 4.33 -> DC xxx J0037 : score x.xxxxx >7on1_c:Histone-fold; title=CENP-A NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH CENP-C organism=? : x : ARG xxxx c0044 <- 4.33 -> DC xxx J0037 : score x.xxxxx >7on1_e:Histone-fold; title=CENP-A NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH CENP-C organism=? : x : ARG xxxx e0177 <- 4.08 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx >7oo3_ABEbc:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;ENTH/VHS_domain; title=POL II-CSB-CSA-DDB1-UVSSA (STRUCTURE1) organism=HOMO SAPIENS / SUS SCROFA : H : ARG NH2 A1416 <- 2.68 -> DC O2 T0016 : score 3.78749 : x : MET xxxx A0266 <- 3.16 -> DT xxx T0029 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0270 <- 4.46 -> DG xxx T0030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0272 <- 4.41 -> DT xxx T0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0331 <- 3.36 -> DG xxx T0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0364 <- 4.06 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0461 <- 3.95 -> DT xxx T0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 4.34 -> DT xxx T0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx 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x.xxxxx : x : LYS xxxx A0331 <- 3.76 -> DG xxx T0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0364 <- 4.09 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0461 <- 3.83 -> DT xxx T0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 4.25 -> DT xxx T0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.67 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 4.23 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx >7oob_ABEb:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=POL II-CSB-CSA-DDB1-UVSSA-ADPBEF3 (STRUCTURE2) organism=HOMO SAPIENS / SUS SCROFA : H : ARG NH2 A1416 <- 2.68 -> DC O2 T0016 : score 3.78749 : V : THR CG2 b0890 <- 3.86 -> DT C7 N0005 : score 4.17337 : x : GLU xxxx A0045 <- 4.42 -> DT xxx T0033 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0266 <- 3.24 -> DT xxx T0029 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0270 <- 3.99 -> DG xxx T0030 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0285 <- 4.45 -> DT xxx T0033 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0331 <- 3.76 -> DG xxx T0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0364 <- 4.09 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0461 <- 3.83 -> DT xxx T0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 4.25 -> DT xxx T0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.67 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 4.23 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0200 <- 4.34 -> DC xxx N0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0222 <- 2.71 -> DC xxx N0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0385 <- 3.30 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0386 <- 3.38 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0391 <- 4.34 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0489 <- 3.35 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0495 <- 4.19 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0498 <- 3.57 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0821 <- 3.30 -> DG xxx T0030 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx b0794 <- 3.98 -> DA xxx N0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx b0795 <- 3.07 -> DA xxx N0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx b0796 <- 3.26 -> DT xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ILE 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xxxx B0222 <- 3.06 -> DC xxx N0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0385 <- 3.25 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0386 <- 3.37 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0391 <- 4.31 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0489 <- 3.47 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0495 <- 4.18 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0498 <- 3.57 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0821 <- 2.91 -> DG xxx T0030 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx b0599 <- 4.02 -> DC xxx T0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx b0787 <- 3.14 -> DC xxx T0032 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx b0792 <- 2.72 -> DG xxx T0031 : score x.xxxxx : x : MET xxxx b0793 <- 3.64 -> DC xxx T0032 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx b0794 <- 2.75 -> DT xxx T0033 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx b0795 <- 4.21 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx b0796 <- 3.28 -> DA xxx N0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx b0800 <- 3.40 -> DA xxx T0034 : score x.xxxxx : x : THR xxxx b0890 <- 3.53 -> DT 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INTERFERON-STIMULATED RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 B0098 <- 5.20 -> DT O4 E0014 : score 2.366 : H : CYS SG B0099 <- 3.31 -> DT O4 E0013 : score 6.3758 : w : CYS SG B0099 <- 5.91 -> DT O4 E0014 : score 4.152 : H : LYS NZ B0103 <- 2.83 -> DG N7 E0011 : score 5.35358 : x : THR xxxx B0095 <- 3.34 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0102 <- 4.39 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx >7opc_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=POL II-CSB-CRL4CSA-UVSSA-SPT6-PAF (STRUCTURE 4) organism=? : H : GLU OE1 A0045 <- 2.57 -> DT N3 T0033 : score 1.82916 : x : PRO xxxx A0044 <- 3.11 -> DT xxx T0033 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0266 <- 2.67 -> DG xxx T0030 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0267 <- 3.02 -> DG xxx T0030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0272 <- 4.28 -> DT xxx T0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0285 <- 4.12 -> DT xxx T0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0364 <- 4.41 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0461 <- 3.97 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INHIBITOR RMC-282 organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.84 -> DC O2 F0821 : score 3.46946 : H : ARG NH1 C0448 <- 2.84 -> DT O2 F0806 : score 4.27196 : H : ARG NH2 C0448 <- 2.68 -> DC O2 F0807 : score 3.78749 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.26 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 4.48 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.99 -> DG xxx E0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 3.71 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx >7ota_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-230 organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.88 -> DC O2 P0821 : score 3.44148 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.07 -> DC O2 T0723 : score 3.49899 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.21 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.42 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.94 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.47 -> DC xxx T0711 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 3.91 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx >7ota_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-230 organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.83 -> DC O2 F0821 : score 3.47645 : H : ARG NH1 C0448 <- 2.61 -> DT O2 F0806 : score 4.47005 : H : ARG NH2 C0448 <- 3.12 -> DT O2 F0806 : score 3.9624 : H : ARG NH2 C0448 <- 2.78 -> DC O2 F0807 : score 3.71351 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.61 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.47 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.55 -> DG xxx E0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 4.27 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx >7otj_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PIF1 HELICASE FROM CANDIDA ALBICANS organism=Candida albicans : w : GLU OE2 B0837 <- 5.59 -> DT O2 D0002 : score 2.279 : V : LEU CD2 B0441 <- 3.86 -> DT C7 D0005 : score 5.64531 >7otk_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-233 organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.70 -> DC O2 P0821 : score 3.56738 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.12 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 4.39 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.36 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.19 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 4.36 -> DG xxx P0805 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.18 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >7otk_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-233 organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.70 -> DC O2 P0821 : score 3.56738 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.12 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 4.39 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.36 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.19 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 4.36 -> DG xxx P0805 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.18 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >7otk_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-233 organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.73 -> DC O2 F0821 : score 3.5464 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.60 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 4.35 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.08 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 4.12 -> DG xxx E0707 : score x.xxxxx >7otn_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-247 organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.64 -> DC O2 P0821 : score 3.60935 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.03 -> DT O2 P0806 : score 4.10832 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.94 -> DC O2 T0723 : score 3.59515 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.27 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 4.28 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.24 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.51 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.00 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.14 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >7otn_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-247 organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.64 -> DC O2 P0821 : score 3.60935 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.03 -> DT O2 P0806 : score 4.10832 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.94 -> DC O2 T0723 : score 3.59515 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.27 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0115 <- 4.28 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.24 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.51 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.00 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.14 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >7otn_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-247 organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.69 -> DC O2 F0821 : score 3.57438 : H : ARG NH1 C0448 <- 2.69 -> DT O2 F0806 : score 4.40115 : H : ARG NH2 C0448 <- 2.95 -> DT O2 F0806 : score 4.10633 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.27 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 4.17 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.38 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.96 -> DG xxx E0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 4.07 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx >7otq_E:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ALC1/CHD1L BOUND TO A PARYLATED NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 E0040 <- 2.90 -> DG N3 I0009 : score 2.99151 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.93 -> DC O2 I0008 : score 3.60255 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.88 -> DG N3 I0009 : score 3.55249 : H : ARG NH2 E0083 <- 3.25 -> DT O2 J-024 : score 3.85233 >7otx_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-257 organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.79 -> DC O2 P0821 : score 3.50443 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.15 -> DC O2 T0723 : score 3.43981 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.16 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.50 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.33 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx >7otx_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-257 organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.79 -> DC O2 P0821 : score 3.50443 : H : ARG NH2 A0448 <- 3.15 -> DC O2 T0723 : score 3.43981 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.16 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.50 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.33 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx >7otx_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-257 organism=? : H : TYR OH C0183 <- 3.19 -> DC O2 F0821 : score 3.22464 : H : ARG NH1 C0448 <- 2.76 -> DT O2 F0806 : score 4.34086 : H : ARG NH2 C0448 <- 2.84 -> DT O2 F0806 : score 4.19947 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.32 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.27 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 3.88 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx >7otz_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-259 organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.75 -> DC O2 P0821 : score 3.53241 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.94 -> DC O2 T0723 : score 3.59515 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.25 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.15 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.92 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.08 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.23 -> DC xxx P0808 : score x.xxxxx >7otz_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-259 organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.89 -> DC O2 F0821 : score 3.43448 : H : ARG NH1 C0448 <- 2.87 -> DT O2 F0806 : score 4.24612 : H : ARG NH2 C0448 <- 3.14 -> DT O2 F0806 : score 3.94547 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.22 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0115 <- 4.44 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.24 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 3.98 -> DG xxx E0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 4.19 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx >7oue_C:DNA-glycosylase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TRAPPED PAB-AGOG/SINGLE-STANDED DNA COVALENT INTERMEDIATE organism=Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) : H : ARG NH2 C0093 <- 2.85 -> DT O2 D0001 : score 4.191 : H : ARG NH2 C0093 <- 2.85 -> DT O2 D0002 : score 4.191 : x : TYR xxxx C0052 <- 3.47 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0053 <- 3.06 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0055 <- 4.17 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0057 <- 3.97 -> DT xxx D0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0094 <- 3.64 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0097 <- 3.73 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0137 <- 3.81 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx >7oue_EG:DNA-glycosylase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TRAPPED PAB-AGOG/SINGLE-STANDED DNA COVALENT INTERMEDIATE organism=Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) : H : GLN OE1 G0053 <- 2.63 -> DT N3 F0007 : score 3.53018 : H : ARG NE G0092 <- 2.70 -> DC O2 F0008 : score 2.71215 >7ouf_B:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF THE STLV INTASOME:B56 COMPLEX BOUND TO THE STRAND- TRANSFER INHIBITOR XZ450 organism=? : x : ARG xxxx B0049 <- 4.30 -> DT xxx K0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0152 <- 4.43 -> DG xxx K0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0158 <- 3.99 -> DC xxx H0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0159 <- 3.13 -> DG xxx K0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0198 <- 3.91 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0199 <- 3.83 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx >7ouf_BD:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF THE STLV INTASOME:B56 COMPLEX BOUND TO THE STRAND- TRANSFER INHIBITOR XZ450 organism=? : H : ARG NH1 D0240 <- 2.51 -> DC O2 H0013 : score 3.8617 : x : ARG xxxx B0049 <- 4.30 -> DT xxx K0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0152 <- 4.43 -> DG xxx K0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0158 <- 3.99 -> DC xxx H0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0159 <- 3.13 -> DG xxx K0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0198 <- 3.91 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0199 <- 3.83 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx >7oug_AB:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STLV-1 INTASOME:B56 IN COMPLEX WITH THE STRAND-TRANSFER INHIBITOR RALTEGRAVIR organism=? : x : THR xxxx B0152 <- 4.23 -> DG xxx K0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0158 <- 3.90 -> DG xxx K0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0159 <- 3.13 -> DG xxx K0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0198 <- 3.94 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0199 <- 3.93 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx >7oug_B:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STLV-1 INTASOME:B56 IN COMPLEX WITH THE STRAND-TRANSFER INHIBITOR RALTEGRAVIR organism=? : x : THR xxxx B0152 <- 4.23 -> DG xxx K0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0158 <- 3.90 -> DG xxx K0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0159 <- 3.13 -> DG xxx K0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0198 <- 3.94 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0199 <- 3.93 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx >7oug_DE:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STLV-1 INTASOME:B56 IN COMPLEX WITH THE STRAND-TRANSFER INHIBITOR RALTEGRAVIR organism=? : x : THR xxxx E0152 <- 4.23 -> DG xxx I0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0158 <- 3.90 -> DG xxx I0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0159 <- 3.13 -> DG xxx I0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0198 <- 3.94 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0199 <- 3.93 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx >7ouh_AB:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF THE STLV INTASOME:B56 COMPLEX BOUND TO THE STRAND- TRANSFER INHIBITOR BICTEGRAVIR organism=? : H : ARG NE B0159 <- 2.85 -> DG N3 K0006 : score 1.73758 : V : LYS CE A0271 <- 3.77 -> DT C7 K0005 : score 2.62053 : x : GLU xxxx B0158 <- 4.29 -> DC xxx L0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0198 <- 3.78 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0199 <- 4.10 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx >7ouh_D:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF THE STLV INTASOME:B56 COMPLEX BOUND TO THE STRAND- TRANSFER INHIBITOR BICTEGRAVIR organism=? : V : LYS CE D0271 <- 3.77 -> DT C7 I0005 : score 2.62053 >7ouh_DE:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF THE STLV INTASOME:B56 COMPLEX BOUND TO THE STRAND- TRANSFER INHIBITOR BICTEGRAVIR organism=? : H : ARG NE E0159 <- 2.85 -> DG N3 I0006 : score 1.73758 : V : LYS CE D0271 <- 3.77 -> DT C7 I0005 : score 2.62053 : x : GLU xxxx E0158 <- 4.29 -> DC xxx J0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0198 <- 3.78 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0199 <- 4.10 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx >7out_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-264 organism=? : H : TYR OH A0183 <- 2.63 -> DC O2 P0821 : score 3.61635 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.94 -> DC O2 T0723 : score 3.59515 : x : ILE xxxx A0094 <- 3.29 -> DG xxx T0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.46 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.36 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0356 <- 4.26 -> DT xxx P0813 : score x.xxxxx >7out_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-264 organism=? : H : TYR OH C0183 <- 2.79 -> DC O2 F0821 : score 3.50443 : H : ARG NH1 C0448 <- 2.64 -> DT O2 F0806 : score 4.44422 : H : ARG NH2 C0448 <- 3.03 -> DT O2 F0806 : score 4.0386 : H : ARG NH2 C0448 <- 2.82 -> DC O2 F0807 : score 3.68392 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.22 -> DG xxx E0708 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0157 <- 4.15 -> DC xxx E0706 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0184 <- 4.17 -> DG xxx E0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0356 <- 3.85 -> DT xxx F0813 : score x.xxxxx >7owf_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=KLENTAQ DNA POLYMERASE IN A TERNARY COMPLEX WITH PRIMER/TEMPLATE AND THE FLUORESCENT NUCLEOTIDE ANALOG BFDUTP organism=Thermus aquaticus : H : LYS NZ A0540 <- 2.77 -> DC O2 B0109 : score 2.96383 : w : LYS NZ A0540 <- 5.74 -> DC O2 C0209 : score 1.3 : w : THR OG1 A0544 <- 5.56 -> DC O2 C0209 : score 2.048 : w : ARG NH1 A0573 <- 5.71 -> DT O2 C0206 : score 1.855 : w : ASN ND2 A0580 <- 5.77 -> DG N3 C0207 : score 2.566 : H : ASN ND2 A0583 <- 2.82 -> DC O2 B0110 : score 4.46157 : w : HIS NE2 A0784 <- 6.25 -> DT O2 C0206 : score 3.682 : x : TYR xxxx A0545 <- 4.38 -> DC xxx B0110 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0754 <- 3.53 -> DG xxx C0205 : score x.xxxxx >7ox7_B: title=TARGET-BOUND SPCAS9 COMPLEX WITH TRAC CHIMERIC RNA-DNA GUIDE organism=Streptococcus pyogenes serotype M1 : H : LYS NZ B1107 <- 2.68 -> DC O2 C-001 : score 3.01686 : w : LYS NZ B1107 <- 5.88 -> DG N3 D0002 : score 2.232 : w : SER OG B1136 <- 5.20 -> DG N3 D0002 : score 2.344 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.26 -> DG N7 D0001 : score 5.4934 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.82 -> DG O6 D0001 : score 6.5736 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.33 -> DG O6 D0002 : score 7.2204 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.14 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7ox8_B: title=TARGET-BOUND SPCAS9 COMPLEX WITH TRAC FULL RNA GUIDE organism=Streptococcus pyogenes serotype M1 : H : LYS NZ B1107 <- 2.82 -> DC O2 C-001 : score 2.93437 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.29 -> DG N7 D0001 : score 5.4571 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.63 -> DG O6 D0001 : score 6.8244 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.23 -> DG O6 D0002 : score 7.3524 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.33 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7ox9_B: title=TARGET-BOUND SPCAS9 COMPLEX WITH AAVS1 ALL-RNA GUIDE organism=Streptococcus pyogenes serotype M1 : H : LYS NZ B1107 <- 2.78 -> DC O2 C-001 : score 2.95794 : w : LYS NZ B1107 <- 5.58 -> DG N3 D0002 : score 2.232 : w : SER OG B1136 <- 5.32 -> DG N3 D0002 : score 2.344 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.15 -> DG N7 D0001 : score 5.6265 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.64 -> DG O6 D0001 : score 6.8112 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.31 -> DG O6 D0002 : score 7.2468 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.07 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7oxa_B: title=TARGET-BOUND SPCAS9 COMPLEX WITH AAVS1 CHIMERIC RNA-DNA GUIDE organism=Streptococcus pyogenes serotype M1 : H : LYS NZ B1107 <- 2.67 -> DC O2 C-001 : score 3.02275 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.20 -> DG N7 D0001 : score 5.566 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.77 -> DG O6 D0001 : score 6.6396 : H : ARG NH1 B1335 <- 3.35 -> DG N7 D0002 : score 5.3845 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.24 -> DG O6 D0002 : score 7.3392 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.19 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7oxq_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DOUBLE STRANDED DNA IN COMPLEX WITH FRAGMENT 048 AT THE TRANSIENT P-POCKET. organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH A0115 <- 2.81 -> DG N2 T0707 : score 4.87996 : H : TYR OH A0183 <- 2.59 -> DC O2 P0820 : score 3.64433 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.09 -> DG N3 P0805 : score 2.87552 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.94 -> DT O2 T0724 : score 4.1148 : x : ARG xxxx A0072 <- 4.45 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.49 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.25 -> DG xxx P0819 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0151 <- 3.62 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.55 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.68 -> DC xxx P0821 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.34 -> DC xxx T0712 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.63 -> DC xxx P0807 : score x.xxxxx >7oxq_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DOUBLE STRANDED DNA IN COMPLEX WITH FRAGMENT 048 AT THE TRANSIENT P-POCKET. organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH C0183 <- 2.90 -> DG N2 F0822 : score 4.79195 : H : ARG NH2 C0448 <- 3.30 -> DA N3 E0722 : score 2.91577 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.37 -> DG xxx E0707 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.45 -> DC xxx F0809 : score x.xxxxx >7oy7_A:DNA-glycosylase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TRAPPED PAB-AGOG/DOUBLE-STANDED DNA COVALENT INTERMEDIATE (DNA CONTAINING CYTOSINE OPPOSITE TO LESION) organism=Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) : H : ARG NE A0093 <- 2.77 -> DC O2 I0006 : score 2.67493 : H : ARG NH2 A0093 <- 3.33 -> DC N3 I0006 : score 2.04818 : w : ARG NH1 A0093 <- 5.74 -> DT O2 B0003 : score 1.855 : H : GLN NE2 A0097 <- 2.92 -> DT O2 B0006 : score 3.83893 : x : TYR xxxx A0052 <- 3.62 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0053 <- 3.63 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0094 <- 3.43 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx >7oz2_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DOUBLE STRANDED DNA SHOWING A TRANSIENT P-POCKET organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH A0115 <- 3.33 -> DG N2 T0707 : score 4.37143 : H : TYR OH A0183 <- 2.57 -> DC O2 P0820 : score 3.65832 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.32 -> DT O2 T0724 : score 4.63973 : x : PHE xxxx A0061 <- 3.94 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0072 <- 3.66 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.21 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.37 -> DC xxx T0709 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0151 <- 3.50 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 4.06 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.29 -> DC xxx P0821 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.47 -> DC xxx T0712 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.69 -> DC xxx P0807 : score x.xxxxx >7oz2_C:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DOUBLE STRANDED DNA SHOWING A TRANSIENT P-POCKET organism=? : H : TYR OH C0183 <- 3.08 -> DG N2 F0822 : score 4.61592 : H : ARG NH2 C0448 <- 2.87 -> DA N3 E0722 : score 3.19439 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.57 -> DG xxx E0707 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.56 -> DC xxx F0809 : score x.xxxxx >7oz2_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DOUBLE STRANDED DNA SHOWING A TRANSIENT P-POCKET organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH C0183 <- 3.08 -> DG N2 F0822 : score 4.61592 : H : ARG NH2 C0448 <- 2.87 -> DA N3 E0722 : score 3.19439 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.57 -> DG xxx E0707 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.56 -> DC xxx F0809 : score x.xxxxx >7oz3_ABCD:TrkA_C-terminal_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=S. AGALACTIAE BUSR IN COMPLEX WITH ITS BUSA-PROMOTOR DNA organism=STREPTOCOCCUS AGALACTIAE : H : ARG NE A0038 <- 3.30 -> DG N7 G0010 : score 3.97962 : H : ARG NH2 A0038 <- 2.89 -> DG N7 G0010 : score 6.26969 : H : GLU OE1 A0050 <- 2.63 -> DC N4 G0012 : score 5.96406 : H : GLU OE1 B0050 <- 2.78 -> DC N4 F0012 : score 5.79102 : x : THR xxxx A0051 <- 3.56 -> DT xxx F0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0053 <- 3.47 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0054 <- 4.24 -> DA xxx F0032 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0069 <- 3.63 -> DG xxx G0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0038 <- 3.25 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0048 <- 3.28 -> DT xxx G0033 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0051 <- 3.10 -> DT xxx G0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0053 <- 3.68 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0054 <- 4.17 -> DA xxx G0032 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0069 <- 3.55 -> DT xxx G0038 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0039 <- 4.34 -> DC xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0048 <- 3.93 -> DG xxx F0030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0049 <- 3.58 -> DT xxx F0031 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0039 <- 3.39 -> DC xxx F0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0048 <- 2.94 -> DT xxx G0030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0049 <- 3.89 -> DT xxx G0031 : score x.xxxxx >7oz3_D:TrkA_C-terminal_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=S. AGALACTIAE BUSR IN COMPLEX WITH ITS BUSA-PROMOTOR DNA organism=? : V : SER CB D0048 <- 3.77 -> DT C7 G0031 : score 3.15477 : x : THR xxxx D0039 <- 3.39 -> DC xxx F0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0049 <- 3.89 -> DT xxx G0031 : score x.xxxxx >7oz5_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DOUBLE STRANDED DNA IN COMPLEX WITH FRAGMENT 166 AT THE TRANSIENT P-POCKET. organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH A0115 <- 2.81 -> DG N2 T0707 : score 4.87996 : H : TYR OH A0183 <- 2.64 -> DC O2 P0820 : score 3.60935 : H : ARG NH1 A0448 <- 3.05 -> DG N3 P0805 : score 2.89994 : H : ARG NH2 A0448 <- 2.90 -> DT O2 T0724 : score 4.14867 : x : LYS xxxx A0066 <- 4.27 -> DC xxx P0821 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0072 <- 3.86 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0074 <- 3.72 -> DC xxx T0706 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0094 <- 3.26 -> DG xxx P0819 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0151 <- 3.18 -> DG xxx P0822 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0157 <- 3.68 -> DG xxx T0707 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.65 -> DC xxx P0821 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 3.66 -> DC xxx P0807 : score x.xxxxx >7oz5_CD:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DOUBLE STRANDED DNA IN COMPLEX WITH FRAGMENT 166 AT THE TRANSIENT P-POCKET. organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : H : TYR OH C0183 <- 3.37 -> DG N2 F0822 : score 4.33231 : H : TYR OH C0183 <- 3.27 -> DG N3 F0822 : score 2.82138 : x : ILE xxxx C0094 <- 3.24 -> DG xxx E0707 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0448 <- 2.90 -> DG xxx E0721 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0475 <- 3.69 -> DG xxx E0720 : score x.xxxxx >7ozw_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DNA APTAMER IN COMPLEX WITH FRAGMENT 166 AT THE TRANSIENT P-POCKET organism=? : x : ILE xxxx A0094 <- 2.72 -> DG xxx F0031 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0183 <- 3.78 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.18 -> DG xxx F0032 : score x.xxxxx >7ozw_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DNA APTAMER IN COMPLEX WITH FRAGMENT 166 AT THE TRANSIENT P-POCKET organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : x : ILE xxxx A0094 <- 2.72 -> DG xxx F0031 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0183 <- 3.78 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 4.18 -> DG xxx F0032 : score x.xxxxx >7p0w_A:DNA-glycosylase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TRAPPED PAB-AGOG/DOUBLE-STANDED DNA COVALENT INTERMEDIATE (DNA CONTAINING THYMINE OPPOSITE TO LESION) organism=Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) : H : ARG NE A0093 <- 2.87 -> DT O2 I0006 : score 2.54085 : H : GLN NE2 A0097 <- 3.05 -> DT O2 B0006 : score 3.73667 : x : TYR xxxx A0052 <- 3.66 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0053 <- 3.58 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0094 <- 3.43 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx >7p15_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DNA APTAMER IN COMPLEX WITH FRAGMENT F04 AT THE TRANSIENT P-POCKET organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : x : ILE xxxx A0094 <- 2.98 -> DG xxx F0031 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0183 <- 3.76 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.74 -> DG xxx F0032 : score x.xxxxx >7p15_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DNA APTAMER IN COMPLEX WITH FRAGMENT F04 AT THE TRANSIENT P-POCKET organism=HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 BH10 : x : ILE xxxx A0094 <- 2.98 -> DG xxx F0031 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0183 <- 3.76 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0184 <- 3.74 -> DG xxx F0032 : score x.xxxxx >7p3f_A: title=STREPTOMYCES COELICOLOR DATP/ATP-LOADED NRDR IN COMPLEX WITH ITS COGNATE DNA organism=? : H : ASP OD1 A0015 <- 2.79 -> DC N4 R0040 : score 5.35556 : H : ARG NH1 A0017 <- 3.39 -> DG N7 F0018 : score 5.3361 >7p3f_ABCD: title=STREPTOMYCES COELICOLOR DATP/ATP-LOADED NRDR IN COMPLEX WITH ITS COGNATE DNA organism=? : H : ASP OD1 A0015 <- 2.79 -> DC N4 R0040 : score 5.35556 : H : ARG NH1 A0017 <- 3.39 -> DG N7 F0018 : score 5.3361 : H : ARG NH1 C0017 <- 3.28 -> DG N7 R0019 : score 5.4692 : H : ARG NH2 C0017 <- 3.38 -> DG O6 R0019 : score 5.8344 : x : ASP xxxx C0015 <- 3.19 -> DC xxx F0039 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0013 <- 4.19 -> DG xxx F0046 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0015 <- 4.30 -> DC xxx R0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0016 <- 3.65 -> DG xxx F0046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0017 <- 3.34 -> DT xxx F0047 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0013 <- 3.49 -> DT xxx R0047 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0015 <- 3.94 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0017 <- 3.11 -> DG xxx R0049 : score x.xxxxx >7p5x_CDFY: title=MYCOBACTERIAL RNAP WITH TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR PAFBC organism=? : H : ARG NH2 C0172 <- 3.08 -> DA N7 O0062 : score 1.57817 : H : ARG NH1 C0219 <- 2.83 -> DC O2 O0061 : score 3.6281 : H : ARG NE Y0046 <- 3.36 -> DG O6 P0119 : score 3.49963 : H : ARG NH1 Y0050 <- 3.12 -> DG O6 O0034 : score 5.694 : H : ARG NH2 Y0050 <- 2.91 -> DG N7 O0034 : score 6.24415 : V : ARG CZ C0412 <- 3.87 -> DT C7 P0103 : score 2.09499 : x : TRP xxxx C0202 <- 3.15 -> DC xxx O0061 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0218 <- 3.67 -> DC xxx O0060 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0393 <- 3.13 -> DA xxx P0105 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0397 <- 4.33 -> DA xxx P0105 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0419 <- 3.58 -> DG xxx P0102 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0420 <- 3.33 -> DT xxx P0101 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0454 <- 3.61 -> DA xxx O0062 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0457 <- 3.67 -> DT xxx P0092 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0458 <- 3.61 -> DA xxx O0063 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C1053 <- 3.84 -> DC xxx P0099 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0330 <- 3.30 -> DA xxx P0100 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0331 <- 4.19 -> DA xxx P0100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0334 <- 4.23 -> DA xxx P0100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0427 <- 4.32 -> DC xxx P0095 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0501 <- 4.40 -> DC xxx P0094 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0502 <- 3.88 -> DC xxx P0094 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0866 <- 3.51 -> DA xxx P0093 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0867 <- 3.76 -> DA xxx P0093 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0164 <- 3.40 -> DA xxx O0056 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0166 <- 3.85 -> DA xxx O0056 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0167 <- 2.98 -> DA xxx O0056 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0170 <- 3.84 -> DA xxx O0056 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0178 <- 3.71 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0184 <- 4.26 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0237 <- 3.94 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0239 <- 3.20 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0240 <- 4.18 -> DT xxx O0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0247 <- 3.03 -> DA xxx P0105 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0248 <- 4.12 -> DA xxx P0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0251 <- 4.41 -> DA xxx P0105 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0255 <- 4.48 -> DA xxx O0056 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0273 <- 3.93 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0274 <- 3.73 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0277 <- 3.41 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0279 <- 3.92 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0282 <- 2.97 -> DG xxx O0053 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0283 <- 3.82 -> DG xxx O0053 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0284 <- 3.78 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0286 <- 3.70 -> DG xxx O0053 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0287 <- 3.19 -> DT xxx O0049 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0288 <- 3.99 -> DT xxx O0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0290 <- 2.89 -> DA xxx P0105 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0291 <- 3.25 -> DT xxx O0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0295 <- 4.07 -> DT xxx O0047 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0309 <- 3.54 -> DT xxx O0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0312 <- 3.61 -> DG xxx P0107 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0314 <- 4.16 -> DA xxx P0104 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0315 <- 3.53 -> DA xxx P0104 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0359 <- 3.56 -> DA xxx P0100 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0365 <- 3.82 -> DC xxx P0099 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0368 <- 3.50 -> DG xxx P0097 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0370 <- 3.46 -> DG xxx P0097 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0371 <- 2.51 -> DA xxx P0098 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0373 <- 3.20 -> DC xxx P0099 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0376 <- 3.50 -> DA xxx P0098 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx Y0049 <- 3.43 -> DC xxx P0117 : score x.xxxxx >7p5x_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=MYCOBACTERIAL RNAP WITH TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR PAFBC organism=? : x : LEU xxxx D0330 <- 3.30 -> DA xxx P0100 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0331 <- 4.19 -> DA xxx P0100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0334 <- 4.23 -> DA xxx P0100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0427 <- 4.32 -> DC xxx P0095 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0501 <- 4.40 -> DC xxx P0094 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0502 <- 3.88 -> DC xxx P0094 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0866 <- 3.51 -> DA xxx P0093 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0867 <- 3.76 -> DA xxx P0093 : score x.xxxxx >7p8l_A:DNA-glycosylase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PYROCOCCUS ABYSSI 8-OXOGUANINE DNA GLYCOSYLASE (PABAGOG) IN COMPLEX WITH DSDNA CONTAINING CYTOSINE OPPOSITE TO 8- OXOG organism=Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) / Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) : w : GLN OE1 A0053 <- 6.13 -> DT O4 B0005 : score 3.068 : w : GLN OE1 A0060 <- 5.61 -> DT O2 B0003 : score 2.481 : H : ARG NE A0093 <- 2.80 -> DC O2 I0006 : score 2.65897 : H : ARG NH2 A0093 <- 2.92 -> DC N3 I0006 : score 2.23604 : w : ARG NH2 A0093 <- 6.40 -> DT O4 B0005 : score 2.366 : x : TYR xxxx A0052 <- 3.70 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0055 <- 4.37 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0057 <- 3.92 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0094 <- 3.56 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx >7p8v_A:ATPase_domain_of_HSP90_chaperone/DNA_topoisomerase_II/histidine_kinase;Ribosomal_protein_S5_domain_2-like; title=THE STRUCTURE OF E. COLI MUTL BOUND TO A 3' RESECTED DNA END organism=Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) : x : ARG xxxx A0316 <- 3.45 -> DA xxx D0038 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0320 <- 3.88 -> DA xxx D0038 : score x.xxxxx >7p8v_AB:ATPase_domain_of_HSP90_chaperone/DNA_topoisomerase_II/histidine_kinase;Ribosomal_protein_S5_domain_2-like; title=THE STRUCTURE OF E. COLI MUTL BOUND TO A 3' RESECTED DNA END organism=Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) / Escherichia coli (strain K12) : x : ARG xxxx A0316 <- 3.45 -> DA xxx D0038 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0320 <- 3.88 -> DA xxx D0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0165 <- 3.34 -> DG xxx D0034 : score x.xxxxx >7p9z_A:DNA-glycosylase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A TRAPPED PAB-AGOG/DOUBLE-STANDED DNA COVALENT INTERMEDIATE (DNA CONTAINING ADENINE OPPOSITE TO LESION) organism=Pyrococcus abyssi : H : ARG NE A0093 <- 2.92 -> DA N3 I0007 : score 2.0521 : H : GLN NE2 A0097 <- 3.19 -> DA N3 I0005 : score 3.71282 : H : GLN NE2 A0097 <- 3.09 -> DT O2 B0006 : score 3.7052 : x : TYR xxxx A0052 <- 3.69 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0053 <- 3.01 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0094 <- 3.44 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx >7pbl_ABCD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=RUVAB BRANCH MIGRATION MOTOR COMPLEXED TO THE HOLLIDAY JUNCTION - RUVB AAA+ STATE S1 [T2 DATASET] organism=? : x : ARG xxxx B0312 <- 3.71 -> DG xxx V0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0312 <- 3.54 -> DT xxx U0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0312 <- 4.32 -> DG xxx U0009 : score x.xxxxx >7pbl_C:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=RUVAB BRANCH MIGRATION MOTOR COMPLEXED TO THE HOLLIDAY JUNCTION - RUVB AAA+ STATE S1 [T2 DATASET] organism=? : x : ARG xxxx C0312 <- 3.54 -> DT xxx U0007 : score x.xxxxx >7pbm_ABCD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=RUVAB BRANCH MIGRATION MOTOR COMPLEXED TO THE HOLLIDAY JUNCTION - RUVB AAA+ STATE S2 [T2 DATASET] organism=? : x : ARG xxxx B0312 <- 4.39 -> DT xxx U0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0312 <- 3.86 -> DC xxx U0008 : score x.xxxxx >7pbm_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=RUVAB BRANCH MIGRATION MOTOR COMPLEXED TO THE HOLLIDAY JUNCTION - RUVB AAA+ STATE S2 [T2 DATASET] organism=? : x : ARG xxxx B0312 <- 4.39 -> DT xxx U0006 : score x.xxxxx >7pbn_ABCD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=RUVAB BRANCH MIGRATION MOTOR COMPLEXED TO THE HOLLIDAY JUNCTION - RUVB AAA+ STATE S3 [T2 DATASET] organism=? : x : ARG xxxx B0312 <- 4.19 -> DT xxx U0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0312 <- 3.87 -> DC xxx U0008 : score x.xxxxx >7pbo_ABCD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=RUVAB BRANCH MIGRATION MOTOR COMPLEXED TO THE HOLLIDAY JUNCTION - RUVB AAA+ STATE S4 [T2 DATASET] organism=? : x : ARG xxxx B0312 <- 3.31 -> DG xxx V0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0312 <- 3.87 -> DC xxx U0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0312 <- 4.47 -> DG xxx U0009 : score x.xxxxx >7pbo_D:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=RUVAB BRANCH MIGRATION MOTOR COMPLEXED TO THE HOLLIDAY JUNCTION - RUVB AAA+ STATE S4 [T2 DATASET] organism=? : x : ARG xxxx D0312 <- 4.47 -> DG xxx U0009 : score x.xxxxx >7pbp_ABCD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=RUVAB BRANCH MIGRATION MOTOR COMPLEXED TO THE HOLLIDAY JUNCTION - RUVB AAA+ STATE S5 [T2 DATASET] organism=? : x : ARG xxxx C0312 <- 3.91 -> DC xxx U0008 : score x.xxxxx >7pbq_ABCDF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=RUVAB BRANCH MIGRATION MOTOR COMPLEXED TO THE HOLLIDAY JUNCTION - RUVB AAA+ STATE S0+A [T2 DATASET] organism=? : x : ARG xxxx A0312 <- 4.05 -> DC xxx U0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0312 <- 4.09 -> DG xxx V0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0312 <- 3.95 -> DA xxx V0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0312 <- 4.42 -> DA xxx U0003 : score x.xxxxx >7pbq_C:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=RUVAB BRANCH MIGRATION MOTOR COMPLEXED TO THE HOLLIDAY JUNCTION - RUVB AAA+ STATE S0+A [T2 DATASET] organism=? : x : ARG xxxx C0312 <- 3.95 -> DA xxx V0010 : score x.xxxxx >7pbr_ABCD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=RUVAB BRANCH MIGRATION MOTOR COMPLEXED TO THE HOLLIDAY JUNCTION - RUVB AAA+ STATE S0-A [T2 DATASET] organism=? : x : ARG xxxx A0312 <- 4.40 -> DC xxx U0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0312 <- 3.56 -> DG xxx V0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0312 <- 3.92 -> DC xxx U0008 : score x.xxxxx >7pbr_C:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=RUVAB BRANCH MIGRATION MOTOR COMPLEXED TO THE HOLLIDAY JUNCTION - RUVB AAA+ STATE S0-A [T2 DATASET] organism=? : x : ARG xxxx C0312 <- 3.92 -> DC xxx U0008 : score x.xxxxx >7pbs_ABCDF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=RUVAB BRANCH MIGRATION MOTOR COMPLEXED TO THE HOLLIDAY JUNCTION - RUVB AAA+ STATE S0+A [T1 DATASET] organism=? : x : ARG xxxx A0312 <- 4.38 -> DC xxx U0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0312 <- 4.03 -> DT xxx U0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0312 <- 3.87 -> DC xxx U0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0312 <- 4.40 -> DA xxx U0010 : score x.xxxxx >7pbs_C:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=RUVAB BRANCH MIGRATION MOTOR COMPLEXED TO THE HOLLIDAY JUNCTION - RUVB AAA+ STATE S0+A [T1 DATASET] organism=? : x : ARG xxxx C0312 <- 3.87 -> DC xxx U0008 : score x.xxxxx >7pbt_ABCD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=RUVAB BRANCH MIGRATION MOTOR COMPLEXED TO THE HOLLIDAY JUNCTION - RUVB AAA+ STATE S1 [T1 DATASET] organism=? : x : ARG xxxx B0312 <- 4.21 -> DT xxx U0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0312 <- 3.76 -> DA xxx V0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0312 <- 4.48 -> DA xxx U0010 : score x.xxxxx >7pbt_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=RUVAB BRANCH MIGRATION MOTOR COMPLEXED TO THE HOLLIDAY JUNCTION - RUVB AAA+ STATE S1 [T1 DATASET] organism=? : x : ARG xxxx B0312 <- 4.21 -> DT xxx U0006 : score x.xxxxx >7pel_AE:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=CRYOEM STRUCTURE OF SIMIAN T-CELL LYMPHOTROPIC VIRUS INTASOME IN COMPLEX WITH PP2A REGULATORY SUBUNIT B56 GAMMA organism=? : x : ARG xxxx A0240 <- 3.71 -> DG xxx M0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0152 <- 4.31 -> DG xxx M0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0158 <- 3.90 -> DC xxx N0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0159 <- 3.01 -> DG xxx M0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0198 <- 4.00 -> DT xxx M0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0199 <- 4.07 -> DT xxx M0007 : score x.xxxxx >7pel_BD:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=CRYOEM STRUCTURE OF SIMIAN T-CELL LYMPHOTROPIC VIRUS INTASOME IN COMPLEX WITH PP2A REGULATORY SUBUNIT B56 GAMMA organism=? : V : ALA CB B0253 <- 3.74 -> DT C7 K0003 : score 5.68296 : x : ARG xxxx B0053 <- 3.57 -> DT xxx K0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0151 <- 3.95 -> DA xxx L0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0152 <- 3.34 -> DA xxx L0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0158 <- 3.90 -> DC xxx L0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0159 <- 3.02 -> DG xxx K0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0198 <- 4.00 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0199 <- 4.07 -> DT xxx K0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0240 <- 3.71 -> DG xxx K0010 : score x.xxxxx >7pel_D:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=CRYOEM STRUCTURE OF SIMIAN T-CELL LYMPHOTROPIC VIRUS INTASOME IN COMPLEX WITH PP2A REGULATORY SUBUNIT B56 GAMMA organism=? : x : ARG xxxx D0240 <- 3.71 -> DG xxx K0010 : score x.xxxxx >7peu_Q:Histone-fold; title=TRINUCLEOSOME OF THE 4X177 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : x : ARG xxxx Q0011 <- 3.45 -> DT xxx I0483 : score x.xxxxx >7pev_G:Histone-fold; title=NUCLEOSOME STACK OF THE 4X177 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : H : ARG NH2 G0042 <- 3.07 -> DT O2 I0124 : score 4.00473 : x : ARG xxxx G0011 <- 3.51 -> DT xxx I0129 : score x.xxxxx >7pew_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME 1 OF THE 4X177 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : H : ARG NH1 A0040 <- 3.03 -> DT O2 J0626 : score 4.10832 : H : ARG NH2 A0040 <- 2.42 -> DT O2 J0626 : score 4.55507 : H : ARG NH1 C0011 <- 2.82 -> DA N3 J0660 : score 3.66732 : H : ARG NH2 C0011 <- 3.20 -> DT O2 J0661 : score 3.89467 : H : ARG NH2 C0042 <- 3.31 -> DG N3 J0655 : score 3.24201 : H : ARG NH1 D0033 <- 3.31 -> DC O2 J0666 : score 3.2777 : H : ARG NH2 D0033 <- 3.23 -> DC O2 I0038 : score 3.38063 : H : ARG NH1 E0040 <- 2.57 -> DG N3 I0095 : score 3.19298 : x : ARG xxxx B0045 <- 3.62 -> DA xxx J0623 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0030 <- 4.17 -> DG xxx I0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.66 -> DT xxx J0593 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.44 -> DG xxx J0612 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0011 <- 3.43 -> DT xxx I0129 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.73 -> DT xxx I0124 : score x.xxxxx >7pew_G:Histone-fold; title=NUCLEOSOME 1 OF THE 4X177 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : x : ARG xxxx G0011 <- 3.43 -> DT xxx I0129 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.73 -> DT xxx I0124 : score x.xxxxx >7pey_KLMNOPQR:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME 3 OF THE 4X177 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : H : ARG NH2 K0040 <- 2.31 -> DT O2 J0272 : score 4.6482 : H : ARG NH1 O0040 <- 2.81 -> DG N3 I0449 : score 3.04646 : x : TYR xxxx K0041 <- 4.18 -> DT xxx J0196 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0042 <- 4.46 -> DA xxx J0302 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx N0030 <- 3.87 -> DG xxx J0313 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0033 <- 2.93 -> DT xxx I0393 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0083 <- 3.82 -> DT xxx J0239 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0045 <- 3.58 -> DC xxx I0446 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0011 <- 3.45 -> DT xxx I0483 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0033 <- 4.47 -> DC xxx J0216 : score x.xxxxx >7pez_l:Histone-fold; title=NUCLEOSOME 4 OF THE 4X177 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : x : ARG xxxx l0045 <- 4.29 -> DA xxx J0092 : score x.xxxxx >7pf0_b:Histone-fold; title=TRINUCLEOSOME OF THE 4X177 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : x : ARG xxxx b0045 <- 4.04 -> DA xxx J0474 : score x.xxxxx >7pf3_s:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=NUCLEOSOME 4 OF THE 4X187 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : H : ARG NH2 s0078 <- 3.13 -> DG N3 J0171 : score 3.37198 : x : SER xxxx s0101 <- 4.48 -> DG xxx J0094 : score x.xxxxx >7pf4_KLMNOPQR:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME 3 OF THE 4X187 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : H : ARG NH2 K0040 <- 2.92 -> DT O2 J0290 : score 4.13173 : H : ARG NH1 N0033 <- 3.23 -> DC O2 J0330 : score 3.3361 : H : ARG NH2 N0033 <- 3.44 -> DC O2 I0420 : score 3.22528 : H : ARG NH1 O0040 <- 2.98 -> DG N3 I0477 : score 2.94267 : x : ARG xxxx L0045 <- 4.00 -> DA xxx J0287 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0011 <- 3.49 -> DA xxx J0324 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0042 <- 3.59 -> DC xxx J0318 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx N0030 <- 4.27 -> DC xxx I0420 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0045 <- 4.03 -> DC xxx I0474 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0011 <- 3.49 -> DC xxx I0512 : score x.xxxxx >7pf4_P:Histone-fold; title=NUCLEOSOME 3 OF THE 4X187 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : x : ARG xxxx P0045 <- 4.03 -> DC xxx I0474 : score x.xxxxx >7pf5_b:Histone-fold; title=NUCLEOSOME 2 OF THE 4X187 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : x : ARG xxxx b0045 <- 4.04 -> DA xxx J0474 : score x.xxxxx >7pfa_A:Histone-fold; title=TRINUCLEOSOME OF THE 4X197 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 3.36 -> DT O2 J0699 : score 3.7592 >7pfc_G:Histone-fold; title=NUCLEOSOME STACK OF THE 4X197 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : H : ARG NH2 G0042 <- 3.04 -> DC O2 I0136 : score 3.52118 : x : ARG xxxx G0011 <- 3.32 -> DC xxx I0143 : score x.xxxxx >7pfd_D:Histone-fold; title=NUCLEOSOME 1 OF THE 4X197 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : H : ARG NH1 D0033 <- 2.45 -> DC O2 J0739 : score 3.9055 : H : ARG NH2 D0033 <- 2.30 -> DC O2 I0051 : score 4.06859 : x : LYS xxxx D0030 <- 4.31 -> DG xxx I0050 : score x.xxxxx >7pfe_d:Histone-fold; title=NUCLEOSOME 2 OF THE 4X197 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : H : ARG NH1 d0033 <- 3.14 -> DC O2 J0542 : score 3.4018 : H : ARG NH2 d0033 <- 2.96 -> DC O2 I0248 : score 3.58036 >7pff_KLMNOPQR:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME 3 OF THE 4X197 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : H : ARG NH2 K0040 <- 3.20 -> DG N3 I0502 : score 3.32144 : H : ARG NH2 M0042 <- 2.91 -> DC O2 I0530 : score 3.61735 : H : ARG NH1 N0033 <- 2.67 -> DC O2 I0542 : score 3.7449 : H : ARG NH2 N0033 <- 3.06 -> DC O2 J0248 : score 3.50638 : H : ARG NH1 O0040 <- 3.18 -> DT O2 J0305 : score 3.97912 : H : ARG NH1 Q0011 <- 3.07 -> DT O2 J0340 : score 4.07386 : H : ARG NH2 Q0042 <- 3.25 -> DC O2 J0333 : score 3.36583 : x : ARG xxxx K0083 <- 4.38 -> DT xxx J0272 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0045 <- 3.33 -> DC xxx I0499 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx N0030 <- 3.90 -> DG xxx J0247 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0083 <- 3.72 -> DG xxx I0469 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0035 <- 4.28 -> DT xxx J0305 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0045 <- 3.53 -> DA xxx J0302 : score x.xxxxx >7pff_P:Histone-fold; title=NUCLEOSOME 3 OF THE 4X197 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : x : ARG xxxx P0035 <- 4.28 -> DT xxx J0305 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0045 <- 3.53 -> DA xxx J0302 : score x.xxxxx >7pfo_25: title=CORE HUMAN REPLISOME organism=? : H : ARG NH2 20562 <- 3.15 -> DT O2 M0054 : score 3.937 : V : LEU CD2 50209 <- 3.73 -> DT C7 M0044 : score 5.83158 : x : TRP xxxx 20569 <- 3.50 -> DT xxx M0055 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 50420 <- 3.17 -> DT xxx M0052 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx 50427 <- 4.25 -> DT xxx M0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 50451 <- 4.13 -> DT xxx M0057 : score x.xxxxx >7pfo_3467KL: title=CORE HUMAN REPLISOME organism=? : H : ARG NH2 40404 <- 3.09 -> DC O2 N0017 : score 3.48419 : H : ARG NH1 K0321 <- 2.90 -> DT O2 N0029 : score 4.22028 : x : PHE xxxx 70285 <- 3.86 -> DC xxx N0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx 70288 <- 3.59 -> DC xxx N0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 70420 <- 3.95 -> DT xxx M0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0062 <- 4.44 -> DA xxx M0038 : score x.xxxxx >7pfo_5:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CORE HUMAN REPLISOME organism=? : V : LEU CD2 50209 <- 3.73 -> DT C7 M0044 : score 5.83158 : x : ARG xxxx 50420 <- 3.17 -> DT xxx M0052 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx 50427 <- 4.25 -> DT xxx M0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 50451 <- 4.13 -> DT xxx M0057 : score x.xxxxx >7pft_P:Histone-fold; title=TRINUCLEOSOME OF THE 4X207 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : x : ARG xxxx P0035 <- 4.23 -> DT xxx J0320 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0045 <- 4.24 -> DA xxx J0317 : score x.xxxxx >7pfv_C:Histone-fold; title=NUCLEOSOME 1 OF THE 4X207 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : H : ARG NH1 C0011 <- 2.93 -> DT O2 J0769 : score 4.19444 : H : ARG NH2 C0011 <- 2.47 -> DT O2 I0061 : score 4.51273 : x : ARG xxxx C0042 <- 3.75 -> DC xxx J0762 : score x.xxxxx >7pfw_g:Histone-fold; title=NUCLEOSOME 2 OF THE 4X207 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : x : ARG xxxx g0011 <- 3.29 -> DA xxx J0475 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx g0042 <- 4.40 -> DT xxx I0349 : score x.xxxxx >7pfx_Q:Histone-fold; title=NUCLEOSOME 3 OF THE 4X207 NUCLEOSOME ARRAY CONTAINING H1 organism=? : H : ARG NH2 Q0011 <- 3.33 -> DT O2 J0355 : score 3.7846 : x : ARG xxxx Q0042 <- 3.79 -> DC xxx J0348 : score x.xxxxx >7pgv_E:Histone-fold; title=H3K36 TRI-METHYLATED NUCLEOSOME LEDGF PWWP DOMAIN COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 E0040 <- 3.45 -> DG N3 I0009 : score 2.65573 : x : ARG xxxx E0083 <- 4.03 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx >7pgw_C:Histone-fold; title=H3K36 TRI-METHYLATED NUCLEOSOME LEDGF PWWP DOMAIN COMPLEX POSE 2 organism=? : x : ARG xxxx C0042 <- 4.50 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx >7ph5_C:Histone-fold; title=H3K36 DI-METHYLATED NUCLEOSOME LEDGF PWWP DOMAIN COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx C0042 <- 4.50 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx >7ph6_C:Histone-fold; title=H3K36 DI-METHYLATED NUCLEOSOME LEDGF PWWP DOMAIN COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx C0042 <- 4.50 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx >7pii_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF THE HUMAN CCAN CENP-A ALPHA-SATELLITE COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : LEU xxxx A0065 <- 4.23 -> DT xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.05 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.39 -> DC xxx J0038 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.00 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.97 -> DA xxx I0038 : score x.xxxxx >7pii_B:Histone-fold; title=STRUCTURE OF THE HUMAN CCAN CENP-A ALPHA-SATELLITE COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx B0045 <- 4.05 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx >7pik_ABC:Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI TNSB IN COMPLEX WITH RIGHT END FRAGMENT OF TN7 TRANSPOSON organism=ESCHERICHIA COLI : H : SER OG A0143 <- 2.59 -> DT O2 K0054 : score 3.85273 : H : ARG NH2 A0150 <- 2.54 -> DT O2 K0056 : score 4.45347 : H : LYS NZ B0116 <- 3.32 -> DG N7 K0025 : score 4.82576 : H : ARG NH1 B0160 <- 2.95 -> DA N3 L0032 : score 3.57159 : H : ARG NH1 B0223 <- 3.15 -> DG O6 K0040 : score 5.6575 : H : ARG NH1 B0223 <- 2.61 -> DT O4 K0041 : score 3.39213 : H : LYS NZ C0116 <- 3.00 -> DG N7 K0004 : score 5.17046 : H : LYS NZ C0116 <- 2.61 -> DG O6 K0004 : score 6.00044 : H : ARG NH1 C0150 <- 3.05 -> DT O2 K0015 : score 4.09109 : H : ARG NH2 C0150 <- 2.43 -> DT O2 K0015 : score 4.5466 : H : ARG NE C0223 <- 3.19 -> DG N7 K0019 : score 4.07689 : H : ARG NH2 C0223 <- 2.56 -> DG O6 K0019 : score 6.9168 : x : THR xxxx A0115 <- 4.13 -> DA xxx L0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0116 <- 3.88 -> DG xxx K0045 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0117 <- 4.09 -> DT xxx K0047 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0118 <- 4.43 -> DT xxx L0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0120 <- 4.36 -> DT xxx K0046 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0115 <- 4.30 -> DT xxx L0042 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0117 <- 4.07 -> DT xxx K0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0118 <- 4.39 -> DT xxx L0042 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0120 <- 4.50 -> DT xxx K0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0140 <- 4.35 -> DG xxx L0038 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0143 <- 3.64 -> DG xxx L0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0150 <- 3.25 -> DT xxx K0036 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0158 <- 3.72 -> DT xxx K0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0227 <- 3.98 -> DT xxx K0039 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0034 <- 4.11 -> DT xxx K0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0117 <- 4.18 -> DT xxx K0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0120 <- 4.24 -> DG xxx K0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0140 <- 4.19 -> DT xxx L0060 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0143 <- 3.32 -> DT xxx K0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0226 <- 4.04 -> DT xxx L0049 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0227 <- 4.03 -> DT xxx K0018 : score x.xxxxx >7pik_B:Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI TNSB IN COMPLEX WITH RIGHT END FRAGMENT OF TN7 TRANSPOSON organism=ESCHERICHIA COLI : H : LYS NZ B0116 <- 3.32 -> DG N7 K0025 : score 4.82576 : H : ARG NH1 B0160 <- 2.95 -> DA N3 L0032 : score 3.57159 : H : ARG NH1 B0223 <- 3.15 -> DG O6 K0040 : score 5.6575 : H : ARG NH1 B0223 <- 2.61 -> DT O4 K0041 : score 3.39213 : x : THR xxxx B0115 <- 4.30 -> DT xxx L0042 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0117 <- 4.07 -> DT xxx K0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0118 <- 4.39 -> DT xxx L0042 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0120 <- 4.50 -> DT xxx K0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0140 <- 4.35 -> DG xxx L0038 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0143 <- 3.64 -> DG xxx L0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0150 <- 3.25 -> DT xxx K0036 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0158 <- 3.72 -> DT xxx K0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0227 <- 3.98 -> DT xxx K0039 : score x.xxxxx >7pks_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=STRUCTURAL BASIS OF INTEGRATOR-MEDIATED TRANSCRIPTION REGULATION organism=? : V : LYS CE A0285 <- 3.83 -> DT C7 N0014 : score 2.58152 : x : THR xxxx A0854 <- 4.45 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1416 <- 4.01 -> DA xxx T0022 : score x.xxxxx >7pks_ABE: title=STRUCTURAL BASIS OF INTEGRATOR-MEDIATED TRANSCRIPTION REGULATION organism=? : V : LYS CE A0285 <- 3.83 -> DT C7 N0014 : score 2.58152 : x : THR xxxx A0854 <- 4.45 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1416 <- 4.01 -> DA xxx T0022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0492 <- 2.64 -> DA xxx N0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0494 <- 4.04 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx >7pla_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF SHCAS12K IN COMPLEX WITH A SGRNA AND A DSDNA TARGET organism=SCYTONEMA HOFMANNII : H : ARG NH1 A0078 <- 2.77 -> DG O6 D0017 : score 6.11983 : H : ARG NH2 A0078 <- 2.64 -> DG O6 D0017 : score 6.8112 : H : THR OG1 A0287 <- 3.24 -> DA N7 C0032 : score 3.11366 : H : ARG NH1 A0421 <- 2.56 -> DT O2 D0018 : score 4.51312 : H : ARG NH2 A0421 <- 3.15 -> DT O2 D0018 : score 3.937 : x : MET xxxx A0081 <- 4.36 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0085 <- 4.46 -> DA xxx C0032 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0306 <- 3.28 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0418 <- 4.25 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx >7plo_34567KLO: title=H. SAPIENS REPLISOME-CUL2/LRR1 COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 K0321 <- 2.79 -> DT O2 N0016 : score 4.2418 : V : LEU CD2 50209 <- 3.51 -> DT C7 M0044 : score 6.1468 : x : ARG xxxx 40404 <- 3.94 -> DG xxx M0045 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx 70285 <- 3.30 -> DT xxx M0046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 70286 <- 3.55 -> DT xxx M0047 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx 70287 <- 4.17 -> DA xxx N0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx 70288 <- 3.29 -> DC xxx N0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx 70289 <- 4.27 -> DT xxx M0047 : score x.xxxxx >7pmk_234567XY: title=S. CEREVISIAE REPLISOME-SCF(DIA2) COMPLEX BOUND TO DOUBLE-STRANDED DNA (CONFORMATION I) organism=? : H : ARG NH1 40449 <- 2.88 -> DC O2 J0104 : score 3.5916 : H : ARG NH2 40449 <- 2.85 -> DC O2 J0105 : score 3.66173 : H : ARG NH2 50460 <- 2.60 -> DT O4 I0101 : score 3.696 : H : ARG NH2 X0401 <- 2.98 -> DG N3 I0010 : score 3.48029 : x : TRP xxxx 20589 <- 3.40 -> DT xxx I0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 50455 <- 3.47 -> DT xxx I0102 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx 50462 <- 3.14 -> DT xxx I0103 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 60614 <- 3.82 -> DC xxx J0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx 60621 <- 4.27 -> DG xxx I0107 : score x.xxxxx >7pmn_23456LXY: title=S. CEREVISIAE REPLISOME-SCF(DIA2) COMPLEX BOUND TO DOUBLE-STRANDED DNA (CONFORMATION II) organism=? : H : ARG NH1 40449 <- 2.75 -> DC O2 J0104 : score 3.6865 : H : ARG NH2 40449 <- 2.97 -> DC O2 J0105 : score 3.57296 : H : ARG NH2 X0401 <- 3.07 -> DG N3 I0010 : score 3.4153 : x : LYS xxxx 20582 <- 3.98 -> DT xxx I0104 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx 20589 <- 3.14 -> DT xxx I0105 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx 50462 <- 3.89 -> DT xxx I0103 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 60614 <- 3.61 -> DG xxx I0106 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx 60621 <- 3.98 -> DG xxx I0107 : score x.xxxxx >7prv_A:Nuclear_receptor_ligand-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THE GLUCOCORTICOID RECEPTOR IN COMPLEX WITH FLUTICASONE FUROATE, A PGC1A COACTIVATOR FRAGMENT AND SGK 23BP organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0447 <- 2.99 -> DG N7 C0015 : score 5.8201 : H : ARG NH2 A0447 <- 2.78 -> DG O6 C0015 : score 6.6264 : V : VAL CG1 A0443 <- 3.75 -> DT C7 C0016 : score 6.13627 : x : LYS xxxx A0442 <- 3.11 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx >7prv_AB:Nuclear_receptor_ligand-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THE GLUCOCORTICOID RECEPTOR IN COMPLEX WITH FLUTICASONE FUROATE, A PGC1A COACTIVATOR FRAGMENT AND SGK 23BP organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0447 <- 2.99 -> DG N7 C0015 : score 5.8201 : H : ARG NH2 A0447 <- 2.78 -> DG O6 C0015 : score 6.6264 : H : ARG NH1 B0447 <- 2.85 -> DG N7 D0014 : score 5.9895 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.68 -> DG O6 D0014 : score 6.7584 : V : VAL CG1 A0443 <- 3.75 -> DT C7 C0016 : score 6.13627 : V : VAL CG1 B0443 <- 3.62 -> DT C7 D0015 : score 6.33324 : x : LYS xxxx A0442 <- 3.11 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0432 <- 4.15 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0442 <- 3.54 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx >7prw_AB:Nuclear_receptor_ligand-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THE GLUCOCORTICOID RECEPTOR IN COMPLEX WITH VELSECORAT, A PGC1A COACTIVATOR FRAGMENT AND SGK 23BP organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0442 <- 2.84 -> DG N7 D0006 : score 5.34281 : H : ARG NH1 A0447 <- 2.91 -> DG N7 C0015 : score 5.9169 : H : ARG NH2 A0447 <- 2.78 -> DG O6 C0015 : score 6.6264 : H : ARG NH1 B0447 <- 2.88 -> DG N7 D0015 : score 5.9532 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.81 -> DG O6 D0015 : score 6.5868 : V : VAL CG1 A0443 <- 3.67 -> DT C7 C0016 : score 6.25748 : V : VAL CG1 B0443 <- 3.70 -> DT C7 D0016 : score 6.21203 : x : LYS xxxx B0442 <- 3.48 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx >7prw_B:Nuclear_receptor_ligand-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=THE GLUCOCORTICOID RECEPTOR IN COMPLEX WITH VELSECORAT, A PGC1A COACTIVATOR FRAGMENT AND SGK 23BP organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0447 <- 2.88 -> DG N7 D0015 : score 5.9532 : H : ARG NH2 B0447 <- 2.81 -> DG O6 D0015 : score 6.5868 : V : VAL CG1 B0443 <- 3.70 -> DT C7 D0016 : score 6.21203 : x : LYS xxxx B0442 <- 3.48 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx >7psx_B:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF HOXB13 BOUND TO HYDROXYMETHYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NE B0220 <- 3.09 -> DA N3 E0012 : score 1.98062 : w : GLN OE1 B0265 <- 5.58 -> DT O4 D0011 : score 3.068 : H : ASN OD1 B0266 <- 3.37 -> DA N6 D0010 : score 5.33531 : H : ASN ND2 B0266 <- 2.91 -> DA N7 D0010 : score 5.74136 : w : ASN OD1 B0266 <- 6.51 -> DT O4 E0009 : score 3.132 : w : ASN OD1 B0266 <- 5.54 -> DT O4 D0011 : score 3.132 : V : ILE CG2 B0262 <- 3.67 -> DT C7 D0011 : score 7.32175 : V : GLN CG B0265 <- 3.79 -> DT C7 E0006 : score 3.26352 : x : LYS xxxx B0273 <- 4.42 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >7pu7_A:PHP_domain-like; title=DNA POLYMERASE FROM M. TUBERCULOSIS organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : w : GLN NE2 A0638 <- 5.94 -> DA N3 T0009 : score 1.888 : x : ARG xxxx A0382 <- 3.68 -> DT xxx P0114 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0544 <- 3.65 -> DG xxx T0011 : score x.xxxxx >7py0_CDG: title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSG (NUSG-EC IN MORE-SWIVELED CONFORMATION) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 D0314 <- 2.93 -> DG O6 N0018 : score 6.4284 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.97 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0182 <- 4.27 -> DC xxx N0021 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 2.98 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.23 -> DC xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 4.39 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0541 <- 3.01 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.24 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 4.17 -> DC xxx N0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 3.25 -> DC xxx N0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0319 <- 3.32 -> DG xxx T0027 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0465 <- 4.33 -> DG xxx T0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.46 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.64 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0015 <- 4.47 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0090 <- 3.62 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx >7py0_G:N-utilization_substance_G_protein_NusG,_N-terminal_domain; title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSG (NUSG-EC IN MORE-SWIVELED CONFORMATION) organism=ESCHERICHIA COLI : x : PHE xxxx G0015 <- 4.47 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0090 <- 3.62 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx >7py1_CDG: title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSG (THE CONSENSUS NUSG-EC) organism=ESCHERICHIA COLI : H : GLU OE2 C0541 <- 2.75 -> DG N2 T0016 : score 4.35336 : H : ARG NH1 D0314 <- 2.88 -> DG O6 N0018 : score 5.986 : H : ARG NH2 D0314 <- 2.84 -> DG O6 N0018 : score 6.5472 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.31 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.27 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 2.87 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 4.30 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 3.20 -> DG xxx T0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0319 <- 4.29 -> DG xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 4.50 -> DG xxx T0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 4.43 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.32 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.68 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0015 <- 4.26 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx >7py1_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSG (THE CONSENSUS NUSG-EC) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 D0314 <- 2.88 -> DG O6 N0018 : score 5.986 : H : ARG NH2 D0314 <- 2.84 -> DG O6 N0018 : score 6.5472 : x : ARG xxxx D0270 <- 3.20 -> DG xxx T0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0319 <- 4.29 -> DG xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 4.50 -> DG xxx T0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 4.43 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.32 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.68 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx >7py3_CD: title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSA (THE CONSENSUS NUSA-EC) organism=ESCHERICHIA COLI : V : ARG CZ C0175 <- 3.58 -> DT C7 N0023 : score 2.24958 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.94 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0156 <- 4.22 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0158 <- 2.95 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0177 <- 3.28 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.15 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 4.35 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 4.14 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 3.76 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0541 <- 3.88 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.22 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0041 <- 4.40 -> DC xxx N0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0255 <- 4.08 -> DG xxx T0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 3.35 -> DC xxx N0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0274 <- 3.22 -> DC xxx N0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.53 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.54 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx >7py3_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSA (THE CONSENSUS NUSA-EC) organism=ESCHERICHIA COLI : x : PRO xxxx D0041 <- 4.40 -> DC xxx N0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0255 <- 4.08 -> DG xxx T0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 3.35 -> DC xxx N0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0274 <- 3.22 -> DC xxx N0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.53 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.54 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx >7py5_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSA AND NUSG (THE CONSENSUS NUSA-NUSG-EC) organism=? : x : ARG xxxx C0151 <- 3.32 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0175 <- 3.49 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0177 <- 4.47 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.52 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.69 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0394 <- 3.41 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.04 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx >7py5_CDG: title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSA AND NUSG (THE CONSENSUS NUSA-NUSG-EC) organism=ESCHERICHIA COLI : x : ARG xxxx C0151 <- 3.32 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0175 <- 3.49 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0177 <- 4.47 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.52 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.69 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0394 <- 3.41 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.04 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 3.09 -> DG xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 3.69 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0352 <- 4.47 -> DG xxx T0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.29 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0465 <- 4.40 -> DG xxx T0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.53 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.36 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0015 <- 4.09 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0090 <- 3.74 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx >7py6_CDG: title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSA AND NUSG (NUSA AND NUSG ELONGATION COMPLEX IN LESS-SWIVELED CONFORMATION) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NE C0151 <- 3.13 -> DT O4 N0023 : score 1.73628 : H : ARG NH2 C0151 <- 3.01 -> DT O4 N0023 : score 3.40458 : H : ARG NH2 C0542 <- 2.63 -> DG O6 T0016 : score 6.8244 : x : TRP xxxx C0183 <- 3.21 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.75 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.32 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0212 <- 3.50 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 3.42 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0319 <- 4.26 -> DG xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 4.32 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.11 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.94 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0090 <- 3.33 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx >7py6_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSA AND NUSG (NUSA AND NUSG ELONGATION COMPLEX IN LESS-SWIVELED CONFORMATION) organism=ESCHERICHIA COLI : x : THR xxxx D0212 <- 3.50 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 3.42 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0319 <- 4.26 -> DG xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 4.32 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.11 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.94 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx >7py7_CDG: title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSA AND NUSG (NUSA AND NUSG ELONGATION COMPLEX IN MORE-SWIVELED CONFORMATION) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH2 C0542 <- 2.41 -> DG O6 T0016 : score 7.1148 : H : ARG NH2 C0542 <- 2.41 -> DG O6 T0016 : score 7.1148 : H : ARG NE D0314 <- 3.01 -> DG O6 N0018 : score 3.7755 : V : LEU CD2 C0538 <- 3.64 -> DT C7 N0023 : score 5.96053 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.34 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.08 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 4.16 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0212 <- 3.94 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0259 <- 3.11 -> DG xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0267 <- 4.19 -> DC xxx N0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 4.26 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0465 <- 4.20 -> DG xxx T0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.46 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.90 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0090 <- 3.34 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx >7py7_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSA AND NUSG (NUSA AND NUSG ELONGATION COMPLEX IN MORE-SWIVELED CONFORMATION) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NE D0314 <- 3.01 -> DG O6 N0018 : score 3.7755 : x : THR xxxx D0212 <- 3.94 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0259 <- 3.11 -> DG xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0267 <- 4.19 -> DC xxx N0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 4.26 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0465 <- 4.20 -> DG xxx T0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.46 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.90 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx >7py8_CDG: title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSG (NUSG-EC IN LESS-SWIVELED CONFORMATION) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 C0470 <- 2.38 -> DA N7 N0019 : score 2.77532 : H : ARG NH2 D0270 <- 2.55 -> DG O6 T0027 : score 6.93 : H : ARG NH2 D0270 <- 2.55 -> DG O6 T0027 : score 6.93 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.31 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.16 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 4.36 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 4.38 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.32 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0541 <- 3.81 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 2.84 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0267 <- 4.35 -> DG xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 3.78 -> DC xxx N0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 3.39 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.55 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 4.10 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0015 <- 3.39 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0088 <- 4.28 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx >7py8_G:N-utilization_substance_G_protein_NusG,_N-terminal_domain; title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSG (NUSG-EC IN LESS-SWIVELED CONFORMATION) organism=ESCHERICHIA COLI : x : PHE xxxx G0015 <- 3.39 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0088 <- 4.28 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx >7pyj_CD: title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSA (NUSA ELONGATION COMPLEX IN LESS-SWIVELED CONFORMATION) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 D0270 <- 2.36 -> DG O6 T0027 : score 6.61867 : H : ARG NH1 D0270 <- 2.36 -> DG O6 T0027 : score 6.61867 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.65 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0177 <- 3.73 -> DT xxx N0023 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.15 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.67 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.67 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.87 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0465 <- 4.49 -> DG xxx T0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.52 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.79 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx >7pyj_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSA (NUSA ELONGATION COMPLEX IN LESS-SWIVELED CONFORMATION) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 D0270 <- 2.36 -> DG O6 T0027 : score 6.61867 : x : GLN xxxx D0465 <- 4.49 -> DG xxx T0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.52 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.79 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx >7pyk_CD: title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSA (NUSA ELONGATION COMPLEX IN MORE-SWIVELED CONFORMATION) organism=ESCHERICHIA COLI : H : ARG NH1 D0314 <- 2.94 -> DT O4 N0020 : score 3.17645 : V : ARG CZ C0151 <- 3.50 -> DT C7 N0023 : score 2.29223 : x : ARG xxxx C0175 <- 3.17 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0177 <- 3.18 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.21 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0185 <- 3.43 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.35 -> DC xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 4.17 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.27 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0267 <- 4.46 -> DG xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 4.40 -> DG xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0320 <- 4.34 -> DC xxx N0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.51 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.47 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx >7pyk_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX BOUND TO NUSA (NUSA ELONGATION COMPLEX IN MORE-SWIVELED CONFORMATION) organism=? : H : ARG NH1 D0314 <- 2.94 -> DT O4 N0020 : score 3.17645 : x : ASP xxxx D0267 <- 4.46 -> DG xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 4.40 -> DG xxx T0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0320 <- 4.34 -> DC xxx N0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.51 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.47 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx >7pza_B:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE CLR-CAMP-DNA COMPLEX organism=Sinorhizobium meliloti 1021 : H : LYS NZ B0197 <- 2.57 -> DG O6 E0005 : score 6.04668 : H : LYS NZ B0197 <- 2.66 -> DT O4 E0006 : score 3.68762 : x : SER xxxx B0194 <- 3.22 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0195 <- 3.03 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0196 <- 3.51 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0199 <- 3.45 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx >7pzb_A:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE CLR-CAMP-DNA COMPLEX organism=Sinorhizobium meliloti 1021 : H : ARG NH2 A0195 <- 2.58 -> DG O6 D0010 : score 6.8904 : H : LYS NZ A0197 <- 2.79 -> DG N7 C0005 : score 5.39667 : H : LYS NZ A0197 <- 3.12 -> DG O6 C0005 : score 5.4108 : V : SER CB A0194 <- 3.58 -> DT C7 C0006 : score 3.3035 : x : PRO xxxx A0196 <- 3.28 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0199 <- 4.10 -> DG xxx D0010 : score x.xxxxx >7q0j_CD: title=RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX IN MORE-SWIVELED CONFORMATION organism=ESCHERICHIA COLI : x : GLU xxxx C0541 <- 4.14 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.01 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx >7q0k_CD: title=RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX IN LESS-SWIVELED CONFORMATION organism=ESCHERICHIA COLI : x : ARG xxxx C0542 <- 3.20 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0267 <- 3.56 -> DC xxx N0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 3.58 -> DC xxx N0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0465 <- 4.48 -> DG xxx T0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.19 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.47 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx >7q0k_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX IN LESS-SWIVELED CONFORMATION organism=ESCHERICHIA COLI : x : ASP xxxx D0267 <- 3.56 -> DC xxx N0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 3.58 -> DC xxx N0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0465 <- 4.48 -> DG xxx T0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.19 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.47 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx >7q0n_A: title=ARBITRIUM RECEPTOR FROM KATMIRA PHAGE organism=BACILLACEAE : w : ASP OD2 A0036 <- 5.37 -> DA N6 D0036 : score 3.409 : x : ASN xxxx A0030 <- 3.23 -> DG xxx D0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0032 <- 2.82 -> DG xxx D0037 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0033 <- 3.72 -> DA xxx D0036 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0035 <- 3.67 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0043 <- 4.16 -> DT xxx D0035 : score x.xxxxx >7q0n_AB: title=ARBITRIUM RECEPTOR FROM KATMIRA PHAGE organism=BACILLACEAE : w : ASP OD2 A0036 <- 5.37 -> DA N6 D0036 : score 3.409 : x : ASN xxxx A0030 <- 3.23 -> DG xxx D0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0032 <- 2.82 -> DG xxx D0037 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0033 <- 3.72 -> DA xxx D0036 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0035 <- 3.67 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0043 <- 4.16 -> DT xxx D0035 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0030 <- 3.32 -> DG xxx C0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0032 <- 2.81 -> DG xxx C0037 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0033 <- 3.74 -> DA xxx C0036 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0035 <- 3.73 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0036 <- 4.21 -> DA xxx C0036 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0110 <- 3.94 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx >7q2x_ABD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;ARM_repeat; title=CRYO-EM STRUCTURE OF CLAMPED S.CEREVISIAE CONDENSIN-DNA COMPLEX (FORM I) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C : x : ARG xxxx B0205 <- 3.52 -> DT xxx G0028 : score x.xxxxx >7q2y_AD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;ARM_repeat; title=CRYO-EM STRUCTURE OF CLAMPED S.CEREVISIAE CONDENSIN-DNA COMPLEX (FORM II) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C : x : TYR xxxx D0373 <- 4.42 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx >7q2y_D:ARM_repeat; title=CRYO-EM STRUCTURE OF CLAMPED S.CEREVISIAE CONDENSIN-DNA COMPLEX (FORM II) organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C : x : TYR xxxx D0373 <- 4.42 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx >7q2z_C: title=CRYO-EM STRUCTURE OF S.CEREVISIAE CONDENSIN YCG1-BRN1-DNA COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C : x : ARG xxxx C0480 <- 3.58 -> DT xxx F0001 : score x.xxxxx >7q2z_CE:ARM_repeat; title=CRYO-EM STRUCTURE OF S.CEREVISIAE CONDENSIN YCG1-BRN1-DNA COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C : x : ARG xxxx C0480 <- 3.58 -> DT xxx F0001 : score x.xxxxx >7q3o_C:Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF CDX1 BOUND TO HYDROXYMETHYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : TYR OH C0189 <- 2.75 -> DA N3 I0010 : score 4.19279 : w : TYR OH C0189 <- 6.04 -> DA N3 B0010 : score 1.448 : H : ARG NE C0190 <- 3.00 -> DA N3 I0012 : score 2.01846 : w : ASN ND2 C0236 <- 5.62 -> DT O4 B0011 : score 3.275 : V : ASN CG C0236 <- 3.66 -> DT C7 B0009 : score 2.74089 : V : ILE CG2 C0232 <- 3.64 -> DT C7 B0011 : score 7.37493 : x : LYS xxxx C0231 <- 3.75 -> DC xxx I0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0235 <- 3.10 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx >7q4n_C:Homeodomain-like; title=TRANSCRIPTION FACTOR CDX2 BOUND TO HYDROXYMETHYLATED DNA organism=Homo sapiens : H : TYR OH C0189 <- 2.74 -> DA N3 E0031 : score 4.2011 : H : ARG NE C0190 <- 3.18 -> DA N3 E0033 : score 1.94277 : V : ASN CG C0236 <- 3.60 -> DT C7 B0009 : score 2.78062 : x : ILE xxxx C0232 <- 3.35 -> DT xxx B0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0235 <- 3.24 -> DT xxx E0027 : score x.xxxxx >7q5b_XYZ:Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF TY3 RETROTRANSPOSON TARGETING A TFIIIB-BOUND TRNA GENE organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C : H : ASN ND2 Y0159 <- 2.74 -> DA N3 a0004 : score 3.85338 : H : THR OG1 Y0215 <- 3.16 -> DA N3 a0004 : score 1.25637 : H : GLU OE1 Z0253 <- 2.64 -> DC N4 a-004 : score 5.95252 >7q94_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Nudix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AGROBACTERIUM TUMEFACIENS NADQ, DNA COMPLEX. organism=Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) / Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) / Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) / Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) : H : GLN OE1 A0248 <- 2.26 -> DA N6 D0020 : score 6.70624 : H : ARG NH1 B0252 <- 3.06 -> DA N7 C0020 : score 2.42712 : x : HIS xxxx A0246 <- 3.22 -> DG xxx D0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0247 <- 3.59 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0249 <- 3.27 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0252 <- 3.04 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0273 <- 2.99 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0246 <- 4.44 -> DG xxx C0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0247 <- 4.30 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0248 <- 2.87 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0249 <- 3.64 -> DG xxx C0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0251 <- 3.03 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0273 <- 2.61 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx >7q94_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Nudix; title=CRYSTAL STRUCTURE OF AGROBACTERIUM TUMEFACIENS NADQ, DNA COMPLEX. organism=Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) / Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) : H : ARG NH1 B0252 <- 3.06 -> DA N7 C0020 : score 2.42712 : x : HIS xxxx B0246 <- 4.44 -> DG xxx C0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0247 <- 4.30 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0248 <- 2.87 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0249 <- 3.64 -> DG xxx C0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0251 <- 3.03 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0273 <- 2.61 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx >7qd4_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF TN4430 TNPA TRANSPOSASE FROM TN3 FAMILY IN COMPLEX WITH 100 BP LONG TRANSPOSON END DNA organism=? : H : ARG NH2 A0044 <- 2.50 -> DT O2 C1034 : score 4.48733 : H : ARG NH2 A0097 <- 3.02 -> DG N7 C1038 : score 6.10369 : H : ARG NH2 A0097 <- 2.41 -> DT O4 C1039 : score 3.83105 : H : TYR OH A0263 <- 2.73 -> DC N4 C1057 : score 4.2731 : H : ARG NH1 A0267 <- 2.90 -> DG N7 C1056 : score 5.929 : H : ARG NH1 A0267 <- 2.86 -> DG O6 C1056 : score 6.01033 : H : ARG NH2 A0390 <- 3.10 -> DA N3 C1075 : score 3.04536 : H : ARG NE A0635 <- 3.08 -> DG N7 C1059 : score 4.17417 : H : ARG NH2 A0635 <- 2.70 -> DG O6 C1059 : score 6.732 : V : VAL CG1 A0003 <- 3.77 -> DT C7 C1048 : score 6.10597 : x : ASN xxxx A0099 <- 3.06 -> DA xxx B0062 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0102 <- 3.49 -> DC xxx B0060 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0161 <- 3.46 -> DT xxx C1046 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0261 <- 3.28 -> DC xxx B0042 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0386 <- 4.43 -> DT xxx C1076 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0623 <- 4.24 -> DC xxx B0038 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0634 <- 3.22 -> DC xxx B0039 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0639 <- 3.62 -> DT xxx C1058 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0899 <- 3.92 -> DC xxx C1066 : score x.xxxxx >7qd5_D: title=CRYO-EM STRUCTURE OF TN4430 TNPA TRANSPOSASE FROM TN3 FAMILY IN COMPLEX WITH 48 BP LONG TRANSPOSON END DNA organism=? : H : ARG NH1 D0044 <- 2.75 -> DT O2 F1034 : score 4.34947 : H : ARG NH2 D0044 <- 2.85 -> DT O2 F1034 : score 4.191 : H : ARG NH2 D0097 <- 2.85 -> DG N7 F1038 : score 6.32077 : H : ARG NH2 D0097 <- 3.03 -> DT O4 F1039 : score 3.39037 : H : TYR OH D0263 <- 2.67 -> DC N4 F1057 : score 4.32367 : H : ARG NH2 D0635 <- 2.96 -> DG O6 F1059 : score 6.3888 : x : VAL xxxx D0003 <- 3.97 -> DT xxx F1048 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0004 <- 4.29 -> DC xxx E0050 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0099 <- 3.17 -> DA xxx E0062 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0102 <- 3.71 -> DA xxx E0059 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0161 <- 3.44 -> DT xxx F1046 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0261 <- 3.23 -> DC xxx E0042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0267 <- 3.27 -> DT xxx F1055 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0623 <- 4.50 -> DC xxx E0038 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0634 <- 3.29 -> DC xxx E0039 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0639 <- 3.71 -> DT xxx F1058 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0899 <- 4.04 -> DC xxx F1066 : score x.xxxxx >7qd6_D: title=CRYO-EM STRUCTURE OF TN4430 TNPA TRANSPOSASE FROM TN3 FAMILY IN COMPLEX WITH STRAND-TRANSFER LIKE DNA PRODUCT organism=? : H : ARG NE D0097 <- 2.91 -> DG N7 F1038 : score 4.32452 : H : ARG NH2 D0097 <- 2.92 -> DG N7 F1038 : score 6.23138 : H : ARG NH2 D0097 <- 2.36 -> DT O4 F1039 : score 3.86658 : H : TYR OH D0263 <- 3.11 -> DC N4 F1057 : score 3.95283 : H : ARG NH1 D0267 <- 2.85 -> DG N7 F1056 : score 5.9895 : H : ARG NH1 D0267 <- 3.13 -> DG O6 F1056 : score 5.68183 : H : ARG NH2 D0267 <- 2.76 -> DG N7 F1056 : score 6.43569 : H : ARG NE D0635 <- 2.85 -> DG O6 F1059 : score 3.90162 : V : VAL CG2 D0003 <- 3.71 -> DT C7 F1048 : score 6.26085 : x : LYS xxxx D0004 <- 4.17 -> DG xxx E0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0044 <- 2.39 -> DT xxx F1034 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0099 <- 3.05 -> DC xxx E0061 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0102 <- 4.26 -> DA xxx E0059 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0103 <- 4.03 -> DG xxx F1036 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0161 <- 3.25 -> DT xxx F1046 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0261 <- 3.34 -> DC xxx E0042 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0634 <- 3.17 -> DC xxx E0039 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0639 <- 3.33 -> DT xxx F1058 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0899 <- 4.01 -> DC xxx F1066 : score x.xxxxx >7qen_ABD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;ARM_repeat; title=S.C. CONDENSIN CORE IN DNA- AND ATP-BOUND STATE organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : V : THR CG2 A0112 <- 3.70 -> DT C7 G0022 : score 4.34285 : x : ARG xxxx B0205 <- 3.19 -> DA xxx F0028 : score x.xxxxx >7qfw_AB:ARM_repeat; title=S.C. CONDENSIN PERIPHERAL YCG1 SUBCOMPLEX BOUND TO DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C : x : VAL xxxx A0888 <- 3.53 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >7qhs_234567:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=S. CEREVISIAE CMGE NUCLEATING ORIGIN DNA MELTING organism=? : x : LYS xxxx 20582 <- 4.25 -> DA xxx A0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx 20589 <- 4.33 -> DA xxx A0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx 60421 <- 3.28 -> DT xxx B0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx 60423 <- 4.03 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 60424 <- 3.36 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 60614 <- 4.24 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx 70363 <- 3.40 -> DA xxx A0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx 70366 <- 3.19 -> DT xxx B0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 50455 <- 3.21 -> DA xxx A0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 50460 <- 3.32 -> DA xxx A0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx 50462 <- 4.24 -> DA xxx A0015 : score x.xxxxx >7qhs_2:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=S. CEREVISIAE CMGE NUCLEATING ORIGIN DNA MELTING organism=? : x : LYS xxxx 20582 <- 4.25 -> DA xxx A0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx 20589 <- 4.33 -> DA xxx A0017 : score x.xxxxx >7qnz_A:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=HUMAN LIG1-DNA-PCNA COMPLEX RECONSTITUTED IN ABSENCE OF ATP organism=? : x : THR xxxx A0798 <- 3.79 -> DT xxx I0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0872 <- 3.76 -> DG xxx J0013 : score x.xxxxx >7qo1_A:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=COMPLEX OF DNA LIGASE I AND FEN1 ON PCNA AND DNA organism=? : x : THR xxxx A0798 <- 3.86 -> DT xxx I0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0872 <- 4.46 -> DG xxx J0013 : score x.xxxxx >7qqo_B: title=SPCAS9 BOUND TO AAVS1 OFF-TARGET1 DNA SUBSTRATE organism=? : H : LYS NZ B1107 <- 2.56 -> DC O2 C-001 : score 3.08757 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.88 -> DG O6 D0001 : score 6.4944 : H : ARG NH2 B1335 <- 3.22 -> DG N7 D0002 : score 5.84831 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.47 -> DG O6 D0002 : score 7.0356 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.31 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7qqp_B: title=SPCAS9 BOUND TO AAVS1 OFF-TARGET3 DNA SUBSTRATE organism=Streptococcus pyogenes : H : LYS NZ B1107 <- 2.69 -> DC O2 C-001 : score 3.01097 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.22 -> DG N7 D0001 : score 5.5418 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.67 -> DG O6 D0001 : score 6.7716 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.33 -> DG O6 D0002 : score 7.2204 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.14 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7qqq_B: title=SPCAS9 BOUND TO AAVS1 OFF-TARGET4 DNA SUBSTRATE organism=Streptococcus pyogenes : H : LYS NZ B1107 <- 2.76 -> DC O2 C-001 : score 2.96972 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.06 -> DG N7 D0001 : score 5.7354 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.49 -> DG O6 D0001 : score 7.0092 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.24 -> DG O6 D0002 : score 7.3392 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.31 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7qqr_B: title=SPCAS9 BOUND TO AAVS1 OFF-TARGET5 DNA SUBSTRATE organism=Streptococcus pyogenes : H : LYS NZ B1107 <- 2.71 -> DC O2 C-001 : score 2.99918 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.20 -> DG N7 D0001 : score 5.566 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.64 -> DG O6 D0001 : score 6.8112 : H : ARG NH1 B1335 <- 3.44 -> DG N7 D0002 : score 5.2756 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.27 -> DG O6 D0002 : score 7.2996 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.38 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7qqs_B: title=SPCAS9 BOUND TO FANCF ON-TARGET DNA SUBSTRATE organism=Streptococcus pyogenes : H : LYS NZ B1107 <- 2.68 -> DC O2 C-001 : score 3.01686 : w : LYS NZ B1107 <- 5.69 -> DG N3 D0002 : score 2.232 : w : SER OG B1136 <- 5.29 -> DG N3 D0002 : score 2.344 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.24 -> DG N7 D0001 : score 5.5176 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.73 -> DG O6 D0001 : score 6.6924 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.36 -> DG O6 D0002 : score 7.1808 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.15 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7qqt_B: title=SPCAS9 BOUND TO FANCF OFF-TARGET1 DNA SUBSTRATE organism=Streptococcus pyogenes : H : LYS NZ B1107 <- 2.70 -> DC O2 C-001 : score 3.00508 : w : LYS NZ B1107 <- 5.94 -> DG N3 D0002 : score 2.232 : w : SER OG B1136 <- 5.16 -> DG N3 D0002 : score 2.344 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.21 -> DG N7 D0001 : score 5.5539 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.67 -> DG O6 D0001 : score 6.7716 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.34 -> DG O6 D0002 : score 7.2072 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.30 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7qqu_B: title=SPCAS9 BOUND TO FANCF OFF-TARGET2 DNA SUBSTRATE organism=Streptococcus pyogenes : H : LYS NZ B1107 <- 2.67 -> DC O2 C-001 : score 3.02275 : w : LYS NZ B1107 <- 5.70 -> DG N3 D0002 : score 2.232 : w : SER OG B1136 <- 5.19 -> DG N3 D0002 : score 2.344 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.16 -> DG N7 D0001 : score 5.6144 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.65 -> DG O6 D0001 : score 6.798 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.34 -> DG O6 D0002 : score 7.2072 : w : ARG NE B1335 <- 6.14 -> DA N6 C-003 : score 1.081 : w : ARG NH2 B1335 <- 6.28 -> DA N6 C-003 : score 1.997 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.22 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7qqv_B: title=SPCAS9 BOUND TO FANCF OFF-TARGET3 DNA SUBSTRATE organism=Streptococcus pyogenes : H : LYS NZ B1107 <- 2.75 -> DC O2 C-001 : score 2.97562 : w : LYS NZ B1107 <- 5.72 -> DG N3 D0002 : score 2.232 : w : SER OG B1136 <- 5.63 -> DG N3 D0002 : score 2.344 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.14 -> DG N7 D0001 : score 5.6386 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.60 -> DG O6 D0001 : score 6.864 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.33 -> DG O6 D0002 : score 7.2204 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.20 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7qqw_B: title=SPCAS9 BOUND TO FANCF OFF-TARGET4 DNA SUBSTRATE organism=Streptococcus pyogenes : H : LYS NZ B1107 <- 2.66 -> DC O2 C-001 : score 3.02865 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.89 -> DG O6 D0001 : score 6.4812 : H : ARG NH1 B1335 <- 2.94 -> DG N7 D0002 : score 5.8806 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.67 -> DG O6 D0002 : score 6.7716 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.25 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7qqx_B: title=SPCAS9 BOUND TO FANCF OFF-TARGET5 DNA SUBSTRATE organism=Streptococcus pyogenes : H : LYS NZ B1107 <- 2.70 -> DC O2 C-001 : score 3.00508 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.31 -> DG N7 D0001 : score 5.4329 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.72 -> DG O6 D0001 : score 6.7056 : H : ARG NH1 B1335 <- 2.94 -> DG N7 D0002 : score 5.8806 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.64 -> DG O6 D0002 : score 6.8112 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.25 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7qqz_B: title=SPCAS9 BOUND TO FANCF OFF-TARGET7 DNA SUBSTRATE organism=Streptococcus pyogenes : H : LYS NZ B1107 <- 2.64 -> DC O2 C-001 : score 3.04043 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.28 -> DG N7 D0001 : score 5.4692 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.74 -> DG O6 D0001 : score 6.6792 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.39 -> DG O6 D0002 : score 7.1412 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.47 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7qr0_B: title=SPCAS9 BOUND TO TRAC OFF-TARGET1 DNA SUBSTRATE organism=Streptococcus pyogenes : H : LYS NZ B1107 <- 2.73 -> DC O2 C-001 : score 2.9874 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.10 -> DG N7 D0001 : score 5.687 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.54 -> DG O6 D0001 : score 6.9432 : w : ARG NH2 B1333 <- 6.22 -> DC N4 C-002 : score 0.976 : H : ARG NH1 B1335 <- 3.34 -> DG N7 D0002 : score 5.3966 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.30 -> DG O6 D0002 : score 7.26 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.39 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7qr1_B: title=SPCAS9 BOUND TO TRAC OFF-TARGET2 DNA SUBSTRATE organism=Streptococcus pyogenes : H : LYS NZ B1107 <- 2.79 -> DC O2 C-001 : score 2.95205 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.10 -> DG N7 D0001 : score 5.687 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.53 -> DG O6 D0001 : score 6.9564 : H : ARG NH1 B1335 <- 3.02 -> DG O6 D0002 : score 5.81567 : H : ARG NH2 B1335 <- 3.05 -> DG N7 D0002 : score 6.06538 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.36 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7qr5_B: title=SPCAS9 BOUND TO FANCF OFF-TARGET6 DNA SUBSTRATE organism=Streptococcus pyogenes : H : LYS NZ B1107 <- 2.51 -> DC O2 C-001 : score 3.11703 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.29 -> DG N7 D0001 : score 5.4571 : H : ARG NH2 B1333 <- 3.08 -> DG O6 D0001 : score 6.2304 : H : ARG NH1 B1335 <- 3.17 -> DG N7 D0002 : score 5.6023 : H : ARG NH2 B1335 <- 3.33 -> DG N7 D0002 : score 5.70785 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.61 -> DG O6 D0002 : score 6.8508 >7qr7_B: title=SPCAS9 BOUND TO AAVS1 OFF-TARGET2 DNA SUBSTRATE organism=Streptococcus pyogenes : H : LYS NZ B1107 <- 2.59 -> DC O2 C-001 : score 3.06989 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.28 -> DG N7 D0001 : score 5.4692 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.78 -> DG O6 D0001 : score 6.6264 : H : ARG NH1 B1335 <- 3.28 -> DG N7 D0002 : score 5.4692 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.77 -> DG O6 D0002 : score 6.6396 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.33 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7qr8_B: title=SPCAS9 BOUND TO PTPRC OFF-TARGET1 DNA SUBSTRATE organism=Streptococcus pyogenes : H : LYS NZ B1107 <- 2.92 -> DC O2 C-001 : score 2.87545 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.20 -> DG N7 D0001 : score 5.566 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.67 -> DG O6 D0001 : score 6.7716 : H : ARG NH1 B1335 <- 3.25 -> DG N7 D0002 : score 5.5055 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.41 -> DG O6 D0002 : score 7.1148 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.20 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B1337 <- 4.33 -> DT xxx C-004 : score x.xxxxx >7qv9_Mb:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators;Translation_proteins_SH3-like_domain;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=CRYOEM STRUCTURE OF BACTERIAL TRANSCRIPTION INTERMEDIATE COMPLEX MEDIATED BY ACTIVATOR PSPF organism=? : H : GLN NE2 M0020 <- 2.29 -> DC N3 N-012 : score 1.54139 : H : LYS NZ M0331 <- 2.72 -> DG O6 T0011 : score 5.87326 : H : ARG NH2 M0383 <- 2.98 -> DG O6 N-014 : score 6.3624 : H : ARG NH1 M0456 <- 2.59 -> DG N7 N-025 : score 6.3041 : H : ARG NH1 M0456 <- 3.19 -> DG O6 N-025 : score 5.60883 : x : PHE xxxx b0085 <- 4.00 -> DA xxx N-011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx M0015 <- 2.31 -> DC xxx N-013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0016 <- 3.01 -> DG xxx T0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx M0017 <- 4.02 -> DC xxx N-012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx M0018 <- 2.62 -> DG xxx T0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx M0019 <- 3.75 -> DG xxx T0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx M0022 <- 2.91 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx M0023 <- 2.43 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx M0328 <- 3.82 -> DG xxx T0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0332 <- 3.97 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0335 <- 2.54 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx M0377 <- 3.27 -> DC xxx T0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0379 <- 3.18 -> DT xxx N-015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0380 <- 3.93 -> DG xxx T0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0382 <- 4.43 -> DT xxx N-016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0455 <- 2.35 -> DT xxx N-027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0457 <- 4.15 -> DT xxx T0023 : score x.xxxxx >7qv9_b:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYOEM STRUCTURE OF BACTERIAL TRANSCRIPTION INTERMEDIATE COMPLEX MEDIATED BY ACTIVATOR PSPF organism=? : x : PHE xxxx b0085 <- 4.00 -> DA xxx N-011 : score x.xxxxx >7qw5_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=ADENINE-SPECIFIC DNA METHYLTRANSFERASE M.BSECI COMPLEXED WITH ADOHCY AND COGNATE UNMETHYLATED DNA DUPLEX organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NH1 A0138 <- 3.25 -> DG N3 Z0006 : score 2.77783 : H : ARG NH1 A0138 <- 3.25 -> DG N3 Z0006 : score 2.77783 : H : ARG NH2 A0138 <- 2.83 -> DC O2 Z0005 : score 3.67653 : H : ARG NH2 A0138 <- 3.07 -> DG N3 Z0006 : score 3.4153 : H : ARG NH2 A0138 <- 3.07 -> DG N3 Z0006 : score 3.4153 : H : GLN NE2 A0140 <- 2.94 -> DA N3 Y0017 : score 3.91417 : H : ARG NE A0159 <- 2.99 -> DT O2 Z0004 : score 2.479 : H : ARG NH2 A0159 <- 2.90 -> DT O2 Y0018 : score 4.14867 : H : ARG NH2 A0159 <- 3.04 -> DC O2 Y0019 : score 3.52118 : H : LYS NZ A0338 <- 2.82 -> DG O6 Y0016 : score 5.75765 : w : ARG NH1 A0431 <- 6.37 -> DG N7 Z0002 : score 2.063 : H : TRP NE1 A0437 <- 2.78 -> DT O4 Y0018 : score 4.82692 : w : ASP OD2 A0454 <- 5.43 -> DC N4 Y0015 : score 3.623 : H : ARG NH1 A0518 <- 3.19 -> DG N7 Z0006 : score 5.5781 : H : ARG NH1 A0518 <- 3.19 -> DG N7 Z0006 : score 5.5781 : H : ARG NH2 A0518 <- 3.05 -> DG O6 Z0006 : score 6.27 : H : ARG NH2 A0518 <- 3.05 -> DG O6 Z0006 : score 6.27 : V : LEU CD1 A0224 <- 3.77 -> DT C7 Z0008 : score 5.77427 : V : LEU CD1 A0512 <- 3.81 -> DT C7 Y0014 : score 5.71695 : x : HIS xxxx A0019 <- 3.51 -> DA xxx Z0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0133 <- 3.09 -> DA xxx Z0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0136 <- 3.30 -> DA xxx Z0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0219 <- 3.78 -> DA xxx Z0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0221 <- 4.32 -> DA xxx Z0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0222 <- 3.60 -> DG xxx Z0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0223 <- 4.10 -> DA xxx Z0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0335 <- 3.76 -> DA xxx Z0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0340 <- 3.97 -> DA xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0425 <- 3.66 -> DT xxx Y0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0438 <- 3.79 -> DA xxx Z0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0455 <- 3.63 -> DA xxx Y0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0475 <- 3.72 -> DT xxx Z0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0513 <- 3.32 -> DT xxx Z0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0514 <- 4.04 -> DC xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0516 <- 3.36 -> DA xxx Y0013 : score x.xxxxx >7qw6_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=ADENINE-SPECIFIC DNA METHYLTRANSFERASE M.BSECI COMPLEXED WITH ADOHCY AND COGNATE HEMIMETHYLATED DNA DUPLEX organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NH2 A0138 <- 3.18 -> DG N3 Z0006 : score 3.33588 : w : GLN NE2 A0140 <- 5.82 -> DC O2 Z0005 : score 2.699 : H : ARG NE A0159 <- 3.20 -> DT O2 Y0018 : score 2.37077 : H : ARG NE A0159 <- 3.05 -> DT O2 Z0004 : score 2.44808 : H : ARG NH2 A0159 <- 3.15 -> DT O2 Y0018 : score 3.937 : H : ARG NH2 A0159 <- 3.00 -> DC O2 Y0019 : score 3.55077 : H : LYS NZ A0338 <- 2.82 -> DG O6 Y0016 : score 5.75765 : H : TRP NE1 A0437 <- 2.84 -> DT O4 Y0018 : score 4.76923 : w : ASP OD2 A0454 <- 5.96 -> DC N4 Z0005 : score 3.623 : w : ASP OD2 A0454 <- 5.35 -> DC N4 Y0015 : score 3.623 : w : TYR OH A0475 <- 5.70 -> DC N4 Z0005 : score 1.343 : H : ARG NH1 A0518 <- 2.94 -> DG N7 Z0006 : score 5.8806 : H : ARG NH2 A0518 <- 2.74 -> DG O6 Z0006 : score 6.6792 : V : LEU CD1 A0512 <- 3.71 -> DT C7 Y0014 : score 5.86024 : V : TYR CG A0425 <- 3.72 -> DT C7 Y0018 : score 3.81637 : V : LEU CD1 A0224 <- 3.68 -> DT C7 Z0008 : score 5.90322 : x : HIS xxxx A0019 <- 3.28 -> DA xxx Z0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0133 <- 3.30 -> DA xxx Z0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0136 <- 3.30 -> DA xxx Z0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0219 <- 3.67 -> DA xxx Z0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0222 <- 3.64 -> DT xxx Z0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0223 <- 4.14 -> DA xxx Z0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0335 <- 3.71 -> DA xxx Z0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0438 <- 3.96 -> DA xxx Z0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0455 <- 3.63 -> DA xxx Y0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0513 <- 3.30 -> DT xxx Z0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0514 <- 3.74 -> DC xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0516 <- 3.43 -> DA xxx Y0013 : score x.xxxxx >7qw7_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=ADENINE-SPECIFIC DNA METHYLTRANSFERASE M.BSECI COMPLEXED WITH ADOHCY AND COGNATE FULLY METHYLATED DNA DUPLEX organism=Geobacillus stearothermophilus : H : ARG NH2 A0138 <- 3.26 -> DG N3 Z0006 : score 3.27811 : H : ARG NH2 A0138 <- 3.26 -> DG N3 Z0006 : score 3.27811 : w : GLN NE2 A0140 <- 6.12 -> DC O2 Z0005 : score 2.699 : H : ARG NE A0159 <- 2.97 -> DT O2 Z0004 : score 2.48931 : H : ARG NH2 A0159 <- 2.90 -> DT O2 Y0018 : score 4.14867 : H : LYS NZ A0338 <- 2.75 -> DG O6 Y0016 : score 5.83858 : H : TRP NE1 A0437 <- 2.95 -> DT O4 Y0018 : score 4.66346 : w : ASP OD2 A0454 <- 5.92 -> DC N4 Z0005 : score 3.623 : w : ASP OD2 A0454 <- 5.36 -> DC N4 Y0015 : score 3.623 : w : TYR OH A0475 <- 5.65 -> DC N4 Z0005 : score 1.343 : H : ARG NH1 A0518 <- 2.95 -> DG N7 Z0006 : score 5.8685 : H : ARG NH1 A0518 <- 2.95 -> DG N7 Z0006 : score 5.8685 : H : ARG NH2 A0518 <- 2.76 -> DG O6 Z0006 : score 6.6528 : H : ARG NH2 A0518 <- 2.76 -> DG O6 Z0006 : score 6.6528 : V : LEU CD1 A0512 <- 3.67 -> DT C7 Y0014 : score 5.91755 : V : TYR CG A0425 <- 3.66 -> DT C7 Y0018 : score 3.87249 : x : ALA xxxx A0222 <- 3.31 -> DC xxx Z0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0224 <- 4.10 -> DT xxx Z0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0335 <- 3.85 -> DA xxx Z0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0438 <- 3.84 -> DA xxx Z0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0455 <- 3.60 -> DA xxx Y0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0513 <- 3.52 -> DT xxx Z0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0514 <- 4.32 -> DG xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0516 <- 3.44 -> DA xxx Y0013 : score x.xxxxx >7qwp_M: title=CRYOEM STRUCTURE OF BACTERIAL TRANSCRIPTION CLOSE COMPLEX (RPC) organism=? : H : SER OG M0335 <- 2.73 -> DT O4 T0012 : score 3.6049 : H : SER OG M0379 <- 3.15 -> DA N6 T0015 : score 3.05946 : H : SER OG M0379 <- 2.68 -> DT O4 N-015 : score 3.64045 : H : ARG NH1 M0383 <- 2.82 -> DG N7 N-014 : score 6.0258 : H : ARG NH2 M0455 <- 2.41 -> DG N7 N-026 : score 6.88262 : x : MET xxxx M0015 <- 2.56 -> DA xxx N-012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0016 <- 2.66 -> DC xxx N-011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx M0019 <- 3.67 -> DG xxx T0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx M0022 <- 3.26 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx M0023 <- 2.49 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx M0377 <- 3.84 -> DC xxx T0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx M0378 <- 3.53 -> DT xxx N-016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0380 <- 4.08 -> DG xxx T0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0382 <- 3.83 -> DT xxx N-016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0456 <- 2.69 -> DC xxx T0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0457 <- 4.41 -> DT xxx T0023 : score x.xxxxx >7qxa_A:DNA/RNA_polymerases; title=CRYO-EM MAP OF HUMAN TELOMERASE-DNA-TPP1 COMPLEX (SHARPENED) organism=HOMO SAPIENS : V : PHE CZ A0645 <- 3.86 -> DT C7 N0019 : score 7.00815 : x : HIS xxxx A0500 <- 3.45 -> DT xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0502 <- 4.19 -> DG xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0653 <- 3.50 -> DT xxx N0019 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0752 <- 3.78 -> DG xxx N0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0759 <- 3.33 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0839 <- 3.89 -> DG xxx N0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0959 <- 3.94 -> DT xxx N0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0964 <- 3.61 -> DG xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0968 <- 3.46 -> DG xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0972 <- 3.09 -> DG xxx N0023 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0977 <- 4.48 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0980 <- 3.18 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx >7qxb_AP:Nucleic_acid-binding_proteins;DNA/RNA_polymerases; title=CRYO-EM MAP OF HUMAN TELOMERASE-DNA-TPP1-POT1 COMPLEX (SHARPENED MAP) organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 A0063 <- 2.84 -> DG N7 N0010 : score 6.0016 : H : ARG NH2 A0063 <- 3.24 -> DG N7 N0010 : score 5.82277 : H : LYS NZ A0502 <- 2.65 -> DT O4 N0025 : score 3.69479 : H : ARG NE A0653 <- 2.72 -> DT O4 N0019 : score 1.88872 : H : THR OG1 A0655 <- 3.16 -> DT O4 N0019 : score 3.6073 : x : LYS xxxx A0329 <- 4.21 -> DG xxx N0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0500 <- 4.44 -> DT xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0631 <- 4.03 -> DG xxx N0030 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0642 <- 4.04 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0643 <- 4.45 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0645 <- 3.55 -> DT xxx N0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0659 <- 4.10 -> DT xxx N0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0717 <- 3.88 -> DG xxx N0030 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0752 <- 4.20 -> DG xxx N0023 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0754 <- 4.31 -> DG xxx N0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0759 <- 3.66 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0839 <- 4.08 -> DG xxx N0030 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0964 <- 3.99 -> DG xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0968 <- 3.29 -> DG xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0972 <- 3.12 -> DG xxx N0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0973 <- 3.80 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0980 <- 2.96 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0031 <- 3.96 -> DG xxx N0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0041 <- 4.18 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx P0042 <- 4.16 -> DT xxx N0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0062 <- 3.62 -> DT xxx N0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx 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RNA POLYMERASE-SIGMA54 HOLO ENZYME WITH PROMOTER DNA CLOSED COMPLEX organism=? : H : SER OG M0335 <- 2.86 -> DT O4 T0012 : score 3.51247 : H : ARG NH1 M0383 <- 3.02 -> DG N7 N-014 : score 5.7838 : H : ARG NH2 M0455 <- 2.27 -> DG O6 N-026 : score 7.2996 : x : MET xxxx M0015 <- 3.63 -> DC xxx N-011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0016 <- 3.21 -> DC xxx N-011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx M0017 <- 2.39 -> DA xxx N-012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx M0019 <- 2.82 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx M0023 <- 2.46 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0332 <- 3.98 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx M0367 <- 3.84 -> DT xxx N-016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx M0377 <- 3.28 -> DC xxx T0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx M0378 <- 3.88 -> DT xxx N-016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0379 <- 3.15 -> DC xxx T0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0382 <- 4.13 -> DT xxx N-016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0456 <- 2.46 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx 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xxxx A0645 <- 3.54 -> DT xxx N0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0659 <- 4.11 -> DT xxx N0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0717 <- 3.83 -> DG xxx N0030 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0752 <- 4.21 -> DG xxx N0023 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0754 <- 4.30 -> DG xxx N0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0759 <- 3.63 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0839 <- 4.12 -> DG xxx N0030 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0964 <- 3.97 -> DG xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0968 <- 3.27 -> DG xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0972 <- 3.14 -> DG xxx N0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0973 <- 3.79 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0980 <- 2.96 -> DA xxx N0027 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx P0030 <- 4.44 -> DG xxx N0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0031 <- 3.34 -> DG xxx N0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx P0038 <- 3.85 -> DT xxx N0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0041 <- 3.73 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx P0042 <- 3.49 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0048 <- 3.60 -> DG xxx N0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0058 <- 4.42 -> DG xxx N0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0060 <- 3.90 -> DA xxx N0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0062 <- 3.37 -> DT xxx N0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx P0087 <- 3.57 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx P0089 <- 3.11 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx P0094 <- 4.41 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx P0096 <- 3.94 -> DA xxx N0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx P0161 <- 3.34 -> DT xxx N0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx P0223 <- 4.06 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx P0224 <- 3.04 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx P0243 <- 3.49 -> DT xxx N0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx P0245 <- 3.63 -> DT xxx N0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx P0271 <- 3.51 -> DT xxx N0013 : score x.xxxxx >7qxs_P:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN TELOMERASE-DNA-TPP1-POT1 COMPLEX (WITH POT1 SIDE CHAINS) organism=HOMO SAPIENS : H : HIS ND1 P0266 <- 2.82 -> DG N7 N0016 : score 6.19818 : H : ARG NH1 P0273 <- 3.06 -> DT O2 N0013 : score 4.08248 : x : LYS xxxx P0030 <- 4.44 -> DG xxx N0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0031 <- 3.34 -> DG xxx N0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx P0038 <- 3.85 -> DT xxx N0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0041 <- 3.73 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx P0042 <- 3.49 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0048 <- 3.60 -> DG xxx N0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0058 <- 4.42 -> DG xxx N0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0060 <- 3.90 -> DA xxx N0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0062 <- 3.37 -> DT xxx N0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx P0087 <- 3.57 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx P0089 <- 3.11 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx P0094 <- 4.41 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx P0096 <- 3.94 -> DA xxx N0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx P0161 <- 3.34 -> DT xxx N0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx P0223 <- 4.06 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx P0224 <- 3.04 -> DG xxx N0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx P0243 <- 3.49 -> DT xxx N0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx P0245 <- 3.63 -> DT xxx N0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx P0271 <- 3.51 -> DT xxx N0013 : score x.xxxxx >7r07_C:DNA/RNA_polymerases; title=ABORTIVE INFECTION DNA POLYMERASE ABIK FROM LACTOCOCCUS LACTIS organism=? : H : ASN ND2 C0346 <- 2.98 -> DC O2 I0007 : score 4.31823 >7r2k_K: title=ELONGATED CASCADE COMPLEX FROM TYPE I-A CRISPR-CAS SYSTEM organism=? : x : ASN xxxx K0025 <- 3.19 -> DT xxx D0042 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx K0027 <- 3.93 -> DT xxx D0042 : score x.xxxxx : x : MET xxxx K0183 <- 3.24 -> DT xxx D0042 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx K0185 <- 4.34 -> DT xxx D0042 : score x.xxxxx >7r2k_KLS: title=ELONGATED CASCADE COMPLEX FROM TYPE I-A CRISPR-CAS SYSTEM organism=? : x : ASN xxxx K0025 <- 3.19 -> DT xxx D0042 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx K0027 <- 3.93 -> DT xxx D0042 : score x.xxxxx : x : MET xxxx K0183 <- 3.24 -> DT xxx D0042 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx K0185 <- 4.34 -> DT xxx D0042 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0090 <- 4.10 -> DA xxx D0043 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0124 <- 3.83 -> DA xxx D0043 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx L0126 <- 4.24 -> DA xxx D0043 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx S0107 <- 3.84 -> DA xxx D0046 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx S0108 <- 4.19 -> DA xxx D0046 : score x.xxxxx >7r3x_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE L439V VARIANT OF POL2CORE IN COMPLEX WITH DNA AND AN INCOMING NUCLEOTIDE organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0967 <- 3.22 -> DT O2 P0010 : score 3.28586 : H : ARG NH2 A0988 <- 3.19 -> DC O2 P0007 : score 3.41022 >7r3y_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE V426L VARIANT OF POL2CORE IN COMPLEX WITH DNA AND AN INCOMING NUCLEOTIDE organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0967 <- 3.13 -> DT O2 P0010 : score 3.35043 : x : ARG xxxx A0988 <- 3.40 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx >7r5r_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF THE HUMAN CCAN CENP-A ALPHA-SATELLITE COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx B0045 <- 4.29 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.98 -> DC xxx J0038 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.92 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.24 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.12 -> DC xxx J-036 : score x.xxxxx >7r5r_G:Histone-fold; title=STRUCTURE OF THE HUMAN CCAN CENP-A ALPHA-SATELLITE COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx G0042 <- 4.12 -> DC xxx J-036 : score x.xxxxx >7r6r_A:Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MYCOBACTERIOPHAGE CLUSTER A2 IMMUNITY REPRESSOR:DNA COMPLEX organism=Mycobacterium phage TipsytheTRex : H : ARG NE A0045 <- 2.82 -> DG N7 B0033 : score 4.40411 : H : ARG NH2 A0045 <- 3.15 -> DG O6 B0033 : score 6.138 : H : GLN NE2 A0046 <- 3.33 -> DG O6 C0067 : score 5.18978 : H : LYS NZ A0075 <- 2.89 -> DG N7 C0071 : score 5.28895 : H : LYS NZ A0075 <- 3.21 -> DG O6 C0071 : score 5.30675 : H : ASP OD2 A0078 <- 3.31 -> DC N4 C0072 : score 5.5676 : H : ARG NH1 A0108 <- 2.94 -> DG N7 B0026 : score 5.8806 : x : THR xxxx A0044 <- 4.00 -> DT xxx C0066 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0047 <- 4.16 -> DT xxx C0065 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0049 <- 3.66 -> DT xxx B0034 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0050 <- 3.42 -> DG xxx C0063 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0079 <- 3.39 -> DC xxx C0072 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0081 <- 3.01 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0084 <- 3.49 -> DC xxx C0073 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0104 <- 4.35 -> DA xxx C0074 : score x.xxxxx >7r6t_D:His-Me_finger_endonucleases; title=HUMAN EXOG COMPLEXED WITH DRP-CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : H : SER OG D0172 <- 2.46 -> DT O2 F0002 : score 3.94886 : x : ARG xxxx D0109 <- 3.55 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0113 <- 3.27 -> DC xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0176 <- 3.36 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0307 <- 4.10 -> DG xxx A0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0311 <- 3.26 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 4.00 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0315 <- 3.77 -> DG xxx A0010 : score x.xxxxx >7r6v_I:His-Me_finger_endonucleases; title=HUMAN EXOG COMPLEXED WITH DRP-CONTAINING DNA organism=Homo sapiens : H : SER OG I0172 <- 2.48 -> DT O2 K0002 : score 3.93407 : H : ASN ND2 I0176 <- 3.00 -> DC O2 K0001 : score 4.30031 : H : LYS NZ I0315 <- 2.88 -> DG N7 L0010 : score 5.29972 : x : ARG xxxx I0109 <- 3.88 -> DT xxx K0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0110 <- 4.43 -> DT xxx K0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0307 <- 4.30 -> DG xxx L0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0311 <- 3.18 -> DC xxx K0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0314 <- 3.81 -> DC xxx K0001 : score x.xxxxx >7r77_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF DNMT5 BINARY COMPLEX WITH HEMIMETHYLATED DNA organism=? : H : GLN NE2 A0668 <- 3.06 -> DG O6 D0007 : score 5.50326 : x : ARG xxxx A0596 <- 4.17 -> DG xxx B0031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0669 <- 3.71 -> DG xxx B0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0672 <- 2.98 -> DC xxx B0032 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0674 <- 4.25 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0684 <- 4.05 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0686 <- 3.42 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx >7r8g_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PSEUDOOCEANICOLA LIPOLYTICUS ARGONAUTE BOUND TO 5' OH GUIDE DNA organism=? : H : GLN OE1 A0120 <- 2.52 -> DA N6 T0015 : score 6.39151 : V : TYR CD2 A0530 <- 3.88 -> DT C7 T0002 : score 3.66671 : x : ASN xxxx A0041 <- 4.02 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0045 <- 3.53 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0049 <- 3.71 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0052 <- 3.58 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0116 <- 3.46 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0119 <- 3.79 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0123 <- 2.94 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0135 <- 3.60 -> DA xxx T0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0209 <- 3.32 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0226 <- 4.06 -> DA xxx T0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0238 <- 3.70 -> DA xxx T0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0271 <- 3.39 -> DA xxx T0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0272 <- 4.16 -> DA xxx T0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0285 <- 3.29 -> DA xxx T0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0293 <- 3.37 -> DC xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0297 <- 3.85 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0501 <- 4.09 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0525 <- 4.44 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx 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x.xxxxx : x : TYR xxxx A0530 <- 3.55 -> DT xxx T0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0628 <- 4.08 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0711 <- 4.38 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0713 <- 2.95 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx >7r8i_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF PSEUDOOCEANICOLA LIPOLYTICUS ARGONAUTE BOUND TO 5' OH GUIDE DNA IN THE PRESENCE OF MG2+ organism=? : H : GLN NE2 A0120 <- 2.39 -> DG O6 T0013 : score 6.28115 : H : GLN NE2 A0135 <- 2.66 -> DG N7 T0011 : score 4.31628 : H : GLN OE1 A0713 <- 2.89 -> DG N2 T0005 : score 5.50675 : H : GLN NE2 A0713 <- 2.58 -> DC O2 T0006 : score 3.85745 : V : PRO CB A0472 <- 3.69 -> DT C7 T0001 : score 5.96582 : x : ARG xxxx A0045 <- 3.20 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0049 <- 4.38 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0052 <- 3.59 -> DG xxx T0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0116 <- 3.24 -> DG xxx T0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0123 <- 3.36 -> DA xxx T0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0133 <- 4.16 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0136 <- 3.63 -> DG xxx T0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0156 <- 3.98 -> DG xxx T0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0158 <- 4.38 -> DG xxx T0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0174 <- 3.61 -> DG xxx T0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0207 <- 4.28 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0209 <- 3.37 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0226 <- 4.03 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0238 <- 3.52 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0271 <- 3.65 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0272 <- 3.40 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0285 <- 3.63 -> DC xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0288 <- 3.21 -> DT xxx T0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0293 <- 3.96 -> DA xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0294 <- 3.88 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0297 <- 3.46 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx 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: HIS xxxx A0034 <- 3.36 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.90 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.59 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7rbi_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA CROSSLINKED COMPLEX, 20 S CA TO MG EXCHANGE organism=HOMO SAPIENS : w : ASN ND2 A0037 <- 6.66 -> DG O6 T0006 : score 2.971 : w : SER OG A0229 <- 5.78 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.90 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : LYS NZ A0234 <- 5.85 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : ARG NH1 A0258 <- 6.09 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : H : TYR OH A0271 <- 2.40 -> DC O2 P0010 : score 3.77723 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.92 -> DC O2 P0011 : score 4.37198 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.57 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.03 -> DG N3 T0007 : score 0.677 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.43 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.67 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : ASP xxxx A0276 <- 3.77 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 4.10 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >7rbj_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA CROSSLINKED COMPLEX, 30 S CA TO MG EXCHANGE organism=HOMO SAPIENS : w : ASN ND2 A0037 <- 6.00 -> DG N7 T0006 : score 3.259 : w : LYS NZ A0234 <- 5.73 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : w : ARG NH1 A0258 <- 6.25 -> DC O2 T0008 : score 1.381 : H : TYR OH A0271 <- 2.75 -> DC O2 P0010 : score 3.53241 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.97 -> DC O2 P0011 : score 4.32718 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.70 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.45 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.53 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : ASP xxxx A0276 <- 3.72 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.52 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >7rbk_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA CROSSLINKED COMPLEX, 40 S CA TO MG EXCHANGE organism=HOMO SAPIENS : w : SER OG A0229 <- 6.17 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.89 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : LYS NZ A0234 <- 5.89 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : TYR OH A0271 <- 2.67 -> DC O2 P0010 : score 3.58837 : H : ASN ND2 A0279 <- 3.00 -> DC O2 P0011 : score 4.30031 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.52 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.40 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.70 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : ASP xxxx A0276 <- 3.37 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.32 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >7rbl_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA CROSSLINKED COMPLEX, 60 S CA TO MG EXCHANGE organism=HOMO SAPIENS : w : SER OG A0229 <- 6.25 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.69 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : LYS NZ A0234 <- 5.98 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : TYR OH A0271 <- 2.59 -> DC O2 P0010 : score 3.64433 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.79 -> DC O2 P0011 : score 4.48845 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.85 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.27 -> DG N3 T0007 : score 0.677 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.42 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.51 -> DC O2 T0008 : score 1.988 : x : ASP xxxx A0276 <- 3.52 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.39 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >7rbm_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA CROSSLINKED COMPLEX, 60 S CA TO MN EXCHANGE organism=HOMO SAPIENS : w : ASN ND2 A0037 <- 6.09 -> DG N7 T0006 : score 3.259 : w : SER OG A0229 <- 5.85 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 6.05 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : LYS NZ A0234 <- 5.63 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : TYR OH A0271 <- 2.64 -> DC O2 P0010 : score 3.60935 : H : ASN ND2 A0279 <- 2.88 -> DC O2 P0011 : score 4.40782 : w : ARG NH1 A0283 <- 5.62 -> DG N3 T0007 : score 1.593 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.05 -> DG N3 T0007 : score 0.677 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.71 -> DG N3 T0007 : score 2.669 : x : ASP xxxx A0276 <- 3.55 -> DC xxx P0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0280 <- 3.94 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >7rbn_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA CROSSLINKED COMPLEX, 20 MIN CA TO MG EXCHANGE organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.44 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.88 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.86 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7rbo_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE BETA CROSSLINKED COMPLEX, 60 MIN CA TO MG EXCHANGE organism=HOMO SAPIENS : x : HIS xxxx A0034 <- 3.38 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.82 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.67 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7rcc_D:Homing_endonucleases; title=FIRST STAGE ENGINEERED VARIANT OF I-ONUI AFTER INITIAL REASSEMBLY organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : ARG NH1 D0032 <- 2.56 -> DG O6 C0022 : score 6.37533 : H : ARG NH2 D0032 <- 2.50 -> DG N7 C0022 : score 6.76769 : H : ARG NH2 D0078 <- 2.62 -> DT O4 C0017 : score 3.68178 : H : ARG NH1 D0080 <- 2.96 -> DG O6 B0007 : score 5.88867 : H : ARG NH2 D0080 <- 2.94 -> DG N7 B0007 : score 6.20585 : H : ARG NH1 D0184 <- 2.82 -> DG N7 B0019 : score 6.0258 : H : ARG NH2 D0184 <- 3.30 -> DG O6 B0019 : score 5.94 : H : ARG NH2 D0186 <- 2.77 -> DG O6 B0020 : score 6.6396 : H : ARG NH1 D0195 <- 3.00 -> DG N7 C0005 : score 5.808 : H : ARG NH2 D0195 <- 3.01 -> DG N7 C0005 : score 6.11646 : H : ARG NH2 D0195 <- 2.35 -> DG O6 C0005 : score 7.194 : H : GLU OE1 D0201 <- 2.96 -> DA N6 B0016 : score 2.59623 : H : GLU OE2 D0201 <- 2.97 -> DC N4 B0017 : score 5.08636 : H : GLN NE2 D0236 <- 3.16 -> DG O6 C0009 : score 5.38716 : H : ARG NH1 D0238 <- 2.35 -> DT O4 C0008 : score 3.56206 : H : ARG NH2 D0238 <- 2.96 -> DT O4 C0008 : score 3.44012 : H : ARG NH2 D0238 <- 2.85 -> DG O6 C0009 : score 6.534 : H : GLU OE1 D0240 <- 2.93 -> DC N4 C0007 : score 5.61798 : V : TYR CD1 D0225 <- 3.76 -> DT C7 C0008 : score 4.72784 : x : SER xxxx D0024 <- 4.09 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0042 <- 2.19 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0046 <- 4.25 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0048 <- 3.77 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0072 <- 3.87 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0076 <- 3.28 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0082 <- 4.48 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0140 <- 3.40 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0180 <- 3.47 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0182 <- 3.30 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0197 <- 3.47 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0203 <- 3.32 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0232 <- 3.61 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0234 <- 3.16 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx >7rcd_A:Homing_endonucleases; title=SECOND STAGE REENGINEERED VARIANT OF I-ONUI TARGETING HUMAN PD1 GENE WITH ACTIVITY ENHANCING SUBSTITUTIONS organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : ARG NH1 A0080 <- 3.26 -> DG O6 B0007 : score 5.52367 : H : ARG NH2 A0080 <- 2.36 -> DG N7 B0007 : score 6.94646 : H : ARG NH2 A0184 <- 2.68 -> DG N7 B0019 : score 6.53785 : H : ARG NH1 A0186 <- 3.16 -> DG O6 B0020 : score 5.64533 : H : ARG NH2 A0186 <- 3.37 -> DG N7 B0020 : score 5.65677 : H : ARG NH1 A0195 <- 2.35 -> DG O6 C0005 : score 6.63083 : H : GLU OE1 A0201 <- 2.88 -> DA N6 B0016 : score 2.63914 : H : GLU OE2 A0201 <- 2.91 -> DC N4 B0017 : score 5.14955 : H : ARG NH1 A0238 <- 2.64 -> DT O4 C0008 : score 3.37252 : H : ARG NH2 A0238 <- 3.16 -> DT O4 C0008 : score 3.29797 : H : ARG NH2 A0238 <- 2.64 -> DG O6 C0009 : score 6.8112 : H : GLU OE1 A0240 <- 3.27 -> DC N4 C0007 : score 5.22576 : V : TYR CD1 A0225 <- 3.52 -> DT C7 C0008 : score 5.0087 : V : ARG CZ A0232 <- 3.73 -> DT C7 C0010 : score 2.16962 : x : SER xxxx A0024 <- 4.05 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0042 <- 3.14 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0046 <- 3.41 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0048 <- 3.18 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0072 <- 3.48 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0076 <- 3.44 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0082 <- 4.33 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0140 <- 3.59 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0180 <- 3.59 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0182 <- 3.29 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0197 <- 3.95 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0203 <- 3.42 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0234 <- 3.23 -> DC xxx B0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0236 <- 2.98 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >7rce_A:Homing_endonucleases; title=THIRD STAGE REENGINEERED VARIANT OF I-ONUI WITH SPECIFICITY ENHANCING SUBSTITUTIONS organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : ARG NH2 A0042 <- 3.03 -> DT O4 B0006 : score 3.39037 : H : ARG NH1 A0184 <- 3.12 -> DG O6 B0019 : score 5.694 : H : ARG NH2 A0184 <- 2.56 -> DG N7 B0019 : score 6.69108 : H : ARG NH1 A0186 <- 3.30 -> DG O6 B0020 : score 5.475 : H : ARG NH2 A0186 <- 2.75 -> DG N7 B0020 : score 6.44846 : H : GLU OE1 A0201 <- 2.59 -> DA N6 B0016 : score 2.7947 : H : GLU OE2 A0201 <- 2.94 -> DC N4 B0017 : score 5.11795 : H : GLN NE2 A0236 <- 3.39 -> DG O6 C0009 : score 5.12012 : H : ARG NH1 A0238 <- 2.92 -> DT O4 C0008 : score 3.18952 : H : ARG NH2 A0238 <- 3.08 -> DT O4 C0008 : score 3.35483 : H : ARG NH2 A0238 <- 2.55 -> DG O6 C0009 : score 6.93 : H : GLU OE1 A0240 <- 3.02 -> DC N4 C0007 : score 5.51416 : V : TYR CB A0225 <- 3.69 -> DT C7 C0008 : score 5.00261 : V : THR CG2 A0046 <- 3.82 -> DT C7 C0017 : score 4.21574 : V : HIS CG A0040 <- 3.77 -> DT C7 C0021 : score 3.02147 : x : SER xxxx A0024 <- 3.90 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0028 <- 4.46 -> DC xxx C0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0030 <- 3.43 -> DA xxx C0020 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0048 <- 3.32 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0072 <- 3.99 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0076 <- 3.40 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0080 <- 4.10 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0082 <- 3.34 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0140 <- 3.67 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0180 <- 3.68 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0182 <- 3.34 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0197 <- 3.87 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0203 <- 3.46 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0232 <- 3.41 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0234 <- 3.07 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >7rcf_A:Homing_endonucleases; title=FOURTH STAGE REENGINEERED VARIANT OF I-ONUI WITH STABILITY ENHANCING SUBSTITUTIONS organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : w : SER OG A0028 <- 6.07 -> DA N6 C0020 : score 2.209 : H : ARG NH1 A0032 <- 2.94 -> DG O6 B0003 : score 5.913 : H : ARG NH2 A0032 <- 3.41 -> DG N7 B0003 : score 5.60569 : w : ARG NE A0042 <- 5.40 -> DA N6 B0005 : score 1.081 : H : ARG NH1 A0184 <- 2.93 -> DG O6 B0019 : score 5.92517 : H : ARG NH2 A0184 <- 2.83 -> DG N7 B0019 : score 6.34631 : H : ARG NH1 A0186 <- 2.74 -> DG O6 B0020 : score 6.15633 : H : ARG NH2 A0186 <- 2.88 -> DG N7 B0020 : score 6.28246 : H : GLU OE1 A0201 <- 3.09 -> DA N6 B0016 : score 2.52649 : H : GLU OE2 A0201 <- 2.79 -> DC N4 B0017 : score 5.27592 : H : GLN NE2 A0236 <- 3.27 -> DG O6 C0009 : score 5.25945 : H : ARG NH1 A0238 <- 2.75 -> DT O4 C0008 : score 3.30063 : H : ARG NH2 A0238 <- 2.98 -> DT O4 C0008 : score 3.42591 : H : ARG NH2 A0238 <- 2.81 -> DG O6 C0009 : score 6.5868 : H : GLU OE1 A0240 <- 3.17 -> DC N4 C0007 : score 5.34112 : V : TYR CD2 A0225 <- 3.71 -> DT C7 C0008 : score 3.82572 : V : ARG CZ A0232 <- 3.74 -> DT C7 C0010 : score 2.16429 : V : THR CG2 A0046 <- 3.86 -> DT C7 C0017 : score 4.17337 : V : HIS CG A0040 <- 3.79 -> DT C7 C0021 : score 3.00647 : x : SER xxxx A0024 <- 4.06 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0030 <- 3.71 -> DA xxx C0020 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0048 <- 2.81 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0070 <- 4.26 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0072 <- 3.85 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0076 <- 3.52 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0082 <- 3.63 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0140 <- 3.73 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0180 <- 3.52 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0182 <- 3.22 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0195 <- 3.37 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0197 <- 3.62 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0203 <- 3.48 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0234 <- 3.24 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx >7rcg_A:Homing_endonucleases; title=I-ONUI_E-HPD1-F FINAL STAGE REENGINEERED VARIANT OF I-ONUI organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : ARG NH1 A0032 <- 2.64 -> DG O6 B0003 : score 6.278 : H : ARG NH2 A0032 <- 2.87 -> DG N7 B0003 : score 6.29523 : H : ARG NH2 A0042 <- 2.99 -> DT O4 B0006 : score 3.4188 : w : ARG NE A0042 <- 5.88 -> DA N6 B0005 : score 1.081 : w : ASN ND2 A0072 <- 6.28 -> DA N6 B0009 : score 2.5 : H : ARG NH2 A0184 <- 3.27 -> DG N7 B0019 : score 5.78446 : H : ARG NH1 A0186 <- 2.83 -> DG O6 B0020 : score 6.04683 : H : ARG NH2 A0186 <- 2.86 -> DG N7 B0020 : score 6.308 : H : ARG NH1 A0195 <- 2.81 -> DG O6 C0005 : score 6.07117 : H : GLU OE1 A0201 <- 2.91 -> DA N6 B0016 : score 2.62305 : H : GLU OE2 A0201 <- 2.99 -> DC N4 B0017 : score 5.0653 : H : GLN NE2 A0236 <- 3.00 -> DG O6 C0009 : score 5.57292 : H : ARG NH1 A0238 <- 2.68 -> DT O4 C0008 : score 3.34638 : H : ARG NH2 A0238 <- 2.77 -> DG O6 C0009 : score 6.6396 : H : GLU OE1 A0240 <- 2.86 -> DC N4 C0007 : score 5.69873 : V : TYR CD2 A0225 <- 3.53 -> DT C7 C0008 : score 3.99409 : V : THR CG2 A0046 <- 3.86 -> DT C7 C0017 : score 4.17337 : V : HIS CG A0040 <- 3.65 -> DT C7 C0021 : score 3.11144 : x : SER xxxx A0024 <- 4.18 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0028 <- 4.10 -> DC xxx C0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0048 <- 3.28 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0070 <- 4.18 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0076 <- 3.50 -> DA xxx C0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0082 <- 3.55 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0140 <- 3.83 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0180 <- 3.42 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0182 <- 3.22 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0203 <- 3.57 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0232 <- 3.40 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0234 <- 3.10 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx >7rcu_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=SYNTHETIC MAX HOMODIMER MIMIC IN COMPLEX WITH DNA organism=? : H : HIS NE2 A0018 <- 2.63 -> DG O6 C0110 : score 8.22428 : H : ARG NH1 A0026 <- 3.13 -> DG N7 C0108 : score 5.6507 : H : HIS NE2 B0018 <- 2.67 -> DG O6 D0123 : score 8.16065 : H : GLU OE1 B0022 <- 3.17 -> DC N4 C0105 : score 5.34112 : x : ASN xxxx A0019 <- 3.21 -> DT xxx C0109 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0022 <- 3.60 -> DC xxx D0118 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0025 <- 4.33 -> DG xxx D0117 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0019 <- 3.50 -> DT xxx D0122 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0025 <- 3.88 -> DG xxx C0104 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0026 <- 3.36 -> DG xxx D0121 : score x.xxxxx >7rcu_E:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=SYNTHETIC MAX HOMODIMER MIMIC IN COMPLEX WITH DNA organism=? : H : HIS NE2 E0018 <- 2.43 -> DG O6 G0110 : score 8.54243 : H : GLU OE2 E0022 <- 2.95 -> DC N4 H0118 : score 5.10742 : H : ARG NH1 E0026 <- 3.10 -> DG O6 G0108 : score 5.71833 : H : ARG NH2 E0026 <- 2.40 -> DG N7 G0108 : score 6.89538 : H : ARG NH2 E0026 <- 2.73 -> DG O6 G0108 : score 6.6924 : x : ASN xxxx E0019 <- 3.33 -> DT xxx G0109 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0025 <- 3.81 -> DC xxx H0118 : score x.xxxxx >7rcu_EF:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=SYNTHETIC MAX HOMODIMER MIMIC IN COMPLEX WITH DNA organism=? : H : HIS NE2 E0018 <- 2.43 -> DG O6 G0110 : score 8.54243 : H : GLU OE2 E0022 <- 2.95 -> DC N4 H0118 : score 5.10742 : H : ARG NH1 E0026 <- 3.10 -> DG O6 G0108 : score 5.71833 : H : ARG NH2 E0026 <- 2.40 -> DG N7 G0108 : score 6.89538 : H : ARG NH2 E0026 <- 2.73 -> DG O6 G0108 : score 6.6924 : H : HIS NE2 F0018 <- 2.70 -> DG O6 H0123 : score 8.11292 : H : GLU OE2 F0022 <- 3.37 -> DC N4 G0105 : score 4.66513 : x : ASN xxxx E0019 <- 3.33 -> DT xxx G0109 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0025 <- 3.81 -> DC xxx H0118 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0019 <- 3.86 -> DT xxx H0122 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0025 <- 4.15 -> DC xxx G0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0026 <- 3.42 -> DG xxx H0121 : score x.xxxxx >7rcu_IJ:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=SYNTHETIC MAX HOMODIMER MIMIC IN COMPLEX WITH DNA organism=? : H : HIS NE2 I0018 <- 3.03 -> DG O6 K0110 : score 7.58797 : H : ARG NH1 I0026 <- 3.25 -> DG N7 K0108 : score 5.5055 : H : ARG NH2 I0026 <- 3.16 -> DG N7 K0108 : score 5.92492 : H : HIS NE2 J0018 <- 2.87 -> DG O6 L0123 : score 7.84249 : H : ARG NH1 J0026 <- 3.41 -> DG N7 L0121 : score 5.3119 : x : ASN xxxx I0019 <- 3.27 -> DT xxx K0109 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0022 <- 3.17 -> DC xxx L0118 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0025 <- 3.87 -> DC xxx L0118 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0019 <- 3.21 -> DT xxx L0122 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx J0022 <- 3.35 -> DC xxx K0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0025 <- 3.49 -> DC xxx K0105 : score x.xxxxx >7rcu_MN:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=SYNTHETIC MAX HOMODIMER MIMIC IN COMPLEX WITH DNA organism=? : H : HIS NE2 M0018 <- 2.38 -> DG O6 O0110 : score 8.62197 : H : GLU OE1 M0022 <- 2.94 -> DC N4 P0118 : score 5.60645 : H : ARG NH1 M0026 <- 3.04 -> DG N7 O0108 : score 5.7596 : H : HIS NE2 N0018 <- 2.51 -> DG O6 P0123 : score 8.41517 : H : GLU OE2 N0022 <- 3.43 -> DC N4 O0105 : score 4.60195 : x : ASN xxxx M0019 <- 3.16 -> DT xxx O0109 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0025 <- 3.30 -> DC xxx P0118 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx N0019 <- 3.19 -> DT xxx P0122 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0025 <- 3.11 -> DG xxx O0104 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0026 <- 3.33 -> DG xxx P0121 : score x.xxxxx >7rdq_CDF: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS REITERATIVE TRANSCRIPTION COMPLEX WITH 11NT OLIGO-G RNA organism=THERMUS THERMOPHILUS HB8 : V : VAL CG1 F0262 <- 3.77 -> DT C7 H0004 : score 6.10597 : V : GLN CG F0245 <- 3.55 -> DT C7 H0007 : score 3.45885 : x : ARG xxxx C0142 <- 3.30 -> DG xxx H0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0166 <- 4.17 -> DG xxx H0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0167 <- 4.06 -> DC xxx H0018 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0170 <- 3.41 -> DT xxx H0019 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0171 <- 3.81 -> DG xxx H0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0187 <- 2.50 -> DT xxx H0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0243 <- 3.66 -> DG xxx H0017 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0325 <- 3.41 -> DG xxx H0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0326 <- 3.96 -> DG xxx H0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0350 <- 2.88 -> DA xxx G0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0357 <- 2.42 -> DA xxx G0026 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0361 <- 3.25 -> DA xxx G0026 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0377 <- 4.00 -> DA xxx G0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0418 <- 3.32 -> DG xxx H0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0422 <- 3.17 -> DG xxx G0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0426 <- 4.39 -> DG xxx H0021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0427 <- 3.38 -> DG xxx 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difficile : H : HIS NE2 C0171 <- 3.09 -> DA N3 f0020 : score 3.99988 : H : GLN NE2 C0346 <- 2.89 -> DA N7 f0019 : score 5.98013 : w : GLU OE2 C0426 <- 5.12 -> DT O4 f0016 : score 2.279 : H : ARG NH1 C0441 <- 3.21 -> DA N7 f0018 : score 2.35032 : H : ARG NH2 C0441 <- 3.25 -> DA N7 f0018 : score 1.52133 : H : SER OG C0514 <- 2.99 -> DA N6 f0021 : score 3.16473 : w : SER OG C0514 <- 5.93 -> DG O6 f0023 : score 2.749 : H : TYR OH C0521 <- 2.86 -> DA N7 f0020 : score 4.10147 >7rfl_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR SGC0946 organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 B0171 <- 3.19 -> DA N3 e0019 : score 3.91495 : H : LYS NZ B0172 <- 2.81 -> DT O2 d0023 : score 3.58001 : H : LYS NZ B0172 <- 2.93 -> DT O2 d0024 : score 3.49391 : H : LYS NZ B0193 <- 3.41 -> DG N3 d0027 : score 1.27648 : H : GLN NE2 B0346 <- 3.03 -> DA N7 e0018 : score 5.80962 : H : ARG NH1 B0425 <- 2.89 -> DG N7 d0027 : score 5.9411 : H : ARG NH2 B0425 <- 2.65 -> DG O6 d0027 : score 6.798 : w : GLU OE2 B0426 <- 5.64 -> DT O4 e0015 : score 2.279 : H : TRP NE1 B0439 <- 2.94 -> DT O4 d0026 : score 4.67308 : H : ARG NH1 B0441 <- 3.30 -> DA N7 e0017 : score 2.30423 : H : ARG NH2 B0441 <- 3.13 -> DA N7 e0017 : score 1.56146 : H : SER OG B0514 <- 2.91 -> DA N6 e0020 : score 3.21737 : H : TYR OH B0521 <- 2.76 -> DA N7 e0019 : score 4.18449 : V : ILE CG2 B0349 <- 3.72 -> DT C7 d0025 : score 7.23311 : x : TYR xxxx B0030 <- 3.72 -> DA xxx e0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0165 <- 3.08 -> DA xxx e0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0168 <- 3.18 -> DA xxx e0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0192 <- 4.21 -> DG xxx d0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0221 <- 3.69 -> DA xxx e0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0253 <- 3.69 -> DA xxx e0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0256 <- 3.71 -> DA xxx e0021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0258 <- 4.30 -> DA xxx e0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0379 <- 4.26 -> DT xxx d0022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 3.58 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0438 <- 3.56 -> DT xxx d0025 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0455 <- 2.98 -> DT xxx d0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0456 <- 3.55 -> DT xxx d0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0472 <- 3.24 -> DT xxx d0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0473 <- 3.10 -> DT xxx d0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0474 <- 4.11 -> DT xxx d0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0476 <- 4.11 -> DA xxx e0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0513 <- 3.57 -> DA xxx e0020 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0517 <- 3.65 -> DA xxx e0020 : score x.xxxxx >7rfl_C:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR SGC0946 organism=Clostridioides difficile : H : LYS NZ C0172 <- 2.86 -> DT O2 g0024 : score 3.54413 : H : LYS NZ C0193 <- 3.36 -> DG N3 g0027 : score 1.29102 : H : ARG NH1 C0425 <- 3.01 -> DG N7 g0027 : score 5.7959 : H : ARG NH2 C0425 <- 2.90 -> DG O6 g0027 : score 6.468 : H : TRP NE1 C0439 <- 2.88 -> DT O4 g0026 : score 4.73077 : w : TYR OH C0455 <- 5.99 -> DT O4 g0023 : score 2.914 : V : ALA CB C0473 <- 3.86 -> DT C7 g0024 : score 5.51499 : V : ILE CG2 C0349 <- 3.70 -> DT C7 g0025 : score 7.26856 >7rfm_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR EPZ004777 organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 B0171 <- 3.28 -> DA N3 e0019 : score 3.83852 : H : LYS NZ B0172 <- 3.03 -> DT O2 d0023 : score 3.42217 : H : LYS NZ B0172 <- 3.20 -> DT O2 d0024 : score 3.3002 : H : LYS NZ B0193 <- 3.17 -> DG N3 d0027 : score 1.34626 : H : GLN OE1 B0346 <- 3.27 -> DA N6 e0018 : score 5.48362 : H : GLN NE2 B0346 <- 3.05 -> DA N7 e0018 : score 5.78526 : H : ARG NH1 B0425 <- 2.99 -> DG N7 d0027 : score 5.8201 : H : ARG NH2 B0425 <- 2.75 -> DG O6 d0027 : score 6.666 : w : GLU OE2 B0426 <- 5.58 -> DT O4 e0015 : score 2.279 : H : TRP NE1 B0439 <- 2.97 -> DT O4 d0026 : score 4.64423 : H : ARG NH2 B0441 <- 2.89 -> DA N7 e0017 : score 1.6417 : H : SER OG B0514 <- 3.00 -> DA N6 e0020 : score 3.15815 : H : TYR OH B0521 <- 2.91 -> DA N7 e0019 : score 4.05995 : V : TYR CZ B0455 <- 3.78 -> DT C7 d0023 : score 5.60738 : V : ILE CG2 B0349 <- 3.74 -> DT C7 d0025 : score 7.19765 : x : TYR xxxx B0030 <- 3.73 -> DA xxx e0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0165 <- 3.16 -> DA xxx e0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0168 <- 3.23 -> DA xxx e0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0192 <- 4.19 -> DG xxx d0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0221 <- 3.63 -> DA xxx e0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0253 <- 3.79 -> DA xxx e0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0256 <- 3.85 -> DA xxx e0021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0258 <- 4.30 -> DA xxx e0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0379 <- 4.28 -> DT xxx d0022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 3.55 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0438 <- 3.48 -> DT xxx d0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0456 <- 3.54 -> DT xxx d0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0472 <- 3.30 -> DT xxx d0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0473 <- 3.15 -> DT xxx d0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0474 <- 4.02 -> DT xxx d0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0476 <- 4.15 -> DA xxx e0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0513 <- 3.54 -> DA xxx e0020 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0517 <- 3.80 -> DA xxx e0020 : score x.xxxxx >7rfm_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR EPZ004777 organism=Clostridioides difficile : x : ILE xxxx B0431 <- 3.97 -> DT xxx e0014 : score x.xxxxx >7rfn_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR SGC8158 organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.17 -> DA N3 d0006 : score 3.93194 : H : LYS NZ A0172 <- 2.89 -> DT O2 e0009 : score 3.52261 : H : LYS NZ A0172 <- 2.79 -> DT O2 e0010 : score 3.59435 : H : LYS NZ A0193 <- 3.25 -> DG N3 e0013 : score 1.323 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.14 -> DA N7 d0005 : score 5.67564 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.97 -> DG N7 e0013 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.90 -> DG O6 e0013 : score 6.468 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.53 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.72 -> DT O4 e0012 : score 4.88462 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.16 -> DA N7 d0004 : score 2.37592 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.10 -> DA N7 d0004 : score 1.57149 : w : TYR OH A0455 <- 5.94 -> DT O2 e0008 : score 3.068 : H : SER OG A0514 <- 3.00 -> DA N6 d0007 : score 3.15815 : H : TYR OH A0521 <- 2.93 -> DA N7 d0006 : score 4.04335 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.66 -> DT C7 e0011 : score 7.33948 : V : ILE CG2 B0431 <- 3.83 -> DT C7 e0015 : score 7.0381 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.46 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 3.10 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.19 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.33 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.64 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.52 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.74 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.10 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.22 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 3.93 -> DT xxx d0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.50 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.69 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.16 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0473 <- 3.11 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 4.00 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.25 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.51 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.61 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx >7rfn_C:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR SGC8158 organism=Clostridioides difficile : H : LYS NZ C0172 <- 2.82 -> DT O2 g0023 : score 3.57283 : H : LYS NZ C0172 <- 2.74 -> DT O2 g0024 : score 3.63023 : H : ARG NH1 C0425 <- 2.94 -> DG N7 g0027 : score 5.8806 : H : ARG NH2 C0425 <- 2.68 -> DG O6 g0027 : score 6.7584 : H : TRP NE1 C0439 <- 2.89 -> DT O4 g0026 : score 4.72115 : w : TYR OH C0455 <- 5.96 -> DT O2 g0022 : score 3.068 : V : ILE CG2 C0349 <- 3.67 -> DT C7 g0025 : score 7.32175 >7rh2_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=IRF4 TRANSCRIPTION FACTOR MUTANT -K59R organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0098 <- 3.12 -> DG N7 D0006 : score 5.6628 : H : CYS SG B0099 <- 3.43 -> DT O4 E0012 : score 6.2054 : H : LYS NZ B0103 <- 2.66 -> DG N7 E0010 : score 5.5367 : x : ARG xxxx B0059 <- 3.80 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0095 <- 3.54 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx >7rh2_GH:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=IRF4 TRANSCRIPTION FACTOR MUTANT -K59R organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 G0098 <- 3.10 -> DG N7 C0006 : score 5.687 : H : CYS SG G0099 <- 3.47 -> DT O4 F0012 : score 6.1486 : H : LYS NZ G0103 <- 2.87 -> DG N7 F0010 : score 5.31049 : H : LYS NZ H0103 <- 2.81 -> DG N7 C0014 : score 5.37513 : H : LYS NZ H0103 <- 2.69 -> DG O6 C0014 : score 5.90795 : x : THR xxxx G0095 <- 3.53 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0059 <- 3.96 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0098 <- 3.29 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx H0099 <- 3.61 -> DA xxx C0013 : score x.xxxxx >7rhx_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF PRECLEAVAGE CRE TETRAMERIC COMPLEX organism=ESCHERICHIA PHAGE P1 : H : LYS NZ A0086 <- 3.30 -> DA N7 D0014 : score 2.64346 : H : GLN NE2 A0090 <- 3.24 -> DT O4 D0012 : score 4.73422 : H : GLN NE2 A0090 <- 3.13 -> DT O4 C0022 : score 4.84842 : H : LYS NZ A0244 <- 3.44 -> DT O2 D0002 : score 3.12802 : H : LYS NZ A0244 <- 3.21 -> DT O2 C0034 : score 3.29303 : H : ARG NH2 A0259 <- 2.74 -> DG N7 C0027 : score 6.46123 : H : ARG NH2 A0282 <- 2.90 -> DA N3 D0011 : score 3.17495 : H : GLN NE2 B0090 <- 3.10 -> DT O4 D0022 : score 4.87956 : H : LYS NZ B0244 <- 3.16 -> DT O2 C0002 : score 3.3289 : H : ARG NH2 B0259 <- 2.93 -> DG N7 D0027 : score 6.21862 : x : HIS xxxx A0040 <- 3.86 -> DT xxx C0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 4.01 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0043 <- 3.86 -> DT xxx C0024 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0044 <- 3.44 -> DA xxx C0023 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 4.43 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.83 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0094 <- 4.45 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0257 <- 4.47 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0317 <- 4.33 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0320 <- 4.45 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0040 <- 3.95 -> DA xxx D0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0041 <- 3.76 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0043 <- 3.50 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0044 <- 3.71 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0086 <- 4.23 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.82 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0241 <- 4.30 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0257 <- 4.43 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0262 <- 4.44 -> DC xxx D0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0282 <- 3.99 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx >7rhx_G:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF PRECLEAVAGE CRE TETRAMERIC COMPLEX organism=? : H : LYS NZ G0043 <- 3.26 -> DT O4 F0010 : score 3.25716 : H : LYS NZ G0086 <- 3.29 -> DA N7 F0014 : score 2.64934 : H : GLN NE2 G0090 <- 2.94 -> DT O4 E0022 : score 5.04568 : H : GLN NE2 G0090 <- 3.37 -> DT O4 F0012 : score 4.59925 : H : LYS NZ G0244 <- 3.29 -> DT O2 E0034 : score 3.23564 : H : LYS NZ G0244 <- 3.04 -> DT O2 F0002 : score 3.41499 : H : ARG NH2 G0282 <- 2.91 -> DA N3 F0011 : score 3.16847 : x : HIS xxxx G0040 <- 3.88 -> DA xxx E0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0041 <- 4.34 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0044 <- 3.44 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0047 <- 3.77 -> DT xxx F0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0087 <- 3.60 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0094 <- 4.25 -> DT xxx E0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0241 <- 4.45 -> DA xxx F0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0259 <- 3.52 -> DG xxx E0027 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0262 <- 4.37 -> DA xxx E0025 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0320 <- 4.31 -> DT xxx F0015 : score x.xxxxx >7rhy_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=CRE RECOMBINASE MUTANT (D33A/A36V/R192A) IN COMPLEX WITH LOXA DNA HAIRPIN organism=ESCHERICHIA PHAGE P1 : H : ARG NH2 A0259 <- 3.46 -> DG N7 B0038 : score 5.54185 : V : LYS CE A0043 <- 3.74 -> DT C7 B0010 : score 2.64004 : x : HIS xxxx A0040 <- 4.06 -> DA xxx B0034 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 4.11 -> DT xxx B0033 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0044 <- 4.48 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0047 <- 4.23 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0086 <- 3.47 -> DA xxx B0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 4.07 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0090 <- 3.17 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 4.23 -> DA xxx B0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0244 <- 3.74 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0262 <- 4.35 -> DA xxx B0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0282 <- 3.48 -> DA xxx B0036 : score x.xxxxx >7rhz_A:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=HETERODIMER OF CRE RECOMBINASE MUTANTS D33A/A36V/R192A AND R72E/L115D/R119D IN COMPLEX WITH LOXP DNA. organism=ESCHERICHIA PHAGE P1 : H : LYS NZ A0086 <- 2.86 -> DG N7 C0014 : score 5.32127 : H : ARG NH1 A0259 <- 2.46 -> DG O6 D0027 : score 6.497 : H : ARG NH2 A0259 <- 2.46 -> DG N7 D0027 : score 6.81877 : V : LYS CE A0043 <- 3.79 -> DT C7 C0010 : score 2.60753 : x : HIS xxxx A0040 <- 3.41 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 4.03 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0044 <- 3.36 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.92 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0090 <- 3.51 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0097 <- 4.23 -> DC xxx D0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 4.40 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0244 <- 3.49 -> DT xxx D0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0282 <- 3.93 -> DA xxx D0025 : score x.xxxxx >7rhz_AB:DNA_breaking-rejoining_enzymes;lambda_integrase-like,_N-terminal_domain; title=HETERODIMER OF CRE RECOMBINASE MUTANTS D33A/A36V/R192A AND R72E/L115D/R119D IN COMPLEX WITH LOXP DNA. organism=ESCHERICHIA PHAGE P1 : H : LYS NZ A0086 <- 2.86 -> DG N7 C0014 : score 5.32127 : H : ARG NH1 A0259 <- 2.46 -> DG O6 D0027 : score 6.497 : H : ARG NH2 A0259 <- 2.46 -> DG N7 D0027 : score 6.81877 : H : LYS NZ B0043 <- 2.76 -> DG N7 D0009 : score 5.42898 : H : LYS NZ B0086 <- 2.97 -> DA N7 D0014 : score 2.83732 : H : ARG NH2 B0241 <- 2.69 -> DA N3 D0004 : score 3.31102 : H : LYS NZ B0244 <- 2.31 -> DT O2 D0002 : score 3.93872 : H : LYS NZ B0244 <- 2.43 -> DT O2 C0034 : score 3.85263 : H : ARG NH1 B0259 <- 2.34 -> DG O6 C0027 : score 6.643 : H : ARG NH2 B0259 <- 2.52 -> DG N7 C0027 : score 6.74215 : H : ARG NH2 B0282 <- 2.93 -> DA N3 D0011 : score 3.15551 : x : HIS xxxx A0040 <- 3.41 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0041 <- 4.03 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0043 <- 3.52 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0044 <- 3.36 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0087 <- 3.92 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0090 <- 3.51 -> DT xxx D0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0097 <- 4.23 -> DC xxx D0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0241 <- 4.40 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0244 <- 3.49 -> DT xxx D0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0282 <- 3.93 -> DA xxx D0025 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0040 <- 4.39 -> DT xxx C0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0041 <- 3.92 -> DT xxx C0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0044 <- 4.07 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0047 <- 4.08 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0087 <- 3.70 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0090 <- 3.03 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0097 <- 3.48 -> DT xxx C0021 : score x.xxxxx >7rim_ABE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX WITH HAIRPIN POLYAMIDE PY-IM 1, SCAFFOLD 1 organism=? : x : ARG xxxx A1386 <- 3.83 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >7rip_ABE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX WITH HAIRPIN POLYAMIDE PY-IM 1, SCAFFOLD 1 SOAKED WITH CTP organism=? : x : ARG xxxx A1386 <- 4.01 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >7riq_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX SCAFFOLD 1 WITHOUT POLYAMIDE organism=? : x : LYS xxxx A0143 <- 4.32 -> DA xxx N0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 2.94 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >7riq_ABE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX SCAFFOLD 1 WITHOUT POLYAMIDE organism=? : x : LYS xxxx A0143 <- 4.32 -> DA xxx N0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1386 <- 2.94 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >7riw_ABE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX SCAFFOLD 2, WITHOUT POLYAMIDE organism=? : x : ARG xxxx A1386 <- 3.15 -> DA xxx T0015 : score x.xxxxx >7rix_ABE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX WITH HAIRPIN POLYAMIDE PY-IM 1, SCAFFOLD 2 organism=? : x : ARG xxxx A1386 <- 3.33 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx >7riy_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX WITH HAIRPIN POLYAMIDE PY-IM 1, SCAFFOLD 2 SOAKED WITH UTP organism=? : x : ARG xxxx A1386 <- 4.40 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >7riy_ABE: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX WITH HAIRPIN POLYAMIDE PY-IM 1, SCAFFOLD 2 SOAKED WITH UTP organism=? : x : ARG xxxx A1386 <- 4.40 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >7rpo_E:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain; title=ARCHAEAL DNA LIGASE AND HETEROTRIMERIC PCNA IN COMPLEX WITH NON- LIGATABLE DNA organism=SACCHAROLOBUS SOLFATARICUS : x : ARG xxxx E0019 <- 4.03 -> DC xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0140 <- 3.59 -> DC xxx Z0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0332 <- 2.95 -> DG xxx Z0027 : score x.xxxxx >7rpw_E:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain; title=ARCHAEAL DNA LIGASE AND HETEROTRIMERIC PCNA IN COMPLEX WITH ADENYLATED DNA organism=? : H : ARG NH1 E0332 <- 2.73 -> DG N3 Z0027 : score 3.0953 : H : ARG NH2 E0332 <- 3.10 -> DC O2 Z0028 : score 3.47679 : x : ARG xxxx E0140 <- 3.24 -> DT xxx Z0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0240 <- 4.01 -> DC xxx Y0003 : score x.xxxxx >7rpx_CE:DNA_clamp;ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain; title=ARCHAEAL DNA LIGASE AND HETEROTRIMERIC PCNA IN COMPLEX WITH END- JOINED DNA organism=SACCHAROLOBUS SOLFATARICUS : V : ARG CZ E0281 <- 3.58 -> DT C7 X0023 : score 2.24958 : x : ARG xxxx E0019 <- 3.61 -> DT xxx Z0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0140 <- 4.05 -> DT xxx Z0030 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0324 <- 3.57 -> DC xxx X0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0325 <- 3.93 -> DC xxx Z0026 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0328 <- 3.31 -> DG xxx X0022 : score x.xxxxx >7rsr_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=KOD-RI INCORPORATING PMT, N+2 organism=Thermococcus kodakarensis : H : ARG NH1 A0612 <- 3.02 -> DC O2 P0010 : score 3.4894 : x : LYS xxxx A0592 <- 3.27 -> DG xxx P0011 : score x.xxxxx >7rss_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=KOD-RI INCORPORATING DNA, N+2 organism=Thermococcus kodakarensis : w : TYR OH A0494 <- 5.63 -> DT O2 T0004 : score 3.068 : H : LYS NZ A0592 <- 2.92 -> DA N3 P0012 : score 2.71028 : H : ARG NH1 A0612 <- 2.91 -> DC O2 P0010 : score 3.5697 >7rsu_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=TNA POLYMERASE, N+2 PRODUCT organism=Thermococcus kodakarensis : H : ARG NH1 A0612 <- 3.00 -> DC O2 P0010 : score 3.504 : H : ARG NH2 A0612 <- 3.34 -> DG N3 P0009 : score 3.22035 : x : LYS xxxx A0592 <- 3.17 -> DC xxx T0008 : score x.xxxxx >7rte_C:p53-like_transcription_factors;DNA-binding_protein_LAG-1_CSL;E_set_domains; title=X-RAY STRUCTURE OF WILD TYPE RBPJ-L3MBTL3-DNA COMPLEX organism=Mus musculus : w : GLU OE1 C0089 <- 6.08 -> DC N4 A0010 : score 3.528 : w : GLU OE2 C0089 <- 6.17 -> DC N4 A0010 : score 3.597 : H : ARG NH1 C0091 <- 2.88 -> DG N7 B0023 : score 5.9532 : H : ARG NH2 C0091 <- 2.83 -> DG O6 B0023 : score 6.5604 : H : LYS NZ C0192 <- 2.67 -> DG O6 B0025 : score 5.93107 : H : GLN OE1 C0222 <- 3.20 -> DG N2 A0014 : score 5.15908 : H : GLN NE2 C0222 <- 3.05 -> DG N3 A0014 : score 4.72686 : x : TYR xxxx C0086 <- 3.57 -> DT xxx A0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0191 <- 3.74 -> DT xxx A0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0221 <- 3.98 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx >7rti_C:p53-like_transcription_factors;DNA-binding_protein_LAG-1_CSL;E_set_domains; title=X-RAY STRUCTURE OF RBPJ-L3MBTL3(DT62)-DNA COMPLEX organism=Mus musculus : w : GLU OE1 C0089 <- 5.98 -> DC N4 A0009 : score 3.528 : w : GLU OE1 C0089 <- 5.89 -> DT O4 B0022 : score 2.749 : w : GLU OE2 C0089 <- 6.06 -> DC N4 A0009 : score 3.597 : H : ARG NH1 C0091 <- 2.94 -> DG N7 B0023 : score 5.8806 : H : ARG NH2 C0091 <- 2.85 -> DG O6 B0023 : score 6.534 : H : LYS NZ C0192 <- 2.46 -> DG O6 B0025 : score 6.17386 : H : GLN OE1 C0222 <- 3.18 -> DG N2 A0013 : score 5.18151 : H : GLN NE2 C0222 <- 2.93 -> DG N3 A0013 : score 4.84627 : x : TYR xxxx C0086 <- 3.65 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0191 <- 3.90 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0221 <- 4.11 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx >7rva_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=UPDATED CRYSTAL STRUCTURE OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54. organism=ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) / ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12) : H : GLU OE1 C0077 <- 2.72 -> DC N4 A0015 : score 5.86024 : w : GLU OE1 C0077 <- 5.67 -> DC N4 A0016 : score 3.528 : w : GLU OE2 C0077 <- 5.67 -> DG O6 A0014 : score 2.892 : w : GLU OE2 C0077 <- 5.78 -> DG N7 A0014 : score 2.669 : H : LYS NZ C0080 <- 2.92 -> DG O6 B0028 : score 5.64203 : w : LYS NZ C0080 <- 6.29 -> DG O6 B0029 : score 3.005 : w : ARG NH2 C0083 <- 5.70 -> DG N7 B0027 : score 2.18 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.76 -> DT O2 B0024 : score 4.2672 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.67 -> DG N3 B0025 : score 3.70412 : H : ARG NH1 C0200 <- 2.87 -> DG O6 A0004 : score 5.99817 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.68 -> DT O4 A0005 : score 3.63914 : w : ARG NH1 C0200 <- 6.03 -> DT O4 A0003 : score 1.768 : H : ASP OD1 C0203 <- 2.80 -> DC N4 B0038 : score 5.34487 : w : ASP OD1 C0203 <- 5.45 -> DT O4 B0037 : score 2.616 : H : ARG NH1 C0206 <- 3.41 -> DG N7 A0006 : score 5.3119 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.58 -> DG O6 A0006 : score 6.8904 : w : ARG NE C0206 <- 5.66 -> DT O4 B0037 : score 1.317 : w : ARG NH2 C0206 <- 5.44 -> DT O4 B0037 : score 2.366 : H : ARG NE C0207 <- 2.53 -> DG N7 B0036 : score 4.66057 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.70 -> DG O6 B0036 : score 6.732 : H : ARG NH1 C0233 <- 2.63 -> DC O2 A0001 : score 3.7741 : V : PRO CG C0202 <- 3.81 -> DT C7 A0003 : score 6.34308 : x : SER xxxx C0075 <- 3.25 -> DG xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 3.58 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.58 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 3.61 -> DT xxx B0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 3.76 -> DG xxx B0036 : score x.xxxxx >7rwi_CD: title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RNA POLYMERASE SIGMA L HOLOENZYME OPEN PROMOTER COMPLEX CONTAINING TNP-2198 organism=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : H : ARG NH2 D0291 <- 2.73 -> DG O6 H0024 : score 6.6924 : x : ARG xxxx C0467 <- 3.25 -> DT xxx H0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0287 <- 3.44 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx >7rwi_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RNA POLYMERASE SIGMA L HOLOENZYME OPEN PROMOTER COMPLEX CONTAINING TNP-2198 organism=? : H : ARG NH2 D0291 <- 2.73 -> DG O6 H0024 : score 6.6924 : x : GLN xxxx D0287 <- 3.44 -> DG xxx G0004 : score x.xxxxx >7s01_CD: title=X-RAY STRUCTURE OF THE PHAGE AR9 NON-VIRION RNA POLYMERASE HOLOENZYME IN COMPLEX WITH A FORKED OLIGONUCLEOTIDE CONTAINING THE P077 PROMOTER organism=? : x : TYR xxxx D0266 <- 3.18 -> DA xxx T0017 : score x.xxxxx >7s03_A:Homeodomain-like; title=DNA-BINDING DOMAIN OF HUMAN SETMAR IN COMPLEX WITH HSMAR1 TERMINAL INVERTED REPEAT (TIR) DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NE A0371 <- 2.81 -> DG O6 B0005 : score 3.93314 : H : ARG NH2 A0371 <- 2.89 -> DG N7 B0005 : score 6.26969 : H : ARG NE A0392 <- 2.98 -> DT O2 C0015 : score 2.48415 : H : ARG NH2 A0392 <- 3.16 -> DA N3 C0016 : score 3.00648 : H : ARG NH1 A0417 <- 3.14 -> DG N7 C0005 : score 5.6386 : H : ARG NH2 A0417 <- 3.16 -> DG O6 C0005 : score 6.1248 : H : HIS NE2 A0427 <- 3.23 -> DG N7 C0006 : score 6.21754 : H : HIS NE2 A0427 <- 3.11 -> DG O6 C0006 : score 7.46071 : H : SER OG A0428 <- 3.02 -> DC N4 B0018 : score 3.51391 : H : ARG NH1 A0432 <- 2.77 -> DG O6 B0017 : score 6.11983 : H : ARG NH2 A0432 <- 2.87 -> DG O6 C0008 : score 6.5076 : V : TRP CB A0375 <- 3.79 -> DT C7 C0019 : score 5.51015 : x : GLU xxxx A0370 <- 4.02 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0372 <- 3.97 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0374 <- 3.43 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0395 <- 3.27 -> DT xxx B0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0416 <- 4.12 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0426 <- 3.58 -> DC xxx B0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0429 <- 4.44 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0431 <- 4.11 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx >7s0t_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF DNA POLYMERASE ZETA WITH MISMATCHED DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : TYR xxxx A1093 <- 4.27 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1195 <- 3.81 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1220 <- 3.73 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx >7s36_P: title=CAS9:SGRNA:DNA (S. PYOGENES) WITH 0 RNA:DNA BASE PAIRS, CLOSED- PROTEIN/BENT-DNA CONFORMATION organism=STREPTOCOCCUS PYOGENES SEROTYPE M1 : H : LYS NZ P1107 <- 2.83 -> DC O2 T0009 : score 2.92848 : H : ARG NH1 P1333 <- 3.31 -> DG N7 N0022 : score 5.4329 : H : ARG NH2 P1333 <- 2.96 -> DG O6 N0022 : score 6.3888 : H : ARG NH1 P1335 <- 2.74 -> DG O6 N0023 : score 6.15633 : H : ARG NH2 P1335 <- 3.04 -> DG N7 N0023 : score 6.07815 : V : CYS CB P1337 <- 3.87 -> DT C7 T0005 : score 5.10698 : x : LYS xxxx P0065 <- 4.36 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx P0263 <- 3.74 -> DT xxx N0013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx P1108 <- 3.07 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx P1219 <- 4.31 -> DG xxx N0022 : score x.xxxxx >7s38_P: title=CAS9:SGRNA:DNA (S. PYOGENES) FORMING A 3-BASE-PAIR R-LOOP organism=STREPTOCOCCUS PYOGENES SEROTYPE M1 : H : LYS NZ P1107 <- 2.61 -> DC O2 T0009 : score 3.05811 : H : ARG NH1 P1333 <- 3.35 -> DG N7 N0022 : score 5.3845 : H : ARG NH2 P1333 <- 2.75 -> DG O6 N0022 : score 6.666 : H : ARG NH1 P1335 <- 3.34 -> DG N7 N0023 : score 5.3966 : H : ARG NH2 P1335 <- 2.52 -> DG O6 N0023 : score 6.9696 : x : LYS xxxx P0065 <- 3.80 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx P0072 <- 4.14 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx P1108 <- 3.17 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx P1219 <- 4.29 -> DG xxx N0022 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx P1337 <- 3.93 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx >7s3h_P: title=CAS9:SGRNA:DNA (S. PYOGENES) WITH 0 RNA:DNA BASE PAIRS, OPEN- PROTEIN/LINEAR-DNA CONFORMATION organism=STREPTOCOCCUS PYOGENES SEROTYPE M1 : H : ARG NH1 P1333 <- 3.25 -> DG N7 N0022 : score 5.5055 : H : ARG NH2 P1333 <- 2.92 -> DG O6 N0022 : score 6.4416 : H : ARG NH1 P1335 <- 2.44 -> DG O6 N0023 : score 6.52133 : H : ARG NH2 P1335 <- 2.73 -> DG N7 N0023 : score 6.474 : x : GLU xxxx P1219 <- 4.14 -> DG xxx N0023 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx P1337 <- 3.44 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx >7s4u_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CAS9 IN COMPLEX WITH 12-14MM DNA SUBSTRATE, 5 MINUTE TIME-POINT organism=STREPTOCOCCUS PYOGENES : H : ARG NH2 A1333 <- 2.95 -> DG O6 D0040 : score 6.402 : x : LYS xxxx A1107 <- 3.66 -> DA xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A1332 <- 3.86 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1335 <- 3.36 -> DA xxx D0041 : score x.xxxxx >7s4v_A: title=CAS9 BOUND TO 12-14MM DNA, 60 MIN TIME-POINT, KINKED CONFORMATION organism=STREPTOCOCCUS PYOGENES : x : LYS xxxx A1107 <- 3.60 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1219 <- 4.42 -> DG xxx D0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1333 <- 3.68 -> DG xxx D0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1335 <- 3.72 -> DG xxx D0033 : score x.xxxxx >7s6h_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=HUMAN PARP1 DELTAV687-E688 BOUND TO NAD+ ANALOG EB-47 AND TO A DNA DOUBLE STRAND BREAK. organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0018 <- 3.31 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0044 <- 3.22 -> DG xxx N0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0048 <- 3.26 -> DG xxx N0026 : score x.xxxxx >7s6h_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain;ADP-ribosylation;Domain_of_polyADP-ribose_polymerase;WGR_domain-like; title=HUMAN PARP1 DELTAV687-E688 BOUND TO NAD+ ANALOG EB-47 AND TO A DNA DOUBLE STRAND BREAK. organism=? : x : TRP xxxx B0589 <- 4.26 -> DC xxx M0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0018 <- 3.31 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0044 <- 3.22 -> DG xxx N0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0048 <- 3.26 -> DG xxx N0026 : score x.xxxxx >7s6h_B:ADP-ribosylation;Domain_of_polyADP-ribose_polymerase;WGR_domain-like; title=HUMAN PARP1 DELTAV687-E688 BOUND TO NAD+ ANALOG EB-47 AND TO A DNA DOUBLE STRAND BREAK. organism=HOMO SAPIENS : x : TRP xxxx B0589 <- 4.26 -> DC xxx M0001 : score x.xxxxx >7s6m_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=HUMAN PARP1 DELTAV687-E688 BOUND TO A DNA DOUBLE STRAND BREAK. organism=? : x : ARG xxxx A0018 <- 3.38 -> DT xxx M0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0044 <- 3.38 -> DG xxx M0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0048 <- 3.37 -> DG xxx M0026 : score x.xxxxx >7s6m_CD:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain;ADP-ribosylation;Domain_of_polyADP-ribose_polymerase;WGR_domain-like; title=HUMAN PARP1 DELTAV687-E688 BOUND TO A DNA DOUBLE STRAND BREAK. organism=HOMO SAPIENS : x : TRP xxxx D0589 <- 4.15 -> DC xxx O0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0018 <- 3.64 -> DT xxx P0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0044 <- 3.10 -> DG xxx P0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0048 <- 3.15 -> DG xxx P0026 : score x.xxxxx >7s81_AF:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain;WGR_domain-like;Domain_of_polyADP-ribose_polymerase; title=STRUCTURE OF HUMAN PARP1 DOMAINS (ZN1, ZN3, WGR, HD) BOUND TO A DNA DOUBLE STRAND BREAK. organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 F0018 <- 2.82 -> DC O2 D0010 : score 3.6354 : x : ARG xxxx A0018 <- 3.45 -> DC xxx E0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0044 <- 3.64 -> DT xxx E0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0048 <- 3.30 -> DT xxx E0026 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0049 <- 4.38 -> DT xxx E0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0044 <- 2.97 -> DA xxx E0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0048 <- 3.35 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0049 <- 4.31 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx >7s81_C:WGR_domain-like;Domain_of_polyADP-ribose_polymerase; title=STRUCTURE OF HUMAN PARP1 DOMAINS (ZN1, ZN3, WGR, HD) BOUND TO A DNA DOUBLE STRAND BREAK. organism=? : x : LYS xxxx C0621 <- 4.38 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx >7s81_CG:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain;WGR_domain-like;Domain_of_polyADP-ribose_polymerase; title=STRUCTURE OF HUMAN PARP1 DOMAINS (ZN1, ZN3, WGR, HD) BOUND TO A DNA DOUBLE STRAND BREAK. organism=HOMO SAPIENS : x : LYS xxxx C0621 <- 4.38 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx >7s81_IN:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain;WGR_domain-like;Domain_of_polyADP-ribose_polymerase; title=STRUCTURE OF HUMAN PARP1 DOMAINS (ZN1, ZN3, WGR, HD) BOUND TO A DNA DOUBLE STRAND BREAK. organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH1 N0018 <- 2.57 -> DC O2 M0010 : score 3.8179 : x : PHE xxxx N0044 <- 3.52 -> DA xxx L0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx N0048 <- 3.58 -> DT xxx M0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx N0049 <- 4.42 -> DT xxx M0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0018 <- 3.17 -> DC xxx L0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0044 <- 3.76 -> DA xxx M0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0048 <- 3.35 -> DT xxx L0026 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx I0049 <- 4.38 -> DT xxx L0026 : score x.xxxxx >7s81_KO:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain;WGR_domain-like;Domain_of_polyADP-ribose_polymerase; title=STRUCTURE OF HUMAN PARP1 DOMAINS (ZN1, ZN3, WGR, HD) BOUND TO A DNA DOUBLE STRAND BREAK. organism=HOMO SAPIENS : x : LYS xxxx K0621 <- 4.43 -> DT xxx M0002 : score x.xxxxx >7s9j_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH FAPY-DG BASE-PAIRED WITH A DC organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.13 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.78 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.49 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7s9k_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH FAPY-DG BASE-PAIRED WITH A DA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.26 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.72 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.48 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7s9l_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH RING OPEN INTERMEDIATE FAPY-DG BASE-PAIRED WITH A DC organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.25 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.77 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.44 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7s9m_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH RING OPEN INTERMEDIATE FAPY-DG BASE-PAIRED WITH A DA organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.30 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.70 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.58 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7s9n_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=BINARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH FAPY-DG IN THE TEMPLATE POSITION organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.28 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.68 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.45 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7s9o_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=BINARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH RING OPEN INTERMEDIATE FAPY-DG IN THE TEMPLATE POSITION organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.01 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 3.80 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.65 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7s9p_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH TEMPLATE FAPY-DG AND AN INCOMING DCTP ANALOG organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 6.50 -> DG N2 T0009 : score 1.651 : w : LYS NZ A0234 <- 5.66 -> DG N2 T0009 : score 0.846 : w : LYS NZ A0234 <- 5.53 -> DG N3 P0009 : score 2.232 : H : TYR OH A0271 <- 2.70 -> DA N3 P0010 : score 4.23431 : w : TYR OH A0271 <- 6.33 -> DC O2 T0008 : score 1.343 : H : ARG NH1 A0283 <- 3.20 -> DT O2 T0007 : score 3.9619 : w : ARG NH1 A0283 <- 6.01 -> DT O2 T0007 : score 1.855 : w : ARG NH2 A0283 <- 6.00 -> DT O2 T0007 : score 2.261 : w : GLU OE1 A0295 <- 5.58 -> DT O2 T0007 : score 2.462 : w : GLU OE2 A0295 <- 5.62 -> DC O2 T0008 : score 1.988 >7s9q_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH TEMPLATE FAPY-DG AND AN INCOMING DATP ANALOG organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0034 <- 3.33 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0035 <- 4.06 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0038 <- 3.51 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7sba_A: title=STRUCTURE OF TYPE I-D CASCADE BOUND TO A DSDNA TARGET organism=SYNECHOCYSTIS SP. PCC 6803 : x : THR xxxx A0146 <- 4.23 -> DA xxx X0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0147 <- 3.52 -> DC xxx X0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0156 <- 4.47 -> DA xxx X0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0162 <- 3.34 -> DC xxx X0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0165 <- 3.85 -> DC xxx X0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0166 <- 3.24 -> DA xxx X0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0167 <- 4.20 -> DC xxx X0005 : score x.xxxxx >7sba_ABC: title=STRUCTURE OF TYPE I-D CASCADE BOUND TO A DSDNA TARGET organism=SYNECHOCYSTIS SP. PCC 6803 : x : THR xxxx A0146 <- 4.23 -> DA xxx X0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0147 <- 3.52 -> DC xxx X0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0156 <- 4.47 -> DA xxx X0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0162 <- 3.34 -> DC xxx X0002 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0165 <- 3.85 -> DC xxx X0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0166 <- 3.24 -> DA xxx X0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0167 <- 4.20 -> DC xxx X0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0117 <- 3.72 -> DA xxx X0006 : score x.xxxxx >7sba_HI: title=STRUCTURE OF TYPE I-D CASCADE BOUND TO A DSDNA TARGET organism=SYNECHOCYSTIS SP. PCC 6803 : H : LYS NZ H0114 <- 3.13 -> DG N7 Y0004 : score 5.03043 : H : LYS NZ I0326 <- 2.66 -> DT O2 Y0005 : score 3.68762 : H : LYS NZ I0326 <- 2.79 -> DC O2 X0012 : score 2.95205 : x : GLN xxxx H0110 <- 3.29 -> DA xxx X0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0552 <- 3.17 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0566 <- 4.29 -> DA xxx X0011 : score x.xxxxx >7sdp_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND COGNATE DNA SEQUENCE WITH TERMINAL THREE PRIME PHOSPHATES. organism=ESCHERICHIA COLI : H : GLU OE1 C0077 <- 2.67 -> DC N4 A0015 : score 5.91792 : w : GLU OE1 C0077 <- 6.35 -> DC N4 A0016 : score 3.528 : w : GLU OE2 C0077 <- 5.32 -> DG N7 A0014 : score 2.669 : H : LYS NZ C0080 <- 3.00 -> DG O6 B0028 : score 5.54954 : H : ARG NH2 C0124 <- 3.05 -> DT O2 B0024 : score 4.02167 : H : ARG NH2 C0124 <- 3.26 -> DG N3 B0025 : score 3.27811 : H : ARG NH1 C0200 <- 3.08 -> DG O6 A0004 : score 5.74267 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.73 -> DT O4 A0005 : score 3.6036 : H : ASP OD1 C0203 <- 2.96 -> DC N4 B0038 : score 5.17384 : H : ARG NH1 C0206 <- 3.42 -> DG N7 A0006 : score 5.2998 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.62 -> DG O6 A0006 : score 6.8376 : H : ARG NE C0207 <- 2.81 -> DG N7 B0036 : score 4.41295 : H : ARG NH2 C0207 <- 3.03 -> DG O6 B0036 : score 6.2964 : x : SER xxxx C0075 <- 3.48 -> DG xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 3.94 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.80 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.81 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 4.10 -> DT xxx B0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 4.14 -> DG xxx B0036 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.47 -> DG xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0233 <- 2.90 -> DC xxx A0001 : score x.xxxxx >7sfc_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=HUMAN DNMT1(729-1600) BOUND TO ZEBULARINE-CONTAINING 12MER DSDNA AND INHIBITOR GSK3735967A organism=Homo sapiens : x : CYS xxxx A1499 <- 4.40 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1507 <- 3.15 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1508 <- 4.06 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1531 <- 4.49 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1533 <- 3.41 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1535 <- 3.51 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx >7sfd_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=HUMAN DNMT1(729-1600) BOUND TO ZEBULARINE-CONTAINING 12MER DSDNA AND INHIBITOR GSK3543105A organism=Homo sapiens : x : CYS xxxx A1499 <- 4.31 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1507 <- 3.28 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1508 <- 4.07 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1533 <- 3.79 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1535 <- 3.96 -> DG xxx D0019 : score x.xxxxx >7sfe_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=HUMAN DNMT1(729-1600) BOUND TO ZEBULARINE-CONTAINING 12MER DSDNA AND INHIBITOR GSK3830334A organism=Homo sapiens : x : CYS xxxx A1499 <- 4.44 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1507 <- 3.13 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1508 <- 4.12 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1533 <- 3.55 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >7sff_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=HUMAN DNMT1(729-1600) BOUND TO ZEBULARINE-CONTAINING 12MER DSDNA AND INHIBITOR GSK3852279B organism=Homo sapiens : x : CYS xxxx A1499 <- 4.39 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1507 <- 3.14 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1508 <- 4.35 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1533 <- 3.52 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >7sfg_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=HUMAN DNMT1(729-1600) BOUND TO ZEBULARINE-CONTAINING 12MER DSDNA AND COFACTOR SAM organism=Homo sapiens : w : GLU OE2 A1531 <- 5.91 -> DG O6 C0004 : score 2.892 : x : MET xxxx A1232 <- 3.57 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1234 <- 3.39 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1235 <- 3.58 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1507 <- 3.83 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1533 <- 3.35 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1535 <- 3.12 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1536 <- 3.72 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx >7sgc_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND COGNATE DNA SEQUENCE WITH TERMINAL FIVE PRIME PHOSPHATES. organism=ESCHERICHIA COLI : H : GLU OE1 C0077 <- 2.66 -> DC N4 A0015 : score 5.92945 : w : GLU OE2 C0077 <- 5.51 -> DG N7 A0014 : score 2.669 : w : GLU OE2 C0077 <- 6.15 -> DG O6 A0014 : score 2.892 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.92 -> DT O2 B0024 : score 4.13173 : H : ARG NH1 C0200 <- 2.56 -> DG O6 A0004 : score 6.37533 : H : ARG NH1 C0200 <- 3.33 -> DT O4 A0005 : score 2.92155 : H : ASP OD1 C0203 <- 3.01 -> DC N4 B0038 : score 5.12039 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.49 -> DG O6 A0006 : score 7.0092 : H : ARG NE C0207 <- 3.07 -> DG N7 B0036 : score 4.18302 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.88 -> DG O6 B0036 : score 6.4944 : x : SER xxxx C0075 <- 3.44 -> DG xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 3.75 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.93 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0080 <- 3.52 -> DG xxx B0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 4.14 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 3.74 -> DT xxx B0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 4.05 -> DG xxx B0036 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.62 -> DG xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0233 <- 3.98 -> DC xxx A0001 : score x.xxxxx >7sgl_ABD: title=DNA-PK COMPLEX OF DNA END PROCESSING organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 B0254 <- 3.29 -> DA N3 E0036 : score 2.92225 : x : ARG xxxx A0264 <- 4.05 -> DT xxx E0030 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0001 <- 4.33 -> DT xxx E0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0036 <- 3.89 -> DG xxx E0027 : score x.xxxxx >7sgl_D:Metallo-hydrolase/oxidoreductase; title=DNA-PK COMPLEX OF DNA END PROCESSING organism=HOMO SAPIENS : x : MET xxxx D0001 <- 4.33 -> DT xxx E0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0036 <- 3.89 -> DG xxx E0027 : score x.xxxxx >7sgz_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF THE YEAST RAD24-RFC LOADER BOUND TO DNA AND THE CLOSED 9- 1-1 CLAMP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : PHE xxxx A0340 <- 3.55 -> DC xxx T0030 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0341 <- 3.18 -> DG xxx P0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0441 <- 3.27 -> DC xxx T0030 : score x.xxxxx >7sh2_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF THE YEAST RAD24-RFC LOADER BOUND TO DNA AND THE OPEN 9-1- 1 CLAMP organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : x : PHE xxxx A0340 <- 3.67 -> DC xxx T0030 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0341 <- 3.05 -> DG xxx P0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0345 <- 4.47 -> DG xxx P0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0348 <- 3.72 -> DG xxx P0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0441 <- 3.25 -> DC xxx T0030 : score x.xxxxx >7sjr_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ADNA-ADNB(W325A) IN COMPLEX WITH DNA AND AMPPNP organism=MYCOLICIBACTERIUM SMEGMATIS : H : ARG NH1 A0825 <- 2.84 -> DT O2 C0003 : score 4.27196 : x : SER xxxx A0826 <- 3.63 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0940 <- 4.25 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1029 <- 3.35 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx >7sjr_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ADNA-ADNB(W325A) IN COMPLEX WITH DNA AND AMPPNP organism=MYCOLICIBACTERIUM SMEGMATIS : H : ARG NH1 A0825 <- 2.84 -> DT O2 C0003 : score 4.27196 : H : ARG NH2 B0436 <- 2.89 -> DT O2 C0053 : score 4.15713 : H : HIS NE2 B0665 <- 2.93 -> DT O2 C0055 : score 5.10351 : H : ARG NH2 B0746 <- 2.74 -> DT O2 C0053 : score 4.28413 : x : PHE xxxx B0079 <- 3.93 -> DT xxx C0056 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0081 <- 3.67 -> DT xxx C0058 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0120 <- 3.87 -> DG xxx C0057 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0142 <- 4.13 -> DT xxx C0058 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0214 <- 3.31 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0254 <- 3.35 -> DG xxx C0057 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0323 <- 3.70 -> DT xxx C0055 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0826 <- 3.63 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0940 <- 4.25 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1029 <- 3.35 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx >7soz_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND COGNATE DNA SEQUENCE WITH TERMINAL THREE PRIME PHOSPHATES CHEMICALLY CROSSLINKED (5 MG/ML EDC, 12 HOURS). organism=Escherichia coli : H : GLU OE1 C0077 <- 2.42 -> DC N4 A0015 : score 6.20631 : H : LYS NZ C0080 <- 2.73 -> DG O6 B0029 : score 5.8617 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.61 -> DT O2 B0024 : score 4.3942 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.78 -> DG O6 A0004 : score 6.6264 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.85 -> DT O4 A0005 : score 3.51831 : H : ASP OD1 C0203 <- 3.00 -> DC N4 B0038 : score 5.13108 : H : ARG NH1 C0206 <- 2.39 -> DG O6 A0006 : score 6.58217 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.80 -> DG N7 A0006 : score 6.38462 : H : ARG NE C0207 <- 3.16 -> DG N7 B0036 : score 4.10343 : H : ARG NH2 C0207 <- 3.03 -> DG O6 B0036 : score 6.2964 : x : SER xxxx C0075 <- 3.13 -> DG xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 3.51 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.98 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.58 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 3.86 -> DT xxx B0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 4.36 -> DG xxx B0036 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.34 -> DG xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0233 <- 4.11 -> DG xxx B0043 : score x.xxxxx >7spm_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND COGNATE DNA SEQUENCE WITH TERMINAL THREE PRIME PHOSPHATES CHEMICALLY CROSSLINKED (30 MG/ML EDC, 12 HOURS, 2 DOSES). organism=Escherichia coli : H : GLU OE1 C0077 <- 2.74 -> DC N4 A0015 : score 5.83716 : H : LYS NZ C0080 <- 2.94 -> DG O6 B0029 : score 5.61891 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.87 -> DT O2 B0024 : score 4.17407 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.77 -> DG O6 A0004 : score 6.6396 : H : ASP OD1 C0203 <- 2.87 -> DC N4 B0038 : score 5.27004 : H : ARG NH1 C0206 <- 3.09 -> DG N7 A0006 : score 5.6991 : H : ARG NH1 C0206 <- 2.52 -> DG O6 A0006 : score 6.424 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.63 -> DG N7 A0006 : score 6.60169 : H : ARG NH1 C0207 <- 2.89 -> DG N7 B0036 : score 5.9411 : H : ARG NH1 C0207 <- 3.17 -> DG O6 B0036 : score 5.63317 : x : SER xxxx C0075 <- 2.98 -> DG xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 3.81 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 4.03 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.60 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 4.21 -> DT xxx B0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 4.23 -> DG xxx B0036 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.51 -> DG xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0233 <- 3.98 -> DC xxx A0001 : score x.xxxxx >7sr6_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HUMAN ENDOGENOUS RETROVIRUS (HERV-K) REVERSE TRANSCRIPTASE TERNARY COMPLEX WITH DSDNA TEMPLATE PRIMER AND DNTP organism=? : H : TYR OH A0194 <- 3.11 -> DG N3 E0022 : score 2.92103 : x : PRO xxxx A0168 <- 4.37 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0195 <- 3.02 -> DT xxx E0023 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0275 <- 3.72 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0436 <- 3.81 -> DG xxx D0019 : score x.xxxxx >7sr6_F:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HUMAN ENDOGENOUS RETROVIRUS (HERV-K) REVERSE TRANSCRIPTASE TERNARY COMPLEX WITH DSDNA TEMPLATE PRIMER AND DNTP organism=? : H : TYR OH F0194 <- 3.06 -> DG N2 I0021 : score 4.63548 : H : TYR OH F0194 <- 3.08 -> DG N3 I0021 : score 2.93971 : w : TYR OH F0194 <- 6.15 -> DT O2 H0008 : score 3.068 : H : ASN ND2 F0275 <- 3.02 -> DA N3 H0010 : score 3.64015 : V : VAL CB F0368 <- 3.71 -> DT C7 I0012 : score 4.01659 : x : PRO xxxx F0168 <- 4.43 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0268 <- 4.39 -> DT xxx I0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0533 <- 4.21 -> DT xxx I0012 : score x.xxxxx >7sr6_FG:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HUMAN ENDOGENOUS RETROVIRUS (HERV-K) REVERSE TRANSCRIPTASE TERNARY COMPLEX WITH DSDNA TEMPLATE PRIMER AND DNTP organism=? : H : TYR OH F0194 <- 3.06 -> DG N2 I0021 : score 4.63548 : H : TYR OH F0194 <- 3.08 -> DG N3 I0021 : score 2.93971 : w : TYR OH F0194 <- 6.15 -> DT O2 H0008 : score 3.068 : H : ASN ND2 F0275 <- 3.02 -> DA N3 H0010 : score 3.64015 : V : VAL CB F0368 <- 3.71 -> DT C7 I0012 : score 4.01659 : x : PRO xxxx F0168 <- 4.43 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0268 <- 4.39 -> DT xxx I0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0533 <- 4.21 -> DT xxx I0012 : score x.xxxxx >7ss5_A:Restriction_endonuclease-like; title=ACTIVATED SGRAI ENDONUCLEASE DNA-BOUND DIMER WITH CA2+ AND INTACT PRIMARY SITE DNA organism=Streptomyces griseus : H : ARG NH1 A0031 <- 3.03 -> DG N7 D0017 : score 5.7717 : H : ARG NH2 A0031 <- 2.82 -> DG O6 D0017 : score 6.5736 : H : ARG NE A0246 <- 2.83 -> DG O6 C0015 : score 3.91738 : H : ARG NH2 A0246 <- 2.98 -> DG N7 C0015 : score 6.15477 : H : ASP OD1 A0248 <- 3.13 -> DC N4 D0012 : score 4.99211 : H : ASP OD2 A0248 <- 2.85 -> DC N4 D0013 : score 6.138 : H : ARG NE A0249 <- 2.98 -> DG O6 C0014 : score 3.79915 : H : ARG NH2 A0249 <- 3.07 -> DG N7 C0014 : score 6.03985 : x : ASN xxxx A0092 <- 3.15 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0096 <- 3.17 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0152 <- 3.17 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0247 <- 3.41 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx >7ss5_AB:Restriction_endonuclease-like; title=ACTIVATED SGRAI ENDONUCLEASE DNA-BOUND DIMER WITH CA2+ AND INTACT PRIMARY SITE DNA organism=Streptomyces griseus : H : ARG NH1 A0031 <- 3.03 -> DG N7 D0017 : score 5.7717 : H : ARG NH2 A0031 <- 2.82 -> DG O6 D0017 : score 6.5736 : H : ARG NE A0246 <- 2.83 -> DG O6 C0015 : score 3.91738 : H : ARG NH2 A0246 <- 2.98 -> DG N7 C0015 : score 6.15477 : H : ASP OD1 A0248 <- 3.13 -> DC N4 D0012 : score 4.99211 : H : ASP OD2 A0248 <- 2.85 -> DC N4 D0013 : score 6.138 : H : ARG NE A0249 <- 2.98 -> DG O6 C0014 : score 3.79915 : H : ARG NH2 A0249 <- 3.07 -> DG N7 C0014 : score 6.03985 : H : ARG NH1 B0031 <- 3.00 -> DG N7 C0017 : score 5.808 : H : ARG NH2 B0031 <- 2.78 -> DG O6 C0017 : score 6.6264 : H : ARG NE B0246 <- 2.83 -> DG O6 D0015 : score 3.91738 : H : ARG NH2 B0246 <- 2.98 -> DG N7 D0015 : score 6.15477 : H : ASP OD1 B0248 <- 3.16 -> DC N4 C0012 : score 4.96004 : H : ASP OD2 B0248 <- 2.88 -> DC N4 C0013 : score 6.1008 : H : ARG NE B0249 <- 2.98 -> DG O6 D0014 : score 3.79915 : H : ARG NH2 B0249 <- 3.07 -> DG N7 D0014 : score 6.03985 : x : ASN xxxx A0092 <- 3.15 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0096 <- 3.17 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0152 <- 3.17 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0247 <- 3.41 -> DA xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0092 <- 3.13 -> DG xxx C0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0096 <- 3.18 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0152 <- 3.16 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0247 <- 3.43 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx >7ssa_L:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF PIONEER FACTOR CBF1 BOUND TO THE NUCLEOSOME organism=? : H : HIS NE2 L0227 <- 2.67 -> DT O4 J0057 : score 5.75481 : H : GLU OE1 L0231 <- 2.55 -> DC N4 J0058 : score 6.05635 : H : ARG NH1 L0235 <- 2.46 -> DG N7 I-060 : score 6.4614 : V : ARG CZ L0234 <- 3.89 -> DT C7 J0057 : score 2.08433 : x : LYS xxxx L0228 <- 4.20 -> DT xxx I-059 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0256 <- 3.27 -> DA xxx I-062 : score x.xxxxx >7st9_BCDE: title=OPEN STATE OF RAD24-RFC:9-1-1 BOUND TO A 5' SS/DSDNA JUNCTION organism=? : H : SER OG E0079 <- 2.92 -> DT O2 J0025 : score 3.6087 : V : ARG CZ E0081 <- 3.53 -> DT C7 J0025 : score 2.27624 : x : ALA xxxx E0078 <- 4.40 -> DT xxx J0028 : score x.xxxxx >7stb_BCDE: title=CLOSED STATE OF RAD24-RFC:9-1-1 BOUND TO A 5' SS/DSDNA JUNCTION organism=? : x : SER xxxx E0079 <- 4.18 -> DT xxx J0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0081 <- 3.93 -> DT xxx J0025 : score x.xxxxx >7su3_ABC: title=CRYOEM STRUCTURE OF DNA-PK COMPLEX VII organism=HOMO SAPIENS : H : SER OG A2740 <- 2.90 -> DG O6 G0039 : score 4.0092 : H : ARG NH1 B0254 <- 2.98 -> DT O2 D0015 : score 4.15138 : H : ARG NH2 B0254 <- 2.49 -> DT O2 D0015 : score 4.4958 : H : ARG NH1 B0403 <- 3.30 -> DC O2 D0017 : score 3.285 : x : ARG xxxx A0264 <- 4.16 -> DA xxx G0034 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A2736 <- 3.49 -> DT xxx G0038 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A2739 <- 3.88 -> DG xxx G0039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A2743 <- 3.46 -> DG xxx G0039 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A2744 <- 3.66 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0271 <- 3.39 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0400 <- 3.38 -> DG xxx F0018 : score x.xxxxx >7su3_C:SPOC_domain-like;vWA-like;C-terminal_domain_of_Ku80; title=CRYOEM STRUCTURE OF DNA-PK COMPLEX VII organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx C0271 <- 3.39 -> DT xxx D0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0400 <- 3.38 -> DG xxx F0018 : score x.xxxxx >7sum_A:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN LIGASE I WITH NICK DUPLEXES CONTAINING COGNATE A:T organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0305 <- 2.94 -> DT O2 D0010 : score 4.18583 : H : LYS NZ A0770 <- 3.41 -> DG N3 D0013 : score 1.27648 : H : THR OG1 A0798 <- 2.78 -> DT O2 C0002 : score 2.72496 : x : HIS xxxx A0546 <- 4.21 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0590 <- 3.72 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0643 <- 3.35 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0872 <- 3.67 -> DA xxx B0013 : score x.xxxxx >7suv_B:DNase_I-like; title=APE1 EXONUCLEASE SUBSTRATE COMPLEX WITH 8OXOG OPPOSITE A organism=Homo sapiens : w : ASP OD2 B0070 <- 5.93 -> DG N2 D0009 : score 1.62 : w : ASP OD2 B0308 <- 5.88 -> DG N2 D0009 : score 1.62 : x : LYS xxxx B0098 <- 3.69 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0177 <- 3.58 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0269 <- 3.56 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0270 <- 3.29 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx >7svb_B:DNase_I-like; title=APE1 EXONUCLEASE SUBSTRATE COMPLEX WITH 8OXOG OPPOSITE C organism=Homo sapiens : w : ASP OD1 B0070 <- 6.36 -> DG N3 E0014 : score 2.718 : w : ASP OD2 B0070 <- 6.47 -> DG N2 D0009 : score 1.62 : w : ASP OD2 B0308 <- 6.10 -> DG N2 D0009 : score 1.62 : x : LYS xxxx B0098 <- 4.06 -> DC xxx E0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0177 <- 3.95 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0269 <- 3.58 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0270 <- 3.62 -> DC xxx E0013 : score x.xxxxx >7svu_BCHIJKXY:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=TNSBCTD-TNSC-TNIQ COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx X0052 <- 4.45 -> DA xxx 20007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx X0059 <- 3.72 -> DT xxx 10026 : score x.xxxxx >7svw_B:Ribonuclease_H-like;mu_transposase,_C-terminal_domain;Homeodomain-like; title=STRAND-TRANSFER COMPLEX OF TNSB FROM SHCAST organism=? : x : LYS xxxx B0290 <- 2.68 -> DG xxx 40007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0343 <- 2.80 -> DC xxx 10002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0346 <- 3.41 -> DC xxx 10002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0351 <- 2.42 -> DC xxx 10003 : score x.xxxxx >7swy_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=2.6 A STRUCTURE OF A 40-601[TA-RICH+1]-40 NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 D0026 <- 2.23 -> DT O2 J-029 : score 4.71593 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.47 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.08 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.64 -> DC xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.73 -> DT xxx I-048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.65 -> DG xxx I0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.88 -> DA xxx I-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.92 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.42 -> DC xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.38 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx >7swy_D:Histone-fold; title=2.6 A STRUCTURE OF A 40-601[TA-RICH+1]-40 NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH2 D0026 <- 2.23 -> DT O2 J-029 : score 4.71593 : x : ARG xxxx D0030 <- 3.73 -> DT xxx I-048 : score x.xxxxx >7sx5_A:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LIGASE I WITH NICK DUPLEXES CONTAINING MISMATCH A:C organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0305 <- 3.14 -> DC O2 D0011 : score 3.4018 : H : ARG NH2 A0305 <- 3.19 -> DT O2 D0010 : score 3.90313 : H : THR OG1 A0798 <- 2.96 -> DC O2 D0015 : score 2.54162 : x : ASN xxxx A0590 <- 4.42 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0635 <- 3.95 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0643 <- 3.53 -> DG xxx D0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0872 <- 3.07 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx >7sxe_A:ATP-dependent_DNA_ligase_DNA-binding_domain;DNA_ligase/mRNA_capping_enzyme,_catalytic_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF LIGASE I WITH NICK DUPLEXES CONTAINING COGNATE G:T organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0305 <- 2.91 -> DT O2 D0010 : score 4.21167 : H : ARG NH2 A0305 <- 3.17 -> DT O2 D0010 : score 3.92007 : H : ARG NH1 A0643 <- 3.32 -> DG N3 B0011 : score 2.7351 : w : ARG NH2 A0643 <- 5.80 -> DC O2 D0020 : score 1.669 : w : LYS NZ A0770 <- 6.00 -> DC O2 D0012 : score 1.3 : H : THR OG1 A0798 <- 3.00 -> DT O2 C0002 : score 2.60554 : x : PHE xxxx A0635 <- 3.94 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0872 <- 3.43 -> DG xxx B0013 : score x.xxxxx >7szj_CDF: title=CRYO-EM STRUCTURE OF RIFAMYCIN BOUND TO E. COLI RNAP AND RRNBP1 PROMOTER COMPLEX organism=? : H : ARG NE F0385 <- 2.89 -> DG N7 X0053 : score 4.3422 : x : ARG xxxx C0371 <- 2.89 -> DG xxx X0055 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 3.87 -> DG xxx X0055 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 2.72 -> DT xxx X0063 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0211 <- 4.29 -> DG xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.94 -> DC xxx X0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.23 -> DC xxx X0054 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.70 -> DC xxx X0054 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 4.38 -> DG xxx X0053 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.73 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0116 <- 4.35 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 3.69 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 4.16 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 3.55 -> DA xxx X0048 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 3.99 -> DA xxx X0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 3.96 -> DA xxx X0048 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 4.02 -> DA xxx X0048 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 2.86 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.18 -> DA xxx X0050 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.77 -> DA xxx X0048 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0432 <- 3.09 -> DA xxx X0051 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 2.97 -> DT xxx X0047 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0437 <- 4.07 -> DC xxx X0046 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 4.17 -> DA xxx Y0034 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0455 <- 4.13 -> DA xxx X0041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0458 <- 4.47 -> DG xxx Y0035 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0585 <- 3.21 -> DC xxx Y0054 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0589 <- 3.92 -> DC xxx X0024 : score x.xxxxx >7szj_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RIFAMYCIN BOUND TO E. COLI RNAP AND RRNBP1 PROMOTER COMPLEX organism=? : H : ARG NE F0385 <- 2.89 -> DG N7 X0053 : score 4.3422 : x : VAL xxxx F0098 <- 3.94 -> DC xxx X0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.23 -> DC xxx X0054 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.70 -> DC xxx X0054 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 4.38 -> DG xxx X0053 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.73 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0116 <- 4.35 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 3.69 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 4.16 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 3.55 -> DA xxx X0048 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 3.99 -> DA xxx X0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 3.96 -> DA xxx X0048 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 4.02 -> DA xxx X0048 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 2.86 -> DT xxx X0052 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.18 -> DA xxx X0050 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.77 -> DA xxx X0048 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0432 <- 3.09 -> DA xxx X0051 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 2.97 -> DT xxx X0047 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0437 <- 4.07 -> DC xxx X0046 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 4.17 -> DA xxx Y0034 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0455 <- 4.13 -> DA xxx X0041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0458 <- 4.47 -> DG xxx Y0035 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0585 <- 3.21 -> DC xxx Y0054 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0589 <- 3.92 -> DC xxx X0024 : score x.xxxxx >7t02_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF DNMT5 PSEUDO-TERNARY COMPLEX SOLVED BY INCUBATION WITH HEMIMETHYLATED DNA AND SAM organism=CRYPTOCOCCUS NEOFORMANS VAR. GRUBII H99 : H : GLN NE2 A0668 <- 3.28 -> DG O6 D0007 : score 5.24784 : H : ARG NH1 A0672 <- 2.81 -> DC O2 B0032 : score 3.6427 : x : ASN xxxx A0669 <- 3.39 -> DG xxx B0031 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0674 <- 3.77 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0684 <- 3.74 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0686 <- 3.43 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0688 <- 3.69 -> DG xxx D0007 : score x.xxxxx >7t18_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=REV1 TERNARY COMPLEX WITH DTTP AND CA2+ organism=Saccharomyces cerevisiae : H : SER OG A0329 <- 2.68 -> DC O2 T0006 : score 2.56131 : x : LEU xxxx A0325 <- 3.70 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0328 <- 3.67 -> DG xxx P0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0626 <- 3.58 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0692 <- 4.47 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx >7t19_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=REV1 TERNARY COMPLEX WITH DGTP AND CA2+ organism=Saccharomyces cerevisiae : H : SER OG A0329 <- 2.83 -> DC O2 T0006 : score 2.48627 : x : LEU xxxx A0325 <- 3.87 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0328 <- 4.35 -> DG xxx P0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0626 <- 3.43 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0692 <- 4.14 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx >7t1a_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=REV1 TERNARY COMPLEX WITH DATP AND CA2+ organism=Saccharomyces cerevisiae : H : SER OG A0329 <- 2.73 -> DC O2 T0006 : score 2.5363 : x : LEU xxxx A0325 <- 3.81 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0328 <- 4.03 -> DG xxx P0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0626 <- 3.25 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0692 <- 4.10 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx >7t1b_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=REV1 TERNARY COMPLEX WITH RCTP AND CA2+ organism=Saccharomyces cerevisiae : H : SER OG A0329 <- 2.78 -> DC O2 T0006 : score 2.51129 : x : LEU xxxx A0325 <- 3.64 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0626 <- 3.37 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0692 <- 4.20 -> DT xxx P0007 : score x.xxxxx >7t20_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;N-terminal_domain_of_DnaB_helicase; title=E. COLI DNAB BOUND TO SSDNA AND AMPPNP organism=? : x : THR xxxx B0358 <- 4.37 -> DT xxx M0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0358 <- 4.34 -> DT xxx M0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0391 <- 4.42 -> DT xxx M0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0358 <- 4.49 -> DT xxx M0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0356 <- 3.85 -> DT xxx M0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0358 <- 3.71 -> DT xxx M0003 : score x.xxxxx >7t20_E:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;N-terminal_domain_of_DnaB_helicase; title=E. COLI DNAB BOUND TO SSDNA AND AMPPNP organism=? : x : ASN xxxx E0356 <- 3.85 -> DT xxx M0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0358 <- 3.71 -> DT xxx M0003 : score x.xxxxx >7t21_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;N-terminal_domain_of_DnaB_helicase; title=E. COLI DNAB BOUND TO SSDNA AND ADP-ALF4 organism=? : H : THR OG1 F0358 <- 3.07 -> DT O2 M0001 : score 2.56754 : x : THR xxxx B0358 <- 4.24 -> DT xxx M0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0391 <- 4.47 -> DT xxx M0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0358 <- 4.06 -> DT xxx M0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0358 <- 3.94 -> DT xxx M0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0356 <- 2.98 -> DT xxx M0001 : score x.xxxxx >7t22_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;N-terminal_domain_of_DnaB_helicase; title=E. COLI DNAB BOUND TO THREE DNAG C-TERMINAL DOMAINS, SSDNA, ADP AND ALF4 organism=? : x : GLN xxxx B0391 <- 4.40 -> DT xxx M0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0356 <- 3.86 -> DT xxx M0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0358 <- 3.67 -> DT xxx M0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0356 <- 4.24 -> DT xxx M0001 : score x.xxxxx >7t22_F:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;N-terminal_domain_of_DnaB_helicase; title=E. COLI DNAB BOUND TO THREE DNAG C-TERMINAL DOMAINS, SSDNA, ADP AND ALF4 organism=? : x : ASN xxxx F0356 <- 4.24 -> DT xxx M0001 : score x.xxxxx >7t23_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;N-terminal_domain_of_DnaB_helicase; title=E. COLI DNAB BOUND TO TWO DNAG C-TERMINAL DOMAINS, SSDNA, ADP AND ALF4 organism=? : x : GLN xxxx B0391 <- 4.25 -> DT xxx M0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0358 <- 4.21 -> DT xxx M0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0356 <- 3.69 -> DT xxx M0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0358 <- 3.70 -> DT xxx M0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0356 <- 3.00 -> DT xxx M0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0358 <- 4.15 -> DT xxx M0001 : score x.xxxxx >7t3l_JK: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CSY-ACRIF24-DNA DIMER organism=? : x : LYS xxxx J0197 <- 4.16 -> DG xxx O0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0205 <- 4.16 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0206 <- 3.23 -> DC xxx P0007 : score x.xxxxx >7t8k_AB: title=BRXR FROM ACINETOBACTER BREX TYPE I PHAGE RESTRICTION SYSTEM BOUND TO DNA organism=ACINETOBACTER SP. NEB 394 : H : ARG NH1 A0038 <- 3.16 -> DG N7 D0006 : score 5.6144 : H : ARG NH2 A0038 <- 3.08 -> DG O6 D0006 : score 6.2304 : H : GLN NE2 A0039 <- 2.95 -> DT O4 D0007 : score 5.0353 : H : ARG NH1 B0038 <- 3.18 -> DG N7 C0006 : score 5.5902 : H : ARG NH2 B0038 <- 3.13 -> DG O6 C0006 : score 6.1644 : H : GLN NE2 B0039 <- 2.96 -> DT O4 C0007 : score 5.02491 : w : HIS NE2 B0059 <- 5.53 -> DC O2 C0004 : score 3.208 : H : LYS NZ B0064 <- 2.62 -> DT O2 C0002 : score 3.71632 : x : SER xxxx A0037 <- 3.96 -> DT xxx C0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0040 <- 3.71 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 3.60 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0064 <- 3.75 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0037 <- 3.71 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0040 <- 3.79 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0042 <- 3.60 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >7t8k_B: title=BRXR FROM ACINETOBACTER BREX TYPE I PHAGE RESTRICTION SYSTEM BOUND TO DNA organism=ACINETOBACTER SP. NEB 394 : H : ARG NH1 B0038 <- 3.18 -> DG N7 C0006 : score 5.5902 : H : ARG NH2 B0038 <- 3.13 -> DG O6 C0006 : score 6.1644 : H : GLN NE2 B0039 <- 2.96 -> DT O4 C0007 : score 5.02491 : w : HIS NE2 B0059 <- 5.53 -> DC O2 C0004 : score 3.208 : H : LYS NZ B0064 <- 2.62 -> DT O2 C0002 : score 3.71632 : x : SER xxxx B0037 <- 3.71 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0040 <- 3.79 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0042 <- 3.60 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >7tan_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF VRK1 C-TERMINAL TAIL BOUND TO NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=HOMO SAPIENS : H : ARG NH2 E0040 <- 3.04 -> DT O2 I0009 : score 4.03013 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.38 -> DG xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.23 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 3.30 -> DT xxx J0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.20 -> DC xxx J0037 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.36 -> DC xxx J0069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0011 <- 3.85 -> DT xxx J-043 : score x.xxxxx >7taw_JK: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE CSY-ACRIF24-PROMOTER DNA DIMER organism=? : H : THR OG1 J0193 <- 3.28 -> DA N7 Y0014 : score 3.08635 : H : THR OG1 J0193 <- 3.15 -> DA N6 Y0014 : score 2.56585 : H : ARG NE J0196 <- 3.30 -> DG N7 X0004 : score 3.97962 : H : ARG NH2 J0196 <- 2.97 -> DG O6 X0004 : score 6.3756 : H : THR OG1 K0193 <- 2.98 -> DA N7 X0014 : score 3.29119 : H : ARG NH2 K0196 <- 2.87 -> DG O6 Y0004 : score 6.5076 : x : SER xxxx J0191 <- 3.96 -> DA xxx Y0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0194 <- 3.78 -> DC xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0197 <- 3.30 -> DG xxx Y0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0206 <- 3.30 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx J0208 <- 3.20 -> DC xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0191 <- 3.83 -> DG xxx X0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx K0194 <- 3.61 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx K0197 <- 3.42 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx K0206 <- 3.37 -> DT xxx Y0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx K0208 <- 3.26 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx >7taw_K: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE CSY-ACRIF24-PROMOTER DNA DIMER organism=? : H : THR OG1 K0193 <- 2.98 -> DA N7 X0014 : score 3.29119 : H : ARG NH2 K0196 <- 2.87 -> DG O6 Y0004 : score 6.5076 : V : ASN CG K0206 <- 3.56 -> DT C7 Y0006 : score 2.8071 : x : SER xxxx K0191 <- 3.83 -> DG xxx X0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx K0194 <- 3.61 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx K0197 <- 3.42 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx K0208 <- 3.26 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx >7tax_J: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE CSY-ACRIF24-PROMOTER DNA COMPLEX organism=? : H : THR OG1 J0193 <- 3.28 -> DA N7 Y0014 : score 3.08635 : H : THR OG1 J0193 <- 3.15 -> DA N6 Y0014 : score 2.56585 : H : ARG NE J0196 <- 3.30 -> DG N7 X0004 : score 3.97962 : H : ARG NH2 J0196 <- 2.97 -> DG O6 X0004 : score 6.3756 : x : SER xxxx J0191 <- 3.96 -> DA xxx Y0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0194 <- 3.78 -> DC xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0197 <- 3.30 -> DG xxx Y0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0206 <- 3.30 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx J0208 <- 3.20 -> DC xxx Y0012 : score x.xxxxx >7tax_JK: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE CSY-ACRIF24-PROMOTER DNA COMPLEX organism=? : H : THR OG1 J0193 <- 3.28 -> DA N7 Y0014 : score 3.08635 : H : THR OG1 J0193 <- 3.15 -> DA N6 Y0014 : score 2.56585 : H : ARG NE J0196 <- 3.30 -> DG N7 X0004 : score 3.97962 : H : ARG NH2 J0196 <- 2.97 -> DG O6 X0004 : score 6.3756 : H : THR OG1 K0193 <- 2.98 -> DA N7 X0014 : score 3.29119 : H : ARG NH2 K0196 <- 2.87 -> DG O6 Y0004 : score 6.5076 : x : SER xxxx J0191 <- 3.96 -> DA xxx Y0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0194 <- 3.78 -> DC xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0197 <- 3.30 -> DG xxx Y0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0206 <- 3.30 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx J0208 <- 3.20 -> DC xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0191 <- 3.83 -> DG xxx X0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx K0194 <- 3.61 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx K0197 <- 3.42 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx K0206 <- 3.37 -> DT xxx Y0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx K0208 <- 3.26 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx >7tdw_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF FOXP3-DNA COMPLEX organism=? : H : HIS ND1 A0387 <- 3.31 -> DT O4 B0009 : score 4.23902 : V : ARG CZ A0386 <- 3.61 -> DT C7 B0006 : score 2.23359 : x : ASN xxxx A0383 <- 3.84 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0390 <- 3.30 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >7tdx_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF FOXP3-DNA COMPLEX organism=? : H : ASN ND2 A0383 <- 3.33 -> DA N7 C0006 : score 5.24824 : H : HIS ND1 A0387 <- 3.42 -> DT O4 B0009 : score 4.13517 : x : ARG xxxx A0386 <- 3.48 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0390 <- 3.12 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0391 <- 4.17 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx >7tea_AC:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS GLNR-DNA COMPLEX organism=Staphylococcus aureus : H : ARG NE A0028 <- 3.21 -> DG N7 D0003 : score 4.05921 : H : ARG NH2 A0028 <- 2.66 -> DG O6 D0003 : score 6.7848 : H : LYS NZ A0048 <- 2.59 -> DT O2 H0012 : score 3.73784 : H : ARG NE C0028 <- 3.10 -> DG N7 H0003 : score 4.15649 : H : ARG NH2 C0028 <- 2.78 -> DG O6 H0003 : score 6.6264 : H : LYS NZ C0048 <- 3.00 -> DT O2 D0012 : score 3.44369 : x : ARG xxxx A0031 <- 3.46 -> DT xxx H0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0032 <- 3.67 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0031 <- 3.27 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0032 <- 3.49 -> DT xxx H0002 : score x.xxxxx >7tea_B:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS GLNR-DNA COMPLEX organism=Staphylococcus aureus : H : ARG NE B0028 <- 3.08 -> DG N7 G0003 : score 4.17417 : H : ARG NH2 B0028 <- 2.60 -> DG O6 G0003 : score 6.864 : H : LYS NZ B0048 <- 2.66 -> DT O2 F0012 : score 3.68762 : x : ARG xxxx B0031 <- 3.27 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0032 <- 3.58 -> DT xxx G0002 : score x.xxxxx >7tea_BE:Putative_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF S. AUREUS GLNR-DNA COMPLEX organism=Staphylococcus aureus : H : ARG NE B0028 <- 3.08 -> DG N7 G0003 : score 4.17417 : H : ARG NH2 B0028 <- 2.60 -> DG O6 G0003 : score 6.864 : H : LYS NZ B0048 <- 2.66 -> DT O2 F0012 : score 3.68762 : H : ARG NE E0028 <- 3.14 -> DG N7 F0003 : score 4.12111 : H : ARG NH2 E0028 <- 3.01 -> DG O6 F0003 : score 6.3228 : H : LYS NZ E0048 <- 3.45 -> DT O2 F0009 : score 3.12085 : H : LYS NZ E0048 <- 3.03 -> DT O2 G0012 : score 3.42217 : x : ARG xxxx B0031 <- 3.27 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0032 <- 3.58 -> DT xxx G0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0031 <- 3.42 -> DT xxx G0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0032 <- 3.66 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx >7tec_A:Putative_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF THE LISTERIA MONOCYTOGENES GLNR-DNA COMPLEX TO 3.45 ANGSTROM organism=Listeria monocytogenes : x : ARG xxxx A0026 <- 4.01 -> DC xxx H0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0029 <- 4.10 -> DT xxx H0014 : score x.xxxxx >7tfh_BCE: title=ATOMIC MODEL OF THE S. CEREVISIAE CLAMP-CLAMP LOADER COMPLEX PCNA-RFC BOUND TO TWO DNA MOLECULES, ONE AT THE 5'-RECESSED END AND THE OTHER AT THE 3'-RECESSED END organism=? : x : ARG xxxx B0272 <- 4.07 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0275 <- 3.46 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0081 <- 4.41 -> DA xxx I0012 : score x.xxxxx >7tfi_ABCE: title=ATOMIC MODEL OF THE S. CEREVISIAE CLAMP-CLAMP LOADER COMPLEX PCNA-RFC BOUND TO DNA WITH AN OPEN CLAMP organism=? : H : ARG NH1 B0272 <- 2.44 -> DA N7 J0020 : score 2.74459 : V : ARG CZ A0632 <- 3.53 -> DT C7 I0011 : score 2.27624 : x : PHE xxxx A0585 <- 4.48 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0636 <- 3.22 -> DT xxx I0013 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0638 <- 3.24 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0639 <- 3.38 -> DT xxx J0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0641 <- 4.30 -> DT xxx J0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0642 <- 3.81 -> DT xxx J0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0275 <- 3.97 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx >7tfj_ABCE: title=ATOMIC MODEL OF S. CEREVISIAE CLAMP-CLAMP LOADER COMPLEX PCNA-RFC BOUND TO DNA WITH A CLOSED CLAMP RING organism=? : H : GLN NE2 A0636 <- 2.52 -> DA N3 I0012 : score 4.25243 : x : PHE xxxx A0582 <- 4.45 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0586 <- 3.62 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0632 <- 2.46 -> DA xxx I0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0638 <- 3.30 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0639 <- 3.31 -> DT xxx J0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0642 <- 3.97 -> DT xxx J0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0272 <- 3.75 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0275 <- 3.34 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx >7tfk_BCE: title=ATOMIC MODEL OF S. CEREVISIAE CLAMP LOADER RFC BOUND TO TWO DNA MOLECULES, ONE AT THE 5'-RECESSED END AND THE OTHER AT THE 3'- RECESSED END organism=? : x : ARG xxxx E0081 <- 3.35 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx >7tfl_A:post-AAA+_oligomerization_domain-like;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=ATOMIC MODEL OF S. CEREVISIAE CLAMP LOADER RFC BOUND TO DNA organism=? : x : PHE xxxx A0582 <- 4.39 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0585 <- 4.19 -> DT xxx J0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0632 <- 4.00 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0636 <- 3.20 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0638 <- 3.26 -> DT xxx J0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0639 <- 4.38 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0642 <- 3.53 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx >7tfl_ABCE:post-AAA+_oligomerization_domain-like;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like; title=ATOMIC MODEL OF S. CEREVISIAE CLAMP LOADER RFC BOUND TO DNA organism=? : x : PHE xxxx A0582 <- 4.39 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0585 <- 4.19 -> DT xxx J0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0632 <- 4.00 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0636 <- 3.20 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0638 <- 3.26 -> DT xxx J0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0639 <- 4.38 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0642 <- 3.53 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0080 <- 3.72 -> DT xxx J0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0081 <- 3.74 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx >7tfl_E:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;post-AAA+_oligomerization_domain-like; title=ATOMIC MODEL OF S. CEREVISIAE CLAMP LOADER RFC BOUND TO DNA organism=? : x : ASN xxxx E0080 <- 3.72 -> DT xxx J0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0081 <- 3.74 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx >7tib_ABCE: title=STRUCTURE OF THE YEAST CLAMP LOADER (REPLICATION FACTOR C RFC) BOUND TO THE OPEN SLIDING CLAMP (PROLIFERATING CELL NUCLEAR ANTIGEN PCNA) AND PRIMER-TEMPLATE DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : GLN NE2 A0636 <- 3.38 -> DT O2 I0011 : score 3.47707 : V : PHE CZ A0585 <- 3.59 -> DT C7 J0019 : score 7.4884 : x : PHE xxxx A0582 <- 3.45 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0632 <- 4.39 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0638 <- 3.30 -> DT xxx J0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0080 <- 3.17 -> DT xxx J0015 : score x.xxxxx >7tid_ABCE:post-AAA+_oligomerization_domain-like;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like;DNA_clamp;post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like;post-AAA+_oligomerization_domain-like; title=STRUCTURE OF THE YEAST CLAMP LOADER (REPLICATION FACTOR C RFC) BOUND TO THE SLIDING CLAMP (PROLIFERATING CELL NUCLEAR ANTIGEN PCNA) AND PRIMER-TEMPLATE DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : GLN NE2 A0636 <- 3.00 -> DT O2 I0011 : score 3.776 : V : PHE CZ A0585 <- 3.59 -> DT C7 J0019 : score 7.4884 : x : ARG xxxx A0434 <- 3.07 -> DG xxx J0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0582 <- 3.37 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0638 <- 3.32 -> DT xxx J0019 : score x.xxxxx >7tjf_ABCDE:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Inhibitor_of_apoptosis_IAP_repeat; title=S. CEREVISIAE ORC BOUND TO 84 BP ARS1 DNA organism=? : H : LYS NZ A0362 <- 2.42 -> DT O2 G0032 : score 3.85981 : H : LYS NZ A0362 <- 3.05 -> DT O2 H0054 : score 3.40782 : H : ARG NH1 A0367 <- 2.73 -> DT O2 G0030 : score 4.3667 : H : TYR OH A0372 <- 2.68 -> DA N3 H0057 : score 4.25091 : H : ARG NH1 B0254 <- 2.80 -> DG O6 G0052 : score 6.08333 : H : ARG NH2 B0254 <- 3.25 -> DG N7 G0052 : score 5.81 : H : TRP NE1 B0396 <- 2.80 -> DT O2 G0034 : score 6.21538 : H : ARG NH2 E0360 <- 2.38 -> DT O2 G0057 : score 4.58893 : H : TYR OH E0363 <- 2.97 -> DA N3 H0030 : score 4.01014 : V : PHE CZ D0485 <- 3.69 -> DT C7 G0036 : score 7.31053 : V : TYR CB D0486 <- 3.83 -> DT C7 H0046 : score 4.8322 : x : PHE xxxx A0360 <- 3.55 -> DA xxx H0053 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0255 <- 3.51 -> DT xxx G0051 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0489 <- 3.65 -> DT xxx G0036 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0490 <- 3.72 -> DG xxx H0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0366 <- 3.47 -> DT xxx G0054 : score x.xxxxx >7tjf_E:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=S. CEREVISIAE ORC BOUND TO 84 BP ARS1 DNA organism=? : H : ARG NH2 E0360 <- 2.38 -> DT O2 G0057 : score 4.58893 : H : TYR OH E0363 <- 2.97 -> DA N3 H0030 : score 4.01014 : x : ARG xxxx E0366 <- 3.47 -> DT xxx G0054 : score x.xxxxx >7tjh_ABCDEI:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Inhibitor_of_apoptosis_IAP_repeat;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=S. CEREVISIAE ORC BOUND TO 84 BP ARS1 DNA AND CDC6 (STATE 1) WITH FLEXIBLE ORC6 N-TERMINAL DOMAIN organism=? : H : LYS NZ A0362 <- 2.39 -> DT O2 G0032 : score 3.88133 : H : LYS NZ A0362 <- 3.08 -> DT O2 H0054 : score 3.3863 : H : ARG NH1 A0367 <- 2.74 -> DT O2 G0030 : score 4.35809 : H : TYR OH A0372 <- 2.92 -> DA N3 H0057 : score 4.05165 : H : TRP NE1 B0396 <- 2.83 -> DT O2 G0034 : score 6.17809 : H : ARG NH1 E0360 <- 2.99 -> DT O2 G0057 : score 4.14277 : H : TYR OH E0363 <- 2.79 -> DT O2 G0056 : score 3.2231 : H : TYR OH E0363 <- 3.22 -> DA N3 H0030 : score 3.80257 : H : ARG NH2 E0366 <- 2.82 -> DT O2 G0054 : score 4.2164 : V : TYR CZ D0486 <- 3.89 -> DT C7 H0048 : score 5.45395 : x : PHE xxxx A0360 <- 3.58 -> DG xxx G0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0254 <- 3.46 -> DG xxx G0052 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0255 <- 3.32 -> DT xxx G0051 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0485 <- 3.91 -> DT xxx G0036 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0489 <- 3.91 -> DT xxx G0036 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0490 <- 3.80 -> DG xxx H0044 : score x.xxxxx >7tji_ABCDEI:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Inhibitor_of_apoptosis_IAP_repeat;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=S. CEREVISIAE ORC BOUND TO 84 BP ARS1 DNA AND CDC6 (STATE 2) WITH FLEXIBLE ORC6 N-TERMINAL DOMAIN organism=? : H : LYS NZ A0362 <- 2.41 -> DT O2 G0032 : score 3.86698 : H : LYS NZ A0362 <- 3.48 -> DT O2 H0054 : score 3.09932 : H : ARG NH1 A0367 <- 2.53 -> DT O2 G0030 : score 4.53896 : H : TYR OH A0372 <- 2.90 -> DA N3 H0057 : score 4.06826 : H : TRP NE1 B0396 <- 2.97 -> DT O2 G0034 : score 6.00406 : H : ARG NH2 E0360 <- 2.40 -> DT O2 G0057 : score 4.572 : H : TYR OH E0363 <- 2.69 -> DA N3 H0030 : score 4.24261 : H : ARG NH1 E0366 <- 2.94 -> DG N3 H0032 : score 2.96709 : V : PHE CZ D0485 <- 3.90 -> DT C7 G0035 : score 6.937 : x : PHE xxxx A0360 <- 3.55 -> DA xxx H0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0254 <- 3.66 -> DG xxx H0032 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0255 <- 3.75 -> DT xxx G0051 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0486 <- 3.33 -> DT xxx H0048 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0489 <- 3.90 -> DT xxx G0036 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0490 <- 3.74 -> DG xxx H0044 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0439 <- 3.51 -> DG xxx G0038 : score x.xxxxx >7tji_B: title=S. CEREVISIAE ORC BOUND TO 84 BP ARS1 DNA AND CDC6 (STATE 2) WITH FLEXIBLE ORC6 N-TERMINAL DOMAIN organism=? : H : TRP NE1 B0396 <- 2.97 -> DT O2 G0034 : score 6.00406 : x : ARG xxxx B0254 <- 3.66 -> DG xxx H0032 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0255 <- 3.75 -> DT xxx G0051 : score x.xxxxx >7tjj_ABCDEI:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Inhibitor_of_apoptosis_IAP_repeat;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=S. CEREVISIAE ORC BOUND TO 84 BP ARS1 DNA AND CDC6 (STATE 1) WITH DOCKED ORC6 N-TERMINAL DOMAIN organism=? : H : LYS NZ A0362 <- 2.37 -> DT O2 G0032 : score 3.89568 : H : LYS NZ A0362 <- 3.27 -> DT O2 H0054 : score 3.24998 : H : ARG NH1 A0367 <- 2.70 -> DT O2 G0030 : score 4.39254 : H : TYR OH A0372 <- 3.14 -> DA N3 H0057 : score 3.86899 : H : ARG NH2 B0254 <- 3.11 -> DG O6 G0052 : score 6.1908 : H : TRP NE1 B0396 <- 2.89 -> DT O2 G0034 : score 6.10351 : H : TYR OH E0363 <- 3.04 -> DA N3 H0030 : score 3.95202 : H : ARG NH2 E0366 <- 2.94 -> DT O2 G0054 : score 4.1148 : V : TYR CZ D0486 <- 3.82 -> DT C7 H0048 : score 5.55159 : x : PHE xxxx A0360 <- 3.65 -> DA xxx H0053 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0255 <- 4.00 -> DT xxx G0051 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0485 <- 4.02 -> DT xxx G0036 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0489 <- 3.90 -> DT xxx G0036 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0490 <- 3.90 -> DG xxx H0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0344 <- 3.44 -> DG xxx H0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0360 <- 2.89 -> DT xxx G0057 : score x.xxxxx >7tjj_D:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=S. CEREVISIAE ORC BOUND TO 84 BP ARS1 DNA AND CDC6 (STATE 1) WITH DOCKED ORC6 N-TERMINAL DOMAIN organism=? : V : TYR CZ D0486 <- 3.82 -> DT C7 H0048 : score 5.55159 : x : PHE xxxx D0485 <- 4.02 -> DT xxx G0036 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0489 <- 3.90 -> DT xxx G0036 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0490 <- 3.90 -> DG xxx H0044 : score x.xxxxx >7tjk_ABCDEI:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Inhibitor_of_apoptosis_IAP_repeat;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=S. CEREVISIAE ORC BOUND TO 84 BP ARS1 DNA AND CDC6 (STATE 2) WITH DOCKED ORC6 N-TERMINAL DOMAIN organism=? : H : LYS NZ A0362 <- 2.54 -> DT O2 G0032 : score 3.77371 : H : ARG NH1 A0367 <- 2.69 -> DT O2 G0030 : score 4.40115 : H : TYR OH A0372 <- 2.90 -> DA N3 H0057 : score 4.06826 : H : TRP NE1 B0396 <- 2.89 -> DT O2 G0034 : score 6.10351 : H : ARG NH2 E0360 <- 2.43 -> DT O2 G0057 : score 4.5466 : H : TYR OH E0363 <- 3.09 -> DA N3 H0030 : score 3.91051 : H : ARG NH2 E0366 <- 3.07 -> DG N3 H0032 : score 3.4153 : V : TYR CZ D0486 <- 3.79 -> DT C7 H0048 : score 5.59344 : x : PHE xxxx A0360 <- 3.58 -> DA xxx H0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0254 <- 3.20 -> DG xxx H0032 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0255 <- 4.10 -> DT xxx G0051 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0485 <- 3.93 -> DT xxx G0035 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0489 <- 4.18 -> DT xxx G0036 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0490 <- 3.54 -> DG xxx H0044 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0439 <- 4.05 -> DG xxx G0038 : score x.xxxxx >7tjk_F: title=S. CEREVISIAE ORC BOUND TO 84 BP ARS1 DNA AND CDC6 (STATE 2) WITH DOCKED ORC6 N-TERMINAL DOMAIN organism=? : x : TYR xxxx F0277 <- 3.48 -> DA xxx G0059 : score x.xxxxx >7tn2_D:Histone-fold; title=COMPOSITE MODEL OF A CHD1-NUCLEOSOME COMPLEX IN THE NUCLEOTIDE-FREE STATE DERIVED FROM 2.3A AND 2.7A CRYO-EM MAPS organism=? : H : ARG NH2 D0026 <- 2.38 -> DT O2 J-029 : score 4.58893 : x : ARG xxxx D0030 <- 3.33 -> DG xxx J0049 : score x.xxxxx >7tqb_H:Immunoglobulin; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MONOCLONAL S9.6 FAB BOUND TO DNA-RNA HYBRID organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : x : ASN xxxx H0055 <- 2.96 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0101 <- 3.77 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx >7tqq_F:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF HUMAN TREX1-DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : SER OG F0078 <- 2.66 -> DG O6 H0001 : score 4.20557 : w : ASN ND2 F0125 <- 5.86 -> DA N3 H0020 : score 2.277 : x : LEU xxxx F0024 <- 3.62 -> DC xxx H0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0025 <- 4.30 -> DT xxx H0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0026 <- 4.03 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0080 <- 3.47 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0081 <- 4.10 -> DC xxx H0022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0084 <- 3.32 -> DC xxx H0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0128 <- 3.61 -> DG xxx H0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0129 <- 3.48 -> DT xxx H0021 : score x.xxxxx >7tqw_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=KOD RSGA INCORPORATING PMT, N+2 organism=Thermococcus kodakarensis : H : ARG NH1 A0612 <- 3.26 -> DC O2 P0010 : score 3.3142 : x : LYS xxxx A0592 <- 3.36 -> DC xxx T0006 : score x.xxxxx >7tr7_A:DNase_I-like; title=APE1 PRODUCT COMPLEX WITH ABASIC SSDNA organism=Homo sapiens : w : ASN OD1 A0226 <- 5.91 -> DG N7 D0003 : score 1.873 : w : ASN OD1 A0229 <- 6.02 -> DC N4 D0002 : score 2.732 : x : ARG xxxx A0177 <- 3.58 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0222 <- 4.42 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0270 <- 3.33 -> DC xxx D0002 : score x.xxxxx >7tr9_CP: title=CASCADE COMPLEX FROM TYPE I-A CRISPR-CAS SYSTEM organism=? : H : ASN OD1 C0096 <- 3.29 -> DG N2 S0060 : score 4.3296 : x : ASN xxxx C0097 <- 3.39 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0098 <- 4.33 -> DG xxx S0061 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0136 <- 1.63 -> DG xxx S0061 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0255 <- 3.00 -> DG xxx S0059 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0256 <- 4.31 -> DG xxx S0059 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0257 <- 3.13 -> DG xxx S0059 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0095 <- 4.17 -> DG xxx S0060 : score x.xxxxx >7tr9_DEIJKL: title=CASCADE COMPLEX FROM TYPE I-A CRISPR-CAS SYSTEM organism=? : H : GLN NE2 J0090 <- 3.27 -> DC O2 S0055 : score 3.34755 : H : GLN NE2 J0182 <- 3.13 -> DT O2 S0046 : score 3.67373 : x : GLU xxxx D0021 <- 3.41 -> DG xxx S0047 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0023 <- 3.63 -> DG xxx S0047 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0025 <- 3.34 -> DG xxx S0054 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0027 <- 3.66 -> DG xxx S0054 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0161 <- 3.77 -> DA xxx S0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0164 <- 3.19 -> DG xxx S0054 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0173 <- 4.41 -> DG xxx S0051 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0182 <- 3.66 -> DA xxx S0052 : score x.xxxxx : x : MET xxxx I0183 <- 3.41 -> DG xxx S0054 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0184 <- 3.57 -> DA xxx S0053 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0185 <- 3.31 -> DG xxx S0054 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0025 <- 3.72 -> DG xxx S0047 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J0027 <- 3.81 -> DG xxx S0048 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0124 <- 3.76 -> DA xxx S0056 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0126 <- 3.77 -> DA xxx S0056 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0164 <- 3.78 -> DG xxx S0049 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J0173 <- 4.30 -> DT xxx S0045 : score x.xxxxx : x : MET xxxx J0183 <- 3.37 -> DG xxx S0048 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0184 <- 3.90 -> DG xxx S0047 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx J0185 <- 3.52 -> DG xxx S0048 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx K0025 <- 3.21 -> DG xxx S0042 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx K0027 <- 3.69 -> DG xxx S0042 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx K0090 <- 3.62 -> DG xxx S0050 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx K0124 <- 3.13 -> DG xxx S0049 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx K0126 <- 3.47 -> DG xxx S0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0164 <- 2.93 -> DG xxx S0042 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx K0185 <- 3.30 -> DG xxx S0042 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0090 <- 3.52 -> DG xxx S0043 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L0124 <- 3.60 -> DG xxx S0043 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx L0126 <- 3.37 -> DG xxx S0044 : score x.xxxxx >7tr9_I: title=CASCADE COMPLEX FROM TYPE I-A CRISPR-CAS SYSTEM organism=? : x : ASN xxxx I0025 <- 3.34 -> DG xxx S0054 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0027 <- 3.66 -> DG xxx S0054 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0161 <- 3.77 -> DA xxx S0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0164 <- 3.19 -> DG xxx S0054 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0173 <- 4.41 -> DG xxx S0051 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0182 <- 3.66 -> DA xxx S0052 : score x.xxxxx : x : MET xxxx I0183 <- 3.41 -> DG xxx S0054 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0184 <- 3.57 -> DA xxx S0053 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0185 <- 3.31 -> DG xxx S0054 : score x.xxxxx >7tra_AQ: title=CASCADE COMPLEX FROM TYPE I-A CRISPR-CAS SYSTEM organism=? : H : ASP OD2 Q0140 <- 2.85 -> DA N6 T0044 : score 3.96254 : x : ARG xxxx A0075 <- 3.05 -> DA xxx T0033 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0113 <- 4.10 -> DA xxx T0034 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0114 <- 3.78 -> DA xxx T0034 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0119 <- 3.89 -> DA xxx T0034 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0133 <- 3.33 -> DA xxx T0032 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0140 <- 3.37 -> DA xxx T0034 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0141 <- 3.98 -> DA xxx T0034 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0142 <- 3.66 -> DA xxx T0034 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0144 <- 2.38 -> DA xxx T0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0147 <- 3.01 -> DA xxx T0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0149 <- 3.99 -> DA xxx T0045 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0150 <- 4.05 -> DA xxx T0045 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0151 <- 4.11 -> DA xxx T0039 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0152 <- 3.18 -> DA xxx T0043 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0153 <- 3.58 -> DA xxx T0039 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0317 <- 4.00 -> DA xxx T0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0435 <- 3.72 -> DA xxx T0032 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0437 <- 3.53 -> DA xxx T0032 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0438 <- 3.00 -> DA xxx T0031 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0441 <- 3.15 -> DA xxx T0033 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0485 <- 3.66 -> DA xxx T0032 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0487 <- 3.36 -> DA xxx T0031 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0489 <- 3.43 -> DA xxx T0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0080 <- 3.21 -> DA xxx T0044 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx Q0119 <- 3.98 -> DA xxx T0040 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx Q0120 <- 3.42 -> DA xxx T0043 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Q0124 <- 3.22 -> DA xxx T0044 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Q0128 <- 4.19 -> DA xxx T0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0143 <- 4.22 -> DA xxx T0044 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Q0213 <- 3.91 -> DA xxx T0040 : score x.xxxxx >7tra_BO: title=CASCADE COMPLEX FROM TYPE I-A CRISPR-CAS SYSTEM organism=? : H : ASN ND2 B0097 <- 3.18 -> DC O2 T0020 : score 4.13905 : H : LYS NZ B0136 <- 2.33 -> DG N7 S0061 : score 5.89217 : x : ASN xxxx B0096 <- 4.02 -> DG xxx S0060 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0098 <- 3.80 -> DG xxx S0060 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0255 <- 3.23 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0256 <- 3.16 -> DG xxx S0059 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0257 <- 3.75 -> DG xxx S0059 : score x.xxxxx >7tra_J: title=CASCADE COMPLEX FROM TYPE I-A CRISPR-CAS SYSTEM organism=? : x : ASN xxxx J0025 <- 3.73 -> DA xxx S0041 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J0027 <- 3.15 -> DG xxx S0042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0124 <- 3.35 -> DG xxx S0050 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0126 <- 3.34 -> DG xxx S0049 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0163 <- 3.01 -> DA xxx S0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0164 <- 3.11 -> DG xxx S0043 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J0173 <- 3.67 -> DT xxx S0039 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx J0182 <- 3.28 -> DA xxx S0040 : score x.xxxxx : x : MET xxxx J0183 <- 3.27 -> DG xxx S0042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0184 <- 3.29 -> DA xxx S0041 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx J0185 <- 3.53 -> DG xxx S0042 : score x.xxxxx >7trd_A:DNA/RNA_polymerases; title=HUMAN TELOMERASE CATALYTIC CORE STRUCTURE AT 3.3 ANGSTROM organism=HOMO SAPIENS : x : LYS xxxx A0329 <- 4.14 -> DT xxx N0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0500 <- 3.81 -> DT xxx N0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0717 <- 4.37 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0839 <- 3.89 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0866 <- 4.37 -> DG xxx N0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0867 <- 4.39 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0977 <- 4.42 -> DT xxx N0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0980 <- 3.26 -> DA xxx N0015 : score x.xxxxx >7tre_A:DNA/RNA_polymerases; title=HUMAN TELOMERASE CATALYTIC CORE WITH SHELTERIN PROTEIN TPP1 organism=HOMO SAPIENS : x : LYS xxxx A0329 <- 4.28 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0500 <- 3.48 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0839 <- 3.99 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0866 <- 4.46 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0977 <- 4.23 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0980 <- 3.32 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx >7trf_A:DNA/RNA_polymerases; title=HUMAN TELOMERASE CATALYTIC CORE RNP WITH H2A/H2B organism=HOMO SAPIENS : x : LYS xxxx A0329 <- 4.14 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0500 <- 3.82 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0717 <- 4.37 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0839 <- 3.89 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0866 <- 4.37 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0867 <- 4.39 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0977 <- 4.42 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0980 <- 3.26 -> DA xxx D0015 : score x.xxxxx >7tve_DF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=ATP AND DNA BOUND SMC5/6 CORE COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE W303 : V : ASN CG F0049 <- 3.76 -> DT C7 B0013 : score 2.67469 >7tve_F: title=ATP AND DNA BOUND SMC5/6 CORE COMPLEX organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE W303 : V : ASN CG F0049 <- 3.76 -> DT C7 B0013 : score 2.67469 >7txc_E:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=HIC2 ZINC FINGER DOMAIN IN COMPLEX WITH THE DNA BINDING MOTIF-2 OF THE BCL11A ENHANCER organism=Homo sapiens : H : GLN OE1 E0544 <- 2.66 -> DA N6 B0030 : score 6.22204 : H : GLN NE2 E0544 <- 3.47 -> DA N7 B0030 : score 5.27372 : H : THR OG1 E0547 <- 3.41 -> DC N4 B0029 : score 3.54127 : H : ARG NH1 E0550 <- 3.28 -> DG N7 B0028 : score 5.4692 : H : ARG NH1 E0550 <- 2.87 -> DG O6 B0028 : score 5.99817 : H : ARG NH2 E0550 <- 2.87 -> DG O6 B0028 : score 6.5076 : H : ARG NH2 E0550 <- 2.38 -> DG O6 A0008 : score 7.1544 : H : ARG NH1 E0572 <- 2.59 -> DG O6 B0027 : score 6.33883 : H : ARG NH2 E0572 <- 2.62 -> DG N7 B0027 : score 6.61446 : x : TYR xxxx E0574 <- 3.41 -> DC xxx A0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0575 <- 3.39 -> DT xxx B0025 : score x.xxxxx >7tz1_A:Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A MYCOBACTERIOPHAGE CLUSTER A2 IMMUNITY REPRESSOR:DNA COMPLEX organism=Mycobacterium phage TipsytheTRex : H : GLN NE2 A0046 <- 2.97 -> DG O6 C0067 : score 5.60775 : H : LYS NZ A0075 <- 2.60 -> DG N7 C0071 : score 5.60133 : H : LYS NZ A0075 <- 3.34 -> DG O6 C0071 : score 5.15645 : H : ASP OD2 A0078 <- 2.93 -> DC N4 C0072 : score 6.0388 : H : LYS NZ A0079 <- 2.39 -> DG O6 B0029 : score 6.25479 : H : LYS NZ A0081 <- 3.36 -> DG O6 B0027 : score 5.13332 : H : ARG NH1 A0108 <- 2.70 -> DG N7 B0026 : score 6.171 : H : ARG NH2 A0108 <- 2.59 -> DG O6 B0026 : score 6.8772 : x : THR xxxx A0044 <- 3.95 -> DT xxx C0066 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0045 <- 2.79 -> DG xxx B0033 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0047 <- 4.14 -> DT xxx C0065 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0049 <- 3.51 -> DT xxx B0034 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0050 <- 3.39 -> DG xxx C0063 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0084 <- 3.24 -> DC xxx C0073 : score x.xxxxx >7u0g_M:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF LIN28B NUCLEOSOME BOUND 3 OCT4 organism=? : H : GLN NE2 M0181 <- 2.71 -> DA N7 J0008 : score 6.19936 : H : THR OG1 M0182 <- 3.04 -> DG O6 I0152 : score 4.01305 : H : ARG NH1 M0186 <- 2.73 -> DT O4 I0151 : score 3.3137 : x : GLN xxxx M0164 <- 3.75 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx M0180 <- 4.09 -> DT xxx I0151 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0183 <- 3.97 -> DT xxx I0151 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx M0185 <- 3.44 -> DT xxx J0010 : score x.xxxxx >7u0i_L:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=STRUCTURE OF LIN28B NUCLEOSOME BOUND 2 OCT4 organism=? : H : GLN OE1 L0181 <- 3.33 -> DA N6 J0094 : score 5.41099 : H : GLN NE2 L0181 <- 2.82 -> DA N7 J0094 : score 6.06538 : H : ARG NH1 L0186 <- 3.11 -> DG N7 I0066 : score 5.6749 : H : ARG NH2 L0186 <- 2.94 -> DG O6 I0066 : score 6.4152 : x : THR xxxx L0182 <- 3.02 -> DA xxx I0068 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx L0185 <- 3.43 -> DT xxx J0095 : score x.xxxxx >7u0j_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF 162BP LIN28B NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH1 E0040 <- 3.04 -> DA N3 I0093 : score 3.50531 : H : ARG NH1 H0034 <- 3.34 -> DA N3 I0133 : score 3.28439 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.43 -> DA xxx J0088 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.49 -> DG xxx I0060 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.37 -> DA xxx J0085 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.99 -> DT xxx J0117 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0034 <- 3.86 -> DG xxx J0127 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.03 -> DC xxx I0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.91 -> DT xxx I0102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.98 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >7u0j_H:Histone-fold; title=STRUCTURE OF 162BP LIN28B NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH1 H0034 <- 3.34 -> DA N3 I0133 : score 3.28439 >7u19_BCE: title=RFC:PCNA BOUND TO NICKED DNA organism=? : x : GLN xxxx B0146 <- 2.88 -> DA xxx I0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0148 <- 3.62 -> DA xxx I0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0155 <- 4.36 -> DA xxx I0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0336 <- 3.36 -> DT xxx J0032 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0337 <- 4.07 -> DT xxx J0031 : score x.xxxxx >7u19_E:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;post-AAA+_oligomerization_domain-like; title=RFC:PCNA BOUND TO NICKED DNA organism=? : x : ASN xxxx E0336 <- 3.36 -> DT xxx J0032 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0337 <- 4.07 -> DT xxx J0031 : score x.xxxxx >7u1t_ABCD:Viral_DNA-binding_domain; title=EBNA1 DNA BINDING DOMAIN (401-641) BINDS TO HALF DYAD SYMMETRY ELEMENT organism=? : H : LYS NZ A0460 <- 2.92 -> DA N3 E0038 : score 2.71028 : H : ARG NH2 A0469 <- 3.13 -> DT O2 E0041 : score 3.95393 : H : LYS NZ A0477 <- 2.55 -> DG N7 E0034 : score 5.65519 : H : LYS NZ B0461 <- 2.45 -> DT O2 F0015 : score 3.83828 : H : LYS NZ B0477 <- 2.48 -> DA N7 F0013 : score 3.12516 : H : LYS NZ C0461 <- 2.71 -> DC O2 E0027 : score 2.99918 : H : LYS NZ C0477 <- 2.48 -> DG N7 F0034 : score 5.73059 : H : LYS NZ C0477 <- 2.93 -> DG O6 F0034 : score 5.63047 : H : LYS NZ D0460 <- 3.04 -> DT O2 E0015 : score 3.41499 : H : LYS NZ D0461 <- 2.79 -> DG N3 E0017 : score 1.45675 : x : TRP xxxx A0464 <- 3.41 -> DC xxx E0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0465 <- 2.87 -> DT xxx F0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0515 <- 3.51 -> DG xxx E0035 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0518 <- 3.18 -> DT xxx F0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0455 <- 2.96 -> DA xxx E0047 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0464 <- 3.15 -> DG xxx E0044 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0465 <- 3.29 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 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>7u32_AFL:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=MVV CLEAVED SYNAPTIC COMPLEX (CSC) INTASOME AT 3.4 A RESOLUTION organism=VISNA/MAEDI VIRUS EV1 KV1772 : H : ARG NE A0155 <- 2.83 -> DG N3 Y0006 : score 1.7446 : H : ARG NH2 A0155 <- 3.06 -> DG N3 Y0006 : score 3.42252 : H : GLN NE2 A0158 <- 2.95 -> DG N3 Z0017 : score 4.82637 : H : ARG NH1 L0231 <- 2.41 -> DC O2 Y0011 : score 3.9347 : x : GLN xxxx A0148 <- 2.99 -> DG xxx Y0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0151 <- 3.22 -> DG xxx Y0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0154 <- 3.57 -> DC xxx Z0018 : score x.xxxxx >7u32_DIN:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=MVV CLEAVED SYNAPTIC COMPLEX (CSC) INTASOME AT 3.4 A RESOLUTION organism=VISNA/MAEDI VIRUS EV1 KV1772 : H : ARG NH1 D0231 <- 2.41 -> DC O2 X0011 : score 3.9347 : H : ARG NE I0155 <- 2.93 -> DG N3 X0006 : score 1.70949 : H : ARG 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title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH AP-SITE AT SHL-6 organism=? : x : HIS xxxx A0039 <- 3.51 -> DG xxx J0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 3.00 -> DG xxx J0082 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 2.93 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.30 -> DG xxx I0050 : score x.xxxxx >7u51_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH AP-SITE AT SHL-6 organism=? : H : ARG NH2 C0011 <- 2.53 -> DT O2 I0032 : score 4.46193 : H : ARG NH1 E0040 <- 2.92 -> DG N3 I0083 : score 2.9793 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.02 -> DG N3 I0083 : score 3.45141 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.51 -> DG xxx J0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 3.00 -> DG xxx J0082 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 2.93 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.30 -> DG xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.53 -> DC xxx J0123 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.20 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>7u7s_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-DGMPNPP TERNARY MISMATCH COMPLEX IN 0.025 MM MG2+ FOR 600S organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.24 -> DG O6 P0004 : score 5.548 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.05 -> DG N7 P0004 : score 6.06538 : x : SER xxxx A0322 <- 3.69 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.84 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.36 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >7u7t_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-DGMPNPP TERNARY MISMATCH COMPLEX IN 0.05 MM MG2+ FOR 600S organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.14 -> DG O6 P0004 : score 5.66967 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.03 -> DG N7 P0004 : score 6.09092 : x : SER xxxx A0322 <- 3.52 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.48 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 3.99 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >7u7u_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-DGMPNPP TERNARY MISMATCH COMPLEX IN 0.1 MM MG2+ FOR 600S organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.25 -> DG N7 P0004 : score 5.5055 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.09 -> DG N7 P0004 : score 6.01431 : x : SER xxxx A0322 <- 3.78 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.87 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.17 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >7u7v_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-DGMPNPP TERNARY MISMATCH COMPLEX IN 0.4 MM MG2+ FOR 600S organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.14 -> DG O6 P0004 : score 5.66967 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.03 -> DG N7 P0004 : score 6.09092 : x : SER xxxx A0322 <- 3.67 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.63 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 3.99 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >7u7w_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-DGMPNPP TERNARY MISMATCH COMPLEX IN 1.0 MM MG2+ FOR 600S organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.14 -> DG O6 P0004 : score 5.66967 : H : ARG NH2 A0382 <- 2.93 -> DG N7 P0004 : score 6.21862 : V : ARG CZ A0061 <- 3.74 -> DT C7 P0008 : score 2.16429 : x : SER xxxx A0322 <- 3.60 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.79 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.17 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >7u7x_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-DGMPNPP TERNARY MISMATCH COMPLEX IN 2.0 MM MG2+ FOR 600S organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.12 -> DG O6 P0004 : score 5.694 : H : ARG NH2 A0382 <- 2.89 -> DG N7 P0004 : score 6.26969 : x : SER xxxx A0322 <- 3.67 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.72 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.10 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >7u7y_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-DGMPNPP TERNARY MISMATCH COMPLEX IN 0.06 MM MN2+ FOR 600S organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0324 <- 6.20 -> DA N7 T0005 : score 1.989 : H : ARG NH1 A0382 <- 3.16 -> DG O6 P0004 : score 5.64533 : H : ARG NH2 A0382 <- 2.91 -> DG N7 P0004 : score 6.24415 : x : ARG xxxx A0061 <- 4.29 -> DT xxx P0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.62 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.85 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.04 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >7u7z_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-DGMPNPP TERNARY MISMATCH COMPLEX IN 0.12 MM MN2+ FOR 600S organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0324 <- 6.15 -> DA N7 T0005 : score 1.989 : H : ARG NH1 A0382 <- 3.20 -> DG O6 P0004 : score 5.59667 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.09 -> DG N7 P0004 : score 6.01431 : x : ARG xxxx A0061 <- 3.04 -> DT xxx P0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.78 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.93 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.21 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >7u80_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-DGMPNPP TERNARY MISMATCH COMPLEX IN 0.25 MM MN2+ FOR 600S organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.16 -> DG O6 P0004 : score 5.64533 : H : ARG NH2 A0382 <- 2.88 -> DG N7 P0004 : score 6.28246 : x : SER xxxx A0322 <- 3.52 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.76 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.21 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >7u81_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-DGMPNPP TERNARY MISMATCH COMPLEX IN 0.5 MM MN2+ FOR 600S organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0324 <- 6.15 -> DA N7 T0005 : score 1.989 : H : ARG NH1 A0382 <- 3.25 -> DG O6 P0004 : score 5.53583 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.12 -> DG N7 P0004 : score 5.976 : x : SER xxxx A0322 <- 3.65 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 4.03 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.27 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >7u82_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-DGMPNPP TERNARY MISMATCH COMPLEX IN 1.0 MM MN2+ FOR 600S organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0324 <- 6.15 -> DA N7 T0005 : score 1.989 : H : ARG NH1 A0382 <- 3.25 -> DG N7 P0004 : score 5.5055 : H : ARG NH1 A0382 <- 3.17 -> DG O6 P0004 : score 5.63317 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.00 -> DG N7 P0004 : score 6.12923 : x : SER xxxx A0322 <- 3.72 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.66 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >7u83_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-DGMPNPP TERNARY MISMATCH COMPLEX IN 3.0 MM MN2+ FOR 600S organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0324 <- 6.28 -> DA N7 T0005 : score 1.989 : H : ARG NH1 A0382 <- 3.29 -> DG N7 P0004 : score 5.4571 : H : ARG NH1 A0382 <- 3.24 -> DG O6 P0004 : score 5.548 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.11 -> DG N7 P0004 : score 5.98877 : x : SER xxxx A0322 <- 3.71 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.79 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.17 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >7u84_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-DGMPNPP TERNARY MISMATCH COMPLEX IN 6.0 MM MN2+ FOR 600S organism=Homo sapiens : w : ASN ND2 A0324 <- 6.23 -> DA N7 T0005 : score 1.989 : H : ARG NH1 A0382 <- 3.13 -> DG O6 P0004 : score 5.68183 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.10 -> DG N7 P0004 : score 6.00154 : x : SER xxxx A0322 <- 3.62 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.57 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.28 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >7ub2_E: title=STRUCTURE OF RECT PROTEIN FROM LISTERIA INNOCCUA PHAGE A118 IN COMPLEX WITH 83-MER ANNEALED DUPLEX organism=? : x : TYR xxxx E0065 <- 4.15 -> DA xxx Y0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0090 <- 3.87 -> DT xxx Z0059 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx E0096 <- 3.24 -> DA xxx Y0023 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0098 <- 3.28 -> DT xxx Z0062 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0099 <- 3.80 -> DT xxx Z0062 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0100 <- 3.58 -> DT xxx Z0062 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0192 <- 3.94 -> DT xxx Z0060 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0194 <- 3.89 -> DT xxx Z0060 : score x.xxxxx >7ubl_A:DnaJ/Hsp40_cysteine-rich_domain; title=TRANSCRIPTION ANTITERMINATION FACTOR QLAMBDA IN COMPLEX WITH Q-LAMBDA- BINDING-ELEMENT DNA organism=Escherichia phage Lambda : H : ARG NH1 A0119 <- 3.12 -> DG N7 C0016 : score 5.6628 : H : ARG NH2 A0119 <- 2.77 -> DG O6 C0016 : score 6.6396 : w : ASP OD1 A0120 <- 5.86 -> DA N6 B0002 : score 3.122 : H : ARG NH1 A0146 <- 2.88 -> DG O6 C0015 : score 5.986 : H : ARG NH2 A0146 <- 2.74 -> DG N7 C0015 : score 6.46123 : H : GLN OE1 A0173 <- 3.04 -> DA N6 B0012 : score 5.76204 : H : GLN NE2 A0173 <- 2.92 -> DA N7 B0012 : score 5.94359 : H : ARG NH1 A0178 <- 2.93 -> DG N7 C0005 : score 5.8927 : H : ARG NH2 A0178 <- 2.87 -> DT O4 B0014 : score 3.50409 : H : ARG NH2 A0178 <- 2.77 -> DG O6 C0005 : score 6.6396 : x : PRO xxxx A0174 <- 3.48 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0177 <- 3.59 -> DA xxx B0012 : score x.xxxxx >7ubm_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=TRANSCRIPTION ANTITERMINATION COMPLEX: "PRE-ENGAGED" QLAMBDA-LOADING COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 C0371 <- 2.80 -> DG O6 10040 : score 6.6 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.40 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.50 -> DC xxx 10047 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.00 -> DC xxx 10047 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 4.20 -> DG xxx 10038 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 3.39 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0446 <- 3.33 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0451 <- 4.12 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.39 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.20 -> DC xxx 10049 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0546 <- 3.96 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.87 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx >7ubm_CDFQ: title=TRANSCRIPTION ANTITERMINATION COMPLEX: "PRE-ENGAGED" QLAMBDA-LOADING COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 C0371 <- 2.80 -> DG O6 10040 : score 6.6 : H : ASN OD1 F0383 <- 3.16 -> DT N3 10037 : score 3.52759 : H : ARG NE F0385 <- 3.38 -> DG N7 10038 : score 3.90887 : H : TYR OH F0430 <- 2.95 -> DT O2 10032 : score 3.12017 : H : ARG NH2 F0584 <- 3.12 -> DT O4 20034 : score 3.3264 : H : ARG NH2 Q0119 <- 2.93 -> DG N7 10018 : score 6.21862 : H : ARG NH2 Q0146 <- 3.42 -> DG N7 10017 : score 5.59292 : H : ARG NH2 Q0178 <- 2.48 -> DT O4 20054 : score 3.78129 : V : ARG CZ F0586 <- 3.59 -> DT C7 10024 : score 2.24425 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.40 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.50 -> DC xxx 10047 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.00 -> DC xxx 10047 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 4.20 -> DG xxx 10038 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 3.39 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0446 <- 3.33 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0451 <- 4.12 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.39 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.20 -> DC xxx 10049 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0546 <- 3.96 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.87 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0255 <- 3.44 -> DC xxx 20023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0261 <- 3.69 -> DC xxx 20023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0352 <- 4.20 -> DA xxx 20016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 3.86 -> DT xxx 20015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.69 -> DT xxx 20015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 4.06 -> DT xxx 20014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.93 -> DT xxx 20014 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0096 <- 3.52 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.33 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.13 -> DG xxx 10040 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.40 -> DG xxx 10038 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.44 -> DT xxx 10037 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0116 <- 4.23 -> DT xxx 10037 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 3.89 -> DT xxx 10037 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 4.15 -> DA xxx 10033 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 3.42 -> DA xxx 10033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 3.22 -> DA xxx 10033 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 4.14 -> DA xxx 10033 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 3.23 -> DA xxx 10036 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.51 -> DA xxx 10035 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0432 <- 3.37 -> DA xxx 10036 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0434 <- 3.26 -> DT xxx 10032 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0437 <- 4.28 -> DC xxx 10031 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 4.09 -> DA xxx 20029 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0444 <- 3.81 -> DA xxx 20029 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0585 <- 3.19 -> DC xxx 20035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0588 <- 4.15 -> DT xxx 20034 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0589 <- 3.33 -> DT xxx 10024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx Q0120 <- 3.21 -> DC xxx 20043 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Q0172 <- 4.36 -> DG xxx 10007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Q0173 <- 3.93 -> DT xxx 20051 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx Q0174 <- 3.70 -> DA xxx 10008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Q0177 <- 3.75 -> DT xxx 20053 : score x.xxxxx >7ubn_CDFNQ: title=TRANSCRIPTION ANTITERMINATION COMPLEX: NUSA-CONTAINING "ENGAGED" QLAMBDA-LOADING COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 C0371 <- 2.43 -> DG O6 10040 : score 6.5335 : H : ARG NH1 C0542 <- 2.38 -> DT O4 10050 : score 3.54246 : H : ASP OD2 F0096 <- 3.21 -> DG N2 10039 : score 5.01134 : H : ARG NH2 F0385 <- 2.66 -> DG N7 10038 : score 6.56338 : H : ARG NH1 F0423 <- 2.72 -> DA N7 10033 : score 2.60122 : H : TYR OH F0430 <- 2.52 -> DT O2 10032 : score 3.3968 : H : THR OG1 F0432 <- 3.16 -> DA N7 10036 : score 3.16829 : H : GLN NE2 F0589 <- 2.96 -> DT O4 10025 : score 5.02491 : H : ARG NH1 Q0119 <- 2.68 -> DG N7 10018 : score 6.1952 : H : ARG NH2 Q0119 <- 2.77 -> DG O6 10018 : score 6.6396 : H : ARG NH2 Q0119 <- 2.48 -> DG O6 10019 : score 7.0224 : H : ARG NH1 Q0146 <- 2.59 -> DG O6 10017 : score 6.33883 : H : ARG NH2 Q0146 <- 3.15 -> DG N7 10017 : score 5.93769 : H : GLN OE1 Q0173 <- 3.30 -> DA N6 20052 : score 5.44731 : H : ARG NH1 Q0178 <- 3.04 -> DG N7 10007 : score 5.7596 : H : ARG NH2 Q0178 <- 2.93 -> DG O6 10007 : score 6.4284 : H : ARG NH2 Q0178 <- 2.57 -> DT O4 20054 : score 3.71732 : V : ALA CB D0791 <- 3.72 -> DT C7 20014 : score 5.71095 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.51 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.43 -> DC xxx 10047 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.00 -> DC xxx 10047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 4.15 -> DC xxx 10047 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 4.01 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0445 <- 3.36 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0446 <- 2.91 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0538 <- 3.38 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0546 <- 3.48 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 4.15 -> DG xxx 10048 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0255 <- 3.76 -> DC xxx 20023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 3.73 -> DT xxx 20015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 4.23 -> DT xxx 20015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.42 -> DT xxx 20014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.42 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.28 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.87 -> DG xxx 10038 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.42 -> DT xxx 10037 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0116 <- 3.98 -> DT xxx 10037 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0264 <- 4.39 -> DT xxx 10032 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 3.14 -> DT xxx 10037 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 4.00 -> DT xxx 10037 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 4.02 -> DA xxx 10033 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 4.11 -> DA xxx 10033 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 3.62 -> DA xxx 10033 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 3.46 -> DT xxx 10037 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.32 -> DA xxx 10035 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0434 <- 4.01 -> DT xxx 10032 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0444 <- 3.72 -> DA xxx 20029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0584 <- 3.57 -> DT xxx 20034 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0585 <- 3.31 -> DC xxx 20035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0586 <- 3.59 -> DT xxx 10024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0588 <- 3.93 -> DC xxx 20035 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx Q0120 <- 3.56 -> DC xxx 20043 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Q0148 <- 3.45 -> DT xxx 10015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx Q0174 <- 3.73 -> DA xxx 10008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Q0177 <- 3.73 -> DA xxx 20052 : score x.xxxxx >7ubn_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=TRANSCRIPTION ANTITERMINATION COMPLEX: NUSA-CONTAINING "ENGAGED" QLAMBDA-LOADING COMPLEX organism=? : H : ASP OD2 F0096 <- 3.21 -> DG N2 10039 : score 5.01134 : H : ARG NH2 F0385 <- 2.66 -> DG N7 10038 : score 6.56338 : H : ARG NH1 F0423 <- 2.72 -> DA N7 10033 : score 2.60122 : H : TYR OH F0430 <- 2.52 -> DT O2 10032 : score 3.3968 : H : THR OG1 F0432 <- 3.16 -> DA N7 10036 : score 3.16829 : H : GLN NE2 F0589 <- 2.96 -> DT O4 10025 : score 5.02491 : x : VAL xxxx F0098 <- 3.42 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.28 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.87 -> DG xxx 10038 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.42 -> DT xxx 10037 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0116 <- 3.98 -> DT xxx 10037 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0264 <- 4.39 -> DT xxx 10032 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0383 <- 3.14 -> DT xxx 10037 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 4.00 -> DT xxx 10037 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 4.02 -> DA xxx 10033 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 4.11 -> DA xxx 10033 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 3.62 -> DA xxx 10033 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 3.46 -> DT xxx 10037 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.32 -> DA xxx 10035 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0434 <- 4.01 -> DT xxx 10032 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0444 <- 3.72 -> DA xxx 20029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0584 <- 3.57 -> DT xxx 20034 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0585 <- 3.31 -> DC xxx 20035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0586 <- 3.59 -> DT xxx 10024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0588 <- 3.93 -> DC xxx 20035 : score x.xxxxx >7ubu_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases;Chromo_domain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZMET2 IN COMPLEX WITH HEMIMETHYLATED CAG DNA AND A HISTONE H3KC9ME2 PEPTIDE organism=ZEA MAYS : H : ARG NH2 A0525 <- 2.57 -> DT O2 B0008 : score 4.42807 : H : ARG NH2 A0525 <- 2.57 -> DT O2 B0008 : score 4.42807 : H : TYR OH A0526 <- 3.40 -> DG N2 C0012 : score 4.30297 : w : LYS NZ A0566 <- 5.56 -> DT O2 B0011 : score 0.522 : H : ARG NH2 A0804 <- 2.76 -> DG O6 C0012 : score 6.6528 : V : TYR CD1 A0776 <- 3.64 -> DT C7 B0008 : score 4.86827 : x : PHE xxxx A0523 <- 3.45 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0527 <- 3.52 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0563 <- 4.30 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0780 <- 3.52 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0787 <- 3.75 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0808 <- 3.47 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0809 <- 3.26 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx >7ufx_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ISORETICULAR, INTERPENETRATING CO-CRYSTAL OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND SCAFFOLD-INSERT DUPLEXES (21MER AND 10MER) CONTAINING THE COGNATE REPE54 SEQUENCE AND AN ADDITIONAL G-C RICH SEQUENCE, RESPECTIVELY. organism=Escherichia coli K-12 : H : GLU OE1 C0077 <- 2.89 -> DC N4 A0015 : score 5.66413 : H : ARG NH2 C0124 <- 3.28 -> DT O2 B0024 : score 3.82693 : H : ARG NH1 C0200 <- 3.12 -> DG O6 A0004 : score 5.694 : H : ARG NH2 C0200 <- 3.23 -> DT O4 A0005 : score 3.24822 : H : ASP OD1 C0203 <- 3.28 -> DC N4 B0038 : score 4.83176 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.47 -> DG O6 A0006 : score 7.0356 : H : ARG NE C0207 <- 3.11 -> DG N7 B0036 : score 4.14764 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.83 -> DG O6 B0036 : score 6.5604 : x : SER xxxx C0075 <- 3.76 -> DG xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 4.01 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 4.01 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0080 <- 3.68 -> DC xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.77 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 3.91 -> DT xxx B0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 3.98 -> DG xxx B0036 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.67 -> DG xxx A0004 : score x.xxxxx >7ugw_ABCD:Type_II_DNA_topoisomerase; title=M. TUBERCULOSIS DNA GYRASE CLEAVAGE CORE BOUND TO DNA AND EVYBACTIN organism=? : H : ARG NH1 B0482 <- 3.16 -> DC O2 V0027 : score 3.3872 : x : TYR xxxx A0031 <- 4.32 -> DA xxx V0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0039 <- 4.49 -> DT xxx V0044 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0091 <- 3.94 -> DA xxx V0045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0128 <- 4.41 -> DG xxx V0024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0181 <- 3.02 -> DC xxx V0031 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0484 <- 3.43 -> DT xxx V0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0031 <- 4.48 -> DA xxx V0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0091 <- 4.36 -> DA xxx V0022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0181 <- 3.24 -> DC xxx V0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0482 <- 3.93 -> DG xxx V0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0484 <- 3.89 -> DT xxx V0006 : score x.xxxxx >7ugw_C:Type_II_DNA_topoisomerase; title=M. TUBERCULOSIS DNA GYRASE CLEAVAGE CORE BOUND TO DNA AND EVYBACTIN organism=? : x : TYR xxxx C0031 <- 4.48 -> DA xxx V0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0091 <- 4.36 -> DA xxx V0022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0181 <- 3.24 -> DC xxx V0008 : score x.xxxxx >7uik_T:Leucine_zipper_domain;Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=MEDIATOR-PIC EARLY (TAIL A + UPSTREAM DNA & ACTIVATOR) organism=? : H : LYS NZ T0018 <- 2.63 -> DG N7 X0004 : score 5.56902 : H : LYS NZ T0018 <- 2.77 -> DG O6 X0005 : score 5.81545 : x : LEU xxxx T0019 <- 4.08 -> DC xxx X0003 : score x.xxxxx >7uik_TU:Leucine_zipper_domain;Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=MEDIATOR-PIC EARLY (TAIL A + UPSTREAM DNA & ACTIVATOR) organism=? : H : LYS NZ T0018 <- 2.63 -> DG N7 X0004 : score 5.56902 : H : LYS NZ T0018 <- 2.77 -> DG O6 X0005 : score 5.81545 : x : LEU xxxx T0019 <- 4.08 -> DC xxx X0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx U0018 <- 1.72 -> DG xxx Y0025 : score x.xxxxx >7uin_D:DNA/RNA_polymerases; title=CRYOEM STRUCTURE OF AN GROUP II INTRON RETROELEMENT organism=? : x : PHE xxxx D0279 <- 3.32 -> DG xxx A0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0281 <- 3.28 -> DG xxx A0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0339 <- 4.05 -> DC xxx A0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0342 <- 4.05 -> DT xxx A0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0396 <- 3.73 -> DG xxx A0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0400 <- 3.56 -> DG xxx A0001 : score x.xxxxx >7uio_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Leucine_zipper_domain;Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=MEDIATOR-PIC EARLY (COMPOSITE MODEL) organism=? : H : LYS NZ A0018 <- 2.63 -> DG N7 A0004 : score 5.56902 : H : LYS NZ A0018 <- 2.76 -> DG O6 A0005 : score 5.82702 : x : LEU xxxx A0019 <- 4.08 -> DC xxx A0003 : score x.xxxxx >7uio_AB:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Eukaryotic_RPB5_N-terminal_domain;RPB5-like_RNA_polymerase_subunit;Leucine_zipper_domain;Zn2/Cys6_DNA-binding_domain; title=MEDIATOR-PIC EARLY (COMPOSITE MODEL) organism=? : H : LYS NZ A0018 <- 2.63 -> DG N7 A0004 : score 5.56902 : H : LYS NZ A0018 <- 2.76 -> DG O6 A0005 : score 5.82702 : x : LEU xxxx A0019 <- 4.08 -> DC xxx A0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0018 <- 1.72 -> DG xxx B0025 : score x.xxxxx >7un7_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE LAMBDA IN COMPLEX WITH A 1NT MICROHOMOLOGY SUBSTRATE organism=? : w : GLN NE2 A0372 <- 6.23 -> DC O2 U0009 : score 2.699 : H : TYR OH A0505 <- 2.63 -> DC O2 P0006 : score 3.61635 : H : ARG NH1 A0517 <- 3.11 -> DG N3 T0006 : score 2.86331 : x : ARG xxxx A0514 <- 3.49 -> DA xxx T0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0529 <- 3.44 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx >7unc_a:Histone-fold; title=POL II-DSIF-SPT6-PAF1C-TFIIS COMPLEX WITH REWRAPPED NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH1 a0040 <- 2.81 -> DT O2 N0082 : score 4.2978 : H : ARG NH2 a0040 <- 3.06 -> DT O2 N0082 : score 4.0132 : x : ARG xxxx a0083 <- 3.49 -> DG xxx T-097 : score x.xxxxx >7und_e:Histone-fold; title=POL II-DSIF-SPT6-PAF1C-TFIIS-NUCLEOSOME COMPLEX (STALLED AT +38) organism=? : H : ARG NH1 e0040 <- 3.07 -> DG N3 T-080 : score 2.88773 : H : ARG NH2 e0083 <- 2.77 -> DC O2 T-096 : score 3.72091 >7uog_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ISORETICULAR, INTERPENETRATING CO-CRYSTAL OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND ASYMMETRICAL EXPANDED DUPLEX (31MER) CONTAINING THE COGNATE REPE54 SEQUENCE AND AN ADDITIONAL G-C RICH SEQUENCE. organism=Escherichia coli K-12 : H : GLU OE1 C0077 <- 2.73 -> DC N4 A0015 : score 5.8487 : w : GLU OE2 C0077 <- 5.86 -> DG N7 A0014 : score 2.669 : H : LYS NZ C0080 <- 2.59 -> DG O6 B0028 : score 6.02356 : H : ARG NH1 C0200 <- 3.16 -> DG O6 A0004 : score 5.64533 : H : ARG NH2 C0200 <- 3.08 -> DT O4 A0005 : score 3.35483 : H : ASP OD1 C0203 <- 3.13 -> DC N4 B0038 : score 4.99211 : H : ARG NH1 C0206 <- 3.26 -> DG N7 A0006 : score 5.4934 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.50 -> DG O6 A0006 : score 6.996 : H : ARG NE C0207 <- 3.05 -> DG N7 B0036 : score 4.20071 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.64 -> DG O6 B0036 : score 6.8112 : x : SER xxxx C0075 <- 3.31 -> DG xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 3.94 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.87 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.92 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0124 <- 3.36 -> DG xxx B0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 3.54 -> DT xxx B0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 3.85 -> DT xxx B0037 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.62 -> DG xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0233 <- 3.60 -> DC xxx A0002 : score x.xxxxx >7upz_A:Leucine_zipper_domain; title=STRUCTURAL BASIS FOR CELL TYPE SPECIFIC DNA BINDING OF C/EBPBETA: THE CASE OF CELL CYCLE INHIBITOR P15INK4B PROMOTER organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 A0281 <- 3.39 -> DA N6 C0011 : score 5.31122 : H : ASN ND2 A0281 <- 3.27 -> DT O4 D0006 : score 4.78786 : w : ASN OD1 A0282 <- 5.62 -> DA N7 C0010 : score 2.277 : H : ARG NH1 A0289 <- 3.10 -> DG N7 C0009 : score 5.687 : H : ARG NH2 A0289 <- 2.29 -> DG O6 C0009 : score 7.2732 : x : ARG xxxx A0278 <- 3.07 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0284 <- 3.95 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0285 <- 3.56 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 4.07 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx >7upz_AB:Leucine_zipper_domain; title=STRUCTURAL BASIS FOR CELL TYPE SPECIFIC DNA BINDING OF C/EBPBETA: THE CASE OF CELL CYCLE INHIBITOR P15INK4B PROMOTER organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 A0281 <- 3.39 -> DA N6 C0011 : score 5.31122 : H : ASN ND2 A0281 <- 3.27 -> DT O4 D0006 : score 4.78786 : w : ASN OD1 A0282 <- 5.62 -> DA N7 C0010 : score 2.277 : H : ARG NH1 A0289 <- 3.10 -> DG N7 C0009 : score 5.687 : H : ARG NH2 A0289 <- 2.29 -> DG O6 C0009 : score 7.2732 : H : ASN OD1 B0281 <- 3.07 -> DA N6 D0012 : score 5.69662 : H : ASN ND2 B0281 <- 3.16 -> DT O4 C0005 : score 4.90412 : w : ASN ND2 B0281 <- 5.67 -> DC N4 C0004 : score 2.395 : V : VAL CG1 B0285 <- 3.77 -> DT C7 D0010 : score 6.10597 : x : ARG xxxx A0278 <- 3.07 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0284 <- 3.95 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0285 <- 3.56 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0288 <- 4.07 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0278 <- 3.19 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0282 <- 3.40 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0284 <- 3.90 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0288 <- 4.07 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0289 <- 4.42 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx >7ur0_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ISORETICULAR, INTERPENETRATING CO-CRYSTAL OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND SCAFFOLD-INSERT DUPLEXES (21MER AND 10MER) CONTAINING THE COGNATE REPE54 SEQUENCE AND AN ADDITIONAL T-A RICH SEQUENCE, RESPECTIVELY. organism=Escherichia coli K-12 : H : GLU OE1 C0077 <- 2.63 -> DC N4 A0015 : score 5.96406 : w : GLU OE2 C0077 <- 5.38 -> DG N7 A0014 : score 2.669 : H : ARG NH2 C0124 <- 3.00 -> DT O2 B0024 : score 4.064 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.57 -> DG N3 B0025 : score 3.77633 : H : ARG NH1 C0200 <- 2.76 -> DG O6 A0004 : score 6.132 : H : ARG NH2 C0200 <- 3.07 -> DT O4 A0005 : score 3.36194 : H : ASP OD1 C0203 <- 2.86 -> DC N4 B0038 : score 5.28073 : H : ARG NH1 C0206 <- 3.30 -> DG N7 A0006 : score 5.445 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.24 -> DG O6 A0006 : score 7.3392 : H : ARG NE C0207 <- 2.95 -> DG N7 B0036 : score 4.28914 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.71 -> DG O6 B0036 : score 6.7188 : x : SER xxxx C0075 <- 3.77 -> DG xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 4.02 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 4.04 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0080 <- 3.40 -> DC xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.77 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 3.82 -> DT xxx B0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 3.59 -> DG xxx B0036 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.29 -> DG xxx A0004 : score x.xxxxx >7usf_D:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase; title=MOUSE MAMMARY TUMOR VIRUS STRAND TRANSFER COMPLEX INTASOME organism=? : x : ARG xxxx D0240 <- 4.09 -> DT xxx I0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0242 <- 3.66 -> DA xxx I0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0255 <- 3.21 -> DA xxx I0002 : score x.xxxxx >7ut1_ABG:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase; title=HIGHER-ORDER ASSEMBLY OF MULTIPLE MMTV STRAND TRANSFER COMPLEX INTASOMES organism=? : H : ARG NE A0159 <- 2.63 -> DC O2 I0006 : score 2.74938 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.73 -> DG O6 I0007 : score 6.6924 : x : GLN xxxx A0152 <- 2.76 -> DG xxx I0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0155 <- 3.77 -> DG xxx I0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0158 <- 3.32 -> DC xxx J0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0259 <- 3.94 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx >7ut1_CE:Ribonuclease_H-like;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase; title=HIGHER-ORDER ASSEMBLY OF MULTIPLE MMTV STRAND TRANSFER COMPLEX INTASOMES organism=? : H : ARG NE E0159 <- 3.09 -> DC O2 L0006 : score 2.50475 : H : ARG NH2 E0159 <- 3.06 -> DC O2 L0006 : score 3.50638 : H : GLN OE1 E0162 <- 3.28 -> DG N2 M0018 : score 5.06935 : H : GLN NE2 E0162 <- 2.77 -> DG N3 M0018 : score 5.0055 : H : ARG NH1 E0240 <- 2.97 -> DG O6 M0015 : score 5.8765 : H : ARG NH2 E0240 <- 2.85 -> DG N7 M0015 : score 6.32077 : x : GLN xxxx E0152 <- 3.76 -> DG xxx L0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0155 <- 3.32 -> DG xxx L0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0158 <- 4.11 -> DC xxx M0019 : score x.xxxxx >7utn_D:Ribonuclease_H-like; title=ISCB AND WRNA BOUND TO TARGET DNA organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : HIS NE2 D0379 <- 2.89 -> DT O2 B0117 : score 5.14543 : H : LYS NZ D0380 <- 2.69 -> DA N3 A0016 : score 2.83802 : V : GLU CB D0459 <- 3.78 -> DT C7 B0117 : score 1.63583 : x : ARG xxxx D0457 <- 3.53 -> DT xxx B0117 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0461 <- 4.36 -> DA xxx B0118 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0462 <- 4.43 -> DC xxx A0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0467 <- 4.02 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0468 <- 3.77 -> DT xxx A0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0476 <- 4.38 -> DT xxx A0013 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0478 <- 3.83 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx >7utt_A: title=STRUCTURE OF NON-HYDROLYZABLE ATP (APCPP) BINDS TO CYCLIC GMP AMP SYNTHASE (CGAS) THROUGH MN COORDINATION organism=? : H : ARG NH1 A0161 <- 2.97 -> DT O2 F0004 : score 4.15999 : H : ARG NH2 A0161 <- 2.85 -> DT O2 F0004 : score 4.191 : w : ARG NH2 A0161 <- 5.81 -> DA N3 E0015 : score 2.092 >7uux_A: title=ATP BINDS TO CYCLIC GMP AMP SYNTHASE (CGAS) THROUGH MG COORDINATION organism=? : H : ARG NH1 A0161 <- 2.84 -> DT O2 F0004 : score 4.27196 : H : ARG NH2 A0161 <- 2.75 -> DT O2 F0004 : score 4.27567 : w : ARG NH2 A0161 <- 5.97 -> DA N3 E0015 : score 2.092 >7uv6_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ISORETICULAR, INTERPENETRATING CO-CRYSTAL OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND SCAFFOLD DUPLEX (21MER) CONTAINING THE COGNATE REPE54 SEQUENCE AND AN INSERT DUPLEX (10MER) WITH GUEST TAMRA- LABELLED THYMINE AND G-C RICH SEQUENCE. organism=Escherichia coli K-12 : H : GLU OE1 C0077 <- 2.82 -> DC N4 A0015 : score 5.74488 : w : GLU OE2 C0077 <- 6.25 -> DG O6 A0014 : score 2.892 : H : LYS NZ C0080 <- 3.04 -> DG O6 B0028 : score 5.50329 : H : ARG NH1 C0124 <- 2.93 -> DT O2 B0024 : score 4.19444 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.24 -> DT O2 B0024 : score 4.70747 : H : ARG NH1 C0200 <- 3.09 -> DG O6 A0004 : score 5.7305 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.99 -> DT O4 A0005 : score 3.4188 : H : ASP OD1 C0203 <- 3.11 -> DC N4 B0038 : score 5.01349 : w : ASP OD1 C0203 <- 5.37 -> DT O4 B0037 : score 2.616 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.65 -> DG O6 A0006 : score 6.798 : w : ARG NE C0206 <- 6.08 -> DT O4 B0037 : score 1.317 : w : ARG NH2 C0206 <- 6.00 -> DT O4 B0037 : score 2.366 : H : ARG NE C0207 <- 3.03 -> DG N7 B0036 : score 4.21839 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.73 -> DG O6 B0036 : score 6.6924 : x : SER xxxx C0075 <- 3.20 -> DG xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 3.87 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.76 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.83 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 3.76 -> DT xxx B0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 3.80 -> DG xxx B0036 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.60 -> DG xxx A0004 : score x.xxxxx >7uv7_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ISORETICULAR, INTERPENETRATING CO-CRYSTAL OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND SCAFFOLD DUPLEX (21MER) CONTAINING THE COGNATE REPE54 SEQUENCE AND AN INSERT DUPLEX (10MER) WITH GUEST TAMRA- LABELLED THYMINE AND T-A RICH SEQUENCE. organism=Escherichia coli K-12 : H : GLU OE1 C0077 <- 2.71 -> DC N4 A0015 : score 5.87177 : w : GLU OE2 C0077 <- 5.37 -> DG N7 A0014 : score 2.669 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.95 -> DT O2 B0024 : score 4.10633 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.92 -> DG N3 B0025 : score 3.52361 : H : ARG NH1 C0200 <- 2.79 -> DG O6 A0004 : score 6.0955 : H : ARG NH2 C0200 <- 3.06 -> DT O4 A0005 : score 3.36905 : H : ASP OD1 C0203 <- 2.95 -> DC N4 B0038 : score 5.18453 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.36 -> DG O6 A0006 : score 7.1808 : H : ARG NE C0207 <- 3.07 -> DG N7 B0036 : score 4.18302 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.74 -> DG O6 B0036 : score 6.6792 : x : SER xxxx C0075 <- 3.60 -> DG xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 3.85 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.95 -> DA xxx B0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0080 <- 3.60 -> DC xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.81 -> DG xxx B0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 3.87 -> DT xxx B0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 3.95 -> DG xxx B0036 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.42 -> DG xxx A0004 : score x.xxxxx >7uwe_I:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF E. COLI TRANSCRIPTION-COUPLED RIBONUCLEOTIDE EXCISION REPAIR (TC-RER) COMPLEX organism=? : V : ASP CB I0199 <- 3.62 -> DT C7 A0015 : score 2.80382 : x : ARG xxxx I0151 <- 3.39 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.50 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 4.31 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.34 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0446 <- 3.25 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 3.75 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 2.94 -> DA xxx A0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0547 <- 3.74 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx >7uwe_IJ: title=CRYOEM STRUCTURE OF E. COLI TRANSCRIPTION-COUPLED RIBONUCLEOTIDE EXCISION REPAIR (TC-RER) COMPLEX organism=? : V : ASP CB I0199 <- 3.62 -> DT C7 A0015 : score 2.80382 : x : ARG xxxx I0151 <- 3.39 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.50 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 4.31 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.34 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0446 <- 3.25 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 3.75 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 2.94 -> DA xxx A0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0547 <- 3.74 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx J0042 <- 4.22 -> DC xxx A0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0255 <- 4.17 -> DC xxx B0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0261 <- 3.82 -> DC xxx B0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0270 <- 4.35 -> DA xxx A0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0274 <- 4.30 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.22 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.02 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.74 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx >7uwh_CIJ: title=CRYOEM STRUCTURE OF E. COLI TRANSCRIPTION-COUPLED RIBONUCLEOTIDE EXCISION REPAIR (TC-RER) COMPLEX BOUND TO RIBONUCLEOTIDE SUBSTRATE organism=? : H : ARG NH1 J0047 <- 3.44 -> DG O6 A0003 : score 5.30467 : H : ARG NH2 J0270 <- 3.40 -> DA N7 A0006 : score 1.47118 : V : ASP CB I0199 <- 3.67 -> DT C7 A0015 : score 2.77028 : x : PRO xxxx C0166 <- 3.23 -> DC xxx A0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0151 <- 3.60 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.45 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 4.24 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.22 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0446 <- 4.37 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0451 <- 3.84 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 3.35 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.27 -> DA xxx A0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0547 <- 2.96 -> DG xxx A0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx J0042 <- 3.49 -> DC xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0274 <- 4.44 -> DA xxx A0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J1170 <- 3.24 -> DT xxx A0030 : score x.xxxxx >7uwh_I:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF E. COLI TRANSCRIPTION-COUPLED RIBONUCLEOTIDE EXCISION REPAIR (TC-RER) COMPLEX BOUND TO RIBONUCLEOTIDE SUBSTRATE organism=? : V : ASP CB I0199 <- 3.67 -> DT C7 A0015 : score 2.77028 >7uxw_C: title=STRUCTURE OF ATP AND GTP BIND TO CYCLIC GMP AMP SYNTHASE (CGAS) THROUGH MG COORDINATION organism=? : x : ARG xxxx C0161 <- 3.44 -> DC xxx J0008 : score x.xxxxx >7uxy_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ISORETICULAR, INTERPENETRATING CO-CRYSTAL OF PROTEIN VARIANT REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 (L53G,Q54G,E55G) AND SYMMETRICAL EXPANDED DUPLEX (31MER) CONTAINING THE COGNATE REPE54 SEQUENCE AND AN ADDITIONAL G-C RICH SEQUENCE. organism=Escherichia coli K-12 : H : GLU OE1 C0077 <- 2.90 -> DC N4 A0022 : score 5.65259 : w : GLU OE2 C0077 <- 6.03 -> DG O6 A0021 : score 2.892 : H : LYS NZ C0080 <- 2.98 -> DG O6 B0013 : score 5.57266 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.51 -> DT O2 B0009 : score 4.47887 : H : ARG NH1 C0200 <- 3.29 -> DG O6 A0011 : score 5.48717 : H : ARG NH2 C0200 <- 3.22 -> DT O4 A0012 : score 3.25532 : H : ASP OD1 C0203 <- 3.27 -> DC N4 B0023 : score 4.84245 : H : ARG NE C0207 <- 2.99 -> DG N7 B0021 : score 4.25377 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.65 -> DG O6 B0021 : score 6.798 : H : ARG NH1 C0233 <- 2.83 -> DC O2 A0008 : score 3.6281 : H : ARG NH2 C0233 <- 2.86 -> DT O2 B0029 : score 4.18253 : x : SER xxxx C0075 <- 3.71 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 4.10 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.82 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 4.05 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 3.95 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 4.19 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.66 -> DG xxx A0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0206 <- 2.19 -> DG xxx A0013 : score x.xxxxx >7uy5_AD: title=TETRAHYMENA TELOMERASE WITH CST organism=? : H : LYS NZ D0660 <- 2.82 -> DG O6 C0019 : score 5.75765 : H : GLU OE1 D0667 <- 3.24 -> DG N2 C0019 : score 3.93095 : x : PHE xxxx A0414 <- 3.64 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0559 <- 3.67 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0563 <- 4.17 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0566 <- 4.23 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0926 <- 4.08 -> DT xxx C0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0588 <- 2.97 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0601 <- 3.32 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0603 <- 3.45 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0605 <- 4.19 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0662 <- 3.39 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0669 <- 4.36 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0673 <- 3.51 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx >7uy5_D:Nucleic_acid-binding_proteins; title=TETRAHYMENA TELOMERASE WITH CST organism=? : H : LYS NZ D0660 <- 2.82 -> DG O6 C0019 : score 5.75765 : H : GLU OE1 D0667 <- 3.24 -> DG N2 C0019 : score 3.93095 : x : ARG xxxx D0588 <- 2.97 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0601 <- 3.32 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0603 <- 3.45 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0605 <- 4.19 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0662 <- 3.39 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0669 <- 4.36 -> DG xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0673 <- 3.51 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx >7uy6_AD:Nucleic_acid-binding_proteins; title=TETRAHYMENA TELOMERASE AT 2.9 ANGSTROM RESOLUTION organism=? : H : LYS NZ D0660 <- 2.66 -> DG O6 C0049 : score 5.94263 : H : GLU OE2 D0667 <- 3.37 -> DG N2 C0049 : score 3.81889 : x : PHE xxxx A0414 <- 3.51 -> DT xxx C0056 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0559 <- 3.55 -> DT xxx C0050 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0563 <- 3.85 -> DT xxx C0050 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0926 <- 3.66 -> DT xxx C0057 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0601 <- 3.38 -> DG xxx C0048 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0603 <- 3.50 -> DG xxx C0047 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0662 <- 3.29 -> DG xxx C0049 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx 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organism=? : H : ARG NH1 C0161 <- 2.98 -> DT O2 I0012 : score 4.15138 >7uzr_C: title=STRUCTURE OF TERNARY COMPLEX OF CGAS WITH DSDNA AND BOUND 5 -PPPG(2 ,5 )PG organism=? : H : ARG NH1 C0161 <- 2.69 -> DC O2 J0008 : score 3.7303 >7v0c_C: title=STRUCTURE OF TERNARY COMPLEX OF CGAS WITH DSDNA AND BOUND 5 -PPPG(2 ,5 )PG organism=? : H : ARG NH1 C0161 <- 3.13 -> DT O2 I0012 : score 4.02219 >7v0r_C: title=STRUCTURE OF TERNARY COMPLEX OF CGAS WITH DSDNA AND BOUND 5 -PPCPG(2 ,5 )PA organism=? : H : ARG NH1 C0161 <- 2.82 -> DC O2 J0008 : score 3.6354 >7v0w_C: title=STRUCTURE OF TERNARY COMPLEX OF CGAS WITH DSDNA AND BOUND 5 -PPPG(2,5 )PA organism=? : H : ARG NH1 C0161 <- 2.63 -> DC O2 J0008 : score 3.7741 >7v59_BE:Cytidine_deaminase-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF SPYCAS9-SGRNA-DNA DIMER organism=? : H : ARG NH2 B1333 <- 2.55 -> DG N7 H0011 : score 6.70385 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.89 -> DG O6 H0011 : score 6.4812 : H : ARG NH1 B1335 <- 2.69 -> DG O6 H0012 : score 6.21717 : H : ARG NH2 B1335 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x : LEU xxxx B0921 <- 3.69 -> DA xxx H0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0961 <- 3.02 -> DG xxx H0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B1107 <- 3.02 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B1242 <- 3.26 -> DC xxx H0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0071 <- 4.50 -> DG xxx H0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0450 <- 3.71 -> DC xxx H0036 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0491 <- 4.35 -> DA xxx H0037 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0495 <- 4.04 -> DT xxx H0038 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0894 <- 4.46 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0911 <- 3.42 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0913 <- 3.32 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0914 <- 4.36 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0916 <- 3.84 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0921 <- 3.54 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0961 <- 3.06 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E1036 <- 4.46 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E1107 <- 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x.xxxxx : x : LYS xxxx E0913 <- 3.32 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0914 <- 4.36 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0916 <- 3.84 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0921 <- 3.54 -> DA xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0961 <- 3.06 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E1036 <- 4.46 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E1107 <- 3.08 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E1108 <- 4.45 -> DG xxx H0030 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E1219 <- 4.44 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E1242 <- 3.26 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx >7v5n_AB:Immunoglobulin; title=CRYSTAL STRUCTURE OF FAB FRAGMENT OF BEVACIZUMAB BOUND TO DNA APTAMER organism=HOMO SAPIENS : w : THR OG1 B0028 <- 5.25 -> DG N7 D0008 : score 3.422 : w : ASN ND2 B0031 <- 5.93 -> DG O6 D0008 : score 2.971 : w : TYR OH B0032 <- 5.79 -> DG O6 D0008 : score 3.344 : H : HIS NE2 B0101 <- 2.74 -> DG O6 D0007 : score 8.04929 : x : TYR xxxx B0102 <- 3.65 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xxxx D0014 <- 3.60 -> DC xxx G0017 : score x.xxxxx >7v6w_FKL:YefM-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HETEROHEXAMERIC SA2YOEB-SA2YEFM COMPLEX BOUND TO 26BP-DNA organism=? : H : ARG NH1 K0010 <- 2.89 -> DG N7 O0018 : score 5.9411 : H : ARG NH2 K0010 <- 2.72 -> DG O6 O0018 : score 6.7056 : H : ARG NH1 L0010 <- 2.97 -> DG N7 P0006 : score 5.8443 : H : ARG NH2 L0010 <- 2.98 -> DG O6 P0006 : score 6.3624 : V : TYR CG F0053 <- 3.68 -> DT C7 O0001 : score 3.85378 : x : THR xxxx L0007 <- 3.30 -> DG xxx P0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0011 <- 4.10 -> DT xxx O0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0014 <- 3.61 -> DC xxx O0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx K0007 <- 3.34 -> DG xxx O0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx K0014 <- 3.31 -> DC xxx P0005 : score x.xxxxx >7v6w_I:YefM-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HETEROHEXAMERIC SA2YOEB-SA2YEFM COMPLEX BOUND TO 26BP-DNA organism=? : H : ARG NH1 I0010 <- 2.93 -> DG N7 P0018 : score 5.8927 : H : ARG NH2 I0010 <- 2.82 -> DG O6 P0018 : score 6.5736 : w : 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LYS xxxx J0011 <- 4.08 -> DT xxx P0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0014 <- 3.27 -> DA xxx P0017 : score x.xxxxx >7v90_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=TELOMERIC MONONUCLEOSOME organism=? : H : HIS NE2 A0039 <- 2.77 -> DT O2 I0069 : score 5.27118 : H : ARG NH1 C0011 <- 2.92 -> DA N3 J0044 : score 3.59368 : H : ARG NH1 G0011 <- 3.00 -> DC O2 J-042 : score 3.504 : x : ARG xxxx A0040 <- 4.21 -> DA xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.37 -> DA xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0026 <- 4.29 -> DG xxx I0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.05 -> DG xxx I-048 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.24 -> DT xxx I-069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.41 -> DG xxx I0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.38 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.04 -> DG xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0026 <- 3.71 -> DG xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.93 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >7v90_D:Histone-fold; title=TELOMERIC MONONUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx D0026 <- 4.29 -> DG xxx I0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.05 -> DG xxx I-048 : score x.xxxxx >7v94_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE CAS12C2-SGRNA-TARGET DNA TERNARY COMPLEX organism=UNCULTURED ARCHAEON : H : ARG NH2 A0137 <- 3.35 -> DT O2 D0007 : score 3.76767 : H : ARG NH1 A0351 <- 2.99 -> DT O4 D0007 : score 3.14377 : x : ASN xxxx A0289 <- 3.22 -> DC xxx C0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0291 <- 3.62 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0294 <- 3.34 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >7v96_Q:Histone-fold; title=TELOMERIC DINUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx Q0011 <- 3.48 -> DG xxx I0248 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0077 <- 4.49 -> DT xxx I0262 : score x.xxxxx >7v99_A:DNA/RNA_polymerases; title=CATALYTIC CORE OF HUMAN TELOMERASE HOLOENZYME organism=HOMO SAPIENS : x : ARG xxxx A0756 <- 4.16 -> DT xxx S0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0980 <- 3.79 -> DA xxx S0021 : score x.xxxxx >7v9g_D: title=NATIVE BEN4 DOMAIN OF PROTEIN BEND3 WITH DNA organism=Mus musculus : H : GLU OE2 D0804 <- 2.57 -> DC N4 B0007 : score 5.50759 : H : ARG NE D0807 <- 3.12 -> DG N7 C0008 : score 4.1388 : H : ARG NH2 D0807 <- 2.79 -> DG O6 C0008 : score 6.6132 : H : LYS NZ D0812 <- 3.06 -> DG N7 C0011 : score 5.10583 : H : LYS NZ D0812 <- 2.54 -> DG O6 C0012 : score 6.08137 : x : ARG xxxx D0808 <- 3.72 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0809 <- 3.62 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >7v9i_A: title=THE MONOMER MUTANT OF BEN4 DOMAIN OF PROTEIN BEND3 WITH DNA organism=Mus musculus : H : GLU OE2 A0804 <- 2.49 -> DC N4 B0007 : score 5.59184 : H : ARG NE A0807 <- 3.02 -> DG N7 C0008 : score 4.22724 : H : ARG NH2 A0807 <- 2.83 -> DG O6 C0008 : score 6.5604 : H : LYS NZ A0812 <- 2.88 -> DG O6 C0012 : score 5.68828 : x : ARG xxxx A0808 <- 4.03 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0809 <- 3.98 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >7v9j_C:Histone-fold; title=TELOMERIC TRINUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx C0011 <- 3.51 -> DG xxx I0157 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.31 -> DT xxx J0238 : score x.xxxxx >7v9k_G:Histone-fold; title=TELOMERIC TETRANUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx G0011 <- 3.51 -> DG xxx I0163 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0124 <- 3.21 -> DG xxx I0207 : score x.xxxxx >7v9s_Z:Histone-fold; title=TELOMERIC TRINUCLEOSOME IN OPEN STATE organism=? : x : ARG xxxx Z0030 <- 3.11 -> DG xxx I0122 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0083 <- 4.21 -> DA xxx J0287 : score x.xxxxx >7v9u_AB:DNA/RNA_polymerases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF E.COLI RETRON-EC86 (RT-MSDNA-RNA) AT 3.2 ANGSTROM organism=? : H : TYR OH B0195 <- 3.33 -> DA N3 C0084 : score 3.71125 >7v9u_B:DNA/RNA_polymerases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF E.COLI RETRON-EC86 (RT-MSDNA-RNA) AT 3.2 ANGSTROM organism=? : H : TYR OH B0195 <- 3.33 -> DA N3 C0084 : score 3.71125 >7v9x_AB:DNA/RNA_polymerases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF E.COLI RETRON-EC86 IN COMPLEX WITH ITS EFFECTOR AT 2.8 ANGSTROM organism=? : H : LYS NZ A0176 <- 3.36 -> DA N3 D0004 : score 2.46591 : H : ARG NE A0180 <- 2.88 -> DC O2 D0003 : score 2.61643 : H : ARG NH2 A0180 <- 3.32 -> DC N3 D0003 : score 2.05276 : H : TYR OH A0195 <- 3.22 -> DA N3 D0084 : score 3.80257 >7vba_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=STRUCTURE OF THE PRE STATE HUMAN RNA POLYMERASE I ELONGATION COMPLEX organism=? : x : LYS xxxx A0197 <- 4.21 -> DT xxx U0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1660 <- 3.60 -> DT xxx U0004 : score x.xxxxx >7vba_AB: title=STRUCTURE OF THE PRE STATE HUMAN RNA POLYMERASE I ELONGATION COMPLEX organism=? : x : LYS xxxx A0197 <- 4.21 -> DT xxx U0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1660 <- 3.60 -> DT xxx U0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0482 <- 2.95 -> DC xxx U0001 : score x.xxxxx >7vbb_AB: title=STRUCTURE OF THE POST STATE HUMAN RNA POLYMERASE I ELONGATION COMPLEX organism=? : x : LYS xxxx A0197 <- 4.23 -> DT xxx U0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1659 <- 4.26 -> DG xxx U0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0482 <- 2.91 -> DC xxx U0001 : score x.xxxxx >7vbc_AB: title=BACK TRACK STATE OF HUMAN RNA POLYMERASE I ELONGATION COMPLEX organism=? : x : LYS xxxx A0197 <- 4.00 -> DT xxx U0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0423 <- 4.15 -> DT xxx T0000 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0987 <- 4.45 -> DT xxx T0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1659 <- 3.72 -> DC xxx T-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0482 <- 3.97 -> DG xxx U0001 : score x.xxxxx >7vbc_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=BACK TRACK STATE OF HUMAN RNA POLYMERASE I ELONGATION COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx B0482 <- 3.97 -> DG xxx U0001 : score x.xxxxx >7vbm_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=THE MOUSE NUCLEOSOME STRUCTURE CONTAINING H3MM18 AIDED BY PL2-6 SCFV organism=MUS MUSCULUS : x : ARG xxxx D0033 <- 3.32 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.48 -> DC xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.46 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx >7ve5_AB:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=C-TERMINAL DOMAIN OF VRAR organism=Staphylococcus aureus : H : LYS NZ A0180 <- 3.07 -> DG N7 D0016 : score 5.09506 : H : LYS NZ A0180 <- 2.75 -> DG O6 D0016 : score 5.83858 : w : LYS NZ A0180 <- 5.57 -> DA N7 D0015 : score 1.655 : H : LYS NZ B0180 <- 3.06 -> DG O6 C0009 : score 5.48017 : w : LYS NZ B0180 <- 5.52 -> DA N7 C0008 : score 1.655 : H : THR OG1 B0181 <- 2.97 -> DC N4 D0007 : score 3.8962 : w : THR OG1 B0181 <- 5.67 -> DA N6 D0008 : score 3.251 : x : LYS xxxx A0177 <- 3.82 -> DA xxx C0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0181 <- 4.38 -> DA xxx C0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0184 <- 3.50 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0175 <- 4.46 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0177 <- 3.36 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0178 <- 3.19 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0182 <- 3.71 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0184 <- 3.57 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >7ve5_B:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=C-TERMINAL DOMAIN OF VRAR organism=Staphylococcus aureus : H : LYS NZ B0180 <- 3.06 -> DG O6 C0009 : score 5.48017 : w : LYS NZ B0180 <- 5.52 -> DA N7 C0008 : score 1.655 : H : THR OG1 B0181 <- 2.97 -> DC N4 D0007 : score 3.8962 : w : THR OG1 B0181 <- 5.67 -> DA N6 D0008 : score 3.251 : x : THR xxxx B0175 <- 4.46 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0177 <- 3.36 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0178 <- 3.19 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0182 <- 3.71 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0184 <- 3.57 -> DT xxx C0010 : score x.xxxxx >7vjm_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=ACA1 IN COMPLEX WITH 19BP PALINDROMIC DNA SUBSTRATE organism=Pseudomonas phage JBD30 : H : ARG NE A0044 <- 3.06 -> DG O6 C0005 : score 3.73609 : H : ARG NH1 A0044 <- 3.08 -> DG N7 C0005 : score 5.7112 : H : TYR OH A0048 <- 3.11 -> DC N4 C0006 : score 3.95283 : H : ARG NH2 A0059 <- 2.59 -> DG N7 D0032 : score 6.65277 : V : VAL CB A0045 <- 3.88 -> DT C7 D0033 : score 3.84964 : x : ARG xxxx A0033 <- 3.28 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 4.17 -> DT xxx D0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0047 <- 3.04 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx >7vjm_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=ACA1 IN COMPLEX WITH 19BP PALINDROMIC DNA SUBSTRATE organism=Pseudomonas phage JBD30 : H : ARG NE A0044 <- 3.06 -> DG O6 C0005 : score 3.73609 : H : ARG NH1 A0044 <- 3.08 -> DG N7 C0005 : score 5.7112 : H : TYR OH A0048 <- 3.11 -> DC N4 C0006 : score 3.95283 : H : ARG NH2 A0059 <- 2.59 -> DG N7 D0032 : score 6.65277 : H : ARG NH1 B0044 <- 3.10 -> DG N7 D0025 : score 5.687 : H : ARG NE B0047 <- 3.26 -> DG N7 D0024 : score 4.01499 : H : ARG NH2 B0047 <- 2.71 -> DG O6 D0024 : score 6.7188 : H : TYR OH B0048 <- 3.28 -> DC N4 D0026 : score 3.80955 : H : ARG NH2 B0059 <- 2.54 -> DG N7 C0012 : score 6.71662 : V : VAL CB A0045 <- 3.88 -> DT C7 D0033 : score 3.84964 : V : VAL CB B0045 <- 3.68 -> DT C7 C0013 : score 4.04605 : x : SER xxxx B0042 <- 4.05 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0033 <- 3.28 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0042 <- 4.17 -> DT xxx D0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0047 <- 3.04 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx >7vjq_A:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PECTOBACTERIUM PHAGE ZF40 APO-ACA2 COMPLEXED WITH 26BP DNA SUBSTRATE organism=Pectobacterium phage ZF40 : H : ARG NE A0030 <- 2.79 -> DG O6 C0019 : score 3.94891 : H : ARG NH2 A0030 <- 2.97 -> DG N7 C0019 : score 6.16754 : H : TYR OH A0034 <- 3.19 -> DA N6 C0020 : score 4.30621 : H : ARG NH1 A0039 <- 2.77 -> DG N7 D0007 : score 6.0863 : H : ARG NH2 A0039 <- 2.95 -> DG O6 D0007 : score 6.402 : x : SER xxxx A0028 <- 3.74 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0031 <- 3.27 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0033 <- 3.39 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx >7vjq_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=PECTOBACTERIUM PHAGE ZF40 APO-ACA2 COMPLEXED WITH 26BP DNA SUBSTRATE organism=Pectobacterium phage ZF40 : H : ARG NE A0030 <- 2.79 -> DG O6 C0019 : score 3.94891 : H : ARG NH2 A0030 <- 2.97 -> DG N7 C0019 : score 6.16754 : H : TYR OH A0034 <- 3.19 -> DA N6 C0020 : score 4.30621 : H : ARG NH1 A0039 <- 2.77 -> DG N7 D0007 : score 6.0863 : H : ARG NH2 A0039 <- 2.95 -> DG O6 D0007 : score 6.402 : H : ARG NE B0030 <- 2.88 -> DG O6 D0019 : score 3.87797 : H : ARG NH2 B0030 <- 2.92 -> DG N7 D0019 : score 6.23138 : H : TYR OH B0034 <- 3.15 -> DA N6 D0020 : score 4.34358 : H : ARG NH1 B0039 <- 2.80 -> DG N7 C0007 : score 6.05 : H : ARG NH2 B0039 <- 3.02 -> DG O6 C0007 : score 6.3096 : x : SER xxxx A0028 <- 3.74 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0031 <- 3.27 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0033 <- 3.39 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0028 <- 3.67 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0031 <- 3.27 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0033 <- 3.32 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx >7vn2_C:Periplasmic_binding_protein-like_II; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MBP-FUSED BIL1/BZR1 (21-90) IN COMPLEX WITH DOUBLE-STRANDED DNA CONTANING ATCACGTGAT organism=? : H : GLU OE2 C0037 <- 2.86 -> DC N4 G0001 : score 5.2022 : x : GLU xxxx C0029 <- 3.77 -> DT xxx G-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0036 <- 3.66 -> DT xxx G0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0040 <- 3.82 -> DT xxx G0000 : score x.xxxxx >7vn3_AB:Periplasmic_binding_protein-like_II; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MBP-FUSED BIL1/BZR1 (21-90) IN COMPLEX WITH DOUBLE-STRANDED DNA CONTANING CACACGTGTG organism=? : H : ARG NH1 B0041 <- 3.39 -> DG N7 F0004 : score 5.3361 : x : ASN xxxx A0033 <- 4.19 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0034 <- 4.35 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0037 <- 3.48 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 4.35 -> DA xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0041 <- 3.40 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0033 <- 4.09 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0037 <- 3.59 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0040 <- 4.24 -> DA xxx E0000 : score x.xxxxx >7vn3_C:Periplasmic_binding_protein-like_II; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MBP-FUSED BIL1/BZR1 (21-90) IN COMPLEX WITH DOUBLE-STRANDED DNA CONTANING CACACGTGTG organism=? : w : ARG NH2 C0023 <- 5.73 -> DT O4 G-002 : score 2.366 : w : GLU OE1 C0029 <- 5.95 -> DC N4 G-001 : score 3.528 : w : ASN ND2 C0033 <- 6.09 -> DC N4 G-001 : score 2.395 : w : GLU OE1 C0037 <- 5.76 -> DA N6 G0002 : score 2.939 : H : ARG NH1 C0041 <- 3.17 -> DG N7 H0004 : score 5.6023 : w : ARG NH1 C0041 <- 5.66 -> DG O6 H0004 : score 2.756 : x : ARG xxxx C0036 <- 3.71 -> DC xxx G-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0040 <- 3.75 -> DA xxx G0000 : score x.xxxxx >7vn3_CD:Periplasmic_binding_protein-like_II; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MBP-FUSED BIL1/BZR1 (21-90) IN COMPLEX WITH DOUBLE-STRANDED DNA CONTANING CACACGTGTG organism=? : w : ARG NH2 C0023 <- 5.73 -> DT O4 G-002 : score 2.366 : w : GLU OE1 C0029 <- 5.95 -> DC N4 G-001 : score 3.528 : w : ASN ND2 C0033 <- 6.09 -> DC N4 G-001 : score 2.395 : w : GLU OE1 C0037 <- 5.76 -> DA N6 G0002 : score 2.939 : H : ARG NH1 C0041 <- 3.17 -> DG N7 H0004 : score 5.6023 : w : ARG NH1 D0036 <- 6.10 -> DA N7 H0000 : score 0.388 : w : GLU OE2 D0037 <- 5.70 -> DA N6 H0002 : score 2.785 : H : ARG NH1 D0041 <- 3.13 -> DG N7 G0004 : score 5.6507 : w : ARG NH1 D0041 <- 5.55 -> DG O6 G0004 : score 2.756 : x : ARG xxxx C0036 <- 3.71 -> DC xxx G-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0040 <- 3.75 -> DA xxx G0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0023 <- 3.77 -> DT xxx H-002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0029 <- 3.87 -> DT xxx H-002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0033 <- 4.06 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0040 <- 3.84 -> DA xxx H0000 : score x.xxxxx >7vn4_AB:Periplasmic_binding_protein-like_II; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MBP-FUSED BIL1/BZR1 (21-90) IN COMPLEX WITH DOUBLE-STRANDED DNA CONTANING TCCACGTGGA organism=? : H : GLU OE2 A0037 <- 2.85 -> DC N4 F0001 : score 5.21273 : H : GLU OE2 B0037 <- 2.92 -> DC N4 E0001 : score 5.13902 : H : ARG NH1 B0041 <- 3.44 -> DG N7 F0004 : score 5.2756 : V : ASN CB A0033 <- 3.83 -> DT C7 E0005 : score 1.92291 : x : ARG xxxx A0040 <- 4.46 -> DC xxx F0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0041 <- 3.23 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0033 <- 4.45 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0040 <- 4.36 -> DC xxx E0000 : score x.xxxxx >7vn4_C:Periplasmic_binding_protein-like_II; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MBP-FUSED BIL1/BZR1 (21-90) IN COMPLEX WITH DOUBLE-STRANDED DNA CONTANING TCCACGTGGA organism=? : w : ARG NH1 C0036 <- 6.31 -> DC N4 G0000 : score 1.892 : w : GLU OE1 C0037 <- 5.72 -> DA N6 G0002 : score 2.939 : w : GLU OE2 C0037 <- 6.04 -> DC N4 G0000 : score 3.597 : H : ARG NH1 C0041 <- 3.03 -> DG N7 H0004 : score 5.7717 : w : ARG NH1 C0041 <- 5.52 -> DG O6 H0004 : score 2.756 : x : ARG xxxx C0023 <- 4.05 -> DT xxx G-003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0033 <- 3.81 -> DT xxx G-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0040 <- 3.62 -> DC xxx G0000 : score x.xxxxx >7vn4_CD:Periplasmic_binding_protein-like_II; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MBP-FUSED BIL1/BZR1 (21-90) IN COMPLEX WITH DOUBLE-STRANDED DNA CONTANING TCCACGTGGA organism=? : w : ARG NH1 C0036 <- 6.31 -> DC N4 G0000 : score 1.892 : w : GLU OE1 C0037 <- 5.72 -> DA N6 G0002 : score 2.939 : w : GLU OE2 C0037 <- 6.04 -> DC N4 G0000 : score 3.597 : H : ARG NH1 C0041 <- 3.03 -> DG N7 H0004 : score 5.7717 : H : GLU OE1 D0037 <- 3.02 -> DC N4 H0001 : score 5.51416 : w : GLU OE2 D0037 <- 5.76 -> DA N6 H0002 : score 2.785 : H : ARG NH1 D0041 <- 3.05 -> DG N7 G0004 : score 5.7475 : w : ARG NH1 D0041 <- 5.41 -> DG O6 G0004 : score 2.756 : x : ARG xxxx C0023 <- 4.05 -> DT 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organism=? : H : ARG NH1 B0041 <- 3.37 -> DG N7 F0004 : score 5.3603 : V : ASN CB B0033 <- 3.69 -> DT C7 F0005 : score 1.99072 : x : ARG xxxx B0036 <- 3.32 -> DT xxx E0000 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0037 <- 3.28 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0040 <- 4.35 -> DT xxx E0000 : score x.xxxxx >7vn8_CD:Periplasmic_binding_protein-like_II; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MBP-FUSED BIL1/BZR1 (21-90) IN COMPLEX WITH DOUBLE-STRANDED DNA CONTANING GTCACGTGAC organism=? : w : ASN OD1 C0033 <- 5.92 -> DG N7 G-001 : score 1.873 : w : GLU OE1 C0037 <- 5.71 -> DA N6 G0002 : score 2.939 : H : ARG NH1 C0041 <- 3.12 -> DG N7 H0004 : score 5.6628 : H : GLU OE1 D0037 <- 2.93 -> DC N4 H0001 : score 5.61798 : w : GLU OE2 D0037 <- 5.53 -> DA N6 H0002 : score 2.785 : H : ARG NH1 D0041 <- 3.15 -> DG N7 G0004 : score 5.6265 : w : ARG NH1 D0041 <- 5.30 -> DG O6 G0004 : score 2.756 : x : ARG xxxx C0023 <- 3.38 -> DT xxx G-003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0029 <- 3.74 -> DT xxx G-002 : score 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>7vwz_CDFGI:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators;Translation_proteins_SH3-like_domain;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ROB-DEPENDENT TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX IN A UNIQUE CONFORMATION organism=ESCHERICHIA COLI K-12 : H : ARG NH2 D0322 <- 3.06 -> DT O4 20021 : score 3.36905 : H : SER OG F0428 <- 2.65 -> DA N7 10069 : score 4.59803 : H : GLN OE1 F0437 <- 2.91 -> DC N4 10064 : 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PARTICLE COMPOSED OF THE WIDOM 601L DNA SEQUENCE organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.84 -> DT O2 J0009 : score 4.19947 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.84 -> DT O2 I0009 : score 4.19947 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.55 -> DT xxx I0069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.43 -> DG xxx I0068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.74 -> DG xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 2.17 -> DT xxx I-042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.29 -> DG xxx J0038 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 3.54 -> DT xxx J0069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.43 -> DG xxx J0068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.74 -> DG xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0011 <- 2.17 -> DT xxx J-042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.29 -> DG xxx I0038 : score x.xxxxx >7vz4_G:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE COMPOSED OF THE WIDOM 601L DNA SEQUENCE organism=? : x : ARG xxxx G0011 <- 2.17 -> DT xxx J-042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.29 -> DG xxx I0038 : score x.xxxxx >7w1m_ABDEH:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Smc_hinge_domain;ARM_repeat;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN COHESIN-CTCF-DNA COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 H0339 <- 3.38 -> DG O6 G0037 : score 5.37767 : H : ARG NH2 H0339 <- 2.36 -> DG N7 G0037 : score 6.94646 : H : GLU OE1 H0362 <- 3.12 -> DC N4 G0036 : score 5.3988 : H : LYS NZ H0365 <- 2.37 -> DG O6 G0035 : score 6.27792 : H : LYS NZ H0393 <- 2.36 -> DG O6 G0032 : score 6.28948 : H : ASP OD1 H0451 <- 2.58 -> DC N4 G0026 : score 5.58005 : H : ARG NH2 H0508 <- 2.54 -> DG N7 F0103 : score 6.71662 : H : HIS NE2 H0509 <- 2.73 -> DG O6 G0014 : score 8.0652 : H : GLN NE2 H0534 <- 3.00 -> DG O6 G0012 : score 5.57292 : V : THR CG2 H0333 <- 3.73 -> DT C7 G0039 : score 4.31107 : V : VAL CG1 H0454 <- 3.72 -> DT C7 F0092 : score 6.18172 : x : ARG xxxx H0277 <- 4.24 -> DG xxx G0045 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0279 <- 3.89 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x.xxxxx : x : ARG xxxx H0457 <- 3.33 -> DT xxx F0092 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0490 <- 3.19 -> DG xxx F0100 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx H0504 <- 3.95 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0506 <- 3.05 -> DG xxx F0104 : score x.xxxxx : x : MET xxxx H0512 <- 3.22 -> DG xxx G0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0516 <- 4.49 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0533 <- 3.56 -> DA xxx G0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0535 <- 3.26 -> DC xxx F0105 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0537 <- 3.33 -> DC xxx F0107 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0566 <- 3.69 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx >7w1m_H:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN COHESIN-CTCF-DNA COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 H0339 <- 3.38 -> DG O6 G0037 : score 5.37767 : H : ARG NH2 H0339 <- 2.36 -> DG N7 G0037 : score 6.94646 : H : GLU OE1 H0362 <- 3.12 -> DC N4 G0036 : score 5.3988 : H : LYS NZ H0365 <- 2.37 -> DG O6 G0035 : score 6.27792 : H : LYS NZ H0393 <- 2.36 -> DG O6 G0032 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4.13 -> DT xxx S-043 : score x.xxxxx >7w27_C: title=CRYSTAL STRUCTURE OF BEND3-BEN4-DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : GLU OE2 C0807 <- 2.86 -> DC N4 A0720 : score 5.2022 : w : GLU OE2 C0807 <- 5.56 -> DT O4 B0008 : score 2.279 : H : ARG NE C0810 <- 2.86 -> DG N7 B0007 : score 4.36873 : H : ARG NH2 C0810 <- 2.83 -> DG O6 B0007 : score 6.5604 : H : LYS NZ C0815 <- 2.90 -> DG N7 B0010 : score 5.27818 : H : LYS NZ C0815 <- 2.99 -> DG O6 B0010 : score 5.5611 : H : LYS NZ C0815 <- 2.94 -> DG O6 B0011 : score 5.61891 : x : ARG xxxx C0811 <- 3.84 -> DC xxx A0719 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0812 <- 3.56 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >7w5p_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DIOXYGENASE CCTET FROM COPRINOPSIS CINEREAIN BOUND TO 12BP N6-METHYLDEOXYADENINE (6MA) CONTAINING DUPLEX DNA organism=COPRINOPSIS CINEREA : H : ARG NH2 A0092 <- 3.07 -> DT O2 C0010 : score 4.00473 : w : ARG NH1 A0092 <- 5.33 -> DA N3 B0003 : score 2.585 : H : HIS NE2 A0234 <- 2.95 -> DC O2 C0006 : score 5.12856 : H : HIS NE2 A0234 <- 2.95 -> DC O2 C0006 : score 5.12856 : H : HIS NE2 A0234 <- 2.98 -> DG N2 B0007 : score 3.59399 : x : PRO xxxx A0231 <- 3.77 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0232 <- 3.27 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >7w5p_AH: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DIOXYGENASE CCTET FROM COPRINOPSIS CINEREAIN BOUND TO 12BP N6-METHYLDEOXYADENINE (6MA) CONTAINING DUPLEX DNA organism=COPRINOPSIS CINEREA : H : ARG NH2 A0092 <- 3.07 -> DT O2 C0010 : score 4.00473 : w : ARG NH1 A0092 <- 5.33 -> DA N3 B0003 : score 2.585 : H : HIS NE2 A0234 <- 2.95 -> DC O2 C0006 : score 5.12856 : H : HIS NE2 A0234 <- 2.95 -> DC O2 C0006 : score 5.12856 : H : HIS NE2 A0234 <- 2.98 -> DG N2 B0007 : score 3.59399 : H : ASN ND2 H0054 <- 2.98 -> DC O2 B0001 : score 4.31823 : x : PRO xxxx A0231 <- 3.77 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0232 <- 3.27 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0018 <- 3.37 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0022 <- 3.30 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0050 <- 3.81 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0260 <- 3.42 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0261 <- 4.01 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0309 <- 3.40 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx >7w5p_DG: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DIOXYGENASE CCTET FROM COPRINOPSIS CINEREAIN BOUND TO 12BP N6-METHYLDEOXYADENINE (6MA) CONTAINING DUPLEX DNA organism=COPRINOPSIS CINEREA : H : HIS NE2 D0234 <- 2.96 -> DC O2 F0006 : score 5.11799 : H : HIS NE2 D0234 <- 2.96 -> DC O2 F0006 : score 5.11799 : H : HIS NE2 D0234 <- 3.00 -> DG N2 E0007 : score 3.57908 : H : ASN ND2 G0054 <- 2.90 -> DC O2 E0001 : score 4.3899 : x : PRO xxxx D0231 <- 3.67 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0232 <- 3.30 -> DC xxx E0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0018 <- 3.31 -> DG xxx F0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0022 <- 3.26 -> DG xxx F0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0050 <- 3.82 -> DG xxx F0012 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0260 <- 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ARG NE C0175 <- 2.39 -> DT O4 10077 : score 2.01141 : H : GLU OE1 C0374 <- 2.40 -> DG N2 10071 : score 4.65508 : H : SER OG D0319 <- 2.99 -> DA N6 20022 : score 3.16473 : H : ASN ND2 D0320 <- 2.46 -> DT O4 20021 : score 5.64397 : H : SER OG F0428 <- 2.96 -> DT O4 10068 : score 3.44136 : H : THR OG1 F0432 <- 3.26 -> DA N7 10067 : score 3.10001 : H : GLN NE2 K0086 <- 2.40 -> DT O4 20061 : score 5.60631 : V : ILE CG2 F0505 <- 3.78 -> DT C7 20021 : score 7.12674 : x : ARG xxxx C0151 <- 3.87 -> DT xxx 10077 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.54 -> DT xxx 10077 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0185 <- 2.99 -> DT xxx 10077 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 2.91 -> DG xxx 10076 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 3.39 -> DT xxx 10077 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0367 <- 3.71 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.16 -> DG xxx 10071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0394 <- 3.40 -> DA xxx 10072 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0473 <- 3.18 -> DA xxx 10072 : 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organism=? : H : ARG NH2 A0594 <- 2.40 -> DC O2 10034 : score 3.99462 : x : ASN xxxx A0623 <- 4.08 -> DC xxx 10034 : score x.xxxxx >7w5y_ACDFK:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Translation_proteins_SH3-like_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=CRYO-EM STRUCTURE OF SOXS-DEPENDENT TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX WITH FPR PROMOTER DNA organism=? : H : ARG NH2 A0594 <- 2.40 -> DC O2 10034 : score 3.99462 : H : GLU OE1 C0374 <- 2.60 -> DG N2 10071 : score 4.48267 : H : TRP NE1 K0036 <- 2.41 -> DT O4 10017 : score 5.18269 : V : ASN CB F0464 <- 3.58 -> DT C7 20024 : score 2.04399 : V : THR CG2 K0087 <- 3.79 -> DT C7 20078 : score 4.24752 : V : GLN CG K0086 <- 3.89 -> DT C7 10007 : score 3.18214 : V : GLN CB K0039 <- 3.73 -> DT C7 10017 : 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score x.xxxxx >7w7l_AB:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=STRUCTURE OF NF-KB P52 HOMODIMER BOUND TO 13-MER A/T-CENTRIC P- SELECTIN KB DNA FRAGMENT organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0052 <- 2.73 -> DG O6 D0004 : score 6.1685 : H : ARG NH2 A0052 <- 3.04 -> DG O6 D0004 : score 6.2832 : H : ARG NH1 A0054 <- 2.82 -> DG O6 D0003 : score 6.059 : H : ARG NH2 A0054 <- 2.75 -> DG N7 D0003 : score 6.44846 : H : GLU OE1 A0058 <- 2.93 -> DC N4 C0010 : score 5.61798 : H : HIS ND1 A0062 <- 2.74 -> DG N7 D0002 : score 6.29775 : H : LYS NZ A0221 <- 2.65 -> DG O6 D0005 : score 5.95419 : H : ARG NH1 B0052 <- 2.71 -> DG O6 C0004 : score 6.19283 : H : ARG NH2 B0052 <- 3.22 -> DG O6 C0004 : score 6.0456 : H : ARG NH1 B0054 <- 2.73 -> DG O6 C0003 : score 6.1685 : H : ARG NH2 B0054 <- 2.69 -> DG N7 C0003 : score 6.52508 : H : GLU OE1 B0058 <- 3.04 -> DC N4 D0010 : score 5.49109 : H : HIS ND1 B0062 <- 2.67 -> DG N7 C0002 : score 6.38488 : H : LYS NZ B0221 <- 2.93 -> DG O6 C0005 : score 5.63047 : x : TYR xxxx A0055 <- 3.68 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0055 <- 3.69 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx >7w9v_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH P300 ACETYLTRANSFERASE CATALYTIC CORE (COMPLEX I) organism=? : x : ARG xxxx A0040 <- 3.37 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.16 -> DG xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.34 -> DT xxx I-047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.22 -> DG xxx J-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.27 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 4.02 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >7w9v_H:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH P300 ACETYLTRANSFERASE CATALYTIC CORE (COMPLEX I) organism=? : x : ARG xxxx H0033 <- 4.02 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >7way_A: title=PLMCASX-SGRNAV1-DSDNA TERNARY COMPLEX AT NTS LOADING STATE organism=PLANCTOMYCETES BACTERIUM : H : LYS NZ A0227 <- 2.30 -> DG O6 B0022 : score 6.35885 : H : LYS NZ A0227 <- 2.93 -> DT O4 C0008 : score 3.49391 : H : GLN NE2 A0512 <- 2.50 -> DA N7 B0023 : score 6.45513 : H : TYR OH A0513 <- 2.68 -> DG N7 B0022 : score 4.39007 : x : ARG xxxx A0192 <- 3.38 -> DT xxx B0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0197 <- 3.80 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0231 <- 3.89 -> DT xxx B0021 : score x.xxxxx >7waz_A: title=PLMCASX-SGRNAV1-DSDNA TERNARY COMPLEX AT TS LOADING STATE organism=PLANCTOMYCETES BACTERIUM : H : LYS NZ A0227 <- 2.38 -> DG O6 B0022 : score 6.26635 : V : ASP CG A0231 <- 3.78 -> DT C7 B0021 : score 2.69649 : x : ARG xxxx A0192 <- 3.17 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0197 <- 3.17 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0507 <- 4.05 -> DT xxx B0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0512 <- 3.08 -> DG xxx B0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0513 <- 3.35 -> DT xxx B0021 : score x.xxxxx >7wb0_A: title=PLMCASX-SGRNAV1-DSDNA TERNARY COMPLEX AT NTS LOADING STATE WITH FLEXIBLE H2 DOMAIN organism=PLANCTOMYCETES BACTERIUM : H : LYS NZ A0227 <- 2.25 -> DG O6 B0022 : score 6.41665 : H : TYR OH A0513 <- 2.28 -> DG N7 B0022 : score 4.73305 : x : ARG xxxx A0192 <- 3.33 -> DT xxx B0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0197 <- 3.41 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0231 <- 4.19 -> DT xxx B0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0512 <- 3.31 -> DA xxx B0023 : score x.xxxxx >7wb1_A: title=PLMCASX-SGRNAV2-DSDNA TERNARY COMPLEX AT NTS LOADING STATE organism=PLANCTOMYCETES BACTERIUM : H : LYS NZ A0227 <- 2.24 -> DG O6 B0022 : score 6.42822 : H : LYS NZ A0227 <- 3.14 -> DT O4 C0008 : score 3.34325 : H : GLN OE1 A0512 <- 2.84 -> DA N6 B0023 : score 6.00414 : H : GLN NE2 A0512 <- 2.98 -> DA N7 B0023 : score 5.87051 : H : TYR OH A0513 <- 2.35 -> DG N7 B0022 : score 4.67303 : x : ARG xxxx A0192 <- 3.05 -> DT xxx B0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0197 <- 3.92 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >7wb3_AB:NADP-binding_Rossmann-fold_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. MARITIMA REX IN TERNARY COMPLEX organism=Thermotoga maritima MSB8 : H : ARG NE A0048 <- 2.86 -> DG N7 C0005 : score 4.36873 : H : ARG NH2 A0048 <- 2.95 -> DG O6 C0005 : score 6.402 : H : LYS NZ A0049 <- 2.50 -> DG O6 C0007 : score 6.12762 : w : SER OG A0052 <- 6.17 -> DA N6 C0006 : score 2.209 : H : ARG NE B0048 <- 2.94 -> DG N7 D0005 : score 4.29798 : H : ARG NH2 B0048 <- 3.06 -> DG O6 D0005 : score 6.2568 : H : LYS NZ B0049 <- 2.65 -> DG O6 D0007 : score 5.95419 : x : SER xxxx A0045 <- 3.96 -> DC xxx D0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0053 <- 3.98 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0060 <- 2.57 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0045 <- 3.93 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0052 <- 4.16 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0060 <- 3.44 -> DA xxx C0021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0062 <- 4.47 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx >7wb3_B:NADP-binding_Rossmann-fold_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF T. MARITIMA REX IN TERNARY COMPLEX organism=Thermotoga maritima MSB8 : H : ARG NE B0048 <- 2.94 -> DG N7 D0005 : score 4.29798 : H : ARG NH2 B0048 <- 3.06 -> DG O6 D0005 : score 6.2568 : H : LYS NZ B0049 <- 2.65 -> DG O6 D0007 : score 5.95419 : x : SER xxxx B0045 <- 3.93 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0052 <- 4.16 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0060 <- 3.44 -> DA xxx C0021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0062 <- 4.47 -> DA xxx C0022 : score x.xxxxx >7wbw_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH ELF1 AND SPT4/5, STALLED AT SHL(-3.5) OF THE NUCLEOSOME organism=? : x : MET xxxx A0253 <- 3.35 -> DA xxx T0068 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0318 <- 3.11 -> DT xxx N-068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1389 <- 4.07 -> DC xxx T0056 : score x.xxxxx >7wbx_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH ELF1 AND SPT4/5, STALLED AT SHL(-3) OF THE NUCLEOSOME organism=? : H : LYS NZ A0318 <- 2.71 -> DT O4 N-065 : score 3.65175 : x : MET xxxx A0253 <- 3.90 -> DA xxx T0064 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0832 <- 3.05 -> DC xxx T0055 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0833 <- 4.16 -> DC xxx T0055 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1389 <- 3.79 -> DG xxx N-051 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1390 <- 4.42 -> DT xxx N-050 : score x.xxxxx >7wju_A:Zinc_beta-ribbon; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE ASCAS12F1-SGRNAV1-DSDNA TERNARY COMPLEX organism=? : H : SER OG A0092 <- 2.90 -> DC N4 D0025 : score 3.60213 : H : SER OG A0092 <- 2.66 -> DT O4 E0005 : score 3.65467 : x : ASN xxxx A0070 <- 4.18 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0072 <- 3.09 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0076 <- 3.54 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0088 <- 3.24 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0093 <- 3.31 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0096 <- 3.52 -> DC xxx D0025 : score x.xxxxx >7wlr_ABCDEFGH:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING KOMAGATAELLA PASTORIS HISTONES organism=? : H : ARG NH1 A0041 <- 2.82 -> DT O2 J0082 : score 4.28918 : H : ARG NH2 D0037 <- 3.11 -> DT O2 I0026 : score 3.97087 : H : ARG NH2 E0041 <- 2.96 -> DG N3 I0082 : score 3.49473 : x : HIS xxxx A0040 <- 4.08 -> DG xxx J0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0042 <- 4.46 -> DA xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0084 <- 4.08 -> DT xxx J0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.41 -> DT xxx I0111 : score x.xxxxx >7wlr_D:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING KOMAGATAELLA PASTORIS HISTONES organism=? : H : ARG NH2 D0037 <- 3.11 -> DT O2 I0026 : score 3.97087 >7wlr_E:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING KOMAGATAELLA PASTORIS HISTONES organism=? : H : ARG NH2 E0041 <- 2.96 -> DG N3 I0082 : score 3.49473 >7wlr_G:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING KOMAGATAELLA PASTORIS HISTONES organism=? : x : ARG xxxx G0042 <- 4.41 -> DT xxx I0111 : score x.xxxxx >7wnh_D:Nuclear_receptor_ligand-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NURR1 BINDING TO NBRE organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 D0281 <- 2.65 -> DC N4 O0268 : score 5.94099 : H : LYS NZ D0284 <- 3.03 -> DG O6 N0268 : score 5.51485 : H : ARG NH1 D0289 <- 2.89 -> DG N7 O0266 : score 5.9411 : x : CYS xxxx D0272 <- 3.98 -> DA xxx N0266 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0288 <- 3.29 -> DG xxx N0269 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0342 <- 3.36 -> DT xxx O0270 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0344 <- 3.43 -> DT xxx O0273 : score x.xxxxx >7wnr_BC:Ribbon-helix-helix; title=DATA-DRIVEN HADDOCK MODEL OF MYCOBACTERIAL NMAZE6-OPERATOR DNA COMPLEX organism=? : H : LYS NZ B0005 <- 3.07 -> DG O6 D0027 : score 5.46861 : H : LYS NZ C0005 <- 2.98 -> DT O4 A0006 : score 3.45804 : H : LYS NZ C0005 <- 3.18 -> DT O4 D0030 : score 3.31455 : x : ALA xxxx B0007 <- 3.46 -> DA xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0007 <- 3.41 -> DT xxx D0028 : score x.xxxxx >7wnr_C:Ribbon-helix-helix; title=DATA-DRIVEN HADDOCK MODEL OF MYCOBACTERIAL NMAZE6-OPERATOR DNA COMPLEX organism=? : H : LYS NZ C0005 <- 2.98 -> DT O4 A0006 : score 3.45804 : H : LYS NZ C0005 <- 3.18 -> DT O4 D0030 : score 3.31455 : x : ALA xxxx C0007 <- 3.41 -> DT xxx D0028 : score x.xxxxx >7wq5_A:DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ARABIDOPSIS TRANSCRIPTIONAL FACTOR WRINKLED1 WITH DSDNA organism=Arabidopsis thaliana : H : HIS NE2 A0072 <- 2.77 -> DG O6 C0010 : score 8.00157 : H : GLU OE1 A0079 <- 2.90 -> DC N4 C0009 : score 5.65259 : H : GLU OE2 A0079 <- 2.88 -> DC N4 D0015 : score 5.18114 : H : GLU OE1 A0181 <- 2.88 -> DC N4 D0006 : score 5.67566 : H : ARG NH1 A0183 <- 2.62 -> DG O6 D0007 : score 6.30233 : H : ARG NH2 A0183 <- 2.89 -> DG N7 D0007 : score 6.26969 : H : TYR OH A0192 <- 2.82 -> DA N7 C0016 : score 4.13468 : V : ALA CB A0172 <- 3.86 -> DT C7 C0017 : score 5.51499 : x : THR xxxx A0070 <- 3.52 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0074 <- 4.17 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0081 <- 3.29 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0083 <- 3.36 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0098 <- 3.01 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0100 <- 3.86 -> DC xxx D0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0174 <- 3.93 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0175 <- 3.27 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0194 <- 3.77 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx >7wwv_ABH: title=DNA BOUND-ICP1 CSY COMPLEX organism=? : H : LYS NZ A0050 <- 3.14 -> DA N3 O0035 : score 2.58809 : H : GLN NE2 A0150 <- 3.15 -> DC O2 N0016 : score 3.43623 : x : ASN xxxx A0148 <- 3.47 -> DG xxx O0033 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0151 <- 3.58 -> DG xxx O0033 : score x.xxxxx >7wwv_CDEFG: title=DNA BOUND-ICP1 CSY COMPLEX organism=? : H : SER OG E0212 <- 3.48 -> DG O6 O0010 : score 3.53465 : H : ASN ND2 F0061 <- 3.02 -> DA N3 O0016 : score 3.64015 : H : ASN ND2 G0061 <- 2.91 -> DA N3 O0022 : score 3.72392 : H : SER OG G0212 <- 3.35 -> DA N6 O0022 : score 2.92787 : x : VAL xxxx C0009 <- 4.13 -> DA xxx O0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0205 <- 3.78 -> DT xxx O0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0207 <- 4.00 -> DT xxx O0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0300 <- 3.53 -> DA xxx O0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0009 <- 3.50 -> DG xxx O0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0011 <- 4.31 -> DG xxx O0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0061 <- 3.08 -> DT xxx O0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0062 <- 4.21 -> DT xxx O0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0063 <- 3.73 -> DT xxx O0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0205 <- 3.58 -> DA xxx O0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0207 <- 4.42 -> DA xxx O0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0212 <- 3.73 -> DT xxx O0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0300 <- 3.45 -> DG xxx O0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0009 <- 4.11 -> DA xxx O0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0050 <- 4.44 -> DG xxx O0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0061 <- 3.06 -> DG xxx O0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E0062 <- 4.09 -> DA xxx O0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0063 <- 3.53 -> DG xxx O0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0205 <- 3.94 -> DA xxx O0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0207 <- 4.41 -> DG xxx O0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0300 <- 3.22 -> DT xxx O0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0009 <- 3.93 -> DA xxx O0024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0062 <- 3.51 -> DA xxx O0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0063 <- 3.64 -> DA xxx O0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0064 <- 4.49 -> DG xxx O0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0094 <- 3.55 -> DG xxx O0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0205 <- 3.88 -> DG xxx O0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0207 <- 4.08 -> DC xxx O0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0212 <- 3.47 -> DA xxx O0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0300 <- 3.44 -> DA xxx O0023 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0009 <- 4.00 -> DG xxx O0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0050 <- 4.29 -> DA xxx O0023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0062 <- 3.62 -> DG xxx O0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0063 <- 3.22 -> DA xxx O0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0094 <- 4.32 -> DG xxx O0030 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0205 <- 3.51 -> DG xxx O0026 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0300 <- 3.24 -> DT xxx O0029 : score x.xxxxx >7wwv_F: title=DNA BOUND-ICP1 CSY COMPLEX organism=? : H : ASN ND2 F0061 <- 3.02 -> DA N3 O0016 : score 3.64015 : x : VAL xxxx F0009 <- 3.93 -> DA xxx O0024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0062 <- 3.51 -> DA xxx O0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0063 <- 3.64 -> DA xxx O0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0064 <- 4.49 -> DG xxx O0015 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0094 <- 3.55 -> DG xxx O0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0205 <- 3.88 -> DG xxx O0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0207 <- 4.08 -> DC xxx O0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0212 <- 3.47 -> DA xxx O0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0300 <- 3.44 -> DA xxx O0023 : score x.xxxxx >7x1n_AD:SRF-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MEF2D-MRE COMPLEX organism=Homo sapiens : H : LYS NZ D0004 <- 3.28 -> DA N3 K0012 : score 2.51034 >7x1n_BC:SRF-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MEF2D-MRE COMPLEX organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx C0003 <- 3.75 -> DG xxx F0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0023 <- 3.69 -> DA xxx F0012 : score x.xxxxx >7x1n_C:SRF-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MEF2D-MRE COMPLEX organism=Homo sapiens : x : ARG xxxx C0003 <- 3.75 -> DG xxx F0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0023 <- 3.69 -> DA xxx F0012 : score x.xxxxx >7x3v_ABCDEFGH: title=CRYO-EM STRUCTURE OF IOC3-N2 NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx A0040 <- 3.53 -> DG xxx I0083 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.94 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.24 -> DG xxx I0122 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.78 -> DT xxx J0083 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.47 -> DT xxx I0027 : score x.xxxxx >7x3v_H:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF IOC3-N2 NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx H0030 <- 4.47 -> DT xxx I0027 : score x.xxxxx >7x3x_ABCDEFGH: title=CRYO-EM STRUCTURE OF N1 NUCLEOSOME-RA organism=? : H : ARG NH2 E0040 <- 3.42 -> DT O2 J0083 : score 3.7084 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.33 -> DG xxx J0066 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0023 <- 3.30 -> DT xxx I0088 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.19 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.25 -> DC xxx J0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.12 -> DC xxx J0111 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 2.93 -> DG xxx J0122 : score x.xxxxx >7x3x_B:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF N1 NUCLEOSOME-RA organism=? : x : ARG xxxx B0023 <- 3.30 -> DT xxx I0088 : score x.xxxxx >7x57_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN SUBNUCLEOSOME (CLOSED FORM) organism=? : x : ARG xxxx C0083 <- 3.93 -> DA xxx J0057 : score 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>7x5e_AB:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors;Leucine_zipper_domain; title=NRF2-MAFG HETERODIMER BOUND WITH CSMBE1 organism=? : H : ARG NH1 A0057 <- 3.22 -> DG N7 C0003 : score 5.5418 : H : ARG NH2 A0057 <- 2.85 -> DG O6 C0003 : score 6.534 : H : ASN OD1 A0061 <- 3.29 -> DC N4 C0004 : score 3.78262 : H : ARG NH2 A0069 <- 2.85 -> DG N7 D0008 : score 6.32077 : H : ASN OD1 B0507 <- 3.04 -> DC N4 C0010 : score 3.9923 : H : ASN ND2 B0507 <- 2.82 -> DT O4 D0005 : score 5.26348 : w : ASN ND2 B0507 <- 5.74 -> DA N7 D0004 : score 1.989 : V : ALA CB B0510 <- 3.90 -> DT C7 D0005 : score 5.459 : V : ALA CB A0065 <- 3.76 -> DT C7 D0009 : score 5.65496 : V : ALA CB B0511 <- 3.75 -> DT C7 C0009 : score 5.66896 : x : TYR xxxx A0064 <- 3.43 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0508 <- 4.28 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0514 <- 4.37 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx >7x5e_E:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors;Leucine_zipper_domain; title=NRF2-MAFG HETERODIMER BOUND WITH CSMBE1 organism=? : H : ARG NH1 E0057 <- 2.98 -> DG N7 G0003 : score 5.8322 : H : ARG NH2 E0057 <- 2.86 -> DG O6 G0003 : score 6.5208 : H : ARG NH1 E0069 <- 2.90 -> DG N7 H0008 : score 5.929 : H : ARG NH2 E0069 <- 2.66 -> DG O6 H0008 : score 6.7848 : V : ALA CB E0065 <- 3.67 -> DT C7 H0009 : score 5.78094 : x : ASN xxxx E0061 <- 3.59 -> DC xxx G0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0064 <- 3.60 -> DG xxx G0003 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx E0068 <- 4.08 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx >7x5e_EF:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors;Leucine_zipper_domain; title=NRF2-MAFG HETERODIMER BOUND WITH CSMBE1 organism=? : H : ARG NH1 E0057 <- 2.98 -> DG N7 G0003 : score 5.8322 : H : ARG NH2 E0057 <- 2.86 -> DG O6 G0003 : score 6.5208 : H : ARG NH1 E0069 <- 2.90 -> DG N7 H0008 : score 5.929 : H : ARG NH2 E0069 <- 2.66 -> DG O6 H0008 : score 6.7848 : H : ARG NH1 F0503 <- 3.24 -> DG N7 H0003 : score 5.5176 : H : ARG NH2 F0503 <- 2.81 -> DG O6 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WITH CSMBE2 organism=? : H : ARG NH1 E0057 <- 2.88 -> DG N7 G0003 : score 5.9532 : H : ARG NH2 E0057 <- 2.60 -> DG O6 G0003 : score 6.864 : w : ARG NH1 E0069 <- 6.07 -> DC N4 H0008 : score 1.892 : H : ASN OD1 F0507 <- 2.92 -> DC N4 G0010 : score 4.09294 : H : ASN ND2 F0507 <- 3.07 -> DT O4 H0005 : score 4.99925 : H : ARG NH1 F0515 <- 3.04 -> DG N7 G0008 : score 5.7596 : H : ARG NH2 F0515 <- 2.54 -> DG O6 G0008 : score 6.9432 : V : ALA CB F0511 <- 3.59 -> DT C7 G0009 : score 5.89292 : V : ALA CB E0065 <- 3.56 -> DT C7 H0009 : score 5.93491 : x : ASN xxxx E0061 <- 3.46 -> DC xxx G0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0064 <- 3.48 -> DG xxx G0003 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx E0068 <- 4.30 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0510 <- 4.08 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx F0514 <- 4.41 -> DT xxx H0005 : score x.xxxxx >7x5g_AB:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors;Leucine_zipper_domain; title=NRF2 (A510Y)-MAFG HETERODIMER BOUND WITH CSMBE2 organism=? : H : ARG NH1 A0057 <- 3.37 -> DG N7 C0003 : score 5.3603 : H : ARG NH2 A0057 <- 2.94 -> DG O6 C0003 : score 6.4152 : H : ASN OD1 A0061 <- 3.19 -> DC N4 C0004 : score 3.86649 : w : ARG NH1 A0069 <- 6.16 -> DC N4 D0008 : score 1.892 : H : ASN OD1 B0507 <- 2.97 -> DC N4 C0010 : score 4.05101 : H : ASN ND2 B0507 <- 2.68 -> DT O4 D0005 : score 5.41145 : H : ARG NH1 B0515 <- 3.30 -> DG N7 C0008 : score 5.445 : H : ARG NH2 B0515 <- 2.53 -> DG O6 C0008 : score 6.9564 : V : ALA CB A0065 <- 3.76 -> DT C7 D0009 : score 5.65496 : V : ALA CB B0511 <- 3.75 -> DT C7 C0009 : score 5.66896 : x : TYR xxxx A0064 <- 3.46 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0510 <- 3.42 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx >7x5g_E:A_DNA-binding_domain_in_eukaryotic_transcription_factors;Leucine_zipper_domain; title=NRF2 (A510Y)-MAFG HETERODIMER BOUND WITH CSMBE2 organism=? : H : ARG NH1 E0057 <- 2.85 -> DG N7 G0003 : score 5.9895 : H : ARG NH2 E0057 <- 2.44 -> DG O6 G0003 : score 7.0752 : H : ARG NH2 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TWO ZUR DIMERS organism=? : H : GLU OE2 C0452 <- 3.15 -> DG N2 O0071 : score 4.00854 : H : LYS NZ F0216 <- 2.68 -> DC O2 O0065 : score 3.01686 : H : ARG NH1 F0284 <- 2.70 -> DG O6 O0063 : score 6.205 : H : LYS NZ F0322 <- 2.49 -> DT O4 O0058 : score 3.80958 : H : THR OG1 F0339 <- 2.82 -> DA N7 P0028 : score 3.40045 : H : GLU OE1 F0484 <- 2.83 -> DC N4 P0050 : score 5.73334 : V : VAL CG2 C0385 <- 3.75 -> DT C7 P0027 : score 6.19962 : V : ARG CZ F0485 <- 3.52 -> DT C7 O0034 : score 2.28157 : V : VAL CG2 F0353 <- 3.76 -> DT C7 O0054 : score 6.18431 : V : GLN CB F0336 <- 3.82 -> DT C7 O0057 : score 1.82468 : x : ARG xxxx C0169 <- 3.36 -> DG xxx O0070 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0191 <- 4.40 -> DC xxx O0069 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0193 <- 3.15 -> DC xxx O0069 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0198 <- 3.13 -> DC xxx O0068 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0199 <- 3.23 -> DC xxx O0069 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0201 <- 3.43 -> DC xxx O0069 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0215 <- 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score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0215 <- 3.14 -> DG xxx O0064 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0219 <- 3.14 -> DG xxx O0064 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0222 <- 3.53 -> DG xxx O0063 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0224 <- 3.92 -> DG xxx O0063 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0227 <- 3.61 -> DT xxx O0062 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0228 <- 3.12 -> DT xxx O0062 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0282 <- 3.50 -> DT xxx O0062 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0285 <- 3.99 -> DT xxx O0062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0292 <- 3.51 -> DT xxx P0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0293 <- 3.38 -> DA xxx P0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0296 <- 3.99 -> DT xxx P0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0300 <- 4.34 -> DG xxx O0064 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0324 <- 3.06 -> DT xxx O0058 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0327 <- 3.76 -> DT xxx O0062 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0328 <- 3.77 -> DC xxx O0061 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0331 <- 3.46 -> DC xxx O0061 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0332 <- 3.26 -> DT xxx O0057 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0335 <- 3.60 -> DA xxx P0028 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0354 <- 4.07 -> DC xxx O0052 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0410 <- 3.38 -> DG xxx P0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0412 <- 3.31 -> DC xxx P0020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0421 <- 3.31 -> DG xxx P0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0473 <- 4.21 -> DG xxx P0047 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0482 <- 4.42 -> DT xxx O0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0483 <- 3.16 -> DG xxx P0047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0487 <- 3.17 -> DG xxx P0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0011 <- 3.83 -> DG xxx P0072 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0049 <- 3.20 -> DG xxx O0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0053 <- 3.23 -> DC xxx O0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0071 <- 3.43 -> DT xxx P0061 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0073 <- 4.35 -> DT xxx P0061 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0033 <- 3.90 -> DG xxx O0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0049 <- 3.25 -> DC xxx P0055 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0050 <- 3.51 -> DC xxx P0055 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0052 <- 3.42 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0049 <- 3.43 -> DT xxx O0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0053 <- 4.36 -> DC xxx P0060 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0011 <- 3.81 -> DT xxx P0078 : score x.xxxxx : x : THR xxxx N0049 <- 3.39 -> DC xxx O0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx N0050 <- 3.03 -> DG xxx O0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0053 <- 3.61 -> DT xxx P0073 : score x.xxxxx >7x74_H:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF STREPTOMYCES COELICOLOR TRANSCRIPTION INITIAL COMPLEX WITH TWO ZUR DIMERS organism=? : x : GLN xxxx H0033 <- 3.90 -> DG xxx O0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0049 <- 3.25 -> DC xxx P0055 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0050 <- 3.51 -> DC xxx P0055 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0052 <- 3.42 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx >7x75_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF STREPTOMYCES COELICOLOR RNAP-PROMOTER OPEN COMPLEX WITH THREE ZUR DIMERS organism=? : H : THR OG1 C0419 <- 2.75 -> DA N3 P0023 : score 1.36738 : x : ARG xxxx C0161 <- 2.77 -> DG xxx P0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0169 <- 3.25 -> DG xxx O0070 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0193 <- 3.37 -> DC xxx O0069 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0194 <- 4.36 -> DC xxx O0069 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0199 <- 3.12 -> DC xxx O0069 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0201 <- 4.30 -> DC xxx O0069 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0215 <- 3.68 -> DC xxx O0068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0293 <- 3.39 -> DT xxx O0067 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0356 <- 3.83 -> DG xxx O0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0362 <- 3.87 -> DG xxx O0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0381 <- 3.26 -> DC xxx P0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0384 <- 4.33 -> DA xxx P0027 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0388 <- 3.93 -> DA xxx P0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0407 <- 3.75 -> DC xxx P0026 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0408 <- 3.06 -> DC xxx P0026 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0411 <- 4.24 -> DT xxx P0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0414 <- 3.89 -> DT xxx P0025 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0415 <- 3.60 -> DT xxx P0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0423 <- 4.20 -> DG xxx P0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0424 <- 4.41 -> DG xxx P0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0425 <- 3.39 -> DG xxx P0021 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0449 <- 3.46 -> DG xxx O0070 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0452 <- 3.06 -> DG xxx O0071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0453 <- 3.12 -> DG xxx O0071 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0458 <- 3.29 -> DG xxx O0070 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1056 <- 4.34 -> DC xxx P0015 : score x.xxxxx >7x76_CDFGHMN:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF STREPTOMYCES COELICOLOR RNAP-PROMOTER OPEN COMPLEX WITH TWO ZUR DIMERS organism=? : H : LYS NZ F0216 <- 2.63 -> DC O2 O0065 : score 3.04632 : H : ARG NH1 F0284 <- 2.42 -> DG O6 O0063 : score 6.54567 : H : LYS NZ F0322 <- 2.74 -> DT O4 O0058 : score 3.63023 : H : ASP OD2 F0415 <- 2.75 -> DC N4 P0020 : score 6.262 : H : ARG NH1 F0483 <- 3.03 -> DG N7 P0048 : score 5.7717 : H : ARG NH1 F0483 <- 2.94 -> DG O6 P0048 : score 5.913 : H : ARG NH2 F0483 <- 2.66 -> DG N7 P0048 : score 6.56338 : H : GLU OE1 F0484 <- 2.71 -> DC N4 P0050 : score 5.87177 : H : THR OG1 N0050 <- 3.29 -> DG N7 O0011 : score 3.15584 : V : THR CG2 G0049 <- 3.88 -> DT C7 O0019 : score 4.15218 : V : ARG CB F0485 <- 3.70 -> DT C7 O0034 : score 1.03026 : V : VAL CG1 F0353 <- 3.78 -> DT C7 O0054 : score 6.09082 : x : ARG xxxx C0161 <- 2.92 -> DG xxx P0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0169 <- 3.23 -> DG xxx O0070 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0193 <- 3.36 -> DC xxx O0069 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0194 <- 4.42 -> DC xxx O0069 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0199 <- 3.23 -> DC xxx O0069 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0201 <- 3.83 -> DC xxx O0069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0293 <- 3.45 -> DT xxx O0067 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0356 <- 3.66 -> DG xxx O0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0362 <- 3.29 -> DG xxx O0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0381 <- 4.25 -> DC xxx P0026 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0388 <- 3.77 -> DA xxx P0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0407 <- 3.38 -> DC xxx P0026 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0408 <- 3.05 -> DC xxx P0026 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0415 <- 3.14 -> DT xxx P0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0419 <- 2.71 -> DA xxx P0023 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0424 <- 4.42 -> DG xxx P0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0425 <- 3.45 -> DG xxx P0021 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0449 <- 3.36 -> DG xxx O0070 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0452 <- 3.69 -> DG xxx O0071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0453 <- 3.08 -> DG xxx O0071 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0458 <- 3.21 -> DG xxx O0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0389 <- 4.43 -> DA xxx O0066 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0427 <- 3.41 -> DC xxx P0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0501 <- 3.50 -> DG xxx P0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0502 <- 4.38 -> DG xxx P0016 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0540 <- 4.29 -> DT xxx P0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0862 <- 3.13 -> DC xxx P0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0215 <- 3.10 -> DG xxx O0064 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0219 <- 3.23 -> DG xxx O0064 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0222 <- 3.86 -> DG xxx O0063 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0224 <- 4.08 -> DG xxx O0063 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0227 <- 3.58 -> DT xxx O0062 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0282 <- 3.40 -> DT xxx O0062 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0285 <- 4.24 -> DT xxx O0062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0292 <- 4.44 -> DA xxx P0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0293 <- 4.50 -> DA xxx P0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0294 <- 4.17 -> DA xxx P0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0296 <- 4.42 -> DA xxx P0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0300 <- 3.67 -> DG xxx O0064 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx 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O0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0011 <- 4.09 -> DG xxx O0035 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0033 <- 3.77 -> DG xxx O0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0048 <- 4.02 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0049 <- 3.24 -> DC xxx P0055 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0050 <- 3.28 -> DG xxx P0054 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0052 <- 3.38 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0049 <- 2.65 -> DG xxx P0062 : score x.xxxxx : x : THR xxxx M0050 <- 3.39 -> DT xxx P0061 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0053 <- 3.81 -> DT xxx P0061 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0011 <- 3.81 -> DT xxx P0078 : score x.xxxxx : x : THR xxxx N0049 <- 3.35 -> DA xxx O0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0053 <- 3.62 -> DT xxx P0073 : score x.xxxxx >7x76_H:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF STREPTOMYCES COELICOLOR RNAP-PROMOTER OPEN COMPLEX WITH TWO ZUR DIMERS organism=? : x : ARG xxxx H0011 <- 4.09 -> DG xxx O0035 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0033 <- 3.77 -> DG xxx O0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0048 <- 4.02 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0049 <- 3.24 -> DC xxx P0055 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0050 <- 3.28 -> DG xxx P0054 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0052 <- 3.38 -> DT xxx O0026 : score x.xxxxx >7x7q_AMP:RuvA_domain_2-like;Nucleic_acid-binding_proteins;DNA_helicase_RuvA_subunit,_C-terminal_domain; title=CRYOEM STRUCTURE OF RUVA-RUVB-HOLLIDAY JUNCTION COMPLEX organism=? : x : LYS xxxx A0119 <- 4.27 -> DT xxx K0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0317 <- 2.83 -> DA xxx K0049 : score x.xxxxx >7x7q_CF:RuvA_domain_2-like;Nucleic_acid-binding_proteins;DNA_helicase_RuvA_subunit,_C-terminal_domain; title=CRYOEM STRUCTURE OF RUVA-RUVB-HOLLIDAY JUNCTION COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx F0054 <- 3.63 -> DT xxx I0031 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0084 <- 4.46 -> DA xxx I0032 : score x.xxxxx >7x7q_F:RuvA_domain_2-like;Nucleic_acid-binding_proteins;DNA_helicase_RuvA_subunit,_C-terminal_domain; title=CRYOEM STRUCTURE OF RUVA-RUVB-HOLLIDAY JUNCTION COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx F0054 <- 3.63 -> DT xxx I0031 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0084 <- 4.46 -> DA xxx I0032 : score x.xxxxx >7xaq_ACG:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF PVRA-DNA COMPLEX organism=? : H : LYS NZ C0047 <- 2.40 -> DG O6 I0034 : score 6.24323 : V : LYS CG G0055 <- 3.54 -> DT C7 E0027 : score 2.25671 : x : THR xxxx A0035 <- 3.43 -> DC xxx I0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0047 <- 3.18 -> DA xxx E0038 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0051 <- 2.09 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0052 <- 3.65 -> DT xxx E0035 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0057 <- 2.84 -> DG xxx I0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0058 <- 3.21 -> DG xxx I0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0115 <- 3.46 -> DT xxx I0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0010 <- 3.69 -> DT xxx E0033 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0047 <- 3.44 -> DG xxx I0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0049 <- 4.11 -> DA 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x.xxxxx >7xaq_BDH:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF PVRA-DNA COMPLEX organism=? : H : GLU OE1 B0037 <- 2.33 -> DC N4 F0039 : score 6.31014 : H : LYS NZ B0047 <- 2.62 -> DA N7 F0038 : score 3.04292 : H : TYR OH D0051 <- 2.99 -> DA N6 J0017 : score 4.49303 : H : LYS NZ D0052 <- 2.41 -> DA N7 J0014 : score 3.16628 : x : ARG xxxx B0014 <- 3.37 -> DT xxx F0035 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0035 <- 2.85 -> DC xxx J0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0036 <- 3.70 -> DG xxx J0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0049 <- 4.09 -> DT xxx F0035 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0051 <- 2.93 -> DT xxx J0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0052 <- 3.22 -> DT xxx F0035 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0055 <- 3.42 -> DC xxx J0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0056 <- 3.09 -> DG xxx J0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0112 <- 4.18 -> DA xxx F0042 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0037 <- 3.09 -> DG xxx J0034 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0047 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NUCLEOSOME-DI COMPLEX (-30I, APO STATE) organism=? : H : ARG NH2 E0040 <- 2.47 -> DT O2 I0009 : score 4.51273 >7xfh_B:Histone-fold; title=STRUCTURE OF NUCLEOSOME-AAG COMPLEX (A-30I, POST-CATALYTIC STATE) organism=? : x : ARG xxxx B0045 <- 4.29 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx >7xfi_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF NUCLEOSOME-DI COMPLEX (-50I, APO STATE) organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.53 -> DG N3 J0009 : score 3.80521 : H : ARG NH1 C0011 <- 2.63 -> DC O2 J0044 : score 3.7741 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.04 -> DT O2 I0009 : score 4.03013 : H : ARG NH2 G0011 <- 2.66 -> DA N3 I0043 : score 3.33046 : x : ARG xxxx A0083 <- 4.26 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.45 -> DC xxx J0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.32 -> DG xxx I0038 : score x.xxxxx >7xfi_C:Histone-fold; title=STRUCTURE OF NUCLEOSOME-DI COMPLEX (-50I, APO STATE) organism=? : H : ARG NH1 C0011 <- 2.63 -> DC O2 J0044 : score 3.7741 : x : ARG xxxx C0042 <- 4.45 -> DC xxx J0037 : score x.xxxxx >7xfl_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF NUCLEOSOME-AAG COMPLEX (A-53I, FREE STATE) organism=? : H : ARG NH1 A0040 <- 3.05 -> DG N3 J0009 : score 2.89994 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.48 -> DT O2 I0009 : score 4.50427 : H : ARG NH2 G0011 <- 2.68 -> DA N3 I0043 : score 3.3175 : x : ARG xxxx A0083 <- 3.23 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.25 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.27 -> DG xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.46 -> DA xxx J-005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.06 -> DG xxx I0038 : score x.xxxxx >7xfm_C:Histone-fold; title=STRUCTURE OF NUCLEOSOME-AAG COMPLEX (A-53I, 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score x.xxxxx : x : THR xxxx C0043 <- 2.52 -> DT xxx G0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0063 <- 3.22 -> DT xxx G0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0172 <- 3.54 -> DT xxx G0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0241 <- 3.87 -> DC xxx F0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0244 <- 4.16 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0246 <- 3.72 -> DT xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0247 <- 3.32 -> DC xxx F0021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0250 <- 3.53 -> DT xxx G0021 : score x.xxxxx >7xg0_ABC: title=CRYOEM STRUCTURE OF TYPE IV-A CSF-CRRNA-DSDNA TERNARY COMPLEX organism=? : H : LYS NZ A0075 <- 2.77 -> DT O2 J0010 : score 3.6087 : H : THR OG1 A0120 <- 3.42 -> DT O4 J0012 : score 3.40517 : V : PHE CZ C0038 <- 3.89 -> DT C7 K0037 : score 6.95479 : x : PHE xxxx A0051 <- 3.12 -> DA xxx K0046 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0079 <- 3.74 -> DT xxx J0012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0121 <- 3.38 -> DG xxx K0044 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0175 <- 3.37 -> DA xxx J0018 : 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-> DA xxx K0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0247 <- 2.92 -> DG xxx K0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0039 <- 3.47 -> DC xxx K0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0111 <- 3.51 -> DC xxx K0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0139 <- 4.10 -> DC xxx K0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0247 <- 3.06 -> DC xxx K0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0106 <- 3.51 -> DT xxx K0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx H0228 <- 4.49 -> DA xxx K0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0229 <- 4.20 -> DC xxx K0015 : score x.xxxxx >7xg0_H: title=CRYOEM STRUCTURE OF TYPE IV-A CSF-CRRNA-DSDNA TERNARY COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx H0106 <- 3.51 -> DT xxx K0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx H0228 <- 4.49 -> DA xxx K0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0229 <- 4.20 -> DC xxx K0015 : score x.xxxxx >7xg2_ABC: title=CRYOEM STRUCTURE OF TYPE IV-A NTS-NICKED DSDNA BOUND CSF-CRRNA TERNARY COMPLEX organism=? : H : LYS NZ A0075 <- 2.50 -> DT O2 J0010 : score 3.80241 : V : PHE CZ C0038 <- 3.58 -> DT C7 K0037 : score 7.50619 : x : PHE xxxx A0051 <- 3.24 -> DA xxx K0045 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0079 <- 3.65 -> DA xxx J0012 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0120 <- 3.04 -> DG xxx K0044 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0121 <- 3.36 -> DG xxx K0044 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0175 <- 3.45 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0178 <- 3.86 -> DT xxx J0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0182 <- 4.00 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0085 <- 4.45 -> DA xxx K0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0087 <- 3.69 -> DA xxx K0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0105 <- 3.73 -> DC xxx J0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0112 <- 3.29 -> DG xxx K0044 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0118 <- 3.93 -> DA xxx K0043 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0120 <- 3.85 -> DA xxx K0043 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0021 <- 3.70 -> DT xxx J0019 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0025 <- 3.99 -> DT xxx K0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0030 <- 3.13 -> DT xxx J0019 : score x.xxxxx : x : SER 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x.xxxxx : x : ARG xxxx D0181 <- 3.65 -> DG xxx K0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0241 <- 4.42 -> DG xxx K0033 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0245 <- 3.59 -> DG xxx K0033 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0246 <- 3.41 -> DA xxx K0031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0247 <- 2.85 -> DG xxx K0033 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E0025 <- 4.04 -> DT xxx K0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0036 <- 4.46 -> DC xxx K0026 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0039 <- 3.44 -> DC xxx K0027 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0111 <- 3.64 -> DT xxx K0034 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0139 <- 3.34 -> DG xxx K0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0241 <- 3.69 -> DC xxx K0027 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0245 <- 4.14 -> DC xxx K0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0246 <- 3.39 -> DT xxx K0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0247 <- 2.61 -> DC xxx K0027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0025 <- 4.19 -> DA xxx K0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0038 <- 3.36 -> DA xxx K0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx 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x.xxxxx >7xg3_ABC: title=CRYOEM STRUCTURE OF TYPE IV-A CASDING BOUND NTS-NICKED CSF-CRRNA- DSDNA QUATERNARY COMPLEX organism=? : H : LYS NZ A0075 <- 2.79 -> DT O2 J0010 : score 3.59435 : x : PHE xxxx A0051 <- 3.74 -> DA xxx K0045 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0079 <- 4.11 -> DC xxx J0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0120 <- 2.85 -> DG xxx K0044 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0121 <- 3.33 -> DG xxx K0044 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0175 <- 3.66 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0182 <- 4.24 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0187 <- 3.22 -> DT xxx J0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0085 <- 4.06 -> DA xxx K0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0087 <- 4.46 -> DA xxx K0043 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0110 <- 4.02 -> DT xxx J0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0112 <- 4.02 -> DG xxx K0044 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0118 <- 3.47 -> DA xxx K0043 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0120 <- 3.49 -> DA xxx K0043 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0020 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score -7.87628 : V : PHE CZ E0038 <- 3.82 -> DT C7 K0025 : score 7.0793 : x : PHE xxxx D0038 <- 3.86 -> DA xxx K0031 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0039 <- 3.54 -> DG xxx K0033 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0111 <- 3.98 -> DT xxx K0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0180 <- 3.08 -> DA xxx K0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0181 <- 3.22 -> DG xxx K0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0241 <- 3.50 -> DG xxx K0032 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0244 <- 1.81 -> DG xxx K0032 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0245 <- 2.71 -> DG xxx K0033 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0246 <- 2.60 -> DA xxx K0031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0247 <- 2.08 -> DG xxx K0033 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E0025 <- 4.37 -> DT xxx K0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0036 <- 4.47 -> DC xxx K0026 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0039 <- 3.96 -> DC xxx K0027 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0111 <- 3.92 -> DT xxx K0034 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0139 <- 3.37 -> DG xxx K0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0181 <- 3.91 -> DT xxx K0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0241 <- 3.91 -> DC xxx K0027 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0245 <- 4.33 -> DC xxx K0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0246 <- 3.46 -> DT xxx K0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0036 <- 3.62 -> DA xxx K0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0038 <- 3.39 -> DA xxx K0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0039 <- 3.88 -> DG xxx K0021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0041 <- 4.49 -> DG xxx K0021 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0139 <- 3.64 -> DT xxx K0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0181 <- 4.20 -> DG xxx K0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0246 <- 2.67 -> DA xxx K0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0247 <- 3.02 -> DG xxx K0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0111 <- 4.19 -> DC xxx K0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0106 <- 2.93 -> DT xxx K0017 : score x.xxxxx >7xg3_G: title=CRYOEM STRUCTURE OF TYPE IV-A CASDING BOUND NTS-NICKED CSF-CRRNA- DSDNA QUATERNARY COMPLEX organism=? : x : PRO xxxx G0111 <- 4.19 -> DC xxx K0022 : score x.xxxxx >7xg4_A: title=CRYOEM STRUCTURE OF TYPE IV-A CASDING BOUND NTS-NICKED CSF-CRRNA- DSDNA QUATERNARY COMPLEX IN A SECOND STATE organism=? : H : LYS NZ A0075 <- 3.19 -> DC O2 J0011 : score 2.71635 : H : THR OG1 A0120 <- 2.62 -> DG N3 K0044 : score 1.78511 : x : PHE xxxx A0051 <- 3.77 -> DA xxx K0045 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0079 <- 3.49 -> DC xxx J0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0121 <- 3.38 -> DG xxx K0044 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0175 <- 3.45 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx >7xg4_ABCD: title=CRYOEM STRUCTURE OF TYPE IV-A CASDING BOUND NTS-NICKED CSF-CRRNA- DSDNA QUATERNARY COMPLEX IN A SECOND STATE organism=? : H : LYS NZ A0075 <- 3.19 -> DC O2 J0011 : score 2.71635 : H : THR OG1 A0120 <- 2.62 -> DG N3 K0044 : score 1.78511 : H : ASN ND2 D0030 <- 2.85 -> DT O4 J0025 : score 5.23177 : H : ARG NH1 D0042 <- 2.39 -> DT O2 J0025 : score 4.65954 : H : ASN ND2 D0247 <- 2.56 -> DG O6 K0033 : score 5.90911 : V : ILE CG2 C0029 <- 3.51 -> DT C7 J0020 : score 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: score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0218 <- 3.27 -> DG xxx K0032 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0221 <- 3.54 -> DG xxx K0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0241 <- 4.04 -> DG xxx K0033 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0245 <- 3.37 -> DG xxx K0033 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0246 <- 2.49 -> DA xxx K0031 : score x.xxxxx >7xg4_EFGH: title=CRYOEM STRUCTURE OF TYPE IV-A CASDING BOUND NTS-NICKED CSF-CRRNA- DSDNA QUATERNARY COMPLEX IN A SECOND STATE organism=? : H : GLN OE1 H0233 <- 2.83 -> DA N6 K0016 : score 6.01625 : x : SER xxxx E0036 <- 3.66 -> DC xxx K0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0038 <- 3.56 -> DT xxx K0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0039 <- 3.52 -> DC xxx K0027 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0111 <- 3.33 -> DT xxx K0034 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0139 <- 3.28 -> DG xxx K0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0181 <- 4.23 -> DC xxx K0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0241 <- 3.25 -> DC xxx K0027 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0245 <- 3.42 -> DC xxx K0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0246 <- 3.66 -> DT xxx K0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0247 <- 2.89 -> DC xxx K0027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0025 <- 4.13 -> DA xxx K0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0036 <- 3.21 -> DA xxx K0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0038 <- 3.27 -> DA xxx K0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0039 <- 3.55 -> DG xxx K0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0111 <- 3.33 -> DT xxx K0028 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0139 <- 4.08 -> DT xxx K0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0181 <- 3.11 -> DG xxx K0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0245 <- 4.49 -> DG xxx K0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0246 <- 3.49 -> DA xxx K0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0247 <- 3.10 -> DG xxx K0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0039 <- 4.06 -> DA xxx K0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0111 <- 3.53 -> DC xxx K0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx G0139 <- 3.12 -> DC xxx K0023 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0247 <- 3.23 -> DA xxx K0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0106 <- 4.03 -> DT xxx K0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0229 <- 3.92 -> DA xxx K0016 : score x.xxxxx >7xht_A: title=STRUCTURE OF THE OGEUISCB-OMEGA RNA-TARGET DNA COMPLEX organism=? : H : HIS NE2 A0380 <- 2.98 -> DA N3 D0001 : score 4.09329 : H : LYS NZ A0381 <- 2.49 -> DT O2 C-001 : score 3.80958 : H : GLU OE2 A0460 <- 2.89 -> DC N4 C-003 : score 5.17061 : x : ASN xxxx A0463 <- 3.65 -> DT xxx C-006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0468 <- 3.74 -> DT xxx C-005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0469 <- 3.39 -> DT xxx C-005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0477 <- 3.62 -> DT xxx C-004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0479 <- 4.07 -> DT xxx C-005 : score x.xxxxx >7xhv_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain;PYP-like_sensor_domain_PAS_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NPAS4-ARNT HETERODIMER IN COMPLEX WITH DNA organism=? : H : HIS NE2 A0094 <- 2.93 -> DT O4 D0008 : score 5.46314 : H : HIS NE2 A0094 <- 2.93 -> DA N6 C0011 : score -5.89145 : H : GLU OE1 A0098 <- 2.65 -> DC N4 D0009 : score 5.94099 : H : ARG NH2 B0013 <- 3.14 -> DG N7 D0012 : score 5.95046 : V : ILE CG2 A0097 <- 3.74 -> DT C7 D0008 : score 7.19765 : x : ARG xxxx A0101 <- 3.28 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0102 <- 3.12 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0005 <- 3.51 -> DC xxx D0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0009 <- 3.74 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0012 <- 3.42 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >7xhv_B:PYP-like_sensor_domain_PAS_domain;HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NPAS4-ARNT HETERODIMER IN COMPLEX WITH DNA organism=? : H : ARG NH2 B0013 <- 3.14 -> DG N7 D0012 : score 5.95046 : x : THR xxxx B0005 <- 3.51 -> DC xxx D0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0009 <- 3.74 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0012 <- 3.42 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >7xi3_A:PYP-like_sensor_domain_PAS_domain;HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NPAS4-ARNT2 HETERODIMER IN COMPLEX WITH DNA organism=? : H : HIS NE2 A0068 <- 2.84 -> DA N6 C0011 : score -6.00033 : H : GLU OE2 A0072 <- 3.18 -> DA N6 D0010 : score 2.81938 : V : ILE CG2 A0071 <- 3.83 -> DT C7 D0008 : score 7.0381 : x : SER xxxx A0069 <- 4.27 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0075 <- 3.73 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0076 <- 3.02 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx >7xi3_AB:PYP-like_sensor_domain_PAS_domain;HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NPAS4-ARNT2 HETERODIMER IN COMPLEX WITH DNA organism=? : H : HIS NE2 A0068 <- 2.84 -> DA N6 C0011 : score -6.00033 : H : GLU OE2 A0072 <- 3.18 -> DA N6 D0010 : score 2.81938 : H : THR OG1 B0005 <- 2.96 -> DA N7 D0013 : score 3.30485 : H : ARG NH2 B0013 <- 2.85 -> DG N7 D0012 : score 6.32077 : V : ILE CG2 A0071 <- 3.83 -> DT C7 D0008 : score 7.0381 : x : SER xxxx A0069 <- 4.27 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0075 <- 3.73 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0076 <- 3.02 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0009 <- 4.17 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx >7xi3_B:PYP-like_sensor_domain_PAS_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NPAS4-ARNT2 HETERODIMER IN COMPLEX WITH DNA organism=? : H : THR OG1 B0005 <- 2.96 -> DA N7 D0013 : score 3.30485 : H : ARG NH2 B0013 <- 2.85 -> DG N7 D0012 : score 6.32077 : x : SER xxxx B0009 <- 4.17 -> DA xxx D0013 : score x.xxxxx >7xi4_A:PYP-like_sensor_domain_PAS_domain;HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NPAS4-ARNT HETERODIMER IN COMPLEX WITH DNA organism=? : H : HIS NE2 A0094 <- 3.43 -> DG O6 C0010 : score 6.95166 : H : ARG NH2 A0102 <- 3.08 -> DG O6 C0008 : score 6.2304 : V : GLU CB A0098 <- 3.68 -> DT C7 C0009 : score 1.67652 : x : ARG xxxx A0101 <- 4.05 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx >7xi4_AB:PYP-like_sensor_domain_PAS_domain;HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE NPAS4-ARNT HETERODIMER IN COMPLEX WITH DNA organism=? : H : HIS NE2 A0094 <- 3.43 -> DG O6 C0010 : score 6.95166 : H : ARG NH2 A0102 <- 3.08 -> DG O6 C0008 : score 6.2304 : H : THR OG1 B0005 <- 2.58 -> DC N4 D0014 : score 4.2108 : H : ARG NH2 B0013 <- 3.31 -> DG N7 D0012 : score 5.73338 : V : GLU CB A0098 <- 3.68 -> DT C7 C0009 : score 1.67652 : x : ARG xxxx A0101 <- 4.05 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0009 <- 3.62 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0012 <- 3.50 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx >7xi9_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN DNMT1 (AA:351-1616) IN COMPLEX WITH UBIQUITINATED H3 AND HEMIMETHYLATED DNA ANALOG (CXXC-ORDERED FORM) organism=? : H : LYS NZ A1535 <- 3.46 -> DC O2 C0017 : score 2.55726 : H : LYS NZ A1535 <- 2.92 -> DG O6 B0007 : score 5.64203 : V : ASN CG A1508 <- 3.76 -> DT C7 C0015 : score 2.67469 : x : LYS xxxx A0981 <- 3.40 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1232 <- 3.63 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1234 <- 3.28 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1235 <- 3.17 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1236 <- 3.73 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1337 <- 3.93 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1507 <- 3.34 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1531 <- 4.29 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1536 <- 4.16 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx >7xib_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN DNMT1 (AA:351-1616) IN COMPLEX WITH UBIQUITINATED H3 AND HEMIMETHYLATED DNA ANALOG (CXXC-DISORDERED FORM) organism=? : w : ARG NH2 A1234 <- 6.05 -> DA N3 B0005 : score 2.092 : w : ASN ND2 A1508 <- 6.32 -> DC N4 C0017 : score 2.395 : H : LYS NZ A1535 <- 2.53 -> DG O6 B0007 : score 6.09293 : x : LYS xxxx A0981 <- 3.38 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1232 <- 3.49 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1235 <- 3.41 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1236 <- 4.00 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1337 <- 3.91 -> DG xxx B0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1507 <- 3.21 -> DG xxx B0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1531 <- 4.44 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1536 <- 4.32 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx >7xjg_AB:DNA/RNA_polymerases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF E.COLI RETRON-EC86 IN COMPLEX WITH ITS EFFECTOR AT 2.5 ANGSTROM organism=? : H : LYS NZ A0176 <- 3.19 -> DA N3 D0004 : score 2.56032 : H : ARG NE A0180 <- 2.78 -> DC O2 D0003 : score 2.66961 : H : ARG NH2 A0180 <- 3.32 -> DC N3 D0003 : score 2.05276 : H : TYR OH A0195 <- 3.12 -> DA N3 D0084 : score 3.8856 >7xjg_C: title=CRYO-EM STRUCTURE OF E.COLI RETRON-EC86 IN COMPLEX WITH ITS EFFECTOR AT 2.5 ANGSTROM organism=? : V : TYR CB C0304 <- 3.59 -> DT C7 G0078 : score 5.12433 >7xlt_HL:Immunoglobulin; title=CRYO-EM STRUCTURE OF R-LOOP MONOCLONAL ANTIBODY S9.6 IN RECOGNIZING RNA:DNA HYBRIDS organism=MUS MUSCULUS : x : TYR xxxx H0054 <- 4.41 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0101 <- 3.95 -> DC xxx A0019 : score x.xxxxx >7xm0_BC: title=CRYSTAL STRUCTURE OF SAU3AI-C AND DNA SUBSTRATE COMPLEX organism=? : H : LYS NZ B0267 <- 2.95 -> DT O2 G0006 : score 3.47956 : H : LYS NZ B0267 <- 3.00 -> DT O2 F0006 : score 3.44369 : H : GLU OE2 B0316 <- 3.21 -> DC N4 F0007 : score 4.83362 : H : SER OG B0319 <- 2.75 -> DA N7 F0005 : score 4.50874 : H : ARG NE B0432 <- 2.97 -> DG N7 G0004 : score 4.27145 : H : ARG NH2 B0432 <- 2.37 -> DG O6 G0004 : score 7.1676 : H : ARG NH2 B0432 <- 3.27 -> DT O4 F0006 : score 3.21978 : H : HIS NE2 B0434 <- 2.79 -> DG N7 F0004 : score 6.81617 : H : ASN OD1 B0436 <- 3.00 -> DA N6 F0002 : score 5.78092 : H : ASN ND2 B0436 <- 3.02 -> DA N7 F0002 : score 5.61221 : H : LYS NZ C0267 <- 2.98 -> DT O2 I0006 : score 3.45804 : H : GLU OE2 C0316 <- 2.85 -> DC N4 I0007 : score 5.21273 : H : SER OG C0319 <- 2.77 -> DA N7 I0005 : score 4.49089 : H : ARG NE C0432 <- 3.04 -> DG N7 H0004 : score 4.20955 : H : ARG NH2 C0432 <- 2.63 -> DG O6 H0004 : score 6.8244 : H : HIS NE2 C0434 <- 2.74 -> DG N7 I0004 : score 6.88419 : H : ASN ND2 C0436 <- 3.11 -> DA N7 I0002 : score 5.50654 : x : GLU xxxx B0266 <- 3.51 -> DA xxx G0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0272 <- 4.37 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0423 <- 3.91 -> DA xxx G0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0433 <- 3.38 -> DA xxx G0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0475 <- 3.08 -> DT xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0415 <- 3.71 -> DT xxx H0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0433 <- 3.58 -> DA xxx H0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0435 <- 4.33 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0475 <- 3.14 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx >7xm0_C:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SAU3AI-C AND DNA SUBSTRATE COMPLEX organism=? : H : LYS NZ C0267 <- 2.98 -> DT O2 I0006 : score 3.45804 : H : GLU OE2 C0316 <- 2.85 -> DC N4 I0007 : score 5.21273 : H : SER OG C0319 <- 2.77 -> DA N7 I0005 : score 4.49089 : H : ARG NE C0432 <- 3.04 -> DG N7 H0004 : score 4.20955 : H : ARG NH2 C0432 <- 2.63 -> DG O6 H0004 : score 6.8244 : H : HIS NE2 C0434 <- 2.74 -> DG N7 I0004 : score 6.88419 : H : ASN ND2 C0436 <- 3.11 -> DA N7 I0002 : score 5.50654 : x : ARG xxxx C0415 <- 3.71 -> DT xxx H0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0433 <- 3.58 -> DA xxx H0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0435 <- 4.33 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0475 <- 3.14 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx >7xn7_ABEW: title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX CONTAINING SPT4/5, ELF1, SPT6, SPN1 AND PAF1C organism=? : x : MET xxxx A0253 <- 3.35 -> DC xxx T0042 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0318 <- 3.05 -> DA xxx T0043 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0449 <- 4.17 -> DC xxx T0033 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0832 <- 3.71 -> DA xxx T0032 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0833 <- 3.98 -> DA xxx T0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1389 <- 3.69 -> DA xxx T0029 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0498 <- 3.43 -> DA xxx N-031 : score x.xxxxx >7xnp_A:Histone-fold; title=STRUCTURE OF NUCLEOSOME-AAG COMPLEX (A-55I, POST-CATALYTIC STATE) organism=? : x : ARG xxxx A0040 <- 3.32 -> DG xxx I-008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.38 -> DC xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.21 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx >7xnp_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF NUCLEOSOME-AAG COMPLEX (A-55I, POST-CATALYTIC STATE) organism=? : H : ARG NH2 G0011 <- 2.66 -> DA N3 I0043 : score 3.33046 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.32 -> DG xxx I-008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.38 -> DC xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.21 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.26 -> DG xxx I-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.12 -> DT xxx J0038 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.34 -> DG xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.23 -> DC xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.24 -> DC xxx I0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.39 -> DG xxx I0057 : score x.xxxxx >7xp3_AB:NAC_domain; title=DNA COMPLEX FORM OF ORESARA1(ANAC092) NAC DOMAIN organism=? : H : TYR OH A0086 <- 2.80 -> DG N2 E0002 : score 4.88974 : H : ARG NH2 A0091 <- 3.07 -> DA N3 F0043 : score 3.0648 : H : LYS NZ A0102 <- 2.63 -> DG O6 F0040 : score 5.97732 : H : THR OG1 A0104 <- 2.78 -> DA N7 F0038 : score 3.42776 : H : TYR OH B0086 <- 2.88 -> DG N2 F0024 : score 4.81151 : H : ARG NH2 B0091 <- 2.98 -> DT O2 F0026 : score 4.08093 : H : LYS NZ B0102 <- 2.68 -> DG O6 E0018 : score 5.91951 : H : THR OG1 B0104 <- 2.76 -> DA N7 E0016 : score 3.44142 : H : THR OG1 B0104 <- 3.38 -> DA N6 E0016 : score 2.43893 : V : PRO CG A0131 <- 3.63 -> DT C7 E0003 : score 6.62923 : V : PRO CG B0131 <- 3.87 -> DT C7 F0025 : score 6.24769 : x : TYR xxxx A0126 <- 3.75 -> DC xxx F0039 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0106 <- 4.31 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0126 <- 3.47 -> DC xxx E0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0132 <- 3.74 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx >7xp3_B:NAC_domain; title=DNA COMPLEX FORM OF ORESARA1(ANAC092) NAC DOMAIN organism=? : H : TYR OH B0086 <- 2.88 -> DG N2 F0024 : score 4.81151 : H : ARG NH2 B0091 <- 2.98 -> DT O2 F0026 : score 4.08093 : H : LYS NZ B0102 <- 2.68 -> DG O6 E0018 : score 5.91951 : H : THR OG1 B0104 <- 2.76 -> DA N7 E0016 : score 3.44142 : H : THR OG1 B0104 <- 3.38 -> DA N6 E0016 : score 2.43893 : V : PRO CG B0131 <- 3.87 -> DT C7 F0025 : score 6.24769 : x : LYS xxxx B0106 <- 4.31 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0126 <- 3.47 -> DC xxx E0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0132 <- 3.74 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx >7xpx_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HISTONE METHYLTRANSFERASE SET8 BOUND TO H4K20ECX-NUCLEOSOME organism=XENOPUS LAEVIS : H : ARG NH1 E0040 <- 3.16 -> DT O2 J0009 : score 3.99635 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.54 -> DT O2 J0009 : score 4.45347 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.21 -> DG xxx J0068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.42 -> DA xxx J-005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 3.34 -> DT xxx J-042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.58 -> DG xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0035 <- 4.49 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.45 -> DC xxx J0007 : score x.xxxxx >7xq5_A:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SCINO2P-SCINO4P BOUND PROMOTER DNA organism=? : H : HIS NE2 A0012 <- 3.19 -> DG N7 C0010 : score 6.27196 : H : GLU OE1 A0016 <- 2.84 -> DC N4 D0007 : score 5.72181 : H : ARG NH1 A0020 <- 3.10 -> DG N7 C0008 : score 5.687 : x : SER xxxx A0015 <- 3.70 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0019 <- 3.54 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0024 <- 4.43 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx >7xq5_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SCINO2P-SCINO4P BOUND PROMOTER DNA organism=? : H : HIS NE2 A0012 <- 3.19 -> DG N7 C0010 : score 6.27196 : H : GLU OE1 A0016 <- 2.84 -> DC N4 D0007 : score 5.72181 : H : ARG NH1 A0020 <- 3.10 -> DG N7 C0008 : score 5.687 : H : HIS NE2 B0012 <- 3.09 -> DG O6 D0012 : score 7.49252 : w : GLU OE1 B0016 <- 6.13 -> DA N6 D0010 : score 2.939 : w : ARG NH1 B0020 <- 5.71 -> DA N6 D0010 : score 1.486 : w : ARG NH1 B0044 <- 5.49 -> DT O2 D0006 : score 1.855 : w : ARG NH2 B0044 <- 5.72 -> DT O2 D0006 : score 2.261 : w : ARG NH2 B0044 <- 5.85 -> DT O2 D0005 : score 2.261 : x : SER xxxx A0015 <- 3.70 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0019 <- 3.54 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0024 <- 4.43 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0019 <- 4.28 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >7xq5_B:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SCINO2P-SCINO4P BOUND PROMOTER DNA organism=? : H : HIS NE2 B0012 <- 3.09 -> DG O6 D0012 : score 7.49252 : w : GLU OE1 B0016 <- 6.13 -> DA N6 D0010 : score 2.939 : w : ARG NH1 B0020 <- 5.71 -> DA N6 D0010 : score 1.486 : w : ARG NH1 B0044 <- 5.49 -> DT O2 D0006 : score 1.855 : w : ARG NH2 B0044 <- 5.72 -> DT O2 D0006 : score 2.261 : w : ARG NH2 B0044 <- 5.85 -> DT O2 D0005 : score 2.261 : x : ARG xxxx B0019 <- 4.28 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >7xrc_C:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DIMERIC BRN2 (POU3F2) POU DOMAIN BOUND TO PALINDROMIC MORE DNA organism=MUS : H : GLN OE1 C0288 <- 3.04 -> DA N6 A0201 : score 5.76204 : H : GLN NE2 C0288 <- 2.99 -> DA N7 A0201 : score 5.85833 : w : GLN OE1 C0288 <- 5.86 -> DA N6 B0210 : score 3.392 : H : THR OG1 C0289 <- 2.67 -> DT O4 A0202 : score 3.98825 : H : THR OG1 C0289 <- 2.78 -> DC N4 B0209 : score 4.04947 : H : ARG NH1 C0293 <- 2.96 -> DG N7 B0208 : score 5.8564 : H : ARG NH2 C0293 <- 2.69 -> DG O6 B0208 : score 6.7452 : w : ARG NH1 C0546 <- 6.20 -> DT O4 B0204 : score 1.768 : H : ASN OD1 C0551 <- 2.76 -> DA N6 A0205 : score 6.06997 : H : ASN ND2 C0551 <- 2.88 -> DA N7 A0205 : score 5.77658 : H : GLN OE1 C0554 <- 3.43 -> DA N6 B0206 : score 5.28994 : H : GLN NE2 C0554 <- 2.79 -> DA N7 B0206 : score 6.10192 : x : SER xxxx C0287 <- 4.40 -> DG xxx B0208 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0292 <- 3.57 -> DT xxx A0202 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0299 <- 4.13 -> DT xxx B0207 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0303 <- 4.45 -> DT xxx B0207 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0547 <- 3.92 -> DA xxx A0205 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0550 <- 3.58 -> DT xxx B0204 : score x.xxxxx >7xse_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX TRANSCRIBING A NUCLEOSOME (EC42) organism=? : x : MET xxxx A0253 <- 3.35 -> DC xxx T0042 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0318 <- 3.05 -> DA xxx T0043 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0449 <- 4.17 -> DC xxx T0033 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0832 <- 3.71 -> DA xxx T0032 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0833 <- 3.98 -> DA xxx T0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1389 <- 3.69 -> DA xxx T0029 : score x.xxxxx >7xsx_a:Histone-fold; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX TRANSCRIBING A NUCLEOSOME (EC49) organism=? : x : ARG xxxx a0083 <- 3.77 -> DA xxx N0026 : score x.xxxxx >7xsz_f:Histone-fold; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX TRANSCRIBING A NUCLEOSOME (EC115) organism=? : x : ARG xxxx f0045 <- 3.66 -> DG xxx N-022 : score x.xxxxx >7xt7_f:Histone-fold; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX TRANSCRIBING A NUCLEOSOME (EC49B) organism=? : x : ARG xxxx f0045 <- 3.74 -> DC xxx T-010 : score x.xxxxx >7xtd_d:Histone-fold; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX TRANSCRIBING A NUCLEOSOME (EC58OCT) organism=? : x : ARG xxxx d0030 <- 3.57 -> DC xxx T0095 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx d0083 <- 4.02 -> DT xxx N-080 : score x.xxxxx >7xti_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX TRANSCRIBING A NUCLEOSOME (EC58HEX) organism=? : x : ILE xxxx A0251 <- 3.79 -> DG xxx T0026 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0253 <- 3.87 -> DG xxx T0026 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0449 <- 4.44 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0832 <- 3.71 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0833 <- 3.98 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1389 <- 3.50 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx >7xue_IJ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HK022 PUTRNA-ASSOCIATED E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 J0270 <- 3.34 -> DG O6 A0084 : score 5.42633 : H : ARG NH1 J0270 <- 3.34 -> DG O6 A0084 : score 5.42633 : x : ARG xxxx I0151 <- 3.39 -> DT xxx A0095 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.86 -> DT xxx A0095 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 2.89 -> DT xxx A0096 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0274 <- 4.31 -> DG xxx A0084 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 3.17 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.88 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.39 -> DA xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.38 -> DA xxx B0014 : score x.xxxxx >7xue_J:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HK022 PUTRNA-ASSOCIATED E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 J0270 <- 3.34 -> DG O6 A0084 : score 5.42633 : x : ASN xxxx J0274 <- 4.31 -> DG xxx A0084 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 3.17 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.88 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.39 -> DA xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.38 -> DA xxx B0014 : score x.xxxxx >7xug_I:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HK022 PUTRNA-LESS E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx I0542 <- 3.97 -> DT xxx A0096 : score x.xxxxx >7xug_IJ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HK022 PUTRNA-LESS E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx I0542 <- 3.97 -> DT xxx A0096 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx J0267 <- 4.24 -> DG xxx A0085 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0270 <- 3.58 -> DG xxx A0085 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0274 <- 3.75 -> DG xxx A0085 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 4.22 -> DC xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.41 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.68 -> DA xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.55 -> DA xxx B0014 : score x.xxxxx >7xui_IJ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF SIGMA70 BOUND HK022 PUTRNA-ASSOCIATED E.COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=? : x : ALA xxxx J0426 <- 3.91 -> DA xxx B0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 4.25 -> DC xxx B0003 : score x.xxxxx >7xur_A:Homeodomain-like; title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN MINI-SNAPC IN COMPLEX WITH HU6-1 PSE organism=? : x : ILE xxxx A0388 <- 3.93 -> DA xxx Y0055 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0389 <- 3.67 -> DT xxx X-059 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0393 <- 4.28 -> DT xxx Y0057 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0436 <- 4.11 -> DT xxx Y0058 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0440 <- 4.06 -> DA xxx Y0059 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0441 <- 4.23 -> DC xxx X-061 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0445 <- 3.15 -> DC xxx X-062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0446 <- 3.38 -> DT xxx X-064 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0492 <- 4.36 -> DG xxx Y0062 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0493 <- 3.72 -> DT xxx X-065 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0496 <- 3.45 -> DT xxx Y0063 : score x.xxxxx >7xur_AB:Homeodomain-like; title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN MINI-SNAPC IN COMPLEX WITH HU6-1 PSE organism=? : H : LYS NZ B0194 <- 2.59 -> DT O4 X-048 : score 3.73784 : x : ILE xxxx A0388 <- 3.93 -> DA xxx Y0055 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0389 <- 3.67 -> DT xxx X-059 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0393 <- 4.28 -> DT xxx Y0057 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0436 <- 4.11 -> DT xxx Y0058 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0440 <- 4.06 -> DA xxx Y0059 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0441 <- 4.23 -> DC xxx X-061 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0445 <- 3.15 -> DC xxx X-062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0446 <- 3.38 -> DT xxx X-064 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0492 <- 4.36 -> DG xxx Y0062 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0493 <- 3.72 -> DT xxx X-065 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0496 <- 3.45 -> DT xxx Y0063 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0148 <- 4.19 -> DA xxx Y0055 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0151 <- 3.56 -> DG xxx X-053 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0350 <- 3.35 -> DT xxx Y0052 : score x.xxxxx >7xur_B: title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN MINI-SNAPC IN COMPLEX WITH HU6-1 PSE organism=? : H : LYS NZ B0194 <- 2.59 -> DT O4 X-048 : score 3.73784 : x : ARG xxxx B0148 <- 4.19 -> DA xxx Y0055 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0151 <- 3.56 -> DG xxx X-053 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0350 <- 3.35 -> DT xxx Y0052 : score x.xxxxx >7xuz_CD: title=CRYSTAL STRUCTURE OF A HDAC4-MEF2A-DNA TERNARY COMPLEX organism=? : x : LYS xxxx C0023 <- 3.91 -> DA xxx F0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0023 <- 3.23 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx >7xuz_D:SRF-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A HDAC4-MEF2A-DNA TERNARY COMPLEX organism=? : x : LYS xxxx D0023 <- 3.23 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx >7xuz_GH: title=CRYSTAL STRUCTURE OF A HDAC4-MEF2A-DNA TERNARY COMPLEX organism=? : x : LYS xxxx G0023 <- 4.10 -> DA xxx J0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0003 <- 3.08 -> DA xxx I0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0023 <- 3.19 -> DA xxx I0012 : score x.xxxxx >7xv6_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN TR4 DNA-BINDING DOMAIN WITH C-TERMINAL EXTENSION (DBD-CTE) HOMODIMER BOUND TO DR1 RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0135 <- 2.92 -> DC N4 D0005 : score 5.62952 : w : GLU OE1 A0135 <- 5.79 -> DA N6 D0004 : score 2.939 : H : LYS NZ A0138 <- 2.85 -> DG O6 C0014 : score 5.72296 : w : LYS NZ A0138 <- 5.37 -> DA N7 C0013 : score 1.655 : w : LYS NZ A0142 <- 5.36 -> DT O4 C0016 : score 1.7 : H : ARG NH1 A0143 <- 2.70 -> DG N7 D0003 : score 6.171 : w : ARG NE A0143 <- 6.79 -> DT O4 C0016 : score 1.317 : w : ARG NH1 A0143 <- 6.73 -> DT O4 C0016 : score 1.768 : w : ARG NH1 A0191 <- 5.58 -> DA N3 C0013 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0191 <- 5.74 -> DA N3 C0013 : score 2.092 : H : GLU OE1 B0135 <- 2.85 -> DC N4 D0012 : score 5.71027 : w : GLU OE1 B0135 <- 5.86 -> DA N6 D0011 : score 2.939 : w : GLU OE2 B0135 <- 5.92 -> DC N4 D0013 : score 3.597 : H : LYS NZ B0138 <- 2.83 -> DG O6 C0007 : score 5.74608 : w : LYS NZ B0142 <- 5.52 -> DT O4 C0009 : score 1.7 : H : ARG NH1 B0143 <- 3.07 -> DG N7 D0010 : score 5.7233 : w : ARG NH1 B0143 <- 5.36 -> DG O6 D0010 : score 2.756 >7xv6_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN TR4 DNA-BINDING DOMAIN WITH C-TERMINAL EXTENSION (DBD-CTE) HOMODIMER BOUND TO DR1 RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 B0135 <- 2.85 -> DC N4 D0012 : score 5.71027 : w : GLU OE1 B0135 <- 5.86 -> DA N6 D0011 : score 2.939 : w : GLU OE2 B0135 <- 5.92 -> DC N4 D0013 : score 3.597 : H : LYS NZ B0138 <- 2.83 -> DG O6 C0007 : score 5.74608 : w : LYS NZ B0142 <- 5.52 -> DT O4 C0009 : score 1.7 : H : ARG NH1 B0143 <- 3.07 -> DG N7 D0010 : score 5.7233 : w : ARG NH1 B0143 <- 5.36 -> DG O6 D0010 : score 2.756 >7xv8_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN TR4 DNA-BINDING DOMAIN HOMODIMER BOUND TO DR1 RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : GLU OE2 A0135 <- 2.99 -> DC N4 D4012 : score 5.0653 : H : ARG NH1 A0143 <- 2.93 -> DG N7 D4010 : score 5.8927 : x : LYS xxxx A0142 <- 3.67 -> DG xxx C3008 : score x.xxxxx >7xv8_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN TR4 DNA-BINDING DOMAIN HOMODIMER BOUND TO DR1 RESPONSE ELEMENT organism=Homo sapiens : H : GLU OE2 A0135 <- 2.99 -> DC N4 D4012 : score 5.0653 : H : ARG NH1 A0143 <- 2.93 -> DG N7 D4010 : score 5.8927 : H : ARG NH1 B0143 <- 3.06 -> DG N7 D4003 : score 5.7354 : x : LYS xxxx A0142 <- 3.67 -> DG xxx C3008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0135 <- 3.56 -> DC xxx D4005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0142 <- 4.32 -> DG xxx C3015 : score x.xxxxx >7xvl_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME-H1.0 LINKER HISTONE ASSEMBLY (STICKY- 169AN DNA FRAGMENT) organism=? : H : ARG NH1 E0040 <- 3.33 -> DG N3 I0009 : score 2.72899 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.19 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.38 -> DA xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 3.19 -> DT xxx I-042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.93 -> DG xxx J0038 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.32 -> DC xxx I-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.98 -> DA xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.71 -> DG xxx J-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.39 -> DC xxx J-047 : score x.xxxxx >7xvl_KLMNOPQR:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME-H1.0 LINKER HISTONE ASSEMBLY (STICKY- 169AN DNA FRAGMENT) organism=? : H : ARG NH2 K0040 <- 3.05 -> DT O2 T0009 : score 4.02167 : H : ARG NH2 M0011 <- 3.27 -> DA N3 T0043 : score 2.93521 : H : ARG NH1 O0040 <- 3.39 -> DG N3 S0009 : score 2.69236 : x : ARG xxxx L0035 <- 4.15 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0045 <- 4.16 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0042 <- 4.22 -> DG xxx T0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0033 <- 4.03 -> DT xxx S-047 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx N0042 <- 4.43 -> DG xxx S-053 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx O0041 <- 4.25 -> DC xxx S-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0042 <- 4.03 -> DT xxx T0071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0083 <- 3.95 -> DG xxx T-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0045 <- 4.15 -> DA xxx S0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0042 <- 3.82 -> DG xxx T-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0033 <- 3.47 -> DC xxx T-047 : score x.xxxxx >7xvl_UVWXYZab:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME-H1.0 LINKER HISTONE ASSEMBLY (STICKY- 169AN DNA FRAGMENT) organism=? : H : ARG NH2 W0011 <- 3.28 -> DA N3 d0043 : score 2.92873 : H : ARG NH1 Y0040 <- 3.01 -> DG N3 c0009 : score 2.92436 : x : ARG xxxx U0040 <- 3.14 -> DT xxx d0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx U0043 <- 4.40 -> DG xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx U0083 <- 4.35 -> DG xxx c-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx V0035 <- 4.19 -> DT xxx d0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx V0045 <- 4.07 -> DA xxx d0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx W0042 <- 3.84 -> DG xxx d0038 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx Y0043 <- 4.11 -> DT xxx d-006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Y0065 <- 3.82 -> DC xxx c0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0083 <- 3.81 -> DG xxx d-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Z0045 <- 4.38 -> DA xxx c0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a0042 <- 4.30 -> DG xxx d-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx b0033 <- 3.65 -> DC xxx d-047 : score x.xxxxx >7xvl_efghijkl:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME-H1.0 LINKER HISTONE ASSEMBLY (STICKY- 169AN DNA FRAGMENT) organism=? : H : ARG NH1 i0040 <- 3.32 -> DG N3 m0009 : score 2.7351 : H : ARG NH2 l0033 <- 3.14 -> DC O2 n-047 : score 3.44721 : x : ARG xxxx e0040 <- 3.32 -> DG xxx n0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx f0035 <- 4.04 -> DT xxx n0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx f0045 <- 4.13 -> DA xxx n0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx g0011 <- 3.45 -> DA xxx n0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx g0042 <- 4.14 -> DG xxx n0038 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx i0041 <- 4.19 -> DC xxx m-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx i0042 <- 4.25 -> DT xxx n0071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx j0045 <- 3.98 -> DA xxx m0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx k0042 <- 3.61 -> DG xxx n-037 : score x.xxxxx >7xvl_j:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME-H1.0 LINKER HISTONE ASSEMBLY (STICKY- 169AN DNA FRAGMENT) organism=? : x : ARG xxxx j0045 <- 3.98 -> DA xxx m0006 : score x.xxxxx >7xvm_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME-H5 LINKER HISTONE ASSEMBLY (STICKY- 169A DNA FRAGMENT) organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.83 -> DT O2 J0009 : score 4.20793 : H : ARG NH1 C0011 <- 3.00 -> DT O2 I-042 : score 4.13415 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.46 -> DT O2 I0009 : score 4.5212 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.23 -> DA xxx J-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.43 -> DG xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.44 -> DA xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.10 -> DG xxx J0038 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.09 -> DT xxx J0069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.42 -> DA xxx I-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0035 <- 4.38 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.48 -> DA xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0013 <- 3.81 -> DT xxx I0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.78 -> DG xxx J-037 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0028 <- 3.32 -> DT xxx I-028 : score x.xxxxx >7xvm_C:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME-H5 LINKER HISTONE ASSEMBLY (STICKY- 169A DNA FRAGMENT) organism=? : H : ARG NH1 C0011 <- 3.00 -> DT O2 I-042 : score 4.13415 : x : ARG xxxx C0042 <- 4.10 -> DG xxx J0038 : score x.xxxxx >7xvn_C:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS FOR DNA RECOGNITION FEATURE OF RETINOID-RELATED ORPHAN RECEPTORS organism=Mus musculus : H : GLU OE2 C0049 <- 2.88 -> DC N4 E0625 : score 5.18114 : H : LYS NZ C0052 <- 2.44 -> DG N7 F0622 : score 5.77368 : H : ARG NH1 C0057 <- 3.20 -> DG N7 E0623 : score 5.566 : x : ARG xxxx C0056 <- 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title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME-H1.3 LINKER HISTONE ASSEMBLY (STICKY- 169A DNA FRAGMENT) organism=? : H : ARG NH2 E0040 <- 3.10 -> DT O2 I0009 : score 3.97933 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.41 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.04 -> DC xxx J-068 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0043 <- 4.47 -> DT xxx I-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.41 -> DG xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.04 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0029 <- 4.04 -> DG xxx I0029 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.39 -> DT xxx J0069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.23 -> DA xxx I-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.08 -> DC xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.48 -> DG xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0031 <- 3.16 -> DG xxx J-049 : score x.xxxxx >7xx5_KLMNOPQR:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME-H1.3 LINKER HISTONE ASSEMBLY (STICKY- 169A DNA FRAGMENT) organism=? : H : ARG NH2 K0040 <- 2.93 -> DT O2 T0009 : score 4.12327 : H : ARG NH1 O0040 <- 2.87 -> DT O2 S0009 : score 4.24612 : H : ARG NH2 O0040 <- 3.25 -> DT O2 S0009 : score 3.85233 : H : LYS NZ R0030 <- 2.77 -> DT O2 S-028 : score 3.6087 : x : TYR xxxx K0041 <- 4.47 -> DC xxx T-068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0045 <- 4.41 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0042 <- 4.07 -> DG xxx S-037 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx O0039 <- 4.46 -> DT xxx T0069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0042 <- 4.09 -> DG xxx S0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0029 <- 4.39 -> DG xxx T-049 : score x.xxxxx >7xx5_R:Histone-fold; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME-H1.3 LINKER HISTONE ASSEMBLY (STICKY- 169A DNA FRAGMENT) organism=? : H : LYS NZ R0030 <- 2.77 -> DT O2 S-028 : score 3.6087 : x : ARG xxxx R0029 <- 4.39 -> DG xxx T-049 : score x.xxxxx >7xx6_BCDEFGHo:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME-H1.0 LINKER HISTONE ASSEMBLY (STICKY- 169A DNA FRAGMENT) organism=? : H : ARG NH2 E0040 <- 3.02 -> DT O2 I0009 : score 4.04707 : H : LYS NZ H0030 <- 2.26 -> DT O2 I-028 : score 3.97459 : x : ARG xxxx C0042 <- 3.75 -> DG xxx J0038 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.15 -> DT xxx J0069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.49 -> DG xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.24 -> DA xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.23 -> DG xxx I0038 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx o0067 <- 3.82 -> DG xxx J-041 : score x.xxxxx >7xx6_KLMNOPQR:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME-H1.0 LINKER HISTONE ASSEMBLY (STICKY- 169A DNA FRAGMENT) organism=? : H : ARG NH1 K0040 <- 3.01 -> DT O2 T0009 : score 4.12554 : H : ARG NH2 K0040 <- 2.74 -> DT O2 T0009 : score 4.28413 : H : ARG NH1 O0040 <- 2.76 -> DT O2 S0009 : score 4.34086 : H : LYS NZ R0030 <- 2.72 -> DT O2 S-028 : score 3.64457 : x : HIS xxxx K0039 <- 3.55 -> DG xxx S0070 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx K0043 <- 4.19 -> DG xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0045 <- 3.98 -> DC xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0042 <- 3.63 -> DG xxx T0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0029 <- 4.24 -> DC xxx S0030 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx O0039 <- 4.36 -> DG xxx T0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0042 <- 4.33 -> DG xxx T0070 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0043 <- 4.31 -> DG xxx T-007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0042 <- 4.15 -> DG xxx T-037 : score x.xxxxx >7xx6_UVWZabp:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME-H1.0 LINKER HISTONE ASSEMBLY (STICKY- 169A DNA FRAGMENT) organism=? : H : ARG NH1 U0040 <- 3.21 -> DT O2 d0009 : score 3.95328 : H 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x.xxxxx : x : ARG xxxx i0040 <- 3.53 -> DC xxx n-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx i0042 <- 4.27 -> DG xxx n0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx j0045 <- 4.33 -> DA xxx m0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx k0042 <- 3.94 -> DG xxx m0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx l0029 <- 4.25 -> DC xxx m0049 : score x.xxxxx >7xx6_p:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME-H1.0 LINKER HISTONE ASSEMBLY (STICKY- 169A DNA FRAGMENT) organism=? : H : GLN OE1 p0067 <- 2.76 -> DG N2 d-041 : score 5.65255 >7xx7_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME-H1X LINKER HISTONE ASSEMBLY (STICKY- 169A DNA FRAGMENT) organism=? : H : ARG NH2 E0040 <- 3.03 -> DT O2 I0009 : score 4.0386 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.35 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0042 <- 4.25 -> DA xxx I0072 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0043 <- 4.48 -> DT xxx I-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 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J-047 : score x.xxxxx >7xx7_KUV:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME-H1X LINKER HISTONE ASSEMBLY (STICKY- 169A DNA FRAGMENT) organism=? : H : ARG NH2 K0040 <- 3.04 -> DT O2 j0092 : score 4.03013 : x : THR xxxx K0022 <- 4.17 -> DT xxx j0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0042 <- 4.37 -> DA xxx i0492 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0083 <- 4.47 -> DG xxx i0397 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx V0005 <- 4.13 -> DA xxx j0169 : score x.xxxxx >7xx7_LMNOPQR:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME-H1X LINKER HISTONE ASSEMBLY (STICKY- 169A DNA FRAGMENT) organism=? : H : LYS NZ N0020 <- 2.88 -> DT O4 S0022 : score 3.52978 : H : LYS NZ N0020 <- 2.61 -> DG O6 S0023 : score 6.00044 : H : ARG NH1 O0040 <- 3.08 -> DT O2 S0009 : score 4.06525 : H : LYS NZ R0030 <- 2.72 -> DT O2 S-028 : score 3.64457 : x 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x.xxxxx : x : TRP xxxx F0438 <- 3.40 -> DT xxx N0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0440 <- 4.40 -> DA xxx N0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0445 <- 3.51 -> DT xxx N0029 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0451 <- 3.87 -> DT xxx T0029 : score x.xxxxx >7xyb_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF AN ALPA-LOADED COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx C0155 <- 3.68 -> DC xxx N0110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0179 <- 4.11 -> DA xxx N0109 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0186 <- 3.72 -> DT xxx N0108 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0203 <- 3.95 -> DA xxx N0109 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0204 <- 4.50 -> DT xxx N0108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0547 <- 3.14 -> DC xxx N0111 : score x.xxxxx >7xyb_CD: title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF AN ALPA-LOADED COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 D0270 <- 3.25 -> DT O4 N0100 : score 2.97383 : x : ARG xxxx C0155 <- 3.68 -> DC xxx N0110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0179 <- 4.11 -> DA xxx N0109 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0186 <- 3.72 -> DT xxx N0108 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0203 <- 3.95 -> DA xxx N0109 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0204 <- 4.50 -> DT xxx N0108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0547 <- 3.14 -> DC xxx N0111 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 3.24 -> DG xxx N0101 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0274 <- 4.05 -> DT xxx N0100 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0426 <- 4.23 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.86 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.99 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 4.13 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx >7xyf_E:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF FFT3-NUCLEOSOME COMPLEX WITH FFT3 BOUND TO SHL+2 POSITION OF THE NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH1 E0040 <- 2.73 -> DG N3 I0082 : score 3.0953 >7xyg_K:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF FFT3-NUCLEOSOME COMPLEX WITH FFT3 BOUND TO SHL+3 POSITION OF THE NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx K0495 <- 3.67 -> DT xxx J0045 : score x.xxxxx >7xzx_N:p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH P53 DNA-BINDING DOMAIN organism=? : H : LYS NZ N0120 <- 2.85 -> DG N7 J0026 : score 5.33204 : H : SER OG N0121 <- 3.07 -> DG N7 J0025 : score 4.24002 : H : ARG NH1 N0280 <- 2.77 -> DG O6 I0166 : score 6.11983 : H : ARG NH2 N0280 <- 3.06 -> DG N7 I0166 : score 6.05262 : x : ALA xxxx N0276 <- 2.65 -> DT xxx I0167 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx N0277 <- 3.50 -> DT xxx I0167 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx N0281 <- 4.29 -> DT xxx I0165 : score x.xxxxx >7xzy_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING 193 BASE-PAIR DNA WITH A P53 TARGET SEQUENCE organism=? : x : ARG xxxx A0040 <- 3.98 -> DT xxx J0107 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 4.25 -> DT xxx J0107 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.00 -> DC xxx J0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 4.14 -> DT xxx I0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.64 -> DC xxx J0135 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.87 -> DC xxx J0147 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 2.87 -> DG xxx J0090 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.89 -> DC xxx I0103 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.17 -> DC xxx I0133 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.78 -> DC xxx I0145 : score x.xxxxx >7xzy_C:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING 193 BASE-PAIR DNA WITH A P53 TARGET SEQUENCE organism=? : x : ARG xxxx C0011 <- 4.14 -> DT xxx I0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.64 -> DC xxx J0135 : score x.xxxxx >7xzz_N:p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME IN COMPLEX WITH P53 organism=? : H : LYS NZ N0120 <- 2.85 -> DG N7 J0026 : score 5.33204 : H : SER OG N0121 <- 3.07 -> DG N7 J0025 : score 4.24002 : H : ARG NH1 N0280 <- 2.77 -> DG O6 I0142 : score 6.11983 : H : ARG NH2 N0280 <- 3.06 -> DG N7 I0142 : score 6.05262 : x : ALA xxxx N0276 <- 2.65 -> DT xxx I0143 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx N0277 <- 3.50 -> DT xxx I0143 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx N0281 <- 4.29 -> DT xxx I0141 : score x.xxxxx >7y00_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING 169 BASE-PAIR DNA WITH A P53 TARGET SEQUENCE organism=? : H : ARG NH2 C0011 <- 2.82 -> DT O2 I0029 : score 4.2164 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.37 -> DG N3 I0081 : score 2.70457 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.33 -> DG N3 I0081 : score 3.22757 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.60 -> DT xxx J0107 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.00 -> DC xxx J0105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.74 -> DC xxx J0135 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.40 -> DG xxx J0155 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.70 -> DC xxx J0147 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.23 -> DG xxx I0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.83 -> DG xxx I0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.44 -> DT xxx J0074 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.17 -> DC xxx I0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.53 -> DC xxx I0109 : score x.xxxxx >7y00_G:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CONTAINING 169 BASE-PAIR DNA WITH A P53 TARGET SEQUENCE organism=? : x : ARG xxxx G0042 <- 3.53 -> DC xxx I0109 : score x.xxxxx >7y01_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZMMCM10 IN COMPLEX WITH 16NT SSDNA AT 2.8. ANGSTROM RESOLUTION organism=Zea mays : H : ASP OD2 A0140 <- 3.36 -> DC N4 B0009 : score 5.5056 : H : SER OG A0167 <- 2.88 -> DC N3 B0007 : score 1.94908 : H : ARG NE A0229 <- 2.81 -> DC O2 B0010 : score 2.65366 : H : CYS SG A0235 <- 3.66 -> DC O2 B0010 : score 4.63998 : H : THR OG1 A0236 <- 2.34 -> DC N3 B0010 : score 1.3314 : x : SER xxxx A0147 <- 3.87 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0149 <- 3.31 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0151 <- 3.77 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0155 <- 4.33 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0157 <- 3.47 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0169 <- 3.30 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0171 <- 3.76 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0195 <- 3.33 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0201 <- 3.54 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0204 <- 3.72 -> DC xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0206 <- 3.62 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0208 <- 3.79 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0237 <- 3.51 -> DC xxx B0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0249 <- 3.65 -> DC xxx B0011 : score x.xxxxx >7y3i_AC:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=STRUCTURE OF DNA BOUND SALL4 organism=Homo sapiens : w : SER OG A0880 <- 6.59 -> DA N6 G0004 : score 2.209 : w : SER OG A0881 <- 6.00 -> DA N7 G0004 : score 2.343 : w : SER OG A0881 <- 5.97 -> DA N6 G0004 : score 2.209 : w : SER OG A0883 <- 5.28 -> DA N7 G0004 : score 2.343 : w : THR OG1 A0909 <- 5.05 -> DT O4 H0006 : score 2.809 : H : ASN OD1 A0912 <- 2.89 -> DA N6 H0005 : score 5.9134 : H : ASN ND2 A0912 <- 2.94 -> DA N7 H0005 : score 5.70614 : w : ASN OD1 A0912 <- 5.61 -> DA N6 G0007 : score 2.837 : w : ASN OD1 A0912 <- 5.88 -> DA N6 H0004 : score 2.837 : w : THR OG1 C0909 <- 5.48 -> DG O6 H0002 : score 2.729 : H : ASN OD1 C0912 <- 2.89 -> DA N6 G0010 : score 5.9134 : H : ASN ND2 C0912 <- 2.81 -> DA N7 G0010 : score 5.85877 : w : ASN OD1 C0912 <- 5.59 -> DG O6 H0002 : score 3.125 : V : VAL CG1 C0915 <- 3.83 -> DT C7 G0008 : score 6.01506 : V : ILE CG2 A0887 <- 3.67 -> DT C7 H0006 : score 7.32175 : x : VAL xxxx A0915 <- 4.40 -> DT xxx H0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0908 <- 4.49 -> DA xxx G0010 : score x.xxxxx >7y3i_B:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=STRUCTURE OF DNA BOUND SALL4 organism=Homo sapiens : w : SER OG B0880 <- 6.37 -> DA N6 L0004 : score 2.209 : w : SER OG B0881 <- 5.78 -> DA N6 L0004 : score 2.209 : w : SER OG B0883 <- 5.06 -> DA N7 L0004 : score 2.343 : w : THR OG1 B0909 <- 5.22 -> DT O4 K0005 : score 2.809 : H : ASN OD1 B0912 <- 2.99 -> DA N6 K0004 : score 5.79297 : H : ASN ND2 B0912 <- 2.97 -> DA N7 K0004 : score 5.67092 : w : ASN OD1 B0912 <- 5.57 -> DA N6 L0007 : score 2.837 : w : ASN OD1 B0912 <- 5.71 -> DA N6 K0003 : score 2.837 : V : ILE CG2 B0887 <- 3.63 -> DT C7 K0005 : score 7.39266 : x : VAL xxxx B0915 <- 4.18 -> DT xxx K0002 : score x.xxxxx >7y3i_BD:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=STRUCTURE OF DNA BOUND SALL4 organism=Homo sapiens : w : SER OG B0880 <- 6.37 -> DA N6 L0004 : score 2.209 : w : SER OG B0881 <- 5.78 -> DA N6 L0004 : score 2.209 : w : SER OG B0883 <- 5.06 -> DA N7 L0004 : score 2.343 : w : THR OG1 B0909 <- 5.22 -> DT O4 K0005 : score 2.809 : H : ASN OD1 B0912 <- 2.99 -> DA N6 K0004 : score 5.79297 : H : ASN ND2 B0912 <- 2.97 -> DA N7 K0004 : score 5.67092 : w : ASN OD1 B0912 <- 5.57 -> DA N6 L0007 : score 2.837 : w : ASN OD1 B0912 <- 5.71 -> DA N6 K0003 : score 2.837 : V : ILE CG2 B0887 <- 3.63 -> DT C7 K0005 : score 7.39266 : x : VAL xxxx B0915 <- 4.18 -> DT xxx K0002 : score x.xxxxx >7y3k_AB:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=STRUCTURE OF SALL4 ZFC4 BOUND WITH 16 BP AT-RICH DSDNA organism=Homo sapiens : w : SER OG A0880 <- 6.33 -> DT O4 H0012 : score 2.338 : w : THR OG1 A0909 <- 5.67 -> DT O4 H0010 : score 2.809 : H : ASN OD1 A0912 <- 2.84 -> DA N6 H0009 : score 5.97362 : H : ASN ND2 A0912 <- 2.86 -> DA N7 H0009 : score 5.80007 : w : ASN OD1 A0912 <- 5.84 -> DA N6 H0008 : score 2.837 : H : ASN OD1 B0912 <- 3.20 -> DA N6 G0010 : score 5.54005 : H : ASN ND2 B0912 <- 3.13 -> DA N7 G0010 : score 5.48306 : V : VAL CG2 B0915 <- 3.68 -> DT C7 G0009 : score 6.30677 : V : ILE CG2 B0887 <- 3.83 -> DT C7 G0011 : score 7.0381 : V : ILE CG2 A0887 <- 3.70 -> DT C7 H0010 : score 7.26856 : x : SER xxxx A0881 <- 4.41 -> DA xxx G0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0883 <- 3.61 -> DA xxx G0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0915 <- 4.31 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0880 <- 4.37 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0881 <- 4.23 -> DG xxx H0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0909 <- 3.91 -> DT xxx G0011 : score x.xxxxx >7y3k_B:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=STRUCTURE OF SALL4 ZFC4 BOUND WITH 16 BP AT-RICH DSDNA organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 B0912 <- 3.20 -> DA N6 G0010 : score 5.54005 : H : ASN ND2 B0912 <- 3.13 -> DA N7 G0010 : score 5.48306 : V : VAL CG2 B0915 <- 3.68 -> DT C7 G0009 : score 6.30677 : V : ILE CG2 B0887 <- 3.83 -> DT C7 G0011 : score 7.0381 : x : SER xxxx B0880 <- 4.37 -> DT xxx G0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0881 <- 4.23 -> DG xxx H0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0909 <- 3.91 -> DT xxx G0011 : score x.xxxxx >7y3l_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=STRUCTURE OF SALL3 ZFC4 BOUND WITH 12 BP AT-RICH DSDNA organism=Homo sapiens : w : THR OG1 A1152 <- 5.25 -> DT O4 H0006 : score 2.809 : H : ASN OD1 A1155 <- 2.81 -> DA N6 H0005 : score 6.00975 : H : ASN ND2 A1155 <- 3.03 -> DA N7 H0005 : score 5.60047 : w : ASN OD1 A1155 <- 5.98 -> DT O4 H0006 : score 3.132 : w : ASN OD1 A1155 <- 5.98 -> DA N6 G0007 : score 2.837 : w : ASN OD1 A1155 <- 6.22 -> DA N6 H0004 : score 2.837 : V : ILE CG2 A1130 <- 3.82 -> DT C7 H0006 : score 7.05583 : x : SER xxxx A1123 <- 4.12 -> DT xxx H0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1126 <- 3.75 -> DA xxx G0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A1158 <- 4.28 -> DT xxx H0003 : score x.xxxxx >7y3m_AB:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=STRUCTURE OF SALL4 ZFC1 BOUND WITH 16 BP AT-RICH DSDNA organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 A0424 <- 2.94 -> DA N6 H0009 : score 5.85318 : H : ASN ND2 A0424 <- 3.11 -> DA N7 H0009 : score 5.50654 : H : ASN OD1 B0424 <- 3.31 -> DA N6 G0010 : score 5.40757 : V : ILE CG2 A0399 <- 3.76 -> DT C7 H0010 : score 7.16219 : V : ILE CG2 B0399 <- 3.74 -> DT C7 G0011 : score 7.19765 : x : SER xxxx B0395 <- 3.78 -> DG xxx H0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0427 <- 3.91 -> DT xxx G0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0395 <- 4.04 -> DA xxx G0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0421 <- 4.28 -> DT xxx H0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0427 <- 4.35 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx >7y3m_CF:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=STRUCTURE OF SALL4 ZFC1 BOUND WITH 16 BP AT-RICH DSDNA organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 C0424 <- 2.97 -> DA N6 E0009 : score 5.81705 : H : ASN ND2 C0424 <- 3.13 -> DA N7 E0009 : score 5.48306 : H : ASN OD1 F0424 <- 3.06 -> DA N6 D0010 : score 5.70866 : H : ASN ND2 F0424 <- 3.24 -> DA N7 D0010 : score 5.35391 : V : ILE CG2 F0399 <- 3.54 -> DT C7 D0011 : score 7.55222 : V : THR CG2 C0421 <- 3.86 -> DT C7 E0010 : score 4.17337 : x : SER xxxx C0395 <- 4.01 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0399 <- 3.64 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0427 <- 4.36 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >7y3m_I:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=STRUCTURE OF SALL4 ZFC1 BOUND WITH 16 BP AT-RICH DSDNA organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 I0424 <- 2.89 -> DA N6 L0009 : score 5.9134 : H : ASN ND2 I0424 <- 2.66 -> DA N7 L0008 : score 6.03489 : H : ASN ND2 I0424 <- 2.74 -> DA N7 L0009 : score 5.94096 : x : SER xxxx I0395 <- 3.69 -> DA xxx K0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0421 <- 4.37 -> DT xxx L0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0427 <- 4.39 -> DT xxx L0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0431 <- 3.49 -> DT xxx L0007 : score x.xxxxx >7y3m_IJ:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=STRUCTURE OF SALL4 ZFC1 BOUND WITH 16 BP AT-RICH DSDNA organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 I0424 <- 2.89 -> DA N6 L0009 : score 5.9134 : H : ASN ND2 I0424 <- 2.66 -> DA N7 L0008 : score 6.03489 : H : ASN ND2 I0424 <- 2.74 -> DA N7 L0009 : score 5.94096 : H : ASN OD1 J0424 <- 3.12 -> DA N6 K0010 : score 5.6364 : H : ASN ND2 J0424 <- 3.23 -> DA N7 K0010 : score 5.36565 : x : SER xxxx J0395 <- 3.08 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J0399 <- 4.15 -> DT xxx K0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0395 <- 3.69 -> DA xxx K0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0421 <- 4.37 -> DT xxx L0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0427 <- 4.39 -> DT xxx L0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0431 <- 3.49 -> DT xxx L0007 : score x.xxxxx >7y43_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE KAT6A WH DOMAIN AND ITS BOUND DOUBLE STRANDED DNA organism=? : w : GLN OE1 A0023 <- 6.47 -> DG O6 B0006 : score 2.87 : H : LYS NZ A0024 <- 2.69 -> DG N7 B0008 : score 5.50439 : H : LYS NZ A0024 <- 2.81 -> DG O6 B0008 : score 5.76921 : H : LYS NZ A0024 <- 2.72 -> DG O6 C0006 : score 5.87326 : w : GLN OE1 A0025 <- 6.27 -> DG O6 B0006 : score 2.87 : w : GLN NE2 A0025 <- 5.95 -> DG N7 C0008 : score 2.582 : H : ARG NH1 A0079 <- 2.92 -> DT O2 B0012 : score 4.20306 : H : ARG NH2 A0079 <- 2.50 -> DC O2 B0013 : score 3.92064 : w : ARG NH1 A0079 <- 5.29 -> DG N3 C0004 : score 1.593 >7y5w_ABCDEFG:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE LEFT-HANDED DI-TETRASOME organism=? : x : ARG xxxx B0045 <- 4.30 -> DT xxx I0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.95 -> DC xxx I0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0045 <- 4.23 -> DT xxx J0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.18 -> DC xxx J0081 : score x.xxxxx >7y5w_E:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE LEFT-HANDED DI-TETRASOME organism=? : x : ARG xxxx E0083 <- 4.18 -> DC xxx J0081 : score x.xxxxx >7y60_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN CAF1LC BOUND RIGHT-HANDED DI-TETRASOME organism=? : x : ARG xxxx G0083 <- 4.35 -> DC xxx I0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.50 -> DG xxx I0055 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0045 <- 4.24 -> DC xxx J0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.74 -> DT xxx J0042 : score x.xxxxx >7y7i_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CHICKEN KNL2 IN COMPLEX WITH THE CENP-A NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.24 -> DT O2 J0227 : score 4.70747 : H : ARG NH1 C0012 <- 2.65 -> DT O2 I0031 : score 4.4356 : H : HIS NE2 E0039 <- 3.25 -> DG N2 I0005 : score 3.39267 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.84 -> DG N3 I0082 : score 3.58137 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.10 -> DG xxx J0152 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0065 <- 4.50 -> DG xxx J0236 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0085 <- 4.26 -> DG xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.49 -> DC xxx J0225 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.39 -> DG xxx J0266 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.89 -> DG xxx I0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0065 <- 3.97 -> DC xxx I0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0085 <- 3.55 -> DG xxx I0098 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0043 <- 3.96 -> DG xxx J0181 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.68 -> DC xxx J0171 : score x.xxxxx >7y7i_E:Histone-fold; title=CHICKEN KNL2 IN COMPLEX WITH THE CENP-A NUCLEOSOME organism=? : H : HIS NE2 E0039 <- 3.25 -> DG N2 I0005 : score 3.39267 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.84 -> DG N3 I0082 : score 3.58137 >7y7r_B: title=QDE-1 IN COMPLEX WITH DNA TEMPLATE, RNA PRIMER AND 3'-DGTP organism=? : w : ARG NH1 B0783 <- 6.00 -> DT O2 E0010 : score 1.855 : w : ARG NH2 B0783 <- 5.74 -> DT O2 E0010 : score 2.261 : x : PRO xxxx B0964 <- 4.03 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B1082 <- 3.87 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx >7y7s_A: title=QDE-1 IN COMPLEX WITH DNA TEMPLATE, RNA PRIMER AND AMPNPP organism=Neurospora crassa : H : SER OG A0490 <- 3.11 -> DA N3 C0010 : score 2.81761 : H : THR OG1 A0546 <- 2.67 -> DA N6 C0002 : score 2.83071 : w : GLN NE2 A0797 <- 5.94 -> DT O2 C0003 : score 1.565 : x : ASP xxxx A0475 <- 3.35 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0488 <- 4.06 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0520 <- 3.75 -> DA xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0590 <- 2.78 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0783 <- 4.38 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0963 <- 4.37 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0964 <- 4.13 -> DG xxx C0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A1082 <- 3.49 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1084 <- 3.87 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx >7y7t_A: title=QDE-1 IN COMPLEX WITH 12NT DNA TEMPLATE, ATP AND 3'-DGTP organism=Neurospora crassa : x : ARG xxxx A0783 <- 4.00 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A1082 <- 3.46 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1084 <- 4.37 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx >7y7t_AB: title=QDE-1 IN COMPLEX WITH 12NT DNA TEMPLATE, ATP AND 3'-DGTP organism=Neurospora crassa : x : ARG xxxx A0783 <- 4.00 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A1082 <- 3.46 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1084 <- 4.37 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B1378 <- 4.19 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx >7y8r_I:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=THE NUCLEOSOME-BOUND HUMAN PBAF COMPLEX organism=? : x : MET xxxx I1036 <- 3.41 -> DG xxx X0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I1157 <- 3.24 -> DG xxx Y0095 : score x.xxxxx >7yc7_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=DARK, FULLY REDUCED STRUCTURE OF THE MMCPDII-DNA COMPLEX AS PRODUCED AT SWISSFEL organism=Methanosarcina mazei : w : ARG NH1 A0429 <- 6.26 -> DA N3 D0008 : score 2.585 : x : HIS xxxx A0161 <- 4.48 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0431 <- 3.31 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0441 <- 3.64 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0450 <- 4.30 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx >7ycm_B:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TR-SFX MMCPDII-DNA COMPLEX: 100 PS SNAPSHOT. INCLUDES 100PS, DARK, AND EXTRAPOLATED STRUCTURE FACTORS organism=Methanosarcina mazei : H : ARG NH2 B0450 <- 2.42 -> DG O6 E0011 : score 7.1016 A : x : HIS xxxx B0161 <- 3.76 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0429 <- 3.46 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0431 <- 3.34 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0441 <- 3.87 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx >7ycp_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TR-SFX MMCPDII-DNA COMPLEX: 250 PS SNAPSHOT. INCLUDES 250 PS, DARK, AND EXTRAPOLATED STRUCTURE FACTORS organism=Methanosarcina mazei : x : HIS xxxx A0161 <- 4.49 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0429 <- 3.08 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0431 <- 3.28 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0441 <- 3.61 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0450 <- 4.49 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx >7ycr_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TR-SFX MMCPDII-DNA COMPLEX: 450 PS SNAPSHOT. INCLUDES 450PS, DARK, AND EXTRAPOLATED STRUCTURE FACTORS organism=Methanosarcina mazei : x : ARG xxxx A0429 <- 2.96 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0431 <- 3.29 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0441 <- 3.58 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0450 <- 4.41 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx >7ycx_124j:Translation_proteins_SH3-like_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Eukaryotic_RPB5_N-terminal_domain;RPB5-like_RNA_polymerase_subunit; title=THE STRUCTURE OF INTAC-PEC COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 11416 <- 2.88 -> DC O2 d0022 : score 3.63954 : x : LYS xxxx 10149 <- 4.28 -> DT xxx d0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 10331 <- 3.28 -> DG xxx d0035 : score x.xxxxx : x : THR xxxx 10854 <- 3.72 -> DA xxx d0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx 10855 <- 3.99 -> DA xxx d0025 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx 11417 <- 4.38 -> DG xxx b0027 : score x.xxxxx >7ycx_1:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=THE STRUCTURE OF INTAC-PEC COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 11416 <- 2.88 -> DC O2 d0022 : score 3.63954 : x : LYS xxxx 10149 <- 4.28 -> DT xxx d0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 10331 <- 3.28 -> DG xxx d0035 : score x.xxxxx : x : THR xxxx 10854 <- 3.72 -> DA xxx d0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx 10855 <- 3.99 -> DA xxx d0025 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx 11417 <- 4.38 -> DG xxx b0027 : score x.xxxxx >7yd6_B:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TR-SFX MMCPDII-DNA COMPLEX: 650 PS SNAPSHOT. INCLUDES 650PS, DARK, AND EXTRAPOLATED STRUCTURE FACTORS organism=Methanosarcina mazei : H : ARG NH2 B0450 <- 2.63 -> DG O6 E0011 : score 6.8244 : x : ARG xxxx B0429 <- 3.02 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0431 <- 3.43 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx >7yd7_B:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TR-SFX MMCPDII-DNA COMPLEX: 1 NS SNAPSHOT. INCLUDES 1 NS, DARK, AND EXTRAPOLATED STRUCTURE FACTORS organism=Methanosarcina mazei : H : ARG NH1 B0450 <- 2.58 -> DG O6 E0011 : score 6.351 : H : ARG NH2 B0450 <- 3.22 -> DG N7 E0011 : score 5.84831 : x : HIS xxxx B0161 <- 3.77 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0429 <- 3.18 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0431 <- 3.34 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0441 <- 4.46 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx >7yd8_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TR-SFX MMCPDII-DNA COMPLEX: 2 NS SNAPSHOT. INCLUDES 2 NS, DARK, AND EXTRAPOLATED STRUCTURE FACTORS organism=Methanosarcina mazei : x : HIS xxxx A0161 <- 4.26 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0429 <- 3.01 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0431 <- 3.35 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0441 <- 3.91 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0450 <- 4.23 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx >7ydw_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MPND-DNA COMPLEX organism=Mus musculus : V : ALA CB A0064 <- 3.88 -> DT C7 F0007 : score 5.48699 >7ydw_AC: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE MPND-DNA COMPLEX organism=Mus musculus : V : ALA CB C0064 <- 3.73 -> DT C7 F0002 : score 5.69696 : V : ALA CB A0064 <- 3.88 -> DT C7 F0007 : score 5.48699 >7ydz_B:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TR-SFX MMCPDII-DNA COMPLEX: DARK STATE AS COLLECTED IN SACLA organism=Methanosarcina mazei : H : ARG NH2 B0450 <- 2.57 -> DG O6 E0011 : score 6.9036 A : x : HIS xxxx B0161 <- 3.96 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0429 <- 3.42 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0431 <- 3.29 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0441 <- 4.00 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx >7ye0_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=DF-SFX MMCPDII-DNA COMPLEX: STEADY STATE OXIDIZED COMPLEX organism=Methanosarcina mazei : x : ARG xxxx A0429 <- 2.85 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0431 <- 3.21 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0441 <- 3.33 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0450 <- 3.06 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx >7ye1_A:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit; title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF C. CRESCENTUS GCRA-TACUP organism=? : x : ARG xxxx A0266 <- 2.88 -> DA xxx H-040 : score x.xxxxx >7ye1_ACDFG:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit; title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF C. CRESCENTUS GCRA-TACUP organism=? : H : ASP OD2 C0205 <- 2.51 -> DC N4 H-001 : score 6.5596 : H : GLU OE2 C0382 <- 2.55 -> DG N2 H-006 : score 4.52577 : H : GLU OE2 F0460 <- 2.39 -> DA N6 H-011 : score 3.30149 : H : SER OG F0557 <- 2.67 -> DG O6 I0004 : score 4.19739 : H : ARG NH1 F0624 <- 2.59 -> DG N7 I0031 : score 6.3041 : H : ARG NH1 F0624 <- 2.73 -> DG O6 I0031 : score 6.1685 : H : GLU OE1 F0625 <- 2.60 -> DC N4 I0033 : score 5.99867 : V : TRP CD2 F0474 <- 3.77 -> DT C7 H-012 : score 5.53763 : V : ARG CZ F0481 <- 3.88 -> DT C7 H-015 : score 2.08966 : V : TRP CB C0189 <- 3.74 -> DT C7 H0000 : score 5.57886 : V : ARG CG C0550 <- 3.51 -> DT C7 H0002 : score 1.078 : x : ARG xxxx A0266 <- 2.88 -> DA xxx H-040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0157 <- 3.14 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0207 <- 4.08 -> DC xxx H-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0453 <- 3.85 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0459 <- 3.47 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0512 <- 3.08 -> DA xxx I0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0516 <- 4.32 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0522 <- 3.80 -> DG xxx I0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0549 <- 4.44 -> DA xxx I-002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0555 <- 3.19 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0214 <- 4.28 -> DG xxx I-011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0321 <- 3.20 -> DA xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0428 <- 4.35 -> DC xxx I0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0786 <- 3.82 -> DG xxx I-001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0787 <- 4.21 -> DG xxx I-001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0116 <- 3.08 -> DG xxx H-005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0117 <- 4.15 -> DG xxx H-005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0120 <- 2.98 -> DG xxx H-005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0129 <- 4.13 -> DT xxx H-007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0423 <- 3.58 -> DT xxx H-007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0425 <- 3.03 -> DT xxx H-007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0426 <- 3.08 -> DT xxx H-007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0433 <- 4.44 -> DA xxx H-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0437 <- 4.04 -> DT xxx I0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0441 <- 4.43 -> DG xxx H-005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0462 <- 3.10 -> DA xxx H-011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0468 <- 3.22 -> DT xxx H-007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0469 <- 3.74 -> DA xxx H-009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0470 <- 3.40 -> DA xxx H-011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0472 <- 3.71 -> DA xxx H-008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0473 <- 3.28 -> DT xxx H-012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0477 <- 3.13 -> DC xxx H-013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0480 <- 4.36 -> DA xxx I0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0494 <- 4.27 -> DT xxx H-015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0495 <- 3.39 -> DC xxx H-017 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0497 <- 4.13 -> DA xxx I0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0500 <- 4.34 -> DA xxx I0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0501 <- 2.88 -> DA xxx I0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0504 <- 4.14 -> DA xxx I0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0542 <- 4.26 -> DT xxx I0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0543 <- 4.20 -> DA xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0545 <- 4.34 -> DA xxx I0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0549 <- 3.96 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0551 <- 3.09 -> DG xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0553 <- 4.23 -> DG xxx I0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0554 <- 4.36 -> DG xxx I0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0562 <- 3.77 -> DG xxx I0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0626 <- 3.41 -> DT xxx H-035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0628 <- 4.28 -> DT xxx I0032 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0034 <- 3.98 -> DA xxx H-020 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0041 <- 3.72 -> DT xxx I0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.24 -> DC xxx H-023 : score x.xxxxx >7ye2_ACDF:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit; title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF C. CRESCENTUS GCRA-TACDOWN organism=? : H : ASN ND2 C0067 <- 3.07 -> DC O2 H-008 : score 4.2376 : H : SER OG C0488 <- 2.98 -> DC N4 H-008 : score 3.54332 : H : THR OG1 D0786 <- 2.63 -> DT N3 I-001 : score 2.4246 : V : ASP CG C0205 <- 3.74 -> DT C7 H-001 : score 2.72332 : V : ARG CZ F0481 <- 3.72 -> DT C7 H-015 : score 2.17495 : x : ARG xxxx C0149 <- 4.34 -> DA xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0157 <- 3.56 -> DA xxx H0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0188 <- 3.98 -> DT xxx H-001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0189 <- 3.19 -> DA xxx H0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0207 <- 3.25 -> DT xxx H-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0402 <- 4.29 -> DA xxx H-003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0453 <- 3.65 -> DA xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0459 <- 3.57 -> DA xxx H0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0485 <- 3.90 -> DC xxx H-008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0504 <- 3.64 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0512 <- 3.79 -> DG xxx I0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0516 <- 3.31 -> DA xxx I0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0546 <- 3.17 -> DA xxx H0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0549 <- 3.15 -> DC xxx I-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0550 <- 3.77 -> DA xxx H0000 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0554 <- 4.34 -> DA xxx H0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0555 <- 4.32 -> DA xxx H0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C1287 <- 4.25 -> DT xxx I0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0121 <- 3.24 -> DG xxx I-006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0214 <- 4.25 -> DT xxx I-011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0261 <- 4.44 -> DG xxx I0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0321 <- 3.30 -> DG xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0322 <- 4.07 -> DA xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0324 <- 4.48 -> DA xxx I0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0336 <- 4.24 -> DC xxx I-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0354 <- 3.31 -> DA xxx I0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0428 <- 3.04 -> DA xxx I0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0429 <- 2.99 -> DT xxx I0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0431 <- 4.26 -> DT xxx I0000 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0116 <- 3.02 -> DC xxx H-005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0117 <- 2.78 -> DG xxx H-004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0120 <- 2.70 -> DT xxx H-006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0129 <- 2.70 -> DT xxx H-007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0134 <- 3.31 -> DT xxx H-007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0423 <- 3.85 -> DT xxx H-007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0426 <- 4.02 -> DT xxx H-007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0428 <- 3.73 -> DC xxx H-005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0432 <- 4.42 -> DC xxx H-005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0436 <- 3.27 -> DG xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0437 <- 3.30 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0441 <- 2.64 -> DC xxx H-005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0459 <- 3.17 -> DA xxx H-011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0470 <- 3.16 -> DA xxx H-011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0473 <- 3.88 -> DA xxx I0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0474 <- 3.55 -> DT xxx H-012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0476 <- 4.01 -> DA xxx I0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0477 <- 3.33 -> DT xxx H-013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0488 <- 3.07 -> DT xxx I0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0494 <- 3.78 -> DG xxx H-016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0495 <- 4.41 -> DC xxx H-017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0501 <- 2.91 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0504 <- 3.46 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0505 <- 4.12 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0508 <- 3.37 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0543 <- 2.72 -> DG xxx I0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0549 <- 3.14 -> DA xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0551 <- 3.89 -> DG xxx I0005 : score x.xxxxx >7ye2_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=THE CRYO-EM STRUCTURE OF C. CRESCENTUS GCRA-TACDOWN organism=? : V : ARG CZ F0481 <- 3.72 -> DT C7 H-015 : score 2.17495 : V : ARG CZ F0488 <- 3.54 -> DT C7 I0010 : score 2.27091 : x : VAL xxxx F0116 <- 3.02 -> DC xxx H-005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0117 <- 2.78 -> DG xxx H-004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0120 <- 2.70 -> DT xxx H-006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0129 <- 2.70 -> DT xxx H-007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0134 <- 3.31 -> DT xxx H-007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0423 <- 3.85 -> DT xxx H-007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0426 <- 4.02 -> DT xxx H-007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0428 <- 3.73 -> DC xxx H-005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0432 <- 4.42 -> DC xxx H-005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0436 <- 3.27 -> DG xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0437 <- 3.30 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0441 <- 2.64 -> DC xxx H-005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0459 <- 3.17 -> DA xxx H-011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0470 <- 3.16 -> DA xxx H-011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0473 <- 3.88 -> DA xxx I0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0474 <- 3.55 -> DT xxx H-012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0476 <- 4.01 -> DA xxx I0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0477 <- 3.33 -> DT xxx H-013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0494 <- 3.78 -> DG xxx H-016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0495 <- 4.41 -> DC xxx H-017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0501 <- 2.91 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0504 <- 3.46 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0505 <- 4.12 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0508 <- 3.37 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0543 <- 2.72 -> DG xxx I0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0549 <- 3.14 -> DA xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0551 <- 3.89 -> DG xxx I0005 : score x.xxxxx >7yeb_B:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TR-SFX MMCPDII-DNA COMPLEX: 3.35 NS SNAPSHOT. INCLUDES 3.35 NS, DARK, AND EXTRAPOLATED STRUCTURE FACTORS organism=Methanosarcina mazei : H : ARG NH2 B0256 <- 3.13 -> DT O2 E0007 : score 3.95393 : H : ASN ND2 B0257 <- 2.89 -> DT O2 E0008 : score 4.66072 : H : GLU OE2 B0301 <- 2.47 -> DT N3 E0007 : score 2.80987 : V : TRP CD2 B0421 <- 3.64 -> DT C7 E0008 : score 5.71627 : x : HIS xxxx B0161 <- 3.74 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0305 <- 3.19 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0379 <- 3.21 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0429 <- 3.46 -> DG xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0431 <- 3.26 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0441 <- 4.14 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx >7yec_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TR-SFX MMCPDII-DNA COMPLEX: 6 NS SNAPSHOT. INCLUDES 6 NS, DARK, AND EXTRAPOLATED STRUCTURE FACTORS organism=Methanosarcina mazei : x : ARG xxxx A0429 <- 3.21 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0431 <- 3.25 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0441 <- 4.30 -> DC xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0450 <- 4.05 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx >7yee_B:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TR-SFX MMCPDII-DNA COMPLEX: 10 NS SNAPSHOT. INCLUDES 10 NS, DARK, AND EXTRAPOLATED STRUCTURE FACTORS. COLLECTED AT SWISSFEL organism=Methanosarcina mazei : w : ASN OD1 B0257 <- 6.12 -> DT O2 E0008 : score 1.953 : H : GLU OE2 B0301 <- 2.55 -> DT N3 E0007 : score 2.76769 : w : ARG NH1 B0429 <- 5.44 -> DA N3 F0008 : score 2.585 : V : TRP CD2 B0305 <- 3.72 -> DT C7 E0007 : score 5.60634 : x : HIS xxxx B0161 <- 4.01 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0256 <- 3.28 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0379 <- 3.26 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0421 <- 3.46 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0431 <- 3.27 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0441 <- 3.98 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0450 <- 3.36 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx >7yei_B:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TR-SFX MMCPDII-DNA COMPLEX: 10 NS TIME-POINT COLLECTED IN SACLA. INCLUDES 10 NS, DARK, AND EXTRAPOLATED STRUCTURE FACTORS organism=Methanosarcina mazei : H : ARG NH1 B0256 <- 2.66 -> DT O2 E0008 : score 4.42699 : H : GLU OE1 B0301 <- 2.79 -> DT N3 E0007 : score 1.75222 : H : ARG NH2 B0450 <- 3.26 -> DG N7 E0012 : score 5.79723 : H : ARG NH2 B0450 <- 2.59 -> DG O6 E0012 : score 6.8772 : x : HIS xxxx B0161 <- 3.45 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0300 <- 3.08 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0305 <- 3.20 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0379 <- 3.31 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0421 <- 3.89 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0429 <- 2.86 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0431 <- 3.16 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx >7yej_B:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TR-SFX MMCPDII-DNA COMPLEX: 100 NS TIME-POINT COLLECTED IN SACLA. INCLUDES 100 NS, DARK, AND EXTRAPOLATED STRUCTURE FACTORS organism=Methanosarcina mazei : H : ARG NH1 B0256 <- 2.94 -> DT O2 E0008 : score 4.18583 : H : ARG NH2 B0256 <- 3.09 -> DT O2 E0008 : score 3.9878 : H : ASN ND2 B0257 <- 2.50 -> DT O2 E0008 : score 5.03092 : H : GLU OE1 B0301 <- 2.74 -> DT N3 E0007 : score 1.7697 : H : ARG NH2 B0450 <- 2.72 -> DG O6 E0012 : score 6.7056 A : x : HIS xxxx B0161 <- 4.00 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0305 <- 3.23 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0379 <- 3.22 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0421 <- 3.88 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0429 <- 3.41 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0431 <- 3.39 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0441 <- 4.06 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx >7yek_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TR-SFX MMCPDII-DNA COMPLEX: 500 NS TIME-POINT COLLECTED IN SACLA. INCLUDES 500 NS, DARK, AND EXTRAPOLATED STRUCTURE FACTORS organism=Methanosarcina mazei : w : ASN OD1 A0257 <- 5.27 -> DT N3 C0008 : score 1.666 : H : GLU OE2 A0301 <- 2.45 -> DT N3 C0007 : score 2.82041 : w : ARG NH1 A0429 <- 5.90 -> DA N3 D0008 : score 2.585 : V : TRP CD2 A0305 <- 3.50 -> DT C7 C0007 : score 5.90864 : V : TRP CD2 A0421 <- 3.87 -> DT C7 C0008 : score 5.40022 : x : HIS xxxx A0161 <- 4.22 -> DC xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0256 <- 3.04 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0379 <- 3.21 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0431 <- 3.24 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0441 <- 3.70 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0450 <- 4.04 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx >7yel_B:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TR-SFX MMCPDII-DNA COMPLEX: 25 US TIME-POINT COLLECTED IN SACLA. INCLUDES 25 US, DARK, AND EXTRAPOLATED STRUCTURE FACTORS organism=Methanosarcina mazei : H : ARG NH1 B0429 <- 2.87 -> DA N3 F0008 : score 3.6305 : H : ARG NH2 B0429 <- 2.64 -> DA N3 F0008 : score 3.34342 : H : ARG NH2 B0450 <- 2.73 -> DG O6 E0011 : score 6.6924 A : x : HIS xxxx B0161 <- 4.12 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0431 <- 3.31 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0441 <- 4.37 -> DC xxx E0008 : score x.xxxxx >7yem_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TR-SFX MMCPDII-DNA COMPLEX: 200 US TIME-POINT COLLECTED IN SACLA. INCLUDES 200 US, DARK, AND EXTRAPOLATED STRUCTURE FACTORS organism=Methanosarcina mazei : w : ASP OD2 A0300 <- 5.15 -> DT O4 C0007 : score 2.798 : x : HIS xxxx A0161 <- 3.10 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0256 <- 3.18 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0257 <- 3.60 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0301 <- 3.28 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0305 <- 3.61 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0379 <- 3.40 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0429 <- 3.80 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0431 <- 3.19 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0441 <- 2.18 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx >7yho_A:DNA-glycosylase; title=CRYOEM STRUCTURE OF ARABIDOPSIS ROS1 IN COMPLEX WITH TG MISMATCH DSDNA AT 3.3 ANGSTROMS RESOLUTION organism=? : H : LYS NZ A0908 <- 2.43 -> DC O2 B0014 : score 3.16417 : x : THR xxxx A0606 <- 4.38 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0608 <- 3.06 -> DG xxx C0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0609 <- 4.16 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0611 <- 3.27 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0613 <- 4.12 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0903 <- 4.15 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0905 <- 3.64 -> DC xxx B0014 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0957 <- 4.06 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0961 <- 4.11 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0971 <- 2.52 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1031 <- 3.29 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1299 <- 3.74 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1300 <- 4.34 -> DT xxx C0026 : score x.xxxxx >7yhp_A:DNA-glycosylase; title=CRYOEM STRUCTURE OF ARABIDOPSIS ROS1 IN COMPLEX WITH 5MC-DSDNA AT 3.1 ANGSTROMS RESOLUTION organism=? : H : LYS NZ A0908 <- 2.39 -> DC O2 B0014 : score 3.18774 : x : GLN xxxx A0607 <- 4.36 -> DG xxx C0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0608 <- 3.26 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0609 <- 4.04 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0610 <- 4.44 -> DC xxx C0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0613 <- 3.57 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0903 <- 2.99 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0905 <- 3.45 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx >7yhq_A:DNA-glycosylase; title=CRYOEM STRUCTURE OF ARABIDOPSIS ROS1 IN COMPLEX WITH A COVALENT- LINKED REACTION INTERMEDIATE AT 3.9 ANGSTROMS RESOLUTION organism=? : x : ASN xxxx A0608 <- 3.08 -> DG xxx C0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0609 <- 4.40 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0610 <- 3.91 -> DC xxx C0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0903 <- 4.25 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0905 <- 2.98 -> DG xxx C0027 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0908 <- 3.17 -> DG xxx C0028 : score x.xxxxx >7yhs_AI: title=STRUCTURE OF CSY-ACRIF4-DSDNA organism=? : H : ASN OD1 A0250 <- 2.90 -> DG N2 N0033 : score 4.704 : x : ASN xxxx A0111 <- 3.51 -> DG xxx N0034 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0112 <- 3.35 -> DC xxx O0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0113 <- 3.41 -> DC xxx O0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0247 <- 4.11 -> DG xxx N0033 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0249 <- 3.96 -> DC xxx O0012 : score x.xxxxx >7yhs_CDEFGH: title=STRUCTURE OF CSY-ACRIF4-DSDNA organism=? : H : SER OG H0262 <- 3.22 -> DC N4 N0022 : score 3.36689 : x : VAL xxxx C0030 <- 4.25 -> DA xxx N0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0354 <- 4.05 -> DA xxx N0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0030 <- 4.04 -> DG xxx N0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0354 <- 3.81 -> DG xxx N0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0085 <- 3.54 -> DA xxx N0031 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0094 <- 4.26 -> DA xxx N0031 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0030 <- 3.35 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0074 <- 3.90 -> DC xxx N0011 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0093 <- 3.56 -> DA xxx N0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0094 <- 4.05 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0095 <- 3.44 -> DC xxx N0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0096 <- 3.16 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0354 <- 4.28 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0030 <- 3.51 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0074 <- 3.92 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0093 <- 3.84 -> DA xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0094 <- 4.00 -> DA xxx N0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0095 <- 3.30 -> DC xxx N0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0096 <- 3.35 -> DA xxx N0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0252 <- 4.07 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0262 <- 3.65 -> DA xxx N0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0354 <- 3.51 -> DC xxx N0023 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx H0030 <- 3.44 -> DG xxx N0030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0074 <- 4.40 -> DC xxx N0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0093 <- 3.41 -> DA xxx N0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0094 <- 3.60 -> DC xxx N0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0095 <- 3.53 -> DA xxx N0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0096 <- 3.05 -> DC xxx N0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0252 <- 4.24 -> DC xxx N0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx H0354 <- 3.69 -> DG xxx N0030 : score x.xxxxx >7yhs_H: title=STRUCTURE OF CSY-ACRIF4-DSDNA organism=? : H : SER OG H0262 <- 3.22 -> DC N4 N0022 : score 3.36689 : x : VAL xxxx H0030 <- 3.44 -> DG xxx N0030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0074 <- 4.40 -> DC xxx N0022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0093 <- 3.41 -> DA xxx N0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0094 <- 3.60 -> DC xxx N0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0095 <- 3.53 -> DA xxx N0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0096 <- 3.05 -> DC xxx N0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0252 <- 4.24 -> DC xxx N0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx H0354 <- 3.69 -> DG xxx N0030 : score x.xxxxx >7yoj_A: title=STRUCTURE OF CASPI WITH GUIDE RNA AND TARGET DNA organism=? : H : ASP OD2 A0268 <- 2.78 -> DC N4 C0008 : score 6.2248 : H : ARG NH2 A0390 <- 2.86 -> DG O6 D0022 : score 6.5208 : H : ARG NH1 A0392 <- 3.20 -> DG N7 D0023 : score 5.566 : x : GLN xxxx A0133 <- 3.12 -> DG xxx D0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0389 <- 4.20 -> DG xxx D0021 : score x.xxxxx >7yoz_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN SUBNUCLEOSOME (INTERMEDIATE FORM) organism=? : x : ARG xxxx A0083 <- 4.41 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.90 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx >7yoz_B:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN SUBNUCLEOSOME (INTERMEDIATE FORM) organism=? : x : ARG xxxx B0045 <- 3.90 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx >7yp9_CD: title=CRYO-EM STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI PAUSED COMPLEX OF TRANSCRIPTION TERMINATION (TTC-PAUSE) organism=? : H : ARG NH1 C0542 <- 2.93 -> DG N7 G-001 : score 5.8927 : H : ARG NH1 D0270 <- 2.74 -> DG O6 G0010 : score 6.15633 : H : ARG NH1 D0270 <- 2.74 -> DG O6 G0010 : score 6.15633 : x : SER xxxx C0055 <- 3.29 -> DA xxx F-003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0056 <- 4.00 -> DA xxx F-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0180 <- 3.14 -> DA xxx F-003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.09 -> DA xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.01 -> DA xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0393 <- 3.53 -> DA xxx F-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0465 <- 3.09 -> DA xxx F-003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0469 <- 3.52 -> DA xxx F-003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0508 <- 3.92 -> DA xxx G0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0567 <- 4.23 -> DA xxx G0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C1242 <- 4.42 -> DA xxx G0003 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0042 <- 4.34 -> DC xxx F-010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0047 <- 3.63 -> DT xxx F-012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0120 <- 3.43 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0212 <- 3.41 -> DT xxx G-011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0253 <- 3.41 -> DG xxx G0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0262 <- 4.31 -> DG xxx G0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0264 <- 4.48 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0267 <- 3.04 -> DG xxx F-009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 3.06 -> DG xxx F-009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0274 <- 3.54 -> DG xxx F-009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 2.97 -> DA xxx F-004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.41 -> DA xxx G0000 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.69 -> DA xxx G0000 : score x.xxxxx >7yp9_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI PAUSED COMPLEX OF TRANSCRIPTION TERMINATION (TTC-PAUSE) organism=? : H : ARG NH1 D0270 <- 2.74 -> DG O6 G0010 : score 6.15633 : x : GLU xxxx D0042 <- 4.34 -> DC xxx F-010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0047 <- 3.63 -> DT xxx F-012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0120 <- 3.43 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0212 <- 3.41 -> DT xxx G-011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0253 <- 3.41 -> DG xxx G0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0262 <- 4.31 -> DG xxx G0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0264 <- 4.48 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0267 <- 3.04 -> DG xxx F-009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0271 <- 3.06 -> DG xxx F-009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0274 <- 3.54 -> DG xxx F-009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 2.97 -> DA xxx F-004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.41 -> DA xxx G0000 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.69 -> DA xxx G0000 : score x.xxxxx >7ypa_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI HAIRPIN-NUCLEATION COMPLEX OF TRANSCRIPTION TERMINATION (TTC-HAIRPIN) organism=? : H : ARG NH1 C0542 <- 3.24 -> DG O6 G-001 : score 5.548 : x : SER xxxx C0055 <- 3.53 -> DA xxx F-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0180 <- 3.39 -> DA xxx F-003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.23 -> DA xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.38 -> DA xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0393 <- 3.72 -> DA xxx F-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0394 <- 4.33 -> DT xxx F-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0465 <- 3.96 -> DA xxx F-003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0469 <- 3.72 -> DA xxx F-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0473 <- 4.43 -> DA xxx F-003 : score x.xxxxx >7ypa_CD: title=CRYO-EM STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI HAIRPIN-NUCLEATION COMPLEX OF TRANSCRIPTION TERMINATION (TTC-HAIRPIN) organism=? : H : ARG NH1 C0542 <- 3.24 -> DG O6 G-001 : score 5.548 : x : SER xxxx C0055 <- 3.53 -> DA xxx F-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0180 <- 3.39 -> DA xxx F-003 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.23 -> DA xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.38 -> DA xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0393 <- 3.72 -> DA xxx F-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0394 <- 4.33 -> DT xxx F-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0465 <- 3.96 -> DA xxx F-003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0469 <- 3.72 -> DA xxx F-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0473 <- 4.43 -> DA xxx F-003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0253 <- 4.27 -> DG xxx G0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0255 <- 3.80 -> DG xxx G0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0261 <- 3.39 -> DG xxx G0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 3.29 -> DG xxx F-009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0274 <- 4.30 -> DG xxx F-009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 3.35 -> DA xxx F-005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.94 -> DA xxx G0000 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.78 -> DA xxx G0000 : score x.xxxxx >7ypb_CD: title=CRYO-EM STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI RELEASE COMPLEX OF TRANSCRIPTION TERMINATION (TTC-RELEASE) organism=? : H : ARG NE C0200 <- 2.80 -> DT O2 F0000 : score 2.57692 : x : SER xxxx C0182 <- 3.89 -> DA xxx F-002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.18 -> DT xxx F0000 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.96 -> DT xxx F-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0371 <- 3.27 -> DT xxx F-004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 4.39 -> DT xxx F-004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.13 -> DG xxx G-001 : score x.xxxxx >7ypo_ABCD: title=CRYO-EM STRUCTURE OF BACULOVIRUS LEF-3 IN COMPLEX WITH SSDNA organism=? : x : TYR xxxx A0311 <- 3.24 -> DA xxx Q0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0313 <- 2.76 -> DA xxx Q0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0361 <- 2.97 -> DA xxx Q0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0363 <- 3.32 -> DA xxx Q0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0230 <- 3.84 -> DA xxx Q0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0311 <- 3.13 -> DA xxx Q0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0313 <- 2.77 -> DA xxx Q0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0361 <- 2.99 -> DA xxx Q0011 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0363 <- 3.35 -> DA xxx Q0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0230 <- 3.52 -> DA xxx Q0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0311 <- 3.24 -> DA xxx Q0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0313 <- 2.69 -> DA xxx Q0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0361 <- 3.03 -> DA xxx Q0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0363 <- 3.40 -> DA xxx Q0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0068 <- 2.98 -> DA xxx Q0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0230 <- 3.80 -> DA xxx Q0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0311 <- 3.21 -> DA xxx Q0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0313 <- 2.85 -> DA xxx Q0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0361 <- 2.98 -> DA xxx Q0023 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0363 <- 3.29 -> DA xxx Q0023 : score x.xxxxx >7ypo_D: title=CRYO-EM STRUCTURE OF BACULOVIRUS LEF-3 IN COMPLEX WITH SSDNA organism=? : x : ASN xxxx D0068 <- 2.98 -> DA xxx Q0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0230 <- 3.80 -> DA xxx Q0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0311 <- 3.21 -> DA xxx Q0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0313 <- 2.85 -> DA xxx Q0022 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0361 <- 2.98 -> DA xxx Q0023 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0363 <- 3.29 -> DA xxx Q0023 : score x.xxxxx >7ypq_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF ONE BACULOVIRUS LEF-3 MOLECULE IN COMPLEX WITH SSDNA organism=? : x : ASN xxxx A0229 <- 3.88 -> DA xxx Q0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0230 <- 4.00 -> DA xxx Q0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0311 <- 3.55 -> DA xxx Q0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0360 <- 4.26 -> DA xxx Q0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0363 <- 3.67 -> DA xxx Q0007 : score x.xxxxx >7yq3_E:L_domain-like;Fibronectin_type_III;Growth_factor_receptor_domain; title=HUMAN INSULIN RECEPTOR BOUND WITH A43 DNA APTAMER AND INSULIN organism=? : x : TYR xxxx E0477 <- 3.33 -> DC xxx G0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0488 <- 3.50 -> DC xxx G0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx E0551 <- 3.51 -> DC xxx G0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0554 <- 3.74 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0703 <- 4.11 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx >7yq3_EF:L_domain-like;Fibronectin_type_III;Growth_factor_receptor_domain; title=HUMAN INSULIN RECEPTOR BOUND WITH A43 DNA APTAMER AND INSULIN organism=? : x : TYR xxxx E0477 <- 3.33 -> DC xxx G0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0488 <- 3.50 -> DC xxx G0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx E0551 <- 3.51 -> DC xxx G0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0554 <- 3.74 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0703 <- 4.11 -> DG xxx G0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0271 <- 4.29 -> DC xxx G0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0272 <- 3.42 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0325 <- 3.22 -> DG xxx G0011 : score x.xxxxx >7yqk_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF GAMMAH2AXK15UB-H4K20ME2 NUCLEOSOME BOUND TO 53BP1 organism=? : H : ARG NH2 C0011 <- 3.05 -> DT O2 I-042 : score 4.02167 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.08 -> DG N3 I0009 : score 3.40808 : H : ARG NH2 G0011 <- 2.37 -> DT O2 I0043 : score 4.5974 : x : ARG xxxx A0040 <- 2.79 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.38 -> DG xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.08 -> DA xxx J0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 4.37 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.26 -> DA xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.30 -> DC xxx J0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.62 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.30 -> DG xxx I0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.46 -> DC xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.98 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.51 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx >7yqk_E:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF GAMMAH2AXK15UB-H4K20ME2 NUCLEOSOME BOUND TO 53BP1 organism=? : H : ARG NH2 E0040 <- 3.08 -> DG N3 I0009 : score 3.40808 >7yrd_A:Histone-fold; title=HISTONE METHYLTRANSFERASE organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.49 -> DA N3 J0228 : score 3.44061 : x : PRO xxxx A0043 <- 4.10 -> DG xxx J0227 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.01 -> DT xxx J0237 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.08 -> DA xxx J0245 : score x.xxxxx >7yrd_C:Histone-fold; title=HISTONE METHYLTRANSFERASE organism=? : x : ARG xxxx C0045 <- 4.12 -> DA xxx J0256 : score x.xxxxx >7yrg_B:Histone-fold; title=HISTONE METHYLTRANSFERASE organism=? : x : ARG xxxx B0045 <- 3.67 -> DG xxx I0068 : score x.xxxxx >7ysf_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZNF524 ZF1-4 IN COMPLEX WITH TELOMERIC DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0131 <- 2.80 -> DT O4 B0012 : score 3.26795 : H : SER OG A0155 <- 2.75 -> DA N7 C0005 : score 4.50874 : H : HIS NE2 A0156 <- 3.02 -> DG N7 B0010 : score 6.50325 : H : ARG NH1 A0159 <- 2.95 -> DG O6 B0009 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0159 <- 2.89 -> DG N7 B0009 : score 6.26969 : w : ARG NH1 A0159 <- 5.53 -> DC N4 C0007 : score 1.892 : H : ARG NH1 A0180 <- 3.41 -> DG N7 B0008 : score 5.3119 : H : ARG NH2 A0180 <- 3.09 -> DG O6 B0008 : score 6.2172 : w : GLU OE1 A0181 <- 5.52 -> DC N4 C0008 : score 3.528 : w : GLU OE2 A0181 <- 5.59 -> DC N4 C0007 : score 3.597 : w : GLU OE2 A0184 <- 5.78 -> DC N4 C0008 : score 3.597 : w : GLU OE2 A0184 <- 6.18 -> DC N4 C0009 : score 3.597 : w : ASN ND2 A0211 <- 5.09 -> DT O4 B0005 : score 3.275 : w : ASN ND2 A0211 <- 5.28 -> DA N7 C0011 : score 1.989 : H : ARG NH1 A0215 <- 2.62 -> DG O6 B0004 : score 6.30233 : H : ARG NH2 A0215 <- 2.84 -> DG N7 B0004 : score 6.33354 : w : ARG NH1 A0215 <- 6.19 -> DA N6 C0012 : score 1.486 : V : ASN CB A0211 <- 3.63 -> DT C7 C0010 : score 2.01978 >7yuk_A: title=COMPLEX STRUCTURE OF BANP BEN DOMAIN BOUND TO DNA organism=? : H : SER OG A0313 <- 2.57 -> DT O4 C0004 : score 3.71866 : w : SER OG A0313 <- 5.68 -> DC N4 C0003 : score 2.105 : H : ARG NE A0316 <- 3.06 -> DG N7 D0008 : score 4.19186 : H : ARG NH2 A0316 <- 2.77 -> DG O6 D0008 : score 6.6396 : w : THR OG1 A0317 <- 5.57 -> DC N4 C0003 : score 2.558 : x : SER xxxx A0310 <- 4.36 -> DT xxx C0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0320 <- 4.23 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx >7yul_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN BEND6 BEN DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=? : H : SER OG A0216 <- 2.93 -> DG N3 C0006 : score 2.69973 : H : THR OG1 A0218 <- 3.02 -> DG N2 C0006 : score 3.84116 : H : ARG NH1 A0254 <- 2.78 -> DG N7 C0006 : score 6.0742 A : H : ARG NH2 A0254 <- 2.90 -> DG O6 C0006 : score 6.468 A : H : ASN ND2 A0261 <- 2.81 -> DG N7 C0008 : score 4.57673 : H : LYS NZ A0265 <- 2.76 -> DG O6 C0010 : score 5.82702 : w : LYS NZ A0265 <- 5.44 -> DG N7 C0010 : score 2.519 : w : LYS NZ A0265 <- 6.06 -> DA N6 C0009 : score 2.097 : x : SER xxxx A0217 <- 3.41 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx >7yun_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN BEND6 BEN DOMAIN IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=? : w : SER OG A0216 <- 5.74 -> DG N3 D0006 : score 2.344 : H : SER OG A0217 <- 2.77 -> DG N3 C0008 : score 2.78843 : w : SER OG A0217 <- 6.09 -> DG N3 D0006 : score 2.344 : w : THR OG1 A0218 <- 5.61 -> DG N2 D0006 : score 2.036 : w : GLN OE1 A0258 <- 6.33 -> DC N4 C0005 : score 3.488 : H : ASN ND2 A0261 <- 2.96 -> DG N7 D0008 : score 4.43915 : w : ASN ND2 A0261 <- 5.80 -> DT O4 C0004 : score 3.275 : w : ASN OD1 A0262 <- 5.66 -> DC N4 C0003 : score 2.732 : H : SER OG B0216 <- 2.81 -> DG N3 C0006 : score 2.76625 : H : SER OG B0217 <- 3.21 -> DG N2 D0008 : score 3.09766 : H : SER OG B0217 <- 2.75 -> DG N3 D0008 : score 2.79951 : H : THR OG1 B0218 <- 3.08 -> DG N2 C0006 : score 3.79294 : H : ARG NH1 B0254 <- 2.83 -> DG N7 C0006 : score 6.0137 : H : ARG NH2 B0254 <- 2.80 -> DG O6 C0006 : score 6.6 : w : ARG NH2 B0254 <- 6.00 -> DG O6 D0006 : score 2.468 : w : GLN OE1 B0258 <- 5.64 -> DC N4 D0005 : score 3.488 : H : ASN ND2 B0261 <- 2.93 -> DG N7 C0008 : score 4.46666 : H : ASN OD1 B0262 <- 2.83 -> DC N4 D0003 : score 4.16843 : x : ARG xxxx A0254 <- 3.91 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx >7yun_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN BEND6 BEN DOMAIN IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=? : H : SER OG B0216 <- 2.81 -> DG N3 C0006 : score 2.76625 : H : SER OG B0217 <- 3.21 -> DG N2 D0008 : score 3.09766 : H : SER OG B0217 <- 2.75 -> DG N3 D0008 : score 2.79951 : H : THR OG1 B0218 <- 3.08 -> DG N2 C0006 : score 3.79294 : H : ARG NH1 B0254 <- 2.83 -> DG N7 C0006 : score 6.0137 : H : ARG NH2 B0254 <- 2.80 -> DG O6 C0006 : score 6.6 : w : ARG NH2 B0254 <- 6.00 -> DG O6 D0006 : score 2.468 : w : GLN OE1 B0258 <- 5.64 -> DC N4 D0005 : score 3.488 : H : ASN ND2 B0261 <- 2.93 -> DG N7 C0008 : score 4.46666 : H : ASN OD1 B0262 <- 2.83 -> DC N4 D0003 : score 4.16843 >7ywx_E:Histone-fold; title=STRUCTURE OF THE HUMAN CCAN CENP-A ALPHA-SATELLITE COMPLEX organism=HOMO SAPIENS : x : LEU xxxx E0065 <- 3.91 -> DT xxx i0018 : score x.xxxxx >7yyh_N: title=STRUCTURE OF THE HUMAN CCANDELTAT CENP-A ALPHA-SATELLITE COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx N0169 <- 4.28 -> DG xxx J0044 : score x.xxxxx >7yz7_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ZEBRAFISH FOXH1 BOUND TO THE TGTGGATT SITE organism=Danio rerio : H : LYS NZ A0090 <- 2.78 -> DC O2 C0008 : score 2.95794 : w : LYS NZ A0090 <- 5.61 -> DA N3 B0010 : score 1.538 : H : TYR OH A0092 <- 2.73 -> DA N3 C0006 : score 4.2094 : H : ARG NH2 A0094 <- 3.05 -> DT O2 B0012 : score 4.02167 : H : ARG NH2 A0094 <- 3.10 -> DG N3 B0013 : score 3.39364 : H : ASP OD1 A0143 <- 2.95 -> DC N4 C0009 : score 5.18453 : w : ASP OD2 A0143 <- 6.07 -> DA N6 C0010 : score 3.409 : H : ARG NE A0146 <- 2.85 -> DG N7 B0006 : score 4.37758 : H : ARG NH2 A0146 <- 2.94 -> DG O6 B0006 : score 6.4152 : w : ARG NH2 A0146 <- 6.03 -> DA N6 C0010 : score 1.997 : H : HIS ND1 A0147 <- 2.79 -> DG O6 B0008 : score 6.23552 : H : LYS NZ A0168 <- 2.93 -> DT O2 B0005 : score 3.49391 : V : SER CB A0144 <- 3.82 -> DT C7 C0007 : score 3.11563 : x : ASN xxxx A0148 <- 4.27 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0150 <- 3.83 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx >7yza_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ZEBRAFISH FOXH1 BOUND TO THE TGTGTATT SITE organism=Danio rerio : H : LYS NZ A0090 <- 3.02 -> DA N3 C0008 : score 2.65474 : w : LYS NZ A0090 <- 5.72 -> DT O2 C0007 : score 0.522 : H : TYR OH A0092 <- 2.71 -> DA N3 C0006 : score 4.22601 : H : ARG NH2 A0094 <- 3.04 -> DT O2 B0012 : score 4.03013 : H : ARG NH2 A0094 <- 3.10 -> DG N3 B0013 : score 3.39364 : w : ARG NH1 A0094 <- 6.33 -> DA N3 B0014 : score 2.585 : H : ASP OD1 A0143 <- 3.05 -> DC N4 C0009 : score 5.07763 : w : ASP OD1 A0143 <- 5.72 -> DT O4 B0007 : score 2.616 : w : ASP OD2 A0143 <- 5.73 -> DA N6 C0010 : score 3.409 : H : ARG NE A0146 <- 2.81 -> DG N7 B0006 : score 4.41295 : H : ARG NH2 A0146 <- 2.85 -> DG O6 B0006 : score 6.534 : w : ARG NH2 A0146 <- 5.90 -> DA N6 C0010 : score 1.997 : w : HIS ND1 A0147 <- 5.31 -> DG O6 B0008 : score 4.006 : H : LYS NZ A0168 <- 3.04 -> DT O2 B0005 : score 3.41499 : w : LYS NZ A0168 <- 6.01 -> DA N3 C0012 : score 1.538 : V : SER CB A0144 <- 3.76 -> DT C7 C0007 : score 3.16259 : x : ASN xxxx A0148 <- 4.49 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0150 <- 3.66 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0152 <- 4.22 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx >7yzb_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN FOXH1 BOUND TO THE TGTGGATT SITE organism=Homo sapiens : H : TYR OH A0028 <- 2.68 -> DA N3 C0006 : score 4.25091 : H : ARG NH2 A0030 <- 3.19 -> DT O2 B0012 : score 3.90313 : H : ARG NH2 A0030 <- 2.89 -> DG N3 B0013 : score 3.54527 : w : ARG NH1 A0030 <- 5.87 -> DC O2 B0014 : score 1.381 : H : ASP OD1 A0079 <- 3.09 -> DC N4 C0009 : score 5.03487 : w : ASP OD1 A0079 <- 6.21 -> DC N4 C0008 : score 2.835 : w : ASP OD2 A0079 <- 5.94 -> DA N6 C0010 : score 3.409 : H : ARG NE A0082 <- 2.74 -> DG N7 B0006 : score 4.47486 : H : ARG NH2 A0082 <- 2.87 -> DG O6 B0006 : score 6.5076 : w : ARG NH2 A0082 <- 6.24 -> DA N6 C0010 : score 1.997 : H : HIS ND1 A0083 <- 2.80 -> DG O6 B0008 : score 6.22308 : H : LYS NZ A0104 <- 2.84 -> DT O2 B0004 : score 3.55848 : H : LYS NZ A0104 <- 2.62 -> DT O2 C0014 : score 3.71632 : x : SER xxxx A0080 <- 3.65 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0084 <- 4.12 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0086 <- 3.73 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx >7yzc_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ZEBRAFISH FOXH1 BOUND TO THE TGTTTATT SITE organism=Danio rerio : H : TYR OH A0092 <- 2.61 -> DA N3 C0006 : score 4.30903 : H : ARG NH2 A0094 <- 3.17 -> DT O2 B0012 : score 3.92007 : H : ARG NH2 A0094 <- 3.35 -> DG N3 B0013 : score 3.21313 : H : ASP OD1 A0143 <- 3.19 -> DA N6 C0009 : score 3.21045 : w : ASP OD1 A0143 <- 5.82 -> DT O4 B0007 : score 2.616 : w : ASP OD1 A0143 <- 5.70 -> DA N7 C0008 : score 2.429 : H : ARG NE A0146 <- 2.83 -> DG N7 B0006 : score 4.39526 : H : ARG NH2 A0146 <- 3.12 -> DG O6 B0006 : score 6.1776 : H : HIS ND1 A0147 <- 2.83 -> DT O4 B0008 : score 4.69219 : w : HIS NE2 A0147 <- 5.90 -> DT O4 C0007 : score 2.296 : H : LYS NZ A0168 <- 3.03 -> DT O2 B0005 : score 3.42217 : x : SER xxxx A0144 <- 3.61 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0148 <- 4.39 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0150 <- 3.74 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >7yzd_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE ZEBRAFISH FOXH1 BOUND TO THE TGTTTACT SITE (FKH MOTIF GTAAACA) organism=Danio rerio : H : TYR OH A0092 <- 2.51 -> DG N3 C0006 : score 3.29472 : H : ARG NH2 A0094 <- 3.22 -> DT O2 B0012 : score 3.87773 : H : ARG NH2 A0094 <- 3.11 -> DG N3 B0013 : score 3.38642 : H : ASP OD1 A0143 <- 3.15 -> DA N6 C0009 : score 3.23831 : w : ASP OD1 A0143 <- 5.49 -> DT O4 B0007 : score 2.616 : H : ARG NE A0146 <- 2.85 -> DG N7 B0006 : score 4.37758 : H : HIS ND1 A0147 <- 2.53 -> DT O4 B0008 : score 4.97542 : H : LYS NZ A0168 <- 2.78 -> DT O2 B0005 : score 3.60153 : V : SER CB A0144 <- 3.72 -> DT C7 C0007 : score 3.19391 : x : SER xxxx A0150 <- 3.52 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0151 <- 3.88 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >7yze_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN FOXA2 BOUND TO THE TGTTTACT SITE (FORKHEAD MOTIF GTAAACA) organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 A0205 <- 3.38 -> DA N6 C0009 : score 5.32327 : H : ASN ND2 A0205 <- 3.11 -> DA N7 C0009 : score 5.50654 : w : ASN OD1 A0205 <- 6.40 -> DA N6 C0008 : score 2.837 : w : ARG NH2 A0208 <- 5.32 -> DG O6 B0006 : score 2.468 : H : HIS ND1 A0209 <- 3.12 -> DT O4 B0008 : score 4.4184 : w : HIS NE2 A0209 <- 5.90 -> DG N7 C0006 : score 3.601 : V : ARG CZ A0208 <- 3.84 -> DT C7 B0005 : score 2.11098 : x : SER xxxx A0206 <- 3.60 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0212 <- 3.78 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0213 <- 4.24 -> DT xxx B0009 : score x.xxxxx >7yzf_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN FOXA2 BOUND TO THE TGTTTATT SITE (FORKHEAD MOTIF ATAAACA) organism=Homo sapiens : H : ASN OD1 C0205 <- 3.16 -> DA N6 B0009 : score 5.58823 : H : ASN ND2 C0205 <- 3.13 -> DA N7 B0009 : score 5.48306 : V : ARG CB C0208 <- 3.85 -> DT C7 A0007 : score 0.992564 : x : SER xxxx C0206 <- 3.70 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0209 <- 3.01 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0212 <- 3.73 -> DT xxx A0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0213 <- 4.15 -> DT xxx A0009 : score x.xxxxx >7yzg_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE XENOPUS FOXH1 BOUND TO THE TGTGGATT SITE organism=Xenopus laevis : H : ASP OD2 A0163 <- 3.40 -> DC N4 C0008 : score 5.456 : H : HIS ND1 A0167 <- 2.82 -> DG O6 B0009 : score 6.19818 : V : ARG CZ A0166 <- 3.61 -> DT C7 B0006 : score 2.23359 : x : ARG xxxx A0114 <- 3.31 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0164 <- 4.15 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0170 <- 3.38 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0188 <- 3.20 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx >7yzo_ACD:Metallo-dependent_phosphatases;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=ENDONUCLEASE STATE OF THE E. COLI MRE11-RAD50 (SBCCD) HEAD COMPLEX BOUND TO ADP AND DSDNA organism=? : x : LYS xxxx C0890 <- 4.45 -> DT xxx F0046 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0110 <- 3.49 -> DT xxx F0034 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0204 <- 4.45 -> DC xxx E-034 : score x.xxxxx >7yzo_D:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=ENDONUCLEASE STATE OF THE E. COLI MRE11-RAD50 (SBCCD) HEAD COMPLEX BOUND TO ADP AND DSDNA organism=? : x : GLN xxxx D0110 <- 3.49 -> DT xxx F0034 : score x.xxxxx >7z03_ACD:Metallo-dependent_phosphatases;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=ENDONUCLEASE STATE OF THE E. COLI MRE11-RAD50 (SBCCD) HEAD COMPLEX BOUND TO ADP AND EXTENDED DSDNA organism=? : x : GLN xxxx D0110 <- 3.98 -> DT xxx F0034 : score x.xxxxx >7z0o_CDE:Histone-fold; title=STRUCTURE OF TRANSCRIPTION FACTOR UAF IN COMPLEX WITH TBP AND 35S RRNA PROMOTER DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 E0295 <- 3.12 -> DC O2 T0064 : score 3.462 : H : LYS NZ E0308 <- 3.16 -> DG N7 N-058 : score 4.99811 : x : ARG xxxx C0050 <- 3.63 -> DT xxx T0074 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx E0307 <- 3.87 -> DT xxx N-060 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0309 <- 3.43 -> DT xxx N-060 : score x.xxxxx >7z0o_E: title=STRUCTURE OF TRANSCRIPTION FACTOR UAF IN COMPLEX WITH TBP AND 35S RRNA PROMOTER DNA organism=SACCHAROMYCES CEREVISIAE : H : ARG NH2 E0295 <- 3.12 -> DC O2 T0064 : score 3.462 : H : LYS NZ E0308 <- 3.16 -> DG N7 N-058 : score 4.99811 : x : ASP xxxx E0307 <- 3.87 -> DT xxx N-060 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0309 <- 3.43 -> DT xxx N-060 : score x.xxxxx >7z0u_A:WRKY_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ATWRKY18 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH W- BOX DNA organism=Arabidopsis thaliana : w : LYS NZ A0187 <- 5.51 -> DG O6 C0006 : score 3.005 : x : LYS xxxx A0183 <- 4.02 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0184 <- 4.46 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0186 <- 4.01 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0198 <- 3.57 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >7z1l_ABE:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF YEAST RNA POLYMERASE III PRE-TERMINATION COMPLEX (PTC) organism=? : H : ARG NH2 B0481 <- 2.75 -> DT O2 S0027 : score 4.27567 : x : ARG xxxx A0152 <- 4.30 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0185 <- 3.94 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1373 <- 4.09 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0479 <- 3.96 -> DT xxx S0026 : score x.xxxxx >7z1l_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=STRUCTURE OF YEAST RNA POLYMERASE III PRE-TERMINATION COMPLEX (PTC) organism=? : H : ARG NH2 B0481 <- 2.75 -> DT O2 S0027 : score 4.27567 : x : LYS xxxx B0479 <- 3.96 -> DT xxx S0026 : score x.xxxxx >7z1m_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=STRUCTURE OF YEAST RNA POLYMERASE III ELONGATION COMPLEX (EC) organism=? : x : LYS xxxx A0360 <- 3.86 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1373 <- 3.53 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx >7z1m_ABE:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF YEAST RNA POLYMERASE III ELONGATION COMPLEX (EC) organism=? : x : LYS xxxx A0360 <- 3.86 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1373 <- 3.53 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0479 <- 4.00 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0481 <- 3.03 -> DT xxx T0019 : score x.xxxxx >7z1n_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=STRUCTURE OF YEAST RNA POLYMERASE III DELTA C53-C37-C11 organism=? : x : ARG xxxx A0152 <- 3.60 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1373 <- 3.15 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx >7z1n_ABE:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF YEAST RNA POLYMERASE III DELTA C53-C37-C11 organism=? : x : ARG xxxx A0152 <- 3.60 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1373 <- 3.15 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0481 <- 4.18 -> DT xxx S0027 : score x.xxxxx >7z1o_ABE:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF YEAST RNA POLYMERASE III PTC + NTPS organism=? : x : ARG xxxx A0152 <- 4.30 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0185 <- 3.69 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1373 <- 4.29 -> DG xxx T0016 : score x.xxxxx >7z1z_DEIN:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=MVV STRAND TRANSFER COMPLEX (STC) INTASOME IN COMPLEX WITH LEDGF/P75 AT 3.5 A RESOLUTION organism=VISNA/MAEDI VIRUS EV1 KV1772 : H : ARG NH2 D0231 <- 2.60 -> DT O2 X0010 : score 4.40267 : H : ARG NE I0155 <- 3.32 -> DG N3 X0006 : score 1.57259 : x : GLN xxxx I0148 <- 3.09 -> DG xxx X0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0151 <- 3.60 -> DG xxx X0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0154 <- 3.80 -> DC xxx W0018 : score x.xxxxx >7z1z_FL:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=MVV STRAND TRANSFER COMPLEX (STC) INTASOME IN COMPLEX WITH LEDGF/P75 AT 3.5 A RESOLUTION organism=VISNA/MAEDI VIRUS EV1 KV1772 : H : ARG NH2 L0231 <- 2.60 -> DT O2 Y0010 : score 4.40267 >7z24_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DNA APTAMER IN COMPLEX WITH NEVIRAPINE organism=? : x : MET xxxx A0230 <- 3.52 -> DG xxx E0031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.06 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.50 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx >7z24_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DNA APTAMER IN COMPLEX WITH NEVIRAPINE organism=? : x : MET xxxx A0230 <- 3.52 -> DG xxx E0031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.06 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.50 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx >7z29_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NNRTI RESISTANT M184I/E138K MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DNA APTAMER IN COMPLEX WITH NEVIRAPINE organism=? : x : MET xxxx A0230 <- 3.84 -> DG xxx E0031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 3.94 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx >7z2d_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DNA APTAMER IN COMPLEX WITH RILPIVIRINE organism=? : x : LYS xxxx A0287 <- 4.11 -> DG xxx E0027 : score x.xxxxx >7z2e_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NNRTI RESISTANT M184I/E138K MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DNA APTAMER IN COMPLEX WITH RILPIVIRINE organism=? : x : ILE xxxx A0094 <- 3.59 -> DG xxx E0031 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0230 <- 4.21 -> DG xxx E0031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.29 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.43 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx >7z2e_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NNRTI RESISTANT M184I/E138K MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DNA APTAMER IN COMPLEX WITH RILPIVIRINE organism=? : x : ILE xxxx A0094 <- 3.59 -> DG xxx E0031 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0230 <- 4.21 -> DG xxx E0031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.29 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0475 <- 4.43 -> DG xxx E0019 : score x.xxxxx >7z2g_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DNA APTAMER IN COMPLEX WITH DORAVIRINE organism=? : x : ILE xxxx A0094 <- 3.19 -> DG xxx E0031 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0183 <- 4.08 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0230 <- 3.90 -> DG xxx E0032 : score x.xxxxx >7z2g_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DNA APTAMER IN COMPLEX WITH DORAVIRINE organism=? : x : ILE xxxx A0094 <- 3.19 -> DG xxx E0031 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0183 <- 4.08 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0230 <- 3.90 -> DG xxx E0032 : score x.xxxxx >7z2h_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NNRTI RESISTANT M184I/E138K MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE WITH A DNA APTAMER IN COMPLEX WITH DORAVIRINE organism=? : x : ILE xxxx A0094 <- 3.24 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0183 <- 3.59 -> DC xxx E0003 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0230 <- 3.90 -> DG xxx E0031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0265 <- 4.41 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0266 <- 4.10 -> DG xxx E0030 : score x.xxxxx >7z2z_ABE:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF YEAST RNA POLYMERASE III-DNA-TY1 INTEGRASE COMPLEX (POL III-DNA-IN1) AT 3.1 A organism=? : x : ARG xxxx A1373 <- 3.81 -> DC xxx T0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0482 <- 3.78 -> DT xxx T0018 : score x.xxxxx >7z4c_B: title=SPCAS9 BOUND TO 6 NUCLEOTIDE COMPLEMENTARY DNA SUBSTRATE organism=? : H : ARG NH1 B1333 <- 3.22 -> DG O6 D0001 : score 5.57233 : H : ARG NH2 B1333 <- 3.28 -> DG N7 D0001 : score 5.77169 : H : ARG NH1 B1335 <- 3.31 -> DG O6 D0002 : score 5.46283 : H : ARG NH2 B1335 <- 3.25 -> DG N7 D0002 : score 5.81 : x : LYS xxxx B0065 <- 4.43 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0072 <- 4.18 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0169 <- 3.74 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B1107 <- 2.90 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1108 <- 3.69 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1219 <- 3.72 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7z4d_E: title=CRYSTAL STRUCTURE OF SPCAS9 BOUND TO A 10 NUCLEOTIDE COMPLEMENTARY DNA SUBSTRATE organism=Streptococcus pyogenes : H : LYS NZ E1107 <- 3.12 -> DC O2 G-001 : score 2.7576 : H : ARG NH1 E1333 <- 3.35 -> DG N7 H0001 : score 5.3845 : H : ARG NH2 E1333 <- 2.49 -> DG O6 H0001 : score 7.0092 : H : ARG NH1 E1335 <- 2.83 -> DG N7 H0002 : score 6.0137 : H : ARG NH2 E1335 <- 2.79 -> DG O6 H0002 : score 6.6132 : x : LEU xxxx E0169 <- 4.01 -> DC xxx G0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0450 <- 3.93 -> DC xxx G0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0491 <- 4.15 -> DC xxx G0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0495 <- 3.51 -> DA xxx G0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0694 <- 3.88 -> DA xxx H-018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx E1012 <- 3.07 -> DC xxx H-020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E1108 <- 3.18 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E1219 <- 4.14 -> DG xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx E1332 <- 3.58 -> DT xxx G-003 : score x.xxxxx >7z4e_B: title=SPCAS9 BOUND TO 8-NUCLEOTIDE COMPLEMENTARY DNA SUBSTRATE organism=? : H : LYS NZ B1107 <- 3.02 -> DC O2 C-001 : score 2.81652 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.55 -> DG O6 D0001 : score 6.93 : H : ARG NH1 B1335 <- 2.63 -> DG O6 D0002 : score 6.29017 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.76 -> DG N7 D0002 : score 6.43569 : x : LEU xxxx B0169 <- 4.01 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0450 <- 3.98 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1108 <- 4.50 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1219 <- 4.30 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7z4g_B: title=SPCAS9 BOUND TO 12-NUCLEOTIDE COMPLEMENTARY DNA SUBSTRATE organism=? : H : ARG NH2 B1333 <- 2.48 -> DG N7 D0001 : score 6.79323 : H : ARG NH1 B1335 <- 3.22 -> DG O6 D0002 : score 5.57233 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.60 -> DG N7 D0002 : score 6.64 : x : TYR xxxx B0072 <- 3.96 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0169 <- 4.34 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0450 <- 3.86 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0491 <- 4.48 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0495 <- 4.00 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0588 <- 4.14 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0694 <- 3.31 -> DT xxx D-019 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0698 <- 4.33 -> DC xxx C0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B1107 <- 2.96 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1108 <- 3.37 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1219 <- 4.18 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7z4h_B: title=SPCAS9 BOUND TO 14-NUCLEOTIDE COMPLEMENTARY DNA SUBSTRATE organism=? : H : LYS NZ B1107 <- 3.13 -> DC O2 C-001 : score 2.75171 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.18 -> DG O6 D0001 : score 5.621 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.55 -> DG N7 D0001 : score 6.70385 : H : ARG NH1 B1335 <- 3.41 -> DG O6 D0002 : score 5.34117 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.84 -> DG N7 D0002 : score 6.33354 : x : TYR xxxx B0072 <- 4.44 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0169 <- 4.10 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0450 <- 3.81 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0491 <- 4.37 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0495 <- 3.59 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0588 <- 3.96 -> DG xxx D-016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0694 <- 3.01 -> DT xxx D-019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B1012 <- 3.63 -> DG xxx D-021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1108 <- 3.77 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1219 <- 3.90 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7z4i_B: title=SPCAS9 BOUND TO 16-NUCLEOTIDE COMPLEMENTARY DNA SUBSTRATE organism=? : H : LYS NZ B1107 <- 3.02 -> DC O2 C-001 : score 2.81652 : H : ARG NH1 B1333 <- 2.76 -> DG N7 D0001 : score 6.0984 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.31 -> DG O6 D0001 : score 7.2468 : H : ARG NH1 B1335 <- 2.56 -> DG O6 D0002 : score 6.37533 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.68 -> DG N7 D0002 : score 6.53785 : x : GLU xxxx B1219 <- 3.93 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B1332 <- 4.08 -> DT xxx C-003 : score x.xxxxx >7z4k_B: title=SPCAS9 BOUND TO 10-NUCLEOTIDE COMPLEMENTARY DNA SUBSTRATE organism=? : H : ARG NH1 B1333 <- 3.21 -> DG N7 D0001 : score 5.5539 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.41 -> DG O6 D0001 : score 7.1148 : H : ARG NH1 B1335 <- 3.08 -> DG N7 D0002 : score 5.7112 : H : ARG NH1 B1335 <- 2.65 -> DG O6 D0002 : score 6.26583 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.69 -> DG N7 D0002 : score 6.52508 : x : LEU xxxx B0169 <- 4.04 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0447 <- 4.33 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0450 <- 4.23 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0491 <- 4.16 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0495 <- 3.76 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B1107 <- 3.27 -> DC xxx C-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1108 <- 3.63 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B1219 <- 4.09 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7z4l_B: title=SPCAS9 BOUND TO 18-NUCLEOTIDE COMPLEMENTARY DNA SUBSTRATE IN THE CHECKPOINT STATE organism=? : H : LYS NZ B1107 <- 2.81 -> DC O2 C-001 : score 2.94026 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.00 -> DG N7 D0001 : score 5.808 : H : ARG NH2 B1333 <- 3.02 -> DG O6 D0001 : score 6.3096 : H : ARG NH1 B1335 <- 2.65 -> DG O6 D0002 : score 6.26583 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.79 -> DG N7 D0002 : score 6.39738 : x : ASP xxxx B1332 <- 4.11 -> DT xxx C-003 : score x.xxxxx >7z5a_A:S13-like_H2TH_domain;N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRAPPED COMPLEX OF MOUSE ENDONUCLEASE VIII- LIKE 3 (MNEIL3) AND HAIRPIN DNA WITH 5'OVERHANG organism=? : x : MET xxxx A0099 <- 3.62 -> DA xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0270 <- 3.41 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0272 <- 3.66 -> DA xxx E0008 : score x.xxxxx >7z5i_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=TRANSCRIPTION FACTOR MYF5 BOUND TO SYMMETRICAL SITE organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0092 <- 2.94 -> DC N4 E0007 : score 5.60645 : H : ARG NE B0091 <- 2.90 -> DG N7 F0005 : score 4.33336 : H : ARG NH2 B0091 <- 2.88 -> DG O6 F0005 : score 6.4944 : H : GLU OE1 B0092 <- 2.92 -> DC N4 F0007 : score 5.62952 : x : THR xxxx A0089 <- 3.40 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0091 <- 3.53 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0095 <- 3.49 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0089 <- 3.22 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0095 <- 3.79 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx >7z5i_B:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=TRANSCRIPTION FACTOR MYF5 BOUND TO SYMMETRICAL SITE organism=Homo sapiens : H : ARG NE B0091 <- 2.90 -> DG N7 F0005 : score 4.33336 : H : ARG NH2 B0091 <- 2.88 -> DG O6 F0005 : score 6.4944 : H : GLU OE1 B0092 <- 2.92 -> DC N4 F0007 : score 5.62952 : x : THR xxxx B0089 <- 3.22 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0095 <- 3.79 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx >7z5k_AB:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=TRANSCRIPTION FACTOR MYF5 BOUND TO NON-SYMMETRICAL SITE organism=Homo sapiens : w : ARG NE A0091 <- 6.21 -> DA N6 E0005 : score 1.081 : w : ARG NH2 A0091 <- 6.34 -> DA N6 E0005 : score 1.997 : H : GLU OE1 A0092 <- 3.32 -> DC N4 E0007 : score 5.16808 : w : GLU OE2 A0092 <- 6.58 -> DC N4 F0010 : score 3.597 : H : ARG NH2 B0085 <- 2.67 -> DG N7 E0012 : score 6.55062 : H : GLU OE1 B0092 <- 3.27 -> DC N4 F0007 : score 5.22576 : w : GLU OE2 B0092 <- 5.81 -> DC N4 E0010 : score 3.597 : x : ARG xxxx A0085 <- 3.36 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0089 <- 3.98 -> DT xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0095 <- 3.68 -> DA xxx E0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0089 <- 3.85 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0091 <- 3.62 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0095 <- 3.51 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx >7z5k_B:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=TRANSCRIPTION FACTOR MYF5 BOUND TO NON-SYMMETRICAL SITE organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 B0085 <- 2.67 -> DG N7 E0012 : score 6.55062 : H : GLU OE1 B0092 <- 3.27 -> DC N4 F0007 : score 5.22576 : w : GLU OE2 B0092 <- 5.81 -> DC N4 E0010 : score 3.597 : x : THR xxxx B0089 <- 3.85 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0091 <- 3.62 -> DG xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0095 <- 3.51 -> DC xxx F0007 : score x.xxxxx >7z6h_DEFG:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF DNA-BOUND HUMAN RAD17-RFC CLAMP LOADER AND 9-1-1 CHECKPOINT CLAMP organism=HOMO SAPIENS : x : ASN xxxx E0102 <- 3.12 -> DT xxx X0061 : score x.xxxxx >7z6h_K:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF DNA-BOUND HUMAN RAD17-RFC CLAMP LOADER AND 9-1-1 CHECKPOINT CLAMP organism=HOMO SAPIENS : x : PHE xxxx K0395 <- 3.59 -> DG xxx X0054 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx K0397 <- 4.27 -> DG xxx X0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0398 <- 3.56 -> DC xxx Y0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx K0405 <- 3.75 -> DC xxx Y0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx K0521 <- 3.07 -> DC xxx Y0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx K0523 <- 4.19 -> DG xxx X0054 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx K0524 <- 4.35 -> DG xxx X0054 : score x.xxxxx >7z6o_A:SPOC_domain-like;vWA-like; title=X-RAY STUDIES OF KU70/80 REVEAL THE BINDING SITE FOR IP6 organism=? : x : ARG xxxx A0254 <- 4.18 -> DA xxx D0033 : score x.xxxxx >7z6o_AB:SPOC_domain-like;vWA-like; title=X-RAY STUDIES OF KU70/80 REVEAL THE BINDING SITE FOR IP6 organism=? : H : ARG NH2 B0400 <- 2.54 -> DA N3 D0024 : score 3.40821 : x : ARG xxxx A0254 <- 4.18 -> DA xxx D0033 : score x.xxxxx >7z7n_D:TATA-box_binding_protein-like; title=MOT1E1434Q:TBP:DNA - SUBSTRATE RECOGNITION STATE organism=? : H : ASN ND2 D0084 <- 2.82 -> DT O2 B0008 : score 4.72717 : H : ASN ND2 D0174 <- 2.97 -> DA N3 A0029 : score 3.67823 : x : VAL xxxx D0086 <- 4.12 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0114 <- 3.32 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0115 <- 3.75 -> DG xxx A0033 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0129 <- 3.68 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0131 <- 3.38 -> DA xxx A0032 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0137 <- 4.45 -> DA xxx A0031 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0176 <- 3.96 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0205 <- 3.40 -> DA xxx A0027 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0206 <- 3.59 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0220 <- 3.66 -> DA xxx A0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0222 <- 3.66 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0228 <- 3.94 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0230 <- 4.30 -> DA xxx A0029 : score x.xxxxx >7z7n_DE:TATA-box_binding_protein-like;ARM_repeat;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MOT1E1434Q:TBP:DNA - SUBSTRATE RECOGNITION STATE organism=? : H : ASN ND2 D0084 <- 2.82 -> DT O2 B0008 : score 4.72717 : H : ASN ND2 D0174 <- 2.97 -> DA N3 A0029 : score 3.67823 : x : VAL xxxx D0086 <- 4.12 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0114 <- 3.32 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0115 <- 3.75 -> DG xxx A0033 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0129 <- 3.68 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0131 <- 3.38 -> DA xxx A0032 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0137 <- 4.45 -> DA xxx A0031 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0176 <- 3.96 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0205 <- 3.40 -> DA xxx A0027 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0206 <- 3.59 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0220 <- 3.66 -> DA xxx A0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0222 <- 3.66 -> DT xxx B0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0228 <- 3.94 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0230 <- 4.30 -> DA xxx A0029 : score x.xxxxx >7z87_ABC:SPOC_domain-like;vWA-like;Protein_kinase-like_PK-like;ARM_repeat;C-terminal_domain_of_Ku80; title=DNA-PK IN THE ACTIVE STATE organism=? : H : ARG NH1 B0254 <- 3.18 -> DC O2 D0015 : score 3.3726 A : x : ARG xxxx A0264 <- 3.86 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A2736 <- 3.18 -> DG xxx E0041 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A2739 <- 3.28 -> DG xxx E0043 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A2740 <- 3.98 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A2743 <- 3.05 -> DG xxx E0043 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A2744 <- 3.58 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0400 <- 3.77 -> DG xxx E0021 : score x.xxxxx >7z87_C:SPOC_domain-like;vWA-like;C-terminal_domain_of_Ku80; title=DNA-PK IN THE ACTIVE STATE organism=? : x : ARG xxxx C0400 <- 3.77 -> DG xxx E0021 : score x.xxxxx >7z88_ABC:SPOC_domain-like;vWA-like;Protein_kinase-like_PK-like;ARM_repeat;C-terminal_domain_of_Ku80; title=DNA-PK IN THE INTERMEDIATE STATE organism=? : H : ARG NH1 B0254 <- 2.96 -> DC O2 D0015 : score 3.5332 : x : TYR xxxx B0032 <- 4.06 -> DG xxx E0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0400 <- 4.14 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx >7z88_C:SPOC_domain-like;vWA-like;C-terminal_domain_of_Ku80; title=DNA-PK IN THE INTERMEDIATE STATE organism=? : x : ARG xxxx C0400 <- 4.14 -> DT xxx E0022 : score x.xxxxx >7z8s_E:ARM_repeat;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MOT1:TBP:DNA - POST HYDROLYSIS STATE organism=? : x : HIS xxxx E1586 <- 3.29 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E1588 <- 3.28 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E1591 <- 4.49 -> DG xxx A0015 : score x.xxxxx >7z9c_AB:Type_II_DNA_topoisomerase;GyrA/ParC_C-terminal_domain-like; title=E.COLI GYRASE HOLOCOMPLEX WITH 217 BP DNA AND ALBICIDIN organism=? : x : SER xxxx A0083 <- 4.12 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0174 <- 3.58 -> DC xxx G0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0447 <- 3.53 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0449 <- 3.88 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx >7z9c_C:Type_II_DNA_topoisomerase; title=E.COLI GYRASE HOLOCOMPLEX WITH 217 BP DNA AND ALBICIDIN organism=? : x : ARG xxxx C0032 <- 4.49 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0174 <- 3.42 -> DT xxx H0022 : score x.xxxxx >7z9c_CD:Type_II_DNA_topoisomerase;GyrA/ParC_C-terminal_domain-like; title=E.COLI GYRASE HOLOCOMPLEX WITH 217 BP DNA AND ALBICIDIN organism=? : x : ARG xxxx C0032 <- 4.49 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0174 <- 3.42 -> DT xxx H0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0449 <- 4.01 -> DT xxx H0020 : score x.xxxxx >7z9g_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=E.COLI GYRASE HOLOCOMPLEX WITH 217 BP DNA AND ALBI-2 organism=? : x : ASP xxxx A0082 <- 4.43 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0083 <- 3.44 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0119 <- 4.37 -> DA xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0174 <- 3.22 -> DC xxx G0022 : score x.xxxxx >7z9g_AB:Type_II_DNA_topoisomerase;GyrA/ParC_C-terminal_domain-like; title=E.COLI GYRASE HOLOCOMPLEX WITH 217 BP DNA AND ALBI-2 organism=? : x : ASP xxxx A0082 <- 4.43 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0083 <- 3.44 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0119 <- 4.37 -> DA xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0174 <- 3.22 -> DC xxx G0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0447 <- 4.16 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0449 <- 3.81 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx >7z9g_CD:Type_II_DNA_topoisomerase;GyrA/ParC_C-terminal_domain-like; title=E.COLI GYRASE HOLOCOMPLEX WITH 217 BP DNA AND ALBI-2 organism=? : x : ARG xxxx C0032 <- 4.34 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0174 <- 3.16 -> DT xxx H0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0449 <- 3.79 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx >7z9k_AB:Type_II_DNA_topoisomerase;GyrA/ParC_C-terminal_domain-like; title=E.COLI GYRASE HOLOCOMPLEX WITH 217 BP DNA AND ALBI-1 (SITE TG) organism=? : x : ASP xxxx A0082 <- 4.32 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0083 <- 3.69 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0174 <- 3.32 -> DC xxx G0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0447 <- 3.06 -> DC xxx G0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0449 <- 3.90 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx >7z9k_C:Type_II_DNA_topoisomerase; title=E.COLI GYRASE HOLOCOMPLEX WITH 217 BP DNA AND ALBI-1 (SITE TG) organism=? : x : ARG xxxx C0032 <- 3.92 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0084 <- 4.36 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0174 <- 3.36 -> DT xxx H0022 : score x.xxxxx >7z9k_CD:Type_II_DNA_topoisomerase;GyrA/ParC_C-terminal_domain-like; title=E.COLI GYRASE HOLOCOMPLEX WITH 217 BP DNA AND ALBI-1 (SITE TG) organism=? : x : ARG xxxx C0032 <- 3.92 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0084 <- 4.36 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0174 <- 3.36 -> DT xxx H0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0449 <- 3.68 -> DT xxx H0020 : score x.xxxxx >7z9m_AB:Type_II_DNA_topoisomerase;GyrA/ParC_C-terminal_domain-like; title=E.COLI GYRASE HOLOCOMPLEX WITH 217 BP DNA AND ALBI-1 (SITE AA) organism=? : x : ASP xxxx A0082 <- 4.41 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0083 <- 3.68 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0174 <- 3.33 -> DG xxx G0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0447 <- 3.96 -> DC xxx G0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0449 <- 3.95 -> DG xxx E0013 : score x.xxxxx >7z9m_C:Type_II_DNA_topoisomerase; title=E.COLI GYRASE HOLOCOMPLEX WITH 217 BP DNA AND ALBI-1 (SITE AA) organism=? : x : ARG xxxx C0032 <- 4.38 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0084 <- 4.47 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0174 <- 3.23 -> DG xxx H0023 : score x.xxxxx >7z9m_CD:Type_II_DNA_topoisomerase;GyrA/ParC_C-terminal_domain-like; title=E.COLI GYRASE HOLOCOMPLEX WITH 217 BP DNA AND ALBI-1 (SITE AA) organism=? : x : ARG xxxx C0032 <- 4.38 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0084 <- 4.47 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0174 <- 3.23 -> DG xxx H0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0449 <- 3.85 -> DA xxx F0013 : score x.xxxxx >7zb5_DE:TATA-box_binding_protein-like;ARM_repeat;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MOT1(1-1836):TBP:DNA - POST-HYDROLYSIS COMPLEX DIMER organism=? : H : ASN ND2 D0084 <- 2.61 -> DT O2 B0005 : score 4.92651 : H : ASN ND2 D0174 <- 3.44 -> DA N3 A0032 : score 3.32031 : H : THR OG1 D0230 <- 2.66 -> DA N3 A0031 : score 1.39175 : x : VAL xxxx D0086 <- 3.83 -> DA xxx A0032 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0114 <- 3.24 -> DG xxx A0035 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0129 <- 3.59 -> DG xxx A0034 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0131 <- 3.56 -> DG xxx A0034 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0137 <- 3.58 -> DG xxx A0033 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0139 <- 3.82 -> DG xxx A0033 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0176 <- 3.76 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0205 <- 3.16 -> DA xxx A0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0206 <- 3.79 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0220 <- 3.32 -> DA xxx A0029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0222 <- 3.63 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0228 <- 3.22 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E1587 <- 3.19 -> DC xxx A0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E1588 <- 2.97 -> DC xxx B0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E1592 <- 4.25 -> DC xxx B0023 : score x.xxxxx >7zb5_E:ARM_repeat;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MOT1(1-1836):TBP:DNA - POST-HYDROLYSIS COMPLEX DIMER organism=? : x : ILE xxxx E1587 <- 3.19 -> DC xxx A0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E1588 <- 2.97 -> DC xxx B0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E1592 <- 4.25 -> DC xxx B0023 : score x.xxxxx >7zes_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HUMAN SLFN11 DIMER BOUND TO SSDNA organism=? : H : GLU OE2 A0676 <- 3.19 -> DG N2 D0004 : score 3.97406 : x : GLU xxxx A0632 <- 4.27 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0651 <- 4.37 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0652 <- 3.60 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0674 <- 3.12 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0711 <- 3.26 -> DC xxx D0003 : score x.xxxxx >7zg5_C:Ribbon-helix-helix; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF SALMONELLA TACAT3-DNA COMPLEX organism=? : V : SER CB C0013 <- 3.75 -> DT C7 E0005 : score 3.17042 >7zi4_Q: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN INO80 COMPLEX BOUND TO A WT NUCLEOSOME organism=? : x : LYS xxxx Q0136 <- 3.73 -> DA xxx X-035 : score x.xxxxx >7zie_A:HMG-box; title=GCF1P, MULTIMERIZES AND BRIDGES THE MITOCHONDRIAL DNA FROM CANDIDA ALBICANS BY A SPECIFIC MECHANISM. organism=? : x : PHE xxxx A0168 <- 3.61 -> DA xxx Z0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0169 <- 3.35 -> DT xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0172 <- 3.97 -> DT xxx Y0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0182 <- 2.98 -> DT xxx Y0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0183 <- 4.20 -> DT xxx Z0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0186 <- 3.26 -> DA xxx Y0019 : score x.xxxxx >7zkl_H:Trypsin-like_serine_proteases; title=X-RAY STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN HUMAN ALPHA THROMBIN AND A PSEUDO-CYCLIC THROMBIN BINDING APTAMER (TBA-NNP/DDP) - CRYSTAL FORM ALPHA organism=? : H : ARG NE H0075 <- 3.35 -> DT O2 A0004 : score 2.29346 : H : ARG NH2 H0075 <- 2.31 -> DT O4 A0013 : score 3.90212 : H : GLU OE2 H0077 <- 2.92 -> DT N3 A0012 : score 2.57264 : H : ARG NE H0077 <- 2.96 -> DT O2 A0013 : score 2.49446 : x : ILE xxxx H0024 <- 3.52 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0071 <- 3.96 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0072 <- 4.15 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0076 <- 3.08 -> DT xxx A0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0079 <- 3.27 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0082 <- 4.21 -> DT xxx A0003 : score x.xxxxx >7zkl_HL:Trypsin-like_serine_proteases; title=X-RAY STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN HUMAN ALPHA THROMBIN AND A PSEUDO-CYCLIC THROMBIN BINDING APTAMER (TBA-NNP/DDP) - CRYSTAL FORM ALPHA organism=? : H : ARG NE H0075 <- 3.35 -> DT O2 A0004 : score 2.29346 : H : ARG NH2 H0075 <- 2.31 -> DT O4 A0013 : score 3.90212 : H : GLU OE2 H0077 <- 2.92 -> DT N3 A0012 : score 2.57264 : H : ARG NE H0077 <- 2.96 -> DT O2 A0013 : score 2.49446 : x : ILE xxxx H0024 <- 3.52 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0071 <- 3.96 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0072 <- 4.15 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0076 <- 3.08 -> DT xxx A0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0079 <- 3.27 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0082 <- 4.21 -> DT xxx A0003 : score x.xxxxx >7zkn_D:Trypsin-like_serine_proteases; title=X-RAY STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN HUMAN ALPHA THROMBIN AND A PSEUDO-CYCLIC THROMBIN BINDING APTAMER (TBA-NNP/DDP) - CRYSTAL FORM GAMMA organism=? : H : ARG NH1 D0093 <- 2.59 -> DT O4 I0004 : score 3.4052 : H : ARG NH1 D0093 <- 3.06 -> DT O2 I0013 : score 4.08248 : H : TRP NE1 D0237 <- 3.15 -> DT O2 I0012 : score 5.78031 : V : PHE CZ D0245 <- 3.57 -> DT C7 I0012 : score 7.52398 >7zko_H:Trypsin-like_serine_proteases; title=X-RAY STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN HUMAN ALPHA THROMBIN AND A PSEUDO-CYCLIC THROMBIN BINDING APTAMER (TBA-NNP/DDP) - CRYSTAL FORM DELTA organism=? : H : ARG NH1 H0093 <- 2.39 -> DT O2 B0004 : score 4.65954 : H : ARG NH2 H0093 <- 2.28 -> DT O4 B0013 : score 3.92345 : H : TRP NE1 H0237 <- 2.76 -> DT O2 B0003 : score 6.26511 >7zla_AB:PLP-dependent_transferases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HOLO-PDXR FROM BACILLUS CLAUSII BOUND TO ITS TARGET DNA IN THE HALF-CLOSED CONFORMATION organism=? : H : ARG NH2 B0074 <- 2.41 -> DC O2 D0046 : score 3.98722 : V : ASN CB B0054 <- 3.84 -> DT C7 D0040 : score 1.91806 : x : TYR xxxx B0017 <- 3.91 -> DA xxx D0039 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0042 <- 3.13 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 2.81 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0052 <- 3.77 -> DG xxx D0041 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0053 <- 2.72 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0055 <- 4.28 -> DT xxx D0040 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0057 <- 3.91 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >7zla_B:PLP-dependent_transferases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HOLO-PDXR FROM BACILLUS CLAUSII BOUND TO ITS TARGET DNA IN THE HALF-CLOSED CONFORMATION organism=? : H : ARG NH2 B0074 <- 2.41 -> DC O2 D0046 : score 3.98722 : V : ASN CB B0054 <- 3.84 -> DT C7 D0040 : score 1.91806 : x : TYR xxxx B0017 <- 3.91 -> DA xxx D0039 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0042 <- 3.13 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 2.81 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0052 <- 3.77 -> DG xxx D0041 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0053 <- 2.72 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0055 <- 4.28 -> DT xxx D0040 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0057 <- 3.91 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx >7zn5_AB:PLP-dependent_transferases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HOLO-PDXR FROM BACILLUS CLAUSII BOUND TO ITS TARGET DNA IN THE CLOSED CONFORMATION, C2 SYMMETRY. organism=? : H : GLN OE1 A0053 <- 2.75 -> DA N6 D0006 : score 6.11309 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.78 -> DT O2 D0004 : score 4.25027 : H : GLU OE1 B0057 <- 3.13 -> DC N4 C0006 : score 5.38726 : V : ASN CB A0054 <- 3.61 -> DT C7 C0040 : score 2.02946 : V : ASN CB B0054 <- 3.60 -> DT C7 D0040 : score 2.03431 : x : ARG xxxx A0043 <- 3.54 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0052 <- 4.18 -> DT xxx C0040 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0057 <- 4.45 -> DC xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0042 <- 3.96 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 3.06 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0052 <- 4.06 -> DT xxx D0040 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0053 <- 3.06 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0074 <- 3.86 -> DC xxx D0046 : score x.xxxxx >7zn5_B:PLP-dependent_transferases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HOLO-PDXR FROM BACILLUS CLAUSII BOUND TO ITS TARGET DNA IN THE CLOSED CONFORMATION, C2 SYMMETRY. organism=? : H : GLU OE1 B0057 <- 3.13 -> DC N4 C0006 : score 5.38726 : V : ASN CB B0054 <- 3.60 -> DT C7 D0040 : score 2.03431 : x : LYS xxxx B0042 <- 3.96 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 3.06 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0052 <- 4.06 -> DT xxx D0040 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0053 <- 3.06 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0074 <- 3.86 -> DC xxx D0046 : score x.xxxxx >7zo1_B: title=SPCAS9 BOUND TO CD34 OFF-TARGET9 DNA SUBSTRATE organism=Streptococcus pyogenes : H : LYS NZ B1107 <- 2.70 -> DC O2 C-001 : score 3.00508 : H : ARG NH1 B1333 <- 3.13 -> DG N7 D0001 : score 5.6507 : H : ARG NH2 B1333 <- 2.58 -> DG O6 D0001 : score 6.8904 : H : ARG NH1 B1335 <- 2.82 -> DG O6 D0002 : score 6.059 : H : ARG NH2 B1335 <- 2.99 -> DG N7 D0002 : score 6.142 : w : ARG NH1 B1335 <- 5.80 -> DA N6 C-003 : score 1.486 : x : GLU xxxx B1219 <- 4.13 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >7zpa_A:PLP-dependent_transferases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HOLO-PDXR FROM BACILLUS CLAUSII BOUND TO ITS TARGET DNA IN THE CLOSED CONFORMATION, C1 SYMMETRY organism=? : H : ARG NH2 A0043 <- 2.96 -> DG N7 D0005 : score 6.18031 : H : GLN OE1 A0053 <- 2.72 -> DA N6 D0006 : score 6.14941 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.77 -> DC O2 D0003 : score 3.72091 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.60 -> DT O2 D0004 : score 4.40267 : V : ASN CB A0054 <- 3.59 -> DT C7 C0040 : score 2.03915 : x : SER xxxx A0052 <- 4.24 -> DT xxx C0040 : score x.xxxxx >7zpa_AB:PLP-dependent_transferases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HOLO-PDXR FROM BACILLUS CLAUSII BOUND TO ITS TARGET DNA IN THE CLOSED CONFORMATION, C1 SYMMETRY organism=? : H : ARG NH2 A0043 <- 2.96 -> DG N7 D0005 : score 6.18031 : H : GLN OE1 A0053 <- 2.72 -> DA N6 D0006 : score 6.14941 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.77 -> DC O2 D0003 : score 3.72091 : H : ARG NH2 A0074 <- 2.60 -> DT O2 D0004 : score 4.40267 : H : GLU OE1 B0057 <- 2.72 -> DC N4 C0006 : score 5.86024 : V : ASN CB A0054 <- 3.59 -> DT C7 C0040 : score 2.03915 : V : ASN CB B0054 <- 3.67 -> DT C7 D0040 : score 2.0004 : x : SER xxxx A0052 <- 4.24 -> DT xxx C0040 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0042 <- 3.33 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0043 <- 2.89 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0052 <- 3.96 -> DT xxx D0040 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0053 <- 2.48 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0074 <- 3.25 -> DC xxx D0046 : score x.xxxxx >7zpp_A:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE MVV CSC INTASOME AT 4.5A RESOLUTION organism=VISNA/MAEDI VIRUS EV1 KV1772 : H : SER OG A0050 <- 3.13 -> DG N2 Q0008 : score 3.15165 : x : ARG xxxx A0030 <- 4.42 -> DG xxx R0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0034 <- 3.88 -> DT xxx Q0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0231 <- 3.31 -> DG xxx Q0018 : score x.xxxxx >7zpp_ADIN:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE MVV CSC INTASOME AT 4.5A RESOLUTION organism=VISNA/MAEDI VIRUS EV1 KV1772 : H : SER OG A0050 <- 3.13 -> DG N2 Q0008 : score 3.15165 : H : ARG NE I0155 <- 3.36 -> DG N3 Q0006 : score 1.55855 : H : ARG NH2 I0155 <- 3.24 -> DG N3 Q0006 : score 3.29255 : x : ARG xxxx A0030 <- 4.42 -> DG xxx R0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0034 <- 3.88 -> DT xxx Q0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0231 <- 3.31 -> DG xxx Q0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0148 <- 2.86 -> DG xxx Q0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0151 <- 3.21 -> DG xxx Q0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0158 <- 3.23 -> DC xxx R0018 : score x.xxxxx >7zqs_D:Zn-dependent_exopeptidases;PA_domain;Transferrin_receptor-like_dimerisation_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN TRANSFERRIN RECEPTOR 1 BOUND TO DNA APTAMER organism=? : H : ARG NH2 D0623 <- 3.25 -> DG N7 C0020 : score 5.81 : H : ARG NH1 D0629 <- 2.61 -> DG N7 C0018 : score 6.2799 : H : ARG NH2 D0629 <- 2.76 -> DG O6 C0018 : score 6.6528 : H : ARG NH1 D0646 <- 2.69 -> DT O4 C0021 : score 3.33984 : H : ARG NH2 D0646 <- 3.06 -> DT O4 C0021 : score 3.36905 : H : ARG NH1 D0651 <- 2.77 -> DT O4 C0025 : score 3.28756 : V : LEU CD2 D0619 <- 3.56 -> DT C7 C0021 : score 6.07516 : V : PHE CZ D0650 <- 3.54 -> DT C7 C0023 : score 7.57734 : x : ASN xxxx D0615 <- 4.00 -> DT xxx C0023 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0626 <- 4.11 -> DG xxx C0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0643 <- 3.78 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0644 <- 3.82 -> DT xxx C0025 : score x.xxxxx >7zs9_e:Histone-fold; title=YEAST RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH THE +1 NUCLEOSOME (COMPLEX A) organism=? : H : ARG NH2 e0040 <- 2.76 -> DG N3 N0072 : score 3.63914 : x : ARG xxxx e0083 <- 3.44 -> DT xxx T-087 : score x.xxxxx >7zvt_AB:SPOC_domain-like;vWA-like;C-terminal_domain_of_Ku80; title=CRYOEM STRUCTURE OF KU HETERODIMER BOUND TO DNA organism=? : H : ARG NH2 B0400 <- 3.04 -> DT O2 D0024 : score 4.03013 >7zvt_B:SPOC_domain-like;vWA-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF KU HETERODIMER BOUND TO DNA organism=? : H : ARG NH2 B0400 <- 3.04 -> DT O2 D0024 : score 4.03013 >7zwa_A:SPOC_domain-like;vWA-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF KU HETERODIMER BOUND TO DNA AND PAXX organism=? : x : ARG xxxx A0254 <- 3.01 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx >7zwa_AB:SPOC_domain-like;vWA-like;C-terminal_domain_of_Ku80; title=CRYOEM STRUCTURE OF KU HETERODIMER BOUND TO DNA AND PAXX organism=? : H : ARG NH1 B0400 <- 2.90 -> DT O2 E0004 : score 4.22028 : H : ARG NH2 B0400 <- 2.52 -> DT O2 E0004 : score 4.4704 : x : ARG 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U5 SNRNA PROMOTER organism=? : V : TYR CG c0389 <- 3.78 -> DT C7 N-023 : score 3.76025 : x : MET xxxx c0385 <- 3.06 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx c0388 <- 3.67 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx >7zwd_AMORUbc:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain;TATA-box_binding_protein-like;Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF SNAPC CONTAINING POL II PRE-INITIATION COMPLEX BOUND TO U5 SNRNA PROMOTER (CC) organism=? : H : ASN ND2 O0257 <- 3.04 -> DT O2 N0004 : score 4.51834 : H : ASN ND2 O0257 <- 3.33 -> DT O2 N0005 : score 4.24306 : H : THR OG1 O0313 <- 3.09 -> DT O2 N0004 : score 2.55668 : H : ARG NE b0151 <- 2.74 -> DC O2 T0018 : score 2.69088 : H : ARG NH2 b0151 <- 2.98 -> DA N3 T0017 : score 3.12311 : V : VAL CB M0283 <- 3.88 -> DT C7 T0003 : score 3.84964 : V : TYR CG c0389 <- 3.79 -> DT C7 N-023 : score 3.75089 : x : THR xxxx 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x.xxxxx : x : MET xxxx c0385 <- 3.23 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx c0388 <- 3.48 -> DC xxx T0020 : score x.xxxxx >7zx7_AMORUbc:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_beta-barrel_domain;Transcription_factor_IIA_TFIIA,_alpha-helical_domain;TATA-box_binding_protein-like;Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Homeodomain-like; title=STRUCTURE OF SNAPC CONTAINING POL II PRE-INITIATION COMPLEX BOUND TO U1 SNRNA PROMOTER (CC) organism=? : H : THR OG1 O0313 <- 2.58 -> DG N3 N0003 : score 1.79889 : H : LYS NZ R0174 <- 3.11 -> DT O2 N0009 : score 3.36477 : H : ARG NE b0151 <- 2.43 -> DC O2 T0018 : score 2.85574 : H : LYS NZ b0194 <- 2.23 -> DA N7 N-012 : score 3.27202 : H : GLU OE1 b0197 <- 3.23 -> DA N6 N-012 : score 2.45139 : V : TYR CG c0389 <- 3.90 -> DT C7 N-023 : score 3.648 : x : THR xxxx M0284 <- 3.68 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0286 <- 3.94 -> DC xxx N-005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx O0167 <- 2.82 -> 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x.xxxxx : x : LEU xxxx O0303 <- 3.29 -> DG xxx N0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0305 <- 3.89 -> DC xxx T-002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0311 <- 2.97 -> DC xxx T-003 : score x.xxxxx >7zxe_MOUbc: title=STRUCTURE OF SNAPC CONTAINING POL II PRE-INITIATION COMPLEX BOUND TO U1 SNRNA PROMOTER (OC) organism=? : H : ASN ND2 O0167 <- 2.30 -> DA N3 T-005 : score 4.18846 : H : THR OG1 O0313 <- 3.11 -> DC O2 N0004 : score 2.46285 : H : THR OG1 O0313 <- 3.11 -> DC O2 N0004 : score 2.46285 : H : ARG NH2 b0148 <- 2.50 -> DA N3 T0019 : score 3.43413 : H : ARG NE b0151 <- 3.16 -> DC O2 T0018 : score 2.46753 : H : ARG NH2 b0151 <- 3.17 -> DA N3 T0017 : score 3 : H : LYS NZ b0194 <- 2.78 -> DA N7 N-012 : score 2.94893 : V : VAL CG1 M0283 <- 3.71 -> DT C7 T0002 : score 6.19687 : x : THR xxxx M0284 <- 3.50 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0169 <- 3.39 -> DA xxx T-005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0197 <- 3.08 -> DG xxx N0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx O0198 <- 4.13 -> DG xxx N0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0212 <- 4.24 -> DC xxx T-006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0214 <- 3.11 -> DT xxx N0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0222 <- 4.08 -> DA xxx T-005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx O0257 <- 3.24 -> DC xxx N0004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0259 <- 3.06 -> DG xxx T-004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0288 <- 3.17 -> DG xxx N0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx O0289 <- 3.18 -> DT xxx T-001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx O0303 <- 4.28 -> DG xxx N0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx O0305 <- 3.42 -> DC xxx T-002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0311 <- 3.31 -> DC xxx T-003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx U0346 <- 3.52 -> DG xxx T-004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx b0146 <- 4.33 -> DT xxx N-019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx b0152 <- 3.35 -> DA xxx N-016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx b0197 <- 4.17 -> DC xxx T0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx b0350 <- 3.61 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx c0388 <- 4.17 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx c0389 <- 3.44 -> DT xxx N-023 : score x.xxxxx >7zxe_b: title=STRUCTURE OF SNAPC CONTAINING POL II PRE-INITIATION COMPLEX BOUND TO U1 SNRNA PROMOTER (OC) organism=? : H : ARG NH2 b0148 <- 2.50 -> DA N3 T0019 : score 3.43413 : H : ARG NE b0151 <- 3.16 -> DC O2 T0018 : score 2.46753 : H : ARG NH2 b0151 <- 3.17 -> DA N3 T0017 : score 3 : H : LYS NZ b0194 <- 2.78 -> DA N7 N-012 : score 2.94893 : x : ILE xxxx b0146 <- 4.33 -> DT xxx N-019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx b0152 <- 3.35 -> DA xxx N-016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx b0197 <- 4.17 -> DC xxx T0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx b0350 <- 3.61 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx >7zyg_A:SPOC_domain-like;vWA-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF KU HETERODIMER BOUND TO DNA, PAXX AND XLF organism=? : x : ARG xxxx A0254 <- 4.35 -> DA xxx E0013 : score x.xxxxx >7zyg_AB:SPOC_domain-like;vWA-like;C-terminal_domain_of_Ku80; title=CRYOEM STRUCTURE OF KU HETERODIMER BOUND TO DNA, PAXX AND XLF organism=? : x : ARG xxxx A0254 <- 4.35 -> DA xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0400 <- 4.29 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx >8a0w_AB:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HIGA2 ANTITOXIN IN COMPLEX WITH OPERATOR DNA organism=Vibrio cholerae : H : ARG NH1 A0068 <- 2.88 -> DG N7 C0014 : score 5.9532 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.77 -> DG O6 C0014 : score 6.6396 : w : ARG NH2 A0068 <- 6.20 -> DC N4 C0013 : score 0.976 : H : GLU OE2 A0071 <- 3.12 -> DA N6 D0003 : score 2.856 : w : GLU OE1 A0071 <- 5.55 -> DT O4 D0002 : score 2.749 : w : GLU OE2 A0071 <- 5.59 -> DC N4 D0004 : score 3.597 : H : ASN ND2 A0072 <- 2.87 -> DG N7 C0012 : score 4.5217 : w : ASN OD1 A0072 <- 6.03 -> DC N4 C0013 : score 2.732 : w : GLN OE1 A0075 <- 5.57 -> DC N4 D0004 : score 3.488 : H : ARG NH1 B0068 <- 2.86 -> DG N7 D0014 : score 5.9774 : H : ARG NH2 B0068 <- 2.62 -> DG O6 D0014 : score 6.8376 : H : GLU OE2 B0071 <- 3.14 -> DA N6 C0003 : score 2.84379 : w : GLU OE1 B0071 <- 5.42 -> DT O4 C0002 : score 2.749 : w : GLU OE2 B0071 <- 5.84 -> DC N4 C0004 : score 3.597 : H : ASN ND2 B0072 <- 2.83 -> DG N7 D0012 : score 4.55838 : w : GLN OE1 B0075 <- 5.70 -> DC N4 C0004 : score 3.488 : H : ARG NH1 B0077 <- 3.29 -> DG O6 D0012 : score 5.48717 A : x : ARG xxxx A0056 <- 3.86 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0069 <- 4.03 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0077 <- 3.54 -> DC xxx D0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0078 <- 4.10 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0056 <- 3.94 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0069 <- 3.91 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx >8a0w_B:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HIGA2 ANTITOXIN IN COMPLEX WITH OPERATOR DNA organism=Vibrio cholerae : H : ARG NH1 B0068 <- 2.86 -> DG N7 D0014 : score 5.9774 : H : ARG NH2 B0068 <- 2.62 -> DG O6 D0014 : score 6.8376 : H : GLU OE2 B0071 <- 3.14 -> DA N6 C0003 : score 2.84379 : w : GLU OE1 B0071 <- 5.42 -> DT O4 C0002 : score 2.749 : w : GLU OE2 B0071 <- 5.84 -> DC N4 C0004 : score 3.597 : H : ASN ND2 B0072 <- 2.83 -> DG N7 D0012 : score 4.55838 : w : GLN OE1 B0075 <- 5.70 -> DC N4 C0004 : score 3.488 : H : ARG NH1 B0077 <- 3.29 -> DG O6 D0012 : score 5.48717 A : x : ARG xxxx B0056 <- 3.94 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0069 <- 3.91 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx >8a0x_ABD:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HIGB2-HIGA2 TETRAMER IN COMPLEX WITH OPERATOR DNA organism=? : H : ARG NH1 A0068 <- 3.09 -> DT O4 E0023 : score 3.07841 : H : ARG NH2 A0068 <- 2.72 -> DG O6 E0022 : score 6.7056 : H : GLU OE1 A0071 <- 3.29 -> DA N6 F0010 : score 2.41921 : H : ASN ND2 A0072 <- 2.94 -> DG N7 E0020 : score 4.45749 : H : ARG NH1 B0068 <- 2.94 -> DG N7 F0021 : score 5.8806 : H : ARG NH2 B0068 <- 2.47 -> DG O6 F0021 : score 7.0356 : H : ARG NH2 B0068 <- 3.02 -> DT O4 F0022 : score 3.39748 : H : ASN ND2 B0072 <- 2.98 -> DG N7 F0019 : score 4.4208 : H : GLN NE2 B0075 <- 3.37 -> DA N7 E0011 : score 5.39551 : x : ARG xxxx A0056 <- 4.07 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0069 <- 3.90 -> DG xxx E0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0075 <- 3.37 -> DA xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0077 <- 2.74 -> DG xxx F0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0078 <- 3.13 -> DT xxx E0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0056 <- 4.11 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0069 <- 4.19 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0071 <- 3.33 -> DA xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0077 <- 2.98 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0078 <- 4.00 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0042 <- 3.03 -> DC xxx F0031 : score x.xxxxx >8a0x_D: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HIGB2-HIGA2 TETRAMER IN COMPLEX WITH OPERATOR DNA organism=? : x : GLN xxxx D0042 <- 3.03 -> DC xxx F0031 : score x.xxxxx >8a1c_A:Origin_of_replication-binding_domain,_RBD-like; title=TRAI TRANS-ESTERASE DOMAIN FROM PKM101 (DNA BOUND) organism=? : H : ASP OD2 A0003 <- 2.71 -> DG N2 C0008 : score 5.55724 : H : THR OG1 A0005 <- 3.12 -> DT O2 C0011 : score 2.5404 : H : THR OG1 A0005 <- 3.10 -> DT N3 C0011 : score 2.20418 : H : ARG NH1 A0080 <- 3.03 -> DG O6 C0003 : score 5.8035 : H : ARG NH2 A0080 <- 2.86 -> DG N7 C0003 : score 6.308 : H : THR OG1 A0086 <- 3.07 -> DT O2 C0011 : score 2.56754 : H : ASN OD1 A0181 <- 2.87 -> DT N3 C0004 : score 3.74806 : H : ASN ND2 A0181 <- 3.19 -> DT O4 C0004 : score 4.87242 : H : ASP OD2 A0182 <- 3.14 -> DG N2 C0003 : score 5.08776 : H : LYS NZ A0188 <- 2.86 -> DT O2 C0005 : score 3.54413 : H : LYS NZ A0196 <- 2.67 -> DG N7 C0007 : score 5.52593 : H : ARG NH1 A0250 <- 3.17 -> DG N7 C0010 : score 5.6023 : H : ARG NH1 A0250 <- 2.74 -> DG O6 C0010 : score 6.15633 : H : GLN OE1 A0256 <- 2.55 -> DA N6 C0006 : score 6.35519 : x : MET xxxx A0001 <- 2.95 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0002 <- 4.00 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0078 <- 3.37 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0088 <- 4.46 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0185 <- 3.51 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0189 <- 3.72 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0216 <- 4.19 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0218 <- 3.44 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0239 <- 3.50 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0255 <- 3.26 -> DA xxx C0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0258 <- 3.77 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0259 <- 4.28 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0262 <- 3.25 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0266 <- 3.82 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx >8a40_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=STRUCTURE OF MAMMALIAN POL II-TFIIS ELONGATION COMPLEX organism=? : x : GLN xxxx A0461 <- 4.44 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 4.28 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.80 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 3.89 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1416 <- 3.59 -> DT xxx T0021 : score x.xxxxx >8a40_ABE: title=STRUCTURE OF MAMMALIAN POL II-TFIIS ELONGATION COMPLEX organism=? : x : GLN xxxx A0461 <- 4.44 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 4.28 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.80 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 3.89 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1416 <- 3.59 -> DT xxx T0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0492 <- 4.07 -> DG xxx N0026 : score x.xxxxx >8a4i_K:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF SALL4 ZINC FINGER CLUSTER 4 WITH AT-RICH DNA organism=? : H : ASN OD1 K0922 <- 3.28 -> DA N6 F0008 : score 5.4437 : H : ASN ND2 K0922 <- 3.29 -> DA N7 F0008 : score 5.2952 : V : VAL CG1 K0925 <- 3.77 -> DT C7 F0006 : score 6.10597 : V : THR CG2 K0919 <- 3.82 -> DT C7 F0009 : score 4.21574 : x : SER xxxx K0891 <- 4.25 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0893 <- 3.21 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx >8a5p_G: title=STRUCTURE OF ARP4-IES4-N-ACTIN-ARP8-INO80HSA SUBCOMPLEX (A-MODULE) OF CHAETOMIUM THERMOPHILUM INO80 ON CURVED DNA organism=? : x : ASN xxxx G0780 <- 4.36 -> DT xxx L-087 : score x.xxxxx >8a5p_GU:Actin-like_ATPase_domain; title=STRUCTURE OF ARP4-IES4-N-ACTIN-ARP8-INO80HSA SUBCOMPLEX (A-MODULE) OF CHAETOMIUM THERMOPHILUM INO80 ON CURVED DNA organism=? : H : ASN ND2 U0037 <- 3.12 -> DG N3 L-093 : score 4.5816 : x : ASN xxxx G0780 <- 4.36 -> DT xxx L-087 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx U0036 <- 3.87 -> DT xxx K0095 : score x.xxxxx >8a5p_U:Actin-like_ATPase_domain; title=STRUCTURE OF ARP4-IES4-N-ACTIN-ARP8-INO80HSA SUBCOMPLEX (A-MODULE) OF CHAETOMIUM THERMOPHILUM INO80 ON CURVED DNA organism=? : H : ASN ND2 U0037 <- 3.12 -> DG N3 L-093 : score 4.5816 : x : LYS xxxx U0036 <- 3.87 -> DT xxx K0095 : score x.xxxxx >8a5q_G: title=STRUCTURE OF ARP4-IES4-N-ACTIN-ARP8-INO80HSA SUBCOMPLEX (A-MODULE) OF CHAETOMIUM THERMOPHILUM INO80 ON STRAIGHT DNA organism=? : x : ASN xxxx G0780 <- 3.76 -> DT xxx L-087 : score x.xxxxx >8a5q_GU:Actin-like_ATPase_domain; title=STRUCTURE OF ARP4-IES4-N-ACTIN-ARP8-INO80HSA SUBCOMPLEX (A-MODULE) OF CHAETOMIUM THERMOPHILUM INO80 ON STRAIGHT DNA organism=? : H : ASN ND2 U0037 <- 3.32 -> DG N3 L-093 : score 4.38581 : x : ASN xxxx G0780 <- 3.76 -> DT xxx L-087 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx U0036 <- 3.79 -> DT xxx K0095 : score x.xxxxx >8a8j_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=COMPLEX OF RECF AND DNA FROM THERMUS THERMOPHILUS. organism=? : x : ARG xxxx A0155 <- 3.62 -> DG xxx Y0017 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0126 <- 4.10 -> DT xxx X0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0155 <- 4.24 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx >8a8j_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=COMPLEX OF RECF AND DNA FROM THERMUS THERMOPHILUS. organism=? : x : GLU xxxx B0126 <- 4.10 -> DT xxx X0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0155 <- 4.24 -> DC xxx X0012 : score x.xxxxx >8a93_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=COMPLEX OF RECF-RECR-DNA FROM THERMUS THERMOPHILUS. organism=? : x : GLU xxxx A0126 <- 4.09 -> DC xxx Y0015 : score x.xxxxx >8a93_AB: title=COMPLEX OF RECF-RECR-DNA FROM THERMUS THERMOPHILUS. organism=? : x : GLU xxxx A0126 <- 4.09 -> DC xxx Y0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0126 <- 3.41 -> DT xxx X0010 : score x.xxxxx >8aag_A:Histone-fold; title=H1-BOUND PALINDROMIC NUCLEOSOME, STATE 1 organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.79 -> DT O2 J0009 : score 4.2418 >8aan_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE NUCLEOPROTEIN COMPLEX OF REP PROTEIN WITH ITERON CONTAINING DSDNA AND DUE SSDNA. organism=Escherichia coli : H : GLU OE2 A0077 <- 2.99 -> DC N4 B0015 : score 5.0653 : w : GLU OE1 A0077 <- 5.86 -> DG N7 B0014 : score 1.976 : w : GLU OE1 A0077 <- 5.94 -> DG O6 B0014 : score 2.669 : w : GLU OE2 A0077 <- 5.74 -> DC N4 B0016 : score 3.597 : H : LYS NZ A0080 <- 2.86 -> DG O6 C0028 : score 5.7114 : w : LYS NZ A0080 <- 5.43 -> DG N7 C0029 : score 2.519 : w : ARG NH2 A0083 <- 6.19 -> DG N7 C0027 : score 2.18 : H : ARG NH1 A0124 <- 3.05 -> DT O2 C0024 : score 4.09109 A : H : ARG NH2 A0124 <- 2.80 -> DT O2 C0024 : score 4.23333 A : w : ARG NH1 A0124 <- 6.16 -> DG N2 C0025 : score 1.082 A : H : ARG NH1 A0200 <- 3.11 -> DG O6 B0004 : score 5.70617 : H : ARG NH2 A0200 <- 2.77 -> DT O4 B0005 : score 3.57517 : w : ARG NH1 A0200 <- 5.82 -> DT O4 B0003 : score 1.768 : H : ASP OD1 A0203 <- 3.26 -> DC N4 C0038 : score 4.85314 : H : ARG NH2 A0206 <- 2.75 -> DG O6 B0006 : score 6.666 : H : ARG NE A0207 <- 2.99 -> DG N7 C0036 : score 4.25377 : H : ARG NH2 A0207 <- 2.91 -> DG O6 C0036 : score 6.4548 : H : ARG NH1 A0233 <- 3.08 -> DC O2 B0001 : score 3.4456 : x : SER xxxx A0075 <- 3.29 -> DG xxx C0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0076 <- 3.90 -> DA xxx C0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0079 <- 3.85 -> DA xxx C0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0197 <- 3.62 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0198 <- 3.99 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0202 <- 3.62 -> DG xxx B0004 : score x.xxxxx >8aas_A:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PYROCOCCUS ABYSSI RPA TRIMERIZATION CORE BOUND TO POLY-DT20 SSDNA organism=? : H : ARG NH1 A0211 <- 2.54 -> DT O2 F0003 : score 4.53034 : H : ASP OD2 A0324 <- 2.52 -> DT N3 F0005 : score 3.78806 : V : PHE CZ A0266 <- 3.84 -> DT C7 F0003 : score 7.04372 >8aas_AB:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PYROCOCCUS ABYSSI RPA TRIMERIZATION CORE BOUND TO POLY-DT20 SSDNA organism=? : H : ARG NH1 A0211 <- 2.54 -> DT O2 F0003 : score 4.53034 : H : ASP OD2 A0324 <- 2.52 -> DT N3 F0005 : score 3.78806 : H : ARG NH2 B0079 <- 2.68 -> DT O2 F0011 : score 4.33493 : H : GLN NE2 B0108 <- 2.93 -> DT O4 F0013 : score 5.05606 : V : PHE CZ A0266 <- 3.84 -> DT C7 F0003 : score 7.04372 : V : LEU CD1 B0076 <- 3.73 -> DT C7 F0013 : score 5.83158 : x : TYR xxxx A0215 <- 3.31 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0222 <- 3.96 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0247 <- 4.42 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0249 <- 3.81 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0264 <- 4.18 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0325 <- 4.34 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0326 <- 3.30 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0327 <- 3.43 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0332 <- 3.14 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0027 <- 4.12 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0078 <- 3.26 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0103 <- 3.38 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0110 <- 4.24 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx >8aas_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE PYROCOCCUS ABYSSI RPA TRIMERIZATION CORE BOUND TO POLY-DT20 SSDNA organism=? : H : ARG NH2 B0079 <- 2.68 -> DT O2 F0011 : score 4.33493 : H : GLN NE2 B0108 <- 2.93 -> DT O4 F0013 : score 5.05606 : V : LEU CD1 B0076 <- 3.73 -> DT C7 F0013 : score 5.83158 : x : PHE xxxx B0027 <- 4.12 -> DT xxx F0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0078 <- 3.26 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0103 <- 3.38 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0110 <- 4.24 -> DT xxx F0012 : score x.xxxxx >8aby_CD: title=RNA POLYMERASE BOUND TO PURIFIED IN VITRO TRANSCRIBED REGULATORY RNA PUTL - PAUSE PRONE, CLOSED CLAMP STATE organism=? : x : GLU xxxx C0541 <- 3.04 -> DG xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.59 -> DG xxx N0026 : score x.xxxxx >8abz_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE AT U-RICH PAUSE BOUND TO NON-REGULATORY RNA - PAUSE PRONE, CLOSED CLAMP STATE organism=? : x : GLU xxxx C0541 <- 3.70 -> DT xxx N0283 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 4.45 -> DT xxx N0283 : score x.xxxxx >8abz_CD: title=RNA POLYMERASE AT U-RICH PAUSE BOUND TO NON-REGULATORY RNA - PAUSE PRONE, CLOSED CLAMP STATE organism=? : x : GLU xxxx C0541 <- 3.70 -> DT xxx N0283 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 4.45 -> DT xxx N0283 : score x.xxxxx >8ac0_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE AT U-RICH PAUSE BOUND TO REGULATORY RNA PUTL - ACTIVE, CLOSED CLAMP STATE organism=? : V : ARG CG C0542 <- 3.79 -> DT C7 N0254 : score 1.00764 >8ac0_CD: title=RNA POLYMERASE AT U-RICH PAUSE BOUND TO REGULATORY RNA PUTL - ACTIVE, CLOSED CLAMP STATE organism=? : V : ARG CG C0542 <- 3.79 -> DT C7 N0254 : score 1.00764 : x : LEU xxxx D0255 <- 3.37 -> DC xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0261 <- 4.34 -> DC xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 4.18 -> DT xxx T0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.59 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx >8ac2_CD: title=RNA POLYMERASE- POST-TERMINATED, OPEN CLAMP STATE organism=? : x : GLN xxxx D0335 <- 3.87 -> DT xxx N0276 : score x.xxxxx >8ac8_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=THE NUCLEOPROTEIN COMPLEX OF REP PROTEIN WITH DUE SSDNA organism=Escherichia coli : H : ASN ND2 A0022 <- 3.10 -> DT O2 B0004 : score 4.46138 : H : ARG NH2 A0047 <- 3.22 -> DT O4 B0002 : score 3.25532 : H : GLN NE2 A0148 <- 3.02 -> DT O4 B0003 : score 4.96262 : H : GLN NE2 A0171 <- 3.07 -> DT O2 B0005 : score 3.72093 : x : ARG xxxx A0017 <- 3.83 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0019 <- 3.65 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0142 <- 4.36 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0144 <- 4.32 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0145 <- 4.06 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0146 <- 3.37 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0172 <- 3.33 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0180 <- 3.62 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0181 <- 4.01 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0182 <- 3.91 -> DT xxx B0006 : score x.xxxxx >8acp_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE AT U-RICH PAUSE BOUND TO REGULATORY RNA PUTL - INACTIVE, OPEN CLAMP STATE organism=? : x : ARG xxxx C0200 <- 3.43 -> DT xxx N0257 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0202 <- 4.43 -> DT xxx N0257 : score x.xxxxx >8acp_CD: title=RNA POLYMERASE AT U-RICH PAUSE BOUND TO REGULATORY RNA PUTL - INACTIVE, OPEN CLAMP STATE organism=? : x : ARG xxxx C0200 <- 3.43 -> DT xxx N0257 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0202 <- 4.43 -> DT xxx N0257 : score x.xxxxx >8ad1_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE AT U-RICH PAUSE BOUND TO RNA PUTL TRIPLE MUTANT - PAUSE PRONE, CLOSED CLAMP STATE organism=? : x : GLU xxxx C0541 <- 3.62 -> DT xxx N0254 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 4.24 -> DT xxx N0254 : score x.xxxxx >8ad1_CD: title=RNA POLYMERASE AT U-RICH PAUSE BOUND TO RNA PUTL TRIPLE MUTANT - PAUSE PRONE, CLOSED CLAMP STATE organism=? : x : GLU xxxx C0541 <- 3.62 -> DT xxx N0254 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 4.24 -> DT xxx N0254 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0255 <- 4.00 -> DC xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0261 <- 3.30 -> DC xxx T0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0262 <- 3.60 -> DC xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0270 <- 4.15 -> DT xxx T0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0427 <- 3.70 -> DC xxx T0015 : score x.xxxxx >8ag6_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HUMAN MUTSALPHA (MSH2/MSH6) BINDING TO DNA WITH A GT MISMATCH organism=? : x : VAL xxxx B0429 <- 4.05 -> DG xxx E0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0431 <- 3.68 -> DC xxx E0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0432 <- 3.37 -> DG xxx F0027 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0434 <- 3.51 -> DT xxx F0026 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0452 <- 3.43 -> DT xxx F0026 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0462 <- 3.85 -> DG xxx F0027 : score x.xxxxx >8ag6_B:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HUMAN MUTSALPHA (MSH2/MSH6) BINDING TO DNA WITH A GT MISMATCH organism=? : x : VAL xxxx B0429 <- 4.05 -> DG xxx E0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0431 <- 3.68 -> DC xxx E0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0432 <- 3.37 -> DG xxx F0027 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0434 <- 3.51 -> DT xxx F0026 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0452 <- 3.43 -> DT xxx F0026 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0462 <- 3.85 -> DG xxx F0027 : score x.xxxxx >8amd_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;RecA_protein,_C-terminal_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE RECA PRESYNAPTIC FILAMENT FROM S.PNEUMONIAE organism=? : V : VAL CG2 A0212 <- 3.68 -> DT C7 D1013 : score 6.30677 : x : VAL xxxx A0177 <- 3.30 -> DT xxx D1010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0182 <- 3.36 -> DT xxx D1009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0210 <- 3.70 -> DT xxx D1013 : score x.xxxxx >8amd_ABFG:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;RecA_protein,_C-terminal_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE RECA PRESYNAPTIC FILAMENT FROM S.PNEUMONIAE organism=? : V : VAL CG1 F0212 <- 3.66 -> DT C7 D1006 : score 6.27263 : V : VAL CG1 B0212 <- 3.67 -> DT C7 D1009 : score 6.25748 : V : VAL CG2 A0212 <- 3.68 -> DT C7 D1013 : score 6.30677 : x : VAL xxxx A0177 <- 3.30 -> DT xxx D1010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0182 <- 3.36 -> DT xxx D1009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0210 <- 3.70 -> DT xxx D1013 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0177 <- 3.27 -> DT xxx D1007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0182 <- 3.87 -> DT xxx D1005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0210 <- 3.61 -> DT xxx D1010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0211 <- 4.45 -> DT xxx D1009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0177 <- 3.30 -> DT xxx D1004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0210 <- 3.36 -> DT xxx D1007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0210 <- 3.87 -> DT xxx D1004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx G0212 <- 3.40 -> DT xxx D1004 : score x.xxxxx >8amu_AB: title=REPB PMV158 OBD DOMAIN BOUND TO DDR REGION organism=Streptococcus agalactiae : H : LYS NZ A0003 <- 2.80 -> DG O6 C0008 : score 5.78077 : H : ASP OD1 A0069 <- 2.89 -> DC N4 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: x : ARG xxxx E0072 <- 3.83 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx >8amu_EF: title=REPB PMV158 OBD DOMAIN BOUND TO DDR REGION organism=Streptococcus agalactiae : H : LYS NZ E0003 <- 2.84 -> DG O6 H0034 : score 5.73452 : H : LYS NZ E0003 <- 2.96 -> DG O6 G0008 : score 5.59578 : H : ASP OD1 E0069 <- 2.84 -> DC N4 G0009 : score 5.30211 : H : LYS NZ E0073 <- 2.88 -> DG N7 H0031 : score 5.29972 : H : LYS NZ E0073 <- 2.91 -> DG O6 H0031 : score 5.65359 : H : LYS NZ F0003 <- 2.90 -> DG O6 G0019 : score 5.66515 : H : ASP OD2 F0069 <- 2.54 -> DC N4 G0020 : score 6.5224 : H : LYS NZ F0073 <- 2.58 -> DG N7 H0020 : score 5.62288 : H : LYS NZ F0073 <- 2.55 -> DG O6 H0020 : score 6.06981 : x : ARG xxxx E0072 <- 3.83 -> DG xxx G0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0067 <- 4.30 -> DT xxx H0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0070 <- 4.31 -> DT xxx H0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0072 <- 4.18 -> DG xxx G0019 : score x.xxxxx >8ap1_AB:DNA/RNA_polymerases;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF YEAST MITOCHONDRIAL RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH TWO GTP MOLECULES POISED FOR DE NOVO INITIATION (IC2) organism=? : H : LYS NZ A0645 <- 3.00 -> DT O2 T0025 : score 3.44369 : H : LYS NZ A0645 <- 3.06 -> DT O2 N0117 : score 3.40065 : H : GLN OE1 A1129 <- 3.14 -> DA N6 T0026 : score 5.64099 : H : GLN OE1 B0149 <- 3.04 -> DG N2 N0120 : score 5.33852 : x : PHE xxxx B0016 <- 4.32 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0103 <- 3.51 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0105 <- 3.22 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0144 <- 3.63 -> DA xxx N0119 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0146 <- 3.72 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0148 <- 3.27 -> DA xxx N0119 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0335 <- 3.33 -> DA xxx N0122 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0336 <- 4.40 -> DA xxx N0122 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0533 <- 4.49 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x.xxxxx : x : PHE xxxx A1138 <- 3.76 -> DT xxx T0025 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1139 <- 4.00 -> DA xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1151 <- 4.04 -> DT xxx T0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1159 <- 4.49 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1163 <- 3.72 -> DC xxx T0019 : score x.xxxxx >8ap1_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF YEAST MITOCHONDRIAL RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH TWO GTP MOLECULES POISED FOR DE NOVO INITIATION (IC2) organism=? : H : GLN OE1 B0149 <- 3.04 -> DG N2 N0120 : score 5.33852 : x : PHE xxxx B0016 <- 4.32 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0103 <- 3.51 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0105 <- 3.22 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0144 <- 3.63 -> DA xxx N0119 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0146 <- 3.72 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0148 <- 3.27 -> DA xxx N0119 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0335 <- 3.33 -> DA 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ARG xxxx F0271 <- 4.09 -> DA xxx G0007 : score x.xxxxx >8asc_OP:SPOC_domain-like;vWA-like; title=KU70/80 BINDS TO THE KU-BINDING MOTIF OF PAXX organism=? : x : ARG xxxx O0254 <- 3.31 -> DG xxx Q0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0271 <- 3.72 -> DA xxx Q0007 : score x.xxxxx >8atf_Q:Histone-fold; title=NUCLEOSOME-BOUND INO80 ATPASE organism=? : x : ARG xxxx Q0040 <- 3.18 -> DG xxx K0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0083 <- 3.37 -> DT xxx L-024 : score x.xxxxx >8att_AB:DNA/RNA_polymerases;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF YEAST MITOCHONDRIAL RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH 4-MER RNA, PPPGPGPUPA (IC4) organism=? : H : GLN OE1 B0149 <- 2.87 -> DG N2 N0120 : score 5.52918 : V : VAL CG2 A1024 <- 3.68 -> DT C7 T0018 : score 6.30677 : V : PHE CD1 A1138 <- 3.76 -> DT C7 T0027 : score 4.19228 : x : TYR xxxx B0054 <- 4.33 -> DA xxx N0122 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0101 <- 3.28 -> DA xxx N0122 : score x.xxxxx : x : TYR 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DC N4 L-043 : score 4.62 : w : GLN NE2 W0078 <- 6.47 -> DA N6 M0041 : score 2.804 : w : SER OG X0074 <- 5.76 -> DT O4 M0033 : score 2.338 : w : SER OG X0074 <- 6.33 -> DA N6 L-034 : score 2.209 : w : GLN OE1 X0078 <- 6.01 -> DA N6 L-033 : score 3.392 : H : GLN OE1 Z0078 <- 3.11 -> DA N6 M0038 : score 5.67731 : w : GLN NE2 Z0078 <- 5.40 -> DT O4 L-040 : score 2.257 : V : THR CG2 X0077 <- 3.66 -> DT C7 L-035 : score 4.38522 : V : SER CB Z0074 <- 3.61 -> DT C7 L-038 : score 3.28002 : x : SER xxxx W0075 <- 3.78 -> DT xxx M0042 : score x.xxxxx : x : THR xxxx W0077 <- 3.60 -> DA xxx L-045 : score x.xxxxx : x : SER xxxx W0081 <- 3.99 -> DT xxx L-044 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Y0077 <- 3.61 -> DA xxx M0046 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx Y0078 <- 3.69 -> DT xxx M0047 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Z0075 <- 3.89 -> DT xxx L-039 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Z0077 <- 3.50 -> DG xxx M0036 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Z0081 <- 3.91 -> DT xxx M0037 : score x.xxxxx >8b4c_D:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=TOXR BACTERIAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR BOUND TO 20 BP TOXT PROMOTER DNA organism=Vibrio cholerae : H : GLN OE1 D0078 <- 3.15 -> DA N6 L-085 : score 5.62888 : w : GLN OE1 D0078 <- 5.37 -> DA N7 L-085 : score 1.196 : w : GLN NE2 D0078 <- 5.68 -> DA N7 L-085 : score 1.888 : w : GLN NE2 D0078 <- 5.54 -> DT O4 M0083 : score 2.257 : x : SER xxxx D0074 <- 3.49 -> DT xxx M0085 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0075 <- 4.03 -> DT xxx M0084 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0077 <- 3.59 -> DA xxx L-087 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0081 <- 4.01 -> DT xxx L-086 : score x.xxxxx >8b4d_B:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=TOXR BACTERIAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR BOUND TO 40 BP TOXT PROMOTER DNA organism=Vibrio cholerae : H : GLN OE1 B0078 <- 2.91 -> DA N6 M0066 : score 5.91941 : V : SER CB B0074 <- 3.85 -> DT C7 L-066 : score 3.09214 : x : SER xxxx B0075 <- 4.04 -> DT xxx L-067 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0077 <- 3.70 -> DA xxx M0064 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0081 <- 3.97 -> DT xxx M0065 : score x.xxxxx >8b4d_BCD:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=TOXR BACTERIAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR BOUND TO 40 BP TOXT PROMOTER DNA organism=Vibrio cholerae : H : GLN OE1 B0078 <- 2.91 -> DA N6 M0066 : score 5.91941 : H : GLN NE2 C0078 <- 2.46 -> DT O4 M0074 : score 5.54402 : H : GLN NE2 C0078 <- 2.79 -> DG O6 L-075 : score 5.81674 : H : GLN OE1 D0078 <- 2.52 -> DA N6 L-085 : score 6.39151 : V : SER CB D0074 <- 3.62 -> DT C7 M0085 : score 3.27219 : V : SER CB B0074 <- 3.85 -> DT C7 L-066 : score 3.09214 : x : SER xxxx B0075 <- 4.04 -> DT xxx L-067 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0077 <- 3.70 -> DA xxx M0064 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0081 <- 3.97 -> DT xxx M0065 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0074 <- 3.85 -> DT xxx M0074 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0075 <- 3.82 -> DT xxx M0074 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0077 <- 3.62 -> DA xxx L-077 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0081 <- 4.13 -> DT xxx L-076 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0075 <- 3.73 -> DT xxx M0084 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0077 <- 3.70 -> DA xxx L-087 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0081 <- 4.10 -> DT xxx L-086 : score x.xxxxx >8b4e_A:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=TOXR BACTERIAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR BOUND TO 25 BP TOXT PROMOTER DNA organism=Vibrio cholerae : H : GLN OE1 A0078 <- 2.74 -> DA N6 L-050 : score 6.1252 : x : SER xxxx A0074 <- 3.56 -> DT xxx M0050 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0075 <- 3.78 -> DT xxx M0049 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0077 <- 3.77 -> DG xxx L-052 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0081 <- 4.20 -> DT xxx L-051 : score x.xxxxx >8b4e_AB:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=TOXR BACTERIAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR BOUND TO 25 BP TOXT PROMOTER DNA organism=Vibrio cholerae : H : GLN OE1 A0078 <- 2.74 -> DA N6 L-050 : score 6.1252 : H : GLN OE1 B0078 <- 3.16 -> DA N6 M0066 : score 5.61678 : V : SER CB B0074 <- 3.81 -> DT C7 L-066 : score 3.12345 : x : SER xxxx A0074 <- 3.56 -> DT xxx M0050 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0075 <- 3.78 -> DT xxx M0049 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0077 <- 3.77 -> DG xxx L-052 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0081 <- 4.20 -> DT xxx L-051 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0075 <- 4.02 -> DT xxx L-067 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0077 <- 3.82 -> DA xxx M0064 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0081 <- 3.97 -> DT xxx M0065 : score x.xxxxx >8b4h_A:Ribonuclease_H-like;Homeodomain-like; title=ISTA TRANSPOSASE CLEAVED DONOR COMPLEX organism=? : H : ARG NE A0234 <- 2.28 -> DC O2 E0009 : score 2.93551 : H : ARG NH2 A0234 <- 2.85 -> DA N3 E0010 : score 3.20735 : H : GLN NE2 A0237 <- 2.38 -> DA N3 F0053 : score 4.36518 : x : THR xxxx A0110 <- 3.17 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0112 <- 4.24 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0113 <- 2.95 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0115 <- 4.33 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0120 <- 4.01 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0227 <- 3.60 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0228 <- 3.20 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0233 <- 3.13 -> DC xxx F0054 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0273 <- 4.40 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx >8b4h_ABC:Ribonuclease_H-like;Homeodomain-like; title=ISTA TRANSPOSASE CLEAVED DONOR COMPLEX organism=? : H : ARG NE A0234 <- 2.28 -> DC O2 E0009 : score 2.93551 : H : ARG NH2 A0234 <- 2.85 -> DA N3 E0010 : score 3.20735 : H : GLN NE2 A0237 <- 2.38 -> DA N3 F0053 : score 4.36518 : H : LYS NZ B0032 <- 2.89 -> DG O6 F0033 : score 5.67672 : H : LYS NZ B0032 <- 2.75 -> DG O6 F0034 : score 5.83858 : H : LYS NZ B0095 <- 2.95 -> DG O6 E0013 : score 5.60735 : H : LYS NZ C0032 <- 2.24 -> DG O6 F0008 : score 6.42822 : H : LYS NZ C0032 <- 2.63 -> DG O6 F0009 : score 5.97732 : H : THR OG1 C0092 <- 2.41 -> DG O6 F0022 : score 4.54418 : H : GLN NE2 C0369 <- 2.96 -> DT O2 E0006 : score 3.80747 : V : ASP CB C0309 <- 3.89 -> DT C7 E0008 : score 2.62271 : V : HIS CB C0307 <- 3.75 -> DT C7 F0051 : score 4.17669 : x : THR xxxx A0110 <- 3.17 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0112 <- 4.24 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0113 <- 2.95 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0115 <- 4.33 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0120 <- 4.01 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0227 <- 3.60 -> DG xxx E0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0228 <- 3.20 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0233 <- 3.13 -> DC xxx F0054 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0273 <- 4.40 -> DA xxx E0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0021 <- 4.16 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0030 <- 3.50 -> DC xxx E0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0031 <- 3.36 -> DT xxx F0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0033 <- 3.54 -> DT xxx E0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0035 <- 4.12 -> DG xxx F0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0052 <- 3.78 -> DA xxx F0042 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0092 <- 2.15 -> DG xxx F0046 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0093 <- 4.09 -> DT xxx F0044 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0030 <- 3.29 -> DC xxx E0051 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0031 <- 3.38 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0033 <- 3.98 -> DT xxx E0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 3.93 -> DG xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0049 <- 3.62 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0052 <- 2.16 -> DT xxx E0044 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0095 <- 3.79 -> DC xxx E0036 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0313 <- 3.62 -> DT xxx F0050 : score x.xxxxx >8b67_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF M644G VARIANT OF DNA POL EPSILON CONTAINING CTP IN THE POLYMERASE ACTIVE SITE organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0967 <- 2.67 -> DT O2 P0010 : score 3.68045 : H : ARG NH1 A0988 <- 2.89 -> DG N3 P0008 : score 2.99762 : H : ARG NH2 A0988 <- 3.27 -> DC O2 P0007 : score 3.35104 >8b6k_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF M644G VARIANT OF DNA POL EPSILON CONTAINING DCTP IN THE POLYMERASE ACTIVE SITE organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0967 <- 2.90 -> DT O2 P0010 : score 3.51544 : H : ARG NH1 A0988 <- 3.16 -> DG N3 P0008 : score 2.83278 : H : ARG NH2 A0988 <- 3.28 -> DC O2 P0007 : score 3.34364 >8b76_B:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF M644G VARIANT OF DNA POL EPSILON CONTAINING DTTP IN THE POLYMERASE ACTIVE SITE organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ B0967 <- 2.62 -> DT O2 C0010 : score 3.71632 : H : ARG NH1 B0988 <- 3.12 -> DG N3 C0008 : score 2.8572 : H : ARG NH2 B0988 <- 3.01 -> DC O2 C0007 : score 3.54337 : x : THR xxxx B0512 <- 3.13 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0825 <- 4.11 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0828 <- 4.30 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0829 <- 3.25 -> DA xxx D0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0831 <- 3.88 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx >8b77_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF N828V VARIANT OF DNA POL EPSILON CONTAINING DATP IN THE POLYMERASE ACTIVE SITE organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ A0967 <- 3.01 -> DT O2 P0010 : score 3.43652 : H : ARG NH2 A0988 <- 3.00 -> DC O2 P0007 : score 3.55077 : x : ARG xxxx A0968 <- 4.32 -> DG xxx T0010 : score x.xxxxx >8b79_B:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF M644G VARIANT OF DNA POL EPSILON CONTAINING UTP IN THE POLYMERASE ACTIVE SITE organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ B0967 <- 2.60 -> DT O2 C0010 : score 3.73067 : H : ARG NH1 B0988 <- 3.08 -> DG N3 C0008 : score 2.88162 : H : ARG NH2 B0988 <- 3.13 -> DC O2 C0007 : score 3.4546 >8b7e_B:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF N828V VARIANT OF DNA POL EPSILON CONTAINING UTP IN THE POLYMERASE ACTIVE SITE organism=Saccharomyces cerevisiae : H : LYS NZ B0967 <- 2.52 -> DT O2 C0010 : score 3.78806 : H : ARG NH1 B0988 <- 3.09 -> DG N3 C0008 : score 2.87552 : H : ARG NH2 B0988 <- 3.17 -> DC O2 C0007 : score 3.42501 : x : ARG xxxx B0744 <- 4.01 -> DA xxx C0003 : score x.xxxxx >8b9a_3467XY: title=S. CEREVISIAE REPLISOME + CTF4, BOUND BY POL ALPHA PRIMASE. COMPLEX ENGAGED WITH A FORK DNA SUBSTRATE CONTAINING A 60 NUCLEOTIDE LAGGING STRAND. organism=? : H : ARG NH1 Y0048 <- 2.98 -> DC O2 R0026 : score 3.5186 : x : PHE xxxx 70363 <- 3.27 -> DT xxx Q0046 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx 70366 <- 4.02 -> DA xxx R0016 : score x.xxxxx >8b9b_3467XY: title=S. CEREVISIAE REPLISOME + CTF4, BOUND BY POL ALPHA. COMPLEX ENGAGED WITH A FORK DNA SUBSTRATE CONTAINING A 60 NUCLEOTIDE LAGGING STRAND. organism=? : H : ARG NH1 Y0048 <- 2.98 -> DC O2 R0026 : score 3.5186 : x : PHE xxxx 70363 <- 3.27 -> DT xxx Q0046 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx 70366 <- 4.02 -> DA xxx R0016 : score x.xxxxx >8b9c_3467XY: title=S. CEREVISIAE POL ALPHA - REPLISOME COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 Y0048 <- 2.94 -> DC O2 R0026 : score 3.59515 : x : PHE xxxx 70363 <- 3.03 -> DT xxx Q0046 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx 70366 <- 3.92 -> DA xxx R0016 : score x.xxxxx >8b9c_Y: title=S. CEREVISIAE POL ALPHA - REPLISOME COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 Y0048 <- 2.94 -> DC O2 R0026 : score 3.59515 >8b9d_235: title=HUMAN REPLISOME BOUND BY POL ALPHA organism=? : V : LEU CD2 50209 <- 3.88 -> DT C7 M0044 : score 5.61666 >8b9d_467KL: title=HUMAN REPLISOME BOUND BY POL ALPHA organism=? : H : ARG NH2 K0321 <- 2.91 -> DT O2 N0029 : score 4.1402 : H : ARG NH1 L0062 <- 2.98 -> DA N3 M0038 : score 3.5495 : H : ARG NH2 L0062 <- 3.05 -> DA N3 M0038 : score 3.07776 >8b9d_5:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=HUMAN REPLISOME BOUND BY POL ALPHA organism=? : V : LEU CD2 50209 <- 3.88 -> DT C7 M0044 : score 5.61666 : x : ARG xxxx 50420 <- 4.00 -> DT xxx M0052 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx 50427 <- 4.22 -> DT xxx M0053 : score x.xxxxx >8bd5_AEFGHIJQ:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CAS12K-SGRNA-DSDNA-S15-TNIQ-TNSC TRANSPOSON RECRUITMENT COMPLEX organism=? : H : SER OG A0056 <- 2.97 -> DT O4 D0002 : score 3.43425 : H : ARG NH2 A0078 <- 2.42 -> DG O6 D-002 : score 7.1016 : H : ARG NH2 A0078 <- 2.85 -> DT O4 D-001 : score 3.51831 : H : LYS NZ A0176 <- 2.27 -> DG O6 D0008 : score 6.39353 : H : THR OG1 A0287 <- 2.29 -> DA N7 C0001 : score 3.76234 : H : THR OG1 A0287 <- 3.24 -> DA N6 C0001 : score 2.51618 : H : ASN ND2 A0306 <- 3.42 -> DG N7 D-003 : score 4.01725 : H : CYS SG A0376 <- 3.49 -> DC O2 C-001 : score 4.83052 : H : ARG NH2 A0421 <- 2.37 -> DT O2 D-001 : score 4.5974 : H : ARG NH2 A0552 <- 2.95 -> DA N3 C-007 : score 3.14255 : H : ASN ND2 Q0059 <- 3.09 -> DT O2 C-017 : score 4.47088 : x : GLN xxxx A0003 <- 4.16 -> DC xxx C-001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0081 <- 4.00 -> DA xxx C0000 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0085 <- 4.07 -> DA xxx C0000 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0089 <- 4.27 -> DC xxx C-003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0093 <- 3.08 -> DT xxx C-004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0097 <- 4.31 -> DT xxx C-005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0103 <- 3.53 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0110 <- 3.24 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0174 <- 4.48 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0175 <- 2.92 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0179 <- 3.42 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0183 <- 4.16 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0202 <- 3.50 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0203 <- 3.13 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0266 <- 3.66 -> DT xxx C-014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0269 <- 4.03 -> DT xxx C-013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0270 <- 4.17 -> DT xxx C-013 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0286 <- 3.53 -> DA xxx C0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0351 <- 4.19 -> DC xxx C-001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0401 <- 3.15 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0418 <- 3.13 -> DT xxx D0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0502 <- 3.87 -> DT xxx C-009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0506 <- 3.48 -> DA xxx C-010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0559 <- 4.08 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0562 <- 4.02 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0566 <- 3.00 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0567 <- 3.27 -> DG xxx D0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0570 <- 3.23 -> DC xxx C-018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0572 <- 3.67 -> DT xxx C-016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0577 <- 4.21 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0578 <- 4.19 -> DA xxx D0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0581 <- 3.18 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0586 <- 4.22 -> DG xxx C-008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0612 <- 3.60 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0615 <- 3.42 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0150 <- 4.27 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : SER xxxx Q0038 <- 3.88 -> DC xxx C-019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Q0048 <- 4.38 -> DC xxx C-018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0052 <- 4.42 -> DT xxx C-017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx Q0057 <- 3.31 -> DT xxx C-017 : score x.xxxxx >8bh3_ABC: title=DNA-PK KU80 MEDIATED DIMER BOUND TO PAXX organism=? : H : LYS NZ A0263 <- 2.68 -> DA N3 d0019 : score 2.84357 : H : ARG NH1 B0254 <- 3.05 -> DT O2 d0024 : score 4.09109 : H : ARG NH1 C0400 <- 2.83 -> DA N3 d0033 : score 3.65996 : H : ARG NH2 C0400 <- 2.35 -> DT O2 e0023 : score 4.61433 : x : ARG xxxx A0264 <- 4.25 -> DT xxx e0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0403 <- 3.68 -> DA xxx e0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0271 <- 3.25 -> DT xxx d0030 : score x.xxxxx >8bh3_LST: title=DNA-PK KU80 MEDIATED DIMER BOUND TO PAXX organism=? : H : ARG NH2 L0400 <- 2.64 -> DT O2 i0023 : score 4.3688 : H : ARG NH2 S0264 <- 2.84 -> DA N3 i0039 : score 3.21383 : H : ARG NH1 T0254 <- 3.42 -> DA N3 i0033 : score 3.22548 : H : ARG NH2 T0254 <- 2.67 -> DC O2 i0034 : score 3.79488 : x : LYS xxxx S0263 <- 3.20 -> DT xxx i0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx T0403 <- 3.81 -> DA xxx i0031 : score x.xxxxx >8bh3_S:Protein_kinase-like_PK-like;ARM_repeat; title=DNA-PK KU80 MEDIATED DIMER BOUND TO PAXX organism=? : H : ARG NH2 S0264 <- 2.84 -> DA N3 i0039 : score 3.21383 : x : LYS xxxx S0263 <- 3.20 -> DT xxx i0041 : score x.xxxxx >8bhv_Aab: title=DNA-PK XLF MEDIATED DIMER BOUND TO PAXX organism=? : H : LYS NZ A2746 <- 2.36 -> DG O6 E0044 : score 6.28948 : H : ARG NH1 b0400 <- 2.65 -> DA N3 E0024 : score 3.79251 : V : THR CG2 a0298 <- 3.81 -> DT C7 E0028 : score 4.22633 : x : LYS xxxx A0124 <- 3.33 -> DG xxx D0022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0125 <- 4.28 -> DG xxx D0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0452 <- 3.43 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0835 <- 3.23 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0839 <- 2.97 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A2228 <- 4.09 -> DG xxx E0044 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A2312 <- 3.65 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A2738 <- 3.02 -> DG xxx E0044 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A2742 <- 3.06 -> DG xxx E0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A2745 <- 2.86 -> DG xxx E0044 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A2749 <- 3.93 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A2750 <- 4.40 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a0254 <- 3.72 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx a0257 <- 4.43 -> DA xxx E0032 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx a0287 <- 3.38 -> DT xxx E0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a0403 <- 3.78 -> DA xxx E0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx b0271 <- 3.56 -> DT xxx D0030 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx b0273 <- 3.43 -> DT xxx E0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx b0397 <- 3.26 -> DA xxx E0024 : score x.xxxxx >8bhv_Fhj: title=DNA-PK XLF MEDIATED DIMER BOUND TO PAXX organism=? : H : ARG NH1 h0254 <- 3.28 -> DT O2 J0025 : score 3.89299 : H : ARG NH2 h0254 <- 3.11 -> DA N3 I0033 : score 3.03888 : x : LYS xxxx F0263 <- 3.61 -> DA xxx J0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0264 <- 3.74 -> DT xxx I0041 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0306 <- 3.73 -> DC xxx J0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F2228 <- 2.89 -> DG xxx I0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F2311 <- 4.36 -> DA xxx I0042 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F2313 <- 3.49 -> DA xxx J0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F2738 <- 2.81 -> DG xxx I0044 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F2742 <- 3.21 -> DA xxx J0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F2743 <- 4.14 -> DC xxx J0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F2745 <- 3.38 -> DA xxx J0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F2746 <- 3.59 -> DC xxx J0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx h0252 <- 3.49 -> DC xxx I0034 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx h0287 <- 4.40 -> DA xxx I0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx j0244 <- 4.43 -> DA xxx I0024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx j0245 <- 4.48 -> DA xxx I0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx j0265 <- 3.14 -> DA xxx I0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx j0273 <- 4.35 -> DT xxx I0023 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx j0360 <- 3.33 -> DA xxx I0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx j0397 <- 2.70 -> DA xxx I0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx j0398 <- 3.36 -> DA xxx I0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx j0400 <- 2.89 -> DA xxx I0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx j0401 <- 4.08 -> DA xxx I0025 : score x.xxxxx >8bhv_j:SPOC_domain-like;vWA-like;C-terminal_domain_of_Ku80; title=DNA-PK XLF MEDIATED DIMER BOUND TO PAXX organism=? : x : SER xxxx j0244 <- 4.43 -> DA xxx I0024 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx j0245 <- 4.48 -> DA xxx I0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx j0265 <- 3.14 -> DA xxx I0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx j0273 <- 4.35 -> DT xxx I0023 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx j0360 <- 3.33 -> DA xxx I0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx j0397 <- 2.70 -> DA xxx I0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx j0398 <- 3.36 -> DA xxx I0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx j0400 <- 2.89 -> DA xxx I0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx j0401 <- 4.08 -> DA xxx I0025 : score x.xxxxx >8bhy_ABC: title=DNA-PK KU80 MEDIATED DIMER BOUND TO PAXX AND XLF organism=? : H : LYS NZ A0263 <- 2.72 -> DA N3 e0039 : score 2.82135 : H : ARG NH2 C0400 <- 2.26 -> DA N3 d0033 : score 3.58964 : x : ARG xxxx A0264 <- 3.55 -> DT xxx e0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0254 <- 3.68 -> DT xxx d0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0403 <- 3.87 -> DA xxx e0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0271 <- 3.08 -> DG xxx d0029 : score x.xxxxx >8bhy_C:SPOC_domain-like;vWA-like;C-terminal_domain_of_Ku80; title=DNA-PK KU80 MEDIATED DIMER BOUND TO PAXX AND XLF organism=? : H : ARG NH2 C0400 <- 2.26 -> DA N3 d0033 : score 3.58964 : x : ARG xxxx C0271 <- 3.08 -> DG xxx d0029 : score x.xxxxx >8bhy_LST: title=DNA-PK KU80 MEDIATED DIMER BOUND TO PAXX AND XLF organism=? : H : ARG NH2 L0400 <- 2.83 -> DT O2 j0034 : score 4.20793 : x : TYR xxxx L0397 <- 3.45 -> DT xxx i0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx S0263 <- 3.39 -> DT xxx i0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx S0264 <- 3.85 -> DA xxx i0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx T0403 <- 3.83 -> DA xxx i0032 : score x.xxxxx >8bot_ABC: title=CRYO-EM STRUCTURE OF NHEJ SUPERCOMPLEX(TRIMER) organism=? : H : ARG NH1 B0254 <- 2.32 -> DT O2 E0024 : score 4.71983 : H : TYR OH B0409 <- 3.32 -> DG N7 E0029 : score 3.84131 : H : HIS NE2 C0243 <- 2.81 -> DT O2 D0023 : score 5.22926 : H : ASN OD1 C0359 <- 2.66 -> DA N6 D0026 : score 6.1904 : H : ASN ND2 C0359 <- 2.52 -> DA N7 D0026 : score 6.19926 : V : THR CB A0304 <- 3.71 -> DT C7 D0041 : score 3.60549 : V : ARG CG B0080 <- 3.78 -> DT C7 E0024 : score 1.01015 : x : LYS xxxx A0164 <- 4.27 -> DT xxx E0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0169 <- 3.32 -> DG xxx E0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0216 <- 4.36 -> DT xxx E0020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0218 <- 4.16 -> DG xxx E0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0263 <- 3.13 -> DT xxx D0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0264 <- 4.39 -> DT xxx D0041 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0265 <- 4.38 -> DT xxx D0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A2313 <- 2.97 -> DA xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0252 <- 3.03 -> DT xxx E0026 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0255 <- 4.47 -> DA xxx D0032 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0256 <- 3.29 -> DA xxx D0032 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0275 <- 2.75 -> DT xxx E0026 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0278 <- 3.11 -> DT xxx E0026 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0280 <- 4.18 -> DT xxx E0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0282 <- 4.02 -> DT xxx D0028 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0285 <- 3.37 -> DT xxx D0028 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0364 <- 4.11 -> DG xxx E0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0444 <- 4.00 -> DA xxx D0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0242 <- 3.75 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0272 <- 3.38 -> DT xxx E0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0275 <- 3.42 -> DT xxx E0030 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0360 <- 3.22 -> DA xxx D0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0397 <- 3.16 -> DA xxx D0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0400 <- 4.43 -> DC xxx D0027 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0401 <- 3.93 -> DA xxx D0026 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0404 <- 3.71 -> DA xxx D0026 : score x.xxxxx >8bot_F:Protein_kinase-like_PK-like;ARM_repeat; title=CRYO-EM STRUCTURE OF NHEJ SUPERCOMPLEX(TRIMER) organism=? : x : ARG xxxx F0264 <- 3.81 -> DT xxx I0041 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0305 <- 3.99 -> DT xxx I0041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0307 <- 3.82 -> DT xxx I0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F2228 <- 4.48 -> DG xxx I0044 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F2738 <- 3.44 -> DT xxx I0043 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F2742 <- 3.26 -> DA xxx J0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F2743 <- 3.81 -> DC xxx J0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F2745 <- 3.55 -> DA xxx J0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F2746 <- 3.48 -> DC xxx J0012 : score x.xxxxx >8bot_FGH: title=CRYO-EM STRUCTURE OF NHEJ SUPERCOMPLEX(TRIMER) organism=? : H : TYR OH H0397 <- 2.54 -> DA N3 I0024 : score 4.36715 : H : ARG NH2 H0400 <- 2.73 -> DT O2 J0034 : score 4.2926 : x : ARG xxxx F0264 <- 3.81 -> DT xxx I0041 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0305 <- 3.99 -> DT xxx I0041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0307 <- 3.82 -> DT xxx I0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F2228 <- 4.48 -> DG xxx I0044 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F2738 <- 3.44 -> DT xxx I0043 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F2742 <- 3.26 -> DA xxx J0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F2743 <- 3.81 -> DC xxx J0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F2745 <- 3.55 -> DA xxx J0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F2746 <- 3.48 -> DC xxx J0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0282 <- 3.59 -> DT xxx I0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0287 <- 3.94 -> DT xxx I0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0403 <- 3.68 -> DA xxx I0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0444 <- 3.44 -> DA xxx I0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0241 <- 3.51 -> DT xxx I0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0242 <- 3.04 -> DT xxx I0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0265 <- 2.94 -> DA xxx I0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0268 <- 3.36 -> DA xxx I0024 : score x.xxxxx >8bot_STU: title=CRYO-EM STRUCTURE OF NHEJ SUPERCOMPLEX(TRIMER) organism=? : H : ARG NH2 T0254 <- 2.40 -> DT O2 W0025 : score 4.572 : H : SER OG T0257 <- 2.28 -> DA N6 V0032 : score 3.63188 : H : LYS NZ T0279 <- 3.03 -> DT O4 W0032 : score 3.42217 : H : LYS NZ T0282 <- 2.94 -> DA N7 W0033 : score 2.85494 : H : SER OG U0244 <- 3.19 -> DA N7 V0024 : score 4.1159 : V : PRO CG T0284 <- 3.88 -> DT C7 W0027 : score 6.23179 : V : VAL CG1 U0272 <- 3.64 -> DT C7 W0030 : score 6.30293 : V : LEU CB T0281 <- 3.60 -> DT C7 W0032 : score 4.61892 : x : LYS xxxx S0163 <- 3.04 -> DA xxx V0031 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx S0164 <- 3.00 -> DA xxx V0031 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx S0166 <- 3.48 -> DA xxx V0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx S0262 <- 3.16 -> DA xxx V0042 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx S0263 <- 3.27 -> DA xxx W0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx S0264 <- 3.26 -> DT xxx V0040 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx S0265 <- 3.75 -> DT xxx V0041 : score x.xxxxx : x : MET xxxx S2742 <- 3.75 -> DA xxx W0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx S2745 <- 4.20 -> DA xxx W0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx S2746 <- 3.23 -> DC xxx W0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx T0080 <- 3.54 -> DT xxx W0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx T0256 <- 3.23 -> DA xxx V0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx T0258 <- 3.82 -> DC xxx V0034 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx T0259 <- 3.27 -> DA xxx V0033 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx T0278 <- 3.46 -> DT xxx W0027 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx T0285 <- 4.15 -> DA xxx V0030 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx T0287 <- 3.46 -> DA xxx V0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx T0300 <- 3.25 -> DA xxx V0031 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx T0343 <- 4.16 -> DA xxx V0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx T0403 <- 4.22 -> DA xxx V0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx T0404 <- 3.09 -> DA xxx V0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx T0444 <- 3.96 -> DA xxx V0024 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx T0482 <- 3.16 -> DA xxx W0033 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx U0125 <- 3.31 -> DG xxx W0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx U0239 <- 3.98 -> DT xxx V0023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx U0240 <- 3.54 -> DT xxx V0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx U0241 <- 2.86 -> DA xxx V0024 : score 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>8bq2_C:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Rad51_N-terminal_domain-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF THE PRE-SYNAPTIC RAD51 NUCLEOPROTEIN FILAMENT IN THE PRESENCE OF ATP AND CA2+ organism=? : x : ARG xxxx C0235 <- 4.06 -> DG xxx W0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0238 <- 4.32 -> DG xxx W0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0239 <- 3.80 -> DA xxx W0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0271 <- 4.27 -> DG xxx W0025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0273 <- 3.40 -> DG xxx W0025 : score x.xxxxx >8br2_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Rad51_N-terminal_domain-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF THE POST-SYNAPTIC RAD51 NUCLEOPROTEIN FILAMENT IN THE PRESENCE OF ATP AND CA2+ organism=? : H : ASP OD2 C0274 <- 3.43 -> DC N4 H0008 : score 5.4188 : x : ARG xxxx A0235 <- 3.67 -> DA xxx H0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0238 <- 3.22 -> DT xxx G0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0239 <- 3.33 -> DC xxx G0016 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0270 <- 3.92 -> DG 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score x.xxxxx >8c5s_AB:DNA/RNA_polymerases;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF YEAST MITOCHONDRIAL RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH 7-MER RNA, PPPGPGPUPAPAPAPU (IC7) organism=? : H : SER OG A0794 <- 2.27 -> DG N7 T0025 : score 4.95715 : H : THR OG1 A1025 <- 3.29 -> DC O2 T0017 : score 2.36833 : H : THR OG1 A1025 <- 3.29 -> DC O2 T0017 : score 2.36833 : H : GLN OE1 A1129 <- 3.36 -> DA N6 T0031 : score 5.37468 : H : ASP OD2 B0101 <- 2.95 -> DA N6 N0122 : score 3.88249 : H : GLN NE2 B0336 <- 2.86 -> DG N3 T0025 : score 4.91593 : x : TYR xxxx B0018 <- 3.77 -> DT xxx N0124 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0103 <- 3.07 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0104 <- 4.05 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0105 <- 2.89 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0144 <- 3.80 -> DA xxx N0119 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0146 <- 3.98 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0148 <- 3.61 -> DA xxx 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ASP xxxx B0104 <- 4.05 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0105 <- 2.89 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0144 <- 3.80 -> DA xxx N0119 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0146 <- 3.98 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0148 <- 3.61 -> DA xxx N0119 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0149 <- 3.66 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx >8c5u_AB:DNA/RNA_polymerases;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF YEAST MITOCHONDRIAL RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH 8-MER RNA, PPPGPGPUPAPAPAPUPG (IC8) organism=? : H : ARG NH1 A0530 <- 3.15 -> DC O2 T0028 : score 3.3945 : H : ARG NH2 A0530 <- 3.07 -> DC O2 T0028 : score 3.49899 : H : LYS NZ A0645 <- 3.21 -> DT O2 T0031 : score 3.29303 : H : ARG NH2 A1151 <- 2.51 -> DT O2 T0016 : score 4.47887 : H : ASP OD2 B0101 <- 2.82 -> DA N6 N0122 : score 3.98655 : H : GLU OE1 B0144 <- 3.01 -> DA N6 N0119 : score 2.56941 : H : GLN OE1 B0149 <- 3.10 -> DG N2 N0120 : score 5.27123 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2.82 -> DA N6 N0122 : score 3.98655 : H : GLU OE1 B0144 <- 3.01 -> DA N6 N0119 : score 2.56941 : H : GLN OE1 B0149 <- 3.10 -> DG N2 N0120 : score 5.27123 : x : TYR xxxx B0018 <- 3.08 -> DT xxx N0124 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0078 <- 4.29 -> DA xxx N0123 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0103 <- 3.34 -> DA xxx N0122 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0104 <- 3.84 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0105 <- 3.21 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0143 <- 4.49 -> DA xxx N0122 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0146 <- 4.09 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0148 <- 3.25 -> DA xxx N0119 : score x.xxxxx >8c7s_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=TRANSCRIPTIONAL PLEIOTROPIC REPRESSOR CODY FROM STAPHYLOCOCCUS AUREUS IN COMPLEX WITH ILE, GTP, AND A 30-BP DNA FRAGMENT ENCOMPASSING TWO OVERLAPPING BINDING SITES organism=Staphylococcus aureus (strain USA300) / Staphylococcus aureus (strain USA300) : H : SER OG A0215 <- 3.28 -> DT O4 M0018 : score 3.21384 : V : VAL CG1 A0218 <- 3.60 -> DT C7 M0018 : score 6.36354 : x : ARG xxxx A0214 <- 4.31 -> DT xxx M0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0237 <- 3.44 -> DA xxx M0014 : score x.xxxxx >8c7s_AB:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=TRANSCRIPTIONAL PLEIOTROPIC REPRESSOR CODY FROM STAPHYLOCOCCUS AUREUS IN COMPLEX WITH ILE, GTP, AND A 30-BP DNA FRAGMENT ENCOMPASSING TWO OVERLAPPING BINDING SITES organism=Staphylococcus aureus (strain USA300) / Staphylococcus aureus (strain USA300) / Staphylococcus aureus (strain USA300) / Staphylococcus aureus (strain USA300) : H : SER OG A0215 <- 3.28 -> DT O4 M0018 : score 3.21384 : H : SER OG B0215 <- 2.60 -> DG O6 M0021 : score 4.25467 : V : VAL CG1 A0218 <- 3.60 -> DT C7 M0018 : score 6.36354 : x : ARG xxxx A0214 <- 4.31 -> DT xxx M0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0237 <- 3.44 -> DA xxx M0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0213 <- 3.73 -> DG xxx M0021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0216 <- 4.29 -> DT xxx M0020 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0237 <- 3.88 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx >8c7u_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;GAF_domain-like; title=TRANSCRIPTIONAL PLEIOTROPIC REPRESSOR CODY FROM ENTEROCOCCUS FAECALIS IN COMPLEX WITH LEU AND A 30-BP DNA FRAGMENT ENCOMPASSING TWO OVERLAPPING BINDING SITES organism=Enterococcus faecalis (strain ATCC 700802 / V583) / Enterococcus faecalis (strain ATCC 700802 / V583) : H : SER OG A0220 <- 3.20 -> DG O6 E0012 : score 3.76374 : V : VAL CG2 A0223 <- 3.58 -> DT C7 F0017 : score 6.45985 : V : VAL CG2 A0221 <- 3.56 -> DT C7 E0011 : score 6.49046 : x : SER xxxx A0209 <- 4.01 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0218 <- 3.62 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0219 <- 3.23 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0242 <- 3.25 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx >8c7u_ABCD:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;GAF_domain-like; title=TRANSCRIPTIONAL PLEIOTROPIC REPRESSOR CODY FROM ENTEROCOCCUS FAECALIS IN COMPLEX WITH LEU AND A 30-BP DNA FRAGMENT ENCOMPASSING TWO OVERLAPPING BINDING SITES organism=Enterococcus faecalis (strain ATCC 700802 / V583) / Enterococcus faecalis (strain ATCC 700802 / V583) / Enterococcus faecalis (strain ATCC 700802 / V583) / Enterococcus faecalis (strain ATCC 700802 / V583) / Enterococcus faecalis (strain ATCC 700802 / V583) / Enterococcus faecalis (strain ATCC 700802 / V583) / Enterococcus faecalis (strain ATCC 700802 / V583) / Enterococcus faecalis (strain ATCC 700802 / V583) : H : SER OG A0220 <- 3.20 -> DG O6 E0012 : score 3.76374 : H : SER OG B0220 <- 2.86 -> DG O6 F0021 : score 4.04193 : H : SER OG C0220 <- 3.14 -> DG O6 E0021 : score 3.81284 : H : SER OG D0220 <- 2.87 -> DG O6 F0012 : score 4.03375 : V : VAL CG2 C0223 <- 3.76 -> DT C7 F0008 : score 6.18431 : V : VAL CG2 A0223 <- 3.58 -> DT C7 F0017 : score 6.45985 : V : VAL CG2 B0223 <- 3.73 -> DT C7 E0008 : score 6.23023 : V : VAL CG2 A0221 <- 3.56 -> DT C7 E0011 : score 6.49046 : V : VAL CG2 D0223 <- 3.83 -> DT C7 E0017 : score 6.07715 : V : VAL CG2 C0221 <- 3.70 -> DT C7 E0020 : score 6.27615 : x : SER xxxx A0209 <- 4.01 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0218 <- 3.62 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0219 <- 3.23 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0242 <- 3.25 -> DC xxx E0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0218 <- 3.24 -> DG xxx F0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0219 <- 3.97 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0242 <- 2.81 -> DT xxx F0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0218 <- 3.24 -> DG xxx E0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0219 <- 3.98 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0242 <- 3.21 -> DA xxx F0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0218 <- 3.08 -> DA xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0219 <- 4.10 -> DT xxx E0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0242 <- 3.00 -> DC xxx F0019 : score x.xxxxx >8cdn_A:p53-like_transcription_factors; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN BRACHYURY IN COMPLEX WITH A SINGLE T BOX BINDING ELEMENT DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0069 <- 2.96 -> DG N7 C0003 : score 5.8564 : x : THR xxxx A0196 <- 3.73 -> DC xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0213 <- 3.76 -> DG xxx C0000 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0217 <- 3.45 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx >8cef_CDJ:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ASYMMETRIC DIMERIZATION IN A TRANSCRIPTION FACTOR SUPERFAMILY IS PROMOTED BY ALLOSTERIC INTERACTIONS WITH DNA organism=Mus musculus : H : GLU OE1 C0097 <- 2.98 -> DC N4 B0019 : score 5.5603 : H : LYS NZ C0100 <- 2.88 -> DG O6 A0008 : score 5.68828 : H : LYS NZ C0104 <- 2.88 -> DG N7 A0009 : score 5.29972 : H : ARG NH1 C0105 <- 2.91 -> DG N7 B0017 : score 5.9169 : H : GLU OE1 D0097 <- 3.19 -> DC N4 A0019 : score 5.31805 : H : LYS NZ D0100 <- 2.97 -> DG O6 B0008 : score 5.58422 : H : ARG NH1 D0105 <- 2.94 -> DG N7 A0017 : score 5.8806 : H : GLU OE1 J0097 <- 3.01 -> DC N4 A0013 : score 5.52569 : H : LYS NZ J0100 <- 2.86 -> DG O6 B0014 : score 5.7114 : H : ARG NH2 J0158 <- 3.20 -> DC O2 B0011 : score 3.40282 : x : ALA xxxx C0101 <- 3.79 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0155 <- 3.58 -> DT xxx B0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0158 <- 3.75 -> DG xxx B0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0101 <- 3.92 -> DG xxx A0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0104 <- 3.15 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0155 <- 3.26 -> DA xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0158 <- 3.10 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0101 <- 3.57 -> DC xxx A0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0104 <- 3.24 -> DG xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0105 <- 3.97 -> DT xxx A0010 : score x.xxxxx >8cef_GHK:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ASYMMETRIC DIMERIZATION IN A TRANSCRIPTION FACTOR SUPERFAMILY IS PROMOTED BY ALLOSTERIC INTERACTIONS WITH DNA organism=Mus musculus : H : GLU OE1 G0097 <- 3.08 -> DC N4 E0019 : score 5.44494 : H : LYS NZ G0100 <- 2.77 -> DG O6 F0008 : score 5.81545 : H : LYS NZ G0104 <- 2.97 -> DG N7 F0009 : score 5.20278 : H : ARG NH1 G0105 <- 2.98 -> DG N7 E0017 : score 5.8322 : H : GLU OE1 H0097 <- 2.93 -> DC N4 F0019 : score 5.61798 : H : LYS NZ H0100 <- 2.79 -> DG O6 E0008 : score 5.79233 : H : ARG NH1 H0105 <- 2.97 -> DG N7 F0017 : score 5.8443 : H : ARG NH1 H0158 <- 2.96 -> DC O2 E0005 : score 3.5332 : H : GLU OE1 K0097 <- 3.07 -> DC N4 E0013 : score 5.45648 : H : LYS NZ K0100 <- 3.02 -> DG N7 F0014 : score 5.14892 : H : ARG NH1 K0158 <- 3.17 -> DC O2 F0011 : score 3.3799 : H : ARG NH2 K0158 <- 2.86 -> DT O2 F0010 : score 4.18253 : H : ARG NH2 K0158 <- 3.17 -> DC O2 F0011 : score 3.42501 : x : ALA xxxx G0101 <- 3.90 -> DG xxx E0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0155 <- 3.78 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0101 <- 3.81 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0104 <- 3.40 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0155 <- 3.43 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx K0101 <- 3.53 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx K0104 <- 3.32 -> DG xxx F0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0105 <- 3.99 -> DT xxx E0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0155 <- 4.45 -> DG xxx E0015 : score x.xxxxx >8cef_H:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=ASYMMETRIC DIMERIZATION IN A TRANSCRIPTION FACTOR SUPERFAMILY IS PROMOTED BY ALLOSTERIC INTERACTIONS WITH DNA organism=Mus musculus : H : GLU OE1 H0097 <- 2.93 -> DC N4 F0019 : score 5.61798 : H : LYS NZ H0100 <- 2.79 -> DG O6 E0008 : score 5.79233 : H : ARG NH1 H0105 <- 2.97 -> DG N7 F0017 : score 5.8443 : H : ARG NH1 H0158 <- 2.96 -> DC O2 E0005 : score 3.5332 : x : ALA xxxx H0101 <- 3.81 -> DG xxx F0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0104 <- 3.40 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0155 <- 3.43 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx >8ceo_r:Histone-fold; title=YEAST RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH CORE MEDIATOR AND THE +1 NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH1 r0040 <- 2.89 -> DT O2 T-054 : score 4.22889 : H : ARG NH2 r0040 <- 2.93 -> DT O2 T-054 : score 4.12327 : x : ARG xxxx r0083 <- 4.08 -> DG xxx N0039 : score x.xxxxx >8cli_A: title=TFIIIC TAUB-DNA MONOMER organism=? : H : ARG NH1 A0401 <- 3.13 -> DG O6 E0054 : score 5.68183 : H : ARG NH1 A0422 <- 2.32 -> DT O2 D0015 : score 4.71983 : H : GLN NE2 A0423 <- 2.93 -> DC O2 D0016 : score 3.59881 : x : ALA xxxx A0206 <- 4.04 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0210 <- 4.00 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0211 <- 3.45 -> DC xxx E0056 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0295 <- 4.41 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0398 <- 3.99 -> DG xxx E0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0405 <- 3.96 -> DG xxx E0052 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0655 <- 3.65 -> DC xxx E0062 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0657 <- 3.05 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0661 <- 3.82 -> DA xxx E0060 : score x.xxxxx >8cli_AC:WD40_repeat-like; title=TFIIIC TAUB-DNA MONOMER organism=? : H : ARG NH1 A0401 <- 3.13 -> DG O6 E0054 : score 5.68183 : H : ARG NH1 A0422 <- 2.32 -> DT O2 D0015 : score 4.71983 : H : GLN NE2 A0423 <- 2.93 -> DC O2 D0016 : score 3.59881 : x : ALA xxxx A0206 <- 4.04 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0210 <- 4.00 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0211 <- 3.45 -> DC xxx E0056 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0295 <- 4.41 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0398 <- 3.99 -> DG xxx E0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0405 <- 3.96 -> DG xxx E0052 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0655 <- 3.65 -> DC xxx E0062 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0657 <- 3.05 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0661 <- 3.82 -> DA xxx E0060 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0743 <- 4.21 -> DA xxx E0044 : score x.xxxxx >8cli_C:WD40_repeat-like; title=TFIIIC TAUB-DNA MONOMER organism=? : x : ASN xxxx C0743 <- 4.21 -> DA xxx E0044 : score x.xxxxx >8clj_AC:WD40_repeat-like; title=TFIIIC TAUB-DNA DIMER organism=? : H : ARG NH1 A0401 <- 3.13 -> DG O6 E0054 : score 5.68183 : H : ARG NH1 A0422 <- 2.33 -> DT O2 D0015 : score 4.71121 : H : GLN NE2 A0423 <- 2.96 -> DC O2 D0016 : score 3.57664 : H : LYS NZ A0657 <- 2.80 -> DG O6 D0013 : score 5.78077 : x : ALA xxxx A0206 <- 4.02 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0210 <- 3.99 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0211 <- 3.47 -> DC xxx E0056 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0237 <- 4.47 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0398 <- 3.98 -> DG xxx E0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0405 <- 3.96 -> DG xxx E0052 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0655 <- 3.75 -> DC xxx E0062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0661 <- 3.82 -> DA xxx E0060 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0743 <- 4.21 -> DA xxx E0044 : score x.xxxxx >8clj_FH:WD40_repeat-like; title=TFIIIC TAUB-DNA DIMER organism=? : H : ARG NH1 F0401 <- 2.99 -> DG O6 J0054 : score 5.85217 : H : ARG NH2 F0401 <- 2.88 -> DG N7 J0053 : score 6.28246 : H : ARG NH1 F0422 <- 2.68 -> DT O2 I0015 : score 4.40976 : H : GLN NE2 F0423 <- 3.05 -> DC O2 I0016 : score 3.51013 : H : LYS NZ F0657 <- 2.65 -> DG O6 I0013 : score 5.95419 : x : ALA xxxx F0206 <- 4.05 -> DT xxx I0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0210 <- 4.11 -> DT xxx I0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0211 <- 3.43 -> DC xxx J0056 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0237 <- 4.33 -> DG xxx I0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0295 <- 4.16 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0398 <- 3.93 -> DG xxx J0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0405 <- 4.40 -> DG xxx J0052 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx F0655 <- 3.53 -> DC xxx J0062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0661 <- 3.77 -> DA xxx J0060 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0743 <- 3.71 -> DA xxx J0044 : score x.xxxxx >8clj_H:WD40_repeat-like; title=TFIIIC TAUB-DNA DIMER organism=? : x : ASN xxxx H0743 <- 3.71 -> DA xxx J0044 : score x.xxxxx >8com_A:Histone-fold; title=STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE FROM TRYPANOSOMA BRUCEI organism=? : x : ARG xxxx A0080 <- 3.49 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx >8com_ABCDEFGH:Histone-fold; title=STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE FROM TRYPANOSOMA BRUCEI organism=? : H : ARG NH1 H0021 <- 3.29 -> DT O2 J-047 : score 3.88438 : x : ARG xxxx A0080 <- 3.49 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.08 -> DT xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0080 <- 4.27 -> DA xxx I0026 : score x.xxxxx >8com_C:Histone-fold; title=STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE FROM TRYPANOSOMA BRUCEI organism=? : x : ARG xxxx C0042 <- 4.08 -> DT xxx J0038 : score x.xxxxx >8com_H:Histone-fold; title=STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE FROM TRYPANOSOMA BRUCEI organism=? : H : ARG NH1 H0021 <- 3.29 -> DT O2 J-047 : score 3.88438 >8csh_AD: title=STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF PSK1 PAR PARTITION PROTEIN BOUND TO CENTROMERE DNA organism=? : w : THR OG1 A0014 <- 6.22 -> DA N6 T0012 : score 3.251 : w : LYS NZ A0015 <- 5.85 -> DA N7 Y0016 : score 1.655 : H : GLN OE1 A0016 <- 3.27 -> DC N4 Y0018 : score 4.1525 : w : ASN ND2 A0020 <- 5.75 -> DT O4 Y0019 : score 3.275 : w : THR OG1 D0014 <- 5.98 -> DA N6 Y0012 : score 3.251 : w : LYS NZ D0015 <- 5.82 -> DA N7 T0016 : score 1.655 : H : GLN OE1 D0016 <- 3.10 -> DC N4 T0018 : score 4.30833 : w : ASN ND2 D0020 <- 5.57 -> DT O4 Y0011 : score 3.275 : x : THR xxxx D0017 <- 3.46 -> DT xxx Y0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0017 <- 3.64 -> DT xxx T0011 : score x.xxxxx >8csh_D: title=STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF PSK1 PAR PARTITION PROTEIN BOUND TO CENTROMERE DNA organism=? : w : THR OG1 D0014 <- 5.98 -> DA N6 Y0012 : score 3.251 : w : LYS NZ D0015 <- 5.82 -> DA N7 T0016 : score 1.655 : H : GLN OE1 D0016 <- 3.10 -> DC N4 T0018 : score 4.30833 : w : ASN ND2 D0020 <- 5.81 -> DT O4 T0019 : score 3.275 : x : THR xxxx D0017 <- 3.46 -> DT xxx Y0011 : score x.xxxxx >8csz_D:Ribonuclease_H-like; title=ISCB AND WRNA BOUND TO TARGET DNA organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : HIS NE2 D0379 <- 2.44 -> DT O2 E0117 : score 5.617 : H : LYS NZ D0380 <- 2.65 -> DA N3 B0016 : score 2.86023 : V : GLU CB D0459 <- 3.89 -> DT C7 E0117 : score 1.59107 : x : ARG xxxx D0457 <- 4.24 -> DT xxx E0117 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0461 <- 4.45 -> DA xxx E0118 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0467 <- 3.99 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0468 <- 3.87 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0478 <- 3.96 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx >8ctl_D:Ribonuclease_H-like; title=ISCB AND WRNA BOUND TO TARGET DNA (LOCKED STATE) organism=SYNTHETIC CONSTRUCT : H : HIS NE2 D0379 <- 2.68 -> DT O2 B0117 : score 5.3655 : H : LYS NZ D0380 <- 2.68 -> DA N3 A0016 : score 2.84357 : H : GLU OE1 D0459 <- 2.80 -> DC N4 A0014 : score 5.76795 : x : ARG xxxx D0457 <- 4.03 -> DT xxx B0117 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0467 <- 4.29 -> DT xxx A0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0468 <- 3.22 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0478 <- 3.39 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx >8cty_DG:Ribonuclease_H-like; title=12-MER DNA STRUCTURE OF EXBIM BOUND TO RNASE-H organism=Halalkalibacterium halodurans : x : THR xxxx D0173 <- 3.76 -> DC xxx J0001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0077 <- 4.33 -> DA xxx J0005 : score x.xxxxx >8cty_G:Ribonuclease_H-like; title=12-MER DNA STRUCTURE OF EXBIM BOUND TO RNASE-H organism=Halalkalibacterium halodurans : x : ASN xxxx G0077 <- 4.33 -> DA xxx J0005 : score x.xxxxx >8ctz_B:Ribonuclease_H-like; title=12-MER DNA STRUCTURE OF EXBIM & O6ME-G BOUND TO RNASE-H organism=Alkalihalobacillus halodurans : H : ASN ND2 B0077 <- 3.05 -> DC O2 E0001 : score 4.25551 : w : ASN ND2 B0106 <- 5.65 -> DC O2 E0003 : score 1.885 : w : THR OG1 B0135 <- 5.73 -> DC O2 E0003 : score 2.048 >8cu0_C:Ribonuclease_H-like; title=12-MER DNA STRUCTURE OF EXBIM BOUND TO RNASEH -MODIFIED DDD organism=Halalkalibacterium halodurans : w : ASN ND2 C0077 <- 5.69 -> DG N3 D0008 : score 2.566 : w : ASN ND2 C0106 <- 5.72 -> DT O2 E0007 : score 1.666 >8cuc_F:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF SALL4 ZINC FINGER DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : w : SER OG F0880 <- 5.78 -> DT O4 B0009 : score 2.338 : w : SER OG F0881 <- 6.49 -> DA N7 A0004 : score 2.343 : w : SER OG F0881 <- 6.04 -> DA N6 A0004 : score 2.209 : w : SER OG F0883 <- 5.69 -> DA N7 A0004 : score 2.343 : w : THR OG1 F0909 <- 5.37 -> DT O4 B0006 : score 2.809 : H : ASN OD1 F0912 <- 2.96 -> DA N6 B0005 : score 5.8291 : H : ASN ND2 F0912 <- 2.96 -> DA N7 B0005 : score 5.68266 : w : ASN OD1 F0912 <- 6.06 -> DA N6 A0007 : score 2.837 : w : ASN OD1 F0912 <- 5.98 -> DA N6 B0004 : score 2.837 : V : ILE CG2 F0887 <- 3.79 -> DT C7 B0006 : score 7.10901 >8cuc_FH:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF SALL4 ZINC FINGER DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : w : SER OG F0880 <- 5.78 -> DT O4 B0009 : score 2.338 : w : SER OG F0881 <- 6.49 -> DA N7 A0004 : score 2.343 : w : SER OG F0881 <- 6.04 -> DA N6 A0004 : score 2.209 : w : SER OG F0883 <- 5.69 -> DA N7 A0004 : score 2.343 : w : THR OG1 F0909 <- 5.37 -> DT O4 B0006 : score 2.809 : H : ASN OD1 F0912 <- 2.96 -> DA N6 B0005 : score 5.8291 : H : ASN ND2 F0912 <- 2.96 -> DA N7 B0005 : score 5.68266 : w : ASN OD1 F0912 <- 6.06 -> DA N6 A0007 : score 2.837 : w : ASN OD1 F0912 <- 5.98 -> DA N6 B0004 : score 2.837 : V : ILE CG2 F0887 <- 3.79 -> DT C7 B0006 : score 7.10901 : x : VAL xxxx F0915 <- 4.16 -> DT xxx B0003 : score x.xxxxx >8cww_A:Histone-fold; title=STRUCTURE OF S. CEREVISIAE HOP1 CBR BOUND TO A NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 3.48 -> DG N3 J0009 : score 3.11926 >8cxs_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR MTA organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.09 -> DA N3 d0006 : score 3.99988 : H : LYS NZ A0172 <- 2.92 -> DT O2 e0009 : score 3.50109 : H : LYS NZ A0172 <- 2.70 -> DT O2 e0010 : score 3.65892 : H : LYS NZ A0193 <- 3.26 -> DG N3 e0013 : score 1.32009 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.06 -> DA N7 d0005 : score 5.77308 : H : ARG NH1 A0425 <- 3.02 -> DG N7 e0013 : score 5.7838 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.91 -> DG O6 e0013 : score 6.4548 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.58 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.73 -> DT O4 e0012 : score 4.875 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.25 -> DA N7 d0004 : score 2.32983 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.19 -> DA N7 d0004 : score 1.54139 : H : SER OG A0514 <- 2.83 -> DA N6 d0007 : score 3.27001 : w : SER OG A0514 <- 6.31 -> DG O6 d0009 : score 2.749 : H : TYR OH A0521 <- 2.92 -> DA N7 d0006 : score 4.05165 : V : TYR CZ A0455 <- 3.84 -> DT C7 e0009 : score 5.52369 : V : ALA CB A0473 <- 3.85 -> DT C7 e0010 : score 5.52899 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.80 -> DT C7 e0011 : score 7.09128 : V : ILE CG2 B0431 <- 3.87 -> DT C7 e0015 : score 6.96719 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.32 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 3.08 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.23 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.18 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.79 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.71 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0255 <- 4.09 -> DG xxx e0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.87 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.17 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.23 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 3.87 -> DT xxx d0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.37 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.65 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.18 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 3.97 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.23 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.48 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.70 -> DC xxx e0007 : score x.xxxxx >8cxs_C:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR MTA organism=Clostridioides difficile : H : LYS NZ C0172 <- 3.13 -> DT O2 g0024 : score 3.35043 : H : LYS NZ C0193 <- 3.47 -> DG N3 g0027 : score 1.25903 : H : ARG NH1 C0425 <- 2.96 -> DG N7 g0027 : score 5.8564 : H : ARG NH2 C0425 <- 2.70 -> DG O6 g0027 : score 6.732 : H : TRP NE1 C0439 <- 2.78 -> DT O4 g0026 : score 4.82692 : w : TYR OH C0455 <- 5.93 -> DT O2 g0022 : score 3.068 : V : TYR CZ C0455 <- 3.86 -> DT C7 g0023 : score 5.4958 : V : ILE CG2 C0349 <- 3.77 -> DT C7 g0025 : score 7.14447 >8cxt_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR N6-BENZYLADENOSINE (COMPOUND 1) organism=Clostridioides difficile 630 : H : HIS NE2 B0171 <- 3.41 -> DA N3 e0019 : score 3.72812 : H : LYS NZ B0172 <- 3.02 -> DT O2 d0024 : score 3.42934 : H : LYS NZ B0193 <- 3.24 -> DG N3 d0027 : score 1.32591 : H : GLN OE1 B0346 <- 3.36 -> DA N6 e0018 : score 5.37468 : H : GLN NE2 B0346 <- 3.13 -> DA N7 e0018 : score 5.68782 : H : ARG NH1 B0425 <- 2.87 -> DG N7 d0027 : score 5.9653 : H : ARG NH2 B0425 <- 2.59 -> DG O6 d0027 : score 6.8772 : w : GLU OE2 B0426 <- 5.74 -> DT O4 e0015 : score 2.279 : H : TRP NE1 B0439 <- 2.96 -> DT O4 d0026 : score 4.65385 : H : ARG NH1 B0441 <- 3.28 -> DA N7 e0017 : score 2.31447 : H : ARG NH2 B0441 <- 3.05 -> DA N7 e0017 : score 1.58821 : H : SER OG B0514 <- 3.24 -> DA N6 e0020 : score 3.00025 : H : TYR OH B0521 <- 3.10 -> DA N7 e0019 : score 3.90221 : V : ILE CG2 B0349 <- 3.58 -> DT C7 d0025 : score 7.4813 : x : TYR xxxx B0030 <- 3.46 -> DA xxx e0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0165 <- 3.18 -> DA xxx e0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0168 <- 3.26 -> DA xxx e0021 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0192 <- 4.16 -> DG xxx d0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0221 <- 3.78 -> DA xxx e0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0253 <- 3.72 -> DA xxx e0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0256 <- 3.81 -> DA xxx e0021 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0258 <- 4.36 -> DA xxx e0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0379 <- 4.26 -> DT xxx d0022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 3.55 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0438 <- 3.50 -> DT xxx d0025 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0455 <- 3.06 -> DT xxx d0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0456 <- 3.61 -> DA xxx e0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0472 <- 3.32 -> DT xxx d0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0473 <- 3.12 -> DT xxx d0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0474 <- 4.11 -> DT xxx d0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0476 <- 4.32 -> DA xxx e0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0513 <- 3.51 -> DA xxx e0020 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0517 <- 3.77 -> DA xxx e0020 : score x.xxxxx >8cxu_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND COMPOUND 2 organism=Clostridioides difficile 630 : H : HIS NE2 A0171 <- 3.05 -> DA N3 d0006 : score 4.03385 : H : LYS NZ A0172 <- 2.92 -> DT O2 e0009 : score 3.50109 : H : LYS NZ A0172 <- 2.75 -> DT O2 e0010 : score 3.62305 : H : LYS NZ A0193 <- 3.21 -> DG N3 e0013 : score 1.33463 : w : ASN OD1 A0255 <- 5.86 -> DG O6 e0004 : score 3.125 : w : ASN OD1 A0255 <- 6.31 -> DG O6 e0004 : score 3.125 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.08 -> DA N7 d0005 : score 5.74872 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.93 -> DG N7 e0013 : score 5.8927 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.83 -> DG O6 e0013 : score 6.5604 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.52 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.81 -> DT O4 e0012 : score 4.79808 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.15 -> DA N7 d0004 : score 2.38104 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.33 -> DA N7 d0004 : score 1.49458 : H : SER OG A0514 <- 3.02 -> DA N6 d0007 : score 3.14499 : H : TYR OH A0521 <- 3.01 -> DA N7 d0006 : score 3.97693 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.68 -> DT C7 e0011 : score 7.30402 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.42 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 2.98 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.23 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.27 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.68 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.71 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.94 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.28 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.31 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 3.97 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.48 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0455 <- 3.04 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.58 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.25 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0473 <- 3.13 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 4.04 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.31 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.62 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.67 -> DC xxx e0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 3.96 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8cxu_C:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND COMPOUND 2 organism=Clostridioides difficile 630 : H : HIS NE2 C0171 <- 3.06 -> DA N3 f0020 : score 4.02535 : H : GLN NE2 C0346 <- 2.95 -> DA N7 f0019 : score 5.90705 : w : GLU OE2 C0426 <- 5.06 -> DT O4 f0016 : score 2.279 : H : ARG NH1 C0441 <- 3.23 -> DA N7 f0018 : score 2.34007 : H : ARG NH2 C0441 <- 3.27 -> DA N7 f0018 : score 1.51465 : H : SER OG C0514 <- 2.94 -> DA N6 f0021 : score 3.19763 : w : SER OG C0514 <- 6.33 -> DG O6 f0023 : score 2.749 : H : TYR OH C0521 <- 2.96 -> DA N7 f0020 : score 4.01844 >8cxv_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND COMPOUND 3 organism=Clostridioides difficile 630 : H : HIS NE2 A0171 <- 3.15 -> DA N3 d0006 : score 3.94892 : H : LYS NZ A0172 <- 2.91 -> DT O2 e0009 : score 3.50826 : H : LYS NZ A0172 <- 2.68 -> DT O2 e0010 : score 3.67327 : H : LYS NZ A0193 <- 3.10 -> DG N3 e0013 : score 1.36662 : w : ASN OD1 A0255 <- 6.29 -> DG O6 e0004 : score 3.125 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.10 -> DA N7 d0005 : score 5.72436 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.95 -> DG N7 e0013 : score 5.8685 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.86 -> DG O6 e0013 : score 6.5208 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.41 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.75 -> DT O4 e0012 : score 4.85577 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.18 -> DA N7 d0004 : score 2.36568 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.30 -> DA N7 d0004 : score 1.50462 : H : SER OG A0514 <- 3.00 -> DA N6 d0007 : score 3.15815 : H : TYR OH A0521 <- 2.93 -> DA N7 d0006 : score 4.04335 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.70 -> DT C7 e0011 : score 7.26856 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.39 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 2.92 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.20 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.24 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.77 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.74 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.88 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.22 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.28 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 4.05 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.44 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0455 <- 3.00 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.60 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.19 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0473 <- 3.16 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 4.05 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.27 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.64 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.73 -> DC xxx e0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 3.96 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8cxv_C:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND COMPOUND 3 organism=Clostridioides difficile 630 : H : HIS NE2 C0171 <- 2.99 -> DA N3 f0020 : score 4.0848 : H : GLN NE2 C0346 <- 2.93 -> DA N7 f0019 : score 5.93141 : w : GLU OE2 C0426 <- 5.32 -> DT O4 f0016 : score 2.279 : H : ARG NH1 C0441 <- 3.25 -> DA N7 f0018 : score 2.32983 : H : ARG NH2 C0441 <- 3.30 -> DA N7 f0018 : score 1.50462 : H : SER OG C0514 <- 2.85 -> DA N6 f0021 : score 3.25685 : w : SER OG C0514 <- 6.24 -> DG O6 f0023 : score 2.749 : H : TYR OH C0521 <- 3.00 -> DA N7 f0020 : score 3.98523 >8cxw_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR PICLIDENOSON (COMPOUND 4) organism=Clostridioides difficile 630 : H : HIS NE2 A0171 <- 3.21 -> DA N3 d0006 : score 3.89797 : H : LYS NZ A0172 <- 2.93 -> DT O2 e0009 : score 3.49391 : H : LYS NZ A0172 <- 2.82 -> DT O2 e0010 : score 3.57283 : H : GLN NE2 A0346 <- 2.96 -> DA N7 d0005 : score 5.89487 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.98 -> DG N7 e0013 : score 5.8322 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.76 -> DG O6 e0013 : score 6.6528 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.65 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.70 -> DT O4 e0012 : score 4.90385 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.24 -> DA N7 d0004 : score 2.33495 : H : SER OG A0514 <- 2.98 -> DA N6 d0007 : score 3.17131 : H : TYR OH A0521 <- 2.95 -> DA N7 d0006 : score 4.02674 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.65 -> DT C7 e0011 : score 7.3572 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.67 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 3.11 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.23 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.41 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0193 <- 3.26 -> DT xxx e0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.78 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.72 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0255 <- 3.75 -> DG xxx e0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.75 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.17 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.25 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 4.09 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.48 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0455 <- 2.96 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.65 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.22 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0473 <- 3.10 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 4.03 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.21 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.62 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.74 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx >8cxw_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR PICLIDENOSON (COMPOUND 4) organism=Clostridioides difficile 630 : H : HIS NE2 A0171 <- 3.21 -> DA N3 d0006 : score 3.89797 : H : LYS NZ A0172 <- 2.93 -> DT O2 e0009 : score 3.49391 : H : LYS NZ A0172 <- 2.82 -> DT O2 e0010 : score 3.57283 : H : GLN NE2 A0346 <- 2.96 -> DA N7 d0005 : score 5.89487 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.98 -> DG N7 e0013 : score 5.8322 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.76 -> DG O6 e0013 : score 6.6528 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.65 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.70 -> DT O4 e0012 : score 4.90385 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.24 -> DA N7 d0004 : score 2.33495 : H : SER OG A0514 <- 2.98 -> DA N6 d0007 : score 3.17131 : H : TYR OH A0521 <- 2.95 -> DA N7 d0006 : score 4.02674 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.65 -> DT C7 e0011 : score 7.3572 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.67 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 3.11 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.23 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.41 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0193 <- 3.26 -> DT xxx e0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.78 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.72 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0255 <- 3.75 -> DG xxx e0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.75 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.17 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.25 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 4.09 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.48 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0455 <- 2.96 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.65 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.22 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0473 <- 3.10 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 4.03 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.21 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.62 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.74 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 3.91 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8cxx_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND COMPOUND 6 organism=Clostridioides difficile 630 : H : HIS NE2 A0171 <- 3.13 -> DA N3 d0006 : score 3.96591 : H : LYS NZ A0172 <- 2.62 -> DT O2 e0010 : score 3.71632 : w : ASN ND2 A0255 <- 5.12 -> DG O6 e0004 : score 2.971 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.09 -> DA N7 d0005 : score 5.73654 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.95 -> DG N7 e0013 : score 5.8685 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.85 -> DG O6 e0013 : score 6.534 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.43 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.76 -> DT O4 e0012 : score 4.84615 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.14 -> DA N7 d0004 : score 2.38616 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.34 -> DA N7 d0004 : score 1.49124 : w : TYR OH A0455 <- 6.18 -> DT O4 e0009 : score 2.914 : H : SER OG A0514 <- 2.86 -> DA N6 d0007 : score 3.25027 : H : TYR OH A0521 <- 2.88 -> DA N7 d0006 : score 4.08486 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.78 -> DT C7 e0011 : score 7.12674 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.48 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 2.99 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.19 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.22 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0193 <- 3.13 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.77 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.79 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.83 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.22 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.30 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 3.97 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.43 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.64 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.16 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0473 <- 3.16 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 4.03 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.31 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.56 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.76 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 3.97 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8cxx_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND COMPOUND 6 organism=Clostridioides difficile 630 : x : ILE xxxx B0431 <- 3.97 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8cxy_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR N6-(2-PHENETHYL)ADENOSINE (COMPOUND 8) organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.11 -> DA N3 d0006 : score 3.98289 : H : LYS NZ A0172 <- 2.92 -> DT O2 e0009 : score 3.50109 : H : LYS NZ A0172 <- 2.66 -> DT O2 e0010 : score 3.68762 : H : LYS NZ A0193 <- 3.12 -> DG N3 e0013 : score 1.3608 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.06 -> DA N7 d0005 : score 5.77308 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.91 -> DG N7 e0013 : score 5.9169 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.81 -> DG O6 e0013 : score 6.5868 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.49 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.78 -> DT O4 e0012 : score 4.82692 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.11 -> DA N7 d0004 : score 2.40152 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.32 -> DA N7 d0004 : score 1.49793 : w : TYR OH A0455 <- 5.98 -> DT O2 e0008 : score 3.068 : H : SER OG A0514 <- 2.91 -> DA N6 d0007 : score 3.21737 : H : TYR OH A0521 <- 2.94 -> DA N7 d0006 : score 4.03505 : V : ALA CB A0473 <- 3.85 -> DT C7 e0010 : score 5.52899 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.74 -> DT C7 e0011 : score 7.19765 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.52 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 2.95 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.16 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.26 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.71 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.82 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.93 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.23 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.20 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 4.04 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.37 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.55 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.24 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 3.96 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.30 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.73 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.75 -> DC xxx e0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 4.08 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8cxy_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR N6-(2-PHENETHYL)ADENOSINE (COMPOUND 8) organism=Clostridioides difficile : x : ILE xxxx B0431 <- 4.08 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8cxz_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR N6-(3-PHENYLPROPYL)ADENOSINE (COMPOUND 14) organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.18 -> DA N3 d0006 : score 3.92345 : H : LYS NZ A0172 <- 2.96 -> DT O2 e0009 : score 3.47239 : H : LYS NZ A0172 <- 2.66 -> DT O2 e0010 : score 3.68762 : H : LYS NZ A0193 <- 3.09 -> DG N3 e0013 : score 1.36952 : w : ASN OD1 A0255 <- 5.96 -> DG O6 e0004 : score 3.125 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.00 -> DA N7 d0005 : score 5.84615 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.91 -> DG N7 e0013 : score 5.9169 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.80 -> DG O6 e0013 : score 6.6 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.45 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.78 -> DT O4 e0012 : score 4.82692 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.15 -> DA N7 d0004 : score 2.38104 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.27 -> DA N7 d0004 : score 1.51465 : H : SER OG A0514 <- 2.94 -> DA N6 d0007 : score 3.19763 : H : TYR OH A0521 <- 2.92 -> DA N7 d0006 : score 4.05165 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.71 -> DT C7 e0011 : score 7.25084 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.39 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 2.96 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.20 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.22 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.71 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.77 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.82 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.21 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.25 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 4.06 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.53 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0455 <- 3.00 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.60 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.18 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0473 <- 3.17 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 4.09 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.21 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.57 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.68 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 4.02 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8cxz_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR N6-(3-PHENYLPROPYL)ADENOSINE (COMPOUND 14) organism=Clostridioides difficile : x : ILE xxxx B0431 <- 4.02 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8cy0_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR MC4756 (COMPOUND 178) organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.24 -> DA N3 d0006 : score 3.87249 : H : LYS NZ A0172 <- 2.90 -> DT O2 e0009 : score 3.51544 : H : LYS NZ A0172 <- 2.89 -> DT O2 e0010 : score 3.52261 : H : LYS NZ A0193 <- 3.15 -> DG N3 e0013 : score 1.35208 : H : GLN NE2 A0346 <- 2.98 -> DA N7 d0005 : score 5.87051 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.96 -> DG N7 e0013 : score 5.8564 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.77 -> DG O6 e0013 : score 6.6396 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.80 -> DT O4 e0012 : score 4.80769 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.33 -> DA N7 d0004 : score 2.28887 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.22 -> DA N7 d0004 : score 1.53136 : H : SER OG A0514 <- 2.80 -> DA N6 d0007 : score 3.28974 : H : TYR OH A0521 <- 2.90 -> DA N7 d0006 : score 4.06826 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.78 -> DT C7 e0011 : score 7.12674 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.42 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 3.05 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.22 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.10 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.77 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.74 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0255 <- 3.48 -> DG xxx e0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.83 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.10 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.24 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0426 <- 4.06 -> DT xxx e0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 4.03 -> DT xxx d0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.51 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0455 <- 2.97 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.68 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.27 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0473 <- 3.14 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 4.03 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.20 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.61 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.65 -> DC xxx e0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 3.91 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8cy0_C:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR MC4756 (COMPOUND 178) organism=Clostridioides difficile : H : LYS NZ C0172 <- 2.88 -> DT O2 g0023 : score 3.52978 : H : LYS NZ C0172 <- 2.87 -> DT O2 g0024 : score 3.53696 : H : LYS NZ C0193 <- 3.08 -> DG N3 g0027 : score 1.37243 : H : ARG NH1 C0425 <- 2.95 -> DG N7 g0027 : score 5.8685 : H : ARG NH2 C0425 <- 2.78 -> DG O6 g0027 : score 6.6264 : H : TRP NE1 C0439 <- 2.87 -> DT O4 g0026 : score 4.74038 : V : ILE CG2 C0349 <- 3.76 -> DT C7 g0025 : score 7.16219 >8cy1_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND COMPOUND 19 organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.15 -> DA N3 d0006 : score 3.94892 : H : LYS NZ A0172 <- 3.00 -> DT O2 e0009 : score 3.44369 : H : LYS NZ A0172 <- 2.63 -> DT O2 e0010 : score 3.70914 : H : LYS NZ A0193 <- 3.06 -> DG N3 e0013 : score 1.37825 : w : ASN ND2 A0255 <- 5.42 -> DG O6 e0004 : score 2.971 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.05 -> DA N7 d0005 : score 5.78526 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.98 -> DG N7 e0013 : score 5.8322 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.88 -> DG O6 e0013 : score 6.4944 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.30 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.83 -> DT O4 e0012 : score 4.77885 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.06 -> DA N7 d0004 : score 2.42712 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.22 -> DA N7 d0004 : score 1.53136 : H : SER OG A0514 <- 2.84 -> DA N6 d0007 : score 3.26343 : H : TYR OH A0521 <- 2.97 -> DA N7 d0006 : score 4.01014 : V : ALA CB A0473 <- 3.90 -> DT C7 e0010 : score 5.459 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.64 -> DT C7 e0011 : score 7.37493 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.30 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 3.10 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.18 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.27 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.74 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.83 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.93 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.23 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.26 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 3.99 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.44 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0455 <- 2.98 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.60 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.19 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 3.93 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.28 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.59 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.75 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 4.10 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8cy1_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND COMPOUND 19 organism=Clostridioides difficile : x : ILE xxxx B0431 <- 4.10 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8cy2_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR APNEA (COMPOUND 9) organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.15 -> DA N3 d0006 : score 3.94892 : H : LYS NZ A0172 <- 2.64 -> DT O2 e0010 : score 3.70197 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.07 -> DA N7 d0005 : score 5.7609 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.97 -> DG N7 e0013 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.82 -> DG O6 e0013 : score 6.5736 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.65 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.86 -> DT O4 e0012 : score 4.75 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.33 -> DA N7 d0004 : score 2.28887 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.32 -> DA N7 d0004 : score 1.49793 : H : SER OG A0514 <- 2.90 -> DA N6 d0007 : score 3.22395 : H : TYR OH A0521 <- 2.96 -> DA N7 d0006 : score 4.01844 : V : ALA CB A0473 <- 3.89 -> DT C7 e0010 : score 5.473 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.70 -> DT C7 e0011 : score 7.26856 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.31 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 3.11 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.19 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.28 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0193 <- 3.19 -> DT xxx e0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.68 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.71 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.97 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.11 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.32 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 4.24 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.61 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0455 <- 2.98 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.74 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.33 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 4.13 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.21 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.65 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.80 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx >8cy2_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR APNEA (COMPOUND 9) organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.15 -> DA N3 d0006 : score 3.94892 : H : LYS NZ A0172 <- 2.64 -> DT O2 e0010 : score 3.70197 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.07 -> DA N7 d0005 : score 5.7609 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.97 -> DG N7 e0013 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.82 -> DG O6 e0013 : score 6.5736 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.65 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.86 -> DT O4 e0012 : score 4.75 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.33 -> DA N7 d0004 : score 2.28887 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.32 -> DA N7 d0004 : score 1.49793 : H : SER OG A0514 <- 2.90 -> DA N6 d0007 : score 3.22395 : H : TYR OH A0521 <- 2.96 -> DA N7 d0006 : score 4.01844 : V : ALA CB A0473 <- 3.89 -> DT C7 e0010 : score 5.473 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.70 -> DT C7 e0011 : score 7.26856 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.31 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 3.11 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.19 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.28 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0193 <- 3.19 -> DT xxx e0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.68 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.71 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.97 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.11 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.32 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 4.24 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.61 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0455 <- 2.98 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.74 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.33 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 4.13 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.21 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.65 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.80 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 4.04 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8cy3_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND COMPOUND 15 organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.23 -> DA N3 d0006 : score 3.88098 : H : LYS NZ A0172 <- 2.63 -> DT O2 e0010 : score 3.70914 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.07 -> DA N7 d0005 : score 5.7609 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.97 -> DG N7 e0013 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.84 -> DG O6 e0013 : score 6.5472 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.39 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.73 -> DT O4 e0012 : score 4.875 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.04 -> DA N7 d0004 : score 2.43736 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.18 -> DA N7 d0004 : score 1.54474 : H : SER OG A0514 <- 3.12 -> DA N6 d0007 : score 3.0792 : H : SER OG A0514 <- 3.48 -> DG O6 d0009 : score 3.53465 : H : TYR OH A0521 <- 3.02 -> DA N7 d0006 : score 3.96863 : V : ALA CB A0473 <- 3.86 -> DT C7 e0010 : score 5.51499 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.62 -> DT C7 e0011 : score 7.41039 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.31 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 2.97 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.20 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 3.94 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0193 <- 3.39 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.80 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.82 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0255 <- 3.47 -> DG xxx e0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.96 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.14 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.46 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 4.11 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.56 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0455 <- 3.10 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.68 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.26 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 4.11 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.34 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.64 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.74 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 4.02 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8cy3_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND COMPOUND 15 organism=Clostridioides difficile : x : ILE xxxx B0431 <- 4.02 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8cy4_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND COMPOUND 16 organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.15 -> DA N3 d0006 : score 3.94892 : H : LYS NZ A0172 <- 2.56 -> DT O2 e0010 : score 3.75936 : H : LYS NZ A0193 <- 3.10 -> DG N3 e0013 : score 1.36662 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.01 -> DA N7 d0005 : score 5.83397 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.94 -> DG N7 e0013 : score 5.8806 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.85 -> DG O6 e0013 : score 6.534 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.45 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.81 -> DT O4 e0012 : score 4.79808 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.16 -> DA N7 d0004 : score 2.37592 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.23 -> DA N7 d0004 : score 1.52802 : w : TYR OH A0455 <- 6.27 -> DT O4 e0009 : score 2.914 : H : SER OG A0514 <- 2.88 -> DA N6 d0007 : score 3.23711 : H : TYR OH A0521 <- 2.97 -> DA N7 d0006 : score 4.01014 : V : ALA CB A0473 <- 3.84 -> DT C7 e0010 : score 5.54298 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.68 -> DT C7 e0011 : score 7.30402 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.38 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 3.05 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.21 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.23 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.78 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.79 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0255 <- 3.62 -> DG xxx e0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.83 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.21 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.42 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 4.09 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.47 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.56 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.24 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 4.06 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.25 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.58 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.69 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 4.12 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8cy4_B:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND COMPOUND 16 organism=Clostridioides difficile : x : ILE xxxx B0431 <- 4.12 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8cy5_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND COMPOUND 39 organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.10 -> DA N3 d0006 : score 3.99138 : H : LYS NZ A0172 <- 2.97 -> DT O2 e0009 : score 3.46522 : H : LYS NZ A0172 <- 2.62 -> DT O2 e0010 : score 3.71632 : H : LYS NZ A0193 <- 3.04 -> DG N3 e0013 : score 1.38406 : w : ASN OD1 A0255 <- 6.04 -> DG O6 e0004 : score 3.125 : w : ASN OD1 A0255 <- 6.16 -> DG O6 e0004 : score 3.125 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.08 -> DA N7 d0005 : score 5.74872 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.99 -> DG N7 e0013 : score 5.8201 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.83 -> DG O6 e0013 : score 6.5604 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.43 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.69 -> DT O4 e0012 : score 4.91346 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.31 -> DA N7 d0004 : score 2.29911 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.33 -> DA N7 d0004 : score 1.49458 : H : SER OG A0514 <- 2.96 -> DA N6 d0007 : score 3.18447 : H : TYR OH A0521 <- 3.00 -> DA N7 d0006 : score 3.98523 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.65 -> DT C7 e0011 : score 7.3572 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.36 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 3.07 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.18 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.32 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.83 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.83 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.87 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.24 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.24 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 4.08 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.48 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0455 <- 3.07 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.56 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.20 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0473 <- 3.09 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 3.90 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.30 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.68 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.74 -> DC xxx e0007 : score x.xxxxx >8cy5_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND COMPOUND 39 organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.10 -> DA N3 d0006 : score 3.99138 : H : LYS NZ A0172 <- 2.97 -> DT O2 e0009 : score 3.46522 : H : LYS NZ A0172 <- 2.62 -> DT O2 e0010 : score 3.71632 : H : LYS NZ A0193 <- 3.04 -> DG N3 e0013 : score 1.38406 : w : ASN OD1 A0255 <- 6.04 -> DG O6 e0004 : score 3.125 : w : ASN OD1 A0255 <- 6.16 -> DG O6 e0004 : score 3.125 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.08 -> DA N7 d0005 : score 5.74872 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.99 -> DG N7 e0013 : score 5.8201 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.83 -> DG O6 e0013 : score 6.5604 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.43 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.69 -> DT O4 e0012 : score 4.91346 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.31 -> DA N7 d0004 : score 2.29911 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.33 -> DA N7 d0004 : score 1.49458 : H : SER OG A0514 <- 2.96 -> DA N6 d0007 : score 3.18447 : H : TYR OH A0521 <- 3.00 -> DA N7 d0006 : score 3.98523 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.65 -> DT C7 e0011 : score 7.3572 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.36 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 3.07 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.18 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.32 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.83 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.83 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.87 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.24 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.24 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 4.08 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.48 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0455 <- 3.07 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.56 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.20 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0473 <- 3.09 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 3.90 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.30 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.68 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.74 -> DC xxx e0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 3.96 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8cyf_A: title=WHIB3 BOUND TO SIGMAAR4-RNAP BETA FLAP TIP CHIMERA AND DNA organism=? : H : ARG NH2 A0038 <- 2.82 -> DC O2 D0010 : score 3.68392 >8cyf_AB:Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=WHIB3 BOUND TO SIGMAAR4-RNAP BETA FLAP TIP CHIMERA AND DNA organism=? : H : ARG NH2 A0038 <- 2.82 -> DC O2 D0010 : score 3.68392 : w : GLU OE2 B0501 <- 5.34 -> DA N6 C0003 : score 2.785 : H : GLN NE2 B0505 <- 3.28 -> DT O4 D0014 : score 4.69269 : w : GLN NE2 B0505 <- 6.14 -> DA N6 C0003 : score 2.804 : x : THR xxxx B0499 <- 4.11 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0502 <- 3.65 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx >8cyf_B:Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=WHIB3 BOUND TO SIGMAAR4-RNAP BETA FLAP TIP CHIMERA AND DNA organism=? : w : GLU OE2 B0501 <- 5.34 -> DA N6 C0003 : score 2.785 : H : GLN NE2 B0505 <- 3.28 -> DT O4 D0014 : score 4.69269 : w : GLN NE2 B0505 <- 6.14 -> DA N6 C0003 : score 2.804 : x : THR xxxx B0499 <- 4.11 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0502 <- 3.65 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx >8cze_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF A XENOPUS NUCLEOSOME WITH WIDOM 601 DNA organism=? : x : ARG xxxx A0040 <- 3.81 -> DG xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.35 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 3.66 -> DT xxx J0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.30 -> DT xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.44 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.51 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0011 <- 3.40 -> DT xxx J-043 : score x.xxxxx >8czq_A:Prokaryotic_type_I_DNA_topoisomerase; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF MTBTOP1 IN COMPLEX WITH BOTH G- AND T- SEGMENTS organism=? : H : SER OG A0555 <- 3.22 -> DG N7 C0006 : score 4.10556 : H : SER OG A0555 <- 2.75 -> DG O6 C0006 : score 4.13194 : x : ARG xxxx A0460 <- 3.90 -> DA xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0556 <- 3.94 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx >8d0b_A: title=HUMAN CST-DNA POLYMERASE ALPHA/PRIMASE PREINITIATION COMPLEX BOUND TO 4XTEL-FOLDBACK TEMPLATE organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ A1167 <- 2.36 -> DG O6 H0003 : score 6.28948 : H : ARG NH1 A1193 <- 3.20 -> DG O6 H0011 : score 5.59667 : H : ARG NH1 A1195 <- 3.17 -> DA N7 H0008 : score 2.3708 : V : ARG CZ A0975 <- 3.79 -> DT C7 H0001 : score 2.13764 : x : ARG xxxx A0926 <- 4.46 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0928 <- 3.92 -> DA xxx H0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0949 <- 3.31 -> DA xxx H0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0951 <- 2.84 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0979 <- 3.90 -> DG xxx H0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0981 <- 4.29 -> DG xxx H0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0983 <- 3.96 -> DA xxx H0002 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0985 <- 4.37 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0987 <- 3.92 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1035 <- 3.40 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1074 <- 3.21 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A1076 <- 4.09 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1083 <- 2.89 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A1085 <- 4.45 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1120 <- 3.82 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1124 <- 4.30 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1164 <- 3.93 -> DG xxx H0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1175 <- 3.65 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1177 <- 2.87 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1179 <- 3.30 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx >8d0b_ABF:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Ribonuclease_H-like;DNA/RNA_polymerases;Zinc_finger_domain_of_DNA_polymerase-alpha; title=HUMAN CST-DNA POLYMERASE ALPHA/PRIMASE PREINITIATION COMPLEX BOUND TO 4XTEL-FOLDBACK TEMPLATE organism=HOMO SAPIENS : H : LYS NZ A1167 <- 2.36 -> DG O6 H0003 : score 6.28948 : H : ARG NH1 A1193 <- 3.20 -> DG O6 H0011 : score 5.59667 : H : ARG NH1 A1195 <- 3.17 -> DA N7 H0008 : score 2.3708 : V : ARG CZ A0975 <- 3.79 -> DT C7 H0001 : score 2.13764 : x : ARG xxxx A0926 <- 4.46 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0928 <- 3.92 -> DA xxx H0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0949 <- 3.31 -> DA xxx H0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0951 <- 2.84 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0979 <- 3.90 -> DG xxx H0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0981 <- 4.29 -> DG xxx H0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0983 <- 3.96 -> DA xxx H0002 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0985 <- 4.37 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0987 <- 3.92 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1035 <- 3.40 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1074 <- 3.21 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A1076 <- 4.09 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1083 <- 2.89 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A1085 <- 4.45 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1120 <- 3.82 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1124 <- 4.30 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1164 <- 3.93 -> DG xxx H0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1175 <- 3.65 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1177 <- 2.87 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1179 <- 3.30 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0024 <- 3.40 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0072 <- 4.15 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0089 <- 3.31 -> DA xxx H0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0141 <- 3.32 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0146 <- 3.44 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0148 <- 3.80 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0554 <- 3.40 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0653 <- 3.48 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx F0654 <- 4.36 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0655 <- 4.14 -> DG xxx H0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0672 <- 4.40 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx >8d0b_B:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Nucleic_acid-binding_proteins; title=HUMAN CST-DNA POLYMERASE ALPHA/PRIMASE PREINITIATION COMPLEX BOUND TO 4XTEL-FOLDBACK TEMPLATE organism=HOMO SAPIENS : x : LEU xxxx B0024 <- 3.40 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0072 <- 4.15 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0089 <- 3.31 -> DA xxx H0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0141 <- 3.32 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0146 <- 3.44 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0148 <- 3.80 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx >8d0b_F:Ribonuclease_H-like;DNA/RNA_polymerases;Zinc_finger_domain_of_DNA_polymerase-alpha; title=HUMAN CST-DNA POLYMERASE ALPHA/PRIMASE PREINITIATION COMPLEX BOUND TO 4XTEL-FOLDBACK TEMPLATE organism=HOMO SAPIENS : x : GLN xxxx F0554 <- 3.40 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0653 <- 3.48 -> DT xxx H0007 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx F0654 <- 4.36 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0655 <- 4.14 -> DG xxx H0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0672 <- 4.40 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx >8d0k_ABCDEF:"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Nucleic_acid-binding_proteins;Prim-pol_domain;PriB_N-terminal_domain-like;Ribonuclease_H-like;DNA/RNA_polymerases;Zinc_finger_domain_of_DNA_polymerase-alpha; title=HUMAN CST-DNA POLYMERASE ALPHA/PRIMASE PREINITIATION COMPLEX BOUND TO 4XTEL-FOLDBACK TEMPLATE - PRIM2C ADVANCED PIC organism=HOMO SAPIENS : H : CYS SG A0928 <- 2.68 -> DA N6 H0002 : score 5.87618 : H : ARG NE A1074 <- 2.83 -> DG O6 H0009 : score 3.91738 : H : LYS NZ A1167 <- 2.66 -> DG O6 H0003 : score 5.94263 : H : GLN NE2 F0554 <- 2.70 -> DT O2 H0007 : score 4.012 : V : HIS CB E0351 <- 3.51 -> DT C7 H0018 : score 4.4242 : V : TYR CD2 D0054 <- 3.63 -> DT C7 H0019 : score 3.90055 : x : ARG xxxx A0926 <- 3.86 -> DA xxx H0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0949 <- 3.21 -> DA xxx H0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0951 <- 2.97 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0975 <- 3.65 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0979 <- 3.29 -> DG xxx H0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0981 <- 4.20 -> DG xxx H0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0983 <- 4.11 -> DA xxx H0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0987 <- 4.45 -> DT xxx H0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1035 <- 3.46 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1036 <- 4.38 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A1076 <- 4.50 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1083 <- 3.69 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A1085 <- 4.26 -> DG xxx H0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1124 <- 4.12 -> DA xxx H0008 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1162 <- 4.19 -> DG xxx H0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1164 <- 3.10 -> DG xxx H0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1175 <- 3.66 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1177 <- 2.96 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1179 <- 3.28 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1193 <- 3.03 -> DG xxx H0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1195 <- 3.45 -> DA xxx H0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0024 <- 3.35 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0067 <- 2.99 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0069 <- 3.14 -> DG xxx H0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0072 <- 4.04 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0089 <- 3.04 -> DA xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0091 <- 4.20 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0141 <- 3.15 -> DG xxx H0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0053 <- 3.56 -> DG xxx H0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0056 <- 3.89 -> DT xxx H0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0307 <- 3.94 -> DA xxx H0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0347 <- 2.73 -> DT xxx H0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0350 <- 4.21 -> DT xxx H0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0356 <- 3.23 -> DT xxx H0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0653 <- 4.37 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0655 <- 4.20 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0672 <- 3.62 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx >8d0k_D:Prim-pol_domain; title=HUMAN CST-DNA POLYMERASE ALPHA/PRIMASE PREINITIATION COMPLEX BOUND TO 4XTEL-FOLDBACK TEMPLATE - PRIM2C ADVANCED PIC organism=HOMO SAPIENS : V : TYR CD2 D0054 <- 3.63 -> DT C7 H0019 : score 3.90055 : x : ILE xxxx D0053 <- 3.56 -> DG xxx H0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0056 <- 3.89 -> DT xxx H0019 : score x.xxxxx >8d0k_E:PriB_N-terminal_domain-like; title=HUMAN CST-DNA POLYMERASE ALPHA/PRIMASE PREINITIATION COMPLEX BOUND TO 4XTEL-FOLDBACK TEMPLATE - PRIM2C ADVANCED PIC organism=HOMO SAPIENS : V : HIS CB E0351 <- 3.51 -> DT C7 H0018 : score 4.4242 : x : MET xxxx E0307 <- 3.94 -> DA xxx H0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0347 <- 2.73 -> DT xxx H0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0350 <- 4.21 -> DT xxx H0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0356 <- 3.23 -> DT xxx H0018 : score x.xxxxx >8d0k_F:Ribonuclease_H-like;DNA/RNA_polymerases;Zinc_finger_domain_of_DNA_polymerase-alpha; title=HUMAN CST-DNA POLYMERASE ALPHA/PRIMASE PREINITIATION COMPLEX BOUND TO 4XTEL-FOLDBACK TEMPLATE - PRIM2C ADVANCED PIC organism=HOMO SAPIENS : H : GLN NE2 F0554 <- 2.70 -> DT O2 H0007 : score 4.012 : x : VAL xxxx F0653 <- 4.37 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0655 <- 4.20 -> DT xxx H0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0672 <- 3.62 -> DG xxx H0011 : score x.xxxxx >8d33_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HUMAN MITOCHONDRIAL DNA POLYMERASE GAMMA TERNARY COMPLEX WITH GC BASEPAIR organism=? : H : ARG NH1 A0853 <- 2.94 -> DC O2 P0024 : score 3.5478 : x : ASN xxxx A0803 <- 3.98 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0861 <- 2.92 -> DT xxx P0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1102 <- 3.54 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx >8d37_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HUMAN MITOCHONDRIAL DNA POLYMERASE GAMMA TERNARY COMPLEX WITH GT BASEPAIR IN REPLICATION CONFORMER organism=? : H : ARG NH1 A0853 <- 3.20 -> DT O2 P0024 : score 3.9619 : x : ASN xxxx A0803 <- 4.09 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0807 <- 4.40 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0861 <- 2.93 -> DT xxx P0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1102 <- 3.93 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1134 <- 4.31 -> DT xxx P0024 : score x.xxxxx >8d3l_ACDEF: title=TYPE I-C CAS4-CAS1-CAS2 COMPLEX BOUND TO A PAM/PAM PRESPACER organism=? : V : LEU CD2 F0020 <- 3.80 -> DT C7 G0014 : score 5.73128 : x : ASP xxxx A0014 <- 2.75 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0049 <- 3.58 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0014 <- 4.25 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0049 <- 3.28 -> DG xxx G0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0072 <- 4.36 -> DG xxx G0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0011 <- 3.82 -> DA xxx H0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0020 <- 4.30 -> DC xxx H0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0021 <- 3.95 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0011 <- 3.16 -> DC xxx G0012 : score x.xxxxx >8d3l_BJ: title=TYPE I-C CAS4-CAS1-CAS2 COMPLEX BOUND TO A PAM/PAM PRESPACER organism=? : H : GLN OE1 J0024 <- 2.61 -> DA N6 G0030 : score 6.28256 : H : ARG NH1 J0039 <- 2.97 -> DT O4 G0033 : score 3.15684 : x : MET xxxx J0011 <- 3.84 -> DT xxx G0028 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0013 <- 3.34 -> DG xxx G0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx J0016 <- 2.95 -> DA xxx G0031 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx J0017 <- 3.11 -> DG xxx G0029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx J0020 <- 2.56 -> DA xxx G0031 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J0028 <- 3.83 -> DG xxx G0029 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx J0034 <- 3.45 -> DG xxx G0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0037 <- 3.72 -> DA xxx G0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0040 <- 3.57 -> DA xxx G0030 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx J0044 <- 3.76 -> DT xxx G0028 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx J0047 <- 3.95 -> DT xxx G0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0113 <- 3.30 -> DT xxx G0033 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0115 <- 3.89 -> DA xxx G0031 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx J0119 <- 3.55 -> DT xxx G0032 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx J0120 <- 4.13 -> DA xxx G0031 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx J0189 <- 4.09 -> DT xxx G0032 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0194 <- 3.32 -> DA xxx G0030 : score x.xxxxx >8d3l_C: title=TYPE I-C CAS4-CAS1-CAS2 COMPLEX BOUND TO A PAM/PAM PRESPACER organism=? : x : ASP xxxx C0014 <- 4.25 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0049 <- 3.28 -> DG xxx G0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0072 <- 4.36 -> DG xxx G0022 : score x.xxxxx >8d3m_ACDEF: title=TYPE I-C CAS4-CAS1-CAS2 COMPLEX BOUND TO A PAM/PROCESSED PRESPACER organism=? : H : ASP OD2 C0014 <- 2.32 -> DC N4 H0001 : score 6.7952 : V : LEU CD2 F0020 <- 3.79 -> DT C7 G0014 : score 5.74561 : x : ASP xxxx A0014 <- 3.14 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0049 <- 3.13 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0049 <- 3.32 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0011 <- 4.07 -> DA xxx H0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0020 <- 4.09 -> DC xxx H0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0021 <- 3.67 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0011 <- 3.19 -> DC xxx G0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0021 <- 4.27 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx >8d3m_F:TTP0101/SSO1404-like; title=TYPE I-C CAS4-CAS1-CAS2 COMPLEX BOUND TO A PAM/PROCESSED PRESPACER organism=? : V : LEU CD2 F0020 <- 3.79 -> DT C7 G0014 : score 5.74561 : x : THR xxxx F0011 <- 3.19 -> DC xxx G0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0021 <- 4.27 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx >8d3p_A: title=TYPE I-C CAS4-CAS1-CAS2 COMPLEX BOUND TO HALF-SITE INTEGRATION INTERMEDIATE (HSI) organism=? : x : ASP xxxx A0014 <- 3.55 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0049 <- 2.87 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx >8d3p_ADEFI: title=TYPE I-C CAS4-CAS1-CAS2 COMPLEX BOUND TO HALF-SITE INTEGRATION INTERMEDIATE (HSI) organism=? : V : LEU CD2 F0020 <- 3.63 -> DT C7 G0014 : score 5.97486 : x : ASP xxxx A0014 <- 3.55 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0049 <- 2.87 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0021 <- 3.38 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0011 <- 3.89 -> DC xxx G0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0021 <- 4.50 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx >8d3p_BC: title=TYPE I-C CAS4-CAS1-CAS2 COMPLEX BOUND TO HALF-SITE INTEGRATION INTERMEDIATE (HSI) organism=? : V : LYS CE C0290 <- 3.73 -> DT C7 g0024 : score 2.64654 : V : ASN CG C0215 <- 3.71 -> DT C7 g0025 : score 2.70779 : V : LEU CD1 C0245 <- 3.53 -> DT C7 g0028 : score 6.11814 : x : LYS xxxx B0312 <- 4.37 -> DC xxx g0048 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0014 <- 4.31 -> DG xxx g0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0071 <- 4.14 -> DT xxx g0023 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0073 <- 3.35 -> DT xxx g0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0075 <- 4.05 -> DT xxx g0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0196 <- 3.35 -> DT xxx g0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0212 <- 3.57 -> DT xxx g0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0237 <- 4.41 -> DT xxx g0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0240 <- 2.68 -> DT xxx g0028 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0248 <- 3.95 -> DT xxx g0028 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0284 <- 4.42 -> DT xxx g0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0289 <- 3.85 -> DT xxx g0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0293 <- 3.09 -> DT xxx g0024 : score x.xxxxx >8d3q_ACDEF: title=TYPE I-C CAS4-CAS1-CAS2 COMPLEX BOUND TO A PAM/NOPAM PRESPACER organism=? : V : LEU CD2 F0020 <- 3.69 -> DT C7 G0014 : score 5.88889 : x : ASP xxxx A0014 <- 3.88 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0049 <- 4.16 -> DG xxx G0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0014 <- 3.99 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0049 <- 3.25 -> DC xxx H0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0011 <- 3.99 -> DA xxx H0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0020 <- 4.41 -> DC xxx H0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0021 <- 3.90 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0011 <- 3.09 -> DC xxx G0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0021 <- 4.10 -> DC xxx H0006 : score x.xxxxx >8d3q_BJ: title=TYPE I-C CAS4-CAS1-CAS2 COMPLEX BOUND TO A PAM/NOPAM PRESPACER organism=? : x : MET xxxx J0011 <- 3.68 -> DT xxx G0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0013 <- 3.90 -> DT xxx G0028 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx J0034 <- 3.94 -> DT xxx G0028 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J0080 <- 3.88 -> DT xxx G0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0111 <- 4.19 -> DT xxx G0028 : score x.xxxxx >8d3r_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HUMAN MITOCHONDRIAL DNA POLYMERASE GAMMA TERNARY COMPLEX WITH GT BASEPAIR IN INTERMEDIATE CONFORMER organism=? : x : ASN xxxx A0803 <- 4.25 -> DG xxx T0009 : score x.xxxxx >8d42_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HUMAN MITOCHONDRIAL DNA POLYMERASE GAMMA TERNARY COMPLEX WITH GT BASEPAIR IN EDITING CONFORMER (COMPOSITE) organism=? : H : ARG NH2 A0562 <- 2.87 -> DT O2 T0023 : score 4.17407 : V : VAL CG2 A0378 <- 3.86 -> DT C7 P0024 : score 6.03123 : V : PHE CD2 A0307 <- 3.52 -> DT C7 T0006 : score 6.96762 : x : LEU xxxx A0203 <- 3.61 -> DT xxx P0024 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0270 <- 3.67 -> DT xxx P0022 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0273 <- 3.12 -> DA xxx P0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0309 <- 3.06 -> DA xxx P0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0310 <- 2.89 -> DT xxx T0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0313 <- 3.68 -> DA xxx P0021 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0843 <- 3.68 -> DA xxx P0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1092 <- 3.66 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1093 <- 3.34 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1094 <- 3.91 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx >8d4a_A: title=CAS12A2 QUATERNARY COMPLEX organism=? : H : LYS NZ A1164 <- 2.48 -> DA N3 G0008 : score 2.95465 : x : TYR xxxx A0465 <- 3.39 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A1065 <- 3.46 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1067 <- 3.81 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A1068 <- 4.42 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1069 <- 3.32 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1073 <- 3.94 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1080 <- 3.47 -> DA xxx G0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1085 <- 4.38 -> DA xxx G0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1092 <- 3.35 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1096 <- 3.50 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A1163 <- 3.50 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >8d86_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ISORETICULAR, INTERPENETRATING CO-CRYSTAL OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND SYMMETRICAL EXPANDED DUPLEX (31MER) CONTAINING THE COGNATE REPE54 SEQUENCE AND AN ADDITIONAL G-C RICH SEQUENCE CO- CRYSTALLIZED WITH A GUEST SMALL MOLECULE, NETROPSIN. organism=Escherichia coli K-12 : H : GLU OE1 C0077 <- 2.92 -> DC N4 A0022 : score 5.62952 : w : GLU OE2 C0077 <- 5.59 -> DG N7 A0021 : score 2.669 : H : LYS NZ C0080 <- 3.37 -> DG O6 B0013 : score 5.12176 : H : ARG NH2 C0124 <- 3.17 -> DT O2 B0009 : score 3.92007 : H : ARG NH1 C0200 <- 2.88 -> DG O6 A0011 : score 5.986 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.86 -> DT O4 A0012 : score 3.5112 : H : ASP OD1 C0203 <- 3.24 -> DC N4 B0023 : score 4.87452 : w : ASP OD1 C0203 <- 5.62 -> DT O4 B0022 : score 2.616 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.75 -> DG O6 A0013 : score 6.666 : w : ARG NE C0206 <- 6.32 -> DT O4 B0022 : score 1.317 : w : ARG NH2 C0206 <- 6.27 -> DT O4 B0022 : score 2.366 : H : ARG NE C0207 <- 3.26 -> DG N7 B0021 : score 4.01499 : H : ARG NH2 C0207 <- 3.08 -> DG O6 B0021 : score 6.2304 : H : ARG NH2 C0233 <- 2.97 -> DT O2 B0029 : score 4.0894 : x : SER xxxx C0075 <- 3.59 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 4.26 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.93 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 4.07 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 3.88 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 4.09 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.69 -> DG xxx A0011 : score x.xxxxx >8d8m_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ISORETICULAR, INTERPENETRATING CO-CRYSTAL OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND SYMMETRICAL EXPANDED DUPLEX (31MER) CONTAINING THE COGNATE REPE54 SEQUENCE AND AN ADDITIONAL G-C RICH SEQUENCE GROWN IN A CALCIUM CHLORIDE CRYSTALLIZATION SOLUTION. organism=Escherichia coli K-12 : H : GLU OE1 C0077 <- 3.10 -> DC N4 A0022 : score 5.42187 : H : LYS NZ C0080 <- 3.43 -> DG O6 B0013 : score 5.05239 : H : ARG NH2 C0124 <- 3.10 -> DT O2 B0009 : score 3.97933 : H : ARG NH1 C0200 <- 3.11 -> DG O6 A0011 : score 5.70617 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.95 -> DT O4 A0012 : score 3.44723 : H : ASP OD1 C0203 <- 3.16 -> DC N4 B0023 : score 4.96004 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.58 -> DG O6 A0013 : score 6.8904 : H : ARG NE C0207 <- 3.20 -> DG N7 B0021 : score 4.06805 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.83 -> DG O6 B0021 : score 6.5604 : H : ARG NH1 C0233 <- 2.60 -> DC O2 A0008 : score 3.796 : H : ARG NH2 C0233 <- 2.89 -> DT O2 B0029 : score 4.15713 : x : SER xxxx C0075 <- 3.64 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 4.02 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.82 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.84 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 3.47 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 3.78 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.63 -> DG xxx A0011 : score x.xxxxx >8d94_A:HD-domain/PDEase-like; title=SAMHD1-DNA COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0372 <- 3.22 -> DT O2 F0004 : score 3.87773 : V : LYS CB A0377 <- 3.64 -> DT C7 F0002 : score 2.39787 >8d96_B: title=HUMAN DNA POLYMERASE ALPHA/PRIMASE ELONGATION COMPLEX I BOUND TO PRIMER/TEMPLATE organism=? : x : HIS xxxx B0303 <- 3.27 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0307 <- 2.23 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0347 <- 2.72 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0348 <- 1.84 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0351 <- 3.60 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0352 <- 3.58 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0360 <- 2.82 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0361 <- 3.96 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0362 <- 2.73 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0363 <- 3.70 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0443 <- 4.05 -> DA xxx F0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0445 <- 3.01 -> DA xxx F0021 : score x.xxxxx >8d96_BC:PriB_N-terminal_domain-like;Ribonuclease_H-like;DNA/RNA_polymerases;Zinc_finger_domain_of_DNA_polymerase-alpha; title=HUMAN DNA POLYMERASE ALPHA/PRIMASE ELONGATION COMPLEX I BOUND TO PRIMER/TEMPLATE organism=? : x : HIS xxxx B0303 <- 3.27 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0307 <- 2.23 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0347 <- 2.72 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0348 <- 1.84 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0351 <- 3.60 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0352 <- 3.58 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0360 <- 2.82 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0361 <- 3.96 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0362 <- 2.73 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0363 <- 3.70 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0443 <- 4.05 -> DA xxx F0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0445 <- 3.01 -> DA xxx F0021 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0951 <- 3.73 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0955 <- 4.26 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0957 <- 3.89 -> DG xxx F0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0962 <- 4.18 -> DA xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0964 <- 3.52 -> DA xxx F0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C1053 <- 3.31 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C1081 <- 3.44 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx >8d9d_B:PriB_N-terminal_domain-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE-ALPHA/PRIMASE ELONGATION COMPLEX II BOUND TO PRIMER/TEMPLATE organism=? : H : ASN OD1 B0348 <- 3.13 -> DC N4 F0017 : score 3.91681 : x : HIS xxxx B0303 <- 3.87 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0307 <- 3.29 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0347 <- 3.38 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0351 <- 4.05 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0360 <- 4.21 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0362 <- 3.14 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0363 <- 3.62 -> DA xxx F0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0364 <- 4.12 -> DA xxx F0021 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0443 <- 2.89 -> DA xxx F0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0445 <- 2.85 -> DA xxx F0021 : score x.xxxxx >8d9d_BC:PriB_N-terminal_domain-like;Ribonuclease_H-like;DNA/RNA_polymerases;Zinc_finger_domain_of_DNA_polymerase-alpha; title=HUMAN DNA POLYMERASE-ALPHA/PRIMASE ELONGATION COMPLEX II BOUND TO PRIMER/TEMPLATE organism=? : H : ASN OD1 B0348 <- 3.13 -> DC N4 F0017 : score 3.91681 : x : HIS xxxx B0303 <- 3.87 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0307 <- 3.29 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0347 <- 3.38 -> DC xxx F0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0351 <- 4.05 -> DC xxx F0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0360 <- 4.21 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0362 <- 3.14 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0363 <- 3.62 -> DA xxx F0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0364 <- 4.12 -> DA xxx F0021 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0443 <- 2.89 -> DA xxx F0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0445 <- 2.85 -> DA xxx F0021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0955 <- 4.22 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0957 <- 4.04 -> DG xxx F0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0962 <- 4.22 -> DA xxx F0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0964 <- 3.49 -> DA xxx F0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C1053 <- 3.41 -> DT xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C1081 <- 3.57 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx >8dc2_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CASLAMBDA (CAS12L) BOUND TO CRRNA AND DNA organism=? : H : ASN ND2 A0102 <- 3.11 -> DG N7 D0000 : score 4.30157 : H : SER OG A0253 <- 3.11 -> DA N7 C0002 : score 4.18733 : x : LYS xxxx A0005 <- 3.12 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0098 <- 3.39 -> DG xxx D0000 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0126 <- 3.21 -> DT xxx D-002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0127 <- 4.11 -> DT xxx D-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0130 <- 3.27 -> DT xxx D-001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0131 <- 3.29 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0250 <- 4.21 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0254 <- 3.53 -> DC xxx D-005 : score x.xxxxx >8dej_AIJK: title=D. VULGARIS TYPE I-C CASCADE BOUND TO DSDNA TARGET organism=? : H : GLU OE1 I0053 <- 3.07 -> DC N4 M0018 : score 5.45648 : H : GLU OE1 I0053 <- 2.69 -> DA N6 M0019 : score 2.74106 : H : ASN ND2 I0072 <- 2.40 -> DT O2 M0013 : score 5.12585 : H : GLN NE2 I0393 <- 3.11 -> DG O6 M0026 : score 5.44521 : H : ASN ND2 I0396 <- 2.65 -> DA N3 M0025 : score 3.92192 : H : LYS NZ I0511 <- 3.10 -> DC O2 M0028 : score 2.76938 : H : GLU OE2 I0568 <- 3.14 -> DC N4 M0032 : score 4.90734 : H : LYS NZ I0607 <- 3.18 -> DG N3 M0030 : score 1.34335 : H : GLN NE2 J0084 <- 2.97 -> DT O4 M0037 : score 5.01453 : V : HIS CB J0078 <- 3.57 -> DT C7 M0036 : score 4.36232 : V : PHE CZ K0117 <- 3.72 -> DT C7 M0037 : score 7.25717 : x : LYS xxxx I0055 <- 3.21 -> DA xxx M0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0056 <- 3.60 -> DC xxx M0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0058 <- 3.16 -> DC xxx M0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0205 <- 3.57 -> DA xxx M0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0212 <- 4.25 -> DG xxx M0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0283 <- 3.46 -> DT xxx M0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0287 <- 3.42 -> DT xxx M0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0394 <- 3.04 -> DG xxx M0026 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0398 <- 4.26 -> DC xxx M0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx I0462 <- 3.26 -> DG xxx M0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0560 <- 3.23 -> DG xxx M0031 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0565 <- 4.46 -> DG xxx M0031 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx I0566 <- 2.98 -> DG xxx M0030 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0569 <- 4.08 -> DC xxx M0032 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0572 <- 3.71 -> DC xxx M0032 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0604 <- 4.04 -> DG xxx M0030 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx I0605 <- 3.11 -> DC xxx M0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0023 <- 2.84 -> DG xxx M0033 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx J0026 <- 3.98 -> DG xxx M0033 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx J0027 <- 3.50 -> DG xxx M0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0072 <- 2.94 -> DT xxx M0036 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0073 <- 3.21 -> DG xxx M0035 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J0077 <- 3.31 -> DT xxx M0036 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx J0080 <- 4.29 -> DT xxx M0037 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J0081 <- 4.17 -> DT xxx M0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0113 <- 3.89 -> DC xxx M0032 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx J0117 <- 3.00 -> DC xxx M0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0072 <- 3.85 -> DC xxx M0040 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx K0073 <- 3.76 -> DG xxx M0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0113 <- 3.39 -> DT xxx M0037 : score x.xxxxx >8dej_J: title=D. VULGARIS TYPE I-C CASCADE BOUND TO DSDNA TARGET organism=? : H : GLN NE2 J0084 <- 2.97 -> DT O4 M0037 : score 5.01453 : V : HIS CB J0078 <- 3.57 -> DT C7 M0036 : score 4.36232 : x : LYS xxxx J0023 <- 2.84 -> DG xxx M0033 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx J0026 <- 3.98 -> DG xxx M0033 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx J0027 <- 3.50 -> DG xxx M0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0072 <- 2.94 -> DT xxx M0036 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0073 <- 3.21 -> DG xxx M0035 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J0077 <- 3.31 -> DT xxx M0036 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx J0080 <- 4.29 -> DT xxx M0037 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx J0081 <- 4.17 -> DT xxx M0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0113 <- 3.89 -> DC xxx M0032 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx J0117 <- 3.00 -> DC xxx M0032 : score x.xxxxx >8df7_A:Topoisomerase_V_catalytic_domain-like;RuvA_domain_2-like; title=STRUCTURE OF M. KANDLERI TOPOISOMERASE V IN COMPLEX WITH DNA. 38 BASE PAIR SYMMETRIC DNA COMPLEX organism=Methanopyrus kandleri : H : ARG NH2 A0288 <- 2.79 -> DG N7 V0032 : score 6.39738 : H : ARG NH2 A0288 <- 2.87 -> DG O6 V0032 : score 6.5076 : x : LYS xxxx A0134 <- 4.23 -> DA xxx V0038 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0201 <- 2.87 -> DC xxx V0039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0289 <- 3.42 -> DT xxx U0005 : score x.xxxxx >8df7_AB:Topoisomerase_V_catalytic_domain-like;RuvA_domain_2-like; title=STRUCTURE OF M. KANDLERI TOPOISOMERASE V IN COMPLEX WITH DNA. 38 BASE PAIR SYMMETRIC DNA COMPLEX organism=Methanopyrus kandleri : H : ARG NH2 A0288 <- 2.79 -> DG N7 V0032 : score 6.39738 : H : ARG NH2 A0288 <- 2.87 -> DG O6 V0032 : score 6.5076 : x : LYS xxxx A0134 <- 4.23 -> DA xxx V0038 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0201 <- 2.87 -> DC xxx V0039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0289 <- 3.42 -> DT xxx U0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0288 <- 3.04 -> DC xxx V0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0753 <- 4.28 -> DT xxx V0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0754 <- 4.01 -> DA xxx U0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0757 <- 3.95 -> DT xxx V0024 : score x.xxxxx >8df8_A:Topoisomerase_V_catalytic_domain-like;RuvA_domain_2-like; title=STRUCTURE OF M. KANDLERI TOPOISOMERASE V IN COMPLEX WITH DNA. 40 BASE PAIR SYMMETRIC DNA COMPLEX organism=Methanopyrus kandleri : H : ARG NH2 A0288 <- 2.39 -> DG N7 V0034 : score 6.90815 : H : ARG NH2 A0288 <- 2.98 -> DG O6 V0034 : score 6.3624 : x : TYR xxxx A0289 <- 4.05 -> DT xxx U0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0753 <- 4.35 -> DT xxx V0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0754 <- 4.09 -> DT xxx V0014 : score x.xxxxx >8df8_AB:Topoisomerase_V_catalytic_domain-like;RuvA_domain_2-like; title=STRUCTURE OF M. KANDLERI TOPOISOMERASE V IN COMPLEX WITH DNA. 40 BASE PAIR SYMMETRIC DNA COMPLEX organism=Methanopyrus kandleri : H : ARG NH2 A0288 <- 2.39 -> DG N7 V0034 : score 6.90815 : H : ARG NH2 A0288 <- 2.98 -> DG O6 V0034 : score 6.3624 : V : ASP CB B0757 <- 3.59 -> DT C7 V0026 : score 2.82394 : x : TYR xxxx A0289 <- 4.05 -> DT xxx U0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0753 <- 4.35 -> DT xxx V0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0754 <- 4.09 -> DT xxx V0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0288 <- 3.29 -> DC xxx V0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0754 <- 3.86 -> DA xxx U0012 : score x.xxxxx >8df9_A:Topoisomerase_V_catalytic_domain-like;RuvA_domain_2-like; title=STRUCTURE OF M. KANDLERI TOPOISOMERASE V IN COMPLEX WITH DNA. 38 BASE PAIR ASYMMETRIC DNA COMPLEX organism=Methanopyrus kandleri : x : THR xxxx A0754 <- 4.45 -> DG xxx V0035 : score x.xxxxx >8dfa_ABCDEIJ: title=TYPE I-C CASCADE BOUND TO SSDNA TARGET organism=? : H : THR OG1 C0124 <- 2.95 -> DG N2 N0032 : score 3.89741 : H : ARG NH1 C0177 <- 3.05 -> DC O2 N0023 : score 3.4675 : x : ARG xxxx B0156 <- 4.27 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0173 <- 3.75 -> DG xxx N0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0174 <- 4.00 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0175 <- 3.58 -> DG xxx N0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0122 <- 4.46 -> DG xxx N0032 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0131 <- 4.23 -> DG xxx N0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0156 <- 3.65 -> DT xxx N0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0160 <- 3.74 -> DT xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0173 <- 3.61 -> DG xxx N0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0174 <- 3.54 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0175 <- 3.97 -> DC xxx N0023 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0131 <- 4.30 -> DG xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0156 <- 3.12 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0172 <- 4.16 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0174 <- 4.13 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0175 <- 3.02 -> DT xxx N0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0124 <- 3.19 -> DC xxx N0020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0413 <- 4.06 -> DC xxx N0029 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0517 <- 3.68 -> DC xxx N0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0553 <- 4.33 -> DC xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0032 <- 4.33 -> DC xxx N0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0033 <- 2.58 -> DC xxx N0017 : score x.xxxxx >8dfa_C: title=TYPE I-C CASCADE BOUND TO SSDNA TARGET organism=? : H : THR OG1 C0124 <- 2.95 -> DG N2 N0032 : score 3.89741 : H : ARG NH1 C0177 <- 3.05 -> DC O2 N0023 : score 3.4675 : x : VAL xxxx C0122 <- 4.46 -> DG xxx N0032 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0131 <- 4.23 -> DG xxx N0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0156 <- 3.65 -> DT xxx N0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0160 <- 3.74 -> DT xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0173 <- 3.61 -> DG xxx N0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0174 <- 3.54 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : MET xxxx C0175 <- 3.97 -> DC xxx N0023 : score x.xxxxx >8dfb_AB:Topoisomerase_V_catalytic_domain-like;RuvA_domain_2-like; title=STRUCTURE OF M. KANDLERI TOPOISOMERASE V IN COMPLEX WITH DNA. 39 BASE PAIR SYMMETRIC DNA COMPLEX organism=Methanopyrus kandleri : H : ARG NH1 A0288 <- 3.20 -> DG O6 U0006 : score 5.59667 : H : ARG NH1 B0287 <- 3.04 -> DG N7 U0031 : score 5.7596 : V : TYR CZ B0289 <- 3.84 -> DT C7 V0005 : score 5.52369 : V : ASP CB B0757 <- 3.75 -> DT C7 V0025 : score 2.71662 : V : TYR CZ A0289 <- 3.90 -> DT C7 U0005 : score 5.44 : V : ASP CB A0757 <- 3.64 -> DT C7 U0025 : score 2.7904 : x : LYS xxxx A0134 <- 4.00 -> DA xxx V0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0135 <- 3.89 -> DA xxx V0039 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0199 <- 3.84 -> DC xxx V0040 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0201 <- 3.84 -> DC xxx V0040 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0754 <- 3.72 -> DA xxx V0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0288 <- 3.35 -> DG xxx V0006 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0754 <- 3.77 -> DA xxx U0012 : score x.xxxxx >8dfb_B:Topoisomerase_V_catalytic_domain-like;RuvA_domain_2-like; title=STRUCTURE OF M. KANDLERI TOPOISOMERASE V IN COMPLEX WITH DNA. 39 BASE PAIR SYMMETRIC DNA COMPLEX organism=Methanopyrus kandleri : H : ARG NH1 B0287 <- 3.04 -> DG N7 U0031 : score 5.7596 : V : TYR CZ B0289 <- 3.84 -> DT C7 V0005 : score 5.52369 : V : ASP CB B0757 <- 3.75 -> DT C7 V0025 : score 2.71662 : V : ARG CG B0288 <- 3.64 -> DT C7 U0032 : score 1.04533 : x : THR xxxx B0754 <- 3.77 -> DA xxx U0012 : score x.xxxxx >8dh0_B:DNA/RNA_polymerases; title=T7 RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX WITH UNNATURAL BASE DDS organism=? : x : TYR xxxx B0427 <- 3.87 -> DT xxx A0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0639 <- 3.35 -> DA xxx A0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0644 <- 3.21 -> DA xxx A0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0784 <- 3.40 -> DA xxx A0011 : score x.xxxxx >8dh1_L:DNA/RNA_polymerases; title=T7 RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX WITH UNNATURAL BASE DDS-PATP PAIR organism=? : x : PHE xxxx L0644 <- 3.25 -> DA xxx M0009 : score x.xxxxx >8dh2_E:DNA/RNA_polymerases; title=T7 RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX WITH UNNATURAL BASE DDS-ATP MISMATCH organism=? : x : PHE xxxx E0644 <- 3.30 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0647 <- 4.37 -> DT xxx H0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0713 <- 3.85 -> DG xxx F0002 : score x.xxxxx >8dh3_M:DNA/RNA_polymerases; title=T7 RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX WITH UNNATURAL BASE DPA organism=? : x : PHE xxxx M0644 <- 3.28 -> DA xxx N0009 : score x.xxxxx >8dh5_M:DNA/RNA_polymerases; title=T7 RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX WITH UNNATURAL BASE DPA-ATP MISMATCH organism=? : x : GLU xxxx M0643 <- 3.68 -> DT xxx P0002 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx M0644 <- 3.35 -> DA xxx N0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx M0713 <- 3.12 -> DC xxx P0009 : score x.xxxxx >8dk2_CD: title=CRYOEM STRUCTURE OF PSEUDOMONAS AERUGINOSA PA14 JETABC IN AN UNCLAMPED STATE TRAPPED IN ATP DEPENDENT DIMERIC FORM organism=? : H : ARG NH2 C0946 <- 2.90 -> DT O4 P0019 : score 3.48277 >8dk3_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYOEM STRUCTURE OF PSEUDOMONAS AERUGINOSA PA14 JETC ATPASE DOMAIN BOUND TO DNA AND CWHD DOMAIN OF JETA organism=? : x : ARG xxxx A0946 <- 3.28 -> DT xxx P0019 : score x.xxxxx >8dk3_AB:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYOEM STRUCTURE OF PSEUDOMONAS AERUGINOSA PA14 JETC ATPASE DOMAIN BOUND TO DNA AND CWHD DOMAIN OF JETA organism=? : x : ARG xxxx A0946 <- 3.28 -> DT xxx P0019 : score x.xxxxx >8dk5_A:Histone-fold; title=STRUCTURE OF 187BP LIN28B NUCLEOSOME WITH SITE 0 MUTATION organism=? : x : ARG xxxx A0040 <- 3.39 -> DA xxx J0088 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.42 -> DG xxx I0060 : score x.xxxxx >8dk5_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF 187BP LIN28B NUCLEOSOME WITH SITE 0 MUTATION organism=? : H : ARG NH1 E0040 <- 2.99 -> DA N3 I0093 : score 3.54213 : H : ARG NH1 H0034 <- 3.41 -> DA N3 I0133 : score 3.23284 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.39 -> DA xxx J0088 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.42 -> DG xxx I0060 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.54 -> DT xxx J0117 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0034 <- 3.97 -> DG xxx J0127 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0040 <- 4.41 -> DT xxx J0128 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.35 -> DC xxx I0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.78 -> DT xxx I0102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.26 -> DG xxx I0110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.91 -> DG xxx I0121 : score x.xxxxx >8dlf_ABCD:Viral_DNA-binding_domain; title=EBNA1 DNA BINDING DOMAIN (DBD) (458-617)+2 REPEATS OF FAMILY REPEAT (FR) REGION organism=? : H : LYS NZ A0460 <- 2.56 -> DT O2 F0008 : score 3.75936 : H : ASN ND2 A0519 <- 3.16 -> DA N7 F0007 : score 5.44784 : H : LYS NZ B0477 <- 2.78 -> DG O6 E0036 : score 5.80389 : H : THR OG1 B0515 <- 3.43 -> DG N7 E0037 : score 3.05788 : H : TYR OH B0518 <- 2.61 -> DA N7 F0019 : score 4.30903 : H : ARG NH2 D0469 <- 2.57 -> DT O2 E0013 : score 4.42807 : H : LYS NZ D0477 <- 2.49 -> DG N7 E0007 : score 5.71982 : x : ARG xxxx A0459 <- 3.34 -> DT xxx E0048 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0461 <- 2.86 -> DT xxx E0048 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0464 <- 3.05 -> DC xxx F0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0465 <- 2.93 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0469 <- 3.50 -> DA xxx F0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0477 <- 3.08 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0515 <- 3.27 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0518 <- 2.75 -> DG xxx E0045 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0464 <- 3.01 -> DG xxx E0040 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0465 <- 3.93 -> DT xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0469 <- 2.84 -> DG xxx F0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0478 <- 4.45 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0519 <- 4.15 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0522 <- 3.57 -> DA xxx F0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0460 <- 3.43 -> DG xxx F0040 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0464 <- 3.49 -> DC xxx F0041 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0465 <- 4.04 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0469 <- 3.99 -> DT xxx F0043 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0477 <- 3.15 -> DA xxx F0037 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0478 <- 3.62 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0514 <- 4.33 -> DC xxx E0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0515 <- 3.17 -> DA xxx F0039 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0518 <- 3.01 -> DC xxx E0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0519 <- 3.21 -> DT xxx F0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0522 <- 3.27 -> DT xxx E0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0461 <- 3.02 -> DA xxx F0049 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0464 <- 3.98 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0514 <- 4.07 -> DT xxx F0045 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0515 <- 3.72 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0518 <- 3.45 -> DC xxx F0047 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0519 <- 2.90 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx >8dlf_D:Viral_DNA-binding_domain; title=EBNA1 DNA BINDING DOMAIN (DBD) (458-617)+2 REPEATS OF FAMILY REPEAT (FR) REGION organism=? : H : ARG NH2 D0469 <- 2.57 -> DT O2 E0013 : score 4.42807 : H : LYS NZ D0477 <- 2.49 -> DG N7 E0007 : score 5.71982 : x : LYS xxxx D0461 <- 3.02 -> DA xxx F0049 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx D0464 <- 3.98 -> DA xxx E0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0514 <- 4.07 -> DT xxx F0045 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0515 <- 3.72 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0518 <- 3.45 -> DC xxx F0047 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0519 <- 2.90 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx >8dmb_P: title=STRUCTURE OF DESULFOVIRGULA THERMOCUNICULI ISRB (DTISRB) IN COMPLEX WITH OMEGA RNA AND TARGET DNA organism=? : H : ARG NH2 P0263 <- 3.05 -> DT O2 Y0002 : score 4.02167 : H : ARG NH2 P0323 <- 2.83 -> DG N7 Y0003 : score 6.34631 : H : GLN OE1 P0326 <- 2.91 -> DA N6 Y0004 : score 5.91941 : x : THR xxxx P0311 <- 3.84 -> DA xxx Y0004 : score x.xxxxx >8dq1_C:Pheromone-binding_domain_of_LuxR-like_quorum-sensing_transcription_factors;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=QUORUM-SENSING RECEPTOR RHLR BOUND TO PQSE organism=? : V : THR CG2 C0211 <- 3.64 -> DT C7 I0004 : score 4.4064 : x : SER xxxx C0210 <- 2.77 -> DT xxx I0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0213 <- 4.44 -> DG xxx J0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0214 <- 3.64 -> DC xxx I0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0215 <- 4.22 -> DC xxx I0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0217 <- 3.21 -> DG xxx J0013 : score x.xxxxx >8dq1_CD:Pheromone-binding_domain_of_LuxR-like_quorum-sensing_transcription_factors;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=QUORUM-SENSING RECEPTOR RHLR BOUND TO PQSE organism=? : x : SER xxxx C0210 <- 2.77 -> DT xxx I0004 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0211 <- 3.64 -> DT xxx I0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0213 <- 4.44 -> DG xxx J0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0214 <- 3.64 -> DC xxx I0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0215 <- 4.22 -> DC xxx I0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0217 <- 3.21 -> DG xxx J0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0210 <- 3.10 -> DG xxx J0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0213 <- 3.49 -> DT xxx I0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0214 <- 2.97 -> DT xxx J0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0217 <- 2.95 -> DC xxx I0014 : score x.xxxxx >8dqw_BCDE: title=OPEN STATE OF RAD24-RFC:9-1-1 BOUND TO A 5' SS/DSDNA JUNCTION organism=? : V : ARG CZ E0081 <- 3.61 -> DT C7 J0025 : score 2.23359 : x : SER xxxx E0079 <- 3.42 -> DT xxx J0025 : score x.xxxxx >8dqx_A:post-AAA+_oligomerization_domain-like;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=OPEN STATE OF RFC:PCNA BOUND TO A 3' SS/DSDNA JUNCTION organism=? : w : ARG NH1 A0464 <- 5.96 -> DG O6 J0004 : score 2.756 : w : ARG NH2 A0464 <- 6.24 -> DG O6 J0004 : score 2.468 : H : SER OG A0674 <- 3.12 -> DG N2 K0004 : score 3.1584 : H : SER OG A0674 <- 2.80 -> DG N3 K0004 : score 2.77179 : w : ARG NH1 A0681 <- 6.08 -> DA N7 J0007 : score 0.388 : V : PHE CB A0552 <- 3.53 -> DT C7 K0001 : score 6.1926 : x : ASN xxxx A0459 <- 3.34 -> DT xxx K0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0461 <- 4.22 -> DT xxx K0002 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0551 <- 4.21 -> DT xxx K0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0553 <- 2.89 -> DT xxx K0001 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0556 <- 4.42 -> DT xxx K0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0663 <- 3.41 -> DT xxx K0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0664 <- 4.03 -> DT xxx K0001 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0666 <- 3.31 -> DT xxx K0002 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0670 <- 3.55 -> DG xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0673 <- 4.00 -> DA xxx J0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0676 <- 4.29 -> DA xxx J0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0680 <- 3.41 -> DA xxx J0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0698 <- 3.58 -> DA xxx J0008 : score x.xxxxx >8dqx_BC: title=OPEN STATE OF RFC:PCNA BOUND TO A 3' SS/DSDNA JUNCTION organism=? : H : LYS NZ B0149 <- 3.31 -> DT O4 I0003 : score 3.22129 : x : MET xxxx B0050 <- 3.39 -> DT xxx I0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0051 <- 3.42 -> DT xxx I0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0145 <- 3.55 -> DT xxx I0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0146 <- 3.18 -> DT xxx I0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0165 <- 2.78 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0272 <- 3.47 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0276 <- 3.73 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0155 <- 4.12 -> DT xxx I0005 : score x.xxxxx >8dqz_A:post-AAA+_oligomerization_domain-like;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=INTERMEDIATE STATE OF RFC:PCNA BOUND TO A 3' SS/DSDNA JUNCTION organism=? : H : ARG NH1 A0632 <- 2.62 -> DT O4 I0000 : score 3.38559 : H : GLN NE2 A0636 <- 2.94 -> DT O2 I0000 : score 3.8232 : x : ARG xxxx A0434 <- 3.35 -> DG xxx I0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0582 <- 3.32 -> DG xxx J0029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0585 <- 4.04 -> DG xxx J0028 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0586 <- 3.96 -> DT xxx I-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0628 <- 3.50 -> DT xxx I-001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0638 <- 3.19 -> DG xxx J0028 : score x.xxxxx >8dqz_ABCE: title=INTERMEDIATE STATE OF RFC:PCNA BOUND TO A 3' SS/DSDNA JUNCTION organism=? : H : ARG NH1 A0632 <- 2.62 -> DT O4 I0000 : score 3.38559 : H : GLN NE2 A0636 <- 2.94 -> DT O2 I0000 : score 3.8232 : x : ARG xxxx A0434 <- 3.35 -> DG xxx I0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0582 <- 3.32 -> DG xxx J0029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0585 <- 4.04 -> DG xxx J0028 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0586 <- 3.96 -> DT xxx I-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0628 <- 3.50 -> DT xxx I-001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0638 <- 3.19 -> DG xxx J0028 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0146 <- 3.67 -> DC xxx J0030 : score x.xxxxx >8dr0_A:post-AAA+_oligomerization_domain-like;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CLOSED STATE OF RFC:PCNA BOUND TO A 3' SS/DSDNA JUNCTION organism=? : H : ARG NH2 A0434 <- 3.03 -> DG N3 I0006 : score 3.44418 : H : ARG NE A0632 <- 3.17 -> DT O4 I0000 : score 1.72141 : H : ARG NH2 A0632 <- 3.15 -> DT O4 I0000 : score 3.30508 : H : GLN NE2 A0636 <- 2.35 -> DT O2 I0000 : score 4.28733 : x : PHE xxxx A0582 <- 3.35 -> DG xxx J0029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0585 <- 4.28 -> DG xxx J0028 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0586 <- 4.14 -> DT xxx I-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0628 <- 3.78 -> DT xxx I-001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0638 <- 3.24 -> DG xxx J0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0641 <- 4.11 -> DG xxx J0029 : score x.xxxxx >8dr0_ABCE: title=CLOSED STATE OF RFC:PCNA BOUND TO A 3' SS/DSDNA JUNCTION organism=? : H : ARG NH2 A0434 <- 3.03 -> DG N3 I0006 : score 3.44418 : H : ARG NE A0632 <- 3.17 -> DT O4 I0000 : score 1.72141 : H : ARG NH2 A0632 <- 3.15 -> DT O4 I0000 : score 3.30508 : H : GLN NE2 A0636 <- 2.35 -> DT O2 I0000 : score 4.28733 : x : PHE xxxx A0582 <- 3.35 -> DG xxx J0029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0585 <- 4.28 -> DG xxx J0028 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0586 <- 4.14 -> DT xxx I-001 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0628 <- 3.78 -> DT xxx I-001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0638 <- 3.24 -> DG xxx J0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0641 <- 4.11 -> DG xxx J0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0146 <- 4.30 -> DC xxx J0030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0148 <- 4.17 -> DC xxx J0030 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0149 <- 4.23 -> DC xxx J0030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0336 <- 3.96 -> DT xxx I-001 : score x.xxxxx >8dr1_BCE: title=CONSENSUS CLOSED STATE OF RFC:PCNA BOUND TO A 3' SS/DSDNA JUNCTION (DNA2) organism=? : H : ASN ND2 E0336 <- 2.77 -> DT O4 I0012 : score 5.31632 : x : GLN xxxx B0146 <- 3.17 -> DC xxx J0030 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0149 <- 4.23 -> DC xxx J0030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0103 <- 3.16 -> DT xxx I0012 : score x.xxxxx >8dr3_BCE: title=CLOSED STATE OF RFC:PCNA BOUND TO A 3' SS/DSDNA JUNCTION (DNA2) WITH NTD organism=? : x : GLN xxxx B0146 <- 3.37 -> DC xxx J0030 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0149 <- 4.36 -> DC xxx J0030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0103 <- 3.82 -> DT xxx I0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0336 <- 3.21 -> DT xxx I0012 : score x.xxxxx >8dr4_A:post-AAA+_oligomerization_domain-like;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=OPEN STATE OF RFC:PCNA BOUND TO A 3' SS/DSDNA JUNCTION (DNA2) WITHOUT NTD organism=? : H : ASN ND2 A0459 <- 3.12 -> DT O4 L0012 : score 4.9464 : V : LYS CG A0550 <- 3.70 -> DT C7 L0012 : score 2.17195 : x : ARG xxxx A0476 <- 3.81 -> DG xxx K0003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0551 <- 3.86 -> DT xxx L0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0552 <- 3.33 -> DT xxx L0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0556 <- 3.29 -> DA xxx K0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0663 <- 3.77 -> DA xxx K0000 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0664 <- 3.69 -> DA xxx K0000 : score x.xxxxx >8dr4_BCE: title=OPEN STATE OF RFC:PCNA BOUND TO A 3' SS/DSDNA JUNCTION (DNA2) WITHOUT NTD organism=? : H : ASN ND2 E0336 <- 2.97 -> DT O4 I0012 : score 5.10494 : x : ASN xxxx E0103 <- 4.03 -> DT xxx I0012 : score x.xxxxx >8dr5_BCE: title=OPEN STATE OF RFC:PCNA BOUND TO A 3' SS/DSDNA JUNCTION (DNA2) WITH NTD organism=? : H : ASN ND2 E0336 <- 2.71 -> DT O4 I0012 : score 5.37974 : x : ASN xxxx E0103 <- 3.81 -> DT xxx I0012 : score x.xxxxx >8dr6_BCE: title=CLOSED STATE OF RFC:PCNA BOUND TO A NICKED DSDNA organism=? : H : ASN ND2 E0336 <- 3.04 -> DT O4 I0016 : score 5.03095 : x : GLN xxxx B0146 <- 3.43 -> DC xxx J0030 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0149 <- 3.31 -> DC xxx J0030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0103 <- 3.89 -> DT xxx I0016 : score x.xxxxx >8dr7_BCE: title=OPEN STATE OF RFC:PCNA BOUND TO A NICKED DSDNA organism=? : H : ASN ND2 E0336 <- 3.02 -> DT O4 I0016 : score 5.05209 : x : GLN xxxx B0146 <- 4.20 -> DC xxx J0030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0103 <- 3.67 -> DT xxx I0016 : score x.xxxxx >8dtp_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CLOSE STATE OF T4 BACTERIOPHAGE GP41 HEXAMER BOUND WITH SINGLE STRAND DNA organism=? : H : ASN ND2 D0327 <- 3.22 -> DT O2 M0010 : score 4.34748 : H : ASN ND2 E0327 <- 2.51 -> DT O2 M0008 : score 5.02143 : x : ARG xxxx A0322 <- 3.24 -> DT xxx M0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0327 <- 3.77 -> DT xxx M0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0327 <- 3.70 -> DT xxx M0006 : score x.xxxxx >8dtp_F:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CLOSE STATE OF T4 BACTERIOPHAGE GP41 HEXAMER BOUND WITH SINGLE STRAND DNA organism=? : V : ASN CB F0327 <- 3.70 -> DT C7 M0006 : score 1.98587 >8du4_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=COMPLEX BETWEEN RBBP5-WDR5 AND AN H2B-UBIQUITINATED NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH1 D0026 <- 2.26 -> DT O2 J0195 : score 4.7715 : x : ARG xxxx A0040 <- 2.95 -> DA xxx I0065 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0119 <- 4.46 -> DC xxx J0294 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0027 <- 3.20 -> DT xxx I0104 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0078 <- 3.78 -> DG xxx I0102 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0013 <- 3.13 -> DT xxx I0117 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.34 -> DC xxx I0111 : score x.xxxxx >8due_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=OPEN STATE OF T4 BACTERIOPHAGE GP41 HEXAMER BOUND WITH SINGLE STRAND DNA organism=? : x : ASN xxxx B0327 <- 3.41 -> DT xxx M0015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0327 <- 4.05 -> DT xxx M0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0327 <- 3.14 -> DT xxx M0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0327 <- 3.60 -> DT xxx M0007 : score x.xxxxx >8due_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=OPEN STATE OF T4 BACTERIOPHAGE GP41 HEXAMER BOUND WITH SINGLE STRAND DNA organism=? : x : ASN xxxx B0327 <- 3.41 -> DT xxx M0015 : score x.xxxxx >8dvf_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=T4 BACTERIOPHAGE PRIMOSOME WITH SINGLE STRAND DNA, STATE 1 organism=? : H : ARG NH1 A0322 <- 3.17 -> DT O2 M0006 : score 3.98774 : H : ARG NH2 A0322 <- 2.69 -> DT O4 M0007 : score 3.63203 : H : ASN ND2 D0327 <- 3.22 -> DT O2 M0010 : score 4.34748 : H : ASN ND2 E0327 <- 2.51 -> DT O2 M0008 : score 5.02143 : x : ASN xxxx C0327 <- 3.77 -> DT xxx M0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0327 <- 3.70 -> DT xxx M0006 : score x.xxxxx >8dvf_H:DNA_primase_core;Zinc_beta-ribbon; title=T4 BACTERIOPHAGE PRIMOSOME WITH SINGLE STRAND DNA, STATE 1 organism=? : H : ASN ND2 H0058 <- 2.99 -> DG O6 T2012 : score 5.4242 : V : TYR CG H0055 <- 3.57 -> DT C7 T2011 : score 3.95668 : x : ARG xxxx H0034 <- 2.89 -> DG xxx T2009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0051 <- 4.17 -> DC xxx T2010 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx H0053 <- 3.09 -> DC xxx T2010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0062 <- 4.27 -> DT xxx T2011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0064 <- 2.78 -> DT xxx T2011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0066 <- 3.37 -> DC xxx T2010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0071 <- 3.26 -> DT xxx T2011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0279 <- 4.48 -> DG xxx T2012 : score x.xxxxx >8dvi_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=T4 BACTERIOPHAGE PRIMOSOME WITH SINGLE STRAND DNA, STATE 2 organism=? : H : ASN ND2 D0327 <- 3.22 -> DT O2 M0010 : score 4.34748 : H : ASN ND2 E0327 <- 2.51 -> DT O2 M0008 : score 5.02143 >8dvp_A:DNA-glycosylase;Nudix; title=GLYCOSYLASE MUTY VARIANT N146S IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING D(8-OXO- G) PAIRED WITH SUBSTRATE PURINE organism=Geobacillus stearothermophilus : w : GLN OE1 A0047 <- 5.77 -> DG N3 C0019 : score 1.484 : x : GLN xxxx A0048 <- 3.15 -> DG xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0050 <- 4.04 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0088 <- 3.13 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0164 <- 4.42 -> DA xxx B0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0308 <- 3.69 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0309 <- 3.82 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >8dvy_A:DNA-glycosylase;Nudix; title=DNA GLYCOSYLASE MUTY VARIANT N146S IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING D(8- OXO-G) PAIRED WITH AN ENZYME-GENERATED ABASIC SITE PRODUCT (AP) AND CRYSTALIZED WITH CALCIUM ACETATE organism=Geobacillus stearothermophilus : w : GLN OE1 A0048 <- 6.08 -> DA N6 C0017 : score 3.392 : x : ARG xxxx A0050 <- 3.77 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0088 <- 3.08 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0306 <- 4.44 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0308 <- 3.75 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0309 <- 3.81 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >8dw0_A:DNA-glycosylase;Nudix; title=GLYCOSYLASE MUTY VARIANT N146S IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING D(8-OXO- G) PAIRED WITH AN ENZYME-GENERATED ABASIC SITE (AP) PRODUCT AND CRYSTALLIZED WITH SODIUM ACETATE organism=Geobacillus stearothermophilus : w : GLN OE1 A0047 <- 5.65 -> DG N3 C0019 : score 1.484 : w : GLN OE1 A0048 <- 6.60 -> DA N7 C0017 : score 1.196 : H : ARG NH2 A0050 <- 2.98 -> DC O2 C0016 : score 3.56556 A : H : TYR OH A0088 <- 3.46 -> DC N4 B0005 : score 3.65784 : x : SER xxxx A0308 <- 3.77 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0309 <- 3.82 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >8dw1_A:DNA/RNA_polymerases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF A HOST-GUEST COMPLEX WITH 5'-CTTAGTTATAACTAAG-3' organism=Moloney murine leukemia virus : H : ASP OD2 A0114 <- 2.98 -> DG N2 G0016 : score 5.26245 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.67 -> DT O2 D0002 : score 4.3434 : x : TYR xxxx A0064 <- 4.10 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0099 <- 3.30 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0100 <- 4.30 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0101 <- 4.10 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx >8dw4_A:DNA-glycosylase;Nudix; title=GLYCOSYLASE MUTY VARIANT N146S IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING D(8-OXO- G) PAIRED WITH AN ABASIC SITE PRODUCT (AP) GENERATED BY THE ENZYME IN CRYSTALS BY REMOVAL OF CALCIUM organism=Geobacillus stearothermophilus : w : GLN OE1 A0047 <- 5.84 -> DG N3 C0019 : score 1.484 : w : GLN OE1 A0048 <- 5.76 -> DA N7 C0017 : score 1.196 : x : ARG xxxx A0050 <- 4.22 -> DG xxx B0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0088 <- 3.14 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0308 <- 3.77 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0309 <- 3.84 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >8dw6_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=T4 BACTERIOPHAGE PRIMOSOME WITH SINGLE-STRAND DNA, STATE 3 organism=? : H : ASN ND2 D0327 <- 3.22 -> DT O2 M0010 : score 4.34748 : H : ASN ND2 E0327 <- 2.51 -> DT O2 M0008 : score 5.02143 : x : ARG xxxx A0322 <- 3.24 -> DT xxx M0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0327 <- 3.77 -> DT xxx M0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0327 <- 3.70 -> DT xxx M0006 : score x.xxxxx >8dw6_F:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=T4 BACTERIOPHAGE PRIMOSOME WITH SINGLE-STRAND DNA, STATE 3 organism=? : V : ASN CB F0327 <- 3.70 -> DT C7 M0006 : score 1.98587 >8dw7_A:DNA-glycosylase;Nudix; title=DNA GLYCOSYLASE MUTY VARIANT N146S IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING THE TRANSITION STATE ANALOG 1N PAIRED WITH D(8-OXO-G) organism=Geobacillus stearothermophilus : w : GLN OE1 A0047 <- 6.03 -> DG N3 C0019 : score 1.484 : w : GLN OE1 A0048 <- 6.17 -> DG N7 C0019 : score 2.87 : w : GLN OE1 A0048 <- 5.69 -> DA N7 C0017 : score 1.196 : H : ARG NH1 A0050 <- 3.17 -> DG N3 B0009 : score 2.82667 : H : TYR OH A0088 <- 3.50 -> DC N4 B0005 : score 3.62413 : w : SER OG A0090 <- 5.94 -> DC O2 B0005 : score 1.768 : w : SER OG A0308 <- 5.97 -> DT O4 B0007 : score 2.338 : x : HIS xxxx A0309 <- 3.84 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >8dw8_A:DNA/RNA_polymerases; title=HOST-GUEST STRUCTURE OF BLMA2 PARTIALLY BOUND TO 5'-ATTAGTTATAACTAAT- 3' organism=Moloney murine leukemia virus : H : ARG NH1 A0116 <- 2.86 -> DT O2 B0002 : score 4.25473 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.66 -> DT O2 B0002 : score 4.35187 : x : TYR xxxx A0064 <- 4.45 -> DA xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0099 <- 3.38 -> DA xxx B0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0112 <- 4.32 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0114 <- 3.29 -> DT xxx G0016 : score x.xxxxx >8dwd_A:DNA-glycosylase;Nudix; title=ADENINE GLYCOSYLASE MUTY VARIANT E43S IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING D(8-OXO-G) PAIRED WITH AN AP SITE GENERATED BY THE ENZYME ACTING ON PURINE organism=Geobacillus stearothermophilus : w : GLN OE1 A0047 <- 5.64 -> DG N3 C0019 : score 1.484 : w : GLN OE1 A0048 <- 5.60 -> DA N7 C0017 : score 1.196 : H : ARG NH2 A0050 <- 2.92 -> DG N3 B0009 : score 3.52361 : H : TYR OH A0088 <- 3.42 -> DC N4 B0005 : score 3.69155 : w : SER OG A0090 <- 6.22 -> DC O2 B0005 : score 1.768 : w : SER OG A0308 <- 5.50 -> DT O4 B0007 : score 2.338 : x : HIS xxxx A0309 <- 3.80 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >8dwe_D:DNA-glycosylase;Nudix; title=ADENINE GLYCOSYLASE MUTY VARIANT E43Q IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING D(8-OXO-G) PAIRED WITH SUBSTRATE PURINE organism=Geobacillus stearothermophilus : w : GLN OE1 D0047 <- 5.95 -> DG N3 F0019 : score 1.484 : w : SER OG D0090 <- 6.05 -> DT O2 F0020 : score 1.55 : w : SER OG D0308 <- 5.40 -> DT O4 E0007 : score 2.338 : x : GLN xxxx D0048 <- 3.38 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0050 <- 3.84 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0088 <- 3.11 -> DC xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0201 <- 3.53 -> DT xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0306 <- 4.39 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0309 <- 3.85 -> DC xxx E0005 : score x.xxxxx >8dwf_A:DNA-glycosylase;Nudix; title=GLYCOSYLASE MUTY VARIANT E43S IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING D(8-OXO- G) PAIRED WITH SUBSTRATE ADENINE organism=Geobacillus stearothermophilus : w : GLN OE1 A0048 <- 6.20 -> DA N6 C0017 : score 3.392 : H : TYR OH A0088 <- 3.17 -> DC N4 B0005 : score 3.90226 : H : TYR OH A0126 <- 2.34 -> DA N3 C0018 : score 4.5332 : x : TRP xxxx A0030 <- 3.11 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0031 <- 3.53 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0043 <- 4.36 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0046 <- 3.64 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0050 <- 3.82 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0051 <- 4.09 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0130 <- 4.19 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0134 <- 4.10 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0144 <- 4.26 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0188 <- 3.37 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0191 <- 3.31 -> DA xxx C0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0308 <- 3.78 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0309 <- 4.07 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >8dwj_A:DNA_primase_core;Zinc_beta-ribbon; title=PRIMASE OF MUTANT BACTERIOPHAGE T4 PRIMOSOME WITH SINGLE STRAND DNA/RNA PRIMER HYBRID IN PRIMER EXITING STATE organism=? : x : ARG xxxx A0034 <- 3.73 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0049 <- 3.62 -> DC xxx T0002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0053 <- 3.08 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0055 <- 3.26 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0058 <- 3.93 -> DG xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0062 <- 3.72 -> DG xxx T0007 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0064 <- 2.92 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0066 <- 3.66 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0071 <- 3.38 -> DG xxx T0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0205 <- 2.58 -> DT xxx T0001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0206 <- 3.88 -> DC xxx T0002 : score x.xxxxx >8dwm_A:DNA/RNA_polymerases; title=HOST-GUEST COMPLEX OF BLEOMYCIN A2 FULLY BOUND TO CTTAGTTATAACTAAG organism=Moloney murine leukemia virus : H : ASP OD2 A0114 <- 2.75 -> DG N2 G0016 : score 5.51356 : H : ARG NH2 A0116 <- 2.28 -> DT O2 B0002 : score 4.6736 : x : TYR xxxx A0064 <- 3.48 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0099 <- 3.21 -> DG xxx G0016 : score x.xxxxx >8dy7_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=STREPTOMYCES VENEZUELAE RNAP TRANSCRIPTION OPEN PROMOTER COMPLEX WITH WHIA AND WHIB TRANSCRIPTION FACTORS organism=? : H : ARG NH1 C0470 <- 2.85 -> DT O4 O0079 : score 3.23527 >8dy7_CDFHI: title=STREPTOMYCES VENEZUELAE RNAP TRANSCRIPTION OPEN PROMOTER COMPLEX WITH WHIA AND WHIB TRANSCRIPTION FACTORS organism=? : H : ARG NH1 C0470 <- 2.85 -> DT O4 O0079 : score 3.23527 : x : VAL xxxx F0219 <- 4.13 -> DT xxx O0072 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0220 <- 3.45 -> DT xxx O0072 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0223 <- 3.46 -> DT xxx O0072 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0340 <- 3.09 -> DA xxx P0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0344 <- 3.22 -> DT xxx O0063 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0358 <- 4.04 -> DC xxx O0060 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0488 <- 3.52 -> DC xxx O0041 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0492 <- 3.06 -> DC xxx O0041 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0037 <- 3.79 -> DT xxx P0065 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0042 <- 4.05 -> DA xxx O0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0077 <- 3.12 -> DT xxx O0038 : score x.xxxxx >8dy9_BHI: title=STREPTOMYCES VENEZUELAE RNAP UNCONSTRAINED OPEN PROMOTER COMPLEX WITH WHIA AND WHIB TRANSCRIPTION FACTORS organism=? : x : ARG xxxx B0259 <- 3.56 -> DG xxx O0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0292 <- 4.12 -> DG xxx P0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0077 <- 3.13 -> DT xxx O0038 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0226 <- 3.87 -> DG xxx P0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0287 <- 3.46 -> DT xxx P0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0288 <- 2.90 -> DG xxx O0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0295 <- 3.10 -> DC xxx P0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0296 <- 3.79 -> DT xxx O0019 : score x.xxxxx >8dy9_CDF: title=STREPTOMYCES VENEZUELAE RNAP UNCONSTRAINED OPEN PROMOTER COMPLEX WITH WHIA AND WHIB TRANSCRIPTION FACTORS organism=? : H : ARG NH1 C0470 <- 3.36 -> DG O6 R0022 : score 5.402 : H : ASP OD2 F0217 <- 2.77 -> DC N4 Q0021 : score 6.2372 : H : THR OG1 F0332 <- 3.28 -> DG O6 Q0018 : score 3.81071 : x : GLN xxxx D0287 <- 4.28 -> DA xxx R0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0219 <- 3.20 -> DC xxx Q0021 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0220 <- 3.68 -> DC xxx Q0021 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0223 <- 3.16 -> DC xxx Q0021 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0226 <- 3.51 -> DG xxx Q0020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0231 <- 3.19 -> DT xxx Q0019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0237 <- 4.43 -> DT xxx Q0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0288 <- 3.69 -> DT xxx Q0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0289 <- 4.11 -> DT xxx Q0019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0304 <- 3.61 -> DC xxx Q0021 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0322 <- 4.15 -> DA xxx Q0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0323 <- 3.60 -> DA xxx Q0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0326 <- 3.96 -> DA xxx Q0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0328 <- 3.63 -> DA xxx Q0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0331 <- 3.80 -> DG xxx Q0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0333 <- 4.03 -> DA xxx Q0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0335 <- 3.33 -> DG xxx Q0018 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0337 <- 4.06 -> DA xxx Q0013 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0340 <- 3.07 -> DG xxx Q0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0344 <- 2.86 -> DA xxx Q0013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0358 <- 4.09 -> DA xxx Q0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0361 <- 3.90 -> DT xxx R0037 : score x.xxxxx >8dy9_I: title=STREPTOMYCES VENEZUELAE RNAP UNCONSTRAINED OPEN PROMOTER COMPLEX WITH WHIA AND WHIB TRANSCRIPTION FACTORS organism=? : V : LYS CE I0287 <- 3.67 -> DT C7 P0025 : score 2.68556 : x : ASP xxxx I0226 <- 3.87 -> DG xxx P0022 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0288 <- 2.90 -> DG xxx O0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0295 <- 3.10 -> DC xxx P0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0296 <- 3.79 -> DT xxx O0019 : score x.xxxxx >8dzj_B: title=CRYO-EM STRUCTURE OF ACIDIBACILLUS SULFUROXIDANS CAS12F IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA organism=? : x : TYR xxxx B0005 <- 3.42 -> DT xxx C0014 : score x.xxxxx >8e23_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE THETA IN COMPLEX WITH ALLOSTERIC INHIBITOR organism=? : H : ARG NH1 A2241 <- 2.74 -> DG N3 C0013 : score 3.08919 : w : ARG NH1 A2241 <- 5.55 -> DA N3 B0006 : score 2.585 : w : ASN ND2 A2248 <- 6.05 -> DA N3 B0007 : score 2.277 : x : LYS xxxx A2181 <- 4.38 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A2209 <- 3.43 -> DA xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A2251 <- 3.14 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A2384 <- 3.25 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A2391 <- 3.59 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A2393 <- 3.59 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A2470 <- 4.29 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A2474 <- 3.33 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx >8e24_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=HUMAN DNA POLYMERASE THETA IN COMPLEX WITH ALLOSTERIC INHIBITOR organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A2241 <- 2.75 -> DG N3 C0013 : score 3.08309 : w : ARG NH1 A2241 <- 5.99 -> DA N3 B0006 : score 2.585 : w : ASN ND2 A2248 <- 6.45 -> DT O2 C0012 : score 1.666 : w : ASN OD1 A2251 <- 5.66 -> DT O2 C0012 : score 1.953 : w : HIS NE2 A2539 <- 6.45 -> DA N3 B0006 : score 2.619 : x : LYS xxxx A2209 <- 3.46 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A2384 <- 3.74 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A2387 <- 4.40 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A2391 <- 3.35 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A2393 <- 3.48 -> DC xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A2470 <- 4.30 -> DC xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A2474 <- 3.12 -> DG xxx C0013 : score x.xxxxx >8e2l_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF LATES CALCARIFER TWINKLE HELICASE WITH ATP AND DNA organism=? : x : TYR xxxx C0412 <- 3.79 -> DT xxx M0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0412 <- 3.79 -> DT xxx M0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0412 <- 3.73 -> DT xxx M0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0412 <- 3.47 -> DT xxx M0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0412 <- 3.28 -> DT xxx M0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0412 <- 3.31 -> DT xxx M0007 : score x.xxxxx >8e2l_F:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF LATES CALCARIFER TWINKLE HELICASE WITH ATP AND DNA organism=? : x : TYR xxxx F0412 <- 3.31 -> DT xxx M0007 : score x.xxxxx >8e2q_AB:Cytidine_deaminase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TADAC-1.17 IN A COMPLEX WITH SSDNA organism=Escherichia coli : H : ARG NE A0150 <- 2.93 -> DG O6 E0005 : score 3.83856 : H : ARG NH2 A0150 <- 3.03 -> DG N7 E0005 : score 6.09092 : H : ASN OD1 A0157 <- 2.89 -> DT N3 E0008 : score 3.73286 >8e2q_CD:Cytidine_deaminase-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF TADAC-1.17 IN A COMPLEX WITH SSDNA organism=Escherichia coli : w : ASP OD1 C0077 <- 5.80 -> DG N2 H0012 : score 2.312 : H : ARG NE D0150 <- 2.88 -> DG O6 H0005 : score 3.87797 : H : ARG NH2 D0150 <- 2.98 -> DG N7 H0005 : score 6.15477 >8e3d_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZBTB7A ZINC FINGER DOMAIN BOUND TO DNA DUPLEX CONTAINING CAST SEQUENCE (#11) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0396 <- 2.70 -> DG O6 Y0008 : score 5.89638 : H : ARG NH1 A0399 <- 2.95 -> DG O6 X0013 : score 5.90083 : H : ARG NH2 A0399 <- 2.90 -> DG N7 X0013 : score 6.25692 : H : ARG NH1 A0421 <- 2.89 -> DG N7 X0012 : score 5.9411 : H : ARG NH2 A0421 <- 3.11 -> DG O6 X0012 : score 6.1908 : H : ASP OD2 A0423 <- 3.02 -> DC N4 Y0010 : score 5.9272 : w : ASP OD2 A0423 <- 6.06 -> DC N4 Y0011 : score 3.623 : H : LYS NZ A0424 <- 3.23 -> DG N7 X0011 : score 4.92271 : H : LYS NZ A0424 <- 3.10 -> DG O6 X0011 : score 5.43392 : H : ARG NH1 A0477 <- 3.18 -> DG N7 X0007 : score 5.5902 : H : ARG NH2 A0477 <- 2.72 -> DG O6 X0007 : score 6.7056 : H : ASP OD2 A0479 <- 2.96 -> DC N4 Y0015 : score 6.0016 : H : HIS NE2 A0480 <- 2.90 -> DG N7 X0006 : score 6.66651 : H : ARG NH1 A0483 <- 2.84 -> DG O6 X0005 : score 6.03467 : H : ARG NH2 A0483 <- 3.24 -> DG N7 X0005 : score 5.82277 : x : SER xxxx A0478 <- 3.87 -> DT xxx Y0014 : score x.xxxxx >8e3e_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZBTB7A ZINC FINGER DOMAIN BOUND TO DNA DUPLEX CONTAINING CAST SEQUENCE (#10) organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0396 <- 2.56 -> DG O6 Y0008 : score 6.05825 : H : ARG NH1 A0399 <- 3.13 -> DG O6 X0013 : score 5.68183 : H : ARG NH2 A0399 <- 2.95 -> DG N7 X0013 : score 6.19308 : H : ARG NH1 A0421 <- 2.94 -> DG N7 X0012 : score 5.8806 : H : ARG NH2 A0421 <- 2.82 -> DG O6 X0012 : score 6.5736 : H : ASP OD2 A0423 <- 2.93 -> DC N4 Y0010 : score 6.0388 : H : LYS NZ A0424 <- 3.23 -> DG O6 X0011 : score 5.28362 : H : ARG NH1 A0477 <- 3.09 -> DG N7 X0007 : score 5.6991 : H : ARG NH2 A0477 <- 2.80 -> DG O6 X0007 : score 6.6 : H : ASP OD2 A0479 <- 3.16 -> DC N4 Y0015 : score 5.7536 : w : ASP OD2 A0479 <- 6.29 -> DC N4 Y0016 : score 3.623 : H : HIS NE2 A0480 <- 3.05 -> DG N7 X0006 : score 6.46244 : H : ARG NH1 A0483 <- 2.71 -> DG O6 X0005 : score 6.19283 : H : ARG NH2 A0483 <- 3.07 -> DG N7 X0005 : score 6.03985 : x : SER xxxx A0478 <- 3.47 -> DT xxx Y0014 : score x.xxxxx >8e3f_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=ESCHERICHIA COLI RHO-DEPENDENT TRANSCRIPTION PRE-TERMINATION COMPLEX CONTAINING 18 NT LONG RNA SPACER, MG-ADP-BEF3, AND NUSG; TEC PART organism=? : V : ASP CG A0199 <- 3.85 -> DT C7 50108 : score 2.64954 : x : HIS xxxx A0150 <- 4.28 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0151 <- 3.23 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0175 <- 3.95 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0182 <- 4.15 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 2.69 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.74 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0542 <- 3.53 -> DC xxx 50111 : score x.xxxxx >8e3f_ABF: title=ESCHERICHIA COLI RHO-DEPENDENT TRANSCRIPTION PRE-TERMINATION COMPLEX CONTAINING 18 NT LONG RNA SPACER, MG-ADP-BEF3, AND NUSG; TEC PART organism=? : H : LYS NZ B1170 <- 2.93 -> DG N3 50122 : score 1.41605 : V : ASP CG A0199 <- 3.85 -> DT C7 50108 : score 2.64954 : x : HIS xxxx A0150 <- 4.28 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0151 <- 3.23 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0175 <- 3.95 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0182 <- 4.15 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 2.69 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.74 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0542 <- 3.53 -> DC xxx 50111 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0046 <- 4.40 -> DC xxx 50097 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0271 <- 2.92 -> DT xxx 50101 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0274 <- 4.21 -> DA xxx 50100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0314 <- 3.62 -> DA xxx 50103 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0317 <- 4.50 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0352 <- 4.09 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0426 <- 4.03 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0427 <- 3.76 -> DC xxx 60015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0790 <- 3.45 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0791 <- 3.75 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0015 <- 4.18 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx >8e3k_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) BOUND TO D(AATAAGCGGAAGTGGG) organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 F0226 <- 5.36 -> DG O6 D0027 : score 2.87 A : H : ARG NE F0230 <- 2.88 -> DG O6 C0009 : score 3.87797 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.93 -> DG N7 C0009 : score 6.21862 : H : ARG NH2 F0233 <- 2.91 -> DG N7 C0008 : score 6.24415 : w : ARG NH2 F0233 <- 5.92 -> DG O6 C0008 : score 2.468 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.56 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.73 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.18 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8e3r_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) BOUND TO D(AATAAAAGGAAGTGGG) organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 F0226 <- 5.05 -> DT O4 D0027 : score 2.257 A : H : ARG NE F0230 <- 2.89 -> DG O6 C0009 : score 3.87009 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.96 -> DG N7 C0009 : score 6.18031 : H : ARG NH2 F0233 <- 2.93 -> DG N7 C0008 : score 6.21862 : w : ARG NH2 F0233 <- 5.75 -> DG O6 C0008 : score 2.468 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.56 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.73 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.13 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8e4h_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) BOUND TO D(AATAAGAGGAAGTGGG) organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 F0226 <- 5.05 -> DT O4 D0027 : score 2.257 : H : ARG NE F0230 <- 2.89 -> DG O6 C0009 : score 3.87009 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.96 -> DG N7 C0009 : score 6.18031 : H : ARG NH2 F0233 <- 2.96 -> DG N7 C0008 : score 6.18031 : w : ARG NH2 F0233 <- 5.78 -> DG O6 C0008 : score 2.468 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.56 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.81 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.17 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8e5d_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF DOUBLE-STRANDED DNA DEAMINASE TOXIN DDDA IN COMPLEX WITH DNA WITH THE TARGET CYTOSINE PARKED IN THE MAJOR GROOVE organism=Burkholderia cenocepacia : H : HIS NE2 A1345 <- 3.03 -> DT O2 B0007 : score 4.99872 : H : ARG NH1 A1403 <- 2.84 -> DT O2 C0011 : score 4.27196 : V : PHE CZ A1375 <- 3.72 -> DT C7 B0007 : score 7.25717 : x : ALA xxxx A1341 <- 3.42 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1378 <- 2.86 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1379 <- 3.40 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx >8e5e_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF DOUBLE-STRANDED DNA DEAMINASE TOXIN DDDA IN COMPLEX WITH DNA WITH THE TARGET CYTOSINE FLIPPED INTO THE ACTIVE SITE organism=Burkholderia cenocepacia : H : HIS NE2 A1345 <- 3.13 -> DT O2 B0007 : score 4.89392 : H : ASN OD1 A1378 <- 3.12 -> DG N2 B0006 : score 4.4928 : H : ARG NH2 A1403 <- 2.53 -> DT O2 C0011 : score 4.46193 : x : THR xxxx A1311 <- 3.37 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1331 <- 4.22 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A1341 <- 3.32 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A1346 <- 3.64 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1372 <- 4.03 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A1373 <- 3.72 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1375 <- 3.41 -> DG xxx B0006 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A1376 <- 4.06 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A1379 <- 4.44 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx >8e5k_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=ESCHERICHIA COLI RHO-DEPENDENT TRANSCRIPTION PRE-TERMINATION COMPLEX CONTAINING 21 NT LONG RNA SPACER, MG-ADP-BEF3, AND NUSG; TEC PART organism=? : V : ASP CG A0199 <- 3.85 -> DT C7 50108 : score 2.64954 : x : HIS xxxx A0150 <- 4.28 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0151 <- 3.23 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0175 <- 3.95 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0182 <- 4.15 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 2.69 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.74 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0542 <- 3.53 -> DC xxx 50111 : score x.xxxxx >8e5k_ABF: title=ESCHERICHIA COLI RHO-DEPENDENT TRANSCRIPTION PRE-TERMINATION COMPLEX CONTAINING 21 NT LONG RNA SPACER, MG-ADP-BEF3, AND NUSG; TEC PART organism=? : H : LYS NZ B1170 <- 2.93 -> DG N3 50122 : score 1.41605 : V : ASP CG A0199 <- 3.85 -> DT C7 50108 : score 2.64954 : x : HIS xxxx A0150 <- 4.28 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0151 <- 3.23 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0175 <- 3.95 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0182 <- 4.15 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 2.69 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.74 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0542 <- 3.53 -> DC xxx 50111 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0046 <- 4.40 -> DC xxx 50097 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0271 <- 2.92 -> DT xxx 50101 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0274 <- 4.21 -> DA xxx 50100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0314 <- 3.62 -> DA xxx 50103 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0317 <- 4.50 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0352 <- 4.09 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0426 <- 4.03 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0427 <- 3.76 -> DC xxx 60015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0790 <- 3.45 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0791 <- 3.75 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0015 <- 4.18 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx >8e5o_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=ESCHERICHIA COLI RHO-DEPENDENT TRANSCRIPTION PRE-TERMINATION COMPLEX CONTAINING 24 NT LONG RNA SPACER, MG-ADP-BEF3, AND NUSG; TEC PART organism=? : V : ASP CG A0199 <- 3.85 -> DT C7 50108 : score 2.64954 : x : HIS xxxx A0150 <- 4.28 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0151 <- 3.23 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0175 <- 3.95 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0182 <- 4.15 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 2.69 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.74 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0542 <- 3.53 -> DC xxx 50111 : score x.xxxxx >8e5o_ABF: title=ESCHERICHIA COLI RHO-DEPENDENT TRANSCRIPTION PRE-TERMINATION COMPLEX CONTAINING 24 NT LONG RNA SPACER, MG-ADP-BEF3, AND NUSG; TEC PART organism=? : H : LYS NZ B1170 <- 2.93 -> DG N3 50122 : score 1.41605 : V : ASP CG A0199 <- 3.85 -> DT C7 50108 : score 2.64954 : x : HIS xxxx A0150 <- 4.28 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0151 <- 3.23 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0175 <- 3.95 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0182 <- 4.15 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 2.69 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.74 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0542 <- 3.53 -> DC xxx 50111 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0046 <- 4.40 -> DC xxx 50097 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0271 <- 2.92 -> DT xxx 50101 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0274 <- 4.21 -> DA xxx 50100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0314 <- 3.62 -> DA xxx 50103 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0317 <- 4.50 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0352 <- 4.09 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0426 <- 4.03 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0427 <- 3.76 -> DC xxx 60015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0790 <- 3.45 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0791 <- 3.75 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0015 <- 4.18 -> DT xxx 50102 : score x.xxxxx >8e5y_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN BOUND TO D(AATAAGCGGAAGTGGG) ACETATE FREE AT PH 5.4 organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 F0226 <- 5.43 -> DG O6 D0027 : score 2.87 A : H : ARG NE F0230 <- 2.87 -> DG O6 C0009 : score 3.88585 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.93 -> DG N7 C0009 : score 6.21862 : H : ARG NH2 F0233 <- 2.93 -> DG N7 C0008 : score 6.21862 : w : ARG NH2 F0233 <- 5.95 -> DG O6 C0008 : score 2.468 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.57 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.79 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.16 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8e66_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ETV6 H396Y VARIANT BOUND TO DNA CONTAINING THE SEQUENCE GGAA organism=Mus musculus : H : ARG NE F0392 <- 2.78 -> DG O6 D0008 : score 3.95679 : H : ARG NH2 F0392 <- 3.12 -> DG N7 D0008 : score 5.976 : H : ARG NE F0395 <- 2.89 -> DG N7 D0007 : score 4.3422 : H : ARG NH2 F0395 <- 2.94 -> DG O6 D0007 : score 6.4152 : x : LYS xxxx F0389 <- 4.09 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0393 <- 4.40 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0396 <- 3.90 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx >8e67_A:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ETV6 H396Y VARIANT BOUND TO DNA CONTAINING THE SEQUENCE GGAT organism=Mus musculus : H : ARG NE A0392 <- 2.84 -> DG O6 B0008 : score 3.9095 : H : ARG NH2 A0392 <- 2.63 -> DG N7 B0008 : score 6.60169 : H : ARG NE A0395 <- 3.12 -> DG N7 B0007 : score 4.1388 : H : ARG NH2 A0395 <- 3.26 -> DG O6 B0007 : score 5.9928 : H : TYR OH A0396 <- 3.01 -> DA N6 B0009 : score 4.47435 : w : TYR OH A0396 <- 6.10 -> DT O4 B0010 : score 2.914 : x : GLU xxxx A0388 <- 3.84 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0389 <- 3.81 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx >8e6x_ABF: title=ESCHERICHIA COLI RHO-DEPENDENT TRANSCRIPTION PRE-TERMINATION COMPLEX CONTAINING 18 NT LONG RNA SPACER, LAMBDA-TR1 RUT RNA, MG-ADP-BEF3, AND NUSG; TEC PART organism=? : H : LYS NZ B1170 <- 2.93 -> DG N3 50122 : score 1.41605 : V : ASP CG A0199 <- 3.85 -> DT C7 50108 : score 2.64954 : x : HIS xxxx A0150 <- 4.28 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0151 <- 3.23 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0175 <- 3.95 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0182 <- 4.15 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 2.70 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.74 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0542 <- 3.53 -> DC xxx 50111 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0271 <- 4.45 -> DT xxx 50101 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0314 <- 3.87 -> DA xxx 50103 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0352 <- 4.09 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0426 <- 4.03 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0427 <- 3.76 -> DC xxx 60015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0790 <- 3.45 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0791 <- 3.75 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0015 <- 4.45 -> DT xxx 50101 : score x.xxxxx >8e6x_F:N-utilization_substance_G_protein_NusG,_N-terminal_domain;Translation_proteins_SH3-like_domain; title=ESCHERICHIA COLI RHO-DEPENDENT TRANSCRIPTION PRE-TERMINATION COMPLEX CONTAINING 18 NT LONG RNA SPACER, LAMBDA-TR1 RUT RNA, MG-ADP-BEF3, AND NUSG; TEC PART organism=? : x : PHE xxxx F0015 <- 4.45 -> DT xxx 50101 : score x.xxxxx >8e6z_ABF: title=ESCHERICHIA COLI RHO-DEPENDENT TRANSCRIPTION PRE-TERMINATION COMPLEX CONTAINING 18 NT LONG RNA SPACER, DC75 RUT MIMIC RNA, MG-ADP-BEF3, AND NUSG; TEC PART organism=? : H : LYS NZ B1170 <- 2.93 -> DG N3 50122 : score 1.41605 : V : ASP CG A0199 <- 3.85 -> DT C7 50108 : score 2.64954 : x : HIS xxxx A0150 <- 4.28 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0151 <- 3.23 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0175 <- 3.95 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0182 <- 4.15 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0183 <- 2.70 -> DA xxx 50110 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0201 <- 3.74 -> DT xxx 50108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0542 <- 3.53 -> DC xxx 50111 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0255 <- 3.62 -> DC xxx 60023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0271 <- 4.45 -> DT xxx 50101 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0314 <- 3.87 -> DA xxx 50103 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0352 <- 4.09 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0426 <- 4.03 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0427 <- 3.76 -> DC xxx 60015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0790 <- 3.45 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0791 <- 3.74 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0015 <- 4.45 -> DT xxx 50101 : score x.xxxxx >8e6z_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=ESCHERICHIA COLI RHO-DEPENDENT TRANSCRIPTION PRE-TERMINATION COMPLEX CONTAINING 18 NT LONG RNA SPACER, DC75 RUT MIMIC RNA, MG-ADP-BEF3, AND NUSG; TEC PART organism=? : H : LYS NZ B1170 <- 2.93 -> DG N3 50122 : score 1.41605 : x : ARG xxxx B0271 <- 4.45 -> DT xxx 50101 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0314 <- 3.87 -> DA xxx 50103 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0352 <- 4.09 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0426 <- 4.03 -> DC xxx 60016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0427 <- 3.76 -> DC xxx 60015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0790 <- 3.45 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0791 <- 3.74 -> DT xxx 60014 : score x.xxxxx >8e70_abcdef: title=ESCHERICHIA COLI RHO-DEPENDENT TRANSCRIPTION PRE-TERMINATION COMPLEX CONTAINING 18 NT LONG RNA SPACER, DC75 RUT MIMIC RNA, MG-ADP-BEF3, AND NUSG; RHO HEXAMER PART organism=? : H : TYR OH a0080 <- 3.20 -> DC O2 80014 : score 3.21764 : H : SER OG a0082 <- 2.83 -> DC O2 80013 : score 2.48627 : H : ARG NH1 a0109 <- 2.87 -> DC O2 80017 : score 3.5989 : H : ARG NH2 a0109 <- 2.58 -> DC O2 80017 : score 3.86146 : H : TYR OH a0110 <- 3.01 -> DC N3 80017 : score 2.4994 : H : TYR OH a0110 <- 3.26 -> DC N4 80017 : score 3.82641 : H : TYR OH b0080 <- 2.54 -> DC O2 80024 : score 3.6793 : H : GLN NE2 b0085 <- 2.70 -> DC O2 80022 : score 3.76877 : H : GLU OE2 b0108 <- 2.37 -> DC N4 80024 : score 5.71821 : H : ARG NH2 b0109 <- 3.31 -> DC O2 80027 : score 3.32145 : H : TYR OH d0080 <- 2.20 -> DC O2 80044 : score 3.91713 : H : GLU OE2 d0108 <- 3.31 -> DC N4 80044 : score 4.72832 : H : TYR OH e0080 <- 2.99 -> DC O2 80054 : score 3.36453 : H : TYR OH e0080 <- 2.55 -> DC O2 80055 : score 3.67231 : H : TYR OH f0080 <- 2.99 -> DC O2 80004 : score 3.36453 : H : ARG NH1 f0109 <- 2.78 -> DC O2 80007 : score 3.6646 : H : ARG NH2 f0109 <- 2.36 -> DC O2 80007 : score 4.02421 : H : TYR OH f0110 <- 2.82 -> DC N3 80007 : score 2.59854 : H : TYR OH f0110 <- 3.10 -> DC N4 80007 : score 3.96126 : x : GLU xxxx e0024 <- 3.90 -> DC xxx 80060 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx e0028 <- 2.99 -> DC xxx 80061 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx e0062 <- 3.73 -> DC xxx 80056 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx e0064 <- 3.25 -> DC xxx 80057 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx e0076 <- 3.85 -> DC xxx 80058 : score x.xxxxx : x : SER xxxx e0082 <- 2.54 -> DC xxx 80053 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx e0083 <- 4.12 -> DC xxx 80054 : score x.xxxxx : x : SER xxxx e0084 <- 2.80 -> DC xxx 80053 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx e0085 <- 1.92 -> DC xxx 80053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx e0088 <- 2.81 -> DC xxx 80052 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx e0089 <- 3.57 -> DC xxx 80052 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx e0102 <- 3.61 -> DC xxx 80054 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx e0108 <- 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score x.xxxxx : x : LEU xxxx f0114 <- 3.08 -> DC xxx 80003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx f0115 <- 3.61 -> DC xxx 80002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx f0116 <- 1.88 -> DC xxx 80001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx f0119 <- 3.35 -> DC xxx 80001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx f0124 <- 3.66 -> DC xxx 80001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx f0128 <- 2.95 -> DC xxx 80061 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx c0062 <- 3.82 -> DC xxx 80035 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx c0064 <- 3.51 -> DC xxx 80036 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx c0080 <- 1.71 -> DC xxx 80034 : score x.xxxxx : x : SER xxxx c0082 <- 1.29 -> DC xxx 80033 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx c0083 <- 4.17 -> DC xxx 80034 : score x.xxxxx : x : SER xxxx c0084 <- 2.47 -> DC xxx 80033 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx c0085 <- 2.17 -> DC xxx 80033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx c0087 <- 4.12 -> DC xxx 80030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx c0088 <- 2.28 -> DC xxx 80031 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx c0089 <- 3.22 -> DT xxx 80032 : score x.xxxxx : x : GLU 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ETA-DNA-RU-ENDED PRIMER-BINARY COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 A0061 <- 2.63 -> DT O4 T0005 : score 3.67468 : x : GLN xxxx A0038 <- 3.08 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0042 <- 3.34 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 3.63 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0062 <- 4.40 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0064 <- 3.93 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.95 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0326 <- 3.61 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0329 <- 3.63 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 4.41 -> DC xxx T0010 : score x.xxxxx >8e8a_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-DT-ENDED PRIMER BINARY COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.07 -> DG O6 P0005 : score 5.75483 : H : ARG NH2 A0382 <- 3.02 -> DG N7 P0005 : score 6.10369 : x : ARG xxxx A0061 <- 3.47 -> DT 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DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0042 <- 3.27 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 4.20 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.22 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0064 <- 4.27 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.90 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0326 <- 3.73 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0329 <- 3.87 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx >8e8d_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-RU-ENDED PRIMER TERNARY MISMATCH COMPLEX:REACTION WITH 10 MM MN2+ FOR 60S organism=Homo sapiens : x : GLN xxxx A0038 <- 3.35 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0042 <- 3.43 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 4.06 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 2.97 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0064 <- 4.35 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.84 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0326 <- 3.80 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0329 <- 3.64 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx >8e8e_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-RU-ENDED PRIMER TERNARY MISMATCH COMPLEX:REACTION WITH 10 MM MN2+ FOR 90S organism=Homo sapiens : x : GLN xxxx A0038 <- 3.81 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0042 <- 3.41 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 4.18 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.45 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0064 <- 4.43 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.87 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0326 <- 3.83 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0329 <- 3.77 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx >8e8f_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-RU-ENDED PRIMER TERNARY MISMATCH COMPLEX:REACTION WITH 10 MM MN2+ FOR 120S organism=Homo sapiens : x : GLN xxxx A0038 <- 3.63 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0042 <- 3.38 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 4.16 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0062 <- 4.41 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0064 <- 4.40 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.92 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0324 <- 4.42 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0326 <- 3.78 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0329 <- 4.06 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx >8e8g_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-RU-ENDED PRIMER TERNARY MISMATCH COMPLEX:REACTION WITH 10 MM MN2+ FOR 180S organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 2.93 -> DT O2 T0005 : score 3.83107 : x : TRP xxxx A0042 <- 3.41 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 4.11 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.71 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0064 <- 4.50 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.65 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0326 <- 3.81 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0329 <- 3.43 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx >8e8h_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-RU-ENDED PRIMER TERNARY MISMATCH COMPLEX:REACTION WITH 10 MM MN2+ FOR 300S organism=Homo sapiens : x : GLN xxxx A0038 <- 3.54 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0042 <- 3.42 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 4.43 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0062 <- 3.81 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0064 <- 4.47 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.79 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0326 <- 3.88 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0329 <- 3.63 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx >8e8j_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-RG-ENDED PRIMER-DGMPNPP TERNARY MISMATCH COMPLEX WITH MG2+ organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 A0038 <- 3.09 -> DT O2 T0005 : score 3.7052 : x : TRP xxxx A0042 <- 3.46 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 4.19 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.40 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0326 <- 4.04 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0328 <- 3.14 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0329 <- 3.31 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx >8e8k_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA-DNA-RC-ENDED PRIMER-DGMPNPP TERNARY MISMATCH COMPLEX WITH MG2+ organism=Homo sapiens : x : GLN xxxx A0038 <- 3.24 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0042 <- 3.17 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 4.46 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0061 <- 3.66 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.94 -> DT xxx T0007 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0326 <- 3.76 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0329 <- 3.69 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx >8e8m_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RNAP PAUSED ELONGATION COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 C0228 <- 2.63 -> DA N7 O0028 : score 2.64731 : H : ARG NH2 C0228 <- 3.14 -> DT O2 O0027 : score 3.94547 : x : ARG xxxx C0181 <- 4.25 -> DT xxx O0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0203 <- 3.44 -> DA xxx O0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0208 <- 4.48 -> DT xxx O0027 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0211 <- 2.84 -> DT xxx O0027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0370 <- 3.89 -> DT xxx O0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0376 <- 3.41 -> DT xxx O0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.31 -> DA xxx O0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0472 <- 4.42 -> DT xxx O0029 : score x.xxxxx >8e8m_CD: title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RNAP PAUSED ELONGATION COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 C0228 <- 2.63 -> DA N7 O0028 : score 2.64731 : H : ARG NH2 C0228 <- 3.14 -> DT O2 O0027 : score 3.94547 : x : ARG xxxx C0181 <- 4.25 -> DT xxx O0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0203 <- 3.44 -> DA xxx O0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0208 <- 4.48 -> DT xxx O0027 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0211 <- 2.84 -> DT xxx O0027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0370 <- 3.89 -> DT xxx O0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0376 <- 3.41 -> DT xxx O0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.31 -> DA xxx O0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0472 <- 4.42 -> DT xxx O0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0287 <- 4.05 -> DT xxx P0115 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0394 <- 3.46 -> DA xxx P0135 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0502 <- 3.88 -> DA xxx P0126 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0867 <- 4.33 -> DA xxx P0126 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0868 <- 4.19 -> DA xxx P0126 : score x.xxxxx >8e95_CD: title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RNAP ELONGATION COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx C0181 <- 4.00 -> DG xxx Q0030 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0211 <- 3.65 -> DT xxx Q0029 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0227 <- 2.66 -> DT xxx Q0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0228 <- 4.11 -> DT xxx Q0029 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0370 <- 4.04 -> DG xxx Q0030 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0371 <- 3.61 -> DG xxx Q0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0376 <- 3.85 -> DG xxx Q0030 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0463 <- 3.51 -> DG xxx Q0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.21 -> DG xxx Q0031 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0472 <- 3.66 -> DG xxx Q0030 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0330 <- 3.80 -> DC xxx P0134 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0501 <- 4.14 -> DT xxx P0126 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0502 <- 4.15 -> DT xxx P0126 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0867 <- 3.31 -> DC xxx P0125 : score x.xxxxx >8e95_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RNAP ELONGATION COMPLEX organism=? : x : LEU xxxx D0330 <- 3.80 -> DC xxx P0134 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0501 <- 4.14 -> DT xxx P0126 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0502 <- 4.15 -> DT xxx P0126 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0867 <- 3.31 -> DC xxx P0125 : score x.xxxxx >8e9a_A:Nucleotidyltransferase; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ASFVPOLX IN COMPLEX WITH 10-23 DNAZYME AND MG organism=African swine fever virus BA71V : H : LYS NZ A0085 <- 3.17 -> DG N3 C0004 : score 1.34626 : x : HIS xxxx A0115 <- 2.77 -> DC xxx C0052 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0120 <- 3.21 -> DC xxx C0052 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0123 <- 3.68 -> DC xxx C0052 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0124 <- 3.62 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0127 <- 3.61 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx >8ea3_DW: title=V-K CAST TRANSPOSOSOME FROM SCYTONEMA HOFMANNI, MAJOR CONFIGURATION organism=? : H : ARG NH2 W0077 <- 2.82 -> DG N7 10007 : score 6.35908 : H : ARG NH1 W0106 <- 2.40 -> DT O2 10016 : score 4.65092 : H : ARG NH2 W0106 <- 2.91 -> DT O2 10016 : score 4.1402 : H : ARG NH2 W0158 <- 3.44 -> DG O6 10019 : score 5.7552 : V : VAL CG2 W0343 <- 3.85 -> DT C7 30081 : score 6.04654 : x : ARG xxxx W0099 <- 2.96 -> DA xxx 10015 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx W0152 <- 3.71 -> DG xxx 10019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx W0154 <- 3.46 -> DT xxx 10020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx W0174 <- 3.77 -> DG xxx 30074 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx W0290 <- 2.60 -> DT xxx 30048 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx W0314 <- 3.74 -> DA xxx 30078 : score x.xxxxx : x : SER xxxx W0315 <- 4.23 -> DA xxx 30078 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx W0321 <- 3.07 -> DC xxx 30077 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx W0322 <- 4.26 -> DC xxx 30077 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx W0325 <- 3.11 -> DA xxx 30076 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx W0346 <- 2.81 -> DT xxx 30081 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx W0351 <- 4.11 -> DA xxx 30082 : score x.xxxxx >8ea4_Y:mu_transposase,_C-terminal_domain;Ribonuclease_H-like; title=V-K CAST TRANSPOSOSOME FROM SCYTONEMA HOFMANNI, MINOR CONFIGURATION organism=? : x : GLN xxxx Y0425 <- 4.47 -> DT xxx 4-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0495 <- 4.32 -> DC xxx 4-009 : score x.xxxxx >8eae_A: title=STRUCTURE OF TERNARY COMPLEX OF CGAS WITH DSDNA AND BOUND 5- PPPG(2,5)PI organism=? : H : ARG NH1 A0161 <- 2.80 -> DT O2 F0004 : score 4.30641 : H : ARG NH2 A0161 <- 2.63 -> DT O2 F0004 : score 4.37727 >8eaf_A:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=SSOMCM HEXAMER BOUND TO MG/ADP-BEFX AND 12-MER OLIGO-DT. CLASS 1 organism=? : x : ARG xxxx A0379 <- 3.07 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx >8eaf_ABCDEF:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=SSOMCM HEXAMER BOUND TO MG/ADP-BEFX AND 12-MER OLIGO-DT. CLASS 1 organism=? : H : ARG NH2 B0379 <- 2.34 -> DT O2 X0002 : score 4.6228 : H : ARG NH2 C0379 <- 2.78 -> DT O2 X0004 : score 4.25027 : x : ARG xxxx A0379 <- 3.07 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0386 <- 4.01 -> DT xxx X0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0386 <- 4.12 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx >8eah_ABCDEF:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=SSOMCM HEXAMER BOUND TO MG/ADP-BEFX AND 16-MER OLIGO-DT. CLASS 1 organism=? : H : ARG NH2 B0379 <- 2.26 -> DT O2 X0002 : score 4.69053 : H : ARG NH2 C0379 <- 2.88 -> DT O2 X0004 : score 4.1656 : x : ARG xxxx A0379 <- 3.10 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0386 <- 4.06 -> DT xxx X0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0386 <- 4.11 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx >8eah_C:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=SSOMCM HEXAMER BOUND TO MG/ADP-BEFX AND 16-MER OLIGO-DT. CLASS 1 organism=? : H : ARG NH2 C0379 <- 2.88 -> DT O2 X0004 : score 4.1656 : x : TYR xxxx C0386 <- 4.11 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx >8eaj_ABCDEF:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=SSOMCM HEXAMER BOUND TO MG/ADP-BEFX AND 46-MER DNA STRAND. CLASS 1 organism=? : H : ARG NH2 B0379 <- 2.33 -> DT O2 X0002 : score 4.63127 : H : ARG NH2 C0379 <- 2.37 -> DT O2 X0004 : score 4.5974 : x : ARG xxxx A0379 <- 3.15 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0386 <- 3.72 -> DT xxx X0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0386 <- 3.88 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0379 <- 4.48 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0381 <- 4.48 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx >8eaj_B:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=SSOMCM HEXAMER BOUND TO MG/ADP-BEFX AND 46-MER DNA STRAND. CLASS 1 organism=? : H : ARG NH2 B0379 <- 2.33 -> DT O2 X0002 : score 4.63127 : x : TYR xxxx B0386 <- 3.72 -> DT xxx X0002 : score x.xxxxx >8eal_ABCDEF:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=SSOMCM HEXAMER BOUND TO MG/ADP-BEFX AND DNA. CLASS 1. MERGED PARTICLES FROM DATASETS WITH 3 DIFFERENT DNA ENTITIES organism=? : H : ARG NH2 B0379 <- 2.28 -> DT O2 X0002 : score 4.6736 : H : ARG NH2 C0379 <- 2.59 -> DT O2 X0004 : score 4.41113 : x : ARG xxxx A0379 <- 3.13 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0386 <- 3.99 -> DT xxx X0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0386 <- 3.92 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx >8eal_C:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=SSOMCM HEXAMER BOUND TO MG/ADP-BEFX AND DNA. CLASS 1. MERGED PARTICLES FROM DATASETS WITH 3 DIFFERENT DNA ENTITIES organism=? : H : ARG NH2 C0379 <- 2.59 -> DT O2 X0004 : score 4.41113 : x : TYR xxxx C0386 <- 3.92 -> DT xxx X0004 : score x.xxxxx >8eb5_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=TANDEM OF HERMES TRANSPOSASE BED DOMAIN IN COMPLEX WITH THE QUASI PALINDROME OF ITS TRANSPOSON LEFT-END organism=Musca domestica : x : ARG xxxx A0063 <- 3.66 -> DT xxx C0012 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0064 <- 3.34 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0066 <- 4.10 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0070 <- 2.17 -> DG xxx C0009 : score x.xxxxx >8ebh_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) BOUND TO D(AATAAGCGGAATGGGG) organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 F0226 <- 6.02 -> DG O6 C0008 : score 2.87 : w : GLN NE2 F0226 <- 5.19 -> DG O6 D0027 : score 2.87 : H : ARG NE F0230 <- 2.87 -> DG O6 C0009 : score 3.88585 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.97 -> DG N7 C0009 : score 6.16754 : H : ARG NH2 F0233 <- 2.94 -> DG N7 C0008 : score 6.20585 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.60 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.81 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.16 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8ebs_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=INITIAL DNA-LESION (CY5) BINDING BY XPC AND TFIIH organism=? : x : HIS xxxx A0415 <- 4.45 -> DT xxx L0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0528 <- 3.30 -> DT xxx M0041 : score x.xxxxx >8ebs_AH: title=INITIAL DNA-LESION (CY5) BINDING BY XPC AND TFIIH organism=? : H : TYR OH H0760 <- 3.27 -> DA N6 M0028 : score 4.23148 : x : HIS xxxx A0415 <- 4.45 -> DT xxx L0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0528 <- 3.30 -> DT xxx M0041 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0185 <- 3.72 -> DT xxx L0031 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0756 <- 3.10 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0794 <- 4.36 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx H0798 <- 4.27 -> DT xxx L0029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0799 <- 4.47 -> DA xxx M0025 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0800 <- 3.22 -> DT xxx L0029 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0805 <- 3.20 -> DT xxx M0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0806 <- 3.22 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx >8ebt_ABHK:Putative_DNA-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=XPA REPOSITIONING CORE7 OF TFIIH RELATIVE TO XPC-DNA LESION (CY5) organism=? : H : LYS NZ A0609 <- 3.34 -> DC O2 L0010 : score 2.62797 : H : HIS NE2 A0629 <- 3.20 -> DT O2 M0048 : score 4.82056 : H : HIS ND1 H0805 <- 3.26 -> DT O4 L0029 : score 4.28623 : H : GLN OE1 K0174 <- 2.26 -> DG N2 L0024 : score 6.21332 : x : LYS xxxx B0507 <- 3.30 -> DT xxx L0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0509 <- 4.36 -> DG xxx L0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0756 <- 3.34 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0797 <- 3.94 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx H0798 <- 4.20 -> DT xxx L0029 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0800 <- 3.30 -> DT xxx L0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0806 <- 3.63 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx K0142 <- 4.33 -> DC xxx M0036 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx K0172 <- 4.11 -> DA xxx L0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx K0175 <- 3.02 -> DG xxx M0035 : score x.xxxxx >8ebt_K:Putative_DNA-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=XPA REPOSITIONING CORE7 OF TFIIH RELATIVE TO XPC-DNA LESION (CY5) organism=? : H : GLN OE1 K0174 <- 2.26 -> DG N2 L0024 : score 6.21332 : x : THR xxxx K0142 <- 4.33 -> DC xxx M0036 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx K0172 <- 4.11 -> DA xxx L0025 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx K0175 <- 3.02 -> DG xxx M0035 : score x.xxxxx >8ebu_ABK: title=XPC RELEASE FROM CORE7-XPA-DNA (CY5) organism=? : H : LYS NZ A0609 <- 2.91 -> DC O2 L0010 : score 2.88134 : H : HIS NE2 A0629 <- 3.23 -> DT O2 M0048 : score 4.78913 : H : TRP NE1 K0175 <- 3.08 -> DG O6 M0035 : score -8.60129 : x : ARG xxxx B0686 <- 4.07 -> DC xxx M0038 : score x.xxxxx : x : THR xxxx K0142 <- 3.77 -> DC xxx M0036 : score x.xxxxx >8ebu_K:Putative_DNA-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=XPC RELEASE FROM CORE7-XPA-DNA (CY5) organism=? : H : TRP NE1 K0175 <- 3.08 -> DG O6 M0035 : score -8.60129 : x : THR xxxx K0142 <- 3.77 -> DC xxx M0036 : score x.xxxxx >8ebv_AH: title=INITIAL DNA-LESION (AP) BINDING BY XPC AND TFIIH COMPLEX 1 organism=? : V : THR CG2 H0689 <- 3.61 -> DT C7 M0026 : score 4.43818 : V : PHE CD2 H0797 <- 3.61 -> DT C7 M0027 : score 6.82111 : x : LYS xxxx A0528 <- 3.81 -> DT xxx L0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0609 <- 4.39 -> DG xxx L0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0192 <- 4.49 -> DT xxx M0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0685 <- 3.07 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0686 <- 2.91 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0692 <- 3.33 -> DT xxx M0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0730 <- 4.08 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0732 <- 3.34 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0754 <- 4.15 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0756 <- 3.16 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0760 <- 3.61 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0762 <- 3.63 -> DT xxx M0027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0794 <- 3.55 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0799 <- 4.19 -> DT xxx M0027 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0800 <- 3.10 -> DT xxx L0029 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0805 <- 2.98 -> DT xxx L0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0806 <- 3.43 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx >8ebv_H:Cysteine_proteinases; title=INITIAL DNA-LESION (AP) BINDING BY XPC AND TFIIH COMPLEX 1 organism=? : V : THR CG2 H0689 <- 3.61 -> DT C7 M0026 : score 4.43818 : V : PHE CD2 H0797 <- 3.61 -> DT C7 M0027 : score 6.82111 : x : ARG xxxx H0192 <- 4.49 -> DT xxx M0024 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0685 <- 3.07 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0686 <- 2.91 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0692 <- 3.33 -> DT xxx M0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0730 <- 4.08 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0732 <- 3.34 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0754 <- 4.15 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0756 <- 3.16 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0760 <- 3.61 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0762 <- 3.63 -> DT xxx M0027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0794 <- 3.55 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0799 <- 4.19 -> DT xxx M0027 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0800 <- 3.10 -> DT xxx L0029 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0805 <- 2.98 -> DT xxx L0029 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0806 <- 3.43 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx >8ebw_AH: title=INITIAL DNA-LESION (AP) BINDING BY XPC AND TFIIH COMPLEX2 organism=? : H : ASN ND2 H0754 <- 2.93 -> DT O4 M0027 : score 5.14722 : H : HIS NE2 H0800 <- 3.35 -> DT N3 L0029 : score -5.38336 : V : ASP CB H0688 <- 3.65 -> DT C7 M0026 : score 2.78369 : V : PHE CD2 H0756 <- 3.50 -> DT C7 M0027 : score 7.00018 : x : LYS xxxx A0528 <- 3.93 -> DT xxx L0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0642 <- 4.15 -> DT xxx L0038 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0686 <- 4.04 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0689 <- 4.12 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0692 <- 3.92 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0758 <- 2.91 -> DT xxx M0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0760 <- 2.55 -> DT xxx M0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0762 <- 4.44 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0794 <- 3.30 -> DT xxx M0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0797 <- 3.26 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0799 <- 3.28 -> DA xxx M0025 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0805 <- 2.77 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0806 <- 3.12 -> DT xxx M0027 : score x.xxxxx >8ebw_H:Cysteine_proteinases; title=INITIAL DNA-LESION (AP) BINDING BY XPC AND TFIIH COMPLEX2 organism=? : H : ASN ND2 H0754 <- 2.93 -> DT O4 M0027 : score 5.14722 : V : ASP CB H0688 <- 3.65 -> DT C7 M0026 : score 2.78369 : V : PHE CD2 H0756 <- 3.50 -> DT C7 M0027 : score 7.00018 : x : LYS xxxx H0642 <- 4.15 -> DT xxx L0038 : score x.xxxxx : x : SER xxxx H0686 <- 4.04 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0689 <- 4.12 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0692 <- 3.92 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0758 <- 2.91 -> DT xxx M0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx H0760 <- 2.55 -> DT xxx M0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0762 <- 4.44 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0794 <- 3.30 -> DT xxx M0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0797 <- 3.26 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0799 <- 3.28 -> DA xxx M0025 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0800 <- 3.33 -> DT xxx L0029 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0805 <- 2.77 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0806 <- 3.12 -> DT xxx M0027 : score x.xxxxx >8ebx_ABHK:Putative_DNA-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=XPA REPOSITIONING CORE7 OF TFIIH RELATIVE TO XPC-DNA LESION (AP) organism=? : H : LYS NZ A0609 <- 3.36 -> DC O2 L0010 : score 2.61618 : H : TYR OH H0656 <- 2.59 -> DT O4 M0026 : score 3.64967 : H : TYR OH H0760 <- 2.56 -> DT O4 M0027 : score 3.67069 : H : HIS NE2 K0172 <- 2.30 -> DT O2 L0023 : score 5.76372 : V : PHE CB H0710 <- 3.69 -> DT C7 M0026 : score 5.96055 : V : LYS CE B0507 <- 3.63 -> DT C7 L0023 : score 2.71157 : x : HIS xxxx A0629 <- 3.67 -> DT xxx M0048 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0509 <- 3.74 -> DG xxx L0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0655 <- 3.89 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0715 <- 3.38 -> DA xxx M0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0756 <- 3.94 -> DT xxx M0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0797 <- 3.91 -> DT xxx M0027 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0805 <- 4.46 -> DA xxx M0028 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0806 <- 3.80 -> DT xxx M0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx K0142 <- 4.08 -> DC xxx M0036 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx K0174 <- 4.20 -> DT xxx L0023 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx K0175 <- 3.10 -> DG xxx M0035 : score x.xxxxx >8ebx_K:Putative_DNA-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=XPA REPOSITIONING CORE7 OF TFIIH RELATIVE TO XPC-DNA LESION (AP) organism=? : H : HIS NE2 K0172 <- 2.30 -> DT O2 L0023 : score 5.76372 : x : THR xxxx K0142 <- 4.08 -> DC xxx M0036 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx K0174 <- 4.20 -> DT xxx L0023 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx K0175 <- 3.10 -> DG xxx M0035 : score x.xxxxx >8eby_ABK: title=XPC RELEASE FROM CORE7-XPA-DNA (AP) organism=? : H : LYS NZ A0609 <- 3.08 -> DC O2 L0010 : score 2.78117 : H : HIS NE2 A0629 <- 3.41 -> DT O2 M0048 : score 4.60049 : x : THR xxxx K0142 <- 4.04 -> DC xxx M0036 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx K0175 <- 2.98 -> DC xxx L0022 : score x.xxxxx >8eby_K:Putative_DNA-binding_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=XPC RELEASE FROM CORE7-XPA-DNA (AP) organism=? : x : THR xxxx K0142 <- 4.04 -> DC xxx M0036 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx K0175 <- 2.98 -> DC xxx L0022 : score x.xxxxx >8edg_C:Ribonuclease_H-like;Hermes_dimerisation_domain;beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HERMES TRANSPOSASE BOUND TO TWO LEFT-ENDS OF ITS DNA TRANSPOSON organism=? : H : ASN ND2 C0067 <- 2.75 -> DA N7 Q0031 : score 5.92922 : V : ARG CB C0063 <- 3.66 -> DT C7 Q0033 : score 1.04031 : x : GLN xxxx C0064 <- 2.77 -> DG xxx R0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0065 <- 3.94 -> DT xxx R0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0066 <- 3.27 -> DA xxx R0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0070 <- 4.31 -> DT xxx R0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0110 <- 4.07 -> DG xxx R0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0319 <- 3.46 -> DC xxx R0001 : score x.xxxxx >8edg_CGK:Ribonuclease_H-like;Hermes_dimerisation_domain;beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HERMES TRANSPOSASE BOUND TO TWO LEFT-ENDS OF ITS DNA TRANSPOSON organism=? : H : ASN ND2 C0067 <- 2.75 -> DA N7 Q0031 : score 5.92922 : H : SER OG G0066 <- 2.40 -> DA N7 Q0015 : score 4.82123 : H : SER OG G0066 <- 3.28 -> DA N6 Q0015 : score 2.97393 : H : ARG NH2 G0070 <- 3.26 -> DG O6 Q0016 : score 5.9928 : H : GLN NE2 K0064 <- 2.27 -> DT O4 Q0021 : score 5.74127 : H : ARG NH1 K0070 <- 3.32 -> DG O6 R0027 : score 5.45067 : H : ARG NH2 K0070 <- 2.89 -> DG O6 Q0019 : score 6.4812 : V : ARG CB C0063 <- 3.66 -> DT C7 Q0033 : score 1.04031 : V : ARG CZ G0318 <- 3.57 -> DT C7 R0046 : score 2.25492 : x : GLN xxxx C0064 <- 2.77 -> DG xxx R0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0065 <- 3.94 -> DT xxx R0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0066 <- 3.27 -> DA xxx R0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0070 <- 4.31 -> DT xxx R0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0110 <- 4.07 -> DG xxx R0004 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0319 <- 3.46 -> DC xxx R0001 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0064 <- 3.22 -> DA xxx Q0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0065 <- 4.01 -> DA xxx Q0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0067 <- 3.97 -> DC xxx R0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0576 <- 4.40 -> DT xxx R0046 : score x.xxxxx : x : THR xxxx K0065 <- 3.36 -> DA xxx R0025 : score x.xxxxx : x : SER xxxx K0066 <- 3.55 -> DG xxx R0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx K0067 <- 4.14 -> DC xxx Q0020 : score x.xxxxx >8ee9_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) BOUND TO D(AATAAAAGGAATGGGG) organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 F0226 <- 5.10 -> DT O4 D0027 : score 2.257 : H : ARG NE F0230 <- 2.86 -> DG O6 C0009 : score 3.89373 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.98 -> DG N7 C0009 : score 6.15477 : H : ARG NH2 F0233 <- 2.92 -> DG N7 C0008 : score 6.23138 : w : ARG NH2 F0233 <- 5.85 -> DG O6 C0008 : score 2.468 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.67 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.75 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.13 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8ef9_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF LATES CALCARIFER DNA POLYMERASE THETA POLYMERASE DOMAIN WITH LONG DUPLEX DNA, COMPLEX IA organism=? : H : LYS NZ A2350 <- 3.12 -> DC O2 E0014 : score 2.7576 : x : ARG xxxx A2382 <- 3.30 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A2389 <- 4.09 -> DA xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A2392 <- 3.59 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A2663 <- 4.33 -> DG xxx F0019 : score x.xxxxx >8efc_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF LATES CALCARIFER DNA POLYMERASE THETA POLYMERASE DOMAIN WITH LONG DUPLEX DNA, COMPLEX IA organism=? : x : ARG xxxx A2382 <- 3.27 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A2392 <- 3.81 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A2607 <- 4.47 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx >8efk_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF LATES CALCARIFER DNA POLYMERASE THETA POLYMERASE DOMAIN WITH HAIRPIN DNA organism=? : H : ASN OD1 A2392 <- 3.23 -> DG N2 E0007 : score 4.3872 : H : ARG NH1 A2599 <- 2.71 -> DT O2 E0003 : score 4.38393 : V : HIS CB A2592 <- 3.66 -> DT C7 E0002 : score 4.26951 : x : ARG xxxx A2382 <- 4.20 -> DG xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A2517 <- 2.95 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A2524 <- 3.20 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A2526 <- 3.98 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A2534 <- 4.02 -> DT xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A2590 <- 3.81 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A2591 <- 4.23 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A2595 <- 3.25 -> DT xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A2603 <- 3.98 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A2607 <- 3.74 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx >8efv_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF SINGLE HOMO-HEXAMERIC HOLLIDAY JUNCTION ATP-DEPENDENT DNA HELICASE RUVB MOTOR organism=? : H : ARG NH1 A0300 <- 2.82 -> DC O2 G0019 : score 3.6354 : H : ARG NH2 A0300 <- 3.03 -> DG N3 G0018 : score 3.44418 >8efv_ABCD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF SINGLE HOMO-HEXAMERIC HOLLIDAY JUNCTION ATP-DEPENDENT DNA HELICASE RUVB MOTOR organism=? : H : ARG NH1 A0300 <- 2.82 -> DC O2 G0019 : score 3.6354 : H : ARG NH2 A0300 <- 3.03 -> DG N3 G0018 : score 3.44418 : H : ARG NH1 C0300 <- 3.17 -> DT O2 H0010 : score 3.98774 : x : ARG xxxx D0300 <- 3.26 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx >8efy_DL:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF DOUBLE HOMO-HEXAMERIC AAA+ ATPASE RUVB MOTORS organism=? : x : ARG xxxx D0300 <- 2.77 -> DG xxx h0010 : score x.xxxxx >8eg7_IJ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF PRE-CONSENSUS ELEMENTAL PAUSED ELONGATION COMPLEX organism=? : x : TRP xxxx I0183 <- 3.30 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.73 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 3.35 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.50 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0047 <- 3.47 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 4.15 -> DA xxx B0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.22 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 4.02 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.63 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.93 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx >8eg7_J:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF PRE-CONSENSUS ELEMENTAL PAUSED ELONGATION COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx J0047 <- 3.47 -> DT xxx A0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 4.15 -> DA xxx B0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.22 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 4.02 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.63 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.93 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx >8eg8_IJ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CONSENSUS ELEMENTAL PAUSED ELONGATION COMPLEX WITH A FOLDED TL organism=? : H : ASN ND2 J0274 <- 2.82 -> DG N7 A0008 : score 4.56755 : H : ASN ND2 J0274 <- 2.62 -> DG O6 A0008 : score 5.84145 : x : ARG xxxx I0151 <- 4.32 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.43 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.12 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 4.40 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.06 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0255 <- 3.51 -> DC xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0270 <- 2.95 -> DG xxx A0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0271 <- 3.58 -> DG xxx A0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.07 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.80 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.62 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 4.10 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx J0932 <- 3.78 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx >8eg8_J:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF CONSENSUS ELEMENTAL PAUSED ELONGATION COMPLEX WITH A FOLDED TL organism=? : H : ASN ND2 J0274 <- 2.82 -> DG N7 A0008 : score 4.56755 : H : ASN ND2 J0274 <- 2.62 -> DG O6 A0008 : score 5.84145 : x : LEU xxxx J0255 <- 3.51 -> DC xxx B0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0270 <- 2.95 -> DG xxx A0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0271 <- 3.58 -> DG xxx A0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.07 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.80 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.62 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 4.10 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx J0932 <- 3.78 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx >8egb_IJ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CONSENSUS ELEMENTAL PAUSED ELONGATION COMPLEX WITH AN UNFOLDED TL organism=? : x : TRP xxxx I0183 <- 2.98 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.19 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0371 <- 3.76 -> DT xxx A0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 4.30 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.14 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0212 <- 4.47 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0255 <- 2.99 -> DC xxx B0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0259 <- 3.07 -> DC xxx B0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0262 <- 4.15 -> DC xxx B0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0270 <- 3.00 -> DG xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0271 <- 4.02 -> DG xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0297 <- 4.17 -> DG xxx A0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx J0298 <- 3.91 -> DG xxx A0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.37 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 4.11 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.54 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 4.29 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx >8egb_J:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF CONSENSUS ELEMENTAL PAUSED ELONGATION COMPLEX WITH AN UNFOLDED TL organism=? : x : THR xxxx J0212 <- 4.47 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0255 <- 2.99 -> DC xxx B0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0259 <- 3.07 -> DC xxx B0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0262 <- 4.15 -> DC xxx B0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0270 <- 3.00 -> DG xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0271 <- 4.02 -> DG xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0297 <- 4.17 -> DG xxx A0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx J0298 <- 3.91 -> DG xxx A0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.37 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 4.11 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.54 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 4.29 -> DG xxx B0016 : score x.xxxxx >8eh8_I:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIS-ELEMENTAL PAUSED ELONGATION COMPLEX WITH A FOLDED TL AND A ROTATED RH-FL (1) organism=? : x : ARG xxxx I0151 <- 3.66 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.57 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.08 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.22 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx >8eh8_IJ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIS-ELEMENTAL PAUSED ELONGATION COMPLEX WITH A FOLDED TL AND A ROTATED RH-FL (1) organism=? : x : ARG xxxx I0151 <- 3.66 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.57 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.08 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.22 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0212 <- 4.04 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0270 <- 4.20 -> DC xxx A0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0274 <- 3.68 -> DC xxx A0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0314 <- 4.19 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 3.54 -> DC xxx B0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 3.33 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.30 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.34 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.82 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx J0932 <- 4.18 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx >8eh9_IJ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIS-ELEMENTAL PAUSED ELONGATION COMPLEX WITH A FOLDED TL AND A ROTATED RH-FL (2) organism=? : H : ARG NH2 I0151 <- 2.62 -> DC O2 A0017 : score 3.83187 : x : TRP xxxx I0183 <- 3.08 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.51 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 4.37 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.24 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0212 <- 4.23 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0270 <- 4.12 -> DC xxx A0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0274 <- 3.69 -> DC xxx A0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 3.52 -> DC xxx B0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 3.36 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.38 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0787 <- 4.07 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.32 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 4.29 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx J0932 <- 3.90 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx >8eh9_J:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIS-ELEMENTAL PAUSED ELONGATION COMPLEX WITH A FOLDED TL AND A ROTATED RH-FL (2) organism=? : x : THR xxxx J0212 <- 4.23 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0270 <- 4.12 -> DC xxx A0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0274 <- 3.69 -> DC xxx A0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 3.52 -> DC xxx B0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 3.36 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.38 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0787 <- 4.07 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.32 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 4.29 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx J0932 <- 3.90 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx >8eha_I:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIS-ELEMENTAL PAUSED ELONGATION COMPLEX WITH A FOLDED TL AND A ROTATED RH-FL (OUT) organism=? : x : TRP xxxx I0183 <- 3.69 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.48 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.18 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx >8eha_IJ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIS-ELEMENTAL PAUSED ELONGATION COMPLEX WITH A FOLDED TL AND A ROTATED RH-FL (OUT) organism=? : x : TRP xxxx I0183 <- 3.69 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.48 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.18 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0212 <- 4.18 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0270 <- 3.53 -> DC xxx A0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0274 <- 3.88 -> DC xxx A0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0321 <- 4.49 -> DT xxx A0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 3.32 -> DC xxx B0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 3.36 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.40 -> DG xxx B0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.33 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 4.22 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx J0932 <- 4.03 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx >8ehf_I:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIS-ELEMENTAL PAUSED ELONGATION COMPLEX WITH AN UNFOLDED TL (1) organism=? : x : ARG xxxx I0151 <- 3.76 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.66 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.91 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 3.59 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.56 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0446 <- 3.87 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0451 <- 4.30 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 4.04 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0547 <- 3.47 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx >8ehf_IJ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIS-ELEMENTAL PAUSED ELONGATION COMPLEX WITH AN UNFOLDED TL (1) organism=? : x : ARG xxxx I0151 <- 3.76 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.66 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 3.91 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 3.59 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.56 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0446 <- 3.87 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0451 <- 4.30 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 4.04 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0547 <- 3.47 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0212 <- 4.04 -> DG xxx B0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0274 <- 3.50 -> DT xxx A0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.49 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.83 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx >8ehi_I:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIS-ELEMENTAL PAUSED ELONGATION COMPLEX WITH AN UNFOLDED TL (2) organism=? : x : ARG xxxx I0151 <- 4.20 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.57 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 4.31 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 2.37 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.79 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0446 <- 3.52 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 3.77 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0547 <- 3.29 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx >8ehi_IJ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF HIS-ELEMENTAL PAUSED ELONGATION COMPLEX WITH AN UNFOLDED TL (2) organism=? : V : ASN CG J0274 <- 3.69 -> DT C7 A0007 : score 2.72103 : x : ARG xxxx I0151 <- 4.20 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx I0183 <- 3.57 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0199 <- 4.31 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0200 <- 2.37 -> DT xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0445 <- 3.79 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0446 <- 3.52 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0538 <- 3.77 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx I0547 <- 3.29 -> DC xxx A0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.11 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.41 -> DA xxx B0016 : score x.xxxxx >8ehq_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS PAUSED TRANSCRIPTION COMPLEX WITH BACILLUS SUBTILIS NUSG organism=? : x : GLU xxxx C0466 <- 3.30 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 4.18 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx >8ehq_CDG: title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS PAUSED TRANSCRIPTION COMPLEX WITH BACILLUS SUBTILIS NUSG organism=? : x : GLU xxxx C0466 <- 3.30 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 4.18 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0330 <- 4.35 -> DC xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0389 <- 4.18 -> DT xxx N0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0394 <- 4.39 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0501 <- 3.99 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0502 <- 4.15 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0867 <- 3.72 -> DC xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0868 <- 3.74 -> DC xxx T0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0011 <- 3.10 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx G0073 <- 2.97 -> DT xxx N0021 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx G0076 <- 3.40 -> DT xxx N0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0077 <- 3.91 -> DT xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0080 <- 3.21 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0081 <- 3.62 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0086 <- 4.16 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0097 <- 3.04 -> DT xxx N0021 : score x.xxxxx >8ej3_CDG: title=M. TUBERCULOSIS RNAP PAUSE ESCAPED COMPLEX WITH BACILLUS SUBTILIS NUSG AND GMPCPP organism=? : x : TRP xxxx C0211 <- 3.21 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0228 <- 2.97 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0466 <- 3.34 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0330 <- 3.63 -> DC xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0345 <- 4.44 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0389 <- 4.25 -> DG xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0501 <- 4.13 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0502 <- 4.29 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0867 <- 3.64 -> DC xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0868 <- 4.20 -> DC xxx T0014 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx G0076 <- 4.38 -> DT xxx N0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0080 <- 3.58 -> DT xxx N0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0086 <- 4.17 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx >8ej3_G:N-utilization_substance_G_protein_NusG,_N-terminal_domain; title=M. TUBERCULOSIS RNAP PAUSE ESCAPED COMPLEX WITH BACILLUS SUBTILIS NUSG AND GMPCPP organism=? : x : TRP xxxx G0076 <- 4.38 -> DT xxx N0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0080 <- 3.58 -> DT xxx N0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0086 <- 4.17 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx >8ej6_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) BOUND TO D(AATAAGAGGAATGGGG) organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 F0226 <- 5.27 -> DT O4 D0027 : score 2.257 : H : ARG NE F0230 <- 2.87 -> DG O6 C0009 : score 3.88585 : H : ARG NH2 F0230 <- 3.00 -> DG N7 C0009 : score 6.12923 : H : ARG NH2 F0233 <- 2.95 -> DG N7 C0008 : score 6.19308 : w : ARG NH2 F0233 <- 5.87 -> DG O6 C0008 : score 2.468 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.66 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.81 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.15 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8ej8_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) Q226E MUTANT BOUND TO D(AATAAAAGGAAGTGGG) organism=Homo sapiens : w : GLU OE2 F0226 <- 6.24 -> DA N6 C0007 : score 2.785 : w : GLU OE2 F0226 <- 5.15 -> DT O4 D0027 : score 2.279 : H : ARG NE F0230 <- 2.90 -> DG O6 C0009 : score 3.86221 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.95 -> DG N7 C0009 : score 6.19308 : H : ARG NH2 F0233 <- 2.99 -> DG N7 C0008 : score 6.142 : w : ARG NH2 F0233 <- 5.83 -> DG O6 C0008 : score 2.468 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.58 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.76 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.16 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8ejo_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HOMEODOMAIN OF PLATYPUS SDUX IN COMPLEX WITH DNA organism=Ornithorhynchus anatinus : H : ARG NH1 A0022 <- 2.65 -> DT O2 D0013 : score 4.4356 : H : ARG NH2 A0022 <- 2.95 -> DT O2 D0013 : score 4.10633 : H : ARG NH2 A0025 <- 2.70 -> DT O2 C0004 : score 4.318 : H : ASN OD1 A0071 <- 3.37 -> DA N6 C0006 : score 5.33531 : H : ASN ND2 A0071 <- 3.10 -> DA N7 C0006 : score 5.51828 : H : ARG NH1 B0022 <- 2.77 -> DC O2 C0013 : score 3.6719 : H : ARG NH2 B0025 <- 2.45 -> DT O2 D0004 : score 4.52967 : H : ASN ND2 B0071 <- 3.34 -> DA N7 D0006 : score 5.2365 : H : ARG NH1 B0075 <- 3.08 -> DG N7 D0005 : score 5.7112 : H : ARG NH2 B0075 <- 2.76 -> DG O6 D0005 : score 6.6528 : V : VAL CG1 A0067 <- 3.79 -> DT C7 C0007 : score 6.07566 : x : GLN xxxx A0070 <- 3.42 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0067 <- 3.97 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0070 <- 3.56 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >8ejo_B:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HOMEODOMAIN OF PLATYPUS SDUX IN COMPLEX WITH DNA organism=Ornithorhynchus anatinus : H : ARG NH1 B0022 <- 2.77 -> DC O2 C0013 : score 3.6719 : H : ARG NH2 B0025 <- 2.45 -> DT O2 D0004 : score 4.52967 : H : ASN ND2 B0071 <- 3.34 -> DA N7 D0006 : score 5.2365 : H : ARG NH1 B0075 <- 3.08 -> DG N7 D0005 : score 5.7112 : H : ARG NH2 B0075 <- 2.76 -> DG O6 D0005 : score 6.6528 : x : VAL xxxx B0067 <- 3.97 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0070 <- 3.56 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >8ejp_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HOMEODOMAIN OF PLATYPUS SDUX IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING 5-BROMOURACIL organism=Ornithorhynchus anatinus : H : ARG NH1 A0022 <- 2.63 -> DT O2 D0013 : score 4.45283 : H : ARG NH2 A0025 <- 2.64 -> DT O2 C0004 : score 4.3688 : H : ASN OD1 A0071 <- 3.28 -> DA N6 C0006 : score 5.4437 : H : ASN ND2 A0071 <- 3.30 -> DA N7 C0006 : score 5.28346 : V : VAL CG1 A0067 <- 3.89 -> DT C7 C0007 : score 5.92415 : x : GLN xxxx A0070 <- 3.34 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx >8ejp_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE HOMEODOMAIN OF PLATYPUS SDUX IN COMPLEX WITH DNA CONTAINING 5-BROMOURACIL organism=Ornithorhynchus anatinus : H : ARG NH1 A0022 <- 2.63 -> DT O2 D0013 : score 4.45283 : H : ARG NH2 A0025 <- 2.64 -> DT O2 C0004 : score 4.3688 : H : ASN OD1 A0071 <- 3.28 -> DA N6 C0006 : score 5.4437 : H : ASN ND2 A0071 <- 3.30 -> DA N7 C0006 : score 5.28346 : H : ARG NH1 B0022 <- 2.79 -> DC O2 C0013 : score 3.6573 : H : ARG NH2 B0025 <- 2.33 -> DT O2 D0004 : score 4.63127 : H : ASN OD1 B0071 <- 3.35 -> DA N6 D0006 : score 5.3594 : H : ASN ND2 B0071 <- 3.37 -> DA N7 D0006 : score 5.20127 : H : ARG NH1 B0075 <- 3.18 -> DG N7 D0005 : score 5.5902 : H : ARG NH2 B0075 <- 3.07 -> DG O6 D0005 : score 6.2436 : V : VAL CG1 B0067 <- 3.82 -> DT C7 D0007 : score 6.03021 : V : VAL CG1 A0067 <- 3.89 -> DT C7 C0007 : score 5.92415 : x : GLN xxxx A0070 <- 3.34 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0070 <- 3.49 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >8ek3_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) Q226E MUTANT BOUND TO D(AATAAGCGGAATGGGG) organism=Homo sapiens : w : GLU OE2 F0226 <- 5.11 -> DG O6 D0027 : score 2.892 : H : ARG NE F0230 <- 2.83 -> DG O6 C0009 : score 3.91738 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.96 -> DG N7 C0009 : score 6.18031 : H : ARG NH2 F0233 <- 2.95 -> DG N7 C0008 : score 6.19308 : w : ARG NH2 F0233 <- 5.86 -> DG O6 C0008 : score 2.468 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.62 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.83 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.21 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8ek8_E:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) BOUND TO D(AATAAAAGGAGAAGGG) organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 E0226 <- 3.21 -> DG N7 A0006 : score 3.85442 : H : GLN NE2 E0226 <- 3.02 -> DG O6 A0007 : score 5.5497 : H : ARG NE E0230 <- 2.93 -> DG O6 A0009 : score 3.83856 : H : ARG NH2 E0230 <- 2.98 -> DG N7 A0009 : score 6.15477 : H : ARG NH2 E0233 <- 2.98 -> DA N7 A0008 : score 1.61161 : x : LYS xxxx E0227 <- 3.86 -> DT xxx B0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0231 <- 4.20 -> DT xxx B0023 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0234 <- 4.05 -> DT xxx B0023 : score x.xxxxx >8ek8_EF:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) BOUND TO D(AATAAAAGGAGAAGGG) organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 E0226 <- 3.21 -> DG N7 A0006 : score 3.85442 : H : GLN NE2 E0226 <- 3.02 -> DG O6 A0007 : score 5.5497 : H : ARG NE E0230 <- 2.93 -> DG O6 A0009 : score 3.83856 : H : ARG NH2 E0230 <- 2.98 -> DG N7 A0009 : score 6.15477 : H : ARG NH2 E0233 <- 2.98 -> DA N7 A0008 : score 1.61161 : H : ARG NE F0230 <- 2.83 -> DG O6 C0009 : score 3.91738 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.99 -> DG N7 C0009 : score 6.142 : H : ARG NH2 F0233 <- 3.00 -> DA N7 C0008 : score 1.60492 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.74 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.22 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0234 <- 3.93 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0227 <- 3.86 -> DT xxx B0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0231 <- 4.20 -> DT xxx B0023 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0234 <- 4.05 -> DT xxx B0023 : score x.xxxxx >8ekj_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) BOUND TO D(AATAAATGGAAGTGGG) organism=Homo sapiens : w : GLN OE1 F0226 <- 5.71 -> DG O6 C0008 : score 2.87 : w : GLN OE1 F0226 <- 5.96 -> DA N6 D0027 : score 3.392 : H : ARG NE F0230 <- 2.92 -> DG O6 C0009 : score 3.84644 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.97 -> DG N7 C0009 : score 6.16754 : w : ARG NE F0233 <- 5.59 -> DG N7 C0008 : score 1.593 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.44 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.72 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.14 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8eku_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) BOUND TO D(AATAAATGGAATGGGG) organism=Homo sapiens : w : GLN OE1 F0226 <- 6.50 -> DA N6 C0006 : score 3.392 : w : GLN NE2 F0226 <- 5.69 -> DG O6 C0008 : score 2.87 : w : GLN NE2 F0226 <- 5.84 -> DA N6 D0027 : score 2.804 : H : ARG NE F0230 <- 2.87 -> DG O6 C0009 : score 3.88585 : H : ARG NH2 F0230 <- 3.03 -> DG N7 C0009 : score 6.09092 : w : ARG NE F0233 <- 5.72 -> DG N7 C0008 : score 1.593 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.61 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.79 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.14 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8ekv_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) BOUND TO D(AATAAGCGGATGTGGG) organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 F0226 <- 5.92 -> DG O6 C0008 : score 2.87 : w : GLN NE2 F0226 <- 5.26 -> DG O6 D0027 : score 2.87 : H : ARG NE F0230 <- 2.78 -> DG O6 C0009 : score 3.95679 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.84 -> DG N7 C0009 : score 6.33354 : H : ARG NH2 F0233 <- 2.95 -> DG N7 C0008 : score 6.19308 A : w : ASN OD1 F0234 <- 5.08 -> DA N7 D0023 : score 2.277 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.93 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx >8ekz_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) BOUND TO D(AATAAGGAGAAGTAGG) organism=Homo sapiens : H : ARG NE F0230 <- 2.87 -> DG O6 C0009 : score 3.88585 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.97 -> DG N7 C0009 : score 6.16754 : H : ARG NH2 F0233 <- 2.98 -> DA N7 C0008 : score 1.61161 : w : ARG NH1 F0233 <- 5.75 -> DG N7 C0007 : score 2.063 : w : ARG NH2 F0233 <- 6.25 -> DA N6 C0008 : score 1.997 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.62 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.78 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.22 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8em9_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) BOUND TO D(AATAGGAGAAGTAGGG) organism=Homo sapiens : H : ARG NE F0230 <- 2.68 -> DG O6 C0009 : score 4.03561 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.68 -> DG N7 C0009 : score 6.53785 : H : ARG NH2 F0233 <- 3.01 -> DA N7 C0008 : score 1.60158 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.92 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.24 -> DT xxx D0025 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0234 <- 3.92 -> DT xxx D0025 : score x.xxxxx >8emd_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) Q226E MUTANT BOUND TO D(AATAAGCGGAAGTGGG) organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 F0226 <- 2.92 -> DC N4 C0007 : score 5.62952 : w : GLU OE1 F0226 <- 5.83 -> DG O6 C0008 : score 2.669 : w : GLU OE1 F0226 <- 5.21 -> DG N7 C0006 : score 1.976 : w : GLU OE2 F0226 <- 5.55 -> DG O6 C0006 : score 2.892 : w : GLU OE2 F0226 <- 5.25 -> DG O6 D0027 : score 2.892 : H : ARG NE F0230 <- 2.88 -> DG O6 C0009 : score 3.87797 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.95 -> DG N7 C0009 : score 6.19308 : H : ARG NH2 F0233 <- 2.97 -> DG N7 C0008 : score 6.16754 : w : ARG NH2 F0233 <- 5.83 -> DG O6 C0008 : score 2.468 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.55 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.75 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.23 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8emh_J:Ribosomal_protein_S5_domain_2-like;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYOEM CHARACTERIZATION OF A UNIQUE AAA+ BRXL PHAGE RESTRICTION FACTOR organism=? : x : SER xxxx J0263 <- 3.84 -> DT xxx O0062 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0287 <- 3.87 -> DC xxx P0020 : score x.xxxxx >8eml_A:Homeodomain-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF GSX2 HOMEODOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0207 <- 2.78 -> DT O2 D0006 : score 4.32364 : w : GLN NE2 A0252 <- 5.82 -> DT O4 D0010 : score 2.257 : H : ASN OD1 A0253 <- 2.81 -> DA N6 D0008 : score 6.00975 : H : ASN ND2 A0253 <- 3.02 -> DA N7 D0008 : score 5.61221 : V : GLN CG A0252 <- 3.66 -> DT C7 C0006 : score 3.36932 : x : ILE xxxx A0249 <- 3.67 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx >8eng_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) BOUND TO D(AATAAGCGGAAGTGGG) WITH HEMI-METHYLATED CPG (FORWARD STRAND) organism=Homo sapiens : w : GLN OE1 F0226 <- 5.65 -> DG O6 C0008 : score 2.87 : w : GLN OE1 F0226 <- 5.57 -> DG O6 D0027 : score 2.87 : H : ARG NE F0230 <- 2.90 -> DG O6 C0009 : score 3.86221 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.95 -> DG N7 C0009 : score 6.19308 : w : ARG NE F0233 <- 5.78 -> DG N7 C0008 : score 1.593 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.52 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.74 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.14 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8eo1_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) BOUND TO D(AATAAGCGGAAGTGGG) WITH HEMI-METHYLATED CPG (REVERSE STRAND) organism=Homo sapiens : w : GLN OE1 F0226 <- 5.23 -> DG O6 D0027 : score 2.87 : H : ARG NE F0230 <- 2.89 -> DG O6 C0009 : score 3.87009 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.93 -> DG N7 C0009 : score 6.21862 : H : ARG NH2 F0233 <- 2.95 -> DG N7 C0008 : score 6.19308 : w : ARG NH2 F0233 <- 5.77 -> DG O6 C0008 : score 2.468 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.59 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.75 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.19 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8eo4_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) BOUND TO D(AATAAGCGGAAGTGGG) WITH DI- METHYLATED CPG SITES organism=Homo sapiens : w : GLN OE1 F0226 <- 6.06 -> DG O6 D0027 : score 2.87 : H : ARG NE F0230 <- 2.91 -> DG O6 C0009 : score 3.85432 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.96 -> DG N7 C0009 : score 6.18031 : w : ARG NE F0233 <- 5.75 -> DG N7 C0008 : score 1.593 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.56 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.74 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.11 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8eoe_CD: title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX WITH BACILLUS SUBTILIS NUSG (EC_LG) organism=? : x : TRP xxxx C0211 <- 3.58 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0228 <- 2.83 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0466 <- 3.39 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0330 <- 3.62 -> DC xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0331 <- 4.14 -> DC xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0336 <- 4.49 -> DC xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0372 <- 3.37 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0389 <- 3.82 -> DA xxx N0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0427 <- 4.43 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0501 <- 4.35 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0502 <- 3.98 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0867 <- 3.65 -> DC xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0868 <- 3.64 -> DC xxx T0014 : score x.xxxxx >8eoe_G:N-utilization_substance_G_protein_NusG,_N-terminal_domain; title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX WITH BACILLUS SUBTILIS NUSG (EC_LG) organism=? : x : ARG xxxx G0080 <- 3.99 -> DA xxx N0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0086 <- 3.45 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx >8eof_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX WITH BACILLUS SUBTILIS NUSG (EC_PG) organism=? : x : TRP xxxx C0211 <- 3.48 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0228 <- 2.66 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0466 <- 3.31 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 4.33 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx >8eof_CDG: title=MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX WITH BACILLUS SUBTILIS NUSG (EC_PG) organism=? : H : ARG NH1 G0080 <- 3.37 -> DA N7 N0019 : score 2.26839 : x : TRP xxxx C0211 <- 3.48 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0228 <- 2.66 -> DC xxx N0024 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0466 <- 3.31 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 4.33 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0330 <- 4.19 -> DC xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0372 <- 3.13 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0389 <- 2.77 -> DA xxx N0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0501 <- 4.08 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0502 <- 4.05 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0867 <- 3.79 -> DC xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0868 <- 3.75 -> DC xxx T0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0086 <- 3.78 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx >8eos_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=M. TUBERCULOSIS RNAP ELONGATION COMPLEX WITH NUSG AND CMPCPP organism=? : x : ARG xxxx C0181 <- 3.62 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0211 <- 3.81 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0228 <- 3.92 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0370 <- 3.95 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0371 <- 3.97 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0376 <- 4.22 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0463 <- 3.53 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.63 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0472 <- 4.28 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx >8eos_CDG: title=M. TUBERCULOSIS RNAP ELONGATION COMPLEX WITH NUSG AND CMPCPP organism=? : x : ARG xxxx C0181 <- 3.62 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0211 <- 3.81 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0228 <- 3.92 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0370 <- 3.95 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0371 <- 3.97 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0376 <- 4.22 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0463 <- 3.53 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.63 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0472 <- 4.28 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0330 <- 3.92 -> DC xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0334 <- 3.20 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0345 <- 3.60 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0372 <- 3.22 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0373 <- 3.10 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0389 <- 3.60 -> DA xxx N0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0427 <- 4.48 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0502 <- 4.06 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0867 <- 3.61 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0868 <- 4.33 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D1012 <- 3.98 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0053 <- 4.06 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0130 <- 4.07 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx >8eot_CDG: title=M. TUBERCULOSIS RNAP ELONGATION COMPLEX WITH NUSG organism=? : x : ARG xxxx D0372 <- 3.60 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0373 <- 3.59 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0389 <- 3.05 -> DA xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0427 <- 4.27 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0502 <- 3.62 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0867 <- 3.45 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0868 <- 4.31 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0053 <- 4.47 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0181 <- 3.59 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0211 <- 3.71 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0228 <- 3.61 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0370 <- 4.41 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0371 <- 3.53 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0376 <- 4.20 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0463 <- 3.40 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 3.23 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0472 <- 4.22 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx >8eot_G:N-utilization_substance_G_protein_NusG,_N-terminal_domain; title=M. TUBERCULOSIS RNAP ELONGATION COMPLEX WITH NUSG organism=? : x : HIS xxxx G0053 <- 4.47 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx >8epx_D: title=TYPE IIS RESTRICTION ENDONUCLEASE PAQCI, DNA BOUND organism=? : H : HIS NE2 D0181 <- 3.15 -> DA N7 K0019 : score 3.94892 : H : ARG NE D0183 <- 3.41 -> DG O6 K0020 : score 3.46022 : H : ARG NH2 D0183 <- 2.33 -> DG N7 K0020 : score 6.98477 : H : GLU OE2 D0184 <- 3.23 -> DA N6 L0029 : score 2.78887 : H : ARG NH2 D0295 <- 3.18 -> DA N3 L0029 : score 2.99352 : H : SER OG D0343 <- 2.95 -> DG O6 L0033 : score 3.96829 : H : ASP OD1 D0347 <- 2.68 -> DC N4 K0018 : score 5.47315 : H : ARG NH2 D0462 <- 3.00 -> DT O2 L0032 : score 4.064 : H : ARG NH2 D0466 <- 2.86 -> DG N7 K0023 : score 6.308 : H : ARG NH2 D0466 <- 2.53 -> DG O6 K0023 : score 6.9564 : H : ARG NH1 D0468 <- 3.26 -> DG N7 K0021 : score 5.4934 : H : ARG NH1 D0468 <- 2.53 -> DG O6 K0021 : score 6.41183 : H : GLN NE2 D0472 <- 3.21 -> DT O4 K0022 : score 4.76536 : x : HIS xxxx D0082 <- 4.47 -> DT xxx K0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0335 <- 3.26 -> DT xxx L0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0340 <- 3.72 -> DT xxx L0032 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0342 <- 3.34 -> DC xxx K0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0346 <- 3.15 -> DG xxx K0017 : score x.xxxxx >8eqg_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) BOUND TO D(AATAAA(DU)GGAAGTGGG) organism=Homo sapiens : w : GLN OE1 F0226 <- 5.93 -> DC N4 D0026 : score 3.488 : w : GLN NE2 F0226 <- 5.81 -> DA N6 D0027 : score 2.804 : H : ARG NE F0230 <- 2.85 -> DG O6 C0009 : score 3.90162 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.94 -> DG N7 C0009 : score 6.20585 : H : ARG NH2 F0233 <- 2.92 -> DG N7 C0008 : score 6.23138 : w : ARG NH2 F0233 <- 5.85 -> DG O6 C0008 : score 2.468 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.53 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.75 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.14 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8eqk_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) BOUND TO D(AATAACCGGAAGTGGG) organism=Homo sapiens : w : GLN OE1 F0226 <- 6.44 -> DC N4 C0006 : score 3.488 : w : GLN NE2 F0226 <- 5.78 -> DG O6 C0008 : score 2.87 : w : GLN NE2 F0226 <- 5.98 -> DG N7 D0027 : score 2.582 : H : ARG NE F0230 <- 2.90 -> DG O6 C0009 : score 3.86221 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.95 -> DG N7 C0009 : score 6.19308 : H : ARG NH2 F0233 <- 2.93 -> DG N7 C0008 : score 6.21862 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.56 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.75 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.16 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8eql_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) Q226E MUTANT BOUND TO D(AATAACCGGAAGTGGG) organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 F0226 <- 3.14 -> DC N4 C0006 : score 5.37573 : H : GLU OE2 F0226 <- 2.87 -> DC N4 C0007 : score 5.19167 : w : GLU OE2 F0226 <- 5.63 -> DG O6 C0008 : score 2.892 : H : ARG NE F0230 <- 2.90 -> DG O6 C0009 : score 3.86221 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.98 -> DG N7 C0009 : score 6.15477 : H : ARG NH2 F0233 <- 2.97 -> DG N7 C0008 : score 6.16754 : w : ARG NH2 F0233 <- 5.78 -> DG O6 C0008 : score 2.468 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.49 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.80 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.21 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8ett_ABCDEF:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CLASS1 OF THE INO80-HEXASOME COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 E0040 <- 2.58 -> DG N3 I0009 : score 3.18688 : x : ARG xxxx B0045 <- 3.80 -> DC xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.46 -> DC xxx J0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.97 -> DG xxx I-068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0078 <- 3.22 -> DG xxx I0028 : score x.xxxxx >8ett_B:Histone-fold; title=CLASS1 OF THE INO80-HEXASOME COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx B0045 <- 3.80 -> DC xxx J0007 : score x.xxxxx >8etv_ABCDEF:Histone-fold; title=CLASS2 OF THE INO80-HEXASOME COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx C0042 <- 4.18 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.57 -> DG xxx I0009 : score x.xxxxx >8eu2_KLMNOP:Histone-fold; title=CLASS3 OF THE INO80-HEXASOME COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx M0042 <- 3.85 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0040 <- 2.88 -> DG xxx I0009 : score x.xxxxx >8eue_ABCDEFHK:Histone-fold; title=CLASS1 OF THE INO80-NUCLEOSOME COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 E0040 <- 2.67 -> DA N3 I0009 : score 3.32398 : x : ARG xxxx A0049 <- 3.92 -> DT xxx J-068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0078 <- 3.90 -> DC xxx J0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 3.64 -> DG xxx J0058 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.91 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0116 <- 3.81 -> DG xxx J-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.10 -> DT xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0035 <- 4.37 -> DT xxx I0039 : score x.xxxxx >8eue_E:Histone-fold; title=CLASS1 OF THE INO80-NUCLEOSOME COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 E0040 <- 2.67 -> DA N3 I0009 : score 3.32398 : x : LEU xxxx E0065 <- 3.91 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0116 <- 3.81 -> DG xxx J-003 : score x.xxxxx >8euj_HMOabfhk:Histone-fold; title=CLASS2 OF THE INO80-NUCLEOSOME COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 h0045 <- 2.89 -> DC O2 I0006 : score 3.63214 : x : ARG xxxx H0030 <- 4.23 -> DA xxx J-047 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx M0041 <- 3.24 -> DC xxx I-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0083 <- 3.55 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0045 <- 4.14 -> DG xxx I-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx f0040 <- 3.77 -> DA xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx f0042 <- 3.24 -> DG xxx J0071 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx f0065 <- 3.64 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx f0083 <- 3.15 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx f0116 <- 3.68 -> DG xxx J-003 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx h0032 <- 4.22 -> DT xxx J-012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx k0042 <- 4.38 -> DA xxx I0038 : score x.xxxxx >8euj_f:Histone-fold; title=CLASS2 OF THE INO80-NUCLEOSOME COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx f0040 <- 3.77 -> DA xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx f0042 <- 3.24 -> DG xxx J0071 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx f0065 <- 3.64 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx f0083 <- 3.15 -> DC xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx f0116 <- 3.68 -> DG xxx J-003 : score x.xxxxx >8eve_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTION COMPLEX organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0382 <- 3.05 -> DG O6 P0004 : score 5.77917 : H : ARG NH2 A0382 <- 2.87 -> DG N7 P0004 : score 6.29523 : x : SER xxxx A0322 <- 3.80 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.61 -> DC xxx P0006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0421 <- 4.08 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0423 <- 4.38 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx >8evf_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=HUMAN DNA POLYMERASE ETA EXTENSION COMPLEX WITH AN INCOMING DCTP organism=Homo sapiens : x : GLN xxxx A0038 <- 3.42 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0048 <- 3.80 -> DG xxx T0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0322 <- 3.94 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.48 -> DG xxx P0004 : score x.xxxxx >8evg_ABCDEFGH: title=162BP CX3CR1 NUCLEOSOME (FURTHER CLASSIFIED WITH BETTER NUCLEOSOME END) organism=? : H : ARG NH1 E0040 <- 2.48 -> DT O2 I0088 : score 4.58202 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.47 -> DG xxx I0148 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 3.44 -> DG xxx J0093 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.04 -> DT xxx J0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.68 -> DA xxx I0055 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.01 -> DT xxx J0091 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.34 -> DG xxx J0122 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.43 -> DC xxx J0141 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.74 -> DG xxx J0132 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.21 -> DC xxx J0153 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.75 -> DC xxx I0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.49 -> DA xxx I0097 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.32 -> DT xxx J0060 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 3.74 -> DG xxx I0085 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.40 -> DG xxx I0117 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.17 -> DG xxx I0136 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.86 -> DG xxx I0127 : score x.xxxxx >8evg_H:Histone-fold; title=162BP CX3CR1 NUCLEOSOME (FURTHER CLASSIFIED WITH BETTER NUCLEOSOME END) organism=? : x : ARG xxxx H0030 <- 3.86 -> DG xxx I0127 : score x.xxxxx >8evh_H:Histone-fold; title=CX3CR1 NUCLEOSOME AND WILD TYPE PU.1 COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx H0030 <- 4.41 -> DT xxx I0049 : score x.xxxxx >8evi_C:Histone-fold; title=CX3CR1 NUCLEOSOME AND PU.1 COMPLEX CONTAINING DISULFIDE BOND MUTATIONS organism=? : x : ARG xxxx C0042 <- 3.92 -> DC xxx I0134 : score x.xxxxx >8evj_E:Histone-fold; title=CX3CR1 NUCLEOSOME BOUND PU.1 AND C/EBPA organism=? : H : ARG NH2 E0040 <- 2.55 -> DA N3 J0076 : score 3.40173 : x : LEU xxxx E0065 <- 3.73 -> DT xxx J0085 : score x.xxxxx >8ex9_A: title=ISDRA2 TNPB IN COMPLEX WITH RERNA AND COGNATE DNA, CONFORMATION 2 (RUVC DOMAIN UNRESOLVED) organism=? : H : LYS NZ A0076 <- 2.51 -> DG O6 C-002 : score 6.11605 : H : ASN ND2 A0124 <- 3.10 -> DT O4 C-004 : score 4.96754 : V : THR CB A0123 <- 3.78 -> DT C7 D0001 : score 3.54378 : V : PHE CZ A0077 <- 3.64 -> DT C7 C-003 : score 7.39947 : V : SER CB A0056 <- 3.83 -> DT C7 C0000 : score 3.1078 : x : TYR xxxx A0052 <- 3.62 -> DT xxx C0000 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0080 <- 3.04 -> DT xxx C0000 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0084 <- 4.20 -> DA xxx D0000 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0121 <- 3.09 -> DA xxx D0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0126 <- 4.42 -> DT xxx C-004 : score x.xxxxx >8exa_A: title=ISDRA2 TNPB IN COMPLEX WITH RERNA AND COGNATE DNA, CONFORMATION 1 (RUVC DOMAIN RESOLVED) organism=? : H : LYS NZ A0076 <- 2.49 -> DG O6 C-002 : score 6.13918 : H : GLN OE1 A0080 <- 3.21 -> DA N6 C-001 : score 5.55625 : V : THR CG2 A0123 <- 3.54 -> DT C7 D0001 : score 4.51232 : x : TYR xxxx A0052 <- 3.11 -> DT xxx C0000 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0056 <- 3.61 -> DT xxx C0000 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0077 <- 3.42 -> DT xxx C-003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0084 <- 3.72 -> DA xxx D0000 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0121 <- 3.66 -> DA xxx D0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0124 <- 3.82 -> DT xxx C-004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0126 <- 4.28 -> DT xxx C-004 : score x.xxxxx >8exy_CDG: title=M. TUBERCULOSIS RNAP PAUSED COMPLEX WITH B. SUBTILIS NUSG AND GMPCPP organism=? : x : GLU xxxx C0466 <- 3.16 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0467 <- 4.19 -> DC xxx N0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0330 <- 4.23 -> DC xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0336 <- 4.47 -> DC xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0389 <- 3.90 -> DT xxx N0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0501 <- 4.05 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0502 <- 4.06 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0867 <- 3.67 -> DC xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0868 <- 4.30 -> DC xxx T0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0011 <- 3.14 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx G0073 <- 3.21 -> DT xxx N0021 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx G0076 <- 3.18 -> DT xxx N0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0077 <- 3.05 -> DT xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0080 <- 3.73 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0081 <- 3.61 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0086 <- 3.73 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx >8exy_G:N-utilization_substance_G_protein_NusG,_N-terminal_domain; title=M. TUBERCULOSIS RNAP PAUSED COMPLEX WITH B. SUBTILIS NUSG AND GMPCPP organism=? : x : TYR xxxx G0011 <- 3.14 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx G0073 <- 3.21 -> DT xxx N0021 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx G0076 <- 3.18 -> DT xxx N0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0077 <- 3.05 -> DT xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0080 <- 3.73 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0081 <- 3.61 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0086 <- 3.73 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx >8eza_ABC: title=NHEJ LONG-RANGE COMPLEX WITH PAXX organism=? : x : ARG xxxx A0254 <- 4.13 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0403 <- 4.28 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0400 <- 4.48 -> DT xxx E0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0264 <- 4.15 -> DG xxx D0023 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C2736 <- 3.05 -> DA xxx D0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C2739 <- 4.27 -> DC xxx D0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C2740 <- 4.00 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C2743 <- 3.28 -> DC xxx D0030 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C2744 <- 3.86 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx >8eza_B:SPOC_domain-like;vWA-like; title=NHEJ LONG-RANGE COMPLEX WITH PAXX organism=? : x : ARG xxxx B0400 <- 4.48 -> DT xxx E0024 : score x.xxxxx >8eza_JKL: title=NHEJ LONG-RANGE COMPLEX WITH PAXX organism=? : x : ARG xxxx J0254 <- 4.13 -> DA xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0403 <- 4.28 -> DG xxx M0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0400 <- 4.48 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0264 <- 4.15 -> DG xxx M0023 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L2736 <- 3.05 -> DA xxx M0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx L2739 <- 4.27 -> DC xxx M0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx L2740 <- 4.00 -> DG xxx N0001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L2743 <- 3.28 -> DC xxx M0030 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx L2744 <- 3.86 -> DG xxx N0001 : score x.xxxxx >8ezb_ABC: title=NHEJ LONG-RANGE COMPLEX WITH ATP organism=? : x : ARG xxxx A0254 <- 4.13 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0403 <- 4.28 -> DG xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0400 <- 4.48 -> DT xxx E0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0264 <- 4.41 -> DG xxx D0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0304 <- 3.84 -> DA xxx D0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0306 <- 3.65 -> DG xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0355 <- 3.74 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0404 <- 3.52 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx >8ezb_B:SPOC_domain-like;vWA-like; title=NHEJ LONG-RANGE COMPLEX WITH ATP organism=? : x : ARG xxxx B0400 <- 4.48 -> DT xxx E0024 : score x.xxxxx >8ezb_JKL: title=NHEJ LONG-RANGE COMPLEX WITH ATP organism=? : x : ARG xxxx J0254 <- 4.13 -> DA xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0403 <- 4.28 -> DG xxx M0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0400 <- 4.48 -> DT xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0264 <- 4.05 -> DG xxx M0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0304 <- 3.56 -> DA xxx M0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx L0306 <- 3.65 -> DG xxx N0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx L0355 <- 3.74 -> DG xxx N0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx L0404 <- 3.52 -> DG xxx N0001 : score x.xxxxx >8f1j_IJ: title=SIGN RNA POLYMERASE EARLY-MELTED INTERMEDIATE BOUND TO MISMATCH DNA FRAGMENT DHSU36MM2 (-12A) organism=? : x : ARG xxxx I0542 <- 3.22 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0212 <- 4.26 -> DT xxx D0057 : score x.xxxxx >8f1j_J:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=SIGN RNA POLYMERASE EARLY-MELTED INTERMEDIATE BOUND TO MISMATCH DNA FRAGMENT DHSU36MM2 (-12A) organism=? : x : THR xxxx J0212 <- 4.26 -> DT xxx D0057 : score x.xxxxx >8f1k_IJ: title=SIGN RNA POLYMERASE EARLY-MELTED INTERMEDIATE BOUND TO FULL DUPLEX DNA FRAGMENT DHSU36 (-12T) organism=? : x : ARG xxxx I0542 <- 3.04 -> DA xxx C0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0212 <- 4.18 -> DT xxx D0057 : score x.xxxxx >8f1k_J:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=SIGN RNA POLYMERASE EARLY-MELTED INTERMEDIATE BOUND TO FULL DUPLEX DNA FRAGMENT DHSU36 (-12T) organism=? : x : THR xxxx J0212 <- 4.18 -> DT xxx D0057 : score x.xxxxx >8f3c_I:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM CONSENSUS STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI QUE-PEC (PAUSED ELONGATION COMPLEX) RNA POLYMERASE MINUS PREQ1 LIGAND organism=? : x : LYS xxxx I0163 <- 3.23 -> DA xxx A0027 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0541 <- 3.15 -> DG xxx A0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.83 -> DG xxx A0025 : score x.xxxxx >8f3c_IJ: title=CRYO-EM CONSENSUS STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI QUE-PEC (PAUSED ELONGATION COMPLEX) RNA POLYMERASE MINUS PREQ1 LIGAND organism=? : H : THR OG1 J0790 <- 3.40 -> DC N3 B0015 : score 1.07292 : x : LYS xxxx I0163 <- 3.23 -> DA xxx A0027 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0541 <- 3.15 -> DG xxx A0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.83 -> DG xxx A0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0040 <- 4.00 -> DC xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0047 <- 3.04 -> DG xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 4.44 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.01 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 4.49 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.60 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx >8f69_A:Class_II_aaRS_and_biotin_synthetases;Class_II_aaRS_ABD-related; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MURINE POLG2 DIMER BOUND TO DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0302 <- 2.75 -> DT O2 D0005 : score 4.34947 >8f69_AB:Class_II_aaRS_and_biotin_synthetases;Class_II_aaRS_ABD-related; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MURINE POLG2 DIMER BOUND TO DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0302 <- 2.75 -> DT O2 D0005 : score 4.34947 >8f6b_ACD:Class_II_aaRS_and_biotin_synthetases;Class_II_aaRS_ABD-related; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MURINE POLG2 HEXAMER BOUND TO DNA organism=? : H : LYS NZ C0363 <- 2.79 -> DG N7 J0004 : score 5.39667 : H : LYS NZ C0363 <- 3.16 -> DG O6 J0004 : score 5.36455 : x : HIS xxxx C0396 <- 3.20 -> DC xxx I0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0302 <- 3.29 -> DC xxx I0009 : score x.xxxxx >8f6b_E:Class_II_aaRS_and_biotin_synthetases;Class_II_aaRS_ABD-related; title=CRYSTAL STRUCTURE OF MURINE POLG2 HEXAMER BOUND TO DNA organism=? : H : ARG NH2 E0302 <- 2.87 -> DT O2 H0005 : score 4.17407 >8fcj_AI: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CASCADE-DNA (P23) COMPLEX IN TYPE I-B CAST SYSTEM organism=? : H : ASN ND2 I0117 <- 2.86 -> DT O2 O0009 : score 4.6892 : x : LYS xxxx A0078 <- 3.23 -> DA xxx N0057 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0116 <- 3.17 -> DA xxx N0057 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0118 <- 3.13 -> DT xxx O0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0184 <- 3.94 -> DT xxx N0058 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0298 <- 3.04 -> DC xxx N0056 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0299 <- 3.48 -> DG xxx O0010 : score x.xxxxx >8fcj_CDEFGHKL: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CASCADE-DNA (P23) COMPLEX IN TYPE I-B CAST SYSTEM organism=? : H : ARG NH2 E0034 <- 2.82 -> DG N7 N0036 : score 6.35908 : H : ARG NH2 E0034 <- 2.68 -> DG O6 N0036 : score 6.7584 : H : SER OG E0169 <- 3.47 -> DC O2 N0031 : score 2.16611 : H : ASN ND2 F0037 <- 3.01 -> DC O2 N0038 : score 4.29135 : H : ASN ND2 H0037 <- 2.47 -> DC O2 N0050 : score 4.77513 : V : THR CG2 H0039 <- 3.69 -> DT C7 N0051 : score 4.35344 : x : LEU xxxx C0109 <- 3.51 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0109 <- 3.43 -> DG xxx N0035 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0135 <- 4.35 -> DG xxx N0035 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0167 <- 4.10 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0168 <- 4.15 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0037 <- 3.68 -> DA xxx N0032 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0039 <- 4.47 -> DG xxx N0033 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0109 <- 3.41 -> DA xxx N0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0163 <- 3.50 -> DA xxx N0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0165 <- 3.03 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0168 <- 3.69 -> DG xxx N0033 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0170 <- 3.57 -> DA xxx N0032 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0171 <- 3.13 -> DG xxx N0033 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0172 <- 4.18 -> DA xxx N0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0034 <- 3.48 -> DT xxx N0040 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0039 <- 3.62 -> DT xxx N0039 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0109 <- 3.42 -> DT xxx N0047 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0165 <- 3.18 -> DG xxx N0036 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0168 <- 3.27 -> DT xxx N0039 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0169 <- 3.77 -> DC xxx N0037 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0170 <- 3.61 -> DC xxx N0037 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0171 <- 3.37 -> DT xxx N0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0172 <- 3.71 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0033 <- 3.82 -> DC xxx N0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0034 <- 4.15 -> DT xxx N0047 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0037 <- 3.23 -> DA xxx N0044 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0039 <- 4.24 -> DA xxx N0045 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0109 <- 3.34 -> DC xxx N0053 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0165 <- 3.21 -> DT xxx N0043 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0168 <- 3.65 -> DA xxx N0045 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0169 <- 3.71 -> DT xxx N0043 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0170 <- 3.64 -> DA xxx N0044 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0171 <- 3.14 -> DA xxx N0045 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0172 <- 3.41 -> DA xxx N0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0034 <- 3.77 -> DT xxx N0051 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0159 <- 4.24 -> DA xxx N0049 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0165 <- 3.43 -> DG xxx N0048 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0168 <- 3.79 -> DT xxx N0051 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0170 <- 3.45 -> DC xxx N0050 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0171 <- 3.37 -> DT xxx N0051 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0172 <- 4.20 -> DC xxx N0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0047 <- 3.28 -> DA xxx N0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0047 <- 3.71 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx >8fcj_E: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CASCADE-DNA (P23) COMPLEX IN TYPE I-B CAST SYSTEM organism=? : H : ARG NH2 E0034 <- 2.82 -> DG N7 N0036 : score 6.35908 : H : ARG NH2 E0034 <- 2.68 -> DG O6 N0036 : score 6.7584 : H : SER OG E0169 <- 3.47 -> DC O2 N0031 : score 2.16611 : x : ASN xxxx E0037 <- 3.68 -> DA xxx N0032 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0039 <- 4.47 -> DG xxx N0033 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0109 <- 3.41 -> DA xxx N0041 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0163 <- 3.50 -> DA xxx N0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0165 <- 3.03 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx E0168 <- 3.69 -> DG xxx N0033 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0170 <- 3.57 -> DA xxx N0032 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0171 <- 3.13 -> DG xxx N0033 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0172 <- 4.18 -> DA xxx N0032 : score x.xxxxx >8fcu_AIJP: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CASCADE-DNA-TNIQ-TNSC COMPLEX IN TYPE I-B CAST SYSTEM organism=? : H : ARG NH1 J0047 <- 3.08 -> DT O4 N0026 : score 3.08494 : x : LEU xxxx I0116 <- 3.77 -> DG xxx O0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0117 <- 3.28 -> DT xxx O0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0118 <- 3.37 -> DA xxx O0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0125 <- 3.23 -> DA xxx O0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0298 <- 3.57 -> DG xxx O0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0299 <- 3.69 -> DG xxx O0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0027 <- 4.06 -> DA xxx O0046 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0031 <- 3.39 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx J0046 <- 4.23 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0050 <- 3.26 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx >8fcu_CDEFGHKL: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CASCADE-DNA-TNIQ-TNSC COMPLEX IN TYPE I-B CAST SYSTEM organism=? : H : THR OG1 E0168 <- 2.60 -> DG N2 N0033 : score 4.17867 : H : THR OG1 E0168 <- 2.87 -> DT O2 N0034 : score 2.67611 : H : THR OG1 F0168 <- 3.28 -> DT O2 N0039 : score 2.45355 : H : THR OG1 F0168 <- 3.30 -> DT O2 N0040 : score 2.44269 : H : SER OG G0169 <- 3.30 -> DT O2 N0043 : score 3.32769 : H : ASN ND2 H0037 <- 2.69 -> DC O2 N0050 : score 4.57804 : x : ARG xxxx C0034 <- 4.42 -> DA xxx N0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0109 <- 3.48 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0160 <- 3.56 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0034 <- 3.33 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0037 <- 3.94 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0039 <- 4.18 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0109 <- 3.38 -> DG xxx N0035 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0159 <- 4.27 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0165 <- 3.39 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0168 <- 3.32 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0169 <- 3.55 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0170 <- 3.31 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0171 <- 3.17 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0172 <- 4.42 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0034 <- 3.24 -> DT xxx N0034 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0037 <- 4.49 -> DG xxx N0033 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0109 <- 3.16 -> DA xxx N0041 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0165 <- 3.34 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0169 <- 3.93 -> DC xxx N0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0170 <- 3.31 -> DC xxx N0031 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0171 <- 3.12 -> DG xxx N0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0034 <- 3.55 -> DT xxx N0039 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0037 <- 4.18 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0039 <- 3.68 -> DT xxx N0039 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0109 <- 3.30 -> DT xxx N0047 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0165 <- 3.14 -> DG xxx N0036 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0169 <- 3.92 -> DC xxx N0037 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0170 <- 3.34 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0171 <- 3.19 -> DT xxx N0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0172 <- 4.25 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0034 <- 3.69 -> DT xxx N0047 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0037 <- 3.41 -> DA xxx N0045 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0039 <- 4.16 -> DA xxx N0045 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0109 <- 3.33 -> DC xxx N0053 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0165 <- 3.18 -> DT xxx N0042 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0168 <- 3.08 -> DA xxx N0045 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0170 <- 3.63 -> DA xxx N0044 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0171 <- 3.26 -> DA xxx N0045 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0172 <- 3.93 -> DA xxx N0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0034 <- 3.35 -> DT xxx N0052 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0039 <- 4.05 -> DT xxx N0051 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0159 <- 4.17 -> DA xxx N0049 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0165 <- 3.37 -> DA xxx N0049 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0168 <- 3.44 -> DT xxx N0051 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0170 <- 3.30 -> DC xxx N0050 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0171 <- 3.24 -> DT xxx N0051 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0172 <- 4.29 -> DC xxx N0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0047 <- 3.89 -> DA xxx N0032 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx K0050 <- 3.37 -> DA xxx N0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0047 <- 4.38 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx L0050 <- 3.54 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx >8fcu_F: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CASCADE-DNA-TNIQ-TNSC COMPLEX IN TYPE I-B CAST SYSTEM organism=? : H : THR OG1 F0168 <- 3.28 -> DT O2 N0039 : score 2.45355 : H : THR OG1 F0168 <- 3.30 -> DT O2 N0040 : score 2.44269 : V : ARG CB F0034 <- 3.85 -> DT C7 N0039 : score 0.992564 : x : ASN xxxx F0037 <- 4.18 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0039 <- 3.68 -> DT xxx N0039 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0109 <- 3.30 -> DT xxx N0047 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0165 <- 3.14 -> DG xxx N0036 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0169 <- 3.92 -> DC xxx N0037 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0170 <- 3.34 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0171 <- 3.19 -> DT xxx N0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0172 <- 4.25 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx >8fcw_RSTUV:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF TNSC-DNA COMPLEX IN TYPE I-B CAST SYSTEM organism=? : x : LYS xxxx T0146 <- 3.29 -> DT xxx O0067 : score x.xxxxx >8fd3_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CASCADE-PAM COMPLEX IN TYPE I-B CAST SYSTEM organism=? : x : LYS xxxx A0078 <- 3.24 -> DA xxx N0057 : score x.xxxxx >8fd3_AI: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CASCADE-PAM COMPLEX IN TYPE I-B CAST SYSTEM organism=? : H : ASN ND2 I0117 <- 2.81 -> DT O2 O0009 : score 4.73666 : x : LYS xxxx A0078 <- 3.24 -> DA xxx N0057 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0116 <- 3.18 -> DA xxx N0057 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0118 <- 3.15 -> DA xxx O0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0184 <- 3.96 -> DT xxx N0058 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0298 <- 3.10 -> DC xxx N0056 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0299 <- 3.57 -> DG xxx O0010 : score x.xxxxx >8ff4_AIJPRSW:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF CASCADE-DNA-TNIQ-TNSC COMPLEX (COMPOSITE) IN TYPE I-B CAST SYSTEM organism=? : H : ARG NH1 J0047 <- 3.08 -> DT O4 N0026 : score 3.08494 : x : LEU xxxx I0116 <- 3.77 -> DG xxx O0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0117 <- 3.28 -> DT xxx O0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0118 <- 3.37 -> DA xxx O0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0125 <- 3.22 -> DA xxx O0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0298 <- 3.57 -> DG xxx O0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0299 <- 3.69 -> DG xxx O0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0027 <- 4.06 -> DA xxx O0046 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0031 <- 3.39 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx J0046 <- 4.23 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0050 <- 3.26 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx >8ff4_L: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CASCADE-DNA-TNIQ-TNSC COMPLEX (COMPOSITE) IN TYPE I-B CAST SYSTEM organism=? : x : ARG xxxx L0047 <- 4.38 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx L0050 <- 3.54 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx >8ff5_AIJ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CASCADE-DNA-FULLRLOOP IN TYPE I-B CAST SYSTEM organism=? : H : GLN OE1 I0299 <- 2.94 -> DG N2 O0010 : score 5.45068 : x : LYS xxxx A0078 <- 2.94 -> DA xxx N0057 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0090 <- 3.42 -> DC xxx N0055 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0116 <- 3.10 -> DG xxx O0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0117 <- 3.28 -> DT xxx O0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0118 <- 3.37 -> DA xxx O0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0125 <- 3.40 -> DA xxx O0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0142 <- 2.31 -> DG xxx O0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0184 <- 3.99 -> DT xxx N0058 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0293 <- 4.16 -> DC xxx N0055 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0294 <- 3.94 -> DT xxx N0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0298 <- 2.98 -> DC xxx N0056 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0027 <- 4.06 -> DA xxx O0046 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0031 <- 3.70 -> DA xxx O0046 : score x.xxxxx >8ff5_CDEFGHKL: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CASCADE-DNA-FULLRLOOP IN TYPE I-B CAST SYSTEM organism=? : H : THR OG1 E0168 <- 2.60 -> DG N2 N0033 : score 4.17867 : H : THR OG1 E0168 <- 2.87 -> DT O2 N0034 : score 2.67611 : H : THR OG1 F0168 <- 3.28 -> DT O2 N0039 : score 2.45355 : H : THR OG1 F0168 <- 3.30 -> DT O2 N0040 : score 2.44269 : H : SER OG G0169 <- 3.30 -> DT O2 N0043 : score 3.32769 : H : ASN ND2 H0037 <- 2.69 -> DC O2 N0050 : score 4.57804 : V : THR CG2 H0039 <- 3.66 -> DT C7 N0051 : score 4.38522 : x : ARG xxxx C0034 <- 4.25 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0109 <- 3.48 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0160 <- 3.84 -> DC xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0034 <- 3.33 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0037 <- 3.94 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0039 <- 4.18 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0109 <- 3.38 -> DG xxx N0035 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0159 <- 3.88 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0165 <- 3.39 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0168 <- 3.32 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0169 <- 3.55 -> DG xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0170 <- 3.31 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0171 <- 3.17 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0172 <- 4.42 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0034 <- 3.24 -> DT xxx N0034 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0037 <- 4.49 -> DG xxx N0033 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0109 <- 3.16 -> DA xxx N0041 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0165 <- 3.34 -> DA xxx N0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0169 <- 3.93 -> DC xxx N0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0170 <- 3.31 -> DC xxx N0031 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0171 <- 3.12 -> DG xxx N0033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0034 <- 3.55 -> DT xxx N0039 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0037 <- 4.18 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0039 <- 3.68 -> DT xxx N0039 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0109 <- 3.30 -> DT xxx N0047 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0165 <- 3.14 -> DG xxx N0036 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0169 <- 3.92 -> DC xxx N0037 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0170 <- 3.34 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0171 <- 3.19 -> DT xxx N0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0172 <- 4.25 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0034 <- 3.69 -> DT xxx N0047 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0037 <- 3.41 -> DA xxx N0045 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0039 <- 4.16 -> DA xxx N0045 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0109 <- 3.45 -> DC xxx N0053 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0165 <- 3.18 -> DT xxx N0042 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0168 <- 3.08 -> DA xxx N0045 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0170 <- 3.62 -> DA xxx N0044 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0171 <- 3.26 -> DA xxx N0045 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0172 <- 3.93 -> DA xxx N0044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0034 <- 3.47 -> DT xxx N0051 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0159 <- 4.17 -> DA xxx N0049 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0165 <- 3.37 -> DA xxx N0049 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0168 <- 3.43 -> DT xxx N0051 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0170 <- 3.30 -> DC xxx N0050 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0171 <- 2.93 -> DT xxx N0051 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0172 <- 4.30 -> DC xxx N0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0047 <- 3.89 -> DA xxx N0032 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx K0050 <- 3.37 -> DA xxx N0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0047 <- 4.38 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx L0050 <- 3.54 -> DC xxx N0038 : score x.xxxxx >8ff5_I: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CASCADE-DNA-FULLRLOOP IN TYPE I-B CAST SYSTEM organism=? : H : ARG NE I0298 <- 2.98 -> DC N3 N0056 : score -8.78352 : H : GLN OE1 I0299 <- 2.94 -> DG N2 O0010 : score 5.45068 : H : GLN OE1 I0299 <- 2.94 -> DG N2 O0010 : score 5.45068 : x : LEU xxxx I0116 <- 3.10 -> DG xxx O0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0117 <- 3.28 -> DT xxx O0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0118 <- 3.37 -> DA xxx O0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0125 <- 3.40 -> DA xxx O0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0142 <- 2.31 -> DG xxx O0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0184 <- 3.99 -> DT xxx N0058 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0293 <- 4.16 -> DC xxx N0055 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0294 <- 3.94 -> DT xxx N0054 : score x.xxxxx >8ffi_AB:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF TETRAMERIZED MAPSPARTA UPON GUIDE RNA-MEDIATED TARGET DNA BINDING organism=? : H : ARG NH1 A0263 <- 2.64 -> DA N3 D0009 : score 3.79988 : H : LYS NZ B0247 <- 3.31 -> DC O2 D0022 : score 2.64565 : x : HIS xxxx A0358 <- 3.73 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0362 <- 3.97 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0391 <- 4.46 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0435 <- 3.34 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx >8ffi_E:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain; title=STRUCTURE OF TETRAMERIZED MAPSPARTA UPON GUIDE RNA-MEDIATED TARGET DNA BINDING organism=? : H : ARG NH1 E0263 <- 2.86 -> DA N3 H0009 : score 3.63787 : x : HIS xxxx E0358 <- 3.64 -> DC xxx H0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0362 <- 4.18 -> DC xxx H0019 : score x.xxxxx >8ffi_EF:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF TETRAMERIZED MAPSPARTA UPON GUIDE RNA-MEDIATED TARGET DNA BINDING organism=? : H : ARG NH1 E0263 <- 2.86 -> DA N3 H0009 : score 3.63787 : x : HIS xxxx E0358 <- 3.64 -> DC xxx H0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0362 <- 4.18 -> DC xxx H0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0247 <- 4.10 -> DC xxx H0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0328 <- 3.95 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx >8ffi_IL:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF TETRAMERIZED MAPSPARTA UPON GUIDE RNA-MEDIATED TARGET DNA BINDING organism=? : H : ARG NH1 I0263 <- 2.91 -> DA N3 K0009 : score 3.60105 : H : LYS NZ L0247 <- 2.31 -> DC O2 K0022 : score 3.23488 : x : HIS xxxx I0358 <- 3.19 -> DG xxx K0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0362 <- 3.93 -> DC xxx K0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0328 <- 4.42 -> DT xxx K0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0435 <- 4.43 -> DG xxx K0020 : score x.xxxxx >8ffi_L:Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF TETRAMERIZED MAPSPARTA UPON GUIDE RNA-MEDIATED TARGET DNA BINDING organism=? : H : LYS NZ L0247 <- 2.31 -> DC O2 K0022 : score 3.23488 : x : TYR xxxx L0328 <- 4.42 -> DT xxx K0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx L0435 <- 4.43 -> DG xxx K0020 : score x.xxxxx >8ffi_MN:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF TETRAMERIZED MAPSPARTA UPON GUIDE RNA-MEDIATED TARGET DNA BINDING organism=? : H : ARG NH1 M0263 <- 2.75 -> DA N3 P0009 : score 3.71887 : x : HIS xxxx M0358 <- 3.55 -> DG xxx P0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0362 <- 4.12 -> DC xxx P0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0072 <- 4.32 -> DT xxx P0021 : score x.xxxxx >8ffz_ABCEH: title=TFIIIA-TFIIIC-BRF1-TBP COMPLEX BOUND TO 5S RRNA GENE organism=? : H : ARG NH1 A0045 <- 3.11 -> DG N7 J0029 : score 5.6749 : H : ARG NE A0062 <- 2.83 -> DT O4 J0030 : score 1.84782 : H : ARG NH1 A0062 <- 2.85 -> DG O6 I0121 : score 6.0225 : H : ARG NH1 A0062 <- 2.94 -> DT O4 J0030 : score 3.17645 : H : LYS NZ A0091 <- 3.02 -> DG N7 I0117 : score 5.14892 : H : LYS NZ A0091 <- 2.84 -> DG N7 I0118 : score 5.34281 : H : LYS NZ A0091 <- 2.89 -> DG O6 I0118 : score 5.67672 : H : SER OG A0093 <- 3.11 -> DC N4 J0034 : score 3.44775 : H : HIS NE2 A0094 <- 3.25 -> DG O6 I0117 : score 7.238 : H : ARG NH1 A0097 <- 2.82 -> DT O4 I0116 : score 3.25488 : H : GLN OE1 A0121 <- 2.77 -> DC N4 J0037 : score 4.61083 : H : GLN NE2 A0121 <- 2.95 -> DT O4 J0038 : score 5.0353 : H : ARG NE A0174 <- 3.07 -> DG N7 J0049 : score 4.18302 : H : ARG NH1 A0174 <- 2.78 -> DG O6 J0049 : score 6.10767 : H : ARG NH1 A0177 <- 2.83 -> DG O6 I0101 : score 6.04683 : H : ARG NH2 A0177 <- 2.77 -> DT O4 I0100 : score 3.57517 : V : ARG CZ C0841 <- 3.56 -> DT C7 I0046 : score 2.26025 : V : GLN CG A0122 <- 3.63 -> DT C7 I0113 : score 3.39374 : x : SER xxxx A0064 <- 3.83 -> DT xxx J0030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0149 <- 4.31 -> DC xxx J0045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0152 <- 3.51 -> DT xxx J0046 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0173 <- 3.85 -> DT xxx I0100 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0176 <- 3.48 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0374 <- 3.71 -> DT xxx I0080 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0161 <- 4.13 -> DA xxx I0138 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx H0257 <- 4.33 -> DA xxx J0151 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0395 <- 4.08 -> DG xxx J0145 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx H0397 <- 3.99 -> DG xxx J0145 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0425 <- 3.45 -> DG xxx J0143 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0440 <- 3.23 -> DG xxx J0143 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx H0448 <- 3.98 -> DA xxx I0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0485 <- 4.23 -> DT xxx I0006 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx H0487 <- 4.15 -> DT xxx J0147 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0516 <- 3.13 -> DT xxx I0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0517 <- 3.55 -> DT xxx J0149 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0531 <- 4.08 -> DT xxx I0004 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0533 <- 3.50 -> DA xxx J0148 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx H0539 <- 4.41 -> DT xxx J0147 : score x.xxxxx >8fii_B:Cytidine_deaminase-like; title=WILD TYPE APOBEC3A IN COMPLEX WITH TT(FDZ)-HAIRPIN INHIBITOR (CRYSTAL FORM 1) organism=Homo sapiens : H : ASP OD1 B0131 <- 2.79 -> DT N3 E-001 : score 1.29489 : x : ARG xxxx B0028 <- 3.45 -> DT xxx E-002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0029 <- 3.14 -> DT xxx E-002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0098 <- 3.82 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0130 <- 3.12 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0132 <- 3.27 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx >8fij_B:Cytidine_deaminase-like; title=WILD TYPE APOBEC3A IN COMPLEX WITH TT(FDZ)-HAIRPIN INHIBITOR (CRYSTAL FORM 2) organism=Homo sapiens : H : ASP OD1 B0131 <- 2.40 -> DT N3 E-001 : score 1.39569 : x : ARG xxxx B0028 <- 3.31 -> DT xxx E-002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0029 <- 2.98 -> DT xxx E-002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0098 <- 3.71 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0130 <- 3.36 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0132 <- 3.55 -> DT xxx E-001 : score x.xxxxx >8fik_A:Cytidine_deaminase-like; title=APOBEC3A E72A INACTIVE MUTANT IN COMPLEX WITH ATTC-HAIRPIN DNA SUBSTRATE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0029 <- 3.23 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx >8fil_B:Cytidine_deaminase-like; title=ZINC-FREE APOBEC3A (INACTIVE E72A MUTANT) IN COMPLEX WITH TTC-HAIRPIN DNA SUBSTRATE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx B0029 <- 3.36 -> DG xxx E0001 : score x.xxxxx >8fim_A:Cytidine_deaminase-like; title=STRUCTURE OF APOBEC3A (E72A INACTIVE MUTANT) IN COMPLEX WITH TTC- HAIRPIN DNA SUBSTRATE organism=Homo sapiens : x : HIS xxxx A0029 <- 3.52 -> DG xxx C0001 : score x.xxxxx >8fix_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI RNA POLYMERASE BACKTRACKED ELONGATION COMPLEX HARBORING A TERMINAL MISMATCH organism=? : x : LYS xxxx C0163 <- 4.41 -> DC xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 4.30 -> DC xxx N0011 : score x.xxxxx >8fix_CD: title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI RNA POLYMERASE BACKTRACKED ELONGATION COMPLEX HARBORING A TERMINAL MISMATCH organism=? : x : LYS xxxx C0163 <- 4.41 -> DC xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 4.30 -> DC xxx N0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0212 <- 4.01 -> DG xxx T0003 : score x.xxxxx >8fiy_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX IN THE TRANSCRIPTION-TRANSLATION COMPLEX (RNAP IN AN ANTI-SWIVELED CONFORMATION) organism=? : x : HIS xxxx C0165 <- 3.06 -> DT xxx T0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0541 <- 3.37 -> DC xxx N0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 4.25 -> DC xxx N0011 : score x.xxxxx >8fiy_CD: title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX IN THE TRANSCRIPTION-TRANSLATION COMPLEX (RNAP IN AN ANTI-SWIVELED CONFORMATION) organism=? : x : HIS xxxx C0165 <- 3.06 -> DT xxx T0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0541 <- 3.37 -> DC xxx N0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 4.25 -> DC xxx N0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0211 <- 3.61 -> DG xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D1170 <- 3.46 -> DC xxx N0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D1326 <- 3.75 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx >8flj_A: title=CAS1-CAS2/3 INTEGRASE AND IHF BOUND TO CRISPR LEADER, REPEAT AND FOREIGN DNA organism=? : H : LYS NZ A0195 <- 3.04 -> DC O2 I0137 : score 2.80474 : x : GLU xxxx A0184 <- 2.62 -> DT xxx J0162 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0187 <- 4.07 -> DA xxx I0139 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0188 <- 2.88 -> DA xxx J0163 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0191 <- 2.83 -> DT xxx I0138 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0192 <- 3.42 -> DG xxx J0164 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0257 <- 3.68 -> DT xxx K0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0258 <- 3.46 -> DT xxx K0029 : score x.xxxxx >8flj_AMN: title=CAS1-CAS2/3 INTEGRASE AND IHF BOUND TO CRISPR LEADER, REPEAT AND FOREIGN DNA organism=? : H : LYS NZ A0195 <- 3.04 -> DC O2 I0137 : score 2.80474 : H : ARG NH1 N0055 <- 3.18 -> DA N3 J0287 : score 3.40222 : x : GLU xxxx A0184 <- 2.62 -> DT xxx J0162 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0187 <- 4.07 -> DA xxx I0139 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0188 <- 2.88 -> DA xxx J0163 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0191 <- 2.83 -> DT xxx I0138 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0192 <- 3.42 -> DG xxx J0164 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0257 <- 3.68 -> DT xxx K0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0258 <- 3.46 -> DT xxx K0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0055 <- 3.57 -> DC xxx J0228 : score x.xxxxx >8flj_CD: title=CAS1-CAS2/3 INTEGRASE AND IHF BOUND TO CRISPR LEADER, REPEAT AND FOREIGN DNA organism=? : x : HIS xxxx C0025 <- 2.95 -> DG xxx K0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0040 <- 4.45 -> DG xxx K0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0062 <- 4.33 -> DG xxx K0001 : score x.xxxxx >8flj_EFGH: title=CAS1-CAS2/3 INTEGRASE AND IHF BOUND TO CRISPR LEADER, REPEAT AND FOREIGN DNA organism=? : x : PRO xxxx E0068 <- 3.54 -> DC xxx J0252 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0069 <- 3.51 -> DG xxx I0049 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0066 <- 3.29 -> DT xxx I0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0066 <- 3.23 -> DT xxx J0186 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0068 <- 3.30 -> DT xxx J0185 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0069 <- 4.19 -> DT xxx J0185 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx H0066 <- 3.46 -> DT xxx I0106 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0067 <- 3.26 -> DT xxx I0106 : score x.xxxxx >8fn3_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INCORPORATING DITP ACROSS DC organism=Homo sapiens : x : LEU xxxx A0378 <- 4.04 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.44 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx >8fn7_ACD:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF WT HIV-1 INTASOME BOUND TO DOLUTEGRAVIR organism=? 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: H : SER OG A0153 <- 2.87 -> DG N2 F0019 : score 3.32712 : H : SER OG A0153 <- 3.07 -> DC O2 E0019 : score 2.36621 : x : HIS xxxx A0051 <- 3.50 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.95 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.56 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0156 <- 3.32 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx >8fnj_GIJ:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF E138K/G140A HIV-1 INTASOME WITH DOLUTEGRAVIR BOUND organism=? : H : SER OG G0153 <- 3.07 -> DC O2 K0019 : score 2.36621 : H : SER OG G0153 <- 2.87 -> DG N2 L0019 : score 3.32712 : x : HIS xxxx G0051 <- 3.50 -> DG xxx K0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0146 <- 3.95 -> DG xxx K0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0152 <- 3.56 -> DC xxx L0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0156 <- 3.32 -> DA xxx L0018 : score x.xxxxx >8fnl_A:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF E138K/Q148K HIV-1 INTASOME WITH DOLUTEGRAVIR BOUND organism=? 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: H : SER OG A0153 <- 3.10 -> DC O2 E0019 : score 2.35121 : w : LYS NZ A0156 <- 5.83 -> DA N3 F0018 : score 1.538 : x : HIS xxxx A0051 <- 3.58 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.96 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.62 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx >8fnp_GIJ:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF E138K/G140S/Q148H HIV-1 INTASOME WITH DOLUTEGRAVIR BOUND organism=? : H : SER OG G0153 <- 3.10 -> DC O2 K0019 : score 2.35121 : w : LYS NZ G0156 <- 5.83 -> DA N3 L0018 : score 1.538 : x : HIS xxxx G0051 <- 3.58 -> DG xxx K0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0146 <- 3.96 -> DG xxx K0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0152 <- 3.62 -> DC xxx L0020 : score x.xxxxx >8fnq_A:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF E138K/G140A/Q148K HIV-1 INTASOME WITH 4D BOUND organism=? : H : SER OG A0153 <- 2.86 -> DG N2 F0019 : score 3.33387 : H : SER OG A0153 <- 3.03 -> DC O2 E0019 : score 2.38622 : H : LYS NZ A0156 <- 2.81 -> DA N3 F0018 : score 2.77137 : x : HIS xxxx A0051 <- 3.43 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.90 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.54 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx >8fnq_ACD:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF E138K/G140A/Q148K HIV-1 INTASOME WITH 4D BOUND organism=? : H : SER OG A0153 <- 2.86 -> DG N2 F0019 : score 3.33387 : H : SER OG A0153 <- 3.03 -> DC O2 E0019 : score 2.38622 : H : LYS NZ A0156 <- 2.81 -> DA N3 F0018 : score 2.77137 : x : HIS xxxx A0051 <- 3.43 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0146 <- 3.90 -> DG xxx E0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0152 <- 3.54 -> DC xxx F0020 : score x.xxxxx >8fnq_GIJ:Ribonuclease_H-like;N-terminal_Zn_binding_domain_of_HIV_integrase;DNA-binding_domain_of_retroviral_integrase; title=STRUCTURE OF E138K/G140A/Q148K HIV-1 INTASOME WITH 4D BOUND organism=? : H : SER OG G0153 <- 3.03 -> DC O2 K0019 : score 2.38622 : H : SER OG G0153 <- 2.86 -> DG N2 L0019 : score 3.33387 : H : LYS NZ G0156 <- 2.81 -> DA N3 L0018 : score 2.77137 : x : HIS xxxx G0051 <- 3.43 -> DG xxx K0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0146 <- 3.90 -> DG xxx K0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0152 <- 3.54 -> DC xxx L0020 : score x.xxxxx >8fog_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INCORPORATING DITP ACROSS DT organism=Homo sapiens : x : LEU xxxx A0378 <- 3.94 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.79 -> DG xxx P0002 : score x.xxxxx >8foh_1AB:Prim-pol_domain;DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF S. CEREVISIAE DNA POLYMERASE ALPHA-PRIMASE COMPLEX IN THE RNA SYNTHESIS STATE organism=? : x : HIS xxxx B0401 <- 4.16 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx >8foj_1:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF S. CEREVISIAE DNA POLYMERASE ALPHA-PRIMASE COMPLEX IN THE POST RNA HANDOFF STATE organism=? : x : ASN xxxx 10681 <- 3.99 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx >8foj_1B:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF S. CEREVISIAE DNA POLYMERASE ALPHA-PRIMASE COMPLEX IN THE POST RNA HANDOFF STATE organism=? : x : ASN xxxx 10681 <- 3.99 -> DG xxx T0005 : score x.xxxxx >8fok_1B:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF S. CEREVISIAE DNA POLYMERASE ALPHA-PRIMASE COMPLEX IN THE DNA ELONGATION STATE organism=? : H : TYR OH 10951 <- 2.71 -> DC O2 T0006 : score 3.56039 : H : TYR OH B0397 <- 2.89 -> DC N4 T0020 : score 4.13825 : x : GLU xxxx 10361 <- 4.23 -> DT xxx T0001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx 10682 <- 4.22 -> DG xxx T0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx 10684 <- 3.09 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx 10685 <- 3.17 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx 10686 <- 3.14 -> DG xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx 10689 <- 3.73 -> DG xxx T0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx 10702 <- 3.59 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 10793 <- 3.35 -> DC xxx T0005 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx 10843 <- 3.76 -> DC xxx T0007 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx 10848 <- 4.41 -> DC xxx T0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx 10956 <- 3.08 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 11047 <- 3.36 -> DG xxx T0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 11048 <- 3.94 -> DC xxx T0011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0401 <- 3.38 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0412 <- 3.55 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx >8fok_B: title=CRYO-EM STRUCTURE OF S. CEREVISIAE DNA POLYMERASE ALPHA-PRIMASE COMPLEX IN THE DNA ELONGATION STATE organism=? : H : TYR OH B0397 <- 2.89 -> DC N4 T0020 : score 4.13825 : x : HIS xxxx B0401 <- 3.38 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0412 <- 3.55 -> DC xxx T0021 : score x.xxxxx >8fs1_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR 11A (YD905) organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.08 -> DA N3 d0006 : score 4.00837 : H : LYS NZ A0172 <- 3.00 -> DT O2 e0009 : score 3.44369 : H : LYS NZ A0172 <- 2.67 -> DT O2 e0010 : score 3.68045 : H : GLN NE2 A0346 <- 3.11 -> DA N7 d0005 : score 5.71218 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.90 -> DG N7 e0013 : score 5.929 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.77 -> DG O6 e0013 : score 6.6396 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.93 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.72 -> DT O4 e0012 : score 4.88462 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.07 -> DA N7 d0004 : score 2.422 : H : SER OG A0514 <- 2.87 -> DA N6 d0007 : score 3.24369 : H : TYR OH A0521 <- 2.93 -> DA N7 d0006 : score 4.04335 : V : TYR CZ A0455 <- 3.87 -> DT C7 e0009 : score 5.48185 : V : ALA CB A0473 <- 3.89 -> DT C7 e0010 : score 5.473 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.71 -> DT C7 e0011 : score 7.25084 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.49 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 3.22 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.16 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.27 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0193 <- 3.21 -> DT xxx e0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.70 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.82 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0255 <- 3.68 -> DG xxx e0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.72 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.14 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.29 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 4.10 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.45 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.74 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.26 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 4.06 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.31 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.61 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.75 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 4.15 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8fs1_C:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR 11A (YD905) organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 C0171 <- 3.02 -> DA N3 f0020 : score 4.05932 : H : GLN OE1 C0346 <- 3.39 -> DA N6 f0019 : score 5.33836 : H : GLN NE2 C0346 <- 2.92 -> DA N7 f0019 : score 5.94359 : w : GLU OE2 C0426 <- 5.50 -> DT O4 f0016 : score 2.279 : H : ARG NH1 C0441 <- 3.31 -> DA N7 f0018 : score 2.29911 : H : ARG NH2 C0441 <- 3.17 -> DA N7 f0018 : score 1.54808 : H : SER OG C0514 <- 3.02 -> DA N6 f0021 : score 3.14499 : H : TYR OH C0521 <- 2.99 -> DA N7 f0020 : score 3.99353 >8fs2_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR 11B (YD907) organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.17 -> DA N3 d0006 : score 3.93194 : H : LYS NZ A0172 <- 3.04 -> DT O2 e0009 : score 3.41499 : H : LYS NZ A0172 <- 2.59 -> DT O2 e0010 : score 3.73784 : H : LYS NZ A0193 <- 3.23 -> DG N3 e0013 : score 1.32882 : H : GLN NE2 A0346 <- 2.95 -> DA N7 d0005 : score 5.90705 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.93 -> DG N7 e0013 : score 5.8927 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.72 -> DG O6 e0013 : score 6.7056 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.82 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.77 -> DT O4 e0012 : score 4.83654 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.17 -> DA N7 d0004 : score 2.3708 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.32 -> DA N7 d0004 : score 1.49793 : H : SER OG A0514 <- 2.95 -> DA N6 d0007 : score 3.19105 : H : TYR OH A0521 <- 3.03 -> DA N7 d0006 : score 3.96032 : V : TYR CZ A0455 <- 3.86 -> DT C7 e0009 : score 5.4958 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.68 -> DT C7 e0011 : score 7.30402 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.56 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 3.16 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.17 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.28 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.68 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.79 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0255 <- 3.68 -> DG xxx e0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.79 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.17 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.24 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 4.07 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.47 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.68 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.29 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0473 <- 3.22 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 3.98 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.29 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.50 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.82 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx >8fs2_AB:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CAMA ADENINE METHYLTRANSFERASE COMPLEXED TO COGNATE SUBSTRATE DNA AND INHIBITOR 11B (YD907) organism=Clostridioides difficile : H : HIS NE2 A0171 <- 3.17 -> DA N3 d0006 : score 3.93194 : H : LYS NZ A0172 <- 3.04 -> DT O2 e0009 : score 3.41499 : H : LYS NZ A0172 <- 2.59 -> DT O2 e0010 : score 3.73784 : H : LYS NZ A0193 <- 3.23 -> DG N3 e0013 : score 1.32882 : H : GLN NE2 A0346 <- 2.95 -> DA N7 d0005 : score 5.90705 : H : ARG NH1 A0425 <- 2.93 -> DG N7 e0013 : score 5.8927 : H : ARG NH2 A0425 <- 2.72 -> DG O6 e0013 : score 6.7056 : w : GLU OE2 A0426 <- 5.82 -> DT O4 d0002 : score 2.279 : H : TRP NE1 A0439 <- 2.77 -> DT O4 e0012 : score 4.83654 : H : ARG NH1 A0441 <- 3.17 -> DA N7 d0004 : score 2.3708 : H : ARG NH2 A0441 <- 3.32 -> DA N7 d0004 : score 1.49793 : H : SER OG A0514 <- 2.95 -> DA N6 d0007 : score 3.19105 : H : TYR OH A0521 <- 3.03 -> DA N7 d0006 : score 3.96032 : V : TYR CZ A0455 <- 3.86 -> DT C7 e0009 : score 5.4958 : V : ILE CG2 A0349 <- 3.68 -> DT C7 e0011 : score 7.30402 : x : TYR xxxx A0030 <- 3.56 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0165 <- 3.16 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0168 <- 3.17 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0192 <- 4.28 -> DG xxx e0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0221 <- 3.68 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0253 <- 3.79 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0255 <- 3.68 -> DG xxx e0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0256 <- 3.79 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0258 <- 4.17 -> DA xxx d0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0379 <- 4.24 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0431 <- 4.07 -> DT xxx d0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0438 <- 3.47 -> DT xxx e0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0456 <- 3.68 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0472 <- 3.29 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0473 <- 3.22 -> DT xxx e0010 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0474 <- 3.98 -> DT xxx e0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0476 <- 4.29 -> DA xxx d0005 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0513 <- 3.50 -> DA xxx d0007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0517 <- 3.82 -> DT xxx e0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0431 <- 3.94 -> DT xxx e0015 : score x.xxxxx >8fs5_A:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF S. CEREVISIAE RAD24-RFC LOADING THE 9-1-1 CLAMP ONTO A 10-NT GAPPED DNA IN STEP 3 (OPEN 9-1-1 AND STABLY BOUND CHAMBER DNA) organism=? : x : PHE xxxx A0340 <- 3.59 -> DC xxx I0020 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0341 <- 3.04 -> DG xxx K0001 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0441 <- 3.26 -> DC xxx I0020 : score x.xxxxx >8ftj_A:N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins;S13-like_H2TH_domain;Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1 (P2G (242K) C(DELTA)100) GLYCOSYLASE BOUND TO DNA DUPLEX CONTAINING UREA organism=Homo sapiens : w : ARG NH2 A0118 <- 6.14 -> DA N3 F0311 : score 2.092 : w : ARG NH2 A0118 <- 6.59 -> DC N4 F0310 : score 0.976 : w : ARG NE A0277 <- 5.75 -> DG N7 D0298 : score 1.593 : x : MET xxxx A0081 <- 4.26 -> DG xxx D0298 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0120 <- 3.20 -> DC xxx F0310 : score x.xxxxx >8fvr_FG: title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx F0542 <- 3.23 -> DA xxx A0041 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0212 <- 3.85 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0213 <- 3.15 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx >8fvr_G:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX organism=? : x : THR xxxx G0212 <- 3.85 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0213 <- 3.15 -> DG xxx B0002 : score x.xxxxx >8fvw_FG: title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX BOUND TO PPGPP organism=? : H : ASP OD1 F0199 <- 2.83 -> DT N3 A0039 : score 1.28455 : x : ARG xxxx F0151 <- 3.24 -> DG xxx A0040 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0183 <- 3.26 -> DT xxx A0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0200 <- 4.06 -> DT xxx A0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0201 <- 3.15 -> DC xxx A0037 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0445 <- 3.44 -> DG xxx A0040 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0446 <- 3.62 -> DG xxx A0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0451 <- 3.42 -> DG xxx A0040 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0538 <- 3.39 -> DG xxx A0040 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0542 <- 3.23 -> DA xxx A0041 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0547 <- 3.83 -> DG xxx A0040 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0567 <- 4.21 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0212 <- 3.39 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0426 <- 3.49 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0427 <- 4.21 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0790 <- 3.35 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0791 <- 3.47 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx >8fvw_G:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYOEM STRUCTURE OF E.COLI TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX BOUND TO PPGPP organism=? : x : THR xxxx G0212 <- 3.39 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0426 <- 3.49 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0427 <- 4.21 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0790 <- 3.35 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0791 <- 3.47 -> DG xxx B0014 : score x.xxxxx >8fy9_ABCDEF: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CAS1:CAS2-DEDDH:PAM-DEFICIENT PRESPACER COMPLEX organism=? : x : HIS xxxx B0029 <- 3.08 -> DC xxx H0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0062 <- 3.28 -> DC xxx H0023 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0029 <- 3.04 -> DA xxx H0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0062 <- 3.24 -> DT xxx G0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0086 <- 4.32 -> DT xxx G0023 : score x.xxxxx >8fy9_B: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CAS1:CAS2-DEDDH:PAM-DEFICIENT PRESPACER COMPLEX organism=? : x : HIS xxxx B0029 <- 3.08 -> DC xxx H0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0062 <- 3.28 -> DC xxx H0023 : score x.xxxxx >8fya_ABCDEF: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CAS1:CAS2-DEDDH:PAM-CONTAINING PRESPACER COMPLEX organism=? : x : HIS xxxx B0029 <- 2.96 -> DC xxx H0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0062 <- 3.49 -> DC xxx H0023 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0029 <- 3.00 -> DA xxx H0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx E0062 <- 3.59 -> DT xxx G0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E0086 <- 4.04 -> DT xxx G0023 : score x.xxxxx >8fyb_ABCDF: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CAS1:CAS2-DEDDH:HALF-SITE INTEGRATION COMPLEX organism=? : x : GLN xxxx A0013 <- 4.03 -> DT xxx H0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0029 <- 2.94 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0062 <- 3.45 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx >8fyc_ABCDFK: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CAS1:CAS2-DEDDH:HALF-SITE INTEGRATION COMPLEX LINEAR CRISPR REPEAT CONFORMATION organism=? : x : HIS xxxx B0029 <- 2.96 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0062 <- 3.99 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0069 <- 4.27 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx >8fyc_B: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CAS1:CAS2-DEDDH:HALF-SITE INTEGRATION COMPLEX LINEAR CRISPR REPEAT CONFORMATION organism=? : x : HIS xxxx B0029 <- 2.96 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0062 <- 3.99 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx >8fyd_AD: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CAS1:CAS2-DEDDH:HALF-SITE INTEGRATION COMPLEX BENT CRISPR REPEAT CONFORMATION organism=? : x : GLN xxxx D0013 <- 3.60 -> DT xxx G0015 : score x.xxxxx >8fyd_BCF: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CAS1:CAS2-DEDDH:HALF-SITE INTEGRATION COMPLEX BENT CRISPR REPEAT CONFORMATION organism=? : H : HIS NE2 B0029 <- 2.95 -> DT N3 H0023 : score -5.86726 : x : PRO xxxx B0062 <- 3.38 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0069 <- 4.01 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx >8fyd_C: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CAS1:CAS2-DEDDH:HALF-SITE INTEGRATION COMPLEX BENT CRISPR REPEAT CONFORMATION organism=? : x : ARG xxxx C0069 <- 4.01 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx >8fzt_E: title=SPCAS9 WITH DUAL-GUIDE RNA AND TARGET DNA organism=? : x : LYS xxxx E1107 <- 3.93 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx E1219 <- 4.34 -> DG xxx D0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E1333 <- 3.80 -> DT xxx D0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E1335 <- 3.64 -> DG xxx D0023 : score x.xxxxx >8g00_IJ:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYO-EM STRUCTURE OF 3DVA COMPONENT 0 OF ESCHERICHIA COLI QUE-PEC (PAUSED ELONGATION COMPLEX) RNA POLYMERASE MINUS PREQ1 LIGAND organism=? : H : THR OG1 J0790 <- 3.40 -> DC N3 B0015 : score 1.07292 : x : LYS xxxx I0163 <- 3.23 -> DA xxx A0027 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0541 <- 3.15 -> DG xxx A0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.83 -> DG xxx A0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0040 <- 4.00 -> DC xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0047 <- 3.04 -> DG xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 4.44 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.01 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 4.49 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.60 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx >8g00_J:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF 3DVA COMPONENT 0 OF ESCHERICHIA COLI QUE-PEC (PAUSED ELONGATION COMPLEX) RNA POLYMERASE MINUS PREQ1 LIGAND organism=? : H : THR OG1 J0790 <- 3.40 -> DC N3 B0015 : score 1.07292 : x : LYS xxxx J0040 <- 4.00 -> DC xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0047 <- 3.04 -> DG xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 4.44 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.01 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 4.49 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.60 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx >8g0z_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MUTANT BACTERIOPHAGE T4 GP41 HELICASE HEXAMER BOUND WITH SINGLE STRAND DNA AND ATPGAMMAS IN THE STALLED PRIMOSOME organism=? : H : ASN ND2 D0327 <- 3.22 -> DT O2 M0010 : score 4.34748 : H : ASN ND2 E0327 <- 2.51 -> DT O2 M0008 : score 5.02143 : x : ARG xxxx A0322 <- 4.35 -> DT xxx M0007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0327 <- 3.77 -> DT xxx M0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0327 <- 3.70 -> DT xxx M0006 : score x.xxxxx >8g0z_E:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MUTANT BACTERIOPHAGE T4 GP41 HELICASE HEXAMER BOUND WITH SINGLE STRAND DNA AND ATPGAMMAS IN THE STALLED PRIMOSOME organism=? : H : ASN ND2 E0327 <- 2.51 -> DT O2 M0008 : score 5.02143 >8g1i_A: title=SPCAS9 WITH SGRNA AND TARGET DNA organism=? : x : LYS xxxx A1107 <- 3.84 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1333 <- 3.56 -> DG xxx D0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1335 <- 3.62 -> DG xxx D0032 : score x.xxxxx >8g1s_IJ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF 3DVA COMPONENT 1 OF ESCHERICHIA COLI QUE-PEC (PAUSED ELONGATION COMPLEX) RNA POLYMERASE MINUS PREQ1 LIGAND organism=? : x : GLU xxxx I0541 <- 2.05 -> DG xxx A0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.53 -> DG xxx A0026 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx J0042 <- 4.17 -> DC xxx A0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0047 <- 3.68 -> DT xxx A0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0212 <- 3.35 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 3.71 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.38 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 3.79 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.64 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 4.36 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx >8g1s_J:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF 3DVA COMPONENT 1 OF ESCHERICHIA COLI QUE-PEC (PAUSED ELONGATION COMPLEX) RNA POLYMERASE MINUS PREQ1 LIGAND organism=? : x : THR xxxx J0212 <- 3.35 -> DT xxx B0004 : score x.xxxxx >8g2w_I:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF 3DVA COMPONENT 2 OF ESCHERICHIA COLI QUE-PEC (PAUSED ELONGATION COMPLEX) RNA POLYMERASE MINUS PREQ1 LIGAND organism=? : x : GLU xxxx I0541 <- 3.46 -> DG xxx A0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.92 -> DG xxx A0025 : score x.xxxxx >8g2w_IJ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF 3DVA COMPONENT 2 OF ESCHERICHIA COLI QUE-PEC (PAUSED ELONGATION COMPLEX) RNA POLYMERASE MINUS PREQ1 LIGAND organism=? : H : ARG NH2 J0047 <- 2.33 -> DT O4 A0011 : score 3.88791 : x : GLU xxxx I0541 <- 3.46 -> DG xxx A0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.92 -> DG xxx A0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0040 <- 3.59 -> DC xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0045 <- 3.92 -> DT xxx A0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 3.86 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 3.57 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 4.41 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.37 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 4.30 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx >8g4w_IJ: title=CRYO-EM CONSENSUS STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI QUE-PEC (PAUSED ELONGATION COMPLEX) RNA POLYMERASE PLUS PREQ1 LIGAND organism=? : x : LYS xxxx I0163 <- 3.59 -> DA xxx A0027 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0541 <- 2.77 -> DC xxx B0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 4.05 -> DG xxx A0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0047 <- 3.28 -> DG xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.28 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.05 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 4.04 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx >8g4w_J:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM CONSENSUS STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI QUE-PEC (PAUSED ELONGATION COMPLEX) RNA POLYMERASE PLUS PREQ1 LIGAND organism=? : x : ARG xxxx J0047 <- 3.28 -> DG xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.28 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.05 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 4.04 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx >8g57_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF NUCLEOSOME-BOUND SIRTUIN 6 DEACETYLASE organism=? : H : ARG NH2 C0011 <- 3.20 -> DT O2 I0142 : score 3.89467 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.71 -> DG N3 J0083 : score 3.67524 : x : LYS xxxx A0004 <- 3.81 -> DC xxx J0140 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 3.68 -> DG xxx I0106 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.27 -> DG xxx I0136 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.50 -> DG xxx I0146 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.21 -> DT xxx I0167 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.06 -> DT xxx I0074 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 2.98 -> DG xxx J0122 : score x.xxxxx >8g57_E:Histone-fold; title=STRUCTURE OF NUCLEOSOME-BOUND SIRTUIN 6 DEACETYLASE organism=? : H : ARG NH2 E0040 <- 2.71 -> DG N3 J0083 : score 3.67524 >8g7e_IJ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF 3DVA COMPONENT 0 OF ESCHERICHIA COLI QUE-PEC (PAUSED ELONGATION COMPLEX) RNA POLYMERASE PLUS PREQ1 LIGAND organism=? : x : LYS xxxx I0163 <- 4.05 -> DA xxx A0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0542 <- 3.67 -> DG xxx A0025 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx J0042 <- 3.48 -> DC xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0047 <- 4.03 -> DC xxx A0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 4.42 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.44 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 4.44 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.07 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.67 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx >8g7e_J:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF 3DVA COMPONENT 0 OF ESCHERICHIA COLI QUE-PEC (PAUSED ELONGATION COMPLEX) RNA POLYMERASE PLUS PREQ1 LIGAND organism=? : x : GLU xxxx J0042 <- 3.48 -> DC xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0047 <- 4.03 -> DC xxx A0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 4.42 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.44 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0427 <- 4.44 -> DT xxx B0016 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.07 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.67 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx >8g86_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=HUMAN OCT4 BOUND TO NUCLEOSOME WITH HUMAN NMATN1 SEQUENCE (FOCUSED REFINEMENT OF NUCLEOSOME) organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.60 -> DC O2 J0009 : score 3.84667 : H : ARG NH1 D0030 <- 2.64 -> DT O2 J0048 : score 4.44422 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.21 -> DA N3 I0009 : score 2.97408 : H : ARG NH2 G0011 <- 2.87 -> DA N3 I0043 : score 3.19439 : H : ARG NH1 H0030 <- 2.58 -> DT O2 I0048 : score 4.49589 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.24 -> DT xxx I0069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.95 -> DT xxx J-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.33 -> DC xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 3.30 -> DC xxx I-042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.24 -> DT xxx J0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.32 -> DC xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.82 -> DC xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.01 -> DA xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.07 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.37 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx >8g86_D:Histone-fold; title=HUMAN OCT4 BOUND TO NUCLEOSOME WITH HUMAN NMATN1 SEQUENCE (FOCUSED REFINEMENT OF NUCLEOSOME) organism=? : H : ARG NH1 D0030 <- 2.64 -> DT O2 J0048 : score 4.44422 >8g87_X:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=HUMAN OCT4 BOUND TO NUCLEOSOME WITH HUMAN NMATN1 SEQUENCE (FOCUSED REFINEMENT OF OCT4 BOUND REGION) organism=? : H : CYS SG X0185 <- 3.42 -> DA N7 J-092 : score 5.02689 : x : SER xxxx X0180 <- 3.64 -> DG xxx I0089 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx X0181 <- 2.92 -> DA xxx J-092 : score x.xxxxx : x : THR xxxx X0182 <- 3.41 -> DG xxx I0089 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0186 <- 3.69 -> DG xxx J-090 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx X0276 <- 4.17 -> DT xxx J-085 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx X0279 <- 4.20 -> DC xxx I0084 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx X0280 <- 2.68 -> DA xxx J-087 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx X0283 <- 3.75 -> DA xxx I0085 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0287 <- 4.37 -> DT xxx I0086 : score x.xxxxx >8g88_F:Histone-fold; title=HUMAN OCT4 BOUND TO NUCLEOSOME WITH HUMAN NMATN1 SEQUENCE organism=? : x : ARG xxxx F0045 <- 4.07 -> DC xxx I0006 : score x.xxxxx >8g8b_C:Histone-fold; title=NUCLEOSOME WITH HUMAN NMATN1 SEQUENCE IN COMPLEX WITH HUMAN OCT4 organism=? : x : ARG xxxx C0011 <- 3.66 -> DG xxx I-042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.15 -> DG xxx J0037 : score x.xxxxx >8g8e_X:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;Homeodomain-like; title=HUMAN OCT4 BOUND TO NUCLEOSOME WITH HUMAN LIN28B SEQUENCE organism=? : H : CYS SG X0185 <- 3.43 -> DA N7 I0083 : score 5.01542 : H : ARG NH2 X0234 <- 2.46 -> DT O2 I0087 : score 4.5212 : x : SER xxxx X0180 <- 3.65 -> DA xxx J-086 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx X0181 <- 2.92 -> DA xxx I0083 : score x.xxxxx : x : THR xxxx X0182 <- 3.42 -> DT xxx I0084 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0186 <- 3.70 -> DG xxx I0085 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx X0276 <- 4.17 -> DT xxx I0090 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx X0279 <- 3.81 -> DT xxx J-091 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx X0280 <- 2.68 -> DA xxx I0088 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx X0283 <- 3.75 -> DA xxx J-090 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0287 <- 4.37 -> DT xxx J-089 : score x.xxxxx >8g8g_C:Histone-fold; title=HUMAN OCT4 BOUND TO NUCLEOSOME WITH HUMAN LIN28B SEQUENCE organism=? : x : ARG xxxx C0011 <- 3.13 -> DG xxx J0043 : score x.xxxxx >8g8z_I:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CRYO-EM STRUCTURE OF 3DVA COMPONENT 1 OF ESCHERICHIA COLI QUE-PEC (PAUSED ELONGATION COMPLEX) RNA POLYMERASE PLUS PREQ1 LIGAND organism=? : x : LYS xxxx I0163 <- 3.61 -> DA xxx A0027 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0541 <- 2.77 -> DG xxx A0025 : score x.xxxxx >8g8z_IJ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF 3DVA COMPONENT 1 OF ESCHERICHIA COLI QUE-PEC (PAUSED ELONGATION COMPLEX) RNA POLYMERASE PLUS PREQ1 LIGAND organism=? : H : ARG NE J0047 <- 2.80 -> DG N7 A0010 : score 4.42179 : H : ARG NH2 J0047 <- 3.24 -> DG O6 A0010 : score 6.0192 : x : LYS xxxx I0163 <- 3.61 -> DA xxx A0027 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0541 <- 2.77 -> DG xxx A0025 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx J0042 <- 3.20 -> DC xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0045 <- 4.04 -> DT xxx A0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0352 <- 4.10 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0426 <- 4.49 -> DC xxx B0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0790 <- 3.17 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0791 <- 3.96 -> DC xxx B0015 : score x.xxxxx >8g9l_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DNA INITIATION SUBCOMPLEX OF XENOPUS LAEVIS DNA POLYMERASE ALPHA- PRIMASE organism=? : x : ARG xxxx A0676 <- 3.18 -> DT xxx C0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0784 <- 3.80 -> DC xxx C0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0947 <- 3.16 -> DC xxx C0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0951 <- 3.75 -> DC xxx C0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0953 <- 4.23 -> DG xxx C0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0958 <- 3.81 -> DA xxx C0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0960 <- 3.21 -> DA xxx C0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1049 <- 4.11 -> DA xxx C0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1077 <- 4.17 -> DG xxx C0031 : score x.xxxxx >8g9l_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=DNA INITIATION SUBCOMPLEX OF XENOPUS LAEVIS DNA POLYMERASE ALPHA- PRIMASE organism=? : H : SER OG B0354 <- 3.36 -> DT O4 C0037 : score 3.15695 : H : THR OG1 B0369 <- 2.86 -> DG N2 C0038 : score 3.96973 : x : ARG xxxx A0676 <- 3.18 -> DT xxx C0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0784 <- 3.80 -> DC xxx C0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0947 <- 3.16 -> DC xxx C0027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0951 <- 3.75 -> DC xxx C0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0953 <- 4.23 -> DG xxx C0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0958 <- 3.81 -> DA xxx C0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0960 <- 3.21 -> DA xxx C0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1049 <- 4.11 -> DA xxx C0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1077 <- 4.17 -> DG xxx C0031 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0309 <- 3.48 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0313 <- 3.31 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0353 <- 3.37 -> DC xxx C0036 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0357 <- 3.31 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0366 <- 3.29 -> DG xxx C0038 : score x.xxxxx >8g9l_B: title=DNA INITIATION SUBCOMPLEX OF XENOPUS LAEVIS DNA POLYMERASE ALPHA- PRIMASE organism=? : H : SER OG B0354 <- 3.36 -> DT O4 C0037 : score 3.15695 : H : THR OG1 B0369 <- 2.86 -> DG N2 C0038 : score 3.96973 : x : HIS xxxx B0309 <- 3.48 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0313 <- 3.31 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0353 <- 3.37 -> DC xxx C0036 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0357 <- 3.31 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0366 <- 3.29 -> DG xxx C0038 : score x.xxxxx >8g9n_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PARTIAL DNA ELONGATION SUBCOMPLEX OF XENOPUS LAEVIS DNA POLYMERASE ALPHA-PRIMASE organism=? : x : LYS xxxx A1049 <- 3.49 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1077 <- 3.45 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx >8g9o_AB:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=COMPLETE DNA ELONGATION SUBCOMPLEX OF XENOPUS LAEVIS DNA POLYMERASE ALPHA-PRIMASE organism=? : H : SER OG A0677 <- 2.35 -> DG N2 C0014 : score 3.67805 : H : THR OG1 B0369 <- 3.08 -> DG N2 C0038 : score 3.79294 : x : ARG xxxx A0676 <- 3.84 -> DG xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0784 <- 3.63 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0947 <- 3.43 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0951 <- 4.18 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0958 <- 3.37 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0960 <- 3.38 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1049 <- 3.47 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1077 <- 3.97 -> DA xxx C0021 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0313 <- 3.27 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0353 <- 2.97 -> DC xxx C0035 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0357 <- 3.86 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0358 <- 3.46 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0366 <- 3.28 -> DG xxx C0038 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0368 <- 3.46 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx >8g9o_B: title=COMPLETE DNA ELONGATION SUBCOMPLEX OF XENOPUS LAEVIS DNA POLYMERASE ALPHA-PRIMASE organism=? : H : THR OG1 B0369 <- 3.08 -> DG N2 C0038 : score 3.79294 : x : MET xxxx B0313 <- 3.27 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0353 <- 2.97 -> DC xxx C0035 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0357 <- 3.86 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0358 <- 3.46 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0366 <- 3.28 -> DG xxx C0038 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0368 <- 3.46 -> DT xxx C0037 : score x.xxxxx >8gao_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=BACTERIOPHAGE T4 STALLED PRIMOSOME WITH MUTANT GP41-E227Q organism=? : H : ASN ND2 C0327 <- 3.37 -> DT O2 M0012 : score 4.20509 : H : ASN ND2 D0327 <- 2.39 -> DT O2 M0010 : score 5.13534 : H : ASN ND2 E0327 <- 2.68 -> DT O2 M0008 : score 4.86006 : V : ARG CB A0322 <- 3.58 -> DT C7 M0007 : score 1.06041 : x : ASN xxxx B0327 <- 4.11 -> DT xxx M0013 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0328 <- 4.29 -> DT xxx M0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0327 <- 3.57 -> DT xxx M0006 : score x.xxxxx >8gao_E:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=BACTERIOPHAGE T4 STALLED PRIMOSOME WITH MUTANT GP41-E227Q organism=? : H : ASN ND2 E0327 <- 2.68 -> DT O2 M0008 : score 4.86006 >8gap_A: title=STRUCTURE OF LARP7 PROTEIN P65-TELOMERASE RNA COMPLEX IN TELOMERASE organism=? : x : PHE xxxx A0414 <- 3.92 -> DT xxx C0056 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0559 <- 3.31 -> DT xxx C0050 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0563 <- 3.45 -> DT xxx C0050 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0926 <- 3.80 -> DT xxx C0057 : score x.xxxxx >8gap_AD:Nucleic_acid-binding_proteins; title=STRUCTURE OF LARP7 PROTEIN P65-TELOMERASE RNA COMPLEX IN TELOMERASE organism=? : H : LYS NZ D0660 <- 2.62 -> DG O6 C0049 : score 5.98888 : x : PHE xxxx A0414 <- 3.92 -> DT xxx C0056 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0559 <- 3.31 -> DT xxx C0050 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0563 <- 3.45 -> DT xxx C0050 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0926 <- 3.80 -> DT xxx C0057 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0603 <- 3.27 -> DG xxx C0047 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0662 <- 3.24 -> DG xxx C0049 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0667 <- 3.46 -> DG xxx C0049 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0669 <- 4.02 -> DG xxx C0048 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0671 <- 4.12 -> DG xxx C0047 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0673 <- 3.93 -> DG xxx C0047 : score x.xxxxx >8gcc_A:Type_II_DNA_topoisomerase; title=T. CRUZI TOPOISOMERASE II ALPHA BOUND TO DSDNA AND THE COVALENT INHIBITOR CT1 organism=? : H : ARG NH1 A0460 <- 3.30 -> DA N3 D0012 : score 3.31385 : x : LYS xxxx A0462 <- 3.29 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0683 <- 3.65 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0826 <- 2.96 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0831 <- 4.37 -> DG xxx C0020 : score x.xxxxx >8gcc_AB:Type_II_DNA_topoisomerase; title=T. CRUZI TOPOISOMERASE II ALPHA BOUND TO DSDNA AND THE COVALENT INHIBITOR CT1 organism=? : H : ARG NH1 A0460 <- 3.30 -> DA N3 D0012 : score 3.31385 : x : LYS xxxx A0462 <- 3.29 -> DT xxx C0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0683 <- 3.65 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0826 <- 2.96 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0831 <- 4.37 -> DG xxx C0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0460 <- 3.24 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0462 <- 3.34 -> DT xxx D0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0683 <- 3.62 -> DA xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0826 <- 3.17 -> DT xxx D0019 : score x.xxxxx >8gh6_A:DNA/RNA_polymerases; title=BOMBYX MORI R2 RETROTRANSPOSON INITIATING TARGET-PRIMED REVERSE TRANSCRIPTION organism=? : H : ARG NH2 A0125 <- 3.01 -> DA N3 T0026 : score 3.10367 : H : LYS NZ A0149 <- 2.80 -> DA N3 T0018 : score 2.77692 : H : ARG NH2 A0151 <- 3.01 -> DG N3 T0020 : score 3.45863 : H : GLU OE1 A0191 <- 2.79 -> DC N4 B0057 : score 5.77948 : H : ARG NH1 A0198 <- 3.21 -> DT O4 T0015 : score 2.99998 : H : ARG NH2 A0198 <- 3.21 -> DG O6 T0014 : score 6.0588 : H : HIS ND1 A0673 <- 2.72 -> DG O6 T0021 : score 6.32265 : H : LYS NZ A0675 <- 2.91 -> DG O6 T0024 : score 5.65359 : H : ASP OD2 A0783 <- 2.83 -> DG N2 B0030 : score 5.42622 : x : VAL xxxx A0129 <- 3.75 -> DT xxx T0028 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0194 <- 3.66 -> DG xxx T0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0764 <- 4.32 -> DT xxx T0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0922 <- 3.55 -> DG xxx B0030 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0924 <- 3.41 -> DC xxx T0041 : score x.xxxxx >8gh8_C:RuvA_domain_2-like;Nucleic_acid-binding_proteins; title=RUVA HOLLIDAY JUNCTION DNA COMPLEX organism=? : x : LYS xxxx C0083 <- 3.49 -> DA xxx H0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0084 <- 3.30 -> DA xxx H0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0088 <- 3.97 -> DA xxx H0014 : score x.xxxxx >8gkh_P: title=STRUCTURE OF THE SPIZELLOMYCES PUNCTATUS FANZOR (SPUFZ) IN COMPLEX WITH OMEGA RNA AND TARGET DNA organism=? : H : GLN NE2 P0129 <- 2.73 -> DA N7 N-003 : score 6.175 : H : GLN OE1 P0130 <- 3.41 -> DA N6 T0002 : score 5.31415 : H : ARG NH1 P0291 <- 2.88 -> DG O6 T0004 : score 5.986 : H : ARG NH2 P0291 <- 2.70 -> DG N7 T0004 : score 6.51231 : x : ARG xxxx P0096 <- 3.30 -> DG xxx N-005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx P0100 <- 4.00 -> DT xxx N-002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx P0133 <- 3.44 -> DT xxx N-002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx P0134 <- 3.34 -> DT xxx T0001 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx P0278 <- 4.30 -> DT xxx T0001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx P0280 <- 3.20 -> DA xxx T0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx P0345 <- 3.12 -> DA xxx N-001 : score x.xxxxx >8gkr_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INCORPORATING 5F-DUTP ACROSS DA organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.32 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 4.04 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.53 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx >8gme_A:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE GP32-DDA-DT17 COMPLEX organism=? : V : LEU CD1 A0035 <- 3.54 -> DT C7 P0596 : score 6.10382 >8gme_AC:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE GP32-DDA-DT17 COMPLEX organism=? : V : LEU CD1 A0035 <- 3.54 -> DT C7 P0596 : score 6.10382 : V : PHE CZ C0240 <- 3.68 -> DT C7 P0603 : score 7.32832 >8gme_BD:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Nucleic_acid-binding_proteins; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE GP32-DDA-DT17 COMPLEX organism=? : V : PRO CG D0152 <- 3.85 -> DT C7 Q0603 : score 6.27949 : x : ASP xxxx D0121 <- 2.69 -> DT xxx Q0605 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0123 <- 4.11 -> DT xxx Q0605 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0124 <- 3.21 -> DT xxx Q0605 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0148 <- 4.23 -> DT xxx Q0601 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx D0150 <- 3.68 -> DT xxx Q0603 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0155 <- 3.79 -> DT xxx Q0601 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0240 <- 3.19 -> DT xxx Q0601 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0276 <- 3.82 -> DT xxx Q0606 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0396 <- 4.38 -> DT xxx Q0602 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0415 <- 3.29 -> DT xxx Q0599 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0416 <- 3.09 -> DT xxx Q0601 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0417 <- 3.26 -> DT xxx Q0601 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0420 <- 3.26 -> DT xxx Q0602 : score x.xxxxx >8gml_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INCORPORATING 5F-DUTP ACROSS DG organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.41 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.57 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.40 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx >8gn3_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ZBTB10 ZF1-2 IN COMPLEX WITH TELOMERIC VAIRANT REPEAT TTGGGG organism=Homo sapiens : w : THR OG1 A0736 <- 5.30 -> DT O4 C0008 : score 2.809 : H : ARG NH1 A0739 <- 2.80 -> DG O6 C0006 : score 6.08333 : H : ARG NH2 A0739 <- 2.97 -> DG N7 C0006 : score 6.16754 : w : ARG NH1 A0739 <- 5.97 -> DA N6 D0006 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0761 <- 2.75 -> DG O6 C0005 : score 6.14417 : H : ARG NH2 A0761 <- 2.90 -> DG N7 C0005 : score 6.25692 : H : GLU OE2 A0763 <- 2.85 -> DC N4 D0007 : score 5.21273 : w : GLU OE2 A0763 <- 5.74 -> DA N6 D0006 : score 2.785 : H : HIS NE2 A0764 <- 2.87 -> DG N7 C0004 : score 6.70733 : H : ARG NH1 A0767 <- 2.91 -> DG O6 C0003 : score 5.9495 : H : ARG NH2 A0767 <- 2.90 -> DG N7 C0003 : score 6.25692 >8gn4_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=THE CRYSTAL STRUCTURE OF ZBTB10 ZF1-2 R767Q IN COMPLEX WITH TELOMERIC DNA TTAGGG organism=Homo sapiens : w : ARG NE A0735 <- 5.96 -> DA N6 C0003 : score 1.081 : w : ARG NH1 A0735 <- 6.08 -> DA N6 C0003 : score 1.486 : w : THR OG1 A0736 <- 5.45 -> DT O4 B0007 : score 2.809 : H : ARG NH1 A0739 <- 2.80 -> DG O6 B0006 : score 6.08333 : H : ARG NH2 A0739 <- 2.86 -> DG N7 B0006 : score 6.308 : w : ARG NH1 A0739 <- 6.04 -> DA N6 C0006 : score 1.486 : H : ARG NH1 A0761 <- 2.88 -> DG O6 B0005 : score 5.986 : H : ARG NH2 A0761 <- 2.98 -> DG N7 B0005 : score 6.15477 : H : GLU OE2 A0763 <- 3.13 -> DC N4 C0007 : score 4.91787 : w : GLU OE1 A0763 <- 5.12 -> DC N4 C0008 : score 3.528 : w : GLU OE2 A0763 <- 6.39 -> DA N6 C0006 : score 2.785 : H : HIS NE2 A0764 <- 2.97 -> DG N7 B0004 : score 6.57128 : H : GLN OE1 A0767 <- 3.04 -> DA N6 B0003 : score 5.76204 : H : GLN NE2 A0767 <- 3.07 -> DA N7 B0003 : score 5.7609 : x : TYR xxxx A0733 <- 4.00 -> DT xxx B0008 : score x.xxxxx >8gpn_E:Histone-fold; title=HUMAN MENIN IN COMPLEX WITH H3K79ME2 NUCLEOSOME organism=? : H : HIS NE2 E0039 <- 3.08 -> DC O2 J0144 : score 4.9911 : H : TYR OH E0041 <- 3.16 -> DG N3 I0006 : score 2.88989 : x : ARG xxxx E0040 <- 3.58 -> DG xxx I0083 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.18 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx >8grm_ABCDEFGH: title=CRYO-EM STRUCTURE OF PRC1 BOUND TO H2AK119-UBCH5B-UB NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH2 C0011 <- 2.60 -> DA N3 J0043 : score 3.36933 : H : ARG NH2 G0011 <- 2.41 -> DT O2 I0043 : score 4.56353 : x : ARG xxxx A0040 <- 2.70 -> DT xxx J0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.28 -> DT xxx J-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.43 -> DG xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.96 -> DA xxx J0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0032 <- 3.48 -> DT xxx I-043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.29 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.66 -> DT xxx I-047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.31 -> DG xxx I0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.36 -> DC xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.00 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0032 <- 3.43 -> DG xxx J-044 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.28 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.93 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >8grm_C:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF PRC1 BOUND TO H2AK119-UBCH5B-UB NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH2 C0011 <- 2.60 -> DA N3 J0043 : score 3.36933 : x : ARG xxxx C0032 <- 3.48 -> DT xxx I-043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.29 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx >8grq_ABCDEFGH:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF BRCA1/BARD1 BOUND TO H2AK127-UBCH5C-UB NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH1 A0040 <- 3.13 -> DG N3 J0009 : score 2.85109 : H : ARG NH2 A0040 <- 2.75 -> DG N3 J0009 : score 3.64636 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.30 -> DT O2 I0009 : score 4.65667 : x : ARG xxxx A0083 <- 3.26 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.40 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 3.86 -> DT xxx J0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.05 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.15 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0042 <- 3.84 -> DT xxx J0071 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.88 -> DG xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0011 <- 3.98 -> DA xxx I0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.22 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx >8gui_G:Histone-fold; title=BRE1-NUCLEOSOME COMPLEX (MODEL I) organism=? : x : ARG xxxx G0011 <- 3.33 -> DT xxx I0032 : score x.xxxxx >8guk_ABCDEFGH: title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE (FREE FORM) organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.94 -> DG N3 I0083 : score 3.50917 : H : ARG NH1 C0011 <- 2.73 -> DT O2 I0117 : score 4.3667 : H : ARG NH2 C0011 <- 3.31 -> DC O2 I0118 : score 3.32145 : H : ARG NH2 D0033 <- 3.14 -> DC O2 J0027 : score 3.44721 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.52 -> DT O2 J0083 : score 4.4704 : H : ARG NH2 G0011 <- 2.69 -> DA N3 J0117 : score 3.31102 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.06 -> DT xxx J0143 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 4.15 -> DA xxx I0007 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.24 -> DC xxx I0092 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.40 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.43 -> DC xxx I0080 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.77 -> DT xxx I0112 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 3.95 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.50 -> DG xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.46 -> DC xxx J0111 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.48 -> DG xxx J0122 : score x.xxxxx >8guk_G:Histone-fold; title=HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE (FREE FORM) organism=? : H : ARG NH2 G0011 <- 2.69 -> DA N3 J0117 : score 3.31102 : x : ARG xxxx G0042 <- 4.46 -> DC xxx J0111 : score x.xxxxx >8gzg_CDFZ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF SYNECHOCYSTIS SP. PCC 6803 RPITC organism=? : H : ARG NH1 C0242 <- 2.97 -> DG O6 10036 : score 5.8765 : H : ASP OD1 C0300 <- 3.07 -> DG N2 10039 : score 4.8719 : H : ARG NH1 C0305 <- 2.68 -> DG O6 10039 : score 6.22933 : H : ASP OD2 F0071 <- 3.24 -> DG N2 10033 : score 4.97858 : H : ARG NE F0074 <- 3.11 -> DG O6 10033 : score 3.69668 : H : THR OG1 F0246 <- 3.12 -> DA N7 10030 : score 3.1956 : H : ARG NH1 F0255 <- 2.66 -> DG O6 10024 : score 6.25367 : H : ARG NH2 F0255 <- 3.28 -> DG N7 10024 : score 5.77169 : H : SER OG F0331 <- 3.36 -> DG N2 20018 : score 2.99643 : H : ARG NH2 F0397 <- 2.97 -> DG N7 20044 : score 6.16754 : H : GLU OE1 F0398 <- 2.98 -> DC N4 20046 : score 5.5603 : V : VAL CG2 F0268 <- 3.80 -> DT C7 10023 : score 6.12308 : x : ARG xxxx C0125 <- 3.67 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0154 <- 3.41 -> DT xxx 10038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0156 <- 4.10 -> DT xxx 10038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0171 <- 3.35 -> DC xxx 10037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0225 <- 4.24 -> DG xxx 10033 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0299 <- 3.57 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0392 <- 3.52 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0395 <- 3.48 -> DA xxx 20011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0396 <- 3.53 -> DT xxx 10040 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0401 <- 3.78 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0434 <- 3.87 -> DT xxx 20013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0073 <- 3.45 -> DG xxx 10033 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0077 <- 3.76 -> DG xxx 10033 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0078 <- 3.99 -> DG xxx 10032 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0085 <- 3.38 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0091 <- 3.61 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0197 <- 3.12 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0199 <- 3.40 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0200 <- 4.24 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0233 <- 4.03 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0234 <- 3.46 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0237 <- 3.55 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0239 <- 3.48 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0242 <- 3.14 -> DA xxx 10030 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0243 <- 3.61 -> DA xxx 10029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0244 <- 3.50 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0247 <- 3.45 -> DT xxx 10026 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0248 <- 3.80 -> DT xxx 10026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0250 <- 3.78 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0251 <- 3.09 -> DG xxx 10025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0254 <- 3.91 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0269 <- 3.54 -> DT xxx 10021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0272 <- 3.26 -> DC xxx 20027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0325 <- 3.63 -> DG xxx 20018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0330 <- 3.75 -> DG xxx 20017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0336 <- 3.78 -> DG xxx 20018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0387 <- 4.43 -> DT xxx 20043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0401 <- 4.36 -> DT xxx 20045 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0402 <- 4.19 -> DT xxx 10003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Z0190 <- 3.77 -> DG xxx 20012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Z0191 <- 4.08 -> DG xxx 20012 : score x.xxxxx >8gzg_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF SYNECHOCYSTIS SP. PCC 6803 RPITC organism=? : H : ASP OD2 F0071 <- 3.24 -> DG N2 10033 : score 4.97858 : H : ARG NE F0074 <- 3.11 -> DG O6 10033 : score 3.69668 : H : THR OG1 F0246 <- 3.12 -> DA N7 10030 : score 3.1956 : H : ARG NH1 F0255 <- 2.66 -> DG O6 10024 : score 6.25367 : H : ARG NH2 F0255 <- 3.28 -> DG N7 10024 : score 5.77169 : H : SER OG F0331 <- 3.36 -> DG N2 20018 : score 2.99643 : H : ARG NH2 F0397 <- 2.97 -> DG N7 20044 : score 6.16754 : H : GLU OE1 F0398 <- 2.98 -> DC N4 20046 : score 5.5603 : V : VAL CG2 F0268 <- 3.80 -> DT C7 10023 : score 6.12308 : V : SER CB F0242 <- 3.79 -> DT C7 10031 : score 3.13911 : x : ILE xxxx F0073 <- 3.45 -> DG xxx 10033 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0077 <- 3.76 -> DG xxx 10033 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0078 <- 3.99 -> DG xxx 10032 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0085 <- 3.38 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0091 <- 3.61 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0197 <- 3.12 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0199 <- 3.40 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0200 <- 4.24 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0233 <- 4.03 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0234 <- 3.46 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0237 <- 3.55 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0239 <- 3.48 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0243 <- 3.61 -> DA xxx 10029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0244 <- 3.50 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0247 <- 3.45 -> DT xxx 10026 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0248 <- 3.80 -> DT xxx 10026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0250 <- 3.78 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0251 <- 3.09 -> DG xxx 10025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0254 <- 3.91 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0269 <- 3.54 -> DT xxx 10021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0272 <- 3.26 -> DC xxx 20027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0325 <- 3.63 -> DG xxx 20018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0330 <- 3.75 -> DG xxx 20017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0336 <- 3.78 -> DG xxx 20018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0387 <- 4.43 -> DT xxx 20043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0401 <- 4.36 -> DT xxx 20045 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0402 <- 4.19 -> DT xxx 10003 : score x.xxxxx >8gzh_CDFZ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF SYNECHOCYSTIS SP. PCC 6803 CTP-BOUND RPITC organism=? : H : ASP OD1 C0300 <- 2.61 -> DG N2 10039 : score 5.3457 : H : ARG NH1 C0305 <- 2.96 -> DG O6 10039 : score 5.88867 : H : ARG NH1 D0266 <- 2.64 -> DT O2 20020 : score 4.44422 : H : ASN OD1 F0197 <- 3.24 -> DT N3 10031 : score 3.46677 : H : THR OG1 F0246 <- 3.36 -> DA N7 10030 : score 3.03172 : H : ARG NH1 F0255 <- 2.71 -> DG O6 10024 : score 6.19283 : H : ARG NH2 F0255 <- 3.28 -> DG N7 10024 : score 5.77169 : V : VAL CG2 F0268 <- 3.81 -> DT C7 10023 : score 6.10777 : x : ARG xxxx C0125 <- 4.06 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0154 <- 3.61 -> DT xxx 10038 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0170 <- 3.14 -> DC xxx 10037 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0171 <- 3.72 -> DC xxx 10037 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0229 <- 4.02 -> DG xxx 10032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0242 <- 3.65 -> DG xxx 10036 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0299 <- 3.75 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0324 <- 3.19 -> DT xxx 20023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0328 <- 3.51 -> DT xxx 20023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0351 <- 4.04 -> DT xxx 20023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0357 <- 3.86 -> DA xxx 20022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0358 <- 4.02 -> DA xxx 20022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0392 <- 3.77 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0395 <- 4.16 -> DA xxx 20011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0396 <- 3.74 -> DT xxx 10040 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0401 <- 3.65 -> DG xxx 10039 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0219 <- 4.43 -> DT xxx 20001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0433 <- 4.25 -> DT xxx 20013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0434 <- 3.64 -> DG xxx 20012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0071 <- 3.02 -> DG xxx 10033 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0073 <- 3.58 -> DG xxx 10033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0074 <- 3.55 -> DG xxx 10033 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0077 <- 3.93 -> DG xxx 10033 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0078 <- 4.17 -> DG xxx 10032 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0085 <- 3.52 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0091 <- 3.79 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0199 <- 3.33 -> DG xxx 10032 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0200 <- 3.71 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0210 <- 4.08 -> DA xxx 20024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0211 <- 3.13 -> DA xxx 20024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0233 <- 3.58 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0234 <- 3.50 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0237 <- 3.30 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0239 <- 3.88 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0242 <- 3.21 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0243 <- 3.55 -> DA xxx 10029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0244 <- 3.68 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0247 <- 3.28 -> DT xxx 10026 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0248 <- 3.96 -> DT xxx 10026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0250 <- 3.68 -> DA xxx 10030 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0251 <- 3.14 -> DG xxx 10025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0254 <- 3.80 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0269 <- 3.70 -> DT xxx 10021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0272 <- 3.88 -> DC xxx 20027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0325 <- 3.70 -> DG xxx 20019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0330 <- 3.57 -> DA xxx 20017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0331 <- 4.05 -> DG xxx 20018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0336 <- 3.39 -> DG xxx 20019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0398 <- 3.25 -> DT xxx 10004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0399 <- 3.90 -> DC xxx 10002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0402 <- 3.66 -> DT xxx 10003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Z0190 <- 3.54 -> DG xxx 20012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Z0191 <- 3.97 -> DG xxx 20012 : score x.xxxxx : x : MET xxxx Z0330 <- 3.46 -> DG xxx 20012 : score x.xxxxx >8gzh_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors;Sigma3_and_sigma4_domains_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF SYNECHOCYSTIS SP. PCC 6803 CTP-BOUND RPITC organism=? : H : ASN OD1 F0197 <- 3.24 -> DT N3 10031 : score 3.46677 : H : THR OG1 F0246 <- 3.36 -> DA N7 10030 : score 3.03172 : H : ARG NH1 F0255 <- 2.71 -> DG O6 10024 : score 6.19283 : H : ARG NH2 F0255 <- 3.28 -> DG N7 10024 : score 5.77169 : V : VAL CG2 F0268 <- 3.81 -> DT C7 10023 : score 6.10777 : x : ASP xxxx F0071 <- 3.02 -> DG xxx 10033 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0073 <- 3.58 -> DG xxx 10033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0074 <- 3.55 -> DG xxx 10033 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0077 <- 3.93 -> DG xxx 10033 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0078 <- 4.17 -> DG xxx 10032 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0085 <- 3.52 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0091 <- 3.79 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0199 <- 3.33 -> DG xxx 10032 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0200 <- 3.71 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0210 <- 4.08 -> DA xxx 20024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0211 <- 3.13 -> DA xxx 20024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0233 <- 3.58 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0234 <- 3.50 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0237 <- 3.30 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0239 <- 3.88 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0242 <- 3.21 -> DT xxx 10031 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0243 <- 3.55 -> DA xxx 10029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0244 <- 3.68 -> DA xxx 10027 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0247 <- 3.28 -> DT xxx 10026 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0248 <- 3.96 -> DT xxx 10026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0250 <- 3.68 -> DA xxx 10030 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0251 <- 3.14 -> DG xxx 10025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0254 <- 3.80 -> DA xxx 20025 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0269 <- 3.70 -> DT xxx 10021 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0272 <- 3.88 -> DC xxx 20027 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0325 <- 3.70 -> DG xxx 20019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0330 <- 3.57 -> DA xxx 20017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0331 <- 4.05 -> DG xxx 20018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0336 <- 3.39 -> DG xxx 20019 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0398 <- 3.25 -> DT xxx 10004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0399 <- 3.90 -> DC xxx 10002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0402 <- 3.66 -> DT xxx 10003 : score x.xxxxx >8h0l_B: title=SULFUR BINDING DOMAIN OF HGA COMPLEXED WITH PHOSPHOROTHIOATED DNA organism=? : H : ASN OD1 B0016 <- 3.39 -> DG N2 E0004 : score 4.2336 : w : ASN OD1 B0016 <- 5.90 -> DG N3 E0004 : score 3.377 : w : ARG NH1 B0070 <- 5.31 -> DG O6 E0008 : score 2.756 : w : ARG NH1 B0070 <- 6.21 -> DG N7 E0008 : score 2.063 : w : ARG NH2 B0070 <- 5.82 -> DG N7 E0008 : score 2.18 : x : ASN xxxx B0072 <- 4.32 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0075 <- 3.46 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0079 <- 3.92 -> DG xxx E0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0104 <- 4.09 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx >8h1j_A:ArfGap/RecO-like_zinc_finger; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE TNPB-OMEGARNA-TARGET DNA TERNARY COMPLEX organism=? : H : TYR OH A0052 <- 3.37 -> DT O4 D-001 : score 3.10327 : H : LYS NZ A0076 <- 2.63 -> DG O6 D-003 : score 5.97732 : H : ASN ND2 A0124 <- 2.70 -> DT O4 D-005 : score 5.39031 : V : SER CB A0056 <- 3.65 -> DT C7 D-001 : score 3.24871 : V : PHE CZ A0077 <- 3.76 -> DT C7 D-004 : score 7.18602 : x : GLN xxxx A0080 <- 3.49 -> DA xxx D-002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0084 <- 4.10 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0121 <- 3.88 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0123 <- 3.89 -> DC xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0126 <- 4.30 -> DT xxx D-005 : score x.xxxxx >8h1t_L:Cysteine_proteinases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF BAP1-ASXL1 BOUND TO CHROMATOSOME organism=? : H : ARG NH1 L0701 <- 3.07 -> DC O2 I0088 : score 3.4529 : H : ARG NH2 L0701 <- 2.62 -> DC O2 I0087 : score 3.83187 >8h3v_X:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE FULL TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX NTCA- NTCB-TAC organism=? : V : ARG CZ X0192 <- 3.69 -> DT C7 10071 : score 2.19095 : V : ARG CG X0187 <- 3.65 -> DT C7 20051 : score 1.04282 : x : VAL xxxx X0188 <- 3.20 -> DT xxx 10072 : score x.xxxxx : x : THR xxxx X0191 <- 3.95 -> DT xxx 20051 : score x.xxxxx >8h40_AEGXY: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX NTCA-TAC organism=? : H : ARG NE G0083 <- 2.95 -> DG N7 10106 : score 4.28914 : H : ARG NE G0083 <- 2.82 -> DG O6 10106 : score 3.92526 : H : ARG NH2 G0083 <- 2.69 -> DG N7 10106 : score 6.52508 : H : ARG NH2 G0083 <- 2.72 -> DG O6 10107 : score 6.7056 : V : THR CG2 Y0191 <- 3.86 -> DT C7 10062 : score 4.17337 : V : LEU CD2 G0165 <- 3.76 -> DT C7 10104 : score 5.78859 : V : VAL CB Y0188 <- 3.53 -> DT C7 20061 : score 4.19336 : x : TRP xxxx A0172 <- 2.96 -> DT xxx 10111 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0174 <- 3.71 -> DT xxx 10111 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0188 <- 3.21 -> DT xxx 10111 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0189 <- 4.35 -> DT xxx 10111 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0243 <- 4.38 -> DG xxx 10105 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0246 <- 4.22 -> DG xxx 10105 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0413 <- 3.84 -> DA xxx 20013 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx G0080 <- 2.78 -> DG xxx 10106 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0082 <- 3.85 -> DG xxx 10106 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0086 <- 2.96 -> DG xxx 10105 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0094 <- 3.48 -> DT xxx 10104 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0164 <- 2.97 -> DG xxx 10105 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0176 <- 3.23 -> DA xxx 20026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0204 <- 2.11 -> DA xxx 10100 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx G0206 <- 3.69 -> DT xxx 10104 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0207 <- 3.49 -> DT xxx 10104 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0208 <- 2.58 -> DA xxx 10102 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0209 <- 3.10 -> DA xxx 10100 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx G0212 <- 2.69 -> DT xxx 10099 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0216 <- 3.41 -> DA xxx 20027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0219 <- 4.46 -> DA xxx 20027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0220 <- 3.31 -> DT xxx 10097 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0234 <- 3.82 -> DT xxx 10095 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0237 <- 3.34 -> DC xxx 20028 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx G0363 <- 4.37 -> DT xxx 10074 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0187 <- 1.84 -> DT xxx 10072 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx X0190 <- 3.99 -> DG xxx 20050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx X0192 <- 3.57 -> DT xxx 10072 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Y0186 <- 3.39 -> DT xxx 20061 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0187 <- 2.82 -> DC xxx 20063 : score x.xxxxx >8h40_Y:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX NTCA-TAC organism=? : V : THR CG2 Y0191 <- 3.86 -> DT C7 10062 : score 4.17337 : V : VAL CB Y0188 <- 3.53 -> DT C7 20061 : score 4.19336 : x : THR xxxx Y0186 <- 3.39 -> DT xxx 20061 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Y0187 <- 2.82 -> DC xxx 20063 : score x.xxxxx >8h7a_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DIMER FORM KAT6A WH DOMAIN WITH ITS BOUND DOUBLE STRANDED DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0024 <- 2.79 -> DG N7 C0009 : score 5.39667 : H : LYS NZ A0024 <- 2.93 -> DG O6 C0010 : score 5.63047 : H : GLN NE2 A0025 <- 2.80 -> DG O6 D0006 : score 5.80513 : w : GLN OE1 A0025 <- 5.56 -> DG N7 D0006 : score 2.87 >8h7a_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DIMER FORM KAT6A WH DOMAIN WITH ITS BOUND DOUBLE STRANDED DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ A0024 <- 2.79 -> DG N7 C0009 : score 5.39667 : H : LYS NZ A0024 <- 2.93 -> DG O6 C0010 : score 5.63047 : H : GLN NE2 A0025 <- 2.80 -> DG O6 D0006 : score 5.80513 : H : LYS NZ B0024 <- 2.76 -> DG N7 D0009 : score 5.42898 : H : LYS NZ B0024 <- 2.93 -> DG O6 D0010 : score 5.63047 : H : GLN NE2 B0025 <- 2.90 -> DG O6 C0006 : score 5.68903 : w : GLN OE1 B0025 <- 5.52 -> DG N7 C0006 : score 2.87 : x : GLN xxxx B0023 <- 4.07 -> DT xxx D0007 : score x.xxxxx >8h7a_EF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DIMER FORM KAT6A WH DOMAIN WITH ITS BOUND DOUBLE STRANDED DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ E0024 <- 2.81 -> DG N7 G0009 : score 5.37513 : H : LYS NZ E0024 <- 3.06 -> DG O6 G0010 : score 5.48017 : H : GLN NE2 E0025 <- 2.89 -> DG O6 H0006 : score 5.70064 : H : LYS NZ F0024 <- 2.79 -> DG N7 H0009 : score 5.39667 : H : LYS NZ F0024 <- 3.03 -> DG O6 H0010 : score 5.51485 : H : GLN NE2 F0025 <- 2.83 -> DG O6 G0006 : score 5.7703 : w : GLN OE1 F0025 <- 5.54 -> DG N7 G0006 : score 2.87 : x : GLN xxxx E0023 <- 4.14 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx >8h7q_ABCEFGHI: title=CRYO-EM STRUCTURE OF SYNECHOCYSTIS SP. PCC6714 CASCADE AT 3.8 ANGSTROM RESOLUTION organism=? : x : ASN xxxx C0027 <- 3.00 -> DA xxx L0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0139 <- 4.07 -> DA xxx L0020 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0158 <- 3.16 -> DA xxx L0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0027 <- 3.03 -> DA xxx L0026 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0075 <- 4.30 -> DT xxx L0030 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0151 <- 4.48 -> DA xxx L0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0157 <- 3.85 -> DA xxx L0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0158 <- 3.42 -> DA xxx L0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0027 <- 3.24 -> DC xxx L0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0096 <- 4.27 -> DG xxx L0040 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.58 -> DG xxx L0040 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0151 <- 3.74 -> DA xxx L0033 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0157 <- 3.52 -> DC xxx L0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0158 <- 3.35 -> DC xxx L0032 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0027 <- 4.36 -> DG xxx L0038 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0075 <- 4.25 -> DG xxx L0041 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx G0141 <- 4.33 -> DG xxx L0038 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0151 <- 3.98 -> DG xxx L0039 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0155 <- 3.50 -> DT xxx L0036 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0157 <- 3.22 -> DT xxx L0037 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0158 <- 3.46 -> DG xxx L0038 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0027 <- 4.24 -> DA xxx L0044 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx H0073 <- 3.86 -> DG xxx L0046 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0075 <- 4.37 -> DG xxx L0047 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0151 <- 3.55 -> DC xxx L0045 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0157 <- 3.26 -> DC xxx L0043 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0158 <- 3.40 -> DA xxx L0044 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0027 <- 3.64 -> DA xxx L0050 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx I0073 <- 4.38 -> DA xxx L0053 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx I0138 <- 4.04 -> DA xxx L0050 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx I0139 <- 2.63 -> DA xxx L0050 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0151 <- 3.51 -> DT xxx L0051 : score x.xxxxx : x : SER xxxx I0152 <- 4.16 -> DT xxx L0051 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx I0157 <- 3.38 -> DG xxx L0049 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0120 <- 3.40 -> DA xxx L0054 : score x.xxxxx >8h9h_G:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ZBTB7A IN COMPLEX WITH GACCC-CONTAINING SEQUENCE organism=Homo sapiens : H : LYS NZ G0396 <- 2.71 -> DG O6 A0004 : score 5.88482 : w : LYS NZ G0396 <- 5.72 -> DG N7 A0003 : score 2.519 : H : ARG NH1 G0399 <- 2.84 -> DG O6 B0007 : score 6.03467 : H : ARG NH2 G0399 <- 2.57 -> DG N7 B0007 : score 6.67831 : H : ARG NH1 G0421 <- 2.85 -> DG N7 B0006 : score 5.9895 : H : ARG NH2 G0421 <- 2.83 -> DG O6 B0006 : score 6.5604 : H : ASP OD2 G0423 <- 2.81 -> DC N4 A0006 : score 6.1876 : H : LYS NZ G0424 <- 2.96 -> DG O6 B0005 : score 5.59578 : x : ALA xxxx G0394 <- 3.79 -> DA xxx A0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0451 <- 3.98 -> DT xxx B0002 : score x.xxxxx >8hag_B:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE P300 CATALYTIC CORE BOUND TO THE H4K12ACK16AC NUCLEOSOME, CLASS 1 (3.2 ANGSTROM RESOLUTION) organism=? : x : ARG xxxx B0017 <- 4.02 -> DT xxx J0107 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0019 <- 3.89 -> DT xxx J0108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 4.10 -> DG xxx J0098 : score x.xxxxx >8hah_C:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE P300 CATALYTIC CORE BOUND TO THE H4K12ACK16AC NUCLEOSOME, CLASS 2 (3.9 ANGSTROM RESOLUTION) organism=? : x : LYS xxxx C0013 <- 4.30 -> DT xxx J0134 : score x.xxxxx >8hak_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE P300 CATALYTIC CORE BOUND TO THE H4K12ACK16AC NUCLEOSOME, CLASS 4 (4.5 ANGSTROM RESOLUTION) organism=? : H : ARG NH1 A0040 <- 2.95 -> DA N3 J0100 : score 3.57159 : H : ARG NH2 D0033 <- 3.31 -> DA N3 K0044 : score 2.90929 : x : LEU xxxx A0065 <- 3.96 -> DT xxx J0109 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.58 -> DC xxx K0067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.51 -> DT xxx J0097 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0017 <- 3.71 -> DG xxx K0048 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0075 <- 4.50 -> DC xxx J0149 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.13 -> DT xxx J0160 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.37 -> DG xxx K0098 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.25 -> DT xxx K0023 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.10 -> DT xxx K0108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.32 -> DC xxx J0067 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0032 <- 4.27 -> DT xxx J0079 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.04 -> DG xxx J0085 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.42 -> DA xxx K0128 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0077 <- 4.50 -> DG xxx K0148 : score x.xxxxx >8hak_D:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE P300 CATALYTIC CORE BOUND TO THE H4K12ACK16AC NUCLEOSOME, CLASS 4 (4.5 ANGSTROM RESOLUTION) organism=? : H : ARG NH2 D0033 <- 3.31 -> DA N3 K0044 : score 2.90929 >8han_K:Bromodomain;FYVE/PHD_zinc_finger; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE CBP CATALYTIC CORE BOUND TO THE H4K12ACK16AC NUCLEOSOME, CLASS 3 organism=? : V : ARG CZ K1498 <- 3.57 -> DT C7 I0103 : score 2.25492 >8hbm_AB:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS OF THE FARNESOID X RECEPTOR/RETINOID X RECEPTOR HETERODIMER ON INVERTED REPEAT DNA organism=? : H : GLU OE1 A0153 <- 2.52 -> DC N4 D0014 : score 6.09095 : H : LYS NZ A0156 <- 2.85 -> DG O6 C0005 : score 5.72296 : H : ARG NH1 A0161 <- 3.10 -> DG N7 D0012 : score 5.687 : H : ARG NH2 A0161 <- 3.09 -> DG N7 D0012 : score 6.01431 : H : GLU OE1 B0145 <- 2.69 -> DC N4 C0014 : score 5.89484 : H : ARG NH1 B0153 <- 2.93 -> DG N7 C0012 : score 5.8927 : x : LYS xxxx A0160 <- 3.06 -> DG xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0152 <- 3.70 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0177 <- 3.54 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx >8hbm_B:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS OF THE FARNESOID X RECEPTOR/RETINOID X RECEPTOR HETERODIMER ON INVERTED REPEAT DNA organism=? : H : GLU OE1 B0145 <- 2.69 -> DC N4 C0014 : score 5.89484 : H : ARG NH1 B0153 <- 2.93 -> DG N7 C0012 : score 5.8927 : x : ARG xxxx B0152 <- 3.70 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0177 <- 3.54 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx >8hbm_EF:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=STRUCTURAL BASIS OF THE FARNESOID X RECEPTOR/RETINOID X RECEPTOR HETERODIMER ON INVERTED REPEAT DNA organism=? : H : ARG NH1 E0161 <- 2.74 -> DG N7 H0012 : score 6.1226 : H : GLU OE1 F0145 <- 2.40 -> DC N4 G0014 : score 6.22938 : H : LYS NZ F0148 <- 2.46 -> DG O6 H0005 : score 6.17386 : x : GLU xxxx E0153 <- 3.45 -> DA xxx H0013 : score x.xxxxx >8he5_a:Histone-fold; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH RAD26 AND ELF1, STALLED AT SHL(-3.5) OF THE NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx a0040 <- 2.79 -> DT xxx N0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx a0065 <- 3.28 -> DG xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a0083 <- 3.36 -> DA xxx N0026 : score x.xxxxx >8hg1_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=THE STRUCTURE OF MPXV POLYMERASE HOLOENZYME IN REPLICATING STATE organism=? : H : ARG NH2 A0832 <- 2.80 -> DT O2 P0022 : score 4.23333 : x : ILE xxxx A0662 <- 4.19 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0665 <- 4.43 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0666 <- 3.62 -> DA xxx T0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0804 <- 3.78 -> DA xxx T0006 : score x.xxxxx >8hg1_B:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=THE STRUCTURE OF MPXV POLYMERASE HOLOENZYME IN REPLICATING STATE organism=? : x : THR xxxx B0161 <- 3.74 -> DA xxx T-001 : score x.xxxxx >8hg1_BC:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like;Uracil-DNA_glycosylase-like; title=THE STRUCTURE OF MPXV POLYMERASE HOLOENZYME IN REPLICATING STATE organism=? : x : THR xxxx B0161 <- 3.74 -> DA xxx T-001 : score x.xxxxx >8hhl_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE CAS12M2-CRRNA-TARGET DNA FULL R-LOOP COMPLEX organism=? : H : LYS NZ A0047 <- 3.48 -> DA N7 D0007 : score 2.53772 : H : LYS NZ A0127 <- 2.78 -> DA N7 D0004 : score 2.94893 : H : ASN ND2 A0156 <- 2.76 -> DT O4 D-002 : score 5.32689 : H : GLN NE2 A0195 <- 3.17 -> DA N7 C0019 : score 5.6391 : H : GLN OE1 A0197 <- 2.65 -> DA N6 C0020 : score 6.23414 : H : GLN NE2 A0197 <- 3.13 -> DT O4 D-003 : score 4.84842 : H : GLN NE2 A0199 <- 2.92 -> DA N7 C0020 : score 5.94359 : H : GLU OE2 A0491 <- 3.36 -> DC N4 D0014 : score 4.67566 : H : ARG NH2 A0499 <- 2.28 -> DT O2 D0010 : score 4.6736 : V : ALA CB A0494 <- 3.57 -> DT C7 D0010 : score 5.92092 : x : MET xxxx A0004 <- 3.86 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0082 <- 4.07 -> DC xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0085 <- 3.36 -> DA xxx C0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0098 <- 4.08 -> DG xxx D0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0108 <- 4.04 -> DG xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0115 <- 3.31 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0116 <- 3.66 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0119 <- 3.42 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0130 <- 3.55 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0141 <- 3.69 -> DT xxx D-002 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0152 <- 3.45 -> DT xxx D-003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0160 <- 2.84 -> DG xxx D0000 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0163 <- 3.45 -> DG xxx D0001 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0164 <- 4.46 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0168 <- 3.92 -> DC xxx C0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0173 <- 3.43 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0174 <- 3.43 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0177 <- 4.47 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0178 <- 3.32 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0180 <- 3.56 -> DA xxx D0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0299 <- 4.13 -> DC xxx C0017 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0320 <- 4.23 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0486 <- 3.16 -> DG xxx D0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0487 <- 4.44 -> DC xxx D0014 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0492 <- 3.36 -> DC xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0495 <- 3.95 -> DC xxx D0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0496 <- 3.34 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0498 <- 3.67 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0502 <- 3.43 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0503 <- 3.32 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0506 <- 4.10 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0507 <- 3.70 -> DG xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0510 <- 4.18 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0543 <- 3.96 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0563 <- 3.49 -> DT xxx D0016 : score x.xxxxx >8hhm_A: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE CAS12M2-CRRNA-TARGET DNA TERNARY COMPLEX INTERMEDIATE STATE organism=? : H : ASN ND2 A0156 <- 2.80 -> DT O4 D0030 : score 5.28462 : H : GLN NE2 A0195 <- 3.12 -> DA N7 C0019 : score 5.7 : H : GLN OE1 A0197 <- 3.09 -> DA N6 C0020 : score 5.70152 : H : GLN NE2 A0197 <- 3.04 -> DT O4 D0029 : score 4.94186 : V : TYR CZ A0141 <- 3.74 -> DT C7 D0030 : score 5.66318 : x : TRP xxxx A0152 <- 3.47 -> DT xxx D0028 : score x.xxxxx >8hi1_ABCDEF: title=STREPTOCOCCUS THERMOPHILUS CAS1-CAS2- PRESPACER TERNARY COMPLEX organism=? : x : HIS xxxx A0029 <- 3.22 -> DA xxx H0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0062 <- 3.18 -> DT xxx G0023 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0029 <- 3.00 -> DA xxx G0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0062 <- 3.46 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0086 <- 4.42 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx >8hi1_C: title=STREPTOCOCCUS THERMOPHILUS CAS1-CAS2- PRESPACER TERNARY COMPLEX organism=? : x : HIS xxxx C0029 <- 3.00 -> DA xxx G0001 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0062 <- 3.46 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0086 <- 4.42 -> DT xxx H0023 : score x.xxxxx >8hig_AB: title=CO-CRYSTAL STRUCTURE OF C-TERMINAL DNA BINDING DOMAIN OF SACCHAROPOLYSPORA ERYTHRAEA GLNR IN COMPLEX WITH ITS COGNATE PROMOTER DNA organism=Saccharopolyspora erythraea NRRL 2338 : H : ARG NH2 A0186 <- 2.56 -> DG N7 C0003 : score 6.69108 : H : ARG NH2 A0186 <- 3.27 -> DG O6 C0003 : score 5.9796 : H : ARG NH2 A0194 <- 2.32 -> DG O6 D0014 : score 7.2336 : H : ARG NH1 B0186 <- 2.87 -> DG O6 C0014 : score 5.99817 : H : ARG NH2 B0186 <- 3.17 -> DG N7 C0014 : score 5.91215 : H : ARG NH2 B0194 <- 2.52 -> DG O6 D0003 : score 6.9696 : V : ASP CB A0189 <- 3.77 -> DT C7 C0004 : score 2.7032 : x : THR xxxx A0187 <- 4.07 -> DG xxx D0014 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0190 <- 3.35 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0193 <- 4.46 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0187 <- 3.97 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0189 <- 4.09 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0190 <- 3.53 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0211 <- 3.40 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx >8hig_B:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CO-CRYSTAL STRUCTURE OF C-TERMINAL DNA BINDING DOMAIN OF SACCHAROPOLYSPORA ERYTHRAEA GLNR IN COMPLEX WITH ITS COGNATE PROMOTER DNA organism=Saccharopolyspora erythraea NRRL 2338 : H : ARG NH1 B0186 <- 2.87 -> DG O6 C0014 : score 5.99817 : H : ARG NH2 B0186 <- 3.17 -> DG N7 C0014 : score 5.91215 : H : ARG NH2 B0194 <- 2.52 -> DG O6 D0003 : score 6.9696 : x : THR xxxx B0187 <- 3.97 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0189 <- 4.09 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0190 <- 3.53 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0211 <- 3.40 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx >8hih_CDFGNOPQ:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators;CheY-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH TRANSCRIPTION FACTOR GLNR organism=? : H : ASP OD1 D0331 <- 3.31 -> DG N2 L0018 : score 4.6247 : H : THR OG1 D0867 <- 2.67 -> DG N2 L0012 : score 4.12242 : H : ASP OD1 F0226 <- 3.34 -> DG N2 K0060 : score 4.5938 : H : ARG NH1 F0313 <- 2.59 -> DT O2 L0023 : score 4.48728 : H : ARG NE F0384 <- 2.52 -> DT O4 L0023 : score 1.96308 : H : GLU OE2 F0419 <- 2.74 -> DA N6 L0021 : score 3.0879 : H : GLU OE2 F0430 <- 2.46 -> DA N6 L0016 : score 3.25877 : H : ASP OD2 F0432 <- 2.74 -> DA N6 L0016 : score 4.05059 : H : ASP OD2 F0432 <- 2.31 -> DG N2 L0017 : score 5.99395 : H : ARG NH2 N0196 <- 3.30 -> DA N7 K0018 : score 1.50462 : H : ARG NH2 O0188 <- 2.40 -> DG O6 L0036 : score 7.128 : H : ARG NH2 O0188 <- 3.00 -> DT O4 L0037 : score 3.41169 : H : ARG NH2 O0196 <- 2.89 -> DG O6 K0038 : score 6.4812 : H : ARG NH1 Q0188 <- 2.77 -> DG N7 K0010 : score 6.0863 : H : ARG NH1 Q0188 <- 2.90 -> DG O6 K0010 : score 5.96167 : H : ARG NH1 Q0195 <- 2.35 -> DG N7 L0069 : score 6.5945 : H : ARG NH1 Q0195 <- 3.06 -> DT O4 L0070 : score 3.09802 : H : ARG NH2 Q0196 <- 3.01 -> DG O6 L0071 : score 6.3228 : H : ARG NH1 Q0213 <- 2.30 -> DC O2 K0015 : score 4.015 : V : TRP CD2 F0350 <- 3.80 -> DT C7 K0053 : score 5.49641 : V : ARG CZ C0467 <- 3.56 -> DT C7 K0067 : score 2.26025 : V : VAL CG2 N0192 <- 3.86 -> DT C7 L0057 : score 6.03123 : x : ARG xxxx C0181 <- 3.40 -> DG xxx K0066 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0203 <- 4.47 -> DG xxx K0066 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0208 <- 3.76 -> DC xxx K0064 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0210 <- 4.14 -> DT xxx K0065 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0211 <- 2.90 -> DT xxx K0065 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0227 <- 4.40 -> DT xxx K0065 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0285 <- 2.72 -> DG xxx K0059 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0305 <- 2.94 -> DA xxx K0062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0421 <- 3.88 -> DA xxx L0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0463 <- 3.22 -> DG xxx K0066 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0466 <- 2.83 -> DA xxx L0011 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0287 <- 3.71 -> DG xxx L0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0288 <- 3.49 -> DT xxx L0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0330 <- 3.86 -> DG xxx L0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0334 <- 4.26 -> DG xxx L0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0389 <- 4.16 -> DG xxx K0060 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0427 <- 4.47 -> DG xxx L0015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0501 <- 4.21 -> DT xxx L0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0502 <- 3.21 -> DT xxx L0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0864 <- 4.49 -> DG xxx L0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0868 <- 4.03 -> DG xxx L0012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0228 <- 3.47 -> DG xxx K0060 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0229 <- 3.39 -> DG xxx K0060 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0232 <- 2.96 -> DG xxx K0060 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0235 <- 4.01 -> DG xxx K0059 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0240 <- 3.33 -> DT xxx K0058 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0299 <- 3.20 -> DT xxx K0058 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0301 <- 3.08 -> DT xxx K0058 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0302 <- 3.25 -> DT xxx K0058 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0317 <- 4.46 -> DG xxx K0060 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0335 <- 3.30 -> DA xxx K0054 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0336 <- 3.90 -> DA xxx K0054 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0339 <- 3.26 -> DA xxx K0054 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0341 <- 4.01 -> DA xxx K0054 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0344 <- 3.58 -> DT xxx K0058 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0345 <- 3.19 -> DA xxx K0056 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0346 <- 3.18 -> DA xxx K0054 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0348 <- 3.43 -> DA xxx K0057 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0349 <- 2.90 -> DT xxx K0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0352 <- 2.86 -> DA xxx L0024 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0353 <- 3.04 -> DT xxx K0053 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0357 <- 3.39 -> DC xxx K0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0364 <- 3.65 -> DA xxx L0022 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0370 <- 3.95 -> DC xxx K0050 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0371 <- 3.28 -> DT xxx K0048 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0374 <- 3.82 -> DA xxx L0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0377 <- 4.22 -> DT xxx L0023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0421 <- 3.37 -> DT xxx L0020 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0425 <- 4.50 -> DT xxx L0020 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0429 <- 4.18 -> DA xxx L0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0438 <- 4.47 -> DG xxx L0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0287 <- 4.39 -> DA xxx L0075 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0288 <- 3.39 -> DA xxx L0075 : score x.xxxxx : x : THR xxxx O0189 <- 3.97 -> DG xxx K0038 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx O0191 <- 3.90 -> DG xxx L0035 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx O0192 <- 3.00 -> DA xxx K0040 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx O0193 <- 3.54 -> DC xxx K0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0195 <- 3.78 -> DT xxx L0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0188 <- 3.48 -> DA xxx L0047 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0195 <- 4.16 -> DG xxx L0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0213 <- 3.59 -> DG xxx L0045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0188 <- 3.04 -> DA xxx K0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx N0189 <- 3.25 -> DA xxx K0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx N0191 <- 3.48 -> DT xxx L0057 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Q0189 <- 4.19 -> DC xxx K0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx Q0191 <- 3.42 -> DC xxx L0067 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx Q0192 <- 2.90 -> DA xxx K0008 : score x.xxxxx >8hih_Q:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators;CheY-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH TRANSCRIPTION FACTOR GLNR organism=? : H : ARG NH1 Q0188 <- 2.77 -> DG N7 K0010 : score 6.0863 : H : ARG NH1 Q0188 <- 2.90 -> DG O6 K0010 : score 5.96167 : H : ARG NH1 Q0195 <- 2.35 -> DG N7 L0069 : score 6.5945 : H : ARG NH1 Q0195 <- 3.06 -> DT O4 L0070 : score 3.09802 : H : ARG NH2 Q0196 <- 3.01 -> DG O6 L0071 : score 6.3228 : H : ARG NH1 Q0213 <- 2.30 -> DC O2 K0015 : score 4.015 : x : THR xxxx Q0189 <- 4.19 -> DC xxx K0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx Q0191 <- 3.42 -> DC xxx L0067 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx Q0192 <- 2.90 -> DA xxx K0008 : score x.xxxxx >8him_AB:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Eukaryotic_RPB5_N-terminal_domain;RPB5-like_RNA_polymerase_subunit; title=A CRYO-EM STRUCTURE OF B. OLERACEA RNA POLYMERASE V ELONGATION COMPLEX AT 2.73 ANGSTROM organism=? : V : ALA CB B0502 <- 3.71 -> DT C7 N0018 : score 5.72495 : x : LEU xxxx A0772 <- 4.09 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0219 <- 3.87 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0221 <- 4.49 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0236 <- 3.43 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0240 <- 3.76 -> DG xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0241 <- 3.86 -> DG xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0243 <- 2.99 -> DA xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0245 <- 3.25 -> DA xxx N0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0267 <- 2.84 -> DT xxx N0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0339 <- 4.40 -> DG xxx N0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0340 <- 3.01 -> DT xxx N0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0388 <- 2.85 -> DT xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0389 <- 3.58 -> DT xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0416 <- 3.42 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0461 <- 3.28 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0463 <- 3.35 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0464 <- 4.19 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0491 <- 3.56 -> DT xxx N0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0495 <- 3.34 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0498 <- 3.14 -> DG xxx N0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0499 <- 4.45 -> DT xxx N0018 : score x.xxxxx >8him_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=A CRYO-EM STRUCTURE OF B. OLERACEA RNA POLYMERASE V ELONGATION COMPLEX AT 2.73 ANGSTROM organism=? : V : ALA CB B0502 <- 3.71 -> DT C7 N0018 : score 5.72495 : x : ILE xxxx B0219 <- 3.87 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0221 <- 4.49 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0236 <- 3.43 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0240 <- 3.76 -> DG xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0241 <- 3.86 -> DG xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0243 <- 2.99 -> DA xxx N0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0245 <- 3.25 -> DA xxx N0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0267 <- 2.84 -> DT xxx N0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0339 <- 4.40 -> DG xxx N0014 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0340 <- 3.01 -> DT xxx N0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0388 <- 2.85 -> DT xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0389 <- 3.58 -> DT xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0416 <- 3.42 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0461 <- 3.28 -> DT xxx N0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0463 <- 3.35 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0464 <- 4.19 -> DG xxx N0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0491 <- 3.56 -> DT xxx N0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0495 <- 3.34 -> DA xxx T0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0498 <- 3.14 -> DG xxx N0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0499 <- 4.45 -> DT xxx N0018 : score x.xxxxx >8hkc_CEF: title=CRYO-EM STRUCTURE OF E. COLI RNAP SIGMA32 COMPLEX organism=? : H : LYS NZ E0130 <- 2.76 -> DG N7 H0029 : score 5.42898 : H : GLU OE1 E0265 <- 2.99 -> DA N6 H0048 : score 2.58013 : x : GLU xxxx C0541 <- 4.16 -> DG xxx H0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.14 -> DC xxx G0042 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0107 <- 4.36 -> DC xxx G0028 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx E0108 <- 3.73 -> DC xxx G0028 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0111 <- 3.39 -> DG xxx H0027 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0114 <- 3.65 -> DG xxx H0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0253 <- 4.09 -> DT xxx H0046 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0263 <- 3.76 -> DC xxx G0004 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0264 <- 4.48 -> DT xxx H0046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0266 <- 3.23 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0268 <- 3.52 -> DA xxx H0048 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx E0269 <- 3.62 -> DC xxx G0003 : score x.xxxxx >8hml_AB:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CO-CRYSTAL STRUCTURE OF THE C TERMINAL DNA BINDING DOMAIN OF SACCHAROPOLYSPORA ERYTHRAEA GLNR IN COMPLEX WITH ITS CONSERVED PROMOTER DNA IN 2.95 ANGSTROM RESOLUTION organism=Saccharopolyspora erythraea NRRL 2338 : H : ARG NH2 A0186 <- 2.58 -> DG N7 C0003 : score 6.66554 : H : ARG NH2 A0186 <- 3.37 -> DT O4 C0004 : score 3.14871 : H : ARG NH2 A0194 <- 2.54 -> DG O6 D0014 : score 6.9432 : H : ARG NH1 B0186 <- 3.08 -> DG O6 C0014 : score 5.74267 : H : ARG NH2 B0186 <- 3.30 -> DG N7 C0014 : score 5.74615 : H : ARG NH2 B0194 <- 2.31 -> DG O6 D0003 : score 7.2468 : V : ASP CB A0189 <- 3.78 -> DT C7 C0004 : score 2.69649 : V : VAL CG2 A0190 <- 3.76 -> DT C7 D0015 : score 6.18431 : x : THR xxxx A0187 <- 4.40 -> DT xxx D0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0193 <- 4.32 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0187 <- 3.82 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0189 <- 4.18 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0190 <- 3.28 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0193 <- 3.78 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0211 <- 3.75 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx >8hml_B:C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CO-CRYSTAL STRUCTURE OF THE C TERMINAL DNA BINDING DOMAIN OF SACCHAROPOLYSPORA ERYTHRAEA GLNR IN COMPLEX WITH ITS CONSERVED PROMOTER DNA IN 2.95 ANGSTROM RESOLUTION organism=Saccharopolyspora erythraea NRRL 2338 : H : ARG NH1 B0186 <- 3.08 -> DG O6 C0014 : score 5.74267 : H : ARG NH2 B0186 <- 3.30 -> DG N7 C0014 : score 5.74615 : H : ARG NH2 B0194 <- 2.31 -> DG O6 D0003 : score 7.2468 : x : THR xxxx B0187 <- 3.82 -> DG xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0189 <- 4.18 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0190 <- 3.28 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0193 <- 3.78 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0211 <- 3.75 -> DA xxx C0012 : score x.xxxxx >8hni_EK: title=HNRNP A2/B1 RRMS IN COMPLEX WITH TELOMERIC DNA organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 E0019 <- 2.94 -> DG O6 R0010 : score 5.64258 : H : LYS NZ E0022 <- 3.17 -> DG N7 R0010 : score 4.98734 : H : ASP OD1 E0049 <- 3.03 -> DG N2 R0011 : score 4.9131 : H : GLU OE1 E0092 <- 2.46 -> DT N3 R0008 : score 1.86763 : H : LYS NZ E0094 <- 2.74 -> DT O2 R0008 : score 3.63023 : H : LYS NZ K0113 <- 2.45 -> DG N7 R0004 : score 5.76291 : H : ARG NH1 K0185 <- 2.85 -> DA N7 R0003 : score 2.53465 : H : GLN NE2 K0191 <- 3.08 -> DT O2 R0007 : score 3.71307 >8hni_FL: title=HNRNP A2/B1 RRMS IN COMPLEX WITH TELOMERIC DNA organism=Homo sapiens : H : GLN NE2 F0019 <- 2.94 -> DG O6 W0010 : score 5.64258 : H : LYS NZ F0022 <- 3.04 -> DG N7 W0010 : score 5.12737 : H : ASP OD1 F0049 <- 3.26 -> DG N2 W0011 : score 4.6762 : H : ARG NH2 F0099 <- 2.31 -> DG O6 W0012 : score 7.2468 : H : LYS NZ L0113 <- 2.47 -> DG N7 W0004 : score 5.74137 : H : LYS NZ L0113 <- 3.11 -> DG O6 W0004 : score 5.42236 : H : ARG NH1 L0185 <- 3.12 -> DA N7 W0003 : score 2.3964 >8hni_K:RNA-binding_domain,_RBD; title=HNRNP A2/B1 RRMS IN COMPLEX WITH TELOMERIC DNA organism=Homo sapiens : H : LYS NZ K0113 <- 2.45 -> DG N7 R0004 : score 5.76291 : H : ARG NH1 K0185 <- 2.85 -> DA N7 R0003 : score 2.53465 : H : GLN NE2 K0191 <- 3.08 -> DT O2 R0007 : score 3.71307 >8hnv_A: title=CRYOEM STRUCTURE OF HPACAS9-SGRNA-DSDNA IN THE PRESENCE OF ACRIIC4 organism=? : H : GLN NE2 A0953 <- 2.80 -> DA N7 C0004 : score 6.08974 : H : TYR OH A0954 <- 2.88 -> DA N7 C0003 : score 4.08486 : H : TYR OH A0954 <- 2.92 -> DA N6 C0003 : score 4.55842 : x : MET xxxx A0821 <- 3.97 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0996 <- 3.61 -> DG xxx D0029 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0998 <- 4.12 -> DG xxx D0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0999 <- 3.36 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A1001 <- 3.16 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A1003 <- 4.25 -> DT xxx D0028 : score x.xxxxx >8hnw_A:Ribonuclease_H-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HPACAS9-SGRNA SURVEILLANCE COMPLEX BOUND TO DOUBLE-STRANDED DNA organism=Haemophilus parainfluenzae : H : GLN NE2 A0953 <- 3.42 -> DA N7 C0004 : score 5.33462 : H : TYR OH A0954 <- 2.80 -> DA N6 C0003 : score 4.67051 : H : THR OG1 A0999 <- 2.72 -> DA N6 D0006 : score 2.80312 : H : ASN ND2 A1001 <- 2.66 -> DA N7 C0005 : score 6.03489 : x : ASN xxxx A0996 <- 3.54 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0998 <- 3.46 -> DG xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A1003 <- 4.43 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >8hqy_ABCDEFGH: title=CRYO-EM STRUCTURE OF SSX1 BOUND TO THE H2AK119UB NUCLEOSOME AT A RESOLUTION OF 3.05 ANGSTROM organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.67 -> DG N3 I0083 : score 3.70412 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.41 -> DT O2 J0083 : score 4.56353 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.24 -> DT xxx J0143 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.58 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.99 -> DG xxx J0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.04 -> DG xxx I0050 : score x.xxxxx >8hr1_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF SSX1 BOUND TO THE UNMODIFIED NUCLEOSOME AT A RESOLUTION OF 3.02 ANGSTROM organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.36 -> DT O2 I0009 : score 4.60587 : x : ARG xxxx A0042 <- 4.09 -> DT xxx J0071 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.23 -> DG xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.83 -> DG xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 2.59 -> DG xxx J0009 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.33 -> DC xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.46 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.28 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx >8hr1_F:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF SSX1 BOUND TO THE UNMODIFIED NUCLEOSOME AT A RESOLUTION OF 3.02 ANGSTROM organism=? : x : ARG xxxx F0045 <- 4.28 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx >8hr5_A:Zinc_beta-ribbon; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE CNCAS12F1-SGRNA-DNA COMPLEX organism=? : H : SER OG A0165 <- 3.38 -> DG O6 D0024 : score 3.61647 : H : ARG NH2 A0202 <- 2.93 -> DG O6 D0024 : score 6.4284 : H : ARG NH2 A0204 <- 3.18 -> DG N7 D0025 : score 5.89938 : x : TYR xxxx A0150 <- 3.15 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0162 <- 3.55 -> DC xxx E0004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0166 <- 4.30 -> DA xxx D0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0168 <- 3.54 -> DT xxx E0006 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0169 <- 3.08 -> DA xxx D0023 : score x.xxxxx >8hsg_I:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=THERMUS THERMOPHILUS RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=? : H : ARG NE I0422 <- 3.23 -> DG N3 N0021 : score 1.60419 : x : ARG xxxx I0420 <- 4.06 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx >8hsg_IJ: title=THERMUS THERMOPHILUS RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX organism=? : H : ASN OD1 J0593 <- 2.62 -> DC N4 N0010 : score 4.34456 : H : ASN OD1 J0593 <- 2.62 -> DC N4 N0010 : score 4.34456 : x : ARG xxxx I0420 <- 4.06 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0422 <- 3.12 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0705 <- 3.58 -> DG xxx T0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0706 <- 3.58 -> DG xxx T0023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J1088 <- 3.81 -> DA xxx T0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J1089 <- 3.53 -> DA xxx T0022 : score x.xxxxx >8hsr_I:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=THERMUS THERMOPHILUS RHO-ENGAGED RNAP ELONGATION COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx I0420 <- 3.03 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0422 <- 3.82 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0423 <- 4.05 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx >8hsr_IJ: title=THERMUS THERMOPHILUS RHO-ENGAGED RNAP ELONGATION COMPLEX organism=? : x : ARG xxxx I0420 <- 3.03 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0422 <- 3.82 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx I0423 <- 4.05 -> DG xxx N0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0593 <- 3.21 -> DC xxx N0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0705 <- 3.21 -> DG xxx T0023 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx J0706 <- 3.72 -> DG xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J1089 <- 4.29 -> DA xxx T0022 : score x.xxxxx >8htx_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF BANP IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=? : H : SER OG A0313 <- 3.01 -> DT O4 C0004 : score 3.40581 : H : ARG NE A0316 <- 3.05 -> DG N7 D0008 : score 4.20071 : H : ARG NH2 A0316 <- 2.68 -> DG O6 D0008 : score 6.7584 : H : ARG NH2 A0321 <- 2.90 -> DG N7 F0012 : score 6.25692 : H : SER OG B0313 <- 3.05 -> DT O4 E0004 : score 3.37737 : H : ARG NE B0316 <- 3.15 -> DG N7 F0008 : score 4.11227 : H : ARG NH2 B0316 <- 2.63 -> DG O6 F0008 : score 6.8244 : x : THR xxxx A0317 <- 4.09 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0320 <- 3.16 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0317 <- 3.91 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0321 <- 3.13 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx >8htx_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF BANP IN COMPLEX WITH METHYLATED DNA organism=? : H : SER OG B0313 <- 3.05 -> DT O4 E0004 : score 3.37737 : H : ARG NE B0316 <- 3.15 -> DG N7 F0008 : score 4.11227 : H : ARG NH2 B0316 <- 2.63 -> DG O6 F0008 : score 6.8244 : x : THR xxxx B0317 <- 3.91 -> DT xxx E0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0321 <- 3.13 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx >8hxy_A:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HISTONE DEACETYLASE COMPLEX RPD3S IN COMPLEX WITH NUCLEOSOME organism=? : x : HIS xxxx A0039 <- 4.18 -> DT xxx J0162 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 2.90 -> DG xxx I0260 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0041 <- 3.89 -> DG xxx I0183 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.26 -> DT xxx J0069 : score x.xxxxx >8hxz_C:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF EAF3 CHD IN COMPLEX WITH NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH2 C0011 <- 2.37 -> DT O2 J0314 : score 4.5974 : H : ARG NH2 C0011 <- 2.57 -> DT O2 I0031 : score 4.42807 >8hyj_ABE: title=A CRYO-EM STRUCTURE OF KTF1-BOUND POLYMERASE V TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX organism=? : V : PHE CD2 B0344 <- 3.79 -> DT C7 N-002 : score 6.52807 : x : LYS xxxx A0240 <- 4.07 -> DG xxx N-009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0241 <- 3.99 -> DG xxx N-009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0416 <- 3.61 -> DA xxx T0000 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0772 <- 3.65 -> DT xxx T-001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0773 <- 3.25 -> DT xxx T-001 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0468 <- 3.64 -> DG xxx N-004 : score x.xxxxx >8hyj_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=A CRYO-EM STRUCTURE OF KTF1-BOUND POLYMERASE V TRANSCRIPTION ELONGATION COMPLEX organism=? : V : PHE CD2 B0344 <- 3.79 -> DT C7 N-002 : score 6.52807 : x : MET xxxx B0468 <- 3.64 -> DG xxx N-004 : score x.xxxxx >8i23_C:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CLOSTRIDIUM THERMOCELLUM RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION OPEN COMPLEX WITH SIGI1 AND ITS PROMOTER organism=? : x : ARG xxxx C0131 <- 4.17 -> DC xxx P0098 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0168 <- 3.25 -> DA xxx O0062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0240 <- 3.48 -> DA xxx O0058 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0243 <- 3.79 -> DT xxx O0057 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0491 <- 4.18 -> DC xxx P0098 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0519 <- 3.39 -> DA xxx O0063 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0544 <- 3.57 -> DG xxx P0093 : score x.xxxxx >8i23_CDF: title=CLOSTRIDIUM THERMOCELLUM RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION OPEN COMPLEX WITH SIGI1 AND ITS PROMOTER organism=? : H : GLU OE2 F0044 <- 3.07 -> DT N3 O0055 : score 2.49356 : H : ARG NH1 F0102 <- 3.33 -> DG O6 O0048 : score 5.4385 : H : ASP OD2 F0105 <- 2.60 -> DC N4 O0047 : score 6.448 : H : ARG NH2 F0108 <- 3.01 -> DG O6 P0107 : score 6.3228 : V : ARG CB F0217 <- 3.70 -> DT C7 P0127 : score 1.03026 : x : ARG xxxx C0131 <- 4.17 -> DC xxx P0098 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0168 <- 3.25 -> DA xxx O0062 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0240 <- 3.48 -> DA xxx O0058 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0243 <- 3.79 -> DT xxx O0057 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0491 <- 4.18 -> DC xxx P0098 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0519 <- 3.39 -> DA xxx O0063 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0544 <- 3.57 -> DG xxx P0093 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0793 <- 3.36 -> DA xxx P0092 : score x.xxxxx : x : ALA 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xxx O0049 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.63 -> DA xxx O0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0101 <- 3.12 -> DG xxx O0048 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0104 <- 3.59 -> DC xxx P0106 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0120 <- 3.70 -> DA xxx P0101 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0121 <- 2.93 -> DA xxx P0101 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0122 <- 3.89 -> DA xxx P0101 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0125 <- 3.03 -> DA xxx P0100 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0173 <- 3.75 -> DA xxx O0032 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0205 <- 3.42 -> DT xxx O0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0215 <- 3.09 -> DG xxx P0128 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0218 <- 3.52 -> DT xxx P0127 : score x.xxxxx >8i24_CDF: title=CLOSTRIDIUM THERMOCELLUM RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION OPEN COMPLEX WITH SIGI6 AND ITS PROMOTER organism=? : H : GLU OE2 F0074 <- 3.05 -> DA N6 O0049 : score 2.89872 : H : HIS NE2 F0084 <- 2.91 -> DA N3 O0050 : score 4.15274 : H : ARG NH1 F0097 <- 2.58 -> DA N3 O0049 : score 3.84406 : H : ARG NH1 F0098 <- 2.40 -> DG O6 O0048 : score 6.57 : H : ASP OD2 F0101 <- 2.57 -> DC N4 O0047 : score 6.4852 : H : ARG NH1 F0104 <- 3.02 -> DG N7 P0107 : score 5.7838 : H : ARG NH1 F0104 <- 2.87 -> DG O6 P0107 : score 5.99817 : H : ARG NH2 F0104 <- 3.13 -> DG N7 P0107 : score 5.96323 : H : GLU OE1 F0218 <- 2.84 -> DC N4 O0024 : score 5.72181 : V : PHE CZ F0041 <- 3.71 -> DT C7 O0055 : score 7.27496 : x : ARG xxxx C0131 <- 4.28 -> DT xxx P0099 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0168 <- 3.19 -> DA xxx O0062 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0184 <- 4.47 -> DA xxx O0061 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0240 <- 3.73 -> DA xxx O0058 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0244 <- 4.07 -> DA xxx O0056 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0485 <- 3.70 -> DA xxx P0100 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0519 <- 4.30 -> DT xxx O0063 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0544 <- 4.24 -> DA xxx P0093 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0133 <- 4.23 -> DC xxx P0088 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx D0224 <- 4.43 -> DT xxx P0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0326 <- 3.07 -> DA xxx O0058 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0793 <- 2.98 -> DT xxx P0092 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0794 <- 3.94 -> DT xxx P0092 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0015 <- 3.34 -> DT xxx O0055 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0016 <- 3.41 -> DA xxx O0054 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0018 <- 4.19 -> DT xxx O0055 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0019 <- 3.82 -> DA xxx O0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0040 <- 4.32 -> DT xxx O0055 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0043 <- 3.40 -> DT xxx O0055 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0044 <- 3.67 -> DT xxx O0055 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0046 <- 3.46 -> DT xxx O0057 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0050 <- 3.50 -> DT xxx O0057 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0056 <- 2.95 -> DT xxx O0057 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0057 <- 3.16 -> DT xxx O0057 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0078 <- 4.26 -> DA xxx O0049 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0080 <- 3.81 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : LYS 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xxx P0126 : score x.xxxxx >8i24_F:Sigma2_domain_of_RNA_polymerase_sigma_factors; title=CLOSTRIDIUM THERMOCELLUM RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION OPEN COMPLEX WITH SIGI6 AND ITS PROMOTER organism=? : H : GLU OE2 F0074 <- 3.05 -> DA N6 O0049 : score 2.89872 : H : HIS NE2 F0084 <- 2.91 -> DA N3 O0050 : score 4.15274 : H : ARG NH1 F0097 <- 2.58 -> DA N3 O0049 : score 3.84406 : H : ARG NH1 F0098 <- 2.40 -> DG O6 O0048 : score 6.57 : H : ASP OD2 F0101 <- 2.57 -> DC N4 O0047 : score 6.4852 : H : ARG NH1 F0104 <- 3.02 -> DG N7 P0107 : score 5.7838 : H : ARG NH1 F0104 <- 2.87 -> DG O6 P0107 : score 5.99817 : H : ARG NH2 F0104 <- 3.13 -> DG N7 P0107 : score 5.96323 : H : GLU OE1 F0218 <- 2.84 -> DC N4 O0024 : score 5.72181 : V : PHE CZ F0041 <- 3.71 -> DT C7 O0055 : score 7.27496 : x : THR xxxx F0015 <- 3.34 -> DT xxx O0055 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0016 <- 3.41 -> DA xxx O0054 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0018 <- 4.19 -> DT xxx O0055 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0019 <- 3.82 -> DA xxx O0054 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0040 <- 4.32 -> DT xxx O0055 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0043 <- 3.40 -> DT xxx O0055 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0044 <- 3.67 -> DT xxx O0055 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0046 <- 3.46 -> DT xxx O0057 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0050 <- 3.50 -> DT xxx O0057 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0056 <- 2.95 -> DT xxx O0057 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0057 <- 3.16 -> DT xxx O0057 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0078 <- 4.26 -> DA xxx O0049 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0080 <- 3.81 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0083 <- 3.05 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0085 <- 3.05 -> DC xxx O0052 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0086 <- 3.09 -> DA xxx O0054 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0088 <- 4.23 -> DA xxx O0054 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0090 <- 3.55 -> DA xxx O0050 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0093 <- 3.96 -> DA xxx O0049 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0094 <- 3.73 -> DA xxx O0049 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0100 <- 4.13 -> DC xxx P0106 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0107 <- 3.37 -> DA xxx P0103 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0113 <- 4.31 -> DG xxx P0101 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0117 <- 3.46 -> DG xxx P0101 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0118 <- 3.92 -> DG xxx P0101 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0171 <- 3.75 -> DA xxx O0032 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0213 <- 4.26 -> DT xxx P0128 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0214 <- 3.01 -> DT xxx O0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0215 <- 3.16 -> DG xxx O0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0219 <- 3.44 -> DT xxx P0126 : score x.xxxxx >8i54_A: title=LB2CAS12A RNA DNA COMPLEX organism=? : x : TYR xxxx A0147 <- 3.97 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0148 <- 3.60 -> DT xxx D-004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0518 <- 4.15 -> DA xxx C0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0567 <- 3.66 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0568 <- 3.65 -> DA xxx C0002 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0571 <- 3.08 -> DA 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TIR-APAZ/AGO-GRNA-DNA COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 C0263 <- 2.25 -> DC O2 K0005 : score 4.10558 : x : HIS xxxx C0358 <- 3.26 -> DA xxx K0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0362 <- 3.60 -> DA xxx K0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0328 <- 4.43 -> DC xxx K0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0435 <- 4.18 -> DC xxx K0016 : score x.xxxxx >8i87_FG:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF TIR-APAZ/AGO-GRNA-DNA COMPLEX organism=? : H : HIS ND1 F0251 <- 2.45 -> DC O2 E0018 : score 3.45006 : H : HIS NE2 G0358 <- 2.69 -> DA N3 E0014 : score 4.33957 : x : PHE xxxx F0245 <- 3.82 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0248 <- 3.54 -> DC xxx E0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0328 <- 4.14 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0263 <- 3.33 -> DC xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0362 <- 3.64 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx >8i87_G:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF TIR-APAZ/AGO-GRNA-DNA COMPLEX organism=? : H : HIS NE2 G0358 <- 2.69 -> DA N3 E0014 : score 4.33957 : x : ARG xxxx G0263 <- 3.33 -> DC xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0362 <- 3.64 -> DA xxx E0014 : score x.xxxxx >8i87_OT:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF TIR-APAZ/AGO-GRNA-DNA COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 O0263 <- 2.30 -> DC O2 U0005 : score 4.06859 : H : HIS NE2 O0358 <- 2.90 -> DA N3 U0014 : score 4.16123 : x : ARG xxxx O0362 <- 3.56 -> DC xxx U0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx T0072 <- 4.39 -> DT xxx U0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx T0287 <- 3.94 -> DT xxx U0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx T0328 <- 4.09 -> DC xxx U0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx T0435 <- 4.45 -> DC xxx U0016 : score x.xxxxx >8ia3_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN USF2 BHLHLZ DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : HIS NE2 A0240 <- 3.09 -> DA N6 C0316 : score -5.69789 : H : HIS NE2 A0240 <- 3.44 -> DT O4 D0328 : score 4.89103 : H : GLU OE2 A0244 <- 2.83 -> DA N6 D0330 : score 3.03297 : H : GLU OE2 B0244 <- 2.76 -> DC N4 C0310 : score 5.30751 : x : ASN xxxx A0241 <- 3.31 -> DT xxx C0314 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0243 <- 4.08 -> DG xxx D0327 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0247 <- 3.62 -> DT xxx D0328 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0248 <- 3.86 -> DC xxx C0312 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0240 <- 2.93 -> DC xxx D0335 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0241 <- 3.85 -> DT xxx D0333 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0243 <- 3.58 -> DG xxx C0308 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0247 <- 3.74 -> DC xxx C0310 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0248 <- 3.36 -> DC xxx D0331 : score x.xxxxx >8ia3_B:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain;Leucine_zipper_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN USF2 BHLHLZ DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : GLU OE2 B0244 <- 2.76 -> DC N4 C0310 : score 5.30751 : x : HIS xxxx B0240 <- 2.93 -> DC xxx D0335 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0241 <- 3.85 -> DT xxx D0333 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0243 <- 3.58 -> DG xxx C0308 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0247 <- 3.74 -> DC xxx C0310 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0248 <- 3.36 -> DC xxx D0331 : score x.xxxxx >8ia3_EF: title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN USF2 BHLHLZ DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : GLU OE2 E0244 <- 2.46 -> DC N4 H0329 : score 5.62343 : x : HIS xxxx E0240 <- 3.33 -> DG xxx G0315 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0241 <- 3.58 -> DT xxx G0314 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0243 <- 3.98 -> DG xxx H0327 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0247 <- 3.10 -> DC xxx H0329 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0248 <- 3.76 -> DC xxx G0312 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0239 <- 4.16 -> DC xxx G0306 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0240 <- 3.24 -> DC xxx H0335 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0241 <- 3.64 -> DT xxx H0333 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0243 <- 3.99 -> DG xxx G0308 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0244 <- 3.14 -> DC xxx G0310 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0247 <- 4.05 -> DC xxx G0310 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0248 <- 3.53 -> DC xxx H0331 : score x.xxxxx >8ibw_C:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURE OF R2 WITH 3'UTR AND DNA IN BINDING STATE organism=? : H : LYS NZ C0149 <- 3.06 -> DT O2 B0048 : score 3.40065 : H : ARG NH1 C0198 <- 3.22 -> DT O4 A0011 : score 2.99344 : H : ARG NH2 C0198 <- 3.26 -> DG O6 A0010 : score 5.9928 : H : LYS NZ C0675 <- 3.31 -> DG N7 A0019 : score 4.83654 : H : LYS NZ C0675 <- 2.96 -> DG O6 A0020 : score 5.59578 : x : ARG xxxx C0125 <- 4.31 -> DT xxx B0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0151 <- 3.10 -> DG xxx B0046 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0191 <- 2.35 -> DC xxx B0051 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0194 <- 3.03 -> DG xxx A0008 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0673 <- 3.60 -> DG xxx A0017 : score x.xxxxx >8ibx_C:DNA/RNA_polymerases; title=STRUCTURE OF R2 WITH 3'UTR AND DNA IN UNWINDING STATE organism=? : H : GLU OE2 C0191 <- 2.42 -> DC N4 B0051 : score 5.66555 : H : LYS NZ C0194 <- 2.75 -> DG N7 A0009 : score 5.43976 : H : HIS ND1 C0673 <- 2.89 -> DG O6 A0017 : score 6.11106 : x : ARG xxxx C0125 <- 3.75 -> DC xxx B0040 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0129 <- 4.18 -> DT xxx A0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0149 <- 3.24 -> DT xxx B0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0151 <- 3.78 -> DG xxx B0046 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0198 <- 3.40 -> DG xxx A0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0675 <- 3.94 -> DG xxx A0019 : score x.xxxxx >8ica_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DATP (1 MILLIMOLAR) AND CACL2 (5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.91 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >8icb_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF ARTIFICIAL MOTHER LIQUOR organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.57 -> DG N3 P0007 : score 2.232 >8icc_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA (NO 5'-PHOSPHATE) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.54 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >8ice_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DATP (1 MILLIMOLAR) AND CDCL2 (1 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 6.05 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >8icf_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DATP (10 MILLIMOLAR) AND MGCL2 (50 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 6.14 -> DT O2 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IN THE PRESENCE OF DGTP (1 MILLIMOLAR) AND MGCL2 (5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.98 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >8icj_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX + THYMIDINE-5'- TRIPHOSPHATE, SOAKED IN THE PRESENCE OF DTTP AND MGCL2 organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.71 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >8ick_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DATP (1 MILLIMOLAR), MGCL2 (5 MILLIMOLAR), AND MNCL2 (5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 6.43 -> DA N3 T0002 : score 1.538 : w : LYS NZ A0234 <- 6.11 -> DT O2 T0003 : score 0.522 : w : LYS NZ A0234 <- 5.80 -> DG N3 P0007 : score 2.232 : w : ARG NH2 A0258 <- 6.14 -> DG N3 P0007 : score 0.677 >8icl_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DATP (1 MILLIMOLAR) AND NICL2 (5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.28 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >8icm_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DATP (1 MILLIMOLAR), MNCL2 (5 MILLIMOLAR), AND AMMONIUM SULFATE (75 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 6.47 -> DT O2 T0004 : score 1.55 : w : LYS NZ A0234 <- 5.97 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >8icn_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF ATP (1 MILLIMOLAR) AND MNCL2 (5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 6.56 -> DA N3 T0002 : score 1.538 : w : LYS NZ A0234 <- 5.83 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >8ico_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF AZT-TP (1 MILLIMOLAR) AND MNCL2 (5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.77 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >8icp_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DATP (1 MILLIMOLAR) AND MNCL2 (5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 6.04 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >8icq_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF OF DATP (0.1 MILLIMOLAR) AND MNCL2 (0.5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.84 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >8icr_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DATP (1 MILLIMOLAR) AND MNCL2 (5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 6.64 -> DA N3 T0002 : score 1.538 : w : LYS NZ A0234 <- 5.20 -> DT O2 T0003 : score 0.522 : w : LYS NZ A0234 <- 5.36 -> DG N3 P0007 : score 2.232 >8ics_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DCTP (1 MILLIMOLAR) AND MNCL2 (5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.38 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >8ict_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DCTP (1 MILLIMOLAR) AND MNCL2 (5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.50 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >8icu_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DDATP (1 MILLIMOLAR) AND MNCL2 (5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.74 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >8icv_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DGTP (1 MILLIMOLAR) AND MNCL2 (5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.76 -> DT xxx P0006 : score x.xxxxx >8icw_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DTTP (1 MILLIMOLAR) AND MNCL2 (5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.75 -> DT xxx P0006 : score x.xxxxx >8icx_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DTTP (1 MILLIMOLAR) AND MNCL2 (5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.48 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >8icy_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX + THYMIDINE-5'- TRIPHOSPHATE, SOAKED IN THE PRESENCE OF DTTP AND MNCL2 organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 6.16 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >8icz_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF OF DATP (1 MILLIMOLAR), MNCL2 (5 MILLIMOLAR), AND LITHIUM SULFATE (75 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.59 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >8ieg_CDEFGHKL:Histone-fold; title=BRE1(MRBD-RING)/RAD6-UB/NUCLEOSOME COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 C0011 <- 3.07 -> DT O2 J0043 : score 4.07386 : H : ARG NH1 C0011 <- 2.69 -> DG N3 I-042 : score 3.11972 : H : ARG NH2 C0011 <- 2.47 -> DT O2 J0043 : score 4.51273 : H : ARG NH1 G0011 <- 2.55 -> DT O2 J-042 : score 4.52173 : H : ARG NH2 G0011 <- 2.72 -> DA N3 I0043 : score 3.29158 : H : ARG NH1 K0040 <- 3.24 -> DG N3 J0009 : score 2.78394 : H : ARG NH2 K0040 <- 3.31 -> DG N3 J0009 : score 3.24201 : x : ARG xxxx K0083 <- 3.12 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0045 <- 4.38 -> DC xxx J0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.26 -> DC xxx J0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.73 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 2.74 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.24 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.09 -> DG xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.90 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >8ieg_K:Histone-fold; title=BRE1(MRBD-RING)/RAD6-UB/NUCLEOSOME COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 K0040 <- 3.24 -> DG N3 J0009 : score 2.78394 : H : ARG NH2 K0040 <- 3.31 -> DG N3 J0009 : score 3.24201 : x : ARG xxxx K0083 <- 3.12 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx >8iej_CDEFGHKL: title=RNF20-RNF40/HRAD6A-UB/NUCLEOSOME COMPLEX organism=? : H : ARG NH1 G0011 <- 2.67 -> DT O2 J-042 : score 4.41838 : H : ARG NH2 G0011 <- 2.80 -> DA N3 I0043 : score 3.23974 : H : ARG NH2 K0040 <- 3.16 -> DG N3 J0009 : score 3.35032 : x : ARG xxxx C0011 <- 3.47 -> DT xxx J0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 3.84 -> DT xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.33 -> DC xxx J0049 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0039 <- 4.48 -> DG xxx I-069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 2.99 -> DT xxx I0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.48 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.19 -> DG xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 4.44 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx K0083 <- 3.77 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx >8iej_K:Histone-fold; title=RNF20-RNF40/HRAD6A-UB/NUCLEOSOME COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 K0040 <- 3.16 -> DG N3 J0009 : score 3.35032 : x : ARG xxxx K0083 <- 3.77 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx >8ifo_A:Glucocorticoid_receptor-like_DNA-binding_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF ESTROGEN RELATED RECEPTOR-GAMMA DNA BINDING DOMAIN COMPLEXED WITH PLA2G12B PROMOTER organism=Homo sapiens : H : GLU OE1 A0146 <- 2.96 -> DC N4 D0014 : score 5.58337 : w : GLU OE2 A0146 <- 6.21 -> DC N4 D0015 : score 3.597 : H : LYS NZ A0149 <- 2.79 -> DG N7 C0003 : score 5.39667 : H : LYS NZ 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xxxx A0150 <- 3.79 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0150 <- 3.58 -> DC xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0154 <- 3.44 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx >8igr_ACDGIJL:Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators;Translation_proteins_SH3-like_domain;Ribosomal_protein_S3_C-terminal_domain;Prokaryotic_type_KH_domain_KH-domain_type_II; title=CRYO-EM STRUCTURE OF CII-DEPENDENT TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX organism=? : H : SER OG A0038 <- 2.34 -> DT O4 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TRANSCRIPTION ACTIVATION COMPLEX organism=? : H : SER OG C0038 <- 2.95 -> DC N4 T0052 : score 3.56537 : H : ARG NH1 C0042 <- 3.01 -> DG O6 N0034 : score 5.82783 : H : ARG NH2 C0042 <- 2.93 -> DG N7 N0034 : score 6.21862 : V : LYS CB C0037 <- 3.85 -> DT C7 N0032 : score 2.27682 : x : THR xxxx C0026 <- 4.38 -> DT xxx N0032 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0027 <- 4.19 -> DT xxx N0031 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0036 <- 4.04 -> DC xxx T0052 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0039 <- 3.01 -> DG xxx T0051 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0041 <- 3.53 -> DT xxx N0033 : score x.xxxxx >8igs_IJL:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RNAP-PROMOTER OPEN COMPLEX AT LAMBDA PROMOTER PRE organism=? : H : GLN NE2 L0437 <- 2.81 -> DT O4 N0048 : score 5.18064 : H : ARG NH1 L0441 <- 2.78 -> DG N7 N0047 : score 6.0742 : H : ARG NH2 L0441 <- 3.04 -> DG O6 N0047 : score 6.2832 : H : GLU OE2 L0458 <- 3.24 -> DC N4 T0039 : score 4.80203 : V : HIS CG L0455 <- 3.75 -> DT C7 N0044 : score 3.03646 : x : ARG xxxx I0542 <- 2.71 -> DA xxx 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score 5.18064 : H : ARG NH1 L0441 <- 2.78 -> DG N7 N0047 : score 6.0742 : H : ARG NH2 L0441 <- 3.04 -> DG O6 N0047 : score 6.2832 : H : GLU OE2 L0458 <- 3.24 -> DC N4 T0039 : score 4.80203 : V : HIS CG L0455 <- 3.75 -> DT C7 N0044 : score 3.03646 : x : PHE xxxx L0419 <- 3.94 -> DA xxx N0050 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0420 <- 3.35 -> DA xxx N0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0423 <- 2.83 -> DA xxx N0050 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0425 <- 3.75 -> DA xxx N0050 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0430 <- 3.81 -> DA xxx N0050 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx L0434 <- 3.99 -> DT xxx N0048 : score x.xxxxx : x : THR xxxx L0440 <- 3.11 -> DT xxx T0037 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx L0454 <- 4.03 -> DT xxx N0046 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx L0585 <- 3.94 -> DT xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx L0586 <- 3.55 -> DC xxx N0025 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx L0589 <- 3.66 -> DC xxx N0025 : score x.xxxxx >8in8_B: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE TARGET SSDNA-BOUND SIR2-APAZ/AGO-GRNA QUATERNARY COMPLEX organism=? : H : THR OG1 B0415 <- 2.78 -> DC O2 J0005 : score 2.63614 : x : PHE xxxx B0416 <- 3.15 -> DT xxx J0004 : score x.xxxxx >8in8_BC:Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE TARGET SSDNA-BOUND SIR2-APAZ/AGO-GRNA QUATERNARY COMPLEX organism=? : H : THR OG1 B0415 <- 2.78 -> DC O2 J0005 : score 2.63614 : x : PHE xxxx B0416 <- 3.15 -> DT xxx J0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0079 <- 4.23 -> DT xxx J0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0080 <- 4.48 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0082 <- 3.95 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0083 <- 3.80 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0084 <- 4.06 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0190 <- 3.38 -> DT xxx J0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0394 <- 4.20 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0396 <- 4.35 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0399 <- 4.45 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0400 <- 3.67 -> DT xxx J0016 : score x.xxxxx >8in8_C:Ribonuclease_H-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE TARGET SSDNA-BOUND SIR2-APAZ/AGO-GRNA QUATERNARY COMPLEX organism=? : x : GLU xxxx C0079 <- 4.23 -> DT xxx J0017 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0080 <- 4.48 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0082 <- 3.95 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0083 <- 3.80 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0084 <- 4.06 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0190 <- 3.38 -> DT xxx J0017 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0394 <- 4.20 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0396 <- 4.35 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0399 <- 4.45 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0400 <- 3.67 -> DT xxx J0016 : score x.xxxxx >8iqi_ABCDEF:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=STRUCTURE OF FULL-LENGTH ASFVPRIMPOL IN COMPLEX-FORM organism=? : x : LYS xxxx A0675 <- 4.50 -> DT xxx G0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0675 <- 3.39 -> DT xxx G0007 : score 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score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0263 <- 4.06 -> DA xxx D0036 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0289 <- 3.88 -> DA xxx D0039 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0358 <- 3.18 -> DC xxx D0043 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0434 <- 4.06 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0435 <- 3.50 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0438 <- 4.24 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0439 <- 4.48 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0442 <- 3.13 -> DA xxx D0044 : score x.xxxxx >8isz_B:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF CRT-SPARTA-GRNA-TDNA MONOMER organism=? : x : ARG xxxx B0263 <- 4.06 -> DA xxx D0036 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0289 <- 3.88 -> DA xxx D0039 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0358 <- 3.18 -> DC xxx D0043 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0434 <- 4.06 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0435 <- 3.50 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0438 <- 4.24 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx 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H0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0362 <- 3.66 -> DT xxx H0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0434 <- 2.79 -> DT xxx H0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0435 <- 3.11 -> DT xxx H0045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0438 <- 3.56 -> DT xxx H0045 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0439 <- 4.44 -> DA xxx H0044 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0440 <- 3.97 -> DA xxx H0044 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0442 <- 4.05 -> DA xxx H0044 : score x.xxxxx >8it1_AB: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CRT-SPARTA-GRNA-TDNA TETRAMER (NADASE ACTIVE FORM) organism=? : H : ARG NH2 B0263 <- 2.25 -> DT O2 C0035 : score 4.699 : H : HIS NE2 B0358 <- 2.32 -> DC O2 C0043 : score 5.79475 : x : SER xxxx A0391 <- 4.26 -> DA xxx C0039 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0435 <- 3.41 -> DT xxx C0045 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0289 <- 4.03 -> DT xxx C0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0362 <- 4.07 -> DT xxx C0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0434 <- 3.31 -> DT xxx C0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0435 <- 3.00 -> DT xxx C0045 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0439 <- 4.47 -> DA xxx C0044 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0442 <- 2.99 -> DA xxx C0044 : score x.xxxxx >8it1_EF: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CRT-SPARTA-GRNA-TDNA TETRAMER (NADASE ACTIVE FORM) organism=? : H : HIS NE2 F0358 <- 2.62 -> DC O2 G0043 : score 5.47752 : x : ARG xxxx E0362 <- 4.31 -> DA xxx G0039 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0391 <- 4.31 -> DA xxx G0039 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0263 <- 3.96 -> DT xxx G0035 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0289 <- 3.64 -> DC xxx G0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0362 <- 4.10 -> DC xxx G0043 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0431 <- 3.16 -> DT xxx G0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0434 <- 2.95 -> DT xxx G0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0435 <- 3.42 -> DT xxx G0045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0438 <- 2.76 -> DT xxx G0045 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0442 <- 3.09 -> DA xxx G0044 : score x.xxxxx >8it1_IJ: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CRT-SPARTA-GRNA-TDNA TETRAMER (NADASE ACTIVE FORM) organism=? : H : ARG NH2 J0263 <- 2.79 -> DT O2 K0035 : score 4.2418 : x : MET xxxx I0435 <- 4.08 -> DT xxx K0045 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx J0289 <- 3.25 -> DC xxx K0037 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx J0358 <- 3.01 -> DC xxx K0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0362 <- 3.83 -> DC xxx K0043 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx J0431 <- 4.21 -> DT xxx K0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0434 <- 2.98 -> DT xxx K0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx J0435 <- 3.34 -> DT xxx K0045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx J0438 <- 3.01 -> DT xxx K0045 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0440 <- 3.58 -> DA xxx K0044 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx J0442 <- 3.82 -> DA xxx K0044 : score x.xxxxx >8it1_MN: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CRT-SPARTA-GRNA-TDNA TETRAMER (NADASE ACTIVE FORM) organism=? : x : SER xxxx M0391 <- 4.15 -> DA xxx O0039 : score x.xxxxx : x : MET xxxx M0435 <- 3.99 -> DT xxx O0045 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx N0289 <- 3.41 -> DT xxx O0038 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx N0358 <- 3.06 -> DC xxx O0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0362 <- 4.04 -> DA xxx O0044 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx N0431 <- 3.19 -> DT xxx O0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx N0434 <- 3.04 -> DT xxx O0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx N0435 <- 3.19 -> DT xxx O0045 : score x.xxxxx : x : THR xxxx N0440 <- 3.91 -> DC xxx O0043 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx N0442 <- 3.07 -> DA xxx O0044 : score x.xxxxx >8it1_N:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF CRT-SPARTA-GRNA-TDNA TETRAMER (NADASE ACTIVE FORM) organism=? : x : LYS xxxx N0289 <- 3.41 -> DT xxx O0038 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx N0358 <- 3.06 -> DC xxx O0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0362 <- 4.04 -> DA xxx O0044 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx N0431 <- 3.19 -> DT xxx O0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx N0434 <- 3.04 -> DT xxx O0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx N0435 <- 3.19 -> DT xxx O0045 : score x.xxxxx : x : THR xxxx N0440 <- 3.91 -> DC xxx O0043 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx N0442 <- 3.07 -> DA xxx O0044 : score x.xxxxx >8ity_P:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN RNA POLYMERASE III PRE-INITIATION COMPLEX CLOSED DNA 1 organism=? : x : ARG xxxx P0110 <- 3.61 -> DA xxx X-012 : score x.xxxxx >8ity_V:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=HUMAN RNA POLYMERASE III PRE-INITIATION COMPLEX CLOSED DNA 1 organism=? : x : ARG xxxx V0110 <- 3.59 -> DG xxx Y0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx V0260 <- 3.57 -> DA xxx Y0034 : score x.xxxxx >8ity_W:Homeodomain-like; title=HUMAN RNA POLYMERASE III PRE-INITIATION COMPLEX CLOSED DNA 1 organism=? : x : ARG xxxx W0295 <- 3.17 -> DG xxx X-032 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx W0297 <- 2.91 -> DA xxx Y0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx W0343 <- 4.25 -> DT xxx X-034 : score x.xxxxx >8iue_34BEPUVW:TATA-box_binding_protein-like;Homeodomain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=RNA POLYMERASE III PRE-INITIATION COMPLEX MELTING COMPLEX 1 organism=? : H : HIS NE2 30193 <- 3.00 -> DA N7 X-049 : score 4.07631 : H : TYR 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: x : TYR xxxx 40403 <- 4.43 -> DT xxx X-064 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx 40440 <- 3.60 -> DA xxx Y0058 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx U0167 <- 2.96 -> DT xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx U0169 <- 3.34 -> DA xxx X-027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0197 <- 3.23 -> DA xxx Y0024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx U0212 <- 3.78 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0214 <- 3.39 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx U0220 <- 4.43 -> DT xxx X-026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx U0222 <- 3.29 -> DA xxx Y0026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx U0257 <- 4.21 -> DA xxx X-027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx U0259 <- 3.56 -> DA xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0288 <- 3.01 -> DT xxx X-030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx U0289 <- 3.36 -> DG xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx U0303 <- 3.45 -> DT xxx X-029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx U0305 <- 3.73 -> DA xxx Y0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx U0311 <- 3.31 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : THR xxxx U0313 <- 3.17 -> DT xxx X-029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx V0110 <- 4.30 -> DG xxx Y0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx W0297 <- 3.22 -> DA xxx Y0034 : score x.xxxxx >8j0k_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TFAP2A IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : SER OG A0222 <- 2.91 -> DC N4 D0011 : score 3.59478 : H : LYS NZ A0257 <- 2.89 -> DG N7 C0010 : score 5.28895 : H : LYS NZ A0257 <- 3.30 -> DG O6 D0003 : score 5.20269 : w : LYS NZ A0257 <- 6.12 -> DC N4 C0011 : score 0.048 : w : SER OG B0222 <- 5.69 -> DC N4 C0011 : score 2.105 : H : LYS NZ B0257 <- 2.88 -> DG O6 C0003 : score 5.68828 : H : LYS NZ B0257 <- 2.92 -> DG N7 D0010 : score 5.25664 : x : ALA xxxx A0256 <- 3.47 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0256 <- 3.49 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx >8j0k_B: title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TFAP2A IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : w : SER OG B0222 <- 5.69 -> DC N4 C0011 : score 2.105 : H : LYS NZ B0257 <- 2.92 -> DG N7 D0010 : score 5.25664 : H : LYS NZ B0257 <- 2.88 -> DG O6 C0003 : score 5.68828 : x : ALA xxxx B0256 <- 3.49 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx >8j0r_A: title=STRUCTURE OF HUMAN TFAP2A IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : SER OG A0222 <- 2.93 -> DC N4 D0011 : score 3.58007 : H : LYS NZ A0257 <- 2.99 -> DG O6 D0003 : score 5.5611 : H : LYS NZ A0257 <- 2.81 -> DG N7 C0010 : score 5.37513 : x : ALA xxxx A0256 <- 3.38 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx >8j0r_AB: title=STRUCTURE OF HUMAN TFAP2A IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : SER OG A0222 <- 2.93 -> DC N4 D0011 : score 3.58007 : H : LYS NZ A0257 <- 2.99 -> DG O6 D0003 : score 5.5611 : H : LYS NZ A0257 <- 2.81 -> DG N7 C0010 : score 5.37513 : H : LYS NZ B0257 <- 2.80 -> DG N7 D0010 : score 5.3859 : H : LYS NZ B0257 <- 2.95 -> DG O6 C0003 : score 5.60735 : x : ALA xxxx A0256 <- 3.38 -> DA xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0222 <- 3.42 -> DC xxx C0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0256 <- 3.43 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx >8j12_B: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE ASCAS12F-SGRNA-TARGET DNA TERNARY COMPLEX organism=? : x : LYS xxxx B0003 <- 3.73 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0005 <- 4.29 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0241 <- 4.18 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0242 <- 3.46 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx >8j1j_B: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE ASCAS12F-YHAM-SGRNAS3-5V7-TARGET DNA organism=? : x : LYS xxxx B0003 <- 3.60 -> DG xxx D0004 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0240 <- 4.15 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0241 <- 4.09 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0242 <- 3.23 -> DC xxx D0001 : score x.xxxxx >8j3r_B: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE ASCAS12F-HKRA-SGRNAS3-5V7-TARGET DNA organism=? : x : PRO xxxx B0240 <- 3.95 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0242 <- 3.09 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx >8j6s_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE SINGLE CAF-1 BOUND RIGHT-HANDED DI-TETRASOME organism=? : x : ARG xxxx H0045 <- 4.35 -> DT xxx J0107 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0045 <- 4.44 -> DC xxx I0096 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0045 <- 3.76 -> DC xxx I0107 : score x.xxxxx >8jh2_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX BOUND WITH ELF1, SPT4/5 AND FOREIGN DNA, STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME organism=? : x : LYS xxxx A0318 <- 2.87 -> DC xxx T0042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0351 <- 3.93 -> DA xxx T0034 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0448 <- 4.23 -> DC xxx T0033 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0449 <- 3.64 -> DA xxx T0032 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0832 <- 3.29 -> DA xxx T0032 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0833 <- 3.84 -> DA xxx T0032 : score x.xxxxx >8jh3_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX CONTAINING 40 BP UPSTREAM DNA LOOP, STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx A1389 <- 4.31 -> DG xxx T0028 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A1407 <- 3.78 -> DG xxx T0028 : score x.xxxxx >8jh4_f:Histone-fold; title=RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX CONTAINING 60 BP UPSTREAM DNA LOOP, STALLED AT SHL(-1) OF THE NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx f0045 <- 4.33 -> DC xxx T0007 : score x.xxxxx >8jhf_ABCDEFGH: title=NATIVE SUV420H1 BOUND TO 167-BP NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx D0030 <- 4.23 -> DG xxx J0132 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.04 -> DG xxx I0132 : score x.xxxxx >8jhg_ABCDEFGH: title=NATIVE SUV420H1 BOUND TO 167-BP NUCLEOSOME organism=? : H : TYR OH A0041 <- 2.64 -> DG N2 J0092 : score 5.04622 : H : TYR OH A0041 <- 2.84 -> DT O2 J0093 : score 3.19093 : x : HIS xxxx C0124 <- 3.39 -> DC xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 4.35 -> DG xxx J0132 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.58 -> DG xxx I0093 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.51 -> DC xxx I0133 : score x.xxxxx >8jho_e:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HISTONE DEACETYLASE COMPLEX RPD3S IN COMPLEX WITH DI-NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH1 e0040 <- 2.88 -> DG N3 I0083 : score 3.00372 : H : ARG NH2 e0040 <- 2.97 -> DG N3 I0083 : score 3.48751 : x : HIS xxxx e0039 <- 3.32 -> DT xxx J0339 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx e0041 <- 4.18 -> DG xxx I0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx e0065 <- 4.30 -> DC xxx I0092 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx e0083 <- 3.88 -> DT xxx J0246 : score x.xxxxx >8jkl_CD: title=IRF4 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO AN DNA CONTAINING GATA MOTIF organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 C0098 <- 2.93 -> DG N7 A0006 : score 6.21862 : H : LYS NZ C0103 <- 2.68 -> DG N7 B0010 : score 5.51516 : x : THR xxxx C0095 <- 3.65 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx C0099 <- 3.74 -> DA xxx A0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0059 <- 3.62 -> DA xxx A0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0098 <- 3.48 -> DC xxx A0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0099 <- 3.81 -> DA xxx A0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0100 <- 4.28 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0103 <- 3.61 -> DG xxx A0014 : score x.xxxxx >8jkl_G:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=IRF4 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO AN DNA CONTAINING GATA MOTIF organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 G0098 <- 3.15 -> DG N7 E0006 : score 5.93769 : x : THR xxxx G0095 <- 3.54 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx G0099 <- 3.83 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0103 <- 3.22 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx >8jkl_GH: title=IRF4 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO AN DNA CONTAINING GATA MOTIF organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 G0098 <- 3.15 -> DG N7 E0006 : score 5.93769 : H : LYS NZ H0103 <- 2.67 -> DG N7 E0014 : score 5.52593 : x : THR xxxx G0095 <- 3.54 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx G0099 <- 3.83 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0103 <- 3.22 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0023 <- 4.29 -> DT xxx F0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0059 <- 3.19 -> DC xxx F0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0098 <- 3.42 -> DC xxx E0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx H0099 <- 3.64 -> DA xxx E0013 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0100 <- 4.28 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx >8jkn_G:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=T95R MUTANT IRF4 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO AN DNA CONTAINING GAAA MOTIF organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 G0098 <- 3.04 -> DG N7 E0006 : score 6.07815 : H : CYS SG G0099 <- 3.66 -> DT O4 F0012 : score 5.8788 : H : LYS NZ G0103 <- 2.62 -> DG N7 F0010 : score 5.57979 : H : LYS NZ G0103 <- 2.57 -> DG O6 F0010 : score 6.04668 : x : ARG xxxx G0095 <- 3.43 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx >8jko_G:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=T95R MUTANT IRF4 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO AN DNA CONTAINING GATA MOTIF organism=Homo sapiens : H : ARG NH2 G0098 <- 3.19 -> DG N7 E0006 : score 5.88662 : H : LYS NZ G0103 <- 2.89 -> DG N7 F0010 : score 5.28895 : H : LYS NZ G0103 <- 3.12 -> DG O6 F0010 : score 5.4108 : V : ARG CZ G0095 <- 3.52 -> DT C7 F0013 : score 2.28157 : x : CYS xxxx G0099 <- 3.70 -> DA xxx E0007 : score x.xxxxx >8jkq_DG: title=T95R MUTANT IRF4 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO AN DNA CONTAINING GACA MOTIF organism=Homo sapiens : H : CYS SG G0099 <- 2.91 -> DC N4 B0006 : score -3.39542 : H : LYS NZ G0103 <- 2.95 -> DG N7 A0014 : score 5.22432 : H : LYS NZ G0103 <- 2.39 -> DG O6 A0014 : score 6.25479 : x : ARG xxxx D0095 <- 3.43 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0098 <- 3.23 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0099 <- 3.99 -> DT xxx B0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0103 <- 3.19 -> DG xxx B0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0095 <- 3.63 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0098 <- 3.43 -> DG xxx A0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0100 <- 4.38 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx >8jkq_FH: title=T95R MUTANT IRF4 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO AN DNA CONTAINING GACA MOTIF organism=Homo sapiens : H : LYS NZ F0103 <- 3.21 -> DG N7 E0010 : score 4.94425 : H : LYS NZ F0103 <- 2.56 -> DG O6 E0010 : score 6.05825 : H : CYS SG H0099 <- 2.90 -> DC N4 E0006 : score -3.40236 : H : CYS SG H0099 <- 3.17 -> DA N6 C0013 : score 5.31382 : x : ARG xxxx F0098 <- 3.35 -> DT xxx C0005 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx F0099 <- 3.89 -> DT xxx E0011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0100 <- 4.10 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0103 <- 3.18 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx >8jkq_H:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=T95R MUTANT IRF4 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO AN DNA CONTAINING GACA MOTIF organism=Homo sapiens : H : CYS SG H0099 <- 2.90 -> DC N4 E0006 : score -3.40236 : H : CYS SG H0099 <- 3.17 -> DA N6 C0013 : score 5.31382 : x : ALA xxxx H0100 <- 4.10 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0103 <- 3.18 -> DT xxx E0005 : score x.xxxxx >8jks_CD: title=T95R MUTANT IRF4 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO AN DNA CONTAINING GAGA MOTIF organism=Homo sapiens : H : CYS SG C0099 <- 3.38 -> DC N4 B0012 : score -3.06907 : H : LYS NZ D0103 <- 2.42 -> DG O6 A0014 : score 6.22011 : H : LYS NZ D0103 <- 2.92 -> DT O4 B0005 : score 3.50109 : x : ARG xxxx C0095 <- 3.15 -> DC xxx B0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0098 <- 3.49 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0103 <- 3.29 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0056 <- 4.38 -> DG xxx A0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0095 <- 3.25 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0098 <- 3.12 -> DG xxx A0012 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0099 <- 3.29 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0100 <- 4.47 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx >8jks_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=T95R MUTANT IRF4 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO AN DNA CONTAINING GAGA MOTIF organism=Homo sapiens : H : LYS NZ D0103 <- 2.92 -> DT O4 B0005 : score 3.50109 : H : LYS NZ D0103 <- 2.42 -> DG O6 A0014 : score 6.22011 : x : HIS xxxx D0056 <- 4.38 -> DG xxx A0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0095 <- 3.25 -> DT xxx B0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0098 <- 3.12 -> DG xxx A0012 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx D0099 <- 3.29 -> DC xxx B0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0100 <- 4.47 -> DT xxx B0005 : score x.xxxxx >8jks_GH: title=T95R MUTANT IRF4 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO AN DNA CONTAINING GAGA MOTIF organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 G0098 <- 2.92 -> DG N7 E0006 : score 5.9048 : V : LYS CB H0103 <- 3.78 -> DT C7 F0004 : score 2.31717 : V : LYS CB G0103 <- 3.85 -> DT C7 F0011 : score 2.27682 : x : ARG xxxx G0095 <- 3.19 -> DT xxx F0013 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx G0099 <- 3.89 -> DC xxx F0012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0056 <- 4.48 -> DG xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0095 <- 3.25 -> DT xxx F0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0098 <- 3.43 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx H0099 <- 3.26 -> DC xxx F0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx H0100 <- 4.27 -> DT xxx F0005 : score x.xxxxx >8jl9_ABCDEFGH: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME WITH SCFV organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.81 -> DT O2 J0009 : score 4.22487 : H : ARG NH1 C0011 <- 3.12 -> DT O2 J0044 : score 4.0308 : H : ARG NH2 C0011 <- 2.89 -> DT O2 I-043 : score 4.15713 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.52 -> DT O2 I0009 : score 4.4704 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.47 -> DT xxx I0069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.07 -> DG xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.87 -> DG xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0011 <- 3.46 -> DT xxx J-043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.15 -> DG xxx I0038 : score x.xxxxx >8jla_ABCDEFGH: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME LACKING N-TERMINAL REGION OF H2A, H2B, H3, AND H4 organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 2.82 -> DT O2 J0009 : score 4.2164 : H : ARG NH2 C0011 <- 3.25 -> DA N3 J0043 : score 2.94817 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.77 -> DT O2 I0009 : score 4.25873 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.19 -> DT xxx I0069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.22 -> DG xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.31 -> DG xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0011 <- 3.35 -> DA xxx I0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.31 -> DG xxx I0038 : score x.xxxxx >8jlb_A:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE 145 BP HUMAN NUCLEOSOME CONTAINING H3.2 C110A MUTANT organism=? : H : ARG NH1 A0040 <- 2.96 -> DT O2 J0009 : score 4.16861 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.22 -> DG xxx J-069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.43 -> DA xxx J0026 : score x.xxxxx >8jlb_ABCDEFGH: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE 145 BP HUMAN NUCLEOSOME CONTAINING H3.2 C110A MUTANT organism=? : H : ARG NH1 A0040 <- 2.96 -> DT O2 J0009 : score 4.16861 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.22 -> DG xxx J-069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.43 -> DA xxx J0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 2.68 -> DT xxx I-042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.32 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.56 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 3.38 -> DG xxx J-008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.45 -> DA xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.46 -> DC xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.91 -> DT xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0011 <- 2.91 -> DG xxx J-042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.87 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.23 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >8jld_A:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE 145 BP HUMAN NUCLEOSOME CONTAINING ACETYLATED H3 TAIL organism=? : H : ARG NH1 A0040 <- 2.64 -> DT O2 J0009 : score 4.44422 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.36 -> DG xxx J-069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.48 -> DG xxx I-024 : score x.xxxxx >8jld_ABCDEFGH: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE 145 BP HUMAN NUCLEOSOME CONTAINING ACETYLATED H3 TAIL organism=? : H : ARG NH1 A0040 <- 2.64 -> DT O2 J0009 : score 4.44422 : H : ARG NH1 C0011 <- 2.22 -> DT O2 I-042 : score 4.80595 : H : ARG NH1 G0011 <- 2.95 -> DG N3 J-042 : score 2.96099 : H : ARG NH1 G0011 <- 3.24 -> DT O2 I0043 : score 3.92745 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.36 -> DG xxx J-069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.48 -> DG xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.23 -> DG xxx I-037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 4.05 -> DG xxx J0048 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0040 <- 2.92 -> DG xxx J-008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 4.47 -> DC xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.99 -> DT xxx I0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.86 -> DG xxx I0048 : score x.xxxxx >8jo2_CDFHI:cAMP-binding_domain-like;"Winged_helix"_DNA-binding_domain;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Putative_DNA-binding_domain;beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase;Nucleic_acid-binding_proteins;Rho_N-terminal_domain-like;Probable_bacterial_effector-binding_domain;Homeodomain-like;Insert_subdomain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;RBP11-like_subunits_of_RNA_polymerase;C-terminal_domain_of_RNA_polymerase_alpha_subunit;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=STRUCTURAL BASIS OF TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION BY THE OMPR/PHOB- FAMILY RESPONSE REGULATOR PMRA organism=? : H : ARG NE C0197 <- 3.11 -> DT O4 10003 : score 1.74372 : H : ARG NE C0371 <- 3.05 -> DG O6 1-004 : score 3.74397 : H : ARG NH2 C0473 <- 2.92 -> DG N7 1-002 : score 6.23138 : H : ASN OD1 D0320 <- 3.02 -> DA N6 20021 : score 5.75684 : H : ASN OD1 F0383 <- 2.99 -> DT N3 1-007 : score 3.65683 : H : ARG NH2 F0397 <- 2.88 -> DT O2 20025 : score 4.1656 : H : THR OG1 F0432 <- 3.33 -> DA N7 1-008 : score 3.05221 : V : TRP CD2 F0434 <- 3.70 -> DT C7 1-012 : score 5.63382 : V : VAL CG1 I0192 <- 3.77 -> DT C7 1-027 : score 6.10597 : V : SER CB F0517 <- 3.82 -> DT C7 20017 : score 3.11563 : V : ASN CB F0464 <- 3.61 -> DT C7 20025 : score 2.02946 : x : SER xxxx C0182 <- 4.14 -> DA xxx 10001 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0183 <- 3.45 -> DG xxx 10002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0187 <- 3.93 -> DT xxx 10003 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0199 <- 3.29 -> DA xxx 10001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0200 <- 3.49 -> DG xxx 10002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0367 <- 3.79 -> DT xxx 1-005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0374 <- 3.50 -> DG xxx 1-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0394 <- 3.10 -> DG xxx 1-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0470 <- 3.31 -> DT xxx 20022 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0497 <- 3.57 -> DT xxx 20022 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0504 <- 3.44 -> DA xxx 20021 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0508 <- 3.64 -> DG xxx 20019 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx C0514 <- 4.24 -> DA xxx 20018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0542 <- 3.65 -> DC xxx 10004 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0120 <- 4.19 -> DG xxx 10009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0314 <- 3.40 -> DT xxx 1-003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0322 <- 3.48 -> DG xxx 20020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0334 <- 4.13 -> DC xxx 20013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0790 <- 3.12 -> DA xxx 20012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0791 <- 3.51 -> DA xxx 20012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0096 <- 3.44 -> DG xxx 1-004 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0098 <- 3.39 -> DT xxx 1-005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0099 <- 3.37 -> DG xxx 1-004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0102 <- 3.32 -> DG xxx 1-006 : score x.xxxxx : x : MET xxxx F0105 <- 3.48 -> DG xxx 1-006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0110 <- 3.84 -> DT xxx 1-007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0112 <- 3.06 -> DT xxx 1-007 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0116 <- 3.51 -> DT xxx 1-007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0385 <- 3.31 -> DG xxx 1-006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0386 <- 3.31 -> DT xxx 1-007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0396 <- 3.40 -> DT xxx 20023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0419 <- 3.57 -> DA xxx 1-011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0420 <- 3.60 -> DA xxx 1-011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0423 <- 3.70 -> DA xxx 1-011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0425 <- 4.14 -> DA xxx 1-011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0428 <- 2.59 -> DT xxx 1-007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0429 <- 3.26 -> DA xxx 1-009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0430 <- 3.49 -> DA xxx 1-011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0433 <- 4.02 -> DA xxx 1-008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx F0437 <- 3.26 -> DT xxx 1-012 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx F0454 <- 4.28 -> DT xxx 1-015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0455 <- 3.58 -> DG xxx 1-017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0461 <- 3.75 -> DT xxx 20025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0465 <- 3.84 -> DT xxx 20025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx F0509 <- 3.54 -> DG xxx 20020 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx F0510 <- 3.56 -> DG xxx 20020 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0511 <- 4.00 -> DG xxx 20020 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0513 <- 2.84 -> DG xxx 20019 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0516 <- 2.93 -> DC xxx 20015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0522 <- 4.12 -> DT xxx 20017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0588 <- 4.19 -> DT xxx 20047 : score x.xxxxx : x : THR xxxx H0187 <- 3.86 -> DT xxx 1-038 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0188 <- 3.27 -> DC xxx 1-037 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0191 <- 2.88 -> DT xxx 20048 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx H0192 <- 3.47 -> DA xxx 20050 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0195 <- 3.87 -> DA xxx 20050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0210 <- 3.66 -> DA xxx 1-031 : score x.xxxxx : x : THR xxxx I0187 <- 4.11 -> DC xxx 1-026 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx I0188 <- 3.70 -> DT xxx 20037 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx I0191 <- 3.88 -> DT xxx 20037 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx I0193 <- 4.00 -> DT xxx 1-027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0210 <- 3.32 -> DG xxx 20034 : score x.xxxxx >8jo2_H:CheY-like;C-terminal_effector_domain_of_the_bipartite_response_regulators; title=STRUCTURAL BASIS OF TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION BY THE OMPR/PHOB- FAMILY RESPONSE REGULATOR PMRA organism=? : x : THR xxxx H0187 <- 3.86 -> DT xxx 1-038 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0188 <- 3.27 -> DC xxx 1-037 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx H0191 <- 2.88 -> DT xxx 20048 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx H0192 <- 3.47 -> DA xxx 20050 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0195 <- 3.87 -> DA xxx 20050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0210 <- 3.66 -> DA xxx 1-031 : score x.xxxxx >8k3d_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF NRF1 DBD BOUND TO DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0206 <- 2.78 -> DG N7 C0004 : score 6.0742 : H : ARG NH2 A0206 <- 2.86 -> DG O6 C0004 : score 6.5208 : H : LYS NZ A0221 <- 2.80 -> DC O2 C0011 : score 2.94615 : H : ARG NE A0244 <- 2.71 -> DG O6 C0006 : score 4.01196 : H : ARG NH2 A0244 <- 2.86 -> DG N7 C0006 : score 6.308 : x : GLN xxxx A0202 <- 3.44 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0203 <- 3.90 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0245 <- 4.17 -> DC xxx C0005 : score x.xxxxx >8k4l_A: title=CRYSTAL STRUCTURE OF NRF1 HOMODIMER IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0206 <- 2.90 -> DG N7 D0009 : score 5.929 : H : ARG NH2 A0206 <- 2.94 -> DG O6 D0009 : score 6.4152 : w : ARG NH2 A0206 <- 5.82 -> DG N7 C0005 : score 2.18 : H : ASN ND2 A0242 <- 3.10 -> DG N7 C0003 : score 4.31074 : H : ARG NE A0244 <- 2.82 -> DG O6 D0011 : score 3.92526 : H : ARG NH2 A0244 <- 2.99 -> DG N7 D0011 : score 6.142 : V : ALA CB A0203 <- 3.77 -> DT C7 D0008 : score 5.64097 : x : GLN xxxx A0202 <- 3.36 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0245 <- 4.41 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx >8k4l_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF NRF1 HOMODIMER IN COMPLEX WITH DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0206 <- 2.90 -> DG N7 D0009 : score 5.929 : H : ARG NH2 A0206 <- 2.94 -> DG O6 D0009 : score 6.4152 : w : ARG NH2 A0206 <- 5.82 -> DG N7 C0005 : score 2.18 : H : ASN ND2 A0242 <- 3.10 -> DG N7 C0003 : score 4.31074 : H : ARG NE A0244 <- 2.82 -> DG O6 D0011 : score 3.92526 : H : ARG NH2 A0244 <- 2.99 -> DG N7 D0011 : score 6.142 : H : ARG NH1 B0206 <- 2.93 -> DG N7 C0009 : score 5.8927 : H : ARG NH2 B0206 <- 2.81 -> DG O6 C0009 : score 6.5868 : w : ARG NH2 B0206 <- 5.80 -> DG N7 D0005 : score 2.18 : H : ASN ND2 B0242 <- 3.05 -> DG N7 D0003 : score 4.3566 : H : ARG NE B0244 <- 2.70 -> DG O6 C0011 : score 4.01985 : H : ARG NH2 B0244 <- 2.94 -> DG N7 C0011 : score 6.20585 : V : ALA CB A0203 <- 3.77 -> DT C7 D0008 : score 5.64097 : x : GLN xxxx A0202 <- 3.36 -> DT xxx D0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0245 <- 4.41 -> DC xxx D0010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0202 <- 3.16 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0203 <- 4.02 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0245 <- 4.32 -> DC xxx C0010 : score x.xxxxx >8k9g_AB: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CRT-SPARTA-GRNA-TDNA DIMER (CONFORMATION-1) organism=? : H : HIS NE2 B0358 <- 2.32 -> DC O2 D0043 : score 5.79475 : x : LYS xxxx A0287 <- 3.59 -> DA xxx D0039 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0391 <- 4.34 -> DT xxx D0038 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0435 <- 4.14 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0289 <- 4.48 -> DC xxx D0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0362 <- 4.43 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0434 <- 3.66 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0435 <- 3.17 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0438 <- 3.79 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0442 <- 3.03 -> DA xxx D0044 : score x.xxxxx >8k9g_B:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF CRT-SPARTA-GRNA-TDNA DIMER (CONFORMATION-1) organism=? : H : HIS NE2 B0358 <- 2.32 -> DC O2 D0043 : score 5.79475 : x : LYS xxxx B0289 <- 4.48 -> DC xxx D0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0362 <- 4.43 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0434 <- 3.66 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0435 <- 3.17 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0438 <- 3.79 -> DT xxx D0045 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0442 <- 3.03 -> DA xxx D0044 : score x.xxxxx >8k9g_EF: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CRT-SPARTA-GRNA-TDNA DIMER (CONFORMATION-1) organism=? : H : HIS NE2 F0358 <- 2.33 -> DC O2 H0043 : score 5.78417 : x : ARG xxxx E0362 <- 4.49 -> DA xxx H0039 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0391 <- 4.24 -> DT xxx H0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0263 <- 3.74 -> DT xxx H0035 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0289 <- 3.44 -> DC xxx H0037 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0431 <- 3.35 -> DT xxx H0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0434 <- 3.34 -> DT xxx H0045 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx F0435 <- 3.77 -> DT xxx H0045 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx F0438 <- 3.52 -> DT xxx H0045 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0442 <- 3.12 -> DA xxx H0044 : score x.xxxxx >8kb5_ABCDEFGH: title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME CONTAINING H3.8 organism=? : H : ARG NH1 A0040 <- 2.95 -> DT O2 J0009 : score 4.17722 : H : ARG NH2 A0040 <- 2.96 -> DT O2 J0009 : score 4.09787 : H : ARG NH2 C0011 <- 3.24 -> DA N3 J0043 : score 2.95465 : H : ARG NH1 E0040 <- 2.83 -> DT O2 I0009 : score 4.28057 : H : ARG NH1 G0011 <- 3.03 -> DT O2 J-043 : score 4.10832 : H : ARG NH2 G0011 <- 2.90 -> DA N3 I0043 : score 3.17495 : x : HIS xxxx A0039 <- 3.82 -> DG xxx I0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.98 -> DG xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.17 -> DG xxx J0038 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.53 -> DG xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 4.01 -> DG xxx I0038 : score x.xxxxx >8kcm_B:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=MMCPDII-DNA COMPLEX CONTAINING LOW-DOSAGE, LIGHT INDUCED REPAIRED DNA. organism=Methanosarcina mazei : w : TYR OH B0158 <- 5.72 -> DG N3 F0009 : score 3.344 : H : ARG NH2 B0256 <- 2.95 -> DT O2 E0007 : score 4.10633 : H : GLU OE2 B0301 <- 2.79 -> DT N3 E0007 : score 2.64117 : H : ARG NH2 B0450 <- 2.57 -> DG O6 F0002 : score 6.9036 A : H : ARG NH2 B0450 <- 2.58 -> DG O6 E0012 : score 6.8904 A : x : HIS xxxx B0161 <- 3.74 -> DC xxx F0011 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0257 <- 3.22 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0305 <- 3.33 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0379 <- 2.99 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0421 <- 3.34 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0429 <- 3.02 -> DA xxx F0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0431 <- 3.29 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0441 <- 3.67 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx >8kd3_R:Histone-fold; title=RPD3S IN COMPLEX WITH NUCLEOSOME WITH H3K36MLA MODIFICATION, H3K9Q MUTATION AND 187BP DNA organism=? : x : ARG xxxx R0030 <- 3.36 -> DG xxx X0048 : score x.xxxxx >8kd5_R:Histone-fold; title=RPD3S IN COMPLEX WITH NUCLEOSOME WITH H3K36MLA MODIFICATION AND 187BP DNA, CLASS2 organism=? : H : ARG NH2 R0030 <- 2.62 -> DG N3 X0048 : score 3.74023 >8kd6_S:Histone-fold; title=RPD3S IN COMPLEX WITH NUCLEOSOME WITH H3K36MLA MODIFICATION AND 187BP DNA, CLASS3 organism=? : H : HIS NE2 S0039 <- 3.27 -> DG N3 Y-068 : score 3.37775 : H : ARG NH1 S0040 <- 3.34 -> DG N3 Y0009 : score 2.72289 : x : TYR xxxx S0041 <- 3.74 -> DG xxx Y-068 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx S0065 <- 4.41 -> DC xxx Y0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx S0083 <- 3.67 -> DG xxx Y0026 : score x.xxxxx >8kd7_S:Histone-fold; title=RPD3S IN COMPLEX WITH NUCLEOSOME WITH H3K36MLA MODIFICATION AND 167BP DNA organism=? : H : TYR OH S0041 <- 2.77 -> DG N2 Y-068 : score 4.91908 : x : HIS xxxx S0039 <- 3.54 -> DC xxx X0070 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx S0040 <- 2.84 -> DG xxx X-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx S0083 <- 3.94 -> DT xxx X-024 : score x.xxxxx >8kg6_34567KL: title=YEAST REPLISOME IN STATE I organism=? : H : LYS NZ 70367 <- 2.96 -> DT O2 I0047 : score 3.47239 : x : ARG xxxx 40449 <- 3.65 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx 40450 <- 3.60 -> DG xxx I0045 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx 70363 <- 3.73 -> DT xxx I0046 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 70364 <- 3.50 -> DT xxx I0047 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx 70366 <- 3.34 -> DA xxx J0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0047 <- 3.60 -> DC xxx J0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0120 <- 4.39 -> DA xxx I0028 : score x.xxxxx >8kg6_L: title=YEAST REPLISOME IN STATE I organism=? : x : LYS xxxx L0047 <- 3.60 -> DC xxx J0026 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx L0120 <- 4.39 -> DA xxx I0028 : score x.xxxxx >8kg8_34567: title=YEAST REPLISOME IN STATE II organism=? : V : PHE CB 70363 <- 3.65 -> DT C7 I0047 : score 6.01856 : x : ARG xxxx 40449 <- 3.70 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx 40450 <- 4.12 -> DG xxx I0045 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 70364 <- 4.46 -> DT xxx I0047 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx 70366 <- 3.50 -> DC xxx J0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 70367 <- 3.37 -> DT xxx I0047 : score x.xxxxx >8kg9_3457: title=YEAST REPLISOME IN STATE III organism=? : H : GLN NE2 40450 <- 3.33 -> DA N3 J0018 : score 3.60007 : V : PHE CG 70363 <- 3.68 -> DT C7 I0046 : score 5.43629 : x : ARG xxxx 40449 <- 2.99 -> DT xxx I0046 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 70364 <- 3.80 -> DT xxx I0046 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx 70366 <- 4.11 -> DC xxx J0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 70367 <- 2.71 -> DT xxx I0047 : score x.xxxxx >8kg9_7:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=YEAST REPLISOME IN STATE III organism=? : V : PHE CG 70363 <- 3.68 -> DT C7 I0046 : score 5.43629 : x : LYS xxxx 70364 <- 3.80 -> DT xxx I0046 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx 70366 <- 4.11 -> DC xxx J0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx 70367 <- 2.71 -> DT xxx I0047 : score x.xxxxx >8mht_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CYTOSINE-SPECIFIC METHYLTRANSFERASE HHAI/DNA COMPLEX organism=Haemophilus haemolyticus : H : SER OG A0087 <- 3.48 -> DG N3 D0426 : score 2.39483 : H : ARG NH1 A0240 <- 3.20 -> DG N7 D0426 : score 5.566 : H : ARG NH2 A0240 <- 3.28 -> DG O6 D0426 : score 5.9664 : x : ILE xxxx A0086 <- 3.28 -> DA xxx C0410 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0228 <- 4.39 -> DT xxx D0425 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0237 <- 3.36 -> DC xxx C0407 : score x.xxxxx >8oej_ABDH:Nucleic_acid-binding_proteins; title=EXTENDED RPA-DNA NUCLEOPROTEIN FILAMENT organism=? : H : ARG NH1 A0211 <- 2.55 -> DT O2 T0037 : score 4.52173 : H : ASP OD2 A0324 <- 2.60 -> DT N3 T0039 : score 3.73067 : H : ARG NH2 B0079 <- 2.66 -> DT O2 T0045 : score 4.35187 : H : GLN NE2 B0108 <- 2.88 -> DT O4 T0047 : score 5.10797 : H : ARG NH1 D0211 <- 2.55 -> DT O2 T0003 : score 4.52173 : H : ASP OD2 D0324 <- 2.60 -> DT N3 T0005 : score 3.73067 : H : ARG NH2 H0079 <- 2.66 -> DT O2 T0011 : score 4.35187 : H : GLN NE2 H0108 <- 2.88 -> DT O4 T0013 : score 5.10797 : V : ARG CZ D0332 <- 3.88 -> DT C7 T0003 : score 2.08966 : V : LEU CD1 H0076 <- 3.72 -> DT C7 T0013 : score 5.84591 : V : ARG CZ A0332 <- 3.88 -> DT C7 T0037 : score 2.08966 : V : LEU CD1 B0076 <- 3.72 -> DT C7 T0047 : score 5.84591 : x : TYR xxxx A0215 <- 3.31 -> DT xxx T0036 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0222 <- 3.96 -> DT xxx T0036 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0247 <- 4.39 -> DT xxx T0036 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0249 <- 3.79 -> DT xxx T0037 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0264 <- 4.13 -> DT xxx T0037 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0266 <- 3.52 -> DT xxx T0036 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0325 <- 4.13 -> DT xxx T0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0326 <- 3.34 -> DT xxx T0039 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0327 <- 3.46 -> DT xxx T0039 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0027 <- 3.47 -> DT xxx T0043 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0078 <- 3.29 -> DT xxx T0046 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0103 <- 3.38 -> DT xxx T0047 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0110 <- 4.30 -> DT xxx T0046 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0215 <- 3.31 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0222 <- 3.96 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0247 <- 4.39 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0249 <- 3.79 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0264 <- 4.13 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0266 <- 3.52 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0325 <- 4.13 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0326 <- 3.34 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0327 <- 3.46 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0027 <- 3.47 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0078 <- 3.28 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx H0103 <- 3.37 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0110 <- 4.30 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx >8oej_B:Nucleic_acid-binding_proteins; title=EXTENDED RPA-DNA NUCLEOPROTEIN FILAMENT organism=? : H : ARG NH2 B0079 <- 2.66 -> DT O2 T0045 : score 4.35187 : H : GLN NE2 B0108 <- 2.88 -> DT O4 T0047 : score 5.10797 : V : LEU CD1 B0076 <- 3.72 -> DT C7 T0047 : score 5.84591 : x : PHE xxxx B0027 <- 3.47 -> DT xxx T0043 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0078 <- 3.29 -> DT xxx T0046 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0103 <- 3.38 -> DT xxx T0047 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0110 <- 4.30 -> DT xxx T0046 : score x.xxxxx >8oel_A:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CONDENSED RPA-DNA NUCLEOPROTEIN FILAMENT organism=? : H : ARG NH1 A0211 <- 2.55 -> DT O2 T0003 : score 4.52173 : H : ASP OD2 A0324 <- 2.60 -> DT N3 T0005 : score 3.73067 : V : ARG CZ A0332 <- 3.88 -> DT C7 T0003 : score 2.08966 : x : TYR xxxx A0215 <- 3.31 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0222 <- 3.96 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0247 <- 4.39 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0249 <- 3.79 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0264 <- 4.13 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0266 <- 3.52 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0325 <- 4.13 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0326 <- 3.34 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0327 <- 3.46 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx >8oel_ABDH:Nucleic_acid-binding_proteins; title=CONDENSED RPA-DNA NUCLEOPROTEIN FILAMENT organism=? : H : ARG NH1 A0211 <- 2.55 -> DT O2 T0003 : score 4.52173 : H : ASP OD2 A0324 <- 2.60 -> DT N3 T0005 : score 3.73067 : H : ARG NH2 B0079 <- 2.66 -> DT O2 T0011 : score 4.35187 : H : GLN NE2 B0108 <- 2.88 -> DT O4 T0013 : score 5.10797 : H : ARG NH1 D0211 <- 2.55 -> DT O2 T0032 : score 4.52173 : H : ASP OD2 D0324 <- 2.60 -> DT N3 T0034 : score 3.73067 : H : ARG NH2 H0079 <- 2.66 -> DT O2 T0040 : score 4.35187 : H : GLN NE2 H0108 <- 2.88 -> DT O4 T0042 : score 5.10797 : V : ARG CZ A0332 <- 3.88 -> DT C7 T0003 : score 2.08966 : V : LEU CD1 B0076 <- 3.72 -> DT C7 T0013 : score 5.84591 : V : VAL CG2 D0100 <- 3.73 -> DT C7 T0014 : score 6.23023 : V : ARG CZ D0332 <- 3.88 -> DT C7 T0032 : score 2.08966 : V : LEU CD1 H0076 <- 3.71 -> DT C7 T0042 : score 5.86024 : x : TYR xxxx A0215 <- 3.31 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0222 <- 3.96 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0247 <- 4.39 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0249 <- 3.79 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0264 <- 4.13 -> DT xxx T0003 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0266 <- 3.52 -> DT xxx T0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0325 <- 4.13 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0326 <- 3.34 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0327 <- 3.46 -> DT xxx T0005 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0027 <- 3.47 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0078 <- 3.28 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0103 <- 3.37 -> DT xxx T0013 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0110 <- 4.30 -> DT xxx T0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0215 <- 3.31 -> DT xxx T0031 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0222 <- 3.96 -> DT xxx T0031 : score x.xxxxx : x : MET xxxx D0247 <- 4.39 -> DT xxx T0031 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0249 <- 3.79 -> DT xxx T0032 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0264 <- 4.13 -> DT xxx T0032 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0266 <- 3.52 -> DT xxx T0031 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0325 <- 4.13 -> DT xxx T0034 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0326 <- 3.34 -> DT xxx T0034 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0327 <- 3.46 -> DT xxx T0034 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0027 <- 3.47 -> DT xxx T0038 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0078 <- 3.29 -> DT xxx T0041 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx H0103 <- 3.37 -> DT xxx T0042 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx H0110 <- 4.30 -> DT xxx T0041 : score x.xxxxx >8oet_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=SFX STRUCTURE OF THE CLASS II PHOTOLYASE COMPLEXED WITH A THYMINE DIMER organism=? : w : TYR OH A0158 <- 5.62 -> DG N3 D0010 : score 3.344 : w : ARG NH1 A0429 <- 5.78 -> DA N3 D0009 : score 2.585 : H : ARG NH1 A0450 <- 3.28 -> DG N7 C0012 : score 5.4692 : H : ARG NH2 A0450 <- 2.60 -> DG O6 C0012 : score 6.864 : x : HIS xxxx A0161 <- 4.33 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0431 <- 3.32 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0441 <- 3.65 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx >8oeu_A:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=STRUCTURE OF THE MAMMALIAN POL II-SPT6 COMPLEX (COMPOSITE STRUCTURE, STRUCTURE 4) organism=? : x : ARG xxxx A0364 <- 4.34 -> DG xxx T0026 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0461 <- 3.90 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 3.36 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.93 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 3.74 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1416 <- 2.43 -> DT xxx T0021 : score x.xxxxx >8oeu_ABE: title=STRUCTURE OF THE MAMMALIAN POL II-SPT6 COMPLEX (COMPOSITE STRUCTURE, STRUCTURE 4) organism=? : x : ARG xxxx A0364 <- 4.34 -> DG xxx T0026 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0461 <- 3.90 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 3.36 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.93 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 3.74 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1416 <- 2.43 -> DT xxx T0021 : score x.xxxxx >8oev_ABE: title=STRUCTURE OF THE MAMMALIAN POL II-SPT6-ELONGIN COMPLEX, LACKING ELOA LATCH (COMPOSITE STRUCTURE, STRUCTURE 3) organism=? : H : ARG NH2 A1416 <- 2.74 -> DT O2 T0021 : score 4.28413 : x : ARG xxxx A0364 <- 4.17 -> DG xxx T0026 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0461 <- 3.65 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 3.37 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.69 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 3.77 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx >8oew_ABE: title=STRUCTURE OF THE MAMMALIAN POL II-ELONGIN COMPLEX, LACKING THE ELOA LATCH (COMPOSITE STRUCTURE, STRUCTURE 2) organism=? : H : ARG NH2 A1416 <- 2.74 -> DT O2 T0021 : score 4.28413 : x : ARG xxxx A0364 <- 4.17 -> DG xxx T0026 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0461 <- 3.65 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 3.37 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.69 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 3.77 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx >8of0_ABE: title=STRUCTURE OF THE MAMMALIAN POL II-SPT6-ELONGIN COMPLEX, STRUCTURE 1 organism=? : H : ARG NH2 A1416 <- 2.83 -> DT O2 T0021 : score 4.20793 : H : ASP OD2 B0569 <- 2.81 -> DG N2 N0026 : score 5.44806 : x : ARG xxxx A0364 <- 4.16 -> DG xxx T0026 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0461 <- 3.56 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 3.42 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.43 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 3.83 -> DG xxx T0024 : score x.xxxxx >8of4_E:Histone-fold; title=NUCLEOSOME BOUND HUMAN SIRT6 (COMPOSITE) organism=? : H : ARG NH2 E0040 <- 3.08 -> DG N3 I0009 : score 3.40808 : x : ARG xxxx E0083 <- 4.40 -> DG xxx I0026 : score x.xxxxx >8off_a:Histone-fold;Ankyrin_repeat;Ubiquitin-like; title=STRUCTURE OF BARD1 ARD-BRCTS IN COMPLEX WITH H2AKC15UB NUCLEOSOMES (MAP1) organism=? : x : ARG xxxx a0041 <- 4.18 -> DG xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a0084 <- 4.47 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a0034 <- 3.85 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx >8off_ab: title=STRUCTURE OF BARD1 ARD-BRCTS IN COMPLEX WITH H2AKC15UB NUCLEOSOMES (MAP1) organism=? : H : ARG NH2 b0041 <- 3.18 -> DT O2 I0009 : score 3.9116 : x : ARG xxxx a0041 <- 4.18 -> DG xxx J0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a0084 <- 4.47 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx a0034 <- 3.85 -> DC xxx I0049 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx b0042 <- 4.25 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx >8olx_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MUTSBETA BOUND TO (CAG)2 DNA (CANONICAL FORM) organism=? : H : LYS NZ B0255 <- 2.99 -> DC O2 D0030 : score 2.8342 : V : TYR CD1 B0254 <- 3.64 -> DT C7 C0030 : score 4.86827 : x : ARG xxxx A0039 <- 3.81 -> DA xxx D0035 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0041 <- 3.14 -> DC xxx D0034 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0042 <- 3.39 -> DC xxx D0034 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0044 <- 3.52 -> DA xxx D0035 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0046 <- 3.50 -> DA xxx D0035 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0065 <- 3.26 -> DA xxx D0035 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0067 <- 4.01 -> DA xxx D0035 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0077 <- 3.22 -> DA xxx D0035 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0079 <- 3.44 -> DA xxx D0035 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0081 <- 3.86 -> DC xxx D0034 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0547 <- 3.41 -> DT xxx D0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0757 <- 1.99 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx >8olx_B:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MUTSBETA BOUND TO (CAG)2 DNA (CANONICAL FORM) organism=? : H : LYS NZ B0255 <- 2.99 -> DC O2 D0030 : score 2.8342 : V : TYR CD1 B0254 <- 3.64 -> DT C7 C0030 : score 4.86827 : x : LYS xxxx B0757 <- 1.99 -> DT xxx C0020 : score x.xxxxx >8om9_B:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MUTSBETA BOUND TO (CAG)2 DNA (OPEN FORM) organism=? : H : LYS NZ B0757 <- 3.18 -> DT O4 C0044 : score 3.31455 : x : TYR xxxx B0254 <- 3.29 -> DG xxx D0031 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0288 <- 4.49 -> DA xxx C0035 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0776 <- 3.63 -> DT xxx C0044 : score x.xxxxx >8oma_A:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MUTSBETA BOUND TO 61BP HOMODUPLEX DNA organism=? : H : LYS NZ A0546 <- 2.78 -> DA N7 D0005 : score 2.94893 : x : GLU xxxx A0205 <- 4.09 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0229 <- 3.63 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0518 <- 4.34 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0527 <- 4.49 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0528 <- 3.52 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0545 <- 3.55 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx >8oma_AB:DNA_repair_protein_MutS,_domain_III;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=MUTSBETA BOUND TO 61BP HOMODUPLEX DNA organism=? : H : LYS NZ A0546 <- 2.78 -> DA N7 D0005 : score 2.94893 : x : GLU xxxx A0205 <- 4.09 -> DA xxx D0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0229 <- 3.63 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0518 <- 4.34 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0527 <- 4.49 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0528 <- 3.52 -> DA xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0545 <- 3.55 -> DT xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0620 <- 4.48 -> DT xxx C0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0623 <- 3.92 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx >8oo6_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=POL I BOUND TO EXTENDED AND DISPLACED DNA SECTION - CLOSED CONFORMATION organism=? : x : LYS xxxx A0635 <- 3.82 -> DC xxx P0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0678 <- 3.43 -> DA xxx P0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0758 <- 3.55 -> DC xxx P0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0759 <- 3.47 -> DC xxx P0018 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0762 <- 4.02 -> DC xxx P0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0766 <- 3.08 -> DG xxx T0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0768 <- 3.49 -> DG xxx T0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0849 <- 3.74 -> DA xxx T0020 : score x.xxxxx >8oo7_GJMNOPQR: title=CRYOEM STRUCTURE INO80CORE HEXASOME COMPLEX COMPOSITE MODEL STATE1 organism=? : H : ARG NH1 J0092 <- 2.93 -> DT O4 L0005 : score 3.18298 : H : ARG NH2 J0092 <- 2.96 -> DT O4 L0005 : score 3.44012 : H : ARG NH2 J0092 <- 3.07 -> DT O4 K-006 : score 3.36194 : H : ARG NH2 Q0040 <- 3.20 -> DG N3 K0009 : score 3.32144 : x : MET xxxx G1258 <- 3.27 -> DG xxx L-033 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx J0112 <- 4.15 -> DT xxx K-006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx M0065 <- 4.29 -> DG xxx L0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0011 <- 3.29 -> DT xxx K-042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0030 <- 4.19 -> DC xxx L0049 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0083 <- 3.73 -> DT xxx L-024 : score x.xxxxx >8oo9_G:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYOEM STRUCTURE INO80CORE HEXASOME COMPLEX ATPASE-DNA REFINEMENT STATE1 organism=? : x : MET xxxx G1258 <- 3.29 -> DT xxx K0034 : score x.xxxxx >8ooa_MNOPQR:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYOEM STRUCTURE INO80CORE HEXASOME COMPLEX HEXASOME REFINEMENT STATE1 organism=? : H : ARG NH2 Q0040 <- 3.15 -> DG N3 K0009 : score 3.35754 : x : LEU xxxx M0065 <- 4.11 -> DG xxx L0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0035 <- 4.33 -> DT xxx L0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0011 <- 3.49 -> DT xxx K-042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0030 <- 4.11 -> DT xxx K-047 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx Q0065 <- 4.36 -> DC xxx K0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0083 <- 3.56 -> DT xxx L-024 : score x.xxxxx >8oop_GJMNOPQR: title=CRYOEM STRUCTURE INO80CORE HEXASOME COMPLEX COMPOSITE MODEL STATE2 organism=? : H : ARG NH1 J0092 <- 3.02 -> DT O2 L0009 : score 4.11693 : H : ARG NH1 J0092 <- 3.04 -> DG N3 L0010 : score 2.90604 : H : ARG NH1 O0011 <- 3.32 -> DA N3 L0043 : score 3.29912 : H : ARG NH1 P0030 <- 3.11 -> DT O2 K-047 : score 4.03941 : H : ARG NH1 Q0040 <- 3.07 -> DG N3 K0009 : score 2.88773 : H : ARG NH2 Q0040 <- 3.18 -> DG N3 K0009 : score 3.33588 : x : MET xxxx G1258 <- 3.19 -> DT xxx K0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0083 <- 4.19 -> DG xxx K-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0045 <- 4.25 -> DC xxx L0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0042 <- 4.35 -> DC xxx L0037 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx Q0039 <- 4.42 -> DC xxx L0070 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Q0041 <- 4.22 -> DA xxx K-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0083 <- 4.11 -> DT xxx L-024 : score x.xxxxx >8oop_Q:Histone-fold; title=CRYOEM STRUCTURE INO80CORE HEXASOME COMPLEX COMPOSITE MODEL STATE2 organism=? : H : ARG NH1 Q0040 <- 3.07 -> DG N3 K0009 : score 2.88773 : H : ARG NH2 Q0040 <- 3.18 -> DG N3 K0009 : score 3.33588 : x : HIS xxxx Q0039 <- 4.42 -> DC xxx L0070 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Q0041 <- 4.22 -> DA xxx K-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx Q0083 <- 4.11 -> DT xxx L-024 : score x.xxxxx >8oos_GMNOPQR:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CRYOEM STRUCTURE INO80CORE HEXASOME COMPLEX ATPASE-HEXASOME REFINEMENT STATE 2 organism=? : H : ARG NH1 O0011 <- 3.26 -> DA N3 L0043 : score 3.3433 : H : ARG NH2 O0011 <- 2.74 -> DT O2 L0044 : score 4.28413 : H : ARG NH1 Q0040 <- 3.10 -> DG N3 K0009 : score 2.86941 : H : ARG NH2 Q0040 <- 3.15 -> DG N3 K0009 : score 3.35754 : H : ARG NH2 Q0083 <- 3.21 -> DT O2 L-024 : score 3.8862 : x : MET xxxx G1258 <- 3.30 -> DT xxx K0034 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx M0083 <- 3.74 -> DG xxx K-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0035 <- 4.49 -> DT xxx L0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0045 <- 4.44 -> DC xxx L0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx O0042 <- 4.45 -> DC xxx L0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx P0030 <- 3.51 -> DG xxx L0048 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx Q0041 <- 3.99 -> DA xxx K-067 : score x.xxxxx >8oos_Q:Histone-fold; title=CRYOEM STRUCTURE INO80CORE HEXASOME COMPLEX ATPASE-HEXASOME REFINEMENT STATE 2 organism=? : H : ARG NH1 Q0040 <- 3.10 -> DG N3 K0009 : score 2.86941 : H : ARG NH2 Q0040 <- 3.15 -> DG N3 K0009 : score 3.35754 : H : ARG NH2 Q0083 <- 3.21 -> DT O2 L-024 : score 3.8862 : x : TYR xxxx Q0041 <- 3.99 -> DA xxx K-067 : score x.xxxxx >8ooy_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=POL I BOUND TO EXTENDED AND DISPLACED DNA SECTION - OPEN CONFORMATION organism=? : x : LYS xxxx A0635 <- 2.67 -> A xxx P0015 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0668 <- 2.50 -> C xxx P0018 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0678 <- 2.88 -> G xxx P0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0766 <- 4.22 -> G xxx T0019 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0845 <- 4.15 -> G xxx T0019 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0849 <- 3.03 -> G xxx T0019 : score x.xxxxx >8osk_A:Histone-fold; title=CLOCK-BMAL1 BOUND TO A NUCLEOSOME SHL+5.8 organism=? : H : ARG NH1 A0040 <- 2.87 -> DT O2 J0083 : score 4.24612 : x : ARG xxxx A0083 <- 4.27 -> DG xxx I0050 : score x.xxxxx >8osl_O:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CLOCK-BMAL1 BOUND TO THE NATIVE POR NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx O0039 <- 4.04 -> DT xxx J0004 : score x.xxxxx : x : SER xxxx O0042 <- 4.06 -> DC xxx I0140 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx O0043 <- 4.33 -> DG xxx J0003 : score x.xxxxx >8osl_P:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain; title=CLOCK-BMAL1 BOUND TO THE NATIVE POR NUCLEOSOME organism=? : V : SER CB P0085 <- 3.64 -> DT C7 I0145 : score 3.25653 : x : GLU xxxx P0088 <- 4.12 -> DT xxx I0145 : score x.xxxxx >8ots_K:lambda_repressor-like_DNA-binding_domains; title=OCT4 AND MYC-MAX CO-BOUND TO A NUCLEOSOME organism=? : x : THR xxxx K0182 <- 3.59 -> DC xxx J0131 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx K0185 <- 3.99 -> DT xxx I0016 : score x.xxxxx >8ott_D:Histone-fold; title=MYC-MAX BOUND TO A NUCLEOSOME AT SHL+5.8 organism=? : H : ARG NH1 D0033 <- 3.23 -> DT O2 I0027 : score 3.93606 : H : ARG NH2 D0033 <- 2.99 -> DT O2 I0027 : score 4.07247 >8ouw_356KL: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CMG HELICASE BOUND TO TIM-1/TIPN-1 AND HOMODIMERIC DNSN-1 ON FORK DNA (CAENORHABDITIS ELEGANS) organism=? : H : ARG NH1 L0052 <- 3.14 -> DA N3 J0038 : score 3.43167 : H : ARG NH2 L0052 <- 2.84 -> DA N3 J0038 : score 3.21383 : x : ILE xxxx 50210 <- 3.70 -> DT xxx J0044 : score x.xxxxx >8ouw_47: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CMG HELICASE BOUND TO TIM-1/TIPN-1 AND HOMODIMERIC DNSN-1 ON FORK DNA (CAENORHABDITIS ELEGANS) organism=? : H : ARG NH2 40508 <- 2.98 -> DT O2 I0005 : score 4.08093 : x : LYS xxxx 70429 <- 3.55 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx >8ouw_7:Nucleic_acid-binding_proteins;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF CMG HELICASE BOUND TO TIM-1/TIPN-1 AND HOMODIMERIC DNSN-1 ON FORK DNA (CAENORHABDITIS ELEGANS) organism=? : x : LYS xxxx 70429 <- 3.55 -> DT xxx I0007 : score x.xxxxx >8ovw_ABILN: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CBF1-CCAN BOUND TOPOLOGICALLY TO CENTROMERIC DNA organism=? : H : GLU OE2 A0231 <- 2.52 -> DC N4 D0143 : score 5.56025 : H : HIS NE2 B0227 <- 3.20 -> DT O4 E0006 : score 5.16026 : H : GLU OE1 B0231 <- 2.40 -> DC N4 E0007 : score 6.22938 : V : VAL CG1 B0230 <- 3.75 -> DT C7 E0006 : score 6.13627 : x : HIS xxxx A0227 <- 3.04 -> DC xxx D0142 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0234 <- 3.29 -> DC xxx D0142 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0235 <- 3.51 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0223 <- 4.12 -> DA xxx E0003 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0234 <- 3.99 -> DC xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0235 <- 3.73 -> DT xxx D0145 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0216 <- 3.97 -> DG xxx E0020 : score x.xxxxx >8ovw_I: title=CRYO-EM STRUCTURE OF CBF1-CCAN BOUND TOPOLOGICALLY TO CENTROMERIC DNA organism=? : x : LYS xxxx I0216 <- 3.97 -> DG xxx E0020 : score x.xxxxx >8ow1_A:HLH,_helix-loop-helix_DNA-binding_domain;USP8_N-terminal_domain-like; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE YEAST INNER KINETOCHORE BOUND TO A CENP-A NUCLEOSOME. organism=? : x : HIS xxxx A0227 <- 3.59 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0231 <- 3.15 -> DC xxx E0144 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0234 <- 3.71 -> DC xxx E0143 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0235 <- 3.67 -> DC xxx D0009 : score x.xxxxx >8ow4_B:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=2.75 ANGSTROM CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NFAT1 WITH BOUND DNA organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 B0421 <- 2.96 -> DG N7 W4007 : score 5.8564 : H : ARG NH2 B0421 <- 2.74 -> DG O6 W4007 : score 6.6792 : H : GLU OE1 B0427 <- 2.87 -> DC N4 C5011 : score 5.6872 : H : ARG NH1 B0430 <- 2.99 -> DG N7 W4006 : score 5.8201 : H : ARG NH2 B0430 <- 3.26 -> DG N7 W4006 : score 5.79723 : H : ARG NH2 B0430 <- 2.98 -> DG O6 W4006 : score 6.3624 : H : GLN OE1 B0571 <- 3.28 -> DA N6 W4008 : score 5.47152 : H : GLN NE2 B0571 <- 3.06 -> DA N7 W4008 : score 5.77308 : x : TYR xxxx B0424 <- 3.27 -> DT xxx C5010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0426 <- 4.24 -> DT xxx C5010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0572 <- 3.71 -> DT xxx C5008 : score x.xxxxx >8ox0_ABCDEFGH:Histone-fold;PH_domain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=STRUCTURE OF APO TELOMERIC NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 3.15 -> DG N3 J0009 : score 3.35754 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.74 -> DC O2 I0009 : score 3.7431 : H : ARG NH2 H0026 <- 3.19 -> DA N3 I-029 : score 2.98704 : x : HIS xxxx A0039 <- 4.33 -> DG xxx I0069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.85 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0017 <- 3.23 -> DA xxx J0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0011 <- 3.37 -> DG xxx J0043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.30 -> DG xxx J0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0026 <- 3.34 -> DG xxx J-029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.39 -> DC xxx I-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0065 <- 3.76 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.24 -> DA xxx J-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0011 <- 3.54 -> DT xxx J-043 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 4.38 -> DA xxx I0049 : score x.xxxxx >8ox1_C:Histone-fold; title=STRUCTURE OF TRF1CORE IN COMPLEX WITH TELOMERIC NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx C0011 <- 3.30 -> DA xxx I-042 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.40 -> DA xxx J0037 : score x.xxxxx >8oy3_B:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TIME-RESOLVED SFX STRUCTURE OF THE CLASS II PHOTOLYASE COMPLEXED WITH A THYMINE DIMER (3 PICOSECOND PUMP-PROBE DELAY) organism=Methanosarcina mazei Go1 : H : ARG NH1 B0450 <- 3.16 -> DG N7 E0012 : score 5.6144 : H : ARG NH2 B0450 <- 2.76 -> DG O6 F0003 : score 6.6528 : H : ARG NH2 B0450 <- 2.37 -> DG O6 E0012 : score 7.1676 : x : ARG xxxx B0429 <- 3.15 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0431 <- 3.27 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0441 <- 3.97 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx >8oy4_B:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TIME-RESOLVED SFX STRUCTURE OF THE CLASS II PHOTOLYASE COMPLEXED WITH A THYMINE DIMER (300 PS PUMP-PROBE DELAY) organism=Methanosarcina mazei Go1 : H : ARG NH2 B0450 <- 2.64 -> DG N7 E0012 : score 6.58892 : H : ARG NH2 B0450 <- 2.85 -> DG O6 E0012 : score 6.534 : w : ARG NE B0450 <- 5.63 -> DG O6 F0003 : score 1.369 : x : HIS xxxx B0161 <- 4.23 -> DG xxx E0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0429 <- 3.14 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0431 <- 3.32 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0441 <- 4.26 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx >8oy5_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TIME-RESOLVED SFX STRUCTURE OF THE CLASS II PHOTOLYASE COMPLEXED WITH A THYMINE DIMER (1 NANOSECOND PUMP-PROBE DELAY) organism=Methanosarcina mazei Go1 : H : ARG NH1 A0450 <- 3.23 -> DG N7 C0012 : score 5.5297 : H : ARG NH2 A0450 <- 3.30 -> DG N7 C0012 : score 5.74615 : H : ARG NH2 A0450 <- 2.82 -> DG O6 C0012 : score 6.5736 : x : HIS xxxx A0161 <- 4.21 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0429 <- 2.91 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0431 <- 3.32 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0441 <- 3.61 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx >8oy6_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TIME-RESOLVED SFX STRUCTURE OF THE CLASS II PHOTOLYASE COMPLEXED WITH A THYMINE DIMER (3 NANOSECOND PUMP-PROBE DELAY) organism=Methanosarcina mazei Go1 : w : TYR OH A0158 <- 5.64 -> DG N3 D0010 : score 3.344 : H : ARG NH2 A0256 <- 3.07 -> DT O2 C0008 : score 4.00473 : H : GLU OE2 A0301 <- 2.93 -> DT N3 C0007 : score 2.56736 : w : ARG NH1 A0429 <- 5.31 -> DA N3 D0009 : score 2.585 : H : ARG NH1 A0450 <- 3.12 -> DG N7 C0012 : score 5.6628 : H : ARG NH2 A0450 <- 2.42 -> DG O6 C0012 : score 7.1016 : V : MET CG A0379 <- 3.65 -> DT C7 C0008 : score 6.02069 : x : HIS xxxx A0161 <- 4.29 -> DG xxx C0005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0257 <- 3.72 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0305 <- 3.13 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0421 <- 3.45 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0431 <- 3.31 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0441 <- 3.75 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx >8oy7_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TIME-RESOLVED SFX STRUCTURE OF THE CLASS II PHOTOLYASE COMPLEXED WITH A THYMINE DIMER (10 NANOSECOND PUMP-PROBE DELAY) organism=Methanosarcina mazei Go1 : w : TYR OH A0158 <- 6.00 -> DG N3 D0010 : score 3.344 : H : ARG NH1 A0256 <- 3.02 -> DT O2 C0008 : score 4.11693 : H : GLU OE2 A0301 <- 2.85 -> DT N3 C0007 : score 2.60954 : w : ARG NH1 A0429 <- 6.01 -> DA N3 D0009 : score 2.585 : H : ARG NH1 A0450 <- 3.14 -> DG N7 C0012 : score 5.6386 : H : ARG NH2 A0450 <- 2.91 -> DG O6 D0003 : score 6.4548 : H : ARG NH2 A0450 <- 2.66 -> DG O6 C0012 : score 6.7848 : V : MET CG A0379 <- 3.75 -> DT C7 C0008 : score 5.87562 : x : HIS xxxx A0161 <- 4.10 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0257 <- 3.68 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0305 <- 3.19 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0421 <- 3.73 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0431 <- 3.31 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0441 <- 4.02 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx >8oy8_B:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TIME-RESOLVED SFX STRUCTURE OF THE CLASS II PHOTOLYASE COMPLEXED WITH A THYMINE DIMER (30 NANOSECOND TIMEPOINT) organism=Methanosarcina mazei Go1 : H : GLU OE2 B0301 <- 2.85 -> DT N3 E0007 : score 2.60954 : H : ARG NH1 B0450 <- 3.27 -> DG O6 E0012 : score 5.5115 : H : ARG NH2 B0450 <- 2.49 -> DG N7 E0012 : score 6.78046 : H : ARG NH2 B0450 <- 3.01 -> DG O6 E0012 : score 6.3228 : V : TRP CD2 B0305 <- 3.62 -> DT C7 E0007 : score 5.74375 : x : HIS xxxx B0161 <- 4.02 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0256 <- 2.68 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0257 <- 3.22 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0300 <- 4.21 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0379 <- 3.37 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0421 <- 3.89 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0429 <- 3.38 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0431 <- 3.67 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0441 <- 3.97 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx >8oy9_B:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TIME-RESOLVED SFX STRUCTURE OF THE CLASS II PHOTOLYASE COMPLEXED WITH A THYMINE DIMER (1 MICROSECOND PUMP-PROBE DELAY) organism=Methanosarcina mazei Go1 : H : ASN ND2 B0257 <- 3.09 -> DT O2 E0008 : score 4.47088 : H : GLU OE2 B0301 <- 2.72 -> DT N3 E0007 : score 2.67807 : V : TRP CD2 B0305 <- 3.53 -> DT C7 E0007 : score 5.86742 : x : ARG xxxx B0256 <- 2.69 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0379 <- 3.21 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0421 <- 3.82 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0429 <- 3.30 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0431 <- 3.45 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0441 <- 4.23 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0450 <- 2.18 -> DG xxx E0012 : score x.xxxxx >8oya_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TIME-RESOLVED SFX STRUCTURE OF THE CLASS II PHOTOLYASE COMPLEXED WITH A THYMINE DIMER (10 MICROSECOND PUMP PROBE DELAY) organism=? : w : HIS NE2 A0161 <- 6.34 -> DC O2 C0006 : score 3.208 : H : ARG NH1 A0256 <- 2.77 -> DT O2 C0008 : score 4.33225 : H : GLU OE2 A0301 <- 2.90 -> DT N3 C0007 : score 2.58318 : w : ARG NH1 A0429 <- 5.98 -> DA N3 D0009 : score 2.585 : w : ARG NH2 A0429 <- 5.45 -> DA N6 D0008 : score 1.997 : H : ARG NH2 A0450 <- 2.86 -> DG N7 C0012 : score 6.308 : w : LYS NZ A0451 <- 6.39 -> DG N7 C0010 : score 2.519 : V : TRP CD1 A0421 <- 3.86 -> DT C7 C0007 : score 7.22333 : x : ASN xxxx A0257 <- 3.05 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0305 <- 3.39 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0379 <- 2.95 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0431 <- 3.18 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0441 <- 4.05 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx >8oyb_A:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TIME-RESOLVED SFX STRUCTURE OF THE CLASS II PHOTOLYASE COMPLEXED WITH A THYMINE DIMER (30 MICROSECOND PUMP-PROBE DELAY) organism=Methanosarcina mazei Go1 : H : GLU OE2 A0301 <- 2.65 -> DT N3 C0007 : score 2.71497 : H : ARG NH1 A0429 <- 2.69 -> DA N3 D0009 : score 3.76306 : H : ARG NH1 A0450 <- 2.83 -> DG N7 C0012 : score 6.0137 : H : ARG NH2 A0450 <- 2.89 -> DG N7 C0012 : score 6.26969 : H : ARG NH2 A0450 <- 2.73 -> DG O6 C0012 : score 6.6924 : H : ARG NH2 A0450 <- 2.79 -> DG O6 D0003 : score 6.6132 : x : HIS xxxx A0161 <- 4.25 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0256 <- 3.46 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0305 <- 3.08 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0379 <- 4.43 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0421 <- 3.68 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0431 <- 3.25 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0441 <- 4.04 -> DC xxx C0009 : score x.xxxxx >8oyc_B:Cryptochrome/photolyase_FAD-binding_domain;Cryptochrome/photolyase,_N-terminal_domain; title=TIME-RESOLVED SFX STRUCTURE OF THE CLASS II PHOTOLYASE COMPLEXED WITH A THYMINE DIMER (100 MICROSECOND TIMPEOINT) organism=Methanosarcina mazei Go1 : H : GLU OE2 B0301 <- 2.52 -> DT N3 E0007 : score 2.78351 : H : ARG NH1 B0450 <- 3.37 -> DG O6 F0003 : score 5.38983 : H : ARG NH2 B0450 <- 2.88 -> DG N7 E0012 : score 6.28246 : x : HIS xxxx B0161 <- 4.15 -> DC xxx E0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0256 <- 3.24 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0257 <- 3.80 -> DT xxx E0008 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0305 <- 3.15 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0379 <- 4.14 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0421 <- 3.73 -> DT xxx E0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0429 <- 3.01 -> DA xxx F0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0431 <- 3.55 -> DA xxx F0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0441 <- 4.17 -> DC xxx E0009 : score x.xxxxx >8oz6_AB:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF SPARTA COMPLEX LIGAND-FREE organism=? : H : ARG NH2 A0263 <- 2.98 -> DA N3 J0003 : score 3.12311 : x : ASN xxxx A0289 <- 4.35 -> DA xxx J0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0358 <- 3.01 -> DA xxx J0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0362 <- 3.34 -> DA xxx J0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0243 <- 3.34 -> DA xxx J0015 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0245 <- 3.19 -> DA xxx J0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0248 <- 3.33 -> DA xxx J0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0251 <- 3.27 -> DA xxx J0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0287 <- 4.12 -> DA xxx J0008 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0328 <- 4.16 -> DA xxx J0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0435 <- 4.49 -> DA xxx J0014 : score x.xxxxx >8oz6_CD:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF SPARTA COMPLEX LIGAND-FREE organism=? : x : ARG xxxx C0263 <- 3.04 -> DA xxx L0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0289 <- 3.36 -> DA xxx L0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0358 <- 3.17 -> DA xxx L0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0362 <- 3.78 -> DA xxx L0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0245 <- 3.19 -> DA xxx L0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0248 <- 3.76 -> DA xxx L0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0251 <- 3.80 -> DA xxx L0016 : score x.xxxxx >8oz6_E:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain; title=CRYOEM STRUCTURE OF SPARTA COMPLEX LIGAND-FREE organism=? : H : ARG NH1 E0362 <- 2.30 -> DA N3 O0013 : score 4.05026 : x : HIS xxxx E0358 <- 4.18 -> DA xxx O0012 : score x.xxxxx >8oz6_EF:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF SPARTA COMPLEX LIGAND-FREE organism=? : H : ARG NH1 E0362 <- 2.30 -> DA N3 O0013 : score 4.05026 : H : ARG NH1 F0072 <- 2.51 -> DA N3 O0016 : score 3.89561 : H : ARG NH2 F0072 <- 3.07 -> DA N3 O0016 : score 3.0648 : x : HIS xxxx E0358 <- 4.18 -> DA xxx O0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0245 <- 3.68 -> DA xxx O0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0248 <- 3.26 -> DA xxx O0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0251 <- 3.27 -> DA xxx O0016 : score x.xxxxx >8oz6_GH:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF SPARTA COMPLEX LIGAND-FREE organism=? : H : ARG NH2 G0362 <- 2.36 -> DA N3 P0014 : score 3.52484 : H : HIS ND1 H0251 <- 2.60 -> DA N3 P0016 : score -6.29067 : x : ARG xxxx G0263 <- 3.16 -> DA xxx P0003 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx G0267 <- 4.04 -> DA xxx P0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx G0289 <- 3.37 -> DA xxx P0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0358 <- 3.06 -> DA xxx P0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0245 <- 3.29 -> DA xxx P0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0248 <- 3.49 -> DA xxx P0016 : score x.xxxxx >8ozd_AB:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF SPARTA COMPLEX DIMER-3 organism=? : H : ARG NH2 A0263 <- 2.38 -> DA N3 J0004 : score 3.51188 : H : ARG NH1 A0362 <- 2.81 -> DA N3 J0013 : score 3.67469 : H : ARG NH2 A0362 <- 2.89 -> DA N3 J0013 : score 3.18143 : x : HIS xxxx A0358 <- 3.40 -> DA xxx J0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0245 <- 3.15 -> DA xxx J0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0248 <- 3.71 -> DA xxx J0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0251 <- 3.91 -> DA xxx J0016 : score x.xxxxx >8ozd_B:Ribonuclease_H-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF SPARTA COMPLEX DIMER-3 organism=? : x : PHE xxxx B0245 <- 3.15 -> DA xxx J0015 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0248 <- 3.71 -> DA xxx J0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0251 <- 3.91 -> DA xxx J0016 : score x.xxxxx >8ozd_CD:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF SPARTA COMPLEX DIMER-3 organism=? : H : ARG NH2 C0263 <- 2.53 -> DA N3 E0020 : score 3.41469 : H : ARG NH1 C0362 <- 2.85 -> DA N3 E0029 : score 3.64523 : H : ARG NH2 C0362 <- 2.91 -> DA N3 E0029 : score 3.16847 : x : HIS xxxx C0358 <- 3.37 -> DA xxx E0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0245 <- 3.13 -> DA xxx E0031 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0248 <- 3.48 -> DA xxx E0032 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0251 <- 3.65 -> DA xxx E0032 : score x.xxxxx >8oze_EF:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF SPARTA COMPLEX DIMER HIGH RESOLUTION organism=? : H : ARG NH1 E0263 <- 2.91 -> DC O2 P0010 : score 3.5697 : H : HIS NE2 E0358 <- 2.80 -> DA N3 P0019 : score 4.24615 : H : HIS ND1 F0251 <- 2.65 -> DC O2 P0023 : score 3.32109 : x : ARG xxxx E0362 <- 3.37 -> DC xxx P0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0072 <- 4.09 -> DC xxx P0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx F0245 <- 3.58 -> DC xxx P0023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0248 <- 3.47 -> DC xxx P0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0287 <- 4.48 -> DT xxx P0015 : score x.xxxxx >8oze_GH:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF SPARTA COMPLEX DIMER HIGH RESOLUTION organism=? : H : ARG NH1 G0263 <- 2.89 -> DC O2 B0010 : score 3.5843 : H : HIS NE2 G0358 <- 2.87 -> DA N3 B0019 : score 4.18671 : H : HIS ND1 H0251 <- 2.62 -> DC O2 B0023 : score 3.34044 : x : ARG xxxx G0362 <- 3.45 -> DC xxx B0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0072 <- 4.15 -> DC xxx B0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0245 <- 3.52 -> DC xxx B0023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0248 <- 3.49 -> DC xxx B0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0287 <- 4.43 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx >8oze_H:Ribonuclease_H-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF SPARTA COMPLEX DIMER HIGH RESOLUTION organism=? : H : HIS ND1 H0251 <- 2.62 -> DC O2 B0023 : score 3.34044 : x : ARG xxxx H0072 <- 4.15 -> DC xxx B0023 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx H0245 <- 3.52 -> DC xxx B0023 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0248 <- 3.49 -> DC xxx B0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0287 <- 4.43 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx >8ozf_A:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain; title=CRYOEM STRUCTURE OF SPARTA COMPLEX TETRAMER POST-NAD CLEAVAGE-2 organism=? : x : ARG xxxx A0263 <- 3.03 -> DA xxx J0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0358 <- 3.07 -> DA xxx J0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0362 <- 3.53 -> DA xxx J0013 : score x.xxxxx >8ozf_AB:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF SPARTA COMPLEX TETRAMER POST-NAD CLEAVAGE-2 organism=? : x : ARG xxxx A0263 <- 3.03 -> DA xxx J0004 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0358 <- 3.07 -> DA xxx J0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0362 <- 3.53 -> DA xxx J0013 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0245 <- 3.22 -> DA xxx J0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0248 <- 3.31 -> DA xxx J0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0251 <- 3.05 -> DA xxx J0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0435 <- 4.23 -> DA xxx J0014 : score x.xxxxx >8ozf_CE:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=CRYOEM STRUCTURE OF SPARTA COMPLEX TETRAMER POST-NAD CLEAVAGE-2 organism=? : x : ARG xxxx C0263 <- 3.15 -> DA xxx L0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0289 <- 4.12 -> DA xxx L0006 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0358 <- 3.17 -> DA xxx L0012 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx E0245 <- 3.21 -> DA xxx L0016 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx E0248 <- 4.13 -> DA xxx L0016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx E0251 <- 3.73 -> DA xxx L0016 : score x.xxxxx : x : MET xxxx E0435 <- 3.44 -> DA xxx L0014 : score 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STRUCTURE 3 organism=? : H : ARG NH2 A1416 <- 2.96 -> DA N3 T0022 : score 3.13607 : x : GLN xxxx A0267 <- 4.20 -> DC xxx T0034 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.69 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 4.16 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1417 <- 4.20 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0492 <- 3.70 -> DA xxx N0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0823 <- 3.87 -> DA xxx N0011 : score x.xxxxx >8p4d_ABE: title=STRUCTURAL INSIGHTS INTO HUMAN CO-TRANSCRIPTIONAL CAPPING - STRUCTURE 4 organism=? : H : ARG NH2 A1416 <- 2.95 -> DA N3 T0022 : score 3.14255 : x : GLN xxxx A0267 <- 4.20 -> DC xxx T0034 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 3.69 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 4.15 -> DA xxx T0025 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1417 <- 4.20 -> DT xxx N0028 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0492 <- 3.70 -> DA xxx N0024 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0823 <- 3.87 -> DA xxx N0011 : score x.xxxxx >8p4e_ABE: title=STRUCTURAL INSIGHTS INTO HUMAN CO-TRANSCRIPTIONAL CAPPING - STRUCTURE 5 organism=? : x : LYS xxxx A0149 <- 4.10 -> DT xxx T0009 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0329 <- 4.22 -> DT xxx N0014 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0331 <- 0.35 -> DT xxx N0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0364 <- 3.76 -> DC xxx T0022 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0461 <- 3.82 -> DG xxx T0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx A0462 <- 3.67 -> DG xxx T0021 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0854 <- 2.30 -> DA xxx T0020 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0855 <- 4.17 -> DA xxx T0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1416 <- 4.35 -> DT xxx T0017 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0200 <- 2.71 -> DG xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0222 <- 1.68 -> DG xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0385 <- 1.59 -> DG xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0386 <- 3.18 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0489 <- 2.23 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0497 <- 4.33 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : PRO 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B0489 <- 3.29 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0492 <- 4.32 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0498 <- 3.88 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx >8p4f_B:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=STRUCTURAL INSIGHTS INTO HUMAN CO-TRANSCRIPTIONAL CAPPING - STRUCTURE 6 organism=? : x : MET xxxx B0200 <- 3.22 -> DG xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0222 <- 4.08 -> DG xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0385 <- 3.47 -> DG xxx N0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0386 <- 2.97 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0391 <- 4.28 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0489 <- 3.29 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0492 <- 4.32 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx B0498 <- 3.88 -> DA xxx N0025 : score x.xxxxx >8pbc_E:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Rad51_N-terminal_domain-like; title=RAD51 FILAMENT ON SSDNA BOUND BY THE BRCA2 C-TERMINUS organism=? : x : ARG xxxx E0235 <- 2.97 -> DG xxx V0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx E0238 <- 3.78 -> DG xxx V0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0239 <- 4.01 -> DA xxx V0015 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0270 <- 3.82 -> DA xxx V0018 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx E0271 <- 3.67 -> DG xxx V0019 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx E0273 <- 3.28 -> DA xxx V0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx E0285 <- 4.28 -> DG xxx V0017 : score x.xxxxx >8pbd_B:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Rad51_N-terminal_domain-like; title=RAD51 FILAMENT ON DSDNA BOUND BY THE BRCA2 C-TERMINUS organism=? : x : ARG xxxx B0235 <- 3.26 -> DG xxx T0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0238 <- 4.22 -> DG xxx T0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0239 <- 3.69 -> DG xxx T0020 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0270 <- 3.64 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx B0271 <- 4.00 -> DG xxx T0025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx B0273 <- 3.56 -> DA xxx T0024 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0274 <- 3.93 -> DT xxx U0004 : score x.xxxxx >8pbl_FG: title=E. COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX STALLED AT THYMINE DIMER LESION organism=? : H : ARG NH1 G0271 <- 3.29 -> DG O6 A0009 : score 5.48717 : x : ARG xxxx F0175 <- 4.33 -> DA xxx A0017 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0177 <- 4.39 -> DA xxx A0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0182 <- 3.88 -> DA xxx A0016 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx F0183 <- 3.01 -> DA xxx A0017 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx F0199 <- 2.96 -> DA xxx A0016 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0201 <- 3.57 -> DT xxx A0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0371 <- 3.88 -> DG xxx A0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0542 <- 3.24 -> DT xxx A0018 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0255 <- 3.29 -> DT xxx B0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0259 <- 3.74 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0275 <- 3.64 -> DG xxx A0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0314 <- 3.68 -> DC xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0316 <- 3.36 -> DC xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0352 <- 4.35 -> DC xxx B0016 : score x.xxxxx >8pbl_G:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=E. COLI RNA POLYMERASE ELONGATION COMPLEX STALLED AT THYMINE DIMER LESION organism=? : H : ARG NH1 G0271 <- 3.29 -> DG O6 A0009 : score 5.48717 : x : LEU xxxx G0255 <- 3.29 -> DT xxx B0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0259 <- 3.74 -> DT xxx A0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0275 <- 3.64 -> DG xxx A0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0314 <- 3.68 -> DC xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0316 <- 3.36 -> DC xxx A0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0352 <- 4.35 -> DC xxx B0016 : score x.xxxxx >8peo_A:Histone-fold; title=H3K36ME2 NUCLEOSOME-LEDGF/P75 PWWP DOMAIN COMPLEX organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 3.32 -> DT O2 J0009 : score 3.79307 >8pop_A: title=HK97 SMALL TERMINASE IN COMPLEX WITH DNA organism=Escherichia phage HK97 : H : ARG NH1 A0007 <- 2.72 -> DT O2 K0016 : score 4.37531 : H : ARG NH2 A0007 <- 2.53 -> DT O2 K0016 : score 4.46193 : x : LYS xxxx A0004 <- 3.48 -> DA xxx K0018 : score x.xxxxx >8pop_ABCDEF: title=HK97 SMALL TERMINASE IN COMPLEX WITH DNA organism=Escherichia phage HK97 : H : ARG NH1 A0007 <- 2.72 -> DT O2 K0016 : score 4.37531 : H : ARG NH2 A0007 <- 2.53 -> DT O2 K0016 : score 4.46193 : H : ARG NH1 B0128 <- 3.06 -> DG N7 J0026 : score 5.7354 : H : ARG NH2 B0128 <- 2.43 -> DG O6 J0026 : score 7.0884 : x : LYS xxxx A0004 <- 3.48 -> DA xxx K0018 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0126 <- 3.47 -> DC xxx J0025 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0129 <- 4.04 -> DC xxx K0019 : score x.xxxxx >8q43_AB: title=CRYSTAL STRUCTURE OF CA4-BOUND CAN2 (E341A) IN COMPLEX WITH OLIGO-C DNA organism=Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 : H : ASN ND2 A0299 <- 2.96 -> DC O2 C0001 : score 4.33614 : H : LYS NZ B0367 <- 2.84 -> DC O2 C0000 : score 2.92258 >8q43_B:Restriction_endonuclease-like; title=CRYSTAL STRUCTURE OF CA4-BOUND CAN2 (E341A) IN COMPLEX WITH OLIGO-C DNA organism=Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 : H : LYS NZ B0367 <- 2.84 -> DC O2 C0000 : score 2.92258 : w : LYS NZ B0367 <- 5.90 -> DC O2 C0000 : score 1.3 >8q63_A:DNA/RNA_polymerases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF IC8', A SECOND STATE OF YEAST MITOCHONDRIAL RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH 8-MER RNA, PPPGPGPUPAPAPAPUPG organism=? : H : SER OG A0644 <- 2.93 -> DA N3 T0030 : score 2.92575 : H : LYS NZ A0645 <- 3.35 -> DT O2 T0031 : score 3.19259 : H : ARG NH2 A1151 <- 2.52 -> DT O2 T0016 : score 4.4704 : x : ASN xxxx A0520 <- 3.97 -> DC xxx T0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0530 <- 4.23 -> DC xxx T0028 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0532 <- 4.43 -> DA xxx T0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0533 <- 4.33 -> DA xxx T0029 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0536 <- 3.23 -> DA xxx T0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0594 <- 3.15 -> DA xxx T0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0640 <- 3.92 -> DT xxx N0117 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0641 <- 3.37 -> DT xxx N0121 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0642 <- 3.55 -> DT xxx N0121 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0798 <- 4.44 -> DA xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0802 <- 4.19 -> DT xxx T0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0827 <- 4.17 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0831 <- 3.56 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1022 <- 3.94 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A1024 <- 4.08 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A1025 <- 2.98 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1026 <- 3.95 -> DC xxx N0130 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A1027 <- 3.21 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1032 <- 3.98 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1129 <- 3.21 -> DT xxx T0031 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1138 <- 3.30 -> DT xxx T0031 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1139 <- 4.14 -> DA xxx T0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1140 <- 3.82 -> DA xxx T0029 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1163 <- 3.49 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1237 <- 3.29 -> DG xxx T0010 : score x.xxxxx >8q63_AB:DNA/RNA_polymerases;S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYO-EM STRUCTURE OF IC8', A SECOND STATE OF YEAST MITOCHONDRIAL RNA POLYMERASE TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX WITH 8-MER RNA, PPPGPGPUPAPAPAPUPG organism=? : H : LYS NZ A0645 <- 3.35 -> DT O2 T0031 : score 3.19259 : H : THR OG1 A1025 <- 2.98 -> DG N3 T0017 : score 1.66105 : H : ARG NH2 A1151 <- 2.52 -> DT O2 T0016 : score 4.4704 : H : ASP OD2 B0101 <- 2.58 -> DA N6 N0122 : score 4.17868 : H : GLU OE2 B0144 <- 2.66 -> DA N6 N0119 : score 3.13672 : H : GLN OE1 B0149 <- 2.64 -> DG N2 N0120 : score 5.78714 : x : TYR xxxx B0018 <- 3.45 -> DT xxx N0124 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0103 <- 3.34 -> DA xxx N0122 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0104 <- 2.91 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx B0105 <- 3.21 -> DG xxx N0120 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0148 <- 3.21 -> DA xxx N0119 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0520 <- 3.97 -> DC xxx T0025 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0530 <- 4.23 -> DC xxx T0028 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0532 <- 4.43 -> DA xxx T0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0533 <- 4.33 -> DA xxx T0029 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0536 <- 3.23 -> DA xxx T0029 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0594 <- 3.15 -> DA xxx T0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0640 <- 3.92 -> DT xxx N0117 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0641 <- 3.37 -> DT xxx N0121 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0642 <- 3.55 -> DT xxx N0121 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0644 <- 2.86 -> DA xxx T0030 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0798 <- 4.44 -> DA xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0802 <- 4.19 -> DT xxx T0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0827 <- 4.17 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0831 <- 3.56 -> DA xxx T0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1022 <- 3.94 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A1024 <- 4.08 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A1026 <- 3.95 -> DC xxx N0130 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A1027 <- 3.21 -> DG xxx T0017 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1032 <- 3.98 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A1129 <- 3.21 -> DT xxx T0031 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A1138 <- 3.30 -> DT xxx T0031 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A1139 <- 4.14 -> DA xxx T0029 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A1140 <- 3.82 -> DA xxx T0029 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A1163 <- 3.49 -> DC xxx T0018 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1237 <- 3.29 -> DG xxx T0010 : score x.xxxxx >8scg_AD: title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT MUTANT F710Y/D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 0H (GROUND STATE) organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ A0582 <- 2.59 -> DC O2 b0006 : score 3.06989 : w : LYS NZ A0582 <- 5.86 -> DA N3 c0008 : score 1.538 : w : LYS NZ A0582 <- 6.28 -> DT O2 b0005 : score 0.522 : w : THR OG1 A0586 <- 5.70 -> DA N3 c0008 : score 2.845 : w : ARG NH1 A0615 <- 5.46 -> DC O2 c0005 : score 1.381 : w : ASN ND2 A0622 <- 5.55 -> DT O2 c0006 : score 1.666 : H : ASN ND2 A0625 <- 3.09 -> DA N3 b0007 : score 3.58685 : w : GLU OE1 A0658 <- 6.14 -> DG N3 c0004 : score 2.669 : w : ARG NH1 A0729 <- 6.06 -> DA N6 c0002 : score 1.486 : w : ARG NH2 A0729 <- 6.26 -> DA N6 c0002 : score 1.997 : w : ASN OD1 A0793 <- 6.45 -> DG N3 c0004 : score 3.377 : w : GLN NE2 A0797 <- 6.46 -> DG N3 c0004 : score 1.484 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.17 -> DG N3 b0012 : score 2.669 : w : ASN OD1 D0793 <- 6.37 -> DG N3 b0012 : score 3.377 : w : GLN NE2 D0797 <- 6.20 -> DG N3 b0012 : score 1.484 : x : ALA xxxx A0707 <- 3.93 -> DC xxx c0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0710 <- 4.38 -> DC xxx c0003 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0714 <- 3.51 -> DC xxx c0003 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0716 <- 4.14 -> DC xxx c0003 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0717 <- 3.82 -> DA xxx c0002 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0719 <- 3.52 -> DA xxx c0002 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0829 <- 4.03 -> DG xxx b0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0615 <- 3.45 -> DG xxx b0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0707 <- 3.98 -> DC xxx b0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.39 -> DC xxx b0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0716 <- 4.07 -> DC xxx b0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0717 <- 4.33 -> DA xxx b0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0719 <- 3.40 -> DA xxx b0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0729 <- 3.45 -> DA xxx b0010 : score x.xxxxx >8scg_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT MUTANT F710Y/D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 0H (GROUND STATE) organism=Geobacillus stearothermophilus : w : GLU OE1 D0658 <- 6.17 -> DG N3 b0012 : score 2.669 : w : ASN OD1 D0793 <- 6.37 -> DG N3 b0012 : score 3.377 : w : GLN NE2 D0797 <- 6.20 -> DG N3 b0012 : score 1.484 : x : ARG xxxx D0615 <- 3.45 -> DG xxx b0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0707 <- 3.98 -> DC xxx b0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.39 -> DC xxx b0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0716 <- 4.07 -> DC xxx b0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0717 <- 4.33 -> DA xxx b0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0719 <- 3.40 -> DA xxx b0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0729 <- 3.45 -> DA xxx b0010 : score x.xxxxx >8sci_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT MUTANT F710Y/D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 1H organism=Geobacillus stearothermophilus : x : PRO xxxx A0531 <- 3.78 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0532 <- 3.45 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0552 <- 3.33 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx >8sci_AD: title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT MUTANT F710Y/D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 1H organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.73 -> DC O2 c0019 : score 2.9874 : w : LYS NZ D0582 <- 5.82 -> DT O2 c0018 : score 0.522 : w : LYS NZ D0582 <- 5.59 -> DA N3 b0017 : score 1.538 : w : THR OG1 D0586 <- 5.45 -> DA N3 b0017 : score 2.845 : H : ASN ND2 D0625 <- 3.11 -> DA N3 c0020 : score 3.57162 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.49 -> DG N3 b0013 : score 2.669 : w : ASN ND2 D0793 <- 6.09 -> DG N3 b0013 : score 2.566 : w : GLN NE2 D0797 <- 5.90 -> DG N3 b0013 : score 1.484 : x : PRO xxxx A0531 <- 3.78 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0532 <- 3.45 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0552 <- 3.33 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0532 <- 2.90 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0552 <- 3.03 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0554 <- 3.29 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0587 <- 4.41 -> DA xxx c0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0615 <- 3.13 -> DG xxx b0013 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0622 <- 4.50 -> DG xxx b0016 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0707 <- 4.37 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0710 <- 3.80 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.40 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0829 <- 3.93 -> DG xxx c0021 : score x.xxxxx >8scj_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT MUTANT F710Y/D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 2H organism=Geobacillus stearothermophilus : H : THR OG1 A0552 <- 2.32 -> DA N3 c0013 : score 1.48382 : x : PRO xxxx A0531 <- 3.69 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0532 <- 3.47 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0554 <- 4.20 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx >8scj_AD: title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT MUTANT F710Y/D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 2H organism=Geobacillus stearothermophilus : H : THR OG1 A0552 <- 2.32 -> DA N3 c0013 : score 1.48382 : H : THR OG1 D0552 <- 3.27 -> DA N3 b0022 : score 1.22658 : H : LYS NZ D0582 <- 2.89 -> DC O2 c0019 : score 2.89312 : w : LYS NZ D0582 <- 6.05 -> DT O2 c0018 : score 0.522 : w : LYS NZ D0582 <- 5.60 -> DA N3 b0017 : score 1.538 : w : THR OG1 D0586 <- 5.76 -> DA N3 b0017 : score 2.845 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.58 -> DG N3 b0013 : score 2.669 : w : ASN ND2 D0793 <- 6.27 -> DG N3 b0013 : score 2.566 : w : GLN NE2 D0797 <- 5.79 -> DG N3 b0013 : score 1.484 : x : PRO xxxx A0531 <- 3.69 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0532 <- 3.47 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0554 <- 4.20 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0532 <- 3.00 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0554 <- 3.43 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0587 <- 4.44 -> DA xxx c0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0615 <- 3.35 -> DC xxx b0014 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0625 <- 3.59 -> DA xxx c0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0706 <- 3.34 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0710 <- 3.85 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.23 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0829 <- 4.07 -> DG xxx c0021 : score x.xxxxx >8sck_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT MUTANT F710Y/D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 4H organism=Geobacillus stearothermophilus : x : PRO xxxx A0531 <- 3.26 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0532 <- 3.33 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0552 <- 3.29 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0554 <- 4.01 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx >8sck_AD: title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT MUTANT F710Y/D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 4H organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.59 -> DC O2 c0019 : score 3.06989 : w : LYS NZ D0582 <- 5.81 -> DA N3 b0017 : score 1.538 : w : THR OG1 D0586 <- 5.80 -> DA N3 b0017 : score 2.845 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.74 -> DC O2 b0014 : score 1.381 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.82 -> DT O2 b0015 : score 1.666 : H : ASN ND2 D0625 <- 3.09 -> DA N3 c0020 : score 3.58685 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.22 -> DG N3 c0022 : score 2.669 : w : ASN ND2 D0793 <- 6.29 -> DG N3 c0022 : score 2.566 : w : GLN NE2 D0797 <- 6.11 -> DG N3 c0022 : score 1.484 : x : PRO xxxx A0531 <- 3.26 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0532 <- 3.33 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0552 <- 3.29 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0554 <- 4.01 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0531 <- 4.27 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0532 <- 3.01 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0552 <- 2.98 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0554 <- 3.16 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0629 <- 3.96 -> DG xxx c0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0710 <- 3.65 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.55 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0829 <- 3.97 -> DG xxx c0021 : score x.xxxxx >8scl_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT MUTANT F710Y/D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 6H organism=Geobacillus stearothermophilus : x : PRO xxxx A0531 <- 4.00 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0532 <- 3.34 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0552 <- 3.14 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0554 <- 4.36 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx >8scl_AD: title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT MUTANT F710Y/D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 6H organism=Geobacillus stearothermophilus : H : THR OG1 D0552 <- 2.39 -> DA N3 b0022 : score 1.46486 : H : LYS NZ D0582 <- 2.67 -> DC O2 c0019 : score 3.02275 : w : LYS NZ D0582 <- 5.30 -> DA N3 b0017 : score 1.538 : w : LYS NZ D0582 <- 5.94 -> DT O2 c0018 : score 0.522 : w : THR OG1 D0586 <- 5.52 -> DA N3 b0017 : score 2.845 : w : ARG NH1 D0615 <- 6.06 -> DC O2 b0014 : score 1.381 : H : ASN ND2 D0625 <- 3.19 -> DA N3 c0020 : score 3.51069 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.35 -> DG N3 b0013 : score 2.669 : w : ASN ND2 D0793 <- 6.49 -> DG N3 b0013 : score 2.566 : w : GLN NE2 D0797 <- 5.83 -> DG N3 b0013 : score 1.484 : x : PRO xxxx A0531 <- 4.00 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0532 <- 3.34 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0552 <- 3.14 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0554 <- 4.36 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0532 <- 3.30 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0554 <- 3.82 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0587 <- 4.48 -> DA xxx c0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0629 <- 3.64 -> DG xxx c0021 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0703 <- 3.38 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0710 <- 3.45 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.54 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0829 <- 3.89 -> DG xxx c0021 : score x.xxxxx >8scm_AD: title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT MUTANT F710Y/D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 8H organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.59 -> DC O2 c0019 : score 3.06989 : w : LYS NZ D0582 <- 5.94 -> DA N3 b0017 : score 1.538 : w : THR OG1 D0586 <- 5.81 -> DA N3 b0017 : score 2.845 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.71 -> DC O2 b0014 : score 1.381 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.89 -> DT O2 b0015 : score 1.666 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.96 -> DA N3 c0020 : score 3.68585 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.01 -> DG N3 c0022 : score 2.669 : w : ASN ND2 D0793 <- 5.96 -> DG N3 c0022 : score 2.566 : w : GLN NE2 D0797 <- 5.85 -> DG N3 c0022 : score 1.484 : x : PRO xxxx A0531 <- 3.79 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0532 <- 3.19 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0552 <- 3.16 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0554 <- 3.74 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0532 <- 3.07 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0552 <- 3.10 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0554 <- 3.67 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0587 <- 4.47 -> DA xxx c0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0703 <- 4.40 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0707 <- 4.49 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0710 <- 3.72 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.38 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0829 <- 3.97 -> DG xxx c0021 : score x.xxxxx >8scm_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT MUTANT F710Y/D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 8H organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.59 -> DC O2 c0019 : score 3.06989 : w : LYS NZ D0582 <- 5.94 -> DA N3 b0017 : score 1.538 : w : THR OG1 D0586 <- 5.81 -> DA N3 b0017 : score 2.845 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.71 -> DC O2 b0014 : score 1.381 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.89 -> DT O2 b0015 : score 1.666 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.96 -> DA N3 c0020 : score 3.68585 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.01 -> DG N3 c0022 : score 2.669 : w : ASN ND2 D0793 <- 5.96 -> DG N3 c0022 : score 2.566 : w : GLN NE2 D0797 <- 5.85 -> DG N3 c0022 : score 1.484 : x : LYS xxxx D0532 <- 3.07 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0552 <- 3.10 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0554 <- 3.67 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0587 <- 4.47 -> DA xxx c0020 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0703 <- 4.40 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0707 <- 4.49 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0710 <- 3.72 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.38 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0829 <- 3.97 -> DG xxx c0021 : score x.xxxxx >8scn_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; 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title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT WILDTYPE D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 0H (GROUND STATE) organism=Geobacillus stearothermophilus : w : GLU OE1 D0658 <- 6.06 -> DG N3 b0012 : score 2.669 : w : ASN OD1 D0793 <- 6.03 -> DG N3 b0012 : score 3.377 : w : GLN NE2 D0797 <- 6.09 -> DG N3 b0012 : score 1.484 : x : ARG xxxx D0615 <- 3.43 -> DG xxx b0012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0707 <- 4.03 -> DC xxx b0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.43 -> DC xxx b0011 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx D0716 <- 4.29 -> DC xxx b0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0717 <- 4.39 -> DA xxx b0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0719 <- 3.42 -> DA xxx b0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0729 <- 3.48 -> DA xxx b0010 : score x.xxxxx >8scp_AD: title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT WILDTYPE D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 1H organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.75 -> DC O2 c0019 : score 2.97562 : w : LYS NZ D0582 <- 5.51 -> DT O2 c0018 : score 0.522 : w : LYS NZ D0582 <- 5.93 -> DA N3 b0017 : score 1.538 : w : THR OG1 D0586 <- 5.61 -> DA N3 b0017 : score 2.845 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.58 -> DC O2 b0014 : score 1.381 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.73 -> DT O2 b0015 : score 1.666 : H : ASN ND2 D0625 <- 3.13 -> DA N3 c0020 : score 3.55638 : w : ASN ND2 D0625 <- 5.78 -> DG N3 b0016 : score 2.566 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.16 -> DG N3 b0013 : score 2.669 : w : ASN ND2 D0793 <- 6.05 -> DG N3 b0013 : score 2.566 : w : GLN NE2 D0797 <- 5.97 -> DG N3 b0013 : score 1.484 : x : PRO xxxx A0531 <- 3.68 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0532 <- 3.34 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0552 <- 3.77 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0554 <- 3.36 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0531 <- 3.99 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0532 <- 3.00 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0552 <- 2.74 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0554 <- 3.15 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0587 <- 4.43 -> DA xxx c0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0710 <- 3.69 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.36 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0829 <- 3.87 -> DG xxx c0021 : score x.xxxxx >8scp_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT WILDTYPE D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 1H organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.75 -> DC O2 c0019 : score 2.97562 : w : LYS NZ D0582 <- 5.51 -> DT O2 c0018 : score 0.522 : w : LYS NZ D0582 <- 5.93 -> DA N3 b0017 : score 1.538 : w : THR OG1 D0586 <- 5.61 -> DA N3 b0017 : score 2.845 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.58 -> DC O2 b0014 : score 1.381 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.73 -> DT O2 b0015 : score 1.666 : H : ASN ND2 D0625 <- 3.13 -> DA N3 c0020 : score 3.55638 : w : ASN ND2 D0625 <- 5.78 -> DG N3 b0016 : score 2.566 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.30 -> DG N3 c0022 : score 2.669 : w : ASN ND2 D0793 <- 6.19 -> DG N3 c0022 : score 2.566 : w : GLN NE2 D0797 <- 6.11 -> DG N3 c0022 : score 1.484 : x : PRO xxxx D0531 <- 3.99 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0532 <- 3.00 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0552 <- 2.74 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0554 <- 3.15 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0587 <- 4.43 -> DA xxx c0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0710 <- 3.69 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.36 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0829 <- 3.87 -> DG xxx c0021 : score x.xxxxx >8scr_AD: title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT WILDTYPE D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 4H organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.82 -> DC O2 c0019 : score 2.93437 : w : LYS NZ D0582 <- 5.77 -> DA N3 b0017 : score 1.538 : w : THR OG1 D0586 <- 5.82 -> DA N3 b0017 : score 2.845 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.45 -> DC O2 b0014 : score 1.381 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.80 -> DT O2 b0015 : score 1.666 : H : ASN ND2 D0625 <- 3.12 -> DA N3 c0020 : score 3.564 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.14 -> DG N3 c0022 : score 2.669 : w : ASN OD1 D0793 <- 6.28 -> DG N3 c0022 : score 3.377 : w : GLN NE2 D0797 <- 6.25 -> DG N3 c0022 : score 1.484 : x : PRO xxxx A0531 <- 3.57 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0532 <- 2.92 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0552 <- 3.39 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0554 <- 3.47 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0531 <- 4.32 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0532 <- 3.11 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0552 <- 2.89 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0554 <- 3.18 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0587 <- 4.44 -> DA xxx c0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0710 <- 3.70 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.60 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0829 <- 3.90 -> DG xxx c0021 : score x.xxxxx >8scr_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT WILDTYPE D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 4H organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.82 -> DC O2 c0019 : score 2.93437 : w : LYS NZ D0582 <- 5.77 -> DA N3 b0017 : score 1.538 : w : THR OG1 D0586 <- 5.82 -> DA N3 b0017 : score 2.845 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.45 -> DC O2 b0014 : score 1.381 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.80 -> DT O2 b0015 : score 1.666 : H : ASN ND2 D0625 <- 3.12 -> DA N3 c0020 : score 3.564 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.14 -> DG N3 c0022 : score 2.669 : w : ASN OD1 D0793 <- 6.28 -> DG N3 c0022 : score 3.377 : w : GLN NE2 D0797 <- 6.25 -> DG N3 c0022 : score 1.484 : x : PRO xxxx D0531 <- 4.32 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0532 <- 3.11 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0552 <- 2.89 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0554 <- 3.18 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0587 <- 4.44 -> DA xxx c0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0710 <- 3.70 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.60 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0829 <- 3.90 -> DG xxx c0021 : score x.xxxxx >8scs_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT WILDTYPE D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 8H organism=Geobacillus stearothermophilus : x : PRO xxxx A0531 <- 3.62 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0532 <- 3.27 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0552 <- 3.26 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0554 <- 3.34 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx >8scs_AD: title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT WILDTYPE D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 8H organism=Geobacillus stearothermophilus : H : THR OG1 D0552 <- 2.62 -> DA N3 b0022 : score 1.40258 : H : LYS NZ D0582 <- 2.67 -> DC O2 c0019 : score 3.02275 : w : LYS NZ D0582 <- 5.85 -> DA N3 b0017 : score 1.538 : w : LYS NZ D0582 <- 6.06 -> DT O2 c0018 : score 0.522 : w : THR OG1 D0586 <- 5.64 -> DA N3 b0017 : score 2.845 : w : TYR OH D0587 <- 5.97 -> DG N2 b0016 : score 2.834 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.55 -> DC O2 b0014 : score 1.381 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.72 -> DT O2 b0015 : score 1.666 : H : ASN ND2 D0625 <- 3.16 -> DA N3 c0020 : score 3.53354 : w : ASN ND2 D0625 <- 5.54 -> DG N3 b0016 : score 2.566 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.15 -> DG N3 b0013 : score 2.669 : w : ASN ND2 D0793 <- 6.18 -> DG N3 b0013 : score 2.566 : w : GLN NE2 D0797 <- 6.03 -> DG N3 b0013 : score 1.484 : x : PRO xxxx A0531 <- 3.62 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0532 <- 3.27 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0552 <- 3.26 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0554 <- 3.34 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0531 <- 3.46 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0532 <- 3.09 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0554 <- 3.49 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0707 <- 4.44 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0710 <- 3.69 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.45 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0829 <- 3.95 -> DG xxx c0021 : score x.xxxxx >8sct_AD: title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT WILDTYPE D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 24H organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.62 -> DC O2 c0019 : score 3.05222 : w : LYS NZ D0582 <- 5.80 -> DA N3 b0017 : score 1.538 : w : THR OG1 D0586 <- 5.78 -> DA N3 b0017 : score 2.845 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.64 -> DC O2 b0014 : score 1.381 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.92 -> DT O2 b0015 : score 1.666 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.89 -> DA N3 c0020 : score 3.73915 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.15 -> DG N3 b0013 : score 2.669 : w : ASN ND2 D0793 <- 6.57 -> DG N3 b0013 : score 2.566 : w : GLN NE2 D0797 <- 6.42 -> DG N3 b0013 : score 1.484 : x : PRO xxxx A0531 <- 3.83 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0532 <- 3.42 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0552 <- 3.33 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0554 <- 3.35 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0531 <- 4.07 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0532 <- 2.95 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0552 <- 2.83 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0554 <- 3.25 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0587 <- 4.46 -> DA xxx c0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0710 <- 3.66 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.55 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0829 <- 3.99 -> DG xxx c0021 : score x.xxxxx >8sct_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT WILDTYPE D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 24H organism=Geobacillus stearothermophilus : H : LYS NZ D0582 <- 2.62 -> DC O2 c0019 : score 3.05222 : w : LYS NZ D0582 <- 5.80 -> DA N3 b0017 : score 1.538 : w : THR OG1 D0586 <- 5.78 -> DA N3 b0017 : score 2.845 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.64 -> DC O2 b0014 : score 1.381 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.92 -> DT O2 b0015 : score 1.666 : H : ASN ND2 D0625 <- 2.89 -> DA N3 c0020 : score 3.73915 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.15 -> DG N3 b0013 : score 2.669 : w : ASN ND2 D0793 <- 6.57 -> DG N3 b0013 : score 2.566 : w : GLN NE2 D0797 <- 6.42 -> DG N3 b0013 : score 1.484 : x : PRO xxxx D0531 <- 4.07 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0532 <- 2.95 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx D0552 <- 2.83 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0554 <- 3.25 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0587 <- 4.46 -> DA xxx c0020 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0710 <- 3.66 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.55 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0829 <- 3.99 -> DG xxx c0021 : score x.xxxxx >8scu_AD: title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT WILDTYPE D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 48H (PRODUCT STATE) organism=Geobacillus stearothermophilus : H : THR OG1 A0552 <- 2.94 -> DA N3 c0013 : score 1.31594 : H : THR OG1 D0552 <- 2.76 -> DA N3 b0022 : score 1.36468 : H : LYS NZ D0582 <- 2.60 -> DC O2 c0019 : score 3.064 : w : LYS NZ D0582 <- 5.44 -> DA N3 b0017 : score 1.538 : w : THR OG1 D0586 <- 5.64 -> DA N3 b0017 : score 2.845 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.57 -> DC O2 b0014 : score 1.381 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.92 -> DT O2 b0015 : score 1.666 : H : ASN ND2 D0625 <- 3.09 -> DA N3 c0020 : score 3.58685 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.28 -> DG N3 b0013 : score 2.669 : w : ASN ND2 D0793 <- 6.11 -> DG N3 b0013 : score 2.566 : w : GLN NE2 D0797 <- 5.97 -> DG N3 b0013 : score 1.484 : x : PRO xxxx A0531 <- 3.94 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0532 <- 3.16 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0554 <- 3.28 -> DA xxx c0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0532 <- 3.19 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0554 <- 3.29 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0587 <- 4.42 -> DA xxx c0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0706 <- 4.49 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0707 <- 4.42 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0710 <- 3.67 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.30 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0829 <- 3.95 -> DG xxx c0021 : score x.xxxxx >8scu_D:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=BST DNA POLYMERASE I LARGE FRAGMENT WILDTYPE D598A WITH 3'-AMINO PRIMER, DGTP, AND CALCIUM TIME-RESOLVED 48H (PRODUCT STATE) organism=Geobacillus stearothermophilus : H : THR OG1 D0552 <- 2.76 -> DA N3 b0022 : score 1.36468 : H : LYS NZ D0582 <- 2.60 -> DC O2 c0019 : score 3.064 : w : LYS NZ D0582 <- 5.44 -> DA N3 b0017 : score 1.538 : w : THR OG1 D0586 <- 5.64 -> DA N3 b0017 : score 2.845 : w : ARG NH1 D0615 <- 5.57 -> DC O2 b0014 : score 1.381 : w : ASN ND2 D0622 <- 5.92 -> DT O2 b0015 : score 1.666 : H : ASN ND2 D0625 <- 3.09 -> DA N3 c0020 : score 3.58685 : w : GLU OE1 D0658 <- 6.26 -> DG N3 c0022 : score 2.669 : w : ASN ND2 D0793 <- 6.09 -> DG N3 c0022 : score 2.566 : w : GLN NE2 D0797 <- 5.95 -> DG N3 c0022 : score 1.484 : x : LYS xxxx D0532 <- 3.19 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0554 <- 3.29 -> DA xxx b0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0587 <- 4.42 -> DA xxx c0020 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx D0706 <- 4.49 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0707 <- 4.42 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx D0710 <- 3.67 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0714 <- 3.30 -> DG xxx c0022 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx D0829 <- 3.95 -> DG xxx c0021 : score x.xxxxx >8sh0_A:Nucleic_acid-binding_proteins; title=STRUCTURE OF HUMAN POT1 DNA BINDING DOMAIN BOUND TO A 5'- PHOSPHORYLATED JUNCTION OF A TELOMERIC DNA HAIRPIN WITH A 3'- OVERHANG organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx A0009 <- 3.83 -> DC xxx B-007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.23 -> DC xxx B-007 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0099 <- 3.66 -> DG xxx B0000 : score x.xxxxx >8sh1_A:Nucleic_acid-binding_proteins; title=STRUCTURE OF HUMAN POT1 DNA BINDING DOMAIN BOUND TO A 5'- PHOSPHORYLATED JUNCTION OF A TELOMERIC DOUBLE-STRANDED DNA DUPLEX WITH A 3'-OVERHANG organism=Homo sapiens : x : TYR xxxx A0009 <- 4.44 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.23 -> DC xxx C0000 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0099 <- 3.73 -> DG xxx B0000 : score x.xxxxx >8siy_CDEFGHIJ:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=ORIGIN RECOGNITION COMPLEX ASSOCIATED (ORCA) PROTEIN BOUND TO H4K20ME3-NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH2 C0040 <- 3.20 -> DT O2 L0009 : score 3.89467 : H : ARG NH2 E0011 <- 3.29 -> DT O2 L0044 : score 3.81847 : H : ARG NH2 G0040 <- 2.83 -> DG N3 K0009 : score 3.58859 : H : ARG NH2 J0033 <- 3.21 -> DG N3 K0048 : score 3.31422 : x : HIS xxxx C0039 <- 4.46 -> DC xxx K0069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0041 <- 3.88 -> DT xxx L-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 4.07 -> DA xxx L0026 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0039 <- 4.07 -> DT xxx L0069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0041 <- 4.01 -> DG xxx K-068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0083 <- 4.37 -> DT xxx L-024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0011 <- 3.06 -> DG xxx L-042 : score x.xxxxx >8siy_G:Histone-fold; title=ORIGIN RECOGNITION COMPLEX ASSOCIATED (ORCA) PROTEIN BOUND TO H4K20ME3-NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH2 G0040 <- 2.83 -> DG N3 K0009 : score 3.58859 : x : HIS xxxx G0039 <- 4.07 -> DT xxx L0069 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0041 <- 4.01 -> DG xxx K-068 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0083 <- 4.37 -> DT xxx L-024 : score x.xxxxx >8sjd_A:Ribonuclease_H-like;Hermes_dimerisation_domain; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HERMES TRANSPOSASE BOUND TO TWO RIGHT-ENDS OF ITS DNA TRANSPOSON. organism=? : x : ARG xxxx A0318 <- 3.14 -> DC xxx G0045 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0375 <- 4.34 -> DA xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0573 <- 3.83 -> DA xxx F0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0576 <- 4.12 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx >8sjd_AC:Ribonuclease_H-like;Hermes_dimerisation_domain;beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HERMES TRANSPOSASE BOUND TO TWO RIGHT-ENDS OF ITS DNA TRANSPOSON. organism=? : x : ILE xxxx C0145 <- 3.63 -> DT xxx G0007 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0146 <- 3.87 -> DC xxx F0038 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0585 <- 3.77 -> DT xxx G0003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0587 <- 3.77 -> DA xxx F0045 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0588 <- 3.93 -> DT xxx G0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0318 <- 3.14 -> DC xxx G0045 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0375 <- 4.34 -> DA xxx F0002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0573 <- 3.83 -> DA xxx F0002 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0576 <- 4.12 -> DG xxx F0003 : score x.xxxxx >8sjd_BD:Ribonuclease_H-like;Hermes_dimerisation_domain;beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=CRYO-EM STRUCTURE OF THE HERMES TRANSPOSASE BOUND TO TWO RIGHT-ENDS OF ITS DNA TRANSPOSON. organism=? : H : LYS NZ D0585 <- 3.00 -> DT O2 J0002 : score 3.44369 : V : ARG CZ B0318 <- 3.64 -> DT C7 J0046 : score 2.2176 : x : ILE xxxx D0145 <- 4.25 -> DT xxx J0007 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0588 <- 3.35 -> DT xxx I0044 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0572 <- 2.80 -> DT xxx J0046 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0576 <- 4.08 -> DG xxx I0003 : score x.xxxxx >8ski_A:DNA/RNA_polymerases;Lesion_bypass_DNA_polymerase_Y-family,_little_finger_domain; title=CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INCORPORATING 5F-DUTP ACROSS HX organism=Homo sapiens : x : SER xxxx A0322 <- 4.49 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0378 <- 3.86 -> DT xxx T0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0382 <- 3.35 -> DT xxx P0003 : score x.xxxxx >8smh_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CHIMERIC ETS-DOMAIN OF MURINE PU.1 HARBORING THE CORRESPONDING BETA- STRAND 3 (S3) RESIDUES FROM MURINE ETS-1 IN COMPLEX WITH D(AATAAGCGGAAGTGGG) organism=Mus musculus : w : GLN NE2 F0226 <- 5.66 -> DG O6 C0008 : score 2.87 : w : GLN NE2 F0226 <- 5.43 -> DG O6 D0027 : score 2.87 : H : ARG NE F0230 <- 2.86 -> DG O6 C0009 : score 3.89373 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.89 -> DG N7 C0009 : score 6.26969 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.52 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.75 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.17 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0233 <- 3.75 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx >8smj_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CHIMERIC ETS-DOMAIN OF MURINE PU.1 HARBORING THE CORRESPONDING BETA- STRAND 3 (S3) RESIDUES FROM MURINE ETS-1 IN COMPLEX WITH D(AATAAGCGGAATGGGG) organism=Mus musculus : w : GLN NE2 F0226 <- 5.68 -> DG O6 C0008 : score 2.87 : H : ARG NE F0230 <- 2.87 -> DG O6 C0009 : score 3.88585 : H : ARG NH2 F0230 <- 2.97 -> DG N7 C0009 : score 6.16754 : w : ARG NE F0233 <- 5.95 -> DG N7 C0008 : score 1.593 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.63 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.74 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.15 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8sp0_AB:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=SYMMETRIC DIMER OF MAPSPARTA BOUND WITH GRNA/TDNA HYBRID organism=? : x : ARG xxxx A0263 <- 3.25 -> DA xxx H0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0358 <- 3.08 -> DG xxx H0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0362 <- 4.38 -> DC xxx H0019 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0366 <- 3.92 -> DA xxx H0023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0247 <- 1.87 -> DC xxx H0022 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0435 <- 3.87 -> DG xxx H0020 : score x.xxxxx >8sp0_E:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain; title=SYMMETRIC DIMER OF MAPSPARTA BOUND WITH GRNA/TDNA HYBRID organism=? : H : ARG NH1 E0263 <- 2.67 -> DA N3 D0009 : score 3.77778 : x : HIS xxxx E0358 <- 3.55 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0362 <- 4.19 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx >8sp0_EF:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=SYMMETRIC DIMER OF MAPSPARTA BOUND WITH GRNA/TDNA HYBRID organism=? : H : ARG NH1 E0263 <- 2.67 -> DA N3 D0009 : score 3.77778 : x : HIS xxxx E0358 <- 3.55 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0362 <- 4.19 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0072 <- 3.82 -> DT xxx D0021 : score x.xxxxx >8sp1_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=CHIMERIC ETS-DOMAIN OF MURINE PU.1 HARBORING THE CORRESPONDING BETA- STRAND 3 (S3) RESIDUES FROM MURINE ETS-1 IN COMPLEX WITH D(AATAAGCGIAAGTGGG) organism=Mus musculus : w : GLN NE2 F0226 <- 5.66 -> DG O6 C0008 : score 2.87 : w : GLN NE2 F0226 <- 5.75 -> DG O6 D0027 : score 2.87 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.37 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.69 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0230 <- 2.84 -> DI xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.16 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0233 <- 3.70 -> DG xxx C0008 : score x.xxxxx >8sp3_AB:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=ASYMMETRIC DIMER OF MAPSPARTA BOUND WITH GRNA/TDNA HYBRID organism=? : H : ARG NH1 A0263 <- 2.94 -> DA N3 D0009 : score 3.57895 : H : LYS NZ B0247 <- 2.48 -> DC O2 D0022 : score 3.13471 : x : HIS xxxx A0358 <- 2.99 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0362 <- 3.99 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx >8sp3_B:Ribonuclease_H-like; title=ASYMMETRIC DIMER OF MAPSPARTA BOUND WITH GRNA/TDNA HYBRID organism=? : H : LYS NZ B0247 <- 2.48 -> DC O2 D0022 : score 3.13471 >8sp3_EF:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=ASYMMETRIC DIMER OF MAPSPARTA BOUND WITH GRNA/TDNA HYBRID organism=? : H : ARG NH1 E0263 <- 2.53 -> DA N3 H0009 : score 3.88088 : x : HIS xxxx E0358 <- 3.22 -> DG xxx H0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0072 <- 4.32 -> DT xxx H0021 : score x.xxxxx >8spo_A:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain; title=TETRAMERIZED ACTIVATION OF MAPSPARTA BOUND WITH NAD+ organism=? : H : ARG NH1 A0263 <- 2.68 -> DA N3 D0009 : score 3.77042 : x : HIS xxxx A0358 <- 3.42 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0362 <- 4.37 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx >8spo_AB:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=TETRAMERIZED ACTIVATION OF MAPSPARTA BOUND WITH NAD+ organism=? : H : ARG NH1 A0263 <- 2.68 -> DA N3 D0009 : score 3.77042 : H : LYS NZ B0247 <- 3.03 -> DC O2 D0022 : score 2.81063 : x : HIS xxxx A0358 <- 3.42 -> DG xxx D0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0362 <- 4.37 -> DC xxx D0019 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0435 <- 3.32 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx >8spo_EF:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=TETRAMERIZED ACTIVATION OF MAPSPARTA BOUND WITH NAD+ organism=? : H : ARG NH1 E0263 <- 2.78 -> DA N3 H0009 : score 3.69678 : x : HIS xxxx E0358 <- 3.45 -> DG xxx H0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0247 <- 4.08 -> DC xxx H0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0328 <- 3.96 -> DT xxx H0013 : score x.xxxxx >8spo_IL:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=TETRAMERIZED ACTIVATION OF MAPSPARTA BOUND WITH NAD+ organism=? : H : ARG NH1 I0263 <- 3.02 -> DA N3 K0009 : score 3.52004 : H : LYS NZ L0247 <- 2.39 -> DC O2 K0022 : score 3.18774 : x : HIS xxxx I0358 <- 3.13 -> DG xxx K0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx I0362 <- 4.34 -> DC xxx K0019 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx L0328 <- 4.23 -> DT xxx K0013 : score x.xxxxx >8spo_MN:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=TETRAMERIZED ACTIVATION OF MAPSPARTA BOUND WITH NAD+ organism=? : H : ARG NH1 M0263 <- 2.82 -> DA N3 P0009 : score 3.66732 : x : HIS xxxx M0358 <- 3.43 -> DG xxx P0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx N0072 <- 4.33 -> DT xxx P0021 : score x.xxxxx >8sps_G:Histone-fold; title=HIGH RESOLUTION STRUCTURE OF ESRRB NUCLEOSOME BOUND OCT4 AT SITE A AND SITE B organism=? : x : ARG xxxx G0042 <- 3.62 -> DT xxx J0041 : score x.xxxxx >8squ_A: title=MONOMERIC MAPSPARTA BOUND WITH GUIDE RNA AND TARGET DNA HYBRID organism=? : H : HIS NE2 A0358 <- 2.94 -> DG N2 D0017 : score 3.62382 : x : ARG xxxx A0263 <- 2.95 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx >8squ_AB:Toll/Interleukin_receptor_TIR_domain;Ribonuclease_H-like; title=MONOMERIC MAPSPARTA BOUND WITH GUIDE RNA AND TARGET DNA HYBRID organism=? : H : HIS NE2 A0358 <- 2.94 -> DG N2 D0017 : score 3.62382 : V : ARG CB B0243 <- 3.63 -> DT C7 D0021 : score 1.04785 : x : ARG xxxx A0263 <- 2.95 -> DA xxx D0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx B0244 <- 2.92 -> DC xxx D0022 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0247 <- 4.39 -> DC xxx D0022 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0391 <- 3.98 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0435 <- 4.17 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx >8sro_AC: title=FOXP3 TETRAMER ON TTTG REPEATS organism=? : H : HIS NE2 A0387 <- 2.61 -> DT O4 I0030 : score 5.82212 : V : ARG CZ A0386 <- 3.61 -> DT C7 I0026 : score 2.23359 : V : LEU CD1 A0391 <- 3.90 -> DT C7 I0030 : score 5.588 : x : ASN xxxx A0383 <- 3.92 -> DA xxx J0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0390 <- 3.20 -> DT xxx I0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx C0383 <- 3.46 -> DA xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0386 <- 3.42 -> DG xxx I0035 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0387 <- 3.26 -> DT xxx I0037 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0390 <- 3.09 -> DT xxx I0037 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0391 <- 3.96 -> DT xxx I0037 : score x.xxxxx >8sro_BD: title=FOXP3 TETRAMER ON TTTG REPEATS organism=? : H : HIS NE2 B0387 <- 2.64 -> DT O4 E0030 : score 5.78846 : H : HIS ND1 D0387 <- 2.64 -> DT O4 E0037 : score 4.87157 : V : ARG CZ B0386 <- 3.79 -> DT C7 E0026 : score 2.13764 : x : ASN xxxx D0383 <- 3.87 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0386 <- 3.50 -> DT xxx E0034 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0390 <- 3.12 -> DT xxx E0037 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0391 <- 4.02 -> DT xxx E0037 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0390 <- 3.25 -> DT xxx E0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0391 <- 3.92 -> DT xxx E0030 : score x.xxxxx >8sro_D:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=FOXP3 TETRAMER ON TTTG REPEATS organism=? : H : HIS ND1 D0387 <- 2.64 -> DT O4 E0037 : score 4.87157 : x : ASN xxxx D0383 <- 3.87 -> DA xxx F0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0386 <- 3.50 -> DT xxx E0034 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0390 <- 3.12 -> DT xxx E0037 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0391 <- 4.02 -> DT xxx E0037 : score x.xxxxx >8srp_ACFHI: title=FOXP3 FORMS LADDER-LIKE MULTIMER TO BRIDGE TTTG REPEATS organism=? : H : HIS NE2 A0387 <- 2.93 -> DT O4 K0021 : score 5.46314 : H : ASN OD1 C0383 <- 3.20 -> DC N4 L0028 : score 3.8581 : H : ASN OD1 C0383 <- 3.20 -> DC N4 L0028 : score 3.8581 : V : ARG CB I0386 <- 3.89 -> DT C7 K0006 : score 0.982513 : V : ARG CZ A0386 <- 3.57 -> DT C7 K0017 : score 2.25492 : V : ARG CZ C0386 <- 3.55 -> DT C7 K0024 : score 2.26558 : V : ARG CB F0386 <- 3.63 -> DT C7 K0038 : score 1.04785 : x : ASN xxxx A0383 <- 3.53 -> DA xxx L0035 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0390 <- 3.16 -> DG xxx K0019 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0391 <- 4.15 -> DT xxx K0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx H0383 <- 3.72 -> DC xxx L0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0386 <- 3.49 -> DT xxx K0046 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx H0387 <- 3.98 -> DT xxx K0048 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx F0387 <- 3.64 -> DA xxx L0015 : score x.xxxxx : x : SER xxxx F0390 <- 3.68 -> DT xxx K0038 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx F0391 <- 3.96 -> DT xxx K0040 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx C0387 <- 3.07 -> DT xxx K0028 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0390 <- 3.65 -> DG xxx K0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0391 <- 4.50 -> DT xxx K0028 : score x.xxxxx >8srp_BDEGJ: title=FOXP3 FORMS LADDER-LIKE MULTIMER TO BRIDGE TTTG REPEATS organism=? : H : ASN ND2 B0383 <- 3.28 -> DA N7 N0026 : score 5.30694 : H : HIS NE2 B0387 <- 2.58 -> DT O4 M0030 : score 5.85577 : H : HIS ND1 D0387 <- 2.73 -> DT O4 M0037 : score 4.7866 : V : ARG CZ D0386 <- 3.60 -> DT C7 M0034 : score 2.23892 : x : ARG xxxx J0386 <- 4.41 -> DT xxx M0048 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx J0387 <- 3.60 -> DT xxx M0049 : score x.xxxxx : x : SER xxxx J0390 <- 3.61 -> DT xxx M0049 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0391 <- 4.09 -> DT xxx M0049 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx G0387 <- 3.99 -> DA xxx N0045 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0390 <- 3.57 -> DT xxx M0008 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx G0391 <- 4.44 -> DT xxx M0009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0386 <- 4.22 -> DT xxx M0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx E0390 <- 3.70 -> DT xxx M0017 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0383 <- 4.00 -> DA xxx N0018 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0390 <- 3.46 -> DT xxx M0036 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0391 <- 4.02 -> DT xxx M0037 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0386 <- 3.60 -> DT xxx M0026 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0390 <- 3.17 -> DT xxx M0029 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx B0391 <- 4.23 -> DT xxx M0030 : score x.xxxxx >8srp_J:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=FOXP3 FORMS LADDER-LIKE MULTIMER TO BRIDGE TTTG REPEATS organism=? : V : SER CB J0390 <- 3.61 -> DT C7 M0049 : score 3.28002 : x : ARG xxxx J0386 <- 4.41 -> DT xxx M0048 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx J0387 <- 3.60 -> DT xxx M0049 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx J0391 <- 4.09 -> DT xxx M0049 : score x.xxxxx >8ssq_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZNFS 3-11 OF CCCTC-BINDING FACTOR (CTCF) COMPLEXED WITH 35MER DNA 35- 4 organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0339 <- 2.64 -> DG N7 C0031 : score 6.2436 : H : ARG NH2 A0339 <- 2.59 -> DG O6 C0031 : score 6.8772 : H : LYS NZ A0365 <- 2.64 -> DG O6 C0029 : score 5.96575 : H : ARG NH1 A0368 <- 2.70 -> DG N7 C0028 : score 6.171 : H : ARG NH2 A0368 <- 2.45 -> DG O6 C0028 : score 7.062 : H : LYS NZ A0393 <- 2.49 -> DG O6 C0026 : score 6.13918 : H : ARG NH1 A0396 <- 3.11 -> DG O6 C0025 : score 5.70617 : H : ARG NH2 A0396 <- 2.97 -> DG N7 C0025 : score 6.16754 : H : GLN OE1 A0418 <- 2.92 -> DA N6 C0024 : score 5.9073 : H : GLN NE2 A0418 <- 2.90 -> DA N7 C0024 : score 5.96795 : H : ASP OD1 A0451 <- 2.62 -> DC N4 C0020 : score 5.53729 : H : ARG NH1 A0508 <- 2.97 -> DG N7 B0027 : score 5.8443 : H : ARG NH2 A0508 <- 3.14 -> DG O6 B0027 : score 6.1512 : H : GLN OE1 A0536 <- 2.96 -> DA N6 B0029 : score 5.85888 : H : ARG NH1 A0566 <- 3.27 -> DG O6 C0003 : score 5.5115 : H : ARG NH2 A0566 <- 2.90 -> DG O6 C0003 : score 6.468 : V : VAL CG2 A0454 <- 3.66 -> DT C7 B0015 : score 6.33738 >8ssr_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZNFS 3-11 OF CCCTC-BINDING FACTOR (CTCF) COMPLEXED WITH 35MER DNA 35- 20 organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0339 <- 2.91 -> DG N7 C0031 : score 5.9169 : H : ARG NH1 A0339 <- 2.60 -> DG O6 C0031 : score 6.32667 : H : ARG NH2 A0339 <- 2.48 -> DG N7 C0031 : score 6.79323 : H : GLU OE2 A0362 <- 2.61 -> DC N4 C0030 : score 5.46547 : H : LYS NZ A0365 <- 2.56 -> DG O6 C0029 : score 6.05825 : H : ARG NH1 A0368 <- 3.18 -> DG O6 C0028 : score 5.621 : H : ARG NH2 A0368 <- 2.40 -> DG N7 C0028 : score 6.89538 : H : LYS NZ A0393 <- 2.68 -> DG N7 C0026 : score 5.51516 : H : ARG NH1 A0396 <- 3.43 -> DG O6 C0025 : score 5.31683 : H : ARG NH2 A0396 <- 3.24 -> DG N7 C0025 : score 5.82277 : H : GLN OE1 A0418 <- 3.38 -> DA N6 C0024 : score 5.35047 : H : GLN NE2 A0418 <- 3.34 -> DA N7 C0024 : score 5.43205 : H : ASP OD1 A0451 <- 2.99 -> DC N4 C0020 : score 5.14177 : H : ARG NH1 A0508 <- 3.15 -> DG N7 B0027 : score 5.6265 : H : ARG NH2 A0508 <- 3.23 -> DG O6 B0027 : score 6.0324 : H : GLN OE1 A0536 <- 3.05 -> DA N6 B0029 : score 5.74994 : H : ARG NH1 A0566 <- 3.05 -> DG O6 B0032 : score 5.77917 : H : ARG NH1 A0566 <- 3.07 -> DG O6 C0003 : score 5.75483 : H : ARG NH2 A0566 <- 2.61 -> DG O6 C0003 : score 6.8508 : V : VAL CG2 A0454 <- 3.79 -> DT C7 B0015 : score 6.13838 : x : GLU xxxx A0336 <- 3.13 -> DC xxx C0032 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0343 <- 3.35 -> DG xxx C0029 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0392 <- 3.58 -> DC xxx B0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0421 <- 3.96 -> DG xxx C0022 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.69 -> DC xxx C0020 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0450 <- 3.19 -> DC xxx B0014 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0506 <- 3.34 -> DG xxx B0026 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx A0509 <- 3.58 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0512 <- 4.26 -> DT xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0534 <- 4.10 -> DA xxx C0005 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0537 <- 4.31 -> DC xxx C0004 : score x.xxxxx >8sss_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZNFS 1-7 OF CCCTC-BINDING FACTOR (CTCF) COMPLEXED WITH 23MER organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 A0277 <- 2.63 -> DG O6 C0022 : score 6.29017 : H : ARG NH2 A0277 <- 2.47 -> DG N7 C0022 : score 6.806 : H : ASN OD1 A0280 <- 2.99 -> DA N6 C0021 : score 5.79297 : H : ASN ND2 A0280 <- 3.21 -> DA N7 C0021 : score 5.38913 : H : ARG NH1 A0283 <- 3.01 -> DG O6 C0020 : score 5.82783 : H : ARG NH2 A0283 <- 3.05 -> DG N7 C0020 : score 6.06538 : H : ARG NH1 A0339 <- 2.81 -> DG O6 C0014 : score 6.07117 : H : ARG NH2 A0339 <- 2.50 -> DG N7 C0014 : score 6.76769 : H : GLU OE2 A0362 <- 2.84 -> DC N4 C0013 : score 5.22326 : H : LYS NZ A0365 <- 3.31 -> DG O6 C0012 : score 5.19113 : H : ARG NH1 A0368 <- 3.09 -> DG O6 C0011 : score 5.7305 : H : ARG NH2 A0368 <- 2.90 -> DG N7 C0011 : score 6.25692 : H : LYS NZ A0393 <- 2.83 -> DG O6 C0009 : score 5.74608 : H : ARG NH1 A0396 <- 3.08 -> DG O6 C0008 : score 5.74267 : H : ARG NH2 A0396 <- 2.97 -> DG N7 C0008 : score 6.16754 : w : ARG NH1 A0396 <- 6.45 -> DC N4 B0015 : score 1.892 : H : GLN OE1 A0418 <- 2.87 -> DA N6 C0007 : score 5.96783 : H : GLN NE2 A0418 <- 2.94 -> DA N7 C0007 : score 5.91923 : H : THR OG1 A0421 <- 2.90 -> DC N4 C0006 : score 3.95267 : w : SER OG A0450 <- 5.52 -> DT O4 B0020 : score 2.338 : w : SER OG A0450 <- 5.50 -> DC N4 B0019 : score 2.105 : H : ASP OD1 A0451 <- 2.86 -> DC N4 C0003 : score 5.28073 : w : ASP OD1 A0451 <- 5.83 -> DT O4 B0020 : score 2.616 : x : SER xxxx A0279 <- 3.66 -> DC xxx B0001 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0308 <- 3.73 -> DA xxx C0017 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0333 <- 4.04 -> DT xxx C0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0334 <- 4.15 -> DA xxx B0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0336 <- 3.69 -> DC xxx C0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0343 <- 3.66 -> DG xxx C0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0390 <- 4.14 -> DG xxx C0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0392 <- 3.30 -> DC xxx B0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0448 <- 3.72 -> DC xxx C0003 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx A0454 <- 3.93 -> DT xxx B0020 : score x.xxxxx >8sst_D:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZNFS 1-7 OF CCCTC-BINDING FACTOR (CTCF) K365T MUTANT COMPLEXED WITH 23MER organism=Homo sapiens : H : ARG NH1 D0283 <- 2.72 -> DG O6 F0020 : score 6.18067 : H : ARG NH2 D0283 <- 2.73 -> DG N7 F0020 : score 6.474 : H : ARG NH1 D0339 <- 2.89 -> DG O6 F0014 : score 5.97383 : H : ARG NH2 D0339 <- 2.86 -> DG N7 F0014 : score 6.308 : H : GLU OE2 D0362 <- 2.61 -> DC N4 F0013 : score 5.46547 : H : ARG NH1 D0368 <- 3.12 -> DG O6 F0011 : score 5.694 : H : ARG NH2 D0368 <- 2.96 -> DG N7 F0011 : score 6.18031 : H : LYS NZ D0393 <- 2.39 -> DG O6 F0009 : score 6.25479 : H : LYS NZ D0393 <- 2.63 -> DG O6 F0010 : score 5.97732 : H : ARG NH1 D0396 <- 3.02 -> DG O6 F0008 : score 5.81567 : H : ARG NH2 D0396 <- 2.81 -> DG N7 F0008 : score 6.37185 : w : ARG NH1 D0396 <- 6.61 -> DC N4 E0015 : score 1.892 : H : GLN OE1 D0418 <- 2.96 -> DA N6 F0007 : score 5.85888 : H : GLN NE2 D0418 <- 3.12 -> DA N7 F0007 : score 5.7 : H : THR OG1 D0421 <- 3.22 -> DC N4 F0006 : score 3.69453 : w : SER OG D0450 <- 5.40 -> DT O4 E0020 : score 2.338 : w : SER OG D0450 <- 5.78 -> DC N4 E0019 : score 2.105 : H : ASP OD1 D0451 <- 2.83 -> DC N4 F0003 : score 5.3128 : w : ASP OD1 D0451 <- 5.37 -> DT O4 E0020 : score 2.616 : w : ASP OD1 D0451 <- 5.79 -> DC N4 F0002 : score 2.835 : V : VAL CG2 D0454 <- 3.74 -> DT C7 E0020 : score 6.21492 : V : THR CG2 D0333 <- 3.78 -> DT C7 F0016 : score 4.25811 : x : ARG xxxx D0277 <- 3.61 -> DA xxx F0021 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx D0280 <- 3.86 -> DA xxx F0021 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0308 <- 4.30 -> DA xxx F0017 : score x.xxxxx : x : SER xxxx D0334 <- 4.11 -> DA xxx E0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0336 <- 3.08 -> DC xxx F0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0343 <- 3.32 -> DG xxx F0012 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx D0390 <- 4.14 -> DG xxx F0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx D0392 <- 3.35 -> DC xxx E0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0448 <- 3.80 -> DC xxx F0003 : score x.xxxxx >8ssu_A:beta-beta-alpha_zinc_fingers; title=ZNFS 3-11 OF CCCTC-BINDING FACTOR (CTCF) COMPLEXED WITH 19MER DNA organism=? : H : GLU OE2 A0336 <- 3.04 -> DC N4 C0018 : score 5.01265 : H : ARG NH1 A0339 <- 2.85 -> DG O6 B0002 : score 6.0225 : H : ARG NH2 A0339 <- 2.56 -> DG O6 C0017 : score 6.9168 : H : GLU OE1 A0362 <- 2.56 -> DC N4 B0003 : score 6.04481 : H : GLU OE2 A0362 <- 2.44 -> DC N4 C0016 : score 5.64449 : H : LYS NZ A0365 <- 2.49 -> DG O6 C0015 : score 6.13918 : H : ARG NH1 A0368 <- 3.02 -> DG O6 C0014 : score 5.81567 : H : ARG NH2 A0368 <- 2.98 -> DG N7 C0014 : score 6.15477 : H : LYS NZ A0393 <- 2.99 -> DG N7 C0012 : score 5.18123 : H : LYS NZ A0393 <- 2.48 -> DG O6 C0012 : score 6.15074 : H : ARG NH1 A0396 <- 2.82 -> DG O6 C0011 : score 6.059 : H : ARG NH2 A0396 <- 2.92 -> DG N7 C0011 : score 6.23138 : H : GLN OE1 A0418 <- 2.89 -> DA N6 C0010 : score 5.94362 : H : GLN NE2 A0418 <- 3.02 -> DA N7 C0010 : score 5.82179 : H : ASP OD1 A0451 <- 3.18 -> DC N4 C0006 : score 4.93866 : V : VAL CG2 A0454 <- 3.56 -> DT C7 B0013 : score 6.49046 >8sva_AFGT: title=STRUCTURE OF THE RHODOCOCCUS SP. USK13 DARR-20 BP DNA COMPLEX organism=? : H : LYS NZ A0044 <- 2.95 -> DG N7 D0020 : score 5.22432 : H : LYS NZ A0044 <- 3.23 -> DG O6 D0020 : score 5.28362 : H : LYS NZ T0044 <- 2.74 -> DA N7 B0021 : score 2.97243 : H : LYS NZ T0044 <- 3.05 -> DG N7 B0022 : score 5.1166 : H : LYS NZ T0044 <- 2.98 -> DG O6 B0022 : score 5.57266 : x : TYR xxxx A0048 <- 3.76 -> DG xxx D0020 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0049 <- 3.59 -> DT xxx B0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0033 <- 4.11 -> DT xxx B0025 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0048 <- 3.05 -> DT xxx B0025 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0043 <- 3.69 -> DA xxx B0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0044 <- 3.75 -> DG xxx D0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0048 <- 3.33 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx T0043 <- 3.81 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx T0048 <- 3.57 -> DG xxx B0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx T0049 <- 3.46 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx >8sva_T:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF THE RHODOCOCCUS SP. USK13 DARR-20 BP DNA COMPLEX organism=? : H : LYS NZ T0044 <- 2.74 -> DA N7 B0021 : score 2.97243 : H : LYS NZ T0044 <- 3.05 -> DG N7 B0022 : score 5.1166 : H : LYS NZ T0044 <- 2.98 -> DG O6 B0022 : score 5.57266 : x : THR xxxx T0043 <- 3.81 -> DT xxx D0014 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx T0048 <- 3.57 -> DG xxx B0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx T0049 <- 3.46 -> DG xxx D0012 : score x.xxxxx >8svd_AFGT: title=STRUCTURE OF M. BAIXIANGNINGIAE DARR-DNA COMPLEX REVEALS NOVEL DIMER- OF-DIMERS DNA BINDING organism=? : H : LYS NZ A0044 <- 2.76 -> DG N7 D0023 : score 5.42898 : H : LYS NZ A0044 <- 2.65 -> DG O6 D0023 : score 5.95419 : H : LYS NZ T0044 <- 3.30 -> DG O6 B0021 : score 5.20269 : x : THR xxxx A0043 <- 3.81 -> DT xxx B0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0048 <- 3.83 -> DG xxx D0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0049 <- 4.00 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx F0033 <- 4.26 -> DT xxx B0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx F0044 <- 3.35 -> DT xxx B0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx F0048 <- 3.13 -> DT xxx B0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx G0043 <- 4.10 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0044 <- 3.51 -> DG xxx D0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0048 <- 3.72 -> DT xxx D0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0049 <- 3.50 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx T0043 <- 3.26 -> DT xxx D0017 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx T0048 <- 3.42 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx T0049 <- 3.48 -> DA xxx D0014 : score x.xxxxx >8svd_EIJK: title=STRUCTURE OF M. BAIXIANGNINGIAE DARR-DNA COMPLEX REVEALS NOVEL DIMER- OF-DIMERS DNA BINDING organism=? : H : LYS NZ E0044 <- 2.97 -> DG N7 Q0023 : score 5.20278 : H : LYS NZ E0044 <- 2.32 -> DG O6 Q0023 : score 6.33572 : H : LYS NZ J0044 <- 2.70 -> DG O6 Q0026 : score 5.89638 : x : THR xxxx E0043 <- 4.43 -> DT xxx M0015 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0048 <- 3.61 -> DG xxx Q0023 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0049 <- 4.18 -> DA xxx M0013 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx I0033 <- 4.39 -> DT xxx M0024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx I0044 <- 3.84 -> DT xxx M0024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx I0048 <- 4.23 -> DT xxx M0024 : score x.xxxxx : x : THR xxxx J0043 <- 3.32 -> DT xxx M0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx J0048 <- 3.67 -> DT xxx Q0027 : score x.xxxxx : x : THR xxxx K0043 <- 3.66 -> DA xxx Q0016 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx K0044 <- 3.30 -> DG xxx M0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx K0048 <- 3.60 -> DG xxx M0021 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx K0049 <- 3.28 -> DA xxx Q0014 : score x.xxxxx >8svd_G:Homeodomain-like;Tetracyclin_repressor-like,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF M. BAIXIANGNINGIAE DARR-DNA COMPLEX REVEALS NOVEL DIMER- OF-DIMERS DNA BINDING organism=? : x : THR xxxx G0043 <- 4.10 -> DT xxx B0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx G0044 <- 3.51 -> DG xxx D0026 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0048 <- 3.72 -> DT xxx D0027 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx G0049 <- 3.50 -> DA xxx B0009 : score x.xxxxx >8svf_A:Histone-fold; title=BAP1/ASXL1 BOUND TO THE H2AK119UB NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx A0040 <- 3.07 -> DG xxx J0108 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.65 -> DT xxx I0075 : score x.xxxxx >8syi_CDGZ: title=CYANOBACTERIAL RNAP-EC organism=? : V : ASP CG C0175 <- 3.64 -> DT C7 N0026 : score 2.7904 : x : ARG xxxx C0130 <- 3.75 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0159 <- 3.63 -> DT xxx N0026 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0253 <- 3.84 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0306 <- 4.35 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0307 <- 4.05 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0312 <- 4.12 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0334 <- 4.27 -> DT xxx N0022 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx C0399 <- 4.46 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0402 <- 3.53 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0403 <- 4.37 -> DA xxx N0028 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx C0408 <- 3.68 -> DG xxx N0027 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx D0261 <- 4.02 -> DC xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0276 <- 4.49 -> DA xxx N0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0320 <- 4.34 -> DC xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0432 <- 4.34 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0433 <- 4.39 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : THR xxxx Z0197 <- 3.52 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx Z0198 <- 4.21 -> DG xxx T0014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx G0029 <- 3.80 -> DC xxx N0019 : score x.xxxxx : x : SER xxxx G0030 <- 3.82 -> DC xxx N0018 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx G0105 <- 3.74 -> DT xxx N0020 : score x.xxxxx >8syi_D:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=CYANOBACTERIAL RNAP-EC organism=? : x : LEU xxxx D0261 <- 4.02 -> DC xxx T0023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0276 <- 4.49 -> DA xxx N0017 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0320 <- 4.34 -> DC xxx N0023 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx D0432 <- 4.34 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx D0433 <- 4.39 -> DT xxx T0015 : score x.xxxxx >8syp_A:Histone-fold; title=GENOMIC CX3CR1 NUCLEOSOME organism=? : x : ARG xxxx A0040 <- 3.37 -> DG xxx J0093 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.21 -> DA xxx I0055 : score x.xxxxx >8syp_ABCDEFGH: title=GENOMIC CX3CR1 NUCLEOSOME organism=? : H : ARG NH1 E0040 <- 3.36 -> DT O2 I0088 : score 3.82409 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.31 -> DT O2 I0088 : score 3.80153 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.37 -> DG xxx J0093 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.21 -> DA xxx I0055 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.48 -> DG xxx J0122 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0077 <- 4.02 -> DC xxx J0141 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0030 <- 3.47 -> DG xxx J0132 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.72 -> DT xxx J0060 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.22 -> DG xxx I0085 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0030 <- 3.56 -> DG xxx I0127 : score x.xxxxx >8t1u_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CRYSTAL STRUCTURE OF THE DRM2-CTA DNA COMPLEX organism=Arabidopsis thaliana : H : CYS SG A0397 <- 3.28 -> DA N6 G0012 : score 5.18757 A : w : ARG NH1 A0598 <- 5.51 -> DA N3 E0010 : score 2.585 : V : LEU CD1 A0395 <- 3.53 -> DT C7 G0011 : score 6.11814 : x : LYS xxxx A0434 <- 4.23 -> DT xxx G0009 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0435 <- 3.59 -> DA xxx E0008 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0472 <- 3.50 -> DA xxx E0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0595 <- 3.13 -> DG xxx E0009 : score x.xxxxx >8t3t_ABCDEFGH: title=STRUCTURE OF BRE1-NUCLEOSOME COMPLEX - STATE3 organism=? : H : ARG NH2 E0040 <- 3.11 -> DT O2 J0083 : score 3.97087 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.55 -> DG xxx I0083 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 4.22 -> DT xxx I0027 : score x.xxxxx >8t3t_H:Histone-fold; title=STRUCTURE OF BRE1-NUCLEOSOME COMPLEX - STATE3 organism=? : x : ARG xxxx H0033 <- 4.22 -> DT xxx I0027 : score x.xxxxx >8t3w_ABCDEFGH: title=STRUCTURE OF BRE1-NUCLEOSOME COMPLEX - STATE2 organism=? : H : ARG NH1 E0040 <- 2.98 -> DT O2 J0083 : score 4.15138 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.62 -> DG xxx J0066 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.44 -> DT xxx I0027 : score x.xxxxx >8t3w_H:Histone-fold; title=STRUCTURE OF BRE1-NUCLEOSOME COMPLEX - STATE2 organism=? : x : ARG xxxx H0033 <- 3.44 -> DT xxx I0027 : score x.xxxxx >8t3y_A:Histone-fold; title=STRUCTURE OF BRE1-NUCLEOSOME COMPLEX - STATE1 organism=? : x : ARG xxxx A0040 <- 3.62 -> DG xxx J0066 : score x.xxxxx >8t3y_ABCDEFGH: title=STRUCTURE OF BRE1-NUCLEOSOME COMPLEX - STATE1 organism=? : H : ARG NH1 E0040 <- 2.98 -> DT O2 J0083 : score 4.15138 : x : ARG xxxx A0040 <- 3.62 -> DG xxx J0066 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0033 <- 3.44 -> DT xxx I0027 : score x.xxxxx >8t9f_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CATALYTIC AND NON-CATALYTIC MECHANISMS OF HISTONE H4 LYSINE 20 METHYLTRANSFERASE SUV420H1 organism=? : H : ARG NH1 A0040 <- 2.73 -> DG N3 J0082 : score 3.0953 : H : ARG NH2 E0040 <- 2.78 -> DG N3 I0083 : score 3.6247 : x : ARG xxxx A0083 <- 4.00 -> DG xxx I0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0045 <- 4.39 -> DC xxx J0081 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0045 <- 4.20 -> DG xxx J0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx H0034 <- 4.20 -> DC xxx J0123 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.19 -> DG xxx I0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.02 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx >8t9f_F:Histone-fold; title=CATALYTIC AND NON-CATALYTIC MECHANISMS OF HISTONE H4 LYSINE 20 METHYLTRANSFERASE SUV420H1 organism=? : x : ARG xxxx F0045 <- 4.39 -> DC xxx J0081 : score x.xxxxx >8t9h_ABCDEFGH:Histone-fold;P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;Chromo_domain-like;Homeodomain-like;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CATALYTIC AND NON-CATALYTIC MECHANISMS OF HISTONE H4 LYSINE 20 METHYLTRANSFERASE SUV420H1 organism=? : H : ARG NE A0040 <- 2.97 -> DT O2 J0083 : score 2.48931 : H : ARG NH2 A0040 <- 2.96 -> DT O2 J0083 : score 4.09787 : x : ARG xxxx B0045 <- 4.37 -> DG xxx J0069 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0042 <- 4.26 -> DC xxx I0111 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.16 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0042 <- 3.88 -> DG xxx J0112 : score x.xxxxx >8t9u_F:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=HUMAN PU.1 ETS-DOMAIN (165-270) IN COMPLEX WITH D(AATAAGCGIAAGTGGG) organism=Homo sapiens : w : GLN NE2 F0226 <- 5.26 -> DG O6 D0027 : score 2.87 A : H : ARG NH2 F0233 <- 2.93 -> DG N7 C0008 : score 6.21862 : w : ASN ND2 F0234 <- 5.52 -> DT O4 D0023 : score 3.275 : x : LYS xxxx F0227 <- 3.78 -> DT xxx D0024 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx F0230 <- 2.89 -> DI xxx C0009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx F0231 <- 4.21 -> DT xxx D0023 : score x.xxxxx >8th9_A:S13-like_H2TH_domain;N-terminal_domain_of_MutM-like_DNA_repair_proteins; title=STRUCTURE OF MAMMALIAN NEIL2 FROM MONODELPHIS DOMESTICA IN COMPLEX WITH THF-CONTAINING DNA organism=? : H : THR OG1 A0154 <- 2.26 -> DC O2 C0007 : score 2.90921 A : H : ASN OD1 A0182 <- 2.94 -> DG N2 D0009 : score 4.6656 : H : ASN OD1 A0182 <- 2.94 -> DG N2 D0009 : score 4.6656 : V : PHE CZ A0311 <- 3.84 -> DT C7 D0010 : score 7.04372 : x : LEU xxxx A0141 <- 3.12 -> DG xxx D0009 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0142 <- 3.49 -> DC xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0153 <- 3.79 -> DC xxx C0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx A0290 <- 4.13 -> DC xxx D0006 : score x.xxxxx >8thu_A:Histone-fold; title=CATALYTIC AND NON-CATALYTIC MECHANISMS OF HISTONE H4 LYSINE 20 METHYLTRANSFERASE SUV420H1 organism=? : x : ARG xxxx A0040 <- 3.68 -> DG xxx J0066 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.37 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx >8thu_ABCDEFGH:Histone-fold;lambda_repressor-like_DNA-binding_domains;p53-like_transcription_factors; title=CATALYTIC AND NON-CATALYTIC MECHANISMS OF HISTONE H4 LYSINE 20 METHYLTRANSFERASE SUV420H1 organism=? : H : ARG NH2 E0040 <- 3.44 -> DT O2 J0083 : score 3.69147 : x : ARG xxxx G0035 <- 3.69 -> DG xxx J0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0035 <- 3.29 -> DT xxx I0112 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0040 <- 3.68 -> DG xxx J0066 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 4.37 -> DT xxx J0050 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0033 <- 3.92 -> DC xxx J0027 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 4.49 -> DG xxx I0050 : score x.xxxxx >8tip_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ISORETICULAR, INTERPENETRATING CO-CRYSTAL OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND SYMMETRICAL EXPANDED DUPLEX (31MER) CONTAINING THE COGNATE REPE54 SEQUENCE AND AN ADDITIONAL G-C RICH SEQUENCE WITH BLUNT ENDS AND 5' TERMINAL PHOSPHATES. organism=Escherichia coli K-12 : H : GLU OE1 C0077 <- 2.80 -> DC N4 A0022 : score 5.76795 : w : GLU OE2 C0077 <- 5.61 -> DG N7 A0021 : score 2.669 : H : LYS NZ C0080 <- 3.34 -> DG O6 B0013 : score 5.15645 : H : LYS NZ C0080 <- 2.22 -> DG O6 B0014 : score 6.45134 : H : ARG NH1 C0200 <- 2.94 -> DG O6 A0011 : score 5.913 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.83 -> DT O4 A0012 : score 3.53252 : H : ASP OD1 C0203 <- 2.92 -> DC N4 B0023 : score 5.21659 : H : ARG NH1 C0206 <- 3.42 -> DG N7 A0013 : score 5.2998 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.49 -> DG O6 A0013 : score 7.0092 : H : ARG NE C0207 <- 2.96 -> DG N7 B0021 : score 4.2803 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.72 -> DG O6 B0021 : score 6.7056 : H : ARG NH2 C0233 <- 2.32 -> DT O2 B0029 : score 4.63973 : x : SER xxxx C0075 <- 3.65 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 4.03 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.86 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.88 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0124 <- 3.57 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 3.83 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 4.06 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.47 -> DG xxx A0011 : score x.xxxxx >8tiq_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ISORETICULAR, INTERPENETRATING CO-CRYSTAL OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND SYMMETRICAL EXPANDED DUPLEX (31MER) CONTAINING THE COGNATE REPE54 SEQUENCE AND AN ADDITIONAL G-C RICH SEQUENCE WITH BLUNT ENDS AND 3' TERMINAL PHOSPHATES. organism=Escherichia coli K-12 : H : GLU OE1 C0077 <- 2.77 -> DC N4 A0022 : score 5.80256 : H : LYS NZ C0080 <- 2.96 -> DG O6 B0013 : score 5.59578 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.97 -> DT O2 B0009 : score 4.0894 : H : ARG NH1 C0200 <- 3.23 -> DG O6 A0011 : score 5.56017 : H : ARG NH2 C0200 <- 3.14 -> DT O4 A0012 : score 3.31218 : H : ASP OD1 C0203 <- 3.02 -> DC N4 B0023 : score 5.1097 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.65 -> DG O6 A0013 : score 6.798 : H : ARG NE C0207 <- 2.93 -> DG N7 B0021 : score 4.30683 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.59 -> DG O6 B0021 : score 6.8772 : H : ARG NH1 C0233 <- 3.02 -> DT O2 B0029 : score 4.11693 : x : SER xxxx C0075 <- 3.45 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 4.07 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.77 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.86 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 3.87 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 3.99 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.63 -> DG xxx A0011 : score x.xxxxx >8tir_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ISORETICULAR, INTERPENETRATING CO-CRYSTAL OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND SYMMETRICAL EXPANDED DUPLEX (31MER) CONTAINING THE COGNATE REPE54 SEQUENCE AND AN ADDITIONAL G-C RICH SEQUENCE WITH 1 STICKY BASES AND 5' TERMINAL PHOSPHATES. organism=Escherichia coli K-12 : H : GLU OE1 C0077 <- 2.89 -> DC N4 A0022 : score 5.66413 : w : GLU OE2 C0077 <- 5.42 -> DG N7 A0021 : score 2.669 : w : GLU OE2 C0077 <- 6.34 -> DG O6 A0021 : score 2.892 : H : LYS NZ C0080 <- 3.38 -> DG O6 B0013 : score 5.1102 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.79 -> DT O2 B0009 : score 4.2418 : H : ARG NH1 C0200 <- 2.99 -> DG O6 A0011 : score 5.85217 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.75 -> DT O4 A0012 : score 3.58938 : H : ASP OD1 C0203 <- 3.08 -> DC N4 B0023 : score 5.04556 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.32 -> DG O6 A0013 : score 7.2336 : H : ARG NE C0207 <- 3.02 -> DG N7 B0021 : score 4.22724 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.61 -> DG O6 B0021 : score 6.8508 : H : ARG NH2 C0233 <- 2.81 -> DT O2 B0029 : score 4.22487 : x : SER xxxx C0075 <- 3.69 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 4.28 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 4.00 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.89 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 3.82 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 4.00 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.55 -> DG xxx A0011 : score x.xxxxx >8tis_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ISORETICULAR, INTERPENETRATING CO-CRYSTAL OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND SYMMETRICAL EXPANDED DUPLEX (31MER) CONTAINING THE COGNATE REPE54 SEQUENCE AND AN ADDITIONAL G-C RICH SEQUENCE WITH 1 STICKY BASES AND 3' TERMINAL PHOSPHATES. organism=Escherichia coli K-12 : H : GLU OE1 C0077 <- 2.71 -> DC N4 A0022 : score 5.87177 : w : GLU OE2 C0077 <- 5.99 -> DG N7 A0021 : score 2.669 : H : LYS NZ C0080 <- 3.33 -> DG O6 B0013 : score 5.16801 : H : ARG NH1 C0124 <- 2.67 -> DG N3 A0028 : score 3.13193 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.43 -> DT O2 B0009 : score 4.5466 : H : ARG NH1 C0200 <- 3.07 -> DG O6 A0011 : score 5.75483 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.84 -> DT O4 A0012 : score 3.52542 : H : ASP OD1 C0203 <- 3.13 -> DC N4 B0023 : score 4.99211 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.66 -> DG O6 A0013 : score 6.7848 : H : ARG NE C0207 <- 2.88 -> DG N7 B0021 : score 4.35105 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.64 -> DG O6 B0021 : score 6.8112 : x : SER xxxx C0075 <- 3.57 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 3.84 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.65 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.97 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 3.76 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 4.15 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.60 -> DG xxx A0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0233 <- 2.84 -> DT xxx B0029 : score x.xxxxx >8tit_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ISORETICULAR, INTERPENETRATING CO-CRYSTAL OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND SYMMETRICAL EXPANDED DUPLEX (31MER) CONTAINING THE COGNATE REPE54 SEQUENCE AND AN ADDITIONAL G-C RICH SEQUENCE WITH 2 STICKY BASE OVERHANGS AND NO TERMINAL PHOSPHATES. organism=Escherichia coli K-12 : H : GLU OE1 C0077 <- 2.83 -> DC N4 A0022 : score 5.73334 : w : GLU OE2 C0077 <- 5.26 -> DG N7 A0021 : score 2.669 : H : LYS NZ C0080 <- 3.03 -> DG O6 B0013 : score 5.51485 : H : LYS NZ C0080 <- 2.22 -> DG O6 B0014 : score 6.45134 : H : ARG NH1 C0124 <- 3.18 -> DT O2 B0009 : score 3.97912 : H : ARG NH1 C0200 <- 3.02 -> DG O6 A0011 : score 5.81567 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.86 -> DT O4 A0012 : score 3.5112 : H : ASP OD1 C0203 <- 3.15 -> DC N4 B0023 : score 4.97073 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.48 -> DG O6 A0013 : score 7.0224 : H : ARG NE C0207 <- 3.02 -> DG N7 B0021 : score 4.22724 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.66 -> DG O6 B0021 : score 6.7848 : H : ARG NH1 C0233 <- 2.66 -> DT O2 B0029 : score 4.42699 : x : SER xxxx C0075 <- 3.63 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 4.13 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.84 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.86 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 3.89 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 3.95 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.61 -> DG xxx A0011 : score x.xxxxx >8tiu_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ISORETICULAR, INTERPENETRATING CO-CRYSTAL OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND SYMMETRICAL EXPANDED DUPLEX (31MER) CONTAINING THE COGNATE REPE54 SEQUENCE AND AN ADDITIONAL G-C RICH SEQUENCE WITH 2 STICKY BASE OVERHANGS AND 3' TERMINAL PHOSPHATES. organism=Escherichia coli K-12 : H : GLU OE1 C0077 <- 3.04 -> DC N4 A0022 : score 5.49109 : w : GLU OE2 C0077 <- 5.65 -> DG O6 A0021 : score 2.892 : H : LYS NZ C0080 <- 3.08 -> DG O6 B0013 : score 5.45705 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.91 -> DT O2 B0009 : score 4.1402 : H : ARG NH1 C0200 <- 3.14 -> DG O6 A0011 : score 5.66967 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.85 -> DT O4 A0012 : score 3.51831 : H : ASP OD1 C0203 <- 3.18 -> DC N4 B0023 : score 4.93866 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.48 -> DG O6 A0013 : score 7.0224 : H : ARG NE C0207 <- 3.13 -> DG N7 B0021 : score 4.12996 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.90 -> DG O6 B0021 : score 6.468 : H : ARG NH2 C0233 <- 2.88 -> DT O2 B0029 : score 4.1656 : x : SER xxxx C0075 <- 3.55 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 4.01 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.82 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.87 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 3.74 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 4.16 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.66 -> DG xxx A0011 : score x.xxxxx >8tiv_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ISORETICULAR, INTERPENETRATING CO-CRYSTAL OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND SYMMETRICAL EXPANDED DUPLEX (31MER) CONTAINING THE COGNATE REPE54 SEQUENCE AND AN ADDITIONAL G-C RICH SEQUENCE WITH BLUNT ENDS AND 5' TERMINAL PHOSPHATES AND CROSSLINKED WITH EDC. organism=Escherichia coli K-12 : H : LYS NZ C0080 <- 3.23 -> DG O6 B0013 : score 5.28362 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.44 -> DT O2 B0009 : score 4.53813 : H : ARG NH2 C0124 <- 3.23 -> DG N3 B0010 : score 3.29977 : H : ARG NH1 C0200 <- 2.89 -> DG O6 A0011 : score 5.97383 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.67 -> DT O4 A0012 : score 3.64625 : H : ASP OD1 C0203 <- 3.29 -> DC N4 B0023 : score 4.82107 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.23 -> DG O6 A0013 : score 7.3524 : H : ARG NE C0207 <- 3.00 -> DG N7 B0021 : score 4.24492 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.67 -> DG O6 B0021 : score 6.7716 : H : ARG NH1 C0233 <- 2.58 -> DC O2 A0008 : score 3.8106 : H : ARG NH2 C0233 <- 2.56 -> DT O2 B0029 : score 4.43653 : x : SER xxxx C0075 <- 3.39 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0077 <- 3.51 -> DC xxx A0022 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.95 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.98 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 4.46 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 3.97 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.51 -> DG xxx A0011 : score x.xxxxx >8tiw_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ISORETICULAR, INTERPENETRATING CO-CRYSTAL OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND SYMMETRICAL EXPANDED DUPLEX (31MER) CONTAINING THE COGNATE REPE54 SEQUENCE AND AN ADDITIONAL G-C RICH SEQUENCE WITH BLUNT ENDS AND 3' TERMINAL PHOSPHATES AND CROSSLINKED WITH EDC. organism=Escherichia coli K-12 : H : GLU OE1 C0077 <- 3.30 -> DC N4 A0022 : score 5.19115 : w : GLU OE2 C0077 <- 5.24 -> DG N7 A0021 : score 2.669 : H : LYS NZ C0080 <- 3.49 -> DG O6 B0013 : score 4.98302 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.57 -> DT O2 B0009 : score 4.42807 : H : ARG NH2 C0124 <- 3.18 -> DG N3 B0010 : score 3.33588 : H : ARG NH1 C0200 <- 3.09 -> DG O6 A0011 : score 5.7305 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.92 -> DT O4 A0012 : score 3.46855 : H : ASP OD1 C0203 <- 3.13 -> DC N4 B0023 : score 4.99211 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.37 -> DG O6 A0013 : score 7.1676 : H : ARG NE C0207 <- 3.11 -> DG N7 B0021 : score 4.14764 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.83 -> DG O6 B0021 : score 6.5604 : H : ARG NH1 C0233 <- 2.72 -> DC O2 A0008 : score 3.7084 : H : ARG NH2 C0233 <- 2.69 -> DT O2 B0029 : score 4.32647 : x : SER xxxx C0075 <- 3.39 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 4.23 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.89 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.96 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 4.17 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 3.97 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.57 -> DG xxx A0011 : score x.xxxxx >8tix_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; 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title=ISORETICULAR, INTERPENETRATING CO-CRYSTAL OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND SYMMETRICAL EXPANDED DUPLEX (31MER) CONTAINING THE COGNATE REPE54 SEQUENCE AND AN ADDITIONAL G-C RICH SEQUENCE WITH 2 STICKY BASE OVERHANGS AND 5' TERMINAL PHOSPHATES AND CROSSLINKED WITH EDC. organism=Escherichia coli K-12 : H : GLU OE1 C0077 <- 3.35 -> DC N4 A0022 : score 5.13347 : H : LYS NZ C0080 <- 3.19 -> DG O6 B0013 : score 5.32987 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.56 -> DT O2 B0009 : score 4.43653 : H : ARG NH1 C0200 <- 2.97 -> DG O6 A0011 : score 5.8765 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.47 -> DT O4 A0012 : score 3.7884 : H : ASP OD1 C0203 <- 3.18 -> DC N4 B0023 : score 4.93866 : H : ARG NH2 C0206 <- 3.01 -> DG N7 A0013 : score 6.11646 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.32 -> DG O6 A0013 : score 7.2336 : H : ARG NE C0207 <- 2.88 -> DG N7 B0021 : score 4.35105 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.49 -> DG O6 B0021 : score 7.0092 : H : ARG NH1 C0233 <- 2.69 -> DC O2 A0008 : score 3.7303 : H : ARG NH2 C0233 <- 2.64 -> DT O2 B0029 : score 4.3688 : x : SER xxxx C0075 <- 3.53 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 4.32 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.88 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.61 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 4.01 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 3.87 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.62 -> DG xxx A0011 : score x.xxxxx >8tj1_C:"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=ISORETICULAR, INTERPENETRATING CO-CRYSTAL OF REPLICATION INITIATOR PROTEIN REPE54 AND SYMMETRICAL EXPANDED DUPLEX (31MER) CONTAINING THE COGNATE REPE54 SEQUENCE AND AN ADDITIONAL G-C RICH SEQUENCE WITH 2 STICKY BASE OVERHANGS AND 3' TERMINAL PHOSPHATES AND CROSSLINKED WITH EDC. organism=Escherichia coli K-12 : H : GLU OE1 C0077 <- 2.93 -> DC N4 A0022 : score 5.61798 : H : LYS NZ C0080 <- 3.28 -> DG O6 B0013 : score 5.22582 : H : ARG NH2 C0124 <- 2.33 -> DT O2 B0009 : score 4.63127 : H : ARG NH1 C0200 <- 2.85 -> DG O6 A0011 : score 6.0225 : H : ARG NH2 C0200 <- 2.66 -> DT O4 A0012 : score 3.65335 : H : ASP OD1 C0203 <- 3.15 -> DC N4 B0023 : score 4.97073 : H : ARG NH2 C0206 <- 2.43 -> DG O6 A0013 : score 7.0884 : H : ARG NE C0207 <- 2.88 -> DG N7 B0021 : score 4.35105 : H : ARG NH2 C0207 <- 2.52 -> DG O6 B0021 : score 6.9696 : H : ARG NH2 C0233 <- 2.83 -> DT O2 B0029 : score 4.20793 : x : SER xxxx C0075 <- 3.43 -> DG xxx B0010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx C0076 <- 4.13 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0079 <- 3.85 -> DA xxx B0011 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0083 <- 3.82 -> DG xxx B0012 : score x.xxxxx : x : SER xxxx C0197 <- 4.04 -> DT xxx B0022 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0198 <- 4.13 -> DG xxx B0021 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx C0202 <- 3.65 -> DG xxx A0011 : score x.xxxxx >8tkl_A:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=MURINE NF-KAPPAB P50 REL HOMOLOGY REGION HOMODIMER IN COMPLEX WITH A TEST 16-MER KAPPAB-LIKE DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH2 A0054 <- 2.67 -> DG O6 C0006 : score 6.7716 : H : ARG NH1 A0056 <- 2.69 -> DG O6 C0005 : score 6.21717 : H : ARG NH2 A0056 <- 2.51 -> DG N7 C0005 : score 6.75492 : H : HIS ND1 A0064 <- 2.59 -> DG N7 C0004 : score 6.48445 : x : TYR xxxx A0057 <- 3.92 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0059 <- 3.53 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0060 <- 3.47 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0241 <- 3.73 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0272 <- 3.81 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0305 <- 4.39 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx >8tkl_AB: title=MURINE NF-KAPPAB P50 REL HOMOLOGY REGION HOMODIMER IN COMPLEX WITH A TEST 16-MER KAPPAB-LIKE DNA organism=Mus musculus : H : ARG NH2 A0054 <- 2.67 -> DG O6 C0006 : score 6.7716 : H : ARG NH1 A0056 <- 2.69 -> DG O6 C0005 : score 6.21717 : H : ARG NH2 A0056 <- 2.51 -> DG N7 C0005 : score 6.75492 : H : HIS ND1 A0064 <- 2.59 -> DG N7 C0004 : score 6.48445 : H : ARG NH1 B0054 <- 3.14 -> DG O6 D0007 : score 5.66967 : H : ARG NH2 B0054 <- 2.73 -> DG O6 D0007 : score 6.6924 : H : HIS ND1 B0064 <- 2.78 -> DG N7 D0005 : score 6.24797 : x : TYR xxxx A0057 <- 3.92 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0059 <- 3.53 -> DC xxx D0012 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0060 <- 3.47 -> DC xxx D0013 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0241 <- 3.73 -> DG xxx C0007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0272 <- 3.81 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0305 <- 4.39 -> DA xxx D0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0056 <- 3.19 -> DG xxx D0006 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0057 <- 3.41 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0059 <- 3.80 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0060 <- 3.47 -> DC xxx C0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0241 <- 3.80 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx >8tkm_AB: title=MURINE NF-KAPPAB P50 REL HOMOLOGY REGION HOMODIMER IN COMPLEX WITH 17- MER KAPPAB DNA FROM HUMAN INTERLEUKIN-6 (IL-6) PROMOTER organism=Mus musculus : H : ARG NH1 A0054 <- 3.37 -> DG N7 C0006 : score 5.3603 : H : ARG NH1 A0054 <- 3.17 -> DG O6 C0006 : score 5.63317 : H : ARG NH2 A0054 <- 2.64 -> DG O6 C0006 : score 6.8112 : H : ARG NH1 A0056 <- 3.08 -> DG O6 C0005 : score 5.74267 : H : ARG NH2 A0056 <- 2.94 -> DG N7 C0005 : score 6.20585 : H : GLU OE2 A0060 <- 3.10 -> DC N4 D0012 : score 4.94946 : H : HIS ND1 A0064 <- 2.90 -> DG N7 C0004 : score 6.09862 : H : ARG NH2 B0054 <- 2.79 -> DG O6 D0006 : score 6.6132 : H : ARG NH1 B0056 <- 3.05 -> DG O6 D0005 : score 5.77917 : H : ARG NH2 B0056 <- 3.01 -> DG N7 D0005 : score 6.11646 : H : GLU OE1 B0060 <- 2.93 -> DC N4 C0012 : score 5.61798 : H : HIS ND1 B0064 <- 2.87 -> DG N7 D0004 : score 6.13595 : H : LYS NZ B0241 <- 2.64 -> DT O4 C0011 : score 3.70197 : x : TYR xxxx A0057 <- 3.46 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx A0059 <- 3.87 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0063 <- 3.90 -> DT xxx C0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0241 <- 3.06 -> DA xxx D0010 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0057 <- 3.40 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0059 <- 3.81 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx >8tkm_B:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=MURINE NF-KAPPAB P50 REL HOMOLOGY REGION HOMODIMER IN COMPLEX WITH 17- MER KAPPAB DNA FROM HUMAN INTERLEUKIN-6 (IL-6) PROMOTER organism=Mus musculus : H : ARG NH2 B0054 <- 2.79 -> DG O6 D0006 : score 6.6132 : H : ARG NH1 B0056 <- 3.05 -> DG O6 D0005 : score 5.77917 : H : ARG NH2 B0056 <- 3.01 -> DG N7 D0005 : score 6.11646 : H : GLU OE1 B0060 <- 2.93 -> DC N4 C0012 : score 5.61798 : H : HIS ND1 B0064 <- 2.87 -> DG N7 D0004 : score 6.13595 : H : LYS NZ B0241 <- 2.64 -> DT O4 C0011 : score 3.70197 : x : TYR xxxx B0057 <- 3.40 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0059 <- 3.81 -> DT xxx C0011 : score x.xxxxx >8tkn_B:p53-like_transcription_factors;E_set_domains; title=MURINE NF-KAPPAB P50 REL HOMOLOGY REGION HOMODIMER IN COMPLEX WITH 10- MER KAPPAB DNA FROM HUMAN NEUTROPHIL GELATINASE-ASSOCIATED LIPOCALIN (NGAL) PROMOTER organism=Mus musculus : H : ARG NH1 B0054 <- 3.17 -> DG N7 D0002 : score 5.6023 : H : ARG NH1 B0054 <- 2.92 -> DG O6 D0002 : score 5.93733 : H : ARG NH2 B0054 <- 2.60 -> DG O6 D0002 : score 6.864 : H : ARG NH1 B0056 <- 2.97 -> DG O6 D0001 : score 5.8765 : H : ARG NH2 B0056 <- 2.74 -> DG N7 D0001 : score 6.46123 : H : GLU OE1 B0060 <- 2.72 -> DC N4 C0009 : score 5.86024 : H : HIS NE2 B0064 <- 2.66 -> DG O6 E0001 : score 8.17655 : x : TYR xxxx B0057 <- 3.26 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : CYS xxxx B0059 <- 4.02 -> DT xxx C0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0241 <- 2.89 -> DA xxx D0003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx B0272 <- 4.07 -> DT xxx C0006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0305 <- 3.78 -> DG xxx C0003 : score x.xxxxx >8tp8_AB: title=STRUCTURE OF THE C. CRESCENTUS WYL-ACTIVATOR, DRID, BOUND TO SSDNA AND COGNATE DNA organism=Caulobacter vibrioides : H : ARG NE A0037 <- 3.25 -> DG O6 U0005 : score 3.58633 : H : ARG NH2 A0037 <- 2.58 -> DG N7 U0005 : score 6.66554 : H : ARG NH1 A0041 <- 3.10 -> DG N7 R0015 : score 5.687 : H : ARG NH2 A0041 <- 3.09 -> DG O6 R0015 : score 6.2172 : H : ARG NE B0037 <- 3.36 -> DG O6 R0005 : score 3.49963 : H : ARG NH2 B0037 <- 3.05 -> DG N7 R0005 : score 6.06538 : x : THR xxxx A0038 <- 4.40 -> DT xxx R0014 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx A0040 <- 3.43 -> DC xxx U0004 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0040 <- 4.10 -> DC xxx R0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0041 <- 2.96 -> DT xxx U0014 : score x.xxxxx >8tp8_CD: title=STRUCTURE OF THE C. CRESCENTUS WYL-ACTIVATOR, DRID, BOUND TO SSDNA AND COGNATE DNA organism=Caulobacter vibrioides : H : ARG NH2 C0041 <- 3.30 -> DG N7 F0015 : score 5.74615 : H : ARG NH2 C0041 <- 2.62 -> DG O6 F0015 : score 6.8376 : H : ARG NE D0037 <- 3.22 -> DG O6 F0005 : score 3.60998 : H : ARG NH2 D0037 <- 2.87 -> DG N7 F0005 : score 6.29523 : H : ARG NH1 D0041 <- 3.37 -> DG N7 T0015 : score 5.3603 : H : ARG NH2 D0041 <- 3.39 -> DG N7 T0015 : score 5.63123 : H : ARG NH2 D0041 <- 2.78 -> DG O6 T0015 : score 6.6264 : x : ARG xxxx C0037 <- 3.43 -> DT xxx F0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx C0040 <- 3.73 -> DC xxx T0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx D0036 <- 3.91 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0040 <- 3.42 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx >8tp8_D: title=STRUCTURE OF THE C. CRESCENTUS WYL-ACTIVATOR, DRID, BOUND TO SSDNA AND COGNATE DNA organism=Caulobacter vibrioides : H : ARG NE D0037 <- 3.22 -> DG O6 F0005 : score 3.60998 : H : ARG NH2 D0037 <- 2.87 -> DG N7 F0005 : score 6.29523 : H : ARG NH1 D0041 <- 3.37 -> DG N7 T0015 : score 5.3603 : H : ARG NH2 D0041 <- 3.39 -> DG N7 T0015 : score 5.63123 : H : ARG NH2 D0041 <- 2.78 -> DG O6 T0015 : score 6.6264 : x : ARG xxxx D0036 <- 3.91 -> DT xxx F0002 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx D0040 <- 3.42 -> DC xxx F0004 : score x.xxxxx >8tpk_A: title=P6522 CRYSTAL FORM OF C. CRESCENTUS DRID-SSDNA-DNA COMPLEX organism=Caulobacter vibrioides : H : ARG NE A0037 <- 3.04 -> DG O6 U0005 : score 3.75186 : H : ARG NH2 A0037 <- 3.20 -> DG N7 U0005 : score 5.87385 : H : ARG NH2 A0041 <- 2.96 -> DG N7 R0015 : score 6.18031 : H : ARG NH2 A0041 <- 2.54 -> DG O6 R0015 : score 6.9432 : x : GLU xxxx A0040 <- 3.08 -> DC xxx U0004 : score x.xxxxx >8tpk_AB: title=P6522 CRYSTAL FORM OF C. CRESCENTUS DRID-SSDNA-DNA COMPLEX organism=Caulobacter vibrioides : H : ARG NE A0037 <- 3.04 -> DG O6 U0005 : score 3.75186 : H : ARG NH2 A0037 <- 3.20 -> DG N7 U0005 : score 5.87385 : H : ARG NH2 A0041 <- 2.96 -> DG N7 R0015 : score 6.18031 : H : ARG NH2 A0041 <- 2.54 -> DG O6 R0015 : score 6.9432 : H : ARG NH2 B0041 <- 2.91 -> DG O6 U0015 : score 6.4548 : x : GLU xxxx A0040 <- 3.08 -> DC xxx U0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0037 <- 3.09 -> DT xxx U0016 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0040 <- 3.11 -> DC xxx R0004 : score x.xxxxx >8trg_H:P-loop_containing_nucleoside_triphosphate_hydrolases;RecA_protein,_C-terminal_domain; title=STRUCTURE OF FULL-LENGTH LEXA BOUND TO A RECA FILAMENT organism=? : H : ARG NH1 H0169 <- 3.26 -> DT O2 L1002 : score 3.91022 : x : MET xxxx H0164 <- 2.99 -> DG xxx L1004 : score x.xxxxx : x : MET xxxx H0197 <- 4.09 -> DG xxx L1007 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx H0199 <- 3.51 -> DG xxx L1006 : score x.xxxxx >8u5y_A:Nucleic_acid-binding_proteins; title=HUMAN RADX TRIMER BOUND TO SSDNA organism=? : H : GLN NE2 A0262 <- 3.19 -> DT O2 D0011 : score 3.62653 : H : ARG NE A0333 <- 2.79 -> DT O4 D0014 : score 1.86269 : H : ARG NH2 A0333 <- 3.17 -> DT O2 D0013 : score 3.92007 : H : ARG NH2 A0333 <- 2.64 -> DT O4 D0014 : score 3.66757 : H : ARG NH2 A0396 <- 2.93 -> DT O2 D0008 : score 4.12327 : V : LYS CE A0304 <- 3.71 -> DT C7 D0011 : score 2.65955 : x : ARG xxxx A0248 <- 3.64 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0250 <- 2.82 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0277 <- 4.30 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0279 <- 3.04 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0280 <- 3.30 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0307 <- 3.29 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0309 <- 3.00 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0310 <- 4.11 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0311 <- 4.06 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0331 <- 2.89 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx >8u5y_ABC: title=HUMAN RADX TRIMER BOUND TO SSDNA organism=? : H : GLN NE2 A0262 <- 3.19 -> DT O2 D0011 : score 3.62653 : H : ARG NE A0333 <- 2.79 -> DT O4 D0014 : score 1.86269 : H : ARG NH2 A0333 <- 3.17 -> DT O2 D0013 : score 3.92007 : H : ARG NH2 A0333 <- 2.64 -> DT O4 D0014 : score 3.66757 : H : ARG NH2 A0396 <- 2.93 -> DT O2 D0008 : score 4.12327 : H : ARG NH2 B0248 <- 2.86 -> DT O2 D0004 : score 4.18253 : H : TYR OH B0250 <- 2.79 -> DT N3 D0006 : score 1.44519 : H : LYS NZ B0304 <- 3.14 -> DT O4 D0005 : score 3.34325 : H : TYR OH C0250 <- 3.04 -> DT N3 D0000 : score 1.37308 : H : GLN NE2 C0262 <- 2.87 -> DT O4 D0000 : score 5.11835 : V : PHE CZ C0264 <- 3.90 -> DT C7 D-001 : score 6.937 : V : TRP CD1 B0279 <- 3.66 -> DT C7 D0006 : score 7.59 : x : LYS xxxx B0252 <- 4.09 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx B0262 <- 3.03 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx B0264 <- 3.76 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx B0277 <- 3.24 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0280 <- 3.79 -> DT xxx D0006 : score x.xxxxx : x : SER xxxx B0302 <- 4.44 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0307 <- 3.11 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0327 <- 4.15 -> DT xxx D0005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx B0333 <- 3.55 -> DT xxx D0009 : score x.xxxxx : x : GLU xxxx B0394 <- 3.27 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0395 <- 3.89 -> DT xxx D0004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0248 <- 3.64 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0250 <- 2.82 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0277 <- 4.30 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx A0279 <- 3.04 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0280 <- 3.30 -> DT xxx D0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0304 <- 3.26 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0307 <- 3.29 -> DT xxx D0011 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0309 <- 3.00 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0310 <- 4.11 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx A0311 <- 4.06 -> DT xxx D0010 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx A0331 <- 2.89 -> DT xxx D0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0248 <- 3.66 -> DT xxx D-001 : score x.xxxxx : x : ILE xxxx C0277 <- 3.31 -> DT xxx D0000 : score x.xxxxx : x : TRP xxxx C0279 <- 3.09 -> DT xxx D0000 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx C0307 <- 3.20 -> DT xxx D-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0310 <- 3.16 -> DT xxx D-001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0333 <- 3.82 -> DT xxx D0002 : score x.xxxxx >8ucu_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=PARTIAL DNA TERMINATION SUBCOMPLEX OF XENOPUS LAEVIS DNA POLYMERASE ALPHA-PRIMASE organism=? : x : LYS xxxx A1049 <- 3.38 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1077 <- 2.99 -> DT xxx D0026 : score x.xxxxx >8ucv_AB: title=COMPLETE DNA TERMINATION SUBCOMPLEX 1 OF XENOPUS LAEVIS DNA POLYMERASE ALPHA-PRIMASE organism=? : H : THR OG1 B0369 <- 2.43 -> DG N2 C0047 : score 4.31528 : V : TYR CB A0960 <- 3.88 -> DT C7 C0015 : score 4.77134 : x : ARG xxxx A0676 <- 3.17 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0784 <- 3.65 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0947 <- 3.70 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0951 <- 3.98 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0958 <- 3.85 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1049 <- 3.40 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1077 <- 4.02 -> DC xxx C0021 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0309 <- 4.17 -> DT xxx C0046 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0313 <- 3.24 -> DT xxx C0046 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0353 <- 2.92 -> DC xxx C0044 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0357 <- 2.95 -> DT xxx C0046 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0358 <- 3.36 -> DT xxx C0046 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0366 <- 3.28 -> DG xxx C0047 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0368 <- 3.33 -> DT xxx C0046 : score x.xxxxx >8ucv_B: title=COMPLETE DNA TERMINATION SUBCOMPLEX 1 OF XENOPUS LAEVIS DNA POLYMERASE ALPHA-PRIMASE organism=? : H : THR OG1 B0369 <- 2.43 -> DG N2 C0047 : score 4.31528 : x : HIS xxxx B0309 <- 4.17 -> DT xxx C0046 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0313 <- 3.24 -> DT xxx C0046 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0353 <- 2.92 -> DC xxx C0044 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B0357 <- 2.95 -> DT xxx C0046 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx B0358 <- 3.36 -> DT xxx C0046 : score x.xxxxx : x : THR xxxx B0366 <- 3.28 -> DG xxx C0047 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx B0368 <- 3.33 -> DT xxx C0046 : score x.xxxxx >8ucw_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=COMPLETE DNA TERMINATION SUBCOMPLEX 2 OF XENOPUS LAEVIS DNA POLYMERASE ALPHA-PRIMASE organism=? : V : TYR CB A0960 <- 3.84 -> DT C7 C0015 : score 4.82003 : x : ARG xxxx A0676 <- 3.50 -> DT xxx C0013 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0784 <- 3.71 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0947 <- 3.65 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : SER xxxx A0951 <- 4.09 -> DC xxx C0016 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0953 <- 4.28 -> DG xxx C0017 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx A0958 <- 3.69 -> DT xxx C0015 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A1049 <- 3.51 -> DT xxx C0019 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A1077 <- 4.36 -> DC xxx C0021 : score x.xxxxx >8uh7_A: title=STRUCTURE OF T4 BACTERIOPHAGE CLAMP LOADER BOUND TO THE T4 CLAMP, PRIMER-TEMPLATE DNA, AND ATP ANALOG organism=? : V : PHE CD2 A0063 <- 3.89 -> DT C7 I0011 : score 6.36528 >8uh7_ABCDE: title=STRUCTURE OF T4 BACTERIOPHAGE CLAMP LOADER BOUND TO THE T4 CLAMP, PRIMER-TEMPLATE DNA, AND ATP ANALOG organism=? : V : PHE CD2 A0063 <- 3.89 -> DT C7 I0011 : score 6.36528 : x : ALA xxxx E0299 <- 3.96 -> DA xxx J0020 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx E0300 <- 4.07 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx >8uk9_ABCDE: title=STRUCTURE OF T4 BACTERIOPHAGE CLAMP LOADER MUTANT D110C BOUND TO THE T4 CLAMP, PRIMER-TEMPLATE DNA, AND ATP ANALOG organism=? : x : PHE xxxx A0063 <- 3.37 -> DA xxx I0012 : score x.xxxxx >8uk9_KLMNQ: title=STRUCTURE OF T4 BACTERIOPHAGE CLAMP LOADER MUTANT D110C BOUND TO THE T4 CLAMP, PRIMER-TEMPLATE DNA, AND ATP ANALOG organism=? : x : GLU xxxx L0116 <- 3.93 -> DC xxx O0017 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx Q0062 <- 3.23 -> DT xxx P0019 : score x.xxxxx >8unf_ABCDE: title=CRYO-EM STRUCTURE OF T4 BACTERIOPHAGE CLAMP LOADER WITH SLIDING CLAMP AND DNA organism=? : x : PHE xxxx A0063 <- 3.15 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : MET xxxx A0064 <- 4.02 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx >8ux1_ABCDEFGH: title=CRYO-EM STRUCTURE OF RAN BOUND TO RCC1 AND THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=? : H : ARG NH2 A0040 <- 3.16 -> DG N3 J0009 : score 3.35032 : H : LYS NZ D0027 <- 2.99 -> DA N3 J0050 : score 2.6714 : H : ARG NH1 D0030 <- 3.35 -> DC O2 I-047 : score 3.2485 : H : ARG NH1 E0040 <- 3.14 -> DT O2 I0009 : score 4.01357 : H : ARG NH2 E0040 <- 3.16 -> DT O2 I0009 : score 3.92853 : H : ARG NH1 H0030 <- 2.84 -> DT O2 J-047 : score 4.27196 : H : ARG NH2 H0030 <- 3.09 -> DT O2 J-047 : score 3.9878 : x : TYR xxxx A0041 <- 4.23 -> DA xxx J-067 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx A0065 <- 4.09 -> DC xxx J0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0083 <- 3.89 -> DT xxx I-024 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx E0041 <- 4.24 -> DT xxx I-067 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0083 <- 3.59 -> DG xxx J-024 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx H0027 <- 3.67 -> DG xxx J-049 : score x.xxxxx >8ux1_H:Histone-fold; title=CRYO-EM STRUCTURE OF RAN BOUND TO RCC1 AND THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE organism=? : H : ARG NH1 H0030 <- 2.84 -> DT O2 J-047 : score 4.27196 : H : ARG NH2 H0030 <- 3.09 -> DT O2 J-047 : score 3.9878 : x : LYS xxxx H0027 <- 3.67 -> DG xxx J-049 : score x.xxxxx >8wak_6PQRTops: title=STRUCTURE OF TRANSCRIBING COMPLEX 2 (TC2), THE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX WITH POL II POSITIONED 2NT DOWNSTREAM OF TSS. organism=? : H : ASN ND2 P0167 <- 2.92 -> DT O2 Y0027 : score 4.63225 : H : ASN ND2 P0257 <- 2.95 -> DA N3 X-028 : score 3.69346 : H : THR OG1 P0313 <- 2.59 -> DA N3 X-028 : score 1.41071 : H : ARG NH1 R0105 <- 2.50 -> DA N7 Y0013 : score 2.71387 : x : VAL xxxx P0169 <- 3.41 -> DA xxx X-027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 3.05 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.57 -> DT xxx Y0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.54 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0220 <- 3.48 -> DA xxx X-026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0222 <- 3.72 -> DT xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 3.44 -> DT xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.31 -> DA xxx X-030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0289 <- 3.45 -> DA xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 3.44 -> DT xxx X-029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 2.96 -> DT xxx Y0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 3.44 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0103 <- 3.51 -> DC xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx R0104 <- 4.20 -> DT xxx Y0011 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx T0174 <- 3.41 -> DG xxx X-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx o1416 <- 3.60 -> DG xxx Y-005 : score x.xxxxx >8wak_T:Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF TRANSCRIBING COMPLEX 2 (TC2), THE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX WITH POL II POSITIONED 2NT DOWNSTREAM OF TSS. organism=? : x : LYS xxxx T0174 <- 3.41 -> DG xxx X-023 : score x.xxxxx >8wal_6PQRTops: title=STRUCTURE OF TRANSCRIBING COMPLEX 3 (TC3), THE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX WITH POL II POSITIONED 3NT DOWNSTREAM OF TSS. organism=? : H : ASN ND2 P0167 <- 2.98 -> DT O2 Y0027 : score 4.57529 : H : ASN ND2 P0257 <- 3.08 -> DA N3 X-028 : score 3.59446 : H : THR OG1 P0313 <- 2.61 -> DA N3 X-028 : score 1.40529 : H : ARG NH2 R0104 <- 2.97 -> DT O2 Y0011 : score 4.0894 : H : ARG NH1 R0105 <- 2.68 -> DA N7 Y0013 : score 2.6217 : H : SER OG o0332 <- 3.15 -> DA N6 Y0008 : score 3.05946 : x : VAL xxxx P0169 <- 3.40 -> DA xxx X-027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 3.04 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx P0198 <- 4.49 -> DG xxx X-024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.58 -> DT xxx Y0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.51 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0220 <- 3.46 -> DA xxx X-026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0222 <- 3.72 -> DT xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 3.47 -> DA xxx X-028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.34 -> DA xxx X-030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0289 <- 3.50 -> DA xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 3.43 -> DT xxx X-029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 2.96 -> DT xxx Y0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 3.50 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0072 <- 4.33 -> DG xxx Y0007 : score x.xxxxx : x : MET xxxx R0083 <- 3.32 -> DA xxx Y0009 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0103 <- 3.64 -> DC xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx T0174 <- 3.26 -> DG xxx X-023 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx o0331 <- 3.64 -> DA xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx p0456 <- 3.39 -> DA xxx Y0008 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx p0457 <- 3.17 -> DC xxx Y0010 : score x.xxxxx >8wan_6PQRTops: title=STRUCTURE OF TRANSCRIBING COMPLEX 4 (TC4), THE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX WITH POL II POSITIONED 4NT DOWNSTREAM OF TSS. organism=? : H : ASN ND2 P0167 <- 2.88 -> DT O2 Y0027 : score 4.67022 : H : ASN ND2 P0257 <- 2.98 -> DA N3 X-028 : score 3.67062 : H : THR OG1 P0313 <- 2.59 -> DA N3 X-028 : score 1.41071 : H : ARG NH1 R0105 <- 2.53 -> DA N7 Y0013 : score 2.69851 : x : VAL xxxx P0169 <- 3.41 -> DA xxx X-027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 3.08 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.61 -> DT xxx Y0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.60 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0220 <- 3.50 -> DA xxx X-026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0222 <- 3.73 -> DT xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 3.47 -> DA xxx X-028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.30 -> DA xxx X-030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0289 <- 3.45 -> DA xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 3.45 -> DT xxx X-029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 2.96 -> DT xxx Y0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 3.43 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0103 <- 3.59 -> DC xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx T0174 <- 3.41 -> DG xxx X-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx o1416 <- 3.68 -> DA xxx Y-007 : score x.xxxxx >8wan_P:TATA-box_binding_protein-like; title=STRUCTURE OF TRANSCRIBING COMPLEX 4 (TC4), THE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX WITH POL II POSITIONED 4NT DOWNSTREAM OF TSS. organism=? : H : ASN ND2 P0167 <- 2.88 -> DT O2 Y0027 : score 4.67022 : H : ASN ND2 P0257 <- 2.98 -> DA N3 X-028 : score 3.67062 : H : THR OG1 P0313 <- 2.59 -> DA N3 X-028 : score 1.41071 : x : VAL xxxx P0169 <- 3.41 -> DA xxx X-027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 3.08 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.61 -> DT xxx Y0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.60 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0220 <- 3.50 -> DA xxx X-026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0222 <- 3.73 -> DT xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 3.47 -> DA xxx X-028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.30 -> DA xxx X-030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0289 <- 3.45 -> DA xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 3.45 -> DT xxx X-029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 2.96 -> DT xxx Y0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 3.43 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx >8wao_6PQRTops: title=STRUCTURE OF TRANSCRIBING COMPLEX 5 (TC5), THE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX WITH POL II POSITIONED 5NT DOWNSTREAM OF TSS. organism=? : H : ASN ND2 P0167 <- 2.96 -> DT O2 Y0027 : score 4.59428 : H : ASN ND2 P0257 <- 3.03 -> DA N3 X-028 : score 3.63254 : H : THR OG1 P0313 <- 2.57 -> DA N3 X-028 : score 1.41612 : H : ARG NH1 R0105 <- 2.53 -> DA N7 Y0013 : score 2.69851 : x : VAL xxxx P0169 <- 3.40 -> DA xxx X-027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 3.05 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.55 -> DT xxx Y0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.59 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0220 <- 3.49 -> DA xxx X-026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0222 <- 3.71 -> DT xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 3.44 -> DT xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.31 -> DA xxx X-030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0289 <- 3.44 -> DA xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 3.38 -> DT xxx X-029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 2.97 -> DT xxx Y0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 3.41 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx T0174 <- 3.38 -> DG xxx X-023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx o0854 <- 3.97 -> DC xxx Y-005 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx o0855 <- 3.59 -> DC xxx Y-005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx o1416 <- 3.67 -> DG xxx Y-008 : score x.xxxxx >8wap_6PQRTops: title=STRUCTURE OF TRANSCRIBING COMPLEX 6 (TC6), THE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX WITH POL II POSITIONED 6NT DOWNSTREAM OF TSS. organism=? : H : ASN ND2 P0167 <- 2.81 -> DT O2 Y0027 : score 4.73666 : H : ASN ND2 P0257 <- 2.97 -> DA N3 X-028 : score 3.67823 : H : THR OG1 P0313 <- 2.57 -> DA N3 X-028 : score 1.41612 : H : ARG NH1 R0105 <- 2.59 -> DA N7 Y0013 : score 2.66779 : x : VAL xxxx P0169 <- 3.41 -> DA xxx X-027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 3.12 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.61 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.59 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0220 <- 3.45 -> DA xxx X-026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0222 <- 3.75 -> DT xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 3.44 -> DT xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.33 -> DA xxx X-030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0289 <- 3.47 -> DA xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 3.43 -> DT xxx X-029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 2.94 -> DT xxx Y0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 3.49 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0103 <- 3.73 -> DC xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx T0174 <- 3.39 -> DG xxx X-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx o1416 <- 3.53 -> DT xxx Y-009 : score x.xxxxx >8wap_T:Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF TRANSCRIBING COMPLEX 6 (TC6), THE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX WITH POL II POSITIONED 6NT DOWNSTREAM OF TSS. organism=? : x : LYS xxxx T0174 <- 3.39 -> DG xxx X-023 : score x.xxxxx >8waq_6PQRTops: title=STRUCTURE OF TRANSCRIBING COMPLEX 7 (TC7), THE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX WITH POL II POSITIONED 7NT DOWNSTREAM OF TSS. organism=? : H : ASN ND2 P0167 <- 2.94 -> DT O2 Y0027 : score 4.61326 : H : ASN ND2 P0257 <- 3.04 -> DA N3 X-028 : score 3.62492 : H : THR OG1 P0313 <- 2.62 -> DA N3 X-028 : score 1.40258 : H : ARG NH1 R0105 <- 2.52 -> DA N7 Y0013 : score 2.70363 : x : VAL xxxx P0169 <- 3.43 -> DA xxx X-027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 3.02 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx P0198 <- 4.50 -> DG xxx X-024 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.55 -> DT xxx Y0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.58 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0220 <- 3.51 -> DA xxx X-026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0222 <- 3.73 -> DT xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 3.50 -> DA xxx X-028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.32 -> DA xxx X-030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0289 <- 3.48 -> DA xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 3.42 -> DT xxx X-029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 2.97 -> DT xxx Y0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 3.50 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx R0103 <- 3.68 -> DC xxx Y0012 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx T0174 <- 3.37 -> DG xxx X-023 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx o1416 <- 3.65 -> DA xxx Y-010 : score x.xxxxx >8waq_T:Rap30/74_interaction_domains;"Winged_helix"_DNA-binding_domain; title=STRUCTURE OF TRANSCRIBING COMPLEX 7 (TC7), THE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX WITH POL II POSITIONED 7NT DOWNSTREAM OF TSS. organism=? : x : LYS xxxx T0174 <- 3.37 -> DG xxx X-023 : score x.xxxxx >8war_6PQRTops: title=STRUCTURE OF TRANSCRIBING COMPLEX 8 (TC8), THE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX WITH POL II POSITIONED 8NT DOWNSTREAM OF TSS. organism=? : H : ASN ND2 P0167 <- 2.87 -> DT O2 Y0027 : score 4.67971 : H : ASN ND2 P0257 <- 3.01 -> DA N3 X-028 : score 3.64777 : H : THR OG1 P0313 <- 2.56 -> DA N3 X-028 : score 1.41883 : H : ARG NH1 R0105 <- 2.54 -> DA N7 Y0013 : score 2.69339 : x : VAL xxxx P0169 <- 3.40 -> DA xxx X-027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 3.07 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.56 -> DT xxx Y0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.59 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0220 <- 3.48 -> DA xxx X-026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0222 <- 3.74 -> DT xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 3.46 -> DT xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.33 -> DA xxx X-030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0289 <- 3.47 -> DA xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 3.39 -> DT xxx X-029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 2.93 -> DT xxx Y0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 3.46 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx T0174 <- 3.39 -> DG xxx X-023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx o0854 <- 3.96 -> DC xxx Y-008 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx o0855 <- 3.52 -> DC xxx Y-008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx o1416 <- 3.63 -> DG xxx Y-011 : score x.xxxxx >8war_R:Cyclin-like;Zinc_beta-ribbon; title=STRUCTURE OF TRANSCRIBING COMPLEX 8 (TC8), THE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX WITH POL II POSITIONED 8NT DOWNSTREAM OF TSS. organism=? : H : ARG NH1 R0105 <- 2.54 -> DA N7 Y0013 : score 2.69339 >8was_6PQRTops: title=STRUCTURE OF TRANSCRIBING COMPLEX 9 (TC9), THE INITIALLY TRANSCRIBING COMPLEX WITH POL II POSITIONED 9NT DOWNSTREAM OF TSS. organism=? : H : ASN ND2 P0167 <- 2.85 -> DT O2 Y0027 : score 4.69869 : H : ASN ND2 P0257 <- 3.02 -> DA N3 X-028 : score 3.64015 : H : THR OG1 P0313 <- 2.53 -> DA N3 X-028 : score 1.42695 : H : ARG NH1 R0105 <- 2.53 -> DA N7 Y0013 : score 2.69851 : x : VAL xxxx P0169 <- 3.40 -> DA xxx X-027 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0197 <- 3.08 -> DT xxx Y0025 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0212 <- 3.60 -> DT xxx Y0026 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0214 <- 3.64 -> DA xxx X-025 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0220 <- 3.50 -> DA xxx X-026 : score x.xxxxx : x : THR xxxx P0222 <- 3.77 -> DT xxx Y0027 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0259 <- 3.45 -> DT xxx Y0028 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0288 <- 3.32 -> DA xxx X-030 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx P0289 <- 3.43 -> DA xxx Y0031 : score x.xxxxx : x : LEU xxxx P0303 <- 3.39 -> DT xxx X-029 : score x.xxxxx : x : PHE xxxx P0305 <- 2.92 -> DT xxx Y0030 : score x.xxxxx : x : VAL xxxx P0311 <- 3.42 -> DA xxx Y0029 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx T0174 <- 3.39 -> DG xxx X-023 : score x.xxxxx : x : THR xxxx o0854 <- 3.95 -> DC xxx Y-009 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx o0855 <- 3.48 -> DC xxx Y-009 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx o1416 <- 3.74 -> DA xxx Y-012 : score x.xxxxx >8wat_o:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=DE NOVO TRANSCRIBING COMPLEX 10 (TC10), THE EARLY ELONGATION COMPLEX WITH POL II POSITIONED 10NT DOWNSTREAM OF TSS organism=? : H : ARG NH2 o1416 <- 2.43 -> DT O2 Y-013 : score 4.5466 : x : MET xxxx o0266 <- 4.43 -> DT xxx Y0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx o0272 <- 4.19 -> DT xxx Y0000 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx o0331 <- 4.44 -> DG xxx Y0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx o0364 <- 4.19 -> DG xxx Y-008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx o0461 <- 3.97 -> DC xxx Y-009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx o0462 <- 4.38 -> DC xxx Y-009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx o0854 <- 3.93 -> DC xxx Y-010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx o0855 <- 3.87 -> DC xxx Y-010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx o1417 <- 4.11 -> DC xxx X0014 : score x.xxxxx >8wat_ops: title=DE NOVO TRANSCRIBING COMPLEX 10 (TC10), THE EARLY ELONGATION COMPLEX WITH POL II POSITIONED 10NT DOWNSTREAM OF TSS organism=? : H : ARG NH2 o1416 <- 2.43 -> DT O2 Y-013 : score 4.5466 : x : MET xxxx o0266 <- 4.43 -> DT xxx Y0000 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx o0272 <- 4.19 -> DT xxx Y0000 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx o0331 <- 4.44 -> DG xxx Y0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx o0364 <- 4.19 -> DG xxx Y-008 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx o0461 <- 3.97 -> DC xxx Y-009 : score x.xxxxx : x : PRO xxxx o0462 <- 4.38 -> DC xxx Y-009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx o0854 <- 3.93 -> DC xxx Y-010 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx o0855 <- 3.87 -> DC xxx Y-010 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx o1417 <- 4.11 -> DC xxx X0014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx p0518 <- 4.34 -> DC xxx Y-010 : score x.xxxxx >8wau_o:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=DE NOVO TRANSCRIBING COMPLEX 11 (TC11), THE EARLY ELONGATION COMPLEX WITH POL II POSITIONED 11NT DOWNSTREAM OF TSS organism=? : H : ARG NH2 o1416 <- 2.80 -> DG N3 Y-014 : score 3.61026 : x : MET xxxx o0266 <- 3.15 -> DA xxx Y-001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx o0272 <- 3.86 -> DA xxx Y-001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx o0331 <- 4.14 -> DA xxx X0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx o0364 <- 4.06 -> DT xxx Y-009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx o0461 <- 3.95 -> DC xxx Y-010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx o0854 <- 3.83 -> DC xxx Y-011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx o0855 <- 3.71 -> DC xxx Y-011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx o1417 <- 4.04 -> DT xxx X0015 : score x.xxxxx >8wau_ops: title=DE NOVO TRANSCRIBING COMPLEX 11 (TC11), THE EARLY ELONGATION COMPLEX WITH POL II POSITIONED 11NT DOWNSTREAM OF TSS organism=? : H : ARG NH2 o1416 <- 2.80 -> DG N3 Y-014 : score 3.61026 : x : MET xxxx o0266 <- 3.15 -> DA xxx Y-001 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx o0272 <- 3.86 -> DA xxx Y-001 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx o0331 <- 4.14 -> DA xxx X0000 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx o0364 <- 4.06 -> DT xxx Y-009 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx o0461 <- 3.95 -> DC xxx Y-010 : score x.xxxxx : x : THR xxxx o0854 <- 3.83 -> DC xxx Y-011 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx o0855 <- 3.71 -> DC xxx Y-011 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx o1417 <- 4.04 -> DT xxx X0015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx p0518 <- 4.34 -> DC xxx Y-011 : score x.xxxxx >8wav_o:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=DE NOVO TRANSCRIBING COMPLEX 12 (TC12), THE EARLY ELONGATION COMPLEX WITH POL II POSITIONED 12NT DOWNSTREAM OF TSS organism=? : H : ARG NH2 o1416 <- 2.93 -> DA N3 Y-015 : score 3.15551 : x : MET xxxx o0266 <- 3.37 -> DG xxx Y-002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx o0272 <- 3.67 -> DG xxx Y-002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx o0331 <- 4.08 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx o0364 <- 4.06 -> DA xxx Y-010 : score x.xxxxx >8wav_ops: title=DE NOVO TRANSCRIBING COMPLEX 12 (TC12), THE EARLY ELONGATION COMPLEX WITH POL II POSITIONED 12NT DOWNSTREAM OF TSS organism=? : H : ARG NH2 o1416 <- 2.93 -> DA N3 Y-015 : score 3.15551 : x : MET xxxx o0266 <- 3.37 -> DG xxx Y-002 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx o0272 <- 3.67 -> DG xxx Y-002 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx o0331 <- 4.08 -> DT xxx X0001 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx o0364 <- 4.06 -> DA xxx Y-010 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx o0461 <- 3.91 -> DC xxx Y-011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx o0854 <- 3.90 -> DC xxx Y-012 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx o0855 <- 3.67 -> DC xxx Y-012 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx p0518 <- 4.39 -> DC xxx Y-012 : score x.xxxxx >8waw_ops: title=DE NOVO TRANSCRIBING COMPLEX 13 (TC13), THE EARLY ELONGATION COMPLEX WITH POL II POSITIONED 13NT DOWNSTREAM OF TSS organism=? : H : ARG NH2 o1416 <- 2.54 -> DA N3 Y-016 : score 3.40821 : x : MET xxxx o0266 <- 3.73 -> DT xxx Y-003 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx o0272 <- 3.31 -> DT xxx Y-003 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx o0331 <- 4.06 -> DG xxx Y-002 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx o0364 <- 4.17 -> DG xxx Y-011 : score x.xxxxx >8wax_ops: title=DE NOVO TRANSCRIBING COMPLEX 14 (TC14), THE EARLY ELONGATION COMPLEX WITH POL II POSITIONED 14NT DOWNSTREAM OF TSS organism=? : H : ARG NH2 o1416 <- 2.85 -> DG N3 Y-017 : score 3.57415 : x : MET xxxx o0266 <- 3.84 -> DT xxx Y-004 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx o0272 <- 3.31 -> DT xxx Y-004 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx o0331 <- 4.11 -> DA xxx X0003 : score x.xxxxx : x : THR xxxx o0854 <- 3.88 -> DC xxx Y-014 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx o0855 <- 3.61 -> DC xxx Y-014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx o1417 <- 3.90 -> DG xxx X0018 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx p0518 <- 4.27 -> DC xxx Y-014 : score x.xxxxx >8way_o:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=DE NOVO TRANSCRIBING COMPLEX 15 (TC15), THE EARLY ELONGATION COMPLEX WITH POL II POSITIONED 15NT DOWNSTREAM OF TSS organism=? : H : ARG NH2 o1416 <- 2.75 -> DC O2 Y-018 : score 3.73571 : x : MET xxxx o0266 <- 3.43 -> DG xxx Y-005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx o0272 <- 3.72 -> DG xxx Y-005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx o0331 <- 3.60 -> DT xxx Y-004 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx o0461 <- 4.28 -> DC xxx Y-014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx o0854 <- 3.81 -> DC xxx Y-015 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx o0855 <- 3.69 -> DC xxx Y-015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx o1417 <- 4.43 -> DA xxx X0019 : score x.xxxxx >8way_ops: title=DE NOVO TRANSCRIBING COMPLEX 15 (TC15), THE EARLY ELONGATION COMPLEX WITH POL II POSITIONED 15NT DOWNSTREAM OF TSS organism=? : H : ARG NH2 o1416 <- 2.75 -> DC O2 Y-018 : score 3.73571 : x : MET xxxx o0266 <- 3.43 -> DG xxx Y-005 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx o0272 <- 3.72 -> DG xxx Y-005 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx o0331 <- 3.60 -> DT xxx Y-004 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx o0364 <- 4.27 -> DT xxx Y-013 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx o1417 <- 4.43 -> DA xxx X0019 : score x.xxxxx >8waz_ops: title=DE NOVO TRANSCRIBING COMPLEX 16 (TC16), THE EARLY ELONGATION COMPLEX WITH POL II POSITIONED 16NT DOWNSTREAM OF TSS organism=? : H : ARG NH2 o1416 <- 2.62 -> DT O2 Y-019 : score 4.38573 : x : MET xxxx o0266 <- 3.31 -> DA xxx Y-006 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx o0272 <- 3.90 -> DA xxx Y-006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx o0331 <- 3.49 -> DG xxx Y-005 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx o0364 <- 4.21 -> DG xxx Y-014 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx o1417 <- 3.92 -> DG xxx X0020 : score x.xxxxx >8wb0_o:beta_and_beta-prime_subunits_of_DNA_dependent_RNA-polymerase; title=DE NOVO TRANSCRIBING COMPLEX 17 (TC17), THE EARLY ELONGATION COMPLEX WITH POL II POSITIONED 17NT DOWNSTREAM OF TSS organism=? : H : ARG NH2 o1416 <- 2.69 -> DC O2 Y-020 : score 3.78009 : x : MET xxxx o0266 <- 3.31 -> DA xxx Y-007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx o0272 <- 3.96 -> DA xxx Y-007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx o0285 <- 4.35 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx o0331 <- 3.25 -> DA xxx Y-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx o0364 <- 4.09 -> DA xxx Y-015 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx o0461 <- 3.85 -> DC xxx Y-016 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx o1417 <- 4.41 -> DC xxx X0021 : score x.xxxxx >8wb0_ops: title=DE NOVO TRANSCRIBING COMPLEX 17 (TC17), THE EARLY ELONGATION COMPLEX WITH POL II POSITIONED 17NT DOWNSTREAM OF TSS organism=? : H : ARG NH2 o1416 <- 2.69 -> DC O2 Y-020 : score 3.78009 : x : MET xxxx o0266 <- 3.31 -> DA xxx Y-007 : score x.xxxxx : x : ASN xxxx o0272 <- 3.96 -> DA xxx Y-007 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx o0285 <- 4.35 -> DT xxx X0006 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx o0331 <- 3.25 -> DA xxx Y-006 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx o0364 <- 4.09 -> DA xxx Y-015 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx o1417 <- 4.41 -> DC xxx X0021 : score x.xxxxx >8wpe_AEG: title=STRUCTURE OF MONKEYPOX VIRUS POLYMERASE COMPLEX F8-A22-E4-H5 (TAG- FREE A22) WITH EXOGENOUS DNA organism=? : H : LYS NZ A0804 <- 3.09 -> DG N3 H0034 : score 1.36952 : H : ARG NH2 A0832 <- 2.83 -> DT O2 I0018 : score 4.20793 : x : TYR xxxx A0668 <- 3.43 -> DG xxx I0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0177 <- 3.25 -> DC xxx I0041 : score x.xxxxx >8wpe_BCF: title=STRUCTURE OF MONKEYPOX VIRUS POLYMERASE COMPLEX F8-A22-E4-H5 (TAG- FREE A22) WITH EXOGENOUS DNA organism=? : x : THR xxxx C0161 <- 3.35 -> DA xxx I0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0185 <- 3.22 -> DG xxx I0007 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0186 <- 4.10 -> DG xxx I0007 : score x.xxxxx >8wpf_AEG: title=STRUCTURE OF MONKEYPOX VIRUS POLYMERASE COMPLEX F8-A22-E4-H5 WITH EXOGENOUS DNA BEARING ONE ABASIC SITE organism=? : H : LYS NZ A0804 <- 3.20 -> DG N3 H0034 : score 1.33754 : H : ARG NH2 A0832 <- 2.60 -> DT O2 H0032 : score 4.40267 : x : TYR xxxx A0668 <- 3.51 -> DG xxx I0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx E0177 <- 3.08 -> DA xxx I0035 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0177 <- 3.30 -> DC xxx I0041 : score x.xxxxx >8wpf_BCF: title=STRUCTURE OF MONKEYPOX VIRUS POLYMERASE COMPLEX F8-A22-E4-H5 WITH EXOGENOUS DNA BEARING ONE ABASIC SITE organism=? : x : HIS xxxx B-009 <- 4.06 -> DA xxx I0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B-008 <- 3.72 -> DA xxx I0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B-006 <- 3.17 -> DA xxx I0009 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx C0087 <- 3.53 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0161 <- 3.48 -> DA xxx I0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0185 <- 2.95 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx >8wpf_C:Uracil-DNA_glycosylase-like; title=STRUCTURE OF MONKEYPOX VIRUS POLYMERASE COMPLEX F8-A22-E4-H5 WITH EXOGENOUS DNA BEARING ONE ABASIC SITE organism=? : x : LYS xxxx C0087 <- 3.53 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0161 <- 3.48 -> DA xxx I0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0185 <- 2.95 -> DA xxx I0005 : score x.xxxxx >8wpk_A:DNA/RNA_polymerases;Ribonuclease_H-like; title=STRUCTURE OF MONKEYPOX VIRUS POLYMERASE COMPLEX F8-A22-E4-H5 WITH EXGENOUS DNA organism=? : H : LYS NZ A0804 <- 3.04 -> DG N3 H0034 : score 1.38406 : H : ARG NH2 A0832 <- 2.99 -> DA N3 H0031 : score 3.11663 : x : LYS xxxx A0340 <- 4.13 -> DT xxx H0033 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0668 <- 4.10 -> DG xxx I0014 : score x.xxxxx >8wpk_AEG: title=STRUCTURE OF MONKEYPOX VIRUS POLYMERASE COMPLEX F8-A22-E4-H5 WITH EXGENOUS DNA organism=? : H : LYS NZ A0804 <- 3.04 -> DG N3 H0034 : score 1.38406 : H : ARG NH2 A0832 <- 2.99 -> DA N3 H0031 : score 3.11663 : x : LYS xxxx A0340 <- 4.13 -> DT xxx H0033 : score x.xxxxx : x : TYR xxxx A0668 <- 4.10 -> DG xxx I0014 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0177 <- 3.31 -> DC xxx I0041 : score x.xxxxx >8wpk_BCF: title=STRUCTURE OF MONKEYPOX VIRUS POLYMERASE COMPLEX F8-A22-E4-H5 WITH EXGENOUS DNA organism=? : x : HIS xxxx B-006 <- 3.22 -> DA xxx I0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B-004 <- 4.05 -> DT xxx I0011 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0161 <- 3.50 -> DA xxx I0008 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx C0185 <- 3.28 -> DG xxx I0007 : score x.xxxxx >8wpp_AEG: title=STRUCTURE OF MONKEYPOX VIRUS POLYMERASE COMPLEX F8-A22-E4-H5 WITH ENDOGENOUS DNA organism=? : H : LYS NZ A0804 <- 2.53 -> DA N3 I0016 : score 2.92688 : H : ARG NH1 E0177 <- 3.12 -> DA N3 H0015 : score 3.4464 : x : TYR xxxx A0668 <- 3.33 -> DG xxx I0014 : score x.xxxxx : x : THR xxxx A0752 <- 3.99 -> DC xxx H0035 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0805 <- 4.15 -> DT xxx I0018 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx A0832 <- 3.05 -> DA xxx H0031 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx A0834 <- 4.26 -> DA xxx H0031 : score x.xxxxx : x : LYS xxxx A0948 <- 4.25 -> DG xxx H0029 : score x.xxxxx : x : ARG xxxx G0177 <- 3.83 -> DC xxx I0041 : score x.xxxxx >8wpp_BCF: title=STRUCTURE OF MONKEYPOX VIRUS POLYMERASE COMPLEX F8-A22-E4-H5 WITH ENDOGENOUS DNA organism=? : H : ARG NH2 C0185 <- 2.61 -> DG N7 I0007 : score 6.62723 : x : HIS xxxx B-009 <- 3.85 -> DA xxx I0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B-008 <- 3.97 -> DA xxx I0009 : score x.xxxxx : x : HIS xxxx B-006 <- 3.25 -> DA xxx I0009 : score x.xxxxx : x : THR xxxx C0161 <- 3.49 -> DA xxx I0009 : score x.xxxxx : x : ASP xxxx C0186 <- 4.18 -> DG xxx I0007 : score x.xxxxx : x : GLN xxxx C0188 <- 4.05 -> DG xxx I0007 : score x.xxxxx >8wpp_E: title=STRUCTURE OF MONKEYPOX VIRUS POLYMERASE COMPLEX F8-A22-E4-H5 WITH ENDOGENOUS DNA organism=? : H : ARG NH1 E0177 <- 3.12 -> DA N3 H0015 : score 3.4464 >9ant_B:Homeodomain-like; title=ANTENNAPEDIA HOMEODOMAIN-DNA COMPLEX organism=Drosophila melanogaster : H : ARG NH1 B0005 <- 2.50 -> DT O2 F0518 : score 4.5648 : H : ARG NH2 B0005 <- 2.71 -> DT O2 F0518 : score 4.30953 : w : GLN NE2 B0050 <- 6.34 -> DT O4 F0521 : score 2.257 A : H : ASN OD1 B0051 <- 2.82 -> DA N6 F0520 : score 5.99771 : H : ASN ND2 B0051 <- 2.74 -> DA N7 F0520 : score 5.94096 : w : ASN OD1 B0051 <- 5.70 -> DT O4 F0521 : score 3.132 : V : ILE CG2 B0047 <- 3.69 -> DT C7 F0521 : score 7.28629 : x : LYS xxxx B0046 <- 3.73 -> DG xxx E0405 : score x.xxxxx : x : MET xxxx B0054 <- 4.25 -> DC xxx E0407 : score x.xxxxx >9ica_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX + 2'-DEOXYADENOSINE-5'- O-(1-THIOTRIPHOSPHATE), SOAKED IN THE PRESENCE OF DATP(ALPHA)S AND MNCL2 organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 6.66 -> DT O2 T0004 : score 1.55 : w : LYS NZ A0234 <- 5.89 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >9icb_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX + 2'-DEOXYADENOSINE-5'- TRIPHOSPHATE, SOAKED IN THE PRESENCE OF DATP AND COCL2 organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.31 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >9icc_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX + 2'-DEOXYADENOSINE-5'- TRIPHOSPHATE, SOAKED IN THE PRESENCE OF DATP AND CRCL3 organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.56 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >9ice_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DATP (1 MILLIMOLAR) AND CUCL2 (0.1 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 4.04 -> DT xxx P0006 : score x.xxxxx >9icf_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX + 2'-DEOXYADENOSINE-5'- TRIPHOSPHATE, SOAKED IN THE PRESENCE OF DATP AND ZNCL2 organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.55 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >9icg_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DCTP (1 MILLIMOLAR) AND ZNCL2 (1 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.87 -> DT xxx P0006 : score x.xxxxx >9ich_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DGTP (1 MILLIMOLAR) AND ZNCL2 (1 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : SER OG A0229 <- 6.30 -> DT O2 T0004 : score 1.55 : w : LYS NZ A0234 <- 5.77 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >9ici_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DTTP (1 MILLIMOLAR) AND ZNCL2 (1 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 5.27 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >9icj_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.45 -> DT xxx P0006 : score x.xxxxx >9ick_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX, SOAKED IN THE PRESENCE OF ARTIFICIAL MOTHER LIQUOR organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.40 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >9icl_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX, SOAKED IN THE PRESENCE OF PYROPHOSPHATE AND MNCL2 organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.08 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >9icm_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SIX BASE PAIRS OF DOUBLE STRANDED DNA (NO 5'-PHOSPHATE) organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.04 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >9icn_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX + 2',3'-DIDEOXYCYTIDINE- 5'-TRIPHOSPHATE, SOAKED IN THE PRESENCE OF DDCTP AND MGCL2 organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.17 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >9ico_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX, SOAKED IN THE PRESENCE OF DTTP AND MGCL2 organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.26 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >9icp_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SIX BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF PYROPHOSPHATE (1 MILLIMOLAR) AND MGCL2 (5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.22 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >9icq_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SIX BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DATP (1 MILLIMOLAR) AND MNCL2 (5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.19 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >9icr_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX + 2'-DEOXYCYTIDINE-5'- TRIPHOSPHATE, SOAKED IN THE PRESENCE OF DCTP AND MNCL2 organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.36 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >9ics_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX + 2',3'-DIDEOXYCYTIDINE- 5'-TRIPHOSPHATE, SOAKED IN THE PRESENCE OF DDCTP AND MNCL2 organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.32 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >9ict_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX + 2'-DEOXYGUANOSINE-5'- TRIPHOSPHATE, SOAKED IN THE PRESENCE OF DGTP AND MNCL2 organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.17 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >9icu_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SIX BASE PAIRS OF DNA; SOAKED IN THE PRESENCE OF DTTP (1 MILLIMOLAR) AND MNCL2 (5 MILLIMOLAR) organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.08 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >9icv_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7)/DNA COMPLEX + 2'-DEOXYADENOSINE-5'- TRIPHOSPHATE, SOAKED IN THE PRESENCE OF DATP AND ZNCL2 organism=Homo sapiens : w : LYS NZ A0234 <- 6.59 -> DA N3 T0002 : score 1.538 : w : LYS NZ A0234 <- 5.37 -> DT O2 T0003 : score 0.522 >9icw_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SIX BASE PAIRS OF DNA; NATIVE STRUCTURE organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.47 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >9icx_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SIX BASE PAIRS OF DNA (NON GAPPED DNA ONLY) organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.69 -> DG xxx P0006 : score x.xxxxx >9icy_A:Nucleotidyltransferase;DNA_polymerase_beta,_N-terminal_domain-like;PsbU/PolX_domain-like; title=DNA POLYMERASE BETA (E.C.2.7.7.7) COMPLEXED WITH SEVEN BASE PAIRS OF DNA (NON GAPPED DNA ONLY) organism=Homo sapiens : x : LYS xxxx A0234 <- 3.61 -> DT xxx P0006 : score x.xxxxx >9mht_A:S-adenosyl-L-methionine-dependent_methyltransferases; title=CYTOSINE-SPECIFIC METHYLTRANSFERASE HHAI/DNA COMPLEX organism=Haemophilus haemolyticus : H : SER OG A0087 <- 3.34 -> DG N3 D0426 : score 2.47244 : H : SER OG A0087 <- 3.34 -> DG N3 D0426 : score 2.47244 : H : GLN OE1 A0237 <- 3.04 -> DG N2 C0408 : score 5.33852 : H : ARG NH1 A0240 <- 3.08 -> DG N7 D0426 : score 5.7112 : H : ARG NH1 A0240 <- 3.08 -> DG N7 D0426 : score 5.7112 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.92 -> DG O6 D0426 : score 6.4416 : H : ARG NH2 A0240 <- 2.92 -> DG O6 D0426 : score 6.4416 : w : LYS NZ A0261 <- 6.17 -> DT O4 C0405 : score 1.7 : x : ILE xxxx A0086 <- 4.00 -> DT xxx C0410 : score x.xxxxx : x : ALA xxxx A0260 <- 4.03 -> DT xxx C0405 : score x.xxxxx